JP2023538900A - がん診断のためのｏｎｃＲＮＡの検出のシステム及び方法 - Google Patents

がん診断のためのｏｎｃＲＮＡの検出のシステム及び方法 Download PDF

Info

Publication number
JP2023538900A
JP2023538900A JP2023511821A JP2023511821A JP2023538900A JP 2023538900 A JP2023538900 A JP 2023538900A JP 2023511821 A JP2023511821 A JP 2023511821A JP 2023511821 A JP2023511821 A JP 2023511821A JP 2023538900 A JP2023538900 A JP 2023538900A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
cancer
sample
seq
sequence identity
relative
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2023511821A
Other languages
English (en)
Inventor
ハニ グダルジ
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
University of California
Original Assignee
University of California
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by University of California filed Critical University of California
Publication of JP2023538900A publication Critical patent/JP2023538900A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/48—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving transferase
    • C12Q1/485—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving transferase involving kinase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/91—Transferases (2.)
    • G01N2333/912—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • G01N2333/91205—Phosphotransferases in general
    • G01N2333/91245—Nucleotidyltransferases (2.7.7)
    • G01N2333/9125—Nucleotidyltransferases (2.7.7) with a definite EC number (2.7.7.-)
    • G01N2333/9128—RNA-directed DNA polymerases, e.g. RT (2.7.7.49)

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本開示は、概して、試料中の非コードＲＮＡ分子の検出、又は対象の試料中の非コードＲＮＡ分子の検出若しくは定量化に基づいた対象の診断、特に、がん診断のための分子バイオマーカーの同定及び使用に関する。TIFF2023538900000724.tif108170

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０２０年８月１６日に出願された米国仮特許出願第６３／０６６，２６９号の優先権を主張し、その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
技術分野
本開示は、概して、試料中の非コードＲＮＡ分子の検出、又は対象の試料中の非コードＲＮＡ分子の検出若しくは定量化に基づいた対象の診断、特に、がん診断のための分子バイオマーカーの同定及び使用に関する。
背景
遺伝子発現ランドスケープの広範なリプログラミングは、がん発生の特徴である。したがって、病理学的遺伝子発現パターンを駆動する調節経路の体系的な同定は、がんを理解し、治療するための重要なステップである。長年にわたり、多数の調節機構が、がん細胞の分化、生存、浸潤、及び拡散に関与する発がん性の遺伝子の発現に関与してきた。多数の研究が、発がん性の根底にある転写経路に焦点を当ててきたが、転写後の調節経路もこのプロセスの主要な調節因子として浮上している。例えば、遺伝子サイレンシングにおいて機能する小さいＲＮＡのサブクラスであるマイクロＲＮＡ（小さい非コードＲＮＡ）は、乳がん進行の最初に特徴付けられた転写後調節因子の中のものであった（１）。ＲＮＡ結合タンパク質（ＲＢＰ）もまた、遺伝子発現の重要な転写後調節因子であり、いくつかの特定のＲＢＰは、発がん性及びがん進行に影響を及ぼすことが示されている（２～５）。最近、他のクラスの小さい非コードＲＮＡである、転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ、６）及びｔＲＮＡ断片（７）が、乳がんの進行に基本的な役割を果たすことが実証された。
がんに関与する調節機構の多様なレパートリーにもかかわらず、それらの間の共通の特徴は、それらが細胞内の既存の経路を選択し、調節不全にすることである。言い換えれば、がん細胞は、体細胞変異（例えば、ＫＲＡＳ、８）、遺伝子融合（例えば、ＢＣＲ－ＡＢＬ、９）、エピジェネティック修飾（例えば、プロモーター過剰メチル化、１０）、及び調節機構の破壊（ＮＦｋＢ転写因子、１０）などの、無数の戦略を採用して、発がん性を過剰に活性化し、腫瘍抑制経路を下方制御する（１１、１２）。これらの戦略は、既に実施されている規制プログラムの病理学的調節に依存しているが、がん細胞が、腫瘍発生を駆動する特殊な調節経路を進化又は操作することができる可能性がしばしば見過ごされている。
概要
乳がんによって発現されるが、健康な正常には存在しない小さい非コードＲＮＡのための系統的スクリーニングを実行すると、２０１個の小さい非コードＲＮＡのセットが、乳がんと強く関連しているが、正常細胞ではほとんど検出できないことが以前に特定された。これらの小さい非コードＲＮＡはがんに関連しているが、機能的には不明であるため、「オーファン非コードＲＮＡ」又は「ｏｎｃＲＮＡ」と命名されている。乳がんの診断及び／又は検出におけるこれらのｏｎｃＲＮＡの先行発見及び応用は、２０１９年５月１６日に発行されたＷＯ２０１９／０９４７８０、及びＦｉｓｈ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．，２０１８，２４：１７４３－１７５１に以前に記載されており、各刊行物の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本開示は、様々な種類のがん、原発組織、及びがんの状態を示すバイオマーカーとして機能する新規の小さい非コードＲＮＡを提供し、これは、早期段階であっても、対象におけるがんを正確に診断するために使用され得る。いくつかの実施形態では、この方法は、好適な試料中の細胞外の循環している小さい非コードＲＮＡの検出を含む。いくつかの実施形態では、試料は、ヒト血清試料である。いくつかの実施形態では、試料は、小さい非コードｍＲＮＡを含むエクソソームを含む分画ヒト血清試料である。
本開示は、良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞を有する対象を診断する方法であって、対象の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出することを含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示の方法における検出するステップは、対象から試料を取得するステップの後に行われる。いくつかの実施形態では、試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップは、試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブと接触させること、及び試料中の量を、対照試料から得た測定値で正規化することを含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法は、試料を、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の非コードＲＮＡ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の非コード核酸配列に相補的な少なくとも１つの核酸分子に曝露することを更に含む。いくつかの実施形態では、開示される方法は、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を基準として、対象が良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞増殖を有する確率又は尤度と、試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を相関させることを更に含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法によって診断される良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞は、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮から選択される組織からのものである。いくつかの実施形態では、開示される方法は、１つ又は複数の基底（ｂａｓａｌ）がん又は管腔（ｌｕｍｉｎａｌ）がんから選択される、対象における前悪性又は悪性の過剰増殖細胞の存在を診断する。
いくつかの実施形態では、試料は、対象からの血液又は血清である。いくつかの実施形態では、試料は、対象からの少なくとも１つの細胞によって播種又は接種された細胞の培養物から採取される。いくつかの実施形態では、試料は、対象からの少なくとも１つの初代細胞によって播種又は接種された細胞の培養物から採取される。いくつかの実施形態では、試料は、対象の血漿、血清若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの組織又は液体試料を含む、ヒト組織試料である。いくつかの実施形態では、試料は、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞を含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法は、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮から選択される対象の組織からの少なくとも１つの細胞を増殖させるのに十分な条件下かつ期間にわたって、培養培地で対象からの少なくとも１つの生検を培養することを更に含む。いくつかの実施形態では、試料は、乳がん細胞からのｏｎｃＲＮＡを含まない。いくつかの実施形態では、対象は、乳房からの過剰増殖細胞を含まないか、又は乳がんと診断されていないか、若しくは乳がんについて治療されていない。
いくつかの実施形態では、開示される方法において試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を測定するステップは、試料をデジタル撮像すること、試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片のエピトープに特異的な既知の量の標識された抗体に曝露すること、試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的な１つ又は複数の色素に曝露すること、試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む少なくとも１つの標識されたプローブに曝露すること、試料をクロマトグラフィーに曝露すること、試料の全ＲＮＡを単離すること、及び全ＲＮＡを配列決定分析に曝露すること、並びに／又は試料を質量分析に曝露すること、のうちの１つ又は組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、このステップは、試料からの細胞の形態を分析することを更に含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップは、化学発光プローブ、蛍光プローブ、及び／又は蛍光顕微鏡を使用することを含む。いくつかの実施形態では、この検出するステップは、試料の全ＲＮＡを、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の非コードＲＮＡ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の非コード核酸配列に相補的なｓヌクレオチド配列を含む少なくとも１つのプローブと接触させることを更に含む。
本開示は、対象においてがん細胞を検出する方法であって、試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ配列に相補的なヌクレオチド配列を含む１つ又は複数のプローブと接触させることによって、試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出することを含む、前記方法に更に関する。いくつかの実施形態では、検出するステップは、対象から試料を得るステップの後に行われる。いくつかの実施形態では、開示される方法は、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを計算することと、
ｂ）少なくとも非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、対象が、がんを有すると診断されるように、１つ以上のスコアを、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと
を更に含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法によって検出される少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片は、配列番号１～配列番号１５４３のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、開示される方法によって検出される少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片は、配列番号１～配列番号１５４３から選択される。
いくつかの実施形態では、試料は、対象の血清若しくは血漿若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの組織を含む、ヒト組織試料である。いくつかの実施形態では、試料は、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞からの全ＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、試料は、血漿、血液又は血清である。いくつかの実施形態では、試料は、細胞全体を含まない。いくつかの実施形態では、試料は、ｏｎｃＲＮＡを含むエクソソームを含むが、細胞全体を含まない。
いくつかの実施形態では、開示される方法の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片を定量化するステップは、試料から全ＲＮＡを単離することを含む。
本開示はまた、がんを有する対象を診断する方法であって、
ａ）対象の試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブと接触させることによって、試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出することと、
ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在又は量が、試料中で検出される場合、対象を、がんを有すると診断することと
を含む、前記方法に関する。
いくつかの実施形態では、検出するステップは、対象から試料を取得するステップの後に行われる。いくつかの実施形態では、ステップａ）は、
ｉ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを計算することと、
ｉｉ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、対象が、がんを有すると診断されるように、１つ以上のスコアを、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと
を更に含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法で使用される１つ又は複数のプローブは、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、開示される方法は、当該がんの抗原の存在、非存在、又は量を検出することを更に含む。いくつかの実施形態では、開示される方法の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片を定量化するステップは、蛍光及び／又はデジタル撮像を使用することを含む。
いくつかの実施形態では、試料は、対象の血漿、血清若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの細胞又は組織を含む、ヒト組織試料である。いくつかの実施形態では、試料は、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞からの全ＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、試料は、ヒト血清である。
本開示は、がんと診断されたか、又はそれを有することが疑われる、治療を必要とする対象を治療する方法であって、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブを、対象からの試料と接触させることと、
ｂ）試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を定量化することと、
ｃ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを計算することと、
ｄ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、対象が、がんを有すると診断されるように、１つ以上のスコアを、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと、
ｅ）対象に、がんのための治療有効量の治療を投与することと
を含む、前記方法に更に関する。
いくつかの実施形態では、開示される方法で使用される１つ又は複数のプローブは、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、フルオロフォア、化学発光剤、及び／又はクエンチング剤を含む少なくとも１つの基質は、開示される方法の検出するステップに使用される。
いくつかの実施形態では、開示される方法のいずれかの対象は、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、表１に列挙されたがんのうちのいずれかから選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、肺がん、乳がん、前立腺がん、結腸直腸がん、膵臓がん、肝臓がん、及び卵巣がんから選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである。
本開示はまた、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に結合する１つ又は複数のプローブ及び／又は染色剤、並びに
ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ及び／又はその機能的断片に結合する少なくとも１つのプローブ又は染色剤の存在、非存在及び／又は量を定量化することができる１つ以上のデバイス
を含む、システムに関する。
本開示はまた、
ａ）試料、
ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に結合する１つ又は複数のプローブ及び／又は染色剤、並びに
ｃ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ及び／又はその機能的断片に結合する少なくとも１つのプローブ又は染色剤の存在、非存在及び／又は量を定量化することができる１つ以上のデバイス
を含む、システムに関する。
いくつかの実施形態では、開示されるシステムに含まれる１つ又は複数のプローブは、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、試料は、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される。いくつかの実施形態では、試料は、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される。いくつかの実施形態では、試料は、表１に列挙されたがんのうちのいずれかから選択されるがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される。いくつかの実施形態では、対象は、肺がん、乳がん、前立腺がん、結腸直腸がん、膵臓がん、肝臓がん、及び卵巣がんから選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである。
本開示は、過剰増殖細胞を含む試料の発達段階又は病理を特徴付けるための方法であって、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な複数のプローブを、試料と接触させることと、
ｂ）試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を定量化することと、
ｃ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上の正規化スコアを計算することと、
ｄ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量よりも多い場合、相関させるステップが、試料を、過剰増殖細胞を含むとして特徴付けることを含むように、１つ以上のスコアを、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量と相関させることと
を含む、前記方法に更に関する。
本開示は、対象が悪性増殖を有するかどうかを決定する方法であって、試料を、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的なプローブ、又は
ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的な基質
と接触させることによって、対象の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量を検出することを含む、前記方法に更に関する。
いくつかの実施形態では、開示される方法で使用される１つ又は複数のプローブは、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、開示される方法で使用される試料は、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される。いくつかの実施形態では、開示される方法で使用される試料は、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される。
本開示は、対象の試料からのＲＮＡを処理する方法であって、
（ｉ）全ＲＮＡ中の小さい非コードＲＮＡを全ｍＲＮＡから分離することと、
（ｉｉ）小さい非コードＲＮＡを分析することと
を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、処理する方法は、対象から試料を得ることを更に含む。いくつかの実施形態では、処理する方法は、遠心分離によって試料の他の成分から試料中の全ＲＮＡを単離するステップを更に含む。いくつかの実施形態では、試料から小さい非コードＲＮＡを分離するステップは、試料の遠心分離及び試料からの細胞全体の除去を含む。いくつかの実施形態では、試料から小さい非コードＲＮＡを分離するステップは、対象の全血からのエクソソームの除去を含み、その試料は全血である。いくつかの実施形態では、分析ステップは、試料中のｏｎｃＲＮＡの存在、非存在、又は量を検出することを含む。いくつかの実施形態では、ｏｎｃＲＮＡは、表２から選択されるいずれか１つ又は複数のｏｎｃＲＮＡに対応するＲＮＡ配列である。いくつかの実施形態では、分析ステップは、試料中のｏｎｃＲＮＡの存在、非存在、又は量を検出することを含む。いくつかの実施形態では、ｏｎｃＲＮＡは、配列番号配列番号１５４４～配列番号６８３４から選択されるいずれか１つ又は複数のｏｎｃＲＮＡに対応するＲＮＡ配列である。いくつかの実施形態では、試料中のｏｎｃＲＮＡの存在又は非存在を検出する方法は、試料中の単離された小さい非コードＲＮＡのプールからＲＮＡを配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出するステップは、試料中の単離された小さい非コードＲＮＡのプールから、ｏｎｃＲＮＡ又はｏｎｃＲＮＡのｃＤＮＡ相補体を増幅することを含む。いくつかの実施形態では、検出するステップは、単離された小さい非コードＲＮＡのプールを、ｃＤＮＡ配列の配列番号１～配列番号１５４３又は表２のＲＮＡ配列のうちのいずれかによってコードされたＲＮＡ配列に特異的なプローブ又は複数のプローブに曝露することを含む。いくつかの実施形態では、１つ又は複数のプローブは、表２のＤＮＡ配列又はその断片のうちの１つ又は複数を含む。いくつかの実施形態では、プローブ又は複数のプローブは、蛍光標識を含む。いくつかの実施形態では、検出することは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によってｏｎｃＲＮＡのＲＮＡ又はｃＤＮＡ配列を増幅することを含む。いくつかの実施形態では、ＲＮＡ又はｃＤＮＡ配列を増幅するためのプローブ又はプライマーは、長さが約４～約１００、２００、３００、又は４００ヌクレオチドであるヌクレオチド配列である。いくつかの実施形態では、プローブ又はプライマーは、配列番号６８３５～配列番号１８６７６から選択される１つ若しくは複数のｃＤＮＡ、又はその断片であって、配列番号６８３５～配列番号１８６７６からの内側にネストされた長さが約４～約５０ヌクレオチドである。
本開示はまた、例えば、配列番号６８３５～配列番号１８６７６から選択される１つ又は複数のｃＤＮＡを含むか、又はそれらから本質的になる、キット、チューブ、又はシステムを含む、組成物に関する。いくつかの実施形態では、組成物は、ＳＥＱ ＩＤ Ｎ：６８３５～配列番号１８６７６に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を有するｃＤＮＡを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、蛍光部分で標識された１つ又は複数のｃＤＮＡ分子を含む。
