JP2024519031A - コンジュゲート療法エンハンサーを含む組成物 - Google Patents

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Abstract

組成物であって、構造P-N-LPM-MOIを有する第1の化合物であって、式中、P-Nは、リジン残基を含むタンパク質薬剤部分であり、LPMは、リンカーであり、MOIは、目的の部分である、第1の化合物と、構造LG-OHを有する第2の化合物であって、式中、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基である、第2の化合物と、を含む、組成物。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、参照により全体が本明細書に組み込まれる、2021年5月17日に出願された出願第63/189,503号に対する優先権を主張する。
本開示は、様々な状態、障害、又は疾患を予防及び/又は治療するのに有用であるコンジュゲート療法エンハンサーに関する。具体的には、本開示は、療法エンハンサーとして機能することができる抗体-薬物コンジュゲートなどのタンパク質コンジュゲートに関する。
コンジュゲート療法エンハンサーは、様々な状態、障害、及び疾患を予防及び/又は治療するために広く使用されている。そのようなエンハンサーは、典型的には、その状態、障害、又は疾患に関与する特定の標的に親和性を有する部分に連結された、抗体などの治療活性分子を含む。しかしながら、既知のコンジュゲーション技術の大部分は、治療活性分子の特定の部位に指向しておらず、通常、コンジュゲートの混合物をもたらす。高度の均一性を有する反応生成物を提供する部位特異的コンジュゲーション技術の開発において依然として必要性が存在する。
本開示は、特定の位置で標的薬剤部分にコンジュゲートされた目的の部分を含有する療法エンハンサー薬剤を含む組成物に関する。
ある実施形態では、組成物であって、
式(P-II)の構造
P-N-LPM-MOI(P-II)
を有する第1の化合物であって、式中、
P-Nは、リジン残基を含むタンパク質薬剤部分であり、
PMは、リンカーであり、
MOIは、目的の部分である、第1の化合物と、
以下の構造
LG-OH(LG-I)
を有する第2の化合物であって、式中、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基である、第2の化合物と、を含む、組成物が提供される。
別の実施形態では、組成物は、
式(R-I)
LG-RG-LRM-MOI(R-I)
を有する第3の化合物であって、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基であり、式(LG-I)中のLGと同一であり、
RGは、反応性基であり、
RMは、リンカーであり、式(P-II)中と同一であり、MOIは、目的の部分である、第3の化合物、
式(R-III)
HO-RG-LRM-MOI(R-III)
を有する第4の化合物、又はそれらの組み合わせを更に含む。
化合物I-36(IVIGにコンジュゲートされたMATE試薬I-20)について、代表的なUPLC/UV280nmトレースが提供される。UPLC条件を実施例2に示す。uABTはユニバーサルな抗体結合末端(Antibody Binding Terminal)を示し、DARは薬物抗体比である。 非コンジュゲートIVIG(図2A)、MATE不純物プール標準(図2B)、及びI-36コンジュゲート(図2C)のUPLCトレース。 uABT、MATE-リンカー、並びにプールされたMATE試薬、及び個々の不純物についての較正曲線。試料を調製し、実施例2に与えられる方法によって分析する。
本発明の実施において当業者を補助するために、以下の詳細な説明が提供される。これ以降、例示的な実施形態について詳細に説明する。しかしながら、これらの実施形態は例示的なものに過ぎず、本開示はそれに限定されず、むしろ添付の特許請求の範囲の範囲によって定義される。当業者は、本開示の趣旨又は範囲から逸脱することなく、本明細書に記載される実施形態において修正及び変形を行い得る。
したがって、実施形態は、本明細書の態様を説明するために、構造及びスキームを参照することによって、以下に記載されるに過ぎない。本明細書で使用される場合、「及び/又は」という用語は、関連する列挙された項目のうちの1つ以上の任意の組み合わせ及び全ての組み合わせを含む。「又は」という用語は、「及び/又は」を意味する。要素の列挙の前の「~のうちの少なくとも1つ」などの表現は、要素の列挙全体を修飾し、列挙の個々の要素を修飾しない。
ある要素が別の要素の「上に」存在すると言及される場合、それは他の要素と直接接触してもよいか、又はそれらの間に介在する要素が存在し得ることが理解されるであろう。対照的に、ある要素が別の要素の「上に直接的に」存在すると言及される場合、介在する要素は存在しない。
第1、第2、第3などの用語は、様々な要素、構成要素、領域、層、及び/又はセクションを説明するために本明細書で使用され得るが、これらの要素、構成要素、領域、層、及び/又はセクションは、これらの用語によって限定されるべきではないことを理解されたい。これらの用語は、ある要素、構成要素、領域、層、又はセクションを別の要素、構成要素、領域、層、又はセクションから区別するためにのみ使用される。したがって、以下で考察される第1の要素、構成要素、領域、層、又はセクションは、本実施形態の教示から逸脱することなく、第2の要素、構成要素、領域、層、又はセクションと呼ぶことができる。
本明細書で使用される場合、用語「備える(comprises)」及び/若しくは「備える(comprising)」、又は「含む(includes)」及び/若しくは「含む(including)」は、記載された特徴、領域、整数、ステップ、動作、要素、及び/又は構成要素の存在を指定するが、1つ以上の他の特徴、領域、整数、ステップ、動作、要素、構成要素、及び/又はそれらの群の存在又は追加を排除するものではないことを理解されたい。
別途定義されない限り、本明細書に使用されている全ての技術用語及び科学用語は、本開示が属する当該技術分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書で使用される専門用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的とし、限定することを意図するものではない。一般的に使用される辞書に定義される用語などの用語は、関連する技術分野及び本開示の文脈におけるそれらの意味と一致する意味を有すると解釈されるべきであり、本明細書で明示的に定義されない限り、理想化された意味又は過度に形式的な意味で解釈されないことを更に理解されたい。
本出願で使用される場合、本明細書で明示的に提供される場合を除き、以下の用語の各々は、以下に記載される意味を有するものとする。追加の定義は、本出願を通じて説明される。本明細書で用語が具体的に定義されていない場合、その用語は、その文脈においてその用語を適用する当業者によって、当該技術分野において認識される意味を付与される。
冠詞「a」及び「an」は、文脈により明らかにそうではないと指示されない限り、冠詞の文法的目的語の1つ又は1つより多く(すなわち少なくとも1つ)を指す。例として、「要素(an element)」は、1つの要素又は1つより多くの要素を意味する。
本明細書で使用される場合、特定の定義が別途提供されない場合、用語「置換された」は、重水素、ハロゲン(-F、-Cl、-Br、-I)、ヒドロキシ基(-OH)、アミノ基(-NH)、カルボキシル基(-COH)、置換若しくは非置換C1~C10アミン基、ニトロ基(-NO)、C1~C10アルキル基、C3~C10シクロアルキル基、C6~C12アリール基、C1~C10アルコキシ基、トリフルオロメチル基(-CF)等のC1~C10トリフルオロアルキル基、又は置換基若しくは化合物の少なくとも1つの水素の代わりにシアノ基(-CN)で置換された基を指す。
追加の態様は、一部は以下の明細書に記載され、一部は明細書から明らかになるであろう。
本開示の薬学的組成物を作製するのに有用な出発物質は、容易に商業的に入手可能であるか、又は当業者によって調製され得る。
本開示は、特定の位置で標的薬剤部分にコンジュゲートされた目的の部分を含有する療法エンハンサー薬剤を含む組成物に関する。
ある実施形態では、組成物であって、
式(P-II)の構造
P-N-LPM-MOI(P-II)
