JP3949111B2 - Novel G protein-coupled receptor and gene thereof - Google Patents

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Description

技術分野
本発明は、新規な受容体(エイコサノイド受容体)タンパク質およびその遺伝子に関する。また、これらを用いた医薬品候補化合物のスクリーニング方法に関する。
背景技術
多くの神経伝達物質、ホルモン、オータコイドなどの生理活性物質は、細胞表面に存在する特異的な受容体タンパク質を介して、生体の機能を調節している。このような受容体の多くは、細胞内に存在する三量体のGTP結合タンパク質(以下、Gタンパク質と称する)と共役しており、その活性化を通じて情報を細胞内に伝達することが知られている。このことから、これら受容体はGタンパク質共役型受容体と総称される。Gタンパク質共役型受容体は、いずれも7個の膜貫通領域を含む共通の構造を有していることが知られている。
Gタンパク質は、α、β及びγサブユニットで構成される三量体であり、基底状態ではこれらサブユニットが会合した不活性型(GDP結合型)として存在する。リガンド刺激を受けたGタンパク質共役型受容体により、不活性型(GDP結合型)Gタンパク質が活性型(GTP結合型)へと変換され、GTPと結合したαサブユニット(Gα)とβ/γサブユニット複合体(Gβγ)とに解離する。そして、GTPと結合したGα(また場合によってはGβγ)が、アデニル酸シクラーゼ、ホスホリパーゼCなどの効果器を制御してシグナルを伝達する。
また、Gタンパク質、特にGαには、多様性があり、Gαの種類によって異なる効果器を制御することも知られており、一般に、Gタンパク質共役型受容体は、特定の種類のGタンパク質を活性化し、そのGタンパク質により特定の情報を細胞内に伝える。
Gタンパク質共役型受容体としては、これまでに、α−及びβ−アドレナリン受容体、ムスカリン性アセチルコリン受容体、アデノシン受容体、アンジオテンシン受容体、エンドセリン受容体、ゴナドトロピン放出因子受容体、H1−及びH2−ヒスタミン受容体、ドーパミン受容体、代謝型グルタミン酸受容体、ソマトスタチン受容体、などが知られている。
いずれも生理活性物質の標的として、生体内での重要な役割を担っている。さらに、現在までに知られている医薬品の多くが、やはりGタンパク質共役型受容体を標的とするリガンド、あるいはアゴニストやアンタゴニストであったという事実も非常に意義深い。
これらのことから、Gタンパク質共役型受容体は、医薬品開発の標的として注目されている。新たなGタンパク質共役型受容体を見出すこと、そのリガンドを同定すること、及び、それらのアゴニストやアンタゴニストをスクリーニング又は同定する方法を見出すことは、新たな医薬品候補化合物のスクリーニングにつながることから、強く望まれている。
エイコサノイド受容体については、以下のようなことが知られている。エイコサノイドと総称されるなかには、プロスタグランジン、プロスタサイクリン、トロンボキサンチン、ロイコトリエンおよび5−オキソ−ETEや5−HETEなどのエイコサテトラエン酸が含まれる。これまでにエイコサノイドをリガンドとする受容体として、プロスタグランジンEP1、EP2、EP3、EP4、F2α受容体、プロスタサイクリンPI2受容体、トロンボキサンチンTA2受容体、ロイコトリエンB4受容体が報告されており、すべてGタンパク質共役型受容体である(Narumiyaら、Physiol.Rev.、第79巻、第1193−1226頁、1999、Mohammed Akbarら、J.Biol.Chem.、第271巻、第18363−18367頁、1996)。しかし、本発明で見出した5−オキソ−ETEなどエイコサテトラエン酸やエイコサトリエン酸をリガンドとする受容体は、これまでに報告されていない。
本発明の目的は、新規Gタンパク質共役型受容体およびその遺伝子を提供することにある。より詳細には、新規なエイコサノイド受容体およびその遺伝子を提供することにある。
また、当該受容体タンパク質に対するリガンドおよび作用薬(アゴニスト又はアンタゴニスト)のスクリーニング、同定、特徴付けを行う方法を提供することにある。また、上記以外の目的については、以下の記載より明らかである。
発明の要旨
本発明者らは、新規Gタンパク質共役型受容体をコードする全長cDNAをヒトから単離した。また、この受容体タンパク質を遺伝子組換え技術により細胞中で発現させることに成功した。さらにこの受容体に対するリガンドを同定し、この受容体が、エイコサノイド受容体であることを見出し、本発明を完成するに到った。
すなわち、本発明は、以下の(A)、(B)及び(C)から選択されるポリペプチドであって、エイコサノイド受容体としての機能または活性を有するポリペプチドに関する。
(A)配列番号2又は21で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド。
(B)配列番号2又は21で示されるアミノ酸配列において、1もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなるポリペプチド。
(C)配列番号1又は20で示される塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸またはその相補物によってコードされるポリペプチド。
また、本発明は、前記ポリペプチドをコードする核酸にも関する。
また、本発明は、前記核酸を含有する組換えベクターならびに宿主細胞にも関する。
また、本発明は、前記ポリペプチドを用いる該ポリペプチドの機能又は活性検出方法にも関する。また、本発明は、これらを用いて、該ポリペプチドの機能又は活性を変調(増強又は抑制)させる方法にも関する。
さらに、本発明は、これらを用いる前記ポリペプチドのリガンドまたは作用薬(アゴニスト又はアンタゴニスト)のスクリーニング方法または同定方法にも関する。
発明を実施するための最良の形態
後記配列表における配列番号1は、発明者らによって単離された受容体タンパク質(TG1019タンパク質と称する)の遺伝子(TG1019遺伝子と称する)のヒト由来cDNA(翻訳領域全長を含む)の塩基配列を表す。配列番号2は、当該cDNAにコードされる受容体タンパク質(TG1019タンパク質)のアミノ酸配列を表す。
本発明の受容体タンパク質は、Gタンパク質共役型受容体タンパク質であり、エイコサノイド受容体としての機能(生物学的活性)を有する。したがって、本発明の受容体タンパク質は、エイコサノイドと特異的に結合する。そして、エイコサノイドと本発明の受容体タンパク質との特異的結合により、受容体タンパク質が刺激され、そして細胞内シグナル伝達が誘導される。
本発明の受容体タンパク質のリガンドであるエイコサノイドとは、エイコサン酸等の炭素数20の脂肪酸に由来する物質をいい、好ましくは、8位が不飽和の脂肪酸である。より詳細には、5−オキソ−6E,8Z,11Z,14Z−エイコサテトラエン酸(5−oxo−6E,8Z,11Z,14Z−eicosatetraenoic acid,5−オキソ−ETEと略称)、5−ヒドロペルオキシエイコサ−6E,8Z,11Z,14Z−テトラエン酸(5−hydroperoxyeicosa−6E,8Z,11Z,14Z−tetraenoic acid,5−HPETEと略称)、アラキドン酸(arachidonic acidまたはeicosa−5Z,8Z,11Z,14Z−tetraenoic acid)、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸(eicosa−5Z,8Z,11Z−trienoic acid)、5−ヒドロキシエイコサ−6E,8Z,11Z−トリエン酸(5−hydroxyeicosa−6E,8Z,11Z−tetraenoic acid,5−HETrEと略称)、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸(eicosa−5Z,8Z−dienoic acid)、5−ヒドロキシエイコサ−6E,8Z,11Z,14Z−テトラエン酸(5−hydroxyeicosa−6E,8Z,11Z,14Z−tetraenoic acid,5−HETEと略称)、および5,8,11−エイコサトリイン酸(5,8,11−eicosatriynoic acid)などをいう。上記リガンドの合成経路図を下記表1に示した。

Figure 0003949111
5−オキソ−ETEは、アラキドン酸から5−HETEを経由して合成され、強力な抗酸球、好中球の走化因子であることが知られている(Schwenkら、J.Biol.Chem.、第270巻、第15029−15036頁、1995年、Guilbertら、Am.J.Respir.Cell Mol.Biol.、第21巻、第97−104頁、1999年)。また、5−オキソ−ETEは、動物レベルでも好酸球の遊走を誘導することが知られている(Stamatiouら、J.Clin.Invest.、第102巻、第2165−2172頁、1998年)。さ(Stamatiouら、J.Clin.Invest.、第102巻、第2165−2172頁、1998年)。さらに、この作用は、未同定のGタンパク質共役型受容体を介した作用であることが推定されている(O’Flahertyら、J.Immunol.、第164巻、第3345−3352頁、2000年)。
したがって、本発明の新規Gタンパク質共役型受容体のアンタゴニストは、抗酸球が関与する喘息などのアレルギーや炎症の治療薬として有用である可能性がある。
アラキドン酸は、プロスタグランジンやロイコトリエンの生合成中間体であり、また、5−HPETEは、アラキドン酸からロイコトリエンへの生合成の中間体であることが知られている。
5−oxoETEや5−HETEは、前立腺ガンや乳がん細胞、肺癌、膵臓癌、中皮腫の成長因子であるとともに、維持因子でもあり、その合成を阻害するとアポトーシスを引き起こすことが知られている(Ghoshら、Biochem.Biophys.Res.Commun.、第235巻、第418−423頁、1997年、Ghoshら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、第95巻、第13182−13187頁、1998年、Avisら、FASEBJ.、第15巻、第2007−2009頁、2001年、Avisら、J.Clin.Invest.、第97巻、第806−813頁、1996年、Dingら、Biochem.Biophys.Res.Commun.、第261巻、第218−223頁、1999年、Romanoら、FASEB J.、第15巻、第2326−2336頁、2001年)。
したがって、本発明の新規Gタンパク質共役型受容体のアンタゴニストは、上記のガンに対する抗ガン剤となる可能性がある。
また、本発明の受容体タンパク質は、リガンド(アゴニスト)により刺激を受けると、Gサブファミリーに属するGタンパク質を活性化する。αサブユニットに着目すると、本発明の受容体タンパク質は、リガンド(アゴニスト)による刺激を受けるとGiα(Gサブファミリーに属するGタンパク質のαサブユニット、例えばGiα1)を活性化型(GTP結合能を有する状態)に変換する。そして、かかるGタンパク質の活性化を介して細胞内でシグナルを伝えることができる。
上記の通り、本発明の受容体タンパク質(ポリペプチド)は、以下の(i)〜(iii)の機能を有するものである。
(i)リガンドとの特異的結合。
(ii)リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)による刺激に基づく細胞内シグナル伝達(Ca2+の濃度変化、cAMPの濃度変化、ホスホリパーゼCの活性化、pHの変化、Kの濃度変化など)の誘導。
(iii)リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)による刺激に基づくGタンパク質(Gサブファミリーに属するGタンパク質のαサブユニット)の活性化。
ここで、リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)としては、例えば、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETE、及び5,8,11−エイコサトリイン酸等のエイコサノイドが挙げられ、これらのうち、5−オキソ−ETEがとりわけ好適な例として挙げられる。
本発明において「リガンド」とは、受容体タンパク質に特異的に結合することができる化合物を意味する。リガンドには、天然の化合物および人工的に合成された化合物の両方が含まれる。
本発明において「アゴニスト」とは、受容体タンパク質と特異的に結合することなどにより該受容体タンパク質を刺激して細胞内シグナル伝達を誘導する能力を有する化合物を意味する。また、本発明において「アンタゴニスト」とは、受容体タンパク質を刺激して細胞内シグナル伝達を誘導する能力を有する化合物の作用に対して、これを抑制する能力を有する化合物を意味する。
本発明のタンパク質またはポリペプチドとしては、配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるものが挙げられる。また、配列番号2で示されるアミノ酸配列において、1もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなるものが挙げられる。アミノ酸の欠失、置換もしくは付加は、エイコサノイド受容体としての機能(生物学的活性;biological activity)が失われない程度であればよく、通常1〜約80個、好ましくは1〜約60個、より好ましくは1〜約45個、さらに好ましくは1〜約30個、さらに一層好ましくは1〜約15個である。
すなわち、本発明のタンパク質またはポリペプチドとしては、配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドの他、配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドと比較して1もしくはそれ以上の保存的アミノ酸置換(conservative amino acid substitutions)を有するポリペプチドが挙げられる。
このようなタンパク質またはポリペプチドには、自然界で発見される変異型タンパク質またはポリペプチドのほか、人為的に改変した変異タンパク質またはポリペプチド、異種生物由来のタンパク質またはポリペプチド等が含まれる。
すなわち、このようなタンパク質またはポリペプチドには、配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドの保存的置換変異体(conservative substitution variants)および自然発生対立変異体(naturally occuring allelic variants)が含まれる。
このようなタンパク質またはポリペプチドは、配列番号2で示されるアミノ酸配列と、通常約75%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約85%以上、さらに好ましくは約90%以上、さらに一層好ましくは約95%以上のアミノ酸レベルのホモロジーを有する。
本発明の核酸(DNA又はRNA)としては、配列番号1で示される塩基配列からなる核酸を含むものが挙げられる。また、配列番号1で示される塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下(より好ましくはハイストリンジェントな条件下)でハイブリダイズし得る核酸またはその相補物(すなわち相補的配列を有する核酸)を含むものが挙げられる。このようなハイブリダイズし得る核酸は、エイコサノイド受容体としての機能(生物学的活性)を有するタンパク質またはポリペプチドをコードするものであればよい。
このような核酸は、配列番号1で示される塩基配列と、通常約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約85%以上、さらに好ましくは90%以上、さらに一層好ましくは95%以上のホモロジーを有する。このような遺伝子又は核酸としては、自然界で発見される変異型遺伝子、人為的に改変した変異型遺伝子、異種生物由来の相同遺伝子(オルソローグ)等が含まれる。
本発明において、ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーションとは、通常、6×SSCまたはこれと同等の塩濃度のハイブリダイゼーション溶液中において、50〜60℃の温度条件下、約16時間ハイブリダイゼーションさせ、必要に応じ、6×SSCまたはこれと同等の塩濃度の溶液等で予備洗浄し、そして1×SSCまたはこれと同等の塩濃度の溶液中で洗浄することをいう。また、より高いストリンジェンシーを有する条件(ハイストリンジェントな条件)とは、前記において、洗浄を0.1×SSCまたはこれと同等の塩濃度の溶液中で行うことをいう。
配列のホモロジーは、例えば、ブラスト法(Blast Method,Altschulら、J.Mol.Biol.、215号、403−410頁、1990年)など慣用の方法を用いて解析できる。
本発明の核酸は、哺乳動物の組織や細胞を遺伝子源としてスクリーニングを行うことにより単離取得できる。哺乳動物としては、イヌ、ウシ、ウマ、ヤギ、ヒツジ、サル、ブタ、ウサギ、ラットおよびマウスなどの非ヒト動物のほか、ヒトが挙げられる。これらのうち、ヒトの治療薬の研究開発に利用する上では、ヒト由来のものを用いることが望ましい。
本発明の核酸は、本明細書中に開示された配列情報(後記配列表の配列番号1)を利用して取得することができる。例えば、開示された塩基配列の情報をもとにプライマーやプローブを設計し、これらを用いるPCR(polymerase chain reaction)法、コロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法を適宜組み合わせて、DNAライブラリーから選択・取得することができる。