図１Ａ及び図１Ｂは、勾配ブースティング分類器の混同行列を示す。ＴＣＧＡデータを、訓練セット及び試験セットに分割し（８０／２０分割）、同定されたｏｎｃＲＮＡを訓練セットの特徴として使用して勾配ブースティング分類器を訓練した。混同行列は、試験セットの分類器予測を使用して計算した。次に、可視化を目的として、混同行列を、行（図１Ａ）及び列（図１Ｂ）に別々に正規化した。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 図１Ａ－１の説明を参照のこと。 各がんの種類に存在するｏｎｃＲＮＡの数の棒グラフを示す。カウントは、各がんについての全てのフィルタリング条件を満たした同定されたｏｎｃＲＮＡの数を表す。 図３Ａ、図３Ｂ、及び図３Ｃは、浸潤性乳がん（図３Ａ）、結腸腺がん（図３Ｂ）、及び肺腺がん（図３Ｃ）内に存在するｏｎｃＲＮＡのヒートマップを示す。ヒートマップは、がんの種類の各々の中で見出されるｏｎｃＲＮＡのＲＮＡ発現データ（ｃｐｍ）から生成され、全ての組織の種類にわたる全ての正常試料でプロットした。発現データは、可視化目的のために最大正規化された。 図３Ａの説明を参照のこと。 図３Ａの説明を参照のこと。
詳細な説明
本開示は、様々な種類のがんを示すバイオマーカーとして機能し、対象におけるがんを正確に診断又はグレード分けするために使用され得る、新規の小さい非コードＲＮＡを提供する。いくつかの実施形態では、この方法は、好適な試料中の細胞外の循環している小さいＲＮＡの検出を伴う。
定義
本方法を説明する前に、本開示は、記載された特定のプロセス、組成物、又は方法論に限定されず、これらは変更されてもよいことを理解されたい。説明で使用される専門用語は、特定のバージョン又は実施形態を記載するためのものであるにすぎず、本開示の範囲を限定することを意図するものではないことも理解されたい。別途定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、当業者によって一般に理解されている意味と同じ意味を有する。例えば、Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ ｏｆ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２ｎｄ Ｅｄ．，Ｊ．Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ １９９４）は、当業者に、本開示で使用される用語の多くに対する一般的な指針を提供する。更に、本開示の実施は、特に断らない限り、当業者の範囲内である、分子生物学（組換え技術を含む）、微生物学、細胞生物学、及び生化学の従来の技術を利用する。そのような技術は、“Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，”２ｎｄ Ｅｄ．（Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，１９８９）、“Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ”（Ｍ．Ｊ．Ｇａｉｔ，Ｅｄ．，１９８４）、“Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ”（Ｒ．Ｉ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙ，Ｅｄ．，１９８７）、“Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ”（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）、“Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，”４ｔｈ Ｅｄ．（Ｄ．Ｍ．Ｗｅｉｒ ＆ Ｃ．Ｃ．Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ，Ｅｄｓ．，Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｉｎｃ．，１９８７）、“Ｇｅｎｅ Ｔｒａｎｓｆｅｒ Ｖｅｃｔｏｒｓ ｆｏｒ Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｃｅｌｌｓ”（Ｊ．Ｍ．Ｍｉｌｌｅｒ ＆ Ｍ．Ｐ．Ｃａｌｏｓ，Ｅｄｓ．，１９８７）、“Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ”（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｅｄｓ．，１９８７）、及び“ＰＣＲ：Ｔｈｅ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ，”（Ｍｕｌｌｉｓ ｅｔ ａｌ．，Ｅｄｓ．，１９９４）などの文献に十分に説明されている。本明細書に記載されるものと同様又は等価の任意の方法及び材料を、本開示の実施形態の実施又は試験において使用することができるが、いくつかの実施形態における方法、デバイス、及び材料をここで記載する。本明細書で言及される全ての刊行物は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。本明細書のいずれのものも、本開示が、先行の発明という理由によりそのような開示に先行する権利がないという了解として解釈されるべきではない。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、文脈がそうでないことを明確に示さない限り、複数の参照を含むことが留意されなければならない。したがって、例えば、「ペプチド」への言及は、当業者に既知である１つ以上のペプチド及びその等価物への言及である。
「約」又は「およそ」という用語は、当該技術分野における典型的な許容範囲内を意味するために本明細書で使用される。例えば、「約」は、平均からの約２の標準偏差として理解され得る。ある特定の実施形態によれば、量などの測定可能な値を指す場合、「約」は、変動が、開示される方法を実施するのに適切であるように、指定された値から±２０％、±１０％、±５％、±１％、±０．９％、±０．８％、±０．７％、±０．６％、±０．５％、±０．４％、±０．３％、±０．２％、又は±０．１％の変動を包含することを意味する。「約」が、一連の数値又は範囲の前に存在する場合、「約」は、一連の数値又は範囲の各々を修飾することができることが理解される。
本明細書において「Ａ及び／又はＢ」などの語句で使用される場合、「及び／又は」という用語は、Ａ及びＢの両方、Ａ又はＢ、Ａ（単独）、及びＢ（単独）を含むことが意図される。同様に、「Ａ、Ｂ、及び／又はＣ」などの語句で使用される場合、「及び／又は」という用語は、以下の実施形態の各々を包含することを意図している。Ａ、Ｂ、及びＣ；Ａ、Ｂ、又はＣ；Ａ又はＣ；Ａ又はＢ；Ｂ又はＣ；Ａ及びＣ；Ａ及びＢ；Ｂ及びＣ；Ａ（単独）；Ｂ（単独）；並びにＣ（単独）。
本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、少なくとも１つの抗原結合部位を通じて、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、又は前述の組み合わせなどの標的を認識し、特異的に結合する免疫グロブリン分子を指す。本明細書で使用される場合、この用語は、インタクトなポリクローナル抗体、インタクトなモノクローナル抗体、一本鎖抗体、抗体断片（Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、及びＦｖ断片など）、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）抗体、二重特異性抗体などの多重特異性抗体、単一特異性抗体、一価抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、抗体の抗原結合部位を含む融合タンパク質、及び抗体が所望の生物学的結合活性を示す限り、抗原結合部位を含む任意の他の修飾された免疫グロブリン分子を包含する。抗体は、免疫グロブリンの５つの主要なクラスのうちのいずれかであり得る：アルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ、及びミューとそれぞれ称される重鎖定常ドメインの同一性に基づく、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、及びＩｇＭ、又はそれらのサブクラス（アイソタイプ）（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、及びＩｇＡ２）。免疫グロブリンの異なるクラスは、異なり、周知のサブユニット構造及び三次元構成を有する。抗体は、裸であってもよいか、又は毒素及び放射性同位体を含むが、これらに限定されない、他の分子にコンジュゲートされてもよい。
「抗体断片」という用語は、インタクトな抗体の一部を指し、インタクトな抗体の抗原決定可変領域を指す。抗体断片の例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、及びＦｖ断片、直鎖抗体、一本鎖抗体、並びに抗体断片から形成される多重特異性抗体が含まれるが、これらに限定されない。本明細書で使用される場合、「抗体断片」は、少なくとも１つの抗原結合部位又はエピトープ結合部位を含む。抗体の「可変領域」という用語は、単独又は組み合わせのいずれかで、抗体軽鎖の可変領域、又は抗体重鎖の可変領域を指す。重鎖又は軽鎖の可変領域は、一般に、「超可変領域」としても知られている３つの相補性決定領域（ＣＤＲ）によって連結された４つのフレームワーク領域（ＦＲ）からなる。各鎖のＣＤＲは、フレームワーク領域によって近接して一緒に保持され、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する。ＣＤＲを決定するための少なくとも２つの技術が存在する。（１）種間配列多様性に基づくアプローチ（すなわち、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ）、及び（２）抗原－抗体複合体の結晶学的研究に基づくアプローチ（Ａｌ－Ｌａｚｉｋａｎｉ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２７３：９２７－９４８）。加えて、これらの２つのアプローチの組み合わせは、ＣＤＲを決定するために当該技術分野で使用されることがある。
本明細書で使用される場合、「バイオマーカー」という用語は、個体のがん状態を予測するのに有用な様々な濃度で個体に存在する生体分子を指す。バイオマーカーには、核酸、タンパク質、並びにそれらのバリアント及び断片が含まれ得るが、これらに限定されない。バイオマーカーは、バイオマーカーをコードする全核酸配列若しくは部分核酸配列を含むＤＮＡ、又はそのような配列の相補体であり得る。本発明において有用なバイオマーカー核酸は、目的の核酸配列のうちのいずれかの全配列又は部分配列を含むＤＮＡ及びＲＮＡの両方を含むと考えられる。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、試料中のエクソソーム内のＲＮＡである。
本明細書で使用される場合、「体液」という用語は、血液（又は血漿若しくは血清などの血液の画分）、リンパ、粘液、涙、唾液、汗、痰、尿、精液、便、脳脊髄液（ＣＳＦ）、母乳、及び腹水を含む体液を指す。いくつかの実施形態では、体液は、血液である。いくつかの実施形態では、体液は、血液の画分である。いくつかの実施形態では、体液は、血漿である。いくつかの実施形態では、体液は、血清である。いくつかの実施形態では、体液は、尿である。
本明細書で使用される場合、「がん」及び「がん性」という用語は、細胞の集団が、無制御な細胞増殖を特徴とする哺乳動物における生理学的状態を指すか、又は説明する。したがって、「がん」という用語は、体の他の部分に浸潤又は広がる可能性のある異常な細胞増殖を伴う疾患の群を指す。がんの例には、肺がん、骨がん、血液がん、慢性骨髄単球性白血病（ＣＭＭＬ）、胆管がん、子宮頸がん、肝臓がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部がん、眼がん、皮膚若しくは眼内黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、結腸がん、乳がん、精巣がん、婦人科腫瘍（例えば、子宮肉腫、卵管がん、子宮内膜がん、子宮頸がん、膣がん若しくは外陰がん）、ホジキン病、食道がん、小腸がん、内分泌系がん（例えば、甲状腺がん、副甲状腺がん若しくは副腎がん）、軟組織肉腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性若しくは急性白血病、小児固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱がん、腎臓若しくは尿管がん（例えば、腎細胞がん、腎盂がん）、又は中枢神経系の新生物（例えば、原発性ＣＮＳリンパ腫、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫若しくは下垂体腺腫）が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「対象におけるがんを特徴付けること」という用語は、対象におけるがん試料の１つ以上の特性の同定を指し、これには、良性、前がん性、又はがん性組織の存在、がんの病期、がんの種類、がんの起源の組織、及び対象の予後が含まれるが、これらに限定されない。がんは、本明細書に開示されるｎｃＲＮＡ及び／又はｏｎｃＲＮＡを含むが、これらに限定されない、１つ以上のがんマーカー遺伝子の発現の同定によって特徴付けられてもよい。本明細書で使用される場合、「がんの病期」という用語は、がんの進行のレベルの定性的又は定量的評価を指す。がんの病期を決定するために使用される基準には、腫瘍の大きさ及び転移の程度（例えば、局所的又は遠隔的）が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「相補的」又は「相補性」という用語は、塩基対合規則によって関連するポリヌクレオチド（すなわち、ヌクレオチドの配列）に関して使用される。例えば、配列「５’－Ａ－Ｇ－Ｔ－３’」は、配列「３’－Ｔ－Ｃ－Ａ－５’」に相補的である。相補性は、「部分的」であってもよく、いくつかの核酸塩基のみが、塩基対合規則に従って一致する。代替的に、核酸間に「完全な」又は「全体的な」相補性が存在し得る。核酸鎖間の相補性の程度は、核酸鎖間のハイブリダイゼーションの効率及び強度に有意な影響を及ぼす。これは、増幅反応、及び核酸間の結合に依存する検出方法において特に重要である。
本明細書及び特許請求の範囲で使用される場合、「含む」という用語は、「からなる」及び「から本質的になる」態様を含むことができる。含むことはまた、「を含むが、これに限定されない」ことを意味することができる。
本明細書で使用される場合、「相関する」又は「相関すること」という用語は、２つの事象のインスタンス間の統計的関連を指し、事象は、数字、データセットなどを含むことができる。例えば、事象が数字を含む場合、正の相関（本明細書では、「直接相関」とも称される）は、一方が増加するにつれて、他方も同様に増加することを意味する。負の相関（本明細書では、「逆相関」とも称される）は、一方が増加するにつれて、他方が減少することを意味する。本開示は、小さい非コードＲＮＡを提供し、そのレベルは、特定の小さい非コードＲＮＡのレベルと、特定の種類のがんを発症する尤度との間などの、特定の結果尺度と相関する。例えば、小さい非コードＲＮＡのレベルの上昇は、患者にとって良好な臨床転帰の尤度と負に相関し得る。この場合、例えば、患者は、がんの再発なしに長期生存の尤度が低下し、かつ／又は化学療法に対する陽性反応などを有し得る。そのような負の相関は、患者が予後不良を示すか、又は化学療法に対して不十分に反応する可能性が高く、これは、例えば、高いハザード比によって、様々な方法で統計的に実証され得ることを示す。
本明細書で使用される場合、「検出する」、「検出すること」、又は「検出」という用語は、組成物を発見若しくは識別する一般的な行為、又は組成物の特定の観察のいずれかを指す。組成物を検出することは、組成物の存在又は非存在を決定することを含み得る。検出することは、組成物を定量化することを含み得る。例えば、検出することは、組成物の発現レベルを決定することを含む。組成物は、核酸分子を含み得る。例えば、組成物は、本明細書に開示されるｎｃＲＮＡ及び／又はｏｎｃＲＮＡの少なくとも一部を含み得る。代替的に、又は追加的に、組成物は、検出可能に標識された組成物であり得る。
本明細書で使用される場合、「診断された」という用語は、徴候及び症状の存在若しくは検出、又は遺伝子分析、病理学的分析、組織学的分析などによる疾患の認識を指す。
「断片」とは、ポリペプチド又は核酸分子の一部を意味する。この部分は、好ましくは、参照核酸分子又はポリペプチドの全長の少なくとも約５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は約９９％を含有する。断片は、約５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、若しくは１００、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００又はそれ以上のヌクレオチド又はアミノ酸を含有し得る。
「機能的断片」という用語は、それぞれの完全長ポリペプチド又は核酸が関係するポリペプチド又は核酸配列の任意の部分を意味し、その部分は、十分な長さのものであり、断片が基礎とする完全長ポリペプチド又は核酸に少なくとも類似又は実質的に類似する生物学的影響を与えるのに十分な構造を有する。いくつかの実施形態では、機能的断片は、本明細書に開示される核酸配列のうちのいずれか１つをコードする完全長又は野生型核酸配列の一部であり、当該部分は、完全長よりも小さいが、完全長又は野生型タンパク質と比較して依然として生物学的に機能的なドメインをコードする、特定の長さ及び／又は構造のポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、機能的断片は、断片が基礎とする野生型又は完全長のポリペプチド配列と比較して、低下した生物学的活性、ほぼ同等の生物学的活性、又は向上した生物学的活性を有し得る。いくつかの実施形態では、機能的断片は、ヒトなどの生物の配列に由来する。そのような実施形態では、機能的断片は、配列が由来する野生型ヒト配列に対して、９９％、９８％、９７％、９６％、９５％、９４％、９３％、９２％、９１％、又は９０％の配列同一性を保持し得る。いくつかの実施形態では、機能的断片は、配列が由来する野生型配列に対して、８５％、８０％、７５％、７０％、６５％、又は６０％の配列同一性を保持し得る。
「遺伝子」という用語は、ポリペプチド、前駆体、又はＲＮＡ（例えば、ｒＲＮＡ、ｔＲＮＡ）の産生に必要なコード配列を含む核酸（例えば、ＤＮＡ）配列を指す。ポリペプチド又はＲＮＡは、完全長又は断片の所望の活性又は機能的特性（例えば、酵素活性、リガンド結合、シグナル伝達、免疫原性など）が保持される限り、完全長のコード配列によって、又はコード配列の任意の部分によってコードされ得る。いくつかの実施形態では、対象の細胞又は試料は、非がん性細胞のゲノムに存在しないｏｎｃＲＮＡを発現及び／又は分泌する過剰増殖細胞を含む。この用語はまた、遺伝子が完全長ｍＲＮＡの長さに対応するように、いずれかの末端で約１ｋｂ以上の距離にわたる、構造遺伝子のコード領域、並びに５’及び３’末端上の両方のコード領域に隣接して位置する配列を包含する。コード領域の５’に位置し、ｍＲＮＡ上に存在する配列は、５’非翻訳配列と称される。コード領域の３’又は下流に位置し、ｍＲＮＡ上に存在する配列は、３’非翻訳配列と称される。「遺伝子」という用語は、遺伝子のｃＤＮＡ及びゲノム形態の両方を包含する。遺伝子のゲノム形態又はクローンは、「イントロン」又は「介在領域」又は「介在配列」と呼ばれる非コード配列によって中断されるコード領域を含有する。イントロンは、核ＲＮＡ（ｈｎＲＮＡ）に転写される遺伝子のセグメントであり、イントロンは、エンハンサーなどの調節エレメントを含有し得る。イントロンは、核転写産物又は一次転写産物から除去又は「スプライスアウト」され、したがって、イントロンは、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）転写産物には存在しない。ｍＲＮＡは、新生ポリペプチドにおけるアミノ酸の配列又は順序を特定するために、翻訳中に機能する。
本明細書で使用される場合、「ハイブリダイゼーション」又は「ハイブリダイズする」という用語は、ワトソン－クリック塩基対合を介して二本鎖を形成するのに十分に相補的なヌクレオチド配列間の二本鎖の形成を指す。２つのヌクレオチド配列は、これらの分子が、塩基対組織相同性を共有する場合、互いに「相補的」である。「相補的」ヌクレオチド配列は、特異性と合わせて、適切なハイブリダイゼーション条件下で安定した二本鎖を形成する。例えば、第１の配列のセクションが、第２の配列のセクションに逆平行センスで結合することができる場合、２つの配列は相補的であり、各配列の３’末端が他の配列の５’末端に結合し、次いで、一方の配列の各Ａ、Ｔ（Ｕ）、Ｇ、及びＣが、他方の配列のＴ（Ｕ）、Ａ、Ｃ、及びＧとそれぞれ整列する。ＲＮＡ配列はまた、相補的Ｇ＝Ｕ又はＵ＝Ｇ塩基対を含むことができる。したがって、２つの配列は、「相補的」であるために完全な相同性を有する必要はない。通常、２つの配列は、ヌクレオチドの少なくとも約９０％（好ましくは、少なくとも約９５％）が、分子の定義された長さにわたって塩基対組織を共有する場合、十分に相補的である。本開示では、各空間インデックスプライマーの捕捉ドメインは、核酸に対する相補性領域、例えば、組織試料のＲＮＡ（好ましくは、ｍＲＮＡ）を含む。いくつかの実施形態では、各空間インデックスプライマーの捕捉ドメインに含まれるそのような相補性領域は、ポリＡ尾部を介してｍＲＮＡを捕捉するためのポリチミジン配列を含む。
「過剰増殖細胞」という用語は、「過剰増殖性障害」、異常な増殖、異常な成長、異常な老化、異常な静止、又は生物内の細胞の異常な除去を特徴とする疾患又は障害を有するか、又は呈する組織又は器官に位置する細胞を指し、あらゆる形態の過形成、新生物、及びがんを含む。いくつかの実施形態では、過剰増殖細胞は、細胞内の既存の成長調節経路の選択又は異常調節事象をもたらす少なくとも１つ又は複数の遺伝子変異を含む。いくつかの実施形態では、過剰増殖細胞がん細胞は、体細胞変異、遺伝子融合、エピジェネティック修飾、及び調節機構の破壊などの無数の戦略のうちの１つ又は複数を採用して、発がん性を過剰に活性化し、腫瘍抑制経路を下方制御する。いくつかの実施形態では、過剰増殖性疾患は、胃腸管又は泌尿器系に由来するがんである。いくつかの実施形態では、過剰増殖性疾患は、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんである。いくつかの実施形態では、過剰増殖性疾患という用語は、肺がん、骨がん、血液がん、慢性骨髄単球性白血病（ＣＭＭＬ）、胆管がん、子宮頸がん、肝臓がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部がん、眼がん、皮膚若しくは眼内黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、結腸がん、乳がん、精巣がん、婦人科腫瘍（例えば、子宮肉腫、卵管がん、子宮内膜がん、子宮頸がん、膣がん若しくは外陰がん）、ホジキン病、食道がん、小腸がん、内分泌系がん（例えば、甲状腺がん、副甲状腺がん若しくは副腎がん）、軟組織肉腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性若しくは急性白血病、小児固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱がん、腎臓若しくは尿管がん（例えば、腎細胞がん、腎盂がん）、又は中枢神経系の新生物（例えば、原発性ＣＮＳリンパ腫、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫若しくは下垂体腺腫）から選択されるがんである。
本明細書で使用される場合、「それを必要とする」という語句は、動物又は哺乳動物が、特定の方法又は治療を必要とすると特定されているか、又は疑われていることを意味する。いくつかの実施形態では、特定は、診断又は観察の任意の手段によって行うことができる。本明細書に記載の方法及び治療のいずれかにおいて、動物又は哺乳動物は、それを必要とし得る。
本明細書で使用される場合、「標識」という用語は、検出可能な（好ましくは、定量化可能な）効果を提供するために使用することができ、核酸又はタンパク質に結合することができる任意の原子又は分子を指す。標識には、色素、２Ｐなどの放射性標識、ビオチンなどの結合部分、ジゴキシゲニンなどのハプテン、発光性、リン光性、又は蛍光性部分、及び単独で又は蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）によって発光スペクトルを抑制若しくはシフトすることができる部分と組み合わせた蛍光色素が含まれるが、これらに限定されない。標識は、蛍光、放射能、比色分析、重量分析、Ｘ線回折又は吸収、磁気、酵素活性などによって検出可能なシグナルを提供することができる。標識は、荷電部分（正又は負の荷電）であってもよいか、又は代替的に、荷電中性であってもよい。標識は、標識を含む配列が検出可能である限り、核酸又はタンパク質配列を含むか、又はそれからなることができる。いくつかの実施形態では、核酸は、標識なしで直接検出される（例えば、配列を直接読み取る）。
本明細書で使用される場合、「レベル」という用語は、非コードＲＮＡ転写産物のコピー数の定性的又は定量的決定を指す。ＲＮＡ転写産物は、ＲＮＡ転写産物のレベルが、患者（例えば、がんを有する患者）の臨床的に関連性のある亜集団などの第１の試料において、関連する亜集団（例えば、がんを有しない患者）などの第２の試料よりも高い場合、「増加したレベル」を示す。個々の患者から得られた腫瘍試料中のＲＮＡ転写産物のレベルの分析の文脈において、ＲＮＡ転写産物は、対象におけるＲＮＡ転写産物のレベルが、患者の臨床的に関連する亜集団のレベル特性に向かって傾いているか、又はより近い近似値である場合、「増加したレベル」を示す。
本明細書で使用される場合、「転移」という用語は、新しい位置で同様のがん性病変の発症を伴う、がんが出現部位から身体の他の領域に広がるか、又は移行するプロセスを指す。「転移性」又は「転移化」細胞は、隣接細胞との付着接触を喪失し、疾患の一次部位から二次部位に（例えば、血流又はリンパを介して）移動する細胞である。
本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」という用語は、単一の抗原決定基又はエピトープの高度に特異的な認識及び結合に関与する均一な抗体集団を指す。これは、典型的には、様々な異なる抗原決定基に対して指向される異なる抗体の混合物を含むポリクローナル抗体とは対照的である。「モノクローナル抗体」という用語は、インタクト及び完全長モノクローナル抗体の両方、並びに抗体断片（例えば、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ）、一本鎖（ｓｃＦｖ）抗体、抗体部分を含む融合タンパク質、及び抗原結合部位を含む任意の他の修飾免疫グロブリン分子を包含する。更に、「モノクローナル抗体」は、ハイブリドーマ産生、ファージ選択、組換え発現、及びトランスジェニック動物を含むが、これらに限定されない、任意の数の技術によって作製されるこのような抗体を指す。