を有する第1の化合物であって、式中、
P-Nは、リジン残基を含むタンパク質薬剤部分であり、
PMは、リンカーであり、
MOIは、目的の部分である、第1の化合物と、
以下の構造
LG-OH(LG-I)
を有する第2の化合物であって、式中、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基である、第2の化合物と、を含む、組成物が提供される。
別の実施形態では、組成物は、
式(R-I)
LG-RG-LRM-MOI(R-I)
を有する第3の化合物であって、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基であり、式(LG-I)中のLGと同一であり、
RGは、反応性基であり、
RMは、リンカーであり、式(P-II)中と同一であり、
MOIは、目的の部分である、第3の化合物、
式(R-III)
HO-RG-LRM-MOI(R-III)
を有する第4の化合物、又はそれらの組み合わせを更に含む。
式(P-II)、(LG-I)、(R-I)、及び(R-III)の構造を有する上の化合物は、2020年11月18日に出願された国際出願第PCT/US20/61127号に詳細に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
標的
本開示を読んだ後、当業者は、本明細書に提供される技術が、様々な標的薬剤を多くの種類の目的の部分にコンジュゲートするのに有用であることを理解するであろう。一部の実施形態では、提供される技術は、タンパク質薬剤を、目的の様々な部分とコンジュゲートするために特に有用である。一部の実施形態では、標的薬剤は、タンパク質薬剤、核酸、若しくはそれらの組み合わせであるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、標的薬剤は、タンパク質薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、標的薬剤は、タンパク質薬剤である。一部の実施形態では、標的薬剤は、細胞、組織、器官又は生物における天然タンパク質である。一部の実施形態では、標的薬剤は、内因性タンパク質である。一部の実施形態では、標的薬剤は、外因性タンパク質である。一部の実施形態では、標的薬剤は、製造されたタンパク質、例えば、様々なバイオテクノロジーを使用して生成されたタンパク質である。一部の実施形態では、標的薬剤は、抗体薬剤である。一部の実施形態では、標的薬剤は、治療薬として有用な抗体である。様々なそのような抗体が当該技術分野で既知であり、標的薬剤として利用され得る。一部の実施形態では、抗体は、モノクローナル抗体である。一部の実施形態では、抗体は、ポリクローナル抗体である。一部の実施形態では、抗体は、IgG抗体である。一部の実施形態では、抗体は、IVIG(一部の実施形態では、健康なドナーからプールされる)である。一部の実施形態では、タンパク質は、Fc領域を含む。一部の実施形態では、抗体は、Fc領域を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、単一の重鎖又はその断片を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、2つの重鎖又はその断片を含む。一部の実施形態では、抗体は、ヒト抗体である。一部の実施形態では、抗体は、キメラ抗体である。一部の実施形態では、抗体は、ヒト化抗体である。一部の実施形態では、抗体は、マウス抗体である。
一部の実施形態では、ポリクローナル抗体薬剤又はIVIG薬剤を特性決定する場合、コンジュゲーションの前、最中、又は後のいずれかで、消化、例えば、IdeZ、IdeSなどを使用して酵素消化が行われ、その結果、抗体の特定の領域(例えば、Fab)が除去されて、(例えば、MSによって)特性決定のための改善された均一性を有する組成物が提供される。
一部の実施形態では、抗体は、治療用抗体、例えば、治療用途のためのFDA承認抗体である。一部の実施形態では、治療用抗体は、がんの治療に有用である。一部の実施形態では、抗体は、アダリムマブ、アレムツズマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、イピリムマブ、セツキシマブ、ダラツムマブ、ジヌツキシマブ、エロツズマブ、イブリツモマブチウキセタン、イムガツズマブ、インフリキシマブ、イピリムマブ、ネシツムマブ、オビヌツズマブ、オファツムマブ、ペルツズマブ、レスリズマブ、リツキシマブ、トラスツズマブ、モガムリズマブ、AMP-224、FS-102、GSK-2857916、ARGX-111、ARGX-110、AFM-13、APN-301、BI-836826、BI-836858、エノブリツズマブ、オトレルツズマブ(otlertuzumab)、ベルツズマブ、KHK-4083、BIW-8962、ALT-803、カロツキシマブ、エプラツズマブ、イネビリズマブ、イサツキシマブ、マルゲツキシマブ、MOR-208、オカラツズマブ、タラコツズマブ、トレメリムマブ、ベンラリズマブ、ルミリキシマブ、MOR-208、イフィバツズマブ(Ifibatuzumab)、GSK2831781、SEA-CD40、KHK-2823、又はBI836858である。一部の実施形態では、抗体は、リツキシマブ、バシリキシマブ、インフリキシマブ、セツキシマブ、シルツキシマブ、ジヌツキシマブ、アルテルトキサキシマブ(altertoxaximab)、ダクリズマブ、パリビズマブ、トラスツズマブ、アレムツズマブ、オマリズマブ、エファリズマブ、ベバシズマブ、ナタリズマブ、トシリズマブ、エクリズマブ、モガムリズマブ、ペルツズマブ、オビヌツズマブ、ベドリズマブ、ペムブロリズマブ、メポリズマブ、エロツズマブ、ダラツムマブ、イキセキズマブ、レスリズマブ、及びアテゾリズマブ、アダリムマブ、パニツムマブ、ゴリムマブ、ウステキヌマブ、カナキヌマブ、オファツムマブ、デノスマブ、イピリムマブ、ベリムマブ、ラキシバクマブ、ラムシルマブ、ニボルマブ、セクキヌマブ、エボロクマブ、アリロクマブ、ネシツムマブ、ブロダルマブ、又はオララツマブである。一部の実施形態では、抗体は、ダラツムマブである。一部の実施形態では、抗体は、セツキシマブである。一部の実施形態では、抗体薬剤部分を含む提供される化合物又は薬剤は、抗体薬剤によって治療され得る状態、障害又は疾患の治療に有用である。
抗体を本開示に従って、いくつかの技術で調製し得る。一部の実施形態では、抗体は、天然免疫グロブリンと比較して、操作された構造を有し得る。一部の実施形態では、抗体は、精製、同定、評価などのための特定のタグを含み得る。一部の実施形態では、抗体は、断片(例えば、CDR及び/又はFcなど)を含有してもよく、完全な免疫グロブリンを含有していなくてもよい。当業者は、本開示に抗体の部位が引用されている場合(例えば、K246、K248、K288、K290、K317など、別段の指示がない限り、EU番号付けによるヒト抗体)、アミノ酸残基は、正確な番号付けされた部位にない場合があるが、例えば、EU番号付けによるその番号付けされた部位及び/又は配列相同性(例えば、同じ又は異なる種の相同体)に対応する部位に存在する場合があることを理解する。
当業者には理解されるであろうが、なかでも、提供される技術は、天然標的(例えば、天然抗体)との指向性コンジュゲーションを提供することができる。一部の実施形態では、標的薬剤は、天然抗体薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、標的薬剤は、操作された抗体薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、標的薬剤(例えば、抗体)は、操作された非天然アミノ酸残基を含まない。
標的結合部分
式(LG-I)及び(R-I)の一部の実施形態では、
LGは、RLG-LLGであり、
LGは、
、R-(Xaa)z-、核酸部分、又は小分子部分であり、
各Xaaは、独立して、アミノ酸又はアミノ酸類似体の残基であり、
tは、0~50であり、
zは、1~50であり、
各Rは、独立して、-L-R’であり、
各Lは、独立して、共有結合、又はC~C20脂肪族若しくは1~5個のヘテロ原子を有するC~C20ヘテロ脂肪族から選択される任意選択的に置換された二価基であり、基の1つ以上のメチレン単位が、任意選択的に、かつ独立して、C(R’)-、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O)-、-S(O)N(R’)-、-C(O)S-、又は-C(O)O-で置き換えられており、
