JP2023545507A - 標的化タンパク質を分解する三環式ヘテロ二官能性化合物 - Google Patents

標的化タンパク質を分解する三環式ヘテロ二官能性化合物 Download PDF

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コリー ドン アンダーソン
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ヤンケ リャン
モーゼ ムースタキム
カトリーナ エル. ジャクソン
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Abstract

対象の標的化疾患媒介性タンパク質を分解する、適切なタンパク質標的化リガンドに連結された三環式セレブロン結合体を含む標的化タンパク質分解用のヘテロ二官能性化合物が提供される。

Description

[関連出願の相互参照]
本願は、2020年10月14日付けで出願された米国仮特許出願第63/091,897号の利益を主張するものであり、この出願の全体が全ての目的で引用することにより本明細書の一部をなす。
開示された発明は、対象の標的疾患媒介性タンパク質を分解する、適切なタンパク質標的化リガンドに連結された三環式セレブロン結合体を含む触媒性医薬タンパク質デグレーダーを提供する。
[参照による援用]
テキストファイルのコンテンツは、「16010-050WO1_SequenceListing_ST25.txt」と名前が付けられ、2021年10月14日に作成され、サイズ3.94KBであり、その内容全体を引用することにより本明細書の一部をなす。
タンパク質は、人体において多くの重要な役割を担う大きく複雑な分子である。タンパク質相互作用は、健康状態及び疾患状態の両方に関与するメカニズムを制御する。多くの疾患は、タンパク質の突然変異、改変、又は過剰発現によって引き起こされ、しばしば、異常な細胞増殖又は他の機能不全につながる。
人体は、タンパク質の安定した平衡を維持する高度に保存された恒常性システムを有する。このシステムは、タンパク質を識別し、それらの構成アミノ酸成分へと分解するのに精巧なタンパク質分解機構に頼っている。このプロセスは、古くなったタンパク質、損傷したタンパク質、ミスフォールドしたタンパク質、又は他には分解の準備ができているタンパク質を識別することにより、クオリティーコントロール検査因子(quality control inspectors)として作用する「E3リガーゼ」によって部分的に媒介される。E3リガーゼは、ユビキチン化と呼ばれるプロセスにおいて、ユビキチンと呼ばれる一連の分子タグをタンパク質に取り付ける。タンパク質がポリユビキチン化されると、これはE3リガーゼによって放出され、細胞のリサイクル工場であるプロテアソームによって素早く認識される。プロテアソームは、ユビキチン化されたタンパク質をそのアミノ酸へと分解し、これらは新たなタンパク質へとリサイクルされる。
このタンパク質分解システムは、ユビキチン-プロテアソーム経路(UPP)と呼ばれることもある。UPPは、抗原プロセシング、アポトーシス、オルガネラの生合成、細胞周期、DNAの転写及び修復、分化及び発生、免疫応答及び炎症、神経及び筋肉の変性、神経網の形態形成、細胞表面受容体、イオンチャネル、及び分泌経路の調節、ストレス及び細胞外モジュレーターに対する応答、リボソーム生合成、並びにウイルス感染を含む殆ど全ての細胞プロセスの調節の中心となる。不適切な又は欠陥のあるプロテアソーム分解は、癌を含む異常な細胞増殖、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病等の神経変性疾患、筋ジストロフィー、及び心血管疾患を含む多岐にわたる臨床障害に関連している。
歴史的に、疾患媒介性タンパク質は、酵素ポケットに嵌まりタンパク質活性を妨げるか、又は別の手段でタンパク質に結合してその活性を妨害する阻害剤を使用する薬物療法の対象とされた。しかしながら、多くのタンパク質は酵素ではなく、活性ポケットを有しない又はin vivoで干渉分子と結合しにくいため、「創薬不可能」である。阻害メカニズムは、適切で持続的な標的の占有に高用量の薬物を必要とすることが多い。薬理学的効果は薬物曝露によって誘導されるため、薬物作用の全体的なタイミング及び持続時間は、薬物の吸収、分布、及び排出に依存する。これらの薬物レベルは達成が困難であり、重大なオフターゲット効果を引き起こす可能性がある。特定の活性部位を有するタンパク質、及びその部位を十分に正しく阻害する化合物の特定を必要とする阻害アプローチは困難である。
最近では、体内のプロテアソームタンパク質分解システムを利用して、疾患媒介性タンパク質を阻害するのではなく分解することに努力が向けられている。
E3ユビキチンリガーゼ及び分解の標的タンパク質に結合することが可能な化合物を記載する、C4 Therapeutics, Inc.によって申請された特許出願には、「BRD9の標的化分解のための化合物(Compounds for Targeted Degradation of BRD9)」と題する特許文献1、「EGFRの分解のためのイソインドリン及びインダゾール化合物(Isoindolinone and Indazole Compounds for the Degradation Of EGFR)」と題する特許文献2、「二官能性化合物(Bifunctional Compounds)」と題する特許文献3、「癌の治療のための二官能性化合物(Bifunctional Compounds for the Treatment of Cancer)」と題する特許文献4、「標的化タンパク質分解(Targeted Protein Degradation)」と題する特許文献5、「スピロ環状化合物(Spirocyclic Compounds)」と題する特許文献6、「BRD9又はMTH1の分解のための化合物(Compounds for the Degradation of BRD9 or MTH1)」と題する特許文献7、「Ikarosの分解のためのセレブロン結合体(Cereblon Binders for the Degradation of Ikaros)」と題する特許文献8、「スピロ環状化合物(Spirocyclic Compounds)」と題する特許文献9、「標的化タンパク質分解のための分解誘導薬及びデグロン(Degraders and Degrons for Targeted Protein Degradation)」と題する特許文献10、「タンパク質分解のためのN/O-結合型デグロン及びデグロニマー(N/O-Linked Degrons and Degronimers for Protein Degradation)」と題する特許文献11、「標的タンパク質分解のためのアミン結合C3-グルタルイミドデグロニマー(Amine-Linked C3-Glutarimide Degronimers for Target Protein Degradation)」と題する特許文献12、「標的タンパク質分解のための複素環式デグロニマー(Heterocyclic Degronimers for Target Protein Degradation)」と題する特許文献13、「標的タンパク質分解のためのスピロ環状デグロニマー(Spirocyclic Degronimers for Target Protein Degradation)」と題する特許文献14、「標的タンパク質分解のためのC3-炭素結合グルタルイミドデグロニマー(C3-Carbon Linked Glutarimide Degronimers for Target Protein Degradation)」と題する特許文献15及び「標的タンパク質分解のためのブロモドメイン標的化デグロニマー(Bromodomain Targeting Degronimers for Target Protein Degradation)」と題する特許文献16が含まれる。
C4 Therapeutics Inc.によって出願された特許文献17は、三環式化合物を記載している。Calico Life Sciences LLC及びAbbVie Inc.によって出願された特許文献18は、様々なセレブロンリガンドに共有結合されたPTPN1リガンド及びPTPN2リガンドを記載している。
タンパク質分解の出願の追加の例としては、特許文献19、特許文献20、特許文献21、特許文献22、特許文献23、及び特許文献24が挙げられる。
これらの努力にもかかわらず、疾患媒介性タンパク質を分解する新たな化合物及び医薬組成物、それらを使用する方法、並びにそれらを調製するプロセスが依然として求められている。
国際公開第2021/178920号 国際公開第2021/127561号 国際公開第2021/086785号 国際公開第2021/083949号 国際公開第2020/132561号 国際公開第2019/236483号 国際公開第2020/051235号 国際公開第2019/191112号 国際公開第2019/204354号 国際公開第2019/099868号 国際公開第2018/237026号 国際公開第2017/197051号 国際公開第2017/197055号 国際公開第2017/197036号 国際公開第2017/197046号 国際公開第2017/197056号 国際公開第2020/210630号 国際公開第2021/127586号 国際公開第2021/041664号 国際公開第2021/143822号 国際公開第2021/143816号 国際公開第2020/010227号 国際公開第2020/006262号 国際公開第2019/148055号
ユビキチンプロテアソーム経路(UPP)を介して疾患媒介性標的タンパク質を分解して、タンパク質の分解に奏効する宿主、典型的にはヒトにおける疾患を治療する化合物並びにそれらの使用及び製造が提供される。本発明は、標的タンパク質に結合する標的化リガンド、E3リガーゼ結合部分(三環式セレブロンリガンド)、標的化リガンドとスペーサーとを共有結合により連結するリンカー、及びリンカーとE3リガーゼ結合部分とを共有結合により連結するスペーサーを含む、一般式I、一般式II、若しくは一般式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩を提供する。
本明細書において提供される本発明の化合物又はその薬学的に許容可能な塩及び/又はその薬学的に許容可能な組成物を使用して、標的タンパク質によって媒介される障害を治療することができる。標的タンパク質は、典型的には、突然変異、改変、又は過剰発現されたタンパク質であって、その突然変異、改変、又は過剰発現によりその正常な機能が、疾患を引き起こす又はその一因となる機能不全へと変換される、タンパク質である。幾つかの態様において、疾患は、癌又は腫瘍等の異常な細胞増殖である。幾つかの実施の形態において、標的タンパク質によって媒介される障害を伴う患者を治療する方法であって、有効量の本明細書に記載される1種以上の化合物又はそれらの薬学的に許容可能な塩を、任意に薬学的に許容可能な組成物において患者、典型的にはヒトに投与することを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態において、三環式セレブロン結合性ヘテロ二官能性化合物は、投与を必要とする宿主、典型的にはヒトに、治療される疾患についての標準治療であり得る別の医薬品作用物質又は生物学的作用物質と組み合わせて投与される。
本明細書において提供される三環式セレブロン結合性ヘテロ二官能性化合物は触媒的である。この化合物によって媒介される標的化タンパク質の分解は、典型的には、最初の標的-リガーゼの遭遇からポリユビキチン化、そして放出からプロテアソームによる分解まで、ミリ秒単位で急速に起こる。標的化タンパク質の分解プロセスが標的タンパク質の1つの分子に対して起こると、デグレーダーが放出され、このプロセスは同じデグレーダー分子で繰り返される。標的タンパク質の結合、E3リガーゼによる三元複合体の形成、ユビキチン化、そして放出からの分解というこの再帰的なプロセスは、単一のデグレーダー分子で何千回も起こり得る。
一態様において、本明細書に記載される三環式セレブロン結合性複素環式デグレーダーは、経口で生物学的に利用可能であり、限定されるものではないが、丸剤、錠剤、ジェルキャップ剤、又は液剤を含む使い勝手の良い固体剤形において有効量で提供され得る。代替的には、デグレーダーを、静脈内送達経由若しくは局所的を含む非経口的に、又はその他の手段で本明細書に更に記載されるように投与することができる。
一態様において、任意に組成物を形成する薬学的に許容可能な担体中の、式I:
Figure 2023545507000002
の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩、N-オキシド、同位体誘導体、若しくはプロドラッグが提供される。
三環式セレブロンリガンドは、以下の部分の1つから選択され、ここで、角括弧付きの結合は、望ましい効力及び触媒的分解プロファイルを達成する様式に関連して、三環式部分が、環-A、環-B、環-C、又は環-D上の共有結合を介してスペーサー/リンカーに取り付けられていることを示す。
Figure 2023545507000003
Figure 2023545507000004
Figure 2023545507000005
Figure 2023545507000006
Figure 2023545507000007
Figure 2023545507000008
Figure 2023545507000009
Figure 2023545507000010
Figure 2023545507000011
Figure 2023545507000012
Figure 2023545507000013
Figure 2023545507000014
Figure 2023545507000015
Figure 2023545507000016
Figure 2023545507000017
Figure 2023545507000018
Figure 2023545507000019
Figure 2023545507000020
Figure 2023545507000021
Figure 2023545507000022
Figure 2023545507000023
nは、0、1、又は2であり、
Xは、NR10、NR6’、O、又はSであり、
X’は、NR10、O、CH、又はSであり、
Qは、CR又はNであり、
Q’及びQ’’は、独立して、CR及びNから選択される。
環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
或る特定の実施の形態において、環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
或る特定の実施の形態において、環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
環-Cは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、各環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
環-Dは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、各環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
及びRは、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、ニトロ、ヘテロアリール、アリール、及び複素環から選択され、又は代替的には、価数及び安定性によって許容される場合に、R若しくはRは、=O、=S、若しくは=NR41等の二価の部分であってもよく、かつR基は、適切かつ所望であれば、任意に別のR基若しくはR基と一緒になって、環-A及び環-B又は環-C及び環-Dを架橋し得る縮合環若しくは二環を形成してもよい。
は、水素、アルキル、ハロゲン、又はハロアルキルであり、
又は、R及びRは一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成し、例えば、R及びRが1炭素連結部を形成する場合に、
Figure 2023545507000024
は、
Figure 2023545507000025
であり、
又は、R及びRは一緒になって、1炭素連結部、2炭素連結部、3炭素連結部、又は4炭素連結部を形成し、例えば、R及びRが1炭素連結部を形成する場合に、
Figure 2023545507000026
は、
Figure 2023545507000027
であり、
又はR及びRに隣接するR基は一緒になって、二重結合を形成する。
及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択され、
及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、及び-NR1011から選択され、
’は、水素、アルキル、又はハロアルキルであり、
又はR及びR’は一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成する。
10及びR11は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)R12、-S(O)R12、及び-SO12から選択され、
各R12は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-NR1314、及びOR13から選択され、かつ、
13及びR14は、それぞれの場合に、独立して、水素、アルキル、及びハロアルキルから選択される。
スペーサーは、構造:
Figure 2023545507000028
であり得る二価の接続部分である。
は、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-から選択される二価の部分であるか、又はアリールアルキル、複素環アルキル、若しくはヘテロアリールアルキル(どちらの方向でも)であり得て、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されていてもよく、
15、R16、R17、及びR18は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル(或る特定の実施の形態において、炭素環である)、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4041)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、アリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルからなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
ここで、X及びR15~R18は一緒になって、三環式セレブロンリガンドとリンカーとを共有結合により接続する安定した部分であり、或る特定の実施の形態において、スペーサーは、共有結合であり、
26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)、-NHSO(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、オキソ、及びシクロアルキルからなる群から選択され、
41は、脂肪族(アルキルを含む)、アリール、ヘテロアリール、又は水素であり、
標的化リガンドは、標的タンパク質に結合する部分であり、かつリンカー-スペーサーを介して三環式セレブロンリガンドに共有結合により連結されており、
標的タンパク質は、in vivoで治療される疾患を引き起こす又はその一因となる選択されたタンパク質であり、
リンカーは、二価の連結基、例えば、式LIの二価の連結基である。
或る特定の実施の形態において、リンカーは、式:
Figure 2023545507000029
(式中、
及びXは、独立して、それぞれの場合に、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-から選択され、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
20、R21、R22、R23、及びR24は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、オキシアルキレン、-C(R4040)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、及び炭素環からなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)、-NHSO(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、オキソ、及びシクロアルキルからなる群から選択され、かつ、
41は、脂肪族、アリール、ヘテロアリール、又は水素である)のリンカーである。
或る特定の態様において、任意に組成物を形成する薬学的に許容可能な担体中の、式II:
Figure 2023545507000030
の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩、N-オキシド、同位体誘導体、若しくはプロドラッグが提供される。式IIの式中、
標的化リガンドは、標的タンパク質に結合する部分であり、かつリンカー-スペーサーを介して三環式セレブロンリガンドに共有結合により連結されており、ここで、標的化リガンドは、以下の部分構造:
Figure 2023545507000031
を含まず、
標的タンパク質は、in vivoで治療される疾患を引き起こす又はその一因となる選択されたタンパク質であり、ここで、標的タンパク質は、PTPアーゼ(例えば、PTPN1又はPTPN2)ではなく、かつ、
他の全ての可変部は、式I又は本明細書に記載される実施の形態において定義される通りである。
或る特定の態様において、任意に組成物を形成する薬学的に許容可能な担体中の、式III:
Figure 2023545507000032
の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩、N-オキシド、同位体誘導体、若しくはプロドラッグが提供される。式IIIの式中、
三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000033
から選択され、
’及びR’は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、ニトロ、ヘテロアリール、アリール、及び複素環から選択され、ここで、R’が水素である場合にR’は水素ではなく、R’が水素である場合にR1’は水素ではなく、かつ、
他の全ての可変部は、式I又は本明細書に記載される実施の形態において定義される通りである。
或る特定の実施の形態において、上記に示される取り付け用の結合を有する三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000034
Figure 2023545507000035
Figure 2023545507000036
Figure 2023545507000037
から選択される。
或る特定の他の実施の形態において、上記に示される取り付け用の結合を有する三環式セレブロン結合性部分は、
Figure 2023545507000038
Figure 2023545507000039
から選択される。
可変部、置換基、実施の形態の全ての組合せ、及びこれらの組合せから得られる化合物が具体的かつ個別に開示されていると見なされる。それというのも、そのような描写は、スペースの都合によるものであるにすぎず、化合物の属又は更には亜属のみを記載することを意図するものではないからである。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-1及び式IIb-1:
Figure 2023545507000040
又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-2及び式IIb-2:
Figure 2023545507000041
又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-3及び式IIb-3:
Figure 2023545507000042
(式中、
、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-4及び式IIb-4:
Figure 2023545507000043
又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-5及び式IIb-5:
Figure 2023545507000044
又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-6及び式IIb-6:
Figure 2023545507000045
又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、式IIa-7及び式IIb-7:
Figure 2023545507000046
又はそれらの薬学的に許容可能な塩から選択される。
本発明の化合物の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000047
Figure 2023545507000048
Figure 2023545507000049
Figure 2023545507000050
Figure 2023545507000051
Figure 2023545507000052
Figure 2023545507000053
Figure 2023545507000054
Figure 2023545507000055
Figure 2023545507000056
Figure 2023545507000057
Figure 2023545507000058
Figure 2023545507000059
Figure 2023545507000060
Figure 2023545507000061
Figure 2023545507000062
が挙げられる。
或る特定の実施の形態において、治療方法であって、有効量の式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩を、任意に薬学的に許容可能な担体中で、治療を必要とする患者、例えばヒトに投与することを含む、方法が提供される。例えば、或る特定の実施の形態において、式I、式II、又は式IIIの化合物をヒトに投与して、異常な細胞増殖又は癌を治療する。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物を使用して、標的化リガンドとしてアロステリックリガンドを有する標的タンパク質を分解する。或る特定の実施の形態において、本発明の化合物を使用して、標的化リガンドとしてオルソステリックリガンドを有する標的タンパク質を分解する。或る特定の実施の形態において、本発明の化合物を使用して、標的化リガンドを介してE3ユビキチンリガーゼ複合体に動員されない標的タンパク質を分解する。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、従来のタンパク質阻害療法を超える1つ以上の、しばしば多数の利点をもたらす。例えば、本発明の三環式セレブロンヘテロ二官能性タンパク質分解性化合物は、a)従来の薬剤耐性を克服することができ、b)タンパク質を破壊することにより標的リガンド効果の動態を延長することができ、そのため、化合物が代謝された後でさえもタンパク質の再合成を必要とし、c)特定の活性又は結合事象ではなく、標的タンパク質の全ての機能を一度に標的化することができ、d)触媒活性のため、阻害剤と比較して高められた効力を有することができ、及び/又はe)従来のタンパク質阻害剤よりも低い投薬量しか必要とし得ないことから、毒性の可能性が減少する。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物を使用して、突然変異した標的タンパク質を有する癌を治療する。或る特定の実施の形態において、標的化リガンドは、突然変異されたタンパク質に選択的に結合するが、野生型タンパク質の結合は顕著ではない。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物を使用して、標的化リガンド単独での治療に耐性である癌を治療する。
或る特定の実施の形態において、本発明の化合物は、標的化リガンド単独と比べて改善された有効性及び/又は安全性のプロファイルをもたらす。
或る特定の実施の形態において、本明細書に記載される三環式セレブロンヘテロ二官能性タンパク質は、標的タンパク質によって媒介される障害を治療するのに、標的化リガンド単独よりも低い濃度で必要とされる。
或る特定の実施の形態において、有効量の本発明の化合物は、標的タンパク質によって媒介される障害の治療における少なくとも1つの副作用が、有効量の標的化リガンド単独よりも少ない。
或る特定の実施の形態において、本明細書に記載される選択された化合物には、標的タンパク質によって媒介される障害の有効な治療をするのに、標的化リガンド単独の有効な治療よりも少ない頻度の投薬が必要とされる。
本発明の別の態様は、標的タンパク質によって媒介される障害を抑制若しくは未然防止するか、又は標的タンパク質の量を調節若しくは減少させるための医薬の製造に使用される本明細書に記載の化合物、又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体、又はその薬学的に許容可能な塩、水和物若しくは溶媒和物、又は医薬組成物を提供する。
本発明の別の態様は、標的タンパク質によって媒介される疾患を治療又は未然防止するための医薬の製造に使用される本明細書に記載の化合物、又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体、又はその薬学的に許容可能な塩、水和物若しくは溶媒和物、又はその医薬組成物を提供する。
或る特定の実施の形態においては、本明細書に記載の選択された化合物は、標的タンパク質が発癌タンパク質又は異常細胞増殖経路のシグナル伝達メディエーターであり、その分解が異常細胞成長を減少させる、腫瘍又は癌等の異常細胞増殖を含む障害の治療に有用である。
或る特定の実施の形態においては、式I、式II、若しくは式IIIの選択された化合物又はその薬学的に許容可能な塩は、同位体の天然存在度を超える量での、すなわち濃縮された少なくとも1つの所望の原子の同位体置換を有する。
或る特定の形態においては、式I、式II若しくは式IIIの化合物又はその薬学的に許容可能な塩は、1つの重水素原子又は複数の重水素原子を含む。
本出願の他の特徴及び利点は、以下の詳細な説明から明らかになるであろう。
このように、本発明は、少なくとも以下の特徴を含む:
(a)本明細書に記載される式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩若しくは同位体誘導体(重水素化誘導体を含む)、又はそれらの薬学的に許容可能な組成物、
(b)癌を含む異常な細胞増殖等の標的タンパク質によって媒介される障害を治療する方法であって、有効量の本明細書に記載される式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩を、任意に薬学的に許容可能な組成物において、治療を必要とするヒト等の患者に投与することを含む、方法、
(c)標的タンパク質によって媒介される障害、例えば、腫瘍若しくは癌等の異常な細胞増殖、炎症性疾患、自己免疫疾患、又は線維性疾患の治療において使用される、式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩若しくは同位体誘導体(重水素化誘導体を含む)、
(d)標的タンパク質によって媒介される障害、例えば、腫瘍又は癌等の異常な細胞増殖を伴う治療を必要とする患者、典型的には、ヒトの治療における、式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩の有効量での使用、
(e)標的タンパク質によって媒介される障害、例えば、腫瘍又は癌等の異常な細胞増殖の治療用の医薬の製造における、式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩若しくは同位体誘導体(重水素化誘導体を含む)の使用、
(f)患者を治療する有効量の式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩、同位体誘導体と、任意に薬学的に許容可能な担体又は希釈剤とを含む、医薬組成物、
(g)ラセミ体を含むエナンチオマー又はジアステレオマー(該当する場合)の混合物としての、本明細書に記載される式I、式II、又は式IIIの化合物、
(h)単離されたエナンチオマー又はジアステレオマーを含むエナンチオマー濃縮された又はジアステレオマー(該当する場合)濃縮された形態(すなわち、約85%超、約90%超、約95%超、約97%超、又は約99%超の純度)における、本明細書に記載される式I、式II、又は式IIIの化合物、及び、
(i)有効量の本明細書に記載される式I、式II、若しくは式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩を含む治療用製品を調製する方法。
レチノイドX受容体(RXR)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 一般的なジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 バチルス・アンシラシス(Bacillus anthracis)のジヒドロ葉酸レダクターゼ(BaDHFR)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 熱ショックタンパク質90(HSP90)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 一般的なキナーゼ及びホスファターゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 チロシンキナーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 オーロラキナーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 タンパク質チロシンホスファターゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ALKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ABLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 JAK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 METの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 mTORC1及び/又はmTORC2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 肥満細胞/幹細胞成長因子受容体(SCFR)(c-KIT受容体としても知られる)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 IGF1R及び/又はIRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 HDM2及び/又はMDM2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BETブロモドメイン含有タンパク質の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 HDACの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 RAF受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 FKBP受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 アンドロゲン受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 エストロゲン受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 甲状腺ホルモン受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 HIVプロテアーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 HIVインテグラーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 HCVプロテアーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 AP1及び/又はAP2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 MCL-1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 IDH1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 RAS又はRASKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 MERTK又はMERの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EGFRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 FLT3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 SMARCA2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 キナーゼ阻害剤標的化リガンドU09-CX-5279(誘導体化されている)の非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 キナーゼ阻害剤化合物Y1W及びY1X(誘導体化されている)を含むキナーゼ阻害剤の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Millan et al.著の「慢性閉塞性肺疾患を治療する吸入用P38阻害剤の設計及び合成(Design and Synthesis of Inhaled P38 Inhibitors for the Treatment of Chronic Obstructive Pulmonary Disease)」 J. Med. Chem., 54: 7797 (2011)において特定されるキナーゼ阻害剤を参照のこと。 キナーゼ阻害剤化合物6TP及び0TP(誘導体化されている)を含むキナーゼ阻害剤の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Schenkel et al.著の「強力で選択性が高いチエノピリジンヤヌスキナーゼ2阻害剤の発見(Discovery of Potent and Highly Selective Thienopyridine Janus Kinase 2 Inhibitors)」 J. Med. Chem., 54 (24): 8440-8450 (2011)において特定されるキナーゼ阻害剤を参照のこと。 キナーゼ阻害剤化合物07Uを含むキナーゼ阻害剤の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Van Eis et al.著の「新規のプロテインキナーゼCアイソザイムの強力で選択的な阻害剤としての2,6-ナフチリジン(2 6-Naphthyridines as potent and selective inhibitors of the novel protein kinase C isozymes)」 Biorg. Med. Chem. Lett., 21(24): 7367-72 (2011)において特定されるキナーゼ阻害剤を参照のこと。 キナーゼ阻害剤化合物YCFを含むキナーゼ阻害剤の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lountos et al.著の「癌治療用の薬物標的であるチェックポイントキナーゼ2(Chk2)との阻害剤複合体の構造的特性評価(Structural Characterization of Inhibitor Complexes with Checkpoint Kinase 2 (Chk2) a Drug Target for Cancer Therapy)」 J. Struct. Biol., 176: 292 (2011)において特定されるキナーゼ阻害剤を参照のこと。 キナーゼ阻害剤XK9及びNXP(誘導体化されている)を含むキナーゼ阻害剤の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lountos et al.著の「癌治療用の薬物標的であるチェックポイントキナーゼ2(Chk2)との阻害剤複合体の構造的特性評価(Structural Characterization of Inhibitor Complexes with Checkpoint Kinase 2 (Chk2) a Drug Target for Cancer Therapy)」J. Struct. Biol., 176: 292 (2011)において特定されるキナーゼ阻害剤を参照のこと。 キナーゼ阻害剤の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 サイクリン依存性キナーゼ9(CDK9)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Baumli et al.著の「P-TEFb(CDK9/サイクリンT1)の構造、フラボピリドールとのその複合体、及びリン酸化による調節(The structure of P-TEFb (CDK9/cyclin T1) its complex with flavopiridol and regulation by phosphorylation.)」 Embo J., 27: 1907-1918 (2008)、Bettayeb et al.著の「CDK阻害剤ロスコビチン及びCR8は、神経芽細胞腫細胞におけるMcl-1下方調節及びアポトーシス細胞死を惹起する(CDK Inhibitors Roscovitine and CR8 Trigger Mcl-1 Down-Regulation and Apoptotic Cell Death in Neuroblastoma Cells.)」Genes Cancer, 1: 369-380 (2010)、Baumli et al.著の「ハロゲン結合は、DRBによる選択的なP-TEFb阻害の基礎を形成する(Halogen bonds form the basis for selective P-TEFb inhibition by DRB.)」 Chem.Biol. 17: 931-936 (2010)、Hole et al.著の「4-(チアゾール-5-イル)-2-(フェニルアミノ)ピリミジン-5-カルボニトリルCdk9阻害剤の構造的及び機能的な比較研究は、アイソタイプ選択性についての根拠を示唆している(Comparative Structural and Functional Studies of 4-(Thiazol- 5-Yl)-2-(Phenylamino)Pyrimidine-5-Carbonitrile Cdk9 Inhibitors Suggest the Basis for Isotype Selectivity.)」 J.Med.Chem. 56: 660 (2013)、Luecking et al.著の「癌の治療用の強力で選択性が高いPTEFb阻害剤BAY 1251152の同定-スキャフォールドホッピングを介して経口適用から静脈内適用へ(Identification of the potent and highly selective PTEFb inhibitor BAY 1251152 for the treatment of cancer-From p.o. to i.v. application via scaffold hops.)」 Luecking et al. U. AACR Annual Meeting, April 1-5, 2017(米国ワシントンDC)を参照のこと。 サイクリン依存性キナーゼ4/6(CDK4/6)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lu H.、Schulze-Gahmen U.著の「サイクリン依存性キナーゼ6特異的阻害の構造的基礎の理解に向けて(Toward understanding the structural basis of cyclin-dependent kinase 6 specific inhibition.)」 J. Med. Chem., 49: 3826-3831 (2006)、「サイクリン依存性キナーゼ4/6の選択的阻害剤としての4-(ピラゾール-4-イル)-ピリミジン(4-(Pyrazol-4-yl)-pyrimidines as selective inhibitors of cyclin-dependent kinase 4/6.)」Cho et al. (2010) J.Med.Chem. 53: 7938-7957、Cho Y.S. et al.著の「強力で選択性が高くかつ経口活性型のCDK4/6阻害剤としての7-アザベンズイミダゾールのフラグメントベースの創薬(Fragment-Based Discovery of 7-Azabenzimidazoles as Potent Highly Selective and Orally Active CDK4/6 Inhibitors.)」 ACS Med Chem Lett 3: 445-449 (2012)、Li Z. et al.著の「FLT3の活性化状態に優先的な親和性を有するFLT3及びCDK4のデュアルキナーゼ阻害剤であるAMG925の発見(Discovery of AMG 925 a FLT3 and CDK4 dual kinase inhibitor with preferential affinity for the activated state of FLT3.)」 J. Med. Chem. 57: 3430-3449 (2014)、Chen P. et al.著の「CDK薬物相互作用のスペクトル及び程度は、臨床成績を予測する(Spectrum and Degree of CDK Drug Interactions Predicts Clinical Performance.)」 Mol. Cancer Ther. 15: 2273-2281 (2016)を参照のこと。 サイクリン依存性キナーゼ12及び/又はサイクリン依存性キナーゼ13の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Zhang T. et al.著の「遠隔のシステイン残基の共有結合標的化によるCdk12阻害剤及びCdk13阻害剤の開発(Covalent Targeting of Remote Cysteine Residues to Develop Cdk12 and Cdk13 Inhibitors.)」 Nat. Chem. Biol. 12: 876 (2016)を参照のこと。 糖質コルチコイド受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 RasG12Cの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 Her3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表し、R’’は、
Figure 2023545507000063
である。
Bcl-2又はBcl-XLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BCL2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Toure B. B. et al.著の「bcl-2ファミリーのタンパク質間相互作用の阻害剤としてのN-ヘテロアリールスルホンアミドの酸性度の役割(The role of the acidity of N-heteroaryl sulfonamides as inhibitors of bcl-2 family protein-protein interactions.)」 ACS Med Chem Lett, 4: 186-190 (2013)、Porter J. e.t al.著の「選択的Bcl-2阻害剤としてのテトラヒドロイソキノリンアミド置換フェニルピラゾール(Tetrahydroisoquinoline Amide Substituted Phenyl Pyrazoles as Selective Bcl-2 Inhibitors)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 230 (2009)、Souers A.J. et al.著の「強力で選択的なBCL-2阻害剤であるABT-199は、血小板を温存しながら抗腫瘍活性を達成する(ABT-199 a potent and selective BCL-2 inhibitor achieves antitumor activity while sparing platelets.)」 Nature Med. 19: 202-208 (2013)、Angelo Aguilar et al.著の「強力で有効性が高いBcl-2/Bcl-xL阻害剤(A Potent and Highly Efficacious Bcl-2/Bcl-xL Inhibitor)」 J Med Chem. 56(7): 3048-3067 (2013)、Longchuan Bai et al.著の「BM-1197:完全な長期持続する腫瘍退縮をin vivoで誘導する新規かつ特異的なBcl-2/Bcl-xL阻害剤(BM-1197: A Novel and Specific Bcl-2/Bcl-xL Inhibitor Inducing Complete and Long-Lasting Tumor Regression In Vivo)」 PLoS ONE 9(6): e99404、Fariba Ne'mati1 et al.著の「Bcl-2/Bcl-XLを標的化すると、ぶどう膜黒色腫患者由来の異種移植片において抗腫瘍活性が誘導される(Targeting Bcl-2/Bcl-XL Induces Antitumor Activity in Uveal Melanoma Patient-Derived Xenografts)」 PLoS ONE 9(1): e80836、「インドール及びピロールの新規誘導体、その製造方法及びそれらを含む医薬組成物(Novel derivatives of indole and pyrrole method for the production thereof and pharmaceutical compositions containing same)」と題する国際公開第2015/011396号、「Bclタンパク質と結合パートナーとの相互作用を阻害する化合物及び方法(Compounds and methods for inhibiting the interaction of Bcl proteins with binding partners)」と題する国際公開第2008/060569号、「抗アポトーシス性Bcl-2タンパク質の阻害剤:特許レビュー(Inhibitors of the anti-apoptotic Bcl-2 proteins: a patent review)」 Expert Opin. Ther. Patents 22(1):2008 (2012)、及びPorter et al.著の「選択的Bcl-2阻害剤としてのテトラヒドロイソキノリンアミド置換フェニルピラゾール(Tetrahydroisoquinoline amide substituted phenyl pyrazoles as selective Bcl-2 inhibitors)」 Bioorg Med Chem Lett., 19(1):230-3 (2009)を参照のこと。 BCL-XLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Zhi-Fu Tao et al.著の「in vivo活性を有する強力で選択的なBCL-XL阻害剤の発見(Discovery of a Potent and Selective BCL-XL Inhibitor with in Vivo Activity)」 ACS Med. Chem. Lett., 5: 1088-1093 (2014)、Joel D. Leverson et al.著の「選択的BCL-2ファミリー阻害剤を活用して、細胞生存依存性を分析し、癌療法用の改善された戦略を定義する(Exploiting selective BCL-2 family inhibitors to dissect cell survival dependencies and define improved strategies for cancer therapy)」 Science Translational Medicine, 7:279ra40 (2015)、及び結晶構造PDB 3ZK6(Guillaume Lessene et al.著の「選択的BCL-XL阻害剤の構造情報に基づく設計(Structure-guided design of a selective BCL-XL inhibitor)」 Nature Chemical Biology 9: 390-397 (2013))を参照のこと。 PPAR-ガンマの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 エルロチニブ、ゲフィチニブ、アファチニブ、ネラチニブ、及びダコミチニブを含むEGFRのL858R突然変異体を標的とするEGFRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 オシメルチニブ、ロシレチニブ、オルムチニブ、ナコチニブ、ナザルチニブ、PF-06747775、イコチニブ、ネラチニブ、アビチニブ、タルロキソチニブ、PF-0645998、テセバチニブ、トランスチニブ(Transtinib)、WZ-3146、WZ8040、及びCNX-2006を含むEGFRのT790M突然変異体を標的とするEGFRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EAI045を含むEGFRのC797S突然変異体を標的とするEGFRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ニロチニブ及びダサチニブを含むBCR-ABL T315I突然変異体を標的とするBCR-ABLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、結晶構造PDB 3CS9を参照のこと。 ニロチニブ、ダサチニブ、ポナチニブ、及びボスチニブを含むBCR-ABLを標的とする標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 セリチニブを含むALKのL1196M突然変異体を標的とするALKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、結晶構造PDB 4MKCを参照のこと。 ルキソリチニブを含むJAK2のV617F突然変異体を標的とするJAK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ベムラフェニブを含むBRAFのV600E突然変異体を標的とするBRAFの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PBD 3OG7を参照のこと。 ダブラフェニブを含むBRAFの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 LRRK2のR1441C突然変異体を標的とするLRRK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 LRRK2のG2019S突然変異体を標的とするLRRK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 LRRK2のI2020T突然変異体を標的とするLRRK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 AG-1478、CHEMBL94431、ドビチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、イマチニブ、Janex 1、パゾパニブ、PD153035、ソラフェニブ、スニチニブ、及びWHI-P180を含むPDGFRαのT674I突然変異体を標的とするPDGFRαの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トザセルチブを含むRETのG691S突然変異体を標的とするRETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トザセルチブを含むRETのR749T突然変異体を標的とするRETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トザセルチブを含むRETのE762Q突然変異体を標的とするRETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トザセルチブを含むRETのY791F突然変異体を標的とするRETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トザセルチブを含むRETのV804M突然変異体を標的とするRETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トザセルチブを含むRETのM918T突然変異体を標的とするRETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 脂肪酸結合タンパク質の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 5-リポキシゲナーゼ活性化タンパク質(FLAP)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 クリングルドメインV 4BVVの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ラクトイルグルタチオンリアーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 mPGES-1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 第Xa因子の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Maignan S. et al.著の「強力な阻害剤と複合体を形成したヒト第Xa因子の結晶構造(Crystal structures of human factor Xa complexed with potent inhibitors.)」 J. Med. Chem. 43: 3226-3232 (2000)、Matsusue T. et al.著の「ヒトFxaとの複合体における新規の結合モデルを誘導する第Xa因子特異的阻害剤(Factor Xa Specific Inhibitor that Induces the Novel Binding Model in Complex with Human Fxa.)」(公開予定)、結晶構造PDB 1iqh、1iqi、1iqk、及び1iqm、Adler M. et al.著の「第Xa因子に結合された2つの強力なノナミジン阻害剤の結晶構造(Crystal Structures of Two Potent Nonamidine Inhibitors Bound to Factor Xa.)」 Biochemistry 41: 15514-15523 (2002)、Roehrig S. et al.著の「新規の抗血栓薬5-クロロ-N-({(5S)-2-オキソ-3-「4-(3-オキソモルホリン-4-イル)フェニル]-1,3-オキサゾリジン-5-イル}メチル)チオフェン-2-カルボキサミド(Bay 59-7939):経口の直接的な第Xa因子阻害剤の発見(Discovery of the Novel Antithrombotic Agent 5-Chloro-N-({(5S)-2-Oxo-3- [4-(3-Oxomorpholin-4-Yl)Phenyl]-1 3-Oxazolidin-5-Yl}Methyl)Thiophene-2- Carboxamide (Bay 59-7939): An Oral Direct Factor Xa Inhibitor.)」 J. Med. Chem. 48: 5900 (2005)、Anselm L. et al.著の「臨床候補物としての第Xa因子阻害剤(3R,4R)-1-(2,2-ジフルオロ-エチル)-ピロリジン-3,4-ジカルボン酸3-[(5-クロロ-ピリジン-2-イル)-アミド]4-{[2-フルオロ-4-(2-オキソ-2H-ピリジン-1-イル)-フェニル]-アミド}の発見(Discovery of a Factor Xa Inhibitor (3R 4R)-1-(2 2-Difluoro-Ethyl)-Pyrrolidine-3 4-Dicarboxylic Acid 3-[(5-Chloro-Pyridin-2-Yl)-Amide] 4-{[2-Fluoro-4-(2-Oxo-2H-Pyridin-1-Yl)-Phenyl]-Amide} as a Clinical Candidate.)」 Bioorg. Med. Chem. 20: 5313 (2010)、及びPinto D.J. et al.著の「血液凝固因子Xaの非常に強力で選択的な有効性を有しかつ経口で生物学的に利用可能な阻害剤である1-(4-メトキシフェニル)-7-オキソ-6-(4-(2-オキソピペリジン-1-イル)フェニル)-4,5,6,7-テトラヒドロ-1H-ピラゾロ[3,4-c]ピリジン-3-カルボキサミド(アピキサバンBMS-562247)の発見(Discovery of 1-(4-Methoxyphenyl)-7-oxo-6-(4-(2-oxopiperidin-1-yl)phenyl)-4 5 6 7-tetrahydro- 1H-pyrazolo[3 4-c]pyridine-3-carboxamide (Apixaban BMS-562247) a Highly Potent Selective Efficacious and Orally Bioavailable Inhibitor of Blood Coagulation Factor Xa.)」 J. Med. Chem. 50: 5339-5356 (2007)を参照のこと。 カリクレイン7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Maibaum J. et al.著の「代替補体経路を標的とする小分子の因子D阻害剤(Small-molecule factor D inhibitors targeting the alternative complement pathway.)」 Nat. Chem. Biol. 12: 1105-1110 (2016)を参照のこと。 カテプシンKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Rankovic Z. et al.著の「カテプシンK阻害剤としての一連の新規の2-シアノ-ピリミジンの設計及び最適化(Design and optimization of a series of novel 2-cyano-pyrimidines as cathepsin K inhibitors)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 1524-1527 (2010)、及びCai J. et al.著の「ケトアミドベースのカテプシンS阻害剤についてのP2としてのトリフルオロメチルフェニル(Trifluoromethylphenyl as P2 for ketoamide-based cathepsin S inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 6890-6894 (2010)を参照のこと。 カテプシンLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Kuhn B. et al.著の「自由エネルギー計算の前向き評価によるカテプシンL阻害剤の優先順位付け(Prospective Evaluation of Free Energy Calculations for the Prioritization of Cathepsin L Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 60: 2485-2497 (2017)を参照のこと。 カテプシンSの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Jadhav P.K. et al.著の「腹部大動脈瘤の治療用のカテプシンS阻害剤LY3000328の発見(Discovery of Cathepsin S Inhibitor LY3000328 for the Treatment of Abdominal Aortic Aneurysm)」 ACS Med. Chem. Lett. 5: 1138-1142. (2014)を参照のこと。 MTH1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Kettle J.G. et al.著の「Mth1の強力で選択的な阻害剤は、癌細胞の生存におけるその役割を探る(Potent and Selective Inhibitors of Mth1 Probe its Role in Cancer Cell Survival.)」 J. Med. Chem. 59: 2346 (2016)、Huber K.V.M. et al.著の「抗癌戦略としての(S)-クリゾチニブによるMth1の立体特異的標的化(Stereospecific Targeting of Mth1 by (S)-Crizotinib as an Anticancer Strategy.)」 Nature 508: 222 (2014)、Gad H. et al.著の「MTH1阻害は、dNTPプールのサニテーションを阻害することによって癌を消滅させる(MTH1 inhibition eradicates cancer by preventing sanitation of the dNTP pool.)」 Nature 508: 215-221 (2014)、Nissink J.W.M. et al.著の「Mth1基質の認識-特異性の曖昧さの一例(Mth1 Substrate Recognition--an Example of Specific Promiscuity.)」 Plos One 11: 51154 (2016)、及びManuel Ellermann et al.著の「強力で選択的な阻害剤の新規のクラスは、広範囲の癌標的としてのMTH1を無効にする(Novel class of potent and selective inhibitors efface MTH1 as broad-spectrum cancer target.)」 AACR National Meeting Abstract 5226, 2017を参照のこと。 MDM2及び/又はMDM4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Popowicz G.M. et al.著の「MDMX及びMDM2に結合された低分子量阻害剤の構造は、p53-MDMX/MDM2アンタゴニスト創薬への新たなアプローチを明らかにする(Structures of low molecular weight inhibitors bound to MDMX and MDM2 reveal new approaches for p53-MDMX/MDM2 antagonist drug discovery.)」 Cell Cycle, 9 (2010)、Miyazaki M. et al.著の「新規の経口活性型のp53-MDM2相互作用阻害剤の合成及び評価(Synthesis and evaluation of novel orally active p53-MDM2 interaction inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. 21: 4319-4331 (2013)、Miyazaki M. et al.著の「有望な候補としてのDS-5272:強力で経口活性型のp53-MDM2相互作用阻害剤の発見(Discovery of DS-5272 as a promising candidate: A potent and orally active p53-MDM2 interaction inhibitor.)」 Bioorg Med Chem. 23: 2360-7 (2015)、Holzer P. et al.著の「ジヒドロイソキノリノン誘導体(NVP-CGM097):p53wt腫瘍における第1相臨床試験が進行中の非常に強力で選択的なMDM2阻害剤の発見(Discovery of a Dihydroisoquinolinone Derivative (NVP-CGM097): A Highly Potent and Selective MDM2 Inhibitor Undergoing Phase 1 Clinical Trials in p53wt Tumors.)」 J. Med. Chem. 58: 6348-6358 (2015)、Gonzalez-Lopez de Turiso F. et al.著の「MDM2-p53阻害剤の合理的な設計及び結合様式の二重性(Rational Design and Binding Mode Duality of MDM2-p53 Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 56: 4053-4070 (2013)、Gessier F. et al.著の「異なる結合様式を有するp53-MDM2相互作用の新規の阻害剤としてのジヒドロイソキノリノン誘導体の発見(Discovery of dihydroisoquinolinone derivatives as novel inhibitors of the p53-MDM2 interaction with a distinct binding mode.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 25: 3621-3625 (2015)、Fry D.C. et al.著の「ヌトリンの分解:強力なタンパク質間相互作用阻害剤の結合決定基の分析(Deconstruction of a nutlin: dissecting the binding determinants of a potent protein-protein interaction inhibitor.)」 ACS Med Chem Lett 4: 660-665 (2013)、Ding Q. et al.著の「臨床開発中の強力で選択的なp53-MDM2阻害剤であるRG7388の発見(Discovery of RG7388 a Potent and Selective p53-MDM2 Inhibitor in Clinical Development.)」 J. Med. Chem. 56: 5979-5983 (2013)、Wang S. et al.著の「SAR405838:完全で持続的な腫瘍退縮を誘導するMDM2-p53相互作用の最適化された阻害剤(SAR405838: an optimized inhibitor of MDM2-p53 interaction that induces complete and durable tumor regression.)」 Cancer Res. 74: 5855-5865 (2014)、Rew Y. et al.著の「MDM2-p53相互作用の強力で選択的な4-アミド安息香酸阻害剤であるAM-7209の発見(Discovery of AM-7209 a Potent and Selective 4-Amidobenzoic Acid Inhibitor of the MDM2-p53 Interaction.)」 J. Med. Chem. 57: 10499-10511 (2014)、Bogen S.L. et al.著の「経口で生物学的に利用可能な強力で有効なHDM2-p53阻害剤としての新規の3,3-二置換ピペリジンの発見(Discovery of Novel 3 3-Disubstituted Piperidines as Orally Bioavailable Potent and Efficacious HDM2-p53 Inhibitors.)」 ACS Med. Chem. Lett. 7: 324-329 (2016)、及びSun D. et al.著の「臨床開発中の強力で選択的かつ経口で生物学的に利用可能なMDM2-p53阻害剤であるAMG232の発見(Discovery of AMG 232 a Potent Selective and Orally Bioavailable MDM2-p53 Inhibitor in Clinical Development.)」 J. Med. Chem. 57: 1454-1472 (2014)を参照のこと。 PARP1、PARP2、及び/又はPARP3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Iwashita A. et al.著の「強力で選択的なポリ(ADPリボース)ポリメラーゼ1/2阻害剤としてのキナゾリノン及びキノキサリン誘導体の発見(Discovery of quinazolinone and quinoxaline derivatives as potent and selective poly(ADP-ribose) polymerase-1/2 inhibitors.)」 Febs Lett. 579: 1389-1393 (2005)、結晶構造PDB 2RCW(A861695と複合体形成されたPARP、Park C.H.)、結晶構造PDB 2RD6(A861696と複合体形成されたPARP、Park C.H.)、結晶構造PDB 3GN7、Miyashiro J. et al.著の「ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ-1(PARP-1)の新規の三環式キノキサリノン阻害剤の合成及びSAR(Synthesis and SAR of novel tricyclic quinoxalinone inhibitors of poly(ADP-ribose)polymerase-1 (PARP-1))」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 4050-4054 (2009)、Gandhi V.B. et al.著の「癌の治療用のポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ(PARP)の強力な阻害剤としての置換された3-オキソイソインドリン-4-カルボキサミドの発見及びSAR(Discovery and SAR of substituted 3-oxoisoindoline-4-carboxamides as potent inhibitors of poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) for the treatment of cancer.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 1023-1026 (2010)、Penning T.D. et al.著の「ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ阻害剤であるフェニル置換ベンズイミダゾールカルボキサミドの最適化:非常に強力で効果的な阻害剤である(S)-2-(2-フルオロ-4-(ピロリジン-2-イル)フェニル)-1H-ベンズイミダゾール-4-カルボキサミド(A-966492)の同定(Optimization of phenyl-substituted benzimidazole carboxamide poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors: identification of (S)-2-(2-fluoro-4-(pyrrolidin-2-yl)phenyl)-1H-benzimidazole-4-carboxamide (A-966492) a highly potent and efficacious inhibitor.)」 J. Med. Chem. 53: 3142-3153 (2010)、Ye N. et al.著の「新規のPARP1阻害剤としての官能化された長鎖付属物を有する一連のベンゾ[de][1,7]ナフチリジン-7(8H)-オンの設計、合成、及び生物学的評価(Design, Synthesis, and Biological Evaluation of a Series of Benzo[de][1 7]naphthyridin-7(8H)-ones Bearing a Functionalized Longer Chain Appendage as Novel PARP1 Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 56: 2885-2903 (2013)、Patel M.R. et al.著の「ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ-1阻害剤としての新規の2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-カルボキサミド及び2,3-ジヒドロベンゾフラン-3(2H)-オン-7-カルボキサミド誘導体の発見及び構造活性相関(Discovery and Structure-Activity Relationship of Novel 2 3-Dihydrobenzofuran-7-carboxamide and 2 3-Dihydrobenzofuran-3(2H)-one-7-carboxamide Derivatives as Poly(ADP-ribose)polymerase-1 Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 57: 5579-5601 (2014)、Thorsell A.G. et al.著の「ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ(PARP)及びタンキラーゼ阻害剤の効力及び曖昧さについての構造的基礎(Structural Basis for Potency and Promiscuity in Poly(ADP-ribose) Polymerase (PARP) and Tankyrase Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 60:1262-1271 (2012)、結晶構造PDB 4RV6(「阻害剤ルカパリブとの複合体におけるヒトARTD1(PARP1)触媒ドメイン(Human ARTD1 (PARP1) catalytic domain in complex with inhibitor Rucaparib)」,Karlberg T. et al.)、Papeo G.M.E. et al.著の「2-[1-(4,4-ジフルオロシクロヘキシル)ピペリジン-4-イル]-6-フルオロ-3-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-イソインドール-4-カルボキサミド(Nms-P118):癌療法用の強力で経口利用可能かつ選択性が高いParp-1阻害剤の発見(Discovery of 2-[1-(4 4-Difluorocyclohexyl)Piperidin-4-Yl]-6-Fluoro-3-Oxo-2 3-Dihydro-1H-Isoindole-4-Carboxamide (Nms-P118): A Potent Orally Available and Highly Selective Parp- 1 Inhibitor for Cancer Therapy.)」 J. Med. Chem. 58: 6875 (2015)、Kinoshita T. et al.著の「ヒトポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼの活性部位の阻害剤による構造変化(Inhibitor-induced structural change of the active site of human poly(ADP-ribose) polymerase.)」 Febs Lett. 556: 43-46 (2004)、及びGangloff A.R. et al.著の「ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ阻害剤としての新規のベンゾ[b][1,4]オキサジン-3(4H)-オンの発見(Discovery of novel benzo[b][1 4]oxazin-3(4H)-ones as poly(ADP-ribose)polymerase inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 23: 4501-4505 (2013)を参照のこと。 PARP14の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PARP15の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PDZドメインの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサー(複数の場合もある)が取り付けられる例示的な点を表す。 ホスホリパーゼA2ドメインの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 タンパク質S100-A7 2WOSの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 サポシン-Bの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 Sec7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 pp60 SrcのSH2ドメインの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 Tank1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 Ubc9 SUMO E2リガーゼSF6Dの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 AP23464を含むSrcの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 Src-AS1及び/又はSrc AS2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トファシチニブを含むJAK3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 トファシチニブ及びポナチニブを含むABLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PD318088、トラメチニブ、及びG-573を含むMEK1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 レゴラフェニブを含むKITの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 エファビレンツ、テノホビル、エムトリシタビン、リトナビル、ラルテグラビル、及びアタザナビルを含むHIV逆転写酵素の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 リトナビル、ラルテグラビル、及びアタザナビルを含むHIVプロテアーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 KSR1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 CTNNB1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、(結晶構造)及び(「小分子によるβ-カテニンの直接的な標的化は、プロテアソーム分解を刺激し、発癌性Wnt/β-カテニンシグナル伝達を抑制する(Direct Targeting of b-Catenin by a Small Molecule Stimulates Proteasomal Degradation and Suppresses Oncogenic Wnt/b-Catenin Signaling)」 Cell Rep 2016, 16(1), 28、「生物学的等価体置換によるβ-カテニン/T細胞因子タンパク質間相互作用についての小分子阻害剤の合理的な設計(Rational Design of Small-Molecule Inhibitors for β-Catenin/T-Cell Factor Protein-Protein Interactions by Bioisostere Replacement)」 ACS Chem Biol 2013, 8, 524、及び「β-カテニンのアロステリック阻害剤は、結腸癌における発癌性Wntシグナル伝達を選択的に標的化する(Allosteric inhibitor of β-catenin selectively targets oncogenic Wnt signaling in colon cancer)」 Sci Rep 2020, 10, 8096を参照のこと)。 BCL6の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PAK1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PAK4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 TNIKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 MEN1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ERK1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 IDO1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 CBPの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 MCL1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Tanaka Y. et al著の「標的タンパク質の構造解析に基づくハイブリダイゼーション戦略を使用することによる強力なMcl-1/Bcl-xL二重阻害剤の発見(Discovery of potent Mcl-1/Bcl-xL dual inhibitors by using a hybridization strategy based on structural analysis of target proteins.)」 J. Med. Chem. 56: 9635-9645 (2013)、Friberg A. et al.著の「フラグメントベースの方法及び構造ベースの設計を使用する強力な骨髄性細胞白血病1(Mcl-1)阻害剤の発見(Discovery of potent myeloid cell leukemia 1 (Mcl-1) inhibitors using fragment-based methods and structure-based design.)」 J. Med. Chem. 56: 15-30 (2013)、Petros A. M. et al著の「抗アポトーシスMCL-1タンパク質の強力な阻害剤のフラグメントベースの発見(Fragment-based discovery of potent inhibitors of the anti-apoptotic MCL-1 protein.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 24: 1484-1488 (2014)、Burke J.P. et al.著の「フラグメントベースの方法及び構造ベースの設計を使用するmcl-1を強力に阻害する三環式インドールの発見(Discovery of tricyclic indoles that potently inhibit mcl-1 using fragment-based methods and structure-based design.)」 J. Med. Chem. 58: 3794-3805 (2015)、Pelz N.F. et al.著の「フラグメントベースの方法を使用する2-インドール-アシルスルホンアミド骨髄性細胞白血病1(Mcl-1)阻害剤の発見(Discovery of 2-Indole-acylsulfonamide Myeloid Cell Leukemia 1 (Mcl-1) Inhibitors Using Fragment-Based Methods.)」 J. Med. Chem. 59: 2054-2066 (2016)、Clifton M.C. et al.著の「マルトース結合タンパク質融合コンストラクトは、MCL1についての頑健な結晶学プラットフォームをもたらす(A Maltose-Binding Protein Fusion Construct Yields a Robust Crystallography Platform for MCL1.)」 Plos One 10: e0125010-e0125010 (2015)、Kotschy A et al.著の「MCL1阻害剤S63845は、多様な癌モデルにおいて忍容性があり、かつ有効である(The MCL1 inhibitor S63845 is tolerable and effective in diverse cancer models.)」 Nature 538:477-482 (2016)、「新規のチエノピリミジン誘導体、それらの製造方法、及びそれらを含む医薬組成物(New thienopyrimidine derivatives a process for their preparation and pharmaceutical compositions containing them)」と題する欧州特許出願公開第2886545号、Jeffrey W. Johannes et al.著の「非天然のペプチド性大環状Mcl-1阻害剤の構造ベースの設計(Structure Based Design of Non-Natural Peptidic Macrocyclic Mcl-1 Inhibitors)」 ACS Med. Chem. Lett. (2017); DOI: 10.1021/acsmedchemlett.6b00464、Bruncko M. et al.著の「高い親和性及び選択性を有する一連のMCL-1阻害剤の構造情報に基づく設計(Structure-Guided Design of a Series of MCL-1 Inhibitors with High Affinity and Selectivity.)」 J. Med. Chem. 58: 2180-2194 (2015)、Taekyu Lee et al.著の「強力な骨髄性細胞白血病-1阻害剤の発見及び生物学的特性評価(Discovery and biological characterization of potent myeloid cell leukemia-1 inhibitors.)」 FEBS Letters 591: 240-251 (2017)、Chen L.et al.著の「骨髄性細胞白血病-1(Mcl-1)の阻害剤としての3-カルボキシ置換された1,2,3,4-テトラヒドロキノリンの構造ベースの設計(Structure-Based Design of 3-Carboxy-Substituted 1 2 3 4- Tetrahydroquinolines as Inhibitors of Myeloid Cell Leukemia-1 (Mcl-1).)」 Org. Biomol. Chem. 14:5505-5510 (2016)、「mcl-1タンパク質を阻害するテトラヒドロナフタレン誘導体(Tetrahydronaphthalene derivatives that inhibit mcl-1 protein)」と題する米国特許出願公開第2016/0068545号、「アポトーシス促進剤としての新たな二環式誘導体の調製(Preparation of new bicyclic derivatives as pro-apoptotic agents)」と題する国際公開第2016/207217号、Gizem Akcay et al.著の「非触媒性リジン側鎖の共有結合修飾によるMcl-1の阻害(Inhibition of Mcl-1 through covalent modification of a noncatalytic lysine side chain)」 Nature Chemical Biology 12: 931-936 (2016)を参照のこと。 ASH1Lの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、結晶構造PDB 4YNM(「S-アデノシルメチオニン(SAM)との複合体におけるヒトASH1L SETドメイン(Human ASH1L SET domain in complex with S-adenosyl methionine (SAM))」 Rogawski D.S. et al.)を参照のこと。 ATAD2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Chaikuad A. et al.著の「創薬可能性が低いATAD2ブロモドメインについてのフラグメントの同定に向けた構造ベースのアプローチ(Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-drugability ATAD2 bromodomain)」 Med Chem Comm 5: 1843-1848 (2014)、Poncet-Montange G. et al.著の「観察されたブロモドメインの柔軟性は、ヒストンペプチド及び小分子リガンドと適合性のあるATAD2の形態を明らかにする(Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.)」 Biochem. J. 466: 337-346 (2015)、Harner M.J. et al.著の「ATAD2のブロモドメインのフラグメントベースのスクリーニング(Fragment-Based Screening of the Bromodomain of ATAD2.)」 J. Med. Chem. 57: 9687-9692 (2014)、Demont E.H. et al.著の「低マイクロモル濃度のAtad2ブロモドメイン阻害剤のフラグメントベースの発見(Fragment-Based Discovery of Low-Micromolar Atad2 Bromodomain Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 58: 5649 (2015)、及びBamborough P. et al.著の「強力なAtad2ブロモドメイン阻害剤へのナフチリドンの構造ベースの最適化(Structure-Based Optimization of Naphthyridones into Potent Atad2 Bromodomain Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 58: 6151 (2015)を参照のこと。 BAZ2A及びBAZ2Bの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 4CUU(「フラグメント-6 N09645との複合体におけるヒトBaz2B(Human Baz2B in Complex with Fragment-6 N09645)」 Bradley A. et al.)、結晶構造PDB 5CUA(「1-アセチル-4-(4-ヒドロキシフェニル)ピペラジンとの複合体におけるジンクフィンガードメインタンパク質2B(BAZ2B)に隣接するブロモドメインの2番目のブロモドメイン(Second Bromodomain of Bromodomain Adjacent to Zinc Finger Domain Protein 2B (BAZ2B) in complex with 1-Acetyl-4-(4-hydroxyphenyl)piperazine.)」 Bradley A. et al.)、Ferguson F.M. et al.著の「創薬可能性が低いブロモドメインを標的化する:BAZ2Bブロモドメインに対するフラグメントベースのスクリーニング及び阻害剤の設計(Targeting low-drugability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.)」 J. Med. Chem. 56: 10183-10187 (2013)、Marchand J.R. et al.著の「BAZ2Bブロモドメインリガンドとしての3-アミノ-2-メチルピリジンの誘導体:in silico発見及びin Crystalloバリデーション(Derivatives of 3-Amino-2-methylpyridine as BAZ2B Bromodomain Ligands: In Silico Discovery and in Crystallo Validation.)」 J. Med. Chem. 59: 9919-9927 (2016)、Drouin L. et al.著の「BAZ2A及びBAZ2Bのブロモドメインを標的とするBAZ2-ICR A化学的プローブの構造に対応した設計(Structure Enabled Design of BAZ2-ICR A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.)」 J. Med. Chem. 58: 2553-2559 (2015)、Chen P. et al.著の「ブロモドメインBAZ2A及びBAZ2Bの選択的化学的プローブであるGSK2801の発見及び特性評価(Discovery and characterization of GSK2801 a selective chemical probe for the bromodomains BAZ2A and BAZ2B.)」 J. Med. Chem. 59:1410-1424 (2016)を参照のこと。 BRD1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5AME(「3Dコンソーシアムフラグメントの4-アセチル-ピペラジン-2-オンとの複合体におけるヒト表面エピトープが操作されたBrd1Aのブロモドメインの結晶構造(the Crystal Structure of the Bromodomain of Human Surface Epitope Engineered Brd1A in Complex with 3D Consortium Fragment 4-Acetyl-Piperazin-2-One)」 Pearce, N.M. et al.)、結晶構造PDB 5AMF(「3Dコンソーシアムフラグメントのエチル-4,5,6,7-テトラヒドロ-1H-インダゾール-5-カルボキシレートとの複合体におけるヒト表面エピトープが操作されたBrd1Aのブロモドメインの結晶構造(Crystal Structure of the Bromodomain of Human Surface Epitope Engineered Brd1A in Complex with 3D Consortium Fragment Ethyl 4 5 6 7-Tetrahydro-1H-Indazole-5-Carboxylate)」, Pearce N.M. et al.)、結晶構造PDB 5FG6(「OF-1化学的プローブとの複合体におけるヒトBRD1(BRPF2)のブロモドメインの結晶構造(the Crystal structure of the bromodomain of human BRD1 (BRPF2) in complex with OF-1 chemical probe.)」, Tallant C. et al.)、Filippakopoulos P. et al.著の「ヒトブロモドメインファミリーのヒストン認識及び大規模構造解析(Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.)」 Cell, 149: 214-231 (2012)を参照のこと。 BRD2ブロモドメイン1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 2ydw、結晶構造PDB 2yek、結晶構造PDB 4a9h、結晶構造PDB 4a9f、結晶構造PDB 4a9i、結晶構造PDB 4a9m、結晶構造PDB 4akn、結晶構造PDB 4alg、及び結晶構造PDB 4uyfを参照のこと。 BRD2ブロモドメイン2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 3oni、Filippakopoulos P. et al.著の「BETブロモドメインの選択的阻害(Selective Inhibition of BET Bromodomains.)」 Nature 468: 1067-1073 (2010)、結晶構造PDB 4j1p、McLure K.G. et al.著の「RVX-208:ヒトにおけるApoA-Iのインデューサーは、BETブロモドメインアンタゴニストである(RVX-208: an Inducer of ApoA-I in Humans is a BET Bromodomain Antagonist.)」 Plos One 8: e83190-e83190 (2013)、Baud M.G. et al.著の「化学生物学。BETブロモドメイン化学的プローブの制御された選択性を操作する凹凸アプローチ(Chemical biology. A bump-and-hole approach to engineer controlled selectivity of BET bromodomain chemical probes)」 Science 346: 638-641 (2014)、Baud M.G. et al.著の「トリアゾロ-ベンゾジアゼピン類似体への新たな合成経路:選択的なブロモ及びエクストラターミナル(BET)ブロモドメイン阻害への凹凸アプローチの範囲の拡大(New Synthetic Routes to Triazolo-benzodiazepine Analogues: Expanding the Scope of the Bump-and-Hole Approach for Selective Bromo and Extra-Terminal (BET) Bromodomain Inhibition)」 J. Med. Chem. 59: 1492-1500 (2016)、Gosmini R. et al.著の「強力なテトラヒドロキノリンApoa1上方調節因子及び選択的なBetブロモドメイン阻害剤であるI-Bet726(Gsk1324726A)の発見(The Discovery of I-Bet726 (Gsk1324726A) a Potent Tetrahydroquinoline Apoa1 Up-Regulator and Selective Bet Bromodomain Inhibitor)」 J. Med. Chem. 57: 8111 (2014)、結晶構造PDB 5EK9(「ヒドロキノリノン阻害剤との複合体におけるヒトBRD2の2番目のブロモドメインの結晶構造(Crystal structure of the second bromodomain of human BRD2 in complex with a hydroquinolinone inhibitor)」, Tallant C. et al)、結晶構造PDB 5BT5、結晶構造PDB 5dfd、Baud M.G. et al.著の「トリアゾロ-ベンゾジアゼピン類似体への新たな合成経路:選択的なブロモ及びエクストラターミナル(BET)ブロモドメイン阻害への凹凸アプローチの範囲の拡大(New Synthetic Routes to Triazolo-benzodiazepine Analogues: Expanding the Scope of the Bump-and-Hole Approach for Selective Bromo and Extra-Terminal (BET) Bromodomain Inhibition)」 J. Med. Chem. 59: 1492-1500 (2016)を参照のこと。 BRD4ブロモドメイン1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5WUU及び結晶構造PDB 5F5Zを参照のこと。 BRD4ブロモドメイン2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Chung C.W. et al.著の「Betファミリーブロモドメインの小分子阻害剤の発見及び特性評価(Discovery and Characterization of Small Molecule Inhibitors of the Bet Family Bromodomains)」 J. Med. Chem. 54: 3827 (2011)、及びRan X. et al.著の「強力で特異的なBETブロモドメイン阻害剤としてのγ-カルボリン類似体の構造ベースの設計(Structure-Based Design of gamma-Carboline Analogues as Potent and Specific BET Bromodomain Inhibitors)」 J. Med. Chem. 58: 4927-4939 (2015)を参照のこと。 BRDTの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 4flp及び結晶構造PDB 4kcxを参照のこと。 BRD9の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 4nqn、結晶構造PDB 4uit、結晶構造PDB 4uiu、結晶構造PDB 4uiv、結晶構造PDB 4z6h、結晶構造PDB 4z6i、結晶構造PDB 5e9v、結晶構造PDB 5eu1、結晶構造PDB 5f1h、結晶構造PDB 5fp2(「in vivoで活性な選択的BRD9阻害剤の構造ベースの設計(Structure-Based Design of an in Vivo Active Selective BRD9 Inhibitor)」 J Med Chem., 2016, 59(10), 4462、及び国際公開第2016/139361号)を参照のこと。 SMARCA4 PB1及び/又はSMARCA2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表し、Aは、N又はCHであり、かつmは、0、1、2、3、4、5、6、7、又は8である。 追加のブロモドメインの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Hewings et al.著の「3,5-ジメチルイソオキサゾールは、アセチル-リジンブロモドメインリガンドとして作用する(3 5-Dimethylisoxazoles Act as Acetyl-lysine Bromodomain Ligands.)」 J. Med. Chem. 54 6761-6770 (2011)、Dawson et al.著の「MLL融合白血病の有効な治療としてのクロマチンへのBET動員の阻害(Inhibition of BET Recruitment to Chromatin as an Effective Treatment for MLL-fusion Leukemia.)」 Nature, 478, 529-533 (2011)、米国特許出願公開第2015/0256700号、米国特許出願公開第2015/0148342号、国際公開第2015/074064号、国際公開第2015/067770号、国際公開第2015/022332号、国際公開第2015/015318号、及び国際公開第2015/011084号を参照のこと。 PB1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 3mb4、結晶構造PDB 4q0n、及び結晶構造PDB 5fh6を参照のこと。 SMARCA4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造3uvd及び結晶構造5dkdを参照のこと。 SMARCA2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造5dkc及び結晶構造5dkh、並びに国際公開第2020/023657号、米国特許出願公開第2020/0038378号、特許文献22、国際公開第2020/078933号、国際公開第2019/207538号、国際公開第2016/138114号、国際公開第2020/035779号、並びに「ブラフマ関連遺伝子1(BRG1)/SMARCA4突然変異癌の治療用のブラフマホモログ(BRM)/SMARCA2 ATPアーゼ活性の経口活性型阻害剤の発見(Discovery of Orally Active Inhibitors of Brahma Homolog (BRM)/ SMARCA2 ATPase Activity for the Treatment of Brahma Related Gene 1 (BRG1)/SMARCA4-Mutant Cancers)」 J Med Chem 2018, 61, 10155を参照のこと。 TRIM24(TIF1a)及び/又はBRPF1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表し、かつmは、0、1、2、3、4、5、6、7、又は8である。 TRIM24(TIF1a)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Palmer W.S. et al.著の「IACS-9571の構造情報に基づく設計:選択的な高親和性TRIM24-BRPF1ブロモドメイン二重阻害剤(Structure-Guided Design of IACS-9571: a Selective High-Affinity Dual TRIM24-BRPF1 Bromodomain Inhibitor.)」 J. Med. Chem. 59: 1440-1454 (2016)を参照のこと。 BRPF1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 4uye、結晶構造PDB 5c7n、結晶構造PDB 5c87、結晶構造PDB 5c89、結晶構造PDB 5d7x、結晶構造PDB 5dya、結晶構造PDB 5epr、結晶構造PDB 5eq1、結晶構造PDB 5etb、結晶構造PDB 5ev9、結晶構造PDB 5eva、結晶構造PDB 5ewv、結晶構造PDB 5eww、結晶構造PDB 5ffy、結晶構造PDB 5fg5、及び結晶構造PDB 5g4rを参照のこと。 CECR2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Moustakim M. et al. Med. Chem. Comm. 7:2246-2264 (2016)、及びCrawford T. et al. Journal of Med. Chem. 59; 5391-5402 (2016)を参照のこと。 CREBBPの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表し、Aは、N又はCHであり、かつmは、0、1、2、3、4、5、6、7、又は8である。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 3p1d、結晶構造PDB 3svh、結晶構造PDB 4nr4、結晶構造PDB 4nr5、結晶構造PDB 4ts8、結晶構造PDB 4nr6、結晶構造PDB 4nr7、結晶構造PDB 4nyw、結晶構造PDB 4nyx、結晶構造PDB 4tqn、結晶構造PDB 5cgp、結晶構造PDB 5dbm、結晶構造PDB 5ep7、結晶構造PDB 5i83、結晶構造PDB 5i86、結晶構造PDB 5i89、結晶構造PDB 5i8g、結晶構造PDB 5j0d、結晶構造PDB 5ktu、結晶構造PDB 5ktw、結晶構造PDB 5ktx、結晶構造PDB 5tb6を参照のこと。 EP300の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5BT3を参照のこと。 PCAFの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、M. Ghizzoni et al. Bioorg. Med. Chem. 18: 5826-5834 (2010)を参照のこと。 PHIPの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Mol Cancer Ther. 7(9): 2621-2632 (2008)を参照のこと。 TAF1及びTAF1Lの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Picaud S. et al. Sci Adv 2: e1600760-e1600760 (2016)を参照のこと。 ヒストンデアセチラーゼ2(HDAC2)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lauffer B. E. J. Biol. Chem. 288: 26926-26943 (2013)、Wagner F. F. Bioorg. Med. Chem. 24: 4008-4015 (2016)、Bressi J. C. Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 3142-3145 (2010)、及びLauffer B. E. J. Biol. Chem. 288: 26926-26943 (2013)を参照のこと。 ヒストンデアセチラーゼ4(HDAC4)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Burli R. W. J. Med. Chem. 56: 9934 (2013)、Luckhurst C. A. ACS Med. Chem. Lett. 7: 34 (2016)、Bottomley M. J. J. Biol. Chem. 283: 26694-26704 (2008)を参照のこと。 ヒストンデアセチラーゼ6の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Harding R. J.(公開予定)、Hai Y. Nat. Chem. Biol. 12: 741-747, (2016)、及びMiyake Y. Nat. Chem. Biol. 12: 748 (2016)を参照のこと。 ヒストンデアセチラーゼ7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lobera M. Nat. Chem. Biol. 9: 319 (2013)、及びSchuetz A. J. Biol. Chem. 283: 11355-11363 (2008)を参照のこと。 ヒストンデアセチラーゼ8の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Whitehead L. Biol. Med. Chem. 19: 4626-4634 (2011)、Tabackman A. A. J. Struct. Biol. 195: 373-378 (2016)、Dowling D. P. Biochemistry 47, 13554-13563 (2008)、Somoza J. R. Biochemistry 12, 1325-1334 (2004)、Decroos C. Biochemistry 54: 2126-2135 (2015)、Vannini A. Proc. Natl Acad. Sci. 101: 15064 (2004)、Vannini A. EMBO Rep. 8: 879 (2007)、結晶構造PDB 5BWZ、Decroos A. ACS Chem. Biol. 9: 2157-2164 (2014)、Somoza J. R. Biochemistry 12: 1325-1334 (2004)、Decroos C. Biochemistry 54: 6501-6513 (2015)、Decroos A. ACS Chem. Biol. 9: 2157-2164 (2014)、及びDowling D. P. Biochemistry 47: 13554-13563 (2008)を参照のこと。 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT2B)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Chaikuad A. J. Med. Chem. 59: 1648-1653 (2016)、結晶構造PDB 1ZS5、及びZeng L. J. Am. Chem. Soc. 127: 2376-2377 (2005)を参照のこと。 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT2A)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Ringel A. E. Acta Crystallogr. D. Struct. Biol. 72: 841-848 (2016)を参照のこと。 B型ヒストンアセチルトランスフェラーゼ触媒ユニット(HAT1)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 2P0Wを参照のこと。 サイクリックAMP依存性転写因子(ATF2)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT5)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 リジン特異的ヒストンデメチラーゼ1A(KDM1A)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Mimasu S. Biochemistry 49: 6494-6503 (2010)、Sartori L. J. Med. Chem. 60: 1673-1693 (2017)、及びVianello P. J. Med. Chem. 60: 1693-1715 (2017)を参照のこと。 HDAC6 Znフィンガードメインの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 一般的なリジンメチルトランスフェラーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 DOT1Lの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表し、Aは、N又はCHであり、かつmは、0、1、2、3、4、5、6、7、又は8である。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5MVS(「アデノシン及び阻害剤CPD1との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex with adenosine and inhibitor CPD1)」 Mobitz, H. et al., ACS Med Chem Lett., 2017, 8: 338-343)、結晶構造PDB 5MW3、5MW4(「阻害剤CPD7との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex inhibitor CPD7)」 Be C. et al.)、結晶構造PDB 5DRT(「阻害剤CPD2との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex inhibitor CPD2)」 Chen, C., et al., ACS Med Chem Lett., 2016, 7: 735-740)、結晶構造PDB 5DRY(「CPD3との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex with CPD3)」, Chen, C., et al., ACS Med Chem Lett., 2016, 7: 735-740)、PDB 5DSXの結晶構造(「CPD10との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex with CPD10)」, Chen, C., et al., ACS Med Chem Lett., 2016, 7: 735-740)、結晶構造PDB 5DT2(「CPD11との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex with CPD11)」, Chen, C., et al., ACS Med Chem Lett., 2016, 7: 735-740)、結晶構造PDB 5JUW(「SS148との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex with SS148)」 Yu W. et al. Structural Genomics Consortium)、結晶構造PDB 6TE6(「阻害剤の化合物3との複合体におけるDot1L(Dot1L in complex with an inhibitor, compound 3)」, Stauffer, F., et al., ACS Med Chem Lett., 2019, 10: 1655-1660)を参照のこと。 EHMT1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5TUZ(「阻害剤MS0124との複合体におけるEHMT1(EHMT1 in complex with inhibitor MS0124)」, Babault N. et al.)を参照のこと。 EHMT2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5TUY(「阻害剤MS0124との複合体におけるEHMT2(EHMT2 in complex with inhibitor MS0124)」, Babault N. et al.)、PDB結晶構造5TTF(「阻害剤MS012との複合体におけるEHMT2(EHMT2 in complex with inhibitor MS012)」, Dong A. et al.)、PDB結晶構造3RJW(Dong A. et al., Structural Genomics Consortium)、PDB結晶構造3K5K(Liu F. et al. J. Med. Chem. 52: 7950-7953 (2009))、及びPDB結晶構造4NVQ(「阻害剤A-366との複合体におけるEHMT2(EHMT2 in complex with inhibitor A-366)」 Sweis R.F. et al.)を参照のこと。 SETD2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5LSY(「シプロヘプタジンとの複合体におけるSETD2(SETD2 in complex with cyproheptadine)」, Tisi D. et al.)、Tisi D. et al. ACS Chem. Biol. 11: 3093-3105 (2016)、結晶構造PDB 5LSS、5LSX、5LSZ、5LT6、5LT7、及び5LT8、PDB結晶構造4FMU、並びにZheng W. et al. J. Am. Chem. Soc. 134: 18004-18014 (2012)を参照のこと。 SETD7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5AYF(「シプロヘプタジンとの複合体におけるSETD7(SETD7 in complex with cyproheptadine.)」 Niwa H. et al.)、PDB結晶構造4JLG(「(R)-PFI-2との複合体におけるSETD7(SETD7 in complex with (R)-PFI-2)」, Dong A. et al.)、PDB結晶構造4JDS(Dong A. et. al Structural Genomics Consortium)、PDB結晶構造4E47(Walker J.R. et al. Structural Genomics Consortium)、PDB結晶構造3VUZ(「AAM-1との複合体におけるSETD7(SETD7 in complex with AAM-1.)」 Niwa H. et al.)、PDB結晶構造3VVO、及びNiwa H et al. Acta Crystallogr. Sect.D 69: 595-602 (2013)を参照のこと。 SETD8の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5TH7(「MS453との複合体におけるSETD8(SETD8 in complex with MS453)」, Yu W. et al.)、及びPDB結晶構造5T5G(Yu W et. al.、公開予定)を参照のこと。 SETDB1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5KE2(「阻害剤XST06472Aとの複合体におけるSETDB1(SETDB1 in complex with inhibitor XST06472A)」, Iqbal A. et al.)、PDB結晶構造5KE3(「フラグメントMRT0181aとの複合体におけるSETDB1(SETDB1 in complex with fragment MRT0181a)」, Iqbal A. et al.)、PDB結晶構造5KH6(「フラグメントのメチル3-(メチルスルホニルアミノ)ベンゾエートとの複合体におけるSETDB1(SETDB1 in complex with fragment methyl 3-(methylsulfonylamino)benzoate)」, Walker J.R. et al. Structural Genomics Consortium)、及びPDB結晶構造5KCO(「[N]-(4-クロロフェニル)メタンスルホンアミドとの複合体におけるSETDB1(SETDB1 in complex with [N]-(4-chlorophenyl)methanesulfonamide)」, Walker J.R. et al.)を参照のこと。 SMYD2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5KJK(「阻害剤AZ13450370との複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with inhibitor AZ13450370)」, Cowen S.D. et al.)、PDB結晶構造5KJM(「AZ931との複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with AZ931)」, Cowen S.D. et al.)、PDB結晶構造5KJN(「AZ506との複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with AZ506)」, Cowen S.D. et al.)、PDB結晶構造5ARF(「N-[3-(4-クロロフェニル)-1-{N’-シアノ-N-[3-(ジフルオロメトキシ)フェニル]カルバムイミドイル}-4,5-ジヒドロ-1H-ピラゾール-4-イル]-N-エチル-2-ヒドロキシアセトアミドとの複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with N-[3-(4-chlorophenyl)-1-{N'-cyano-N-[3-(difluoromethoxy)phenyl]carbamimidoyl}-4 5-dihydro-1H-pyrazol-4-YL]-N-ethyl-2-hydroxyacetamide)」, Eggert E. et al.)、PDB結晶構造5ARG(「BAY598との複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with BAY598)」, Eggert E. et al.)、PDB結晶構造4YND(「A-893との複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with A-893)」, Sweis R.F. et al.)、PDB結晶構造4WUY(「LLY-507との複合体におけるSMYD2(SMYD2 in complex with LLY-507)」, Nguyen H. et al.)、及びPDB結晶構造3S7B(「N-シクロヘキシル-N-3-[2-(3,4-ジクロロフェニル)エチル]-N-(2-{[2-(5-ヒドロキシ-3-オキソ-3,4-ジヒドロ-2H-1,4-ベンゾオキサジン)-8-イル)エチル]アミノ}エチル)-β-アラニンアミド(N-cyclohexyl-N~3~-[2-(3 4-dichlorophenyl)ethyl]- N-(2-{[2-(5-hydroxy-3-oxo-3 4-dihydro-2H- 1 4-benzoxazin-8-yl)ethyl]amino}ethyl)-beta- alaninamide)」, Ferguson A.D. et al.)を参照のこと。 SMYD3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造5H17(「5’-{[(3S)-3-アミノ-3-カルボキシプロピル][3-(ジメチルアミノ)プロピル]アミノ}-5’-デオキシアデノシンとの複合体におけるSMYD3(SMYD3 in complex with 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl][3-(dimethylamino)propyl]amino}- 5'-deoxyadenosine)」, Van Aller G.S. et al.)、結晶構造5CCL(「オキシインドール化合物との複合体におけるSMYD3(SMYD3 in complex with oxindole compound)」, Mitchell L.H. et al.)、及び結晶構造5CCM(「SAM及びEPZ030456を伴うSMYD3の結晶構造(Crystal structure of SMYD3 with SAM and EPZ030456)」)を参照のこと。 SUV4-20H1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5CPR(「阻害剤A-196との複合体におけるSUV4-20H1(SUV4-20H1 in complex with inhibitor A-196), Bromberg K.D. et al.)を参照のこと。 野生型アンドロゲン受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5T8E及び5T8J(「4-(ピロリジン-1-イル)ベンゾニトリル誘導体との複合体におけるアンドロゲン受容体(Androgen Receptor in complex with 4-(pyrrolidin-1-yl)benzonitrile derivatives)」, Asano M. et al.)、Asano M. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. 27: 1897-1901 (2017)、PDB結晶構造5JJM(「アンドロゲン受容体(Androgen Receptor)」, Nadal M. et al.)、PDB結晶構造5CJ6(「2-クロロ-4-[[(1R,2R)-2-ヒドロキシ-2-メチル-シクロペンチル]アミノ]-3-メチル-ベンゾニトリル誘導体との複合体におけるアンドロゲン受容体(Androgen Receptor in complex with 2-Chloro-4-[[(1R 2R)-2-hydroxy-2-methyl-cyclopentyl]amino]-3-methyl-benzonitrile derivatives)」, Saeed A. et al.)、PDB結晶構造4QL8(「3-アルコキシ-ピロロ[1,2-b]ピラゾリン誘導体との複合体におけるアンドロゲン受容体(Androgen Receptor in complex with 3-alkoxy-pyrrolo[1 2-b]pyrazolines derivatives)」, Ullrich T. et al.)、PDB結晶構造4HLW(「仮想スクリーニングによるヒトアンドロゲン受容体のアンドロゲン受容体結合機能3(BF3)部位(Androgen Receptor Binding Function 3 (BF3) Site of the Human Androgen Receptor through Virtual Screening)」, Munuganti R.S. et al.)、PDB結晶構造3V49(「アクチベーターペプチド及びsarm阻害剤1を伴うアンドロゲン受容体lbd(Androgen Receptor lbd with activator peptide and sarm inhibitor 1)」, Nique F. et al.)、Nique F. et al. J. Med. Chem. 55: 8225-8235 (2012)、PDB結晶構造2YHD(「AF2小分子阻害剤との複合体におけるアンドロゲン受容体(Androgen Receptor in complex with AF2 small molecule inhibitor)」, Axerio-Cilies P. et al.)、PDB結晶構造3RLJ(「SARM S-22との複合体におけるアンドロゲン受容体リガンド結合ドメイン(Androgen Receptor ligand binding domain in complex with SARM S-22)」, Bohl C.E. et al.)、Bohl C.E. et al. J. Med. Chem. 54: 3973-3976 (2011)、PDB結晶構造3B5R(「SARM C-31との複合体におけるアンドロゲン受容体リガンド結合ドメイン(Androgen Receptor ligand binding domain in complex with SARM C-31)」, Bohl C.E. et al.)、Bohl C.E. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett.18: 5567-5570 (2008)、PDB結晶構造2PIP(「小分子との複合体におけるアンドロゲン受容体リガンド結合ドメイン(Androgen Receptor ligand binding domain in complex with small molecule)」, Estebanez-Perpina E. et al.)、Estebanez-Perpina. E. Proc. Natl. Acad. Sci. 104:16074-16079 (2007)、PDB結晶構造2PNU(「EM5744との複合体におけるアンドロゲン受容体リガンド結合ドメイン(Androgen Receptor ligand binding domain in complex with EM5744)」, Cantin L. et al.)、並びにPDB結晶構造2HVC(「LGD2226との複合体におけるアンドロゲン受容体リガンド結合ドメイン(Androgen Receptor ligand binding domain in complex with LGD2226)」, Wang F. et al.)を参照のこと。追加の関連のリガンドについては、Matias P.M. et al.著の「アンドロゲン非依存性前立腺癌に由来する突然変異ヒトアンドロゲン受容体(Ar(Ccr))における糖質コルチコイド応答についての構造的基礎(Structural Basis for the Glucocorticoid Response in a Mutant Human Androgen Receptor (Ar(Ccr)) Derived from an Androgen-Independent Prostate Cancer.)」 J. Med. Chem. 45: 1439 (2002)、Sack J.S. et al.著の「アンドロゲン受容体のリガンド結合ドメイン、及び天然のアゴニストであるジヒドロテストステロンと複合体を形成したそのT877A突然変異体の結晶学的構造(Crystallographic structures of the ligand-binding domains of the androgen receptor and its T877A mutant complexed with the natural agonist dihydrotestosterone.)」 Proc. Natl. Acad. Sci. 98: 4904-4909 (2001)、He B. et al.著の「アンドロゲン受容体ドメイン間相互作用及びコアクチベーター相互作用についての構造的基礎は、核内受容体活性化機能の優位性における移行を示唆している(Structural basis for androgen receptor interdomain and coactivator interactions suggests a transition in nuclear receptor activation function dominance.)」 Mol. Cell 16: 425-438 (2004)、Pereira de Jesus-Tran K.著の「様々なアゴニストと複合体を形成したヒトアンドロゲン受容体リガンド結合ドメインの結晶構造を比較すると、結合親和性を担う分子決定基が明らかになる(Comparison of crystal structures of human androgen receptor ligand-binding domain complexed with various agonists reveals molecular determinants responsible for binding affinity.)」 Protein Sci. 15: 987-999 (2006)、Bohl C.E. et al.著の「アンドロゲン受容体における非ステロイド性リガンドの適応についての構造的基礎(Structural Basis for Accommodation of Nonsteroidal Ligands in the Androgen Receptor.)」 Mol Pharmacol. 63(1):211-23 (2003)、Sun C. et al.著の「N-アリール-ヒドロキシビシクロヒダントイン足場に基づく強力な経口活性型で筋肉選択的なアンドロゲン受容体モジュレーターの発見(Discovery of potent orally-active and muscle-selective androgen receptor modulators based on an N-aryl-hydroxybicyclohydantoin scaffold.)」 J. Med. Chem. 49: 7596-7599 (2006)、Nirschl A.A. et al.著の「N-アリール-オキサゾリジン-2-イミンの筋肉選択的なアンドロゲン受容体モジュレーターは、ファーマコフォアの再配向を通じて効力を高める(N-aryl-oxazolidin-2-imine muscle selective androgen receptor modulators enhance potency through pharmacophore reorientation.)」 J. Med. Chem. 52: 2794-2798 (2009)、Bohl C.E. et al.著の「プロピオンアミド選択的アンドロゲン受容体モジュレーターの結合様式に対するB環置換パターンの影響(Effect of B-ring substitution pattern on binding mode of propionamide selective androgen receptor modulators.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 5567-5570 (2008)、Ullrich T. et al.著の「経皮投与に理想的な物理化学的特性を有する選択的アンドロゲン受容体モジュレーターとしての3-アルコキシ-ピロロ[1,2-b]ピラゾリン(3-alkoxy-pyrrolo[1 2-b]pyrazolines as selective androgen receptor modulators with ideal physicochemical properties for transdermal administration.)」 J. Med. Chem. 57: 7396-7411 (2014)、Saeed A. et al.著の「2-クロロ-4-[[(1R,2R)-2-ヒドロキシ-2-メチル-シクロペンチル]アミノ]-3-メチル-ベンゾニトリル:筋萎縮症用の経皮的選択的アンドロゲン受容体モジュレーター(SARM)(2-Chloro-4-[[(1R 2R)-2-hydroxy-2-methyl-cyclopentyl]amino]-3-methyl-benzonitrile: A Transdermal Selective Androgen Receptor Modulator (SARM) for Muscle Atrophy.)」 J. Med. Chem. 59: 750-755 (2016)、Nique et al.著の「新たな選択的アンドロゲン受容体モジュレーターとしてのジアリールヒダントインの発見(Discovery of diarylhydantoins as new selective androgen receptor modulators.)」 J. Med. Chem. 55: 8225-8235 (2012)、及びMichael E. Jung et al.著の「去勢抵抗性前立腺癌(CRPC)用のチオヒダントインアンドロゲン受容体アンタゴニストについての構造-活性相関(Structure-Activity Relationship for Thiohydantoin Androgen Receptor Antagonists for Castration-Resistant Prostate Cancer (CRPC).)」 J. Med. Chem. 53: 2779-2796 (2010)を参照のこと。 突然変異T877Aアンドロゲン受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造4OGH(「アンドロゲン受容体T877A-AR-LBD(Androgen Receptor T877A-AR-LBD)」, Hsu C.L. et al.)、及びPDB結晶構造2OZ7(「アンドロゲン受容体T877A-AR-LBD(Androgen Receptor T877A-AR-LBD)」, Bohl C.E. et al.)を参照のこと。 突然変異W741Lアンドロゲン受容体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造4OJB(「アンドロゲン受容体T877A-AR-LBD(Androgen Receptor T877A-AR-LBD)」, Hsu C.L. et al.)を参照のこと。 