非コードＲＮＡ転写産物に関して本明細書で使用される場合、「正規化された」という用語は、参照ＲＮＡ転写産物のセット又は対照セットの平均レベルと比較した、ＲＮＡ転写産物のレベルを指す。参照ＲＮＡ転写産物は、患者、組織、又は治療にわたる最小限の変動に基づく。代替的に、非コードＲＮＡ転写産物は、試験されたＲＮＡ転写産物の全体、又はそのような試験されたＲＮＡ転写産物のサブセットに正規化され得る。
本明細書で使用される場合、「オリゴヌクレオチド」という用語は、一本鎖ポリヌクレオチド鎖の短い長さを指す。オリゴヌクレオチドは、典型的には、２００個未満の残基長（例えば、１５～１００個）であるが、本明細書で使用される場合、この用語は、より長いポリヌクレオチド鎖を包含することも意図される。オリゴヌクレオチドは、多くの場合、それらの長さによって言及される。例えば、２４残基オリゴヌクレオチドは、「２４量体」と称される。オリゴヌクレオチドは、自己ハイブリダイズによって、又は他のポリヌクレオチドとハイブリダイズすることによって、二次及び三次構造を形成することができる。このような構造は、二本鎖、ヘアピン、十字型、曲がり、及び三本鎖を含むことができるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「又は」という単語は、特定のリストの任意の１つのメンバーを意味し、そのリストのメンバーの任意の組み合わせも含む。
本明細書で使用される場合、「患者」という用語は、疾患又は障害を患っている対象を指す。「患者」という用語は、ヒト及び獣医学的対象を含む。いくつかの実施形態では、「患者」は、がんと診断されているか、又はそれを有すると疑われている。いくつかの実施形態では、「患者」は、がん治療の必要性を有すると診断されている。いくつかの実施形態では、「患者」は、乳がんを有すると診断されていないか、又は疑われていない。
「患者応答」は、（１）減速及び完全な増殖停止を含む、腫瘍増殖のある程度の阻害、（２）腫瘍細胞の数の減少、（３）腫瘍サイズの減少、（４）隣接する末梢臓器及び／若しくは組織への腫瘍細胞浸潤の阻害（すなわち、減少、減速、若しくは完全な停止）、（５）転移の阻害（すなわち、減少、減速、若しくは完全な停止）、（６）腫瘍の退縮若しくは拒絶をもたらし得るが、そうでなくてもよい、抗腫瘍免疫応答の増強、（７）がんに関連する１つ以上の症状のある程度の緩和、（８）治療後の生存期間の増加、並びに／又は（９）治療後の所与の時点での死亡率の低下を含むが、これらに限定されない、患者への利益を示す任意のエンドポイントを使用して評価され得る。
２つのポリヌクレオチド又は２つのポリペプチド配列の「パーセント同一性」又は「パーセント相同性」という用語は、ＧＡＰコンピュータプログラム（ＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｐａｃｋａｇｅ、バージョン１０．３（Ａｃｃｅｌｒｙｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．）の一部）を使用して、そのデフォルトパラメータを使用して配列を比較することによって決定される。２つ以上の核酸又はアミノ酸配列の文脈において本明細書で使用される場合、「同一の」又は「同一性」は、配列が、特定の領域にわたって同一である特定のパーセンテージの残基を有することを意味し得る。パーセンテージは、２つの配列を最適に整列させ、指定された領域にわたって２つの配列を比較し、同一の残基が両方の配列に存在する位置の数を決定して、一致した位置の数を得、その一致した位置の数を指定された領域における位置の総数で割り、その結果に１００を掛けて配列同一性のパーセンテージを得ることによって計算され得る。２つの配列が異なる長さのものである場合、又はアライメントが１つ以上の交互の末端を生じ、指定された比較領域が単一の配列のみを含む場合、単一の配列の残基は、分母に含まれるが、計算の分子には含まれない。ＤＮＡ及びＲＮＡを比較する場合、チミン（Ｔ）及びウラシル（Ｕ）は、等価とみなされ得る。同一性は、手動、又はＢＬＡＳＴ若しくはＢＬＡＳＴ ２．０などのコンピュータ配列アルゴリズムを使用して実施することができる。簡潔に述べると、Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｏｏｌを表す、ＢＬＡＳＴアルゴリズムは、配列類似性を決定するのに好適である。ＢＬＡＳＴ分析を実施するためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）を通して公的に入手可能である。このアルゴリズムは、最初に、問い合わせ配列中の長さＷの短いワードを同定することによって、高スコア配列対（ＨＳＰ）を同定することを含み、これは、データベース配列中の同じ長さのワードと整列された場合に、いくつかの正の値の閾値スコアＴと一致するか、又は満たす。Ｔは、近傍ワードスコア閾値と称される（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．）。これらの最初の近傍ワードヒットは、それらを含むＨＳＰを見出すための検索を開始するための種として作用する。ワードヒットは、累積アライメントスコアが増加され得る限り、各配列に沿って両方向に伸長される。各方向におけるワードヒットの延長は、１）累積アライメントスコアがその最大達成値から量Ｘだけ低下し、２）累積スコアが１つ以上の負のスコアリング残基アライメントの累積のためにゼロ以下になるか、又は３）いずれかの配列の末端に到達した場合に、停止される。ＢｌａｓｔアルゴリズムパラメータＷ、Ｔ、及びＸは、アライメントの感度及び速度を決定する。Ｂｌａｓｔプログラムは、デフォルトとして、１１のワード長（Ｗ）、５０のＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリックス（全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｈｅｎｉｋｏｆｆ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９９２，８９，１０９１５－１０９１９を参照されたい）アライメント（Ｂ）、１０の期待値（Ｅ）、Ｍ＝５、Ｎ＝４、及び両方の鎖の比較を使用する。ＢＬＡＳＴアルゴリズム（全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｋａｒｌｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９９３，９０，５８７３－５７８７）及びＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴは、２つの配列間の類似性の統計的分析を実施する。ＢＬＡＳＴアルゴリズムによって提供される類似性の１つの尺度は、最小合計確率（Ｐ（Ｎ））であり、これは、２つのヌクレオチド配列間の一致が偶然に生じる確率の指標を提供する。例えば、核酸は、試験核酸と他の核酸との比較における最小合計確率が、約１未満、約０．１未満、約０．０１未満、及び約０．００１未満である場合、別の核酸に類似すると考えられる。２つの一本鎖ポリヌクレオチドの配列が、逆平行方向で整列され得る場合、ギャップの導入がなく、いずれかの配列の５’又は３’末端に不対ヌクレオチドがなく、一方のポリヌクレオチドにおける全てのヌクレオチドが、他方のポリヌクレオチドにおけるその相補的ヌクレオチドと反対になるように、２つの一本鎖ポリヌクレオチドは互いの「相補体」である。ポリヌクレオチドは、２つのポリヌクレオチドが適度にストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズすることができる場合、別のポリヌクレオチドに「相補的」である。したがって、ポリヌクレオチドは、その相補体ではなく、別のポリヌクレオチドに相補的であり得る。
「ポリヌクレオチド」及び「核酸」及び「核酸分子」という用語は、本明細書で交換可能に使用され、任意の長さのヌクレオチドのポリマーを指し、ＤＮＡ及びＲＮＡを含む。ポリヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾ヌクレオチド若しくは塩基、及び／又はそれらの類似体、又はＤＮＡ若しくはＲＮＡポリメラーゼによってポリマーに組み込まれ得る任意の基質であり得る。
「ポリペプチド」及び「ペプチド」及び「タンパク質」という用語は、本明細書で交換可能に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。ポリマーは、直鎖又は分岐鎖であり得、修飾アミノ酸を含み得、非アミノ酸によって中断され得る。この用語はまた、天然に又は介入によって修飾されたアミノ酸ポリマー、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、又は標識化成分とのコンジュゲーションなどの任意の他の操作若しくは修飾も包含する。定義内には、例えば、アミノ酸の１つ以上の類似体（例えば、非天然アミノ酸を含む）を含有するポリペプチド、並びに当該技術分野で既知の他の修飾も含まれる。本開示のポリペプチドは、抗体又は融合タンパク質に基づくことができるため、ある特定の実施形態では、ポリペプチドは、単鎖又は関連鎖（例えば、二量体）として生じ得ることが理解される。
本明細書で使用される場合、「予後」という用語は、乳がんなどの新生物疾患の再発、転移性広がり、及び薬物耐性を含む、がんに起因する死亡又は進行の尤度の予測を指す。
本明細書で使用される場合、「参照」ＲＮＡ転写産物という用語は、そのレベルが、試験試料中のＲＮＡ転写産物のレベルを比較するために使用され得る、ＲＮＡ転写産物を指す。いくつかの実施形態では、参照ＲＮＡ転写産物は、ベータ－グロビン、アルコールデヒドロゲナーゼ、又は任意の他のＲＮＡ転写産物などのハウスキーピング遺伝子を含み、そのレベル又は発現は、ＲＮＡ転写産物を含有する細胞の疾患状態に応じて変化しない。別の実施形態では、アッセイされたＲＮＡ転写産物の全て、又はそのサブセットは、参照ＲＮＡ転写産物として機能し得る。
「塩」という用語は、無機及び／又は有機酸で形成される酸性塩、並びに無機及び／又は有機塩基で形成される塩基性塩を指す。これらの酸及び塩基の例は、当業者に周知である。このような酸付加塩は、通常、薬学的に許容されるが、薬学的に許容されない酸の塩が、問題の化合物の調製及び精製において有用なものである場合がある。本開示の化合物の酸付加塩は、最も好適には、薬学的に許容される酸から形成され、例えば、無機酸、例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸又はリン酸、及び有機酸、例えば、コハク酸、マレイン酸、酢酸又はフマル酸で形成されたものを含む。他の薬学的に許容されない塩、例えば、シュウ酸塩は、例えば、本開示の化合物の単離において、実験室での使用のために、又はその後の薬学的に許容される酸付加塩への変換のために使用されてもよい。本開示の範囲内には、溶媒和物及び水和物も含まれる。本開示の特定の化合物のインビボ加水分解性エステル又はアミドは、遊離ヒドロキシ又はアミノ官能基を有するこれらの化合物を、塩化メチレン又はクロロホルムなどの不活性溶媒中の塩基の存在下で所望のエステルの酸塩化物で処理することによって形成することができる。好適な塩基には、トリエチルアミン又はピリジンが含まれる。逆に、遊離カルボキシ基を有する本開示の化合物は、好適な塩基の存在下での活性化、続いて所望のアルコールでの処理を含むことができる標準条件を使用してエステル化することができる。薬学的に許容される付加塩の例には、非毒性の無機及び有機酸付加塩、例えば、塩酸由来の塩酸塩、臭化水素酸由来の臭化水素酸塩、硝酸由来の硝酸塩、過塩素酸由来の過塩素酸塩、リン酸由来のリン酸塩、硫酸由来の硫酸塩、ギ酸由来のギ酸塩、酢酸由来の酢酸塩、アコニット酸由来のアコニット酸塩、アスコルビン酸由来のアスコルビン酸塩、ベンゼンスルホン酸由来のベンゼンスルホン酸塩、安息香酸由来の安息香酸塩、ケイ皮酸由来のケイ皮酸塩、クエン酸由来のクエン酸塩、エンボン酸由来のエンボン酸塩、エナント酸由来のエナント酸塩、フマル酸由来のフマル酸塩、グルタミン酸由来のグルタミン酸塩、グリコール酸由来のグリコール酸塩、乳酸由来の乳酸塩、マレイン酸由来のマレイン酸塩、マロン酸由来のマロン酸塩、マンデル酸由来のマンデル酸塩、メタンスルホン酸由来のメタンスルホン酸塩、ナフタレン－２－スルホン酸由来のナフタレン－２－スルホン酸塩、フタル酸由来のフタル酸塩、サリチル酸由来のサリチル酸塩、ソルビン酸由来のソルビン酸塩、ステアリン酸由来のステアリン酸塩、コハク酸由来のコハク酸塩、酒石酸由来の酒石酸塩、ｐ－トルエンスルホン酸由来のトルエン－ｐ－スルホン酸塩などが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、塩は、本開示の化合物のナトリウム、リジン、及びアルギニン塩である。このような塩は、当該技術分野において周知であり、記載されている手順によって形成され得る。
薬学的に許容されると考慮することができないシュウ酸などの他の酸は、本開示の化合物及びその薬学的に許容される酸付加塩を得る際の中間体として有用な塩の調製に有用であり得る。本開示の化合物の金属塩には、カルボキシ基を含有する本開示の化合物のナトリウム塩などのアルカリ金属塩が含まれる。本開示に従って入手可能な異性体の混合物は、それ自体が個々の異性体に既知の方法で分離することができ、ジアステレオ異性体は、例えば、多相溶媒混合物の間での分画、再結晶化及び／若しくはクロマトグラフィー分離、例えば、シリカゲル上での分画、又は例えば、逆相カラム上での中圧液体クロマトグラフィーによって分離することができ、ラセミ体は、例えば、光学的に純粋な塩形成試薬を用いた塩の形成、及びそのように入手可能なジアステレオ異性体の混合物の分離、例えば、分画結晶化によって、又は光学的に活性なカラム材料上でのクロマトグラフィーによって分離することができる。
本明細書で使用される場合、「試料」という用語は、本明細書に記載されるように、目的の供給源から得られるか、又はそれに由来する生体試料を指す。いくつかの実施形態では、目的の供給源は、動物又はヒトなどの生物を含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、生体組織又は生体液を含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、骨髄、血液、血液細胞、腹水、組織若しくは細針生検試料、細胞含有体液、遊離浮遊核酸、痰、唾液、尿、脳脊髄液、腹膜液、胸水、糞便、リンパ、婦人科液体、皮膚スワブ、膣スワブ、口腔スワブ、鼻スワブ、洗浄液（ｗａｓｈｉｎｇ）又は管洗浄液若しくは気管支肺胞洗浄液などの洗浄液（ｌａｖａｇｅｓ）、吸引物、擦過物、骨髄標本、組織生検標本、外科標本、糞便、他の体液、分泌物及び／若しくは排泄物、並びに／又はそれらからの細胞などであってもよいか、又はそれらを含んでもよい。いくつかの実施形態では、生体試料は、個体から得られた細胞であるか、又はそれを含む。いくつかの実施形態では、試料は、本明細書に開示されるエクソソーム又はｏｎｃＲＮＡ配列（又はその断片、例えば、表１で同定された核酸配列に対して約７５％～約９９％の配列同一性を有する核酸配列）を含む。いくつかの実施形態では、試料は、任意選択により、血清又は血液中の、エクソソーム又はエクソーム若しくは複数のエクソソーム内のｏｎｃＲＮＡ配列を含み、配列は、表２から選択される１つ又は複数の配列を含む。試料は、任意選択により、血清又は血液中の、エクソソーム又はエクソーム若しくは複数のエクソソーム内のｏｎｃＲＮＡ配列を含み、配列は、表２で同定された核酸配列に対して約７５％～約９９％の配列同一性を有する断片である１つ又は複数の配列を含む。いくつかの実施形態では、ｏｎｃＲＮＡ配列は、細胞全体から解離される。いくつかの実施形態では、試料は、細胞全体から解離したエクソソーム及び／又は核酸配列を含み、試料は、細胞全体を含まない。いくつかの実施形態では、試料は、任意の適切な手段によって目的の供給源から直接得られた「一次試料」である。例えば、いくつかの実施形態では、一次生体試料は、生検（例えば、細針吸引物又は組織生検）、外科手術、体液の採取（例えば、血液、リンパ、糞便など）などからなる群から選択される方法によって得られる。いくつかの実施形態では、文脈から明らかなように、「試料」という用語は、一次試料を、処理することによって（例えば、その１つ以上の成分を除去すること、及び／又はそれに１つ以上の薬剤を添加することによって）得られる調製物を指す。例えば、半透過性膜を使用して濾過する。そのような「処理された試料」は、例えば、試料から抽出されたか、又は一次試料を、ｍＲＮＡの増幅若しくは逆転写、特定の成分の単離及び／又は精製などの技術に供することによって得られた核酸又はタンパク質を含み得る。いくつかの実施形態では、「試料」は、循環する小さい非コードＲＮＡを含有する試料である。いくつかの実施形態では、試料は、フィルターを通過したか、又は細胞全体を除去するために遠心分離して再懸濁された、処理された試料である。
「スコア」は、対象における１つ又は複数の非コードＲＮＡの存在、非存在、又は量に基づいて、値の正規化後に割り当てられ得るか、又は生成され得る数値である。いくつかの実施形態では、スコアは、対照データ値に対して正規化される。いくつかの実施形態では、対照データセットは、陰性対照データセットである。
本明細書で使用される場合、「小さい非コードＲＮＡ」又は「小さいｎｃＲＮＡ」（ｓＲＮＡ）という用語は、タンパク質に翻訳されず、転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）、リボソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）、核小体低分子ＲＮＡ（ｓｎｏＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、核内低分子（ｓｎＲＮＡ）、Ｙ ＲＮＡ、ｖａｕｌｔ ＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ、転写開始ＲＮＡ（ｔｉＲＮＡ）、転写開始部位関連ＲＮＡ（ＴＳＳａ－ＲＮＡ）、及びｐｉｗｉ相互作用ＲＮＡ（ｐｉＲＮＡ）を含むＲＮＡを指す。小さいｎｃＲＮＡは、一般に、１８～２００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、本明細書で使用される場合、小さいｎｃＲＮＡは、５０～１００ヌクレオチドである。ｎｃＲＮＡは、内因性起源（例えば、ヒトの小さい非コードＲＮＡ）又は外因性起源（例えば、ウイルス、細菌、寄生虫）であり得る。「カノニカル」ｎｃＲＮＡとは、ゲノム配列から予測されるＲＮＡの配列を指し、特定のＲＮＡについて同定される最も豊富な配列である。「トリミングされた」ｎｃＲＮＡとは、エキソヌクレアーゼ媒介性ヌクレオチドトリミングが、分子の５’及び／又は３’末端で１つ以上のヌクレオチドを除去したｎｃＲＮＡを指す。「伸長ｎｃＲＮＡ」とは、カノニカルな小さい非コードＲＮＡ配列よりも長く、当該技術分野で認識される用語である、小さい非コードＲＮＡを指す。「オーファンｎｃＲＮＡ」又は「ｏｎｃＲＮＡ」とは、未知の機能を有するがん特異的な小さいｎｃＲＮＡを指す。伸長を構成するヌクレオチドは、前駆体配列のヌクレオチドに対応し、したがって、非鋳型ヌクレオチド付加とは対照的に、ゲノムによってコードされる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、上記に開示される小さいｎｃＲＮＡのいずれか１つ又は組み合わせを検出することを含む。
「ストリンジェンシー」という用語は、その下で核酸ハイブリダイゼーションが行われる、温度、イオン強度、及び有機溶媒などの他の化合物の存在の条件に関して使用される。「低ストリンジェンシー条件」下で、目的の核酸配列は、その正確な相補体、単一塩基のミスマッチを有する配列、密接に関連する配列（例えば、９０％以上の同一性を有する配列）、及び部分的な同一性のみを有する配列（例えば、５０～９０％の同一性を有する配列）にハイブリダイズする。「中程度のストリンジェンシー条件」下では、目的の核酸配列は、その正確な相補体、単一塩基のミスマッチを有する配列、及び密接に関連する配列（例えば、９０％以上の同一性）のみにハイブリダイズする。「高ストリンジェンシー条件」下では、目的の核酸配列は、その正確な相補体、及び（そのような温度の条件に応じて）単一塩基のミスマッチを有する配列のみにハイブリダイズする。言い換えれば、高ストリンジェンシーの条件下で、単一塩基のミスマッチを有する配列へのハイブリダイゼーションを除外するように温度を上げることができる。したがって、本明細書で使用される場合、「高ストリンジェンシー」という用語は、以下の条件を指す。（１）洗浄には、低いイオン強度及び高い温度、例えば、１５ｍＭの塩化ナトリウム／１．５ｍＭのクエン酸ナトリウム／０．１％のドデシル硫酸ナトリウムを５０℃で利用するか、（２）ハイブリダイゼーション中に、ホルムアミドなどの変性剤、例えば、０．１％のウシ血清アルブミン／０．１％のフィコール／０．１％のポリビニルピロリドン／５０ｍＭのリン酸ナトリウム緩衝液を含む５０％（ｖ／ｖ）のホルムアミドを、ｐＨ６．５で、５×ＳＳＣ（０．７５ＭのＮａＣｌ、７５ｍＭのクエン酸ナトリウム）中で、４２℃で利用するか、又は（３）ハイブリダイゼーション中に、５×ＳＳＣ、５０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ６．８）、０．１％のピロリン酸ナトリウム、５×デンハルト溶液、超音波処理したサケ精子ＤＮＡ（５０μｇ／ｍｌ）、０．１％のＳＤＳ、及び１０％の硫酸デキストラン中の５０％のホルムアミドを４２℃で利用し、０．２×ＳＳＣ及び５０％のホルムアミド中で４２℃で洗浄し、続いて、５５℃でＥＤＴＡを含有する０．１×ＳＳＣからなる洗浄液で洗浄する。
本明細書で使用される場合、「対象」という用語は、哺乳動物、魚類、鳥類、爬虫類、又は両生類などの脊椎動物を指す。「対象」という用語は、飼い慣らされた動物（例えば、ネコ、イヌなど）、家畜（例えば、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギなど）、及び実験動物（例えば、マウス、ウサギ、ラット、モルモット、ミバエなど）も含む。一態様では、対象は、哺乳動物である。別の態様では、対象は、ヒトである。この用語は、特定の年齢又は性別を示すものではない。このように、男性又は女性にかかわらず、成人、小児及び青年が含まれることが意図される。いくつかの実施形態では、対象は、本明細書に記載の診断方法を使用してスクリーニングされる任意の生物である。いくつかの実施形態では、対象は、がんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、限定されないが、がんなどの基礎疾患又は障害の治療を必要とするヒトである。
「実質的に同一」とは、核酸分子（又はポリペプチド）が、参照核酸配列（例えば、本明細書に記載の核酸配列のうちのいずれか１つ）又はアミノ酸配列に対して少なくとも約５０％の配列同一性を含むことを意味する。いくつかの実施形態では、そのような配列は、比較のために使用される参照配列に対して、核酸レベル又はアミノ酸レベルで、少なくとも約６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、又は更に９９％同一である。
「治療有効量」という用語は、所望の治療効果を達成するのに十分な量、例えば、治療されている疾患に関連する症状、例えば、がん増殖又は過剰増殖性障害に関連する障害の予防又は改善又は減少をもたらす量を意味する。対象に投与される化合物の量は、疾患の種類及び重症度、並びに全体的な健康、年齢、性別、体重及び薬物に対する耐性などの個体の特徴に依存する。これはまた、疾患の程度、重症度、及び種類にも依存する。当業者は、これら及び他の要因に応じて適切な用量を決定することができるであろう。投与レジメンは、有効量を構成するものに影響を及ぼし得る。更に、いくつかの分割投与量、及び交互投与量は、毎日若しくは連続して投与することができるか、又は用量は、連続的に注入することができるか、若しくはボーラス注射であってもよい。更に、本開示の化合物の投与量は、治療的又は予防的状況の緊急性によって示されるように、比例して増加させることができるか、又は減少させることができる。典型的には、治療効果を達成するのに十分な、本開示の化合物の有効量は、１日当たり体重１キログラム当たり約０．０００００１ｍｇ～１日当たり体重１キログラム当たり約１０，０００ｍｇの範囲である。好ましくは、投与量範囲は、１日当たり体重１キログラム当たり約０．０００１ｍｇ～１日当たり体重１キログラム当たり約１００ｍｇである。本明細書に開示される化合物は、互いに組み合わせて、又は１つ以上の追加の治療用化合物と組み合わせて投与することもできる。
本明細書で使用される場合、「治療」又は「治療すること」という用語は、対象についての臨床結果を含む有益な又は所望の結果を得るためのアプローチである。本明細書の目的のために、有益な又は所望の臨床結果には、以下のうちの１つ以上が含まれるが、これらに限定されない。（１）状況、障害、又は状態に罹患している可能性があるか、又はそれにかかりやすい可能性があるが、状況、障害、又は状態の臨床症状をまだ経験していないか、又は示していないヒトで発生する状況、障害、又は状態の臨床症状の出現を予防するか、又は遅延させること、（２）状況、障害、又は状態を阻害すること、すなわち、疾患の発症、若しくはその再発（維持治療の場合）、又はその少なくとも１つの臨床症状、徴候、若しくは検査を停止、低減、又は遅延させること、あるいは（３）疾患を緩和すること、すなわち、状況、障害、若しくは状態、又はその臨床若しくは亜臨床の症状若しくは徴候のうちの少なくとも１つの退縮を引き起こすこと。いくつかの実施形態では、患者が、以下のうちの１つ以上を示す場合、対象は、本開示の方法による治療が成功している。がん細胞の数の減少及び／若しくはがん細胞の完全な欠如、腫瘍サイズの減少、腫瘍増殖の阻害、軟部組織及び骨へのがん細胞の拡散を含む末梢器官へのがん細胞浸潤の阻害及び／若しくは欠如、腫瘍若しくはがん細胞転移の阻害及び／若しくは欠如、がん増殖の阻害及び／若しくは欠如、特定のがんに関連する１つ以上の症状の緩和、罹患率及び死亡率の低下、生活の質の向上、腫瘍原性の減少、がん幹細胞の数若しくは頻度の減少、又はそのような効果のいくつかの組み合わせ。
本明細書で使用される場合、「腫瘍」という用語は、悪性又は良性にかかわらず、全ての新生物細胞の成長及び増殖、並びに全ての前がん性及びがん性の細胞及び組織を指す。「良性」腫瘍は、がん性ではなく、近くの組織に侵入しないか、又は身体の他の部分に拡散しない。「前悪性」腫瘍は、まだがん性ではないが、悪性になる可能性がある腫瘍である。他方で、「悪性」腫瘍は、がん性であり、増殖して身体の他の部分に拡散する可能性がある。
本明細書で使用される場合、「腫瘍試料」という用語は、がん患者から得られる腫瘍物質を含む試料を指す。この用語は、腫瘍組織試料、例えば、外科的切除によって得られる組織、及び生検によって得られる組織、例えば、コア生検又は細針生検を包含する。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、ホルマリン固定され、パラフィン包埋された組織試料などの、固定され、ワックス包埋された組織試料である。更に、「腫瘍試料」という用語は、原発腫瘍以外の部位、例えば、循環腫瘍細胞から得られた腫瘍細胞を含む試料を包含する。この用語はまた、患者の腫瘍細胞の子孫である細胞、例えば、原発腫瘍細胞又は循環腫瘍細胞に由来する細胞培養試料も包含する。この用語は、インビボで腫瘍細胞から脱落したタンパク質又は核酸物質を含み得る試料、例えば、骨髄、血液、血漿、血清などを更に包含する。この用語はまた、腫瘍細胞に対して濃縮されたか、又はそれらの調達後に他の方法で操作された試料、並びに患者の腫瘍物質から得られるポリヌクレオチド及び／又はポリペプチドを含む試料を包含する。