各-Cy-は、独立して、任意選択的に置換された二価の単環式、二環式、又は多環式基であり、各単環式環は、独立して、C3~20脂環式環、C6~20アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択され、
LGは、-LLG1-、-LLG1-LLG2-、-LLG1-LLG2-LLG3-、又は-LLG1-LLG2-LLG3-LLG4-であり、
RGは、-LRG1-LRG2-、-LLG4-LRG1-LRG2-、-LLG3-LLG4-LRG1-LRG2-、又は-LLG2-LLG3-LLG4-LRG1-LRG2-であり、
LG1、LLG2、LLG3、LLG4、LRG1、LRG2、及びLRMの各々は、独立して、Lであり、
各Lは、独立して、共有結合、又は1つ以上の脂肪族部分、アリール部分、各々が独立して1~20個のヘテロ原子を有するヘテロ脂肪族部分、各々が独立して1~20個のヘテロ原子を有するヘテロ芳香族部分、又はかかる部分のうちの任意の1つ以上の任意の組み合わせを含む、二価の任意選択的に置換された直鎖若しくは分岐C1~100基であり、基の1つ以上のメチレン単位が、任意選択的に、かつ独立して、C1~6アルキレン、C1~6アルケニレン、1~5個のヘテロ原子を有する二価のC1~6ヘテロ脂肪族基、-C≡C-、-Cy-、-C(R’)-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-C(O)C(R’)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O)-、-S(O)N(R’)-、-C(O)S-、-C(O)O-、-P(O)(OR’)-、-P(O)(SR’)-、-P(O)(R’)-、-P(O)(NR’)-、-P(S)(OR’)-、-P(S)(SR’)-、-P(S)(R’)-、-P(S)(NR’)-、-P(R’)-、-P(OR’)-、-P(SR’)-、-P(NR’)-、アミノ酸残基、又は-[(-O-C(R’)-C(R’)-)]-(式中、nは、1~20である)で置き換えられ、
各R’は、独立して、-R、-C(O)R、-COR、又は-SORであり、
各Rは、独立して、-Hであるか、又はC1~30脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC1~30ヘテロ脂肪族、C6~30アリール、C6~30アリール脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC6~30アリールヘテロ脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有する5~30員のヘテロアリール、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~30員のヘテロシクリルから選択される任意選択的に置換された基であるか、あるいは
2つのR基が、任意選択的に、かつ独立して、一緒になって共有結合を形成するか、又は
同一の原子上の2つ以上のR基が、任意選択的に、かつ独立して、原子と一緒になって、原子に加えて、0~10個のヘテロ原子を有する任意選択的に置換された3~30員の単環式、二環式、若しくは多環式の環を形成するか、又は
2つ以上の原子上の2つ以上のR基が、任意選択的に、かつ独立して、それらの介在原子と一緒になって、介在原子に加えて、0~10個のヘテロ原子を有する任意選択的に置換された3~30員の単環式、二環式、又は多環式の環を形成する。
一部の実施形態では、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分であるか、又はそれを含み、標的薬剤は、抗体薬剤である。
一部の実施形態では、LGは、Fc領域に結合する標的結合部分であるか、若しくはそれを含み、かつ/又はRLGは、DCAWXLGELVWCT(配列番号1)であるか、若しくはそれを含み、2つのシステイン残基が、任意選択的にジスルフィド結合を形成し、Xはアミノ酸残基である。
一部の実施形態では、LGは、式A-1~A-50の構造を有する標的結合部分であるか、又はそれを含む。
目的の部分
本開示を読む当業者は、本開示に従って、様々な種類の目的の部分を様々な目的のために利用することができることを理解するであろう。
一部の実施形態では、目的の部分は、検出可能な部分であるか、又はそれを含む。とりわけ、そのような部分は、検出、定量化、診断、治療などに有用であり得る。一部の実施形態では、目的の部分は、放射性標識であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、分光法によって検出することができる標識であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、FITC部分などのフルオロフォアであるか、又はそれを含む。
目的の部分は、医学的状態、障害、又は疾患に関与する特定の標的に対する親和性を有する部分であってもよい。一部の実施形態では、目的の部分は、治療薬剤部分であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、薬物部分、例えば、抗体-薬物コンジュゲート中の薬物部分であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、毒性薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、細胞傷害性薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、抗がん薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、抗がん薬剤は、化学療法薬剤である。
一部の実施形態では、目的の部分は、タンパク質、核酸、細胞などの他の薬剤と相互作用し、かつ/又はそれらを動員することができる部分であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、特定の細胞型、例えば、免疫細胞、疾患細胞などによって発現されるタンパク質と相互作用する。一部の実施形態では、目的の部分は、免疫細胞結合剤である。一部の実施形態では、目的の部分は、免疫細胞を動員する。一部の実施形態では、目的の部分は、例えば、所望の標的(例えば、がん細胞、抗原など)を除去し、死滅させ、及び/又は阻害するために、1つ以上の免疫活性を誘発し、促進し、及び/又は増強する。一部の実施形態では、目的の部分は、疾患細胞と相互作用し、動員し、及び/又は結合し、疾患細胞の除去、死滅、及び/又は阻害を誘発し、促進し、及び/又は増強する。
一部の実施形態では、目的の部分は、小分子薬剤であるか、又はそれを含む(例えば、そのタンパク質標的、細胞標的などに特異的に結合することができる)。一部の実施形態では、目的の部分は、ペプチド若しくはタンパク質薬剤(例えば、scFv、特定の標的に対するペプチド結合剤など)であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、核酸薬剤(例えば、オリゴヌクレオチド、mRNAなど)であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、炭水化物薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、脂質薬剤であるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、目的の部分は、タンパク質複合体(例えば、Fab)であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、フルオロフォアであるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、細胞傷害性小分子薬剤であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、細胞傷害性ペプチド薬剤であるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、目的の部分は、アジュバントである。当業者は、本開示に従って、様々なアジュバントを目的の部分として利用することができることを理解するであろう。一部の実施形態では、アジュバントは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、US2019/0015516に記載されているものである。一部の実施形態では、目的の部分は、免疫系を刺激する。