エストロゲン及び/又はアンドロゲンの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EGFR及びErbB2/4受容体についての標的化リガンドであるアファチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 VEGFR1/2/3受容体、PDGFRβ受容体、及びKit受容体についての標的化リガンドであるアキシチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BCR-Abl受容体、Src受容体、Lyn受容体、及びHck受容体についての標的化リガンドであるボスチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 RET受容体、c-Met受容体、VEGFR1/2/3受容体、Kit受容体、TrkB受容体、Flt3受容体、Axl受容体、及びTie2受容体についての標的化リガンドであるカボザンチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ALK受容体、IGF-1R受容体、InsR受容体、及びROS1受容体についての標的化リガンドであるセリチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 ALK受容体、c-Met受容体、HGFR受容体、ROS1受容体、及びMST1R受容体についての標的化リガンドであるクリゾチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 B-Raf受容体についての標的化リガンドであるダブラフェニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BCR-Abl受容体、Src受容体、Lck受容体、Lyn受容体、Yes受容体、Fyn受容体、Kit受容体、EphA2受容体、及びPDGFRβ受容体についての標的化リガンドであるダサチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EGFR受容体についての標的化リガンドであるエルロチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 HER2乳癌受容体、PNET受容体、RCC受容体、RAML受容体、及びSEGA受容体についての標的化リガンドであるエベロリムスの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EGFR受容体及びPDGFR受容体についての標的化リガンドであるゲフィチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BTK受容体についての標的化リガンドであるイブルチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BCR-Abl受容体、Kit受容体、及びPDGFR受容体についての標的化リガンドであるイマチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EGFR受容体及びErbB2受容体についての標的化リガンドであるラパチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 VEGFR1/2/3受容体、FGFR1/2/3/4受容体、PDGFRα受容体、Kit受容体、及びRET受容体についての標的化リガンドであるレンバチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BCR-Abl受容体、PDGRF受容体、及びDDR1受容体についての標的化リガンドであるニロチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 FGFR1/2/3受容体、Flt3受容体、Lck受容体、PDGFRα/β受容体、及びVEGFR1/2/3受容体についての標的化リガンドであるニンテダニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 CDK4/6受容体についての標的化リガンドであるパルボシクリブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 VEGFR1/2/3受容体、PDGFRα/β受容体、FGFR1/3受容体、Kit受容体、Lck受容体、Fms受容体、及びItk受容体についての標的化リガンドであるパゾパニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 BCR-Abl受容体、T315I VEGFR受容体、PDGFR受容体、FGFR受容体、EphR受容体、Srcファミリーキナーゼ受容体、Kit受容体、RET受容体、Tie2受容体、及びFlt3受容体についての標的化リガンドであるポナチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 VEGFR1/2/3、BCR-Abl、B-Raf、B-Raf(V600E)、Kit、PDGFRα/β、RET、FGFR1/2、Tie2、及びEph2Aについての標的化リガンドであるレゴラフェニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 JAK1/2受容体についての標的化リガンドであるルキソリチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 FKBP12/mTOR受容体についての標的化リガンドであるシロリムスの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 B-Raf受容体、CDK8受容体、Kit受容体、Flt3受容体、RET受容体、VEGFR1/2/3受容体、及びPDGFR受容体についての標的化リガンドであるソラフェニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PDGFRα/β、VEGFR1/2/3、Kit、Flt3、CSF-1R、RETについての標的化リガンドであるスニチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 FKBP12/mTORについての標的化リガンドであるテムシロリムスの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 JAK3受容体についての標的化リガンドであるトファシチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 MEK1/2受容体についての標的化リガンドであるトラメチニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 EGFR、VEGFR、RET、Tie2、Brk、及びEphRについての標的化リガンドであるバンデタニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 A/B/C-Raf受容体、KSR1受容体、及びB-Raf(V600E)受容体についての標的化リガンドであるベムラフェニブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PI3Ka受容体についての標的化リガンドであるイデラシブ(Idelasib)の非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PI3Ka受容体についての標的化リガンドであるブパルリシブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PI3Ka受容体についての標的化リガンドであるタセリシブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PI3Kaについての標的化リガンドであるコパンリシブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PI3Kaについての標的化リガンドであるアルペリシブの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 CNNTB1についての標的化リガンドであるニクロサミドの非限定的な例を示す図である。Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。 PCAF及びGCN5受容体1のBRD4ブロモドメイン(BRD4 Bromodomains of PCAF and GCN5 receptors 1)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5tpx(「PCAFブロモドメイン化学的プローブの発見(Discovery of a PCAF Bromodomain Chemical Probe)」)、Moustakim, M., et al. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 56: 827 (2017)、PDB結晶構造5mlj(「強力で細胞浸透性が高く、かつ選択的なp300/CBP関連因子(PCAF)/一般制御非抑制5(GCN5)ブロモドメイン化学的プローブの発見(Discovery of a Potent, Cell Penetrant, and Selective p300/CBP-Associated Factor (PCAF)/General Control Nonderepressible 5 (GCN5) Bromodomain Chemical Probe)」)、及びHumphreys, P. G. et al. J. Med. Chem. 60: 695 (2017)を参照のこと。 G9a(EHMT2)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガントについては、PDB結晶構造3k5k、(「ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼG9aの強力で選択的な阻害剤としての2,4-ジアミノ-7-アミノアルコキシキナゾリンの発見(Discovery of a 2,4-diamino-7-aminoalkoxyquinazoline as a potent and selective inhibitor of histone lysine methyltransferase G9a)」)、Liu, F. et al. J. Med. Chem. 52: 7950 (2009)、PDB結晶構造3rjw(「化学的プローブは、細胞内のG9a及びGLPメチルトランスフェラーゼ活性を選択的に阻害する(A chemical probe selectively inhibits G9a and GLP methyltransferase activity in cells)」)、Vedadi, M. et al. Nat. Chem. Biol. 7: 566 (2011)、PDB結晶構造4nvq(「ヒストンメチルトランスフェラーゼg9aの強力で選択的な阻害剤の発見及び開発(Discovery and development of potent and selective inhibitors of histone methyltransferase g9a)」、及びSweis, R.F. et al. ACS Med Chem Lett 5: 205 (2014)を参照のこと。 EZH2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5ij8(「阻害剤を伴うポリコーム抑制複合体2構造は、活性化及び薬剤耐性のメカニズムを明らかにする(Polycomb repressive complex 2 structure with inhibitor reveals a mechanism of activation and drug resistance)」、Brooun, A. et al. Nat Commun 7: 11384 (2016)、PDB結晶構造5ls6(「B細胞リンパ腫についての第I相臨床試験に適したヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2の強力で選択的な阻害剤である(R)-N-((4-メトキシ-6-メチル-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリジン-3-イル)メチル)-2-メチル-1-(1-(1-(2,2,2-トリフルオロエチル)ピペリジン-4-イル)エチル)-1H-インドール-3-カルボキサミド(CPI-1205)の同定(Identification of (R)-N-((4-Methoxy-6-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)methyl)-2-methyl-1-(1-(1-(2,2,2-trifluoroethyl)piperidin-4-yl)ethyl)-1H-indole-3-carboxamide (CPI-1205), a Potent and Selective Inhibitor of Histone Methyltransferase EZH2, Suitable for Phase I Clinical Trials for B-Cell Lymphomas)」)、Vaswani, R.G. et al. J. Med. Chem. 59: 9928 (2016)、並びにPDB結晶構造5ij8及び5ls6を参照のこと。 EEDの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造5h15及び5h19(「EEDによる多様な一連のポリコーム抑制複合体2阻害剤の認識の発見及び分子的基礎(Discovery and Molecular Basis of a Diverse Set of Polycomb Repressive Complex 2 Inhibitors Recognition by EED)」)、Li, L. et al. PLoS ONE 12: e0169855 (2017)、並びにPDB結晶構造5h19を参照のこと。 KMT5A(SETD8)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、PDB結晶構造5t5gを参照のこと。 DOT1Lの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造4eki(「コンフォメーション適応は、ヒトタンパク質メチルトランスフェラーゼDOT1Lの強力で選択的かつ持続的な阻害を誘導する(Conformational adaptation drives potent, selective and durable inhibition of the human protein methyltransferase DOT1L)」)、Basavapathruni, A. et al. Chem. Biol. Drug Des. 80: 971 (2012)、PDB結晶構造4hra(「MLL融合白血病の治療としてのDOT1Lの強力な阻害(Potent inhibition of DOT1L as treatment of MLL-fusion leukemia)」)、Daigle, S.R. et al. Blood 122: 1017 (2013)、PDB結晶構造5dry(「構造ベースのフラグメント化アプローチによる新規のDot1L阻害剤の発見(Discovery of Novel Dot1L Inhibitors through a Structure-Based Fragmentation Approach)」)、Chen, C. et al. ACS Med. Chem. Lett. 7: 735 (2016)、PDB結晶構造5dt2(「構造ベースのフラグメント化アプローチによる新規のDot1L阻害剤の発見(Discovery of Novel Dot1L Inhibitors through a Structure-Based Fragmentation Approach)」)、及びChen, C. et al. ACS Med. Chem. Lett. 7: 735 (2016)を参照のこと。 PRMT3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造3smq(「タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ3のアロステリック阻害剤(An allosteric inhibitor of protein arginine methyltransferase 3)」)、Siarheyeva, A. et al. Structure 20: 1425 (2012)、PDB結晶構造4ryl(「タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ3(PRMT3)の強力で選択的かつ細胞活性なアロステリック阻害剤(A Potent, Selective and Cell-Active Allosteric Inhibitor of Protein Arginine Methyltransferase 3 (PRMT3))」)、及びKaniskan, H.U. et al. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 54: 5166 (2015)を参照のこと。 CARM1(PRMT4)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「インドール阻害剤及びピラゾール阻害剤によるCarm1阻害の構造的基礎(Structural Basis for Carm1 Inhibition by Indole and Pyrazole Inhibitors.)」 Sack, J.S. et al. Biochem. J. 436: 331 (2011)において記載されるPDB結晶構造2y1x及び2y1w並びに関連のリガンドを参照のこと。 PRMT5の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「MCLモデルにおけるin vivo及びin vitroでの効力を有するPRMT5の選択的阻害剤(A selective inhibitor of PRMT5 with in vivo and in vitro potency in MCL models.)」 Chan-Penebre, E. Nat. Chem. Biol. 11: 432 (2015)において記載されるPDB結晶構造4x61及び関連のリガンドを参照のこと。 PRMT6の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「アルギニンメチルトランスフェラーゼの強力な阻害剤としてのアリールピラゾール:最初のPRMT6ツール化合物の同定(Aryl Pyrazoles as Potent Inhibitors of Arginine Methyltransferases: Identification of the First PRMT6 Tool Compound.)」 Mitchell, L.H. et al. ACS Med. Chem. Lett. 6: 655 (2015)において記載されるPDB結晶構造4y30及び関連のリガンドを参照のこと。 LSD1(KDM1A)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「ヒストンリジンデメチラーゼKDM1A/LSD1の新たな可逆的阻害剤としてのチエノ[3,2-b]ピロール-5-カルボキサミド。パート2:構造ベースの薬物設計及び構造活性相関(Thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamides as New Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1. Part 2: Structure-Based Drug Design and Structure-Activity Relationship.)」 Vianello, P. et al. J. Med. Chem. 60: 1693 (2017)において記載されるPDB結晶構造5lgu及び関連のリガンドを参照のこと。 KDM4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、PDB結晶構造3rvh、「フラグメントのドッキング及び連結による十文字ヒストンデメチラーゼ阻害剤の発見(Docking and Linking of Fragments to Discover Jumonji Histone Demethylase Inhibitors.)」 Korczynska, M., et al. J. Med. Chem. 59: 1580 (2016)において記載されるPDB結晶構造5a7p及び関連のリガンド、並びに「強力な細胞透過性KDM4(JMJD2)及びKDM5(JARID1)ヒストンリジンデメチラーゼ阻害剤としての8位置換されたピリド[3,4-d]ピリミジン-4(3H)-オン誘導体(8-Substituted Pyrido[3,4-d]pyrimidin-4(3H)-one Derivatives As Potent, Cell Permeable, KDM4 (JMJD2) and KDM5 (JARID1) Histone Lysine Demethylase Inhibitors.)」 Bavetsias, V. et al. J. Med. Chem. 59: 1388 (2016)において記載されるPDB結晶構造3f3c及び関連のリガンドを参照のこと。 KDM5の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「ヒトKdm5Bの構造解析は、ヒストンデメチラーゼ阻害剤の開発に導く(Structural Analysis of Human Kdm5B Guides Histone Demethylase Inhibitor Development.)」 Johansson, C. et al. Nat. Chem. Biol. 12: 539 (2016)において記載されるPDB結晶構造3fun及び関連のリガンド、並びに「KDM5デメチラーゼの阻害剤は、薬物耐性の癌細胞の生存を低下させる(An inhibitor of KDM5 demethylases reduces survival of drug-tolerant cancer cells.)」 Vinogradova, M. et al. Nat. Chem. Biol. 12: 531 (2016)において記載されるPDB結晶構造5ceh及び関連のリガンドを参照のこと。 KDM6の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「選択的な十文字H3K27デメチラーゼ阻害剤は、炎症誘発性マクロファージ応答を調節する(A Selective Jumonji H3K27 Demethylase Inhibitor Modulates the Proinflammatory Macrophage Response.)」 Kruidenier, L. et al. Nature 488: 404 (2012)において記載されるPDB結晶構造4ask及び関連のリガンドを参照のこと。 L3MBTL3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、PDB結晶構造4fl6を参照のこと。 メニンの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「メニン-MLL相互作用の薬理学的阻害は、in vivoでMLL白血病の進行を遮断する(Pharmacologic Inhibition of the Menin-MLL Interaction Blocks Progression of MLL Leukemia In Vivo)」 Borkin, D. et al. Cancer Cell 27: 589 (2015)において記載されるPDB結晶構造4x5y及び関連のリガンド、並びに「メニン混合形質型白血病(MLL)相互作用の高親和性小分子阻害剤は、天然のタンパク質間相互作用を厳密に模倣する(High-Affinity Small-Molecule Inhibitors of the Menin-Mixed Lineage Leukemia (MLL) Interaction Closely Mimic a Natural Protein-Protein Interaction)」 He, S. et al. J. Med. Chem. 57: 1543 (2014)において記載されるPDB結晶構造4og8及び関連のリガンドを参照のこと。 HDAC6の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、PDB結晶構造5kh3及び5eeiを参照のこと。 HDAC7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「ヒトHDAC7は、クラスIIaヒストンデアセチラーゼに特異的な亜鉛結合モチーフ及び潜在的なデアセチラーゼ活性を有する(Human HDAC7 harbors a class IIa histone deacetylase-specific zinc binding motif and cryptic deacetylase activity.)」Schuetz, A. et al. J. Biol. Chem. 283: 11355 (2008)において記載されるPDB結晶構造3c10及び関連のリガンド、並びに「非キレート性亜鉛結合基を介した選択的なクラスIiaヒストンデアセチラーゼ阻害(Selective Class Iia Histone Deacetylase Inhibition Via a Non-Chelating Zinc Binding Group.)」 Lobera, M. et al. Nat. Chem. Biol. 9: 319 (2013)において記載されるPDB結晶構造PDB 3zns及び関連のリガンドを参照のこと。 非受容体1型タンパク質チロシンホスファターゼPTP1Bの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「ホスホチロシンペプチドミメティクスによるタンパク質チロシンホスファターゼ1Bの阻害についての構造的基礎(Structural basis for inhibition of the protein tyrosine phosphatase 1B by phosphotyrosine peptide mimetics)」 Groves, M.R. et al. Biochemistry 37: 17773-17783 (1998)において記載されるPDB結晶構造1bzj、「強力で経口活性型の小分子PTP1B阻害剤である[(3-ブロモ-7-シアノ-2-ナフチル)(ジフルオロ)メチル]ホスホン酸の発見(Discovery of [(3-bromo-7-cyano-2-naphthyl)(difluoro)methyl]phosphonic acid, a potent and orally active small molecule PTP1B inhibitor.)」 Han Y, Bioorg Med Chem Lett. 18:3200-5 (2008)において記載されるPDB結晶構造3cwe、「タンパク質チロシンホスファターゼ1B阻害剤としての二環式及び三環式チオフェン(Bicyclic and tricyclic thiophenes as protein tyrosine phosphatase 1B inhibitors.)」 Moretto, A.F. et al. Bioorg. Med. Chem. 14: 2162-2177 (2006)において記載されるPDB結晶構造2azr及び2b07、「タンパク質チロシンホスファターゼ-1B阻害剤の構造ベースの設計(Structure-Based Design of Protein Tyrosine Phosphatase-1B Inhibitors.)」 Black, E. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. 15: 2503 (2005)及び「イソチアゾリジノン複素環式ホスホネートミメティクスによるタンパク質チロシンホスファターゼ1Bの阻害についての構造的基礎(Structural Basis for Inhibition of Protein-Tyrosine Phosphatase 1B by Isothiazolidinone Heterocyclic Phosphonate Mimetics.)」 Ala, P.J. et al. J. Biol. Chem. 281: 32784 (2006)において記載されるPDB結晶構造PDB 2bgd、2bge、2cm7、2cm8、2cma、2cmb、2cmc、「ホスファターゼPTP1B阻害剤としての1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリニルスルファミン酸(1,2,3,4-Tetrahydroisoquinolinyl sulfamic acids as phosphatase PTP1B inhibitors.)」 Klopfenstein, S.R. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. 16: 1574-1578 (2006)において記載されるPDB結晶構造2f6t及び2f6w、「タンパク質チロシンホスファターゼ1B阻害剤としての単環式チオフェン:Asp48との相互作用の捕捉(Monocyclic thiophenes as protein tyrosine phosphatase 1B inhibitors: Capturing interactions with Asp48.)」 Wan, Z.K. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. 16: 4941-4945 (2006)において記載されるPDB結晶構造2h4g、2h4k、2hb1、「タンパク質チロシンホスファターゼ-1B阻害剤の構造ベースの最適化:アルギニン24との相互作用の捕捉(Structure-based optimization of protein tyrosine phosphatase-1 B inhibitors: capturing interactions with arginine 24.)」 Wan, Z. K. et al. Chem Med Chem. 3:1525-9 (2008)において記載されるPDB結晶構造2zn7、「チオフェンPTP1B阻害剤の酸置換のプロービング(Probing acid replacements of thiophene PTP1B inhibitors.)」 Wan, Z.K. et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 2913-2920 (2007)において記載されるPDB結晶構造2nt7、2nta、並びに「抗糖尿病薬としてのチアジアゾール誘導体(Thiadiazole derivatives as antidiabetic agents)」と題するNovartis AGに譲渡された国際公開第2008/148744号を参照のこと。また、「2-(オキサリルアミノ)-安息香酸は、タンパク質チロシンホスファターゼの一般的な競合阻害剤である(2-(oxalylamino)-benzoic acid is a general, competitive inhibitor of protein-tyrosine phosphatases.)」 Andersen, H.S. et al. J. Biol. Chem. 275: 7101-7108 (2000)、「タンパク質チロシンホスファターゼ1Bの低分子量、非リン、非ペプチド、及び選択性が高い阻害剤の構造ベースの設計(Structure-based design of a low molecular weight, nonphosphorus, nonpeptide, and highly selective inhibitor of protein-tyrosine phosphatase 1B.)」 Iversen, L.F. et al. J. Biol. Chem. 275: 10300-10307 (2000)、及び「タンパク質チロシンホスファターゼの選択的阻害剤の構造ベースの設計についての基礎としての立体障害(Steric hindrance as a basis for structure-based design of selective inhibitors of protein-tyrosine phosphatases.)」 Iversen, L.F. et al. Biochemistry 40: 14812-14820 (2001)において記載されるPDB結晶構造1c84、1c84、1c85、1c86、1c88、1l8gも参照のこと。 非受容体11型チロシンタンパク質ホスファターゼSHP2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「発癌性Src相同性-2ドメイン含有タンパク質チロシンホスファターゼ-2(SHP2)についてのサリチル酸ベースの小分子阻害剤(Salicylic acid based small molecule inhibitor for the oncogenic Src homology-2 domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (SHP2).)」 Zhang, X. et al. J. Med. Chem. 53: 2482-2493 (2010)において記載される結晶構造PDB 4pvg及び305x、並びに「SHP2のアロステリック阻害:強力で選択的かつ経口で効果的なホスファターゼ阻害剤の同定(Allosteric Inhibition of SHP2: Identification of a Potent, Selective, and Orally Efficacious Phosphatase Inhibitor.)」 Garcia Fortanet, J. et al. J. Med. Chem. 59: 7773-7782 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ehr及び関連のリガンドを参照のこと。また、「SHP2のアロステリック阻害:強力で選択的かつ経口で効果的なホスファターゼ阻害剤の同定(Allosteric Inhibition of SHP2: Identification of a Potent, Selective, and Orally Efficacious Phosphatase Inhibitor.)」 Garcia Fortanet, J. et al. J. Med. Chem. 59: 7773-7782 (2016)、及び「SHP2ホスファターゼのアロステリック阻害は、受容体チロシンキナーゼによって誘導される癌を阻害する(Allosteric inhibition of SHP2 phosphatase inhibits cancers driven by receptor tyrosine kinases.)」 Chen, Y.P. et al. Nature 535: 148-152 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ehrも参照のこと。 非受容体22型チロシンタンパク質ホスファターゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「自己免疫疾患に関連する標的であるリンパ系特異的チロシンホスファターゼ(LYP)についての強力で選択的な小分子阻害剤(A Potent and Selective Small-Molecule Inhibitor for the Lymphoid-Specific Tyrosine Phosphatase (LYP), a Target Associated with Autoimmune Diseases.)」 He, Y. et al. J. Med. Chem. 56: 4990-5008 (2013)において記載される結晶構造PDB 4j51を参照のこと。 スカベンジャーmRNA脱キャッピング酵素DcpSの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、「脊髄性筋萎縮症用の治療標的としてのDcpS(DcpS as a therapeutic target for spinal muscular atrophy.)」 Singh, J. et al. ACS Chem.Biol. 3: 711-722 (2008)において記載される結晶構造PDB 3bl7、3bl9、3bla、4qde、4qdv、4qeb、及び関連のリガンドを参照のこと。 BRD4ブロモドメイン1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Filippakopoulos, P. et al.著の「BETファミリーのブロモドメインを標的とするタンパク質相互作用阻害剤としてのベンゾジアゼピン及びベンゾトリアゼピン(Benzodiazepines and benzotriazepines as protein interaction inhibitors targeting bromodomains of the BET family)」, Bioorg. Med. Chem. 20: 1878-1886 (2012)における結晶構造PDB 3u5k及び3u51並びに関連のリガンド、結晶構造PDB 3u5l、Dawson, M.A. et al.著の「Mll融合性白血病に有効な治療法としてのクロマチンへのBetの動員の阻害(Inhibition of Bet Recruitment to Chromatin as an Effective Treatment for Mll-Fusion Leukaemia.)」 Nature 478: 529 (2011)において記載される結晶構造PDB 3zyu及び関連のリガンド、Mirguet, O. et al.著の「新規のBetファミリーブロモドメイン阻害剤としてのナフチリジン(Naphthyridines as Novel Bet Family Bromodomain Inhibitors.)」 Chemmedchem 9: 589 (2014)において記載される結晶構造PDB 4bw1及び関連のリガンド、Dittmann, A. et al.著の「一般的に使用されるPi3-キナーゼプローブLy294002は、Betブロモドメインの阻害剤である(The Commonly Used Pi3-Kinase Probe Ly294002 is an Inhibitor of Bet Bromodomains)」 ACS Chem. Biol. 9: 495 (2014)において記載される結晶構造PDB 4cfl及び関連のリガンド、Fish, P.V. et al.著の「フラグメント由来のヒットの最適化によるブロモ及び余分なC末端ブロモドメイン阻害のための化学的プローブの同定(Identification of a chemical probe for bromo and extra C-terminal bromodomain inhibition through optimization of a fragment-derived hit.)」 J. Med. Chem. 55: 9831-9837 (2012)において記載される結晶構造PDB 4e96及び関連のリガンド、Atkinson, S.J. et al.著の「新規のエピジェネティックプローブとしての二重Hdac/Bet阻害剤の構造ベースの設計(The Structure Based Design of Dual Hdac/Bet Inhibitors as Novel Epigenetic Probes.)」 Medchemcomm 5: 342 (2014)において記載される結晶構造PDB 4clb及び関連のリガンド、Zhang, G. et al.著の「BRD4阻害によるHIV関連腎臓疾患におけるNF-κB転写活性の下方調節(Down-regulation of NF-{kappa}B Transcriptional Activity in HIV-associated Kidney Disease by BRD4 Inhibition.)」 J. Biol. Chem. 287: 28840-28851 (2012)において記載される結晶構造PDB 4f3i及び関連のリガンド、Zhao, L.著の「ヒストンリーダーBRD4ブロモドメインの阻害剤としての2-チアゾリジノンのフラグメントベースの創薬(Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.)」 J. Med. Chem. 56: 3833-3851 (2013)において記載される結晶構造PDB 4hxl及び関連のリガンド、Zhao, L. et al.著の「ヒストンリーダーBRD4ブロモドメインの阻害剤としての2-チアゾリジノンのフラグメントベースの創薬(Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.)」 J. Med. Chem. 56: 3833-3851 (2013)において記載される結晶構造PDB 4hxs及び関連のリガンド、Gehling, V.S. et al.著の「イソオキサゾールアゼピンBET阻害剤の発見、設計、及び最適化(Discovery, Design, and Optimization of Isoxazole Azepine BET Inhibitors.)」 ACS Med Chem Lett 4: 835-840 (2013)において記載される結晶構造PDB 4lrg及び関連のリガンド、Vidler, L.R. et al.著の「構造ベースの仮想スクリーニングを使用するBRD4の新規の小分子阻害剤の発見(Discovery of Novel Small-Molecule Inhibitors of BRD4 Using Structure-Based Virtual Screening.)」 J. Med. Chem. 56: 8073-8088 (2013)において記載される結晶構造PDB 4mep及び関連のリガンド、Ember, S.W. et al.著の「ブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)のアセチル-リジン結合部位は、多様なキナーゼ阻害剤と相互作用する(Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.)」 ACS Chem.Biol. 9: 1160-1171 (2014)において記載される結晶構造PDB 4nr8及びPDB 4c77並びに関連のリガンド、Ember, S.W. et al.著の「ブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)のアセチル-リジン結合部位は、多様なキナーゼ阻害剤と相互作用する(Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.)」 ACS Chem. Biol. 9: 1160-1171 (2014)において記載される結晶構造PDB 4o7a及び関連のリガンド、「ブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)のアセチル-リジン結合部位は、多様なキナーゼ阻害剤と相互作用する(Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.)」 Ember, S.W. et al. (2014) ACS Chem. Biol. 9: 1160-1171において記載される結晶構造PDB 407b及び関連のリガンド、Ember, S.W. et al.著の「ブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)のアセチル-リジン結合部位は、多様なキナーゼ阻害剤と相互作用する(Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.)」 ACS Chem. Biol. 9: 1160-1171 (2014)において記載される結晶構造PDB 4o7c及び関連のリガンド、結晶構造PDB 4gpj、Theodoulou, N.H. et al.著の「ブロモドメイン含有タンパク質9阻害のための選択的細胞活性化学的プローブであるI-Brd9の発見(The Discovery of I-Brd9, a Selective Cell Active Chemical Probe for Bromodomain Containing Protein 9 Inhibition.)」 J. Med. Chem. 59: 1425 (2016)において記載される結晶構造PDB 4uix及び関連のリガンド、Theodoulou, N.H., et al.著の「ブロモドメイン含有タンパク質9阻害のための選択的細胞活性化学的プローブであるI-Brd9の発見(The Discovery of I-Brd9, a Selective Cell Active Chemical Probe for Bromodomain Containing Protein 9 Inhibition.)」 J. Med. Chem. 59: 1425 (2016)において記載される結晶構造PDB 4uiz及び関連のリガンド、McKeown, M.R. et al.著の「偏った多成分反応による新規のブロモドメイン阻害剤の開発(Biased multicomponent reactions to develop novel bromodomain inhibitors.)」 J. Med. Chem. 57: 9019-9027 (2014)において記載される結晶構造PDB 4wiv及び関連のリガンド、Taylor, A.M. et al.著の「BETブロモドメインの経口活性型阻害剤としてのベンゾトリアゾロ[4,3-d][1,4]ジアゼピンの発見(Discovery of Benzotriazolo[4,3-d][1,4]diazepines as Orally Active Inhibitors of BET Bromodomains.)」 ACS Med. Chem. Lett. 7: 145-150 (2016)において記載される結晶構造PDB 4x2i及び関連のリガンド、Duffy, B.C.著の「タンパク質リガンドのドッキング及び構造情報に基づく設計を使用するBRD4(1)阻害剤の新たな化学的系列の発見(Discovery of a new chemical series of BRD4(1) inhibitors using protein-ligand docking and structure-guided design.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 25: 2818-2823 (2015)において記載される結晶構造PDB 4yh3及び関連のリガンド、Duffy, B.C.著の「タンパク質リガンドのドッキング及び構造情報に基づく設計を使用するBRD4(1)阻害剤の新たな化学的系列の発見(Discovery of a new chemical series of BRD4(1) inhibitors using protein-ligand docking and structure-guided design.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 25: 2818-2823 (2015)において記載される結晶構造PDB 4yh4及び関連のリガンド、Taylor, A.M.著の「BETブロモドメインの経口活性型阻害剤としてのベンゾトリアゾロ[4,3-d][1,4]ジアゼピンの発見(Discovery of Benzotriazolo[4,3-d][1,4]diazepines as Orally Active Inhibitors of BET Bromodomains.)」 ACS Med. Chem. Lett. 7: 145-150 (2016)において記載される結晶構造PDB 4z1q及び関連のリガンド、結晶構造PDB 4zw1、Demont, E.H.著の「低マイクロモル濃度のAtad2ブロモドメイン阻害剤のフラグメントベースの発見(Fragment-Based Discovery of Low-Micromolar Atad2 Bromodomain Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 58: 5649 (2015)において記載される結晶構造PDB 5a5s及び関連のリガンド、Bamborough, P.著の「強力なAtad2ブロモドメイン阻害剤へのナフチリドンの構造ベースの最適化(Structure-Based Optimization of Naphthyridones Into Potent Atad2 Bromodomain Inhibitors)」 J. Med. Chem. 58: 6151 (2015)において記載される結晶構造PDB 5a85及び関連のリガンド、Sullivan, J.M.著の「自閉症様症候群は、若いマウスにおけるBetタンパク質の薬理学的抑制によって誘発される(Autism-Like Syndrome is Induced by Pharmacological Suppression of Bet Proteins in Young Mice.)」 J. Exp. Med. 212: 1771 (2015)において記載される結晶構造PDB 5acy及び関連のリガンド、Waring, M.J. et al.著の「Betブロモドメインの強力で選択的な二価阻害剤(Potent and Selective Bivalent Inhibitors of Bet Bromodomains.)」 Nat. Chem. Biol. 12: 1097 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ad2及び関連のリガンド、Chekler, E.L. et al.著の「選択的CREB結合タンパク質ブロモドメイン阻害剤の転写プロファイリングは、治療の機会を強調する(Transcriptional Profiling of a Selective CREB Binding Protein Bromodomain Inhibitor Highlights Therapeutic Opportunities.)」 Chem. Biol. 22: 1588-1596 (2015)において記載される結晶構造PDB 5cfw及び関連のリガンド、Xue, X. et al.著の「強力で特異的なBETブロモドメイン阻害剤としてのベンゾ[cd]インドール-2(1H)-オンの発見:構造ベースの仮想スクリーニング、最適化、及び生物学的評価(Discovery of Benzo[cd]indol-2(1H)-ones as Potent and Specific BET Bromodomain Inhibitors: Structure-Based Virtual Screening, Optimization, and Biological Evaluation.)」 J. Med. Chem. 59: 1565-1579 (2016)において記載される結晶構造PDB 5cqt及び関連のリガンド、Hugle, M. et al.著の「4-アシルピロール誘導体は、BRD4(1)のアセチルリジン認識部位の阻害剤を設計する新規ベクターを生成する(4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).)」 J. Med. Chem. 59: 1518-1530 (2016)において記載される結晶構造PDB 5d3r及び関連のリガンド、Milhas, S. et al.著の「タンパク質間相互作用阻害(2P2I)指向の化学的ライブラリーは、ヒットの発見を加速する(Protein-Protein Interaction Inhibition (2P2I)-Oriented Chemical Library Accelerates Hit Discovery.)」 (2016) ACS Chem.Biol. 11: 2140-2148において記載される結晶構造PDB 5dlx及び関連のリガンド、Milhas, S. et al.著の「タンパク質間相互作用阻害(2P2I)指向の化学的ライブラリーは、ヒットの発見を加速する(Protein-Protein Interaction Inhibition (2P2I)-Oriented Chemical Library Accelerates Hit Discovery.)」 ACS Chem. Biol. 11: 2140-2148 (2016)において記載される結晶構造PDB 5dlz及び関連のリガンド、Kharenko, O.A. et al.著の「BETブロモドメインの新規のBD2選択的阻害剤であるRVX-297(RVX-297- a novel BD2 selective inhibitor of BET bromodomains.)」 Biochem. Biophys. Res. Commun. 477: 62-67 (2016)において記載される結晶構造PDB 5dw2及び関連のリガンド、結晶構造PDB 5dlx、Albrecht, B.K. et al.著の「ヒトの臨床試験についての候補としてのブロモドメイン及びエクストラターミナル(BET)ファミリーのベンゾイソオキサゾロアゼピン阻害剤(CPI-0610)の同定(Identification of a Benzoisoxazoloazepine Inhibitor (CPI-0610) of the Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Family as a Candidate for Human Clinical Trials.)」 J. Med. Chem. 59: 1330-1339 (2016)において記載される結晶構造PDB 5his及び関連のリガンド、Crawford, T.D. et al.著の「CBP/EP300のブロモドメインについての強力で選択的なin vivoプローブ(GNE-272)の発見(Discovery of a Potent and Selective in Vivo Probe (GNE-272) for the Bromodomains of CBP/EP300.)」 J. Med. Chem. 59: 10549-10563 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ku3及び関連のリガンド、Bamborough, P. et al.著の「ATAD2ブロモドメインについての化学的プローブ(A Chemical Probe for the ATAD2 Bromodomain.)」 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 55: 11382-11386 (2016)において記載される結晶構造PDB 5lj2及び関連のリガンド、Wang, L.著の「強力なブロモドメイン及びエクストラターミナルドメイン(BET)ファミリーのブロモドメイン阻害剤としての新規のピリドン及びピリドン大環状分子のフラグメントベースの構造に対応した発見(Fragment-based, structure-enabled discovery of novel pyridones and pyridone macrocycles as potent bromodomain and extra-terminal domain (BET) family bromodomain inhibitors.)」 J. Med. Chem. 10.1021/acs.jmedchem.7b00017 (2017)において記載される結晶構造PDB 5dlx及び関連のリガンド、「BRD4阻害剤としてのベンズイミダゾール誘導体、並びにそれらの調製及び癌治療のための使用(Benzimidazole derivatives as BRD4 inhibitors and their preparation and use for the treatment of cancer)」と題するBoehringer Ingelheim International GmbH(ドイツ)に譲渡された国際公開第2015/169962号、及び「アゾロジアゼピン誘導体、並びにその調製、新形成、炎症性疾患、及び他の障害を治療する組成物及び方法(Azolodiazepine derivatives and their preparation, compositions and methods for treating neoplasia, inflammatory disease and other disorders)」と題するDana-Farber Cancer Institute, Inc(米国)に譲渡された国際公開第2011/143669号を参照のこと。 ALKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Bossi, R.T. et al.著の「ATP競合阻害剤との複合体における未分化リンパ腫キナーゼの結晶構造(Crystal Structures of Anaplastic Lymphoma Kinase in Complex with ATP Competitive Inhibitors)」 Biochemistry 49: 6813-6825 (2010)において記載される結晶構造PDB 2xb7及び2xba並びに関連のリガンド、Huang, Q. et al.著の「強力で選択的な阻害剤の設計によるクリゾチニブに耐性の臨床的未分化リンパ腫キナーゼ突然変異の克服(Design of Potent and Selective Inhibitors to Overcome Clinical Anaplastic Lymphoma Kinase Mutations Resistant to Crizotinib.)」 J. Med. Chem. 57: 1170 (2014)において記載される結晶構造PDB 2yfx、4ccb、4ccu、及び4cd0並びに関連のリガンド、Johnson, T.W. et al.著の「前臨床脳曝露及びAlk耐性突然変異に対する広域スペクトル効力を有するAlk/Ros1の大環状阻害剤である(10R)-7-アミノ-12-フルオロ-2,10,16-トリメチル-15-オキソ-10,15,16,17-テトラヒドロ-2H-8,4-(メテノ)ピラゾロ[4,3-H][2,5,11]ベンゾオキサジアザシクロテトラデシン-3-カルボニトリル(Pf-06463922)の発見(Discovery of (10R)-7-Amino-12-Fluoro-2,10,16-Trimethyl-15-Oxo-10,15,16,17-Tetrahydro-2H-8,4-(Metheno)Pyrazolo[4,3-H][2,5,11]Benzoxadiazacyclotetradecine-3-Carbonitrile (Pf-06463922), a Macrocyclic Inhibitor of Alk/Ros1 with Pre-Clinical Brain Exposure and Broad Spectrum Potency Against Alk-Resistant Mutations.)」 J. Med. Chem. 57: 4720 (2014)において記載される結晶構造PDB、4cli、4cmo、及び4cnh並びに関連のリガンド、Epstein, L.F. et al.著の「R1275Q神経芽細胞腫突然変異体及び或る特定のATP競合阻害剤は、未分化リンパ腫キナーゼの代替活性化ループ構造を安定化する(The R1275Q Neuroblastoma Mutant and Certain ATP-competitive Inhibitors Stabilize Alternative Activation Loop Conformations of Anaplastic Lymphoma Kinase.)」 J. Biol. Chem. 287: 37447-37457 (2012)において記載される結晶構造PDB 4fny及び関連のリガンド、Bryan, M.C. et al著の「強力で選択的な未分化リンパ腫キナーゼ阻害剤としてのピペリジンカルボキサミドの迅速な開発(Rapid development of piperidine carboxamides as potent and selective anaplastic lymphoma kinase inhibitors.)」 J. Med. Chem. 55: 1698-1705 (2012)において記載される結晶構造PDB 4dce及び関連のリガンド、Gummadi, V.R. et al.著の「7-アザインドールベースの未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)阻害剤:独特な結合様式を有する野生型及び突然変異型(L1196M)の活性化合物の発見(Discovery of 7-azaindole based anaplastic lymphoma kinase (ALK) inhibitors: wild type and mutant (L1196M) active compounds with unique binding mode.)」 (2013) Bioorg. Med. Chem. Lett. 23: 4911-4918において記載される結晶構造PDB 4joa及び関連のリガンド、並びにTu, C.H. et al.著の「ピラゾリルアミン誘導体は、未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)のI型及びII型の結合様式の間のコンフォメーションの切り替えを明らかにする(Pyrazolylamine Derivatives Reveal the Conformational Switching between Type I and Type II Binding Modes of Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK).)」 J. Med. Chem. 59: 3906-3919 (2016)において記載される結晶構造PDB 5iui及び関連のリガンドを参照のこと。 BTKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Marcotte, D.J. et al.著の「活性型及び非活性型のコンフォメーションにおけるヒトブルトン型チロシンキナーゼの構造は、TECファミリーキナーゼの活性化メカニズムを示唆している(Structures of human Bruton's tyrosine kinase in active and inactive conformations suggest a mechanism of activation for TEC family kinases.)」 Protein Sci. 19: 429-439 (2010)及びKuglstatter, A. et al.著の「多数のリガンド複合体構造からのブルトン型チロシンキナーゼのコンフォメーションの柔軟性への洞察(Insights into the conformational flexibility of Bruton's tyrosine kinase from multiple ligand complex structures)」 Protein Sci. 20: 428-436" (2011)において記載される結晶構造PDB 3gen、3piz及び関連のリガンド、Lou, Y. et al.著の「関節リウマチの治療用の強力で選択的なブルトン型チロシンキナーゼ(BTK)阻害剤であるRN486の構造ベースの薬物設計(Structure-Based Drug Design of RN486, a Potent and Selective Bruton's Tyrosine Kinase (BTK) Inhibitor, for the Treatment of Rheumatoid Arthritis)」 J. Med. Chem. 58: 512-516 (2015)において記載される結晶構造PDB 3ocs、4ot6及び関連のリガンド、Liu, J. et al.著の「関節リウマチの治療用の可逆的なBTK阻害剤としての8-アミノ-イミダゾ[1,5-a]ピラジンの発見(Discovery of 8-Amino-imidazo[1,5-a]pyrazines as Reversible BTK Inhibitors for the Treatment of Rheumatoid Arthritis.)」 ACS Med. Chem. Lett. 7: 198-203 (2016)において記載される結晶構造PDB 5fbn及び5fbo並びに関連のリガンド、Kuglstatter, A. et al.著の「多数のリガンド複合体構造からのブルトン型チロシンキナーゼのコンフォメーションの柔軟性への洞察(Insights into the conformational flexibility of Bruton's tyrosine kinase from multiple ligand complex structures.)」 Protein Sci. 20: 428-436 (2011)において記載される結晶構造PDB 3pix及び関連のリガンド、並びにBujacz, A. et al.著の「ビフィドバクテリウム・ロンガム由来のβ-フルクトフラノシダーゼのアポ型及びそのフルクトースとの複合体の結晶構造(Crystal structures of the apo form of beta-fructofuranosidase from Bifidobacterium longum and its complex with fructose.)」 Febs J. 278: 1728-1744 (2011)において記載される結晶構造PDB 3pij及び関連のリガンドを参照のこと。 FLT3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Zorn, J.A. et al.著の「阻害剤キザルチニブ(AC220)に結合したFLT3キナーゼドメインの結晶構造(Crystal Structure of the FLT3 Kinase Domain Bound to the Inhibitor Quizartinib (AC220).)」 Plos One 10: e0121177-e0121177 (2015)において記載される結晶構造PDB 4xuf及び4rt7並びに関連のリガンドを参照のこと。 TNIKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 2x7f、Masuda, M. et al.著の「TNIK阻害は、結腸直腸癌の幹細胞性を無効にする(TNIK inhibition abrogates colorectal cancer stemness.)」 Nat Commun 7: 12586-12586 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ax9及び5d7a並びに関連のリガンドを参照のこと。 NTRK1、NTRK2、及びNTRK3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Wang, T. et al.著の「強力なTrka阻害剤としての二置換イミダゾ[4,5-b]ピリジン及びプリンの発見(Discovery of Disubstituted Imidazo[4,5-B]Pyridines and Purines as Potent Trka Inhibitors.)」 ACS Med. Chem. Lett. 3: 705 (2012)において記載される結晶構造PDB 4aoj及び関連のリガンド、Stachel, S.J. et al.著の「キナーゼスクリーニングからの多様性の最大化:慢性疼痛用の新規の選択的な汎Trk阻害剤の同定(Maximizing diversity from a kinase screen: identification of novel and selective pan-Trk inhibitors for chronic pain.)」 J. Med. Chem. 57: 5800-5816 (2014)において記載される結晶構造PDB 4pmm、4pmp、4pms、及び4pmt並びに関連のリガンド、Choi, H.S. et al.著の「(R)-2-フェニルピロリジン置換イミダゾピリダジン:新たなクラスの強力で選択的な汎TRK阻害剤((R)-2-Phenylpyrrolidine Substituted Imidazopyridazines: A New Class of Potent and Selective Pan-TRK Inhibitors.)」 ACS Med. Chem. Lett. 6: 562-567 (2015)において記載される結晶構造PDB 4yps及び4yne並びに関連のリガンド、Bertrand, T. et al.著の「Trka及びTrkbの結晶構造は、選択的阻害を達成するのに重要な領域を示唆している(The Crystal Structures of Trka and Trkb Suggest Key Regions for Achieving Selective Inhibition.)」 J. Mol. Biol. 423: 439 (2012)において記載される結晶構造PDB 4at5及び4at3並びに関連のリガンド、並びにAlbaugh, P. et al.著の「齧歯類の癌腫瘍モデルにおいて有効性を有する選択的TRK阻害剤であるGNF-5837の発見(Discovery of GNF-5837, a selective TRK Inhibitor with efficacy in rodent cancer tumor models.)」 ACS Med. Chem. Lett. 3: 140-145 (2012)及びChoi, H.S. et al.著の「(R)-2-フェニルピロリジン置換イミダゾピリダジン:新たなクラスの強力で選択的な汎TRK阻害剤((R)-2-Phenylpyrrolidine Substitute Imidazopyridazines: a New Class of Potent and Selective Pan-TRK Inhibitors.)」 ACS Med Chem Lett 6: 562-567 (2015)において記載される結晶構造PDB 3v5q及び4ymj並びに関連のリガンドを参照のこと。 FGFR1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Brison, Y. et al.著の「DSR-Eグルカンスクラーゼから誘導されるα-(1-2)分岐スクラーゼの機能的及び構造的な特性評価(Functional and structural characterization of alpha-(1-2) branching sucrase derived from DSR-E glucansucrase.)」 J. Biol. Chem. 287: 7915-7924 (2012)及びMohammadi, M. et al.著の「FGF受容体チロシンキナーゼドメインに結合した血管新生阻害剤の結晶構造(Crystal structure of an angiogenesis inhibitor bound to the FGF receptor tyrosine kinase domain.)」 EMBO J. 17: 5896-5904 (1998)において記載される結晶構造PDB 3tto及び2fgi並びに関連のリガンド、結晶構造PDB 4fb3、Harrison, C. et al.著の「ポリオーマウイルスのラージT抗原は、ウイルス起点の対称反復配列に非対称に結合する(Polyomavirus large T antigen binds symmetrical repeats at the viral origin in an asymmetrical manner.)」 J. Virol. 87: 13751-13759 (2013)において記載される結晶構造PDB 4rwk及び関連のリガンド、Sohl, C.D. et al.著の「FGFR1ゲートキーパー突然変異についてのチロシンキナーゼ阻害剤耐性の分子メカニズムの解明:標的化療法の弱点(Illuminating the Molecular Mechanisms of Tyrosine Kinase Inhibitor Resistance for the FGFR1 Gatekeeper Mutation: The Achilles' Heel of Targeted Therapy.)」 ACS Chem. Biol. 10: 1319-1329 (2015)において記載される結晶構造PDB 4rwl及び関連のリガンド、結晶構造PDB 4uwc、Tucker, J.A. et al.著の「Fgfrキナーゼアイソフォーム選択性への構造的洞察:Fgfr1及びFgfr4との複合体におけるAzd4547及びポナチニブの多様な結合様式(Structural Insights Into Fgfr Kinase Isoform Selectivity: Diverse Binding Modes of Azd4547 and Ponatinib in Complex with Fgfr1 and Fgfr4.)」 Structure 22: 1764 (2014)において記載される結晶構造PDB 4v01及び関連のリガンド、Klein, T. et al.著の「Fgfr1キナーゼにおける活性化ループ再編成のエネルギー論への構造的及び動的な洞察(Structural and Dynamic Insights Into the Energetics of Activation Loop Rearrangement in Fgfr1 Kinase.)」 Nat. Commun. 6: 7877 (2015)において記載される結晶構造PDB 5a46及び関連のリガンド、並びにPatani, H. et al.著の「FGFRキナーゼにおける癌突然変異の活性化及び臨床使用における阻害剤に対するそれらの応答の差の様相(Landscape of activating cancer mutations in FGFR kinases and their differential responses to inhibitors in clinical use.)」 Oncotarget 7: 24252-24268 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ew8及び関連のリガンドを参照のこと。 FGFR2及びFGFR3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Chen, H. et al.著の「キナーゼヒンジ領域における分子ブレーキは、受容体チロシンキナーゼの活性を調節する(A molecular brake in the kinase hinge region regulates the activity of receptor tyrosine kinases.)」 Mol. Cell 27: 717-730 (2007)、及び「VEGFR2よりも高い選択性を有する新規のFGFR3阻害剤としての1,3,5-トリアジン及びピリミジン誘導体の構造ベースの薬物設計(Structure-based drug design of 1,3,5-triazine and pyrimidine derivatives as novel FGFR3 inhibitors with high selectivity over VEGFR2)」 Bioorg Med Chem 2020, 28, 115453において記載される結晶構造PDB 2pvf及び関連のリガンドを参照のこと。 FGFR4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lesca, E. et al.著の「ヒト線維芽細胞成長因子受容体4キナーゼの構造解析(Structural analysis of the human fibroblast growth factor receptor 4 kinase.)」 J. Mol. Biol. 426: 3744-3756 (2014)において記載される結晶構造PDB 4tyi及び関連のリガンドを参照のこと。 METの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 3qti及び3zcl、Peterson, E.A. et al.著の「強力で選択的な8-フルオロトリアゾロピリジンc-Met阻害剤の発見(Discovery of Potent and Selective 8-Fluorotriazolopyridine c-Met Inhibitors.)」 J. Med. Chem. 58: 2417-2430 (2015)及びCui, J.J. et al.著の「高いプロテインキナーゼ選択性を有するが、広範なホスホジエステラーゼファミリー阻害を示す受容体チロシンキナーゼC-metの阻害剤である(S)-6-(1-(6-(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-b]ピリダジン-3-イル)エチル)キノリン(Pf-04254644)からの教訓によれば、ラットにおける心筋変性が引き起こされる(Lessons from (S)-6-(1-(6-(1-Methyl-1H-Pyrazol-4-Yl)-[1,2, 4]Triazolo[4,3-B]Pyridazin-3-Yl)Ethyl)Quinoline (Pf-04254644), an Inhibitor of Receptor Tyrosine Kinase C-met with High Protein Kinase Selectivity But Broad Phosphodiesterase Family Inhibition Leading to Myocardial Degeneration in Rats.)」 J. Med. Chem. 56: 6651 (2013)において記載される結晶構造PDB 4xmo、4xyf、及び3zcl並びに関連のリガンド、Boezio, A.A. et al.著の「高い非結合標的カバー率及び頑健なin vivo抗腫瘍活性を有するMETの強力で選択的な阻害剤である(R)-6-(1-(8-フルオロ-6-(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-a]ピリジン-3-イル)エチル)-3-(2-メトキシエトキシ)-1,6-ナフチリジン-5(6H)-オン(AMG337)の発見(Discovery of (R)-6-(1-(8-Fluoro-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-yl)ethyl)-3-(2-methoxyethoxy)-1,6-naphthyridin-5(6H)-one (AMG 337), a Potent and Selective Inhibitor of MET with High Unbound Target Coverage and Robust In Vivo Antitumor Activity.)」 J. Med. Chem. 59: 2328-2342 (2016)において記載される結晶構造PDB 5eyd及び関連のリガンド、Kim, K.S. et al.著の「Metキナーゼのピロロピリジン-ピリドン系阻害剤の発見:合成、X線結晶構造解析、及び生物学的活性(Discovery of pyrrolopyridine-pyridone based inhibitors of Met kinase: synthesis, X-ray crystallographic analysis, and biological activities.)」 J. Med. Chem. 51: 5330-5341 (2008)において記載される結晶構造PDB 3ce3及び関連のリガンド、Bellon, S.F. et al.著の「新規の結合様式を有するc-Met阻害剤は、幾つかの遺伝性乳頭状腎細胞癌関連突然変異に対して活性を示す(c-Met inhibitors with novel binding mode show activity against several hereditary papillary renal cell carcinoma-related mutations.)」 J. Biol. Chem. 283: 2675-2683 (2008)において記載される結晶構造PDB 2rfn及び関連のリガンド、並びにSmith, B.D. et al著の「アルチラチニブは、MET、TIE2、及びVEGFR2のバランスのとれた阻害により、腫瘍の成長、浸潤、血管新生、及び微小環境を介した薬剤耐性を阻害する(Altiratinib Inhibits Tumor Growth, Invasion, Angiogenesis, and Microenvironment-Mediated Drug Resistance via Balanced Inhibition of MET, TIE2, and VEGFR2.)」 Mol. Cancer Ther. 14: 2023-2034 (2015)において記載される結晶構造PDB 5dg5及び関連のリガンドを参照のこと。 JAK1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Zak, M. et al.著の「好ましい物理化学的特性及びJAK2に対する高い選択性を有する強力なJAK1阻害剤としてのC-2ヒドロキシエチルイミダゾピロロピリジンの同定(Identification of C-2 Hydroxyethyl Imidazopyrrolopyridines as Potent JAK1 Inhibitors with Favorable Physicochemical Properties and High Selectivity over JAK2.)」 J. Med. Chem. 56: 4764-4785 (2013)において記載される結晶構造PDB 4ivd及び関連のリガンド、Vasbinder, M.M. et al.著の「強力なJAK1選択的阻害剤としてのアザベンズイミダゾールの同定(Identification of azabenzimidazoles as potent JAK1 selective inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 26: 60-67 (2016)において記載される結晶構造PDB 5e1e及び関連のリガンド、Simov, V., et al.著の「JAK1選択的キナーゼ阻害剤としての(ベンズ)イミダゾールピリドンの構造ベースの設計及び開発(Structure-based design and development of (benz)imidazole pyridones as JAK1-selective kinase inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 26: 1803-1808 (2016)において記載される結晶構造PDB 5hx8及び関連のリガンド、Caspers, N.L. et al.著の「新規の金属キレート剤浸漬システムを使用するJAK1用のハイスループット結晶構造決定プラットフォームの開発(Development of a high-throughput crystal structure-determination platform for JAK1 using a novel metal-chelator soaking system.)」 Acta Crystallogr. Sect. F 72: 840-845 (2016)、及びKettle, J. G.著の「JAK1選択的キナーゼ阻害剤AZD4205の発見(Discovery of the JAK1 selective kinase inhibitor AZD4205)」, AACR National Meeting, April 2017において記載される結晶構造PDB 5hx8及び関連のリガンドを参照のこと。 JAK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Andraos, R. et al.著の「JAK阻害剤による活性化ループリン酸化の調節は、結合様式に依存する(Modulation of activation-loop phosphorylation by JAK inhibitors is binding mode dependent.)」 Cancer Discov 2: 512-523 (2012)において記載される結晶構造PDB 3ugc及び関連のリガンド、Hart, A.C. et al.著の「選択的ヤヌスキナーゼの2-イミダゾ[4,5-d]ピロロ[2,3-b]ピリジン阻害剤の構造ベースの設計(Structure-Based Design of Selective Janus Kinase 2 Imidazo[4,5-d]pyrrolo[2,3-b]pyridine Inhibitors.)」 ACS Med. Chem. Lett. 6: 845-849 (2015)において記載される結晶構造PDB 5cf4、5cf5、5cf6、及び5cf8並びに関連のリガンド、Brasca, M.G. et al著の「骨髄増殖性障害の潜在的な治療としてのJak2の新規のピロールカルボキサミド阻害剤(Novel Pyrrole Carboxamide Inhibitors of Jak2 as Potential Treatment of Myeloproliferative Disorders)」 Bioorg. Med. Chem. 23: 2387 (2015)において記載される結晶構造PDB 5aep及び関連のリガンド、Farmer, L.J. et al.著の「VX-509(デセルノチニブ):自己免疫疾患の治療用の強力で選択的なヤヌスキナーゼ3阻害剤の発見(Discovery of VX-509 (Decernotinib): A Potent and Selective Janus Kinase 3 Inhibitor for the Treatment of Autoimmune Diseases.)」 J. Med. Chem. 58: 7195-7216 (2015)において記載される結晶構造PDB 4ytf、4yth及び4yti並びに関連のリガンド、Menet, C.J. et al.著の「選択的JAK1阻害剤としてのトリアゾロピリジン:GLPG0634に対するヒット特定から(Triazolopyridines as Selective JAK1 Inhibitors: From Hit Identification to GLPG0634.)」 J. Med. Chem. 57: 9323-9342 (2014)において記載される結晶構造PDB 4ytf、4yth、4yti、及び関連のリガンド、Siu, M. et al.著の「JAK2阻害剤としての2-アミノ-[1,2,4]トリアゾロ[1,5-a]ピリジン(2-Amino-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridines as JAK2 inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 23: 5014-5021 (2013)において記載される結晶構造PDB 4ji9及び関連のリガンド、並びにSchenkel, L.B. et al.著の「強力で選択性が高いチエノピリジンヤヌスキナーゼ2阻害剤の発見(Discovery of potent and highly selective thienopyridine janus kinase 2 inhibitors.)」 J. Med. Chem. 54: 8440-8450 (2011)において記載される結晶構造PDB 3io7及び3iok並びに関連のリガンドを参照のこと。 JAK3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lynch, S.M. et al.著の「Jakファミリー及びキノームに対して改善された選択性を有する強力なJak3阻害剤を特定するためのコンフォメーションバイアス及び構造ベースの設計の戦略的使用(Strategic Use of Conformational Bias and Structure Based Design to Identify Potent Jak3 Inhibitors with Improved Selectivity Against the Jak Family and the Kinome.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 23: 2793 (2013)において記載される結晶構造PDB 3zc6及び関連のリガンド、並びにSoth, M. et al.著の「3-アミドピロロピラジンJAKキナーゼ阻害剤:JAK3対JAK1選択的阻害剤の開発並びに細胞モデル及びin vivoモデルにおける評価(3-Amido Pyrrolopyrazine JAK Kinase Inhibitors: Development of a JAK3 vs JAK1 Selective Inhibitor and Evaluation in Cellular and in Vivo Models.)」 J. Med. Chem. 56: 345-356 (2013)、及びJaime-Figueroa, S. et al.著の「強力なJAK3キナーゼ阻害剤としての一連の新規の5H-ピロロ[2,3-b]ピラジン-2-フェニルエーテルの発見(Discovery of a series of novel 5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-2-phenyl ethers, as potent JAK3 kinase inhibitors.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 23: 2522-2526 (2013)において記載される結晶構造PDB 4hvd、4i6q、及び3zep並びに関連のリガンドを参照のこと。 KITの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Mol, C.D. et al.著の「c-Kitチロシンキナーゼの自己阻害及びSTI-571阻害の構造的基礎(Structural basis for the autoinhibition and STI-571 inhibition of c-Kit tyrosine kinase.)」 J. Biol. Chem. 279: 31655-31663 (2004)において記載される結晶構造PDB 1t46及び関連のリガンド、並びにGarner, A.P. et al.著の「ポナチニブは、ポリクローナル薬物耐性KIT癌タンパク質を阻害し、大幅に前治療を受けた消化管間質腫瘍(GIST)患者における治療可能性を示す(Ponatinib Inhibits Polyclonal Drug-Resistant KIT Oncoproteins and Shows Therapeutic Potential in Heavily Pretreated Gastrointestinal Stromal Tumor (GIST) Patients.)」 Clin. Cancer Res. 20: 5745-5755 (2014)において記載される結晶構造PDB 4u0i及び関連のリガンドを参照のこと。 EGFRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、結晶構造PDB 5hcy、4rj4、及び5cav、Heald, R.著の「非共有結合型の突然変異体選択的上皮成長因子受容体阻害剤:リード最適化のケーススタディ(Noncovalent Mutant Selective Epidermal Growth Factor Receptor Inhibitors: A Lead Optimization Case Study)」, J. Med. Chem. 58, 8877-8895 (2015)、Hanano, E. J.著の「T790M耐性突然変異を含む上皮成長因子受容体の選択的で非共有結合型のジアミノピリミジンベースの阻害剤の発見(Discovery of Selective and Noncovalent Diaminopyrimidine-Based Inhibitors of Epidermal Growth Factor Receptor Containing the T790M Resistance Mutation.)」 J. Med. Chem., 57, 10176-10191 (2014)、Chan, B. K. et al.著の「非共有結合型の突然変異体選択的上皮成長因子受容体阻害剤の発見(Discovery of a Noncovalent, Mutant-Selective Epidermal Growth Factor Receptor Inhibitor)」 J. Med. Chem. 59, 9080 (2016)、Jia, Y. et al.著の「突然変異体選択的アロステリック阻害剤によるEGFR(T790M)及びEGFR(C797S)耐性の克服(Overcoming EGFR(T790M) and EGFR(C797S) resistance with mutant-selective allosteric inhibitors)」 Nature 534, 129 (2016)において記載される結晶構造PDB 5d41及び関連のリガンド、Ward, R. A.著の「上皮成長因子受容体(EGFR)の活性化型及びゲートキーパー突然変異型の共有結合型阻害剤の構造ベース及び反応性ベースの開発(Structure- and reactivity-based development of covalent inhibitors of the activating and gatekeeper mutant forms of the epidermal growth factor receptor (EGFR))」 J. Med. Chem. 56, 7025-7048 (2013)、「受容体の野生型形態を温存する感作突然変異及びT790M耐性突然変異の両方の強力で選択的なEGFR阻害剤(AZD9291)の発見(Discovery of a Potent and Selective EGFR Inhibitor (AZD9291) of Both Sensitizing and T790M Resistance Mutations That Spares the Wild Type Form of the Receptor)」 J. Med. Chem., 57 (20), 8249-8267 (2014)において記載される結晶構造PDB 4zau及び関連のリガンド、Bryan, M. C. et al.著の「EGFRのT790M二重突然変異体の選択性が高い非共有結合型阻害剤としてのピリドン(Pyridones as Highly Selective, Noncovalent Inhibitors of T790M Double Mutants of EGFR)」 ACS Med. Chem. Lett., 7 (1), 100-104 (2016)において記載される結晶構造PDB 5em7及び関連のリガンド、Zhou, W. et al.著の「EGFRのT790Mに対する新規の突然変異体選択的EGFRキナーゼ阻害剤(Novel mutant-selective EGFR kinase inhibitors against EGFR T790M)」 Nature 462(7276), 1070-1074 (2009)において記載される結晶構造PDB 3IKA及び関連のリガンド、Lelais, G., J.著の「EGFR突然変異非小細胞肺癌の治療用の発癌性(L858R、ex19del)及び耐性(T790M)EGFR突然変異体の新規で強力なWT温存共有結合型阻害剤である(R,E)-N-(7-クロロ-1-(1-[4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]アゼパン-3-イル)-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-2-イル)-2-メチルイソニコチンアミド(EGF816)の発見(Discovery of (R,E)-N-(7-Chloro-1-(1-[4-(dimethylamino)but-2-enoyl]azepan-3-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-2-methylisonicotinamide (EGF816), a Novel, Potent, and WT Sparing Covalent Inhibitor of Oncogenic (L858R, ex19del) and Resistant (T790M) EGFR Mutants for the Treatment of EGFR Mutant Non-Small-Cell Lung Cancers)」 Med. Chem., 59 (14), 6671-6689 (2016)において記載される結晶構造PDB 5feq及び関連のリガンド、Lee, H.-J.著の「EGFRのT790Mの非共有結合型の野生型温存阻害剤(Noncovalent Wild-type-Sparing Inhibitors of EGFR T790M)」 Cancer Discov. 3(2): 168-181 (2013)、Huang, W-S. et al.著の「未分化リンパ腫キナーゼのホスフィンオキシド含有の強力な経口活性型阻害剤であるブリガチニブ(AP26113)の発見(Discovery of Brigatinib (AP26113), a Phosphine Oxide-Containing, Potent, Orally Active Inhibitor of Anaplastic Lymphoma Kinase.)」 J. Med. Chem. 59: 4948-4964 (2016)において記載される結晶構造PDB 5j7h及び関連のリガンド、Hennessy, E. J. et al.著の「T790M突然変異を有するEGFRの新規の不可逆的阻害剤を同定するための構造ベースの設計の利用(Utilization of Structure-Based Design to Identify Novel, Irreversible Inhibitors of EGFR Harboring the T790M Mutation.)」 ACS. Med. Chem. Lett. 7: 514-519 (2016)において記載される結晶構造PDB 4v0g及び関連のリガンド、Cheng, H.著の「T790M含有EGFR突然変異体の強力なWT温存不可逆的阻害剤である1-{(3R,4R)-3-[({5-クロロ-2-[(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)アミノ]-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル}オキシ)メチル]-4-メトキシピロリジン-1-イル}プロパ-2-エン-1-オン(PF-06459988)の発見(Discovery of 1-{(3R,4R)-3-[({5-Chloro-2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)methyl]-4-methoxypyrrolidin-1-yl}prop-2-en-1-one (PF-06459988), a Potent, WT Sparing, Irreversible Inhibitor of T790M-Containing EGFR Mutants.)」 J. Med. Chem. 59: 2005-2024 (2016)において記載される結晶構造PDB 5hg7及び関連のリガンド、Hao, Y.著の「L858R/T790M耐性突然変異に対する強力で選択的な上皮成長因子受容体(EGFR)阻害剤としてのN5位で置換された6,7-ジオキソ-6,7-ジヒドロプテリジンの発見及び構造最適化(Discovery and Structural Optimization of N5-Substituted 6,7-Dioxo-6,7-dihydropteridines as Potent and Selective Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) Inhibitors against L858R/T790M Resistance Mutation.)」 J. Med. Chem. 59: 7111-7124 (2016)、Planken, S.著の「構造ベースの薬物設計によるN-((3R,4R)-4-フルオロ-1-(6-((3-メトキシ-1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)アミノ)-9-メチル-9H-プリン-2-イル)ピロリジン-3-イル)アクリルアミド(PF-06747775):野生型EGFRを上回る選択性を有する発癌性EGFR突然変異体を標的とする高親和性の不可逆的阻害剤の発見(Discovery of N-((3R,4R)-4-Fluoro-1-(6-((3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino)-9-methyl-9H-purin-2-yl)pyrrolidine-3-yl)acrylamide (PF-06747775) through Structure-Based Drug Design: A High Affinity Irreversible Inhibitor Targeting Oncogenic EGFR Mutants with Selectivity over Wild-Type EGFR.)」 J. Med. Chem. 60: 3002-3019 (2017)において記載される結晶構造PDB 5ug8、5ug9、及び5ugc並びに関連のリガンド、Wang, A.著の「異なる結合様式を有する新規の不可逆的なEGFR突然変異キナーゼ阻害剤としての(R)-1-(3-(4-アミノ-3-(3-クロロ-4-(ピリジン-2-イルメトキシ)フェニル)-1H-ピラゾロ[3,4-d]ピリミジン-1-イル)ピペリジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(CHMFL-EGFR-202)の発見(Discovery of (R)-1-(3-(4-Amino-3-(3-chloro-4-(pyridin-2-ylmethoxy)phenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one (CHMFL-EGFR-202) as a Novel Irreversible EGFR Mutant Kinase Inhibitor with a Distinct Binding Mode.)」 J. Med. Chem. 60: 2944-2962 (2017)及びJuchum, M.著の「固定化されたヒンジ結合モチーフを有する三置換イミダゾールは、臨床的に関連するEGFRのL858R/T790M及びL858R/T790M/C797S突然変異体の1桁nMの阻害剤として作用する:ターゲットホッピングの一例(Trisubstituted imidazoles with a rigidized hinge binding motif act as single digit nM inhibitors of clinically relevant EGFR L858R/T790M and L858R/T790M/C797S mutants: An example of target hopping.)」 J. Med. Chem. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.7b00178 (2017)において記載される結晶構造PDB 5gnk及び関連のリガンドを参照のこと。 PAK1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Rudolph, J. et al.著の「化学的に多様なグループIのp21-活性化キナーゼ(PAK)阻害剤は、狭い治療濃度域で急性心血管毒性を与える(Chemically Diverse Group I p21-Activated Kinase(PAK) Inhibitors Impart Acute Cardiovascular Toxicity with a Narrow Therapeutic Window.)」 J. Med. Chem. 59, 5520-5541 (2016)、及びKarpov AS, et al. ACS Med Chem Lett. 22;6(7):776-81 (2015)を参照のこと。 PAK4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Staben ST, et al. J Med Chem. 13;57(3):1033-45 (2014)、及びGuo, C. et al.著の「新規のPAK阻害剤としてのピロロアミノピラゾールの発見(Discovery of pyrroloaminopyrazoles as novel PAK inhibitors)」 J. Med. Chem. 55, 4728-4739 (2012)を参照のこと。 IDOの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Yue, E. W.; et al.著の「マウス黒色腫モデルにおけるin vivoでの薬力学的活性及び有効性を有するインドールアミン-2,3-ジオキシゲナーゼの強力な競合的阻害剤の発見(Discovery of potent competitive inhibitors of indoleamine 2,3-dioxygenase with in vivo pharmacodynamic activity and efficacy in a mouse melanoma model.)」 J. Med. Chem. 52, 7364-7367 (2009)、Tojo, S.; et al.著の「IDO1阻害剤としてのイミダゾチアゾール誘導体の結晶構造及び構造、並びに活性の関係(Crystal structures and structure, and activity relationships of imidazothiazole derivatives as IDO1 inhibitors.)」 ACS Med. Chem. Lett. 5, 1119-1123 (2014)、Mautino, M.R. et al.著の「癌療法のための新規のインドールアミン-2,3-ジオキシゲナーゼ(IDO)経路阻害薬候補であるNLG919(NLG919, a novel indoleamine-2,3- dioxygenase (IDO)-pathway inhibitor drug candidate for cancer therapy)」 Abstract 491, AACR 104th Annual Meeting 2013; Apr 6-10, 2013(ワシントンDC)、及び「IDO阻害剤として有用な縮合イミダゾール誘導体(Fused imidazole derivatives useful as IDO inhibitors)」と題する国際公開第2012/142237号を参照のこと。 ERK1及びERK2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Blake, J.F. et al.著の「初期の臨床開発における細胞外シグナル制御キナーゼ1/2(ERK1/2)阻害剤である(S)-1-(1-(4-クロロ-3-フルオロフェニル)-2-ヒドロキシエチル)-4-(2-((1-メチル-1H-ピラゾール-5-イル)アミノ)ピリミジン-4-イル)ピリジン-2(1H)-オン(GDC-0994)の発見(Discovery of (S)-1-(1-(4-Chloro-3-fluorophenyl)-2-hydroxyethyl)-4-(2-((1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)amino)pyrimidin-4-yl)pyridin-2(1H)-one (GDC-0994), an Extracellular Signal-Regulated Kinase 1/2 (ERK1/2) Inhibitor in Early Clinical Development)」 J. Med. Chem. 59: 5650-5660 (2016)において記載される結晶構造PDB 5K4I及び5K4J並びに関連のリガンド、Bagdanoff, J. T. et al.著の「ERK2キナーゼの阻害剤としてのテトラヒドロピロロジアゼペノン(Tetrahydropyrrolo-diazepenones as inhibitors of ERK2 kinase)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 25, 3788-3792 (2015)において記載される結晶構造PDB 5BVF及び関連のリガンド、Deng, Y.et al.著の「不活性キナーゼの親和性選択スクリーニングによる新規の二重メカニズムのERK阻害剤の発見(Discovery of Novel, Dual Mechanism ERK Inhibitors by Affinity Selection Screening of an Inactive Kinase)」 J. Med. Chem. 57: 8817-8826 (2014)において記載される結晶構造PDB 4QYY及び関連のリガンド、Jha, S. et al.著の「ERK阻害に対する治療抵抗性の分析(Dissecting Therapeutic Resistance to ERK Inhibition)」 Mol.Cancer Ther. 15: 548-559 (2016)において記載される結晶構造PDB 5HD4及び5HD7並びに関連のリガンド、Ren, L. et al.著の「ERK1/2の非常に強力で選択的かつ効果的な小分子阻害剤の発見(Discovery of highly potent, selective, and efficacious small molecule inhibitors of ERK1/2.)」 J. Med. Chem. 58: 1976-1991 (2015)において記載される結晶構造PDB 4XJ0及び関連のリガンド、Ward, R.A. et al.著の「Erk1/2の選択性が高く強力な共有結合型阻害剤の構造情報に基づく設計(Structure-Guided Design of Highly Selective and Potent Covalent Inhibitors of Erk1/2.)」 J. Med. Chem. 58: 4790 (2015)、Burrows, F. et al.著の「MAPK経路の調節不全の腫瘍において頑健な前臨床単剤活性を有する強力なERK阻害剤であるKO-947(KO-947, a potent ERK inhibitor with robust preclinical single agent activity in MAPK pathway dysregulated tumors)」ポスター番号5168、AACR国内会議2017、Bhagwat, S. V. et al.著の「MAPK経路の変化を伴う癌モデルにおいて強力な抗腫瘍活性を有する選択的で新規のERK1/2阻害剤であるLY3214996の発見(Discovery of LY3214996, a selective and novel ERK1/2 inhibitor with potent antitumor activities in cancer models with MAPK pathway alterations.)」AACR国内会議2017において記載される結晶構造PDB 4ZZM、4ZZN、4ZZO、及び関連のリガンド、Cheng, R. et al.著の「高親和性リガンドとの複合体におけるヒトMapkapキナーゼ3の高解像度結晶構造(High-resolution crystal structure of human Mapkap kinase 3 in complex with a high affinity ligand)」 Protein Sci. 19: 168-173 (2010)において記載される結晶構造PDB 3FHR及び3FXH並びに関連のリガンド、Ward, R.A. et al.著の「適度に活性で曖昧な化学的開始点からのERK1/2の強力で選択的な阻害剤の構造情報に基づく発見(Structure-Guided Discovery of Potent and Selective Inhibitors of ERK1/2 from a Modestly Active and Promiscuous Chemical Start Point.)」 J. Med. Chem. 60, 3438-3450 (2017)において記載される結晶構造PDB 5NGU、5NHF、5NHH、5NHJ、5NHL、5NHO、5NHP、及び5NHV並びに関連のリガンド、Oubrie, A. et al.著の「系列全体を通して強力な生化学的活性及び細胞ベースの活性を有する新規のATP競合的MK2阻害剤(Novel ATP competitive MK2 inhibitors with potent biochemical and cell-based activity throughout the series.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 22: 613-618 (2012)、「コンフォメーション制御を使用する細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)の強力で選択的なピリミジルピロール阻害剤の構造情報に基づく設計(Structure-Guided Design of Potent and Selective Pyrimidylpyrrole Inhibitors of Extracellular Signal-Regulated Kinase (ERK) Using Conformational Control)」 J Med Chem 2009, 52(20), 6362、国際公開第2015/051341号、「非小細胞肺癌(NSCLC)のモデルにおける単剤療法及び併用療法の両方において効果的なERK1/2(AZD0364)の強力で選択的な経口阻害剤の発見(Discovery of a Potent and Selective Oral Inhibitor of ERK1/2 (AZD0364) That Is Efficacious in Both Monotherapy and Combination Therapy in Models of Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC))」 J Med Chem 2019, 62(24), 11004、及び「ERK阻害剤LY3214996は、ERK経路誘導型の癌を標的にする:精密医療に向けた治療的アプローチ(ERK Inhibitor LY3214996 Targets ERK Pathway-Driven Cancers: A Therapeutic Approach Toward Precision Medicine)」 Mol Cancer Ther 2020, 19, 325において記載される結晶構造PDB 3SHE及び3R1N並びに関連のリガンドを参照のこと。 ABL1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Schindler, T., et al.著の「アベルソンチロシンキナーゼのSTI-571阻害の構造的メカニズム(Structural mechanism for STI-571 inhibition of abelson tyrosine kinase)」, Science 289: 1938-1942 (2000)、及びHorio, T. et al.著の「3位で置換されたベンズアミド誘導体のAbl/Lyn二重阻害活性に寄与する構造因子(Structural factors contributing to the Abl/Lyn dual inhibitory activity of 3-substituted benzamide derivatives)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 2712-2717 (2007)において記載される結晶構造PDB 1fpu及び2e2b並びに関連のリガンド、Cowan-Jacob, S.W. et al.著の「慢性骨髄性白血病を治療する薬物の発見への構造生物学の寄与(Structural biology contributions to the discovery of drugs to treat chronic myelogenous leukemia)」, Acta Crystallog. Sect. D 63: 80-93 (2007)及びOkram, B. et al.著の「一般的な作成戦略(A general strategy for creating)」, Chem. Biol. 13: 779-786 (2006)において記載される結晶構造PDB 2hzn及び2hiw並びに関連のリガンド、Weisberg, E. et al.著の「ネイティブ及び突然変異型のBcr-Ablの選択的阻害剤であるAMN107の特性評価(Characterization of AMN107, a selective inhibitor of native and mutant Bcr-Abl)」, Cancer Cell 7: 129-14 (2005)において記載される結晶構造PDB 3cs9及び関連のリガンド、O'Hare, T. et al.著の「慢性骨髄性白血病用の汎BCR-ABL阻害剤であるAP24534は、T315I突然変異体を強力に阻害し、突然変異ベースの耐性を克服する(AP24534, a pan-BCR-ABL inhibitor for chronic myeloid leukemia, potently inhibits the T315I mutant and overcomes mutation-based resistance)」, Cancer Cell 16: 401-412 (2009)において記載される結晶構造PDB 3ik3及び関連のリガンド、Jahnke, W. et al.著の「結合又は屈曲:NMRベースのコンフォメーションアッセイによるアロステリックAblキナーゼアゴニストとアンタゴニストとの識別(Binding or bending: distinction of allosteric Abl kinase agonists from antagonists by an NMR-based conformational assay)」, J. Am. Chem. Soc. 132: 7043-7048 (2010)において記載される結晶構造PDB 3mss及び関連のリガンド、Zhou, T. et al.著の「汎BCR-ABL阻害剤のポナチニブ(AP24534)の構造メカニズム:キナーゼ阻害剤耐性を克服するための教訓(Structural Mechanism of the Pan-BCR-ABL Inhibitor Ponatinib (AP24534): Lessons for Overcoming Kinase Inhibitor Resistance)」, Chem. Biol. Drug Des. 77: 1-11 (2011)において記載される結晶構造PDB 3oy3及び関連のリガンド、Chan, W.W. et al.著の「スイッチ制御阻害剤DCC-2036によるゲートキーパーT315I突然変異体を含むBCR-ABL1チロシンキナーゼのコンフォメーション制御阻害(Conformational Control Inhibition of the BCR-ABL1 Tyrosine Kinase, Including the Gatekeeper T315I Mutant, by the Switch-Control Inhibitor DCC-2036)」, Cancer Cell 19: 556-568 (2011)において記載される結晶構造PDB 3qri及び3qrk並びに関連のリガンド、Liu, F. et al.著の「慢性骨髄性白血病(CML)用の新規の強力なII型のネイティブ及び突然変異型のBCR-ABL阻害剤(CHMFL-074)の発見及び特性評価(Discovery and characterization of a novel potent type II native and mutant BCR-ABL inhibitor (CHMFL-074) for Chronic Myeloid Leukemia (CML))」, Oncotarget 7: 45562-45574 (2016)及びYoung, M.A. et al.著の「オーロラキナーゼ阻害剤VX-680との複合体におけるイマチニブ耐性Abl突然変異体のキナーゼドメインの構造(Structure of the kinase domain of an imatinib-resistant Abl mutant in complex with the Aurora kinase inhibitor VX-680)」, Cancer Res. 66: 1007-1014 (2006)において記載される結晶構造PDB 5hu9及び2f4j並びに関連のリガンド、Tokarski, J.S. et al.著の「活性化ABLキナーゼドメインに結合したダサチニブ(BMS-354825)の構造は、イマチニブ耐性ABL突然変異体に対するその阻害活性を解明する(The Structure of Dasatinib (BMS-354825) Bound to Activated ABL Kinase Domain Elucidates Its Inhibitory Activity against Imatinib-Resistant ABL Mutants)」, Cancer Res. 66: 5790-5797 (2006)及びZhou, T. et al.著の「AblキナーゼのT315I突然変異体の結晶構造(Crystal Structure of the T315I Mutant of Abl Kinase)」, Chem. Biol. Drug Des. 70: 171-181 (2007)において記載される結晶構造PDB 2gqg及び2qoh並びに関連のリガンド、Tokarski, J.S. et al.著の「活性化ABLキナーゼドメインに結合したダサチニブ(BMS-354825)の構造は、イマチニブ耐性ABL突然変異体に対するその阻害活性を解明する(The Structure of Dasatinib (BMS-354825) Bound to Activated ABL Kinase Domain Elucidates Its Inhibitory Activity against Imatinib-Resistant ABL Mutants)」, Cancer Res. 66: 5790-5797 (2006)及びZhou, T. et al.著の「AblキナーゼのT315I突然変異体の結晶構造(Crystal Structure of the T315I Mutant of Abl Kinase)」, Chem. Biol. Drug Des. 70: 171-181 (2007)において記載される結晶構造PDB 2gqg及び2qoh並びに関連のリガンド、Tokarski, J.S. et al.著の「活性化ABLキナーゼドメインに結合したダサチニブ(BMS-354825)の構造は、イマチニブ耐性ABL突然変異体に対するその阻害活性を解明する(The Structure of Dasatinib (BMS-354825) Bound to Activated ABL Kinase Domain Elucidates Its Inhibitory Activity against Imatinib-Resistant ABL Mutants)」, Cancer Res. 66: 5790-5797 (2006)及びZhou, T. et al.著の「AblキナーゼのT315I突然変異体の結晶構造(Crystal Structure of the T315I Mutant of Abl Kinase)」, Chem. Biol. Drug Des. 70: 171-181(2007)において記載される結晶構造PDB 2gqg及び2qoh並びに関連のリガンド、Berkholz, D.S. et al.著の「1Å分解能に近いヒトグルタチオンレダクターゼの触媒サイクル(Catalytic cycle of human glutathione reductase near 1 A resolution)」 J. Mol. Biol. 382: 371-384 (2008)において記載される結晶構造PDB 3dk3及び3dk8並びに関連のリガンド、Levinson, N.M. et al.著の「ablチロシンキナーゼドメインに結合するキナーゼ阻害剤ボスチニブ及びボスチニブの異性体の構造及び分光分析(Structural and spectroscopic analysis of the kinase inhibitor bosutinib and an isomer of bosutinib binding to the abl tyrosine kinase domain)」, Plos One 7: e29828-e29828 (2012)において記載される結晶構造PDB 3ue4及び関連のリガンド、Jensen, C.N. et al.著の「2-ヒドロキシビフェニル3-モノオキシゲナーゼ(Hbpa)のApo結合型及びFad結合型の構造は、指向性進化を使用することにより特定された活性ホットスポットの位置を突き止める(Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution)」, Chembiochem 16: 968 (2015)において記載される結晶構造PDB 4cy8及び関連のリガンド、Cowan-Jacob, S.W. et al.著の「慢性骨髄性白血病を治療する薬物の発見への構造生物学の寄与(Structural biology contributions to the discovery of drugs to treat chronic myelogenous leukaemia)」, Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 63(Pt 1):80-93 (2007)において記載される結晶構造PDB 2hz0及び関連のリガンド、Yang, J. et al.著の「ミリストイル結合部位に結合する細胞透過性の小分子c-Ablキナーゼ活性化因子の発見及び特性評価(Discovery and Characterization of a Cell-Permeable, Small-Molecule c-Abl Kinase Activator that Binds to the Myristoyl Binding Site)」, Chem. Biol. 18: 177-186 (2011)において記載される結晶構造PDB 3pyy及び関連のリガンド、並びにKim, M.K., et al.著の「N末端規則経路における酵母N末端アミダーゼの二重特異性についての構造的基礎(Structural basis for dual specificity of yeast N-terminal amidase in the N-end rule pathway)」, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 12438-12443 (2016)において記載される結晶構造PDB 5k5v及び関連のリガンドを参照のこと。 ABL2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Salah, E. et al.著の「イマチニブ、トザセルチブ(Vx-680)、及びトリアゾールカルボチオアミドクラスのI型阻害剤との複合体におけるAbl関連遺伝子(Abl2)の結晶構造(Crystal Structures of Abl-Related Gene (Abl2) in Complex with Imatinib, Tozasertib (Vx-680), and a Type I Inhibitor of the Triazole Carbothioamide Class)」, J. Med. Chem. 54: 2359 (2011)において記載される結晶構造PDB 2xyn及び関連のリガンド、Ha, B.H. et al.著の「ダサチニブとの複合体におけるABL2/ARGキナーゼの構造(Structure of the ABL2/ARG kinase in complex with dasatinib)」 Acta Crystallogr. Sect.F 71: 443-448 (2015)において記載される結晶構造PDB 4xli及び関連のリガンド、並びにSalah, E. et al.著の「グリベックとの複合体におけるヒトABL2の結晶構造(The crystal structure of human ABL2 in complex with Gleevec)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 3gvu及び関連のリガンドを参照のこと。 AKT1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Lippa, B. et al.著の「新規のAkt阻害剤の合成及び構造ベースの最適化(Synthesis and structure based optimization of novel Akt inhibitors)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 3359-3363 (2008)、Freeman-Cook, K.D. et al.著の「Aktの選択的ATP競合阻害剤の設計(Design of selective, ATP-competitive inhibitors of Akt)」, J. Med. Chem. 53: 4615-4622 (2010)、Blake, J.F. et al著の「Aktのピロロピリミジン阻害剤の発見(Discovery of pyrrolopyrimidine inhibitors of Akt)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 5607-5612 (2010)、Kallan, N.C. et al.著の「スピロクロマンAkt阻害剤の発見及びSAR(Discovery and SAR of spirochromane Akt inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 21: 2410-2414 (2011)、Lin, K著の「Aktのホスファターゼのアクセシビリティを制限するATP部位のオン-オフスイッチ(An ATP-Site On-Off Switch That Restricts Phosphatase Accessibility of Akt)」, Sci.Signal. 5: ra37-ra37 (2012)、Addie, M. et al.著の「経口で生物学的に利用可能なAktキナーゼの強力な阻害剤である4-アミノ-N-[(1S)-1-(4-クロロフェニル)-3-ヒドロキシプロピル]-1-(7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(AZD5363)の発見(Discovery of 4-Amino-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-hydroxypropyl]-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidine-4-carboxamide (AZD5363), an Orally Bioavailable, Potent Inhibitor of Akt Kinases)」, J. Med. Chem. 56: 2059-2073 (2013)、Wu, W.I., et al.著の「アロステリック阻害剤を伴うヒトAKT1の結晶構造は、新たなキナーゼ阻害の様式を明らかにする(Crystal structure of human AKT1 with an allosteric inhibitor reveals a new mode of kinase inhibition.)」 Plos One 5: 12913-12913 (2010)、Ashwell, M.A. et al.著の「一連の3-(3-フェニル-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)ピリジン-2-アミン:経口で生物学的に利用可能な選択的で強力なATP非依存性Akt阻害剤の発見及び最適化(Discovery and optimization of a series of 3-(3-phenyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)pyridin-2-amines: orally bioavailable, selective, and potent ATP-independent Akt inhibitors)」, J. Med. Chem. 55: 5291-5310 (2012)、並びにLapierre, J.M. et al.著の「3-(3-(4-(1-アミノシクロブチル)フェニル)-5-フェニル-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)ピリジン-2-アミン(ARQ092):経口で生物学的に利用可能な選択的で強力なアロステリックAKT阻害剤の発見(Discovery of 3-(3-(4-(1-Aminocyclobutyl)phenyl)-5-phenyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)pyridin-2-amine (ARQ 092): An Orally Bioavailable, Selective, and Potent Allosteric AKT Inhibitor)」, J. Med. Chem. 59: 6455-6469 (2016)を参照のこと。 AKT2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Davies, T.G.et al.著の「Pkb、Pka、及びPka-Pkbキメラに結合する阻害剤の構造比較(A Structural Comparison of Inhibitor Binding to Pkb, Pka and Pka-Pkb Chimera)」, J. Mol. Biol. 367: 882 (2007)において記載される結晶構造PDB 2jdo及び2jdr並びに関連のリガンド、Saxty, G. et al著の「フラグメントベースのリード探索を使用するプロテインキナーゼBの阻害剤の同定(Identification of Inhibitors of Protein Kinase B Using Fragment-Based Lead Discovery)」, J. Med. Chem. 50: 2293-2296 (2007)において記載される結晶構造PDB 2uw9及び関連のリガンド、Mchardy, T.et al.著の「プロテインキナーゼB(Akt)の選択的な経口活性型阻害剤としての4-アミノ-1-(7H-ピロロ[2,3-D]ピリミジン-4-イル)ピペリジン-4-カルボキサミドの発見(Discovery of 4-Amino-1-(7H-Pyrrolo[2,3-D]Pyrimidin-4-Yl)Piperidine-4-Carboxamides as Selective, Orally Active Inhibitors of Protein Kinase B (Akt))」, J. Med. Chem. 53: 2239d (2010)において記載される結晶構造PDB 2x39及び2xh5並びに関連のリガンド、Hadler, K.S. et al.著の「エンテロバクター・アエロゲネス由来のグリセロホスホジエステラーゼにおける触媒的に適格な二核中心の基質促進型の形成及び反応性の調節(Substrate-promoted formation of a catalytically competent binuclear center and regulation of reactivity in a glycerophosphodiesterase from Enterobacter aerogenes)」, J. Am. Chem. Soc. 130: 14129-14138 (2008)において記載される結晶構造PDB 3d03及び関連のリガンド、並びにRouse, M.B. et al.著の「AKTキナーゼの強力な阻害剤としてのアミノフラザン(Aminofurazans as potent inhibitors of AKT kinase)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 1508-1511 (2009)において記載される結晶構造PDB 3e87、3e8d、及び3e88並びに関連のリガンドを参照のこと。 BMXの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Muckelbauer, J. et al.著の「X染色体における骨髄キナーゼ:TecファミリーキナーゼのX線結晶構造(X-ray crystal structure of bone marrow kinase in the x chromosome: a Tec family kinase)」, Chem. Biol. Drug Des. 78: 739-748 (2011)において記載される結晶構造PDB 3sxr及び3sxr並びに関連のリガンドを参照のこと。 CSF1Rの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Schubert, C. et al.著の「2つの阻害剤との複合体におけるコロニー刺激因子-1受容体(cFMS)のチロシンキナーゼドメインの結晶構造(Crystal structure of the tyrosine kinase domain of colony-stimulating factor-1 receptor (cFMS) in complex with two inhibitors)」, J. Biol. Chem. 282: 4094-4101 (2007)において記載される結晶構造PDB 2i0v及び2i1m並びに関連のリガンド、Huang, H. et al.著の「ピリド[2,3-d]ピリミジン-5-オンのクラスの抗炎症性FMS阻害剤の設計及び合成(Design and synthesis of a pyrido[2,3-d]pyrimidin-5-one class of anti-inflammatory FMS inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 2355-2361 (2008)において記載される結晶構造PDB 3bea及び関連のリガンド、M.T., McKay、D.B. Overgaard著の「ホスホラミドンと複合体を形成したシュードモナス・エルギノーザのエラスターゼの構造(Structure of the Elastase of Pseudomonas aeruginosa Complexed with Phosphoramidon)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 3dpk及び関連のリガンド、Illig, C.R. et al.著の「抗炎症臨床的候補の4-シアノ-N-[2-(1-シクロヘキセン-1-イル)-4-[1-[(ジメチルアミノ)アセチル]-4-ピペリジニル]フェニル]-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド(JNJ-28312141)をもたらす強力なクラスのアリールアミドコロニー刺激因子-1受容体阻害剤の最適化(Optimization of a Potent Class of Arylamide Colony-Stimulating Factor-1 Receptor Inhibitors Leading to Anti-inflammatory Clinical Candidate 4-Cyano-N-[2-(1-cyclohexen-1-yl)-4-[1-[(dimethylamino)acetyl]-4-piperidinyl]phenyl]-1H-imidazole-2-carboxamide (JNJ-28312141)」, J. Med. Chem. 54: 7860-7883 (2011)において記載される結晶構造PDB 3krj及び3krl並びに関連のリガンド、Tap, W.D. et al.著の「腱滑膜巨細胞腫瘍におけるCSF1Rキナーゼの構造情報に基づく遮断:(Structure-Guided Blockade of CSF1R Kinase in Tenosynovial Giant-Cell Tumor:)」, N Engl J Med 373: 428-437 (2015)において記載される結晶構造PDB 4r7h及び関連のリガンド、Meyers, M.J. et al.著の「構造ベースの薬物設計により、DFG-in結合性CSF-1Rキナーゼ阻害剤からDFG-out結合様式への変換が可能となる(Structure-based drug design enables conversion of a DFG-in binding CSF-1R kinase inhibitor to a DFG-out binding mod)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 1543-1547 (2010)において記載される結晶構造PDB 3lcd及び3lcoa並びに関連のリガンド、Zhang, C. et al.著の「特異性が高いFMS及びKITの二重キナーゼ阻害剤の設計及び薬理学(Design and pharmacology of a highly specific dual FMS and KIT kinase inhibitor)」, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110: 5689-5694 (2013)において記載される結晶構造PDB 4hw7及び関連のリガンド、並びにTap, W.D. et al.著の「腱滑膜巨細胞腫瘍におけるCSF1Rキナーゼの構造情報に基づく遮断(Structure-Guided Blockade of CSF1R Kinase in Tenosynovial Giant-Cell Tumor)」, N Engl J Med 373: 428-437 (2015)において記載される結晶構造PDB 4r7i及び関連のリガンドを参照のこと。 CSKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Levinson, N.M. et al.著の「c-Srcのその不活性化因子Cskによる認識についての構造的基礎(Structural basis for the recognition of c-Src by its inactivator Csk)」 Cell 134: 124-134 (2008)を参照のこと。 DDR1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Canning, P. et al.著の「選択的で多標的のII型キナーゼ阻害剤によるコラーゲン受容体Ddr1の阻害を決定する構造的メカニズム(Structural Mechanisms Determining Inhibition of the Collagen Receptor Ddr1 by Selective and Multi-Targeted Type II Kinase Inhibitors)」, J. Mol. Biol. 426: 2457 (2014)において記載される結晶構造PDB 3zos及び4bkj並びに関連のリガンド、Kim, H. et al.著の「強力で選択的なDdr1受容体チロシンキナーゼ阻害剤の発見(Discovery of a Potent and Selective Ddr1 Receptor Tyrosine Kinase Inhibitor)」, ACS Chem.Biol. 8: 2145 (2013)において記載される結晶構造PDB 4ckr及び関連のリガンド、Murray, C.W et al.著の「強力で選択的なDDR1/2阻害剤のフラグメントベースの発見(Fragment-Based Discovery of Potent and Selective DDR1/2 Inhibitors)」, ACS Med.Chem.Lett. 6: 798-803 (2015)において記載される結晶構造PDB 5bvk、5bvn、及び5bvw並びに関連のリガンド、Wang, Z. et al.著の「選択的なディスコイジンドメイン受容体1(DDR1)阻害剤としてのテトラヒドロイソキノリン-7-カルボキサミドの構造ベースの設計(Structure-Based Design of Tetrahydroisoquinoline-7-carboxamides as Selective Discoidin Domain Receptor 1 (DDR1) Inhibitors)」, J. Med. Chem. 59: 5911-5916 (2016)において記載される結晶構造PDB 5fdp及び関連のリガンド、並びにBartual, S.G. et al.著の「2.65オングストロームの解像度でのD2164阻害剤との複合体におけるDDR1受容体チロシンキナーゼの構造(Structure of DDR1 receptor tyrosine kinase in complex with D2164 inhibitor at 2.65 Angstroms resolution)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 5fdx及び関連のリガンドを参照のこと。 EPHA2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Heinzlmeir, S. et al.著の「化学的プロテオミクス及び構造生物学は、臨床的キナーゼ薬によるEPHA2阻害を定義する(Chemical Proteomics and Structural Biology Define EPHA2 Inhibition by Clinical Kinase Drug)」, ACS Chem. Biol. 11: 3400-3411 (2016)において記載される結晶構造PDB 5i9x、5i9y、5ia0、及び5ia1並びに関連のリガンド、Heinzlmeir, S. et al.著の「ダヌセルチブ(PHA739358)を伴うエフリンA2(EphA2)受容体プロテインキナーゼの結晶構造(Crystal Structure of Ephrin A2 (EphA2) Receptor Protein Kinase with danusertib (PHA739358))」, ACS Chem Biol 11 3400-3411 (2016)において記載される結晶構造PDB 5i9z及び関連のリガンド、並びにHeinzlmeir, S. et al.