がんに対するバイオマーカーとしての小さい非コードＲＮＡ
ヒトゲノムは、膨大な量の非コードＲＮＡ（ｎｃＲＮＡ）転写産物をコードする。非コードＲＮＡは、転写産物のサイズに基づいて、小さいｎｃＲＮＡ（ｓｍＲＮＡ）及び長いｎｃＲＮＡ（ｌｎｃＲＮＡ）の２つのクラスに分類され得る。小さいｎｃＲＮＡは、一般に、１８～２００ヌクレオチド長であるが、ｌｎｃＲＮＡは、２００ヌクレオチドより大きい。小さいｎｃＲＮＡは、多様な細胞機能を有し、非常に豊富な転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）、リボソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）、核小体低分子ＲＮＡ（ｓｎｏＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、核内低分子ＲＮＡ（ｓｎＲＮＡ）、及びｐｉｗｉ相互作用ＲＮＡ（ｐｉＲＮＡ）を含むいくつかのクラスからなる（Ａｍａｒａｌ ｅｔ ａｌ．，２００８、Ｍａｒｔｅｎｓ－Ｕｚｕｎｏｖａ ｅｔ ａｌ．，２０１３）。小さい非コードＲＮＡは、十分な配列相補性を有する部位で標的ｍＲＮＡに結合することにより、翻訳抑制因子として作用し（Ａｍｅｒｅｓ ｅｔ ａｌ．，２００７）、一方、非常に豊富な細胞質Ｙ ＲＮＡは、Ｒｏタンパク質の細胞内位置に影響を与えることにより、ＲＮＡ品質対照において機能する（Ｓｉｍ ｅｔ ａｌ．，２００９）。ｍＲＮＡ翻訳に対する成熟した小さい非コードＲＮＡの抑制活性は、定義された細胞内位置でレトロトランスポゾンをサイレンシングするｐｉＲＮＡに加えて、ｓｉＲＮＡ及びエンドｓｉＲＮＡを含む、他のクラスのｎｃＲＮＡによって共有される（Ｃｈｕｍａ ａｎｄ Ｐｉｌｌａｉ，２００９）。小さい非コードＲＮＡ活性は、細胞質中の十分なレベルの存在量、及びエンドソーム膜に局在するＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）との相互作用に依存するが（Ｇｉｂｂｉｎｇｓ ｅｔ ａｌ．，２００９、Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，２００９ａ）、少ない存在量の小さい非コードＲＮＡは、翻訳抑制に対する影響が少ない。結果として、特定の小さい非コードＲＮＡのレベルのわずかな変化は、既に細胞プロセスに影響を与えている場合があるが、強い摂動は、疾患を引き起こす可能性がある。存在量に加えて、（ＲＩＳＣ）タンパク質との相互作用だけでなく、ＲＮＡパートナー及び正確な細胞内局在化は、小さい非コードＲＮＡ生理を制御する相互に関連する因子である（Ｍｕｌｌｏｋａｎｄｏｖ ｅｔ ａｌ．，２０１２、Ｗｅｅ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。
小さいＲＮＡは、エクソソームなどの細胞由来の細胞外小胞内で分泌され得る。ｍＲＮＡ及び小さい非コードＲＮＡ種の両方が、エクソソームに含まれることが見出されている。したがって、エクソソームは、環境におけるＲＮＡ含有量の転移及び分解からの保護のための手段を提供することができ、ＲＮＡバイオマーカーの信頼性の高い検出のための安定した供給源を可能にする。
本開示は、がんを有する対象に由来する生体試料中に、「正常」である対象、すなわち、がんを有しない対象と比較して、差異的に存在することが見出される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーに関する。小さい非コードＲＮＡバイオマーカー又は小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのセットは、試料中の小さい非コードＲＮＡバイオマーカー又は小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのセットの発現レベルの差が、統計的に有意であると決定される場合、試料間に差異的に存在する。統計的有意性についての一般的な検定には、ｔ検定、ＡＮＯＶＡ、Ｋｎｉｓｋａｌ－Ｗａｌｌｉｓ、Ｗｉｌｃｏｘｏｎ、Ｍａｎｎ－Ｗｈｉｔｎｅｙ、及びオッズ比が含まれるが、これらに限定されない。小さい非コードＲＮＡバイオマーカーは、単独で又は組み合わせて使用して、対象が、がんを有するか、又は有しないかの相対リスクの尺度を提供することができる。
様々な種類のがんの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーは、様々な起源の組織からの複数の種類のがんの小さいＲＮＡの配列決定によって発見され、がん細胞において特異的に発現される、これまでに知られていなかった小さい非コードＲＮＡを同定した。がん細胞、特に、肺、乳房、前立腺、大腸、膵臓、肝臓、及び卵巣からのがん細胞において特異的に発現される何百もの以前に知られていなかった小さい非コードＲＮＡを、このようにして同定し、それぞれのがん適応症を提供して表１（配列番号１～１５２４）に開示した。現在、これらの小さい非コードＲＮＡを、バイオマーカーとして使用して、がんの種類及び対象、例えば、がん状態が以前に知られていなかった対象、又はがんに罹患していると疑われる対象の状況を決定することができる。これは、対象の生体試料中の本明細書に開示される小さい非コードＲＮＡのうちの１つ以上、又はそれらの組み合わせのレベルを決定することによって達成され得る。正常又は健常な対象の生体試料中のものと比較して、これらの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのうちの１つ以上のレベルの差は、対象が、対象の試料中に検出された小さい非コードＲＮＡのうちの１つ以上に関連する種類及び起源の組織のがんを有することを示し、これは、がんの早期、中等度若しくは中期、又は重度若しくは後期であり得る。
いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを使用して、がんを有するが、別の方法では、がんに関連する症状を有しないと疑われる対象におけるがんを検出及び／又は診断することができる。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを使用して、早期がんに特徴的な症状を有する対象におけるがんを検出及び／又は診断することができる。
いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを使用して、対象におけるがん進行の経過をモニタリングすることができる。対象のがんの状況は、時間の経過とともに変化する可能性がある。例えば、がんは、治療計画の過程の間に時間の経過とともに悪化又は改善する場合がある。このような悪化又は改善により、１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、対象の試料中で検出されるように、統計的に有意な様式で変化し得る。例えば、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、がんの発症とともに経時的に増加し得る。したがって、対象から得られた第１の試料中の１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定し、対象から得られた第２の試料中の同じ１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することによって、対象におけるがんの進行の経過をモニタリングすることができ、第２の試料は、第１の試料の後に得られる。第１の試料中のレベルと比較した第２の試料中のレベルは、疾患の進行を示す。例えば、第２の試料と比較して、第１の試料からの表１からの１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの上昇は、対象が、表１に提供されるように、検出に使用される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーに関連するがんの種類を発症したか、又は疾患が悪化したことを示す。逆に、第２の試料と比較して、第１の試料からの表１からの１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの減少は、疾患が改善したことを示す。
試験対象から得られた生体試料中の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルが、正常な対象に存在する小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと異なるか否かは、試験対象からの試料中の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを好適な対照と比較することによって確認され得る。当業者は、問題のアッセイに適切な対照を選択することができる。例えば、好適な対照は、健康であり、がんを有しないことが知られている対象からの生体試料（例えば、陰性対照）であってもよい。好適な対照が正常な対象から得られる場合、好適な対照と比較して、試験対象における小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの統計的に有意な差は、対象が、検出された特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーに関連するがんの種類を有することを示す。いくつかの実施形態では、小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの差は、対照と比較して、試験対象の増加である。好適な対照はまた、参照基準であってもよい。参照基準は、比較のための参照レベルとして機能し、その結果、試験試料は、試験対象におけるがんの種類、起源の組織、及びがんの状況を推定するために、参照基準と比較され得る。参照標準は、既知の対象、例えば、正常な対象であることが知られている対象、又はがんを有することが知られている対象における１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを表し得る。同様に、参照標準は、既知の対象の集団、例えば、正常な対象であることが知られている対象の集団、又は特定の種類のがんを有することが知られている対象の集団における１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを表し得る。参照基準は、例えば、複数の個体からの試料をプールし、プールされた試料中の特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することによって得られ、それによって平均集団にわたって基準を生成することができる。そのような参照基準は、個体集団中の特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの平均レベルを表す。参照基準は、例えば、複数の個体から得られた個々の試料中に存在すると決定された特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを平均化することによっても得られ得る。そのような基準はまた、個体集団中の特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの平均レベルを表す。参照基準はまた、個体集団における既知の対象における特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを各々表す値の集合であってもよい。いくつかの実施形態では、試験試料は、対象におけるがんの種類、起源の組織、及びがんの状況又は段階を推測するために、そのような値の集合と比較されてもよい。いくつかの実施形態では、参照基準は、絶対値である。そのような実施形態では、試験試料は、対象におけるがんの種類、起源の組織、及びがんの状況又は段階を推定するために、絶対値と比較されてもよい。いくつかの実施形態では、好適な対照に対する試料中の１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベル間の比較は、ソフトウェア分類アルゴリズムを実行することによって行われる。
いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約１０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約２０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約３０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約４０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約５０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約６０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約７０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約８０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約９０％以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約１００％以上の発現の増加である。
いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約２倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約３倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約４倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約５倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約６倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約７倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約８倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約９倍以上の発現の増加である。いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される非コードＲＮＡの増加した発現は、正常な試料中の同じ非コードＲＮＡの発現よりも約１０倍以上の発現の増加である。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、表１（配列番号１～配列番号１５４３）に開示される核酸配列のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、表２（配列番号１５４４～配列番号６８３４）に開示される核酸配列のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号２９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号３９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号４９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号５９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号６９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号７９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号８９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号９９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１００９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１０９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１１９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１２９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１３９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２８に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４２９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４３９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４４９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４５９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４６９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４７９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４８９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１４９９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５００に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５０９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１５に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１６に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１７に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１８に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５１９に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５２０に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５２１に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５２２に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５２３に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、配列番号１５２４に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む。
いくつかの実施形態では、試料中で検出される１つ以上の非コードＲＮＡは、表１（配列番号１～配列番号１５４３）に開示される核酸配列の１つ又は複数の機能的断片を含む。いくつかの実施形態では、単独で又は表１（配列番号１～配列番号１５４３）の１つ又は複数の配列の発現と組み合わせて、１つ又は複数の小さい非コードＲＮＡの単なる存在又は発現は、対象におけるがんの存在、特に検出された小さい非コードＲＮＡに関連するがんの種類を示す。いくつかの実施形態では、単独で又は表１（配列番号１～配列番号１５４３）の核酸配列のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は約９９％の配列同一性を有する１つ又は複数の配列の発現と組み合わせて、１つ又は複数の小さい非コードＲＮＡの単なる存在又は発現は、対象におけるがんの存在、特に検出された小さい非コードＲＮＡに関連するがんの種類を示す。当業者は、問題のアッセイに応じて適切であり得る更なる好適な対照を容易に想起することができる。上述の好適な対照は、例示的であり、限定的であることは意図されない。
一般に、正常な対象中の同じ小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを表す好適な対照と比較して、試験対象の生体試料中の表１（配列番号１～配列番号１５４３）に提供される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのうちの１つ以上のレベルの増加は、試験対象が、試験対象中で検出された１つ以上の小さい非コードＲＮＡに関連する種類及び起源の組織のがんを有することを示すであろう。２つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルが、試験対象において決定されるいくつかの事例では、好適な対照と比較して、１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの増加があってもよく、１つ以上の更なる小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの変化又は増加はなくてもよい。そのような事例では、正常な対象における小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを表す好適な対照と比較して、小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのうちの１つ以上のレベルの差は、試験対象が、試験対象において異なるレベルを示した１つ以上の小さい非コードＲＮＡに関連する種類及び起源の組織のがんを有することを示す。そのような差の決定は、本明細書に記載のように、ソフトウェア分類アルゴリズムの実行によって支援され得る。
生体試料
１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの発現レベルは、対象から得られた生体試料において決定されてもよい。対象の試料は、対象に由来するものである。そのような試料は、対象から得られた後に更に処理され得る。例えば、ＲＮＡは、試料から単離されてもよい。この例では、試料から単離されたＲＮＡは、対象から得られた試料でもある。１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定するのに有用な生体試料は、体全体の細胞、組織、及び体液を含む、本質的に任意の供給源から得てもよい。
いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定するために使用される生体試料は、循環する小さい非コードＲＮＡ、例えば、細胞外の小さい非コードＲＮＡを含有する試料である。細胞外の小さい非コードＲＮＡは、循環系、例えば、血液試料若しくはリンパ試料からの、又は尿若しくは唾液などの別の体液からの流体などの体液を含む、広範囲の生体材料中で自由に循環する。したがって、いくつかの実施形態では、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定するために使用される生体試料は、体液、例えば、血液、その画分、血清、血漿、尿、唾液、涙、汗、精液、膣分泌物、リンパ、気管支分泌物、ＣＳＦ、全血などである。いくつかの実施形態では、試料は、非侵襲的に得られる試料である。いくつかの実施形態では、試料は、ヒトからの血清試料である。いくつかの実施形態では、試料は、ヒトからの体液である。いくつかの実施形態では、試料は、ヒトからの液体生検である。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、検出及び／又は診断のために少量の試料を使用することを含む。いくつかの実施形態では、開示される方法は、約２０マイクロリットル以下、約４０マイクロリットル、約８０マイクロリットル、約１００マイクロリットル、約２００マイクロリットル、約３００マイクロリットル、約４００マイクロリットル、約５００マイクロリットル、約６００マイクロリットル、約７００マイクロリットル、約８００マイクロリットル、約９００マイクロリットル、約１ミリリットル、約１．１ミリリットル、約１．２ミリリットル、約１．３ミリリットル、約１．４ミリリットル、約１．５ミリリットル、約１．６ミリリットル、約１．７ミリリットル、約１．８ミリリットル、約１．９ミリリットル、又は約２．０ミリリットルの試料中で、全ＲＮＡを単離すること、及び／又は小さい非コードＲＮＡを増幅させることを含む。いくつかの実施形態では、試料サイズは、対象の血漿、全血、又は血清の形態の液体試料の約２０マイクロリットル～約２ミリリットルである。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法は、約２０マイクロリットル以下の血清、約４０マイクロリットル以下の血清、約８０マイクロリットル以下の血清、約１００マイクロリットル以下の血清、約２００マイクロリットル以下の血清、約３００マイクロリットル以下の血清、約４００マイクロリットル以下の血清、約５００マイクロリットル以下の血清、約６００マイクロリットル以下の血清、約７００マイクロリットル以下の血清、約８００マイクロリットル以下の血清、約９００マイクロリットル以下の血清、約１ミリリットル以下の血清、約１．１ミリリットル以下の血清、約１．２ミリリットル以下の血清、約１．３ミリリットル以下の血清、約１．４ミリリットル以下の血清、約１．５ミリリットル以下の血清、約１．６ミリリットル以下の血清、約１．７ミリリットル以下の血清、約１．８ミリリットル以下の血清、約１．９ミリリットル以下の血清、又は約２．０ミリリットル以下の血清の試料中の全ＲＮＡを単離すること、及び／又は小さい非コードＲＮＡを増幅させることを含む。
循環する小さい非コードＲＮＡには、細胞内の小さい非コードＲＮＡ、微小胞内、エクソソーム内の細胞外の小さい非コードＲＮＡ、及び細胞又は微小胞と関連していない細胞外の小さい非コードＲＮＡ（細胞外の非小胞性の非コードＲＮＡ）が含まれる。いくつかの実施形態では、１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定するために使用される生体試料（例えば、循環する小さい非コードＲＮＡを含有する試料）は、細胞を含有してもよい。他の実施形態では、生体試料は、細胞（例えば、血清試料）を含まなくてもよいか、又は実質的に含まなくてもよい。いくつかの実施形態では、循環する小さい非コードＲＮＡ、例えば、細胞外の小さい非コードＲＮＡを含有する試料は、血液由来の試料である。例示的な血液由来の試料の種類には、例えば、血漿試料、血清試料、血液試料などが含まれる。他の実施形態では、循環する小さい非コードＲＮＡを含有する試料は、リンパ試料である。循環する小さい非コードＲＮＡはまた、尿及び唾液中に見出され、これらの起源に由来する生体試料は、同様に、１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定するのに好適である。
