JP2024511941A - 酵母における異種タンパク質の分泌を指示するための合成シグナルペプチド - Google Patents

酵母における異種タンパク質の分泌を指示するための合成シグナルペプチド Download PDF

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Abstract

本明細書では、酵母における発現ペイロードタンパク質の分泌を指示するシグナルペプチドが提供される。治療的及び非治療的用途のためにシグナルペプチドを使用する方法も提供される。シグナルペプチドを含む酵母を含む組成物、並びに治療的及び非治療的用途のためにシグナルペプチドを含む当該酵母を使用する方法も提供される。開示されたシグナルペプチドを設計及び生成する方法も提供される。【選択図】図1

Description

本開示は、概してシグナルペプチドに関し、より具体的には、組換えタンパク質の分泌を増加させる合成シグナルペプチドに関する。
酵母は、研究、治療、及び産業目的のためにタンパク質を産生するための宿主として日常的に使用されている。産生されると、タンパク質は通常小胞体(ER)内に移行し、次いでゴルジに輸送され、次いで細胞外空間に分泌される。この分泌経路に沿った移動は、通常は約16~30個のアミノ酸を含み、タンパク質のN末端に融合されるシグナルペプチドによって促進される。しかしながら、酵母による組換え型タンパク質の合成を遺伝的に最適化するかなりの努力にもかかわらず、合成タンパク質が細胞外空間に到達するために使用されるシャペロン経路の最適化は比較的少なく、成功することはほとんどない。したがって、酵母の生成能力は、依然として小さすぎるため、産業型用途に使用できず、それゆえ、小規模なプロセスに限定される。
現在使用されている最も一般的なシグナルペプチドは、Saccharomyces cerevisiae由来のα-接合因子プロタンパク質シグナルペプチドα-MFである。その性能は、ペイロードタンパク質に応じて大きく異なる。任意の特定のペイロードタンパク質のその性能の評価を提供するのは、時間とリソースを費やした直接的な実験評価のみである。したがって、α-MFは通常、S.cerevisiaeだけでなく、オルソロガス酵母株でもそのまま実装されるため、酵母において組換えタンパク質を効果的に産生することは予測不可能性及び課題を増大させる。分泌を最適化するためのいくつかの努力がなされてきたが、ほとんどが、全てではないにせよ、経験的な設計又は指向的進化のいずれかに依存しており、これらは骨の折れる、小規模な方法であり、開始テンプレートとして天然シグナルペプチドを必要とする。したがって、酵母で産生される組換え型タンパク質の分泌を増加させるだけでなく、多数の酵母種にわたって適用されたシステムを設計する必要性が存在する。
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、式Iは、本明細書に記載されるように以下によって表される:A-(A-A-(A-(A-A-A-A-A-A10-(A11(式I)。
特定の実施形態では、式IIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:B-(B-(B-(B-(B-(B-B-B-B-B10-(B11(式II)。
特定の実施形態では、式IIIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:C-(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-C-C10-C11-[C12-C13(式III)。
特定の実施形態では、式IVは、本明細書に記載されるように以下によって表される:D-(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-D10-D11-D12-[D13-D14(式IV)。
特定の実施形態では、式Vは、本明細書に記載されるように以下によって表される:E-[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-E11-E12-E13-[E14-E15(式V)。
特定の実施形態では、式IXは、本明細書に記載されるように以下によって表される:F-(F-(F-[(F-(F-F-F-F-[F-F10(式IX)。
特定の実施形態では、式XIIIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:L-(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12(式XIII)。
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、及び式XVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、式VIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:G-G-G-G-G-G-G-G-G-G10-G11-G12-G13-G14-G15-G16-G17-G18-G19-G20-G21-G22-G23-G24-G25(式VI)。
特定の実施形態では、式VIIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H10-(H11-(H12-(H13-(H14-(H15-(H16-(H17-(H18-(H19-(H20-(H21-(H22-(H23-(H24-(H25-(H26-(H27-(H28-(H29-(H30-(H31-(H32-(H33-(H34-(H35-(H36-H37-H38-H39-H40(式VII)。
特定の実施形態では、式VIIIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I10-(I11-(I12-(I13-(I14-(I15-(I16-(I17-I18-I19-I20-I21-I22-I23(式VIII)。
特定の実施形態では、式Xは、本明細書に記載されるように以下によって表される:(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J10-(J11-(J12-(J13-(J14-(J15-(J16-(J17-(J18-(J19-(J20-(J21-J22-J23-J24-J25(式X)。
特定の実施形態では、式XIは、本明細書に記載されるように以下によって表される:(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K10-(K11-(K12-(K13-(K14-(K15-(K16-(K17-(K18-(K19-(K20-(K21-(K22-(K23-(K24-(K25-(K26-(K27-(K28-(K29-(K30-(K31-(K32-(K33-(K34-(K35-(K36-(K37-(K38-(K39-(K40-(K41-(K42-(K43-(K44-(K45-(K46-(K47-(K48-(K49-(K50-(K51-(K52-(K53-(K54-(K55-(K56-(K57-(K58-(K59-(K60-(K61-(K62-(K63-(K64-(K65-(K66-(K67-(K68-(K69-(K70-(K71-(K72-(K73-(K74-(K75-(K76-(K77-(K78-(K79-(K80-(K81-(K82-(K83-(K84-(K85-(K86-(K87-(K88-K89-K89-K89-K89-K89(式XI)。
特定の実施形態では、式XIVは、本明細書に記載されるように以下によって表される:(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M10-(M11-(M12-(M13-(M14-(M15-(M16-(M17-(M18-(M19-(M20-(M21-(M22-(M23-(M24-(M25-(M26-(M27-(M28-(M29-(M30-(M31-(M32-(M33-(M34-(M35-(M36-(M37-(M38-(M39-(M40-(M41-(M42-(M43-(M44-(M45-(M46-(M47-(M48-(M49-(M50-(M51-(M52-(M53-(M54-(M55-(M56-(M57-(M58-(M59-(M60-(M61-(M62-(M63-(M64-(M65-(M66-(M67-(M68-(M69-(M70(式XIV)。
特定の実施形態では、式XVは、本明細書に記載されるように以下によって表される:(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N10-(N11-(N12-(N13-(N14-(N15-(N16-(N17-(N18-(N19-(N20-(N21-(N22-(N23-(N24-(N25-(N26-(N27-(N28-(N29-(N30-(N31-(N32-(N33-(N34-(N35-(N36-(N37-(N38-(N39-(N40-(N41-(N42-(N43-(N44-(N45-(N46-(N47-(N48-(N49-(N50-(N51-(N52-(N53-(N54-(N55-(N56-(N57-(N58-(N59-(N60-(N61-(N62-(N63-(N64-(N65-(N66-(N67-(N68-(N69-(N70-(N71(式XV)。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、プレタンパク質+プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プレタンパク質+プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号30のアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、ポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、(X-(Y-Zの式を含み、式中、Xは、プレタンパク質シグナルペプチドであり、Yは、プロタンパクシグナルペプチドであり、Zは、ペイロードタンパク質であり、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることはできない。
いくつかの実施形態では、酵母が提供される。いくつかの実施形態では、酵母は、(X1)n-(Y1)m-Z1の式を有するポリペプチドをコードする異種核酸分子を含み、式中、X1は、本明細書に提供されるプレタンパク質シグナルペプチドであり、Y1は、本明細書に提供されるプロタンパク質シグナルペプチドであり、Z1は、ペイロードタンパク質であり、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることはできない。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質を生成するための方法が提供される。いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に提供される組換えポリペプチドをコードする核酸で酵母をトランスフェクトすることと、操作された酵母を産生することと、操作された酵母を増殖させるのに有効な環境で操作された酵母を培養することと、操作された酵母によるペイロードタンパク質の分泌を誘導することと、を含む。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態の治療を必要とする対象において、治療を行うための方法が提供される。いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に提供される治療有効量の酵母を対象に投与することを含む。
本開示の前述及びその他の特徴は、添付図面を参照して進行するいくつかの実施形態の以下の詳細な説明からより明らかになるであろう。
ペイロードタンパク質の分泌を増加させるために本明細書に開示される方法に従って利用され得る、合成プレタンパク質シグナル(sPre)、合成プロタンパク質シグナル(sPro)、及び天然のプレタンパク質シグナル(nPre)ペプチドの組み合わせを表す4つの組換えポリペプチド構築物を提供する。 野生型及び操作されたK.lactis酵母によって分泌された無細胞上清中のマルトース結合タンパク質(MBP)の量を示すウェスタンブロットを提供する。 操作されたK.lactis酵母(合成シグナルペプチドsynKlac-v1を発現する)対野生型K.lactis酵母によるMBPの蓄積を経時的にグラフで示す。 野生型K.lactis酵母対操作されたK.lactis酵母(合成シグナルペプチドsynKlac-v1を発現する)によるMBPの蓄積を、酵母増殖(光学密度)の関数としてグラフで示す。 野生型K.lactis酵母対操作されたK.lactis酵母(合成シグナルペプチドsynKlac-v1を発現する)におけるMBP RNA発現のグラフである。 野生型K.lactis酵母対操作されたK.lactis酵母(合成シグナルペプチドsynKlac-v1を発現する)によって産生された正規化されたTNF-αレベルのグラフである。 野生型P.pastoris(天然シグナルペプチド(PHO1、α-MF)対操作されたP.パストリス酵母(合成シグナルペプチドsynPichia-v1又はsynPichia-v4を発現する)によって生成された正規化されたフィターゼレベルのグラフである。 野生型S.cerevisiae酵母対操作されたS.cerevisiae酵母(合成シグナルペプチドsynScer-v5を発現する)による正規化されたインスリン産生を報告する。インスリンをELISAを使用して定量化し、データを試験した各バリアントのインスリンmRNAレベルに対して正規化した。図7Aは、synScer-v5シグナルペプチドを利用する酵母と、α-MFシグナルペプチドを利用する酵母との間の比較を報告する。図7Bは、synScer-v5シグナルペプチドを利用する酵母と、optYAPを発現する酵母との間の比較を報告する。 野生型S.boulardii酵母によって生成された精製されたインベルターゼ抽出物の正規化された酵素活性対、操作されたS.boulardii酵母(合成シグナルペプチドsynScer-v1を発現する)によって生成された精製されたインベルターゼ抽出物の酵素活性を報告する。図8Aは、培養培地から精製されたインベルターゼからのインベルターゼ活性を報告する。図8Bは、ペリプラズム抽出物から精製されたインベルターゼからのインベルターゼ活性を報告する。 様々なpHレベルでの市販のインベルターゼの活性と比較した、操作されたS.boulardii酵母によって生成されたインベルターゼの活性を報告する。図9Aは、操作されたS.boulardiiからのデータを報告する。図9Bは、市販のインベルターゼからのデータを報告する。 野生型対、合成シグナルペプチドsynScer-v1でインベルターゼを発現するように操作されたS.boulardiiにおいて産生された、インベルターゼ活性の間接的な尺度としての経時的なグルコースレベルの変化をグラフで示す。 操作されたS.boulardii酵母を経口投与されたマウスの様々な胃腸組織における酵母の量をグラフで示す。 野生型S.boulardiiによって生成されたインベルターゼの活性対、操作されたS.boulardii酵母(合成シグナルペプチドsynScer-v1を発現する)によって生成されたインベルターゼの酵素活性をグラフで示す。 野生型S.boulardii対、操作されたS.boulardii酵母(合成シグナルペプチドsynScer-v1、synScer-v3、又はsynScer-v5を発現する)による正規化されたIGF-1産生をグラフで示す。 野生型S.boulardii対、操作されたS.boulardii酵母(合成シグナルペプチドsynScer-v4又はsynScer-v5を発現する)による正規化されたリゾチーム産生をグラフで示す。 マウスの上部消化管を介したペイロードタンパク質(mCherry)の展開を発現するように操作されたS.boulardiiの生存を経時的な図式的に示す。 合成シグナルペプチドsynScer-v1に融合されたスクラーゼを発現するように操作された凍結乾燥S.boulardii酵母におけるCFU当たりのスクラーゼ活性をグラフで示す。 合成シグナルペプチドsynScer-v1に融合されたスクラーゼを発現するように操作されたS.boulardii酵母によって発現されたスクラーゼの活性をpHの関数としてグラフで示す。 合成シグナルペプチドsynScer-v1に融合されたスクラーゼを発現するように操作されたS.boulardii酵母のグルコースの存在下でのスクラーゼ活性の喪失を、野生型S.boulardiiに発現されるスクラーゼと比較してグラフで示す。 合成シグナルペプチドsynScer-v1に融合されたスクラーゼを発現するように操作されたS.boulardii酵母による胃腸組織における経時的な持続性をグラフで示す。 合成シグナルペプチドsynScer-v1に融合されたスクラーゼを発現するように操作されたboulardii酵母を投与されたスクロースチャレンジマウスのグルコース変動(glucose excursion)時間曲線をグラフで示す。 棒グラフ形式で表した図20のAUCデータである。 インベルターゼタンパク質の分泌効率を改善するために本明細書に開示される方法に従って利用され得る合成及び天然のプレタンパク質及びプロタンパク質シグナルペプチドの様々な組み合わせを表す様々な組換えポリペプチド構築物を提供する。 天然又はS.cerevisiaeシグナル(SBsyn-Scerv1)を含む組換えポリペプチドを発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化されたインベルターゼ産生対、S.boulardii(SBsyn-Sbouv2、SBsyn-Sbouv3,SBsyn-Sbouv4)由来の様々な合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化されたインベルターゼ産生との間の比較を報告する。 リゾチームタンパク質の分泌効率を改善するために、本明細書に開示される方法に従って利用され得る合成及び天然のプレタンパク質及びプロタンパク質シグナルペプチドの様々な組み合わせを表す様々な組換えポリペプチド構築物を提供する。 ニワトリリゾチームシグナル配列を含む組換えポリペプチドを発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化されたリゾチーム産生対、S.boulardii(SBsyn-Sbouv)由来の様々な合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化されたリゾチーム産生との間の比較を報告する。 ベータ-ガラクトシダーゼタンパク質の分泌効率を改善するために、本明細書に開示される方法に従って利用され得る合成プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの組み合わせを表す組換えポリペプチド構築物を提供する。 S. boulardii(SBsyn-Sbouv2)由来の合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化されたベータ-ガラクトシダーゼ産生をグラフで示す。 抗TNFαタンパク質の分泌効率を改善するために、本明細書に開示される方法に従って利用され得る合成及び天然のプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの様々な組み合わせを表す様々な組換えポリペプチド構築物を提供する。 S.boulardii(SBsyn-Sbouv1及びSBsyn-Sbouv2)由来の合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化された抗TNFα活性産生をグラフで示す。 抗TNFα抗体断片を分泌するためのS.boulardii細胞の使用をグラフで示す。図30Aは、一価抗TNFα抗体断片の分泌を報告する。図30Bは、二価抗TNFα抗体断片の分泌を報告する。 Sbouv2-インベルターゼポリペプチドを一過性に発現するS.boulardii細胞によるインベルターゼの分泌と、インベルターゼの安定かつ信頼できる発現のためにインベルターゼに融合されたSbouv2合成シグナルペプチドを含む構築物のコピーをS.boulardiiゲノムに組み込むことによって操作されたS.boulardii細胞によるインベルターゼの分泌を比較する。 LCRFタンパク質の分泌効率を改善するために、本明細書に開示される方法に従って利用され得る合成及び天然のプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの様々な組み合わせを表す様々な組換えポリペプチド構築物を提供する。 S.boulardii由来の合成シグナルペプチドを含む組換え融合タンパク質を発現するように改変されたS.boulardiiによる正規化されたLCRF産生をグラフで示す。
本開示は、酵母における発現されたタンパク質又はペプチドの分泌を指示する新しい合成シグナルペプチドを提供することによって、前述の課題に対する解決策を提示する。開示されたシグナルペプチドは、以前に特徴解析された天然シグナルペプチドによってもたらされる性能変動性の課題を克服し、酵母からの任意のタンパク質又はペプチドの生成及び分泌を促進するために使用され得る。
開示される合成プレタンパク質(sPre)シグナルペプチド及び合成プロタンパク質(sPro)シグナルペプチドは、酵母における任意の組換えタンパク質の分泌を増加させる。分泌の増加は、合成プレタンパク質シグナルペプチド単独、合成プロタンパク質シグナルペプチド単独、又は両方を用いて有利に達成され得る。任意の実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質(nPro)シグナルペプチド又はsProシグナルペプチドと組み合わせて使用され得る。同様に、任意の実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、天然のプレタンパク質(nPre)シグナルペプチド又はsPreシグナルペプチドと組み合わせて使用され得る。合成プロタンパク質シグナルペプチドを合成プレタンパク質シグナルペプチドとともに使用することは、例えば、ゴルジ輸送を促進することによって、ペイロードタンパク質の分泌を更に改善し得る。有利なことに、本明細書に開示されるシグナルペプチドは、酵母からの任意のペイロードタンパク質の分泌を促進するように生成され、最適化されている。開示される合成プレタンパク質シグナルペプチド及び合成プロタンパク質シグナルペプチドの使用は、治療剤、農業、又は食品などの任意の酵母適合性環境への任意の所望のペイロードの分泌の増加を達成するために使用され得る。
本組成物及び方法が記載される前に、本発明の範囲は、本明細書に記載される特定のプロセス、組成物、又は方法論に限定されず、これらが変化する可能性があることが理解されるべきである。本明細書で使用される用語は、特定のバージョン又は実施形態を説明することのみを目的とするものであり、本発明の範囲を限定することを意図するものではないことも理解されるべきである。別段の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものと類似又は同等の任意の方法及び材料を、本明細書に開示される方法及びシステムの実施形態の実施又は試験に使用することができるが、好ましい方法、装置、及び材料をここで説明する。
定義
以下の用語及び方法の説明は、本開示をより良く説明し、本開示の実施において当業者を導くために提供される。
本明細書で使用される場合、「含む(comprising)」とは、「含む(including)」ことを意味し、「a」又は「an」又は「the」という単数形は、文脈が別途明確に指示しない限り、複数の言及を含む。例えば、「治療剤を含む」ことへの言及は、1つ又は複数のそのような治療剤が含まれる。用語「又は」は、文脈が別段を明確に示さない限り、記載された代替要素のうちの単一の要素を指す。例えば、「A又はB」という語句は、A単独又はB単独を指す。「A、B、又はそれらの組み合わせ」という語句は、A単独、B単独、又はAとBの組み合わせを指す。同様に、「A及びBのうちの1つ以上」は、A、B、又はA及びBの両方の組み合わせを指す。用語「A及びB」という語句は、A及びBの組み合わせを指す。更に、本明細書で論じる様々な要素、特徴及びステップ、並びにこのような要素、特徴及びステップの各々に対する他の既知の等価物は、当業者によって混合及び適合させて、本明細書に記載の原理に従う方法を実施することができる。様々な要素、特徴、及びステップのうち、いくつかが特に含まれるものもあれば、他の要素が特定の例において特に除外されるものもある。
別段の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、当業者に一般的に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものと類似又は同等の方法及び材料を、本開示の実施又は試験に使用することができるが、好適な方法及び材料を以下に記載する。材料、方法、及び実施例は、例示に過ぎず、限定することを意図するものではない。本明細書に引用される全ての参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。
いくつかの実施例では、特定の実施形態を説明及び特許請求するために使用される成分の量、分子量、反応条件などの特性を発現する数字は、場合によっては、「約」又はおよそという「用語」によって修正されるものとして理解されるべきである。例えば、「約」又は「およそ」は、それが記述されている値の+/-5%の変動を示し得る。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書に記載の数値パラメータは、特定の実施形態の所望の特性に応じて変化し得る近似値である。いくつかの実施例の広範な範囲を示す数値範囲及びパラメータが近似値であるにもかかわらず、特定の実施例に示される数値は、実行可能な限り正確に報告される。本明細書の値の範囲の列挙は、その範囲内に収まる各別個の値を個別に参照する簡略的な方法として機能することが単に、意図されている。
本開示の様々な実施形態の検討を容易にするために、特定の用語に関して以下の説明が提供される。
本明細書で使用される場合、酵母とは、出芽によって繁殖し、糖をアルコール及び二酸化炭素に変換することができる細胞からなる顕微鏡的真菌を指す。本明細書に開示されるように、酵母は、異種ペイロードタンパク質の発現を誘導するように遺伝子改変され得る。本明細書で使用される場合、「遺伝子改変された」又はその任意の文法的変形は、組換えタンパク質をコードし、その発現を促進する核酸又は核酸分子を酵母細胞に導入する実践を指す。核酸は一過性に導入されてもよく、又は安定した発現のために核酸が酵母のゲノムに組み込まれてもよい。本明細書で使用される場合、「核酸」及び「核酸分子」という用語は、互換的に使用することができる。核酸又は核酸分子は、任意の長さであってもよい。核酸は、DNA、mRNA、tRNA、又はrRNAであってもよい。核酸又は核酸分子は、ヌクレオチドモノマーから構成され、モノマーの各トリプレット(コドン)は、RNAヌクレオチドモノマーのトリプレット(核酸がDNAである場合)又はアミノ酸(核酸がRNAである場合)のいずれかをコードする。DNAはまた、DNAの転写を開始すべき場所を示す1つ以上のプロモーター領域も含む。mRNAもまた、mRNAの翻訳を開始すべき場所を示すリボソーム結合部位、並びにmRNAの翻訳を終了すべき場所を示す1つ以上の終止コドンを含む。酵母細胞への核酸又は核酸分子の導入は、当技術分野で公知の任意の方法によって達成することができる。そのような方法は、以下でより詳細に説明される。
本明細書に開示される任意の実施形態又は態様では、本明細書に開示される組換えポリペプチドをコードする核酸は、そのような導入のための当業者に公知の任意の方法を使用して酵母細胞に導入され得る。そのような方法としては、トランスフェクション、形質転換、形質導入、感染(例えば、ウイルス形質導入)、注射、マイクロインジェクション、遺伝子銃、ヌクレオフェクション、ナノ粒子衝撃、形質転換、コンジュゲーション、ゲル、油、若しくはクリーム中の核酸の適用によるもの、エレクトロポレーションによるもの、脂質ベースのトランスフェクション試薬を使用する、又は任意の他の好適なトランスフェクション方法によるものが挙げられる。当業者であれば、容易に識別可能な文献情報源を使用して、そのような方法を容易に理解及び適合させるであろう。
本明細書で使用される場合、「形質転換」及び「トランスフェクション」という用語は、宿主細胞に外来性核酸を導入するための様々な当技術分野で認識されている技術を指すことを意図しており、リン酸カルシウム又は塩化カルシウム共沈殿、DEAE-デキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクション(例えば、市販の試薬、例えば、 LIPOFECTIN(登録商標)(Invitrogen Corp.、San Diego,CA)、LIPOFECTAMINE(登録商標)(Invitrogen)、FUGENE(登録商標)(Roche Applied Science、Basel,Switzerland)、JETPEI(商標)(Polyplus-transfection Inc.、New York,NY)、EFFECTENE(登録商標)(Qiagen、Valencia,CA)、DREAMFECT(商標)(OZ Biosciences、France)など等を使用する)、又はエレクトロポレーション(例えば、インビボエレクトロポレーション)が含まれる。宿主細胞を形質転換又はトランスフェクトするための好適な方法は、Sambrook,et al.(Molecular Cloning:A Laboratory Manual.2nd,ed.,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,1989)、及び他の実験マニュアルに見出すことができる。
細胞への核酸の非ウイルス送達の方法及び材料には、バイオリスティック法、ビロソーム、リポソーム、免疫リポソーム、ポリカチオン又は脂質-核酸コンジュゲート、裸のDNA、人工ビリオン、及びDNAの薬剤により強化された取り込み(agent-enhanced uptake)が更に含まれる。リポフェクションは、米国特許第5,049,386号、同第4,946,787号、及び同第4,897,355号に記載されており、リポフェクション試薬は、市販されている(例えば、TRANSFECTAM(商標)及びLIPOFECTIN(商標))。ポリヌクレオチドの効率的な受容体認識リポフェクションに好適なカチオン性脂質及び中性脂質としては、WO91/17424及びWO91/16024に開示されているものが挙げられる。
本明細書に記載の方法は、酵母宿主内に組換えポリペプチドを生成することを含む。本明細書で使用される場合、異種又は組換えは、宿主酵母に天然に見出されないか、又は宿主酵母によって産生されないタンパク質又は核酸を記述する。本明細書で使用される場合、「組換えポリペプチド」は、ペイロードタンパク質と、それらに直接的又は間接的に融合された合成シグナルペプチドとを含む。本明細書で使用される場合、「組換えポリペプチド」及び「組換え融合タンパク質」は、少なくとも第1及び第2の成分(例えば、合成シグナルペプチド及びペイロードタンパク質)を含むポリペプチドに関連して互換的に使用され得る。本明細書で使用される場合、シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質の生成された後にその細胞外分泌を促進する、ペイロードタンパク質のN末端に直接的又は間接的に融合された任意のタンパク質又はペプチドである。シグナルペプチドは、プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドのうちの1つ以上を含み得る。
理論に拘束されることは望まないが、本明細書に開示される合成プレタンパク質シグナルペプチドは、リボソームから小胞体へのタンパク質の効率的な移動を促進し、本明細書に開示される合成プロタンパク質シグナルペプチドは、最終的な分泌のためのERからゴルジ装置へのタンパク質の輸送を促進すると考えられる。プロタンパク質シグナルペプチドは、輸送及び局在化、階層的組織化及びオリゴマー化など、適切なタンパク質フォールディングの促進、並びにタンパク質活性機能の調節を含む、様々なタイプの細胞プロセスを調節することが知られている。更に、プロタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、特定の細胞局在におけるタンパク質の量について濃縮することができる。例えば、目的のタンパク質にプロタンパク質配列ペプチドを含めることは、酵母の副形質中の目的のタンパク質の量について濃縮することができる。移動を促進することに関連して、本明細書に記載されるプレタンパク質シグナルペプチド、プロタンパク質シグナルペプチド、又はそれらの組み合わせの効果は、標的依存性である。理論に束縛されることは望まないが、いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドを含まないプレタンパク質シグナルペプチドは、より効率的な移動及び分泌を促進するであろう。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドを含まないプロタンパク質シグナルペプチドは、より効率的な移動及び分泌を促進する。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの両方を含めることにより、より効率的な分泌が促進される。
ペプチドの化学構造は、従来的な、当業者に公知である、一連のアミノ酸一文字略語又は「アミノ酸配列」又は「配列」によって本明細書に記述される。参照配列が明示的に開示されるが、任意の態様及び実施形態では、参照配列は、参照配列の特性及び機能性を維持しながら、保存的アミノ酸置換、並びにバリアント及び断片を含むように改変されてもよい。
本明細書に開示される方法は、合成シグナルペプチドを利用して、酵母によるペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる。本明細書で使用される場合、「合成シグナルペプチド」は、その配列が本明細書で提供されるように生成され、組換えで作製されるシグナルペプチドを指す。組換えにより産生されたシグナルペプチドは、「合成シグナルペプチド」又は単に「シグナルペプチド」と称され得る。合成プレタンパク質(sPre)シグナルペプチド及び合成プロタンパク質(sPro)シグナルペプチドのうちの1つ以上を含むシグナルペプチド。前述で強調したように、この文脈において合成という用語は、その配列が本明細書に規定されるように生成される、組換えにより産生されるプレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドを指す。その後、プレシグナルペプチド及びプロシグナルペプチドは、「合成」プレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチド、又は単にプレタンパク質ペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドと呼んでもよい。天然のプレタンパク質シグナルペプチド又はプレタンパク質シグナルペプチドが利用又は言及される実施形態では、ペプチドは、そのように示される。本出願の文脈において、「天然」という用語は、その配列が、全体的又は部分的に、本出願の時点で公知のプレシグナルペプチド配列又はプロシグナルペプチド配列から採用されるプレシグナルペプチド又はプロシグナルペプチドを指す。言い換えれば、「天然」シグナルペプチドは、本明細書に提供される式又は方法を使用して生成されない。しかしながら、合成シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチド(sPre-nProシグナルペプチド)と融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含み得ることが理解されるべきである。別の例では、合成シグナルペプチドは、合成プロタンパク質シグナルペプチド(nPre-sProシグナルペプチド)に融合された天然のプレタンパク質シグナルペプチドを含み得る。更に別の実施例では、合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチドを含み、プロタンパク質シグナルペプチドを含まない。同様に、合成シグナルペプチドは、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含むが、プレタンパク質シグナルペプチドは含まないことがある。
プレタンパク質シグナルペプチド(合成又は天然)は、10~50個のアミノ酸を含み、それらは、ペイロードタンパク質のN末端に直接的に、又は、ペイロードタンパク質のN末端に、Kexプロテアーゼ(KR)部位、Ste13切断部位、及びそれらの間のスペーサーのうちの1つ以上を介して間接的にのいずれかで付加される。
プロタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質のN末端に直接的に、又はペイロードタンパク質のN末端に、KR部位、Ste13切断部位、及びその間のスペーサーのうちの1つ以上を介して間接的にのいずれかで付加される、10~200個のアミノ酸を含む。多くのタンパク質は、プロタンパク質シグナルペプチドを含んで天然に発現されるが、記載されるように、これらの天然のプロタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質の十分な分泌を生成する活性を欠くことが多い。本明細書に記載される様々な合成シグナルペプチドは、天然シグナルペプチドの全て又は一部の置換として使用され得る。
プレタンパク質シグナルペプチド及び/又はプロタンパク質シグナルペプチドは、合成であっても天然であっても、隣接するアミノ酸のN末端アミノ酸への結合を介して、例えば、ペプチド結合、ジペプチドスペーサー、又は膜結合/親油性アルファヘリックスペプチドシグナルペプチド(例えば、アミノ酸配列FCTFFEKHHRKWDILLEKSTGVMEAによって表されるMISTIC又は配列番号26)によって、隣接するアミノ酸に付加され得る。
本明細書で使用される場合、「ハイドロパシー指標」又は「HP指標」は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Kovacs JM,Mant CT,Hodges RS. Determination of intrinsic hydrophilicity/hydrophobicity of amino acid side chains in peptides in the absence of nearest-neighbor or conformational effects. Biopolymers.2006;84(3):283-97.doi:10.1002/bip.20417. PMID:16315143;PMCID:PMC2744689に定義されているペプチド/タンパク質中のアミノ酸側鎖の「固有の」疎水性/親水性を指す。疎水性/親水性値を合成ペプチドを介して決定し、HP指標値は、i位のアミノ酸Xとi+1位のアミノ酸Glyとの間のRP-HPLC保持時間の差として計算される。したがって、グリシンよりも疎水性であるアミノ酸は、正のHP指標値を有し、グリシンよりも親水性であるアミノ酸は、負のHP指標値を有し、グリシンは、0値を有する。本出願に利用される値に対応する値を、以下の表1で参照されたい。
Figure 2024511941000002
本明細書で使用される場合、「ヘリシティ」は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Deber CM,Wang C,Liu LP,Prior AS,Agrawal S,Muskat BL,Cuticchia AJ. TM Finder:a prediction program for transmembrane protein segments using a combination of hydrophobicity and nonpolar phase helicity scales. Protein Sci.2001 Jan;10(1):212-9.doi:10.1110/ps.30301. PMID:11266608;PMCID:PMC2249854に概説されるように、実験用KKAAAXAAAAAXAAWAAXAAAKKKK(配列番号84)-アミドペプチドにおける各ゲスト「X」残基の非極性相ヘリカル傾向を指す。各アミノ酸のヘリシティ値を以下の表2に示す。
Figure 2024511941000003
本明細書で使用される場合、「ペイロードタンパク質」又は「目的のタンパク質」は、宿主によって生成され、合成シグナルペプチドの存在によって促進される、分泌経路を通して細胞外空間内に付き添われる、タンパク質を指す。細胞外空間への分泌時に、合成シグナルペプチドの全て、一部がペイロードタンパク質に融合していても、又は合成シグナルペプチドがまったくペイロードタンパク質に融合していなくてもよい。任意選択的に、合成シグナルペプチドに部分的又は完全にまだ付着しているペイロードタンパク質を更に処理して、例えば、残りのシグナルペプチドを除去してもよい。ペイロードタンパク質は、例えば、酵素、酵素阻害剤、成長因子、ホルモン、抗体、抗原、ワクチン、治療剤、又はそれらの任意の組み合わせなど、既知又は未知の任意のタンパク質であってもよい。より具体的な実施例は、本明細書で以下に従う。
本明細書に開示される組成物は、対象への組成物の投与を通して、様々な方法で対象に提供され得る。本明細書で使用される場合、投与する又は投与は、対象に組成物を提供すること又は対象への組成物の提供を意味する。経口投与は、本明細書で使用される場合、口を介した活性剤の送達を指す。局所投与は、本明細書で使用される場合、皮膚、粘膜(例えば、鼻膜、膣膜、口腔膜など)などの体表面への活性剤の送達を指す。
「操作された酵母」と互換的に称される、本明細書に開示される様々な遺伝子改変された酵母によって分泌されるペイロードタンパク質は、医薬組成物として対象に提供され得る。追加的又は代替的に、操作された酵母自体が、医薬組成物として対象に提供され得る。
本明細書に開示される様々な組成物は、例えば、がんなどの多くの疾患の治療に有用であり得る。本明細書で使用される場合、がんは、制御されていない細胞増殖を特徴とする状態を指す。がんの例としては、以下に限定されないが、扁平上皮がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、肺腺がん、肺扁平上皮がん、胃腸がん、ホジキンリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫、膵がん、膠芽腫、子宮頸がん、結腸がん、結腸直腸がん、子宮内膜がん又は子宮がん、腎細胞がん及びウィルムス腫瘍などの腎臓がん、基底細胞がん、黒色腫、前立腺がん、並びに食道がんが挙げられる。いくつかの実施形態では、疾患又は状態には、以下に限定されないが、感染症、自己免疫疾患、酵素欠損症(原発性(先天性)酵素欠損症及び機能性腸障害に続発する酵素欠損症を含む)、糖尿病、肥満、代謝障害、腸内細菌異常増殖症、腸感染症、細菌性膣症、短腸症候群、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、小腸症候群、セリアック病、グルテン不耐症、大腸炎、消化性潰瘍、胃炎、ポリープ、痔核、硬変症、又はがんが含まれ得る。
本明細書に開示される様々な組成物は、1つ以上の薬物、生物製剤、又は活性剤を含んでもよく、それらは、本明細書で互換的に使用され、所望の薬理学的又は生理学的効果を誘導する化学物質又は化合物を指し、治療有効な、予防的有効な、又は美容的に有効な薬剤を含む。「薬物」、「生物製剤」、及び「活性剤」は、限定されないが、塩、エステル、アミド、プロドラッグ、活性代謝産物、包接錯体、類似体などを含む、本明細書で具体的に言及されるそれらの薬物、生物製剤、及び活性剤の任意の薬学的に許容可能な薬理学的に活性な誘導体及び類似体を含む。適切な薬物、生物製剤、活性剤は、以下に限定されないが、嫌酒薬、アミノ酸、アンモニア解毒剤、同化剤、蘇生薬、鎮痛剤、アンドロゲン剤、麻酔薬、食欲抑制化合物、食欲減退薬、アンタゴニスト、抗アレルギー剤、抗アメーバー剤、抗貧血薬、抗狭心症薬、抗不安薬、抗関節炎薬、抗アテローム性動脈硬化剤、抗菌剤;抗悪性腫瘍薬、及び抗がん補助増強剤(anti-cancer supplementary potentiating agent)を含む抗がん剤;抗コリン薬、抗胆石形成剤(anticholelithogenic agent)、抗凝固剤、抗コクシジウム剤、抗痙攣剤、抗鬱剤、抗糖尿病薬、止瀉薬、抗利尿薬、解毒剤、抗運動障害薬(anti-dyskinetics agent)、制吐剤、抗てんかん薬、抗エストロゲン剤、抗線維素溶解剤、抗真菌剤(anti-fungal agent)、抗緑内障剤、抗血友病剤、抗出血剤、抗ヒスタミン剤、抗高脂血症剤、抗高リポタンパク血症剤、降圧剤、抗低血圧剤;抗感染症薬、例えば抗生物質及び抗ウイルス剤; 抗炎症剤、ステロイド系及び非ステロイド系の両方;抗角化剤、抗マラリア薬、抗微生物剤、抗片頭痛薬、抗有糸分裂薬、抗真菌剤(anti-mycotic agent)、制嘔吐剤、抗悪性腫瘍剤、抗好中球減少剤(anti-neutropenic agent)、抗強迫神経症薬(anti-obsessional agent)、抗寄生虫剤、抗パーキンソン病薬、抗ニューモシスティス剤(anti-pneumocystic agent)、抗増殖剤、抗前立腺肥大薬、抗原虫剤、鎮痒剤、抗乾癬剤、抗精神病薬、解熱剤、鎮痙薬、抗リウマチ剤、住血吸虫駆除薬、抗脂漏薬、鎮痙薬、抗血栓剤、抗結核薬、鎮咳薬、抗潰瘍剤、抗尿路結石薬(anti-urolithic agent)、抗ウイルス剤、胃食道逆流症薬、抗不安薬、食欲抑制剤、注意欠陥障害(ADD)及び注意欠陥多動性障害(ADHD)薬、静菌剤及び殺菌剤、良性前立腺肥大症療法剤、血糖調節剤、骨吸収抑制剤、気管支拡張薬; 炭酸脱水素酵素阻害剤;抗狭心症薬、抗不整脈剤、ベータ遮断薬、カルシウムチャネル遮断薬、心抑制剤、心血管治療薬、心臓保護剤(cardioprotectant)、及び強心剤を含む循環器用薬;中枢神経系(CNS)作用薬、中枢神経系刺激薬、胆汁分泌促進剤、コリン作用薬、コリン作動薬、コリンエステラーゼ不活性化剤、抗コクシジウム剤、認知力補助剤及び認知力改善剤;充血緩和剤を含む感冒薬;抑制剤、診断補助具、利尿薬、ドパミン作用薬、外部寄生虫撲滅薬、催吐薬;歯垢、歯石又はう蝕の形成を阻害する酵素;酵素阻害剤、エストロゲン、繊維素溶解薬、フッ素虫歯予防/虫歯予防剤、遊離酸素ラジカル捕捉剤、胃腸運動促進剤(gastrointestinal motility agent)、遺伝物質、グルココルチコイド、生殖腺刺激成分、止血剤、生薬、ヒスタミンH2受容体拮抗薬、ホルモン、ホルモン分解薬(hormonolytic)、催眠剤、コレステロール低下剤、血糖降下薬、脂質低下剤、降圧剤、免疫剤、免疫促進剤、免疫調節剤、免疫刺激剤、免疫抑制剤、インポテンツ療法補助剤、阻害剤、角質溶解薬、ロイコトリエン阻害剤、肝障害治療;エチレンジアミン四酢酸、四ナトリウム塩などの金属キレート剤;有糸分裂阻害剤、気分調製剤(mood regulator)、粘液溶解薬、粘膜保護剤、筋弛緩薬、散瞳薬、麻薬拮抗薬、神経遮断薬、神経筋遮断薬、神経保護剤、ニコチン、NMDA拮抗薬、非ホルモンステロール誘導体;ビタミン 必須アミノ酸及び脂肪酸などの栄養剤;抗緑内障剤などの眼科薬、オキシトシン剤、鎮痛剤、副交感神経遮断薬、ペプチド薬、プラスミノーゲン活性化因子、血小板活性化因子拮抗薬、血小板凝集阻害剤、脳卒中後及び頭部外傷治療、増強剤、プロゲスチン、プロスタグランジン、前立腺成長阻害剤、創傷洗浄剤としてのタンパク質分解酵素、プロチロトロピン剤(prothyrotropin agent)、精神刺激薬、向精神薬、放射性薬剤、調節剤、弛緩剤、再分配剤、疥癬虫殺虫剤、硬化薬、鎮静剤、鎮静催眠剤、選択的アデノシンA1拮抗薬、セロトニン拮抗薬、セロトニン阻害剤、セロトニン受容体拮抗薬;プロゲストゲン、エストロゲン、コルチコステロイド、アンドロゲン及び同化剤を含むステロイド;禁煙用薬、興奮剤、抑制剤、交感神経様作用薬、共力剤、甲状腺ホルモン、抗甲状腺薬、甲状腺ホルモン模倣剤、精神安定剤、歯の脱感作剤;過酸化物、金属亜塩素酸塩、過ホウ酸塩、過炭酸塩、ペルオキシ酸、及びそれらの組み合わせなどの歯のホワイトニング剤、不安定狭心症薬、尿酸排泄促進剤、血管収縮薬、一般的な冠動脈、末梢血管及び脳血管を含む血管拡張薬、傷薬;創傷治癒剤、キサンチンオキシダーゼ阻害剤、などが含まれ得る。
抗生物質とは、細菌及び他の微生物の増殖を阻害することによって、又は既存のコロニーを破壊することによって、細菌感染症を治療することができる化学物質を指す。
抗炎症とは、炎症及び腫脹を低減する活性剤を指す。
化学療法剤は、異常な細胞増殖を特徴とする疾患の治療において治療的有用性を有する化学物質を指す。このような疾患には、腫瘍、新生物、及びがんが含まれる。一例では、化学療法剤は、放射性化合物である。一例では、化学療法剤は、モノクローナル抗体などの生物製剤である。化学療法とは、化学療法剤の使用を指す。
放射線療法は、細胞が正常に機能する能力を制限するか、又は完全に破壊するために、細胞に十分な損傷を誘発するための指向性ガンマ線又はベータ線の使用を指す。
本明細書に開示される様々な組成物は、有効量の薬物、生物製剤、又は活性剤を含み得る。有効量は、状態を予防、治療、低減、及び/又は改善するなど、所望の応答を誘発するのに十分な薬物、生物製剤、又は活性剤(単独で、又は1つ以上の他の活性剤とともに)の量を指す。有効量の活性剤は、単独で、又は1つ以上の他の活性剤と併用して、対象における状態に関連する1つ以上の兆候若しくは症状の低減についてアッセイすること、又は治療される状態に関連する1つ以上の分子のレベルを測定することなどの、多くの異なる方法で決定することができる。
本明細書に開示される様々な組成物は、様々な薬学的に許容可能な賦形剤を含み得る。本明細書で使用される場合、pH調整剤又は調節剤は、製剤中で所望のpH制御を達成するために使用される化合物又は緩衝剤を指す。例示的なpH調節剤としては、酸(例えば、酢酸、アジピン酸、炭酸、クエン酸、フマル酸、リン酸、ソルビン酸、コハク酸、酒石酸)、塩基(例えば、酸化マグネシウム、三塩基性リン酸カリウム)、及びその薬学的に許容可能な塩が挙げられる。
本開示に有用な薬学的に許容可能な担体は、当該技術分野で従来的に知られている担体である。担体の性質は、採用される特定の投与様式に依存し得る。例えば、経口適用には、通常、水、生理食塩水、平衡塩類溶液、デキストロース水溶液、グリセロールなどの薬学的及び生理学的に許容可能な流体がビヒクルとして挙げられる。生物学的に中性の担体に加えて、経口用組成物は、湿潤剤又は乳化剤、防腐剤、及びpH緩衝剤などの補助物質も含有してもよい。
抗酸化剤は、酸素又は過酸化物によって促進される酸化又は反応を阻害する化合物を指す。
粘膜付着性物質とは、追加の接着物質なしで水和時に粘膜に強く付着し、インビボで組織に付着したままになる物質を指す。
合成シグナルペプチド
いくつかの実施形態では、酵母からのペイロードタンパク質の分泌を増加させる合成シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、上述のように、合成プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドのうちの1つ以上を含む。任意の実施形態では、天然のプレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドは、合成シグナルペプチドと組み合わされてもよいが、ただしプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドのうちの少なくとも1つが合成である。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチド及びペイロードタンパク質を含む組換えポリペプチドが提供され、合成シグナルペプチドは、直接的又は間接的に、ペイロードタンパク質に融合される。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、目的のタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチド及び目的のタンパク質は、ペプチドリンカーを介して結合される。適切なペプチドリンカーは当技術分野で公知であり、任意のそのようなリンカーを利用することができる。いくつかの実施形態では、リンカーは、可撓性ペプチドリンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは、非切断性ペプチドリンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは、切断可能なペプチドリンカーである。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチド及びペイロードタンパク質を含む。例えば、図1は、ペイロードタンパク質のN末端に付加された合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを表す構築物を示し、合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチドのみを含む(sPreシグナルペプチド、標示A)。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、合成プロタンパク質シグナルペプチド及びペイロードタンパク質を含む。例えば、図1は、ペイロードタンパク質のN末端に付加された合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを表す構築物を示し、合成シグナルペプチドは、合成プロタンパク質シグナルペプチドのみを含む(sProシグナルペプチド、標示B)。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチド、合成プロタンパク質シグナルペプチド、及びペイロードタンパク質を含む。例えば、図1は、ペイロードタンパク質のN末端に付加された合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを表す構築物を示し、合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチド及び合成プロタンパク質シグナルペプチドの両方を含む(sPre-sProシグナルペプチド、標示C)。プレタンパク質シグナルペプチドは、プロタンパク質シグナルペプチドのN末端に付加され、これはペイロードタンパク質のN末端に付加される。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、天然のプレタンパク質シグナルペプチド、合成プロタンパク質シグナルペプチド、及びペイロードタンパク質を含む。例えば、図1は、合成プロタンパク質シグナルペプチドに融合された天然のプレタンパク質シグナルペプチドを含む合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを表す構築物を示す(nPre-sProシグナルペプチド、標示D)。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチド、天然のプロタンパク質シグナルペプチド、及びペイロードタンパク質を含む。
以下の表3は、本明細書で言及される様々なアミノ酸配列を列挙する。表3では、括弧内に含まれるアミノ酸は任意である。複数のアミノ酸が括弧内に含まれる場合、アミノ酸のうちのいずれか一方を、他方のアミノ酸を追加することなく追加又は除外され得ることが理解されるべきである。配列EEGEPK(配列番号78)及びDVVYPK(配列番号79)は、スペーサーであり、DKREEGPK(配列番号80)、KREEGPK(配列番号81)、DKREKRE(配列番号82)、及びDKR(配列番号83)は、Kexプロテアーゼ部位である。
Figure 2024511941000004
Figure 2024511941000005
上記の例に列挙されるKexプロテアーゼ部位に加えて、本開示のプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドはまた、アミノ酸配列NVISKR(配列番号68)、又はアミノ酸配列SDVTKR(配列番号69)によって与えられるようなKEX2切断部位を任意に含有し得る。任意の実施形態では、配列番号68の配列は、本明細書に提供される任意のプレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドのC末端又はN末端に付加され得る。したがって、いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、提供される通りである。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、提供される通りである。任意の実施形態では、配列番号69の配列は、本明細書に提供される任意のプレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドのC末端又はN末端に付加され得る。したがって、いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、提供される通りである。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、提供される通りである。
いくつかの実施形態では、KEX2切断部位は、以下の式によって表すことができる、
(式XII)
式中、i)X、X、及びXはGではなく、ii)X及びXがGであり、XがAであり、又はXがSである場合、XはSではなく、iii)XがAであり、XがSである場合、XはTではなく、又はiv)XはDではなく、B及びBは各々、独立して、塩基性アミノ酸である。式XIIの詳細は、米国特許第8,936,917号に記載されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。したがって、任意の実施形態では、式XIIの配列は、本明細書に提供される任意のプレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドのC末端又はN末端に付加され得る。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、提供される通りである。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、提供される通りである。
任意の合成プレタンパク質又はプロタンパク質シグナルペプチドは、既知のシグナルペプチドの一部又は全てと組み合わせることができる。表3の配列番号1~25、31~38、55~58、及び70~75のいずれかと組み合わせて合成シグナルペプチドを生成し得る既知のシグナルペプチドの例としては、HSp150、PHO5、SUC2、KILM1、GGP1、SUN、PLB、CRH、EXG、AGA2、HAS pre-pro、PIR1、XPR2 pre、XPR2 pre-pro、pGKL、SCW、及びDSEが挙げられるが、これらに限定されない。
当業者であれば、配列番号1~38、55~58、及び70~75のうちのいずれか1つの発現をコードする核酸を開発することができるであろう。以下の表4は、表3に記載される合成ペプチドを生成するために使用され得るヌクレオチド配列の例を提供する。表4に提供される核酸配列は例示的であり、決して限定することを意図するものではないことが理解されるべきである。コドンの縮重の性質のため、他の核酸分子を使用することができる。いくつかの実施形態では、核酸分子は、細菌系における発現に最適化されたコドンである。いくつかの実施形態では、核酸分子は、真核生物系又は真核細胞における発現に最適化されたコドンである。
Figure 2024511941000006
Figure 2024511941000007
本明細書に開示される合成シグナルペプチドは、酵母での使用に最適化され、任意のタンパク質の発現を誘導するために使用され得る。開発されている特定の合成シグナルペプチドを例示するために、好適な酵母種の特定の例を本明細書で以下に提供する。
上述のように、表3はアミノ酸配列を開示するが、任意の態様及び実施形態では、表3の配列のいずれも、保存的アミノ酸置換で修飾されて、一次配列の特性及び機能性を維持する活性バリアントを産生してもよい。これらの保存的アミノ酸置換は、コンセンサス配列並びにバリアント配列をカプセル化する、以下の式によって一般的に説明され得る。ここで、バリアント配列を詳述する様々な式を説明する。
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
配列番号1のバリアント(式I)
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-(A-A-(A-(A-(A)-(A)-(A)-(A)-(A10)-(A11(式I)
式中、
w及びxは各々、独立して、1、2、3、4、又は5であり、
yは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
zは、1、2、又は3であり、

は、メチオニンであり、
各Aは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、中性アミノ酸又は正電荷をもつアミノ酸であり、
各A、A、A、及びA10は独立して、W及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Aは、独立して、P、W、M、及びCを除く、塩基性又は中性アミノ酸であり、
各Aは、独立して、W、M、及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Aは、独立して、Pを除く、約1.9より小さいハイドロパシー指標及び約5.4~約7.5(両端を含む)の等電点を有する非芳香族アミノ酸であり、
各Aは、独立して、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各A11は、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸である。
いくつかの実施形態では、wは、1である。いくつかの実施形態では、wは、2である。いくつかの実施形態では、wは、3である。いくつかの実施形態では、wは、4である。いくつかの実施形態では、wは、5である。いくつかの実施形態では、xは、1である。いくつかの実施形態では、xは、2である。いくつかの実施形態では、xは、3である。いくつかの実施形態では、xは、4である。いくつかの実施形態では、xは、5である。いくつかの実施形態では、yは、2~18、4~16、6~14、8~12、7~11、及び8~10から選択される整数であり得る。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、yは、3である。いくつかの実施形態では、yは、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20である。いくつかの実施形態では、zは、1である。いくつかの実施形態では、zは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3である。w、x、y、及びzの値は各々、独立して選択され、任意の変数w、x、y、又はzの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、各A、A、A、及びA10は各々、独立して、A、G、I、L、M、F、S、T、V、P、E、Y、Q 及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各A、A、A、及びA10は各々、独立して、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Aは各々、A、G、I、L、M、F、S、T、V、P、E、Y、Q 及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Aは、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Aは各々、A、G、I、L、M、F、S、T、V、P、E、Y、Q 及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Aは、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Aは各々、A、G、I、L、M、F、S、T、V、P、E、Y、Q 及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Aは、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、A10は各々、A、G、I、L、M、F、S、T、V、P、E、Y、Q 及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、A10は、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各A11は、独立して、N、S、T、C、A、V、G、I、L、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各A11は、独立して、A、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Aは、独立して、K、R、H及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。w、x、y、zのうちのいずれか1つが、1よりも大きい整数である実施形態では、w、x、y、zによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。例えば、wが3である(Aについては、この群はAに拡張し、各Aは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する中性アミノ酸又は正電荷をもつアミノ酸である。この意味は、別段の明示的な示唆がない限り、本明細書及び以下に開示される全ての更なる式に拡張される。
いくつかの実施形態では、配列番号1の配列は、以下のように式Iから導き出すことができる:wは、1であり、xは、2であり、yは、9であり、zは、2であり、Aは、メチオニンであり、Aは、Kであり、Aは、Lであり、Aの1番目及び2番目の例は両方とも、Sであり、Aの9つ例は、全てLであり、Aは、Sであり、Aは、Sであり、Aは、Lであり、Aは、Vであり、A10は、Lであり、A11の両方の例は、Aである。
配列番号4~7のバリアント(式II)
特定の実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-(B-(B-(B-(B-(B-(B)-(B)-(B)-(B10)-(B11 (式II)
式中、
u及びwは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v及びzは各々、独立して、1、2、又は3であり、
xは、0、1、又は2であり、
yは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、

は、メチオニンであり、
各B、B、B、B、及びB10は各々、独立して、W及びCを除く、約-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Bは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、正電荷をもつアミノ酸又は極性アミノ酸であり、
各Bは、独立して、P、W、M、及びCを除く、約-5より大きく-0.5より小さいハイドロパシー指標を有する極性アミノ酸、又は約5~11の等電点を有するアミノ酸であり、
各B及びB11は各々、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
は、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、uは、0である。いくつかの実施形態では、uは、1である。いくつかの実施形態では、uは、2である。いくつかの実施形態では、uは、3である。いくつかの実施形態では、wは、0である。いくつかの実施形態では、wは、1である。いくつかの実施形態では、wは、2である。いくつかの実施形態では、wは、3である。いくつかの実施形態では、vは、1である。いくつかの実施形態では、vは、2である。いくつかの実施形態では、vは、3である。いくつかの実施形態では、zは、1である。いくつかの実施形態では、zは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3である。いくつかの実施形態では、xは、0である。いくつかの実施形態では、xは、1である。いくつかの実施形態では、xは、2である。いくつかの実施形態では、yは、2~18、4~16、6~14、8~12、7~11、及び8~10から選択される整数であり得る。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、yは、3である。いくつかの実施形態では、yは、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20である。u、w、v、z、x、及びyの値は各々、独立して選択され、任意の変数u,w,v,z,x、又はyの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、各B、B、B、B、及びB10は各々、独立して、A、G、I、L、M、F、S、T、V、N、Q、E、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各B、B、B、B及びB10は各々、独立して、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、A、G、I、L、M、F、S、T、V、N、Q、E、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、A、G、I、L、M、F、S、T、V、N、Q、E、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、A、G、I、L、M、F、S、T、V、N、Q、E、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Bは、A、G、I、L、M、F、S、T、V、N、Q、E、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Bは、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、B10は、A、G、I、L、M、F、S、T、V、N、Q、E、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、B10は、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、K、R、E、D、G、A、V、L、I、F、S、T、Y、N、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、K、R、E、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは、独立して、G、A、V、L、I、F、S、T、Y、N、K、R、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各B及びB11は各々、独立して、A、S、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Bは、A、S、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各B11は、独立して、A、S、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Bは、A、C、G、I、L、M、F、S、T、W、Y、V、N、Q、D、E、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Bは各々、独立して、K、R、H及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。本明細書に記載するように、u、w、v、z、x及びyのうちのいずれか1つが、1よりも大きい整数である実施形態では、u、w、v、z、x及びyによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。
いくつかの実施形態では、配列番号4の配列は、以下のように式IIから導き出すことができる:uは、0であり、vは、1であり、wは、1であり、xは、1であり、yは、11であり、zは、3であり、Bは、メチオニンであり、Bは、存在せず、Bは、Kであり、Bは、Lであり、Bは、Sであり、11個の(11)B残基のストリングは以下の通りである:T-L-L-L-T-L-L-L-L-L-L;Bは、Aであり、Bは、Lであり、Bは、Vであり10は、Lであり、3つの(3)B11残基のストリングは以下の通りである:A-A-S。
いくつかの実施形態では、配列番号5の配列は、以下のように式IIから導き出すことができる:uは、1であり、vは、1であり、wは、1であり、xは、0であり、yは、11であり、zは、3であり、Bは、メチオニンであり、Bは、Lであり、Bは、Kであり、Bは、Lであり、Bは、存在せず、11個の(11)B残基のストリングは以下の通りである:L-L-L-I-L-L-L-L-L-L-V;Bは、Sであり、Bは、Lであり、Bは、Vであり、B10は、Lであり、及び3つの(3)B11残基のストリングは以下の通りである:A-A-S。
いくつかの実施形態では、配列番号6の配列は、以下のように式IIから導き出すことができる:uは、0であり、vは、1であり、wは、0であり、xは、0であり、yは、15であり、zは、3であり、Bは、メチオニンであり、Bは、存在せず、Bは、Kであり、Bは、存在せず、Bは、存在せず、15個全ての(15)B残基は、Lであり、Bは、Aであり、Bは、Lであり、Bは、Vであり、B10は、Lであり、3つの(3)B11残基のストリングは以下の通りである:A-A-S。
いくつかの実施形態では、配列番号7の配列は、以下のように式IIから導き出すことができる:uは、0であり、vは1、であり、wは、0であり、xは、0であり、yは、6であり、zは、3であり、Bは、メチオニンであり、Bは、存在せず、Bは、Kであり、Bは、存在せず、Bは、存在せず、6つ全ての(6)B残基は、Lであり、Bは、Sであり、Bは、Lであり、Bは、Vであり、B10は、Lであり、3つの(3)B11残基のストリングは以下の通りである:A-A-S。
配列番号9のバリアント(式III)
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-(C)-(C10)-(C11)-[(C12)-(C13)] (式III)
式中、C~C13は、以下の表5に記載される特性を有し、
Figure 2024511941000008
式中、rは、1~3から選択される整数であり、
t、u、y、及びzは、独立して、0~3(両端を含む)から選択される整数であり、
各v及びwは、独立して、0~2(両端を含む)から選択される整数であり、
xは、2~10(両端を含む)から選択される整数であり、
aは、0又は1である。
いくつかの実施形態では、Cは、メチオニンである。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、約5.6~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-5.1~約0.6のハイドロパシー指標、及び約0.8~約1のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、C、C、及びC10は各々、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C10は、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C及びCは各々、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、C、C11、及びC12は各々、独立して、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは各々、独立して、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Cは、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C11は、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C12は、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C13は、約5.6~約6.3の等電点、約105g/mol~約120g/molの分子量、約0~約9.4のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.1のヘリシティを有するアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、rは、1である。いくつかの実施形態では、rは、2であり、いくつかの実施形態では、rは、3である。いくつかの実施形態では、tは、0である。いくつかの実施形態では、tは、1である。いくつかの実施形態では、tは、2である。いくつかの実施形態では、tは、3である。いくつかの実施形態では、uは、0である。いくつかの実施形態では、uは、1である。いくつかの実施形態では、uは、2である。いくつかの実施形態では、uは、3である。いくつかの実施形態では、yは、0である。いくつかの実施形態では、yは、1である。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、yは、3である。いくつかの実施形態では、zは、0である。いくつかの実施形態では、zは、1である。いくつかの実施形態では、zは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3である。いくつかの実施形態では、vは、0である。いくつかの実施形態では、vは、1である。いくつかの実施形態では、vは、2である。いくつかの実施形態では、wは、0である。いくつかの実施形態では、wは、1である。いくつかの実施形態では、wは、2である。いくつかの実施形態では、xは、3~9、4~8、6~10、8~10、2~5、及び3~6から選択される整数であり得る。いくつかの実施形態では、xは、2である。いくつかの実施形態では、xは、3である。いくつかの実施形態では、xは、4である。いくつかの実施形態では、xは、5である。いくつかの実施形態では、xは、6である。いくつかの実施形態では、xは、7である。いくつかの実施形態では、xは、8である。いくつかの実施形態では、xは、9である。いくつかの実施形態では、xは、10である。いくつかの実施形態では、aは、0であり、[(C12)-(C13)]により与えられる残基は存在しない。いくつかの実施形態では、aは、1であり、[(C12)-(C13)]によって与えられる残基が存在する。r、t、u、y、z、v、w、及びxの値は各々、独立して選択され、任意の変数r、t、u、y、z、v、w、又はxの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、各C、C、C、及びC10は各々、独立して、L、F、I、V、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、C、C、及びC10は各々、独立して、L、F、I、V、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、L、F、I、V、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、L、F、I、V、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、L、F、I、V、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、L、F、I、V、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、L、F、I、V、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、L、F、I、V、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C10は、L、F、I、V、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C10は、L、F、I、V、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、C、C11、及びC12は各々、独立して、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C、C、C11、及びC12は各々、独立して、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Cは、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Cは、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C11は、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C11は、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C12は、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C12は、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、K、R、H、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、C13は、P、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C及びCは各々、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、Y、H、V、I、F、G、W、C、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各C及びCは各々、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、Y、H、V、I、F、G、W、C、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、Y、H、V、I、F、G、W、C、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Cは、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。本明細書に記載するように、r、t、u、y、z、v、w、及びxのうちのいずれか1つが、1より大きい整数である実施形態では、r、t、u、y、z、v、w、及びxによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。
更に、[(C-(Cを考慮すると、xが1より大きい整数である実施形態では、式[(C-(Cは、[(C-(C]がx回繰り返されることを示すものではないことが理解されるべきである。むしろ、(C-(Cが1を超えるxに起因して拡張される場合、Cの各例は独立して、上記に詳述される適切なアミノ酸から選択され得、同様に、Cの各例は独立して、上記に詳述される適切なアミノ酸から選択され得る。例えば[(C-(Cの仮定を考慮すると、式は、1番目及び2番目のCが両方ともLであり、1番目及び2番目のCが両方ともAである、配列L-A-L-Aを生成することができ、同様に、1番目のCがLであり、1番目のCがAであり、2番目のCがVであり、2番目のCがCである、L-A-V-Cを産生することができる。更なる例では、[(C-(Cの仮定を考慮すると、式は、1番目、2番目及び3番目のCが全てLであり、1番目、2番目及び3番目のCが全てAである配列L-A-L-A-L-Aを生成することができ、同様に、1番目のCがLであり、1番目のCがAであり、2番目CがVであり、2番目CがCであり、3番目のCが、Hであり、3番目Cが、Pである、L-A-V-C-H-Pを産生することができる。xの同じ機能は、v及びwの値にも当てはまる。例えば、[(C-(Cの仮定を考慮すると、v及びwの各例は、上述のように0~2の整数であり得る。したがって、vの1番目の例及びvの2番目の例は各々1であってもよく、又はvの1番目の例は1であってもよく、vの2番目の例は2であってもよい。
したがって、例えば、xが、3である、式IIIの式C-(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-(C)-(C10)-(C11)-[(C12)-(C13)]を考慮する場合、式IIIの式は以下のように記述されることを想定することができ、
-(C-(C-(C-(C-(C-(C-(C-(C-(C-(C-(C-(C)-(C10)-(C11)-[(C12)-(C13)]
式中、各v及びwは、独立して、0、1又は2から選択され、各C及びCは、独立して、上記に概説した適切なアミノ酸から選択される。この意味は、別段の明示的な示唆がない限り、本明細書及び以下に開示される全ての更なる式に拡張される。
いくつかの実施形態では、配列番号9の配列は、以下のように式IIIから導き出すことができる:rは、1であり、tは、2であり、uは、2であり、vは、2であり、wは、2であり、xは、2であり、yは、2であり、zは、1であり、aは、1であり、Cは、メチオニンであり、Cは、Kであり、2つの(2)C残基のストリングは以下の通りである:L-S、2つの(2)C残基のストリングは以下の通りである:S-L、[(C-(Cによって与えられる8つの(8)残基のストリングは以下の通りである:L-L-A-L-L-L-A-L、2つの(2)C残基のストリングは以下の通りである:A-S、Cが、Lであり、Cが、Aであり、C10が、Lであり、C11が、Aであり、C12が存在し、Aであり、C13が存在し、Pである。
配列番号12のバリアント(式IV)
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-(D10)-(D11)-(D12)-[(D13)-(D14)] (式IV)
式中、D~D14は、以下の表6に記載される特性を有し、
Figure 2024511941000009
qは、1、2、又は3(包括的)から選択される整数であり、
r、t、及びuは、独立して、0、1、2、又は3(包括的)から選択される整数であり、
各v、w、x、及びyは、独立して、0、1、又は2(包括的)から選択される整数であり、
zは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10(包括的)から選択される整数であり、
aは、0又は1である。
いくつかの実施形態では、Dは、メチオニンである。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各D、D、及びD11は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D11は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約5.4~約6.1の等電点、約117g/mol~約205g/molの分子量、約2.5~約34のハイドロパシー指標、及び約1~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各D、D10、D12、及びD13は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D10は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D12は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D13は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D14は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、qは、1である。いくつかの実施形態では、qは、2である。いくつかの実施形態では、qは、3である。いくつかの実施形態では、rは、0である。いくつかの実施形態では、rは、1である。いくつかの実施形態では、rは、2である。いくつかの実施形態では、rは、3である。いくつかの実施形態では、tは、0である。いくつかの実施形態では、tは、1である。いくつかの実施形態では、tは、2である。いくつかの実施形態では、tは、3である。いくつかの実施形態では、uは、0である。いくつかの実施形態では、uは、1である。いくつかの実施形態では、uは、2である。いくつかの実施形態では、uは、3である。いくつかの実施形態では、vは、0である。いくつかの実施形態では、vは、1である。いくつかの実施形態では、vは、2である。いくつかの実施形態では、wは、0である。いくつかの実施形態では、wは、1である。いくつかの実施形態では、wは、2である。いくつかの実施形態では、xは、0である。いくつかの実施形態では、xは、1である。いくつかの実施形態では、xは、2である。いくつかの実施形態では、yは、0である。いくつかの実施形態では、yは、1である。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3~9、4~8、6~10、8~10、2~5、又は3~6(全て両端を含む)から選択される整数であってもよい。いくつかの実施形態では、zは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3である。いくつかの実施形態では、zは、4である。いくつかの実施形態では、zは、5である。いくつかの実施形態では、zは、6である。いくつかの実施形態では、zは、7である。いくつかの実施形態では、zは、8である。いくつかの実施形態では、zは、9である。いくつかの実施形態では、zは、10である。いくつかの実施形態では、aは、0であり、[(D13)-(D14)]により与えられる残基は存在しない。いくつかの実施形態では、aは、1であり、[(D13)-(D14)]によって与えられる残基が存在する。r、t、u、v、w、x、y、及びzの値は各々、独立して選択され、任意の変数r、t、u、v、w、x、y、又はzの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、K及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、F、L、I、W、V、M、Y、P、C、A、Q、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各D、D及びD11は各々、独立して、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各D、D及びD11は各々、独立して、L及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、L及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、L及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Dは、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Dは、L及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D11は、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D11は、L及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、A、C、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各D、D10、D12、及びD13は各々、独立して、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各D、D10、D12、D13は各々、独立して、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D10は、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D10は、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D12は、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D12は、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D13は、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D13は、A及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、V、W、I、L、F、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、L、I、A、T、S、G、N、R K、Y、Q、C、H、W、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Dは、独立して、L及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、D14は、P、Y、M、V、A、T、Q、S、N、G、I、E、D、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。本明細書に記載するように、r、t、u、v、w、x、y、及びzのうちのいずれか1つが、1よりも大きい整数である実施形態では、r、t、u、v、w、x、y、及びzによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。
式IIIに関して概説されるように、-[(D-(D-(D-(Dによって与えられる式IVの部分は、[(D-(D-(D-(D]の「z」回繰り返しとして解釈されるべきではなく、むしろ、「z」回拡張された場合、各v、x、w、及びyは、上記に提供される整数から独立して選択でき、各D、D、D、及びDは、上記に提供される適切なアミノ酸から独立して選択され得る。
したがって、例えば、zが、3である、式IVの式D-(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-(D10)-(D11)-(D12)-[(D13)-(D14)]を考慮する場合、式IVの式は、以下のように記述されることを想定することができ、
-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D-(D10)-(D11)-(D12)-[(D13)-(D14)]
式中、各v、x、w、及びyは、独立して、0、1、又は2から選択され、各D、D、D、及びDは、独立して、上記に概説した適切なアミノ酸から選択される。
いくつかの実施形態では、配列番号12の配列は、以下のように式IVから導き出すことができる:qは、1であり、rは、1であり、tは、1であり、uは、2であり、zの全ての例についてvは0であり、zの全ての例についてxは、0であり、wは、1であり、yは、1であり、zは、6であり、aは、1であり、Dは、メチオニンであり、Dは、Kであり、Dは、Fであり、Dは、Lであり、2(2)D残基のストリングは以下の通りである:S-L;zの全ての例についてDは、存在せず、zの全ての例についてDは、存在せず、[(D-(Dによって与えられる12個の(12)残基のストリングは以下の通りである:L-L-A-L-V-A-A-L-A-L-A-L;D10は、Aであり、D11は、Lであり、D12は、Aであり、D13は存在し、Aであり、D14は存在し、Pである。
配列番号14、15、及び16のバリアント(式V)
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-(E11)-(E12)-(E13)-[(E14)-(E15)] 式V
式中、E~E15は、以下の表7に記載される特性を有し、
Figure 2024511941000010
式中、各i、j、q、w、x、及びaは、独立して、0又は1であり、
rは、1、2、又は3(包括的)から選択される整数であり、
t、u、v、及びzは、独立して、0、1、2、又は3(包括的)から選択される整数であり、
yは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10(包括的)から選択される整数である。