著の「化学的プロテオミクス及び構造生物学は、臨床的キナーゼ薬によるEPHA2阻害を定義する(Chemical Proteomics and Structural Biology Define EPHA2 Inhibition by Clinical Kinase Drug)」, ACS Chem. Biol. 11: 3400-3411 (2016)において記載される結晶構造PDB 5ia2、5ia3、5ia4、及び5ia5並びに関連のリガンドを参照のこと。 EPHA3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Zhao, H. et al.著の「フラグメントベースのドッキング及び分子動力学によるチロシンキナーゼ阻害剤の新規のケモタイプの発見(Discovery of a novel chemotype of tyrosine kinase inhibitors by fragment-based docking and molecular dynamics)」, ACS Med. Chem. Lett. 3: 834-838 (2012)において記載される結晶構造PDB 4g2f及び関連のリガンド、Lafleur, K. et al.著の「チロシンキナーゼEphB4の阻害剤の最適化。2.X線結晶構造解析による細胞効力の改善及び結合様式の検証(Optimization of Inhibitors of the Tyrosine Kinase EphB4. 2. Cellular Potency Improvement and Binding Mode Validation by X-ray Crystallography)」, J. Med. Chem. 56: 84-96 (2013)において記載される結晶構造PDB 4gk2及び4gk3並びに関連のリガンド、Lafleur, K. et al.著の「チロシンキナーゼEphB4の阻害剤の最適化。2.X線結晶構造解析による細胞効力の改善及び結合様式の検証(Optimization of Inhibitors of the Tyrosine Kinase EphB4. 2. Cellular Potency Improvement and Binding Mode Validation by X-ray Crystallography)」, J. Med. Chem. 56: 84-96 (2013)において記載される結晶構造PDB 4gk3及び関連のリガンド、Unzue, A. et al.著の「I1/2型及びII型のEphチロシンキナーゼ阻害剤としてのピロロ[3,2-b]キノキサリン誘導体:構造ベースの設計、合成、及びin vivoでの検証(Pyrrolo[3,2-b]quinoxaline Derivatives as Types I1/2 and II Eph Tyrosine Kinase Inhibitors: Structure-Based Design, Synthesis, and in Vivo Validation)」, J. Med. Chem. 57: 6834-6844 (2014)において記載される結晶構造PDB 4p4c及び4p5q並びに関連のリガンド、Unzue, A. et al.著の「I1/2型及びII型のEphチロシンキナーゼ阻害剤としてのピロロ[3,2-b]キノキサリン誘導体:構造ベースの設計、合成、及びin vivoでの検証(Pyrrolo[3,2-b]quinoxaline Derivatives as Types I1/2 and II Eph Tyrosine Kinase Inhibitors: Structure-Based Design, Synthesis, and in Vivo Validation)」, J. Med. Chem. 57: 6834-6844 (2014)において記載される結晶構造PDB 4p5z及び関連のリガンド、Dong, J. et al.著の「I型、I1/2型、及びII型の阻害剤のEphチロシンキナーゼへの結合の構造解析(Structural Analysis of the Binding of Type I, I1/2, and II Inhibitors to Eph Tyrosine Kinases)」, ACS Med.Chem.Lett. 6: 79-83 (2015)において記載される結晶構造PDB 4twn及び関連のリガンド、Walker, J.R.著の「ALW-II-38-3との複合体におけるヒトエフリンA型受容体3(Epha3)のキナーゼドメイン(Kinase Domain of Human Ephrin Type-A Receptor 3 (Epha3) in Complex with ALW-II-38-3)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 3dzq及び関連のリガンドを参照のこと。 EPHA4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Clifton, I.J. et al.著の「デルタ((L)-アルファ-アミノアジポイル)-(L)-システイニル-(D)-メチオニンを伴うイソペニシリンNシンターゼの結晶構造は、鉄へのチオエーテル配位を明らかにする(The Crystal Structure of Isopenicillin N Synthase with Delta((L)-Alpha-Aminoadipoyl)-(L)-Cysteinyl-(D)-Methionine Reveals Thioether Coordination to Iron)」, Arch. Biochem. Biophys. 516: 103 (2011)において記載される結晶構造PDB 2y60及び関連のリガンド、並びにVan Linden, O.P et al.著の「Epha4受容体チロシンキナーゼについての小分子阻害剤のフラグメントベースのリード探索(Fragment Based Lead Discovery of Small Molecule Inhibitors for the Epha4 Receptor Tyrosine Kinase)」, Eur. J. Med. Chem. 47: 493 (2012)において記載される結晶構造PDB 2xyu及び関連のリガンドを参照のこと。 EPHA7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Walker, J.R. et al.著の「ALW-II-49-7との複合体におけるヒトエフリンa型受容体7(epha7)のキナーゼドメイン(Kinase domain of human ephrin type-a receptor 7 (epha7) in complex with ALW-II-49-7)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 3dko及び関連のリガンドを参照のこと。 EPHB4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Bardelle, C. et al.著の「チロシンキナーゼEphb4の阻害剤。パート2:3,5-ビス置換されたアニリノピリミジンの構造ベースの発見及び最適化(Inhibitors of the Tyrosine Kinase Ephb4. Part 2: Structure-Based Discovery and Optimization of 3,5-Bis Substituted Anilinopyrimidines)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 5717(2008)において記載される結晶構造PDB 2vx1及び関連のリガンド、Bardelle, C. et al.著の「チロシンキナーゼEphb4の阻害剤。パート3:非ベンゾジオキソールベースのキナーゼ阻害剤の同定(Inhibitors of the Tyrosine Kinase Ephb4. Part 3: Identification of Non-Benzodioxole-Based Kinase Inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 6242-6245 (2010)において記載される結晶構造PDB 2x9f及び関連のリガンド、Barlaam, B.et al.著の「チロシンキナーゼEphb4の阻害剤。パート4:ベンジルアルコール系列の発見及び最適化(Inhibitors of the Tyrosine Kinase Ephb4. Part 4: Discovery and Optimization of a Benzylic Alcohol Series)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 21: 2207 (2011)において記載される結晶構造PDB 2xvd及び関連のリガンド、Overman, R.C.et al.著の「ヒトEphbチロシンキナーゼドメインの構造ファミリーポートレートの完成(Completing the Structural Family Portrait of the Human Ephb Tyrosine Kinase Domains)」, Protein Sci. 23: 627 (2014)において記載される結晶構造PDB 3zew及び関連のリガンド、Kim, M.H. et al.著の「強力な受容体チロシンキナーゼ阻害剤の設計、合成、及び生物学的評価(The Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Potent Receptor Tyrosine Kinase Inhibitors.)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 22: 4979 (2012)において記載される結晶構造PDB 4aw5及び関連のリガンド、Vasbinder, M.M. et al.著の「強力な突然変異B-RafV600E選択的キナーゼ阻害剤の新規の系列の発見及び最適化(Discovery and Optimization of a Novel Series of Potent Mutant B-Raf V600E Selective Kinase Inhibitors)」 J. Med. Chem. 56: 1996., (2013)において記載される結晶構造PDB 4bb4及び関連のリガンド、Bardelle, C. et al著の「チロシンキナーゼEphb4の阻害剤。パート1:一連の2,4-ビス-アニリノピリミジンの構造ベースの設計及び最適化(Inhibitors of the Tyrosine Kinase Ephb4. Part 1: Structure-Based Design and Optimization of a Series of 2,4-Bis-Anilinopyrimidines)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 2776-2780 (2008)において記載される結晶構造PDB 2vwu、2vwv、及び2vww並びに関連のリガンド、Bardelle, C. et al.著の「チロシンキナーゼEphb4の阻害剤。パート2:3,5-ビス置換されたアニリノピリミジンの構造ベースの発見及び最適化(Inhibitors of the Tyrosine Kinase Ephb4. Part 2: Structure-Based Discovery and Optimization of 3,5-Bis Substituted Anilinopyrimidines)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 5717 (2008)において記載される結晶構造PDB 2vwx、2vwy、及び2vwz並びに関連のリガンド、並びにWelin, M.et al.著の「ヒトGmpシンテターゼの基質特異性及びオリゴマー化(Substrate Specificity and Oligomerization of Human Gmp Synthetas)」, J. Mol. Biol. 425: 4323 (2013)において記載される結晶構造PDB 2vxo及び関連のリガンドを参照のこと。 ERBB2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Aertgeerts, K. et al著の「HER2タンパク質のキナーゼドメインの阻害及びアロステリック活性化のメカニズムの構造解析(Structural Analysis of the Mechanism of Inhibition and Allosteric Activation of the Kinase Domain of HER2 Protein)」, J. Biol. Chem. 286: 18756-18765 (2011)において記載される結晶構造及び関連のリガンド、並びにIshikawa, T.et al.著の「ピロロ[3,2-d]ピリミジン足場を有する新規のヒト上皮成長因子受容体2(HER2)/上皮成長因子受容体(EGFR)の二重阻害剤の設計及び合成(Design and Synthesis of Novel Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2)/Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) Dual Inhibitors Bearing a Pyrrolo[3,2-d]pyrimidine Scaffold)」 J. Med. Chem. 54: 8030-8050 (2011)において記載される結晶構造及び関連のリガンドを参照のこと。 ERBB3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Littlefield, P.et al.著の「ATP競合阻害剤は、HER3シュードキナーゼのアロステリック機能を調節する(An ATP-Competitive Inhibitor Modulates the Allosteric Function of the HER3 Pseudokinase)」, Chem. Biol. 21: 453-458 (2014)を参照のこと。 ERBB4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Qiu, C. et al.著の「HER4/ErbB4キナーゼの活性化及び阻害のメカニズム(Mechanism of Activation and Inhibition of the HER4/ErbB4 Kinase)」, Structure 16: 460-467 (2008)及びWood, E.R. et al.著の「ErbBキナーゼの調整可能な共有結合型修飾因子としての6-エチニルチエノ[3,2-d]ピリミジン-4-アニリン及び6-エチニルチエノ[2,3-d]ピリミジン-4-アニリン(6-Ethynylthieno[3,2-d]- and 6-ethynylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-anilines as tunable covalent modifiers of ErbB kinases)」, Proc. Natl. Acad. Sci. Usa 105: 2773-2778 (2008)を参照のこと。 FESの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Filippakopoulos, P. et al著の「SH2-キナーゼドメインの構造的カップリングは、Fes及びAblの基質認識及びキナーゼ活性化を結びつける(Structural Coupling of SH2-Kinase Domains Links Fes and Abl Substrate Recognition and Kinase Activation.)」 Cell 134: 793-803 (2008)及びHellwig, S. et al.著の「c-Fesタンパク質チロシンキナーゼの小分子阻害剤(Small-Molecule Inhibitors of the c-Fes Protein-Tyrosine Kinase)」, Chem. Biol. 19: 529-540 (2012)を参照のこと。 FYNの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Kinoshita, T. et. al.著の「スタウロスポリンと複合体を形成したヒトFynキナーゼドメインの構造(Structure of human Fyn kinase domain complexed with staurosporine)」, Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 840-844 (2006)を参照のこと。 GSG2(ハスピン)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Filippakopoulos, P. et al.著の「ピラゾロピリミジンリガンドを伴うヒトハスピンの結晶構造(Crystal Structure of Human Haspin with a pyrazolo-pyrimidine ligand)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 3e7v、PDB 3f2n、3fmd、及び関連のリガンド、Eswaran, J. et al.著の「非定型ヒトキナーゼハスピンの構造及び機能的特性評価(Structure and functional characterization of the atypical human kinase haspin)」, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106: 20198-20203 (2009)において記載される結晶構造PDB 3iq7及び関連のリガンド、並びにChaikuad, A. et al.著の「ERK1/2の独特な阻害剤結合部位は、遅い結合反応速度と関連している(A unique inhibitor binding site in ERK1/2 is associated with slow binding kinetics)」, Nat. Chem. Biol. 10: 853-860 (2014)において記載される結晶構造PDB 4qtc及び関連のリガンドを参照のこと。 HCKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Schindler, T. et al.著の「Srcファミリー選択的チロシンキナーゼ阻害剤との複合体におけるHckの結晶構造(Crystal structure of Hck in complex with a Src family-selective tyrosine kinase inhibitor)」, Mol. Cell 3: 639-648 (1999)において記載される結晶構造PDB 1qcf及び関連のリガンド、Burchat, A. et al.著の「臓器同種移植片の拒絶反応を防ぐSrcファミリー選択的な経口活性型のLck阻害剤であるA-770041の発見(Discovery of A-770041, a Src-Family Selective Orally Active Lck Inhibitor that Prevents Organ Allograft Rejection)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 16: 118 (2006)において記載される結晶構造PDB 2c0i及び2c0t並びに関連のリガンド、Sabat, M.et al.著の「リンパ球特異的キナーゼ(Lck)の2-ベンズイミダゾール置換ピリミジン系阻害剤の開発(The development of 2-benzimidazole substituted pyrimidine based inhibitors of lymphocyte specific kinase (Lck))」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 16: 5973-5977 (2006)において記載される結晶構造PDB 2hk5及び関連のリガンド、Saito, Y. et al.著の「ピロロ-ピリミジン誘導体は、in vivoでヒト初代AML幹細胞を標的にする(A Pyrrolo-Pyrimidine Derivative Targets Human Primary AML Stem Cells in Vivo)」, Sci Transl Med 5: 181ra52-181ra52 (2013)において記載される結晶構造PDB 3vry、3vs3、3vs6、及び3vs7並びに関連のリガンド、並びにParker, L.J. et al著の「蛍光リガンドSKF86002を使用するキナーゼ結晶の同定及びATP競合阻害剤のスクリーニング(Kinase crystal identification and ATP-competitive inhibitor screening using the fluorescent ligand SKF86002)」,. Acta Crystallogr.,Sect.D 70: 392-404 (2014)において記載される結晶構造PDB 4lud及び関連のリガンドを参照のこと。 IGF1Rの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Velaparthi, U. et al.著の「インスリン様成長因子1受容体(IGF-1R)の阻害剤としての3-(1H-ベンゾ[d]イミダゾール-2-イル)ピリジン-2(1H)-オンの発見及び初期SAR(Discovery and initial SAR of 3-(1H-benzo[d]imidazol-2-yl)pyridin-2(1H)-ones as inhibitors of insulin-like growth factor 1-receptor (IGF-1R))」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 2317-2321 (2007)において記載される結晶構造PDB 2oj9及び関連のリガンド、Wittman, M.D. et al.著の「臨床開発におけるインスリン様成長因子受容体(IGF-1R)キナーゼの2,4-二置換されたピロロ[1,2-f][1,2,4]トリアジン阻害剤(BMS-754807)の発見(Discovery of a 2,4-disubstituted pyrrolo[1,2-f][1,2,4]triazine inhibitor (BMS-754807) of insulin-like growth factor receptor (IGF-1R) kinase in clinical development.)」, J. Med. Chem. 52: 7360-7363 (2009)において記載される結晶構造PDB 3i81及び関連のリガンド、Sampognaro, A.J. et al.著の「IGF-1Rキナーゼ及びIRキナーゼの一連の2,4-二置換されたピロロ[1,2-f][1,2,4]トリアジン阻害剤におけるプロリン同配体(Proline isosteres in a series of 2,4-disubstituted pyrrolo[1,2-f][1,2,4]triazine inhibitors of IGF-1R kinase and IR kinase)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 20: 5027-5030 (2010)において記載される結晶構造PDB 3nw5及び関連のリガンド、Buchanan, J.L. et al.著の「インスリン様成長因子-1受容体(IGF-1R)阻害剤としての2,4-ビス-アリールアミノ-1,3-ピリミジンの発見(Discovery of 2,4-bis-arylamino-1,3-pyrimidines as insulin-like growth factor-1 receptor (IGF-1R) inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 21: 2394-2399 (2011)において記載される結晶構造PDB 3qqu及び関連のリガンド、Kettle, J.G. et al.著の「新規の系列のDyrk1Bキナーゼ阻害剤の発見及び最適化によるMek耐性仮説の調査(Discovery and Optimization of a Novel Series of Dyrk1B Kinase Inhibitors to Explore a Mek Resistance Hypothesis.)」 J. Med. Chem. 58: 2834 (2015)において記載される結晶構造PDB 4d2r及び関連のリガンド、Monferrer, D. et al.著の「コマモナス・テストステロニT-2由来の全長LysR型調節因子TsaRに対する構造的研究は、四量体LTTRフォールドの新規のオープンコンホメーションを明らかにする(Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold)」, Mol. Microbiol. 75: 1199-1214 (2010)において記載される結晶構造PDB 3fxq及び関連のリガンド、Degorce, S. et al.著の「Igf-R1の強力で選択的な、経口で生物学的に利用可能かつ効果的な新規の阻害剤であるAzd9362の発見(Discovery of Azd9362, a Potent Selective Orally Bioavailable and Efficacious Novel Inhibitor of Igf-R1)」(公開予定)において記載される結晶構造PDB 5fxs及び関連のリガンド、Mayer, S.C.et al.著の「リード同定による、癌治療において使用することが可能であるインスリン様成長因子受容体(IGF-1R)のイソキノリンジオン阻害剤の作製(Lead identification to generate isoquinolinedione inhibitors of insulin-like growth factor receptor (IGF-1R) for potential use in cancer treatment)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 18: 3641-3645 (2008)において記載される結晶構造PDB 2zm3及び関連のリガンド、「リード同定による、癌治療において使用することが可能であるインスリン様成長因子受容体(IGF-1R)の3-シアノキノリン阻害剤の作製(Lead identification to generate 3-cyanoquinoline inhibitors of insulin-like growth factor receptor (IGF-1R) for potential use in cancer treatment)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 62-66 (2009)において記載される結晶構造PDB 3f5p及び関連のリガンド、Nemecek, C. et al.著の「ビスアザインドールに関連する強力なIGF1-R阻害剤の設計(Design of Potent IGF1-R Inhibitors Related to Bis-azaindoles)」 Chem. Biol. Drug Des. 76: 100-106 (2010)において記載される結晶構造PDB 3lvp及び関連のリガンド、Lesuisse, D. et al.著の「最初の非ATP競合IGF-1Rキナーゼ阻害剤の発見:競合阻害剤と比較した利点(Discovery of the first non-ATP competitive IGF-1R kinase inhibitors: Advantages in comparison with competitive inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 21: 2224-2228 (2011)において記載される結晶構造PDB 3o23及び関連のリガンド、Wu, J. et al.著の「IGF1受容体の小分子阻害及び活性化ループトランスリン酸化(Small-molecule inhibition and activation-loop trans-phosphorylation of the IGF1 receptor)」, Embo J. 27: 1985-1994 (2008)において記載される結晶構造PDB 3d94及び関連のリガンド、並びにStauffer, F.et al.著の「IGF-1R阻害剤の5-[3-フェニル-(2-環状エーテル)-メチルエーテル]-4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン系列の同定(Identification of a 5-[3-phenyl-(2-cyclic-ether)-methylether]-4-aminopyrrolo[2,3-d]pyrimidine series of IGF-1R inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 26: 2065-2067 (2016)において記載される結晶構造PDB 5hzn及び関連のリガンドを参照のこと。 INSRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、Katayama, N. et al.著の「プロテインキナーゼとそれらの阻害剤との間の水素結合パターンに重要な要素の特定(Identification of a key element for hydrogen-bonding patterns between protein kinases and their inhibitors)」, Proteins 73: 795-801 (2008)において記載される結晶構造PDB 2z8c及び関連のリガンド、Chamberlain, S.D.et al.著の「4,6-ビス-アニリノ-1H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン:IGF-1R受容体チロシンキナーゼの強力な阻害剤の発見(Discovery of 4,6-bis-anilino-1H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidines: Potent inhibitors of the IGF-1R receptor tyrosine kinase)」, (2009) Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 469-473において記載される結晶構造PDB 3ekk及び関連のリガンド、Chamberlain, S.D. et al.著の「JNK選択性に対する4,6-ビス-アニリノ-1H-ピロロ[2,3-d]ピリミジンIGF-1Rチロシンキナーゼ阻害剤の最適化(Optimization of 4,6-bis-anilino-1H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine IGF-1R tyrosine kinase inhibitors towards JNK selectivity)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 360-364 (2009)において記載される結晶構造PDB 3ekn及び関連のリガンド、Sanderson, M.P. et al.著の「抗腫瘍効果とグルコース恒常性の乱れとを切り離す薬物動態特性を備えた新規のIGF1R/INSRチロシンキナーゼ阻害剤であるBI 885578(BI 885578, a Novel IGF1R/INSR Tyrosine Kinase Inhibitor with Pharmacokinetic Properties That Dissociate Antitumor Efficacy and Perturbation of Glucose Homeostasis)」 Mol. Cancer Ther. 14: 2762-2772, (2015)において記載される結晶構造PDB 5e1s及び関連のリガンド、Patnaik, S. et al.著の「インスリン様成長因子-1受容体(IGF-1R)チロシンキナーゼの強力な阻害剤としての3,5-二置換-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジンの発見(Discovery of 3,5-disubstituted-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridines as potent inhibitors of the insulin-like growth factor-1 receptor (IGF-1R) tyrosine kinase)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 19: 3136-3140 (2009)において記載される結晶構造PDB 3eta及び関連のリガンド、Stauffer, F.et al.著の「IGF-1R阻害剤の5-[3-フェニル-(2-環状エーテル)-メチルエーテル]-4-アミノピロロ[2,3-d]ピリミジン系列の同定(Identification of a 5-[3-phenyl-(2-cyclic-ether)-methylether]-4-aminopyrrolo[2,3-d]pyrimidine series of IGF-1R inhibitors)」, Bioorg. Med. Chem. Lett. 26: 2065-2067 (2016)において記載される結晶構造PDB 5hhw及び関連のリガンド、並びにAnastassiadis, T. et al.著の「細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)阻害剤から誘導される選択性が高いインスリン受容体(IR)/インスリン様成長因子1受容体(IGF-1R)二重阻害剤(A highly selective dual insulin receptor (IR)/insulin-like growth factor 1 receptor (IGF-1R) inhibitor derived from an extracellular signal-regulated kinase (ERK) inhibitor)」, J. Biol. Chem. 288: 28068-28077 (2013)において記載される結晶構造PDB 4ibm及び関連のリガンドを参照のこと。 HBVの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表し、Yは、メチル又はイソプロピルであり、かつXは、N又はCである。追加の例及び関連のリガンドについては、Weber, O.; et al.著の「トランスジェニックマウスモデルにおける新規の非ヌクレオシド化合物によるヒトB型肝炎ウイルス(HBV)の阻害(Inhibition of human hepatitis B virus (HBV) by a novel non-nucleosidic compound in a transgenic mouse model.)」 Antiviral Res.54, 69-78 (2002)、Deres, K.; et al.著の「ヌクレオカプシドの薬物誘導枯渇によるB型肝炎ウイルスの複製の阻害(Inhibition of hepatitis B virus replication by drug-induced depletion of nucleocapsids.)」 Science, 299, 893-896 (2003)、Stray, S. J.、Zlotnick, A.著の「BAY 41-4109は、B型肝炎ウイルスのカプシドアセンブリに対して多数の効果を有する(BAY 41-4109 has multiple effects on Hepatitis B virus capsid assembly.)」 J. Mol. Recognit. 19, 542-548 (2006)、Stray, S. J.; et al.著の「ヘテロアリールジヒドロピリミジンは、B型肝炎ウイルスのカプシドアセンブリを活性化して誤った方向に誘導する可能性がある(heteroaryldihydropyrimidine activates and can misdirect hepatitis B virus capsid assembly.)」 Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 102, 8138-8143 (2005)、Guan, H.; et al.著の「新規化合物Z060228は、HBVカプシドのアセンブリを阻害する(The novel compound Z060228 inhibits assembly of the HBV capsid.)」 Life Sci. 133, 1-7 (2015)、Wang, X. Y.; et al.著の「新規の化合物GLS4によるHBV複製のin vitroでの阻害、及びアデホビル-ジピボキシル耐性のHBV突然変異に対するその有効性(In vitro inhibition of HBV replication by a novel compound, GLS4, and its efficacy against adefovir-dipivoxil-resistant HBV mutations.)」 Antiviral Ther. 17, 793-803 (2012)、Klumpp, K.; et al.著の「ウイルスコアタンパク質に結合したB型肝炎ウイルス複製阻害剤の高解像度結晶構造(High-resolution crystal structure of a hepatitis B virus replication inhibitor bound to the viral core protein.)」 112, 15196-15201 (2015)、Qiu, Z.; et al.著の「経口で生物学的に利用可能な4-メチルヘテロアリールジヒドロピリミジンベースのB型肝炎ウイルス(HBV)カプシド阻害剤の設計及び合成(Design and synthesis of orally bioavailable 4-methyl heteroaryldihydropyrimidine based hepatitis B virus (HBV) capsid inhibitors.)」 J. Med. Chem. 59, 7651-7666 (2016)、Zhu, X.; et al.著の「カプシドアセンブリを標的とする抗HBV剤としての2,4-ジアリール-4,6,7,8-テトラヒドロキナゾリン-5(1H)-オン誘導体(2,4-Diaryl-4,6,7,8-tetrahydroquinazolin-5(1H)-one derivatives as anti-HBV agents targeting at capsid assembly.)」 Bioorg. Med. Chem. Lett. 20, 299-301 (2010)、Campagna, M. R.; et al.著の「スルファモイルベンズアミド誘導体は、B型肝炎ウイルスのヌクレオカプシドのアセンブリを阻害する(Sulfamoylbenzamide derivatives inhibit the assembly of hepatitis B virus nucleocapsids.)」 J. Virol. 87, 6931-6942 (2013)、Campagna, M. R.; et al.著の「スルファモイルベンズアミド誘導体は、B型肝炎ウイルスのヌクレオカプシドのアセンブリを阻害する(Sulfamoylbenzamide derivatives inhibit the assembly of hepatitis B virus nucleocapsids.)」 J. Virol. 87, 6931-6942 (2013)、「B型肝炎抗ウイルス剤(Hepatitis B antiviral agents)」と題する国際公開第2013/096744号、「B型肝炎コアタンパク質アロステリックモジュレーター(Hepatitis B core protein allosteric modulators)」と題する国際公開第2015/138895号、Wang, Y. J.; et al.著の「新規のピリダジノン誘導体は、ゲノムフリーのカプシド形成を誘導することにより、B型肝炎ウイルスの複製を阻害する(A novel pyridazinone derivative inhibits hepatitis B virus replication by inducing genome-free capsid formation.)」 Antimicrob. Agents Chemother. 59, 7061-7072 (2015)、「肝炎治療用の縮合二環式スルファモイル誘導体(Fused bicyclic sulfamoyl derivatives for the treatment of hepatitis)」と題する国際公開第2014/033167号、「アゼパン誘導体及びB型肝炎感染症を治療する方法(Azepane derivatives and methods of treating hepatitis B infections)」と題する米国特許出願公開第2015/0132258号、並びに「B型肝炎ウイルスアセンブリエフェクター(Hepatitis B viral assembly effector)」と題する国際公開第2015/057945号を参照のこと。 エピジェネティックなシグナル伝達及びクロマチン生物学に関与する8つのサブファミリーへと編成されたタンパク質のヒトブロモドメインファミリーのデンドログラムを示す図である。図9におけるブロモドメインファミリーのタンパク質のいずれも、本発明による標的タンパク質として選択することができる。 CBP及び/又はP300の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、標的化リガンドの追加の例については、「環状アデノシン一リン酸応答エレメント結合性タンパク質結合性タンパク質(CBP)の高度に進んだ強力で選択的なブロモドメイン阻害剤であるGNE-781(GNE-781, A Highly Advanced Potent and Selective Bromodomain Inhibitor of Cyclic Adenosine Monophosphate Response Element Binding Protein, Binding Protein (CBP))」 J Med Chem 2017, 60(22), 9162、CCS-1477、国際公開第2018/073586号、FT-7051、及び国際公開第2019/055869号を参照のこと。 BRD9の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる点である。追加の例については、「in vivoで活性の選択的なBRD9阻害剤の構造ベースの設計(Structure-Based Design of an in Vivo Active Selective BRD9 Inhibitor)」 J Med Chem 2016, 59(10), 4462、国際公開第2016/139361号を参照のこと。 CBL-Bの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、国際公開第2019/14800号を参照のこと。 ERKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる点である。追加の例については、「コンフォメーション制御を使用する細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)の強力で選択的なピリミジルピロール阻害剤の構造情報に基づく設計(Structure-Guided Design of Potent and Selective Pyrimidylpyrrole Inhibitors of Extracellular Signal-Regulated Kinase (ERK) Using Conformational Control)」 J Med Chem 2009, 52(20), 6362、国際公開第2015/051341号、「非小細胞肺癌(NSCLC)のモデルにおける単剤療法及び併用療法の両方で効果的なERK1/2(AZD0364)の強力で選択的な経口阻害剤の発見(Discovery of a Potent and Selective Oral Inhibitor of ERK1/2 (AZD0364) That Is Efficacious in Both Monotherapy and Combination Therapy in Models of Nonsmall Cell Lung Cancer (NSCLC))」 J Med Chem 2019, 62(24), 11004、「ERK阻害剤LY3214996は、ERK経路誘導型癌を標的にする:精密医療に向けた治療的アプローチ(ERK Inhibitor LY3214996 Targets ERK Pathway-Driven Cancers: A Therapeutic Approach Toward Precision Medicine)」 Mol Cancer Ther 2020, 19, 325を参照のこと。 WDR5の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、「WDリピート含有タンパク質5(WDR5)と混合形質白血病1(MLL1)と間の相互作用の小分子アンタゴニストの構造ベースの最適化(Structure-Based Optimization of a Small Molecule Antagonist of the Interaction Between WD Repeat-Containing Protein 5 (WDR5) and Mixed-Lineage Leukemia 1 (MLL1))」 J Med Chem 2016, 59(6), 2478、国際公開第2017/147700号、「ピコモル濃度の親和性を有するWIN部位阻害剤によるクロマチンからのWDR5の置き換え(Displacement of WDR5 from Chromatin by a WIN Site Inhibitor with Picomolar Affinity)」 Cell Rep 2019, 26(11), 2916、「WDリピート含有タンパク質5-MYCのタンパク質間相互作用のサリチル酸由来のスルホンアミド阻害剤の発見及び最適化(Discovery and Optimization of Salicylic Acid-Derived Sulfonamide Inhibitors of the WD Repeat-Containing Protein 5-MYC Protein-Protein Interaction)」 J Med Chem 2019, 62(24), 11232を参照のこと。 NSP3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、「重症急性呼吸器症候群コロナウイルスのパパイン様の新規プロテアーゼ阻害剤:設計、合成、タンパク質-リガンドX線構造、及び生物学的評価(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Papain-like Novel Protease Inhibitors: Design, Synthesis, Protein-Ligand X-ray Structure and Biological Evaluation)」, J Med Chem 2010, 53, 4968、「ヒトコロナウイルスのパパイン様プロテアーゼの一連の強力で選択性が高い阻害剤のX線構造及び生物学的評価(X-ray Structural and Biological Evaluation of a Series of Potent and Highly Selective Inhibitors of Human Coronavirus Papain-like Proteases)」, J Med Chem 2014, 57, 2393を参照のこと。 RETの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、プラルセチニブ「RET誘導型癌についてのBLU-667による精密標的化療法(Precision Targeted Therapy with BLU-667 for RET-Driven Cancers)」 Cancer Discovery, 2018, 8(7), 836、セルペルカチニブ、国際公開第2018/071447号、「イソオキサゾール部分を含むピラゾロ[3,4-d]ピリミジン-4-アミン誘導体は、RETゲートキーパー突然変異体の選択的かつ強力な阻害剤である(A Pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine Derivative Containing an Isoxazole Moiety Is a Selective and Potent Inhibitor of RET Gatekeeper Mutants)」 J Med Chem, 2016, 59, 358を参照のこと。 CTNNB1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる点である。追加の例については、「小分子によるβ-カテニンの直接的な標的化は、プロテアソーム分解を刺激し、発癌性Wnt/β-カテニンシグナル伝達を抑制する(Direct Targeting of b-Catenin by a Small Molecule Stimulates Proteasomal Degradation and Suppresses Oncogenic Wnt/b-Catenin Signaling)」 Cell Rep2016, 16(1), 28、「生物学的等価体置換によるβ-カテニン/T細胞因子タンパク質間相互作用についての小分子阻害剤の合理的な設計(Rational Design of Small-Molecule Inhibitors for β-Catenin/T-Cell Factor Protein-Protein Interactions by Bioisostere Replacement)」 ACS Chem Biol 2013, 8, 524、及び「β-カテニンのアロステリック阻害剤は、結腸癌における発癌性Wntシグナル伝達を選択的に標的化する(Allosteric inhibitor of β-catenin selectively targets oncogenic Wnt signaling in colon cancer)」 Sci Rep 2020, 10, 8096を参照のこと。 IRAK4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例及び関連のリガンドについては、それぞれの参考文献(Rajapaksa N.S. et al.著の「強力なin vivo活性を有する強力なベンゾラクタムIRAK4阻害剤の発見(Discovery of Potent Benzolactam IRAK4 Inhibitors with Robust in Vivo Activity.)」 ACS Med. Chem. Lett. 11: 327-333 (2020)、McElroy W.T. et al.著の「齧歯類の炎症モデルにおいて効果的なIRAK4の強力で選択的なアミドピラゾール阻害剤(Potent and Selective Amidopyrazole Inhibitors of IRAK4 That Are Efficacious in a Rodent Model of Inflammation.)」 ACS Med. Chem. Lett. 6: 677-682 (2015)、Nunes J. et al.著の「PROTACによる分解についてのIRAK4の標的化(Targeting IRAK4 for Degradation with PROTACs)」 ACS Med. Chem. Lett. 10: 1081-1085 (2019); 4)、Degorce S. L. et al.著の「IRAK4の一連のピロロトリアジン阻害剤における透過性の最適化(Optimization of permeability in a series of pyrrolotriazine inhibitors of IRAK4)」. Bioorg. Med. Chem. 26: 913-924 (2018)、国際公開第2019/099926号及び国際公開第2019/133531号)における結晶構造PDB 6UYA、4YP8、5UIU、及び6F3Iを参照のこと。 FGFR2及びFGFR3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる点である。追加の例については、「VEGFR2に対する高い選択性を有する新規のFGFR3阻害剤としての1,3,5-トリアジン及びピリミジン誘導体の構造ベースの薬物設計(Structure-based drug design of 1,3,5-triazine and pyrimidine derivatives as novel FGFR3 inhibitors with high selectivity over VEGFR2)」 Bioorg Med Chem 2020, 28, 115453を参照のこと。 SMARCA2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる点である。追加の例については、国際公開第2020/023657号、米国特許出願公開第2020/0038378号、特許文献22、国際公開第2020/078933号、国際公開第2019/207538号、国際公開第2016/138114号、「ブラフマ関連遺伝子1(BRG1)/SMARCA4突然変異癌の治療用のブラフマホモログ(BRM)/SMARCA2 ATPアーゼ活性の経口活性型阻害剤の発見(Discovery of Orally Active Inhibitors of Brahma Homolog (BRM)/ SMARCA2 ATPase Activity for the Treatment of Brahma Related Gene 1 (BRG1)/SMARCA4-Mutant Cancers)」 J Med Chem 2018, 61, 10155、2)国際公開第2020/035779号を参照のこと。 NRASの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、「小分子リガンドはRasにおける異なるポケットに結合し、SOSを介したヌクレオチド交換活性を阻害する(Small-molecule Ligands Bing to a Distinct Pocket in Ras and Inhibit SOS-Mediated Nucleotide Exchange Activity)」 PNAS 2012 109 (14) 5299-5304、結晶構造PDB 4EPY(「K-Rasに結合し、Sosを介した活性化を阻害する小分子の発見(Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-Mediated Activation)」 Angew. Chem. Int. Ed 2012, 51, 6140-6143)、結晶構造PDB 6GQY、6GQT(「活性及び不活性のRAS結合性化合物の組合せからの新たなRASエフェクター阻害剤の構造ベースの開発(Structure-based development of new RAS-effector inhibitors from a combination of active and inactive RAS-binding compounds)」 2019 PNAS 116 (7), 2545-2550)、結晶構造PDB 6FA4、1HE8(「細胞内抗体フラグメントを使用して誘導されたRAS-エフェクタータンパク質相互作用の小分子阻害剤(Small molecule inhibitors of RAS-effector protein interactions derived using an intracellular antibody fragment)」 2018 Nature Communications 9(1), 3169)、及び「エフェクター結合を破壊する高親和性の非共有結合型アロステリックKRAS阻害剤の発見(Discovery of High-Affinity Noncovalent Allosteric KRAS Inhibitors That Disrupt Effector Binding)」 ACS Omega 2019, 4, 2921-2930を参照のこと。 ADARの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6VFF(Thuy-Boun, A.S., et al, Nucleic Acids Res, 2020, 48, 7958-7972)、及び結晶構造PDB 5HP2、5HP3、5ED1、5ED2(Mathews, M.M, et al., Nat Struct Mol Biol., 2016, 23,426-433)を参照のこと。 NSD2又はWHSC1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6XCG(Zhou, M.Q, et al.著の「化合物UNC6934を伴うヒストン-リジンN-メチルトランスフェラーゼNSD2-PWWP1(Histone-lysine N-methyltransferase NSD2-PWWP1 with compound UNC6934)」(公開予定))、結晶構造PDB 6UE6(Liu, Y et al.著の「MR837との複合体におけるNSD2のPWWP1ドメイン(PWWP1 domain of NSD2 in complex with MR837)」(公開予定))、結晶構造PDB 5LSS、5LSU、5LSX、5LSY、5LSZ、5LT6、5LT7、5LT8(Tisi, D., et al著の「エピジェネティックな癌遺伝子MMSETの構造及びN-アルキルシネファンギン誘導体による阻害(Structure of the Epigenetic Oncogene MMSET and Inhibition by N-Alkyl Sinefungin Derivatives.)」, ACS Chem Biol., 2016, 11: 3093-3105)を参照のこと。 PI3KCAの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 3HHM、3HIZ(Mandelker, D., et al.著の「PI3Kαと膜との間の相互作用を変化させる頻度の高いキナーゼドメイン突然変異(A frequent kinase domain mutation that changes the interaction between PI3K{alpha} and the membrane.)」, Proc Natl Acad Sci U S A., 2009, 106: 16996-17001)を参照のこと。 RIT1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 4KLZ(Shah, D.M., et al.著の「GDP複合体の安定化による小分子GTPアーゼの阻害、関節リウマチの標的であるRit1に適用される新規アプローチ(Inhibition of Small GTPases by Stabilization of the GDP Complex, a Novel Approach applied to Rit1, a Target for Rheumatoid Arthritis)」(公開予定))を参照のこと。 WRNの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 2FC0(Perry, J.J., et al.著の「WRNエキソヌクレアーゼの構造及び分子メカニズムは、DNA末端プロセシングにおける編集の役割を示唆している(WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.)」, Nat Struct Mol Biol., 2006, 13: 414-422)、及び結晶構造PDB 6YHR(Newman, J.A., et al.著の「ウェルナー症候群ヘリカーゼの結晶構造(Crystal structure of Werner syndrome helicase)」(公開予定))を参照のこと。 ALK融合物、例えば、EML4-ALK又はNMP-ALKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 4CGB、4CGC(Richards, M.W., et al.著の「Emlタンパク質及びEml4-Alk変異体3腫瘍性タンパク質の微小管会合は、N末端三量体化ドメインを必要とする(Microtubule Association of Eml Proteins and the Eml4-Alk Variant 3 Oncoprotein Require an N-Terminal Trimerization Domain)」, Biochem J., 2015, 467: 529)、結晶構造PDB 3AOX(Sakamoto, H., et al.著の「耐性のゲートキーパー突然変異体を遮断することができる選択的ALK阻害剤であるCH5424802(CH5424802, a selective ALK inhibitor capable of blocking the resistant gatekeeper mutant)」, Cancer Cell, 2011, 19: 679-690)、結晶構造PDB 6MX8(Huang, W.S., et al.著の「未分化リンパ腫キナーゼのホスフィンオキシド含有の強力な経口活性型阻害剤であるブリガチニブ(AP26113)の発見(Discovery of Brigatinib (AP26113), a Phosphine Oxide-Containing, Potent, Orally Active Inhibitor of Anaplastic Lymphoma Kinase)」, J Med Chem., 2016, 59: 4948-4964)、4Z55(Michellys, P.Y., et al.著の「新規の選択的未分化リンパ腫キナーゼ阻害剤の設計及び合成(Design and synthesis of novel selective anaplastic lymphoma kinase inhibitors.)」, Bioorg Med Chem Lett., 2016, 26: 1090-1096)、及び結晶構造PDB 4FOB、4FOC、4FOD(Lewis, R.T., et al著の「癌の治療に潜在的な有用性を有する新規のクラスの強力で選択的かつ経口で生物学的に利用可能な未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)阻害剤の発見及び最適化(The Discovery and Optimization of a Novel Class of Potent, Selective, and Orally Bioavailable Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK) Inhibitors with Potential Utility for the Treatment of Cancer.)」, J Med Chem., 2012, 55: 6523-6540)を参照のこと。 BAP1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 2W12、2W13、2W14、2W15(Lingott, T.J. et al.著の「ペプチドミメティックと複合体を形成したヘビ毒メタロプロテイナーゼBap1の高解像度結晶構造:阻害剤結合への洞察(High-Resolution Crystal Structure of the Snake Venom Metalloproteinase Bap1 Complexed with a Peptidomimetic: Insight into Inhibitor Binding)」, Biochemistry, 2009, 48: 6166)を参照のこと。 EPAS1又はHIF2αの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5UFP(Cho, H., et al.著の「前臨床腎臓癌モデルにおけるHIF-2αアンタゴニストのオンターゲット効果(On-target efficacy of a HIF-2 alpha antagonist in preclinical kidney cancer models.)」, Nature, 2016, 539: 107-111)、結晶構造PDB 6D09(Du, X著の「HIF2a-B:ARNT-B複合体に結合したPT1940の結晶構造(Crystal structure of PT1940 bound to HIF2a-B*:ARNT-B* complex)」(公開予定))、結晶構造PDB 5TBM(Wallace, E.M., et al.著の「HIF2αの小分子アンタゴニストは、腎細胞癌の前臨床モデルにおいて効果的である(A Small-Molecule Antagonist of HIF2 alpha Is Efficacious in Preclinical Models of Renal Cell Carcinoma.)」, Cancer Res., 2016, 76: 5491-5500)、及び結晶構造PDB 6E3S、6E3T、6E3U(Wu, D., et al.著の「化学的リガンドによるHIF-2活性の双方向調節(Bidirectional modulation of HIF-2 activity through chemical ligands.)」, Nat Chem Biol., 2019, 15: 367-376)を参照のこと。 GRB2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 1CJ1(Furet, P., et al.著の「アスパラギンミメティックを含むGrb2-SH2ドメインの高親和性アンタゴニストの構造ベースの設計、合成、及びX線結晶構造解析(Structure-based design, synthesis, and X-ray crystallography of a high-affinity antagonist of the Grb2-SH2 domain containing an asparagine mimetic)」, J Med Chem., 1999, 42: 2358-2363)、結晶構造PDB 2AOA、2AOB(Phan, J., et al.著の「Grb2 SH2ドメインとの複合体における高親和性大環状ペプチドミメティックの結晶構造(Crystal Structures of a High-affinity Macrocyclic Peptide Mimetic in Complex with the Grb2 SH2 Domain)」, J Mol Biol., 2005, 353: 104-115)、結晶構造PDB 3KFJ、3IN7、3IMJ、3IMD、3IN8(Delorbe, J.E., et al. 著の「タンパク質-リガンド相互作用におけるコンフォメーション制約の熱力学的及び構造的効果。リガンドの予備組織化に関連するエントロピーの逆説(Thermodynamic and Structural Effects of Conformational Constraints in Protein-Ligand Interactions. Entropic Paradoxy Associated with Ligand Preorganization.)」, J Am Chem Soc., 2009, 131: 16758-16770)、結晶構造PDB 2HUW、3C71(Benfield, A.P., et al. 著の「リガンドの予備組織化は、タンパク質-リガンド相互作用におけるエントロピーペナルティを伴う可能性がある(Ligand Preorganization May Be Accompanied by Entropic Penalties in Protein-Ligand Interactions.)」, Angew Chem Int Ed Engl., 2006, 45: 6830-6835)、及び結晶構造PDB 1X0N(Ogura, K et al. 著の「阻害剤と複合体を形成した成長因子受容体結合タンパク質SH2ドメインのNMR構造(NMR structure of growth factor receptor binding protein SH2 domain complexed with the inhibitor)」(公開予定))を参照のこと。 KMT2D又はMLL2/MLL4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 7BRE(Li, Y., et al.著の「MLL2複合体の結晶構造は、KMT2ファミリーメチルトランスフェラーゼによって触媒されるP53上のメチル化部位の特定を導く(Crystal Structure of MLL2 Complex Guides the Identification of a Methylation Site on P53 Catalyzed by KMT2 Family Methyltransferases)」, Structure, 2020)、結晶構造PDB 4ZAP(Zhang, Y., et al.著の「MLLファミリーSETドメインの触媒特性の発展(Evolving Catalytic Properties of the MLL Family SET Domain.)」, Structure, 2015, 23: 1921-1933)、結晶構造PDB 6KIZ(Xue, H., et al.著の「MLLメチルトランスフェラーゼによるヌクレオソーム認識及び修飾の構造的基礎(Structural basis of nucleosome recognition and modification by MLL methyltransferases.)」, Nature, 2019, 573: 445-449)、及び結晶構造PDB 3UVK(Zhang, P., et al. 著の「WDR5ペプチド結合溝の可塑性は、ヒストンメチルトランスフェラーゼのSET1ファミリーの結合を可能にする(The plasticity of WDR5 peptide-binding cleft enables the binding of the SET1 family of histone methyltransferases.)」, Nucleic Acids Res., 2012, 40: 4237-4246)を参照のこと。 MLLT1又はENLの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6HT0、6HT1(Moustakin, M. et al.著の「MLLT1/3 YEATSドメイン化学的プローブの発見(Discovery of an MLLT1/3 YEATS Domain Chemical Probe)」, Angew Chem Int Ed Engl., 2018, 57: 16302-16307)、結晶構造PDB 6T1I、6T1J、6TIL、6T1M、6T1N、6T1O(Ni, X., et al. 著の「MLLT1における代替的なピペラジン-尿素YEATSドメイン結合体の相互作用メカニズムへの構造的洞察(Structural Insights into Interaction Mechanisms of Alternative Piperazine-urea YEATS Domain Binders in MLLT1)」, ACS Med Chem Lett., 2019, 10: 1661-1666)、及び結晶構造PDB 6HPW、6HPY、6HPX、6HPZ(Heidenreich, D., et al. 著の「11-19白血病タンパク質(ENL)の阻害性フラグメントの同定に向けた構造ベースのアプローチ(Structure-Based Approach toward Identification of Inhibitory Fragments for Eleven-Nineteen-Leukemia Protein (ENL))」, J Med Chem., 2018, 61: 10929-10934)を参照のこと。 NSD3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6G24、6G25、6G29、6G2B、6G2C、6G2E、6G2F、6G2O、6G3T(Bottcher, J., et al.著の「NSD3のPWWP1ドメインに対する化学的プローブのフラグメントベースの発見(Fragment-based discovery of a chemical probe for the PWWP1 domain of NSD3)」, Nat Chem Biol., 2019, 15: 822-829)、結晶構造PDB 5UPD(Tempel, W., et al.著の「ヒトウォルフヒルシュホーン症候群候補1様タンパク質1(WHSC1L1)のメチルトランスフェラーゼドメイン(Methyltransferase domain of human Wolf-Hirschhorn Syndrome Candidate 1-Like protein 1 (WHSC1L1))」(公開予定))、及び結晶構造PDB 6CEN(Morrison, M.J., et al.著の「ヒストンメチルトランスフェラーゼWHSC1についてのペプチド阻害剤の同定(Identification of a peptide inhibitor for the histone methyltransferase WHSC1)」, PLoS One, 2018, 13: e0197082-e0197082)を参照のこと。 PPM1D又はWIP1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 3UYH、ADA3、4DAQ(Micco, M., et al.著の「膵臓癌細胞におけるテロメア標的化剤としてのナフタレンジイミドg-四重鎖リガンドの構造ベースの設計及び評価(Structure-based design and evaluation of naphthalene diimide g-quadruplex ligands as telomere targeting agents in pancreatic cancer cells)」, J Med Chem., 2013, 56: 2959-2974)を参照のこと。 SOS1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5OVE、5OVF、5OVG、5OVH、5OVI(Hillig, R.C., et al.著の「RAS-SOS1相互作用の破壊を介してRAS活性化を遮断する強力なSOS1阻害剤の発見(Discovery of potent SOS1 inhibitors that block RAS activation via disruption of the RAS-SOS1 interaction)」, Proc Natl Acad Sci U S A., 2019, 116: 2551-2560)、結晶構造PDB 6F08(Ballone, A., et al.著の「セブンレスホモログ1(SOS1)のヒトSonとの複合体における14-3-3ゼータの構造特性評価(Structural characterization of 14-3-3 zeta in complex with the human Son of sevenless homolog 1 (SOS1))」, J Struct Biol., 2018, 202: 210-215)、結晶構造PDB 6D5E、6D5G、6D5H、6D5J、6D5L、6D5M、6D5V、6D5W、6D55、6D59(Hodges, T.R. et al.著の「RAS上のSOS1媒介性ヌクレオチド交換のベンズイミダゾール由来の活性化因子の発見及び構造ベースの最適化(Discovery and Structure-Based Optimization of Benzimidazole-Derived Activators of SOS1-Mediated Nucleotide Exchange on RAS)」, J Med Chem., 2018, 61: 8875-8894)、結晶構造PDB 6SCM、6SFR(Kessler, D., et al.著の「阻害剤BI-3406との複合体におけるSOS1(SOS1 in Complex with Inhibitor BI-3406)」(公開予定))、結晶構造PDB 6V94、6V9J、6V9L、6V9M、6V9N(Sarkar, D., et al.著の「フラグメントベースの方法を使用するRASにおけるSOS1媒介性ヌクレオチド交換のスルホンアミド由来のアゴニストの発見(Discovery of Sulfonamide-Derived Agonists of SOS1-Mediated Nucleotide Exchange on RAS Using Fragment-Based Methods.)」, J Med Chem., 2020, 63: 8325-8337)を参照のこと。 TBXT又はブラキウリの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5QS6、5QSC、5QSE、5QSF、5QRW(Newman, J. A., et al.著の「PanDDA解析グループの寄託(PanDDA analysis group deposition)」(公開予定))、及び結晶構造PBD 6ZU8(Newman, J. A., et al.著の「アファチニブとの複合体におけるヒトブラキウリG177D変異体の結晶構造(Crystal structure of human Brachyury G177D variant in complex with Afatinib)」(公開予定))を参照のこと。 USP7の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5UQV、5UQX(Kategaya, L., et al.著の「USP7小分子阻害剤はユビキチン結合を妨害する(USP7 small-molecule inhibitors interfere with ubiquitin binding)」, Nature, 2017, 550: 534-538)、結晶構造PDB 6VN2、6VN3、6VN4、6VN5、6VN6(Leger, P.R., et al.著の「in vivoでの抗腫瘍活性を有するUSP7の強力な選択的かつ経口で生物学的に利用可能な阻害剤の発見(Discovery of Potent, Selective, and Orally Bioavailable Inhibitors of USP7 with In Vivo Antitumor Activity.)」, J Med Chem., 2020, 63: 5398-5420)、及び結晶構造PDB 5N9R、5N9T(Gavory, G., et al.著の「非常に強力で選択的なアロステリックUSP7阻害剤の発見及び特性評価(Discovery and characterization of highly potent and selective allosteric USP7 inhibitors.)」, Nat Chem Biol., 2018, 14: 118-125)、及び結晶構造PDB 5NGE、5NGF(Turnbull, A.P., et al.著の「選択的な小分子阻害剤によるUSP7阻害の分子的基礎(Molecular basis of USP7 inhibition by selective small-molecule inhibitors)」, Nature, 2017, 550: 481-486)を参照のこと。 BKV及びJCVの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5J4V、5J4Y(Bonafoux, D., et al.著の「JCウイルス及びBKウイルスの二重ヘリカーゼ阻害剤のフラグメントベースの発見(Fragment-Based Discovery of Dual JC Virus and BK Virus Helicase Inhibitors.)」, J Med Chem., 2016, 59: 7138-7151)を参照のこと。 CK1α(カゼインキナーゼ1α)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5ML5、5MQV(Halekotte, J., et al.著の「プロテインキナーゼCK1デルタの強力/選択的な阻害剤としての最適化された4,5-ジアリールイミダゾール、及びp38アルファMAPKとのそれらの構造的関係(Optimized 4,5-Diarylimidazoles as Potent/Selective Inhibitors of Protein Kinase CK1 delta and Their Structural Relation to p38 alpha MAPK.)」, Molecules, 2017,22)を参照のこと。 GSPT1/ERF3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5LZT、5LZS、5LZV、5LZU、5LZX、5LZW、5LZZ、5LZY(Shao, S., et al.著の「翻訳GTPアーゼ複合体による哺乳動物リボソームmRNA状態の解読(Decoding Mammalian Ribosome-mRNA States by Translational GTPase Complexes)」, Cell, 2016, 167: 1229-1240.e15)を参照のこと。 IFZVの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB(Iyer, S., et al.著の「血管新生タンパク質であるヒト胎盤成長因子-1(PlGF-1)の2.0Åの解像度での結晶構造(The crystal structure of human placenta growth factor-1 (PlGF-1), an angiogenic protein, at 2.0 A resolution.)」, J Biol Chem., 2001, 276: 12153-12161)、及び結晶構造PDB IRV6(Christinger, H.W., et al.著の「血管内皮成長因子受容体-1のドメイン2との複合体における胎盤成長因子の結晶構造(The crystal structure of placental growth factor in complex with domain 2 of vascular endothelial growth factor receptor-1)」, J Biol Chem., 2004, 279: 10382-10388)を参照のこと。 NSD2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6XCG(Zhou, M. Q.著の「化合物UNC6934を伴うヒストン-リジンN-メチルトランスフェラーゼNSD2-PWWP1(Histone-lysine N-methyltransferase NSD2-PWWP1 with compound UNC6934)」(公開予定))、及び結晶構造PDB 6UE6(Liu, Y., et al.著の「MR837との複合体におけるNSD2のPWWP1ドメイン(PWWP1 domain of NSD2 in complex with MR837)」(公開予定))を参照のこと。 TAUの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6VA2、6VA3(Chen, J.L. et al.著の「TauプレmRNAを標的とし、かつスプライシングに影響を与える小分子の設計、最適化、及び研究(Design, Optimization, and Study of Small Molecules That Target Tau Pre-mRNA and Affect Splicing.)」, J Am Chem Soc., 2020, 142: 8706-8727)を参照のこと。 CYP17A1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 3RUK、3SWZ(Devore, N.M. et al.著の「前立腺癌治療薬アビラテロン及びTOK-001を伴うシトクロムP450 17A1の構造(Structures of cytochrome P450 17A1 with prostate cancer drugs abiraterone and TOK-001)」, Nature, 2012, 482: 116-119)、及び結晶構造PDB 6CHI、6CIZ(Fehl, C., et al.著の「シトクロムP450 21A2よりもステロイド産生シトクロムP450 17A1についての選択性が向上した阻害剤の構造ベースの設計(Structure-Based Design of Inhibitors with Improved Selectivity for Steroidogenic Cytochrome P450 17A1 over Cytochrome P450 21A2)」, J Med Chem., 2018, 61: 4946-4960)を参照のこと。 SALL4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 7BQU、7BQV(Furihata, H., et al.著の「5-ヒドロキシサリドマイドにより現れるIMiD選択性の構造的基礎(Structural bases of IMiD selectivity that emerges by 5-hydroxythalidomide)」, Nat Commun., 2020, 11: 4578-4578)、及び結晶構造PDB 6UML(Matyskiela, M.E., et al.著の「SALL4-ポマリドミド-セレブロン-DDB1複合体の結晶構造(Crystal structure of the SALL4-pomalidomide-cereblon-DDB1 complex)」, Nat Struct Mol Biol., 2020, 27: 319-322)を参照のこと。 FAM38の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6KG7(Wang, L., et al.著の「哺乳動物の触覚チャネルPIEZO2の構造及びメカノゲーティング(Structure and mechanogating of the mammalian tactile channel PIEZO2.)」, Nature, 2019, 573: 225-229)を参照のこと。 CYP20A1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、Durairaj et al. Biological Chemistry, 2020, 401(3), 361-365を参照のこと。 HTTの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5XI1(Khan, E., et al.著の「ミリセチンは、ハンチントン病(HD)及び脊髄小脳失調症(SCA)におけるCAGリピートRNAの毒性レベルを低下させる(Myricetin Reduces Toxic Level of CAG Repeats RNA in Huntington's Disease (HD) and Spino Cerebellar Ataxia (SCAs).)」, ACS Chem Biol., 2018, 13: 180-188)を参照のこと。 KRASの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6CU6(Hobbs, G.A., et al.著の「非定型のKRASG12R突然変異体は、膵臓癌におけるPI3Kシグナル伝達及びマクロピノサイトーシスが損なわれている(Atypical KRASG12RMutant Is Impaired in PI3K Signaling and Macropinocytosis in Pancreatic Cancer.)」, Cancer Discov., 2020, 10: 104-123)、結晶構造PDB 6GJ5、6GJ6、6GJ8、6JG7(「KRASにおける創薬不可能なポケットの創薬(Drugging an Undruggable Pocket on KRAS)」 PNAS 2019 116 (32) 15823-15829)、及び結晶構造PDB 6BP1(Lu, J., et al.著の「KRASスイッチ突然変異体D33E及びA59Gは、状態1のコンフォメーションにおいて結晶化する(KRAS Switch Mutants D33E and A59G Crystallize in the State 1 Conformation.)」, Biochemistry, 2018, 57: 324-333)を参照のこと。 NRF2(NFE2L2)の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 5CGJ(Winkel, A.F., et al.著の「Keap1への非共有結合型の小分子結合体及びNrf2シグナル伝達の選択的活性化因子であるRA839の特性評価(Characterization of RA839, a Noncovalent Small Molecule Binder to Keap1 and Selective Activator of Nrf2 Signaling.)」, J Biol Chem., 2015, 290: 28446-28455)、及び6TYM、6TYP(Ma, B., et al.著の「新規の経口で生物学的に利用可能な非共有結合型のNrf2活性化因子の設計、合成、及び同定(Design, synthesis and identification of novel, orally bioavailable non-covalent Nrf2 activators)」, Bioorg Med Chem Lett., 2020, 30: 126852-126852)を参照のこと。 P300の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 4PZR、4PZS、4PZT(Maksimoska, J., et al.著の「アセチル補酵素A及びその類似体に結合したp300ヒストンアセチルトランスフェラーゼの構造(Structure of the p300 Histone Acetyltransferase Bound to Acetyl-Coenzyme A and Its Analogues)」, Biochemistry, 2014, 53: 3415-3422)、及び結晶構造PDB 6PGU(Gardberg, A.S., et al.著の「正しい測定を行う:p300-HATのアロステリック阻害部位の発見(Make the right measurement: Discovery of an allosteric inhibition site for p300-HAT)」, Struct Dyn., 2019, 6: 054702-054702)を参照のこと。 PIK3CAの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6OAC(Rageot, D., et al.著の「クラスIのPI3K及びmTORキナーゼの強力な経口で生物学的に利用可能かつ脳透過性の二重阻害剤である(S)-4-(ジフルオロメチル)-5-(4-(3-メチルモルホリノ)-6-モルホリノ-1,3,5-トリアジン-2-イル)ピリジン-2-アミン(PQR530)((S)-4-(Difluoromethyl)-5-(4-(3-methylmorpholino)-6-morpholino-1,3,5-triazin-2-yl)pyridin-2-amine (PQR530), a Potent, Orally Bioavailable, and Brain-Penetrable Dual Inhibitor of Class I PI3K and mTOR Kinase)」, J Med Chem., 2019, 62: 6241-6261)、及び結晶構造PDB 5SX8、5SWP(Miller, M.S. et al.著の「アロステリック結合部位の特定によるPI3Kα発癌性突然変異体特異的阻害剤の設計(Identification of allosteric binding sites for PI3K alpha oncogenic mutant specific inhibitor design.)」, Bioorg Med Chem., 2017, 25: 1481-1486)を参照のこと。 SARM1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 6QWV(Sporny, M., et al.著の「SARM1の八量環配置の構造的証拠(Structural Evidence for an Octameric Ring Arrangement of SARM1)」, J Mol Biol., 2019, 431: 3591-3605)、及び結晶構造PDB 6O0Q、6O0R、6O0T、6O0V、6O0W(Horsefield, S., et al.著の「細胞死経路における動物及び植物のTIRドメインによるNAD切断活性(NAD+ cleavage activity by animal and plant TIR domains in cell death pathways)」, Science, 2019, 365: 793-799)を参照のこと。 SNCAの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、結晶構造PDB 4I5M、4I5P、4I6B、4I6F、4I6H(Aubele, D.L., et al.著の「ラット脳におけるα-シヌクレインのリン酸化を減少させる選択的かつ脳透過性のポロ様キナーゼ-2(Plk-2)阻害剤(Selective and brain-permeable polo-like kinase-2 (Plk-2) inhibitors that reduce alpha-synuclein phosphorylation in rat brain)」, Chem Med Chem., 2013, 8: 1295-1313)を参照のこと。 MAPTの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、結晶構造PDB 6VI3、6VHL(Arakhamia, T., et al.著の「翻訳後修飾は、タウオパチー株の構造的多様性を媒介する(Posttranslational Modifications Mediate the Structural Diversity of Tauopathy Strains)」, Cell, 2020, 180: 633-644.e12)、及び結晶構造PDB 6FAU、6FAV、6FAW、6FBW、6FBY、6FI4、6FI5(Andrei, S. A., et al.著の「2つの異なる結合様式を介して動作するハイブリッド小分子ペプチドによる14-3-3/Tauの阻害(Inhibition of 14-3-3/Tau by Hybrid Small-Molecule Peptides Operating via Two Different Binding Modes.)」, ACS Chem Neurosci., 2018, 9: 2639-2654)。 PTPN2又はTCPTPの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。例えば、結晶構造PDB 2FJN、2FJM(Asante-Appiah, E., et al.著の「タンパク質チロシンホスファターゼ-1Bのコンフォメーション支援阻害は、T細胞タンパク質チロシンホスファターゼに対する阻害剤の選択性を惹起する(Conformation-assisted inhibition of protein-tyrosine phosphatase-1B elicits inhibitor selectivity over T-cell protein-tyrosine phosphatase)」, J Biol Chem., 2006, 281: 8010-8015)。 STAT3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。ここに示される例は、Zheng, W. et al.著の「MMPPは、STAT3のDNA結合ドメインへの直接結合を介してSTAT3のDNA結合活性を阻害することにより非小細胞肺癌の増殖を抑制する(MMPP Attenuates Non-Small Cell Lung Cancer Growth by Inhibiting the STAT3 DNA-Binding Activity via Direct Binding to the STAT3 DNA-Binding Domain)」, Theranostics 2017, 7(18):4632、及び米国特許出願公開第2006/0247318号における化合物に由来する。追加の例については、Yang, L. et al.著の「癌、サイトカイン、及び成長因子におけるSTAT3の新規の活性化因子及び小分子阻害剤(Novel Activators and Small-Molecule Inhibitors of STAT3 in Cancer, Cytokine & Growth Factor)」Reviews 2019, 49, 10-22を参照のこと。 MyD88の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。ここに示される例は、Sucking, C. et al著の「寄生虫産物ES-62の小分子類似体は、MyD88のTIRドメインと相互作用して、炎症誘発性シグナル伝達を阻害する(Small Molecule Analogues of the parasitic worm product ES-62 interact with the TIR domain of MyD88 to inhibit pro-inflammatory signaling)」(2018) 8:2123、及びLoiarro, M. et al著の「重要な進歩:新規のペプチドミメティック化合物によるMyD88の二量体化並びにIRAK1及びIRAK4の動員の阻害(Pivotal Advance: Inhibition of MyD88 dimerization and recruitment of IRAK1 and IRAK4 by a novel peptidomimetic compound.)」Journal of Leukocyte Biology, (2007) 82: 801-810における化合物に由来する。 PTP4A3の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。ここに示される例は、Ahn, J. et al著の「PRL-3阻害剤としてのロダニンD誘導体の合成及び生物学的評価(Synthesis and Biological Evaluation of RhodanineD derivatives as PRL-3 Inhibitors)」Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2006) 16(11):2996-2999、及びMin, G. et al著の「ロダニンベースのPRL-3阻害剤は、転移性癌細胞の遊走及び浸潤を遮断した(Rhodanine-Based PRL-3 Inhibitors Blocked the Migration and Invasion of Metastatic Cancer Cells)」Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2013) 23(13):3769-3774における化合物に由来する。追加の例については、Tasker, N. et al著の「小分子阻害剤によるタンパク質チロシンホスファターゼ4Aの治療可能性の開拓(Tapping the Therapeutic Potential of Protein Tyrosine Phosphatase 4A with Small Molecule Inhibitors)」Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2019) 29(16):2008-2015を参照のこと。 SF3B1の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。ここに示される例は、Kaida, D. et al著の「スプライセオスタチンAは、SF3bを標的とし、プレmRNAのスプライシング及び核内保持の両方を阻害する(Spliceostatin A Targets SF3b and Inhibits Both Splicing and Nuclear Retention of pre-mRNA)」Nature Chemical Biology (2007) 3:576-583、及びKotake, Y. et al著の「抗腫瘍天然産物プラジエノライドの標的としてのスプライシング因子SF3b(Splicing Factor SF3b as a Target of the Antitumor Natural Product Pladienolide)」Nature Chemical Biology (2007) 3:570-575における化合物に由来する。追加の例については、Effenberger, K. et al著の「スプライセオソームの小分子阻害剤によるスプライシングの調節(Modulating Splicing with Small Molecular Inhibitors of the Spliceosome)」WIREs RNA (2016) 8:e1381を参照のこと。 ARID1B及びARID2の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、Chory et al. ACS Chemical Biology 2020, 15(6), 1685を参照のこと。 クラスII BRAF突然変異体の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、Cho et al. Biochemical and Biophysical Research Communications 2020, 352(2), 315を参照のこと。 NRASQ61Kの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例については、Song et al. Am J Cancer Res2017, 7(4), 831、及びJohnson et al. Curr Treat Options Oncol.2015, 16(4), 15を参照のこと。 毛細血管拡張性運動失調症突然変異(ATM)キナーゼの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例は、J Med Chem, 2019, 62: 2988-3008に示される。 ATRの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例は、Journal of Molecular Biology Volume 429, Issue 11, 2 June 2017, Pages 1684-1704に示される。 BPTFの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例は、Organic & Biomolecular Chemistry 2020, 18(27): 5174-5182に示される。 DNA-PKの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例は、J. Med. Chem. 2020, 63, 7, 3461-3471に示される。 elf4Eの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。追加の例は、J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 4960-4964に示される。 TEAD、例えば、TEAD1、TEAD2、TEAD3、及び/又はTEAD4の標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。 YAPの標的化リガンドの非限定的な例を示す図であり、ここで、Rは、リンカーが取り付けられる例示的な点を表す。 本発明の標的タンパク質分解性化合物の非限定的な代表的な式を示す図である。
ユビキチンプロテアソーム経路(UPP)を介して疾患媒介性標的タンパク質を分解するため、タンパク質による分解に奏効する障害を治療するのに有用である化合物並びにそれらの使用及び製造が提供される。本発明は、標的タンパク質に結合する標的化リガンド、E3リガーゼ結合部分(三環式セレブロンリガンド)、標的化リガンドとスペーサーとを共有結合により連結するリンカー、及びリンカーとE3リガーゼ結合部分とを共有結合により連結するスペーサーを含む、一般式I、一般式II、若しくは一般式IIIの化合物、又はそれらの薬学的に許容可能な塩を提供する。
本明細書において提供される本発明の化合物又はその薬学的に許容可能な塩及び/又はその薬学的に許容可能な組成物を使用して、標的タンパク質によって媒介される障害を治療することができる。標的タンパク質は、典型的には、突然変異、改変、又は過剰発現されたタンパク質であって、その突然変異、改変、又は過剰発現が、その正常な機能を、疾患を引き起こす又はその一因となる機能不全へと変換する、タンパク質である。幾つかの態様において、疾患は、癌又は腫瘍等の異常な細胞増殖である。幾つかの実施形態において、標的タンパク質によって媒介される障害を伴う患者を治療する方法であって、有効量の本明細書に記載される1種以上の化合物又はそれらの薬学的に許容可能な塩を、任意に薬学的に許容可能な組成物において患者、典型的にはヒトに投与することを含む、方法が提供される。
本明細書において提供される三環式ヘテロ二官能性化合物は触媒的である。この化合物によって媒介される標的タンパク質の分解は、典型的には、最初の標的-リガーゼの遭遇からポリユビキチン化、そして放出からプロテアソームによる分解までミリ秒単位で急速に起こる。標的化タンパク質の分解プロセスが標的タンパク質の1つの分子に対して起こると、デグレーダーが放出され、このプロセスは同じデグレーダー分子で繰り返される。標的タンパク質の結合、E3リガーゼによる三元複合体の形成、ユビキチン化、そして放出からの分解というこの再帰的なプロセスは、単一のデグレーダー分子で何千回も起こり得る。
I.定義
他に規定のない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本願が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書において、文脈上明らかに他の指示がない限り単数形は複数形も含む。本明細書に記載されるものと同様又は同等の方法及び材料を本願の実施及び試験に用いることができるが、好適な方法及び材料を下記に説明する。本明細書で言及される全ての刊行物、特許出願、特許及び他の参照文献は引用することにより本明細書の一部をなす。本明細書で引用される参照文献は本願に対する従来技術であると認められるものではない。抵触の場合は、定義を含む本明細書が優先される。加えて、材料、方法及び例は一例にすぎず、限定を意図するものではない。
化合物は正式名称を用いて記載される。他に規定のない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者により一般に理解されるものと同じ意味を有する。
本明細書に記載の各化合物の或る特定の実施形態において、化合物は、文脈により明確に除外されない限り、それぞれが具体的に記載されるかのように、ラセミ体、エナンチオマー、エナンチオマーの混合物、ジアステレオマー、ジアステレオマーの混合物、互変異性体、N-オキシド、又は回転異性体等の異性体の形態であり得る。
数量を特定しない用語(The terms "a" and "an")は量の限定を表すのではなく、言及される項目の少なくとも1つの存在を表す。「又は」という用語は「及び/又は」を意味する。値の範囲の列挙は本明細書に他に指定されない限り、単にその範囲に含まれる各々の別個の値に個別に言及する簡単な方法としての役割を果たすことを意図するものであり、各々の別個の値は、それらが本明細書に個別に列挙されたかのように引用することにより本明細書の一部をなす。全ての範囲の端点はその範囲内に含まれ、独立して組み合わせることができる。本明細書に記載の全ての方法は、本明細書に他に指定されない又は文脈により明らかに否定されない限り、好適な順序で行うことができる。例又は例示的な言葉(例えば、「等(such as)」)の使用は単に本発明をよりよく説明することを意図するものであり、他に主張のない限り本発明の範囲の限定を示すものではない。
本発明は、同位体の天然存在度を超える量での、すなわち濃縮された少なくとも1つの所望の原子の同位体置換を有する本明細書に記載の化合物を含む。同位体は同じ原子番号を有するが質量数が異なる、すなわち同じ陽子数を有するが、中性子数が異なる原子である。同位体置換が用いられる場合、少なくとも1つの重水素による水素の置換えが一般的である。
より一般的には、本発明の化合物に組み込むことができる同位体の例としては、水素、炭素、窒素、酸素、フッ素及び塩素の同位体、例えばH、H、11C、13C、14C、15N、17O、18O、18F、35S、及び36Clのそれぞれが挙げられる。非限定的な一実施形態において、同位体標識された化合物を代謝研究(例えば、14Cを用いる)、反応動態研究(例えばH又はHを用いる)、薬物若しくは基質組織分布アッセイ又は患者の放射線治療を含む検出又は画像化技法、例えば陽電子放射断層撮影(PET)又は単一光子放射断層撮影(SPECT)に使用することができる。付加的に、本発明の化合物に存在する任意の水素原子を18F原子で置換してもよく、この置換は、PET又はSPECT研究に特に望ましい場合がある。同位体標識した本発明の化合物及びそのプロドラッグは概して、非同位体標識試薬を容易に利用可能な同位体標識試薬に置き換えることで、スキーム又は下記の実施例及び調製に開示される手順を行うことによって調製することができる。
一般的な例として、限定されるものではないが、水素の同位体、例えば重水素(H)及び三重水素(H)を所望の結果が達成される記載の構造のいずれの部位にも使用することができる。代替的又は付加的に、炭素の同位体、例えば13C及び14Cを使用することができる。
同位体置換、例えば重水素置換は部分的又は完全であり得る。部分的重水素置換は、少なくとも1つの水素が重水素で置換されることを意味する。或る特定の実施形態において、同位体は対象の任意の位置の同位体が90%、95%若しくは99%又はそれ以上濃縮される。非限定的な一実施形態において重水素は所望の位置で90%、95%又は99%濃縮される。
非限定的な一実施形態において、重水素原子による水素原子の置換は本明細書に記載されるいずれかの化合物において生じさせることができる。例えば、基のいずれかがメチル、エチル若しくはメトキシであるか、又は例えば置換によってこれらを含有する場合、アルキル残基を重水素化してもよい(非限定的な実施形態において、CDH、CDH、CD、CHCD、CDCD、CHDCHD、CHCD、CHDCHD、OCDH、OCDH又はOCD等)。或る特定の他の実施形態において、2つの置換基が合わされて環を形成する場合、非置換の炭素を重水素化してもよい。或る特定の実施形態において、少なくとも1つの重水素が、in vivoでの化合物の代謝の間に切断される結合を有する原子に又は代謝される結合から1原子、2原子、若しくは3原子離れた原子に配置されている(例えば、α-同位体効果、β-同位体効果、若しくはγ-同位体効果、又は一次同位体効果、二次同位体効果、若しくは三次同位体効果と呼ばれる場合もある)。
本発明の化合物は溶媒(水を含む)とともに溶媒和物を形成し得る。したがって、非限定的な一実施形態において、本発明は本明細書に記載の溶媒和形態の化合物を含む。「溶媒和物」という用語は、本発明の化合物(その塩を含む)と1つ以上の溶媒分子との分子複合体を指す。溶媒の非限定的な例は水、エタノール、イソプロパノール、ジメチルスルホキシド、アセトン及び他の通常の有機溶媒である。「水和物」という用語は、本発明の化合物及び水を含む分子複合体を指す。本発明による薬学的に許容可能な溶媒和物には、溶媒が同位体置換され得るもの、例えばDO、d-アセトン、d-DMSOが含まれる。溶媒和物は液体形態又は固体形態であり得る。
2つの文字又は記号間にないダッシュ記号(「-」)は、置換基の取り付け点を示すために用いられる。例えば、-(C=O)NHはケト(C=O)基の炭素を介して取り付ける。
「アルキル」は、分岐鎖又は直鎖の飽和脂肪族炭化水素基である。非限定的な一実施形態において、アルキル基は、1個~約12個の炭素原子、より一般的には1個~約6個の炭素原子、又は1個~約4個の炭素原子を含む。非限定的な一実施形態において、アルキルは1個~約8個の炭素原子を含む。或る特定の実施形態において、アルキルはC~C、C~C、C~C、C~C、又はC~Cである。本明細書で使用される指定範囲は、独立した種として記載される範囲の各成員を有するアルキル基を示す。例えば、本明細書で使用されるC~Cアルキルの用語は、1個、2個、3個、4個、5個、又は6個の炭素原子を有する直鎖又は分岐鎖のアルキル基を示し、これらがそれぞれ独立した種として記載されることを意味することを意図する。例えば、本明細書で使用されるC~Cアルキルの用語は、1個、2個、3個、又は4個の炭素原子を有する直鎖又は分岐鎖のアルキル基を示し、これらがそれぞれ独立した種として記載されることを意味することを意図する。アルキルの例としては、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、t-ブチル、n-ペンチル、イソペンチル、tert-ペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、2-メチルペンタン、3-メチルペンタン、2,2-ジメチルブタン、及び2,3-ジメチルブタンが挙げられるが、これらに限定されない。特段の指示がない限り、アルキルという用語には、シクロアルキル又は炭素環が含まれる。
「アルケニル」は、鎖に沿って安定した点で生じ得る1つ以上の炭素-炭素二重結合を有する線状又は分岐脂肪族炭化水素基である。本明細書で使用される指定範囲は、アルキル部分について上記されるように独立した種として記載される範囲の各成員を有するアルケニル基を示す。非限定的な一実施形態において、アルケニルは、2個~約12個の炭素原子、より一般には2個~約6個の炭素原子又は2個~約4個の炭素原子を含有する。或る特定の実施形態において、アルケニルはC、C~C、C~C、C~C又はC~Cである。アルケニルラジカルの例としては、エテニル、プロペニル、アリル、プロペニル、ブテニル及び4-メチルブテニルが挙げられるが、これらに限定されない。「アルケニル」という用語は、「シス」及び「トランス」アルケニル配置、又は代替的には「E」及び「Z」アルケニル配置も含む。「アルケニル」という用語は、少なくとも1つの不飽和点を有するシクロアルキル又は炭素環基も包含する。
「アルキニル」は、鎖に沿って任意の安定した点で生じ得る1つ以上の炭素-炭素三重結合を有する分岐又は直鎖脂肪族炭化水素基である。本明細書で使用される指定範囲は、アルキル部分について上記されるように独立した種として記載される範囲の各成員を有するアルキニル基を示す。非限定的な一実施形態において、アルキニルは、2個~約12個の炭素原子、より一般には2個~約6個の炭素原子又は2個~約4個の炭素原子を含有する。或る特定の実施形態において、アルキニルはC、C~C、C~C、C~C又はC~Cである。アルキニルの例としては、エチニル、プロピニル、1-ブチニル、2-ブチニル、3-ブチニル、1-ペンチニル、2-ペンチニル、3-ペンチニル、4-ペンチニル、1-ヘキシニル、2-ヘキシニル、3-ヘキシニル、4-ヘキシニル及び5-ヘキシニルが挙げられるが、これらに限定されない。「アルキニル」という用語はまた、三重結合不飽和の少なくとも1つの点を有するシクロアルキル基又は炭素環式基を包含する。
「ハロ」及び「ハロゲン」は独立してフッ素、塩素、臭素又はヨウ素である。
「ハロアルキル」は、ハロゲン原子の最大許容数までの1つ以上の上記のハロ原子で置換される分岐又は直鎖アルキル基である。ハロアルキル基の例としては、フルオロメチル、ジフルオロメチル、トリフルオロメチル、クロロメチル、ジクロロメチル、トリクロロメチル、ペンタフルオロエチル、ヘプタフルオロプロピル、ジフルオロクロロメチル、ジクロロフルオロメチル、ジフルオロエチル、ジフルオロプロピル、ジクロロエチル及びジクロロプロピルが挙げられるが、これらに限定されない。「パーハロアルキル(Perhaloalkyl)」は、全ての水素原子がハロゲン原子に置き換えられたアルキル基を意味する。例としては、トリフルオロメチル及びペンタフルオロエチルが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される「アリール」は、芳香環系内に6個~14個の環炭素原子及び0個のヘテロ原子を有する単環式又は多環式(例えば二環式又は三環式)の4n+2芳香環系(例えば6個、10個又は14個のπ電子が環状配置で共有される)のラジカル(「C6~14アリール」)を指す。幾つかの実施形態において、アリール基は6個の環炭素原子を有する(「Cアリール」、例えばフェニル)。幾つかの実施形態において、アリール基は10個の環炭素原子を有する(「C10アリール」、例えば、1-ナフチル及び2-ナフチル等のナフチル)。幾つかの実施形態において、アリール基は14個の環炭素原子を有する(「C14アリール」、例えばアントラシル(anthracyl))。「アリール」は、上に規定のアリール環が1つ以上のシクロアルキル又は複素環基と融合し、ラジカル又は取り付け点がアリール環上にある環系も含み、このような場合に炭素原子の数はアリール環系中の炭素原子の数を指定し続ける。1つ以上の融合シクロアルキル又は複素環基は4員~7員の飽和した又は部分的に不飽和のシクロアルキル又は複素環基であってもよい。
「アリールアルキル」は、本明細書において定義されるアリール基で置換された本明細書において定義されるアルキル基、又は本明細書において定義されるアルキル基で置換された本明細書において定義されるアリール基のいずれかを指す。
「複素環」という用語は、窒素、硫黄、ホウ素、ケイ素及び酸素から独立して選択される1個、2個、3個又は4個のヘテロ原子が存在する、飽和した及び部分的に飽和したヘテロ原子含有環ラジカルを表す。複素環は単環式の3員~10員の環、及び5員~16員の二環式の環系(架橋、融合及びスピロ融合した二環式の環系を含み得る)を含み得る。複素環は-O-O-、-O-S-又は-S-S-部分を含有する環を含まない。飽和複素環基の例としては、1個~4個の窒素原子を含有する飽和した3員~6員の複素単環(heteromonocyclic)基(例えばピロリジニル、イミダゾリジニル、ピペリジニル、ピロリニル、ピペラジニル)、1個又は2個の酸素原子及び1個~3個の窒素原子を含有する飽和した3員~6員の複素単環基(例えば、モルホリニル)、1個又は2個の硫黄原子及び1個~3個の窒素原子を含有する飽和した3員~6員の複素単環基(例えば、チアゾリジニル)が挙げられる。部分的に飽和した複素環ラジカルの例としては、ジヒドロチエニル、ジヒドロピラニル、ジヒドロフリル及びジヒドロチアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。部分的に飽和した及び飽和した複素環基の例としては、ピロリジニル、イミダゾリジニル、ピペリジニル、ピロリニル、ピラゾリジニル、ピペラジニル、モルホリニル、テトラヒドロピラニル、チアゾリジニル、ジヒドロチエニル、2,3-ジヒドロ-ベンゾ[1,4]ジオキサニル、インドリニル、イソインドリニル、ジヒドロベンゾチエニル、ジヒドロベンゾフリル、イソクロマニル、クロマニル、1,2-ジヒドロキノリル、1,2,3,4-テトラヒドロ-イソキノリル、1,2,3,4-テトラヒドロ-キノリル、2,3,4,4a,9,9a-ヘキサヒドロ-1H-3-アザ-フルオレニル、5,6,7-トリヒドロ-1,2,4-トリアゾロ[3,4-a]イソキノリル、3,4-ジヒドロ-2H-ベンゾ[1,4]オキサジニル、ベンゾ[1,4]ジオキサニル、2,3-ジヒドロ-1H-1λ’-ベンゾ[d]イソチアゾール-6-イル、ジヒドロピラニル、ジヒドロフリル及びジヒドロチアゾリルが挙げられるが、これらに限定されない。
「複素環」は、複素環ラジカルがアリール又は炭素環ラジカルと融合/縮合し、取り付け点が複素環系である基も含む。「複素環」は、複素環ラジカルがオキソ基(すなわち、
Figure 2023545507000064
)で置換された基、例えば1個~5個の窒素原子を含有する部分的に不飽和の縮合複素環基、例えばインドリン又はイソインドリン;1個又は2個の酸素原子及び1個~3個の窒素原子を含有する部分的に不飽和の縮合複素環基;1又は2個の硫黄原子及び1個~3個の窒素原子を含有する部分的に不飽和の縮合複素環基;並びに1個又は2個の酸素又は硫黄原子を含有する飽和した縮合複素環基も含む。
「複素環」という用語は、「二環式複素環」も含む。「二環式複素環」という用語は、複素環の架橋、融合又はスピロ環状部分が1つある、本明細書で規定される複素環を表す。複素環の架橋、融合又はスピロ環状部分は、安定した分子が生じる限りにおいて炭素環、複素環又はアリール基とすることができる。文脈により除外されない限り、「複素環」という用語は、二環式複素環を含む。二環式複素環は、融合複素環がオキソ基で置換された基を含む。二環式複素環の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000065
が挙げられる。
「複素環アルキル」は、本明細書において定義される複素環基で置換された本明細書において定義されるアルキル基、又は本明細書において定義されるアルキル基で置換された本明細書において定義される複素環基のいずれかを指す。
「ヘテロアリール」という用語は、O、N及びSから独立して選択される1つ、2つ、3つ、又は4つのヘテロ原子を含有し、環窒素及び硫黄原子(複数の場合もある)が任意に酸化され、窒素原子(複数の場合もある)が任意に第四級化された(quarternized)安定な芳香環系を表す。例としては、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、2-ピリジル、3-ピリジル、4-ピリジル、ピリミジル、ピラジニル、ピリダジニル、トリアゾリル(例えば、4H-1,2,4-トリアゾリル、1H-1,2,3-トリアゾリル、2H-1,2,3-トリアゾリル)等の1個~4個の窒素原子を含有する不飽和の5員又は6員のヘテロモノシクリル(heteromonocyclyl)基;酸素原子を含有する不飽和の5員又は6員の複素単環基、例えばピラニル、2-フリル、3-フリル等;硫黄原子を含有する不飽和の5員又は6員の複素単環基、例えば2-チエニル、3-チエニル等;1個又は2個の酸素原子及び1個~3個の窒素原子を含有する不飽和の5員又は6員の複素単環基、例えばオキサゾリル、イソオキサゾリル、オキサジアゾリル(例えば、1,2,4-オキサジアゾリル、1,3,4-オキサジアゾリル、1,2,5-オキサジアゾリル);1個又は2個の硫黄原子及び1個~3個の窒素原子を含有する不飽和の5員又は6員の複素単環基、例えばチアゾリル、チアジアゾリル(例えば、1,2,4-チアジアゾリル、1,3,4-チアジアゾリル、1,2,5-チアジアゾリル)が挙げられるが、これらに限定されない。或る特定の実施形態において、「ヘテロアリール」基は、8員、9員又は10員の二環式の環系である。8員、9員又は10員の二環式のヘテロアリール基の例としては、ベンゾフラザニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾチアゾリル、ベンゾオキサゾリル、キナゾリニル、キノキサリニル、ナフチリジニル、キノリニル、イソキノリニル、ベンゾフラニル、インドリル、インダゾリル及びベンゾトリアゾリルが挙げられる。
「ヘテロアリールアルキル」は、本明細書において定義されるヘテロアリール基で置換された本明細書において定義されるアルキル基、又は本明細書において定義されるアルキル基で置換された本明細書において定義されるヘテロアリール基のいずれかを指す。
本明細書で使用される場合、「炭素環式」、「炭素環」又は「シクロアルキル」は、非芳香環系中に全ての炭素環原子及び3個~14個の環炭素原子(「C3~14シクロアルキル」)及び0個のヘテロ原子を含有する飽和した又は部分的に不飽和の(すなわち、芳香族でない)基を含む。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、3個~10個の環炭素原子を有する(「C3~10シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、3個~9個の環炭素原子を有する(「C3~9シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、3個~8個の環炭素原子を有する(「C3~8シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、3個~7個の環炭素原子を有する(「C3~7シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、3個~6個の環炭素原子を有する(「C3~6シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、4個~6個の環炭素原子を有する(「C4~6シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、5個又は6個の環炭素原子を有する(「C5~6シクロアルキル」)。幾つかの実施形態において、シクロアルキル基は、5個~10個の環炭素原子を有する(「C5~10シクロアルキル」)。例示的なC3~6シクロアルキル基としては、限定されるものではないが、シクロプロピル(C)、シクロプロペニル(C)、シクロブチル(C)、シクロブテニル(C)、シクロペンチル(C)、シクロペンテニル(C)、シクロヘキシル(C)、シクロヘキセニル(C)、シクロヘキサジエニル(C)等が挙げられる。例示的なC3~8シクロアルキル基としては、限定されるものではないが、上述のC3~6シクロアルキル基、及びシクロヘプチル(C)、シクロヘプテニル(C)、シクロヘプタジエニル(C)、シクロヘプタトリエニル(C)、シクロオクチル(C)、シクロオクテニル(C)等が挙げられる。例示的なC3~10シクロアルキル基としては、限定されるものではないが、上述のC3~8シクロアルキル基、及びシクロノニル(C)、シクロノネニル(C)、シクロデシル(C10)、シクロデセニル(C10)等が挙げられる。上述の例に示されるように、或る特定の実施形態において、シクロアルキル基は飽和していても、又は1つ以上の炭素間二重結合を含有していてもよい。「シクロアルキル」という用語は、上記に規定されるシクロアルキル環が1つの複素環、アリール又はヘテロアリール環と融合し、取り付け点がシクロアルキル環上にある環系も含み、このような場合に炭素数は炭素環系中の炭素数を表し続ける。「シクロアルキル」という用語は、上記に規定されるシクロアルキル環がスピロ環状複素環、アリール又はヘテロアリール環を有し、取り付け点がシクロアルキル環上にある環系も含み、このような場合に炭素数は炭素環系中の炭素数を表し続ける。「シクロアルキル」という用語は、非芳香環系中に5個~14個の炭素原子及び0個のヘテロ原子を含有する二環式又は多環式の融合、架橋又はスピロ環系も含む。「シクロアルキル」の代表的な例としては、
Figure 2023545507000066
が挙げられるが、これらに限定されない。
「二環」という用語は、2つの環が縮合し、各環が独立して炭素環、複素環、アリール及びヘテロアリールから選択される環系を指す。二環基の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000067
が挙げられる。
「二環」という用語がR20、R21、R22、R23又はR24等の二価残基との関連において使用される場合、取り付け点は別個の環上にあっても、又は同じ環上にあってもよい。或る特定の実施形態において、両方の取り付け点は同じ環上にある。或る特定の実施形態において、両方の取り付け点は異なる環上にある。二価二環基の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000068
が挙げられる。
「脂肪族」は、飽和した又は不飽和の直鎖、分岐又は環状炭化水素を指す。本明細書において、「脂肪族」は、限定されるものではないが、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル及びシクロアルキニル部分を含むことが意図され、これらの定義の各々を包含する。或る特定の実施形態において、「脂肪族」は、1個~20個の炭素原子を有する脂肪族基を示すために使用される。脂肪族鎖は、例えばモノ不飽和、ジ不飽和、トリ不飽和、又は多価不飽和、又はアルキニルであり得る。不飽和脂肪族基は、シス配置又はトランス配置であり得る。或る特定の実施形態において、脂肪族基は1個~約12個の炭素原子、より一般には1個~約6個の炭素原子又は1個~約4個の炭素原子を含有する。或る特定の実施形態において、脂肪族基は、1個~約8個の炭素原子を含有する。或る特定の実施形態において、脂肪族基はC~C、C~C、C~C、C~C又はC~Cである。本明細書で使用される指定の範囲は、独立した種として記載される範囲の各成員を有する脂肪族基を示す。例えば、C~C脂肪族という用語は本明細書で使用される場合、1個、2個、3個、4個、5個又は6個の炭素原子を有する直鎖又は分岐アルキル、アルケニル又はアルキニル基を示し、これらの各々が独立した種として記載されることを意図したものである。例えば、C~C脂肪族という用語は本明細書で使用される場合、1個、2個、3個又は4個の炭素原子を有する直鎖又は分岐アルキル、アルケニル又はアルキニル基を示し、これらの各々が独立した種として記載されることを意図したものである。或る特定の実施形態において、脂肪族基は、安定した部分が形成されるように1つ以上の官能基で置換される。
「ヘテロ脂肪族」という用語は、鎖中に炭素原子の代わりに少なくとも1個のヘテロ原子、例えばアミン、カルボニル、カルボキシ、オキソ、チオ、ホスフェート、ホスホネート、窒素、リン、ケイ素又はホウ素原子を含有する脂肪族部分を指す。或る特定の実施形態において、ヘテロ原子は窒素のみである。或る特定の実施形態において、ヘテロ原子は酸素のみである。或る特定の実施形態において、ヘテロ原子は硫黄のみである。「ヘテロ脂肪族」は本明細書で、限定されるものではないが、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルケニル及びヘテロシクロアルキニル部分を含むことが意図される。或る特定の実施形態において、「ヘテロ脂肪族」は、1個~20個の炭素原子を有するヘテロ脂肪族基(環状、非環状、置換、非置換、分岐又は非分岐)を示すために使用される。或る特定の実施形態において、ヘテロ脂肪族基は、安定した部分が形成されるように任意に置換される。ヘテロ脂肪族部分の非限定的な例は、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、アミド、ポリアミド、ポリラクチド、ポリグリコリド、チオエーテル、エーテル、アルキル-複素環-アルキル、-O-アルキル-O-アルキル、アルキル-O-ハロアルキル等である。
「剤形」は活性剤の投与単位を意味する。剤形の例としては、錠剤、カプセル、注射剤、懸濁液、液体、エマルション、インプラント、粒子、スフェア、クリーム、軟膏、坐剤、吸入可能形態、経皮形態、口腔剤形、舌下剤形、局所剤形、ゲル、粘膜剤形等が挙げられる。「剤形」はインプラント、例えば視覚インプラント(optical implant)も含み得る。
本明細書で使用される場合、「内因性」は、生物、細胞、組織又は系の内部からの又は内部で産生された任意の物質を指す。
本明細書で使用される場合、「外因性」という用語は、生物、細胞、組織又は系の外部から導入された又は外部で産生された任意の物質を指す。
「調節する」という用語は、本明細書で使用される場合、治療又は化合物の非存在下での被験体における応答のレベルと比較した、及び/又は他の点では同一であるが、未治療の被験体における応答のレベルと比較した、被験体における応答のレベルの検出可能な上昇又は低下を媒介することを意味する。この用語は、固有のシグナル又は応答を乱し、及び/又はそれに影響を及ぼすことで被験体、好ましくはヒトにおける有益な治療応答を媒介することを包含する。
化合物の「非経口」投与は、例えば皮下(s.c.)、静脈内(i.v.)、筋肉内(i.m.)若しくは胸骨内注射、又は注入法を含む。
本明細書で使用される場合、「医薬組成物」は、本明細書に記載される選択活性化合物等の少なくとも1つの活性剤と、担体等の少なくとも1つの他の物質とを含む組成物である。「医薬合剤(Pharmaceutical combinations)」は、単一の剤形に組み合わせるか、又は別個の剤形でともに与えることができる少なくとも2つの活性剤の組合せであり、本明細書に記載の任意の障害を治療するために活性剤が併用されることが指示される。
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容可能な塩」は、親化合物が、生物学的に許容可能な毒性の喪失を伴って、その無機塩及び有機塩、酸付加塩又は塩基付加塩を作製することによって修飾された開示の化合物の誘導体である。本化合物の塩は、従来の化学的方法によって塩基性又は酸性部分を含有する親化合物から合成することができる。概して、かかる塩は、遊離酸形態のこれらの化合物と化学量論量の適切な塩基(Na、Ca、Mg又はKの水酸化物、炭酸塩、重炭酸塩等)とを反応させるか、又は遊離塩基形態のこれらの化合物と化学量論量の適切な酸とを反応させることによって調製することができる。かかる反応は典型的には水若しくは有機溶媒又はそれら2つの混合物中で行われる。概して、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール又はアセトニトリルのような非水媒体が実用可能な場合に典型的である。本化合物の塩は、化合物及び化合物の塩の溶媒和物を更に含む。
薬学的に許容可能な塩の例としては、アミン等の塩基性残基の鉱酸塩又は有機酸塩、カルボン酸等の酸性残基のアルカリ塩又は有機塩等が挙げられるが、これらに限定されない。薬学的に許容可能な塩としては、例えば非毒性無機酸又は有機酸から形成される親化合物の従来の非毒性塩及び第四級アンモニウム塩が挙げられる。例えば、従来の非毒性酸の塩としては、塩酸、臭化水素酸、硫酸、スルファミン酸、リン酸、硝酸等の無機酸に由来するもの、及び酢酸、プロピオン酸、コハク酸、グリコール酸、ステアリン酸、乳酸、リンゴ酸、酒石酸、クエン酸、アスコルビン酸、パモ酸、マレイン酸、ヒドロキシマレイン酸、フェニル酢酸、グルタミン酸、安息香酸、サリチル酸、メシル酸、エシル酸、ベシル酸、スルファニル酸、2-アセトキシ安息香酸、フマル酸、トルエンスルホン酸、メタンスルホン酸、エタンジスルホン酸、シュウ酸、イセチオン酸、HOOC-(CH-COOH(式中、nは0~4である)等の有機酸から、又は同じ対イオンを生成する異なる酸を用いて調製される塩が挙げられる。更なる好適な塩の一覧は、例えばRemington's Pharmaceutical Sciences, 17th ed., Mack Publishing Company, Easton, Pa., p. 1418 (1985)に見ることができる。
「担体」という用語は、活性剤がその中で使用又は送達される希釈剤、添加剤又はビヒクルを意味する。
「薬学的に許容可能な添加剤」は、概して安全であり、生物学的にも他の形でも宿主(通常はヒト)への投与に不適切ではない、医薬組成物/合剤の調製に有用な添加剤を意味する。或る特定の実施形態において、獣医学的使用に許容可能な添加剤が使用される。
「患者」又は「宿主」又は「被験体」は、本明細書に具体的に記載される障害のいずれかの治療を必要とするヒト又は非ヒト動物である。通例、宿主はヒトである。「宿主」は、代替的には、例えば哺乳動物、霊長類(例えば、ヒト)、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、イヌ、ネコ、ウサギ、ラット、マウス、魚類、鳥類等を指す場合もある。
本発明の医薬組成物/合剤の「治療有効量」は、宿主に投与した場合に症状の改善又は疾患自体の軽減若しくは縮減等の治療効果をもたらすのに効果的な量を意味する。
或る特定の実施形態において、「プロドラッグ」は、例えば哺乳動物又はヒトにおいて、in vivoで親分子に代謝される又は化学的に転化される形式の親分子である。プロドラッグの非限定的な例としては、エステル、例えば第一級又は第二級アミンのアミド、カーボネート、カルバメート、ホスフェート、ケタール、イミン、オキサゾリジン、及びチアゾリジンが挙げられる。プロドラッグは、pHの変化時(例えば、胃内又は腸内)又は酵素(例えば、エステラーゼ又はアミダーゼ)の作用時に親分子を放出するように設計され得る。
或る特定の実施形態において、「安定」とは、化合物の10%未満、5%未満、3%未満、又は1%未満が周囲条件下で分解し、少なくとも3ヶ月、4ヶ月、5ヶ月、又は6ヶ月の貯蔵寿命を有することを意味する。或る特定の実施形態において、周囲条件で貯蔵される化合物は、ほぼ室温で貯蔵され、空気及び約40%未満、50%未満、60%未満、又は70%未満の相対湿度に曝露される。或る特定の実施形態において、周囲条件で貯蔵される化合物は、ほぼ室温で不活性ガス(アルゴン又は窒素等)下にて貯蔵される。典型的には、本明細書に記載される部分は、その部分が複素芳香族でない限り、互いに直接結合した1個又は2個より多くのヘテロ原子を有しない。
本開示全体を通して、本発明の様々な態様は、範囲形式で提示され得る。範囲形式での記載は、便宜上のものにすぎず、本発明の範囲の限定と解釈すべきでないことを理解されたい。範囲の記載は、考え得る全ての部分範囲及びその範囲内の個々の数値を具体的に開示していると考えるべきである。例えば、1~6等の範囲の記載は、1~3、1~4、1~5、2~4、2~6、3~6等の部分範囲、並びにその範囲内の個々の数、例えば1、2、2.7、3、4、5、5.3及び6を具体的に開示していると考えるべきである。このことは、範囲の広さに関わらず当てはまる。
II.本発明の化合物
「アルキル」の実施形態
或る特定の実施形態において、「アルキル」はC~C10アルキル、C~Cアルキル、C~Cアルキル、C~Cアルキル、C~Cアルキル、C~Cアルキル、C~Cアルキル、C~Cアルキル、又はC若しくはCアルキルである。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、1個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、2個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、3個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、4個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、5個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、6個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、7個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、8個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、9個の炭素を含む。
或る特定の実施形態において、「アルキル」は、10個の炭素を含む。
「アルキル」の非限定的な例としては、メチル、エチル、プロピル、ブチル、ペンチル及びヘキシルが挙げられる。
「アルキル」の付加的な非限定的な例としては、イソプロピル、イソブチル、イソペンチル及びイソヘキシルが挙げられる。
「アルキル」の付加的な非限定的な例としては、sec-ブチル、sec-ペンチル及びsec-ヘキシルが挙げられる。
「アルキル」の付加的な非限定的な例としては、tert-ブチル、tert-ペンチル及びtert-ヘキシルが挙げられる。
「アルキル」の付加的な非限定的な例としては、ネオペンチル、3-ペンチル及び活性ペンチル(active pentyl)が挙げられる。
「ハロアルキル」の実施形態
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」はC~C10ハロアルキル、C~Cハロアルキル、C~Cハロアルキル、C~Cハロアルキル、C~Cハロアルキル、C~Cハロアルキル、C~Cハロアルキル、C~Cハロアルキル及びC若しくはCハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、1個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、1個の炭素及び1個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、1個の炭素及び2個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、1個の炭素及び3個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、2個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、2個の炭素及び1個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、2個の炭素及び2個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、2個の炭素及び3個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、2個の炭素及び4個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、2個の炭素及び5個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び1個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び2個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び3個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び4個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び5個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び6個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、3個の炭素及び7個のハロゲンを有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、4個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、5個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「ハロアルキル」は、6個の炭素を有する。
「ハロアルキル」の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000069
が挙げられる。
「ハロアルキル」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000070
が挙げられる。
「ハロアルキル」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000071
が挙げられる。
「ハロアルキル」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000072
が挙げられる。
「ハロアルキル」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000073
が挙げられる。
「アリール」の実施形態
或る特定の実施形態において、「アリール」は、6炭素の芳香族基(フェニル)である。
或る特定の実施形態において、「アリール」は、10炭素の芳香族基(ナフチル)である。
或る特定の実施形態において、「アリール」は、取り付け点がアリール環である、複素環に縮合した6炭素芳香族基である。「アリール」の非限定的な例としては、インドリン、テトラヒドロキノリン、テトラヒドロイソキノリン及びジヒドロベンゾフランが挙げられ、ここで、各基の取り付け点は芳香環上にある。
例えば、
Figure 2023545507000074
は、「アリール」基である。
しかしながら、
Figure 2023545507000075
は、「複素環」基である。
或る特定の実施形態において、「アリール」は、取り付け点がアリール環である、シクロアルキルに縮合した6炭素の芳香族基である。「アリール」の非限定的な例としては、ジヒドロインデン及びテトラヒドロナフタレンが挙げられ、ここで、各基の取り付け点は芳香環上にある。
例えば、
Figure 2023545507000076
は、「アリール」基である。
しかしながら、
Figure 2023545507000077
は、「シクロアルキル」基である。
「ヘテロアリール」の実施形態
或る特定の実施形態において、「ヘテロアリール」は、1個、2個、3個又は4個の窒素原子を含有する5員の芳香族基である。
5員の「ヘテロアリール」基の非限定的な例としては、ピロール、フラン、チオフェン、ピラゾール、イミダゾール、トリアゾール、テトラゾール、イソオキサゾール、オキサゾール、オキサジアゾール、オキサトリアゾール、イソチアゾール、チアゾール、チアジアゾール及びチアトリアゾールが挙げられる。
