JP2024512004A - 操作されたキメラ融合タンパク質組成物およびその使用方法 - Google Patents
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Abstract
罹患細胞などの標的細胞上の表面分子に結合することが可能な結合性ドメインを有するキメラ融合タンパク質を発現する操作された骨髄細胞などの操作された細胞を作製および使用するための組成物および方法。【選択図】図1C
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関連出願の相互参照
[0001]本出願は、それらの各々が、参照によりその全体において本明細書に組み込まれる、2021年3月17日に出願された、米国特許仮出願第63/162,352号、2021年4月9日に出願された、米国特許仮出願第63/172,922号、2021年9月14日に出願された、米国特許仮出願第63/243,947号、および2021年10月14日に出願された、米国特許仮出願第63/255,540号の利益を主張する。
[0001]本出願は、それらの各々が、参照によりその全体において本明細書に組み込まれる、2021年3月17日に出願された、米国特許仮出願第63/162,352号、2021年4月9日に出願された、米国特許仮出願第63/172,922号、2021年9月14日に出願された、米国特許仮出願第63/243,947号、および2021年10月14日に出願された、米国特許仮出願第63/255,540号の利益を主張する。
[0002]細胞免疫療法は、がんおよび遷延性の感染症など、処置が困難な疾患に対抗し、また、他の処置形態に不応性である、ある特定の疾患にも対抗するための、有望な新技術である。CAR-T細胞の発見、および免疫療法における、それらの潜在的な使用により、大きなブレークスルーが生じた。CAR-T細胞とは、キメラ抗原受容体を発現するTリンパ球であって、T細胞を、がん細胞など、特異的罹患細胞へと標的化する一助となり、援用される細胞内ドメイン、および共発現される免疫抑制性サイトカインに応じて、標的がん細胞を死滅させるように意図された細胞傷害性応答を誘導する場合もあり、免疫抑制および/または免疫寛容を誘導する場合もある、Tリンパ球である。CAR T細胞は、なおも、がん治療のための、有望なツールであり続けるが、途上における、いくつかの限界が、CAR-T細胞における進歩を遅延させ、臨床試験におけるその有望性を減殺している。
[0003]CAR-T細胞の限界を理解することは、技術を利用し、良好な免疫療法モデルへの革新を持続するための鍵である。具体的には、T細胞悪性腫瘍において、CAR-T細胞は、大きな問題に直面していると考えられる。CAR-T細胞と、悪性T細胞とは、大半のT細胞リンパ腫(TCL)において、表面抗原を共有するため、CAR-T細胞は、がん細胞と同様に、細胞傷害作用下に置かれる。一部の場合に、CAR-T生成物は、悪性T細胞により夾雑される場合がある。加えて、T細胞無形成は、CAR-T細胞の存続の延長のために、潜在的な問題である。他の限界は、CAR-T細胞が、それらの抗腫瘍潜勢力を下方調節するように作用する、充実性腫瘍および強力な腫瘍微小環境へと浸透する能力の乏しさを含む。CAR-T細胞機能はまた、内因性T細胞の不活化および疲弊をもたらす、免疫抑制性腫瘍微小環境(TME)による負の影響も受ける。
[0004]マクロファージを含む骨髄細胞は、骨髄系統に由来する細胞であり、自然免疫系に属する。骨髄細胞は、血液へと逸出し、組織へと遊走する、骨髄幹細胞に由来する。それらの主要な機能のうちの一部は、貪食、T細胞応答の活性化、ならびに細胞破砕物および細胞外マトリックスの除去を含む。骨髄細胞はまた、ホメオスタシスの維持、ならびに炎症の惹起および消失においても、重要な役割を果たす。さらに、骨髄細胞は、それらが、周囲の微小環境から受け取る刺激の種類に応じて、炎症促進性~抗炎症性の範囲にわたる、異なる応答を提示しうる、マクロファージを含む、多数の下流細胞へと分化しうる。さらに、組織マクロファージは、CD8+ Tエフェクター細胞およびCD4+ Tエフェクター細胞、NK細胞、および制御性T細胞を含む、他の免疫細胞型に対して、広範な、調節および活性化の役割を果たすことが示されている。マクロファージは、悪性腫瘍内の、主要な免疫浸潤物であることが示されており、エフェクターの免疫浸潤および免疫機能に対して、広範な免疫抑制効果を及ぼすことも示されている。
[0005]骨髄細胞の多様な機能性は、骨髄細胞を、多数の治療効果を及ぼすように操作されうる、理想的な細胞治療剤候補とする。本開示は、免疫系の骨髄細胞(例えば、CD14+細胞)、特に、貪食細胞を使用する免疫療法に関する。骨髄細胞を使用する、多数の治療適応が想定されうるであろう。例えば、骨髄細胞による免疫療法は、がん、自己免疫、線維性疾患、および感染症において、極めて重要でありうるであろう。本開示は、免疫系の貪食細胞、特に、単球を含む骨髄細胞を使用する免疫療法に関する。骨髄細胞のこれらの機能のうちの1つまたは複数を、治療的使用のために利用することは、本明細書で開示される本発明の目的である。例えば、操作された骨髄細胞を含む骨髄細胞の貪食活性を、治療的使用のために利用することは、本明細書で開示される本発明の目的である。例えば、操作された骨髄細胞を含む骨髄細胞が、T細胞の活性化を促進する能力を利用することは、本明細書で開示される本発明の目的である。例えば、操作された骨髄細胞を含む骨髄細胞が、腫瘍殺滅分子の分泌を促進する能力を利用することは、本明細書で開示される本発明の目的である。例えば、操作された骨髄細胞を含む骨髄細胞が、免疫細胞および免疫分子の動員および輸送を促進する能力を利用することは、本明細書で開示される本発明の目的である。一態様では、本開示は、骨髄細胞内で発現されると、骨髄細胞が、分子、分子アセンブリー、対象物、または標的、例えば、その表面上の標的抗原を含む細胞の、標的化された攻撃および貪食を駆動する、新たで有用なキメラ構築物を提供する。本開示の多くの様相のうちの1つは、(i)骨髄細胞(例えば、新たな改善キメラ構築物を発現する、操作された骨髄細胞)の貪食能を増強し;標的(例えば、標的抗原)に対して、組織的かつ持続的な免疫応答を惹起する一助となることである。本開示は、骨髄細胞の機能的側面を増強することに加えて、細胞の分化能、その成熟可能性、および/または可塑性を損なわないことを目的として、骨髄細胞にトランスフェクトもしくは形質導入するか、または骨髄細胞内の遺伝子改変を、他の形で誘導するのに成功しうる、新規の方法および組成物を提示する。結果として得られる細胞は、治療的に有効な、操作された骨髄細胞またはエフェクター骨髄細胞と称されうる。本明細書で記載される改善のための、1つの戦略は、骨髄細胞の炎症性表現型を、エフェクター骨髄細胞を発生させるように誘導することである。1つの戦略は、標的との係合時に、炎症性表現型を帯びることが可能である、エフェクター骨髄細胞を作出することである。一態様では、エフェクター骨髄細胞は、その標的への係合時に、骨髄細胞内のI型インターフェロン応答を誘導または活性化することが可能である。別の戦略は、骨髄細胞内のI型インターフェロン応答を強化して、これらの細胞を、エフェクター骨髄細胞へと発生させることである。炎症性表現型を誘導するための、1つの戦略は、その標的への係合時に、エフェクター骨髄細胞内のNF-kB応答を誘導または活性化することである。生体試料から分離された骨髄細胞を、本明細書で記載される免疫療法のためのエフェクター骨髄細胞へと発生させるための、1つの戦略は、骨髄細胞内のI型インターフェロン応答もしくはNFカッパB応答またはこれらの両方を誘導および/または強化することである。
[0006]本開示は、がん細胞および感染細胞などの罹患細胞を、直接的に、かつ/または間接的に攻撃し、これらを死滅させうる(ATAK)、マクロファージまたは他の貪食細胞など、操作された骨髄細胞(例えば、CD14+細胞)の作製および使用を伴う。マクロファージおよび他の貪食細胞などの操作された骨髄細胞は、組換え核酸技術、合成核酸、遺伝子編集法(例えば、CRISPR)、形質導入(例えば、ウイルス構築物を使用する)、電気穿孔、またはヌクレオフェクションを使用して、例えば、疾患関連抗原(例えば、がん抗原)に特異的な細胞外結合性ドメインを有する、キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする核酸配列(例えば、mRNA、DNA、プラスミド、ウイルス構築物)を、細胞へと組み込むことにより調製されうる。骨髄細胞は、広範かつ多様な範囲の活性を及ぼすように操作されうることが見出されている。例えば、骨髄細胞は、広範かつ多様な範囲の活性を及ぼすのに、抗原結合性ドメインを含有するキメラ融合タンパク質(CFP)を発現するように操作されうることが見出されている。例えば、骨髄細胞は、CFPの標的細胞上の抗原への結合時に、細胞が、標的細胞の貪食の増大を呈するよう、貪食活性が増強されるように操作されうることが見出されている。また、骨髄細胞は、CFPの標的細胞上の抗原への結合時に、細胞が、腫瘍微小環境内のT細胞などのT細胞の活性化を促進するよう、T細胞の活性化を促進するように操作されうることも見出されている。操作された骨髄細胞は、CFPの、標的細胞上の抗原への結合時に、細胞が、近傍の細胞からの、腫瘍殺滅分子の分泌を促進するよう、腫瘍殺滅分子の分泌を促進するように操作されうる。操作された骨髄細胞は、CFPの、標的細胞上の抗原への結合時に、細胞が、免疫細胞および免疫分子の、標的細胞または腫瘍微小環境への動員および輸送を促進するよう、免疫細胞および免疫分子の動員および輸送を促進するように操作されうる。
[0007]本開示は、操作された骨髄細胞が、CAR-T細胞の限界のうちの、少なくとも一部を克服する、重要な発見であって、充実性腫瘍へとたやすく動員されること;生存期間が操作可能であること、したがって、無形成および免疫不全症を結果としてもたらす、存続の延長の危険性が小さいこと;骨髄細胞は、T細胞と夾雑される可能性がないこと;骨髄細胞は、例えば、悪性T細胞と同じ抗原を発現しないため、フラトリサイドを回避しうること;および骨髄細胞は、展開されうる、大量の抗腫瘍機能を有することを含む発見に基づく。一部の点では、操作された骨髄由来細胞は、罹患細胞を標的化し、破壊するための、より安全な免疫療法ツールでありうる。
[0008]さらに、マクロファージなどの骨髄細胞は、腫瘍環境(TME)内において、遍在することが見出されており、とりわけ、一部の腫瘍型では、最も豊富な細胞である。免疫系における、それらの役割の一部として、マクロファージなどの骨髄細胞は、天然では、罹患細胞の除去に関与する。本発明は、骨髄細胞機能の利用に関し、とりわけ、罹患細胞の標的化、殺滅、ならびに直接的除去および/または間接的除去のほか、抗原およびサイトカインなどのペイロードの送達に関する。
[0009]操作された骨髄細胞はまた、in vivoにおいて短命でもあり、表現型的に多様でもあり、高感受性でもあり、可塑性でもあり、in vitroにおける操作が困難であると見出されることが多い。例えば、単球内の外因性遺伝子の発現は、非造血細胞内の外因性遺伝子の発現と比較して困難となっている。骨髄細胞(例えば、単球/マクロファージ)にトランスフェクトすることと関連する、著明な技術的困難が存在する。プロフェッショナル貪食細胞として、単球/マクロファージなどの骨髄細胞は、核酸の完全性を破壊しうる、多くの強力な分解酵素を含み、これらの細胞への遺伝子導入を、非効率的過程としている。これは、免疫刺激または炎症性刺激への曝露後における、それらの生理学の劇的な変化を経る活性化マクロファージにとりわけ当てはまる。マクロファージは、一般に、分裂しない最終段階の細胞であるため、これらの細胞へのウイルスによる形質導入は理想的ではなく;このため、複製性ゲノムへの組込みに依存する一部のベクターは、成功が限られている。さらに、マクロファージは、「危険信号」に対する反応性が大きいため、遺伝子導入のために使用された元のウイルスベクターのうちのいくつかは、これらの細胞内で強力な抗ウイルス反応を誘導し、これらのベクターを遺伝子送達に不適切なものとしている。加えて、骨髄細胞は、顕著に異なる機能性を有する、表現型変異体へと分化する、潜在的可能性を有し、ある特定の状況下では、in vivoにおける使用のために意図された目的に有効でない場合もある。例えば、腫瘍への能動的な遊走、および有効な腫瘍殺滅活性に必要な骨髄細胞は、ある特定の細胞表面マーカーの同定に基づき、その可塑性を保持する細胞段階において、in vivo送達されることが要求されうる。骨髄細胞の可塑性は、分離の性格、取扱い、細胞を操作するための、ex vivoにおける、核酸素材の、細胞への導入方式などの影響を受ける場合がある。多様な細胞段階の骨髄細胞(例えば、可塑性が高度もしくは低度の段階にある骨髄細胞、または炎症機能もしくは他の免疫調節機能を付与する表現型を伴う骨髄細胞)は、in vivoにおける使用のために意図された目的に、特定の価値の各々を有し、これらの全ては、本開示の範囲内にあるが、少なくとも一態様では、本明細書で論じられる方法は、in vivo投与の前に、高度の骨髄細胞可塑性を保持する、治療用骨髄細胞集団の作出に焦点を当てる。一態様では、本開示は、骨髄細胞の機能的側面を増強することに加えて、細胞の分化能、その成熟可能性、および/または可塑性を損なわないことを目的として、骨髄細胞にトランスフェクトもしくは形質導入するか、または骨髄細胞内の遺伝子改変を、他の形で誘導するのに成功しうる、新規の方法および組成物を提示する。
[0010]本明細書の一態様では、罹患細胞、例えば、がん細胞などの標的細胞上で発現された抗原に結合する治療剤が提供される。治療剤の、標的細胞上の標的抗原への結合は、標的細胞の破壊過程を惹起しうる。一部の実施形態では、治療剤は、哺乳動物細胞、ヒト細胞、骨髄細胞、または単球など、対象の細胞内で発現されうる組換え核酸である。一部の実施形態では、治療剤は、標的細胞上の標的抗原に結合しうる組換えタンパク質である。一部の実施形態では、治療剤は、細胞、例えば、哺乳動物細胞、ヒト細胞、骨髄細胞、または単球であり、この場合、細胞は、骨髄細胞の、細胞表面上において標的抗原を発現する罹患細胞への標的化が可能であり;骨髄細胞が、罹患細胞を溶解するか、またはこれを貪食するように、組換え核酸を含み、かつ/または組換えタンパク質を発現する。
[0011]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含む、キメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、キメラ融合タンパク質が、細胞外キューに応答し、細胞内ドメインが、細胞外キューを受け取ると、細胞内作用機構および骨髄細胞の活性化に影響を及ぼす組換え核酸が提供される。一実施形態では、キメラ融合タンパク質は、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインに加えて、細胞外抗原結合性ドメインを有する、キメラ受容体であり、キメラ融合タンパク質の細胞外抗原結合性ドメインの、細胞外結合性ドメインが結合する標的抗原への係合が、受容体への、骨髄細胞の、受容体媒介性活性化のための細胞外キューをもたらす。
[0012]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-Serモチーフを有する細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、Xaa1は、親水性アミノ酸であり、Xaa3は、任意のアミノ酸である、組換え核酸が提供される。一部の実施形態では、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-SerのSerは、リン酸化部位である。
[0013]一部の実施形態では、Xaa1は、セリン、トレオニン、チロシン、ヒスチジン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、リシン、またはアルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、セリンである。一部の実施形態では、Xaa1は、トレオニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、チロシンである。一部の実施形態では、Xaa1は、ヒスチジンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、リシン、またはアルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミンである。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、リシンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アルギニンである。
[0014]一部の実施形態では、Xaa1は、ヒスチジン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、リシン、またはアルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、ヒスチジンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、リシン、またはアルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミンである。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、リシンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、セリンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、トレオニンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、チロシンではない。
[0015]一部の実施形態では、Xaa1は、セリン、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、リシン、またはアルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、セリンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミンである。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、リシンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、ヒスチジンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、トレオニンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、チロシンではない。
[0016]一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、リシン、またはアルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アスパラギン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミンである。一部の実施形態では、Xaa1は、グルタミン酸である。一部の実施形態では、Xaa1は、リシンである。一部の実施形態では、Xaa1は、アルギニンである。一部の実施形態では、Xaa1は、セリンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、トレオニンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、チロシンではない。一部の実施形態では、Xaa1は、ヒスチジンではない。
[0017]一部の実施形態では、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-Serは、SLHISである。
[0018]一部の実施形態では、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-Serは、NLEISである。
[0019]一部の実施形態では、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-Serは、DLAISである。
[0020]一部の実施形態では、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-Serは、ELLISである。
[0021]一部の態様では、キメラ融合タンパク質は、抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含み、この場合、膜貫通ドメインは、細胞外ドメインと作動可能に連結されている。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、少なくとも1つのさらなる細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、少なくとも1つのさらなる細胞内シグナル伝達ドメインは、細胞内PI3キナーゼ動員ドメイン、貪食受容体細胞内ドメイン、パターン認識受容体細胞内ドメイン、CD40細胞内ドメイン、FcR細胞内ドメイン、またはサイトカイン受容体細胞内ドメインもしくはケモカイン受容体細胞内ドメインに由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、細胞質ゾルアダプタータンパク質、ミトコンドリア膜タンパク質、または小胞体膜タンパク質に由来するアミノ酸配列を含む。一態様では、キメラ融合タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインは、TRIFタンパク質に由来するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、短縮型TRIF細胞内ドメインを含む。一部の実施形態では、短縮型TRIF細胞内ドメインの配列は、約150~300アミノ酸の長さ、約150~270アミノ酸の長さ、または約150~250アミノ酸の長さである。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号36に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号37に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号38に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号41に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[0022]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、Gタンパク質共役受容体84(GPR84)、Gタンパク質サブユニットベータ2(GNB2)、またはホスファチジルイノシトール-3,4,5-三リン酸依存性Rac交換因子1(PREX1)に由来するシグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。GPR84、GNB2、またはPREX1の細胞内シグナル伝達ドメインは、貪食促進活性を有しうる。一部の実施形態では、キメラ融合タンパク質は、抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含み、この場合、膜貫通ドメインは、細胞外ドメインと作動可能に連結されている。一部の実施形態では、GPR84、GNB2、またはPREX1に由来するシグナル伝達ドメインは、GPR84、GNB2、またはPREX1に由来する細胞内シグナル伝達ドメインである。
[0023]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号39に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。
[0024]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号40に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。
[0025]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号42に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。
[0026]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号43に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。
[0027]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号45に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。
[0028]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結され、膜貫通ドメインが、CD68に由来し、ホモ二量体化を阻害または阻止する突然変異を含む、組換え核酸が提供される。
[0029]一部の実施形態では、キメラ融合タンパク質は、膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、配列番号47を含む。
[0030]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含み、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結され、膜貫通ドメインが、CD64またはCD89に由来し、細胞内シグナル伝達ドメインを欠く、キメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸が提供される。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD16タンパク質、例えば、CD16aタンパク質に由来する。一部の実施形態では、キメラ融合タンパク質は、細胞内で発現された場合に、FcRγ鎖と共に複合体を形成する。
[0031]本明細書の一態様では、(a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号48に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸が提供される。
[0032]一部の実施形態では、キメラ融合タンパク質は、PI3キナーゼ動員ドメインを含む第2の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、CFPは、配列番号39とIRF活性化増強モチーフの配列とを含む融合アミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、CFPは、配列番号40とIRF活性化増強モチーフの配列とを含む融合アミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。
[0033]一実施形態では、CFPは、配列番号39と配列番号40とを含む融合アミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。
[0034]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、IRFタンパク質に結合する。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TRAFタンパク質結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TBK1リン酸化部位を含む。一部の実施形態では、CFPは、第2、第3、または第4の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、CFPは、抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含み、この場合、膜貫通ドメインは、細胞外ドメインと作動可能に連結される。
[0035]一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、腫瘍抗原に対する親和性を有するドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、Tリンパ球抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、Bリンパ球抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインが結合する抗原は、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CCR4、CD8、CD30、CD45、CD56、チミジンキナーゼ(TK1)、ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)、受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1)、ムチン1、ムチン16(MUC16)、MUC1、表皮増殖因子受容体vIII(EGFRvIII)、メソテリン、ヒト表皮増殖因子受容体2(HER2)、EBNA-1、LEMD1、ホスファチジルセリン、癌胎児性抗原(CEA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、グリピカン3(GPC3)、濾胞刺激ホルモン受容体、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、エリスロポエチン産生肝細胞癌A2(EphA2)、EphB2、ナチュラルキラー2D(NKG2D)群リガンド、ジシアロガングリオシド2(GD2)、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD19、CD20、CD22、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44v6、CD45、CD70、CD56、CD79b、CD97、CD117、CD123、CD133、CD138、CD171、CD179a、CD213A2、CD248、CD276、PSCA、CS-1、CLECL1、GD3、PSMA、FLT3、TAG72、EPCAM、IL-1、インテグリン、インテグリン受容体、Claudin 3.0、Claudin 18.2、Trop-2、PRSS21、VEGFR2、PDGFRベータ、SSEA-4、EGFR、NCAM、プロスターゼ、PAP、ELF2M、GM3、TEM7R、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、Dsg1、Dsg3、およびIGLL1に由来する抗原からなる群から選択される。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、CD5に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、HER2に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、CD137、CD70、Claudin 3.0、Claudin 18.2、またはTrop-2に結合する。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、第1の標的抗原結合性ドメインと、第1の標的結合性ドメインと同一ではない第2の標的抗原結合性ドメインとを含む。一部の実施形態では、第2の標的抗原結合性ドメインは、CD47に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、微生物抗原に対する親和性を有するドメインを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、ウイルス抗原に対する親和性を有するドメインを含む。一部の実施形態では、ドメインは、抗体またはその断片を含む。一部の実施形態では、ドメインは、scFvを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8a、CD28、CD68、CD2、FcRγ、FcRα、FcRβ、FcRε、シンタキシン3、シンタキシン4、またはシンタキシン5の膜貫通ドメインに由来する。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、抗原結合性ドメインと膜貫通ドメインとを接続するヒンジドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内で発現された場合に、キメラ融合タンパク質は、その標的抗原への結合時に、細胞内ドメインを活性化してIRF活性化を誘導する。一部の実施形態では、組換え核酸は、RNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、mRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、1つまたは複数の脂質と会合する。一部の実施形態では、組換え核酸は、リポソーム内に封入される。一部の実施形態では、リポソームは、脂質ナノ粒子である。
[0036]本明細書の一態様では、配列番号52と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号52と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号52と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号52と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号52の配列または配列番号52に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0037]本明細書の一態様では、配列番号53と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号53と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号53と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号53と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号53の配列または配列番号53の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0038]本明細書の一態様では、配列番号54と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号54と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号54と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号54と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号54の配列または配列番号54の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0039]本明細書の一態様では、配列番号55と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号55と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号55と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号55と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号55の配列または配列番号55の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0040]本明細書の一態様では、配列番号56と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号56と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号56と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号56と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号56の配列または配列番号56の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0041]本明細書の一態様では、配列番号57と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号57と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号57と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号57と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号57の配列または配列番号57の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0042]本明細書の一態様では、配列番号58と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号58と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号58と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号58と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号58の配列または配列番号58の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0043]本明細書の一態様では、配列番号59と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号59と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号59と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号59と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号59の配列または配列番号59の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0044]本明細書の一態様では、配列番号60と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号60と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号60と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号60と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号60の配列または配列番号60の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0045]本明細書の一態様では、配列番号61と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号61と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号61と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号61と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号61の配列または配列番号61の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0046]本明細書の一態様では、配列番号62と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号62と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号62と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号62と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号62の配列または配列番号62の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0047]本明細書の一態様では、配列番号63と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号63と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号63と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号63と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号63の配列または配列番号63の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0048]本明細書の一態様では、配列番号64と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号64と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号64と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号64と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号64の配列または配列番号64の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0049]本明細書の一態様では、配列番号65と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号65と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号65と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号65と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号65の配列または配列番号65の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0050]本明細書の一態様では、配列番号66と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号66と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号66と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号66と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号66の配列または配列番号66の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0051]本明細書の一態様では、配列番号67と少なくとも80%同一である配列をコードする組換え核酸が提供される。本明細書の一態様では、配列番号67と少なくとも80%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号67と少なくとも90%同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書では、配列番号67と同一である配列をコードする組換えmRNA構築物が提供される。本明細書の一部の実施形態では、配列番号67の配列または配列番号67の配列に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列をコードする組換え核酸を含む細胞が提供される。
[0052]一部の実施形態では、組換え核酸は、プラスミドまたはベクターである。
[0053]本明細書の一態様では、上記で記載された実施形態のうちのいずれか1つによる組換え核酸を含む細胞が提供される。一部の実施形態では、細胞は、免疫細胞である。一部の実施形態では、細胞は、骨髄細胞、リンパ系細胞、前駆細胞、幹細胞、または人工多能性細胞である。一部の実施形態では、細胞は、CD14+/CD16-である。
[0054]本明細書の一態様では、キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含み、CFPが、(a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン;(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含み、細胞内シグナル伝達ドメインが、活性化されるとIFN転写因子に結合する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、操作された細胞が提供される。
[0055]本明細書の一態様では、キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含み、CFPが、(a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン;(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含み、細胞内シグナル伝達ドメインが、ミトコンドリア受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、操作された細胞が提供される。
[0056]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、配列番号39に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、配列番号40に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[0057]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、STING、MAVS、TRIF、TASL、NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP4、NLRP5、NLRP6、NLRP7、NLRP89、NLRP9、NLRP10、NLRP11、NLRP12、NLRP13、NLRP1~14、NOD1、NOD2、Pyrin、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、CD40、Tank1結合性キナーゼ(TBK)、TNFR1、ケモカイン、MHCクラスIIトランス活性化因子(CIITA)、IPAF、BIRC1、RIG-I様受容体(RLR)タンパク質、マクロファージガラクトース型レクチン(MGL)、DC-SIGN(CLEC4L)、ランジェリン(CLEC4K)、骨髄系DAP12会合レクチン(MDL)1(CLEC5A)、DC関連C型レクチン1(デクチン1)サブファミリータンパク質、デクチン1/CLEC7A、DNGR1/CLEC9A、骨髄系C型レクチン様受容体(MICL)(CLEC12A)、CLEC2(CLEC1B)、CLEC12B、DC免疫受容体(DCIR)サブファミリータンパク質、DCIR/CLEC4A、デクチン2/CLEC6A、血中DC抗原2(BDCA2)(CLEC4C)、Mincle(マクロファージ誘導性C型レクチン)(CLEC4E)に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[0058]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、配列番号42に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[0059]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、配列番号43に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[0060]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、配列番号45に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[0061]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、活性化されるとIFN転写因子に結合する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[0062]一部の実施形態では、IFN転写因子は、タンパク質IRF1~IRF9のうちのいずれか1つである。
[0063]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TRAF動員ドメインを含む。
[0064]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、IKKリン酸化を誘導する。
[0065]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TBKリン酸化を誘導する。
[0066]一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、腫瘍抗原または微生物抗原に結合する。
[0067]一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CCR4、CD8、CD30、CD45、CD56、チミジンキナーゼ(TK1)、ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)、受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1)、ムチン1、ムチン16(MUC16)、MUC1、表皮増殖因子受容体vIII(EGFRvIII)、メソテリン、ヒト表皮増殖因子受容体2(HER2)、EBNA-1、LEMD1、ホスファチジルセリン、癌胎児性抗原(CEA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、グリピカン3(GPC3)、濾胞刺激ホルモン受容体、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、エリスロポエチン産生肝細胞癌A2(EphA2)、EphB2、ナチュラルキラー2D(NKG2D)群リガンド、ジシアロガングリオシド2(GD2)、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD19、CD20、CD22、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44v6、CD45、CD56、CD79b、CD97、CD117、CD123、CD133、CD138、CD171、CD179a、CD213A2、CD248、CD276、PSCA、CS-1、CLECL1、GD3、PSMA、FLT3、TAG72、EPCAM、IL-1、インテグリン、インテグリン受容体、Claudin 3.0、Claudin 18.2、Trop-2、PRSS21、VEGFR2、PDGFRベータ、SSEA-4、EGFR、NCAM、プロスターゼ、PAP、ELF2M、GM3、TEM7R、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、Dsg1、Dsg3、およびIGLL1のうちの1つまたは複数に結合する。
[0068]一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、ウイルス抗原に結合する。
[0069]一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8a、CD28、CD68、CD2、FcRγ、FcRα、FcRβ、FcRε、シンタキシン3、シンタキシン4、またはシンタキシン5の膜貫通ドメインに由来する。
[0070]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、FcRγ、FcRα、またはFcRεに由来する細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、PI3キナーゼ動員ドメインをさらに含む。
[0071]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、IRF転写因子に結合し、抗原結合性ドメインのそのコグネイト抗原への結合時に、IRF転写因子を活性化する。
[0072]一部の実施形態では、細胞は、抗原結合性ドメインのそのコグネイト抗原への結合時に、炎症促進性サイトカインを誘導する。
[0073]一部の実施形態では、炎症促進性サイトカインは、IL-1、IL-6、IL-12、IL-23、TNF、CXCL9、CXCL10、CXCL11、IL-18、IL-23、IL-27、およびインターフェロンのうちの1つまたは複数を含む。
[0074]一部の実施形態では、細胞は、骨髄細胞、リンパ球、または幹細胞である。
[0075]一部の実施形態では、細胞は、骨髄細胞である。
[0076]本明細書における、本開示の一態様ではまた、本明細書で記載された実施形態のうちのいずれか1つによる組換え核酸、記載された実施形態のうちのいずれか1つによる細胞、または記載された実施形態のうちのいずれか1つによる操作された細胞と;薬学的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物も提示される。
[0077]一部の実施形態では、操作された細胞は、CD14+/CD16-である。
[0078]上記で記載された実施形態による医薬組成物は、細胞のうちの少なくとも50%がCD14+/CD16-であり、細胞のうちの10%未満が樹状細胞である細胞の集団を含む。一部の実施形態では、細胞は、CCR2の高発現を呈する。一部の実施形態では、細胞は、トーナルシグナル伝達およびデノボの活性化を呈さず、活性化時に、M0、M1、またはM2分化を呈する。
[0079]本明細書の一部の態様では、対象におけるがんまたはウイルス感染を処置する方法であって、対象へと、上記の実施形態のうちのいずれか1つによる医薬組成物を投与するステップを含む方法が提供される。
[0080]本明細書の一部の態様では、キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含み、CFPが、(a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン;(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含み、細胞内シグナル伝達ドメインが、TRIFに由来するドメインを含む、操作されたCD14+/CD16-細胞が提供される。
[0081]一部の実施形態では、TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインは、短縮型TRIFドメインである。
[0082]一部の実施形態では、TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインは、300未満のアミノ酸を含む。
[0083]一部の実施形態では、TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインは、250未満のアミノ酸を含む。
[0084]一部の実施形態では、TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインは、細胞外結合性ドメインの標的との係合時にIFN応答を呈する。
[0085]本明細書の一態様では、対象におけるがんを処置する方法であって、対象へと、上記で記載された実施形態のうちのいずれか1つによる医薬組成物を投与するステップを含む方法が提供される。
[0086]本明細書の一態様では、対象におけるがんを処置する方法であって、対象へと、上記で記載された実施形態のうちのいずれか1つによる医薬組成物を投与するステップを含む方法が提供される。
[0087]一部の実施形態では、がんは、胃がん、卵巣がん、腎臓がん、乳がん、前立腺がん、肝がん、脳がん、リンパ腫、白血病、皮膚がん、膵臓がん、結腸直腸がん、神経膠芽腫、および肺がんからなる群から選択される。
参照による組込み
[0088]本明細書で言及される、全ての刊行物、特許、および特許出願は、各個別の刊行物、特許、または特許出願が、参照により組み込まれることが、具体的に、かつ、個別に指し示された場合と同じ程度において、参照により本明細書に組み込まれる。
[0088]本明細書で言及される、全ての刊行物、特許、および特許出願は、各個別の刊行物、特許、または特許出願が、参照により組み込まれることが、具体的に、かつ、個別に指し示された場合と同じ程度において、参照により本明細書に組み込まれる。
[0089]本発明の新規の特色は、付属の特許請求の範囲において、詳細に示される。本発明の原理が利用される、例示的な実施形態を示す以下の詳細な説明および添付した図面を参照することにより、本発明の特色および利点についての良好な理解が得られるであろう。
[00152]T細胞療法は、多くの患者のためのがん処置を変革した。しかし、進行期充実性腫瘍を伴う、大部分の患者にとって、持続的臨床利益は達成されていない。T細胞と異なり、骨髄細胞は、腫瘍内にたやすく蓄積し、場合によって、腫瘍塊のうちの、最大で50%に寄与する。骨髄細胞は、腫瘍細胞を特異的に標的化し、貪食し、溶解させ、腫瘍細胞に対する、in vivoにおける免疫活性化を組織する、Activate,Target,Attack & Kill(ATAK)細胞と称される、高度に有効な抗腫瘍細胞となるように、特異的に操作されうる。