一部の実施形態では、目的の部分は、粒子であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、粒子は、ナノ粒子であるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、目的の部分は、核酸部分であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、オリゴヌクレオチドであるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、アプタマーであるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、目的の部分は、抗体薬剤である。一部の実施形態では、目的の部分は、抗体断片であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、標的結合部分が結合する領域を含有しない抗体薬剤部分である。一部の実施形態では、目的の部分は、Fc領域を含有しない抗体薬剤である。一部の実施形態では、目的の部分は、scFvであるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、scFvは、抗体標的薬剤とは異なる抗原についてのものである。
一部の実施形態では、目的の部分は、反応性部分、特に、生体直交型反応のための反応パートナーであるか、又はそれを含む。生体直交型反応のためのものを含む、好適な反応性部分は当該技術分野で広く知られており、本明細書で利用することができる。一部の実施形態では、生体直交型反応は、環化付加反応、例えば、クリック化学である。一部の実施形態では、目的の部分は、-N3であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、アルキンであるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、目的の部分は、COVID-19疾患に関与するSARS-CoV-2ウイルスに結合する部分であり得る。例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、SARS-CoV-2ウイルスに結合する部分は、L.Cao et al.,“De novo design of picomolar SARS-CoV-2 mini-protein inhibitors”Science 370,426-431(2020)に開示されるポリペプチドであってもよい。そのようなポリペプチド部分は、SARS-CoV-2スパイクタンパク質への結合、細胞の結合及び/又は感染の阻害、低減及び予防、SARS-CoV-2ウイルス及び/又はそれによって感染した細胞の阻害、死滅、及び除去などを引き起こし得る。SARS-CoV-2ウイルスと相互作用する様々な目的の部分は、2021年3月25日に出願された国際特許出願第PCT/US21/24186号、2021年2月6日に出願された米国仮特許出願第63/146584号、及び2021年4月30日に出願された米国仮特許出願第63/182098号に記載されており、それらの出願各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態では、目的の部分は、標的薬剤の1つ以上の特性及び/又は活性を改善する。一部の実施形態では、目的の部分は、安定性エンハンサーであるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、目的の部分は、標的薬剤の1つ以上の薬力学的特性及び/又は薬物動態学的特性を改善する。
一部の実施形態では、以下の条件
(a)目的の部分は、治療薬剤であるか、又はそれを含み、
(b)目的の部分は、タンパク質、核酸、若しくは細胞に結合することができる部分であるか、又はそれを含み、かつ/あるいは
(c)目的の部分は、生体直交型反応に好適な反応性部分であるか、又はそれを含む、のうちの少なくとも1つが満たされる。
一部の実施形態では、MOIは、治療薬剤部分であるか、又はそれを含み、かつ/又はMOIは、抗体薬剤であるか、又はそれを含む。
連結基
一部の実施形態では、部分は、リンカー部分を介して、互いに任意選択的に接続される。例えば、一部の実施形態では、反応性基(例えば、RG)は、リンカー(例えば、LRM)を介して、目的の部分(例えば、MOI)に接続されている。一部の実施形態では、部分(例えば、LG)はまた、様々な部分に連結するための1つ以上のリンカー、例えば、LLG1、LLG2、LLG3、LLG4などを含んでいてもよい。一部の実施形態では、LLGは、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LLG1は、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LLG2は、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LLG3は、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LLG4は、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LRMは、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LPMは、本明細書に記載のLである。一部の実施形態では、LPMは、本明細書に記載のリンカー部分である。一部の実施形態では、LPMは、本明細書に記載のLである。
様々な型のリンカー部分、及び/又は様々な目的のためのリンカー部分(例えば、抗体-薬物コンジュゲートに利用されるものなど)は、本開示に従って利用され得る。
リンカー部分は、それらがどのように使用されるかに応じて、二価又は多価のいずれかであり得る。一部の実施形態では、リンカー部分は、二価である。一部の実施形態では、リンカーは、多価であり、2つを超える部分を接続する。
一部の実施形態では、LLMは、1つ以上の-[(CH-O]-を含み、式中、各nは、独立して、1~20であり、mは、1~100である。
一部の実施形態では、LRMリンカーは、1つ以上の-[(CH-O]-を含み、式中、各nは、独立して、1~20であり、mは、1~100である。
反応性基
一部の実施形態では、提供される化合物(例えば、反応パートナーとして有用なもの)は、反応性基(例えば、RG)を含む。本明細書で例示されるように、多くの実施形態では、提供される化合物において、反応性基(例えば、RG)は、第1の基(例えば、LG)と目的の部分(例えば、MOI)との間に位置し、任意選択的に、かつ独立して、リンカーを介して、第1の基及び目的の部分に連結される。一部の実施形態では、RGは、本明細書に記載の反応性基である。
一部の実施形態では、本明細書に示されるように、反応性基は、標的結合部分を含まない化合物で利用される場合、ゆっくりと反応し、目的の部分と標的薬剤とのコンジュゲーションを低レベルでもたらし、一部の実施形態では、コンジュゲーションを実質的にもたらさない。本明細書に示されるように、例えば、式R-Iの化合物又はその塩におけるような、同じ化合物中の反応性基と標的結合部分との組み合わせは、とりわけ、反応性基と標的薬剤との間の反応を促進し、反応効率を増強し、副反応を低下させ、及び/又は反応選択性を改善することができる(例えば、目的の部分と標的薬剤とのコンジュゲーションが生じる標的部位に関して)。