5員の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000078
が挙げられる。
或る特定の実施形態において、「ヘテロアリール」は、1個、2個又は3個の窒素原子を含有する6員の芳香族基(すなわち、ピリジニル、ピリダジニル、トリアジニル、ピリミジニル及びピラジニル)である。
1個又は2個の窒素原子を有する6員の「ヘテロアリール」基の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000079
が挙げられる。
或る特定の実施形態において、「ヘテロアリール」は、窒素、酸素及び硫黄から選択される1個又は2個の原子を含有する9員の二環式の芳香族基である。
二環式の「ヘテロアリール」基の非限定的な例としては、インドール、ベンゾフラン、イソインドール、インダゾール、ベンズイミダゾール、アザインドール、アザインダゾール、プリン、イソベンゾフラン、ベンゾチオフェン、ベンゾイソオキサゾール、ベンゾイソチアゾール、ベンゾオキサゾール及びベンゾチアゾールが挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000080
が挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000081
が挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000082
が挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000083
が挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000084
が挙げられる。
或る特定の実施形態において、「ヘテロアリール」は、1個又は2個の窒素を含有する10員の二環式の芳香族基である。
二環式の「ヘテロアリール」基の非限定的な例としては、キノリン、イソキノリン、キノキサリン、フタラジン、キナゾリン、シンノリン及びナフチリジンが挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000085
が挙げられる。
二環式の「ヘテロアリール」基の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000086

が挙げられる。
「シクロアルキル」の実施形態
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、C~Cシクロアルキル、C~Cシクロアルキル、C~Cシクロアルキル、C~Cシクロアルキル、C若しくはCシクロアルキル、C~Cシクロアルキル、C~Cシクロアルキル又はC~Cシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、3個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、4個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、5個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、6個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、7個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、8個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、9個の炭素を有する。
或る特定の実施形態において、「シクロアルキル」は、10個の炭素を有する。
「シクロアルキル」の非限定的な例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル及びシクロデシルが挙げられる。
「シクロアルキル」の付加的な非限定的な例としては、ジヒドロインデン及びテトラヒドロナフタレンが挙げられ、ここで、各基の取り付け点はシクロアルキル環上にある。
例えば、
Figure 2023545507000087
は、「シクロアルキル」基である。
しかしながら、
Figure 2023545507000088
は、「アリール」基である。
「複素環」の実施形態
或る特定の実施形態において、「複素環」は、1個の窒素と3個、4個、5個、6個、7個又は8個の炭素原子とを有する環式環(cyclic ring)を指す。
或る特定の実施形態において、「複素環」は、1個の窒素と、1個の酸素と、3個、4個、5個、6個、7個又は8個の炭素原子とを有する環式環を指す。
或る特定の実施形態において、「複素環」は、2個の窒素と、3個、4個、5個、6個、7個又は8個の炭素原子とを有する環式環を指す。
或る特定の実施形態において、「複素環」は、1個の酸素と、3個、4個、5個、6個、7個又は8個の炭素原子とを有する環式環を指す。
或る特定の実施形態において、「複素環」は、1個の硫黄と、3個、4個、5個、6個、7個又は8個の炭素原子とを有する環式環を指す。
「複素環」の非限定的な例としては、アジリジン、オキシラン、チイラン、アゼチジン、1,3-ジアゼチジン、オキセタン及びチエタンが挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、ピロリジン、3-ピロリン、2-ピロリン、ピラゾリジン及びイミダゾリジンが挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、テトラヒドロフラン、1,3-ジオキソラン、テトラヒドロチオフェン、1,2-オキサチオラン及び1,3-オキサチオランが挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、ピペリジン、ピペラジン、テトラヒドロピラン、1,4-ジオキサン、チアン、1,3-ジチアン、1,4-ジチアン、モルホリン及びチオモルホリンが挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、インドリン、テトラヒドロキノリン、テトラヒドロイソキノリン及びジヒドロベンゾフランが挙げられ、ここで、各基の取り付け点は複素環上にある。
例えば、
Figure 2023545507000089
は、「複素環」基である。
しかしながら、
Figure 2023545507000090
は、「アリール」基である。
「複素環」の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000091
も挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000092
が挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000093
が挙げられる。
「複素環」の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000094
も挙げられる。
「複素環」の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000095
も挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000096
が挙げられる。
「複素環」の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000097
が挙げられる。
任意の置換基
或る特定の実施形態において、1つ、2つ、3つ又は4つの置換基で置換され得る本明細書に記載の部分は、1つの置換基で置換される。
或る特定の実施形態において、1つ、2つ、3つ又は4つの置換基で置換され得る本明細書に記載の部分は、2つの置換基で置換される。
或る特定の実施形態において、1つ、2つ、3つ又は4つの置換基で置換され得る本明細書に記載の部分は、3つの置換基で置換される。
或る特定の実施形態において、1つ、2つ、3つ又は4つの置換基で置換され得る本明細書に記載の部分は、4つの置換基で置換される。
及び/又はRの非限定的な実施形態
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、独立して、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、及びニトロから選択される。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、独立して、ハロゲン、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、及びニトロから選択される。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、独立して、ハロゲン、-S(O)R12、-SO12、シアノ、及びニトロから選択される。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、独立して、アルキル、ハロアルキル、-OR10、及び-SR10から選択される。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、独立して、アルキル、ハロアルキル、及びシアノから選択される。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、水素である。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、アルキルである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、-OR10である。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、-SR10である。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、-S(O)R12である。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、-SO12である。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、-NR1011である。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、シアノである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、ニトロである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、アリールである。
或る特定の実施形態において、それぞれのR及び/又はRは、複素環式である。
或る特定の実施形態において、環-A又は環-C上には、1つだけのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-A又は環-C上には、2つだけのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-A又は環-C上には、3つのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-B上には、1つだけのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-B上には、2つだけのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-B上には、3つのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-D上には、1つだけのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-D上には、2つだけのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、環-D上には、3つのR置換基が存在する。
或る特定の実施形態において、1つのR置換基は、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、2つのR置換基は、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、3つのR置換基は、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、1つのR置換基は、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、2つのR置換基は、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、3つのR置換基は、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、1つのR置換基は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、2つのR置換基は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、3つのR置換基は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、1つのR置換基は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、2つのR置換基は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、3つのR置換基は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、1つのR置換基は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、2つのR置換基は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、3つのR置換基は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、1つのR置換基は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、2つのR置換基は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、3つのR置換基は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合5員ヘテロアリール環を形成する。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合6員ヘテロアリール環を形成する。
或る特定の実施形態において、R基はR基と一緒になって、縮合6員複素環を形成する。
或る特定の実施形態において、R基はR基と一緒になって、縮合5員複素環を形成する。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合5員ヘテロアリール環を形成する。
或る特定の実施形態において、2つのR基は一緒になって、縮合6員ヘテロアリール環を形成する。
の非限定的な実施形態
或る特定の実施形態において、Rは、水素及びハロゲンから選択される。
或る特定の実施形態において、Rは、アルキル及びハロアルキルから選択される。
或る特定の実施形態において、Rは、水素である。
或る特定の実施形態において、Rは、ハロゲンである。
或る特定の実施形態において、Rは、アルキルである。
或る特定の実施形態において、Rは、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、Rは、フルオロである。
或る特定の実施形態において、Rは、クロロである。
或る特定の実施形態において、Rは、ブロモである。
或る特定の実施形態において、Rは、ヨードである。
或る特定の実施形態において、Rは、メチルである。
或る特定の実施形態において、Rは、エチルである。
或る特定の実施形態において、Rは、トリフルオロメチルである。
或る特定の実施形態において、Rは、ペンタフルオロエチルである。
或る特定の実施形態において、Rは、ジフルオロメチルである。
或る特定の実施形態において、Rは、フルオロメチルである。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、1炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、2炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、3炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、4炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、二重結合を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、1炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、2炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、3炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、4炭素連結部を形成する。
及びRの非限定的な実施形態
或る特定の実施形態において、R及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される。
或る特定の実施形態において、R及びRは、独立して、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、及び-NR1011から選択される。
或る特定の実施形態において、R及びRは、独立して、アルキル、-OR10、-SR10、及び-NR1011から選択される。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、1炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、2炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、3炭素連結部を形成する。
或る特定の実施形態において、RはR基と一緒になって、4炭素連結部を形成する。
10及びR11の非限定的な実施形態
或る特定の実施形態において、R10は、水素である。
或る特定の実施形態において、R10は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R10は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R10は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R10は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R10は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R10は、-C(O)R12である。
或る特定の実施形態において、R10は、-S(O)R12である。
或る特定の実施形態において、R10は、-SO12である。
或る特定の実施形態において、R11は、水素である。
或る特定の実施形態において、R11は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R11は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R11は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R11は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R11は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R11は、-C(O)R12である。
或る特定の実施形態において、R11は、-S(O)R12である。
或る特定の実施形態において、R11は、-SO12である。
12の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R12は、水素である。
或る特定の実施形態において、R12は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R12は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R12は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R12は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R12は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R12は、-NR1314である。
或る特定の実施形態において、R12は、OR13である。
13の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R13は、水素である。
或る特定の実施形態において、R13は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R14は、水素である。
或る特定の実施形態において、R14は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R14は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、水素であり、かつR14は、水素である。
或る特定の実施形態において、R13は、水素であり、かつR14は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、水素であり、かつR14は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、アルキルであり、かつR14は、水素である。
或る特定の実施形態において、R13は、アルキルであり、かつR14は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、アルキルであり、かつR14は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、ハロアルキルであり、かつR14は、水素である。
或る特定の実施形態において、R13は、ハロアルキルであり、かつR14は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R13は、ハロアルキルであり、かつR14は、ハロアルキルである。
及びXの非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、Xは、結合である。
或る特定の実施形態において、Xは、複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、Xは、アリールである。
或る特定の実施形態において、Xは、二環である。
或る特定の実施形態において、Xは、アルキルである。
或る特定の実施形態において、Xは、脂肪族である。
或る特定の実施形態において、Xは、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(NR27)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、CR4041-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(NR27)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S-である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する5員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する5員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,4方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,4方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、一方の連結部は、窒素に結合されており、一方の連結部は、炭素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、両方の取り付け点は、炭素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、両方の取り付け点は、窒素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、縮合二環式アルカンである。
或る特定の実施形態において、Xは、スピロ二環式アルカンである。
或る特定の実施形態において、Xは:から選択される。
或る特定の実施形態において、Xは、結合である。
或る特定の実施形態において、Xは、複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、Xは、アリールである。
或る特定の実施形態において、Xは、二環である。
或る特定の実施形態において、Xは、アルキルである。
或る特定の実施形態において、Xは、脂肪族である。
或る特定の実施形態において、Xは、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(NR27)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、CR4041-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(NR27)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S-である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する5員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する5員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,4方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,4方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、一方の連結部は、窒素に結合されており、一方の連結部は、炭素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、両方の取り付け点は、炭素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、両方の取り付け点は、窒素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、縮合二環式アルカンである。
或る特定の実施形態において、Xは、スピロ二環式アルカンである。
の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、Xは、結合である。
或る特定の実施形態において、Xは、複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、Xは、アリールである。
或る特定の実施形態において、Xは、二環である。
或る特定の実施形態において、Xは、アルキルである。
或る特定の実施形態において、Xは、脂肪族である。
或る特定の実施形態において、Xは、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(NR27)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、CR4041-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(NR27)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、Xは、-S-である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する5員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する5員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,4方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の芳香族複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,2方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,3方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1,4方向に取り付け点を有する6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、一方の連結部は、窒素に結合されており、一方の連結部は、炭素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、1個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、両方の取り付け点は、炭素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環であり、両方の取り付け点は、窒素に結合されている。
或る特定の実施形態において、Xは、2個のヘテロ原子を有する二環式複素環である。
或る特定の実施形態において、Xは、縮合二環式アルカンである。
或る特定の実施形態において、Xは、スピロ二環式アルカンである。
15、R16、及びR17の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R15は、結合である。
或る特定の実施形態において、R15は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R15は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R15は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R15は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R15は、二環である。
或る特定の実施形態において、R15は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R15は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R15は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R15は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R15は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R15は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R15は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R15は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R15は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R15は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R15は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R15は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R15は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R16は、結合である。
或る特定の実施形態において、R16は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R16は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R16は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R16は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R16は、二環である。
或る特定の実施形態において、R16は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R16は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R16は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R16は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R16は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R16は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R16は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R16は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R16は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R16は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R16は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R16は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R16は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R17は、結合である。
或る特定の実施形態において、R17は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R17は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R17は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R17は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R17は、二環である。
或る特定の実施形態において、R17は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R17は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R17は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R17は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R17は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R17は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R17は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R17は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R17は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R17は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R17は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R17は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R17は、ヘテロアリールアルキルである。
20、R21、及びR22、R23、及びR24の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R20は、結合である。
或る特定の実施形態において、R20は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R20は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R20は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R20は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R20は、二環である。
或る特定の実施形態において、R20は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R20は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R20は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R20は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R20は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R20は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R20は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R20は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R20は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R20は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R20は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R20は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R20は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R21は、結合である。
或る特定の実施形態において、R21は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R21は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R21は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R21は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R21は、二環である。
或る特定の実施形態において、R21は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R21は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R21は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R21は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R21は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R21は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R21は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R21は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R21は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R21は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R21は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R21は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R21は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R22は、結合である。
或る特定の実施形態において、R22は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R22は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R22は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R22は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R22は、二環である。
或る特定の実施形態において、R22は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R22は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R22は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R22は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R22は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R22は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R22は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R22は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R22は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R22は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R22は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R22は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R22は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R23は、結合である。
或る特定の実施形態において、R23は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R23は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R23は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R23は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R23は、二環である。
或る特定の実施形態において、R23は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R23は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R23は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R23は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R23は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R23は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R23は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R23は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R23は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R23は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R23は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R23は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R23は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R24は、結合である。
或る特定の実施形態において、R24は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R24は、-C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-C(O)O-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-OC(O)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-SO-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-S(O)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-C(S)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、C(O)NR27-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-NR27C(O)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-O-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-S-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-NR27-である。
或る特定の実施形態において、R24は、C(R4041)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、P(O)(OR26)O-である。
或る特定の実施形態において、R24は、-P(O)(OR26)-である。
或る特定の実施形態において、R24は、二環である。
或る特定の実施形態において、R24は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R24は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R24は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R24は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R24は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R24は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R24は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R24は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R24は、乳酸である。
或る特定の実施形態において、R24は、グリコール酸である。
或る特定の実施形態において、R24は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R24は、複素環アルキルである。
或る特定の実施形態において、R24は、ヘテロアリールアルキルである。
26の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R26は、水素である。
或る特定の実施形態において、R26は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R26は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R26は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R26は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R26は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R26は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R26は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R26は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R26は、脂肪族である。
27の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R27は、水素である。
或る特定の実施形態において、R27は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R27は、アリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R27は、ヘテロアリールアルキルである。
或る特定の実施形態において、R27は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R27は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R27は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R27は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R27は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R27は、脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R27は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)(脂肪族)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)(アリール)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)(ヘテロ脂肪族)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)(ヘテロアリール)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)O(脂肪族)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)O(アリール)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)O(ヘテロ脂肪族)である。
或る特定の実施形態において、R27は、-C(O)O(ヘテロアリール)である。
40の非限定的な実施形態:
或る特定の実施形態において、R40は、水素である。
或る特定の実施形態において、R40は、R27である。
或る特定の実施形態において、R40は、アルキルである。
或る特定の実施形態において、R40は、アルケンである。
或る特定の実施形態において、R40は、アルキンである。
或る特定の実施形態において、R40は、フルオロである。
或る特定の実施形態において、R40は、ブロモである。
或る特定の実施形態において、R40は、クロロである。
或る特定の実施形態において、R40は、ヒドロキシルである。
或る特定の実施形態において、R40は、アルコキシである。
或る特定の実施形態において、R40は、アジドである。
或る特定の実施形態において、R40は、アミノである。
或る特定の実施形態において、R40は、シアノである。
或る特定の実施形態において、R40は、-N(アルキルを含む脂肪族)である。
或る特定の実施形態において、R40は、-NHSO(アルキルを含む脂肪族)である。
或る特定の実施形態において、R40は、-N(アルキルを含む脂肪族)SOアルキルである。
或る特定の実施形態において、R40は、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)である。
或る特定の実施形態において、R40は、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)である。
或る特定の実施形態において、R40は、-NHSOアルケニルである。
或る特定の実施形態において、R40は、-N(アルキル)SOアルケニルである。
或る特定の実施形態において、R40は、-NHSOアルキニルである。
或る特定の実施形態において、R40は、-N(アルキル)SOアルキニルである。
或る特定の実施形態において、R40は、ハロアルキルである。
或る特定の実施形態において、R40は、脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R40は、ヘテロ脂肪族である。
或る特定の実施形態において、R40は、アリールである。
或る特定の実施形態において、R40は、ヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、R40は、複素環である。
或る特定の実施形態において、R40は、オキソである。
或る特定の実施形態において、R40は、シクロアルキルである。
式I、式II、又は式IIIの化合物の非限定的な例
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000098
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000099
から選択される。
本明細書の構造において、ヒドロキシル(例えば、R基又はR基)は、窒素に隣接するヘテロアリール環炭素上に位置し、本明細書に特段の指示がない限り、それぞれの別個の互変異性体又はそれらの混合物を個別に言及する簡潔な方法として、1つの互変異性体のみが示されており、それぞれの別個の互変異性体又はそれらの混合物は、あたかも個別に本明細書に列挙されているかのように本明細書に組み込まれる。これは、
Figure 2023545507000100
の非限定的な例によって説明され、これには、
Figure 2023545507000101
の両方が含まれる。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000102
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000103
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000104
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000105
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000106
Figure 2023545507000107
Figure 2023545507000108
Figure 2023545507000109
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000110
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000111
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000112
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000113
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000114
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000115
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000116
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000117
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000118
から選択される。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000119
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000120
である。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、結合である。
環-A、環-B、環-C、及び環-Dの実施形態
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000121
は、以下:
Figure 2023545507000122
から選択され、ここで、破線は、スペーサー/リンカーに取り付けられる可能性のある線を示す。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000123
は、
Figure 2023545507000124
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000125
は、
Figure 2023545507000126
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000127
は、
Figure 2023545507000128
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000129
は、
Figure 2023545507000130
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000131
は、
Figure 2023545507000132
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000133
は、
Figure 2023545507000134
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000135
は、
Figure 2023545507000136
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000137
は、
Figure 2023545507000138
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000139
は、
Figure 2023545507000140
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000141
は、
Figure 2023545507000142
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000143
は、
Figure 2023545507000144
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000145
は、
Figure 2023545507000146
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000147
は、
Figure 2023545507000148
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000149
は、
Figure 2023545507000150
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000151
は、
Figure 2023545507000152
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000153
は、
Figure 2023545507000154
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000155
は、
Figure 2023545507000156
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000157
は、
Figure 2023545507000158
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000159
は、
Figure 2023545507000160
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000161
は、
Figure 2023545507000162
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000163
は、
Figure 2023545507000164
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000165
は、
Figure 2023545507000166
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000167
は、
Figure 2023545507000168
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000169
は、
Figure 2023545507000170
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000171
は、
Figure 2023545507000172
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000173
は、
Figure 2023545507000174
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000175
は、
Figure 2023545507000176
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000177
は、
Figure 2023545507000178
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000179
は、
Figure 2023545507000180
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000181
は、
Figure 2023545507000182
Figure 2023545507000183
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000184
は、
Figure 2023545507000185
Figure 2023545507000186
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000187
は、
Figure 2023545507000188
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000189
は、
Figure 2023545507000190
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000191
についての
Figure 2023545507000192
は、
Figure 2023545507000193
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000194
内の
Figure 2023545507000195
は、
Figure 2023545507000196
から選択され、例えば、
Figure 2023545507000197
が、
Figure 2023545507000198
である場合に、
Figure 2023545507000199
は、
Figure 2023545507000200
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000201
内の
Figure 2023545507000202
は、
Figure 2023545507000203
から選択される。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000204
についての
Figure 2023545507000205
は、
Figure 2023545507000206
から選択される。
本明細書における構造において、構造:
Figure 2023545507000207
は、環-A及び環-B又は環-C及び環-Dのいずれかに縮合されたシクロアルキル環、複素環式環、アリール環、又はヘテロアリール環を指す。これは、以下の非限定的な例によって説明され、
Figure 2023545507000208
は、
Figure 2023545507000209
を指し、かつ
Figure 2023545507000210
は、
Figure 2023545507000211
を指す。
本明細書で使用される場合に、
Figure 2023545507000212
は、三環式セレブロンリガンドと三環式環上の任意の位置との価数によって許容される接続点を示す。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000213
は、環-A又は環-C上の(反時計回りに数えて)1番目の利用可能な位置に結合されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000214
は、
Figure 2023545507000215
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000216
は、環-A又は環-C上の(反時計回りに数えて)2番目の利用可能な位置に結合されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000217
は、
Figure 2023545507000218
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000219
は、環-A又は環-C上の(反時計回りに数えて)3番目の利用可能な位置に結合されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000220
は、
Figure 2023545507000221
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000222
は、環-B又は環-D上の(反時計回りに数えて)1番目の利用可能な位置に結合されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000223
は、
Figure 2023545507000224
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000225
は、環-B又は環-D上の(反時計回りに数えて)2番目の利用可能な位置に結合されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000226
は、
Figure 2023545507000227
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000228
は、環-B又は環-D上の(反時計回りに数えて)3番目の利用可能な位置に結合されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000229
は、
Figure 2023545507000230
である。
或る特定の実施形態において、
Figure 2023545507000231
は、環-A上の2番目若しくは3番目の位置、又は環-B上の1番目若しくは2番目の位置から選択される点に接続されている。例えば、この実施形態において、
Figure 2023545507000232
は、
Figure 2023545507000233
である。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである。
或る特定の実施形態において、環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである。
三環式セレブロンリガンドの実施形態
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000234
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000235
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000236
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000237
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000238
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000239
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000240
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000241
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000242
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000243
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000244
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000245
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000246
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000247
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000248
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000249
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000250
Figure 2023545507000251
から選択される。
或る特定の実施形態において、三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000252
Figure 2023545507000253
から選択される。
代替的な実施形態において、セレブロン結合性リガンドは、
Figure 2023545507000254
(式中、各Rは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、及び-NR1011から選択されるか、又は2つのR基は互いに一緒になって、3員又は4員のスピロ環を形成する)である。
代替的な実施形態において、セレブロン結合性リガンドは、
Figure 2023545507000255
(式中、各Rは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択されるか、又は2つのR基は互いに一緒になって、3員環~6員環を形成する)である。
代替的な実施形態において、セレブロン結合性リガンドは、
Figure 2023545507000256
である。
代替的な実施形態において、セレブロン結合性リガンドは、
Figure 2023545507000257
である。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、以下のものから選択される:
Figure 2023545507000258
Figure 2023545507000259
非限定的な同位体の実施形態
或る特定の実施形態においては、化合物は、同位体標識される。或る特定の実施形態においては、R、R、R、R、R、R、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、R20、R21、R22、R23、R24、R26、R27、R40、R41又はR42から独立して選択される少なくとも1つのR基が、価数によって許容される場合に1つ、2つ又はそれ以上の同位体によって同位体標識される。或る特定の実施形態においては、同位体標識は重水素である。或る特定の実施形態においては、少なくとも1つの重水素が、in vivoで化合物の代謝中に破壊される結合を有する原子上に位置するか、又は代謝される結合から1、2若しくは3原子離れている(例えば、α、β若しくはγ、又は一次、二次若しくは三次同位体効果と称される場合もある)。別の実施形態においては、同位体標識は13Cである。他の実施形態においては、同位体標識は18Fである。
追加の実施形態
1.或る特定の実施形態において、任意に組成物を形成する薬学的に許容可能な担体中の、式I:
Figure 2023545507000260
の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩、N-オキシド、同位体誘導体、若しくはプロドラッグが提供される。
式Iにおいて:
三環式セレブロンリガンドは、以下の部分の1つから選択され、ここで、角括弧付きの結合は、望ましい効力及び触媒的分解プロファイルを達成する様式に関連して、三環式部分が、環-A、環-B、環-C、又は環-D上の共有結合を介してスペーサー/リンカーに取り付けられていることを示す。
Figure 2023545507000261
Figure 2023545507000262
Figure 2023545507000263
Figure 2023545507000264
Figure 2023545507000265
Figure 2023545507000266
Figure 2023545507000267
Figure 2023545507000268
Figure 2023545507000269
Figure 2023545507000270
Figure 2023545507000271
Figure 2023545507000272
Figure 2023545507000273
Figure 2023545507000274
Figure 2023545507000275
Figure 2023545507000276
Figure 2023545507000277
Figure 2023545507000278
Figure 2023545507000279
Figure 2023545507000280
Figure 2023545507000281
nは、0、1、又は2であり、
Xは、NR10、NR6’、O、又はSであり、
X’は、NR10、O、CH、又はSであり、
Qは、CR又はNであり、
Q’及びQ’’は、独立して、CR及びNから選択される。
環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
或る特定の実施形態においては、環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
或る特定の実施形態においては、環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
環-Cは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、各環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
環-Dは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、各環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている。
及びRは、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、ニトロ、ヘテロアリール、アリール、及び複素環から選択され、又は代替的には、価数及び安定性によって許容される場合に、R若しくはRは、=O、=S、若しくは=NR41等の二価の部分であってもよく、かつR基は、適切かつ所望であれば、任意に別のR基若しくはR基と一緒になって、環-A及び環-B又は環-C及び環-Dを架橋し得る縮合環若しくは二環を形成してもよい。
は、水素、アルキル、ハロゲン、又はハロアルキルであり、
又は、R及びRは一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成し、例えば、R及びRが1炭素連結部を形成する場合に、
Figure 2023545507000282
は、
Figure 2023545507000283
であり、
又は、R及びRは一緒になって、1炭素連結部、2炭素連結部、3炭素連結部、又は4炭素連結部を形成し、例えば、R及びRが1炭素連結部を形成する場合に、
Figure 2023545507000284
は、
Figure 2023545507000285
であり、
又はR及びRに隣接するR基は一緒になって、二重結合を形成する。
及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択され、
及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、及び-NR1011から選択され、
’は、水素、アルキル、又はハロアルキルであり、
又はR及びR’は一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成する。
10及びR11は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)R12、-S(O)R12、及び-SO12から選択され、
各R12は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-NR1314、及びOR13から選択され、かつ、
13及びR14は、それぞれの場合に、独立して、水素、アルキル、及びハロアルキルから選択される。
スペーサーは、構造:
Figure 2023545507000286
であり得る二価の接続部分である。
は、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-から選択される二価の部分であるか、又はアリールアルキル、複素環アルキル、若しくはヘテロアリールアルキル(どちらの方向でも)であり得て、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されていてもよく、
15、R16、R17、及びR18は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル(或る特定の実施形態においては、炭素環である)、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4041)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、アリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルからなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
ここで、X及びR15~R18は一緒になって、三環式セレブロンリガンドとリンカーとを共有結合により接続する安定した部分であり、或る特定の実施形態において、スペーサーは、共有結合であり、
26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)、-NHSO(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、オキソ、及びシクロアルキルからなる群から選択され、
41は、脂肪族(アルキルを含む)、アリール、ヘテロアリール、又は水素であり、
標的化リガンドは、標的タンパク質に結合する部分であり、かつリンカー-スペーサーを介して三環式セレブロンリガンドに共有結合により連結されており、
標的タンパク質は、in vivoで治療される疾患を引き起こす又はその一因となる選択されたタンパク質であり、
リンカーは、二価の連結基、例えば、式LIの二価の連結基である。
2.環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている、実施形態1の化合物。
3.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである、実施形態1の化合物。
4.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである、実施形態1の化合物。
5.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである、実施形態1の化合物。
6.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である、実施形態1の化合物。
7.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である、実施形態1の化合物。
8.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員の複素環である、実施形態1の化合物。
9.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員の複素環である、実施形態1の化合物。
10.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである、実施形態1の化合物。
11.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである、実施形態1の化合物。
12.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員のシクロアルキルである、実施形態1の化合物。
13.環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員のシクロアルキルである、実施形態1の化合物。
14.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
15.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
16.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
17.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
18.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
19.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員の複素環である、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
20.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員の複素環である、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
21.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
22.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
23.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員のシクロアルキルである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
24.環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員のシクロアルキルである、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
25.環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている、実施形態1~13のいずれか1つの化合物。
26.Rは、水素である、実施形態1~25のいずれか1つの化合物。
27.Rは、アルキルである、実施形態1~25のいずれか1つの化合物。
28.Rは、ハロゲンである、実施形態1~25のいずれか1つの化合物。
29.Rは、ハロアルキルである、実施形態1~25のいずれか1つの化合物。
30.Rは、水素である、実施形態1~29のいずれか1つの化合物。
31.Rは、ハロゲン、ハロアルキル、又はアルキルである、実施形態1~29のいずれか1つの化合物。
32.Rは、-OR10、-SR10、又は-NR1011である、実施形態1~29のいずれか1つの化合物。
33.Rは、-S(O)R12、-SO12である、実施形態1~29のいずれか1つの化合物。
34.三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000287
Figure 2023545507000288
から選択される、実施形態1~33のいずれか1つの化合物。
35.三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000289
Figure 2023545507000290
から選択される、実施形態1~25のいずれか1つの化合物。
36.三環式セレブロンリガンドは、
Figure 2023545507000291
である、実施形態1~25のいずれか1つの化合物。
37.化合物は、
Figure 2023545507000292
から選択される、実施形態1~25のいずれか1つの化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
38.4個のR置換基が存在する、実施形態1~37のいずれか1つの化合物。
39.3個のR置換基が存在する、実施形態1~37のいずれか1つの化合物。
40.2個のR置換基が存在する、実施形態1~37のいずれか1つの化合物。
41.1個のR置換基が存在する、実施形態1~37のいずれか1つの化合物。
42.Rは、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される、実施形態1~41のいずれか1つの化合物。
43.Rは、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011から選択される、実施形態1~41のいずれか1つの化合物。
44.Rは、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される、実施形態1~41のいずれか1つの化合物。
45.Rは、ヘテロアリール、アリール、及び複素環から選択される、実施形態1~41のいずれか1つの化合物。
46.2個のR置換基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する、実施形態1~40のいずれか1つの化合物。
47.少なくとも1個のRは、アルキルである、実施形態1~41のいずれか1つの化合物。
48.少なくとも1個のRは、ハロゲンである、実施形態1~41のいずれか1つの化合物。
49.化合物は、
Figure 2023545507000293
(式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、実施形態37の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
50.化合物は、
Figure 2023545507000294
(式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、実施形態37の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
51.化合物は、
Figure 2023545507000295
(式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、実施形態1の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
52.化合物は、
Figure 2023545507000296
(式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、実施形態1の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
53.Qは、CRである、実施形態49~52のいずれか1つの化合物。
54.Qは、Nである、実施形態49~52のいずれか1つの化合物。
55.Qは、CRである、実施形態49~54のいずれか1つの化合物。
56.Qは、Nである、実施形態49~54のいずれか1つの化合物。
57.Qは、CRである、実施形態49~56のいずれか1つの化合物。
58.Qは、Nである、実施形態49~56のいずれか1つの化合物。
59.3個のR置換基が存在する、実施形態1~52のいずれか1つの化合物。
60.2個のR置換基が存在する、実施形態1~58のいずれか1つの化合物。
61.1個のR置換基が存在する、実施形態1~58のいずれか1つの化合物。
62.Rは、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される、実施形態1~61のいずれか1つの化合物。
63.Rは、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011から選択される、実施形態1~61のいずれか1つの化合物。
64.Rは、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される、実施形態1~61のいずれか1つの化合物。
65.2個のR置換基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する、実施形態1~60のいずれか1つの化合物。
66.少なくとも1個のRは、アルキルである、実施形態1~61のいずれか1つの化合物。
67.少なくとも1個のRは、ハロゲンである、実施形態1~61のいずれか1つの化合物。
68.Rは、水素である、実施形態1~67のいずれか1つの化合物。
69.Rは、アルキルである、実施形態1~67のいずれか1つの化合物。
70.Rは、ハロアルキルである、実施形態1~67のいずれか1つの化合物。
71.R及びRは一緒になって、1炭素連結部を形成する、実施形態1~67のいずれか1つの化合物。
72.R及びRは一緒になって、2炭素連結部を形成する、実施形態1~67のいずれか1つの化合物。
73.Rは、水素である、実施形態1~70のいずれか1つの化合物。
74.Rは、アルキルである、実施形態1~70のいずれか1つの化合物。
75.Rは、ハロアルキルである、実施形態1~70のいずれか1つの化合物。
76.少なくとも1個のRは、水素である、実施形態1~75のいずれか1つの化合物。
77.少なくとも1個のRは、アルキルである、実施形態1~75のいずれか1つの化合物。
78.少なくとも1個のRは、ハロアルキルである、実施形態1~75のいずれか1つの化合物。
79.nは、0である、実施形態1~75のいずれか1つの化合物。
80.nは、1である、実施形態1~78のいずれか1つの化合物。
81.nは、2である、実施形態1~78のいずれか1つの化合物。
82.リンカーは、式:
Figure 2023545507000297
(式中、
及びXは、独立して、それぞれの場合に、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-から選択され、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されており、
20、R21、R22、R23、及びR24は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4040)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、及び炭素環からなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)、-NHSO(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、及びシクロアルキルからなる群から選択され、かつ、
41は、脂肪族、アリール、ヘテロアリール、又は水素である)のリンカーである、実施形態1~81のいずれか1つの化合物。
83.Lは、式:
Figure 2023545507000298
のリンカーである、実施形態82の化合物。
84.Xは、結合である、実施形態82又は83の化合物。
85.Xは、複素環である、実施形態82又は83の化合物。
86.Xは、NRである、実施形態82又は83の化合物。
87.Xは、C(O)である、実施形態82又は83の化合物。
88.Xは、結合である、実施形態82~87のいずれか1つの化合物。
89.Xは、複素環である、実施形態82~87のいずれか1つの化合物。
90.Xは、NRである、実施形態82~87のいずれか1つの化合物。
91.Xは、C(O)である、実施形態82~87のいずれか1つの化合物。
92.R20は、結合である、実施形態82~91のいずれか1つの化合物。
93.R20は、CHである、実施形態82~91のいずれか1つの化合物。
94.R20は、複素環である、実施形態82~91のいずれか1つの化合物。
95.R20は、アリールである、実施形態82~91のいずれか1つの化合物。
96.R20は、フェニルである、実施形態82~91のいずれか1つの化合物。
97.R20は、二環である、実施形態82~91のいずれか1つの化合物。
98.R21は、結合である、実施形態82~97のいずれか1つの化合物。
99.R21は、CHである、実施形態82~97のいずれか1つの化合物。
100.R21は、複素環である、実施形態82~97のいずれか1つの化合物。
101.R21は、アリールである、実施形態82~97のいずれか1つの化合物。
102.R21は、フェニルである、実施形態82~97のいずれか1つの化合物。
103.R21は、二環である、実施形態82~97のいずれか1つの化合物。
104.リンカーは、式:
Figure 2023545507000299
のリンカーである、実施形態83の化合物。
105.R22は、結合である、実施形態82~104のいずれか1つの化合物。
106.R22は、CHである、実施形態82~104のいずれか1つの化合物。
107.R22は、複素環である、実施形態82~104のいずれか1つの化合物。
108.R22は、アリールである、実施形態82~104のいずれか1つの化合物。
109.R22は、フェニルである、実施形態82~104のいずれか1つの化合物。
110.R22は、二環である、実施形態82~104のいずれか1つの化合物。
111.リンカーは、式:
Figure 2023545507000300
のリンカーである、実施形態82の化合物。
112.R23は、結合である、実施形態82~111のいずれか1つの化合物。
113.R23は、CHである、実施形態82~111のいずれか1つの化合物。
114.R23は、複素環である、実施形態82~111のいずれか1つの化合物。
115.R23は、アリールである、実施形態82~111のいずれか1つの化合物。
116.R23は、フェニルである、実施形態82~111のいずれか1つの化合物。
117.R23は、二環である、実施形態82~111のいずれか1つの化合物。
118.リンカーは、式:
Figure 2023545507000301
のリンカーである、実施形態82の化合物。
119.R24は、結合である、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
120.R24は、CHである、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
121.R24は、複素環である、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
122.R24は、アリールである、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
123.R24は、フェニルである、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
124.R24は、二環である、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
125.R24は、C(O)である、実施形態82~118のいずれか1つの化合物。
126.リンカーは、
Figure 2023545507000302
から選択される、実施形態1~125のいずれか1つの化合物。
127.スペーサーは、構造:
Figure 2023545507000303
(式中、
は、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-から選択される二価の部分であるか、又はアリールアルキル、複素環アルキル、若しくはヘテロアリールアルキル(どちらの方向でも)であり得て、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されていてもよく、
15、R16、R17、及びR18は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル(或る特定の実施の形態において、炭素環である)、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4041)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、アリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルからなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されている)の二価の接続部分である、実施形態1~126のいずれか1つの化合物。
128.Lは、式:
Figure 2023545507000304
のリンカーである、実施形態127の化合物。
129.Xは、結合である、実施形態128又は129の化合物。
130.Xは、複素環である、実施形態128又は129の化合物。
131.Xは、NRである、実施形態128又は129の化合物。
132.Xは、C(O)である、実施形態128又は129の化合物。
133.R15は、結合である、実施形態127~132のいずれか1つの化合物。
134.R15は、CHである、実施形態127~132のいずれか1つの化合物。
135.R15は、複素環である、実施形態127~132のいずれか1つの化合物。
136.R15は、アリールである、実施形態127~132のいずれか1つの化合物。
137.R15は、フェニルである、実施形態127~132のいずれか1つの化合物。
138.R15は、二環である、実施形態127~132のいずれか1つの化合物。
139.R16は、結合である、実施形態127~138のいずれか1つの化合物。
140.R16は、CHである、実施形態127~138のいずれか1つの化合物。
141.R16は、複素環である、実施形態127~138のいずれか1つの化合物。
142.R16は、アリールである、実施形態127~138のいずれか1つの化合物。
143.R16は、フェニルである、実施形態127~138のいずれか1つの化合物。
144.R16は、二環である、実施形態127~138のいずれか1つの化合物。
145.R17は、結合である、実施形態127~144のいずれか1つの化合物。
146.R17は、CHである、実施形態127~144のいずれか1つの化合物。
147.R17は、複素環である、実施形態127~144のいずれか1つの化合物。
148.R17は、アリールである、実施形態127~144のいずれか1つの化合物。
149.R17は、フェニルである、実施形態127~144のいずれか1つの化合物。
150.R17は、二環である、実施形態127~144のいずれか1つの化合物。
151.R18は、結合である、実施形態127~150のいずれか1つの化合物。
152.R18は、CHである、実施形態127~150のいずれか1つの化合物。
153.R18は、複素環である、実施形態127~150のいずれか1つの化合物。
154.R18は、アリールである、実施形態127~150のいずれか1つの化合物。
155.R18は、フェニルである、実施形態127~150のいずれか1つの化合物。
156.R18は、二環である、実施形態127~150のいずれか1つの化合物。
157.標的化リガンドが図中の構造から選択され、ここで、標的化リガンドは、1個、2個、3個、又は4個のR40置換基で任意に置換されている、実施形態1~156のいずれか1つの化合物。
158.実施形態1~157のいずれか1つの化合物又はその薬学的に許容可能な塩と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
159.治療を必要とする患者における標的タンパク質によって媒介されない障害を治療する方法であって、有効量の実施形態1~157のいずれか1つの化合物又は実施形態158の医薬組成物を投与することを含む、方法。
160.治療を必要とする患者における標的タンパク質によって媒介される障害を治療する方法であって、有効量の実施形態1~157のいずれか1つの化合物又は実施形態158の医薬組成物を投与することを含む、方法。
161.治療を必要とする患者における標的タンパク質によって媒介される障害を治療する方法であって、有効量の実施形態1~157のいずれか1つの化合物又は実施形態158の医薬組成物を投与することを含む、方法。
162.障害は、異常な細胞増殖である、実施形態159、160、又は161の方法。
163.障害は、神経変性障害である、実施形態159、160、又は161の方法。
164.障害は、免疫系障害である、実施形態159、160、又は161の方法。
165.患者は、ヒトである、実施形態159~164のいずれか1つの方法。
III.スペーサー
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000305
(式中、各R’は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、アリール、複素環、及びヘテロアリールから選択される)から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000306
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、価数が許せば、任意に1以上の不飽和度を有する炭素数1~5の長さの直鎖状アルキル鎖から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000307
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、R’から選択される1個又は2個の置換基で任意に置換された複素環基である。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、1個又は2個の窒素原子を有する6員の複素環基である。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、1個又は2個の酸素原子を有する6員の複素環基である。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000308
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000309
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000310
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000311
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000312
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000313

から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000314
Figure 2023545507000315
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000316
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000317
から選択される。
或る特定の実施形態において、スペーサーは、
Figure 2023545507000318
から選択される。
スペーサーの或る特定の実施形態において、上の図中の左側の結合がリンカーに接続されている。
スペーサーの他の実施形態において、上の図中の右側の結合がリンカーに接続されている。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、
Figure 2023545507000319
から選択される。
本明細書の構造において、2つの縮合環のうちの1つで結合が浮いている場合に、この結合は、価数によって許容される場合に、いずれかの環上の任意の適切な位置に取り付けられ得る。例えば、
Figure 2023545507000320
の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000321
の両方が挙げられる。
IV.リンカー
リンカーが式I、式II又は式IIIの化合物に含まれる。リンカーは、E3リガーゼ結合部分を標的化リガンドに取り付けさせる化学的に安定した二価の基である。本発明によると、本明細書に記載される任意の所望のリンカーは、得られる化合物が薬学的に許容可能な剤形の一部として、少なくとも2ヶ月、3ヶ月、6ヶ月又は1年間の安定した貯蔵寿命を有し、それ自体が薬学的に許容可能である限りにおいて使用することができる。
本明細書に記載されるリンカーは、いずれの方向でも使用することができ、すなわち、左端がスペーサー部分、右端が標的化リガンドに連結するか、又は左端が標的化リガンドに連結し、右端がスペーサー部分に連結する。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個若しくは20個、又はそれ以上の炭素原子の鎖を有し、そのうち1つ以上の炭素がO、N、S又はP等のヘテロ原子に置き換えられていてもよい。
或る特定の実施形態においては、鎖は、鎖中に2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個又は20個の連続した原子を有する。例えば、鎖は、連続していても、部分的に連続していても、又は不連続であってもよい1つ以上のエチレングリコール単位(例えば、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個又は12個のエチレングリコール単位)を含み得る。
或る特定の実施形態においては、鎖は、独立してアルキル、アリール、ヘテロアリール、アルケニル若しくはアルキニル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、シクロアルキル又は複素環置換基であり得る分岐を有していてもよい少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ又は8つの連続した鎖を有する。
他の実施形態においては、リンカーは、エチレングリコール、プロピレングリコール、乳酸及び/又はグリコール酸の1つ以上を含むか又はそれから構成されていてもよい。一般的には、プロピレングリコールは疎水性を加え、一方でプロピレングリコールは親水性を加える。乳酸セグメントは、グリコール酸セグメントよりも長い半減期を有する傾向がある。ブロック及びランダム乳酸-コ-グリコール酸部分、並びにエチレングリコール及びプロピレングリコールは、薬学的に許容可能であることが当該技術分野において知られており、所望の半減期及び親水性を得るために修飾又は配置することができる。或る特定の態様において、これらの単位には、適切な薬物特性を達成するために、所望に応じてアルキル、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキルを含む脂肪族等の他の部分が隣接又は散在していてもよい。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000322
から選択される。
一態様においては、リンカーは、式LI、式LII、式LIII、式LIV、式LV、式LVI、式LVII、式LVIII、式IX及び式LX:
Figure 2023545507000323
の部分からなる群から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000324
から選択される。
一態様においては、リンカーは、式LDI、式LDII、式LDIII、式LDIV、式LDV、式LDVI、及び式LDVII:
Figure 2023545507000325
(式中、全ての可変部は、本明細書において記載されるものである)の部分からなる群から選択される。
以下は、本発明において使用することができるリンカーの非限定的な例である。この精緻化に基づき、当業者は、本発明の目的を達成するリンカーの全範囲を使用する方法を理解する。
リンカーの非限定的な例としては、
Figure 2023545507000326
が挙げられる。
リンカーの非限定的な例としては、
Figure 2023545507000327
が挙げられる。
或る特定の実施形態においては、Xが標的化リガンドに取り付けられる。別の実施形態においては、Xが標的化リガンドに取り付けられる。
20、R21、R22、R23及びR24の部分の非限定的な例としては、
Figure 2023545507000328
が挙げられる。
20、R21、R22、R23及びR24の部分の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000329
が挙げられる。
20、R21、R22、R23及びR24の部分の付加的な非限定的な例としては、
Figure 2023545507000330
が挙げられる。
付加的な実施形態においては、リンカー部分は、少なくとも1個、少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、少なくとも5個、少なくとも6個、少なくとも7個、少なくとも8個、少なくとも9個、少なくとも10個のエチレングリコール単位を有する任意に置換された(ポリ)エチレングリコール、又は任意に置換されたO、N、S、P若しくはSi原子が散在する任意に置換されたアルキル基である。
或る特定の実施形態においては、リンカーには、アリール、フェニル、ベンジル、アルキル、アルキレン又は複素環基が隣接、置換又は散在していてもよい。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、非対称であっても又は対称であってもよい。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、非線形鎖であってもよく、脂肪族又は芳香族又は複素芳香族環状部分であっても又はそれを含んでいてもよい。
本明細書に記載される化合物の実施形態のいずれにおいても、リンカー基は、本明細書に記載される任意の好適な部分であり得る。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000331
からなる群から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000332
からなる群から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000333
からなる群から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000334
からなる群から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000335
からなる群から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000336
から選択される。
或る特定の実施形態においては、リンカーは、
Figure 2023545507000337
から選択される。
或る特定の実施形態においては、上に描かれたリンカーの右の結合が標的化リガンドに取り付けられる。或る特定の実施形態においては、上に描かれたリンカーの左の結合が標的化リガンドに取り付けられる。
V.標的タンパク質
細胞性タンパク質の分解は、細胞の恒常性、並びに増殖、分化、及び細胞死等の正常な細胞機能に必要とされる。このシステムが機能不全になるか、又はin vivoで異常なタンパク質の挙動を特定して減らさないと、ヒト等の宿主において疾患状態が発生する可能性がある。当業者には十分に知られ、文献及び特許出願において公開され、科学プレゼンテーションにおいて提示されているように、広範囲のタンパク質が機能不全になって、in vivoで疾患を引き起こすか、調節するか、又は増幅する可能性がある。
したがって、或る特定の実施形態において、本発明の選択された三環式セレブロン結合性ヘテロ二官能性デグレーダー化合物を、投与を必要とする宿主にin vivoで有効量にて投与して、治療される障害を媒介する選択されたタンパク質を触媒的に分解することができる。選択されたタンパク質標的は、生物学的経路の改変、病原性シグナル伝達、又はシグナルカスケード若しくは細胞侵入の調節等の作用機序を介して、ヒトにおける障害を調節し得る。そのタンパク質は、突然変異されているか、改変されているか、又は過剰発現されている場合がある。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、阻害することができ又は別の手段で結合することができる結合ポケット又は活性部位を有さず、容易にアロステリック制御することができないという点で、古典的な感覚では創薬可能ではないタンパク質である。別の実施形態において、標的タンパク質は、古典的な感覚では創薬可能であるタンパク質であるが、治療目的では、タンパク質の分解は阻害よりも好ましい。
本発明の三環式化合物による分解の標的となり得る標的タンパク質の具体的な例とともに、分解の原理としては、限定されるものではないが、以下のものが挙げられる:
CK1αは、リン酸化基質としてカゼイン等の酸性タンパク質を利用するカゼインキナーゼである。CK1AはWntシグナル伝達に関与し、その過剰発現は癌における生存率不良と相関している。
GSPT1(G1期からS期への移行1(G1 to S phase transition 1))は、翻訳終結因子である。GSPT1はBIRC2と相互作用し、タンパク質分解的にプロセシングされてIAP結合タンパク質となる。GSPT1は、胃部癌を含む癌組織において発現される。
STATタンパク質は、様々な細胞外シグナル伝達タンパク質によって活性化され得る細胞質転写因子である。Statタンパク質は、制御不能な細胞増殖、抗アポトーシス応答、及び/又は血管新生に関与する様々な遺伝子を上方調節することが明らかになっている。
SALL4(Spalt様転写因子4)は、デュアン-橈側列症候群及びIvic症候群等の発達症候群及び発達異常に関連する発達転写因子である。
ZBTB16(ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有16)としても知られるPLZF(前骨髄球性白血病ジンクフィンガー)は、細胞増殖、分化、器官の発達、細胞維持、及び免疫細胞の発達を調節する転写因子である。PLZFは一部の癌においては腫瘍抑制因子として作用するが、PLZFは実際には、腎細胞癌、神経膠芽腫、及び精巣癌等の或る特定の癌における癌タンパク質である。
p63(腫瘍タンパク質p63)は、細胞増殖、アポトーシス、分化、更には老化に関与する多面的タンパク質である。p63には幾つかのアイソフォームが存在する。p63の一部の形態は腫瘍を抑制するが、その他の形態及び突然変異体は癌転移を促進する。
NRASは小さなGTP結合性タンパク質であり、その発癌性活性化突然変異は腫瘍形成を誘導する。NRAS突然変異は、例えば、黒色腫及び甲状腺癌において見られ、Q61K及びQ61Rで発生することもある。
BRD9(ブロモドメイン含有タンパク質9)は、SWI/SNF(BAF)クロマチンリモデリング複合体の構成部分である。BRD9における突然変異は幾つかの癌に関連付けられており、ネイティブなBRD9でさえ過剰発現すると発癌性となる可能性がある。BRD9に関連する癌としては、子宮頸癌、非小細胞肺癌、及び肝臓癌が挙げられる。
P13KCAは、限定されるものではないが、乳癌、子宮内膜癌、頭頸部扁平上皮癌、及び肺扁平上皮癌を含む多岐にわたるヒトの癌にわたって最も一般的に突然変異している癌遺伝子の1つであるキナーゼである。突然変異は、例えば、H1047R、E545K、E542Kであり、PI3K-AKT-mTOR経路の異常な活性化につながることもある。
RET(RET癌原遺伝子)は、細胞膜にまたがる、細胞の環境と相互作用するタンパク質である。RETは成長因子に結合し、細胞内で化学反応の複雑なカスケードのトリガとなる。RET媒介性障害の非限定的な例としては、無症候性傍神経節腫、ヒルシュスプルング病、多発性内分泌腫瘍症、肺癌、及び他の癌が挙げられる。
RIT1は小さなGTP結合タンパク質であり、これは、癌、例えば、ヌーナン症候群(RASオパシー)、肺癌、及びヘム悪性腫瘍における活性化突然変異である。
MCL1はBCL2ファミリーのメンバーであり、アポトーシスの調節因子である。MCL1に関連する疾患としては、骨髄性白血病及びクラミジアが挙げられる。
ARID1Bは、ATリッチな相互作用ドメイン含有タンパク質1である。ARID1Bは、SW1/SNF複合体の構成要素であり、非特異的にDNAに結合する。これは、ARID1A突然変異癌細胞系統に特異的な上位の依存性である。ARID1A欠損癌は、限定されるものではないが、卵巣明細胞癌を含む或る特定の腫瘍を高いパーセンテージで含む。
P300(ヒストンアセチルトランスフェラーゼp300又はp300 HAT)は、DNAへのヒストンの巻き付きを媒介することによりクロマチンリモデリングを介して遺伝子の転写を調節する酵素である。結果として、P300は細胞成長及び細胞分裂において極めて重要な役割を果たす。P300の突然変異は、結腸癌、胃癌、乳癌、及び膵臓癌を含む様々な種類の癌を引き起こす可能性がある。
ARID2は、ポリブロモ関連BAF(PBAF)クロマチンリモデリング複合体の構成要素である。
FAM38(PIEZO1としても知られる)は、非特異的なカチオンチャネルの孔形成サブユニットである。カチオンチャネルサブユニットとして、FAM38は小胞体へのR-Rasの動員に関与している。FAM38の損失は、小細胞肺癌系統においてメタセシス(metathesis)を引き起こすことが明らかになっている。
ヒストンメチルトランスフェラーゼ(「HMT」)遺伝子クラスに属するNSD2は、例えば、多発性骨髄腫、ALL、CLL、及びMCLの発癌性融合転写物によって過剰発現される。
CSKは、細胞成長、分化、遊走、及び免疫応答の調節に関与する非受容体型チロシンプロテインキナーゼである。
CBLBは、E2ユビキチンコンジュゲート酵素からユビキチンを受け取り、それを基質に移して分解するE3ユビキチン-タンパク質リガーゼである。
EGFR(上皮成長因子受容体)はチロシンキナーゼ受容体である。EGFRは、結腸直腸癌、腺癌(肺の腺癌を含む)、神経膠芽腫、及び頭頸部の上皮性腫瘍を含む幾つかの上皮性悪性腫瘍の進行に関連している。さらに、EGFRは、微生物感染又はHCV等のウイルスの侵入についての受容体として使用され得る。
WRNはRecQ DNAヘリカーゼである。WRN損失は、MSI(マイクロサテライト不安定性)細胞においてはDNA損傷につながるが、MSS(マイクロサテライト安定性)細胞においてはDNA損傷につながらない。これは、MSI細胞において優先的に細胞死及び細胞周期停止を促進するDSB応答につながる可能性がある。
NTRK及びその遺伝子融合物(NTRK1遺伝子融合物、NTRK2遺伝子融合物、及びNTRK3遺伝子融合物を含む)は、幾つかの成人癌及び小児癌についての癌遺伝子である。NTRK融合物は、分泌性乳癌、乳腺相似分泌癌、及び乳児型線維肉腫等のまれな癌の主要な原因である。NTRK融合物は同様にまた、より一般的な癌を引き起こす可能性もある。
ADARはRNA特異的アデノシンデアミナーゼである。IFN誘導性(ISG)シグネチャー陽性の癌細胞は、ISGでもあるdsRNA編集酵素であるADARの損失を受けやすい。慢性的なシグナル伝達をもたらす腫瘍由来のIFNはdsRNAの蓄積に応答するプライム型の細胞状態を引き起こし、ISG陽性腫瘍がADAR損失を受けやすくする。ADAR1の損失は、抗原提示の不活性化によって引き起こされるPD-1チェックポイント遮断に対する耐性を克服する。
SOS1はKRASの活性型の生成を促進するため、遮断するとKRASの上流又は突然変異体の活性化を打ち消すことができる。
KRASは、細胞外シグナルを細胞核に中継するRAS/MAPK経路内のタンパク質であるK-Rasをコードする遺伝子である。これらのシグナルは、増殖又は分化のいずれかをもたらす。K-Rasは、分子のオンオフスイッチのように機能するGTPに結合するとシグナルを送る。KRAS突然変異は、盲腸癌において頻繁に観察される。K-Rasは、結腸直腸癌及び肺癌を含む幾つかの癌に関与している。
WDR5は、WDリピートタンパク質ファミリーのメンバーである。WDリピートは、gly-his及びtrp-aspによって囲まれた40アミノ酸の最小保存領域である。WDR5は宿主細胞因子C1、MLLと相互作用し、MYC動員の重要な決定要因である。WD5は混合形質型白血病に関与している。
ALKのキナーゼドメインが様々なタンパク質のアミノ末端部分に融合されたEML-ALK及びALKの融合タンパク質等のALK融合物を含むALKは、限定されるものではないが、ALCL、IMT、DLBCL、NSCLC、RMC、RCC、乳癌、結腸癌、漿液性卵巣癌(SOC)、及び食道扁平上皮癌(ESCC)を含む多くの癌において報告されている。
PTPN2はCD8T細胞亜集団を調節し、腫瘍免疫に影響を与える。
CTNNB1(β-カテニン)は、Wntシグナル伝達経路の部分として細胞シグナル伝達に関与している。この経路内のタンパク質はCTNNB1に取り付き、核へのタンパク質移動のトリガとなる。CTNNB1は、デスモイド腫瘍、毛母腫、ウィルムス腫瘍、アルドステロン産生腺腫、卵巣癌、及びその他の癌に関連している。
FGFR1、FGFR3、又はFGFR4(及び融合物)を含むFGFRは、扁平上皮NSCLC、乳癌、卵巣癌、膀胱癌、胃部癌、及び子宮内膜癌を含む多数の癌において増幅される受容体チロシンキナーゼである。
ROS1は、多岐にわたる腫瘍細胞において高度に発現される癌原遺伝子受容体チロシンキナーゼである。
MYD88(骨髄分化一次応答88)は、免疫細胞におけるシグナル伝達に関与するタンパク質を作る指示を出し、癌細胞においてその突然変異が見られる。
HER2(ヒト上皮成長因子受容体2)は、乳房細胞の外側にある成長促進タンパク質である。HER2陰性の乳癌細胞であってもHER2を有するが、正常レベルを超えるHER2を有する乳癌細胞はHER2陽性と呼ばれる。HER2は、乳癌の治療において非常に重要な遺伝子である。乳癌のおよそ5つに1つは、癌細胞の成長につながるHER2遺伝子の余分なコピーを有している。
TBXTは、多数の癌において過剰発現した転写因子であり、腫瘍の悪性度及び攻撃性と相関している。
PTP4A3(PRL3)はタンパク質チロシンホスファターゼIVA3であり、細胞シグナル伝達に関与し、過剰発現により細胞成長が引き起こされるプレニル化ホスファターゼである。
MET(エキソン14スキッピング突然変異を含む)は、受容体チロシンキナーゼであり、選択的スプライシングされたMET受容体は、ユビキチン化の減少及び下方調節の遅延を示すことから、MET及びMAPキナーゼの長期にわたる活性化をもたらし、形質転換する可能性がある。
USP7は、前立腺癌、肺癌、脳癌、結腸癌、乳癌、及びその他の癌に関与する脱ユビキチン化酵素である。
NRF2(NFE2L2)は、細胞保護作用のある抗酸化タンパク質の発現を調節する基本的なロイシンジッパータンパク質であり、突然変異又は活性化は癌を促進する可能性がある。
SF3B1は、RNAユニットのスプライシングに関与する遺伝子である。SF3B1は、RNAスプライシング、mRNAスプライシングマイナー経路、及びアンドロゲン受容体のPKN1活性化刺激に関与している。SF3B1に対する突然変異は、様々な癌に関連している。
Ikarosファミリーのタンパク質(IKZF1、IKZF2、IKZF3、IKZF4、又はIKZF5)のいずれか。IKZF2(Helios)及びIKZF4(Eos)は、Treg細胞において選択的に発現されるが、エフェクター細胞又は記憶細胞においては発現されない。FoxP/IKZF4/CtBP1は、Tregにおける遺伝子発現(IL-2、IFN-γ)を抑制し、その抑制シグネチャーを維持する阻害性複合体を形成する。TregにおいてIKZF4をノックダウンすると、免疫応答を抑制する細胞の能力が無効になり、部分的なエフェクター機能が有効になる。IKZF2は、IKZF4とは異なるメカニズムを介してTreg分化を調節する。FoxPを発現するTregにおけるIKZF2のノックアウトは、阻害特性の喪失(IL-2の増加を伴う)及びSTAT5(FoxPを調節する)を介したTエフェクターサイトカインの発現を促進する。
MEN1は、多発性内分泌腫瘍症1型(MEN-1症候群)に関連する推定腫瘍抑制因子である。MEN1は常染色体優性遺伝性障害であり、その罹患者は副甲状腺、脳下垂体前葉、及び腸膵臓内分泌組織において様々な腫瘍を発症する。
JCVタンパク質は、JCウイルスゲノムによってコードされている。免疫系が弱まっている人においては、JCウイルスが進行性多発性白質脳症(PML)と呼ばれる重篤な脳感染症を引き起こす可能性がある。PMLは神経細胞の外膜を損傷する。これは、永続的な障害を引き起こす可能性があり、致命的になる可能性さえある。JCウイルスのゲノムは、ラージ腫瘍抗原及びスモール腫瘍抗原、アグノプロテイン、並びにカプシドタンパク質VP1~VP3をコードしている。カプシドタンパク質は、細胞侵入に関与し、アグノプロテインはビリオンの成熟に関与する。
CYP17A1及びCYP20A1はヘムタンパク質であり、シトクロムP450ファミリーのメンバーである。シトクロムP450タンパク質は、薬物代謝並びにコレステロール、ステロイド、及びその他の脂質の合成に関与する多くの反応を触媒するモノオキシゲナーゼである。多くのP450は薬物代謝に重要な酵素であり、その他のP450は内因性基質を代謝することによって生理学的な役割を果たす。例えば、CYP17A1は主に内分泌作用及びステロイドホルモン代謝に関連しており、突然変異はまれな形態の先天性副腎過形成症、具体的には17α-ヒドロキシラーゼ欠損症/17,20-リアーゼ欠損症及び単独17,20-リアーゼ欠損症に関連している。CYP20A1は、脳及び肝臓において発現されるヒトにおけるオーファンアイソフォーム(orphan isoform)である。
BKVタンパク質は、BKウイルスゲノムによってコードされている。ヒトポリオーマウイルスBK(BKV)は、世界中でヒトに感染し、腎臓において持続的な感染を確立する。BKウイルスのゲノムは、3つの調節タンパク質と、ラージ腫瘍抗原及びスモール腫瘍抗原と、アグノプロテインと、カプシドタンパク質VP1~VP3とをコードしている。アグノプロテインは、ウイルス複製を調節し、ウイルスが細胞に侵入したら宿主細胞のプロセスを混乱させるのに役立つ。
MEK1/2は、多岐にわたる細胞外シグナルに応答して、増殖、分化、及び細胞周期進行等の様々な細胞プロセスを調節するシグナル伝達カスケードであるRas/Raf/MEK/ERK経路に関与する細胞外シグナル制御キナーゼである。この経路における過剰活性化又は突然変異は多くの癌に関連付けられており、MEKの阻害は細胞増殖を遮断することから、アポトーシスがもたらされる。例えば、β3-αCループMEK1突然変異体は強い発癌能を示すが、臨床療法又は臨床試験においてMEK阻害剤に対して異なる感受性を示す。
アタキシン2はLike-Sm(LSm)タンパク質ファミリーのメンバーであり、RNAプロセシング及びRNA代謝に関連する多数の機能に関与している。ATXN2における突然変異は、神経変性疾患である脊髄小脳失調症2型(SCA2)を引き起こす。
JAK2は非受容体型チロシンキナーゼであり、ヤヌスキナーゼファミリーのメンバーである。JAK2は、II型サイトカイン受容体ファミリー、GM-CSF受容体ファミリー、gp130受容体ファミリー、及び単鎖受容体のメンバーによるシグナル伝達に関与している。JAK2遺伝子とTEL(ETV6)遺伝子との融合物(TEL-JAK2)及びPCM1遺伝子との融合物は、白血病を患う患者において見つかっており、JAK2における突然変異は、真性多血症、本態性血小板血症、及び骨髄線維症、並びにその他の骨髄増殖性疾患に関与している。
PTPN11(SHP2)は、RTKシグナル伝達のメディエーターとして機能する非受容体型チロシンホスファターゼである。AML、JMML、及び神経芽細胞腫に見られる反復突然変異を伴う癌において、過剰発現が観察されており、SHP2の喪失又は阻害は、AML又はその他のRTK誘導型癌の増殖を抑制することが明らかになっている。
ERK1/ERK2は、多岐にわたる細胞外シグナルに応答して、増殖、分化、及び細胞周期進行等の様々な細胞プロセスを調節するシグナル伝達カスケードであるRas/Raf/MEK/ERK経路に関与する細胞外シグナル制御キナーゼである。この経路の過剰活性化は、多くの癌に関連付けられている。
BRAFのII型突然変異体は、「BRAF融合突然変異体を含む600以外のコドンを含む高い又は中程度のBRAFキナーゼ活性を有する構成的活性RAS非依存性二量体」として分類されるBRAF突然変異である。II型突然変異体を有する患者は、典型的には、I型突然変異体を有する患者よりも短い生存期間を有し、癌はより攻撃性となる可能性がある。
ERBB3は、癌との強い遺伝的つながりを有する膜貫通型の疑似RTKである。
GRB2は、MAPKを含む下流経路へのRTKシグナル伝達に関与する足場アダプターである。GRB2は、多岐にわたるシグナル伝達分子を受容体に動員して、増殖及び浸潤等の細胞応答をもたらす多量体シグナル伝達複合体を形成するため、癌及び腫瘍形成に関連付けられている。
CBP(CREBBP)は、多くの異なる転写因子の転写共活性化に関与する転写コアクチベーターであるため、DNA修復、細胞成長、分化、及びアポトーシス等の幅広い細胞活動に関与している。CBP(CREBBP)は、白血病、NSCLC、HCV関連肝細胞癌、黒色腫、肺癌、リンパ腫、及び膀胱癌を含む様々な癌に関連している。
ATAD2はブロモ/ATPヘリカーゼであり、これは、エストラジオール標的遺伝子のサブセットを誘導するのに必要とされる核内受容体ESR1の転写コアクチベーターとなり得て、トリプルネガティブ乳癌に関与し得る。
BAP1は、癌における腫瘍抑制因子及び転移抑制因子として機能し得る脱ユビキチン化酵素である。発癌における遺伝子環境相互作用を調節するBAP1の能力は、核及び細胞質におけるその二重の役割に関連付けられている。核内では、BAP1は幾つかの遺伝子プログラムの転写調節を調整し、相同組換えを促進することによってDNA修復を促進する。BAP1は、PBRM1欠損CRCにおいて見られる。
BRPF1は、H3に対するHAT活性を有するMoz及びMorfと関連するブロモドメイン含有ヒストンリーダーである。BRPF1は、白血病を含む造血器癌等の癌に関与する。
BRD4はエピジェネティックリーダーであり、BETタンパク質ファミリーのメンバーである。BRD4はアセチル化されたヒストンに結合し、細胞遺伝子転写及び細胞増殖の制御において中心的な役割を担うため、血管新生並びに炎症関連疾患、心血管疾患、中枢神経系障害、及び癌の発症に重要である。
EPAS1(HIF2a)は、酸素濃度に対する生理学的応答に関与する転写因子のグループに属し、低酸素条件下でコードされる。EPAS1(HIF2a)は、心臓の発達においても重要であり、心臓の保護に必要とされるカテコールアミンのバランスを維持するのにも重要である。突然変異は、傍神経節腫、ソマトスタチノーマ、及び/又は褐色細胞腫等の神経内分泌腫瘍を引き起こすことが多い。
KMT2Dは、癌との強い遺伝的つながりを有するヒストンメチルトランスフェラーゼである。このタンパク質は、転写エンハンサー上の系統決定的転写因子と共局在し、細胞分化及び胚発生に不可欠である。KMT2Dはまた、細胞運命遷移、代謝、及び腫瘍抑制の調節において重要な役割を担う。
メニンは、KMT2A(MLL)及びMLL融合タンパク質のN末端に二座で結合する足場タンパク質であり、クロマチンへの結合及び局在化を可能にし、白血病及びその他の癌に関連付けられる。
MLLT1(ENL)はYEATSドメイン含有タンパク質であり、転写開始/伸長(YEATSドメイン依存的)に関与し、DOT1Lとの重要な相互作用因子の役割を担う。
DOT1Lは、進化的に保存されたメチル化マークであるヒストンH3のリジン79をメチル化するヒストンH3K79メチルトランスフェラーゼである。DOT1Lは、遺伝子発現からDNA損傷応答及び細胞周期進行に至る多くの主要なプロセスに関与している。DOT1Lは、混合形質型白血病(MLL)再構成白血病の発症にも関与している。
NSD2は、発生初期に遍在的に発現され、ALL、CLL、及びMCLを含む癌細胞において過剰発現されるヒストンメチルトランスフェラーゼである。
TAUは、遺伝子MAPT(微小管関連タンパク質タウ)から選択的スプライシングによって生成される6つの高溶解性タンパク質アイソフォームである。TAUタンパク質は、主に軸索における微小管の安定性を維持する役割を担い、中枢神経系(CNS)のニューロンにおいて豊富に存在する。アルツハイマー病及びパーキンソン病等の神経系の病状及び認知症は、神経原線維変化と呼ばれる過剰リン酸化された不溶性凝集体になったタウタンパク質に関連している。
HTTはハンチントンタンパク質である。HTTは発生に不可欠であり、ニューロン及び精巣において高度に発現される。ハンチンチンは脳由来神経栄養因子(BDNF)の発現を転写レベルで上方調節し、その突然変異型はハンチントン病を引き起こす。
NSD3はヒストンメチルトランスフェラーゼであり、扁平上皮肺癌、乳癌、及びAMLを含む癌に見られる8p11-12増幅のドライバーである。
SNCAはシヌクレインファミリーのメンバーであり、ドーパミンの放出及び輸送の調節、微小管関連タンパク質タウの線維化、並びに非ドーパミン作動性ニューロンにおける神経保護表現型に関与している。SNCAの突然変異は、パーキンソン病、アルツハイマー病(AD)、レビー小体病(LBD)、及び筋系萎縮症(MSA)等の神経変性疾患に関連している。
SMARCA2及びSMARCA4は、SWI/SNFファミリーのタンパク質によってコードされるタンパク質であり、ヘリカーゼ及びATPアーゼの活性を有し、ATP依存性クロマチンリモデラーとしてクロマチン構造を変更することによって遺伝子の転写を調節する。
BTKは、多くのB細胞悪性腫瘍における白血病細胞の増殖及び生存に重要な発癌性シグナル伝達において重要な役割を担うチロシンキナーゼである。BTKは当初、原発性免疫不全症X連鎖無ガンマグロブリン血症(XLA)において突然変異していることが明らかにされ、Bリンパ球の発達の様々な段階で不可欠である。
TAF1は、キナーゼドメイン、アセチルトランスフェラーゼ、及びブロモドメインを有するTBP関連因子である。TAF1は、転写開始の間に極めて重要な機能を果たす転写因子II D複合体の重要な構成要素である。TAF1遺伝子の変異体は、知的障害を含む神経発達障害に関連している。
IRAK4は、Toll様受容体(TLR)からの自然免疫応答のシグナル伝達に関与するトレオニン/セリンプロテインキナーゼである。IRAK4又はその固有のキナーゼ活性が失われると、TLR経路を介したシグナル伝達が完全に停止する可能性がある。したがって、IRAK4は、関節リウマチ、炎症性腸疾患、及びその他の自己免疫疾患を含む様々な炎症性障害に関連している。
SARM1は、Toll様受容体活性化転写プログラムの負の調節因子である。軸索損傷後に、SARM1は「自己破壊」メカニズムを開始して、代謝産物NADを分解する。これはニューロンにおいて代謝不全を引き起こし、軸索変性をもたらす。
PPM1D(WIP1)は癌タンパク質であり、Ser/Thrタンパク質ホスファターゼのPP2Cファミリーのメンバーである。PPM1Dは、細胞ストレス応答経路の負の制御因子であり、乳癌、食道癌、結腸癌、血液癌、甲状腺癌、肉腫、肺癌、卵巣癌を含む様々な癌において増幅される。
幾つかの実施形態において、コロナウイルスタンパク質が分解される。幾つかの実施形態において、コロナウイルスタンパク質は、ベータコロナウイルスタンパク質である。幾つかの実施形態において、コロナウイルスタンパク質は、重症急性呼吸器症候群(SARS)-CoVタンパク質、中東呼吸器症候群(MERS)-CoVタンパク質、又はSARS-CoV-2タンパク質である。幾つかの実施形態において、標的タンパク質は、SARS-CoV-2タンパク質である。幾つかの実施形態において、SARS-CoV2タンパク質は、スパイク(S)タンパク質(アクセッション番号BCA87361.1)、膜(M)タンパク質(アクセッション番号BCA87364.1)、エンベロープ(E)タンパク質(アクセッション番号BCA87363.1)、若しくはヌクレオカプシドリンタンパク質(N)タンパク質(アクセッション番号BCA87368.1)、又はそれらと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、若しくは98%相同の配列、又はそれらのホモログ、突然変異体、コンジュゲート、誘導体、断片、若しくはオルソログから選択される構造タンパク質から選択される。幾つかの実施形態において、SARS-CoV2タンパク質は、nsp1(リーダータンパク質)(アクセッション番号YP_009725297.1)、nsp2(アクセッション番号YP_009725298.1)、nsp3(パパイン様プロテイナーゼ)(アクセッション番号YP_009725299.1)、nsp4(アクセッション番号YP_009725300.1)、nsp5(3C様プロテイナーゼ)(アクセッション番号YP_009725301.1)、nsp6(推定膜貫通ドメイン)(アクセッション番号YP_009725302.1)、nsp7(アクセッション番号YP_009725303.1)、nsp8(プライマーゼ)(アクセッション番号YP_009725304.1)、nsp9(アクセッション番号YP_009725305.1)、nsp10(アクセッション番号YP_009725306.1)、nsp11(アクセッション番号YP_009725312.1)、nsp12(RNA依存性RNAポリメラーゼ)(アクセッション番号YP_009725307.1)、nsp13(ヘリカーゼ)(アクセッション番号YP_009725308.1)、nsp14(3’-5’エキソヌクレアーゼ、グアニンN7-メチルトランスフェラーゼ)(アクセッション番号YP_009725309.1)、nsp15(エンドRNアーゼ)(アクセッション番号YP_009725310.1)、若しくはnsp16(2’-O-リボース-メチルトランスフェラーゼ)(アクセッション番号YP_009725311.1)、又はそれらと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、若しくは98%相同の配列、又はそれらのホモログ、突然変異体、コンジュゲート、誘導体、断片、若しくはオルソログを含む、非構造タンパク質である。幾つかの実施形態において、SARS-CoV2タンパク質は、ORF3aタンパク質(アクセッション番号BCA87362.1)、ORF6タンパク質(アクセサリータンパク質6)(アクセッション番号BCA87365.1)、ORF7aタンパク質(アクセサリータンパク質7a)(アクセッション番号BCA87366.1)、ORF7bタンパク質(アクセサリータンパク質7b)(アクセッション番号BCB15096.1)、ORF8タンパク質(アクセッション番号QJA17759.1)、ORF9bタンパク質(アクセサリータンパク質9b)(UniprotKB-P0DTD2)、若しくはORF10タンパク質(アクセッション番号BCA87369.1)、又はそれらと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、若しくは98%相同の配列、又はそれらのホモログ、突然変異体、コンジュゲート、誘導体、断片、若しくはオルソログから選択される。幾つかの実施形態において、SARS-CoV2タンパク質は、NCBI参照配列:NC_045512.2のヌクレオチド25814~25880によってコードされるORF3bタンパク質(Konno et al.著の「SARS-CoV-2のORF3bは、強力なインターフェロンアンタゴニストであり、その活性は天然に存在する伸長変異体によって高められる(SARS-CoV-2 ORF3b Is a Potent Interferon Antagonist Whose Activity Is Increased by a Naturally Occurring Elongation Variant.)」Cell Reports, Volume 32, Issue 12, 22 September 2020, 108185を参照のこと)、又はそれらと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、若しくは98%相同の配列、又はそれらのホモログ、突然変異体、コンジュゲート、誘導体、断片、若しくはオルソログである。
他の実施形態において、標的タンパク質は、コロナウイルス以外のウイルスのウイルスタンパク質、例えば、プロテアーゼ、ポリメラーゼ、エキソヌクレアーゼ、ヘリカーゼ、グリコシルトランスフェラーゼ、エステラーゼ、インテグラーゼ、逆転写酵素、キナーゼ、プライマーゼ、プロテイナーゼ、メチルトランスフェラーゼ、又はヌクレオチダーゼである。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物を使用して、コロナウイルス変異体、例えばアルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、イプシロン、イータ、イオタ、カッパ、ミュー、及びゼータから選択されるSARS-CoV-2変異体を治療する。SARS-CoV-2のアルファ変異体の非限定的な例としては、B.1.1.7及びQ.1~Q.8が挙げられる。SARS-CoV-2のベータ変異体の非限定的な例としては、B.1.351、B.1.351.2、及びB.1.351.3が挙げられる。SARS-CoV-2のガンマ変異体の非限定的な例としては、P.1、P.1.1、及びP.1.2が挙げられる。SARS-CoV-2のデルタ変異体の非限定的な例としては、B.1.617.2及びAY.1が挙げられる。SARS-CoV-2のイプシロン変異体の非限定的な例としては、B.1.427及びB.1.429が挙げられる。SARS-CoV-2のイータ変異体の非限定的な例としては、B.1.525が挙げられる。SARS-CoV-2のイオタ変異体の非限定的な例としては、B.1.526が挙げられる。SARS-CoV-2のカッパ変異体の非限定的な例としては、B.1.617.1が挙げられる。SARS-CoV-2のミュー変異体の非限定的な例としては、B.1.621及びB.1.621.1が挙げられる。SARS-CoV-2のゼータ変異体の非限定的な例としては、P.2が挙げられる。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物を使用して、SARS-CoV-2以外のコロナウイルスを治療する。コロナウイルスの追加の例としては、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス(SARS-CoV)、コウモリSARS様コロナウイルスWIV1(コウモリSL-CoV-WIVl)、アルファコロナウイルス229E(HCoV-229E)、ニューヘイブンコロナウイルスNL63(HCoV-NL63)、ベータコロナウイルスOC43(HCoV-OC43)、コロナウイルスHKIJ I(HCoV-HKUl)、及び中東呼吸器症候群コロナウイルス(MERS-CoV)が挙げられる。
