JP2024045611A - 癌患者における薬物応答性を予測する方法 - Google Patents

癌患者における薬物応答性を予測する方法 Download PDF

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Abstract

【課題】癌患者における薬物応答性を予測する方法の提供。【解決手段】本発明は、癌を有する患者における遺伝子発現を検出するための方法、デバイス及びキット、又は癌を有する患者の治療、例えば２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される塩による治療に対する応答性を測定するための方法、デバイス及びキットを特徴とする。本発明はさらに、治療、例えば２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される塩による治療を投与することにより、癌を有する患者を治療する方法を含み、特に、患者が本明細書に記載のバイオマーカーの発現に基づいて治療に応答性であると測定された場合に、癌を有する患者を治療する方法を含む。【選択図】なし

Description

癌治療を受けている対象における癌の応答性を予測するためのバイオマーカーの使用。
ＤＮＡマイクロアレイは、患者の腫瘍サンプルにおける遺伝子発現を測定し、診断を容易にするために使用されてきた。遺伝子発現は、患者における癌の種類、病期、及び起源に加えて、癌の存在を明らかにすることができる。遺伝子発現は、癌治療の有効性を予測する上でも役割を果たす可能性がある。ここ数十年、国立癌研究所（ＮＣＩ）は、６０のヒト癌細胞株の増殖を制限する効果について癌治療薬の試験を行ってきた。ＮＣＩはまた、ＤＮＡマイクロアレイを使用してこれらの６０の癌細胞株における遺伝子発現を測定してきた。ＮＣＩデータセットを使用して、遺伝子発現と治療効果の関係を探る研究が行れてきた。
癌治療中、効果的な治療法を見つけるための試行錯誤のアプローチにより、重要な時間が失われることがよくある。さらに、癌細胞は、以前に有効であった治療法に対して耐性を発達させることがよくある。そのような状況では、患者の転帰は、そのような耐性を早期に発見することで大幅に改善されることになる。
したがって、当該技術分野では、医療処置に対する癌患者の応答性を予測することができる方法及びデバイスが必要とされている。
癌を有する患者（例えば、乳癌、卵巣癌、膵癌、又はその再発を有する患者）などの患者におけるバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）の遺伝子発現をそれぞれ検出するための方法、ならびに２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者（例えば、乳癌、卵巣癌又は膵癌、又はその再発を有する患者）の応答性を測定する方法を特徴としている。本発明はまた、癌の治療を必要とする患者（例えば、乳癌、卵巣癌又は膵癌、又はその再発を有する患者）において、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を患者に投与することを含む方法であって、患者が、本明細書に記載の診断方法に従って、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であるか、又は応答性であることが測定されている、方法も特徴とする。
この方法で診断又は治療することができる癌の例示的な種類としては、例えば、骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、結腸直腸癌（例えば、大腸癌及び直腸癌）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤白血病、及び慢性白血病）、骨髄異形成症候群、リンパ腫（例えば、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及びリンパ球性リンパ腫）、子宮頸癌、前立腺癌、食道癌、骨髄腫、神経膠腫（例えば、乏突起膠腫）、膵癌（例えば、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様腺癌、コロイド腺癌、膵島細胞癌、及び膵臓神経内分泌癌）、卵巣癌（例えば、卵巣腺癌又は胚性癌腫）、消化管間質腫瘍、肉腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、平滑筋肉腫、ユーイング肉腫、及び横紋筋肉腫）、乳癌（例えば、髄様癌）、ＥＲ陽性癌、膀胱癌、頭頸部癌（例えば、頭頸部の扁平上皮癌）、肺癌（例えば、非小細胞肺癌、大細胞癌、気管支原性癌、及び乳頭腺癌）、転移性癌、口腔癌、子宮癌、精巣癌（例えば、精上皮腫及び胚性癌腫）、皮膚癌（例えば、扁平上皮癌及び基底細胞癌）、甲状腺癌（例えば、乳頭癌及び髄様癌）、脳癌（例えば、星状細胞腫及び頭蓋咽頭癌）、胃癌、上皮内癌、骨癌、胆道癌、眼癌、肝癌（例えば、肝細胞癌又は肝腫）、喉頭癌、腎臓癌（例えば、腎細胞癌及びウィルムス腫瘍）、胃癌、芽細胞腫（例えば、腎芽細胞腫、髄芽細胞腫、血管芽細胞腫、神経芽細胞腫、及び網膜芽細胞腫）、真性多血症、脊索腫、滑膜腫、中皮腫、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、嚢胞腺癌、胆管癌、絨毛癌、上皮癌、上衣腫、松果体腫、聴神経腫、神経鞘腫、髄膜腫、下垂体腺腫、神経鞘腫瘍、小腸の癌、内分泌系の癌、陰茎の癌、尿道の癌、皮膚又は眼内黒色腫、婦人科腫瘍、小児の充実性腫瘍、又は中枢神経系の新生物が挙げられる。例えば、癌は充実性腫瘍又は血液学的癌であり得る。
第１の態様は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌（例えば、乳癌、卵巣癌又は膵癌などの上述の癌の１つ）を有する患者の応答性を測定する方法を特徴とする。特に、患者は、乳癌、卵巣癌又は膵癌の再発などの癌の再発を有する可能性がある。この方法には以下のものが含まれる：（ａ）１つ以上の核酸分子を含む患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）を、（ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は（ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子を含むデバイス（例えば、マイクロアレイ）と接触させることと、（ｂ）患者からの１つ以上の核酸分子と、デバイスの一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出すること。患者は、以下の場合に２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定される：（ｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いに類似している；（ｉｉ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；（ｉｉｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いと異なっている；及び／又は（ｉｖ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている。
第１の態様の方法は、以下の場合に２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を患者に投与することをさらに含み得る：（ｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いに類似している；（ｉｉ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；（ｉｉｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いと異なっている；及び／又は（ｉｖ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている。この方法は、以下の場合に２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の１つ以上の癌治療法を患者に投与することをさらに含み得る：（ｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いと異なっている；（ｉｉ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている；（ｉｉｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いと類似している；及び／又は（ｉｖ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いと類似している。特に、癌治療法の１つ以上は、手術、放射線、又は治療薬を含み得、該治療薬は、例えば、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、ＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１阻害剤、イピリムマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドミド、プレドニゾン、デキサメタゾン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、メルファラン、カペシタビン、テガフール、イリノテカン、オキサリプラチン、セツキシマブ、ロイコボリン、ＳＮ－３８、エベロリムス、テムシロリムス、ブレオマイシン、ロムスチン、デプシペプチド、カルボプラチン、エルロチニブ、ゲムシタビン、マイトキサントロン、シスプラチン、ブスルファン、エピルビシン、三酸化ヒ素、ベンダムスチン、フルベストラント、テニポシド、アドリアマイシン、デシタビン、エストラムスチン、エトポシド、アザグアニン、アクラルビシン、マイトキサントロン、マイトマイシン、パクリタキセル、タキソテール、イロフルベン、５－ＦＵ、ａｒａ－ｃ、メチルプレドニゾロン、メトトレキサート、メチル－ｇａｇ、ベリノスタット、カルボプラチン、イダルビシン、ＩＬ４－ＰＲ３８、バルプロ酸、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ）、シトキサン、トポテカン、ヒドロキサム酸サブエロイルアニリド、リューケラン、フルダラビン、ビンブラスチン、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、テガフール、ダウノルビシン、メクロレタミン、ストレプトゾシン、カルムスチン、メルカプトプリン、ダクチノマイシン、トレチノイン、イホスファミド、タモキシフェン、フロクスウリジン、チオグアニン、ＰＳＣ ８３３、ハーセプチン、ベバシズマブ、セレコキシブ、イレッサ、アナストロゾール、レトロゾール、又はリツキシマブである。
また、癌の治療を必要とする、乳癌、卵巣癌又は膵癌などの上述の癌の１つを有する患者における癌の治療方法であって、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を患者に投与することを含み、当該患者が、本発明の第１の態様の方法に従い、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定される、方法も特徴としている。特に、患者は、乳癌、卵巣癌又は膵癌の再発などの癌の再発を有する可能性がある。
第２の態様は、癌（例えば、乳癌、卵巣癌又は膵癌などの上述の癌の１つ）を有する患者を治療する方法を特徴とする。特に、患者は、乳癌、卵巣癌又は膵癌の再発などの癌の再発を有する可能性がある。この方法には以下のものが含まれる：（ａ）１つ以上の核酸分子を含む患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）を、（ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は（ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子を含むデバイスと接触させることと、（ｂ）患者からの１つ以上の核酸分子と、デバイスの一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出することと、（ｃ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を患者に投与すること。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、以下の場合に患者に投与することができる：（ｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いに類似している；（ｉｉ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；（ｉｉｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いと異なっている；及び／又は（ｉｖ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている。
また、対象（例えば、患者）における癌（例えば、乳癌、卵巣癌又は膵癌などの上述の癌の１つ、又はその再発）の治療に使用するための２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物であって、対象が、前述の態様の方法により、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されている、組成物も特徴としている。
第３の態様は、対象（例えば、患者）における癌（例えば、乳癌、卵巣癌又は膵癌などの上述の癌の１つ、又はその再発）の治療に使用するための２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物であって、対象が、以下により、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されている、組成物を特徴とする：（ａ）１つ以上の核酸分子を含む対象（例えば、患者）からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）を、（ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は（ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子を含むデバイスと接触させることと、（ｂ）患者からの１つ以上の核酸分子と、デバイスの一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出すること。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物は、以下の場合に患者に投与することができる：（ｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いに類似している；（ｉｉ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；（ｉｉｉ）感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の発現度合いと異なっている；及び／又は（ｉｖ）耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている。
前述の態様のいずれかにおいて、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）の投与前、投与と同時、又は投与後に、１つ以上の追加の治療法（例えば、手術、放射線、又は治療薬）を患者に投与してもよい。特に、治療薬は、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、ＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１阻害剤、イピリムマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドミド、プレドニゾン、デキサメタゾン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、メルファラン、カペシタビン、テガフール、イリノテカン、オキサリプラチン、セツキシマブ、ロイコボリン、ＳＮ－３８、エベロリムス、テムシロリムス、ブレオマイシン、ロムスチン、デプシペプチド、カルボプラチン、エルロチニブ、ゲムシタビン、マイトキサントロン、シスプラチン、ブスルファン、エピルビシン、三酸化ヒ素、ベンダムスチン、フルベストラント、テニポシド、アドリアマイシン、デシタビン、エストラムスチン、エトポシド、アザグアニン、アクラルビシン、マイトキサントロン、マイトマイシン、パクリタキセル、タキソテール、イロフルベン、５－ＦＵ、ａｒａ－ｃ、メチルプレドニゾロン、メトトレキサート、メチル－ｇａｇ、ベリノスタット、カルボプラチン、イダルビシン、ＩＬ４－ＰＲ３８、バルプロ酸、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ）、シトキサン、トポテカン、ヒドロキサム酸サブエロイルアニリド、リューケラン、フルダラビン、ビンブラスチン、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、テガフール、ダウノルビシン、メクロレタミン、ストレプトゾシン、カルムスチン、メルカプトプリン、ダクチノマイシン、トレチノイン、イホスファミド、タモキシフェン、フロクスウリジン、チオグアニン、ＰＳＣ ８３３、ハーセプチン、ベバシズマブ、セレコキシブ、イレッサ、アナストロゾール、レトロゾール、及びリツキシマブからなる群から選択され得る。治療薬は、非経口（例えば、静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与）、経腸、又は局所投与され得る。
前述の態様のいずれかにおいて、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、非経口（例えば、静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与）、経腸（例えば、経口）、又は局所投与され得る。好ましくは、２Ｘ－１２１、薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は経口投与される。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、２回以上、例えば毎日１回以上（例えば、最大６日間で毎日１回）、１週間に１回以上、隔週で１回以上、３週間毎に１回以上、又は毎月１回以上投与され得る。好ましくは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、毎日１回投与される。この方法はさらに、第１投与量の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）を投与した後、第２投与量の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）を患者に１週間、２週間、３週間、４週間、又は５週間投与することを含み得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、特定の剤形（例えば、液剤、錠剤、カプセル剤など）で投与され得、当該剤形は、約５～５０００ｍｇ（例えば、約５０～８００ｍｇ）の投与量で投与され得る。特に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、約１０ｍｇ、５０ｍｇ、２００ｍｇ、又は６００ｍｇの投与量で投与され得る。好ましくは、約６００ｍｇの２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は毎日投与される。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、硬ゼラチンカプセル（例えば、１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇの硬ゼラチンカプセル）又はフィルムコート錠（例えば、１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇのフィルムコート錠）の形態で投与され得る。好ましくは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）は、硬ゼラチンカプセル（例えば、２００ｍｇの硬ゼラチンカプセル）の形態で投与される。特に、接触工程（ａ）及び測定工程（ｂ）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩、又はそれを含む組成物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物）を患者に投与する前、投与と同時、又は投与した後に行われる。接触工程（ａ）及び測定工程（ｂ）のそれぞれは、複数回行ってもよい。
上記の態様のいずれかにおいて、デバイスは、表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））のヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上の一本鎖核酸分子を含み得る。特に、デバイスの１つ以上の一本鎖核酸分子は、１０～１００ヌクレオチドの範囲の長さ（例えば、２０～６０ヌクレオチドの範囲の長さ）を有する。
前述の態様のいずれかにおいて、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度及び／又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）の感度及び／又は耐性は、ＮＣＩ６０細胞株のＧ１５０データに基づく。
上記の態様のいずれかにおいて、この方法は、１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）などの、表２に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）、及び／又は１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））などの、表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）を、平均スコアに転換することを含み得、当該平均スコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する患者の応答性を示す。この方法はさらに、１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）などの、表２に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）に関する平均スコアから、１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））などの、表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）に関する平均スコアを減じて異なるスコアを入手することを更に含み得、当該異なるスコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する患者の応答性を示す。特に、カットオフ値を上回る平均スコア及び／又は異なるスコアは、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることを示し、カットオフ値が約０．３、約０．３５、約０．４、約０．４５、約０．５、約０．６、約０．７、約０．８、約０．９、又はそれ以上である場合などである。
上記の態様のいずれにおいても、デバイスは、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）系プラットフォームなどのマイクロアレイであり得る。感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）などの、表２に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）及び／又は耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））などの、表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）の発現度合いは、マイクロアレイ分析又は核酸増幅法（例えば、逆転写定量リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ｑＰＣＲ））を使用して測定され得る。特に、感度バイオマーカー及び／又は耐性バイオマーカーの発現度合いは、表２及び／又は表３の１つ以上のバイオマーカーをコードする遺伝子から転写されるｍＲＮＡの量を検出することにより測定される。
上記の態様のいずれにおいても、感度バイオマーカーは、下記の１つ以上から選択され得る：ＳＲＳＦ７（配列番号１）、ＵＣＨＬ１（配列番号２）、ＭＬＬＴ１１（配列番号３）、ＡＤＤ２（配列番号４又は５）、ＰＲＭＴ１（配列番号６）、ＳＲＳＦ３（配列番号７）、ＰＲＭＴ５（配列番号８）、ＣＯＣＨ（配列番号９）、ＲＵＶＢＬ１（配列番号１０）、ＭＡＲＣＫＳＬ１（配列番号１１）、ＣＨＥＲＰ（配列番号１２）、ＭＴＳＳ１（配列番号１３）、ＬＳＭ４（配列番号１４）、ＲＡＰＧＥＦ５（配列番号１５）、ＰＲＰＦ４（配列番号１６）、ＬＳＭ４（配列番号１７）、ＤＥＳＩ２（配列番号１８）、ＲＮＰＳ１（配列番号１９）、ＳＮＸ１０（配列番号２０）、ＣＵＬ３（配列番号２１）、ＣＨＤ４（配列番号２２）、ＭＳＨ２（配列番号２３）、ＨＮＲＮＰＭ（配列番号２４）、ＳＲＳＦ１（配列番号２５）、ＮＥＬＬ２（配列番号２６）、ＰＡＩＣＳ（配列番号２７）、ＨＯＸＡ１０（配列番号２８）、ＢＵＢ１Ｂ（配列番号２９）、Ｅ２Ｆ５（配列番号３０）、ＭＡＧＥＤ４ ＭＡＧＥＤ４Ｂ ＳＮＯＲＡ１１Ｄ ＳＮＯＲＡ１１Ｅ（配列番号３１）、ＰＲＰＦ８（配列番号３２）、ＳＯＲＤ（配列番号３３）、ＨＮＲＮＰＵ（配列番号３４）、ＰＥＸ５（配列番号３５）、ＨＹＰＫ ＭＩＲ１２８２ ＳＥＲＦ２ ＳＥＲＦ２－Ｃ１５ＯＲＦ６３（配列番号３６）、ＳＴＲＡＰ（配列番号３７）、ＮＤＵＦＡＢ１（配列番号３８）、ＦＡＲＳＡ（配列番号３９）、ＳＴＯＭＬ２（配列番号４０）、ＥＲＨ（配列番号４１）、ＨＳＢＰ１（配列番号４２）、ＤＤＸ３９Ａ（配列番号４３）、ＯＤＣ１（配列番号４４）、ＴＡＦ５（配列番号４５）、ＴＢＣ１Ｄ３１（配列番号４６）、ＴＲＡ２Ｂ（配列番号４７）、ＮＵＤＣ（配列番号４８）、ＤＤＸ２３（配列番号４９）、ＰＲＰＦ３１（配列番号５０）、ＵＢＥ２Ｓ（配列番号５１）、ＴＣＦ４（配列番号５２）、ＭＬＦ２（配列番号５３）、ＣＣＤＣ１８１（配列番号５４）、ＴＣＦ４（配列番号５５）、ＤＥＳＩ２（配列番号５６）、ＲＰＦ１（配列番号５７）、ＰＡＳＫ（配列番号５８）、ＮＵＰ８８（配列番号５９）、ＲＮＡＳＥＨ２Ａ（配列番号６０）、ＦＢＬ（配列番号６１）、ＬＯＣ１０１９２８７４７ ＲＢＭＸ ＳＮＯＲＤ６１（配列番号６２）、ＮＸＦ１（配列番号６３）、ＰＬＥＫＨＯ１（配列番号６４）、ＧＡＲ１（配列番号６５）、ＲＰＡ１（配列番号６６）、ＺＮＦ２４（配列番号６７）、ＢＯＰ１
ＭＩＲ７１１２（配列番号６８）、ＲＡＢ３Ｂ（配列番号６９）、ＳＬＣ３５Ｇ２（配列番号７０）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号７１）、ＤＫＣ１ ＭＩＲ６６４Ｂ ＳＮＯＲＡ５６（配列番号７２）、ＰＳＭＣ３ＩＰ（配列番号７３）、ＤＮＡＪＣ７（配列番号７４）、ＲＲＰ１Ｂ（配列番号７５）、ＮＭＥ１（配列番号７６）、ＳＮＲＰＡ（配列番号７７）、ＤＢＮ１（配列番号７８）、ＫＩＡＡ００２０（配列番号７９）、ＳＵＰＶ３Ｌ１（配列番号８０）、ＺＮＦ５７３（配列番号８１）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号８２）、ＴＯＸ３（配列番号８３）、ＨＳＰＤ１（配列番号８４）、ＡＣＬＹ（配列番号８５）、ＴＯＸ３（配列番号８６）、ＭＳＡＮＴＤ３－ＴＭＥＦＦ１ ＴＭＥＦＦ１（配列番号８７）、ＡＫＩＲＩＮ１（配列番号８８）、ＵＢＥ２Ｍ（配列番号８９）、ＭＴＦ２（配列番号９０）、ＥＷＳＲ１（配列番号９１）、ＦＡＲＳＡ（配列番号９２）、ＳＫＰ２（配列番号９３）、ＴＭＥＭ９７（配列番号９４）、ＨＮＲＮＰＤ（配列番号９５）、ＩＬＫＡＰ（配列番号９６）、ＮＡＳＰ（配列番号９７）、ＳＮＲＰＤ１（配列番号９８）、ＴＩＭＭ４４（配列番号９９）、ＰＫＮ１（配列番号１００）、ＳＴＡＵ２（配列番号１０１）、ＤＮＡＡＦ２（配列番号１０２）、ＳＮＲＰＤ２（配列番号１０３）、ＦＵＳ（配列番号１０４）、ＰＡＳＫ（配列番号１０５）、ＡＴＰ６Ｖ１Ｇ２－ＤＤＸ３９Ｂ ＤＤＸ３９Ｂ ＳＮＯＲＤ８４（配列番号１０６）、ＰＤＳＳ１（配列番号１０７）、ＮＵＤＣ（配列番号１０８）、ＴＯＸ３（配列番号１０９）、ＴＰＧＳ２（配列番号１１０）、ＳＬＩＲＰ（配列番号１１１）、ＮＣＬ（配列番号１１２）、ＡＮＰ３２Ａ（配列番号１１３）、ＳＡＦＢ（配列番号１１４）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１５）、ＣＥＰ６８（配列番号１１６）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１７）、Ｃ８ｏｒｆ３３（配列番号１１８）、ＭＲＰＬ１１（配列番号１１９）、ＰＯＬＲ２Ｉ（配列番号１２０）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号１２１）、ＭＣＡＭ ＭＩＲ６７５６（配列番号１２２）、ＥＣＳＩＴ（配列番号１２３）、ＭＤＫ（配列番号１２４）、ＰＵＦ６０（配列番号１２５）、ＰＦＮ２（配列番号１２６）、ＳＹＮＣＲＩＰ（配列番号１２７）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号１２８）、ＳＬＣ１６Ａ１（配列番号１２９）、ＰＯＬＲ２Ｈ（配列番号１３０）、ＭＡＰ３Ｋ７（配列番号１３１）、ＣＳＲＰ２（配列番号１３２）、ＢＣＬ１１Ａ（配列番号１３３）、ＰＮＫＰ（配列番号１３４）、ＤＮＡＪＣ６（配列番号１３５）、ＦＤＦＴ１（配列番号１３６）、ＦＡＤＳ１ ＭＩＲ１９０８（配列番号１３７）、ＲＰＡＲＰ－ＡＳ１（配列番号１３８）、ＤＨＲＳ７（配列番号１３９）、ＣＣＮＢ１ＩＰ１（配列番号１４０）、ＣＣＴ３ ＬＯＣ１０１９２７１３７（配列番号１４１）、ＤＤＸ１８（配列番号１４２）、ＡＡＲＳＤ１ ＰＴＧＥＳ３Ｌ ＰＴＧＥＳ３Ｌ－ＡＡＲＳＤ１（配列番号１４３）、ＨＮＲＮＰＤＬ（配列番号１４４）、ＡＴＸＮ７Ｌ３Ｂ（配列番号１４５）、ＭＲＰＳ１４（配列番号１４６）、ＳＯＸ４（配列番号１４７）、ＥＬＯＶＬ２（配列番号１４８）、ＫＣＮＪ８（配列番号１４９）、ＴＲＩＡＰ１（配列番号１５０）、ＥＩＦ２Ｂ１（配列番号１５１）、ＦＢＸＬ１４（配列番号１５２）、ＭＡＰＲＥ２（配列番号１５３）、ＯＲＣ４（配列番号１５４）、ＭＤＮ１（配列番号１５５）、ＫＮＯＰ１（配列番号１５６）、ＫＢＴＢＤ１１（配列番号１５７）、ＦＡＤＳ２（配列番号１５８）、ＲＡＮＢＰ１（配列番号１５９）、ＰＬＥＫＨＢ１（配列番号１６０）、ＨＳＰＥ１（配列番号１６１）、ＴＭＥＭ９７（配列番号１６２）、ＩＴＦＧ２ ＬＯＣ１００５０７４２４（配列番号１６３）、ＳＦＰＱ（配列番号１６４）、ＲＦＣ３（配列番号１６５）、ＳＤＲ３９Ｕ１（配列番号１６６）、ＰＢＫ（配列番号１６７）、ＰＨＢ（配列番号１６８）、ＫＨＤＲＢＳ１（配列番号１６９）、ＰＤＡＰ１（配列番号１７０）、ＳＳＲＰ１（配列番号１７１）、及びＢ３ＧＡＬＴ２（配列番号１７２）。
上記の態様のいずれにおいても、耐性バイオマーカーは、下記の１つ以上から選択され得る：ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）、ＧＡＤＤ４５Ｂ（配列番号１７５）、ＣＬＩＣ１（配列番号１７６）、ＬＡＳＰ１（配列番号１７７）、ＡＰＯＢＥＣ３Ｂ（配列番号１７９）、ＬＧＡＬＳ１（配列番号１８０）、ＴＡＰＢＰ（配列番号１８１）、ＡＨＮＡＫ（配列番号１８２）、ＢＨＬＨＥ４０（配列番号１８３）、Ｓ１００Ａ１１（配列番号１８４）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１８５）、ＺＢＴＢ３８（配列番号１８６）、ＳＴＡＴ１（配列番号１８７）、ＴＣＩＲＧ１（配列番号１８８）、Ｓ１００Ａ１１Ｐ１（配列番号１８９）、ＣＴＳＡ（配列番号１９０）、ＶＥＧＦＡ（配列番号１９１）、ＳＴＯＭ（配列番号１９２）、Ｐ４ＨＢ（配列番号１９３）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１９４）、ＦＸＹＤ５（配列番号１９５）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９６）、ＹＰＥＬ５（配列番号１９７）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９８）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９９）、ＳＴＯＭ（配列番号２００）、ＰＬＩＮ３（配列番号２０１）、ＲＲＢＰ１（配列番号２０２）、ＩＲＦ１（配列番号２０３）、ＬＭＮＡ（配列番号２０４）、ＮＰＣ２（配列番号２０５）、Ｐ４ＨＢ（配列番号２０６）、ＫＬＦ６（配列番号２０７）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２０８）、ＲＨＯＣ（配列番号２０９）、ＣＤ５９（配列番号２１０）、ＳＲＧＮ（配列番号２１１）、ＳＲＧＮ（配列番号２１２）、ＳＴＡＴ１（配列番号２１３）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２１４）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２１５）、ＰＩＥＺＯ１（配列番号２１６）、ＬＧＡＬＳ３（配列番号２１７）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２１８）、ＣＤ９７（配列番号２１９）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２２０）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２２１）、ＦＮＤＣ３Ｂ ＬＯＣ１０１９２８６１５（配列番号２２２）、ＣＫＬＦ ＣＫＬＦ－ＣＭＴＭ１（配列番号２２３）、ＩＦＩ３５（配列番号２２４）、ＴＩＰＡＲＰ（配列番号２２５）、ＴＡＰ１（配列番号２２６）、ＭＩＣＡＬＬ２（配列番号２２７）、ＲＲＢＰ１（配列番号２２８）、ＺＦＰ３６（配列番号２２９）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２３０）、ＴＮＩＰ１（配列番号２３１）、ＣＤ５９（配列番号２３２）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２３３）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２３４）、ＦＬＮＢ（配列番号２３５）、ＰＳＧ６（配列番号２３６）、ＣＢＸ７（配列番号２３７）、ＲＡＲＲＥＳ３（配列番号２３８）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２３９）、ＳＵＮ２（配列番号２４０）、ＥＨＤ２（配列番号２４１）、ＭＡＰ３Ｋ５（配列番号２４２）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２４３）、ＮＯＬ１２ ＴＲＩＯＢＰ（配列番号２４４）、ＣＫＬＦ（配列番号２４５）、ＡＲＰＣ１Ｂ（配列番号２４６）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２４７）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２４８）、ＲＰ１１－３９５Ｂ７．７（配列番号２４９）、ＥＨＤ２（配列番号２５０）、ＬＥＰＲＯＴ（配列番号２５１）、ＢＴＮ３Ａ２ ＢＴＮ３Ａ３（配列番号２５２）、ＩＮＰＰ４Ｂ（配列番号２５３）、ＤＵＳＰ１（配列番号２５４）、ＥＶＩ２Ａ（配列番号２５５）、ＴＦＰＩ（配列番号２５６）、ＥＨＤ１（配列番号２５７）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２５８）、ＥＰＡＳ１（配列番号２５９）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６０）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２６１）、ＣＬＩＣ３（配列番号２６２）、ＴＦＰＩ（配列番号２６３）、ＮＡＣＣ２（配列番号２６４）、ＴＧＦＢＩ（配列番号２６５）、ＩＥＲ３（配列番号２６６）、ＭＩＣＡ（配列番号２６７）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２６８）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６９）、ＣＮＮ２（配列番号２７０）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７１）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２７２）、ＭＢＮＬ１（配列番号２７３）、ＩＳＧ１５（配列番号２７４）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７５）、ＣＯＰＧ１（配列番号２７６）、ＣＤ９９（配列番号２７７）、ＰＳＭＢ９（配列番号２７８）、ＺＦＰ３６Ｌ１（配列番号２７９）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２８０）、ＳＨＣ１（配列番号２８１）、ＧＳＴＫ１（配列番号２８２）、ＣＡＶ１（配列番号２８３）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号２８４）、ＫＲＴ７（配列番号２８５）、ＴＦＰＩ（配列番号２８６）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号２８７）、ＲＨＯＧ（配列番号２８８）、ＣＤＨ１１（配列番号２８９）、ＡＢＣＣ３（配列番号２９０）、ＣＡＶ１（配列番号２９１）、ＨＬＡ－Ｊ（配列番号２９２）、ＭＹＬ１２Ａ（配列番号２９３）、ＭＲＰＳ１０（配列番号２９４）、ＲＲＡＳ（配列番号２９５）、ＴＭＥＭ２（配列番号２９６）、ＳＩＤＴ２（配列番号２９７）、ＲＡＢ１１ＦＩＰ１（配列番号２９８）、ＲＴＰ４（配列番号２９９）、ＬＯＣ１０１９２８９１６
ＮＮＭＴ（配列番号３００）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号３０１）、ＴＭＥＭ１８９ ＴＭＥＭ１８９－ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ２（配列番号３０２）、ＲＰＮ２（配列番号３０３）、ＩＴＧＡ５（配列番号３０４）、ＣＤＣ４２ＥＰ１（配列番号３０５）、ＢＴＮ３Ａ３（配列番号３０６）、ＯＳＥＲ１（配列番号３０７）、ＣＨＳＴ１５（配列番号３０８）、ＭＤＦＩＣ（配列番号３０９）、ＣＡＶ２（配列番号３１０）、ＣＡＲＤ１０（配列番号３１１）、ＲＡＣ２（配列番号３１２）、ＭＬＰＨ（配列番号３１３）、Ｆ２Ｒ（配列番号３１４）、ＩＣＡＭ３（配列番号３１５）、ＣＲＩＭ１ ＬＯＣ１０１９２９５００（配列番号３１６）、ＩＦＩ１６（配列番号３１７）、ＥＶＩ２Ｂ（配列番号３１８）、ＰＦＫＦＢ３（配列番号３１９）、ＭＩＲ６５１３ ＴＭＢＩＭ１（配列番号３２０）、ＡＰＯＬ３（配列番号３２１）、ＣＤ５５（配列番号３２２）、ＴＲＡＭ２（配列番号３２３）、Ｓ１００Ａ４（配列番号３２４）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３２５）、ＰＩＰ４Ｋ２Ａ（配列番号３２６）、ＲＰＮ２（配列番号３２７）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３２８）、ＩＦＩＴ３（配列番号３２９）、ＰＬＡＣ８（配列番号３３０）、ＳＤＦ４（配列番号３３１）、ＣＡＶ２（配列番号３３２）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号３３３）、ＭＶＰ（配列番号３３４）、ＲＮＨ１（配列番号３３５）、ＥＩＦ１（配列番号３３６）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３３７）、ＡＳＬ（配列番号３３８）、ＣＤ９９（配列番号３３９）、ＵＳＰ４（配列番号３４０）、ＴＡＣＣ１（配列番号３４１）、ＣＤ５５（配列番号３４２）、ＰＤＸＫ（配列番号３４３）、ＢＳＴ２（配列番号３４４）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３４５）、ＤＵＳＰ５（配列番号３４６）、ＴＮＦＳＦ１３（配列番号３４７）、ＣＯＭＴ（配列番号３４８）、ＣＹＲ６１（配列番号３４９）、ＬＹ６Ｅ（配列番号３５０）、ＡＣＳＬ５（配列番号３５１）、ＧＢＰ２（配列番号３５２）、ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ（配列番号３５３）、ＰＴＲＦ（配列番号３５４）、ＣＹＲ６１（配列番号３５５）、ＢＴＮ３Ａ１（配列番号３５６）、ＰＬＥＣ（配列番号３５７）、ＣＴＮＮＤ１ ＴＭＸ２－ＣＴＮＮＤ１（配列番号３５８）、ＴＮＦＲＳＦ１４（配列番号３５９）、ＡＢＣＣ１０（配列番号３６０）、ＳＥＬＰＬＧ（配列番号３６１）、ＧＰＸ４（配列番号３６２）、ＥＤＥＭ１（配列番号３６３）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号３６４）、ＤＭＢＴ１（配列番号３６５）、ＰＳＭＢ８（配列番号３６６）、ＦＮ１（配列番号３６７）、ＣＯＬ１Ａ１（配列番号３６８）、ＦＯＳ（配列番号３６９）、ＣＹＬＤ（配列番号３７０）、ＡＤＡＭＴＳ１（配列番号３７１）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３７２）、ＧＡＴＡ６（配列番号３７３）、ＹＷＨＡＢ（配列番号３７４）、ＣＩＢ１（配列番号３７５）、ＯＰＴＮ（配列番号３７６）、ＩＦＩ１６（配列番号３７７）、ＣＦＬＡＲ（配列番号３７８）、ＰＴＧＥＲ４（配列番号３７９）、ＣＣＮＤ１（配列番号３８０）、ＰＤＬＩＭ５（配列番号３８１）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号３８２）、ＣＹＰ１Ｂ１（配列番号３８３）、ＳＶＩＬ（配列番号３８４）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号３８５）、ＴＡＧＬＮ２（配列番号３８６）、ＩＦＩ２７（配列番号３８７）、ＦＬＩＩ（配列番号３８８）、ＳＴＡＴ６（配列番号３８９）、ＷＷＰ２（配列番号３９０）、ＦＬＮＣ（配列番号３９１）、ＰＡＲＰ１２（配列番号３９２）、ＶＰＳ１３Ｄ（配列番号３９３）、ＩＦＩＴＭ２（配列番号３９４）、ＣＴＳＺ（配列番号３９５）、Ｃ１９ｏｒｆ１０（配列番号３９６）、ＤＡＰＫ１（配列番号３９７）、ＬＯＣ１０１９２８１８９ ＲＳＲＰ１（配列番号３９８）、ＭＹＯＦ（配列番号３９９）、ＡＴＰ２Ｂ４（配列番号４００）、ＡＸＬ（配列番号４０１）、ＭＩＲ６７８７
ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号４０２）、ＬＹ９６（配列番号４０３）、ＦＮ１（配列番号４０４）、ＣＲＥＢ３Ｌ１（配列番号４０５）、ＴＮＦＳＦ１２－ＴＮＦＳＦ１３ ＴＮＦＳＦ１３（配列番号４０６）、ＰＯＦＵＴ２（配列番号４０７）、ＷＤＲ１（配列番号４０８）、ＳＬＣ７Ａ７（配列番号４０９）、ＭＩＣＢ（配列番号４１０）、ＧＡＴＡ３（配列番号４１１）、ＬＲＲＦＩＰ１（配列番号４１２）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号４１３）、及びＩＴＭ２Ａ（配列番号４１４）。
特定の実施形態では、感度バイオマーカーは、下記の１つ以上を含み得る：（ａ）配列番号１～２５；（ｂ）配列番号２６～５０；（ｃ）配列番号５１～７５；（ｄ）配列番号７６～１００；（ｅ）配列番号１０１～１２５；（ｆ）配列番号１２６～１５０；及び／又は（ｇ）配列番号１５１～１７２。より具体的な実施形態では、感度バイオマーカーは、ＳＲＳＦ７（配列番号１）であり得る。
特定の実施形態では、耐性バイオマーカーは、下記の１つ以上を含み得る：（ａ）配列番号１７３～２００；（ｂ）配列番号２０１～２２５；（ｃ）配列番号２２６～２５０；（ｄ）配列番号２５１～２７５；（ｅ）配列番号２７６～３００；（ｆ）配列番号３０１～３２５；（ｇ）配列番号３２６～３５０；（ｈ）配列番号３５１～３７５；（ｉ）配列番号３７６～４００；及び／又は（ｊ）配列番号４０１～４１４。より具体的な実施形態では、耐性バイオマーカーは、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）であり得る。
特定の実施形態では、感度バイオマーカーは、少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、又は少なくとも１７２個の、表２のバイオマーカーから選択され得る。耐性バイオマーカーは、少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、少なくとも１７５個、少なくとも１８０個、少なくとも１８５個、少なくとも１９０個、少なくとも１９５個、少なくとも２００個、少なくとも２０５個、少なくとも２１０個、少なくとも２１５個、少なくとも２２０個、少なくとも２２５個、少なくとも２３０個、少なくとも２３５個、少なくとも２４０個、又は少なくとも２４２個の、表３のバイオマーカーから選択され得る。
上記の態様のいずれにおいても、癌は、充実性腫瘍癌及び血液学的癌から選択される。例えば、癌は、例えば多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）である。特定の実施形態では、癌は、乳癌（例えば、エストロゲン受容体陽性（ＥＲ ｐｏｓ）乳癌、又は乳癌の転移性形態である。他の実施形態では、癌は卵巣癌である。別の実施形態では、癌は膵癌である。
定義
本明細書で使用される場合、「ａ」又は「ａｎ」は、特に明記しない限り、「少なくとも１つ」又は「１つ以上」を意味する。さらに、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」には、文脈から明確に指示されていない限り、複数の指示対象が含まれる。
本明細書で使用される場合、「約」は、記載された値の±１０％の量を指す。
本明細書で使用される「２Ｘ－１２１」という用語は、８－（イソインドリン－２－イルメチル）－２，９－ジヒドロ－３Ｈ－ピリダジノ［３，４，５－ｄｅ］キナゾリン－３－オンを指す。２Ｘ－１２１は、以下の構造を有する。
２Ｘ－１２１は、癌細胞のＤＮＡ損傷修復に関わる重要な酵素であるポリ（ＡＤＰリボース）ポリメラーゼ（ＰＡＲＰ）の低分子標的阻害剤である。２Ｘ－１２１は、ＰＡＲＰ１／２とタンキラーゼ１／２（転移、特にトリプルネガティブ乳癌において重要なチェックポイントであるＷｎｔ／β－カテニンの重要なレギュレーター）の両方に対して新規のデュアル阻害作用を有する経口生物学的に利用可能な低分子ＰＡＲＰ阻害剤である。 ２Ｘ－１２１はＰ糖タンパク質の基質ではなく、Ｐ糖タンパク質発現細胞で活性を示すことから、ＰＡＲＰ阻害剤耐性を克服する可能性があることを示唆している。２Ｘ－１２１は、以前はＥ７４４９として知られていた。２Ｘ－１２１は、ＭｃＧｏｎｉｇｌｅ ｅｔ ａｌ．（Ｏｎｃｏｔａｒｇｅｔ ６：４１３０７－４１３２３、２０１５）に記載されており、参照により本明細書に組み込まれる。
「バイオマーカー」とは、細胞若しくは組織に存在する又は細胞若しくは組織からの核酸分子（例えば、ｍＲＮＡ又はその相補体、例えばｃＤＮＡ）又は核酸分子によりコードされるタンパク質を意味する。バイオマーカーの発現は、癌治療薬（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に対する細胞又は組織（および、したがって、細胞又は組織を含む患者、又は細胞又は組織が得られた患者）の応答性（例えば、感度又は耐性）と相関する。特に、感度バイオマーカーは、表２に示される遺伝子のいずれか１つから発現した核酸分子（例えば、ｍＲＮＡ又はその相補体）、又はその核酸分子によりコードされるタンパク質であり、耐性バイオマーカーは、表３に示される遺伝子のいずれか１つから発現した核酸分子（例えば、ｍＲＮＡ又はその補体）、又はその核酸分子によりコードされるタンパク質である。