例えば、哺乳動物の細胞や組織から調製したmRNAからcDNAを合成し、これを鋳型として、PCR法によりcDNA断片を得る。得られたcDNAをプローブとして用い、コロニーハイブリダイゼーション法又はプラークハイブリダイゼーション法によりcDNAライブラリーをスクリーニングし、そして全長cDNAを取得することができる。また、ゲノミックDNAライブラリーをスクリーニングすることにより、ゲノム遺伝子を単離することもできる。また、他の哺乳動物のDNAライブラリーをスクリーニングすることにより、異種生物由来の相同遺伝子(オルソローグ)を単離することもできる。
cDNAライブラリーおよびゲノミックDNAライブラリー等のDNAライブラリーは、例えば、「Molecular Cloning」(Sambrook,J.,Fritsch,E.F.およびManiatis,T.著、Cold Spring Harbor Laboratory Pressより1989年に発刊)に記載の方法により調製することができる。あるいは、市販のライブラリーがある場合はこれを用いてもよい。
得られたcDNAの塩基配列を決定することにより、遺伝子産物のタンパク質をコードする翻訳領域を決定することができ、このタンパク質のアミノ酸配列を得ることができる。
本発明のタンパク質またはポリペプチドは、通常の遺伝子組換え技術により過剰発現(overexpression)させることによって生産することができる。また、他のタンパク質やペプチドとの融合蛋白(fusion protein)の形で発現させ生産することもできる。
本発明のタンパク質またはポリペプチドを過剰発現(overexpression)させた細胞は、例えば、以下のようにして得ることができる。まず、本発明のタンパク質またはポリペプチドをコードするDNAを、適当なプロモーターの下流に連結される形でベクターに挿入し、発現ベクターを構築する。ついで得られた発現ベクターを宿主細胞に導入する。
この発現系(宿主−ベクター系)としては、例えば、細菌、酵母、昆虫細胞及び哺乳動物細胞の発現系などが挙げられる。このうち、機能がよく保存されたタンパク質を得るためには、昆虫細胞(Spodoptera frugiperda SF9、SF21等)および哺乳動物細胞(サルCOS−7細胞、チャイニーズハムスターCHO細胞、ヒトHeLa細胞等)を宿主として用いることが好ましい。
本発明のタンパク質またはポリペプチドを発現させるためのプロモーターとしては、哺乳動物細胞系の場合、SV40プロモーター、LTRプロモーター、エロンゲーション1αプロモーター等、昆虫細胞系の場合、ポリヘドリンプロモーター等を用いることができる。
この発現系に用いるベクターとしては、哺乳動物細胞系の場合には、レトロウイルス系ベクター、パピローマウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、SV40系ベクター等、昆虫細胞系の場合には、バキュロウイルスベクター等を用いることができる。
本発明のタンパク質またはポリペプチドをコードするDNAとしては、自然界に存在するmRNAに対応するcDNA(例えば、配列番号1に示される塩基配列からなるもの)を用いることができるが、これに限定されない。目的とするタンパク質のアミノ酸配列に対応するDNAを設計して用いることもできる。この場合、ひとつのアミノ酸をコードするコドンは各々1〜6種類知られており、用いるコドンの選択は任意でよいが、例えば発現に利用する宿主のコドン使用頻度を考慮して、より発現効率の高い配列を設計することができる。設計した塩基配列を持つDNAは、DNAの化学合成、前記cDNAの断片化と結合、塩基配列の一部改変等によって取得できる。人為的な塩基配列の一部改変、突然変異導入を、所望の改変をコードする合成オリゴヌクレオチドからなるプライマーを利用したPCR法や部位特異的突然変異導入法(site specific mutagenesis)(Markら、Proceedings of National Academy of Sciences、第81巻、第5662〜5666頁、1984年)等によって行うことができる。
本発明のタンパク質またはポリペプチドを、発現ベクターを導入した細胞の培養物などから、公知の精製方法(無機塩類による塩析、有機溶媒による分画沈殿、イオン交換樹脂カラムクロマトグラフィー、アフィニティーカラムクロマトグラフィー、ゲルろ過法など)を適宜組合せることによって、分離精製することができる。
本発明のタンパク質またはポリペプチドを過剰発現(overexpression)させることにより、細胞における該タンパク質またはポリペプチドの機能又は活性を高める(増強させる)ことができる。
本発明の核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸(オリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド)またはその相補物を、本発明の遺伝子を検出するためのプローブとして使用することができる。また、この核酸またはその相補物を、遺伝子の発現を変調(例えば抑制)させるために、例えばアンチセンスオリゴヌクレオチドや、リボザイム、デコイとして使用することもできる。このような核酸としては、例えば、配列番号1示される塩基配列からなる核酸(センス鎖またはアンチセンス鎖)の、原則として連続する14塩基以上の部分配列もしくはその相補的な配列を有するヌクレオチドを用いることができる。
本発明のタンパク質もしくはポリペプチド、またはこれと免疫学的同等性を有するタンパク質もしくはペプチド(タンパク質の断片または部分配列を有する合成ペプチド等)を抗原として用いて、本発明のタンパク質もしくはポリペプチドを認識する抗体を取得することができる。免役学的同等性を有するとは、例えば本発明のタンパク質もしくはポリペプチドに対する抗体と交差反応を生じるということを意味する。
ポリクローナル抗体は、宿主動物(例えば、ラットやウサギ等)に抗原を接種し、免疫血清を回収する通常の方法により調製することができる。モノクローナル抗体は、通常のハイブリドーマ法などの技術により調製することができる。また、モノクローナル抗体の遺伝子を改変してヒト化モノクローナル抗体等を調製することができる。
上記で得られた抗体を用いて、通常の免疫化学的方法(immunochemical assay法など)により、本発明のタンパク質もしくはポリペプチドの細胞中又は組織中などにおける発現を検出することができる。あるいは、抗体を用いるアフィニティクロマトグラフィーにより本発明のタンパク質もしくはポリペプチドを精製することができる。また、中和抗体を用いて、本発明のタンパク質またはポリペプチドの機能または活性を変調させる(例えば抑制させる)ことができる。
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドは、エイコサノイド受容体としての機能または活性(生物学的活性)を有する。かかる機能または活性としては、例えば、以下のようなものが挙げられる。
(i)リガンドとの特異的結合。
(ii)リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)による刺激に基づく細胞内シグナル伝達の誘導。
(iii)リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)による刺激に基づくGタンパク質〔より詳細には、Giα(Gサブファミリーに属するGタンパク質のαサブユニット、例えばGiα1など)〕の活性化。
ここでリガンド(アゴニストとして作用するリガンド)としては、エイコサノイド(例えば、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETE、および5,8,11−エイコサトリイン酸など)が挙げられる。
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドのかかる機能または活性を、例えば、以下のようにして検出することができる。
前記(i)の機能または活性の検出方法
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチド(これを含む膜画分の形態、あるいは、これを細胞表面上に発現している細胞の形態のもの等)を、リガンド〔エイコサノイド、例えば、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETE、および5,8,11−エイコサトリイン酸〕と接触せしめ、両者の特異的結合を検出する。かかる結合の検出には、例えば、標識(例えば、RI標識、蛍光標識など)を付したリガンドを用いることができる。標識を付したリガンドとともに、非標識リガンドを混合して用いる通常の競合アッセイにより特異的結合を検出することができる。
前記(ii)の機能または活性の検出方法
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドを細胞表面に発現している細胞を、リガンド〔エイコサノイド(例えば、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETE、および5,8,11−エイコサトリイン酸等のアゴニストとして作用するもの)と接触せしめ、誘導される細胞内シグナル伝達(例えば、Ca2+の濃度変化、cAMPの濃度変化、ホスホリパーゼCの活性化、pHの変化、Kの濃度変化など)を検出する。本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドを、より低いレベルで発現している(または発現していない)細胞を対照として用い、このような対照細胞における細胞内シグナル伝達のレベルと比較して、それよりも細胞内シグナル伝達のレベルが高ければ、その程度に応じ(ii)の機能または活性を有すると認められる。
細胞内シグナル伝達の検出の具体的な方法については、例えば、文献〔Chenらの方法、Analytical Biochemistry、第226巻、第349−354頁、1995年(Ca2+の濃度変化、cAMPの濃度変化); Graminskiらの方法、J.Biol.Chem.、第268巻、第5957−5964頁、1993年(ホスホリパーゼCの活性化); Sakuraiらの方法、Cell、第92巻、第573−585頁、1998年(Ca2+の濃度変化); Hollopeterらの方法、Nature、第409巻、第202−207頁、2001年(Kの濃度変化); Tatemotoらの方法、Biochem.Biophys.Res.Commun.、第251巻、第471−476頁、1998年(pHの変化); Hinumaらの方法、Nature、第393巻、第272−273頁、1998年(arachidonic acid metabolite releasing);特開平9−268号公報など〕に記載された方法に準じて行うことができる。
前記(iii)の機能または活性の検出方法
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドとGiα(Gサブファミリーに属するGタンパク質のαサブユニット、例えばGiα1)との融合タンパク質を細胞膜上に発現させた細胞から、膜画分を調製する。この膜画分を、リガンド〔エイコサノイド(例えば、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETE、および5,8,11−エイコサトリイン酸等のアゴニストとして作用するもの〕の存在下および非存在下で、標識したGTPまたはそのアナログ〔例えば、GTPγS(グアノシン5’−O−(3−チオ三リン酸))など分解されにくいGTPアナログ〕と接触せしめる。その後、標識したGTPまたはそのアナログの膜画分への結合を検出する。リガンドの非存在下での結合レベルと比較して、リガンドの存在下での結合レベルの方がより高ければ、その程度に応じ前記(iii)の機能または活性があるものと認められる。
ここで、Giα(Gサブファミリーに属するGタンパク質のαサブユニット、例えばGiα1)及びその遺伝子については、既にアミノ酸配列および塩基配列が知られている〔ヒトGiα1(351Cys→Ile)/Bahiaら、Biochemistry、第37巻、第11555−11562頁、1998年:ヒトGiα1/Genbank/EMBL accession no.AFO55013、PIR/SWISS−PROT accession no.PO4898:等〕。
従って、GiαをコードするDNAを、開示された既知配列情報を利用して、PCR(polymerase chain reaction)法、コロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法またはこれらを適宜組合わせて、DNAライブラリーから選択・取得することができる。GiαをコードするDNAを、本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドをコードするDNAの下流に結合し、それを適当なプロモータを含むベクターに組込んで、融合タンパク質を発現させるためのベクターを得ることができる。そして、その融合タンパク質の発現ベクターを、細胞に導入して、融合タンパク質を発現させることができる。
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドを、これに対するリガンドまたは作用薬(アゴニストまたはアンタゴニスト)のスクリーニング又は同定のために使用することができる。
本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドに対するリガンドまたは作用薬(アゴニストまたはアンタゴニスト)のスクリーニングまたは同定方法は、本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチド(これを含む膜画分の形態、あるいは、これを細胞表面上に発現している細胞の形態のもの等)を試験化合物と接触せしめる工程;及び該試験化合物の存在下における(1)該受容体タンパク質もしくはポリペプチドと試験化合物との特異的結合、(2)細胞内シグナル伝達、または(3)Gタンパク質(Giα)の活性化を検出する工程を含む方法を用いて実施することができる。
より詳細には、リガンド、アゴニストおよびアンタゴニストのスクリーニングまたは同定方法は、各々、以下のように実施することができる。
(A)リガンドのスクリーニングまたは同定方法
(1)本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチド(これを含む膜画分の形態、あるいは、これを細胞表面上に発現している細胞の形態のもの等)を試験化合物と接触せしめ、(2)本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドと試験化合物との特異的結合を検出し、(3)試験化合物が該受容体タンパク質もしくはポリペプチドと結合する能力を有するか否か、または該能力の強さを決定することにより実施できる。
かかる特異的結合の検出は、例えば、標識(例えば、RI標識、蛍光標識など)を付した既知リガンドを、非標識の試験化合物とともに混合して用いる通常の競合アッセイ法などにより実施することができる。
特異的結合能を有する試験化合物(リガンド)は、作用薬(アゴニストまたはアンタゴニスト)である可能性が高い。
(B)アゴニストのスクリーニングまたは同定方法
(1)本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチド(これを含む膜画分の形態、あるいは、これを細胞表面上に発現している細胞の形態等)を試験化合物と接触せしめ、(2)該試験化合物の存在下において、細胞内シグナル伝達またはGタンパク質(Giα)の活性化を検出し、(3)該試験化合物が、該受容体タンパク質もしくはポリペプチドの刺激に基づいて、細胞内シグナル伝達またはGタンパク質の活性化を誘導する能力の有するか否か、または該能力の強さを決定することにより実施できる。
細胞内シグナル伝達(例えば、Ca2+またはcAMPの濃度変化、ホスホリパーゼCの活性化、pHの変化、Kの濃度変化など)の検出、あるいは、Gタンパク質(Giα)の活性化を、前記と同様の方法を用いて検出することができる。
(C)アンタゴニストのスクリーニングまたは同定方法
(1)本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチド(これを含む膜画分の形態、あるいは、これを細胞表面上に発現している細胞の形態等)を試験化合物およびリガンド(好ましくは、アゴニストとして作用するリガンド)と接触せしめ、(2)本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドの機能または活性を検出し、(3)該試験化合物が、本発明の受容体タンパク質もしくはポリペプチドの機能もしくは活性を抑制する能力を有するか否か、または該能力の強さを決定することにより実施できる。
ここで、リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)としては、例えば、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETE、及び5,8,11−エイコサトリイン酸等のエイコサノイドが挙げられ、これらのうち、5−オキソ−ETEがとりわけ好適な例として挙げられる。
また、本発明のタンパク質もしくはポリペプチドの機能または活性としては、前記(i)(ii)又は(iii)、すなわち
(i)リガンドとの特異的結合、
(ii)リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)による刺激に基づく細胞内シグナル伝達又は
(iii)リガンド(アゴニストとして作用するリガンド)による刺激に基づくGタンパク質の活性化が挙げられる。
これら機能または活性の検出は、例えば、リガンド(好ましくは、アゴニストとして作用するリガンド)とともに試験化合物を添加もしくは非添加するほかは、前記と同様の方法を適用することにより実施できる。