提供される化合物中の反応性基は、標的薬剤中の様々な型の基と反応することができる。一部の実施形態では、提供される化合物中の反応性基は、標的薬剤のアミノ基、例えば、タンパク質のリジン残基の側鎖上の-NH基と選択的に反応する。一部の実施形態では、反応性基は、提供される化合物(例えば、式R-I又はその塩のもの)で利用される場合、標的薬剤の特定の部位、例えば、本明細書の例に示されるように、IgG1のK246、K248、K288、K290、K317など、IgG2の場合はK251、K253など、IgG4の場合はK239、K241のうちの1つ以上と選択的に反応する。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK246又はK248である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK246及び/又はK248である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK246である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK248である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK288又はK290である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK288である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK290である。一部の実施形態では、部位は、K317である。一部の実施形態では、部位は、抗体重鎖のK414である。一部の実施形態では、部位は、抗体軽鎖のK185である。一部の実施形態では、部位は、抗体軽鎖のK187である。一部の実施形態では、部位は、IgG2重鎖のK251及び/又はK253である。一部の実施形態では、部位は、IgG2重鎖のK251である。一部の実施形態では、部位は、IgG2重鎖のK253である。一部の実施形態では、部位は、IgG4重鎖のK239及び/又はK241である。一部の実施形態では、部位は、IgG4重鎖のK239である。一部の実施形態では、部位は、IgG4重鎖のK241である。一部の実施形態では、コンジュゲーションは、軽鎖部位にわたって1つ以上の重鎖部位で選択的に生じる。一部の実施形態では、標的結合部分を有しない技術については、コンジュゲーションは、重鎖部位よりも軽鎖部位で生じる(例えば、図15を参照されたい)。
一部の実施形態では、反応性基(例えば、RG)は、エステル基であるか、又はそれを含む。一部の実施形態では、反応性基(例えば、RG)は、求電子基(例えば、Michaelアクセプター)であるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、RGは、式-LLG2、-LLG2-LLG3-LLG4-LRG1-、又は-LRG1-LRG2-の基であり、
LG2は、-NH-、-NHC(O)-、-(CH-NHC(O)-、-(CH-OC(O)-、-(CH-OC(O)NH-、-C(O)-NHCH-、-C(O)-NHCHCH-、-C(O)O-CH-、又はNH-C(O)O-CH-であり、
LG3は、任意選択的に置換されたアリール環であり、
LG4-は、結合、-NH-又は-O-であり、
RG1は、-O-C(O)-、-C(O)-、-S(O)-、-OS(O)-、又は-OP(O(OR)-であり、
RG2は、-CH-C(O)-、-C(O)-、又は-CH-であり、
LGは、-(O)C-[(CHO](CHNH-、-(O)C-[(CHO](CHNH-、-[(CHO]NHC(O)[(CHO]NH-、-[(CHO]{NHC(O)[(CHO]NH-、-[(CHO]Cy[(CHO]NH-、-[(CHO]Cy[(CHO]NHC(O)[(CHO]NH-、又は-[(CHO]Cy[(CHO]{NHC(O)[(CHO]NH-であり、
式中、n、m、及びpは、各出現時に独立して1~12から選択される整数であり、Cyは、任意選択的に置換された環状基である。
一部の実施形態では、RGは、式-LLG2-LLG3-LLG4-LRG1の基であり、
から選択される。
一部の実施形態では、nは、各出現時に2である。
一部の実施形態では、反応性基は、-C(O)-O-又は-O-C(O)-であるか、又はそれを含む。
一部の実施形態では、反応性基は、任意選択的に-C(O)-O-又は-O-C(O)-に結合されたアリール基を含み、1つ以上の電子吸引基で置換されている。
一部の実施形態では、アリール基は、
の構造を有し、式中、Rは、独立して、各出現時に、ハロゲン、-NO、-F、-L-R’、-C(O)-L-R’、-S(O)-L-R’、-S(O)-L-R’、及び-P(O)(-L-R’)から選択され、R’は、H又はC~Cアルキルである。
組成物
一部の実施形態では、組成物は、第1の化合物及び第2の化合物を等モル量で含んでもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、50モルパーセント(mole%)以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、50mole%以下、45mole%以下、40mole%以下、35mole%以下、30mole%以下、25mole%以下、20mole%以下、15mole%以下、10mole%以下、又は5mole%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、5%以下、4%以下、3%以下、2%以下、又は1%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、1.0%以下、0.9%以下、0.8%以下、0.7%以下、0.6%以下、0.5%以下、0.4%以下、0.3%以下、0.2%以下、0.1%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、0.10%以下、0.09%以下、0.08%以下、0.07%以下、0.06%以下、0.05%以下、0.04%以下、0.03%以下、0.02%以下、0.01%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、0.010%以下、0.009%以下、0.008%以下、0.007%以下、0.006%以下、0.005%以下、0.004%以下、0.003%以下、0.002%以下、0.001%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、0.0010%以下、0.0009%以下、0.0008%以下、0.0007%以下、0.0006%以下、0.0005%以下、0.0004%以下、0.0003%以下、0.0002%以下、0.0001%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、0.00010%以下、0.00009%以下、0.00008%以下、0.00007%以下、0.00006%以下、0.00005%以下、0.00004%以下、0.00003%以下、0.00002%以下、0.00001%以下であってもよい。一部の実施形態では、第2の化合物の量は、組成物中の第1の化合物及び第2の化合物の総モル数に基づいて、0.000010%以下、0.000009%以下、0.000008%以下、0.000007%以下、0.000006%以下、0.000005%以下、0.000004%以下、0.000003%以下、0.000002%以下、0.000001%以下であってもよい。
一部の実施形態では、組成物は、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせを更に含んでもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、5%以下、4%以下、3%以下、2%以下、又は1%以下であってもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、1.0%以下、0.9%以下、0.8%以下、0.7%以下、0.6%以下、0.5%以下、0.4%以下、0.3%以下、0.2%以下、0.1%以下であってもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、0.10%以下、0.09%以下、0.08%以下、0.07%以下、0.06%以下、0.05%以下、0.04%以下、0.03%以下、0.02%以下、0.01%以下であってもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、0.010%以下、0.009%以下、0.008%以下、0.007%以下、0.006%以下、0.005%以下、0.004%以下、0.003%以下、0.002%以下、0.001%以下であってもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、0.0010%以下、0.0009%以下、0.0008%以下、0.0007%以下、0.0006%以下、0.0005%以下、0.0004%以下、0.0003%以下、0.0002%以下、0.0001%以下であってもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、0.00010%以下、0.00009%以下、0.00008%以下、0.00007%以下、0.00006%以下、0.00005%以下、0.00004%以下、0.00003%以下、0.00002%以下、0.00001%以下であってもよい。一部の実施形態では、第3の化合物、第4の化合物、又はそれらの組み合わせの量は、組成物中の第1の化合物のモル数に基づいて、0.000010%以下、0.000009%以下、0.000008%以下、0.000007%以下、0.000006%以下、0.000005%以下、0.000004%以下、0.000003%以下、0.000002%以下、0.000001%以下であってもよい。