いくつかの実施形態では、Eは、メチオニンである。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約1のハイドロパシー指標、及び約0.85~約1のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75.1g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約5~約10.8の等電点、約105g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E及びEは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約5~約9.75の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E、E13、及びE14は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E13は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E14は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E10及びE12は、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E10は、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E12は、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E11は、約5~約9.75の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E15は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約15.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.2のヘリシティを有するアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、iは、0である。いくつかの実施形態では、iは、1である。いくつかの実施形態では、jは、0である。いくつかの実施形態では、jは、1である。いくつかの実施形態では、qは、0である。いくつかの実施形態では、qは、1である。いくつかの実施形態では、wは、0である。いくつかの実施形態では、wは、1である。いくつかの実施形態では、xは、0である。いくつかの実施形態では、xは、1である。いくつかの実施形態では、rは、1である。いくつかの実施形態では、rは、2である。いくつかの実施形態では、rは、3である。いくつかの実施形態では、tは、0である。いくつかの実施形態では、tは、1である。いくつかの実施形態では、tは、2である。いくつかの実施形態では、tは、3である。いくつかの実施形態では、uは、0である。いくつかの実施形態では、uは、1である。いくつかの実施形態では、uは、2である。いくつかの実施形態では、uは、3である。いくつかの実施形態では、vは、0である。いくつかの実施形態では、vは、1である。いくつかの実施形態では、vは、2である。いくつかの実施形態では、vは、3である。いくつかの実施形態では、zは、0である。いくつかの実施形態では、zは、1である。いくつかの実施形態では、zは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3である。いくつかの実施形態では、yは、3~9、4~8、6~10、8~10、2~5、又は3~6(全て両端を含む)から選択される整数であってもよい。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、yは、3である。いくつかの実施形態では、yは、4である。いくつかの実施形態では、yは、5である。いくつかの実施形態では、yは、6である。いくつかの実施形態では、yは、7である。いくつかの実施形態では、yは、8である。いくつかの実施形態では、yは、9である。いくつかの実施形態では、yは、10である。いくつかの実施形態では、aは、0であり、[(E14)-(E15)]によって与えられる残基は存在しない。いくつかの実施形態では、aは、1であり、[(E14)-(E15)]によって与えられる残基が存在する。i、j、q、w、x、r、t、u、v、z、及びyの値は各々、独立して選択され、任意の変数i、j、q、w、x、r、t、u、v、z、又はyの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、K、R、S、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、F、L、I、W、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、F、L、I、W、V、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、K、R、H、S、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、K、R、H、及びSであってもよい。いくつかの実施形態では、各E及びEは各々、独立して、L、I、F、V、C、A、Y、T、Q、N、S、K、H、W、G、D、M、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E及びEは各々、独立して、L、I、F、V、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、L、I、F、V、C、A、Y、T、Q、N、S、K、H、W、G、D、M、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、L、I、F、V、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、L、I、F、V、C、A、Y、T、Q、N、S、K、H、W、G、D、M、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、L、I、F、V、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、T、Q、S、A、C、R、K、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、S、G、K、A、C、Y、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E、E13、及びE14は各々、独立して、A、T、G、S、V、I、L、Y、W、F、C、Q、N、P、E、M、R、K、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E、E13、及びE14は各々、独立して、A、T、G、S、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、A、T、G、S、V、I、L、Y、W、F、C、Q、N、P、E、M、R、K、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Eは、独立して、A、T、G、S、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E10及びE12は、独立して、L、F、I、V、C、Y、T、Q、N、S、K、H、M、G、A、W、D、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E10及びE12は、独立して、L、F、I、V、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E10は、独立して、L、F、I、V、C、Y、T、Q、N、S、K、H、M、G、A、W、D、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E10は、独立して、L、F、I、V、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E12は、L、F、I、V、C、Y、T、Q、N、S、K、H、M、G、A、W、D、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E12は、L、F、I、V、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E13は、A、T、G、S、V、I、L、Y、W、F、C、Q、N、P、E、M、R、K、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E13は、A、T、G、S、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E14は、A、T、G、S、V、I、L、Y、W、F、C、Q、N、P、E、M、R、K、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、E14は、A、T、G、S、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E11は、独立して、V、W、I、C、L、A、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各E15は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。本明細書に記載するように、r、t、u、v、z、及びyのうちのいずれか1つが、1よりも大きい整数である実施形態では、r、t、u、v、z、及びyによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。
式IIIに関して概説されるように、[(E-(Eによって与えられる式Vの部分は、[(E-(E]の「y」回繰り返しとして解釈されるべきではなく、むしろ、「y」回拡張された場合、各w及びxは、上記に提供される整数から独立して選択でき、各E及びEは、上記に提供される適切なアミノ酸から独立して選択され得る。同じことが、[(E-(E-(Eによって与えられる式Vの部分について理解されるべきである。
したがって、例えば、rが、2であり、yが2である、式Vの式E-[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-(E11)-(E12)-(E13)-[(E14)-(E15)]を考慮する場合、式Vの式は以下のように記述されることを想定することができ、
-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E-(E10-(E11)-(E12)-(E13)-[(E14)-(E15)]
式中、各i、j、q、w、及びxは、独立して、0又は1から選択され、各E、E、E、E、及びEは、独立して、上記に概説した適切なアミノ酸から選択される。
いくつかの実施形態では、配列番号14の配列は、以下のように式Vから導き出すことができる:iは、1であり、jは、1であり、qは、1であり、rは、1であり、tは、1であり、uは、2であり、vは、0であり、wは、1であり、xは、1であり、yは、5であり、zは、0であり、aは、1であり、Eは、メチオニンであり、Eは、Kであり、Eは、Fであり、Eは、Kであり、Eは、Lであり、2つの(2)E残基のストリングは、以下の通りである:T-L;Eは、存在せず、[(E-(Eによって与えられる10個の(10)残基のストリングは以下の通りである:L-A-A-L-L-A-L-A-A-L;E10は、存在せず、E11は、Vであり、E12は、Lであり、E13は、Aであり、E14は存在し、Aであり、E15は存在し、Sである。
いくつかの実施形態では、配列番号15の配列は、以下のように式Vから導き出すことができる:iは、1であり、jは、1であり、qは、1であり、rは、1であり、tは、1であり、uは、2であり、vは、0であり、wは、1であり、xは、1であり、yは、4であり、zは、0であり、aは、1であり、Eは、メチオニンであり、Eは、Kであり、Eは、Fであり、Eは、Sであり、Eは、Sであり、2つの(2)E残基のストリングは、以下の通りである:I-L;Eは、存在せず、[(E-(Eによって与えられる8つの(8)残基のストリングは以下の通りである:L-L-L-A-L-L-A-L;E10は、存在せず、E11は、Vであり、E12は、Lであり、E13は、Aであり、E14は存在し、Aであり、E15は存在し、Sである。
いくつかの実施形態では、配列番号16の配列は、以下のように式Vから導き出すことができる:iは、1であり、jは、1であり、qは、1であり、rは、2であり、tは、1であり、uは、2であり、vは、0であり、wは、1であり、xは、1であり、yは、3であり、zは、0であり、aは、1であり、Eは、メチオニンであり、[(E-(E-(Eによって与えられる6個の(6)残基のストリングは以下の通りである:K-L-L-S-L-L;Eは、Aであり、2つの(2)E残基のストリングは以下の通りである:L-L;Eは、存在せず、[(E-(Eによって与えられる6つの(6)残基のストリングは以下の通りである:L-L-L-A-S-L;E10は、存在せず、E11は、Vであり、E12は、Lであり、E13は、Aであり、E14は存在し、Aであり、E15は存在し、Sである。
配列番号31、32、及び33のバリアント(式IX)
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-(F-(F-[(F-(F-(F)-(F)-(F)-[(F)-(F10)] (式IX)
式中、F~F10は、以下の表8に記載される特性を有し、
Figure 2024511941000011
式中、v及びwは、独立して、0、1、2、又は3(包括的)から選択される整数であり、
x及びyが、独立して、0、1、2、3、又は4から選択され、
zは、1、2、3、4、5、6、7、又は8(包括的)から選択される整数であり、
aは、0又は1である。
いくつかの実施形態では、Fは、約5.4~約11の等電点、約89g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約31のハイドロパシー指標、及び約0.9~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各F及びFは各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Fは、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各F、F、F、及びFは各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Fは、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Fは、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Fは、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、F10は、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、vは、0である。いくつかの実施形態では、vは、1である。いくつかの実施形態では、vは、2である。いくつかの実施形態では、vは、3である。いくつかの実施形態では、wは、0である。いくつかの実施形態では、wは、1である。いくつかの実施形態では、wは、2である。いくつかの実施形態では、wは、3である。いくつかの実施形態では、xは、0である。いくつかの実施形態では、xは、1である。いくつかの実施形態では、xは、2である。いくつかの実施形態では、xは、3である。いくつかの実施形態では、xは、4である。いくつかの実施形態では、yは、0である。いくつかの実施形態では、yは、1である。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、yは、3である。いくつかの実施形態では、yは、4である。いくつかの実施形態では、zは、3~8、4~8、6~8、2~5、又は3~6(全て両端を含む)から選択される整数であってもよい。いくつかの実施形態では、zは、1である。いくつかの実施形態では、zは、2である。いくつかの実施形態では、zは、3である。いくつかの実施形態では、zは、4である。いくつかの実施形態では、zは、5である。いくつかの実施形態では、zは、6である。いくつかの実施形態では、zは、7である。いくつかの実施形態では、zは、8である。いくつかの実施形態では、aは、0であり、[(F)-(F10)]によって与えられる残基は存在しない。いくつかの実施形態では、aは、1であり、[(F)-(F10)]によって与えられる残基が存在する。v、w、x、y、及びzの値は各々、独立して選択され、任意の変数v、w、x、y、又はzの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、Fは、M、F、L、A、S、又はRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、E、T、A、C、P、Y、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、E、T、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各F及びFは、独立して、S、Q、R、T、K、H、I、F、L、P、N、G、E、D、A、Y、M、V、W、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各F及びFは、独立して、S、Q、R、T、K、H、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、L、I、V、M、A、F、W、Y、P、C、T、Q、N、S、G、E、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Fは、独立して、L、I、V、M、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各F、F、F、及びFは各々、独立して、A、C、G、S、V、L、T、F、Q、N、P、Y、E、K、H、W、I、M、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各F、F、F、及びFは各々、独立して、A、C、G、S、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、F10は、P、C、Y、M、V、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。本明細書に記載するように、v、w、x、y、及びzのうちのいずれか1つが、1よりも大きい整数である実施形態では、v、w、x、y、及びzによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。
式IIIに関して概説されるように、[(F-(Fによって与えられる式IXの部分は、[(F-(F]の「z」回繰り返しとして解釈されるべきではなく、むしろ、「z」回拡張された場合、各x及びyは、上記に提供される整数から独立して選択でき、各F及びFは、上記に提供される適切なアミノ酸から独立して選択され得る。
したがって、例えば、zが、3である、式IXの式F-(F-(F-[(F-(F-(F)-(F)-(F)-[(F)-(F10)]を考慮する場合、式IXの式は、以下のように記述されることを想定することができ、
-(F-(F-(F-(F-(F-(F-(F-(F-(F)-(F)-(F)-[(F)-(F10)]
式中、各x及びyは、独立して、0、1、2、3、又は4から選択され、各F及びFは、独立して、上記に概説した適切なアミノ酸から選択される。
いくつかの実施形態では、配列番号31の配列は、以下のように式IXから導き出すことができる:vは、3であり、wは、0であり、xは、1であり、yは、1であり、zは、6であり、aは、1であり、Fは、メチオニンであり、3つの(3)F残基のストリングは、以下の通りである。K-S-S;Fは、存在せず、[(F-(Fによって与えられる12個の(12)残基のストリングは以下の通りである:L-L-L-L-A-L-L-A-L-A-A-L;Fは、Aであり、Fは、Sであり、Fは、Aであり、Fは存在し、Aであり、F10は存在し、Pである。
いくつかの実施形態では、配列番号32の配列は、以下のように式IXから導き出すことができる:vは、2であり、wは、0であり、xは、1であり、yは、1であり、zは、6であり、aは、1であり、Fは、メチオニンであり、2つの(2)F残基のストリングは以下の通りである。K-S;Fは、存在せず、[(F-(Fによって与えられる12個の(12)残基のストリングは以下の通りである。S-L-L-L-L-L-L-A-L-A-S-L;Fは、Aであり、Fは、Lであり、Fは、Aであり、Fは存在し、Aであり、F10は存在し、Pである。
いくつかの実施形態では、配列番号33の配列は、以下のように式IXから導き出すことができる:vは、3であり、wは、0であり、xは、1であり、yは、1であり、zは、7であり、aは、1であり、Fは、メチオニンであり、3つの(3)F残基のストリングは、以下の通りである。K-S-S;Fは、存在せず、[(F-(Fによって与えられる14個の(14)残基のストリングは以下の通りである:S-L-L-L-L-A-L-L-A-L-L-A-A-L;Fは、Aであり、Fは、Sであり、Fは、Aであり、Fは存在し、Aであり、F10は存在し、Pである。
配列番号70、71、72、及び73のバリアント(式XIII)
いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12 (式XIII)
式中、L~L12は、以下の表9に記載される特性を有し、
Figure 2024511941000012
式中、
xは、1、2、又は3であり、
yは、1、2、3、又は4であり、
zは、5、6、7、8、9、又は10であり、
各aは、独立して、0又は1である。
いくつかの実施形態では、Lは、メチオニンである。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各L及びLは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各L、L、及びLは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各L、L、L10、及びL11は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L10は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L11は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L12は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、xは、1である。いくつかの実施形態では、xは、2である。いくつかの実施形態では、xは、3である。いくつかの実施形態では、yは、1である。いくつかの実施形態では、yは、2である。いくつかの実施形態では、yは、3である。いくつかの実施形態では、yは、4である。いくつかの実施形態では、zは、5である。いくつかの実施形態では、zは、6である。いくつかの実施形態では、zは、7である。いくつかの実施形態では、zは、8である。いくつかの実施形態では、zは、9である。いくつかの実施形態では、zは、10である。いくつかの実施形態では、aは、0である。いくつかの実施形態では、aは、1である。任意の変数x、y、z、及びaの値は各々、独立して選択され、任意の変数x、y、z、又はaの値は、他の変数に対して選択された値とは独立していることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、Lは、メチオニンである。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、S、N、Q、R、T、K、P、G、E、H、D、A、C、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、S、N、Q、R、T、K、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、L、F、I、W、V、T、M、Y、P、C、A、Q、N、S、G、E、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、L、F、I、W、V、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、A、T、G、S、C、P、I、L、F、R、V、Q、Y、K、N、E、D、H、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、A、T、G、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、S、N、Q、R、T、K、P、G、E、H、D、A、C、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、S、N、Q、R、T、K、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、L、F、I、W、V、T、M、Y、P、C、A、Q、N、S、G、E、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Lは、独立して、L、F、I、W、V、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、Lは、A、T、G、S、C、P、I、L、F、R、V、Q、Y、K、N、E、D、H、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、A、T、G、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、存在しない。いくつかの実施形態では、Lが、存在する。いくつかの実施形態では、Lは、L、F、I、W、V、T、M、Y、P、C、A、Q、N、S、G、E、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Lは、L、F、I、W、V、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L10は、存在しない。いくつかの実施形態では、L10が、存在する。いくつかの実施形態では、L10は、A、T、G、S、C、P、I、L、F、R、V、Q、Y、K、N、E、D、H、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L10は、A、T、G、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L11は、存在しない。いくつかの実施形態では、L11が、存在する。いくつかの実施形態では、L11は、A、T、G、S、C、P、I、L、F、R、V、Q、Y、K、N、E、D、H、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L11は、A、T、G、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L12は、存在しない。いくつかの実施形態では、L12が、存在する。いくつかの実施形態では、L12は、P、T、S、D、C、Y、M、V、A、Q、N、W、G、I、E、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、L12は、P、T、S、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。本明細書に記載するように、x、y、及びzのうちのいずれか1つが、1よりも大きい整数である実施形態では、x、y、及びzによって記載される群中の各アミノ酸は、開示されたアミノ酸の群から独立して選択され、したがって、同一であっても異なっていてもよい。
式IIIに関して概説されるように、[(L-(L-(Lによって与えられる式XIIIの部分は、[(L-(L-(L]の「z」繰り返しとして解釈されるべきではなく、むしろ、「z」回拡張された場合、各aは、上記に提供される整数から独立して選択でき、各L、L、及びLは、上記に提供される適切なアミノ酸から独立して選択され得る。
したがって、例えば、zが、5である、式XIIIの式L-(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12を考慮する場合、式XIIIの式は、以下のように記述されることを想定することができ、
-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12
式中、各aは、独立して、0又は1であり、各L、L、及びLは、独立して、上記に概説したとして適切なアミノ酸から選択される。
いくつかの実施形態では、配列番号70の配列は、以下のように式XIIIから導き出すことができる:xは、1であり、yは、2であり、zは、6であり、Lは、メチオニンであり、Lは、Rであり、[(L-(L内の「a」の4つの例の全てが1であり、[(L-(Lによって与えられる4つの(4)残基のストリングは以下の通りである:S-L-S-L;全ての(Lについて「a」は1であり、全ての(Lについて「a」は0であり、全ての(Lについて「a」は、1であり、[(L-(Lによって与えられる12個の(12)残基のストリングは以下の通りである:A-L-L-L-L-L-A-L-L-A-S-L;Lは、存在せず、Lは存在し、Aであり、Lは存在し、Lであり、L10は存在し、Aであり、L11は存在し、Aであり、L12は存在し、Pである。
いくつかの実施形態では、配列番号71の配列は、以下のように式XIIIから導き出すことができる:xは、1であり、yは、2であり、zは、6であり、Lは、メチオニンであり、Lは、Rであり、[(L-(L内の「a」の4つの例の全てが1であり、[(L-(Lによって与えられる4つの(4)残基のストリングは以下の通りである:L-S-L-S;全ての(Lについて「a」は1であり、全ての(Lについて「a」は0であり、全ての(Lについて「a」は、1であり、[(L-(Lによって与えられる12個の(12)残基のストリングは以下の通りである:L-L-L-L-L-L-A-L-L-A-S-L;Lは、存在せず、Lは存在し、Aであり、Lは存在し、Lであり、L10は存在し、Aであり、L11は存在し、Aであり、L12は存在し、Pである。
いくつかの実施形態では、配列番号72の配列は、以下のように式XIIIから導き出すことができる:xは、1であり、yは、2であり、zは、6であり、Lは、メチオニンであり、Lは、Rであり、[(L-(L内の「a」の4つの例の全てが1であり、[(L-(Lによって与えられる4つの(4)残基のストリングは以下の通りである:L-S-S-L;全ての(Lについて「a」は1であり、全ての(Lについて「a」は0であり、全ての(Lについて「a」は、1であり、[(L-(Lによって与えられる12個の(12)残基のストリングは以下の通りである:L-L-G-L-L-L-A-L-A-A-S-L;Lは、存在せず、Lは存在し、Aであり、Lは存在し、Lであり、L10は存在し、Aであり、L11は存在し、Aであり、L12は存在し、Pである。
いくつかの実施形態では、配列番号73の配列は、以下のように式XIIIから導き出すことができる:xは、1であり、yは、1であり、zは、7であり、Lは、メチオニンであり、Lは、Rであり、[(L-(L内の「a」の両方の例が1であり、[(L-(Lによって与えられる2つの(2)残基のストリングは以下の通りである:L-S;全ての(Lについて「a」は1であり、全ての(Lについて「a」は0であり、全ての(Lについて「a」は、1であり、[(L-(Lによって与えられる14個の(14)残基のストリングは以下の通りである:L-L-L-A-L-L-A-L-L-A-L-A-S-L;Lは、存在せず、Lは存在し、Aであり、Lは存在し、Lであり、L10は存在し、Aであり、L11は存在し、Aであり、L12は存在し、Pである。
配列番号21のバリアント(式VI)
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
-G-G-G-G-G-G-G-G-G10-G11-G12-G13-G14-G15-G16-G17-G18-G19-G20-G21-G22-G23-G24-G25(式VI)
以下の表10は、作製され得る様々な置換を記載し、好ましいアミノ酸に下線を付している。
Figure 2024511941000013
いくつかの実施形態では、Gは、I、L、F、V、A、N、S、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、P、S、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、L、F、I、V、Y、A、S、R、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、V、M、P、Y、A、T、S、N、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、A、G、R、Y、K、D、M、V、W、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、N、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、V、P、A、T、Q、G、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、P、Y、T、Q、S、N、W、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、Gは、F、L、A、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G10は、H、S、N、D、Q、E、T、Y、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G11は、S、R、T、G、K、E、D、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G12は、D、E、Q、N、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G13は、N、S、E、D、T、H、K、A、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G14は、G、S、N、H、E、C、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G15は、S、T、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G16は、E、D、Q、N、S、T、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G17は、W、N、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G18は、L及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G19は、Y、V、A、Q、N、S、E、D、L、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G20は、K、R、S、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G21は、Rである。いくつかの実施形態では、G22は、D、E、N、S、T、G、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G23は、V、P、Y、I、A、E、K、F、T、S、G、D、M、及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G23は、V、P、Y、I、A、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G24は、V、P、Y、I、A、E、K、F、T、S、G、D、M、及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G24は、V、P、Y、I、A、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、G25は、Y、P、A、T、Q、S、E、F、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号21(IPLVANVSFNSDNGSQWLYKRDVVY)のアミノ酸配列を含む。
配列番号22、23、及び24のバリアント(式VII及び式VIII)
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H10-(H11-(H12-(H13-(H14-(H15-(H16-(H17-(H18-(H19-(H20-(H21-(H22-(H23-(H24-(H25-(H26-(H27-(H28-(H29-(H30-(H31-(H32-(H33-(H34-(H35-(H36-H37-H38-H39-H40(式VII)
式中、各mは、独立して、0、1、又は2である。以下の表11は、各位置で使用され得る様々なアミノ酸を記載し、好ましいアミノ酸には下線を付している。
Figure 2024511941000014
いくつかの実施形態では、アミノ酸位置H~H36は、省略されてもよく、又は余分に最大1回繰り返されてもよく(すなわち、0~2回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。更に、任意のアミノ酸位置H~H36の省略又は繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の省略又は繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、式VIIで生成された配列の最小長さは、14個の(14)アミノ酸である。
いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、E、D、S、L、G、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、E、D、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、P、S、R、T、N、G、D、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、P、S、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、W及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、S、N、A、P、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、T、Q、A、E、F、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、L、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、F、V、M、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、V、P、I、A、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、T、G、V、W、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Hは、独立して、T、G、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H10は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H10は、独立して、R、H、S、G、N、E、T、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H11は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H11は、独立して、S、G、D、A、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H12は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H12は、独立して、T、S、E、G、D、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H13は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H13は、独立して、L、M、Y、N、S、D、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H14は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H14は、独立して、D、Q、N、S、K、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H15は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H15は、独立して、E、S、D、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H15は、独立して、E及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H16は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H16は、独立して、I、L、V、M、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H17は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H17は、独立して、T、G、V、W、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H17は、独立して、T、G、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H18は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H18は、独立して、D、E、S、T、K、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H19は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H19は、独立して、Y、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H20は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H20は、独立して、N、Q、S、T、R、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H21は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H21は、独立して、S、K、T、A、Y、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H21は、独立して、S及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H22は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H22は、独立して、T、Q、S、D、C、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H23は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H23は、独立して、G、S、K、N、H、D、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H24は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各H24は、独立して、I、L、V、P、N、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H25は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H25は、独立して、A、T、G、R、Y、L、F、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H25は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各H26は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H26は、独立して、V、I、F、M、L、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H26は、独立して、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H27は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H27は、独立して、D、E、Q、N、S、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H28は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H28は、独立して、P、S、R、T、N、G、D、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H28は、独立して、P、S、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H29は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H29は、独立して、E、D、T、A、Y、M、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H30は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H30は、独立して、T、Q、A、E、F、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H30は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各H31は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H31は、独立して、F、W、V、M、S、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H32は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H32は、独立して、H、S、E、G、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H33は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H33は、独立して、A、T、G、R、Y、L、F、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H33は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各H34は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H34は、独立して、S、K、T、A、Y、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H34は、独立して、S及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H35は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H35は、独立して、R、K、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各H36は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各H36は、独立して、H、R、S、T、A、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、H37は、K、Q、D、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、H38は、R、K、T、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、H39は、D、N、S、T、K、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、H40は、V、I、F、M、L、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、H40は、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号22、23、及び24からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I10-(I11-(I12-(I13-(I14-(I15-(I16-(I17-I18-I19-I20-I21-I22-I23 (式VIII)
式中、各mは、独立して、0、1、又は2であり、各xは、独立して、0、1、2、3、又は4である。以下の表12は、各位置で使用され得る様々なアミノ酸を記載し、好ましいアミノ酸は下線を付している。
Figure 2024511941000015
いくつかの実施形態では、アミノ酸位置I~I、I、I、I12、I15、及びI17は、省略されてもよく、又は余分に最大1回繰り返されてもよく(すなわち、0~2回含まれる)、各繰り返しは独立して、示されるアミノ酸から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置I、I11、I13、I14、及びI16は、省略されてもよく、又は余分に最大3回繰り返されてもよく(すなわち、0~4回含まれる)、各繰り返しは独立して、示されるアミノ酸から選択される。更に、任意のアミノ酸位置1~9及び11~17の省略又は繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の省略又は繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、式VIIIを使用して生成された配列の最小長さは、17アミノ酸である。
いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、S、Q、E、A、I、G、V、R、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、A、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、T、S、E、R、P、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、T、N、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、P、A、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、S、Q、E、A、I、G、V、R、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、A、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、T、S、K、H、Y、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、F、L、W、A、T、M、Y、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、F、L、W、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Iは、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I10は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I10は、独立して、G、S、N、E、D、A、K、H、C、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I10は、独立して、G及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I11は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I11は、独立して、I、L、V、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I12は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I12は、独立して、T、N、A、E、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I13は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I13は、独立して、E、Q、S、T、R、K、A、L、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I13は、独立して、Eである。いくつかの実施形態では、各I14は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I14は、独立して、T、S、Q、F、A、G、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I14は、独立して、T及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I15は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I15は、独立して、F、L、W、A、T、M、Y、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I15は、独立して、F、L、W、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I16は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I16は、独立して、G、S、N、E、D、A、K、H、C、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I16は、独立して、G及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I17は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各I17は、独立して、I、L、V、N、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各I17は、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、I18は、R、K、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、I18は、Rである。いくつかの実施形態では、I19は、H、R、S、N、T、A、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、I20は、K、N、Q、D、E、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、I21は、R、K、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、I21は、Rである。いくつかの実施形態では、I22は、D、N、S、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、I23は、V、I、L、F、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。
一次配列番号34、35、36、37、及び38(式X)のバリアント
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J10-(J11-(J12-(J13-(J14-(J15-(J16-(J17-(J18-(J19-(J20-(J21-J22-J23-J24-J25 (式X)
式中、各zは、独立して、0、1、2、3、4、又は5である。以下の表13は、各位置で使用され得る様々なアミノ酸を記載し、好ましいアミノ酸は下線を付している。
Figure 2024511941000016
Figure 2024511941000017
いくつかの実施形態では、アミノ酸位置J~J21は、省略されてもよく、又は余分に最大4回繰り返されてもよく(すなわち、0~5回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。更に、任意のアミノ酸位置J~J21の省略又は繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の省略又は繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。
いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、H、K、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、D、E、N、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、G、A、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、F、I、P、A、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、S、R、T、G、K、E、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、T、S、A、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、D、E、N、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、Y、C、A、W、I、S、E、D、F、L、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Jは、独立して、H、K、N、D、G、T、A、C、Y、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J10は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J10は、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J10は、独立して、L、V、A、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J11は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J11は、独立して、I、W、V、Y、P、T、N、S、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J12は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J12は、独立して、A、G、Q、N、R、Y、E、D、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J13は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J13は、独立して、I、L、W、V、M、Y、P、A、S、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J14は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J14は、独立して、V、C、L、F、A、T、N、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J15は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J15は、独立して、G、S、R、K、A、T、H、E、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J16は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J16は、独立して、D、E、Q、S、H、T、R、G、Y、V、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J17は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J17は、独立して、E、S、G、Y、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J18は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J18は、独立して、A、S、P、H、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J19は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J19は、独立して、N、E、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J20は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J20は、独立して、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J20は、独立して、Rである。いくつかの実施形態では、各J21は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各J21は、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J21は、独立して、L、V、A、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各J22は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、J22は、K、R、D、T、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、J23は、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、J24は、S、N、G、E、D、P、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、J25は、A、T、S、Y、M、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号34、35、36、37、及び38からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一次配列番号34、35、36、37、及び38(式XI)のバリアント
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K10-(K11-(K12-(K13-(K14-(K15-(K16-(K17-(K18-(K19-(K20-(K21-(K22-(K23-(K24-(K25-(K26-(K27-(K28-(K29-(K30-(K31-(K32-(K33-(K34-(K35-(K36-(K37-(K38-(K39-(K40-(K41-(K42-(K43-(K44-(K45-(K46-(K47-(K48-(K49-(K50-(K51-(K52-(K53-(K54-(K55-(K56-(K57-(K58-(K59-(K60-(K61-(K62-(K63-(K64-(K65-(K66-(K67-(K68-(K69-(K70-(K71-(K72-(K73-(K74-(K75-(K76-(K77-(K78-(K79-(K80-(K81-(K82-(K83-(K84-(K85-(K86-(K87-(K88-K89-K89-K89-K89-K89 (式XI)
式中、bは各々、独立して、0、1、2、又は3である。以下の表14は、各位置で使用され得る様々なアミノ酸を記載し、好ましいアミノ酸は下線を付している。
Figure 2024511941000018
Figure 2024511941000019
Figure 2024511941000020
Figure 2024511941000021
Figure 2024511941000022
いくつかの実施形態では、アミノ酸位置K~K88は、省略されてもよく、又は余分に最大2回繰り返されてもよく(すなわち、0~3回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。更に、任意のアミノ酸位置K~K88の省略又は繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の省略又は繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。
いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、S、G、D、A、C、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、Q、S、E、T、R、K、G、A、Y、M、V、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、R、G、N、D、A、P、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、E、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、S、Q、R、T、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、N、Q、R、H、K、A、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立してAである。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Kは、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K10は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K10は、独立して、K、H、E、A、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K11は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K11は、独立して、S、T、K、E、A、C、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K12は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K12は、独立して、K、R、H、S、Q、D、E、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K13は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K13は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K13は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K14は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K14は、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K14は、独立して、D、Q、S、G、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K15は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K15は、独立して、C、A、M、V、S、E、G、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K16は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K16は、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K16は、独立して、R、K、S、Q、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K17は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K17は、独立して、A、G、S、Q、Y、E、D、H、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K18は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K18は、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K18は、独立して、R、K、S、Q、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K19は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K19は、独立して、E、D、T、H、K、G、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K20は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K20は、独立して、F、L、I、V、M、T、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K21は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K21は、独立して、E、D、S、G、A、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K22は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K22は、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K22は、独立して、D、T、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K23は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K23は、独立して、G、S、N、E、D、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K24は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K24は、独立して、T、S、E、G、P、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K25は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K25は、独立して、K、S、G、T、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K26は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K26は、独立して、S、G、K、E、D、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K27は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K27は、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K27は、独立して、P及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K28は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各K28は、独立して、E、D、Q、S、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K29は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K29は、独立して、A、T、S、E、V、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K30は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K30は、独立して、K、H、S、G、N、Q、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K31は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K31は、独立して、L、F、V、P、A、N、G、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K32は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K32は、独立して、A、G、N、P、R、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K33は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K33は、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K33は、独立して、R及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K34は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K34は、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K34は、独立して、E、S、T、V、及びIを含む群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K35は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K35は、独立して、A、T、Q、P、R、V、N、E、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K35は、独立して、A、T、Q、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K36は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K36は、独立して、R、K、H、G、Q、D、T、Y、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K37は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K37は、独立して、D、E、N、T、C、Y、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K38は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K38は、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K38は、独立して、S、Q、R、T、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K39は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各K39は、独立して、K、S、G、Q、D、E、A、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K40は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K40は、独立して、H、K、S、D、E、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K41は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K41は、独立して、A、T、S、N、P、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K42は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K42は、独立して、K、D、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K43は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K43は、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、
及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K43は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K44は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K44は、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K44は、独立して、L及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K45は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K45は、独立して、G、S、K、N、T、Q、D、A、P、L、F、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K45は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K46は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K46は、独立して、L、F、Q、S、G、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K47は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K47は、独立して、S、R、E、A、P、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K48は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K48は、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K48は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各K49は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K49は、独立して、E、S、T、R、G、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K50は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K50は、独立して、S、N、R、A、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K51は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K51は、独立して、G、A、T、H、M、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K52は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K52は、独立して、S、T、H、A、C、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K53は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K53は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K53は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K54は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K54は、独立して、S、H、Y、F、N、Q、R、T、G、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K54は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各K55は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K55は、独立して、A、T、Q、E、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K56は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K56は、独立して、S、N、E、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K57は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K57は、独立して、D、S、R、K、A、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K58は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K58は、独立して、K、S、G、D、T、L、R、E、Y、及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K58は、独立して、K、S、G、D、T、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K59は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K59は、独立して、S、R、G、A、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K60は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K60は、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K60は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各K61は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K61は、独立して、R、S、G、N、E、T、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K62は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K62は、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K63は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K63は、独立して、A、G、S、Q、R、E、D、V、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K63は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各K64は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K64は、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K64は、独立して、E、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K65は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K65は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K65は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K66は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K66は、独立して、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K66は、独立して、A、G、P、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K67は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K67は、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K67は、独立して、T、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K68は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K68は、独立して、I、V、P、及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K69は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K69は、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K69は、独立して、D、Q、S、G、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K70は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K70は、独立して、G、S、R、N、T、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K71は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K71は、独立して、E、D、N、S、T、H、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K72は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K72は、独立して、L、I、W、V、A、T、S、E、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K73は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K73は、独立して、G、S、K、A、C、F、N、T、Q、D、P、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K73は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各K74は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K74は、独立して、A、S、N、P、K、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K75は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K75は、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K75は、独立して、P及びAからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K76は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K76は、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K76は、独立して、L及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K77は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K77は、独立して、M、V、Y、L、A、N、E、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K78は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K78は、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K78は、独立して、D、T、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K79は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K79は、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K79は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各K80は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K80は、独立して、K、R、S、A、P、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K81は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K81は、独立して、F、L、V、A、T、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K82は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K82は、独立して、L、F、M、A、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K83は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K83は、独立して、D、S、H、A、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K84は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K84は、独立して、A、T、Q、S、R、V、L、G、H、F、K、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K84は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各K85
は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K85は、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K85は、独立して、T、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K86は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K86は、独立して、A、P、R、Y、K、D、M、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K87は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K87は、独立して、N、S、D、T、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K88は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各K88は、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各K88は、独立して、R及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K89は、K、R、H、G、E、T、Y、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K90は、R、S、G、N、Q、A、Y、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K90は、Rである。いくつかの実施形態では、K91は、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K92は、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K92は、A、G、P、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、K93は、E、D、Q、S、R、K、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。
配列番号74のバリアント(式XIV)
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M10-(M11-(M12-(M13-(M14-(M15-(M16-(M17-(M18-(M19-(M20-(M21-(M22-(M23-(M24-(M25-(M26-(M27-(M28-(M29-(M30-(M31-(M32-(M33-(M34-(M35-(M36-(M37-(M38-(M39-(M40-(M41-(M42-(M43-(M44-(M45-(M46-(M47-(M48-(M49-(M50-(M51-(M52-(M53-(M54-(M55-(M56-(M57-(M58-(M59-(M60-(M61-(M62-(M63-(M64-(M65-(M66-(M67-(M68-(M69-(M70 (式XIV)
式中、各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、各cは、独立して、1又は2である。以下の表15は、各位置で使用され得る様々なアミノ酸を記載し、好ましいアミノ酸は下線を付している。
Figure 2024511941000023
Figure 2024511941000024
Figure 2024511941000025
Figure 2024511941000026
Figure 2024511941000027
Figure 2024511941000028
いくつかの実施形態では、アミノ酸位置M~M66は、省略されてもよく、又は余分に最大2回繰り返されてもよく(すなわち、0~3回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。任意のアミノ酸位置M~M66の省略又は繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の省略又は繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置M67~M70は、余分に最大1回繰り返されてもよく(すなわち、1~2回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。任意のアミノ酸位置M67~M70の繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。
いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、A、T、C、S、Y、E、H、V、W、I、L、F、G、Q、N、P、R、K、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、G、S、R、A、T、Q、E、D、C、Y、I、L、及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、R、H、N、Q、E、A、Y、M、V、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Rである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、P、Y、A、T、Q、S、G、D、R、K、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、H、P、F、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、G、S、H、P、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、N、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Mは、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各M10は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M10は、独立して、Q、E、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M11は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M11は、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M11は、独立して、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M12は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M12は、独立して、S、G、A、N、Q、R、T、K、E、H、D、P、I、F、V、C、Y、L、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M12は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M13は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M13は、独立して、T、Q、N、S、D、P、F、A、E、G、H、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M13は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M14は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M14は、独立して、L、F、I、V、M、Y、A、T、Q、N、S、D、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M14は、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各M15は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M15は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M15は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M16は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M16は、独立して、T、S、A、E、G、C、R、P、Y、M、V、W、I、F、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M16は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M17は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M17は、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M17は、独立してDである。いくつかの実施形態では、各M18は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各M18は、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M18は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各M19は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M19は、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M19は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M20は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M20は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M20は、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各M21は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M21は、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M21は、独立して、Fである。いくつかの実施形態では、各M22は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M22は、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M22は、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各M23は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M23は、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M23は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M24は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M24は、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M24は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M25は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M25は、独立して、F、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M25は、独立して、Fである。いくつかの実施形態では、各M26は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M26は、独立して、T、P、F、Q、N、S、A、E、G、D、K、Y、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M26は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M27は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M27は、独立して、D、E、Q、N、S、T、R、K、G、A、Y、P、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M27は、独立してDである。いくつかの実施形態では、各M28は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各M28は、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M28は、独立してTである。いくつかの実施形態では、各M29は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各M29は、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M29は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M30は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M30は、独立して、D、Q、N、H、K、G、C、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M31は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各M31は、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M31は、独立して、Fである。いくつかの実施形態では、各M32は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M32は、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M32は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M33は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M33は、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M33は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各M34は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M34は、独立して、T、A、V、I、P、F、Q、N、S、E、G、D、K、Y、C、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M34は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M35は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M35は、独立して、G、S、R、N、H、D、P、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群か
ら選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M35は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各M36は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M36は、独立して、T、Q、S、A、E、D、K、H、P、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M36は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M37は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M37は、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M37は、独立して、Iである。いくつかの実施形態では、各M38は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M38は、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、C、P、R、Y、E、V、W、T、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M38は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各M39は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M39は、独立して、S、T、E、P、V、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M39は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M40は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M40は、独立して、T、S、A、D、P、M、Q、E、K、H、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M40は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M41は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M41は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M41は、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各M42は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M42は、独立して、P、Y、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M43は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M43は、独立して、S、E、P、V、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M43は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M44は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M44は、独立して、N、Q、S、E、D、T、H、K、G、A、P、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M45は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M45は、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M45は、独立して、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M46は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各M46は、独立して、A、T、S、N、R、Y、K、D、H、M、L、F、G、Q、C、P、E、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M46は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各M47は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M47は、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M47は、独立して、Iである。いくつかの実施形態では、各M48は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M48は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M48は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M49は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M49は、独立して、F、V、A、T、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M50は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M50は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M50は、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各M51は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M51は、独立して、G、S、R、H、D、P、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M51は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各M52は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M52は、独立して、T、N、S、G、C、R、H、A、D、P、M、Q、E、K、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M52は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各M53は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M53は、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M53は、独立して、Iである。いくつかの実施形態では、各M54は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M54は、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M54は、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各M55は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M55は、独立して、D、E、Q、N、S、K、G、A、Y、P、F、T、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M55は、独立して、Dである。いくつかの実施形態では、各M56は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M56は、独立して、L、F、I、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M56は、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各M57は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M57は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M57は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M58は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M58は、独立して、P、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M59は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M59は、独立して、N、Q、S、E、D、T、R、K、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M60は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M60は、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M60は、独立して、Gである。いくつかの実施形態では、各M61は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M61は、独立して、S、P、V、T、A、R、K、E、H、C、Y、I、F、L、N、Q、G、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M61は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M62は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M62は、独立して、P、K、A、Y、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M62は、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各M63は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M63は、独立して、A、G、S、N、E、K、D、H、M、V、W、I、L、F、T、R、Y、Q、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M63は、独立して、Aである。いくつかの実施形態では、各M64は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M64は、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M64は、独立して、Dである。いくつかの実施形態では、各M65は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M65は、独立して、L、V、F、I、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M65は、独立して、Lである。いくつかの実施形態では、各M66は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各M66は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、V、C、Y、I、F、L、Q、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M66は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各M67は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M67は、独立して、K、R、H、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M68は、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M68は、独立して、R、K、H、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M69は、独立して、S、A、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M69は、独立して、S、A、N、Q、R、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M70は、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、C、R、K、H、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各M70は、独立して、T、Q、N、S、A、及びEからなる群から選択されるアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号74のアミノ酸配列を含む。
配列番号75のバリアント(式XV)
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、以下により表されるアミノ酸配列を含み、
(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N10-(N11-(N12-(N13-(N14-(N15-(N16-(N17-(N18-(N19-(N20-(N21-(N22-(N23-(N24-(N25-(N26-(N27-(N28-(N29-(N30-(N31-(N32-(N33-(N34-(N35-(N36-(N37-(N38-(N39-(N40-(N41-(N42-(N43-(N44-(N45-(N46-(N47-(N48-(N49-(N50-(N51-(N52-(N53-(N54-(N55-(N56-(N57-(N58-(N59-(N60-(N61-(N62-(N63-(N64-(N65-(N66-(N67-(N68-(N69-(N70-(N71 (式XV)
式中、各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、各cは、独立して、1又は2である。以下の表16は、各位置で使用され得る様々なアミノ酸を記載し、好ましいアミノ酸は下線を付している。
Figure 2024511941000029
Figure 2024511941000030
Figure 2024511941000031
Figure 2024511941000032
Figure 2024511941000033
Figure 2024511941000034
いくつかの実施形態では、アミノ酸位置N~N66は、省略されてもよく、又は余分に最大2回繰り返されてもよく(すなわち、0~3回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。任意のアミノ酸位置N~N66の省略又は繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の省略又は繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置N67~N71は、余分に最大1回繰り返されてもよく(すなわち、1~2回含まれる)、各繰り返しでは独立して、示されるアミノ酸から選択される。任意のアミノ酸位置N67~N71の繰り返しは、別の位置での任意のアミノ酸の繰り返しとは無関係であることが理解されるべきである。
いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、S、N、D、Q、R、T、G、E、H、A、P、M、V、K、Y、W、F、L、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、I及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、P、V、A、S、N、G、E、L、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、A、G、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各Nは、独立して、F及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N10は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N10は、独立して、T、Q、N、R、K、M、S、E、D、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N10は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N11は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N11は、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N11は、独立して、A、G、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N12は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N12は、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、P、L、M、V、Y、W、F、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N12は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N13は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N13は、独立して、L、F、I、W、V、M、Y、C、A、T、Q、N、S、G、E、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N14は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N14は、独立して、V、I、L、A、T、S、G、R、P、Y、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N14は、独立して、Vである。いくつかの実施形態では、各N15は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N15は、独立して、S、N、Q、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、I、F、L、R、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N15は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N16は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N16は、独立して、T、N、S、A、D、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N16は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N17は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N17は、独立して、S、N、Q、R、K、E、D、A、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N17は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N18は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N18は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N18は、独立して、Vである。いくつかの実施形態では、各N19は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N19は、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、Y、M、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N19は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N20は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N20は、独立して、S、Q、R、K、E、A、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N20は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N21は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N21は、独立して、V、W、I、C、L、F、A、T、S、E、D、K、G、R、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N21は、独立して、Vである。いくつかの実施形態では、各N22は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N22は、独立して、T、Q、N、S、A、D、C、K、P、Y、M、V、W、I、F、G、E、H、R、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N22は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N23は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N23は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N23は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N24は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N24は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N24は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N25は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N25は、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N25は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N26は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N26は、独立して、T、N、D、S、A、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N26は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N27は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N27は、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N27は、独立して、D及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N28は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N28は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N28は、独立してVである。いくつかの実施形態では、各N29は、独立して存在しない。いくつかの実施形態では、各N29は、独立して、T、S、A、D、C、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N29は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N30は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N30は、独立して、P、Y、V、A、T、S、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N30は、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各N31は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N31は、独立して、T、Q、S、A、G、K、H、P、Y、V、I、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N31は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N32は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N32は、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N32は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N33は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N33は、独立して、E、D、Q、N、S、T、H、R、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N34は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N34は、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N34は、独立して、D及びN
からなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N35は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N35は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N35は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N36は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N36は、独立して、G、S、K、A、T、Q、D、C、P、Y、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N37は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N37は、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N37は、独立して、F及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N38は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N38は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N38は、独立して、Vである。いくつかの実施形態では、各N39は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N39は、独立して、L、F、I、W、V、M、C、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N40は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N40は、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N40は、独立して、Pである。いくつかの実施形態では、各N41は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N41は、独立して、D、N、R、G、Y、E、Q、S、H、T、K、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N41は、独立して、D及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N42は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N42は、独立して、S、R、E、A、N、T、G、P、V、Q、K、H、D、Y、M、I、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N42は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N43は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N43は、独立して、G、S、R、K、A、N、Q、H、E、D、P、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N44は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N44は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、N、E、D、C、K、H、R、V、L、M、F、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N44は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N45は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N45は、独立して、S、T、G、A、V、I、R、E、N、P、Q、K、H、D、Y、M、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N45は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N46は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N46は、独立して、Cである。いくつかの実施形態では、各N47は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N47は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、Y、V、W、I、L、Q、M、F、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N47は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N48は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N48は、独立して、G、S、R、K、N、T、Q、H、E、D、P、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N49は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N49は、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N49は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N50は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N50は、独立して、V、A、T、S、G、I、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N50は、独立して、Vである。いくつかの実施形態では、各N51は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N51は、独立して、A、T、G、S、Q、N、R、Y、E、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N52は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N52は、独立して、D、E、Q、N、S、T、K、A、Y、P、M、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N53は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N53は、独立して、A、T、C、G、S、N、P、R、K、D、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N54は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N54は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N54は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N55は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N55は、独立して、E、D、N、T、R、K、G、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N56は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N56は、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、W、K、C、Y、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N56は、独立して、A、G、及びQからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N57は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N57は、独立して、Y、C、N、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N58は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N58は、独立して、S、T、G、H、A、P、Y、V、F、L、N、R、K、E、D、W、I、Q、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N58は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N59は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N59は、独立して、I、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N59は、独立して、I及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N60は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N60は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N61は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N61は、独立して、G、S、R、K、A、N、T、Q、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N62は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N62は、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N62は、独立して、I及びVからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N63は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N63は、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N63は、独立して、Tである。いくつかの実施形態では、各N64は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N64は、独立して、S、N、Q、R、G、K、E、D、P、Y、W、F、T、H、A、V、L、I、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N64は、独立して、Sである。いくつかの実施形態では、各N65は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N65は、独立して、A、C、G、S、Q、N、R、Y、E、K、D、H、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N66は、独立して、存在しない。いくつかの実施形態では、各N66は、独立して、V、I、A、T、S、G、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N66は、独立して、Vである。いくつかの実施形態では、各N67は、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N67は、独立して、S、N、Q、R、及びTからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N68は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N68は、独立して、K、R、H、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N69は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N69は、独立して、K、R、H、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N70は、独立して、D、E、Q、N、S、H、T、R、K、G、A、C、Y、P、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N70は、独立して、D、E、Q及びNからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N71は、独立して、A、T、C、G、S、Q、N、P、R、Y、E、K、D、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である。いくつかの実施形態では、各N71は、独立して、A、T、C、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号75のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式Iのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式Vのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IXのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式XIIIのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号68、配列番号69、又は式XIIのアミノ酸配列を更に含む。
いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号1のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号2のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号3のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号4のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号6のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号7のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号8のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号10のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号11のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号12のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号13のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号14のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号15のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号16のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号28のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号31のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号32のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号33のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号55のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号70のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号71のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号72のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号73のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、及び式XVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式VIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式VIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式VIIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式Xのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式XIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式XIVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式XVのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、34、35、36、37、38、56、57、58、74、及び75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号68、配列番号69、又は式XIIのアミノ酸配列を更に含む。
いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号18のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号19のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号20のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号21のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号22のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号23のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号24のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号25のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号27のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号29のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号34のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号35のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号36のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号37のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号38のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号56のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号57のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号58のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号74のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号75のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、プレタンパク質+プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プレタンパク質+プロタンパク質シグナルペプチドは、配列番号30のアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドが提供され、組換えポリペプチドは、(X-(Y-Zの式を含み、式中、Xは合成プレタンパク質シグナルペプチドであり、Yは合成プロタンパク質シグナルペプチドであり、Zはペイロードタンパク質であり、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることはできない。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、組換えポリペプチドが、(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-Zの式を含む。
いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、ペイロードタンパク質ZのN末端に、配列番号68、配列番号69、又は式XIIのアミノ酸配列を更に含む。いくつかの実施形態では、(X-(Y-Zの式は、(X-(Y-(K-Zで更に記述されてもよく、式中、Xは合成プレタンパク質シグナルペプチドであり、Yは合成プロタンパク質シグナルペプチドであり、Kは配列番号68、配列番号69、及び式XIIからなる群から選択される配列であり、Zはペイロードタンパク質であり、式中、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、pは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることはできない。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(Y)-(K)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(K)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-(K)-Zの式を含む。
いくつかの実施形態では、nは、1であり、Xは、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式Iのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式Vのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IXのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式XIIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、mは、1であり、Yは、式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、及び式XVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式VIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式VIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式VIIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式Xのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式XIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式XIVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式XVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、X及びYは、組み合わされ、プレタンパク質+プロタンパク質シグナルペプチドによって表され、配列番号30のアミノ酸配列と、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、任意のペプチド又はタンパク質である。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号59と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
APVNTTTEDETAQIPAEAVIGYSDLEGDFDVAVLPFSNSTNNGLLFINTTIASIAAKEEGVSLDKREEGEPKSMTNETSDRPLVHFTPNKGWMNDPNGLWYDEKDAKWHLYFQYNPNDTVWGTPLFWGHATSDDLTNWEDQPIAIAPKRNDSGAFSGSMVVDYNNTSGFFNDTIDPRQRCVAIWTYNTPESEEQYISYSLDGGYTFTEYQKNPVLAANSTQFRDPKVFWYEPSQKWIMTAAKSQDYKIEIYSSDDLKSWKLESAFANEGFLGYQYECPGLIEVPTEQDPSKSYWVMFISINPGAPAGGSFNQYFVGSFNGTHFEAFDNQSRVVDFGKDYYALQTFFNTDPTYGSALGIAWASNWEYSAFVPTNPWRSSMSLVRKFSLNTEYQANPETELINLKAEPILNISNAGPWSRFATNTTLTKANSYNVDLSNSTGTLEFELVYAVNTTQTISKSVFADLSLWFKGLEDPEEYLRMGFEVSASSFFLDRGNSKVKFVKENPYFTNRMSVNNQPFKSENDLSYYKVYGLLDQNILELYFNDGDVVSTNTYFMTTGNALGSVNMTTGVDNLFYIDKFQVREVK (配列番号59)
又は配列番号59と実質的に類似しているか、又は配列番号59の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号59と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号59のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号60と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
SMTNETSDRPLVHFTPNKGWMNDPNGLWYDEKDAKWHLYFQYNPNDTVWGTPLFWGHATSDDLTNWEDQPIAIAPKRNDSGAFSGSMVVDYNNTSGFFNDTIDPRQRCVAIWTYNTPESEEQYISYSLDGGYTFTEYQKNPVLAANSTQFRDPKVFWYEPSQKWIMTAAKSQDYKIEIYSSDDLKSWKLESAFANEGFLGYQYECPGLIEVPTEQDPSKSYWVMFISINPGAPAGGSFNQYFVGSFNGTHFEAFDNQSRVVDFGKDYYALQTFFNTDPTYGSALGIAWASNWEYSAFVPTNPWRSSMSLVRKFSLNTEYQANPETELINLKAEPILNISNAGPWSRFATNTTLTKANSYNVDLSNSTGTLEFELVYAVNTTQTISKSVFADLSLWFKGLEDPEEYLRMGFEVSASSFFLDRGNSKVKFVKENPYFTNRMSVNNQPFKSENDLSYYKVYGLLDQNILELYFNDGDVVSTNTYFMTTGNALGSVNMTTGVDNLFYIDKFQVREVK (配列番号60)
又は配列番号60と実質的に類似しているか、又は配列番号60の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号60と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号60のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号61と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACQLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV (配列番号61)
又は配列番号61と実質的に類似しているか、又は配列番号61の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号61と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号61のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号62と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
IKHRLNGFTILEHPDPAKRDLLQDIVTWDDKSLFINGERIMLFSGEVHPFRLPVPSLWLDIFHKIRALGFNCVSFYIDWALLEGKPGDYRAEGIFALEPFFDAAKEAGIYLIARPGSYINAEVSGGGFPGWLQRVNGTLRSSDEPFLKATDNYIANAAAAVAKAQITNGGPVILYQPENEYSGGCCGVKYPDADYMQYVMDQARKADIVVPFISNDASPSGHNAPGSGTSAVDIYGHDSYPLGFDCANPSVWPEGKLPDNFRTLHLEQSPSTPYSLLEFQAGAFDPWGGPGFEKCYALVNHEFSRVFYRNDLSFGVSTFNLYMTFGGTNWGNLGHPGGYTSYDYGSPITETRNVTREKYSDIKLLANFVKASPSYLTATPRNLTTGVYTDTSDLAVTPLIGDSPGSFFVVRHTDYSSQESTSYKLKLPTSAGNLTIPQLEGTLSLNGRDSKIHVVDYNVSGTNIIYSTAEVFTWKKFDGNKVLVLYGGPKEHHELAIASKSNVTIIEGSDSGIVSTRKGSSVIIGWDVSSTRRIVQVGDLRVFLLDRNSAYNYWVPELPTEGTSPGFSTSKTTASSIIVKAGYLLRGAHLDGADLHLTADFNATTPIEVIGAPTGAKNLFVNGEKASHTVDKNGIWSSEVKYAAPEIKLPGLKDLDWKYLDTLPEIKSSYDDSAWVSADLPKTKNTHRPLDTPTSLYSSDYGFHTGYLIYRGHFVANGKESEFFIRTQGGSAFGSSVWLNETYLGSWTGADYAMDGNSTYKLSQLESGKNYVITVVIDNLGLDENWTVGEETMKNPRGILSYKLSGQDASAITWKLTGNLGGEDYQDKVRGPLNEGGLYAERQGFHQPQPPSESWESGSPLEGLSKPGIGFYTAQFDLDLPKGWDVPLYFNFGNNTQAARAQLYVNGYQYGKFTGNVGPQTSFPVPEGILNYRGTNYVALSLWALESDGAKLGSFELSYTTPVLTGYGNVESPEQPKYEQRKGAY (配列番号62)
又は配列番号62と実質的に類似しているか、又は配列番号62の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号62と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号62のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号63と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDYWMYWVRQAPGKGLEWVSEINTNGLITKYPDSVGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCARSPSGFNRGQGTLVTVSS (配列番号63)
又は配列番号63と実質的に類似しているか、又は配列番号63の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号63と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号63のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号64と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK (配列番号64)
又は配列番号64と実質的に類似しているか、又は配列番号64の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号64と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号64のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号65と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
AQSEPELKLESVVIVSRHGVRAPTKATQLMQDVTPDAWPTWPVKLGELTPRGGELLAYLGHYWRQRLVADGLLPKCGCPQSGQVAILADVDERTRKTGEAFAAGLAPDCAITVHTQADTSSPDPLFNPLKTGVCQLDNANVTDAILERAGGSLADFTGHYQTAFRELERVLNFPQSNLCLKREKQDESCSLTQALPSELKVSADCVSLTGAVSLASMLTEIFLLQQAQGMPEPGWGRITDSHQWNTLLSLHNAQFDLLQRTPEVARSRATPLLDLIKTALTPHPPQKQAYGVTLPTSVLFLAGHDTNLANLGGALELNWTLPGQPDNTPPGGELVFERWRRLSDNSQWIQVSLVFQTLQQMRDKTPLSLNTPPGEVKLTLAGCEERNAQGMCSLAGFTQIVNEARIPACSL (配列番号65)
又は配列番号65と実質的に類似しているか、又は配列番号65の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号65と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号65のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号66と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKEWKGIVEQCCTSICSLYQLENYCN (配列番号66)
又は配列番号66と実質的に類似しているか、又は配列番号66の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号66と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号66のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号67と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
GPETLCGAELVDALQFVCGPRGFYFNKPTGYGSSIRRAPQTGIVDECCFRSCDLRRLEMYCAPLKPTKAARSIRAQRHTDMPKTQKEVHLKNTSRGSAGNKTYRM (配列番号67)
又は配列番号67と実質的に類似しているか、又は配列番号67の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号67と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号67のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号85と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACQLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV (配列番号85)
又は配列番号85と実質的に類似しているか、又は配列番号85の活性断片である。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号85と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号85のアミノ酸配列を含む。
本明細書の実施形態のいずれかでは、Zは、親和性タグを更に含み得る。親和性タグは、例えば、タンパク質の精製又は検出のために利用することができる。親和性タグは、親和性タグが利用される当技術分野で既知の任意の方法に利用され得る。親和性タグは当技術分野で公知であり、任意のそのような親和性タグを利用することができる。利用され得る親和性タグの非限定的な例としては、6XHIS、FLAG、GST、MBP、ストレプトアビジンペプチド、GFPなどが挙げられる。いくつかの実施形態では、精製又は検出に利用され得る任意のペプチド配列を利用することができる。
いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドが、(X-(Y-Zの式を含み、式中、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、式中、n及びmは同時に0であることができず、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、及びZは、配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、及び85からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、構成要素X、Y、及びZは、直接融合している。いくつかの実施形態では、構成要素X、Y、及びZは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介して間接的に融合している。
いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、ペイロードタンパク質ZのN末端に配列番号68のアミノ酸配列を更に含む。いくつかの実施形態では、(X-(Y-Zの式は、(X-(Y-(K-Zで更に記述されてもよく、式中、Xは、合成プレタンパク質シグナルペプチドであり、Yは、合成プロタンパク質シグナルペプチドであり、Kは、配列番号68、配列番号69、及び式XIIからなる群から選択される配列であり、Zは、ペイロードタンパク質であり、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、pは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることができない。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(Y)-(K)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(K)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-(K)-Zの式を含む。
いくつかの実施形態では、核酸が提供される。いくつかの実施形態では、核酸は、本明細書に提供される組換えポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、合成シグナルペプチド及びペイロードタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、本明細書に提供される通りである。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、本明細書に提供される通りである。
いくつかの実施形態では、操作された酵母が提供される。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、(X-(Y-Zの式を有する組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変され、式中、Xは合成プレタンパク質シグナルペプチドであり、Yは合成プロタンパク質シグナルペプチドであり、Zはペイロードタンパク質であり、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることができない。
いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、ペイロードタンパク質ZのN末端に配列番号68のアミノ酸配列を更に含む。いくつかの実施形態では、(X-(Y-Zの式は、(X-(Y-(K-Zで更に記述されてもよく、式中、Xは、合成プレタンパク質シグナルペプチドであり、Yは、合成プロタンパク質シグナルペプチドであり、Kは、配列番号68、配列番号69、及び式XIIからなる群から選択される配列であり、Zは、ペイロードタンパク質であり、式中、nは、0又は1であり、mは、0又は1であり、pは、0又は1であり、n及びmは、同時に0であることができない。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが0であり、mが1であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(Y)-(K)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが0であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(K)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、pが0であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-Zの式を含む。いくつかの実施形態では、nが1であり、mが1であり、pが1であり、組換えポリペプチドが、(X)-(Y)-(K)-Zの式を含む。
いくつかの実施形態では、nが、1であり、Xが、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式Iのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式Vのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式IXのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、式XIIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Xは、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、mは、1であり、Yは、式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、及び式XVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式VIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式VIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式VIIIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式Xのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式XIのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式XIVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、式XVのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Yは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、Zは、任意のペプチド又はタンパク質である。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、Zは、配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、及び67からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、及び85からなる群から選択されるアミノ酸配列と、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、又は少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、Zは、配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、及び85からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、構成要素X、Y、及びZは、直接融合している。いくつかの実施形態では、構成要素X、Y、及びZは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介して間接的に融合している。
いくつかの実施形態では、X、Y、及びZの同一性は、利用される酵母の菌株によって影響を受ける。いくつかの実施形態では、酵母の菌株は、本明細書に提供される任意の酵母である。いくつかの実施形態では、酵母は、Kluyveromyces、Pichia、Saccharomyces、Trichoderma、及びAspergillusからなる群から選択される。具体的な酵母、X、Y、及びZの組み合わせを以下に記載し、提供する。以下に提供される実施形態は、単に例示的であり、いかなる方法でも本発明の範囲を限定することを意図するものではないことが理解されるべきである。したがって、特定の実施形態は、特定のプレタンパク質又はプロタンパク質の配列番号の使用について言及していない場合があり得るが、これは、特定の配列番号が特定の酵母での使用から除外されると解釈されるべきではない。更に、特定の実施形態は、任意の合成プレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドを含めることについて言及していない場合があり得るが、これは、プレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドが特定の酵母での使用から除外されると解釈されるべきではない。例えば、組換えポリペプチドが特定の酵母での使用について記載され、その組換えポリペプチドが合成プレタンパク質シグナルペプチドドメイン及びペイロードタンパク質ドメインを含むと言われている場合には、これは合成プロタンパク質シグナルドメインが特定の酵母には含まれ得ないと解釈されるべきではない。同様に、使用について記載される組換えポリペプチドが特定の酵母であり、その組換えポリペプチドが合成プロタンパク質シグナルペプチドドメイン及びペイロードタンパク質ドメインを含むと言われる場合には、これは合成プレタンパク質シグナルドメインが特定の酵母には含まれ得ないと解釈されるべきではない。
Kluyveromyces酵母における合成プレタンパク質シグナルペプチド及びそれらの使用
いくつかの実施形態では、Kluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)からのペイロードタンパク質の分泌を促進するために、ペイロードタンパク質に融合され得る合成プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、Kluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的のいずれかで融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変され得る。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子は、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むペプチドをコードする任意の核酸分子である。例えば、配列番号39は、配列番号1のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドをコードするために使用され得る。前述の例は、いかなる方法でも限定することを意図するものではないことを理解されたい。当業者であれば、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドの発現を誘導するであろう好適なヌクレオチド配列の開発方法を理解するであろう。いくつかの実施形態では、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むシグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチド又は本明細書に開示される合成シグナルペプチドに直接的又は間接的に融合されてもよい。
いくつかの実施形態では、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、Kluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と、式I 配列番号1のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Kluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)をこの核酸分子で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、配列番号1の合成シグナルペプチドをコードする核酸分子は、配列番号39である。いくつかの実施形態では、式I又は配列番号1の合成シグナルペプチドアミノ酸をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、Kluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸を提供することと、Kluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質とシグナルペプチドα-MF、又はSUC2、PHO5、若しくはHSAなどの任意の他の一般的に利用されるシグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを使用するKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)により分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を産生及び分泌させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に接続される。
いくつかの実施形態では、操作されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)が提供され、酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される接続リンカーペプチド配列を介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。いくつかの実施形態では、配列番号1のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドをコードするために使用される核酸分子は、配列番号39によって与えられる。いくつかの実施形態では、式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドをコードするために使用される核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定するものではなく、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
Pichia酵母における合成プレタンパク質シグナルペプチド及びそれらの使用
いくつかの実施形態では、酵母種Pichia(例えば、P.pastoris)で使用するための合成プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、Pichia酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変され得る。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルは、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7により表されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に間接的に融合され、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介して接続される。いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6若しくは7をコードする任意の核酸を利用して、合成シグナルペプチドの発現を誘導することができる。-当業者であれば、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7によって表される合成プレタンパク質シグナルの発現を誘導するであろう好適なヌクレオチド配列の開発方法を理解するであろう。いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7の合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチド又は本明細書に開示される合成シグナルペプチドに直接的又は間接的に更に融合されてもよい。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチドに更に融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に開示される合成シグナルペプチドに更に融合される。いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7の合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、34、35、36、37、38、56、57、及び58からなる群から選択される合成プロタンパク質シグナルペプチドに更に融合される。いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7の合成プレタンパク質シグナルペプチドは、配列番号17によって表される合成プロタンパク質シグナルペプチドに更に融合される。
いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、いくつかの実施形態では、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)をこの核酸分子で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、Pichia酵母からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)をこの核酸で遺伝的に改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質とプレタンパク質シグナルペプチドα-MF(配列番号27により表されるアミノ酸配列からなるα-MF)とを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変されたPichia酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を産生及び分泌させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、操作されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)が提供され、酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸で遺伝子改変される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定するものではなく、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
Saccharomyces酵母における合成プレタンパク質シグナルペプチド及びそれらの使用
別の実施形態では、酵母種Saccharomyces(例えば、S.boulardii又はS.cerevisiae)で使用するための合成プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、S.cerevisiae酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変され得る。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。いくつかの実施形態では、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16をコードする任意の核酸を利用して、合成プレタンパク質シグナルペプチドの発現を誘導することができる。当業者であれば、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドの発現を誘導するであろう好適な核酸を開発する方法を理解するであろう。いくつかの実施形態では、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチドに直接的又は間接的に融合されてもよい。いくつかの実施形態では、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドは、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24などの本明細書に開示される合成シグナルペプチドに直接的又は間接的に融合されてもよい。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然又は合成のプロタンパク質シグナルペプチドに直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介して、天然又は合成のプロタンパク質シグナルペプチドに間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、又は16のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、Saccharomyces酵母を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Saccharomyces酵母をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、Saccharomyces酵母からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Saccharomyces酵母をこの核酸で遺伝的に改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質とプレタンパク質シグナルペプチドα-MF若しくは酵母アスパラギン酸プロテアーゼ3(YAP)とを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変されたSaccharomyces酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を産生及び分泌させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、操作されたSaccharomyces酵母(例えば、S.boulardii又はS.cerevisiae)が提供され、酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定せず、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
Trichoderma酵母における合成プレタンパク質シグナルペプチド及びそれらの使用
いくつかの実施形態では、酵母種Trichoderma(例えば、T.reesei又はT.viride)で使用するための合成プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、Trichoderma酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変され得る。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。いくつかの実施形態では、式IX又は配列番号31、32、若しくは33をコードする任意の核酸分子を利用して、合成シグナルペプチドの発現を誘導することができる。当業者であれば、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドの発現を誘導するであろう好適なヌクレオチド配列の開発方法を理解するであろう。いくつかの実施形態では、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチド又は本明細書に開示される合成シグナルペプチドに直接的又は間接的に更に融合されてもよい。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチドに更に融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に開示される合成シグナルペプチドに更に融合される。