試験化合物の能力を決定するにあたっては、適切な対照をとることが望ましい。このような対照としては、試験化合物の非存在下での検出・試験、本発明の受容体タンパク質を発現していないか、あるいは同受容体タンパク質の発現レベルがより少ない細胞を用いた検出・試験があげられる。さらに正確な決定のためにこれらの対照を複数組合せてもよい。
前記方法などにより、アンタゴニストとして選別又は同定された化合物は、これを本発明のポリペプチドを発現している細胞と接触せしめることにより、該細胞における該ポリペプチド(エイコサノイド受容体)の機能又は活性を抑制することができる。
また、本発明のポリペプチド(エイコサノイド受容体)に対するアンタゴニストは、医薬の有効成分として使用できることが期待される。従って、前記方法などにより、本発明のポリペプチド(エイコサノイド受容体)に対するアンタゴニストとして選別又は同定された化合物は、医薬の製造のために使用できる。医薬の製造においては、慣用の担体とともに混合して医薬組成物を製造することができ、かかる組成物を医薬として販売することができる。
医薬として用いる際、投与方法は特に限定されず、一般的な経口もしくは非経口的な方法(経口、静脈内、筋肉内、皮下など)を適用すればよい。また、必要に応じては、投与方法に応じた不活性な担体と共に、慣用の医薬製剤(錠剤、顆粒剤、カプセル剤、散剤、注射剤、吸入剤等)として製剤化して用いればよい。例えば、一般的な医薬において許容される結合剤、崩壊剤、増量剤、充填剤、滑沢剤などの賦活剤あるいは希釈剤とともに化合物を用い、通常の方法により、製剤化して用いることができる。
投与量は、投与方法、患者の年令、体重、状態によっても異なるが、一般的な投与量、例えば1日当たり、経口投与の場合は、1〜300mg/kg、非経口投与の場合には、0.01〜50mg/kgの範囲で設定される。
リガンドまたは作用薬のスクリーニング又は同定のために使用する受容体タンパク質もしくはポリペプチドは、受容体タンパク質もしくはポリペプチドを含む膜画分の形態、あるいは、受容体タンパク質もしくはポリペプチドを細胞表面上に発現している細胞の形態等で用いることができる。
受容体タンパク質もしくはポリペプチドを細胞表面上に発現している細胞としては、該受容体タンパク質もしくはポリペプチドを過剰発現(overexpression)させた細胞などを用いることができ、例えば、該受容体タンパク質もしくはポリペプチドコードする核酸を含む組換えベクターを導入した細胞などを用いることができる。
組換えベクターを導入する宿主細胞としては、外来受容体タンパク質を、その機能を損なうことなく細胞膜上に発現し得る細胞(哺乳類の細胞、昆虫細胞など)を使用できる。また、宿主細胞としては、組換えベクターを導入する前の細胞それ自体は、対象の受容体タンパク質またはポリペプチドを発現していないか、低いレベルでのみ発現している細胞を用いることが望ましい。
該受容体タンパク質もしくはポリペプチドを含む膜画分は、受容体タンパク質もしくはポリペプチドを発現している細胞を破砕した後、分画遠心分離法や密度勾配遠心分離法などの遠心力を利用した分画法を用いて、調製できる。例えば、細胞破砕液を、低速(約500〜3000rpm)で短時間(通常、約1〜10分)遠心し、上清について、さらに高速(約15000〜30000rpm)で通常約30〜120分程度遠心し、得られた沈殿画分を、膜画分として用いる。
以下、実施例をもって本発明をさらに詳しく説明するが、これらの実施例は本発明を制限するものではない。
なお、下記実施例において、各操作は特に明示がない限り、「モレキュラークローニング(Molecular Cloning)」(Sambrook,J.,Fritsch,E.F.及びManiatis,T.著、Cold Spring Harbor Laboratory Pressより1989年に発刊)に記載の方法により行うか、または、市販の試薬やキットを用いる場合には市販品の指示書に従って使用した。
実施例
実施例1 ヒトTG1019の単離
(1)ペプチドをリガンドとするGタンパク質共役型受容体62個のアミノ酸配列をアライメントし、これらGタンパク質共役型受容体間でよく保存されているアミノ酸配列(配列番号3)を求めた。この配列(配列番号3)をクエリー配列として、ホモロジー検索法としてtblastn(Altschul SFら、J.Mol.Biol.、第215巻、第403−410頁、1990年)を用いてNCBI(National Center for Biotechnology Information)のHigh−Throughput Genomic Sequencesデータベースを検索した。その結果、クローンAC013396.3中にホモロジーの高い配列(配列番号4)が見出された。AC013396.3の配列を用い、この配列(配列番号4)を含むオープンリーディングフレーム(配列番号5)を推測した。このオープンリーディングフレームにコードされるポリペプチドのアミノ酸配列についてHMMTOP(膜タンパク質判別および膜貫通ヘリックス予測システム)(Tusnady GEら、J.Mol.Biol.、第283巻、第489−506頁、1998年)を用いた膜貫通領域の予測および、既知Gタンパク質共役型受容体とのホモロジー解析などを行った。その結果、配列番号5に示される塩基配列は、新規Gタンパク質共役型受容体の全長をコードするものであることが推測された。
(2)上記(1)のAC013396.3の塩基配列に基づいてプライマーを設計し、配列番号5を含むDNAをPCRによって取得した。
ヒトcDNAライブラリ(商品名「Human Universal QUICK−Clone cDNA」;クロンテック社製)を用い、1回目のPCRを行った。その際、センスプライマーとしては、配列番号6に示す塩基配列からなる合成オリゴヌクレオチド(AC013396.3の第97735〜97760番目の塩基を含む領域に対応するプライマー)を用い、アンチセンスプライマーとしては、配列番号7に示す塩基配列からなる合成オリゴヌクレオチド(AC013396.3の第96299〜96324番目の塩基を含む領域に対応するプライマー)を用いた。これらプライマー及び鋳型cDNAを含むPCR反応液(25μl)〔組成: 鋳型cDNA(商品名「Human Universal QUICK−Clone cDNA」、クロンテック社製)1μl、滅菌水18.5μl、PCR用緩衝液(Advantage 2 PCR Buffer、クロンテック社製)2.5μl、デオキシヌクレオチド溶液(dATP、dCTP、dGTP及びdTTP、各10mM)0.5μl、ポリメラーゼ溶液(Advantage 2 Polymlerase Mix、クロンテック社製)0.5μl、センスプライマー(10μM)1.0μl、アンチセンスプライマー(10μM)1.0μl〕を調製し、PCR〔条件:94℃、30秒、(94℃ 30秒→64℃ 30秒→72℃ 2.5分)×30回、72℃ 2.5分〕を実施した。ついで、前記で得られたPCR反応液1μlを鋳型として用い、2回目のPCRを行った。その際、PCRの反応液組成および反応条件は前記同様とした。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳動に供し、バンドを切り出して、配列番号5を含むcDNA断片(約1500bp)を精製取得した。これを、ベクタープラスミド(pGEM−T Easy、プロメガ社製)に連結し、得られたプラスミドを用いて、cDNA断片の塩基配列を決定した。その結果、配列番号1に示した塩基配列(1462bp)を得た。
配列番号1の中には、1つのオープンリーディングフレームが同定された。これにコードされるタンパク質(TG1019タンパク質と称する)のアミノ酸配列(423アミノ酸残基)は配列番号2に示した通りであった。配列番号2について、HMMTOPによる膜貫通領域の予測および、既知Gタンパク質共役型受容体とのホモロジー解析を行った。その結果、TG1019タンパク質は、新規なG蛋白共役型受容体であると推定され、前記で得られたcDNA(1462bp)は、TG1019タンパク質の遺伝子(TG1019遺伝子と称する)の翻訳領域全長を含むcDNAであると考えられた。図1には、それら塩基配列及びアミノ酸配列とともに、膜貫通領域(下線部)を示した。
配列番号1のDNA塩基配列を、Genbankに登録されたヒトゲノムDNA配列(Genbank Accession No.ACO13396(ver3))と比較したところ、4塩基の相違が認められた。相違する塩基は、配列番号1における第487番目(G⇔A)、771番目(G⇔A)、1022番目(C⇔A)及び1038番目(G⇔A)の塩基であった。
これら塩基の相違に伴ない、当該DNAにコードされるポリペプチドのアミノ酸配列にも3アミノ酸残基の相違が生じ、相違する残基は、配列番号2における第150番目(Gly⇔Asp)、245番目(Glu⇔Lys)及び334番目(Ala⇔Thr)〕の残基であった。
そこで、ヒトcDNAライブラリー(商品名:Marathon Ready cDNA library,human fetal spleen; Clonetech社製)を鋳型としてPCR(独立に2回)を行なって、前記の相違が見られた塩基を含むApaI断片を取得して、複数クローンについて塩基配列を解析した。
その結果、配列番号1における1022番目の塩基の相違(C⇔A)は、遺伝子多型(nucleotide polymorphism)によるものと考えられ、自然発生対立変異体(naturally occurring allelic variants)に由来すると考えられた。この塩基配列の相違によって、コードされるポリペプチドのアミノ酸配列上の相違は生じない。
一方、配列番号1における第487番目(G⇔A)、771番目(G⇔A)及び1038番目(G⇔A)の塩基における相違は、PCRエラーによるものと考えられ、これらについては、Genbank Accession No.ACO13396(ver3)の配列が正しいと考えられた。
すなわち、これらのPCRエラー等を修正した塩基配列は、配列番号1における第487番目、771番目、1022番目及び1038番目の塩基が「A」(アデニン)であると考えられ、修正後の塩基配列にコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号2における第150番目、245番目及び334番目のアミノ酸残基が各々Asp、Lys、Thrであると考えられた。
PCRエラー修正後の塩基配列を後記配列表の配列番号20に、それにコードされるポリペプチドのアミノ酸配列を配列番号21に各々示した。
実施例2 TG1019遺伝子の発現分布
ヒトの各種組織や細胞におけるTG1019遺伝子発現分布を、ドットブロット解析により調べた。ドットブロットは、ヒト組織由来およびヒト培養細胞由来のmRNA(ナイロンメンブレンにドットされたもの)(Multiple Tissue Expression Array、クロンテック社製)およびRI標識プローブを用いて行った。メンブレンには、図2に示した各種ヒト組織由来およびヒト培養細胞由来のmRNA〔ポリ(A)RNA〕がドット(吸着固定)されている。
RI標識プローブは、以下のように調製したものを用いた。すなわち、前記実施例1の(2)項で得たcDNA断片を含むプラスミドを制限酵素NotIで処理した後、アガロースゲル電気泳動により約1500bpのDNA断片(TG1019遺伝子の翻訳領域全長を含むcDNA断片)を精製・取得した。このcDNA断片を鋳型とし、ランダムプライマー(random hexadeoxyribonucleotides)、ヌクレオチド混液(dATP、dGTP及びdTTP)およびDNAポリメラーゼI(Large(Klenow)Fragment)を含むラベリング用キット(Prime−a−Gene Labeling system、プロメガ社製)と[α−32P]dCTPを用いてラベリングを行った後、ゲルろ過で精製し、RI標識プローブを調製した。
ドットブロットのハイブリダイゼーションは、以下のようにして行った。
mRNAの固定されたメンブレンを、溶液I〔Salmon Testes DNA(9.4μg/μl:SIGMA社製)160μlを97℃で5分間処理後、氷中で冷却し、これに60℃のExpressHyb hybridization Solution(クロンテック社製)15mlを加えて調製したもの〕中で、68℃、30分間プレインキュベートした。
ついで、このメンブレンを、標識プローブ含有ハイブリダイゼーション溶液〔前記RI標識プローブ20μl、ヒトCOT−1 DNA(1μg/μl:Roche社製)30μl、サケ精巣DNA(9.4μg/μl:SIGMA社製)16μl、20×SSC(3M塩化ナトリウム、300mMクエン酸ナトリウム、pH7.0)50μl、及びヌクレアーゼフリーH2O(プロメガ社製)84μlを加えて、200μlの溶液を調製し、これを97℃で5分間処理後、68℃で30分間インキュベートし、さらに5mlの前記溶液Iを加えて調製したもの〕中で、65℃、12時間ハイブリダイズさせた。ついで、メンブレンを、1%SDSを含む2×SSC(300mM塩化ナトリウム、30mMクエン酸ナトリウム、pH7.0)にて、65℃、20分間、5回、プレ洗浄した後、さらに、0.5%SDSを含む0.1×SSC(15mM塩化ナトリウム、1.5mMクエン酸ナトリウム、pH7.0)にて55℃、20分間、2回洗浄した。
イメージアナライザー(Bio−imaging Analysis System 2000、フジフィルム社製)を用いてハイブリダイゼーションのシグナルを検出した結果、試験に供したほぼ全ての組織のmRNAでシグナルが見られた。シグナルが見られた組織の中では、肝臓、腎臓、末梢白血球及び脾臓で比較的強いシグナルが見られた。これらの結果から、TG1019遺伝子は、多くの組織で発現しており、その中でも肝臓、腎臓、末梢白血球及び脾臓での発現が比較的高いと考えられた。
実施例3 TG1019タンパク質(Gタンパク質共役型受容体)のリガンド同定
TG1019タンパク質は、前記実施例1の通り、Gタンパク質共役型受容体であると推定された。そこで、TG1019タンパク質とGタンパク質の融合タンパク質を含む膜画分を用い、以下のようにして、GTPγS(グアノシン 5’−O−(3−チオ三リン酸))とのリガンド依存的な結合を検出する方法〔Wenzel−Seifertら、Mol.Pharmacol.、第58巻、第954−966頁、2000年; Bahiaら、Biochemistry、第37巻、第11555−11562頁、1998年〕により、リガンドの同定を行った。
(1)融合タンパク質を発現させるためのプラスミドの調製
以下、(イ)〜(ニ)のようにして、TG1019タンパク質とGタンパク質〔Giα1(351Cys→Ile)、Gqα、又はGsαL〕との融合タンパク質を発現させるためのプラスミドを調製した。また、融合タンパク質の概略図を図3に示した。ここで、Giα1(351Cys→Ile)は、Giα1タンパク質の351番目のシステイン残基をイソロイシン残基に変換した変異型Giα1タンパク質を意味する。
(イ)TG1019遺伝子cDNAの調製
前記実施例1の(2)項で得られたTG1019遺伝子cDNA(翻訳領域全長を含む)を含むプラスミドを鋳型として用い、PCRを行った。
その際、センスプライマー(プライマーTG1019−1)及びアンチセンスプライマー(プライマーTG1019−2)としては、各々、配列番号8および配列番号9に示す塩基配列を有する合成オリゴヌクレオチドを用いた。
これらプライマーはTG1019遺伝子のcDNA塩基配列(配列番号1)を元に設計したものであり、PCR産物として、TG1019タンパク質の全長をコードするcDNA(終止コドンを除く)を含み、その両端に制限酵素認識部位(N末端にBglII部位、C末端にCpoIおよびHindIII部位)が付加されたDNA断片が得られるよう設計されている。
かくして、得られたPCR産物を、ベクタープラスミド(PCR産物クローニング用ベクターシステム)(pGEM−T Easy Vector、プロメガ社製)に連結し、得られたプラスミドを、制限酵素NotI及びCpoIで処理して、生じた約1300bpのDNA断片を回収した。
(ロ)Gタンパク質(Giα1(351Cys→Ile))との融合タンパク質発現用プラスミドの調製
ヒト脳由来cDNA(Marathon−Ready cDNA Brain、クロンテック社製)を鋳型として用い、PCRを行った。その際、センスプライマー(プライマーGiα1−1)及びアンチセンスプライマー(プライマーGiα1−2)としては、各々、配列番号10および配列番号11に示す塩基配列を有する合成オリゴヌクレオチドを用いた。
これらプライマーは、Giα1タンパク質をコードするcDNAの既知塩基配列(Genbank/EMBL accession no.AFO55013)を元に設計したものであり、PCR産物としてGiα1タンパク質の全長をコードするcDNAが得られるよう設計されている。
ついで、前記PCRで得られた産物を鋳型として、2回目のPCRを行った。その際、センスプライマー(プライマーGiα1−3)及びアンチセンスプライマー(プライマーGiα1−4)としては、各々、配列番号12および配列番号13に示す塩基配列を有する合成オリゴヌクレオチドを用いた。
これらプライマーは、PCR産物として、Giα1(351Cys→Ile)(Giα1タンパク質の351番目のシステイン残基がイソロイシン残基に置換された変異型Giα1タンパク質)の全長をコードするcDNAを含み、その両端に制限酵素認識部位(CpoI部位およびBamHI部位)が付加されたDNA断片が得られるように設計されている。
得られたPCR産物を、ベクタープラスミド(pGEM−T Easy Vector、プロメガ社製)に連結した。このプラスミドを制限酵素NotI及びBamHIで処理し、生じた約1100bpのDNA断片を、バキュロウイルスベクタープラスミドpVL1392(ファーミンジェン社製)のNotI/BamHI部位に挿入して、プラスミドpVL1392/Giα1(351Cys→Ile)を得た。