別の実施形態では、組成物であって、
式(P-II)の構造
P-N-LPM-MOI(P-II)
を有する第1の化合物であって、式中、
P-Nは、リジン残基を含むタンパク質薬剤部分であり、
PMは、リンカーであり、
MOIは、目的の部分である、第1の化合物と、
以下の構造
LG-OH(LG-I)
を有する第2の化合物であって、式中、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基である、第2の化合物、及び
式(R-I)
LG-RG-LRM-MOI(R-I)
を有する第3の化合物であって、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基であり、式(LG-I)中のLGと同一であり、
RGは、反応性基であり、
RMは、リンカーであり、式(P-II)中と同一であり、
MOIは、目的の部分である、第3の化合物のうちの少なくとも1つと、を含む、組成物が提供される。
別の実施形態では、組成物は、
式(R-III)
HO-RG-LRM-MOI(R-III)
を有する第4の化合物、又はそれらの組み合わせを更に含み得る。
本発明は、以下の非限定的な例によって更に例示される。
実施例1.以下の薬剤I-29、I-30、I-31、I-32、I-33、I-34、I-35、I-36を調製するための特定の技術。
一部の実施形態では、本開示は、MATE薬剤及びその組成物を調製するための技術を提供する。一部の実施形態では、提供される技術は、複数の抗体薬剤(例えば、Gamunex-CなどのIVIG組成物)を含む組成物を、各々が標的結合部分、抗体結合部分、及びその間の反応性基(及びそのような部分を連結する任意選択的なリンカー部分)を含む複数の薬剤(例えば、I-3、I-7、I-8、I-15、I-19、I-20、I-21、I-22、I-23など)を含む組成物と反応させることを含む。例として以下に記載するのは、特定のMATE薬剤の調製物及びその組成物である。
1.反応/コンジュゲーションプロトコル。
1.1 IVIG緩衝液の交換
Gamunex-C(1mL、約100mg/mL)を、MWCO 30kDaのAmicon-15mL単位を使用して、50mMのホウ酸塩pH8.2に緩衝液交換した。緩衝液交換されたIVIGのタンパク質濃度を、280nmで消衰係数1.41mL・mg-1cm-1を使用して、UV-Visによって決定した。50mMのホウ酸緩衝液pH8.2を使用して、緩衝液交換されたIVIGを20mg/mLに調節した。
1.2 試薬ストック溶液の調製
試薬を個別に秤量し、ストック溶液を調製するために使用されるDMSO体積は、以下のように計算される。
DMSO体積(mL)=(固形物重量(mg)/分子量)×純度(%)/5mM×10
試薬の特定の調製に関するデータを以下に示す。
試薬I-7、I-8、I-15、I-19、I-20、I-21、I-22、及びI-23の構造を以下に示す。
1.3 コンジュゲーション反応の設定
I-29、I-30、I-31、I-32、I-34、I-35、I-36についての手順:
50mMのホウ酸塩pH8.2(4mg、20mg/mL、200μL)中のIVIGに、試薬(DMSO中5mM、13.3μL、2.5当量)を添加した。反応物を十分に混合し、室温で一晩回転させた。
I-33についての手順:
50mMのホウ酸塩pH8.2(2.62mg、20mg/mL、130.8μL)中のIVIGに、試薬(DMSO中5mM、8.7μL、2.5当量)を添加した。反応物を十分に混合し、室温で一晩回転させた。以下の表は、以下のセクションで更に詳細に説明される各MATE試薬を生成するために使用されるMATE試薬を示す。
上の手順の各々において、薬剤I-29、I-30、I-31、I-32、I-33、I-34、I-35、I-36に加えて、反応混合物は、薬剤I-29、I-30、I-31、I-32、I-33、I-34、I-35、及びI-36と等モル量で形成された以下の生成物を含んでいた。
2.精製
粗混合物を、2サイクルのために、アミコン-4mL MWCO 30kDa中の50mMのグリシンpH2.2と緩衝液交換した。次いで、2サイクルのために、アミコン-4mL MWCO 30kDa中のPBSに緩衝液交換した。不溶性の白色沈殿物が、フィルターの底部に観察された。一部の実施形態では、放出された抗体結合部分を酸性条件下で除去した。
8つの試料からの溶液及び沈殿物を、それぞれ、1.5mLのチューブに集め、16000gで5分間遠心分離した。透明な上清を注意深く集めた。上清中のタンパク質コンジュゲートの濃度を、消衰係数1.41mL・mg-1cm-1を使用して、UV-Vis Nanodrop機器によって決定した。特定の調製物からのタンパク質コンジュゲートの濃度、体積、及び収率を以下の表に示す。
最終MATE薬剤濃度を1.5~3.0mg/mLの範囲に調節するために、3.0mg/mLを標的として、全てのコンジュゲートをPBSで希釈した。一部の実施形態では、PBSを添加すると、一部又は全ての試料に白色沈殿物が迅速に形成されることが観察された。コンジュゲートを回収するために、それらの試料を、16000gで3分間遠心分離した。透明な上清を注意深く集めた。上清中のタンパク質コンジュゲートの濃度を、消衰係数1.41mL・mg-1cm-1を使用して、UV-Vis Nanodrop機器によって決定した。特定の調製物からの最終コンジュゲートの濃度、体積、及び収率を、以下の表に要約する。
3.DAR(標的結合部分/抗体部分の比)決定のための分析方法
MATEコンジュゲート(50μg)を、10×グリコール緩衝液2(0.1×総体積)、1μLのIdeZ及び1μLのPNGase Fとともに、37℃で1時間インキュベートした。次いで、8μgの試料を取り出し、水で50倍に希釈した。注入量は、所望のシグナルに応じて、2μL又は3μLであった。
機器:
LC:Waters Acquity UPLCタンパク質BEH C4カラム(300Å、17μm×2.1mm×50mm)
MS:Waters Xevo G2-QTOF
処理ソフトウェア:MassLynx
移動A:水+0.1%ギ酸
移動B:アセトニトリル+0.1%ギ酸
データ分析:総イオンクロマトグラム(TIC)が得られる。スペクトル分析のために、TIC領域が選択される。領域は、バイアスなしでコンジュゲートFc及び非コンジュゲートFcの両方を包含するように選択される。TICからMSプロファイルを取得する。デコンボリューションのために、電荷状態エンベロープが選択される。生スペクトルは、MaxEnt1デコンボリューションツールを使用してデコンボリューションされ、ゼロ電荷スペクトルが得られる。BAR(抗体当たりのFc×Fcにおける結合剤分布比)は、以下の式を使用して計算される。
BAR=[1(Fcコンジュゲート))/[1(Fcコンジュゲート)+1(Fc非コンジュゲート)]×2
m/z 8000~30000、解像度1.50でデコンボリューションする。LC-MS分析によるDARの結果を以下に示す。
本出願全体を通して、様々な刊行物が、著者名及び日付、又は特許番号若しくは特許公開番号によって参照される。これらの刊行物の開示は、本明細書に記載されており、かつ本明細書で特許請求される本発明の日付の時点で当業者に既知の最先端技術をより完全に説明するために、参照によりそれらの全体が本出願に組み込まれる。しかしながら、本明細書における参考文献の引用は、そのような参考文献が先行技術であるという認識として解釈されるべきではない。