いくつかの実施形態では、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、Trichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、T. reesei酵母をこの核酸分子で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、Trichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Trichoderma酵母をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質と、本明細書に提供される天然のプレタンパク質シグナルペプチド配列又は本明細書に提供される対照のプレタンパク質シグナルペプチド配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変されたTrichoderma酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を分泌するのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、操作されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)が提供され、酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定せず、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
合成プレタンパク質シグナルペプチド及びその使用は、Aspergillus酵母株である。
いくつかの実施形態では、酵母種Aspergillus(例えば、A.niger)で使用するための合成プレタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、Aspergillus酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変され得る。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。いくつかの実施形態では、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73をコードする任意の核酸分子を利用して、合成シグナルペプチドの発現を誘導することができる。当業者であれば、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドの発現を誘導するであろう好適なヌクレオチド配列の開発方法を理解するであろう。いくつかの実施形態では、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチド又は本明細書に開示される合成シグナルペプチドに直接的又は間接的に更に融合されてもよい。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然の構成的プロタンパク質シグナルペプチドに更に融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に開示される合成シグナルペプチドに更に融合される。
いくつかの実施形態では、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、Aspergillus酵母(例えば、A.niger)を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Aspergillus酵母をこの核酸分子で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、Aspergillus酵母(例えばA.niger)からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、Aspergillus酵母をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質と、本明細書に提供される天然のプレタンパク質シグナルペプチド配列又は本明細書に提供される対照のプレタンパク質シグナルペプチド配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変されたAspergillus酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を分泌するのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、対照プレタンパク質シグナルペプチドは、次のものである:
MSFRSLLALSGLVCTGLA(配列番号76)
いくつかの実施形態では、対照プレタンパク質シグナルペプチドは、以下の配列番号77により表される、グルコアミラーゼタンパク質である。
MSFRSLLALSGLVCTGLANVISKRATLDSWLSNEATVARTAILNNIGADGAWVSGADSGIVVASPSTDNPDYFYTWTRDSGLVLKTLVDLFRNGDTSLLSTIENYISAQAIVQGISNPSGDLSSGAGLGEPKFNVDETAYTGSWGRPQRDGPALRATAMIGFGQWLLDNGYTSTATDIVWPLVRNDLSYVAQYWNQTGYDLWEEVNGSSFFTIAVQHRALVEGSAFATAVGSSCSWCDSQAPEILCYLQSFWTGSFILANFDSSRSGKDANTLLGSIHTFDPEAACDDSTFQPCSPRALANHKEVVDSFRSIYTLNDGLSDSEAVAVGRYPEDTYYNGNPWFLCTLAAAEQLYDALYQWDKQGSLEVTDVSLDFFKALYSDAATGTYSSSSSTYSSIVDAVKTFADGFVSIVETHAASNGSMSEQYDKSDGEQLSARDLTWSYAALLTANNRRNSVVPASWGETSASSVPGTCAATSAIGTYSSVTVTSWPSIVATGGTTTTATPTGSGSVTSTSKTTATASKTSTSTSSTSCTTPTAVAVTFDLTATTTYGENIYLVGSISQLGDWETSDGIALSADKYTSSDPLWYVTVTLPAGESFEYKFIRIESDDSVEWESDPNREYTVPQACGTSTATVTDTWR (配列番号77)
いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、操作されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)が提供され、酵母は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された合成プレタンパク質シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの発現をコードする核酸分子で遺伝子改変される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プレタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定せず、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
Saccharomyces、Pichia、及びKluyveromyces酵母株における合成プロタンパク質シグナルペプチド
いくつかの実施形態では、上述のプレタンパク質シグナルペプチドとの組み合わせでの使用に対する適合性に加えて、合成プレタンパク質シグナルペプチドなしでも使用され得る、様々な合成プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列を含むことができ、それらのいずれかは、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Pichia(例えば、P.pastoris)、及び/又はKluyveromyces(例えば、K.lactis)などの本明細書に提供される任意の酵母株で使用され得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのみを含み得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、任意の天然の構成的プレタンパク質シグナルペプチドを更に含み得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、本明細書に記載される任意の合成プレタンパク質シグナルペプチドを更に含み得る。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチド(天然又は合成)と組み合わせて使用される場合、プロタンパク質シグナルペプチドのN末端は、プレタンパク質シグナルペプチドのC末端に直接的又は間接的に融合されてもよい。プロタンパク質シグナルペプチドは、次いで、任意選択的にKR部位、Ste13切断部位、及び/又はスペーサーを介して、ペイロードタンパク質のN末端に直接的又は間接的に融合され得る。いくつかの実施形態では、間接的融合は、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを含めることを介して達成され得る。
したがって、いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドが提供され、このペプチドは、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、プレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、天然シグナルペプチドである。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、合成シグナルペプチドである。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、又は24のアミノ酸配列を含む合成プロタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、酵母株を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と、式VI、式VII、式VIII又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、酵母をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、酵母株は、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Pichia(例えば、P.pastoris)、及び/又はKluyveromyces(例えば、K.lactis)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、酵母株からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プロタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、酵母をこの核酸分子で遺伝的に改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質と天然のプロタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を分泌させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、酵母株は、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Pichia(例えば、P.pastoris)、及び/又はKluyveromyces(例えば、K.lactis)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、若しくは24のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質は、天然のプレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質は、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定せず、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
Trichoderma酵母株における合成プロタンパク質シグナルペプチド
いくつかの実施形態では、上述のプレタンパク質シグナルペプチドとの組み合わせでの使用に対する適合性に加えて、合成プレタンパク質シグナルペプチドなしでも使用され得る、様々な合成プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むことができ、それらのいずれかは、Trichoderma株内の任意の酵母種(例えば、T.reesei、T.viride)で使用され得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列のみを含み得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、任意の天然の構成的プレタンパク質シグナルペプチドを更に含み得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドのいずれかを更に含み得る。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチド(天然又は合成)と組み合わせて使用される場合、プロタンパク質シグナルペプチドのN末端は、プレタンパク質シグナルペプチドのC末端に直接的又は間接的に融合されてもよい。プロタンパク質シグナルペプチドは、次いで、任意選択的にKR部位、Ste13切断部位、及び/又はスペーサーを介して、ペイロードタンパク質のN末端に直接的又は間接的に融合され得る。いくつかの実施形態では、間接的融合は、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを含めることを介して達成され得る。
したがって、いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドが提供され、この合成シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、プレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプレタンパク質シグナルペプチドである。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドである。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含む合成プロタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、酵母株を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、酵母をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、酵母株は、Trichoderma酵母株(例えば、T.reesei、T.viride)である。いくつかの実施形態では、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、酵母株からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プロタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、酵母をこの核酸分子で遺伝的に改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質と天然のプロタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を分泌させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、酵母株は、Trichoderma酵母株(例えば、T.reesei、T.viride)である。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、天然のプレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定せず、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
Aspergillus酵母株における合成プロタンパク質シグナルペプチド及びそれらの使用
いくつかの実施形態では、上述のプレタンパク質シグナルペプチドとの組み合わせでの使用に対する適合性に加えて、合成プレタンパク質シグナルペプチドなしでも使用され得る、様々な合成プロタンパク質シグナルペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、プロタンパク質シグナルペプチドは、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むことができ、それらのいずれも、Aspergillus株内の任意の酵母種(例えば、A.niger)で使用され得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列のみを含み得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、任意の天然の構成的プレタンパク質シグナルペプチドを更に含み得る。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドのいずれかを更に含み得る。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチド(天然又は合成)と組み合わせて使用される場合、プロタンパク質シグナルペプチドのN末端は、プレタンパク質シグナルペプチドのC末端に直接的又は間接的に融合されてもよい。プロタンパク質シグナルペプチドは、次いで、任意選択的にKR部位、Ste13切断部位、及び/又はスペーサーを介して、ペイロードタンパク質のN末端に直接的又は間接的に融合され得る。いくつかの実施形態では、間接的融合は、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを含めることを介して達成され得る。
したがって、いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドが提供され、この合成シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、プレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、天然のプレタンパク質シグナルペプチドである。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドである。いくつかの実施形態では、プレタンパク質シグナルペプチドは、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含む合成プロタンパク質シグナルペプチドと、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、ペイロードタンパク質が産生される酵母によってより容易に分泌されることをもたらす。したがって、別の実施形態では、酵母株を用いてペイロードタンパク質を産生する方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、酵母をこの核酸で遺伝子改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、組換えポリペプチドを発現させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、酵母株は、Aspergillus酵母株(例えば、A.niger)である。いくつかの実施形態では、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列をコードする核酸分子は、当該アミノ酸配列をコードする任意の核酸分子である。
いくつかの実施形態では、酵母株からのペイロードタンパク質の細胞外分泌を増加させる方法が提供され、方法は、ペイロードタンパク質と合成プロタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子を提供することと、酵母をこの核酸分子で遺伝的に改変し、それによって、操作された酵母を生成することと、ペイロードタンパク質と天然のプロタンパク質シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量と比較した場合に、増加した量のペイロードタンパク質を分泌させるのに効果的な条件下で操作された酵母を培養することと、を含む。いくつかの実施形態では、酵母株は、Aspergillus酵母株(例えば、A.niger)である。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、天然のプレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、本明細書に提供される合成プレタンパク質シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、合成プロタンパク質シグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるペプチドリンカーを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、任意のペプチド又はタンパク質であってもよい。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、酵素(例えば、インベルターゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、リゾチーム、An-PEP)、成長因子(例えば、IGF-1)、インスリン、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド)、粘膜タンパク質(例えば、トレフォイル因子、Reg3タンパク質、スーパーオキシドジスムターゼ)、農業用製品(例えば、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質を含む群から選択される。列挙された例は、明確にするためにのみ提供されており、いかなる方法でも限定することを意図するものではない。したがって、例えば、本開示は、「成長因子」についてIGF-1に限定せず、むしろ当技術分野で既知の全ての成長因子を包含し、含む。
操作された酵母を生成する方法
特定の酵母株を遺伝子改変して、その酵母における任意のペイロードタンパク質又はペプチドの分泌を増加させるために使用できる合成シグナルペプチドが、本明細書に提供される。様々な好適なシグナルペプチドが上記に開示され、以下の表17に詳述される様々な合成プレタンパク質シグナル及び合成プロタンパク質シグナルを含むシグナルペプチドの具体例が示されている。
Figure 2024511941000035
Figure 2024511941000036
前の表に列挙された好適な株は、例示を目的とし、排他的なものではない。したがって、表は、「好適な株」が、列挙されたプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドを使用することができる唯一の株であることを示唆するものとして解釈されるべきではない。むしろ、「好適な株」は、列挙されたプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドを使用することができる株の一例に過ぎない。
いくつかの実施形態では、任意の合成シグナル配列は、追加のプロタンパク質シグナルペプチド配列を含まずに、合成プレタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73)のみを含んでもよい。いくつかの実施形態では、任意の合成シグナル配列は、任意の天然のプロタンパク質ペプチド又はその一部(例えば、プロα-MF)に融合されたプレタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73)を含んでもよい。いくつかの実施形態では、任意の合成シグナル配列は、任意の合成プロタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74又は75)又はその一部に融合されたプレタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73)を含んでもよい。いくつかの実施形態では、任意の合成シグナル配列は、追加のプレタンパク質シグナルペプチド配列を含まずに合成プロタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75)のみを含んでもよい。いくつかの実施形態では、任意の合成シグナルペプチドは、任意の天然のプレタンパク質シグナルペプチド又はその一部(例えば、プレα-MF、SUC2プレ)に融合されたプロタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75)を含んでもよい。いくつかの実施形態では、任意の合成シグナル配列は、任意の合成プレタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73)又はその一部に融合されたプロタンパク質シグナルペプチド(例えば、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75)を含んでもよい。合成シグナル伝達ペプチドにその全体又は一部が組み込まれ得るシグナルペプチドの他の例には、HSp150、PHO1、PHO5、SUC2、KILM1、GGP1、SUN、PLB、CRH、EXG、AGA2、HAS pre-pro、PIR1、XPR2 pre、XPR2 pre-pro、pGKL、SCW、及びDSEが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドを含む組換え型ポリペプチドを発現する操作された酵母を生成する方法が提供され、方法は、酵母を提供することと、酵母を合成シグナルペプチドを含む組換え型ポリペプチドをコードする核酸分子と接触させることと、酵母を遺伝子改変して組換えポリペプチドの発現を誘導するのに好適な条件下で酵母を培養し、それによって操作された酵母を生成することと、を含む。
酵母は、これらに限定されないが、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)などの任意の酵母株であってもよい。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドの発現の誘導することは、当業者に公知の任意の発現系を介して実施され得る。例えば、いくつかの実施形態では、操作された酵母を生成する方法は、組換えポリペプチドをコードする核酸(例えば、RNA、DNA)を含有するベクターを調製することと、宿主酵母にベクターを輸送することと(「遺伝子改変」)、組換えポリペプチドを発現させるのに有効な条件下で酵母を培養することと、を含み得る。本明細書で使用される場合、「ベクター」という用語は、それが連結されている他のヌクレオチドを輸送することができるヌクレオチド分子を指す。ベクターの典型的なタイプの1つは「プラスミド」であり、これは追加のDNA切片をライゲーションすることができる環状二本鎖DNAループを表す。別のタイプのベクターはウイルスベクターであり、追加のDNA切片をウイルスゲノムとライゲーションすることができる。DNAを酵母に導入する方法は、当業者に公知であり、形質転換法、トランスフェクション方法、エレクトロポレーション法、核注入法、又はリポソーム、ミセル、皮膚細胞などの担体、又はプロトプラストを使用する融合法などを挙げることができる。組換えポリペプチドをコードする組換え核酸は、ゲノム若しくはcDNAライブラリーからの単離、PCRによる増幅、又は化学合成を含む、当業者に公知の従来技術を使用して、任意の供給源から得ることができる。
いくつかの実施形態では、操作された酵母は、酵母の健康を維持するのに効果的な環境で一定期間、酵母の増殖を誘導するために培養され、それによって合成シグナルペプチド及びペイロードタンパク質を含む所望の量の組換えポリペプチドを生成することができる。酵母の培養は、一般的に行われており、当技術分野で周知である。一般に、酵母は、細菌ペプトン、酵母抽出物、及びグルコースを含む培養培地の存在下で、ブロス又は寒天中で増殖させることができる。アミノ酸、緩衝剤、多糖類、及び塩などの補助成分も、株及び用途に応じて使用される場合がある。操作された酵母は、室温で増殖させることができ、又はより効果的には最大約30℃~37℃の温度で増殖させることができる。温度は、酵母細胞の増殖を制御し、所望の組換えポリペプチドの産生を調節するために使用され得る。したがって、いくつかの実施形態では、酵母は、約4℃~約50℃の温度で増殖させ得る。列挙された温度範囲は、その範囲内の任意の温度範囲を含む。したがって、いくつかの実施形態では、酵母は、約4℃~約40℃、約10℃~約50℃、約10℃、~約45℃、約15℃、~約45℃、約20℃~約45℃、約25℃~約45℃、約30℃~約50℃、約35℃~約50℃、約37℃~約50℃、約40℃~約50℃、又は約45℃~約50℃の温度で増殖させ得る。同様に、列挙された範囲には、その範囲内のあらゆる個々の温度が含まれる。したがって、いくつかの実施形態では、酵母は、約4℃の温度で増殖させ得る。いくつかの実施形態では、酵母は、約50℃の温度で増殖させ得る。いくつかの実施形態では、酵母は、約4℃、約5℃、約6℃、約7℃、約8℃、約9℃、約10℃、約11℃、約12℃、約13℃、約14℃、約15℃、約16℃、約17℃、約18℃、約19℃、約20℃、約21℃、約22℃、約23℃、約24℃、約25℃、約26℃、約27℃、約28℃、約29℃、約30℃、約31℃、約32℃、約33℃、約34℃、約35℃、約36℃、約37℃、約38℃、約39℃、約40℃、約41℃、約42℃、約43℃、約44℃、約45℃、約46℃、約47℃、約48℃、約49℃、又は約50℃の温度で増殖させ得る。更に、当業者であれば、利用する酵母株及び産生される組換えポリペプチドに応じて、増殖条件に対する更なる改変が必要である可能性があることを認識するであろう。このような改変は、本出願の範囲内である。いずれの場合も、宿主酵母によるペイロードタンパク質の分泌により、その周囲の培養培地におけるペイロードタンパク質の蓄積をもたらし、次いで、そこで収集、単離、及び/又は定量化され得る。様々な細胞内機構を介して、ペイロードタンパク質は、それが融合された合成シグナルペプチドの一部若しくは全部とともに、又はそれらなしに、細胞外分泌される。
いくつかの実施形態では、操作された酵母によって産生され得るタンパク質は、いずれかのタンパク質が含まれる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される操作された酵母によって産生され得るタンパク質は、これらに限定されないが、マルトース結合タンパク質(MBP)、トレフォイル因子、ムチン、DNase、凝固因子又は血液増量因子(blood volumizing factor)、インスリン及びインスリン類似体、インクレチン(例えば、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン)、EGFP、PDGF、HB-EGF、α1-アンチトリプシン、血清アルブミン、コラーゲン、ペプシノゲン、腫瘍壊死因子、ストレプトキナーゼ、グルカゴン、レピルジン、デシルジン、ヒルジン、エンカランチド(encallantide)、IFN-α 2b、抗原及び抗体(例えば、抗IL-6R Ab、抗RSV ab、破傷風毒素断片C、An-PEP、HIV-1 gp120(細胞内)、HIV-1 gp120(分泌物)、Bm86ダニ腸糖タンパク質、マウス単鎖抗体、抗TNF Ab、がん抗体、sHBsAg)、酵素(例えば、リゾチーム、インベルターゼ、ガラクタナーゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、キチニアーゼ(chitiniase)、キシラナーゼ、カタラーゼ、D-アラニンカルボキシペプチダーゼ、α-アミラーゼ、アスパラギン酸プロテイナーゼII、ガラクトシダーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、ラスブリカーゼ、オクリプラスミン、パンクレリパーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ(I及びII)、ホスホグリセリン酸キナーゼ(phosphoglyserate kinase)、GADPH、酸性ホスファターゼ)、酵素阻害剤(例えば、クニッツプロテアーゼ阻害剤、ダニ抗凝固タンパク質、ギランテン(ghilanten)、tPAグリングル2型ドメイン)、ホルモン(例えば、HGH、卵胞刺激ホルモン、ヒト副甲状腺ホルモン)、ワクチン(例えば、肝炎ワクチン(I)、HPVワクチン)、食品加工製品(例えば、ブラゼイン、キモシン(chymocin)、ベータ-ガラクトシダーゼ)、及びサイトカインが含まれる。
いくつかの実施形態では、酵母によるペイロードタンパク質の分泌は、本明細書に開示される合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドの一部としてペイロードタンパク質を発現するように酵母を遺伝子改変することによって増加する。したがって、いくつかの実施形態では、操作された酵母は、天然シグナルペプチドを発現する酵母よりも約10%~約200%多いペイロードタンパク質を分泌し得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、約10%~約50%多い、約20%~約70%多い、約30%~約90%多い、又は約50%~約200%多いペイロードタンパク質を発現し得る。ペイロードタンパク質分泌の増加の任意の個々のパーセンテージが、本明細書に記載される実施形態内に包含されることが理解されるべきである。したがって、いくつかの実施形態では、酵母は、約10%多いペイロードタンパク質を分泌し得る。いくつかの実施形態では、酵母は、約20%多いペイロードタンパク質を分泌し得る。いくつかの実施形態では、酵母は、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約100%、約110%、約120%、約130%、約140%、約150%、約160%、約170%、約180%、約190%、若しくは約200%多い、又は列挙されたパーセンテージのいずれかに含まれる任意のパーセンテージの、ペイロードタンパク質を分泌し得る。当業者であれば、特定の対象の組換えポリペプチドの発現に関する日常的な最適化中の増殖条件の変化が、操作された酵母によって分泌されるペイロードタンパク質の量にも影響を与え得ることを認識するであろう。したがって、いくつかの実施形態では、操作された酵母は、少なくとも10%多いペイロードタンパク質を分泌し得る。したがって、いくつかの実施形態では、操作された酵母は、天然シグナルペプチドを発現する酵母と比較して、約10%多い、約100%多い、約500%多い、約1000%多い、又は約10,000%多いペイロードタンパク質を分泌し得る。いくつかの実施形態では、分泌は、酵母が増殖した培養培地中のペイロードタンパク質の濃度を測定することによって測定される。濃度は、酵母の増殖の変動を考慮して、光学密度に対して正規化されてもよい。いくつかの実施形態では、分泌は、ペイロードタンパク質濃度を測定するために当業者に公知の任意の方法によって測定される。
いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、培地からの沈殿、免疫親和性クロマトグラフィー、受容体親和性クロマトグラフィー、又は疎水性相互作用クロマトグラフィーなどの当業者に公知の任意の方法を使用して、操作された酵母が増殖する培養培地から単離することができる。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、親和性クロマトグラフィー、サイズ排除濾過、カチオン又はアニオン交換クロマトグラフィー、高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)、逆相HPLCなどの従来のクロマトグラフィー方法によって単離され得る。
いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、単離を補助し得る特異的結合パートナー又は薬剤によって認識される特異的親和性ペプチド、タグ、標識、又はキレート残基を含むように設計されてもよい。いくつかの実施形態では、次いで、追加のタグ、標識、又は残基を含む組換えポリペプチドバリアントを切断して、ペイロードタンパク質を得てもよい。
合成シグナルペプチド及びその使用方法
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される様々なシグナルペプチドは、任意のペイロードタンパク質を任意の環境に送達するために酵母で利用され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるシグナルペプチドを利用する操作された酵母は、治療用タンパク質、診断用タンパク質、又はタンパク質ベースのワクチンのうちの1つ以上を、それを必要とする対象に送達するために使用され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるシグナルペプチドを利用する操作された酵母は、ペイロードタンパク質を、対象内の特定の器官又は位置に、例えば、対象の消化管、皮膚、生殖管などに送達するために使用され得る。いくつかの実施形態では、対象は、コンパニオンアニマル(例えば、イヌ、ネコ、齧歯類など)などの動物であってもよい。いくつかの実施形態では、対象は、家畜動物(例えば、ウシ、ヒツジ、ウマ、ブタ、ヤギなど)であってもよい。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。
いくつかの実施形態では、操作された酵母は、タンパク質ベースの除草剤、殺真菌剤、殺菌剤、殺虫剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料のうちの1つ以上を、農業環境において、例えば、作物若しくは植物(種子、根、穀粒、塊茎、球根、挿し木(slip)、根茎、草、若しくは蔓など)に、又は植物成長環境(表土、追肥、堆肥、肥やし、地下水面、若しくは水耕タンクなど)に送達するために使用され得る。
いくつかの実施形態では、操作された酵母は、治療用タンパク質、診断用タンパク質、タンパク質ベースのワクチン、腐敗防止剤(例えば、殺菌剤又は殺真菌剤)、タンパク質ベースの風味剤、タンパク質サプリメント、又はアレルゲン分解剤(例えば、グルテン酵素)を送達するために、パン、乳製品、又は発酵飲料などの食品に組み込まれてもよい。
いくつかの実施形態では、操作された酵母は、発酵が望ましい任意の用途又は環境で任意のタンパク質を送達するために使用できる。更なる具体的な使用が、本明細書において以下に記載される。
治療用組成物及びその使用方法
本明細書に開示される合成シグナルペプチド及びそれらの使用方法は、酵母によって発現されるペイロードタンパク質の分泌を促進するために使用され得る。いくつかの実施形態では、ペイロードタンパク質は、治療有効性を有し得、そのため、対象における状態、障害、又は疾患を治療するために使用することができる。したがって、いくつかの実施形態では、提供される、状態、障害、又は疾患の治療を必要とする対象においてそれを行う方法であって、方法は、治療有効量のタンパク質を含む組成物を投与することを含み、このタンパク質は、本明細書に開示される合成プレタンパク質シグナル及び合成プロタンパク質シグナルのうちの一方又は両方を含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変された操作された酵母において産生される。いくつかの実施形態では、投与は、経口又は局所などの任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、組成物は、経口投与される。いくつかの実施形態では、組成物は、局所投与される。
いくつかの実施形態では、治療有効量の治療用ペイロードタンパク質を含む医薬組成物が提供され、この治療用ペイロードタンパク質は、本明細書の任意の態様又は実施形態に開示されるように、合成プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方を含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子で遺伝子改変された操作された酵母によって生成される。いくつかの実施形態では、疾患又は状態には、以下に限定されないが、感染症、自己免疫疾患、酵素欠損症(原発性(先天性)酵素欠損症及び機能性腸障害に続発する酵素欠損症を含む)、糖尿病、肥満、代謝障害、腸内細菌異常増殖症、腸感染症、細菌性膣症、短腸症候群、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、小腸症候群、セリアック病、グルテン不耐症、大腸炎、消化性潰瘍、胃炎、ポリープ、痔核、硬変症、又はがんが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される任意の操作された酵母によって産生される治療用タンパク質を含む組成物は、経口、局所、非経口、又は経皮投与用に製剤化され得る。これらの組成物は、丸薬、錠剤、カプセルと、マイクロカプセル、粉末、サシェ、糖剤、ゲル、液体、懸濁液、溶液、食品、クリーム又は顆粒の形態であってよく、更に1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤、例えば、これらに限定されないが、担体、溶媒、共溶媒、乳化剤、滑沢剤、崩壊剤、結合剤、フィラー、流動促進剤、レオロジー剤、可溶化剤、抗菌剤、抗酸化剤、防腐剤、着色剤、香味剤、皮膚軟化剤、pH調節剤、などを含むことができる。
いくつかの実施形態では、食品には、乳製品、ヨーグルト、アイスクリーム、ミルクベースの飲料、ミルクベース付け合わせ、プリン、ミルクセーキ、アイスティ、フルーツジュース、ダイエットドリンク、ソーダ、スポーツドリンク、栄養補助食品用の粉末飲料混合物、幼児及び乳児用食品、カルシウム補充オレンジジュース、コーヒー又はシロップが含まれ得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、操作された酵母は、対象への薬物送達のための導管として利用され得る。例えば、操作された酵母は、状態、障害、又は疾患を治療するために対象に経口投与されてもよく、操作された酵母は、対象内で治療用タンパク質を産生及び分泌し続け、したがって、対象に治療的利益を提供する。したがって、いくつかの実施形態では、状態、障害、又は疾患の治療を必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、治療有効量の本明細書に記載される操作された酵母を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、対象に経口投与されてもよい。いくつかの実施形態では、状態、障害、又は疾患は、胃腸疾患若しくは状態、局所疾患若しくは状態、又は粘膜疾患若しくは状態を含み得るが、これらに限定されない。例えば疾患は、ウイルス(例えば、ロタウイルス)、細菌、真菌、寄生虫感染症(例えば、以下に限定されないが腸内細菌異常増殖症、細菌性膣症、STI)、自己免疫疾患(例えば、GBS)、酵素欠損症又はビタミン欠乏症(ラクトース不耐症、CSID、セリアック病/グルテン不耐症など)、糖尿病などの代謝障害、炎症性胃腸疾患(例えば、過敏性腸症候群、炎症性腸疾患、大腸炎、胃炎、ポリープ)、治癒/修復が必要とされる他の胃腸状態又は疾患(例えば、消化性潰瘍)、炎症性皮膚状態(例えば、アトピー性皮膚炎、糖尿病性潰瘍)、創傷、短腸症候群、痔核、硬変症、又はがんであり得る。いくつかの実施形態では、投与は、経口又は局所などの任意の経路を介して実施され得る。治療有効量の操作された酵母は、コロニー形成単位(CFU)で測定されてもよく、例えば約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUなどの任意の量であってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
別の実施形態では、本明細書の任意の態様又は実施形態に開示される合成プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、ペイロードタンパク質を含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子で遺伝子改変された操作された酵母を含む医薬組成物が提供される。
いくつかの実施形態では、組成物は、ペイロードタンパク質に直接的又は間接的に融合された、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を含む。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、組成物は、ペイロードタンパク質に直接又は間接的に融合された、a)配列番号2、3、4、5、6、又は7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を含む。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、組成物は、ペイロードタンパク質に直接又は間接的に融合された、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を含む。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、組成物は、ペイロードタンパク質に直接又は間接的に融合された、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を含む。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、組成物は、ペイロードタンパク質に直接又は間接的に融合された、a)式XIII若しくは配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド、及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、ペイロードタンパク質とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸分子で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を含む。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、ペイロードタンパク質に直接融合される。いくつかの実施形態では、一方又は両方のシグナルペプチドは、例えば、本明細書に提供されるリンカーペプチドを介してペイロードタンパク質に間接的に融合される。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、酵素欠損であり、ペイロードタンパク質は、酵素である。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、先天性スクロース・イソマルターゼ欠損症であり、ペイロードタンパク質は、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、機能性腸障害に続発するスクロース不耐症であり、ペイロードタンパク質は、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、機能性腸障害に続発するイソマルターゼ不耐症であり、ペイロードタンパク質は、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、機能性腸障害に続発するスクロース不耐症及びイソマルターゼ不耐症のうちの一方又は両方であり、ペイロードタンパク質は、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、グルテン不耐性、難治性スプルー、又はセリアック病のうちの1つ以上であり、ペイロードタンパク質は、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン(sedolisin)、及びラロゾチド(larozotide)のうちの1つ以上である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、グルテン不耐症であり、ペイロードタンパク質は、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、難治性スプルーであり、ペイロードタンパク質は、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、セリアック病であり、ペイロードタンパク質は、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上である。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、膵炎又は膵外分泌機能不全であり、ペイロードタンパク質は、トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、膵炎であり、ペイロードタンパク質は、トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、膵外分泌機能不全であり、ペイロードタンパク質は、トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上から選択される。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、エンテロペプチダーゼ欠損症又はエンテロキナーゼ欠損症であり、ペイロードタンパク質は、エンテロペプチダーゼ、プロエンテロペプチダーゼ、及びエンテロキナーゼのうちの1つ又は全てである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、エンテロペプチダーゼ欠損症であり、ペイロードタンパク質は、エンテロペプチダーゼ、プロエンテロペプチダーゼ、及びエンテロキナーゼのうちの1つ又は全てである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、エンテロキナーゼ欠損症であり、ペイロードタンパク質は、エンテロペプチダーゼ、プロエンテロペプチダーゼ、及びエンテロキナーゼのうちの1つ又は全てである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、小腸内細菌異常増殖症、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、C.difficile感染症、嚢胞性線維症、壊死性腸炎、及び糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、小腸内細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、炎症性腸疾患であり、ペイロードタンパク質は腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、過敏性腸症候群であり、ペイロードタンパク質は、腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、C.difficile感染症であり、ペイロードタンパク質は、腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、嚢胞性線維症であり、ペイロードタンパク質は、腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、壊死性腸炎であり、ペイロードタンパク質は腸アルカリホスファターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、腸アルカリホスファターゼである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、短腸症候群であり、ペイロードタンパク質は、IGF-1、GLP-2、又はGLP-2の合成誘導体である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、短腸症候群であり、ペイロードタンパク質は、IGF-1である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、短腸症候群であり、ペイロードタンパク質は、GLP-2である。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、短腸症候群であり、ペイロードタンパク質は、GLP-2の合成誘導体である。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、ラクトース過敏症又はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質は、ラクターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、ラクトース過敏症であり、ペイロードタンパク質は、ラクターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、ラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質は、ラクターゼである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、トレハロース過敏症又はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質は、トレハラーゼである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、マルトース過敏症又はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質は、マルターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、マルトース過敏症であり、ペイロードタンパク質はマルターゼである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質はマルターゼである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、悪性貧血であり、ペイロードタンパク質は、内因子である。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、リゾチーム、ナイシン、デフェンシン、マガイニン、カテスリチン(cateslytin)、又はそれらの任意の組み合わせである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、リゾチームである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、ナイシンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、デフェンシンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、マガイニンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質は、カテスリチンである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、1型糖尿病又は2型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インスリン、又はインクレチンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、1型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インスリン、又はインクレチンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、1型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インスリンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、1型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インクレチンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、2型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インスリン、又はインクレチンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、2型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インスリンである。いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、2型糖尿病であり、ペイロードタンパク質は、インクレチンである。
いくつかの実施形態では、疾患又は状態は、炎症性要素を有し、ペイロードタンパク質は、IL-10,IL-22、TGFβ、又はそれらの任意の組み合わせである。
インベルターゼ/スクラーゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療する方法
操作された酵母は、例えば、インベルターゼ及び/又はイソマルターゼの欠損症などの酵素欠損症を治療するために使用され得る。したがって、いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ欠損症及び/又はイソマルターゼ欠損症の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法が提供され、方法は、1)インベルターゼ(又はそのプロドラッグ若しくは活性バリアント)と第1の合成シグナルペプチドとを含む第1の組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母、並びに2)イソマルターゼ(又はそのプロドラッグ若しくは活性バリアント)と第2の合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母、のうちの一方又は両方を対象に経口投与し、それによって、インベルターゼ欠損症及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療することを含む。いくつかの実施形態では、第1及び第2の合成シグナルペプチドは、独立して、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症は、これらに限定されないが、過敏性腸症候群、機能性ディスペプシア、機能性嘔吐、機能性腹痛、機能性便秘、及び/又は機能性下痢などの機能性腸障害に続発し得る。
いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)インベルターゼと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、並びに2)イソマルターゼと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、のうちの1つ以上で遺伝子改変された操作されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)インベルターゼと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、並びに2)イソマルターゼと、a)配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、のうちの一方あるいは両方で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)イソマルターゼと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、並びに2)インベルターゼと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、のうちの一方あるいは両方で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)イソマルターゼと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、並びに2)インベルターゼと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、のうちの一方あるいは両方で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)イソマルターゼと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、並びに2)インベルターゼと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸、のうちの一方あるいは両方で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、スクラーゼ/インベルターゼ及び/又はイソマルターゼ欠損症は、例えば、先天性スクラーゼ・イソマルターゼ欠損症であり得る。対象がスクラーゼ/インベルターゼ欠損症及びイソマルターゼ欠損症の両方を有し、両方の酵素を発現するように操作された酵母を投与することが望まれる任意の実施形態では、同じ酵母株を使用して両方の酵素を発現させてもよく、又は1つの酵母株を使用してインベルターゼを発現させ、別の酵母株を使用してイソマルターゼを発現させてもよい。いくつかの実施形態では、両方の酵素の投与は、両方の酵素を発現するために1つの酵母株を利用して実施される。いくつかの実施形態では、両方の酵素の投与は、インベルターゼを発現する酵母株と、イソマルターゼを発現する別の酵母株を利用して実施される。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
ラクトース不耐症を治療する方法
いくつかの実施形態では、ラクトース欠損症又はラクトース不耐症の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法が提供され、方法は、対象に、ラクトース(又はそのプロドラッグ若しくは活性バリアント)及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を投与し、それによってラクトース欠損症又はラクトース不耐症を治療することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、ラクターゼ欠損症/ラクトース不耐症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、ラクターゼとa)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、ラクターゼ欠損症/ラクトース不耐症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、ラクターゼと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、ラクターゼ欠損症/ラクトース不耐症を治療する方法が提供され、方法は、それを必要とする対象に、ラクターゼとa)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、ラクターゼ欠損症/ラクトース不耐症を治療する方法が提供され、方法は、それを必要とする対象に、ラクターゼとa)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、ラクターゼ欠損症/ラクトース不耐症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、ラクターゼとa)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより欠損症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
膵臓障害を治療する方法
いくつかの実施形態では、膵臓炎又は膵外分泌機能不全などの膵臓障害の治療を必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上と合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与し、それにより障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に提供されるトリアシルグリセロールリパーゼと合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変され、膵炎又は膵外分泌機能不全のうちの一方又は両方を治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に提供されるコリパーゼと合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変され、膵炎又は膵外分泌機能不全のうちの一方又は両方を治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に提供されるアルファ-アミラーゼと合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変され、膵炎又は膵外分泌機能不全のうちの一方又は両方を治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に提供されるトリプシンと合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変され、膵炎又は膵外分泌機能不全のうちの一方又は両方を治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に提供されるキモトリプシンと合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変され、膵炎又は膵外分泌機能不全のうちの一方又は両方を治療するのに有効である。
いくつかの実施形態では、膵炎又は膵外分泌機能不全を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上と、2)a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VII又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、膵炎又は膵外分泌機能不全を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上と、2)a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、膵炎又は膵外分泌機能不全を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上と、2)a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、膵炎又は膵外分泌機能不全を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上と、2)a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、膵炎又は膵外分泌機能不全を治療する方法が提供され、方法は、それを必要とする対象に、1)トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上と、2)a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
セリアック病/グルテン不耐症/難治性スプルーを治療する方法
いくつかの実施形態では、aspergillus nigerプロリルエンドプロテアーゼ(An-PEP)、Myoxococcus xanthusプロリルエンドプロテアーゼ(Mx-PEP)、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上の欠損症の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法であって、方法は、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、並びにラロゾチド(又はそのプロドラッグ若しくは活性バリアント)及び合成シグナルペプチドのうちの1つ以上を含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与することを含み、それにより欠損症を治療することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、An-PEP及び本明細書に提供される合成シグナルペプチドを含み、操作された酵母は、セリアック病、グルテン不耐症、又は難治性スプルーを治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、Mx-PEP及び本明細書に提供される合成シグナルペプチドを含み、操作された酵母は、セリアック病、グルテン不耐症、又は難治性スプルーを治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ及び本明細書に提供される合成シグナルペプチドを含み、操作された酵母は、セリアック病、グルテン不耐症、又は難治性スプルーを治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、サブチリシン及び本明細書で提供される合成シグナルペプチドを含み、操作された酵母は、セリアック病、グルテン不耐症、又は難治性スプルーを治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、セドリシン及び本明細書に提供される合成シグナルペプチドを含み、操作された酵母は、セリアック病、グルテン不耐症、又は難治性スプルーを治療するのに有効である。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、ラロゾチド及び本明細書に提供される合成シグナルペプチドを含み、操作された酵母は、セリアック病、グルテン不耐症、又は難治性スプルーを治療するのに有効である。
いくつかの実施形態では、セリアック病、グルテン不耐症、及び難治性スプルーのうちの1つ以上を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上と、2)a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20、21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより疾患又は障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、セリアック病、グルテン不耐症、及び難治性スプルーのうちの1つ以上を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上と、2)a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21若しくはVar.Seq.6のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより疾患又は障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、セリアック病、グルテン不耐症、及び難治性スプルーのうちの1つ以上を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上と、2)a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより疾患又は障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、セリアック病、グルテン不耐症、及び難治性スプルーのうちの1つ以上を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上と、2)a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより疾患又は障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、セリアック病、グルテン不耐症、及び難治性スプルーのうちの1つ以上を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン、及びラロゾチドのうちの1つ以上と、2)a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより疾患又は障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
エンテロペプチダーゼ/エンテロキナーゼ欠損症を治療する方法
エンテロキナーゼ又はエンテロペプチダーゼ欠損症は、早期乳児期における重度のタンパク質吸収不全を特徴とする常染色体劣性障害であり、本開示に従って操作された酵母によって治療され得る。したがって、いくつかの実施形態では、エンテロキナーゼ/エンテロペプチダーゼ欠損症の治療を必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、エンテロペプチダーゼ(エンテロキナーゼ)及びプロエンテロペプチダーゼのうちの一方又は両方及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与し、それによって障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、エンテロキナーゼ欠損症又はエンテロペプチダーゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)エンテロペプチダーゼ/エンテロキナーゼ及びプロエンテロペプチダーゼのうちの一方又は両方と、2)a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、エンテロキナーゼ欠損症又はエンテロペプチダーゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)エンテロペプチダーゼ/エンテロキナーゼ及びプロエンテロペプチダーゼのうちの一方又は両方と、2)a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、エンテロキナーゼ欠損症又はエンテロペプチダーゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)エンテロペプチダーゼ/エンテロキナーゼ及びプロエンテロペプチダーゼのうちの一方又は両方と、2)a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25、若しくは、のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、エンテロキナーゼ欠損症又はエンテロペプチダーゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)エンテロペプチダーゼ/エンテロキナーゼ及びプロエンテロペプチダーゼのうちの一方又は両方と、2)a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、エンテロキナーゼ欠損症又はエンテロペプチダーゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)エンテロペプチダーゼ/エンテロキナーゼ及びプロエンテロペプチダーゼのうちの一方又は両方と、2)a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより障害を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
小腸内細菌異常増殖症又は細菌感染症を治療する方法
いくつかの実施形態では、細菌感染症又は細菌異常増殖症の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法が提供され、方法は、1)リゾチーム及び腸アルカリホスファターゼの一方又は両方と、2)合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与し、それにより感染又は異常増殖症を治療することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、細菌感染症又は異常増殖症は、糖尿病と関連し得る小腸内細菌異常増殖症、C.difficile感染症、及び嚢胞性線維症に関連する腸内細菌異常増殖症を含み得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、細菌感染症は、Escherichia Coli(E.Coli)、Clostridioides difficile、P.aeruginosa、Shigella、Salmonella、Vibrio cholera、又はcryptosporidiumの感染などであるがこれらに限定されない、任意のグラム陽性又はグラム陰性細菌によって引き起こされ得る。
いくつかの実施形態では、細菌異常増殖症又は感染症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)リゾチーム及び腸アルカリホスファターゼのうちの一方又は両方と、2)a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより感染症又は異常増殖症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、細菌異常増殖症又は感染症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)リゾチーム及び腸アルカリホスファターゼのうちの一方又は両方と、2)a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより感染症又は異常増殖症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、細菌異常増殖症又は感染症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)リゾチーム及び腸アルカリホスファターゼのうちの一方又は両方と、2)a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより感染症又は異常増殖症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、細菌異常増殖症又は感染症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)リゾチーム及び腸アルカリホスファターゼのうちの一方又は両方と、2)a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより感染症又は異常増殖症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、細菌異常増殖症又は感染症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、1)リゾチーム及び腸アルカリホスファターゼのうちの一方又は両方と、2)a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより感染症又は異常増殖症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、操作された酵母によって産生され、したがって対象における細菌異常増殖症又は感染症の治療を提供し得る他の抗菌タンパク質としては、ヒトベータデフェンシン、動物起源のペプチド抗菌剤(例えば、マガイニン、デルマセプチン、カテスリチン)、及び微生物起源のペプチド抗菌剤(例えば、ナイシン、サカシン(sakacin))が挙げられる。いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、リゾチームを発現するように遺伝子改変された操作された酵母を用いた細菌感染症を治療する方法は、操作された酵母と組み合わせて抗菌剤を投与することを更に含み得る。例えば、細菌感染症は、合成シグナルペプチド及びリゾチームを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母と、治療有効量の抗菌剤とを投与することによって治療され得る。いくつかの実施形態では、抗菌剤は、キヌプリスチン、ピペラシリン、ペニシリン、クラリスロマイシン、ニトロフラントイン、シプロフロキサシン、テリスロマイシン、メトロニダゾール、レボフロキサシン、エリスロマイシン、テオフィリン、ゲミフロキサシン、テトラサイクリン、アジスロマイシン、デラフロキサシン、エラバサイクリン、モキシフロキサシン、ダルババンシン、アモキシシリン、フィダキソマイシン、チゲサイクリン、セフトリアキソン、ミノサイクリン、リファペンチン、クリンダマイシン、セフタジジム、オリタヤンシン、ノルフロキサシン、ドキシサイクリン、セフロキシム、トブラマイシン、セフチブテン、ゲンタマイシン、セフォタキシーム、バンコマイシン、テラバンシン、ダプトマイシン、セファレキシン、ホホマイシン(fofomycin)、テジゾリド、アズトレオナム、ナフシリン、フェニトイン、エルタペネム、セファゾリン、イソニアジド、ドリペネム、リファブチン、メロペネム、リネゾリド、オフラキサシン(oflaxacin)、セフォキシチン、オキサシリン、ワーファリン、ネオマイシン、リファンピン、セフェピム、及びジゴキシンを含む群から選択される。いくつかの実施形態では、抗菌剤は、経口、局所、鼻腔内、粘膜、耳、非経口などの任意の経路によって投与することができる。
胃腸障害を治療する方法
いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法が提供され、方法は、腸アルカリホスファターゼ及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害は、炎症性腸疾患(IBD)、過敏性腸症候群(IBS)、及び壊死性腸炎を含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害を治療するための方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、腸アルカリホスファターゼと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害は、IBS、IBD、及び壊死性腸炎を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害を治療するための方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、腸アルカリホスファターゼと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害は、IBS、IBD、及び壊死性腸炎を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害を治療するための方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、腸アルカリホスファターゼと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害は、IBS、IBD、及び壊死性腸炎を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害を治療するための方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、腸アルカリホスファターゼと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害は、IBS、IBD、及び壊死性腸炎を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害を治療するための方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、腸アルカリホスファターゼと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより障害を治療することを含む。いくつかの実施形態では、炎症性胃腸障害は、IBS、IBD、及び壊死性腸炎を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法
操作された酵母は、1型糖尿病及び2型糖尿病などのインスリン欠損症又は障害を治療するために使用できる。したがって、いくつかの実施形態では、1型糖尿病又は2型糖尿病の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法が提供され、方法は、インスリン(又はそのペプチド類似体若しくはプロドラッグ)及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インスリン(又はそのペプチド類似体若しくはプロドラッグ)と、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インスリン(又はそのペプチド類似体若しくはプロドラッグ)と、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インスリン(又はそのペプチド類似体若しくはプロドラッグ)と、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インスリン(又はそのペプチド類似体若しくはプロドラッグ)と、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インスリン(又はそのペプチド類似体若しくはプロドラッグ)と、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより欠損症又は疾患を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
いくつかの実施形態では、1型糖尿病又は2型糖尿病の治療を必要とする対象においてそれを治療する方法が提供され、方法は、インクレチン及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与し、それによって1型糖尿病又は2型糖尿病を治療することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、インクレチンは、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン、ジアグルチド(diaglutide)、エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、シタグリプチン、サキサグリプチン、アログリプチン、リナグリプチン、及びGIPを含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インクレチンと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。いくつかの実施形態では、インクレチンは、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン、ジアグルチド(diaglutide)、エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、シタグリプチン、サキサグリプチン、アログリプチン、リナグリプチン、及びGIPを含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インクレチンと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。いくつかの実施形態では、インクレチンは、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン、ジアグルチド(diaglutide)、エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、シタグリプチン、サキサグリプチン、アログリプチン、リナグリプチン、及びGIPを含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インクレチンと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。いくつかの実施形態では、インクレチンは、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン、ジアグルチド(diaglutide)、エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、シタグリプチン、サキサグリプチン、アログリプチン、リナグリプチン、及びGIP)を含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インクレチンと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより、欠損症又は疾患を治療することを含む。いくつかの実施形態では、インクレチンは、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン、ジアグルチド(diaglutide)、エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、シタグリプチン、サキサグリプチン、アログリプチン、リナグリプチン、及びGIPを含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、インスリン欠損症/糖尿病を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、インクレチンと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより欠損症又は疾患を治療することを含む。いくつかの実施形態では、インクレチンは、GLP-1、GLP-2、レプチン、アペリン、グレリン、PYY、ネスファチン、ジアグルチド(diaglutide)、エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、シタグリプチン、サキサグリプチン、アログリプチン、リナグリプチン、及びGIPを含む群から選択されるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
胃腸上皮を修復する方法
操作された酵母は、例えば、トレフォイル因子(例えば、TFF1/2/3)又はIGF-1の産生を介して、IBD又はIBSなどの任意の疾患又は状態によって引き起こされる胃腸上皮の治癒及び修復を促進するために使用され得る。
したがって、いくつかの実施形態では、胃腸内皮における増殖及び修復を促進することを必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、TFF1、TFF2、TFF3、又はIGF-1のうちの1つ以上及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与し、それにより胃腸内皮における増殖及び修復を促進することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、胃腸の増殖及び修復を促進する方法が提供され、方法は、TFF1、TFF2、TFF3、又はIGF-1と、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより胃腸の増殖及び修復を促進することを含む。
いくつかの実施形態では、胃腸の増殖及び修復を促進する方法が提供され、方法は、TFF1、TFF2、TFF3、又はIGF-1と、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより胃腸の増殖及び修復を促進することを含む。
いくつかの実施形態では、胃腸の増殖及び修復を促進する方法が提供され、方法は、TFF1、TFF2、TFF3、又はIGF-1と、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより胃腸の増殖及び修復を促進することを含む。
いくつかの実施形態では、胃腸の増殖及び修復を促進する方法が提供され、方法は、TFF1、TFF2、TFF3、又はIGF-1と、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより胃腸の増殖及び修復を促進することを含む。
いくつかの実施形態では、胃腸の増殖及び修復を促進する方法が提供され、方法は、TFF1、TFF2、TFF3、又はIGF-1と、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより胃腸の増殖及び修復を促進することを含む。
任意の実施形態では、胃腸上皮の増殖及び/又は修復は、短腸症候群、IBS、IBD、又は胃腸上皮が損傷又は機能不全である任意の他の疾患などの状態又は疾患と関連している可能性がある。いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
短腸症候群を治療する方法
操作された酵母は、短腸症候群を治療するのに使用することができる。したがって、いくつかの実施形態では、短腸症候群の治療を必要とする対象における短腸症候群を治療する方法が提供され、方法は、IGF-1、GLP-2、又はその任意の合成類似体若しくはプロドラッグ、及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列のうちの一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、短腸症候群を治療する方法が提供され、方法は、IGF-1、GLP-2又はその任意の合成類似体若しくはプロドラッグと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20、21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、を含む組換えポリペプチドコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それによって、短腸症候群を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、短腸症候群を治療する方法が提供され、方法は、IGF-1又はその任意の合成類似体若しくはプロドラッグと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それによって、短腸症候群を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、短腸症候群を治療する方法が提供され、方法は、IGF-1、GLP-2又はその任意の合成類似体若しくはプロドラッグと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それによって、短腸症候群を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、短腸症候群を治療する方法が提供され、方法は、IGF-1、GLP-2又はその任意の合成類似体若しくはプロドラッグと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それによって、短腸症候群を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、短腸症候群を治療する方法が提供され、方法は、IGF-1、GLP-2又はその任意の合成類似体若しくはプロドラッグと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それによって、短腸症候群を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
トレハロース過敏症を治療する方法