主要な位置にグリシンを含むβ-ヘアピンターンを有する或る特定のタンパク質(「g-ループタンパク質」又は「g-ループデグロン」)は、セレブロンがサリドマイド様分子(IMiD)ネオ基質タンパク質にも結合される場合に、セレブロンについての「構造的デグロン」として作用することが報告されている。このような「g-ループデグロン」含有タンパク質としては、一般に、αターンを有するβヘアピンを形成し、ターンの頂点に3つの骨格水素結合アクセプター(位置i、i+1、及びi+2)の幾何学的配置を有し、主要な位置(i+3)にグリシン残基を有する小さな逆平行βシートが挙げられる(例えば、Matyskiela, et al著の「新規のセレブロンモジュレーターは、GSPT1をCRL4-CRBNユビキチンリガーゼに動員する(A novel cereblon modulator recruits GSPT1 to the CRL4-CRBN ubiquitin ligase.)」 Nature 535, 252-257 (2016)、Sievers et al.著の「CRBNを介してサリドマイド類似体によって標的化されるヒトC2H2ジンクフィンガーデグロムの定義(Defining the human C2H2 zinc finger degrome targeted by thalidomide analogs through CRBN.)」 Science 362, eaat0572 (2018)を参照のこと)。これらのgループデグロンは、限定されるものではないが、Sal様4(SALL4)、GSPT1、IKFZ1、IKFZ3、及びCK1α、ZFP91、ZNF93等を含む多くのタンパク質において特定されている。
幾つかの実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、g-ループデグロンを含むタンパク質を分解することができ、ここで、タンパク質は、プロテインキナーゼ、C2H2含有ジンクフィンガータンパク質、RNA認識モチーフ含有タンパク質、ジンクβリボン含有タンパク質、βプロペラ含有タンパク質、PループNTPアーゼ含有タンパク質、リアリー・インタレスティング・ニュー・ジーン(really interesting new gene)(RING)フィンガードメイン含有タンパク質、SRCホモロジー3(SH3)ドメイン含有タンパク質、イムノグロブリンE-セットドメイン含有タンパク質、Tudorドメイン含有タンパク質、ジンクフィンガーFYVE/PHD型含有タンパク質、Ig様ドメイン含有タンパク質、ユビキチン様ドメイン含有タンパク質、コンカナバリン様ドメイン含有タンパク質、C1ドメイン含有タンパク質、プレクストリン相同(PH)ドメイン含有タンパク質、OBフォールドドメイン含有タンパク質、NADPロスマンフォールドドメイン含有タンパク質、アクチン様ATPアーゼドメイン含有タンパク質、及びヘリックス-ターン-ヘリックス(HTH)ドメイン含有タンパク質から選択される。幾つかの実施形態において、プロテインキナーゼ、C2H2含有ジンクフィンガータンパク質、RNA認識モチーフ含有タンパク質、ジンクβリボン含有タンパク質、βプロペラ含有タンパク質、PループNTPアーゼ含有タンパク質、リアリー・インタレスティング・ニュー・ジーン(RING)フィンガードメイン含有タンパク質、SRCホモロジー3(SH3)ドメイン含有タンパク質、イムノグロブリンE-セットドメイン含有タンパク質、Tudorドメイン含有タンパク質、ジンクフィンガーFYVE/PHD型含有タンパク質、Ig様ドメイン含有タンパク質、ユビキチン様ドメイン含有タンパク質、コンカナバリン様ドメイン含有タンパク質、C1ドメイン含有タンパク質、プレクストリン相同(PH)ドメイン含有タンパク質、OBフォールドドメイン含有タンパク質、NADPロスマンフォールドドメイン含有タンパク質、アクチン様ATPアーゼドメイン含有タンパク質、又はヘリックス-ターン-ヘリックス(HTH)ドメイン含有タンパク質は過剰発現されるか、又は機能獲得型突然変異を含む。幾つかの実施形態において、デグロンは、ASXモチーフ及びSTモチーフからの内部水素結合によって安定化される。
幾つかの実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、「g-ループデグロン」を有するタンパク質を分解することができ、ここで、「g-ループデグロン」は、[D/N]XX[S/T]Gモチーフ(配列番号1)を含み、式中、D=アスパラギン酸、N=アスパラギンであり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、S=セリン、T=トレオニン、G=グリシンである。或る特定の実施形態において、「g-ループデグロン」含有タンパク質は、DXXSG(配列番号2)のアミノ酸配列を含み、式中、D=アスパラギン酸であり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、S=セリン、G=グリシンである。別の実施形態において、「g-ループデグロン」含有タンパク質は、NXXSG(配列番号3)のアミノ酸配列を含み、式中、N=アスパラギンであり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、S=セリン、G=グリシンである。更に別の実施形態において、「g-ループデグロン」含有タンパク質は、DXXTG(配列番号4)のアミノ酸配列を含み、式中、D=アスパラギン酸であり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、T=トレオニン、G=グリシンである。また別の実施形態において、「g-ループデグロン」含有タンパク質は、NXXTG(配列番号5)のアミノ酸配列を含み、式中、N=アスパラギンであり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、T=トレオニン、G=グリシンである。幾つかの実施形態において、「g-ループデグロン」含有タンパク質は、CXXCG(配列番号6)のアミノ酸配列を含み、式中、C=システインであり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、G=グリシンである。或る特定の実施形態において、「g-ループデグロン」含有タンパク質は、NXXNG(配列番号7)のアミノ酸配列を含み、式中、N=アスパラギンであり、Xは任意のアミノ酸残基であり得て、G=グリシンである。
幾つかの実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、「g-ループデグロン」を含むC2H2ジンクフィンガードメインを有するタンパク質を分解することができる。幾つかの実施形態において、ジンクフィンガードメインは、コンセンサス配列C-X-X-C-G(配列番号8)を有し、式中、C=システイン、X=任意のアミノ酸、G=グリシンである。代替的な実施形態において、ジンクフィンガードメインを有するタンパク質は、コンセンサス配列Q-C-X-X-C-G(配列番号9)を有し、式中、C=システイン、X=任意のアミノ酸、G=グリシン、Q=グルタミンである。また更なる実施形態において、ジンクフィンガードメインは、コンセンサス配列Q-C-X-C-G-X-F-X-L-X-H-X-H(配列番号10)を有し、式中、C=システイン、X=任意のアミノ酸、G=グリシン、Q=グルタミン、F=フェニルアラニン、L=ロイシン、H=ヒスチジンである。幾つかの実施形態において、C2H2ジンクフィンガードメインは、X-C-X-CG-X-C-X(配列番号11)を含み、式中、C=システイン、X=任意のアミノ酸、G=グリシンである。幾つかの実施形態において、Cジンクフィンガードメイン含有タンパク質は過剰発現される。幾つかの実施形態において、Cジンクフィンガー含有タンパク質の発現は、限定されるものではないが、癌を含む疾患又は障害に関連する。
例えば、本発明のヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質である非定型E3ユビキチンリガーゼ(ZFP91)を分解する。ジンクフィンガータンパク質である非定型E3ユビキチンリガーゼは、Cys-Hisジンクフィンガーを含み、腫瘍細胞の生存を保護し、フォークヘッドボックスA1(FOXA1)の不安定化を通じて化学耐性を付与する(例えば、Tang, et al.著の「ユビキチナーゼZFP91は、腫瘍細胞の生存を促進し、FOXA1の不安定化を通じて化学耐性を付与する(The ubiquitanse ZFP91 promotes tumor cell survival and confers chemoresistance through FOXA1 destabilization)」, Carcinogenesis, Col. 41(1), Jan. 2020を参照のこと)。ジンクフィンガータンパク質である非定型E3ユビキチンリガーゼは、非古典的NF-κB経路調節を通じて作用すると考えられており、その過剰発現はNF-κBシグナル伝達経路の活性化の増加につながり、胃部癌、乳癌、結腸癌、腎臓癌、卵巣癌、膵臓癌、胃癌、前立腺癌、肉腫、及び黒色腫を含む多くの癌に関与している(例えば、Paschke著の「正常組織及び癌におけるZFP91ジンクフィンガータンパク質発現パターン(ZFP91 zinc finger protein expression pattern in normal tissues and cancers.)」 Oncol Lett. 2019; Mar; 17(3):3599-3606を参照のこと)。或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ジンクフィンガータンパク質である非定型E3ユビキチンリガーゼを分解し、限定されるものではないが、胃部癌、乳癌、結腸癌、腎臓癌、卵巣癌、膵臓癌、胃癌、前立腺癌、肉腫、及び黒色腫を含む癌を治療する。或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ジンクフィンガータンパク質である非定型E3ユビキチンリガーゼを分解し、肉腫、黒色腫、又は胃部癌を治療する。
別の実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質276(ZFP276)を分解する。
更に別の実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質653(ZFP653)を分解する。ジンクフィンガータンパク質653は、SF1への結合についてGRIP1及び他のp160コアクチベーターと競合することによって、転写のより一般的なリプレッサーとして作用し得る(例えば、Borud et al.著の「核内受容体の転写活性を調節する新規のジンクフィンガータンパク質のクローニング及び特性評価(Cloning and characterization of a novel zinc finger protein that modulates the transcriptional activity of nuclear receptors.)」 Molec. Endocr. 17: 2303-2319, 2003を参照のこと)。
他の例としては、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質692(ZFP692)を分解する。AICAR応答エレメント結合性タンパク質(AREBP)としても知られるジンクフィンガータンパク質692は、Cys-Hisジンクフィンガーを含み、in vivoでAMPKによって調節される肝臓のグルコース産生の主要なモジュレーターであると考えられている(Shirai et al.著の「in vivoでAMPKによって調節される肝臓のグルコース産生の主要なモジュレーターであるAICAR応答エレメント結合性タンパク質(AREBP)(AICAR response element binding protein (AREBP), a key modulator of hepatic glucose production regulated by AMPK in vivo.)」 Biochem Biophys Res Commun. 2011 Oct 22;414(2):287-91を参照のこと)。の過剰発現及びその過剰発現は、PI3K/AKT経路を活性化することによる結腸腺癌及び転移の促進(例えば、Xing et al.著の「ジンクフィンガータンパク質692は、PI3K/AKT経路を活性化することによって、結腸腺癌細胞の成長及び転移を促進する(Zinc finger protein 692 promotes colon adenocarcinoma cell growth and metastasis by activating the PI3K/AKT pathway.)」 Int J Oncol. 2019 May; 54(5): 1691-1703を参照のこと)、並びに肺腺癌及び肺癌における転移の発生に関連付けられている。短い干渉RNAを介したジンクフィンガータンパク質692発現をノックダウンすると、細胞浸潤が減少し、肺癌細胞におけるアポトーシスが増加し、異種移植モデルにおける肺癌腫瘍成長が抑制された(例えば、Zhang et al.著の「ZNF692は、肺腺癌における増殖及び細胞移動を促進する(ZNF692 promotes proliferation and cell mobility in lung adenocarcinoma.)」 Biochem Biophys Res Commun. 2017 Sep 2;490(4):1189-1196を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ジンクフィンガータンパク質692を分解し、肺腺癌又は癌腫又は結腸腺癌を含む肺癌又は結腸癌を治療する。
本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質827(ZFP827)を分解することもできる。ジンクフィンガータンパク質827は、核内受容体に結合し、ヌクレオソームリモデリング及びヒストン脱アセチル化(NURD)複合体をテロメアに動員して相同組換えを誘導することにより、テロメアの代替伸長(ALT)経路を調節するジンクフィンガータンパク質である(例えば、Conomos, D.、Reddel, R. R.、Pickett, H. A.著の「NuRD-ZNF827のテロメアへの動員は、相同組換えのための分子足場を作り上げる(NuRD-ZNF827 recruitment to telomeres creates a molecular scaffold for homologous recombination.)」 Nature Struct. Molec. Biol. 21: 760-770, 2014を参照のこと)。ジンクフィンガータンパク質827は、ALT関連前骨髄球性白血病(PML)核小体(APB)及びその他のテロメア異常に関連付けられている。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、限定されるものではないが、ALT陽性前骨髄球性白血病、骨肉腫、副腎/PNS神経芽細胞腫、乳癌、神経膠芽腫、結腸直腸癌、膵神経内分泌腫瘍(NET)、神経内分泌腫瘍、結腸直腸癌、肝臓癌、平滑筋肉腫を含む軟部組織癌、悪性線維性組織球腫、脂肪肉腫、胃癌/胃部癌、精巣癌、及び甲状腺癌を含むALT関連障害におけるZNF827を分解する。
他の実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、E4F転写因子1タンパク質(E4F1)を分解する。E4F転写因子1は、p53についてのユビキチンリガーゼとして機能すると考えられており、p53によって制御される細胞の生死の決定において重要な役割を担うp53の主要な翻訳後調節因子である(例えば、Le Cam et al.著の「E4Fタンパク質は、胚細胞周期の間の有糸分裂の進行に必要とされる(The E4F protein is required for mitotic progression during embryonic cell cycles.)」Molec. Cell. Biol. 24: 6467-6475, 2004を参照のこと)。E4F1の過剰発現は、骨髄性白血病細胞の発達と関連付けられている(例えば、Hatachi et al.著の「E4F1欠乏症は、白血病細胞の酸化ストレス媒介性の細胞死をもたらす(E4F1 deficiency results in oxidative stress-mediated cell death of leukemic cells.)」 J Exp Med. 2011 Jul 4; 208(7): 1403-1417を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、E4F転写因子1を分解し、限定されるものではないが、急性骨髄性白血病(AML)、未分化型AML、最小限の細胞成熟を伴う骨髄芽球性白血病、細胞成熟を伴う骨髄芽球性白血病、前骨髄球性白血病、骨髄単球性白血病、好酸球増多症を伴う骨髄単球性白血病、単球性白血病、赤白血病、巨核芽球性白血病、慢性骨髄性白血病(CML)、若年性骨髄単球性白血病(JMML)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)を含む骨髄起源の白血病、骨髄増殖性腫瘍、例えば、多血症(PV)、本態性血小板血症(ET)、骨髄線維症を伴う骨髄異形成(MMM)、好酸球増多症候群(HES)、全身性肥満細胞疾患(SMCD)、骨髄線維症、及び原発性骨髄線維症を含む骨髄増殖性腫瘍を治療する。E4F1発現は、p53欠損癌細胞における生存にも不可欠である(例えば、Rodier et al.著の「転写因子E4F1は、CHK1依存性チェックポイント及びミトコンドリアの機能を調整する(The Transcription Factor E4F1 Coordinates CHK1-Dependent Checkpoint and Mitochondrial Functions.)」 Cell Reports Volume 11, ISSUE 2, P220-233, April 14, 2015を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、E4F転写因子1を分解し、限定されるものではないが、卵巣癌、小細胞肺癌、膵臓癌、頭頸部扁平上皮癌、及びトリプルネガティブ乳癌を含むp53欠損関連障害を治療する。
別の態様において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質517(ZFP517)を分解する。ジンクフィンガータンパク質517は、副腎皮質癌(ACC)における発癌ドライバーとして特定されている(例えば、Rahane et al.著の「ヒト副腎皮質癌(ACC)特異的な遺伝子突然変異シグネチャーの確立(Establishing a human adrenocortical carcinoma (ACC)-specific gene mutation signature.)」 Cancer Genet. 2019; 230:1-12を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物においてジンクフィンガータンパク質517に使用して、副腎皮質癌を治療する。
更に別の態様において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質582(ZFP582)を分解する。ジンクフィンガータンパク質582は、nDNA損傷応答、増殖、細胞周期制御、及び腫瘍性形質転換、最も注目すべきは子宮頸癌、食道癌、及び結腸直腸癌に関与すると考えられている(例えば、Huang et al.著の「メチローム解析は、子宮頸部腫瘍においてジンクフィンガータンパク質582(ZNF582)の頻度の高いDNAメチル化を特定する(Methylomic analysis identifies frequent DNA methylation of zinc finger protein 582 (ZNF582) in cervical neoplasms.)」 PLoS One 7: e41060, 2012、Tang et al.著の「食道扁平上皮癌についての潜在的なバイオマーカーとしてのPAX1遺伝子、SOX1遺伝子、及びZNF582遺伝子の異常なDNAメチル化(Aberrant DNA methylation of PAX1, SOX1 and ZNF582 genes as potential biomarkers for esophageal squamous cell carcinoma.)」 Biomedicine & Pharmacotherapy Volume 120, December 2019, 109488、Harada et al.著の「腸洗浄液中のDNAメチル化の分析による結腸直腸癌の検出(Analysis of DNA Methylation in Bowel Lavage Fluid for Detection of Colorectal Cancer.)」 Cancer Prev Res; 7(10); 1002-10; 2014を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ジンクフィンガータンパク質582を分解し、限定されるものではないが、子宮頸部腺癌を含む子宮頸癌、扁平上皮癌及び扁平上皮腺癌を含む食道癌、並びに結腸直腸癌を含む癌を治療する。
別の実施形態において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質654(ZFP654)を分解する。
代替的に、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガータンパク質787(ZFP787)を分解する。
本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、癌における過剰メチル化1(Hypermethylated in Cancer 1)(HIC1)タンパク質を分解することができる。癌における過剰メチル化1タンパク質は、N末端のBTB/POZタンパク質間相互作用ドメインと、そのC末端半分に5つのKruppel様C2H2ジンクフィンガーモチーフとを含む(例えば、Deltour et al.著の「候補腫瘍抑制遺伝子HIC-1のカルボキシ末端は、系統発生的に保存されている(The carboxy-terminal end of the candidate tumor suppressor gene HIC-1 is phylogenetically conserved.)」 Biochim. Biophys. Acta 1443: 230-232, 1998を参照のこと)。癌における過剰メチル化1タンパク質遺伝子の発現の障害のミラー・ディッカー症候群(例えば、Grimm et al.著の「ミラー・ディッカー症候群についての候補遺伝子であるHIC1のホモログである新規のマウス遺伝子Hic1の単離及び胚性発現(Isolation and embryonic expression of the novel mouse gene Hic1, the homologue of HIC1, a candidate gene for the Miller-Dieker syndrome.)」 Hum. Molec. Genet. 8: 697-710, 1999を参照のこと)。
本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、癌における過剰メチル化2(Hypermethylated in Cancer 2)(HIC2)タンパク質を分解する。
本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、GDNF誘導性ジンクフィンガータンパク質1(GZF1)を分解することができる。GDNF誘導性ジンクフィンガータンパク質1は、12bpのGZF1応答エレメント(GRE)に結合し、遺伝子転写を抑制する転写調節因子である(例えば、Morinaga et al.著の「GDNF誘導性ジンクフィンガータンパク質1は、HOXA10遺伝子調節領域に結合する配列特異的な転写リプレッサーである(GDNF-inducible zinc finger protein 1 is a sequence-specific transcriptional repressor that binds to the HOXA10 gene regulatory region.)」 Nucleic Acids Res. 33: 4191-4201, 2005を参照のこと)。
代替的に、例えば、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、オッドスキップ関連1(Odd Skipped Related 1)(OSR1)タンパク質を分解することができる。オッドスキップ関連1タンパク質は、3つのC2H2型のジンクフィンガー、チロシンリン酸化部位、及び幾つかの推定PXXP SH3結合モチーフを含む(例えば、Katoh, M.著の「ヒト染色体2p24上のOSR1の分子クローニング及び特性評価(Molecular cloning and characterization of OSR1 on human chromosome 2p24.)」 Int. J. Molec. Med. 10: 221-225, 2002を参照のこと)。
別の態様において、本発明の三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、オッドスキップ関連2(Odd Skipped Related 2)(OSR2)タンパク質を分解する。
更に別の実施形態において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、SAL様4(SALL4)タンパク質を分解することができる。SAL様4タンパク質は、SAL型の3つのC2H2ダブルジンクフィンガードメインを有し、その2つ目は、そのC末端に取り付けられた単一のC2H2ジンクフィンガーと、脊椎動物SAL様タンパク質に典型的なN末端のC2HCジンクフィンガーモチーフとを有する。SAL様4タンパク質の突然変異は、デュアン-橈側列症候群の発症と関連している(例えば、Borozdin et al.著の「SALL4の欠失は、オキヒロ症候群及び肢端-腎-眼症候群の一般的な原因であり、病原性メカニズムとしてハプロ不全を認める(SALL4 deletions are a common cause of Okihiro and acro-renal-ocular syndromes and confirm haploinsufficiency as the pathogenic mechanism.)」 J. Med. Genet. 41: e113, 2004を参照のこと)。SAL様4タンパク質の過剰発現は、中でも、肺癌、胃部癌、肝臓癌、腎癌、骨髄異形成症候群、未分化胚細胞腫、卵黄嚢腫、及び絨毛癌を含む胚細胞・性索間質性腫瘍、並びに白血病を含む多くの癌の促進、成長、及び転移に関連している。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、SAL様4タンパク質を分解し、限定されるものではないが、中でも、胃部癌、肝臓癌、腎癌、骨髄異形成症候群、未分化胚細胞腫、卵黄嚢腫、及び絨毛癌を含む胚細胞・性索間質性腫瘍、並びに白血病を含む癌を治療する。
本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、B細胞リンパ腫6(BCL6)タンパク質を分解することもできる。B細胞リンパ腫6は自律的なトランスリプレッサードメインを含み、POZモチーフを含む2つの非連続領域が最大のトランス抑制活性を媒介する。B細胞リンパ腫6遺伝子転座の転座は、非ホジキンリンパ腫等の骨髄増殖性障害の発症に関連している。B細胞リンパ腫6の過剰発現は、活性酸素種の増加を防ぎ、癌細胞において化学療法試薬によって誘導されるアポトーシスを阻害する(例えば、Tahara et al.著の「B細胞リンパ腫6の過剰発現は、骨髄腫細胞系統における遺伝子発現プロファイルを変化させ、DNA損傷応答の低下と関連している(Overexpression of B-cell lymphoma 6 alters gene expression profile in a myeloma cell line and is associated with decreased DNA damage response.)」 Cancer Sci. 2017 Aug;108(8):1556-1564、Cardenas et al.著の「癌療法の標的としてのBCL6癌タンパク質の役割の拡大(The expanding role of the BCL6 oncoprotein as a cancer therapeutic target.)」 Clin Cancer Res. 2017 Feb 15; 23(4): 885-893を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、B細胞リンパ腫6を分解し、限定されるものではないが、血液腫瘍又は固形腫瘍、例えば、限定されるものではないが、B細胞白血病又はリンパ腫、例えば、限定されるものではないが、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)及びABC-DLBCLサブタイプ、B急性リンパ芽球性白血病、慢性骨髄性白血病、乳癌、及び非小細胞肺癌を含む癌を治療する。
さらに、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、B細胞リンパ腫6B(BCL6B)タンパク質を分解する。B細胞リンパ腫6Bタンパク質は、N末端POZドメインと、5つのC末端ジンクフィンガーモチーフとを含み、転写リプレッサーとして作用すると考えられている(例えば、Okabe et al.著の「新規のBcl6ホモログであるBAZFは、転写リプレッサーとして機能する(BAZF, a novel Bcl6 homolog, functions as a transcriptional repressor.)」 Molec. Cell. Biol. 18: 4235-4244, 1998を参照のこと)。B細胞リンパ腫6Bタンパク質の過剰発現は、胚細胞腫瘍の発生と関連付けられている(Ishii et al.著の「FGF2は、MAP2K1活性化によるEtv5及びBcl6bの上方調節を介して、マウス精原幹細胞の自己複製を媒介する(FGF2 mediates mouse spermatogonia stem cell self-renewal via upregulation of Etv5and Bcl6bthrough MAP2K1activation.)」 Development 139, 1734-1743 (2012))。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、B細胞リンパ腫6Bを分解し、限定されるものではないが、未分化胚細胞腫及び精上皮腫を含む、限定されるものではないが、胚腫、奇形腫、卵黄嚢腫、並びに絨毛癌を含む胚細胞癌を含む癌を治療する。
代替的に、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、初期成長応答1(EGR1)タンパク質を分解することができる。初期成長応答1タンパク質は、トランスフォーミング成長因子-ベータ-1遺伝子発現を直接制御し、サイクリンD2(CCND2)、p19(Ink4d)、及びFasを含む幾つかの標的遺伝子を調節することにより、前立腺癌細胞だけでなく、神経膠腫細胞の増殖及び生存にも関与することが明らかになっている(例えば、Virolle et al.著の「Erg1は、前立腺癌細胞の成長及び生存を促進する:新規のEgr1標的遺伝子の特定(Erg1 promotes growth and survival of prostate cancer cells: identification of novel Egr1 target genes.)」 J. Biol. Chem. 278: 11802-11810, 2003、Chen et al.著の「EGR1の阻害は、CCND1プロモーターを標的とすることによって神経膠腫の増殖を阻害する(Inhibition of EGR1 inhibits glioma proliferation by targeting CCND1 promoter.)」 Journal of Experimental & Clinical Cancer Research Volume 36, Article number: 186 (2017)を参照のこと)。アポトーシスシグナルに対する耐性の付与にEgr1によって使用される1つのメカニズムは、Egr1がFas発現を阻害する能力であり、これはFasLに対する非感受性につながる。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、初期成長応答1タンパク質を分解し、限定されるものではないが、前立腺癌又は、限定されるものではないが、毛様細胞性星状細胞腫、びまん性星状細胞腫、退形成性星状細胞腫、多形性膠芽細胞腫を含む神経膠腫を含む癌を治療する。
更に別の態様において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、初期成長応答4(EGR4)タンパク質を分解することができる。初期成長応答4タンパク質は、カルボキシ末端近くにC/Hサブタイプの3つのジンクフィンガーを含む(例えば、Crosby et al.著の「ジンクフィンガー転写因子NGFI-Cをコードする遺伝子の神経特異的な発現、ゲノム構造、及び染色体局在(Neural-specific expression, genomic structure, and chromosomal localization of the gene encoding the zinc-finger transcription factor NGFI-C.)」 Proc. Nat. Acad. Sci. 89: 4739-4743, 1992を参照のこと)。初期成長応答4タンパク質の過剰発現は、胆管癌の発生に関連付けられている(例えば、Gong et al.著の「グラミシジンは、EGR4を抑制することによって胆管癌の細胞成長を阻害する(Gramicidin inhibits cholangiocarcinoma cell growth by suppressing EGR4.)」 Artificial Cells, Nanomedicine, and Biotechnology, 48:1, 53-59 (2019)を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、初期成長応答4タンパク質を分解し、限定されるものではないが、胆管癌を含む癌を治療する。
或る特定の態様において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、Sal様1(SALL1)タンパク質を分解することができる。
代替的な実施形態において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、Sal様3(SALL3)タンパク質を分解することができる。SALL3タンパク質は、4つのダブルジンクフィンガー(DZF)ドメインを含み、各ドメインには、2つ目のジンクフィンガーモチーフ内の特徴的な8アミノ酸のストレッチであるSALボックスと同一である又は密接に関連する配列が含まれている。
更に別の実施形態において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、腫瘍タンパク質p63(TP63)を分解することができる。腫瘍タンパク質p63の過剰発現は、肺癌の発生及び予後不良、口腔癌及び頭頸部癌における放射線耐性、皮膚の扁平上皮癌に関連付けられている(例えば、Massion et al.著の「肺癌の発生及び予後におけるp63の増幅及び過剰発現の重要性(Significance of p63 amplification and overexpression in lung cancer development and prognosis.)」 Cancer Res. 2003 Nov 1;63(21):7113-21、Moergel et al.著の「p63の過剰発現は、口腔扁平上皮癌の放射線耐性及び予後と関連している(Overexpression of p63 is associated with radiation resistance and prognosis in oral squamous cell carcinoma.)」 Oral Oncol. 2010 Sep;46(9):667-71を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、腫瘍タンパク質p63を分解し、限定されるものではないが、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、頭頸部癌、及び皮膚の扁平上皮癌を含む癌を治療する。
更に別の実施形態において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、広空間ジンクフィンガー(Widely-Interspaced Zinc Finger)含有(WIZ)タンパク質を分解することができる。
本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質7A(Zinc Finger and BTB Domain Containing Protein 7A)(ZBTB7A)を分解することもできる。ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質7Aの発現は、前立腺癌、非小細胞肺癌、膀胱癌、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、口腔扁平上皮癌、及び肝細胞癌を含む多くの癌に関連している(例えば、Han et al.著の「ZBTB7Aは、前立腺癌におけるアンドロゲン受容体の転写抑制活性を媒介する(ZBTB7A Mediates the Transcriptional Repression Activity of the Androgen Receptor in Prostate Cancer.)」 Cancer Res 2019;79:5260-71、Molloy et al.著の「ZBTB7Aは、乳癌におけるエストロゲン受容体アルファの発現を制御する(ZBTB7A governs estrogen receptor alpha expression in breast cancer.)」 Journal of Molecular Cell Biology, Volume 10, Issue 4, August 2018, Pages 273-284を参照のこと)。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質7Aを分解し、限定されるものではないが、前立腺癌、非小細胞肺癌、乳癌、口腔扁平上皮癌、前立腺癌、卵巣癌、神経膠腫、膀胱癌、及び肝細胞癌を含む癌を治療する。
他の態様において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質7B(ZBTB7B)を分解することができる。ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質7Bの発現は、乳癌、前立腺癌、尿路上皮癌、子宮頸癌、及び結腸直腸癌と関連している。したがって、或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質7Bを分解し、限定されるものではないが、乳癌、前立腺癌、尿路上皮癌、子宮頸癌、及び結腸直腸癌を含む癌を治療する。
本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、カゼインキナーゼIアルファI(CK1α又はCK1アルファ)を分解することができる。CK1アルファは、NF-κBの二機能性調節因子である(例えば、Bidere et al.著の「カゼインキナーゼ1アルファは、抗原受容体誘導性NF-κB活性化及びヒトリンパ腫細胞の生存を制御する(Casein kinase 1-alpha governs antigen-receptor-induced NF-kappa-B activation and human lymphoma cell survival.)」 Nature 458: 92-96, 2009を参照のこと)。CK1アルファは、T細胞受容体の結合時にCBM複合体と動的に会合して、サイトカイン産生及びリンパ球増殖に関与する。しかしながら、CK1アルファキナーゼ活性は、その後CARMA1のリン酸化及び不活性化を促進するという対照的な役割を担う。したがって、CK1アルファは、受容体誘導NF-κBを最初に促進し、次に終結させる二重の「ゲーティング」機能を有する。ABC DLBCL細胞は、構成的なNF-κB活性にCK1アルファを必要とすることから、CK1アルファが条件付きで必須の悪性遺伝子として機能することを示している。CK1アルファの発現は、中でも、5q(del(5q)MDS)の枯渇を伴う骨髄異形成疾患(例えば、Kronke, et al.著の「レナリドミドは、del(5q)MDSにおけるCK1アルファのユビキチン化及び分解を誘導する(Lenalidomide induces ubiquitination and degradation of CK1-alpha in del(5q) MDS.)」 Nature 523: 183-188, 2015を参照のこと)、結腸直腸癌、乳癌、白血病、多発性骨髄腫、肺癌、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非小細胞肺癌、及び膵臓癌(例えば、Richter et al.著の「CK1αの過剰発現は、結腸直腸癌における生存率不良と相関している(CK1α overexpression correlates with poor survival in colorectal cancer.)」 BMC Cancer. 2018; 18: 140、Jiang et al.著の「カゼインキナーゼ1α:生物学的メカニズム及びセラノスティックの可能性(Casein kinase 1α: biological mechanisms and theranostic potential.)」 Cell Commun Signal. 2018; 16: 23を参照のこと)と関連付けられている。したがって、幾つかの実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、カゼインキナーゼIアルファIを分解し、限定されるものではないが、結腸直腸癌、乳癌、白血病、多発性骨髄腫、肺癌、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非小細胞肺癌、膵臓癌を含む癌、限定されるものではないが、5q症候群、単一血球系統の異形成を伴う不応性血球減少症、難治性貧血、難治性好中球減少症、及び難治性血小板減少症を含む骨髄異形成症候群、環状鉄芽球を伴う難治性貧血、多血球系統異形成を伴う難治性血球減少症(RCMD)、過剰芽球を伴う難治性貧血(REAB)I及びII、移行期の芽球増加を伴う不応性貧血(RAEB-T)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、分類不能型骨髄異形成、小児期の難治性血球減少症(小児期の異形成)を治療する。
本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、配列類似性を有するファミリー(Family with Sequence Similarity)83メンバーH(FAM83H)を分解することもできる。FAM83Hは、MYC及びβ-カテニン等の腫瘍関連分子とともにヒトの癌の進行に関与すると考えられており、過剰発現は、肺癌、乳癌、結腸癌、肝臓癌、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、食道癌、神経膠腫、肝細胞癌、甲状腺癌、腎細胞癌、骨肉腫、及び胃癌と関連付けられている(例えば、Kim et al.著の「FAM83Hは、β-カテニンの安定化及び骨肉腫の進行に関与している(FAM83H is involved in stabilization of β-catenin and progression of osteosarcomas.)」 Journal of Experimental & Clinical Cancer Research volume 38, Article number: 267 (2019)を参照のこと)。したがって、幾つかの実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、FAM83Hを分解し、限定されるものではないが、肺癌、乳癌、結腸癌、肝臓癌、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、食道癌、神経膠腫、甲状腺癌、限定されるものではないが、肝細胞癌を含む肝臓癌、腎細胞癌、骨肉腫、及び胃癌を含む癌を治療する。
代替的に、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質16(ZBTB16)を分解することができる。ZBTB16の過剰発現及び転座は、急性前骨髄球性白血病を含む様々な血液癌の発症と関連付けられている(例えば、Zhang et al.著の「前骨髄球性白血病ジンクフィンガー遺伝子のゲノム配列、構造編成、分子進化、及び異常な再編成(Genomic sequence, structure organization, molecule evolution, and aberrant rearrangement of promyelocytic leukemia zinc finger gene.)」 Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 11422-11427, 1999を参照のこと)。したがって、幾つかの実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、ZBTB16を分解し、限定されるものではないが、急性前骨髄球性白血病、急性リンパ芽球性白血病、成人T細胞リンパ腫/ATL、及びバーキットリンパ腫を含む、限定されるものではないが、白血病又はリンパ腫を含む、限定されるものではないが、血液癌を含む癌を治療する。
代替的な実施形態において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ATリッチ相互作用ドメイン含有タンパク質2(ARID2)を分解することができる。ARID2は、PBAFクロマチンリモデリング複合体のサブユニットであり、これは、核内受容体によるリガンド依存性転写活性化を促進する(例えば、Yan et al.著の「PBAFクロマチンリモデリング複合体は、選択的インターフェロン応答遺伝子の発現を調節するのに、新規の特異性サブユニットのBAF200を必要とする(PBAF chromatin-remodeling complex requires a novel specificity subunit, BAF200, to regulate expression of selective interferon-responsive genes.)」 Genes Dev. 19: 1662-1667, 2005を参照のこと)。
別の態様において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において有効量で宿主に投与して、ポリブロモ関連BAF(PBAF)を分解することができる。PBAFにおける突然変異は、滑膜肉腫及び多発性骨髄腫の発症と関連付けられている(例えば、Alfert et al.著の「発生及び疾患におけるBAF複合体(The BAF complex in development and disease.)」 Epigenetics & Chromatin volume 12, Article number: 19 (2019)を参照のこと)。したがって、幾つかの実施形態において、本発明の化合物又はその薬学的塩を、任意に本明細書に記載される医薬組成物において使用して、PBAFを分解し、限定されるものではないが、滑膜肉腫及び多発性骨髄腫を含む癌を治療する。
他の実施形態において、本発明の選択された三環式ヘテロ二官能性化合物は、セレブロンに結合して新形質表面を形成した後に投与されると、多くのネオ基質に結合することができ、こうして「多重薬理」の形態がもたらされる。例えば、三環式化合物は、IRAK4、IKZF1及び/又はIKZF3、及び/又はAiolosに結合して分解することができる。他の例において、三環式化合物は、投与されると、上記で又は本明細書において名前が挙げられたタンパク質の2つ以上、例えば、SALL4及びIKZF1/3又はIKZF2/4を分解することができる。
標的タンパク質は、標的タンパク質に対するリガンドである標的化リガンドにより動員される。典型的には、標的化リガンドは、非共有結合的に標的タンパク質に結合する。代替的な実施形態において、標的タンパク質は、不可逆的又は可逆的であり得る方式でデグロンに共有結合される。
或る特定の実施形態において、選択された標的タンパク質は、医学的障害を引き起こす又は医学的障害によって引き起こされる増幅、転座、欠失、又は逆位の事象を受けた遺伝子から発現される。或る特定の態様において、選択された標的タンパク質は、医学的障害を引き起こす又は医学的障害によって引き起こされるリン酸化、アセチル化、プロピオニル化及びクロチル化を含むアシル化、N-結合型グリコシル化、アミド化、ヒドロキシル化、メチル化及びポリメチル化、O-結合型グリコシル化、ピログルタモイル化、ミリストイル化、ファルネシル化、ゲラニルゲラニル化、ユビキチン化、スモイル化、又は硫酸化の1つ又はそれらの組合せによって翻訳後修飾されている。
本明細書において企図されるように、本発明は、対象の標的タンパク質に結合する標的化リガンドを有する三環式セレブロン結合性ヘテロ二官能性デグレーダーを含む。標的タンパク質は、その分解によってin vivoで有益な治療効果を引き起こす、デグレーダーが結合され得るあらゆるアミノ酸配列である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、病原体又は毒素由来のような非内因性ペプチドである。別の実施形態において、標的タンパク質は、障害を媒介する内因性タンパク質であり得る。内因性タンパク質は、タンパク質の正常な形態又は異常な形態のいずれかであり得る。例えば、標的タンパク質は、癌細胞において見出される突然変異タンパク質、又は例えば、部分的若しくは完全な機能獲得若しくは機能喪失がヌクレオチド多型によってコードされるタンパク質であり得る。幾つかの実施形態において、デグレーダーは、タンパク質の正常な形態ではなく、タンパク質の異常な形態を標的とする。別の実施形態において、標的タンパク質は、炎症性障害又は自己免疫障害を含む免疫障害を媒介し得る。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、非限定的な例として、HIV、HBV、HCV、RSV、HPV、CMV、フラビウイルス、ペスチウイルス、コロナウイルス、ノロウイルス科等のウイルス由来の非内因性タンパク質である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、細菌由来の非内因性タンパク質であり、これらは、例えば、グラム陽性細菌、グラム陰性細菌、又はその他であってもよく、細菌の薬剤耐性形態であり得る。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は真菌由来の非内因性タンパク質である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質はプリオン由来の非内因性タンパク質である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、真核病原体、例えば原生生物、蠕虫等に由来するタンパク質である。
一態様において、標的タンパク質は、クロマチンの構造及び機能を媒介する。標的タンパク質は、DNAメチル化又はヒストンの共有結合修飾等のエピジェネティックな作用を媒介し得る。一例は、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC4、HDAC5、HDAC6、HDAC7、HDAC8、HDAC9、HDAC10、又はHDAC11)である。代替的に、標的タンパク質は、リジンアセチル化のリーダーであるブロモドメイン(例えば、BRD1、BRD2、BRD3、BRD4、BRD5、BRD6、BRD7、BRD8、BRD9、及びBRDT)であってもよい。図9は、例えば本発明による標的タンパク質として作用し得るブロモドメインファミリーのタンパク質を例示している。
標的タンパク質の他の非限定的な例は、構造タンパク質、受容体、酵素、細胞表面タンパク質、アポトーシスシグナル伝達に関与するタンパク質、アロマターゼ、ヘリカーゼ、代謝プロセス(同化作用又は異化作用)のメディエーター、抗酸化物質、プロテアーゼ、キナーゼ、酸化還元酵素、トランスフェラーゼ、ヒドロラーゼ、リアーゼ、イソメラーゼ、リガーゼ、酵素調節因子、シグナル伝達物質、構造分子、結合活性(タンパク質、脂質炭水化物)、細胞運動性タンパク質、膜融合タンパク質、細胞間情報伝達メディエーター、生物学的プロセスの調節因子、行動タンパク質、細胞接着タンパク質、細胞死に関与するタンパク質、輸送に関与するタンパク質(タンパク質輸送体活性、核輸送、イオン輸送体、チャネル輸送体、担体活性、パーミアーゼ、セクレターゼ又は分泌メディエーター、電子輸送体、シャペロン調節因子、核酸結合、転写調節因子、細胞外組織化及び生合成調節因子、並びに翻訳調節因子を含む)である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、既知の疾患状態に関連するシグナル伝達カスケードの調節因子である。別の実施形態において、標的タンパク質は、シグナル伝達カスケードの調節とは異なるメカニズムによって障害を媒介する。本明細書において別段の記載があるように、真核生物系又はウイルス、細菌、若しくは真菌を含む微生物系におけるあらゆるタンパク質が、本発明を使用するプロテアソーム分解についての標的である。標的タンパク質は、真核生物のタンパク質であってもよく、幾つかの実施形態において、ヒトのタンパク質であってもよい。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、RXR、DHFR、Hsp90、キナーゼ、HDM2、MDM2、BETブロモドメイン含有タンパク質、HDAC、IDH1、Mcl-1、ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ、核内ホルモン受容体、芳香族炭化水素受容体(AHR)、RAS、RAF、FLT、SMARC、KSR、NF2L、CTNB、CBLB、BCLである。
或る特定の実施形態において、ブロモドメイン含有タンパク質は、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性を有する。
或る特定の実施形態において、ブロモドメイン含有タンパク質は、BRD2、BRD3、BRD4、BRDT、又はASH1Lである。
或る特定の実施形態において、ブロモドメイン含有タンパク質は、非BETタンパク質である。
或る特定の実施形態において、非BETタンパク質は、BRD7又はBRD9である。
或る特定の実施形態において、FLTは、FLT3ではない。或る特定の実施形態において、RASは、RASKではない。或る特定の実施形態において、RAFは、RAF1ではない。或る特定の実施形態において、SMARCは、SMARC2ではない。或る特定の実施形態において、KSRは、KSR1ではない。或る特定の実施形態において、NF2Lは、NF2L2ではない。或る特定の実施形態において、CTNBは、CTNNB1ではない。或る特定の実施形態において、BCLは、BCL6ではない。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、EGFR、FLT3、RAF1、SMARCA2、KSR1、NF2L2、CTNNB1、CBLB、BCL6、及びRASKから選択される。
別の実施形態において、標的タンパク質は、EGFR、FLT3、RAF1、SMARCA2、KSR1、NF2L2、CTNNB1、CBLB、BCL6、及びRASKから選択されない。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、EGFRリガンド、FLT3リガンド、RAF1リガンド、SMARCA2リガンド、KSR1リガンド、NF2L2リガンド、CTNNB1リガンド、CBLBリガンド、BCL6リガンド、又はRASKリガンドである。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、EGFRリガンド、FLT3リガンド、RAF1リガンド、SMARCA2リガンド、KSR1リガンド、NF2L2リガンド、CTNNB1リガンド、CBLBリガンド、BCL6リガンド、又はRASKリガンドではない。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、STATタンパク質リガンドではない。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、IRAK4リガンドではない。
本発明を使用して、タンパク質が調節不全となり、患者がタンパク質の分解から便益を受けることとなるあらゆる疾患状態及び/又は病態を含む、広範囲の疾患状態及び/又は病態を治療することができる。
例えば、ヒト療法薬について知られる標的である標的タンパク質を選択することができ、この療法薬は、本発明によるデグレーダーに組み込まれる場合に、標的化リガンドとして使用され得る。これらの標的タンパク質としては、多遺伝子病においての機能を回復するのに使用され得るタンパク質が挙げられ、例えば、B7.1及びB7、TINFR1m、TNFR2、NADPHオキシダーゼ、Bcl2/Bax及びアポトーシス経路における他のパートナー、C5a受容体、HMG-CoAレダクターゼ、PDE Vホスホジエステラーゼ型、PDE IVホスホジエステラーゼ4型、PDE I、PDEII、PDEIII、スクアレンシクラーゼ阻害剤、CXCR1、CXCR2、一酸化窒素(NO)シンターゼ、シクロオキシゲナーゼ1、シクロオキシゲナーゼ2、5HT受容体、ドーパミン受容体、Gタンパク質、例えば、Gq、ヒスタミン受容体、5-リポキシゲナーゼ、トリプターゼのセリンプロテアーゼ、チミジル酸シンターゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、トリパノソーマGAPDH、グリコーゲンホスホリラーゼ、炭酸脱水酵素、ケモカイン受容体、JAW STAT、RXR等、HIV1プロテアーゼ、HIV1インテグラーゼ、インフルエンザノイラミニダーゼ、B型肝炎逆転写酵素、ナトリウムチャネル、多剤耐性(MDR)タンパク質P-糖タンパク質(及びMRP)、チロシンキナーゼ、CD23、CD124、チロシンキナーゼp56 lck、CD4、CD5、IL-2受容体、IL-1受容体、TNF-αR、ICAM1、Cat+チャネル、VCAM、VLA-4インテグリン、セレクチン、CD40/CD40L、ニューロキニン及び受容体、イノシン一リン酸デヒドロゲナーゼ、p38MAPキナーゼ、Ras/Raf/MER/ERK経路、インターロイキン-1変換酵素、カスパーゼ、HCV、NS3プロテアーゼ、HCV NS3 RNAヘリカーゼ、グリシンアミドリボヌクレオチドホルミルトランスフェラーゼ、ライノウイルス3Cプロテアーゼ、単純ヘルペスウイルス-1(HSV-I)プロテアーゼ、サイトメガロウイルス(CMV)プロテアーゼ、ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ、サイクリン依存性キナーゼ、血管内皮成長因子、オキシトシン受容体、ミクロソーム輸送タンパク質阻害剤、胆汁酸輸送阻害剤、5αレダクターゼ阻害剤、アンジオテンシンII、グリシン受容体、ノルアドレナリン再取り込み受容体、エンドセリン受容体、神経ペプチドY及び受容体、エストロゲン受容体、アンドロゲン受容体、アデノシン受容体、アデノシンキナーゼ及びAMPデアミナーゼ、プリン作動性受容体(P2Y1、P2Y2、P2Y4、P2Y6、P2X1-7)、ファルネシルトランスフェラーゼ、ゲラニルゲラニルトランスフェラーゼ、NGFについての受容体であるTrkA、βアミロイド、チロシンキナーゼFlk-IIKDR、ビトロネクチン受容体、インテグリン受容体、Her-2/neu、テロメラーゼ阻害、細胞質ホスホリパーゼA2、並びにEGF受容体チロシンキナーゼが挙げられる。追加のタンパク質標的としては、例えば、エクジソン20-モノオキシゲナーゼ、GABA作動性塩素イオンチャネルのイオンチャネル、アセチルコリンエステラーゼ、電位感受性ナトリウムチャネルタンパク質、カルシウム放出チャネル、及び塩素イオンチャネルが挙げられる。また更なる標的タンパク質としては、アセチル-CoAカルボキシラーゼ、アデニロコハク酸シンテターゼ、プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼ、及びエノールピルビルシキミ酸-リン酸シンターゼが挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、チロシンキナーゼ(例えば、AATK、ABL、ABL2、ALK、AXL、BLK、BMX、BTK、CSF1R、CSK、DDR1、DDR2、EGFR、EPHA1、EPHA2、EPHA3、EPHA4、EPHA5、EPHA6、EPHA7、EPHA8、EPHA10、EPHB1、EPHB2、EPHB3、EPHB4、EPHB6、ERBB2、ERBB3、ERBB4、FER、FES、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FGR、FLT1、FLT3、FLT4、FRK、FYN、GSG2、HCK、IGF1R、ILK、INSR、INSRR、IRAK4、ITK、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KSR1、LCK、LMTK2、LMTK3、LTK、LYN、MATK、MERTK、MET、MLTK、MST1R、MUSK、NPR1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PDGFRA、PDGFRB、PLK4、PTK2、PTK2B、PTK6、PTK7、RET、ROR1、ROR2、ROS1、RYK、SGK493、SRC、SRMS、STYK1、SYK、TEC、TEK、TEX14、TIE1、TNK1、TNK2、TNNI3K、TXK、TYK2、TYRO3、YES1、又はZAP70)を含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合するキナーゼから誘導される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、セリン/トレオニンキナーゼ(例えば、カゼインキナーゼ2、プロテインキナーゼA、プロテインキナーゼB、プロテインキナーゼC、Rafキナーゼ、CaMキナーゼ、AKT1、AKT2、AKT3、ALK1、ALK2、ALK3、ALK4、オーロラA、オーロラB、オーロラC、CHK1、CHK2、CLK1、CLK2、CLK3、DAPK1、DAPK2、DAPK3、DMPK、ERK1、ERK2、ERK5、GCK、GSK3、HIPK、KHS1、LKB1、LOK、MAPKAPK2、MAPKAPK、MNK1、MSSK1、MST1、MST2、MST4、NDR、NEK2、NEK3、NEK6、NEK7、NEK9、NEK11、PAK1、PAK2、PAK3、PAK4、PAK5、PAK6、PIM1、PIM2、PLK1、RIP2、RIP5、RSK1、RSK2、SGK2、SGK3、SIK1、STK33、TAO1、TAO2、TGF-β、TLK2、TSSK1、TSSK2、ULK1、又はULK2)を含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合するキナーゼから誘導される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、サイクリン依存性キナーゼ、例えば、CDK1、CDK2、CDK3、CDK4、CDK5、CDK6、CDK7、CDK8、CDK9、CDK10、CDK11、CDK12、又はCDK13を含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合するキナーゼから誘導される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、ロイシンリッチリピートキナーゼ(例えば、LRRK2)を含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合するキナーゼから誘導される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、脂質キナーゼ(例えば、PIK3CA、PIK3CB)又はスフィンゴシンキナーゼ(例えば、S1P)を含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合するキナーゼから誘導される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、ASH1L、ATAD2、BAZ1A、BAZ1B、BAZ2A、BAZ2B、BRD1、BRD2、BRD3、BRD4、BRD5、BRD6、BRD7、BRD8、BRD9、BRD10、BRDT、BRPF1、BRPF3、BRWD3、CECR2、CREBBP、EP300、FALZ、GCN5L2、KIAA1240、LOC93349、MLL、PB1、PCAF、PHIP、PRKCBP1、SMARCA2、SMARCA4、SP100、SP110、SP140、TAF1、TAF1L、TIF1a、TRIM28、TRIM33、TRIM66、WDR9、ZMYND11、及びMLL4を含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合するBETブロモドメイン含有タンパク質から誘導される。或る特定の実施形態において、BETブロモドメイン含有タンパク質は、BRD4である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、限定されるものではないが、BRD2、BRD3、BRD4、アンテナペディアホメオドメインタンパク質、BRCA1、BRCA2、CCAAT増強結合性タンパク質、ヒストン、ポリコーム群タンパク質、高移動度群タンパク質、テロメア結合タンパク質、FANCA、FANCD2、FANCE、FANCF、肝細胞核因子、Mad2、NF-κB、核内受容体コアクチベーター、CREB結合タンパク質、p55、p107、p130、Rbタンパク質、p53、c-fos、c-jun、c-mdm2、c-myc、及びc-relを含む、標的化リガンドが結合することができる又は結合する核タンパク質から誘導される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、レチノイドX受容体(RXR)ファミリーのメンバーであり、治療される障害は、神経精神障害又は神経変性障害である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、レチノイドX受容体(RXR)ファミリーのメンバーであり、治療される障害は、統合失調症である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)であり、治療される障害は、癌である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)であり、治療される障害は、微生物性である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、バチルス・アンシラシス由来のジヒドロ葉酸レダクターゼ(BaDHFR)であり、治療される障害は、炭疽である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、熱ショックタンパク質90(HSP90)であり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、キナーゼ又はホスファターゼであり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、HDM2及び/又はMDM2であり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、BETブロモドメイン含有タンパク質であり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、リジンメチルトランスフェラーゼであり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、RAFファミリーに属し、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、FKBPファミリーに属し、治療される障害は、自己免疫障害である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、FKBPファミリーに属し、治療される障害は、臓器拒絶反応である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、FKBPファミリーに属し、この化合物は、臓器不全を未然防止するのに予防的に投与される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、アンドロゲン受容体であり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、エストロゲン受容体であり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、ウイルスタンパク質であり、治療される障害は、ウイルス感染症である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、ウイルスタンパク質であり、治療される障害は、HIV、HPV、又はHCVである。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、AP-1転写因子又はAP-2転写因子であり、治療される障害は、癌である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、HIVプロテアーゼであり、治療される障害は、HIV感染症である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、HIVインテグラーゼであり、治療される障害は、HIV感染症である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、HCVプロテアーゼであり、治療される障害は、HCV感染症である。或る特定の実施形態において、治療は予防的であり、標的タンパク質は、ウイルスタンパク質である。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)ファミリーのメンバーであり、障害は、神経変性障害である。或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)ファミリーのメンバーであり、障害は、ハンチントン病、パーキンソン病、ケネディ病、筋萎縮性側索硬化症、ルビンシュタイン-テイビ症候群、又は脳卒中である。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、標的タンパク質と共有結合を形成する。共有結合を利用する標的タンパク質及び標的化リガンドの非限定的な例としては、「共有結合型阻害剤の設計及び発見(Covalent Inhibitors Design and Discovery)」 Eur J Med Chem. 2017 Sep 29;138:96-114. doi: 10.1016/j.ejmech.2017.06.019、「リジン標的化共有結合型阻害剤(Lysine-Targeting Covalent Inhibitors.)」 Angew Chem Int Ed Engl. 2017 Aug 29. doi: 10.1002/anie.201707630、「非触媒リジン側鎖の共有結合修飾によるMcl-1の阻害(Inhibition of Mcl-1 Through Covalent Modification of a Noncatalytic Lysine Side Chain.)」 Nat Chem Biol. 2016 Nov;12(11):931-936、「T790M-EGFR誘導型共有結合型阻害剤の標的のプロテオームワイドマップ(Proteome-wide Map of Targets of T790M-EGFR-Directed Covalent Inhibitors)」 Cell Chem. Biol. 2016 Nov: 24:1-13、「ヒトプロテオームにおけるリジン反応性及びリガンド結合性のグローバルプロファイリング(Global Profiling of Lysine Reactivity and Ligandability in the Human Proteome)」 Nat. Chem. 2017 Jul 31, doi:10.1038/nchem.2826、「共有結合薬物の再燃(The Resurgence of Covalent Drugs)」 Nat. Rev. Drug Disc. 2011 10, 307-217、米国特許第8,008,309号、及び米国特許第9,790,226号に記載されるものが挙げられる。
代替的な実施形態において、標的タンパク質は、DOTL1、CBP、WDR5、BRAF、KRAS、MCL1、PTPN2、HER2、及びSHOC2から選択される。別の代替的な実施形態において、標的タンパク質は、UCHL1、USP6、USP14、及びUSP30から選択される。別の代替的な実施形態において、標的タンパク質は、USP1、USP2、USP4、USP6、USP7、USP8、USP9x、USP10、USP11、USP13、USP14、USP17、及びUSP28から選択される。
代替的な実施形態において、標的タンパク質は、DOTL1、CBP、WDR5、BRAF、KRAS、MCL1、PTPN2、PTPN1、HER2、及びSHOC2から選択される。
或る特定の実施形態において、標的タンパク質は、レチノイドX受容体(RXR)、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)、バチルス・アンシラシスのジヒドロ葉酸レダクターゼ(BaDHFR)、熱ショックタンパク質90(HSP90)、チロシンキナーゼ、オーロラキナーゼ、ATM、ATR、BPTF、ALK、ABL、JAK2、MET、mTORC1、mTORC2、肥満細胞/幹細胞成長因子受容体(SCFR)、IGF1R、HDM2、MDM2、HDAC、RAF受容体、アンドロゲン受容体、エストロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、HIVプロテアーゼ、HIVインテグラーゼ、AP1、AP2、MCL-1、DNA-PK、elF4E、IDH1、RAS、RASK、MERTK、MER、EGFR、FLT3、SMARCA2、サイクリン依存性キナーゼ9(CDK9)、サイクリン依存性キナーゼ12、サイクリン依存性キナーゼ13、糖質コルチコイド受容体、RasG12C、Her3、Bcl-2、Bcl-XL、PPAR-ガンマ、BCR-ABL、BRAF、LRRK2、PDGFRα、RET、脂肪酸結合タンパク質、5-リポキシゲナーゼ活性化タンパク質(FLAP)、クリングルドメインV 4BVV、ラクトイルグルタチオンリアーゼ、mPGES-1、第Xa因子、カリクレイン7、カテプシンK、カテプシンL、カテプシンS、MTH1、MDM4、PARP1、PARP2、PARP3、PARP14、PARP15、PDZドメイン、ホスホリパーゼA2ドメイン、タンパク質S100-A7 2WOS、NRASQ61K、NRASQ61R、TEAD1、TEAD2、TEAD3、TEAD4、サポシン-B、Sec7、pp60 Src、Tank1、Ubc9 SUMO E2リガーゼSF6D、Src、Src-AS1、Src-AS2、JAK3、MEK1、KIT、KSR1、CTNNB1、BCL6、PAK1、PAK4、TNIK、MEN1、ERK1、IDO1、CBP、ASH1L、ATAD2、YAP、BAZ2A、BAZ2B、BDRT、BDR9、SMARCA4、PB1、TRIM24(TIF1a)、BRPF1、CECR2、CREBBP、PCAF、PHIP、TAF1、ヒストンデアセチラーゼ2、ヒストンデアセチラーゼ4、ヒストンデアセチラーゼ6、ヒストンデアセチラーゼ7、ヒストンデアセチラーゼ8、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT2B)、WWTR1、A2aR、FTアーゼ及び/又はGGTアーゼのαサブユニット、ARG1、B-TrCP、CBX7、Cdc7/ASK、Cdc7-Dbf4、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT2A)、B型ヒストンアセチルトランスフェラーゼ触媒ユニット(HAT1)、サイクリックAMP依存性転写因子(ATF2)、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT5)、リジン特異的ヒストンデメチラーゼ1A(KDM1A)、DOT1L、EHMT1、ceacam-1、CENP-E、clAP1/2、DKC1、DMT3A、DNA複製/修復タンパク質、DNA2、DNMT3B、E2F1、EFHD2/SWIPROSIN、Eg5、EMI1、ERCC1/XPF、EWS-FLI、FoxA1、GATA3、FOXP1、GCN2、GNAQ、GNA11、SETD2、SETD7、SETD8、SETDB1、SMYD2、SMYD3、SUV4-20H1、ErbB2受容体、ErbB4受容体、VEGFR1受容体、VEGFR2受容体、VEGFR3受容体、PDGFRβ受容体、受容体、Lyn受容体、Hck受容体、c-Met受容体、TrkB受容体、Axl受容体、Tie2受容体、Ros1受容体、HGFR受容体、MST1R受容体、Lck受容体、Yes受容体、HER2、PNET受容体、RCC受容体、RAML受容体、SEGA受容体、PDGFR受容体、ErbB2受容体、HK2、HSP70、IAP類、IQGAP1、LSF、MCT1、MCT4、MEF2B、MMP3、MMP14、MUC1、MyB、Myd88、FGFR1受容体、FGFR2受容体、FGFR3受容体、FGFR4受容体、PDGRF受容体、DDR1受容体、PDGRα受容体、PDGRβ受容体、CDK4受容体、CDK6受容体、Fms受容体、T315I VEGFR受容体、FGFR受容体、Flt3受容体、Eph2A受容体、JAK1受容体、FKBP12受容体、mTOR受容体、CDK8受容体、CSF-1R受容体、MEK2受容体、Brk受容体、PI3Ka受容体、GCN5受容体、G9a(EHMT2)、EZH2、EED、PRMT3、PRMT4、PRMT5、PRMT6、NR2F6、NSD1、P70S6K、PIN1、SERCA、SF3B1、サーチュイン2、Skp2、SMAD3、SPOP、Tal1、KDM1、KDM4、KDM5、KDM6、L3MBTL3、メニン、HDAC6、HDAC7、PTP1B、SHP2、TBK1、Trib2、TRIF、TS、XPO1、RASN、ARID1B、スカベンジャーmRNAデキャッピング酵素DcpS、ALK、BTK、NTRK1、NTRK2、NTRK3、IDO、ERK2、ABL1、ABL2、ATK1、ATK2、BMX、CSK、EPHA3、EPHA4、EPHA7、EPHB4、FES、FYN、GSG2、INSR、HBV、CBL-B、ERK、WDR5、NSP3、IRAK4、NRAS、ADAR、ASCL1、PAX8、TP63、SARM1、アタキシン-2、KSR2、CXCR4、HDAC10、NSD2、WHSC1、RIT1、WRN、BAP1、EPAS1、HIF2α、GRB2、KMT2D、MLL2、MLL4、MLLT1、ENL、NSD3、PPM1D、WIP1、SOS1、TBXT、ブラキウリ、USP7、BKV、JCV、CK1α、GSPT1、ERF3、IFZV、TAU、CYP17A1、SALL4、FAM38、CYP20A1、HTT、NRF2、NFE2L2、P300、PIK3CA、SARM1、SNCA、MAPT、TCPTP、STAT3、MyD88、PTP4A3、SF3B1、ARID1B、及びARID2から選択される。
或る特定の実施形態において、本明細書において言及される標的タンパク質は、それを発現する遺伝子によって名付けられている。当業者は、遺伝子が標的タンパク質として言及される場合に、遺伝子によってコードされるタンパク質が標的タンパク質であることを認識するであろう。例えば、SMRCA2によってコードされるタンパク質SMCA2についてのリガンドは、SMRCA2の標的化リガンドとして言及される。
VI.標的化リガンド
或る特定の態様において、標的化リガンドは、選択されたデグレーダーによるプロテアソーム分解について選択された標的タンパク質に共有結合又は非共有結合するリガンドである。標的化リガンドは、標的タンパク質に結合する分子又は部分(例えば、ペプチド、ヌクレオチド、抗体、抗体フラグメント、アプタマー、生体分子、又は他の化学的構造物)であり、ここで、標的タンパク質は、以下で詳細に記載される宿主における疾患のメディエーターである。例示的な標的リガンドは、図1A~図63に示されている。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、宿主に対する治療効果を達成する手段としての分解について選択された内因性タンパク質に結合する。例示的な標的化リガンドとしては、数ある中で、RXRリガンド、DHFRリガンド、Hsp90阻害剤、キナーゼ阻害剤、HDM2阻害剤及びMDM2阻害剤、ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的とする化合物、HDAC阻害剤、MerTKのリガンド、IDH1のリガンド、Mcl-1のリガンド、SMRCA2のリガンド、EGFRのリガンド、RAFのリガンド、cRAFのリガンド、ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管新生阻害剤、核内ホルモン受容体化合物、免疫抑制化合物、及び芳香族炭化水素受容体(AHR)を標的とする化合物が挙げられる。標的化リガンドには、それらの薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、及び同位体誘導体も含まれると考えられる。
或る特定の態様において、標的化リガンドは、患者若しくは被験体において、又は診断アッセイにおいてデハロゲナーゼ酵素に結合し、ハロアルカン(好ましくは、少なくとも1つのハロ基で、好ましくはアルキル基の遠位端(すなわち、リンカーから離れたところ)のハロ基で置換されたC~C10アルキル基)である。また他の実施形態において、標的化リガンドは、ハロアルキル基であり、ここで、上記アルキル基は一般に、約1個又は2個の炭素長~約12個の炭素長、多くの場合に約2個~10個の炭素長、多くの場合に約3個の炭素長~約8個の炭素長、より多くの場合に約4個の炭素長~約6個の炭素長のサイズ範囲である。ハロアルキル基は一般に、直鎖状アルキル基であり(分岐鎖状アルキル基を使用することもできるが)、少なくとも1つのハロゲン基、好ましくは単一のハロゲン基、多くの場合に単一の塩化物基で末端封鎖されている。本発明において使用されるハロアルキルPT基は、好ましくは、化学構造-(CH-ハロによって表され、ここで、vは、2~約12、多くの場合に約3~約8、より多くの場合に約4~約6の任意の整数である。ハロは、あらゆるハロゲンであってもよいが、好ましくはCl又はBrであり、より多くの場合にClである。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、レチノイドX受容体(RXR)アゴニスト又はアンタゴニストである。非限定的な例としては、レチノール、レチノイン酸、ベキサロテン、ドコサヘキセン酸、国際公開第99/29324号、「初めてのレチノイドX受容体ホモ二量体アンタゴニストの同定(Identification of the First Retinoid X Receptor Homodimer Antagonist)」と題するCanan Koch et al.による出版物(J. Med. Chem. 1996, 39, 3229-3234)、国際公開第97/12853号、欧州特許出願公開第0947496号、国際公開第2016/002968号に開示される化合物、及びそれらの類似体が挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、DHFRアゴニスト又はアンタゴニストである。非限定的な例としては、葉酸、メトトレキサート、「N5位で置換された8,10-ジデアザテトラヒドロ葉酸類似体の合成、葉酸拮抗薬、及び抗癌活性(Synthesis, Antifolate and Anticancer Activities of N5-Substituted 8,10-Dideazatetrahydrofolate Analogues)」と題するTian et al.(Chem. Biol. Drug Des. 2016, 87, 444-454)によって開示された8,10-ジデアザテトラヒドロフォレート化合物、「リード分子の合理的な修飾:抗癌活性及びジヒドロ葉酸レダクターゼ阻害活性の増強(Rational Modification of the Lead Molecule: Enhancement in the Anticancer and Dihydrofolate Reductase Inhibitory Activity)」と題するKaur et al.(Biorg. Med. Chem. Lett. 2016, 26, 1936-1940)によって調製された化合物、国際公開第2016/022890号、「ジヒドロ葉酸レダクターゼの新たな小分子阻害剤は、ストレプトコッカス・ミュータンスを阻害する(New Small-Molecule Inhibitors of Dihydrofolate Reductase Inhibit Streptococcus Mutans)」と題するZhang et al.(Int. J. Antimicrob. Agents 46, 174-182)によって開示された化合物、「抗癌剤としての合理的に設計されたジヒドロ葉酸レダクターゼ阻害剤のメカニズムに触発された開発(Mechanism Inspired Development of Rationally Designed Dihydrofolate Reductase Inhibitors as Anticancer Agents)」と題するSingh et al.(J. Med. Chem. 2012, 55, 6381-6390)によって開発された修飾トリメトプリム類似体、国際公開第2011/153310号、及びそれらの類似体が挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、エストロゲン、エストロゲン類似体、SERM(選択的エストロゲン受容体モジュレーター)、SERD(選択的エストロゲン受容体デグレーダー)、完全エストロゲン受容体デグレーダー、又は部分的な若しくは完全なエストロゲンアンタゴニスト若しくはアゴニストの別形から誘導される。例は、部分的な抗エストロゲン剤であるラロキシフェン及びタモキシフェン、並びに完全な抗エストロゲン剤であるフルベストラントである。抗エストロゲン化合物の非限定的な例は、Astra Zenecaに譲渡された国際公開第2014/19176号、国際公開第2013/090921号、国際公開第2014/203129号、国際公開第2014/203132号、及びOlema Pharmaceuticalsに譲渡された米国特許出願公開第2013/0178445号、及び米国特許第9,078,871号、米国特許第8,853,423号、及び米国特許第8,703,810号、並びに米国特許出願公開第2015/0005286号、国際公開第2014/205136号、及び国際公開第2014/205138号に示されている。抗エストロゲン化合物の更なる非限定的な例としては、アノルドリン、バゼドキシフェン、ブロパレストロール、クロロトリアニセン、クエン酸クロミフェン、シクロフェニル、ラソフォキシフェン、オルメロキシフェン、ラロキシフェン、タモキシフェン、トレミフェン、及びフルベストラント等のSERMS、アミノグルテチミド、テストラクトン、アナストロゾール、エキセメスタン、ファドロゾール、フォルメスタン、及びレトロゾール等のアロマターゼ阻害剤、並びにリュープロレリン、セトロレリックス、アリルエストレノール、酢酸クロルマジノン、酢酸シプロテロン、酢酸デルマジノン、ジドロゲステロン、酢酸メドロキシプロゲステロン、酢酸メゲストロール、酢酸ノメゲストロール、酢酸ノルエチステロン、プロゲステロン、及びスピロノラクトン等の抗ゴナドトロピン剤が挙げられる。本発明により使用され得る他のエストロゲン性リガンドは、米国特許第4,418,068号、米国特許第5,478,847号、米国特許第5,393,763号、及び米国特許第5,457,117号、国際公開第2011/156518号、米国特許第8,455,534号及び米国特許第8,299,112号、米国特許第9,078,871号、米国特許第8,853,423号、米国特許第8,703,810号、米国特許出願公開第2015/0005286号、及び国際公開第2014/205138号、米国特許出願公開第2016/0175289号、米国特許出願公開第2015/0258080号、国際公開第2014/191726号、国際公開第2012/084711号、国際公開第2002/013802号、国際公開第2002/004418号、国際公開第2002/003992号、国際公開第2002/003991号、国際公開第2002/003990号、国際公開第2002/003989号、国際公開第2002/003988号、国際公開第2002/003986号、国際公開第2002/003977号、国際公開第2002/003976号、国際公開第2002/003975号、国際公開第2006/078834号、米国特許第6821989号、米国特許出願公開第2002/0128276号、米国特許第6777424号、米国特許出願公開第2002/0016340号、米国特許第6326392号、米国特許第6756401号、米国特許出願公開第2002/0013327号、米国特許第6512002号、米国特許第6632834号、米国特許出願公開第2001/0056099号、米国特許第6583170号、米国特許第6479535号、国際公開第1999/024027号、米国特許第6005102号、欧州特許第0802184号、米国特許第5998402号、米国特許第5780497号、米国特許第5880137号、国際公開第2012/048058号、及び国際公開第2007/087684号に記載されている。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、「熱ショックタンパク質90(Hsp90)阻害剤の三環式系列 パートI:Hsp90分子シャペロンの強力な阻害剤としての三環式イミダゾ[4,5-c]ピリジンの発見(Tricyclic Series of Heat Shock Protein 90 (Hsp90) Inhibitors Part I: Discovery of Tricyclic Imidazo[4,5-C]Pyridines as Potent Inhibitors of the Hsp90 Molecular Chaperone)」と題するVallee et al.(J. Med. Chem. 2011, 54, 7206-7219)において特定されたYKB(N-[4-(3H-イミダゾ[4,5-c]ピリジン-2-イル)-9H-フルオレン-9-イル]-スクシンアミド)を含むHSP90阻害剤、「4,5-ジアリールイソオキサゾールHsp90シャペロン阻害剤:癌治療用の潜在的治療剤(4,5-Diarylisoxazole Hsp90 Chaperone Inhibitors: Potential Therapeutic Agents for the Treatment of Cancer)」と題するBrough et al.(J. Med. Chem. 2008, 51, 196-218)において特定された化合物2GJ(5-[2,4-ジヒドロキシ-5-(1-メチルエチル)フェニル]-n-エチル-4-[4-(モルホリン-4-イルメチル)フェニル]イソオキサゾール-3-カルボキサミド)を含むHSP90阻害剤(修飾)、HSP90阻害剤のゲルダナマイシン((4E,6Z,8S,9S,10E,12S,13R,14S,16R)-13-ヒドロキシ-8,14,19-トリメトキシ-4,10,12,16-テトラメチル-3,20,22-トリオキソ-2-アザビシクロ[16.3.1](誘導体化)若しくはそれらの誘導体のいずれか(例えば、17-アルキルアミノ-17-デスメトキシゲルダナマイシン(「17-AAG」)又は17-(2-ジメチルアミノエチル)アミノ-17-デスメトキシゲルダナマイシン(「17-DMAG」))、又は「Hsp90アイソフォームへのプリン系阻害剤の結合における構造活性の相関(Structure-Activity Relationships in Purine-Based Inhibitor Binding to Hsp90 Isoforms)」と題するWright et al.(Chem. Biol. 2004, 11, 775-785)において特定されたHSP90阻害剤PU3を含むHSP90阻害剤(修飾)である。Hsp90の標的化リガンドのその他の非限定的な例としては、「再発性難治性血液悪性腫瘍を伴う成人患者におけるHsp90阻害剤Pf-04929113(Snx5422)の第I相試験(Phase I Trial of the Hsp90 Inhibitor Pf-04929113 (Snx5422) in Adult Patients with Recurrent, Refractory Hematologic Malignancies)」と題するReddy et al.(Clin. Lymphoma Myeloma Leuk. 2013, 13, 385-391)による現在第I相臨床試験中のSNX5422、又は「Nvp-Auy922:前臨床乳癌モデルにおける強力な抗腫瘍活性を有する小分子Hsp90阻害剤(Nvp-Auy922: A Small Molecule Hsp90 Inhibitor with Potent Antitumor Activity in Preclinical Breast Cancer Models)」と題するJensen et al.(Breast Cancer Research: BCR 2008, 10, R33-R33)によって抗癌活性が評価されたNVP-AUY922が挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、「慢性閉塞性肺疾患を治療する吸入用P38阻害剤の設計及び合成」(Design and Synthesis of Inhaled P38 Inhibitors for the Treatment of Chronic Obstructive Pulmonary Disease)」と題するMillan et al.(J. Med. Chem. 2011, 54, 7797-7814)において特定されたキナーゼ阻害剤Y1W及びキナーゼ阻害剤Y1Xを含むキナーゼ阻害剤、「強力で選択性が高いチエノピリジンヤヌスキナーゼ2阻害剤の発見(Discovery of Potent and Highly Selective Thienopyridine Janus Kinase 2 Inhibitors)」と題するSchenkel et al.(J. Med. Chem. 2011, 54, 8440-8450)において特定された化合物6TP及び化合物0TPを含むキナーゼ阻害剤、「新規のプロテインキナーゼCアイソザイムの強力で選択的な阻害剤としての2,6-ナフチリジン(2,6-Naphthyridines as Potent and Selective Inhibitors of the Novel Protein Kinase C Isozymes)」と題するvan Eis et al.(Biorg. Med. Chem. Lett. 2011, 21, 7367-7372)において特定されたキナーゼ阻害剤(「癌療法用の薬物標的であるチェックポイントキナーゼ2(Chk2)との阻害剤複合体の構造特性評価(Structural Characterization of Inhibitor Complexes with Checkpoint Kinase 2 (Chk2), a Drug Target for Cancer Therapy)」と題するLountos et al.(J. Struct. Biol. 2011, 176, 292-301)において特定されたキナーゼ阻害剤XK9及びキナーゼ阻害剤NXPを含むキナーゼ阻害剤07U及びキナーゼ阻害剤YCFを含む)、アファチニブ、フォスタマチニブ、ゲフィチニブ、レンバチニブ、バンデタニブ、グリベック、パゾパニブ、AT-9283、TAE684、ニロタニブ、NVP-BSK805、クリゾチニブ、JNJ FMS、フォレチニブ、OSI-027、OSI-930、又はOSI-906である。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、「Mdm2の小分子アンタゴニストによるP53経路のin vivoでの活性化(In Vivo Activation of the P53 Pathway by Small-Molecule Antagonists of Mdm2)」と題するVassilev et al.(Science 2004, 303, 844-848)及び「小分子によって誘導される標的細胞内タンパク質分解:ケミカルプロテオミクスへの道(Targeted Intracellular Protein Degradation Induced by a Small Molecule: En Route to Chemical Proteomics)」と題するSchneekloth et al.(Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 5904-5908)において特定された化合物ヌトリン-3、化合物ヌトリン-2、及び化合物ヌトリン-1を含むHDM2/MDM2阻害剤である。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、「Betブロモドメインの選択的阻害(Selective Inhibition of Bet Bromodomains)」と題するFilippakopoulos et al.(Nature 2010, 468, 1067-1073)において特定されたJQ1等のヒトBETブロモドメインの標的化リガンド、「合成ヒストン模倣体による炎症の抑制(Suppression of Inflammation by a Synthetic Histone Mimic)」と題するNicodeme et al.(Nature 2010, 468, 1119-1123)、「Betファミリーブロモドメインの小分子阻害剤の発見及び特性評価(Discovery and Characterization of Small Molecule Inhibitors of the Bet Family Bromodomains)」と題するChung et al.(J. Med. Chem. 2011, 54, 3827-3838)において特定されたリガンド、「3,5-ジメチルイソオキサゾールは、アセチル-リジン-模倣ブロモドメインリガンドとして作用する(3,5-Dimethylisoxazoles Act as Acetyl-Lysine-Mimetic Bromodomain Ligands)」と題するHewings et al.(J. Med. Chem. 2011, 54, 6761-6770)において開示された化合物、「MLL融合性白血病用の有効な治療としてのクロマチンへのBet動員の阻害(Inhibition of Bet Recruitment to Chromatin as an Effective Treatment for MLL-Fusion Leukaemia)」と題するDawson et al.(Nature 2011, 478, 529-533)において特定されたリガンド、又は以下の米国特許出願公開第2015/0256700号、米国特許出願公開第2015/0148342号、国際公開第2015/074064号、国際公開第2015/067770号、国際公開第2015/022332号、国際公開第2015/015318号、及び国際公開第2015/011084号の特許出願において特定されたリガンドである。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、「Tsa及びSaha阻害剤に結合したヒストンデアセチラーゼホモログの構造(Structures of a Histone Deacetylase Homologue Bound to the Tsa and Saha Inhibitors)」と題するFinnin et al.(Nature 1999, 401, 188-193)において特定されたHDACの標的化リガンド、又は国際公開第02/22577号のPCTにおいて式(I)として特定されたリガンドである。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、「Bix-01294によるG9a様タンパク質リジンメチルトランスフェラーゼ阻害の構造的基礎(Structural Basis for G9a-Like Protein Lysine Methyltransferase Inhibition by Bix-01294)」と題するChang et al.(Nat Struct Mol Biol 2009, 16, 312-317)において特定されたヒトリジンメチルトランスフェラーゼリガンド、「ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼG9aの強力で選択的な阻害剤としての2,4-ジアミノ-7-アミノアルコキシキナゾリンの発見(Discovery of a 2,4-Diamino-7-Aminoalkoxyquinazoline as a Potent and Selective Inhibitor of Histone Lysine Methyltransferase G9a)」と題するLiu et al.(J Med Chem 2009, 52, 7950-7953)において特定されたリガンド、アザシチジン、デシタビン、又はそれらの類似体である。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、血管新生阻害剤である。血管新生阻害剤の非限定的な例としては、GA-1、エストラジオール、テストステロン、オバリシン、フマギリン、及びそれらの類似体が挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、免疫抑制化合物である。免疫抑制化合物の非限定的な例としては、AP21998、ヒドロコルチゾン、プレドニゾン、プレドニゾロン、メチルプレドニゾロン、ジプロピオン酸ベクロメタゾン、メトトレキサート、シクロスポリン、タクロリムス、アクチノマイシン、及びそれらの類似体が挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、芳香族炭化水素受容体(AHR)リガンドである。AHRリガンドの非限定的な例としては、アピゲニン、SR1、LGC006、及びそれらの類似体が挙げられる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、MerTKの標的化リガンド又はMerの標的化リガンドである。MerTKの標的化リガンドの非限定的な例は、両者とも「癌治療用のピリミジン化合物(Pyrimidine Compounds for the Treatment of Cancer)」と題するWang, et al.によって出願された国際公開第2013/177168号及び国際公開第2014/085225号に含まれる。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、EGFRリガンドである。或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、アファチニブ、ダコミチニブ、ネラチニブ、ポジオチニブ、及びカネルチニブ、又はそれらの誘導体から選択されるEGRFリガンドである。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、FLT3リガンドである。或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、タンデュチニブ、レスタウルチニブ、ソラフェニブ、ミドスタウリン、キザルチニブ、及びクレノラニブから選択されるFLT3リガンドである。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、RAF阻害剤である。或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、ダブラフェニブ、レゴラフェニブ、及びベムラフェニブから選択されるRAF阻害剤である。或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、cRAF阻害剤である。
幾つかの実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、Hewitt, W.M., et. al. (2016) Angew.Chem.Int.Ed.Engl. 55: 5703-5707による「SUMO E2酵素Ubc9のアロステリック阻害への洞察(Insights Into the Allosteric Inhibition of the SUMO E2 Enzyme Ubc9.)」において記載されるものを含むUbc9 SUMO E2リガーゼ5F6Dの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「小分子阻害剤PJ34及びXAV939との複合体におけるヒトタンキラーゼ1の構造(Structure of human tankyrase 1 in complex with small-molecule inhibitors PJ34 and XAV939.)」 Kirby, C.A., Cheung, A., Fazal, A., Shultz, M.D., Stams, T, (2012) Acta Crystallogr.,Sect.F 68: 115-118、及び「タンキラーゼを阻害する新規のニコチンアミド同配体としての[1,2,4]トリアゾール-3-イルアミンの構造-有効性の関係(Structure-Efficiency Relationship of [1,2,4]Triazol-3-ylamines as Novel Nicotinamide Isosteres that Inhibit Tankyrases.)」 Shultz, M.D., et al. (2013) J.Med.Chem. 56: 7049-7059において記載されるものを含むTank1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「pp60SrcのSH2ドメインへの低親和性阻害剤フラグメントの特異的結合についての要件は、全長阻害剤の高親和性結合についての要件と同一である(Requirements for Specific Binding of Low Affinity Inhibitor Fragments to the SH2 Domain of pp60Src Are Identical to Those for High Affinity Binding of Full Length Inhibitors)」Gudrun Lange, et al., J. Med. Chem. 2003, 46, 5184-5195において記載されるものを含むpp60 Srcの標的化リガンドのSH2ドメインである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「リソソームタンパク質のサポシンBは、クロロキンに結合する(The Lysosomal Protein Saposin B Binds Chloroquine)」 Huta, B.P., et al., (2016) Chemmedchem 11: 277において記載されるものを含むSec7ドメインの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「サイトメガロウイルス免疫モジュレーターUL141の構造は、受容体結合についての構造的Igフォールド多様性を強調する(The structure of cytomegalovirus immune modulator UL141 highlights structural Ig-fold versatility for receptor binding)」 I. Nemcovicova and D. M. Zajonc Acta Cryst. (2014). D70, 851-862において記載されるものを含むサポシンBの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「2,6ANSとの複合体におけるヒトS100A7の2WOS構造(2WOS STRUCTURE OF HUMAN S100A7 IN COMPLEX WITH 2,6 ANS)」 DOI: 10.2210/pdb2wos/pdb及び「癌及び炎症経路における関係物であるS100A7上の結合部位の特定及び特性評価(Identification and Characterization of Binding Sites on S100A7, a Participant in Cancer and Inflammation Pathways.)」 Leon, R., Murray, et al., (2009) Biochemistry 48: 10591-10600において記載されるものを含むタンパク質S100-A7 2OWSの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「ヒト非膵臓分泌型ホスホリパーゼA2の初めての強力で選択的な阻害剤の構造ベースの設計(Structure-based design of the first potent and selective inhibitor of human non-pancreatic secretory phospholipase A2)」 Schevitz, R.W., et al., Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 458-465において記載されるものを含むホスホリパーゼA2の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「ポイズドフラグメントライブラリーにより、非定型ブロモドメインであるPHIP(2)の初めて報告された阻害剤をもたらす迅速な合成的拡張が可能となる(A Poised Fragment Library Enables Rapid Synthetic Expansion Yielding the First Reported Inhibitors of PHIP(2), an Atypical Bromodomain)」 Krojer, T.; et al. Chem. Sci. 2016, 7, 2322-2330において記載されるものを含むPHIPの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「AF6 PDZドメインの低分子量リガンドの発見(Discovery of Low-Molecular-Weight Ligands for the AF6 PDZ Domain)」 Mangesh Joshi, et al. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 3790-3795において記載されるものを含むPDZの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ-13/ジンクフィンガー抗ウイルスタンパク質におけるADP-リボシルトランスフェラーゼ活性の欠如についての構造的基礎(Structural Basis for Lack of ADP-ribosyltransferase Activity in Poly(ADP-ribose) Polymerase-13/Zinc Finger Antiviral Protein.)」 Karlberg, T., et al., (2015) J.Biol.Chem. 290: 7336-7344において記載されるものを含むPARP15の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「ドッキングベースの仮想スクリーニングを介したADP-リボシルトランスフェラーゼについてのリガンドの発見(Discovery of Ligands for ADP-Ribosyltransferases via Docking-Based Virtual Screening.)」 Andersson, C.D., et al.,(2012) J.Med.Chem. 55: 7706-7718.、「PARP及びタンキラーゼ阻害剤のファミリーワイドな化学的プロファイリング及び構造解析(Family-wide chemical profiling and structural analysis of PARP and tankyrase inhibitors.)」 Wahlberg, E., et al. (2012) Nat.Biotechnol. 30: 283-288、「ドッキングベースの仮想スクリーニングを介したADP-リボシルトランスフェラーゼについてのリガンドの発見(Discovery of Ligands for ADP-Ribosyltransferases via Docking-Based Virtual Screening)」 Andersson, C.D., et al. (2012) J.Med.Chem. 55: 7706-7718において記載されるものを含むPARP14の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「MTH1阻害は、dNTPプールのサニテーションを阻害することによって癌を消滅させる(MTH1 inhibition eradicates cancer by preventing sanitation of the dNTP pool)」 Helge Gad, et. al. Nature, 2014, 508, 215-221において記載されるものを含むMTH1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「mPGES-1阻害剤複合体の結晶構造は、強力な鎮痛性及び抗炎症性の療法薬の合理的な設計についての基礎を形成する(Crystal Structures of mPGES-1 Inhibitor Complexes Form a Basis for the Rational Design of Potent Analgesic and Anti-Inflammatory Therapeutics.)」 Luz, J.G., et al., (2015) J.Med.Chem. 58: 4727-4737において記載されるものを含むmPGES-1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「阻害剤が結合したヒト5-リポキシゲナーゼ活性化タンパク質の結晶構造(Crystal structure of inhibitor-bound human 5-lipoxygenase-activating protein)」 Ferguson, A.D., McKeever, B.M., Xu, S., Wisniewski, D., Miller, D.K., Yamin, T.T., Spencer, R.H., Chu, L., Ujjainwalla, F., Cunningham, B.R., Evans, J.F., Becker, J.W. (2007) Science 317: 510-512において記載されるものを含むFLAP-5-リポキシゲナーゼ活性化タンパク質の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「分子設計に関する現実世界の視点(A Real-World Perspective on Molecular Design.)」 Kuhn, B.; et al. J. Med. Chem. 2016, 59, 4087-4102において記載されるものを含むFA結合タンパク質の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、限定されるものではないが、「強力で選択的なBCL-2阻害剤であるABT-199は、血小板を温存しながら抗腫瘍活性を達成する(ABT-199, a potent and selective BCL-2 inhibitor, achieves antitumor activity while sparing platelets.)」Souers, A.J., et al. (2013) NAT.MED. (N.Y.) 19: 202-208において記載されるものを含むBCL2の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、NF2L2の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、CTNNB1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、CBLBの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、BCL6の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、RASKの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、TNIKの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、MEN1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、PI3Kaの標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、IDO1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、MCL1の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、PTPN2の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、HER2の標的化リガンドである。
別の実施形態において、標的化リガンドは、EGFRの標的化リガンドである。或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、エルロチニブ(タルセバ)、ゲフィチニブ(イレッサ)、アファチニブ(ジロトリフ(Gilotrif))、ロシレチニブ(CO-1686)、オシメルチニブ(タグリッソ)、オルムチニブ(オリタ)、ナコチニブ(ASP8273)、ナザルチニブ(EGF816)、PF-06747775(Pfizer)、イコチニブ(BPI-2009)、ネラチニブ(HKI-272、PB272)、アビチニブ(AC0010)、EAI045、タルロキソチニブ(TH-4000、PR-610)、PF-06459988(Pfizer)、テセバチニブ(XL647、EXEL-7647、KD-019)、トランスチニブ、WZ-3146、WZ8040、CNX-2006、及びダコミチニブ(PF-00299804、Pfizer)から選択される。リンカーは、これらの標的化リガンド上の、リガンドがEGFRに結合するのを妨げないあらゆる場所に配置され得る。リンカーの結合場所の非限定的な例を以下の表に示す。或る特定の実施形態において、EGFRの標的化リガンドは、EGFRのL858R突然変異体に結合する。別の実施形態において、EGFRの標的化リガンドは、EGFRのT790M突然変異体に結合する。別の実施形態において、EGFRの標的化リガンドは、EGFRのC797G突然変異体又はC797S突然変異体に結合する。或る特定の実施形態において、EGFRの標的化リガンドは、エルロチニブ、ゲフィチニブ、アファチニブ、ネラチニブ、及びダコミチニブから選択され、EGFRのL858R突然変異体に結合する。別の実施形態において、EGFRの標的化リガンドは、オシメルチニブ、ロシレチニブ、オルムチニブ、ナコチニブ、ナザルチニブ、PF-06747775、イコチニブ、ネラチニブ、アビチニブ、タルロキソチニブ、PF-0645998、テセバチニブ、トランスチニブ(Transtinib)、WZ-3146、WZ8040、及びCNX-2006から選択され、EGFRのT790M突然変異体に結合する。別の実施形態において、EGFRの標的化リガンドは、EAI045であり、EGFRのC797G突然変異体又はC797S突然変異体に結合する。
或る特定の実施形態において、タンパク質標的及び標的化リガンドのペアは、リガンドのライブラリーをスクリーニングすることにより選択される。そのようなスクリーニングは、Duong-Ly et alによる「キナーゼ阻害剤のプロファイリングにより、疾患関連突然変異キナーゼを阻害する予期せぬ機会が明らかになる(Kinase Inhibitor Profiling Reveals Unexpected Opportunities to Inhibit Disease-Associated Mutant Kinases)」; Cell Reports 14, 772-781 February 2, 2016において例示されている。
或る特定の実施形態において、タンパク質標的及び標的化リガンドのペアは、曖昧なキナーゼ結合リガンドをコンテクスト特異的分解についてスクリーニングすることによって発見される。標的化リガンドの非限定的な例を以下に示すが、これらは、「キナーゼ阻害剤プロファイリングに最適化されたケミカルプロテオミクスアッセイ(Optimized Chemical Proteomics Assay for Kinase Inhibitor Profiling)」 Guillaume Medard, Fiona Pachl, Benjamin Ruprecht, Susan Klaeger,Stephanie Heinzlmeir, Dominic Helm, Huichao Qiao, Xin Ku, Mathias Wilhelm, Thomas Kuehne, Zhixiang Wu, Antje Dittmann, Carsten Hopf, Karl Kramer, and Bernhard Kuster J. Proteome Res., 2015, 14(3), pp 1574-1586において見出される:
Figure 2023545507000338
Figure 2023545507000339
これらのリガンドは、以下に示されるようにリンカーに取り付けられ得る:
Figure 2023545507000340
Figure 2023545507000341
Figure 2023545507000342
Figure 2023545507000343
Figure 2023545507000344
(式中、Rは、スペーサーが取り付けられる例示的な点を表す)。
代替的な実施形態において、標的化リガンドは、DOTL1リガンド、CBPリガンド、ERK1リガンド、ERK2リガンド、JAK2リガンド、FGFR3リガンド、FGFR4リガンド、WDR5リガンド、PAK4リガンド、BRAFリガンド、KRASリガンド、BTKリガンド、及びSHOC2リガンドから選択される。別の代替的な実施形態において、標的化リガンドは、UCHL1リガンド、USP1リガンド、USP2リガンド、USP4リガンド、USP6リガンド、USP7リガンド、USP8リガンド、USP9xリガンド、USP10リガンド、USP11リガンド、USP13リガンド、USP14リガンド、USP17リガンド、及びUSP28リガンドから選択される。
本発明によれば、標的化リガンドは、治療用途のためのデグレーダーの所望の結果を達成するあらゆる方式でリンカーに共有結合され得る。或る特定の非限定的な実施形態において、標的化リガンドは、リガンドの標的タンパク質への結合に悪影響を及ぼさない官能基を有するリンカーに結合される。以下の取り付け点は、例示的な性質のものであり、当業者は様々な適切な取り付け点を決定することができるであろう。
以下に記載される非限定的な化合物は、これらの種類の標的化リガンドのメンバーの一部を例示している。
或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、ASH1Lに結合する。例えば、ASH1L小分子阻害剤は、国際公開第2017/197240号(引用することによりその全体が本明細書の一部をなす)に記載される通りであり得る。或る特定の実施形態において、標的化リガンドは、
Figure 2023545507000345
(式中、全ての可変部は、国際公開第2017/197240号に定義される通りである)である。国際公開第2017/197240号の出願に記載されているように、幾つかの実施形態において、そこに示される式のいずれかを、リンカーで接続されたASH1L阻害剤及びE3ユビキチンリガーゼリガンドから構成される二官能性化合物に変換することができ、この化合物は、ASH1Lに結合し、Eユビキチンリガーゼ(セレブロン、VHLリガーゼ等)複合体を動員して、ASH1Lをユビキチン化し、プロテアソームを媒介したASH1Lの分解を誘導する機能を有する。本発明において、リンカーは、本明細書に記載されるデグロンに共有結合した本明細書において定義されるリンカーである。
代替的な実施形態において、標的化リガンドは、国際公開第2018/065768号、国際公開第2018/060742号、国際公開第2018/060691号、国際公開第2018/060689号、国際公開第2017/163078号、国際公開第2017/158388号、国際公開第2017/158381号、国際公開第2017/141036号、国際公開第2018/103614号、国際公開第2017/093718号、国際公開第2017/009650号、国際公開第2016/156816号、又は国際公開第2016/046530号において記載される脱ユビキチン化酵素(DUB)阻害剤である。
代替的な実施形態において、本明細書に記載される標的化リガンドのいずれも、R101から選択される1個以上、例えば1個、2個、3個、4個、又は5個の基で任意に置換されていてもよい。
VII.治療方法
式I、式II、又は式IIIの化合物は、本明細書に記載の任意の障害を治療するために、任意に薬学的に許容可能な担体中で、それを必要とするヒトを含む宿主の治療に有効量で使用することができる。
本明細書において使用される「治療する(treat)」、「治療する(treating)」、及び「治療(treatment)」等の用語は、本化合物が結合するタンパク質によって調節されるあらゆる疾患状態又は病態の治療を含む、本化合物が投与され得る患者に便益を与えるあらゆる行為を指す。本発明による化合物を使用して治療され得る、癌を含む例示的で非限定的な疾患状態又は病態は、本明細書において上記に示されている。
本明細書に記載される式I、式II、又は式IIIの化合物及び組成物を使用して、ヒト等の患者を冒す障害の媒介物である標的タンパク質を分解することができる。本発明の式I、式II、又は式IIIの化合物によってもたらされるタンパク質レベルの制御は、細胞、例えば患者の細胞内のそのタンパク質のレベルを低下させることによって標的タンパク質によって調節される疾患状態又は病態の治療を提供する。或る特定の実施形態において、上記方法は、任意に薬学的に許容可能な添加剤、担体、アジュバントを含む有効量の本明細書に記載される化合物、すなわち薬学的に許容可能な組成物を、任意に別の生物活性剤又は活性剤の組合せと組み合わせて投与することを含む。
式I、式II、又は式IIIの化合物に関連して使用される場合の「疾患状態又は病態」という用語は、標的タンパク質を介してタンパク質の調節不全(すなわち、患者において発現されるタンパク質の量が上昇している)が起こり、患者におけるそのようなタンパク質の分解が、有益な療法又は症状の緩和を必要とする患者にそれをもたらし得るあらゆる疾患状態又は病態を指すことを意味する。或る特定の場合において、疾患状態又は病態は治癒し得る。式I、式II、又は式IIIの化合物は、ヒトを含む宿主に有効量で投与した場合に、例えば、B細胞リンパ腫又はT細胞リンパ腫、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ウィスコット・アルドリッチ症候群、又は移植後リンパ増殖性障害等の骨髄増殖性障害又はリンパ増殖性障害、アジソン病、セリアック病、皮膚筋炎、グレーブス病、甲状腺炎、多発性硬化症、悪性貧血、反応性関節炎、狼瘡、又はI型糖尿病等の自己免疫障害を含む免疫障害、高コレステロール血症を含む心臓機能不全の疾患、ウイルス感染症及び/又は細菌感染症を含む感染性疾患、喘息、慢性消化性潰瘍、結核、関節リウマチ、歯周炎、潰瘍性大腸炎、クローン病、又は肝炎を含む炎症性病態を治療するのに治療剤として有用である。
例えば、式V、式VI、式VII、式VIII、又は式XIIの化合物に関連して使用される場合の「疾患状態又は病態」という用語は、限定されるものではないが、セレブロン結合体であるサリドマイド、ポマリドミド、又はレナリドミドについて知られる用途を含む、セレブロン又はセレブロン含有E3リガーゼの活性を減少させることによって治療され得るあらゆる治療適応症を指す。セレブロン結合体についての用途の非限定的な例は、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群等の血液障害、癌、腫瘍、異常な細胞増殖、HIV/AIDS、HBV、HCV、肝炎、クローン病、サルコイドーシス、移植片対宿主病、関節リウマチ、ベーチェット病、結核、及び骨髄線維症である。他の適応症としては、B細胞リンパ腫又はT細胞リンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ウィスコット・アルドリッチ症候群、又は移植後リンパ増殖性障害等の骨髄増殖性障害又はリンパ増殖性障害、アジソン病、セリアック病、皮膚筋炎、グレーブス病、甲状腺炎、多発性硬化症、悪性貧血、関節炎、及び特に関節リウマチ、狼瘡、又はI型糖尿病等の自己免疫障害を含む免疫障害、高コレステロール血症を含む心臓機能不全の疾患、本明細書において一般的に記載されるウイルス感染症及び/又は細菌感染症を含む感染性疾患、喘息、慢性消化性潰瘍、結核、関節リウマチ、歯周炎、及び潰瘍性大腸炎を含む炎症性病態が挙げられる。
或る特定の実施形態において、本発明は、式I、式II、又は式IIIの化合物を、任意に別の生物活性剤と組み合わせて、感染性疾患を有する患者、例えばヒトに投与することを提供し、ここで、この療法は、感染病原体のタンパク質を標的とする。疾患状態又は病態は、ウイルス(非限定的な例として、HIV、HBV、HCV、HSV、HPV、RSV、CMV、エボラ、フラビウイルス、ペスチウイルス、ロタウイルス、インフルエンザ、コロナウイルス、EBV、ウイルス性肺炎、薬剤耐性ウイルス、鳥インフルエンザ、RNAウイルス、DNAウイルス、アデノウイルス、ポックスウイルス、ピコルナウイルス、トガウイルス、オルソミクソウイルス、レトロウイルス、又はヘパドノウイルス)、細菌(グラム陰性、グラム陽性)、真菌、原生動物、蠕虫、ワーム、プリオン、寄生虫、若しくは他の微生物等の微生物病原体若しくは他の外因性病原体によって引き起こされる疾患であり得るか、又は疾患状態及び/又は病態をもたらすタンパク質の過剰発現によって引き起こされる疾患状態であり得る。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物で治療される病態は、異常な細胞増殖に関連する障害である。異常な細胞増殖、特に過剰増殖は、遺伝子突然変異、感染、毒素への曝露、自己免疫障害、及び良性腫瘍又は悪性腫瘍の誘発を含む多岐にわたる要因の結果として起こり得る。
細胞過剰増殖と関連する多数の皮膚障害が存在する。例えば、乾癬は、概して肥厚鱗屑によって覆われたプラークを特徴とするヒト皮膚の良性疾患である。この疾患は、原因不明の表皮細胞の増殖増加に起因する。慢性湿疹も表皮の顕著な過剰増殖と関連する。皮膚細胞の過剰増殖に起因する他の疾患としては、アトピー性皮膚炎、扁平苔癬、疣贅、尋常性天疱瘡、日光角化症、基底細胞癌及び扁平上皮癌が挙げられる。
他の過剰増殖性細胞障害としては、血管増殖障害、線維性障害、自己免疫障害、移植片対宿主拒絶反応、腫瘍及び癌が挙げられる。
血管増殖性障害は、血管新生障害及び血管原性障害を含む。血管組織中のプラークの発生の過程での平滑筋細胞の増殖は、例えば再狭窄、網膜症及びアテローム性動脈硬化症を引き起こす。細胞移動及び細胞増殖の両方が動脈硬化病変の形成において役割を果たす。
線維性障害は、細胞外基質の異常形成が原因であることが多い。線維性障害の例としては、肝硬変及びメサンギウム増殖性細胞障害が挙げられる。肝硬変は、肝臓瘢痕の形成を生じる細胞外基質構成要素の増加を特徴とする。肝硬変は、肝臓の硬変等の疾患を引き起こす可能性がある。肝臓瘢痕を生じる細胞外基質の増加は、肝炎等のウイルス感染に起因する可能性もある。脂質細胞が肝硬変において重要な役割を果たすようである。
メサンギウム障害は、メサンギウム細胞の異常増殖によって引き起こされる。メサンギウム過剰増殖性細胞障害には、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、悪性腎硬化症、血栓性微小血管症症候群、移植片拒絶反応及び糸球体症等の様々なヒト腎疾患が含まれる。
増殖性成分による別の疾患は関節リウマチである。関節リウマチは概して、自己反応性T細胞の活性と関連し、コラーゲン及びIgEに対して産生される自己抗体に起因すると考えられる自己免疫疾患とみなされる。
異常細胞増殖性成分を含み得る他の障害としては、ベーチェット症候群、急性呼吸促迫症候群(ARDS)、虚血性心疾患、透析後症候群、白血病、後天性免疫不全症候群、血管炎、脂質性組織球増殖症、敗血性ショック及び一般的な炎症が挙げられる。
皮膚接触過敏症及び喘息は、顕著な罹患率を伴い得る免疫応答のほんの二例である。他にはアトピー性皮膚炎、湿疹、シェーグレン症候群に続発する乾性角結膜炎を含むシェーグレン症候群、円形脱毛症、節足動物刺咬反応によるアレルギー応答、クローン病、アフタ性潰瘍、虹彩炎、結膜炎、角結膜炎、潰瘍性大腸炎、皮膚エリテマト-デス、強皮症、膣炎、直腸炎及び薬疹が挙げられる。これらの病態は、以下の症状又は兆候のいずれか1つ以上を生じる可能性がある:掻痒、腫脹、発赤、水疱、痂皮形成、潰瘍形成、疼痛、落屑、ひび割れ、脱毛、瘢痕化、又は皮膚、眼若しくは粘膜に生じる体液の滲出。
アトピー性皮膚炎及び湿疹では、概して皮膚への免疫介在性白血球浸潤(特に単核細胞、リンパ球、好中球及び好酸球の浸潤)がこれらの疾患の発症に重要に寄与する。慢性湿疹も表皮の顕著な過剰増殖と関連する。免疫介在性白血球浸潤は、喘息では気道、乾性角結膜炎では眼の涙腺(tear producing gland)のように皮膚以外の部位にも生じる。
非限定的な一実施形態において、本発明の化合物は接触性皮膚炎、アトピー性皮膚炎、湿疹様皮膚炎、乾癬、シェーグレン症候群に続発する乾性角結膜炎を含むシェーグレン症候群、円形脱毛症、節足動物刺咬反応によるアレルギー応答、クローン病、アフタ性潰瘍、虹彩炎、結膜炎、角結膜炎、潰瘍性大腸炎、喘息、アレルギー性喘息、皮膚エリテマト-デス、強皮症、膣炎、直腸炎及び薬疹の治療に外用剤として使用される。この新規の方法は、菌状息肉症等の疾患における悪性白血球による皮膚の浸潤の低減にも有用であり得る。これらの化合物を使用して、化合物を眼に局所的に投与することによって、涙液減少型ドライアイ(免疫介在性角結膜炎等)に苦しむ患者においてそれを治療することもできる。
本発明による化合物を用いて治療することができる疾患状態又は病態としては、例えば喘息、多発性硬化症等の自己免疫疾患、様々な癌、繊毛関連疾患、口蓋裂、糖尿病、心臓病、高血圧、炎症性腸疾患、精神遅滞、気分障害、肥満、屈折異常、不妊、アンジェルマン症候群、カナバン病、セリアック病、シャルコー-マリー-トゥース病、嚢胞性線維症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ヘモクロマトーシス、血友病、クラインフェルター症候群、神経線維腫症、フェニルケトン尿症、多発性嚢胞腎1(PKD1)又は2(PKD2)、プラダー-ウィリー症候群、鎌状赤血球症、テイ-サックス病、ターナー症候群が挙げられる。
本発明による化合物によって治療することができる更なる疾患状態又は病態としては、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症(ルーゲーリック病)、神経性無食欲症、不安障害、アテローム性動脈硬化症、注意欠陥多動性障害、自閉症、双極性障害、慢性疲労症候群、慢性閉塞性肺疾患、クローン病、冠状動脈性心疾患、認知症、鬱病、1型糖尿病、2型糖尿病、癲癇、ギラン-バレー症候群、過敏性腸症候群、ループス、メタボリックシンドローム、多発性硬化症、心筋梗塞、肥満、強迫性障害、パニック障害、パーキンソン病、乾癬、関節リウマチ、サルコイドーシス、統合失調症、脳卒中、閉塞性血栓性血管炎、トゥレット症候群、血管炎が挙げられる。
本発明による化合物によって治療することができる更に付加的な疾患状態又は病態としては、特に無セルロプラスミン血症、軟骨無形成症II型、軟骨形成不全、尖頭症、ゴーシェ病2型、急性間欠性ポルフィリン症、カナバン病、大腸腺腫性ポリポーシス、ALAデヒドラターゼ欠損症、アデニロコハク酸リアーゼ欠損症、副腎性器症候群、副腎白質ジストロフィー、ALA-Dポルフィリン症、ALAデヒドラターゼ欠損症、アルカプトン尿症、アレキサンダー病、アルカプトン尿性組織褐変症、α1-アンチトリプシン欠損症、α-1プロテイナーゼ阻害剤欠損症、肺気腫、筋萎縮性側索硬化症、アルストレーム症候群、アレキサンダー病、エナメル質形成不全症、ALAデヒドラターゼ欠損症、アンダーソン-ファブリー病、アンドロゲン不応症、貧血、びまん性体部被角血管腫、網膜血管腫症(フォンヒッペル-リンドウ病)、アペール症候群、クモ指症(マルファン症候群)、スティックラー症候群、先天性多発性関節弛緩症(エーラス-ダンロス症候群#多発性関節弛緩型)、毛細血管拡張性運動失調症、レット症候群、原発性肺高血圧、サンドホフ病、神経線維腫症II型、ベーレ-スティーブンソン脳回状頭皮症候群、家族性地中海熱、ベンジャミン症候群、β-サラセミア、両側性聴神経線維腫症(神経線維腫症II型)、第V因子ライデン栓友病、ブロッホ-サルツバーガー症候群(色素失調症)、ブルーム症候群、X連鎖鉄芽球性貧血、ボンネヴィー-ウルリッヒ症候群(ターナー症候群)、ブルヌヴィーユ病(結節性硬化症)、プリオン病、バート-ホッグ-デュベ症候群、骨粗鬆症(骨形成不全症)、幅広母指-母趾症候群(Broad Thumb-Hallux syndrome)(ルビンシュタイン-テイビ症候群)、青銅色糖尿病/青銅色肝硬変(Bronzed Cirrhosis)(ヘモクロマトーシス)、球脊髄型筋萎縮症(ケネディ病)、ビュルガー-グリュッツ症候群(リポタンパク質リパーゼ欠損症)、CGD慢性肉芽腫症、屈曲肢異形成症、ビオチニダーゼ欠損症、心筋症(ヌーナン症候群)、猫鳴き症候群、CAVD(先天性精管欠損症)、ケイラー心臓顔症候群(CBAVD)、CEP(先天性赤芽球性ポルフィリン症)、嚢胞性線維症、先天性甲状腺機能低下症、軟骨形成異常症候群(軟骨形成不全)、耳脊椎巨大骨端異形成症、レッシュ-ナイハン症候群、ガラクトース血症、エーラス-ダンロス症候群、致死性異形成症、コフィン-ローリー症候群、コケイン症候群(家族性腺腫性ポリポーシス)、先天性赤芽球性ポルフィリン症、先天性心疾患、メトヘモグロビン血症/先天性メトヘモグロビン血症、軟骨形成不全、X連鎖鉄芽球性貧血、結合組織病、円錐動脈幹異常顔貌症候群、クーリー貧血症(β-サラセミア)、銅蓄積症(ウィルソン病)、銅輸送病(Copper transport disease)(メンケス病)、遺伝性コプロポルフィリン症、カウデン症候群、頭蓋顔面関節異常(クルーゾン症候群)、クロイツフェルト-ヤコブ病(プリオン病)、コケイン症候群、カウデン症候群、クルシュマン-バッテン-シュタイナート症候群(筋強直性ジストロフィー)、ベーレ-スティーブンソン脳回状頭皮症候群、原発性高シュウ酸尿症、脊椎骨端骨幹端異形成症(ストラドウィック型)、デュシェンヌ及びベッカー型筋ジストロフィー(DBMD)、アッシャー症候群、ドグルーシー症候群及びデジェリン-ソッタス症候群を含む退行性神経疾患、発達障害、遠位型脊髄性筋萎縮症V型、アンドロゲン不応症、びまん性グロボイド体硬化症(クラッベ病)、ディジョージ症候群、ジヒドロテストステロン受容体欠損症、アンドロゲン不応症、ダウン症候群、小人症、骨髄性プロトポルフィリン症、赤血球型5-アミノレブリン酸合成酵素欠損症、赤芽球性ポルフィリン症、骨髄性プロトポルフィリン症、赤血球産生性ウロポルフィリン症、フリードライヒ運動失調症-家族性発作性多漿膜炎、晩発性皮膚、家族性圧過敏性ニューロパチー、原発性肺高血圧(PPH)、膵臓線維性嚢胞、脆弱X症候群、ガラクトース血症、遺伝性脳障害、巨細胞性肝炎(新生児ヘモクロマトーシス)、グレンブラッド-ストランドベリー症候群(弾力繊維性仮性黄色腫)、ギュンター病(先天性赤芽球性ポルフィリン症)、ヘモクロマトーシス、ハルグレン症候群、鎌状赤血球貧血、血友病、肝性骨髄性ポルフィリン症(HEP)、ヒッペル-リンドウ病(フォンヒッペル-リンドウ病)、ハンチントン病、ハッチンソン-ギルフォード-プロジェリア症候群(早老症)、高アンドロゲン症、軟骨低形成症、低色素性貧血、X連鎖重症複合免疫不全症を含む免疫系障害、インスレー-アストリー症候群、ジャクソン-ワイス症候群、ジュベール症候群、レッシュ-ナイハン症候群、ジャクソン-ワイス症候群、高シュウ酸尿症を含む腎疾患、クラインフェルター症候群、クニースト異形成症、まだら認知症、ランガー-サルディーノ軟骨無形成症、毛細血管拡張性運動失調症、リンチ症候群、リシルヒドロキシラーゼ欠損症、マチャド-ジョセフ病、クニースト異形成症を含む代謝障害、マルファン症候群、運動障害、モワット-ウィルソン症候群、嚢胞性線維症、ムエンケ症候群、多発性神経線維腫症、ナンス-インスレー症候群、ナンス-スウィーニー軟骨異形成症、ニーマン-ピック病、ノアク症候群(ファイファー症候群)、オスラー-ウェーバー-ランジュ病、ポイツ-ジェガース症候群、多発性嚢胞腎、多骨性線維性骨異形成(マッキューン-オールブライト症候群)、ポイツ-ジェガース症候群、プラダー-ラープハルト-ウィリー症候群、ヘモクロマトーシス、原発性高尿酸血症(レッシュ-ナイハン症候群)、原発性肺高血圧、原発性老年性変性認知症、プリオン病、早老症(ハッチンソンギルフォードプロジェリア症候群)、慢性遺伝性進行性舞踏病(ハンチントン)(ハンチントン病)、進行性筋萎縮症、脊髄性筋萎縮症、プロピオン酸血症、プロトポルフィリン症、近位型筋強直性ジストロフィー、肺動脈性肺高血圧症、PXE(弾力繊維性仮性黄色腫)、Rb(網膜芽細胞腫)、レックリングハウゼン病(神経線維腫症I型)、再発性多発性漿膜炎、網膜障害、網膜芽細胞腫、レット症候群、3型RFALS、リッカー症候群、ライリー-デイ症候群、ルシー-レビー症候群、発達遅滞及び黒色表皮腫を伴う重度の軟骨形成不全(SADDAN)、リー-フラウメニ症候群、肉腫、乳房、白血病及び副腎(sarcoma, breast, leukemia, and adrenal gland)(SBLA)症候群、結節性硬化症(sclerosis tuberose (tuberous sclerosis))、SDAT、先天性SED(先天性脊椎骨端骨異形成症)、ストラドウィック型SED(ストラドウィック型脊椎骨端骨幹端異形成症)、SEDc(先天性脊椎骨端骨異形成症)、ストラドウィック型SEMD(ストラドウィック型脊椎骨端骨幹端異形成症)、シュプリンツェン症候群、皮膚色素沈着障害、スミス-レムリ-オピッツ症候群、南アフリカ遺伝性ポルフィリン症(異型ポルフィリン症)、乳児発症上行性遺伝性痙性麻痺、言語及びコミュニケーション障害、スフィンゴリピドーシス、テイ-サックス病、脊髄小脳失調、スティックラー症候群、脳卒中、アンドロゲン不応症、テトラヒドロビオプテリン欠損症、β-サラセミア、甲状腺疾患、ソーセージ様ニューロパチー(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー)、トリーチャーコリンズ症候群、トリプロX症候群(トリプルX症候群)、トリソミー21(ダウン症候群)、トリソミーX、VHL症候群(フォンヒッペル-リンドウ病)、視力障害及び失明(アルストレーム症候群)、フロリク病、ワールデンブルグ症候群、ワールブルグ-ショー-フレデリウス症候群、ヴァイセンバッハー-ツヴァイミューラー症候群、ウォルフ-ヒルシュホーン症候群、ウォルフ周期性疾患、ヴァイセンバッハー-ツヴァイミューラー症候群、並びに色素性乾皮症が挙げられる。
「新形成(neoplasia)」又は「癌」という用語は、本明細書全体を通して、癌性又は悪性新生物、すなわち、多くの場合、正常よりも急速に細胞増殖によって成長し、新たな成長を開始させた刺激が停止した後も成長し続ける異常組織の形成及び成長をもたらす病理過程を指すために使用される。悪性新生物は、構造的構成及び正常組織との機能的協調の部分的又は完全な欠如を示し、殆どが周辺組織に侵入し、幾つかの部位に転移し、除去を試みた後も再発する可能性があり、適切に治療しなければ患者の死亡を引き起こす。本明細書で使用される場合、新形成という用語は、全ての癌性疾患状態を記載するために使用され、悪性血液原性腫瘍、腹水腫瘍及び固形腫瘍と関連する病理過程を含む又は包含する。単独での又は少なくとも1つの付加的な抗癌剤と組み合わせた本化合物によって治療することができる例示的な癌としては、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、肝細胞癌、並びに腎細胞癌、膀胱、腸、乳房、子宮頸部、結腸、食道、頭部、腎臓、肝臓、肺、頚部、卵巣、膵臓、前立腺及び胃の癌;白血病;良性及び悪性リンパ腫、特にバーキットリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫;良性及び悪性黒色腫;骨髄増殖性疾患;ユーイング肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、脂肪肉腫、筋肉腫、末梢性神経上皮腫、滑膜肉腫、神経膠腫、星状細胞腫、乏突起膠腫、上衣腫、膠芽腫、神経芽細胞腫、神経節細胞腫、神経節膠腫、髄芽腫、松果体細胞腫瘍、髄膜腫、髄膜肉腫、神経繊維腫及びシュワン細胞腫を含む肉腫;腸癌、乳癌、前立腺癌、子宮頸癌、子宮癌、肺癌、卵巣癌、精巣癌、甲状腺癌、星状細胞腫、食道癌、膵臓癌、胃癌、肝臓癌、結腸癌、黒色腫;癌肉腫、ホジキン病、ウィルムス腫瘍及び奇形癌が挙げられる。本発明による化合物を用いて治療することができる付加的な癌としては、例えばT細胞性急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)、T細胞性リンパ芽球性リンパ腫(T-LL)、末梢性T細胞リンパ腫、成人T細胞白血病、Pre-B ALL、Pre-Bリンパ腫、大細胞型B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、B細胞ALL、フィラデルフィア染色体陽性ALL及びフィラデルフィア染色体陽性CMLが挙げられる。