いくつかの実施形態では、本開示の方法のいずれかは、試料若しくは細胞、又はエクソソーム若しくは微小胞から全ＲＮＡを単離するステップを含む。血液、血漿及び／又は血清から（例えば、全体が本明細書に参照により組み込まれる、Ｔｓｕｉ ＮＢ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．４８，１６４７－５３を参照されたい）、並びに尿から（例えば、全体が本明細書に参照により組み込まれる、Ｂｏｏｍ Ｒ ｅｔ ａｌ．（１９９０）Ｊ Ｃｌｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２８，４９５－５０３を参照されたい）の発現分析のためのＲＮＡを単離する方法は、記載されており、当業者によって日常的に使用される。
試料中の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの決定
生体試料中の１つ以上の開示される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、任意の好適な方法によって決定され得る。試料中の小さい非コードＲＮＡのレベル又は量を測定するための任意の信頼できる方法が、使用され得る。一般に、小さい非コードＲＮＡは、例えば、増幅ベースの方法（例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ＰＣＲ）、定量的ポリメラーゼ連鎖反応（ｑＰＣＲ）、ローリングサークル増幅など）、ハイブリダイゼーションベースの方法（例えば、ハイブリダイゼーションアレイ（例えば、マイクロアレイ）、ナノストリング分析、ノーザンブロット分析、分岐ＤＮＡ（ｂＤＮＡ）シグナル増幅、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションなど）、及び配列決定ベースの方法（例えば、次世代配列決定方法、例えば、Ｉｌｌｕｍｉｎａ又はＩｏｎＴｏｒｒｅｎｔプラットフォームを使用する）を含む、ｍＲＮＡについて既知の様々な方法によって、単離されたＲＮＡの試料などの試料（その画分を含む）から検出及び定量化され得る。他の例示的な技術には、リボヌクレアーゼ保護アッセイ（ＲＰＡ）及び質量分析が含まれる。
いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、分析の前にＤＮＡ（ｃＤＮＡ）に変換される。ｃＤＮＡは、従来の技術を使用して、単離された小さい非コードＲＮＡの逆転写によって生成することができる。いくつかの実施形態では、小さい非コードＲＮＡは、測定前に増幅される。他の実施形態では、小さい非コードＲＮＡのレベルは、増幅プロセス中に測定される。更に他の実施形態では、小さい非コードＲＮＡのレベルは、測定前に増幅されない。試料中の小さい非コードＲＮＡのレベルを決定するのに好適ないくつかの例示的な方法は、以下により詳細に説明される。これらの方法は、例示としてのみ提供され、当業者には、他の好適な方法も同様に使用され得ることが明らかであろう。
Ａ．増幅ベースの方法
ＰＣＲ、ＲＴ－ＰＣＲ、ｑＰＣＲ、及びローリングサークル増幅を含むが、これらに限定されない、小さい非コードＲＮＡ核酸配列のレベルを検出するための多くの増幅ベースの方法が存在する。他の増幅ベースの技術には、例えば、リガーゼ連鎖反応、多重ライゲーション可能なプローブ増幅、インビトロ転写（ＩＶＴ）、鎖置換増幅、転写媒介増幅、ＲＮＡ（Ｅｂｅｒｗｉｎｅ）増幅、及び当業者に既知の他の方法が含まれる。
典型的なＰＣＲ反応は、標的核酸種を選択的に増幅させる複数のステップ、又はサイクル、すなわち、標的核酸が変性される、変性ステップ、一組のＰＣＲプライマー（すなわち、フォワード及びリバースプライマー）が相補的ＤＮＡ鎖にアニーリングする、アニーリングステップ、及び熱安定性ＤＮＡポリメラーゼがプライマーを伸長する、伸長ステップを含む。これらのステップを複数回繰り返すことによって、ＤＮＡ断片を増幅させて、標的配列に対応する単位複製配列を産生する。典型的なＰＣＲ反応には、変性、アニーリング、及び伸長の２０以上のサイクルが含まれる。多くの場合、アニーリング及び伸長ステップは同時に実行することができ、この場合、サイクルは、２つのステップのみを含む。逆転写反応（小さい非コードＲＮＡに対して相補性を有するｃＤＮＡ配列を産生する）が、ＰＣＲ増幅の前に行われてもよい。逆転写反応は、例えば、ＲＮＡベースのＤＮＡポリメラーゼ（逆転写酵素）及びプライマーの使用を含む。
本開示は、本明細書に開示され、表２に現れる完全長のｏｎｃＲＮＡに相補的なｃＤＮＡ配列を含む組成物に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、表２に提供されるｃＤＮＡ配列の断片を含む組成物に関し、これは、約４～約２００ヌクレオチド長であり、表２からの完全長のｏｎｃＲＮＡの連続した部分に相補的である。いくつかの実施形態では、本開示は、表２に開示されるｏｎｃＲＮＡの一部に対して相補的である少なくとも１つ又は少なくとも２つのプローブを含むキットに関する。いくつかの実施形態では、本開示は、表２に提供されるｃＤＮＡ配列の断片を含む組成物に関し、これは、約４～約３００ヌクレオチド長であり、完全長のｏｎｃＲＮＡ内に入れ子になっているか、又はＤＮＡ配列全体を含む任意の位置にある、表２からの完全長のｏｎｃＲＮＡの連続した部分に相補的である。
小さい非コードＲＮＡの定量的リアルタイムＰＣＲのためのキットは、既知であり、市販されている。好適なキットの例には、ＴａｑＭａｎ ｍｉＲＮＡアッセイ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）及びｍｉｒＶａｎａ．ｑＲＴ－ＰＣＲ ｍｉＲＮＡ検出キット（Ａｍｂｉｏｎ）が含まれるが、これらに限定されない。小さい非コードＲＮＡは、逆転写酵素の前に、ユニバーサルプライマー配列、ポリアデニル化配列、又はアダプター配列を含有する一本鎖オリゴヌクレオチドにライゲーションし、ユニバーサルプライマー配列に相補的なプライマー、ポリ（Ｔ）プライマー、又はアダプター配列に相補的な配列を含むプライマーを使用して増幅させることができる。いくつかの実施形態では、本開示は、表２に開示される１つのｏｎｃＲＮＡの一部に対して相補的である少なくとも１つのプローブを含むキットに関する。いくつかの実施形態では、キットは、表２からのＤＮＡ配列を含み、そのようなＤＮＡ配列は、標的化されるｏｎｃＲＮＡに対応する。いくつかの実施形態では、キットは、表２の相補的ＤＮＡ配列に対して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の配列同一性を有する、表２で同定されるＤＮＡ配列又はその断片を含む。いくつかの実施形態では、前述のｃＤＮＡ配列は、表２に提供されるＤＮＡ配列内に入れ子になっている（例えば、その断片である）、約４～約２５０ヌクレオチド長の配列から各々独立して選択される１種又は２種以上のアニーリングオリゴであり得る。いくつかの実施形態では、ｃＤＮＡ配列又はその断片は、ＰＣＲ反応のためのプローブとして利用することができ、それらは、会合するｏｎｃＲＮＡを検出するためのプライマーとして作用する。
いくつかの事例では、カスタムｑＲＴ－ＰＣＲアッセイが、小さい非コードＲＮＡレベルの決定のために開発され得る。生体試料、例えば、体液中の小さい非コードＲＮＡを測定するためのカスタムｑＲＴ－ＰＣＲアッセイは、例えば、伸長逆転写プライマー及びロック核酸修飾ＰＣＲを伴う方法を使用して開発され得る。カスタムの小さい非コードＲＮＡアッセイは、標的配列に対応する化学的に合成された小さい非コードＲＮＡの希釈系列でアッセイを実行することによって試験することができる。これにより、各アッセイの検出限界及び定量化の線形範囲の決定が可能になる。更に、標準曲線として使用される場合、これらのデータは、生体試料中で測定された小さい非コードＲＮＡの絶対存在量の推定を可能にする。
増幅曲線を、任意選択により、確認して、Ｃｔ値が各増幅プロットの線形範囲で評価されることを検証してもよい。典型的には、線形範囲は数桁に及ぶ。アッセイされた各候補の小さい非コードＲＮＡについて、小さい非コードＲＮＡの化学的に合成されたバージョンを得て、希釈系列で分析して、アッセイの感度の限界、及び定量化の線形範囲を決定することができる。相対発現レベルは、例えば、Ｌｉｖａｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ（２００１）Ｄｅｃｅｍｂｅｒ；２５（４）：４０２－８に記載されているように決定することができる。
いくつかの実施形態では、２つ以上の小さい非コードＲＮＡは、単一の反応体積で増幅される。例えば、ｑＲＴ－ＰＣＲなどの多重ｑ－ＰＣＲは、１つより多いプライマー対及び／又は１つより多いプローブを使用することによって、１つの反応体積において、目的の少なくとも２つの小さい非コードＲＮＡの同時増幅及び定量化を可能にする。プライマー対は、各々の小さい非コードＲＮＡに特異的に結合する少なくとも１つの増幅プライマーを含み、プローブは、それらが互いに区別可能であるように標識され、したがって、複数の小さい非コードＲＮＡの同時定量化を可能にする。
ローリングサークル増幅は、等温条件下で線形又は幾何学的動態のいずれかで環化オリゴヌクレオチドプローブを複製することができるＤＮＡ－ポリメラーゼ駆動反応である（例えば、Ｌｉｚａｒｄｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｇｅｎ．（１９９８）１９（３）：２２５－２３２、Ｇｕｓｅｖ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ．Ｊ．Ｐａｔｈｏｌ．（２００１）１５９（１）：６３－６９、Ｎａｌｌｕｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．（２００１）２９（２３）：Ｅ１１８を参照されたい）。一方が、ＤＮＡの（＋）鎖にハイブリダイズし、他方が、（－）鎖にハイブリダイズする２つのプライマーの存在下では、鎖置換の複雑なパターンは、９０分以下で各ＤＮＡ分子の１０９コピー超の生成をもたらす。閉環ＤＮＡ分子のタンデムに連結されたコピーは、単一のプライマーを使用することによって形成され得る。このプロセスは、マトリックス関連ＤＮＡを使用しても実行され得る。ローリングサークル増幅に使用される鋳型は、逆転写されてもよい。この方法は、非常に低い小さい非コードＲＮＡ濃度での、小さい非コードＲＮＡ配列及び発現レベルの高感度指標として使用され得る（例えば、Ｃｈｅｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｇｅｗ Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．（２００９）４８（１８）：３２６８－７２、Ｎｅｕｂａｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍｂｉｏｃｈｅｍ．（２００９）１０（８）：１２８９－９１を参照されたい）。
Ｂ．ハイブリダイゼーションベースの方法
小さい非コードＲＮＡは、ハイブリダイゼーションアレイ（例えば、マイクロアレイ）、ナノストリング分析、ノーザンブロット分析、分岐ＤＮＡ（ｂＤＮＡ）シグナル増幅、及びｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを含むが、これらに限定されない、ハイブリダイゼーションベースの方法を使用して検出され得る。
マイクロアレイを使用して、多数の小さい非コードＲＮＡの発現レベルを同時に測定することができる。マイクロアレイは、スライドガラス上に微細ピンで印刷すること、事前に作製されたマスクを使用したフォトリソグラフィー、動的マイクロミラーデバイスを使用したフォトリソグラフィー、インクジェット印刷、又はマイクロ電極アレイ上の電気化学を含む、様々な技術を使用して製造することができる。また、マイクロ流体ｑＲＴ－ＰＣＲ反応のアレイに基づく、マイクロ流体ＴａｑＭａｎ低密度アレイ、及び関連するマイクロ流体ｑＲＴ－ＰＣＲベースの方法も有用である。
Ａｘｏｎ Ｂ－４０００スキャナ及びＧｅｎｅ－Ｐｉｘ Ｐｒｏ４．０ソフトウェア又は他の好適なソフトウェアを使用して画像をスキャンすることができる。バックグラウンド減算後の非陽性スポット、及びＥＳＤ手順によって検出された外れ値は、除去される。得られたシグナル強度値は、チップ当たりの中央値に正規化され、次いで、各々の小さい非コードＲＮＡについての幾何平均及び標準誤差を得るために使用される。各シグナルは、対数ベース２に変換することができ、１標本ｔ検定を行うことができる。各試料についての独立したハイブリダイゼーションは、データのロバスト性を高めるために、各々の小さい非コードＲＮＡが複数回スポットされたチップ上で行うことができる。
マイクロアレイは、疾患における小さい非コードＲＮＡの発現プロファイリングに使用され得る。例えば、ＲＮＡは、試料から抽出することができ、任意選択で、小さい非コードＲＮＡは、全ＲＮＡからサイズ選択される。オリゴヌクレオチドリンカーは、小さい非コードＲＮＡの５’及び３’末端に結合することができ、得られたライゲーション生成物は、ＲＴ－ＰＣＲ反応のための鋳型として使用される。センス鎖ＰＣＲプライマーは、その５’末端に結合したフルオロフォアを有することができ、それによってＰＣＲ生成物のセンス鎖を標識する。ＰＣＲ生成物を変性させ、次いでマイクロアレイにハイブリダイズする。アレイ上の対応する小さい非コードＲＮＡ捕捉プローブ配列に相補的である標的核酸と称されるＰＣＲ生成物は、塩基対合を介して、捕捉プローブが取り付けられているスポットにハイブリダイズする。次いで、マイクロアレイレーザースキャナを使用して励起されると、スポットは蛍光を発する。
次いで、いくつかの陽性及び陰性対照並びにアレイデータ正規化方法を使用して、各スポットの蛍光強度を、特定の小さい非コードＲＮＡのコピー数の観点から評価し、これにより、特定の小さい非コードＲＮＡの発現レベルの評価がもたらされる。
体液試料から抽出された小さい非コードＲＮＡを含有する全ＲＮＡは、小さい非コードＲＮＡのサイズ選択なしに直接使用することもできる。例えば、ＲＮＡは、Ｔ４ ＲＮＡリガーゼ及びフルオロフォアで標識した短いＲＮＡリンカーを使用して標識された３’末端であり得る。アレイ上の対応する小さい非コードＲＮＡ捕捉プローブ配列に相補的なフルオロフォアで標識した小さい非コードＲＮＡは、塩基対合を介して、捕捉プローブが取り付けられているスポットにハイブリダイズする。次いで、いくつかの陽性及び陰性対照並びにアレイデータ正規化方法を使用して、各スポットの蛍光強度を、特定の小さい非コードＲＮＡのコピー数の観点から評価し、これにより、特定の小さい非コードＲＮＡの発現レベルの評価がもたらされる。
スポットオリゴヌクレオチドマイクロアレイ、予め製造したオリゴヌクレオチドマイクロアレイ、又はスポットロングオリゴヌクレオチドアレイを含むが、これらに限定されない、いくつかの種類のマイクロアレイを用いることができる。いくつかの実施形態では、本開示は、シリカ、プラスチック、又はシリカ若しくはプラスチックの両方の組み合わせを含む固体支持体に関する。
ｎＣｏｕｎｔｅｒ分析システム（ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈ．）を使用して、増幅することなく、小さい非コードＲＮＡを検出することもできる。この技術は、溶液中でハイブリダイズする２つの核酸ベースのプローブ（例えば、レポータープローブ及び捕捉プローブ）を利用する。ハイブリダイゼーション後、過剰なプローブを除去し、プローブ／標的複合体を製造業者のプロトコルに従って分析する。ｎＣｏｕｎｔｅｒ ｍｉＲＮＡアッセイキットは、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから入手可能であり、非常に特異性の高い高度に類似した小さい非コードＲＮＡを区別することができる。
小さい非コードＲＮＡは、分岐ＤＮＡ（ｂＤＮＡ）シグナル増幅を使用して検出することもできる（例えば、Ｕｒｄｅａ，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（１９９４），１２：９２６－９２８を参照されたい）。ｂＤＮＡシグナル増幅に基づく小さい非コードＲＮＡアッセイは、市販されている。そのようなアッセイの１つは、ＱｕａｎｔｉＧｅｎｅ．ＲＴＭ．２．０ ｍｉＲＮＡアッセイ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、Ｓａｎｔａ Ｃｌａｒａ，Ｃａｌｉｆ．）である。
ノーザンブロット及びｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを使用して、小さい非コードＲＮＡを検出することもできる。ノーザンブロット及びｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを行うための好適な方法は、当該技術分野で既知である。
いくつかの実施形態では、バイオマーカー発現は、多重分析物プロファイル試験、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、放射免疫アッセイ、ウェスタンブロットアッセイ、免疫蛍光アッセイ、酵素免疫アッセイ、免疫沈降アッセイ、化学発光アッセイ、免疫組織化学アッセイ、ドットブロットアッセイ、又はスロットブロットアッセイを含むが、これらに限定されない、当業者に既知のアッセイによって決定される。いくつかの実施形態では、抗体は、アッセイで使用され、抗体は、検出可能に標識される。抗体標識には、免疫蛍光標識、化学発光標識、リン光標識、酵素標識、放射標識、アビジン／ビオチン、コロイド金粒子、着色粒子、及び磁性粒子が含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、バイオマーカー発現は、ＩＨＣアッセイによって決定される。
いくつかの実施形態では、バイオマーカー発現は、バイオマーカーに特異的に結合する薬剤を使用して決定される。バイオマーカーへの特異的結合を示す任意の分子実体を利用して、試料中のそのバイオマーカータンパク質のレベルを決定することができる。特異的結合剤には、抗体、抗体断片、抗体模倣物、及びポリヌクレオチド（例えば、アプタマー）が含まれるが、これらに限定されない。当業者は、必要な特異性の程度は、バイオマーカータンパク質を検出するために使用される特定のアッセイによって決定されることを理解する。いくつかの実施形態では、本開示は、固体支持体（抗体、抗体断片、抗体模倣物、及び／又はＴ３ｐ若しくはその塩に結合することができるポリヌクレオチドを含むＥＬＩＳＡプレート、ゲル、ビーズ又はカラムなどを含むシステムに関する。
Ｃ．配列決定ベースの方法
高度な配列決定方法も同様に利用可能であれば使用することができる。例えば、小さい非コードＲＮＡは、Ｉｌｌｕｍｉｎａを使用して検出することができる。次世代配列決定（例えば、ＨｉＳｅｑ、ＨｉＳｃａｎ、ＧｅｎｏｍｅＡｎａｌｙｚｅｒ、又はＭｉＳｅｑシステム（Ｉｌｌｕｍｉｎａ，Ｉｎｃ．、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．）を例えば使用する、Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ－Ｂｙ－Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ又はＴｒｕＳｅｑ法）。小さい非コードＲＮＡはまた、Ｉｏｎ Ｔｏｒｒｅｎｔ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ（Ｉｏｎ Ｔｏｒｒｅｎｔ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．、Ｇｕｌｌｉｆｏｒｄ，Ｃｏｎｎ．）、又は他の好適な半導体配列決定方法を使用して検出することもできる。ｏｎｃＲＮＡの直接検出は、ＲＮＡを配列決定し、表２のＲＮＡ配列の１つ又は断片として配列を同定することによって、いくつかの実施形態で同定され得る。
Ｄ．追加の小さい非コードＲＮＡ検出ツール
質量分析を使用して、ＲＮａｓｅマッピングを使用して小さい非コードＲＮＡを定量化することができる。単離されたＲＮＡは、ＭＳ又はタンデムＭＳ（ＭＳ／ＭＳ）アプローチによるそれらの分析の前に、高い特異性を有するＲＮＡエンドヌクレアーゼ（ＲＮａｓｅ）（例えば、全ての未修飾グアノシン残基の３’側で切断するＲＮａｓｅ Ｔｌ）で酵素的に消化することができる。開発された最初のアプローチは、ＥＳＩ－ＭＳに直接結合された逆相ＨＰＬＣによるエンドヌクレアーゼ消化物のオンラインクロマトグラフィー分離を利用した。転写後修飾の存在は、ＲＮＡ配列に基づいて予想されるものからの質量シフトによって明らかにすることができる。次いで、異常な質量／電荷値のイオンを、タンデムＭＳ配列決定のために単離して、転写後に修飾されたヌクレオシドの配列配置を特定することができる。
マトリックス支援レーザー脱離／イオン化質量分析（ＭＡＬＤＩ－ＭＳ）は、転写後修飾ヌクレオシドに関する情報を取得するための分析アプローチとしても使用されてきた。ＭＡＬＤＩベースのアプローチは、分離ステップによってＥＳＩベースのアプローチと区別することができる。ＭＡＬＤＩ－ＭＳでは、質量分析計を使用して小さい非コードＲＮＡを分離する。
限られた量のインタクトな小さい非コードＲＮＡを分析するために、ナノＥＳＩ－ＭＳと結合したキャピラリーＬＣのシステムを、線形イオントラップオービトラップハイブリッド質量分析計（ＬＴＱ Ｏｒｂｉｔｒａｐ ＸＬ、Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）又はカスタムメイドのナノスプレーイオンソース、Ｎａｎｏｖｏｌｕｍｅ Ｖａｌｖｅ（Ｖａｌｃｏ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）、及びスプリットレスナノＨＰＬＣシステム（ＤｉＮａ、ＫＹＡ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を装備したタンデム四重極飛行時間質量分析計（ＱＳＴＡＲ ＸＬ、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用することによって用いることができる。分析物／ＴＥＡＡを、ナノＬＣトラップカラム上にロードし、脱塩し、次いで濃縮する。インタクトな小さい非コードＲＮＡをトラップカラムから溶出し、Ｃｌ ８キャピラリーカラムに直接注入し、極性を増加させる溶媒の勾配を使用してＲＰ－ＨＰＬＣによってクロマトグラフィーを行う。クロマトグラフィー溶出液は、負極性モードでイオンをスキャンできるイオン化電圧を使用して、キャピラリーカラムに取り付けられたスプレーヤーチップから噴霧される。
小さい非コードＲＮＡの検出及び測定のための更なる方法には、例えば、鎖侵入（ｓｔｒａｎｄ ｉｎｖａｓｉｏｎ）アッセイ（Ｔｈｉｒｄ Ｗａｖｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．）、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）、ｃＤＮＡ、ＭＴＤＮＡ（金属ＤＮＡ、Ａｄｖａｎｃｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｓａｓｋａｔｏｏｎ，ＳＫ）、及びＵＳ Ｇｅｎｏｍｉｃｓによって開発されたものなどの単一分子方法が含まれる。表面酵素反応と、ナノ粒子増幅型ＳＰＲイメージング（ＳＰＲＩ）とを組み合わせた新規アプローチを使用して、複数の小さい非コードＲＮＡをマイクロアレイ形式で検出することができる。ポリ（Ａ）ポリメラーゼの表面反応は、ロック核酸（ＬＮＡ）マイクロアレイ上にハイブリダイズした小さい非コードＲＮＡ上にポリ（Ａ）尾部を作製する。次いで、ＤＮＡ修飾ナノ粒子をポリ（Ａ）尾部上に吸着させ、ＳＰＲＩで検出する。この超高感度ナノ粒子増幅型ＳＰＲＩ法は、アトモルレベルでの小さい非コードＲＮＡプロファイリングに使用され得る。
Ｅ．増幅した又は増幅していない小さい非コードＲＮＡの検出
ある特定の実施形態では、標識、色素、又は標識されたプローブ及び／若しくはプライマーを使用して、増幅した又は増幅していない小さい非コードＲＮＡを検出する。当業者は、検出方法の感度及び標的の存在量に基づいて、どの検出方法が適切であるかを認識するであろう。検出方法の感度及び標的の存在量に応じて、検出前に増幅が必要であってもよいか、又は必要でなくてもよい。当業者は、小さい非コードＲＮＡ増幅が好ましい検出方法を認識するであろう。
プローブ又はプライマーは、標準（Ａ、Ｔ又はＵ、Ｇ及びＣ）塩基、又は修飾塩基を含み得る。修飾塩基には、例えば、米国特許第５，４３２，２７２号、同第５，９６５，３６４号、及び同第６，００１，９８３号に記載されているＡＥＧＩＳ塩基（Ｅｒａｇｅｎ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ製）が含まれるが、これらに限定されない。ある特定の態様では、塩基は、天然のホスホジエステル結合又は異なる化学結合によって結合される。異なる化学結合には、例えば、米国特許第７，０６０，８０９号に記載されているペプチド結合又はロック核酸（ＬＮＡ）結合が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、本開示は、表２のＤＮＡ又はｃＤＮＡ配列のうちの１つ又は組み合わせを含むか、又はそれからなるプローブ又はプライマーを含むシステムに関する。いくつかの実施形態では、本開示は、表２のＤＮＡ又はｃＤＮＡ配列の断片のうちの１つ又は組み合わせを含むか、又はそれからなるプローブ又はプライマーを含むシステムに関する。
更なる態様では、増幅反応に存在するオリゴヌクレオチドプローブ又はプライマーは、時間の関数として産生される増幅生成物の量をモニタリングするのに好適である。ある特定の態様では、異なる一本鎖特性と二本鎖特性とを有するプローブを使用して、核酸を検出する。プローブには、５’－エキソヌクレアーゼアッセイ（例えば、ＴＡＱＭＡＮ）プローブ（米国特許第５，５３８，８４８号を参照されたい）、ステムループ分子ビーコン（例えば、米国特許第６，１０３，４７６号及び同第５，９２５，５１７号を参照されたい）、ステムレス又は線形ビーコン（例えば、ＷＯ９９２１８８１、米国特許第６，４８５，９０１号及び同第６，６４９，３４９号を参照されたい）、ペプチド核酸（ＰＮＡ）分子ビーコン（例えば、米国特許第６，３５５，４２１号及び同第６，５９３，０９１号を参照されたい）、線形ＰＮＡビーコン（例えば、米国特許第６，３２９，１４４号を参照されたい）、非ＦＲＥＴプローブ（例えば、米国特許第６，１５０，０９７号を参照されたい）、Ｓｕｎｒｉｓｅ．ＴＭ．／ＡｍｐｌｉｆｌｕｏｒＢ．ＴＭ．プローブ（例えば、米国特許第６，５４８，２５０号を参照されたい）、ステムループ及び二本鎖ＳＣＯＲＰＩＯＮプローブ（例えば、米国特許第６，５８９，７４３号を参照されたい）、バルジループプローブ（例えば、米国特許第６，５９０，０９１号を参照されたい）、シュードノットプローブ（例えば、米国特許第６，５４８，２５０号を参照されたい）、サイクリコン（ｃｙｃｌｉｃｏｎｓ）（例えば、米国特許第６，３８３，７５２号を参照されたい）、ＭＧＢ Ｅｃｌｉｐｓｅ．ＴＭ．プローブ（Ｅｐｏｃｈ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、ヘアピンプローブ（例えば、米国特許第６，５９６，４９０号を参照されたい）、ＰＮＡライトアッププローブ、アンチプライマークエンチプローブ（Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．５３：６２４－６３３（２００６））、自己組織化ナノ粒子プローブ、並びに例えば、米国特許第６，４８５，９０１号に記載されているフェロセン修飾プローブが含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、増幅反応におけるプライマーのうちの１つ以上は、標識を含むことができる。なお更なる実施形態では、異なるプローブ又はプライマーは、互いに区別可能な検出可能な標識を含む。いくつかの実施形態では、プローブ又はプライマーなどの核酸は、２つ以上の区別可能な標識で標識され得る。