[00153]本出願は、免疫抑制性腫瘍微小環境を回避し、高度の腫瘍細胞溶解性/免疫原性効力を呈するように操作された骨髄細胞を増強するための手法に基づく。Toll様受容体およびSTING-cGASなどの自然免疫シグナル伝達センサーへの係合は、炎症促進性抗腫瘍免疫応答を上方調節する重要な経路として探索されており、抗腫瘍免疫と関連している。合成アゴニストを使用して、これらの経路を活性化する、これらの手法は、強力でありうるが、自然免疫シグナル伝達の、局所化された、腫瘍特異的活性化の送達は、達成が困難である。多くの常套的化学療法剤、標的化抗がん剤、免疫アジュバント、および腫瘍溶解性ウイルスは、完全なI型IFNシグナル伝達の存在下で、十分に有効であるに過ぎない。組換えI型インターフェロンおよびIFNをコードするベクターを使用する免疫療法が試みられている。例えば、未処置である、病期IIIbまたは病期IVの非小細胞肺癌(NSCLC)を処置するのに、TLR-9アゴニストが、化学療法と組み合わされている(Manegold,C.ら、「Addition of PF-3512676 (CpG 7909) to a taxane/platinum regimen for first-line treatment of unresectable non-small cell lung cancer (NSCLC) improves objective response - phase II clinical trial」、Eur.J.Cancer.、3:326、2005)。別の研究は、免疫チェックポイント遮断と組み合わされた、IFN産生性iPSC由来増殖性骨髄細胞の投与が、例えば、チェックポイント遮断に対して不応性であるがんにおける、単一処置モダリティーに対する耐性を克服するのに有用でありうることを示唆した(Tsuchiya,N.ら、Cell Reports、29、162~175、2019年10月)。
[00154]本明細書で開示される、本手法は、腫瘍認識を、自然免疫シグナル伝達とカップリングする、新たなクラスのキメラ抗原受容体(ATAK受容体)を作出する手法である。このような組換えキメラ受容体は、キメラ受容体を介して、骨髄細胞が、がん細胞へと標的化され、次いで、腫瘍認識時に、骨髄細胞内の自然免疫応答をさらに活性化し、腫瘍細胞の貪食性溶解、およびリンパ球性免疫応答のさらなる活性化をもたらすように、本明細書で記載される骨髄細胞内で発現される。がん認識ドメインの、FcRg、TLR、およびサイトカイン受容体、本明細書でデザインされ、記載されるキメラ抗原受容体などの自然免疫受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインとの組合せは、骨髄細胞は、がんを認識し、広範かつ微調整可能な免疫応答を誘発するようにプログラムされうることを裏付ける。データは、自然免疫経路を利用することにより、ATAK受容体を構築することの多用途性を示し、細胞療法および直接的in vivo療法における、それらの臨床開発を支持する。
[00155]全ての用語は、それらが、当業者により理解される通りに理解されることが意図される。そうでないことが規定されない限りにおいて、本明細書で使用される技術用語および科学用語は、本開示が関連する技術分野の当業者により一般に理解される意味と同じ意味を有する。
[00156]本明細書で使用される節の見出しは、構成的目的のためだけのものであり、記載される対象物を限定するものとしては解釈されないものとする。
[00157]本開示の多様な特色は、単一の実施形態の文脈で記載されうるが、特色はまた、個別に提供される場合もあり、任意の適切な組合せで提供される場合もある。逆に、本明細書では、明確さのために、本開示は、個別の実施形態の文脈で記載されうるが、本開示はまた、単一の実施形態でも、実施されうる。
[00158]本明細書における、「一部の実施形態」、「ある実施形態」、「一実施形態」、または「他の実施形態」への言及は、実施形態との関連で記載される、特色、構造、または特徴が、本開示の、少なくとも一部の実施形態には含まれるが、全ての実施形態には、必ずしも含まれないことを意味する。
[00159]本明細書および特許請求の範囲で使用される、「~を含むこと(comprising)」(ならびに「~を含む(comprise)」、「~を含む(comprises)」、および「含まれた(comprised)」など、「~を含むこと(comprising)」の任意の形態)、「~を有すること」(ならびに「~を有する(have)」および「~を有する(has)」など、「~を有すること」の任意の形態)、「~を含むこと(including)」(ならびに「~を含む(include)」および「~を含む(includes)」など、「~を含むこと(including)」の任意の形態)、または「~を含有すること」(ならびに「~を含有する(contain)」および「~を含有する(contains)」など、「~を含有すること」の任意の形態)という用語は、包含的またはオープンエンドであり、さらなる、列挙されていない要素または方法ステップを除外しない。本明細書で論じられる任意の実施形態は、本開示の任意の方法または組成物に関して実施される場合があり、この逆も成り立つことが想定される。さらに、本開示の組成物は、本開示の方法を達成するのに使用されうる。本発明の方法を達成することができる。
[00160]パラメータ、量、時間的持続など、測定可能な値に言及する場合に、本明細書で使用される、「約」または「およそ」という用語は、そのような変動が、本開示において実施するのに適切である限りにおいて、指定された値の±30%またはこれ未満、±20%またはこれ未満、±10%もしくはこれ未満、±5%もしくはこれ未満、または±1%もしくはこれ未満の変動、および指定された値からこれらの変動を包摂することが意図される。「約」または「およそ」という修飾語が言及する値はまた、具体的に開示される場合もあることが理解されるものとする。
[00161]「薬剤」とは、任意の細胞、低分子化合物、抗体、もしくこれらの断片、核酸分子、またはポリペプチドを指す場合がある。
[00162]「変更」または「変化」とは、増大または減少を指す場合がある。例えば、変更は、1%、2%、3%、4%、5%、10%、20%、30%、または40%、50%、60%、なおまたは70%、75%、80%、90%、もしくは100%までの増大または減少でありうる。例えば、変更は、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、20倍、30倍、または40倍、50倍、60倍、なおまたは70倍、75倍、80倍、90倍、もしくは100倍までの増大または減少でありうる。
[00163]本明細書で使用される、「抗原提示細胞」または「APC」は、プロフェッショナル抗原提示細胞(例えば、Bリンパ球、マクロファージ、単球、樹状細胞、ランゲルハンス細胞)のほか、他の抗原提示細胞(例えば、ケラチノサイト、内皮細胞、星状膠細胞、線維芽細胞、希突起膠細胞、胸腺上皮細胞、甲状腺上皮細胞、神経膠細胞(脳)、膵ベータ細胞、および血管内皮細胞)を含む。APCは、主要組織適合性複合体(MHC)分子を発現することが可能であり、その表面上に、T細胞による認識が可能であり、T細胞の活性化および免疫応答を誘発しうる、MHCと複合体化された抗原を提示しうる。プロフェッショナル抗原提示細胞、とりわけ、樹状細胞は、ナイーブT細胞の刺激において、鍵となる役割を果たす。線維芽細胞などの非プロフェッショナル抗原提示細胞もまた、この過程に寄与しうる。APCはまた、外因性抗原をプロセシングし、プロセシングされた抗原を、クラスIMHC分子上に提示することにより、ペプチド抗原も交差提示しうる。クラスI MHC分子との会合時に認識されるタンパク質をもたらす抗原は、一般に、細胞内で産生されるタンパク質であり、これらの抗原は、プロセシングされ、クラスIMHC分子と会合する。
[00164]「生体試料」とは、生物に由来する、任意の組織、細胞、体液、または他の素材を指す場合がある。
[00165]「エピトープ」という用語は、抗体もしくはその結合性断片、T細胞受容体、および/または抗体様分子に結合することが可能である、配列または構造またはアミノ酸残基など、任意のタンパク質決定基を指す場合がある。エピトープ決定基は、典型的に、アミノ酸または糖の側鎖などの分子の、化学的に活性の表面基からなり、一般に、特異的三次元構造特徴のほか、特異的電荷特徴を有する。「T細胞エピトープ」とは、T細胞受容体により認識される、ペプチドまたはペプチド-MHC複合体を指す場合がある。
[00166]操作された骨髄細胞などの操作された細胞は、一過性に発現された場合であってもなお、細胞内で、少なくとも1つの外因性核酸配列を有する細胞を指す場合がある。外因性核酸の発現は、他の箇所に記載される、多様な方法により実施される場合があり、当技術分野で公知の方法を包摂する。本開示は、操作された細胞、例えば、操作された貪食細胞などの操作された骨髄細胞の調製および使用に関する。本開示は、とりわけ、例えば、キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする、外因性核酸を含む操作された細胞に関する。
[00167]「免疫応答」という用語は、T細胞媒介性免疫応答、NK細胞媒介性免疫応答、および/またはB細胞媒介性免疫応答を含むがこれらに限定されない。これらの応答は、T細胞共刺激およびNK細胞共刺激のモジュレーションにより影響される場合がある。例示的な免疫応答は、T細胞応答、例えば、サイトカイン産生および細胞媒介性細胞傷害作用を含む。加えて、免疫応答は、NK細胞の活性化、B細胞の活性化、および/またはT細胞の活性化の影響を間接的に受けた免疫応答、例えば、抗体産生(体液性応答)、およびサイトカイン応答性細胞、例えば、マクロファージの活性化を含む。免疫応答は、獲得免疫応答を含む。獲得免疫系は、侵入生物の抗原など、外来分子構造に対して反応しうる。自然免疫系と異なり、獲得免疫系は、病原体に対して、高度に特異的である。獲得免疫はまた、長期持続性の保護ももたらしうる。獲得免疫反応は、体液性免疫反応および細胞媒介性免疫反応を含む。体液性免疫反応では、B細胞により、体液へと分泌された抗体は、病原体由来抗原に結合し、様々な機構、例えば、補体媒介性溶解を介して、病原体の消失をもたらす。細胞媒介性免疫反応では、他の細胞を破壊することが可能なT細胞が活性化される。例えば、疾患と関連するタンパク質が、細胞内に存在する場合、これらは、細胞内で、タンパク質分解により、ペプチドへと断片化される。次いで、特異的細胞タンパク質は、このようにして形成された抗原またはペプチドへと接合し、これらを、細胞の表面へと移送し、ここで、抗原またはペプチドは、T細胞などの分子的防御機構により提示される。細胞傷害性T細胞は、これらの抗原を認識し、これらの抗原を保有する細胞を死滅させうる。
[00168]「リガンド」とは、受容体など、別の分子に結合するか、またはこれらと複合体を形成することが可能である分子を指す場合がある。リガンドは、タンパク質、糖タンパク質、炭水化物、リポタンパク質、ホルモン、脂肪酸、リン脂質、または受容体に結合する、任意の構成要素を含みうるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、受容体は、特異的リガンドを有する。一部の実施形態では、受容体は、リガンドに広域的に結合する場合があり、この場合、受容体は、構造的構成、電荷分布、または他の任意の物理化学的特徴において、少なくとも1つの類似性を共有する、いくつかのリガンドに結合しうる。リガンドは、生体分子でありうる。リガンドは、非生体材料でありうる。例えば、リガンドは、スカベンジャー受容体MARCOである、負帯電粒子に対するリガンドでありうる。例えば、リガンドは、スカベンジャー受容体SRA1である、TiO2に対するリガンドでありうる。本明細書で記載されるCFPの文脈では、細胞外結合性ドメインは、結合性ドメインの標的としてもまた呼称される、リガンドに結合しうる。一部の実施形態では、標的は、この場合、標的細胞が、その細胞表面上において、CFPの細胞外抗原結合性ドメインが結合する標的抗原を発現させるという意味で、標的細胞である、がん細胞などの罹患細胞上で発現される抗原である。本開示では、抗(標的)結合性ドメイン、または抗(標的)結合性細胞外ドメイン、または抗(標的)CFPは、それぞれ、(標的)結合性ドメイン、または(標的)結合性細胞外ドメイン、または(標的)CFPなどの用語と、互換的に使用されることが多い。例えば、がん細胞上で発現されるHER2は、CFPの抗HER2結合性細胞外ドメインが結合する抗原(リガンド)であるか;または、代替的に、CFPのHER2結合性細胞外ドメインが結合するとも言明される、抗原(リガンド)である。
[00169]「主要組織適合性複合体(MHC)」、「MHC分子」、または「MHCタンパク質」という用語は、抗原性ペプチドに結合し、抗原性ペプチドを、Tリンパ球へと提示することが可能なタンパク質を指す。このような抗原性ペプチドは、T細胞エピトープを表酢場合がある。ヒトMHCはまた、HLA複合体とも呼ばれる場合がある。したがって、「ヒト白血球抗原(HLA)」、「HLA分子」、または「HLAタンパク質」という用語は、「主要組織適合性複合体(MHC)」、「MHC分子」、および「MHCタンパク質」という用語と、互換的に使用される。HLAタンパク質は、HLAクラスIと分類される場合もあり、HLAクラスIIと分類される場合もある。2つのHLAクラスのタンパク質の構造な、極めて類似するが;これらは、全く異なる機能を有する。クラスIのHLAタンパク質は、大半の腫瘍細胞を含む、体内のほぼ全ての細胞の表面上に存在する。クラスIのHLAタンパク質は、通例、細胞内に存在する、内因性タンパク質または病原体由来する抗原をロードされ、次いで、ナイーブまたは細胞傷害性T-リンパ球(CTL)へと提示される。HLAクラスIIタンパク質は、樹状細胞、B細胞、およびマクロファージを含むがこれらに限定されない、抗原提示細胞(APC)上に存在する。HLAクラスIIタンパク質は、主に、外部、例えば、細胞の外部の抗原供給源からプロセシングされたペプチドを、ヘルパーT細胞へと提示する。
[00170]HLAクラスII系では、マクロファージおよび未成熟樹状細胞などの貪食細胞は、貪食により、実体を、その酸性酵素が、取り込まれたタンパク質を、多くの異なるペプチドへと切断するリソソーム融合するファゴソーム(ただし、B細胞は、エンドソームへの、より一般的なエンドサイトーシスを呈する)へと取り込みうる。オートファジーは、HLAクラスIIペプチドの、別の供給源である。最も研究が進んだ、サブクラスIIのHLA遺伝子は、HLA-DPA1、HLA-DPB1、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DRA、およびHLA-DRB1である。
[00171]HLAクラスII分子による、CD4+ヘルパーT細胞への、ペプチドの提示は、外来抗原に対する免疫応答をもたらす。活性化されると、CD4+ T細胞は、B細胞分化および抗体産生のほか、CD8+ T細胞(CTL)応答を促進しうる。CD4+ T細胞はまた、他の免疫細胞の分化を活性化し、これらを誘導する、サイトカインおよびケモカインも分泌しうる。HLAクラスII分子は、典型的に、クラスIペプチド結合溝より開放的なペプチド結合溝を形成するように相互作用する、α鎖と、β鎖とによるヘテロニ量体である。
[00172]HLA対立遺伝子は、典型的に、共優性的な形で発現される。例えば、各人が、3つのクラスI遺伝子(HLA-A、HLA-B、およびHLA-C)の各々の、2つずつの対立遺伝子を保有するので、6つの異なる種類のクラスII HLAを発現しうる。クラスII HLA遺伝子座では、各人は、HLA-DP遺伝子(α鎖およびβ鎖をコードする、DPA1およびDPB1)、HLA-DQ(αおよびβ鎖についての、DQA1およびDQB1)、1つの遺伝子である、HLA-DRα(DRA1)、および1つまたは複数の遺伝子である、HLA-DRβ(DRB1およびDRB3、DRB4、またはDRB5)の対を継承する。HLA-DRB1は、例えば、約400種を超える、公知の対立遺伝子を有する。これは、1つのヘテロ接合性個体が、6つまたは8つの機能的クラスII HLA対立遺伝子:各親から、3つまたはこれを超える対立遺伝子を継承しうることを意味する。したがって、HLA遺伝子は、高度に多型的であり;多くの異なる対立遺伝子が、集団内の異なる個体に存在する。HLAタンパク質をコードする遺伝子は、多くの可能なバリエーションを有し、各人の免疫系が、広範にわたる外来侵入物に反応することを可能とする。一部のHLA遺伝子は、それらの各々が、特定の番号を与えられた、数百に及ぶバージョン(対立遺伝子)を同定されている。一部の実施形態では、クラスI HLA対立遺伝子は、HLA-A*02:01、HLA-B*14:02、HLA-A*23:01、HLA-E*01:01(非古典的)である。一部の実施形態では、クラスII HLA対立遺伝子は、HLA-DRB*01:01、HLA-DRB*01:02、HLA-DRB*11:01、HLA-DRB*15:01、およびHLA-DRB*07:01である。
[00173]「骨髄細胞」とは、広く、造血細胞系のうちの、骨髄系統の細胞を指し、例えば、リンパ球系統を除外する場合がある。骨髄細胞は、例えば、顆粒球系統および単球系統の細胞を含む。骨髄細胞は、単球、樹状細胞、組織マクロファージ、および顆粒球を含む、免疫系の、主要な細胞コンパートメントである。骨髄細胞の細胞個体発生、活性化、分化、および組織特異的機能についてのモデルは、過去数年間にわたり再検討され、驚くべき結果がもたらされている。しかし、ホメオスタシスおよび疾患の両方における、それらの巨大な可塑性および異種性は、理解からほど遠い。骨髄細胞は、貪食、およびT細胞を活性化するそれらの能力を含む、多くの機能を有するが、治療的使用のための、これらの機能の利用については、捉えどころがないままである。こうして、T細胞悪性腫瘍を含むがこれらに限定されない、改善された治療剤の開発に向けて、他の細胞型を使用するための、新規の方途が求められている。
[00174]骨髄細胞は、骨髄中の造血幹細胞に由来する、共通の前駆細胞から分化される。骨髄細胞系統への拘束は、別個の転写因子の活性化により統御される場合があり、したがって、骨髄細胞は、細胞外刺激および細胞内刺激に基づき、末端の細胞型へと、さらに分化する能力として記載されうるレベルの可塑性を有する細胞として特徴付けられうる。骨髄細胞は、それらの表面上における、多様なケモカイン受容体を介して、局所組織へと、急速に動員されうる。骨髄細胞は、多様なサイトカインおよびケモカインに対して応答性である。
[00175]骨髄細胞は、例えば、骨髄内で、G-CSF、GM-CSF、Flt3L、CCL2、VEGF、およびS100A8/9など、1つまたは複数のサイトカインおよびケモカインの影響下において、造血幹細胞由来する細胞でありうる。一部の実施形態では、骨髄細胞は、前駆細胞である。一部の実施形態では、骨髄細胞は、共通の骨髄前駆細胞、または顆粒球前駆細胞、骨髄芽細胞、または単球-樹状細胞前駆細胞、またはこれらの組合せの特徴を有する細胞でありうる。骨髄は、顆粒球もしくは単球、またはこれらの前駆細胞を含みうる。骨髄は、未成熟顆粒球、未成熟単球、未成熟マクロファージ、未成熟好中球、および未成熟樹状細胞を含みうる。骨髄は、単球または前単球性細胞または単球前駆体を含みうる。場合によって、本明細書で使用される骨髄細胞は、M0表現型、M1表現型、またはM2表現型を有する単球を指す場合がある。骨髄は、樹状細胞(DC)、成熟DC、単球由来DC、形質細胞様DC、前樹状細胞、またはDC前駆体を含みうる。骨髄は、成熟好中球、好中球前駆体、または多形核球(PMN)でありうる、好中球を含みうる。骨髄は、マクロファージ、単球由来マクロファージ、組織マクロファージ、M0表現型、M1表現型、またはM2表現型のマクロファージを含みうる。単球またはマクロファージは、極性化を呈する。本明細書で使用される、「極性化」とは、マクロファージが、生理学的状態と称されることが多い、特異的な微小環境刺激およびシグナルに応答して、顕著に異なる機能的表現型を呈する過程を指す場合がある。場合によって、マクロファージは、1つの極性化状態から、別の極性化状態へと移行しうる。例えば、マクロファージは、古典的活性化マクロファージ(M1マクロファージ)、および代替活性化マクロファージ(M2マクロファージ)へと極性化されうる。M2マクロファージは、亜類型である、M2a、M2b、M2c、およびM2dへと分けられる。これらのマクロファージは、それらの細胞表面マーカー、分泌されるサイトカイン、および生物学的機能が異なる。M1マクロファージは、典型的に、細胞が、表面上に、TLR-2、TLR-4、CD80、CD86、iNOS、およびMHC-IIを発現させる表現型により特徴付けられる。これらの細胞は、多様なサイトカインおよびケモカイン、例えば、TNF-α、IL-1α、IL-1β、IL-6、IL-12、CXCL9、およびCXCL10を放出し、典型的に、M1遺伝子の発現を調節する、NF-kB、STAT1、STAT5、IRF3、およびIRF5などの転写因子の活性化を呈する。NF-κBおよびSTAT1は、M1マクロファージの極性化に関与する、2つの主要な経路であると考えられる。M1表現型は、マクロファージの殺菌機能および腫瘍殺滅機能と関連し、高度の貪食性機能および炎症性機能を呈する。他方、免疫抑制性環境下に置かれた、腫瘍関連マクロファージは、一般に、M2極性化の程度が大きい。骨髄は、腫瘍浸潤単球(TIM)を含みうる。骨髄は、腫瘍関連単球(TAM)を含みうる。骨髄は、骨髄由来抑制細胞(MDSC)を含みうる。骨髄は、組織内常在マクロファージを含みうる。骨髄は、腫瘍関連DC(TADC)を含みうる。したがって、骨髄細胞は、1つまたは複数の細胞表面マーカー、例えば、CD11b、CD14、CD15、CD16、CD38、CCR5、CD66、Lox-1、CD11c、CD64、CD68、CD163、CCR2、CCR5、HLA-DR、CD1c、CD83、CD141、CD209、MHC-II、CD123、CD303、CD304、SIGLECファミリータンパク質、およびCLECファミリータンパク質を発現しうる。場合によって、骨髄細胞は、細胞表面マーカー、例えば、CD11b、CD14、CD15、CD16、CD66、Lox-1、CD11c、CD64、CD68、CD163、CCR2、CCR5、HLA-DR、CD1c、CD83、CD141、CD209、MHC-II、CD123、CD303、CD304、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数の、高度の発現または低度の発現により特徴付けられうる。一実施形態では、本明細書で記載される方法を使用して、マクロファージのM1極性化を活性化することが所望される。
[00176]「貪食」は、「飲作用」と互換的に使用され、細胞が、がん細胞または感染細胞などの粒子を飲み込む過程を指す場合がある。この過程は、粒子を含有する、内部コンパートメント(ファゴソーム)をもたらしうる。この過程は、がん細胞または感染細胞などの粒子を取り込み、かつ/またはこれらを、体内から除去するのに使用されうる。貪食受容体は、貪食過程に関与しうる。貪食過程は、免疫応答および抗原提示と緊密に連関しうる。外因性抗原のプロセシングは、一部の種類のエンドサイトーシスイベントによる、それらの、プロフェッショナル抗原提示細胞への取込みを後続させる。貪食はまた、抗原提示も容易としうる。例えば、貪食された細胞または病原体に由来する抗原であって、がん抗原を含む抗原は、プロセシングされ、APCの細胞表面上に提示されうる。
[00177]「ポリペプチド」とは、糖タンパク質、リポタンパク質、細胞タンパク質、または膜タンパク質など、ペプチド結合を介して、一緒に連結されたアミノ酸を含有する分子を指す場合がある。ポリペプチドは、タンパク質の、1つまたは複数のサブユニットを含みうる。ポリペプチドは、組換え核酸によりコードされうる。一部の実施形態では、ポリペプチドは、単一のアミノ酸鎖内に、スペーサー、リンカーまたはペプチド切断配列により隔てられうる、1つを超えるペプチド配列を含みうる。ポリペプチドは、融合ポリペプチドでありうる。ポリペプチドは、1つまたは複数のドメイン、モジュール、または部分を含みうる。
[00178]「受容体」とは、細胞外シグナルを、細胞へと伝達するポリペプチドなど、シグナルを伝達するポリペプチドから構成される化学構造を指す場合がある。受容体は、細胞内の情報、細胞または生物の形成を伝えるのに用いられる。受容体は、少なくとも1つの受容体ユニットを含み、2つまたはこれを超える受容体ユニットを含有する場合があり、この場合、各受容体ユニットは、タンパク質分子、例えば、糖タンパク質分子を含む。受容体は、リガンドに結合し、リガンドと複合体を形成しうる構造を含有しうる。シグナル伝達情報は、細胞の表面上のリガンドへの結合に続く、受容体のコンフォメーション変化により伝えられる場合がある。
[00179]「抗体」という用語は、免疫グロブリンとして一般に公知である、タンパク質のクラスであって、IgG(IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4を含む)、IgA(IgA1およびIgA2を含む)、IgD、IgE、IgM、およびIgYを含むがこれらに限定されないタンパク質のクラスを指す。「抗体」という用語は、全長抗体、単鎖抗体、単一ドメイン抗体(sdAb)、およびこれらの抗原結合性断片を含むがこれらに限定されない。抗原結合性抗体断片は、Fab、Fab’、およびF(ab’)2、Fd(VHおよびCH1からなる)、単鎖可変断片(scFv)、単鎖抗体、ジスルフィド連結された可変断片(dsFv)、およびVLドメインおよび/またはVHドメインを含む断片を含むがこれらに限定されない。抗体は、任意の動物に由来しうる。単鎖抗体を含む、抗原結合性抗体断片は、単独における可変領域(複数可)を含む場合もあり、ヒンジ領域、CH1ドメイン、CH2ドメイン、およびCH3ドメインのうちの1つまたは複数と組み合わせられた可変領域(複数可)を含む場合もある。また、可変領域(複数可)と、ヒンジ領域、CH1、CH2、およびCH3ドメインとの、任意の組合せも含まれる。抗体は、例えば、HLA関連ポリペプチドまたはHLA-ペプチド複合体に特異的に結合する、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ならびにヒトモノクローナル抗体およびヒトポリクローナル抗体でありうる。
[00180]「組換え核酸」という用語は、組換え手段により調製されるか、発現されるか、創出されるか、または分離された核酸を指す。組換え核酸は、自然発生ではないヌクレオチド配列を含有しうる。組換え核酸は、実験室で合成されうる。組換え核酸は、組換えDNA技術、例えば、酵素制限消化、ライゲーション、およびDNAクローニングなど、DNAの酵素修飾を使用することにより調製されうる。組換え核酸は、DNA、RNA、これらの類似体、またはこれらの組合せでありうる。組換えDNAは、メッセンジャーRNA(mRNA)を作出することなどのために、ex vivoで転写される場合もあり、in vitroで転写される場合もある。組換えmRNAは、分離され、精製され、細胞にトランスフェクトするのに使用されうる。組換え核酸は、タンパク質またはポリペプチドをコードしうる。本明細書を通して、デオキシリボヌクレオチド(DNA)、リボヌクレオチド(RNA)を含みうる核酸配列が記載されるか、または、一部の実施形態では、修飾デオキシリボヌクレオチド、または修飾リボヌクレオチドが記載される。例えば、修飾ヌクレオチドは、5-ヒドロキシメチルシトシン(5hmC)、5-ホルミルシトシン(5fC)、7-メチルグアノシン、シュードウリジン、ジヒドロウリジンなどでありうる。当業者は、困難を伴わずに、所与のポリヌクレオチド配列から、RNA配列、例えば、mRNA配列を決定することができる。配列は、コドン最適化される場合がある。
[00181]核酸を、細胞へと導入するか、または組み込む過程は、形質転換、トランスフェクション、または形質導入を介しうる。形質転換とは、細菌細胞による、外来核酸の取込みの過程である。この工程は、プラスミドDNAの繁殖、タンパク質の作製、および他の適用に適合される。形質転換は、細胞外DNAを、環境から取り込む、コンピテントの細菌細胞へと、組換えプラスミドDNAを導入する。一部の細菌種は、ある特定の環境条件下で、天然でコンピテントであるが、コンピテンスは、実験室状況において、人工的に誘導される。トランスフェクションとは、DNA、RNA、または抗体などの低分子の、真核細胞への導入である。トランスフェクションはまた、バクテリオファージの、細菌細胞への導入も指す場合がある。「形質導入」が、多くの場合、組換えウイルスベクター粒子の、標的細胞への導入について記載するのに使用されるのに対し、「感染」とは、ヒトまたは動物への、野生型ウイルスの天然の感染を指す。
[00182]「ベクター」という用語は、宿主細胞内の自律的複製が可能であり、核酸分子のクローニングを可能とする核酸分子を指す場合がある。当業者公知の通り、ベクターは、プラスミド、コスミド、ファージミド、ウイルスベクター、ファージベクター、酵母ベクター、哺乳動物ベクターなどを含むがこれらに限定されない。例えば、外因性遺伝子を形質転換するためのベクターは、プラスミドでありうる。ある特定の実施形態では、ベクターは、複製起点、ならびに宿主細胞内の核酸配列の複製および/または維持に必要な他のエレメントを含有する核酸配列を含む。一部の実施形態では、本明細書で提供されるベクターまたはプラスミドは、発現ベクターである。発現ベクターは、それらが作動的に連結された、遺伝子および/または核酸配列の発現を方向付けることが可能である。一部の実施形態では、発現ベクターまたはプラスミドは、環状二本鎖DNA分子の形態にある。ベクターまたはプラスミドは、宿主細胞のゲノムへと組み込まれる場合もあり、組み込まれない場合もある。一部の実施形態では、プラスミドの核酸配列は、導入の後で、宿主細胞のゲノム内または染色体内に組み込まれない。例えば、プラスミドは、宿主細胞内における核酸配列、例えば、プラスミドにより保有される遺伝子またはオープンリーディングフレームの一過性発現または安定的発現のためのエレメントを含みうる。一部の実施形態では、ベクターは、一過性発現ベクターである。一部の実施形態では、ベクターは、宿主細胞内で自律的に複製される、安定発現ベクターである。一部の実施形態では、プラスミドの核酸配列は、宿主細胞への導入時に、宿主細胞のゲノムまたは染色体へと組み込まれる。本明細書で開示される方法において使用されうる発現ベクターは、プラスミド、エピソーム、細菌人工染色体、酵母人工染色体、バクテリオファージ、またはウイルスベクターを含むがこれらに限定されない。ベクターは、DNAベクターの場合もあり、RNAベクターの場合もある。一部の実施形態では、本明細書で提供されるベクターは、宿主細胞への導入時に、宿主細胞のゲノムへとの統合(例えば、逆転写を介する)が可能である、RNAベクター、例えば、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターである。当業者により公知である、同等の機能を果たす、他の形態の発現ベクター、例えば、自己複製型染色体外ベクター、または宿主ゲノムへの統合が可能であるベクターもまた、使用されうる。例示的なベクターは、それらが連結された核酸の、自律的複製および/または自律的発現が可能であるベクターである。
[00183]一部の実施形態では、核酸は、ナノ粒子の形態で、生体系へと送達されうる。本明細書で開示される核酸配列は、適切なナノ粒子、例えば、リポソーム、脂質ナノ粒子、またはポリマーナノ粒子を介して、in vivo送達されうる。脂質ナノ粒子は、極性脂質を含みうる。一部の実施形態では、脂質ナノ粒子は、カチオン性脂質を含む。一部の実施形態では、脂質ナノ粒子は、カチオン性脂質および非カチオン性脂質を含む。一部の実施形態では、脂質ナノ粒子は、中性脂質を含む。一部の実施形態では、脂質ナノ粒子は、PEG化脂質を含む。
[00184]代替的に、一部の実施形態では、核酸は、細胞療法の準備のために、ex vivoにおいて、生細胞に電気穿孔される場合があり、この場合、細胞は、骨髄細胞である。
[00185]融合タンパク質に言及して使用される、「スペーサー」または「リンカー」という用語は、融合タンパク質の、他の2つのペプチド配列を接続するペプチド配列を指す。一部の実施形態では、リンカーまたはスペーサーは、タンパク質もしくはRNA配列を接続するか、またはタンパク質もしくはRNA配列の間の、何らかの最小限の距離または他の空間関係を保存すること以外に、具体的生体活性を有さない。一部の実施形態では、スペーサーの構成要素であるアミノ酸は、分子のフォールディング、可撓性、正味の電荷、または疎水性など、一部の分子特性に影響を与えるように選択されうる。本開示の実施形態における使用に適するリンカーは、当業者に周知であり、直鎖状または分枝鎖状である炭素リンカー、複素環式炭素リンカー、またはペプチドリンカーを含むがこれらに限定されない。一部の実施形態では、リンカーは、2つまたはこれを超えるポリペプチド、例えば、2つの抗原性ペプチドを、各抗原性ペプチドが、適正にフォールディングすることを確保するのに十分な距離だけ隔てるのに使用される。例示的なペプチドリンカー配列は、可撓性の伸展型コンフォメーションを取り、秩序化二次構造の発生への傾向を呈さない。可撓性のリンカータンパク質領域内のアミノ酸は、Gly、Asn、およびSer、またはGly、Asn、およびSerを含有するアミノ酸配列の、任意の並べ替えを含みうる。ThrおよびAlaなど、他の中性近傍のアミノ酸もまた、リンカー配列内で使用されうる。
[00186]「~を処置する」、「処置された」、「~を処置すること」、「処置」などの用語は、障害および/またはこれと関連する症状(例えば、新生物もしくは腫瘍、または感染作用物質、または自己免疫疾患)を低減、防止、または改善することを指すように意図される。「~を処置すること」とは、疾患(例えば、がん、または感染作用物質による感染、または自己免疫疾患)の発症、または発症の疑いの後における対象への、治療の投与を指す場合がある。「~を処置すること」は、疾患と関連する任意の症状もしくは他の疾病の影響、および/または治療と関連する副作用の発生もしくは再発の頻度、または重症度を低下させることを指す場合がある、「~を緩和すること」の概念「~を処置すること」という用語はまた、も包摂する。患者における、疾患または障害の重症度を軽減すること、例えば、疾患を伴う患者の寿命を伸ばすか、もしくは生存性を延長すること、またはその再発を遅延させること、例えば、疾患を患ったことがある患者における寛解期間を延ばすことを指す、「~を管理すること」の概念を含む。障害または状態の処置が、障害、状態、またはこれと関連する症状が、完全に消失されることが、除外されるわけではないが、これを要求するわけではないことが察知される。本明細書で使用される、「~を防止する」、「~を防止すること」、「防止」という用語、およびこれらの文法的同等物は、薬剤または化合物の投与が始まる時点において、このような症状を発症していない対象において、疾患または状態と関連する症状の発症を回避するか、またはこれを遅延させることを指す場合がある。ある特定の実施形態では、本明細書で記載される、対象または患者の処置は、薬物、代謝物、防止的成分、核酸、ペプチド、またはタンパク質などの治療用組成物であって、薬物、代謝物、または防止的成分をコードするか、または他の形で形成する、治療用組成物の投与を含む。一部の実施形態では、処置は、細胞または細胞集団を、それを必要とする対象へと投与するステップを含む。一部の実施形態では、処置は、対象へと、本明細書で記載される、操作された細胞のうちの1つまたは複数、例えば、1つまたは複数の操作された貪食細胞などの骨髄細胞を投与するステップを含む。処置は、病理学的な疾患、状態、または症候群の場合もあり、潜在的疾患、状態、または症候群の場合もある、疾患または状態または症候群の処置を含む。場合によって、本明細書で使用される処置は、治療用ワクチンを投与するステップを含みうる。一部の実施形態では、操作された貪食細胞が、患者または対象へと投与される。一部の実施形態では、ヒト対象へと投与される細胞は、免疫原性の低減を結果としてもたらす。例えば、操作された貪食細胞は、移植片対宿主病(GVHD)またはフラトリサイド効果をもたらさないか、またはこれらの低減をもたらしうる。一部の実施形態では、ヒト対象へと投与される操作された細胞は、対象に対して、免疫適合性である(すなわち、対象において、天然で発現されるHLA亜型とのマッチングを有する)。対象特異的HLA対立遺伝子、または対象のHLA遺伝子型は、当技術分野で公知の任意の方法により決定されうる。例示的実施形態では、方法は、遺伝子多型を決定するステップであって、遺伝子多型を有する対立遺伝子変異体を含む、遺伝子参照セットに照らした、データセットのシーケンシングから抽出されるリードのアライメントを生成するステップ、アライメントにおいて、各対立遺伝子変異体についての、第1の事後確率または事後確率から導出されるスコアを決定するステップ、第1の事後確率または事後確率から導出されるスコアが最大である対立遺伝子変異体を、第1の対立遺伝子変異体として同定するステップ、第1の対立遺伝子変異体、および1つまたは複数の他の対立遺伝子変異体によりアライメントされた、1つまたは複数の重複リードを同定するステップ、重み付け係数を使用して、1つまたは複数の他の対立遺伝子変異体についての、第2の事後確率または事後確率から導出されるスコアを決定するステップ、第1の対立遺伝子変異体および第2の対立遺伝子変異体が、遺伝子多型の遺伝子型を規定する場合に、第2の事後確率または事後確率から導出されるスコアが最大である対立遺伝子変異体を選択することにより、第2の対立遺伝子変異体を同定するステップ、ならびに第1の対立遺伝子変異体および第2の対立遺伝子変異体についてのアウトプットを与えるステップを含みうるステップを含む。
[00187]「断片」とは、タンパク質または核酸の部分を指す場合がある。一部の実施形態では、断片は、参照タンパク質または参照核酸の生体活性のうちの、少なくとも50%、75%、または80%、または90%、95%、なおまたは99%を保持する。
[00188]「単離された」、「精製された」、「生物学的に純粋である」という用語、およびこれらの文法的同等物は、その天然状態で見出される通り、通常、これに随伴する構成要素が、多様な程度で非含有である素材を指す。「~を単離する」とは、元の供給源または環境からの単離の程度を表す。「~を精製する」とは、単離より高度である、単離の程度を表す。「精製された」タンパク質または「生物学的に純粋である」タンパク質は、不純物が、タンパク質の生物学的特性に、実質的な影響を及ぼさないか、または他の有害な帰結を引き起こさないように、他の素材が、十分に非含有である。すなわち、本開示の核酸またはペプチドは、組換えDNA法により作製される場合に、細胞素材、ウイルス素材、もしくは培養培地が、実質的に非含有であるか、または化学合成される場合に、化学的前駆体もしくは他の化学物質が、実質的に非含有である場合に、精製されている。純度および均一性は、典型的に、分析化学法、例えば、ポリアクリルアミドゲル電気泳動または高速液体クロマトグラフィーを使用して決定される。「精製された」という用語は、核酸またはタンパク質が、電気泳動ゲル内で、本質的に1つのバンドをもたらすことを表す場合がある。修飾、例えば、リン酸化またはグリコシル化にかけられうるタンパク質について、異なる修飾は、個別に精製されうる、異なる単離タンパク質をもたらしうる。
[00189]「新生物」または「がん」という用語は、不適切に高レベルの細胞分裂、不適切に低レベルのアポトーシス、またはこれらの両方により引き起こされるか、またはこれらの結果としてもたらされる、任意の疾患を指す。神経膠芽腫は、新生物またはがんの、1つの非限定例である。「がん」または「腫瘍」または「過剰増殖性障害」という用語は、コントロール不能の増殖、不死性、転移の可能性、急速な増殖、および増殖率、ならびにある特定の特徴的な形状特色など、がん原因細胞に典型的な特徴を保有する細胞の存在を指す。がん細胞は、腫瘍形態であることが多いが、このような細胞は、動物において、単独で存在する場合もあり、白血病細胞など、非腫瘍原性のがん細胞の場合もある。
[00190]「ワクチン」という用語とは、疾患(例えば、新生物/腫瘍/感染作用物質/自己免疫疾患)の予防および/または処置のために、免疫を発生させるための組成物を意味するものとして理解されるべきである。したがって、本明細書で使用されるワクチンとは、組換え核酸、または組換え核酸を含み、これを発現する細胞を含み、ワクチン接種により、特異的防御および保護物質を作出するために、ヒトまたは動物において使用されることが意図される薬剤である。「ワクチン組成物」は、薬学的に許容される賦形剤、担体、または希釈剤を含みうる。本開示の態様は、貪食細胞ベースワクチンの調製における、技術の使用に関する。
[00191]「薬学的に許容される」という用語とは、ヒトを含む動物における使用について、米国連邦政府もしくは米国州政府の規制機関により承認されているか、もしくは承認可能であるか、または米国薬局方もしくは他の一般に認識された薬局方に収載されていることを指す。「薬学的に許容される賦形剤、担体、または希釈剤」とは、薬剤と一緒に対象に投与することが可能であり、その薬理学的活性を破壊せず、治療量の薬剤を送達するのに十分な用量で投与された場合に、非毒性である、賦形剤、担体、または希釈剤を指す。
[00192]本開示の方法において有用な核酸分子は、活性を有するまたはポリペプチドをコードする任意の核酸分子を含むがこれらに限定されない。内因性配列に対する実質的な同一性を有するポリヌクレオチドは、典型的に、二本鎖核酸分子のうちの、少なくとも一方の鎖とハイブリダイズすることが可能である。「ハイブリダイズする」とは、多様な厳密性の条件下で、核酸分子が、相補的なポリヌクレオチド配列、またはそれらの部分の間で対合して、二本鎖分子を形成する場合を指す(例えば、Wahl,G.M.およびS L.Berger(1987)、Methods Enzymol.、152:399;Kimmel,A.R.(1987)、Methods Enzymol.、152:507を参照されたい)。例えば、厳密な塩濃度は、通例、約750mM未満のNaClおよび75mMのクエン酸三ナトリウム、約500mM未満のNaClおよび50mMのクエン酸三ナトリウム、または約250mM未満のNaClおよび25mMのクエン酸三ナトリウムでありうる。低厳密性のハイブリダイゼーションが、有機溶媒、例えば、ホルムアミドの非存在下で得られうるのに対し、高厳密性のハイブリダイゼーションは、少なくとも約35%のホルムアミドの存在下で、または少なくとも約50%のホルムアミドの存在下で得られうる。厳密な温度条件は、通例、少なくとも約30℃、少なくとも約37℃、または少なくとも約42℃の温度を含みうる。当業者には、ハイブリダイゼーション時間、洗浄剤、例えば、ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)の濃度、および担体DNAの組入れまたは除外など、さらなるパラメータの変動も周知である。必要に応じて、これらの多様な条件を組み合わせることにより、多様なレベルの厳密性が達せられる。例示的実施形態では、ハイブリダイゼーションは、750mMのNaCl、75mMのクエン酸三ナトリウム、および1%のSDS中、30℃で生じうる。別の例示的実施形態では、ハイブリダイゼーションは、500mMのNaCl、50mMのクエン酸三ナトリウム、1%のSDS、35%のホルムアミド、および100μg/mlの変性サケ精子DNA(ssDNA)中、37℃で生じうる。別の例示的実施形態では、ハイブリダイゼーションは、250mMのNaCl、25mMのクエン酸三ナトリウム、1%のSDS、50%のホルムアミド、および200μg/mlのssDNA中、42℃で生じうる。当業者には、これらの条件における、有用な変動がたやすく明らかであろう。大半の適用では、ハイブリダイゼーションに後続する洗浄ステップもまた、厳密性が変動しうる。洗浄の厳密性条件は、塩濃度および温度により規定されうる。上記の通り、洗浄の厳密性は、塩濃度を減少させることにより増大される場合もあり、温度を上昇させることにより増大される場合もある。例えば、洗浄ステップのための厳密な塩濃度は、約30mM未満のNaClおよび3mMのクエン酸三ナトリウムの場合もあり、約15mM未満のNaClおよび1.5mMのクエン酸三ナトリウムの場合もある。洗浄ステップのための厳密な温度条件は、少なくとも約25℃、少なくとも約42℃、または少なくとも約68℃の温度を含みうる。例示的実施形態では、洗浄ステップは、30mMのNaCl、3mMのクエン酸三ナトリウム、および0.1%のSDS中、25℃で生じうる。他の例示的実施形態では、洗浄ステップは、15mMのNaCl、1.5mMのクエン酸三ナトリウム、および0.1%のSDS中、42℃で生じうる。別の例示的実施形態では、洗浄ステップは、15mMのNaCl、1.5mMのクエン酸三ナトリウム、および0.1%のSDS中、68℃で生じるであろう。当業者には、これらの条件における、さらなる変動がたやすく明らかであろう。当業者には、ハイブリダイゼーション法が周知であり、例えば、BentonおよびDavis(Science、196:180、1977);GrunsteinおよびHogness(Proc.Natl.Acad.Sci.、USA、72:3961、1975);Ausubelら(「Current Protocols in Molecular Biology」、Wiley Interscience、New York、2001);BergerおよびKimmel(「Guide to Molecular Cloning Techniques」、1987、Academic Press、New York);ならびにSambrookら、「Molecular Cloning:A Laboratory Manual」、Cold Spring Harbor Laboratory Press、New Yorkにおいて記載されている。
[00193]「実質的に相同な」とは、参照アミノ酸配列(例えば、本明細書で記載されるアミノ酸配列のうちのいずれか1つ)または参照核酸配列(例えば、本明細書で記載される核酸配列のうちのいずれか1つ)に対する少なくとも50%の同一性を提示する、ポリペプチドまたは核酸分子を指す。このような配列は、アミノ酸レベルまたは核酸レベルにおいて、比較のために使用される配列と少なくとも60%、80%、もしくは85%、90%、95%、96%、97%、98%、なおもしくは99%、またはこれを超えて同一でありうる。配列相同性は、典型的に、配列解析ソフトウェア(例えば、Sequence Analysis Software Package of the Genetics Computer Group、University of Wisconsin Biotechnology Center、1710 University Avenue、Madison、Wis.53705、BLASTプログラム、BESTFITプログラム、GAPプログラム、またはPILEUP/PRETTYBOXプログラム)を使用して測定される。このようなソフトウェアは、相同性の程度を、多様な置換、欠失、および/または他の修飾へと割り当てることにより、同一な配列または同様の配列をマッチさせる。保存的置換は、典型的に、以下の群:グリシン、アラニン;バリン、イソロイシン、ロイシン;アスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、グルタミン;セリン、トレオニン;リシン、アルギニン;およびフェニルアラニン、チロシン内に置換を含む。同一性の程度を決定する、例示的手法では、BLASTプログラムが使用される場合があり、e-3~e-mの間の確率スコアが、近縁配列を指し示しうる。「参照」とは、比較の基準である。それぞれの配列内の、特異的位置または残基の番号付けは、特定のタンパク質、および使用される番号付けスキームに依存することが理解されるであろう。番号付けは、例えば、成熟タンパク質の前駆体と、成熟タンパク質自体とで異なる場合があり、種間の配列の差違は、番号付けに影響を及ぼしうる。当業者は、当技術分野で周知の方法により、例えば、参照配列に照らした配列アライメント、および相同な残基の決定により、任意の相同なタンパク質内、およびそれぞれをコードする核酸内において、それぞれの残基を同定することが可能であろう。
[00194]「対象」という用語または「患者」とは、処置、観察、または実験を目的とする、動物(例えば、ヒト)などの生物を指す。例だけを目的として述べると、対象は、非ヒト霊長動物、ネズミ科動物、ウシ科動物、ウマ科動物、イヌ科動物、ヒツジ科動物、またはネコ科動物など、ヒトまたは非ヒト哺乳動物を含むがこれらに限定されない哺乳動物を含むがこれらに限定されない。
[00195]「治療効果」という用語とは、障害(例えば、新生物、腫瘍、または感染作用物質による感染、または自己免疫性疾患)またはその関連病態の症状のうちの1つまたは複数に対するある程度の緩和を指す。一方で、「治療効果」は、治療用組成物の投与後における、疾患の症状の軽減、例えば、腫瘍塊の、10%、20%、30%などの低減を指し示す場合がある。別の実施形態では、「治療効果」は、1つもしくは複数の症状の部分寛解もしくは完全寛解、または疾患の改善に関する場合がある。本明細書で使用される、「治療有効量」とは、単回投与用量または複数回投与用量における、細胞または対象への投与時に、このような処置の非存在下で予測される場合を越えて、このような障害を伴う患者の生存性を延長するか、障害の1つもしくは複数の徴候もしくは症状を軽減するか、障害を防止するか、または遅延させるのに有効である薬剤の量を指す。「治療有効量」は、治療効果を達成するのに要求される量を定量することが意図される。医療技術分野における当業者である主治医または獣医は、要求される、医薬組成物の「治療有効量」(例えば、ED50)を、たやすく決定し、これを処方することができる。
[00196]本明細書では、標的抗原に特異的に結合するようにデザインされる、操作された骨髄細胞(好中球、単球、骨髄樹状細胞(mDCs)、マスト細胞、およびマクロファージを含むがこれらに限定されない)が提供される。標的抗原は、感染細胞、損傷細胞、悪性細胞、白血病細胞、または腫瘍細胞など、標的細胞上のみで発現されうる。操作された骨髄細胞は、標的細胞を、直接的に(例えば、貪食により)攻撃し、これを死滅させる場合もあり、かつ/または間接的に(例えば、T細胞を活性化することにより)攻撃し、これを死滅させる場合もある。一部の実施形態では、標的細胞は、がん細胞である。
[00197]がんは、本開示において、詳細に記載される、1つの例示的実施形態であるが、本明細書で記載される方法および技術は、体内の感染細胞または他の形で罹患した細胞の標的化において有用であることが想定される。同様に、本明細書では、操作された細胞を使用する、治療用組成物およびワクチン組成物について記載される。
[00198]骨髄エフェクター細胞は、ヒト生体試料から分離され、このような細胞を操作する方法を使用して、治療目的の細胞を調製するように、ex vivoにおいて改変されるが、改変が、これらの細胞の可塑性を変更しないように改変された骨髄細胞から作出されうる。単球系統の細胞は、貪食性であり、有効な抗原提示細胞である。一態様では、本発明は、操作された骨髄細胞が、がんを含む、多数の疾患の処置において、有効性が大きな治療モダリティーでありうるという、重要な知見に根ざす。骨髄細胞は、骨髄細胞の免疫機能を増強する、キメラ抗原受容体を発現させるように操作される場合があり、この場合、細胞は、高度に貪食性であり、体内の罹患細胞または感染細胞を攻撃し、死滅させうる。キメラ抗原受容体は、(a)高度に標的特異的であり、標的抗原に結合するように特異的に方向付けられており、細胞外抗原結合性ドメインを有し、(b)骨髄細胞を活性化して、貪食細胞表現型の活性化を達するように高度に特殊化された細胞内ドメインを有するように、本明細書で記載される通りにデザインされ、特異的に改変された、組換え構築物である。例えば、高度に特殊化された細胞内ドメインは、受容体の細胞外領域の、標的への結合による活性化時に、細胞の内部で、細胞内インターフェロンシグナル伝達カスケード、および転写因子を活性化する、すなわち、転写因子であるIRF(IFN調節因子)の活性化を方向付けるシグナル伝達キューを発生させうる、キメラ受容体を作出するようにデザインされる。加えて、本明細書で記載される方法および組成物はまた、組換え核酸が、in vivoの骨髄細胞内で特異的に発現され、これにより、治療能を有する活性化骨髄細胞を発生させるように、キメラ抗原受容体をコードする組換え核酸が、それを必要とする対象において、局所投与または全身投与される、遺伝子治療においても有用である。一部の実施形態では、核酸は、mRNAである。一部の実施形態では、mRNAは、LNPにより送達される。
[00199]貪食細胞は、免疫系の天然前哨であり、身体防御の最前線を形成する。貪食細胞は、病原体、感染細胞、異物、またはがん性細胞を飲み込み、これを、身体から除去する。大半の潜在的病原体は、例えば、目覚ましい感染または疾患を引き起こす前に、貪食系により、急速に中和される。これは、クラスリンでコーティングされたピット系を介する、受容体媒介性取込みであるピノサイトーシス、特に、膜の波打ちおよび貪食の帰結としての、マクロピノサイトーシスを伴いうる。こうして、貪食細胞は、様々な非自己(および自己)要素により活性化され、それらの「標的」の認識において、あるレベルの可塑性を呈する。大半の貪食細胞は、それらの表面上において、パターン認識分子であり、広範にわたる外来粒子のほか、死細胞、細胞破砕物、および体内の望ましくない粒子に結合しうる、スカベンジャー受容体を発現する。一態様では、キメラ抗原受容体(CAR)をコードする組換え核酸は、細胞内で発現されうる。CARは、特異的腫瘍細胞を攻撃するように、様々な形でデザインされる場合があり、CARを発現する骨髄エフェクター細胞は、腫瘍細胞を貪食し、死滅させるように活性化されうる。CARは、標的への係合に、特異的に応答して活性化される、貪食性受容体を作出するようにデザインされる場合があり、マクロファージの貪食可能性は、受容体の、特異的に操作された細胞内ドメインにより増強される。本明細書で記載される骨髄細胞のためのCARプラットフォームは、体内への投与時に、または骨髄細胞が、CARを介して、その標的と係合する前の、任意の時点に、骨髄細胞内で、トニックシグナル伝達が検出されないようにデザインされる。これは、ex vivoにおいて調べられることが多い。同時に、CARを発現する骨髄細胞は、適切な刺激の存在下で、M0表現型、M1表現型、またはM2表現型へとさらに分化することができ、少なくとも投与時に分化するように、細胞性可塑性を保持しうる。加えて、CAR発現骨髄エフェクター細胞は、リンパ節へと遊走し、抗原を、リンパ節内のナイーブT細胞へと交差提示し、これにより、適応応答を活性化しうる。
[00200]一部の実施形態では、本明細書では、生体試料から分離され、組換えタンパク質を発現させるように、ex vivoにおいて操作され、組成物の骨髄細胞が、in vivoにおける免疫活性化の誘導において有効である、「エフェクター」骨髄細胞となるように、医薬組成物へと製剤化される骨髄細胞を作出するための組成物および方法が開示される。一部の実施形態では、組成物の骨髄細胞は、細胞が、標的細胞の攻撃および破壊において有効な骨髄細胞である、「ATAK」骨髄細胞と称される。本明細書で開示されるATAK骨髄細胞は、例えば、キメラ受容体、例えば、免疫細胞内のインターフェロン誘導性タンパク質に由来する、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む、キメラ抗原受容体を発現する、操作された骨髄細胞組換えタンパク質である。一部の実施形態では、本明細書で記載される方法および組成物は、操作された骨髄細胞が、エフェクター表現型を呈するようにすることを対象とする。一部の実施形態では、操作された骨髄細胞、例えば、単球は、M0表現型またはM1表現型の単球であり、骨髄細胞内で発現されたキメラ抗原受容体の活性化は、細胞が、M1表現型を呈するようにする。操作された細胞により呈されたM1表現型は、腫瘍細胞へと標的化されるようにデザインされた場合の細胞が、高度に腫瘍殺滅性となるようにする。
[00201]本明細書では、がんなどの疾患または状態を処置するための組成物および方法が提供される。本明細書で提供される組成物および方法は、好中球、単球、骨髄樹状細胞(mDC)、マスト細胞、およびマクロファージを含むがこれらに限定されない、ヒト骨髄細胞を利用して、がん細胞などの罹患細胞を標的化する。本明細書で提供される組成物および方法は、T細胞の活性化および動員、エフェクター免疫細胞の活性化(例えば、CD8 T細胞およびNK細胞の活性化)、抗原の交差提示、炎症応答の増強、制御性T細胞の低減、および貪食を含む、様々な機構により、がん細胞などの罹患細胞、および/または罹患組織を消失させるのに使用されうる。例えば、骨髄細胞は、がん細胞に対する免疫応答を維持するのに使用されうる。
[00202]本出願人らは、貪食性受容体(PR)融合タンパク質(PFP)、スカベンジャー受容体(SR)融合タンパク質(SFP)、インテグリン受容体(IR)融合タンパク質(IFP)、またはカスパーゼ動員受容体(カスパーゼ-CAR)融合タンパク質など、キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含む組成物について、既に記載した。組換え核酸によりコードされるCFPは、標的細胞の抗原に結合する抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン(ECD)を含みうる。細胞外ドメインは、ヒンジドメインまたは細胞外ドメインなどの受容体に由来する、ヒンジドメインまたは細胞外ドメインへと融合されうる。組換え核酸によりコードされるCFPは、CD2、CD8、CD28、CD68、貪食受容体、スカベンジャー受容体、またはインテグリン受容体に由来する膜貫通ドメインなどの膜貫通ドメインをさらに含みうる。一部の実施形態では、組換え核酸によりコードされるCFPは、貪食受容体、スカベンジャー受容体、またはインテグリン受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどの細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインをさらに含む。例えば、細胞内ドメインは、貪食受容体、スカベンジャー受容体、またはインテグリン受容体に由来する、1つまたは複数の細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。例えば、細胞内ドメインは、貪食活性、炎症応答、一酸化窒素の産生、インテグリンの活性化、エフェクター細胞遊走の増強(例えば、ケモカイン受容体の発現を介する)、抗原提示、および/または交差提示の増強を促進する、1つまたは複数の細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。一部の実施形態では、CFPは、貪食受容体融合タンパク質(PFP)である。一部の実施形態では、CFPは、貪食スカベンジャー受容体融合タンパク質(PFP)である。一部の実施形態では、CFPは、インテグリン受容体融合タンパク質(IFP)である。一部の実施形態では、CFPは、炎症性受容体融合タンパク質である。一部の実施形態では、組換え核酸によりコードされるCFPは、動員ドメインを含む細胞内ドメインをさらに含む。例えば、細胞内ドメインは、1つまたは複数のPI3K動員ドメイン、カスパーゼ動員ドメイン、またはカスパーゼ活性化/動員ドメイン(CARD)を含みうる。
