JP2023538925A - アデノ随伴ウイルスの収量を増加させるための核酸構築物及びその構築方法 - Google Patents

アデノ随伴ウイルスの収量を増加させるための核酸構築物及びその構築方法 Download PDF

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Abstract

アデノ随伴ウイルスの収量を増加させるための核酸構築物及びその構築方法に関し、核酸構築物は、アデノ随伴ウイルス(AAV)エレメント、及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含み、AAVエレメントは、Capタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含む。構築方法は、外来標的遺伝子を運ぶAAVエレメント及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込むことを含む。得られた本発明の組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)は、空カプシド率が低く、同時に単一細胞及び培養物の単位体積あたりのrAAV収量を増加させ、生産コストを削減し、スケールアップが容易である。

Description

本発明は、遺伝子導入ベクターの技術分野に関し、特にアデノ随伴ウイルスの収量を増加させるための核酸構築物及びその構築方法に関する。
組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)は、基礎研究や臨床遺伝子治療で広く使用されている遺伝子導入ベクターである。その安全性が高く、宿主細胞範囲が広く、免疫原性が低く、生体内で外来遺伝子を発現させる時間が長いなどの特徴から、rAAVは最も有望な遺伝子導入ベクターの1つと見なされており、世界中の遺伝子治療及びワクチン研究で広く使用されている。近年、ますます多くの研究者が大規模な動物研究及びヒト臨床試験にrAAVを使用している。AAVゲノムは、ITR配列、非構造タンパク質Rep、及び構造タンパク質Capの3つのコアエレメントを含む。
昆虫バキュロウイルス系は、組換えタンパク質を産生するための一般的な手段であり、従来のトリプルプラスミド一過性トランスフェクション法と比較して、昆虫細胞は、培養密度が高く、無血清浮遊培養が可能であり、スケールアップが容易であるという利点を有し、また、バキュロウイルス感染細胞の産生方法はバッチ安定性がより高い。研究者は2002年からrAAVの産生にそれを使用し始めたが、昆虫細胞では、Cap、Rep、及びAAVベクターゲノムDNAの比率が理想的な比率に達するのが容易ではなく、AAVのパッケージング効率が高くないなどの様々な理由により、従来の方法でパッケージングされた組換えAAVベクターは、空カプシド率が高い(11%~34%)(非特許文献1)。空カプシドAAVと標的遺伝子を運ぶAAVの物理的及び化学的特性が非常に類似しており、精製が非常に難しいため、空カプシドAAVは臨床グレードのAAVベクターの製造において除去しなければならない不純物である。
Benskey et al.2016 Smith RH,Levy JR,Kotin RM:A simplified baculovirus-AAV expression vector system coupled with one-step affinity purification yields high-titer rAAV stocks from insect cells.Mol Ther 2009,17(11):1888-1896.
上記の従来技術の欠点に鑑みて、本発明の目的は、従来技術の問題を解決するために、組換えアデノ随伴ウイルスの収量及び品質を向上させるための核酸構築物及びその構築方法を提供することである。
上記の目的及び他の関連する目的を達成するために、本発明の第1態様によって提供される核酸構築物は、AAVエレメント、IEタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びバキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドを含み、AAVエレメントはCapタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含む。
いくつかの実施形態では、IEタンパク質は、Acie0、Acie01、Acie02のうちの1つ以上の遺伝子によってコードされ、及び/又は、バキュロウイルス組換え相同領域は、hr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上から選択される。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、IEタンパク質遺伝子のプロモーターを更に含む。いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターは、Gp64、pH、p6.9又はp10のうちの1つ以上から選択される。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、バキュロウイルスプロモーターを更に含む。いくつかの実施形態では、バキュロウイルスプロモーターは、バキュロウイルス組換え相同領域に結合される。いくつかの実施形態では、バキュロウイルスプロモーターは、好ましくは、pH、Gp64、p6.9又はp10のうちの1つ以上である。
いくつかの実施形態では、AAVシスエレメントは、ITR配列から選択される。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、外来標的遺伝子を更に含む。いくつかの実施形態では、外来標的遺伝子はAAVエレメントに埋め込まれている。
いくつかの実施形態では、核酸構築物の構造は、IE遺伝子発現カセット-Cap遺伝子発現カセット-ITR-外来標的遺伝子発現カセット-ITR-Rep遺伝子発現カセットを含む。いくつかの実施形態では、核酸構築物の構造は、IE遺伝子発現カセット-Cap遺伝子発現カセット-ITR-外来標的遺伝子発現カセット-ITR-Rep遺伝子発現カセットである。
いくつかの実施形態では、核酸構築物のヌクレオチド配列は、配列番号1を含み、又は配列番号1と比較して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%の相同性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸構築物のヌクレオチド配列は、配列番号1に示される通りである。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、アデノ随伴ウイルスベクター又は組換えバキュロウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、核酸構築物は、アデノ随伴ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、核酸構築物は、組換えバキュロウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、組換えバキュロウイルスベクターは、好ましくは組換えバキュロウイルスシャトルベクターである。
本発明の第2態様は組換えバキュロウイルスを提供し、この組換えバキュロウイルスは、上記のいずれかの核酸構築物をバキュロウイルス系によって構築することによって得られるか、又は上記のいずれかの核酸構築物中の任意のエレメントを含む核酸構築物をバキュロウイルス系によって共同構築することによって得られる。
本発明の第3態様はアデノ随伴ウイルスを提供し、このアデノ随伴ウイルスは、上記のいずれかの組換えバキュロウイルスを細胞に感染させた後にパッケージングすることによって得られる。
本発明の第4態様は細胞株を提供し、この細胞株は、上記のいずれかの組換えバキュロウイルスに感染した細胞株である。
本発明の第5態様はアデノ随伴ウイルスベクター系を提供し、このアデノ随伴ウイルスベクター系は、バキュロウイルス系及び上記の核酸構築物を含む。
本発明の第6態様は上記の核酸構築物の構築方法を提供し、この構築方法は、外来標的遺伝子を運ぶAAVエレメント、IEタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びバキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込むことを含む。
上記方法は、以下の特徴のうちの1つ以上(例えば、2つ又は3つ)を含む。
1)AAVエレメントは、Capタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含み、例えば、AAVシスエレメントは、好ましくはITR配列である。
2)IEタンパク質をコードするポリヌクレオチドは、Acie0、Acie01又はAcie02のうちの1つ以上から選択される。
3)バキュロウイルスベクター骨格は、pFastBacdual、pFastBac1、pFastBacHTA、pFastBacHTB又はpFastBacHTCのうちの1つから選択される。
4)バキュロウイルス組換え相同領域は、hr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上から選択される。
本発明の第7態様はアデノ随伴ウイルスの収量を増加させるための産生方法を提供し、この産生方法は、組換えバキュロウイルスを昆虫細胞株に感染させる工程を含む。
上述のように、本発明のアデノ随伴ウイルスの収量を増加させるための核酸構築物及びその構築方法は、少なくとも以下の有益な効果を有する:
1)本発明は、バキュロウイルスベクターに挿入された標的遺伝子の昆虫細胞での発現を明らかに減少させ、昆虫細胞に対する標的遺伝子発現の影響を低減し、産生細胞の増殖指標を改善し、rAAVのパッケージングにより有利である。
2)従来の接着293及び293T細胞の産生、並びに従来のバキュロウイルス産生方法と比較して、この最適化されたベクター構築方法は、単一細胞及び培養物の単位体積あたりのrAAV収量を明らかに増加させ、生産コストを削減し、またスケールアップすることができる。
3)様々な規模、種類のアデノ随伴ウイルス遺伝子治療ベクターの製造など、幅広い応用が可能である。
本発明のpFBd-Cap-ITR-Repベクターの構造を示す概略図である。 本発明のpFBd-Cap-ITR-Repベクターのマップを示す概略図である。 本発明のpFBd-IE-hr1Cap-ITR-Repベクターの構造を示す概略図である。 本発明のpFBd-IE-hr1Cap-ITR-Repベクターのマップを示す概略図である。 本発明のBV-Cap-ITR-Rep及びBV-IE-hr1Cap-ITR-RepがSF9細胞に感染してから2~4日後のEGFP発現量の比較を示す図である。 2つのBV感染細胞溶解液に対する本発明のAAV Capモノクローナル抗体のWB検出を示す図である。 本発明のrAAV2の電子顕微鏡検出(力価2.0E+13VG/mL)を示す図である。 本発明のBV-Cap-ITR-Rep及びBV-IE-hr1Cap-ITR-RepでパッケージングされたrAAV2が293T細胞に感染してから2日後の蛍光観察を示す図である。
本発明は、少なくとも部分的には、AAVエレメント、IEタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びバキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物が、バキュロウイルスの宿主である昆虫細胞における挿入された標的遺伝子の発現を明らかに制御することができ、細胞状態を改善し、アデノ随伴ウイルスのパッケージング効率を高め、それによってアデノ随伴ウイルスの収量を大幅に増加させるという発見に基づいている。本発明は、rAAVの空カプシド率を予想外に低下させ(例えば、Capの発現量が増加しても、空カプシドの増加にはつながらない)、より優れた感染性を有するrAAVを産生し、単一細胞及び培養物の単位体積あたりのrAAV収量を明らかに増加させることができ、したがって、様々なアデノ随伴ウイルス遺伝子治療ベクターの大規模産生に適している。
以下に別段の定義がない限り、本明細書で言及されるすべての技術用語及び科学用語は、当業者によって一般的に理解される意味を有する。
「核酸構築物」という用語は、標的細胞又は組織に導入することができる人工的に構築された核酸セグメントを指し、核酸構築物はレンチウイルスベクター又はアデノ随伴ウイルスベクターであってもよく、レンチウイルスベクター又はアデノ随伴ウイルスベクターは、ベクター骨格、即ち空のベクター、及び発現カセットを含む。
「ベクター」という用語は、1つ以上の核酸又は1つ以上のポリヌクレオチドを標的細胞又は組織に導入又は移入するために使用される核酸断片又はポリヌクレオチド断片を指す。通常、ベクターは外来DNAを別の細胞又は組織に導入するために使用される。ベクターは、細菌中で増殖するための細菌耐性遺伝子及び生物体内で標的タンパク質を発現させるためのプロモーターを含むことができる。DNAは、PCR又は当業者に知られている任意の他の1種以上の適切な技術によってインビトロで生成することができる。
本発明の第1態様は核酸構築物を提供し、この核酸構築物は、AAVエレメント及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含み、AAVエレメントはCapタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含む。
一実施形態では、核酸構築物は、バキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドを更に含む。
いくつかの実施形態では、核酸構築物のヌクレオチド配列は、配列番号1を含み、又は配列番号1と比較して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%の相同性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、核酸構築物のヌクレオチド配列は、配列番号1に示される通りである。
配列番号1
TTCTCTGTCACAGAATGAAAATTTTTCTGTCATCTCTTCGTTATTAATGTTTGTAATTGACTGAATATCAACGCTTATTTGCAGCCTGAATGGCGAATGGGACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTC
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CCGCGTCGGCGTGGTTGTACTTGAGGTAAGGGTTGTCTCCGCTGTCGAGCTGCCGGTCGTAGGCTTTGTCGTGCTCGAGGGCAGCGGCGTCTGCCTCGTTCACCGGCTCTCCCTTGTCCAGTCCGTTGAAGGGTCCGAGGTACTTGTACCCGGGAAGCACAAGGCCCCTGCTGTCGTCCTTATGCCGCTCTGCGGGCTTTGGTGGTGGTGGGCCGGGTTTGAGCTTCCACCACTGTCTTATTCCTTCAGAGAGAGTGTCCTCGAGCCAATCGGGTAGATAACCGTCGGCAGCCGTGGCGGCTCAAGTCTTCGTCGAGTGATTGTAAATAAAATGTAATTTACAGTATAGTATTTTAATTAATATACAAATGATTTGATAATAATTCTTATTTAACTATAATATATTGTGTTGGGTTGAATTAAAGGTCCGTATCTCCAGACTGCAGTTTAAATTGTGTAATTTATGTAGCTGTAATTTTTACCTTATTAATATTTTTTACGCTTTGCATTCGACGACTGAACTCCCAAATATATGTTTAACTCGTCTTGGTCGTTTGAATTTTTGTTGCTGTGTTTCCTAATATTTTCCATCACCTTAAATATGTTATTGTAATCCTCAATGTTGAACTTGCAATTGGACACGGCATAGTTTTCCATAGTCGTGTAAAACATGGTATTGGCTGCATTGTAATACATCCGACTGAGCGGGTACGGATCTATGTGTTTGAGCAGCCTGTTCAAAAACTCTGCATCGTCGCAAAACGGAATTTGGTCACGATCCCGGTCCGAAGCGCGCGGAATTCAAAGCGCTACGTCAGCGACGTCATCGATTATTGCTCCAATACTAGGGTTTTGTTTTACTATCTGTTCTGCGGTCCACACATCTTCTTCGCTAGTCACGTACGCAAACAACTCGGGCCGCAAAGGTGTTTTAAAACATATCAGATTAGAATCTTTTATAACTTGGCCGCATTGTAAATAGTTGTGCCAACGCGCGGGAAACATTTTACACGTGCTTTCAATCTTATCTCATAAACGCAACTAAATATGATCCTTCAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAACGCACGATTAATTATGACTCATAAGCTGATGTCATGTTTTGCACACGGCTCATAACCGAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACGCGTAAAACACAATCAAGTATGAGTCATAAGCTGATGTCATGTTTTGCACACGGCTCATAACCGAACTGGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAACGCACGATCAGTGGATGATGTCATAAACTTATCTCATGTTTTGCACACGGCTCATAACTTGAGTCATAAGCTGATATCAGAAGATTATTAACGTGTTTAGGTATGACTCATTTGTTTTCAAAACTGAACTCGCTTTACGGATAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCAGGGGATGATGTCATTATACAAATGATGTCATTTGTTTTTCAAAACTAAACTCGCTTTACGGGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCGAGGGATAATGTCATTTGTTATTCTCAAATATGATGTCATTTAAATTTTTATTATGCAAGAATTGTATGTTGCTGTGTCATTTATGAATGTTTTATCGACAACTTGTTTATTTGTTTCATTGACTTGTTGTTGTTCGTGATTATGATTAATTATAAATCTTTTGTTGGGGTCAACATCGATGTATACGCCGCTACAGGGCGCGTACTATGGTTGCTTTGACGTATGCGGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATACCGCATCAGGCGCCCCTGCAGGCAGCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTACGCGTTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGCGCTACCGGTCGCCACCGTCGACGTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATCTAGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTCATTTTATGTTTCAGGTTCAGGGGGAGATGTGGGAGGTTTTTTAAAGTTTAAACAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCTGCCTGCAGGACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCGCGGCCGCTCTAGAGATCATGGAGATAATTAAAATGATAACCATCTCGCAAATAAATAAGTATTTTACTGTTTTCGTAACAGTTTTGTAATAAAAAAACCTATAAATATTCCGGATTATTCATACCGTCCCACCATCGGGCGCGGATCCGCCGCCCTGGCGGGGTTTTACGAGATTGTGATTAAGGTCCCCAGCGACCTTGACGAGCATCTGCCCGGCATTTCTGACAGCTTTGTGAACTGGGTGGCCGAGAAGGAGTGGGAGTTGCCGCCAGATTCTGACTTGGATCTGAATCTGATTGAGCAGGCACCCCTGACCGTGGCCGAGAAGCTGCAGCGCGACTTTCTGACGGAGTGGCGCCGTGTGAGTAAGGCCCCGGAGGCCCTTTTCTTTGTGCAATTTGAGAAGGGAGAGAGCTACTTCCACTTACACGTGCTCGTGGAAACCACCGGGGTGAAATCCTTAGTTTTGGGACGTTTCCTGAGTCAGATTCGCGAAAAACTGATTCAGAGAATTTACCGCGGGATCGAGCCGACTTTGCCAAACTGGTTCGCGGTCACAAAGACCAGAAACGGCGCCGGAGGCGGGAACAAGGTGGTGGACGAGTGCTACATCCCCAATTACTTGCTCCCCAAAACCCAGCCTGAGCTCCAGTGGGCGTGGACTAATTTAGAACAGTATTTAAGCGCCTGTTTGAATCTCACGGAGCGTAAACGGTTGGTGGCGCAGCATCTGACGCACGTGTCGCAGACGCAGGAGCAGAACAAAGAGAATCAGAATCCCAATTCTGACGCGCCGGTGATCAGATCAAAAACTTCAGCCAGGTACATGGAGCTGGTCGGGTGGCTCGTGGACAAGGGGATTACCTCGGAGAAGCAGTGGATACAGGAGGACCAGGCCTCATACATCTCCTTCAATGCGGCCTCCAACTCGCGGTCCCAAATCAAGGCTGCCTTGGACAATGCGGGAAAGATTATGAGCCTGACTAAAACCGCCCCCGACTACC
TGGTGGGCCAGCAGCCCGTGGAGGACATTTCCAGCAATCGGATTTATAAAATTTTGGAACTAAACGGGTACGATCCCCAATATGCGGCTTCCGTCTTTCTGGGATGGGCCACGAAAAAGTTCGGCAAGAGGAACACCATCTGGCTGTTTGGGCCTGCAACTACCGGGAAGACCAACATCGCGGAGGCCATAGCCCACACTGTGCCCTTCTACGGGTGCGTAAACTGGACCAATGAGAACTTTCCCTTCAACGACTGTGTGGACAAGATGGTGATCTGGTGGGAGGAGGGGAAGATGACCGCCAAGGTCGTGGAGTCGGCCAAAGCCATTCTCGGAGGAAGCAAGGTGCGCGTGGACCAGAAATGCAAGTCCTCGGCCCAGATAGACCCGACTCCCGTGATCGTCACCTCCAACACCAACATGTGCGCCGTGATTGACGGGAACTCAACGACCTTCGAACACCAGCAGCCGTTGCAAGACCGGATGTTCAAATTTGAACTCACCCGCCGTCTGGATCATGACTTTGGGAAGGTCACCAAGCAGGAAGTCAAAGACTTTTTCCGGTGGGCAAAGGATCACGTGGTTGAGGTGGAGCATGAATTCTACGTCAAAAAGGGTGGAGCCAAGAAAAGACCCGCCCCCAGTGACGCAGATATAAGTGAGCCCAAACGGGTGCGCGAGTCAGTTGCGCAGCCATCGACGTCAGACGCGGAAGCATCGATCAACTACGCAGACAGGTACCAAAACAAATGTTCTCGTCACGTGGGCATGAATCTGATGCTGTTTCCCTGCAGACAATGCGAGAGAATGAATCAGAATTCAAATATCTGCTTCACTCACGGACAGAAAGACTGTTTAGAGTGCTTTCCCGTGTCAGAATCTCAACCCGTTTCTGTCGTCAAAAAGGCGTATCAGAAACTGTGCTACATTCATCATATCATGGGAAAGGTGCCAGACGCTTGCACTGCCTGCGATCTGGTCAATGTGGATTTGGATGACTGCATCTTTGAACAATAATCTAGAGCCTGCAGTCTCGACAAGCTTGTCGAGAAGTACTAGAGGATCATAATCAGCCATACCACATTTGTAGAGGTTTTACTTGCTTTAAAAAACCTCCCACACCTCCCCCTGAACCTGAAACATAAAATGAATGCAATTGTTGTTGTTAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGGATCTGATCACTGCTTGAGCCTAGGAGATCCGAACCAGATAAGTGAAATCTAGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCCGCCCACAGCGGGGCATTTTTCTTCCTGTTATGTTTTTAATCAAACATCCTGCCAACTCCATGTGACAAACCGTCATCTTCGGCTACTTT
いくつかの実施形態では、AAVエレメントは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV DJ、AAV DJ/8、AAV rh10、AAV Retro、AAV PHP.eB、AAV PHP.B又はAAV PHP.Sなどの異なる血清型のAAVに由来する。異なる血清型のAAVのカプシドタンパク質は、細胞表面の異なる受容体を認識するため、異なる組織細胞への感染効率は大きく異なる可能性があり、特定の臓器標的特異性を示す。特定の実験目的に応じて適切な血清型のAAVを選択して、特定のタイプの細胞組織への特定の血清型のAAVの特異的な高効率形質導入を実現することができる。
いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV1に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV2に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV3に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV4に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV5に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV6に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV7に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV8に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV9に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV DJに由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV DJ/8に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV rh10に由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV Retroに由来する。いくつかの実施形態では、AAVエレメントはAAV PHP.eB/PHP.B/PHP.Sに由来する。
Capタンパク質は構造タンパク質であり、通常、VP1、VP2、及びVP3構造タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、3つの構造タンパク質をAAVのカプシドタンパク質に組み立てることができると考えられる。
Repタンパク質は非構造タンパク質であり、通常、Rep78及び52タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、Repタンパク質はDNAの複製及びパッケージングを調節することができると考えられる。
一実施形態では、AAVシスエレメントは、末端逆位配列(ITR配列)から選択される。いくつかの実施形態では、ITR配列はヘアピン構造に折り畳むことができ、AAV
DNA複製開始及び組換えAAVビリオンのパッケージングに必要な唯一の既知のシスエレメントであると考えられる。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、外来標的遺伝子を更に含む。いくつかの実施形態では、外来標的遺伝子はAAVエレメントによって運ばれ、即ち、外来標的遺伝子は、AAVエレメントに埋め込まれている。
具体的には、いくつかの実施形態では、外来標的遺伝子は両端のITR配列の間に埋め込まれている。
好ましくは、いくつかの実施形態では、外来標的遺伝子のサイズは≦3.5kbである。いくつかの実施形態では、両端のITR配列の間のサイズ制限により、外来標的遺伝子のサイズは一般に大きすぎてはならず、さもなければパッケージング効果が低下する可能性があると考えられる。
外来遺伝子の種類は、実験の目的によって異なる。外来遺伝子は、AADC、FVIII、FIXなどの様々な疾患の治療に関連する遺伝子であってもよく、また、EGFP、mCherry遺伝子などの実験室で一般的に使用されるツール遺伝子であってもよい。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、IEタンパク質遺伝子のプロモーターを更に含むと考えられる。いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターは、Gp64、pH、p6.9又はp10のうちの1つ以上から選択されると考えられる。いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターはGp64を含む。いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターはpHを含む。いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターはp6.9を含む。いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターはp10を含む。
好ましくは、いくつかの実施形態では、IEタンパク質遺伝子のプロモーターはpH強力プロモーターから選択される。いくつかの実施形態では、核酸構築物にieの追加のコピーを加え、強力プロモーターpHの制御下で発現させると、ウイルスの内因性レベルを上回り、バキュロウイルス感染後の後期細胞の生存が増加すると考えられる。
いくつかの実施形態では、IEタンパク質は、Acie0、Acie01又はAcie02のうちの1つ以上(例えば、2つ又は3つ)の遺伝子によってコードされるタンパク質から選択される。いくつかの実施形態では、IEタンパク質は、Acie0によってコードされるタンパク質、即ちIE0から選択される。Acie0のヌクレオチド配列は配列番号10に示されるとおりであり、IE0タンパク質のアミノ酸配列は配列番号11に示されるとおりである。いくつかの実施形態では、IEタンパク質は、Acie01によってコードされるタンパク質、即ちIE1から選択される。Acie01のヌクレオチド配列は配列番号12に示されるとおりであり、IE1タンパク質のアミノ酸配列は配列番号13に示されるとおりである。いくつかの実施形態では、IEタンパク質は、Acie02によってコードされるタンパク質、即ちIE2タンパク質から選択される。Acie02のヌクレオチド配列は配列番号14に示されるとおりであり、IE2タンパク質のアミノ酸配列は配列番号15に示されるとおりである。
配列番号10~15の配列は以下の通りである:
配列番号10
ATGATAAGAACCAGCAGTCACGTGCTGAACGTCCAGGAAAATATAATGACGTCAAACTGTGCGTCATCGCCATATTCGTGCGAGGCAACGTCCGCTTGCGCAGAAGCTCAGCAGGTAATGATCGATAACTTTGTTTTCTTTCACATGTACAACGCCGACATACAAATTGACGCAAAGCTGCAATGCGGCGTGCGCTCGGCCGCGTTTGCAATGATCGACGATAAACATTTGGAAATGTACAAGCATAGAATAGAGAATAAATTTTTTTATTACTATGATCAATGTGCCGACATTGCCAAACCCGACCGTCTGCCCGATGACGACGGCGCGTGCTGTCACCATTTTATTTTTGATGCCCAACGTATTATTCAATGTATTAAAGAGATTGAAAGCGCGTACGGCGTGCGTGATCGCGGCAATGTAATAGTGTTTTATCCGTACTTGAAACAGTTGCGAGACGCGTTGAAGCTAATTAAAAACTCTTTTGCGTGTTGTTTTAAAATTATAAATTCTATGCAAATGTACGTGAACGAGTTAATATCAAATTGCCTGTTGTTTATTGAAAAGCTGGAAACTATTAATAAAACTGTTAAAGTTATGAATTTGTTTGTAGACAATTTGGTTTTGTACGAATGCAATGTTTGTAAAGAAATATCTACGGATGAAAGATTTTTAAAGCCAAAAGAATGTTGCGAATACGCTATATGCAACGCGTGCTGCGTTAACATGTGGAAGACGGCCACCACGCACGCAAAATGTCCAGCGTGCAGGACATCGTATAAATAA
配列番号11