いくつかの態様では、標識は、１つ以上のプローブに取り付けられ、以下の特性のうちの１つ以上を有する。（ｉ）検出可能なシグナルを提供すること、（ｉｉ）第２の標識と相互作用して、第２の標識、例えば、ＦＲＥＴ（蛍光共鳴エネルギー移動）によって提供される検出可能なシグナルを修飾すること、（ｉｉｉ）ハイブリダイゼーション、例えば、二本鎖形成を安定化すること、及び（ｉｖ）結合複合体又は親和性セット、例えば、親和性、抗体－抗原、イオン複合体、ハプテン－リガンド（例えば、ビオチン－アビジン）のメンバーを提供すること。更に他の態様では、標識の使用は、既知の標識、連結、連結基、試薬、反応条件、並びに分析及び精製方法を利用する多数の既知の技術のうちのいずれか１つを使用して達成することができる。
小さい非コードＲＮＡは、直接的又は間接的方法によって検出することができる。直接検出方法では、１つ以上の小さい非コードＲＮＡが、核酸分子に連結される検出可能な標識によって検出される。そのような方法では、小さい非コードＲＮＡは、プローブへの結合の前に標識され得る。したがって、結合は、プローブに結合している標識された小さい非コードＲＮＡをスクリーニングすることによって検出される。プローブは、任意選択により、反応体積でビーズに連結される。
ある特定の実施形態では、核酸は、標識されたプローブとの直接結合によって検出され、その後、プローブが検出される。いくつかの実施形態では、増幅した小さい非コードＲＮＡなどの核酸は、プローブとコンジュゲートしたＦＩｅｘＭＡＰ Ｍｉｃｒｏｓｐｈｅｒｅｓ（Ｌｕｍｉｎｅｘ）を使用して検出されて、所望の核酸を捕捉する。いくつかの方法は、例えば、蛍光標識で修飾されたポリヌクレオチドプローブでの検出又は分岐ＤＮＡ（ｂＤＮＡ）検出を伴ってもよい。
いくつかの実施形態では、バイオマーカー発現は、各バイオマーカーについての特定のプライマー及び／又はプローブを含むＰＣＲベースのアッセイを使用して決定される。本明細書で使用される場合、「プローブ」という用語は、特異的に意図される標的生体分子を選択的に結合することができる任意の分子を指す。いくつかの実施形態では、本明細書で使用される場合、「プローブ」という用語は、本明細書に開示される基質及び／又は反応生成物及び／又はプロテアーゼのうちのいずれかに、間接的又は直接的、共有結合的又は非共有結合的に結合又は会合し得る任意の分子を指し、その会合又は結合は、本明細書に開示される方法を使用して検出可能である。いくつかの実施形態では、プローブは、蛍光性プローブ、抗体又は吸光度ベースのプローブである。吸光度ベースのプローブの場合、発色団ｐＮＡ（パラ－ニトロアナリン）は、本明細書に開示される標的核酸配列の検出及び／又は定量化のためのプローブとして使用され得る。いくつかの実施形態では、プローブは、蛍光原性分子又は基質で標識された核酸配列を含んでもよく、これは、酵素に曝露すると、蛍光原性となり、核酸配列は、表１に開示される核酸配列のうちのいずれかに相補的であるか、又は表１に開示される核酸配列（配列番号１～配列番号１５４３）のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の配列同一性を含むものである。プローブは、既知の技術を使用して当業者によって合成され得るか、又は生物学的調製物に由来することができる。プローブには、ＲＮＡ、ＤＮＡ、タンパク質、ペプチド、アプタマー、抗体、及び有機分子が含まれ得るが、これらに限定されない。「プライマー」又は「プローブ」という用語は、特定の配列を有するオリゴヌクレオチド、又は特定の配列を有するオリゴリボヌクレオチドを包含する。
標的分子は、表１に同定された核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせであり得る。いくつかの実施形態では、標的分子は、表１に提供される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は約９９％の配列同一性を含む核酸配列である。いくつかの実施形態では、標的分子は、表２に同定された核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、又は配列番号１５４４～配列番号６８４３から選択される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、並びに／あるいは表２の核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、又は配列番号１５４４～配列番号６８４３から選択される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は約９９％の配列同一性を含む核酸配列のうちのいずれか１つ又は組み合わせの任意の増幅断片である。標的分子は、表２に同定された核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、又は配列番号１５４４～配列番号１８から選択される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせであり得る。いくつかの実施形態では、標的分子は、表１に提供される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸配列のうちのいずれか１つ若しくは組み合わせに対して、少なくとも約７０％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は約９９％の配列同一性を含む核酸配列である。
他の実施形態では、核酸は、間接検出方法によって検出される。例えば、ビオチン化プローブは、ストレプトアビジンコンジュゲート色素と組み合わせて、結合した核酸を検出することができる。ストレプトアビジン分子は、増幅した小さい非コードＲＮＡ上のビオチン標識に結合し、結合した小さい非コードＲＮＡは、ストレプトアビジン分子に結合した色素分子を検出することによって検出される。いくつかの実施形態では、ストレプトアビジンコンジュゲート色素分子は、ＰＨＹＣＯＬＩＮＫを含む。ストレプトアビジンＲ－フィコエリトリン（ＰＲＯｚｙｍｅ）。他のコンジュゲート色素分子は、当業者に既知である。
標識には、検出可能な蛍光、化学発光、又は生物発光シグナルを生成又はクエンチする、発光、光散乱、及び光吸収化合物が含まれるが、これらに限定されない（例えば、Ｋｒｉｃｋａ，Ｌ．，Ｎｏｎｉｓｏｔｏｐｉｃ ＤＮＡ Ｐｒｏｂｅ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ（１９９２）及びＧａｒｍａｎ Ａ．，Ｎｏｎ－Ｒａｄｉｏａｃｔｉｖｅ Ｌａｂｅｌｉｎｇ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ（１９９７）を参照されたい。）。いくつかの実施形態では、レポーターフルオロフォア及びクエンチャーフルオロフォアを含む二重標識化蛍光プローブが使用される。それらを容易に区別できるように、異なる発光スペクトルを有する一対のフルオロフォアが選択されることが理解されるであろう。
ある特定の実施形態では、標識は、二本鎖、例えば、インターカレーター及びインターカレーティング色素（臭化エチジウム及びＳＹＢＲ－Ｇｒｅｅｎを含むが、これらに限定されない）、副溝結合剤、及び架橋官能基のハイブリダイゼーションを増強、安定化、又は影響を与えるのに役立つハイブリダイゼーション安定化部分である（例えば、Ｂｌａｃｋｂｕｒｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．“ＤＮＡ ａｎｄ ＲＮＡ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ”ｉｎ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ ｉｎ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｙ（１９９６）を参照されたい）。
他の実施形態では、オリゴヌクレオチドライゲーション（ＯＬＡ）方法、及び標的核酸配列にハイブリダイズする区別可能なプローブを非結合プローブから分離することを可能にする方法を含む、小さい非コードＲＮＡを定量化するためにハイブリダイゼーション及び／又はライゲーションに依存する方法が使用され得る。一例として、米国特許出願公開第２００６／００７８８９４号に開示されているようなＨＡＲＰ様プローブを使用して、ｍｉＲＮＡの量を測定することができる。そのような方法では、プローブと標的核酸との間のハイブリダイゼーション後、ハイブリダイズされたプローブをハイブリダイズされていないプローブと区別するようにプローブを修飾する。その後、プローブを増幅及び／又は検出してもよい。一般に、プローブ不活性化領域は、プローブの標的ハイブリダイゼーション領域内のヌクレオチドのサブセットを含む。その標的核酸にハイブリダイズされていないＨＡＲＰプローブの増幅又は検出を低減又は防止するために、かつ、それによって、標的核酸の検出を可能にするために、ハイブリダイゼーション後のプローブ不活性化ステップは、その標的化核酸配列にハイブリダイズされるＨＡＲＰプローブと、対応するハイブリダイズされていないＨＡＲＰプローブとを区別することができる薬剤を使用して実施される。薬剤は、増幅できないように、ハイブリダイズされていないＨＡＲＰプローブを不活性化又は修飾することができる。プローブライゲーション反応を使用して、小さい非コードＲＮＡを定量化することもできる。多重ライゲーション依存性プローブ増幅（ＭＬＰＡ）技術（Ｓｃｈｏｕｔｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３０：ｅ５７（２００２））では、標的核酸上で互いにすぐ隣接してハイブリダイズする一対のプローブは、標的核酸の存在によって駆動されて互いにライゲーションされる。いくつかの態様では、ＭＬＰＡプローブは、隣接ＰＣＲプライマー結合部位を有する。ＭＬＰＡプローブは、ライゲーションされると、特異的に増幅され、それによって、小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの検出及び定量化を可能にする。
小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルの検出
本明細書に記載の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーは、個別に、又は診断試験と組み合わせて、対象におけるがんの種類、起源の組織、及びがんの状況又は段階を評価するために使用することができる。がんの状況又は段階は、がんの存在又は非存在を含む。がんの状況又は段階はまた、がんの経過をモニタリングすること、例えば、疾患の進行をモニタリングすることを含み得る。対象のがんの状況又は段階に基づいて、例えば、追加の診断試験又は治療手順を含む、追加の手順が示され得る。
疾患の状況を正確に予測するための診断試験の能力は、一般に、アッセイの精度、アッセイの感度、アッセイの特異性、又は「曲線下面積」（ＡＵＣ）、例えば、受信者操作特性（ＲＯＣ）曲線下面積の観点から測定される。本明細書で使用される場合、精度は、誤分類された試料の割合の尺度である。精度は、例えば、試験集団における、正しく分類された試料の総数を、試料の総数で割ったものとして計算することができる。感度は、試験によって陽性であると予測される「真の陽性」の尺度であり、正確に同定された乳がん試料の数を、乳がん試料の総数で割ったものとして計算することができる。特異性は、試験によって陰性であると予測される「真の陰性」の尺度であり、正しく同定された正常試料の数を、正常試料の総数で割ったものとして計算することができる。ＡＵＣは、感度対偽陽性率（１－特異性）のプロットである、受信者操作特性曲線下面積の尺度である。ＡＵＣが大きいほど、試験の予測値が、より有力になる。試験の有用性の他の有用な尺度には、陽性として試験する実際の陽性の割合である「陽性予測値」、及び陰性として試験する実際の陰性の割合である「陰性予測値」が含まれる。いくつかの実施形態では、異なるがんの状況を有する対象から得られた試料中の１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、好適な対照と比較して決定される場合、正常な対象に対して少なくとも約０．０５（ｐ＝０．０５）の統計的に有意な差を示す。いくつかの実施形態では、異なるがんの状況を有する対象から得られた試料中の１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、好適な対照と比較して決定される場合、正常な対象に対して少なくとも約０．０１（ｐ＝０．０１）の統計的に有意な差を示す。いくつかの実施形態では、異なるがんの状況を有する対象から得られた試料中の１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、好適な対照と比較して決定される場合、正常な対象に対して少なくとも約０．００５（ｐ＝０．００５）の統計的に有意な差を示す。いくつかの実施形態では、異なるがんの状況を有する対象から得られた試料中の１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、好適な対照と比較して決定される場合、正常な対象に対して少なくとも約０．００１（ｐ＝０．００１）の統計的に有意な差を示す。
他の実施形態では、本明細書に記載の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーを、個別に又は組み合わせて使用する診断試験は、少なくとも約７５％の精度、例えば、少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％、又は約１００％の精度を示す。他の実施形態では、本明細書に記載の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーを、個別に又は組み合わせて使用する診断試験は、少なくとも約７５％の特異性、例えば、少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％、又は約１００％の特異性を示す。他の実施形態では、本明細書に記載の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーを、個別に又は組み合わせて使用する診断試験は、少なくとも約７５％の感度、例えば、少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％、又は約１００％の感度を示す。他の実施形態では、本明細書に記載の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーを、個別に又は組み合わせて使用する診断試験は、各々、少なくとも約７５％の特異性及び感度、例えば、少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％又は約１００％の特異性及び感度（例えば、少なくとも約８０％の特異性及び少なくとも約８０％の感度、又は例えば、少なくとも約８０％の特異性及び少なくとも約９５％の感度）を示す。
表１に列挙される各バイオマーカー（配列番号１～配列番号１５４３）は、提供されるように、特定の種類のがんに関連するものとして識別される。いくつかの事例では、１つの特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーは、２つ以上の種類のがんと関連し得る（例えば、配列番号１）。他の事例では、１つの特定の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーは、１つの種類のみのがんと関連し得る（例えば、配列番号２８）。
表１に列挙される各バイオマーカー（配列番号１～配列番号１５４３）は、正常な対象と比較して、特定の種類のがんを有する対象に由来する生体試料中に異なって存在し、したがって、各々は、試験対象におけるそれらの種類のがんの決定を容易にするのに個々に有用である。そのような方法は、対象から得られた試料におけるバイオマーカーのレベルを決定することを含む。試料中のバイオマーカーのレベルを決定することは、任意の好適な方法、例えば、本明細書に記載の方法を使用して、試料中のバイオマーカーのレベルを測定、検出、又はアッセイすることを含み得る。試料中のバイオマーカーのレベルを決定することはまた、試料中のバイオマーカーのレベルを測定、検出、又はアッセイしたアッセイの結果を調べることを含み得る。この方法はまた、試料中のバイオマーカーのレベルを好適な対照と比較することを含み得る。好適な対照を使用して評価した場合の正常な対象におけるバイオマーカーのレベルと比較したバイオマーカーのレベルの変化は、対象のがんの状況又は段階を示す。対象が、特定のがんの状況又は段階を有すると分類される、上記又は下記のバイオマーカーの量を表すバイオマーカーの診断量を使用することができる。例えば、バイオマーカーが、正常な個体と比較してがんを有する個体からの試料において上方制御される場合、診断カットオフを上回る測定量は、個体が有するがんの種類の診断を提供する。一般に、表１の個々の小さい非コードＲＮＡバイオマーカー（配列番号１～配列番号１５４３）は、正常な個体から得られた試料と比較して、がん試料中で上方制御される。当該技術分野で十分に理解されているように、アッセイで使用される特定の診断カットオフを調整することは、所望される診断アッセイの感度及び／又は特異性を調整することを可能にする。特定の診断カットオフは、例えば、異なるがんの状況を有する対象からの統計的に有意な数の試料中のバイオマーカーの量を測定し、所望の精度、感度、及び／又は特異性のレベルでカットオフを引き出すことによって決定されてもよい。ある特定の実施形態では、診断カットオフは、本明細書に記載されるように、分類アルゴリズムの支援により決定することができる。いくつかの実施形態では、その
したがって、対象からの試料中の少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベルを決定することによって、対象におけるがんを診断するための方法が提供され、（好適な対照と比較して決定される場合）正常な対象におけるものに対する少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベルの差が、対象におけるがんを示す。いくつかの実施形態では、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡは、表１（配列番号１～配列番号１５４３）からの１つ以上の小さい非コードＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡは、表２（配列番号１５４４～配列番号６５６９）からの１つ以上の小さい非コードＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、（好適な対照と比較して決定される場合）正常な対象におけるものに対する少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベルの差は、対象において検出された少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡに関連すると同定されたがんの種類を示す。例えば、対象からの試料中の少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベルを決定する開示される方法では、対照に対する少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベルの増加は、対象におけるがん、特に、検出された少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡに関連すると同定されたがんの種類を示す。
任意選択で、この方法は、試料中の少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベルに基づいて、対象が、がんを有するか、又は有しないかの診断を提供することを更に含み得る。追加的又は代替的に、この方法は、好適な対照と比較した少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡのレベル又は複数のレベルの差を、対象におけるがんの診断と相関させることを更に含み得る。いくつかの実施形態では、そのような診断は、対象に直接提供されてもよいか、又は対象のケアに関与する別の当事者に提供されてもよい。
個々の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーは、本明細書に示されるように、様々な種類のがんの診断用途に有用であるが、小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの組み合わせは、単独で使用される場合、小さい非コードＲＮＡバイオマーカーよりも、がんの状況又は段階のより大きな予測値を提供することができる。具体的には、複数の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの検出は、診断試験の精度、感度、及び／又は特異性を増加させることができる。複数の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの検出は、対象におけるがんの種類及び／又はその状況若しくは段階を絞り込むのにも役立つことができる。これは、所与の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーが、２つ以上の種類のがんと関連していると同定される場合に特に有用である。例えば、ＲＮＡバイオマーカーＡが、がんＸ、Ｙ、及びＺに関連していると同定される場合、ＲＮＡバイオマーカーＢは、がんＸ及びＹに関連していると同定され、ＲＮＡバイオマーカーＣは、消去プロセスによって、がんＸ及びＺに関連していると同定され、対象におけるＲＮＡバイオマーカーＡ、Ｂ、及びＣの存在の検出は、対象が、がんＸを有することを示す。したがって、本開示は、表１（配列番号１～配列番号１５４３）に提供される個々のＲＮＡバイオマーカー及び本明細書に記載されるバイオマーカーの組み合わせ、並びに本明細書に記載される方法及びキットにおけるそれらの使用を含む。
したがって、対象からの試料中の２つ以上の小さい非コードＲＮＡのレベルを決定することによって、対象におけるがんを診断するための方法が提供され、（好適な対照と比較して決定される場合）正常な対象におけるものに対する小さい非コードＲＮＡのレベルの差が、対象におけるがんを示す。いくつかの実施形態では、小さい非コードＲＮＡは、表１（配列番号１～配列番号１５４３）に提供される小さい非コードＲＮＡのうちの１つ以上を含む。いくつかの実施形態では、このようにして診断されたがんの種類は、表１（配列番号１～配列番号１５４３）で提供される各々の個々の小さい非コードＲＮＡと関連しているとして表１で提供されるものである。いくつかの実施形態では、このようにして診断されたがんの種類は、表２（配列番号１５４４～配列番号６８３４）で提供される各々の個々の小さい非コードＲＮＡと関連しているとして表２で提供されるものである。
また、対象からの試料中の２つ以上の小さい非コードＲＮＡのレベルを決定すること、試料中の２つ以上の小さい非コードＲＮＡのレベルを、正常な対象及び特定の種類のがんを有する対象に存在する同じ小さい非コードＲＮＡのレベルを表すデータのセットと比較すること、並びに比較に基づいて、対象を、その特定の種類のがんを有するか、又は有しないとして診断することによって、対象におけるがんを診断する方法も提供される。そのような方法では、データのセットは、対象からの試料と比較するための好適な対照又は参照基準として機能する。
対象からの試料とデータセットとの比較は、分類アルゴリズムによって支援されてもよく、その分類アルゴリズムは、試料中の２つ以上の小さい非コードＲＮＡの集合レベルと、正常な対象又はがんを有する対象に存在する同じ小さい非コードＲＮＡのレベルとの間に統計的に有意な差が存在するか否かを計算する。
がんの状況を特定するための分類アルゴリズムの生成
いくつかの実施形態では、次いで、「既知の試料」などの試料を使用して生成されるデータを使用して、分類モデルを「訓練」することができる。「既知の試料」は、予め分類された、例えば、正常な対象に由来するか、又は特定の種類のがんを有する対象に由来すると分類された試料である。スペクトルから導き出され、分類モデルを形成するために使用されるデータは、「訓練データセット」と称され得る。訓練されると、分類モデルは、未知の試料を使用して生成されたスペクトルから導き出されるデータのパターンを認識することができる。次に、分類モデルを使用して、未知の試料をクラスに分類することができる。これは、例えば、特定の生体試料が、ある特定の生物学的状態（例えば、疾患対非疾患）に関連付けられているか否かを予測する際に有用であり得る。
いくつかの実施形態では、分類モデルを形成するために使用される訓練データセットについてのデータは、定量的ＰＣＲ（例えば、二重デルタＣｔ法を使用して得られたＣｔ値）から、又はマイクロアレイ分析などのハイスループット発現プロファイリング（例えば、小さい非コードＲＮＡ発現アッセイからの総カウント又は正規化されたカウント）から直接得ることができる。
分類モデルは、データに存在する客観的パラメータに基づいてデータの本体をクラスに分離しようとする任意の好適な統計分類（又は「学習」）方法を使用して形成することができる。分類方法は、教師あり又は教師なしのいずれかであり得る。教師あり及び教師なし分類プロセスの例は、Ｊａｉｎ，“Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｐａｔｔｅｒｎ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ：Ａ Ｒｅｖｉｅｗ，”ＩＥＥＥ Ｔｒａｎｓａｃｔｉｏｎｓ ｏｎ Ｐａｔｔｅｒｎ Ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ Ｍａｃｈｉｎｅ Ｉｎｔｅｌｌｉｇｅｎｃｅ，Ｖｏｌ．２２，Ｎｏ．１，Ｊａｎｕａｒｙ ２０００に記載されており、その教示は参照により組み込まれる。
教師あり分類では、既知のカテゴリの例を含む訓練データが、既知のクラスの各々を定義する１つ以上の関係セットを学習する学習メカニズムに提示される。次いで、新しいデータが学習メカニズムに適用され得、その学習メカニズムは、次いで、学習された関係を使用して新しいデータを分類する。教師あり分類プロセスの例には、線形回帰プロセス（例えば、多重線形回帰（ＭＬＲ）、部分最小二乗（ＰＬＳ）回帰及び主成分回帰（ＰＣＲ））、二分決定木（例えば、ＣＡＲＴ－分類及び回帰木などの再帰分割プロセス）、逆伝搬ネットワークなどの人工ニューラルネットワーク、判別分析（例えば、ベイズ分類器又はフィッシャー分析）、ロジスティック分類器、並びにサポートベクター分類器（サポートベクターマシン）が含まれる。