「癌」及び「癌性」という用語は、通常、制御されていない細胞増殖により特徴づけられる哺乳類（例えば、ヒト）における生理学的状態を指すか、又は説明する。癌の例としては、例えば、骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、結腸直腸癌（例えば、大腸癌及び直腸癌）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤白血病、及び慢性白血病）、骨髄異形成症候群、リンパ腫（例えば、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及びリンパ球性リンパ腫）、子宮頸癌、前立腺癌、食道癌、骨髄腫、神経膠腫（例えば、乏突起膠腫）、膵癌（例えば、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様腺癌、コロイド腺癌、膵島細胞癌、及び膵臓神経内分泌癌）、卵巣癌（例えば、卵巣腺癌又は胚性癌腫）、消化管間質腫瘍、肉腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、平滑筋肉腫、ユーイング肉腫、及び横紋筋肉腫）、乳癌（例えば、髄様癌）、ＥＲ陽性癌、膀胱癌、頭頸部癌（例えば、頭頸部の扁平上皮癌）、肺癌（例えば、非小細胞肺癌、大細胞癌、気管支原性癌、及び乳頭腺癌）、転移性癌、口腔癌、子宮癌、精巣癌（例えば、精上皮腫及び胚性癌腫）、皮膚癌（例えば、扁平上皮癌及び基底細胞癌）、甲状腺癌（例えば、乳頭癌及び髄様癌）、脳癌（例えば、星状細胞腫及び頭蓋咽頭癌）、胃癌、上皮内癌、骨癌、胆道癌、眼癌、肝癌（例えば、肝細胞癌又は肝腫）、喉頭癌、腎臓癌（例えば、腎細胞癌及びウィルムス腫瘍）、胃癌、芽細胞腫（例えば、腎芽細胞腫、髄芽細胞腫、血管芽細胞腫、神経芽細胞腫、及び網膜芽細胞腫）、真性多血症、脊索腫、滑膜腫、中皮腫、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、嚢胞腺癌、胆管癌、絨毛癌、上皮癌、上衣腫、松果体腫、聴神経腫、神経鞘腫、髄膜腫、下垂体腺腫、神経鞘腫瘍、小腸の癌、内分泌系の癌、陰茎の癌、尿道の癌、皮膚又は眼内黒色腫、婦人科腫瘍、小児の充実性腫瘍、及び中枢神経系の新生物が挙げられるが、これらに限定されない。癌という用語には、血液学的癌（例えば、多発性骨髄腫などの血液の癌）及び充実性腫瘍（例えば、乳癌）が含まれる。
本明細書で互換的に使用される「発現度合い」及び「発現の度合い」という用語は、細胞、組織、生物学的サンプル、生物、又は患者における遺伝子産物の量、例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ（例えば、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ））、又は所定の遺伝子のタンパク質を指す。
本明細書で使用される「遺伝子」とは、産生されたＲＮＡを測定することによりその活性を見極めることができるコード遺伝子又は非コード遺伝子を示す。例としては、タンパク質コード遺伝子、マイクロＲＮＡ、核内低分子ＲＮＡ、及び触媒特性、調節特性、又はコード特性を有する他のＲＮＡが挙げられる。
本明細書で使用される「増殖を阻害する」とは、治療（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に曝露された細胞の増殖の減少から明らかなように、治療無しの細胞の増殖に比べて、例えば１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、又は９９％以上の、インビボ又はインビトロでの細胞増殖（例えば、癌細胞増殖、例えば、対照としてＮＣＩ６０癌細胞株の増殖阻害と比較したもの）の減少を引き起こすことを意味する。増殖阻害は、細胞のアポトーシスを誘発し、細胞のネクローシスを誘発し、細胞周期進行を遅らせ、細胞代謝を妨害し、細胞溶解を誘発し、又は細胞の増殖を減少させる他のメカニズムを誘発する治療（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）の結果であり得る。
本明細書で使用される「マイクロアレイ」とは、１つ以上の対象オリゴヌクレオチド、例えば、ＲＮＡ、ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、又はそれらの類似体を一度に定量する任意の方法により使用されるデバイスを意味する。例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社製のマイクロアレイをはじめとする多くのＤＮＡマイクロアレイ（例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＧ－Ｕ１３３Ａアレイ）は、単一の遺伝子の発現を測定するためにいくつかのプローブを使用する。ＤＮＡマイクロアレイは、例えば、ＲＮＡに相補的な完全長ｃＤＮＡ又はＲＮＡの一部にハイブリダイズするｃＤＮＡフラグメントであり得るオリゴヌクレオチドプローブを含み得る。ＤＮＡマイクロアレイはまた、ロックされた核酸又はＬＮＡなどのＤＮＡ又はＲＮＡの改変型を含み得る。例示的なＲＮＡとしては、ｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、及びｍｉＲＮＡ前駆体が挙げられる。
本明細書で使用される場合、「パーセント（％）配列同一性」という用語は、最大パーセントの配列同一性を達成するために配列をアライメントし、必要に応じてギャップを導入した後、候補配列、例えば本発明のプローブ又はプライマーの核酸残基が、参照配列、例えば本発明のバイオマーカー配列の核酸残基と同一である割合を指す（例えば、最適なアライメントのために候補配列及び参照配列の一方又は両方にギャップを導入することができ、比較目的のために非相同配列を無視することができる）。 パーセント配列同一性を測定する目的のためのアライメントは、当業者の技術範囲の様々な方法で、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ－２、ＢＬＡＳＴ－Ｐ、ＢＬＡＳＴ－Ｎ、ＢＬＡＳＴ－Ｘ、ＷＵ－ＢＬＡＳＴ－２、ＡＬＩＧＮ、ＡＬＩＧＮ－２、ＣＬＵＳＴＡＬ、Ｍｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）などのコンピュータソフトウェアを使用して達成することができる。さらに、当業者であれば、比較される配列の長さにわたって最適なアライメントを達成するのに必要な任意のアルゴリズムを含む、アライメントを測定するのに適切なパラメータを見極めることができる。
本明細書で使用される「ＮＣＩ６０」は、以下の癌細胞株を含む、肺癌、大腸癌、乳癌、卵巣癌、白血病、腎臓癌、黒色腫、前立腺及び脳癌からの６０の癌細胞株のパネルを意味する：ＮＳＣＬＣ＿ＮＣＩＨ２３、ＮＳＣＬＣ＿ＮＣＩＨ５２２、ＮＳＣＬＣ＿Ａ５４９ＡＴＣＣ、ＮＳＣＬＣ＿ＥＫＶＸ、ＮＳＣＬＣ＿ＮＣＩＨ２２６、ＮＳＣＬＣ＿ＮＣＩＨ３３２Ｍ、ＮＳＣＬＣ＿Ｈ４６０、ＮＳＣＬＣ＿ＨＯＰ６２、ＮＳＣＬＣ＿ＨＯＰ９２、ＣＯＬＯＮ＿ＨＴ２９、ＣＯＬＯＮ＿ＨＣＣ－２９９８、ＣＯＬＯＮ＿ＨＣＴ１１６、ＣＯＬＯＮ＿ＳＷ６２０、ＣＯＬＯＮ＿ＣＯＬＯ２０５、ＣＯＬＯＮ＿ＨＣＴ１５、ＣＯＬＯＮ＿ＫＭ１２、ＢＲＥＡＳＴ＿ＭＣＦ７、ＢＲＥＡＳＴ＿ＭＣＦ７ＡＤＲｒ、ＢＲＥＡＳＴ＿ＭＤＡＭＢ２３１、ＢＲＥＡＳＴ＿ＨＳ５７８Ｔ、ＢＲＥＡＳＴ＿ＭＤＡＭＢ４３５、ＢＲＥＡＳＴ＿ＭＤＮ、ＢＲＥＡＳＴ＿ＢＴ５４９、ＢＲＥＡＳＴ＿Ｔ４７Ｄ、ＯＶＡＲ＿ＯＶＣＡＲ３、ＯＶＡＲ＿ＯＶＣＡＲ４、ＯＶＡＲ＿ＯＶＣＡＲ５、ＯＶＡＲ＿ＯＶＣＡＲ８、ＯＶＡＲ＿ＩＧＲＯＶ１、ＯＶＡＲ＿ＳＫＯＶ３、ＬＥＵＫ＿ＣＣＲＦＣＥＭ、ＬＥＵＫ＿Ｋ５６２、ＬＥＵＫ＿ＭＯＬＴ４、ＬＥＵＫ＿ＨＬ６０、ＬＥＵＫ＿ＲＰＭＩ８２６６、ＬＥＵＫ＿ＳＲ、ＲＥＮＡＬ＿ＵＯ３１、ＲＥＮＡＬ＿ＳＮ１２Ｃ、ＲＥＮＡＬ＿Ａ４９８、ＲＥＮＡＬ＿ＣＡＫＩ１、ＲＥＮＡＬ＿ＲＸＦ３９３、ＲＥＮＡＬ＿７８６０、ＲＥＮＡＬ＿ＡＣＨＮ、ＲＥＮＡＬ＿ＴＫ１０、ＭＥＬＡＮ＿ＬＯＸＩＭＶＩ、ＭＥＬＡＮ＿ＭＡＬＭＥ３Ｍ、ＭＥＬＡＮ＿ＳＫＭＥＬ２、ＭＥＬＡＮ＿ＳＫＭＥＬ５、ＭＥＬＡＮ＿ＳＫＭＥＬ２８、ＭＥＬＡＮ＿Ｍ１４、ＭＥＬＡＮ＿ＵＡＣＣ６２、ＭＥＬＡＮ＿ＵＡＣＣ２５７、ＰＲＯＳＴＡＴＥ＿ＰＣ３、ＰＲＯＳＴＡＴＥ＿ＤＵ１４５、ＣＮＳ＿ＳＮＢ１９、ＣＮＳ＿ＳＮＢ７５、ＣＮＳ＿Ｕ２５１、ＣＮＳ＿ＳＦ２６８、ＣＮＳ＿ＳＦ２９５、及びＣＮＳ＿ＳＦ５３９。
本明細書で互換的に使用される「患者」及び「対象」という用語は、任意の動物（例えば、ヒトなどの哺乳類）を指す。本明細書に記載の方法に従い、治療（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に対する応答性について治療又は試験される患者は、卵巣癌又は乳癌などの癌と診断された患者であり得る。診断は、Ｘ線、ＭＲＩ、又は生検などの当該技術分野で知られている任意の方法又は技術により行われ、医師により確認され得る。治療的ではない可能性のある薬物治療への患者の曝露を最小限に抑えるために、患者は、記載された方法に従い、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩などの癌治療薬に対して応答性又は非応答性のいずれかであると測定され得る。
本明細書で使用される「耐性」とは、インビトロ又はインビボ（例えば、ヒトなどの癌を有する対象において）での細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）が、抗癌剤（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）による治療に対して耐性を有すること、例えば、細胞又は組織が、抗癌剤（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）への曝露（例えば、治療）にもかかわらず、生存及び増殖できることを意味する。耐性は、薬物不活性化、薬物標的変化、薬物流出、ＤＮＡ損傷修復、細胞死阻害、細胞周期調節、上皮間葉系移行（ＥＭＴ）、エピジェネティクス、及び他のメカニズムの１つ以上を細胞又は組織が利用することによって生じ得る。「耐性」細胞又は組織とは、インビトロ又はインビボ（例えば、ヒトなどの癌を有する対象において）での細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）それぞれであって、治療（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）を獲得した及び／又は示すものを指す。例えば、耐性細胞又は組織とは、細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）をそれぞれ癌治療薬（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に曝露した際に、治療に曝露されなかった細胞又は組織の増殖に比べて、３０％、２５％、２０％、１５％、１０％、５％、又は１％未満の細胞又は腫瘍の増殖の阻害を示すものを言う。治療に対する耐性は、細胞増殖アッセイ、例えば、本明細書に記載のＮＣＩ６０アッセイなどの、入射光線の細胞の吸光度の関数としての治療された細胞の増殖を測定する細胞ベースのアッセイにより測定され得る。このアッセイでは、吸光度が高いほど細胞増殖が多く、したがって治療に対して耐性を有することを示している。
本明細書で使用される「感度」及び「応答性」という用語は、癌治療薬（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）が所望の効果を有する（例えば、誘発する）可能性を指すか、あるいは、インビトロ又はインビボ（例えば、ヒトなどの癌を有する対象において）での細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）において治療により引き起こされるか又は誘発される所望の効果の強さを指す。例えば、所望の効果は、インビトロでの細胞（例えば、癌細胞）の増殖を、治療に曝露されなかった細胞（例えば、癌細胞）の増殖に比べて、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は１００％以上の割合で阻害することを含み得る。所望の効果はまた、例えば、約３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は１００％の腫瘍量の減少を含み得る。本明細書で使用される「感度を有する」又は「応答性である」とは、インビトロ又はインビボ（例えば、ヒトなどの癌を有する対象において）での細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）であって、治療薬（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に対して感度又は応答性を示すものを指す。治療に対する応答性は、細胞増殖アッセイ、例えば、本明細書に記載のＮＣＩ６０アッセイなどの、入射光線の細胞の吸光度の関数としての治療された細胞の増殖を測定する細胞ベースのアッセイにより測定され得る。このアッセイでは、吸光度が低いほど細胞増殖が少なく、したがって治療に対して感度を有するか、又は応答性があることを示している。増殖の減少が大きいほど、治療に対する感度又は応答性が高いことを示している。
本明細書で使用される「サンプル」という用語は、対象から採取された任意の試料（例えば、細胞、組織（例えば、生検により得られた組織サンプル）、血液、血清、血漿、尿、脳脊髄液、又は膵液など）を指す。好ましくは、サンプルは、癌に冒された身体の一部から採取される（例えば、癌組織の生検）。生検は、細針吸引生検、コア針生検（例えば、定位コア針生検、真空支援コア生検、又は磁気共鳴画像（ＭＲＩ）ガイド下生検）、又は外科的生検（例えば、切開生検又は切除生検）を含み得る。サンプルは、例えば、細胞破片及び他の不要な分子を除去するために、追加の精製及び処理を経てもよい。追加の処理はさらに、例えば、ＰＣＲ（例えば、ＲＴ－ＰＣＲ）を使用する増幅を含み得る。不要な分子の除去などのサンプル精製の標準的な方法は、当該技術分野で知られている。
１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は耐性バイオマーカーのパラメータ（例えば、バイオマーカー発現度合い、差分スコア、又は平均スコア）の数値に関して本明細書で使用される「実質的に類似している」又は「対応している）とは、例えば、癌患者からの試験サンプル（例えば、腫瘍生検）において測定されるように、試験サンプルにおけるパラメータの数値が、参照サンプル（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍））におけるパラメータの数値の±０～３０％であることを意味する。例えば、試験サンプルにおけるパラメータの数値は実質的に、試験サンプルと参照サンプルのパラメータ値が、例えば、３０％未満、２９％未満、２８％未満、２７％未満、２６％未満、２５％未満、２４％未満、２３％未満、２２％未満、２１％未満、２０％未満、１９％未満、１８％未満、１７％未満、１６％未満、１５％未満、１４％未満、１３％未満、１２％未満、１１％未満、１０％未満、９％未満、８％未満、７％未満、６％未満、５％未満、４％未満、３％未満、２％未満、又は１％未満だけ異なっている場合に、参照サンプルにおけるパラメータの数値に類似しているとすることができるか、又は対応しているとすることができる。
１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は耐性バイオマーカーのパラメータ（例えば、バイオマーカー発現度合い、差分スコア、又は平均スコア）の数値に関して本明細書で使用される「実質的に異なっている」とは、例えば、癌患者からの試験サンプル（例えば、腫瘍生検）において測定されるように、試験サンプルにおけるパラメータの数値が、参照サンプル（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍））におけるパラメータの数値と３０％を超えて逸脱することを意味する。
例えば、試験サンプルにおけるパラメータ値は実質的に、試験サンプルと参照サンプルのパラメータ値が、例えば、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％以上を超えて異なる場合、参照サンプルのパラメータの数値と異なり得る。
本明細書で互換的に使用される「治療」、「医学的治療」から「治療する」、及び「治療法」とは、癌（例えば、ヒト）、癌細胞、又は腫瘍を有する患者に抗癌剤（例えば、薬物、タンパク質、抗体、核酸、化学療法剤、又は放射性薬剤）を投与又は曝露すること、又は疾患、障害、又は状態を治療又は予防するために使用される他の形態の医学的介入（例えば、手術、凍結療法、放射線療法、又はそれらの組み合わせ）を指す。特に、医学的治療は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含み得る。例えば、治療される癌は、血液学的癌又は充実性腫瘍である。癌の例としては、例えば、骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、結腸直腸癌（例えば、大腸癌及び直腸癌）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤白血病、及び慢性白血病）、骨髄異形成症候群、リンパ腫（例えば、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及びリンパ球性リンパ腫）、子宮頸癌、前立腺癌、食道癌、骨髄腫、神経膠腫（例えば、乏突起膠腫）、膵癌（例えば、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様腺癌、コロイド腺癌、膵島細胞癌、及び膵臓神経内分泌癌）、卵巣癌（例えば、卵巣腺癌又は胚性癌腫）、消化管間質腫瘍、肉腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、平滑筋肉腫、ユーイング肉腫、及び横紋筋肉腫）、乳癌（例えば、髄様癌）、ＥＲ陽性癌、膀胱癌、頭頸部癌（例えば、頭頸部の扁平上皮癌）、肺癌（例えば、非小細胞肺癌、大細胞癌、気管支原性癌、及び乳頭腺癌）、転移性癌、口腔癌、子宮癌、精巣癌（例えば、精上皮腫及び胚性癌腫）、皮膚癌（例えば、扁平上皮癌及び基底細胞癌）、甲状腺癌（例えば、乳頭癌及び髄様癌）、脳癌（例えば、星状細胞腫及び頭蓋咽頭癌）、胃癌、上皮内癌、骨癌、胆道癌、眼癌、肝癌（例えば、肝細胞癌又は肝腫）、喉頭癌、腎臓癌（例えば、腎細胞癌及びウィルムス腫瘍）、胃癌、芽細胞腫（例えば、腎芽細胞腫、髄芽細胞腫、血管芽細胞腫、神経芽細胞腫、及び網膜芽細胞腫）、真性多血症、脊索腫、滑膜腫、中皮腫、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、嚢胞腺癌、胆管癌、絨毛癌、上皮癌、上衣腫、松果体腫、聴神経腫、神経鞘腫、髄膜腫、下垂体腺腫、神経鞘腫瘍、小腸の癌、内分泌系の癌、陰茎の癌、尿道の癌、皮膚又は眼内黒色腫、婦人科腫瘍、小児の充実性腫瘍、又は中枢神経系の新生物が挙げられる。放射線療法としては、患者への放射性薬剤の投与又は放射線への患者の曝露が挙げられる。放射線は、粒子加速器及び関連する医療機器又は薬剤などの、例えば、Ｘ線、ガンマ線、又は電子（ベータ線）ビームを放出する線源から生成され得る。治療は、例えば、対象又は生体から腫瘍を除去するための手術であり得るか、又はそれをさらに含み得る。
本発明の他の特徴及び利点は、以下の詳細な説明、図面、及び特許請求の範囲から明らかになるであろう。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
癌を有する対象の、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する応答性を測定する方法であって、
（ａ）１つ以上の核酸分子を含む前記対象からのサンプルを、
（ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は
（ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子
を含むデバイスと接触させることと、
（ｂ）前記サンプル由来の前記１つ以上の核酸分子と、前記デバイスの前記一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、前記１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出することと、
を含む、方法。
（項目２）
（ｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いに類似している；
（ｉｉ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；
（ｉｉｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている；及び／又は
（ｉｖ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている；
場合、前記対象が、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定される、項目１に記載の方法。
（項目３）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与のために、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩での治療に対して応答性があると測定された対象を選択することを更に含む、項目１又は２に記載の方法。
（項目４）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性があると測定された対象に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の１つ以上の癌治療法を投与することを更に含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
（ｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている；
（ｉｉ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている；
（ｉｉｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いに類似している；及び／又は
（ｉｖ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；
項目４に記載の方法。
（項目６）
（ｉ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている前記細胞又は組織の感度が、ＮＣＩ６０細胞株のＧＩ５０データに基づく；及び／又は
（ｉｉ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている前記細胞又は組織の耐性が、ＮＣＩ６０細胞株のＧＩ５０データに基づく、
項目２～５のいずれか一項に記載の方法。
（項目７）
前記１つ以上の癌治療法が手術、放射線、又は治療薬を含む、項目４に記載の方法。
（項目８）
前記治療薬が、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、ＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１阻害剤、イピリムマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドミド、プレドニゾン、デキサメタゾン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、メルファラン、カペシタビン、テガフール、イリノテカン、オキサリプラチン、セツキシマブ、ロイコボリン、ＳＮ－３８、エベロリムス、テムシロリムス、ブレオマイシン、ロムスチン、デプシペプチド、カルボプラチン、エルロチニブ、ゲムシタビン、マイトキサントロン、シスプラチン、ブスルファン、エピルビシン、三酸化ヒ素、ベンダムスチン、フルベストラント、テニポシド、アドリアマイシン、デシタビン、エストラムスチン、エトポシド、アザグアニン、アクラルビシン、マイトキサントロン、マイトマイシン、パクリタキセル、タキソテール、イロフルベン、５－ＦＵ、ａｒａ－ｃ、メチルプレドニゾロン、メトトレキサート、メチル－ｇａｇ、ベリノスタット、カルボプラチン、イダルビシン、ＩＬ４－ＰＲ３８、バルプロ酸、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ）、シトキサン、トポテカン、ヒドロキサム酸サブエロイルアニリド、リューケラン、フルダラビン、ビンブラスチン、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、テガフール、ダウノルビシン、メクロレタミン、ストレプトゾシン、カルムスチン、メルカプトプリン、ダクチノマイシン、トレチノイン、イホスファミド、タモキシフェン、フロクスウリジン、チオグアニン、ＰＳＣ ８３３、ハーセプチン、ベバシズマブ、セレコキシブ、イレッサ、アナストロゾール、レトロゾール、及びリツキシマブからなる群から選択される、項目７に記載の方法。
（項目９）
癌の治療を必要とする対象における癌の治療方法であって、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に投与することを含み、前記対象が、項目１に記載の方法に従い、２Ｘ－１２１又はその薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されている、方法。
（項目１０）
癌を有する対象の治療方法であって、
（ａ）１つ以上の核酸分子を含む前記対象からのサンプルを、
（ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は
（ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子
を含むデバイスと接触させることと、
（ｂ）前記サンプル由来の前記１つ以上の核酸分子と、前記デバイスの前記一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、前記１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出することと、
（ｃ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に投与することと、
を含む、方法。
（項目１１）
（ｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いに類似している；
（ｉｉ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；
（ｉｉｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている；及び／又は
（ｉｖ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている；
場合、前記対象に２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が投与される、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
（ｉ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている前記細胞又は組織の感度が、ＮＣＩ６０細胞株のＧＩ５０データに基づく；及び／又は
（ｉｉ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている前記細胞又は組織の耐性が、ＮＣＩ６０細胞株のＧＩ５０データに基づく、
項目１１に記載の方法。
（項目１３）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与前、投与と同時、又は投与後に、１つ以上の追加の治療法を前記対象に投与することを更に含む、項目１０に記載の方法。
（項目１４）
前記１つ以上の追加の治療法が手術、放射線、又は治療薬を含む、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記治療薬が、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、ＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１阻害剤、イピリムマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドミド、プレドニゾン、デキサメタゾン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、メルファラン、カペシタビン、テガフール、イリノテカン、オキサリプラチン、セツキシマブ、ロイコボリン、ＳＮ－３８、エベロリムス、テムシロリムス、ブレオマイシン、ロムスチン、デプシペプチド、カルボプラチン、エルロチニブ、ゲムシタビン、マイトキサントロン、シスプラチン、ブスルファン、エピルビシン、三酸化ヒ素、ベンダムスチン、フルベストラント、テニポシド、アドリアマイシン、デシタビン、エストラムスチン、エトポシド、アザグアニン、アクラルビシン、マイトキサントロン、マイトマイシン、パクリタキセル、タキソテール、イロフルベン、５－ＦＵ、ａｒａ－ｃ、メチルプレドニゾロン、メトトレキサート、メチル－ｇａｇ、ベリノスタット、カルボプラチン、イダルビシン、ＩＬ４－ＰＲ３８、バルプロ酸、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ）、シトキサン、トポテカン、ヒドロキサム酸サブエロイルアニリド、リューケラン、フルダラビン、ビンブラスチン、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、テガフール、ダウノルビシン、メクロレタミン、ストレプトゾシン、カルムスチン、メルカプトプリン、ダクチノマイシン、トレチノイン、イホスファミド、タモキシフェン、フロクスウリジン、チオグアニン、ＰＳＣ ８３３、ハーセプチン、ベバシズマブ、セレコキシブ、イレッサ、アナストロゾール、レトロゾール、及びリツキシマブからなる群から選択される、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記治療薬が非経口、経腸、又は局所投与される、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記治療薬が静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与される、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が非経口、経腸、又は局所投与される、項目３及び９～１７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与される、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が経口投与される、項目１８に記載の方法。
（項目２１）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に２回以上投与することを含む、項目３及び９～２０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２２）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に毎日１回以上、１週間に１回以上、隔週で１回以上、３週間毎に１回以上、又は毎月１回以上投与することを含む、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に１日１回投与することを含む、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
第１投与量の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与の２週間、３週間、４週間、又は５週間後に、第２投与量の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に投与することを含む、項目３及び９～２３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が剤形で投与される、項目３及び９～２４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が前記対象に、約５～５０００ｍｇの投与量で投与される、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が前記対象に、約１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇの投与量で投与される、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が前記対象に、約５０～８００ｍｇの投与量で投与される、項目２６に記載の方法。
（項目２９）
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が前記対象に、約６００ｍｇの投与量で投与される、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記接触工程（ａ）及び前記測定工程（ｂ）が、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を前記対象に投与する前、投与と同時、又は投与した後に行われる、項目３及び９～２９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３１）
前記接触工程（ａ）及び／又は前記測定工程（ｂ）が複数回行われる、項目３及び９～３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
前記デバイスがマイクロアレイである、項目１～３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３）
前記マイクロアレイがデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）系プラットフォームである、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記デバイスが少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上の、（ｉ）及び／又は（ｉｉ）の一本鎖核酸分子を含む、項目１～３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
前記デバイスの前記１つ以上の一本鎖核酸分子が、１０～１００ヌクレオチドの範囲の長さを有する、項目１～３４のいずれか一項に記載の方法。
（項目３６）
前記１つ以上の一本鎖核酸分子が２０～６０ヌクレオチドの範囲の長さを有する、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記方法が、前記１つ以上の感度バイオマーカー、及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを、平均スコアに転換することを含み、前記平均スコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する前記対象の前記応答性を示す、項目１～３６のいずれか一項に記載の方法。
（項目３８）
前記１つ以上の感度バイオマーカーに関する前記平均スコアから、前記１つ以上の耐性バイオマーカーに関する前記平均スコアを減じて異なるスコアを入手することを更に含み、前記異なるスコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する前記対象の前記応答性を示す、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
カットオフ値を上回る前記平均スコア及び／又は前記異なるスコアは、前記対象が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることを示す、項目３７又は３８に記載の方法。
（項目４０）
前記カットオフ値が約０．３、約０．３５、約０．４、約０．４５、約０．５、約０．６、約０．７、約０．８、約０．９、又はそれ以上である、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
前記１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが、マイクロアレイ分析又は核酸増幅法により測定される、項目１～４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
前記核酸増幅法が、逆転写定量リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ｑＰＣＲ）である、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
（ｉ）前記感度バイオマーカーの発現度合いが、表２のバイオマーカーの１つ以上をコードする遺伝子から転写されるｍＲＮＡの量を検出することにより測定される；及び／又は
（ｉｉ）前記耐性バイオマーカーの発現度合いが、表３のバイオマーカーの１つ以上をコードする遺伝子から転写されるｍＲＮＡの量を検出することにより測定される、
項目１～４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
前記感度バイオマーカーが
（ａ）配列番号１～２５の１つ以上；
（ｂ）配列番号２６～５０の１つ以上；
（ｃ）配列番号５１～７５の１つ以上；
（ｄ）配列番号７６～１００の１つ以上；
（ｅ）配列番号１０１～１２５の１つ以上；
（ｆ）配列番号１２６～１５０の１つ以上；
（ｇ）配列番号１５１～１７２の１つ以上；及び／又は
（ｈ）配列番号１～１７２の１つ以上
から選択される、項目１～４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記耐性バイオマーカーが
（ａ）配列番号１７３～２００の１つ以上；
（ｂ）配列番号２０１～２２５の１つ以上；
（ｃ）配列番号２２６～２５０の１つ以上；
（ｄ）配列番号２５１～２７５の１つ以上；
（ｅ）配列番号２７６～３００の１つ以上；
（ｆ）配列番号３０１～３２５の１つ以上；
（ｇ）配列番号３２６～３５０の１つ以上；
（ｈ）配列番号３５１～３７５の１つ以上；
（ｉ）配列番号３７６～４００の１つ以上；
（ｊ）配列番号４０１～４１４の１つ以上；及び／又は
（ｋ）配列番号１７３～４１４の１つ以上
から選択される、項目１～４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
（ｉ）前記感度バイオマーカーが、少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、又は少なくとも１７２個の、表２のバイオマーカーから選択される；かつ／又は
（ｉｉ）前記耐性バイオマーカーが少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、少なくとも１７５個、少なくとも１８０個、少なくとも１８５個、少なくとも１９０個、少なくとも１９５個、少なくとも２００個、少なくとも２０５個、少なくとも２１０個、少なくとも２１５個、少なくとも２２０個、少なくとも２２５個、少なくとも２３０個、少なくとも２３５個、少なくとも２４０個、又は少なくとも２４２個の、表３のバイオマーカーから選択される、
項目１～４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目４７）
（ｉ）前記感度バイオマーカーがＳＲＳＦ７（配列番号１）である；かつ／又は
（ｉｉ）前記耐性バイオマーカーがＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）である、
項目１～４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目４８）
前記癌が充実性腫瘍癌及び血液学的癌から選択される、項目１～４７のいずれか一項に記載の方法。
（項目４９）
前記癌が
多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）からなる群から選択される、項目１～４８のいずれか一項に記載の方法。
（項目５０）
前記癌が乳癌である、項目４９に記載の方法。
（項目５１）
前記乳癌がエストロゲン受容体陽性（ＥＲ ｐｏｓ）乳癌であるか、又は乳癌の転移性形態である、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
前記癌が卵巣癌である、項目４９に記載の方法。
（項目５３）
前記癌が膵癌である、項目４９に記載の方法。
（項目５４）
前記対象が癌の再発を有する、項目１～５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５５）
前記対象由来の前記サンプルが腫瘍サンプルである、項目１～５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目５６）
対象における癌の治療において使用するための、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物であって、前記対象が、項目１又は２に記載の方法に従い、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されている、組成物。
（項目５７）
対象における癌の治療において使用するための、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を含む組成物であって、
（ａ）１つ以上の核酸分子を含む前記対象からのサンプルを、
（ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は
（ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子
を含むデバイスと接触させることと、
（ｂ）前記サンプル由来の前記１つ以上の核酸分子と、前記デバイスの前記一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、前記１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出することと、
（ｃ）
（ｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いに類似している；
（ｉｉ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している；
（ｉｉｉ）前記１つ以上の感度バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている；及び／又は
（ｉｖ）前記１つ以上の耐性バイオマーカーの前記発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている；
場合に、前記対象が、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることを測定することと、
により、前記対象が、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されている、組成物。
（項目５８）
（ｉ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている前記細胞又は組織の感度が、ＮＣＩ６０細胞株のＧＩ５０データに基づく；及び／又は
（ｉｉ）２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている前記細胞又は組織の耐性が、ＮＣＩ６０細胞株のＧＩ５０データに基づく、
項目５７に記載の使用のための組成物。
（項目５９）
前記接触工程（ａ）及び／又は前記測定工程（ｂ）が複数回行われる、項目５７又は５８に記載の使用のための組成物。
（項目６０）
前記デバイスがマイクロアレイであり、任意に、前記マイクロアレイがデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）系プラットフォームである、項目５７～５９のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６１）
前記デバイスが少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、又はそれ以上の、（ｉ）及び／又は（ｉｉ）の一本鎖核酸分子を含む、項目５７～６０のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６２）
前記デバイスの前記１つ以上の一本鎖核酸分子が、１０～１００ヌクレオチドの範囲の長さを有し、任意に、前記１つ以上の一本鎖核酸分子が２０～６０ヌクレオチドの範囲の長さを有する、項目５７～６１のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６３）
工程（ｃ）が前記１つ以上の感度バイオマーカー、及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを、平均スコアに転換することを含み、前記平均スコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する前記対象の前記応答性を示す、項目５７～６２のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６４）
工程（ｃ）が前記１つ以上の感度バイオマーカーに関する前記平均スコアから、前記１つ以上の耐性バイオマーカーに関する前記平均スコアを減じて異なるスコアを入手することを更に含み、前記異なるスコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する前記対象の前記応答性を示す、項目６３に記載の使用のための組成物。
（項目６５）
カットオフ値を上回る前記平均スコア及び／又は前記異なるスコアは、前記対象が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることを示し、任意に、前記カットオフ値が約０．３、約０．３５、約０．４、約０．４５、約０．５、約０．６、約０．７、約０．８、約０．９、又はそれ以上である、項目６３又は６４に記載の使用のための組成物。
（項目６６）
前記１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが、マイクロアレイ分析又は核酸増幅法により測定され、任意に、前記核酸増幅法が、逆転写定量リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ｑＰＣＲ）である、項目５７～６５のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６７）
（ｉ）前記感度バイオマーカーの発現度合いが、表２のバイオマーカーの１つ以上をコードする遺伝子から転写されるｍＲＮＡの量を検出することにより測定される；及び／又は
（ｉｉ）前記耐性バイオマーカーの発現度合いが、表３のバイオマーカーの１つ以上をコードする遺伝子から転写されるｍＲＮＡの量を検出することにより測定される、
項目５７～６６のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６８）
前記感度バイオマーカーが
（ａ）配列番号１～２５の１つ以上；
（ｂ）配列番号２６～５０の１つ以上；
（ｃ）配列番号５１～７５の１つ以上；
（ｄ）配列番号７６～１００の１つ以上；
（ｅ）配列番号１０１～１２５の１つ以上；
（ｆ）配列番号１２６～１５０の１つ以上；
（ｇ）配列番号１５１～１７２の１つ以上；及び／又は
（ｈ）配列番号１～１７２の１つ以上
から選択される、項目５７～６７のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目６９）
前記耐性バイオマーカーが
（ａ）配列番号１７３～２００の１つ以上；
（ｂ）配列番号２０１～２２５の１つ以上；
（ｃ）配列番号２２６～２５０の１つ以上；
（ｄ）配列番号２５１～２７５の１つ以上；
（ｅ）配列番号２７６～３００の１つ以上；
（ｆ）配列番号３０１～３２５の１つ以上；
（ｇ）配列番号３２６～３５０の１つ以上；
（ｈ）配列番号３５１～３７５の１つ以上；
（ｉ）配列番号３７６～４００の１つ以上；
（ｊ）配列番号４０１～４１４の１つ以上；及び／又は
（ｋ）配列番号１７３～４１４の１つ以上
から選択される、項目５７～６８のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７０）
（ｉ）前記感度バイオマーカーが、少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、又は少なくとも１７２個の、表２のバイオマーカーから選択される；かつ／又は