MIRTSSHVLNVQENIMTSNCASSPYSCEATSACAEAQQVMIDNFVFFHMYNADIQIDAKLQCGVRSAAFAMIDDKHLEMYKHRIENKFFYYYDQCADIAKPDRLPDDDGACCHHFIFDAQRIIQCIKEIESAYGVRDRGNVIVFYPYLKQLRDALKLIKNSFACCFKIINSMQMYVNELISNCLLFIEKLETINKTVKVMNLFVDNLVLYECNVCKEISTDERFLKPKECCEYAICNACCVNMWKTATTHAKCPACRTSYK
配列番号12
ATGATCCGTACATCCAGCCACGTCCTGAACGTCCAAGAAAACATCATGACTTCCAACTGTGCTTCCAGCCCCTACTCCTGTGAGGCCACTTCAGCCTGCGCTGAGGCCCAGCAACTGCAGGTGGACACAGGTGGCGATAAGATCGTGAACAACCAGGTCACCATGACTCAAATCAACTTCAACGCTTCCTACACCTCTGCCAGCACTCCCTCTCGTGCTAGCTTCGACAACTCATACTCGGAGTTCTGCGACAAGCAACCTAACGATTACTTGTCTTACTACAACCACCCAACCCCGGACGGAGCTGATACTGTCATCTCCGACTCTGAAACCGCTGCCGCTAGCAACTTCCTCGCCTCAGTTAACTCGCTCACTGACAACGATTTGGTGGAGTGTCTGCTCAAGACCACTGACAACCTGGAGGAAGCTGTGTCCTCTGCCTACTACAGCGAGTCACTCGAACAGCCAGTGGTCGAACAACCCTCTCCTAGCTCAGCTTACCACGCCGAGTCCTTCGAACACTCTGCTGGTGTCAACCAGCCGTCGGCCACAGGCACCAAGAGGAAGTTGGACGAGTACCTGGATAACTCCCAGGGAGTTGTGGGTCAATTCAACAAGATCAAGTTGAGACCTAAGTACAAGAAGAGCACCATCCAGTCATGCGCTACACTGGAACAAACCATCAACCACAACACTAACATCTGTACAGTGGCTTCCACCCAGGAGATCACTCACTACTTCACAAACGACTTCGCCCCCTACCTGATGAGGTTCGACGATAACGACTACAACTCGAACAGATTCTCCGATCACATGTCTGAAACCGGTTACTACATGTTCGTCGTTAAGAAGTCCGAGGTGAAGCCTTTCGAAATCATCTTCGCCAAGTACGTCTCTAACGTGGTCTACGAGTACACAAACAACTACTACATGGTTGACAACCGTGTGTTCGTTGTGACCTTCGATAAGATCCGCTTCATGATCAGCTACAACCTGGTTAAGGAGACTGGCATCGAAATCCCACACTCACAGGACGTCTGCAACGATGAGACCGCCGCTCAAAACTGCAAGAAGTGTCACTTCGTGGACGTCCACCACACATTCAAGGCCGCTCTGACCTCCTACTTCAACCTCGATATGTACTACGCTCAGACAACCTTCGTGACCTTGCTGCAATCACTCGGCGAGCGTAAGTGTGGATTCCTCTTGTCGAAGTTGTACGAGATGTACCAGGACAAGAACCTCTTCACTTTGCCCATCATGCTGAGCCGCAAGGAATCAAACGAGATCGAAACCGCCTCTAACAACTTCTTCGTCTCGCCATACGTTTCCCAGATCCTCAAGTACTCGGAGTCCGTCCAATTCCCGGACAACCCTCCCAACAAGTACGTCGTTGATAACCTGAACCTCATCGTGAACAAGAAGAGCACTCTGACATACAAGTACTCGTCCGTCGCTAACCTGCTCTTCAACAACTACAAGTACCACGACAACATCGCTTCTAACAACAACGCCGAGAACCTCAAGAAGGTCAAGAAGGAAGACGGAAGCATGCACATCGTTGAGCAGTACTTGACTCAAAACGTCGATAACGTTAAGGGTCACAACTTCATCGTGTTGTCCTTCAAGAACGAGGAAAGGCTGACCATCGCTAAGAAGAACAAGGAGTTCTACTGGATCTCTGGCGAAATCAAGGACGTTGATGTGAGCCAGGTCATCCAAAAGTACAACAGATTCAAGCACCACATGTTCGTGATCGGCAAGGTCAACCGTCGCGAGTCAACTACACTGCACAACAACTTGCTGAAGCTCTTGGCCTTGATCCTGCAGGGACTGGTGCCACTCTCCGACGCCATCACATTCGCCGAGCAAAAGCTCAACTGCAAGTACAAGAAGTTCGAGTTCAACTAA
配列番号13
MIRTSSHVLNVQENIMTSNCASSPYSCEATSACAEAQQLQVDTGGDKIVNNQVTMTQINFNASYTSASTPSRASFDNSYSEFCDKQPNDYLSYYNHPTPDGADTVISDSETAAASNFLASVNSLTDNDLVECLLKTTDNLEEAVSSAYYSESLEQPVVEQPSPSSAYHAESFEHSAGVNQPSATGTKRKLDEYLDNSQGVVGQFNKIKLRPKYKKSTIQSCATLEQTINHNTNICTVASTQEITHYFTNDFAPYLMRFDDNDYNSNRFSDHMSETGYYMFVVKKSEVKPFEIIFAKYVSNVVYEYTNNYYMVDNRVFVVTFDKIRFMISYNLVKETGIEIPHSQDVCNDETAAQNCKKCHFVDVHHTFKAALTSYFNLDMYYAQTTFVTLLQSLGERKCG
FLLSKLYEMYQDKNLFTLPIMLSRKESNEIETASNNFFVSPYVSQILKYSESVQFPDNPPNKYVVDNLNLIVNKKSTLTYKYSSVANLLFNNYKYHDNIASNNNAENLKKVKKEDGSMHIVEQYLTQNVDNVKGHNFIVLSFKNEERLTIAKKNKEFYWISGEIKDVDVSQVIQKYNRFKHHMFVIGKVNRRESTTLHNNLLKLLALILQGLVPLSDAITFAEQKLNCKYKKFEFN
配列番号14
ATGAGTCGCCAAATCAACGCCGCCACTCCCAGCAGCAGCCGCCGCCACAGGCTGTCTCTCAGCCGTCGCCGCATCAACTTTACAACATCTCCCGAAGCCCAGCCGTCTTCAAGCAGTCGCAGCCAGCCGTCTTCAAGCAGTCGCAGCCATCGCCGTCAGGAGCGGCGTCAGGAGCAGCGTGTCAGCGAAGAAAACGTGCAGATTATCGGGAACGTCAACGAGCCGTTGACGCGCACCTACCATCGTCAGGGTGTCACGTATTACGTGCACGGTCAGGTTAACATTAGCAATGACGATCCGCTATTAAGTCAAGAGGATGACGTCATACTAATTAATAGTGAAAATGTGGATCGTGAACGGTTTCCCGACATCACTGCCCAGCAGTACCAGGATAACATTGCGTCGGAGACAGCTGCGCAGAGGGCTCTGCAACGAGGTTTAGATCTTGAGGCTCAGCTGATGAATGAGATTGCCCCAAGGTCTCCCACTTATAGTCCATCTTATTCGCCGAATTACGTAATACCACAGTCGCCAGATTTGTTTGCCTCGCCGCAGTCTCCGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAATCAGAACCCGAAGAAGAAGTAGAGGTTTCGTGTAATATTTGTTTTACTACTTTTAAAGACACTAAAAACGTAAATTCCTCGTTTGTGACTTCGATTCATTGTAACCATGCTGTGTGTTTCAAGTGTTATGTCAAGATAATTATGGACAATTCTGTGTACAAATGTTTTTGCAGCGCTACTTCATCAGATTGTCGCGTGTACAATAAGCACGGGTATGTAGAATTTATGCCCATTAACGTCACTCGTAACCAGGATTCCATCAAACAGCATTGGCGCGAGCTTTTAGAAAATAACACGGTCAACAATCACACCACGGACTTGAACTATGTGGAGCAATTGCAAAAAGAACTGTCCGAGCTGCGAGCCAAGACCAGCCAAGTTGAACATAAAATGACCATGTTAAACAGCGACTACATTATGCTTAAACACAAGCATGCTGTCGCCGAATTAGATTTACAAAAGGCAAACTATGACTTGCAAGAATCTACCAAGAAATCAGAAGAGTTGCAATCGACTGTGAATAATCTGCAAGAACAATTGCGTAAGCAGGTGGCCGAGTCTCAAGCCAAATTTTCAGAGTTTGAGCGCAGTAACTCTGATTTAGTTTCTAAGTTACAAACTGTTATGTCTAGACGTTAA
配列番号15
MSRQINAATPSSSRRHRLSLSRRRINFTTSPEAQPSSSSRSQPSSSSRSHRRQERRQEQRVSEENVQIIGNVNEPLTRTYHRQGVTYYVHGQVNISNDDPLLSQEDDVILINSENVDRERFPDITAQQYQDNIASETAAQRALQRGLDLEAQLMNEIAPRSPTYSPSYSPNYVIPQSPDLFASPQSPQPQQQQQQQSEPEEEVEVSCNICFTTFKDTKNVNSSFVTSIHCNHAVCFKCYVKIIMDNSVYKCFCSATSSDCRVYNKHGYVEFMPINVTRNQDSIKQHWRELLENNTVNNHTTDLNYVEQLQKELSELRAKTSQVEHKMTMLNSDYIMLKHKHAVAELDLQKANYDLQESTKKSEELQSTVNNLQEQLRKQVAESQAKFSEFERSNSDLVSKLQTVMSRR
いくつかの実施形態では、IE1タンパク質はバキュロウイルス最初期遺伝子1(ie1)の産物であると考えられ、IEタンパク質はバキュロウイルス転写調節因子タンパク質と呼ばれることもある。これは、初期及び後期ウイルス遺伝子を活性化し、ウイルスゲノム複製に関与する能力を備えた多機能タンパク質であり、ウイルスサイクルの調節に関与する。
いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域(hr)は、hr1(ヌクレオチド配列が配列番号16に示される)、hr2(ヌクレオチド配列が配列番号17に示される)、hr3(ヌクレオチド配列が配列番号18に示される)、hr4(hr4 leftのヌクレオチド配列が配列番号19に示され、hr4 rightのヌクレオチド配列が配列番号20に示される)、及びhr5(ヌクレオチド配列が配列番号21に示される)のうちの1つ以上(例えば、2つ、3つ、4つ又は5つ)から選択される。
配列番号16~21の配列は以下の通りである:
配列番号16
ATCGATGTTGACCCCAACAAAAGATTTATAATTAATCATAATCACGAACAACAACAAGTCAATGAAACAAATAAACAAGTTGTCGATAAAACATTCATAAATGACACAGCAACATACAATTCTTGCATAATAAAAATTTAAATGACATCATATTTGAGAATAACAAATGACATTATCCCTCGATTGTGTTTTACAAGTAGAATTCTACCCGTAAAGCGAGTTTAGTTTTGAAAAACAAATGACATCATTTGTATAATGACATCATCCCCTGATTGTGTTTTACAAGTAGAATTCTATCCGTAAAGCGAGTTCAGTTTTGA
AAACAAATGAGTCATACCTAAACACGTTAATAATCTTCTGATATCAGCTTATGACTCAAGTTATGAGCCGTGTGCAAAACATGAGATAAGTTTATGACATCATCCACTGATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCCAGTTCGGTTATGAGCCGTGTGCAAAACATGACATCAGCTTATGACTCATACTTGATTGTGTTTTACGCGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTCGGTTATGAGCCGTGTGCAAAACATGACATCAGCTTATGAGTCATAATTAATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTGAAGGATCATATTTAGTTGCGTTTATGAGATAAGATTGAAAGCACGTGTAAAATGTTTCCCGCGCGTTGGCACAACTATTTACAATGCGGCCAAGTTATAAAAGATTCTAATCTGATATGTTTTAAAACACCTTTGCGGCCCGAGTTGTTTGCGTACGTGACTAGCGAAGAAGATGTGTGGACCGCAGAACAGATAGTAAAACAAAACCCTAGTATTGGAGCAATAATCGAT
配列番号17
TGAGCAAAACACAACCGGCAAATTCTCGGCGGCCGTTTGGGAATGCGGAATAATTGCCATATGTAAATGATGTCATCGGTTCTAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACGTGTAAAACATAATCAAGAGATGATGTCATTTGTTTTTCAAAACTGAACTCAAGAAATGATGTCATTTGTTTTTCAAAACTGAACTGGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCGAGAGATGATGTCATATTTTGCACACGGCTCTAATTAAACTCGCTTTACGAGTAAAATTCTACTTGTAACGCATGATCAAGGGATGATGTCATTGGATGAGTCATTTGTTTTTCAAAACTAAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCAAGGGATGATGTCATTATACAAATGATGTCATTTGTTTTTCAAAACTAAACTCGCTTTACGGGTAGAATTCTACTTGTAAAACAGCAACTCGAGGGATGATGTCATCCTTTACTCGATGATTATAAACGTGTTTATGTATGACTCATTTGTTTTTCAAAACTAAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAACGCACGATCAAGGGATGATGTCATTTATTTGTGCAAAGCTCGATGTCATCTTTTGCACACGATTATAAACACAATCCAAATAATGACTCATTTGTTTTCAAAACTGAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCAAGGGATGATGTCATTTTCAAAATGATGTCATTTGTTTTTCAAAACTAAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCAAGGGATGATGTCATTTTAAAAATGATCATTTGTTTTTCAAAACTAAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACGTGTAAAACACAATCAAGGGATGATGTCATTTACTAAATAAAATAATTATTTAAATAAAACTGTTTTTTATTGTCAAATACACATTGATTCAC
配列番号18
ACGCGTAGAATTCTACTTGTAAAGCAAGTTAAAATAAGCCGTGTGCAAAAATGACATCAGACAAATGACATCATCTACCTATCATGATCATGTTAATAATCATGTTTTAAAATGACATCAGCTTATGACTAATAATTGATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTTAGTTTTGAAAACAAATGAGTCATCATTAAACATGTTAATAATCGTGTATAAAGGATGACATCATCCACTAATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTCGGTTTTGAAAAACAAATGACATCATTTCTTGATTGTGTTTTACACGTAGAATTCTACTCGTAAAGTATGTTCAGTTTAAAAAACAAATGACATCATTTTACAGATGACATCATTTCTTGATTATGTTTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTTAGTTTTAAAAAACAAATGACATCATCTCTTGATTATGTTTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTTAGTTTTGAAAAACAAATGACATCATCTCTTGATTATGTTTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTTAGTTTTGAAAAACAAATGACATCATCCCTTGATCATGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTGAATTTTGATTACAATATT
配列番号19
ATGCATATAATTGTGTACAAAATATGACTCATTAATCGATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTGGTAAAGCAAGTTCGGTTGTGAGCCGTGTGCAAAACATGACATCATAACTAATCATGTTTATAATCATGTGCAAAATATGACATCATCCGACGATTGTGTTTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTTAAAAATTTTGTGACGTCAATGAAACAACGTGTAATATTTTTTACAATATTTAAGTGAAACATTATGACTTCCAATAATTTTGTGGATGTGGATACGTTTGCAAGACAATTGATTACAGATAAATGTAGTGCTCTAATCGAAAGATGCGGATCTGTTGCCGGCAAACATTTTAGAGATTAGTAGAGAAAGGCCAGAGACAAGTATTTTGAGGTGCCAACTCAAAAAAACTATGAATACATTAAAAAATTATTTTTACGAACAAAATATATGGACGATTCGATAGATTATAAAGATTTTAACAGACGCATCCTATTGATAGTTTTTAAATTCGCTTTAAACAAGAGCACCAACTACTTTCCATCGTACTAAAGAGATCATCGAGGTGGCCATTAAACGTTTAAACAAAATTAACCCCGATTTAAAGAGTTCTCCGCGCAATGCTTCAGCATTACAAATGAATGTTTGGAAAATCTAGA
配列番号20
AACTGGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCAAGAAATGATGTCATTTTTGTACGTGATTATAAACATGTTTAAACATGGTACATTGAACTTAATTTTTGCAAGTTGATAAACTAGATTAATGTATGACTCATTTGTTTGTGCAAGTTGATAAACGTGATTAATATATGACTCATATGTTTGTGCAAAAATGGTGTCATCGTACAAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTA
CTTGTAAAACACAATCGAGGGATGATGTCATTTGTAGAATGATGTCATTTGTTTTTTCAAAACCGAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAAAACACAATCGAGGGATGATGTCATTTGTAGAATGATGTCATCGTACAAACTCGCTTTACGAGTAGAATTCTAGTAAAACAC
配列番号21
TTGAAAATTTATTGCCTAATATTATTTTTGTCAGTTCGTTGTCATTTATTAATTTGGATGATGTCCATTTGTTTTTAAAATTGAACTGGCTTTACGAGTAGAATTCTACGCGTAAAACACAATCAAGTATGAGTCATAAGCTGATGTCATGTTTTGCACACGGCTCATAACCGAACTGGCTTTACGAGTAGAATTCTACTTGTAACGCACGATCGAGTGGATGATGGTCATTTGTTTTTCAAATCGAGATGATGTCATGTTTTGCACACGGGCTCATAAACTGCTTTACGAGTAGAATTCTACGTGTAACGCACGATCGATTGATGAGTCATTTGTTTTGCAATATGATATCATACAATATGACTCATTTGTTTTTCAAAACCGAACTTGATTTACGGGTAGAATTCTACTCGTAAAGCACAATCAAAAAGATGATGTCATTTGTTTTTCAAAACTGAACTCTCGGCTTTACGAGTAGAATTCTACGTGTAAAACACAATCAAGAAATGATGTCATTTGTTATAAAAATAAAAGCTGATGTCATGTTTTGCACATGGCTCATAACTAAACTCGCTTTACGGGTAGAATTCTACGCGTAAAACATGATTGATAATTAAATAATTCATTTGCAAAGCTATACGTTAAATCAAACGGACGTTATGGAATTGTATAATATTAAATATGCAATTGATCCAACAAATAAAATTATAATAGAGCAAGTCGAC
好ましくは、いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域はhr1から選択される。いくつかの実施形態では、hr1はバキュロウイルスゲノムに散在する反復配列であり、hr1はバキュロウイルスの複製起点であるだけでなく、エンハンサーとしての機能も有すると考えられる。その増強効果は感染初期では明らかではないが、感染後期ではより顕著になる。いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域(hr)はhr2を含む。いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域(hr)はhr3を含む。いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域(hr)はhr4を含む。いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域(hr)はhr5を含む。
いくつかの実施形態では、核酸構築物は、バキュロウイルスプロモーターを更に含む。いくつかの実施形態では、バキュロウイルスプロモーターは、ポリヘドロンプロモーター(pH)、Gp64、p6.9又はp10のうちの1つ以上(例えば、2つ、3つ又は4つ)から選択される。いくつかの実施形態では、hrはバキュロウイルスプロモーターにシスで結合して、IE媒介トランス活性化を促進することができ、同時に、IEは二量体形態でhr1に結合して、下流タンパク質の発現量を増加させると考えられる。
いくつかの実施形態では、核酸構築物の構造は、IE遺伝子発現カセット-Cap遺伝子発現カセット-hr1-ITR-外来標的遺伝子発現カセット-ITR-Rep遺伝子発現カセットを含む。いくつかの実施形態では、核酸構築物の構造は、IE遺伝子発現カセット-Cap遺伝子発現カセット-ITR-外来標的遺伝子発現カセット-ITR-Rep遺伝子発現カセットである。
遺伝子発現カセットは、遺伝子及びそのプロモーターを含む。
好ましい実施形態では、核酸構築物の構造は、pA-IE1-pH-pA-Cap-p6.9p10-hr1-ITR-外来標的遺伝子及びそのプロモーター-pA-ITR-pH-Rep-pAを含む。好ましい実施形態では、核酸構築物の構造は、pA-IE1-pH-pA-Cap-p6.9p10-hr1-ITR-外来標的遺伝子及びそのプロモーター-pA-ITR-pH-Rep-pAである。
具体的には、いくつかの実施形態では、核酸構築物は、アデノ随伴ウイルスベクター又は組換えバキュロウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、核酸構築物は、アデノ随伴ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、核酸構築物は、組換えバキ
ュロウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、組換えバキュロウイルスベクターは、組換えバキュロウイルスシャトルベクターである。
いくつかの実施形態では、アデノ随伴ウイルスベクター又は組換えバキュロウイルスベクターは、ベクター骨格を更に含む。
いくつかの実施形態では、ベクター骨格は、pFastBacdual、pFastBac1、pFastBacHTA、pFastBacHTB又はpFastBacHTCなどの市場で販売されている適切なベクター骨格から選択することができる。
一実施形態では、ベクター骨格はpFastBacdualである。
いくつかの実施形態では、核酸構築物をパッケージングすることによって得られるrAAVの力価は、少なくとも1x1012VG/mL(例えば、少なくとも1.5x1012、2x1012、2.5x1012、3x1012、3.5x1012、4x1012、4.5x1012、5x1012、5.5x1012、6x1012、7x1012、7.5x1012、8x1012、8.5x1012、9x1012、9.5x1012、1x1013、5x1013、又は1x1014VG/mL)であり、即ち、ウイルス培養液1mlあたりに含まれるAAVゲノムのコピー数は、少なくとも1x1012(例えば、少なくとも1.5x1012、2x1012、2.5x1012、3x1012、3.5x1012、4x1012、4.5x1012、5x1012、5.5x1012、6x1012、7x1012、7.5x1012、8x1012、8.5x1012、9x1012、9.5x1012、1x1013、5x1013、又は1x1014)である。
いくつかの実施形態では、核酸構築物をパッケージングすることによって得られるrAAVの力価は、少なくとも2.60E+12VG/mLであり、即ち、ウイルス培養液1mlあたりに含まれるAAVゲノムのコピー数は、少なくとも2.60E+12である。
rAAVの収量はqPCR方法によって検出され、検出手順は以下のとおりである。
定量PCRで使用される標準品は、PvuI-HF(NEB)単一制限酵素消化によって線形化されたpAAV-MCSプラスミドである。
定量PCRで使用されるプライマー配列は以下のとおりである。
ITR Forward primer 5’-GGAACCCCTAGTGATGGAGTT-3’(配列番号2)
ITR Reverse primer 5’-CGGCCTCAGTGAGCGA-3’(配列番号3)
定量PCR操作プログラム:95℃で60秒間(95℃で15秒間、60℃で30秒間、40サイクル)。定量PCRで得られたCT値及び標準品の濃度から標準曲線を描いた後、サンプルの力価を換算する。
本発明の第2態様は組換えバキュロウイルスを提供し、この組換えバキュロウイルスは、上記のいずれかの核酸構築物をバキュロウイルス系によって構築することによって得られるか、又は上記のいずれかの核酸構築物中の任意のエレメントを含む核酸構築物をバキュロウイルス系によって共同構築することによって得られる。
上記のいずれかの核酸構築物中の任意のエレメントを含む核酸構築物は主に、AAVエ
レメントを含む核酸構築物、IEタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物、バキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物を指す。AAVエレメントを含む核酸構築物はまた、Capタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物、AAVシスエレメントをコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物から選択することができる。組換えバキュロウイルスは、上記の核酸構築物をバキュロウイルス系によって共同構築することによって得ることができる。
バキュロウイルス系は、Bac-to-Bacシステム(ThermoFisher/Invitrogen由来)、flashBac/BacMagicシステム(Mirus/EMD/OET/Nextgen由来)、BaculoDirectシステム(ThermoFisher/Invitrogen由来)又はBacPAK6/Baculogoldシステム(BD Biosciences/Clonetech由来)から選択される。
具体的には、組換えバキュロウイルスは、コンピテント細胞を上記核酸構築物で形質転換し、Bacmidを抽出し、SF9昆虫細胞をトランスフェクトすることによって得られる。
コンピテント細胞は、本発明の発明目的を限定しない限り、当技術分野で適用可能な任意のコンピテント細胞から選択することができる。例えば、コンピテント細胞はDH10Bacであり得る。
本発明の第3態様はアデノ随伴ウイルス(AAV)を提供し、このアデノ随伴ウイルスは、上記のいずれかの組換えバキュロウイルスをパッケージングすることによって得られる。アデノ随伴ウイルスは、血友病、脊髄性筋萎縮症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、パーキンソン病、加齢黄斑変性症などの様々な疾患を治療するために使用することができる。
本発明の第4態様は細胞株を提供し、この細胞株は、上記のいずれかの組換えバキュロウイルスに感染した細胞株である。
いくつかの実施形態では、細胞株は、SF9細胞、SF21細胞、High5細胞などの昆虫細胞株である。
本発明の第5態様はアデノ随伴ウイルスベクター系を提供し、このアデノ随伴ウイルスベクター系は、バキュロウイルス系及び上記の核酸構築物を含む。
本発明の第6態様は上記の核酸構築物の構築方法を提供し、この構築方法は、外来標的遺伝子を運ぶAAVエレメント及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込むことを含む。
構築方法は、バキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込むことを更に含む。
いくつかの実施形態では、AAVエレメントは、Capタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含む。
いくつかの実施形態では、AAVシスエレメントは、末端逆位配列(ITR配列)から
選択される。
具体的には、いくつかの実施形態では、IEタンパク質をコードするポリヌクレオチドは、強力プロモーターpHに結合される。
いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、バキュロウイルスプロモーターにシスで結合される。いくつかの実施形態では、バキュロウイルスプロモーターはp6.9又はp10である。
いくつかの実施形態では、バキュロウイルスベクター骨格は、pFastBacdual、pFastBac1、pFastBacHTA、pFastBacHTB又はpFastBacHTCなどから選択される。
いくつかの実施形態では、バキュロウイルス組換え相同領域は、hr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上(例えば、2つ、3つ、4つ、又は5つ)から選択される。
本発明の第7態様はアデノ随伴ウイルスの産生方法を提供し、この産生方法は、組換えバキュロウイルスを昆虫細胞株に感染させる工程を含む。
このアデノ随伴ウイルスの産生方法は、アデノ随伴ウイルスの収量を増加させることができる。
いくつかの実施形態では、細胞株は昆虫細胞株から選択される。一実施形態では、昆虫細胞株はSF9細胞から選択される。
本発明の第8態様は、疾患を治療する方法を提供し、この方法は、有効量の上記のいずれかのアデノ随伴ウイルスを患者に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、疾患には、例えば、血友病、脊髄性筋萎縮症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、パーキンソン病、加齢黄斑変性症などが含まれる。
本発明はまた、以下の任意の番号付き段落を含む。
1.核酸構築物であって、AAVエレメント、及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含み、AAVエレメントがCapタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含むことを特徴とする、核酸構築物。
2.バキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドを更に含むことを特徴とする、段落1に記載の核酸構築物。
3.IEタンパク質が、Acie0、Acie01又はAcie02のうちの1つ以上によってコードされるタンパク質から選択され、及び/又は、バキュロウイルス組換え相同領域がhr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上から選択されることを特徴とする、段落2に記載の核酸構築物。
4.核酸構築物がIEタンパク質遺伝子のプロモーターを更に含み、IEタンパク質遺伝子のプロモーターがGp64、pH、p6.9又はp10のうちの1つ以上から選択されることを特徴とする、段落1~3のいずれか一項に記載の核酸構築物。