本発明による開示の化合物を用いて治療することができる付加的な癌としては、例えば急性顆粒球性白血病、急性リンパ球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、腺癌、腺肉腫、副腎癌、副腎皮質癌、肛門癌、未分化星状細胞腫、血管肉腫、虫垂癌、星状細胞腫、基底細胞癌、B細胞リンパ腫、胆管癌、膀胱癌、骨癌、骨髄癌、腸癌、脳癌、脳幹グリオーマ、乳癌、トリプル(エストロゲン、プロゲステロン及びHER-2)ネガティブ乳癌、ダブルネガティブ乳癌(エストロゲン、プロゲステロン及びHER-2の2つが陰性である)、シングルネガティブ(エストロゲン、プロゲステロン及びHER-2の1つが陰性である)、エストロゲン受容体陽性、HER2陰性乳癌、エストロゲン受容体陰性乳癌、エストロゲン受容体陽性乳癌、転移性乳癌、ルミナルA乳癌、ルミナルB乳癌、Her2陰性乳癌、HER2陽性又は陰性乳癌、プロゲステロン受容体陰性乳癌、プロゲステロン受容体陽性乳癌、再発乳癌、カルチノイド腫瘍、子宮頸癌、胆管癌、軟骨肉腫、慢性リンパ球性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、結腸癌、大腸癌、頭蓋咽頭腫、皮膚リンパ腫、皮膚黒色腫、びまん性星状細胞腫、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、類上皮肉腫、食道癌、ユーイング肉腫、肝外胆管癌、眼癌、ファローピウス管癌、線維肉腫、胆嚢癌、胃部癌、消化管癌、消化管カルチノイド癌、消化管間質腫瘍(GIST)、胚細胞腫瘍、多形性膠芽腫(GBM)、神経膠腫、有毛細胞白血病、頭頸部癌、血管内皮腫、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、浸潤性乳管癌(IDC)、浸潤性小葉癌(ILC)、炎症性乳癌(IBC)、腸癌、肝内胆管癌、侵襲性/浸潤性乳癌、膵島細胞癌、顎癌、カポジ肉腫、腎臓癌、喉頭癌、平滑筋肉腫、軟膜転移、白血病、口唇癌、脂肪肉腫、肝臓癌、非浸潤性小葉癌、低悪性度星状細胞腫、肺癌、リンパ節癌、リンパ腫、男性乳癌、髄様癌、髄芽腫、黒色腫、髄膜腫、メルケル細胞癌、間葉性軟骨肉腫、間葉性(mesenchymous)中皮腫、転移性乳癌、転移性黒色腫、転移性扁平上皮頸部癌、混合神経膠腫、単胚葉性奇形腫(monodermal teratoma)、口癌(mouth cancer)、粘液癌、粘膜黒色腫、多発性骨髄腫、菌状息肉症、骨髄異形成症候群、鼻腔癌、鼻咽腔癌、頸部癌、神経芽細胞腫、神経内分泌腫瘍(NET)、非ホジキンリンパ腫、非小細胞肺癌(NSCLC)、燕麦細胞癌、眼癌、眼内黒色腫、乏突起膠腫、口部癌、口腔癌、口腔咽頭癌、骨原性肉腫、骨肉腫、卵巣癌、上皮性卵巣癌、卵巣胚細胞腫瘍、卵巣原発性腹膜癌、卵巣性索間質腫瘍、ページェット病、膵臓癌、乳頭状癌、副鼻腔癌、副甲状腺癌、骨盤癌、陰茎癌、末梢神経癌、腹膜癌、咽頭癌、褐色細胞腫、毛様細胞性星状細胞腫、松果体部腫瘍、松果体芽腫、脳下垂体癌、原発性中枢神経系(CNS)リンパ腫、前立腺癌、直腸癌、腎細胞癌、腎盂癌、横紋筋肉腫、唾液腺癌、軟部組織肉腫、骨の肉腫(bone sarcoma)、肉腫、副鼻腔癌、皮膚癌、小細胞肺癌(SCLC)、小腸癌、脊椎癌、脊柱癌、脊髄癌、扁平上皮癌、胃癌、滑膜肉腫、T細胞リンパ腫、精巣癌、咽喉癌、胸腺腫/胸腺癌、甲状腺癌、舌癌、扁桃腺癌、移行上皮癌、卵管癌、管状癌(tubular carcinoma)、診断未確定の癌、尿管癌、尿道癌、子宮腺癌、子宮癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、T細胞性急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)、T細胞性リンパ芽球性リンパ腫(T-LL)、末梢性T細胞リンパ腫、成人T細胞白血病、Pre-B ALL、Pre-Bリンパ腫、大細胞型B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、B細胞ALL、フィラデルフィア染色体陽性ALL、フィラデルフィア染色体陽性CML、若年性骨髄単球性白血病(JMML)、急性前骨髄球性白血病(AMLのサブタイプ)、大顆粒リンパ球性白血病、成人T細胞慢性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫;粘膜関連リンパ組織リンパ腫(MALT)、小細胞型リンパ球性リンパ腫、縦隔大細胞型B細胞リンパ腫、節性辺縁帯B細胞リンパ腫(NMZL);脾辺縁帯リンパ腫(SMZL);血管内大細胞型B細胞リンパ腫;原発性滲出性リンパ腫;又はリンパ腫様肉芽腫症;B細胞前リンパ球性白血病;分類不能脾リンパ腫/白血病、びまん性赤脾髄小型B細胞リンパ腫;リンパ形質細胞性リンパ腫;重鎖病、例えばα重鎖病、γ重鎖病、μ重鎖病、形質細胞性骨髄腫、骨の孤立性形質細胞腫;骨外性形質細胞腫;原発性皮膚濾胞中心リンパ腫、T細胞/組織球豊富型大細胞型B細胞リンパ腫、慢性炎症と関連するDLBCL;高齢者のエプスタインバーウイルス(EBV)+DLBCL;原発性縦隔(胸腺)大細胞型B細胞リンパ腫、原発性皮膚DLBCL下肢型、ALK+大細胞型B細胞リンパ腫、形質芽細胞性リンパ腫;HHV8関連多中心性キャッスルマン病に生ずる大細胞型B細胞リンパ腫;びまん性大細胞型B細胞リンパ腫の中間的な特徴を有する分類不能B細胞リンパ腫、又はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫と古典的ホジキンリンパ腫との中間的な特徴を有する分類不能B細胞リンパ腫が挙げられる。
或る特定の実施形態において、癌はNUT正中線癌である。
或る特定の実施形態において、癌は腺様嚢胞癌である。
「生物活性剤」という用語は、本発明による化合物以外の作用物質であって、本化合物と組み合わせて、本化合物が使用される意図された療法、阻害、及び/又は未然防止/予防の達成を補助する生物学的活性を有する作用物質として使用される、作用物質を説明するのに使用される。本明細書において使用するのに好ましい生物活性剤としては、本化合物が使用又は投与されるものと同様の薬理学的活性を有する作用物質が挙げられ、例えば、抗癌剤、特に抗HIV剤及び抗HCV剤を含む抗ウイルス剤、抗微生物剤、抗真菌剤等が挙げられる。
VIII.併用療法
本明細書に記載される開示の化合物は、本明細書に記載されるものを含むが、それに限定されない障害を有するヒト等の患者を治療するために、単独で、又は別の本発明の化合物若しくは別の生物活性剤若しくは第2の治療剤と組み合わせて有効量で使用することができる。
「生物活性剤」という用語は、療法の所望の結果を達成するために本発明の化合物と組み合わせて又は交互に使用することができる、本発明による選択された化合物以外の作用物質を記載するために使用される。或る特定の実施形態において、本発明の化合物及び生物活性剤は、それらが重複する期間中にin vivoで活性な、例えばCmax、Tmax、AUC又は他の薬物動態パラメーターが重複する期間を有するように投与される。別の実施形態において、重複する薬物動態パラメーターを有しないが、一方が他方の治療効力に対して治療的影響を有する、本発明の化合物及び生物活性剤がそれを必要とする患者に投与される。
本実施形態の一態様では、生物活性剤は、非限定的な例としてPD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、PD-L2阻害剤、CTLA-4阻害剤、LAG-3阻害剤、TIM-3阻害剤、T細胞活性化のVドメインIgサプレッサー(V-domain Ig suppressor of T-cell activation:VISTA)阻害剤を含むチェックポイント阻害剤、小分子、ペプチド、ヌクレオチド又は他の阻害剤を含むが、これらに限定されない免疫調節剤である。或る特定の態様では、免疫調節剤はモノクローナル抗体等の抗体である。
PD-1受容体に結合することによってPD-1及びPD-L1の相互作用を遮断し、免疫抑制を阻害するPD-1阻害剤としては例えば、ニボルマブ(Opdivo)、ペムブロリズマブ(Keytruda)、ピディリズマブ、AMP-224(AstraZeneca及びMedImmune)、PF-06801591(Pfizer)、MEDI0680(AstraZeneca)、PDR001(Novartis)、REGN2810(Regeneron)、SHR-12-1(Jiangsu Hengrui Medicine Company及びIncyte Corporation)、TSR-042(Tesaro)及びPD-L1/VISTA阻害剤CA-170(Curis Inc.)が挙げられる。PD-L1受容体に結合することによってPD-1及びPD-L1の相互作用を遮断し、免疫抑制を阻害するPD-L1阻害剤としては例えば、アテゾリズマブ(Tecentriq)、デュルバルマブ(AstraZeneca及びMedImmune)、KN035(Alphamab)及びBMS-936559(Bristol-Myers Squibb)が挙げられる。CTLA-4に結合し、免疫抑制を阻害するCTLA-4チェックポイント阻害剤としては、イピリムマブ、トレメリムマブ(AstraZeneca及びMedImmune)、AGEN1884及びAGEN2041(Agenus)が挙げられるが、これらに限定されない。LAG-3チェックポイント阻害剤としては、BMS-986016(Bristol-Myers Squibb)、GSK2831781(GlaxoSmithKline)、IMP321(Prima BioMed)、LAG525(Novartis)、並びにPD-1及びLAG-3の二重阻害剤MGD013(MacroGenics)が挙げられるが、これらに限定されない。TIM-3阻害剤の一例は、TSR-022(Tesaro)である。
或る特定の実施形態においては、チェックポイント阻害剤は、ニボルマブ/OPDIVO(商標)、ペムブロリズマブ/KEYTRUDA(商標)、及びピディリズマブ/CT-011、MPDL3280A/RG7446、MEDI4736、MSB0010718C、BMS 936559、AMP 224等のPDL2/lg融合タンパク質、若しくはB7-H3(例えば、MGA271)、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG 3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK1、CHK2、A2aR、B-7ファミリーリガンドの阻害剤、又はそれらの組合せから選択される。
また別の実施形態において、本明細書に記載される活性化合物のうちの1つを乳癌、卵巣癌、子宮内膜癌又は子宮癌等の女性生殖器系の異常組織の治療のために、SERM(選択的エストロゲン受容体モジュレーター)、SERD(選択的エストロゲン受容体デグレーダー、完全エストロゲン受容体デグレーダー、又は別の形態の部分若しくは完全エストロゲンアンタゴニスト若しくはアゴニストを含むが、これらに限定されない有効量のエストロゲン阻害剤と組み合わせて又は交互に有効量で投与することができる。ラロキシフェン及びタモキシフェンのような部分的な抗エストロゲン剤は、子宮成長のエストロゲン様刺激、及び場合によっては、腫瘍成長を実際に刺激する乳癌の進行中のエストロゲン様作用を含む幾らかのエストロゲン様効果を保持する。対照的に、完全な抗エストロゲン剤であるフルベストラントは、子宮に対するエストロゲン様作用を有さず、タモキシフェン耐性腫瘍において効果的である。
抗エストロゲン化合物の非限定的な例は、Astra Zenecaに譲渡された国際公開第2014/19176号、Olema Pharmaceuticalsに譲渡された国際公開第2013/090921号、国際公開第2014/203129号、国際公開第2014/203132号及び米国特許出願公開第2013/0178445号、並びに米国特許第9,078,871号、同第8,853,423号及び同第8,703,810号、並びに米国特許出願公開第2015/0005286号、国際公開第2014/205136号及び国際公開第2014/205138号に提示されている。
抗エストロゲン化合物の付加的な非限定的な例としては、アノルドリン、バゼドキシフェン、ブロパレストロール、クロロトリアニセン、クエン酸クロミフェン、シクロフェニル、ラソフォキシフェン、オルメロキシフェン、ラロキシフェン、タモキシフェン、トレミフェン及びフルベストラント等のSERM;アミノグルテチミド、テストラクトン、アナストロゾール、エキセメスタン、ファドロゾール、ホルメスタン及びレトロゾール等のアロマターゼ阻害剤;並びにリュープロレリン、セトロレリックス、アリルエストレノール、酢酸クロルマジノン、酢酸シプロテロン、酢酸デルマジノン、ジドロゲステロン、酢酸メドロキシプロゲステロン、酢酸メゲストロール、酢酸ノメゲストロール、酢酸ノルエチステロン、プロゲステロン及びスピロノラクトン等の抗ゴナドトロピンが挙げられる。
本発明に従って使用することができる他のエストロゲンリガンドは、米国特許第4,418,068号;同第5,478,847号;同第5,393,763号;及び同第5,457,117号、国際公開第2011/156518号、米国特許第8,455,534号及び同第8,299,112号、米国特許第9,078,871号;同第8,853,423号;同第8,703,810号;米国特許出願公開第2015/0005286号;及び国際公開第2014/205138号、米国特許出願公開第2016/0175289号、米国特許出願公開第2015/0258080号、国際公開第2014/191726号、国際公開第2012/084711号;国際公開第2002/013802号;国際公開第2002/004418号;国際公開第2002/003992号;国際公開第2002/003991号;国際公開第2002/003990号;国際公開第2002/003989号;国際公開第2002/003988号;国際公開第2002/003986号;国際公開第2002/003977号;国際公開第2002/003976号;国際公開第2002/003975号;国際公開第2006/078834号;米国特許第6821989号;米国特許出願公開第2002/0128276号;米国特許第6777424号;米国特許出願公開第2002/0016340号;米国特許第6326392号;米国特許第6756401号;米国特許出願公開第2002/0013327号;米国特許第6512002号;米国特許第6632834号;米国特許出願公開第2001/0056099号;米国特許第6583170号;米国特許第6479535号;国際公開第1999/024027号;米国特許第6005102号;欧州特許第0802184号;米国特許第5998402号;米国特許第5780497号、米国特許第5880137号、国際公開第2012/048058号及び国際公開第2007/087684号に記載されている。
別の実施形態において、本明細書に記載される活性化合物は、前立腺癌又は精巣癌等の男性生殖器系の異常組織の治療のために、選択的アンドロゲン受容体モジュレーター、選択的アンドロゲン受容体デグレーダー、完全アンドロゲン受容体デグレーダー、又は別の形態の部分若しくは完全アンドロゲンアンタゴニストを含むが、これらに限定されない有効量のアンドロゲン(テストステロン等)阻害剤と組み合わせて又は交互に有効量で投与することができる。或る特定の実施形態において、前立腺又は精巣癌はアンドロゲン耐性である。
抗アンドロゲン化合物の非限定的な例は、国際公開第2011/156518号、並びに米国特許第8,455,534号及び同第8,299,112号に提示されている。抗アンドロゲン化合物の付加的な非限定的な例としては、エンザルタミド、アパルタミド、酢酸シプロテロン、酢酸クロルマジノン、スピロノラクトン、カンレノン、ドロスピレノン、ケトコナゾール、トピルタミド、酢酸アビラテロン及びシメチジンが挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はALK阻害剤である。ALK阻害剤の例としては、クリゾチニブ、アレクチニブ、セリチニブ、TAE684(NVP-TAE684)、GSK1838705A、AZD3463、ASP3026、PF-06463922、エントレクチニブ(RXDX-101)及びAP26113が挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はEGFR阻害剤である。EGFR阻害剤の例としては、エルロチニブ(タルセバ)、ゲフィチニブ(イレッサ)、アファチニブ(ジロトリフ)、ロシレチニブ(CO-1686)、オシメルチニブ(タグリッソ)、オルムチニブ(オリタ)、ナコチニブ(ASP8273)、ナザルチニブ(EGF816)、PF-06747775(Pfizer)、イコチニブ(BPI-2009)、ネラチニブ(HKI-272;PB272);アビチニブ(AC0010)、EAI045、タルロキソチニブ(TH-4000;PR-610)、PF-06459988(Pfizer)、テセバチニブ(XL647;EXEL-7647;KD-019)、トランスチニブ、WZ-3146、WZ8040、CNX-2006及びダコミチニブ(PF-00299804;Pfizer)が挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はHER-2阻害剤である。HER-2阻害剤の例としては、トラスツズマブ、ラパチニブ、ado-トラスツズマブエムタンシン及びペルツズマブが挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はCD20阻害剤である。CD20阻害剤の例としては、オビヌツズマブ、リツキシマブ、オファツムマブ、イブリツモマブ、トシツモマブ及びオクレリズマブが挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はJAK3阻害剤である。JAK3阻害剤の例としては、タソシチニブが挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はBCL-2阻害剤である。BCL-2阻害剤の例としては、ベネトクラクス、ABT-199(4-[4-[[2-(4-クロロフェニル)-4,4-ジメチルシクロヘキサ-1-エン-1-イル]メチル]ピペラジン-1-イル]-N-[[3-ニトロ-4-[[(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)メチル]アミノ]フェニル]スルホニル]-2-[(1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-5-イル)オキシ]ベンズアミド)、ABT-737(4-[4-[[2-(4-クロロフェニル)フェニル]メチル]ピペラジン-1-イル]-N-[4-[[(2R)-4-(ジメチルアミノ)-1-フェニルスルファニルブタン-2-イル]アミノ]-3-ニトロフェニル]スルホニルベンズアミド)(navitoclax)、ABT-263((R)-4-(4-((4’-クロロ-4,4-ジメチル-3,4,5,6-テトラヒドロ-[1,1’-ビフェニル]-2-イル)メチル)ピペラジン-1-イル)-N-((4-((4-モルホリノ-1-(フェニルチオ)ブタン-2-イル)アミノ)-3((トリフルオロメチル)スルホニル)フェニル)スルホニル)ベンズアミド)、GX15-070(メシル酸オバトクラックス、(2Z)-2-[(5Z)-5-[(3,5-ジメチル-1H-ピロール-2-イル)メチリデン]-4-メトキシピロール-2-イリデン]インドール;メタンスルホン酸)))、2-メトキシ-アンチマイシンA3、YC137(4-(4,9-ジオキソ-4,9-ジヒドロナフト[2,3-d]チアゾール-2-イルアミノ)-フェニルエステル)、ポゴシン、エチル2-アミノ-6-ブロモ-4-(1-シアノ-2-エトキシ-2-オキソエチル)-4H-クロメン-3-カルボキシレート、ニロチニブ-d3、TW-37(N-[4-[[2-(1,1-ジメチルエチル)フェニル]スルホニル]フェニル]-2,3,4-トリヒドロキシ-5-[[2-(1-メチルエチル)フェニル]メチル]ベンズアミド)、アポゴッシポロン(ApoG2)、HA14-1、AT101、sabutoclax、ガンボギン酸又はG3139(オブリメルセン)が挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はキナーゼ阻害剤である。或る特定の実施形態において、キナーゼ阻害剤はホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)阻害剤、ブルトン型チロシンキナーゼ(BTK)阻害剤若しくは脾臓チロシンキナーゼ(Syk)阻害剤、又はそれらの組合せから選択される。
PI3キナーゼ阻害剤の例としては、ワートマニン、デメトキシビリジン、ペリホシン、イデラリシブ、ピクチリシブ、Palomid 529、ZSTK474、PWT33597、CUDC-907及びAEZS-136、デュベリシブ(duvelisib)、GS-9820、BKM120、GDC-0032(タセリシブ)、(2-[4-[2-(2-イソプロピル-5-メチル-1,2,4-トリアゾール-3-イル)-5,6-ジヒドロイミダゾ[1,2-d][1,4]ベンゾオキサゼピン-9-イル]ピラゾール-1-イル]-2-メチルプロパンアミド)、MLN-1117((2R)-1-フェノキシ-2-ブタニル水素(S)-メチルホスホネート;又はメチル(オキソ){[(2R)-1-フェノキシ-2-ブタニル]オキシ}ホスホニウム))、BYL-719((2S)-N1-[4-メチル-5-[2-(2,2,2-トリフルオロ-1,1-ジメチルエチル)-4-ピリジニル]-2-チアゾリル]-1,2-ピロリジンジカルボキシアミド)、GSK2126458(2,4-ジフルオロ-N-{2-(メチルオキシ)-5-[4-(4-ピリダジニル)-6-キノリニル]-3-ピリジニル}ベンゼンスルホンアミド)(オミパリシブ)、TGX-221((±)-7-メチル-2-(モルホリン-4-イル)-9-(1-フェニルアミノエチル)-ピリド[1,2-a]-ピリミジン-4-オン)、GSK2636771(2-メチル-1-(2-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンジル)-6-モルホリノ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-4-カルボン酸ジヒドロクロリド)、KIN-193((R)-2-((1-(7-メチル-2-モルホリノ-4-オキソ-4H-ピリド[1,2-a]ピリミジン-9-イル)エチル)アミノ)安息香酸)、TGR-1202/RP5264、GS-9820((S)-1-(4-((2-(2-アミノピリミジン-5-イル)-7-メチル-4-モヒドロキシプロパン(mohydroxypropan)-1-オン)、GS-1101(5-フルオロ-3-フェニル-2-([S)]-1-[9H-プリン-6-イルアミノ]-プロピル)-3H-キナゾリン-4-オン)、AMG-319、GSK-2269557、SAR245409(N-(4-(N-(3-((3,5-ジメトキシフェニル)アミノ)キノキサリン-2-イル)スルファモイル)フェニル)-3-メトキシ-4メチルベンズアミド)、BAY80-6946(2-アミノ-N-(7-メトキシ-8-(3-モルホリノプロポキシ)-2,3-ジヒドロイミダゾ[1,2-c]キナズ(quinaz))、AS 252424(5-[1-[5-(4-フルオロ-2-ヒドロキシ-フェニル)-フラン-2-イル]-メタ-(Z)-イリデン]-チアゾリジン-2,4-ジオン)、CZ 24832(5-(2-アミノ-8-フルオロ-[1,2,4]トリアゾロ[1,5-a]ピリジン-6-イル)-N-tert-ブチルピリジン-3-スルホンアミド)、ブパルリシブ(5-[2,6-ジ(4-モルホリニル)-4-ピリミジニル]-4-(トリフルオロメチル)-2-ピリジンアミン)、GDC-0941(2-(1H-インダゾール-4-イル)-6-[[4-(メチルスルホニル)-1-ピペラジニル]メチル]-4-(4-モルホリニル)チエノ[3,2-d]ピリミジン)、GDC-0980((S)-1-(4-((2-(2-アミノピリミジン-5-イル)-7-メチル-4-モルホリノチエノ[3,2-d]ピリミジン-6-イル)メチル)ピペラジン-1-イル)-2-ヒドロキシプロパン-1-オン(RG7422としても知られる))、SF1126((8S,14S,17S)-14-(カルボキシメチル)-8-(3-グアニジノプロピル)-17-(ヒドロキシメチル)-3,6,9,12,15-ペンタオキソ-1-(4-(4-オキソ-8-フェニル-4H-クロメン-2-イル)モルホリノ-4-イウム)-2-オキサ-7,10,13,16-テトラアザオクタデカン-18-オエート)、PF-05212384(N-[4-[[4-(ジメチルアミノ)-1-ピペリジニル]カルボニル]フェニル]-N’-[4-(4,6-ジ-4-モルホリニル-1,3,5-トリアジン-2-イル)フェニル]尿素)(ゲダトリシブ)、LY3023414、BEZ235(2-メチル-2-{4-[3-メチル-2-オキソ-8-(キノリン-3-イル)-2,3-ジヒドロ-1H-イミダゾ[4,5-c]キノリン-1-イル]フェニル}プロパンニトリル)(ダクトリシブ(dactolisib))、XL-765(N-(3-(N-(3-(3,5-ジメトキシフェニルアミノ)キノキサリン-2-イル)スルファモイル)フェニル)-3-メトキシ-4-メチルベンズアミド)及びGSK1059615(5-[[4-(4-ピリジニル)-6-キノリニル]メチレン]-2,4-チアゾリジンジオン)、PX886([(3aR,6E,9S,9aR,10R,11aS)-6-[[ビス(プロパ-2-エニル)アミノ]メチリデン]-5-ヒドロキシ-9-(メトキシメチル)-9a,11a-ジメチル-1,4,7-トリオキソ-2,3,3a,9,10,11-ヘキサヒドロインデノ[4,5h]イソクロメン-10-イル]アセテート(ソノリシブ(sonolisib)としても知られる))、LY294002、AZD8186、PF-4989216、ピララリシブ(pilaralisib)、GNE-317、PI-3065、PI-103、NU7441(KU-57788)、HS 173、VS-5584(SB2343)、CZC24832、TG100-115、A66、YM201636、CAY10505、PIK-75、PIK-93、AS-605240、BGT226(NVP-BGT226)、AZD6482、ボクスタリシブ(voxtalisib)、アルペリシブ、IC-87114、TGI100713、CH5132799、PKI-402、コパンリシブ(BAY 80-6946)、XL 147、PIK-90、PIK-293、PIK-294、3-MA(3-メチルアデニン)、AS-252424、AS-604850、アピトリシブ(GDC-0980;RG7422)が挙げられるが、これらに限定されない。
BTK阻害剤の例としては、イブルチニブ(PCI-32765としても知られる)(Imbruvica(商標))(1-[(3R)-3-[4-アミノ-3-(4-フェノキシ-フェニル)ピラゾロ[3,4-d]ピリミジン-1-イル]ピペリジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン)、ジアニリノピリミジン系阻害剤、例えばAVL-101及びAVL-291/292(N-(3-((5-フルオロ-2-((4-(2-メトキシエトキシ)フェニル)アミノ)ピリミジン-4-イル)アミノ)フェニル)アクリルアミド)(Avila Therapeutics)(米国特許出願公開第2011/0117073号(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、ダサチニブ(N-(2-クロロ-6-メチルフェニル)-2-(6-(4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-メチルピリミジン-4-イルアミノ)チアゾール-5-カルボキサミド)、LFM-A13(α-シアノ-β-ヒドロキシ-β-メチル-N-(2,5-ジブロモフェニル)プロペンアミド)、GDC-0834(R-N-(3-(6-(4-(1,4-ジメチル-3-オキソピペラジン-2-イル)フェニルアミノ)-4-メチル-5-オキソ-4,5-ジヒドロピラジン-2-イル)-2-メチルフェニル)-4,5,6,7-テトラヒドロベンゾ[b]チオフェン-2-カルボキサミド)、CGI-560 4-(tert-ブチル)-N-(3-(8-(フェニルアミノ)イミダゾ[1,2-a]ピラジン-6-イル)フェニル)ベンズアミド、CGI-1746(4-(tert-ブチル)-N-(2-メチル-3-(4-メチル-6-((4-(モルホリン-4-カルボニル)フェニル)アミノ)-5-オキソ-4,5-ジヒドロピラジン-2-イル)フェニル)ベンズアミド)、CNX-774(4-(4-((4-((3-アクリルアミドフェニル)アミノ)-5-フルオロピリミジン-2-イル)アミノ)フェノキシ)-N-メチルピコリンアミド)、CTA056(7-ベンジル-1-(3-(ピペリジン-1-イル)プロピル)-2-(4-(ピリジン-4-イル)フェニル)-1H-イミダゾ[4,5-g]キノキサリン-6(5H)-オン)、GDC-0834((R)-N-(3-(6-((4-(1,4-ジメチル-3-オキソピペラジン-2-イル)フェニル)アミノ)-4-メチル-5-オキソ-4,5-ジヒドロピラジン-2-イル)-2-メチルフェニル)-4,5,6,7-テトラヒドロベンゾ[b]チオフェン-2-カルボキサミド)、GDC-0837((R)-N-(3-(6-((4-(1,4-ジメチル-3-オキソピペラジン-2-イル)フェニル)アミノ)-4-メチル-5-オキソ-4,5-ジヒドロピラジン-2-イル)-2-メチルフェニル)-4,5,6,7-テトラヒドロベンゾ[b]チオフェン-2-カルボキサミド)、HM-71224、ACP-196、ONO-4059(Ono Pharmaceuticals)、PRT062607(4-((3-(2H-1,2,3-トリアゾール-2-イル)フェニル)アミノ)-2-(((1R,2S)-2-アミノシクロヘキシル)アミノ)ピリミジン-5-カルボキサミド塩酸塩)、QL-47(1-(1-アクリロイルインドリン-6-イル)-9-(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)ベンゾ[h][1,6]ナフチリジン-2(1H)-オン)及びRN486(6-シクロプロピル-8-フルオロ-2-(2-ヒドロキシメチル-3-{1-メチル-5-[5-(4-メチル-ピペラジン-1-イル)-ピリジン-2-イルアミノ]-6-オキソ-1,6-ジヒドロ-ピリジン-3-イル}-フェニル)-2H-イソキノリン-1-オン)、並びにBTK活性を阻害することが可能な他の分子、例えばAkinleye et ah, Journal of Hematology & Oncology, 2013, 6:59(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)に開示されるBTK阻害剤が挙げられる。
Syk阻害剤は、セルデュラチニブ(Cerdulatinib)(4-(シクロプロピルアミノ)-2-((4-(4-(エチルスルホニル)ピペラジン-1-イル)フェニル)アミノ)ピリミジン-5-カルボキサミド)、エントスプレチニブ(entospletinib)(6-(1H-インダゾール-6-イル)-N-(4-モルホリノフェニル)イミダゾ[1,2-a]ピラジン-8-アミン)、フォスタマチニブ([6-({5-フルオロ-2-[(3,4,5-トリメトキシフェニル)アミノ]-4-ピリミジニル}アミノ)-2,2-ジメチル-3-オキソ-2,3-ジヒドロ-4H-ピリド[3,2-b][1,4]オキサジン-4-イル]メチル二水素ホスフェート)、フォスタマチニブ二ナトリウム塩(ナトリウム(6-((5-フルオロ-2-((3,4,5-トリメトキシフェニル)アミノ)ピリミジン-4-イル)アミノ)-2,2-ジメチル-3-オキソ-2H-ピリド[3,2-b][1,4]オキサジン-4(3H)-イル)メチルホスフェート)、BAY 61-3606(2-(7-(3,4-ジメトキシフェニル)-イミダゾ[1,2-c]ピリミジン-5-イルアミノ)-ニコチンアミドHCl)、RO9021(6-[(1R,2S)-2-アミノ-シクロヘキシルアミノ]-4-(5,6-ジメチル-ピリジン-2-イルアミノ)-ピリダジン-3-カルボン酸アミド)、イマチニブ(グリベック;4-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-N-(4-メチル-3-{[4-(ピリジン-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ}フェニル)ベンズアミド)、スタウロスポリン、GSK143(2-(((3R,4R)-3-アミノテトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)アミノ)-4-(p-トリルアミノ)ピリミジン-5-カルボキサミド)、PP2(1-(tert-ブチル)-3-(4-クロロフェニル)-1H-ピラゾロ[3,4-d]ピリミジン-4-アミン)、PRT-060318(2-(((1R,2S)-2-アミノシクロヘキシル)アミノ)-4-(m-トリルアミノ)ピリミジン-5-カルボキサミド)、PRT-062607(4-((3-(2H-1,2,3-トリアゾール-2-イル)フェニル)アミノ)-2-(((1R,2S)-2-アミノシクロヘキシル)アミノ)ピリミジン-5-カルボキサミド塩酸塩)、R112(3,3’-((5-フルオロピリミジン-2,4-ジイル)ビス(アザンジイル))ジフェノール)、R348(3-エチル-4-メチルピリジン)、R406(6-((5-フルオロ-2-((3,4,5-トリメトキシフェニル)アミノ)ピリミジン-4-イル)アミノ)-2,2-ジメチル-2H-ピリド[3,2-b][1,4]オキサジン-3(4H)-オン)、ピセアタンノール(3-ヒドロキシレスベラトロール)、YM193306(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643を参照されたい)、7-アザインドール、ピセアタンノール、ER-27319(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、化合物D(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、PRT060318(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、ルテオリン(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、アピゲニン(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、ケルセチン(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、フィセチン(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、ミリセチン(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)、モリン(Singh et al. Discovery and Development of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) Inhibitors, J. Med. Chem. 2012, 55, 3614-3643(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)が挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はMEK阻害剤である。MEK阻害剤は既知であり、例えばトラメチニブ/GSK1120212(N-(3-{3-シクロプロピル-5-[(2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ]-6,8-ジメチル-2,4,7-トリオキソ-3,4,6,7-テトラヒドロピリド[4,3-d]ピリミジン-1(2H)-イル}フェニル)アセトアミド)、セルメチニブ(6-(4-ブロモ-2-クロロアニリノ)-7-フルオロ-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-3-メチルベンズイミダゾール-5-カルボキサミド)、ピマセルチブ/AS703026/MSC 1935369((S)-N-(2,3-ジヒドロキシプロピル)-3-((2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ)イソニコチンアミド)、XL-518/GDC-0973(1-({3,4-ジフルオロ-2-[(2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ]フェニル}カルボニル)-3-[(2S)-ピペリジン-2-イル]アゼチジン-3-オール)、レファメチニブ/BAY869766/RDEA119(N-(3,4-ジフルオロ-2-(2-フルオロ-4-ヨードフェニルアミノ)-6-メトキシフェニル)-1-(2,3-ジヒドロキシプロピル)シクロプロパン-1-スルホンアミド)、PD-0325901(N-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]-3,4-ジフルオロ-2-[(2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ]-ベンズアミド)、TAK733((R)-3-(2,3-ジヒドロキシプロピル)-6-フルオロ-5-(2-フルオロ-4-ヨードフェニルアミノ)-8-メチルピリド[2,3-d]ピリミジン-4,7(3H,8H)-ジオン)、MEK162/ARRY438162(5-[(4-ブロモ-2-フルオロフェニル)アミノ]-4-フルオロ-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-1-メチル-1H-ベンズイミダゾール-6-カルボキサミド)、R05126766(3-[[3-フルオロ-2-(メチルスルファモイルアミノ)-4-ピリジル]メチル]-4-メチル-7-ピリミジン-2-イルオキシクロメン-2-オン)、WX-554、R04987655/CH4987655(3,4-ジフルオロ-2-((2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ)-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-5-((3-オキソ-1,2-オキサジナン-2イル)メチル)ベンズアミド)又はAZD8330(2-((2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ)-N-(2ヒドロキシエトキシ)-1,5-ジメチル-6-オキソ-1,6-ジヒドロピリジン-3-カルボキサミド)、U0126-EtOH、PD184352(CI-1040)、GDC-0623、BI-847325、コビメチニブ、PD98059、BIX02189、BIX02188、ビニメチニブ、SL-327、TAK-733、PD318088が挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はRaf阻害剤である。Raf阻害剤は既知であり、例えばベムラフェニブ(N-[3-[[5-(4-クロロフェニル)-1H-ピロロ[2,3-b]ピリジン-3-イル]カルボニル]-2,4-ジフルオロフェニル]-1-プロパンスルホンアミド)、トシル酸ソラフェニブ(4-[4-[[4-クロロ-3-(トリフルオロメチル)フェニル]カルバモイルアミノ]フェノキシ]-N-メチルピリジン-2-カルボキサミド;4-メチルベンゼンスルホネート)、AZ628(3-(2-シアノプロパン-2-イル)-N-(4-メチル-3-(3-メチル-4-オキソ-3,4-ジヒドロキナゾリン-6-イルアミノ)フェニル)ベンズアミド)、NVP-BHG712(4-メチル-3-(1-メチル-6-(ピリジン-3-イル)-1H-ピラゾロ[3,4-d]ピリミジン-4-イルアミノ)-N-(3-(トリフルオロメチル)フェニル)ベンズアミド)、RAF-265(1-メチル-5-[2-[5-(トリフルオロメチル)-1H-イミダゾール-2-イル]ピリジン-4-イル]オキシ-N-[4-(トリフルオロメチル)フェニル]ベンズイミダゾール-2-アミン)、2-ブロモアルジシン(2-ブロモ-6,7-ジヒドロ-1H,5H-ピロロ[2,3-c]アゼピン-4,8-ジオン)、Rafキナーゼ阻害剤IV(2-クロロ-5-(2-フェニル-5-(ピリジン-4-イル)-1H-イミダゾール-4-イル)フェノール)、ソラフェニブN-オキシド(4-[4-[[[[4-クロロ-3(トリフルオロメチル)フェニル]アミノ]カルボニル]アミノ]フェノキシ]-N-メチル-2ピリジンカルボキサミド1-オキシド)、PLX-4720、ダブラフェニブ(GSK2118436)、GDC-0879、RAF265、AZ628、SB590885、ZM336372、GW5074、TAK-632、CEP-32496、LY3009120及びGX818(エンコラフェニブ)が挙げられる。
或る特定の実施形態において、生物活性剤は、限定されるものではないが、MK-2206、GSK690693、ペリホシン(KRX-0401)、GDC-0068、トリシリビン、AZD5363、ホノキオール、PF-04691502及びミルテホシンを含むAKT阻害剤、限定されるものではないが、P406、ドビチニブ、キザルチニブ(AC220)、アムバチニブ(MP-470)、タンズチニブ(MLN518)、ENMD-2076及びKW-2449を含むFLT-3阻害剤、又はそれらの組合せである。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はmTOR阻害剤である。mTOR阻害剤の例としては、ラパマイシン及びその類縁体、エベロリムス(Afinitor)、テムシロリムス、リダフォロリムス、シロリムス及びデフォロリムスが挙げられるが、これらに限定されない。MEK阻害剤の例としては、トラメチニブ/GSK1120212(N-(3-{3-シクロプロピル-5-[(2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ]-6,8-ジメチル-2,4,7-トリオキソ-3,4,6,7-テトラヒドロピリド[4,3-d]ピリミジン-1(2H-イル}フェニル)アセトアミド)、セルメチニブ(6-(4-ブロモ-2-クロロアニリノ)-7-フルオロ-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-3-メチルベンズイミダゾール-5-カルボキサミド)、ピマセルチブ/AS703026/MSC1935369((S)-N-(2,3-ジヒドロキシプロピル)-3-((2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ)イソニコチンアミド)、XL-518/GDC-0973(1-({3,4-ジフルオロ-2-[(2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ]フェニル}カルボニル)-3-[(2S)-ピペリジン-2-イル]アゼチジン-3-オール)(コビメチニブ)、レファメチニブ/BAY869766/RDEA119(N-(3,4-ジフルオロ-2-(2-フルオロ-4-ヨードフェニルアミノ)-6-メトキシフェニル)-1-(2,3-ジヒドロキシプロピル)シクロプロパン-1-スルホンアミド)、PD-0325901(N-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]-3,4-ジフルオロ-2-[(2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ]-ベンズアミド)、TAK733((R)-3-(2,3-ジヒドロキシプロピル)-6-フルオロ-5-(2-フルオロ-4-ヨードフェニルアミノ)-8-メチルピリド[2,3d]ピリミジン-4,7(3H,8H)-ジオン)、MEK162/ARRY438162(5-[(4-ブロモ-2-フルオロフェニル)アミノ]-4-フルオロ-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-1-メチル-1H-ベンズイミダゾール-6-カルボキサミド)、R05126766(3-[[3-フルオロ-2-(メチルスルファモイルアミノ)-4-ピリジル]メチル]-4-メチル-7-ピリミジン-2-イルオキシクロメン-2-オン)、WX-554、R04987655/CH4987655(3,4-ジフルオロ-2-((2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ)-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-5-((3-オキソ-1,2-オキサジナン-2-イル)メチル)ベンズアミド)又はAZD8330(2-((2-フルオロ-4-ヨードフェニル)アミノ)-N-(2-ヒドロキシエトキシ)-1,5-ジメチル-6-オキソ-1,6-ジヒドロピリジン-3-カルボキサミド)が挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はRAS阻害剤である。RAS阻害剤の例としては、Reolysin及びsiG12D LODERが挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はHSP阻害剤である。HSP阻害剤としては、ゲルダナマイシン又は17-N-アリルアミノ-17-デメトキシゲルダナマイシン(17AAG)、及びラディシコールが挙げられるが、これらに限定されない。
付加的な生物活性化合物としては、例えばエベロリムス、トラベクテジン、アブラキサン、TLK 286、AV-299、DN-101、パゾパニブ、GSK690693、RTA 744、ON 0910.Na、AZD 6244(ARRY-142886)、AMN-107、TKI-258、GSK461364、AZD 1152、エンザスタウリン、バンデタニブ、ARQ-197、MK-0457、MLN8054、PHA-739358、R-763、AT-9263、FLT-3阻害剤、VEGFR阻害剤、オーロラキナーゼ阻害剤、PIK-1モジュレーター、HDAC阻害剤、c-MET阻害剤、PARP阻害剤、Cdk阻害剤、IGFR-TK阻害剤、抗HGF抗体、焦点接着班キナーゼ阻害剤、Mapキナーゼ(mek)阻害剤、VEGF trap抗体、ペメトレキセド、パニツムマブ、アムルビシン、オレゴボマブ、Lep-etu、ノラトレキシド、azd2171、バタブリン(batabulin)、オファツムマブ、ザノリムマブ、エドテカリン、テトランドリン、ルビテカン、テスミリフェン(tesmilifene)、オブリメルセン、チシリムマブ、イピリムマブ、ゴシポール、Bio 111、131-I-TM-601、ALT-110、BIO 140、CC 8490、シレンギチド、ギマテカン、IL13-PE38QQR、INO 1001、IPdR KRX-0402、ルカントン、LY317615、ノイラジアブ(neuradiab)、ビテスパン(vitespan)、Rta 744、Sdx 102、タランパネル、アトラセンタン、Xr 311、ロミデプシン、ADS-100380、スニチニブ、5-フルオロウラシル、ボリノスタット、エトポシド、ゲムシタビン、ドキソルビシン、リポソームドキソルビシン、5’-デオキシ-5-フルオロウリジン、ビンクリスチン、テモゾロミド、ZK-304709、セリシクリブ;PD0325901、AZD-6244、カペシタビン、L-グルタミン酸、N-[4-[2-(2-アミノ-4,7-ジヒドロ-4-オキソ-1H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)エチル]ベンゾイル]-,二ナトリウム塩七水和物、カンプトテシン、PEG標識イリノテカン、タモキシフェン、クエン酸トレミフェン、アナストラゾール、エキセメスタン、レトロゾール、DES(ジエチルスチルベストロール)、エストラジオール、エストロゲン、結合型エストロゲン、ベバシズマブ、IMC-1C11、CHIR-258);3-[5-(メチルスルホニルピペラジンメチル)-インドリル-キノロン、バタラニブ、AG-013736、AVE-0005、酢酸ゴセレリン、酢酸ロイプロリド、パモ酸トリプトレリン、酢酸メドロキシプロゲステロン、カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン、酢酸メゲストロール、ラロキシフェン、ビカルタミド、フルタミド、ニルタミド、酢酸メゲストロール、CP-724714;TAK-165、HKI-272、エルロチニブ、ラパチニブ、カネルチニブ、ABX-EGF抗体、アービタックス、EKB-569、PKI-166、GW-572016、ロナファルニブ、BMS-214662、チピファルニブ;アミホスチン、NVP-LAQ824、スベロイルアニリドヒドロキサム酸(suberoyl analide hydroxamic acid)、バルプロ酸、トリコスタチンA、FK-228、SU11248、ソラフェニブ、KRN951、アミノグルテチミド、アムサクリン、アナグレリド、L-アスパラギナーゼ、カルメット-ゲラン桿菌(BCG)ワクチン、アドリアマイシン、ブレオマイシン、ブセレリン、ブスルファン、カルボプラチン、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン、クラドリビン、クロドロネート、シプロテロン、シタラビン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ジエチルスチルベストロール、エピルビシン、フルダラビン、フルドロコルチゾン、フルオキシメステロン、フルタミド、グリベック、ゲムシタビン、ヒドロキシウレア、イダルビシン、イホスファミド、イマチニブ、ロイプロリド、レバミゾール、ロムスチン、メクロレタミン、メルファラン、6-メルカプトプリン、メスナ、メトトレキサート、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ニルタミド、オクトレオチド、オキサリプラチン、パミドロネート、ペントスタチン、プリカマイシン、ポルフィマー、プロカルバジン、ラルチトレキセド、リツキシマブ、ストレプトゾシン、テニポシド、テストステロン、サリドマイド、チオグアニン、チオテパ、トレチノイン、ビンデシン、13-シス-レチノイン酸、フェニルアラニンマスタード、ウラシルマスタード、エストラムスチン、アルトレタミン、フロクスウリジン、5-デオキシウリジン、シトシンアラビノシド、6-メルカプトプリン、デオキシコホルマイシン、カルシトリオール、バルルビシン、ミトラマイシン、ビンブラスチン、ビノレルビン、トポテカン、ラゾキシン、マリマスタット、COL-3、ネオバスタット(neovastat)、BMS-275291、スクアラミン、エンドスタチン、SU5416、SU6668、EMD121974、インターロイキン-12、IM862、アンギオスタチン、ビタキシン(vitaxin)、ドロロキシフェン、イドキシフェン(idoxyfene)、スピロノラクトン、フィナステリド、シミチジン(cimitidine)、トラスツズマブ、デニロイキンジフチトクス、ゲフィチニブ、ボルテゾミブ、パクリタキセル、クレモフォールを含まないパクリタキセル、ドセタキセル、エポチロンB、BMS-247550、BMS-310705、ドロロキシフェン、4-ヒドロキシタモキシフェン、ピペンドキシフェン、ERA-923、アルゾキシフェン、フルベストラント、アコルビフェン、ラソフォキシフェン、イドキシフェン、TSE-424、HMR-3339、ZK186619、トポテカン、PTK787/ZK 222584、VX-745、PD 184352、ラパマイシン、40-O-(2-ヒドロキシエチル)-ラパマイシン、テムシロリムス、AP-23573、RAD001、ABT-578、BC-210、LY294002、LY292223、LY292696、LY293684、LY293646、ワートマニン、ZM336372、L-779,450、PEG-フィルグラスチム、ダルベポエチン、エリトロポエチン、顆粒球コロニー刺激因子、ゾレドロネート、プレドニゾン、セツキシマブ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、ヒストレリン、ペグ化インターフェロンα-2a、インターフェロンα-2a、ペグ化インターフェロンα-2b、インターフェロンα-2b、アザシチジン、PEG-L-アスパラギナーゼ、レナリドミド、ゲムツズマブ、ヒドロコルチゾン、インターロイキン-11、デキスラゾキサン、アレムツズマブ、オールトランスレチノイン酸、ケトコナゾール、インターロイキン-2、メゲストロール、免疫グロブリン、ナイトロジェンマスタード、メチルプレドニゾロン、イブリツモマブチウキセタン、アンドロゲン、デシタビン、ヘキサメチルメラミン、ベキサロテン、トシツモマブ、三酸化ヒ素、コルチゾン、エチドロネート、ミトタン、シクロスポリン、リポソームダウノルビシン、Edwina-アスパラギナーゼ、ストロンチウム89、カソピタント、ネツピタント(netupitant)、NK-1受容体アンタゴニスト、パロノセトロン、アプレピタント、ジフェンヒドラミン、ヒドロキシジン、メトクロプラミド、ロラゼパム、アルプラゾラム、ハロペリドール、ドロペリドール、ドロナビノール、デキサメサゾン、メチルプレドニゾロン、プロクロルペラジン、グラニセトロン、オンダンセトロン、ドラセトロン、トロピセトロン、ペグフィルグラスチム、エリトロポエチン、エポエチンα、ダルベポエチンα及びそれらの混合物が挙げられる。
或る特定の実施形態においては、化合物をイホスファミドと組み合わせて投与する。
或る特定の実施形態において、生物活性剤はメシル酸イマチニブ(グリベック(商標))、ダサチニブ(Sprycel(商標))、ニロチニブ(Tasigna(商標))、ボスチニブ(Bosulif(商標))、トラスツズマブ(Herceptin(商標))、トラスツズマブ-DM1、ペルツズマブ(Perjeta(商標))、ラパチニブ(Tykerb(商標))、ゲフィチニブ(Iressa(商標))、エルロチニブ(Tarceva(商標))、セツキシマブ(Erbitux(商標))、パニツムマブ(Vectibix(商標))、バンデタニブ(Caprelsa(商標))、ベムラフェニブ(Zelboraf(商標))、ボリノスタット(Zolinza(商標))、ロミデプシン(Istodax(商標))、ベキサロテン(Tagretin(商標))、アリトレチノイン(Panretin(商標))、トレチノイン(Vesanoid(商標))、カルフィルゾミブ(Kyprolis(商標))、プララトレキサート(Folotyn(商標))、ベバシズマブ(Avastin(商標))、Ziv-アフリベルセプト(Zaltrap(商標))、ソラフェニブ(Nexavar(商標))、スニチニブ(Sutent(商標))、パゾパニブ(Votrient(商標))、レゴラフェニブ(Stivarga(商標))及びカボザンチニブ(Cometriq(商標))から選択されるが、これらに限定されない。
或る特定の態様では、生物活性剤は抗炎症剤、化学療法剤、放射線治療剤、付加的な治療剤又は免疫抑制剤である。
好適な化学療法生物活性剤としては、放射性分子、細胞毒素又は細胞毒性薬とも称される毒素が挙げられるが、これらに限定されず、細胞の生存能力にとって有害な任意の作用物質、及び化学療法化合物を含有するリポソーム又は他のベシクルが含まれる。一般的な抗癌医薬品としては、ビンクリスチン(Oncovin(商標))又はリポソームビンクリスチン(Marqibo(商標))、ダウノルビシン(ダウノマイシン又はCerubidine(商標))又はドキソルビシン(アドリアマイシン(商標))、シタラビン(シトシンアラビノシド、ara-C又はCytosar(商標))、L-アスパラギナーゼ(Elspar(商標))又はPEG-L-アスパラギナーゼ(ペグアスパラガーゼ又はOncaspar(商標))、エトポシド(VP-16)、テニポシド(Vumon(商標))、6-メルカプトプリン(6-MP又はPurinethol(商標))、メトトレキサート、シクロホスファミド(Cytoxan(商標))、プレドニゾン、デキサメサゾン(Decadron)、イマチニブ(Gleevec(商標))、ダサチニブ(Sprycel(商標))、ニロチニブ(Tasigna(商標))、ボスチニブ(Bosulif(商標))及びポナチニブ(Iclusig(商標))が挙げられる。
付加的な好適な化学療法剤の例としては、1-デヒドロテストステロン、5-フルオロウラシル、ダカルバジン、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、アクチノマイシンD、アドリアマイシン、アルデスロイキン、アルキル化剤、アロプリノールナトリウム、アルトレタミン、アミホスチン、アナストロゾール、アントラマイシン(AMC)、抗有糸分裂剤、シス-ジクロロジアミン白金(II)(DDP)(シスプラチン)、ジアミノジクロロ白金、アントラサイクリン、抗生物質、代謝拮抗物質、アスパラギナーゼ、BCG生菌(BCG live)(膀胱内)、ベタメタゾンリン酸ナトリウム及び酢酸ベタメタゾン、ビカルタミド、硫酸ブレオマイシン、ブスルファン、ロイコボリンカルシウム、カリケアマイシン、カペシタビン、カルボプラチン、ロムスチン(CCNU)、カルムスチン(BSNU)、クロラムブシル、シスプラチン、クラドリビン、コルヒチン、結合型エストロゲン、シクロホスファミド、シクロトスファミド(Cyclothosphamide)、シタラビン、シタラビン、サイトカラシンB、シトキサン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダクチノマイシン(以前はアクチノマイシン)、ダウノルビシンHCL、クエン酸ダウノルビシン、デニロイキンジフチトクス、デキスラゾキサン、ジブロモマンニトール、ジヒドロキシアントラシンジオン(dihydroxy anthracin dione)、ドセタキセル、メシル酸ドラセトロン、ドキソルビシンHCL、ドロナビノール、大腸菌(E. coli)L-アスパラギナーゼ、エメチン、エポエチン-α、エルウィニアL-アスパラギナーゼ、エステル化エストロゲン、エストラジオール、リン酸エストラムスチンナトリウム、エチジウムブロミド、エチニルエストラジオール、エチドロネート、エトポシド、シトロボラム因子、リン酸エトポシド、フィルグラスチム、フロクスウリジン、フルコナゾール、リン酸フルダラビン、フルオロウラシル、フルタミド、フォリン酸、ゲムシタビンHCL、グルココルチコイド、酢酸ゴセレリン、グラミシジンD、グラニセトロンHCL、ヒドロキシウレア、イダルビシンHCL、イホスファミド、インターフェロンα-2b、イリノテカンHCL、レトロゾール、ロイコボリンカルシウム、酢酸ロイプロリド、レバミゾールHCL、リドカイン、ロムスチン、メイタンシノイド、メクロレタミンHCL、酢酸メドロキシプロゲステロン、酢酸メゲストロール、メルファランHCL、メルカプトプリン、メスナ、メトトレキサート、メチルテストステロン、ミトラマイシン、マイトマイシンC、ミトタン、ミトキサントロン、ニルタミド、酢酸オクトレオチド、オンダンセトロンHCL、パクリタキセル、パミドロン酸二ナトリウム、ペントスタチン、ピロカルピンHCL、プリマイシン(plimycin)、ポリフェプロザン20カルムスチンインプラント、ポルフィマーナトリウム、プロカイン、プロカルバジンHCL、プロプラノロール、リツキシマブ、サルグラモスチム、ストレプトゾトシン、タモキシフェン、タキソール、テニポシド、テノポシド(tenoposide)、テストラクトン、テトラカイン、チオエパクロラムブシル(thioepa chlorambucil)、チオグアニン、チオテパ、トポテカンHCL、クエン酸トレミフェン、トラスツズマブ、トレチノイン、バルルビシン、硫酸ビンブラスチン、硫酸ビンクリスチン及び酒石酸ビノレルビンが挙げられるが、これらに限定されない。
幾つかの実施形態においては、本発明の化合物は、化学療法剤(例えば細胞毒性薬、又は癌の治療に有用な他の化学化合物)と組み合わせて投与される。化学療法剤の例としては、アルキル化剤、代謝拮抗物質、葉酸類似体、ピリミジン類似体、プリン類似体及び関連の阻害剤、ビンカアルカロイド、エピポドフィロトキシン、抗生物質、L-アスパラギナーゼ、トポイソメラーゼ阻害剤、インターフェロン、白金配位錯体、アントラセンジオン置換尿素、メチルヒドラジン誘導体、副腎皮質抑制剤、副腎皮質ステロイド、プロゲスチン、エストロゲン、抗エストロゲン剤、アンドロゲン、抗アンドロゲン剤、並びにゴナドトロピン放出ホルモン類似体が挙げられる。5-フルオロウラシル(5-FU)、ロイコボリン(LV)、イリノテカン、オキサリプラチン、カペシタビン、パクリタキセル及びドセタキセルも含まれる。化学療法剤の非限定的な例としては、チオテパ及びシクロホスファミド等のアルキル化剤;ブスルファン、インプロスルファン及びピポスルファン等のアルキルスルホネート;ベンゾドーパ(benzodopa)、カルボコン、メツレドーパ(meturedopa)及びウレドーパ(uredopa)等のアジリジン;アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド及びトリメチロールメラミンを含むエチレンイミン及びメチラメラミン(methylamelamines);アセトゲニン(特にブラタシン及びブラタシノン);カンプトテシン(合成類似体トポテカンを含む);ブリオスタチン;カリスタチン;CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシン及びビゼレシン合成類似体を含む);クリプトフィシン(特にクリプトフィシン1及びクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成類似体KW-2189及びCB1-TM1を含む);エリュテロビン;パンクラチスタチン;サルコジクチイン;スポンギスタチン;クロラムブシル、クロルナファジン、シクロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノブエンビキン、フェネステリン、プレドニマスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード等のナイトロジェンマスタード;カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン及びラニムスチン等のニトロソウレア;エンジイン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケアマイシンγll及びカリケアマイシンωll(例えば、Agnew, Chem. Inti. Ed Engl. 33:183-186 (1994)を参照されたい))等の抗生物質;ジネミシンAを含むジネミシン;クロドロネート等のビスホスホネート;エスペラミシン;並びにネオカルチノスタチンクロモフォア及び関連色素タンパク質エンジイン抗生物質クロモフォア)、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、アントラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン(carabicin)、カミノマイシン(caminomycin)、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ADRIAMYCIN(商標)(モルホリノドキソルビシン、シアノモルホリノドキソルビシン、2-ピロリノドキソルビシン及びデオキシドキソルビシンを含むドキソルビシン)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシンC等のマイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、ケラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン;メトトレキサート及び5-フルオロウラシル(5-FU)等の代謝拮抗物質;デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート等の葉酸類似体;フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン等のプリン類似体;アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン等のピリミジン類似体;カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン等のアンドロゲン;アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン等の抗副腎剤(anti-adrenals);フロリン酸(frolinic acid)等の葉酸補充剤;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルウラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトレキサート;デフォファミン(defofamine);デメコルシン;ジアジクオン;エルフォルミチン(elfomithine);酢酸エリプチニウム;エポチロン;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシウレア;レンチナン;ロニダミン;メイタンシン及びアンサミトシン等のメイタンシノイド;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモール;ニトラクリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ロソキサントロン;ポドフィリン酸;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK(商標)多糖類複合体(JHS Natural Products,Eugene,OR);ラゾキサン;リゾキシン;シゾフラン(sizofuran);スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクオン;2,2’,2’’-トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン(特にT-2トキシン、ベラクリン(verracurin)A、ロリジンA及びアングイジン);ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン(gacytosine);アラビノシド(「Ara-C」);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド、例えばTAXOL(商標)(パクリタキセル;Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,NJ)、クレモフォールを含まないパクリタキセルのアルブミン改変ナノ粒子製剤であるABRAXANE(商標)(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,IL)及びTAXOTERE(商標)ドセタキセル(Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);クロラムブシル;GEMZAR(商標)ゲムシタビン;6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;シスプラチン、オキサリプラチン及びカルボプラチン等の白金配位錯体;ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP-16);イホスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;NAVELBINE(商標)ビノレルビン;ノバントロン;テニポシド;エダトレキサート;ダウノマイシン;アミノプテリン;xeloda;イバンドロネート;イリノテカン(例えばCPT-11);トポイソメラーゼ阻害剤RFS 2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイン酸等のレチノイド;カペシタビン;並びに上記のいずれかの薬学的に許容可能な塩、酸又は誘導体が挙げられる。2つ以上の化学療法剤を本発明の化合物と組み合わせて投与されるカクテルに使用することができる。併用化学療法の好適な投与計画が当該技術分野において既知である。例えば、併用投与計画は、Saltz et al., Proc. Am. Soc. Clin. Oncol. 18:233a (1999)及びDouillard et al., Lancet 355(9209): 1041-1047 (2000)に記載されている。
本明細書に開示される化合物と組み合わせて投与することができる付加的な治療剤としては、ベバシズマブ、スチニブ(sutinib)、ソラフェニブ、2-メトキシエストラジオールすなわち2ME2、フィナスネート(finasunate)、バタラニブ、バンデタニブ、アフリベルセプト、ボロシキシマブ、エタラシズマブ(MEDI-522)、シレンギチド、エルロチニブ、セツキシマブ、パニツムマブ、ゲフィチニブ、トラスツズマブ、ドビチニブ、フィギツムマブ、アタシセプト、リツキシマブ、アレムツズマブ、アルデスロイキン(aldesleukine)、アトリズマブ、トシリズマブ、テムシロリムス、エベロリムス、ルカツムマブ(lucatumumab)、ダセツズマブ、HLL1、huN901-DM1、アチプリモード、ナタリズマブ、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、マリゾミブ、タネスピマイシン、メシル酸サキナビル、リトナビル、メシル酸ネルフィナビル、硫酸インジナビル、ベリノスタット、パノビノスタット、マパツムマブ、レクサツムマブ、デュラネルミン(dulanermin)、ABT-737、オブリメルセン、プリチデプシン(plitidepsin)、タルマピモド(talmapimod)、P276-00、エンザスタウリン、チピファルニブ、ペリホシン、イマチニブ、ダサチニブ、レナリドミド、サリドマイド、シンバスタチン、セレコキシブ、バゼドキシフェン、AZD4547、リロツムマブ、オキサリプラチン(Eloxatin)、PD0332991、リボシクリブ(LEE011)、アベマシクリブ(LY2835219)、HDM201、フルベストラント(Faslodex)、エキセメスタン(Aromasin)、PIM447、ルキソリチニブ(INC424)、BGJ398、ネシツムマブ、ペメトレキセド(Alimta)及びラムシルマブ(IMC-1121B)が挙げられる。
或る特定の実施形態において、付加的な療法はモノクローナル抗体(MAb)である。一部のMAbは、癌細胞を破壊する免疫応答を刺激する。B細胞によって自然に産生される抗体と同様に、これらのMAbは癌細胞表面を「被覆し」、免疫系によるその破壊を誘発する可能性がある。例えば、ベバシズマブは腫瘍細胞、及び腫瘍微小環境中の他の細胞によって分泌されるタンパク質であり、腫瘍血管の発生を促進する血管内皮成長因子(VEGF)を標的とする。VEGFはベバシズマブに結合すると、その細胞受容体と相互作用することができず、新たな血管の成長をもたらすシグナル伝達が妨げられる。同様に、セツキシマブ及びパニツムマブは上皮成長因子受容体(EGFR)を標的とし、トラスツズマブはヒト上皮成長因子受容体2(HER-2)を標的とする。細胞表面成長因子受容体に結合するMAbは、標的受容体が正常な成長促進シグナルを送るのを防ぐ。これらはアポトーシスを誘発し、腫瘍細胞を破壊するように免疫系を活性化する可能性もある。
本発明の一態様では、生物活性剤は免疫抑制剤である。免疫抑制剤は、カルシニューリン阻害剤、例えばシクロスポリン又はアスコマイシン、例えばシクロスポリンA(NEORAL(商標))、FK506(タクロリムス)、ピメクロリムス、mTOR阻害剤、例えばラパマイシン又はその誘導体、例えばシロリムス(RAPAMUNE(商標))、エベロリムス(Certican(商標))、テムシロリムス、ゾタロリムス、バイオリムス-7、バイオリムス-9、ラパログ、例えばリダフォロリムス、アザチオプリン、campath 1H、S1P受容体モジュレーター、例えばフィンゴリモド又はその類縁体、抗IL-8抗体、ミコフェノール酸又はその塩、例えばナトリウム塩又はそのプロドラッグ、例えばミコフェノール酸モフェチル(CELLCEPT(商標))、OKT3(ORTHOCLONE OKT3(商標))、プレドニゾン、ATGAM(商標)、THYMOGLOBULIN(商標)、ブレキナルナトリウム、OKT4、T10B9.A-3A、33B3.1、15-デオキシスペルグアリン、トレスペリムス(tresperimus)、レフルノミド(ARAVA(商標))、CTLAI-Ig、抗CD25、抗IL2R、バシリキシマブ(SIMULECT(商標))、ダクリズマブ(ZENAPAX(商標))、ミゾリビン、メトトレキサート、デキサメサゾン、ISAtx-247、SDZ ASM 981(ピメクロリムス、Elidel(商標))、CTLA4Ig(アバタセプト)、ベラタセプト、LFA3Ig、エタネルセプト(ImmunexによりEnbrel(商標)として販売される)、アダリムマブ(Humira(商標))、インフリキシマブ(Remicade(商標))、抗LFA-1抗体、ナタリズマブ(Antegren(商標))、エンリモマブ、ガビリモマブ(gavilimomab)、抗胸腺細胞免疫グロブリン、シプリズマブ、アレファセプト、エファリズマブ、ペンタサ、メサラジン、アサコール、リン酸コデイン、ベノリレート、フェンブフェン、ナプロシン、ジクロフェナク、エトドラク及びインドメタシン、アスピリン及びイブプロフェンであり得る。
幾つかの実施形態においては、生物活性剤は、癌治療に使用されるサイトカイン(例えば、インターフェロン又はインターロイキン(例えばIL-2))等の生物学的製剤である治療剤である。幾つかの実施形態においては、生物学的製剤は、抗VEGF剤、例えばベバシズマブ(AVASTIN(商標))等の血管新生抑制剤である。幾つかの実施形態においては、生物学的製剤は、標的を作動して(agonizes)、抗癌応答を刺激するか、又は癌に重要な抗原に拮抗する免疫グロブリン系生物学的製剤、例えばモノクローナル抗体(例えばヒト化抗体、完全ヒト抗体、Fc融合タンパク質又はその機能的フラグメント)である。かかる作用物質としては、RITUXAN(商標)(リツキシマブ)、ZENAPAX(商標)(ダクリズマブ)、SIMULECT(商標)(バシリキシマブ)、SYNAGIS(商標)(パリビズマブ)、REMICADE(商標)(インフリキシマブ)、HERCEPTIN(商標)(トラスツズマブ)、MYLOTARG(商標)(ゲムツズマブオゾガマイシン)、CAMPATH(商標)(アレムツズマブ)、ZEVALIN(商標)(イブリツモマブチウキセタン)、HUMIRA(商標)(アダリムマブ)、XOLAIR(商標)(オマリズマブ)、BEXXAR(商標)(トシツモマブ-l-131)、RAPTIVA(商標)(エファリズマブ)、ERBITUX(商標)(セツキシマブ)、AVASTIN(商標)(ベバシズマブ)、TYSABRI(商標)(ナタリズマブ)、ACTEMRA(商標)(トシリズマブ)、VECTIBIX(商標)(パニツムマブ)、LUCENTIS(商標)(ラニビズマブ)、SOURIS(商標)(エクリズマブ)、CIMZIA(商標)(セルトリズマブペゴル)、SIMPONI(商標)(ゴリムマブ)、ILARIS(商標)(カナキヌマブ)、STELARA(商標)(ウステキヌマブ)、ARZERRA(商標)(オファツムマブ)、PROLIA(商標)(デノスマブ)、NUMAX(商標)(モタビズマブ)、ABTHRAX(商標)(ラキシバクマブ)、BENLYSTA(商標)(ベリムマブ)、YERVOY(商標)(イピリムマブ)、ADCETRIS(商標)(ブレンツキシマブベドチン)、PERJETA(商標)(ペルツズマブ)、KADCYLA(商標)(アドトラスツズマブエムタンシン)及びGAZYVA(商標)(オビヌツズマブ)が挙げられる。抗体-薬物複合体も含まれる。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物と組み合わせて使用される本明細書に記載される化合物は、代わりにリンカーへの取り付け点が活性を維持する適切な場所である標的化リガンドとして使用される。
併用療法は、非薬物治療である治療剤を含んでいてもよい。例えば、放射線療法、凍結療法、温熱療法及び/又は腫瘍組織の外科的切除に加えて化合物が投与され得る。
或る特定の実施形態においては、第1及び第2の治療剤が同時に又はいずれかの順序で順次に投与される。第1の治療剤は、第2の治療剤の直前又は直後、最大1時間、最大2時間、最大3時間、最大4時間、最大5時間、最大6時間、最大7時間、最大8時間、最大9時間、最大10時間、最大11時間、最大12時間、最大13時間、14時間、最大16時間、最大17時間、最大(up)18時間、最大19時間、最大20時間、最大21時間、最大22時間、最大23時間、最大24時間、又は最大1日~7日、1日~14日、1日~21日若しくは1日~30日前又は後に投与することができる。
或る特定の実施形態においては、第2の治療剤は、本発明の化合物とは異なる投与スケジュールで投与される。例えば、第2の治療剤は、治療サイクル毎に1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日又は14日の治療の休暇を有し得る。別の実施形態においては、第1の治療剤が治療の休暇を有する。例えば、第1の治療剤は、治療サイクル毎に1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日又は14日の治療の休暇を有し得る。或る特定の実施形態においては、第1及び第2の治療剤の両方が治療の休暇を有する。
IX.医薬組成物
本明細書に記載される式I、式II、若しくは式IIIの選択された化合物、又はその薬学的に許容可能な塩は、無溶媒の化学物質として投与され得るが、より典型的には、本明細書に記載される障害のいずれかについてのそのような治療を必要とする患者、典型的にはヒトに有効な量を薬学的に許容可能な担体中に含む医薬組成物として投与される。医薬組成物は、唯一の活性剤として化合物若しくはその塩を含み得るか、又は代替的な実施形態において、化合物又はその塩、及び治療される疾患用の少なくとも1種の追加の活性剤を含み得る。
本発明の医薬組成物は、あらゆる所望の投与様式によって、治療的有効量で投与され得る。或る特定の実施形態において、化合物又はその薬学的に許容可能な塩は、経口送達用の薬学的に許容可能な担体とともに有効量で送達される。より一般的な非限定的な例として、医薬組成物は、経口(バッカル及び舌下を含む)、直腸、鼻、局所、経皮、肺、膣若しくは非経口(筋肉内、動脈内、髄腔内、皮下、及び静脈内を含む)、注射、吸入、若しくは噴霧、大動脈内、頭蓋内、表皮下、腹腔内、皮下に適したもの、又は従来の薬学的に許容可能な担体を含む他の投与手段によるものである。典型的な投与様式は、苦痛の程度に応じて調整することができる使いやすい毎日の投与計画を使用する経口、局所、又は静脈内である。
これらの化合物は触媒的であるため、典型的には、有効性に必要とされる量は、対応する標的タンパク質阻害剤の場合よりも少ない。
好適な投与量範囲は、治療される疾患の重症度、被験体の年齢及び相対的健康、使用される化合物の効力、投与の経路及び形態、並びに関与する医師の選好及び経験等の多数の要因によって決まる。かかる疾患を治療する当業者は、過度の実験を行うことなく、個人的な知識及び本願の開示に依存して、所与の疾患に対する開示の組成物の治療有効量を確認することができる。
或る特定の実施形態においては、医薬組成物は、単位剤形に約0.001mg~約2000mg、約1mg~約1000mg、約10mg~約800mg又は約20mg~約600mgの活性化合物と、任意に約0.1mg~約2000mg、約10mg~約1000mg、約100mg~約800mg又は約200mg~約600mgの付加的な活性剤とを含有する剤形である。例は、少なくとも約0.001mg、0.005mg、0.01mg、0.025mg、0.05mg、0.1mg、1mg、5mg、10mg、25mg、50mg、100mg、200mg、250mg、300mg、400mg、500mg、600mg、700mg又は750mgの活性化合物又はその塩、及び最大約1gの活性化合物又はその塩を含む剤形である。
或る特定の実施形態において、医薬組成物は、約0.01mg~約1000mg、約0.1mg~約750mg、約1mg~約500mg、又は約5mg、10mg、15mg、若しくは20mg~約250mgの活性化合物又はその薬学的に許容可能な塩を含む剤形で存在する。剤形の例は、少なくとも0.01mg、0.05mg、0.1mg、1mg、5mg、10mg、25mg、50mg、100mg、200mg、250mg、300mg、400mg、500mg、600mg、700mg、又は750mgの活性化合物又はその塩を送達するものである。重量が本明細書で使用される場合に、その重量は、化合物単独又はその薬学的に許容可能な塩と組み合わせた化合物のいずれかを指し得る。
幾つかの実施形態においては、本明細書に開示される化合物を1日1回(QD)、1日2回(BID)又は1日3回(TID)投与する。幾つかの実施形態においては、本明細書に開示されるか、又は記載のように使用される化合物を少なくとも1日、少なくとも2日、少なくとも3日、少なくとも4日、少なくとも5日、少なくとも6日、少なくとも7日、少なくとも8日、少なくとも9日、少なくとも10日、少なくとも11日、少なくとも12日、少なくとも13日、少なくとも14日、少なくとも15日、少なくとも16日、少なくとも17日、少なくとも18日、少なくとも19日、少なくとも20日、少なくとも21日、少なくとも22日、少なくとも23日、少なくとも24日、少なくとも25日、少なくとも26日、少なくとも27日、少なくとも28日、少なくとも29日、少なくとも30日、少なくとも31日、少なくとも35日、少なくとも45日、少なくとも60日、少なくとも75日、少なくとも90日、少なくとも120日、少なくとも150日、少なくとも180日又は無期限にわたって少なくとも1日1回投与する。
或る特定の実施形態においては、本発明の化合物を1日1回、1日2回、1日3回又は1日4回投与する。
或る特定の実施形態においては、本発明の化合物を1日1回経口投与する。或る特定の実施形態においては、本発明の化合物を1日2回経口投与する。或る特定の実施形態においては、本発明の化合物を1日3回経口投与する。或る特定の実施形態においては、本発明の化合物を1日4回経口投与する。
或る特定の実施形態において、本発明の化合物又はその塩は、医療提供者によって指示されたスケジュールを使用して静脈内投与される。或る特定の実施形態において、化合物は、少なくとも1日1回、1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、1ヶ月に1回以下の頻度で投与される。或る特定の実施形態において、本発明の化合物は、1日2回で静脈内投与される。
幾つかの実施形態において、本発明の化合物は、治療サイクル間に治療の休暇を設けて投与される。例えば、化合物は、1治療周期当たり1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日の治療の休暇を有し得るか、又はそれどころか少なくとも3週間若しくは4週間休むことができる。
幾つかの実施形態において、負荷用量を投与して治療を開始する。例えば、化合物を、維持用量の治療サイクルよりも少なくとも約1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、3.5倍、4倍、4.5倍、5倍、5.5倍、6倍、6.5倍、7倍、7.5倍、8倍、8.5倍、9倍、9.5倍、又は10倍高い用量である投薬量で投与して、治療を開始することができる。追加の例示的な負荷用量は、最初の1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、又は10日の治療における少なくとも約1.5倍、2倍、2.5倍、3倍、3.5倍、4倍、4.5倍、5倍、5.5倍、5倍、6.5倍、7倍、7.5倍、8倍、8.5倍、9倍、9.5倍、又は10倍高い用量の後に、治療サイクルにおける残りの治療日数における維持用量を含む。
医薬組成物はまた、有効量の本明細書に記載される活性化合物及び追加の活性剤を含んでいてもよく、ここで、追加の活性剤は、それ自体の治療レジメンに従って、又は医療提供者によって決定される通りに、又は代替的には本発明の化合物と同期して投与される。
或る特定の実施形態において、治療量は、例えば、約0.0001mg/kg(体重)~約25mg/kg(体重)の範囲内であり得る。被験体には、対象の障害の徴候、症状、若しくは原因を軽減及び/又は緩和するのに、又は生物学的系の任意の他の所望の変化をもたらすのに必要とされる量の用量が投与され得る。所望であれば、製剤は、活性成分の徐放性投与又は制御放出投与に適合された腸溶性コーティングを用いて調製され得る。
或る特定の実施形態において、用量は、約0.001mg/kg~10mg/kg(患者体重)の範囲、例えば、約0.0001mg/kg、約0.0005mg/kg、約0.001mg/kg、約0.005mg/kg、約0.01mg/kg、約0.05mg/kg、約0.1mg/kg、約0.15mg/kg、約0.2mg/kg、約0.25mg/kg、約0.3mg/kg、約0.35mg/kg、約0.4mg/kg、約0.45mg/kg、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2.0mg/kg、約2.5mg/kg、約3.0mg/kg、約3.5mg/kg、約4.0mg/kg、約4.5mg/kg、約5.0mg/kg、約5.5mg/kg、約6.0mg/kg、約6.5mg/kg、約7.0mg/kg、約7.5mg/kg、約8.0mg/kg、約8.5mg/kg、約9.0mg/kg、約9.5mg/kg、又は約10mg/kgである。
開示された化合物又はその塩の有効量は、患者の体重、サイズ、又は年齢に基づいて投与され得る。例えば、治療量は、例えば、少なくとも1回の用量において、約0.01mg/kg(体重)~約250mg/kg(体重)、又は約0.1mg/kg~約10mg/kgの範囲内であり得る。患者には、対象の障害を軽減及び/又は緩和するのに、及び/又は治癒するのに必要とされる量の用量が投与され得る。所望であれば、製剤は、活性成分の徐放性投与又は制御放出投与に適合された腸溶性コーティングを用いて調製され得る。
或る特定の実施形態においては、用量は、約0.01mg/kg~100mg/kg(患者体重)の範囲、例えば約0.01mg/kg、約0.05mg/kg、約0.1mg/kg、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約10mg/kg、約15mg/kg、約20mg/kg、約25mg/kg、約30mg/kg、約35mg/kg、約40mg/kg、約45mg/kg、約50mg/kg、約55mg/kg、約60mg/kg、約65mg/kg、約70mg/kg、約75mg/kg、約80mg/kg、約85mg/kg、約90mg/kg、約95mg/kg又は約100mg/kgである。
医薬製剤は、単位剤形であるのが好ましい。かかる剤形においては、製剤は、適切な量の有効成分を含有する単位用量に細分される。単位剤形は、包装された錠剤、カプセル、及びバイアル又はアンプル内の粉末等の個別の量の製剤が包装に含まれる包装された製剤であってもよい。また、単位剤形はカプセル、錠剤、カシェ剤若しくはトローチ剤自体であっても、又は包装された形態の適切な数のこれらのいずれかであってもよい。
或る特定の実施形態においては、化合物は、薬学的に許容可能な塩として投与される。薬学的に許容可能な塩の非限定的な例としては、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、ショウノウ酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシ-エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩(pectinate)、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩及び吉草酸塩が挙げられる。代表的なアルカリ金属塩又はアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム及びマグネシウム、並びにアンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン及びエチルアミンを含むが、これらに限定されない非毒性アンモニウム、第四級アンモニウム及びアミンカチオンが挙げられる。
意図される投与方法に応じて、医薬組成物は、固体、半固体又は液体の剤形、例えば錠剤、坐剤、丸薬、カプセル、粉末、液体、シロップ、懸濁液、クリーム、軟膏、ローション、ペースト、ゲル、スプレー、エアロゾル、フォーム又は油、注射液又は輸液、経皮パッチ、皮下パッチ、吸入製剤、医療デバイス、坐剤、口腔内若しくは舌下製剤、非経口製剤、又は点眼液等の形態、好ましくは正確な投与量の単回投与に適した単位剤形とすることができる。
錠剤及びカプセル等の幾つかの剤形は、有効成分の適切な量、例えば所望の目的を達成するのに有効な量を含む適切な大きさの単位用量に細分される。組成物は、有効量の選択薬物を薬学的に許容可能な担体と組み合わせて含み、さらに、他の医薬品、アジュバント、希釈剤、緩衝剤等を含むことができる。
担体は、添加剤及び希釈剤を含み、治療される患者への投与に適するように十分に高い純度及び十分に低い毒性である必要がある。担体は不活性であっても、又はそれ自体に薬効を有していてもよい。化合物と併用される担体の量は、化合物の単位用量につき投与に有用な量の物質を与えるのに十分なものである。
担体のクラスとしては、アジュバント、結合剤、緩衝剤、着色料、希釈剤、崩壊剤、添加剤、乳化剤、香味料、ゲル、流動促進剤、滑沢剤、保存料、安定剤、界面活性剤、可溶化剤、錠剤化剤(tableting agents)、湿潤剤又は固化剤が挙げられるが、これらに限定されない。
幾つかの担体が2つ以上のクラスに挙げられることがあり、例えば植物油を幾つかの製剤では滑沢剤として、他の製剤では希釈剤として使用することができる。
例示的な薬学的に許容可能な担体としては、糖、デンプン、セルロース、トラガント末、モルト、ゼラチン、タルク、ワセリン、ラノリン、ポリエチレングリコール、アルコール、経皮浸透促進剤(transdermal enhancers)及び植物油が挙げられる。本発明の化合物の活性を実質的に妨げない任意の活性剤が医薬組成物に含まれていてもよい。
幾つかの添加剤としては、水、生理食塩水、グリセロール、ポリエチレングリコール、ヒアルロン酸、エタノール等の液体が挙げられるが、これらに限定されない。化合物は、例えば療法の目的に応じて所望される固体、液体、噴霧乾燥物、マイクロ粒子、ナノ粒子、制御放出システム等の形態で提供することができる。非液体製剤に適した添加剤も当業者に既知である。薬学的に許容可能な添加剤及び塩の徹底的な論考は、Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Edition (Easton, Pennsylvania: Mack Publishing Company, 1990)に見ることができる。
さらに、湿潤剤又は乳化剤、生理的緩衝物質、界面活性剤等の補助物質が、かかるビヒクル中に存在していてもよい。生理的緩衝液は、薬理学的に許容可能であり、製剤に所望のpH、すなわち生理学的に許容可能な範囲のpHを与える任意の溶液であり得る。緩衝溶液の例としては、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、トリス緩衝食塩水、ハンクス緩衝食塩水等が挙げられる。
固体組成物については、従来の非毒性固体担体として、例えば医薬品グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルク、セルロース、グルコース、スクロース、炭酸マグネシウム等が挙げられる。液体の薬学的に投与可能な組成物は例えば、本明細書に記載される活性化合物及び任意の医薬アジュバントを添加剤、例えば水、生理食塩水、水性デキストロース、グリセロール、エタノール等に、例えば溶解し、分散させ、それにより溶液又は懸濁液を形成することによって調製することができる。必要に応じて、投与される医薬組成物は、湿潤剤又は乳化剤、pH緩衝剤等の非毒性補助物質、例えば酢酸ナトリウム、ソルビタンモノラウレート、トリエタノールアミン酢酸ナトリウム、トリエタノールアミンオレエート等を少量含有していてもよい。かかる剤形を調製する実際の方法は、当業者に既知であるか、又は明らかであり、例えば上記のRemington's Pharmaceutical Sciencesを参照されたい。
更に別の実施形態においては、ポリカチオン(キトサン及びその第四級アンモニウム誘導体、ポリ-L-アルギニン、アミノ化ゼラチン)、ポリアニオン(N-カルボキシメチルキトサン、ポリアクリル酸)、及びチオール化ポリマー(カルボキシメチルセルロース-システイン、ポリカルボフィル-システイン、キトサン-チオブチルアミジン、キトサン-チオグリコール酸、キトサン-グルタチオンコンジュゲート)等のポリマーを含む浸透促進添加剤の使用が提供される。
或る特定の実施形態においては、添加剤は、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム(二塩基性)、ステアリン酸カルシウム、クロスカルメロース、架橋ポリビニルピロリドン、クエン酸、クロスポビドン、システイン、エチルセルロース、ゼラチン、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ラクトース、ステアリン酸マグネシウム、マルチトール、マンニトール、メチオニン、メチルセルロース、メチルパラベン、微結晶性セルロース、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、ポビドン、アルファ化デンプン、プロピルパラベン、パルミチン酸レチニル、シェラック、二酸化ケイ素、カルボキシメチルセルロースナトリウム、クエン酸ナトリウム、デンプングリコール酸ナトリウム、ソルビトール、デンプン(トウモロコシ)、ステアリン酸、スクロース、タルク、二酸化チタン、ビタミンA、ビタミンE、ビタミンC及びキシリトールから選択される。
医薬組成物/合剤は、経口投与用に配合することができる。経口投与については、組成物は、錠剤、カプセル、ソフトゲルカプセルの形態をとることができ、又は水性若しくは非水性の溶液、懸濁液若しくはシロップであってもよい。錠剤及びカプセルが典型的な経口投与形態である。経口用の錠剤及びカプセルは、ラクトース及びトウモロコシデンプン等の1つ以上の一般に使用される担体を含むことができる。ステアリン酸マグネシウム等の滑沢剤も通例添加される。通例、本開示の組成物は、ラクトース、デンプン、スクロース、グルコース、メチルセルロース、ステアリン酸マグネシウム、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、マンニトール、ソルビトール等の経口用の非毒性の薬学的に許容可能な不活性担体と組み合わせることができる。さらに、所望又は必要に応じて、好適な結合剤、滑沢剤、崩壊剤及び着色料を混合物に組み入れてもよい。好適な結合剤としては、デンプン、ゼラチン、グルコース又はβ-ラクトース等の天然糖、コーンシロップ、アラビアゴム、トラガカントゴム等の天然及び合成ゴム、又はアルギン酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロース、ポリエチレングリコール、ワックス等が挙げられる。これらの剤形に使用される滑沢剤としては、オレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸マグネシウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム等が挙げられる。崩壊剤としては、限定されるものではないが、デンプン、メチルセルロース、寒天、ベントナイト、キサンタンガム等が挙げられる。
液体懸濁液を使用する場合、活性剤をエタノール、グリセロール、水等の任意の経口用の非毒性の薬学的に許容可能な不活性担体、並びに乳化剤及び懸濁剤と組み合わせることができる。必要に応じて、香料、着色料及び/又は甘味料を添加してもよい。本明細書の経口製剤に組み入れる他の任意の成分としては、保存料、懸濁剤、増粘剤等が挙げられるが、これらに限定されない。
眼内送達については、化合物は所望に応じて、例えば硝子体内、基質内、前房内、テノン嚢下、網膜下、球後、球周囲、脈絡膜上、結膜、結膜下、強膜上、眼周囲、経強膜、球後、後強膜近傍、角膜周囲又は涙管注射により、若しくは粘液、ムチン若しくは粘膜関門を介して即時若しくは制御放出方式で、又は眼内デバイスにより投与することができる。
非経口製剤は、液体の溶液若しくは懸濁液として、注射前の液体への可溶化若しくは懸濁に適した固体形態、又はエマルションとして従来の形態にて調製することができる。通例、滅菌注射用懸濁液は、好適な担体、分散剤又は湿潤剤と懸濁剤とを用いて当該技術分野において既知の手法に従って配合される。滅菌注射用製剤は、許容可能な程度に非毒性の非経口的に許容可能な希釈剤又は溶媒中の滅菌注射用溶液又は懸濁液とすることもできる。用いることができる許容可能なビヒクル及び溶媒には、水、リンガー液及び等張塩化ナトリウム溶液がある。加えて、滅菌不揮発性油、脂肪酸エステル又はポリオールが溶媒又は懸濁媒として従来用いられている。加えて、非経口投与には、一定レベルの投与量が維持されるように徐放システム又は持続放出システムを使用することが含まれ得る。
非経口投与には、関節内、静脈内、筋肉内、皮内、腹腔内及び皮下経路が含まれ、酸化防止剤、緩衝剤、制菌剤、及び製剤を意図されるレシピエントの血液と等張にする溶質を含有し得る水性及び非水性の等張滅菌注射液、並びに懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤及び保存料を含み得る水性及び非水性の滅菌懸濁液が含まれる。或る特定の非経口経路を介した投与は、滅菌注射器、又は連続注入システム等の他の何らかの機械デバイスによって推進される針又はカテーテルを通して本開示の製剤を患者の体内に導入することを含み得る。本開示によって提供される製剤は、当該技術分野において非経口投与に認められている注射器、注入器、ポンプ、又は任意の他のデバイスを用いて投与することができる。
非経口投与用の本開示による製剤には、水性又は非水性の滅菌溶液、懸濁液又はエマルションが含まれる。非水性の溶媒又はビヒクルの例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、オリーブ油及びトウモロコシ油等の植物油、ゼラチン、並びにオレイン酸エチル等の注射用有機エステルである。かかる剤形は、保存料、湿潤剤、乳化剤及び分散剤等のアジュバントを含有していてもよい。これらは、例えば細菌捕捉フィルター(bacteria retaining filter)を通した濾過、組成物への滅菌剤の組入れ、組成物への照射又は組成物の加熱によって滅菌することができる。これらは、使用直前に滅菌水又は他の何らかの滅菌注射用媒体を用いて製造することもできる。
滅菌注射用溶液は、必要量の本開示の化合物の1つ以上を、必要に応じて上に列挙した様々な他の成分を含む適切な溶媒に組み込み、続いて濾過減菌を行うことによって調製される。概して、分散液は、基本的な分散媒と上に列挙したものからの他の必要とされる成分とを含有する滅菌ビヒクルに様々な滅菌有効成分を組み入れることによって調製される。滅菌注射用溶液の調製のための滅菌粉末の場合、典型的な調製方法は、予め滅菌濾過した溶液から有効成分及び任意の付加的な所望の成分の粉末を生じる真空乾燥法及び凍結乾燥法である。このため、例えば、注射による投与に適した非経口組成物は1.5重量%の有効成分を10体積%のプロピレングリコール及び水に撹拌することによって調製される。溶液を塩化ナトリウムで等張にし、滅菌する。
代替的には、本開示の医薬組成物は、直腸投与用の坐剤の形態で投与することができる。これらは、作用物質と、室温では固体であるが、直腸温度では液体であるため、直腸内で融解して薬物を放出する好適な非刺激性の添加剤とを混合することによって調製することができる。かかる材料としては、ココアバター、ミツロウ及びポリエチレングリコールが挙げられる。
本開示の医薬組成物は、鼻エアロゾル又は吸入によって投与することもできる。かかる組成物は、医薬製剤の技術分野において既知の手法に従って調製され、ベンジルアルコール若しくは他の好適な保存料、バイオアベイラビリティを高めるための吸収促進剤、フルオロカーボン若しくは窒素等の噴射剤、及び/又は他の従来の可溶化剤又は分散剤を用いて生理食塩水中の溶液として調製することができる。
口腔内投与用の製剤としては、錠剤、トローチ剤、ゲル等が挙げられる。代替的には、口腔内投与は、当業者に既知の経粘膜送達システムを用いて達成することができる。本開示の化合物は、従来の経皮薬物送達システム、すなわち作用物質が通例、体表に貼り付けられる薬物送達デバイスとして働く積層構造内に含まれる経皮「パッチ」を用いて、皮膚又は粘膜組織を通して送達することもできる。かかる構造においては、薬物組成物は通例、上部裏打ち層の下にある層、すなわち「リザーバ」に含まれる。積層デバイスは、単一のリザーバを含んでいても、又は複数のリザーバを含んでいてもよい。或る特定の実施形態においては、リザーバは、薬物送達中に皮膚にシステムを貼り付ける働きをする、薬学的に許容可能な接触接着材料のポリマーマトリックスを含む。好適な皮膚接触接着材料の例としては、ポリエチレン、ポリシロキサン、ポリイソブチレン、ポリアクリレート、ポリウレタン等が挙げられるが、これらに限定されない。
代替的には、薬物含有リザーバ及び皮膚接触接着剤は、別個の異なる層として存在し、この場合、上記のようなポリマーマトリックスであっても、又は液体若しくはゲルのリザーバであっても、又は他の何らかの形態をとっていてもよいリザーバの下に接着剤がある。デバイスの上面となる、これらの積層体における裏打ち層は、積層構造の主要な構造要素として機能し、デバイスにその可撓性の多くを与える。裏打ち層に選択される材料は、活性剤及び存在する他の任意の材料に対して実質的に不透過性である必要がある。
本開示の組成物は、特に気道への、鼻腔内投与を含むエアロゾル投与用に配合することができる。化合物は例えば、概して、例えば約5ミクロン以下の小さな粒径を有し得る。かかる粒径は、当該技術分野において既知の手段、例えば微粉化によって得ることができる。有効成分は、クロロフルオロカーボン(CFC)、例えばジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン若しくはジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素又は他の好適なガス等の好適な噴射剤とともに加圧パックに入れて提供される。エアロゾルは、好都合にはレシチン等の界面活性剤も含有し得る。薬物の用量は、計量バルブによって制御することができる。
代替的には、有効成分は、乾燥粉末、例えばラクトース、デンプン、デンプン誘導体、例えばヒドロキシプロピルメチルセルロース及びポリビニルピロリジン(PVP)等の好適な粉末ベース中の化合物の混合粉末の形態で提供することができる。粉末担体が鼻腔内でゲルを形成する。例えば、粉末組成物は、例えばゼラチンのカプセル若しくはカートリッジ、又はブリスターパック内の単位投与形態にて与えることができ、そこから粉末を吸入器によって投与することができる。
直腸投与に適した製剤は通例、単位用量坐剤として与えられる。これらは、活性化合物と1つ以上の従来の固体担体、例えばココアバターとを混和させた後、得られる混合物を成形することによって調製することができる。
或る特定の実施形態においては、医薬組成物は、上で定義した投与方法を用いた皮膚への局所適用に適している。
或る特定の実施形態においては、医薬組成物は、経皮投与に適しており、長時間にわたってレシピエントの表皮と密接に接触して留まるように適合させた個別パッチとして与えることができる。経皮投与に適した製剤は、イオン導入によって送達することもでき(例えば、Pharmaceutical Research 3 (6):318 (1986)を参照されたい)、通例、任意に緩衝化した活性化合物の水溶液の形態をとる。
或る特定の実施形態においては、マイクロニードルパッチ又はデバイスが生体組織、特に皮膚を越えた又はその中への薬物の送達のために提供される。マイクロニードルパッチ又はデバイスは、皮膚又は他の組織の障壁を越えた又はその中への臨床的に関連する速度での薬物送達を、組織に対する損傷、疼痛又は刺激が殆ど又は全くなしに可能にする。
肺への投与に好適な製剤は、広範な受動呼吸駆動及び能動動力駆動の単回/複数回投与乾燥粉末吸入器(DPI)によって送達することができる。呼吸器送達に最も一般的に使用されるデバイスとしては、ネブライザー、定量吸入器及び乾燥粉末吸入器が挙げられる。ジェットネブライザー、超音波ネブライザー及び振動メッシュネブライザーを含む幾つかのタイプのネブライザーが利用可能である。好適な肺送達デバイスの選択は、薬物及びその製剤の性質、作用部位及び肺の病態生理等のパラメーターによって決まる。
薬物送達デバイス及び方法の付加的な非限定的な例としては、例えば「チロシンキナーゼ阻害剤の経口投与のための医薬剤形(Pharmaceutical Dosage Form For Oral Administration Of Tyrosine Kinase Inhibitor)」と題する米国特許出願公開第20090203709号(Abbott Laboratories);「プロドラッグの結膜下又は眼周囲送達による後眼部への活性薬物の送達(Delivery of an active drug to the posterior part of the eye via subconjunctival or periocular delivery of a prodrug)」と題する米国特許出願公開第20050009910号、「眼圧を低下させる生分解性ポリマー(Biodegradable polymers for lowering intraocular pressure)」と題する米国特許出願公開第20130071349号、「チロシンキナーゼミクロスフェア(Tyrosine kinase microspheres)」と題する米国特許第8,481,069号、「チロシンキナーゼミクロスフェアを作製する方法(Method of making tyrosine kinase microspheres)」と題する米国特許第8,465,778号、「チロシンキナーゼ阻害剤を含有する持続放出眼内インプラント及び関連方法(Sustained release intraocular implants containing tyrosine kinase inhibitors and related methods)」と題する米国特許第8,409,607号、「生分解性硝子体内チロシンキナーゼインプラント(Biodegradable intravitreal tyrosine kinase implants)」と題する米国特許第8,512,738号及び米国特許出願公開第2014/0031408号、「持続眼内放出のためのミクロスフェア薬物送達系(Microsphere Drug Delivery System for Sustained Intraocular Release)」と題する米国特許出願公開第2014/0294986号、「治療効果が延長された網膜症を治療する方法(Methods For Treating Retinopathy With Extended Therapeutic Effect)」と題する米国特許第8,911,768号(Allergan, Inc.);「改善された注射性を有する注射用懸濁液の調製(Preparation of injectable suspensions having improved injectability)」と題する米国特許第6,495,164号(Alkermes Controlled Therapeutics, Inc.);「充填材を含有する生分解性マイクロカプセル(Biodegradable Microcapsules Containing Filling Material)」と題する国際公開第2014/047439号(Akina, Inc.);「薬物送達用の組成物及び方法(Compositions And Methods For Drug Delivery)」と題する国際公開第2010/132664号(Baxter International Inc. Baxter Healthcare SA);「薬物担持量が向上したポリマーナノ粒子及びその使用方法(Polymeric nanoparticles with enhanced drug loading and methods of use thereof)」と題する米国特許出願公開第20120052041号(The Brigham and Women’s Hospital, Inc.);「治療剤を含む治療用ナノ粒子、並びにそれを作製及び使用する方法(Therapeutic Nanoparticles Comprising a Therapeutic Agent and Methods of Making and Using Same)」と題する米国特許出願公開第20140178475号、米国特許出願公開第20140248358号及び米国特許出願公開第20140249158号(BIND Therapeutics, Inc.);「薬物送達のためのポリマーマイクロ粒子(Polymer microparticles for drug delivery)」と題する米国特許第5,869,103号(Danbiosyst UK Ltd.);「Peg化ナノ粒子(Pegylated Nanoparticles)」と題する米国特許第8628801号(ナバーラ大学);「眼内薬物送達系(Ocular drug delivery system)」と題する米国特許出願公開第2014/0107025号(Jade Therapeutics, LLC);「改善された放出プロファイルを有するマイクロ粒子及び生分解性ゲルから構成される薬剤送達系、並びにその使用方法(Agent delivering system comprised of microparticle and biodegradable gel with an improved releasing profile and methods of use thereof)」と題する米国特許第6,287,588号、「放出プロファイルを改善するための生分解性材料内のマイクロ粒子から構成される生物活性剤送達系(Bioactive agent delivering system comprised of microparticles within a biodegradable to improve release profiles)」と題する米国特許第6,589,549号(Macromed, Inc.);「非線形親水性疎水性マルチブロックコポリマーのナノ粒子及びマイクロ粒子(Nanoparticles and microparticles of non-linear hydrophilichydrophobic multiblock copolymers)」と題する米国特許第6,007,845号及び米国特許第5,578,325号(Massachusetts Institute of Technology);「眼周囲又は結膜下投与のための眼科用デポー配合物(Ophthalmic depot formulations for periocular or subconjunctival administration)」と題する米国特許出願公開第20040234611号、米国特許出願公開第20080305172号、米国特許出願公開第20120269894号及び米国特許出願公開第20130122064号(Novartis Ag);「ブロックポリマー(Block polymer)」と題する米国特許第6,413,539号(Poly-Med, Inc.);「炎症を改善するための薬剤の送達(Delivery of an agent to ameliorate inflammation)」と題する米国特許出願公開第20070071756号(Peyman);「注射用デポー配合物、及びナノ粒子を含む難溶性薬物の持続放出をもたらす方法(Injectable Depot Formulations And Methods For Providing Sustained Release Of Poorly Soluble Drugs Comprising Nanoparticles)」と題する米国特許出願公開第20080166411号(Pfizer, Inc.);「生物活性分子の送達の向上のための方法及び組成物(Methods and compositions for enhanced delivery of bioactive molecules)」と題する米国特許第6,706,289号(PR Pharmaceuticals, Inc.);並びに「薬物送達用のマトリックスを含有するマイクロ粒子(Microparticle containing matrices for drug delivery)」と題する米国特許第8,663,674号(Surmodics)が挙げられる。
X.生物学的データ
生物学的例1:
CBP/P300の分解プロトコル:
アッセイ培地は、フェノールレッド不含DMEM培地であり、ウシ胎児血清(FBS)をGibco(米国ニューヨーク州、グランドアイランド)から購入した。Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイシステムを、Promega(米国ウィスコンシン州、マディソン)から購入した。内在的にタグ付けされたHiBiT-CBPを有する安定したHEK293T細胞系統を、相同性誘導型修復(homologous directed repair)を使用してHiBiT融合タグをN末端で導入するCRISPR/Cas9遺伝子編集によって社内で作製した。細胞培養フラスコ及び384ウェルマイクロプレートを、VWR(米国ペンシルベニア州、ラドナー)から購入した。
CBPの分解を、Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイキットを使用して発光シグナルの定量化に基づいて決定した。試験化合物を、10μMの最高濃度(10μMの濃度)から11点の半対数滴定で2連において384ウェルプレートに加えた。細胞を、アッセイ培地中の1ウェル当たり10000個の細胞の細胞密度で384ウェルのコーニング3570プレート(Corning、米国マサチューセッツ州、テュークスベリー)へと加えた。プレートを5%COで37℃にて6時間インキュベートした。試験化合物の不存在下で処理された細胞はネガティブコントロールであり、培地はポジティブコントロールであった。6時間インキュベートした後に、Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイ試薬を細胞に加えた。EnVision(商標)マルチラベルリーダー(PerkinElmer、米国カリフォルニア州、サンタクララ)において発光を取得した。
Figure 2023545507000346
生物学的例2:
NRASの分解プロトコル:
アッセイ培地は、フェノールレッド不含DMEM培地であり、ウシ胎児血清(FBS)をGibco(米国ニューヨーク州、グランドアイランド)から購入した。Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイシステムを、Promega(米国ウィスコンシン州、マディソン)から購入した。安定したHEK293T HiBiT-NRAS細胞系統を、レンチウイルスを使用してC末端にHiBiT融合タグを有するNRASドメインを異所的に発現させて社内で作製した。細胞培養フラスコ及び384ウェルマイクロプレートを、VWR(米国ペンシルベニア州、ラドナー)から購入した。
NRASの分解を、Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイキットを使用して発光シグナルの定量化に基づいて決定した。試験化合物を、10μMの最高濃度から10点の半対数滴定で2連において384ウェルプレートに加えた。細胞を、アッセイ培地中の1ウェル当たり2500個の細胞の細胞密度で384ウェルプレートへと加えた。プレートを5%COで37℃にて24時間インキュベートした。試験化合物の不存在下で処理された細胞はネガティブコントロールであり、培地はポジティブコントロールであった。24時間インキュベートした後に、Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイ試薬を細胞に加えた。EnVision(商標)マルチラベルリーダー(PerkinElmer、米国カリフォルニア州、サンタクララ)において発光を取得した。
生物学的例3:CRBNの結合データ
NanoBRET(商標)アッセイ
細胞セレブロン(CRBN)に対する試験化合物の細胞透過性及び結合親和性を、293T細胞におけるCRBN-NanoLuc(商標)融合タンパク質に可逆的に結合されたポマリドミド-NanoBRET(商標)トレーサーの競合的置換によって決定した。293T細胞を、CRBN及びNanoLuc(商標)ルシフェラーゼの融合物を発現するようにレンチウイルストランスフェクションによって改変した。改変されたCRBN-NanoLuc 293T細胞系統を、様々な濃度の試験化合物、及び予め決められたKD濃度(300nM)のNanoBRET蛍光トレーサーとコンジュゲートされたポマリドミドプローブで同時処理し、37℃で2時間インキュベートして平衡に到達させた。試験化合物の親和性を、製造業者の指示に従って、NanoBRET試薬(Promega)を加えた後にNanoBRET-ポマリドミドトレーサーシグナルを置き換えることにより決定した。
OptiMEM培地中に2×10個の細胞/mL(8000個の細胞/ウェル)で懸濁された40μLの293T細胞を、Multidrop Combi試薬ディスペンサー(Thermo Fisher)を使用して、384ウェルの白色のTC処理されたマイクロプレートの各ウェルに分注した。10mMのDMSO試験化合物ストック溶液をDMSO中で連続希釈(半対数)して、音響に対応した(acoustic ready)384ウェルの低デッドボリュームのマイクロプレート(Labcyte)において11点の用量列(10000μM、3160μM、1000μM、316μM、100μM、31.6μM、10μM、3.2μM、1μM、0.3μM、0.1μM)を作製した。Echo 550音響リキッドハンドラー(Labcyte)を使用して、293T細胞が入った白色のTC処理されたマイクロプレートの各384ウェルに40nLの連続希釈された化合物溶液を2連で分注した。40nLのDMSOを全てのコントロールウェルに移した。40nLのNanoBRET-ポマリドミドトレーサーを、列1~列23における全てのウェルに分注した。40nLの追加のDMSOを列24に分注した。DMSOの最終濃度は、全ての試料について0.2%であった。プレートを短時間遠心させ、細胞を37℃、5%COで2時間インキュベートした。20μLのNanoBRET TEアッセイ試薬を各ウェルに加え、EnVisionマルチラベルリーダー(PerkinElmer)においてNanoBRETシグナルを取得した。CRBN-NanoLucからのドナー発光を、NanoLuc 460/50フィルターを用いて450nmで検出し、NanoBRET-ポマリドミドトレーサーのアクセプター蛍光(618nm)を、600nmロングパスNanoBRETフィルターを用いて検出した。アクセプターシグナル/ドナーシグナルの比率を各ウェルごとに計算した。列24(NanoBRET-ポマリドミドトレーサーを加えていない細胞)をポジティブコントロール(P)として使用した。
化合物で処理された試料(T)のパーセント応答を、各ウェルについてのアクセプター/ドナー比をバックグラウンド(すなわち、ポジティブコントロール)シグナル減算後の同じマイクロタイタープレート上のDMSOで処理されたネガティブ(N)コントロールに対して正規化することによって計算した:応答%=100×(シグナル(T)-平均(P))/(平均(N)-平均(P))。
CRBN FPの結合アッセイ
CRBN-DDB1に対する試験化合物の結合定数(KD)の決定を、確立された高感度で定量的なin vitro蛍光偏光(FP)結合アッセイを使用して行った。コントロール化合物を同じプレート上で実行した。化合物を、Frontier Scientific Services Incにより低デッドボリュームプレート中で供給された連続希釈DMSOストックから、音響技術を使用して黒色の384ウェルの適合性FPプレートに総反応容量の1%まで分注した。化合物を行Aから行Pまで垂直に配置した。濃度列は横方向で列1~例11であり、次に列12~例22で重複している。列23及び列24を、それぞれ0%(5nMのプローブ)及び100%のコントロール(高濃度のタンパク質とともに5nMのプローブ)用に確保する。CRBN-DDB1への化合物の結合を、単一部位リガンド枯渇モデル(single site ligand depletion model)によって決定されるように、113nMのKDを有するAlexa-647 Fluor(商標)ベースのプローブを置き換えることによって測定した。50mMのHEPES(pH7.4)、200mMのNaCl、1mMのTCEP、及び0.05%のプルロン酸-127中の150nMのCRBN-DDB1及び5nMのプローブ色素を含む20μLの混合物を、化合物が入ったウェルに加え、室温で1.5時間インキュベートした。100%のプローブが結合されるコントロールウェルは、1500nMのCRBNを含んでいた。CRBN-DDB1を除く整合用コントロールプレートを使用して、バックグラウンド蛍光の補正を行った。プレートを適切なFPフィルターセットを備えたEnvisionプレートリーダーにおいて読み取った。
Figure 2023545507000347
生物学的例4:ERK HTRF法
材料
Colo205 CCL-222細胞をATCCから購入した。フェノールレッド不含RPMI 1640培地及びウシ胎児血清(FBS)をGibco(米国ニューヨーク州、グランドアイランド)から購入した。細胞培養フラスコ及び384ウェルマイクロプレートを、VWR(米国ペンシルベニア州、ラドナー)から入手した。総ERK HTRFアッセイキットを、Cisbio(64NRKPEH、米国マサチューセッツ州、ベッドフォード)から購入した。
ERK1/2の分解分析
ERK1/2の分解を、総ERK1/2 HTRFアッセイキットを使用してFRETシグナルの定量化に基づいて決定した。試験化合物を、10μMの最高濃度から10点の半対数滴定で2連において384ウェルプレートに加えた。COLO205細胞を、1ウェル当たり5000個の細胞の細胞密度で384ウェルプレートへと加えた。プレートを5%COで37℃にて6時間維持した。試験化合物の不存在下で処理された細胞はネガティブコントロールであった。全ての試薬を含むが細胞を含まないウェルによってポジティブコントロールを設けた。HTRF試薬を、製造業者の指示に従って加えるとともに、95℃で10分間溶解物を変性させ、室温に冷却した後に抗体を加える追加の工程を行った。抗体を加えた後に、試料を一晩インキュベートした。EnVision(商標)マルチラベルリーダー(PerkinElmer、米国カリフォルニア州、サンタクララ)においてFRETシグナルを取得した。
Figure 2023545507000348
生物学的例5:NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiTの分解アッセイ
NSP3 Ubl-2_PLpro-HA-HiBiTを安定的に発現する239T細胞系統の作製
本明細書に記載される二官能性デグレーダーによって媒介される標的タンパク質の分解の定量的細胞分解のために、HA及びHiBiTを、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(Sars-CoV-2)由来のORF1aポリタンパク質のアミノ酸1564~アミノ酸1878のヒトコドン最適化遺伝子配列のC末端に追加し、NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiTを発現する293T(ATCC(商標)、CRL-3216)細胞系統を社内で作製した。NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiTの発現を、予想される分子量のHA抗体を用いて確認した。
NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T CRBN-/-の細胞系統を、CRISPR/Cas9編集CRBN-/-の293T細胞系統を使用して同様に作製した。
材料
NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T系統を、社内で本明細書に記載されるように作製した。親の293T細胞系統、及びNSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT 293T細胞系統を、以下の培地:10%の血清(Thermo Fisher、10437036)を含むDMEM(Thermo Fisher、11965092)中で慣例通りに、20回以下の継代まで培養した。アッセイのために、NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiT細胞を撒種して、10%の血清(Thermo Fisher、10437036)を含むフェノールレッド不含DMEM(Thermo Fisher、21063045、又は代替的なフェノールレッド不含DMEM)中で処理した。Corning(商標)の384ウェルの低フランジの黒色平底ポリスチレンTC処理マイクロプレート(Corning、3571)においてアッセイを実施した。Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイシステム(Promega、N3050)において細胞を溶解した。
NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiTの分解アッセイ(細胞)
試験化合物を、10mMの最高濃度から11点の半対数滴定で2連において384ウェルプレートに加え、使用するまで-20℃で貯蔵した。簡単に説明すると、化合物処理の日に、試験化合物が入った384ウェルプレートに、試験化合物の最高用量が10μMとなる容量において1ウェル当たり2500個の細胞の密度で細胞を播種した。さらに、ネガティブコントロール細胞をビヒクル単独で処理した。プレートを5%COで37℃にてアッセイ期間(6時間又は24時間)にわたってインキュベートした。所望のインキュベーション時間の後に、Nano-Glo(商標)HiBiT溶解アッセイシステム(製造業者の推奨に従って調製され、1:1(容量/容量)の比率で細胞に加えられる)を加えることによって細胞を溶解した。マイクロプレートをオービタルプレートシェーカーで300rpm~600rpmにて10分間撹拌し、室温で更に60分間インキュベートした。EnVision(商標)マルチラベルリーダー(PerkinElmer、米国カリフォルニア州、サンタクララ)において発光を取得した。
化合物の存在下で測定された発光応答の定量化を、高シグナル/非分解コントロール (未処理の細胞+溶解検出試薬)及び低シグナル/完全分解コントロール(未処理の細胞、溶解検出試薬なし)に対して正規化した。データを4パラメーターロジスティックフィットで分析して、シグモイド状の用量-応答曲線を作成した。DC50は、総細胞NSP3 UBL2_PLpro-HA-HiBiTの正確に50%が分解された化合物の濃度である。Emax、すなわち各化合物の最大効果は、化合物処理後に細胞内に残留している残留タンパク質の量を表す。
Figure 2023545507000349
Figure 2023545507000350
XI.一般的合成
本明細書に記載の化合物は、当業者に既知の方法によって調製することができる。非限定的な例としては、開示の化合物は、下記のスキームを用いて作製することができる。
立体中心を有する本発明の化合物は便宜上、立体化学を有さずに描かれ得る。純粋な又は濃縮されたエナンチオマー及びジアステレオマーを当該技術分野で既知の方法によって調製することができることが当業者には認識される。光学活性な材料を得る方法の例として、少なくとも下記が挙げられる。
i)結晶の物理的分離-個々のエナンチオマーの肉眼で見える結晶を手作業で分離する技術。別々のエナンチオマーの結晶が存在する、すなわち材料はコングロメレートであり、結晶は視覚的に識別される場合にこの技術を使用することができる。
ii)同時結晶化-個々のエナンチオマーをラセミ体の溶液から別々に結晶させる技術であり、エナンチオマーが固体状態においてコングロメレートである場合のみ可能である。
iii)酵素分解-エナンチオマーの酵素との反応速度の違いによりラセミ体を部分的に又は完全に分離する技術。
iv)酵素不斉合成-少なくとも合成の1工程にて酵素反応を使用して、エナンチオマーとして純粋な又はエナンチオマーとして濃縮された所望のエナンチオマーの合成前駆物質を得る合成技術。
v)化学不斉合成-キラル触媒又はキラル補助剤によって達成され得る、生成物において不斉性(すなわち、キラリティー)をもたらす条件下で非キラル前駆物質から所望のエナンチオマーを合成する合成技術。
vi)ジアステレオマー分離-ラセミ化合物を、個々のエナンチオマーをジアステレオマーに変換する、エナンチオマーとして純粋な試薬(キラル補助剤)と反応させる技術。その後、得られたジアステレオマーを、より明確な構造的な差異によって、クロマトグラフィー又は結晶化により分離した後にキラル補助剤を除去して所望のエナンチオマーを得る。
vii)一次及び二次の不斉変換-ラセミ体に由来するジアステレオマーを迅速に平衡化して、所望のエナンチオマーに由来するジアステレオマーの溶解に優位性(preponderance)を生じさせるか、又は所望のエナンチオマーに由来するジアステレオマーの優先的な結晶化が平衡を乱し、最終的には原則として全ての材料を所望のエナンチオマーから結晶ジアステレオマーに変換する技術。その後、所望のエナンチオマーをジアステレオマーから解放する。
viii)速度論的分割-この技術は、速度論的条件(kinetic conditions)下でのキラル、非ラセミ試薬、又は触媒とのエナンチオマーの不均等な反応速度による、ラセミ体の部分的又は完全な分割(又は部分的に分割された化合物の更なる分割)の達成を指す。
ix)非ラセミ前駆物質からのエナンチオ特異的(enantiospecific)合成-合成の間に立体化学の完全性が損なわれない又はほとんど損なわれない、所望のエナンチオマーを非キラル出発物質から得る合成技術。
x)キラル液体クロマトグラフィー-固定相との異なる相互作用によって、ラセミ体のエナンチオマーを液体移動相において分離する技術(キラルHPLCによるものを含む)。固定相はキラル材料で作製されてもよく、又は移動相は異なる相互作用を引き起こすため追加のキラル材料を含んでもよい。
xi)キラルガスクロマトグラフィー-ラセミ体を揮発させ、固定非ラセミキラル吸着相を備えるカラムにより、気体移動相においてそれらの異なる相互作用によってエナンチオマーを分離する技術。
xii)キラル溶媒による抽出-特定のキラル溶媒中への1つのエナンチオマーの選択溶解によりエナンチオマーが分離される技術。
xiii)キラルメンブレンを越える輸送-ラセミ体を薄いメンブレンバリアと接触して配置する技術。バリアは、典型的には、一方にラセミ体が含まれる、2つの混和性流体を隔てるものであり、濃度又は圧力の差等の駆動力は、メンブレンバリアを越える優先的な輸送をもたらす。ラセミ体の1つのエナンチオマーのみを通過させるメンブレンの非ラセミキラル特性の結果として分離が起こる。
xiv)擬似移動床クロマトグラフィーを或る特定の実施形態で使用する。多様なキラル固定相を商業的に入手することができる。
一般的な合成スキーム1
Figure 2023545507000351
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム1に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、銅触媒(例えば、ヨウ化銅(I)、塩化銅(I)、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、配位子(例えば、ビピリジン、1,10-フェナントロリン、ジメチルエチレンジアミン、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、炭酸セシウム、炭酸カリウム、第三リン酸カリウム、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、ジメチルスルホキシド、アセトニトリル、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、化合物3を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、4を得る。工程3において、化合物4を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて5を加えて、6を得る。
一般的な合成スキーム2
Figure 2023545507000352
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム2に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、銅触媒(例えば、ヨウ化銅(I)、塩化銅(I)、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、配位子(例えば、ビピリジン、1,10-フェナントロリン、ジメチルエチレンジアミン、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、炭酸セシウム、炭酸カリウム、第三リン酸カリウム、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、ジメチルスルホキシド、アセトニトリル、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、化合物3を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、4を得る。工程3において、化合物4を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて5を加えて、6を得る。
一般的な合成スキーム3
Figure 2023545507000353
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム3に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、銅触媒(例えば、臭化銅(II)、酢酸銅(II)、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、及び塩基(例えば、ピリジン、4-ジメチルアミノピリジン、カリウムtert-ブトキシド、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で周囲空気下にて2と反応させて、3を得る。工程2において、化合物3を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、4を得る。工程3において、化合物4を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて5を加えて、6を得る。
一般的な合成スキーム4
Figure 2023545507000354
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム4に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、2を得る。工程2において、化合物2を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて3を加えて、4を得る。工程3において、化合物4を、パラジウム触媒(例えば、酢酸パラジウム(II)、Pd(dba)、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、ホスフィン配位子(例えば、BINAP、XantPhos、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なホスフィン配位子)、及び塩基(例えば、カリウムtert-ブトキシド、炭酸セシウム、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、THF、ジオキサン、又はDMF)中で高められた温度にて5と反応させて、6を得る。
一般的な合成スキーム5
Figure 2023545507000355
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム5に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物2を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて3を加えて、4を得る。工程2において、化合物4を、パラジウム触媒(例えば、酢酸パラジウム(II)、Pd(dba)、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、ホスフィン配位子(例えば、BINAP、XantPhos、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なホスフィン配位子)、及び塩基(例えば、カリウムtert-ブトキシド、炭酸セシウム、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、THF、ジオキサン、又はDMF)中で高められた温度にて5と反応させて、6を得る。
一般的な合成スキーム6
Figure 2023545507000356
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム6に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、塩基(例えば、ピリジン、トリエチルアミン、又は代替的にはトリフラート化条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、ジクロロメタン又はトルエン)中でフェニルトリフルイミドと反応させて、2を得る。工程2において、化合物2を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、3を得る。工程3において、化合物3を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて4を加えて、5を得る。工程4において、化合物5を、パラジウム触媒(例えば、酢酸パラジウム(II)、Pd(dba)、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、ホスフィン配位子(例えば、BINAP、XantPhos、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なホスフィン配位子)、及び塩基(例えば、カリウムtert-ブトキシド、炭酸セシウム、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、THF、ジオキサン、又はDMF)中で高められた温度にて6と反応させて、7を得る。
一般的な合成スキーム7
Figure 2023545507000357
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム7に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、パラジウム触媒(例えば、PdCl(dppf)、PdCl(PPh)、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、XPhos、PPh、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、酢酸カリウム、カリウムエトキシド、炭酸カリウム、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、DMA、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、化合物3をエステル交換に供して、4を得る。工程3において、化合物4を、銅触媒(例えば、臭化銅(II)、酢酸銅(II)、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、及び塩基(例えば、ピリジン、4-ジメチルアミノピリジン、カリウムtert-ブトキシド、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で周囲空気下にて5と反応させて、6を得る。
一般的な合成スキーム8
Figure 2023545507000358
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム8に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、パラジウム触媒(例えば、PdCl(dppf)、PdCl(PPh)、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、XPhos、PPh、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、酢酸カリウム、カリウムエトキシド、炭酸カリウム、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、DMA、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、化合物3をエステル交換に供して、4を得る。工程3において、化合物4を、銅触媒(例えば、臭化銅(II)、酢酸銅(II)、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、及び塩基(例えば、ピリジン、4-ジメチルアミノピリジン、カリウムtert-ブトキシド、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で周囲空気下にて5と反応させて、6を得る。
一般的な合成スキーム9
Figure 2023545507000359
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム9に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、パラジウム触媒(例えば、PdCl(dppf)、PdCl(PPh)、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、XPhos、PPh、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、酢酸カリウム、カリウムエトキシド、炭酸カリウム、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、DMA、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、化合物3をエステル交換に供して、4を得る。工程3において、化合物4を、銅触媒(例えば、臭化銅(II)、酢酸銅(II)、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、及び塩基(例えば、ピリジン、4-ジメチルアミノピリジン、カリウムtert-ブトキシド、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で周囲空気下にて5と反応させて、6を得る。
一般的な合成スキーム10
Figure 2023545507000360
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム10に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、パラジウム触媒(例えば、Pd(OAc)、Pd(PPh、又は代替的には別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、P(p-MeOPh)、PPh、PCy、又は代替的には別の適切な配位子)、水、及びピバル酸無水物の存在下に有機溶媒(例えば、ジメトキシエタン、THF、又はトルエン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。
一般的な合成スキーム11
Figure 2023545507000361
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム11に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、有機溶媒(例えば、エタノール又はメタノール)中で適切なカルボニル還元剤(例えば、水素化ホウ素ナトリウム)と反応させて、2を得る。
一般的な合成スキーム12
Figure 2023545507000362
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム12に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、適切な還元剤(例えば、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム又はシアノ水素化ホウ素ナトリウム)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール又はエタノール)中で2と反応させて、2を得る。
一般的な合成スキーム13
Figure 2023545507000363
式IIIの化合物を、一般的な合成スキーム13に示される経路に従って合成することができる。工程1において、化合物1を、パラジウム触媒(例えば、Pd(OAc)、Pddba、又は代替的には鈴木カップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、XPhos、PCy、又は代替的には鈴木カップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、炭酸ナトリウム、第三リン酸カリウム、炭酸カリウム、又は代替的には鈴木カップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒水溶液(例えば、10:1のトルエン:水、5:1のTHF:水、又は1:1のエタノール:水)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。
一般的な合成スキーム14
Figure 2023545507000364