他の実施形態では、作成される分類モデルは、教師なし学習方法を使用して形成され得る。教師なし分類は、訓練データセットが導き出されたスペクトルを事前に分類せずに、訓練データセットの類似性に基づいて分類を学習しようとする。教師なし学習方法には、クラスター分析が含まれる。クラスター分析は、理想的には互いに非常に類似しており、他のクラスターのメンバーとは非常に異なるメンバーを有するべき「クラスター」又はグループにデータを分割しようとする。次に、類似性は、データ項目間の距離を測定する距離メトリックを使用して測定され、互いに近いデータ項目を一緒にクラスター化する。クラスタリング技法には、ＭａｃＱｕｅｅｎのＫ平均アルゴリズム及びＫｏｈｏｎｅｎの自己組織化マップアルゴリズムが含まれる。生物学的情報の分類に使用するために主張される学習アルゴリズムは、例えば、ＰＣＴ国際公開第０１／３１５８０号（Ｂａｒｎｈｉｌｌ ｅｔ ａｌ．，“Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ ｄｅｖｉｃｅｓ ｆｏｒ ｉｄｅｎｔｉｆｙｉｎｇ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｉｎ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｓｙｓｔｅｍｓ ａｎｄ ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ ｕｓｅ ｔｈｅｒｅｏｆ”）、米国特許出願公開第２００２／０１９３９５０Ａ１号（Ｇａｖｉｎ ｅｔ ａｌ，“Ｍｅｔｈｏｄ ｏｒ ａｎａｌｙｚｉｎｇ ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒａ”）、米国特許出願公開第２００３／０００４４０２Ａ１号（Ｈｉｔｔ ｅｔ ａｌ．，“Ｐｒｏｃｅｓｓ ｆｏｒ ｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｉｎｇ ｂｅｔｗｅｅｎ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｓｔａｔｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｈｉｄｄｅｎ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｆｒｏｍ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｄａｔａ”）、及び米国特許出願公開第２００３／００５５６１５Ａ１号（Ｚｈａｎｇ ａｎｄ Ｚｈａｎｇ，“Ｓｙｓｔｅｍｓ ａｎｄ ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｄａｔａ”）に記載されている。前述の特許出願の内容は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
分類モデルは、任意の好適なデジタルコンピュータ上で形成され、使用され得る。好適なデジタルコンピュータには、Ｕｎｉｘ、ＷＩＮＤＯＷＳ、又はＬＩＮＵＸベースのオペレーティングシステムなどの任意の標準又は特殊なオペレーティングシステムを使用するマイクロコンピュータ、ミニコンピュータ、又は大型コンピュータが含まれる。
訓練データセット及び分類モデルは、デジタルコンピュータによって実行又は使用されるコンピュータコードによって具体化され得る。コンピュータコードは、光学又は磁気ディスク、スティック、テープなどを含む任意の好適なコンピュータ可読媒体に格納することができ、Ｃ、Ｃ＋＋、ビジュアルベーシックなどを含む任意の好適なコンピュータプログラミング言語で書くことができる。
上記の学習アルゴリズムは、様々な種類のがんに対する小さい非コードＲＮＡバイオマーカーの分類アルゴリズムを開発するために使用され得る。分類アルゴリズムは、次いで、単独で又は組み合わせて使用されるバイオマーカーについての診断値（例えば、カットオフポイント）を提供することによって、診断試験で使用され得る。
追加の診断試験
様々な種類のがんを示す小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルは、対象におけるがんの独立した診断指標として使用されてもよい。任意選択で、方法は、がんの診断を容易にするための少なくとも１つの追加の試験の実施を含み得る。例えば、がんの診断を容易にするために、１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することに加えて、他の試験が行われてもよい。がんの診断を容易にするために臨床診療で使用される任意の他の試験又は試験の組み合わせは、本明細書に記載される小さい非コードＲＮＡバイオマーカーと併せて使用され得る。
治療方法
いくつかの実施形態では、対象が、本明細書に記載の方法によって特定の種類のがんと診断される場合、本開示は、がんを有すると特定された対象を治療する方法を更に提供する。したがって、いくつかの実施形態では、本開示は、対象においてがんを治療する方法であって、対象からの試料中の少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象におけるがんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。別の実施形態では、本開示は、がんを有する対象を治療する方法であって、対象からの試料中の少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルが、好適な対照と比較して決定される場合、正常な対象におけるそれとは異なる（例えば、増加した）、がんを有する対象を特定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。
いくつかの実施形態では、本開示は、対象において肺がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号１２１及び２４１～５９３から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における肺がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において乳がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号１～１１から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における乳がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において前立腺がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号１３６７～配列番号１４２３から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における前立腺がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において結腸がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号１２～１７２から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における結腸がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において直腸がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号１１９１及び１４２４～１５４３から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における直腸がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において膵臓がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号２６１、２６４、３１５、４９４及び１０５７～１３６６から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における膵臓がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において肝臓がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号１４８及び１７３～２４０から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における肝臓がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、対象において卵巣がんを治療する方法であって、対象からの試料中の配列番号５９４～１０５６から選択される少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定することであって、好適な対照と比較して決定される場合、少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルと、正常な対象におけるそれとの差が、対象における卵巣がんを示す、決定することと、対象に治療有効量のがん治療薬を投与することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示の方法は、検出するステップを含み、ｏｎｃＲＮＡを検出するステップは、試料から単離されたＲＮＡを配列決定することによって、又は試料中のｏｎｃＲＮＡに対応する逆転写ＤＮＡを増幅することによって検出される。
「がん治療薬」という用語は、例えば、がんの治療のために米国食品医薬品局によって承認された物質を含む。例えば、乳がんを治療するために承認された薬物には、アベマシクリブ、アビトレキサート（Ａｂｉｔｒｅｘａｔｅ）（メトトレキサート）、アブラキサン（パクリタキセルアルブミン安定化ナノ粒子製剤）、Ａｄｏ－トラスツズマブエムタンシン、アフィニトール（エベロリムス）、アナストロゾール、アレディア（パミドロン酸二ナトリウム）、アリミデックス（アナストロゾール）、アロマシン（エキセメスタン）、カペシタビン、クラフェン（Ｃｌａｆｅｎ）（シクロホスファミド）、シクロホスファミド、シトキサン（シクロホスファミド）、ドセタキセル、ドキソルビシン塩酸塩、エレンス（Ｅｌｌｅｎｃｅ）（エピルビシン塩酸塩）、エピルビシン塩酸塩、エリブリンメシル酸塩、エベロリムス、エキセメスタン、５－ＦＵ（フルオロウラシル注射剤）、フェアストン（トレミフェン）、フェソロデックス（フルベストラント）、フェマーラ（レトロゾール）、フルオロウラシル注射剤、フォレックス（Ｆｏｌｅｘ）（メトトレキサート）、フォレックス（Ｆｏｌｅｘ）ＰＦＳ（メトトレキサート）、フルベストラント、ゲムシタビン塩酸塩、ジェムザール（ゲムシタビン塩酸塩）、ゴセレリン酢酸塩、ハラヴェン（エリブリンメシル酸塩）、ハーセプチン（トラスツズマブ）、イブランス（パルボシクリブ）、イクサベピロン、イグゼンプラ（イクサベピロン）、カドサイラ（Ａｄｏ－トラスツズマブエムタンシン）、キスカリ（Ｋｉｓｑａｌｉ）（リボシクリブ）、ラパチニブ、ジトシレート、レトロゾール、酢酸メゲストロール、メトトレキサート、メトトレキサートＬＰＦ（メトトレキサート）、メキサート（Ｍｅｘａｔｅ）（メトトレキサート）、メキサート（Ｍｅｘａｔｅ）－ＡＱ（メトトレキサート）、ネオサール（Ｎｅｏｓａｒ）（シクロホスファミド）、ネラチニブマレイン酸塩、ネルリンクス（Ｎｅｒｌｙｎｘ）（ネラチニブマレイン酸塩）、ノルバデックス（タモキシフェンクエン酸塩）、パクリタキセル、パクリタキセルアルブミン安定化ナノ粒子製剤、パルボシクリブ、パミドロン酸二ナトリウム、パージェタ（ペルツズマブ）、ペルツズマブ、リボシクリブ、タモキシフェンクエン酸塩、タキソール（パクリタキセル）、タキソテール（ドセタキセル）、チオテパ、トレミフェン、トラスツズマブ、タイケルブ（ラパチニブ二トシル酸塩）、ベルバン（Ｖｅｌｂａｎ）（ビンブラスチン硫酸塩）、ベルサール（Ｖｅｌｓａｒ）（ビンブラスチン硫酸塩）、ベージニオ（アベマシクリブ）、ビンブラスチン硫酸塩、ゼローダ（カペシタビン）、ゾラデックス（ゴセレリン酢酸塩）が含まれるが、これらに限定されない。
がん治療薬は、医薬組成物を使用して対象に投与され得る。好適な医薬組成物は、薬学的に有効な量のがん治療薬（又はその薬学的に許容される塩若しくはエステル）を含み、任意選択で、薬学的に許容される担体を含む。ある特定の実施形態では、これらの組成物は、任意選択で、１つ以上の追加の治療剤を更に含む。
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される塩」という用語は、健全な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー応答などを伴わずに、ヒト及び下等動物の組織との接触での使用に好適であり、妥当な利益／リスク比に見合っている塩を指す。アミン、カルボン酸、及び他の種類の化合物の薬学的に許容される塩は、当該技術分野において周知である。例えば、Ｓ．Ｍ．Ｂｅｒｇｅ，ｅｔ ａｌ．は、参照により本明細書に組み込まれる、Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，６６：１－１９（１９７７）に薬学的に許容される塩を詳細に記載している。塩は、化合物の最終的な単離及び精製中に、又は遊離塩基若しくは遊離酸機能を好適な試薬と別々に反応させることによって、インサイチュで調製することができる。例えば、遊離塩基機能は、好適な酸と反応させることができる。更に、化合物が酸性部分を有する場合、好適な薬学的に許容されるその塩は、アルカリ金属塩、例えば、ナトリウム又はカリウム塩、及びアルカリ土類金属塩、例えば、カルシウム又はマグネシウム塩などの金属塩を含んでもよい。いくつかの実施形態では、がん治療薬は、薬学的に許容される塩である。
本明細書で使用される「薬学的に許容されるエステル」という用語は、インビボで加水分解するエステルを指し、親化合物又はその塩を残すためにヒト体内で容易に分解するエステルを含む。好適なエステル基には、例えば、薬学的に許容される脂肪族カルボン酸、特に、アルカン酸、アルケン酸、シクロアルカン酸、及びアルカン二酸に由来するものが含まれ、各アルキル又はアルケニル部分は、有利には、６個以下の炭素原子を有する。いくつかの実施形態では、がん治療薬は、薬学的に許容されるエステルである。
上記のように、医薬組成物は、薬学的に許容される担体を更に含んでもよい。「薬学的に許容される担体」という用語は、所望の特定の剤形を調製するのに好適な、任意及び全ての溶媒、希釈剤、又は他の液体ビヒクル、分散剤若しくは懸濁剤、界面活性剤、等張剤、増粘剤若しくは乳化剤、防腐剤、固体結合剤、滑沢剤などを含む。Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｓｉｘｔｅｅｎｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ．，１９８０）は、医薬組成物の製剤化に使用される様々な担体及びその調製のための既知の技術を開示している。薬学的に許容される担体として機能することができる材料のいくつかの例には、ラクトース、グルコース及びスクロースなどの糖、トウモロコシデンプン及びジャガイモデンプンなどのデンプン、カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース及び酢酸セルロースなどのセルロース及びその誘導体、粉末トラガカント、モルト、ゼラチン、タルク、ココアバター及び坐剤ワックスなどの賦形剤、ピーナッツ油、綿実油などの油、紅花油、ゴマ油、オリーブ油、コーン油及び大豆油、グリコール、プロピレングリコールなど、オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル、寒天、水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤、アルギン酸、発熱物質を含まない水、等張食塩水、リンゲル液、エチルアルコール、及びリン酸緩衝液、並びにラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムなどの他の非毒性相溶性滑沢剤、並びに着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味料、矯味矯臭剤及び芳香剤が含まれるが、これらに限定されず、防腐剤及び酸化防止剤もまた、調合者の判断に従って、組成物に存在してもよい。
本開示で使用するための組成物は、所望のがん治療薬の任意の濃度を有するように製剤化され得る。いくつかの実施形態では、組成物は、治療有効量のがん治療薬を含むように製剤化される。
本開示は、概して、良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞を有する対象を診断する方法であって、試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出することを含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、検出するステップは、対象（例えば、ヒト対象）からの試料を、１つ又は複数のプローブに曝露することを含み、各プローブは、試料中の１つ又は複数の非コードＲＮＡ分子に結合することができる。いくつかの実施形態では、プローブは、表１のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１５４３）の相補体に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む標識化核酸分子（ＤＮＡ、ＲＮＡ、又はそのハイブリッド）である。いくつかの実施形態では、プローブは、表１のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１５４３）の相補体に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含むＲＮＡ配列である標識化核酸分子（ＤＮＡ、ＲＮＡ、又はそのハイブリッド）であり、各チミンは、ウラシルで置き換えられる。いくつかの実施形態では、プローブは、表２のＤＮＡ配列に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む、標識化核酸分子（ＤＮＡ、ＲＮＡ、又はそのハイブリッド）である。いくつかの実施形態では、複数のプローブは、表２のいずれかの核酸配列（配列番号１５４４～配列番号１８６７６）に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む核酸配列に相補的なＲＮＡ又はＤＮＡである標識化核酸配列のうちの１つ又は組み合わせである。いくつかの実施形態では、複数のプローブは、表１のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１５４３）に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む核酸配列に相補的なＲＮＡ又はＤＮＡである標識化核酸配列のうちの１つ又は組み合わせである。いくつかの実施形態では、複数のプローブは、表１のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１５４３）から選択される標識化核酸配列のうちの１つ又は組み合わせである。いくつかの実施形態では、複数のプローブは、表１又は表２のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１８６７６）から選択される核酸配列に相補的な核酸配列のうちの１つ又は組み合わせを含む。
開示される方法の実施形態のいずれかでは、対象は、がんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトであってもよい。開示される方法の実施形態のいずれかでは、検出するステップは、対象から試料を取得するステップの後に行われる。
いくつかの実施形態では、プローブ又は複数のプローブは、表１のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１８６７６）に対して、少なくとも７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む核酸分子（ＤＮＡ、ＲＮＡ、又はそのハイブリッド）に結合するＣＤＲを含む、１つ又は複数の抗体又は抗体断片である。いくつかの実施形態では、プローブ又は複数のプローブは、表１のいずれかの核酸配列（配列番号１～配列番号１８６７６）に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の配列同一性を含む核酸分子（ＤＮＡ、ＲＮＡ、又はそのハイブリッド）に結合するＣＤＲを含む、１つ又は複数の抗体又は抗体断片であり、各配列のチミンがウラシルで置き換えられるように、配列の各々が修飾される。実施形態のいくつかでは、方法は、試料を１つ又は複数のプローブに曝露する前に、試料からＲＮＡを単離することを更に含む。いくつかの実施形態では、方法は、半定量的若しくは定量的ＰＣＲ、又は試料中の非コードＲＮＡの配列決定分析を行うことによって、試料中の小さいＲＮＡ（ｓｍＲＮＡ）などの非コードＲＮＡの量を検出又は定量化することを含む。プローブは、一本鎖ヌクレオチド配列が、対象からの非コードＲＮＡを含む試料に曝露されるように、ＥＬＩＳＡプレート、プラスチック、スライド、マイクロアレイ、シリカチップ、又は他の表面などの固体支持体に固定され得る。いくつかの実施形態では、プローブは、約５～約１００ヌクレオチド長を含み得、表１（配列番号１～配列番号１５４３）に提供される配列のいずれか、又は表１（配列番号１～配列番号１５４３）に示される配列のＲＮＡ若しくはＤＮＡ形態の任意の相補配列を含む。開示される方法の実施形態のいずれかでは、試料中の非コードＲＮＡのうちの１つに対して少なくとも約７０％の配列同一性を有する少なくとも１つの小さい非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップは、化学発光プローブ、蛍光プローブ、及び／又は蛍光顕微鏡を使用して、検出可能なプローブのシグナルを非コードＲＮＡの存在と相関させることによって、存在又量を計算することを含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、表１（配列番号１～配列番号１５４３）に開示されるものなどの１つ以上の小さい非コードＲＮＡの存在若しくは量、又はそれらの任意の組み合わせを、対象ががんを有する尤度と相関させるステップを更に含む。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のいずれかは、表２（配列番号１５４４～配列番号６８３４）に開示されるものなどの１つ以上の小さい非コードＲＮＡの存在若しくは量、又はそれらの任意の組み合わせを、対象が、がんを有する尤度と相関させるステップを更に含む。いくつかの実施形態では、本開示は、がんに関与するｍｉＲＮＡを分析するのに有用な対象からリボ核酸（ＲＮＡ）画分を調製、単離、又は評価する方法であって、対象の血漿又は血清の実質的に無細胞の試料からＲＮＡを抽出して、ＲＮＡプールを得ることと、（ｂ）（ｉ）ＲＮＡの配列識別、及び（ｉｉ）１つ又は複数のプローブを非コードＲＮＡに曝露することによって非コードＲＮＡを選択的に除去することによって、（ａ）で抽出されたＲＮＡの画分を産生することであって、（ｂ）の後の非コードＲＮＡが、表１に開示される１つ又は複数のＲＮＡを含む、産生することと、（ｃ）（ｂ）で産生されたＲＮＡの画分中の非コードＲＮＡを分析することと、を含む、前記方法に関する。いくつかの実施形態では、分析するステップは、対照試料からの非コードＲＮＡの対照量と比較して、試料中の非コードＲＮＡの量を正規化することと、試料中の非コードＲＮＡの正規化された存在、非存在又は量を、対照試料中の非コードＲＮＡの存在、非存在又は量と比較することによって、対象が、がんを有するかどうかを決定することと、を含む。
小さいＲＮＡバイオマーカーを検出するためのキット
別の態様では、本開示は、対象におけるがんの種類、起源の組織、及びがんの状況又は段階を診断するためのキットを提供し、このキットは、表１（配列番号１～配列番号１５４３、この配列は、任意選択で、開示されるチミンの１つ、２つ以上、又は全ての代わりにウラシルを含む）、及びそれらの組み合わせからの１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定するのに有用である。いくつかの実施形態では、１つ以上の小さい非コードＲＮＡは、表１に列挙されるバイオマーカー（配列番号１～配列番号１５４３）から選択される。キットは、対象の試料中でがんを診断する小さい非コードＲＮＡ又は小さい非コードＲＮＡの群の存在を選択的に検出するように適合された材料及び試薬を含み得る。例えば、一実施形態では、キットは、小さい非コードＲＮＡに特異的にハイブリダイズする試薬を含み得る。このような試薬は、小さい非コードＲＮＡ、例えば、プローブ又はプライマーを検出するのに好適な形態の核酸分子であり得る。このキットは、１つ以上の小さい非コードＲＮＡを検出するためのアッセイを実行するのに有用な試薬、例えば、ｑＰＣＲ反応における１つ以上の小さい非コードＲＮＡを検出するために使用され得る試薬を含んでもよい。キットは同様に、１つ以上の小さい非コードＲＮＡを検出するのに有用なマイクロアレイを含んでもよい。
いくつかの実施形態では、キットは、標識又は製品挿入物の形態で好適な操作パラメータのための説明書を含んでもよい。例えば、説明書は、試料を収集する方法、試料中の１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを決定する方法、並びに／又は試料中の１つ以上の小さい非コードＲＮＡバイオマーカーのレベルを、対象のがんの種類、起源の組織、及びがんの状況又は段階と相関させる方法に関する情報又は指示を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、キットは、参照基準、好適な対照として使用されるか、又は試験試料中のバイオマーカーを検出するためのアッセイの較正のために使用される、小さい非コードＲＮＡバイオマーカー試料を含む１つ以上の容器を含んでもよい。
他の実施形態は、以下の非限定的な実施例に記載されている。特許、公開出願、技術論文及び学術論文を含む様々な刊行物が、本明細書を通して引用される。これらの引用される刊行物の各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
実施例１．がんにおけるオーファンの小さい非コードＲＮＡについての系統的探索
乳がんによって発現されるが、健康な正常には存在しない小さい非コードＲＮＡのための系統的スクリーニングを実行すると、２０１個の小さい非コードＲＮＡのセットが、乳がんと強く関連しているが、正常細胞ではほとんど検出できないことが以前に特定された。２０１９年５月１６日に公開されたＷＯ２０１９／０９４７８０、及びＦｉｓｈ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．，２０１８，２４：１７４３－１７５１（参照により本明細書に組み込まれる）を参照されたい。これらの小さい非コードＲＮＡはがんに関連しているが、機能的には不明であるため、「オーファン非コードＲＮＡ」又は「ｏｎｃＲＮＡ」と命名されている。このアプローチ及び概念は、がん特異的なＲＮＡランドスケープを調べるために、いくつかのがんにわたって拡張され、適用された。
がん細胞で発現するが、正常組織では検出できない汎がんオーファン非コードＲＮＡ（ｏｎｃＲＮＡ）を同定するために、データベースを設計し、Ｔｈｅ Ｃａｎｃｅｒ Ｇｅｎｏｍｅ Ａｔｌａｓ（ＴＣＧＡ）からの小さいＲＮＡ（ｓｍＲＮＡ）配列決定データセットを使用して体系的アプローチを実装した。１１０８２個のデータセットを、Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｄａｔａ Ｃｅｎｔｅｒ Ｄａｔａ Ｐｏｒｔａｌを介してＢＡＭ形式でダウンロードした。次いで、リード配列は、リードの正規化されたカウント（１００万当たりのカウント）、研究メタデータ、及び染色体座標とともに、データベースにアップロードされ、次いで、全てのデータセットにわたってそれらの鎖特異的配列に基づいてグループ化した。集約後、低複雑度の配列を有するｓｍＲＮＡを、データベースから除去した。次いで、ｓｍＲＮＡを、それらが存在する組織種類に基づいてグループ化し、異なる組織間の重複を可能にした。各組織種類について、正常な非疾患試料の割合及びｓｍＲＮＡが存在するがん試料の割合を計算した。少なくとも１つの組織種類について正常試料の１０％を超えて存在したか、又は全ての組織種類についてがん試料の１０％未満で存在したＳａｍｌｌ－ＲＮＡを除去した。残りのｓｍＲＮＡは、組織種類に基づいて再びグループ化し、重複を可能にした。各組織種類について、片側フィッシャー正確検定を使用して、組織特異的がん試料と、全ての組織種類の正常試料との間の組織グループ内の各ｓｍＲＮＡの存在及び非存在を比較した。組織特異的試験のうちの少なくとも１つにおいて、補正されたｆｄｒ＜０．１のｓｍＲＮＡを選択した。ｏｎｃＲＮＡデータベースには、これら全ての基準を満たす１，５４３個のｓｍＲＮＡが存在した。このようにして同定された１，５４３個のｓｍＲＮＡの各々の配列を、それぞれのがん性適応症とともに下記の表１に提供する。