[00203]本明細書では、改善された免疫原性のCAR組成物、例えば、CARを発現する細胞内のインターフェロン応答を活性化する細胞内ドメインを含む、キメラ融合タンパク質(CFP;キメラ抗原受容体であるCARと互称される)をコードする組換え核酸が提供される。本明細書では、pLxISモチーフを含む、少なくとも1つの細胞内ドメインを含む、免疫原性CFPが提供される。組換え核酸は、DNAの場合もあり、RNAの場合もある。CARをコードする組換え核酸は、ベクター内に組入れられうる。組換えCARは、細胞内で発現されると、細胞内のI型インターフェロンの産生を活性化する。このような細胞は、1型インターフェロン応答が可能である、哺乳動物細胞である。このような細胞は、免疫細胞、例えば、リンパ球または骨髄細胞である。
[00204]一部の実施形態では、キメラ受容体をコードする組換え核酸は、その中に、キメラ受容体の炎症促進性細胞内ドメインをコードする、特異的配列を含む。一部の実施形態では、本明細書で記載されるキメラ受容体タンパク質は、細胞外ドメインにおけるその標的との係合時に、キメラ抗原受容体を発現させる細胞内で、インターフェロン応答遺伝子、またはI型インターフェロンの産生の誘導をもたらすシグナル伝達カスケードを活性化することが可能である、細胞内ドメインを含む。一部の実施形態では、本明細書で記載されるキメラ受容体タンパク質は、自然免疫経路アダプタータンパク質、例えば、ミトコンドリア抗ウイルスシグナル伝達タンパク質(MAVS)、インターフェロン遺伝子刺激因子(STING)、Toll/IL-1Rドメイン含有アダプター誘導性IFN(TRIF)、およびエンドリソソームSLC15A4タンパク質と相互作用するTLRアダプター(TASL)、またはこれらの一部に由来するドメインを含む。一部の実施形態では、自然免疫経路アダプタータンパク質、例えば、MAVS、STING、TRIF、またはTASLタンパク質のドメインまたは断片は、組換えDNA技術により、本明細書で記載されるCFPまたはCARの細胞内ドメイン内に組み込まれ、この場合、ドメインまたは断片は、TBK1またはIKKεによりリン酸化されIRF-3の、シグナル伝達複合体への動員を媒介する、pLxISモチーフ(pは、親水性残基を表し、xは、任意の残基を表し、Sは、リン酸化部位を表す)を含む。
[00205]一部の実施形態では、本明細書で記載されるキメラ受容体タンパク質は、細胞外ドメインにおけるその標的との係合時に、キメラ抗原受容体を発現させる細胞内で、核内因子カッパB応答性遺伝子、またはNFカッパB応答をもたらすシグナル伝達カスケードを活性化することが可能である、細胞内ドメインを含む。
エフェクター骨髄細胞およびインターフェロンの活性化
[00206]I型およびII型のインターフェロン(IFN)は、感染およびがんにおける免疫応答の調節で、重要な役割を果たす。I型は、多数のIFNαファミリーメンバーである、IFNβ、IFNδ、IFNε、IFNκ、IFNτ、およびIFNωを含む、複数の亜型により代表され、これらの全ては、IFNαR1タンパク質と、IFNαR2タンパク質とから構成されるヘテロ二量体のIFNαRである、同じ細胞表面受容体を利用する。II型IFNは、IFNgにより代表される。これらの2つのIFN型は、ほぼ全ての細胞により発現されて、シグナル伝達イベントを誘発し、多様な細胞性応答を誘発する、顕著に異なる細胞表面受容体に結合する。骨髄細胞は、インターフェロンの、鍵となる標的である。細胞内細菌感染に対する初期免疫応答において、活性化ナチュラルキラー(NK)細胞および活性化T細胞は、IFNγ産生の供給源である。感染の初期段階において、サイトカインである、インターロイキン(IL)12およびIL-18の産生は、これらのリンパ球集団による、抗原非特異的IFNγ産生を駆動する。抗原特異的CD4+ T細胞およびCD8+ T細胞もまた、これらの病原体に応答して、IFNγを産生しうる。約20のIFNαタンパク質と、単一のIFNβとを含む、多数の個別のI型IFNが存在する。これらのI型IFNの各々は、保存的な細胞表面I型IFN受容体である、IFNαRに結合することにより、宿主細胞へとシグナル伝達する。細胞表面IFNαRのライゲーションは、多数の抗ウイルス性免疫誘導遺伝子(immune stimulated gene)(ISG)産物の発現を誘導し、これにより、宿主を、ある特定のウイルス感染から保護する(Sadler A J、「Interferon-inducible antiviral effectors」(総説)Nat Rev Immunol.、2008年7月、8(7):559~68)。しかし、I型IFNに対する応答性はまた、Listeria monocytogenes、Mycobacterium tuberculosis、Fransicella tularensis、および他の細菌を含む、多数の細胞内細菌感染(Rayamajhi M.ら、「Antagonistic crosstalk between type I and II interferons and increased host susceptibility to bacterial infections」.Virulence.2010年9~10月、1(5):418~22)に対する易感染性の増大とも、劇的に相関する。IFNγは、ホモ二量体として分泌され、細胞表面受容体をライゲーションすることにより、宿主細胞に対して作用する。各IFNγ受容体は、2つのI型内在性膜サブユニットである、IFNγR1およびIFNγR2から構成される、ヘテロ二量体である。IFNγホモ二量体の、細胞への結合は、2つのIFNγR1サブユニット、および2つIFNγR2サブユニットのほか、さらなるシグナル伝達構成要素が存在するように、2つの受容体による複合体の凝集を引き起こす。シグナル伝達のためには、両方のサブユニットが要求されるが、IFNγに対する実際の結合性部位は、IFNγR1上に位置する(Kearney S.ら、「Differential effects of type I and II interferons on myeloid cells and resistance to intracellular bacterial infections」.Immunol Res.、2013年3月、55(0):187~200)。IFNγが、IFNγR1サブユニットと相互作用する場合、IFNγは、IFNγR1サブユニットと、IFNγR2サブユニットとの緊密な会合を可能とする、コンフォメーション変化を誘導する。受容体内の、これらの再配置は、受容体と構成的に会合する、Janus関連キナーゼ(JAK)の自己リン酸化および交差リン酸化を誘導する。IFNγR1は、JAK1に対する結合性モチーフを含有し、IFNγR2は、JAK2に対する結合性モチーフを含有する。JAKタンパク質のリン酸化は、それらの触媒活性を刺激し、次いで、IFNγR1のC末端におけるチロシン残基(Y440)をリン酸化する。このリン酸化チロシン残基は、転写シグナル伝達因子兼活性化因子1(STAT-1)タンパク質上のSH2ドメインに対するドッキング部位をもたらす。各受容体の複合体は、2つのIFNγR1サブユニットを含有するため、2つのSTAT-1タンパク質は、受容体に結合することが可能である。JAK1およびJAK2は、受容体との会合を維持し、動員された各STAT-1タンパク質を、チロシン残基701(Y701)においてリン酸化する。このリン酸化は、STAT-1単量体の、受容体からの放出、およびこれらによる、ホモ二量体の形成を可能とする。STAT-1ホモ二量体は、核へと移行し、IFN誘導遺伝子(ISG)のプロモーターDNA内のガンマ活性化配列(GAS)に結合する結果として、これらの転写の増大をもたらす。I型IFNは、IFNγにより活性化されるものと同様に、カノニカルのJAK/STAT経路を介してシグナル伝達する。IFNαRへのリガンドの結合は、2つの受容体サブユニットの二量体化、ならびにこれらと会合したTYK2キナーゼおよびJAK1キナーゼへのリン酸転移を惹起する。キナーゼは、それらのSH2ドメインを介して、タンパク質であるSTAT1およびSTAT2を動員するように、IFNαR1およびIFNαR2の細胞質テール内の残基をリン酸化する。これらのSTATタンパク質の、受容体サブユニットへのドッキングは、STAT-1上のY701およびSTAT-2上のY690における、活性化JAKタンパク質によりこれらのリン酸化を可能とする。STAT単量体のリン酸化は、それらを、それらのドッキング部位から放出し、それらが、二量体化し、ホモ二量体形態またはヘテロ二量体形態で、IRF9と組み合わされて、転写因子ISG因子3(ISGF3)を産生することを可能とする。ISGF3は、核へと移行して、ISGを同定し、それらの転写を誘導する。I型IFNシグナル伝達により誘導されるISGは、典型的に、それらのプロモーター内に、インターフェロン刺激応答エレメント(ISRE)またはガンマ活性化配列(GAS)エレメントを含有するが、ISREを含有する遺伝子が、明らかに優先される。I型IFNの結果として転写されるISGの一部の例は、遺伝子である、ISG15、IP-10、IRF-7、およびPKR[66]を含有するISRE、ならびに遺伝子である、IRF-1、IRF-2、IRF-8、およびIRF-9を含有するGASである(Kearney S.ら、「Differential effects of type I and II interferons on myeloid cells and resistance to intracellular bacterial infections」.Immunol Res.、2013年3月、55(0):187~200)。
[00206]I型およびII型のインターフェロン(IFN)は、感染およびがんにおける免疫応答の調節で、重要な役割を果たす。I型は、多数のIFNαファミリーメンバーである、IFNβ、IFNδ、IFNε、IFNκ、IFNτ、およびIFNωを含む、複数の亜型により代表され、これらの全ては、IFNαR1タンパク質と、IFNαR2タンパク質とから構成されるヘテロ二量体のIFNαRである、同じ細胞表面受容体を利用する。II型IFNは、IFNgにより代表される。これらの2つのIFN型は、ほぼ全ての細胞により発現されて、シグナル伝達イベントを誘発し、多様な細胞性応答を誘発する、顕著に異なる細胞表面受容体に結合する。骨髄細胞は、インターフェロンの、鍵となる標的である。細胞内細菌感染に対する初期免疫応答において、活性化ナチュラルキラー(NK)細胞および活性化T細胞は、IFNγ産生の供給源である。感染の初期段階において、サイトカインである、インターロイキン(IL)12およびIL-18の産生は、これらのリンパ球集団による、抗原非特異的IFNγ産生を駆動する。抗原特異的CD4+ T細胞およびCD8+ T細胞もまた、これらの病原体に応答して、IFNγを産生しうる。約20のIFNαタンパク質と、単一のIFNβとを含む、多数の個別のI型IFNが存在する。これらのI型IFNの各々は、保存的な細胞表面I型IFN受容体である、IFNαRに結合することにより、宿主細胞へとシグナル伝達する。細胞表面IFNαRのライゲーションは、多数の抗ウイルス性免疫誘導遺伝子(immune stimulated gene)(ISG)産物の発現を誘導し、これにより、宿主を、ある特定のウイルス感染から保護する(Sadler A J、「Interferon-inducible antiviral effectors」(総説)Nat Rev Immunol.、2008年7月、8(7):559~68)。しかし、I型IFNに対する応答性はまた、Listeria monocytogenes、Mycobacterium tuberculosis、Fransicella tularensis、および他の細菌を含む、多数の細胞内細菌感染(Rayamajhi M.ら、「Antagonistic crosstalk between type I and II interferons and increased host susceptibility to bacterial infections」.Virulence.2010年9~10月、1(5):418~22)に対する易感染性の増大とも、劇的に相関する。IFNγは、ホモ二量体として分泌され、細胞表面受容体をライゲーションすることにより、宿主細胞に対して作用する。各IFNγ受容体は、2つのI型内在性膜サブユニットである、IFNγR1およびIFNγR2から構成される、ヘテロ二量体である。IFNγホモ二量体の、細胞への結合は、2つのIFNγR1サブユニット、および2つIFNγR2サブユニットのほか、さらなるシグナル伝達構成要素が存在するように、2つの受容体による複合体の凝集を引き起こす。シグナル伝達のためには、両方のサブユニットが要求されるが、IFNγに対する実際の結合性部位は、IFNγR1上に位置する(Kearney S.ら、「Differential effects of type I and II interferons on myeloid cells and resistance to intracellular bacterial infections」.Immunol Res.、2013年3月、55(0):187~200)。IFNγが、IFNγR1サブユニットと相互作用する場合、IFNγは、IFNγR1サブユニットと、IFNγR2サブユニットとの緊密な会合を可能とする、コンフォメーション変化を誘導する。受容体内の、これらの再配置は、受容体と構成的に会合する、Janus関連キナーゼ(JAK)の自己リン酸化および交差リン酸化を誘導する。IFNγR1は、JAK1に対する結合性モチーフを含有し、IFNγR2は、JAK2に対する結合性モチーフを含有する。JAKタンパク質のリン酸化は、それらの触媒活性を刺激し、次いで、IFNγR1のC末端におけるチロシン残基(Y440)をリン酸化する。このリン酸化チロシン残基は、転写シグナル伝達因子兼活性化因子1(STAT-1)タンパク質上のSH2ドメインに対するドッキング部位をもたらす。各受容体の複合体は、2つのIFNγR1サブユニットを含有するため、2つのSTAT-1タンパク質は、受容体に結合することが可能である。JAK1およびJAK2は、受容体との会合を維持し、動員された各STAT-1タンパク質を、チロシン残基701(Y701)においてリン酸化する。このリン酸化は、STAT-1単量体の、受容体からの放出、およびこれらによる、ホモ二量体の形成を可能とする。STAT-1ホモ二量体は、核へと移行し、IFN誘導遺伝子(ISG)のプロモーターDNA内のガンマ活性化配列(GAS)に結合する結果として、これらの転写の増大をもたらす。I型IFNは、IFNγにより活性化されるものと同様に、カノニカルのJAK/STAT経路を介してシグナル伝達する。IFNαRへのリガンドの結合は、2つの受容体サブユニットの二量体化、ならびにこれらと会合したTYK2キナーゼおよびJAK1キナーゼへのリン酸転移を惹起する。キナーゼは、それらのSH2ドメインを介して、タンパク質であるSTAT1およびSTAT2を動員するように、IFNαR1およびIFNαR2の細胞質テール内の残基をリン酸化する。これらのSTATタンパク質の、受容体サブユニットへのドッキングは、STAT-1上のY701およびSTAT-2上のY690における、活性化JAKタンパク質によりこれらのリン酸化を可能とする。STAT単量体のリン酸化は、それらを、それらのドッキング部位から放出し、それらが、二量体化し、ホモ二量体形態またはヘテロ二量体形態で、IRF9と組み合わされて、転写因子ISG因子3(ISGF3)を産生することを可能とする。ISGF3は、核へと移行して、ISGを同定し、それらの転写を誘導する。I型IFNシグナル伝達により誘導されるISGは、典型的に、それらのプロモーター内に、インターフェロン刺激応答エレメント(ISRE)またはガンマ活性化配列(GAS)エレメントを含有するが、ISREを含有する遺伝子が、明らかに優先される。I型IFNの結果として転写されるISGの一部の例は、遺伝子である、ISG15、IP-10、IRF-7、およびPKR[66]を含有するISRE、ならびに遺伝子である、IRF-1、IRF-2、IRF-8、およびIRF-9を含有するGASである(Kearney S.ら、「Differential effects of type I and II interferons on myeloid cells and resistance to intracellular bacterial infections」.Immunol Res.、2013年3月、55(0):187~200)。
組換えキメラ受容体タンパク質
[00207]本明細書では、(i)膜貫通ドメインおよび(ii)貪食受容体細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインを含む貪食または繋留受容体(PR)サブユニットのクラス(例えば、貪食受容体融合タンパク質(PFP));ならびに抗原、例えば、標的細胞の抗原、または標的細胞上に提示される抗原に特異的である細胞外抗原結合性ドメインが提供され、融合受容体の抗原結合性ドメインによる標的への抗原結合が、貪食受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを活性化するように、膜貫通ドメインおよび抗原結合性ドメインが作動的に連結されている。
[00207]本明細書では、(i)膜貫通ドメインおよび(ii)貪食受容体細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインを含む貪食または繋留受容体(PR)サブユニットのクラス(例えば、貪食受容体融合タンパク質(PFP));ならびに抗原、例えば、標的細胞の抗原、または標的細胞上に提示される抗原に特異的である細胞外抗原結合性ドメインが提供され、融合受容体の抗原結合性ドメインによる標的への抗原結合が、貪食受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを活性化するように、膜貫通ドメインおよび抗原結合性ドメインが作動的に連結されている。
[00208]一部の実施形態では、CFPの細胞外ドメインは、Ig結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、FcRγI、FcRγIIA、FcRγIIB、FcRγIIC、FcRγIIIA、FcRγIIIB、FcRn、TRIM21、FcRL5結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞外ドメインは、FcR細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞外ドメインは、FcRα、FcRβ、FcRε、またはFcRγの細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、FcRα(FCAR)細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、FcRβ細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、FCER1A細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、FCGR1A、FCGR2A、FCGR2B、FCGR2C、FCGR3A、またはFCGR3Bの細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、インテグリンドメインまたはインテグリン受容体ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、1つまたは複数のインテグリンドメインである、α1、α2、αIIb、α3、α4、α5、α6、α7、α8、α9、α10、α11、αD、αE、αL、αM、αV、αX、β1、β2、β3、β4、β5、β6、β7、またはβ8を含む。
[00209]一部の実施形態では、CFPは、膜貫通ドメインへと、作動的に連結された、抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、受容体の細胞外ドメイン、ヒンジ、スペーサー、および/またはリンカーをさらに含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、貪食受容体の細胞外部分を含む。一部の実施形態では、CFPの細胞外部分は、細胞内シグナル伝達ドメインが由来する受容体と同じ受容体に由来する。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、スカベンジャー受容体の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、免疫グロブリンのドメインを含む。一部の実施形態では、免疫グロブリンのドメインは、免疫グロブリンの細胞外ドメインまたは免疫グロブリンのヒンジ領域を含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、食細胞貪食ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、多量体アセンブリーが可能な構造を含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、多量体化のための土台を含む。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、300、300、400、または500アミノ酸の長さである。一部の実施形態では、細胞外ドメインは、最大で、500、400、300、200、または100アミノ酸の長さである。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、標的細胞の抗原に特異的に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、抗体ドメインを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、受容体ドメイン、抗体ドメインを含み、この場合、抗体ドメインは、単鎖可変断片(scFv)、Fab、単一ドメイン抗体(sdAb)、ナノボディー、VHドメイン、VLドメイン、VNARドメイン、VHHドメイン、二特異性抗体、ダイアボディー、またはこれらの機能的断片もしくは組合せである、機能的抗体断片を含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、リガンド、受容体の細胞外ドメイン、またはアダプターを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、単一の抗原に特異的である、単一の抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、少なくとも2つの抗原結合性ドメインを含み、この場合、少なくとも2つの抗原結合性ドメインの各々は、異なる抗原に特異的である。
[00210]一部の実施形態では、抗原は、がん関連抗原、系統関連抗原、病原性抗原、または自己免疫性抗原である。一部の実施形態では、抗原は、ウイルス抗原を含む。一部の実施形態では、抗原は、Tリンパ球抗原である。一部の実施形態では、抗原は、細胞外抗原である。一部の実施形態では、抗原は、細胞内抗原である。一部の実施形態では、抗原は、チミジンキナーゼ(TK1)、ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)、受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1)、ムチン1、ムチン16(MUC16)、MUC1、表皮増殖因子受容体vIII(EGFRvIII)、メソテリン、ヒト表皮増殖因子受容体2(HER2)、EBNA-1、LEMD1、ホスファチジルセリン、癌胎児性抗原(CEA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、グリピカン3(GPC3)、濾胞刺激ホルモン受容体、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、エリスロポエチン産生肝細胞癌A2(EphA2)、EphB2、ナチュラルキラー2D(NKG2D)群リガンド、ジシアロガングリオシド2(GD2)、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD19、CD20、CD22、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44v6、CD45、CD56CD79b、CD97、CD117、CD123、CD133、CD138、CD171、CD179a、CD213A2、CD248、CD276、PSCA、CS-1、CLECL1、GD3、PSMA、FLT3、TAG72、EPCAM、IL-1、インテグリン受容体、PRSS21、VEGFR2、PDGFRβ、SSEA-4、EGFR、NCAM、プロスターゼ、PAP、ELF2M、GM3、TEM7R、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、Dsg1、Dsg3、IGLL1、およびこれらの組合せに由来する抗原からなる群から選択される。一部の実施形態では、抗原は、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CCR4、CD8、CD30、CD45、およびCD56からなる群から選択されるタンパク質の抗原である。一部の実施形態では、抗原は、卵巣がん抗原またはTリンパ腫抗原である。一部の実施形態では、抗原は、インテグリン受容体の抗原である。一部の実施形態では、抗原は、α1、α2、αIIb、α3、α4、α5、α6、α7、α8、α9、α10、α11、αD、αE、αL、αM、αV、αX、β1、β2、β3、β4、β5、β6、β7、およびβ8からなる群から選択される、インテグリン受容体またはインテグリンの抗原である。一部の実施形態では、抗原は、インテグリン受容体リガンドの抗原である。一部の実施形態では、抗原は、フィブロネクチン、ビトロネクチン、コラーゲン、またはラミニンの抗原である。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、2つまたはこれを超える、異なる抗原に結合しうる。
[00211]一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、本明細書で提示される表中の抗原結合性ドメインの配列など、本明細書で提示される抗原結合性ドメインの配列を含む。
[00212]一部の実施形態では、標的タンパク質は、CD70である。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、抗CD70抗体またはその結合性断片を含み、この場合、抗原結合性ドメインは、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAPRSIFSINAMGWYRQAPGKQRELVAAITSGGSPTYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCATGPYGLDNALDAWGQGTQVTVSSおよびQVQLQESGGGLVQTGGSLRLACTASGFTFDDYAIAWFRQAPGKEREFVAAISWSGGTTHYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKPEDTAVYFCAKSLRSSPSSRWFGSRGQGTQVTVSSからなる群から選択されるVH配列のうちのいずれか1つの、HC CDR3である、重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む、重鎖可変ドメイン(VH)を含む。一部の実施形態では、抗CD70抗体またはその結合性断片のVHは、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAPRSIFSINAMGWYRQAPGKQRELVAAITSGGSPTYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCATGPYGLDNALDAWGQGTQVTVSSおよびQVQLQESGGGLVQTGGSLRLACTASGFTFDDYAIAWFRQAPGKEREFVAAISWSGGTTHYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKPEDTAVYFCAKSLRSSPSSRWFGSRGQGTQVTVSSからなる群から選択されるVH配列のうちのいずれか1つの、
HC CDR1である、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)をさらに含む。一部の実施形態では、抗CD70抗体またはその結合性断片のVHは、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAPRSIFSINAMGWYRQAPGKQRELVAAITSGGSPTYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCATGPYGLDNALDAWGQGTQVTVSSおよびQVQLQESGGGLVQTGGSLRLACTASGFTFDDYAIAWFRQAPGKEREFVAAISWSGGTTHYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKPEDTAVYFCAKSLRSSPSSRWFGSRGQGTQVTVSSからなる群から選択されるVH配列のうちのいずれか1つの、HC CDR2である、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)をさらに含む。一部の実施形態では、抗CD70抗体またはその結合性断片のVHは、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAPRSIFSINAMGWYRQAPGKQRELVAAITSGGSPTYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCATGPYGLDNALDAWGQGTQVTVSSおよびQVQLQESGGGLVQTGGSLRLACTASGFTFDDYAIAWFRQAPGKEREFVAAISWSGGTTHYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKPEDTAVYFCAKSLRSSPSSRWFGSRGQGTQVTVSSからなる群から選択される配列のうちのいずれか1つに対する、70~100%の配列同一性を有する。一部の実施形態では、VHは、単一ドメイン抗体のドメインである。一部の実施形態では、VHは、VHHである。
HC CDR1である、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)をさらに含む。一部の実施形態では、抗CD70抗体またはその結合性断片のVHは、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAPRSIFSINAMGWYRQAPGKQRELVAAITSGGSPTYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCATGPYGLDNALDAWGQGTQVTVSSおよびQVQLQESGGGLVQTGGSLRLACTASGFTFDDYAIAWFRQAPGKEREFVAAISWSGGTTHYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKPEDTAVYFCAKSLRSSPSSRWFGSRGQGTQVTVSSからなる群から選択されるVH配列のうちのいずれか1つの、HC CDR2である、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)をさらに含む。一部の実施形態では、抗CD70抗体またはその結合性断片のVHは、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAPRSIFSINAMGWYRQAPGKQRELVAAITSGGSPTYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKAEDTAVYYCATGPYGLDNALDAWGQGTQVTVSSおよびQVQLQESGGGLVQTGGSLRLACTASGFTFDDYAIAWFRQAPGKEREFVAAISWSGGTTHYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLKPEDTAVYFCAKSLRSSPSSRWFGSRGQGTQVTVSSからなる群から選択される配列のうちのいずれか1つに対する、70~100%の配列同一性を有する。一部の実施形態では、VHは、単一ドメイン抗体のドメインである。一部の実施形態では、VHは、VHHである。
[00213]一部の実施形態では、標的タンパク質は、GPC3である。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、抗GPC3抗体またはその結合性断片を含み、この場合、抗原結合性ドメインは、ATACADTTQYAYDY、ATACADTTLYEYDY、ATACVDTTQYEYDY、ATACADATQHEYDY、ATACADTTQYDYDY、ATACADTTQYEYDY、ATACADTTHYEYDY、ATACVITTLYEYDY、ATACAETTLYEYDY、ATACADTTQHEYDY、ATACVDTTHYEYDY、ATACASTTLYEYDY、ATACVVTTLYEYDY、ATACGGATGPYDY、ATACAGAIGPYDY、ATACVVVGDQNDY、ATACVVVGDRNDY、ATDCAGGTSTPYDY、ATDCAGGTATPYDY、ATACVVADRNEYDY、ATSCVVVTKNEYDY、ATACSGLTHEYDY、ATTCSGLTHEYDY、ATACANWSSLGPYDY、ATACANWSTLGPYDY、ATACSDPRVYEYDY、ATTCASPEKYEYDY、ATHCGGTSWGTSYDY、ATHCGGSSWSNEYDY、YARYSGRTY、ASSAWPAGPKHQVEYDY、ATACGSLVGMYDY、ATACGSAVHEYDY、ATDCVGFGSNWFDY、ATACASPVIYEYDY、ATDCAGGVGHEYDY、ATDCSLHGSDYPYDYおよびAVRIYSGSFDNTLAYDYからなる群から選択される配列のうちのいずれか1つの、重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む、重鎖可変ドメイン(VH)を含む。一部の実施形態では、抗GPC3抗体またはその結合性断片のVHは、GFPLAYYA、GFSLDYYA、GFPLDYYA、GFTLDYYA、GFSLNYYA、GFTLAYYA、GFTLGYYA、GFPLNYYA、GFPLHYYA、GFSLGYYA、GFPLGYYA、GFPLEYYA、GSDFRADA、GRTFSSYG、GFSLAYYAおよびGLTFRSVGからなる群から選択される配列のうちのいずれか1つの、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)をさらに含む。一部の実施形態では、抗GPC3抗体またはその結合性断片のVHは、ISNSDGST、ISASDGST、ISSSDGST、ISSSDGNT、ISSADGST、ISSSGGST、ISSGDGST、ISAGDGNT、ISSSDDST、ISSNDGST、ISSPDGST、ISSRTGGT、ISAGDGSST、ISSSDGSSSDGNT、ISSGDGNT、ISSGDGKT、ISSSDGGT、ISSRTGST、ISSRTGNT、ISSSDGHSST、ISSSSDGNT、ISASNGNT、ISSGSDGNT、ISASDGNT、IDSITSI、ISWSGGSTIAASVGST、ISSSDGSDGNTおよびASPSGVITからなる群から選択される配列のうちのいずれか1つの、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)をさらに含む。一部の実施形態では、抗GPC3抗体またはその結合性断片のVHは、QVQLQESGGGLVHSGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADAVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVHSGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSADGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLGPEDTAVYYCATACADTTQYDYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVHSGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRRAPGKEREGVSCISSGDGKTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACAGAIGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVPPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSADGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLGPEDTAVYYCATACADTTQYDYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFSLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGHSSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNNLKPEDTAVYYCATDCAGGTATPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSSYGMGWFRQAPGKEREFVAAISWSGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCASSAWPAGPKHQVEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVACISSRTGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVALQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQDGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISASDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACAETTLYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGESLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACANWSTLGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGESLRLSCAASGFTLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNRLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLKLSCAASGSDFRADAMGWYRQAPGKEREPVAIDSITSIYYVDSVEGRFTISRDNTKNTVYLQMTSLKPEDTAVYYCYARYSGRTYWGRGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISASDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCATACADTTLYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADAVKGRFAISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACSDPRVYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADAVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADAVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVDTTHYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADATQHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLGPEDTAVYYCATACADTTQYDYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLAYYAIGWFRRAPGKEREGVSCISSSDGNTYYADAVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISAGDGSSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACASTTLYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSADGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNAVYLQMNSLGPEDTAVYYCATACADTTQYDYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSADGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLGPEDTAVYYCATACADTTQYDYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSADGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVDTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSPDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVDTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDCSLHGSDYPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLEYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACSDPRVYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDDSTYYADSVKGRFTISRDNDKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDCAGGTSTPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLHYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSGDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATSCVVVTKNEYDYWGQGTQVTVSS、
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QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLHYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLHYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVADRNEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLHYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCATACVVADRNEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLNYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISASDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATTCASPEKYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLNYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFIISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFPLNYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGSAVHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCIAASVGSTYYADSVKGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDCAGGVGHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNAVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNAVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVDTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDCAGGTSTPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSLNYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISAGDGNTYYADSVKGRFTISRDNAANTVSLQMDSLKPEDTAVYYCATACVITTLYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLAYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVACISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVACISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPQDTAVYYCATACGSLVGMYDYWGQGTQVTVSP、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISASDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATTCASPEKYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISASNGNTYYADSVKGRFTISRDSAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATTCSGLTHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSGDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSGDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATHCGGSSWSNEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSNDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQHEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGGTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSSSDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNNLKPEDTAVYYCATACVVTTLYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSP、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNMLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACASPVIYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDCAGGTSTPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACADTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACANWSSLGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTGVYYCATACGGATGPYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCEGSGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSGDGNTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDCVGFGSNWFDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVACISSRTGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVALQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGGTYYADSVKGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDRNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGGTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVDTTQYEYDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGGTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGNTYYADSVKGRFTISRDDAKNMVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGSTYYADSVKGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLGYYAIGWFRQALGKEREGVSCISSRTGSTYYADSVKGRFTVSRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGSTYYADSVKGRFAISRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGSTYYADSVKGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLGYYAIGWFRQAPGKEREGVSCISSRTGSTYYADSVKGRFTVSRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATACVVVGDQNDYWGQGTQVTVSS、QVQLQESGGGL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[00214]一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、Dsg1またはDsg3など、自己抗原またはその断片を含む。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、受容体ドメインまたは抗体ドメインを含み、この場合、抗体ドメインは、Dsg1またはDsg3などの自己抗原に結合する。
[00215]一部の実施形態では、膜貫通ドメインおよび抗原結合性ドメインは、リンカーを介して作動的に連結される。一部の実施形態では、膜貫通ドメインおよび抗原結合性ドメインは、CD8α、IgG1、またはIgG4のヒンジ領域などのリンカーを介して作動的に連結される。
[00216]一部の実施形態では、細胞外ドメインは、多量体化土台を含む。
[00217]一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD28膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD68膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD2膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、FcR膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、FcRγ膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、FcRα膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、FcRβ膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、FcRε膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、シンタキシン3またはシンタキシン4またはシンタキシン5などのシンタキシンに由来する膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CFPが、細胞内で発現されると、内因性受容体の膜貫通ドメインと共にオリゴマー化する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CFPが、細胞内で発現されると、外因性受容体の膜貫通ドメインと共にオリゴマー化する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CFPが、細胞内で発現されると、内因性受容体の膜貫通ドメインと共に二量体化する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CFPが、細胞内で発現されると、外因性受容体の膜貫通ドメインと共に二量体化する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、細胞内シグナル伝達ドメインが由来するタンパク質と異なるタンパク質に由来する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、細胞外ドメインが由来するタンパク質と異なるタンパク質に由来する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、貪食受容体の膜貫通ドメインを含む。一部の実施形態では、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメインは、同じタンパク質に由来する。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、細胞内シグナル伝達ドメインと同じタンパク質に由来する。一部の実施形態では、組換え核酸は、DAP12動員ドメインをコードする。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、DAP12と共にオリゴマー化する膜貫通ドメインを含む。
[00218]一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、少なくとも12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、または32アミノ酸の長さである。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、最大で、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、または32アミノ酸の長さである。
[00219]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、貪食受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、Megf10、MerTk、FcRα、またはBai1から選択される貪食受容体以外の貪食受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TNFR1、MDA5、CD40、レクチン、デクチン1、CD206、スカベンジャー受容体A1(SRA1)、MARCO、CD36、CD163、MSR1、SCARA3、COLEC12、SCARA5、SCARB1、SCARB2、CD68、OLR1、SCARF1、SCARF2、CXCL16、STAB1、STAB2、SRCRB4D、SSC5D、CD205、CD207、CD209、RAGE、CD14、CD64、F4/80、CCR2、CX3CR1、CSF1R、Tie2、HuCRIg(L)、CD64、CD32a、CD16a、CD89、Fcアルファ受容体I、CR1、CD35、CD3ζ、CR3、CR4、Tim-1、Tim-4、およびCD169からなる群から選択される貪食受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、PI3K動員ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、スカベンジャー受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、CD47阻害ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、Rac阻害ドメイン、Cdc42阻害ドメイン、またはGTPアーゼ阻害ドメインを含む。一部の実施形態では、Rac阻害ドメイン、Cdc42阻害ドメイン、またはGTPアーゼ阻害ドメインは、PFPを発現する細胞の貪食カップにおいて、Rac、Cdc42、またはGTPアーゼを阻害する。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、F-アクチンディスアセンブリー活性化ドメイン、ARHGAP12活性化ドメイン、ARHGAP25活性化ドメイン、またはSH3BP1活性化ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、ホスファターゼ阻害ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、ARP2/3阻害ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、少なくとも1つのITAMドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはこれを超えるITAMドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、Fcイプシロン受容体1鎖、Fcイプシロン受容体2鎖、Fcガンマ受容体1鎖、Fcガンマ受容体2a鎖、Fcガンマ受容体2b1鎖、Fcガンマ受容体2b2鎖、Fcガンマ受容体3a鎖、Fcガンマ受容体3b鎖、Fcベータ受容体1鎖、TYROBP(DAP12)、CD5、CD16a、CD16b、CD22、CD23、CD32、CD64、CD79a、CD79b、CD89、CD278、CD66d、これらの機能的断片、およびこれらに対する少なくとも1つであるが20を超えない修飾を有するこれらのアミノ酸配列のITAMドメインから選択される、少なくとも1つのITAMドメインを含む。一部の実施形態では、少なくとも1つのITAMドメインは、Srcファミリーキナーゼのリン酸化部位を含む。一部の実施形態では、少なくとも1つのITAMドメインは、Syk動員ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、F-アクチン脱重合活性化ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、酵素活性を欠く。