5.核酸構築物がバキュロウイルスプロモーターを更に含み、バキュロウイルスプロモーターがバキュロウイルス組換え相同領域に結合されており、バキュロウイルスプロモーターが好ましくはpH、Gp64、p6.9又はp10の1つ以上であることを特徴とする、段落1~4のいずれか一項に記載の核酸構築物。
6.AAVシスエレメントがITR配列から選択されることを特徴とする、段落1~5のいずれか一項に記載の核酸構築物。
7.核酸構築物が外来標的遺伝子を更に含み、外来標的遺伝子がAAVエレメントに埋め込まれていることを特徴とする、段落1~6のいずれか一項に記載の核酸構築物。
8.核酸構築物の構造が、IE遺伝子発現カセット-Cap遺伝子発現カセット-ITR-外来標的遺伝子発現カセット-ITR-Rep遺伝子発現カセットであることを特徴とする、段落1~7のいずれか一項に記載の核酸構築物。
9.核酸構築物のヌクレオチド配列が配列番号1であることを特徴とする、段落1~8のいずれか一項に記載の核酸構築物。
10.核酸構築物がアデノ随伴ウイルスベクター又は組換えバキュロウイルスベクターであり、組換えバキュロウイルスベクターが好ましくは組換えバキュロウイルスシャトルベクターであることを特徴とする、段落1~9のいずれか一項に記載の核酸構築物。
11.段落1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物をバキュロウイルス系によって構築することによって得られるか、又は段落1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物中の任意のエレメントを含む核酸構築物をバキュロウイルス系によって共同構築することによって得られることを特徴とする、組換えバキュロウイルス。
12.段落11に記載の組換えバキュロウイルスを細胞に感染させた後にパッケージングすることによって得られることを特徴とする、アデノ随伴ウイルス。
13.段落11に記載の組換えバキュロウイルスに感染した細胞株であることを特徴とする、細胞株。
14.バキュロウイルス系及び段落1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物を含むことを特徴とする、アデノ随伴ウイルスベクター系。
15.外来標的遺伝子を運ぶAAVエレメント及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込むことを含むことを特徴とする、段落1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物を構築する方法。
16.構築方法が以下の特徴のうちの1つ以上を含むことを特徴とする、段落15に記載の構築方法。
1)AAVエレメントは、Capタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含み、AAVシスエレメントは、好ましくはITR配列である。
2)IEタンパク質は、Acie0、Acie01又はAcie02遺伝子のうちの1つ以上によってコードされる。
3)バキュロウイルスベクター骨格は、pFastBacdual、pFastBac1、pFastBacHTA、pFastBacHTB又はpFastBacHTCのうちの1つから選択される。
4)バキュロウイルス組換え相同領域は、hr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上から選択される。
5)バキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込む。
17.段落11に記載の組換えバキュロウイルスを昆虫細胞株に感染させる工程を含むことを特徴とする、アデノ随伴ウイルスの産生方法。
以下、特定の具体例を通じて本発明の実施形態を説明するが、当業者は、本明細書に開示された内容から本発明の他の利点及び効果を容易に理解することができる。本発明はまた、他の異なる特定の実施形態によって実施又は適用することでき、本発明の精神から逸脱することなく、異なる観点及び用途に基づいて、本明細書の細部に様々な修正又は変更を加えることができる。
本発明の具体的な実施形態を更に説明する前に、本発明の保護範囲は、以下の特定の具体的な実施形態に限定されないことを理解されたい。また、本発明の実施例で使用される用語は、特定の具体的な実施形態を説明するためのものであり、本発明の保護範囲を限定するものではないことも理解されたい。本発明の明細書及び特許請求の範囲において、単数形「1つ」、「一」及び「この」は、文脈が明確に別段の指示をしない限り、複数形を含む。
実施例が数値範囲を与える場合、本発明において別段の記載がない限り、各数値範囲の2つの終点及び2つの終点間の任意の値を選択できることを理解すべきである。別段の定義がない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語及び科学用語は、当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。実施例で使用される特定の方法、装置、及び材料に加えて、当業者はまた、従来技術の把握及び本発明の記載に従って、本発明の実施例に記載される方法、装置、及び材料と類似又は同等の従来技術における任意の方法、装置及び材料を使用して本発明を実現することができる。
以下の実施例では、EGFPを外来標的遺伝子として例に挙げる。
実施例1 組換えバキュロウイルスシャトルベクターの構築及び組換えバキュロウイルスの取得
関連遺伝子の決定:Capタンパク質及びRepタンパク質の遺伝子はいずれもAAV2ゲノム(GenBank:AF043303.1)に由来し、リボソームリーキースキャニングメカニズムに基づいて、文献(非特許文献2)を参照して塩基の点突然変異を行った。Acie01(GenBank:NC_001623.1)、バキュロウイルス組換え相同領域hr1(GenBank:M14313.1)。
それぞれ対応する配列の合成を遺伝子会社に委託した:Cap遺伝子配列(配列番号4のヌクレオチド配列)、Rep遺伝子配列(配列番号5のヌクレオチド配列)、hr1とp6.9、p10プロモーターの組み合わせ(hr1p6.9p10、配列番号6のヌクレオチド配列)、pHプロモーターとAcie01の組み合わせ(pH-Acie01、配列番号7のヌクレオチド配列)。当技術分野で周知の相同組換え法を使用して上記の配列及びpAAV-EGFPベクター(康霖生物科技(杭州)有限公司によって形質転換された)中のITR-CMV-EGFP配列をpFastBacdual(Invitrogen)にクローニングし、配列決定及び同定後に2つの組換えバキュロウイルスシャトルベクター、pFBd-Cap-ITR-Rep(図1及び図2、配列番号8のヌクレオチド配列)及びpFBd-IE-hr1Cap-ITR-Rep(図3及び図4、配列番
号9のヌクレオチド配列)をそれぞれ得た。
配列番号4~9の配列は以下の通りである:
配列番号4
ACGGCTGCCGACGGTTATCTACCCGATTGGCTCGAGGACACTCTCTCTGAAGGAATAAGACAGTGGTGGAAGCTCAAACCCGGCCCACCACCACCAAAGCCCGCAGAGCGGCATAAGGACGACAGCAGGGGCCTTGTGCTTCCCGGGTACAAGTACCTCGGACCCTTCAACGGACTGGACAAGGGAGAGCCGGTGAACGAGGCAGACGCCGCTGCCCTCGAGCACGACAAAGCCTACGACCGGCAGCTCGACAGCGGAGACAACCCTTACCTCAAGTACAACCACGCCGACGCGGAGTTCCAGGAGCGCCTTAAAGAAGATACGTCTTTTGGGGGCAACCTCGGACGAGCAGTCTTCCAGGCGAAAAAGAGGGTTCTTGAACCTCTGGGCCTGGTTGAGGAACCTGTTAAGACGGCTCCGGGAAAAAAGAGGCCGGTAGAGCACTCTCCTGTGGAGCCAGACTCCTCCTCGGGAACCGGAAAGGCGGGCCAGCAGCCTGCAAGAAAAAGATTGAATTTTGGTCAGACTGGAGACGCAGACTCAGTACCTGACCCCCAGCCTCTCGGACAGCCACCAGCAGCCCCCTCTGGTCTGGGAACTAATACGATGGCTACAGGCAGTGGCGCACCAATGGCAGACAATAACGAGGGCGCCGACGGAGTGGGTAATTCCTCGGGAAATTGGCATTGCGATTCCACATGGATGGGCGACAGAGTCATCACCACCAGCACCCGAACCTGGGCCCTGCCCACCTACAACAACCACCTCTACAAACAAATTTCCAGCCAATCAGGAGCCTCGAACGACAATCACTACTTTGGCTACAGCACCCCTTGGGGGTATTTTGACTTCAACAGATTCCACTGCCACTTTTCACCACGTGACTGGCAAAGACTCATCAACAACAACTGGGGATTCCGACCCAAGAGACTCAACTTCAAGCTCTTTAACATTCAAGTCAAAGAGGTCACGCAGAATGACGGTACGACGACGATTGCCAATAACCTTACCAGCACGGTTCAGGTGTTTACTGACTCGGAGTACCAGCTCCCGTACGTCCTCGGCTCGGCGCATCAAGGATGCCTCCCGCCGTTCCCAGCAGACGTCTTCATGGTGCCACAGTATGGATACCTCACCCTGAACAACGGGAGTCAGGCAGTAGGACGCTCTTCATTTTACTGCCTGGAGTACTTTCCTTCTCAGATGCTGCGTACCGGAAACAACTTTACCTTCAGCTACACTTTTGAGGACGTTCCTTTCCACAGCAGCTACGCTCACAGCCAGAGTCTGGACCGTCTCATGAATCCTCTCATCGACCAGTACCTGTATTACTTGAGCAGAACAAACACTCCAAGTGGAACCACCACGCAGTCAAGGCTTCAGTTTTCTCAGGCCGGAGCGAGTGACATTCGGGACCAGTCTAGGAACTGGCTTCCTGGACCCTGTTACCGCCAGCAGCGAGTATCAAAGACATCTGCGGATAACAACAACAGTGAATACTCGTGGACTGGAGCTACCAAGTACCACCTCAATGGCAGAGACTCTCTGGTGAATCCGGGCCCGGCGATGGCAAGCCACAAGGACGATGAAGAAAAGTTTTTTCCTCAGAGCGGGGTTCTCATCTTTGGGAAGCAAGGCTCAGAGAAAACAAATGTGGACATTGAAAAGGTCATGATTACAGACGAAGAGGAAATCAGGACAACCAATCCCGTGGCTACGGAGCAGTATGGTTCTGTATCTACCAACCTCCAGAGAGGCAACAGACAAGCAGCTACCGCAGATGTCAACACACAAGGCGTTCTTCCAGGCATGGTCTGGCAGGACAGAGATGTGTACCTTCAGGGGCCCATCTGGGCAAAGATTCCACACACGGACGGACATTTTCACCCCTCTCCCCTCATGGGTGGATTCGGACTTAAACACCCTCCTCCACAGATTCTCATCAAGAACACCCCGGTACCTGCGAATCCTTCGACCACCTTCAGTGCGGCAAAGTTTGCTTCCTTCATCACACAGTACTCCACGGGACAGGTCAGCGTGGAGATCGAGTGGGAGCTGCAGAAGGAAAACAGCAAACGCTGGAATCCCGAAATTCAGTACACTTCCAACTACAACAAGTCTGTTAATGTGGACTTTACTGTGGACACTAATGGCGTGTATTCAGAGCCTCGCCCCATTGGCACCAGATACCTGACTCGTAATCTGTAA
配列番号5
CTGGCGGGGTTTTACGAGATTGTGATTAAGGTCCCCAGCGACCTTGACGAGCATCTGCCCGGCATTTCTGACAGCTTTGTGAACTGGGTGGCCGAGAAGGAGTGGGAGTTGCCGCCAGATTCTGACTTGGATCTGAATCTGATTGAGCAGGCACCCCTGACCGTGGCCGAGAAGCTGCAGCGCGACTTTCTGACGGAGTGGCGCCGTGTGAGTAAGGCCCCGGAGGCCCTTTTCTTTGTGCAATTTGAGAAGGGAGAGAGCTACTTCCACTTACACGTGCTCGTGGAAACCACCGGGGTGAAATCCTTAGTTTTGGGACGTTTCCTGAGTCAGATTCGCGAAAAACTGATTCAGAGAATTTACCGCGGGATCGAGCCGACTTTGCCAAACTGGTTCGCGGTCACAAAGACCAGAAACGGCGCCGGAGGCGGGAACAAGGTGGTGGACGAGTGCTACATCCCCAATTACTTGCTCCCCAAAACCCAGCCTGAGCTCCAGTGGGCGTGGACTAATTTAGAACAGTATTTAAGCGCCTGTTTGAATCTCACGGAGCGTAAACGGTTGGTGGCGCAGCATCTGACGCACGTGTCGCAGACGCAGGAGCAGAACAAAGAGAATCAGAATCCCAATTCTGACGCGCCGGTGATCAGATCAAAAACTTCAGCCAGGTACATGGAGCTGGTCGGGTGGCTCGTGGACAAGGGGATTACCTCGGAGAAGCAGTGGATACAGGAGGACCAGGCCTCATACATCTCCTTCAATGCGGCCTCCAACTCGCGGTCCCAAATCAAGGCTGCCTTGGACAATGCGGGAAAGATTATGAGCCTGACTAAAACCGCCCCCGACTACCTGGTGGGCCAGCAGCCCGTGGAGGACATTTCCAGCAATCGGATTTATAAAATTTTGGAACTAAACGGGTACGATCCCCAATATGCGGCTTCCGTCTTTCTGGGATGGGCCACGAAAAAGTTCGGCAAGAGGAACACCATCTGGCTGTTTGGGCCTGCAACTACCGGGAAGACCAACATCGCGGAGGCCATAGCCCACACTGTGCCCTTCTACGGGTGCGTAAACTGGACCAATGAGAACTTTCCCTTCAACGACTGTGTGGACAAGATGGTGATCTGGTGGGAGGAGGGGAAGATGACCGCCAAGGTCGTGGAGTCGGCCAAAGCCATTCTCGGAGGAAGCAAGGTGCGC
GTGGACCAGAAATGCAAGTCCTCGGCCCAGATAGACCCGACTCCCGTGATCGTCACCTCCAACACCAACATGTGCGCCGTGATTGACGGGAACTCAACGACCTTCGAACACCAGCAGCCGTTGCAAGACCGGATGTTCAAATTTGAACTCACCCGCCGTCTGGATCATGACTTTGGGAAGGTCACCAAGCAGGAAGTCAAAGACTTTTTCCGGTGGGCAAAGGATCACGTGGTTGAGGTGGAGCATGAATTCTACGTCAAAAAGGGTGGAGCCAAGAAAAGACCCGCCCCCAGTGACGCAGATATAAGTGAGCCCAAACGGGTGCGCGAGTCAGTTGCGCAGCCATCGACGTCAGACGCGGAAGCATCGATCAACTACGCAGACAGGTACCAAAACAAATGTTCTCGTCACGTGGGCATGAATCTGATGCTGTTTCCCTGCAGACAATGCGAGAGAATGAATCAGAATTCAAATATCTGCTTCACTCACGGACAGAAAGACTGTTTAGAGTGCTTTCCCGTGTCAGAATCTCAACCCGTTTCTGTCGTCAAAAAGGCGTATCAGAAACTGTGCTACATTCATCATATCATGGGAAAGGTGCCAGACGCTTGCACTGCCTGCGATCTGGTCAATGTGGATTTGGATGACTGCATCTTTGAACAATAA
配列番号6