（ｉｉ）前記耐性バイオマーカーが少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、少なくとも１７５個、少なくとも１８０個、少なくとも１８５個、少なくとも１９０個、少なくとも１９５個、少なくとも２００個、少なくとも２０５個、少なくとも２１０個、少なくとも２１５個、少なくとも２２０個、少なくとも２２５個、少なくとも２３０個、少なくとも２３５個、少なくとも２４０個、又は少なくとも２４２個の、表３のバイオマーカーから選択される、
項目５７～６９のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７１）
（ｉ）前記感度バイオマーカーがＳＲＳＦ７（配列番号１）である；かつ／又は
（ｉｉ）前記耐性バイオマーカーがＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）である、
項目５７～７８のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７２）
前記組成物が非経口、経腸、又は局所投与のために製剤化される、項目５６～７１のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７３）
前記組成物が静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与のために製剤化され、任意に、前記組成物が経口投与のために製剤化される、項目７２に記載の使用のための組成物。
（項目７４）
前記組成物が前記対象に２回以上投与される、項目５６～７３のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７５）
前記組成物が前記対象に、毎日１回以上、１週間に１回以上、隔週で１回以上、３週間毎に１回以上、又は毎月１回以上投与され、任意に、前記組成物が前記対象に１日１回投与される、項目７４に記載の使用のための組成物。
（項目７６）
前記組成物が前記対象に、第１投与量の投与の２週間、３週間、４週間、又は５週間後に、第２投与量として投与される、項目５６～７５のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７７）
前記組成物が剤形で投与される、項目５６～７６のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目７８）
前記組成物が前記対象に、約５～５０００ｍｇの投与量で投与される、項目７７に記載の使用のための組成物。
（項目７９）
前記組成物が前記対象に、約１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇの投与量で投与される、項目７８に記載の使用のための組成物。
（項目８０）
前記組成物が前記対象に、約５０～８００ｍｇの投与量で投与され、任意に、前記組成物が前記対象に、約６００ｍｇの投与量で投与される、項目７８に記載の使用のための組成物。
（項目８１）
前記対象が癌の再発を有する、項目５６～８０のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目８２）
前記癌が充実性腫瘍癌及び血液学的癌から選択される、項目５６～８１のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目８３）
前記癌が多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）からなる群から選択される、項目５６～８２のいずれか一項に記載の組成物。
（項目８４）
前記癌が乳癌であり、任意に、前記乳癌がエストロゲン受容体陽性（ＥＲ ｐｏｓ）乳癌であるか、又は乳癌の転移性形態である、項目８３に記載の使用のための組成物。
（項目８５）
前記癌が卵巣癌である、項目８３に記載の使用のための組成物。
（項目８６）
前記癌が膵癌である、項目８３に記載の使用のための組成物。
（項目８７）
前記対象由来の前記サンプルが腫瘍サンプルである、項目５７～８６のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
２Ｘ－１２１の既知の作用機序（ＰＡＲＰトラッピング、相同修復とＢＲＣＡ、塩基除去修復、及びＷｎｔ／タンキラーゼ経路）に関連する表２及び表３の遺伝子を示す模式図である。 生検が利用可能な２Ｘ－１２１で治療された１６人の第Ｉ相患者のベースライン腫瘍直径からの変化を示すウォーターフォールプロットを示す図である。プロットは、部分奏効（ＰＲ）、病態安定（ＳＤ）、病態進行（ＰＤ）のうち、全体的な奏効が最も良好な患者を示している。 ２Ｘ－１２１に対する用量反応予測因子（ＤＲＰ）の予測感度と２Ｘ－１２１に対する臨床応答の比較を表すグラフを示す図である。カットオフ値は水平線で示されている。 ２Ｘ－１２１に対するＤＲＰの予測感度と２Ｘ－１２１に対する臨床応答を比較したグラフであって、２つの応答カテゴリーのみを示す図である。カットオフ値は水平線で示されている。 カットオフ値の関数としての応答率を示すグラフである。 カットオフ値が５０を上回る集団（Ｎ＝６）とカットオフ値が５０を下回る集団（Ｎ＝７）の２つの集団における全生存期間のカプランマイヤー曲線を示す図である。 は、カットオフ値が５０を上回る集団（Ｎ＝６）とカットオフ値が５０を下回る集団（Ｎ＝７）の２つの集団における無増悪生存期間のカプランマイヤー曲線を示す図である。
発明の詳細な説明
表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの発現度合いを使用して、癌を有する対象が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答する可能性が高いかどうかを測定できることを発見した。表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーの核酸配列に相補的又は同一である配列と実質的な同一性（例えば、少なくとも８５％、９０％、９５％、９９％、又は１００％の配列同一性）を有する１つ以上の一本鎖オリゴヌクレオチドプローブを有するマイクロアレイなどのデバイスは、本明細書に記載の方法に従い、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を評価するために使用することができる。例えば、プローブを使用して、癌を有する患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）におけるＳＲＳＦ７（配列番号１）などの、表２に記載される感度バイオマーカーの１つ以上（例えば、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）を検出することができる。加えて、プローブを使用して、癌を有する患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）におけるＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表３に記載される耐性バイオマーカーの１つ以上（例えば、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）を検出することができる。したがって、本発明は、疾患進行の様々な段階（例えば、癌と診断された患者又は癌再発後の患者）において、及び治療プロセス中の様々な時点（例えば、任意の癌治療薬の投与前、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の１つ以上の癌治療薬の投与後、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与前、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される塩の投与中）において、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用され得る個々のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）、及び表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのセットを特徴とする。
特に、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得るかどうかを、例えば、デバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して、対象から得られた生物学的サンプル（例えば、腫瘍生検）における、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の発現度合いを検出することにより測定する方法を特徴としている。次いで、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと比較して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する患者の応答性を測定することができる。
患者は、下記の１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）における、感度バイオマーカーの発現度合いに類似している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る：（例えば、１つ以上のＳＲＳＦ７（配列番号１）、ＵＣＨＬ１（配列番号２）、ＭＬＬＴ１１（配列番号３）、ＡＤＤ２（配列番号４又は５）、ＰＲＭＴ１（配列番号６）、ＳＲＳＦ３（配列番号７）、ＰＲＭＴ５（配列番号８）、ＣＯＣＨ（配列番号９）、ＲＵＶＢＬ１（配列番号１０）、ＭＡＲＣＫＳＬ１（配列番号１１）、ＣＨＥＲＰ（配列番号１２）、ＭＴＳＳ１（配列番号１３）、ＬＳＭ４（配列番号１４）、ＲＡＰＧＥＦ５（配列番号１５）、ＰＲＰＦ４（配列番号１６）、ＬＳＭ４（配列番号１７）、ＤＥＳＩ２（配列番号１８）、ＲＮＰＳ１（配列番号１９）、ＳＮＸ１０（配列番号２０）、ＣＵＬ３（配列番号２１）、ＣＨＤ４（配列番号２２）、ＭＳＨ２（配列番号２３）、ＨＮＲＮＰＭ（配列番号２４）、ＳＲＳＦ１（配列番号２５）、ＮＥＬＬ２（配列番号２６）、ＰＡＩＣＳ（配列番号２７）、ＨＯＸＡ１０（配列番号２８）、ＢＵＢ１Ｂ（配列番号２９）、Ｅ２Ｆ５（配列番号３０）、ＭＡＧＥＤ４ ＭＡＧＥＤ４Ｂ ＳＮＯＲＡ１１Ｄ ＳＮＯＲＡ１１Ｅ（配列番号３１）、ＰＲＰＦ８（配列番号３２）、ＳＯＲＤ（配列番号３３）、ＨＮＲＮＰＵ（配列番号３４）、ＰＥＸ５（配列番号３５）、ＨＹＰＫ ＭＩＲ１２８２ ＳＥＲＦ２ ＳＥＲＦ２－Ｃ１５ＯＲＦ６３（配列番号３６）、ＳＴＲＡＰ（配列番号３７）、ＮＤＵＦＡＢ１（配列番号３８）、ＦＡＲＳＡ（配列番号３９）、ＳＴＯＭＬ２（配列番号４０）、ＥＲＨ（配列番号４１）、ＨＳＢＰ１（配列番号４２）、ＤＤＸ３９Ａ（配列番号４３）、ＯＤＣ１（配列番号４４）、ＴＡＦ５（配列番号４５）、ＴＢＣ１Ｄ３１（配列番号４６）、ＴＲＡ２Ｂ（配列番号４７）、ＮＵＤＣ（配列番号４８）、ＤＤＸ２３（配列番号４９）、ＰＲＰＦ３１（配列番号５０）、ＵＢＥ２Ｓ（配列番号５１）、ＴＣＦ４（配列番号５２）、ＭＬＦ２（配列番号５３）、ＣＣＤＣ１８１（配列番号５４）、ＴＣＦ４（配列番号５５）、ＤＥＳＩ２（配列番号５６）、ＲＰＦ１（配列番号５７）、ＰＡＳＫ（配列番号５８）、ＮＵＰ８８（配列番号５９）、ＲＮＡＳＥＨ２Ａ（配列番号６０）、ＦＢＬ（配列番号６１）、ＬＯＣ１０１９２８７４７ ＲＢＭＸ ＳＮＯＲＤ６１（配列番号６２）、ＮＸＦ１（配列番号６３）、ＰＬＥＫＨＯ１（配列番号６４）、ＧＡＲ１（配列番号６５）、ＲＰＡ１（配列番号６６）、ＺＮＦ２４（配列番号６７）、ＢＯＰ１ ＭＩＲ７１１２（配列番号６８）、ＲＡＢ３Ｂ（配列番号６９）、ＳＬＣ３５Ｇ２（配列番号７０）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号７１）、ＤＫＣ１ ＭＩＲ６６４Ｂ ＳＮＯＲＡ５６（配列番号７２）、ＰＳＭＣ３ＩＰ（配列番号７３）、ＤＮＡＪＣ７（配列番号７４）、ＲＲＰ１Ｂ（配列番号７５）、ＮＭＥ１（配列番号７６）、ＳＮＲＰＡ（配列番号７７）、ＤＢＮ１（配列番号７８）、ＫＩＡＡ００２０（配列番号７９）、ＳＵＰＶ３Ｌ１（配列番号８０）、ＺＮＦ５７３（配列番号８１）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号８２）、ＴＯＸ３（配列番号８３）、ＨＳＰＤ１（配列番号８４）、ＡＣＬＹ（配列番号８５）、ＴＯＸ３（配列番号８６）、ＭＳＡＮＴＤ３－ＴＭＥＦＦ１ ＴＭＥＦＦ１（配列番号８７）、ＡＫＩＲＩＮ１（配列番号８８）、ＵＢＥ２Ｍ（配列番号８９）、ＭＴＦ２（配列番号９０）、ＥＷＳＲ１（配列番号９１）、ＦＡＲＳＡ（配列番号９２）、ＳＫＰ２（配列番号９３）、ＴＭＥＭ９７（配列番号９４）、ＨＮＲＮＰＤ（配列番号９５）、ＩＬＫＡＰ（配列番号９６）、ＮＡＳＰ（配列番号９７）、ＳＮＲＰＤ１（配列番号９８）、ＴＩＭＭ４４（配列番号９９）、ＰＫＮ１（配列番号１００）、ＳＴＡＵ２（配列番号１０１）、ＤＮＡＡＦ２（配列番号１０２）、ＳＮＲＰＤ２（配列番号１０３）、ＦＵＳ（配列番号１０４）、ＰＡＳＫ（配列番号１０５）、ＡＴＰ６Ｖ１Ｇ２－ＤＤＸ３９Ｂ ＤＤＸ３９Ｂ ＳＮＯＲＤ８４（配列番号１０６）、ＰＤＳＳ１（配列番号１０７）、ＮＵＤＣ（配列番号１０８）、ＴＯＸ３（配列番号１０９）、ＴＰＧＳ２（配列番号１１０）、ＳＬＩＲＰ（配列番号１１１）、ＮＣＬ（配列番号１１２）、ＡＮＰ３２Ａ（配列番号１１３）、ＳＡＦＢ（配列番号１１４）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１５）、ＣＥＰ６８（配列番号１１６）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１７）、Ｃ８ｏｒｆ３３（配列番号１１８）、ＭＲＰＬ１１（配列番号１１９）、ＰＯＬＲ２Ｉ（配列番号１２０）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号１２１）、ＭＣＡＭ ＭＩＲ６７５６（配列番号１２２）、ＥＣＳＩＴ（配列番号１２３）、ＭＤＫ（配列番号１２４）、ＰＵＦ６０（配列番号１２５）、ＰＦＮ２（配列番号１２６）、ＳＹＮＣＲＩＰ（配列番号１２７）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号１２８）、ＳＬＣ１６Ａ１（配列番号１２９）、ＰＯＬＲ２Ｈ（配列番号１３０）、ＭＡＰ３Ｋ７（配列番号１３１）、ＣＳＲＰ２（配列番号１３２）、ＢＣＬ１１Ａ（配列番号１３３）、ＰＮＫＰ（配列番号１３４）、ＤＮＡＪＣ６（配列番号１３５）、ＦＤＦＴ１（配列番号１３６）、ＦＡＤＳ１ ＭＩＲ１９０８（配列番号１３７）、ＲＰＡＲＰ－ＡＳ１（配列番号１３８）、ＤＨＲＳ７（配列番号１３９）、ＣＣＮＢ１ＩＰ１（配列番号１４０）、ＣＣＴ３ ＬＯＣ１０１９２７１３７（配列番号１４１）、ＤＤＸ１８（配列番号１４２）、ＡＡＲＳＤ１ ＰＴＧＥＳ３Ｌ ＰＴＧＥＳ３Ｌ－ＡＡＲＳＤ１（配列番号１４３）、ＨＮＲＮＰＤＬ（配列番号１４４）、ＡＴＸＮ７Ｌ３Ｂ（配列番号１４５）、ＭＲＰＳ１４（配列番号１４６）、ＳＯＸ４（配列番号１４７）、ＥＬＯＶＬ２（配列番号１４８）、ＫＣＮＪ８（配列番号１４９）、ＴＲＩＡＰ１（配列番号１５０）、ＥＩＦ２Ｂ１（配列番号１５１）、ＦＢＸＬ１４（配列番号１５２）、ＭＡＰＲＥ２（配列番号１５３）、ＯＲＣ４（配列番号１５４）、ＭＤＮ１（配列番号１５５）、ＫＮＯＰ１（配列番号１５６）、ＫＢＴＢＤ１１（配列番号１５７）、ＦＡＤＳ２（配列番号１５８）、ＲＡＮＢＰ１（配列番号１５９）、ＰＬＥＫＨＢ１（配列番号１６０）、ＨＳＰＥ１（配列番号１６１）、ＴＭＥＭ９７（配列番号１６２）、ＩＴＦＧ２ ＬＯＣ１００５０７４２４（配列番号１６３）、ＳＦＰＱ（配列番号１６４）、ＲＦＣ３（配列番号１６５）、ＳＤＲ３９Ｕ１（配列番号１６６）、ＰＢＫ（配列番号１６７）、ＰＨＢ（配列番号１６８）、ＫＨＤＲＢＳ１（配列番号１６９）、ＰＤＡＰ１（配列番号１７０）、ＳＳＲＰ１（配列番号１７１）、及びＢ３ＧＡＬＴ２（配列番号１７２））。患者はまた、下記の１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る：（例えば、１つ以上のＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）、ＧＡＤＤ４５Ｂ（配列番号１７５）、ＣＬＩＣ１（配列番号１７６）、ＬＡＳＰ１（配列番号１７７）、ＡＰＯＢＥＣ３Ｂ（配列番号１７９）、ＬＧＡＬＳ１（配列番号１８０）、ＴＡＰＢＰ（配列番号１８１）、ＡＨＮＡＫ（配列番号１８２）、ＢＨＬＨＥ４０（配列番号１８３）、Ｓ１００Ａ１１（配列番号１８４）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１８５）、ＺＢＴＢ３８（配列番号１８６）、ＳＴＡＴ１（配列番号１８７）、ＴＣＩＲＧ１（配列番号１８８）、Ｓ１００Ａ１１Ｐ１（配列番号１８９）、ＣＴＳＡ（配列番号１９０）、ＶＥＧＦＡ（配列番号１９１）、ＳＴＯＭ（配列番号１９２）、Ｐ４ＨＢ（配列番号１９３）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１９４）、ＦＸＹＤ５（配列番号１９５）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９６）、ＹＰＥＬ５（配列番号１９７）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９８）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９９）、ＳＴＯＭ（配列番号２００）、ＰＬＩＮ３（配列番号２０１）、ＲＲＢＰ１（配列番号２０２）、ＩＲＦ１（配列番号２０３）、ＬＭＮＡ（配列番号２０４）、ＮＰＣ２（配列番号２０５）、Ｐ４ＨＢ（配列番号２０６）、ＫＬＦ６（配列番号２０７）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２０８）、ＲＨＯＣ（配列番号２０９）、ＣＤ５９（配列番号２１０）、ＳＲＧＮ（配列番号２１１）、ＳＲＧＮ（配列番号２１２）、ＳＴＡＴ１（配列番号２１３）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２１４）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２１５）、ＰＩＥＺＯ１（配列番号２１６）、ＬＧＡＬＳ３（配列番号２１７）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２１８）、ＣＤ９７（配列番号２１９）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２２０）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２２１）、ＦＮＤＣ３Ｂ ＬＯＣ１０１９２８６１５（配列番号２２２）、ＣＫＬＦ ＣＫＬＦ－ＣＭＴＭ１（配列番号２２３）、ＩＦＩ３５（配列番号２２４）、ＴＩＰＡＲＰ（配列番号２２５）、ＴＡＰ１（配列番号２２６）、ＭＩＣＡＬＬ２（配列番号２２７）、ＲＲＢＰ１（配列番号２２８）、ＺＦＰ３６（配列番号２２９）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２３０）、ＴＮＩＰ１（配列番号２３１）、ＣＤ５９（配列番号２３２）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２３３）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２３４）、ＦＬＮＢ（配列番号２３５）、ＰＳＧ６（配列番号２３６）、ＣＢＸ７（配列番号２３７）、ＲＡＲＲＥＳ３（配列番号２３８）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２３９）、ＳＵＮ２（配列番号２４０）、ＥＨＤ２（配列番号２４１）、ＭＡＰ３Ｋ５（配列番号２４２）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２４３）、ＮＯＬ１２ ＴＲＩＯＢＰ（配列番号２４４）、ＣＫＬＦ（配列番号２４５）、ＡＲＰＣ１Ｂ（配列番号２４６）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２４７）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２４８）、ＲＰ１１－３９５Ｂ７．７（配列番号２４９）、ＥＨＤ２（配列番号２５０）、ＬＥＰＲＯＴ（配列番号２５１）、ＢＴＮ３Ａ２ ＢＴＮ３Ａ３（配列番号２５２）、ＩＮＰＰ４Ｂ（配列番号２５３）、ＤＵＳＰ１（配列番号２５４）、ＥＶＩ２Ａ（配列番号２５５）、ＴＦＰＩ（配列番号２５６）、ＥＨＤ１（配列番号２５７）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２５８）、ＥＰＡＳ１（配列番号２５９）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６０）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２６１）、ＣＬＩＣ３（配列番号２６２）、ＴＦＰＩ（配列番号２６３）、ＮＡＣＣ２（配列番号２６４）、ＴＧＦＢＩ（配列番号２６５）、ＩＥＲ３（配列番号２６６）、ＭＩＣＡ（配列番号２６７）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２６８）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６９）、ＣＮＮ２（配列番号２７０）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７１）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２７２）、ＭＢＮＬ１（配列番号２７３）、ＩＳＧ１５（配列番号２７４）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７５）、ＣＯＰＧ１（配列番号２７６）、ＣＤ９９（配列番号２７７）、ＰＳＭＢ９（配列番号２７８）、ＺＦＰ３６Ｌ１（配列番号２７９）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２８０）、ＳＨＣ１（配列番号２８１）、ＧＳＴＫ１（配列番号２８２）、ＣＡＶ１（配列番号２８３）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号２８４）、ＫＲＴ７（配列番号２８５）、ＴＦＰＩ（配列番号２８６）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号２８７）、ＲＨＯＧ（配列番号２８８）、ＣＤＨ１１（配列番号２８９）、ＡＢＣＣ３（配列番号２９０）、ＣＡＶ１（配列番号２９１）、ＨＬＡ－Ｊ（配列番号２９２）、ＭＹＬ１２Ａ（配列番号２９３）、ＭＲＰＳ１０（配列番号２９４）、ＲＲＡＳ（配列番号２９５）、ＴＭＥＭ２（配列番号２９６）、ＳＩＤＴ２（配列番号２９７）、ＲＡＢ１１ＦＩＰ１（配列番号２９８）、ＲＴＰ４（配列番号２９９）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３００）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号３０１）、ＴＭＥＭ１８９ ＴＭＥＭ１８９－ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ２（配列番号３０２）、ＲＰＮ２（配列番号３０３）、ＩＴＧＡ５（配列番号３０４）、ＣＤＣ４２ＥＰ１（配列番号３０５）、ＢＴＮ３Ａ３（配
列番号３０６）、ＯＳＥＲ１（配列番号３０７）、ＣＨＳＴ１５（配列番号３０８）、ＭＤＦＩＣ（配列番号３０９）、ＣＡＶ２（配列番号３１０）、ＣＡＲＤ１０（配列番号３１１）、ＲＡＣ２（配列番号３１２）、ＭＬＰＨ（配列番号３１３）、Ｆ２Ｒ（配列番号３１４）、ＩＣＡＭ３（配列番号３１５）、ＣＲＩＭ１ ＬＯＣ１０１９２９５００（配列番号３１６）、ＩＦＩ１６（配列番号３１７）、ＥＶＩ２Ｂ（配列番号３１８）、ＰＦＫＦＢ３（配列番号３１９）、ＭＩＲ６５１３ ＴＭＢＩＭ１（配列番号３２０）、ＡＰＯＬ３（配列番号３２１）、ＣＤ５５（配列番号３２２）、ＴＲＡＭ２（配列番号３２３）、Ｓ１００Ａ４（配列番号３２４）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３２５）、ＰＩＰ４Ｋ２Ａ（配列番号３２６）、ＲＰＮ２（配列番号３２７）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３２８）、ＩＦＩＴ３（配列番号３２９）、ＰＬＡＣ８（配列番号３３０）、ＳＤＦ４（配列番号３３１）、ＣＡＶ２（配列番号３３２）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号３３３）、ＭＶＰ（配列番号３３４）、ＲＮＨ１（配列番号３３５）、ＥＩＦ１（配列番号３３６）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３３７）、ＡＳＬ（配列番号３３８）、ＣＤ９９（配列番号３３９）、ＵＳＰ４（配列番号３４０）、ＴＡＣＣ１（配列番号３４１）、ＣＤ５５（配列番号３４２）、ＰＤＸＫ（配列番号３４３）、ＢＳＴ２（配列番号３４４）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３４５）、ＤＵＳＰ５（配列番号３４６）、ＴＮＦＳＦ１３（配列番号３４７）、ＣＯＭＴ（配列番号３４８）、ＣＹＲ６１（配列番号３４９）、ＬＹ６Ｅ（配列番号３５０）、ＡＣＳＬ５（配列番号３５１）、ＧＢＰ２（配列番号３５２）、ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ（配列番号３５３）、ＰＴＲＦ（配列番号３５４）、ＣＹＲ６１（配列番号３５５）、ＢＴＮ３Ａ１（配列番号３５６）、ＰＬＥＣ（配列番号３５７）、ＣＴＮＮＤ１ ＴＭＸ２－ＣＴＮＮＤ１（配列番号３５８）、ＴＮＦＲＳＦ１４（配列番号３５９）、ＡＢＣＣ１０（配列番号３６０）、ＳＥＬＰＬＧ（配列番号３６１）、ＧＰＸ４（配列番号３６２）、ＥＤＥＭ１（配列番号３６３）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号３６４）、ＤＭＢＴ１（配列番号３６５）、ＰＳＭＢ８（配列番号３６６）、ＦＮ１（配列番号３６７）、ＣＯＬ１Ａ１（配列番号３６８）、ＦＯＳ（配列番号３６９）、ＣＹＬＤ（配列番号３７０）、ＡＤＡＭＴＳ１（配列番号３７１）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３７２）、ＧＡＴＡ６（配列番号３７３）、ＹＷＨＡＢ（配列番号３７４）、ＣＩＢ１（配列番号３７５）、ＯＰＴＮ（配列番号３７６）、ＩＦＩ１６（配列番号３７７）、ＣＦＬＡＲ（配列番号３７８）、ＰＴＧＥＲ４（配列番号３７９）、ＣＣＮＤ１（配列番号３８０）、ＰＤＬＩＭ５（配列番号３８１）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号３８２）、ＣＹＰ１Ｂ１（配列番号３８３）、ＳＶＩＬ（配列番号３８４）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号３８５）、ＴＡＧＬＮ２（配列番号３８６）、ＩＦＩ２７（配列番号３８７）、ＦＬＩＩ（配列番号３８８）、ＳＴＡＴ６（配列番号３８９）、ＷＷＰ２（配列番号３９０）、ＦＬＮＣ（配列番号３９１）、ＰＡＲＰ１２（配列番号３９２）、ＶＰＳ１３Ｄ（配列番号３９３）、ＩＦＩＴＭ２（配列番号３９４）、ＣＴＳＺ（配列番号３９５）、Ｃ１９ｏｒｆ１０（配列番号３９６）、ＤＡＰＫ１（配列番号３９７）、ＬＯＣ１０１９２８１８９ ＲＳＲＰ１（配列番号３９８）、ＭＹＯＦ（配列番号３９９）、ＡＴＰ２Ｂ４（配列番号４００）、ＡＸＬ（配列番号４０１）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号４０２）、ＬＹ９６（配列番号４０３）、ＦＮ１（配列番号４０４）、ＣＲＥＢ３Ｌ１（配列番号４０５）、ＴＮＦＳＦ１２－ＴＮＦＳＦ１３ ＴＮＦＳＦ１３（配列番号４０６）、ＰＯＦＵＴ２（配列番号４０７）、ＷＤＲ１（配列番号４０８）、ＳＬＣ７Ａ７（配列番号４０９）、ＭＩＣＢ（配列番号４１０）、ＧＡＴＡ３（配列番号４１１）、ＬＲＲＦＩＰ１（配列番号４１２）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号４１３）、及びＩＴＭ２Ａ（配列番号４１４））。患者はまた、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍）における、感度バイオマーカーの発現度合いに異なっている場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。患者はまた、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いに異なっている場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。
また、癌の再発を有する患者などの癌を有する患者を治療する方法であって、患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）における、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）の発現度合いを検出し、次いでバイオマーカーの発現度合いに基づいて２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を投与することによる方法も特徴としている。特に、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、感度バイオマーカーの発現度合いに類似している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を癌を有する患者に投与することができる。さらに、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における耐性バイオマーカーの発現度合いに類似している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を癌を有する患者に投与することができる。加えて、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を癌を有する患者に投与することができる。また、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を癌を有する患者に投与することができる。したがって、この方法を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることが予測される癌患者、例えば、多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）を有する患者を治療することができる。
本明細書では、薬物応答性のバイオマーカーを同定し、癌患者におけるバイオマーカー遺伝子発現を検出し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩で癌患者を治療する方法ついて記載されている。これらの方法で使用するためのデバイスとキットについても記載されている。
薬物応答性のバイオマーカーを同定する方法
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩での治療などの癌治療に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３のバイオマーカーの１つ以上）を同定する方法も特徴としている。そのような方法は、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩により治療された細胞株（例えば、ＮＣＩ６０細胞株）の増殖阻害値（ＧＩ５０）に基づくアルゴリズムと、それに続く遺伝子発現の測定（例えば、マイクロアレイ（例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＧ－Ｕ１３３Ａ Ｇｅｎｅｃｈｉｐアレイ）を使用して）を含み得る。
インビトロ癌増殖阻害スクリーニングの方法体系
癌スクリーニングパネルのヒト腫瘍細胞株は、５％ウシ胎児血清と２ｍＭのＬ－グルタミンを含むＲＰＭＩ１６４０培地中で増殖させることができる。細胞は、個々の細胞株の倍加時間に応じて、５，０００～４０，０００細胞／ウェルの範囲のプレーティング密度で１００μＬの９６ウェルマイクロタイタープレートに接種することができる。細胞接種後、実験用化合物を添加する前に、マイクロタイタープレートを３７℃、５％ＣＯ２、９５％空気、及び１００％相対湿度で２４時間インキュベートすることができる。
２４時間後、化合物添加時（Ｔｚ）の各細胞株の細胞集団の測定値を表すために、各細胞株の２枚のプレートをＴＣＡでｉｎ ｓｉｔｕ固定することができる。実験化合物は、所望の最終最大試験濃度の４００倍でジメチルスルホキシドに可溶化し、使用前に凍結保存することができる。化合物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）の添加時に、凍結濃縮物のアリコートを解凍し、５０μＧ／ｍＬのゲンタマイシンを含む完全培地で所望の最終最大試験濃度の２倍に希釈することができる。さらに４つの、１０倍又は１／２対数の連続希釈を行って、合計５つの濃度と対照を提供する。これらの異なる化合物希釈液の１００μＬのアリコートを、すでに１００μＬの培地を含む適切なマイクロタイターウェルに添加し、その結果、必要とされる最終化合物濃度を得る。
化合物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）の添加に続いて、プレートを、３７℃、５％ＣＯ２、９５％空気、及び１００％相対湿度でさらに４８時間インキュベートすることができる。付着細胞については、冷ＴＣＡを添加してアッセイを終了させることができる。細胞は、５０μＬの冷５０％（ｗ／ｖ）ＴＣＡ（最終濃度、１０％ＴＣＡ）を穏やかに添加することによりｉｎ ｓｉｔｕ固定し、４℃で６０分間インキュベートすることができる。上清を廃棄し、プレートを水道水で５回洗浄し、風乾させることができる。１％酢酸中０．４％（ｗ／ｖ）のスルホローダミンＢ（ＳＲＢ）溶液（１００μＬ）を各ウェルに添加し、プレートを室温で１０分間インキュベートすることができる。染色後、１％酢酸で５回洗浄することにより未結合の色素を除去し、プレートを風乾させることができる。続いて、結合した染色液を１０ｍＭのトリズマ塩基で可溶化し、自動式プレートリーダーにより５１５ｎｍの波長で吸光度を読み取ることができる。懸濁細胞については、５０μＬの８０％ＴＣＡ（最終濃度、１６％ＴＣＡ）を穏やかに添加することによって、静置した細胞をウェルの底に固定することによりアッセイを終了させることを除き、方法体系は同じであり得る。７つの吸光度測定［ゼロ時間（Ｔｚ）、対照増殖（Ｃ）、及び５つの濃度レベルの化合物（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）の存在下での試験増殖（Ｔｉ）］を使用して、増殖率をそれぞれの化合物濃度レベルで計算することができる。増殖阻害率は次のように計算することができる：
濃度がＴｉ＞／＝Ｔｚの場合、［（Ｔｉ－Ｔｚ）／（Ｃ－Ｔｚ）］×１００
濃度がＴｉ＜Ｔｚの場合、［（Ｔｉ－Ｔｚ）／Ｔｚ］×１００
各実験的薬剤（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）について、３つの用量応答パラメータを計算することができる。５０％増殖阻害（ＧＩ５０）は、［（Ｔｉ－Ｔｚ）／（Ｃ－Ｔｚ）］×１００＝５０から計算され、これは、化合物のインキュベーション中の対照細胞におけるタンパク質の純増加（ＳＲＢ染色により測定）の５０％減少をもたらす薬剤（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）濃度である。総増殖阻害（ＴＧＩ）をもたらす化合物濃度は、Ｔｉ＝Ｔｚから計算される。治療後の細胞の純損失を示すＬＣ５０（化合物治療の終了時に測定されたタンパク質が開始時と比較して５０％の減少をもたらす化合物の濃度）は、［（Ｔｉ－Ｔｚ）／Ｔｚ］×１００＝－５０から計算される。活性レベルに達した場合は、これら３つのパラメータのそれぞれについて値が計算されるが、効果に達していない場合や超えている場合は、そのパラメータの値は、試験された最大濃度又は最小濃度よりも大きいか、又は小さいものとして表される。
遺伝子発現と増殖阻害分析
ＮＣＩ６０癌細胞株の遺伝子発現測定値は、公的に利用可能なデータベース（例えば、米国国立癌研究所及びマサチューセッツ工科大学）から取得することができる。各データセットは、異なるチップで測定されたサンプルの発現を比較できるように正規化することができる。正規化の好ましい方法はロジット変換であり、これは、次式のように、各チップ上の各遺伝子ｙについて実行することができる：
ロジット（ｙ）＝ｌｏｇ［（ｙ－バックグラウンド）／（飽和）－ｙ）］、
式中、バックグラウンドは、チップ上で測定される最小強度からシグナル強度範囲の０．１％を差し引いた値：最小値－０．００１＊（最大値－最小値）として計算され、「飽和」は、チップ上で測定される最大強度にシグナル強度範囲の０．１％を加えた値：最大値＋０．００１＊（最大値－最小値）として計算される。結果として得られるロジット変換後のデータを次いで、平均値を０及び標準偏差を１となるようにｚ変換する。
次に、遺伝子発現を、癌細胞の増殖阻害と相関させることができる。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩などの癌治療薬の存在下でのＮＣＩ６０細胞株の増殖阻害データ（ＧＩ５０）は、ＮＣＩから得ることができる。各細胞株における各遺伝子のロジット変換された発現度合いとＧＩ５０（５０％増殖阻害をもたらす所与の化合物の濃度）の対数との間の相関関係は、例えば、ピアソン相関係数又はスピアマンの順位相関係数を使用して計算することができる。ＧＩ５０を使用する代わりに、所与の治療に対する患者の感度の他の任意の測定値（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）を、患者の遺伝子発現度合いと相関させることができる。１つの遺伝子に関して複数の測定値を利用可能であり得ることから、相関係数の最も正確な測定は、例えば、同じ遺伝子の発現を測定するすべてのプローブに関して計算された相関係数の中央値であり得る。
例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する増殖阻害又は患者の感度に対するプローブにより測定された遺伝子発現の相関係数の中央値は、対象のすべての遺伝子について計算することができる。相関の中央値が、例えば０．２５、０．３０、０．３１、０．３２、０．３３、０．３４、０．３５、０．３６、０．３７、０．３８、０．３９、０．４０、又はそれよりも高い値を上回る遺伝子は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌の再発を有する患者）の応答性を評価するための感度バイオマーカーとして使用することができる。同様に、相関の中央値が、例えば、－０．２５、－０．３０、－０．３１、－０．３２、－０．３３、－０．３４、－０．３５、－０．３６、－０．３７、－０．３８、－０．３９、－０．４０、又はそれよりも低い値を下回る遺伝子は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌の再発を有する患者）の応答性を評価するための耐性バイオマーカーとして使用することができる。好ましくは、感度バイオマーカーの相関係数は０．２５を超え、一方、耐性バイオマーカーの相関係数は－０．２５未満である。結果は、それぞれ表２及び表３に示されるように、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する感度又は耐性に相関するバイオマーカー遺伝子のリストである。
癌の種類
本発明の方法、デバイス、及びキットは、癌に罹患している、癌と診断されている、又は癌にかかりやすい対象における癌を診断、予後、監視、治療、及び／又は軽減するために使用することができる。この方法を使用して診断、予知、監視、治療、又は軽減することができる癌の非限定的な例として、血液学的腫瘍及び充実性腫瘍が挙げられる。特に、癌の例としては、例えば、結腸直腸癌（例えば、大腸癌及び直腸癌）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤白血病、及び慢性白血病）、骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、骨髄異形成症候群、リンパ腫（例えば、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及びリンパ球性リンパ腫）、子宮頸癌、前立腺癌、食道癌、骨髄腫、神経膠腫（例えば、乏突起膠腫）、膵癌（例えば、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様腺癌、コロイド腺癌、膵島細胞癌、及び膵臓神経内分泌癌）、卵巣癌（例えば、卵巣腺癌又は胚性癌腫）、消化管間質腫瘍、肉腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、平滑筋肉腫、ユーイング肉腫、及び横紋筋肉腫）、乳癌（例えば、髄様癌）、ＥＲ陽性癌、膀胱癌、頭頸部癌（例えば、頭頸部の扁平上皮癌）、肺癌（例えば、非小細胞肺癌、大細胞癌、気管支原性癌、及び乳頭腺癌）、転移性癌、口腔癌、子宮癌、精巣癌（例えば、精上皮腫及び胚性癌腫）、皮膚癌（例えば、扁平上皮癌及び基底細胞癌）、甲状腺癌（例えば、乳頭癌及び髄様癌）、脳癌（例えば、星状細胞腫及び頭蓋咽頭癌）、胃癌、上皮内癌、骨癌、胆道癌、眼癌、肝癌（例えば、肝細胞癌又は肝腫）、喉頭癌、腎臓癌（例えば、腎細胞癌及びウィルムス腫瘍）、胃癌、芽細胞腫（例えば、腎芽細胞腫、髄芽細胞腫、血管芽細胞腫、神経芽細胞腫、及び網膜芽細胞腫）、真性多血症、脊索腫、滑膜腫、中皮腫、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、嚢胞腺癌、胆管癌、絨毛癌、上皮癌、上衣腫、松果体腫、聴神経腫、神経鞘腫、髄膜腫、下垂体腺腫、神経鞘腫瘍、小腸の癌、内分泌系の癌、陰茎の癌、尿道の癌、皮膚又は眼内黒色腫、婦人科腫瘍、小児の充実性腫瘍、又は中枢神経系の新生物が挙げられる。
特に、この方法は、例えば、多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）を診断、予後、監視、治療、又は予防するのに有用である。例えば、癌は、ステージＩ、ステージＩＩ、又はステージＩＩＩの多発性骨髄腫などの多発性骨髄腫であり得る。特に、癌は、再発性の多発性骨髄腫であり得る。あるいは、癌は、髄様癌などの乳癌である。癌は、エストロゲン受容体陽性（ＥＲ ｐｏｓ）乳癌であり得る。癌は、乳癌の転移性形態であり得る。乳癌は、例えば、ステージ０、ステージＩ、ステージＩＩ、ステージＩＩＩ、又はステージＩＶの乳癌であり得る。
癌患者におけるバイオマーカー遺伝子発現を検出する方法
癌患者は、癌患者（例えば、癌又はその再発を有する患者）から得られた生物学的サンプルにおけるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３のバイオマーカーの１つ以上）の遺伝子発現を検出することにより、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する感度又は耐性について評価することができる。生物学的サンプルとしては、例えば、細胞、組織（例えば、生検により得られた組織サンプル）、血液、血清、血漿、尿、痰、脳脊髄液、リンパ組織又は体液、又は膵液を挙げることができる。例えば、生物学的サンプルは、対象の組織（例えば、リンパ節、胸腺、脾臓、骨髄、乳房、結腸直腸、膵臓、子宮頸部、前立腺、膀胱、肺、胃腸、頭、首、又は卵巣組織）からの腫瘍サンプル（例えば、生検）などの、対象から得られた新鮮な凍結された又はホルマリン固定されたパラフィン包埋（ＦＦＰＥ）組織であり得る。
ＲＮＡ抽出とバイオマーカー発現測定
細胞サンプル又は組織サンプルは、処理するまで液体窒素で急速冷凍することができる。ＲＮＡは、例えば、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社のＴｒｉｚｏｌ試薬を使用して、製造元の指示に従って抽出し、直接検出するか、又は検出のためにｃＤＮＡに変換することができる。ＲＮＡは、例えば、Ａｍｂｉｏｎ社のＭｅｓｓａｇｅＡｍｐキットを使用して、製造元の指示に従って増幅することができる。増幅されたＲＮＡは、例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ Ｉｎｃ．社のＨＧ－Ｕ１３３Ａ又はＨＧ－Ｕ１３３＿Ｐｌｕｓ２ ＧｅｎｅＣｈｉｐ、及び互換性のある機器（例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社のＧＣＳ３０００Ｄｘを使用して、製造元の指示を使用して定量化することができる。結果として得られるバイオマーカー発現測定値は、本明細書に記載されているようにさらに分析することができる。記載される手順は、例えば、Ｒ－Ｐｒｏｊｅｃｔ社から入手可能なＲソフトウェアを使用して実行することができ、Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒから入手可能なパッケージで補足することができる。
表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））は、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、逆転写酵素ＰＣＲ（ＲＴ－ＰＣＲ）、定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、アレイ（例えば、マイクロアレイ）、遺伝子チップ、パイロシーケンシング、ナノポアシーケンシング、ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｂｙ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（ＳＢＳ）法、ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｂｙ ｅｘｐａｎｓｉｏｎ（ＳＢＥ）法、一分子リアルタイム技術、ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｂｙ ｌｉｇａｔｉｏｎ（ＳＢＬ）法、マイクロフルイディクス、赤外蛍光、次世代シーケンシング（例えば、ＲＮＡ－Ｓｅｑ技術）、ノーザンブロット、ウエスタンブロット、サザンブロット、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ
ｎＣｏｕｎｔｅｒ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（例えば、米国特許出願公開番号ＵＳ２０１１／０２０１５１５、ＵＳ２０１１／０２２９８８８、及びＵＳ２０１３／００１７９７１に記載されているものであって、これらの各文献は、参照によりその全体が組み込まれる）、プロテオミクス技術（例えば、質量分析又はタンパク質アレイ）、及びそれらの組み合わせを使用して、癌患者（例えば、癌の再発を有する患者などの、本明細書に記載の癌の種類のいずれかを有する患者）から得られた生物学的サンプル（例えば、腫瘍サンプル）において測定することができる。
デバイス
本発明のデバイスは、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーの発現度合いを検出するために使用することができる。デバイスは、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の少なくとも５個（例えば、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個以上）の連続的なヌクレオチドに相補的又は同一である核酸配列と少なくとも８５％の配列同一性（例えば、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性）を有する少なくとも１つの一本鎖核酸を含み得、少なくとも１つの一本鎖核酸が、１つ以上のバイオマーカーの発現度合いの検出に十分である。デバイスを使用して、一本鎖核酸と、バイオマーカー（例えば、ｍＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、又は非コードＲＮＡ）、バイオマーカーをコードする核酸（例えば、ｍＲＮＡ）、又はその相補的核酸との間の特異的なハイブリダイゼーションにより、所与のバイオマーカーの発現度合いを検出することができる。デバイスは、マイクロアレイであり得るか、又はマイクロアレイを含み得る。デバイスはまた、次世代シーケンシング（例えば、ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｂｙ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（ＳＢＳ）法）のための試薬及び材料を含み得るか、又はそれらと共に使用することができる。このデバイスは、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ試薬及び少なくとも１つのｎＣｏｕｎｔｅｒカートリッジを含み得る、それらと共に使用することができる。デバイスは、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーのポリペプチド産物に検出可能に結合することができる１つ以上のタンパク質結合部分（例えば、タンパク質、抗体、核酸、アプタマー、アフィボディ、脂質、リン脂質、低分子、上記のいずれかの標識された変異体、及び当該技術分野で周知であるようにタンパク質検出に有用な他の任意の部分）を含むタンパク質アレイであり得るか、又はそれを含み得る。