[00220]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメインに由来するドメインを含まない。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、MerTK細胞内ドメインに由来するドメインを含まない。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TLR4細胞内ドメインに由来するドメインを含まない。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、CD47阻害ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、PSGL-1の細胞内領域など、インテグリンを活性化するドメインを含む。
[00221]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、EPACおよびC3Gに由来するドメインなど、GTPアーゼであるRap1を活性化するドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、パキシリンに由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、接着斑キナーゼを活性化する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、単一の貪食受容体に由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、単一のスカベンジャー受容体に由来する。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、貪食増強ドメインを含む。
[00222]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、炎症促進性シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、炎症促進性シグナル伝達ドメインは、キナーゼ活性化ドメインまたはキナーゼ結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、炎症促進性シグナル伝達ドメインは、IL-1シグナル伝達カスケード活性化ドメインを含む。一部の実施形態では、炎症促進性シグナル伝達ドメインは、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、STING、NLRPファミリーメンバーであるNLRP1~14、NOD1、NOD2、ピリン、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、CD40、Tank1結合性キナーゼ(TBK)、カスパーゼドメイン、プロカスパーゼ結合性ドメイン、またはこれらの任意の組合せに由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[00223]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、コネキシン(Cx)タンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含む。例えば、細胞内ドメインは、Cx43、Cx46、Cx37、Cx40、Cx33、Cx50、Cx59、Cx62、Cx32、Cx26、Cx31、Cx30.3、Cx31.1、Cx30、Cx25、Cx45、Cx47、Cx31.3、Cx36、Cx31.9、Cx39、Cx40.1、またはCx23に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。例えば、細胞内ドメインは、Cx43に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。
[00224]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、SIGLECタンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含む。例えば、細胞内ドメインは、Siglec-1(シアロアデシン)、Siglec-2(CD22)、Siglec-3(CD33)、Siglec-4(MAG)、Siglec-5、Siglec-6、Siglec-7、Siglec-8、Siglec-9、Siglec-10、Siglec-11、Siglec-12、Siglec-13、Siglec-14、Siglec-15、Siglec-16、またはSiglec-17に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。
[00225]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、TLRタンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、エンドリソソームTLR、例えば、TLR3、TLR7、TLR8、またはTLR9の細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLR3タンパク質に由来しうる。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLR7タンパク質、TLR8タンパク質、またはTLR9タンパク質に由来しうる。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、細胞表面TLR1、同TLR2、同TLR4、同TLR5、同TLR6、および同TLR10の、細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。
[00226]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、構築物を発現する骨髄細胞の、有効性および貪食可能性を最大化するために、別の細胞内ドメインまたは膜貫通ドメインと、特異的に対にされる。例えば、一部の実施形態では、CD64 TMまたはその一部を含む膜貫通ドメインは、自然免疫アダプタータンパク質のICDもしくはPI3キナーゼ動員ドメイン、またはこれらの両方を含む、細胞内シグナル伝達ドメインと、特異的に対にされうる。一部の実施形態では、キメラ受容体細胞内ドメイン(複数可)および/または膜貫通ドメインによる、ドメインの組合せは、構築物を発現する細胞、例えば、骨髄細胞の貪食指数を最大化することへと方向付けられる。一部の実施形態では、キメラ受容体細胞内ドメイン(複数可)および/または膜貫通ドメインによる、ドメインの組合せは、細胞が、標的細胞を溶解し、免疫を長期にわたり応答性とするために、免疫応答経路を活性化することが可能であるように、構築物を発現する細胞の炎症可能性を最大化することへと方向付けられる。一部の実施形態では、キメラ受容体細胞内ドメイン(複数可)および/または膜貫通ドメインによる、ドメインの組合せは、キメラタンパク質を発現する細胞によるトニックシグナル伝達を最小化するか、または消失させることへと方向付けられる。一部の実施形態では、キメラ受容体細胞内ドメイン(複数可)および/または膜貫通ドメインによる、ドメインの組合せは、免疫応答の特異性を最大化することへと方向付けられる。
[00227]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、C型レクチンタンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含む。例えば、細胞内ドメインは、マンノース受容体タンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。例えば、細胞内ドメインは、アシアロ糖タンパク質受容体タンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。例えば、細胞内ドメインは、マクロファージガラクトース型レクチン(MGL)、DC-SIGN(CLEC4L)、ランジェリン(CLEC4K)、骨髄系DAP12会合レクチン(MDL)1(CLEC5A)、DC関連C型レクチン1(デクチン1)サブファミリータンパク質、デクチン1/CLEC7A、DNGR1/CLEC9A、骨髄系C型レクチン様受容体(MICL)(CLEC12A)、CLEC2(CLEC1B)、CLEC12B、DC免疫受容体(DCIR)サブファミリータンパク質、DCIR/CLEC4A、デクチン2/CLEC6A、血中DC抗原2(BDCA2)(CLEC4C)、Mincle(macrophage inducible C type lectin)(CLEC4E)、NOD様受容体タンパク質、NOD様受容体MHCクラスIIトランス活性化因子(CIITA)、IPAF、BIRC1、RIG-I様受容体(RLR)タンパク質、RIG-I、MDA5、LGP2、NAIP5/Birc1e、NLRPタンパク質、NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP4、NLRP5、NLRP6、NLRP7、NLRP89、NLRP9、NLRP10、NLRP11、NLRP12、NLRP13、NLRP14、NLRタンパク質、NOD1もしくはNOD2、またはこれらの任意の組合せに由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。
[00228]一部の実施形態では、細胞内ドメインは、細胞接着分子に由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含む。例えば、細胞内ドメインは、分子である、IgCAM、カドヘリン、インテグリン、C型レクチン様ドメインタンパク質(CTLD)、および/またはプロテオグリカンに由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。例えば、細胞内ドメインは、E-カドヘリン、P-カドヘリン、N-カドヘリン、R-カドヘリン、B-カドヘリン、T-カドヘリン、またはM-カドヘリンに由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。例えば、細胞内ドメインは、E-セレクチン、L-セレクチン、またはP-セレクチンなどのセレクチンに由来する細胞内シグナル伝達ドメインなどのシグナル伝達ドメインを含みうる。
[00229]一部の実施形態では、CFPは、全長細胞内シグナル伝達ドメインを含まない。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、少なくとも5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、300、300、400、または500アミノ酸の長さである。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、最大で、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、300、300、400、または500アミノ酸の長さである。
[00230]一部の実施形態では、組換え核酸は、FcRα鎖細胞外ドメイン、FcRα鎖膜貫通ドメイン、および/またはFcRα鎖細胞内ドメインをコードする。一部の実施形態では、組換え核酸は、FcRβ鎖細胞外ドメイン、FcRβ鎖膜貫通ドメイン、および/またはFcRβ鎖細胞内ドメインをコードする。一部の実施形態では、FcRα鎖またはFcRβ鎖は、細胞内で発現されると、FcRγと複合体を形成する。一部の実施形態では、FcRα鎖またはFcRβ鎖は、細胞内で発現されると、内因性FcRγと複合体を形成する。一部の実施形態では、FcRα鎖またはFcRβ鎖は、FcRγを発現しない細胞膜へと組み込まれない。一部の実施形態では、CFPは、FcRα鎖細胞内シグナル伝達ドメインを含まない。一部の実施形態では、CFPは、FcRβ鎖細胞内シグナル伝達ドメインを含まない。一部の実施形態では、組換え核酸は、TREM細胞外ドメイン、TREM膜貫通ドメイン、および/またはTREM細胞内ドメインをコードする。一部の実施形態では、TREMは、TREM1、TREM2、またはTREM3である。
[00231]一部の実施形態では、組換え核酸は、炎症促進性ポリペプチドをコードする配列を含む。一部の実施形態では、組成物は、組換え核酸内の、炎症促進性ヌクレオチドまたはヌクレオチド、例えば、ATP、ADP、UTP、UDP、および/またはUDP-グルコースをさらに含む。
細胞内インターフェロン応答性ドメイン
[00232]大半のTLRは、免疫応答の一部としての、炎症促進性遺伝子の発現を駆動する、転写因子タンパク質NF-κBを活性化する、MyD88と呼ばれるアダプタータンパク質を活性化する。TLRの亜群(TLR3およびTLR4)は、キナーゼ酵素が、リン酸基を、転写因子であるIRF3へと付加することを可能とする土台として作用するタンパク質TRIFに係合しうる。このリン酸化は、広範な遺伝子発現プログラムを活性化する、インターフェロン調節因子(IRF)と称される転写因子ファミリーのメンバーである、IRF3を活性化する。これらのプログラムの顕徴は、I型インターフェロン分子の産生である。インターフェロンは、適応免疫応答と称される、免疫系の一部門の、強力な駆動因子であるので、それらの存在は、自己免疫に寄与する危険性を冒す。宿主自身の免疫系による、このような攻撃を防止するために、インターフェロン応答は、緊密に調節されなければならない。安全弁として、IRF3が活性化される前に、TRIF内のアミノ酸残基の特定の配列である、pLxISモチーフがリン酸化されなければならない。この対照機構は、TLRシグナル伝達のためのアダプタータンパク質としてのTRIFのみに特異的ではなく、IRF3または類縁タンパク質であるIRF7を関与させて、インターフェロン発現を駆動する、センシング経路の一般的顕徴である、「ライセンシングステップ」をもたらす。核酸の認識を、I型インターフェロンの産生とつなぐ、同定された、あらゆる自然センシング経路は、1つの経路を例外として、これまでに、pLxISモチーフを含有することが公知である、3つのアダプタータンパク質:TRIF、MAVS、およびSTINGのうちの1つを介してシグナル伝達することが示されている。したがって、pLxISモチーフ含有アダプタータンパク質は、核酸認識を、抗ウイルス防御へと、特異的に回路付ける。一部の実施形態では、CFPの細胞内シグナル伝達ドメインは、自然免疫応答タンパク質のICDを含む。一部の実施形態では、自然免疫応答タンパク質は、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、STING、MAVS、TRIF、TASL、NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP4、NLRP5、NLRP6、NLRP7、NLRP89、NLRP9、NLRP10、NLRP11、NLRP12、NLRP13、NLRP1~14、NOD1、NOD2、Pyrin、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、CD40、Tank1結合性キナーゼ(TBK)、TNFR1、ケモカイン、MHCクラスIIトランス活性化因子(CIITA)、IPAF、BIRC1、RIG-I様受容体(RLR)タンパク質、マクロファージガラクトース型レクチン(MGL)、DC-SIGN(CLEC4L)、ランジェリン(CLEC4K)、骨髄系DAP12会合レクチン(MDL)1(CLEC5A)、DC関連C型レクチン1(デクチン1)サブファミリータンパク質、デクチン1/CLEC7A、DNGR1/CLEC9A、骨髄系C型レクチン様受容体(MICL)(CLEC12A)、CLEC2(CLEC1B)、CLEC12B、DC免疫受容体(DCIR)サブファミリータンパク質、DCIR/CLEC4A、デクチン2/CLEC6A、血中DC抗原2(BDCA2)(CLEC4C)、Mincle(マクロファージ誘導性C型レクチン)(CLEC4E)に由来する細胞内シグナル伝達ドメインから選択される。一部の実施形態では、CFPは、アミノ酸配列モチーフである、pLxISを含む、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内インターフェロン誘導性部分は、配列番号36~41から選択されるアミノ酸配列を含む。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号30のMDA5細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号36のRIG1細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号37のMyd88細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号38のSTING部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号39のMAVS部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号40のTRIF部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号41のTASL部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。
[00232]大半のTLRは、免疫応答の一部としての、炎症促進性遺伝子の発現を駆動する、転写因子タンパク質NF-κBを活性化する、MyD88と呼ばれるアダプタータンパク質を活性化する。TLRの亜群(TLR3およびTLR4)は、キナーゼ酵素が、リン酸基を、転写因子であるIRF3へと付加することを可能とする土台として作用するタンパク質TRIFに係合しうる。このリン酸化は、広範な遺伝子発現プログラムを活性化する、インターフェロン調節因子(IRF)と称される転写因子ファミリーのメンバーである、IRF3を活性化する。これらのプログラムの顕徴は、I型インターフェロン分子の産生である。インターフェロンは、適応免疫応答と称される、免疫系の一部門の、強力な駆動因子であるので、それらの存在は、自己免疫に寄与する危険性を冒す。宿主自身の免疫系による、このような攻撃を防止するために、インターフェロン応答は、緊密に調節されなければならない。安全弁として、IRF3が活性化される前に、TRIF内のアミノ酸残基の特定の配列である、pLxISモチーフがリン酸化されなければならない。この対照機構は、TLRシグナル伝達のためのアダプタータンパク質としてのTRIFのみに特異的ではなく、IRF3または類縁タンパク質であるIRF7を関与させて、インターフェロン発現を駆動する、センシング経路の一般的顕徴である、「ライセンシングステップ」をもたらす。核酸の認識を、I型インターフェロンの産生とつなぐ、同定された、あらゆる自然センシング経路は、1つの経路を例外として、これまでに、pLxISモチーフを含有することが公知である、3つのアダプタータンパク質:TRIF、MAVS、およびSTINGのうちの1つを介してシグナル伝達することが示されている。したがって、pLxISモチーフ含有アダプタータンパク質は、核酸認識を、抗ウイルス防御へと、特異的に回路付ける。一部の実施形態では、CFPの細胞内シグナル伝達ドメインは、自然免疫応答タンパク質のICDを含む。一部の実施形態では、自然免疫応答タンパク質は、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、STING、MAVS、TRIF、TASL、NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP4、NLRP5、NLRP6、NLRP7、NLRP89、NLRP9、NLRP10、NLRP11、NLRP12、NLRP13、NLRP1~14、NOD1、NOD2、Pyrin、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、CD40、Tank1結合性キナーゼ(TBK)、TNFR1、ケモカイン、MHCクラスIIトランス活性化因子(CIITA)、IPAF、BIRC1、RIG-I様受容体(RLR)タンパク質、マクロファージガラクトース型レクチン(MGL)、DC-SIGN(CLEC4L)、ランジェリン(CLEC4K)、骨髄系DAP12会合レクチン(MDL)1(CLEC5A)、DC関連C型レクチン1(デクチン1)サブファミリータンパク質、デクチン1/CLEC7A、DNGR1/CLEC9A、骨髄系C型レクチン様受容体(MICL)(CLEC12A)、CLEC2(CLEC1B)、CLEC12B、DC免疫受容体(DCIR)サブファミリータンパク質、DCIR/CLEC4A、デクチン2/CLEC6A、血中DC抗原2(BDCA2)(CLEC4C)、Mincle(マクロファージ誘導性C型レクチン)(CLEC4E)に由来する細胞内シグナル伝達ドメインから選択される。一部の実施形態では、CFPは、アミノ酸配列モチーフである、pLxISを含む、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内インターフェロン誘導性部分は、配列番号36~41から選択されるアミノ酸配列を含む。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号30のMDA5細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号36のRIG1細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号37のMyd88細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号38のSTING部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号39のMAVS部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号40のTRIF部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。本明細書では、貪食を増強するための、キメラ抗原受容体融合タンパク質であって、抗原結合性ドメインと、配列番号41のTASL部分を含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCFPが提供される。
[00233]一部の実施形態では、組成物は、炎症促進性ポリペプチドをさらに含む。一部の実施形態では、炎症促進性ポリペプチドは、ケモカイン、サイトカインである。一部の実施形態では、ケモカインは、IL-1、IL3、IL5、IL-6、IL-8、il8IL-12、IL-13、IL-23、TNF、CCL2、CXCL9、CXCL10、CXCL11、IL-18、IL-23、IL-27、CSF、MCSF、GMCSF、IL17、IP-10、RANTES、およびインターフェロンからなる群から選択される。一部の実施形態では、サイトカインは、IL-1、IL3、IL5、IL-6、IL-12、IL-13、IL-23、TNF、CCL2、CXCL9、CXCL10、CXCL11、IL-18、IL-23、IL-27、CSF、MCSF、GMCSF、IL17、IP-10、RANTES、およびインターフェロンからなる群から選択される。
[00234]一部の実施形態では、自然免疫防御において高度に活性であることが公知である、細胞内アダプタータンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインが、キメラ受容体タンパク質内に組み込まれる。一部の実施形態では、1つまたは複数の突然変異が、キメラタンパク質の有効性を損なわずに、天然の細胞内アダプタータンパク質ドメインに特徴的な細胞内刺激に対する、細胞内ドメインの応答性を低減するように、1つまたは複数の細胞内ドメイン内に導入される。一部の実施形態では、このような有効性は、キメラタンパク質を発現させない、同一の細胞と比較した、貪食可能性の増強と称される。一部の実施形態では、このような有効性は、キメラタンパク質を発現させない、同一の細胞と比較した、炎症可能性の増強と称される。一部の実施形態では、このような有効性は、キメラタンパク質を発現させない、同一の細胞と比較した、キメラタンパク質を発現する細胞内の、NFカッパBの活性化、またはインターフェロンの活性化の増強と称される。
[00235]一部の実施形態では、骨髄細胞は、送達のために、特異的に標的化される。骨髄細胞は、PLGA(ポリ(乳酸-co-グリコール酸))および/またはポリビニルアルコール(PVA)などの特化生体分解性ポリマーを使用して標的化されうる。一部の実施形態では、骨髄細胞機能に影響を及ぼすように、1つまたは複数の化合物を、このようなポリマー構造内に、選択的に組み込むことができる。一部の実施形態では、標的化構造は、例えば、1つまたは複数のPLGA層および1つまたは複数のPVA層により多層化される。一部の実施形態では、標的化構造は、層化活性のための秩序にアセンブルされる。一部の実施形態では、標的化ポリマー構造は、骨髄細胞表面に付着し、骨髄細胞を、特異的極性化を付与する微小環境内に維持することなどのために、増殖因子およびサイトカインなど、1つまたは複数の構成要素を送達しうる、柔軟構造など、特異的形状の構成要素に組織化される。一部の実施形態では、ポリマー構造は、骨髄細胞により貪食されず、表面上の付着を維持しうるような構造である。一部の実施形態では、1つまたは複数の増殖因子は、サイトカインなどのM1極性化因子でありうる。一部の実施形態では、1つまたは複数の増殖因子は、サイトカインなどのM2極性化因子でありうる。一部の実施形態では、1つまたは複数の増殖因子は、IFNγなど、マクロファージ活性化サイトカインでありうる。一部の実施形態では、ポリマー構造は、充実性腫瘍内などのin vivo環境において、1つまたは複数の増殖因子の持続放出が可能なである。
[00236]一部の実施形態では、組換え核酸は、炎症のホメオスタシス調節因子をコードする配列を含む。一部の実施形態では、炎症のホメオスタシス調節因子は、mRNAの非翻訳領域(UTR)内の配列である。一部の実施形態では、UTR内の配列は、RNA結合性タンパク質に結合する配列である。一部の実施形態では、翻訳は、RNA結合性タンパク質の、非翻訳領域(UTR)内の配列への結合時に、阻害または阻止される。一部の実施形態では、UTR内の配列は、WWWU(AUUUA)UUUW[配列中、Wは、AまたはUである]のコンセンサス配列を含む。一部の実施形態では、組換え核酸は、バイシストロニックベクター上で発現される。
[00237]一部の実施形態では、標的細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、ヒト細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、病原体により感染された細胞を含む。一部の実施形態では、標的細胞は、がん細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、リンパ球であるがん細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、卵巣がん細胞であるがん細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、乳腺細胞であるがん細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、膵細胞であるがん細胞である。一部の実施形態では、標的細胞は、神経膠芽腫細胞であるがん細胞である。
[00238]一部の実施形態では、組換え核酸は、DNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、RNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、mRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、非修飾mRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、修飾mRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、circRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、tRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、マイクロRNAである。
[00239]本明細書ではまた、本明細書で記載されるCFPをコードする、組換え核酸配列を含むベクターも提供される。一部の実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。一部の実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターである。一部の実施形態では、ベクターは、1つまたは複数のポリペプチドをコードする、少なくとも1つの核酸配列へと作動可能に連結されたプロモーターをさらに含む。一部の実施形態では、ベクターは、ポリシストロニックベクターである。一部の実施形態では、少なくとも1つの核酸配列の各々は、個別のプロモーターへと作動可能に連結される。一部の実施形態では、ベクターは、1つまたは複数の内部リボソーム侵入部位(IRES)をさらに含む。一部の実施形態では、ベクターは、1つまたは複数のポリペプチドをコードする、少なくとも1つの核酸配列に隣接する、5’UTRおよび/または3’UTRをさらに含む。一部の実施形態では、ベクターは、1つまたは複数の調節領域をさらに含む。
[00240]本明細書ではまた、本明細書で記載される組成物の組換え核酸によりコードされるポリペプチドも提供される。
[00241]本明細書では、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインを含む貪食または繋留受容体(PR)サブユニット;ならびに標的細胞の抗原に特異的な抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含むCFP(例えば、貪食受容体融合タンパク質(PFP))をコードする組換え核酸配列を含む組成物であって、膜貫通ドメインと細胞外ドメインとが作動的に連結されており;CFPの標的細胞の抗原への結合時に、CFPを発現する、好中球、単球、骨髄樹状細胞(mDC)、マスト細胞、またはマクロファージなどの骨髄細胞の殺滅または貪食活性が、CFPを発現しない細胞と比較して、少なくとも5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、100%、150%、200%、250%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、または1000%を超えて増大される、組成物が提供される。
[00242]表1は、開示について非限定的であることが意図される、キメラ融合タンパク質ドメインおよび/またはその断片の例示的配列を示す。下線は、Kabatによる番号付けシステムに従い、それぞれの重鎖および軽鎖について、CDR1、CDR2、およびCDR3の順序で、CDR配列を表示する。
[00244]本明細書では、細胞内ドメインが、その標的抗原との接触時に、例えば抗原結合性ドメインの標的抗原との係合時に、骨髄細胞の自然免疫応答を活性化し、その貪食潜在性を活性化し、炎症性サイトカインおよびケモカイン応答、CFPを発現する骨髄細胞の抗原提示およびT細胞活性化を活性化することが可能である、少なくとも1つの自然免疫活性化細胞内ドメイン、例えば、パターン認識受容体細胞内シグナル伝達ドメイン、TLR細胞内シグナル伝達ドメイン、FcR細胞内シグナル伝達ドメイン、細胞内アダプタータンパク質シグナル伝達ドメイン、またはこれらの断片を含む、すぐ上の段落で記載されたCFPをコードする組換え核酸配列が提供される。
[00245]一部の実施形態では、炎症促進性シグナル伝達ドメインは、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、NLRPファミリーメンバーであるNLRP1~14、NOD1、NOD2、ピリン、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、IL-1、IL3、IL5、IL-6、IL-12、IL-13、IL-23、TNF、IL-18、IL-23、IL-27、CSF、MCSF、GMCSF、IL17、IP-10、またはRANTESに由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[00246]一部の実施形態では、CFPは、インターフェロン応答性の転写因子IRF1、IRF2、IRF3、IRF4、IRF5、IRF6、IRF7、IRF8、またはIRF9を活性化するタンパク質に由来する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[00247]一部の実施形態では、CFPは、細胞内アダプタータンパク質に由来する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、アダプタータンパク質は、CFPを、ミトコンドリア区画、小胞体区画、またはリソソーム区画などの細胞小器官へと係留する、膜貫通タンパク質を含みうる。一部の実施形態では、細胞内アダプタータンパク質は、細胞質ゾルタンパク質である。
[00249]一部の実施形態では、例えば、本明細書で記載されるCFPの、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号30のアミノ酸配列、または配列番号30に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、MDA5細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号30に対する少なくとも少なくとも86%、または少なくとも87%、または少なくとも88%、または少なくとも89%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号30に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MDA5細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号30に対する少なくとも少なくとも91%、または少なくとも92%、または少なくとも93%、または少なくとも94%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号30に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、MDA5細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号30に対する少なくとも少なくとも96%、または少なくとも97%、または少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号30に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MDA5細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号30に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MDA5細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号30に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MDA5細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号30に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00250]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号36のアミノ酸配列、または配列番号36に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、RIG-1細胞内ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号36に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、RIG-1細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号36に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、RIG-1細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号36に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、RIG-1細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号36に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、RIG-1細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号36に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、RIG-1細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号36に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00251]一部の実施形態では、CFPの細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号37のアミノ酸配列、または配列番号37に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、MyD88細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号37に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MyD88細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号37に対する少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号37に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、MyD88細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号37に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MyD88細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号37に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MyD88細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号37に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MyD88細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号37に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00252]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号38のアミノ酸配列、または配列番号38に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、STING細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号38に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、STING細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号38に対する少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号38に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、STING細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号38に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、STING細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号38に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、STING細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号38に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、STING細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号38に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00253]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号39もしくは40のアミノ酸配列、または配列番号39もしくは40に対する少なくとも85%の配列同一性を伴うアミノ酸配列を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号39または40に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号39または40に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号39もしくは40に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号39もしくは40に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号39もしくは40に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号39もしくは40に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00254]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号45のアミノ酸配列、または配列番号45に対する少なくとも85%の配列同一性を伴う配列を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号45に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号45に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号45に対する少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号45に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号45に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号45に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、MAVS細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号45に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00255]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号41のアミノ酸配列、または配列番号41に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、TRIF細胞内ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号41に対する少なくとも少なくとも86%、または少なくとも87%、または少なくとも88%、または少なくとも89%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号41に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号41に対する少なくとも少なくとも91%、または少なくとも92%、または少なくとも93%、または少なくとも94%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号41に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号41に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号41に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号41に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号41に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00256]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号43のアミノ酸配列、または配列番号43に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、TRIF細胞内ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号43に対する少なくとも少なくとも86%、または少なくとも87%、または少なくとも88%、または少なくとも89%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号43に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号43に対する少なくとも少なくとも91%、または少なくとも92%、または少なくとも93%、または少なくとも94%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号43に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号43に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号43に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号43に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号43に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00257]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号44のアミノ酸配列、または配列番号44に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、TRIF細胞内ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号44に対する少なくとも少なくとも86%、または少なくとも87%、または少なくとも88%、または少なくとも89%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号44に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号44に対する少なくとも少なくとも91%、または少なくとも92%、または少なくとも93%、または少なくとも94%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号44に対する少なくとも95%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[00258]一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号44に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号44に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号44に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TRIF細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号44に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00259]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号42のアミノ酸配列、または配列番号42に対する少なくとも85%の配列同一性を有する、TASL細胞内ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号42に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TASL細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号42に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TASL細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメインもしくはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびヒンジドメインと共に含む。一部の実施形態では、CFPの細胞内ドメインは、配列番号42に対する少なくとも90%の配列同一性を有する、TASL細胞内シグナル伝達ドメインに由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含み;この場合、CFPは、標的細胞上のCD5分子、標的細胞上のHER2分子、標的細胞上のCD19分子、標的細胞上のTROP2分子、標的細胞上のGPC3分子、標的細胞上のCD70分子、標的細胞上のCD137分子、標的細胞上のCD7分子、標的細胞上のClaudin分子、標的細胞上のCD22分子、または標的細胞上のGP75分子に結合することが可能である、細胞外結合性ドメインを、CD8膜貫通ドメインもしくはCD28膜貫通ドメイン、またはCD64膜貫通ドメインもしくはCD16膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメイン、またはCD40細胞内シグナル伝達ドメインなど、1つまたは複数のさらなる細胞内シグナル伝達ドメインと共に含む。例えば、本明細書で開示される、例示的CFP分子は、配列番号8もしくは配列番号9、またはこれらの両方の配列、あるいは配列番号10または配列番号11の配列を含む、アミノ酸配列を有する、細胞外CD5結合性ドメイン;および配列番号42に対する少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む細胞内ドメインを含む。
[00260]一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的抗CD5結合性CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン、および/もしくはQQYDESPWT(配列番号100)のCDR3配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;配列番号41の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号43の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号44の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号30の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号36の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号37の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号38の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号39の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号40の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号10もしくは配列番号11の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともRGYDWYFDV(配列番号99)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号100のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号45の細胞内ドメインをさらに含む。
[00261]一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的抗HER2結合性CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン、および/もしくはQQHYTTPPT(配列番号102)のCDR3配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;配列番号41の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号43の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号44の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号30の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号36の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号37の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号38の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号39の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号40の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号14もしくは配列番号94の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともWGGDGFYAMDV(配列番号101)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号102のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号45の細胞内ドメインをさらに含む。
