JP4053526B2 - 表面プラズモン共鳴分析における離脱速度係数の測定方法 - Google Patents
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Description
dR/dt=Ka×C×[Rmax−R(t)]−Kd×R(t) (i)
R(t)=(Ka×C×Rmax)/(Ka×C+Kd) ×(1−exp(-Ka×C+Kd) ×t))(ii)(上記式(i)を解いたもの)
Ka:吸着速度係数、Kd:離脱速度係数、C:アナライト濃度(既知)、Rmax:理論的最大結合量、t:時間
(a)アナライト濃度を振った測定を行う(図4)。
(b)リガンドの固定量を事前に測定し、その値から算出する(図5)。
(c)Ka、Kdと同様にRmaxも変数として扱い、非線形回帰を行う。
等の方法が採られていた。しかしながら、上記の(a)の場合は、測定回数が増大するためコストと時間がかかるという問題があった。また、上記の(b)の場合も、測定時間と手間が増大するという問題、並びにリガンド固定量のバラツキによる誤差が生じ、測定精度が低下するという問題があった。さらに、上記(c)の場合のように非線形回帰を行った場合は、計算量の増大による誤差が生じるとともに、ここでもリガンド固定量のバラツキによる誤差が生じ、精度が低下するという問題があった。
好ましくは、液流が停止した状態で測定を行うことができる。
好ましくは、前記流路系内の液体を、測定すべき被験物質を含有しない対照液体から、測定すべき被験物質を含有する試料液体へと交換し、その後、試料液体の流れを停止させた状態で表面プラズモン共鳴の変化を測定する。
本発明の方法では、表面プラズモン共鳴測定装置を用いて表面プラズモン共鳴の信号変化を測定し、表面プラズモン共鳴の信号曲線のうち解離曲線の信号および傾き、もしくは信号の比を用いて離脱速度係数(Kd)を測定する。
R’(t)=dR(t)/dt≒[ R (t+Δt)−R (t) ] / Δt
結合/解離の微分方程式は下記式で示される。
dR/dt=ka×C×[Rmax−R(t)]−kd×R(t) (1)
R(t)=(ka*C*Rmax)/(ka*C+kd)*(1−exp(-ka*C+kd)*t)) (1’)
R(t)=R(t0)×exp (-kd×t) (2)
R'(t)=dR/dt=−kd×R(t0)×exp (-kd×t)=−kd×R(t)
ここで、R(t0)は洗浄の瞬間(t=t0)の結合量であり、測定により一意に求まる。
したがって、
R(t)=R(t0)×exp (-kd×t) (2)
R(t+△t)=R(t0)×exp [ -kd×(t+△t)]=R(t0)×exp (-kd×t)×exp (-kd×△t) =R(t) ×exp (-kd×△t)
より、
核酸としては、測定の対象とする核酸と相補的にハイブリダイズするものを使用することができる。核酸は、DNA(cDNAを含む)、RNAのいずれも使用できる。DNAの種類は特に限定されず、天然由来のDNA、遺伝子組換え技術により調製した組換えDNA、又は化学合成DNAの何れでもよい。
低分子有機化合物としては通常の有機化学合成の方法で合成することができる任意の化合物が挙げられる。
免疫グロブリン結合性蛋白質としては、例えばプロテインAあるいはプロテインG、リウマチ因子(RF)等を使用することができる。
糖結合性蛋白質としては、レクチン等が挙げられる。
脂肪酸あるいは脂肪酸エステルとしては、ステアリン酸、アラキジン酸、ベヘン酸、ステアリン酸エチル、アラキジン酸エチル、ベヘン酸エチル等が挙げられる。
金属膜として50nmの金が蒸着された本発明の誘電体ブロックをModel-208UV−オゾンクリーニングシステム(TECHNOVISION INC.)で30分間処理した後、エタノール/水(80/20)中11-ヒドロキシ-1-ウンデカンチオールの5.0mM溶液を金属膜に接触するように添加し、25℃で18時間表面処理を行った。その後、エタノールで5回、エタノール/水混合溶媒で1回、水で5回洗浄を行った。