当業者は、日常的な実験のみを使用して、本明細書に記載される特定の手順に対する多数の均等物を認識するか、又は確認することができるであろう。かかる均等物は、本開示の範囲内であるとみなされ、以下の特許請求の範囲により網羅される。例えば、本明細書の説明及び実施例で具体的に開示されるもの以外の薬学的に許容される塩を用いることができる。更に、項目のリスト内の特定の項目、又は項目のより大きい群内の項目のサブセット群を、他の特定の項目、項目のサブセット群、又は項目のより大きい群と組み合わせることが、かかる組み合わせを特定する本明細書の特定の開示の有無にかかわらず可能であるよう意図されている。
実施例2.薬物抗体比(DAR)、DAR分布、及びMATE試薬関連不純物を決定するための分析方法
a.DAR種の定量化及び不純物の同定
以下のUPLC分析方法は、異なるDARを有する種及びMATE試薬関連不純物の同時測定を可能にする。薬物基質/薬物製品(DR/DP)及びDAR/DAR分布は、個々のDAR構成要素のHPLC/UV280nmシグナル面積に基づいて計算される。MATE試薬関連DS/DP不純物含有量(MATE試薬、MATEリンカー及びユニバーサル抗体結合末端(uABT))は、DS/DPタンパク質濃度に対する試料不純物濃度の比率(不純物の重量%/タンパク質の重量%として報告される)として決定される。UPLCシグナルの同一性は、タンパク質及び個々の不純物のRS及びLCMS分析によって確認した。代表的なUPLC/UV280トレースは、図1に化合物I-36について示されている。DSは、所望の生成物(MATE)であり、不純物は、その生成物の重量%(DS/DP)として表される。
UPLC法は、WATERS ACQUITY UPLCシステム、UV280nm検出で行われる。MS検出器は、WATERS XEVO G2-XS QTof検出器である。この検出器は、種の分子量決定に使用される。オートサンプラは、22~23℃の周囲条件で機能する。カラム温度80℃を有するHALO 1000Å Diphenylカラム、2.7μm、2.1×50mmを使用する。流速は0.5mL/分である。移動相Aは、0.5%トリフルオロ酢酸であり、移動相Bは、0.05%トリフルオロ酢酸を含むアセトニトリルである。
不純物分析及びDAR分析方法のためのWaters Xevo G2-XS QTof検出器に関するMS検出器設定を表2に示す。
DS/DP試料を、DMSO:水希釈ビヒクルにおける50倍のDS/DP希釈(6:94v/v)に対応する、およそ1.5mg/mLのタンパク質濃度に希釈する。I-36などの試料を-20℃で保存した。試料を解凍し、およそ2時間かけて周囲温度に平衡化する。試料を1~2分間、ボルテックス撹拌する。希釈ビヒクル(DMSO:水=6:94)中で標的濃度(タンパク質1.5mg/mL)に希釈する。希釈された試料は、分析まで室温で保存し、分析は試料希釈の4時間以内に完了されるべきである。代替的に、希釈した試料を分析前に2~8℃で24時間保存し得る。希釈した試料を2~8℃で保存する場合、試料を30分間かけて室温に平衡化させ、次いで、使用前に1~2分間ボルテックス撹拌する必要がある。
b.I-36薬物抗体比(DAR)及びDAR分布分析
前のセクションに示すUPLC法、検出器パラメータ、及び試料調製方法を使用して、I-36調製物についてDAR及びDAR分布を決定する。DAR種を定量化する前に、(i)非コンジュゲートIVIG、(ii)非コンジュゲートIVIGを含むMATE不純物のプール標準のUPLCスペクトルを得る。これらのスペクトルを図2A~Cに示す。データを表3及び4に示す。
b.MATE不純物分析のためのUPLC法(1)較正曲線の調製
プールされた標準ストック溶液(PLストック)を以下のように調製する。個々のuABT、MATE試薬(MR)及びMATE-リンカー標準(STD)ストック溶液を、DMSO中で、2.00mg/mLのSTDストック溶液濃度で調製する。等体積の個々の1mg/mLのDMSOストック溶液を合わせる。得られた個々のプールされたストック溶液濃度は、0.667mg/mL(PLストック)である。DMSO標準ストック溶液を-70℃で最長1ヶ月保管する。
MATE反応中に形成されるほとんどの不純物を定量するために、個々の不純物濃度範囲が0.004mg/mL~0.04mg/mL(又は、5uLの注入体積に対して0.02ug/注入~0.2ug/注入)である較正曲線が必要である。DMSO溶液を周囲温度で解凍し、次いで、十分にボルテックス撹拌する。IVIG作業ストック(82.5mg/mL)は、165mg/mLのIVIG参照物質を水で2倍に希釈することによって調製される。較正曲線基準は、表5に従う。6%のDMSO濃度及び一定のIVIG:プール不純物の比率(w/w)が、全てのキャリブレータについて維持される。キャリブレータ溶液を、周囲温度で保存する。較正溶液の安定性は限られているため、キャリブレータ調製後4時間以内に測定を実施する必要がある。
(2)DS/DP試料の取り扱い
希釈したDS/DP試料は、少なくとも2時間安定である。表6に示される希釈された試料の再現性の研究に続いて、不純物分析のために50倍のDS/DP試料希釈液を選択した。
較正曲線は、個々の不純物及びプールされた不純物について再現可能であることが分かった。uABT、MATE-リンカー、及びMATE試薬試料の較正曲線データを図3に示す。I-36/I-20のuABT、MATE-リンカー、及びMATE試薬の較正曲線計算因子を較正曲線から抽出し、表7に提示する。
表7に示す較正曲線計算因子を使用して、I-36コンジュゲーション反応を2回繰り返した場合の不純物を計算した。結果を、表8にまとめている。総タンパク質濃度は、タンパク質較正曲線を使用して確立された。

Claims (20)

  1. 組成物であって、
    式(P-II)の構造
    P-N-LPM-MOI(P-II)
    を有する第1の化合物であって、式中、
    P-Nは、リジン残基を含むタンパク質薬剤部分であり、
    PMは、リンカーであり、
    MOIは、目的の部分である、第1の化合物と、
    以下の構造
    LG-OH(LG-I)
    を有する第2の化合物であって、式中、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基である、第2の化合物と、を含む、組成物。
  2. 式(R-I)
    LG-RG-LRM-MOI(R-I)
    を有する第3の化合物であって、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基であり、式(LG-I)中のLGと同一であり、
    RGは、反応性基であり、
    RMは、リンカーであり、式(P-II)中と同一であり、
    MOIは、目的の部分である、第3の化合物、
    式(R-III)
    HO-RG-LRM-MOI(R-III)
    を有する第4の化合物、又はそれらの組み合わせを更に含む、請求項1に記載の組成物。
  3. LGは、RLG-LLGであり、
    LGは、
    、 R-(Xaa)z-、核酸部分、又は小分子部分であり、
    各Xaaは、独立して、アミノ酸又はアミノ酸類似体の残基であり、
    tは、0~50であり、
    zは、1~50であり、
    各Rは、独立して、-L-R’であり、
    各Lは、独立して、共有結合、又はC~C20脂肪族若しくは1~5個のヘテロ原子を有するC~C20ヘテロ脂肪族から選択される任意選択的に置換された二価基であり、前記基の1つ以上のメチレン単位が、任意選択的に、かつ独立して、C(R’)-、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O)-、-S(O)N(R’)-、-C(O)S-、又は-C(O)O-で置き換えられており、
    各-Cy-は、独立して、任意選択的に置換された二価の単環式、二環式、又は多環式基であり、各単環式環は、独立して、C3~20脂環式環、C6~20アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択され、
    LGは、-LLG1-、-LLG1-LLG2-、-LLG1-LLG2-LLG3-、又は-LLG1-LLG2-LLG3-LLG4-であり、
    RGは、-LRG1-LRG2-、-LLG4-LRG1-LRG2-、-LLG3-LLG4-LRG1-LRG2-、又は-LLG2-LLG3-LLG4-LRG1-LRG2-であり、
    LG1、LLG2、LLG3、LLG4、LRG1、LRG2、及びLRMの各々は、独立して、Lであり、