[00262]一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的抗TROP2結合性CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン、および/もしくはQQHYITPLT(配列番号104)のCDR3配列を含む軽鎖可変ドメインを含み;配列番号41の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号43の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号44の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号30の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号36の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号37の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号38の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号39の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号40の細胞内ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、本明細書で記載される例示的CFPは、配列番号34もしくは配列番号35の配列を有する細胞外抗原結合性ドメイン、または少なくともGGFGSSYWYFDV(配列番号103)のCDR3配列を含むVHドメイン、および/もしくは配列番号104のCDR3配列を含むVLドメインを含み;配列番号45の細胞内ドメインをさらに含む。
IRF誘導性タンパク質およびIRF活性化経路
[00263]I型IFNは、自然抗ウイルス免疫を媒介する、鍵となるサイトカインであり、このため、炎症促進性応答を駆動する。I型IFNは、微生物の二本鎖(ds)DNA、dsRNA、およびLPSを認識する、cGMP-AMPシンターゼ、レチノイン酸誘導性タンパク質1(RIG-I)様受容体、およびToll様受容体によりたやすく誘導される。これらのシグナル伝達経路は、転写因子IRF-3(IFN regulatory factor 3)の動員および活性化で合流する。アダプタータンパク質STING(IFN遺伝子刺激因子)、MAVS(ミトコンドリア抗ウイルスシグナル伝達)、およびTRIF(TIRドメイン含有アダプター誘導性IFN-β)は、保存的pLxISモチーフを介して、IRF-3の動員を媒介する。リン酸化されたSTING、MAVS、およびTRIFのpLxISモチーフが、一般に、IRF-3に、同様の形で結合するのに対し、モチーフの上流の残基は、特異性を付与する。IFN-αおよびIFN-βなどのI型IFNは、抗ウイルス免疫を媒介する、主要なサイトカインファミリーである。細胞質ゾル中の、微生物dsDNAは、サイクリックジヌクレオチドである、cGAMP(サイクリック[G(2’,5’)pA(3’,5’)p])の合成を触媒する酵素である、cGAS(cGMP-AMP synthase)に結合し、これを活性化する。第2のメッセンジャーとして、cGAMPは、小胞体(ER)膜上に位置するアダプタータンパク質STING(IFN遺伝子刺激因子)に結合し、タンパク質キナーゼTBK1(TANK-binding kinase 1)を介する、転写因子IRF-3(IFN regulatory factor 3)の活性化を方向付ける。リン酸化IRF-3は、二量体化し、核へと移行して、IFN-β遺伝子の転写を惹起する。これに対し、細胞質ゾル中の、ウイルスdsDNAは、アダプタータンパク質MAVS(ミトコンドリア抗ウイルスシグナル伝達)を介して、IRF-3を活性化する、RLR[レチノイン酸誘導性タンパク質1(RIG-I)様受容体]により感知される。さらに、エンドソーム内のウイルスdsRNA、および細菌の細胞壁構成要素であるLPSを認識するTLR(Toll-like receptor)である、TLR3およびTLR4は、それぞれ、また、I型IFNおよび炎症性サイトカインの誘導も媒介する(1)。これらの2つのTLRは、アダプタータンパク質でTRIF(TIRドメイン含有アダプター誘導性IFN-β)を使用して、IRF-3の動員および活性化を媒介する。注目すべきことに、これら3つの自然免疫センサーファミリーのシグナル伝達経路は、TBK1およびIRF-3の活性化で合流する。機構的に述べると、アダプタータンパク質STING、MAVS、およびTRIFは、TBK1またはIKKεによりリン酸化され、IRF-3の、シグナル伝達複合体への動員を媒介する保存的モチーフである、pLxIS(pは、親水性残基を表し、xは、任意の残基を表し、Sは、リン酸化部位を表す)を含有する。TBK1と、IRF-3との近接性の誘導は、IRF-3のリン酸化および活性化を結果としてもたらす。さらに、IRF-3自体もまた、IRF-3の、リン酸化誘導性二量体化/活性化に極めて重要である、pLxISモチーフを含有する。STING、MAVS、およびTRIFのpLxISモチーフ内のリン酸化部位であるセリンの突然変異は、それらのそれぞれのシグナル伝達経路内における、I型IFNの誘導を失効化する。しかし、IRF-3の動員および活性化の正確な分子的機構は、依然として未知である。リン酸化されたSTING(pSTING)、MAVS(pMAVS)、およびTRIF(pTRIF)による、IRF-3の動員の構造的基礎を解明するために、本発明者らは、3つのアダプタータンパク質に由来するpLxISモチーフを含有するペプチドを発現させ、これらを、in vitroにおいて、TBK1によりリン酸化させ、IRF-3のC末端ドメイン(CTD)との、それらの複合体についての結晶構造を決定した。
[00263]I型IFNは、自然抗ウイルス免疫を媒介する、鍵となるサイトカインであり、このため、炎症促進性応答を駆動する。I型IFNは、微生物の二本鎖(ds)DNA、dsRNA、およびLPSを認識する、cGMP-AMPシンターゼ、レチノイン酸誘導性タンパク質1(RIG-I)様受容体、およびToll様受容体によりたやすく誘導される。これらのシグナル伝達経路は、転写因子IRF-3(IFN regulatory factor 3)の動員および活性化で合流する。アダプタータンパク質STING(IFN遺伝子刺激因子)、MAVS(ミトコンドリア抗ウイルスシグナル伝達)、およびTRIF(TIRドメイン含有アダプター誘導性IFN-β)は、保存的pLxISモチーフを介して、IRF-3の動員を媒介する。リン酸化されたSTING、MAVS、およびTRIFのpLxISモチーフが、一般に、IRF-3に、同様の形で結合するのに対し、モチーフの上流の残基は、特異性を付与する。IFN-αおよびIFN-βなどのI型IFNは、抗ウイルス免疫を媒介する、主要なサイトカインファミリーである。細胞質ゾル中の、微生物dsDNAは、サイクリックジヌクレオチドである、cGAMP(サイクリック[G(2’,5’)pA(3’,5’)p])の合成を触媒する酵素である、cGAS(cGMP-AMP synthase)に結合し、これを活性化する。第2のメッセンジャーとして、cGAMPは、小胞体(ER)膜上に位置するアダプタータンパク質STING(IFN遺伝子刺激因子)に結合し、タンパク質キナーゼTBK1(TANK-binding kinase 1)を介する、転写因子IRF-3(IFN regulatory factor 3)の活性化を方向付ける。リン酸化IRF-3は、二量体化し、核へと移行して、IFN-β遺伝子の転写を惹起する。これに対し、細胞質ゾル中の、ウイルスdsDNAは、アダプタータンパク質MAVS(ミトコンドリア抗ウイルスシグナル伝達)を介して、IRF-3を活性化する、RLR[レチノイン酸誘導性タンパク質1(RIG-I)様受容体]により感知される。さらに、エンドソーム内のウイルスdsRNA、および細菌の細胞壁構成要素であるLPSを認識するTLR(Toll-like receptor)である、TLR3およびTLR4は、それぞれ、また、I型IFNおよび炎症性サイトカインの誘導も媒介する(1)。これらの2つのTLRは、アダプタータンパク質でTRIF(TIRドメイン含有アダプター誘導性IFN-β)を使用して、IRF-3の動員および活性化を媒介する。注目すべきことに、これら3つの自然免疫センサーファミリーのシグナル伝達経路は、TBK1およびIRF-3の活性化で合流する。機構的に述べると、アダプタータンパク質STING、MAVS、およびTRIFは、TBK1またはIKKεによりリン酸化され、IRF-3の、シグナル伝達複合体への動員を媒介する保存的モチーフである、pLxIS(pは、親水性残基を表し、xは、任意の残基を表し、Sは、リン酸化部位を表す)を含有する。TBK1と、IRF-3との近接性の誘導は、IRF-3のリン酸化および活性化を結果としてもたらす。さらに、IRF-3自体もまた、IRF-3の、リン酸化誘導性二量体化/活性化に極めて重要である、pLxISモチーフを含有する。STING、MAVS、およびTRIFのpLxISモチーフ内のリン酸化部位であるセリンの突然変異は、それらのそれぞれのシグナル伝達経路内における、I型IFNの誘導を失効化する。しかし、IRF-3の動員および活性化の正確な分子的機構は、依然として未知である。リン酸化されたSTING(pSTING)、MAVS(pMAVS)、およびTRIF(pTRIF)による、IRF-3の動員の構造的基礎を解明するために、本発明者らは、3つのアダプタータンパク質に由来するpLxISモチーフを含有するペプチドを発現させ、これらを、in vitroにおいて、TBK1によりリン酸化させ、IRF-3のC末端ドメイン(CTD)との、それらの複合体についての結晶構造を決定した。
pMAVSおよびpTRIFによる、IRF-3動員の機構。
[00264]cGAS-STING経路を介するdsDNAセンシングと対照的に、RLRは、細胞質ゾル中のdsDNAを感知し、アダプターであるMAVSを介して、IRF-3を活性化し、TLR3およびTLR4は、アダプターであるTRIFを使用して、IRF-3を動員する。MAVSまたはTRIFのpLxISモチーフのリン酸化は、IRF-3の動員および活性化に要求される。
TRAF相互作用性タンパク質:
[00265]約180アミノ酸のタンパク質相互作用性ドメインである、TRAFドメインの存在は、TRAFファミリータンパク質の、顕著に異なる特色であり、哺乳動物では、ファミリー内の7つのTRAFタンパク質中、この基準に従う6つ(TRAF1~TRAF6)が、TRAFファミリーとして同定されている。TRAFドメインは、2つの顕著に異なる領域:TRAF-NドメインおよびTRAF-Cドメインへと細分されうる。多様な受容体が、TRAF-Cドメインに結合するのに対し、多様な細胞内シグナル伝達分子は、TRAF-Nドメインに結合する。TRAFドメインの構造的類似性にも拘わらず、各TRAFタンパク質は、相互作用パートナー:上流の受容体および下流のエフェクター分子に対する特異性を伴う、特異的生体機能を有する。TRAF2のTRAFドメインの構造は、Wu博士の研究グループにより、1999年頃に最初に報告され、TRAF6のTRAFドメインの構造は、同じ研究グループにより、3年後に報告された。それ以来、TRAF3、TRAF5、TRAF4、およびTRAF1のTRAFドメインの構造も報告されている。TRAF構造は、TRAF-Nドメインが、コイルドコイル構造であり、TRAF-Cが、7~8つのアンチパラレルβシートフォールドから構成されることを明らかにした。6つ全てのTRAFファミリーメンバーの構造アライメントは、TRAF-Cドメインのアライメントが、良好であるのに対し、TRAF-Nの位置および長さは、TRAFファミリーメンバー間で変動することを示す。配列解析は、TRAF-Nの長さが、ファミリー内で変動するのに対し、TRAF-Cドメインの長さは、保存的であることを指し示す:TRAF4およびTRAF6のTRAF-Nの長さが、比較的短いのに対し、TRAF3およびTRAF5のTRAF-Nの長さは、比較的長い。全体的構造は、ほぼ同一であるが、明白な構造的差違が観察された。例えば、TRAF4およびTRAF6の、TRAFドメイン内の、一部のループの長さおよび位置は、他のTRAFファミリーメンバーの場合と異なる。TRAF4が、受容体結合性領域の中に、より強く負に帯電した表面を含有するのに対し、TRAF6は、受容体結合性領域内に、より強く正に帯電した表面を含有する。表面特徴は、パートナーとの、それらの相互作用方式を決定することが多いため、TRAF1、TRAF2、TRAF3、およびTRAF5、すなわち、多様な帯電表面間で同様である、TRAFドメインの静電表面は、同様の相互作用方式で、同じ結合性ポケット内に、多様な受容体を受け入れるために重要であることが示されている。これに対し、機能的に異なるTRAFの結合表面上の、異なる特徴である、TRAF4およびTRAF6は、TRAF4およびTRAF6が、異なる相互作用方式で、異なる受容体を受け入れることを指し示す。
[00265]約180アミノ酸のタンパク質相互作用性ドメインである、TRAFドメインの存在は、TRAFファミリータンパク質の、顕著に異なる特色であり、哺乳動物では、ファミリー内の7つのTRAFタンパク質中、この基準に従う6つ(TRAF1~TRAF6)が、TRAFファミリーとして同定されている。TRAFドメインは、2つの顕著に異なる領域:TRAF-NドメインおよびTRAF-Cドメインへと細分されうる。多様な受容体が、TRAF-Cドメインに結合するのに対し、多様な細胞内シグナル伝達分子は、TRAF-Nドメインに結合する。TRAFドメインの構造的類似性にも拘わらず、各TRAFタンパク質は、相互作用パートナー:上流の受容体および下流のエフェクター分子に対する特異性を伴う、特異的生体機能を有する。TRAF2のTRAFドメインの構造は、Wu博士の研究グループにより、1999年頃に最初に報告され、TRAF6のTRAFドメインの構造は、同じ研究グループにより、3年後に報告された。それ以来、TRAF3、TRAF5、TRAF4、およびTRAF1のTRAFドメインの構造も報告されている。TRAF構造は、TRAF-Nドメインが、コイルドコイル構造であり、TRAF-Cが、7~8つのアンチパラレルβシートフォールドから構成されることを明らかにした。6つ全てのTRAFファミリーメンバーの構造アライメントは、TRAF-Cドメインのアライメントが、良好であるのに対し、TRAF-Nの位置および長さは、TRAFファミリーメンバー間で変動することを示す。配列解析は、TRAF-Nの長さが、ファミリー内で変動するのに対し、TRAF-Cドメインの長さは、保存的であることを指し示す:TRAF4およびTRAF6のTRAF-Nの長さが、比較的短いのに対し、TRAF3およびTRAF5のTRAF-Nの長さは、比較的長い。全体的構造は、ほぼ同一であるが、明白な構造的差違が観察された。例えば、TRAF4およびTRAF6の、TRAFドメイン内の、一部のループの長さおよび位置は、他のTRAFファミリーメンバーの場合と異なる。TRAF4が、受容体結合性領域の中に、より強く負に帯電した表面を含有するのに対し、TRAF6は、受容体結合性領域内に、より強く正に帯電した表面を含有する。表面特徴は、パートナーとの、それらの相互作用方式を決定することが多いため、TRAF1、TRAF2、TRAF3、およびTRAF5、すなわち、多様な帯電表面間で同様である、TRAFドメインの静電表面は、同様の相互作用方式で、同じ結合性ポケット内に、多様な受容体を受け入れるために重要であることが示されている。これに対し、機能的に異なるTRAFの結合表面上の、異なる特徴である、TRAF4およびTRAF6は、TRAF4およびTRAF6が、異なる相互作用方式で、異なる受容体を受け入れることを指し示す。
[00266]本開示の目的で、上記の段落で論じられた、任意の経路、シグナル伝達中間項、または活性化部分は、本明細書で開示される、CFPの誘導時に、適用に応じて、活性化可能または機能的であると考えられうる。同様に、本明細書で開示されるCFPは、論じられた経路内で記載される、適用可能な標的のうちのいずれの標的化においても有用でありうる。シグナル伝達ドメイン、シグナル伝達経路、シグナル伝達中間項、活性化遺伝子の転写因子に関する、既存の文献の日付現在において、当業者にたやすく公知である、任意の経路またはその一部は、本開示の予察内にあることが理解される。
TLR細胞内ドメインを伴うキメラタンパク質、TLR細胞内シグナル伝達経路、およびNFカッパBの活性化:
[00267]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLRタンパク質に由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、TLR細胞内シグナル伝達ドメインに由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含むようにデザインされたCFPは、受容体の細胞外ドメインの、その標的への係合時に、NFカッパBを活性化しうる。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、エンドリソソームTLR、例えば、TLR3、TLR7、TLR8、またはTLR9の細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLR3タンパク質に由来しうる。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLR7タンパク質、TLR8タンパク質、またはTLR9タンパク質に由来しうる。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、細胞表面TLR1、同TLR2、同TLR4、同TLR5、同TLR6、および同TLR10の、細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。一部の実施形態では、炎症応答のための細胞質ドメインは、TLR3、TLR4、TLR9、MYD88、TRIF、RIG-1、MDA5、CD40、IFN受容体、NLRP-1、NLRP-2、NLRP-3、NLRP-4、NLRP-5、NLRP-6、NLRP-7、NLRP-8、NLRP-9、NLRP-10、NLRP-11、NLRP-12、NLRP-13、NLRP-14、NOD1、NOD2、Pyrin、AIM2、NLRC4、および/またはCD40の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[00267]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLRタンパク質に由来する、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、TLR細胞内シグナル伝達ドメインに由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含むようにデザインされたCFPは、受容体の細胞外ドメインの、その標的への係合時に、NFカッパBを活性化しうる。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、エンドリソソームTLR、例えば、TLR3、TLR7、TLR8、またはTLR9の細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLR3タンパク質に由来しうる。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TLR7タンパク質、TLR8タンパク質、またはTLR9タンパク質に由来しうる。一部の実施形態では、細胞内ドメインは、細胞表面TLR1、同TLR2、同TLR4、同TLR5、同TLR6、および同TLR10の、細胞内シグナル伝達ドメインを含みうる。一部の実施形態では、炎症応答のための細胞質ドメインは、TLR3、TLR4、TLR9、MYD88、TRIF、RIG-1、MDA5、CD40、IFN受容体、NLRP-1、NLRP-2、NLRP-3、NLRP-4、NLRP-5、NLRP-6、NLRP-7、NLRP-8、NLRP-9、NLRP-10、NLRP-11、NLRP-12、NLRP-13、NLRP-14、NOD1、NOD2、Pyrin、AIM2、NLRC4、および/またはCD40の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
[00268]一部の実施形態では、貪食スカベンジャー受容体(PR)融合タンパク質(PFP)は、IL-1シグナル伝達カスケードの活性化のための、炎症促進性細胞質ドメインを含む。
[00269]一部の実施形態では、キメラ受容体(例えば、貪食性受容体(PR)融合タンパク質(PFP))の細胞質部分は、toll様受容体3(TLR3)、toll様受容体4(TLR4)、toll様受容体7(TLR7)、toll様受容体8(TLR8)、toll様受容体9(TLR9)の細胞内シグナル伝達ドメインなど、toll様受容体に由来する細胞質ドメインを含む。
[00270]一般に、TLRは、多様な細胞内局在、発生経路、活性化、認識、および作用方式を有する。TLRは、樹状細胞(DC)およびマクロファージなどの自然免疫細胞のほか、線維芽細胞および上皮細胞などの非免疫細胞において発現される。細胞表面TLRは、主に、脂質、リポタンパク質、およびタンパク質などの微生物膜成分を認識する。TLR4は、細菌性リポ多糖(LPS)を認識する。TLR2は、TLR1またはTLR6と共に、リポタンパク質、ペプチドグリカン、リポタイコ酸、ザイモサン、マンナン、およびtGPI-ムチンを含む、多種多様なPAMPを認識する。TLR5は、細菌性フラジェリンを認識する。TLR10は、マウスでは、終止コドンの挿入に起因して、偽遺伝子であるが、ヒトTLR10は、TLR2と協同して、リステリア菌に由来するリガンドを認識する。TLR10はまた、A型インフルエンザウイルスによるウイルス感染も感知する。
[00271]細胞内TLRは細菌およびウイルスに由来する核酸を認識し、自己免疫などの疾患状態において、自己核酸もまた認識する。TLR3は、ウイルス性二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA、および損傷細胞に由来する自己RNAを認識する。TLR7は、主に、形質細胞様DC(pDC)内で発現され、ウイルスに由来する一本鎖(ss)RNAを認識する。TLR7はまた、従来型DC(cDC)内の、B型連鎖球菌に由来するRNAも認識する。ヒトTLR8は、ウイルス性RNAおよび細菌性RNAに応答する。構造解析は、非刺激ヒトTLR8は、あらかじめ形成された二量体として存在し、LRR14と、LRR15との間のZループは、N末端側の半分と、C末端側の半分とに切断されるが、互いとの会合を維持し、リガンド認識および二量体化に参与することを明らかにした。リガンドの結合は、2つのC末端を近接させるように、二量体の再組織化を誘導する。TLR13は、細菌性23S rRNA、および未知の水疱性口炎ウイルス構成要素を認識する。TLR9は、非メチル化CpG-DNAモチーフに富む、細菌性DNAおよびウイルス性DNAを認識し;また、宿主ヘモグロビンが消化された後の解毒過程において、Plasmodium falciparumにより産生される、不溶性の結晶性副産物である、ヘモゾインも認識する。TLR11は、エンドリソソーム内に局所化され、尿路病原性大腸菌(UPEC)のフラジェリンまたは未知のタンパク質性構成要素のほか、Toxoplasma gondiiに由来するプロフィリン様分子を認識する。TLR12は、主に、骨髄細胞内で発現され、TLR11と高度に類似し、T.gondiiに由来するプロフィリンを認識する。TLR12は、TLR11を伴う、ホモ二量体またはヘテロ二量体として機能する。全てのTLRは、ER内で合成され、ゴルジ体へと輸送され、細胞表面、またはエンドソームなどの細胞内コンパートメントへと動員される。TLRの細胞内局在は、リガンド認識のほか、TLRが、自己免疫を引き起こしうる、自己核酸と接触することを阻止するために、極めて重要であると考えられる。
[00272]個々のTLRは、MyD88、TRIF、TIRAP/MAL、またはTRAMなど、TIRドメイン含有アダプターのセットのメンバーを、差動的に動員する。MyD88は、全てのTLRにより利用され、炎症性サイトカイン遺伝子の誘導のために、NF-κBおよびMAPKを活性化する。TIRAPは、MyD88を、TLR2およびTLR4などの細胞表面TLRへと動員する、分取アダプターである。TIRAPはまた、TLR9などのエンドソームTLRを介するシグナル伝達にも参与する。TIRAPの脂質結合性ドメインは、細胞膜において、PI(4,5)P2に結合し、エンドソーム上において、PI(3)Pに結合し、これらは、それぞれの部位において、機能的TLR4/TLR9シグナル伝達複合体の形成を媒介する。したがって、TIRAPは、異なる脂質に結合することにより、細胞表面TLRおよびエンドソームTLRの両方と会合する。TRIFは、TLR3およびTLR4へと動員され、I型IFN遺伝子および炎症性サイトカイン遺伝子の誘導のために、IRF3、NF-κB、およびMAPKの活性化をもたらす、代替的経路を促進する。TRAMは、TRIFと、TLR4とを連結するように、TLR3ではなく、TLR4へと、選択的に動員される。TLR3は、TRIFと直接相互作用し、この相互作用は、TLR3の細胞質ドメイン内の2つのチロシン残基の、表皮増殖因子ErbB1およびBtkによるリン酸化を要求する。TLRの係合の後、MyD88は、IRAKキナーゼファミリーのメンバーと共に複合体を形成する。IRAK4は、IRAK1を活性化し、次いで、IRAK1は、いくつかの部位において自己リン酸化され、MyD88から放出される。IRAK1は、RINGドメインE3ユビキチンリガーゼである、TRAF6と会合する。TRAF6は、ユビキチン結合酵素である、UBC13およびUEV1Aと共に、TRAF6自体およびTAK1タンパク質キナーゼ複合体の両方の、K63結合型ポリユビキチン化を促進する。TAK1は、MAPKKKファミリーのメンバーであり、TRAF6により生じたポリユビキチン鎖と相互作用して、TAK1の活性化を駆動する、調節性サブユニットである、TAB1、TAB2、およびTAB3と複合体を形成する。次いで、TAK1は、IKK複合体-NF-κB経路、およびIKK複合体-MAPK経路の活性化をもたらす、2つの異なる経路を活性化する。IKK複合体は、触媒性サブユニットである、IKKαおよびIKKβと、調節性サブユニットであるNEMO(また、IKKγとも呼ばれる)とから構成される。TAK1は、ユビキチン鎖を介して、IKK複合体に結合し、これは、IKK複合体がリン酸化することを可能とし、IKKβを活性化する。IKK複合体は、NF-κB阻害性タンパク質IκBαをリン酸化し、IκBαは、プロテアソーム分解を経、NF-κBが、核へと移行して、炎症促進性遺伝子発現を誘導することを可能とする。TAK1の活性化はまた、AP-1ファミリーの転写因子の活性化、またはmRNAの安定化を媒介して、炎症性応答を調節する、ERK1/2、p38、およびJNKなど、MAPKファミリーメンバーの活性化も結果としてもたらす。
[00273]一部の実施形態では、本明細書で記載される細胞内ドメインは、別のドメイン、例えば、別の細胞内ドメイン、膜貫通ドメイン、または細胞外ドメインなどの構造ドメイン;シグナル伝達ドメインなどの機能ドメインと、特異的に対にされうる。一部の実施形態では、MyD88、TRIF、TIRAP/MAL、TLR、MAVS、MDA5、STING、RIG1、TASLなど、本明細書の節において記載される細胞内ドメイン、または本明細書で言及される、他の任意のドメインは、別のドメインまたはその構成要素と対をなすために、調整または改変されうる。対をなすとは、検討中の1つもしくは複数のドメインの一部、またはこれらの断片もしくは構成要素の、CFPタンパク質の分子構造の任意の一部としての、CFPデザインへの組入れを意味することが意図される。一部の実施形態では、調整は、CFP分子内の、ドメインの、構造的な位置合せまたは配置の場合があり、例えば、検討中の2つのドメインは、並置されるか、またはこれらの間の、1つもしくは複数のドメインにより隔てられるか、またはこれらの間の、1つもしくは複数のアミノ酸により隔てられる。1つまたは複数のアミノ酸は、リンカーでありうる。1つまたは複数のアミノ酸は、2つの隣接するドメイン間に、構造的懸隔をもたらす場合もあり、2つの隣接するドメイン間に、可撓性をもたらす場合もあり、1つまたは複数のアミノ酸を伴わないドメインを含む、分子構造より三次元的な配向性を付与する場合もある。一部の実施形態では、調整または改変は、突然変異など、ドメイン内の修飾を含みうる。
[00274]一部の実施形態では、MyD88、TRIF、TIRAP/MAL、TLR、MAVS、MDA5、STING、RIG1、TASLなど、本明細書の節において記載される細胞内ドメイン、または本明細書で言及される、他の任意のドメインは、PI3キナーゼ動員ドメインなどのキナーゼ動員ドメインなど、CFP内の別の細胞内ドメインとの対合またはこの組入れのために調整または改変されうる。一部の実施形態では、PI3キナーゼ動員ドメインは、トニックシグナル伝達を遮蔽するように改変される。一部の実施形態では、ドメインである、MyD88、TRIF、TIRAP/MAL、TLR、MAVS、MDA5、STING、RIG1、TASL、またはこれらの断片のうちのいずれか1つまたは複数など、他の細胞内ドメインのうちの1つは、トニックシグナル伝達を低減するか、またはこれを消失させるように改変される。
[00275]一部の実施形態では、MyD88、TRIF、TIRAP/MAL、TLR、MAVS、MDA5、STING、RIG1、TASLなど、本明細書の節において記載される細胞内ドメイン、または本明細書で言及される、他の任意のドメインは、膜貫通ドメインなど、別の構造ドメインとの対合またはこの組入れのために調整または改変されうる。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD68ドメインである。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD64ドメインである。一部の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD89ドメインである。一部の実施形態では、突然変異CD68ドメイン、例えば、配列番号46が使用されうる。
[00276]本開示の目的で、上記の段落で論じられた、任意の経路、シグナル伝達中間項、または活性化部分は、本明細書で開示される、TLR細胞内シグナル伝達ドメインを含む、開示されるCFPの誘導時に、適用に応じて、活性化可能または機能的であると考えられうる。同様に、本明細書で開示されるCFPは、論じられた経路内で記載される、適用可能な標的のうちのいずれの標的化においても有用でありうる。シグナル伝達ドメイン、シグナル伝達経路、シグナル伝達中間項、活性化遺伝子の転写因子に関する、既存の文献の日付現在において、当業者にたやすく公知である、任意の経路またはその一部は、本開示の予察内にあることが理解される。
治療用組成物
[00277]本明細書の一態様では、CD14+細胞、CD14+/CD16-細胞、CD14+/CD16+細胞、CD14-/CD16+細胞、CD14-/CD16-細胞、樹状細胞、M0マクロファージ、M2マクロファージ、M1マクロファージ、またはモザイク骨髄細胞/マクロファージ/樹状細胞などの骨髄細胞が提供される。本明細書の一部の実施形態では、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、または少なくとも50%のCD14+細胞を含む治療用組成物が提供される。一部の実施形態では、治療用組成物は、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、または少なくとも50%のCD14+/CD16-細胞を含む。本明細書の一部の実施形態では、20%未満、15%未満、10%未満、または5%未満の樹状細胞を含む治療用組成物が提供される。本明細書で記載される治療用組成物のための骨髄細胞は、キメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、本明細書で記載される、CFP受容体タンパク質またはエンゲージャータンパク質をコードする組換え核酸を含む。本明細書で記載される治療用組成物のための骨髄細胞は、組換え核酸によりコードされるCFPを発現するか、または本明細書で記載される組換え核酸によりコードされるエンゲージャータンパク質を発現する。
[00277]本明細書の一態様では、CD14+細胞、CD14+/CD16-細胞、CD14+/CD16+細胞、CD14-/CD16+細胞、CD14-/CD16-細胞、樹状細胞、M0マクロファージ、M2マクロファージ、M1マクロファージ、またはモザイク骨髄細胞/マクロファージ/樹状細胞などの骨髄細胞が提供される。本明細書の一部の実施形態では、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、または少なくとも50%のCD14+細胞を含む治療用組成物が提供される。一部の実施形態では、治療用組成物は、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、または少なくとも50%のCD14+/CD16-細胞を含む。本明細書の一部の実施形態では、20%未満、15%未満、10%未満、または5%未満の樹状細胞を含む治療用組成物が提供される。本明細書で記載される治療用組成物のための骨髄細胞は、キメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、本明細書で記載される、CFP受容体タンパク質またはエンゲージャータンパク質をコードする組換え核酸を含む。本明細書で記載される治療用組成物のための骨髄細胞は、組換え核酸によりコードされるCFPを発現するか、または本明細書で記載される組換え核酸によりコードされるエンゲージャータンパク質を発現する。
[00278]本明細書の一部の実施形態では、キメラ融合受容体タンパク質(CFP)などのキメラ融合タンパク質を含み、CFPが、(a)(i)本明細書で開示される標的のうちのいずれか1つに特異的に結合するscFv、および(ii)CD8に由来するヒンジドメイン、CD28に由来するヒンジドメイン;またはCD68に由来する細胞外ドメインの、少なくとも一部を含む細胞外ドメイン;(b)CD8膜貫通ドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD2膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメイン;ならびに(c)少なくとも2つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、少なくとも2つの細胞内シグナル伝達ドメインが、(i)FcRγまたはFcRεに由来する、第1の細胞内シグナル伝達ドメイン、(ii)第2の細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、NLRPファミリーメンバーであるNLRP1~14、NOD1、NOD2、ピリン、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、IL-1、IL3、IL5、IL-6、IL-12、IL-13、IL-23、TNF、IL-18、IL-23、IL-27、CSF、MCSF、GMCSF、IL17、IP-10、またはRANTESに由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、およびPI3K動員ドメイン、またはCD40に由来するドメインを含む、第2の細胞内シグナル伝達ドメインを含む治療用組成物が提供される。
[00279]一部の実施形態では、医薬組成物は、治療有効用量の骨髄細胞を含む、細胞集団を含む。一部の実施形態では、細胞集団は、投与後の対象において、エフェクター細胞へと分化し;投与後に、対象の罹患部位へと浸潤するか、もしくは投与後に、対象の罹患部位へと遊走し;かつ/または投与後の対象において、少なくとも5日間の寿命を有する。
[00280]一部の実施形態では、骨髄細胞は、治療的に有効な骨髄細胞を作出するようにさらに改変または操作されうる。分離された細胞は、その機能的/発生的可塑性、分化潜在的可能性、および細胞生存率を変更せずに、細胞内で、遺伝子、またはこれらの断片を発現させることにより操作されうる。
[00281]一部の実施形態では、骨髄細胞は、非内因性ポリヌクレオチドを、細胞へと発現させることにより、治療的に有効な骨髄細胞を作出するようにさらに改変または操作されうる。非内因性ポリヌクレオチドは、タンパク質またはペプチドをコードする。代替的に、非内因性ポリペプチドは、阻害性RNA、またはモルホリノなど、非コード配列でありうる。
[00282]一部の実施形態では、骨髄細胞は、細胞のゲノム配列を、安定的に変更することにより、治療的に有効な骨髄細胞を作出するようにさらに改変または操作されうる。一部の実施形態では、骨髄細胞は、CRISPR-CAS系を使用して、骨髄細胞ゲノムを編集することにより操作されうる。一部の実施形態では、1つまたは複数の遺伝子は、遺伝子発現をサイレンシングするように編集されうる。一部の実施形態では、骨髄細胞は、遺伝子を欠失させるように操作されうる。一部の実施形態では、1つまたは複数の遺伝子は、遺伝子を増強するように編集されうる。一部の実施形態では、遺伝子素材は、骨髄細胞へと、メッセンジャーRNAの形態で導入され、この場合、メッセンジャーRNAは、タンパク質またはペプチドをコードし、これにより、骨髄細胞を、治療的に有効とする。一部の実施形態では、ネイキッドDNAまたはメッセンジャーRNA(mRNA)は、核酸を、骨髄細胞内部に導入するのに使用されうる。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体をコードするDNAまたはmRNAは、脂質ナノ粒子(LNP)への封入により、貪食細胞へと導入される。mRNAは、一本鎖であり、コドン最適化される場合がある。一部の実施形態では、mRNAは、5’-メチルシトシン、またはシュードウリジンもしくはメチルシュードウリジンなど、1つまたは複数の修飾塩基または非天然塩基を含みうる。一部の実施形態では、mRNAのうちの、約50%またはこれを超えるウリジン(「U」)残基が、メチルシュードウリジンへと転換されうる。一部の実施形態では、mRNAは、50~10,000塩基長でありうる。一態様では、トランス遺伝子は、mRNAとして送達される。mRNAは、約100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10,000を超える塩基を含みうる。一部の実施形態では、mRNAは、10,000塩基長を超える場合がある。一部の実施形態では、mRNAは、約11,000塩基長でありうる。一部の実施形態では、mRNAは、約12,000塩基長でありうる。一部の実施形態では、mRNAは、融合タンパク質をコードする、トランス遺伝子配列を含む。LNPに封入されたDNAまたはRNAは、マクロファージにトランスフェクトするために使用される場合もあり、対象へと投与される場合もある。一部の実施形態では、mRNAは、一過性トランスフェクションにより、エフェクター骨髄細胞集団へと組み込まれる。一部の実施形態では、一過性トランスフェクション法は、mRNAの電気穿孔を含む。一部の実施形態では、一過性トランスフェクションは、化学的トランスフェクションを含む。一部の実施形態では、1ml当たり1~5,000マイクログラムのmRNAが、上記で記載された方法に適するプロトコールを使用するトランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり1~2,000マイクログラムのmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり1~1,000マイクログラムのmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり1~1,000マイクログラムのmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり1~500マイクログラムのmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり1~250マイクログラムのmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり約500マイクログラムまたはこれ未満のmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり約250マイクログラムまたはこれ未満のmRNAが、トランスフェクションのために使用されうる。一部の実施形態では、1ml当たり約10マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約20マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約30マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約40マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約50マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約60マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約80マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約100マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約150マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約200マイクログラムのmRNAが使用される。一部の実施形態では、1ml当たり約20、50、100、150、200、250、300、400、500、または1000マイクログラムのmRNAが使用される。方法、ならびに測定器および/または試薬についての製造元の指示書に基づき、または当業者に周知の通りに、トランスフェクションのために、適切な細胞密度が選択される。
[00283]一部の実施形態では、組換え核酸は、mRNAである。mRNA構築物は、氷上で融解され、単球へと、静かにピペッティングされ、あらかじめ混合されうる。一部の実施形態では、mRNAは、細胞へと電気穿孔される。エルトリエーション後における細胞は、プールされ、遠心分離され、前記の目的のために最適化された、MaxCyte ATXシステムを使用する、mRNAによる電気穿孔にかけられうる。一部の実施形態では、各構築物のための各プロトコールに最適化された電気穿孔緩衝液、細胞密度、および/またはmRNA濃度が使用される。
[00284]一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、骨髄細胞へと、環状RNA(circRNA)の形態で導入されうる。環状RNA(circRNA)内では、3’末端と、5’末端とが、共有結合的に連結される。circRNAは、LNPを使用して、細胞内部に送達されうる。
[00285]一部の実施形態では、トランス遺伝子の、マクロファージおよび他の貪食細胞への安定的組込みは、トランスポザーゼおよび転位性因子、特に、mRNAコードトランスポザーゼの使用を介して達せられうる。一実施形態では、長鎖散在エレメント-1(L1)RNAは、トランス遺伝子のレトロ転位、およびマクロファージまたは貪食細胞への安定的組込みのために想定されうる。レトロトランスポゾンは、貪食または繋留受容体(PR)融合タンパク質(PFP)をコードする組換え核酸の安定的組込みのために使用されうる。
[00286]一部の実施形態では、骨髄細胞は、トランス遺伝子の、一過性発現ベクターへの組込みを介して、トランス遺伝子を発現させることにより改変されうる。一部の実施形態では、トランス遺伝子の発現は、調節因子により、細胞の外側から時間的に調節されうる。例は、トランス遺伝子の発現が、テトラサイクリンの存在または非存在を介して調節される、Tet-on/Tet-off系を含む。
[00287]一部の実施形態では、骨髄細胞は、細胞を、骨髄細胞内のタンパク質の場合もあり、酵素の場合もある、阻害剤の場合もあり、活性化剤の場合もある化合物と接触させることにより、治療的に有効な細胞を作出するように改変されうる。
[00288]一部の実施形態では、キメラ抗原受容体をコードするポリヌクレオチドは、前出節で記載された方法により得られる、分離された骨髄細胞へと導入される場合があり、この場合、キメラ抗原受容体は、骨髄細胞内の発現時に、骨髄細胞の自然免疫応答機能を増強する。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体の発現は、in vivoにおいて、骨髄細胞を、特異的標的へと方向付ける場合もあり、in vitroにおいて、骨髄細胞を、特異的標的へと方向付ける場合もある。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、骨髄細胞の貪食可能性を増大させうる。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、骨髄細胞の免疫原性を増大させる。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、細胞内シグナル伝達を増強しうる。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、細胞内の1つまたは複数のタンパク質と協同的に機能しうる。一部の実施形態では、キメラ抗原受容体は、骨髄細胞内部で、第2の受容体または膜貫通タンパク質と共に、二量体化するまたは多量体化する場合があり、この場合、第2の受容体または膜貫通タンパク質は、内因性タンパク質である。一部の実施形態では、細胞は、融解の直後に、または核酸組込みの後に、ex vivoにおいて培養される。一部の実施形態では、ex vivoにおける培養は、調節された血清成分、例えば、ヒト血清アルブミン(HSA)を含みうる、適切な培地の存在下で実施される。一部の実施形態では、ex vivoにおける培養および操作は、血清含有濃度が低度である培地中で実施されうる。一部の実施形態では、血清は、補体不活性化のために特異的に処置される。一部の実施形態では、骨髄細胞は、M-CSFの存在下、上記で記載された通り、ex vivoにおいて培養されうる。一部の実施形態では、骨髄細胞は、GM-CSFの存在下、上記で記載された通り、ex vivoにおいて培養されうる。一部の実施形態では、骨髄細胞は、1つまたは複数のサイトカインの存在下で培養されうる。一部の実施形態では、骨髄細胞は、増殖因子またはサイトカインの非存在下、ex vivoにおいて、ある時間にわたり培養または操作されうる。一部の実施形態では、本明細書で提示される方法は、72時間、70時間、65時間、60時間、55時間、50時間、45時間、40時間、または35時間、または30時間、または28時間、または26時間、または24時間未満における、骨髄細胞の分離または濃縮および操作を含む。一部の実施形態では、骨髄細胞は、24時間未満、または20時間未満、または16時間未満、または14時間未満、または12時間未満、または10時間未満、または8時間未満、または6時間未満、または約4時間未満にわたり培養されうる。分離または濃縮および操作の後における骨髄細胞は、短時間にわたり培養され、さらなる使用まで凍結される場合がある。一部の実施形態では、骨髄細胞は、1回、または最大で2回にわたり融解される。
[00289]一部の実施形態では、治療的コンピテント細胞は、ポリペプチドをコードする組換え核酸を電気穿孔され、凍結および融解され、培養物が24時間未満にわたり安定化された細胞であり、この場合、投与時における細胞集団内の細胞は、(i)少なくとも70%を超える生存率、(ii)少なくとも50%を超えるCD14+/CD16-細胞;および/または50%を超えるCD11b+/CD14+/CD16-細胞;(iii)5%未満のCD3+細胞、5%未満のCD19+細胞、約10%未満のCD56+細胞、約10%未満のCD42b+細胞;(iv)50%を超える、電気穿孔された核酸によりコードされるポリペプチドを発現する細胞を呈する。一部の実施形態では、治療的コンピテント細胞は、ポリペプチドをコードする組換え核酸を電気穿孔され、培養物が24時間未満にわたり安定化され、凍結および融解された細胞であり、この場合、投与時における細胞集団内の細胞は、(i)少なくとも70%を超える生存率、(ii)少なくとも50%を超えるCD14+/CD16-細胞;および/または50%を超えるCD11b+/CD14+/CD16-細胞;(iii)5%未満のCD3+細胞、5%未満のCD19+細胞、約10%未満のCD56+細胞、約10%未満のCD42b+細胞;(iv)50%を超える電気穿孔された核酸によりコードされるポリペプチドを発現する細胞を呈する。一部の実施形態では、治療的コンピテント細胞は、培養物が24時間未満にわたり安定化され、ポリペプチドをコードする組換え核酸を電気穿孔され、凍結および融解された細胞であり、この場合、投与時における細胞集団内の細胞は、(i)少なくとも70%を超える生存率、(ii)少なくとも50%を超えるCD14+/CD16-細胞;および/または50%を超えるCD11b+/CD14+/CD16-細胞;(iii)5%未満のCD3+細胞、5%未満のCD19+細胞、約10%未満のCD56+細胞、約10%未満のCD42b+細胞;(iv)50%を超える電気穿孔された核酸によりコードされるポリペプチドを発現する細胞を呈する。細胞は、病原体非含有でなければならない。上記の実施形態では、治療的コンピテント細胞は、2回を超えない回数にわたり、好ましくは1回凍結および融解される場合があり、融解から24時間以内に、融解から18時間以内に、融解から8時間以内に、または融解から2時間以内に投与されうる。細胞は、投与の前に、本開示において本明細書で記載される基準を満たすように、品質保証について調べられる。
[00290]本明細書では、がん細胞を標的化し、攻撃し、これを死滅させるように特異的にデザインされた、貪食性受容体(PR)融合タンパク質(PFP)をコードする組換え核酸を発現する、操作された貪食細胞、特に、マクロファージを含む医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するための方法が提供される。PFPはまた、貪食のためのキメラ抗原受容体(CAR-P)とも呼称され、本明細書では、いずれの用語も、互換的に使用されうる。本明細書の記載では、操作された貪食細胞はまた、CAR-P細胞とも呼称される。
[00291]がんは、B細胞がん(例えば、多発性骨髄腫、ワルデンシュトロームマクログロブリン血症)、重鎖病(例えば、アルファ鎖病、ガンマ鎖病、およびミュー鎖病など)、良性単クローン性免疫グロブリン血症、および免疫細胞性アミロイドーシス、黒色腫、乳がん、肺がん、気管支がん、結腸直腸がん、前立腺がん(例えば、転移性前立腺がん、ホルモン不応性前立腺がん)、膵がん、胃がん、卵巣がん、膀胱がん、脳がんまたは中枢神経系がん、末梢神経系がん、食道がん、子宮頸がん、子宮がんまたは子宮内膜がん、口腔がんまたは咽頭がん、肝がん、腎がん、精巣がん、胆管がん、小腸がんまたは虫垂がん、唾液腺がん、甲状腺がん、副腎がん、骨肉腫、軟骨肉腫、造血組織がんなどを含むがこれらに限定されない。本開示により包摂される方法に適用可能ながんの種類についての、他の非限定例は、ヒト肉腫およびヒト癌腫、例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、軟骨腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、滑膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、結腸直腸がん、膵がん、乳がん、卵巣がん、扁平上皮がん、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭癌、乳頭腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支癌、腎細胞癌、ヘパトーマ、胆管癌、肝がん、絨毛癌、精上皮腫、胚性癌、ウィルムス腫瘍、子宮頸がん、骨がん、脳腫瘍、精巣がん、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星状細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経腫瘍、希突起神経膠腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫;白血病、例えば、急性リンパ性白血病および急性骨髄性白血病(骨髄芽球性白血病、前骨髄性白血病、骨髄単球性白血病、単球性白血病、および赤白血病);慢性白血病(慢性骨髄性(顆粒球性)白血病および慢性リンパ性白血病);ならびに真性多血症、リンパ腫(ホジキン病および非ホジキン病)、多発性骨髄腫、ワルデンシュトロームマクログロブリン血症、および重鎖病を含む。一部の実施形態では、がんは、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸がん、婦人科がん、腎がん、喉頭がん、肺がん、経口がん、頭頸部がん、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、または皮膚がんなどであるがこれらに限定されない上皮がんである。他の実施形態では、がんは、乳がん、前立腺がん、肺がん、または結腸がんである。さらに他の実施形態では、上皮がんは、非小細胞肺がん、非乳頭状腎細胞癌、子宮頸癌、卵巣癌(例えば、漿液性卵巣癌)、または乳癌である。上皮がんは、漿液性がん、内膜がん、粘液性がん、明細胞がん、または未分化がんを含むがこれらに限定されない、他の多様な形でも特徴付けられうる。一部の実施形態では、本開示は、マントル細胞リンパ腫を含むがこれらに限定されない、リンパ腫またはその亜型の、処置、診断、および/または予後診断において使用される。リンパ増殖性障害もまた、増殖性疾患であると考えられる。
[00292]一般に、細胞性免疫療法は、患者に、生細胞を含む医薬を施すステップを含む。一部の態様では、がんを有する患者または対象は、自家細胞を用いて処置され、その方法は、PBMC由来マクロファージを、分離または濃縮するステップ、ex vivoにおいて、貪食性受容体融合タンパク質(PFP)である、貪食のためのキメラ抗原受容体をコードする組換え核酸を、マクロファージへと導入することにより、マクロファージを改変して、腫瘍溶解が可能である、高度に貪食性のマクロファージを作出するステップ、および改変されたマクロファージを、患者または対象へと投与するステップを含む。
[00293]一態様では、対象は、治療用貪食細胞を含む、投与1回または複数回分の用量の医薬組成物を投与され、この場合、細胞は、同種細胞である。HLAは、対象との適合性のために、かつ、細胞が、移植片対宿主病である、GVHDをもたらさないように、マッチさせることができる。診療所に来院する対象は、治療剤または治療レジメンを決定する前に、対象により発現されるHLA抗原を決定するために、HLA遺伝子型検査を受ける。
[00294]一部の実施形態では、治療有効用量は、注入1回について、細胞107個~骨髄細胞1012個の間の範囲である。細胞数は、年齢、体重、および対象に関連する他のパラメータに従い変動する場合があり、医療従事者により決定されうる。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約2×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約3×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約4×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約5×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約6×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約7×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約8×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約9×107個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約2×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約3×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約4×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約5×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約6×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約7×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約8×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約9×108個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約2×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約3×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約4×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約5×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約6×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約7×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約8×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約9×109個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約1010個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約5×1010個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約1011個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約5×1011個である。一部の実施形態では、治療有効用量は、骨髄細胞約1012個である。
[00295]本明細書の一態様では、本明細書で記載される、受容体またはエンゲージャーなどのキメラ融合タンパク質でありうる、1つまたは複数の組換えタンパク質をコードする、1つまたは複数の組換えポリ核酸が提供される。一部の実施形態では、組換えポリ核酸は、mRNAである。一部の実施形態では、組換えポリ核酸は、circRNAを含む。一部の実施形態では、組換えポリ核酸は、ウイルスベクター内に組入れられる。一部の実施形態では、組換えポリ核酸は、ウイルスベクターを介して送達される。