マイクロアレイ
バイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に記載されるバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号 １７３又は１７４又は１７８））は、マイクロアレイなどのハイスループット発現プロファイリングプラットフォームを使用して測定することができる。特に、２Ｘ－１２１（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に対する癌を有する対象（例えば、癌の再発を有する患者）の応答性を評価する方法において使用するためのマイクロアレイは、対象の１つ以上のバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３の１つ以上のバイオマーカー）又はその相補配列にハイブリダイズすることができるオリゴヌクレオチドプローブ（例えば、ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、又はＲＮＡプローブ）を含むか、又はそれを生成することにより作製される。各プローブは、例えば、選択されたバイオマーカーの核酸配列に相補的又は同一である、例えば、少なくとも１０個、１５個、２０個、２５個、３０個以上の連続した核酸残基（例えば、少なくとも１５個）を有し得る。プローブ核配列はまた、バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はその相補配列をコードする遺伝子の核酸配列に対して少なくとも８５％（例えば、９０％、９５％、９９％、又は１００％）の配列同一性を有し得る。特に、プローブ配列は、バイオマーカーの核酸配列の全部又は一部に相補的であり得る。
例えば、２Ｘ－１２１（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）応答性を測定するための本発明のマイクロアレイは、表２に示される下記のような１個以上（例えば、少なくとも５個、１０個、１５個、又は２０個以上（例えば、すべて））のバイオマーカーのプローブを含み得る：ＳＲＳＦ７（配列番号１）、ＵＣＨＬ１（配列番号２）、ＭＬＬＴ１１（配列番号３）、ＡＤＤ２（配列番号４）、ＡＤＤ２（配列番号５）、ＰＲＭＴ１（配列番号６）、ＳＲＳＦ３（配列番号７）、ＰＲＭＴ５（配列番号８）、ＣＯＣＨ（配列番号９）、ＲＵＶＢＬ１（配列番号１０）、ＭＡＲＣＫＳＬ１（配列番号１１）、ＣＨＥＲＰ（配列番号１２）、ＭＴＳＳ１（配列番号１３）、ＬＳＭ４（配列番号１４）、ＲＡＰＧＥＦ５（配列番号１５）、ＰＲＰＦ４（配列番号１６）、ＬＳＭ４（配列番号１７）、ＤＥＳＩ２（配列番号１８）、ＲＮＰＳ１（配列番号１９）、ＳＮＸ１０（配列番号２０）、ＣＵＬ３（配列番号２１）、ＣＨＤ４（配列番号２２）、ＭＳＨ２（配列番号２３）、ＨＮＲＮＰＭ（配列番号２４）、ＳＲＳＦ１（配列番号２５）、ＮＥＬＬ２（配列番号２６）、ＰＡＩＣＳ（配列番号２７）、ＨＯＸＡ１０（配列番号２８）、ＢＵＢ１Ｂ（配列番号２９）、Ｅ２Ｆ５（配列番号３０）、ＭＡＧＥＤ４ ＭＡＧＥＤ４Ｂ ＳＮＯＲＡ１１Ｄ ＳＮＯＲＡ１１Ｅ（配列番号３１）、ＰＲＰＦ８（配列番号３２）、ＳＯＲＤ（配列番号３３）、ＨＮＲＮＰＵ（配列番号３４）、ＰＥＸ５（配列番号３５）、ＨＹＰＫ ＭＩＲ１２８２ ＳＥＲＦ２ ＳＥＲＦ２－Ｃ１５ＯＲＦ６３（配列番号３６）、ＳＴＲＡＰ（配列番号３７）、ＮＤＵＦＡＢ１（配列番号３８）、ＦＡＲＳＡ（配列番号３９）、ＳＴＯＭＬ２（配列番号４０）、ＥＲＨ（配列番号４１）、ＨＳＢＰ１（配列番号４２）、ＤＤＸ３９Ａ（配列番号４３）、ＯＤＣ１（配列番号４４）、ＴＡＦ５（配列番号４５）、ＴＢＣ１Ｄ３１（配列番号４６）、ＴＲＡ２Ｂ（配列番号４７）、ＮＵＤＣ（配列番号４８）、ＤＤＸ２３（配列番号４９）、ＰＲＰＦ３１（配列番号５０）、ＵＢＥ２Ｓ（配列番号５１）、ＴＣＦ４（配列番号５２）、ＭＬＦ２（配列番号５３）、ＣＣＤＣ１８１（配列番号５４）、ＴＣＦ４（配列番号５５）、ＤＥＳＩ２（配列番号５６）、ＲＰＦ１（配列番号５７）、ＰＡＳＫ（配列番号５８）、ＮＵＰ８８（配列番号５９）、ＲＮＡＳＥＨ２Ａ（配列番号６０）、ＦＢＬ（配列番号６１）、ＬＯＣ１０１９２８７４７ ＲＢＭＸ ＳＮＯＲＤ６１（配列番号６２）、ＮＸＦ１（配列番号６３）、ＰＬＥＫＨＯ１（配列番号６４）、ＧＡＲ１（配列番号６５）、ＲＰＡ１（配列番号６６）、ＺＮＦ２４（配列番号６７）、ＢＯＰ１ ＭＩＲ７１１２（配列番号６８）、ＲＡＢ３Ｂ（配列番号６９）、ＳＬＣ３５Ｇ２（配列番号７０）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号７１）、ＤＫＣ１ ＭＩＲ６６４Ｂ ＳＮＯＲＡ５６（配列番号７２）、ＰＳＭＣ３ＩＰ（配列番号７３）、ＤＮＡＪＣ７（配列番号７４）、ＲＲＰ１Ｂ（配列番号７５）、ＮＭＥ１（配列番号７６）、ＳＮＲＰＡ（配列番号７７）、ＤＢＮ１（配列番号７８）、ＫＩＡＡ００２０（配列番号７９）、ＳＵＰＶ３Ｌ１（配列番号８０）、ＺＮＦ５７３（配列番号８１）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号８２）、ＴＯＸ３（配列番号８３）、ＨＳＰＤ１（配列番号８４）、ＡＣＬＹ（配列番号８５）、ＴＯＸ３（配列番号８６）、ＭＳＡＮＴＤ３－ＴＭＥＦＦ１ ＴＭＥＦＦ１（配列番号８７）、ＡＫＩＲＩＮ１（配列番号８８）、ＵＢＥ２Ｍ（配列番号８９）、ＭＴＦ２（配列番号９０）、ＥＷＳＲ１（配列番号９１）、ＦＡＲＳＡ（配列番号９２）、ＳＫＰ２（配列番号９３）、ＴＭＥＭ９７（配列番号９４）、ＨＮＲＮＰＤ（配列番号９５）、ＩＬＫＡＰ（配列番号９６）、ＮＡＳＰ（配列番号９７）、ＳＮＲＰＤ１（配列番号９８）、ＴＩＭＭ４４（配列番号９９）、ＰＫＮ１（配列番号１００）、ＳＴＡＵ２（配列番号１０１）、ＤＮＡＡＦ２（配列番号１０２）、ＳＮＲＰＤ２（配列番号１０３）、ＦＵＳ（配列番号１０４）、ＰＡＳＫ（配列番号１０５）、ＡＴＰ６Ｖ１Ｇ２－ＤＤＸ３９Ｂ ＤＤＸ３９Ｂ ＳＮＯＲＤ８４（配列番号１０６）、ＰＤＳＳ１（配列番号１０７）、ＮＵＤＣ（配列番号１０８）、ＴＯＸ３（配列番号１０９）、ＴＰＧＳ２（配列番号１１０）、ＳＬＩＲＰ（配列番号１１１）、ＮＣＬ（配列番号１１２）、ＡＮＰ３２Ａ（配列番号１１３）、ＳＡＦＢ（配列番号１１４）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１５）、ＣＥＰ６８（配列番号１１６）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１７）、Ｃ８ｏｒｆ３３（配列番号１１８）、ＭＲＰＬ１１（配列番号１１９）、ＰＯＬＲ２Ｉ（配列番号１２０）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号１２１）、ＭＣＡＭ ＭＩＲ６７５６（配列番号１２２）、ＥＣＳＩＴ（配列番号１２３）、ＭＤＫ（配列番号１２４）、ＰＵＦ６０（配列番号１２５）、ＰＦＮ２（配列番号１２６）、ＳＹＮＣＲＩＰ（配列番号１２７）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号１２８）、ＳＬＣ１６Ａ１（配列番号１２９）、ＰＯＬＲ２Ｈ（配列番号１３０）、ＭＡＰ３Ｋ７（配列番号１３１）、ＣＳＲＰ２（配列番号１３２）、ＢＣＬ１１Ａ（配列番号１３３）、ＰＮＫＰ（配列番号１３４）、ＤＮＡＪＣ６（配列番号１３５）、ＦＤＦＴ１（配列番号１３６）、ＦＡＤＳ１ ＭＩＲ１９０８（配列番号１３７）、ＲＰＡＲＰ－ＡＳ１（配列番号１３８）、ＤＨＲＳ７（配列番号１３９）、ＣＣＮＢ１ＩＰ１（配列番号１４０）、ＣＣＴ３ ＬＯＣ１０１９２７１３７（配列番号１４１）、ＤＤＸ１８（配列番号１４２）、ＡＡＲＳＤ１ ＰＴＧＥＳ３Ｌ ＰＴＧＥＳ３Ｌ－ＡＡＲＳＤ１（配列番号１４３）、ＨＮＲＮＰＤＬ（配列番号１４４）、ＡＴＸＮ７Ｌ３Ｂ（配列番号１４５）、ＭＲＰＳ１４（配列番号１４６）、ＳＯＸ４（配列番号１４７）、ＥＬＯＶＬ２（配列番号１４８）、ＫＣＮＪ８（配列番号１４９）、ＴＲＩＡＰ１（配列番号１５０）、ＥＩＦ２Ｂ１（配列番号１５１）、ＦＢＸＬ１４（配列番号１５２）、ＭＡＰＲＥ２（配列番号１５３）、ＯＲＣ４（配列番号１５４）、ＭＤＮ１（配列番号１５５）、ＫＮＯＰ１（配列番号１５６）、ＫＢＴＢＤ１１（配列番号１５７）、ＦＡＤＳ２（配列番号１５８）、ＲＡＮＢＰ１（配列番号１５９）、ＰＬＥＫＨＢ１（配列番号１６０）、ＨＳＰＥ１（配列番号１６１）、ＴＭＥＭ９７（配列番号１６２）、ＩＴＦＧ２ ＬＯＣ１００５０７４２４（配列番号１６３）、ＳＦＰＱ（配列番号１６４）、ＲＦＣ３（配列番号１６５）、ＳＤＲ３９Ｕ１（配列番号１６６）、ＰＢＫ（配列番号１６７）、ＰＨＢ（配列番号１６８）、ＫＨＤＲＢＳ１（配列番号１６９）、ＰＤＡＰ１（配列番号１７０）、ＳＳＲＰ１（配列番号１７１）、及びＢ３ＧＡＬＴ２（配列番号１７２）。
２Ｘ－１２１（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）応答性を測定するための本発明のマイクロアレイはまた、表３に示される下記のような１個以上（例えば、少なくとも５個、１０個、１５個、又は２０個以上（例えば、すべて））の耐性バイオマーカーのプローブを含み得る：ＨＬＡ－Ｅ（配列番号３１７３又は１７４又は１７８）、ＧＡＤＤ４５Ｂ（配列番号１７５）、ＣＬＩＣ１（配列番号１７６）、ＬＡＳＰ１（配列番号１７７）、ＡＰＯＢＥＣ３Ｂ（配列番号１７９）、ＬＧＡＬＳ１（配列番号１８０）、ＴＡＰＢＰ（配列番号１８１）、ＡＨＮＡＫ（配列番号１８２）、ＢＨＬＨＥ４０（配列番号１８３）、Ｓ１００Ａ１１（配列番号１８４）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１８５）、ＺＢＴＢ３８（配列番号１８６）、ＳＴＡＴ１（配列番号１８７）、ＴＣＩＲＧ１（配列番号１８８）、Ｓ１００Ａ１１Ｐ１（配列番号１８９）、ＣＴＳＡ（配列番号１９０）、ＶＥＧＦＡ（配列番号１９１）、ＳＴＯＭ（配列番号１９２）、Ｐ４ＨＢ（配列番号１９３）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１９４）、ＦＸＹＤ５（配列番号１９５）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９６）、ＹＰＥＬ５（配列番号１９７）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９８）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９９）、ＳＴＯＭ（配列番号２００）、ＰＬＩＮ３（配列番号２０１）、ＲＲＢＰ１（配列番号２０２）、ＩＲＦ１（配列番号２０３）、ＬＭＮＡ（配列番号２０４）、ＮＰＣ２（配列番号２０５）、Ｐ４ＨＢ（配列番号２０６）、ＫＬＦ６（配列番号２０７）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２０８）、ＲＨＯＣ（配列番号２０９）、ＣＤ５９（配列番号２１０）、ＳＲＧＮ（配列番号２１１）、ＳＲＧＮ（配列番号２１２）、ＳＴＡＴ１（配列番号２１３）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２１４）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２１５）、ＰＩＥＺＯ１（配列番号２１６）、ＬＧＡＬＳ３（配列番号２１７）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２１８）、ＣＤ９７（配列番号２１９）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２２０）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２２１）、ＦＮＤＣ３Ｂ ＬＯＣ１０１９２８６１５（配列番号２２２）、ＣＫＬＦ ＣＫＬＦ－ＣＭＴＭ１（配列番号２２３）、ＩＦＩ３５（配列番号２２４）、ＴＩＰＡＲＰ（配列番号２２５）、ＴＡＰ１（配列番号２２６）、ＭＩＣＡＬＬ２（配列番号２２７）、ＲＲＢＰ１（配列番号２２８）、ＺＦＰ３６（配列番号２２９）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２３０）、ＴＮＩＰ１（配列番号２３１）、ＣＤ５９（配列番号２３２）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２３３）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２３４）、ＦＬＮＢ（配列番号２３５）、ＰＳＧ６（配列番号２３６）、ＣＢＸ７（配列番号２３７）、ＲＡＲＲＥＳ３（配列番号２３８）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２３９）、ＳＵＮ２（配列番号２４０）、ＥＨＤ２（配列番号２４１）、ＭＡＰ３Ｋ５（配列番号２４２）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２４３）、ＮＯＬ１２ ＴＲＩＯＢＰ（配列番号２４４）、ＣＫＬＦ（配列番号２４５）、ＡＲＰＣ１Ｂ（配列番号２４６）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２４７）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２４８）、ＲＰ１１－３９５Ｂ７．７（配列番号２４９）、ＥＨＤ２（配列番号２５０）、ＬＥＰＲＯＴ（配列番号２５１）、ＢＴＮ３Ａ２ ＢＴＮ３Ａ３（配列番号２５２）、ＩＮＰＰ４Ｂ（配列番号２５３）、ＤＵＳＰ１（配列番号２５４）、ＥＶＩ２Ａ（配列番号２５５）、ＴＦＰＩ（配列番号２５６）、ＥＨＤ１（配列番号２５７）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２５８）、ＥＰＡＳ１（配列番号２５９）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６０）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２６１）、ＣＬＩＣ３（配列番号２６２）、ＴＦＰＩ（配列番号２６３）、ＮＡＣＣ２（配列番号２６４）、ＴＧＦＢＩ（配列番号２６５）、ＩＥＲ３（配列番号２６６）、ＭＩＣＡ（配列番号２６７）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２６８）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６９）、ＣＮＮ２（配列番号２７０）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７１）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２７２）、ＭＢＮＬ１（配列番号２７３）、ＩＳＧ１５（配列番号２７４）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７５）、ＣＯＰＧ１（配列番号２７６）、ＣＤ９９（配列番号２７７）、ＰＳＭＢ９（配列番号２７８）、ＺＦＰ３６Ｌ１（配列番号２７９）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２８０）、ＳＨＣ１（配列番号２８１）、ＧＳＴＫ１（配列番号２８２）、ＣＡＶ１（配列番号２８３）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号２８４）、ＫＲＴ７（配列番号２８５）、ＴＦＰＩ（配列番号２８６）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号２８７）、ＲＨＯＧ（配列番号２８８）、ＣＤＨ１１（配列番号２８９）、ＡＢＣＣ３（配列番号２９０）、ＣＡＶ１（配列番号２９１）、ＨＬＡ－Ｊ（配列番号２９２）、ＭＹＬ１２Ａ（配列番号２９３）、ＭＲＰＳ１０（配列番号２９４）、ＲＲＡＳ（配列番号２９５）、ＴＭＥＭ２（配列番号２９６）、ＳＩＤＴ２（配列番号２９７）、ＲＡＢ１１ＦＩＰ１（配列番号２９８）、ＲＴＰ４（配列番号２９９）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３００）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号３０１）、ＴＭＥＭ１８９ ＴＭＥＭ１８９－ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ２（配列番号３０２）、ＲＰＮ２（配列番号３０３）、ＩＴＧＡ５（配列番号３０４）、ＣＤＣ４２ＥＰ１（配列番号３０５）、ＢＴＮ３Ａ３（配列番号３０６）、ＯＳＥＲ１（配列番号３０７）、ＣＨＳＴ１５（配列番号３０８）、ＭＤＦＩＣ（配列番号３０９）、ＣＡＶ２（配列番号３１０）、ＣＡＲＤ１０（配列番号３１１）、ＲＡＣ２（配列番号３１２）、ＭＬＰＨ（配列番号３１３）、Ｆ２Ｒ（配列番号３１４）、ＩＣＡＭ３（配列番号３１５）、ＣＲＩＭ１ ＬＯＣ１０１９２９５００（配列番号３１６）、ＩＦＩ１６（配列番号３１７）、ＥＶＩ２Ｂ（配列番号３１８）、ＰＦＫＦＢ３（配列番号３１９）、ＭＩＲ６５１３ ＴＭＢＩＭ１（配列番号３２０）、ＡＰＯＬ３（配列番号３２１）、ＣＤ５５（配列番号３２２）、ＴＲＡＭ２（配列番号３２３）、Ｓ１００Ａ４（配列番号３２４）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３２５）、ＰＩＰ４Ｋ２Ａ（配列番号３２６）、ＲＰＮ２（配列番号３２７）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３２８）、ＩＦＩＴ３（配列番号３２９）、ＰＬＡＣ８（配列番号３３０）、ＳＤＦ４（配列番号３３１）、ＣＡＶ２（配列番号３３２）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号３３３）、ＭＶＰ（配列番号３３４）、ＲＮＨ１（配列番号３３５）、ＥＩＦ１（配列番号３３６）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３３７）、ＡＳＬ（配列番号３３８）、ＣＤ９９（配列番号３３９）、ＵＳＰ４（配列番号３４０）、ＴＡＣＣ１（配列番号３４１）、ＣＤ５５（配列番号３４２）、ＰＤＸＫ（配列番号３４３）、ＢＳＴ２（配列番号３４４）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３４５）、ＤＵＳＰ５（配列番号３４６）、ＴＮＦＳＦ１３（配列番号３４７）、ＣＯＭＴ（配列番号３４８）、ＣＹＲ６１（配列番号３４９）、ＬＹ６Ｅ（配列番号３５０）、ＡＣＳＬ５（配列番号３５１）、ＧＢＰ２（配列番号３５２）、ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ（配列番号３５３）、ＰＴＲＦ（配列番号３５４）、ＣＹＲ６１（配列番号３５５）、ＢＴＮ３Ａ１（配列番号３５６）、ＰＬＥＣ（配列番号３５７）、ＣＴＮＮＤ１ ＴＭＸ２－ＣＴＮＮＤ１（配列番号３５８）、ＴＮＦＲＳＦ１４（配列番号３５９）、ＡＢＣＣ１０（配列番号３６０）、ＳＥＬＰＬＧ（配列番号３６１）、ＧＰＸ４（配列番号３６２）、ＥＤＥＭ１（配列番号３６３）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号３６４）、ＤＭＢＴ１（配列番号３６５）、ＰＳＭＢ８（配列番号３６６）、ＦＮ１（配列番号３６７）、ＣＯＬ１Ａ１（配列番号３６８）、ＦＯＳ（配列番号３６９）、ＣＹＬＤ（配列番号３７０）、ＡＤＡＭＴＳ１（配列番号３７１）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３７２）、ＧＡＴＡ６（配列番号３７３）、ＹＷＨＡＢ（配列番号３７４）、ＣＩＢ１（配列番号３７５）、ＯＰＴＮ（配列番号３７６）、ＩＦＩ１６（配列番号３７７）、ＣＦＬＡＲ（配列番号３７８）、ＰＴＧＥＲ４（配列番号３７９）、ＣＣＮＤ１（配列番号３８０）、ＰＤＬＩＭ５（配列番号３８１）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号３８２）、ＣＹＰ１Ｂ１（配列番号３８３）、ＳＶＩＬ（配列番号３８４）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号３８５）、ＴＡＧＬＮ２（配列番号３８６）、ＩＦＩ２７（配列番号３８７）、ＦＬＩＩ（配列番号３８８）、ＳＴＡＴ６（配列番号３８９）、ＷＷＰ２（配列番号３９０）、ＦＬＮＣ（配列番号３９１）、ＰＡＲＰ１２（配列番号３９２）、ＶＰＳ１３Ｄ（配列番号３９３）、ＩＦＩＴＭ２（配列番号３９４）、ＣＴＳＺ（配列番号３９５）、Ｃ１９ｏｒｆ１０（配列番号３９６）、ＤＡＰＫ１（配列番号３９７）、ＬＯＣ１０１９２８１８９ ＲＳＲＰ１（配列番号３９８）、ＭＹＯＦ（配列番号３９９）、ＡＴＰ２Ｂ４（配列番号４００）、ＡＸＬ（配列番号４０１）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号４０２）、ＬＹ９６（配列番号４０３）、ＦＮ１（配列番号４０４）、ＣＲＥＢ３Ｌ１（配列番号４０５）、ＴＮＦＳＦ１２－ＴＮＦＳＦ１３ ＴＮＦＳＦ１３（配列番号４０６）、ＰＯＦＵＴ２（配列番号４０７）、ＷＤＲ１（配列番号４０８）、ＳＬＣ７Ａ７（配列番号４０９）、ＭＩＣＢ（配列番号４１０）、ＧＡＴＡ３（配列番号４１１）、ＬＲＲＦＩＰ１（配列番号４１２）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号４１３）、及びＩＴＭ２Ａ（配列番号４１４）。
マイクロアレイプローブは一本鎖又は二本鎖であり得る。プローブは標識（例えば、蛍光分子、色素分子、低分子、エピトープタグ、バーコード配列、ポリペプチド、又は他の任意の検出可能な分子で検出可能に標識）され得る。プローブは検出可能に標識され、固体支持体上に固定化されてマイクロアレイを形成することができる。例えば、プローブは予め調製されて表面にスポットされ得るか、又はマイクロアレイの表面上で（ｉｎ ｓｉｔｕ）直接合成され得る。マイクロアレイはまた、アレイの各要素（例えば、プローブ）の配列及び位置が既知であるように構成することができる。例えば、２Ｘ－１２１（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩）に対する応答性の可能性の増大と発現が相関する一連のバイオマーカーは、固体支持体上に配列することができる。標識されたプローブと特定の標的核酸（例えば、表２及び／又は表３の１つ以上のバイオマーカーに対応するｍＲＮＡ）とのハイブリダイゼーションは、ｍＲＮＡが由来するサンプルがそのバイオマーカー（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する感度バイオマーカー又は耐性バイオマーカー）を発現することを示す。
ＰＣＲベースの技術
わずか１個～最大２５個以上のバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に記載されるバイオマーカーの５～２５個又は１０～２５個、又は少なくとも最初の２５個）を使用して、本明細書に記載の方法を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定することができる。癌患者（例えば、癌の再発を有する患者）からの組織又は細胞サンプルは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）などの核酸増幅法を使用して、遺伝子発現度合いについて好適に分析することができる。そのようなＰＣＲベースの技術としては、逆転写ＰＣＲ（ＲＴ－ＰＣＲ）、定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、逆転写ｑＰＣＲ（ＲＴ－ｑＰＣＲ）、又は定量的ループ介在等温増幅（ｑ－ＬＡＭＰ）を挙げることができる。例えば、表２又は３のバイオマーカーに対応するｍＲＮＡは、（ａ）少なくとも１つのプライマーを使用する逆転写によりサンプルからｃＤＮＡを生成すること；（ｂ）そのようにして生成されたｃＤＮＡをセンスプライマー及びアンチセンスプライマーとしての標的ポリヌクレオチドを使用して増幅し、そこに含まれる標的ｃＤＮＡを増幅すること；及び（ｃ）増幅された標的ｃＤＮＡの存在をポリヌクレオチドプローブを使用して検出することにより、生物学的サンプルにおいて検出することができる。ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２及び／又は表３に示される標的配列を含むプライマー及びプローブを使用して、示されるバイオマーカーの１つ以上の発現度合いをＰＣＲを使用して検出することができる。この方法は、（例えば、比較対照ｍＲＮＡ配列、又はアクチンファミリーメンバー又はＧＡＰＤＨなどの「ハウスキーピング」遺伝子のレベルを同時に調べることにより）生物学的サンプルにおける標的ｍＲＮＡのレベルの測定を可能にする１つ以上のステップを含み得る。これらのＰＣＲベースの技術のためのプライマーは、当該技術分野で知られている方法に従い、検出のために標識することができる。
シーケンシング
ＳＲＳＦ７（例えば、配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（例えば、配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの発現度合いは、参照により本明細書に組み込まれるＭｏｒｔａｚａｖｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ５：６２１－６２８，２００８に記載されているように、次世代シーケンシングプラットフォーム（例えば、ＲＮＡ－Ｓｅｑ）などのシーケンシング技術を使用して測定することができる。ＲＮＡ－Ｓｅｑは、サンプルにおけるＲＮＡ分子を直接シーケンシングすることにより発現を監視するためのロバストな技術である。この方法体系には、例えば２００ヌクレオチドの平均長さへのＲＮＡの断片化、ランダムプライミングによるｃＤＮＡへの変換、及び二本鎖ｃＤＮＡの合成（例えば、Ａｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社のＪｕｓｔ ｃＤＮＡ ＤｏｕｂｌｅＳｔｒａｎｄｅｄ ｃＤＮＡ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｋｉｔを使用）が含まれ得る。次いで、ｃＤＮＡを分子ライブラリーに変換して、各ライブラリーにシーケンスアダプター（例えば、Ｉｌｌｕｍｉｎａ（登録商標）／Ｓｏｌｅｘａ社）を付加することによりシーケンスを行うことができ、結果として得られる５０～１００ヌクレオチドの読み取りがゲノム上にマッピングされる。この方法による使用に適した例示的なシーケンシングプラットフォームには、例えば、４５４パイロシーケンシング、Ｉｌｌｕｍｉｎａ社のｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｂｙ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ、ＳＯＬｉＤシーケンシング、Ｉｏｎ Ｔｏｒｒｅｎｔ社のシーケンシング、及びＰａｃＢｉｏ ＲＳシーケンシングが含まれる。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する患者の応答性を測定する方法
本発明は、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（例えば、配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（例えば、配列番号１７３又は１７４又は１７８））を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る癌患者（例えば、癌又はその再発を有する患者）の検出及びスクリーニングのための診断方法を特徴としている。本発明の方法を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する患者の応答性を予測し、任意に、癌の進行中及び／又は再発の場合に癌患者を治療（例えば、一次治療、二次治療、及び／又は三次治療）することができる。
本発明は、個々のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（例えば、配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））及びバイオマーカーのセット（表２及び／又は表３に記載されるバイオマーカーの２つ以上）を提供し、その発現度合いは、癌患者（例えば、癌を有するヒト）から得られた生物学的サンプル（例えば、生検材料などの腫瘍サンプル）中で検出されるように、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることを示すものである。バイオマーカーは、例えば、Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ．（Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．１１：３４－３３、２０１２）、Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｎａｔ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．１０５：１２８４－１２９１，２０１３）、Ｋｎｕｄｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（ＰＬｏＳ Ｏｎｅ，９：ｅ８７４１５，２０１４）、及びＢｕｈｌ ｅｔ ａｌ．（ＰＬｏＳ Ｏｎｅ １３（３）：ｅ０１９４６０９，２０１８）に従来記載されたものと同様の方法を使用して同定した。これらの各文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。特に、細胞株（例えば、ＮＣＩ６０細胞）の増殖阻害値（ＧＩ５０）に基づくアルゴリズムが使用される。細胞株は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩により治療され、ベースライン遺伝子発現が（例えば、マイクロアレイ分析、ＲＴ－ＰＣＲ、ｑＰＣＲ、又は次世代シーケンシングにより）測定される。正規化後、例えば、ピアソン相関係数が０．２５より大きいか、又は－０．２５より小さい遺伝子は、それぞれ感度バイオマーカー又は耐性バイオマーカーとして分類することができる。特に、０．２５以上の相関係数は、例えば、表２及び／又は表３に示される遺伝子の発現度合いが、ｖａｎ’ｔ Ｖｅｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ ４１５（６８７１）：５３０－５３６，２００２に記載されているように、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する感度などの癌治療感度の可能性と相関するかどうかを確立するための当該技術分野で知られている統計的に有意なカットオフ値である。上記文献は、参照により本明細書に組み込まれる。
あるいは、正規化後、患者と同じ診断を受けた参照集団における５０パーセンタイルのカットオフ値を上回るか、又はそれ以上（例えば、６０パーセンタイル、７０パーセンタイル、又は８０パーセンタイル、又はそれ以上）である発現度合いを有する遺伝子を、それぞれ感度バイオマーカー又は耐性バイオマーカーとして分類することができる。
バイオマーカーの発現度合いの比較
本明細書に記載されているように同定された１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は耐性バイオマーカーを使用して、癌患者から得られた生物学的サンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いを測定することにより、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する応答性を予測することができる。単一のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２又は３のバイオマーカーのいずれか）又はバイオマーカーのセット（例えば、表２及び／又は表３のバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌の再発を有する患者）の応答性を測定することができる。癌患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）におけるバイオマーカーの発現度合いを測定した後、サンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）におけるバイオマーカーの発現度合いと比較することができる。癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いに類似している場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であることが予測される。あるいは、癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと異なっている場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であることが予測される。
癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）の発現度合いはまた、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）におけるバイオマーカーの発現度合いと比較することができる。癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いに類似している場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であることが予測される。あるいは、癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと異なっている場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であることが予測される。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性はまた、バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）の発現度合いを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている（例えば、癌患者集団からの）１つ以上の細胞又は組織、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている（例えば、癌患者集団からの）１つ以上の細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと比較することにより予測することができる。特に、バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いに類似している場合と、バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと異なっている場合に、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いに類似している場合と、バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと異なっている場合に、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
加えて、１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、１つ以上のＳＲＳＦ７（配列番号１）、ＵＣＨＬ１（配列番号２）、ＭＬＬＴ１１（配列番号３）、ＡＤＤ２（配列番号４）、ＡＤＤ２（配列番号５）、ＰＲＭＴ１（配列番号６）、ＳＲＳＦ３（配列番号７）、ＰＲＭＴ５（配列番号８）、ＣＯＣＨ（配列番号９）、ＲＵＶＢＬ１（配列番号１０）、ＭＡＲＣＫＳＬ１（配列番号１１）、ＣＨＥＲＰ（配列番号１２）、ＭＴＳＳ１（配列番号１３）、ＬＳＭ４（配列番号１４）、ＲＡＰＧＥＦ５（配列番号１５）、ＰＲＰＦ４（配列番号１６）、ＬＳＭ４（配列番号１７）、ＤＥＳＩ２（配列番号１８）、ＲＮＰＳ１（配列番号１９）、ＳＮＸ１０（配列番号２０）、ＣＵＬ３（配列番号２１）、ＣＨＤ４（配列番号２２）、ＭＳＨ２（配列番号２３）、ＨＮＲＮＰＭ（配列番号２４）、ＳＲＳＦ１（配列番号２５）、ＮＥＬＬ２（配列番号２６）、ＰＡＩＣＳ（配列番号２７）、ＨＯＸＡ１０（配列番号２８）、ＢＵＢ１Ｂ（配列番号２９）、Ｅ２Ｆ５（配列番号３０）、ＭＡＧＥＤ４ ＭＡＧＥＤ４Ｂ ＳＮＯＲＡ１１Ｄ ＳＮＯＲＡ１１Ｅ（配列番号３１）、ＰＲＰＦ８（配列番号３２）、ＳＯＲＤ（配列番号３３）、ＨＮＲＮＰＵ（配列番号３４）、ＰＥＸ５（配列番号３５）、ＨＹＰＫ ＭＩＲ１２８２ ＳＥＲＦ２ ＳＥＲＦ２－Ｃ１５ＯＲＦ６３（配列番号３６）、ＳＴＲＡＰ（配列番号３７）、ＮＤＵＦＡＢ１（配列番号３８）、ＦＡＲＳＡ（配列番号３９）、ＳＴＯＭＬ２（配列番号４０）、ＥＲＨ（配列番号４１）、ＨＳＢＰ１（配列番号４２）、ＤＤＸ３９Ａ（配列番号４３）、ＯＤＣ１（配列番号４４）、ＴＡＦ５（配列番号４５）、ＴＢＣ１Ｄ３１（配列番号４６）、ＴＲＡ２Ｂ（配列番号４７）、ＮＵＤＣ（配列番号４８）、ＤＤＸ２３（配列番号４９）、ＰＲＰＦ３１（配列番号５０）、ＵＢＥ２Ｓ（配列番号５１）、ＴＣＦ４（配列番号５２）、ＭＬＦ２（配列番号５３）、ＣＣＤＣ１８１（配列番号５４）、ＴＣＦ４（配列番号５５）、ＤＥＳＩ２（配列番号５６）、ＲＰＦ１（配列番号５７）、ＰＡＳＫ（配列番号５８）、ＮＵＰ８８（配列番号５９）、ＲＮＡＳＥＨ２Ａ（配列番号６０）、ＦＢＬ（配列番号６１）、ＬＯＣ１０１９２８７４７ ＲＢＭＸ ＳＮＯＲＤ６１（配列番号６２）、ＮＸＦ１（配列番号６３）、ＰＬＥＫＨＯ１（配列番号６４）、ＧＡＲ１（配列番号６５）、ＲＰＡ１（配列番号６６）、ＺＮＦ２４（配列番号６７）、ＢＯＰ１ ＭＩＲ７１１２（配列番号６８）、ＲＡＢ３Ｂ（配列番号６９）、ＳＬＣ３５Ｇ２（配列番号７０）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号７１）、ＤＫＣ１ ＭＩＲ６６４Ｂ ＳＮＯＲＡ５６（配列番号７２）、ＰＳＭＣ３ＩＰ（配列番号７３）、ＤＮＡＪＣ７（配列番号７４）、ＲＲＰ１Ｂ（配列番号７５）、ＮＭＥ１（配列番号７６）、ＳＮＲＰＡ（配列番号７７）、ＤＢＮ１（配列番号７８）、ＫＩＡＡ００２０（配列番号７９）、ＳＵＰＶ３Ｌ１（配列番号８０）、ＺＮＦ５７３（配列番号８１）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号８２）、ＴＯＸ３（配列番号８３）、ＨＳＰＤ１（配列番号８４）、ＡＣＬＹ（配列番号８５）、ＴＯＸ３（配列番号８６）、ＭＳＡＮＴＤ３－ＴＭＥＦＦ１ ＴＭＥＦＦ１（配列番号８７）、ＡＫＩＲＩＮ１（配列番号８８）、ＵＢＥ２Ｍ（配列番号８９）、ＭＴＦ２（配列番号９０）、ＥＷＳＲ１（配列番号９１）、ＦＡＲＳＡ（配列番号９２）、ＳＫＰ２（配列番号９３）、ＴＭＥＭ９７（配列番号９４）、ＨＮＲＮＰＤ（配列番号９５）、ＩＬＫＡＰ（配列番号９６）、ＮＡＳＰ（配列番号９７）、ＳＮＲＰＤ１（配列番号９８）、ＴＩＭＭ４４（配列番号９９）、ＰＫＮ１（配列番号１００）、ＳＴＡＵ２（配列番号１０１）、ＤＮＡＡＦ２（配列番号１０２）、ＳＮＲＰＤ２（配列番号１０３）、ＦＵＳ（配列番号１０４）、ＰＡＳＫ（配列番号１０５）、ＡＴＰ６Ｖ１Ｇ２－ＤＤＸ３９Ｂ ＤＤＸ３９Ｂ ＳＮＯＲＤ８４（配列番号１０６）、ＰＤＳＳ１（配列番号１０７）、ＮＵＤＣ（配列番号１０８）、ＴＯＸ３（配列番号１０９）、ＴＰＧＳ２（配列番号１１０）、ＳＬＩＲＰ（配列番号１１１）、ＮＣＬ（配列番号１１２）、ＡＮＰ３２Ａ（配列番号１１３）、ＳＡＦＢ（配列番号１１４）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１５）、ＣＥＰ６８（配列番号１１６）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１７）、Ｃ８ｏｒｆ３３（配列番号１１８）、ＭＲＰＬ１１（配列番号１１９）、ＰＯＬＲ２Ｉ（配列番号１２０）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号１２１）、ＭＣＡＭ ＭＩＲ６７５６（配列番号１２２）、ＥＣＳＩＴ（配列番号１２３）、ＭＤＫ（配列番号１２４）、ＰＵＦ６０（配列番号１２５）、ＰＦＮ２（配列番号１２６）、ＳＹＮＣＲＩＰ（配列番号１２７）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号１２８）、ＳＬＣ１６Ａ１（配列番号１２９）、ＰＯＬＲ２Ｈ（配列番号１３０）、ＭＡＰ３Ｋ７（配列番号１３１）、ＣＳＲＰ２（配列番号１３２）、ＢＣＬ１１Ａ（配列番号１３３）、ＰＮＫＰ（配列番号１３４）、ＤＮＡＪＣ６（配列番号１３５）、ＦＤＦＴ１（配列番号１３６）、ＦＡＤＳ１ ＭＩＲ１９０８（配列番号１３７）、ＲＰＡＲＰ－ＡＳ１（配列番号１３８）、ＤＨＲＳ７（配列番号１３９）、ＣＣＮＢ１ＩＰ１（配列番号１４０）、ＣＣＴ３
ＬＯＣ１０１９２７１３７（配列番号１４１）、ＤＤＸ１８（配列番号１４２）、ＡＡＲＳＤ１ ＰＴＧＥＳ３Ｌ ＰＴＧＥＳ３Ｌ－ＡＡＲＳＤ１（配列番号１４３）、ＨＮＲＮＰＤＬ（配列番号１４４）、ＡＴＸＮ７Ｌ３Ｂ（配列番号１４５）、ＭＲＰＳ１４（配列番号１４６）、ＳＯＸ４（配列番号１４７）、ＥＬＯＶＬ２（配列番号１４８）、ＫＣＮＪ８（配列番号１４９）、ＴＲＩＡＰ１（配列番号１５０）、ＥＩＦ２Ｂ１（配列番号１５１）、ＦＢＸＬ１４（配列番号１５２）、ＭＡＰＲＥ２（配列番号１５３）、ＯＲＣ４（配列番号１５４）、ＭＤＮ１（配列番号１５５）、ＫＮＯＰ１（配列番号１５６）、ＫＢＴＢＤ１１（配列番号１５７）、ＦＡＤＳ２（配列番号１５８）、ＲＡＮＢＰ１（配列番号１５９）、ＰＬＥＫＨＢ１（配列番号１６０）、ＨＳＰＥ１（配列番号１６１）、ＴＭＥＭ９７（配列番号１６２）、ＩＴＦＧ２ ＬＯＣ１００５０７４２４（配列番号１６３）、ＳＦＰＱ（配列番号１６４）、ＲＦＣ３（配列番号１６５）、ＳＤＲ３９Ｕ１（配列番号１６６）、ＰＢＫ（配列番号１６７）、ＰＨＢ（配列番号１６８）、ＫＨＤＲＢＳ１（配列番号１６９）、ＰＤＡＰ１（配列番号１７０）、ＳＳＲＰ１（配列番号１７１）、及びＢ３ＧＡＬＴ２（配列番号１７２））及び１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、１つ以上のＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）、ＧＡＤＤ４５Ｂ（配列番号１７５）、ＣＬＩＣ１（配列番号１７６）、ＬＡＳＰ１（配列番号１７７）、ＡＰＯＢＥＣ３Ｂ（配列番号１７９）、ＬＧＡＬＳ１（配列番号１８０）、ＴＡＰＢＰ（配列番号１８１）、ＡＨＮＡＫ（配列番号１８２）、ＢＨＬＨＥ４０（配列番号１８３）、Ｓ１００Ａ１１（配列番号１８４）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１８５）、ＺＢＴＢ３８（配列番号１８６）、ＳＴＡＴ１（配列番号１８７）、ＴＣＩＲＧ１（配列番号１８８）、Ｓ１００Ａ１１Ｐ１（配列番号１８９）、ＣＴＳＡ（配列番号１９０）、ＶＥＧＦＡ（配列番号１９１）、ＳＴＯＭ（配列番号１９２）、Ｐ４ＨＢ（配列番号１９３）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１９４）、ＦＸＹＤ５（配列番号１９５）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９６）、ＹＰＥＬ５（配列番号１９７）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９８）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９９）、ＳＴＯＭ（配列番号２００）、ＰＬＩＮ３（配列番号２０１）、ＲＲＢＰ１（配列番号２０２）、ＩＲＦ１（配列番号２０３）、ＬＭＮＡ（配列番号２０４）、ＮＰＣ２（配列番号２０５）、Ｐ４ＨＢ（配列番号２０６）、ＫＬＦ６（配列番号２０７）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２０８）、ＲＨＯＣ（配列番号２０９）、ＣＤ５９（配列番号２１０）、ＳＲＧＮ（配列番号２１１）、ＳＲＧＮ（配列番号２１２）、ＳＴＡＴ１（配列番号２１３）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２１４）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２１５）、ＰＩＥＺＯ１（配列番号２１６）、ＬＧＡＬＳ３（配列番号２１７）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２１８）、ＣＤ９７（配列番号２１９）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２２０）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２２１）、ＦＮＤＣ３Ｂ ＬＯＣ１０１９２８６１５（配列番号２２２）、ＣＫＬＦ ＣＫＬＦ－ＣＭＴＭ１（配列番号２２３）、ＩＦＩ３５（配列番号２２４）、ＴＩＰＡＲＰ（配列番号２２５）、ＴＡＰ１（配列番号２２６）、ＭＩＣＡＬＬ２（配列番号２２７）、ＲＲＢＰ１（配列番号２２８）、ＺＦＰ３６（配列番号２２９）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２３０）、ＴＮＩＰ１（配列番号２３１）、ＣＤ５９（配列番号２３２）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２３３）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２３４）、ＦＬＮＢ（配列番号２３５）、ＰＳＧ６（配列番号２３６）、ＣＢＸ７（配列番号２３７）、ＲＡＲＲＥＳ３（配列番号２３８）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２３９）、ＳＵＮ２（配列番号２４０）、ＥＨＤ２（配列番号２４１）、ＭＡＰ３Ｋ５（配列番号２４２）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２４３）、ＮＯＬ１２ ＴＲＩＯＢＰ（配列番号２４４）、ＣＫＬＦ（配列番号２４５）、ＡＲＰＣ１Ｂ（配列番号２４６）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２４７）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２４８）、ＲＰ１１－３９５Ｂ７．７（配列番号２４９）、ＥＨＤ２（配列番号２５０）、ＬＥＰＲＯＴ（配列番号２５１）、ＢＴＮ３Ａ２ ＢＴＮ３Ａ３（配列番号２５２）、ＩＮＰＰ４Ｂ（配列番号２５３）、ＤＵＳＰ１（配列番号２５４）、ＥＶＩ２Ａ（配列番号２５５）、ＴＦＰＩ（配列番号２５６）、ＥＨＤ１（配列番号２５７）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２５８）、ＥＰＡＳ１（配列番号２５９）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６０）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２６１）、ＣＬＩＣ３（配列番号２６２）、ＴＦＰＩ（配列番号２６３）、ＮＡＣＣ２（配列番号２６４）、ＴＧＦＢＩ（配列番号２６５）、ＩＥＲ３（配列番号２６６）、ＭＩＣＡ（配列番号２６７）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２６８）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６９）、ＣＮＮ２（配列番号２７０）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７１）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２７２）、ＭＢＮＬ１（配列番号２７３）、ＩＳＧ１５（配列番号２７４）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７５）、ＣＯＰＧ１（配列番号２７６）、ＣＤ９９（配列番号２７７）、ＰＳＭＢ９（配列番号２７８）、ＺＦＰ３６Ｌ１（配列番号２７９）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２８０）、ＳＨＣ１（配列番号２８１）、ＧＳＴＫ１（配列番号２８２）、ＣＡＶ１（配列番号２８３）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号２８４）、ＫＲＴ７（配列番号２８５）、ＴＦＰＩ（配列番号２８６）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号２８７）、ＲＨＯＧ（配列番号２８８）、ＣＤＨ１１（配列番号２８９）、ＡＢＣＣ３（配列番号２９０）、ＣＡＶ１（配列番号２９１）、ＨＬＡ－Ｊ（配列番号２９２）、ＭＹＬ１２Ａ（配列番号２９３）、ＭＲＰＳ１０（配列番号２９４）、ＲＲＡＳ（配列番号２９５）、ＴＭＥＭ２（配列番号２９６）、ＳＩＤＴ２（配列番号２９７）、ＲＡＢ１１ＦＩＰ１（配列番号２９８）、ＲＴＰ４（配列番号２９９）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３００）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号３０１）、ＴＭＥＭ１８９ ＴＭＥＭ１８９－ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ２（配列番号３０２）、ＲＰＮ２（配列番号３０３）、ＩＴＧＡ５（配列番号３０４）、ＣＤＣ４２ＥＰ１（配列番号３０５）、ＢＴＮ３Ａ３（配列番号３０６）、ＯＳＥＲ１（配列番号３０７）、ＣＨＳＴ１５（配列番号３０８）、ＭＤＦＩＣ（配列番号３０９）、ＣＡＶ２（配列番号３１０）、ＣＡＲＤ１０（配列番号３１１）、ＲＡＣ２（配列番号３１２）、ＭＬＰＨ（配列番号３１３）、Ｆ２Ｒ（配列番号３１４）、ＩＣＡＭ３（配列番号３１５）、ＣＲＩＭ１ ＬＯＣ１０１９２９５００（配列番号３１６）、ＩＦＩ１６（配列番号３１７）、ＥＶＩ２Ｂ（配列番号３１８）、ＰＦＫＦＢ３（配列番号３１９）、ＭＩＲ６５１３ ＴＭＢＩＭ１（配列番号３２０）、ＡＰＯＬ３（配列番号３２１）、ＣＤ５５（配列番号３２２