トレハラーゼ欠損症は、身体が酵素トレハラーゼを欠き、したがってトレハロースをグルコースに変換することができない代謝状態である。したがって、いくつかの実施形態では、トレハラーゼ欠損症の治療を必要とする対象におけるトレハラーゼ欠損症を治療する方法が提供され、方法は、トレハラーゼ(又はそのプロドラッグ若しくは活性バリアント)及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与し、それによって欠損症を治療することを含む。いくつかの実施形態では、前記合成シグナルペプチドが、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列のうちの一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であってもよい。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、トレハロース過敏症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、トレハラーゼと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それによって、トレハロース過敏症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、トレハロース過敏症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、トレハラーゼと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それによって、トレハロース過敏症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、トレハロース過敏症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、トレハラーゼと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)、を投与し、それによって、トレハロース過敏症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、トレハロース過敏症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、トレハラーゼと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それによって、トレハロース過敏症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、トレハロース過敏症を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、トレハラーゼと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それによって、トレハロース過敏症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
悪性貧血を治療する方法
持続性貧血は、それなしではB12を吸収することができない胃タンパク質内因子の欠如に起因する、身体がビタミンB12を適切に利用できないことを特徴とするまれな血液障害である。したがって、いくつかの実施形態では、悪性貧血の治療を必要とする対象において悪性貧血を治療する方法が提供され、方法は、内因子(又はそのプロドラッグ若しくは活性バリアント)と合成シグナルペプチドをと含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であってもよい。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、悪性貧血を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、内因子と、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それによって、悪性貧血を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、悪性貧血を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、内因子と、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それによって、悪性貧血を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、悪性貧血を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、内因子と、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)、を投与し、それによって、悪性貧血を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、悪性貧血を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、内因子と、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それによって、悪性貧血を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、悪性貧血を治療する方法が提供され、方法は、治療を必要とする対象に、内因子と、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それによって、悪性貧血を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
炎症を低減する方法
操作された酵母は、IL-10、IL-22、及び/又はTGFβなどの修復促進サイトカインを産生するために使用でき、これらは様々な疾患及び状態の治療に好適であり得る。更に、操作された酵母は、抗TNFα抗体又は抗TNFα抗体の断片を産生するために使用できる。IL-10、IL-22、TGFβ及び/又は抗TNFα抗体又はその断片の経口投与は、IBS、IBDなどの炎症性GI状態によって引き起こされる損傷を治療及び修復するのに有益であり得る。いくつかの実施形態では、IL-10を発現するように遺伝子改変された操作された酵母は、クローン病を治療するか、又は腫瘍転移を阻害するために、対象に経口投与されてもよい。したがって、いくつかの実施形態では、炎症状態の治療を必要とする対象において炎症状態を治療する方法が提供され、方法は、IL-10、IL-22、TGFβ、及び抗TNFα抗体若しくはその断片、又はその類似体若しくはプロドラッグのうちの1つ以上と、合成シグナルペプチドとを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であってもよい。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、炎症を治療する方法が提供され、方法は、IL-10、IL-22、TGFβ、及び抗TNFα抗体又はその断片、又はその類似体若しくはプロドラッグのうちの1つ以上と、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方と、を含む組換えポリペプチドコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、炎症を治療する方法が提供され、方法は、IL-10、IL-22、TGFβ、及び抗TNFα抗体又はその断片、又はその類似体若しくはプロドラッグのうちの1つ以上と、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、炎症を治療する方法が提供され、方法は、IL-10、IL-22、TGFβ、及び抗TNFα抗体又はその断片、又はその類似体若しくはプロドラッグのうちの1つ以上と、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、炎症を治療する方法が提供され、方法は、IL-10、IL-22、TGFβ、及び抗TNFα抗体又はその断片、又はその類似体若しくはプロドラッグのうちの1つ以上と、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、炎症を治療する方法が提供され、方法は、IL-10、IL-22、TGFβ、及び抗TNFα抗体又はその断片、又はその類似体若しくはプロドラッグのうちの1つ以上と、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
がんの治療方法
操作された酵母は、様々ながん、例えば、限定されないが、消化管のがんを治療するために使用され得る。したがって、いくつかの実施形態では、がんの治療を必要とする対象においてがんを治療する方法が提供され、方法は、1つ以上の抗がん治療及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であってもよい。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、がんを治療する方法が提供され、方法は、1つ以上の抗がん治療薬(anti-cancer therapeutic)と、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、がんを治療する方法が提供され、方法は、1つ以上の抗がん治療薬と、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、がんを治療する方法が提供され、方法は、1つ以上の抗がん治療薬と、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、がんを治療する方法が提供され、方法は、1つ以上の抗がん治療薬と、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、がんを治療する方法が提供され、方法は、1つ以上の抗がん治療薬と、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより炎症を治療することを含む。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
食欲抑制を促進する方法
操作された酵母は、消化及び満腹感において重要な役割を有するペプチドホルモンコレシストキニン(CCK、パンクレオザイミンとしても知られる)の放出を誘導するために使用することができる。管腔CCK放出因子(LCRF)の経口投与は、食欲抑制の促進、胃内容排出の遅延、及び/又は膵臓分泌の誘導に有益であり得る。これらと同じ機能を呈する他のタンパク質としては、カゼインタンパク質及び大豆タンパク質が挙げられる。したがって、LCRF、カゼイン、及び/又は大豆タンパク質の投与は、i)食欲の抑制、及びii)消化の促進を通して、いくつかの消化障害及び肥満の治療に有用であり得る。いくつかの実施形態では、LCRF、カゼイン、及び/又は大豆タンパク質を発現するように遺伝子改変された操作された酵母を、食欲抑制を促進するために対象に経口投与することができる。したがって、いくつかの実施形態では、食欲抑制の促進を必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、LCRF及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドはカゼインを含む。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、大豆タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、食欲抑制を促進する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより食欲抑制を促進する。
いくつかの実施形態では、食欲抑制を促進する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより食欲抑制を促進する。
いくつかの実施形態では、食欲抑制を促進する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより食欲抑制を促進する。
いくつかの実施形態では、食欲抑制を促進する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより食欲抑制を促進する。
いくつかの実施形態では、食欲抑制を促進する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより食欲抑制を促進する。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
胃内容排出の遅延方法
操作された酵母は、消化及び満腹感において重要な役割を有するペプチドホルモンコレシストキニン(CCK、パンクレオザイミンとしても知られる)の放出を誘導するために使用することができる。管腔CCK放出因子(LCRF)の経口投与は、食欲抑制の促進、胃内容排出の遅延、及び/又は膵臓分泌の誘導に有益であり得る。これらと同じ機能を呈する他のタンパク質としては、カゼインタンパク質及び大豆タンパク質が挙げられる。したがって、LCRF、カゼイン、及び/又は大豆タンパク質の投与は、i)食欲の抑制、及びii)消化の促進を通して、いくつかの消化障害及び肥満の治療に有用であり得る。いくつかの実施形態では、LCRF、カゼイン、及び/又は大豆タンパク質を発現するように遺伝子改変された操作された酵母を、食欲抑制を促進するために対象に経口投与することができる。したがって、いくつかの実施形態では、胃内容排出の遅延を必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、LCRF及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドはカゼインを含む。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、大豆タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、胃内容排出の遅延方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより胃内容排出を遅延させる。
いくつかの実施形態では、胃内容排出の遅延方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより胃内容排出を遅延させる。
いくつかの実施形態では、胃内容排出の遅延方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより胃内容排出を遅延させる。
いくつかの実施形態では、胃内容排出の遅延方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより胃内容排出を遅延させる。
いくつかの実施形態では、胃内容排出の遅延方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより胃内容排出を遅延させる。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
膵臓分泌を誘導する方法
操作された酵母は、消化及び満腹感において重要な役割を有するペプチドホルモンコレシストキニン(CCK、パンクレオザイミンとしても知られる)の放出を誘導するために使用することができる。管腔CCK放出因子(LCRF)の経口投与は、食欲抑制の促進、胃排出の遅延、及び/又は膵臓分泌の誘導に有益であり得る。これらと同じ機能を呈する他のタンパク質としては、カゼインタンパク質及び大豆タンパク質が挙げられる。したがって、LCRF、カゼイン、及び/又は大豆タンパク質の投与は、i)食欲の抑制、及びii)消化の促進を通して、いくつかの消化障害及び肥満の治療に有用であり得る。いくつかの実施形態では、LCRF、カゼイン、及び/又は大豆タンパク質を発現するように遺伝子改変された操作された酵母を、食欲抑制を促進するために対象に経口投与することができる。したがって、いくつかの実施形態では、膵臓分泌の誘導を必要とする対象においてそれを行う方法が提供され、方法は、LCRF及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された治療有効量の操作された酵母を、対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドはカゼインを含む。いくつかの実施形態では、組換えポリペプチドは、大豆タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、若しくは73のプレタンパク質アミノ酸配列、及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、若しくは75のプロタンパク質アミノ酸配列の一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、膵臓分泌を誘導する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより膵臓分泌を誘導する。
いくつかの実施形態では、膵臓分泌を誘導する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより膵臓分泌を誘導する。
いくつかの実施形態では、膵臓分泌を誘導する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより膵臓分泌を誘導する。
いくつかの実施形態では、膵臓分泌を誘導する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより膵臓分泌を誘導する。
いくつかの実施形態では、膵臓分泌を誘導する方法が提供され、方法は、LCRFと、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより膵臓分泌を誘導する。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、投与経路は、経口又は局所である。治療有効量の操作された酵母は、例えば、約100CFU~1020CFU、約10~1015CFU、10~1010CFU、又は約10~約10CFUであってもよい。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU~約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約10~約1015CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、約100CFU、約10CFU、又は約10CFU~約10CFU、約1010CFU、約1015CFU、又は約1020CFUである。いくつかの実施形態では、治療有効量の操作された酵母は、上記の範囲のいずれかに含まれる任意の量のCFUである。
操作された酵母の組成物
治療剤として操作された酵母を投与する任意の方法では、操作された酵母は、対象への経口投与に適した組成物に組み込まれ得る。したがって、いくつかの実施形態では、組成物が提供され、組成物は、本明細書に提供される操作された酵母を含む。有利なことに、本明細書に開示されるように、操作された酵母は、凍結乾燥及び/又はフリーズドライ後であっても活性を保持し、消費前の再構成のためのものなどの医薬品に組み込むための特に貯蔵安定性の形態を提供する。したがって、いくつかの実施形態では、医薬組成物中の操作された酵母は、凍結乾燥又はフリーズドライ形態で提供され得る。本明細書に開示される操作された酵母を含む経口組成物は、丸剤、錠剤、カプセル、マイクロカプセル、粉末、サシェ、糖剤、ゲル、液体、懸濁液、溶液、食品、クリーム、又は顆粒の形態であってもよい。いくつかの実施形態では、組成物は、1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤を更に含む。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な賦形剤は、担体、溶媒、共溶媒、乳化剤、滑沢剤、崩壊剤、結合剤、フィラー、流動促進剤、レオロジー剤、可溶化剤、抗菌剤、抗酸化剤、防腐剤、着色剤、香味剤、軟化剤、pH調節剤などを含むが、これらに限定されない群から選択される。
いくつかの実施形態では、食品には、乳製品、ヨーグルト、アイスクリーム、ミルクベースの飲料、ミルクベース付け合わせ、プリン、ミルクセーキ、アイスティ、フルーツジュース、ダイエットドリンク、ソーダ、スポーツドリンク、栄養補助食品用の粉末飲料混合物、幼児及び乳児用食品、カルシウム補充オレンジジュース、コーヒー又はシロップが含まれ得るが、これらに限定されない。
農業用組成物及びその使用方法
操作された酵母を使用して、限定されないが、分解酵素(例えば、セルロース)、土壌及び他の農業酵素(例えば、リパーゼ、プロテアーゼ、ポリメラーゼ、アミラーゼ、ペルオキシダーゼ、カタラーゼ、ベータグルコシダーゼ、FDA加水分解、アミダーゼ、ウレアーゼ、ホスファターゼ、スルファターゼ)殺真菌剤(例えば、キチナーゼ、キチン結合タンパク質、シクロフィリン様タンパク質、デフェンシン、脂質輸送タンパク質、ミラクリン様タンパク質、ヌクレアーゼ、タウマチン様タンパク質、及びこれに類するもの)、殺虫剤(例えば、Vip1、Vip2、Vip3、Cryタンパク質、及びこれに類するもの)、植物活性化剤(例えば、分岐-β-グルカン、キチンオリゴマー、ペクチン分解酵素、酵素活性とは無関係の誘導因子活性(例えば、エンドキシラナーゼ、エリシチン PaNie)、avr遺伝子産物(例えば、AVR4、AVR9)、ウイルスタンパク質(例えば、バイアル(vial)コートタンパク質、ハーピン)、フラジェリン、タンパク質又はペプチド毒素(例えば、ビクストリン)、糖タンパク質、インベルターゼの糖ペプチド断片、シリンゴリド(syringolid)、根粒形成因子(リポキトオリゴ糖)、FAC(脂肪酸アミノ酸コンジュゲート)、エルゴステロール、細菌毒素(例えば、コロナチン)、及びスフィンガニン類似体マイコトキシン(例えば、フモニシンB1)などの農業ペイロードタンパク質を生産するために使用できる、様々な疾患及び状態を治療するのに好適であり得る。上述の農業ペイロードタンパク質のうちの1つ以上を、作物、庭園などの農業環境に適用することは、土壌及び植物の健康を促進するのに有益であり得る。したがって、いくつかの実施形態では、土壌及び/又は植物の健康を促進する方法が提供され、方法は、1つ以上の農業ペイロードタンパク質及び合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドを発現するように遺伝子改変された有効量の操作された酵母を土壌又は植物に適用することを含む。いくつかの実施形態では、合成シグナルペプチドは、a)式II、式III、式IV、式V、式IX、式XIII又は配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73のプレタンパク質アミノ酸配列及びb)式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、式XV又は配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75のプロタンパク質アミノ酸配列うちの一方又は両方を含む。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、本明細書に開示される任意の株であり得る。いくつかの実施形態では、操作された酵母は、Kluyveromyces(例えば、K.lactis)、Pichia(例えば、P.pastoris)、Saccharomyces(例えば、S.cerevisiae、S.boulardii)、Trichoderma(例えば、T.reesei、T.viride)、及びAspergillus(例えば、A.niger)を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、土壌及び/又は植物の健康を促進する方法が提供され、方法は、本明細書に提供される農業ペイロードタンパク質のうちの1つ以上と、a)式I又は配列番号1のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号20若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたKluyveromyces酵母(例えば、K.lactis)を投与し、それにより土壌及び/又は植物の健康を促進する。
いくつかの実施形態では、土壌及び/又は植物の健康を促進する方法が提供され、方法は、本明細書に提供される農業ペイロードタンパク質のうちの1つ以上と、a)式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI又は配列番号17、20、若しくは21のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたPichia酵母(例えば、P.pastoris)を投与し、それにより土壌及び/又は植物の健康を促進する。
いくつかの実施形態では、土壌及び/又は植物の健康を促進する方法が提供され、方法は、本明細書に提供される農業ペイロードタンパク質のうちの1つ以上と、a)式III、式IV、式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式VI、式VII、式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたSaccharomyces酵母(例えば、S.cerevisiae又はS.boulardii)を投与し、それにより土壌及び/又は植物の健康を促進する。
いくつかの実施形態では、土壌及び/又は植物の健康を促進する方法が提供され、方法は、本明細書に提供される農業ペイロードタンパク質のうちの1つ以上と、a)式IX又は配列番号31、32、若しくは33のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式X、式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたTrichoderma酵母(例えば、T.reesei又はT.viride)を投与し、それにより土壌及び/又は植物の健康を促進する。
いくつかの実施形態では、土壌及び/又は植物の健康を促進する方法が提供され、方法は、本明細書に提供される農業ペイロードタンパク質のうちの1つ以上と、a)式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73のアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチド及びb)式XIV、式XV、又は配列番号74若しくは75のアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドをコードする核酸で遺伝子改変されたAspergillus酵母(例えば、A.niger)を投与し、それにより土壌及び/又は植物の健康を促進する。
いくつかの実施形態では、投与は、任意の経路を介して実施され得る。いくつかの実施形態では、組成物は、土壌及び/又は植物上に噴霧される。農業有効量の操作された酵母は、土壌及び/又は植物の健康に望ましい有益な効果をもたらすために必要な任意の量であり得る。
列挙された実施形態:
いくつかの実施形態では、以下の実施形態が提供される:
1. 式I、II、III、IV、V、IX、及びXIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドであって、式Iは、以下のように与えられ、
-(A-A-(A-(A-A-A-A-A-A10-(A11 (式I)
式中、
w及びxは各々、独立して、1、2、3、4、又は5であり、
yは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
zは、1、2、又は3であり、

は、メチオニンであり、
各Aは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、中性アミノ酸又は正電荷をもつアミノ酸であり、
各A、A、A、及びA10は各々、独立して、W及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Aは、独立して、P、W、M、及びCを除く、塩基性又は中性アミノ酸であり、
は、W、M、及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
は、Pを除く、約1.9より小さいハイドロパシー指標及び約5.4~約7.5の等電点を有する非芳香族アミノ酸であり、
は、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各A11は、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
式IIは、以下のように与えられ、
-(B-(B-(B-(B-(B-B-B-B-B10-(B11 (式II)
式中、
u及びwは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v及びzは各々、独立して、1、2、又は3であり、
xは、0、1、又は2であり、
yは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
は、メチオニンであり、
各B、B、B、B、及びB10は各々、独立して、W及びCを除く、約-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Bは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、正電荷をもつアミノ酸又は極性アミノ酸であり、
各Bは、独立して、P、W、M、及びCを除く、約-5より大きく約-0.5より小さいハイドロパシー指標を有する極性アミノ酸、又は約5~約11の等電点を有するアミノ酸であり、
各B及びB11は各々、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
は、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
式IIIは、以下のように与えられ、
-(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-C-C10-C11-[C12-C13 (式III)
式中、
rは、1、2、又は3であり、
t、u、y、及びzは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v及びwは各々、独立して、0、1、又は2であり、
aは、0又は1であり、
xは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
は、メチオニンであり、
各Cは、独立して、約5.6~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-5.1~約0.6のハイドロパシー指標、及び約0.8~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各C、C、C、及びC10は各々、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各C及びCは各々、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各C、C、C11、及びC12は各々、独立して、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
13は、約5.6~約6.3の等電点、約105g/mol~約120g/molの分子量、約0~約9.4のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式IVは、以下のように与えられ、
-(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-D10-D11-D12-[D13-D14 (式IV)
式中、
qは、1、2、又は3であり、
r、t、及びuは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v、w、x、及びyは各々、独立して、0、1、又は2であり、
aは、0又は1であり、
zは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
は、メチオニンであり、
各Dは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dは、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各D、D、及びD11は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dは、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dは、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dは、独立して、約5.4~約6.1の等電点、約117g/mol~約205g/molの分子量、約2.5~約34のハイドロパシー指標、及び約1~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各D、D10、D12、及びD13は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
14は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式Vは、以下のように与えられ、
-[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-E11-E12-E13-[E14-E15(式V)
式中、
i、j、q、w、x及びaは各々、独立して、0又は1であり、
rは、1、2、又は3であり、
t、u、v、及びzは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
yは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
は、メチオニンであり、
各Eは、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約1のハイドロパシー指標、及び約0.85~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75.1g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eは、独立して、約5~約10.8の等電点、約105g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各E及びEは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eは、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eは、独立して、約5~約9.75の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各E、E13、及びE14は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各E10及びE12は、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
11は、約5~約9.75の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
15は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約15.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.2のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式IXは、以下のように与えられ、
-(F-(F-[(F-(F-F-F-F-[F-F10 (式IX)
式中、
v及びwは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
x及びyは各々、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
aは、0又は1であり、
zは、1、2、3、4、5、6、7、又は8であり、
は、約5.4~約11の等電点、約89g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約31のハイドロパシー指標、及び約0.9~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各F及びFは各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各F、F、F、及びFは各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
10は、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式XIIIは、以下のように与えられ、
-(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12 (式XIII)
式中、
xは、1、2、又は3であり、
yは、1、2、3、又は4であり、
zは、5、6、7、8、9、又は10であり、
各aは、独立して、0又は1であり、
各Lは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各L及びLは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各L、L、及びLは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各L、L、L10、及びL11は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
12は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である、プレタンパク質シグナルペプチド。
2. 式Iにおいて、
各Aが、独立して、K、R、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各A、A、A、及びA10が各々、独立して、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各A11が、独立して、A、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
3. 式IIにおいて、
各B、B、B、B、及びB10が各々、独立して、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Bが、独立して、K、R、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各B及びB11が、独立して、A、S、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
4. 式IIIにおいて、
各Cが、独立して、K、R、H、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各C、C、C、及びC10が各々、独立して、L、V、I、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各C及びCが各々、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、Y、H、V、I、F、G、W、C、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各C、C、C11、及びC12が各々、独立して、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
13が、P、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
5. 式IVにおいて、
各Dが、独立して、K及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Dが、独立して、F、L、I、W、V、M、Y、P、C、A、Q、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各D、D、及びD11が各々、独立して、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Dが、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、A、C、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Dが、独立して、L、I、A、T、S、G、N、R K、Y Q、C、H、W、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Dが、独立して、V、W、I、L、F、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各D、D10、D12、及びD13が各々、独立して、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
14が、P、Y、M、V、A、T、Q、S、N、G、I、E、D、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
6. 式Vにおいて、
各Eが、独立して、K、R、S、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Eが、独立して、F、L、I、W、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Eが、独立して、K、R、H、S、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各E及びEが各々、独立して、L、I、F、V、C、A、Y、T、Q、N、S、K、H、W、G、D、M、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Eが、独立して、T、Q、S、A、C、R、K、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Eが、独立して、S、G、K、A、C、Y、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各E、E13、及びE14が各々、独立して、A、T、G、S、V、I、L、Y、W、F、C、Q、N、P、E、M、R、K、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各E10及びE12が各々、独立して、L、F、I、V、C、Y、T、Q、N、S、K、H、M、G、A、W、D、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。
11が、V、W、I、C、L、A、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
15が、S、N、R、T、G、K、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
7. 式IXにおいて、
が、M、F、L、A、S、又はRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Fが、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、E、T、A、C、P、Y、V、W、I、L、又はFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各F及びFが各々、独立して、S、Q、R、T、K、H、I、F、L、P、N、G、E、D、A、Y、M、V、W、又はCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Fが、独立して、L、I、V、M、A、F、W、Y、P、C、T、Q、N、S、G、E、R、K、又はHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各F、F、F、及びFが各々、独立して、A、C、G、S、V、L、T、F、Q、N、P、Y、E、K、H、W、I、M、R、又はDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
10が、P、C、Y、M、V、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、F、R、K、又はHからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
8. 式XIIIにおいて、
各Lが、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各L及びLが各々、独立して、S、N、Q、R、T、K、P、G、E、H、D、A、C、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各L、L、及びLが各々、独立して、L、F、I、W、V、T、M、Y、P、C、A、Q、N、S、G、E、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各L、L、L10、及びL11が各々、独立して、A、T、G、S、C、P、I、L、F、R、V、Q、Y、K、N、E、D、H、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
12が、P、T、S、D、C、Y、M、V、A、Q、N、W、G、I、E、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
9. シグナルペプチドが、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
10. アミノ酸配列が、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択される、実施形態1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
11. 配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、プレタンパク質シグナルペプチド。
12. 式VI、VII、VIII、X、XI、XIV、及びXVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、プロタンパク質シグナルペプチドであって、
式VIは、以下のように与えられ、
-G-G-G-G-G-G-G-G-G10-G11-G12-G13-G14-G15-G16-G17-G18-G19-G20-G21-G22-G23-G24-G25 (式VI)
式中、
は、I、L、F、V、A、N、S、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、P、S、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、L、F、I、V、Y、A、S、R、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、V、M、P、Y、A、T、S、N、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、A、G、R、Y、K、D、M、V、W、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、N、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、V、P、A、T、Q、G、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、P、Y、T、Q、S、N、W、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
は、F、L、A、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
10は、H、S、N、D、Q、E、T、Y、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
11は、S、R、T、G、K、E、D、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
12は、D、E、Q、N、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
13は、N、S、E、D、T、H、K、A、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
14は、G、S、N、H、E、C、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
15は、S、T、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
16は、E、D、Q、N、S、T、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
17は、W、N、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
18は、L及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
19は、Y、V、A、Q、N、S、E、D、L、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
20は、K、R、S、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
21は、Rであり、
22は、D、E、N、S、T、G、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
23及びG24は各々、独立して、V、P、Y、I、A、E、K、F、T、S、G、D、M、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
25は、Y、P、A、T、Q、S、E、F、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式VIIは、以下のように与えられ、
(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H10-(H11-(H12-(H13-(H14-(H15-(H16-(H17-(H18-(H19-(H20-(H21-(H22-(H23-(H24-(H25-(H26-(H27-(H28-(H29-(H30-(H31-(H32-(H33-(H34-(H35-(H36-H37-H38-H39-H40 (式VII)
式中、
各mは、独立して、0、1、又は2であり、
各Hは、独立して、E、D、S、L、G、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H及びH28は各々、独立して、P、S、R、T、N、G、D、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hは、独立して、W及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hは、独立して、S、N、A、P、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H及びH30は各々、独立して、T、Q、A、E、F、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hは、独立して、L、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hは、独立して、F、V、M、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hは、独立して、V、P、I、A、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H及びH17は各々、独立して、T、G、V、W、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H10は、独立して、R、H、S、G、N、E、T、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H11は、独立して、S、G、D、A、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H12は、独立して、T、S、E、G、D、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H13は、独立して、L、M、Y、N、S、D、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H14は、独立して、D、Q、N、S、K、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H15は、独立して、E、S、D、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H16は、独立して、I、L、V、M、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H18は、独立して、D、E、S、T、K、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H19は、独立して、Y、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H20は、独立して、N、Q、S、T、R、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H21及びH34は各々、独立して、S、K、T、A、Y、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H22は、独立して、T、Q、S、D、C、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H23は、独立して、G、S、K、N、H、D、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H24は、独立して、I、L、V、P、N、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H25及びH33は各々、独立して、A、T、G、R、Y、L、F、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H26及びH40は各々、独立して、V、I、F、M、L、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H27は、独立して、D、E、Q、N、S、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H29は、独立して、E、D、T、A、Y、M、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H31は、独立して、F、W、V、M、S、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H32は、独立して、H、S、E、G、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H35は、独立して、R、K、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H36は、独立して、H、R、S、T、A、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
37は、K、Q、D、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
38は、R、K、T、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
39は、D、N、S、T、K、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式VIIIは、以下のように与えられ、
(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I10-(I11-(I12-(I13-(I14-(I15-(I16-(I17-I18-I19-I20-I21-I22-I23 (式VIII)
式中、
各mは、独立して、0、1、又は2であり、
各xは、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
各I及びIは各々、独立して、S、Q、E、A、I、G、V、R、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iは、独立して、T、S、E、R、P、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iは、独立して、Lである。
各Iは、独立して、T、N、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iは、独立して、P、A、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iは、独立して、T、S、K、H、Y、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I及びI15は各々、独立して、F、L、W、A、T、M、Y、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iは、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I10及びI16は各々、独立して、G、S、N、E、D、A、K、H、C、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I11は、独立して、I、L、V、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I12は、独立して、T、N、A、E、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I13は、独立して、E、Q、S、T、R、K、A、L、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I14は、独立して、T、S、Q、F、A、G、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I17は、独立して、I、L、V、N、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
18及びI21は各々、独立して、R、K、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
19は、H、R、S、N、T、A、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
20は、K、N、Q、D、E、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
22は、D、N、S、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
23は、V、I、L、F、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式Xは、以下のように与えられ、
(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J10-(J11-(J12-(J13-(J14-(J15-(J16-(J17-(J18-(J19-(J20-(J21-J22-J23-J24-J25 (式X)
式中、
各zは、独立して、0、1、2、3、4、又は5であり、
各Jは、独立して、H、K、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、G、A、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、F、I、P、A、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、S、R、T、G、K、E、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、T、S、A、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、Y、C、A、W、I、S、E、D、F、L、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jは、独立して、H、K、N、D、G、T、A、C、Y、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J10は、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J11は、独立して、I、W、V、Y、P、T、N、S、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J12は、独立して、A、G、Q、N、R、Y、E、D、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J13は、独立して、I、L、W、V、M、Y、P、A、S、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J14は、独立して、V、C、L、F、A、T、N、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J15は、独立して、G、S、R、K、A、T、H、E、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J16は、独立して、D、E、Q、S、H、T、R、G、Y、V、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J17は、独立して、E、S、G、Y、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J18は、独立して、A、S、P、H、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J19は、独立して、N、E、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J20は、独立して、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J21は、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
22は、K、R、D、T、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
23は、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
24は、S、N、G、E、D、P、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
25は、A、T、S、Y、M、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式XIは、以下のように与えられ、
(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K10-(K11-(K12-(K13-(K14-(K15-(K16-(K17-(K18-(K19-(K20-(K21-(K22-(K23-(K24-(K25-(K26-(K27-(K28-(K29-(K30-(K31-(K32-(K33-(K34-(K35-(K36-(K37-(K38-(K39-(K40-(K41-(K42-(K43-(K44-(K45-(K46-(K47-(K48-(K49-(K50-(K51-(K52-(K53-(K54-(K55-(K56-(K57-(K58-(K59-(K60-(K61-(K62-(K63-(K64-(K65-(K66-(K67-(K68-(K69-(K70-(K71-(K72-(K73-(K74-(K75-(K76-(K77-(K78-(K79-(K80-(K81-(K82-(K83-(K84-(K85-(K86-(K87-(K88-K89-K89-K89-K89-K89 (式XI)
式中、
各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、
各Kは、独立して、S、G、D、A、C、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、Q、S、E、T、R、K、G、A、Y、M、V、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、R、G、N、D、A、P、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、N、Q、R、H、K、A、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kは、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K10は、独立して、K、H、E、A、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K11は、独立して、S、T、K、E、A、C、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K12は、独立して、K、R、H、S、Q、D、E、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K13は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K14は、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K15は、独立して、C、A、M、V、S、E、G、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K16は、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K17は、独立して、A、G、S、Q、Y、E、D、H、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K18は、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K19は、独立して、E、D、T、H、K、G、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K20は、独立して、F、L、I、V、M、T、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K21は、独立して、E、D、S、G、A、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K22は、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K23は、独立して、G、S、N、E、D、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K24は、独立して、T、S、E、G、P、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K25は、独立して、K、S、G、T、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K26は、独立して、S、G、K、E、D、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K27は、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K28は、独立して、E、D、Q、S、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K29は、独立して、A、T、S、E、V、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K30は、独立して、K、H、S、G、N、Q、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K31は、独立して、L、F、V、P、A、N、G、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K32は、独立して、A、G、N、P、R、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K33は、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K34は、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K35は、独立して、A、T、Q、P、R、V、N、E、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K36は、独立して、R、K、H、G、Q、D、T、Y、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K37は、独立して、D、E、N、T、C、Y、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K38は、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K39は、独立して、K、S、G、Q、D、E、A、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K40は、独立して、H、K、S、D、E、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K41は、独立して、A、T、S、N、P、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K42は、独立して、K、D、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K43は、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K44は、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K45は、独立して、G、S、K、N、T、Q、D、A、P、L、F、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K46は、独立して、L、F、Q、S、G、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K47は、独立して、S、R、E、A、P、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K48は、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K49は、独立して、E、S、T、R、G、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K50は、独立して、S、N、R、A、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K51は、独立して、G、A、T、H、M、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K52は、独立して、S、T、H、A、C、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K53は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K54は、独立して、S、H、Y、F、N、Q、R、T、G、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K55は、独立して、A、T、Q、E、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K56は、独立して、S、N、E、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K57は、独立して、D、S、R、K、A、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K58は、独立して、K、S、G、D、T、L、R、E、Y、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K59は、独立して、S、R、G、A、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K60は、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K61は、独立して、R、S、G、N、E、T、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K62は、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K63は、独立して、A、G、S、Q、R、E、D、V、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K64は、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K65は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K66は、独立して、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K67は、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K68は、独立して、I、V、P、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K69は、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K70は、独立して、G、S、R、N、T、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K71は、独立して、E、D、N、S、T、H、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K72は、独立して、L、I、W、V、A、T、S、E、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K73は、独立して、G、S、K、A、C、F、N、T、Q、D、P、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K74は、独立して、A、S、N、P、K、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K75は、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K76は、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K77は、独立して、M、V、Y、L、A、N、E、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K78は、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K79は、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K80は、独立して、K、R、S、A、P、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K81は、独立して、F、L、V、A、T、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K82は、独立して、L、F、M、A、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K83は、独立して、D、S、H、A、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K84は、独立して、A、T、Q、S、R、V、L、G、H、F、K、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K85は、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K86は、独立して、A、P、R、Y、K、D、M、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K87は、独立して、N、S、D、T、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K88は、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
89は、K、R、H、G、E、T、Y、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
90は、R、S、G、N、Q、A、Y、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
91は、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
92は、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
93は、E、D、Q、S、R、K、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式XIVは、以下のように与えられ、
(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M10-(M11-(M12-(M13-(M14-(M15-(M16-(M17-(M18-(M19-(M20-(M21-(M22-(M23-(M24-(M25-(M26-(M27-(M28-(M29-(M30-(M31-(M32-(M33-(M34-(M35-(M36-(M37-(M38-(M39-(M40-(M41-(M42-(M43-(M44-(M45-(M46-(M47-(M48-(M49-(M50-(M51-(M52-(M53-(M54-(M55-(M56-(M57-(M58-(M59-(M60-(M61-(M62-(M63-(M64-(M65-(M66-(M67-(M68-(M69-(M70 (式XIV)、
式中、
各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、
各cは、独立して、1又は2であり、
各Mは、独立して、A、T、C、S、Y、E、H、V、W、I、L、F、G、Q、N、P、R、K、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、G、S、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、R、H、N、Q、E、A、Y、M、V、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、P、Y、A、T、Q、S、G、D、R、K、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、H、P、F、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mは、独立して、G、S、H、P、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、N、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M10は、独立して、Q、E、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M11は、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M12は、独立して、S、G、A、N、Q、R、T、K、E、H、D、P、I、F、V、C、Y、L、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M13は、独立して、T、Q、N、S、D、P、F、A、E、G、H、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M14は、独立して、L、F、I、V、M、Y、A、T、Q、N、S、D、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M15は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M16は、独立して、T、S、A、E、G、C、R、P、Y、M、V、W、I、F、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M17は、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M18は、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M19は、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M20は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M21は、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M22は、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M23は、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M24は、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M25は、独立して、F、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M26は、独立して、T、P、F、Q、N、S、A、E、G、D、K、Y、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M27は、独立して、D、E、Q、N、S、T、R、K、G、A、Y、P、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M28は、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M29は、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M30は、独立して、D、Q、N、H、K、G、C、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M31は、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M32は、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M33は、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M34は、独立して、T、A、V、I、P、F、Q、N、S、E、G、D、K、Y、C、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M35は、独立して、G、S、R、N、H、D、P、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M36は、独立して、T、Q、S、A、E、D、K、H、P、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M37は、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M38は、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、C、P、R、Y、E、V、W、T、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M39は、独立して、S、T、E、P、V、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M40は、独立して、T、S、A、D、P、M、Q、E、K、H、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M41は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M42は、独立して、P、Y、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M43は、独立して、S、E、P、V、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M44は、独立して、N、Q、S、E、D、T、H、K、G、A、P、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M45は、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M46は、独立して、A、T、S、N、R、Y、K、D、H、M、L、F、G、Q、C、P、E、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M47は、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M48は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M49は、独立して、F、V、A、T、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M50は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M51は、独立して、G、S、R、H、D、P、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M52は、独立して、T、N、S、G、C、R、H、A、D、P、M、Q、E、K、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M53は、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M54は、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M55は、独立して、D、E、Q、N、S、K、G、A、Y、P、F、T、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M56は、独立して、L、F、I、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M57は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M58は、独立して、P、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M59は、独立して、N、Q、S、E、D、T、R、K、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M60は、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M61は、独立して、S、P、V、T、A、R、K、E、H、C、Y、I、F、L、N、Q、G、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M62は、独立して、P、K、A、Y、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M63は、独立して、A、G、S、N、E、K、D、H、M、V、W、I、L、F、T、R、Y、Q、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M64は、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M65は、独立して、L、V、F、I、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M66は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、V、C、Y、I、F、L、Q、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M67は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M68は、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M69は、独立して、S、A、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M70は、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、C、R、K、H、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式XVは、以下のように与えられ、
(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N10-(N11-(N12-(N13-(N14-(N15-(N16-(N17-(N18-(N19-(N20-(N21-(N22-(N23-(N24-(N25-(N26-(N27-(N28-(N29-(N30-(N31-(N32-(N33-(N34-(N35-(N36-(N37-(N38-(N39-(N40-(N41-(N42-(N43-(N44-(N45-(N46-(N47-(N48-(N49-(N50-(N51-(N52-(N53-(N54-(N55-(N56-(N57-(N58-(N59-(N60-(N61-(N62-(N63-(N64-(N65-(N66-(N67-(N68-(N69-(N70-(N71 (式XV)、
式中、
各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、
各cは、独立して、1又は2であり、
各Nは、独立して、S、N、D、Q、R、T、G、E、H、A、P、M、V、K、Y、W、F、L、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、P、V、A、S、N、G、E、L、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nは、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N10は、独立して、T、Q、N、R、K、M、S、E、D、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N11は、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N12は、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、P、L、M、V、Y、W、F、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N13は、独立して、L、F、I、W、V、M、Y、C、A、T、Q、N、S、G、E、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N14は、独立して、V、I、L、A、T、S、G、R、P、Y、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N15は、独立して、S、N、Q、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、I、F、L、R、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N16は、独立して、T、N、S、A、D、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N17は、独立して、S、N、Q、R、K、E、D、A、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N18は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N19は、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、Y、M、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N20は、独立して、S、Q、R、K、E、A、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N21は、独立して、V、W、I、C、L、F、A、T、S、E、D、K、G、R、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N22は、独立して、T、Q、N、S、A、D、C、K、P、Y、M、V、W、I、F、G、E、H、R、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N23は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N24は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N25は、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N26は、独立して、T、N、D、S、A、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N27は、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N28は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N29は、独立して、T、S、A、D、C、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N30は、独立して、P、Y、V、A、T、S、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N31は、独立して、T、Q、S、A、G、K、H、P、Y、V、I、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N32は、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N33は、独立して、E、D、Q、N、S、T、H、R、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N34は、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N35は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N36は、独立して、G、S、K、A、T、Q、D、C、P、Y、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N37は、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N38は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N39は、独立して、L、F、I、W、V、M、C、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N40は、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N41は、独立して、D、N、R、G、Y、E、Q、S、H、T、K、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N42は、独立して、S、R、E、A、N、T、G、P、V、Q、K、H、D、Y、M、I、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N43は、独立して、G、S、R、K、A、N、Q、H、E、D、P、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N44は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、N、E、D、C、K、H、R、V、L、M、F、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N45は、独立して、S、T、G、A、V、I、R、E、N、P、Q、K、H、D、Y、M、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N46は、独立して、Cであり、