このプラスミドの制限酵素NotI/CpoI部位に、前記(イ)で得たDNA断片を挿入し、融合タンパク質発現用プラスミド pVL1392/TG1019−Giα1(351Cys→Ile)を得た。
(ハ)Gタンパク質(Gqα)との融合タンパク質発現用プラスミドの調製
ヒト前立腺由来cDNA(Marathon−Ready cDNA Prostate、クロンテック社製)を鋳型として用い、PCRを行った。その際、センスプライマー(プライマーGqα−1)及びアンチセンスプライマー(プライマーGqα−2)としては、各々、配列番号14および配列番号15に示す塩基配列を有する合成オリゴヌクレオチドを用いた。これらプライマーは、GqαをコードするcDNAの既知塩基配列(Genbank/EMBL accession no.U43083)を元に設計したものであり、PCR産物としてGqαの全長をコードするcDNAが得られるよう設計されている。
ついで、前記PCRで得られた産物を鋳型として、2回目のPCRを行った。その際、センスプライマー(プライマーGqα−3)及びアンチセンスプライマー(プライマーGqα−4)としては、各々、配列番号16および配列番号17に示す塩基配列を有する合成オリゴヌクレオチドを用いた。これらプライマーは、PCR産物として、Gqαの全長をコードするcDNAを含み、その両端に制限酵素認識部位(CpoI部位およびBamHI部位)が付加されたDNA断片が得られるように設計されている。
得られたPCR産物を、ベクタープラスミド(pGEM−T Easy Vector、プロメガ社製)に連結した。得られたプラスミドを制限酵素NotI及びBamHIで処理し、生じた約1100bpのDNA断片を、バキュロウイルスベクタープラスミドpVL1392のNotI/BamHI部位に挿入して、プラスミドpVL1392/Gqαを得た。
このプラスミドの制限酵素NotI/CpoI部位に、前記(イ)で得たDNA断片を挿入し、融合タンパク質発現用プラスミド pVL1392/TG1019−Gqαを得た。
(ニ)Gタンパク質(GsαL)との融合タンパク質発現用プラスミドの調製
ヒト骨髄由来cDNA(Marathon−Ready cDNA Bone marrow、クロンテック社製)を鋳型として用い、PCRを行った。その際、センスプライマー(プライマーGsαL−1)及びアンチセンスプライマー(プライマーGsαL−2)としては、各々、配列番号18および配列番号19に示す塩基配列を有する合成オリゴヌクレオチドを用いた。
これらプライマーは、GsαLをコードするcDNAの既知塩基配列(Genbank/EMBL accession no.XO4408)を元に設計されたものであり、PCR産物としてGsαLの全長をコードするcDNAを含み、その両端に制限酵素認識部位(CpoI部位およびXbaI部位)が付加されたDNA断片が得られるように設計されている。
得られたPCR産物を、ベクタープラスミド(pGEM−T Easy Vector、プロメガ社製)に連結した。得られたプラスミドを制限酵素NotI及びXbaIで処理し、生じた約1200bpのDNA断片を、バキュロウイルスベクタープラスミドpVL1392(ファーミンジェン社製)のNotI/XbaI部位に挿入して、プラスミドpVL1392/GsαLを得た。
このプラスミドの制限酵素NotI/CpoI部位に、前記(イ)で得たDNA断片を挿入し、融合タンパク質発現用プラスミド pVL1392/TG1019−GsαLを得た。
(2)融合タンパク質を含む膜画分の調製
前記(1)の(ロ)〜(ニ)で得られた3種の発現用プラスミドは、図3(概略図)で示したように、TG1019タンパク質のC末端に付加されたリンカー配列(−Gly−Pro−)を介して、TG1019タンパク質(全長)とGタンパク質〔Giα1(351Cys→Ile)、Gqα又はGsαL〕が連結した構造の融合タンパク質を発現するプラスミドである。
これら融合タンパク質発現用プラスミドpVL1392/TG1019−Giα1(351Cys→Ile)、pVL1392/TG1019−Gqα又はpVL1392/TG1019−GsαLを、以下のようにして、昆虫細胞内で発現させ、融合タンパク質を含む膜画分を調製した。
まず、昆虫細胞 Sf9(Spodoptera frugiperda SF9)(ファーミンジェン社製)をコラーゲンコート処理済みの3cmシャーレに約60%コンフルエントとなるように、1.5mlの培地〔10%ウシ胎仔血清、0.1mg/mlストレプトマイシンおよび100U/mlペニシリンを含むGrace’s Insect Cell Culture Medium(pH6.2:ライフテックオリエンタル社製)]中で27℃で15分間インキュベートした。
培地を取り除き、トランスフェクション用緩衝液(Transfection Buffer A、ファーミンジェン社製)375μlを加えた後、予め調製しておいたDNA溶液〔融合タンパク質発現用プラスミド1μg、Linearized BaculoGold Baculovilus DNA(ファーミンジェン社製)0.125μg、滅菌水25μl中で混和し、25℃で15分間インキュベートした後、Transfection Buffer B(ファーミンジェン社製)375μlを加えたもの〕400μlを滴下した。
これを27℃で4時間培養した後、培養液を除き、培地1.2mlを加えて27℃で5日間培養した。得られた培養液を遠心分離(1,000×g、5分間)し、上清をウイルス液Iとして回収した。
Sf9細胞をコラーゲンコート処理済みの3cmシャーレに約30%コンフルエントとなるように播き、前記で得たウイルス液I(100μl)と培地1.2mlを加えて27℃で4日間培養した。得られた培養液を遠心分離(1,000×g、5分間)し、その上清をウイルス液11として回収した。
Sf9細胞をコラーゲンコート処理済みの10cmシャーレに約70%コンフルエントとなるように播き、前記で得たウイルス液II(500μl)と培地12mlを加え、27℃で4日間培養した。こうして得られた培養液を遠心分離(1,000×g、5分間)し、その上清をウイルス液IIIとして回収した。
Sf9細胞をコラーゲンコート処理済みの10cmシャーレに約70%コンフルエントとなるように播き、前記で得たウイルス液III(100μl)と培地12mlを加え、27℃で4日間培養した。こうして得られた細胞を冷却したPBS(リン酸緩衝生理食塩水,pH7.4)で洗浄後、冷却した溶解緩衝液〔20mM Tris−HCl,pH7.5、1mM EDTA、0.2mMフッ化フェニルメチルスルホニル、10μg/mlペプスタチン、10μg/mlロイペプチン、および2μg/mlアプロチニン〕3.6mlに懸濁し、テフロンホモジナイザーを用いて細胞を破砕した。この細胞破砕液を遠心分離(600×g、10分間)し、得られた上清をさらに遠心分離(50,000×g、20分間)した。得られた沈殿物を冷却した反応緩衝液〔20mM Tris−HCl,pH7.5、50mM塩化ナトリウム、10mM塩化マグネシウム〕450μlに、テフロンホモジナイザーを用いて懸濁して、融合タンパク質を発現した膜画分を得た。
(3)融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの結合試験
前記(2)で得た膜画分(450μl)を反応緩衝液(7.54ml)に懸濁し、これにGDP(10mM)10μlを加えた。この溶液160μlに試験検体20μlを加え、30℃で10分間インキュベーションした後、[35S]GTPγS(5nM,5nCi/μl:アマシャム ファルマシア バイオテク社製)20μlを加え、反応を開始した。30℃で1時間インキュベーションした後、ガラスフィルター(UniFilter−96GF/B、パッカード社製)を用いてろ過することで反応を停止した。フィルターを、冷却した反応緩衝液200μlで3回洗浄した後、フィルター上の[35S]GTPγS量(膜画分との結合量)を液体シンチレーション測定法によって測定した。こうして測定した[35S]GTPγS結合量から、非特異的結合量(10μMGTPγS存在下で測定した結合量)を差し引き、[35S]GTPγSの特異的結合量を求めた。
核酸、アミノ酸、ペプチド関連化合物、組織抽出物および脂質関連化合物約370種を試験検体として検定した。その結果(図4)、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分を用いた場合、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETEおよび5,8,11−エイコサトリイン酸を添加することによって濃度依存的に[35S]GTPγSの特異的結合量が増加した。
TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分を用いた場合には、これら化合物による特異的結合量の増加は、認められなかった。一方、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分を用いた場合は、5(S)−HPETEにて特異的結合量が増加したが、Giαにおける場合と比較するとその増加量は小さいものであった。
これらの結果から、TG1019タンパク質は、Giα1あるいはGqαタンパク質と共役するタイプのGタンパク質共役型受容体であると考えられた。また、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−HETEおよび5,8,11−エイコサトリイン酸がそのリガンド(アゴニスト)として作用することが明らかとなった。
すなわち、TG1019タンパク質は、5−オキソ−ETE、5−HPETE、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−HETrE、エイコサ−5,8−ジエン酸、5−HETE、および5,8,11−エイコサトリイン酸をリガンド(アゴニスト)とするエイコサノイドの受容体であると考えられた。
実施例4 TG1019タンパク質(Gタンパク質共役型受容体)のアンタゴニストの同定
5−オキソ−ETE(アゴニストとして作用するリガンド)及び試験化合物の存在下、5−オキソ−ETE刺激に基づくTG1019タンパク質のGタンパク質活性化作用を検出し、試験化合物の拮抗作用を調べた。
Gタンパク質活性化の検出は、TG1019タンパク質とGiα1との融合タンパク質を含む膜画分および標識GTPγSを用いて、前記実施例3の(3)と同様にして実施した。
すなわち、TG1019タンパク質とGiα1との融合タンパク質を含む膜画分(450μl)を反応液(7.54ml)に懸濁し、これにGDP(10mM)10μlを加えた。この溶液160μlに、5−オキソ−ETE(最終濃度0.1μM)及び各種濃度の試験化合物(0M、10−7M〜10−5M)を添加して、30℃で10分間インキュベーションした。(5−オキソ−ETE及び試験化合物の合計液量:20μl)
これに〔35S〕GTPγS 20μlを加えて反応を開始し、30℃で1時間インキュベーションした後、ガラスフィルターでろ過することにより反応を停止した。
フィルター上の〔35S〕GTPγS量(膜画分との結合量)を液体シンチレーションにより測定し、測定した〔35S〕GTPγS量から、非特異的結合量(10μMGTPγS存在下で測定した時の結合量)を差引き、特異的結合量を求めた。
その結果、種々のポリ不飽和脂肪酸化合物は、5−オキソ−ETE刺激に基づくTG1019タンパク質のGタンパク質活性化作用を抑制し、拮抗作用を示すことがわかった。
このように、TG1019タンパク質(Gタンパク質共役型受容体)のアンタゴニストとして作用するものとして同定されたこれら化合物及びそのIC50値を下記表2に示した。
Figure 0003949111
実施例5 TG1019タンパク質(Gタンパク質共役型受容体)のCHO細胞中での発現と機能の確認
以下のようにして、TG1019タンパク質発現用ベクターをCHO細胞に一過性(transiently)に導入して組換え型TG1019タンパク質を発現させ、この細胞を用いてTG1019タンパク質のエイコサノイド受容体としての機能を確認した。
まず、前記実施例1(1)(イ)で得たTG1019タンパク質全長をコードするDNAを、ベクタープラスミドpcDNA3.1(発現ベクター、invitrogen社製)のNotI認識部位にサブクローニングし、TG1019タンパク質の発現用ベクタープラスミド pcDNA3.1−TG1019 を得た。
CHO細胞(1x10細胞)を、10%牛胎児血清含有DMEM/F−12培地中で、37℃20時間培養した。この細胞を用い、プラスミドDNA(pcDNA3.1−TG1019、又は対照としてベクターpcDNA3.1)(5μg)およびトランスフェクション用試薬(LipofectAMINE、Invitrogen社製)を添加してトランスフェクションを実施し、24時間培養した。百日咳毒素(pertussis toxin)で前処理する場合は、20時間培養後に、百日咳毒素(100ng)を添加して引き続き4時間培養した。
培養後の細胞を回収・洗浄し、ロリプラム(25mM)を含むKRH緩衝液(Krebs−Ringer Hepes buffer、pH7.4)に懸濁して37℃、30分インキュベートした後、96穴プレートに接種(5−7.5x10細胞/90μl/ウエル)した。
ついで、フォルスコリン(1μM)及び5−オキソ−ETE(最終濃度0M又は10−11〜10−5M)を含むKRH緩衝液(90μl/ウエル)を添加し、室温で10分インキュベートした後、細胞を溶解させてcAMP産生量を測定した。
cAMP産生量は、アマシャム・バイオサイエンス(Amersham Biosciences)社製のcAMPエンザイム・イムノアッセイ・システムを用いて測定した。
その結果、ベクターのみ導入した細胞では、フォルスコリン刺激時のcAMP産生は、5−オキソ−ETEの添加によって変化しなかった。一方、pcDNA3.1−TG1019を導入してTG1019タンパク質を発現させた細胞では、フォルスコリン刺激時のcAMP産生は、5−オキソ−ETEの添加によって濃度依存的に抑制された。
また、TG1019タンパク質を発現させた細胞を、感受性のG蛋白質を不活化させる百日咳毒素で前処理した場合には、5−オキソ−ETE添加によるcAMP産生の抑制は見られなかった。
これらの結果から、TG1019タンパク質は、5−オキソ−ETEをリガンド(アゴニストとして作用するリガンド)とするエイコサノイド受容体であり、Gi(アデニレートシクラーゼ抑制性のG蛋白質)と共役するG蛋白質共役型受容体であることが確認された。
産業上の利用可能性
本発明の受容体タンパク質及びその遺伝子は、細胞内情報伝達のメカニズム研究のために有用である。また、新たな疾患に対する治療薬の標的分子となり得る。
また、本発明の受容体タンパク質及びその遺伝子を利用した作用薬(アゴニストまたはアンタゴニスト)のスクリーニング、同定および特徴付けの方法は、新しい医薬の研究開発のために有用である。
【配列表】
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【図面の簡単な説明】
図1は、TG1019のアミノ酸配列、塩基配列及び推測される7回膜貫通領域(下線部)を示した図である。
図2は、ヒトの各組織又は細胞におけるTG1019遺伝子の発現分布(ドットブロットの結果)を示した図である。
図3は、TG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質の構造の概略を示した模式図である。
図4Aは、5−オキソ−ETEを試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Bは、5−HPETEを試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Cは、アラキドン酸を試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Dは、エイコサ−5Z−8Z−11Z−トリエン酸を試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Eは、5−HETrEを試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Fは、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸を試験化合物として用いたときのTGT019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Gは、5−HETEを試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。
図4Hは、5,8,11−エイコサトリイン酸(ETI)を試験化合物として用いたときのTG1019タンパク質と各種Gタンパク質との融合タンパク質を含む膜画分とGTPγSとの特異的結合量に対する各種試験物質の影響を示した図である。特異的結合量は、試験物質を添加しない場合をコントロールとし、その時の結合量に対する相対値(コントロールの%)で表している。「 ○ Giα1(351Cys→Ile)」は、TG1019タンパク質とGiα1(351Cys→Ile)との融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 △ Gqα 」は、TG1019タンパク質とGqαとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。「 □ GsαL 」は、TG1019タンパク質とGsαLとの融合タンパク質を含む膜画分における試験結果を示す。Technical field
The present invention relates to a novel receptor (eicosanoid receptor) protein and a gene thereof. Moreover, it is related with the screening method of the pharmaceutical candidate compound using these.