ATCGATGTTGACCCCAACAAAAGATTTATAATTAATCATAATCACGAACAACAACAAGTCAATGAAACAAATAAACAAGTTGTCGATAAAACATTCATAAATGACACAGCAACATACAATTCTTGCATAATAAAAATTTAAATGACATCATATTTGAGAATAACAAATGACATTATCCCTCGATTGTGTTTTACAAGTAGAATTCTACCCGTAAAGCGAGTTTAGTTTTGAAAAACAAATGACATCATTTGTATAATGACATCATCCCCTGATTGTGTTTTACAAGTAGAATTCTATCCGTAAAGCGAGTTCAGTTTTGAAAACAAATGAGTCATACCTAAACACGTTAATAATCTTCTGATATCAGCTTATGACTCAAGTTATGAGCCGTGTGCAAAACATGAGATAAGTTTATGACATCATCCACTGATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCCAGTTCGGTTATGAGCCGTGTGCAAAACATGACATCAGCTTATGACTCATACTTGATTGTGTTTTACGCGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTCGGTTATGAGCCGTGTGCAAAACATGACATCAGCTTATGAGTCATAATTAATCGTGCGTTACAAGTAGAATTCTACTCGTAAAGCGAGTTGAAGGATCATATTTAGTTGCGTTTATGAGATAAGATTGAAAGCACGTGTAAAATGTTTCCCGCGCGTTGGCACAACTATTTACAATGCGGCCAAGTTATAAAAGATTCTAATCTGATATGTTTTAAAACACCTTTGCGGCCCGAGTTGTTTGCGTACGTGACTAGCGAAGAAGATGTGTGGACCGCAGAACAGATAGTAAAACAAAACCCTAGTATTGGAGCAATAATCGATGACGTCGCTGACGTAGCGCTTTGAATTCCGCGCGCTTCGGACCGGGATCGTGACCAAATTCCGTTTTGCGACGATGCAGAGTTTTTGAACAGGCTGCTCAAACACATAGATCCGTACCCGCTCAGTCGGATGTATTACAATGCAGCCAATACCATGTTTTACACGACTATGGAAAACTATGCCGTGTCCAATTGCAAGTTCAACATTGAGGATTACAATAACATATTTAAGGTGATGGAAAATATTAGGAAACACAGCAACAAAAATTCAAACGACCAAGACGAGTTAAACATATATTTGGGAGTTCAGTCGTCGAATGCAAAGCGTAAAAAATATTAATAAGGTAAAAATTACAGCTACATAAATTACACAATTTAAACTGCAGTCTGGAGATACGGACCTTTAATTCAACCCAACACAATATATTATAGTTAAATAAGAATTATTATCAAATCATTTGTATATTAATTAAAATACTATACTGTAAATTACATTTTATTTACAATC
配列番号7
AACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGGATCTGATCACTGCTTGAGCCTAGGAGATCCGATCATGGAGATAATTAAAATGATAACCATCTCGCAAATAAATAAGTATTTTACTGTTTTCGTAACAGTTTTGTAATAAAAAAACCTATAAATATTCCGGATTATTCATACCGTCCCACCATCGGGCGCATGATCCGTACATCCAGCCACGTCCTGAACGTCCAAGAAAACATCATGACTTCCAACTGTGCTTCCAGCCCCTACTCCTGTGAGGCCACTTCAGCCTGCGCTGAGGCCCAGCAACTGCAGGTGGACACAGGTGGCGATAAGATCGTGAACAACCAGGTCACCATGACTCAAATCAACTTCAACGCTTCCTACACCTCTGCCAGCACTCCCTCTCGTGCTAGCTTCGACAACTCATACTCGGAGTTCTGCGACAAGCAACCTAACGATTACTTGTCTTACTACAACCACCCAACCCCGGACGGAGCTGATACTGTCATCTCCGACTCTGAAACCGCTGCCGCTAGCAACTTCCTCGCCTCAGTTAACTCGCTCACTGACAACGATTTGGTGGAGTGTCTGCTCAAGACCACTGACAACCTGGAGGAAGCTGTGTCCTCTGCCTACTACAGCGAGTCACTCGAACAGCCAGTGGTCGAACAACCCTCTCCTAGCTCAGCTTACCACGCCGAGTCCTTCGAACACTCTGCTGGTGTCAACCAGCCGTCGGCCACAGGCACCAAGAGGAAGTTGGACGAGTACCTGGATAACTCCCAGGGAGTTGTGGGTCAATTCAACAAGATCAAGTTGAGACCTAAGTACAAGAAGAGCACCATCCAGTCATGCGCTACACTGGAACAAACCATCAACCACAACACTAACATCTGTACAGTGGCTTCCACCCAGGAGATCACTCACTACTTCACAAACGACTTCGCCCCCTACCTGATGAGGTTCGACGATAACGACTACAACTCGAACAGATTCTCCGATCACATGTCTGAAACCGGTTACTACATGTTCGTCGTTAAGAAGTCCGAGGTGAAGCCTTTCGAAATCATCTTCGCCAAGTACGTCTCTAACGTGGTCTACGAGTACACAAACAACTACTACATGGTTGACAACCGTGTGTTCGTTGTGACCTTCGATAAGATCCGCTTCATGATCAGCTACAACCTGGTTAAGGAGACTGGCATCGAAATCCCACACTCACAGGACGTCTGCAACGATGAGACCGCCGCTCAAAACTGCAAGAAGTGTCACTTCGTGGACGTCCACCACACATTCAAGGCCGCTCTGACCTCCTACTTCAACCTCGATATGTACTACGCTCAGACAACCTTCGTGACCTTGCTGCAATCACTCGGCGAGCGTAAGTGTGGATTCCTCTTGTCGAAGTTGTACGAGATGTA
CCAGGACAAGAACCTCTTCACTTTGCCCATCATGCTGAGCCGCAAGGAATCAAACGAGATCGAAACCGCCTCTAACAACTTCTTCGTCTCGCCATACGTTTCCCAGATCCTCAAGTACTCGGAGTCCGTCCAATTCCCGGACAACCCTCCCAACAAGTACGTCGTTGATAACCTGAACCTCATCGTGAACAAGAAGAGCACTCTGACATACAAGTACTCGTCCGTCGCTAACCTGCTCTTCAACAACTACAAGTACCACGACAACATCGCTTCTAACAACAACGCCGAGAACCTCAAGAAGGTCAAGAAGGAAGACGGAAGCATGCACATCGTTGAGCAGTACTTGACTCAAAACGTCGATAACGTTAAGGGTCACAACTTCATCGTGTTGTCCTTCAAGAACGAGGAAAGGCTGACCATCGCTAAGAAGAACAAGGAGTTCTACTGGATCTCTGGCGAAATCAAGGACGTTGATGTGAGCCAGGTCATCCAAAAGTACAACAGATTCAAGCACCACATGTTCGTGATCGGCAAGGTCAACCGTCGCGAGTCAACTACACTGCACAACAACTTGCTGAAGCTCTTGGCCTTGATCCTGCAGGGACTGGTGCCACTCTCCGACGCCATCACATTCGCCGAGCAAAAGCTCAACTGCAAGTACAAGAAGTTCGAGTTCAACTAA
配列番号8
TTCTCTGTCACAGAATGAAAATTTTTCTGTCATCTCTTCGTTATTAATGTTTGTAATTGACTGAATATCAACGCTTATTTGCAGCCTGAATGGCGAATGGGACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAATTTAACGCGAATTTTAACAAAATATTAACGTTTACAATTTCAGGTGGCACTTTTCGGGGAAATGTGCGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATATTGAAAAAGGAAGAGTATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAACTGTCAGACCAAGTTTACTCATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTCCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCATTGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGCAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAAGAGCGCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTTCACACCGCAGACCAGCCGCGTAACCTGGCAAAATCGGTTACGGTTGAGTAATAAATGGATGCCCTGCGTAAGCGGGTGTGGGCGGACAATAAAGTCTTAAACTGAACAAAATAGATCTAAACTATGACAATAAAGTCTTAAACTAGACAGAATAGTTGTAAACTGAAATCAGTCCAGTTATGCTGTGAAAAAGCATACTGGACTTTTGTTATGGCTAAAGCAAACTCTTCATTTTCTGAAGTGCAAATTGCCCGTCGTATTAAAGAGGGGCGTGGCCAAGGGCATGGTAAAGACTATATTCGCGGCGTTGTGACAATTTACCGAACAACTCCGCGGCCGGGAAGCCGATCTCGGCTTGAACGAATTGTTAGGTGGCGGTACTTGGGTCGATATCAAAGTGCATCACTTCTTCCCGTATGCCCAACTTTGTATAGAGAGCCACTGCGGGATCGTCACCGTAATCTGCTTGCACGTAGATCACATAAGCACCAAGCGCGTTGGCCTCATGCTTGAGGAGATTGATGAGCGCGGTGGCAATGCCCTGCCTCCGGTGCTCGCCGGAGACTGCGAGATCATAGATATAGAT
CTCACTACGCGGCTGCTCAAACCTGGGCAGAACGTAAGCCGCGAGAGCGCCAACAACCGCTTCTTGGTCGAAGGCAGCAAGCGCGATGAATGTCTTACTACGGAGCAAGTTCCCGAGGTAATCGGAGTCCGGCTGATGTTGGGAGTAGGTGGCTACGTCTCCGAACTCACGACCGAAAAGATCAAGAGCAGCCCGCATGGATTTGACTTGGTCAGGGCCGAGCCTACATGTGCGAATGATGCCCATACTTGAGCCACCTAACTTTGTTTTAGGGCGACTGCCCTGCTGCGTAACATCGTTGCTGCTGCGTAACATCGTTGCTGCTCCATAACATCAAACATCGACCCACGGCGTAACGCGCTTGCTGCTTGGATGCCCGAGGCATAGACTGTACAAAAAAACAGTCATAACAAGCCATGAAAACCGCCACTGCGCCGTTACCACCGCTGCGTTCGGTCAAGGTTCTGGACCAGTTGCGTGAGCGCATACGCTACTTGCATTACAGTTTACGAACCGAACAGGCTTATGTCAACTGGGTTCGTGCCTTCATCCGTTTCCACGGTGTGCGTCACCCGGCAACCTTGGGCAGCAGCGAAGTCGAGGCATTTCTGTCCTGGCTGGCGAACGAGCGCAAGGTTTCGGTCTCCACGCATCGTCAGGCATTGGCGGCCTTGCTGTTCTTCTACGGCAAGGTGCTGTGCACGGATCTGCCCTGGCTTCAGGAGATCGGTAGACCTCGGCCGTCGCGGCGCTTGCCGGTGGTGCTGACCCCGGATGAAGTGGTTCGCATCCTCGGTTTTCTGGAAGGCGAGCATCGTTTGTTCGCCCAGGACTCTAGCTATAGTTCTAGTGGTTGGCCTACGTACCCGTAGTGGCTATGGCAGGGCTTGCCGCCCCGACGTTGGCTGCGAGCCCTGGGCCTTCACCCGAACTTGGGGGTTGGGGTGGGGAAAAGGAAGAAACGCGGGCGTATTGGTCCCAATGGGGTCTCGGTGGGGTATCGACAGAGTGCCAGCCCTGGGACCGAACCCCGCGTTTATGAACAAACGACCCAACACCCGTGCGTTTTATTCTGTCTTTTTATTGCCGTCATAGCGCGGGTTCCTTCCGGTATTGTCTCCTTCCGTGTTTCAGTTAGCCTCCCCCATCTCCCGGTACCGCATGCTTACAGATTACGAGTCAGGTATCTGGTGCCAATGGGGCGAGGCTCTGAATACACGCCATTAGTGTCCACAGTAAAGTCCACATTAACAGACTTGTTGTAGTTGGAAGTGTACTGAATTTCGGGATTCCAGCGTTTGCTGTTTTCCTTCTGCAGCTCCCACTCGATCTCCACGCTGACCTGTCCCGTGGAGTACTGTGTGATGAAGGAAGCAAACTTTGCCGCACTGAAGGTGGTCGAAGGATTCGCAGGTACCGGGGTGTTCTTGATGAGAATCTGTGGAGGAGGGTGTTTAAGTCCGAATCCACCCATGAGGGGAGAGGGGTGAAAATGTCCGTCCGTGTGTGGAATCTTTGCCCAGATGGGCCCCTGAAGGTACACATCTCTGTCCTGCCAGACCATGCCTGGAAGAACGCCTTGTGTGTTGACATCTGCGGTAGCTGCTTGTCTGTTGCCTCTCTGGAGGTTGGTAGATACAGAACCATACTGCTCCGTAGCCACGGGATTGGTTGTCCTGATTTCCTCTTCGTCTGTAATCATGACCTTTTCAATGTCCACATTTGTTTTCTCTGAGCCTTGCTTCCCAAAGATGAGAACCCCGCTCTGAGGAAAAAACTTTTCTTCATCGTCCTTGTGGCTTGCCATCGCCGGGCCCGGATTCACCAGAGAGTCTCTGCCATTGAGGTGGTACTTGGTAGCTCCAGTCCACGAGTATTCACTGTTGTTGTTATCCGCAGATGTCTTTGATACTCGCTGCTGGCGGTAACAGGGTCCAGGAAGCCAGTTCCTAGACTGGTCCCGAATGTCACTCGCTCCGGCCTGAGAAAACTGAAGCCTTGACTGCGTGGTGGTTCCACTTGGAGTGTTTGTTCTGCTCAAGTAATACAGGTACTGGTCGATGAGAGGATTCATGAGACGGTCCAGACTCTGGCTGTGAGCGTAGCTGCTGTGGAAAGGAACGTCCTCAAAAGTGTAGCTGAAGGTAAAGTTGTTTCCGGTACGCAGCATCTGAGAAGGAAAGTACTCCAGGCAGTAAAATGAAGAGCGTCCTACTGCCTGACTCCCGTTGTTCAGGGTGAGGTATCCATACTGTGGCACCATGAAGACGTCTGCTGGGAACGGCGGGAGGCATCCTTGATGCGCCGAGCCGAGGACGTACGGGAGCTGGTACTCCGAGTCAGTAAACACCTGAACCGTGCTGGTAAGGTTATTGGCAATCGTCGTCGTACCGTCATTCTGCGTGACCTCTTTGACTTGAATGTTAAAGAGCTTGAAGTTGAGTCTCTTGGGTCGGAATCCCCAGTTGTTGTTGATGAGTCTTTGCCAGTCACGTGGTGAAAAGTGGCAGTGGAATCTGTTGAAGTCAAAATACCCCCAAGGGGTGCTGTAGCCAAAGTAGTGATTGTCGTTCGAGGCTCCTGATTGGCTGGAAATTTGTTTGTAGAGGTGGTTGTTGTAGGTGGGCAGGGCCCAGGTTCGGGTGCTGGTGGTGATGACTCTGTCGCCCATCCATGTGGAATCGCAATGCCAATTTCCCGAGGAATTACCCACTCCGTCGGCGCCCTCGTTATTGTCTGCCATTGGTGCGCCACTGCCTGTAGCCATCGTATTAGTTCCCAGACCAGAGGGGGCTGCTGGTGGCTGTCCGAGAGGCTGGGGGTCAGGTACTGAGTCTGCGTCTCCAGTCTGACCAAAATTCAATCTTTTTCTTGCAGGCTGCTGGCCCGCCTTTCCGGTTCCCGAGGAGGAGTCTGGCTCCACAGGAGAGTGCTCTACCGGCCTCTTTTTTCCCGGAGCCGTCTTAACAGGTTCCTCAACCAGGCCCAGAGGTTCAAGAACCCTCTTTTTCGCCTGGAAGACTGCTCGTCCGAGGTTGCCCCCAAAAGACGTATCTTCTTTAAGGCGCTCCTGGAACTCCGCGTCGGCGTGGTTGTACTTGAGGTAAGGGTTGTCTCCGCTGTCGAGCTGCCGGTCGTAGGCTTTGTCGTGCTCGAGGGCAGCGGCGTCTGCCTCGTTCACCGGCTCTCCCTTGTCCAGTCCGTTGAAGGGTCCGAGGTACTTGTACCCGGGAAGCACAAGGCCCCTGCTGTCGTCCTTATGCCGCTCTGCGGGCTTTGGTGGTGGTGGGCCGGGTTTGAGCTTCCACCACTGTCTTATTCCTTCAGAGAGAGTGTCCTCGAGCCAATCGGGTAGATAACCGTCGGCAGCCGTGGCGGCGCTAGCACCATGGCTCGAGATCCCGGGTGATCAAGTCTTCGTCGAGTGATTGTAAATAAAATGTAATTTACAGTATAGTATTTTAATTAATATACAAATGATTTGATAATAATTCTTATTTAACTATAATATATTGTGTTGGGTTGAATTAAAGGTCCGTATACGCCGCTACAGGGCGCGTACTATGGTTGCTTTGACGTATGCGGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATACCGCATCAGGCGCCCCTGCAGGCAGCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTACGCGTTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGT
ACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGCGCTACCGGTCGCCACCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTAGGTCGACGTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATCTAGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTCATTTTATGTTTCAGGTTCAGGGGGAGATGTGGGAGGTTTTTTAAAGTTTAAACAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCTGCCTGCAGGACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCGCGGCCGCTCTAGAGATCATGGAGATAATTAAAATGATAACCATCTCGCAAATAAATAAGTATTTTACTGTTTTCGTAACAGTTTTGTAATAAAAAAACCTATAAATATTCCGGATTATTCATACCGTCCCACCATCGGGCGCGGATCCGCCGCCCTGGCGGGGTTTTACGAGATTGTGATTAAGGTCCCCAGCGACCTTGACGAGCATCTGCCCGGCATTTCTGACAGCTTTGTGAACTGGGTGGCCGAGAAGGAGTGGGAGTTGCCGCCAGATTCTGACTTGGATCTGAATCTGATTGAGCAGGCACCCCTGACCGTGGCCGAGAAGCTGCAGCGCGACTTTCTGACGGAGTGGCGCCGTGTGAGTAAGGCCCCGGAGGCCCTTTTCTTTGTGCAATTTGAGAAGGGAGAGAGCTACTTCCACTTACACGTGCTCGTGGAAACCACCGGGGTGAAATCCTTAGTTTTGGGACGTTTCCTGAGTCAGATTCGCGAAAAACTGATTCAGAGAATTTACCGCGGGATCGAGCCGACTTTGCCAAACTGGTTCGCGGTCACAAAGACCAGAAACGGCGCCGGAGGCGGGAACAAGGTGGTGGACGAGTGCTACATCCCCAATTACTTGCTCCCCAAAACCCAGCCTGAGCTCCAGTGGGCGTGGACTAATTTAGAACAGTATTTAAGCGCCTGTTTGAATCTCACGGAGCGTAAACGGTTGGTGGCGCAGCATCTGACGCACGTGTCGCAGACGCAGGAGCAGAACAAAGAGAATCAGAATCCCAATTCTGACGCGCCGGTGATCAGATCAAAAACTTCAGCCAGGTACATGGAGCTGGTCGGGTGGCTCGTGGACAAGGGGATTACCTCGGAGAAGCAGTGGATACAGGAGGACCAGGCCTCATACATCTCCTTCAATGCGGCCTCCAACTCGCGGTCCCAAATCAAGGCTGCCTTGGACAATGCGGGAAAGATTATGAGCCTGACTAAAACCGCCCCCGACTACCTGGTGGGCCAGCAGCCCGTGGAGGACATTTCCAGCAATCGGATTTATAAAATTTTGGAACTAAACGGGTACGATCCCCAATATGCGGCTTCCGTCTTTCTGGGATGGGCCACGAAAAAGTTCGGCAAGAGGAACACCATCTGGCTGTTTGGGCCTGCAACTACCGGGAAGACCAACATCGCGGAGGCCATAGCCCACACTGTGCCCTTCTACGGGTGCGTAAACTGGACCAATGAGAACTTTCCCTTCAACGACTGTGTGGACAAGATGGTGATCTGGTGGGAGGAGGGGAAGATGACCGCCAAGGTCGTGGAGTCGGCCAAAGCCATTCTCGGAGGAAGCAAGGTGCGCGTGGACCAGAAATGCAAGTCCTCGGCCCAGATAGACCCGACTCCCGTGATCGTCACCTCCAACACCAACATGTGCGCCGTGATTGACGGGAACTCAACGACCTTCGAACACCAGCAGCCGTTGCAAGACCGGATGTTCAAATTTGAACTCACCCGCCGTCTGGATCATGACTTTGGGAAGGTCACCAAGCAGGAAGTCAAAGACTTTTTCCGGTGGGCAAAGGATCACGTGGTTGAGGTGGAGCATGAATTCTACGTCAAAAAGGGTGGAGCCAAGAAAAGACCCGCCCCCAGTGACGCAGATATAAGTGAGCCCAAACGGGTGCGCGAGTCAGTTGCGCAGCCATCGACGTCAGACGCGGAAGCATCGATCAACTACGCAGACAGGTACCAAAACAAATGTTCTCGTCACGTGGGCATGAATCTGATGCTGTTTCCCTGCAGACAATGCGAGAGAATGAATCAGAATTCAAATATCTGCTTCACTCACGGACAGAAAGACTGTTTAGAGTGCTTTCCCGTGTCAGAATCTCAACCCGTTTCTGTCGTCAAAAAGGCGTATCAGAAACTGTGCTACATTCATCATATCATGGGAAAGGTGCCAGACGCTTGCACTGCCTGCGATCTGGTCAATGTGGATTTGGATGACTGCATCTTTGAACAATAATCTAGAGCCTGCAGTCTCGACAAGCTTGTCGAGAAGTACTAGAGGATCATAATCAGCCATACCACATTTGTAGAGGTTTTACTTGCTTTAAAAAACCTCCCACACCTCCCCCTGAACCTGAAACATAAAATGAATGCAATTGTTGTTGTTAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGGATCTGATCACTGCTTGAGCCTAGGAGATCCGAACCAGATAAGTGAAATCTAGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAA
CTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCCGCCCACAGCGGGGCATTTTTCTTCCTGTTATGTTTTTAATCAAACATCCTGCCAACTCCATGTGACAAACCGTCATCTTCGGCTACTTT
配列番号9
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GGTGTGCGTCACCCGGCAACCTTGGGCAGCAGCGAAGTCGAGGCATTTCTGTCCTGGCTGGCGAACGAGCGCAAGGTTTCGGTCTCCACGCATCGTCAGGCATTGGCGGCCTTGCTGTTCTTCTACGGCAAGGTGCTGTGCACGGATCTGCCCTGGCTTCAGGAGATCGGTAGACCTCGGCCGTCGCGGCGCTTGCCGGTGGTGCTGACCCCGGATGAAGTGGTTCGCATCCTCGGTTTTCTGGAAGGCGAGCATCGTTTGTTCGCCCAGGACTCTAGCTATAGTTCTAGTGGTTGGCCTACGTACCCGTAGTGGCTATGGCAGGGCTTGCCGCCCCGACGTTGGCTGCGAGCCCTGGGCCTTCACCCGAACTTGGGGGTTGGGGTGGGGAAAAGGAAGAAACGCGGGCGTATTGGTCCCAATGGGGTCTCGGTGGGGTATCGACAGAGTGCCAGCCCTGGGACCGAACCCCGCGTTTATGAACAAACGACCCAACACCCGTGCGTTTTATTCTGTCTTTTTATTGCCGTCATAGCGCGGGTTCCTTCCGGTATTGTCTCCTTCCGTGTTTCAGTTAGCCTCCCCCATCTCCCGGTACCGCATGCCTTAGTTGAACTCGAACTTCTTGTACTTGCAGTTGAGCTTTTGCTCGGCGAATGTGATGGCGTCGGAGAGTGGCACCAGTCCCTGCAGGATCAAGGCCAAGAGCTTCAGCAAGTTGTTGTGCAGTGTAGTTGACTCGCGACGGTTGACCTTGCCGATCACGAACATGTGGTGCTTGAATCTGTTGTACTTTTGGATGACCTGGCTCACATCAACGTCCTTGATTTCGCCAGAGATCCAGTAGAACTCCTTGTTCTTCTTAGCGATGGTCAGCCTTTCCTCGTTCTTGAAGGACAACACGATGAAGTTGTGACCCTTAACGTTATCGACGTTTTGAGTCAAGTACTGCTCAACGATGTGCATGCTTCCGTCTTCCTTCTTGACCTTCTTGAGGTTCTCGGCGTTGTTGTTAGAAGCGATGTTGTCGTGGTACTTGTAGTTGTTGAAGAGCAGGTTAGCGACGGACGAGTACTTGTATGTCAGAGTGCTCTTCTTGTTCACGATGAGGTTCAGGTTATCAACGACGTACTTGTTGGGAGGGTTGTCCGGGAATTGGACGGACTCCGAGTACTTGAGGATCTGGGAAACGTATGGCGAGACGAAGAAGTTGTTAGAGGCGGTTTCGATCTCGTTTGATTCCTTGCGGCTCAGCATGATGGGCAAAGTGAAGAGGTTCTTGTCCTGGTACATCTCGTACAACTTCGACAAGAGGAATCCACACTTACGCTCGCCGAGTGATTGCAGCAAGGTCACGAAGGTTGTCTGAGCGTAGTACATATCGAGGTTGAAGTAGGAGGTCAGAGCGGCCTTGAATGTGTGGTGGACGTCCACGAAGTGACACTTCTTGCAGTTTTGAGCGGCGGTCTCATCGTTGCAGACGTCCTGTGAGTGTGGGATTTCGATGCCAGTCTCCTTAACCAGGTTGTAGCTGATCATGAAGCGGATCTTATCGAAGGTCACAACGAACACACGGTTGTCAACCATGTAGTAGTTGTTTGTGTACTCGTAGACCACGTTAGAGACGTACTTGGCGAAGATGATTTCGAAAGGCTTCACCTCGGACTTCTTAACGACGAACATGTAGTAACCGGTTTCAGACATGTGATCGGAGAATCTGTTCGAGTTGTAGTCGTTATCGTCGAACCTCATCAGGTAGGGGGCGAAGTCGTTTGTGAAGTAGTGAGTGATCTCCTGGGTGGAAGCCACTGTACAGATGTTAGTGTTGTGGTTGATGGTTTGTTCCAGTGTAGCGCATGACTGGATGGTGCTCTTCTTGTACTTAGGTCTCAACTTGATCTTGTTGAATTGACCCACAACTCCCTGGGAGTTATCCAGGTACTCGTCCAACTTCCTCTTGGTGCCTGTGGCCGACGGCTGGTTGACACCAGCAGAGTGTTCGAAGGACTCGGCGTGGTAAGCTGAGCTAGGAGAGGGTTGTTCGACCACTGGCTGTTCGAGTGACTCGCTGTAGTAGGCAGAGGACACAGCTTCCTCCAGGTTGTCAGTGGTCTTGAGCAGACACTCCACCAAATCGTTGTCAGTGAGCGAGTTAACTGAGGCGAGGAAGTTGCTAGCGGCAGCGGTTTCAGAGTCGGAGATGACAGTATCAGCTCCGTCCGGGGTTGGGTGGTTGTAGTAAGACAAGTAATCGTTAGGTTGCTTGTCGCAGAACTCCGAGTATGAGTTGTCGAAGCTAGCACGAGAGGGAGTGCTGGCAGAGGTGTAGGAAGCGTTGAAGTTGATTTGAGTCATGGTGACCTGGTTGTTCACGATCTTATCGCCACCTGTGTCCACCTGCAGTTGCTGGGCCTCAGCGCAGGCTGAAGTGGCCTCACAGGAGTAGGGGCTGGAAGCACAGTTGGAAGTCATGATGTTTTCTTGGACGTTCAGGACGTGGCTGGATGTACGGATCATGCGCCCGATGGTGGGACGGTATGAATAATCCGGAATATTTATAGGTTTTTTTATTACAAAACTGTTACGAAAACAGTAAAATACTTATTTATTTGCGAGATGGTTATCATTTTAATTATCTCCATGATCGGATCTCCTAGGCTCAAGCAGTGATCAGATCCAGACATGATAAGATACATTGATGAGTTTGGACAAACCACAACTAGAATGCAGTGAAAAAAATGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTTGTCTAGTACTTCTCGACGGTACCGCATGCTATGCATCAGCTGCTAGCACCATGGCTCGAGTTACAGATTACGAGTCAGGTATCTGGTGCCAATGGGGCGAGGCTCTGAATACACGCCATTAGTGTCCACAGTAAAGTCCACATTAACAGACTTGTTGTAGTTGGAAGTGTACTGAATTTCGGGATTCCAGCGTTTGCTGTTTTCCTTCTGCAGCTCCCACTCGATCTCCACGCTGACCTGTCCCGTGGAGTACTGTGTGATGAAGGAAGCAAACTTTGCCGCACTGAAGGTGGTCGAAGGATTCGCAGGTACCGGGGTGTTCTTGATGAGAATCTGTGGAGGAGGGTGTTTAAGTCCGAATCCACCCATGAGGGGAGAGGGGTGAAAATGTCCGTCCGTGTGTGGAATCTTTGCCCAGATGGGCCCCTGAAGGTACACATCTCTGTCCTGCCAGACCATGCCTGGAAGAACGCCTTGTGTGTTGACATCTGCGGTAGCTGCTTGTCTGTTGCCTCTCTGGAGGTTGGTAGATACAGAACCATACTGCTCCGTAGCCACGGGATTGGTTGTCCTGATTTCCTCTTCGTCTGTAATCATGACCTTTTCAATGTCCACATTTGTTTTCTCTGAGCCTTGCTTCCCAAAGATGAGAACCCCGCTCTGAGGAAAAAACTTTTCTTCATCGTCCTTGTGGCTTGCCATCGCCGGGCCCGGATTCACCAGAGAGTCTCTGCCATTGAGGTGGTACTTGGTAGCTCCAGTCCACGAGTATTCACTGTTGTTGTTATCCGCAGATGTCTTTGATACTCGCTGCTGGCGGTAACAGGGTCCAGGAAGCCAGTTCCTAGACTGGTCCCGAATGTCACTCGCTCCGGCCTGAGAAAACTGAAGCCTTGACTGCGTGGTGGTTCCACTTGGAGTGTTTGTTCTGCTCAAGTAATACAGGTACTGGTCGATGAGAGGATTCATGAGACGGTCCAGACTCTGGCTGTGAGCGTAGCTGCTGTGGAAAGGAACGTCCTCAAAAGTGTAGCTGAAGGTAAAGTTGTTTCCGGTACGCAGCATCTGAGAAGGAAAGTACTCCAGGCAGTAAAATGAAGAGCGTCCTACTGCCTGACTCCCGTTGTTCAGGGTGAGGTATCCATACTGTGGCACCATGAAGACGTCTGCTGG