[00296]本明細書の一部の実施形態では、キメラ融合受容体タンパク質(CFP)などのキメラ融合タンパク質を含み、CFPが、(a)(i)本明細書で開示される標的のうちのいずれか1つに特異的に結合するscFv、および(ii)CD8に由来するヒンジドメイン、CD28に由来するヒンジドメイン;またはCD68に由来する細胞外ドメインの、少なくとも一部を含む細胞外ドメイン;(b)CD8膜貫通ドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD2膜貫通ドメイン、またはCD68膜貫通ドメイン;ならびに(c)少なくとも2つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、少なくとも2つの細胞内シグナル伝達ドメインが、(i)FcRγまたはFcRε、インターフェロン誘導性ドメインに由来する、第1の細胞内シグナル伝達ドメイン、および/または(ii)(A)が、PI3K動員ドメインを含むか、または(B)が、CD40に由来する、第3の細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインを含む治療用組成物が提供される。
[00297]本明細書の一部の実施形態では、本明細書で開示される、二特異性エンゲージャーまたは三特異性エンゲージャーをコードする組換え核酸を含む治療用組成物が提供される。
共投与のための、他の治療用組成物
[00298]一部の実施形態では、治療用組成物は、CD47アゴニスト、Racを阻害する薬剤、Cdc42を阻害する薬剤、GTPアーゼを阻害する薬剤、F-アクチンのディスアセンブリーを促進する薬剤、PI3KのPFPへの動員を促進する薬剤、PI3Kの活性を促進する薬剤、ホスファチジルイノシトール3,4,5-三リン酸の産生を促進する薬剤、ARHGAP12の活性を促進する薬剤、ARHGAP25の活性を促進する薬剤、SH3BP1の活性を促進する薬剤、一次リンパ系臓器内および/または二次リンパ系臓器内におけるリンパ球の封鎖を促進する薬剤、二次リンパ系臓器内の、ナイーブT細胞およびセントラルメモリーT細胞の濃度を増大させる薬剤、ならびにこれらの任意の組合せからなる群から選択される、さらなる治療剤をさらに含む。
[00298]一部の実施形態では、治療用組成物は、CD47アゴニスト、Racを阻害する薬剤、Cdc42を阻害する薬剤、GTPアーゼを阻害する薬剤、F-アクチンのディスアセンブリーを促進する薬剤、PI3KのPFPへの動員を促進する薬剤、PI3Kの活性を促進する薬剤、ホスファチジルイノシトール3,4,5-三リン酸の産生を促進する薬剤、ARHGAP12の活性を促進する薬剤、ARHGAP25の活性を促進する薬剤、SH3BP1の活性を促進する薬剤、一次リンパ系臓器内および/または二次リンパ系臓器内におけるリンパ球の封鎖を促進する薬剤、二次リンパ系臓器内の、ナイーブT細胞およびセントラルメモリーT細胞の濃度を増大させる薬剤、ならびにこれらの任意の組合せからなる群から選択される、さらなる治療剤をさらに含む。
[00299]一部の実施形態では、骨髄細胞は、(a)CFPと二量体化する、内因性ペプチドまたは内因性タンパク質;(b)CFPと二量体化する、非内因性ペプチドまたは非内因性タンパク質;および/または(c)第2の組換えポリ核酸配列をさらに含み、この場合、第2の組換えポリ核酸配列は、CFPと相互作用するペプチドまたはタンパク質をコードする配列を含み;二量体化または相互作用は、CFPを発現する骨髄細胞による貪食を、CFPを発現しない骨髄細胞と比較して強化する。
[00300]一部の実施形態では、骨髄細胞は、(i)エフェクター活性、交差提示、呼吸バースト、ROSの産生、iNOSの産生、炎症性メディエーター、細胞外小胞の産生、ホスファチジルイノシトール3,4,5-三リン酸の産生、抗原を発現する標的細胞との齧作用、貪食のCD47媒介性阻害に対する抵抗性、貪食のLILRB1媒介性阻害に対する抵抗性、もしくはこれらの任意の組合せの増大;および/または(ii)IL-1、IL3、IL-6、IL-10、IL-12、IL-13、IL-23、TNFα、サイトカインのTNFファミリー、CCL2、CXCL9、CXCL10、CXCL11、IL-18、IL-23、IL-27、CSF、MCSF、GMCSF、IL-17、IP-10、RANTES、インターフェロン、MHCクラスIタンパク質、MHCクラスIIタンパク質、CD40、CD48、CD58、CD80、CD86、CD112、CD155、TRAIL/TNFファミリーの死受容体、TGFβ、B7-DC、B7-H2、LIGHT、HVEM、TL1A、41BBL、OX40L、GITRL、CD30L、TIM1、TIM4、SLAM、PDL1、MMP(例えば、MMP2、MMP7、およびMMP9)、またはこれらの任意の組合せの発現の増大を呈する。
[00301]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、貪食または繋留受容体(PR)に由来するか、または細胞内シグナル伝達ドメインは、貪食活性化ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、Megf10、MerTk、FcRアルファ、またはBai1から選択される貪食受容体以外の受容体に由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TNFR1、MDA5、CD40、レクチン、デクチン1、CD206、スカベンジャー受容体A1(SRA1)、MARCO、CD36、CD163、MSR1、SCARA3、COLEC12、SCARA5、SCARB1、SCARB2、CD68、OLR1、SCARF1、SCARF2、CXCL16、STAB1、STAB2、SRCRB4D、SSC5D、CD205、CD207、CD209、RAGE、CD14、CD64、F4/80、CCR2、CX3CR1、CSF1R、Tie2、HuCRIg(L)、CD64、CD32a、CD16a、CD89、Fcα受容体I、CR1、CD35、CD3ζ、補体受容体、CR3、CR4、Tim-1、Tim-4、およびCD169からなる群から選択される受容体(例えば、貪食受容体)などのタンパク質に由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、炎症促進性シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、PI3K動員ドメインではない、炎症促進性シグナル伝達ドメインを含む。
[00302]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、ITAMドメインを含有する受容体に由来する。
[00303]本明細書では、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインを含むPRサブユニット;ならびに標的細胞の抗原に特異的な抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含み;膜貫通ドメインと細胞外ドメインとが作動的に連結されており;細胞内シグナル伝達ドメインが、Megf10、MerTk、FcRα、またはBai1から選択される貪食受容体以外の貪食受容体に由来する、貪食または繋留受容体(PR)融合タンパク質(PFP)などのCFPをコードする組換え核酸を含む組成物が提供される。
[00304]一部の実施形態では、CFPの標的細胞の抗原への結合時に、CFPを発現する細胞の殺滅活性は、CFPを発現しない細胞と比較して、少なくとも5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、100%、150%、200%、250%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、または1000%を超えて増大される。一部の実施形態では、CFPは、CFPが、細胞内で発現されると、細胞の細胞膜へと機能的に組み込まれる。一部の実施形態では、CFPの標的細胞の抗原への結合時に、CFPを発現する細胞の殺滅活性は、CFPを発現しない細胞と比較して、少なくとも1.1倍、1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、3.5倍、4倍、4.5倍、5倍、5.5倍、6倍、6.5倍、7倍、7.5倍、8倍、8.5倍、9倍、9.5倍、10倍、11倍、12倍、13倍、14倍、15倍、16倍、17倍、18倍、19倍、20倍、25倍、30倍、40倍、50倍、75倍、または100倍に増大される。
[00305]一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TNFR1、MDA5、CD40、レクチン、デクチン1、CD206、スカベンジャー受容体A1(SRA1)、MARCO、CD36、CD163、MSR1、SCARA3、COLEC12、SCARA5、SCARB1、SCARB2、CD68、OLR1、SCARF1、SCARF2、CXCL16、STAB1、STAB2、SRCRB4D、SSC5D、CD205、CD207、CD209、RAGE、CD14、CD64、F4/80、CCR2、CX3CR1、CSF1R、Tie2、HuCRIg(L)、CD64、CD32a、CD16a、CD89、Fcα受容体I、CR1、CD35、CD3ζ、CR3、CR4、Tim-1、Tim-4、およびCD169からなる群から選択される貪食受容体などの受容体に由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、炎症促進性シグナル伝達ドメインを含む。
[00306]本明細書では、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞内ドメインを含むPRサブユニット;ならびに標的細胞の抗原に特異的な抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含み;膜貫通ドメインと細胞外ドメインとが作動的に連結されており;細胞内シグナル伝達ドメインが、TNFR1、MDA5、CD40、レクチン、デクチン1、CD206、スカベンジャー受容体A1(SRA1)、MARCO、CD36、CD163、MSR1、SCARA3、COLEC12、SCARA5、SCARB1、SCARB2、CD68、OLR1、SCARF1、SCARF2、CXCL16、STAB1、STAB2、SRCRB4D、SSC5D、CD205、CD207、CD209、RAGE、CD14、CD64、F4/80、CCR2、CX3CR1、CSF1R、Tie2、HuCRIg(L)、CD64、CD32a、CD16a、CD89、Fcα受容体I、CR1、CD35、CD3ζ、CR3、CR4、Tim-1、Tim-4、およびCD169からなる群から選択される貪食受容体などの受容体に由来する、貪食または繋留受容体(PR)融合タンパク質(PFP)などのCFPをコードする組換え核酸を含む組成物が提供される。
[00307]一部の実施形態では、CFPの標的細胞の抗原への結合時に、CFPを発現する細胞の殺滅活性は、CFPを発現しない細胞と比較して、少なくとも5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、100%、150%、200%、250%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、または1000%を超えて増大される。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、Megf10、MerTk、FcRα、またはBai1から選択される貪食受容体以外の貪食受容体に由来する。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、炎症促進性シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD19に由来するPI3K動員ドメインなどのPI3K動員ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、PI3K動員ドメインではない、炎症促進性シグナル伝達ドメインを含む。
[00308]一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、抗原を発現する標的細胞の貪食の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、抗原を発現する標的細胞の貪食の、CFPを発現しない細胞と比較した、少なくとも1.1倍の増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、抗原を発現する標的細胞の貪食の、CFPを発現しない細胞と比較した、少なくとも2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、20倍、30倍、または50倍の増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、サイトカインの産生の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、サイトカインは、IL-1、IL3、IL-6、IL-12、IL-13、IL-23、TNF、CCL2、CXCL9、CXCL10、CXCL11、IL-18、IL-23、IL-27、CSF、MCSF、GMCSF、IL17、IP-10、RANTES、インターフェロン、およびこれらの組合せからなる群から選択される。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、エフェクター活性の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、交差提示の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、MHCクラスIIタンパク質の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD80の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD86の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、MHCクラスIタンパク質の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、TRAIL/TNFファミリーの死受容体の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、B7-H2の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、LIGHTの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、HVEMの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD40の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、TL1Aの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、41BBLの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、OX40Lの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、GITRL死受容体の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD30Lの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、TIM4の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、TIM1のリガンドの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、SLAMの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD48の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD58の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD155の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、CD112の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、PDL1の発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、B7-DCの発現の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、呼吸バーストの、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、ROSの産生の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、iNOSの産生の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、iNOSの産生の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、細胞外小胞の産生の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、抗原を発現する標的細胞との齧作用の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、貪食のCD47媒介性阻害に対する抵抗性の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、貪食のLILRB1媒介性阻害に対する抵抗性の、CFPを発現しない細胞と比較した増大を呈する。一部の実施形態では、CFPを発現する細胞は、ホスファチジルイノシトール3,4,5-三リン酸の産生の増大を呈する。
[00309]本明細書ではまた、本明細書で記載される組換え核酸、本明細書で記載されるベクター、本明細書で記載されるポリペプチド、または本明細書で記載される細胞など、本明細書で記載される組成物と;薬学的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物も提示される。操作された細胞は、骨髄細胞である。一態様では、配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、もしくはこれを含む組換え核酸、または配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、もしくはこれを含む組換え核酸を含む細胞、または配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、もしくはこれを含む組換え核酸を含む操作された細胞と;薬学的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物が開示される。一実施形態では、細胞は、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43、44、および45から選択される配列のうちの少なくとも1つを含むアミノ酸配列をコードする組換え核酸を含む。一実施形態では、細胞は、骨髄細胞である。一実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。一実施形態では、細胞は、初代ヒト細胞である。一実施形態では、細胞は、初代ヒト免疫細胞である。一部の実施形態では細胞は、前駆細胞もしくは幹細胞、または未分化細胞である。一部の実施形態では細胞は、ヒト対象の生体試料から得られる。一部の実施形態では細胞は、ヒト対象の生体試料から分離され、細胞表面マーカーの発現など、表現型について選択される。一実施形態では、分離された細胞は、前駆細胞、骨髄前駆細胞、CD14+/CD16-として特徴付けられる細胞である。
[00310]一実施形態では、分離された細胞または操作された細胞は、CD14+/CD16-である。
[00311]一態様では、医薬組成物は、操作された細胞を含み、この場合、操作された細胞は、CD14+/CD16-である。
[00312]一態様では、医薬組成物は、細胞のうちの少なくとも50%がCD14+/CD16-であり、細胞のうちの10%未満が樹状細胞である細胞の集団を含む。一実施形態では、細胞は、CCR2の高発現を呈する。一実施形態では、細胞は、トーナルシグナル伝達およびデノボの活性化を呈さず、活性化時に、M0、M1、またはM2分化を呈する。
[00313]本明細書では、対象におけるがんまたはウイルス感染を処置する方法であって、対象へと、配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、もしくはこれを含む組換え核酸を含む医薬組成物、または配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、もしくはこれを含む組換え核酸を含む細胞、または配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、もしくはこれを含む組換え核酸を含む操作された細胞と;薬学的に許容される賦形剤とを投与するステップを含む方法が提供される。一部の実施形態では、医薬組成物は、細胞の集団を含み、この場合、細胞のうちの少なくとも50%はCD14+CD16-であり、細胞のうちの10%未満は樹状細胞であり;細胞は、CCR2の高発現を呈する。一実施形態では、細胞は、トーナルシグナル伝達およびデノボの活性化を呈さず、活性化時に、M0、M1、またはM2分化を呈する。
[00314]本明細書の一部の実施形態では、本明細書内の別の箇所で記載される通り、細胞を含む治療用組成物、組換え核酸を含む細胞が提供される。一部の実施形態では、治療用組成物は、本明細書内の別の箇所で記載される通り、キメラタンパク質を発現する組換え核酸を含む。一部の実施形態では、骨髄細胞は、CD14+細胞、CD14+/CD16-細胞、CD14+/CD16+細胞、CD14-/CD16+細胞、CD14-/CD16-細胞、樹状細胞、M0マクロファージ、M2マクロファージ、M1マクロファージ、またはモザイク骨髄細胞/マクロファージ/樹状細胞である。
[00315]一部の実施形態では、医薬組成物は、さらなる治療剤をさらに含む。一部の実施形態では、さらなる治療剤は、CD47アゴニスト、Racを阻害する薬剤、Cdc42を阻害する薬剤、GTPアーゼを阻害する薬剤、F-アクチンのディスアセンブリーを促進する薬剤、PI3KのPFPへの動員を促進する薬剤、PI3Kの活性を促進する薬剤、ホスファチジルイノシトール3,4,5-三リン酸の産生を促進する薬剤、ARHGAP12の活性を促進する薬剤、ARHGAP25の活性を促進する薬剤、SH3BP1の活性を促進する薬剤、およびこれらの任意の組合せからなる群から選択される。一部の実施形態では、薬学的に許容される賦形剤は、無血清培地、脂質、またはナノ粒子を含む。
[00316]一部の実施形態では、治療剤は、対象において全身注射または局所注射される、配列番号1~51の配列のうちのいずれか1つをコードするか、またはこれを含む組換え核酸である。一部の実施形態では、組換え核酸は、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43、44、および45から選択される配列をコードする配列のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、組換え核酸は、mRNAまたはcircRNAである。一部の実施形態では、組換え核酸は、医薬組成物中の、1つまたは複数の脂質成分と会合する。脂質成分は、リポソームまたは脂質ナノ粒子の形態でと会合しうる。脂質成分は、少なくとも1つのカチオン性脂質を含みうる。医薬組成物の、1つまたは複数の脂質は、をコンジュゲートされる場合もあり、修飾される場合もある。
新規のキメラ受容体融合タンパク質(CFP)構築物を作出するための方法
[00317]本明細書の一態様では、新規のキメラ受容体タンパク質を作出するための方法であって、融合受容体が、骨髄細胞内で発現されると、本明細書で記載されるエフェクター骨髄細胞として機能するように、例えば、骨髄細胞機能の増強において有用でありうる、新規のドメインの同定を含む方法が提供される。本明細書で記載される融合タンパク質の作出は、周知の分子クローニング法を使用して実施される場合があり、配列は、組換え核酸を作出した後で検証されうる。
[00317]本明細書の一態様では、新規のキメラ受容体タンパク質を作出するための方法であって、融合受容体が、骨髄細胞内で発現されると、本明細書で記載されるエフェクター骨髄細胞として機能するように、例えば、骨髄細胞機能の増強において有用でありうる、新規のドメインの同定を含む方法が提供される。本明細書で記載される融合タンパク質の作出は、周知の分子クローニング法を使用して実施される場合があり、配列は、組換え核酸を作出した後で検証されうる。
[00318]キメラ抗原受容体をコードする組換え核酸の調製:骨髄細胞内の発現のためにデザインされ、真核細胞内の増幅および/または発現についての試験のためのプラスミドベクター内に組み込まれる、キメラ抗原受容体(CAR)をコードする、組換え核酸構築物が調製される。組換えCARは、当技術分野で公知の分子クローニング法を使用して構築される。組換えCARタンパク質は、細胞内ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞外ドメインを含む。各ドメイン、またはドメインのサブセクションは、異種供給源配列から、PCRにより作出される、核酸配列によりコードされる場合があり、クローニングにより、ベクターへと、個別につなぎ合わされる場合もあり、長鎖核酸へとライゲーションされ、次いで、これが、増幅に適するプロモーターおよび3’側調節エレメントと共に、適切なプラスミドまたはベクターの、マルチクローニング部位へと挿入される場合もある。略述すると、例示的CARは、1つまたは複数のシグナル伝達ドメイン(例えば、PI3キナーゼ動員ドメイン)をコードする核酸(nucleic)配列、CD8ヒンジドメインおよびCD8膜貫通ドメインをコードする核酸配列、細胞外末端において、標的抗原結合性scFvをコードする配列を有する、細胞外ドメインをコードする核酸配列を組み込むことにより調製される。ある特定の構築物は、細胞外末端において、その標的抗原に結合するscFvに対して、立体障害をもたらさないようにデザインされた、FLAGペプチド配列を含む。これらの構成要素は、完全に機能的な膜貫通CARをコードする配列へと、一緒にライゲーションされる。組換えタンパク質の個別のドメインをコードする核酸サブユニットは、2つのドメイン間に介在する、可撓性の短鎖リンカー配列を含むようにデザインされる。プロモーターおよび3’側安定化構造ユニットを有する構築物は、プラスミド内でライゲーションされる。1つの変形形態では、構築物は、ORF2pをコードし、それぞれの5’-UTR配列および3’-UTR配列、CMVプロモーターを有する、レトロトランスポゾンAluエレメント内に配置される。プラスミドは、E.coli内で増幅され、シーケンシングにより検証されるか、または-80℃で保管される。
mRNAの調製:mRNAは、消化されたプラスミドを、鋳型として使用する、in vitro転写により調製され、夾雑DNAを除去するように精製され、ポリアデニル化されうる。RNA産物は、精製され、RNアーゼ非含有水中に、1mg/mlまで再懸濁され、クライオバイアル内で保管される。
[00319]新規のCFPを作出するために有用な、CFPのECD、TM、ICD、および抗原結合性ドメインの同定は、本明細書で記載される方法を使用してなされうる。略述すると、多数の、潜在的な候補タンパク質が、貪食特性、およびそれらのそれぞれの貪食関連細胞内シグナル伝達の増強についてスクリーニングされうる。次いで、有用ドメインは、新規のCFPを作出するために使用されうる。スクリーンは、2つの部分:A.貪食受容体(PR)ドメインのスクリーニング;B.抗原結合性ドメインについてのスクリーニングに分けられうる。
PRドメインについてのスクリーニング:
[00320]一実施形態では、約5,800種の細胞膜タンパク質を、本明細書で記載される一般的方法に従い、それらの貪食可能性についてスクリーニングした。J774マクロファージ細胞に、5,800種の細胞膜タンパク質のライブラリーを、一過性にトランスフェクトした。細胞膜の、多様な潜在的機能を査定するのに、ハイスループットマルチプレックスアッセイ(ロボット操作を伴う、6ウェルプレートアッセイセットアップ~384ウェルプレートアッセイの範囲の)が設定されうる。例示的なアッセイは、貪食アッセイ、サイトカイン産生アッセイ、インフラマソーム活性化アッセイ、およびiNOS活性化アッセイを含むがこれらに限定されない。例示的な略式法については、以下の段落で記載されうる。各方法の変形形態も使用することができ、当業者により理解されうる。例示的な被験細胞内シグナル伝達ドメインは、CD40-FcRγ;FcRγ-CD40;NLRP3;FcRγ-SH2-Proカスパーゼ;FcRγ-Myd88;FcRγ-IFN受容体;FcR-TNFR1;FcRγ-TNFR2;FcR-AIM2;FcRγ-TRIFN;FcRγ-Proカスパーゼ;TRIFC;RIG1;MDA5;TBK;CD64;CD16A;CD89;FcRε;SIRPβ(2つの連続細胞内ドメインは、ハイフンでつながれた用語により表されうる、例えば、FcRγ-Myd88とは、シグナル伝達ドメイン1としてのFcRγ細胞内シグナル伝達ドメインと;シグナル伝達ドメイン2としてのMyd88細胞内シグナル伝達ドメインとを含む、細胞内ドメインを指す)を含むがこれらに限定されない。スクリーニングされる細胞外リンカードメインは、CD64、CD16A、CD89、SIRPα、FcRε、CD8ヒンジを含むがこれらに限定されない。被験膜貫通ドメインは、CD8、CD64、CD16A、CD89、FcRε、SIRPα、TNFR1、およびCD40を含むがこれらに限定されない。MDA5ドメインについてもまた、スクリーニングした。
[00320]一実施形態では、約5,800種の細胞膜タンパク質を、本明細書で記載される一般的方法に従い、それらの貪食可能性についてスクリーニングした。J774マクロファージ細胞に、5,800種の細胞膜タンパク質のライブラリーを、一過性にトランスフェクトした。細胞膜の、多様な潜在的機能を査定するのに、ハイスループットマルチプレックスアッセイ(ロボット操作を伴う、6ウェルプレートアッセイセットアップ~384ウェルプレートアッセイの範囲の)が設定されうる。例示的なアッセイは、貪食アッセイ、サイトカイン産生アッセイ、インフラマソーム活性化アッセイ、およびiNOS活性化アッセイを含むがこれらに限定されない。例示的な略式法については、以下の段落で記載されうる。各方法の変形形態も使用することができ、当業者により理解されうる。例示的な被験細胞内シグナル伝達ドメインは、CD40-FcRγ;FcRγ-CD40;NLRP3;FcRγ-SH2-Proカスパーゼ;FcRγ-Myd88;FcRγ-IFN受容体;FcR-TNFR1;FcRγ-TNFR2;FcR-AIM2;FcRγ-TRIFN;FcRγ-Proカスパーゼ;TRIFC;RIG1;MDA5;TBK;CD64;CD16A;CD89;FcRε;SIRPβ(2つの連続細胞内ドメインは、ハイフンでつながれた用語により表されうる、例えば、FcRγ-Myd88とは、シグナル伝達ドメイン1としてのFcRγ細胞内シグナル伝達ドメインと;シグナル伝達ドメイン2としてのMyd88細胞内シグナル伝達ドメインとを含む、細胞内ドメインを指す)を含むがこれらに限定されない。スクリーニングされる細胞外リンカードメインは、CD64、CD16A、CD89、SIRPα、FcRε、CD8ヒンジを含むがこれらに限定されない。被験膜貫通ドメインは、CD8、CD64、CD16A、CD89、FcRε、SIRPα、TNFR1、およびCD40を含むがこれらに限定されない。MDA5ドメインについてもまた、スクリーニングした。
貪食アッセイ:
[00321]直径1nm、5nm、または10nmの範囲の、抗原へと連結された、シリカビーズまたはポリスチレンビーズを、マクロファージのスクリーンのために使用した。不活性ビーズは、支持体つき脂質二重層でコーティングすることができ、抗原を、脂質二重層へとライゲーションすることができる。各細胞系が、クローニングされた組換え細胞膜タンパク質を発現する、J774マクロファージ細胞系を調製することができる。組換え細胞膜タンパク質はまた、蛍光タグも発現しうる。細胞系は、熱不活化血清および抗生剤(ペニシリン/ストレプトマイシン)を伴う完全RPMI培地中で維持し、繁殖させることができる。アッセイの当日、細胞を、6ウェルプレート内のウェル1つ当たり1ml当たりの細胞1×106個の密度、または12もしくは24ウェルプレート内の、これに比例する密度で播種し、2~6分間にわたりインキュベートすることができる。次いで、細胞を、リン酸緩衝生理食塩液中で1回洗浄し、ビーズを、血清枯渇培地中または補体枯渇栄養培地中に添加することができる。細胞は、ビーズを添加した30分間後および2時間後に、光学顕微鏡により視覚化することができる。タグ付け抗体を使用して、免疫蛍光反応を実施することができ、蛍光共焦点顕微鏡は、飲作用時の相互作用および細胞タンパク質の共局在を検出するのに使用される。信頼水準は、ダネットの多重比較補正を伴う、クルスカル-ワリス検定により決定されうる。
[00321]直径1nm、5nm、または10nmの範囲の、抗原へと連結された、シリカビーズまたはポリスチレンビーズを、マクロファージのスクリーンのために使用した。不活性ビーズは、支持体つき脂質二重層でコーティングすることができ、抗原を、脂質二重層へとライゲーションすることができる。各細胞系が、クローニングされた組換え細胞膜タンパク質を発現する、J774マクロファージ細胞系を調製することができる。組換え細胞膜タンパク質はまた、蛍光タグも発現しうる。細胞系は、熱不活化血清および抗生剤(ペニシリン/ストレプトマイシン)を伴う完全RPMI培地中で維持し、繁殖させることができる。アッセイの当日、細胞を、6ウェルプレート内のウェル1つ当たり1ml当たりの細胞1×106個の密度、または12もしくは24ウェルプレート内の、これに比例する密度で播種し、2~6分間にわたりインキュベートすることができる。次いで、細胞を、リン酸緩衝生理食塩液中で1回洗浄し、ビーズを、血清枯渇培地中または補体枯渇栄養培地中に添加することができる。細胞は、ビーズを添加した30分間後および2時間後に、光学顕微鏡により視覚化することができる。タグ付け抗体を使用して、免疫蛍光反応を実施することができ、蛍光共焦点顕微鏡は、飲作用時の相互作用および細胞タンパク質の共局在を検出するのに使用される。信頼水準は、ダネットの多重比較補正を伴う、クルスカル-ワリス検定により決定されうる。
[00322]一部の例では、染料をロードした腫瘍細胞を、マクロファージ細胞系へとフィードすることができ、貪食について、顕微鏡により評価する。
サイトカイン産生:
[00323]マクロファージ細胞系は、上記で記載された通りに培養することができる。一アッセイでは、細胞膜タンパク質を発現する、各J774細胞系を、マルチウェルに播種し、抗原連結ビーズで抗原投与し、4時間後および24時間後において、上清を回収することにより、サイトカイン産生についてアッセイした。サイトカインは、ELISAにより、上清からアッセイすることができる。別の画分では、細胞は、インキュベーションの4時間後および24時間後に、ビーズにより回収することができ、サイトカインを検出するために、フローサイトメトリーを実施する。各場合に、IL-1α、IL-1β、IL-6、IL-12、IL-23、TNF-α、GMCSF、CXCL1、CXCL3、CXCL9、CXCL-10、MIP1-α、およびMIP-2から選択されうる、複数のサイトカインは、マルチプレックスフォーマットでアッセイすることができる。マクロファージ炎症性サイトカインアレイキット(R&D Systems)を使用する。
[00323]マクロファージ細胞系は、上記で記載された通りに培養することができる。一アッセイでは、細胞膜タンパク質を発現する、各J774細胞系を、マルチウェルに播種し、抗原連結ビーズで抗原投与し、4時間後および24時間後において、上清を回収することにより、サイトカイン産生についてアッセイした。サイトカインは、ELISAにより、上清からアッセイすることができる。別の画分では、細胞は、インキュベーションの4時間後および24時間後に、ビーズにより回収することができ、サイトカインを検出するために、フローサイトメトリーを実施する。各場合に、IL-1α、IL-1β、IL-6、IL-12、IL-23、TNF-α、GMCSF、CXCL1、CXCL3、CXCL9、CXCL-10、MIP1-α、およびMIP-2から選択されうる、複数のサイトカインは、マルチプレックスフォーマットでアッセイすることができる。マクロファージ炎症性サイトカインアレイキット(R&D Systems)を使用する。
[00324]炎症性遺伝子およびサイトカイン活性化のための細胞内シグナル伝達経路は、MAPキナーゼのリン酸化、JNKシグナル伝達経路、Aktシグナル伝達経路、STAT-1のリン酸化および活性化を含む、インターフェロン活性化経路についてのウェスタンブロット解析により同定することができる。
機能的アッセイ
インフラマソーム活性化アッセイ:
[00325]NLRP3インフラマソームの活性化は、IL-1の産生の増大の、ELISAによる検出、および短鎖カスパーゼを作出する、プロカスパーゼの切断を検出する、カスパーゼ-1の活性化の、ウェスタンブロットによる検出によりアッセイする。マイクロウェルプレートによるマルチプレックス設定では、カスパーゼ1活性化の迅速な読取りのために、Caspase-Glo(Promega Corporation)を使用する。
インフラマソーム活性化アッセイ:
[00325]NLRP3インフラマソームの活性化は、IL-1の産生の増大の、ELISAによる検出、および短鎖カスパーゼを作出する、プロカスパーゼの切断を検出する、カスパーゼ-1の活性化の、ウェスタンブロットによる検出によりアッセイする。マイクロウェルプレートによるマルチプレックス設定では、カスパーゼ1活性化の迅速な読取りのために、Caspase-Glo(Promega Corporation)を使用する。
iNOS活性化アッセイ:
[00326]酸化バーストの潜在的可能性の活性化は、蛍光測定アッセイNOS活性アッセイキット(AbCAM)を使用して、iNOSの活性化およびNOの産生により測定することができる。
[00326]酸化バーストの潜在的可能性の活性化は、蛍光測定アッセイNOS活性アッセイキット(AbCAM)を使用して、iNOSの活性化およびNOの産生により測定することができる。
がん細胞殺滅アッセイ:
[00327]Raji B細胞は、がん抗原提示細胞として使用されうる。Raji細胞を、がん細胞の全細胞粗抽出物とインキュベートし、J774マクロファージ細胞系と共に共インキュベートすることができる。マクロファージは、感染の1時間後に、細胞を破壊する場合があり、これは、顕微鏡により検出される場合もあり、細胞死アッセイにより検出される場合もある。
[00327]Raji B細胞は、がん抗原提示細胞として使用されうる。Raji細胞を、がん細胞の全細胞粗抽出物とインキュベートし、J774マクロファージ細胞系と共に共インキュベートすることができる。マクロファージは、感染の1時間後に、細胞を破壊する場合があり、これは、顕微鏡により検出される場合もあり、細胞死アッセイにより検出される場合もある。
高アフィニティー抗原結合性ドメインについてのスクリーニング:
[00328]CFPのための細胞外結合性ドメインを作出するために、がんリガンドを、抗体の軽鎖可変ドメインおよび重鎖可変ドメインについてのスクリーニングにかけることができる。ヒト全長抗体ライブラリーまたはヒトscFvライブラリーをスクリーニングすることができる。また、ラマにおける新規の免疫グロブリン結合性ドメインの開発、および単一ドメイン抗体の調製のために、ラマを免疫化するための、潜在的なリガンドも使用することができる。
[00328]CFPのための細胞外結合性ドメインを作出するために、がんリガンドを、抗体の軽鎖可変ドメインおよび重鎖可変ドメインについてのスクリーニングにかけることができる。ヒト全長抗体ライブラリーまたはヒトscFvライブラリーをスクリーニングすることができる。また、ラマにおける新規の免疫グロブリン結合性ドメインの開発、および単一ドメイン抗体の調製のために、ラマを免疫化するための、潜在的なリガンドも使用することができる。
[00329]次いで、スクリーンから同定された、特異的な有用ドメインを逆転写し、レンチウイルス発現ベクターへとクローニングして、CFP構築物を作出することができる。スクリーンから作出された、高度な貪食受容体の、細胞外領域、膜貫通領域、および細胞質領域に由来する、1つまたは複数のドメインを使用して、CFPをコードする組換え核酸を作出することができる。略述すると、炎症促進性サイトカイン産生およびインフラマソーム活性化の、高度な活性化因子を示す細胞膜受容体を、同定することができる。バイオインフォマティクス研究を実施して、細胞外活性化ドメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、特異的キナーゼ活性化部位、SH2動員部位を含む、機能的ドメインを同定することができる。次いで、これらのスクリーニングされた機能的ドメインを、新規のCFPを作出するための、モジュラー構築物内でクローニングすることができる。これらは、候補CFPの場合があり、これらのキメラ構築物の各々を、in vitroおよび/またはin vivoにおける、貪食増強、サイトカイン産生、およびケモカイン、ならびに/または腫瘍細胞殺滅について調べる。マイクロ粒子ベース貪食アッセイを使用して、貪食の変化について検討した。略述すると、ストレプトアビジンカップリング蛍光ポリスチレン微粒子(直径6μm)を、ビオチニル化組換え発現/精製がんリガンドとコンジュゲートさせることができる。新規のCFPを発現する骨髄細胞を、リガンドでコーティングされた微粒子と共に、1~4時間にわたりインキュベートし、フローサイトメトリーを使用して、貪食量について解析し、定量した。次いで、デザイナーCFPによるプラスミド構築物またはレンチウイルス構築物を調製し、マクロファージ細胞内で、がん細胞の溶解について調べることができる。
対象に由来する骨髄細胞を作製する方法
PBMCからの、骨髄細胞の単離:
[00330]末梢血単核細胞は、Histopaque 1077(Sigma)を使用する、密度遠心分離により、正常ドナー軟膜から分離することができる。洗浄の後、CliniMACS GMPグレードCD14マイクロビーズおよびLS磁気分離カラム(Miltenyi Biotec)を使用して、CD14+単球を、単核細胞画分から分離することができる。略述すると、細胞を、PEA緩衝液(リン酸緩衝生理食塩液[PBS]+1L当たり2.5ミリモルのエチレンジアミン四酢酸[EDTA]、およびヒト血清アルブミン[20%のAlburex、Octopharmaのうちの、最終容量0.5%])中、適切な濃度まで再懸濁させ、製造元の指示書に従い、CliniMACS CD14ビーズと共にインキュベートし、次いで、洗浄し、磁化LSカラムを流過させた。洗浄の後、精製された単球を、脱磁化カラムから溶出させ、洗浄し、培養に関連する培地中に再懸濁させることができる。CD14+細胞の、白血球アファレーシスからの分離:PBMCは、研究に参加する旨の説明同意文書を提出した肝硬変ドナーから、白血球アファレーシスにより回収することができる。末梢血の、単核細胞(MNC)についての白血球アファレーシスは、Optiaアファレーシスを使用する、滅菌回収により実行する。MNCのための、標準的回収プログラムを使用し、2.5倍の血液量を処理する。CD14細胞の分離は、GMP準拠機能閉鎖系(CliniMACS Prodigyシステム、Miltenyi Biotec)を使用して実行する。略述すると、細胞カウントのために、白血球アファレーシス生成物をサンプリングし、分離前フローサイトメトリーのために、アリコートを採取する。単球(CD14+)の百分率および細胞の絶対数を決定することができ、要求される場合は、容量を、選択のための要求基準(全白血球20×109個以下;1mL当たりの白血球400×106個未満;CD14細胞3.5×109個以下、容量:50~300mL)を満たすように調整する。CD14細胞の単離および分離は、CliniMACS Prodigyを、CliniMACS CD14マイクロビーズ(医療機器分類III)、TS510チュービングセット、およびLP-14プログラムと共に使用して実行する。処理の終了時に、選択されたCD14+陽性単球を、医薬のグレードの0.5%ヒトアルブミン(Alburex)を含有する、PBS/EDTA緩衝液(CliniMACS緩衝液、Miltenyi)中で洗浄し、次いで、培養のためのTexMACS(または同等物)培地中で再懸濁させることができる。
PBMCからの、骨髄細胞の単離:
[00330]末梢血単核細胞は、Histopaque 1077(Sigma)を使用する、密度遠心分離により、正常ドナー軟膜から分離することができる。洗浄の後、CliniMACS GMPグレードCD14マイクロビーズおよびLS磁気分離カラム(Miltenyi Biotec)を使用して、CD14+単球を、単核細胞画分から分離することができる。略述すると、細胞を、PEA緩衝液(リン酸緩衝生理食塩液[PBS]+1L当たり2.5ミリモルのエチレンジアミン四酢酸[EDTA]、およびヒト血清アルブミン[20%のAlburex、Octopharmaのうちの、最終容量0.5%])中、適切な濃度まで再懸濁させ、製造元の指示書に従い、CliniMACS CD14ビーズと共にインキュベートし、次いで、洗浄し、磁化LSカラムを流過させた。洗浄の後、精製された単球を、脱磁化カラムから溶出させ、洗浄し、培養に関連する培地中に再懸濁させることができる。CD14+細胞の、白血球アファレーシスからの分離:PBMCは、研究に参加する旨の説明同意文書を提出した肝硬変ドナーから、白血球アファレーシスにより回収することができる。末梢血の、単核細胞(MNC)についての白血球アファレーシスは、Optiaアファレーシスを使用する、滅菌回収により実行する。MNCのための、標準的回収プログラムを使用し、2.5倍の血液量を処理する。CD14細胞の分離は、GMP準拠機能閉鎖系(CliniMACS Prodigyシステム、Miltenyi Biotec)を使用して実行する。略述すると、細胞カウントのために、白血球アファレーシス生成物をサンプリングし、分離前フローサイトメトリーのために、アリコートを採取する。単球(CD14+)の百分率および細胞の絶対数を決定することができ、要求される場合は、容量を、選択のための要求基準(全白血球20×109個以下;1mL当たりの白血球400×106個未満;CD14細胞3.5×109個以下、容量:50~300mL)を満たすように調整する。CD14細胞の単離および分離は、CliniMACS Prodigyを、CliniMACS CD14マイクロビーズ(医療機器分類III)、TS510チュービングセット、およびLP-14プログラムと共に使用して実行する。処理の終了時に、選択されたCD14+陽性単球を、医薬のグレードの0.5%ヒトアルブミン(Alburex)を含有する、PBS/EDTA緩衝液(CliniMACS緩衝液、Miltenyi)中で洗浄し、次いで、培養のためのTexMACS(または同等物)培地中で再懸濁させることができる。
細胞のカウントおよび純度:
[00331]Sysmex XP-300自動式解析器(Sysmex)を使用して、全MNCおよび分離単球画分の細胞カウントを実施することができる。Sysmexは、単球数を、一貫して過小評価したので、マクロファージ数の評価は、絶対細胞数を決定するのに、TruCountチューブ(Becton Dickinson)を伴う、フローサイトメトリーにより実行する。フローサイトメトリー(FACSCanto II、BD Biosciences)を、ヒト白血球に対する抗体パネル(CD45-VioBlue、CD15-FITC、CD14-PE、CD16-APC)と共に使用して、分離の純度について評価し、好中球の夾雑(CD45int、CD15pos)量を決定することにより、生成物の品質について評価する。
[00331]Sysmex XP-300自動式解析器(Sysmex)を使用して、全MNCおよび分離単球画分の細胞カウントを実施することができる。Sysmexは、単球数を、一貫して過小評価したので、マクロファージ数の評価は、絶対細胞数を決定するのに、TruCountチューブ(Becton Dickinson)を伴う、フローサイトメトリーにより実行する。フローサイトメトリー(FACSCanto II、BD Biosciences)を、ヒト白血球に対する抗体パネル(CD45-VioBlue、CD15-FITC、CD14-PE、CD16-APC)と共に使用して、分離の純度について評価し、好中球の夾雑(CD45int、CD15pos)量を決定することにより、生成物の品質について評価する。
細胞培養物:健常ドナー試料による培養物の養生
[00332]マクロファージの分化に最適の培養培地を探索し、3つの候補を、細胞生成物のために使用して調べた。加えて、単球の低温保存の、治療的使用のための、骨髄細胞およびマクロファージの導出に対する影響について検討した。本開示の他の箇所で記載される通りに、機能的アッセイを行って、骨髄細胞およびマクロファージの貪食能力、ならびにさらなる極性化に対するそれらの能力、および貪食可能性を定量した。
[00332]マクロファージの分化に最適の培養培地を探索し、3つの候補を、細胞生成物のために使用して調べた。加えて、単球の低温保存の、治療的使用のための、骨髄細胞およびマクロファージの導出に対する影響について検討した。本開示の他の箇所で記載される通りに、機能的アッセイを行って、骨髄細胞およびマクロファージの貪食能力、ならびにさらなる極性化に対するそれらの能力、および貪食可能性を定量した。
対象試料による、フルスケールの工程検証
[00333]Prodigyによる分離物に由来する、白血球アファレーシスから培養される単球は、GMPグレードのTexMACS(Miltenyi)および100ng/mLのM-CSFを伴う培養バッグ(MACS GMP分化バッグ、Miltenyi)中に、1mL当たり、1cm2当たりの単球2×106個で培養することができる。単球は、100ng/mLの、GMP準拠組換えヒトM-CSF(R&D Systems)と共に培養することができる。細胞は、5%のCO2を伴う加湿雰囲気中、37℃で、7日間にわたり培養することができる。50%の培養培地を除去し、次いで、200ng/mLのM-CSFを補充された、新鮮培地をフィードして(100ng/mLの最終濃度を回復させるために)、培養(2および4日目)期間中、2回にわたり、50%容量の培地交換を実行する。
[00333]Prodigyによる分離物に由来する、白血球アファレーシスから培養される単球は、GMPグレードのTexMACS(Miltenyi)および100ng/mLのM-CSFを伴う培養バッグ(MACS GMP分化バッグ、Miltenyi)中に、1mL当たり、1cm2当たりの単球2×106個で培養することができる。単球は、100ng/mLの、GMP準拠組換えヒトM-CSF(R&D Systems)と共に培養することができる。細胞は、5%のCO2を伴う加湿雰囲気中、37℃で、7日間にわたり培養することができる。50%の培養培地を除去し、次いで、200ng/mLのM-CSFを補充された、新鮮培地をフィードして(100ng/mLの最終濃度を回復させるために)、培養(2および4日目)期間中、2回にわたり、50%容量の培地交換を実行する。
細胞の採取:
[00334]正常ドナー由来マクロファージのために、7日目に、細胞解離緩衝液(Gibco、ThermoFisher)およびpastetteを使用して、細胞を、ウェルから採取することができる。細胞を、PEA緩衝液中に再懸濁させ、カウントし、次いで、フローサイトメトリーのために、試験1回当たりの細胞約1×106個を、染色することができる。7日目に、血清に由来する、医薬グレードの0.5%ヒトアルブミン(HAS;Alburex)を含有する、PBS/EDTA緩衝液(CliniMACS緩衝液、Miltenyi)を使用して、白血球アファレーシス由来マクロファージを、培養バッグから採取することができる。採取された細胞は、2つの認可生成物:0.5%ヒトアルブミン(Alburex)を伴う、注入用の0.9%生理食塩液(Baxter)から構成される賦形剤中に再懸濁させることができる。
[00334]正常ドナー由来マクロファージのために、7日目に、細胞解離緩衝液(Gibco、ThermoFisher)およびpastetteを使用して、細胞を、ウェルから採取することができる。細胞を、PEA緩衝液中に再懸濁させ、カウントし、次いで、フローサイトメトリーのために、試験1回当たりの細胞約1×106個を、染色することができる。7日目に、血清に由来する、医薬グレードの0.5%ヒトアルブミン(HAS;Alburex)を含有する、PBS/EDTA緩衝液(CliniMACS緩衝液、Miltenyi)を使用して、白血球アファレーシス由来マクロファージを、培養バッグから採取することができる。採取された細胞は、2つの認可生成物:0.5%ヒトアルブミン(Alburex)を伴う、注入用の0.9%生理食塩液(Baxter)から構成される賦形剤中に再懸濁させることができる。
フローサイトメトリーによる特徴付け:
[00335]フローサイトメーターである、FACSCanto II(BD Biosciences)またはMACSQuant 10(Miltenyi)を使用して、単球およびマクロファージ細胞の表面マーカー発現について解析することができる。典型的に、各試料について、約20,000例ずつの事象を収集することができる。分離したての細胞および成熟7日目の細胞における、白血球マーカーの細胞表面発現は、細胞を、特異的抗体(最終希釈率:1:100)と共にインキュベートすることにより実行する。細胞を、FcRブロッキング剤(Miltenyi)と共に、5分間にわたりインキュベートし、次いで、抗体カクテルと共に、4℃で20分間にわたりインキュベートする。細胞を、PEA中で洗浄することができ、死細胞除外染料である、DRAQ7(BioLegend)を、1:100で添加する。細胞は、以下:CD45-VioBlue、CD14-PE、またはCD14-PerCP-Vio700、CD163-FITC、CD169-PEおよびCD16-APC(全て、Miltenyi製)、CCR2-BV421、CD206-FITC、CXCR4-PE、およびCD115-APC(全て、BioLegend製)、ならびに25F9-APCおよびCD115-APC(eBioscience)の範囲の表面マーカーについて染色することができる。前方散乱および側方散乱、ならびにDRAQ7死細胞弁別器(BioLegend)を使用して、破砕物、ダブレット、および死細胞を除外するように、単球およびマクロファージの両方にゲートをかけ、FlowJoソフトウェア(Tree Star)を使用して、解析することができる。初期の詳細な表現型解析から、単球からの、機能的マクロファージの作出について規定するパネルを、出荷判定基準(CD45-VB/CD206-FITC/CD14-PE/25F9 APC/DRAQ7)として開発した。マクロファージは、平均値蛍光強度(MFI)が、25F9およびCD206の両方について、5つの時点において、0日目における単球より高レベルである細胞として決定することができる。他のマーカーについて、拡張パネル(CCR2-BV421/CD163-FITC/CD169-PE/CD14-PerCP-Vio700/CD16-APC/DRAQ7から構成される)の一部として評価する、第2のパネルも開発するが、細胞生成物のための出荷判定基準の一部としては使用しない。
[00335]フローサイトメーターである、FACSCanto II(BD Biosciences)またはMACSQuant 10(Miltenyi)を使用して、単球およびマクロファージ細胞の表面マーカー発現について解析することができる。典型的に、各試料について、約20,000例ずつの事象を収集することができる。分離したての細胞および成熟7日目の細胞における、白血球マーカーの細胞表面発現は、細胞を、特異的抗体(最終希釈率:1:100)と共にインキュベートすることにより実行する。細胞を、FcRブロッキング剤(Miltenyi)と共に、5分間にわたりインキュベートし、次いで、抗体カクテルと共に、4℃で20分間にわたりインキュベートする。細胞を、PEA中で洗浄することができ、死細胞除外染料である、DRAQ7(BioLegend)を、1:100で添加する。細胞は、以下:CD45-VioBlue、CD14-PE、またはCD14-PerCP-Vio700、CD163-FITC、CD169-PEおよびCD16-APC(全て、Miltenyi製)、CCR2-BV421、CD206-FITC、CXCR4-PE、およびCD115-APC(全て、BioLegend製)、ならびに25F9-APCおよびCD115-APC(eBioscience)の範囲の表面マーカーについて染色することができる。前方散乱および側方散乱、ならびにDRAQ7死細胞弁別器(BioLegend)を使用して、破砕物、ダブレット、および死細胞を除外するように、単球およびマクロファージの両方にゲートをかけ、FlowJoソフトウェア(Tree Star)を使用して、解析することができる。初期の詳細な表現型解析から、単球からの、機能的マクロファージの作出について規定するパネルを、出荷判定基準(CD45-VB/CD206-FITC/CD14-PE/25F9 APC/DRAQ7)として開発した。マクロファージは、平均値蛍光強度(MFI)が、25F9およびCD206の両方について、5つの時点において、0日目における単球より高レベルである細胞として決定することができる。他のマーカーについて、拡張パネル(CCR2-BV421/CD163-FITC/CD169-PE/CD14-PerCP-Vio700/CD16-APC/DRAQ7から構成される)の一部として評価する、第2のパネルも開発するが、細胞生成物のための出荷判定基準の一部としては使用しない。