Background art
Many physiologically active substances such as neurotransmitters, hormones, and otacoids regulate the functions of living bodies through specific receptor proteins present on the cell surface. Many of these receptors are coupled to trimeric GTP-binding proteins (hereinafter referred to as G proteins) present in cells, and are known to transmit information into cells through their activation. ing. Therefore, these receptors are collectively referred to as G protein-coupled receptors. It is known that all G protein-coupled receptors have a common structure including seven transmembrane regions.
The G protein is a trimer composed of α, β, and γ subunits, and exists in an inactive form (GDP binding type) in which these subunits are associated in the ground state. An inactive type (GDP-binding type) G protein is converted into an active type (GTP-binding type) by a G protein-coupled receptor stimulated by a ligand, and an α subunit (Gα) and β / γ bound to GTP. Dissociates into subunit complex (Gβγ). Then, Gα (or Gβγ in some cases) bound to GTP controls an effector such as adenylate cyclase or phospholipase C and transmits a signal.
In addition, G proteins, particularly Gα, are diverse and are known to control effectors that vary depending on the type of Gα. In general, G protein-coupled receptors activate a specific type of G protein. And transmits specific information into the cell using the G protein.
As G protein-coupled receptors, α- and β-adrenergic receptors, muscarinic acetylcholine receptors, adenosine receptors, angiotensin receptors, endothelin receptors, gonadotropin-releasing factor receptors, H1- and H2 have been used so far. -Histamine receptors, dopamine receptors, metabotropic glutamate receptors, somatostatin receptors, etc. are known.
All of them play an important role in vivo as targets of physiologically active substances. Furthermore, the fact that many of the pharmaceuticals known to date have been ligands, agonists or antagonists that also target G protein-coupled receptors is also very significant.
For these reasons, G protein-coupled receptors are attracting attention as targets for drug development. Finding new G protein-coupled receptors, identifying their ligands, and finding ways to screen or identify their agonists and antagonists lead to the screening of new drug candidate compounds, It is desired.
Regarding the eicosanoid receptor, the following is known. The generic names of eicosanoids include prostaglandins, prostacyclins, thromboxanes, leukotrienes, and eicosatetraenoic acids such as 5-oxo-ETE and 5-HETE. To date, prostaglandin EP1, EP2, EP3, EP4, F2α receptor, prostacyclin PI2 receptor, thromboxanthin TA2 receptor, leukotriene B4 receptor have been reported as receptors having eicosanoid as a ligand. G protein coupled receptor (Narumiya et al., Physiol. Rev., 79, 1193-1226, 1999, Mohammed Akbar et al., J. Biol. Chem., 271, 18363-18367, 1996). However, a receptor having eicosatetraenoic acid or eicosatrienoic acid as a ligand such as 5-oxo-ETE found in the present invention has not been reported so far.
An object of the present invention is to provide a novel G protein-coupled receptor and its gene. More specifically, it is to provide a novel eicosanoid receptor and its gene.
It is another object of the present invention to provide a method for screening, identifying and characterizing a ligand and an agonist (agonist or antagonist) for the receptor protein. Further, other purposes than the above will be apparent from the following description.
Summary of the Invention
The present inventors isolated a full-length cDNA encoding a novel G protein-coupled receptor from humans. Moreover, this receptor protein was successfully expressed in cells by genetic recombination technology. Furthermore, the ligand for this receptor was identified, and this receptor was found to be an eicosanoid receptor, and the present invention was completed.
That is, the present invention relates to a polypeptide selected from the following (A), (B) and (C), which has a function or activity as an eicosanoid receptor.
(A) A polypeptide comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or 21.
(B) A polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or 21.
(C) A polypeptide encoded by a nucleic acid capable of hybridizing under stringent conditions with a nucleic acid comprising the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 20, or a complement thereof.
The present invention also relates to a nucleic acid encoding the polypeptide.
The present invention also relates to a recombinant vector containing the nucleic acid and a host cell.
The present invention also relates to a method for detecting the function or activity of the polypeptide using the polypeptide. The present invention also relates to a method of using these to modulate (enhance or suppress) the function or activity of the polypeptide.
Furthermore, the present invention also relates to a screening method or identification method of a ligand or an agonist (agonist or antagonist) of the polypeptide using these.
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
SEQ ID NO: 1 in the sequence listing below represents the nucleotide sequence of a human-derived cDNA (including the entire translation region) of a gene (referred to as TG1019 gene) of a receptor protein (referred to as TG1019 protein) isolated by the inventors. . SEQ ID NO: 2 represents the amino acid sequence of the receptor protein (TG1019 protein) encoded by the cDNA.
The receptor protein of the present invention is a G protein-coupled receptor protein and has a function (biological activity) as an eicosanoid receptor. Therefore, the receptor protein of the present invention specifically binds to eicosanoids. Then, the specific binding between the eicosanoid and the receptor protein of the present invention stimulates the receptor protein and induces intracellular signal transduction.
The eicosanoid which is a ligand of the receptor protein of the present invention refers to a substance derived from a fatty acid having 20 carbon atoms such as eicosanoic acid, preferably an unsaturated fatty acid at the 8-position. More specifically, 5-oxo-6E, 8Z, 11Z, 14Z-eicosatetraenoic acid (abbreviated as 5-oxo-6E, 8Z, 11Z, 14Z-eicosatetranoic acid, 5-oxo-ETE), 5-hydro Peroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z, 14Z-tetraenoic acid (abbreviated as 5-hydroperoxyeicosa-6E, 8Z, 11Z, 14Z-tetraenoic acid, 5-HPETE), arachidonic acid (arachidonic acid or eicosa-5Z, 11Z, 11Z) , 14Z-tetraenoic acid), eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid (eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienic acid), 5-hydroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z-trienoic acid 5-hydroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z-tetraenoic acid, abbreviated as 5-HETrE), eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid (eicosa-5Z, 8Z-dienic acid), 5-hydroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z , 14Z-tetraenoic acid (5-hydroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z, 14Z-tetraenoic acid, abbreviated as 5-HETE), 5,8,11-eicosatriic acid (5,8,11-eicosatrynoic acid), etc. Say. The synthesis route diagram of the ligand is shown in Table 1 below.
Figure 0003949111
5-Oxo-ETE is synthesized from arachidonic acid via 5-HETE and is known to be a potent antiacidophilic, neutrophil chemotactic factor (Schwenk et al., J. Biol. Chem. 270, 15029-15036, 1995, Guilbert et al., Am. J. Respir. Cell Mol. Biol., 21, 97-104, 1999). 5-oxo-ETE is also known to induce eosinophil migration at the animal level (Stamatiou et al., J. Clin. Invest., 102, 2165-2172, 1998). . (Stamatiou et al., J. Clin. Invest., 102, 2165-2172, 1998). Furthermore, this action is presumed to be an action via an unidentified G protein-coupled receptor (O'Flaherty et al., J. Immunol., 164, 3345-3352, 2000). ).
Therefore, the novel G protein-coupled receptor antagonist of the present invention may be useful as a therapeutic agent for allergies and inflammation such as asthma in which anti-acid spheres are involved.
Arachidonic acid is a biosynthetic intermediate for prostaglandins and leukotrienes, and 5-HPETE is known to be an intermediate for biosynthesis of arachidonic acid to leukotrienes.
5-oxoETE and 5-HETE are growth factors for prostate cancer, breast cancer cells, lung cancer, pancreatic cancer, and mesothelioma, as well as maintenance factors, and are known to cause apoptosis when their synthesis is inhibited ( Ghosh et al., Biochem. Biophys.Res. Commun., 235, 418-423, 1997, Ghosh et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 13182-13187, 1998. , Avis et al., FASEB J., 15, 2007-2009, 2001, Avis et al., J. Clin. Invest., 97, 806-813, 1996, Ding et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 261, 218-223 In 1999, Romano et al., FASEB J., Vol. 15, pp. 2326-2336, 2001).
Therefore, the novel G protein-coupled receptor antagonist of the present invention may be an anticancer agent against the above-mentioned cancer.
In addition, when the receptor protein of the present invention is stimulated by a ligand (agonist), i Activates G proteins belonging to the subfamily. Focusing on the α subunit, when the receptor protein of the present invention is stimulated by a ligand (agonist), G (G i Α subunit of G protein belonging to subfamily, eg G iα1 ) Into an activated form (a state having GTP binding ability). A signal can be transmitted in the cell through activation of the G protein.
As described above, the receptor protein (polypeptide) of the present invention has the following functions (i) to (iii).
(I) Specific binding to a ligand.
(Ii) Intracellular signal transduction based on stimulation by a ligand (ligand acting as an agonist) (Ca 2+ Concentration change, cAMP concentration change, phospholipase C activation, pH change, K + Induction).
(Iii) G protein based on stimulation by a ligand (ligand acting as an agonist) (G i Activation of α subunit of G protein belonging to subfamily.
Here, as the ligand (ligand acting as an agonist), for example, 5-oxo-ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z- Examples include eicosanoids such as dienoic acid, 5-HETE, and 5,8,11-eicosatriic acid, among which 5-oxo-ETE is a particularly preferred example.
In the present invention, “ligand” means a compound capable of specifically binding to a receptor protein. Ligand includes both natural and artificially synthesized compounds.
In the present invention, the “agonist” means a compound having the ability to stimulate the receptor protein by specifically binding to the receptor protein and induce intracellular signal transduction. In the present invention, “antagonist” means a compound having the ability to suppress the action of a compound having the ability to stimulate receptor protein and induce intracellular signal transduction.
Examples of the protein or polypeptide of the present invention include those consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2. In addition, the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 includes an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted or added. The amino acid deletion, substitution or addition may be performed so long as the function as an eicosanoid receptor (biological activity) is not lost, usually 1 to about 80, preferably 1 to about 60, More preferably 1 to about 45, still more preferably 1 to about 30, and still more preferably 1 to about 15.
That is, the protein or polypeptide of the present invention includes one or more conservatives as compared to the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 and the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. Examples include polypeptides having amino acid substitutions (conservative amino acid subscriptions).
Such proteins or polypeptides include mutant proteins or polypeptides found in nature, artificially modified mutant proteins or polypeptides, proteins or polypeptides derived from heterologous organisms, and the like.
That is, such proteins or polypeptides include conservative substitution variants and naturally occurring allelic variants of the polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. .
Such a protein or polypeptide is usually about 75% or more, preferably about 80% or more, more preferably about 85% or more, more preferably about 90% or more, and the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 2. Preferably it has about 95% or more amino acid level homology.
Examples of the nucleic acid (DNA or RNA) of the present invention include those containing a nucleic acid consisting of the base sequence represented by SEQ ID NO: 1. In addition, a nucleic acid that can hybridize with a nucleic acid comprising the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 under stringent conditions (more preferably under highly stringent conditions) or a complement thereof (that is, a nucleic acid having a complementary sequence) Including. Such a hybridizable nucleic acid only needs to encode a protein or polypeptide having a function (biological activity) as an eicosanoid receptor.
Such a nucleic acid is usually about 70% or more, preferably about 80% or more, more preferably about 85% or more, still more preferably 90% or more, and still more preferably 95% with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1. Has the above homology. Examples of such genes or nucleic acids include mutant genes found in nature, artificially modified mutant genes, and homologous genes (orthologues) derived from different organisms.
In the present invention, hybridization under stringent conditions is usually performed by hybridization in a hybridization solution having a salt concentration of 6 × SSC or equivalent at a temperature of 50 to 60 ° C. for about 16 hours. If necessary, it is pre-washed with a solution of 6 × SSC or a salt concentration equivalent thereto, and washed in a solution of 1 × SSC or a salt concentration equivalent thereto. Further, the condition having higher stringency (high stringency condition) means that the washing is performed in a solution having a salt concentration of 0.1 × SSC or equivalent thereto.
The sequence homology can be analyzed by using a conventional method such as a blast method (Blast Method, Altschul et al., J. Mol. Biol., 215, 403-410, 1990).
The nucleic acid of the present invention can be isolated and obtained by screening using mammalian tissue or cells as a gene source. Mammals include humans, as well as non-human animals such as dogs, cows, horses, goats, sheep, monkeys, pigs, rabbits, rats and mice. Of these, it is desirable to use human-derived ones for use in research and development of human therapeutics.
The nucleic acid of the present invention can be obtained by utilizing the sequence information disclosed in this specification (SEQ ID NO: 1 in the sequence listing described later). For example, primers and probes are designed based on the disclosed nucleotide sequence information, and selected from a DNA library by appropriately combining PCR (polymerase chain reaction) method, colony hybridization method, and plaque hybridization method・ Can be acquired.
For example, cDNA is synthesized from mRNA prepared from mammalian cells and tissues, and a cDNA fragment is obtained by PCR using this as a template. Using the obtained cDNA as a probe, a cDNA library can be screened by colony hybridization or plaque hybridization, and full-length cDNA can be obtained. A genomic gene can also be isolated by screening a genomic DNA library. In addition, homologous genes (orthologues) derived from heterologous organisms can be isolated by screening DNA libraries of other mammals.
DNA libraries such as cDNA libraries and genomic DNA libraries are published in, for example, “Molecular Cloning” (Sambrook, J., Fritsch, EF and Maniatis, T., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989). ). Alternatively, if there is a commercially available library, it may be used.
By determining the base sequence of the obtained cDNA, the translation region encoding the protein of the gene product can be determined, and the amino acid sequence of this protein can be obtained.
The protein or polypeptide of the present invention can be produced by overexpression using conventional gene recombination techniques. It can also be expressed and produced in the form of a fusion protein with other proteins or peptides.
A cell in which the protein or polypeptide of the present invention is overexpressed can be obtained, for example, as follows. First, a DNA encoding the protein or polypeptide of the present invention is inserted into a vector in a form linked to the downstream of an appropriate promoter to construct an expression vector. Subsequently, the obtained expression vector is introduced into a host cell.
Examples of this expression system (host-vector system) include bacterial, yeast, insect cell and mammalian cell expression systems. Among these, in order to obtain a protein having a well-preserved function, insect cells (Spodoptera frugiperda SF9, SF21, etc.) and mammalian cells (monkey COS-7 cells, Chinese hamster CHO cells, human HeLa cells, etc.) are used as hosts. It is preferable to use it.
As a promoter for expressing the protein or polypeptide of the present invention, SV40 promoter, LTR promoter, elongation 1α promoter or the like is used in the case of a mammalian cell system, and polyhedrin promoter or the like is used in the case of an insect cell system. it can.
As a vector used for this expression system, a retrovirus vector, papilloma virus vector, vaccinia virus vector, SV40 vector or the like is used in the case of a mammalian cell system, and a baculovirus vector or the like is used in the case of an insect cell system. be able to.