各N47は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、Y、V、W、I、L、Q、M、F、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N48は、独立して、G、S、R、K、N、T、Q、H、E、D、P、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N49は、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N50は、独立して、V、A、T、S、G、I、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N51は、独立して、A、T、G、S、Q、N、R、Y、E、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N52は、独立して、D、E、Q、N、S、T、K、A、Y、P、M、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N53は、独立して、A、T、C、G、S、N、P、R、K、D、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N54は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N55は、独立して、E、D、N、T、R、K、G、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N56は、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、W、K、C、Y、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N57は、独立して、Y、C、N、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N58は、独立して、S、T、G、H、A、P、Y、V、F、L、N、R、K、E、D、W、I、Q、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N59は、独立して、I、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N60は、独立して、Sであり
各N61は、独立して、G、S、R、K、A、N、T、Q、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N62は、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N63は、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N64は、独立して、S、N、Q、R、G、K、E、D、P、Y、W、F、T、H、A、V、L、I、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N65は、独立して、A、C、G、S、Q、N、R、Y、E、K、D、H、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N66は、独立して、V、I、A、T、S、G、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N67は、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N68は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N69は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N70は、独立して、D、E、Q、N、S、H、T、R、K、G、A、C、Y、P、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N71は、独立して、A、T、C、G、S、Q、N、P、R、Y、E、K、D、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である、プロタンパク質シグナルペプチド。
13. シグナルペプチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態12に記載のプロタンパク質シグナルペプチド。
14. アミノ酸配列が、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択される、実施形態12に記載のプロタンパク質シグナルペプチド。
15. 配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、プロタンパク質シグナルペプチド。
16. (X-(Y-Zの式を含むポリペプチドであって、式中、
は、プレタンパク質シグナルペプチドであり、
は、プロタンパク質シグナルペプチドであり、
は、ペイロードタンパク質であり、
nは、0~1であり、mは、0~1であり、
n及びmは、同時に0であることはできない、ポリペプチド。
17. nが、1であり、Xが、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、式Iが、以下のように与えられ、
-(A-A-(A-(A-A-A-A-A-A10-(A11 (式I)
式中、
w及びxが各々、独立して、1、2、3、4、又は5であり、
yが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
zが、1、2、又は3であり、
が、メチオニンであり、
各Aが、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、中性アミノ酸又は正電荷をもつアミノ酸であり、
各A、A、A、及びA10が各々、独立して、W及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Aが、独立して、P、W、M、及びCを除く、塩基性又は中性アミノ酸であり、
が、W、M、及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
が、Pを除く、約1.9より小さいハイドロパシー指標及び約5.4~約7.5の等電点を有する非芳香族アミノ酸であり、
が、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各A11が、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
式IIが、以下のように与えられ、
-(B-(B-(B-(B-(B-B-B-B-B10-(B11 (式II)
式中、
u及びwが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v及びzが各々、独立して、1、2、又は3であり、
xが、0、1、又は2であり、
yが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
が、メチオニンであり、
各B、B、B、B、及びB10が各々、独立して、W及びCを除く、約-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
各Bが、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、正電荷をもつアミノ酸又は極性アミノ酸であり、
各Bが、独立して、P、W、M、及びCを除く、約-5より大きく約-0.5より小さいハイドロパシー指標を有する極性アミノ酸、又は約5~約11の等電点を有するアミノ酸であり、
各B及びB11が各々、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
が、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
式IIIが、以下のように与えられ、
-(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-C-C10-C11-[C12-C13 (式III)
式中、
rが、1、2、又は3であり、
t、u、y、及びzが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v及びwが各々、独立して、0、1、又は2であり、
aが、0又は1であり、
xが、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
が、メチオニンであり、
各Cが、独立して、約5.6~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-5.1~約0.6のハイドロパシー指標、及び約0.8~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各C、C、C、及びC10が各々、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各C及びCが各々、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各C、C、C11、及びC12が各々、独立して、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
13が、約5.6~約6.3の等電点、約105g/mol~約120g/molの分子量、約0~約9.4のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式IVが、以下のように与えられ、
-(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-D10-D11-D12-[D13-D14 (式IV)
式中、
qが、1、2、又は3であり、
r、t、及びuが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
v、w、x、及びyが各々、独立して、0、1、又は2であり、
aが、0又は1であり、
zが、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
が、メチオニンであり、
各Dが、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dが、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各D、D、及びD11が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dが、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dが、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Dが、独立して、約5.4~約6.1の等電点、約117g/mol~約205g/molの分子量、約2.5~約34のハイドロパシー指標、及び約1~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各D、D10、D12、及びD13が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
14が、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式Vが、以下のように与えられ、
-[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-E11-E12-E13-[E14-E15 (式V)
式中、
i、j、q、w、x及びaが各々、独立して、0又は1であり、
rが、1、2、又は3であり、
t、u、v、及びzが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
yが、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
が、メチオニンであり、
各Eが、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約1のハイドロパシー指標、及び約0.85~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eが、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75.1g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eが、独立して、約5~約10.8の等電点、約105g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各E及びEが各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eが、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Eが、独立して、約5~約9.75の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各E、E13、及びE14が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各E10及びE12が、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
11が、約5~約9.75の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
15が、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約15.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.2のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式IXが、以下のように与えられ、
-(F-(F-[(F-(F-F-F-F-[F-F10 (式IX)
式中、
v及びwが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
x及びyが各々、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
aが、0又は1であり、
zが、1、2、3、4、5、6、7、又は8であり、
が、約5.4~約11の等電点、約89g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約31のハイドロパシー指標、及び約0.9~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Fが、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各F及びFが各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各Fが、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各F、F、F、及びFが各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
10が、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
式XIIIが、以下のように与えられ、
-(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12 (式XIII)
式中、
xが、1、2、又は3であり、
yが、1、2、3、又は4であり、
zが、5、6、7、8、9、又は10であり、
各aが、独立して、0又は1であり、
各Lが、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各L及びLが各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各L、L、及びLが各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
各L、L、L10、及びL11が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
12が、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である、実施形態16に記載のポリペプチド。
18. nが、1であり、Xが、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態16又は17に記載のポリペプチド。
19. mが、1であり、Yが、式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、及び式XVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、式VIが、以下のように与えられ、
- G - G - G - G - G - G - G - G - G10 - G11 - G12 - G13 - G14 - G15 - G16 - G17 - G18 - G19 - G20 - G21 - G22 - G23 - G24 - G25 (式VI)
式中、
が、I、L、F、V、A、N、S、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、P、S、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、L、F、I、V、Y、A、S、R、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、V、M、P、Y、A、T、S、N、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、A、G、R、Y、K、D、M、V、W、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、N、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、V、P、A、T、Q、G、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、P、Y、T、Q、S、N、W、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
が、F、L、A、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
10が、H、S、N、D、Q、E、T、Y、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
11が、S、R、T、G、K、E、D、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
12が、D、E、Q、N、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
13が、N、S、E、D、T、H、K、A、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
14が、G、S、N、H、E、C、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
15が、S、T、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
16が、E、D、Q、N、S、T、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
17が、W、N、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
18が、L及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
19が、Y、V、A、Q、N、S、E、D、L、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
20が、K、R、S、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
21が、Rであり、
22が、D、E、N、S、T、G、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
23及びG24が各々、独立して、V、P、Y、I、A、E、K、F、T、S、G、D、M、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
25が、Y、P、A、T、Q、S、E、F、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式VIIが、以下のように与えられ、
(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H10-(H11-(H12-(H13-(H14-(H15-(H16-(H17-(H18-(H19-(H20-(H21-(H22-(H23-(H24-(H25-(H26-(H27-(H28-(H29-(H30-(H31-(H32-(H33-(H34-(H35-(H36-H37-H38-H39-H40 (式VII)
式中、
各mが、独立して、0、1、又は2であり、
各Hが、独立して、E、D、S、L、G、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H及びH28が各々、独立して、P、S、R、T、N、G、D、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hが、独立して、W及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hが、独立して、S、N、A、P、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H及びH30が各々、独立して、T、Q、A、E、F、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hが、独立して、L、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hが、独立して、F、V、M、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Hが、独立して、V、P、I、A、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H及びH17が各々、独立して、T、G、V、W、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H10が、独立して、R、H、S、G、N、E、T、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H11が、独立して、S、G、D、A、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H12が、独立して、T、S、E、G、D、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H13が、独立して、L、M、Y、N、S、D、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H14が、独立して、D、Q、N、S、K、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H15が、独立して、E、S、D、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H16が、独立して、I、L、V、M、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H18が、独立して、D、E、S、T、K、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H19が、独立して、Y、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H20が、独立して、N、Q、S、T、R、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H21及びH34が各々、独立して、S、K、T、A、Y、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H22が、独立して、T、Q、S、D、C、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H23が、独立して、G、S、K、N、H、D、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H24が、独立して、I、L、V、P、N、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H25及びH33が各々、独立して、A、T、G、R、Y、L、F、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H26及びH40が各々、独立して、V、I、F、M、L、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H27が、独立して、D、E、Q、N、S、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H29が、独立して、E、D、T、A、Y、M、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H31が、独立して、F、W、V、M、S、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H32が、独立して、H、S、E、G、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H35が、独立して、R、K、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各H36が、独立して、H、R、S、T、A、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
37が、K、Q、D、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
38が、R、K、T、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
39が、D、N、S、T、K、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式VIIIが、以下のように与えられ、
(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I10-(I11-(I12-(I13-(I14-(I15-(I16-(I17-I18-I19-I20-I21-I22-I23 (式VIII)
式中、
各mが、独立して、0、1、又は2であり、
各xが、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
各I及びIが各々、独立して、S、Q、E、A、I、G、V、R、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iが、独立して、T、S、E、R、P、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iが、独立して、Lである。
各Iが、独立して、T、N、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iが、独立して、P、A、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iが、独立して、T、S、K、H、Y、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I及びI15が各々、独立して、F、L、W、A、T、M、Y、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Iが、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I10及びI16が各々、独立して、G、S、N、E、D、A、K、H、C、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I11が、独立して、I、L、V、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I12が、独立して、T、N、A、E、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I13が、独立して、E、Q、S、T、R、K、A、L、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I14が、独立して、T、S、Q、F、A、G、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各I17が、独立して、I、L、V、N、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
18及びI21が各々、独立して、R、K、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
19が、H、R、S、N、T、A、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
20が、K、N、Q、D、E、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
22が、D、N、S、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
23が、V、I、L、F、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式Xが、以下のように与えられ、
(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J10-(J11-(J12-(J13-(J14-(J15-(J16-(J17-(J18-(J19-(J20-(J21-J22-J23-J24-J25 (式X)
式中、
各zが、独立して、0、1、2、3、4、又は5であり、
各Jが、独立して、H、K、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、G、A、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、F、I、P、A、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、S、R、T、G、K、E、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、T、S、A、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、Y、C、A、W、I、S、E、D、F、L、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Jが、独立して、H、K、N、D、G、T、A、C、Y、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J10が、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J11が、独立して、I、W、V、Y、P、T、N、S、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J12が、独立して、A、G、Q、N、R、Y、E、D、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J13が、独立して、I、L、W、V、M、Y、P、A、S、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J14が、独立して、V、C、L、F、A、T、N、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J15が、独立して、G、S、R、K、A、T、H、E、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J16が、独立して、D、E、Q、S、H、T、R、G、Y、V、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J17が、独立して、E、S、G、Y、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J18が、独立して、A、S、P、H、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J19が、独立して、N、E、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J20が、独立して、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各J21が、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
22が、K、R、D、T、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
23が、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
24が、S、N、G、E、D、P、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
25が、A、T、S、Y、M、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式XIが、以下のように与えられ、
(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K10-(K11-(K12-(K13-(K14-(K15-(K16-(K17-(K18-(K19-(K20-(K21-(K22-(K23-(K24-(K25-(K26-(K27-(K28-(K29-(K30-(K31-(K32-(K33-(K34-(K35-(K36-(K37-(K38-(K39-(K40-(K41-(K42-(K43-(K44-(K45-(K46-(K47-(K48-(K49-(K50-(K51-(K52-(K53-(K54-(K55-(K56-(K57-(K58-(K59-(K60-(K61-(K62-(K63-(K64-(K65-(K66-(K67-(K68-(K69-(K70-(K71-(K72-(K73-(K74-(K75-(K76-(K77-(K78-(K79-(K80-(K81-(K82-(K83-(K84-(K85-(K86-(K87-(K88-K89-K89-K89-K89-K89 (式XI)
式中、
各bが、独立して、0、1、2、又は3であり、
各Kが、独立して、S、G、D、A、C、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、Q、S、E、T、R、K、G、A、Y、M、V、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、R、G、N、D、A、P、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、N、Q、R、H、K、A、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Kが、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K10が、独立して、K、H、E、A、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K11が、独立して、S、T、K、E、A、C、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K12が、独立して、K、R、H、S、Q、D、E、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K13が、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K14が、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K15が、独立して、C、A、M、V、S、E、G、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K16が、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K17が、独立して、A、G、S、Q、Y、E、D、H、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K18が、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K19が、独立して、E、D、T、H、K、G、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K20が、独立して、F、L、I、V、M、T、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K21が、独立して、E、D、S、G、A、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K22が、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K23が、独立して、G、S、N、E、D、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K24が、独立して、T、S、E、G、P、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K25が、独立して、K、S、G、T、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K26が、独立して、S、G、K、E、D、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K27が、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K28が、独立して、E、D、Q、S、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K29が、独立して、A、T、S、E、V、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K30が、独立して、K、H、S、G、N、Q、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K31が、独立して、L、F、V、P、A、N、G、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K32が、独立して、A、G、N、P、R、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K33が、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K34が、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K35が、独立して、A、T、Q、P、R、V、N、E、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K36が、独立して、R、K、H、G、Q、D、T、Y、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K37が、独立して、D、E、N、T、C、Y、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K38が、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K39が、独立して、K、S、G、Q、D、E、A、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K40が、独立して、H、K、S、D、E、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K41が、独立して、A、T、S、N、P、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K42が、独立して、K、D、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K43が、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K44が、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K45が、独立して、G、S、K、N、T、Q、D、A、P、L、F、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K46が、独立して、L、F、Q、S、G、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K47が、独立して、S、R、E、A、P、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K48が、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K49が、独立して、E、S、T、R、G、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K50が、独立して、S、N、R、A、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K51が、独立して、G、A、T、H、M、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K52が、独立して、S、T、H、A、C、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K53が、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K54が、独立して、S、H、Y、F、N、Q、R、T、G、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K55が、独立して、A、T、Q、E、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K56が、独立して、S、N、E、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K57が、独立して、D、S、R、K、A、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K58が、独立して、K、S、G、D、T、L、R、E、Y、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K59が、独立して、S、R、G、A、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K60が、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K61が、独立して、R、S、G、N、E、T、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K62が、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K63が、独立して、A、G、S、Q、R、E、D、V、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K64が、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K65が、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K66が、独立して、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K67が、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K68が、独立して、I、V、P、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K69が、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K70が、独立して、G、S、R、N、T、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K71が、独立して、E、D、N、S、T、H、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K72が、独立して、L、I、W、V、A、T、S、E、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K73が、独立して、G、S、K、A、C、F、N、T、Q、D、P、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K74が、独立して、A、S、N、P、K、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K75が、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K76が、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K77が、独立して、M、V、Y、L、A、N、E、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K78が、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K79が、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K80が、独立して、K、R、S、A、P、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K81が、独立して、F、L、V、A、T、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K82が、独立して、L、F、M、A、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K83が、独立して、D、S、H、A、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K84が、独立して、A、T、Q、S、R、V、L、G、H、F、K、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K85が、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K86が、独立して、A、P、R、Y、K、D、M、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K87が、独立して、N、S、D、T、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各K88が、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
89が、K、R、H、G、E、T、Y、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
90が、R、S、G、N、Q、A、Y、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
91が、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
92が、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
93が、E、D、Q、S、R、K、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式XIVが、以下のように与えられ、
(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M10-(M11-(M12-(M13-(M14-(M15-(M16-(M17-(M18-(M19-(M20-(M21-(M22-(M23-(M24-(M25-(M26-(M27-(M28-(M29-(M30-(M31-(M32-(M33-(M34-(M35-(M36-(M37-(M38-(M39-(M40-(M41-(M42-(M43-(M44-(M45-(M46-(M47-(M48-(M49-(M50-(M51-(M52-(M53-(M54-(M55-(M56-(M57-(M58-(M59-(M60-(M61-(M62-(M63-(M64-(M65-(M66-(M67-(M68-(M69-(M70 (式XIV)、
式中、
各bが、独立して、0、1、2、又は3であり、
各cが、独立して、1又は2であり、

各Mが、独立して、A、T、C、S、Y、E、H、V、W、I、L、F、G、Q、N、P、R、K、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、G、S、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、R、H、N、Q、E、A、Y、M、V、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、P、Y、A、T、Q、S、G、D、R、K、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、H、P、F、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Mが、独立して、G、S、H、P、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、N、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M10が、独立して、Q、E、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M11が、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M12が、独立して、S、G、A、N、Q、R、T、K、E、H、D、P、I、F、V、C、Y、L、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M13が、独立して、T、Q、N、S、D、P、F、A、E、G、H、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M14が、独立して、L、F、I、V、M、Y、A、T、Q、N、S、D、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M15が、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M16が、独立して、T、S、A、E、G、C、R、P、Y、M、V、W、I、F、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M17が、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M18が、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M19が、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M20が、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M21が、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M22が、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M23が、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり
各M24が、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M25が、独立して、F、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M26が、独立して、T、P、F、Q、N、S、A、E、G、D、K、Y、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M27が、独立して、D、E、Q、N、S、T、R、K、G、A、Y、P、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M28が、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M29が、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M30が、独立して、D、Q、N、H、K、G、C、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M31が、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M32が、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M33が、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M34が、独立して、T、A、V、I、P、F、Q、N、S、E、G、D、K、Y、C、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M35が、独立して、G、S、R、N、H、D、P、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M36が、独立して、T、Q、S、A、E、D、K、H、P、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M37が、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M38が、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、C、P、R、Y、E、V、W、T、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M39が、独立して、S、T、E、P、V、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M40が、独立して、T、S、A、D、P、M、Q、E、K、H、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M41が、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M42が、独立して、P、Y、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M43が、独立して、S、E、P、V、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M44が、独立して、N、Q、S、E、D、T、H、K、G、A、P、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M45が、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M46が、独立して、A、T、S、N、R、Y、K、D、H、M、L、F、G、Q、C、P、E、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M47が、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M48が、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M49が、独立して、F、V、A、T、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M50が、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M51が、独立して、G、S、R、H、D、P、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M52が、独立して、T、N、S、G、C、R、H、A、D、P、M、Q、E、K、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M53が、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M54が、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M55が、独立して、D、E、Q、N、S、K、G、A、Y、P、F、T、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M56が、独立して、L、F、I、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M57が、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M58が、独立して、P、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M59が、独立して、N、Q、S、E、D、T、R、K、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M60が、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M61が、独立して、S、P、V、T、A、R、K、E、H、C、Y、I、F、L、N、Q、G、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M62が、独立して、P、K、A、Y、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M63が、独立して、A、G、S、N、E、K、D、H、M、V、W、I、L、F、T、R、Y、Q、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M64が、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M65が、独立して、L、V、F、I、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M66が、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、V、C、Y、I、F、L、Q、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M67が、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M68が、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M69が、独立して、S、A、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各M70が、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、C、R、K、H、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
式XVが、以下のように与えられ、
(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N10-(N11-(N12-(N13-(N14-(N15-(N16-(N17-(N18-(N19-(N20-(N21-(N22-(N23-(N24-(N25-(N26-(N27-(N28-(N29-(N30-(N31-(N32-(N33-(N34-(N35-(N36-(N37-(N38-(N39-(N40-(N41-(N42-(N43-(N44-(N45-(N46-(N47-(N48-(N49-(N50-(N51-(N52-(N53-(N54-(N55-(N56-(N57-(N58-(N59-(N60-(N61-(N62-(N63-(N64-(N65-(N66-(N67-(N68-(N69-(N70-(N71 (式XV)、
式中、
各bが、独立して、0、1、2、又は3であり、
各cが、独立して、1又は2であり、
各Nが、独立して、S、N、D、Q、R、T、G、E、H、A、P、M、V、K、Y、W、F、L、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、P、V、A、S、N、G、E、L、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各Nが、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N10が、独立して、T、Q、N、R、K、M、S、E、D、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N11が、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N12が、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、P、L、M、V、Y、W、F、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N13が、独立して、L、F、I、W、V、M、Y、C、A、T、Q、N、S、G、E、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N14が、独立して、V、I、L、A、T、S、G、R、P、Y、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N15が、独立して、S、N、Q、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、I、F、L、R、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N16が、独立して、T、N、S、A、D、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N17が、独立して、S、N、Q、R、K、E、D、A、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N18が、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N19が、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、Y、M、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N20が、独立して、S、Q、R、K、E、A、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N21が、独立して、V、W、I、C、L、F、A、T、S、E、D、K、G、R、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N22が、独立して、T、Q、N、S、A、D、C、K、P、Y、M、V、W、I、F、G、E、H、R、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N23が、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N24が、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N25が、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N26が、独立して、T、N、D、S、A、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N27が、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N28が、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N29が、独立して、T、S、A、D、C、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N30が、独立して、P、Y、V、A、T、S、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N31が、独立して、T、Q、S、A、G、K、H、P、Y、V、I、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N32が、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N33が、独立して、E、D、Q、N、S、T、H、R、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N34が、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N35が、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N36が、独立して、G、S、K、A、T、Q、D、C、P、Y、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N37が、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N38が、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N39が、独立して、L、F、I、W、V、M、C、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N40が、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N41が、独立して、D、N、R、G、Y、E、Q、S、H、T、K、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N42が、独立して、S、R、E、A、N、T、G、P、V、Q、K、H、D、Y、M、I、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N43が、独立して、G、S、R、K、A、N、Q、H、E、D、P、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N44が、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、N、E、D、C、K、H、R、V、L、M、F、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N45が、独立して、S、T、G、A、V、I、R、E、N、P、Q、K、H、D、Y、M、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N46が、独立して、Cであり、
各N47が、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、Y、V、W、I、L、Q、M、F、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N48が、独立して、G、S、R、K、N、T、Q、H、E、D、P、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N49が、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N50が、独立して、V、A、T、S、G、I、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N51が、独立して、A、T、G、S、Q、N、R、Y、E、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N52が、独立して、D、E、Q、N、S、T、K、A、Y、P、M、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N53が、独立して、A、T、C、G、S、N、P、R、K、D、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N54が、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N55が、独立して、E、D、N、T、R、K、G、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N56が、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、W、K、C、Y、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N57が、独立して、Y、C、N、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N58が、独立して、S、T、G、H、A、P、Y、V、F、L、N、R、K、E、D、W、I、Q、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N59が、独立して、I、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N60が、独立して、Sであり
各N61が、独立して、G、S、R、K、A、N、T、Q、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N62が、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N63が、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり
各N64が、独立して、S、N、Q、R、G、K、E、D、P、Y、W、F、T、H、A、V、L、I、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N65が、独立して、A、C、G、S、Q、N、R、Y、E、K、D、H、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N66が、独立して、V、I、A、T、S、G、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N67が、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N68が、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N69が、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N70が、独立して、D、E、Q、N、S、H、T、R、K、G、A、C、Y、P、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
各N71が、独立して、A、T、C、G、S、Q、N、P、R、Y、E、K、D、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態16~18のいずれか1つに記載のポリペプチド。
20. mが、1であり、Yが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態16~19のいずれか1つに記載のポリペプチド。
21. Zが、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、及び栄養タンパク質からなる群から選択される、実施形態16~20のいずれか1つに記載のポリペプチド。
22. (X-(Y-Zの式を有するポリペプチドをコードする異種核酸分子を含む酵母であって、式中、
は、実施形態1~11のいずれか1つに記載のプレタンパク質シグナルペプチドであり、
は、実施形態12~15のいずれか1つに記載のプロタンパク質シグナルペプチドであり、
は、ペイロードタンパク質であり、
nは、0~1であり、mは、0~1であり、
ただし、n及びmの両方が0ではない、酵母。
23. 酵母が、Kluyveromyces、Pichia、Saccharomyces、Trichoderma、及びAspergillusからなる群から選択される、実施形態22に記載の酵母。
24. 前記酵母が、Kluyveromyces酵母であり、Xが、式I又は配列番号1から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、配列番号20、又は配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態22に記載の酵母。
25. 前記酵母が、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)であり、Xが、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、配列番号20、又は配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態22に記載の酵母。
26. 前記酵母が、Saccharomyces酵母であり、Xが、式III、式IV、若しくは式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、式VII、若しくは式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態22に記載の酵母。
27. 前記酵母が、Trichoderma酵母であり、Xが、式IX又は配列番号31、32、若しくは33から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式X若しくは式XI又は配列番号34、35、36、37、若しくは38から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態22に記載の酵母。
28. 前記酵母が、Aspergillus酵母(例えば、A.niger)であり、Xが、式XIII、又は配列番号70、71、72、若しくは73から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式XIV若しくは式XV又は配列番号74若しくは75から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態22に記載の酵母。
29. Zが、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、殺虫剤、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、及び栄養タンパク質からなる群から選択される、実施形態22~28のいずれか1つに記載の酵母。
30. ペイロードタンパク質を産生するための方法であって、
i)実施形態16~21のいずれか1つに記載のポリペプチドをコードする核酸で酵母をトランスフェクトし、操作された酵母を産生することと、
ii)操作された酵母を増殖させるのに有効な環境で操作された酵母を培養することと、
iii)操作された酵母によるペイロードタンパク質の分泌を誘導することと、を含む、方法。
31. ペイロードタンパク質の分泌を誘導することが、実施形態16~21のいずれか1つに記載のポリペプチドを発現するのに十分な条件下で酵母を培養することを含み、シグナルペプチドの存在が、ペイロードタンパク質の分泌を誘導する、実施形態30に記載の方法。
32. 酵母が、Kluyveromyces、Pichia、Saccharomyces、Trichoderma、及びAspergillusからなる群から選択される、実施形態30又は31に記載の方法。
33. 酵母が、Kluyveromyces酵母であり、Xが、式I又は配列番号1から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI又は配列番号20若しくは配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態30又は31に記載の方法。
34. 酵母が、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)であり、Xが、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI又は配列番号20若しくは配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態30又は31に記載の方法。
35. 酵母が、Saccharomyces酵母であり、Xが、式III、式IV、若しくは式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、式VII、若しくは式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態30又は31に記載の方法。
36. 酵母がTrichoderma酵母であり、Xが、式IX又は配列番号31、32、若しくは33から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式X若しくは式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態30又は31に記載の方法。
37. 酵母が、Aspergillus酵母(例えば、A.niger)であり、Xが、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式XIV若しくは式XV又は配列番号74若しくは75から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態30又は31に記載の方法。
38. 酵母を、培養培地中で増殖させ、方法が、培養培地からペイロードタンパク質を回収することを更に含む、実施形態29~37のいずれか1つに記載の方法。
39. Zが、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、肥料、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質からなる群から選択される、実施形態29~38のいずれかに記載の方法。
40. 疾患又は状態の治療を必要とする対象において、治療を行うための方法であって、治療有効量の実施形態22~29のいずれか1つに記載の酵母を対象に投与することを含む、方法。
41. 疾患又は状態が、感染症、自己免疫疾患、原発性(先天性)酵素欠損症、機能性腸障害に続発する酵素欠損症、糖尿病、肥満、代謝障害、腸内細菌異常増殖症、腸感染症、細菌性膣症、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、小腸症候群、セリアック病、グルテン不耐症、大腸炎、消化性潰瘍、又は別の胃腸の状態若しくは障害から選択される、実施形態40に記載の方法。
42. 疾患又は状態が、酵素欠損症であり、ペイロードタンパク質が、酵素である、実施形態40又は41に記載の方法。
43. 疾患又は状態が、先天性スクラーゼ・イソマルターゼ欠損症であり、ペイロードタンパク質が、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である、実施形態40又は41に記載の方法。
44. 疾患又は状態が、機能性腸障害に続発するスクロース及びイソマルターゼ不耐症のうちの一方又は両方であり、ペイロードタンパク質が、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である、請求項40又は41に記載の方法。
45. 疾患又は状態が、グルテン不耐症、難治性スプルー、又はセリアック病のうちの1つ以上であり、ペイロードタンパク質が、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン(sedolisin)、及びラロゾチド(larozotide)のうちの1つ以上である、実施形態40又は41に記載の方法。
46. 疾患又は状態が、膵炎又は膵外分泌機能不全であり、ペイロードタンパク質が、トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上から選択される、請求項40又は41に記載の方法。
47. 疾患又は状態が、エンテロペプチダーゼ欠損症又はエンテロキナーゼ欠損症であり、ペイロードタンパク質が、エンテロペプチダーゼ、プロエンテロペプチダーゼ、及びエンテロキナーゼのうちの1つ又は全てである、実施形態40又は41に記載の方法。
48. 疾患又は状態が、小腸内細菌異常増殖症、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、C.difficile感染症、嚢胞性線維症、壊死性腸炎、及び糖尿病であり、ペイロードタンパク質が、腸アルカリホスファターゼである、実施形態40又は41に記載の方法。
49. 疾患又は状態が、短腸症候群であり、ペイロードタンパク質が、IGF-1、GLP-2、又はGLP-2の合成誘導体である、実施形態40又は41に記載の方法。
50. 疾患又は状態が、ラクトース過敏症又はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質が、ラクターゼである、実施形態40又は41に記載の方法。
51. 疾患又は状態が、トレハロース過敏症又はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質が、トレハラーゼである、実施形態40又は41に記載の方法。
52. 疾患又は状態が、マルトース過敏症又はラクトース不耐症であり、ペイロードタンパク質が、マルターゼである、実施形態40又は41に記載の方法。
53. 疾患又は状態が、悪性貧血であり、ペイロードタンパク質が、内因子である、実施形態40又は41に記載の方法。
54. 疾患又は状態が、細菌異常増殖症であり、ペイロードタンパク質がリゾチーム、ナイシン、デフェンシン、マガイニン、カテスリチン(cateslytin)、又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態40又は41に記載の方法。
55. 状態が、E.coli、C.difficile、vibrio cholera、Shigella、Salmonella、Cryptosporidium、又はそれらの任意の組み合わせのうちの1つ以上によって引き起こされる細菌感染症である、請求項40又は41に記載の方法。
56. 状態が、ウイルス感染症である、実施形態40又は41に記載の方法。
57. 疾患又は状態が、1型糖尿病又は2型糖尿病であり、ペイロードタンパク質が、インスリン、又はインクレチンである、実施形態40又は41に記載の方法。
58. 投与が、経口又は局所である、実施形態40又は41に記載の方法。
59. 疾患又は状態が、炎症性要素を有し、ペイロードタンパク質が、IL-10、IL-22、TGFβ、抗TNFα抗体若しくはその断片、又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態40又は41に記載の方法。
実施例1:マルトース結合タンパク質(MBP)の分泌に対する合成シグナルペプチドの効果。配列番号1によって表されるアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチド(synKlac-v1)の機能性及び分泌活性は、synKlac-v1をコードする核酸をK.lactisに基づく市販の発現システムキットに組み込んで、標準的なプレタンパク質シグナルペプチドα-MFを、synKlac-v1をコードする核酸で置換することによって、測定した。式I又は配列番号1をコードする核酸(DNA)配列は、K.lactisゲノムから取得された配列番号39のヌクレオチドによって表される。
合成シグナルペプチドsynKlac-v1を使用したMBPの分泌を、K.lactis(α-MF)由来のアルファ接合因子を含む標準構築物を利用した産生と比較した。synKlac-v1が存在する場合、プロタンパク質シグナルペプチド及びKR部位が必須ではないという仮説を検証するために、プロタンパク質シグナルペプチド及びKR部位モチーフを含まないα-MFを特徴とする対照組換えポリペプチドを作製した(α-MF(PPSPなし)。
誘導性ガラクトースプロモーターによって駆動されるように、数時間間隔にわたって増殖させた酵母から得られた無細胞上清中のMBPの分泌を測定することによって、synKlac-v1、α-MF、及びα-MF(PPSPなし)の分泌効率を定性的及び定量的に評価した。図2は、3時間、9時間、28時間、及び55時間の4つの異なる時点でウェスタンブロットを使用して検出されたMBPタンパク質産生を示す。各組換えポリペプチドバリアントに由来するMBPタンパク質の発現を、800nmの発光波長を有する二次抗体の検出及び定量化を使用して、4回の反復で測定した。3時間の時点で得られた2つの試料を使用してシグナルを正規化し、ウェスタンブロットゲル間のシグナルの比較を可能にした。更に、各ゲルは、各時点で各レーンで検出されたタンパク質量が、同数の細胞、約10コロニー形成単位(CFU)、のK.ラクティスに由来するように光学密度によって正規化された無細胞上清を特徴とした。
図2に示される結果は、各時点で、プロタンパク質シグナルペプチドの欠如にもかかわらず、synKlac-v1合成シグナルペプチドによって駆動されるタンパク質分泌が、α-MFによって駆動されるタンパク質分泌よりも優れていたことを実証する。これらの結果は、合成シグナルペプチドsynKlac-v1を使用してタンパク質分泌を駆動する場合、プロタンパク質シグナルペプチド及びKR部位は必要ではないという仮説を確認し、synKlac-v1機能が現在使用中の分泌シグナルペプチドと比較して、時間及び細胞増殖期にわたって優れていることを示した。更に、これらの結果は、プロタンパク質シグナルペプチドが存在しないα-MFが機能を維持しているが、変更されたα-MFが、インタクトなα-MFと比較して低い効率を有することを示した。
このようにして得られたウェスタンブロットデータを、MBPタンパク質に結合した抗体によって生成された蛍光シグナル強度を測定することによって定量化した。各組換えポリペプチドバリアントについてのデータを、時間及び細胞培養増殖についてプロットした。図3A及び図3Bに示す結果は、酵母培養の初期であっても、天然シグナルペプチドα-MF又はα-MF(PPSPなし)を使用して分泌されたMBPの濃度と比較した場合、培養培地が、合成シグナルペプチドsynKlac-v1を使用して分泌されたMBPのより高い濃度を含有することを示す。約25時間の培養時間後のsynKlac-v1に由来するMBPタンパク質の濃度(及び約25~30の光学密度)は定常期に達し、天然シグナルペプチドα-MF又はα-MF(PPSPなし)を使用して分泌されたMBPの濃度よりも約3倍高い。
組換えポリペプチドバリアントの各々のMBP転写物レベルを測定して、検出された分泌の増加がmRNA転写物産生の増加に起因するものではないことを確認した。図4は、定量的PCRを使用するMBP RNA発現の定量から得られた結果を示す。細胞培養物をガラクトースを含有する誘導培地に移した後、28時間に各試料からRNAを収集した。cDNAを各試料に対して合成し、2つの異なる酵母クローンに対して定量的PCRを実施した。MBPタンパク質産生を、アクチン発現に対して正規化した。エラーバーは、各クローンに対する3つの生物学的反復測定からの標準偏差を示す。図4に提示されるデータは、synKlac-v1が酵母においてα-MFよりも高いMBPタンパク質の分泌をもたらすことを示し、分泌の有意な増加がmRNA転写物産生の増加に起因するものではないことを確認した。
実施例2:TNFαの分泌に対する合成シグナルペプチドの効果
酵母からのペイロードタンパク質の分泌を指示できる追加の合成シグナルペプチドを同定及び設計するために、synKlac-v1に変異を導入した。本開示の方法に従って設計された合成シグナルプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドは、試験された全ての酵母株においてペイロードタンパク質の分泌を増加させ、過去30年間、分泌のゴールドスタンダードと考えられてきたα-MFによって駆動される分泌よりも優れていることが実証された。
他のペイロードに対するsynKlac-v1の分泌効率を検証するために、抗TNFα抗体断片の分泌を試験した。分泌を、synKlac-v1又はα-MFのいずれかによって駆動される抗TNFαを分泌するK.lactis株の間で比較した。酵母を誘導培地中で24時間増殖させ、その後、培養上清をELISA分析に供した。図5は、ELISA由来シグナル値を600nmでの培養物の光学密度で割ることによって導き出された任意の単位で報告された分泌効率を示す。エラーバーは、4つの生物学的反復からの平均の標準誤差を示す。要約すると、図5の結果は、synKlac-v1が、K.lactisにおいてα-MFによって誘導される分泌の30%を超える多さの抗TNFα分泌を誘導することを示す。
S.boulardiiからの抗TNFα抗体断片の分泌も調査した。2つの合成シグナルペプチドバリアント、Sbouバリアント1及びSbouバリアント2を試験した(図28)。両方のバリアントは、配列番号14によって表されるプレタンパク質シグナルペプチドを含む。Sbouバリアント1は、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含有しない一方で、Sbouバリアント2は、配列番号22によって表されるプロタンパク質シグナルペプチドを更に含む。酵母を誘導培地中で24時間増殖させ、その後、培養上清をELISA分析に供した。図29は、ELISA由来シグナル値を600nmでの培養物の光学密度で割ることによって導き出された任意の単位で報告された分泌効率を示す。エラーバーは、4つの生物学的反復からの平均の標準誤差を示す。要約すると、図29の結果は、Sbouバリアント1(合成プロタンパク質シグナルペプチドなし)が、Sbouバリアント2(プロタンパク質シグナルペプチドを含有する)と比較してTNFα分泌を増加させたことを示す。
実施例3:フィターゼの分泌に対する合成シグナルペプチドの効果。方法を生物製剤又は他の生物産物を生成するために日常的に使用される他の酵母株にも拡張するために、合成シグナルペプチドを、P.pastorisにおける使用及び発現のために設計した。各々が合成プレタンパク質シグナルペプチドを含むが、プロタンパク質シグナルペプチドを欠く4つの組換えポリペプチドバリアントを、P.pastoris用の市販の発現プラスミド(Pichia Expression Kit-K1710-001、Invitrogen(登録商標)から入手可能)にクローニングした。Escherichia coli由来のフィターゼ酵素の商業的に有意なバージョン(Nov9X、ABVista(登録商標))をこれらのプラスミドにクローニングし、Pichiaにおいて日常的に使用される2つのシグナルペプチドに対し、プレタンパク質シグナルペプチドのP.pastorisでのフィターゼ酵素の分泌を促進する能力を試験した。これらの組換えポリペプチドバリアントの構築物を図6に示す。
酵素活性アッセイを使用して測定された、S.cerevisiae α-MF(配列番号2)、PHO1(配列番号30)由来のシグナルペプチド、又は配列番号4(synPichia-v1)、配列番号5(synPichia-v2)、配列番号6(synPichia-v3)、若しくは配列番号7(synPichia-v4)によって表されるアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドを発現しているP.pastoris株によって分泌されるフィターゼの量。具体的には、フィターゼは、フィチン酸ドデカナトリウム基質(7.5mMのフィチン酸、100mMのNaOAc、pH5.5)から遊離した遊離リン酸の量を定量化することによって推定されるフィターゼ活性を通して間接的に測定された。異なる希釈度の50μLのP.pastoris培養上清(誘導培地(BMMY)中で48時間増殖)を、100μLの基質とともに37℃で1時間インキュベートした。100μLのColor Stop試薬(モリブデン酸アンモニウム、バナジン酸アンモニウム、及び硝酸)を添加することによって反応を停止させ、415nmでの吸光度を測定した。フィターゼの量を、米由来の精製フィターゼ酵素を使用して生成された標準曲線を使用して定量した。次いで、フィターゼの量を、培養物の対応するCFUで(除算して)正規化した。図6における各組換えポリペプチドバリアントについての正規化フィターゼ収量は、3つの生物学的反復から導き出された。α-MF-フィターゼポリペプチドに対応する正規化されたフィターゼ収量を1(1)に設定し、互いの組換えポリペプチドバリアントの比較収量を報告する。合成シグナルペプチドsynPichia-v1又はsynPichia-v4を含む組換えポリペプチドは、天然α-MFシグナルペプチドを含む組換えポリペプチドと比較した場合、フィターゼの分泌の最大20%の増加を示し、PHO1シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドと比較した場合、40%を超える増加を示す。synPichia-v2及びsynPichia-v3を含む組換えポリペプチドの結果は示されていない。
実施例4:インスリンの分泌に対する合成シグナルペプチドの効果。優れたシグナルペプチドの設計におけるアプローチの有効性を試験し、最も広く使用されている市販の酵母であるS.cerevisiaeへのアプローチを拡張するために、いくつかのバージョンの合成シグナルペプチドを設計した。合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチド、又は合成プロタンパク質シグナルペプチドと融合した合成プレタンパク質シグナルペプチドのいずれかを含有した。これらの合成シグナルペプチドを、酵母におけるインスリンの発現に日常的に使用されるプラスミドにクローニングし、各々からのインスリンの分泌を測定し、S.cerevisiaeからのインスリンの生成に日常的に使用される他のシグナルペプチドと比較した。配列番号20(synScer-v5)に融合された配列番号9によって表されるアミノ酸配列を含む合成シグナルペプチドを含む組換えポリペプチドバリアントの性能を、α-MF及び酵母アスパラギン酸プロテアーゼ3(YAP)のインスリンを分泌する性能と比較した。
図7に示すように、合成シグナルペプチドを使用して、インスリン分泌は改善された。図7は、a)synScer-v5合成シグナルペプチド、b)α-MFシグナルペプチド、及びc)optYAPに融合されたインスリンをコードする核酸を有するプラスミドを保有する酵母株におけるCFU当たり分泌されたインスリンの量を示す。各組換えポリペプチドバリアントをコードする核酸を含むプラスミドを含有するS.cerevisiae培養物を48時間増殖させ、各培養上清中のインスリンをELISAを使用して定量した。正規化されたインスリン収量を、ELISA由来シグナルをCFUの数で割ることによって生成し、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。プラスミドコピー数の変化に起因し得る転写レベルの変動を説明するために、インスリン正規化収量を、試験した各バリアントのインスリンmRNAレベルに対して正規化した。RNAを各バリアント試料から収集した。各試料についてcDNAを合成し、定量的PCR(qPCR)を行った。インスリン産生を、TAF10(YDR167W)遺伝子の発現に対して正規化した。次いで、各バリアントのインスリン正規化収量を、TAF10発現値で割った。異なるqPCRアッセイにわたる変動性を説明するために、synScer-v5バリアントに対応する試料を、α-MF及びoptYAPバリアントの試料で別々にアッセイした。このデータは、図7A及び7Bの2つの別個のグラフに提示される。エラーバーは、少なくとも3つの生物学的反復測定からの平均の標準誤差を示す。図7に提示されるデータは、配列番号20に融合された配列番号9によって表されるアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドを含む合成シグナルペプチドの使用が、S.cerevisiaeにおけるα-MF及びoptYAPバリアントよりも約2倍高い分泌効率を提供することを示す。
実施例5:インベルターゼの分泌に対する合成シグナルペプチドの効果。合成プロタンパク質シグナルペプチドを含む/含まない最適化されたシグナルペプチドの異なるバージョンについても、スクロース不耐症(例えば、先天性スクラーゼ・イソマルターゼ欠損症、機能性腸障害)の治療のため、S.boulardiiにおけるインベルターゼの分泌について試験した。合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナル、又は合成プロタンパク質シグナルと融合した合成プレタンパク質シグナルのいずれかを含有した。これらの合成シグナルペプチドをコードする核酸を、S.boulardiiでタンパク質の発現するように設計されたプラスミドにクローニングし、各々からのインベルターゼの分泌を測定し、S.boulardiiで天然インベルターゼタンパク質をコードするSUC2遺伝子の内因性バージョンに存在する天然シグナルペプチドと比較した。
図8に示すように、インベルターゼ分泌は、インベルターゼに天然の分泌単独で使用した場合と比較して、合成シグナルペプチドを使用した場合に150%を超えて増加した。図8は、配列番号25(synScer-v1)に融合された配列番号9によって表されるアミノ酸を含む合成シグナルペプチド及び天然シグナルペプチドを有するインベルターゼをコードする核酸を有するプラスミドを保有する酵母株におけるCFU当たり分泌されるインベルターゼの量を示す。分泌されたインベルターゼの大部分は酵母細胞のペリプラズムに蓄積することが知られており、その一部は増殖培地中に排出されることも知られている。各組換えポリペプチドバリアントをコードする核酸を含むプラスミドを含有するS.boulardii培養物を、プラスミドの選択のためにG418抗生物質を含む標準的なYPD培地中で24時間増殖させ、培養上清並びにこれらの細胞のザイモリアーゼ処理によって調製されたペリプラズム抽出物におけるインベルターゼ活性を評価した。発現した組換えインベルターゼを、ニッケル親和性クロマトグラフィーを使用して精製した。インベルターゼ活性を、SIGMAからのキットを使用して精製された抽出物から測定し、正規化されたインベルターゼ収量を、インベルターゼ活性をCFUの数で割ることによって生成し、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。