[00336]単球およびマクロファージは、分離された末梢血細胞の、スクロース勾配遠心分離試料中で形成された軟膜層を回収することにより分離することができる。酸性エンドソームへと取り込まれた場合に限り蛍光発光する、pHRodoビーズを使用して、CD14細胞を、貪食性取込みについて調べることができる。略述すると、単球またはマクロファージを、1~2uLのpHRodo Escherichia coli bioparticles(Life Technologies、Thermo Fisher)と共に、1時間にわたり培養し、次いで、培地を採取し、細胞を洗浄して、貪食されなかった粒子を除去することができる。EVOS顕微鏡(Thermo Fisher)を使用して、貪食について評価し、ImageJソフトウェア(NIH)を使用して、画像を捕捉し、細胞内へのビーズの取込みを定量した。7日目のマクロファージを、M1表現型またはM2表現型(または、それぞれ、M[IFNγ]表現型対M[IL-4]表現型)への極性化を誘導するように、IFNγ(50ng/mL)またはIL-4(20ng/mL)で、48時間にわたりで処理することにより、規定された分化マクロファージへと極性化する能力を検討する。48時間後に、EVOS明視野顕微鏡により、細胞を視覚化することができ、次いで、前述と同様に、採取し、表現型解析することができる。作出後におけるマクロファージ、および炎症性刺激に応答するマクロファージの、サイトカイン/増殖因子分泌プロファイルについて、さらなる解析を実施する。前述と同様に、マクロファージは、健常ドナー軟膜から作出することができ、非処理のまま放置するか、または炎症肝内に存在する状態を模倣するように、TNFα(50ng/mL;Peprotech)、およびポリイノシン酸:ポリシチジン酸(polyI:C、TLR3に結合するウイルス相同体、1g/mL;Sigma)、もしくは最大限のマクロファージ活性化をもたらすように、リポ多糖(LPS、100ng/mL;Sigma)+IFNγ(50IU/mL、Peprotech)で刺激した。7日目のマクロファージを、一晩にわたりインキュベートし、上清を回収し、スピンダウンして、破砕物を除去し、次いで、試験まで、-80℃で保管した。Magpixマルチプレックス酵素免疫測定プレートリーダー(BioRad)上で試行された、27プレックスヒトサイトカインキットおよび9プレックスマトリックスメタロプロテアーゼキットを使用して、セクレトーム解析を実施する。
生成物の安定性:
[00337]工程開発時に、PBS/EDTA緩衝液;0.5%HAS(Alburex)を伴うPBS/EDTA緩衝液、0.9%生理食塩液単独または0.5%HASを伴う生理食塩液を含む、多様な賦形剤について調べることができる。0.5%HAS賦形剤を伴う、0.9%の生理食塩液(Baxter)が、最適の細胞生存率および表現型を維持することが見出される(データは示さない)。肝硬変ドナーに由来するマクロファージの、採取後における安定性について、3工程の最適化試行において探索し、工程検証試行では、より限定的な範囲の時点について評価した(n=3)。採取および賦形剤(注入用の0.9%生理食塩液、0.5%ヒト血清アルブミン)中の再懸濁後、バッグは、周囲温度(21℃~22℃)で保管することができ、採取の0、2、4、6、8、12、24、30、および48時間後に、サンプリングする。出荷判定基準のための抗体パネルを、各試料について試行し、25F9およびCD206についての幾何MFIにより、生存率および0日目からの平均値倍数変化を測定する。
[00337]工程開発時に、PBS/EDTA緩衝液;0.5%HAS(Alburex)を伴うPBS/EDTA緩衝液、0.9%生理食塩液単独または0.5%HASを伴う生理食塩液を含む、多様な賦形剤について調べることができる。0.5%HAS賦形剤を伴う、0.9%の生理食塩液(Baxter)が、最適の細胞生存率および表現型を維持することが見出される(データは示さない)。肝硬変ドナーに由来するマクロファージの、採取後における安定性について、3工程の最適化試行において探索し、工程検証試行では、より限定的な範囲の時点について評価した(n=3)。採取および賦形剤(注入用の0.9%生理食塩液、0.5%ヒト血清アルブミン)中の再懸濁後、バッグは、周囲温度(21℃~22℃)で保管することができ、採取の0、2、4、6、8、12、24、30、および48時間後に、サンプリングする。出荷判定基準のための抗体パネルを、各試料について試行し、25F9およびCD206についての幾何MFIにより、生存率および0日目からの平均値倍数変化を測定する。
統計学的解析:
[00338]結果は、平均値±SDとして発現されうる。対応のない両側t検定による評価が可能な場合、GraphPad Prism 6を使用して、差違の統計学的有意性について評価する。P値が、<0.05である場合に、結果を、統計学的に有意であると考えることができる。
[00338]結果は、平均値±SDとして発現されうる。対応のない両側t検定による評価が可能な場合、GraphPad Prism 6を使用して、差違の統計学的有意性について評価する。P値が、<0.05である場合に、結果を、統計学的に有意であると考えることができる。
[00339]本明細書ではまた、本明細書で記載される組成物、本明細書で記載されるベクター、または本明細書で記載されるポリペプチドを含む細胞も提供される。一部の実施形態では、細胞は、貪食細胞である。一部の実施形態では、細胞は、幹細胞由来細胞、骨髄細胞、マクロファージ、樹状細胞、リンパ球、マスト細胞、単球、好中球、小膠細胞、または星状膠細胞である。一部の実施形態では、細胞は、自家細胞である。一部の実施形態では、細胞は、同種細胞である。一部の実施形態では、細胞は、M1細胞である。一部の実施形態では、細胞は、M2細胞である。一部の実施形態では、細胞は、M1マクロファージ細胞である。一部の実施形態では、細胞は、M2マクロファージ細胞である。一部の実施形態では、細胞は、M1骨髄細胞である。一部の実施形態では、細胞は、M2骨髄細胞である。
[00340]本明細書ではまた、それを必要とする対象における疾患を処置する方法であって、対象へと、本明細書で記載される医薬組成物を投与するステップを含む方法も提供される。一部の実施形態では、疾患は、がんである。一部の実施形態では、がんは、固形がんである。一部の実施形態では、固形がんは、卵巣がんであり、適切ながんは、卵巣がん、腎臓がん、乳がん、前立腺がん、肝がん、脳がん、リンパ腫、白血病、皮膚がん、膵臓がん、結腸直腸がん、肺がんを含む。一部の実施形態では、がんは、液性がんである。一部の実施形態では、液性がんは、白血病またはリンパ腫である。一部の実施形態では、液性がんは、T細胞リンパ腫である。一部の実施形態では、疾患は、T細胞悪性腫瘍である。
[00341]一部の実施形態では、方法は、さらなる治療剤を、対象へと投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、さらなる治療剤は、CD47アゴニスト、Racを阻害する薬剤、Cdc42を阻害する薬剤、GTPアーゼを阻害する薬剤、F-アクチンのディスアセンブリーを促進する薬剤、PI3KのPFPへの動員を促進する薬剤、PI3Kの活性を促進する薬剤、ホスファチジルイノシトール3,4,5-三リン酸の産生を促進する薬剤、ARHGAP12の活性を促進する薬剤、ARHGAP25の活性を促進する薬剤、SH3BP1の活性を促進する薬剤、およびこれらの任意の組合せからなる群から選択される。
[00342]一部の実施形態では、投与するステップは、注入または注射を含む。一部の実施形態では、投与するステップは、固形がんへの直接的投与を含む。一部の実施形態では、投与するステップは、circRNAベース送達手順、非粒子封入型mRNAベース送達手順、mRNAベース送達手順、ウイルスベース送達手順、粒子ベース送達手順、リポソームベース送達手順、またはエクソソームベース送達手順を含む。一部の実施形態では、CD4+ T細胞応答またはCD8+ T細胞応答が、対象において誘発される。
[00343]本明細書ではまた、細胞を調製する方法であって、細胞を、本明細書で記載される組成物、本明細書で記載されるベクター、または本明細書で記載されるポリペプチドと接触させるステップを含む方法も提供される。一部の実施形態では、接触させるステップは、形質導入を含む。一部の実施形態では、接触させるステップは、化学的トランスフェクション、電気穿孔、ヌクレオフェクション、またはウイルスによる感染もしくは形質導入を含む。
[00344]本明細書では、上記で記載された組成物のうちのいずれか1つを含む治療剤を投与するための方法が提供される。一部の実施形態では、治療的は、非経口投与経路を介して投与される。
[00345]一部の実施形態では、治療的は、筋内投与経路を介して投与される。一部の実施形態では、治療的は、静脈内投与経路を介して投与される。一部の実施形態では、治療的は、皮下投与経路を介して投与される。
[00346]本明細書ではまた、本明細書で記載される、1つまたは複数の組換え核酸と、脂質とを、本明細書で記載される水性組成物中に含む、医薬組成物を調製する方法も提供される。一部の実施形態では、組成物は、本明細書で記載されるベクターを含む。一部の実施形態では、脂質は、脂質ナノ粒子の形成を含む。
実施例1.細胞内インターフェロン活性化ドメインを伴う、キメラ抗原受容体タンパク質構築物:
[00347]本実施例では、炎症性シグナル伝達細胞内ドメインを有する、本明細書で記載される、多様なCFP構築物の、アミノ酸配列および核酸配列が開示される。下記で詳述される核酸配列は、一般に使用される分子クローニング法を使用して、それらから、適切な構築物または変異体を作製および使用する場合の指針をもたらすための、DNA配列およびmRNA配列について、当業者により、容易に解釈されうる。
[00347]本実施例では、炎症性シグナル伝達細胞内ドメインを有する、本明細書で記載される、多様なCFP構築物の、アミノ酸配列および核酸配列が開示される。下記で詳述される核酸配列は、一般に使用される分子クローニング法を使用して、それらから、適切な構築物または変異体を作製および使用する場合の指針をもたらすための、DNA配列およびmRNA配列について、当業者により、容易に解釈されうる。
[00349]HER2-FcR-MDA5キメラ融合タンパク質(CFP)アミノ酸配列(CDR配列に下線を付す):
atgtggctgcagagcctgctgctgctgggcaccgtggcgtgcagcattagcgaaattcagctggtgcagagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcgtgcgcattagctgcgcggcgagcggctatacctttaccaactatggcatgaactgggtgcgccaggcgccgggcaaaggcctggaatggatgggctggattaacacccataccggcgaaccgacctatgcggatagctttaaaggccgctttacctttagcctggatgatagcaaaaacaccgcgtatctgcagattaacagcctgcgcgcggaagataccgcggtgtatttttgcacccgccgcggctatgattggtattttgatgtgtggggccagggcaccaccgtgaccgtgagcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcgatattcagatgacccagagcccgagcagcctgagcgcgagcgtgggcgatcgcgtgaccattacctgccgcgcgagccaggatattaacagctatctgagctggtttcagcagaaaccgggcaaagcgccgaaaaccctgatttatcgcgcgaaccgcctggaaagcggcgtgccgagccgctttagcggcagcggcagcggcaccgattataccctgaccattagcagcctgcagtatgaagattttggcatttattattgccagcagtatgatgaaagcccgtggacctttggcggcggcaccaaactggaaattaaaagcggcggcggcggcagcggcgcgctgagcaacagcattatgtattttagccattttgtgccggtgtttctgccggcgaaaccgaccaccaccccggcgccgcgcccgccgaccccggcgccgaccattgcgagccagccgctgagcctgcgcccggaagcgtgccgcccggcggcgggcggcgcggtgcatacccgcggcctggatatttatatttgggcgccgctggcgggcacctgcggcgtgctgctgctgagcctggtgattaccctgtattgccgcctgaaaattcaggtgcgcaaagcggcgattaccagctatgaaaaaagcgatggcgtgtataccggcctgagcacccgcaaccaggaaacctatgaaaccctgaaacatgaaaaaccgccgcagggcagcggcagcatgagcaacggctatagcaccgatgaaaactttcgctatctgattagctgctttcgcgcgcgcgtgaaaatgtatattcaggtggaaccggtgctggattatctgacctttctgccggcggaagtgaaagaacagattcagcgcaccgtggcgaccagcggcaacatgcaggcggtggaactgctgctgagcaccctggaaaaaggcgtgtggcatctgggctggacccgcgaatttgtggaagcgctgcgccgcaccggcagcccgctggcggcgcgctatatgaacccggaactgaccgatctgccgagcccgagctttgaaaacgcgcatgatgaatatctgcagctgctgaacctgctgcagccgaccctggtggataaactgctggtgcgcgatgtgctggataaatgcatggaagaagaactgctgaccattgaagatcgcaaccgcattgcggcggcggaaaacaacggcaacgaaagcggcgtgcgcgaactgctgaaacgcattgtgcagaaagaaaactggtttagcgcgtttctgaacgtgctgcgccagaccggcaacaacgaactggtgcaggaactgaccggcagcgattgcagcgaaagcaacgcggaaattgaaaac(配列番号48)。
[00351]本明細書で開示される、HER2-CD8ヒンジ-FcR-MDA5をコードする、例示的核酸配列は、以下の配列を含む:
ATGTGGCTGCAGTCTCTGCTGCTGCTGGGAACAGTGGCCTGCAGCATCAGCGACATCCAGATGACACAGAGCCCTAGCAGCCTGTCTGCCTCTGTGGGCGATAGAGTGACCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGGATGTGAATACCGCCGTGGCCTGGTATCAGCAGAAGCCTGGAAAAGCCCCTAAGCTGCTGATCTACAGCGCCAGCTTTCTGTACAGCGGCGTGCCAAGCAGATTCAGCGGCAGCAGATCTGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCTAGCCTGCAGCCTGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGCACTACACCACACCTCCAACCTTTGGCCAGGGCACCAAGGTGGAAATCAAGAGAACAGGCAGCACCAGCGGCTCTGGAAAGCCTGGATCTGGCGAAGGATCTGAGGTGCAGCTGGTTGAATCTGGCGGAGGACTTGTTCAGCCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCAACATCAAGGACACCTACATCCACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAGGGACTTGAATGGGTCGCCAGAATCTACCCCACCAACGGCTACACCAGATACGCCGATAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCGCCGACACCAGCAAGAACACCGCCTACCTGCAGATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTTCTAGATGGGGAGGCGACGGCTTCTACGCCATGGATGTTTGGGGACAGGGCACCCTGGTCACAGTTTCTTCTAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGAGCCCTGAGCAATAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACACCCGCTCCTAGACCACCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTCAGACCTGAAGCCTGTAGACCTGCAGCTGGCGGAGCTGTGCATACCAGAGGCCTGGATATCTACATTTGGGCCCCTCTGGCTGGCACATGTGGCGTTCTGCTGCTCTCTCTGGTCATCACCCTGTACTGCAGACGGCTGAAGATCCAAGTGCGGAAGGCCGCCATCACCAGCTACGAGAAATCTGATGGCGTGTACACCGGCCTGAGCACCCGGAATCAAGAAACCTACGAGACACTGAAGCACGAGAAGCCTCCACAAATGAGTAACGGTTACAGCACGGACGAGAACTTCCGCTATCTGATTAGCTGTTTCCGGGCTCGCGTAAAGATGTATATCCAGGTAGAGCCAGTGCTGGATTACCTGACGTTCCTCCCTGCCGAGGTGAAGGAACAGATTCAGCGAACAGTAGCGACATCAGGAAATATGCAAGCGGTGGAGTTGCTGCTCTCTACCCTCGAAAAAGGTGTTTGGCACCTGGGATGGACACGGGAATTCGTCGAAGCTCTCAGGCGAACTGGATCTCCTCTTGCCGCTAGGTACATGAACCCGGAACTCACTGATTTGCCGTCACCGTCTTTCGAGAACGCCCATGATGAGTATCTCCAGCTTCTGAATTTGCTTCAGCCTACCTTGGTCGACAAACTGTTGGTTCGGGACGTTTTGGACAAGTGTATGGAGGAGGAGCTGCTGACCATCGAGGACAGAAACCGGATAGCTGCGGCAGAGAACAATGGCAACGAGTCAGGAGTTCGGGAGTTGTTGAAGAGGATAGTGCAAAAGGAGAATTGGTTCAGCGCTTTCCTTAACGTACTCCGACAGACAGGCAACAATGAACTCGTACAAGAGTTGACAGGGTCAGATTGCAGTGAATCCAACGCCGAAATTGAAAAT(配列番号68)
ATGTGGCTGCAGTCTCTGCTGCTGCTGGGAACAGTGGCCTGCAGCATCAGCGACATCCAGATGACACAGAGCCCTAGCAGCCTGTCTGCCTCTGTGGGCGATAGAGTGACCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGGATGTGAATACCGCCGTGGCCTGGTATCAGCAGAAGCCTGGAAAAGCCCCTAAGCTGCTGATCTACAGCGCCAGCTTTCTGTACAGCGGCGTGCCAAGCAGATTCAGCGGCAGCAGATCTGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCTAGCCTGCAGCCTGAGGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGCACTACACCACACCTCCAACCTTTGGCCAGGGCACCAAGGTGGAAATCAAGAGAACAGGCAGCACCAGCGGCTCTGGAAAGCCTGGATCTGGCGAAGGATCTGAGGTGCAGCTGGTTGAATCTGGCGGAGGACTTGTTCAGCCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCCGCCAGCGGCTTCAACATCAAGGACACCTACATCCACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAGGGACTTGAATGGGTCGCCAGAATCTACCCCACCAACGGCTACACCAGATACGCCGATAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCGCCGACACCAGCAAGAACACCGCCTACCTGCAGATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTTCTAGATGGGGAGGCGACGGCTTCTACGCCATGGATGTTTGGGGACAGGGCACCCTGGTCACAGTTTCTTCTAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGAGCCCTGAGCAATAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACACCCGCTCCTAGACCACCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTCAGACCTGAAGCCTGTAGACCTGCAGCTGGCGGAGCTGTGCATACCAGAGGCCTGGATATCTACATTTGGGCCCCTCTGGCTGGCACATGTGGCGTTCTGCTGCTCTCTCTGGTCATCACCCTGTACTGCAGACGGCTGAAGATCCAAGTGCGGAAGGCCGCCATCACCAGCTACGAGAAATCTGATGGCGTGTACACCGGCCTGAGCACCCGGAATCAAGAAACCTACGAGACACTGAAGCACGAGAAGCCTCCACAAATGAGTAACGGTTACAGCACGGACGAGAACTTCCGCTATCTGATTAGCTGTTTCCGGGCTCGCGTAAAGATGTATATCCAGGTAGAGCCAGTGCTGGATTACCTGACGTTCCTCCCTGCCGAGGTGAAGGAACAGATTCAGCGAACAGTAGCGACATCAGGAAATATGCAAGCGGTGGAGTTGCTGCTCTCTACCCTCGAAAAAGGTGTTTGGCACCTGGGATGGACACGGGAATTCGTCGAAGCTCTCAGGCGAACTGGATCTCCTCTTGCCGCTAGGTACATGAACCCGGAACTCACTGATTTGCCGTCACCGTCTTTCGAGAACGCCCATGATGAGTATCTCCAGCTTCTGAATTTGCTTCAGCCTACCTTGGTCGACAAACTGTTGGTTCGGGACGTTTTGGACAAGTGTATGGAGGAGGAGCTGCTGACCATCGAGGACAGAAACCGGATAGCTGCGGCAGAGAACAATGGCAACGAGTCAGGAGTTCGGGAGTTGTTGAAGAGGATAGTGCAAAAGGAGAATTGGTTCAGCGCTTTCCTTAACGTACTCCGACAGACAGGCAACAATGAACTCGTACAAGAGTTGACAGGGTCAGATTGCAGTGAATCCAACGCCGAAATTGAAAAT(配列番号68)
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGITFSINTMGWYRQAPGKQRELVALISSIGDTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCKRFRTAAQGTDYWGQGTQVTVSS(配列番号107)。
[00353]MDA5細胞内ドメインを使用する、さらなる例示的CFP構築物は、以下のアミノ酸配列を有する、CD5-FcR-MDA5構築物(配列番号4)でありうる:
[00355]CD5-FcR-MDA5をコードする例示的ポリヌクレオチド配列は、以下の配列を含みうる:
atgtggctgcagagcctgctgctgctgggcaccgtggcgtgcagcattagcgaaattcagctggtgcagagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcgtgcgcattagctgcgcggcgagcggctatacctttaccaactatggcatgaactgggtgcgccaggcgccgggcaaaggcctggaatggatgggctggattaacacccataccggcgaaccgacctatgcggatagctttaaaggccgctttacctttagcctggatgatagcaaaaacaccgcgtatctgcagattaacagcctgcgcgcggaagataccgcggtgtatttttgcacccgccgcggctatgattggtattttgatgtgtggggccagggcaccaccgtgaccgtgagcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcgatattcagatgacccagagcccgagcagcctgagcgcgagcgtgggcgatcgcgtgaccattacctgccgcgcgagccaggatattaacagctatctgagctggtttcagcagaaaccgggcaaagcgccgaaaaccctgatttatcgcgcgaaccgcctggaaagcggcgtgccgagccgctttagcggcagcggcagcggcaccgattataccctgaccattagcagcctgcagtatgaagattttggcatttattattgccagcagtatgatgaaagcccgtggacctttggcggcggcaccaaactggaaattaaaagcggcggcggcggcagcggcgcgctgagcaacagcattatgtattttagccattttgtgccggtgtttctgccggcgaaaccgaccaccaccccggcgccgcgcccgccgaccccggcgccgaccattgcgagccagccgctgagcctgcgcccggaagcgtgccgcccggcggcgggcggcgcggtgcatacccgcggcctggatatttatatttgggcgccgctggcgggcacctgcggcgtgctgctgctgagcctggtgattaccctgtattgccgcctgaaaattcaggtgcgcaaagcggcgattaccagctatgaaaaaagcgatggcgtgtataccggcctgagcacccgcaaccaggaaacctatgaaaccctgaaacatgaaaaaccgccgcagggcagcggcagcatgagcaacggctatagcaccgatgaaaactttcgctatctgattagctgctttcgcgcgcgcgtgaaaatgtatattcaggtggaaccggtgctggattatctgacctttctgccggcggaagtgaaagaacagattcagcgcaccgtggcgaccagcggcaacatgcaggcggtggaactgctgctgagcaccctggaaaaaggcgtgtggcatctgggctggacccgcgaatttgtggaagcgctgcgccgcaccggcagcccgctggcggcgcgctatatgaacccggaactgaccgatctgccgagcccgagctttgaaaacgcgcatgatgaatatctgcagctgctgaacctgctgcagccgaccctggtggataaactgctggtgcgcgatgtgctggataaatgcatggaagaagaactgctgaccattgaagatcgcaaccgcattgcggcggcggaaaacaacggcaacgaaagcggcgtgcgcgaactgctgaaacgcattgtgcagaaagaaaactggtttagcgcgtttctgaacgtgctgcgccagaccggcaacaacgaactggtgcaggaactgaccggcagcgattgcagcgaaagcaacgcggaaattgaaaac(配列番号49)。
atgtggctgcagagcctgctgctgctgggcaccgtggcgtgcagcattagcgaaattcagctggtgcagagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcgtgcgcattagctgcgcggcgagcggctatacctttaccaactatggcatgaactgggtgcgccaggcgccgggcaaaggcctggaatggatgggctggattaacacccataccggcgaaccgacctatgcggatagctttaaaggccgctttacctttagcctggatgatagcaaaaacaccgcgtatctgcagattaacagcctgcgcgcggaagataccgcggtgtatttttgcacccgccgcggctatgattggtattttgatgtgtggggccagggcaccaccgtgaccgtgagcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcgatattcagatgacccagagcccgagcagcctgagcgcgagcgtgggcgatcgcgtgaccattacctgccgcgcgagccaggatattaacagctatctgagctggtttcagcagaaaccgggcaaagcgccgaaaaccctgatttatcgcgcgaaccgcctggaaagcggcgtgccgagccgctttagcggcagcggcagcggcaccgattataccctgaccattagcagcctgcagtatgaagattttggcatttattattgccagcagtatgatgaaagcccgtggacctttggcggcggcaccaaactggaaattaaaagcggcggcggcggcagcggcgcgctgagcaacagcattatgtattttagccattttgtgccggtgtttctgccggcgaaaccgaccaccaccccggcgccgcgcccgccgaccccggcgccgaccattgcgagccagccgctgagcctgcgcccggaagcgtgccgcccggcggcgggcggcgcggtgcatacccgcggcctggatatttatatttgggcgccgctggcgggcacctgcggcgtgctgctgctgagcctggtgattaccctgtattgccgcctgaaaattcaggtgcgcaaagcggcgattaccagctatgaaaaaagcgatggcgtgtataccggcctgagcacccgcaaccaggaaacctatgaaaccctgaaacatgaaaaaccgccgcagggcagcggcagcatgagcaacggctatagcaccgatgaaaactttcgctatctgattagctgctttcgcgcgcgcgtgaaaatgtatattcaggtggaaccggtgctggattatctgacctttctgccggcggaagtgaaagaacagattcagcgcaccgtggcgaccagcggcaacatgcaggcggtggaactgctgctgagcaccctggaaaaaggcgtgtggcatctgggctggacccgcgaatttgtggaagcgctgcgccgcaccggcagcccgctggcggcgcgctatatgaacccggaactgaccgatctgccgagcccgagctttgaaaacgcgcatgatgaatatctgcagctgctgaacctgctgcagccgaccctggtggataaactgctggtgcgcgatgtgctggataaatgcatggaagaagaactgctgaccattgaagatcgcaaccgcattgcggcggcggaaaacaacggcaacgaaagcggcgtgcgcgaactgctgaaacgcattgtgcagaaagaaaactggtttagcgcgtttctgaacgtgctgcgccagaccggcaacaacgaactggtgcaggaactgaccggcagcgattgcagcgaaagcaacgcggaaattgaaaac(配列番号49)。
[00356]本明細書で開示される、CD5-CD8ヒンジ-CD8TM-FcR-MDA5をコードする、例示的核酸配列は、以下の配列を含む:
ATGTGGCTGCAGTCTCTGCTGCTGCTGGGAACAGTGGCCTGCAGCATCAGCGAGATCCAGCTGGTTCAGTCTGGCGGCGGACTTGTGAAACCTGGCGGATCTGTCAGAATCAGCTGTGCCGCCAGCGGCTACACCTTCACCAACTACGGCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAAGGCCTTGAGTGGATGGGCTGGATCAATACCCACACCGGCGAGCCAACCTACGCCGATAGCTTTAAGGGCAGATTCACCTTCAGCCTGGACGACAGCAAGAACACCGCCTACCTGCAGATCAACAGCCTGAGAGCCGAGGATACCGCCGTGTACTTCTGCACCAGAAGAGGCTACGACTGGTACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACAGTTTCTAGCGGAGGCGGAGGATCAGGTGGCGGTGGATCTGGCGGTGGTGGCTCTGATATCCAGATGACACAGAGCCCTAGCAGCCTGTCTGCCTCTGTGGGCGATAGAGTGACCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGGACATCAACAGCTACCTGAGCTGGTTCCAGCAGAAGCCTGGCAAGGCCCCTAAGACACTGATCTACCGGGCCAACAGACTGGAAAGCGGCGTGCCAAGCAGATTTTCTGGCAGCGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACAATCAGCAGCCTGCAGTACGAGGACTTCGGCATCTACTACTGCCAGCAGTACGACGAGAGCCCTTGGACATTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGAGCCCTGAGCAATAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACACCCGCTCCTAGACCACCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTCAGACCTGAAGCCTGTAGACCTGCAGCTGGCGGAGCTGTGCATACCAGAGGCCTGGATATCTACATTTGGGCCCCTCTGGCTGGCACATGTGGCGTTCTGCTGCTCTCTCTGGTCATCACCCTGTACTGCAGACGGCTGAAGATCCAAGTGCGGAAGGCCGCCATCACCAGCTACGAGAAATCTGATGGCGTGTACACCGGCCTGAGCACCCGGAATCAAGAAACCTACGAGACACTGAAGCACGAGAAGCCTCCACAAATGAGTAACGGTTACAGCACGGACGAGAACTTCCGCTATCTGATTAGCTGTTTCCGGGCTCGCGTAAAGATGTATATCCAGGTAGAGCCAGTGCTGGATTACCTGACGTTCCTCCCTGCCGAGGTGAAGGAACAGATTCAGCGAACAGTAGCGACATCAGGAAATATGCAAGCGGTGGAGTTGCTGCTCTCTACCCTCGAAAAAGGTGTTTGGCACCTGGGATGGACACGGGAATTCGTCGAAGCTCTCAGGCGAACTGGATCTCCTCTTGCCGCTAGGTACATGAACCCGGAACTCACTGATTTGCCGTCACCGTCTTTCGAGAACGCCCATGATGAGTATCTCCAGCTTCTGAATTTGCTTCAGCCTACCTTGGTCGACAAACTGTTGGTTCGGGACGTTTTGGACAAGTGTATGGAGGAGGAGCTGCTGACCATCGAGGACAGAAACCGGATAGCTGCGGCAGAGAACAATGGCAACGAGTCAGGAGTTCGGGAGTTGTTGAAGAGGATAGTGCAAAAGGAGAATTGGTTCAGCGCTTTCCTTAACGTACTCCGACAGACAGGCAACAATGAACTCGTACAAGAGTTGACAGGGTCAGATTGCAGTGAATCCAACGCCGAAATTGAAAAT(配列番号75)
[00357]
ATGTGGCTGCAGTCTCTGCTGCTGCTGGGAACAGTGGCCTGCAGCATCAGCGAGATCCAGCTGGTTCAGTCTGGCGGCGGACTTGTGAAACCTGGCGGATCTGTCAGAATCAGCTGTGCCGCCAGCGGCTACACCTTCACCAACTACGGCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAAGGCCTTGAGTGGATGGGCTGGATCAATACCCACACCGGCGAGCCAACCTACGCCGATAGCTTTAAGGGCAGATTCACCTTCAGCCTGGACGACAGCAAGAACACCGCCTACCTGCAGATCAACAGCCTGAGAGCCGAGGATACCGCCGTGTACTTCTGCACCAGAAGAGGCTACGACTGGTACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACAGTTTCTAGCGGAGGCGGAGGATCAGGTGGCGGTGGATCTGGCGGTGGTGGCTCTGATATCCAGATGACACAGAGCCCTAGCAGCCTGTCTGCCTCTGTGGGCGATAGAGTGACCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGGACATCAACAGCTACCTGAGCTGGTTCCAGCAGAAGCCTGGCAAGGCCCCTAAGACACTGATCTACCGGGCCAACAGACTGGAAAGCGGCGTGCCAAGCAGATTTTCTGGCAGCGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACAATCAGCAGCCTGCAGTACGAGGACTTCGGCATCTACTACTGCCAGCAGTACGACGAGAGCCCTTGGACATTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGAGCCCTGAGCAATAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACACCCGCTCCTAGACCACCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTCAGACCTGAAGCCTGTAGACCTGCAGCTGGCGGAGCTGTGCATACCAGAGGCCTGGATATCTACATTTGGGCCCCTCTGGCTGGCACATGTGGCGTTCTGCTGCTCTCTCTGGTCATCACCCTGTACTGCAGACGGCTGAAGATCCAAGTGCGGAAGGCCGCCATCACCAGCTACGAGAAATCTGATGGCGTGTACACCGGCCTGAGCACCCGGAATCAAGAAACCTACGAGACACTGAAGCACGAGAAGCCTCCACAAATGAGTAACGGTTACAGCACGGACGAGAACTTCCGCTATCTGATTAGCTGTTTCCGGGCTCGCGTAAAGATGTATATCCAGGTAGAGCCAGTGCTGGATTACCTGACGTTCCTCCCTGCCGAGGTGAAGGAACAGATTCAGCGAACAGTAGCGACATCAGGAAATATGCAAGCGGTGGAGTTGCTGCTCTCTACCCTCGAAAAAGGTGTTTGGCACCTGGGATGGACACGGGAATTCGTCGAAGCTCTCAGGCGAACTGGATCTCCTCTTGCCGCTAGGTACATGAACCCGGAACTCACTGATTTGCCGTCACCGTCTTTCGAGAACGCCCATGATGAGTATCTCCAGCTTCTGAATTTGCTTCAGCCTACCTTGGTCGACAAACTGTTGGTTCGGGACGTTTTGGACAAGTGTATGGAGGAGGAGCTGCTGACCATCGAGGACAGAAACCGGATAGCTGCGGCAGAGAACAATGGCAACGAGTCAGGAGTTCGGGAGTTGTTGAAGAGGATAGTGCAAAAGGAGAATTGGTTCAGCGCTTTCCTTAACGTACTCCGACAGACAGGCAACAATGAACTCGTACAAGAGTTGACAGGGTCAGATTGCAGTGAATCCAACGCCGAAATTGAAAAT(配列番号75)
[00357]
MWLQSLLLLGTVACSISEIQLVQSGGGLVKPGGSVRISCAASGYTFTNYGMNWVRQAPGKGLEWMGWINTHTGEPTYADSFKGRFTFSLDDSKNTAYLQINSLRAEDTAVYFCTRRGYDWYFDVWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDINSYLSWFQQKPGKAPKTLIYRANRLESGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQYEDFGIYYCQQYDESPWTFGGGTKLEIKSGGGGSGALSNSIMYFSHFVPVFLPAKPTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCRLKIQVRKAAITSYEKSDGVYTGLSTRNQETYETLKHEKPPQGSGSQRWKSKLYSIVCGKSTPEKEGELEGTTTKPLAPNPSFSPTPGFTPTLGFSPVPSSTFTSSSTYTPGDCPNFAAPRREVAPPYQGADPILATALASDPIPNPLQKWEDSAHKPQSLDTDDPATLYAVVENVPPLRWKEFVRRLGLSDHEIDRLELQNGRCLREAQYSMLATWRRRTPRREATLELLGRVLRDMDLLGCLEDIEEALCGPAALPPAPSLLR(配列番号50)
[00359]CD5-FcR-TNFR1をコードする例示的ポリヌクレオチド配列は、以下の配列を含みうる:
atgtggctgcagagcctgctgctgctgggcaccgtggcgtgcagcattagcgaaattcagctggtgcagagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcgtgcgcattagctgcgcggcgagcggctatacctttaccaactatggcatgaactgggtgcgccaggcgccgggcaaaggcctggaatggatgggctggattaacacccataccggcgaaccgacctatgcggatagctttaaaggccgctttacctttagcctggatgatagcaaaaacaccgcgtatctgcagattaacagcctgcgcgcggaagataccgcggtgtatttttgcacccgccgcggctatgattggtattttgatgtgtggggccagggcaccaccgtgaccgtgagcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcggcggcggcggcagcgatattcagatgacccagagcccgagcagcctgagcgcgagcgtgggcgatcgcgtgaccattacctgccgcgcgagccaggatattaacagctatctgagctggtttcagcagaaaccgggcaaagcgccgaaaaccctgatttatcgcgcgaaccgcctggaaagcggcgtgccgagccgctttagcggcagcggcagcggcaccgattataccctgaccattagcagcctgcagtatgaagattttggcatttattattgccagcagtatgatgaaagcccgtggacctttggcggcggcaccaaactggaaattaaaagcggcggcggcggcagcggcgcgctgagcaacagcattatgtattttagccattttgtgccggtgtttctgccggcgaaaccgaccaccaccccggcgccgcgcccgccgaccccggcgccgaccattgcgagccagccgctgagcctgcgcccggaagcgtgccgcccggcggcgggcggcgcggtgcatacccgcggcctggatatttatatttgggcgccgctggcgggcacctgcggcgtgctgctgctgagcctggtgattaccctgtattgccgcctgaaaattcaggtgcgcaaagcggcgattaccagctatgaaaaaagcgatggcgtgtataccggcctgagcacccgcaaccaggaaacctatgaaaccctgaaacatgaaaaaccgccgcagggcagcggcagccagcgctggaaaagcaaactgtatagcattgtgtgcggcaaaagcaccccggaaaaagaaggcgaactggaaggcaccaccaccaaaccgctggcgccgaacccgagctttagcccgaccccgggctttaccccgaccctgggctttagcccggtgccgagcagcacctttaccagcagcagcacctataccccgggcgattgcccgaactttgcggcgccgcgccgcgaagtggcgccgccgtatcagggcgcggatccgattctggcgaccgcgctggcgagcgatccgattccgaacccgctgcagaaatgggaagatagcgcgcataaaccgcagagcctggataccgatgatccggcgaccctgtatgcggtggtggaaaacgtgccgccgctgcgctggaaagaatttgtgcgccgcctgggcctgagcgatcatgaaattgatcgcctggaactgcagaacggccgctgcctgcgcgaagcgcagtatagcatgctggcgacctggcgccgccgcaccccgcgccgcgaagcgaccctggaactgctgggccgcgtgctgcgcgatatggatctgctgggctgcctggaagatattgaagaagcgctgtgcggcccggcggcgctgccgccggcgccgagcctgctgcgc(配列番号51)。
[00360]CD5-CD8ヒンジ-CD8TM-FcR-TNFR1をコードする例示的ポリヌクレオチド配列は、以下の通りである:
ATGTGGCTGCAGTCTCTGCTGCTGCTGGGAACAGTGGCCTGCAGCATCAGCGAGATCCAGCTGGTTCAGTCTGGCGGCGGACTTGTGAAACCTGGCGGATCTGTCAGAATCAGCTGTGCCGCCAGCGGCTACACCTTCACCAACTACGGCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAAGGCCTTGAGTGGATGGGCTGGATCAATACCCACACCGGCGAGCCAACCTACGCCGATAGCTTTAAGGGCAGATTCACCTTCAGCCTGGACGACAGCAAGAACACCGCCTACCTGCAGATCAACAGCCTGAGAGCCGAGGATACCGCCGTGTACTTCTGCACCAGAAGAGGCTACGACTGGTACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACAGTTTCTAGCGGAGGCGGAGGATCAGGTGGCGGTGGATCTGGCGGTGGTGGCTCTGATATCCAGATGACACAGAGCCCTAGCAGCCTGTCTGCCTCTGTGGGCGATAGAGTGACCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGGACATCAACAGCTACCTGAGCTGGTTCCAGCAGAAGCCTGGCAAGGCCCCTAAGACACTGATCTACCGGGCCAACAGACTGGAAAGCGGCGTGCCAAGCAGATTTTCTGGCAGCGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACAATCAGCAGCCTGCAGTACGAGGACTTCGGCATCTACTACTGCCAGCAGTACGACGAGAGCCCTTGGACATTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGAGCCCTGAGCAATAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACACCCGCTCCTAGACCACCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTCAGACCTGAAGCCTGTAGACCTGCAGCTGGCGGAGCTGTGCATACCAGAGGCCTGGATATCTACATTTGGGCCCCTCTGGCTGGCACATGTGGCGTTCTGCTGCTCTCTCTGGTCATCACCCTGTACTGCAGACGGCTGAAGATCCAAGTGCGGAAGGCCGCCATCACCAGCTACGAGAAATCTGATGGCGTGTACACCGGCCTGAGCACCCGGAATCAAGAAACCTACGAGACACTGAAGCACGAGAAGCCTCCACAAGGCAGCGGCAGCCAAAGATGGAAGAGCAAGCTGTATAGCATCGTGTGCGGCAAGTCCACCCCTGAGAAGGAAGGAGAGCTGGAAGGCACCACAACAAAGCCTCTGGCCCCTAACCCCTCATTCAGCCCTACCCCCGGCTTCACCCCCACCCTGGGATTTAGCCCCGTGCCCAGCAGCACCTTCACCAGCTCTAGCACCTACACCCCTGGCGACTGCCCCAACTTCGCCGCCCCTAGACGCGAGGTGGCCCCTCCTTACCAGGGCGCCGACCCTATCCTGGCCACAGCCCTGGCTTCTGATCCGATTCCTAATCCTCTGCAGAAGTGGGAGGACAGCGCCCACAAGCCCCAGAGCCTGGACACCGACGACCCCGCCACCCTGTACGCCGTGGTGGAAAACGTGCCTCCACTGCGGTGGAAAGAGTTCGTGCGGCGGCTGGGCCTGAGCGACCACGAGATCGACAGACTGGAACTGCAGAACGGCCGTTGCCTGAGAGAGGCCCAGTACAGCATGCTGGCAACATGGCGGAGAAGAACACCCAGAAGAGAGGCCACCCTGGAACTGCTGGGCAGAGTGCTGAGAGATATGGACCTGCTGGGTTGTCTGGAAGATATCGAGGAAGCCCTGTGCGGTCCTGCCGCTCTGCCTCCTGCTCCATCTCTGCTGAGA(配列番号82)
[00361]
ATGTGGCTGCAGTCTCTGCTGCTGCTGGGAACAGTGGCCTGCAGCATCAGCGAGATCCAGCTGGTTCAGTCTGGCGGCGGACTTGTGAAACCTGGCGGATCTGTCAGAATCAGCTGTGCCGCCAGCGGCTACACCTTCACCAACTACGGCATGAACTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAAGGCCTTGAGTGGATGGGCTGGATCAATACCCACACCGGCGAGCCAACCTACGCCGATAGCTTTAAGGGCAGATTCACCTTCAGCCTGGACGACAGCAAGAACACCGCCTACCTGCAGATCAACAGCCTGAGAGCCGAGGATACCGCCGTGTACTTCTGCACCAGAAGAGGCTACGACTGGTACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACAGTTTCTAGCGGAGGCGGAGGATCAGGTGGCGGTGGATCTGGCGGTGGTGGCTCTGATATCCAGATGACACAGAGCCCTAGCAGCCTGTCTGCCTCTGTGGGCGATAGAGTGACCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGGACATCAACAGCTACCTGAGCTGGTTCCAGCAGAAGCCTGGCAAGGCCCCTAAGACACTGATCTACCGGGCCAACAGACTGGAAAGCGGCGTGCCAAGCAGATTTTCTGGCAGCGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACAATCAGCAGCCTGCAGTACGAGGACTTCGGCATCTACTACTGCCAGCAGTACGACGAGAGCCCTTGGACATTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGAGCCCTGAGCAATAGCATCATGTACTTCAGCCACTTCGTGCCCGTGTTTCTGCCCGCCAAGCCTACAACAACACCCGCTCCTAGACCACCTACACCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTCAGACCTGAAGCCTGTAGACCTGCAGCTGGCGGAGCTGTGCATACCAGAGGCCTGGATATCTACATTTGGGCCCCTCTGGCTGGCACATGTGGCGTTCTGCTGCTCTCTCTGGTCATCACCCTGTACTGCAGACGGCTGAAGATCCAAGTGCGGAAGGCCGCCATCACCAGCTACGAGAAATCTGATGGCGTGTACACCGGCCTGAGCACCCGGAATCAAGAAACCTACGAGACACTGAAGCACGAGAAGCCTCCACAAGGCAGCGGCAGCCAAAGATGGAAGAGCAAGCTGTATAGCATCGTGTGCGGCAAGTCCACCCCTGAGAAGGAAGGAGAGCTGGAAGGCACCACAACAAAGCCTCTGGCCCCTAACCCCTCATTCAGCCCTACCCCCGGCTTCACCCCCACCCTGGGATTTAGCCCCGTGCCCAGCAGCACCTTCACCAGCTCTAGCACCTACACCCCTGGCGACTGCCCCAACTTCGCCGCCCCTAGACGCGAGGTGGCCCCTCCTTACCAGGGCGCCGACCCTATCCTGGCCACAGCCCTGGCTTCTGATCCGATTCCTAATCCTCTGCAGAAGTGGGAGGACAGCGCCCACAAGCCCCAGAGCCTGGACACCGACGACCCCGCCACCCTGTACGCCGTGGTGGAAAACGTGCCTCCACTGCGGTGGAAAGAGTTCGTGCGGCGGCTGGGCCTGAGCGACCACGAGATCGACAGACTGGAACTGCAGAACGGCCGTTGCCTGAGAGAGGCCCAGTACAGCATGCTGGCAACATGGCGGAGAAGAACACCCAGAAGAGAGGCCACCCTGGAACTGCTGGGCAGAGTGCTGAGAGATATGGACCTGCTGGGTTGTCTGGAAGATATCGAGGAAGCCCTGTGCGGTCCTGCCGCTCTGCCTCCTGCTCCATCTCTGCTGAGA(配列番号82)
[00361]
実施例2.CFP構築物について調べるための機能アッセイ
[00362]標的化構築物を、機能的特性について調べる。白血球アファレーシス試料から分離された、THP-1細胞またはCD14+/CD16-単球に、それぞれのCFPをコードするポリヌクレオチド構築物をトランスフェクトした。
[00362]標的化構築物を、機能的特性について調べる。白血球アファレーシス試料から分離された、THP-1細胞またはCD14+/CD16-単球に、それぞれのCFPをコードするポリヌクレオチド構築物をトランスフェクトした。
[00363]細胞トランスフェクションのための方法、およびトランスフェクション効率の検出:THP-1細胞を採取し、MaxCyte Electroporation bufferで、1回洗浄した。細胞を、1ml当たり1,000万個の密度で再懸濁させ、エッペンドルフ管内に100ugのATAK受容体RNAへと添加し、2回にわたり混合し、MaxCyte processing assembly(OC-25x3)へとロードした。MaxCyte上のTHP-1プログラムを使用して、細胞を電気穿孔する。電気穿孔の後、細胞を、37℃で、10分間にわたりインキュベートし、MaxCyte processing assembly内に回収し、次いで、あらかじめ加熱された培地を含有するプレートへと、1ml当たりの細胞50万個の密度で移した。
[00364]一晩にわたるインキュベーションの後、電気穿孔された単球内の、ATAK受容体の発現を、フローサイトメトリーにより評価する。抗Fab-Alexa Fluor-647抗体(希釈率を1:50とする)を使用して、ATAK受容体のscFvの発現を検出した。染色された試料を、Cytek Northern lights cytometer上に収集し、結合剤陽性細胞のパーセントを、モックトランスフェクト対照に照らした、抗Fab強度の増大に基づき計算した。
[00365]貪食アッセイのための方法:Sartorius Incucyte pHrodo-Red labeling kit protocolに従い、標的腫瘍細胞(SKOV3)を、pHrodo-Red染料(最終濃度を700ng/mlとする)で標識化する。標識化の後、培養培地を使用して、SKOV3細胞を、1ml当たりの細胞50万個の密度で再懸濁させる。CD14陽性単球を、ドナーLeukopakから分離し、MaxCyteを使用して、100ug/mlのATAK受容体RNAを電気穿孔した。電気穿孔の後、細胞を、37℃、培養培地中1ml当たりの細胞200万個の密度で、一晩にわたり回収した。翌日、NC-200を使用して、細胞をカウントし、培養培地を使用して、1ml当たりの細胞250万個の密度で再懸濁させる。低接着性U字底96ウェルプレート内に、50uLの腫瘍細胞(全細胞50,000個)を、50uLのATAK受容体トランスフェクト単球(全細胞125,000個)へと、5:1のE:T比で添加した。細胞を混合し、37℃で、一晩にわたりインキュベートする。
[00366]翌日、細胞を、単球を特異的に標識化する、CD45-Alexa Fluor 700で染色する。次いで、試料を、Cytek Northern lights上に収集して、pHrodo-RedおよびCD45のシグナル強度を検出する。貪食は、貪食指数パーセント、ならびに単球内のpHrodo-Red強度の特異的増大として測定する。貪食指数は、全単球数に照らして正規化された、pHrodo-redシグナルが高度である単球のパーセントとして計算する。ATAK単球の貪食活性を、モックトランスフェクト対照と比較して、ATAK受容体の有効性を決定する。
[00367]貪食は、図4Aおよび5Aにおいて示される通り、標識化腫瘍細胞を使用して調べることができる。