As DNA encoding the protein or polypeptide of the present invention, cDNA corresponding to mRNA existing in nature (for example, one consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1) can be used, but is not limited thereto. A DNA corresponding to the amino acid sequence of the target protein can also be designed and used. In this case, 1 to 6 types of codons encoding one amino acid are known, and the selection of codons to be used may be arbitrary. For example, considering the frequency of codon usage of the host used for expression, the expression efficiency can be improved. High arrays can be designed. DNA having the designed base sequence can be obtained by chemical synthesis of DNA, fragmentation and binding of the cDNA, partial modification of the base sequence, and the like. Artificial base sequence partial modification and mutation introduction are performed by PCR or site-specific mutagenesis (Mark specific et al., Proceedings) using a primer comprising a synthetic oligonucleotide encoding the desired modification. of National Academy of Sciences, 81, 5562-5666, 1984).
The protein or polypeptide of the present invention can be purified from a culture of a cell into which an expression vector has been introduced, by known purification methods (salting out with inorganic salts, fractional precipitation with an organic solvent, ion exchange resin column chromatography, affinity column chromatography). , Gel filtration method, etc.) can be separated and purified by an appropriate combination.
By overexpression of the protein or polypeptide of the present invention, the function or activity of the protein or polypeptide in the cell can be increased (enhanced).
A nucleic acid (oligonucleotide or polynucleotide) that hybridizes with the nucleic acid of the present invention under stringent conditions or its complement can be used as a probe for detecting the gene of the present invention. In addition, this nucleic acid or its complement can also be used as, for example, an antisense oligonucleotide, a ribozyme, or a decoy in order to modulate (for example, suppress) gene expression. As such a nucleic acid, for example, a nucleotide having a continuous partial sequence of 14 bases or more or its complementary sequence of a nucleic acid (sense strand or antisense strand) consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 is used. be able to.
Recognizing the protein or polypeptide of the present invention using the protein or polypeptide of the present invention, or a protein or peptide having immunological equivalence to the protein or polypeptide (such as a synthetic peptide having a protein fragment or partial sequence) as an antigen Antibodies can be obtained. Having immunological equivalence means, for example, that it causes a cross reaction with an antibody against the protein or polypeptide of the present invention.
Polyclonal antibodies can be prepared by the usual method of inoculating a host animal (eg, rat or rabbit) with an antigen and recovering immune serum. Monoclonal antibodies can be prepared by techniques such as ordinary hybridoma methods. In addition, humanized monoclonal antibodies and the like can be prepared by modifying the gene of the monoclonal antibody.
Using the antibody obtained above, the expression of the protein or polypeptide of the present invention in a cell or tissue can be detected by an ordinary immunochemical method (such as immunochemical assay). Alternatively, the protein or polypeptide of the present invention can be purified by affinity chromatography using an antibody. In addition, neutralizing antibodies can be used to modulate (eg, suppress) the function or activity of the protein or polypeptide of the invention.
The receptor protein or polypeptide of the present invention has a function or activity (biological activity) as an eicosanoid receptor. Examples of such functions or activities include the following.
(I) Specific binding to a ligand.
(Ii) Induction of intracellular signal transduction based on stimulation by a ligand (ligand acting as an agonist).
(Iii) G protein based on stimulation by a ligand (ligand acting as an agonist) [more specifically, G protein (G i Α subunit of G protein belonging to subfamily, eg G iα1 Etc))) activation.
Here, as ligands (ligands acting as agonists), eicosanoids (for example, 5-oxo-ETE, 5-HPPEE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z) -Dienoic acid, 5-HETE, and 5,8,11-eicosatriic acid, etc.).
Such a function or activity of the receptor protein or polypeptide of the present invention can be detected, for example, as follows.
Method for detecting function or activity of (i) above
The receptor protein or polypeptide of the present invention (in the form of a membrane fraction containing the same or in the form of cells expressing this on the cell surface, etc.) is bound to a ligand [eicosanoid such as 5-oxo- ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid, 5-HETE, and 5,8,11-eicosatriic acid] Contact and detect specific binding of both. For detection of such binding, for example, a ligand with a label (for example, RI label, fluorescent label, etc.) can be used. Specific binding can be detected by a conventional competitive assay using a mixture of unlabeled ligand together with labeled ligand.
Method for detecting function or activity of (ii)
Cells expressing the receptor protein or polypeptide of the present invention on the cell surface are labeled with ligands [eicosanoids (eg, 5-oxo-ETE, 5-HPTEE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, In contact with and induce induced intracellular signaling (eg, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid, 5-HETE, and 5,8,11-eicosatriic acid, etc.) Ca 2+ Concentration change, cAMP concentration change, phospholipase C activation, pH change, K + , Etc.). A cell expressing (or not expressing) a receptor protein or polypeptide of the invention at a lower level is used as a control and compared to the level of intracellular signaling in such a control cell, If the level of intracellular signal transduction is higher than that, it is recognized that it has the function or activity (ii) depending on its level.
Specific methods for detecting intracellular signal transduction are described in, for example, the literature [Chen et al., Analytical Biochemistry, Vol. 226, pages 349-354, 1995 (Ca 2+ Concentration change, cAMP concentration change); Graminski et al. Biol. Chem. 268, 5957-5964, 1993 (activation of phospholipase C); Method of Sakurai et al., Cell 92, 573-585, 1998 (Ca 2+ Concentration change); Method of Hollopeter et al., Nature, 409, 202-207, 2001 (K + Concentration change); Tatemoto et al., Biochem. Biophys. Res. Commun. 251, 471-476, 1998 (pH change); Hinuma et al., Nature, 393, 272-273, 1998 (arachidonic acid metabolite releasing); JP-A-9-268 Etc.] can be carried out according to the method described in the Japanese Patent Publication.
Method for detecting function or activity of (iii)
The receptor protein or polypeptide of the present invention and G (G i Α subunit of G protein belonging to subfamily, eg G iα1 Membrane fraction is prepared from the cells in which the fusion protein is expressed on the cell membrane. This membrane fraction was converted into a ligand [eicosanoid (eg, 5-oxo-ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid, 5 In the presence and absence of -HETE, and those acting as agonists such as 5,8,11-eicosatriic acid] or the like [eg GTPγS (guanosine 5′-O— (3 -GTP analogs that are not easily degraded, such as thiotriphosphate)), and then detecting the binding of the labeled GTP or analog thereof to the membrane fraction, as compared to the level of binding in the absence of ligand. If the level of binding in the presence of the ligand is higher, it is recognized that the function or activity of (iii) is present depending on the level. It is.
Where G (G i Α subunit of G protein belonging to subfamily, eg G iα1 ) And its gene, the amino acid sequence and base sequence are already known [human G iα1 (351 Cys → Ile) / Bahia et al., Biochemistry, 37, 11555-11562, 1998: Human G iα1 / Genbank / EMBL accession no. AFO55013, PIR / SWISS-PROT accession no. PO4898: etc.].
Therefore, G DNA that encodes is selected from a DNA library using the disclosed known sequence information, PCR (polymerase chain reaction) method, colony hybridization method, plaque hybridization method or a combination thereof as appropriate. be able to. G Is bound downstream of the DNA encoding the receptor protein or polypeptide of the present invention and incorporated into a vector containing an appropriate promoter to obtain a vector for expressing the fusion protein. it can. Then, the fusion protein expression vector can be introduced into cells to express the fusion protein.
The receptor protein or polypeptide of the present invention can be used for screening or identification of a ligand or agonist (agonist or antagonist) thereto.
The method for screening or identifying a ligand or an agonist (agonist or antagonist) for the receptor protein or polypeptide of the present invention comprises the receptor protein or polypeptide of the present invention (form of a membrane fraction containing the same or cell Contacting the test compound with a test compound; and (1) specific binding of the receptor protein or polypeptide to the test compound in the presence of the test compound ( 2) intracellular signaling, or (3) G protein (G ) In the method of detecting activation.
In more detail, the screening or identification method of a ligand, an agonist, and an antagonist can each be implemented as follows.
(A) Ligand screening or identification method
(1) The receptor protein or polypeptide of the present invention (in the form of a membrane fraction containing the same or in the form of cells expressing this on the cell surface, etc.) is contacted with a test compound (2 ) Detecting the specific binding between the receptor protein or polypeptide of the present invention and the test compound, (3) whether or not the test compound has the ability to bind to the receptor protein or polypeptide, or the strength of the ability This can be done by determining the length.
Such specific binding can be detected, for example, by a conventional competitive assay method in which a known ligand with a label (for example, RI label, fluorescent label, etc.) is mixed with an unlabeled test compound. .
A test compound (ligand) having specific binding ability is likely to be an agonist (agonist or antagonist).
(B) Agonist screening or identification method
(1) contacting the receptor protein or polypeptide of the present invention (the form of a membrane fraction containing the same or the form of cells expressing the same on the cell surface) with a test compound, (2) In the presence of a test compound, intracellular signaling or G protein (G Whether (3) the test compound has the ability to induce intracellular signaling or G protein activation based on stimulation of the receptor protein or polypeptide, or This can be done by determining the strength of the ability.
Intracellular signaling (eg, Ca 2+ Or change in cAMP concentration, activation of phospholipase C, change in pH, K + Concentration change) or G protein (G ) Can be detected using the same method as described above.
(C) Method for screening or identifying antagonist
(1) The receptor protein or polypeptide of the present invention (the form of a membrane fraction containing the same or the form of a cell expressing the same on the cell surface) is used as a test compound and a ligand (preferably an agonist). (2) detecting the function or activity of the receptor protein or polypeptide of the present invention, and (3) the test compound determines the function or activity of the receptor protein or polypeptide of the present invention. This can be done by determining whether or not the ability to suppress or the strength of the ability.
Here, as the ligand (ligand acting as an agonist), for example, 5-oxo-ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z- Examples include eicosanoids such as dienoic acid, 5-HETE, and 5,8,11-eicosatriic acid, among which 5-oxo-ETE is a particularly preferred example.
The function or activity of the protein or polypeptide of the present invention includes the above (i) (ii) or (iii), that is,
(I) specific binding to a ligand;
(Ii) intracellular signal transduction based on stimulation by a ligand (ligand acting as an agonist) or
(Iii) G protein activation based on stimulation by a ligand (ligand that acts as an agonist) can be mentioned.
Detection of these functions or activities can be carried out, for example, by applying the same method as described above except that a test compound is added or not added together with a ligand (preferably a ligand that acts as an agonist).
Appropriate controls should be taken in determining the ability of the test compound. Such controls include detection / test in the absence of test compound, detection / test using cells that do not express the receptor protein of the present invention or have a lower level of expression of the receptor protein. Is given. A plurality of these controls may be combined for more accurate determination.
A compound selected or identified as an antagonist by the above-mentioned method or the like is brought into contact with a cell expressing the polypeptide of the present invention, thereby bringing the function or activity of the polypeptide (eicosanoid receptor) into the cell. Can be suppressed.
Moreover, the antagonist with respect to the polypeptide (eicosanoid receptor) of this invention is anticipated that it can be used as an active ingredient of a pharmaceutical. Therefore, a compound selected or identified as an antagonist for the polypeptide (eicosanoid receptor) of the present invention by the above method or the like can be used for the manufacture of a medicament. In the production of a medicine, it can be mixed with a conventional carrier to produce a pharmaceutical composition, and the composition can be sold as a medicine.
When used as a medicine, the administration method is not particularly limited, and a general oral or parenteral method (oral, intravenous, intramuscular, subcutaneous, etc.) may be applied. If necessary, it may be formulated and used as a conventional pharmaceutical preparation (tablet, granule, capsule, powder, injection, inhalant, etc.) together with an inert carrier according to the administration method. For example, a compound can be used together with an activator or diluent such as a binder, a disintegrant, a bulking agent, a filler, a lubricant, and the like that are acceptable in general medicine, and can be formulated by a conventional method.
The dose varies depending on the administration method, patient age, body weight, and condition, but a general dose, for example, 1 to 300 mg / kg for oral administration per day, or for parenteral administration, It is set in the range of 0.01 to 50 mg / kg.
The receptor protein or polypeptide used for screening or identification of a ligand or agonist is in the form of a membrane fraction containing the receptor protein or polypeptide, or the receptor protein or polypeptide expressed on the cell surface. It can be used in the form of a living cell.
As a cell expressing the receptor protein or polypeptide on the cell surface, a cell in which the receptor protein or polypeptide is overexpressed can be used. For example, the receptor protein or polypeptide can be used. Cells into which a recombinant vector containing a peptide-encoding nucleic acid has been introduced can be used.
As a host cell into which a recombinant vector is introduced, cells (mammalian cells, insect cells, etc.) that can express a foreign receptor protein on the cell membrane without impairing its function can be used. In addition, as a host cell, it is desirable to use a cell that does not express the target receptor protein or polypeptide or that is expressed only at a low level before introducing the recombinant vector.
The membrane fraction containing the receptor protein or polypeptide is obtained by crushing cells expressing the receptor protein or polypeptide and then using centrifugal force such as differential centrifugation or density gradient centrifugation. It can be prepared using a drawing method. For example, the cell lysate is centrifuged at a low speed (about 500 to 3000 rpm) for a short time (usually about 1 to 10 minutes), and the supernatant is further centrifuged at a high speed (about 15000 to 30000 rpm) for about 30 to 120 minutes. Then, the obtained precipitate fraction is used as a membrane fraction.
EXAMPLES Hereinafter, although an Example demonstrates this invention further in detail, these Examples do not restrict | limit this invention.
In the following Examples, unless otherwise specified, “Molecular Cloning” (Sambrook, J., Fritsch, EF, and Maniatis, T., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989) Published in the year), or when using commercially available reagents and kits, they were used according to the instructions for commercial products.
Example
Example 1 Isolation of human TG1019
(1) The amino acid sequences of 62 G protein-coupled receptors having peptides as ligands were aligned, and an amino acid sequence (SEQ ID NO: 3) well conserved among these G protein-coupled receptors was determined. NCBI (National Center for) using this sequence (SEQ ID NO: 3) as a query sequence and tblastn (Altschul SF et al., J. Mol. Biol., 215, 403-410, 1990) as a homology search method. Biotechnology Information) High-Throughput Genomic Sequences database was searched. As a result, a highly homologous sequence (SEQ ID NO: 4) was found in clone AC013396.3. Using the sequence of AC013396.3, an open reading frame (SEQ ID NO: 5) containing this sequence (SEQ ID NO: 4) was deduced. HMMTOP (membrane protein discrimination and transmembrane helix prediction system) (Tusnady GE et al., J. Mol. Biol., 283, 489-506, 1998) ) Was used to predict the transmembrane region and homology analysis with known G protein-coupled receptors. As a result, it was speculated that the base sequence shown in SEQ ID NO: 5 encodes the full length of the novel G protein-coupled receptor.
(2) Primers were designed based on the base sequence of AC013396.3 in (1) above, and DNA containing SEQ ID NO: 5 was obtained by PCR.