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム14に示される経路に従って合成することができる。工程1において、中間体1(Saari et al.(Saari, W. et al.著の「幾つかのジヒドロ及びテトラヒドロ-4H-イミダゾ[5,4,1-ij]キノリン誘導体の合成及び反応(Synthesis and reactions of some dihydro and tetrahydro-4H-imidazo[5,4,1-ij]quinoline derivatives)」 Journal of Heterocyclic Chemistry, 1982, 19(4):837-840を参照のこと)の手順によって調製される)を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて2を加えて、3を得る。工程2において、3を、パラジウム触媒(例えば、酢酸パラジウム(II)、Pd(dba)、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、ホスフィン配位子(例えば、BINAP、XantPhos、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なホスフィン配位子)、及び塩基(例えば、カリウムtert-ブトキシド、炭酸セシウム、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、THF、ジオキサン、又はDMF)中で高められた温度にて4と反応させて、5を得る。
一般的な合成スキーム15
Figure 2023545507000365
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム15に示される経路に従って合成することができる。工程1において、中間体1を、銅触媒(例えば、ヨウ化銅(I)、塩化銅(I)、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、配位子(例えば、ビピリジン、1,10-フェナントロリン、ジメチルエチレンジアミン、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、炭酸セシウム炭酸塩(cesium carbonate carbonate)、第三リン酸カリウム、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、ジメチルスルホキシド、アセトニトリル、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。
一般的な合成スキーム16
Figure 2023545507000366
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム16に示される経路に従って合成することができる。工程1において、1を、パラジウム触媒(例えば、PdCl(dppf)、PdCl(PPh)、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、XPhos、PPh、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、酢酸カリウム、カリウムエトキシド、炭酸カリウム、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、DMA、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、中間体3をエステル交換して、4を得る。工程3において、中間体4を、銅触媒(例えば、臭化銅(II)、酢酸銅(II)、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、及び塩基(例えば、ピリジン、4-ジメチルアミノピリジン、カリウムtert-ブトキシド、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で周囲空気下にて5と反応させて、6を得る。
一般的な合成スキーム17
Figure 2023545507000367
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム17に示される経路に従って合成することができる。工程1において、中間体1(Kukla et al.(Kukla, M. J. et al.著の「4,5,6,7-テトラヒドロ-5-メチルイミダゾ[4,5,1-jk][1,4]ベンゾジアゼピン-2(1H)-オン(TIBO)誘導体の合成及び抗HIV-1活性(Synthesis and anti-HIV-1 activity of 4,5,6,7-tetrahydro-5-methylimidazo[4,5,1-jk][1,4]benzodiazepin-2(1H)-one (TIBO) derivatives)」 J. Med. Chem. 1991, 34(11):3187-3197を参照のこと)の手順によって調製される)を、塩基(例えば、トリエチルアミン、ピリジン、又はBoc保護条件において使用される他の適切な塩基)の存在下にジクロロメタン中で2と反応させて、3を得る。工程2において、中間体3を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて4を加えて、5を得る。工程3において、中間体5を、パラジウム触媒(例えば、酢酸パラジウム(II)、Pd(dba)、又はバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される他の適切なパラジウム触媒)、ホスフィン配位子(例えば、BINAP、XantPhos、又はバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される他の適切なホスフィン配位子)、及び塩基(例えば、カリウムtert-ブトキシド、炭酸セシウム、又はバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される他の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、THF、ジオキサン、又はDMF)中で高められた温度にて6と反応させて、7を得る。工程4において、中間体7を、ジクロロメタン中で8と反応させて、9を得る。
一般的な合成スキーム18
Figure 2023545507000368
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム18に示される経路に従って合成することができる。工程1において、中間体1を、銅触媒(例えば、ヨウ化銅(I)、塩化銅(I)、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、配位子(例えば、ビピリジン、1,10-フェナントロリン、ジメチルエチレンジアミン、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、炭酸セシウム、炭酸カリウム、第三リン酸カリウム、又は代替的にはウルマンカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、ジメチルスルホキシド、アセトニトリル、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、中間体3を、ジクロロメタン中で4と反応させて、5を得る。
一般的な合成スキーム19
Figure 2023545507000369
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム19に示される経路に従って合成することができる。工程1において、1を、パラジウム触媒(例えば、PdCl(dppf)、PdCl(PPh)、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、配位子(例えば、XPhos、PPh、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な配位子)、及び塩基(例えば、酢酸カリウム、カリウムエトキシド、炭酸カリウム、又は代替的には宮浦カップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、DMA、又はジオキサン)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、中間体3をエステル交換に供して、4を得る。工程3において、中間体4を、銅触媒(例えば、臭化銅(II)、酢酸銅(II)、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な銅触媒)、及び塩基(例えば、ピリジン、4-ジメチルアミノピリジン、カリウムtert-ブトキシド、又は代替的にはチャン・ラムカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で周囲空気下にて5と反応させて、6を得る。工程4において、6を、ジクロロメタン中で7と反応させて、8を得る。
一般的な合成スキーム20
Figure 2023545507000370
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム20に示される経路に従って合成することができる。工程1において、中間体1を、塩基(例えば、炭酸カリウム、炭酸セシウム、又はフェノールアルキル化条件において使用される他の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、DMF、DMA、又はアセトニトリル)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、中間体3を、水性条件温度下で鉄粉とともにHClと反応させて、4を得る。工程3において、4を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、6を得る。工程4において、中間体6を、有機溶媒(例えば、テトラヒドロフラン又はジクロロメタン)中で塩基(例えば、水素化ナトリウム)と反応させ、続いて7を加えて、8を得る。工程5において、8を、パラジウム触媒(例えば、酢酸パラジウム(II)、Pd(dba)、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なパラジウム触媒)、ホスフィン配位子(例えば、BINAP、XantPhos、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切なホスフィン配位子)、及び塩基(例えば、カリウムtert-ブトキシド、炭酸セシウム、又は代替的にはバックワルド-ハートウィグカップリング条件において使用される別の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、トルエン、THF、ジオキサン、又はDMF)中で高められた温度にて9と反応させて、10を得る。
一般的な合成スキーム21
Figure 2023545507000371
式Iの化合物を、一般的な合成スキーム21に示される経路に従って合成することができる。工程1において、中間体1を、塩基(例えば、炭酸カリウム、炭酸セシウム、又はフェノールアルキル化条件において使用される他の適切な塩基)の存在下に有機溶媒(例えば、DMF、DMA、又はアセトニトリル)中で高められた温度にて2と反応させて、3を得る。工程2において、3を、塩基(例えば、LDA、LiHMDS、又は他の適切な強い立体障害塩基)と反応させる。工程3において、4を、弱い還元剤(例えば、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム、シアノ水素化ホウ素ナトリウム、又は還元的アミノ化条件において使用される他の適切な水素化物還元剤)の存在下に有機溶媒(例えば、メタノール、アセトニトリル、又はジクロロメタン)中で5と反応させて、6を得る。工程4において、6を、三塩化アルミニウムの存在下にジクロロメタン中でトリホスゲンと反応させて、8を得る。工程5において、8を、有機溶媒(例えば、DMF、DMA、又はジオキサン)中で高められた温度にて9と反応させて、10を得る。
実施例1.tert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチル]カルバメート(化合物1)の合成
Figure 2023545507000372
工程1:クロロホルム(100mL)中の1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン1(10g、59.11mmol)の0℃の溶液に、クロロホルム(20mL)中の分子状臭素(14.17g、88.66mmol、4.54mL)の溶液を加えた。得られた混合物を室温で一晩撹拌した。このときに、反応物を飽和チオ硫酸ナトリウム水溶液中に注いだ。形成された黄色の固体を真空濾過によって単離し、水及びペンタンで洗浄し、凍結乾燥機に入れて、6-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン2(14.59g、49.99mmol、84.57%の収率、85%の純度)を得て、これを更に精製せずに使用した。
工程2:乾燥THF(2mL)中の6-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン2(40g、161.24mmol)の冷却された溶液に、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液)(37.07g、1.61mol)を、約5℃に温度を維持しつつ少しずつ加えた。添加が完了したら、得られた混合物を室温で30分間撹拌した。次いで、反応混合物を再び0℃に冷却し、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(154.80g、806.21mmol)の溶液を滴加した。添加が完了した後に、得られた溶液を65℃で16時間加熱した。次いで、反応混合物を0℃に冷却し、氷冷された塩化アンモニウム水溶液の添加によりクエンチし、酢酸エチルで抽出した。合わせた抽出物を、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮した。粗製物質をEtOAcで洗浄し、乾燥させて、3-(6-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン3(30g、59.07mmol、36.63%の収率、70.72%の純度)を淡黄色の固体として得た。
工程3:1,4-ジオキサン(60mL)中の3-(6-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン3(2.00g、5.57mmol)及びカリウム[[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]メチル]トリフルオロボレート(3.30g、13.92mmol)のよく撹拌された溶液が入った250mLの密閉管に、炭酸セシウム(5.44g、16.71mmol)及び水(8mL)を加えた。得られた溶液をNガスにより10分間脱ガスした。次いで、酢酸パラジウム(II)(125.01mg、556.83μmol)及びジ(1-アダマンチル)-n-ブチルホスフィン(99.82mg、278.42μmol)を加え、再びNガスにより5分間脱ガスし、反応混合物を100℃に16時間加熱した。反応が完了した後に(TLC)、粗製混合物を0℃に冷却し、飽和NHCl溶液でゆっくりクエンチし、酢酸エチル(2×75mL)で抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により石油エーテル中0%→100%の酢酸エチルを使用して精製したところ、所望の化合物は、石油エーテル中50%→60%の酢酸エチルで溶出し、こうしてtert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチル]カルバメート4(1.0g、2.21mmol、39.68%の収率、90.47%の純度)を黄色の固体として得た。LC-MS (ESI): m/z 354.0 [M-56+H]+。
工程4:無水DCM(20mL)中のtert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチル]カルバメート4(1.70g、4.15mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコに、ジオキサン中4.0Mの塩化水素溶液(4M、5.0mL)を0℃で加えた。得られた混合物を室温で1時間撹拌した。出発物質が消費された後に、過剰の溶媒を除去した。粗生成物をジエチルエーテル(10mL)で洗浄し、乾燥させて、3-[6-(アミノメチル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩5(1.5g、4.00mmol、96.25%の収率、92.12%の純度)を黄色の固体として得た。更に精製せずに使用した。
工程5:DMF(10mL)中の12-tert-ブトキシ-12-オキソ-ドデカン酸(224.78mg、784.85μmol)の撹拌された溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(608.62mg、4.71mmol、820.24μL)に続いてHATU(447.63mg、1.18mmol)を加え、得られた混合物を10分間撹拌した後に、3-[6-(アミノメチル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩5(0.300g、784.85μmol)を加えた。得られた反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応混合物に水を加え、酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、濃縮した後に、粗製物質を逆相クロマトグラフィー(C18、水:ACN)により精製して、tert-ブチル12-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチルアミノ]-12-オキソ-ドデカノエート6(0.180g、273.53μmol、34.85%の収率、87.79%の純度)を得た。
工程6:無水DCM(10mL)中のtert-ブチル12-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチルアミノ]-12-オキソ-ドデカノエート6(1000.00mg、1.73mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコ中に、99%の1,4-ジオキサン中4Mの塩化水素(4M、5.0mL)を0℃で加えた。得られた混合物を室温で2時間撹拌し、TLCにより監視した。出発物質が消費された後に、過剰の溶媒を減圧下で反応混合物から除去して、粗生成物を得た。粗生成物をジエチルエーテル(10mL)でトリチュレートし、乾燥させて、12-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチルアミノ]-12-オキソ-ドデカン酸の化合物1(720mg、1.22mmol、70.73%の収率、94.89%の純度)を黄色の固体として得た。LCMS (ESI): m/z 522.3 [M+H]+
実施例2.N1-(2-((4-((6-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン-5-イル)-2-メトキシピリジン-3-イル)アミノ)ベンジル)(メチル)アミノ)エチル)-N12-((1-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-2-オキソ-1,2-ジヒドロベンゾ[cd]インドール-6-イル)メチル)ドデカンジアミド(化合物2)の合成
Figure 2023545507000373
工程1:12-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチルアミノ]-12-オキソ-ドデカン酸1(23mg、0.045mmol)、N1-(4-((6-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン-5-イル)-2-メトキシピリジン-3-イル)アミノ)ベンジル)-N1-メチルエタン-1,2-ジアミン(20mg、0.045mmol)、HATU(26mg、0.067mmol)、及びDIPEA(23μL、0.13mmol)の溶液を、DMF(1ml)中で室温にて1時間撹拌した。得られた反応混合物を水(1.5mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×3mL)で抽出し、蒸発乾固させた。粗製物質を質量ベースの分取HPLC[カラム:X select C18(250×19)mm、5ミクロン、移動相:A:水中0.1%のHCOOH、B:アセトニトリル]により精製して、N1-(2-((4-((6-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン-5-イル)-2-メトキシピリジン-3-イル)アミノ)ベンジル)(メチル)アミノ)エチル)-N12-((1-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-2-オキソ-1,2-ジヒドロベンゾ[cd]インドール-6-イル)メチル)ドデカンジアミドギ酸塩の化合物2(7mg、19%)を得た。LC-MS (ESI): m/z 902.5 [M+H]+。
実施例3.N1-((1-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-2-オキソ-1,2-ジヒドロベンゾ[cd]インドール-6-イル)メチル)-N12-(2-((4-((2-フルオロ-3,3’-ジメトキシ-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)アミノ)ベンジル)(メチル)アミノ)エチル)ドデカンジアミド(化合物3)の合成
Figure 2023545507000374
工程1:12-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]メチルアミノ]-12-オキソ-ドデカン酸1(23mg、0.045mmol)、N1-(4-((6-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ジオキシン-5-イル)-2-メトキシピリジン-3-イル)アミノ)ベンジル)-N1-メチルエタン-1,2-ジアミン(20mg、0.045mmol)、HATU(26mg、0.067mmol)、及びDIPEA(23μL、0.13mmol)の溶液を、DMF(1ml)中で室温にて1時間撹拌した。得られた反応混合物を水(1.5mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×3mL)で抽出し、蒸発乾固させた。粗製物質を質量ベースの分取HPLC[カラム:X select C18(250×19)mm、5ミクロン、移動相:A:水中0.1%のHCOOH、B:アセトニトリル]により精製して、N1-((1-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-2-オキソ-1,2-ジヒドロベンゾ[cd]インドール-6-イル)メチル)-N12-(2-((4-((2-フルオロ-3,3’-ジメトキシ-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)アミノ)ベンジル)(メチル)アミノ)エチル)ドデカンジアミドの化合物3(9mg、21%)を得た。LC-MS (ESI): m/z 914.4 [M+H]+。
実施例4.N’-[[4-[[6-(2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-5-イル)-2-メトキシ-3-ピリジル]アミノ]フェニル]メチル]-N’-メチル-エタン-1,2-ジアミントリフルオロアセテート(化合物4)を得る合成
Figure 2023545507000375
工程1:無水ACN(10mL)中の1-(4-ブロモフェニル)-N-メチル-メタンアミン1(5g、24.99mmol、5.00mL)の混合物のよく撹拌された溶液が入った250mLの密閉管に、室温で炭酸セシウム(16.28g、49.98mmol)を加えた。得られた反応混合物を60℃で24時間撹拌した。反応の進行をTLCにより監視した。反応が完了した後に、反応混合物を、セライトを通して濾過し、EtOAc(1000mL)で洗浄した。溶液を減圧下で乾燥させて、粗生成物のtert-ブチルN-[2-[(4-ブロモフェニル)メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート3(8.5g、24.76mmol、99.09%の収率)を淡黄色の油状物として得た。
工程2:1,4-ジオキサン(20mL)中の5-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン4(1000.00mg、4.65mmol)及び4,4,4’,4’,5,5,5’,5’-オクタメチル-2,2’-ビ-1,3,2-ジオキサボロラン(1.77g、6.98mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの密閉管中に、酢酸カリウム(1.14g、11.63mmol、726.72μL)を加えた後に、Nガスにより10分間脱ガスした。次いで、[1,1’-ビス(ジ-tert-ブチルホスフィノ)フェロセン]ジクロロパラジウム(II)(303.07mg、465.02μmol)を加え、再び混合物をNガスにより5分間脱ガスした後に、120℃で3時間加熱した。次いで、反応混合物に、6-ブロモ-2-メトキシ-ピリジン-3-アミン5(944.16mg、4.65mmol)、炭酸カリウム(1.29g、9.30mmol、561.30μL)、水(4mL)、及びPd(PPh(537.36mg、465.02μmol)を加えた。この溶液をNガスにより10分間脱ガスし、110℃に3時間加熱した。反応が完了した後に(TLC)、粗製混合物を0℃に冷却し、水(10mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×75mL)で抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により石油エーテル中0%→60%の酢酸エチルを使用して精製したところ、所望の化合物は、石油エーテル中30%→40%の酢酸エチルで溶出し、こうして6-(2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-5-イル)-2-メトキシ-ピリジン-3-アミン6(600mg、1.90mmol、40.84%の収率、81.75%の純度)を薄褐色の固体として得た。LC-MS (ESI): m/z 259.0 [M + H]+。
工程3:1,4-ジオキサン(30mL)中の6-(2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-5-イル)-2-メトキシ-ピリジン-3-アミン6(1.50g、5.83mmol)及びtert-ブチルN-[2-[(4-ブロモフェニル)メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート3(2.00g、5.83mmol)のよく撹拌された溶液が入った250mLの密閉管中に、炭酸セシウム(5.70g、17.48mmol)を加えた。この混合物をNガスにより10分間脱ガスした後に、酢酸パラジウム(II)(13.08mg、58.27μmol)及びジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン(83.33mg、174.80μmol)を加え、再びNガスにより5分間脱ガスした。反応混合物を110℃に16時間加熱した。出発物質が消費された後に(TLC)、反応混合物を酢酸エチル(100mL)及び水(20mL)で希釈し、有機層を分離し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により石油エーテル中0%→100%の酢酸エチルを使用して精製したところ、所望の化合物は、石油エーテル中90%→100%の酢酸エチルで溶出し、こうしてtert-ブチルN-[2-[[4-[[6-(2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-5-イル)-2-メトキシ-3-ピリジル]アミノ]フェニル]メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート7(1.2g、2.04mmol、34.93%の収率、88.30%の純度)を濃厚な褐色の液体として得た。LC-MS (ESI): m/z 521.3[M+H]+。
工程4:無水DCM(5mL)中のtert-ブチルN-[2-[[4-[[6-(2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-5-イル)-2-メトキシ-3-ピリジル]アミノ]フェニル]メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート7(700mg、1.34mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコ中に、TFA(1.53g、13.45mmol、1.04mL)を0℃で加えた。得られた混合物を室温で1時間撹拌した。出発物質が消費された後に(TLC)、過剰の溶媒を減圧下で反応混合物から除去して、粗生成物を得た。粗生成物をジエチルエーテル(10mL)でトリチュレートし、乾燥させて、N’-[[4-[[6-(2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-5-イル)-2-メトキシ-3-ピリジル]アミノ]フェニル]メチル]-N’-メチル-エタン-1,2-ジアミントリフルオロアセテートの化合物4(700mg、1.18mmol、87.66%の収率、90%の純度)を褐色の液体として得た。LC-MS (ESI): m/z 421.3 [M+H]+。
実施例5.N’-[[4-[3-フルオロ-2-メトキシ-4-(3-メトキシフェニル)アニリノ]フェニル]メチル]-N’-メチル-エタン-1,2-ジアミン(化合物5)の合成
Figure 2023545507000376
工程1:無水1,4-ジオキサン(15mL)中の4-ブロモ-3-フルオロ-2-メトキシ-アニリン1(2g、9.09mmol)、(3-メトキシフェニル)ボロン酸2(1.52g、10.00mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの密閉管に、炭酸カリウム(3.77g、27.27mmol、1.65mL)を周囲温度で加えた。得られた溶液をNガスで10分間脱ガスした。その溶液にPd(dppf)Cl・CHCl(371.13mg、454.47μmol)を加え、反応混合物を100℃で6時間撹拌した。反応が完了した後に、反応混合物を室温に冷却した。反応混合物を、セライトパッドを通して濾過し、EtOAc(300mL)で洗浄した。濾液を水(2×100mL)で洗浄した後に、有機相を分離し、ブライン溶液(200mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させた。溶液を濾過し、減圧下で乾燥させて粗生成物を得て、これを0%→50%のEtOAc:石油エーテルで溶出させるフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により精製したところ、化合物は、8%→10%のEtOAc:石油エーテル中で溶出し、こうして3-フルオロ-2-メトキシ-4-(3-メトキシフェニル)アニリン3(1.3g、5.08mmol、55.88%の収率、96.60%の純度)を淡黄色の油状物として得た。LCMS (ESI): m/z 248.0 [M + H]+。
工程2:無水1,4-ジオキサン(12mL)中の3-フルオロ-2-メトキシ-4-(3-メトキシフェニル)アニリン3(1.04g、4.20mmol)及びtert-ブチルN-[2-[(4-ブロモフェニル)メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート4(1.2g、3.50mmol)のよく撹拌された溶液が入った50mLの密閉管形反応器に、炭酸セシウム(3.42g、10.49mmol)を室温にて窒素雰囲気下で加えた。得られた混合物を、反応混合物中に窒素ガスをバブリングすることにより10分間脱ガスした。引き続き、XPhos(166.65mg、349.59μmol)に続いて酢酸パラジウム(II)(39.24mg、174.80μmol)を加えた。得られた反応混合物を100℃に6時間加熱した。反応混合物を、セライトを通して濾過し、EtOAc(250mL)で洗浄した。濾液を水(2×100mL)で洗浄した後に、有機相を分離し、ブライン溶液(100mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させた。溶液を濾過し、減圧下で乾燥させて粗生成物を得て、これを0%→10%のMeOH:DCMで溶出させるカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により精製した。化合物は2%→5%のMeOH:DCM中で溶出し、こうしてtert-ブチルN-[2-[[4-[3-フルオロ-2-メトキシ-4-(3-メトキシフェニル)アニリノ]フェニル]メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート5(1.6g、2.80mmol、80.05%の収率、89.13%の純度)を帯赤褐色のゴム状の固体として得た。LCMS (ESI): m/z 510.3 [M + H]+。更に精製せずに使用した。
工程3:無水DCM(5mL)中のtert-ブチルN-[2-[[4-[3-フルオロ-2-メトキシ-4-(3-メトキシフェニル)アニリノ]フェニル]メチル-メチル-アミノ]エチル]カルバメート5(700mg、1.37mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコに、ジオキサン中4.0Mの塩化水素溶液(4M、2.04mL)を0℃で加えた。得られた混合物を室温で1時間撹拌した。溶媒を減圧下で反応混合物から除去して、粗生成物を得た。粗生成物をジエチルエーテル(10mL)でトリチュレートし、乾燥させて、N’-[[4-[3-フルオロ-2-メトキシ-4-(3-メトキシフェニル)アニリノ]フェニル]メチル]-N’-メチル-エタン-1,2-ジアミンの化合物5(610mg、1.33mmol、96.56%の収率、96.97%の純度)を黄色の固体として得た。LC-MS (ESI): m/z 410.3 [M+H]+。
実施例6.3-[5-(アミノメチル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩(化合物6)の合成
Figure 2023545507000377
工程1:DCE(1440mL)中の1,5-ジブロモナフタレン1(120g、419.64mmol、000)の撹拌された溶液を0℃に冷却し、塩化クロロアセチル(61.61g、545.53mmol、43.39mL)を滴加した。反応混合物をこの温度で約15分間撹拌した。次いで、三塩化アルミニウム(72.74g、545.53mmol、29.81mL)を少しずつ加え、反応混合物を室温までゆっくり温め、5時間撹拌した。反応混合物を冷水(500mL)及びDCM(1200mL)でクエンチした後に、セライトを通して濾過した。濾液を水及びブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介してDCM層を乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製固体を得た。この粗製物質を石油エーテル(1200mL)中2%の酢酸エチル中で30分間撹拌し、固体を濾過し、石油エーテル(1200mL)で洗浄して、2-クロロ-1-(4,8-ジブロモ-1-ナフチル)エテノン2(110g、294.39mmol、70.15%の収率、97%の純度)を薄緑色の固体として得た。TLC:Rf:0.3、石油エーテル中10%のEtOAc、UV検出。
工程2:HSO(2400mL)中の2-クロロ-1-(4,8-ジブロモ-1-ナフチル)エテノン2(200g、551.81mmol)の撹拌された溶液に、水(40mL)中の亜硝酸ナトリウム(39.98g、579.40mmol、18.42mL)の溶液を0℃で滴加し、得られた反応混合物を25℃で2時間撹拌した。次いで、反応混合物を冷水(870mL)中に注ぎ、濾過した。こうして得られた固体を酢酸エチル及び水の溶液(1:1、870mL:870mL)に加え、セライトを介して混合物を濾過し、酢酸エチル(500mL)で洗浄した。水層を酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。次いで、合わせた有機層をブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮した。粗製物質を石油エーテル中10%の酢酸エチルで洗浄し、乾燥させて、4,8-ジブロモナフタレン-1-カルボン酸3(160g、402.46mmol、72.93%の収率、83%の純度)を褐色の固体として得た。TLC:Rf:0.2、石油エーテル中50%のEtOAc、UV検出。
工程3:水酸化アンモニウム(28%溶液)(1.98kg、56.49mol、2.2L)中の4,8-ジブロモナフタレン-1-カルボン酸3(160g、484.89mmol、000)の撹拌された懸濁液に、銅(8.01g、126.07mmol)を加え、反応混合物を80℃で2時間撹拌した。反応混合物を室温に冷却し、濃塩酸でpH2~pH3に酸性化した。得られた懸濁液を濾過し、乾燥させて、粗生成物を得た。この粗製物を石油エーテル中10%の酢酸エチル中で30分間撹拌し、濾過し、石油エーテルで洗浄して、5-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン4(105g、342.84mmol、70.70%の収率、81%の純度)を褐色の固体として得た。TLC:Rf:0.3、石油エーテル中70%のEtOAc、UV検出。
工程4:乾燥THF(200mL)中の5-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン4(2.0g、6.85mmol)及び5-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン(2.0g、6.85mmol)のよく撹拌された溶液が入った500mLの三つ口丸底フラスコに、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、2.63g、68.53mmol)を0℃で加え、反応混合物を周囲温度で撹拌した。1時間後に、乾燥THF(10mL)中に溶解された3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン5(6.58g、30.84mmol、000)を0℃で加えた。反応混合物を65℃で16時間撹拌した。反応混合物を飽和塩化アンモニウム水溶液(50mL)でクエンチした後に、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。有機層を集め、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮した。次いで、得られた残留物をDCM(10mL)でトリチュレートして、3-(5-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン6(1.5g、3.30mmol、48.14%の収率、79%の純度)を黄色の固体として得た。LCMS (ES+): m/z 359.0 [M+H]+。1H NMR (d6-DMSO, 400 MHz) δ 11.14 (s, 1H), 8.12 (d, J = 7.48 Hz, 1H), 7.99 (d, J = 7.44 Hz, 1H), 7.72-7.62 (m, 2H), 7.26 (d, J = 6.92 Hz, 1H), 5.46 (dd, J = 12.84, 5.28 Hz, 1H), 2.99-2.90 (m, 1H), 2.81-2.63 (m, 2H), 2.12-2.07 (m, 1H); LC MS: ES+ 359.07, 361.02 (ブロモパターン)。
工程5:炉乾燥させた250mLの密閉管に、1,4-ジオキサン(30mL)及び水(8mL)中の3-(5-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン6(1g、2.78mmol)及びカリウム[[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]メチル]トリフルオロボレート7(1.65g、6.96mmol)を入れ、炭酸セシウム(2.72g、8.35mmol)を加えた。内容物を窒素ガスで10分間脱ガスし、続いてジ(1-アダマンチル)-n-ブチルホスフィン(49.91mg、139.21μmol)及び酢酸パラジウム(II)(62.51mg、278.42μmol)を加えた。得られた混合物を100℃で16時間撹拌した。反応が完了した後に、反応混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン溶液(20mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。粗生成物を50%→60%の酢酸エチル-石油エーテルで溶出させるフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により精製して、tert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]メチル]カルバメート8(200mg、458.73μmol、16.48%の収率、93.91%の純度)を淡黄色の固体として得た。LCMS (ESI): m/z 354.0 [M+H-tBu]+。
工程6:炉乾燥させた50mLの一つ口丸底フラスコに、tert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]メチル]カルバメート8(600mg、1.47mmol)及びDCM(10mL)を入れた後に、0℃に冷却した。次いで、ジオキサン中4.0Mの塩化水素溶液(4.80g、131.65mmol、6mL)を加え、得られた混合物を室温で1時間撹拌した。次に、反応混合物を真空中で濃縮した。得られた粗生成物をジエチルエーテル(20mL)で洗浄して、3-[5-(アミノメチル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩の化合物6(505mg、1.40mmol、95.46%の収率、95.78%の純度)を淡黄色の固体として得た。LCMS (ESI): m/z 310.2 [M+H]+
実施例7.3-[4-(アミノメチル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩(化合物7)及び3-(4-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物8)の合成
Figure 2023545507000378
工程1パート(1):ピリジン(36mL)中の7-ブロモ-14-オキサトリシクロトリデカ-,2(6),3(7),4(8),5(9)-ペンタエン-10,11-ジオン1(CAS番号24050-49-5、5g、18.05mmol)及びヒドロキシルアミン塩酸塩(1.25g、18.05mmol、750.92μL)の溶液を還流下で5時間撹拌し、続いて80℃に冷却した。次いで、反応系に塩化4-トルエンスルホニル(6.88g、36.09mmol)を加えた。加えた後に、温度を上げ、反応物を5時間還流撹拌し、続いて室温に冷却した。反応混合物を90mLの水中に注ぎ、撹拌して結晶を析出させ、これを濾過により集めた。結晶をビーカーに移し、90mLのNaHCO水溶液及び90mLの水で順次洗浄し、続いて濾過した。結晶を水で洗浄し、乾燥させて、更なる反応用の中間体を得た。中間体の全量をEtOH(15mL)及び水(18mL)中に溶解し、反応器に入れ、撹拌した。次いで、水酸化ナトリウム(フレーク、98%、1.4M、60mL)を混合物に滴加した。その後、混合物を加熱還流させ、この温度でエタノールを留去しながら3時間反応を行った。反応が完了した後に、反応混合物を75℃に冷却し、塩酸(36%(重量/重量)の水溶液、8.00g、219.41mmol、10mL)を滴加した。60℃で結晶が析出した。滴加が完了した後に、混合物を更に冷却した。析出した結晶を濾過により集め、水で洗浄し、乾燥させて、4-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン及び7-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オンの位置異性体混合物を黄色の固体として得た。更に精製せずに次の工程で使用した。
工程1パート(2):DCM(30mL)中の4-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン及び7-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン(3g、12.1mmol)(位置異性体混合物)の撹拌された溶液に、トリエチルアミン(1.84g、18.14mmol、2.53mL)及びDMAP(73.87mg、604.66μmol)を室温で加え、続いてtert-ブトキシカルボニルtert-ブチルカーボネート(1.98g、9.07mmol、2.08mL)を0℃で加えた。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物を室温で3時間撹拌した。反応混合物を水中に注ぎ、DCMで抽出し、NaSOを介して乾燥させ、濾過し、溶媒を減圧下で除去した。粗製化合物をカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、4%の酢酸エチル-石油エーテル)により精製して、tert-ブチル4-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-カルボキシレート2(1g、2.77mmol、45.87%の収率、96.58%の純度)をオフホワイト色の固体として得て、tert-ブチル7-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-カルボキシレート3(1.1g、1.88mmol、31.07%の収率、59.47%の純度)をオフホワイト色の固体として得た。
工程2:DCM(15mL)中のtert-ブチル4-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-カルボキシレート2(2.0g、5.74mmol)の撹拌された溶液に(2,2,2-トリフルオロエチル)2,2,2-トリフルオロアセテート4(12.06g、57.44mmol、8.10mL)を0℃で5分間かけて加えた。反応混合物を室温まで温め、この温度で3時間撹拌した。反応混合物を減圧下で45℃にて濃縮した。粗生成物を、ジエチルエーテルを使用してトリチュレートして、所望の生成物である4-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン5(1.9g、7.66mmol、133.34%の収率)を帯緑色の液体として得た。粗生成物を更なる精製を一切行わずに後続工程に進めた。
工程3:1,4-ジオキサン(45mL)及び水(15mL)中の4-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン5(1.5g、6.05mmol)、カリウム((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)メチル-トリフルオロボレート6(3.58g、15.12mmol)のよく撹拌された懸濁液が入った250mLの密閉管に、炭酸セシウム(5.91g、18.14mmol)、ジ(1-アダマンチル)-n-ブチルホスフィン(108.40mg、302.33μmol)、及び酢酸パラジウム(II)(135.75mg、604.66μmol)を周囲温度で窒素下にて加えた。得られた混合物を100℃で16時間撹拌した。反応混合物を周囲温度に冷却し、水(5mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×60mL)で抽出し、合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製残留物を得た。粗製化合物を石油エーテル中50%→60%の酢酸エチルで溶出させるフラッシュカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により精製して、tert-ブチルN-[(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-4-イル)メチル]カルバメート7(1.3g、4.05mmol、67.02%の収率、93%の純度)を淡黄色の固体として得た。LC-MS (ESI) m/z: 243.2 [M-tBu+H]+。
工程4:テトラヒドロフラン(150mL)中のtert-ブチルN-[(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-4-イル)メチル]カルバメート7(2.6g、8.72mmol)のよく撹拌された懸濁液が入った500mLの三つ口丸底フラスコに、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、2.58g、64.49mmol)を0℃で窒素下にて加えた。反応混合物を周囲温度で1時間撹拌させた。次いで、反応混合物に、テトラヒドロフラン(15mL)中の3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン8(5.35g、27.89mmol)を0℃で加えた。反応混合物を65℃で4時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、飽和塩化アンモニウム溶液(30mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×150mL)で抽出し、合わせた有機層を、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製残留物を得た。粗製化合物を石油エーテル中40%→60%の酢酸エチルで溶出させるカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、230メッシュ~400メッシュ)により精製して、tert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-4-イル]メチル]カルバメート9(2.6g、5.91mmol、67.76%の収率、93%の純度)を黄色の固体として得た。LC-MS (ESI) m/z: 408.0 [M-H]-。
工程5:DCM(10mL)中のtert-ブチルN-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-4-イル]メチル]カルバメート9(1g、2.44mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの丸底フラスコに、1,4-ジオキサン中4MのHCl(89.05mg、2.44mmol、10mL)を0℃で滴加した。加えた後に、冷却浴を取り外し、反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して粗製物質を得て、これをジエチルエーテル(10mL)でトリチュレートし、乾燥させて、3-[4-(アミノメチル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩の化合物7(800mg、2.17mmol、89.04%の収率、94%の純度)を得た。LCMS (ESI): m/z 310.2 [M+H]+。
工程6:THF(50mL)中の4-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン2(5g、20.16mmol)の撹拌された溶液に、水素化ナトリウム(4.84g、201.55mmol)を0℃で窒素雰囲気下にて加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン8(19.35g、100.78mmol)を0℃で窒素雰囲気下にて少しずつ加えた。次いで、反応混合物を65℃に加熱し、この65℃の温度で2時間撹拌した。水(100mL)及びEtOAc(50mL)を加え、層を分離し、水層をEtOAc(50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(25mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮して、3-(4-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物8(3.0g、7.59mmol、37.66%の収率、90.88%の純度)を得た。1H NMR (d6-DMSO, 400 MHZ) δ 11.14 (s, 1H), 8.52 (s, 1H), 8.23 (s, 1H), 7.65-7.55 (m, 2H), 7.22-7.19 (m, 1H), 5.47-5.44 (m, 1H), 2.96-2.90 (m, 1H), 2.77-2.63 (m, 2H), 2.13-2.11 (m, 1H); LC MS: ES+ 358.9, 361.1。
実施例8.3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-ij]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物9)の合成
Figure 2023545507000379
工程1:DMA(300mL)中の8-ブロモ-1-クロロ-イソキノリン1(50g、206.19mmol)及び4-メトキシベンジルアミン2(42.43g、309.28mmol、40.41mL)の溶液を密閉容器中で120℃にて3時間加熱した。反応混合物を酢酸エチル及び水で希釈した。無水硫酸ナトリウムを介して有機層を乾燥させ、濃縮した。反応混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中5%の酢酸エチル)により精製して、8-ブロモ-N-(4-メトキシベンジル)イソキノリン-1-アミン3(52g、72%)を得た。
工程2:MeOH(500mL)中の8-ブロモ-N-[(4-メトキシフェニル)メチル]イソキノリン-1-アミン3(52g、151.51mmol)の溶液に、トリエチルアミン(61.32g、606.03mmol、84.47mL)を加えた後に、容器をアルゴンで10分間パージした。DPPP(12.50g、30.30mmol)及び酢酸パラジウム(II)(3.40g、15.15mmol)を加え、反応混合物をParrのオートクレーブ内で100℃にて70psiの一酸化炭素の雰囲気下で振盪した。反応混合物を、セライト床を通して濾過し、濃縮した。粗製物質を酢酸エチルで希釈し、水に続いてブラインで洗浄した。無水硫酸ナトリウムを介して有機層を乾燥させ、濃縮した。粗製物質をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中60%の酢酸エチル)により精製して、19-[(4-メトキシフェニル)メチル]-18,19-ジアザトリシクロドデカ-1(3),2(12),8,14,16(18)-ペンタエン-17-オン4(44g、90%)をオフホワイト色の固体として得た。
工程3:TFA(12mL)中の19-[(4-メトキシフェニル)メチル]-18,19-ジアザトリシクロドデカ-1(3),2(12),8,14,16(18)-ペンタエン-17-オン4(1g、3.44mmol)の冷却された溶液に、トリフル酸(3.62g、24.11mmol、2.12mL)を滴加した。冷却浴を取り外し、反応混合物を25℃で14時間撹拌した。反応混合物を蒸発させ、飽和重炭酸ナトリウム溶液でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層を水に続いてブラインで洗浄した。無水硫酸ナトリウムを介して有機部分を乾燥させ、濃縮して、10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(5),3,6,8(10)-ペンタエン-9-オン5(580mg、82%)を得た。
工程4:アセトニトリル(3mL)中の10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(5),3,6,8(10)-ペンタエン-9-オン5(85mg、499.51μmol)の0℃の撹拌された懸濁液に、N-ブロモスクシンイミド(88.90mg、499.51μmol、42.33μL)を加えた。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物を25℃で14時間撹拌した。反応混合物を蒸発させ、飽和Na溶液でクエンチし、酢酸エチルで抽出した。有機層を水に続いてブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中60%の酢酸エチル)により精製して、6-ブロモ-10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(4),3(6),5(7),8(10)-ペンタエン-9-オン6を帯黄色の固体として得た(40mg、31%)。
工程5:THF(10容量当量(vol eq))中の6-ブロモ-10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(4),3(6),5(7),8(10)-ペンタエン-9-オン6(1当量)の0℃の溶液に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン7(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-ij]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物9を得る。
実施例9.3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[2,3,4-de]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物10)の合成
Figure 2023545507000380
工程1:メタノール(50.0mL)中の5-ブロモ-2H-イソキノリン-1-オン1(18g、80.34mmol)及び1,3-ビス(ジフェニルホスフィノ)プロパン(6.63g、16.07mmol)の撹拌された溶液をアルゴンで5分間脱ガスし、続いて反応混合物中に99%のトリエチルアミン(32.52g、321.35mmol、44.79mL)及び酢酸パラジウム(II)(1.80g、8.03mmol)を加えた。得られた反応混合物をParのオートクレーブ内で80psiのCOにおいて100℃にて12時間加熱した。セライトを通して反応混合物を濾過し、濾液を濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中40%の酢酸エチル)により精製して、メチル1-オキソ-2H-イソキノリン-5-カルボキシレート2(12g、54.92mmol、68.36%の収率、93%の純度)を灰色の固体として得た。
工程2:アセトニトリル(100mL)中のメチル1-オキソ-2H-イソキノリン-5-カルボキシレート2(7.7g、37.89mmol)の撹拌された溶液に、亜硝酸tert-ブチル(15.63g、151.58mmol、18.03mL)を加えた。反応混合物を60℃で16時間加熱した後に、減圧下で濃縮した。粗製物質をアセトニトリル(20ml)で処理し、0℃に冷却し、20分間撹拌し、濾過した。固体残留物をエーテルで洗浄し、減圧下で乾燥させて、メチル4-ニトロ-1-オキソ-2H-イソキノリン-5-カルボキシレート3(4.5g、17.42mmol、45.97%の収率、96.07%の純度)を白色の固体として得た。
工程3:THF(20mL)及び水(5mL)中のメチル4-ニトロ-1-オキソ-2H-イソキノリン-5-カルボキシレート3(2g、8.06mmol)の撹拌された溶液に、亜鉛(526.93mg、8.06mmol、73.80μL)及び塩化アンモニウム(431.05mg、8.06mmol、281.73μL)を室温で加えた。次いで、混合物を70℃に12時間加熱した。室温まで冷却した後に、セライトを通して混合物を濾過し、濾液を濃縮して、粗製10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(4),3(6),5(7)-テトラエン-8,9-ジオン4(800mg、3.44mmol、42.66%の収率、80%の純度)を黄色の固体として得た。更に精製せずに次の工程で使用した。
工程4:DCE(40mL)中の10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(4),3(6),5(7)-テトラエン-8,9-ジオン4(500mg、2.69mmol)の撹拌された溶液に、臭化ホスホリル(615.99mg、2.15mmol、218.43μL)を加え、反応混合物を90℃に16時間加熱した。次いで、反応混合物を室温に冷却し、氷水中に注ぎ、重炭酸ナトリウムで塩基性化し、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮した。得られた粗製物を、ヘキサン中20%の酢酸エチルで溶出させるシリカカラムクロマトグラフィーにより精製して、8-ブロモ-10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(4),3(6),5(7),8(10)-ペンタエン-9-オン5(70mg、252.95μmol、9.42%の収率、90%の純度)を黄色の固体として得た。
工程5:THF(10容量当量)中の8-ブロモ-10,11-ジアザトリシクロドデカ-(2),1(4),3(6),5(7),8(10)-ペンタエン-9-オン5(1当量)の0℃の溶液に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン6(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[2,3,4-de]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物10を得る。
実施例10.3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-de]キノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物11)を得る合成
Figure 2023545507000381
工程1:水酸化アンモニウム(28%の溶液)(100当量)中の5,8-ジブロモキノリン-4-カルボン酸1(CAS:1603199-45-6)の撹拌された懸濁液に、銅(4当量)を加え、反応混合物を80℃で2時間撹拌する。反応混合物を室温に冷却し、標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、6-ブロモピロロ[4,3,2-de]キノリン-2(1H)-オン2を生成物として得る。
工程2:THF(10容量当量)中の6-ブロモピロロ[4,3,2-de]キノリン-2(1H)-オン2の0℃の溶液に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン3(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-de]キノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物11を得る。
実施例11.3-(8-ブロモ-5-オキソピロロ[2,3,4-de]キノリン-4(5H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物12)の合成
Figure 2023545507000382
工程1:DMF(10容量当量)中の8-ブロモキノリン-4-アミン1(CAS:65340-75-2)の撹拌された懸濁液に、ピコリン酸2(1当量)、TEA(3当量)、続いてHATU(1.1当量)を加え、混合物を室温で撹拌する。反応が完了したら、混合物をクエンチし、標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、N-(8-ブロモキノリン-4-イル)ピコリンアミド3を得る。
工程2:1,4-ジオキサン(10容量当量)中のN-(8-ブロモキノリン-4-イル)ピコリンアミド3(1当量)、CoCl(0.3当量)、AgCO(2.5当量)、ベンゼン-1,3,5-トリイルトリホルメート(TFBen、1.75当量)、PivOH(1当量)、及びTEA(3当量)の懸濁液を130℃で20時間加熱する。反応が完了したら、混合物を標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、8-ブロモピロロ[2,3,4-de]キノリン-5(4H)-オン4を得る(Org. Lett. 2019, 21, 5694-5698からの手順に従う)。
工程3:THF(10容量当量)中の0℃の8-ブロモピロロ[2,3,4-de]キノリン-5(4H)-オン4に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン5(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(8-ブロモ-5-オキソピロロ[2,3,4-de]キノリン-4(5H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物12を得る。
実施例12.3-(5-ブロモ-2-オキソピロロ[2,3,4-de]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物13)の合成
Figure 2023545507000383
工程1:DMF(10容量当量)中の8-ブロモイソキノリン-4-アミン1(CAS:1781091-48-2)の撹拌された懸濁液に、ピコリン酸2(1当量)、TEA(3当量)、続いてHATU(1.1当量)を加え、混合物を室温で撹拌する。反応が完了したら、混合物をクエンチし、標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、N-(8-ブロモイソキノリン-4-イル)ピコリンアミド3を得る。
工程2:1,4-ジオキサン(10容量当量)中のN-(8-ブロモイソキノリン-4-イル)ピコリンアミド3(1当量)、CoCl(0.3当量)、AgCO(2.5当量)、ベンゼン-1,3,5-トリイルトリホルメート(TFBen、1.75当量)、PivOH(1当量)、及びTEA(3当量)の懸濁液を130℃で20時間加熱する。反応が完了したら、混合物を標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、5-ブロモピロロ[2,3,4-de]イソキノリン-2(1H)-オン4を得る(Org. Lett. 2019, 21, 5694-5698からの手順に従う)。
工程3:THF(10容量当量)中の0℃の5-ブロモピロロ[2,3,4-de]イソキノリン-2(1H)-オン4に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン5(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-2-オキソピロロ[2,3,4-de]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物13を得る。
実施例13.3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-de]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物14)の合成
Figure 2023545507000384
工程1:水酸化アンモニウム(28%の溶液)(100当量)中の5-ブロモイソキノリン-4-カルボン酸1(国際公開第2012/090177号、1当量)の撹拌された懸濁液に、銅(4当量)を加え、反応混合物を80℃で2時間撹拌する。反応混合物を室温に冷却し、標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、ピロロ[4,3,2-de]イソキノリン-2(1H)-オン2を得る。
工程2:CHCN(10容量)中のピロロ[4,3,2-de]イソキノリン-2(1H)-オン2(1当量)の0℃の溶液に、NBS(1当量)を加え、冷却浴を取り外し、反応混合物を室温で16時間撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、6-ブロモピロロ[4,3,2-de]イソキノリン-2(1H)-オン3を得る。
工程3:THF(10容量当量)中の6-ブロモピロロ[4,3,2-de]イソキノリン-2(1H)-オン(1当量)の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%、5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン4(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-de]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物14を得る。
実施例14.3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[2,3,4-ij]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物15)の合成
Figure 2023545507000385
工程1:水酸化アンモニウム(28%の溶液)(100当量)中の8-ブロモイソキノリン-1-カルボン酸1(CAS番号:1256818-87-7、1当量)の撹拌された溶液に、銅(4当量)を加え、反応混合物を80℃で2時間撹拌する。反応混合物を室温に冷却し、標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製して、ピロロ[2,3,4-ij]イソキノリン-2(1H)-オン2を得た。
工程2:CHCN(10容量)中のピロロ[2,3,4-ij]イソキノリン-2(1H)-オン2(1当量)の0℃の溶液に、NBS(1当量)を加え、冷却浴を取り外し、反応混合物を室温で16時間撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、6-ブロモピロロ[2,3,4-ij]イソキノリン-2(1H)-オン3を得る。
工程3:THF(10容量当量)中の6-ブロモピロロ[2,3,4-ij]イソキノリン-2(1H)-オン3(1当量)の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%、5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン4(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[2,3,4-ij]イソキノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物15を得る。
実施例15.3-(3-ブロモ-8-オキソピロロ[4,3,2-de]フタラジン-7(8H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物16)の合成
Figure 2023545507000386
工程1:EtOH(10容量当量)中の7-アセチル-2,7-ジヒドロピロロ[4,3,2-de]フタラジン-3,8-ジオン1(Heterocycles (1981), 16(1), 21-4、1当量)の溶液に、炭酸カリウム(3当量)を加え、反応混合物を室温から50℃に加熱しながら撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、2,7-ジヒドロピロロ[4,3,2-de]フタラジン-3,8-ジオン2を得る。
工程2:DCE(10容量当量)中の2,7-ジヒドロピロロ[4,3,2-de]フタラジン-3,8-ジオン2の溶液に、POBr(1当量)を加え、反応物を90℃で16時間撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-ブロモピロロ[4,3,2-de]フタラジン-8(7H)-オン3を得る。
工程3:THF(10容量当量)中の3-ブロモピロロ[4,3,2-de]フタラジン-8(7H)-オン3(1当量)の0℃の溶液に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン4(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(3-ブロモ-8-オキソピロロ[4,3,2-de]フタラジン-7(8H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物16を得る。
実施例16.3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物17)の合成
Figure 2023545507000387
工程1:NMP中の5-フルオロ-4(1H)-キナゾリノン1(CAS番号436-72-6、1当量)及び4-メチルベンジルアミン2(5当量)の溶液を反応が完了するまで100℃で加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、5-((4-メトキシベンジル)アミノ)キナゾリン-4(3H)-オン3を得る。
工程2:トルエン(10容量当量)中の5-((4-メトキシベンジル)アミノ)キナゾリン-4(3H)-オン3(1当量)の溶液に、POCl(1当量)を加え、反応混合物を反応が完了するまで100℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、4-クロロ-N-(4-メトキシベンジル)キナゾリン-5-アミン4を得る。
工程3:MeOH(10容量当量)中の4-クロロ-N-(4-メトキシベンジル)キナゾリン-5-アミン4(1当量(1 ea))の溶液に、TEA(4当量)を加えた後に、溶液をアルゴンで10分間パージする。DPPP(0.2当量)及び酢酸パラジウム(II)(0.1当量)を加え、反応混合物をparrのオートクレーブ内で100℃にて70psiの一酸化炭素の雰囲気下で、反応が完了したと見なされるまで振盪する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、1-(4-メトキシベンジル)ピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-2(1H)-オン5を得る。
工程4:TFA(12容量当量)中の生成物(produce)1-(4-メトキシベンジル)ピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-2(1H)-オン5の冷却された溶液に、トリフル酸(8当量)を加え、反応混合物を反応が完了するまで室温で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、ピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-2(1H)-オン6を得る。
工程5:CHCN(10容量当量)中のピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-2(1H)-オン6(1当量)の混合物に、NBS(1当量)を0℃で加え、冷却浴を取り外し、反応混合物を反応が完了したと見なされるまで室温で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、6-ブロモピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-2(1H)-オン7を得る。
工程6:THF(10容量当量)中の6-ブロモピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-2(1H)-オン7(1当量)の0℃の溶液に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソピロロ[4,3,2-de]キナゾリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物17を得る。
実施例17.3-(8-ブロモ-5-オキソピロロ[2,3,4-de]キナゾリン-4(5H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物18)の合成
Figure 2023545507000388
工程1:ジクロロエタン:ピリジン(10:1)中の8-ブロモ-4-キナゾリンアミン1(CAS番号1260657-19-9、1当量)の0℃の溶液に、ジホスゲン(1.1当量~1.5当量)を加え、反応物をこの温度で2時間撹拌し、続いて温度をゆっくりと50℃に高めた後に、この温度で2時間維持する。反応混合物を1NのHClでクエンチし、標準的な後処理及び精製を行って、(8-ブロモキナゾリン-4-イル)カルバミン酸塩化物2を得る。
工程2:ジクロロエタン中の(8-ブロモキナゾリン-4-イル)カルバミン酸塩化物2の0℃の溶液に、三塩化インジウム(1.1当量~5当量)を加える。反応混合物を加熱還流させ、反応が完了するまでこの温度で維持する。次いで、冷却した反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、8-ブロモピロロ[2,3,4-de]キナゾリン-5(4H)-オン3を得る。
工程3:THF中の8-ブロモピロロ[2,3,4-de]キナゾリン-5(4H)-オン3の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。冷却浴を取り外し、反応混合物を室温で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド4(5当量~8当量)を少しずつ加える。加えた後に、冷却浴を取り外し、反応物をゆっくりと70℃に加熱し、反応が完了したと判断されるまで撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(8-ブロモ-5-オキソピロロ[2,3,4-de]キナゾリン-4(5H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物18を得る。
実施例18.3-(3-ブロモ-2-メチル-7-オキソ-2,7-ジヒドロ-6H-ピロロ[4,3,2-cd]インダゾール-6-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物19)及び3-(3-ブロモ-2-メチル-6-オキソ-2,6-ジヒドロ-7H-ピロロ[2,3,4-cd]インダゾール-7-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物20)の合成
Figure 2023545507000389
工程1:THF中の市販の4-ブロモ-3-フルオロベンゾニトリル1(Cas番号:133059-44-6、1当量)の-78℃の溶液に、LDAの溶液(THF中2M、1.1当量)を滴加し、この温度で1時間~3時間撹拌した。このときに、THF中のN-メトキシ-N-メチルアセトアミド2(1.2当量)の溶液を滴加し、冷却浴を取り外し、反応混合物を更に1時間~24時間撹拌する。標準的な手順を使用して単離及び精製を行って、2-アセチル-4-ブロモ-3-フルオロベンゾニトリル3を得る。
工程2:DMF中の2-アセチル-4-ブロモ-3-フルオロベンゾニトリル3(1当量)の0℃の溶液に、ヒドラジン(1.1当量)を滴加する。次いで、冷却浴を取り外し、反応物を室温で更に1時間~24時間撹拌させる。標準的な手順を使用して単離及び精製を行って、7-ブロモ-3-メチル-1H-インダゾール-4-カルボニトリル4を得る。
工程3:DCM及び水の混合物中の7-ブロモ-3-メチル-1H-インダゾール-4-カルボニトリル4(1当量)の溶液に、KMnO(10当量)を加え、室温で撹拌して1時間~24時間還流させる。標準的なプロトコルを使用して単離及び精製を行って、7-ブロモ-4-シアノ-1H-インダゾール-3-カルボン酸5を得る。
工程4:4:1の水:過酸化水素中の7-ブロモ-4-シアノ-1H-インダゾール-3-カルボン酸5(1当量)の溶液に、20当量のNaOHを加え、反応混合物を1時間~24時間還流させる。標準的なプロトコルを使用して単離及び精製を行って、7-ブロモ-1H-インダゾール-3,4-ジカルボン酸6を得る。
工程5:AcOH(10容量当量)中の7-ブロモ-1H-インダゾール-3,4-ジカルボン酸6(1当量)の混合物を、反応が完了するまで100℃で加熱する。標準的な後処理及び精製プロトコルを行って、8-ブロモ-3H-ピラノ[3,4,5-cd]インダゾール-3,5(1H)-ジオン7を得る。
工程6:DMF中の8-ブロモ-3H-ピラノ[3,4,5-cd]インダゾール-3,5(1H)-ジオン7(1当量)の冷却された溶液に、NaH(油中60%、2当量)を加え、反応混合物をこの温度で10分間撹拌した後に、MeI(1.1当量)を加える。冷却浴を取り外し、反応混合物を反応が完了するまで撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、8-ブロモ-1-メチル-3H-ピラノ[3,4,5-cd]インダゾール-3,5(1H)-ジオン8を得る。
工程7:ピリジン(10容量当量)中の8-ブロモ-1-メチル-3H-ピラノ[3,4,5-cd]インダゾール-3,5(1H)-ジオン8(1当量、18.05mmol)及びヒドロキシルアミン塩酸塩(1当量、1.25g、18.05mmol、750.92μL)の溶液を5時間還流加熱し、続いて80℃に冷却し、塩化4-トルエンスルホニル(2当量)を加える。加えた後に、温度を上げ、反応物を5時間還流撹拌し、続いて冷却する。反応混合物を水中に注ぎ、EtOAc(3回)で抽出する。有機層を合わせ、水、NaHCO飽和水溶液、ブラインで洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させた後に、濾過し、蒸発乾固させた。EtOH(10容量当量)及び水(10容量当量)中の残留物の撹拌された溶液に、1Mの水酸化ナトリウム水溶液(10当量)を滴加する。その後、エタノールを留去しながら混合物を3時間還流撹拌する。反応が完了した後に、反応混合物を75℃に冷却し、36%(重量/重量)の水溶液の塩酸(10容量当量)を滴加する。標準的な後処理及び精製に続いて位置異性体の分離を行って、3-ブロモ-2-メチル-2,6-ジヒドロ-7H-ピロロ[4,3,2-cd]インダゾール-7-オン9及び3-ブロモ-2-メチル-2,7-ジヒドロ-6H-ピロロ[2,3,4-cd]インダゾール-6-オン10を得る。
工程8:THF中の3-ブロモ-2-メチル-2,6-ジヒドロ-7H-ピロロ[4,3,2-cd]インダゾール-7-オン9の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド11(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(3-ブロモ-2-メチル-7-オキソ-2,7-ジヒドロ-6H-ピロロ[4,3,2-cd]インダゾール-6-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物19を得る。
工程9:THF中の3-ブロモ-2-メチル-2,7-ジヒドロ-6H-ピロロ[2,3,4-cd]インダゾール-6-オンの0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド11(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(3-ブロモ-2-メチル-6-オキソ-2,6-ジヒドロ-7H-ピロロ[2,3,4-cd]インダゾール-7-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物20を得る。
実施例19.3-(6-ブロモ-2-オキソ-3,4-ジヒドロ-5-オキサ-1,2a-ジアザアセナフチレン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物21)の合成
Figure 2023545507000390
工程1:酢酸中の3,4-ジヒドロ-5-オキサ-1,2a-ジアザアセナフチレン-2(1H)-オン1(1当量)(CAS番号:1267075-60-4)の溶液に、N-ブロモスクシンイミド(1.2当量)を室温で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、6-ブロモ-3,4-ジヒドロ-5-オキサ-1,2a-ジアザアセナフチレン-2(1H)-オン2を得る。
工程2:0℃のTHF中に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド3(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソ-3,4-ジヒドロ-5-オキサ-1,2a-ジアザアセナフチレン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物21を得る。
実施例20.3-(7-ブロモ-2-オキソ-5,6-ジヒドロ-4H-イミダゾ[4,5,1-ij]キノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物22)の合成
Figure 2023545507000391
工程1:THF中の7-ブロモ-5,6-ジヒドロ-4H-イミダゾ[4,5,1-ij]キノリン-2(1H)-オン1(1当量)(CAS番号:1609453-63-5)の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド2(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(7-ブロモ-2-オキソ-5,6-ジヒドロ-4H-イミダゾ[4,5,1-ij]キノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物22を得る。
実施例21.3-(5-ブロモ-1-オキソ-6,7-ジヒドロイミダゾ[4,5,1-hi]インドール-2(1H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物23)の合成
Figure 2023545507000392
工程1:THF中の4-ブロモインドリン-7-アミン1(1当量)(CAS番号:1783558-27-9)の溶液に、1,1’-カルボニルジイミダゾール(1.2当量)を室温で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで加熱還流させる。次いで、冷却した反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、5-ブロモ-6,7-ジヒドロイミダゾ[4,5,1-hi]インドール-1(2H)-オン2を得る。
工程2:THF中の5-ブロモ-6,7-ジヒドロイミダゾ[4,5,1-hi]インドール-1(2H)-オン2(1当量)の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド3(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-1-オキソ-6,7-ジヒドロイミダゾ[4,5,1-hi]インドール-2(1H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物23を得る。
実施例22.3-(7-ブロモ-2-オキソ-4H-イミダゾ[4,5,1-ij]キノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物24)の合成
Figure 2023545507000393
3-(7-ブロモ-2-オキソ-4H-イミダゾ[4,5,1-ij]キノリン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンを、3,4-ジヒドロ-5-オキサ-1,2a-ジアザアセナフチレン-2(1H)-オンを4H-イミダゾ[4,5,1-ij]キノリン-2(1H)-オン(CAS番号83848-83-3)と置き換えることを除き、実施例19の化合物21と同様にして調製することができる。
実施例23.3-(5-ブロモ-1-オキソ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-2(1H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物25)の合成
Figure 2023545507000394
工程1:酢酸中の4-(2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-1-イル)ブタン酸1(1当量)(CAS番号:3273-68-5)の溶液に、N-ブロモスクシンイミド(1.2当量)を室温で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、4-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-1-イル)ブタン酸2を得る。
工程2:ジクロロメタン中の4-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[d]イミダゾール-1-イル)ブタン酸2(1当量)の溶液に、塩化チオニル(2当量)を加え、反応混合物を室温で2時間撹拌する。混合物を真空中で濃縮し、残留物にジクロロエタン及び塩化アルミニウム(3当量)を少しずつ加える。反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌して還流させる。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、5-ブロモ-8,9-ジヒドロ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-1,6(2H,7H)-ジオン3を得る。
工程3:5-ブロモ-8,9-ジヒドロ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-1,6(2H,7H)-ジオン3(1当量)の0℃のTFA溶液に、トリエチルシラン(1.2当量)をゆっくりと加え、溶液を完了したと判断されるまで0℃で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、5-ブロモ-6,7,8,9-テトラヒドロ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-1(2H)-オン4を得る。
工程4:アセトニトリル中の5-ブロモ-6,7,8,9-テトラヒドロ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-1(2H)-オン4(1当量)の溶液に、トリエチルアミン(5当量)を加える。反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌して還流させる。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、5-ブロモ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-1(2H)-オン5を得る。
工程5:THF中の5-ブロモ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-1(2H)-オン5(1当量)の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加え、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド6(5当量~8当量)を少しずつ加え、冷却浴を取り外し、反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-1-オキソ-2,9a-ジアザベンゾ[cd]アズレン-2(1H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物25を得る。
実施例24.3-(5-ブロモ-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物26)の合成
Figure 2023545507000395
工程1:THF中の7-ヨード-1H-インダゾール-6-オール1(1当量)(CAS番号:1190314-62-5)の溶液に、DIEA(1.2当量)に続いてクロロギ酸エチル(1.1当量)を0℃で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、エチル6-ヒドロキシ-7-ヨード-1H-インダゾール-1ーカルボキシレート2を得る。
工程2:DMF中のエチル6-ヒドロキシ-7-ヨード-1H-インダゾール-1-カルボキシレート2(1当量)の溶液に、炭酸カリウム(1.5当量)に続いて臭化ベンジル(1.1当量)を0℃で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、エチル6-(ベンジルオキシ)-7-ヨード-1H-インダゾール-1-カルボキシレート3を得る。
工程3:DMF及びTEA(3当量)中に溶解されたエチル6-(ベンジルオキシ)-7-ヨード-1H-インダゾール-1-カルボキシレート3(1当量)及びベンジルプロパルギルエーテル4(1.5当量)(CAS番号:4039-82-1)の溶液をArで脱ガスする。Pd(PPhCl(0.1当量)及びヨウ化銅(I)(0.1当量)を加え、混合物を密閉し、完了したと判断されるまで電子レンジにおいて80℃で加熱する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、6-(ベンジルオキシ)-7-(3-(ベンジルオキシ)プロパ-1-イン-1-イル)-1H-インダゾール5を得る。
工程4:MeOH中の6-(ベンジルオキシ)-7-(3-(ベンジルオキシ)プロパ-1-イン-1-イル)-1H-インダゾール5(1当量)の溶液に、Pd/C(10%、10当量)をN雰囲気下で加える。懸濁液を脱ガスし、Hで3回パージする。混合物をH(15psi)下にて、完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、7-(3-ヒドロキシプロピル)-1H-インダゾール-6-オール6を得る。
工程5:DMF中の7-(3-ヒドロキシプロピル)-1H-インダゾール-6-オール6(1当量)の溶液に、KOH(3当量)及びI(1.5当量)を加える。混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、7-(3-ヒドロキシプロピル)-3-ヨード-1H-インダゾール-6-オール7を得る。
工程6:THF中の7-(3-ヒドロキシプロピル)-3-ヨード-1H-インダゾール-6-オール7(1当量)の溶液に、TEA(2当量)に続いて塩化メタンスルホニル(1.2当量)を加える。混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。溶媒を除去し、残留物をTHF中に溶解し、0℃に冷却する。次いで、NaH(鉱油中60%、2.2当量)を少しずつ加え、混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、2-ヨード-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-5-オール8を得る。
工程7:ジオキサン及びHO(容量/容量4:1)中の2,6-ビス(ベンジルオキシ)-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン9(1当量)、2-ヨード-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-5-オール8(1当量)、及びCsCO(3当量)の溶液に、Pd(dppf)Cl(0.1当量)を加える。反応混合物をアルゴンで脱ガスした後に、完了したと判断されるまで100℃で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、2-(2,6-ビス(ベンジルオキシ)ピリジン-3-イル)-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-5-オール10を得る。
工程8:EtOH及びEtOAc(容量/容量1:1)中の2-(2,6-ビス(ベンジルオキシ)ピリジン-3-イル)-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-5-オール10(1当量)の溶液に、Pd/C(10%、10当量)をN雰囲気下で加える。懸濁液を脱ガスし、Hで3回パージする。混合物をH(15psi)下にて、完了したと判断されるまで室温で撹拌する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、3-(5-ヒドロキシ-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン11を得る。
工程9:アセトニトリル中の3-(5-ヒドロキシ-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン11(1当量の溶液に、トリフェニルホスフィン(1.3当量)及び臭素(2当量)を加える。反応混合物を完了したと判断されるまで還流下で加熱する。次いで、反応混合物を標準的な後処理及び精製に供して、3-(5-ブロモ-7,8-ジヒドロ-6H-ピラゾロ[4,5,1-ij]キノリン-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物26を得る。
実施例25.3-(5-ブロモ-2-チオキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物27)の合成
Figure 2023545507000396
工程1:無水ジメチルホルムアミド中に溶解された5-ブロモベンゾ[cd]インドール-2(1H)-オン1の溶液に、鉱油中60%の水素化ナトリウムの溶液(1.3当量)を加える。混合物を室温で1時間撹拌する。混合物にジメチル2-ブロモペンタンジオエート2(CAS:760-94-1、1当量)を加える。得られた混合物を室温で18時間撹拌する。反応物を標準的なプロトコルを使用する標準的な後処理及び精製に供して、ジメチル2-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ペンタンジオエート3を得る(国際公開第2007/056281号に記載されるのと同様に)。
工程2:トルエン中に溶解されたジメチル2-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ペンタンジオエート3及びローソン試薬(CAS:19172-47-5、1当量)の溶液を110℃で10時間撹拌する。反応が完了したと判断された後に、溶媒を蒸発させ、得られた粗製物質を標準的なプロトコルを使用して精製して、ジメチル2-(5-ブロモ-2-チオキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ペンタンジオエート4を得る(国際公開第2005/028436号に記載されるのと同様に)。
工程3:ジメチル2-(5-ブロモ-2-チオキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ペンタンジオエート4、氷酢酸、及び濃HCl(1:1)の溶液を100℃で2.5時間撹拌する。反応物を標準的な後処理に供し、標準的なプロトコルを使用して精製して、2-(5-ブロモ-2-チオキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ペンタン二酸5を得る(国際公開第2005/028436号に記載されるのと同様に)。
工程4:CHCl中の2-(5-ブロモ-2-チオキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ペンタン二酸5、トリフルオロアセトアミド(CAS:354-38-1、1.8当量)、HOBt(3.9当量)、EDCI(3.9当量)、及びトリエチルアミン(5.5当量)の混合物を周囲温度で3日間撹拌する。反応物を標準的な後処理に供し、標準的なプロトコルを使用して精製して、3-(5-ブロモ-2-チオキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物27を得る(国際公開第2005/028436号に記載されるのと同様に)。
実施例26.3-(6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物28)の合成
Figure 2023545507000397
工程1:ベンジルアミン2(1.2mmol、CAS:100-46-9)、水(10mL)、及び4-ブロモ-1,8-ナフタル酸無水物1(1mmol、CAS:81-86-7)の混合物を密閉加圧管において混ぜ合わせ、マイクロ波の照射下で450W及び80℃にて数分間反応させる。反応させた後に、混合物を濾過して、2-ベンジル-6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1,3(2H)-ジオン3(収率:95%)を得る(Synthetic Communications (2012), 42(20), 3042-3052に記載されるように)。
工程2:無水塩化アルミニウム(4.0mmol)及びLiAlH(4.0mmol)の溶液を、撹拌しながら冷えた乾燥THF(氷浴)に加える。氷浴を取り外した後に、2-ベンジル-6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1,3(2H)-ジオン3(1.0mmol)を少しずつ分けて加える。混合物を40℃で5.5時間撹拌した後に、室温で10時間撹拌する。反応物を標準的な後処理に供し、標準的なプロトコルを使用して精製して、2-ベンジル-6-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン4を得る(Journal of the American Chemical Society (2003), 125(19), 5786-5791に記載されるのと同様に)。
工程3:クロロギ酸エチル5(21mmol)の溶液に、乾燥ジクロロメタン中の2-ベンジル-6-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン4(16mmol)の溶液を加える。反応物を8時間還流させる。冷却した後に、溶媒を減圧下で除去する。エチレングリコール(424mmol)及びヒドラジン一水和物(80mmol)中のKOHの溶液を残留物に加えた後に、4時間加熱還流させる。冷却した後に、反応物を標準的な後処理に供し、標準的なプロトコルを使用して精製して、6-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン6を得る(Journal of the American Chemical Society (2003), 125(19), 5786-5791に記載されるのと同様に)。
工程4:THF(10容量当量)中の6-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン6(1当量)の0℃の溶液に、NaH(5当量)を加え、この温度で15分間撹拌した後に、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン7(1当量)を加える。反応混合物をゆっくりと60℃に加熱し、反応が完了するまでこの温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物28を得る。
実施例27.3-(6-ブロモ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物29)及び3-(7-ブロモ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物30)の合成
Figure 2023545507000398
工程1:乾燥4-ブロモナフタレン-1,8-ジアミン1(17.1mmol)を乳鉢及び乳棒を用いて破砕し、12mLの無水エタノール中に溶解する。ギ酸(106mmol)を加え、反応物を40分間還流撹拌する。反応物を水(2mL)で希釈し、2NのNHOHで塩基性化する。得られた沈殿物を濾過し、エーテルで洗浄し、エタノール中で再結晶化させて、6-ブロモ-1H-ペリミジン2を得る。
工程2:炉乾燥させたフラスコにおいて、6-ブロモ-1H-ペリミジン2(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン3(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、有機層をブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(6-ブロモ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物29、及び3-(7-ブロモ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物30を得る。
実施例28.3-(7-ブロモ-1H-ベンゾ[de]シンノリン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物31)の合成
Figure 2023545507000399
工程1:10mlのエタノール中の1mmolの5-ブロモ-8-ニトロ-1-ナフトアルデヒド1及び1mlの88%のヒドラジン水和物の混合物をアルゴン雰囲気において6時間還流加熱する。次いで、混合物を冷却し、20mlの水中に注ぎ、沈殿物を濾別し、乾燥させて、7-ブロモ-1H-ベンゾ[de]シンノリン2を得る。
工程2:THF(10mL)中に溶解された7-ブロモ-1H-ベンゾ[de]シンノリン2(385.65μmol)の溶液を0℃に冷却した後に、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(7-ブロモ-1H-ベンゾ[de]シンノリン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物31を得る。
実施例29.3-(6-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物32)及び3-(7-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物33)の合成
Figure 2023545507000400
工程1:4-ブロモナフタレン-1,8-ジアミン1(0.014mol)の溶液をHO(600mL)及びAcOH(20mL)中に懸濁し、還流させる。高温の懸濁液を濾過し(セライトを備えた濾過るつぼ)、室温に冷却する。HO(20mL)中のNaNO(1.55g、0.032mol)を滴加する。反応混合物を5時間撹拌した後に、濾過し(濾過るつぼ)、高温のHOで洗浄し、一晩乾燥させて、6-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン2を得る。
工程2:THF(10mL)中に溶解された6-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン2(385.65μmol)の溶液を0℃に冷却した後に、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン3(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(6-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物32及び3-(7-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物33を得る。
実施例30.3-(6-ブロモ-2H-ナフト[1,8-cd]イソオキサゾール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物34)の合成
Figure 2023545507000401
工程1:8-アミノ-4-ブロモナフタレノール1(1.0mmol)、ベンジルアミン(1.3mmol)、FeBr、及び乾燥クロロベンゼン(1mL)の溶液を、炉乾燥させたシュレンク管に加える。シュレンク管に分子酸素バルーンを備え付ける。反応混合物を110℃で撹拌する。反応物をTLCにより出発物質の完全な消費について監視する。反応物を室温に冷却し、CHClで希釈し、水で洗浄する。無水NaSOを介して有機層を乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮する。粗製物質をシリカカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/ヘキサン)により精製して、6-ブロモ-2H-ナフト[1,8-cd]イソオキサゾール2を得る。
工程2:DMF(3mL)中の3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン3(1.0mmol)及びDIPEA(2.5mmol)の撹拌された溶液に、6-ブロモ-2H-ナフト[1,8-cd]イソオキサゾール2(2.5mmol)を加える。得られた溶液を80℃~100℃で5時間加熱する。次いで、反応混合物を室温に冷却し、減圧下で蒸発させる。粗製反応混合物を逆相分取HPLCにより精製して、3-(6-ブロモ-2H-ナフト[1,8-cd]イソオキサゾール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物34を得る。
実施例31.3-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物35)及び3-(7-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物36)の合成
Figure 2023545507000402
工程1:100mLのTHF中の4-ブロモナフタレン-1,8-ジアミン1(31.6mmol)の溶液に、10mLのTHF中のクロロギ酸エチル(31.6mmol)の溶液を0℃で30分間かけて滴加する。混合物を25℃で1日間撹拌した後に、40℃で2時間加熱する。沈殿物を濾過し、CHClで洗浄して、6-ブロモ-1H-ペリミジン-2(3H)-オンを得る。
工程2:6-ブロモ-1H-ペリミジン-2(3H)-オン2(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン3(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物35及び3-(7-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ペリミジン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物36を得る。
実施例32.3-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]キノリン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物37)の合成
Figure 2023545507000403
工程1:80mlのCHCl中の5-ブロモアセナフチレン-1(2H)-オン1(3g)及び0.8NのNHの混合物を2mlの濃HSOとともに50℃で0.5時間撹拌した後に、0℃に冷却する。混合物を飽和KHCO水溶液で中和し、濾過する。濾液の有機層を水及びブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮する。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/ヘキサン)により精製して、6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]キノリン-2(3H)-オン2を得る。
工程2:6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]キノリン-2(3H)-オン2(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]キノリン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物37を得る。
実施例33.3-(6-ブロモ-2-オキソナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-3(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物38)及び3-(7-ブロモ-2-オキソナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-3(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物39)の合成
Figure 2023545507000404
工程1:マイクロ波管に6-ブロモ-1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン1及びクロロギ酸エチルを入れ、密閉し、200℃に4分間加熱する。反応物を冷却し、濃縮する。粗製残留物をシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、7-ブロモナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-2(3H)-オン2及び6-ブロモナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-2(3H)-オン3の混合物を得る。
工程2:7-ブロモナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-2(3H)-オン2及び6-ブロモナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-2(3H)-オン3の混合物(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(7-ブロモ-2-オキソナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-3(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物38及び3-(6-ブロモ-2-オキソナフト[1,8-de][1,3]オキサジン-3(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物39を得る。
実施例34.3-(6-ブロモ-1,1-ジオキシド-2H-ナフト[1,8-cd]イソチアゾール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物40)の合成
Figure 2023545507000405
工程1:4-ブロモ-8-アミノ-ナフタレン-1-スルホン酸ナトリウム1(1.2g、3.70mmol)をオキシ塩化リン(10mL、107.5mmol)中に懸濁し、混合物を1時間還流させて、希薄な懸濁液を得る。混合物を室温に冷却し、氷(100mL)に加える。沈殿物を集め、水(20mL)で洗浄した後に、真空下で乾燥させる。固体を塩化メチレン中5%のメタノール中に溶解し、シリカゲルカラムに載せ、塩化メチレン中5%のメタノールで溶出させて、6-ブロモ-2H-ナフト[1,8-cd]イソチアゾール1,1-ジオキシド2を得る。
工程2:6-ブロモ-2H-ナフト[1,8-cd]イソチアゾール1,1-ジオキシド2(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、3-(6-ブロモ-2-オキソ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]キノリン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン化合物40を得る。
実施例35.5-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1,3-オキサジナン-2,4-ジオン(化合物41)の合成
Figure 2023545507000406
工程1:クロロホルム(20ml)中に懸濁された1,3-オキサジナン-2,4-ジオン1(50.3mmol)の懸濁液に臭素(87.8mmol)の溶液を加え、混合物を密閉容器において110℃の温度で90分間撹拌する。冷却した後に、容器を開放し、臭化水素がもはや漏れ出なくなるまで撹拌を継続する。反応混合物を減圧下で濃縮する。残留物をエタノール中に溶解し、蒸発させて、5-ブロモ-1,3-オキサジナン-2,4-ジオンを得る。
工程2:6-ブロモベンゾ[cd]インドール2(1H)-オン3(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。5-ブロモ-1,3-オキサジナン-2,4-ジオン2(1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、5-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1,3-オキサジナン-2,4-ジオンの化合物41を得る。
実施例36.5-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ピリミジン-2,4(3H,5H)-ジオン(化合物42)の合成
Figure 2023545507000407
工程1:6-ブロモベンゾ[cd]インドール-2(1H)-オン2(385.65μmol)をTHF(10mL)中に溶解した後に、0℃に冷却する。水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、147.77mg、3.86mmol)を少しずつ加え、0℃で30分間撹拌する。5-ブロモピリミジン-2,4(3H,5H)-ジオン1(PCT国際出願の国際公開第2016/044770号、1.93mmol)を加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した後に、0℃で16時間撹拌する。反応の進行をTLCにより監視し、反応が完了した後に、反応混合物を冷水でクエンチし、酢酸エチルで抽出し、ブラインで洗浄する。有機層を分離し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗製化合物を得る。粗製物質をカラムクロマトグラフィーにより10%→50%の酢酸エチルで溶出させることによって精製して、5-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ピリミジン-2,4(3H,5H)-ジオンの化合物42を得る。
実施例37.3-(5-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物43)の合成
Figure 2023545507000408
工程1:乾燥THF(200mL)中の5-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン1(2.0g、6.85mmol)のよく撹拌された溶液が入った500mLの三つ口丸底フラスコに、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液、2.63g、68.53mmol)を0℃で加え、反応混合物を周囲温度で撹拌した。1時間後に、乾燥THF(30mL)中に溶解された3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン2(6.58g、30.84mmol)を0℃で加えた。反応混合物を65℃で16時間撹拌した。反応混合物を飽和塩化アンモニウム溶液(50mL)で0℃にてクエンチした後に、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮して粗製化合物を得て、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物を石油エーテル中80%→100%の酢酸エチルで溶出させて、3-(5-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物43(1.3g、2.85mmol、41.57%の収率、78.7%の純度)を黄色の固体として得た。LCMS (ES+): m/z 359.0 [M+H]+
実施例38.以下の化合物を同様にして合成することができる:
Figure 2023545507000409
実施例39.以下のアミン中間体を、標準的な化学を使用してブロモ中間体に転化させ、先行するアルキル化反応において利用して、生成物を調製することができる。
Figure 2023545507000410
実施例40.3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アゼパン-2,7-ジオン(化合物55)の合成
Figure 2023545507000411
工程1:ジメトキシメタン2(4当量)を0℃でアセチルメタンスルホネート3(4当量)に加え、反応物を25℃で2時間撹拌する。DMF中の2,7-アゼパンジオン1(1当量、CAS番号4726-93-6)及びDiPEA(4当量)の溶液を反応混合物に45分かけて加えた後に、15分間撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン4を得る(米国特許出願公開第2003/375340号に記載されるように)。
工程2:CHCl中の1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン4(1当量)及びBr(1当量)の溶液を密閉管において110℃で1.5時間加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-ブロモ-1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン5を得る。
工程3:THF中の5-ブロモベンゾ[cd]インドール-2(1H)-オン6(5当量)の0℃の溶液に、NaH(油中60%、10当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物を室温で60分間撹拌する。反応混合物を0℃に冷却し、THF中の3-ブロモ-1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン(1当量)をゆっくりと加え、冷却浴を取り外し、反応混合物をゆっくりと65℃に加熱する。反応混合物を反応が完了したと判断されるまで、この温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン7を得る。
工程4:ジオキサン、水、及び濃HCl中の3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン7(1当量)の溶液を反応が完了したと判断されるまで還流加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アゼパン-2,7-ジオンの化合物55を得る。
実施例41.3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ピロリジン-2,5-ジオン(化合物56)の合成
Figure 2023545507000412
工程1:THF中の3-ブロモ-1-(メトキシメチル)アゼパン-2,7-ジオン2(5当量)の0℃の溶液に、NaH(油中60%、10当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物を室温で60分間撹拌する。反応混合物を0℃に冷却し、THF中の3-ブロモ-1-{[4-(メチルオキシ)フェニル]メチル}-1H-ピロール-2,5-ジオン1(国際公開第2008/074716号、1当量)をゆっくりと加え、冷却浴を取り外す。反応混合物をゆっくりと65℃に加熱し、反応混合物を反応が完了したと判断されるまでこの温度で撹拌する。標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1-(4-メトキシベンジル)-1H-ピロール-2,5-ジオン3を得る。
工程2:EtOH中の3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1-(4-メトキシベンジル)-1H-ピロール-2,5-ジオン3及び触媒PtOの懸濁液を、水素の雰囲気下で適切な圧力及び温度にて撹拌して、標準的な後処理プロトコルの後に3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピロリジン-2,5-ジオン4を得る。
工程3:アセトニトリル及び水中の3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピロリジン-2,5-ジオン4の溶液に、CAN(1当量~3当量)を加える。得られた混合物を反応が完了したと判断されるまで、室温で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(5-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ピロリジン-2,5-ジオンの化合物56を得る。
実施例42.5-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1,3-ジアザビシクロ[3.1.1]ヘプタン-2,4-ジオン(化合物57)の合成
Figure 2023545507000413
工程1:メタノール(10容量当量)中のtert-ブチル3-オキソアゼチジン-1-カルボキシレート(1当量)の撹拌された溶液に、メチル8-アミノ-5-ブロモ-1-ナフトエート1(1.1)に続いてTMSCN(2当量)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌する。標準的な後処理及び精製を行って、tert-ブチル3-((4-ブロモ-8-(メトキシカルボニル)ナフタレン-1-イル)アミノ)-3-シアノアゼチジン-1-カルボキシレート2を得る。
工程2:THF(10容量当量)中のtert-ブチル3-((4-ブロモ-8-(メトキシカルボニル)ナフタレン-1-イル)アミノ)-3-シアノアゼチジン-1-カルボキシレート2(1当量)の撹拌された溶液に、カリウムtert-ブトキシド(2当量)を0℃で加え、反応混合物を室温まで温める。反応混合物を1Mのクエン酸溶液で中和し(pH6に調整し)、酢酸エチルで希釈する。標準的な後処理及び精製を行って、tert-ブチル3-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-3-シアノアゼチジン-1-カルボキシレート3を得る。
工程3:DCM(15容量当量)中のtert-ブチル3-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-3-シアノアゼチジン-1-カルボキシレート3(1当量)の撹拌された混合物に、トリフルオロ酢酸(3容量当量)を加える。混合物を完了するまで室温で撹拌し、標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アゼチジン-3-カルボニトリル4を得る。
工程4:乾燥エタノール(20容量当量)中の臭化シアン(1当量)及び酢酸ナトリウム(1当量)の溶液に、3-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アゼチジン-3-カルボニトリル4(1当量)を加え、反応混合物を室温で24時間撹拌する。標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アゼチジン-1,3-ジカルボニトリル5を得る。
工程5:3-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アゼチジン-1,3-ジカルボニトリル5(1当量mmol)を4.6MのHCl水溶液中に溶解し、2時間還流させる。0℃に冷却した後に、標準的な後処理及び精製を行って、5-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-1,3-ジアザビシクロ[3.1.1]ヘプタン-2,4-ジオンの化合物57を得る。
実施例43.1-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-3-アザビシクロ[3.1.1]ヘプタン-2,4-ジオン(化合物58)の合成
Figure 2023545507000414
工程1:メタノール(10容量当量)中のメチル3-オキソシクロブタン-1-カルボキシレート(1当量)の撹拌された溶液に、メチル8-アミノ-5-ブロモ-1-ナフトエート1(1.1当量)を加え、反応物を室温で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に冷却し、シアン化トリメチルシリル(2当量)を滴加する。冷却浴を取り外し、反応混合物を室温で16時間撹拌する。標準的な後処理及び精製を行って、メチル5-ブロモ-8-((1-シアノ-3-(メトキシカルボニル)シクロブチル)アミノ)-1-ナフトエート(2)を得る。
工程2:酢酸(30当量)中のメチル5-ブロモ-8-((1-シアノ-3-(エトキシカルボニル)シクロブチル)アミノ)-1-ナフトエート(2)(1当量)の撹拌された溶液に、硫酸(0.7当量)を加え、反応混合物を16時間還流させる。標準的な後処理及び精製を行って、1-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)-3-アザビシクロ[3.1.1]ヘプタン-2,4-ジオンの化合物58を得る。
実施例44.tert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレート(化合物59)の合成
Figure 2023545507000415
工程1:DMF(12mL)中の3-(6-ブロモ-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン1(740mg、2.06mmol)の溶液に、tert-ブチル4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレート2(764.47mg、2.47mmol)及びフッ化セシウム(469.44mg、3.09mmol、113.94μL)を25℃で加え、反応混合物を窒素で5分間脱ガスした。次いで、[1,1’-ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン]ジクロロパラジウム(II)(168.25mg、206.03μmol)を加え、再び反応混合物を窒素で5分間脱ガスした後に、反応混合物を80℃で10時間撹拌した。完了したら、反応混合物を冷却し、水(50mL)中に注ぎ、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。有機層を合わせ、ブライン(50ml)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させた後に、減圧下で濃縮した。溶離液としてヘキサン中0%→100%の酢酸エチルを使用するシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーにより粗製物質を精製して、tert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレートの化合物59(404mg、803.96μmol、39.02%の収率、91.84%の純度)を黄色の固体として得た。LCMS m/z [M+H]+=406.3[M-56(脱第三級ブチル(de tertiary butyl))]、純度91.84%。
実施例45.tert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]ピペリジン-1-カルボキシレート(化合物60)の合成
Figure 2023545507000416
工程1:1,4-ジオキサン(10mL)中のtert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレートの化合物59(200mg、433.36μmol)の溶液に、20重量%の炭素上水酸化パラジウム(100mg、712.08μmol)を窒素雰囲気下で加え、反応混合物を水素雰囲気下で25℃にて16時間撹拌した。完了したら、セライトパッドを通して反応混合物を濾過し、セライトパッドを酢酸エチル(100mL)で洗浄し、濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]ピペリジン-1-カルボキシレートの化合物60(201mg、380.60μmol、87.83%の収率、87.77%の純度)を黄色の固体として得た。LCMS m/z [M+H]+=364.2[M-100(脱第三級ブチル)]。
実施例46.3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジル)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(化合物61)の合成
Figure 2023545507000417
工程1:DCM(4mL)中のtert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]ピペリジン-1-カルボキシレートの化合物60(200mg、431.48μmol)の溶液に、トリフルオロ酢酸(983.97mg、8.63mmol、664.84μL)を0℃で加え、反応混合物を25℃で4時間撹拌させた。完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮し、残留物をメチルtert-ブチルエーテル(2×20mL)でトリチュレートし、溶媒をデカンテーションして固体を得て、それを減圧下で乾燥させて、3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジル)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオンの化合物61(192mg、213.94μmol、49.58%の収率、53.20%の純度)を薄褐色の吸湿性固体として得た。LCMS m/z [M+H]+ = 364.3。
実施例47.9-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ノナン酸(化合物62)の合成
Figure 2023545507000418
工程1:アセトニトリル(2mL)中の3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジル)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオンの化合物61(50mg、104.73μmol)の溶液に、N-エチル-N-イソプロピル-プロパン-2-アミン(94.75mg、733.09μmol、127.69μL)及び9-ブロモノナン酸2(24.83mg、104.73μmol)を室温で加えた。次いで、反応物を80℃で4時間撹拌した。反応の進行をLCMSにより監視した。反応が完了した後に、それを減圧下で濃縮し、EtOAc(200mL)中に溶解し、飽和NaHCO溶液で洗浄した。NaSOを介して有機層を乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗製物質をジエチルエーテルでトリチュレートし、減圧下で乾燥させて、9-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ノナン酸の化合物62を得て、これを更に精製せずに後続工程において使用した。TLC:DCM中10%のMeOH(Rf:0.2)。
実施例48.3-[7-(ジフルオロメチル)-6-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3,4-ジヒドロ-2H-キノリン-1-イル]-1-[1-[9-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ノナノイル]-4-ピペリジル]-N-メチル-6,7-ジヒドロ-4H-ピラゾロ[4,3-c]ピリジン-5-カルボキサミドギ酸塩(化合物63)の合成
Figure 2023545507000419
工程1:DMF(2mL)中の3-[7-(ジフルオロメチル)-6-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3,4-ジヒドロ-2H-キノリン-1-イル]-N-メチル-1-(4-ピペリジル)-6,7-ジヒドロ-4H-ピラゾロ[4,3-c]ピリジン-5-カルボキサミド1(47.15mg、78.91μmol、022)及び9-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ノナン酸の化合物62(50mg、78.91μmol、061)の撹拌された溶液に、N-エチル-N-イソプロピル-プロパン-2-アミン(81.59mg、631.26μmol、109.95μL)及びPyBOP(49.28mg、94.69μmol)を室温で加えた。次いで、反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応の進行をLCMSにより監視した。反応が完了した後に、反応混合物を減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。粗生成物を逆相分取HPLCにより精製して、3-[7-(ジフルオロメチル)-6-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3,4-ジヒドロ-2H-キノリン-1-イル]-1-[1-[9-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ノナノイル]-4-ピペリジル]-N-メチル-6,7-ジヒドロ-4H-ピラゾロ[4,3-c]ピリジン-5-カルボキサミドギ酸塩の化合物63(28.2mg、25.60μmol、32.44%の収率、97.32%の純度)を淡黄色の固体として得た。LCMS m/z [M+H]+ = 1026.0。TLC:DCM中10%のMeOH(Rf:0.1)。
実施例49.tert-ブチル4-[(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-6-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(化合物64)の合成
Figure 2023545507000420
工程1:トルエン(20mL)中のtert-ブチル4-アミノピペリジン-1-カルボキシレート(2.02g、10.08mmol)及び6-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オンの化合物42(2.5g、10.08mmol)の撹拌された溶液に、ナトリウムイソプロポキシド(2.91g、30.23mmol)を室温で加えた。反応溶液を窒素で10分間脱ガスした後に、Pd(P(t-Bu)(1.03g、2.02mmol)を反応溶液に加え、再び窒素で5分間脱ガスした。次いで、混合物を110℃で16時間撹拌した。反応の進行をLCMSにより監視した。反応が完了した後に、セライトを通してそれを濾過し、EtOAcで洗浄した。有機層を水及びブライン溶液で洗浄した。無水NaSOを介して有機層を乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ、溶離液として石油エーテル中50%のEAを使用するカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル4-[(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-6-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートの化合物64(0.35、914.43μmol、9.07%の収率、96%の純度)を橙色の固体として得た。TLC:石油エーテル中50%のEA(Rf:0.2)。
実施例50.tert-ブチル4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(化合物65)の合成
Figure 2023545507000421
工程1:THF(4mL)中のtert-ブチル4-[(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-6-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートの化合物64(0.35g、952.54μmol)の撹拌された溶液に、水素化ナトリウム(342.88mg、14.29mmol)を0℃で加え、室温で1時間撹拌した。次いで、3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(914.48mg、4.76mmol)を室温で反応混合物に加え、65℃で16時間撹拌した。反応の進行をLCMSにより監視した。反応が完了した後に、反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物をEtOAcで希釈し、冷水及びブライン溶液で洗浄した。無水NaSOを介して有機層を乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ、溶離液として石油エーテル中50%のEAを使用するカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートの化合物65(0.2g、409.58μmol、43.00%の収率、98%の純度)を褐色の固体として得た。TLC:石油エーテル中50%のEA(Rf:0.3)。
実施例51.3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジルアミノ)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオントリフルオロアセテート(化合物66)の合成
Figure 2023545507000422
工程1:DCM(5mL)中のtert-ブチル4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートの化合物65(0.1g、208.97μmol、000)の撹拌された懸濁液に、トリフルオロ酢酸(238.27mg、2.09mmol、161.00μL)を滴加する。反応混合物を室温で3時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、残留物をジエチルエーテル(10mL)でトリチュレートして、3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジルアミノ)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオントリフルオロアセテートの化合物66(0.1g、168.55μmol、80.66%の収率、83%の純度)を得た。TLC:Rf 0.2(10% MeOH/DCM)
実施例52.9-[4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]-1-ピペリジル]ノナン酸(化合物67)の合成
Figure 2023545507000423
工程1:ACN(4mL)中の3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジルアミノ)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオンの化合物66(50mg、101.53μmol)、DIPEA(78.74mg、609.20μmol、106.11μL)、及び9-ブロモノナン酸1(24.08mg、101.53μmol)の溶液を、密閉管において80℃で24時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、残留物をジエチルエーテル(10mL)でトリチュレートして、9-[4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール]-6-イル]アミノ]-1-ピペリジル]ノナン酸の化合物67(50mg、66.40μmol、65.40%の収率、71%の純度)を得た。TLC:Rf 0.2(70% EtOAc/石油エーテル)
実施例53.3-[7-(ジフルオロメチル)-6-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3,4-ジヒドロ-2H-キノリン-1-イル]-1-[1-[9-[4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]-1-ピペリジル]ノナノイル]-4-ピペリジル]-N-メチル-6,7-ジヒドロ-4H-ピラゾロ[4,3-c]ピリジン-5-カルボキサミド(化合物68)の合成
Figure 2023545507000424