[00368]SKOV3細胞殺滅アッセイのための方法:SKOV3-ルシフェラーゼ細胞を使用して、ATAK受容体トランスフェクト単球の腫瘍殺滅活性について調べる。CD14陽性単球を、ドナーLeukopakから分離し、MaxCyteを使用して、100ug/mlのATAK受容体RNAを電気穿孔した。電気穿孔の後、細胞を、37℃、培養培地中、2時間にわたり回収する。回収の後、培養培地を使用して、細胞を、1ml当たり250万個の密度で再懸濁させる。SKOV3-ルシフェラーゼ細胞を採取し、1ml当たりの細胞250万個の密度で再懸濁させ、100ulの細胞懸濁液(ウェル1つ当たりの全細胞25,000個の密度)を、96ウェル平底プレート内に添加する。100uLのATAK受容体トランスフェクト単球を、同じウェルへと、1:1および10:1のE:T比で添加する。細胞を混合し、37℃で、3日間にわたりインキュベートする。
[00369]3日目に、ATAK単球により分泌されたサイトカインおよびケモカインを測定するために、上清を回収し、凍結させる。細胞を溶解させ、ルミネセンスプレートリーダーを使用して、SKOV3ルシフェラーゼレベルを測定する。ATAK単球を含有する試料についての、ルシフェラーゼレベルの、モックトランスフェクト対照と比較した低下は、ATAK細胞のSKOV3殺滅活性を指し示す。
[00370]以下の方法を使用して、骨髄細胞の極性化可能性について調べる。これらのエフェクター骨髄細胞に、核酸構築物を電気穿孔し、後続の使用および試験のために凍結させる。次いで、融解させたら、細胞を、例えば、(i)GMCSF、(ii)IL4、IL10、およびTGFベータ(M2刺激)、(iii)活性化T細胞馴化培地(TCM)、ならびに(iv)MCSFを伴う、個別のアリコート培養物中の極性化刺激下にある培養にかけた。細胞は、24、48、および72時間後に、フローサイトメトリーにより解析し、サイトカイン解析は、Luminexにより実施した。
[00371]THP1-Dual細胞を使用して、NF-κB/IFN経路の活性化を検出するための方法:THP1-Dual細胞は、分泌型アルカリホスファターゼの上流に、NF-κB応答エレメントを有し、分泌型ルシフェラーゼの上流に、IFN刺激性応答エレメントを有する。アルカリホスファターゼの上清中レベルの測定が、NF-κBシグナル伝達経路の活性化を指し示す一方、ルシフェラーゼの上清中レベルは、IFNシグナル伝達経路活性化を指し示す。MaxCyteを使用して、THP1-Dual細胞に、100ug/mlのATAK受容体RNAを電気穿孔する。電気穿孔の後、細胞を、37℃、培養培地中、2時間にわたり回収する。回収の後、培養培地を使用して、細胞を、1ml当たり50万個の密度で再懸濁させる。SKOV3細胞を採取し、1ml当たりの細胞50万個の密度で再懸濁させる。96ウェルプレート内に、100ulのSKOV3細胞懸濁液(ウェル1つ当たりの全細胞50,000個の密度)、および100uLのATAK-THP1-Dual細胞(全細胞50,000個)を、96ウェル平底プレートに、1:1のE:T比で添加する。細胞を混合し、37℃で、24時間にわたりインキュベートする。24時間後、細胞を遠心分離し、上清を回収する。
[00372]NF-κB経路の活性化を検出するために、QUANTI-Blue solution(Invivogen)を、上清へと添加し、37℃で、2時間にわたりインキュベートし、その後、吸光度プレートリーダーを使用して、ODを測定する。吸光度の増大は、NF-κBシグナル伝達の活性化を指し示し、ATAKトランスフェクトTHP1-Dual細胞についてのOD値を、モックトランスフェクト対照のOD値と比較して、ATAK受容体の活性を決定することができる。
[00373]IFN経路の活性化を検出するために、QUANTI-Luc solution(Invivogen)を、上清へと添加し、ルミネセンスプレートリーダーを使用して、ルシフェラーゼレベルを測定する。ルシフェラーゼレベルの上昇は、IFNシグナル伝達の活性化を含意し、ATAKトランスフェクトTHP1-Dual細胞と、モックトランスフェクト対照との間で比較されうる。
実施例3.CFP構築物を発現する骨髄細胞内の、NFカッパBの活性化、および炎症性サイトカインの誘導
[00374]本実施例では、個々の構築物を、THP-1細胞へと電気穿孔し、発現解析および機能解析を実施した。MDA5細胞内ドメインを有する構築物(図2E)以外の、多様な構築物(図2A~2D)の発現は、高度であった。同様に、HER2-FcR-PI3K-MDA5、HER2-CD68-FcR-PI3K-RIG1、およびHER2-CD68-FcR-PI3K-MyD88をコードする構築物は、THP-1骨髄細胞内で、低度の発現を示した(図2E、2F)。CFP構築物が、CD64膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメインを含む場合、高度のCFP発現が観察されたが、さらなる二重細胞内シグナル伝達ドメイン、または複数の細胞内シグナル伝達ドメイン、特に、例えば、PI3Kシグナル伝達ICDおよびTLRシグナル伝達ICDを含有するが、他の点では同一である構築物内では観察されなかった。さらなるドメインの、CD64またはCD89との融合は、見かけ上、機能の喪失を結果としてもたらすことが観察された(例えば、図4Cに示される貪食)。並行アッセイにおいて、CD40 ICDを、PI3キナーゼ動員ドメインなど、別のシグナル伝達ICDと共に有する構築物は、CD40 ICDではなく、TLRシグナル伝達ドメインを含む、マルチICDを伴うCFP構築物と比較して、やや高度の発現レベルを示す。貪食指数により指し示される貪食可能性は、CD40ICD構築物において、TLR-ICDを含有するマルチICDと比べて高度であった(図2F、図4D)。図4Bに示される通り、MDA5 ICDを、FcR ICDと共に含有する構築物(HER2-FcR-MDA5)は、HER2-CD40-FcR CFPと同等以上の貪食指数を示した。PI3キナーゼ動員ドメインを、MDA5、RIG-1、またはMyD88のシグナル伝達細胞内ドメインと共に、細胞内領域内に配置したところ、発現(図2F、図2G)および貪食(図4Dおよび図4E)のいずれもが、FcRおよびPI3キナーゼ動員ドメインを含有する構築物を下回った。
[00374]本実施例では、個々の構築物を、THP-1細胞へと電気穿孔し、発現解析および機能解析を実施した。MDA5細胞内ドメインを有する構築物(図2E)以外の、多様な構築物(図2A~2D)の発現は、高度であった。同様に、HER2-FcR-PI3K-MDA5、HER2-CD68-FcR-PI3K-RIG1、およびHER2-CD68-FcR-PI3K-MyD88をコードする構築物は、THP-1骨髄細胞内で、低度の発現を示した(図2E、2F)。CFP構築物が、CD64膜貫通ドメイン、またはCD89膜貫通ドメインを含む場合、高度のCFP発現が観察されたが、さらなる二重細胞内シグナル伝達ドメイン、または複数の細胞内シグナル伝達ドメイン、特に、例えば、PI3Kシグナル伝達ICDおよびTLRシグナル伝達ICDを含有するが、他の点では同一である構築物内では観察されなかった。さらなるドメインの、CD64またはCD89との融合は、見かけ上、機能の喪失を結果としてもたらすことが観察された(例えば、図4Cに示される貪食)。並行アッセイにおいて、CD40 ICDを、PI3キナーゼ動員ドメインなど、別のシグナル伝達ICDと共に有する構築物は、CD40 ICDではなく、TLRシグナル伝達ドメインを含む、マルチICDを伴うCFP構築物と比較して、やや高度の発現レベルを示す。貪食指数により指し示される貪食可能性は、CD40ICD構築物において、TLR-ICDを含有するマルチICDと比べて高度であった(図2F、図4D)。図4Bに示される通り、MDA5 ICDを、FcR ICDと共に含有する構築物(HER2-FcR-MDA5)は、HER2-CD40-FcR CFPと同等以上の貪食指数を示した。PI3キナーゼ動員ドメインを、MDA5、RIG-1、またはMyD88のシグナル伝達細胞内ドメインと共に、細胞内領域内に配置したところ、発現(図2F、図2G)および貪食(図4Dおよび図4E)のいずれもが、FcRおよびPI3キナーゼ動員ドメインを含有する構築物を下回った。
[00375]前出の段落で言及された構築物の一部を発現するTHP-1細胞は、とりわけ、PI3キナーゼ動員ドメインを、MDA5、RIG-1、またはMyD88のシグナル伝達細胞内ドメインと共に、細胞内領域内に配置した場合、発現時に、トニックシグナル伝達を呈する。図5Cに示される、HER2-CD64-CD40-PI3K構築物は、トニックシグナル伝達を呈した。HER2-CD64構築物内では、NFカッパBの活性化が誘導されたが、CD40 ICDおよびPI3キナーゼ動員細胞内ドメインを付加したところ、持続性のNFカッパB誘導が観察された(図5C)。本明細書で理解される通り、HER2-CD64またはHER2-CD89の発現は、IFNを誘導しない(図5D)。同様に、さらなるICDを伴わない、HER2-CD89構築物単独では、NFカッパBが誘導されたが、CD40 ICDおよびPI3Kシグナル伝達ICDの、構築物への付加は、標的細胞(例えば、HER2発現SKOV3)との接触時において、NFカッパBを誘導する、その能力を低下させた。HER2-CD89構築物内では、PI3キナーゼ動員ドメイン(PI3K)およびMDA5ドメインの付加も、同様の影響を及ぼした。同様に、HER2-FcR-PI3K-MAVSは、持続性のNFカッパBシグナル伝達またはIFNガンマシグナル伝達を呈した(図5Gおよび図5H)。これらの結果は、ICDが、個別に、またはそれらの天然のタンパク質内では、ある特定の、予測可能な形で機能する場合であってもなお、組み合わされた組換えタンパク質内における、細胞内ICD機能の影響についての、大きな予測不可能性を明らかにした。したがって、構築物のデザインの成功は、常套的分子クローニングのみに依存せず、断片または機能ドメインの任意の取合わせが、所望の機能を伴うCARを創出しうると期待される。CARへと構造化された場合における、異なるドメインの、互いに対する適合性および機能的能力は、骨髄細胞の貪食の改善のためにデザインされたCAR構築物の作出の成功において、極めて重要な側面である。未だ包括的ではない、進行中の所見の一部を例示する、予備的データを、下記(表7)に表解する:
実施例4.TRIF長鎖構築物およびTRIF(短鎖)構築物を発現する細胞内における、NFカッパBの活性化およびIFN応答
[00377]十分な発現レベルを呈し、トニックシグナル伝達を回避し、細胞外ドメインの活性化時に、NFカッパBの活性化およびIFN応答を示す構築物をデザインするために、いくつかの他の構築物をデザインし、調べた。図2Gおよび図5Iは、代表的構築物デザイン、およびTHP-1細胞内における発現データを示す。THP-1細胞に、mRNA構築物を電気穿孔し、HER2-CFP構築物の発現を、フローサイトメトリーにより決定した。貪食は、図5Aの概略図で裏付けられたプロトコールに従いアッセイし、これらの細胞内における、NFカッパBの活性化、インターフェロンガンマ活性化、およびサイトカイン発現のレベルを決定した。驚くべきことに、PI3キナーゼ動員ドメイン、およびTRIF(短鎖)(配列番号43のTRIFドメイン)と呼ばれる、TRIFの短縮型の両方を含む構築物は、長鎖TRIF(配列番号44)を含む、前出の段落で記載された構築物より高度の発現レベルを裏付けた(図5I)。TRIP(短鎖)を発現するTHP-1細胞は、トニックシグナル伝達を欠き、標的SKOV3腫瘍細胞の存在下に限り、NFカッパBおよびIFNの活性化を示し(図5G~5H、図5J)、TRIF(短鎖)を発現する細胞の貪食指数の、他の自然免疫アダプタードメインを、PI3キナーゼ動員ドメインと共に発現する細胞に対する改善を示した(図4E)。30分の1の発現(図2G、右)にも拘わらず、TRIF(短鎖)構築物による貪食は、ベースライン構築物(HER2-FcR-PI3K)と同等である(図4E)。他の構築物についての、NFカッパBの発現レベルおよび活性化は、図5J~5Lにおいて裏付けた。図5Nは、CD40構築物およびTRIF構築物による、炎症性サイトカインの発現を示す。
[00377]十分な発現レベルを呈し、トニックシグナル伝達を回避し、細胞外ドメインの活性化時に、NFカッパBの活性化およびIFN応答を示す構築物をデザインするために、いくつかの他の構築物をデザインし、調べた。図2Gおよび図5Iは、代表的構築物デザイン、およびTHP-1細胞内における発現データを示す。THP-1細胞に、mRNA構築物を電気穿孔し、HER2-CFP構築物の発現を、フローサイトメトリーにより決定した。貪食は、図5Aの概略図で裏付けられたプロトコールに従いアッセイし、これらの細胞内における、NFカッパBの活性化、インターフェロンガンマ活性化、およびサイトカイン発現のレベルを決定した。驚くべきことに、PI3キナーゼ動員ドメイン、およびTRIF(短鎖)(配列番号43のTRIFドメイン)と呼ばれる、TRIFの短縮型の両方を含む構築物は、長鎖TRIF(配列番号44)を含む、前出の段落で記載された構築物より高度の発現レベルを裏付けた(図5I)。TRIP(短鎖)を発現するTHP-1細胞は、トニックシグナル伝達を欠き、標的SKOV3腫瘍細胞の存在下に限り、NFカッパBおよびIFNの活性化を示し(図5G~5H、図5J)、TRIF(短鎖)を発現する細胞の貪食指数の、他の自然免疫アダプタードメインを、PI3キナーゼ動員ドメインと共に発現する細胞に対する改善を示した(図4E)。30分の1の発現(図2G、右)にも拘わらず、TRIF(短鎖)構築物による貪食は、ベースライン構築物(HER2-FcR-PI3K)と同等である(図4E)。他の構築物についての、NFカッパBの発現レベルおよび活性化は、図5J~5Lにおいて裏付けた。図5Nは、CD40構築物およびTRIF構築物による、炎症性サイトカインの発現を示す。
[00378]予備的所見を、下記(表8)に表解する:
実施例5.多様なHER2-CD40 CFP構築物を伴う初代ヒト単球についての試験
[00380]上記の結果に基づき、それぞれのCFP標的の存在下における、発現、貪食、および炎症性サイトカイン/ケモカインの放出について調べることにより、細胞内シグナル伝達ドメインおよび/または膜貫通ドメインの特異的組合せを使用する、受容体の増強について、ヒト初代単球内で調べる。(i)CD40および(ii)TRIFに由来するドメインを含むICDシグナル伝達ドメインは、CFPの増強について、上位の候補ドメインであった。前出の節で裏付けられた、THP-1細胞内の、CD40構築物およびTRIF構築物による、高度の発現および活性は、大きな有望性を保持したが、ヒト初代単球内では、これらの構築物の発現は低度であった。したがって、構築物の発現および安定性を改善するために、CD68膜貫通ドメインを、CD64膜貫通ドメイン、ならびにCD8ヒンジドメインおよびCD8膜貫通ドメインと交換した。初代単球内の、HER2-CD40 CFP構築物の表面発現について調べるために、初代単球を、2例の健常ヒトドナーから採取し、下記の表中の構築物を電気穿孔した(表9)。
[00380]上記の結果に基づき、それぞれのCFP標的の存在下における、発現、貪食、および炎症性サイトカイン/ケモカインの放出について調べることにより、細胞内シグナル伝達ドメインおよび/または膜貫通ドメインの特異的組合せを使用する、受容体の増強について、ヒト初代単球内で調べる。(i)CD40および(ii)TRIFに由来するドメインを含むICDシグナル伝達ドメインは、CFPの増強について、上位の候補ドメインであった。前出の節で裏付けられた、THP-1細胞内の、CD40構築物およびTRIF構築物による、高度の発現および活性は、大きな有望性を保持したが、ヒト初代単球内では、これらの構築物の発現は低度であった。したがって、構築物の発現および安定性を改善するために、CD68膜貫通ドメインを、CD64膜貫通ドメイン、ならびにCD8ヒンジドメインおよびCD8膜貫通ドメインと交換した。初代単球内の、HER2-CD40 CFP構築物の表面発現について調べるために、初代単球を、2例の健常ヒトドナーから採取し、下記の表中の構築物を電気穿孔した(表9)。
[00382]上記の構築物を発現するヒト初代単球による、SKOV3腫瘍の殺滅活性について調べるために、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された初代ヒト単球100,000個を、SKOV3-GFP-ルシフェラーゼ腫瘍細胞20,000個と共に共培養した。共培養の72時間後に、腫瘍細胞のルシフェラーゼ活性を検出し、ルシフェラーゼシグナル強度の低下により、殺滅を決定した。図9Aは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された、2例の異なるドナーに由来する初代ヒト単球による、SKOV3の殺滅活性についてのグラフを示す。
[00383]上記の構築物を発現するヒト初代単球による、SKBR3腫瘍の殺滅活性について調べるために、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された初代ヒト単球100,000個を、SKBR3-ルシフェラーゼ腫瘍細胞20,000個と共に共培養した。共培養の72時間後に、腫瘍細胞のルシフェラーゼ活性を検出し、ルシフェラーゼシグナル強度の低下により、殺滅を決定した。図9Bは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された、2例の異なるドナーに由来する初代ヒト単球による、SKBR3の殺滅活性についてのグラフを示す。
[00384]上記の構築物を発現するヒト初代単球のサイトカイン/ケモカイン誘導能について調べるために、上記の構築物を発現し、抗原で刺激された、ヒト初代単球、および上記の構築物を発現し、腫瘍細胞で刺激された、ヒト初代単球について調べた。抗原で刺激された、HER2-CFP初代単球試料について、96ウェルプレートを、2.5μg/mLのHER2-hisタンパク質でコーティングし、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された、初代ヒト単球ウェル1つ当たり100,000個を添加した。上清を、刺激の48時間後に回収し、分泌されたサイトカインを、Luminexにより解析した。腫瘍細胞で刺激された、HER2-CFP初代単球試料について、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された初代ヒト単球100,000個を、腫瘍細胞(SKOV3-GFP-ルシフェラーゼ細胞またはSKBR3-ルシフェラーゼ細胞)20,000個と共に共培養した。上清を、刺激の48時間後に回収し、分泌されたサイトカインを、Luminexにより解析した。統計学的有意性は、HER2-CFPを電気穿孔され、腫瘍細胞と共に共培養された初代単球試料と、モック電気穿孔され、腫瘍細胞と共に共培養された初代単球試料との間で決定した。図10Aは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、炎症促進性サイトカインであるIL-6の誘導についてのグラフを示す。図10Bは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、炎症促進性サイトカインであるIL-1βの誘導についてのグラフを示す。図10Cは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、TNF-αの誘導についてのグラフを示す。図10Dは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、IFN-αの誘導についてのグラフを示す。図10Eは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、IP10の誘導についてのグラフを示す。図10Fは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、IL-12の誘導についてのグラフを示す。上記の研究から、構築物は、高度のサイトカイン/ケモカイン応答を誘導することが見られた(例えば、図10A、図10B;具体的には、CD40、FcR、およびPI3Kの細胞内ドメインの、CD64膜貫通ドメインとの組合せは、高レベルのサイトカイン、例えば、IL-1bおよびIL6を誘導した)。これは、これらのキメラ受容体の、標的抗原への係合時に、単球が高度に活性化され、炎症応答の増強が可能であったことを指し示す。活性化細胞自体による、標的細胞の貪食に加えて、NFカッパBおよびIFN応答性遺伝子の、活性化CFP媒介性誘導のほか、骨髄細胞による、炎症性サイトカイン/ケモカインの放出も、これらの細胞が、in vivoにおける免疫活性化の増強を、潜在的にもたらしうることの徴候である。上記の構築物を発現するヒト初代単球をさらに特徴付けるために、Human nCounter Myeloid Innate Immunity V2 Panel(770遺伝子)を使用する、Nanostring遺伝子発現解析を援用する。
実施例6.多様なHER2-TRIF CFP構築物を伴う初代ヒト単球についての試験
[00385]初代単球内の、HER2-TRIF CFP構築物の表面発現について調べるために、初代単球を、2例の健常ヒトドナーから採取し、下記の表中の構築物を電気穿孔した(表10)。
[00385]初代単球内の、HER2-TRIF CFP構築物の表面発現について調べるために、初代単球を、2例の健常ヒトドナーから採取し、下記の表中の構築物を電気穿孔した(表10)。
[00388]上記の構築物を発現するヒト初代単球による、SKOV3腫瘍の殺滅活性について調べるために、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された初代ヒト単球100,000個を、SKOV3-GFP-ルシフェラーゼ腫瘍細胞20,000個と共に共培養した。共培養の72時間後に、腫瘍細胞のルシフェラーゼ活性を検出し、ルシフェラーゼシグナル強度の低下により、殺滅を決定した。図12Aは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された、2例の異なるドナーに由来する初代ヒト単球による、SKOV3の殺滅活性についてのグラフを示す。
[00389]上記の構築物を発現するヒト初代単球による、SKBR3腫瘍の殺滅活性について調べるために、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された初代ヒト単球100,000個を、SKBR3-ルシフェラーゼ腫瘍細胞20,000個と共に共培養した。共培養の72時間後に、腫瘍細胞のルシフェラーゼ活性を検出し、ルシフェラーゼシグナル強度の低下により、殺滅を決定した。図12Bは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された、2例の異なるドナーに由来する初代ヒト単球による、SKBR3の殺滅活性についてのグラフを示す。
[00390]上記の構築物を発現するヒト初代単球のサイトカイン/ケモカイン誘導能について調べるために、上記の構築物を発現し、抗原で刺激された、ヒト初代単球、および上記の構築物を発現し、腫瘍細胞で刺激された、ヒト初代単球について調べた。抗原で刺激された、HER2-CFP初代単球試料について、96ウェルプレートを、2.5μg/mLのHER2-hisタンパク質でコーティングし、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された、初代ヒト単球ウェル1つ当たり100,000個を添加した。上清を、刺激の48時間後に回収し、分泌されたサイトカインを、Luminexにより解析した。腫瘍細胞で刺激された、HER2-CFP初代単球試料について、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔された初代ヒト単球100,000個を、腫瘍細胞(SKOV3-GFP-ルシフェラーゼ細胞またはSKBR3-ルシフェラーゼ細胞)20,000個と共に共培養した。上清を、刺激の48時間後に回収し、分泌されたサイトカインを、Luminexにより解析した。統計学的有意性は、HER2-CFPを電気穿孔され、腫瘍細胞と共に共培養された初代単球試料と、モック電気穿孔され、腫瘍細胞と共に共培養された初代単球試料との間で決定した。図13Aは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、炎症促進性サイトカインであるIL-6の誘導についてのグラフを示す。図13Bは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、炎症促進性サイトカインであるIL-1βの誘導についてのグラフを示す。図13Cは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、TNF-αの誘導についてのグラフを示す。図13Dは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、IFN-αの誘導についてのグラフを示す。図13Eは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、IP10の誘導についてのグラフを示す。図13Fは、表示のHER2-CFP構築物を電気穿孔され、HER-2抗原により刺激される(上)か、またはSKOV3腫瘍細胞(下、左)もしくはSKBR3腫瘍細胞(下、右)と共に共培養された、ヒトドナーに由来する初代ヒト単球による、IL-12の誘導についてのグラフを示す。Human nCounter Myeloid Innate Immunity V2 Panel(770遺伝子)を使用する、Nanostring遺伝子発現解析を援用する。
[00391]加えて、予備的in vivo研究では、TRIFおよびCD40の細胞内ドメインを含むCFPは、図14に示される通り、ICDが、実際に、保護的免疫を付与したことを指し示す。TRIFまたはCD40ベースのATAK受容体を備えた初代単球は、B16黒色腫腫瘍モデルにおいて、強力な抗腫瘍応答を示した。(左)ATAK単球で処置されたマウスにおける、処置後の黒色腫の腫瘍容量である。(右)FcR-PI3K ATAK受容体またはTRIF/CD40ドメインを伴うATAK受容体で処置された腫瘍保有マウスの生存率である。
Claims (128)
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、Xaa1-Leu-Xaa3-Iso-Serモチーフを有する細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、Xaa1は、親水性アミノ酸であり、Xaa3は、任意のアミノ酸である、組換え核酸。
- キメラ融合タンパク質が、抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含み、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結されている、請求項1に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、少なくとも1つのさらなる細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項1または2に記載の組換え核酸。
- 少なくとも1つのさらなる細胞内シグナル伝達ドメインが、細胞内PI3キナーゼ動員ドメイン、貪食受容体細胞内ドメイン、パターン認識受容体細胞内ドメイン、CD40細胞内ドメイン、FcR細胞内ドメイン、またはサイトカイン受容体細胞内ドメインもしくはケモカイン受容体細胞内ドメインに由来する、請求項3に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、細胞質ゾルアダプタータンパク質、ミトコンドリア膜タンパク質、または小胞体膜タンパク質に由来するアミノ酸配列を含む、請求項1から4のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、TRIFタンパク質に由来するアミノ酸配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、短縮型TRIF細胞内ドメインを含む、請求項1から6のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 短縮型TRIF細胞内ドメインの配列が、約150~300アミノ酸の長さ、約150~270アミノ酸の長さ、または約150~250アミノ酸の長さである、請求項1から7のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号36に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号37に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号38に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号41に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号39に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号40に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号42に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号43に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号45に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結され、膜貫通ドメインが、CD68に由来し、ホモ二量体化を阻害または阻止する突然変異を含む、組換え核酸。
- キメラ融合タンパク質が、膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインをさらに含む、請求項15に記載の組換え核酸。
- 膜貫通ドメインが、配列番号47を含む、請求項15または16に記載の組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結され、膜貫通ドメインが、CD64またはCD89に由来し、細胞内シグナル伝達ドメインを欠く、組換え核酸。
- キメラ融合タンパク質が、細胞内で発現された場合に、FcRγ鎖と共に複合体を形成する、請求項18または21に記載の組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、配列番号48に対する少なくとも80%のアミノ酸配列同一性を有する配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- PI3キナーゼ動員ドメインを含む第2の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項1から23のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号39とIRF活性化増強モチーフの配列とを含む融合アミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項10に記載の組換え核酸。
- 配列番号40とIRF活性化増強モチーフの配列とを含む融合アミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項10に記載の組換え核酸。
- 配列番号39と配列番号40とを含む融合アミノ酸配列を含む細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項10に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、IRFタンパク質に結合する、請求項1から27のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、TRAFタンパク質結合性ドメインを含む、請求項1から28のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、TBK1リン酸化部位を含む、請求項1から29のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 第2、第3、または第4の細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項1から30のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含み、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結されている、請求項10から31のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインが、腫瘍抗原に対する親和性を有するドメインを含む、請求項1から32のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、Tリンパ球抗原結合性ドメインを含む、請求項1から33のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、Bリンパ球抗原結合性ドメインを含む、請求項1から33のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- (a)膜貫通ドメイン、および(b)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、細胞内ドメインが、GPR84、GNB2、またはPREX1に由来するシグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。
- キメラ融合タンパク質が、抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメインをさらに含み、膜貫通ドメインが、細胞外ドメインと作動可能に連結されている、請求項36に記載の組換え核酸。
- GPR84、GNB2、またはPREX1に由来するシグナル伝達ドメインが、GPR84、GNB2、またはPREX1に由来する細胞内シグナル伝達ドメインである、請求項36に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインが結合する抗原が、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CCR4、CD8、CD30、CD45、CD56、チミジンキナーゼ(TK1)、ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)、受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1)、ムチン1、ムチン16(MUC16)、MUC1、表皮増殖因子受容体vIII(EGFRvIII)、メソテリン、ヒト表皮増殖因子受容体2(HER2)、EBNA-1、LEMD1、ホスファチジルセリン、癌胎児性抗原(CEA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、グリピカン3(GPC3)、濾胞刺激ホルモン受容体、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、エリスロポエチン産生肝細胞癌A2(EphA2)、EphB2、ナチュラルキラー2D(NKG2D)群リガンド、ジシアロガングリオシド2(GD2)、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD19、CD20、CD22、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44v6、CD45、CD56、CD79b、CD97、CD117、CD123、CD133、CD138、CD171、CD179a、CD213A2、CD248、CD276、PSCA、CS-1、CLECL1、GD3、PSMA、FLT3、TAG72、EPCAM、IL-1、インテグリン、インテグリン受容体、Claudin 3.0、Claudin 18.2、Trop-2、PRSS21、VEGFR2、PDGFRベータ、SSEA-4、EGFR、NCAM、プロスターゼ、PAP、ELF2M、GM3、TEM7R、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、Dsg1、Dsg3、およびIGLL1に由来する抗原からなる群から選択される、請求項1から38のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、第1の標的抗原結合性ドメインと、第1の標的結合性ドメインと同一ではない第2の標的抗原結合性ドメインとを含む、請求項1から39のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 第2の標的抗原結合性ドメインが、CD47に結合する、請求項40に記載の組成物。
- 抗原結合性ドメインが、微生物抗原に対する親和性を有するドメインを含む、請求項1から38のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインが、ウイルス抗原に対する親和性を有するドメインを含む、請求項42に記載の組換え核酸。
- ドメインが、抗体またはその断片を含む、請求項1から43のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- ドメインが、scFvを含む、請求項1から43のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 膜貫通ドメインが、CD8a、CD28、CD68、CD2、FcRγ、FcRα、FcRβ、FcRε、シンタキシン3、シンタキシン4、またはシンタキシン5の膜貫通ドメインに由来する、請求項1から45のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、抗原結合性ドメインと膜貫通ドメインとを接続するヒンジドメインを含む、請求項1から46のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内で発現された場合に、キメラ融合タンパク質が、その標的抗原への結合時に、細胞内ドメインを活性化してIRF活性化を誘導する、請求項1から47のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 組換え核酸が、RNAである、請求項1から48のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 組換え核酸が、mRNAである、請求項49に記載の組換え核酸。
- 組換え核酸が、1つまたは複数の脂質と会合する、請求項1から50のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 組換え核酸が、リポソーム内に封入される、請求項51に記載の組換え核酸。
- リポソームが、脂質ナノ粒子である、請求項52に記載の組換え核酸。
- 組換え核酸が、ベクターである、請求項1から53のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 請求項1から54のいずれか一項に記載の組換え核酸を含む細胞。
- 免疫細胞である、請求項55に記載の細胞。
- 骨髄細胞、リンパ系細胞、前駆細胞、幹細胞、または人工多能性細胞である、請求項55または56に記載の細胞。
- CD14+/CD16-である、請求項57に記載の細胞。
- キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含み、CFPが、(a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン;(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含み、細胞内シグナル伝達ドメインが、活性化されるとIFN転写因子に結合する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、操作された細胞。
- キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含み、CFPが、(a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン;(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含み、細胞内シグナル伝達ドメインが、ミトコンドリア受容体に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、配列番号39に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項59または60に記載の組成物。
- 細胞内ドメインが、配列番号40に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項59または60に記載の組成物。
- 細胞内ドメインが、TLR3、TLR4、TLR7、TLR9、TRIF、RIG-1、MYD88、MAL、IRAK1、MDA-5、IFN受容体、STING、MAVS、TRIF、TASL、NLRP1、NLRP2、NLRP3、NLRP4、NLRP5、NLRP6、NLRP7、NLRP89、NLRP9、NLRP10、NLRP11、NLRP12、NLRP13、NLRP1~14、NOD1、NOD2、Pyrin、AIM2、NLRC4、FCGR3A、FCERIG、CD40、Tank1結合性キナーゼ(TBK)、TNFR1、ケモカイン、MHCクラスIIトランス活性化因子(CIITA)、IPAF、BIRC1、RIG-I様受容体(RLR)タンパク質、マクロファージガラクトース型レクチン(MGL)、DC-SIGN(CLEC4L)、ランジェリン(CLEC4K)、骨髄系DAP12会合レクチン(MDL)1(CLEC5A)、DC関連C型レクチン1(デクチン1)サブファミリータンパク質、デクチン1/CLEC7A、DNGR1/CLEC9A、骨髄系C型レクチン様受容体(MICL)(CLEC12A)、CLEC2(CLEC1B)、CLEC12B、DC免疫受容体(DCIR)サブファミリータンパク質、DCIR/CLEC4A、デクチン2/CLEC6A、血中DC抗原2(BDCA2)(CLEC4C)、Mincle(マクロファージ誘導性C型レクチン)(CLEC4E)に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項59に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、配列番号42に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項59に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、配列番号43に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項59または60に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、配列番号45に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項59または60に記載の操作された細胞。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、活性化されるとIFN転写因子に結合する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項60に記載の操作された細胞。
- IFN転写因子が、タンパク質IRF1~IRF9のうちのいずれか1つである、請求項59または67に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、TRAF動員ドメインを含む、請求項59に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、IKKリン酸化を誘導する、請求項59に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、TBKリン酸化を誘導する、請求項59に記載の操作された細胞。
- 抗原結合性ドメインが、腫瘍抗原または微生物抗原に結合する、請求項59から71のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 抗原結合性ドメインが、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CCR4、CD8、CD30、CD45、CD56、チミジンキナーゼ(TK1)、ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)、受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1(ROR1)、ムチン1、ムチン16(MUC16)、MUC1、表皮増殖因子受容体vIII(EGFRvIII)、メソテリン、ヒト表皮増殖因子受容体2(HER2)、EBNA-1、LEMD1、ホスファチジルセリン、癌胎児性抗原(CEA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、グリピカン3(GPC3)、濾胞刺激ホルモン受容体、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、エリスロポエチン産生肝細胞癌A2(EphA2)、EphB2、ナチュラルキラー2D(NKG2D)群リガンド、ジシアロガングリオシド2(GD2)、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD19、CD20、CD22、CD24、CD30、CD33、CD38、CD44v6、CD45、CD56、CD79b、CD97、CD117、CD123、CD133、CD138、CD171、CD179a、CD213A2、CD248、CD276、PSCA、CS-1、CLECL1、GD3、PSMA、FLT3、TAG72、EPCAM、IL-1、インテグリン、インテグリン受容体、Claudin 3.0、Claudin 18.2、Trop-2、PRSS21、VEGFR2、PDGFRベータ、SSEA-4、EGFR、NCAM、プロスターゼ、PAP、ELF2M、GM3、TEM7R、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、Dsg1、Dsg3、およびIGLL1のうちの1つまたは複数に結合する、請求項59から71のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 抗原結合性ドメインが、ウイルス抗原に結合する、請求項59から71のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 膜貫通ドメインが、CD8a、CD28、CD68、CD2、FcRγ、FcRα、FcRβ、FcRε、シンタキシン3、シンタキシン4、またはシンタキシン5の膜貫通ドメインに由来する、請求項59から74のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、FcRγ、FcRα、またはFcRεに由来する細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項59から75のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 細胞内ドメインが、PI3キナーゼ動員ドメインをさらに含む、請求項59から76のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 細胞内シグナル伝達ドメインが、IRF転写因子に結合し、抗原結合性ドメインのそのコグネイト抗原への結合時に、IRF転写因子を活性化する、請求項59から77のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 抗原結合性ドメインのそのコグネイト抗原への結合時に、炎症促進性サイトカインを誘導する、請求項59から78のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 炎症促進性サイトカインが、IL-1、IL-6、IL-12、IL-23、TNF、CXCL9、CXCL10、CXCL11、IL-18、IL-23、IL-27、およびインターフェロンのうちの1つまたは複数を含む、請求項79に記載の操作された細胞。
- 骨髄細胞、リンパ球、または幹細胞である、請求項59から80のいずれか一項に記載の操作された細胞。
- 骨髄細胞である、請求項81に記載の操作された細胞。
- 請求項1から54のいずれか一項に記載の組換え核酸、請求項55から58のいずれか一項に記載の細胞、または請求項59から82のいずれか一項に記載の操作された細胞と;薬学的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物。
- 操作された細胞が、CD14+細胞および/またはCD16-細胞である、請求項83に記載の医薬組成物。
- 細胞のうちの少なくとも50%がCD14+/CD16-であり、細胞のうちの10%未満が樹状細胞である細胞の集団を含む、請求項83または84に記載の医薬組成物。
- 細胞が、CCR2の高発現を呈する、請求項85に記載の医薬組成物。
- 細胞が、トーナルシグナル伝達およびデノボの活性化を呈さず、活性化時に、M0、M1、またはM2分化を呈する、請求項85または86に記載の医薬組成物。
- 対象におけるがんまたはウイルス感染を処置する方法であって、対象へと、請求項83から87のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与するステップを含む方法。
- キメラ融合タンパク質(CFP)をコードする組換え核酸を含み、CFPが、(a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン;(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含み、細胞内ドメインが、TRIFに由来するドメインを含む、操作されたCD14+/CD16-細胞。
- TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインが、短縮型TRIFドメインである、請求項89に記載の操作された細胞。
- TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインが、300未満のアミノ酸を含む、請求項89に記載の操作された細胞。
- TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインが、250未満のアミノ酸を含む、請求項89に記載の操作された細胞。
- TRIFに由来するドメインを含む細胞内ドメインが、細胞外結合性ドメインの標的との係合時にIFN応答を呈する、請求項89に記載の操作された細胞。
- 配列番号66のアミノ酸配列、または配列番号66に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5または15のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号66のアミノ酸配列、または配列番号66に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む組換えポリヌクレオチドと、適切な賦形剤とを含む医薬組成物。
- 組換えポリヌクレオチドが、1つまたは複数の脂質と会合したmRNAである、請求項95に記載の医薬組成物。
- 配列番号66の配列、または配列番号66に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有する組換えタンパク質を発現する操作された細胞の集団であって、細胞のうちの少なくとも50%がCD14+/CD16-であり、細胞のうちの10%未満が樹状細胞である細胞の集団と;薬学的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物。
- 配列番号56のアミノ酸配列、または配列番号56に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号59のアミノ酸配列、または配列番号59に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号60のアミノ酸配列、または配列番号60に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号61のアミノ酸配列、または配列番号61に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号62のアミノ酸配列、または配列番号62に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号63のアミノ酸配列、または配列番号63に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号64のアミノ酸配列、または配列番号64に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 配列番号67のアミノ酸配列、または配列番号67に対する少なくとも80%の配列同一性を有する配列を有するポリペプチドをコードする配列を含む、請求項1から5のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 請求項98から105のいずれか一項に記載の組換え核酸を含む、操作された骨髄細胞。
- (a)抗原結合性ドメインを含む細胞外ドメイン、(b)細胞外ドメインに作動可能に連結された膜貫通ドメイン、および(c)膜貫通ドメインに作動可能に連結された細胞内ドメインを含むキメラ融合タンパク質をコードする組換え核酸であって、膜貫通ドメインが、CD68、CD64、またはCD8に由来する膜貫通ドメインであり、
細胞内ドメインが、TRIFに由来するドメイン、またはCD40に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、組換え核酸。 - 細胞内ドメインが、TRIFに由来するドメインを含む、請求項107に記載の組換え核酸。
- TRIFに由来するドメインが、短縮型TRIFドメインである、請求項108に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、CD40に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項107に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、Fc受容体(FcR)に由来する細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項107から110のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、Fcガンマに由来する細胞内シグナル伝達ドメインをさらに含む、請求項107から110のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞内ドメインが、PI3キナーゼ動員ドメインをさらに含む、請求項107から112のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、CD8アルファに由来するヒンジドメインを含む、請求項107から113のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインが、HER2結合性ドメインである、請求項107から114のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 膜貫通ドメインが、CD64に由来する膜貫通ドメインである、請求項107から115のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 膜貫通ドメインが、CD8アルファに由来する膜貫通ドメインである、請求項107から115のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインが、HER2結合性ドメインであり、細胞外ドメインが、CD8アルファに由来するヒンジドメインを含み、膜貫通ドメインが、CD8アルファに由来する膜貫通ドメインであり;細胞内ドメインが、CD40に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、Fcγ(Fcガンマ)に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、およびPI3キナーゼ動員ドメインを含む、請求項107に記載の組換え核酸。
- CD40に由来する細胞内シグナル伝達ドメインが、膜貫通ドメインへと連結され、Fcγに由来する細胞内シグナル伝達ドメインが、CD40に由来する細胞内シグナル伝達ドメインへと連結され、PI3キナーゼ動員ドメインが、Fcγに由来する細胞内シグナル伝達ドメインへと連結される、請求項118に記載の組換え核酸。
- 抗原結合性ドメインが、HER2結合性ドメインであり、膜貫通ドメインが、CD64に由来する膜貫通ドメインであり;細胞内ドメインが、Fcγに由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、PI3キナーゼ動員ドメイン、およびTRIFに由来する細胞内ドメインを含む、請求項107に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、CD8アルファに由来するヒンジドメインを含まない、請求項120に記載の組換え核酸。
- 細胞外ドメインが、ヒンジドメインを含まない、請求項120に記載の組換え核酸。
- Fcγに由来する細胞内シグナル伝達ドメインが、膜貫通ドメインへと連結され、PI3キナーゼ動員ドメインが、Fcγに由来する細胞内シグナル伝達ドメインへと連結され、TRIFに由来する細胞内ドメインが、PI3キナーゼ動員ドメインへと連結される、請求項120から122のいずれか一項に記載の組換え核酸。
- 請求項107から123のいずれか一項に記載の組換え核酸を含む細胞。
- 骨髄細胞である、請求項124に記載の細胞。
- 請求項124または125に記載の細胞を含む医薬組成物。
- 配列番号68、75、または82に記載の配列を含むmRNA。
- がんの処置における使用のための、請求項127に記載のmRNA。
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