    各Lは、独立して、共有結合、又は1つ以上の脂肪族部分、アリール部分、各々が独立して1~20個のヘテロ原子を有するヘテロ脂肪族部分、各々が独立して1~20個のヘテロ原子を有するヘテロ芳香族部分、又はかかる部分のうちの任意の1つ以上の任意の組み合わせを含む、二価の任意選択的に置換された直鎖若しくは分岐C1~100基であり、前記基の1つ以上のメチレン単位が、任意選択的に、かつ独立して、C1~6アルキレン、C1~6アルケニレン、1~5個のヘテロ原子を有する二価のC1~6ヘテロ脂肪族基、-C≡C-、-Cy-、-C(R’)-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-C(O)C(R’)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O)-、-S(O)N(R’)-、-C(O)S-、-C(O)O-、-P(O)(OR’)-、-P(O)(SR’)-、-P(O)(R’)-、-P(O)(NR’)-、-P(S)(OR’)-、-P(S)(SR’)-、-P(S)(R’)-、-P(S)(NR’)-、-P(R’)-、-P(OR’)-、-P(SR’)-、-P(NR’)-、アミノ酸残基、又は-[(-O-C(R’)-C(R’)-)]-(式中、nは、1~20である)で置き換えられ、
    各R’は、独立して、-R、-C(O)R、-COR、又は-SORであり、
    各Rは、独立して、-Hであるか、又はC1~30脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC1~30ヘテロ脂肪族、C6~30アリール、C6~30アリール脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC6~30アリールヘテロ脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有する5~30員のヘテロアリール、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~30員のヘテロシクリルから選択される任意選択的に置換された基であるか、あるいは
    2つのR基が、任意選択的に、かつ独立して、一緒になって共有結合を形成するか、又は
    同一の原子上の2つ以上のR基が、任意選択的に、かつ独立して、前記原子と一緒になって、前記原子に加えて、0~10個のヘテロ原子を有する任意選択的に置換された3~30員の単環式、二環式、若しくは多環式の環を形成するか、又は
    2つ以上の原子上の2つ以上のR基が、任意選択的に、かつ独立して、それらの介在原子と一緒になって、前記介在原子に加えて、0~10個のヘテロ原子を有する任意選択的に置換された3~30員の単環式、二環式、又は多環式の環を形成する、請求項1又は2に記載の組成物。
  4. LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分であるか、又はそれを含み、前記標的薬剤は、抗体薬剤である、請求項1又は2に記載の組成物。
  5. LGは、Fc領域に結合する標的結合部分であるか、若しくはそれを含み、かつ/又はRLGは、DCAWXLGELVWCT(配列番号1)であるか、若しくはそれを含み、2つのシステイン残基が、任意選択的にジスルフィド結合を形成し、Xはアミノ酸残基である、請求項3に記載の組成物。
  6. 以下の条件
    (a)前記目的の部分は、治療薬剤であるか、又はそれを含み、
    (b)前記目的の部分は、タンパク質、核酸、若しくは細胞に結合することができる部分であるか、又はそれを含み、かつ/あるいは
    (c)前記目的の部分は、生体直交型反応に好適な反応性部分であるか、又はそれを含む、のうちの少なくとも1つが満たされる、請求項3に記載の組成物。
  7. LGは、本明細書に示される式A-1~A-50の構造を有する標的結合部分であるか、又はそれを含む、請求項1又は2に記載の組成物。
  8. MOIは、治療薬剤部分であるか、若しくはそれを含み、かつ/又はMOIは、抗体薬剤であるか、若しくはそれを含む、請求項1又は2に記載の組成物。
  9. LMは、1つ以上の-[(CH-O]-を含み、式中、各nは、独立して1~20であり、mは1~100である、請求項1に記載の組成物。
  10. RMリンカーは、1つ以上の-[(CH-O]-を含み、式中、各nは、独立して1~20であり、mは1~100である、請求項2に記載の組成物。
  11. RGは、式-LLG2、-LLG2-LLG3-LLG4-LRG1-、又は-LRG1-LRG2-の基であり、式中、
    LG2は、-NH-、-NHC(O)-、-(CH-NHC(O)-、-(CH-OC(O)-、-(CH-OC(O)NH-、-C(O)-NHCH-、-C(O)-NHCHCH-、-C(O)O-CH-、又は-NH-C(O)O-CH-であり、
    LG3は、任意選択的に置換されたアリール環であり、
    LG4-は、結合、-NH-又は-O-であり、
    RG1は、-O-C(O)-、-C(O)-、-S(O)-、-OS(O)-、又は-OP(O(OR)-であり、
    RG2は、-CH-C(O)-、-C(O)-、又は-CH-であり、
    LGは、-(O)C-[(CHO](CHNH-、-(O)C-[(CHO](CHNH-、-[(CHO]NHC(O)[(CHO]NH-、-[(CHO]{NHC(O)[(CHO]NH-、-[(CHO]Cy[(CHO]NH-、-[(CHO]Cy[(CHO]NHC(O)[(CHO]NH-、又は-[(CHO]Cy[(CHO]{NHC(O)[(CHO]NH-であり、
    式中、n、m、及びpは、各出現時に独立して1~12から選択される整数であり、Cyは、任意選択的に置換された環状基である、請求項1又は2に記載の組成物。
  12. RGは、式-LLG2-LLG3-LLG4-LRG1の基であり、
    から選択される、請求項11に記載の組成物。
  13. nは、各出現時に2である、請求項11に記載の組成物。
  14. 前記反応性基は、-C(O)-O-若しくは-O-C(O)-であるか、又はそれを含む、請求項11に記載の組成物。
  15. 前記反応性基は、任意選択的に-C(O)-O-又は-O-C(O)-に結合されたアリール基を含み、1つ以上の電子吸引基で置換されている、請求項11に記載の組成物。
  16. 前記アリール基は、
    の構造を有し、式中、Rは、独立して、各出現時に、ハロゲン、-NO、-F、-L-R’、-C(O)-L-R’、-S(O)-L-R’、-S(O)-L-R’、及び-P(O)(-L-R’)から選択され、R’は、H又はC~Cアルキルである、請求項11に記載の組成物。
  17. 前記第1の化合物及び前記第2の化合物が、等モル量で存在する、請求項2に記載の組成物。
  18. 式(R-I)において、
    前記標的薬剤は、K246又はK248を含むIgG重鎖を含む抗体であり、
    前記標的結合部分は、前記反応性基を前記IgG重鎖のK246又はK248に近接させて、K246又はK248と前記反応性基との間の反応を可能にし、K246又はK248に対するLRM-MOIを含む部分の接続、及び前記化合物から標的結合部分を含有する基の除去をもたらすように、前記抗体に結合するように構成されている、請求項2に記載の組成物。
  19. 組成物であって、
    式(P-II)の構造
    P-N-LPM-MOI(P-II)
    を有する第1の化合物であって、式中、
    P-Nは、リジン残基を含むタンパク質薬剤部分であり、
    PMは、リンカーであり、
    MOIは、目的の部分である、第1の化合物と、
    以下の構造
    LG-OH(LG-I)
    を有する第2の化合物であって、式中、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基である、第2の化合物、
    式(R-I)
    LG-RG-LRM-MOI(R-I)
    を有する第3の化合物であって、LGは、標的薬剤に結合する標的結合部分を含む基であり、式(LG-I)中のLGと同一であり、
    RGは、反応性基であり、
    RMは、リンカーであり、式(P-II)中と同一であり、
    MOIは、目的の部分である、第3の化合物のうちの少なくとも1つと、を含む、組成物。
  20. 式(R-III)
    HO-RG-LRM-MOI(R-III)
    を有する第4の化合物、又はそれらの組み合わせを更に含む、請求項19に記載の組成物。
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