工程1:DMF(2mL)中の3-[7-(ジフルオロメチル)-6-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3,4-ジヒドロ-2H-キノリン-1-イル]-N-メチル-1-(4-ピペリジル)-6,7-ジヒドロ-4H-ピラゾロ[4,3-c]ピリジン-5-カルボキサミド1(国際公開第2020/173440号、50mg、89.12μmol)及び9-[4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]-1-ピペリジル]ノナン酸の化合物67(47.65mg、89.12μmol)の撹拌された溶液に、N-エチル-N-イソプロピル-プロパン-2-アミン(69.11mg、534.69μmol、93.13μL)を加える。得られた溶液を室温で5分間撹拌した後に、ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ(トリピロリジン-1-イル)ホスホニウム;ヘキサフルオロホスフェート(69.56mg、133.67μmol)を加え、反応混合物を28℃で16時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、粗製物質をHPLCにより精製して、3-[7-(ジフルオロメチル)-6-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3,4-ジヒドロ-2H-キノリン-1-イル]-1-[1-[9-[4-[[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]アミノ]-1-ピペリジル]ノナノイル]-4-ピペリジル]-N-メチル-6,7-ジヒドロ-4H-ピラゾロ[4,3-c]ピリジン-5-カルボキサミドの化合物68(19.35mg、17.44μmol、19.57%の収率、98.00%の純度)を得た。LCMS m/z [M+H]+ = 1041.1
実施例54.3-(6-ブロモ-1-オキソ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物69)及び3-(7-ブロモ-1-オキソ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物70)の合成
Figure 2023545507000425
工程1:適切な溶媒中の6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1,3(2H)-ジオン1の溶液に、水素化ホウ素ナトリウムを少量ずつ加える。反応が完了したと判断されたら、標準的な後処理及び精製プロトコルを行って、2つの位置異性体の6-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1-オン2及び7-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1-オン3を得る。
工程2:THF中の6-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1-オン2又は7-ブロモ-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1-オン3(1当量)の0℃の溶液に、NaH(油中60%、10当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物を室温で60分間撹拌する。反応混合物を0℃に冷却し、THF中の3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(5当量)をゆっくりと加え、冷却浴を取り外し、反応混合物をゆっくりと65℃に加熱する。反応混合物を反応が完了したと判断されるまで、この温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-1-オキソ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物69)又は3-(7-ブロモ-1-オキソ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-2(3H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物70)をそれぞれ得る。
実施例55.1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ジヒドロピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン(化合物71)の合成
Figure 2023545507000426
工程1:DCM中の1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン1の溶液に、DMAP及びBocOを加え、反応が完了したと判断されるまで撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、tert-ブチル3-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-2,6-ジオキソ-3,6-ジヒドロピリミジン-1(2H)-カルボキシレート2を得る。
工程2:THF中のtert-ブチル3-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-2,6-ジオキソ-3,6-ジヒドロピリミジン-1(2H)-カルボキシレート2の-78℃の溶液に、L-セレクトリドを滴加する。反応物を反応が完了したと判断されるまで、適切な温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、tert-ブチル3-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-2,6-ジオキソテトラヒドロピリミジン-1(2H)-カルボキシレート3を得る。
工程3:適切な溶媒中のtert-ブチル3-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-2,6-ジオキソテトラヒドロピリミジン-1(2H)-カルボキシレート3の撹拌された溶液に濃塩酸を加える。反応物を反応が完了したと判断されるまで、適切な温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ジヒドロピリミジン-2,4-(1H,3H)-ジオン(化合物71)を得る。
実施例56.1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン(化合物72)の合成
Figure 2023545507000427
工程1:適切な溶媒中の6-ブロモ-1H-ベンゾ[de]イソキノリン-1,3(2H)-ジオン1の溶液に、水素化ホウ素ナトリウムを少量ずつ加える。反応が完了したと判断されたら、標準的な後処理及び精製プロトコルを行って、6-ブロモ-2-ヒドロキシアセナフチレン-1(2H)-オン2を得る。
工程2:THF中の6-ブロモ-2-ヒドロキシアセナフチレン-1(2H)-オン2の撹拌された溶液に、DIAD、PPh、及び3-ベンゾイルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン3を加える。次いで、反応混合物を反応が完了したと判断されるまで、適切な温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-ベンゾイル-1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ピリミジン-2,4-(1H,3H)-ジオン4を得る。
工程3:反応容器において、3-ベンゾイル-1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン4をMeOH中のNHの溶液中に溶解し、反応が完了したと判断されるまで適切な温度で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、1-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)ピリミジン-2,4-(1H,3H)-ジオン(化合物72)を得る。
実施例57.3-(6-ブロモ-2-オキソ-1,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物73)及び3-(6-ブロモ-1-オキソ-2,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-2(1H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物74)の合成
Figure 2023545507000428
工程1:塩酸水溶液中のメチル5-アミノ-6-ブロモ-4-メチルピラゾロ[1,5-a]ピリジン-3-カルボキシレート1(国際公開第2017/178377号において記載されるように合成される)の懸濁液に、亜硝酸ナトリウムを加える。適切な長さの時間の後に、HPOの水溶液を滴加し、反応溶液を再び反応が完了したと判断されるまで撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、メチル6-ブロモ-4-メチルピラゾロ[1,5-a]ピリジン-3-カルボキシレート2を得る。
工程2:水中のメチル6-ブロモ-4-メチルピラゾロ[1,5-a]ピリジン-3-カルボキシレート2の懸濁液に、過マンガン酸カリウムを加える。反応が完了したと判断された後に、標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って粗製物質を得て、それをメタノールに溶解することによって直ちに使用する。次いで、得られた溶液に水酸化カリウムを加え、混合物を反応が完了したと判断されるまで加熱する。メチル6-ブロモ-4-メチルピラゾロ[1,5-a]ピリジン-3-カルボキシレート2。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、6-ブロモピラゾロ[1,5-a]ピリジン-3,4-ジカルボン酸3を得る。
工程3:6-ブロモピラゾロ[1,5-a]ピリジン-3,4-ジカルボン酸3を酢酸中に溶解し、反応が完了したと判断されるまで加熱還流させる。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、4-ブロモ-6H,8H-7-オキサ-2,2a-ジアザアセナフチレン-6,8-ジオン4を得る。
工程4:ピリジン(10容量当量)中の4-ブロモ-6H,8H-7-オキサ-2,2a-ジアザアセナフチレン-6,8-ジオン4(1当量)及びヒドロキシルアミン塩酸塩(1当量)の溶液を5時間還流加熱し、続いて80℃に冷却し、塩化4-トルエンスルホニル(2当量)を加える。加えた後に、温度を上げ、反応物を5時間還流撹拌し、続いて冷却する。反応混合物を水中に注ぎ、EtOAc(3回)で抽出する。有機層を合わせ、水、NaHCO飽和水溶液、ブラインで洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させた後に、濾過し、蒸発乾固させた。EtOH(10容量当量)及び水(10容量当量)中の残留物の撹拌された溶液に、1Mの水酸化ナトリウム水溶液(10当量)を滴加する。その後、エタノールを留去しながら混合物を3時間還流撹拌する。反応が完了した後に、反応混合物を75℃に冷却し、36%(重量/重量)の水溶液の塩酸(10容量当量)を滴加する。標準的な後処理及び精製に続いて位置異性体の分離を行って、6-ブロモ-1,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-2(1H)-オン5及び6-ブロモ-2,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-1(2H)-オン6を得る。
工程5:THF中の6-ブロモ-1,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-2(1H)-オン5又は6-ブロモ-2,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-1(2H)-オン6の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-2-オキソ-1,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-1(2H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物73、又は3-(6-ブロモ-1-オキソ-2,4,4a-トリアザシクロペンタ[cd]インデン-2(1H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物74をそれぞれ得る。
実施例58.3-(6-ブロモ-4-メチル-2-オキソ-2,4-ジヒドロ-1H-ピロロ[4,3,2-cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物75)及び3-(6-ブロモ-4-メチル-1-オキソ-1,4-ジヒドロ-2H-ピロロ[2,3,4-cd]インドール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物76)の合成
Figure 2023545507000429
工程1:DMF中のメチル6-ブロモ-3-ホルミル-1H-インドール-4-カルボキシレート1(Bioorg. Med. Chem. Lett. (2017) 27(2) 217-222に記載されるように合成される)の撹拌された溶液に、水素化ナトリウムを0℃で少しずつ加える。加えた後に、ヨウ化メチルを滴加し、次いで反応物を必要に応じて加熱する。反応が完了したと判断されたら、標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、メチル6-ブロモ-3-ホルミル-1-メチル-1H-インドール-4-カルボキシレート2を得る。
工程2:tert-ブチルアルコール中のメチル6-ブロモ-3-ホルミル-1-メチル-1H-インドール-4-カルボキシレート2の撹拌された溶液に、NaClO、NaHPO、及び2-メチル-2-ブテンを加える。得られた溶液を反応が完了したと判断されるまで撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、6-ブロモ-4-(メトキシカルボニル)-1-メチル-1H-インドール-3-カルボン酸3を得る。
工程3:反応フラスコにおいて、6-ブロモ-4-(メトキシカルボニル)-1-メチル-1H-インドール-3-カルボン酸3をメタノール中に溶解する。次いで、得られた溶液に水酸化カリウムを加え、混合物を反応が完了したと判断されるまで加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って物質を得て、これを後続の変換において直ちに使用する。この物質を酢酸中に溶解し、反応が完了したと判断されるまで加熱還流させる。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、7-ブロモ-1-メチル-3H-ピラノ[3,4,5-cd]インドール-3,5(1H)-ジオン4を得る。
工程4:ピリジン(10容量当量)中の7-ブロモ-1-メチル-3H-ピラノ[3,4,5-cd]インドール-3,5(1H)-ジオン4(1当量)及びヒドロキシルアミン塩酸塩(1当量)の溶液を5時間還流加熱し、続いて80℃に冷却し、塩化4-トルエンスルホニル(2当量)を加える。加えた後に、温度を上げ、反応物を5時間還流撹拌し、続いて冷却する。反応混合物を水中に注ぎ、EtOAc(3回)で抽出する。有機層を合わせ、水、NaHCO飽和水溶液、ブラインで洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させた後に、濾過し、蒸発乾固させた。EtOH(10容量当量)及び水(10容量当量)中の残留物の撹拌された溶液に、1Mの水酸化ナトリウム水溶液(10当量)を滴加する。その後、エタノールを留去しながら混合物を3時間還流撹拌する。反応が完了した後に、反応混合物を75℃に冷却し、36%(重量/重量)の水溶液の塩酸(10容量当量)を滴加する。標準的な後処理及び精製に続いて位置異性体の分離を行って、6-ブロモ-4-メチル-1,4-ジヒドロ-2H-ピロロ[4,3,2-cd]インドール-2-オン5及び6-ブロモ-4-メチル-2,4-ジヒドロ-1H-ピロロ[2,3,4-cd]インドール-1-オン6を得る。
工程5:THF中の6-ブロモ-4-メチル-1,4-ジヒドロ-2H-ピロロ[4,3,2-cd]インドール-2-オン5又は6-ブロモ-4-メチル-2,4-ジヒドロ-1H-ピロロ[2,3,4-cd]インドール-1-オン6の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(6-ブロモ-4-メチル-2-オキソ-2,4-ジヒドロ-1H-ピロロ[4,3,2-cd]インドール-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物75又は3-(6-ブロモ-4-メチル-1-オキソ-1,4-ジヒドロ-2H-ピロロ[2,3,4-cd]インドール-2-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物76をそれぞれ得る。
実施例59.3-(3-クロロ-7-オキソピロロ[2,3,4-de]フタラジン-8(7H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物77)の合成
Figure 2023545507000430
工程1:トルエン中の1,4-ジオキソ-1,2,3,4-テトラヒドロフタラジン-5-カルボン酸1の溶液にPOClを滴加した後に、反応混合物を適宜加熱する。反応が完了したと判断されたら、標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、1,4-ジクロロフタラジン-5-カルボニル塩化物2を得る。
工程2:適切な溶媒中の1,4-ジクロロフタラジン-5-カルボニル塩化物2の溶液に、4-メトキシベンジルアミンを加え、得られた混合物を反応が完了したと判断されるまで撹拌する。反応溶液を0℃に冷却し、水素化ナトリウムを少しずつ加える。水素化ナトリウムを加えた後に、反応物を必要に応じて反応が完了したと判断されるまで加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-クロロ-8-(4-メトキシベンジル)ピロロ[2,3,4-de]フタラジン-7(8H)-オン3を得る。
工程3:トリフルオロ酢酸中に溶解された3-クロロ-8-(4-メトキシベンジル)ピロロ[2,3,4-de]フタラジン-7(8H)-オン3の溶液を、反応が完了したと判断されるまで撹拌する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-クロロピロロ[2,3,4-de]フタラジン-7(8H)-オン4を得る。
工程4:THF中の3-クロロピロロ[2,3,4-de]フタラジン-7(8H)-オン4の0℃の溶液に、NaH(鉱油中60%の分散液、10当量~15当量)を少しずつ加える。次いで、冷却浴を取り外し、反応混合物をこの温度で1時間撹拌する。反応混合物を0℃に再冷却し、3-ブロモ-グルタルイミド(5当量~8当量)を少しずつ加えた後に、冷却浴をもう一度取り外し、反応物を反応が完了したと判断されるまで、ゆっくりと70℃に加熱する。標準的なプロトコルを使用して標準的な後処理及び精製を行って、3-(3-クロロ-7-オキソピロロ[2,3,4-de]フタラジン-8(7H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物77を得る。
実施例60.3-(5-ブロモ-2-メトキシアセナフチレン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物78)の合成
Figure 2023545507000431
工程1:3-(5-ブロモ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピペリジン-2,6-ジオン1をDMF中に溶解し、氷浴を使用して-78℃にする。LDAを滴加し、反応物を撹拌させる。MeIを加え、反応物を完了したと判断されるまで室温で撹拌させる。中間体の3-(5-ブロモ-2-メトキシアセナフチレン-1-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピペリジン-2,6-ジオンを標準的な後処理及び精製プロトコルに従って得た後に、TFA中に溶解し、反応が完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、3-(5-ブロモ-2-メトキシアセナフチレン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物78を得る。
実施例61.(E)-3-(5-ブロモ-2-オキソアセナフチレン-1(2H)-イリデン)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物79)の合成
Figure 2023545507000432
工程1:THF中の3-ブロモ-1-(4-メトキシベンジル)ピペリジン-2,6-ジオン2を、THF中のZnの懸濁液に滴加し、氷浴中で0℃に冷却する。懸濁液を1時間撹拌する。THF中に溶解された5-ブロモアセナフチレン-1,2-ジオン1を懸濁液に滴加し、反応物を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、3-(5-ブロモ-1-ヒドロキシ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピペリジン-2,6-ジオン3を得る。
工程2:3-(5-ブロモ-1-ヒドロキシ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピペリジン-2,6-ジオン3をTFA中に溶解し、反応が完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、(E)-3-(5-ブロモ-2-オキソアセナフチレン-1(2H)-イリデン)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物79を得る。
実施例62.1-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ジヒドロピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン(化合物80)の合成
Figure 2023545507000433
工程1:メチル8-ブロモ-1-ナフトエート1及びベンジルヒドラジンカルボキシレート2をジオキサン中に溶解し、2-(ジ-tert-ブチルホスフィノ)-2’-イソプロポキシ-1,1’-ビナフチルPddba及びCsCOを加える。溶液を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、ベンジル2-(8-(メトキシカルボニル)ナフタレン-1-イル)ヒドラジン-1-カルボキシレート2を得る。
工程2:ベンジル2-(8-(メトキシカルボニル)ナフタレン-1-イル)ヒドラジン-1-カルボキシレート2を適切な溶媒中に溶解し、HClを加える。反応物を加熱し、完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、ベンジル(2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)カルバメート3を得る。
工程3:ベンジル(2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)カルバメート3をDCM中に溶解し、TFAを加える。溶液を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、1-アミノベンゾ[cd]インドール-2(1H)-オン4を得る。
工程4:1-アミノベンゾ[cd]インドール-2(1H)-オン4、メチル3-オキソプロパノエート5、NaBH(OAc)、及びAcOHをDMF中に溶解し、完了したと判断されるまで室温で撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、メチル3-((2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アミノ)プロパノエート6を得る。
工程5:メチル3-((2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)アミノ)プロパノエート6を適切な溶媒中に溶解し、KOCN及び1NのHClを加える。反応物を加熱し、完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、1-(2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ジヒドロピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン7を得る。
工程6:DCM中の1-(2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ジヒドロピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン7の0℃の溶液にNBSを加える。冷却浴を取り外し、反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製を行って、1-(6-ブロモ-2-オキソベンゾ[cd]インドール-1(2H)-イル)ジヒドロピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオンの化合物80を得る。
実施例63.3-(5-ブロモアセナフチレン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物81)の合成
Figure 2023545507000434
工程1:3-(5-ブロモ-1-ヒドロキシ-2-オキソ-1,2-ジヒドロアセナフチレン-1-イル)-1-(4-メトキシベンジル)ピペリジン-2,6-ジオン1をTFA中に溶解し、EtSiHを加える。反応物を加熱し、完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、3-(5-ブロモアセナフチレン-1-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物81を得る。
実施例64.3-(8-ブロモ-4-オキソピロロ[4,3,2-de]シンノリン-5(4H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物82)の合成
Figure 2023545507000435
工程1:4-ブロモインドリン-2-オン1を適切な溶媒中に溶解し、ギ酸エチル及びNaOEtを加える。反応物を完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、4-ブロモ-2-オキソインドリン-3-カルバルデヒド2を得る。
工程2:4-ブロモ-2-オキソインドリン-3-カルバルデヒド2をMeOH中に溶解し、p-トルエンスルホン酸を加える。反応物を完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、4-ブロモ-3-(ジメトキシメチル)インドリン-2-オン3を得る。
工程3:4-ブロモ-3-(ジメトキシメチル)インドリン-2-オン3及びtert-ブチルヒドラジンカルボキシレート4をジオキサン中に溶解し、2-(ジ-tert-ブチルホスフィノ)-2’-イソプロポキシ-1,1’-ビナフチルPddba及びCsCOを加える。溶液を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、tert-ブチル2-(3-(ジメトキシメチル)-2-オキソインドリン-4-イル)ヒドラジン-1-カルボキシレート5を得る。
工程4:tert-ブチル2-(3-(ジメトキシメチル)-2-オキソインドリン-4-イル)ヒドラジン-1-カルボキシレート5をトルエン中に溶解し、HClを加える。反応物を加熱し、完了したと判断されるまで撹拌させる。反応物を室温に冷却し、MnOを加え、反応物を完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、ピロロ[4,3,2-de]シンノリン-4(5H)-オン6を得る。
工程5:ピロロ[4,3,2-de]シンノリン-4(5H)-オン6を乾燥THF中に溶解し、溶液を0℃にした後に、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液)を加える。反応混合物を周囲温度で撹拌する。1時間後に、乾燥THF(10mL)中に溶解された3-ブロモピペリジン-2,6-ジオンを0℃で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで65℃で撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、3-(4-オキソピロロ[4,3,2-de]シンノリン-5(4H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン7を得る。
工程6:DCM中の3-(4-オキソピロロ[4,3,2-de]シンノリン-5(4H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン7の0℃の溶液にNBSを加える。冷却浴を取り外し、反応混合物を完了したと判断されるまで室温で撹拌する。標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製を行って、3-(8-ブロモ-4-オキソピロロ[4,3,2-de]シンノリン-5(4H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物82を得る。
実施例65.3-(8-ブロモ-5-オキソピロロ[2,3,4-de]シンノリン-4(5H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオン(化合物83)の合成
Figure 2023545507000436
工程1:5-ブロモ-4-ヨードイソベンゾフラン-1(3H)-オン1をCCl中に溶解し、AIBN及びNBSを加える。反応物を完了したと判断されるまで撹拌させる。反応物を標準的な手順を使用して後処理し、得られた残留物を水中に溶解し、KOHを加える。標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製を行って、5-ブロモ-3-ヒドロキシ-4-ヨードイソベンゾフラン-1(3H)-オン2を得る。
工程2:5-ブロモ-3-ヒドロキシ-4-ヨードイソベンゾフラン-1(3H)-オン2を適切な溶媒中に溶解し、NaCNに続いてNHOHを加える。HCl水溶液を加え、反応物を撹拌する。標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製を行って、6-ブロモ-7-ヨード-3-オキソイソインドリン-1-カルボン酸3を得る。
工程3:6-ブロモ-7-ヨード-3-オキソイソインドリン-1-カルボン酸3をMeOH中に溶解し、HClを加える。反応物を加熱し、完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的なプロトコルを使用して後処理及び精製を行って、メチル6-ブロモ-7-ヨード-3-オキソイソインドリン-1-カルボキシレート4を得る。
工程4:メチル6-ブロモ-7-ヨード-3-オキソイソインドリン-1-カルボキシレート4及びtert-ブチルヒドラジンカルボキシレート5をジオキサン中に溶解し、2-(ジ-tert-ブチルホスフィノ)-2’-イソプロポキシ-1,1’-ビナフチルPddba及びCsCOを加える。溶液を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、メチル6-ブロモ-7-(2-(tert-ブトキシカルボニル)ヒドラジネイル)-3-オキソイソインドリン-1-カルボキシレート6を得る。
工程5:メチル6-ブロモ-7-(2-(tert-ブトキシカルボニル)ヒドラジネイル)-3-オキソイソインドリン-1-カルボキシレート6をトルエン中に溶解し、HClを加える。反応物を還流に至らしめ、完了したと判断されるまで還流させる。反応物を室温に冷却し、MnOを加え、反応物を完了したと判断されるまで撹拌させる。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、8-ブロモ-2,4-ジヒドロピロロ[2,3,4-de]シンノリン-3,5-ジオン7を得る。
工程6:8-ブロモ-2,4-ジヒドロピロロ[2,3,4-de]シンノリン-3,5-ジオン7を適切な溶媒中に溶解し、氷浴を使用して0℃にする。SOClを加え、反応物を室温まで温め、完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、8-ブロモ-3-クロロピロロ[2,3,4-de]シンノリン-5(4H)-オン8を得る。
工程7:8-ブロモ-3-クロロピロロ[2,3,4-de]シンノリン-5(4H)-オン8をDMF中に溶解し、NaSMeを加える。溶液を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、8-ブロモ-3-(メチルチオ)ピロロ[2,3,4-de]シンノリン-5(4H)-オン9を得る。
工程8:8-ブロモ-3-(メチルチオ)ピロロ[2,3,4-de]シノリン-5(4H)-オン9を適切な溶媒中に溶解し、ラネーNiを加える。溶液を完了したと判断されるまで撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、8-ブロモピロロ[2,3,4-de]シンノリン-5(4H)-オン10を得る。
工程9:8-ブロモピロロ[2,3,4-de]シンノリン-5(4H)-オン10を乾燥THF中に溶解し、溶液を0℃にした後に、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液)を加える。反応混合物を周囲温度で撹拌する。1時間後に、乾燥THF(10mL)中に溶解された3-ブロモピペリジン-2,6-ジオンを0℃で加える。反応混合物を完了したと判断されるまで65℃で撹拌する。標準的な後処理及び精製プロトコルに従って、3-(8-ブロモ-5-オキソピロロ[2,3,4-de]シンノリン-4(5H)-イル)ピペリジン-2,6-ジオンの化合物83を得る。
実施例66
2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]酢酸の合成
Figure 2023545507000437
工程-1:
密閉管におけるN,N-ジメチルホルムアミド(3mL)中の3-[2-オキソ-6-(4-ピペリジル)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(化合物61、100mg、275.17μmol)及びトリエチルアミン(263.20mg、2.60mmol、362.54μL)の撹拌された溶液に、tert-ブチル2-ブロモアセテート(152.20mg、780.32μmol、114.44μL)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応混合物を冷水(30ml)中に注ぎ、沈殿物を濾過し、水及び石油エーテルで洗浄し、乾燥させて、tert-ブチル2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]アセテート(1、70mg、145.12μmol、28%の収率)を薄褐色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 478 [M + H]+1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.13 (s, 1H), 8.42 (d, J = 8.40 Hz, 1H), 8.11 (d, J = 6.80 Hz, 1H), 7.86 (t, J = 7.20 Hz, 1H), 7.40 (d, J = 7.60 Hz, 1H), 7.11 (s, 1H), 5.43-5.47 (m, 1H), 3.39-3.26 (m, 3H), 3.18 (s, 2H), 3.00-2.92 (m, 3H), 2.81-2.74 (m, 1H), 2.71-2.56 (m, 1H), 2.11-2.08 (m, 1H), 1.84-1.76 (m, 4H), 1.45 (s, 9H)。
工程-2:
ジクロロメタン(3mL)中のtert-ブチル2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]アセテート(1、70mg、146.58μmol)の0℃の撹拌された溶液に、トリフルオロ酢酸(1.48g、12.98mmol、1.0mL)をゆっくりと加えた。次いで、反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、粗製物質をジエチルエーテルでトリチュレートし、濾過し、乾燥させて、2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]酢酸(2、60mg、108.69μmol、74%の収率)を薄褐色のゴム状の固体として得た。更に精製せずに使用した。LC-MS (ES+): m/z 422 [M + H]+
実施例67
4-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ブタン酸の合成
Figure 2023545507000438
4-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ブタン酸の合成は、tert-ブチル2-ブロモアセテートをtert-ブチル4-ブロモブタノエートに置き換えることを除き、2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]酢酸と実質的に同様であった。LC-MS (ES+): m/z 450 [M + H]+
実施例68
tert-ブチル3-(6-ブロモ-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル)アゼチジン-1-カルボキシレートの合成
Figure 2023545507000439
工程1
ジクロロメタン(200mL)中の1-tert-ブトキシカルボニルアゼチジン-3-カルボン酸(1、24.06g、119.56mmol)の撹拌された溶液に、塩化オキサリル(3.34g、26.30mmol、2.29mL)及びピリジン(2.08g、26.30mmol、2.13mL)を25℃で滴加し、25℃で2時間撹拌した。次いで、ジクロロメタン(30mL)中の2,4-ジブロモアニリン(2、6g、23.91mmol、2.61mL)の溶液を25℃で加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。得られた混合物を水でクエンチし、ジクロロメタン(3×100mL)で抽出した。合わせた有機抽出物を水及びブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で蒸発させて、tert-ブチル3-[(2,4-ジブロモフェニル)カルバモイル]アゼチジン-1-カルボキシレート(3、28g、23.86mmol、99%の収率)を黄色の油状物として得た。更に精製せずに使用した。
工程-2:
1,2-ジメトキシエタン(250mL)中のtert-ブチル3-[(2,4-ジブロモフェニル)カルバモイル]アゼチジン-1-カルボキシレート(3、27g、62.19mmol)の撹拌された溶液に、炭酸セシウム(30.40g、93.29mmol)、1,10-フェナントロリン(2.24g、12.44mmol)、及びヨウ化銅(I)(1.18g、6.22mmol、210.76μL)を加え、混合物を90℃で16時間撹拌した。反応混合物を周囲温度に冷却し、酢酸エチルで希釈し、セライトケークを通して濾過し、濾過ケークを酢酸エチルで洗浄した。溶媒の蒸発に続いてカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、石油エーテル中0%→20%の酢酸エチル)を行って、tert-ブチル3-(6-ブロモ-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル)アゼチジン-1-カルボキシレート(4、4g、11.13mmol、18%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 353.21 [M + H]+
工程-3:
1,4-ジオキサン(20mL)中のtert-ブチル3-(6-ブロモ-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル)アゼチジン-1-カルボキシレート(4、1.7g、4.81mmol)、ビス(ピナコラト)ジボロン(1.34g、5.29mmol)、及び酢酸カリウム(1.18g、12.03mmol、752.15μL)の撹拌された溶液を窒素で5分間パージし、Pd(dppf)Cl(393.05mg、481.30μmol)を加えた。得られた混合物を85℃で16時間撹拌した。反応混合物を周囲温度に冷却し、水(50mL)中に注ぎ、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機抽出物を水及びブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、蒸発乾固させた。得られた粗製混合物をカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、石油エーテル中0%→20%の酢酸エチル)により精製して、tert-ブチル3-[6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(5、1.9g、4.46mmol、93%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 400.28 [M + H]+
実施例69
3-[2-(アゼチジン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-6-イル]-6-ベンジル-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-7-オンの合成
Figure 2023545507000440
工程-1:
密閉管におけるクロロホルム(100mL)中の3-ブロモ-5-メチル-6-ニトロ-1-トリチル-インダゾール(1、10.85g、21.77mmol)の撹拌された溶液に、NBS(11.62g、65.31mmol、5.54mL)及びアゾビスイソブチロニトリル(357.50mg、2.18mmol)を加えた。得られた混合物を90℃で16時間撹拌した。反応混合物を周囲温度に冷却し、水(100mL)で希釈し、DCM(3×150mL)で抽出した。合わせた有機物を水及びブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮して、3-ブロモ-5-(ブロモメチル)-6-ニトロ-1-トリチル-インダゾール(2、12.55g、7.81mmol、36%の収率)を暗褐色のゴム状の固体として得た。更に精製せずに使用した。
工程-2:
密閉管におけるDMF(100mL)中の3-ブロモ-5-(ブロモメチル)-6-ニトロ-1-トリチル-インダゾール(2、12.55g、21.74mmol)の撹拌された溶液に、DIPEA(14.05g、108.70mmol、18.93mL)及びフェニルメタンアミン(3.49g、32.61mmol)を窒素雰囲気下で加え、得られた混合物を90℃に16時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、水(100ml)で希釈した後に、酢酸エチル(3×150ml)で抽出した。合わせた有機物を水、ブラインで洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。溶離液としての石油エーテル中10%→50%の酢酸エチルで溶出させるシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製を行って、N-[(3-ブロモ-6-ニトロ-1-トリチル-インダゾール-5-イル)メチル]-1-フェニル-メタンアミン(3、4.71g、7.61mmol、35%の収率)を淡黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 603.2 [M]+、及び605.2 [M + 2]+
工程-3:
250mLの一つ口丸底フラスコに、THF(30mL)及び水(60mL)中のN-[(3-ブロモ-6-ニトロ-1-トリチル-インダゾール-5-イル)メチル]-1-フェニル-メタンアミン(3、8.34g、13.82mmol)のよく撹拌された溶液を入れ、そこに窒素雰囲気下で亜ジチオン酸ナトリウム(12.03g、69.10mmol)を加えた。反応混合物を室温で3時間撹拌した。反応混合物を水(400mL)で希釈し、15分間撹拌した。形成された固体を濾過し、真空中で乾燥させて、5-[(ベンジルアミノ)メチル]-3-ブロモ-1-トリチル-インダゾール-6-アミン(4、8.5g、12.70mmol、92%の収率)を黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 574.8 [M + H]+
工程-4:
250mLの一つ口丸底フラスコに、THF(35mL)中の5-[(ベンジルアミノ)メチル]-3-ブロモ-1-トリチル-インダゾール-6-アミン(4、3.5g、6.10mmol)のよく撹拌された溶液を入れ、そこに粒状の炭酸カリウム(1.69g、12.21mmol、736.61μL)及びトリホスゲン(3.62g、12.21mmol)を窒素雰囲気下で小分けにして加えた。得られた混合物を室温で3時間撹拌した。反応混合物を氷冷水(400mL)中に滴加することにより反応混合物をクエンチし、1時間撹拌し、得られた固体を濾過し、真空中で乾燥させて、粗製6-ベンジル-3-ブロモ-1-トリチル-5,8-ジヒドロピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-7-オン(5、3.1g、3.94mmol、65%の収率)をクリーム色の固体として得た。1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 9.35 (s, 1H), 7.35-7.17 (m, 21H), 6.13 (s, 1H), 4.49 (s, 2H), 4.34 (s, 2H)。
工程-5:
50mLの密閉管に、THF(11mL)及び水(4mL)中の6-ベンジル-3-ブロモ-1-トリチル-5,8-ジヒドロピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-7-オン(5、600mg、1.00mmol)及びtert-ブチル3-[6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(6、600mg、1.50mmol)のよく撹拌された溶液を入れた。反応混合物を窒素でパージし、第三リン酸カリウム無水物(636.36mg、3.00mmol)及びXPhos Pd G2(23.59mg、29.98μmol)を加えた。得られた混合物を窒素雰囲気下で3時間かけて80℃に加熱した。反応混合物を室温に冷却し、水(30mL)及び酢酸エチル(30mL)で希釈した。得られた混合物を、セライト床を通して濾過し、濾液を酢酸エチル(2×40mL)で抽出した。合わせた有機物をブラインで洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮して粗製物を得て、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィーに通して石油エーテル中の0%→100%の酢酸エチルで溶出させることにより精製したところ、生成物は、石油エーテル中65%のEAで溶出し、こうしてtert-ブチル3-[6-(6-ベンジル-7-オキソ-1-トリチル-5,8-ジヒドロピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(7、500mg、529.64μmol、53%の収率)を黄色の固体として得た。1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 9.30 (s, 1H), 8.11 (d, J = 0.80 Hz, 1H), 7.91 (s, 1H), 7.86-7.83 (m, 1H), 7.77 (d, J = 8.40 Hz, 1H), 7.37-7.23 (m, 20H), 6.17 (s, 1H), 4.52 (s, 2H), 4.38 (s, 2H), 4.31-4.29 (m, 2H), 4.17-4.15 (m, 3H), 1.42 (s, 9H)。
工程-6:
DCM(3mL)中のtert-ブチル3-[6-(6-ベンジル-7-オキソ-1-トリチル-5,8-ジヒドロピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(7、200mg、252.23μmol)の撹拌された溶液に、トリフルオロ酢酸(2.96g、25.96mmol、2.00mL)に続いてトリイソプロピルシラン(773.00mg、4.88mmol、1mL)を加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮して粗製物質を得て、これを石油エーテルで洗浄し(トリチル副生成物を除去し)、乾燥させて、3-[2-(アゼチジン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-6-イル]-6-ベンジル-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-7-オン(8、180mg、286.97μmol、76%の収率)を淡褐色のゴム状の油状物として得て、これを更に精製せずに後続工程において直ちに使用した。LC-MS (ES+): m/z 467 [M + 18]+
実施例70
3-[6-[1-[2-[3-[6-(6-ベンジル-7-オキソ-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-イル]-2-オキソ-エチル]-4-ピペリジル]-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(化合物100)の合成
Figure 2023545507000441
N,N-ジメチルホルムアミド(3mL)中の3-[2-(アゼチジン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-6-イル]-6-ベンジル-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-7-オン(1、50mg、110.99μmol)、2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]酢酸(2、51.45mg、122.09μmol)、及びDIPEA(71.72mg、554.95μmol、96.66μL)の撹拌された溶液に、PyBOP(115.52mg、221.98μmol)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。冷水を反応混合物に加えた後に、ジクロロメタンで抽出した。次いで、合わせた有機抽出物を、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させた後に、濃縮した。粗製物質を分取HPLCにより精製して、生成物の3-[6-[1-[2-[3-[6-(6-ベンジル-7-オキソ-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-イル]-2-オキソ-エチル]-4-ピペリジル]-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(12mg、13.08μmol、12%の収率)を薄黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 854 [M + H]+1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 12.98 (s, 1H), 11.14 (s, 1H), 9.59 (s, 1H), 8.46-8.44 (m, 1H), 8.22 (d, J = 1.20 Hz, 1H), 8.12 (d, J = 7.20 Hz, 1H), 8.00 (dd, J = 1.60, 8.40 Hz, 1H), 7.91-7.81 (m, 3H), 7.40-7.25 (m, 6H), 7.12-6.95 (m, 1H), 6.96 (s, 1H), 5.48-5.41 (m, 1H), 4.81-4.73 (m, 1H), 4.61-4.59 (m, 3H), 4.44 (s, 2H), 4.40-4.31 (m, 1H), 4.30-4.21 (m, 2H), 3.04-2.96 (m, 5H), 2.78-2.61 (m, 2H), 2.11-2.08 (m, 2H), 1.92-1.26 (m, 3H), 1.72-1.68 (m, 3H)。
実施例71
3-[6-[1-[4-[3-[6-(6-ベンジル-7-オキソ-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-イル]-4-オキソ-ブチル]-4-ピペリジル]-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(化合物101)の合成
Figure 2023545507000442
N,N-ジメチルホルムアミド(3mL)中の3-[2-(アゼチジン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-6-イル]-6-ベンジル-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-7-オン(1、50mg、110.99μmol)、4-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]ブタン酸(2、54.88mg、122.09μmol)、及びDIPEA(71.72mg、554.95μmol、96.66μL)の撹拌された溶液に、PyBOP(115.52mg、221.98μmol)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。冷水を反応混合物に加えた後に、ジクロロメタンで抽出した。合わせた有機抽出物を、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濃縮した。粗製物質を分取HPLCにより精製して、生成物の3-[6-[1-[4-[3-[6-(6-ベンジル-7-オキソ-5,8-ジヒドロ-1H-ピラゾロ[4,3-g]キナゾリン-3-イル)-1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル]アゼチジン-1-イル]-4-オキソ-ブチル]-4-ピペリジル]-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン(12mg、13.06μmol、12%の収率)を薄黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 882 [M + H]+1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 12.96 (s, 1H), 11.12 (s, 1H), 9.59 (s, 1H), 8.38 (d, J = 8.00 Hz, 1H), 8.16 (d, J = 4.40 Hz, 1H), 8.06 (d, J = 6.80 Hz, 1H), 7.96 (dd, J = 1.20, 8.20 Hz, 1H), 7.87-7.77 (m, 3H), 7.39-7.30 (m, 6H), 7.11-6.96 (m, 1H), 6.94 (s, 1H), 5.43-5.40 (m, 1H), 4.65-4.59 (m, 3H), 4.53-4.50 (m, 1H), 4.42 (s, 2H), 4.35-4.22 (m, 3H), 3.02-3.00 (m, 5H), 2.16-2.08 (m, 7H), 1.91-1.80 (m, 7H)。
Figure 2023545507000443
化合物2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]酢酸を、特許文献18の第203頁~第204頁に記載される方法に従って調製した。
実施例72
2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]-1-ピペリジル]酢酸の合成
Figure 2023545507000444
工程-1:
DCE(2000mL)中の1,5-ジブロモナフタレン(1、162g、566.51mmol)の撹拌された溶液を0℃に冷却し、塩化2-クロロアセチル(2、83.18g、736.46mmol、58.57mL)を滴加した。得られた溶液を0℃で15分間撹拌し、続いて無水塩化アルミニウム(98.20g、736.46mmol、40.25mL)を少しずつ加えた。次いで、得られた反応混合物をゆっくりと室温まで温め、16時間撹拌した。完了した後に(TLCにより監視)、反応混合物を氷冷水中に注ぎ、DCM(2回)で抽出した。合わせた有機抽出物を水及びブラインで更に洗浄し、硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。こうして得られた粗製物をカラムクロマトグラフィー(100~200のシリカ;グラジエント:ヘキサン中0%→5%のEtOAc)により精製して、2-クロロ-1-(4,8-ジブロモ-1-ナフチル)エタノン(3、150g、390mmol、69%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO d6) δ 8.36 (dd, J = 8.48, 0.72 Hz, 1H), 8.11-8.07 (m, 2H), 7.69 (t, J = 8.04 Hz, 1H), 7.59 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 5.05 (s, 2H);
工程-2:
硫酸(1.8L)中の2-クロロ-1-(4,8-ジブロモ-1-ナフチル)エタノン(3、151g、416.62mmol)の撹拌された溶液に、亜硝酸ナトリウム(30.27g、438.75mmol)を室温で加え、得られた反応混合物を65℃で45分間撹拌した。反応が完了した後に、反応混合物を冷水(2リットル)中に注ぎ、得られた固体を濾別した。こうして得られた固体を10%の炭酸ナトリウム溶液(4リットル)に加え、室温で30分間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を激しく撹拌しながら濃HClで慎重に酸性化し、再び濾過して、不溶性不純物を除去した。次いで、濾液(水溶液)を酢酸エチル(2回)で抽出した。合わせた有機抽出物をブラインで更に洗浄し、硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮して、4,8-ジブロモナフタレン-1-カルボン酸(4、110g、299mmol、72%の収率)を薄褐色の固体として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO d6) δ 13.48 (br s, 1H), 8.33 (d, J = 8.36 Hz, 1H), 8.09 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 8.01 (d, J = 7.72 Hz, 1H), 7.65 (t, J = 8.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J = 7.72 Hz, 1H)。LC-MS (ES-): m/z 328.90 [M-H]-
工程-3:
アンモニア水溶液(700mL)中の4,8-ジブロモナフタレン-1-カルボン酸(4、65g、196.99mmol)の撹拌された懸濁液に、銅粉末(3.25g、51.22mmol)を加え、得られた反応混合物を80℃で2時間撹拌した。完了した後に(TLCにより監視)、反応混合物を氷冷水中に注ぎ、激しく撹拌しながら濃HCl(pH約2)でゆっくりと酸性化した。得られた黄色の沈殿物を濾過し、減圧下で乾燥させて、5-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン(5、39g、151.68mmol、77%の収率)を褐色の固体として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO d6) δ 10.88 (s, 1H), 8.05 (d, J = 7.44 Hz, 1H), 7.88 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 7.61 (t, J = 7.8 Hz, 1H), 7.53 (d, J = 8.56 Hz, 1H), 7.04 (d, J = 7.0 Hz, 1H)。LC-MS (ES+): m/z 248.2 [M + H]+
工程-4:
ジオキサン(30mL)及び水(10mL)中の5-ブロモ-1H-ベンゾ[cd]インドール-2-オン(5、3g、12.09mmol)の溶液に、tert-ブチル4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレート(6、5.61g、18.14mmol)及び炭酸ナトリウム(3.85g、36.28mmol)を室温で加え、反応混合物を窒素ガスで15分間パージした。この溶液に、シクロペンチル(ジフェニル)ホスファン;ジクロロメタン;ジクロロパラジウム;鉄(987.57mg、1.21mmol)を室温で加え、反応混合物を窒素ガスで更に5分間パージした。反応混合物を、LCMSにより監視しながら、90℃で10時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を室温で冷やし、水(100mL)へと注ぎ、酢酸エチル(2×250mL)で抽出し、ブライン(100ml)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、回転蒸発器において濃縮して粗製物を得て、これをBiotage(商標)のIsoleraフラッシュカラムクロマトグラフィー(100メッシュ~200メッシュの50gのシリカゲル、ヘキサン中0%→100%の酢酸エチル)により精製して、tert-ブチル4-(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-5-イル)-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレート(7、2.5g、6.87mmol、57%の収率)を淡黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 351.2 [M + H]+
工程-5:
1,4-ジオキサン(25mL)中のtert-ブチル4-(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-5-イル)-3,6-ジヒドロ-2H-ピリジン-1-カルボキシレート(7、2.5g、7.13mmol)の撹拌された溶液に、炭素上20重量%の水酸化パラジウム(50%の水)(1.2g、8.54mmol)を窒素雰囲気下で加えた。得られた反応混合物を水素雰囲気下で4時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を、セライト床を通して濾過し、酢酸エチル(100mL)で洗浄し、真空下で濃縮した。粗製化合物を、100メッシュ~200メッシュのシリカゲルを使用し、石油エーテル中0%→25%の酢酸エチルで溶出させるカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル4-(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-5-イル)ピペリジン-1-カルボキシレート(8、1.7g、4.58mmol、64%の収率)を淡黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 297.0 [M-56 + H]+:
工程-6:
250mLの三つ口丸底フラスコにおいて、THF(100mL)中のtert-ブチル4-(2-オキソ-1H-ベンゾ[cd]インドール-5-イル)ピペリジン-1-カルボキシレート(8、0.8g、2.27mmol)の溶液に、水素化ナトリウム(鉱油中60%の分散液)(720.01mg、18.79mmol)を0℃で加え、混合物を室温で60分間撹拌した。これに続いて、THF(10mL)中の3-ブロモピペリジン-2,6-ジオン(9、1.31g、6.81mmol)を0℃で加えた。得られた反応混合物を60℃に4時間加熱した。反応が完了したら、反応混合物を0℃にて飽和塩化アンモニウム(50mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×100mL)で抽出し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、真空中で濃縮した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、石油エーテル中0%→40%の酢酸エチル)により精製して、tert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]ピペリジン-1-カルボキシレート(10、0.5g、855.40μmol、38%の収率)を淡黄色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 464.2 [M + H]+
工程-7:
DCM(30mL)中のtert-ブチル4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]ピペリジン-1-カルボキシレート(10、0.85g、1.83mmol)の撹拌された溶液に、ジオキサン中4.0Mの塩化水素溶液(12.95g、355.25mmol、16.19mL)を加えた。得られた反応混合物を、TLC及びUPLCにより監視しながら室温で4時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、石油エーテル(50mL)で洗浄して、3-[2-オキソ-5-(4-ピペリジル)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩(11、0.68g、1.64mmol、89%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。粗製化合物を更なる精製を行わずに直接的に後続工程に進めた。LC-MS (ES+): m/z 364.2 [M + H]+
工程-8:
DMF(5mL)中の3-[2-オキソ-5-(4-ピペリジル)ベンゾ[cd]インドール-1-イル]ピペリジン-2,6-ジオン塩酸塩(11、250mg、625.20μmol)の溶液に、DIPEA(808.01mg、6.25mmol、1.09mL)及びtert-ブチル2-ブロモアセテート(12、182.92mg、937.81μmol、137.54μL)を室温で加えた。反応混合物をこの温度で4時間撹拌し、反応混合物の進行をUPLC及びTLCにより監視した。反応混合物を氷冷水(50mL)中に注ぎ、酢酸エチル(2×50mL)で抽出し、無水硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。粗生成物を石油エーテル(50mL)で洗浄して、tert-ブチル2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]-1-ピペリジル]アセテート(13、230mg、446.61μmol、71%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 478.4 [M + H]+
工程-9:
DCM(5mL)中のtert-ブチル2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]-1-ピペリジル]アセテート(13、230mg、481.62μmol)の撹拌された溶液に、ジオキサン中4.0Mの塩化水素溶液(5.26g、144.19mmol、6.57mL)を室温で加えた。得られた反応混合物をこの温度で40時間撹拌し、反応の進行をTLC及びUPLCにより監視した。反応混合物を減圧下で濃縮し、粗生成物を石油エーテル(50mL)で洗浄し、濃縮して、2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]-1-ピペリジル]酢酸塩酸塩(14、180mg、371.08μmol、77%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 422.2 [M + H]+
実施例73
N-[(3-フルオロフェニル)メチル]-1-[1-[4-[2-(4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボキサミド塩酸塩の合成
Figure 2023545507000445
工程-1:
無溶媒の無水チタン(IV)イソプロポキシド(50.31mL)中の1-(4-ブロモ-1-ナフチル)エタノン(1、1、5.0g、19.07mmol)の混合物のよく撹拌された溶液が入った250mLの丸底フラスコに、メチルピペリジン-4-カルボキシレート(2、4.10g、28.60mmol、3.86mL)を周囲温度で加えた。反応混合物を80℃で6時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、水素化ホウ素ナトリウム(3.60g、95.14mmol、3.35mL)を反応混合物に加えた。反応混合物を30℃で3時間撹拌した。反応終了後に、反応混合物を0℃に冷却し、反応塊を水で希釈し、沈殿した固体を濾過した。濾液を酢酸エチル(2×150mL)で抽出した。有機相を合わせ、ブライン(100mL)で洗浄した。合わせた有機相を乾燥させ(無水NaSO)、濾過し、濾液を減圧下で濃縮して粗製残留物を得て、これをフラッシュシリカゲル(60メッシュ~120メッシュ)カラムにより石油エーテル中0%→100%の酢酸エチルを用いて精製して、イソプロピル1-[1-(4-ブロモ-1-ナフチル)エチル]ピペリジン-4-カルボキシレート(3、3.5g、8.14mmol、43%の収率)を無色の濃厚な液体として得た。LC-MS (ES+): m/z 404.2 [M + H]+
工程-2:
無水アセトニトリル(60mL)中のイソプロピル1-[1-(4-ブロモ-1-ナフチル)エチル]ピペリジン-4-カルボキシレート(3、5g、12.37mmol)、tert-ブチル4-エチニルピペリジン-1-カルボキシレート(4、3.36g、16.08mmol)のよく撹拌された溶液が入った250mLの密閉管に、炭酸セシウム(10.07g、30.91mmol)を室温で加えた。反応混合物を窒素ガスで10分間パージした後に、XPhos(589.50mg、1.24mmol)及びXPhos-Pd-G3(524.00mg、618.29μmol)を加えた。反応物を90℃で5時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物をセライトのパッドを通して濾過し、酢酸エチル(500mL)で洗浄し、濾液を減圧下で濃縮して粗製化合物を得て、これをフラッシュカラムクロマトグラフィー(230メッシュ~400メッシュのシリカゲル、石油エーテル中40%の酢酸エチル)により精製して、tert-ブチル4-[2-[4-[1-(4-イソプロポキシカルボニル-1-ピペリジル)エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(5、4g、7.36mmol、60%の収率)を薄褐色のゴム状の固体として得た。LC-MS(ES+): m/z 533.2 [M + H]+
工程-3:
メタノール(40mL)及びTHF(40mL)及び水(20mL)中のtert-ブチル4-[2-[4-[1-(4-イソプロポキシカルボニル-1-ピペリジル)エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(5、4.08g、7.51mmol)の撹拌された溶液が入った250mLの一つ口丸底フラスコに、98%の水酸化リチウム一水和物(3.15g、75.09mmol、2.09mL)を周囲温度で加え、得られた混合物を3時間撹拌した。反応が完了したら、揮発物を真空下で蒸発させて粗生成物を得て、これを10%のクエン酸溶液でpH=4に酸性化し、DCM中10%のMeOH(2×400mL)で抽出した。合わせた有機層を、NaSOを介して乾燥させ、減圧下で濃縮して、1-[1-[4-[2-(1-tert-ブトキシカルボニル-4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボン酸(6、3.67g、7.41mmol、99%の収率)を褐色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 491.2 [M + H]+
工程-4:
無水DMF(40mL)中の1-[1-[4-[2-(1-tert-ブトキシカルボニル-4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボン酸(6、4g、7.51mmol)及び(3-フルオロフェニル)メタンアミン(7、940.19mg、7.51mmol、857.05μL)のよく撹拌された溶液が入った100mLの丸底フラスコに、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(4.85g、37.56mmol、6.54mL)を室温で窒素雰囲気下にて加えた。5分後に、HATU(4.28g、11.27mmol)を加え、得られた混合物を室温で3時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を水(100mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×150mL)で抽出し、硫酸ナトリウムを介して乾燥させ、減圧下で濃縮して粗生成物を得て、これをカラムクロマトグラフィー(100gのシリカゲルカラム、石油エーテル中0%→100%の酢酸エチル)により精製して、tert-ブチル4-[2-[4-[1-[4-[(3-フルオロフェニル)メチルカルバモイル]-1-ピペリジル]エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(8、3.5g、5.57mmol、74%の収率)を褐色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 598.2 [M + H]+
工程-5:
無水DCM(5mL)中のtert-ブチル4-[2-[4-[1-[4-[(3-フルオロフェニル)メチルカルバモイル]-1-ピペリジル]エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(8、3.5g、5.56mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコに、1,4-ジオキサン中4Mの塩化水素(5.56mmol)を0℃で加えた。内容物を室温で2時間撹拌した。反応が完了した後に、溶媒を除去して粗製化合物を得て、これをトルエンで溶解し、蒸発乾固させ、MTBEで洗浄して、N-[(3-フルオロフェニル)メチル]-1-[1-[4-[2-(4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボキサミド塩酸塩(9、3g、5.21mmol、94%の収率)を褐色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 498.2 [M + H]+
実施例74
N-[(3-フルオロフェニル)メチル]-1-[1-[5-[2-(4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボキサミド二塩酸塩の合成
Figure 2023545507000446
工程-1:
無水DMF(200mL)中の5-ブロモナフタレン-1-カルボン酸(1、8g、31.86mmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコに、N,N-ジメチルピリジン-4-アミン(11.68g、95.59mmol)及び3-(エチルイミノメチレンアミノ)-N,N-ジメチル-プロパン-1-アミン塩酸塩(12.22g、63.73mmol)に続いてN-メトキシメタンアミン塩酸塩(2、12.43g、127.45mmol)を周囲温度で窒素雰囲気下にて加えた。内容物を周囲温度で16時間撹拌した。反応が完了した後に、反応混合物を水(500mL)中に注ぎ、EtOAc(2×500mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(300mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過した。濾液を減圧下で濃縮して粗生成物を得て、これをカラムクロマトグラフィー(100gのシリカゲル、0%→100%のEtOAc/石油エーテル)により精製して、5-ブロモ-N-メトキシ-N-メチル-ナフタレン-1-カルボキサミド(3、9g、26.35mmol、83%の収率)を無色の濃厚な液体として得た。LC-MS (ES+): m/z 295.9 [M + H]+
工程-2:
無水THF(100mL)中の5-ブロモ-N-メトキシ-N-メチル-ナフタレン-1-カルボキサミド(3、8.5g、24.88mmol)のよく撹拌された溶液が入った500mLの三つ口丸底フラスコに、無水塩化セリウム(III)(9.20g、37.32mmol)を0℃で加えた。得られた反応混合物を室温で1時間撹拌した後に、これを0℃に冷却し、THF中1Mの溶液(149.28mL、149.28mmol)の臭化メチルマグネシウムを滴加した。得られた溶液を室温で12時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を0℃未満にて飽和NHCl溶液(200mL)でゆっくりクエンチした。反応混合物をセライトのパッドを通して濾過し、濾過ケークをEtOAcで洗浄し、EtOAc(2×500mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(150mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過した。濾液を減圧下で濃縮して粗生成物を得て、これをカラムクロマトグラフィー(100g、シリカゲル、0%→100%のEtOAc/石油エーテル)により精製して、1-(5-ブロモ-1-ナフチル)エタノン(4、6.5g、24.74mmol、99%の収率)を無色の濃厚な液体として得た。LCMS (ES-): m/z 249.2 [M - H]-
工程-3:
100mLの密閉管において、1-(5-ブロモ-1-ナフチル)エタノン(4、6g、22.84mmol)、メチルピペリジン-4-カルボキシレート(5、4.91g、34.26mmol、4.63mL)、及び無水チタン(IV)イソプロポキシド(60mL)を周囲温度で混合した。反応混合物を80℃で6時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、水素化ホウ素ナトリウム(2.59g、68.52mmol、2.42mL)を加えた。次いで、これを30℃で3時間撹拌した。反応が完了した後に、反応混合物を0℃に冷却し、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム溶液で逐次洗浄した。固体沈殿物を濾過し、濾液をEtOAc(2×150mL)で抽出した。合わせた有機相をブライン(100mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して粗生成物を得て、これをフラッシュカラムクロマトグラフィー(10%のトリエチルアミン/石油エーテルで中和された230メッシュ~400メッシュのシリカゲル、0%→100%のEtOAc/石油エーテル)により精製して、イソプロピル1-[1-(5-ブロモ-1-ナフチル)エチル]ピペリジン-4-カルボキシレート(6、7g、14.97mmol、66%の収率)を無色の濃厚な液体として得た。LC-MS (ES+): m/z 405.9 [M+ H]+
工程-4:
無水アセトニトリル(10mL)中のイソプロピル1-[1-(5-ブロモ-1-ナフチル)エチル]ピペリジン-4-カルボキシレート(6、1g、2.13mmol)及びtert-ブチル4-エチニルピペリジン-1-カルボキシレート(7、578.67mg、2.77mmol)のよく撹拌された溶液が入った50mLの密閉管に、炭酸セシウム(2.08g、6.38mmol)を周囲温度で窒素雰囲気下にて加えた。得られた混合物を窒素ガスで10分間脱ガスした。引き続き、XPhos-Pd-G3(90.02mg、106.35μmol)及びジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン(101.39mg、212.69μmol)を加え、得られた混合物を窒素ガスで更に5分間脱ガスした後に、90℃で4時間加熱した。出発物質が消費された後に、反応混合物を周囲温度に冷却し、水(100mL)及びEtOAc(100mL)中に注いだ。次いで、これをセライトのパッドを通して濾過し、濾過ケークをEtOAc(50mL)で洗浄し、EtOAc(2×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(150mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過した。濾液を減圧下で濃縮して粗生成物を得て、これをBiotage(商標)のIsolera(230メッシュ~400メッシュのシリカゲル、0%→100%の酢酸エチル/石油エーテルを用いる)により精製して、tert-ブチル4-[2-[5-[1-(4-イソプロポキシカルボニル-1-ピペリジル)エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(8、1g、1.76mmol、83%の収率)を濃厚なオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 533.4 [M + H]+
工程-5:
1:1:1のTHF(10mL):メタノール(10mL):水(10mL)中のtert-ブチル4-[2-[5-[1-(4-イソプロポキシカルボニル-1-ピペリジル)エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(8、1g、1.76mmol)の混合物のよく撹拌された溶液に、水酸化リチウム一水和物(740.47mg、17.65mmol)を0℃で加えた。反応の進行をTLC(石油エーテル中100%のEtOAc)により監視しながら反応混合物を30℃で12時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮し、水(50mL)で希釈し、MTBE(2×150ml)で抽出した。水相をクエン酸溶液(pH4)で酸性化し、EtOAc(2×250mL)で抽出した。有機層を減圧下で濃縮して、1-[1-[5-[2-(1-tert-ブトキシカルボニル-4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボン酸(9、900mg、1.74mmol、99%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 491.1 [M + H]+
工程-6:
無水DMF(10mL)中の1-[1-[5-[2-(1-tert-ブトキシカルボニル-4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボン酸(9、900mg、1.74mmol)のよく撹拌された溶液が入った10mLの一つ口丸底フラスコに、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(1.13g、8.71mmol、1.52mL)及びHATU(993.91mg、2.61mmol)に続いて(3-フルオロフェニル)メタンアミン(10、327.12mg、2.61mmol、297.38μL)を周囲温度で窒素雰囲気下にて加えた。内容物を周囲温度で2時間撹拌した。反応が完了した後に、反応混合物を水(50mL)中に注ぎ、EtOAc(2×250mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、無水NaSOを介して乾燥させ、濾過した。濾液を減圧下で濃縮して粗生成物を得て、これをBiotage(商標)のIsolera(230メッシュ~400メッシュのシリカゲル、0%→100%の酢酸エチル/石油エーテル)により精製した。生成物を逆相クロマトグラフィー(BiotageのC18 120g SNAP、移動相:移動相A:水中0.1%の重炭酸アンモニウム、移動相B:アセトニトリル;流速:15mL/分)により更に精製して、tert-ブチル4-[2-[5-[1-[4-[(3-フルオロフェニル)メチルカルバモイル]-1-ピペリジル]エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(11、400mg、668.56μmol、38%の収率)をオフホワイト色の固体として得た。LC-MS (ES+): m/z 598.3 [M + H]+
工程-7:
DCM(4mL)中のtert-ブチル4-[2-[5-[1-[4-[(3-フルオロフェニル)メチルカルバモイル]-1-ピペリジル]エチル]-1-ナフチル]エチニル]ピペリジン-1-カルボキシレート(11、390mg、651.85μmol)のよく撹拌された溶液が入った100mLの一つ口丸底フラスコに、99%の1,4-ジオキサン中4Mの塩化水素(21.9mL、87.69mmol)を0℃で加えた。反応混合物を周囲温度で2時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得て、これをMTBE(2×200mL)及びアセトニトリル(50ml)で洗浄し、乾燥させて、N-[(3-フルオロフェニル)メチル]-1-[1-[5-[2-(4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボキサミド二塩酸塩(12、370mg、639.66μmol、98%の収率)を白色の固体として得た。LCMS (ES+): m/z 498.3 [M + H]+
実施例75
1-[1-[4-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]アセチル]-4-ピペリジル]エチニル]-1-ナフチル]エチル]-N-[(3-フルオロフェニル)メチル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物102)の合成
Figure 2023545507000447
DMF(0.5mL)中のN-[(3-フルオロフェニル)メチル]-1-[1-[4-[2-(4-ピペリジル)エチニル]-1-ナフチル]エチル]ピペリジン-4-カルボキサミド(30mg、51.35μmol)及び2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]酢酸(23.51mg、51.35μmol)の撹拌された溶液に、DIPEA(5当量)及びHATU(2.0当量)を加え、反応混合物を室温で5時間撹拌した。反応が完了したら、反応混合物を氷冷水(10ml)で希釈し、固体沈殿物を濾過し、真空下で乾燥させた。粗生成物を分取HPLC(NHOAc法)により精製して、1-[1-[4-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]アセチル]-4-ピペリジル]エチニル]-1-ナフチル]エチル]-N-[(3-フルオロフェニル)メチル]ピペリジン-4-カルボキサミド(15mg、15.05μmol、29%の収率)を得た。LC-MS (ES+): m/z 901.5 [M + H]+1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.11 (s, 1H), 8.49 (d, J = 7.1 Hz, 1H), 8.43 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 8.37-8.20 (m, 2H), 8.09 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 7.85 (dd, J = 8.3, 7.0 Hz, 1H), 7.75-7.42 (m, 4H), 7.45-7.21 (m, 2H), 7.13-6.82 (m, 4H), 5.40 (d, J = 12.1 Hz, 1H), 4.25 (d, J = 6.0 Hz, 2H), 4.21-4.07 (m, 1H), 4.05-3.80 (m, 2H), 3.62-3.38 (m, 6H), 3.30-3.18 (m, 1H), 3.21-2.57 (m, 6H), 2.38-2.26 (m, 2H), 2.24-1.46 (m, 15H), 1.38 (d, J = 6.5 Hz, 3H)。
化合物102の合成に従って、化合物103、化合物104、及び化合物105を調製した。
実施例76
1-[1-[4-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]-1-ピペリジル]アセチル]-4-ピペリジル]エチニル]-1-ナフチル]エチル]-N-[(3-フルオロフェニル)メチル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物103)
Figure 2023545507000448
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.11 (s, 1H), 8.48 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 8.35-8.19 (m, 2H), 8.00 (d, J = 7.3 Hz, 1H), 7.84 (d, J = 8.7 Hz, 1H), 7.70 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 7.62 (d, J = 7.5 Hz, 1H), 7.59-7.42 (m, 4H), 7.37-7.27 (m, 1H), 7.15 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.09-6.84 (m, 4H), 5.44 (dd, J = 12.9, 5.4 Hz, 1H), 4.24 (d, J = 5.9 Hz, 2H), 4.21-4.09 (m, 1H), 4.06-3.76 (m, 2H), 3.56-3.36 (m, 1H), 3.30-3.16 (m, 2H), 3.17-3.08 (m, 1H), 3.02 (d, J = 10.1 Hz, 3H), 2.96-2.86 (m, 1H), 2.86-2.54 (m, 4H), 2.41-2.23 (m, 2H), 2.22-1.42 (m, 15H), 1.38 (d, J = 6.5 Hz, 3H)。LC-MS (ES+): m/z 901.4 [M + H]+
実施例77
1-[1-[5-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-6-イル]-1-ピペリジル]アセチル]-4-ピペリジル]エチニル]-1-ナフチル]エチル]-N-[(3-フルオロフェニル)メチル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物104)
Figure 2023545507000449
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.13 (s, 1H), 8.47 (dd, J = 23.9, 8.6 Hz, 3H), 8.30 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 8.18 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 8.09 (t, J = 7.1 Hz, 1H), 7.86 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 7.65 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 7.62-7.42 (m, 4H), 7.35 (ddd, J = 14.0, 9.1, 6.7 Hz, 3H), 7.04 (ddd, J = 19.1, 13.4, 8.7 Hz, 5H), 5.44 (d, J = 12.6 Hz, 1H), 4.25 (d, J = 6.0 Hz, 3H), 4.21-4.08 (m, 1H), 3.95 (s, 2H), 3.60-3.35 (m, 2H), 2.98 (d, J = 18.8 Hz, 4H), 2.87-2.57 (m, 4H), 2.36-2.20 (m, 3H), 2.22-1.44 (m, 12H), 1.40 (d, J = 6.4 Hz, 4H)。
LC-MS (ES+): m/z 901.4 [M + H]+
実施例78
1-[1-[5-[2-[1-[2-[4-[1-(2,6-ジオキソ-3-ピペリジル)-2-オキソ-ベンゾ[cd]インドール-5-イル]-1-ピペリジル]アセチル]-4-ピペリジル]エチニル]-1-ナフチル]エチル]-N-[(3-フルオロフェニル)メチル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物105)
Figure 2023545507000450
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.11 (s, 1H), 8.49 (d, J = 8.7 Hz, 1H), 8.29 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 8.18 (d, J = 8.3 Hz, 1H), 8.00 (d, J = 7.3 Hz, 1H), 7.85 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 7.70 (d, J = 7.4 Hz, 1H), 7.64 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 7.60-7.42 (m, 3H), 7.38-7.25 (m, 1H), 7.15 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.09-6.88 (m, 3H), 5.44 (dd, J = 12.9, 5.4 Hz, 1H), 4.24 (d, J = 5.9 Hz, 2H), 4.21-4.08 (m, 1H), 3.96 (d, J = 12.8 Hz, 2H), 3.38 (s, 3H), 3.28 (s, 2H), 3.02 (s, 3H), 2.83-2.69 (m, 2H), 2.70-2.58 (m, 3H), 2.39-2.23 (m, 2H), 2.24-1.44 (m, 14H), 1.39 (d, J = 6.5 Hz, 3H)。
LC-MS (ES+): m/z 901.4 [M + H]+
本明細書に引用される全ての刊行物及び特許出願は、個々の刊行物又は特許出願がそれぞれ具体的かつ個別に引用することにより本明細書の一部をなすことが示されるかのように、引用することにより本明細書の一部をなす。
上記の発明は、理解を明確にする目的で説明及び例として幾らか詳細に記載しているが、当業者には、本発明の教示を踏まえることで、特許請求の範囲及び実施形態に規定される本発明の趣旨又は範囲から逸脱することなく、或る特定の変更及び修正をそれに加えることができることが容易に明らかである。

Claims (190)

  1. 式:
    Figure 2023545507000451
    (式中、
    前記三環式セレブロンリガンドは、以下の部分の1つから選択され、ここで、角括弧付きの結合は、前記三環式部分が、環-A、環-B、環-C、又は環-D上の共有結合を介して前記スペーサー/リンカーに取り付けられていることを示し、
    Figure 2023545507000452
    Figure 2023545507000453
    Figure 2023545507000454
    Figure 2023545507000455
    Figure 2023545507000456
    Figure 2023545507000457
    Figure 2023545507000458
    Figure 2023545507000459
    Figure 2023545507000460
    Figure 2023545507000461
    Figure 2023545507000462
    Figure 2023545507000463
    Figure 2023545507000464
    Figure 2023545507000465
    Figure 2023545507000466
    Figure 2023545507000467
    Figure 2023545507000468
    Figure 2023545507000469
    Figure 2023545507000470
    Figure 2023545507000471
    Figure 2023545507000472
    nは、0、1、又は2であり、
    Xは、NR10、NR6’、O、又はSであり、
    X’は、NR10、O、CH、又はSであり、
    Qは、CR又はNであり、
    Q’及びQ’’は、独立して、CR及びNからなる群から選択され、
    環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルからなる群から選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されており、
    環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルからなる群から選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されており、
    環-Cは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルからなる群から選択される縮合環であり、ここで、各環-Cは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されており、
    環-Dは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルからなる群から選択される縮合環であり、ここで、各環-Dは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されており、
    及びRは、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、ニトロ、ヘテロアリール、アリール、及び複素環からなる群から選択され、又は代替的には、価数及び安定性によって許容される場合に、R若しくはRは、=O、=S、若しくは=NR41等の二価の部分であってもよく、かつR基は、適切かつ所望であれば、任意に別のR基若しくはR基と一緒になって、環-A及び環-B又は環-C及び環-Dを架橋し得る縮合環若しくは二環を形成してもよく、
    は、水素、アルキル、ハロゲン、又はハロアルキルであり、
    又はR及びRは一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成し、
    又はR及びRは一緒になって、1炭素連結部、2炭素連結部、3炭素連結部、又は4炭素連結部を形成し、
    又はR及びRに隣接するR基は一緒になって、二重結合を形成し、
    及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルからなる群から選択され、
    及びRは、独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、及び-NR1011からなる群から選択され、
    ’は、水素、アルキル、又はハロアルキルであり、
    又はR及びR’は一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成し、
    10及びR11は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)R12、-S(O)R12、及び-SO12からなる群から選択され、
    各R12は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-NR1314、及びOR13からなる群から選択され、
    13及びR14は、それぞれの場合に、独立して、水素、アルキル、及びハロアルキルからなる群から選択され、
    スペーサーは、構造:
    Figure 2023545507000473
    の二価の接続部分であり、
    は、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-からなる群から選択される二価の部分であるか、又はアリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルであり得て、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されていてもよく、
    15、R16、R17、及びR18は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4041)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、アリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルからなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
    ここで、X及びR15~R18は一緒になって、前記三環式セレブロンリガンドと前記リンカーとを共有結合により接続する安定した部分であり、
    26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
    27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
    40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(脂肪族)、-N(脂肪族)、-NHSO(脂肪族)、-N(脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、オキソ、及びシクロアルキルからなる群から選択され、
    41は、脂肪族、アリール、ヘテロアリール、又は水素であり、
    標的化リガンドは、標的タンパク質に結合する部分であり、かつ前記リンカー-スペーサーを介して前記三環式セレブロンリガンドに共有結合により連結されており、
    標的タンパク質は、疾患を引き起こす又はその一因となる選択されたタンパク質であり、かつ、
    リンカーは、二価の連結基である)の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  2. 式:
    Figure 2023545507000474
    (式中、
    角括弧付きの結合は、前記三環式部分が、環-A又は環-B上の共有結合を介して前記スペーサー/リンカーに取り付けられていることを示し、
    nは、0、1、又は2であり、
    環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルからなる群から選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されており、
    環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員~8員の複素環、5員~8員のシクロアルキル、又は5員~8員のシクロアルケニルからなる群から選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されており、
    及びRは、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、ハロゲン、ハロアルキル、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011、シアノ、ニトロ、ヘテロアリール、アリール、及び複素環からなる群から選択され、又は代替的には、価数及び安定性によって許容される場合に、R若しくはRは、=O、=S、若しくは=NR41等の二価の部分であってもよく、かつR基は、適切かつ所望であれば、任意に別のR基若しくはR基と一緒になって、環-A及び環-B又は環-C及び環-Dを架橋し得る縮合環若しくは二環を形成してもよく、
    は、水素、アルキル、ハロゲン、又はハロアルキルであり、
    又はR及びRは一緒になって、1炭素連結部又は2炭素連結部を形成し、
    又はR及びRは一緒になって、1炭素連結部、2炭素連結部、3炭素連結部、又は4炭素連結部を形成し、
    又はR及びRに隣接するR基は一緒になって、二重結合を形成し、
    10及びR11は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)R12、-S(O)R12、及び-SO12からなる群から選択され、
    各R12は、独立して、水素、アルキル、ハロアルキル、複素環、アリール、ヘテロアリール、-NR1314、及びOR13からなる群から選択され、
    13及びR14は、それぞれの場合に、独立して、水素、アルキル、及びハロアルキルからなる群から選択され、
    スペーサーは、構造:
    Figure 2023545507000475
    の二価の接続部分であり、
    は、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-からなる群から選択される二価の部分であるか、又はアリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルであり得て、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されていてもよく、
    15、R16、R17、及びR18は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4041)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、アリールアルキル、複素環アルキル、及びヘテロアリールアルキルからなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
    ここで、X及びR15~R18は一緒になって、前記三環式セレブロンリガンドと前記リンカーとを共有結合により接続する安定した部分であり、
    26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
    27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
    40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(脂肪族)、-N(脂肪族)、-NHSO(脂肪族)、-N(脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、オキソ、及びシクロアルキルからなる群から選択され、
    41は、脂肪族、アリール、ヘテロアリール、又は水素であり、
    標的化リガンドは、標的タンパク質に結合する部分であり、かつ前記リンカー-スペーサーを介して前記三環式セレブロンリガンドに共有結合により連結されており、ここで、前記標的化リガンドは、以下の部分構造:
    Figure 2023545507000476
    を含まず、
    標的タンパク質は、in vivoで治療される疾患を引き起こす又はその一因となる選択されたタンパク質であり、ここで、標的タンパク質は、PTPアーゼではなく、かつ、
    リンカーは、二価の連結基である)の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  3. 前記標的タンパク質は、AATK、ABL、ABL2、ALK、AXL、BLK、BMX、CSF1R、CSK、DDR1、DDR2、EGFR、EPHA1、EPHA2、EPHA3、EPHA4、EPHA5、EPHA6、EPHA7、EPHA8、EPHA10、EPHB1、EPHB2、EPHB3、EPHB4、EPHB6、ERBB2、ERBB3、ERBB4、FER、FES、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FGR、FLT1、FLT3、FLT4、FRK、FYN、GSG2、HCK、IGF1R、ILK、INSR、INSRR、ITK、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KSR1、LCK、LMTK2、LMTK3、LTK、LYN、MATK、MERTK、MET、MLTK、MST1R、MUSK、NPR1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PDGFRA、PDGFRB、PLK4、PTK2、PTK2B、PTK6、PTK7、RET、ROR1、ROR2、ROS1、RYK、SGK493、SRC、SRMS、STYK1、SYK、TEC、TEK、TEX14、TIE1、TNK1、TNK2、TNNI3K、TXK、TYK2、TYRO3、YES1、及びZAP70から選択される、請求項1又は2に記載の化合物。
  4. 前記標的タンパク質は、セリンキナーゼ又はトレオニンキナーゼである、請求項1又は2に記載の化合物。
  5. 前記標的タンパク質は、カゼインキナーゼ2、プロテインキナーゼA、プロテインキナーゼB、プロテインキナーゼC、Rafキナーゼ、CaMキナーゼ、AKT1、AKT2、AKT3、ALK1、ALK2、ALK3、ALK4、オーロラA、オーロラB、オーロラC、CHK1、CHK2、CLK1、CLK2、CLK3、DAPK1、DAPK2、DAPK3、DMPK、ERK1、ERK2、ERK5、GCK、GSK3、HIPK、KHS1、LKB1、LOK、MAPKAPK2、MAPKAPK、MNK1、MSSK1、MST1、MST2、MST4、NDR、NEK2、NEK3、NEK6、NEK7、NEK9、NEK11、PAK1、PAK2、PAK3、PAK4、PAK5、PAK6、PIM1、PIM2、PLK1、RIP2、RIP5、RSK1、RSK2、SGK2、SGK3、SIK1、STK33、TAO1、TAO2、TGF-β、TLK2、TSSK1、TSSK2、ULK1、及びULK2から選択される、請求項1又は2に記載の化合物。
  6. 前記標的タンパク質は、サイクリン依存性キナーゼである、請求項1又は2に記載の化合物。
  7. 前記標的タンパク質は、CDK1、CDK2、CDK3、CDK4、CDK5、CDK6、CDK7、CDK8、CDK9、CDK10、CDK11、CDK12、及びCDK13から選択される、請求項1又は2に記載の化合物。
  8. 前記標的タンパク質は、BETブロモドメイン含有タンパク質である、請求項1又は2に記載の化合物。
  9. 前記標的タンパク質は、ASH1L、ATAD2、BAZ1A、BAZ1B、BAZ2A、BAZ2B、BRD1、BRD2、BRD3、BRD4、BRD5、BRD6、BRD7、BRD8、BRD9、BRD10、BRDT、BRPF1、BRPF3、BRWD3、CECR2、CREBBP、EP300、FALZ、GCN5L2、KIAA1240、LOC93349、MLL、PB1、PCAF、PHIP、PRKCBP1、SMARCA2、SMARCA4、SP100、SP110、SP140、TAF1、TAF1L、TIF1a、TRIM28、TRIM33、TRIM66、WDR9、ZMYND11、及びMLL4から選択される、請求項1又は2に記載の化合物。
  10. 前記標的タンパク質は、核タンパク質である、請求項1又は2に記載の化合物。
  11. 前記標的タンパク質は、アンテナペディアホメオドメインタンパク質、BRCA1、BRCA2、CCAAT増強結合性タンパク質、ヒストン、ポリコーム群タンパク質、高移動度群タンパク質、テロメア結合タンパク質、FANCA、FANCD2、FANCE、FANCF、肝細胞核因子、Mad2、NF-κB、核内受容体コアクチベーター、CREB結合タンパク質、p55、p107、p130、Rbタンパク質、p53、c-fos、c-jun、c-mdm2、c-myc、及びc-relから選択される、請求項1又は2に記載の化合物。
  12. 前記標的タンパク質は、レチノイドx受容体タンパク質である、請求項1又は2に記載の化合物。
  13. 前記標的タンパク質は、ホスファターゼである、請求項1又は2に記載の化合物。
  14. 前記標的タンパク質は、アンドロゲン受容体である、請求項1又は2に記載の化合物。
  15. 前記標的タンパク質は、エストロゲン受容体である、請求項1又は2に記載の化合物。
  16. 前記標的タンパク質は、ウイルスタンパク質である、請求項1又は2に記載の化合物。
  17. 前記標的タンパク質は、ウイルスプロテアーゼ、ウイルスインテグラーゼ、又はウイルス非構造タンパク質である、請求項1又は2に記載の化合物。
  18. 前記標的タンパク質は、HIVプロテアーゼ、HIVインテグラーゼ、HCVプロテアーゼ、コロナウイルス非構造タンパク質、又はコロナウイルス非構造タンパク質3である、請求項1又は2に記載の化合物。
  19. 前記標的タンパク質は、BaDHFR、HSP90、HDM2、MDM2、DOTL1、CBP、WDR5、SHOC2、UCHL1、USP6、USP30、USP1、USP2、USP4、USP7、USP8、USP9、USP10、USP11、USP13、USP14、USP17、USP28、又はSMRCA2である、請求項1又は2に記載の化合物。
  20. 前記標的タンパク質は、CK1a、GSPT1、STATタンパク質、SALL4、PLZF、p63、NRAS、BRD9、P13KCA、RET、RIT1ARID1B、P300、ARID2、FAM38、NSD2、EGFR、WRN、NTRK、ADAR、SOS1、WDR5、ALK、CTNNB1、FGFR、ROS1、MYD88、TBXT、PTP4A3、MET、USP7、NRF2、SF3B1、IKZF1、IKZF2、IKZF3、IKZF4、IKZF5、MEN1、JCV、CYP17A1、BKV、MEK1、MEK2、ERK1、ERK2、ERBB3、GRB2、CBP、ATAD2、BAP1、BRPF1、BRD4、KMT2D、メニン、MLLT1、DOT1L、NSD2、NSD3、TAF1、及びPPM1Dである、請求項1又は2に記載の化合物。
  21. 前記標的タンパク質は、レチノイドX受容体(RXR)、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)、バチルス・アンシラシスのジヒドロ葉酸レダクターゼ(BaDHFR)、熱ショックタンパク質90(HSP90)、チロシンキナーゼ、オーロラキナーゼ、ALK、ABL、MET、mTORC1、mTORC2、肥満細胞/幹細胞成長因子受容体(SCFR)、IGF1R、HDM2、MDM2、HDAC、RAF受容体、アンドロゲン受容体、エストロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、HIVプロテアーゼ、HIVインテグラーゼ、AP1、AP2、MCL-1、IDH1、MERTK、MER、EGFR、FLT3、サイクリン依存性キナーゼ9(CDK9)、サイクリン依存性キナーゼ12、サイクリン依存性キナーゼ13、糖質コルチコイド受容体、RasG12C、Her3、Bcl-2、Bcl-XL、PPAR-ガンマ、BCR-ABL、LRRK2、PDGFRα、RET、脂肪酸結合タンパク質、5-リポキシゲナーゼ活性化タンパク質(FLAP)、クリングルドメインV 4BVV、ラクトイルグルタチオンリアーゼ、mPGES-1、第Xa因子、カリクレイン7、カテプシンK、カテプシンL、カテプシンS、MTH1、MDM4、PARP1、PARP2、PARP3、PARP14、PARP15、PDZドメイン、ホスホリパーゼA2ドメイン、タンパク質S100-A7 2WOS、サポシン-B、Sec7、pp60 Src、Tank1、Ubc9 SUMO E2リガーゼSF6D、Src、Src-AS1、Src-AS2、JAK3、MEK1、KIT、KSR1、CTNNB1、BCL6、PAK1、PAK4、TNIK、MEN1、ERK1、IDO1、CBP、ASH1L、ATAD2、BAZ2A、BAZ2B、BDRT、BDR9、SMARCA4、PB1、TRIM24(TIF1a)、BRPF1、CECR2、CREBBP、PCAF、PHIP、TAF1、ヒストンデアセチラーゼ2、ヒストンデアセチラーゼ4、ヒストンデアセチラーゼ6、ヒストンデアセチラーゼ7、ヒストンデアセチラーゼ8、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT2B)、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT2A)、B型ヒストンアセチルトランスフェラーゼ触媒ユニット(HAT1)、サイクリックAMP依存性転写因子(ATF2)、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(KAT5)、リジン特異的ヒストンデメチラーゼ1A(KDM1A)、DOT1L、EHMT1、SETD2、SETD7、SETD8、SETDB1、SMYD2、SMYD3、SUV4-20H1、ErbB2受容体、ErbB4受容体、VEGFR1受容体、VEGFR2受容体、VEGFR3受容体、PDGFRβ受容体、受容体、Lyn受容体、Hck受容体、c-Met受容体、TrkB受容体、Axl受容体、Tie2受容体、Ros1受容体、HGFR受容体、MST1R受容体、Lck受容体、Yes受容体、PNET受容体、RCC受容体、RAML受容体、SEGA受容体、PDGFR受容体、ErbB2受容体、FGFR1受容体、FGFR2受容体、FGFR3受容体、FGFR4受容体、PDGRF受容体、DDR1受容体、PDGRα受容体、PDGRβ受容体、CDK4受容体、CDK6受容体、Fms受容体、T315I VEGFR受容体、FGFR受容体、Flt3受容体、Eph2A受容体、JAK1受容体、FKBP12受容体、mTOR受容体、CDK8受容体、CSF-1R受容体、MEK2受容体、Brk受容体、PI3Ka受容体、GCN5受容体、G9a(EHMT2)、EZH2、EED、PRMT3、PRMT4、PRMT5、PRMT6、KDM1、KDM4、KDM5、KDM6、L3MBTL3、メニン、HDAC6、HDAC7、PTP1B、SHP2、スカベンジャーmRNAデキャッピング酵素DcpS、ALK、NTRK1、NTRK2、NTRK3、IDO、ERK2、ABL1、ABL2、ATK1、ATK2、BMX、EPHA3、EPHA4、EPHA7、EPHB4、FES、FYN、GSG2、INSR、HBV、CBL-B、ERK、WDR5、NSP3、NRAS、ADAR、NSD2、WHSC1、RIT1、WRN、BAP1、HIF2α、GRB2、KMT2D、MLL2、MLL4、MLLT1、ENL、NSD3、PPM1D、WIP1、SOS1、TBXT、ブラキウリ、USP7、BKV、JCV、CK1α、GSPT1、ERF3、IFZV、TAU、CYP17A1、SALL4、FAM38、CYP20A1、NRF2、NFE2L2、P300、PIK3CA、TCPTP、STAT3、MyD88、PTP4A3、SF3B1、ARID1B、又はARID2である、請求項1又は2に記載の化合物。
  22. 前記標的化リガンドは、図中に記載される構造から選択され、任意に1個、2個、3個、又は4個のR40置換基で置換されている、請求項21に記載の化合物。
  23. 環-Aは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている、請求項1又は2に記載の化合物。
  24. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである、請求項1又は2に記載の化合物。
  25. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである、請求項1又は2に記載の化合物。
  26. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである、請求項1又は2に記載の化合物。
  27. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である、請求項1又は2に記載の化合物。
  28. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である、請求項1又は2に記載の化合物。
  29. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員の複素環である、請求項1又は2に記載の化合物。
  30. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員の複素環である、請求項1又は2に記載の化合物。
  31. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである、請求項1又は2に記載の化合物。
  32. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである、請求項1又は2に記載の化合物。
  33. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員のシクロアルキルである、請求項1又は2に記載の化合物。
  34. 環-Aは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員のシクロアルキルである、請求項1又は2に記載の化合物。
  35. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されたフェニルである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  36. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のヘテロアリールである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  37. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のヘテロアリールである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  38. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員の複素環である、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  39. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員の複素環である、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  40. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員の複素環である、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  41. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員の複素環である、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  42. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された5員のシクロアルキルである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  43. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された6員のシクロアルキルである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  44. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された7員のシクロアルキルである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  45. 環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換された8員のシクロアルキルである、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  46. 環-Bは、フェニル、5員若しくは6員のヘテロアリール、5員若しくは6員の複素環、5員若しくは6員のシクロアルキル、又は5員若しくは6員のシクロアルケニルから選択される縮合環であり、ここで、環-Bは、価数によって許容される場合に、Rから独立して選択される1個、2個、又は3個の置換基で任意に置換されている、請求項1~34のいずれか一項に記載の化合物。
  47. は、水素である、請求項1~46のいずれか一項に記載の化合物。
  48. は、アルキルである、請求項1~46のいずれか一項に記載の化合物。
  49. は、ハロゲンである、請求項1~46のいずれか一項に記載の化合物。
  50. は、ハロアルキルである、請求項1~46のいずれか一項に記載の化合物。
  51. は、水素である、請求項1~50のいずれか一項に記載の化合物。
  52. は、ハロゲン、ハロアルキル、又はアルキルである、請求項1~50のいずれか一項に記載の化合物。
  53. は、-OR10、-SR10、又は-NR1011である、請求項1~50のいずれか一項に記載の化合物。
  54. は、-S(O)R12、-SO12である、請求項1~50のいずれか一項に記載の化合物。
  55. 三環式セレブロンリガンドは、
    Figure 2023545507000477
    Figure 2023545507000478
    から選択される、請求項1及び3~54のいずれか一項に記載の化合物。
  56. 三環式セレブロンリガンドは、
    Figure 2023545507000479
    Figure 2023545507000480
    Figure 2023545507000481
    から選択される、請求項1及び3~54のいずれか一項に記載の化合物。
  57. 前記化合物は、
    Figure 2023545507000482
    から選択される、請求項2~22のいずれか一項に記載の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  58. 4個のR置換基が存在する、請求項1~57のいずれか一項に記載の化合物。
  59. 3個のR置換基が存在する、請求項1~57のいずれか一項に記載の化合物。
  60. 2個のR置換基が存在する、請求項1~57のいずれか一項に記載の化合物。
  61. 1個のR置換基が存在する、請求項1~57のいずれか一項に記載の化合物。
  62. 前記R基は、独立して、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される、請求項1~61のいずれか一項に記載の化合物。
  63. 前記R基は、独立して、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011から選択される、請求項1~61のいずれか一項に記載の化合物。
  64. 前記R基は、独立して、ハロゲン及びハロアルキルから選択される、請求項1~61のいずれか一項に記載の化合物。
  65. は、ヘテロアリール、アリール、及び複素環から選択される、請求項1~61のいずれか一項に記載の化合物。
  66. 2個のR置換基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する、請求項1~60のいずれか一項に記載の化合物。
  67. 少なくとも1個のRは、アルキルである、請求項1~61のいずれか一項に記載の化合物。
  68. 少なくとも1個のRは、ハロゲンである、請求項1~61のいずれか一項に記載の化合物。
  69. 前記化合物は、
    Figure 2023545507000483
    (式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、請求項2~22のいずれか一項に記載の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  70. 前記化合物は、
    Figure 2023545507000484
    (式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、請求項2~22のいずれか一項に記載の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  71. 前記化合物は、
    Figure 2023545507000485
    (式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、請求項2~22のいずれか一項に記載の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  72. 前記化合物は、
    Figure 2023545507000486
    (式中、Q、Q、及びQは、独立して、CH、CR、及びNから選択され、かつ他の全ての可変部は、本明細書において定義される通りである)から選択される、請求項2~22のいずれか一項に記載の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  73. は、CRである、請求項69~72のいずれか一項に記載の化合物。
  74. は、Nである、請求項69~72のいずれか一項に記載の化合物。
  75. は、CRである、請求項69~74のいずれか一項に記載の化合物。
  76. は、Nである、請求項69~74のいずれか一項に記載の化合物。
  77. は、CRである、請求項69~76のいずれか一項に記載の化合物。
  78. は、Nである、請求項69~76のいずれか一項に記載の化合物。
  79. 3個のR置換基が存在する、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物。
  80. 2個のR置換基が存在する、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物。
  81. 1個のR置換基が存在する、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物。
  82. 前記R基は、独立して、アルキル、ハロゲン、及びハロアルキルから選択される、請求項1~81のいずれか一項に記載の化合物。
  83. 前記R基は、独立して、-OR10、-SR10、-S(O)R12、-SO12、-NR1011から選択される、請求項1~81のいずれか一項に記載の化合物。
  84. 前記R基は、独立して、ヘテロアリール、アリール、及び複素環から選択される、請求項1~81のいずれか一項に記載の化合物。
  85. 2個のR置換基は一緒になって、縮合フェニル環を形成する、請求項1~80のいずれか一項に記載の化合物。
  86. 少なくとも1個のRは、アルキルである、請求項1~81のいずれか一項に記載の化合物。
  87. 少なくとも1個のRは、ハロゲンである、請求項1~81のいずれか一項に記載の化合物。
  88. は、水素である、請求項1~87のいずれか一項に記載の化合物。
  89. は、アルキルである、請求項1~87のいずれか一項に記載の化合物。
  90. は、ハロアルキルである、請求項1~87のいずれか一項に記載の化合物。
  91. 及びRは一緒になって、1炭素連結部を形成する、請求項1~87のいずれか一項に記載の化合物。
  92. 及びRは一緒になって、2炭素連結部を形成する、請求項1~87のいずれか一項に記載の化合物。
  93. は、水素である、請求項1~90のいずれか一項に記載の化合物。
  94. は、アルキルである、請求項1~90のいずれか一項に記載の化合物。
  95. は、ハロアルキルである、請求項1~90のいずれか一項に記載の化合物。
  96. 少なくともの1つのRは、水素である、請求項1~95のいずれか一項に記載の化合物。
  97. 少なくともの1つのRは、アルキルである、請求項1~95のいずれか一項に記載の化合物。
  98. 少なくともの1つのRは、ハロアルキルである、請求項1~95のいずれか一項に記載の化合物。
  99. nは、0である、請求項1~95のいずれか一項に記載の化合物。
  100. nは、1である、請求項1~98のいずれか一項に記載の化合物。
  101. nは、2である、請求項1~98のいずれか一項に記載の化合物。
  102. リンカーは、式:
    Figure 2023545507000487
    (式中、
    及びXは、独立して、それぞれの場合に、結合、複素環、アリール、ヘテロアリール、二環、-NR27-、-CR4041-、-O-、-C(O)-、-C(NR27)-、-C(S)-、-S(O)-、-S(O)-、及び-S-から選択され、その複素環、アリール、ヘテロアリール、及び二環のそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で置換されており、
    20、R21、R22、R23、及びR24は、独立して、それぞれの場合に、結合、アルキル、-C(O)-、-C(O)O-、-OC(O)-、-SO-、-S(O)-、-C(S)-、-C(O)NR27-、-NR27C(O)-、-O-、-S-、-NR27-、-C(R4040)-、-P(O)(OR26)O-、-P(O)(OR26)-、二環、アルケン、アルキン、ハロアルキル、アルコキシ、アリール、複素環、脂肪族、ヘテロ脂肪族、ヘテロアリール、乳酸、グリコール酸、及び炭素環からなる群から選択され、そのそれぞれは、R40から独立して選択される1個、2個、3個、又は4個の置換基で任意に置換されており、
    26は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、アルケン、アルキン、アリール、ヘテロアリール、複素環、脂肪族、及びヘテロ脂肪族からなる群から選択され、
    27は、独立して、それぞれの場合に、水素、アルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、複素環、アリール、ヘテロアリール、-C(O)(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、-C(O)O(脂肪族、アリール、ヘテロ脂肪族、又はヘテロアリール)、アルケン、及びアルキンからなる群から選択され、
    40は、独立して、それぞれの場合に、水素、R27、アルキル、アルケン、アルキン、フルオロ、ブロモ、クロロ、ヒドロキシル、アルコキシ、アジド、アミノ、シアノ、-NH(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)、-NHSO(アルキルを含む脂肪族)、-N(アルキルを含む脂肪族)SOアルキル、-NHSO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-N(アルキル)SO(アリール、ヘテロアリール、又は複素環)、-NHSOアルケニル、-N(アルキル)SOアルケニル、-NHSOアルキニル、-N(アルキル)SOアルキニル、ハロアルキル、脂肪族、ヘテロ脂肪族、アリール、ヘテロアリール、複素環、及びシクロアルキルからなる群から選択され、かつ、
    41は、脂肪族、アリール、ヘテロアリール、又は水素である)のリンカーである、請求項1~101のいずれか一項に記載の化合物。
  103. Lは、式:
    Figure 2023545507000488
    のリンカーである、請求項102に記載の化合物。
  104. は、結合である、請求項102又は103に記載の化合物。
  105. は、複素環である、請求項102又は103に記載の化合物。
  106. は、NRである、請求項102又は103に記載の化合物。
  107. は、C(O)である、請求項102又は103に記載の化合物。
  108. は、結合である、請求項102~107のいずれか一項に記載の化合物。
  109. は、複素環である、請求項102~107のいずれか一項に記載の化合物。
  110. は、NRである、請求項102~107のいずれか一項に記載の化合物。
  111. は、C(O)である、請求項102~107のいずれか一項に記載の化合物。
  112. 20は、結合である、請求項102~111のいずれか一項に記載の化合物。
  113. 20は、CHである、請求項102~111のいずれか一項に記載の化合物。
  114. 20は、複素環である、請求項102~111のいずれか一項に記載の化合物。
  115. 20は、アリールである、請求項102~111のいずれか一項に記載の化合物。
  116. 20は、フェニルである、請求項102~111のいずれか一項に記載の化合物。
  117. 20は、二環である、請求項102~111のいずれか一項に記載の化合物。
  118. 21は、結合である、請求項102~117のいずれか一項に記載の化合物。
  119. 21は、CHである、請求項102~117のいずれか一項に記載の化合物。
  120. 21は、複素環である、請求項102~117のいずれか一項に記載の化合物。
  121. 21は、アリールである、請求項102~117のいずれか一項に記載の化合物。
  122. 21は、フェニルである、請求項102~117のいずれか一項に記載の化合物。
  123. 21は、二環である、請求項102~117のいずれか一項に記載の化合物。
  124. リンカーは、式:
    Figure 2023545507000489
    のリンカーである、請求項102に記載の化合物。
  125. 22は、結合である、請求項102~124のいずれか一項に記載の化合物。
  126. 22は、CHである、請求項102~124のいずれか一項に記載の化合物。
  127. 22は、複素環である、請求項102~124のいずれか一項に記載の化合物。
  128. 22は、アリールである、請求項102~124のいずれか一項に記載の化合物。
  129. 22は、フェニルである、請求項102~124のいずれか一項に記載の化合物。
  130. 22は、二環である、請求項102~124のいずれか一項に記載の化合物。
  131. リンカーは、式:
    Figure 2023545507000490
    のリンカーである、請求項102に記載の化合物。
  132. 23は、結合である、請求項102~131のいずれか一項に記載の化合物。
  133. 23は、CHである、請求項102~131のいずれか一項に記載の化合物。
  134. 23は、複素環である、請求項102~131のいずれか一項に記載の化合物。
  135. 23は、アリールである、請求項102~131のいずれか一項に記載の化合物。
  136. 23は、フェニルである、請求項102~131のいずれか一項に記載の化合物。
  137. 23は、二環である、請求項102~131のいずれか一項に記載の化合物。
  138. リンカーは、式:
    Figure 2023545507000491
    のリンカーである、請求項102に記載の化合物。
  139. 24は、結合である、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  140. 24は、CHである、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  141. 24は、複素環である、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  142. 24は、アリールである、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  143. 24は、フェニルである、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  144. 24は、二環である、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  145. 24は、C(O)である、請求項102~138のいずれか一項に記載の化合物。
  146. リンカーは、
    Figure 2023545507000492
    から選択される、請求項1~145のいずれか一項に記載の化合物。
  147. スペーサーは、式:
    Figure 2023545507000493
    の二価の接続部分である、請求項1~146のいずれか一項に記載の化合物。
  148. は、結合である、請求項1~147のいずれか一項に記載の化合物。
  149. は、複素環である、請求項1~147のいずれか一項に記載の化合物。
  150. は、NRである、請求項1~147のいずれか一項に記載の化合物。
  151. は、C(O)である、請求項1~147のいずれか一項に記載の化合物。
  152. 15は、結合である、請求項1~151のいずれか一項に記載の化合物。
  153. 15は、CHである、請求項1~151のいずれか一項に記載の化合物。
  154. 15は、複素環である、請求項1~151のいずれか一項に記載の化合物。
  155. 15は、アリールである、請求項1~151のいずれか一項に記載の化合物。
  156. 15は、フェニルである、請求項1~151のいずれか一項に記載の化合物。
  157. 15は、二環である、請求項1~151のいずれか一項に記載の化合物。
  158. 16は、結合である、請求項1~157のいずれか一項に記載の化合物。
  159. 16は、CHである、請求項1~157のいずれか一項に記載の化合物。
  160. 16は、複素環である、請求項1~157のいずれか一項に記載の化合物。
  161. 16は、アリールである、請求項1~157のいずれか一項に記載の化合物。
  162. 16は、フェニルである、請求項1~157のいずれか一項に記載の化合物。
  163. 16は、二環である、請求項1~157のいずれか一項に記載の化合物。
  164. 17は、結合である、請求項1~163のいずれか一項に記載の化合物。
  165. 17は、CHである、請求項1~163のいずれか一項に記載の化合物。
  166. 17は、複素環である、請求項1~163のいずれか一項に記載の化合物。
  167. 17は、アリールである、請求項1~163のいずれか一項に記載の化合物。
  168. 17は、フェニルである、請求項1~163のいずれか一項に記載の化合物。
  169. 17は、二環である、請求項1~163のいずれか一項に記載の化合物。
  170. 18は、結合である、請求項1~169のいずれか一項に記載の化合物。
  171. 18は、CHである、請求項1~169のいずれか一項に記載の化合物。
  172. 18は、複素環である、請求項1~169のいずれか一項に記載の化合物。
  173. 18は、アリールである、請求項1~169のいずれか一項に記載の化合物。
  174. 18は、フェニルである、請求項1~169のいずれか一項に記載の化合物。
  175. 18は、二環である、請求項1~169のいずれか一項に記載の化合物。
  176. Figure 2023545507000494
    Figure 2023545507000495
    Figure 2023545507000496
    Figure 2023545507000497
    から選択される化合物、又はその薬学的に許容可能な塩。
  177. 請求項1~176のいずれか一項に記載の化合物又はその薬学的に許容可能な塩と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
  178. 治療を必要とする患者における前記標的タンパク質によって媒介される障害を治療する方法であって、有効量の請求項1~176のいずれか一項に記載の化合物又は請求項177に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  179. 前記患者は、ヒトである、請求項178に記載の方法。
  180. 前記障害は、異常な細胞増殖である、請求項178又は179に記載の方法。
  181. 前記障害は、神経変性障害である、請求項178又は179に記載の方法。
  182. 前記障害は、免疫系障害である、請求項178又は179に記載の方法。
  183. ヒトにおける前記標的タンパク質によって媒介される障害を治療する医薬の製造において使用される、請求項1~176のいずれか一項から選択される化合物若しくはその薬学的に許容可能な塩又は組成物。
  184. 前記障害は、異常な細胞増殖である、請求項183に記載の使用のための化合物。
  185. 前記障害は、神経変性障害である、請求項183に記載の使用のための化合物。
  186. 前記障害は、免疫系障害である、請求項183に記載の使用のための化合物。
  187. ヒトにおける前記標的タンパク質によって媒介される障害の治療における、請求項1~176のいずれか一項から選択される化合物若しくはその薬学的に許容可能な塩又は組成物の使用。
  188. 前記障害は、異常な細胞増殖である、請求項187に記載の使用。
  189. 前記障害は、神経変性障害である、請求項187に記載の使用。
  190. 前記障害は、免疫系障害である、請求項187に記載の使用。
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