追加の合成ペプチドバリアントも、同じ方法を使用して調査した(Sbouバリアント1~Sbouバリアント12)。図22は、試験されたバリアントを示す。Sbouバリアント1~4によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号14によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント5~8によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号15によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント9~12によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号16によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント1、5、及び9は、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含まない。Sbouバリアント2、6、及び10は、配列番号22によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。Sbouバリアント3、7、及び11は、配列番号23によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。Sbouバリアント5、8、及び12は、配列番号24によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。これらのバリアントを使用したS.boulardiiからのインベルターゼ分泌の、野生型、天然のプレタンパク質シグナルペプチド、及びsynScer-v1と比較した結果を、図23に示す。結果は、合成シグナルペプチドのSbouバリアントクラスの選択メンバーが、野生型、天然のプレタンパク質シグナルペプチド、及びsynScer-v1と比較して、インベルターゼ分泌の増加をもたらすことを示す。
合成シグナルペプチドを使用して分泌されたインベルターゼ酵素の活性に対するpHの効果を、SIGMAから入手した純粋な酵母インベルターゼ酵素の活性と比較した。図9は、市販の精製酵素と比較して、操作された酵母によって分泌されるインベルターゼの活性が類似であるか又は改善されたことを示し、したがって合成シグナルペプチドが分泌されたインベルターゼのpHプロファイルを損なわないことを示す。
腸内のインベルターゼの送達剤としてのS.boulardiiの有用性を明らかにするために、マウスに、合成シグナルペプチドsynScer-v1(配列番号25に融合された配列番号9)又は天然シグナルペプチドのいずれかを有するインベルターゼをコードするプラスミドを担持するS.boulardii株を胃管栄養法によって経口投与した。次いで、インベルターゼ発現酵母を与えられたマウスに、スクロースを経口投与した。マウスにおけるインベルターゼ活性の代用として血糖値をモニタリングした。図10に示す血糖値は、おそらくこれらの操作された酵母によるインベルターゼの分泌速度が高いことに起因して、synScer-v1保有酵母を提供したマウスにおいて、より高いレベルのインベルターゼ活性を示している。
S.boulardii酵母を、操作された酵母の投与を受けたマウスの消化器系の様々な組織から単離した。組織を各マウスから抽出し、PBSですすぎ、次いでG418抗生物質を用いて標準的な増殖培地上に異なる希釈率でプレーティングした。図11に見られるように、操作された酵母の投与を受けたマウスは、播種された全ての組織においてその酵母を保持しているようである。また、大腸炎(デキストラン硫酸ナトリウム(DSS)で4日間処置)を有するマウスの小胃腸組織では酵母の保持がより高く、したがって、疾患を軽減するのに有益であることが判明する可能性のあるペイロードを増加させる送達の機会を提供することも注目すべきである。
合成シグナルペプチドsynScer-v1を有するインベルターゼをコードするプラスミドを保有するS.boulardii株から分泌されるインベルターゼの量を、S.boulardii野生型株と比較した。CFU当たりの総量は、S.boulardiiペリプラズム抽出物からのインベルターゼ活性を測定し、そのインベルターゼ活性をCFUの数で割ることによって推定され、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。図12に見られるように、操作されたS.boulardii株は、野生型S.boulardii株と比較して、7倍高いインベルターゼ酵素/CFUを産生した。スクロース不耐症(例えば、先天性スクラーゼ・イソマルターゼ欠損症、機能性腸障害)の治療に使用されるサクロシダーゼ(SUCRAID(登録商標))の1回用量に相当する、17,000単位のインベルターゼ活性を生成するのに、約10CFUの操作されたS.boulardii株で十分であることが推定された。したがって、このアプローチで使用される合成シグナルペプチドは、対応する用量の野生型S.boulardiiよりも約10倍高いスクラーゼペイロードを提供する可能性があるため、重要なプロバイオティクスペイロードの送達のための堅牢な送達ビヒクルを提供することができる可能性がある。更に、スクラーゼ・イソマルターゼ障害(CSID)を治療するために使用されるSUCRAID(登録商標)には、アレルギー反応を引き起こすことが観察されているパパインが含まれる。対照的に、使用される合成シグナルペプチドは、アレルギー反応のリスクが低いCSIDを治療するための方法を提供することができる可能性がある。
実施例6:IGF-1の分泌に対する合成シグナルペプチドの効果。短腸症候群の治療のために、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含む/含まない合成シグナルペプチドを有する最適化されたシグナルペプチドの様々なバージョンも、S.boulardiiにおけるIGF-1の分泌について試験した。特定の合成シグナルペプチドには、配列番号20(synScer-v5)、21(synScer-v4)、又は25(synScer-v1)と組み合わせた配列番号9が含まれた。合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナルペプチド、又は合成プロタンパク質シグナルペプチドと融合した合成プレタンパク質シグナルペプチドのいずれかを含有した。これらの合成シグナルペプチドをコードする核酸を、S.boulardiiでインスリン様成長因子1(IGF-1)タンパク質の発現するように設計されたプラスミドにクローニングした。各々からのIGF-1の分泌を、ELISAを使用して測定した。操作されたS.boulardii株及び野生型のS.boulardii株を、標準的な増殖条件で24時間増殖させた。分泌されたIGF-1のレベルは、培養上清に対してELISAを行うことによって定量化され、次いで、IGF-1量をCFUの数で割ることによって正規化されたインベルターゼ収量として表され、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。図13に示されるように、異なる合成シグナルペプチドは、S.boulardii由来の培養上清においてIGF-1の強い分泌を示すが、分泌シグナルを有しない野生型酵母は、培養上清においていかなるIGF-1も示さない。
実施例7:リゾチーム分泌に対するシグナルペプチドの効果。小腸内細菌異常増殖症、回腸嚢炎、C.difficile感染症、又は任意の他の腸感染症の治療のために、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含む/含まない最適化されたシグナルペプチドの様々なバージョンはまた、S.boulardiiにおけるリゾチーム分泌について試験した。合成シグナルペプチド又はα-MFなどの酵母からタンパク質を分泌するために日常的に使用されるシグナルペプチドを有するリゾチームをコードする核酸を有するプラスミドを保有するS.boulardii株を構築した。特定の合成シグナルペプチドには、配列番号20(synScer-v5)又は21(synScer-v4)と組み合わせた配列番号9が含まれ、配列番号9は、S.cerevisiaeプロタンパク質シグナルペプチドα-MF(配列番号2)と融合された。
リゾチーム活性は、α-MFシグナル又は合成シグナルペプチドのいずれかをコードする異なるプラスミドを保有するS.boulardii培養物の培養上清から推定され、また対照としてプラスミドを全く含まないスウィル型(swill-type)のS.boulardii株の培養上清からも推定された。株を72時間増殖させ、市販のキットを使用してリゾチームの酵素活性を推定した。CFU当たりの総量は、S.boulardii上清からリゾチーム活性を測定し、リゾチーム活性をCFUの数で割ることによって推定され(CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定される)、次いで野生型S.boulardii株の上清から測定されたバックグラウンド活性/CFUを差し引きすることによって推定された。図14に見られるように、合成シグナルペプチド(例えば、synScer-v4又はsynScer-v5)をコードするプラスミドを保有する菌株は、α-MFプラスミドを保有する株と比較して、CFU当たり約50%高いレベルのリゾチームを生成した。したがって、合成シグナルペプチドは、S.boulardiiからのリゾチーム分泌を助ける。
これらの結果に基づいて、同じ方法を使用して、追加の合成ペプチドバリアントも調査した(Sbouバリアント1~Sbouバリアント12)。図24は、試験されたバリアントを示す。Sbouバリアント1~4によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号14によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント5~8によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号15によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント9~12によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号16によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント1、5、及び9は、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含まない。Sbouバリアント2、6、及び10は、配列番号22によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。Sbouバリアント3、7、及び11は、配列番号23によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。Sbouバリアント5、8、及び12は、配列番号24によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。追加のバリアントであるSbou-ニワトリリゾチームも試験し、これは、配列番号55によって表されるアミノ酸配列を含むプレタンパク質合成ペプチドシグナルを含み、追加の合成プロタンパク質シグナルペプチドを含まない。結果を図25に示す。
図25に示されるように、分泌の有効性は、プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの性質に大きく依存していた。配列番号14によって表されるプレタンパク質シグナルペプチドを含むバリアント(Sbouバリアント1~4)については、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含めることにより、リゾチーム分泌が減少した。この観察は、配列番号15によって表されるプレタンパク質シグナルペプチドを含むバリアント(Sbouバリアント5~8)に対しても当てはまる。しかしながら、配列番号16によって表されるプレタンパク質シグナルペプチドを含むバリアント(Sbouバリアント9~12)については、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含めることは、リゾチーム分泌を増加させた。したがって、結果は、タンパク質分泌を増加させるための明確かつ明白な規則(例えば、プロタンパク質シグナルペプチドの包含又は除外)がないことを示し、むしろ分泌の量は、プレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの異なる性質、並びに個々のプレタンパク質シグナルペプチド及びプロタンパク質シグナルペプチドの異なる組み合わせに依存することを示している。
実施例8:マウス胃腸における操作された酵母の生体内分布
5匹の健康なC57BL/6マウスに、蛍光タンパク質(mCherry)を発現するように操作された10CFUのS.boulardiiを経口投与した。酵母細胞を、他の製剤賦形剤を含まない300mLのPBS中に懸濁した。
経口投与の1.5、3、6、24、及び48時間後、マウスを屠殺し、その消化管を取り出し、ThermoFisher、iBright CCDカメラで撮像した。画像を図15に示し、蛍光シグナルは黒色で報告される。
得られた画像は、酵母生存及び上部消化管を通した蛍光タンパク質の展開を最大24時間示し、盲腸内で便へのパッケージングにより消化管への曝露は少ない。酵母用量は、48時間までにほとんど枯渇し、これは、S.boulardiiが胃腸生着菌ではないことを示す以前の文献と一致する。これは、規制当局が非コロニー形成/非生着シャシー株を優先しているため、組換え生存生物学的療法(recombinant live biotherapeutic)に関して重要な特性である。
実施例9:凍結乾燥後の活性
本明細書に開示されるように、操作された酵母は、凍結乾燥及びフリーズドライ後にも活性を保持しており、これは、この形態の安定性だけでなく貯蔵及び輸送の容易さを考慮すると特に有利である。凍結乾燥後、本明細書に開示されるように、操作された酵母は、スクラーゼを発現する操作されたS.boulardiiを使用して試験した場合、生理学的に代表的なスクロースチャレンジ(腸液1mL当たり80mg)に対して、腸液を模倣した条件下での用量範囲にわたって、野生型酵母よりも少なくとも3倍及び最大40倍優れた活性を示す。このような高い活動により 市販製品の範囲内の活性レベル、例えばSUCRAID(商標)(17,000IU)を達成するために必要なCFUの数は、少なくとも1gの凍結乾燥生成物を必要とする野生型酵母の場合は1010CFU/用量の予測値から、約250mg以下の用量で製剤化され得る操作された酵母を使用した場合は10CFU/用量であり、CSID介入は、早年齢の子供に使用できなければならないため、経口摂取のための錠剤の設置面積を最小化することに関して重要な利点になる。このデータを図16に示す。
合成シグナルペプチドを使用して分泌されたインベルターゼ酵素の活性に対するpHの効果を、SIGMAから入手した純粋な酵母インベルターゼ酵素の活性と比較した。図17は、市販の精製酵素と比較して、凍結乾燥された操作された酵母によって分泌されるインベルターゼの類似又は改善された活性を示し、したがって、図9に示すように、操作された酵母を凍結乾燥することが、非凍結乾燥形態と比較して、様々なpHで、特に近位上部消化管における状態を表す5より小さいpHレベルでは分泌型インベルターゼの変化活性プロファイルを低下させないことを示す。
実施例10:グルコース非感受性
SUCRAID(商標)などの市販の酵母産物と比較した別の利点は、そのような市販の酵母におけるスクラーゼ/インベルターゼ活性がグルコースの存在下で抑制されることである。グルコースは、スクラーゼ/インベルターゼ活性自体の副産物であり、したがって、グルコース副産物が環境中に蓄積するにつれて、酵素活性インベルターゼ/スクラーゼを自動調節して活性を低下させる。したがって、グルコースが蓄積すると、野生型酵母の治療活性が減少する。対照的に、本明細書に開示される操作された酵母は、天然に発現された酵素に追加される発現系を利用し、したがってスクラーゼ/インベルターゼ発現及び、したがって活性はグルコースに対して非感受性である。これは、野生型S.boulardiiと比較して、2%対0.05%グルコースで増殖させた培養物間で発明者らの操作されたS.boulardii発現スクラーゼの活性損失を定量化することによって試験された。結果を図18に示す。特に、高グルコース環境では、操作されたS.boulardii酵母(左)は、野生型S.boulardii(右)よりも低いインベルターゼ活性の喪失を示す。
実施例11:マウス胃腸においてインベルターゼを分泌する操作された酵母の生体内分布
25匹の健康なC57BL/6マウスに、シグナル伝達ペプチドsynScer-v1を使用してインベルターゼを発現するように操作された10CFUのS.boulardiiを経口投与した。酵母細胞を、他の製剤賦形剤を含まない300mLのPBS中に懸濁した。
経口投与の1.5、3、6、24、及び48時間後、5匹のマウスを屠殺し、その消化管を取り出し、S.boulardiiのCFUの数を、各時点で切除された胃腸組織試料をホモジナイズし、酵母選択寒天を含むペトリ皿上にプレーティングすることによって定量した。結果を図19に示し、酵母用量は、消化の時間スケールで胃腸において持続しており、その活性が最も必要とされる(例えば、1~6時間にわたって)。酵母は、48時間までにほとんど枯渇し、これは、S.boulardiiが胃腸生着菌ではないことを示す以前の文献と一致する。これは、規制当局が非コロニー形成/非生着シャシー株を優先しているため、組換え生存生物学的療法に関して重要な特性である。
実施例12:マウス胃腸においてインベルターゼを分泌する操作された酵母のインビボ活性
9匹の健康な、離乳したばかりの3週齢のC57BL/6マウスを入手し、1週間無糖食餌に置き、その後2g/kgのスクロースを経口的にチャレンジし、次に10CFUの野生型S.boulardii、シグナル伝達ペプチドsynScer-v1を使用してインベルターゼを発現するように操作されたS.boulardii、又は300μLのPBSのいずれかを経口投与した(群当たり3匹のマウス)。酵母細胞を、他の製剤賦形剤を含まない300μLのPBS中に懸濁した。
経口投与の15分、30分、60分、90分、120分、及び150分後、用量活性を、Accuchek(商標)血糖測定器を使用して記録されたマウス血糖値の定量化を介して測定し、消化管における経口スクロースチャレンジの破壊の結果として血糖の増加が予想され、結果として、血中で検出可能なレベルでマウス胃腸組織によって吸収されるグルコース副産物の蓄積をもたらす。結果を図20に示し、PBS対照と比較した酵母用量で血糖変動曲線が見られ、図21に示すように、それぞれのグルコース変動曲線の下面積(AUC)によって決定されるように、野生型酵母と比較して操作された酵母では25%高い活性が観察された。重要なことに、この結果は、ヒトで使用されると予想される用量よりも少なくとも10倍低い10CFU用量で達成された。
実施例13:ベータ-ガラクトシダーゼ又はラクターゼの分泌に対するS.boulardii合成シグナルペプチドの効果
ラクトース不耐症の治療のために、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含むS.boulardii最適化シグナルペプチドを、S.boulardiiにおけるラクターゼの分泌について試験した。合成シグナルペプチドは、合成プロタンパク質シグナルとともに使用される合成プレタンパク質シグナルを含有した。これらの合成シグナルペプチドをコードする核酸を、S.boulardiiでタンパク質を発現するように設計されたプラスミドにクローニングし、ラクターゼの分泌を測定した。野生型S.boulardii細胞を対照として使用した。
図27に示すように、S.boulardii細胞は、ラクターゼを分泌するように首尾よく操作されている。図27は、配列番号22に融合された配列番号14によって表されるアミノ酸を含む合成シグナルペプチド(Sbou-variant2)を有するラクターゼをコードする核酸を有するプラスミドを保有する酵母株におけるCFU当たりで分泌されるラクターゼの量を示す。分泌されたラクターゼは、増殖培地中に排出される。各組換え融合タンパク質バリアントをコードする核酸を含むプラスミドを含有するS.boulardii培養物を、プラスミドの選択のために、G418抗生物質を含む標準的なYPD培地中で24時間増殖させ、培養上清中のラクターゼ活性で評価した。ラクターゼは、ラクトースをグルコースとガラクトースに加水分解する。活性は、培養上清を基質ラクトースとインキュベートすることによって測定され、遊離グルコースは、Thermo Fisher製のキット(Amplex Red Glucoseアッセイキット、カタログ番号A22189)を製造業者の指示に従って使用して測定された。次いで、ラクターゼ活性を、1単位のラクターゼ活性が、pH4.5、37℃で1.0μmolのグルコース/分で生成する酵素の量と等しいとする式を使用して計算した。遊離されたグルコースの量は、ラクターゼ活性をCFUの数で割ることによって正規化され、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。ラクトース不耐症の治療に使用されるLACTAID(登録商標)の1用量に相当する、9000単位のラクターゼ活性を生成するには、約10^9CFUの操作されたS.boulardii株で十分であると推定された。10^9CFUのS.boulardiiは、経口プロバイオティクス製品用に配合される業界標準の量の酵母であるため、これらのデータは、配列番号14及び配列番号22への融合を介したラクターゼ分泌用に操作されたS.boulardii株の生存率が、ラクトース不耐症に対する治療的上実行可能な介入を表すことを示している。
実施例14:抗TNFα抗体断片の分泌に対するS.boulardii合成シグナルペプチドの効果
合成プロタンパク質シグナルペプチドを含む/含まない最適化されたシグナルペプチドの異なるバージョンも、S.boulardiiにおける抗TNFα抗体断片の異なるバージョンの分泌について試験した。抗TNFα抗体は、腸の炎症性腸疾患を含む炎症性疾患の臨床のゴールドスタンダード療法で使用される。操作された酵母によって送達される抗TNFα抗体断片の一価又は二価形態は、同様に腸における治療目的に使用され得る。合成シグナルペプチドは、合成プレタンパク質シグナル、又は合成プロタンパク質シグナルと融合した合成プレタンパク質シグナルのいずれかを含有した。これらの合成シグナルペプチドをコードする核酸を、S.boulardiiでタンパク質を発現するように設計されたプラスミドにクローニングし、一価又は二価形態の抗TNFα抗体断片のいずれかの分泌を分析した。
図30に見られるように、S.boulardii細胞は、抗TNFα抗体断片を分泌するように首尾よく操作されている。図30は、配列番号14のみ(Sbou-variant1)によって表されるか、又は配列番号22(Sbou-variant2)に融合されたアミノ酸を含む合成シグナルペプチドを有する6×HISタグ付き一価又は二価抗TNFαのいずれかをコードする核酸を有するプラスミドを保有する酵母株において、CFU当たりに分泌される一価抗TNFα抗体断片の量を示す。分泌された抗TNFα抗体断片は、増殖培地中に排出される。各組換え融合タンパク質バリアントをコードする核酸を含むプラスミドを含むS.boulardii培養物を、プラスミドの選択のためにG418抗生物質を含む標準的なYPD培地中で24時間増殖させ、Perkin-Elmer AlphaLISAキット(抗6xHis AlphaLISAアクセプタービーズカタログ番号AL178C、抗FLAGアルファドナービーズカタログ番号AS103D)を使用して、製造業者の指示を使用して、培養上清中の抗TNFα活性を評価し、培養上清からの抗TNFα-6xHisとTNF-アルファ-FLAG多量体タンパク質(カタログ番号50-114-6050、Fisher Scientific)との間の結合を検出した。上清からのELISA活性を、増殖培地を使用してバックグラウンドを差し引いた後、活性をCFUの数で割ることによって正規化し、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。図30に示される結果に基づいて、一価抗TNFα抗体断片が、Sbouバリアント1で最適な分泌を示す(図30a)一方で、二価抗TNFa抗体断片が、Sbouバリアント2で最適な分泌を示す(図30b)ことは明らかである。したがって、S.boulardii細胞は、複数のバージョンの抗炎症性抗TNFaのタンパク質を分泌するように首尾よく操作された。重要なことに、同じペイロードの2つの異なるバージョンについて観察された違いは、細胞内の異なる分泌経路の利用に起因する可能性があり、合成プロペプチド配列(すなわち、配列番号22)の存在及び/又は非存在に基づいて優先的に関与し、したがって、ここで行われる合成シグナル配列の複数のバージョンを試験することの重要性が強調される。
実施例15:染色体に組み込まれた発現カセットを介したインベルターゼの分泌に対する合成シグナルペプチドの効果の強化
S.boulardii細胞は、インベルターゼに融合されたSbouv2合成シグナルペプチドを含有する構築物のコピーをS.boulardiiゲノムに組み込むことによって、インベルターゼの安定かつ確実に発現できるように操作された。S boulardiiゲノム中の複数の遺伝子座を、インベルターゼ発現構築物のゲノム組み込みの標的として使用し、CRISPR-Cas9媒介性遺伝子標的化アプローチを使用して操作した。使用される標的遺伝子座は、二倍体S.boulardii細胞中の1つの位置又は2つのコピーに存在するleu2、his3、及びura3などの遺伝子であるか、又は酵母ゲノム中のTyエレメントの長末端反復配列(LTR)などのマルチコピー遺伝子座であってもよく、これはゲノム内の複数の部位に存在するため、複数のコピーの組み込みが可能になる。図31に見られるように、安定して組み込まれたインベルターゼ構築物を有するS.boulardii株は、プラスミド上にインベルターゼ構築物を保有する株と比較して、インベルターゼの分泌を135%多く呈示する。したがって、これらの操作により、抗生物質選択マーカーをもたない、プラスミド上にインベルターゼ発現系を保有する菌株よりも高いインベルターゼの分泌を示す、安定なS.boulardii株の生成が可能となった。プラスミドコピー数は、細胞分裂のたびに変化し、遺伝子の発現の幅広い変動につながる可能性があり、したがってペイロードの発現の信頼の低下につながる可能性がある。プラスミドはまた、典型的には抗生物質の使用による遺伝子選択の使用を必要とし、これはヒトでの使用には不可能であり、安全ではない可能性がある。インベルターゼの発現に使用されるこのゲノム組み込みアプローチは、これらの制限を取り除き、本明細書に記載される他の全ての治療薬などの任意のタンパク質又はペプチドの最適化された信頼性の高い分泌を達成するために、安定なS.boulardii細胞を生成するように容易に拡張することもできる。
実施例16:管腔CCK放出因子(LCRF)の分泌に対するS.boulardii合成シグナルペプチドの効果
合成プロタンパク質シグナルペプチドを含むS.boulardii最適化シグナルペプチドを、S.boulardiiにおけるLCRFの分泌について試験した。LCRFペプチドは、消化及び満腹感に重要な役割を有するペプチドホルモンコレシストキニン(CCK)又はパンクレオザイミンの放出を誘発する。合成シグナルペプチドバリアント(Sbouバリアント1~Sbouバリアント12)をコードする核酸を、S.boulardiiでタンパク質を発現するように設計されたプラスミドにクローニングし、LCRFの分泌を測定した。野生型S.boulardii細胞を対照として使用した。
図32は、試験されたシグナルペプチドバリアントを示す。Sbouバリアント1~4によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号14によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント5~8によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号15によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント9~12によって利用されるプレタンパク質合成ペプチドは、配列番号16によって表されるアミノ酸配列を含む。Sbouバリアント1、5、及び9は、合成プロタンパク質シグナルペプチドを含まない。Sbouバリアント2、6、及び10は、配列番号22によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。Sbouバリアント3、7、及び11は、配列番号23によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。Sbouバリアント5、8、及び12は、配列番号24によって表されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質合成シグナルペプチドを更に含む。
図33は、6×HIS-3xFLAGペプチドでC末端にタグ付けされたLCRFに融合された合成シグナルペプチドバリアントをコードする核酸を有するプラスミドを保有する酵母株におけるCFU当たり分泌されたLCRFの量を示す。分泌されたLCRFペプチドは、増殖培地中に排出される。各組換え融合タンパク質バリアントをコードする核酸を含むプラスミドを含むS.boulardii培養物を、プラスミドの選択のためにG418抗生物質を含む標準的なYPD培地中で24時間増殖させ、培養上清中のペプチドの存在を、Perkin-Elmer AlphaLISAキット(抗6xHis AlphaLISA Acceptor Beadsカタログ番号AL178C、抗FLAGアルファドナービーズカタログ番号AS103D)を使用し、製造業者の指示を使用してアッセイし、ペプチド上に存在するHisタグ及びFLAGタグへの結合を検出した。上清からのELISA活性を、増殖培地を使用してバックグラウンドを差し引いた後、活性をCFUの数で割ることによって正規化し、CFUの数は対応する培養物の600nmでの光学密度に基づいて推定された。図33に示す結果は、プレシグナルペプチド及びプロシグナルペプチド並びにそれらの組み合わせの最適化が、分泌の最大レベルを達成する上で重要であることを示す。このアプローチは、消化及び満腹感に重要な臨床的に関連する量のペプチドを産生するために使用され得るS.boulardii細胞からの堅牢な分泌を提供し得る。
実施例17:例示的なプレペプチド、プロペプチド、及びペイロードタンパク質の組み合わせ
本明細書に詳述されるように、提供される任意のプレタンパク質シグナルペプチドは、提供される任意のプロタンパク質シグナルペプチドと対になり得る。更に、任意のプレタンパク質シグナルペプチド又はプロタンパク質シグナルペプチドは、それぞれ対応するプロタンパク質シグナルペプチド又はプレタンパク質シグナルペプチドの非存在下で使用することができる。以下の表18及び19は、本明細書に記載される様々な実施形態についての、プレタンパク質シグナルペプチド、プロタンパク質シグナルペプチド、及びペイロードタンパク質の組み合わせの例示的実施形態を記載する。
Figure 2024511941000037
Figure 2024511941000038
Figure 2024511941000039
Figure 2024511941000040
実施例18:昆虫に侵入された植物の予防及び治療のための操作された酵母の使用
植物における昆虫の侵入を防止するためのベクターとしての操作された酵母の適合性を試験するために、操作された酵母は、殺虫剤(例えば、Vip1、Vip2、Vip3、Cryタンパク質など)と、本明細書に提供されるプレタンパク質シグナルペプチド及び本明細書に提供されるプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドを発現するように生成される。最適なプレタンパク質ペプチドとプロタンパク質ペプチドの組み合わせを提供するために、様々な組み合わせが構築される。植物には、組換えポリペプチド又は対照組成物を発現する酵母を噴霧し、定着させる。所定の時間の後、各群の植物を昆虫に曝露し、殺虫剤を発現する酵母の昆虫に関連する損傷及び侵入を防ぐ能力が評価される。
同様に、操作された酵母は、既存の昆虫侵入を治療する能力について評価される。操作された酵母は、殺虫剤(例えば、Vip1、Vip2、Vip3、Cryタンパク質など)と、本明細書に提供されるプレタンパク質シグナルペプチド及び本明細書に提供されるプロタンパク質シグナルペプチドのうちの一方又は両方とを含む組換えポリペプチドを発現するように生成される。最適なプレタンパク質ペプチドとプロタンパク質ペプチドの組み合わせを提供するために、様々な組み合わせが構築される。植物体は、所定の期間、昆虫に曝露される。侵入が確立されたら、植物に、対照組成物又は本実施例に記載される操作された酵母を含む組成物のいずれかを噴霧する。既存の昆虫の侵入を除去する酵母の能力が評価される。
説明された実施形態は、開示された製品及び方法の単なる例であり、本発明の範囲を限定するものとみなされるべきではないことが認識されるべきである。むしろ、本発明の範囲は、以下の特許請求の範囲によって定義される。したがって、これらの特許請求の範囲及び趣旨の範囲内にあるもの全てを本発明として主張する。

Claims (59)

  1. 式I、II、III、IV、V、IX、及びXIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含むプレタンパク質シグナルペプチドであって、
    式Iは、以下のように表され、
    -(A-A-(A-(A-A-A-A-A-A10-(A11 (式I)
    式中、
    w及びxは各々、独立して、1、2、3、4、又は5であり、
    yは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
    zは、1、2、又は3であり、
    は、メチオニンであり、
    各Aは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、中性アミノ酸又は正電荷をもつアミノ酸であり、
    各A、A、A、及びA10は各々、独立して、W及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    各Aは、独立して、P、W、M、及びCを除く、塩基性又は中性アミノ酸であり、
    は、W、M、及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    は、Pを除く、約1.9より小さいハイドロパシー指標及び約5.4~約7.5の等電点を有する非芳香族アミノ酸であり、
    は、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    各A11は、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
    式IIは、以下のように表され、
    -(B-(B-(B-(B-(B-B-B-B-B10-(B11 (式II)
    式中、
    u及びwは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    v及びzは各々、独立して、1、2、又は3であり、
    xは、0、1、又は2であり、
    yは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
    は、メチオニンであり、
    各B、B、B、B、及びB10は各々、独立して、W及びCを除く、約-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    各Bは、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、正電荷をもつアミノ酸又は極性アミノ酸であり、
    各Bは、独立して、P、W、M、及びCを除く、約-5より大きく約-0.5より小さいハイドロパシー指標を有する極性アミノ酸、又は約5~約11の等電点を有するアミノ酸であり、
    各B及びB11は各々、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
    は、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    式IIIは、以下のように表され、
    -(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-C-C10-C11-[C12-C13 (式III)
    式中、
    rは、1、2、又は3であり、
    t、u、y、及びzは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    v及びwは各々、独立して、0、1、又は2であり、
    aは、0又は1であり、
    xは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
    は、メチオニンであり、
    各Cは、独立して、約5.6~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-5.1~約0.6のハイドロパシー指標、及び約0.8~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各C、C、C、及びC10は各々、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各C及びCは各々、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各C、C、C11、及びC12は各々、独立して、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    13は、約5.6~約6.3の等電点、約105g/mol~約120g/molの分子量、約0~約9.4のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式IVは、以下のように表され、
    -(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-D10-D11-D12-[D13-D14 (式IV)
    式中、
    qは、1、2、又は3であり、
    r、t、及びuは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    v、w、x、及びyは各々、独立して、0、1、又は2であり、
    aは、0又は1であり、
    zは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
    は、メチオニンであり、
    各Dは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dは、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各D、D、及びD11は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dは、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dは、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dは、独立して、約5.4~約6.1の等電点、約117g/mol~約205g/molの分子量、約2.5~約34のハイドロパシー指標、及び約1~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各D、D10、D12、及びD13は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    14は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式Vは、以下のように表され、
    -[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-E11-E12-E13-[E14-E15 (式V)
    式中、
    i、j、q、w、x及びaは各々、独立して、0又は1であり、
    rは、1、2、又は3であり、
    t、u、v、及びzは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    yは、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
    は、メチオニンであり、
    各Eは、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約1のハイドロパシー指標、及び約0.85~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75.1g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eは、独立して、約5~約10.8の等電点、約105g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各E及びEは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eは、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eは、独立して、約5~約9.75の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各E、E13、及びE14は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各E10及びE12は、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    11は、約5~約9.75の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    15は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約15.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.2のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式IXは、以下のように表され、
    -(F-(F-[(F-(F-F-F-F-[F-F10 (式IX)
    式中、
    v及びwは各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    x及びyは各々、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
    aは、0又は1であり、
    zは、1、2、3、4、5、6、7、又は8であり、
    は、約5.4~約11の等電点、約89g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約31のハイドロパシー指標、及び約0.9~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各F及びFは各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Fは、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各F、F、F、及びFは各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    10は、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式XIIIは、以下のように表され、
    -(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12 (式XIII)
    式中、
    xは、1、2、又は3であり、
    yは、1、2、3、又は4であり、
    zは、5、6、7、8、9、又は10であり、
    各aは、独立して、0又は1であり、
    各Lは、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各L及びLは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各L、L、及びLは各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各L、L、L10、及びL11は各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    12は、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である、プレタンパク質シグナルペプチド。
  2. 式Iにおいて、
    各Aが、独立して、K、R、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各A、A、A、及びA10が各々、独立して、L、V、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各A11が、独立して、A、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  3. 式IIにおいて、
    各B、B、B、B、及びB10が各々、独立して、L、V、A、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Bが、独立して、K、R、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各B及びB11が、独立して、A、S、G、及びPからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  4. 式IIIにおいて、
    各Cが、独立して、K、R、H、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各C、C、C、及びC10が各々、独立して、L、V、I、A、W、Y、T、Q、S、H、C、N、D、R、P、K、G、E、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各C及びCが各々、独立して、S、N、Q、R、T、K、A、Y、H、V、I、F、G、W、C、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各C、C、C11、及びC12が各々、独立して、A、S、V、G、I、L、F、C、T、K、P、Q、N、Y、E、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    13が、P、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  5. 式IVにおいて、
    各Dが、独立して、K及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、F、L、I、W、V、M、Y、P、C、A、Q、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各D、D、及びD11が各々、独立して、L、I、F、W、V、M、Y、A、T、N、S、G、E、D、C、Q、R、H、P、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、A、C、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、L、I、A、T、S、G、N、R K、Y Q、C、H、W、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、V、W、I、L、F、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各D、D10、D12、及びD13が各々、独立して、A、S、T、G、V、L、C、Y、K、I、F、Q、N、H、R、E、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    14が、P、Y、M、V、A、T、Q、S、N、G、I、E、D、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  6. 式Vにおいて、
    各Eが、独立して、K、R、S、Q、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、F、L、I、W、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、K、R、H、S、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各E及びEが各々、独立して、L、I、F、V、C、A、Y、T、Q、N、S、K、H、W、G、D、M、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、T、Q、S、A、C、R、K、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、S、G、K、A、C、Y、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各E、E13、及びE14が各々、独立して、A、T、G、S、V、I、L、Y、W、F、C、Q、N、P、E、M、R、K、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各E10及びE12が各々、独立して、L、F、I、V、C、Y、T、Q、N、S、K、H、M、G、A、W、D、P、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸である。
    11が、V、W、I、C、L、A、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    15が、S、N、R、T、G、K、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  7. 式IXにおいて、
    が、M、F、L、A、S、又はRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Fが、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、E、T、A、C、P、Y、V、W、I、L、又はFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各F及びFが各々、独立して、S、Q、R、T、K、H、I、F、L、P、N、G、E、D、A、Y、M、V、W、又はCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Fが、独立して、L、I、V、M、A、F、W、Y、P、C、T、Q、N、S、G、E、R、K、又はHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各F、F、F、及びFが各々、独立して、A、C、G、S、V、L、T、F、Q、N、P、Y、E、K、H、W、I、M、R、又はDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    10が、P、C、Y、M、V、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、F、R、K、又はHからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  8. 式XIIIにおいて、
    各Lが、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各L及びLが各々、独立して、S、N、Q、R、T、K、P、G、E、H、D、A、C、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各L、L、及びLが各々、独立して、L、F、I、W、V、T、M、Y、P、C、A、Q、N、S、G、E、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各L、L、L10、及びL11が各々、独立して、A、T、G、S、C、P、I、L、F、R、V、Q、Y、K、N、E、D、H、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    12が、P、T、S、D、C、Y、M、V、A、Q、N、W、G、I、E、L、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  9. 前記シグナルペプチドが、配列番号1、2、3、4、5 6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、31、32、33、70、71、72、及び73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  10. 前記アミノ酸配列が、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択される、請求項1に記載のプレタンパク質シグナルペプチド。
  11. 配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、プレタンパク質シグナルペプチド。
  12. 式VI、VII、VIII、X、XI、XIV、及びXVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含むプロタンパク質シグナルペプチドであって、
    式VIは、以下のように表され、
    -G-G-G-G-G-G-G-G-G10-G11-G12-G13-G14-G15-G16-G17-G18-G19-G20-G21-G22-G23-G24-G25 (式VI)
    式中、
    は、I、L、F、V、A、N、S、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、P、S、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、L、F、I、V、Y、A、S、R、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、V、M、P、Y、A、T、S、N、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、A、G、R、Y、K、D、M、V、W、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、N、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、V、P、A、T、Q、G、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、P、Y、T、Q、S、N、W、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    は、F、L、A、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    10は、H、S、N、D、Q、E、T、Y、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    11は、S、R、T、G、K、E、D、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    12は、D、E、Q、N、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    13は、N、S、E、D、T、H、K、A、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    14は、G、S、N、H、E、C、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    15は、S、T、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    16は、E、D、Q、N、S、T、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    17は、W、N、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    18は、L及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    19は、Y、V、A、Q、N、S、E、D、L、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    20は、K、R、S、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    21は、Rであり、
    22は、D、E、N、S、T、G、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    23及びG24は各々、独立して、V、P、Y、I、A、E、K、F、T、S、G、D、M、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    25は、Y、P、A、T、Q、S、E、F、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式VIIは、以下のように表され、
    (H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H10-(H11-(H12-(H13-(H14-(H15-(H16-(H17-(H18-(H19-(H20-(H21-(H22-(H23-(H24-(H25-(H26-(H27-(H28-(H29-(H30-(H31-(H32-(H33-(H34-(H35-(H36-H37-H38-H39-H40 (式VII)
    式中、
    各mは、独立して、0、1、又は2であり、
    各Hは、独立して、E、D、S、L、G、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H及びH28は各々、独立して、P、S、R、T、N、G、D、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hは、独立して、W及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hは、独立して、S、N、A、P、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H及びH30は各々、独立して、T、Q、A、E、F、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hは、独立して、L、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hは、独立して、F、V、M、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hは、独立して、V、P、I、A、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H及びH17は各々、独立して、T、G、V、W、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H10は、独立して、R、H、S、G、N、E、T、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H11は、独立して、S、G、D、A、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H12は、独立して、T、S、E、G、D、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H13は、独立して、L、M、Y、N、S、D、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり
    各H14は、独立して、D、Q、N、S、K、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり
    各H15は、独立して、E、S、D、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H16は、独立して、I、L、V、M、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり
    各H18は、独立して、D、E、S、T、K、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H19は、独立して、Y、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H20は、独立して、N、Q、S、T、R、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H21及びH34は各々、独立して、S、K、T、A、Y、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H22は、独立して、T、Q、S、D、C、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H23は、独立して、G、S、K、N、H、D、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H24は、独立して、I、L、V、P、N、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H25及びH33は各々、独立して、A、T、G、R、Y、L、F、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H26及びH40は各々、独立して、V、I、F、M、L、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H27は、独立して、D、E、Q、N、S、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H29は、独立して、E、D、T、A、Y、M、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H31は、独立して、F、W、V、M、S、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H32は、独立して、H、S、E、G、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H35は、独立して、R、K、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H36は、独立して、H、R、S、T、A、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    37は、K、Q、D、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    38は、R、K、T、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    39は、D、N、S、T、K、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式VIIIは、以下のように表され、
    (I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I10-(I11-(I12-(I13-(I14-(I15-(I16-(I17-I18-I19-I20-I21-I22-I23 (式VIII)
    式中、
    各mは、独立して、0、1、又は2であり、
    各xは、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
    各I及びIは各々、独立して、S、Q、E、A、I、G、V、R、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iは、独立して、T、S、E、R、P、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iは、独立して、Lである。
    各Iは、独立して、T、N、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iは、独立して、P、A、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iは、独立して、T、S、K、H、Y、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I及びI15は各々、独立して、F、L、W、A、T、M、Y、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iは、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I10及びI16は各々、独立して、G、S、N、E、D、A、K、H、C、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I11は、独立して、I、L、V、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I12は、独立して、T、N、A、E、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I13は、独立して、E、Q、S、T、R、K、A、L、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I14は、独立して、T、S、Q、F、A、G、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I17は、独立して、I、L、V、N、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    18及びI21は各々、独立して、R、K、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    19は、H、R、S、N、T、A、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    20は、K、N、Q、D、E、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    22は、D、N、S、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    23は、V、I、L、F、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式Xは、以下のように表され、
    (J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J10-(J11-(J12-(J13-(J14-(J15-(J16-(J17-(J18-(J19-(J20-(J21-J22-J23-J24-J25 (式X)
    式中、
    各zは、独立して、0、1、2、3、4、又は5であり、
    各Jは、独立して、H、K、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、G、A、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、F、I、P、A、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、S、R、T、G、K、E、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、T、S、A、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、Y、C、A、W、I、S、E、D、F、L、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jは、独立して、H、K、N、D、G、T、A、C、Y、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J10は、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J11は、独立して、I、W、V、Y、P、T、N、S、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J12は、独立して、A、G、Q、N、R、Y、E、D、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J13は、独立して、I、L、W、V、M、Y、P、A、S、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J14は、独立して、V、C、L、F、A、T、N、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J15は、独立して、G、S、R、K、A、T、H、E、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J16は、独立して、D、E、Q、S、H、T、R、G、Y、V、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J17は、独立して、E、S、G、Y、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J18は、独立して、A、S、P、H、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J19は、独立して、N、E、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J20は、独立して、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J21は、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    22は、K、R、D、T、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    23は、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    24は、S、N、G、E、D、P、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    25は、A、T、S、Y、M、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式XIは、以下のように表され、
    (K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K10-(K11-(K12-(K13-(K14-(K15-(K16-(K17-(K18-(K19-(K20-(K21-(K22-(K23-(K24-(K25-(K26-(K27-(K28-(K29-(K30-(K31-(K32-(K33-(K34-(K35-(K36-(K37-(K38-(K39-(K40-(K41-(K42-(K43-(K44-(K45-(K46-(K47-(K48-(K49-(K50-(K51-(K52-(K53-(K54-(K55-(K56-(K57-(K58-(K59-(K60-(K61-(K62-(K63-(K64-(K65-(K66-(K67-(K68-(K69-(K70-(K71-(K72-(K73-(K74-(K75-(K76-(K77-(K78-(K79-(K80-(K81-(K82-(K83-(K84-(K85-(K86-(K87-(K88-K89-K89-K89-K89-K89 (式XI)
    式中、
    各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、
    各Kは、独立して、S、G、D、A、C、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、Q、S、E、T、R、K、G、A、Y、M、V、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、R、G、N、D、A、P、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、N、Q、R、H、K、A、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kは、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K10は、独立して、K、H、E、A、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K11は、独立して、S、T、K、E、A、C、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K12は、独立して、K、R、H、S、Q、D、E、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K13は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K14は、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K15は、独立して、C、A、M、V、S、E、G、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K16は、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K17は、独立して、A、G、S、Q、Y、E、D、H、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K18は、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K19は、独立して、E、D、T、H、K、G、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K20は、独立して、F、L、I、V、M、T、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K21は、独立して、E、D、S、G、A、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K22は、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K23は、独立して、G、S、N、E、D、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K24は、独立して、T、S、E、G、P、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K25は、独立して、K、S、G、T、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K26は、独立して、S、G、K、E、D、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K27は、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K28は、独立して、E、D、Q、S、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K29は、独立して、A、T、S、E、V、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K30は、独立して、K、H、S、G、N、Q、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K31は、独立して、L、F、V、P、A、N、G、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K32は、独立して、A、G、N、P、R、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K33は、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K34は、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K35は、独立して、A、T、Q、P、R、V、N、E、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K36は、独立して、R、K、H、G、Q、D、T、Y、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K37は、独立して、D、E、N、T、C、Y、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K38は、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K39は、独立して、K、S、G、Q、D、E、A、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K40は、独立して、H、K、S、D、E、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K41は、独立して、A、T、S、N、P、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K42は、独立して、K、D、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K43は、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K44は、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K45は、独立して、G、S、K、N、T、Q、D、A、P、L、F、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K46は、独立して、L、F、Q、S、G、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K47は、独立して、S、R、E、A、P、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K48は、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K49は、独立して、E、S、T、R、G、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K50は、独立して、S、N、R、A、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K51は、独立して、G、A、T、H、M、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K52は、独立して、S、T、H、A、C、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K53は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K54は、独立して、S、H、Y、F、N、Q、R、T、G、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K55は、独立して、A、T、Q、E、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K56は、独立して、S、N、E、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K57は、独立して、D、S、R、K、A、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K58は、独立して、K、S、G、D、T、L、R、E、Y、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K59は、独立して、S、R、G、A、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K60は、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K61は、独立して、R、S、G、N、E、T、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K62は、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K63は、独立して、A、G、S、Q、R、E、D、V、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K64は、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K65は、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K66は、独立して、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K67は、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K68は、独立して、I、V、P、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K69は、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K70は、独立して、G、S、R、N、T、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K71は、独立して、E、D、N、S、T、H、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K72は、独立して、L、I、W、V、A、T、S、E、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K73は、独立して、G、S、K、A、C、F、N、T、Q、D、P、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K74は、独立して、A、S、N、P、K、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K75は、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K76は、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K77は、独立して、M、V、Y、L、A、N、E、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K78は、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K79は、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K80は、独立して、K、R、S、A、P、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K81は、独立して、F、L、V、A、T、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K82は、独立して、L、F、M、A、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K83は、独立して、D、S、H、A、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K84は、独立して、A、T、Q、S、R、V、L、G、H、F、K、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K85は、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K86は、独立して、A、P、R、Y、K、D、M、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K87は、独立して、N、S、D、T、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K88は、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    89は、K、R、H、G、E、T、Y、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    90は、R、S、G、N、Q、A、Y、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    91は、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    92は、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    93は、E、D、Q、S、R、K、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式XIVは、以下のように表され、
    (M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M10-(M11-(M12-(M13-(M14-(M15-(M16-(M17-(M18-(M19-(M20-(M21-(M22-(M23-(M24-(M25-(M26-(M27-(M28-(M29-(M30-(M31-(M32-(M33-(M34-(M35-(M36-(M37-(M38-(M39-(M40-(M41-(M42-(M43-(M44-(M45-(M46-(M47-(M48-(M49-(M50-(M51-(M52-(M53-(M54-(M55-(M56-(M57-(M58-(M59-(M60-(M61-(M62-(M63-(M64-(M65-(M66-(M67-(M68-(M69-(M70 (式XIV)、
    式中、
    各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、
    各cは、独立して、1又は2であり、
    各Mは、独立して、A、T、C、S、Y、E、H、V、W、I、L、F、G、Q、N、P、R、K、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、G、S、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、R、H、N、Q、E、A、Y、M、V、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、P、Y、A、T、Q、S、G、D、R、K、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、H、P、F、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mは、独立して、G、S、H、P、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、N、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M10は、独立して、Q、E、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M11は、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M12は、独立して、S、G、A、N、Q、R、T、K、E、H、D、P、I、F、V、C、Y、L、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M13は、独立して、T、Q、N、S、D、P、F、A、E、G、H、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M14は、独立して、L、F、I、V、M、Y、A、T、Q、N、S、D、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M15は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M16は、独立して、T、S、A、E、G、C、R、P、Y、M、V、W、I、F、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M17は、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M18は、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M19は、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M20は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M21は、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M22は、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M23は、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M24は、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M25は、独立して、F、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M26は、独立して、T、P、F、Q、N、S、A、E、G、D、K、Y、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M27は、独立して、D、E、Q、N、S、T、R、K、G、A、Y、P、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M28は、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M29は、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M30は、独立して、D、Q、N、H、K、G、C、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M31は、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M32は、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M33は、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M34は、独立して、T、A、V、I、P、F、Q、N、S、E、G、D、K、Y、C、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M35は、独立して、G、S、R、N、H、D、P、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M36は、独立して、T、Q、S、A、E、D、K、H、P、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M37は、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M38は、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、C、P、R、Y、E、V、W、T、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M39は、独立して、S、T、E、P、V、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M40は、独立して、T、S、A、D、P、M、Q、E、K、H、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M41は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M42は、独立して、P、Y、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M43は、独立して、S、E、P、V、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M44は、独立して、N、Q、S、E、D、T、H、K、G、A、P、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M45は、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M46は、独立して、A、T、S、N、R、Y、K、D、H、M、L、F、G、Q、C、P、E、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M47は、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M48は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M49は、独立して、F、V、A、T、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M50は、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M51は、独立して、G、S、R、H、D、P、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M52は、独立して、T、N、S、G、C、R、H、A、D、P、M、Q、E、K、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M53は、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M54は、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M55は、独立して、D、E、Q、N、S、K、G、A、Y、P、F、T、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M56は、独立して、L、F、I、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M57は、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M58は、独立して、P、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M59は、独立して、N、Q、S、E、D、T、R、K、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M60は、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M61は、独立して、S、P、V、T、A、R、K、E、H、C、Y、I、F、L、N、Q、G、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M62は、独立して、P、K、A、Y、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M63は、独立して、A、G、S、N、E、K、D、H、M、V、W、I、L、F、T、R、Y、Q、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M64は、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M65は、独立して、L、V、F、I、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M66は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、V、C、Y、I、F、L、Q、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M67は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M68は、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M69は、独立して、S、A、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M70は、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、C、R、K、H、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式XVは、以下のように表され、