）、ＴＲＡＭ２（配列番号３２３）、Ｓ１００Ａ４（配列番号３２４）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３２５）、ＰＩＰ４Ｋ２Ａ（配列番号３２６）、ＲＰＮ２（配列番号３２７）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３２８）、ＩＦＩＴ３（配列番号３２９）、ＰＬＡＣ８（配列番号３３０）、ＳＤＦ４（配列番号３３１）、ＣＡＶ２（配列番号３３２）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号３３３）、ＭＶＰ（配列番号３３４）、ＲＮＨ１（配列番号３３５）、ＥＩＦ１（配列番号３３６）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３３７）、ＡＳＬ（配列番号３３８）、ＣＤ９９（配列番号３３９）、ＵＳＰ４（配列番号３４０）、ＴＡＣＣ１（配列番号３４１）、ＣＤ５５（配列番号３４２）、ＰＤＸＫ（配列番号３４３）、ＢＳＴ２（配列番号３４４）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３４５）、ＤＵＳＰ５（配列番号３４６）、ＴＮＦＳＦ１３（配列番号３４７）、ＣＯＭＴ（配列番号３４８）、ＣＹＲ６１（配列番号３４９）、ＬＹ６Ｅ（配列番号３５０）、ＡＣＳＬ５（配列番号３５１）、ＧＢＰ２（配列番号３５２）、ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ（配列番号３５３）、ＰＴＲＦ（配列番号３５４）、ＣＹＲ６１（配列番号３５５）、ＢＴＮ３Ａ１（配列番号３５６）、ＰＬＥＣ（配列番号３５７）、ＣＴＮＮＤ１ ＴＭＸ２－ＣＴＮＮＤ１（配列番号３５８）、ＴＮＦＲＳＦ１４（配列番号３５９）、ＡＢＣＣ１０（配列番号３６０）、ＳＥＬＰＬＧ（配列番号３６１）、ＧＰＸ４（配列番号３６２）、ＥＤＥＭ１（配列番号３６３）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号３６４）、ＤＭＢＴ１（配列番号３６５）、ＰＳＭＢ８（配列番号３６６）、ＦＮ１（配列番号３６７）、ＣＯＬ１Ａ１（配列番号３６８）、ＦＯＳ（配列番号３６９）、ＣＹＬＤ（配列番号３７０）、ＡＤＡＭＴＳ１（配列番号３７１）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３７２）、ＧＡＴＡ６（配列番号３７３）、ＹＷＨＡＢ（配列番号３７４）、ＣＩＢ１（配列番号３７５）、ＯＰＴＮ（配列番号３７６）、ＩＦＩ１６（配列番号３７７）、ＣＦＬＡＲ（配列番号３７８）、ＰＴＧＥＲ４（配列番号３７９）、ＣＣＮＤ１（配列番号３８０）、ＰＤＬＩＭ５（配列番号３８１）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号３８２）、ＣＹＰ１Ｂ１（配列番号３８３）、ＳＶＩＬ（配列番号３８４）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号３８５）、ＴＡＧＬＮ２（配列番号３８６）、ＩＦＩ２７（配列番号３８７）、ＦＬＩＩ（配列番号３８８）、ＳＴＡＴ６（配列番号３８９）、ＷＷＰ２（配列番号３９０）、ＦＬＮＣ（配列番号３９１）、ＰＡＲＰ１２（配列番号３９２）、ＶＰＳ１３Ｄ（配列番号３９３）、ＩＦＩＴＭ２（配列番号３９４）、ＣＴＳＺ（配列番号３９５）、Ｃ１９ｏｒｆ１０（配列番号３９６）、ＤＡＰＫ１（配列番号３９７）、ＬＯＣ１０１９２８１８９ ＲＳＲＰ１（配列番号３９８）、ＭＹＯＦ（配列番号３９９）、ＡＴＰ２Ｂ４（配列番号４００）、ＡＸＬ（配列番号４０１）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号４０２）、ＬＹ９６（配列番号４０３）、ＦＮ１（配列番号４０４）、ＣＲＥＢ３Ｌ１（配列番号４０５）、ＴＮＦＳＦ１２－ＴＮＦＳＦ１３
ＴＮＦＳＦ１３（配列番号４０６）、ＰＯＦＵＴ２（配列番号４０７）、ＷＤＲ１（配列番号４０８）、ＳＬＣ７Ａ７（配列番号４０９）、ＭＩＣＢ（配列番号４１０）、ＧＡＴＡ３（配列番号４１１）、ＬＲＲＦＩＰ１（配列番号４１２）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号４１３）、及びＩＴＭ２Ａ（配列番号４１４））を組み合わせて使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を測定することができる。例えば、癌患者の予測される応答性は、例えば、差分スコアから測定され得、これは、表２の１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）と、表３の１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）との間の差分として定義され得る。
次いで、癌患者の差分スコアを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における差分スコアと比較することができる。特に、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアに類似している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。加えて、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアに類似している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。さらに、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
加えて、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して類似している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。また、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して類似している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。さらに、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
加えて、差分スコアが約０．３（例えば、約０．３、約０．３５、約０．４、約０．４５、約０．５、約０．５５、約０．６、約０．６５、約０．７、又はそれ以上）のカットオフ値を上回る場合、癌患者（例えば、癌再発を有する患者）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であると測定され得る。あるいは、差分スコアが約０．３（例えば、約０．２９、約０．２８、約０．２７、約０．２６、約０．２、約０．１５、約０．１、約０．０５、約０．０２、約０．０１、又はそれ以下）のカットオフ値を下回る場合、癌患者（例えば、癌再発を有する患者）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であると測定され得る。
加えて、表２の１つ以上の感度バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）及び／又は表３の１つ以上の耐性バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を予測することができる。癌患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）におけるバイオマーカーの平均スコアを測定した後、サンプルにおけるバイオマーカーの平均スコアを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）におけるバイオマーカーの平均スコアと比較することができる。癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの平均スコアに類似している場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であることが予測される。あるいは、癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの平均スコアと異なっている場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であることが予測される。
癌患者からのサンプルにおける表２の１つ以上の感度バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）及び／又は表３の１つ以上の耐性バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）はまた、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）におけるバイオマーカーの平均スコアと比較することができる。癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの平均スコアに類似している場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であることが予測される。あるいは、癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの平均スコアと異なっている場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であることが予測される。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性はまた、癌患者からのサンプルにおける表２の１つ以上の感度バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）及び／又は表３の１つ以上の耐性バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）を、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている（例えば、癌患者集団からの）１つ以上の細胞又は組織及び２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている（例えば、癌患者集団からの）１つ以上の細胞又は組織におけるバイオマーカーの平均スコアと比較することにより予測することができる。特に、バイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して類似している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。加えて、バイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、バイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して類似している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。さらに、バイオマーカーの平均スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
加えて、表２の１つ以上の感度バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）が約０．３（例えば、約０．３、約０．３５、約０．４、約０．４５、約０．５、約０．５５、約０．６、約０．６５、約０．７、又はそれ以上）のカットオフ値を上回る場合、癌患者（例えば、癌再発を有する患者）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であると測定され得る。あるいは、表２の１つ以上の感度バイオマーカーの平均スコアが約０．３（例えば、約０．２９、約０．２８、約０．２７、約０．２６、約０．２、約０．１５、約０．１、約０．０５、約０．０２、約０．０１、又はそれ以下）のカットオフ値を下回る場合、癌患者（例えば、癌再発を有する患者）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であると測定され得る。加えて、表３の１つ以上の耐性バイオマーカーの平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）が約０．３（例えば、約０．３、約０．３５、約０．４、約０．４５、約０．５、約０．５５、約０．６、約０．６５、約０．７、又はそれ以上）のカットオフ値を上回る場合、癌患者（例えば、癌再発を有する患者）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であると測定され得る。あるいは、表３の１つ以上の耐性バイオマーカーの平均スコアが約０．３（例えば、約０．２９、約０．２８、約０．２７、約０．２６、約０．２、約０．１５、約０．１、約０．０５、約０．０２、約０．０１、又はそれ以下）のカットオフ値を下回る場合、癌患者（例えば、癌再発を有する患者）は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であると測定され得る。
本明細書に記載されているように同定された１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は耐性バイオマーカーを使用して、癌患者から得られた生物学的サンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いを測定することにより、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する応答性を予測することができる。単一のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２及び／又は３のバイオマーカーのいずれか）又はバイオマーカーのセット（例えば、表２及び／又は表３のバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて）（例えば、表２及び／又は表３の上位上位１個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位２個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位３個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位４個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位５個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位１０個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位１５個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位２０個のバイオマーカー、表２及び／又は表３の上位２５個のバイオマーカー、又は表２及び／又は表３のすべてのバイオマーカー））を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を測定することができる。癌患者からのサンプル（例えば、腫瘍サンプル）におけるバイオマーカーの発現度合いを測定した後、サンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）におけるバイオマーカーの発現度合いと比較することができる。癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いに対応している場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であることが予測される。あるいは、癌患者からのサンプル中のバイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織中のバイオマーカーの発現度合いと実質的に異なっている場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であることが予測される。
癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）の発現度合いはまた、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）におけるバイオマーカーの発現度合いと比較することができる。癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いに対応している場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であることが予測される。あるいは、癌患者からのサンプルにおけるバイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと異なっている場合、癌患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であることが予測される。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性はまた、バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）の発現度合いを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている（例えば、癌患者集団からの）１つ以上の細胞又は組織、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている（例えば、癌患者集団からの）１つ以上の細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと比較することにより予測することができる。特に、バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いとを比較して対応している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。さらに、バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いとを比較して対応している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。また、バイオマーカーの発現度合いが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織におけるバイオマーカーの発現度合いとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
加えて、１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、１つ以上のＳＲＳＦ７（配列番号１）、ＵＣＨＬ１（配列番号２）、ＭＬＬＴ１１（配列番号３）、ＡＤＤ２（配列番号４）、ＡＤＤ２（配列番号５）、ＰＲＭＴ１（配列番号６）、ＳＲＳＦ３（配列番号７）、ＰＲＭＴ５（配列番号８）、ＣＯＣＨ（配列番号９）、ＲＵＶＢＬ１（配列番号１０）、ＭＡＲＣＫＳＬ１（配列番号１１）、ＣＨＥＲＰ（配列番号１２）、ＭＴＳＳ１（配列番号１３）、ＬＳＭ４（配列番号１４）、ＲＡＰＧＥＦ５（配列番号１５）、ＰＲＰＦ４（配列番号１６）、ＬＳＭ４（配列番号１７）、ＤＥＳＩ２（配列番号１８）、ＲＮＰＳ１（配列番号１９）、ＳＮＸ１０（配列番号２０）、ＣＵＬ３（配列番号２１）、ＣＨＤ４（配列番号２２）、ＭＳＨ２（配列番号２３）、ＨＮＲＮＰＭ（配列番号２４）、ＳＲＳＦ１（配列番号２５）、ＮＥＬＬ２（配列番号２６）、ＰＡＩＣＳ（配列番号２７）、ＨＯＸＡ１０（配列番号２８）、ＢＵＢ１Ｂ（配列番号２９）、Ｅ２Ｆ５（配列番号３０）、ＭＡＧＥＤ４ ＭＡＧＥＤ４Ｂ ＳＮＯＲＡ１１Ｄ ＳＮＯＲＡ１１Ｅ（配列番号３１）、ＰＲＰＦ８（配列番号３２）、ＳＯＲＤ（配列番号３３）、ＨＮＲＮＰＵ（配列番号３４）、ＰＥＸ５（配列番号３５）、ＨＹＰＫ ＭＩＲ１２８２ ＳＥＲＦ２ ＳＥＲＦ２－Ｃ１５ＯＲＦ６３（配列番号３６）、ＳＴＲＡＰ（配列番号３７）、ＮＤＵＦＡＢ１（配列番号３８）、ＦＡＲＳＡ（配列番号３９）、ＳＴＯＭＬ２（配列番号４０）、ＥＲＨ（配列番号４１）、ＨＳＢＰ１（配列番号４２）、ＤＤＸ３９Ａ（配列番号４３）、ＯＤＣ１（配列番号４４）、ＴＡＦ５（配列番号４５）、ＴＢＣ１Ｄ３１（配列番号４６）、ＴＲＡ２Ｂ（配列番号４７）、ＮＵＤＣ（配列番号４８）、ＤＤＸ２３（配列番号４９）、ＰＲＰＦ３１（配列番号５０）、ＵＢＥ２Ｓ（配列番号５１）、ＴＣＦ４（配列番号５２）、ＭＬＦ２（配列番号５３）、ＣＣＤＣ１８１（配列番号５４）、ＴＣＦ４（配列番号５５）、ＤＥＳＩ２（配列番号５６）、ＲＰＦ１（配列番号５７）、ＰＡＳＫ（配列番号５８）、ＮＵＰ８８（配列番号５９）、ＲＮＡＳＥＨ２Ａ（配列番号６０）、ＦＢＬ（配列番号６１）、ＬＯＣ１０１９２８７４７ ＲＢＭＸ ＳＮＯＲＤ６１（配列番号６２）、ＮＸＦ１（配列番号６３）、ＰＬＥＫＨＯ１（配列番号６４）、ＧＡＲ１（配列番号６５）、ＲＰＡ１（配列番号６６）、ＺＮＦ２４（配列番号６７）、ＢＯＰ１ ＭＩＲ７１１２（配列番号６８）、ＲＡＢ３Ｂ（配列番号６９）、ＳＬＣ３５Ｇ２（配列番号７０）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号７１）、ＤＫＣ１ ＭＩＲ６６４Ｂ ＳＮＯＲＡ５６（配列番号７２）、ＰＳＭＣ３ＩＰ（配列番号７３）、ＤＮＡＪＣ７（配列番号７４）、ＲＲＰ１Ｂ（配列番号７５）、ＮＭＥ１（配列番号７６）、ＳＮＲＰＡ（配列番号７７）、ＤＢＮ１（配列番号７８）、ＫＩＡＡ００２０（配列番号７９）、ＳＵＰＶ３Ｌ１（配列番号８０）、ＺＮＦ５７３（配列番号８１）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号８２）、ＴＯＸ３（配列番号８３）、ＨＳＰＤ１（配列番号８４）、ＡＣＬＹ（配列番号８５）、ＴＯＸ３（配列番号８６）、ＭＳＡＮＴＤ３－ＴＭＥＦＦ１ ＴＭＥＦＦ１（配列番号８７）、ＡＫＩＲＩＮ１（配列番号８８）、ＵＢＥ２Ｍ（配列番号８９）、ＭＴＦ２（配列番号９０）、ＥＷＳＲ１（配列番号９１）、ＦＡＲＳＡ（配列番号９２）、ＳＫＰ２（配列番号９３）、ＴＭＥＭ９７（配列番号９４）、ＨＮＲＮＰＤ（配列番号９５）、ＩＬＫＡＰ（配列番号９６）、ＮＡＳＰ（配列番号９７）、ＳＮＲＰＤ１（配列番号９８）、ＴＩＭＭ４４（配列番号９９）、ＰＫＮ１（配列番号１００）、ＳＴＡＵ２（配列番号１０１）、ＤＮＡＡＦ２（配列番号１０２）、ＳＮＲＰＤ２（配列番号１０３）、ＦＵＳ（配列番号１０４）、ＰＡＳＫ（配列番号１０５）、ＡＴＰ６Ｖ１Ｇ２－ＤＤＸ３９Ｂ ＤＤＸ３９Ｂ ＳＮＯＲＤ８４（配列番号１０６）、ＰＤＳＳ１（配列番号１０７）、ＮＵＤＣ（配列番号１０８）、ＴＯＸ３（配列番号１０９）、ＴＰＧＳ２（配列番号１１０）、ＳＬＩＲＰ（配列番号１１１）、ＮＣＬ（配列番号１１２）、ＡＮＰ３２Ａ（配列番号１１３）、ＳＡＦＢ（配列番号１１４）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１５）、ＣＥＰ６８（配列番号１１６）、ＳＴＩＰ１（配列番号１１７）、Ｃ８ｏｒｆ３３（配列番号１１８）、ＭＲＰＬ１１（配列番号１１９）、ＰＯＬＲ２Ｉ（配列番号１２０）、ＦＡＭ１３４Ｂ（配列番号１２１）、ＭＣＡＭ ＭＩＲ６７５６（配列番号１２２）、ＥＣＳＩＴ（配列番号１２３）、ＭＤＫ（配列番号１２４）、ＰＵＦ６０（配列番号１２５）、ＰＦＮ２（配列番号１２６）、ＳＹＮＣＲＩＰ（配列番号１２７）、ＴＳＰＡＮ３（配列番号１２８）、ＳＬＣ１６Ａ１（配列番号１２９）、ＰＯＬＲ２Ｈ（配列番号１３０）、ＭＡＰ３Ｋ７（配列番号１３１）、ＣＳＲＰ２（配列番号１３２）、ＢＣＬ１１Ａ（配列番号１３３）、ＰＮＫＰ（配列番号１３４）、ＤＮＡＪＣ６（配列番号１３５）、ＦＤＦＴ１（配列番号１３６）、ＦＡＤＳ１ ＭＩＲ１９０８（配列番号１３７）、ＲＰＡＲＰ－ＡＳ１（配列番号１３８）、ＤＨＲＳ７（配列番号１３９）、ＣＣＮＢ１ＩＰ１（配列番号１４０）、ＣＣＴ３
ＬＯＣ１０１９２７１３７（配列番号１４１）、ＤＤＸ１８（配列番号１４２）、ＡＡＲＳＤ１ ＰＴＧＥＳ３Ｌ ＰＴＧＥＳ３Ｌ－ＡＡＲＳＤ１（配列番号１４３）、ＨＮＲＮＰＤＬ（配列番号１４４）、ＡＴＸＮ７Ｌ３Ｂ（配列番号１４５）、ＭＲＰＳ１４（配列番号１４６）、ＳＯＸ４（配列番号１４７）、ＥＬＯＶＬ２（配列番号１４８）、ＫＣＮＪ８（配列番号１４９）、ＴＲＩＡＰ１（配列番号１５０）、ＥＩＦ２Ｂ１（配列番号１５１）、ＦＢＸＬ１４（配列番号１５２）、ＭＡＰＲＥ２（配列番号１５３）、ＯＲＣ４（配列番号１５４）、ＭＤＮ１（配列番号１５５）、ＫＮＯＰ１（配列番号１５６）、ＫＢＴＢＤ１１（配列番号１５７）、ＦＡＤＳ２（配列番号１５８）、ＲＡＮＢＰ１（配列番号１５９）、ＰＬＥＫＨＢ１（配列番号１６０）、ＨＳＰＥ１（配列番号１６１）、ＴＭＥＭ９７（配列番号１６２）、ＩＴＦＧ２ ＬＯＣ１００５０７４２４（配列番号１６３）、ＳＦＰＱ（配列番号１６４）、ＲＦＣ３（配列番号１６５）、ＳＤＲ３９Ｕ１（配列番号１６６）、ＰＢＫ（配列番号１６７）、ＰＨＢ（配列番号１６８）、ＫＨＤＲＢＳ１（配列番号１６９）、ＰＤＡＰ１（配列番号１７０）、ＳＳＲＰ１（配列番号１７１）、及びＢ３ＧＡＬＴ２（配列番号１７２））及び１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、１つ以上のＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）、ＧＡＤＤ４５Ｂ（配列番号１７５）、ＣＬＩＣ１（配列番号１７６）、ＬＡＳＰ１（配列番号１７７）、ＡＰＯＢＥＣ３Ｂ（配列番号１７９）、ＬＧＡＬＳ１（配列番号１８０）、ＴＡＰＢＰ（配列番号１８１）、ＡＨＮＡＫ（配列番号１８２）、ＢＨＬＨＥ４０（配列番号１８３）、Ｓ１００Ａ１１（配列番号１８４）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１８５）、ＺＢＴＢ３８（配列番号１８６）、ＳＴＡＴ１（配列番号１８７）、ＴＣＩＲＧ１（配列番号１８８）、Ｓ１００Ａ１１Ｐ１（配列番号１８９）、ＣＴＳＡ（配列番号１９０）、ＶＥＧＦＡ（配列番号１９１）、ＳＴＯＭ（配列番号１９２）、Ｐ４ＨＢ（配列番号１９３）、ＬＩＴＡＦ（配列番号１９４）、ＦＸＹＤ５（配列番号１９５）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９６）、ＹＰＥＬ５（配列番号１９７）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９８）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号１９９）、ＳＴＯＭ（配列番号２００）、ＰＬＩＮ３（配列番号２０１）、ＲＲＢＰ１（配列番号２０２）、ＩＲＦ１（配列番号２０３）、ＬＭＮＡ（配列番号２０４）、ＮＰＣ２（配列番号２０５）、Ｐ４ＨＢ（配列番号２０６）、ＫＬＦ６（配列番号２０７）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２０８）、ＲＨＯＣ（配列番号２０９）、ＣＤ５９（配列番号２１０）、ＳＲＧＮ（配列番号２１１）、ＳＲＧＮ（配列番号２１２）、ＳＴＡＴ１（配列番号２１３）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２１４）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２１５）、ＰＩＥＺＯ１（配列番号２１６）、ＬＧＡＬＳ３（配列番号２１７）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２１８）、ＣＤ９７（配列番号２１９）、ＨＬＡ－Ｂ（配列番号２２０）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２２１）、ＦＮＤＣ３Ｂ ＬＯＣ１０１９２８６１５（配列番号２２２）、ＣＫＬＦ ＣＫＬＦ－ＣＭＴＭ１（配列番号２２３）、ＩＦＩ３５（配列番号２２４）、ＴＩＰＡＲＰ（配列番号２２５）、ＴＡＰ１（配列番号２２６）、ＭＩＣＡＬＬ２（配列番号２２７）、ＲＲＢＰ１（配列番号２２８）、ＺＦＰ３６（配列番号２２９）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２３０）、ＴＮＩＰ１（配列番号２３１）、ＣＤ５９（配列番号２３２）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２３３）、ＬＤＬＲＡＰ１（配列番号２３４）、ＦＬＮＢ（配列番号２３５）、ＰＳＧ６（配列番号２３６）、ＣＢＸ７（配列番号２３７）、ＲＡＲＲＥＳ３（配列番号２３８）、ＣＦＬＡＲ（配列番号２３９）、ＳＵＮ２（配列番号２４０）、ＥＨＤ２（配列番号２４１）、ＭＡＰ３Ｋ５（配列番号２４２）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２４３）、ＮＯＬ１２ ＴＲＩＯＢＰ（配列番号２４４）、ＣＫＬＦ（配列番号２４５）、ＡＲＰＣ１Ｂ（配列番号２４６）、ＴＮＦＳＦ１０（配列番号２４７）、ＨＬＡ－Ｇ（配列番号２４８）、ＲＰ１１－３９５Ｂ７．７（配列番号２４９）、ＥＨＤ２（配列番号２５０）、ＬＥＰＲＯＴ（配列番号２５１）、ＢＴＮ３Ａ２ ＢＴＮ３Ａ３（配列番号２５２）、ＩＮＰＰ４Ｂ（配列番号２５３）、ＤＵＳＰ１（配列番号２５４）、ＥＶＩ２Ａ（配列番号２５５）、ＴＦＰＩ（配列番号２５６）、ＥＨＤ１（配列番号２５７）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２５８）、ＥＰＡＳ１（配列番号２５９）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６０）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２６１）、ＣＬＩＣ３（配列番号２６２）、ＴＦＰＩ（配列番号２６３）、ＮＡＣＣ２（配列番号２６４）、ＴＧＦＢＩ（配列番号２６５）、ＩＥＲ３（配列番号２６６）、ＭＩＣＡ（配列番号２６７）、ＢＴＮ３Ａ２（配列番号２６８）、ＩＱＧＡＰ１（配列番号２６９）、ＣＮＮ２（配列番号２７０）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７１）、ＶＥＧＦＡ（配列番号２７２）、ＭＢＮＬ１（配列番号２７３）、ＩＳＧ１５（配列番号２７４）、ＴＮＦＡＩＰ８（配列番号２７５）、ＣＯＰＧ１（配列番号２７６）、ＣＤ９９（配列番号２７７）、ＰＳＭＢ９（配列番号２７８）、ＺＦＰ３６Ｌ１（配列番号２７９）、ＩＬ６ＳＴ（配列番号２８０）、ＳＨＣ１（配列番号２８１）、ＧＳＴＫ１（配列番号２８２）、ＣＡＶ１（配列番号２８３）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号２８４）、ＫＲＴ７（配列番号２８５）、ＴＦＰＩ（配列番号２８６）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号２８７）、ＲＨＯＧ（配列番号２８８）、ＣＤＨ１１（配列番号２８９）、ＡＢＣＣ３（配列番号２９０）、ＣＡＶ１（配列番号２９１）、ＨＬＡ－Ｊ（配列番号２９２）、ＭＹＬ１２Ａ（配列番号２９３）、ＭＲＰＳ１０（配列番号２９４）、ＲＲＡＳ（配列番号２９５）、ＴＭＥＭ２（配列番号２９６）、ＳＩＤＴ２（配列番号２９７）、ＲＡＢ１１ＦＩＰ１（配列番号２９８）、ＲＴＰ４（配列番号２９９）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３００）、ＳＰＴＢＮ１（配列番号３０１）、ＴＭＥＭ１８９ ＴＭＥＭ１８９－ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ１ ＵＢＥ２Ｖ２（配列番号３０２）、ＲＰＮ２（配列番号３０３）、ＩＴＧＡ５（配列番号３０４）、ＣＤＣ４２ＥＰ１（配列番号３０５）、ＢＴＮ３Ａ３（配列番号３０６）、ＯＳＥＲ１（配列番号３０７）、ＣＨＳＴ１５（配列番号３０８）、ＭＤＦＩＣ（配列番号３０９）、ＣＡＶ２（配列番号３１０）、ＣＡＲＤ１０（配列番号３１１）、ＲＡＣ２（配列番号３１２）、ＭＬＰＨ（配列番号３１３）、Ｆ２Ｒ（配列番号３１４）、ＩＣＡＭ３（配列番号３１５）、ＣＲＩＭ１ ＬＯＣ１０１９２９５００（配列番号３１６）、ＩＦＩ１６（配列番号３１７）、ＥＶＩ２Ｂ（配列番号３１８）、ＰＦＫＦＢ３（配列番号３１９）、ＭＩＲ６５１３ ＴＭＢＩＭ１（配列番号３２０）、ＡＰＯＬ３（配列番号３２１）、ＣＤ５５（配列番号３２２



）、ＴＲＡＭ２（配列番号３２３）、Ｓ１００Ａ４（配列番号３２４）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３２５）、ＰＩＰ４Ｋ２Ａ（配列番号３２６）、ＲＰＮ２（配列番号３２７）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３２８）、ＩＦＩＴ３（配列番号３２９）、ＰＬＡＣ８（配列番号３３０）、ＳＤＦ４（配列番号３３１）、ＣＡＶ２（配列番号３３２）、ＨＬＡ－Ｃ（配列番号３３３）、ＭＶＰ（配列番号３３４）、ＲＮＨ１（配列番号３３５）、ＥＩＦ１（配列番号３３６）、ＳＥＲＰＩＮＢ１（配列番号３３７）、ＡＳＬ（配列番号３３８）、ＣＤ９９（配列番号３３９）、ＵＳＰ４（配列番号３４０）、ＴＡＣＣ１（配列番号３４１）、ＣＤ５５（配列番号３４２）、ＰＤＸＫ（配列番号３４３）、ＢＳＴ２（配列番号３４４）、ＬＯＣ１０１９２８９１６ ＮＮＭＴ（配列番号３４５）、ＤＵＳＰ５（配列番号３４６）、ＴＮＦＳＦ１３（配列番号３４７）、ＣＯＭＴ（配列番号３４８）、ＣＹＲ６１（配列番号３４９）、ＬＹ６Ｅ（配列番号３５０）、ＡＣＳＬ５（配列番号３５１）、ＧＢＰ２（配列番号３５２）、ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ（配列番号３５３）、ＰＴＲＦ（配列番号３５４）、ＣＹＲ６１（配列番号３５５）、ＢＴＮ３Ａ１（配列番号３５６）、ＰＬＥＣ（配列番号３５７）、ＣＴＮＮＤ１ ＴＭＸ２－ＣＴＮＮＤ１（配列番号３５８）、ＴＮＦＲＳＦ１４（配列番号３５９）、ＡＢＣＣ１０（配列番号３６０）、ＳＥＬＰＬＧ（配列番号３６１）、ＧＰＸ４（配列番号３６２）、ＥＤＥＭ１（配列番号３６３）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号３６４）、ＤＭＢＴ１（配列番号３６５）、ＰＳＭＢ８（配列番号３６６）、ＦＮ１（配列番号３６７）、ＣＯＬ１Ａ１（配列番号３６８）、ＦＯＳ（配列番号３６９）、ＣＹＬＤ（配列番号３７０）、ＡＤＡＭＴＳ１（配列番号３７１）、ＡＬＤＯＡ（配列番号３７２）、ＧＡＴＡ６（配列番号３７３）、ＹＷＨＡＢ（配列番号３７４）、ＣＩＢ１（配列番号３７５）、ＯＰＴＮ（配列番号３７６）、ＩＦＩ１６（配列番号３７７）、ＣＦＬＡＲ（配列番号３７８）、ＰＴＧＥＲ４（配列番号３７９）、ＣＣＮＤ１（配列番号３８０）、ＰＤＬＩＭ５（配列番号３８１）、ＨＬＡ－Ｆ（配列番号３８２）、ＣＹＰ１Ｂ１（配列番号３８３）、ＳＶＩＬ（配列番号３８４）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号３８５）、ＴＡＧＬＮ２（配列番号３８６）、ＩＦＩ２７（配列番号３８７）、ＦＬＩＩ（配列番号３８８）、ＳＴＡＴ６（配列番号３８９）、ＷＷＰ２（配列番号３９０）、ＦＬＮＣ（配列番号３９１）、ＰＡＲＰ１２（配列番号３９２）、ＶＰＳ１３Ｄ（配列番号３９３）、ＩＦＩＴＭ２（配列番号３９４）、ＣＴＳＺ（配列番号３９５）、Ｃ１９ｏｒｆ１０（配列番号３９６）、ＤＡＰＫ１（配列番号３９７）、ＬＯＣ１０１９２８１８９ ＲＳＲＰ１（配列番号３９８）、ＭＹＯＦ（配列番号３９９）、ＡＴＰ２Ｂ４（配列番号４００）、ＡＸＬ（配列番号４０１）、ＭＩＲ６７８７ ＳＬＣ１６Ａ３（配列番号４０２）、ＬＹ９６（配列番号４０３）、ＦＮ１（配列番号４０４）、ＣＲＥＢ３Ｌ１（配列番号４０５）、ＴＮＦＳＦ１２－ＴＮＦＳＦ１３
ＴＮＦＳＦ１３（配列番号４０６）、ＰＯＦＵＴ２（配列番号４０７）、ＷＤＲ１（配列番号４０８）、ＳＬＣ７Ａ７（配列番号４０９）、ＭＩＣＢ（配列番号４１０）、ＧＡＴＡ３（配列番号４１１）、ＬＲＲＦＩＰ１（配列番号４１２）、ＲＮＡＳＥＴ２（配列番号４１３）、及びＩＴＭ２Ａ（配列番号４１４））を組み合わせて使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を測定することができる。例えば、癌患者の予測される応答性は、例えば、差分スコアから測定され得、これは、表２の１つ以上の感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））の平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）と、表３の１つ以上の耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））の平均スコア（すなわち、発現度合いの平均）との間の差分として定義され得る。
次いで、癌患者の差分スコアを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における差分スコアと比較することができる。特に、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアに対応している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。加えて、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアに対応している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。また、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容される治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
加えて、差分スコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して対応している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。さらに、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。あるいは、差分スコアが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して対応している場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。さらに、差分スコアが実質的に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアと、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における差分スコアとを比較して異なっている場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して非応答性であり得る。
あるいは、差分スコアが、患者と同じ診断を受けた参照集団における５０パーセンタイルのカットオフ値を上回るか、又はそれ以上である（例えば、差分スコアは、６０パーセンタイル、７０パーセンタイル、又は８０パーセンタイルのカットオフ値を上回るか、又はそれ以上である）場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性であり得る。
好ましくは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度又は耐性のいずれかを有することが知られている細胞又は組織は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して未知の応答性を有する癌患者と同じ癌の種類のものである。例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度又は耐性のいずれかを有することが知られている癌患者及び細胞又は組織は両方とも、例えば、骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、結腸直腸癌（例えば、大腸癌及び直腸癌）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤白血病、及び慢性白血病）、骨髄異形成症候群、リンパ腫（例えば、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及びリンパ球性リンパ腫）、子宮頸癌、前立腺癌、食道癌、骨髄腫、神経膠腫（例えば、乏突起膠腫）、膵癌（例えば、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様腺癌、コロイド腺癌、膵島細胞癌、及び膵臓神経内分泌癌）、卵巣癌（例えば、卵巣腺癌又は胚性癌腫）、消化管間質腫瘍、肉腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、平滑筋肉腫、ユーイング肉腫、及び横紋筋肉腫）、乳癌（例えば、髄様癌）、ＥＲ陽性癌、膀胱癌、頭頸部癌（例えば、頭頸部の扁平上皮癌）、肺癌（例えば、非小細胞肺癌、大細胞癌、気管支原性癌、及び乳頭腺癌）、転移性癌、口腔癌、子宮癌、精巣癌（例えば、精上皮腫及び胚性癌腫）、皮膚癌（例えば、扁平上皮癌及び基底細胞癌）、甲状腺癌（例えば、乳頭癌及び髄様癌）、脳癌（例えば、星状細胞腫及び頭蓋咽頭癌）、胃癌、上皮内癌、骨癌、胆道癌、眼癌、肝癌（例えば、肝細胞癌又は肝腫）、喉頭癌、腎臓癌（例えば、腎細胞癌及びウィルムス腫瘍）、胃癌、芽細胞腫（例えば、腎芽細胞腫、髄芽細胞腫、血管芽細胞腫、神経芽細胞腫、及び網膜芽細胞腫）、真性多血症、脊索腫、滑膜腫、中皮腫、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、嚢胞腺癌、胆管癌、絨毛癌、上皮癌、上衣腫、松果体腫、聴神経腫、神経鞘腫、髄膜腫、下垂体腺腫、神経鞘腫瘍、小腸の癌、内分泌系の癌、陰茎の癌、尿道の癌、皮膚又は眼内黒色腫、婦人科腫瘍、小児の充実性腫瘍、及び中枢神経系などの血液学的癌又は充実性腫瘍から選択される癌の種類を有し得る。特に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性又は感度を有することが知られている患者及び細胞又は組織の癌は、例えば、多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）である。特に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して既知の耐性又は感度を有する患者及び細胞又は組織の癌は、エストロゲン受容体陽性（ＥＲ ｐｏｓ）乳癌であり得る。特定の例では、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して既知の耐性又は感度を有する患者及び細胞又は組織の癌は、乳癌の転移性形態であり得る。あるいは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して既知の耐性又は感度を有する患者及び細胞又は組織の癌は、卵巣癌であり得る。追加の実施形態では、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して既知の耐性又は感度を有する患者及び細胞又は組織の癌は、膵癌であり得る。
ニューラルネットワーク、サポートベクターマシン、Ｋ最近傍法、及び最近重心法などの機械学習技術を用いて、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度を有する患者と２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して耐性を有する患者とを、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性の分類を各患者に割り当てるモデル変数としてのバイオマーカー発現を使用して判別するモデルを開発することができる。様々な測定値を使用して患者を分類するために使用される機械学習技術は、米国特許第５，８２２，７１５号；米国特許出願公開第２００３／００７３０８３号、２００５／０２２７２６６号、２００５／０２０８５１２号、２００５／０１２３９４５号、２００３／０１２９６２９号、及び２００２／０００６６１３号；及びＶａｐｎｉｋ Ｖ Ｎ．Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｌｅａｒｎｉｎｇ Ｔｈｅｏｒｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９８；Ｈａｓｔｉｅ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｔｈｅ Ｅｌｅｍｅｎｔｓ ｏｆ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｌｅａｒｎｉｎｇ：Ｄａｔａ Ｍｉｎｉｎｇ，Ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ，ａｎｄ
Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，Ｎ．Ｙ．；Ａｇｒｅｓｔｉ，１９９６，Ａｎ Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｔｏ Ｃａｔｅｇｏｒｉｃａｌ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ；Ｖ．Ｔｒｅｓｐ ｅｔ ａｌ．，「Ｎｅｕｒａｌ Ｎｅｔｗｏｒｋ Ｍｏｄｅｌｉｎｇ ｏｆ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｐｒｏｃｅｓｓｅｓ，Ｈａｎｓｏｎ Ｓ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．（Ｅｄｓ．），Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｌｅａｒｎｉｎｇ Ｔｈｅｏｒｙ ａｎｄ Ｎａｔｕｒａｌ Ｌｅａｒｎｉｎｇ Ｓｙｓｔｅｍｓ ２，ＭＩＴ Ｐｒｅｓｓ，１９９４に記載されており、各文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
感度バイオマーカーと耐性バイオマーカー