上記のデキストラン測定チップ内の溶液を除去した後、200mM EDC(N-エチル-N'-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド ハイドロクロライド)と50mM NHS(N-ヒドロキシスクシンイミド)の混合溶液70μlを添加し、10分間放置した。混合溶液を除去した後、100μlの水で3回、100μlのAcetate5.0バッファー(BIAcore社製)で3回洗浄した。Acetate5.0バッファーを100μl入れた状態でこのチップを本発明の表面プラズモン共鳴測定装置に設置し、チップ内をProteinA溶液(ProteinA(ナカライテスク社製)を50μg/mlになるようAcetate5.0(BIAcore社製)に溶解したもの)に入れ替え30分間放置し、ProteinAを固定した。チップ内を1M エタノールアミン溶液に置き換え、10分間放置した。チップ内を100μlのAcetate5.0バッファーで10回洗浄した。ProteinAの固定による共鳴シグナル変化量は、500RUであった。
上記のデキストラン測定チップ内の溶液を除去した後、200mM EDCと50mM NHSの混合溶液70μlを添加し、10分間放置した。混合溶液を除去した後、100μlの水で3回、100μlのAcetate5.0バッファーで3回洗浄した。チップ内を1M エタノールアミン溶液に置き換え、10分間放置した。チップ内を100μlのAcetate5.0バッファーで10回洗浄した。
本発明のProteinA固定チップに対し、誘電体ブロックをシリコンゴムでふたをすることで、内容積15μlのセルを作成した。また、ふたのシリコンゴムに2箇所、1mmφの穴をあけ、内径0.5mm、外径1mmのテフロンチューブを通し、流路を作成した。同様に参照チップにもふた、流路を作成し、2つのチップを直列につなぎ、流路系を作成した。この流路系の2つのチップをそれぞれ、本発明の表面プラズモン共鳴測定装置に設置した。
流路系内をHBS-EPバッファー(BIAcore社製)で満たした。液交換前を基準とした信号変化を0.5秒間隔で測定した。流路系内を20μl/secの速度でmouse IgG溶液(mouse IgG(コスモバイオより購入)を10μg/mlになるようHBS-EPバッファーに溶解したもの)に置き換えた。置き換えに要した時間は5秒であった。
具体的には、結合開始後 300秒(t=t0=300、R(t0=300)=350.0RU) において PBSバッファ(緩衝生理食塩水)にて洗浄を行い、洗浄1秒後(t=t0 +△t=301、△t=1、R(t0 +△t=301)=349.7RU)の時のSPR信号を元に算出し、kd=8.6×10-4 [s-1 ] の値を得た。これは、以前に (b)の方法、即ちリガンドの固定量を事前に測定し、その値からRmaxを算出しkd を求めた場合の、kd=9.0×10-4 [s-1 ] と誤差の範囲で等しい値であった。
11 誘電体ブロック
12 金属膜
13 試料保持枠
14 センシング物質
30 光ビーム
31 レーザ光源
32 集光レンズ
40 光検出器
S40 出力信号
400 ガイドロッド
401 スライドブロック
402 精密ねじ
403 パルスモータ
404 モータコントローラ
410 ユニット連結体
411 連結部材
Claims (2)
- 表面プラズモン共鳴測定装置を用いて表面プラズモン共鳴の信号変化を測定することにより、金属表面に固定化された被解析分子と該被解析分子と相互作用する分子との反応における離脱速度係数(Kd)を測定する方法において、表面プラズモン共鳴の信号曲線のうち解離曲線の信号および傾き、もしくは信号の比を用いて離脱速度係数(Kd)を算出することを特徴とし、以下の式の何れかを用いて、表面プラズモン共鳴の信号曲線のうちの解離曲線から離脱速度係数(Kd)を算出し、かつ金属膜上に形成されたセルを含む流路系と、金属膜面で全反射した光ビームの強度を測定して表面プラズモン共鳴の状態を検出する光検出手段とを備えてなる表面プラズモン共鳴測定装置を用い、前記流路系内の液体を、測定すべき被験物質を含有しない対照液体から、測定すべき被験物質を含有する試料液体へと交換し、その後、前記流路系内の液体を、洗浄液に交換し、液の流れを停止させた状態で表面プラズモン共鳴の信号変化を測定することを特徴とする、上記の方法。
- 誘電体ブロックと、この誘電体ブロックの一面に形成された金属膜と、光ビームを発生させる光源と、前記光ビームを前記誘電体ブロックに対して、該誘電体ブロックと金属膜との界面で全反射条件が得られるように、かつ、種々の入射角成分を含むようにして入射させる光学系と、前記金属膜上に形成されたセルを含む流路系と、前記界面で全反射した光ビームの強度を測定して表面プラズモン共鳴の状態を検出する光検出手段とを備えてなる表面プラズモン共鳴測定装置を用いる、請求項1に記載の方法。
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