    (N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N10-(N11-(N12-(N13-(N14-(N15-(N16-(N17-(N18-(N19-(N20-(N21-(N22-(N23-(N24-(N25-(N26-(N27-(N28-(N29-(N30-(N31-(N32-(N33-(N34-(N35-(N36-(N37-(N38-(N39-(N40-(N41-(N42-(N43-(N44-(N45-(N46-(N47-(N48-(N49-(N50-(N51-(N52-(N53-(N54-(N55-(N56-(N57-(N58-(N59-(N60-(N61-(N62-(N63-(N64-(N65-(N66-(N67-(N68-(N69-(N70-(N71 (式XV)、
    式中、
    各bは、独立して、0、1、2、又は3であり、
    各cは、独立して、1又は2であり、
    各Nは、独立して、S、N、D、Q、R、T、G、E、H、A、P、M、V、K、Y、W、F、L、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、P、V、A、S、N、G、E、L、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nは、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N10は、独立して、T、Q、N、R、K、M、S、E、D、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N11は、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N12は、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、P、L、M、V、Y、W、F、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N13は、独立して、L、F、I、W、V、M、Y、C、A、T、Q、N、S、G、E、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N14は、独立して、V、I、L、A、T、S、G、R、P、Y、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N15は、独立して、S、N、Q、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、I、F、L、R、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N16は、独立して、T、N、S、A、D、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N17は、独立して、S、N、Q、R、K、E、D、A、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N18は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N19は、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、Y、M、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N20は、独立して、S、Q、R、K、E、A、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N21は、独立して、V、W、I、C、L、F、A、T、S、E、D、K、G、R、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N22は、独立して、T、Q、N、S、A、D、C、K、P、Y、M、V、W、I、F、G、E、H、R、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N23は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N24は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N25は、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N26は、独立して、T、N、D、S、A、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N27は、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N28は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N29は、独立して、T、S、A、D、C、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N30は、独立して、P、Y、V、A、T、S、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N31は、独立して、T、Q、S、A、G、K、H、P、Y、V、I、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N32は、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N33は、独立して、E、D、Q、N、S、T、H、R、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N34は、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N35は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N36は、独立して、G、S、K、A、T、Q、D、C、P、Y、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N37は、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N38は、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N39は、独立して、L、F、I、W、V、M、C、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N40は、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N41は、独立して、D、N、R、G、Y、E、Q、S、H、T、K、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N42は、独立して、S、R、E、A、N、T、G、P、V、Q、K、H、D、Y、M、I、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N43は、独立して、G、S、R、K、A、N、Q、H、E、D、P、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N44は、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、N、E、D、C、K、H、R、V、L、M、F、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N45は、独立して、S、T、G、A、V、I、R、E、N、P、Q、K、H、D、Y、M、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N46は、独立して、Cであり、
    各N47は、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、Y、V、W、I、L、Q、M、F、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N48は、独立して、G、S、R、K、N、T、Q、H、E、D、P、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N49は、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N50は、独立して、V、A、T、S、G、I、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N51は、独立して、A、T、G、S、Q、N、R、Y、E、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N52は、独立して、D、E、Q、N、S、T、K、A、Y、P、M、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N53は、独立して、A、T、C、G、S、N、P、R、K、D、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N54は、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N55は、独立して、E、D、N、T、R、K、G、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N56は、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、W、K、C、Y、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N57は、独立して、Y、C、N、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N58は、独立して、S、T、G、H、A、P、Y、V、F、L、N、R、K、E、D、W、I、Q、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N59は、独立して、I、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N60は、独立して、Sであり
    各N61は、独立して、G、S、R、K、A、N、T、Q、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N62は、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N63は、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N64は、独立して、S、N、Q、R、G、K、E、D、P、Y、W、F、T、H、A、V、L、I、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N65は、独立して、A、C、G、S、Q、N、R、Y、E、K、D、H、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N66は、独立して、V、I、A、T、S、G、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N67は、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N68は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N69は、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N70は、独立して、D、E、Q、N、S、H、T、R、K、G、A、C、Y、P、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N71は、独立して、A、T、C、G、S、Q、N、P、R、Y、E、K、D、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である、プロタンパク質シグナルペプチド。
  13. 前記シグナルペプチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項12に記載のプロタンパク質シグナルペプチド。
  14. 前記アミノ酸配列が、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択される、請求項12に記載のプロタンパク質シグナルペプチド。
  15. 配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、プロタンパク質シグナルペプチド。
  16. (X-(Y-Zの式を含むポリペプチドであって、式中、
    は、プレタンパク質シグナルペプチドであり、
    は、プロタンパク質シグナルペプチドであり、
    は、ペイロードタンパク質であり、
    nは、0~1であり、mは、0~1であり、
    n及びmは、同時に0であることはできない、ポリペプチド。
  17. nが、1であり、Xが、式I、式II、式III、式IV、式V、式IX、及び式XIIIからなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    式Iが、以下のように表され、
    -(A-A-(A-(A-A-A-A-A-A10-(A11 (式I)
    式中、
    w及びxが各々、独立して、1、2、3、4、又は5であり、
    yが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
    zが、1、2、又は3であり、
    が、メチオニンであり、
    各Aが、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、中性アミノ酸又は正電荷をもつアミノ酸であり、
    各A、A、A、及びA10が各々、独立して、W及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    各Aが、独立して、P、W、M、及びCを除く、塩基性又は中性アミノ酸であり、
    が、W、M、及びCを除く、-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    が、Pを除く、約1.9より小さいハイドロパシー指標及び約5.4~約7.5の等電点を有する非芳香族アミノ酸であり、
    が、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    各A11が、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
    式IIが、以下のように与えられ、
    -(B-(B-(B-(B-(B-B-B-B-B10-(B11 (式II)
    式中、
    u及びwが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    v及びzが各々、独立して、1、2、又は3であり、
    xが、0、1、又は2であり、
    yが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20であり、
    が、メチオニンであり、
    各B、B、B、B、及びB10が各々、独立して、W及びCを除く、約-1より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    各Bが、独立して、約1より小さいハイドロパシー指標を有する、正電荷をもつアミノ酸又は極性アミノ酸であり、
    各Bが、独立して、P、W、M、及びCを除く、約-5より大きく約-0.5より小さいハイドロパシー指標を有する極性アミノ酸、又は約5~約11の等電点を有するアミノ酸であり、
    各B及びB11が各々、独立して、約133g/molより小さい分子量を有する中性アミノ酸であり、
    が、約-1.3より大きいハイドロパシー指標を有するアミノ酸であり、
    式IIIが、以下のように表され、
    -(C-(C-(C-[(C-(C-(C-(C-C-C10-C11-[C12-C13 (式III)
    式中、
    rが、1、2、又は3であり、
    t、u、y、及びzが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    v及びwが各々、独立して、0、1、又は2であり、
    aが、0又は1であり、
    xが、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
    が、メチオニンであり、
    各Cが、独立して、約5.6~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-5.1~約0.6のハイドロパシー指標、及び約0.8~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各C、C、C、及びC10が各々、独立して、約2.75~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各C及びCが各々、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各C、C、C11、及びC12が各々、独立して、約2.75~約9.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    13が、約5.6~約6.3の等電点、約105g/mol~約120g/molの分子量、約0~約9.4のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式IVが、以下のように表され、
    -(D-(D-(D-(D-[(D-(D-(D-(D-D10-D11-D12-[D13-D14 (式IV)
    式中、
    qが、1、2、又は3であり、
    r、t、及びuが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    v、w、x、及びyが各々、独立して、0、1、又は2であり、
    aが、0又は1であり、
    zが、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
    が、メチオニンであり、
    各Dが、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各D、D、及びD11が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Dが、独立して、約5.4~約6.1の等電点、約117g/mol~約205g/molの分子量、約2.5~約34のハイドロパシー指標、及び約1~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各D、D10、D12、及びD13が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.75~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    14が、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約182g/molの分子量、約-5.1~約32のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式Vが、以下のように表され、
    -[(E-(E-(E-(E-(E-(E-[(E-(E-(E10-E11-E12-E13-[E14-E15 (式V)
    式中、
    i、j、q、w、x及びaが各々、独立して、0又は1であり、
    rが、1、2、又は3であり、
    t、u、v、及びzが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    yが、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10であり、
    が、メチオニンであり、
    各Eが、独立して、約3.2~約10.8の等電点、約105g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約1のハイドロパシー指標、及び約0.85~約1のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75.1g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、約5~約10.8の等電点、約105g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各E及びEが各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、約5~約10.8の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Eが、独立して、約5~約9.75の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各E、E13、及びE14が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各E10及びE12が、独立して、約5~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    11が、約5~約9.75の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約33.5のハイドロパシー指標、及び約0.79~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    15が、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-4~約15.5のハイドロパシー指標、及び約0.57~約1.2のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式IXが、以下のように表され、
    -(F-(F-[(F-(F-F-F-F-[F-F10 (式IX)
    式中、
    v及びwが各々、独立して、0、1、2、又は3であり、
    x及びyが各々、独立して、0、1、2、3、又は4であり、
    aが、0又は1であり、
    zが、1、2、3、4、5、6、7、又は8であり、
    が、約5.4~約11の等電点、約89g/mol~約175g/molの分子量、約-4~約31のハイドロパシー指標、及び約0.9~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Fが、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各F及びFが各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各Fが、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各F、F、F、及びFが各々、独立して、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    10が、約3~約11の等電点、約89g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    式XIIIが、以下のように表され、
    -(L-[(L-(L-[(L-(L-(L-(L-(L-(L10-(L11-(L12 (式XIII)
    式中、
    xが、1、2、又は3であり、
    yが、1、2、3、又は4であり、
    zが、5、6、7、8、9、又は10であり、
    各aが、独立して、0又は1であり、
    各Lが、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各L及びLが各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各L、L、及びLが各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    各L、L、L10、及びL11が各々、独立して、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸であり、
    12が、約2.7~約10.8の等電点、約75g/mol~約205g/molの分子量、約-5.1~約34のハイドロパシー指標、及び約0.5~約1.3のヘリシティを有するアミノ酸である、請求項16に記載のポリペプチド。
  18. nが、1であり、Xが、配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、28、31、32、33、55、70、71、72、又は73からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項16又は17に記載のポリペプチド。
  19. mが、1であり、Yが、式VI、式VII、式VIII、式X、式XI、式XIV、及び式XVからなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    式VIが、以下のように表され、
    -G-G-G-G-G-G-G-G-G10-G11-G12-G13-G14-G15-G16-G17-G18-G19-G20-G21-G22-G23-G24-G25 (式VI)
    式中、
    が、I、L、F、V、A、N、S、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、P、S、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、L、F、I、V、Y、A、S、R、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、V、M、P、Y、A、T、S、N、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、A、G、R、Y、K、D、M、V、W、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、N、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、V、P、A、T、Q、G、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、P、Y、T、Q、S、N、W、F、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    が、F、L、A、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    10が、H、S、N、D、Q、E、T、Y、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    11が、S、R、T、G、K、E、D、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    12が、D、E、Q、N、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    13が、N、S、E、D、T、H、K、A、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    14が、G、S、N、H、E、C、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    15が、S、T、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    16が、E、D、Q、N、S、T、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    17が、W、N、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    18が、L及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    19が、Y、V、A、Q、N、S、E、D、L、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    20が、K、R、S、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    21が、Rであり、
    22が、D、E、N、S、T、G、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    23及びG24が各々、独立して、V、P、Y、I、A、E、K、F、T、S、G、D、M、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    25が、Y、P、A、T、Q、S、E、F、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式VIIが、以下のように表され、
    (H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H-(H10-(H11-(H12-(H13-(H14-(H15-(H16-(H17-(H18-(H19-(H20-(H21-(H22-(H23-(H24-(H25-(H26-(H27-(H28-(H29-(H30-(H31-(H32-(H33-(H34-(H35-(H36-H37-H38-H39-H40 (式VII)
    式中、
    各mが、独立して、0、1、又は2であり、
    各Hが、独立して、E、D、S、L、G、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H及びH28が各々、独立して、P、S、R、T、N、G、D、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hが、独立して、W及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hが、独立して、S、N、A、P、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H及びH30が各々、独立して、T、Q、A、E、F、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hが、独立して、L、F、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hが、独立して、F、V、M、T、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Hが、独立して、V、P、I、A、S、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H及びH17が各々、独立して、T、G、V、W、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H10が、独立して、R、H、S、G、N、E、T、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H11が、独立して、S、G、D、A、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H12が、独立して、T、S、E、G、D、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H13が、独立して、L、M、Y、N、S、D、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H14が、独立して、D、Q、N、S、K、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H15が、独立して、E、S、D、L、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H16が、独立して、I、L、V、M、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H18が、独立して、D、E、S、T、K、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H19が、独立して、Y、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H20が、独立して、N、Q、S、T、R、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H21及びH34が各々、独立して、S、K、T、A、Y、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H22が、独立して、T、Q、S、D、C、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H23が、独立して、G、S、K、N、H、D、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H24が、独立して、I、L、V、P、N、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H25及びH33が各々、独立して、A、T、G、R、Y、L、F、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H26及びH40が各々、独立して、V、I、F、M、L、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H27が、独立して、D、E、Q、N、S、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H29が、独立して、E、D、T、A、Y、M、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H31が、独立して、F、W、V、M、S、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H32が、独立して、H、S、E、G、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H35が、独立して、R、K、S、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各H36が、独立して、H、R、S、T、A、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    37が、K、Q、D、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    38が、R、K、T、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    39が、D、N、S、T、K、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式VIIIが、以下のように表され、
    (I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I-(I10-(I11-(I12-(I13-(I14-(I15-(I16-(I17-I18-I19-I20-I21-I22-I23 (式VIII)
    式中、
    各mが、独立して、0、1、又は2であり、
    各xが、独立して、0、1、2、3、又は4であり、

    各I及びIが各々、独立して、S、Q、E、A、I、G、V、R、T、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iが、独立して、T、S、E、R、P、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iが、独立して、Lである。
    各Iが、独立して、T、N、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iが、独立して、P、A、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iが、独立して、T、S、K、H、Y、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I及びI15が各々、独立して、F、L、W、A、T、M、Y、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Iが、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I10及びI16が各々、独立して、G、S、N、E、D、A、K、H、C、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I11が、独立して、I、L、V、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I12が、独立して、T、N、A、E、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I13が、独立して、E、Q、S、T、R、K、A、L、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I14が、独立して、T、S、Q、F、A、G、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各I17が、独立して、I、L、V、N、A、T、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    18及びI21が各々、独立して、R、K、Q、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    19が、H、R、S、N、T、A、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    20が、K、N、Q、D、E、A、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    22が、D、N、S、A、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    23が、V、I、L、F、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式Xが、以下のように表され、
    (J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J-(J10-(J11-(J12-(J13-(J14-(J15-(J16-(J17-(J18-(J19-(J20-(J21-J22-J23-J24-J25 (式X)
    式中、
    各zが、独立して、0、1、2、3、4、又は5であり、
    各Jが、独立して、H、K、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、G、A、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、F、I、P、A、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、S、R、T、G、K、E、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、T、S、A、D、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、D、E、N、G、P、H、T、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、Y、C、A、W、I、S、E、D、F、L、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Jが、独立して、H、K、N、D、G、T、A、C、Y、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J10が、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J11が、独立して、I、W、V、Y、P、T、N、S、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J12が、独立して、A、G、Q、N、R、Y、E、D、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J13が、独立して、I、L、W、V、M、Y、P、A、S、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J14が、独立して、V、C、L、F、A、T、N、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J15が、独立して、G、S、R、K、A、T、H、E、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J16が、独立して、D、E、Q、S、H、T、R、G、Y、V、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J17が、独立して、E、S、G、Y、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J18が、独立して、A、S、P、H、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J19が、独立して、N、E、R、K、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J20が、独立して、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各J21が、独立して、L、V、A、G、E、I、P、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    22が、K、R、D、T、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    23が、R、T、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    24が、S、N、G、E、D、P、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    25が、A、T、S、Y、M、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式XIが、以下のように表され、
    (K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K-(K10-(K11-(K12-(K13-(K14-(K15-(K16-(K17-(K18-(K19-(K20-(K21-(K22-(K23-(K24-(K25-(K26-(K27-(K28-(K29-(K30-(K31-(K32-(K33-(K34-(K35-(K36-(K37-(K38-(K39-(K40-(K41-(K42-(K43-(K44-(K45-(K46-(K47-(K48-(K49-(K50-(K51-(K52-(K53-(K54-(K55-(K56-(K57-(K58-(K59-(K60-(K61-(K62-(K63-(K64-(K65-(K66-(K67-(K68-(K69-(K70-(K71-(K72-(K73-(K74-(K75-(K76-(K77-(K78-(K79-(K80-(K81-(K82-(K83-(K84-(K85-(K86-(K87-(K88-K89-K89-K89-K89-K89 (式XI)
    式中、
    各bが、独立して、0、1、2、又は3であり、
    各Kが、独立して、S、G、D、A、C、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、Q、S、E、T、R、K、G、A、Y、M、V、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、R、G、N、D、A、P、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、N、Q、R、H、K、A、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Kが、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K10が、独立して、K、H、E、A、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K11が、独立して、S、T、K、E、A、C、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K12が、独立して、K、R、H、S、Q、D、E、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K13が、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K14が、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K15が、独立して、C、A、M、V、S、E、G、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K16が、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K17が、独立して、A、G、S、Q、Y、E、D、H、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K18が、独立して、R、K、S、Q、T、Y、N、V、I、L、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K19が、独立して、E、D、T、H、K、G、P、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K20が、独立して、F、L、I、V、M、T、G、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K21が、独立して、E、D、S、G、A、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K22が、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K23が、独立して、G、S、N、E、D、Y、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K24が、独立して、T、S、E、G、P、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K25が、独立して、K、S、G、T、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K26が、独立して、S、G、K、E、D、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K27が、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K28が、独立して、E、D、Q、S、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K29が、独立して、A、T、S、E、V、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K30が、独立して、K、H、S、G、N、Q、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K31が、独立して、L、F、V、P、A、N、G、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K32が、独立して、A、G、N、P、R、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K33が、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K34が、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K35が、独立して、A、T、Q、P、R、V、N、E、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K36が、独立して、R、K、H、G、Q、D、T、Y、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K37が、独立して、D、E、N、T、C、Y、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K38が、独立して、S、Q、R、T、D、G、E、A、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K39が、独立して、K、S、G、Q、D、E、A、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K40が、独立して、H、K、S、D、E、T、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K41が、独立して、A、T、S、N、P、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K42が、独立して、K、D、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K43が、独立して、G、S、N、T、Q、D、P、L、F、V、K、A、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K44が、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K45が、独立して、G、S、K、N、T、Q、D、A、P、L、F、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K46が、独立して、L、F、Q、S、G、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K47が、独立して、S、R、E、A、P、V、W、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K48が、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K49が、独立して、E、S、T、R、G、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K50が、独立して、S、N、R、A、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K51が、独立して、G、A、T、H、M、V、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K52が、独立して、S、T、H、A、C、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K53が、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K54が、独立して、S、H、Y、F、N、Q、R、T、G、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K55が、独立して、A、T、Q、E、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K56が、独立して、S、N、E、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K57が、独立して、D、S、R、K、A、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K58が、独立して、K、S、G、D、T、L、R、E、Y、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K59が、独立して、S、R、G、A、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K60が、独立して、A、T、Q、G、R、K、D、L、F、C、V、S、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K61が、独立して、R、S、G、N、E、T、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K62が、独立して、E、S、T、V、I、H、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K63が、独立して、A、G、S、Q、R、E、D、V、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K64が、独立して、E、A、V、Q、G、Y、M、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K65が、独立して、G、S、T、E、P、W、R、N、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K66が、独立して、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K67が、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K68が、独立して、I、V、P、及びAからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K69が、独立して、D、Q、S、G、V、E、N、H、R、P、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K70が、独立して、G、S、R、N、T、Y、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K71が、独立して、E、D、N、S、T、H、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K72が、独立して、L、I、W、V、A、T、S、E、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K73が、独立して、G、S、K、A、C、F、N、T、Q、D、P、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K74が、独立して、A、S、N、P、K、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K75が、独立して、P、A、E、L、T、Q、S、G、K、Y、F、C、V、W、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K76が、独立して、L、T、F、V、P、A、K、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K77が、独立して、M、V、Y、L、A、N、E、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K78が、独立して、D、T、G、A、Y、N、S、C、P、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K79が、独立して、A、S、V、G、Q、R、E、D、L、T、K、F、C、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K80が、独立して、K、R、S、A、P、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K81が、独立して、F、L、V、A、T、S、E、D、R、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K82が、独立して、L、F、M、A、N、G、及びEからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K83が、独立して、D、S、H、A、V、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K84が、独立して、A、T、Q、S、R、V、L、G、H、F、K、D、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K85が、独立して、T、Q、E、N、S、A、Y、V、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K86が、独立して、A、P、R、Y、K、D、M、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K87が、独立して、N、S、D、T、A、P、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各K88が、独立して、R、S、N、A、P、Y、V、I、F、及びGからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    89が、K、R、H、G、E、T、Y、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    90が、R、S、G、N、Q、A、Y、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    91が、V、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    92が、A、G、P、M、N、V、及びSからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    93が、E、D、Q、S、R、K、M、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式XIVが、以下のように表され、
    (M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M-(M10-(M11-(M12-(M13-(M14-(M15-(M16-(M17-(M18-(M19-(M20-(M21-(M22-(M23-(M24-(M25-(M26-(M27-(M28-(M29-(M30-(M31-(M32-(M33-(M34-(M35-(M36-(M37-(M38-(M39-(M40-(M41-(M42-(M43-(M44-(M45-(M46-(M47-(M48-(M49-(M50-(M51-(M52-(M53-(M54-(M55-(M56-(M57-(M58-(M59-(M60-(M61-(M62-(M63-(M64-(M65-(M66-(M67-(M68-(M69-(M70 (式XIV)、
    式中、
    各bが、独立して、0、1、2、又は3であり、
    各cが、独立して、1又は2であり、
    各Mが、独立して、A、T、C、S、Y、E、H、V、W、I、L、F、G、Q、N、P、R、K、D、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、G、S、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、及びNからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、R、H、N、Q、E、A、Y、M、V、W、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、P、Y、A、T、Q、S、G、D、R、K、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、H、P、F、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Mが、独立して、G、S、H、P、R、A、T、Q、E、D、C、Y、V、I、L、N、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M10が、独立して、Q、E、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M11が、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M12が、独立して、S、G、A、N、Q、R、T、K、E、H、D、P、I、F、V、C、Y、L、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M13が、独立して、T、Q、N、S、D、P、F、A、E、G、H、L、C、K、V、R、Y、I、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M14が、独立して、L、F、I、V、M、Y、A、T、Q、N、S、D、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M15が、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M16が、独立して、T、S、A、E、G、C、R、P、Y、M、V、W、I、F、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M17が、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M18が、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M19が、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M20が、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M21が、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M22が、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M23が、独立して、T、P、F、S、A、E、G、C、R、Y、M、V、W、I、L、Q、N、D、H、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり
    各M24が、独立して、S、T、A、N、R、G、E、P、V、F、L、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M25が、独立して、F、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M26が、独立して、T、P、F、Q、N、S、A、E、G、D、K、Y、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M27が、独立して、D、E、Q、N、S、T、R、K、G、A、Y、P、V、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M28が、独立して、T、Q、N、S、A、G、C、R、K、P、Y、M、V、I、L、F、E、W、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M29が、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M30が、独立して、D、Q、N、H、K、G、C、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M31が、独立して、F、L、W、Y、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M32が、独立して、S、T、E、A、P、V、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M33が、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、T、C、Y、E、H、V、W、I、L、F、P、R、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M34が、独立して、T、A、V、I、P、F、Q、N、S、E、G、D、K、Y、C、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M35が、独立して、G、S、R、N、H、D、P、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M36が、独立して、T、Q、S、A、E、D、K、H、P、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M37が、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M38が、独立して、A、G、S、Q、N、K、D、C、P、R、Y、E、V、W、T、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M39が、独立して、S、T、E、P、V、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M40が、独立して、T、S、A、D、P、M、Q、E、K、H、Y、V、W、I、F、L、N、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M41が、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M42が、独立して、P、Y、A、T、Q、S、N、W、G、I、E、D、L、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M43が、独立して、S、E、P、V、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M44が、独立して、N、Q、S、E、D、T、H、K、G、A、P、W、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M45が、独立して、V、I、L、F、C、A、及びTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M46が、独立して、A、T、S、N、R、Y、K、D、H、M、L、F、G、Q、C、P、E、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M47が、独立して、I、L、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M48が、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M49が、独立して、F、V、A、T、Q、N、S、E、G、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M50が、独立して、L、F、I、V、Y、A、T、Q、S、D、M、N、K、P、E、R、H、G、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M51が、独立して、G、S、R、H、D、P、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M52が、独立して、T、N、S、G、C、R、H、A、D、P、M、Q、E、K、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M53が、独立して、I、L、W、V、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M54が、独立して、P、K、Y、A、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M55が、独立して、D、E、Q、N、S、K、G、A、Y、P、F、T、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M56が、独立して、L、F、I、V、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M57が、独立して、S、P、V、E、T、A、F、L、N、R、G、Q、K、H、D、I、C、Y、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M58が、独立して、P、M、V、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M59が、独立して、N、Q、S、E、D、T、R、K、G、A、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M60が、独立して、G、S、H、P、R、D、N、A、T、Q、E、C、Y、V、I、L、W、F、K、及びMからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M61が、独立して、S、P、V、T、A、R、K、E、H、C、Y、I、F、L、N、Q、G、D、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M62が、独立して、P、K、A、Y、T、Q、S、G、D、R、C、V、I、L、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M63が、独立して、A、G、S、N、E、K、D、H、M、V、W、I、L、F、T、R、Y、Q、C、及びPからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M64が、独立して、D、E、Q、T、K、P、F、N、S、G、A、Y、R、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M65が、独立して、L、V、F、I、Y、P、A、T、Q、N、S、G、E、D、K、H、M、C、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M66が、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、V、C、Y、I、F、L、Q、M、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M67が、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M68が、独立して、R、K、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M69が、独立して、S、A、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各M70が、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、C、R、K、H、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    式XVが、以下のように表され、
    (N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N-(N10-(N11-(N12-(N13-(N14-(N15-(N16-(N17-(N18-(N19-(N20-(N21-(N22-(N23-(N24-(N25-(N26-(N27-(N28-(N29-(N30-(N31-(N32-(N33-(N34-(N35-(N36-(N37-(N38-(N39-(N40-(N41-(N42-(N43-(N44-(N45-(N46-(N47-(N48-(N49-(N50-(N51-(N52-(N53-(N54-(N55-(N56-(N57-(N58-(N59-(N60-(N61-(N62-(N63-(N64-(N65-(N66-(N67-(N68-(N69-(N70-(N71 (式XV)、
    式中、
    各bが、独立して、0、1、2、又は3であり、
    各cが、独立して、1又は2であり、
    各Nが、独立して、S、N、D、Q、R、T、G、E、H、A、P、M、V、K、Y、W、F、L、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、P、V、A、S、N、G、E、L、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各Nが、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N10が、独立して、T、Q、N、R、K、M、S、E、D、H、P、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N11が、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、K、C、Y、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N12が、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、P、L、M、V、Y、W、F、I、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N13が、独立して、L、F、I、W、V、M、Y、C、A、T、Q、N、S、G、E、D、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N14が、独立して、V、I、L、A、T、S、G、R、P、Y、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N15が、独立して、S、N、Q、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、I、F、L、R、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N16が、独立して、T、N、S、A、D、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N17が、独立して、S、N、Q、R、K、E、D、A、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N18が、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N19が、独立して、T、Q、N、S、A、E、G、D、Y、M、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N20が、独立して、S、Q、R、K、E、A、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N21が、独立して、V、W、I、C、L、F、A、T、S、E、D、K、G、R、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N22が、独立して、T、Q、N、S、A、D、C、K、P、Y、M、V、W、I、F、G、E、H、R、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N23が、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N24が、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N25が、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N26が、独立して、T、N、D、S、A、R、P、Y、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N27が、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N28が、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M、及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N29が、独立して、T、S、A、D、C、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N30が、独立して、P、Y、V、A、T、S、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N31が、独立して、T、Q、S、A、G、K、H、P、Y、V、I、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N32が、独立して、S、R、E、A、Q、K、N、D、T、G、H、C、P、Y、I、F、L、M、V、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N33が、独立して、E、D、Q、N、S、T、H、R、G、A、P、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N34が、独立して、D、N、R、E、Q、S、H、T、K、G、W、I、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N35が、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、K、H、V、F、L、N、D、C、M、W、E、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N36が、独立して、G、S、K、A、T、Q、D、C、P、Y、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N37が、独立して、F、Y、A、T、N、及びRからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N38が、独立して、V、A、T、S、G、R、W、I、C、L、F、E、D、K、P、Y、N、H、M及びQからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N39が、独立して、L、F、I、W、V、M、C、A、T、Q、N、S、G、D、R、K、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N40が、独立して、P、A、S、Y、V、T、G、I、E、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N41が、独立して、D、N、R、G、Y、E、Q、S、H、T、K、W、及びIからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N42が、独立して、S、R、E、A、N、T、G、P、V、Q、K、H、D、Y、M、I、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N43が、独立して、G、S、R、K、A、N、Q、H、E、D、P、W、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N44が、独立して、T、Q、S、A、G、P、Y、I、N、E、D、C、K、H、R、V、L、M、F、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N45が、独立して、S、T、G、A、V、I、R、E、N、P、Q、K、H、D、Y、M、F、L、C、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N46が、独立して、Cであり、
    各N47が、独立して、S、N、R、T、G、K、E、H、D、A、P、Y、V、W、I、L、Q、M、F、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N48が、独立して、G、S、R、K、N、T、Q、H、E、D、P、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N49が、独立して、T、S、G、D、C、A、L、N、R、P、Y、V、W、I、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N50が、独立して、V、A、T、S、G、I、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、及びKからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N51が、独立して、A、T、G、S、Q、N、R、Y、E、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N52が、独立して、D、E、Q、N、S、T、K、A、Y、P、M、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N53が、独立して、A、T、C、G、S、N、P、R、K、D、H、M、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N54が、独立して、L、F、I、V、P、A、T、Q、S、G、R、K、H、M、Y、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N55が、独立して、E、D、N、T、R、K、G、A、及びVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N56が、独立して、A、G、Q、T、S、N、P、R、D、V、W、K、C、Y、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N57が、独立して、Y、C、N、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N58が、独立して、S、T、G、H、A、P、Y、V、F、L、N、R、K、E、D、W、I、Q、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N59が、独立して、I、V、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N60が、独立して、Sであり
    各N61が、独立して、G、S、R、K、A、N、T、Q、E、D、P、及びYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N62が、独立して、I、V、L、F、W、Y、A、T、S、E、D、及びHからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N63が、独立して、T、Q、N、G、C、M、S、A、E、D、Y、V、I、F、L、及びWからなる群から選択されるアミノ酸であり
    各N64が、独立して、S、N、Q、R、G、K、E、D、P、Y、W、F、T、H、A、V、L、I、M、及びCからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N65が、独立して、A、C、G、S、Q、N、R、Y、E、K、D、H、M、V、I、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N66が、独立して、V、I、A、T、S、G、R、P、Y、L、N、H、C、M、F、Q、E、K、及びDからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N67が、独立して、S、N、Q、R、T、G、K、E、H、D、A、C、P、Y、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N68が、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N69が、独立して、K、R、H、S、G、N、Q、D、E、T、A、C、P、Y、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N70が、独立して、D、E、Q、N、S、H、T、R、K、G、A、C、Y、P、M、V、W、I、F、及びLからなる群から選択されるアミノ酸であり、
    各N71が、独立して、A、T、C、G、S、Q、N、P、R、Y、E、K、D、H、M、V、W、I、L、及びFからなる群から選択されるアミノ酸である、請求項16~18のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  20. mが、1であり、Yが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、24、25、27、29、34、35、36、37、38、56、57、58、74、又は75からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項16~19のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  21. が、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、及び栄養タンパク質からなる群から選択される、請求項16~20のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  22. (X-(Y-Zの式を有するポリペプチドをコードする異種核酸分子を含む酵母であって、式中、
    は、請求項1~11のいずれか一項に記載のプレタンパク質シグナルペプチドであり、
    は、請求項12~15のいずれか一項に記載のプロタンパク質シグナルペプチドであり、
    は、ペイロードタンパク質であり、
    nは、0~1であり、mは、0~1であり、
    ただし、n及びmの両方が0ではない、酵母。
  23. 前記酵母が、Kluyveromyces、Pichia、Saccharomyces、Trichoderma、及びAspergillusからなる群から選択される、請求項22に記載の酵母。
  24. 前記酵母が、Kluyveromyces酵母であり、Xが、式I又は配列番号1から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、配列番号20、又は配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の酵母。
  25. 前記酵母が、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)であり、Xが、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、配列番号20、又は配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の酵母。
  26. 前記酵母が、Saccharomyces酵母であり、Xが、式III、式IV、若しくは式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、式VII、若しくは式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の酵母。
  27. 前記酵母が、Trichoderma酵母であり、Xが、式IX又は配列番号31、32、若しくは33から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式X若しくは式XI又は配列番号34、35、36、37、若しくは38から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の酵母。
  28. 前記酵母が、Aspergillus酵母(例えば、A.niger)であり、Xが、式XIII、又は配列番号70、71、72、若しくは73から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式XIV若しくは式XV又は配列番号74若しくは75から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の酵母。
  29. が、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、殺虫剤、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、又は肥料)、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、及び栄養タンパク質からなる群から選択される、請求項22~28のいずれか一項に記載の酵母。
  30. ペイロードタンパク質を産生するための方法であって、
    i)請求項16~21のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸で酵母をトランスフェクトし、操作された酵母を産生することと、
    ii)前記操作された酵母を増殖させるのに有効な環境で前記操作された酵母を培養することと、
    iii)前記操作された酵母による前記ペイロードタンパク質の分泌を誘導することと、を含む、方法。
  31. 前記ペイロードタンパク質の分泌を誘導することが、請求項16~21のいずれか一項に記載のポリペプチドを発現するのに十分な条件下で前記酵母を培養することを含み、前記シグナルペプチドの存在が、前記ペイロードタンパク質の分泌を誘導する、請求項30に記載の方法。
  32. 前記酵母が、Kluyveromyces、Pichia、Saccharomyces、Trichoderma、及びAspergillusからなる群から選択される、請求項30又は31に記載の方法。
  33. 前記酵母が、Kluyveromyces酵母であり、Xが、式I又は配列番号1から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI又は配列番号20若しくは配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項30又は31に記載の方法。
  34. 前記酵母が、Pichia酵母(例えば、P.pastoris)であり、Xが、式II又は配列番号2、3、4、5、6、若しくは7から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI又は配列番号20若しくは配列番号21から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項30又は31に記載の方法。
  35. 前記酵母が、Saccharomyces酵母であり、Xが、式III、式IV、若しくは式V、又は配列番号8、9、10、11、12、13、14、15、若しくは16から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式VI、式VII、若しくは式VIII、又は配列番号18、19、20、21、22、23、24、若しくは25から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項30又は31に記載の方法。
  36. 前記酵母がTrichoderma酵母であり、Xが、式IX又は配列番号31、32、若しくは33から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式X若しくは式XI、又は配列番号34、35、36、37、若しくは38から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項30又は31に記載の方法。
  37. 前記酵母が、Aspergillus酵母(例えば、A.niger)であり、Xが、式XIII又は配列番号70、71、72、若しくは73から選択されるアミノ酸配列を含み、Yが、式XIV若しくは式XV又は配列番号74若しくは75から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項30又は31に記載の方法。
  38. 前記酵母を、培養培地中で増殖させ、前記方法が、前記培養培地から前記ペイロードタンパク質を回収することを更に含む、請求項29~37のいずれか一項に記載の方法。
  39. が、抗ウイルス剤、インスリン、インクレチン、サイトカイン、抗体、抗菌ペプチド、粘膜タンパク質、酵素、酵素阻害剤、ホルモン、殺虫剤、殺菌剤除草剤、殺真菌剤、殺線虫剤、殺ダニ剤、植物成長調整剤、植物成長刺激剤、肥料、ワクチン、診断用タンパク質、飼料変換酵素、香味剤、又は栄養タンパク質からなる群から選択される、請求項29~38のいずれかに記載の方法。
  40. 疾患又は状態の治療を必要とする対象において、治療を行うための方法であって、治療有効量の請求項22~29のいずれか一項に記載の酵母を前記対象に投与することを含む、方法。
  41. 前記疾患又は状態が、感染症、自己免疫疾患、原発性(先天性)酵素欠損症、機能性腸障害に続発する酵素欠損症、糖尿病、肥満、代謝障害、腸内細菌異常増殖症、腸感染症、細菌性膣症、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、小腸症候群、セリアック病、グルテン不耐症、大腸炎、消化性潰瘍、又は別の胃腸の状態若しくは障害から選択される、請求項40に記載の方法。
  42. 前記疾患又は状態が、酵素欠損症であり、前記ペイロードタンパク質が、酵素である、請求項40又は41に記載の方法。
  43. 前記疾患又は状態が、先天性スクラーゼ・イソマルターゼ欠損症であり、前記ペイロードタンパク質が、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である、請求項40又は41に記載の方法。
  44. 前記疾患又は状態が、機能性腸障害に続発するスクロース及びイソマルターゼ不耐症のうちの一方又は両方であり、前記ペイロードタンパク質が、インベルターゼ及びイソマルターゼのうちの一方又は両方である、請求項40又は41に記載の方法。
  45. 前記疾患又は状態が、グルテン不耐症、難治性スプルー、又はセリアック病のうちの1つ以上であり、前記ペイロードタンパク質が、An-PEP、Mx-PEP、Aspergillus tubigensisプロリルエンドペプチダーゼ、スブチリシン、セドリシン(sedolisin)、及びラロゾチド(larozotide)のうちの1つ以上である、請求項40又は41に記載の方法。
  46. 前記疾患又は状態が、膵炎又は膵外分泌機能不全であり、前記ペイロードタンパク質が、トリアシルグリセロールリパーゼ、コリパーゼ、アルファ-アミラーゼ、トリプシン、及びキモトリプシンのうちの1つ以上から選択される、請求項40又は41に記載の方法。
  47. 前記疾患又は状態が、エンテロペプチダーゼ欠損症又はエンテロキナーゼ欠損症であり、前記ペイロードタンパク質が、エンテロペプチダーゼ、プロエンテロペプチダーゼ、及びエンテロキナーゼのうちの1つ又は全てである、請求項40又は41に記載の方法。
  48. 前記疾患又は状態が、小腸内細菌異常増殖症、炎症性腸疾患、過敏性腸症候群、C.difficile感染症、嚢胞性線維症、壊死性腸炎、及び糖尿病であり、前記ペイロードタンパク質が、腸アルカリホスファターゼである、請求項40又は41に記載の方法。
  49. 前記疾患又は状態が、短腸症候群であり、前記ペイロードタンパク質が、IGF-1、GLP-2、又はGLP-2の合成誘導体である、請求項40又は41に記載の方法。
  50. 前記疾患又は状態が、ラクトース過敏症又はラクトース不耐症であり、前記ペイロードタンパク質が、ラクターゼである、請求項40又は41に記載の方法。
  51. 前記疾患又は状態が、トレハロース過敏症又はラクトース不耐症であり、前記ペイロードタンパク質が、トレハラーゼである、請求項40又は41に記載の方法。
  52. 前記疾患又は状態が、マルトース過敏症又はラクトース不耐症であり、前記ペイロードタンパク質がマルターゼである、請求項40又は41に記載の方法。
  53. 前記疾患又は状態が、悪性貧血であり、前記ペイロードタンパク質が、内因子である、請求項40又は41に記載の方法。
  54. 前記疾患又は状態が、細菌異常増殖症であり、前記ペイロードタンパク質がリゾチーム、ナイシン、デフェンシン、マガイニン、カテスリチン(cateslytin)、又はそれらの任意の組み合わせである、請求項40又は41に記載の方法。
  55. 前記状態が、E.coli、C.difficile、vibrio cholera、Shigella、Salmonella、Cryptosporidium、又はそれらの任意の組み合わせのうちの1つ以上によって引き起こされる細菌感染症である、請求項40又は41に記載の方法。
  56. 前記状態が、ウイルス感染症である、請求項40又は41に記載の方法。
  57. 前記疾患又は状態が、1型糖尿病又は2型糖尿病であり、前記ペイロードタンパク質が、インスリン、又はインクレチンである、請求項40又は41に記載の方法。
  58. 前記投与が、経口又は局所である、請求項40又は41に記載の方法。
  59. 前記疾患又は状態が、炎症性要素を有し、前記ペイロードタンパク質が、IL-10、IL-22、TGFβ、抗TNFα抗体若しくはその断片、又はそれらの任意の組み合わせである、請求項40又は41に記載の方法。
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