表２及び／又は表３の１つ以上のバイオマーカーの発現度合いを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を測定することができる。特定の実施形態では、感度バイオマーカーは、表２からの（ａ）配列番号１～２５の１つ以上；（ｂ）配列番号２６～５０の１つ以上；（ｃ）配列番号５１～７５の１つ以上；（ｄ）配列番号７６～１００の１つ以上；（ｅ）配列番号１０１～１２５の１つ以上；（ｆ）配列番号１２６～１５０の１つ以上；（ｇ）配列番号１５１～１７２の１つ以上；及び／又は（ｈ）配列番号１～１７２の１つ以上から選択され得る。さらに、特定の実施形態では、耐性バイオマーカーは、表３の（ａ）配列番号１７３～２００の１つ以上；（ｂ）配列番号２０１～２２５の１つ以上；（ｃ）配列番号２２６～２５０の１つ以上；（ｄ）配列番号２５１～２７５の１つ以上；（ｅ）配列番号２７６～３００の１つ以上；（ｆ）配列番号３０１～３２５の１つ以上；（ｇ）配列番号３２６～３５０の１つ以上；（ｈ）配列番号３５１～３７５の１つ以上；（ｉ）配列番号３７６～４００の１つ以上；（ｊ）配列番号４０１～４１４の１つ以上；及び／又は（ｋ）配列番号１７３～４１４の１つ以上から選択され得る。特定の実施形態では、少なくとも１個（例えば、少なくとも１個、少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、又は少なくとも１７２個（例えば、少なくとも上位１個、少なくとも上位５個、少なくとも上位１０個、少なくとも上位１５個、少なくとも上位２０個、少なくとも上位２５個、少なくとも上位３０個、少なくとも上位３５個、少なくとも上位４０個、少なくとも上位４５個、少なくとも上位５０個、少なくとも上位５５個、少なくとも上位６０個、少なくとも上位６５個、少なくとも上位７０個、少なくとも上位７５個、少なくとも上位８０個、少なくとも上位８５個、少なくとも上位９０個、少なくとも上位９５個、少なくとも上位１００個、少なくとも上位１０５個、少なくとも上位１１０個、少なくとも上位１１５個、少なくとも上位１２０個、少なくとも上位１２５個、少なくとも上位１３０個、少なくとも上位１３５個、少なくとも上位１４０個、少なくとも上位１４５個、少なくとも上位１５０個、少なくとも上位１５５個、少なくとも上位１６０個、少なくとも上位１６５個、少なくとも上位１７０個、又は少なくとも上位１７２個））の、表２の感度バイオマーカー、及び／又は少なくとも１個（例えば、少なくとも１個、少なくとも５個、少なくとも１０個、少なくとも１５個、少なくとも２０個、少なくとも２５個、少なくとも３０個、少なくとも３５個、少なくとも４０個、少なくとも４５個、少なくとも５０個、少なくとも５５個、少なくとも６０個、少なくとも６５個、少なくとも７０個、少なくとも７５個、少なくとも８０個、少なくとも８５個、少なくとも９０個、少なくとも９５個、少なくとも１００個、少なくとも１０５個、少なくとも１１０個、少なくとも１１５個、少なくとも１２０個、少なくとも１２５個、少なくとも１３０個、少なくとも１３５個、少なくとも１４０個、少なくとも１４５個、少なくとも１５０個、少なくとも１５５個、少なくとも１６０個、少なくとも１６５個、少なくとも１７０個、少なくとも１７５個、少なくとも１８０個、少なくとも１８５個、少なくとも１９０個、少なくとも１９５個、少なくとも２００個、少なくとも２０５個、少なくとも２１０個、少なくとも２１５個、少なくとも２２０個、少なくとも２２５個、少なくとも２３０個、少なくとも２３５個、少なくとも２４０個、又は少なくとも２４２個（例えば、少なくとも上位１個、少なくとも上位５個、少なくとも上位１０個、少なくとも上位１５個、少なくとも上位２０個、少なくとも上位２５個、少なくとも上位３０個、少なくとも上位３５個、少なくとも上位４０個、少なくとも上位４５個、少なくとも上位５０個、少なくとも上位５５個、少なくとも上位６０個、少なくとも上位６５個、少なくとも上位７０個、少なくとも上位７５個、少なくとも上位８０個、少なくとも上位８５個、少なくとも上位９０個、少なくとも上位９５個、少なくとも上位１００個、少なくとも上位１０５個、少なくとも上位１１０個、少なくとも上位１１５個、少なくとも上位１２０個、少なくとも上位１２５個、少なくとも上位１３０個、少なくとも上位１３５個、少なくとも上位１４０個、少なくとも上位１４５個、少なくとも上位１５０個、少なくとも上位１５５個、少なくとも上位１６０個、少なくとも上位１６５個、少なくとも上位１７０個、少なくとも上位１７５個、少なくとも上位１８０個、少なくとも上位１８５個、少なくとも上位１９０個、少なくとも上位１９５個、少なくとも上位２００個、少なくとも上位２０５個、少なくとも上位２１０個、少なくとも上位２１５個、少なくとも上位２２０個、少なくとも上位２２５個、少なくとも上位２３０個、少なくとも上位２３５個、少なくとも上位２４０個、又は少なくとも上位２４２個）の、表３の耐性バイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を測定することができる。より具体的な実施形態では、表２からの１つの感度バイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１））、及び／又は表３からの１つの耐性バイオマーカー（例えば、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８））を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を測定することができる。感度を有すると判断されたら、患者は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩により治療することができる。
特に、配列番号１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌又はその再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１、３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１、２、４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３、５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４、６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５、７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６、８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７、９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８、１０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９、１１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０、１２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１、１３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２、１４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３、１５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４、１６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５、１７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６、１８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７、１９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８、２０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９、２１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０、２２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１、２３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２、２４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３、２５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４、２６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５、２７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６、２８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７、２９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８、３０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９、３１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０、３２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１、３３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２、３４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３、３５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４、３６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５、３７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６、３８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７、３９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８、４０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９、４１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０、４２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４１、４３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番４３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４２、４４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４３、４５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４４、４６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４５、４７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４６、４８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４７、４９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４８、５０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４９、５１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５０、５２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５１、５３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５２、５４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５３、５５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５４、５６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５５、５７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５６、５８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５７、５９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号５９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号５９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号５９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号５９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号５９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５８、６０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～５９、６１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６０、６２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６１、６３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６２、６４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６３、６５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６４、６６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６５、６７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６６、６８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６７、６９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号６９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号６９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号６９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号６９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号６９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６８、７０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～６９、７１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７０、７２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７１、７３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７２、７４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７３、７５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７４、７６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７５、７７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７６、７８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７７、７９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号７９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号７９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号７９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号７９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号７９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７８、８０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～７９、８１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８０、８２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８１、８３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８２、８４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８３、８５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８４、８６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８５、８７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８６、８８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８７、８９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号８９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号８９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号８９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号８９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号８９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８８、９０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～８９、９１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９０、９２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９１、９３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９２、９４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９３、９５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９４、９６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９５、９７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９６、９８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９７、９９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号９９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号９９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号９９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号９９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号９９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９８、１００～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１００のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１００のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１００のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１００のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１００のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～９９、１０１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１００、１０２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０１、１０３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０２、１０４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０３、１０５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０４、１０６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０５、１０７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０６、１０８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０７、１０９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１０９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１０９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１０９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１０９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１０９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０８、１１０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１０９、１１１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１０、１１２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１１、１１３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１２、１１４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１３、１１５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１４、１１６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１５、１１７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１６、１１８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１７、１１９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１１９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１１９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１１９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１１９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１１９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１８、１２０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１１９、１２１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２０、１２２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２１、１２３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２２、１２４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２３、１２５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２４、１２６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２５、１２７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２６、１２８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２７、１２９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１２９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１２９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１２９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１２９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１２９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２８、１３０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１２９、１３１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３０、１３２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３１、１３３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３２、１３４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３３、１３５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３４、１３６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３５、１３７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３６、１３８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３７、１３９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１３９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１３９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１３９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１３９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１３９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３８、１４０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１３９、１４１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４０、１４２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４１、１４３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４２、１４４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４３、１４５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４４、１４６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４５、１４７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４６、１４８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１４９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１４９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１４９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１４９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１４９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４８、１５０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１４９、１５１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５０、１５２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５１、１５３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５２、１５４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５４、１５６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５５、１５７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５６、１５８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５７、１５９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１５９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１５９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１５９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１５９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１５９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５８、１６０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１５９、１６１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６０、１６２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６１、１６３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６２、１６４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６３、１６５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６４、１６６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６５、１６７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６６、１６８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６７、１６９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１６９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１６９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１６９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１６９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１６９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６８、１７０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１６９、１７１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７０、１７２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７１、１７３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７２、１７４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７３、１７５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７４、１７６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７５、１７７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７６、１７８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７７、１７９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１７９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１７９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１７９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１７９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１７９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７８、１８０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１７９、１８１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８０、１８２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８１、１８３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８２、１８４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８３、１８５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８４、１８６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８５、１８７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８６、１８８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８７、１８９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１８９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１８９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１８９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１８９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１８９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８８、１９０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１８９、１９１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９０、１９２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９１、１９３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９２、１９４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９３、１９５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９４、１９６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９５、１９７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９６、１９８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９７、１９９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号１９９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号１９９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号１９９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号１９９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号１９９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９８、２００～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２００のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２００のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２００のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２００のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２００のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～１９９、２０１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２００、２０２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０１、２０３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０２、２０４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０３、２０５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０４、２０６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができるffffffffffffffffffffffffffffff。配列番号２０６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０５、２０７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０６、２０８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０７、２０９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２０９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２０９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２０９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２０９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２０９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０８、２１０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２０９、２１１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１０、２１２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１１、２１３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１２、２１４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１３、２１５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１４、２１６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１５、２１７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１６、２１８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１７、２１９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２１９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２１９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２１９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２１９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２１９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１８、２２０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２１９、２２１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２０、２２２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２１、２２３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２２、２２４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２３、２２５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２４、２２６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２５、２２７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２６、２２８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２７、２２９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２２９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２２９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２２９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２２９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２２９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２８、２３０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２２９、２３１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３０、２３２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３１、２３３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３２、２３４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３３、２３５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３４、２３６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３５、２３７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３６、２３８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３７、２３９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２３９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２３９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２３９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２３９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２３９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３８、２４０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２３９、２４１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４０、２４２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４１、２４３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４２、２４４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４３、２４５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４４、２４６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４５、２４７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４６、２４８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４７、２４９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２４９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２４９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２４９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２４９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２４９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４８、２５０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２４９、２５１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５０、２５２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５１、２５３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５２、２５４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５３、２５５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５４、２５６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５５、２５７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５６、２５８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５７、２５９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２５９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２５９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２５９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２５９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２５９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５８、２６０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２５９、２６１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６０、２６２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６１、２６３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６２、２６４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６３、２６５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６４、２６６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６５、２６７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６６、２６８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６７、２６９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２６９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２６９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２６９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２６９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２６９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６８、２７０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２６９、２７１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７０、２７２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７１、２７３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７２、２７４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７３、２７５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７４、２７６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７５、２７７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７６、２７８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７７、２７９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２７９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２７９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２７９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２７９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２７９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７８、２８０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２７９、２８１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８０、２８２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８１、２８３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８２、２８４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８３、２８５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８４、２８６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８５、２８７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８６、２８８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８７、２８９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２８９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２８９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２８９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２８９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２８９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８８、２９０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２８９、２９１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９０、２９２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９１、２９３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９２、２９４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９３、２９５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９４、２９６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９５、２９７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９６、２９８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９７、２９９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号２９９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号２９９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号２９９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号２９９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号２９９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９８、３００～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３００のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３００のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３００のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３００のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３００のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～２９９、３０１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３００、３０２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０１、３０３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０２、３０４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０３、３０５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０４、３０６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０５、３０７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０６、３０８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０７、３０９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３０９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３０９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３０９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３０９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３０９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０８、３１０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３０９、３１１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１０、３１２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１１、３１３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１２、３１４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１３、３１５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１４、３１６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１５、３１７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１６、３１８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１７、３１９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３１９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３１９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３１９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３１９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３１９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１８、３２０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３１９、３２１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２０、３２２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２１、３２３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２２、３２４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２３、３２５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２４、３２６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２５、３２７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２６、３２８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２７、３２９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３２９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３２９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３２９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３２９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３２９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２８、３３０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３２９、３３１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３０、３３２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３１、３３３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３２、３３４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３３、３３５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３４、３３６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３５、３３７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３６、３３８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３７、３３９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３３９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３３９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３３９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３３９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３３９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３８、３４０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３３９、３４１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４０、３４２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４１、３４３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４２、３４４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４３、３４５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４４、３４６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４５、３４７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４６、３４８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４７、３４９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３４９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３４９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３４９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３４９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３４９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４８、３５０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３４９、３５１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５０、３５２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５１、３５３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５２、３５４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５３、３５５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５４、３５６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５５、３５７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５６、３５８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５７、３５９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３５９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３５９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３５９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３５９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３５９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５８、３６０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。て許容されるその塩。配列番号３６０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３５９、３６１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６０、３６２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６１、３６３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６２、３６４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６３、３６５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６４、３６６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６５、３６７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６６、３６８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６７、３６９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３６９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３６９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３６９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３６９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３６９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６８、３７０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３６９、３７１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７０、３７２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７１、３７３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７２、３７４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７３、３７５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７４、３７６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７５、３７７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７６、３７８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７７、３７９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３７９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３７９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３７９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３７９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３７９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７８、３８０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３７９、３８１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８０、３８２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８１、３８３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８２、３８４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８３、３８５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８４、３８６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８５、３８７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８６、３８８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８７、３８９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３８９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３８９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３８９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３８９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３８９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８８、３９０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３８９、３９１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９０、３９２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９１、３９３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９２、３９４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９３、３９５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９４、３９６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９５、３９７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９６、３９８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９７、３９９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号３９９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号３９９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号３９９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号３９９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号３９９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９８、４００～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４００のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４００のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４００のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４００のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４００のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～３９９、４０１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４００、４０２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０１、４０３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０２、４０４～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０３、４０５～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０５のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０５のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０５のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０５のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０５のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０４、４０６～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０６のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０６のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０６のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０６のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０６のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０５、４０７～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０７のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０７のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０７のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０７のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０７のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０６、４０８～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０８のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０８のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０８のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０８のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０８のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０７、４０９～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４０９のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４０９のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４０９のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４０９のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４０９のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０８、４１０～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４１０のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４１０のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４１０のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４１０のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４１０のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４０９、４１１～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４１１のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４１１のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４１１のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４１１のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４１１のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４１０、４１２～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４１２のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４１２のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４１２のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４１２のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４１２のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４１１、４１３～４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４１３のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４１３のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４１３のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４１３のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４１３のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４１２、４１４のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
配列番号４１４のバイオマーカーを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、癌再発を有する患者）の応答性を評価することができる。配列番号４１４のバイオマーカーの発現度合いは、核酸増幅法（例えば、ＰＣＲ）又はデバイス（例えば、マイクロアレイ）を使用して評価することができる。上記のように、次いで、患者サンプルにおける配列番号４１４のバイオマーカーの発現度合いは、例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して感度又は耐性を有することが知られている細胞（例えば、癌細胞）又は組織（例えば、腫瘍組織）における配列番号４１４のバイオマーカーの発現度合いと比較し、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者の応答性を測定するために使用することができる。配列番号４１４のバイオマーカーを単独で使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する癌患者の応答性を予測するか、又は１つ以上の更なるバイオマーカー（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの１個、２個、３個、４個、５個、１０個、１５個、２０個、２５個、又はすべて（例えば、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位３個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位４個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位１５個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２０個、表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーの上位２５個、又は表２及び／又は表３に示されるバイオマーカーのすべて））、例えば配列番号１～４１３のバイオマーカーと併用して予測することができる。バイオマーカーの発現度合いは、例えば、マイクロアレイ、ＰＣＲ、又は本明細書に記載の他の技術を使用して、例えば、表２及び表３に示される標的配列に基づく核酸プローブ配列を使用して測定することができる。
治療法
本発明の診断方法は、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対して応答性である可能性が高いかどうかの評価を可能にし、ひいては、（例えば、一次治療及び／又は二次又は三次治療として）患者の治療を指示するために使用することができる。この方法に従い、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する応答性について治療又は試験される患者としては、例えば、癌と診断された患者、癌治療を受けていない患者（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の抗癌剤又は放射線）、癌治療を受けた患者（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の抗癌剤又は放射線）、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療中の患者を挙げることができる。例えば、患者は、血液学的癌又は充実性腫瘍、例えば骨髄腫（例えば、多発性骨髄腫）、結腸直腸癌（例えば、大腸癌及び直腸癌）、白血病（例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、急性骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤白血病、及び慢性白血病）、骨髄異形成症候群、リンパ腫（例えば、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及びリンパ球性リンパ腫）、子宮頸癌、前立腺癌、食道癌、骨髄腫、神経膠腫（例えば、乏突起膠腫）、膵癌（例えば、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様腺癌、コロイド腺癌、膵島細胞癌、及び膵臓神経内分泌癌）、卵巣癌（例えば、卵巣腺癌又は胚性癌腫）、消化管間質腫瘍、肉腫（例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、平滑筋肉腫、ユーイング肉腫、及び横紋筋肉腫）、乳癌（例えば、髄様癌）、ＥＲ陽性癌、膀胱癌、頭頸部癌（例えば、頭頸部の扁平上皮癌）、肺癌（例えば、非小細胞肺癌、大細胞癌、気管支原性癌、及び乳頭腺癌）、転移性癌、口腔癌、子宮癌、精巣癌（例えば、精上皮腫及び胚性癌腫）、皮膚癌（例えば、扁平上皮癌及び基底細胞癌）、甲状腺癌（例えば、乳頭癌及び髄様癌）、脳癌（例えば、星状細胞腫及び頭蓋咽頭癌）、胃癌、上皮内癌、骨癌、胆道癌、眼癌、肝癌（例えば、肝細胞癌又は肝腫）、喉頭癌、腎臓癌（例えば、腎細胞癌及びウィルムス腫瘍）、胃癌、芽細胞腫（例えば、腎芽細胞腫、髄芽細胞腫、血管芽細胞腫、神経芽細胞腫、及び網膜芽細胞腫）、真性多血症、脊索腫、滑膜腫、中皮腫、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、嚢胞腺癌、胆管癌、絨毛癌、上皮癌、上衣腫、松果体腫、聴神経腫、神経鞘腫、髄膜腫、下垂体腺腫、神経鞘腫瘍、小腸の癌、内分泌系の癌、陰茎の癌、尿道の癌、皮膚又は眼内黒色腫、婦人科腫瘍、小児の充実性腫瘍、及び中枢神経系の新生物から選択される癌の種類を有し得る。特に、患者の癌は、例えば、多発性骨髄腫、乳癌、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、慢性期の慢性骨髄性白血病（ＣＭＬＣＰ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、皮膚Ｔ細胞リンパ腫（ＣＴＣＬ）、末梢性Ｔ細胞リンパ腫（ＰＴＣＬ）、ホジキンリンパ腫、肝細胞癌（ＨＣＣ）、子宮頸癌、前立腺癌、腎臓癌、腎細胞癌（ＲＣＣ）、食道癌、黒色腫、膠腫、膵癌、卵巣癌、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、肉腫、エストロゲン受容体陽性（ＥＲｐｏｓ）乳癌、肺癌、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、中皮腫、腸癌、大腸癌、膀胱癌、副腎臓癌、胆嚢癌、及び頭頸部の扁平上皮細胞癌（ＳＣＣＨＮ）である。患者は、エストロゲン受容体陽性（ＥＲ ｐｏｓ）乳癌を有し得る。患者はまた、乳癌の転移性形態を有し得る。患者はまた、上記の癌の種類のいずれかの再発形態、例えば、再発性乳癌、再発性卵巣癌、又は再発性膵癌などの癌の再発を有し得る。
本発明の方法に従い、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることが見出された患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩での治療のために優先的に選択され得る。例えば、患者は、患者から得られた生物学的サンプル（例えば、腫瘍サンプル）における１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーの発現度合いを測定することにより、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であることが同定され、続いて２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を投与され得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与前、投与と同時、又は投与後に、１つ以上の追加の治療法（例えば、手術、放射線、又は治療薬）を患者に投与してもよい。特に、治療薬は、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、ＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１阻害剤、イピリムマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドミド、プレドニゾン、デキサメタゾン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、メルファラン、カペシタビン、テガフール、イリノテカン、オキサリプラチン、セツキシマブ、ロイコボリン、ＳＮ－３８、エベロリムス、テムシロリムス、ブレオマイシン、ロムスチン、デプシペプチド、カルボプラチン、エルロチニブ、ゲムシタビン、マイトキサントロン、シスプラチン、ブスルファン、エピルビシン、三酸化ヒ素、ベンダムスチン、フルベストラント、テニポシド、アドリアマイシン、デシタビン、エストラムスチン、エトポシド、アザグアニン、アクラルビシン、マイトキサントロン、マイトマイシン、パクリタキセル、タキソテール、イロフルベン、５－ＦＵ、ａｒａ－ｃ、メチルプレドニゾロン、メトトレキサート、メチル－ｇａｇ、ベリノスタット、カルボプラチン、イダルビシン、ＩＬ４－ＰＲ３８、バルプロ酸、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ）、シトキサン、トポテカン、ヒドロキサム酸サブエロイルアニリド、リューケラン、フルダラビン、ビンブラスチン、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、テガフール、ダウノルビシン、メクロレタミン、ストレプトゾシン、カルムスチン、メルカプトプリン、ダクチノマイシン、トレチノイン、イホスファミド、タモキシフェン、フロクスウリジン、チオグアニン、ＰＳＣ ８３３、ハーセプチン、ベバシズマブ、セレコキシブ、イレッサ、アナストロゾール、レトロゾール、及びリツキシマブの１つ以上であり得る。治療薬は、非経口（例えば、静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与）、経腸、又は局所投与され得る。