A first PCR was performed using a human cDNA library (trade name “Human Universal QUICK-Clone cDNA”; manufactured by Clontech). At that time, as a sense primer, a synthetic oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 6 (a primer corresponding to the region containing the 97735th to 97760th bases of AC013396.3) was used, and as an antisense primer, a sequence was used. A synthetic oligonucleotide (primer corresponding to the region containing the 96299th to 96324th bases of AC013396.3) having the base sequence shown in No. 7 was used. PCR reaction solution (25 μl) containing these primers and template cDNA [Composition: Template cDNA (trade name “Human Universal QUICK-Clone cDNA”, manufactured by Clontech) 1 μl, sterile water 18.5 μl, PCR buffer (Advantage 2 PCR Buffer, Clontech) 2.5 μl, Deoxynucleotide solution (dATP, dCTP, dGTP and dTTP, 10 mM each) 0.5 μl, Polymerase solution (Advantage 2 Polymerase Mix, Clontech) 0.5 μl, Sense primer (10 μM) 1.0 μl, antisense primer (10 μM) 1.0 μl], and PCR [conditions: 94 ° C., 30 seconds, (94 ° C. 30 seconds → 64 ° C. 30 seconds → 72 ° C. 2.5 minutes) × 30 times, 72 ° C .5 minutes] was carried out. Next, a second PCR was performed using 1 μl of the PCR reaction solution obtained above as a template. At that time, the PCR reaction solution composition and reaction conditions were the same as described above. The obtained PCR product was subjected to agarose gel electrophoresis, the band was cut out, and a cDNA fragment containing SEQ ID NO: 5 (about 1500 bp) was purified and obtained. This was linked to a vector plasmid (pGEM-T Easy, manufactured by Promega), and the nucleotide sequence of the cDNA fragment was determined using the resulting plasmid. As a result, the base sequence (1462 bp) shown in SEQ ID NO: 1 was obtained.
Within SEQ ID NO: 1 an open reading frame was identified. The amino acid sequence (423 amino acid residues) of the protein encoded thereby (referred to as TG1019 protein) was as shown in SEQ ID NO: 2. For SEQ ID NO: 2, a transmembrane region was predicted by HMMTOP and homology analysis with a known G protein-coupled receptor was performed. As a result, TG1019 protein is presumed to be a novel G protein-coupled receptor, and the cDNA (1462 bp) obtained above is a cDNA containing the entire translation region of the gene for TG1019 protein (referred to as TG1019 gene). It was thought that there was. FIG. 1 shows a transmembrane region (underlined portion) together with the base sequence and amino acid sequence.
When the DNA base sequence of SEQ ID NO: 1 was compared with a human genomic DNA sequence registered in Genbank (Genbank Accession No. ACO13396 (ver3)), a difference of 4 bases was observed. The different bases were the 487th (G⇔A), 771th (G⇔A), 1022th (C⇔A) and 1038th (G⇔A) bases in SEQ ID NO: 1.
With these base differences, a difference of 3 amino acid residues also occurs in the amino acid sequence of the polypeptide encoded by the DNA, and the different residues are the 150th position (GlylAsp) in SEQ ID NO: 2, 245 (Glu⇔Lys) and 334th (Ala⇔Thr)] residues.
Accordingly, PCR (independently twice) was performed using a human cDNA library (trade name: Marathon Ready cDNA library, human fetal splene; manufactured by Clonetech) as a template, and an ApaI fragment containing the base in which the above difference was found was obtained. Obtained and analyzed the base sequence of multiple clones.
As a result, the 1022 base difference (C⇔A) in SEQ ID NO: 1 was considered to be due to a nucleotide polymorphism, and was thought to be derived from a naturally occurring allelic variant. . This difference in the base sequence does not cause a difference in the amino acid sequence of the encoded polypeptide.
On the other hand, the differences in the 487th (G⇔A), 771th (G⇔A) and 1038th (G⇔A) bases in SEQ ID NO: 1 are considered to be due to PCR errors, and for these, Genbank Accession No. The sequence of ACO13396 (ver3) was considered correct.
That is, the base sequence in which these PCR errors and the like are corrected is considered that the 487th, 771st, 1022nd and 1038th bases in SEQ ID NO: 1 are “A” (adenine). As for the amino acid sequence of the polypeptide encoded by (2), the 150th, 245th and 334th amino acid residues in SEQ ID NO: 2 were considered to be Asp, Lys and Thr, respectively.
The base sequence after correcting the PCR error is shown in SEQ ID NO: 20 in the Sequence Listing, and the amino acid sequence of the polypeptide encoded thereby is shown in SEQ ID NO: 21.
Example 2 TG1019 gene expression distribution
The distribution of TG1019 gene expression in various human tissues and cells was examined by dot blot analysis. Dot blotting was performed using human tissue-derived and human cultured cell-derived mRNA (dots on a nylon membrane) (Multiple Tissue Expression Array, manufactured by Clontech) and an RI-labeled probe. On the membrane, various human tissue-derived and human cultured cell-derived mRNAs [poly (A) RNA] shown in FIG. 2 are dotted (adsorbed and fixed).
The RI-labeled probe used was prepared as follows. That is, after treating the plasmid containing the cDNA fragment obtained in section (2) of Example 1 with the restriction enzyme NotI, a DNA fragment of about 1500 bp (cDNA fragment containing the entire translation region of the TG1019 gene) by agarose gel electrophoresis. Was purified and obtained. Using this cDNA fragment as a template, a labeling kit (Prime-a-Gene Labeling Prosym.), Including a random primer (random hexanucleonucleotides), a nucleotide mixture (dATP, dGTP and dTTP) and DNA polymerase I (Large (Klenow) Fragment) Made) and [α -32 After labeling with P] dCTP, it was purified by gel filtration to prepare an RI-labeled probe.
Hybridization of the dot blot was performed as follows.
The membrane on which the mRNA was immobilized was treated with 160 μl of Solution I [Salmon Tests DNA (9.4 μg / μl: manufactured by SIGMA) at 97 ° C. for 5 minutes, cooled in ice, and then expressed at 60 ° C. Express Hyb hybridization Solution ( (Prepared by adding 15 ml of Clontech)] and preincubating for 30 minutes at 68 ° C.
Subsequently, this membrane was mixed with a labeled probe-containing hybridization solution [20 μl of the above-mentioned RI-labeled probe, human COT-1 DNA (1 μg / μl: manufactured by Roche)], salmon testis DNA (9.4 μg / μl: manufactured by SIGMA) 16 μl. , 20 × SSC (3M sodium chloride, 300 mM sodium citrate, pH 7.0) 50 μl, and nuclease-free H 2 O (Promega) 84 μl were prepared to prepare a 200 μl solution, which was treated at 97 ° C. for 5 minutes. Incubated at 68 ° C. for 30 minutes, and further prepared by adding 5 ml of the solution I], the mixture was hybridized at 65 ° C. for 12 hours. Next, the membrane was pre-washed with 2 × SSC containing 1% SDS (300 mM sodium chloride, 30 mM sodium citrate, pH 7.0) at 65 ° C. for 20 minutes 5 times, and then 0.5%. The plate was washed twice with 0.1 × SSC (15 mM sodium chloride, 1.5 mM sodium citrate, pH 7.0) containing SDS at 55 ° C. for 20 minutes.
As a result of detecting a hybridization signal using an image analyzer (Bio-imaging Analysis System 2000, manufactured by Fuji Film), a signal was observed in mRNA of almost all tissues subjected to the test. Among the tissues where signals were observed, relatively strong signals were observed in the liver, kidney, peripheral leukocytes and spleen. From these results, it was considered that the TG1019 gene is expressed in many tissues, among which the expression in the liver, kidney, peripheral leukocytes and spleen is relatively high.
Example 3 Ligand Identification of TG1019 Protein (G Protein Coupled Receptor)
TG1019 protein was presumed to be a G protein-coupled receptor as in Example 1. Therefore, using a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and G protein, ligand-dependent binding to GTPγS (guanosine 5′-O- (3-thiotriphosphate)) is detected as follows. [Wenzel-Seifert et al., Mol. Pharmacol. 58, 954-966, 2000; Bahia et al., Biochemistry, 37, 11555-11562, 1998].
(1) Preparation of plasmid for expressing fusion protein
Hereinafter, TG1019 protein and G protein [G iα1 (351Cys → Ile), G Or G sαL A plasmid for expressing the fusion protein was prepared. A schematic diagram of the fusion protein is shown in FIG. Where G iα1 (351Cys → Ile) is G iα1 Mutant G obtained by converting 351st cysteine residue of protein to isoleucine residue iα1 Means protein.
(A) Preparation of TG1019 gene cDNA
PCR was performed using the plasmid containing the TG1019 gene cDNA (including the entire translation region) obtained in the item (2) of Example 1 as a template.
At that time, as the sense primer (primer TG1019-1) and the antisense primer (primer TG1019-2), synthetic oligonucleotides having the base sequences shown in SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9, respectively, were used.
These primers are designed based on the cDNA base sequence (SEQ ID NO: 1) of the TG1019 gene. The PCR product contains cDNA encoding the full length of the TG1019 protein (excluding the stop codon) and recognizes restriction enzymes at both ends. It is designed to obtain a DNA fragment to which a site (BglII site at the N-terminus and CpoI and HindIII sites at the C-terminus) is added.
Thus, the obtained PCR product was ligated to a vector plasmid (vector system for PCR product cloning) (pGEM-T Easy Vector, Promega), and the obtained plasmid was treated with restriction enzymes NotI and CpoI. The resulting DNA fragment of about 1300 bp was recovered.
(B) G protein (G iα1 Preparation of plasmid for fusion protein expression with (351Cys → Ile))
PCR was performed using cDNA derived from human brain (Marathon-Ready cDNA Brain, manufactured by Clontech) as a template. At that time, sense primer (primer G iα1 -1) and antisense primer (primer G iα1 -2) were synthetic oligonucleotides having the base sequences shown in SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11, respectively.
These primers are G iα1 Designed based on the known base sequence of cDNA encoding protein (Genbank / EMBL accession no. AFO55013). iα1 It is designed to obtain cDNA that encodes the full length of the protein.
Subsequently, a second PCR was performed using the product obtained by the PCR as a template. At that time, sense primer (primer G iα1 -3) and antisense primer (primer G iα1 As for -4), synthetic oligonucleotides having the base sequences shown in SEQ ID NO: 12 and SEQ ID NO: 13, respectively, were used.
These primers can be used as PCR products as G iα1 (351Cys → Ile) (G iα1 Mutant G in which the 351st cysteine residue of the protein is replaced with an isoleucine residue iα1 It is designed so as to obtain a DNA fragment containing a cDNA encoding the full length of (protein) and having restriction enzyme recognition sites (CpoI site and BamHI site) added to both ends thereof.
The obtained PCR product was ligated to a vector plasmid (pGEM-T Easy Vector, manufactured by Promega). This plasmid was treated with restriction enzymes NotI and BamHI, and the resulting DNA fragment of about 1100 bp was inserted into the NotI / BamHI site of baculovirus vector plasmid pVL1392 (manufactured by Pharmingen) to obtain plasmid pVL1392 / G. iα1 (351 Cys → Ile) was obtained.
The DNA fragment obtained in (a) above was inserted into the restriction enzyme NotI / CpoI site of this plasmid, and the plasmid for fusion protein expression pVL1392 / TG1019-G iα1 (351 Cys → Ile) was obtained.
(C) G protein (G Preparation of fusion protein expression plasmid with
PCR was performed using human prostate-derived cDNA (Marathon-Ready cDNA Prostate, manufactured by Clontech) as a template. At that time, sense primer (primer G -1) and antisense primer (primer G -2) were synthetic oligonucleotides having the base sequences shown in SEQ ID NO: 14 and SEQ ID NO: 15, respectively. These primers are G Was designed based on the known base sequence of cDNA encoding (Genbank / EMBL accession no. U43083). It is designed so that cDNA encoding the full length of can be obtained.
Subsequently, a second PCR was performed using the product obtained by the PCR as a template. At that time, sense primer (primer G -3) and antisense primer (primer G As for -4), synthetic oligonucleotides having the base sequences shown in SEQ ID NO: 16 and SEQ ID NO: 17 were used. These primers can be used as PCR products as G It is designed to obtain a DNA fragment containing a cDNA encoding the full length of, and having restriction enzyme recognition sites (CpoI site and BamHI site) added to both ends thereof.
The obtained PCR product was ligated to a vector plasmid (pGEM-T Easy Vector, manufactured by Promega). The resulting plasmid was treated with restriction enzymes NotI and BamHI, and the resulting DNA fragment of about 1100 bp was inserted into the NotI / BamHI site of the baculovirus vector plasmid pVL1392 to obtain plasmid pVL1392 / G. Got.
The DNA fragment obtained in (a) above was inserted into the restriction enzyme NotI / CpoI site of this plasmid, and the plasmid for fusion protein expression pVL1392 / TG1019-G Got.
(D) G protein (G sαL Preparation of fusion protein expression plasmid with
PCR was carried out using human bone marrow-derived cDNA (Marathon-Ready cDNA Bone marlow, manufactured by Clontech) as a template. At that time, sense primer (primer G sαL -1) and antisense primer (primer G sαL -2), synthetic oligonucleotides having the nucleotide sequences shown in SEQ ID NO: 18 and SEQ ID NO: 19 were used.
These primers are G sαL Designed based on the known nucleotide sequence of the cDNA coding for (Genbank / EMBL accession no. XO4408). sαL It is designed to obtain a DNA fragment containing a cDNA encoding the full-length of DNA and having restriction enzyme recognition sites (CpoI site and XbaI site) added to both ends thereof.
The obtained PCR product was ligated to a vector plasmid (pGEM-T Easy Vector, manufactured by Promega). The obtained plasmid was treated with restriction enzymes NotI and XbaI, and the resulting DNA fragment of about 1200 bp was inserted into the NotI / XbaI site of baculovirus vector plasmid pVL1392 (manufactured by Pharmingen) to obtain plasmid pVL1392 / G. sαL Got.
The DNA fragment obtained in (a) above was inserted into the restriction enzyme NotI / CpoI site of this plasmid to obtain a fusion protein expression plasmid pVL1392 / TG1019-GsαL.
(2) Preparation of membrane fraction containing fusion protein
As shown in FIG. 3 (schematic diagram), the three expression plasmids obtained in (b) to (d) of (1) above are linker sequences (-Gly added to the C-terminus of the TG1019 protein. TG1019 protein (full length) and G protein [G iα1 (351Cys → Ile), G Or G sαL ] Is a plasmid that expresses a fusion protein having a linked structure.
These fusion protein expression plasmids pVL1392 / TG1019-G iα1 (351Cys → Ile), pVL1392 / TG1019-G Or pVL1392 / TG1019-G sαL Was expressed in insect cells as follows, and a membrane fraction containing the fusion protein was prepared.
First, 1.5 ml of medium [10% fetal calf serum, 0.1 mg] was prepared so that insect cell Sf9 (Spodoptera frugiperda SF9) (manufactured by Farmingen) was about 60% confluent in a collagen-coated 3 cm petri dish. Incubation was carried out at 27 ° C. for 15 minutes in Grace's Insect Cell Culture Medium (pH 6.2: manufactured by Lifetech Oriental) containing / ml streptomycin and 100 U / ml penicillin.
The medium was removed, 375 μl of transfection buffer (Transfection Buffer A, Pharmingen) was added, and a DNA solution prepared beforehand (1 μg of plasmid for fusion protein expression, Linearized BaculoGold Baculovirus DNA (Farmingen) (Made by Co., Ltd.) 0.125 μg, mixed in 25 μl of sterilized water, incubated at 25 ° C. for 15 minutes, and then added with 375 μl of Transfection Buffer B (manufactured by Pharmingen)].
After culturing this at 27 ° C. for 4 hours, the culture solution was removed, 1.2 ml of medium was added, and the mixture was cultured at 27 ° C. for 5 days. The obtained culture solution was centrifuged (1,000 × g, 5 minutes), and the supernatant was recovered as virus solution I.