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2つの組換えベクターをそれぞれDH10Bacコンピテント細胞(Invitrogen)に形質転換してブルーホワイトセレクションを行い、白色陽性クローンを採取して培養し、PureLink(商標) HiPure Plasmid DNA Purification Kits(Invitrogen)を使用してバクミド(Bacmid)を抽出した。2種類のBacmidをそれぞれ接着SF9細胞(Gbico)にトランスフェクトし、3日後に初代組換えバキュロウイルスを回収し、P2継代まで増幅した。最後に、得られたP2継代組換えバキュロウイルスをそれぞれBV-Cap-ITR-Rep及びBV-IE-hr1Cap-ITR-Repと命名し、ウイルス力価をTCID50法でそれぞれ測定した。この部分の詳細については、Bac to Bac Expression System操作マニュアル(Invitrogen)を参照された
い。
実施例2 rAAV2のパッケージング及び力価測定
2種類のP2継代組換えバキュロウイルスをMOI=0.1で25mLの懸濁SF9細胞(密度3.0E+06細胞/mL)にそれぞれ感染させ、4日後に細胞を回収し、5mLのTNT溶解液(20mM Tris-HCl (pH7.5)、150mM NaCl、1% Triton(登録商標) X-100、10mmol/l MgCl)を用いて室温で1時間インキュベートして細胞を溶解した。最終濃度50U/mLのヌクレアーゼを追加して37℃で2時間消化し、サンプルを取り、プロテイナーゼK(TIANGEN)を用いて56℃で外殻を1時間消化し、qPCRで力価を測定した。検出手順は以下のとおりである。
定量PCRで使用される標準品は、PvuI-HF(NEB)単一制限酵素消化によって線形化されたpAAV-EGFPプラスミドであった(プラスミド配列は、以下の配列番号22に示される)。
配列番号22
ACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGGACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATCTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCACGTTAAGGGATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCCTTTTAAATTAAAAATGAAGTTTTAAATCAATCTAAAGTATATATGAGTAAACTTGGTCTGACAGTTACCAATGCTTAATCAGTGAGGCACCTATCTCAGCGATCTGTCTATTTCGTTCATCCATAGTTGCCTGACTCCCCGTCGTGTAGATAACTACGATACGGGAGGGCTTACCATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGATACCGCGAGACCCACGCTCACCGGCTCCAGATTTATCAGCAATAAACCAGCCAGCCGGAAGGGCCGAGCGCAGAAGTGGTCCTGCAACTTTATCCGCCTCCATCCAGTCTATTAATTGTTGCCGGGAAGCTAGAGTAAGTAGTTCGCCAGTTAATAGTTTGCGCAACGTTGTTGCCATTGCTACAGGCATCGTGGTGTCACGCTCGTCGTTTGGTATGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGTGCAAAAAAGCGGTTAGCTCCTTCGGTCCTCCGATCGTTGTCAGAAGTAAGTTGGCCGCAGTGTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACTGCATAATTCTCTTACTGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGTCATTCTGAGAATAGTGTATGCGGCGACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAATACGGGATAATACCGCGCCACATAGCAGAACTTTAAAAGTGCTCATCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGCTGTTGAGATCCAGTTCGATGTAACCCACTCGTGCACCCAACTGATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTTCTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAATGCCGCAAAAAAGGGAATAAGGGCGACACGGAAATGTTGAATACTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGGGGTTCCGCGCACATTTCCCCGAAAAGTGCCACCTGACGTCTAAGAAACCATTATTATCATGACATTAACCTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCCCTTTCGTCTCGCGCGTTTCGGTGATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGCAGCTCCCGGAGACGGTCACAGCTTGTCTGTAAGCGGATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGTGTTGGCGGGTGTCGGGGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAGTGCACCATAAAATTGTAAACGTTAATATTTTGTTAAAATTCGCGTTAAATTTTTGTTAAATCAGCTCATTTTTTAACCAATAGGCCGAAATCGGCAAAATCCCTTATAAATCAAAAGAATAGCCCGAGATAGGGTTGAGTGTTGTTCCAGTTTGGAACAAGAGTCCACTATTAAAGAACGTGGACTCCAACGTCAAAGGGCGAAAAACCGTCTATCAGGGCGATGGCCCACTACGTGAACCATCACCCAAATCAAGTTTTTTGGGGTCGAGGTGCCGTAAAGCACTAAATCGGAACCCTAAAGGGAGCCCCCGATTTAGAGCTTGACGGGGAAAGCCGGCGAACGTGGCGAGAAAGGAAGGGAAGAAAGCGAAAGGAGCGGGCGCTAGGGCGCTGGCAAGTGTAGCGGTCACGCTGCGCGTAACCACCACACCCGCCGCGCTTAATGCGCCGCTACAGGGCGCGTACTATGGTTGCTTTGACGTATGCGGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATACCGCATCAGGCGCCCCTGCAGGCAGCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCG
GGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTACGCGTTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGTCAGATCCGCTAGCGCTACCGGTCGCCACCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCACCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCGACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTAGGTCGACGTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATCTAGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTCATTTTATGTTTCAGGTTCAGGGGGAGATGTGGGAGGTTTTTTAAAGTTTAAACAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCTGCCTGCAGG
定量PCRで使用されるプライマー配列は以下のとおりであった。
ITR Forward primer 5’-GGAACCCCTAGTGATGGAGTT-3’(配列番号2)
ITR Reverse primer 5’-CGGCCTCAGTGAGCGA-3’(配列番号3)
定量PCR操作プログラム:95℃で60秒間(95℃で15秒間、60℃で30秒間、40サイクル)。
定量PCRで得られたCT値及び標準品の濃度から標準曲線を描いた後、サンプルの力価を換算した。BV-Cap-ITR-Rep及びBV-IE-hr1Cap-ITR-RepでパッケージングされたrAAV収量は、それぞれ2.39E+04VG/細胞(7.18E+10VG/mLに相当)及び8.67E+05VG/細胞(2.60E+12VG/mLに相当)であった。
実施例3 細胞感染過程におけるEGFPの発現と細胞溶解液におけるCapタンパク質の発現量の比較
感染48時間後、72時間後、96時間後、それぞれ倒立蛍光顕微鏡下で2種類のバキュロウイルスに感染した細胞を観察したところ、最適化された組換えバキュロウイルスは標的遺伝子(本実施例の標的遺伝子はEGFPである)の発現を大幅に減少させることができた(図5)。標的遺伝子(EGFP)の発現量の減少は、細胞内のrAAVパッケージングへの干渉を弱めるようであり、rAAVパッケージング関連の構造及び機能タンパク質の発現により有利である。
Capタンパク質抗体(Progen)を使用して同量の細胞溶解液にWB検出を行った(図6)。結果は、最適化された組換えバキュロウイルスが細胞に感染した後、細胞におけるCapタンパク質の発現レベルが有意に増加したことを示した。
実施例4 精製rAAV2の電子顕微鏡検出及び感染性測定
POROS(商標) CaptureSelect(登録商標)アフィニティークロマトグラフィー充填剤を用いて細胞溶解液を精製し、蛍光定量PCR法により力価を測定し(測定方法は実施例2と同様)、精製したrAAV2をネガティブ染色処理し、透過型電子顕微鏡下で観察した(図7)。ゲノムをパッケージングしたrAAV2は中実粒子であり、核酸を含まない欠陥のあるrAAV粒子の中心は暗く染色された。全体として、形状は損なわれておらず、従来方法(非特許文献1)と比較して空カプシド率が大幅に低下し(約3%)、これは、最適化されたバキュロウイルスベクター構築物を用いると、パッケージング製品中の空カプシドウイルスの割合が大幅に減少することを示し、下流の空カプシドウイルス除去などの工程の負担が大幅に軽減される。
精製したrAAV2を段階希釈し、それぞれMOI=10000、2000、400及び80で培養した293T細胞(48ウェルプレート、5.0E+04細胞/ウェル)に感染させた。感染2日後、EGFPの発現を蛍光顕微鏡で観察した。実験結果は、このシステムによって作製されたrAAV2が高いインビトロ感染活性を有することを示した(図8)。
上記の実施例は、本発明に開示された実施形態を説明するためのものであり、本発明を限定するものとして解釈されるべきではない。更に、本発明の範囲及び精神から逸脱することなく、本明細書に記載された様々な修正及び本発明の方法の変更が当業者には明らかであろう。本発明の様々な特定の好ましい実施形態に関連して本発明を具体的に説明したが、本発明はこれらの特定の実施形態に限定されるべきではないことを理解されたい。実際、本発明を得るために当業者には明らかな上記のような様々な変更は、本発明の範囲に含まれるべきである。

Claims (17)

  1. 核酸構築物であって、
    AAVエレメント、及びIEタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含み、
    前記AAVエレメントがCapタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含むことを特徴とする、
    核酸構築物。
  2. バキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドを更に含むことを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  3. 前記IEタンパク質が、Acie0、Acie01又はAcie02遺伝子のうちの1つ以上によってコードされ、及び/又は、前記バキュロウイルス組換え相同領域が、hr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上から選択されることを特徴とする、請求項2に記載の核酸構築物。
  4. 前記核酸構築物がIEタンパク質遺伝子のプロモーターを更に含み、前記IEタンパク質遺伝子のプロモーターがGp64、pH、p6.9又はp10のうちの1つ以上から選択されることを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  5. 前記核酸構築物がバキュロウイルスプロモーターを更に含み、前記バキュロウイルスプロモーターがバキュロウイルス組換え相同領域に結合されており、前記バキュロウイルスプロモーターが好ましくはpH、Gp64、p6.9又はp10のうちの1つ以上であることを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  6. 前記AAVシスエレメントがITR配列から選択されることを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  7. 前記核酸構築物が外来標的遺伝子を更に含み、前記外来標的遺伝子がAAVエレメントに埋め込まれていることを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  8. 前記核酸構築物の構造が、IE遺伝子発現カセット-Cap遺伝子発現カセット-ITR-外来標的遺伝子発現カセット-ITR-Rep遺伝子発現カセットであることを特徴とする、請求項7に記載の核酸構築物。
  9. 前記核酸構築物のヌクレオチド配列が配列番号1であることを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  10. 前記核酸構築物がアデノ随伴ウイルスベクター又は組換えバキュロウイルスベクターであり、前記組換えバキュロウイルスベクターが好ましくは組換えバキュロウイルスシャトルベクターであることを特徴とする、請求項1に記載の核酸構築物。
  11. 請求項1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物をバキュロウイルス系によって構築することによって得られる、又は請求項1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物中の任意のエレメントを含む核酸構築物をバキュロウイルス系によって共同構築することによって得られることを特徴とする、組換えバキュロウイルス。
  12. 請求項11に記載の組換えバキュロウイルスを細胞に感染させた後にパッケージングすることによって得られることを特徴とする、アデノ随伴ウイルス。
  13. 請求項11に記載の組換えバキュロウイルスに感染した細胞株であることを特徴とする、細胞株。
  14. バキュロウイルス系及び請求項1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物を含むことを特徴とする、アデノ随伴ウイルスベクター系。
  15. 外来標的遺伝子を運ぶAAVエレメント、IEタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びバキュロウイルス組換え相同領域をコードするポリヌクレオチドをバキュロウイルスベクター骨格に組み込むことを含むことを特徴とする、請求項1~10のいずれか一項に記載の核酸構築物を構築する方法。
  16. 前記構築方法が以下の特徴のうちの1つ以上を含むことを特徴とする、請求項15に記載の構築方法。
    1)前記AAVエレメントは、Capタンパク質をコードするポリヌクレオチド、Repタンパク質をコードするポリヌクレオチド、及びAAVシスエレメントを含み、前記AAVシスエレメントは、好ましくはITR配列である。
    2)IEタンパク質をコードする前記ポリヌクレオチドは、Acie0、Acie01又はAcie02のうちの1つ以上から選択される。
    3)前記バキュロウイルスベクター骨格は、pFastBacdual、pFastBac1、pFastBacHTA、pFastBacHTB又はpFastBacHTCのうちの1つから選択される。
    4)前記バキュロウイルス組換え相同領域は、hr1、hr2、hr3、hr4又はhr5のうちの1つ以上から選択される。
  17. 請求項11に記載の組換えバキュロウイルスを昆虫細胞株に感染させる工程を含むことを特徴とする、アデノ随伴ウイルスの産生方法。
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