あるいは、患者は、例えば、患者から得られた生物学的サンプルにおける１つ以上のバイオマーカー（例えば、ＳＲＳＦ７（配列番号１）及び／又はＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）などの、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーの発現度合いを測定することにより、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性である可能性が低いものとして同定され得る。患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して非応答性であることを示す１つ以上のバイオマーカーの発現度合いを示した場合、患者は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の治療（例えば、手術、放射線、又は治療薬）を投与され得る。特に、治療薬は、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤、ＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１阻害剤、イピリムマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドミド、プレドニゾン、デキサメタゾン、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ドキソルビシン、メルファラン、カペシタビン、テガフール、イリノテカン、オキサリプラチン、セツキシマブ、ロイコボリン、ＳＮ－３８、エベロリムス、テムシロリムス、ブレオマイシン、ロムスチン、デプシペプチド、カルボプラチン、エルロチニブ、ゲムシタビン、マイトキサントロン、シスプラチン、ブスルファン、エピルビシン、三酸化ヒ素、ベンダムスチン、フルベストラント、テニポシド、アドリアマイシン、デシタビン、エストラムスチン、エトポシド、アザグアニン、アクラルビシン、マイトキサントロン、マイトマイシン、パクリタキセル、タキソテール、イロフルベン、５－ＦＵ、ａｒａ－ｃ、メチルプレドニゾロン、メトトレキサート、メチル－ｇａｇ、ベリノスタット、カルボプラチン、イダルビシン、ＩＬ４－ＰＲ３８、バルプロ酸、全トランスレチノイン酸（ＡＴＲＡ）、シトキサン、トポテカン、ヒドロキサム酸サブエロイルアニリド、リューケラン、フルダラビン、ビンブラスチン、ダカルバジン、ヒドロキシ尿素、テガフール、ダウノルビシン、メクロレタミン、ストレプトゾシン、カルムスチン、メルカプトプリン、ダクチノマイシン、トレチノイン、イホスファミド、タモキシフェン、フロクスウリジン、チオグアニン、ＰＳＣ ８３３、ハーセプチン、ベバシズマブ、セレコキシブ、イレッサ、アナストロゾール、レトロゾール、及びリツキシマブの１つ以上であり得る。治療薬は、非経口（例えば、静脈内、筋肉内、経皮、皮内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻投与）、経腸、又は局所投与され得る。特に、患者は、例えば、手術、放射線、及び／又はヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）阻害剤及び／又はドセタキセルなどの治療薬の投与により治療され得る。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与
本明細書に記載の方法に従い、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されたら、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が、患者に、例えば、非経口、経腸、又は局所患者され得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の経腸経路としては、経口、口内、口唇下、舌下、又は吸入による投与が挙げられ得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の非経口経路には、静脈内、経皮、皮内、筋肉内、動脈内、頭蓋内、皮下、眼窩内、心室内、脊髄内、腹腔内、又は経鼻内が挙げられる。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与のための好ましい経路は経口であり得る。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、例えば、約５～５０００ｍｇ、１０～４５００ｍｇ、１５～４０００ｍｇ、２０～３５００ｍｇ、２５～３０００ｍｇ、３０～２５００ｍｇ、３５～２０００ｍｇ、４０～１５００ｍｇ、４５～１０００ｍｇ、５０～１０００ｍｇ、５０～９５０ｍｇ、５０～９００ｍｇ、５０～８５０ｍｇ、５０～８００ｍｇ、５５～８００ｍｇ、６０～８００ｍｇ、６５～８００ｍｇ、７０～８００ｍｇ、７５～８００ｍｇ、８０～８００ｍｇ、８５～８００ｍｇ、９０～８００ｍｇ、９５～８００ｍｇ、１００～８００ｍｇ、１２５～８００ｍｇ、１５０～８００ｍｇ、１７５～８００ｍｇ、２００～８００ｍｇ、２２５～８００ｍｇ、２５０～８００ｍｇ、２７５～８００ｍｇ、３００～８００ｍｇ、３２５～８００ｍｇ、３５０～８００ｇ、３７５～８００ｍｇ、４００～８００ｍｇ、４２５～８００ｍｇ、４５０～８００ｍｇ、４７５～８００ｍｇ、５００～８００ｍｇ、５２５～８００ｍｇ、５５０～８００ｍｇ、５７５～８００ｍｇ、６００～８００ｍｇ、６２５～８００ｍｇ、６５０～８００ｍｇ、６７５～８００ｍｇ、７００～８００ｍｇ、７２５～８００ｍｇ、７５０～８００ｍｇ、又は７７５～８００ｍｇの投与量で投与され得る。特に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、約１０ｍｇ、５０ｍｇ、２００ｍｇ、又は６００ｍｇの投与量で投与され得る。好ましくは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、約６００ｍｇの投与量で投与され得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、２回以上、例えば毎時１回以上、毎日１回以上（例えば、最大６日間で毎日１回）、１週間に１回以上、隔週で１回以上、３週間毎に１回以上、４週間毎に１回以上、隔月で１回以上、３ヶ月毎に１回以上、半年毎に１回以上、又は毎年１回以上、患者に投与され得る。好ましくは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、毎日１回投与され得る。この方法はさらに、第１投与量の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与の１週間、２週間、３週間、４週間、又は５週間後に、第２投与量の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を患者に投与することを含み得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与は、そのような頻度で一定期間にわたって繰り返され、その後、治療を行わない期間が続き得る。そのような反復投与は、指定された長さの期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、６ヶ月、８ヶ月、１０ヶ月、１２ヶ月、１８ヶ月、２４ヶ月、３６ヶ月、４８ヶ月、又は６０ヶ月）継続する治療過程にわたって行われ得る。
患者は、２Ｘ－１２１の薬剤として許容される塩又は薬剤として許容されるその塩を投与され得る。本明細書に記載の２Ｘ－１２１の薬剤として許容される塩又は薬剤として許容されるその塩としては、健全な医学的判断の範囲内であり、ヒト及び動物の組織と接触して使用するのに適しており、過度の毒性、刺激性、アレルギー反応がなく、合理的なベネフィット・リスク比に見合ったものが挙げられ得る。薬剤として許容される塩は、当該技術分野で周知である。例えば、薬剤として許容される塩は、以下に記載されている：Ｂｅｒｇｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ６６：１１９，１９７７及びＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓａｌｔｓ：Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ，Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ，ａｎｄ Ｕｓｅ，（Ｅｄｓ，Ｐ．Ｈ．Ｓｔａｈｌ ａｎｄ Ｃ．Ｇ．Ｗｅｒｍｕｔｈ），Ｗｉｌｅｙ－ＶＣＨ，２００８。これらの塩は、本明細書に記載の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の最終的な単離及び精製中にその場で、又は遊離塩基基を適切な有機酸と反応させることにより別々に調製することができる。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、薬剤として許容される塩として調製可能なように、イオン化可能な基を有し得る。これらの塩は、無機酸又は有機酸を含む酸付加塩であってもよいし、又は酸性形態の２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の場合、無機塩基又は有機塩基から調製された塩であってもよい。多くの場合、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、薬剤として許容される酸又は塩基の付加生成物として調製された薬剤として許容される塩として調製又は使用され得る。薬剤として許容される適切な酸及び塩基、並びに適切な塩を調製するための方法は、当該技術分野で周知である。塩は、無機酸及び有機酸並びに塩基を含む、薬剤として許容される非毒性の酸及び塩基から調製され得る。
代表的な酸付加塩としては、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、樟脳スルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、２箇所で任意に置換されたヒドロキシルエタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２－ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、３－フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸、吉草酸塩などが挙げられる。代表的なアルカリ金属塩又はアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどの他、非毒性のアンモニウム、第四級アンモニウム、及びアミンカチオンが挙げられ、これらには、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、エチルアミンなどが含まれるが、これらに限定されない。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、１つ以上の薬剤として許容される担体、医薬品添加剤、又は希釈剤を含む医薬組成物において投与され得る。２Ｘ－１２１の又は薬剤として許容されるその塩の適切な担体、医薬品添加剤、又は希釈剤の例としては、例えば、生理食塩水、滅菌水、ポリアルキレングリコール、植物由来の油、水添ナフタレン、適切な緩衝液、１，３－ブタンジオール、リンゲル液及び／又は塩化ナトリウム溶液が挙げられる。非経口投与のための例示的な製剤としては、界面活性剤、例えば、ヒドロキシプロピルセルロースと適切に混合された水中で調製された溶液が挙げられ得る。分散液はまた、グリセロール、液体ポリエチレングリコール、ＤＭＳＯ、及びアルコールの有無にかかわらずそれらの混合物、及び油中で調製され得る。通常の保管及び使用条件下では、これらの製剤は、微生物の増殖を防ぐための防腐剤が含まれていてもよい。他の例示的な担体、医薬品添加剤、又は希釈剤は、Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ，６ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｒｏｗｅ ｅｔ ａｌ．，Ｅｄｓ．，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐｒｅｓｓ（２００９）に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
医薬組成物は、その意図された投与経路に適合するように製剤化され得る。非経口、皮内、又は皮下投与に使用される溶液又は懸濁液としては、以下の成分を含めることができる：滅菌希釈液、例えば注射用水、生理食塩水、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール又は他の合成溶媒；抗菌剤、例えばベンジルアルコール又はメチルパラベン；酸化防止剤、例えばアスコルビン酸又は亜硫酸水素ナトリウム；キレート剤、例えばエチレンジアミン四酢酸；緩衝剤、酢酸塩、クエン酸塩又はリン酸塩、及び塩化ナトリウム又はデキストロースなどの張性を調整するための薬剤。ｐＨは、塩酸又は水酸化ナトリウムなどの酸又は塩基で調整され得る。非経口製剤は、ガラス製又はプラスチック製のアンプル、使い捨て注射器又は複数回投与用バイアルに封入され得る。
注射可能な使用に適した医薬組成物としては、無菌水溶液（ここでは水溶性）又は分散液や無菌の注射可能な溶液又は分散液の即時調製のための無菌粉末が挙げられる。静脈内投与の場合、適切な担体としては、生理食塩水、静菌水、又はリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。いずれの場合も、組成物は無菌でなければならず、容易な注射針通過性が存在する程度まで流動性あることが望ましい。それは製造及び保管の条件下で安定していなければならず、細菌及び真菌などの微生物の汚染作用から保護されていなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、及び液体ポリエチレングリコールなど）、及びそれらの適切な混合物を含む溶媒又は分散媒体であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用、分散の場合に必要な粒径の維持、及び界面活性剤の使用により維持され得る。微生物の作用の防止は、様々な抗菌剤及び抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなどにより達成され得る。多くの場合、等張剤、例えば、糖類、マンニトール、ソルビトールなどの多価アルコール、及び塩化ナトリウムを組成物中に含めることが好ましいであろう。注射可能な組成物の吸収の延長は、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンを組成物中に含めることによりもたらされ得る。
滅菌注射液は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を、必要に応じて、上記で列挙された成分の１つ又は組み合わせと共に必要な量で適切な溶媒に組み込み、続いて濾過滅菌することにより調製され得る。分散液は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を、基本的な分散媒体及び上記に列挙された成分から必要な他の成分を含む滅菌賦形剤に組み込むことにより調製され得る。滅菌注射液を調製するための無菌粉末の場合、好ましい調製方法は、真空乾燥及び凍結乾燥であり得、これにより、２Ｘ－１２１の粉末又は薬剤として許容されるその塩に加えて、予め滅菌濾過されたその溶液からの任意の追加の所望の成分が得られる。
経口組成物としては、不活性希釈剤又は食用担体が挙げられ得る。組成物は、ゼラチンカプセルに封入され得るか、又は錠剤に圧縮され得る。経口治療投与の目的で、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を医薬品添加剤と組み合わせて、錠剤、トローチ剤、又はゼラチンカプセルの形態で使用することができる。特に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、硬ゼラチンカプセル（例えば、１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇの硬ゼラチンカプセル）又はフィルムコート錠（例えば、１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇのフィルムコート錠）として製剤化され得る。好ましくは、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、硬ゼラチンカプセル（例えば、２００ｍｇの硬ゼラチンカプセル）として製剤化され得る。経口組成物はまた、うがい薬として使用するための流体担体を使用して調製され得、ここで、流体担体中の化合物は、経口的に適用され、嚥下され、吐き出されるか、又は飲み込まれる。薬剤として適合性のある結合剤、及び／又はアジュバント材料を組成物の一部として含めることができる。錠剤、丸剤、カプセル剤、トローチ剤などは、以下の成分のいずれか、又はこれらに類する化合物を含むことができる：結合剤、例えば微結晶性セルロース、トラガカントガム又はゼラチン；医薬品添加剤、例えばデンプン又はラクトース；崩壊剤、例えばアルギン酸、又はコーンスターチ；潤滑剤、例えばステアリン酸マグネシウム；滑剤、例えばコロイド状二酸化ケイ素；甘味料、例えばショ糖又はサッカリン；又はフレーバー剤、例えばペパーミント、サリチル酸メチル、オレンジフレーバー。
全身投与はまた、経粘膜的又は経皮的手段によるものであり得る。経粘膜又は経皮投与の場合、浸透されるべきバリアに適切な浸透剤が製剤中に使用され得る。そのような浸透剤は一般に知られており、例えば、経粘膜投与用に、界面活性剤、胆汁酸塩、及びフシジン酸誘導体が挙げられる。経鼻投与は、点鼻薬又は坐薬の使用によって行われ得る。経皮投与の場合、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、当該技術分野で一般に知られているように、軟膏、軟膏剤、ゲル、又はクリームに製剤化され得る。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、インプラント及びマイクロカプセル化送達システムを含む制御放出製剤などの、身体からの急速な排出から化合物を保護する担体と共に調製され得る。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、ポリ乳酸などの生分解性の生体適合性ポリマーが使用され得る。そのような製剤を調製するための方法は、当業者には明らかであろう。リポソーム懸濁液もまた、薬剤として許容される担体として使用され得る。これらは、当業者に知られている方法に従い調製され得る。
医薬組成物は、投与指示書と共に、容器、パック、又はディスペンサーに含めることができる。
医薬品を製剤化する方法は、当該技術分野で知られており、例えば、Ｎｉａｚｉ，Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ（Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ），ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ ２００９には、液体、滅菌、圧縮、半圧縮、及びＯＴＣ形態の製剤化開発について記載されている。経皮及び粘膜送達、リンパ系送達、ナノ粒子、制御された薬物放出システム、セラノスティクス、タンパク質及びペプチド薬物、並びに生物学的送達については、Ｗａｎｇ
ｅｔ ａｌ．，Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ（Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ），Ｗｉｌｅｙ ２０１６に記載されており、ペプチド及びタンパク質薬の製剤化及び送達については、例えば、Ｂａｎｇａ，Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｐｅｐｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ，Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ，ａｎｄ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（Ｔｈｉｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ），ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ ２０１５に記載されている。
キット
本発明のキットを使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する癌患者（例えば、多発性骨髄腫などの血液学的癌、又は乳癌又は卵巣癌などの充実性腫瘍）の応答性を測定することができる。本発明のキットは、例えば、生物学的サンプル（２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩で治療される患者から得られたものなど）から核酸を採取及び／又は精製するための試薬及び／又は材料、そのような核酸を増幅して、増幅されたサンプルを生成するための試薬、及び／又は本発明の少なくとも１つのデバイスを含み得る。核酸を増幅するための試薬としては、例えば、ＤＮＡポリメラーゼ、ＲＮＡポリメラーゼ、ＰＣＲ緩衝液、塩化マグネシウム溶液、核酸プライマー（例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する応答性の特定のバイオマーカーを標的とするように設計されたプライマー）を含むがこれらに限定されないＰＣＲ試薬、及び／又は当該技術分野で周知の任意の他のＰＣＲ試薬が挙げられ得る。特に、この方法で有用なキットとしては、以下の１つ以上が挙げられ得る：腫瘍からのＲＮＡ抽出用キット（例えば、Ａｍｂｉｏｎ Ｉｎｃ社のＴｒｉｚｏｌ ｆｏｒ ｍＲＮＡ，ｍｉｒＶａｎａ ｍｉＲＮＡ ｉｓｏｌａｔｉｏｎ ｋｉｔ）、ＲＮＡ標識用キット（例えば、Ａｍｂｉｏｎ
Ｉｎｃ社のＭｅｓｓａｇｅＡｍｐ、Ｇｅｎｉｓｐｈｅｒｅ Ｉｎｃ社のＦｌａｓｈＴａｇ）、バイオマーカー発現を測定するためのマイクロアレイ（例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ Ｉｎｃ社のＨＧ－Ｕ１３３Ａ、ＨＧ－Ｕ１３３＿Ｐｌｕｓ２又はｍｉＲＮＡ－１．０）、マイクロアレイハイブリダイゼーションステーション及びスキャナー（例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ Ｉｎｃ社のＧｅｎｅＣｈｉｐ Ｓｙｓｔｅｍ ３０００Ｄｘ）、及び／又は本明細書に記載されるバイオマーカー遺伝子又はＲＮＡ（例えば、ｍｉＲＮＡ）の発現を分析するためのソフトウェア（例えば、Ｒ－Ｐｒｏｊｅｃｔ社のＲ又はＩｎｓｉｇｈｔｆｕｌ Ｃｏｒｐ社のＳ－Ｐｌｕｓに実装）。
例えば、本発明のキットは、表２及び／又は表３の１つ以上のバイオマーカーを検出することが可能な１つ以上のプローブを含み得る（例えば、このキットは、表２及び表３のバイオマーカーのプローブを含み得る）。そのようなプローブは、例えば、核酸配列の相補性に基づいてバイオマーカーにハイブリダイズすることが可能な核酸を含み得る。特に、プローブは、１つ以上のバイオマーカーの少なくとも５個（例えば、少なくとも１５個）の連続するヌクレオチドに相補的又は同一である核酸配列に対して少なくとも８５％の配列同一性（例えば、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性）を有する。プローブは、マイクロアレイなどの固体表面に取り付けることができる。キットには、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇキャプチャープローブ、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇレポータープローブ、及び／又は１つ以上のｎＣｏｕｎｔｅｒカートリッジが含まれ得る。キットには、ポリ（Ｔ）オリゴヌクレオチド、ダイターミネーター、シーケンシングアダプター、アダプターライゲーション試薬、逆転写酵素、プライマー（例えば、ランダムプライマー）、ＤＮＡ切断酵素、ポリメラーゼ、及び／又はそれらの任意の組み合わせを含むがこれらに限定されない、次世代シーケンシング用の試薬が含まれ得る。キットはまた、表２及び／又は表３の１つ以上のバイオマーカーのポリペプチド産物を検出するためのタンパク質アレイ及び／又は試薬を含むものであり得る。
以下の実施例は、本発明を限定するのではなく、例示することを意図している。
実施例１ ２Ｘ－１２１に対する感度バイオマーカー及び耐性バイオマーカーの同定
細胞株のＮＣＩ６０パネルを使用して、２Ｘ－１２１に対する感度を測定することができるが、他の細胞株パネルを使用することも可能である。ここでは、表１に示される７４個の細胞株のパネルを使用した。
表１の癌細胞６１株（Ｍ１４ ＨＥＣ－１ ＥＣＣ－１ ＳＮＧ－ｌｌ ＨＥＣ－８８ｎｕ ＳＲ ＩＭ－９ Ｎａｍａｌｗａ ＭＣ／ＣＡＲ Ｕ２６６ ＪＶＭ－１３ ＮＣＥＢ－１ ＡＲＨ－７７を除く）のベースラインＤＮＡチップ測定を、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＧ－Ｕ１３３Ｐｌｕｓ２アレイ及び正規化されたロジットを使用して行った。各アレイについて、ロジット変換を行った後、平均値をゼロ及び標準偏差を１となるようにＺ変換を行い、増殖阻害と相関させた（－ｌｏｇ（ＧＩ５０））。各細胞株における表２及び表３の各遺伝子の発現度合いは、２Ｘ－１２１の存在下でのそれらの細胞株（ｌｏｇ（ＧＩ５０））の増殖と相関していた。次いで、ピアソン相関係数を測定して、２Ｘ－１２１に対する感度に正負の相関を示す遺伝子を同定した。表２及び表３は、上位の正の相関性がある遺伝子（感度バイオマーカー）と負の相関性がある遺伝子（耐性バイオマーカー）を示している。特に、ピアソン相関が０．２５より大きい又は－０．２５より小さい遺伝子は、それぞれ感度バイオマーカー又は耐性バイオマーカーとして分類することができる。
表２ ２Ｘ－１２１に対する感度バイオマーカー。ダッシュ記号は、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘプローブセットが特定の遺伝子にマッピングされていないことを意味している。Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＩＤは、アレイタイプＨＧ－Ｕ１３３＿Ｐｌｕｓ＿２を参照している。
表３ ２Ｘ－１２１に対する耐性バイオマーカー。ダッシュ記号は、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘプローブセットが特定の遺伝子にマッピングされていないことを意味している。Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＩＤは、アレイタイプＨＧ－Ｕ１３３＿Ｐｌｕｓ＿２を参照している。すべての相関は負である。
表２及び表３は、それぞれ２Ｘ－１２１に対する感度バイオマーカー及び耐性バイオマーカーを示している。図１は、２ｘ－１２１の既知の作用機序、すなわち、ＰＡＲＰトラッピング、相同修復とＢＲＣＡ、塩基除去修復、及びＷｎｔ／タンキラーゼ経路に関連する表２及び表３のタンパク質コード遺伝子を示している。
実施例２ 臨床的概念実証研究
２Ｘ－１２１の第Ｉ相試験を英国で実施した（ｃｌｉｎｉｃａｌｔｒｉａｌ．ｇｏｖ ｎｕｍｂｅｒ ＮＣＴ０１６１８１３６）。２Ｘ－１２１を５０～８００ｍｇの１日経口用量として投与した。第Ｉ相試験に登録された４１名の患者のうち、３５名が奏功評価を受けた。このうち、２名は部分奏効（ＰＲ）（全奏効率（ＯＲＲ）５％）であり、１３名は病態安定（ＳＤ）であった。生検とＢＲＣＡ分析は任意で行われ、それぞれ１６名と７名の患者から得られた。図２は、生検を受けた１６名の患者のベースライン腫瘍径からの変化のウォーターフォールプロットを示している。
生検を受けた１６名の患者のうち、１３名がラボでの品質管理（ＱＣ）に合格し、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＧ－Ｕ１３３Ｐｌｕｓ２アレイで分析した。１３名の患者を表４に示している。
１３個のサンプルの２Ｘ－１２１感度の盲目的な予測を開始する前に、統計解析計画を完了した。この解析では、各患者について、表２の遺伝子の平均発現量から表３の遺伝子の平均発現量の差分を差し引いて、差分スコアを求めた。このスコアを８１９名の乳癌患者の参照集団と比較して、差分スコアをパーセンタイルスコアに変換した。パーセンタイルスコアは「ＤＲＰスコア」として表４に示され、図３と図４、及び表５と表６に使用される。この解析では、ＤＲＰスコアを使用して２Ｘ－１２１に対する感度を予測したが、本明細書で議論されているように、ＤＲＰスコアを使用しない他の解析（例えば、差分スコアを作成せずに、感度バイオマーカー又は耐性バイオマーカーの発現度合いのみに基づく解析）も考えられる。
図３は、２Ｘ－１２１に対する用量調整済みの予測感度と２Ｘ－１２１に対する臨床応答の非盲検比較を示している。最高得点のＳＤ患者は、実際には長期無増悪膵癌生存者であった（最終検査時４０６日目にはまだ生存しており、最終評価時３２１日目には無増悪であった、表４参照）。表４に記載されているように、予測値は用量に合わせて調整されている。カットオフ値は水平線で示されている。調整されたスコアと腫瘍径の変化との間のピアソン相関テストは、片側Ｐ値が０．０７でＣＣが０．４２であることを示している。図３と同様に、図４もまた、２Ｘ－１２１に対する予測感度と、２Ｘ－１２１に対する臨床応答の比較を示しているが、２つの応答カテゴリーに絞られている。用量調整スコアと腫瘍径の変化との間のピアソン相関テストは、片側Ｐ値が０．０７でＣＣが０．４２であることを示している。表５及び表６は、予め指定されたカットオフ値５０（集団の中央値）でのＤＲＰの臨床成績を示している。
全体的な精度：１００％正しい予測
感度：応答者の１００％が正しく予測
特異性：非応答者の１００％が正しく予測
全体的な精度：６９％正しい予測
感度：応答者の１００％が正しく予測
特異性：非応答者の６４％が正しく予測
図３と図４、及び表４で行ったようにスコアを用量に合わせて調整すると、表６に変更はないが、表５の非応答者は応答者として予測され、統計の悪化を招くことになる。したがって、ＤＲＰは用量の調整なしで行うことができる。第Ｉ相試験の遡及的分析では、最高用量が最低用量の１６倍である用量漸増試験であったため、用量調整を行った。表５における３名の卵巣癌患者全員が６００～８００ｍｇの高用量を投与された（表４）ため、このサブセットの用量調整は不要であった。
図５は、カットオフ値の選択が、用量調整済みのカットオフ値を上回る患者の奏効率にどのように影響するかを示している。図４のｙ軸上のカットオフ値０は、カットオフ値を上回る集団の１００％（図５のｘ軸）に対応し、奏功率は２／１３＝１５％となる。図４のＹ軸上のカットオフ値５０は、カットオフ値を上回る集団の５０％に対応し、２／６＝３３％の２倍の奏功率に対応している。
図６は、用量調整済みカットオフ値５０を上回る集団（Ｎ＝６）とカットオフ値５０を下回る集団（Ｎ＝７）の２つの集団における全生存期間（ＯＳ）のカプランマイヤー曲線を示している。ハザード比は０．２６である（片側Ｐ＝０．０４）。予測された耐性群（カットオフ値未満）の生存期間中央値は２０８日である。他の群では、半数以上の患者が生存していた。
図７は、カットオフ値５０を上回る集団（Ｎ＝６）とカットオフ値５０を下回る集団（Ｎ＝７）の２つの集団における無増悪生存期間（ＰＦＳ）のカプランマイヤー曲線を示している。ハザード比は０．５９（Ｐ＝０．２片側）である。予測された耐性群（カットオフ値未満）の中央値ＰＦＳは１５５日であるのに対し、予測された感度群では２９６日であった。
ＢＲＣＡ変異状態との比較
ＢＲＣＡ変異状態は、この試験に参加した７名の患者のみで、そのうち６名はＢＲＣＡ変異を有していた。このうち６名のうち１名が２Ｘ－１２１に対して応答し、ＢＲＣＡ変異集団において１／６又は１６％の反応率を与える。これは、ＤＲＰスコアで分析された選択されていない１３名の患者で観察された奏効率と同等であった。したがって、ＢＲＣＡ変異は２Ｘ－１２１応答の予測因子ではない可能性がある。
先行プラチナ応答との比較
表３は、１名の２Ｘ－１２１応答者（患者＃１１）が従来のカルボプラチンに対して病態進行（ＰＤ）の応答を示したのに対し、表４に示されていない患者を含む試験全体で６名の２Ｘ－１２１非応答者が先行プラチナに対して応答を示したことを示している（表４の患者９、１０、１２を含む）。したがって、先行プラチナ応答は、２Ｘ－１２１に対する応答を決定するものではない可能性がある。
結論
事前に指定された統計解析計画では、図３、５又は６に示されている用量調整済み解析のいずれかで、１３名の患者のこの小さなサンプルで片側（帰無仮説が誤った方向に有意な関連を含んでいた）Ｐ値が０．１を下回ることが求められていた。図３と図６のいずれもこれらの基準を満たし、ＤＲＰは試験ＢＲＣＡとこの試験のバイオマーカーとしての先行プラチナよりも確実に優れた成績を示した。
実施例３ ２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する乳癌患者の応答性の予測
本明細書に記載の診断方法を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する乳癌患者の応答性を予測することができる。特に、乳癌患者は、以前にいかなる癌治療も受けたことがない患者、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の癌治療を受けた患者であり得る。さらに、患者は、乳癌又は乳癌の再発と診断された患者であり得る。
生物学的サンプル（例えば、生検により得られた乳房組織サンプルなどの乳房組織サンプル）は、当該技術分野で周知の方法によって患者から得ることができる。サンプルは、例えば、ホルマリン固定及びパラフィン包埋により、凍結及び／又は調製することができる。特に、ｍＲＮＡをサンプルから単離することができ、遺伝子発現プロファイルを、例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＧ－Ｕ１３３Ａなどのマイクロアレイプラットフォームを使用して、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーについて測定することができる。表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーはまた、例えば、本明細書に記載されるものなどの、シーケンシング又はＰＣＲベースの技術により測定することができる。
例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いは、配列番号１、配列番号１～５；配列番号１～１０；配列番号１～１５：配列番号１～２０；又は配列番号１～２５の１つ以上のバイオマーカーなどの、患者からのサンプル中で測定することができる。特に、バイオマーカーは、ＳＲＳＦ７（配列番号１）である。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いも、配列番号１７３又は１７４又は１７８；配列番号１７３～１７９；配列番号１７３～１８４；配列番号１７３～１８９；配列番号１７３～１９４；又は配列番号１７３～１９９などの、患者からのサンプル中で測定することができる。特に、バイオマーカーは、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）である。
乳癌患者は、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、感度バイオマーカーの発現度合いに類似（例えば、実質的に類似）している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。乳癌患者はまた、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似（例えば、実質的に類似）している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。さらに、乳癌患者は、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている（例えば、実質的に異なっている）場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。乳癌患者はまた、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている（例えば、実質的に異なっている）場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。患者が応答性であると予測される場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を投与され得、例えば２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が約５～５０００ｍｇ（例えば、約５０～８００ｍｇ）の用量で経口投与され得る。逆に、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の治療に対して非応答性であると予測される場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の１つ以上の治療、例えば放射線又は治療薬（例、ドキソルビシン、エピルビシン、パクリタキセル、ドセタキセル、５－フルオロウラシル（５－ＦＵ）、シクロホスファミド、カルボプラチン、シスプラチン、ビノレルビン、ゲムシタビン、ミトキサントロン、イクサベピロン、エリブリン、イリノテカン、カペシタビン、テガフール、オキサリプラチン、及び／又は本明細書に記載の別の治療薬）を投与され得る。
実施例４ ２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する卵巣癌患者の応答性の予測
本発明の診断方法を使用して、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による治療に対する卵巣癌患者の応答性を予測することができる。特に、卵巣癌患者は、以前にいかなる癌治療も受けたことがない患者、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の癌治療を受けた患者であり得る。さらに、患者は、卵巣癌又は卵巣癌の再発と診断された患者であり得る。
生物学的サンプル（例えば、生検により得られた卵巣組織サンプルなどの卵巣組織サンプル）は、当該技術分野で周知の方法によって患者から得ることができる。サンプルは、例えば、ホルマリン固定及びパラフィン包埋により、凍結及び／又は調製することができる。特に、ｍＲＮＡをサンプルから単離することができ、遺伝子発現プロファイルを、例えば、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ ＨＧ－Ｕ１３３Ａなどのマイクロアレイプラットフォームを使用して、表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーについて測定することができる。表２及び／又は表３に示される１つ以上のバイオマーカーはまた、例えば、本明細書に記載されるものなどの、シーケンシング又はＰＣＲベースの技術により測定することができる。
例えば、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いは、配列番号１、配列番号１～５；配列番号１～１０；配列番号１～１５：配列番号１～２０；又は配列番号１～２５の１つ以上のバイオマーカーなどの、患者からのサンプル中で測定することができる。特に、バイオマーカーは、ＳＲＳＦ７（配列番号１）である。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いも、配列番号１７３又は１７４又は１７８；配列番号１７３～１７９；配列番号１７３～１８４；配列番号１７３～１８９；配列番号１７３～１９４；又は配列番号１７３～１９９などの、患者からのサンプル中で測定することができる。特に、バイオマーカーは、ＨＬＡ－Ｅ（配列番号１７３又は１７４又は１７８）である。
卵巣癌患者は、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、感度バイオマーカーの発現度合いに類似（例えば、実質的に類似）している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。卵巣癌患者はまた、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して感度を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いに類似（例えば、実質的に類似）している場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。さらに、卵巣癌患者は、１つ以上の感度バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、感度バイオマーカーの発現度合いと異なっている（例えば、実質的に異なっている）場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。卵巣癌患者はまた、１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いが、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して耐性を有することが知られている細胞又は組織における、耐性バイオマーカーの発現度合いと異なっている（例えば、実質的に異なっている）場合に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であり得る。患者が応答性であると予測される場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩を投与され得、例えば２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が約５～５０００ｍｇ（例えば、約５０～８００ｍｇ）の用量で経口投与され得る。逆に、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の治療に対して非応答性であると予測される場合、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の１つ以上の治療、例えば放射線又は治療薬（例、カルボプラチン、シスプラチン、ドセタキセル、パクリタキセル、及び／又は本明細書に記載の別の治療薬）を投与され得る。
実施例５ ２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩による乳癌患者の治療
乳癌患者は、本明細書に記載の方法により、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩での治療に対して応答性であると予測された後、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩で治療することができる。特に、乳癌患者は、以前にいかなる癌治療も受けたことがない患者、又は２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩以外の癌治療を受けた患者であり得る。さらに、患者は、乳癌又は乳癌の再発と診断された患者であり得る。
乳癌患者は、前述の実施例３に例示された方法に従って、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定することができる。本明細書に記載の方法に従い、患者が２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対して応答性であると測定されたら、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩が、患者に、例えば、１日用量６００ｍｇを経口投与することができる（例えば、患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩をそれぞれ２００ｍｇ含む３つの硬ゼラチンカプセルを投与され得る）。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩（例えば、１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇの硬ゼラチンカプセル）又はフィルムコート錠剤（例えば、１０ｍｇ、５０ｍｇ、又は２００ｍｇのフィルムコート錠）の代替的な投与レジメン及び形態もまた、投与することができる。
２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩は、第１の治療レジメン中に１回以上（例えば、最大６日間以上で毎日１回以上）患者に投与することができる。患者は、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の第１の治療レジメンの投与の１週間、２週間、３週間、４週間、又は５週間後に、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の第２の治療レジメンを投与され得る。２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩の投与は、そのような頻度で一定期間にわたって繰り返され、その後、治療を行わない期間が続き得る。そのような反復投与は、指定された長さの期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、６ヶ月、又は１年以上）継続する治療過程にわたって行われ得る。
他の実施形態
上記の明細書に記載されているすべての刊行物、特許、及び特許出願は、参照により本明細書に組み込まれる。本発明の記載されたデバイス及び使用方法の様々な修正及び変形は、本発明の範囲及び精神から逸脱することなく、当業者には明らかであろう。本発明は特定の実施形態に関連して説明されてきたが、特許請求される本発明は、そのような特定の実施形態に過度に限定されるべきではないことを理解されたい。実際、当業者には明らかである本発明を実施するための記載された態様の様々な修正は、本発明の範囲内にあることが意図されている。例えば、タンパク質、代謝物のレベルの測定、遺伝子変異及びＤＮＡコピー数多型の特定はすべて、患者の応答性を判断するのに役立つと期待されている。

Claims (1)

  1. 癌を有する対象の、２Ｘ－１２１又は薬剤として許容されるその塩に対する応答性を測定する方法であって、
    （ａ）１つ以上の核酸分子を含む前記対象からのサンプルを、
    （ｉ）表２のバイオマーカーから選択される１つ以上の感度バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子；及び／又は
    （ｉｉ）表３のバイオマーカーから選択される１つ以上の耐性バイオマーカーのヌクレオチドと特異的にハイブリダイゼーション可能な、１つ以上の一本鎖核酸分子
    を含むデバイスと接触させることと、
    （ｂ）前記サンプル由来の前記１つ以上の核酸分子と、前記デバイスの前記一本鎖核酸分子とのハイブリダイゼーションを測定して、前記１つ以上の感度バイオマーカー及び／又は前記１つ以上の耐性バイオマーカーの発現度合いを検出することと、
    を含む、方法。
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