Sf9 cells were seeded in a collagen-coated 3 cm petri dish so as to be about 30% confluent, and the virus solution I (100 μl) obtained above and 1.2 ml of the medium were added and cultured at 27 ° C. for 4 days. The obtained culture solution was centrifuged (1,000 × g, 5 minutes), and the supernatant was recovered as virus solution 11.
Sf9 cells were seeded in a 10 cm Petri dish treated with collagen so as to be about 70% confluent, and the virus solution II (500 μl) obtained above and 12 ml of the medium were added and cultured at 27 ° C. for 4 days. The culture solution thus obtained was centrifuged (1,000 × g, 5 minutes), and the supernatant was recovered as virus solution III.
Sf9 cells were seeded in a 10 cm Petri dish treated with collagen so as to be about 70% confluent, virus solution III (100 μl) obtained above and 12 ml of medium were added, and cultured at 27 ° C. for 4 days. The cells thus obtained were washed with chilled PBS (phosphate buffered saline, pH 7.4) and then cooled lysis buffer [20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.2 mM phenylmethyl fluoride. Sulfonyl, 10 μg / ml pepstatin, 10 μg / ml leupeptin, and 2 μg / ml aprotinin] were suspended in 3.6 ml, and the cells were disrupted using a Teflon homogenizer. The cell lysate was centrifuged (600 × g, 10 minutes), and the resulting supernatant was further centrifuged (50,000 × g, 20 minutes). The resulting precipitate was suspended in 450 μl of a cooled reaction buffer (20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM sodium chloride, 10 mM magnesium chloride) using a Teflon homogenizer, and a membrane fraction expressing the fusion protein was obtained. Obtained.
(3) Binding test between membrane fraction containing fusion protein and GTPγS
The membrane fraction (450 μl) obtained in (2) above was suspended in a reaction buffer (7.54 ml), and 10 μl of GDP (10 mM) was added thereto. After adding 20 μl of test sample to 160 μl of this solution and incubating at 30 ° C. for 10 minutes, [ 35 20 μl of S] GTPγS (5 nM, 5 nCi / μl: Amersham Pharmacia Biotech) was added to initiate the reaction. After incubation at 30 ° C. for 1 hour, the reaction was stopped by filtration using a glass filter (UniFilter-96GF / B, Packard). The filter was washed 3 times with 200 μl of chilled reaction buffer and then on the filter [ 35 The amount of S] GTPγS (the amount bound to the membrane fraction) was measured by a liquid scintillation measurement method. The amount of non-specific binding (the amount of binding measured in the presence of 10 μM GTPγS) is subtracted from the amount of [35S] GTPγS binding thus measured, 35 The specific binding amount of S] GTPγS was determined.
About 370 nucleic acids, amino acids, peptide related compounds, tissue extracts and lipid related compounds were tested as test specimens. As a result (FIG. 4), TG1019 protein and G iα1 When a membrane fraction containing a fusion protein with (351Cys → Ile) is used, 5-oxo-ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z , 8Z-dienoic acid, 5-HETE and 5,8,11-eicosatriic acid in a concentration-dependent manner [ 35 The specific binding amount of S] GTPγS increased.
TG1019 protein and G sαL When the membrane fraction containing the fusion protein was used, an increase in the specific binding amount by these compounds was not observed. On the other hand, TG1019 protein and G In the case of using a membrane fraction containing a fusion protein, the specific binding amount increased with 5 (S) -HPETE. The amount of increase was small compared to the case of.
From these results, TG1019 protein is iα1 Or G It was thought to be a type of G protein-coupled receptor that conjugated to proteins. Also, 5-oxo-ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid, 5-HETE and 5,8,11-eico It became clear that satriic acid acts as its ligand (agonist).
That is, TG1019 protein comprises 5-oxo-ETE, 5-HPETE, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z, 11Z-trienoic acid, 5-HETrE, eicosa-5,8-dienoic acid, 5-HETE, and 5, It was considered to be an eicosanoid receptor having 8,11-eicosatriic acid as a ligand (agonist).
Example 4 Identification of antagonist of TG1019 protein (G protein-coupled receptor)
In the presence of 5-oxo-ETE (ligand acting as an agonist) and a test compound, the G protein activation effect of TG1019 protein based on 5-oxo-ETE stimulation was detected, and the antagonistic action of the test compound was examined.
Detection of G protein activation was carried out in the same manner as (3) of Example 3 above using a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and Giα1 and labeled GTPγS.
That is, a membrane fraction (450 μl) containing a fusion protein of TG1019 protein and Giα1 was suspended in a reaction solution (7.54 ml), and 10 μl of GDP (10 mM) was added thereto. To 160 μl of this solution, 5-oxo-ETE (final concentration 0.1 μM) and various concentrations of test compounds (0 M, 10 -7 M-10 -5 M) was added and incubated at 30 ° C. for 10 minutes. (Total solution volume of 5-oxo-ETE and test compound: 20 μl)
to this〔 35 The reaction was started by adding 20 μl of S] GTPγS, incubated at 30 ° C. for 1 hour, and then filtered through a glass filter to stop the reaction.
On the filter 35 The amount of S] GTPγS (the amount bound to the membrane fraction) was measured by liquid scintillation and measured [ 35 The amount of non-specific binding (the amount of binding when measured in the presence of 10 μM GTPγS) was subtracted from the amount of S] GTPγS to determine the amount of specific binding.
As a result, it was found that various polyunsaturated fatty acid compounds suppress the G protein activation action of TG1019 protein based on 5-oxo-ETE stimulation and show an antagonistic action.
Thus, these compounds identified as acting as antagonists of TG1019 protein (G protein-coupled receptor) and their IC50 values are shown in Table 2 below.
Figure 0003949111
Example 5 Confirmation of expression and function of TG1019 protein (G protein-coupled receptor) in CHO cells
In the following manner, a TG1019 protein expression vector is transiently introduced into CHO cells to express recombinant TG1019 protein, and the function of TG1019 protein as an eicosanoid receptor is confirmed using these cells. did.
First, the DNA encoding the full length of the TG1019 protein obtained in Example 1 (1) (a) was subcloned into the NotI recognition site of the vector plasmid pcDNA3.1 (expression vector, manufactured by Invitrogen) for expression of the TG1019 protein. The vector plasmid pcDNA3.1-TG1019 was obtained.
CHO cells (1x10 6 Cells) was cultured in DMEM / F-12 medium containing 10% fetal bovine serum for 20 hours at 37 ° C. Using this cell, plasmid DNA (pcDNA3.1-TG1019, or vector pcDNA3.1 as a control) (5 μg) and a transfection reagent (LipofectAMINE, manufactured by Invitrogen) were added, and transfection was performed for 24 hours. did. In the case of pretreatment with pertussis toxin, pertussis toxin (100 ng) was added after culturing for 20 hours, followed by culturing for 4 hours.
The cultured cells were collected and washed, suspended in KRH buffer (Krebs-Ringer Hepes buffer, pH 7.4) containing rolipram (25 mM), incubated at 37 ° C. for 30 minutes, and then inoculated into a 96-well plate (5 -7.5x10 4 Cells / 90 μl / well).
Then forskolin (1 μM) and 5-oxo-ETE (final concentration 0 M or 10 -11 -10 -5 KRH buffer (90 μl / well) containing M) was added and incubated at room temperature for 10 minutes, and then the cells were lysed and the amount of cAMP produced was measured.
The amount of cAMP produced was measured using a cAMP enzyme immunoassay system manufactured by Amersham Biosciences.
As a result, in cells into which only the vector was introduced, cAMP production upon forskolin stimulation did not change with the addition of 5-oxo-ETE. On the other hand, in cells in which pcDNA3.1-TG1019 was introduced to express TG1019 protein, cAMP production upon forskolin stimulation was suppressed in a concentration-dependent manner by the addition of 5-oxo-ETE.
In addition, when cells expressing TG1019 protein were pretreated with pertussis toxin that inactivates sensitive G protein, suppression of cAMP production by addition of 5-oxo-ETE was not observed.
From these results, TG1019 protein is an eicosanoid receptor using 5-oxo-ETE as a ligand (ligand that acts as an agonist), and is a G protein-coupled type that is coupled to Gi (adenylate cyclase-inhibitory G protein). Confirmed to be a receptor.
Industrial applicability
The receptor protein and its gene of the present invention are useful for studying the mechanism of intracellular signal transduction. It can also be a target molecule for therapeutics for new diseases.
In addition, the screening, identification and characterization methods of agonists (agonists or antagonists) using the receptor protein of the present invention and its gene are useful for research and development of new drugs.
[Sequence Listing]
Figure 0003949111
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[Brief description of the drawings]
FIG. 1 is a diagram showing the amino acid sequence, base sequence, and presumed seven-transmembrane region (underlined portion) of TG1019.
FIG. 2 is a view showing the expression distribution (result of dot blot) of TG1019 gene in each human tissue or cell.
FIG. 3 is a schematic diagram showing an outline of the structure of a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins.
FIG. 4A is a graph showing the influence of various test substances on the specific binding amount between GTPγS and a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins when 5-oxo-ETE is used as a test compound. It is. The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4B is a diagram showing the influence of various test substances on the specific binding amount of a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins and GTPγS when 5-HPETE is used as a test compound. . The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4C is a graph showing the influence of various test substances on the specific binding amount between GTPγS and a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins when arachidonic acid is used as a test compound. The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4D shows various test substances with respect to specific binding amounts of a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins and GTPγS when eicosa-5Z-8Z-11Z-trienoic acid is used as a test compound. It is the figure which showed the influence. The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4E is a graph showing the influence of various test substances on the specific binding amount between a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins and GTPγS when 5-HETrE is used as a test compound. . The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4F shows the effect of various test substances on the specific binding amount between GTPγS and a membrane fraction containing a fusion protein of TGT019 protein and various G proteins when eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid is used as a test compound. FIG. The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4G is a diagram showing the influence of various test substances on the specific binding amount of a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins and GTPγS when 5-HETE is used as a test compound. . The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.
FIG. 4H shows various amounts of specific binding amounts of a membrane fraction containing a fusion protein of TG1019 protein and various G proteins and GTPγS when 5,8,11-eicosatriic acid (ETI) is used as a test compound. It is the figure which showed the influence of the test substance. The specific binding amount is expressed as a relative value (% of control) with respect to the binding amount at the time when the test substance is not added as a control. 「○ G iα1 (351Cys → Ile) ”refers to TG1019 protein and G iα1 The test result in the membrane fraction containing the fusion protein with (351Cys → Ile) is shown. 「△ G "Is the TG1019 protein and G The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown. 「□ G sαL "Is the TG1019 protein and G sαL The test result in the membrane fraction containing a fusion protein is shown.

Claims (8)

エイコサノイド受容体としての機能または活性を有するポリペプチド、
(A)配列番号2又は21で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド;または
(B)配列番号1又は20で示される塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得る核酸またはその相補物によってコードされるポリペプチド
に対するアンタゴニストのスクリーニングまたは同定方法であって、リガンドがエイコサノイドである、以下の工程(1)〜(3)
(1)該ポリペプチドを試験化合物およびリガンドと接触せしめる工程;
(2)該ポリペプチドの機能または活性を検出する工程;および(3)該試験化合物が該ポリペプチドの機能もしくは活性を抑制する能力を有するか否か、または該能力の強さを決定する工程;を含む方法。
A polypeptide having a function or activity as an eicosanoid receptor,
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or 21; or
(B) a method for screening or identifying an antagonist for a polypeptide encoded by a nucleic acid which can hybridize under stringent conditions with a nucleic acid comprising the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 20, or a complement thereof. The following steps (1) to (3) , wherein the ligand is an eicosanoid:
(1) contacting the polypeptide with a test compound and a ligand;
(2) detecting the function or activity of the polypeptide; and (3) determining whether or not the test compound has the ability to suppress the function or activity of the polypeptide, or the strength of the ability. A method comprising;
ポリペプチドの機能または活性が、以下の(i)、(ii)及び(iii)から選択される請求の範囲第1項記載の方法。
(i)リガンドとの特異的結合。
(ii)リガンドの刺激に基づく細胞内シグナル伝達の誘導。
(iii)リガンドによる刺激に基づくGタンパク質の活性化。
The method according to claim 1, wherein the function or activity of the polypeptide is selected from the following (i), (ii) and (iii).
(I) Specific binding to a ligand.
(Ii) Induction of intracellular signal transduction based on ligand stimulation.
(Iii) Activation of G protein based on stimulation by ligand.
細胞内シグナル伝達が、Ca2+の濃度変化、cAMPの濃度変化、ホスホリパーゼCの活性化、pHの変化およびKの濃度変化から選択されるものである請求の範囲第項記載の方法。Intracellular signaling, change in concentration of Ca 2+, changes in the concentration of cAMP, activation of phospholipase C, Method ranging second claim of claim is selected from changed and K + concentration change of pH. Gタンパク質の活性化が、Giサブファミリーに属するGタンパク質のαサブユニットの活性化である請求の範囲第項記載の方法。The method according to claim 2 , wherein the activation of the G protein is the activation of the α subunit of the G protein belonging to the Gi subfamily. エイコサノイドが、5−オキソ−6E,8Z,11Z,14Z−エイコサテトラエン酸、5(S)−ヒドロペルオキシエイコサ−6E,8Z,11Z,14Z−テトラエン酸、アラキドン酸、エイコサ−5Z,8Z,11Z−トリエン酸、5−ヒドロキシエイコサ−6E,8Z,11Z−トリエン酸、エイコサ−5Z,8Z−ジエン酸、5−ヒドロキシエイコサ−6E,8Z,11Z,14Z−テトラエン酸および5,8,11−エイコサトリイン酸からなる群より選択されるものである請求の範囲第1〜4項のいずれか1項記載の方法。The eicosanoid is 5-oxo-6E, 8Z, 11Z, 14Z-eicosatetraenoic acid, 5 (S) -hydroperoxyeicosa-6E, 8Z, 11Z, 14Z-tetraenoic acid, arachidonic acid, eicosa-5Z, 8Z. , 11Z-trienoic acid, 5-hydroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z-trienoic acid, eicosa-5Z, 8Z-dienoic acid, 5-hydroxyeicosa-6E, 8Z, 11Z, 14Z-tetraenoic acid and 5,8 5. The method according to any one of claims 1 to 4 , wherein the method is selected from the group consisting of 11-eicosatriic acid. ポリペプチドが、該ポリペプチドを含む膜画分の形態のもの、または、該ポリペプチドが細胞表面上に発現している細胞の形態のものである請求の範囲第1〜5項のいずれか1項記載の方法。The polypeptide according to any one of claims 1 to 5 , wherein the polypeptide is in the form of a membrane fraction containing the polypeptide or in the form of a cell in which the polypeptide is expressed on the cell surface. The method described in the paragraph. 該ポリペプチドが細胞表面上に発現している細胞が、該ポリペプチドをコードする核酸またはこれを含む発現ベクターを導入して該ポリペプチドを過剰発現させた細胞である請求の範囲第項記載の方法。Cells expressing the polypeptide on the cell surface, the claims 6 Claims for introducing an expression vector comprising a nucleic acid or which encodes a polypeptide is a cell overexpressing the polypeptide the method of. 医薬の選別、同定もしくは特徴づけのために使用されるものである、請求の範囲第1〜7項のいずれか1項記載の方法。The method according to any one of claims 1 to 7 , which is used for selection, identification or characterization of a medicine.
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