Figure 2023538900000001
Figure 2023538900000002
Figure 2023538900000003
Figure 2023538900000004
Figure 2023538900000005
Figure 2023538900000006
Figure 2023538900000007
Figure 2023538900000008
Figure 2023538900000009
Figure 2023538900000010
Figure 2023538900000011
Figure 2023538900000012
Figure 2023538900000013
Figure 2023538900000014
Figure 2023538900000015
Figure 2023538900000016
Figure 2023538900000017
Figure 2023538900000018
Figure 2023538900000019
Figure 2023538900000020
Figure 2023538900000021
Figure 2023538900000022
Figure 2023538900000023
Figure 2023538900000024
Figure 2023538900000025
Figure 2023538900000026
Figure 2023538900000027
Figure 2023538900000028
Figure 2023538900000029
Figure 2023538900000030
Figure 2023538900000031
Figure 2023538900000032
Figure 2023538900000033
Figure 2023538900000034
Figure 2023538900000035
Figure 2023538900000036
Figure 2023538900000037
Figure 2023538900000038
Figure 2023538900000039
Figure 2023538900000040
Figure 2023538900000041
Figure 2023538900000042
Figure 2023538900000043
Figure 2023538900000044
Figure 2023538900000045
Figure 2023538900000046
Figure 2023538900000047
Figure 2023538900000048
表Ｘ
がん試料（列の見出しでは「がん」）内に有意に存在することが見出された固有のｏｎｃＲＮＡ種の数（列の見出しでは「ｏｎｃＲＮＡカウント」）を含む表であり、Ｔｈｅ Ｃａｎｃｅｒ Ｇｅｎｏｍｅ Ａｔｌａｓ（ＴＣＧＡ）からの３２のがんの種類の各々については正常組織試料中には見出されない。
Figure 2023538900000049
上記の手順を、より大きな試料セットを使用して再度事前に形成した。注釈付きｏｎｃＲＮＡの全ては、ＴＣＧＡデータベース内の全てのがんの種類にわたって見出された。注釈付きｏｎｃＲＮＡは、以下のＴＣＧＡがんの種類に有意に見出された。直腸腺がん（ＲＥＡＤ）、結腸腺がん（ＣＯＡＤ）、食道がん（ＥＳＣＡ）、頭頸部扁平上皮がん（ＨＮＳＣ）、リンパ系腫瘍びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫（ＤＬＢＣ）、肝臓肝細胞がん（ＬＩＨＣ）、肺腺がん（ＬＵＡＤ）、肺扁平上皮がん（ＬＵＳＣ）、卵巣漿液性嚢胞腺がん（ＯＶ）、膵臓腺がん（ＰＡＡＤ）、胃腺がん（ＳＴＡＤ）、及び浸潤性乳がん（ＢＲＣＡ）。
ＴＣＧＡ正常試料と比較して、３２のＴＣＧＡがんの種類の各々に有意に存在することが見出されたｏｎｃＲＮＡのｌｏｇ１０数の棒グラフを作成した。フィッシャー正確検定を使用して、有意性を統計的に検定し、０．１のＦＤＲカットオフを使用して、上記のように複数の仮説検定を補正した。
訓練データセットに対する５倍の相互検証（８０／２０分割）と、訓練に使用される特徴の数にわたる３２のＴＣＧＡがんの種類に対する汎がん分類器の性能精度のプロット。実験は、再帰的な特徴除去の目的のために実行して、最も有益な特徴を選択して、本発明者らの最終モデルを訓練した。使用した特徴は、試料内のｏｎｃＲＮＡの存在／非存在の２進コード化であった。この特徴選択ステップのための本発明者らの選択モデルとして、５００個の推定値及び３の最大深度を有するＥｘｔｒｅｍｅ Ｇｒａｄｉｅｎｔ Ｂｏｏｓｔｉｎｇ（ＸＧＢ）モデルを使用した。
訓練データセットに対する５倍の相互検証（８０／２０訓練／試験分割から）と、訓練に使用される特徴の数にわたる３２のＴＣＧＡがんの種類に対する汎がん分類器の性能精度のプロット。実験は、再帰的な特徴除去の目的のために実行して、最も有益な特徴を選択して、本発明者らの最終モデルを訓練した。使用した特徴は、試料内のｏｎｃＲＮＡの１００万当たりのカウント（ｃ．ｐ．ｍ）であった。この特徴選択ステップのための本発明者らの選択モデルとして、５００個の推定値及び３の最大深度を有するＥｘｔｒｅｍｅ Ｇｒａｄｉｅｎｔ Ｂｏｏｓｔｉｎｇ（ＸＧＢ）モデルを使用した。再帰的な特徴除去を介して選択したｏｎｃＲＮＡの特徴のヒートマップを使用して、本発明者らの最終的なＸＧＢ分類器を訓練して、ＴＣＧＡの３２のがんの種類にわたってがんの種類を分類した。使用した特徴は、試料内のｏｎｃＲＮＡの存在／非存在の２進コード化であった。
選択したｏｎｃＲＮＡの特徴の追加のヒートマップを、使用した再帰的な特徴除去を介して作製して、本発明者らの最終的なＸＧＢ分類器を訓練して、ＴＣＧＡの３２のがんの種類にわたってがんの種類を分類した。使用した特徴は、試料内のｏｎｃＲＮＡの１００万当たりのカウント（ｃ．ｐ．ｍ）であった。混同行列を、本発明者らの最終的な汎がんＸＧＢ性能及び８０／２０訓練／試験、１０４０３のがん試料のクラスのバランスの取れた分割からのホールドアウト試験データでのがんのサブタイプから作成した。混同行列を、列によって正規化した。分類器を、選択したｏｎｃＲＮＡの特徴の２進表現（存在／非存在）で訓練した。最終的なＸＧＢ分類器は、５００個の推定値、３の最大深度、及び８のラムダ正則化パラメータから構成された。
一対他（ｏｎｅ－ｖｓ－ｔｈｅ－ｒｅｓｔ）マルチクラスストラテジーを使用してがん特異的２進予測を行うように訓練した勾配ブースティング分類器（ＧＢＣ）のＲＯＣ曲線を利用した。ＧＢＣを、８０／２０訓練／試験、クラスのバランスの取れた分割からの訓練データで訓練し、ホールドアウト試験セットで評価した。使用した特徴は、以前に選択したｏｎｃＲＮＡからの２進コード化であった。以下のがん分類器のＲＯＣ曲線をプロットした。ＢＲＣＡ、ＣＯＡＤ、ＥＳＣＡ、ＬＩＨＣ、ＬＵＡＤ、ＬＵＳＣ、ＯＶ、ＰＡＡＤ、及びＳＴＡＤ。
３２のＴＣＧＡがんの種類の各々についてのがん－正常予測のために訓練した分類器の分類結果。各がんについて、Ｌ１正則化を用いた線形サポートベクター分類モデルを、がん及び正常試料に特異的な試料で訓練した。８０／２０訓練／試験分割を行って、がん特異的試料及び全てのＴＣＧＡ正常試料のデータセットを訓練及び試験データセットに分離した。
線形サポートベクター分類モデルのＲＯＣ曲線を使用して、がん－正常予測を行った。試験データセット（８０／２０訓練／試験分割）での全体的な精度は、以下のがんの種類についても生成する。ＢＲＣＡ、ＣＯＡＤ、ＥＳＣＡ、ＬＩＨＣ＜ＬＵＡＤ、ＬＵＳＣ、ＯＶ、ＰＡＡＤ、及びＳＴＡＤ。
ＢＲＣＡ腫瘍
ＴＣＧＡ－ＢＲＣＡデータセットにおける正常、Ｉ期、並びにＩＩ期及びＩＩＩ期の試料にわたるｏｎｃＲＮＡ発現のバイオリンプロット及びボックスプロット。Ｐ値を計算し、ＦＤＲを、関連付けについて一方向ＡＮＯＶＡ検定を使用して補正した。正常、ｎ＝１０４、Ｔ１：ｎ＝２７７、Ｔ２：ｎ＝６２８、Ｔ３：ｎ＝１３７。
ＴＣＧＡ－ＢＲＣＡデータセットにおけるＢＲＣＡサブタイプによってグループ化された試料にわたるｏｎｃＲＮＡ発現のバイオリンプロット及びボックスプロット。Ｐ値を計算し、ＦＤＲを、関連付けについて一方向ＡＮＯＶＡ検定を使用して補正した。ＢＲＣＡ－基底、ｎ＝１７２、ＢＲＣＡ－Ｈｅｒ２：ｎ＝７７、ＢＲＣＡ－ＬｕｍＡ：ｎ＝５０５、ＢＲＣＡ－ＬｕｍＢ：ｎ＝１９２。
ＢＲＣＡサブタイプを予測するためにＢＲＣＡ ｏｎｃＲＮＡで訓練されたＸＧＢ分類器の試験性能を示す混同行列を作成した。注釈付きサブタイプを有する９４６個のＢＲＣＡ患者試料を、８０／２０比を使用して訓練／試験セットに分割した。最初に、訓練データセット上の６８２個のＢＲＣＡ ｏｎｃＲＮＡの最終リストの選択を特徴付けるために、一方向ＡＮＯＶＡ検定を使用した。次いで、１００個の推定値及び３の最大深度を用いてＸＧＢ分類器について、選択した特徴を訓練し、ホールドアウト試験データセットで評価した。
１０６２個のＢＲＣＡ ｏｎｃＲＮＡの存在／非存在のヒートマップは、ＢＲＣＡサブタイプグループ全体にわたる発現の有意差を示している。基底、Ｈｅｒ２、ＬｕｍＡ、及びＬｕｍＢ。ＢＲＣＡ ｏｎｃＲＮＡは、一方向ＡＮＯＶＡ検定を使用して検定した。０．１のカットオフでのＦＤＲ補正を、複数の仮説検定で補正するように設定した。
１０６２個のＢＲＣＡ ｏｎｃＲＮＡのｃ．ｐ．ｍ発現のヒートマップは、ＢＲＣＡサブタイプグループ全体にわたる発現の有意差を示している。基底、Ｈｅｒ２、ＬｕｍＡ、及びＬｕｍＢ。ＢＲＣＡ ｏｎｃＲＮＡは、一方向ＡＮＯＶＡ検定を使用して検定した。０．１のカットオフでのＦＤＲ補正を、複数の仮説検定で補正するように設定した。
ＴＣＧＡ－ＢＲＣＡ患者についての生存分析を、ｏｎｃＲＮＡの存在及び非存在に基づいて、高リスクのグループ及び低リスクのグループに層別化した。リスクスコアを、交差検証を伴う訓練データセットに適合した正則化ｃｏｘモデル（Ｃｏｘ Ｅｌａｓｔｉｃ Ｎｅｔ）を使用して計算し、ホールドアウトデータセット（１０６８人の患者の８０／２０訓練／試験分割）で評価した。ホールドアウトデータセット内の患者の生存曲線を示す。Ｐ値は、ログランク検定から計算した。
ヒートマップは、ホールドアウトデータセット内のＢＲＣＡ患者にわたる正則化ｃｏｘモデルからの回帰係数の兆候から構成された。ｏｎｃＲＮＡについての正の係数を、１（負の場合は－１）の値でプロットした。正の係数は、より高いリスクへの寄与を示し、負の係数はより低いリスクへの寄与を示す。
ホールドアウトＢＲＣＡ患者データセットにおける再構築された遺伝子発現から追加のヒートマップを構築した。オートエンコーダーを最初に訓練して、全てのＢＲＣＡ患者にわたって（最も分散の高い５８９個の遺伝子の）遺伝子発現プロファイルの埋め込みを減少させた。次に、ＢＲＣＡ患者のｏｎｃＲＮＡ２進プロファイルを使用して、遺伝子発現プロファイル埋め込みを予測するために完全に接続されたニューラルネットワークを訓練した。次に、以前に訓練されたオートエンコーダーからのデコーダーを使用して、予測された遺伝子発現埋め込みから遺伝子発現プロファイルを再構築した。ｏｎｃＲＮＡニューラルネットワークについて、１０８５個のＢＲＣＡ患者データから８０／２０分割により生成された訓練データを訓練した。
表２
３２種類のがんの各々について、この表は、がんの種類に続いて、対応するがん試料内に有意に存在することが見出されるｏｎｃＲＮＡのリストを含む。ｏｎｃＲＮＡは、セミコロン（；）によって分割された各三つ組の第１の配列である。相補体及び逆相補体ＤＮＡ配列の両方は、三つ組内の第２及び第３の配列として報告され、コンマ「，」で区切られ、第２の配列は相補体配列に対応し、第３の配列は、逆相補体配列を参照するコンマに続く。
配列識別子は、配列番号１５４４から配列番号６，８３４まで連続して分離された各ＲＮＡ配列に、以下の副腎皮質がん配列から始まる表２のそれらの出現の順序で割り当てられる。配列識別子は、表２の各ＤＮＡに、それらが上から下に現れる順序で割り当てられる。したがって、以下の第１の出現ＲＮＡは、配列番号１５４４であり、第２の出現配列、ＣＡＵＣＵＵＵＵＵＵＵＣＵＣＵＡＧＣＵＧＵＵＵＧＡＡＧＡＵＵＵＵＣＵＣＵＵＵＡＵＣＡＣＵＧＧＵＵＣＵＡＡＧＵＡＡＡＵＵＧＡＵＵＡＵＧＧＵＧＵＧＣＣＵＵＡＧＵＧＵＧＵＵＧＵＣＵＡが続き、これは配列番号１５４５である。このパターンは、配列番号６，８３４である、表の上から下まで列挙される最後のＲＮＡ配列まで続く。以下の最初に同定されたｃＤＮＡ配列は、配列番号６８３５であり、第２のＡＡＴＡＡＴＡＣＡＧＧＴＡＧＡＴＡＡＡＣＣＡＡＧＡＧは、配列番号６８３６である。このパターンは、配列番号１８，６７６である、表２の最後に同定された配列まで続く。したがって、表２のｏｎｃＲＮＡは、配列番号１５４４～配列番号６８３４である。ｏｎｃＲＮＡに対応するＤＮＡ配列は、配列番号６８３５～配列番号１８６７６である。
Figure 2023538900000050
Figure 2023538900000051
Figure 2023538900000052
Figure 2023538900000053
Figure 2023538900000054
Figure 2023538900000055
Figure 2023538900000056
Figure 2023538900000057
Figure 2023538900000058
Figure 2023538900000059
Figure 2023538900000060
Figure 2023538900000061
Figure 2023538900000062
Figure 2023538900000063
Figure 2023538900000064
Figure 2023538900000065
Figure 2023538900000066
Figure 2023538900000067
Figure 2023538900000068
Figure 2023538900000069
Figure 2023538900000070
Figure 2023538900000071
Figure 2023538900000072
Figure 2023538900000073
Figure 2023538900000074
Figure 2023538900000075
Figure 2023538900000076
Figure 2023538900000077
Figure 2023538900000078
Figure 2023538900000079
Figure 2023538900000080
Figure 2023538900000081
Figure 2023538900000082
Figure 2023538900000083
Figure 2023538900000084
Figure 2023538900000085
Figure 2023538900000086
Figure 2023538900000087
Figure 2023538900000088
Figure 2023538900000089
Figure 2023538900000090
Figure 2023538900000091
Figure 2023538900000092
Figure 2023538900000093
Figure 2023538900000094
Figure 2023538900000095
Figure 2023538900000096
Figure 2023538900000097
Figure 2023538900000098
Figure 2023538900000099
Figure 2023538900000100
Figure 2023538900000101
Figure 2023538900000102
Figure 2023538900000103
Figure 2023538900000104
Figure 2023538900000105
Figure 2023538900000106
Figure 2023538900000107
Figure 2023538900000108
Figure 2023538900000109
Figure 2023538900000110
Figure 2023538900000111
Figure 2023538900000112
Figure 2023538900000113
Figure 2023538900000114
Figure 2023538900000115
Figure 2023538900000116
Figure 2023538900000117
Figure 2023538900000118
Figure 2023538900000119
Figure 2023538900000120
Figure 2023538900000121
Figure 2023538900000122
Figure 2023538900000123
Figure 2023538900000124
Figure 2023538900000125
Figure 2023538900000126
Figure 2023538900000127
Figure 2023538900000128
Figure 2023538900000129
Figure 2023538900000130
Figure 2023538900000131
Figure 2023538900000132
Figure 2023538900000133
Figure 2023538900000134
Figure 2023538900000135
Figure 2023538900000136
Figure 2023538900000137
Figure 2023538900000138
Figure 2023538900000139
Figure 2023538900000140
Figure 2023538900000141
Figure 2023538900000142
Figure 2023538900000143
Figure 2023538900000144
Figure 2023538900000145
Figure 2023538900000146
Figure 2023538900000147
Figure 2023538900000148
Figure 2023538900000149
Figure 2023538900000150
Figure 2023538900000151
Figure 2023538900000152
Figure 2023538900000153
Figure 2023538900000154
Figure 2023538900000155
Figure 2023538900000156
Figure 2023538900000157
Figure 2023538900000158
Figure 2023538900000159
Figure 2023538900000160
Figure 2023538900000161
Figure 2023538900000162
Figure 2023538900000163
Figure 2023538900000164
Figure 2023538900000165
Figure 2023538900000166
Figure 2023538900000167
Figure 2023538900000168
Figure 2023538900000169
Figure 2023538900000170
Figure 2023538900000171
Figure 2023538900000172
Figure 2023538900000173
Figure 2023538900000174
Figure 2023538900000175
Figure 2023538900000176
Figure 2023538900000177
Figure 2023538900000178
Figure 2023538900000179
Figure 2023538900000180
Figure 2023538900000181
Figure 2023538900000182
Figure 2023538900000183
Figure 2023538900000184
Figure 2023538900000185
Figure 2023538900000186
Figure 2023538900000187
Figure 2023538900000188
Figure 2023538900000189
Figure 2023538900000190
Figure 2023538900000191
Figure 2023538900000192
Figure 2023538900000193
Figure 2023538900000194
Figure 2023538900000195
Figure 2023538900000196
Figure 2023538900000197
Figure 2023538900000198
Figure 2023538900000199
Figure 2023538900000200
Figure 2023538900000201
Figure 2023538900000202
Figure 2023538900000203
Figure 2023538900000204
Figure 2023538900000205
Figure 2023538900000206
Figure 2023538900000207
Figure 2023538900000208
Figure 2023538900000209
Figure 2023538900000210
Figure 2023538900000211
Figure 2023538900000212
Figure 2023538900000213
Figure 2023538900000214
Figure 2023538900000215
Figure 2023538900000216
Figure 2023538900000217
Figure 2023538900000218
Figure 2023538900000219
Figure 2023538900000220
Figure 2023538900000221
Figure 2023538900000222
Figure 2023538900000223
Figure 2023538900000224
Figure 2023538900000225
Figure 2023538900000226
Figure 2023538900000227
Figure 2023538900000228
Figure 2023538900000229
Figure 2023538900000230
Figure 2023538900000231
Figure 2023538900000232
Figure 2023538900000233
Figure 2023538900000234
Figure 2023538900000235
Figure 2023538900000236
Figure 2023538900000237
Figure 2023538900000238
Figure 2023538900000239
Figure 2023538900000240
Figure 2023538900000241
Figure 2023538900000242
Figure 2023538900000243
Figure 2023538900000244
Figure 2023538900000245
Figure 2023538900000246
Figure 2023538900000247
Figure 2023538900000248
Figure 2023538900000249
Figure 2023538900000250
Figure 2023538900000251
Figure 2023538900000252
Figure 2023538900000253
Figure 2023538900000254
Figure 2023538900000255
Figure 2023538900000256
Figure 2023538900000257
Figure 2023538900000258
Figure 2023538900000259
Figure 2023538900000260
Figure 2023538900000261
Figure 2023538900000262
Figure 2023538900000263
Figure 2023538900000264
Figure 2023538900000265
Figure 2023538900000266
Figure 2023538900000267
Figure 2023538900000268
Figure 2023538900000269
Figure 2023538900000270
Figure 2023538900000271
Figure 2023538900000272
Figure 2023538900000273
Figure 2023538900000274
Figure 2023538900000275
Figure 2023538900000276
Figure 2023538900000277
Figure 2023538900000278
Figure 2023538900000279
Figure 2023538900000280
Figure 2023538900000281
Figure 2023538900000282
Figure 2023538900000283
Figure 2023538900000284
Figure 2023538900000285
Figure 2023538900000286
Figure 2023538900000287
Figure 2023538900000288
Figure 2023538900000289
Figure 2023538900000290
Figure 2023538900000291
Figure 2023538900000292
Figure 2023538900000293
Figure 2023538900000294
Figure 2023538900000295
Figure 2023538900000296
Figure 2023538900000297
Figure 2023538900000298
Figure 2023538900000299
Figure 2023538900000300
Figure 2023538900000301
Figure 2023538900000302
Figure 2023538900000303
Figure 2023538900000304
Figure 2023538900000305
Figure 2023538900000306
Figure 2023538900000307
Figure 2023538900000308
Figure 2023538900000309
Figure 2023538900000310
Figure 2023538900000311
Figure 2023538900000312
Figure 2023538900000313
Figure 2023538900000314
Figure 2023538900000315
Figure 2023538900000316
Figure 2023538900000317
Figure 2023538900000318
Figure 2023538900000319
Figure 2023538900000320
Figure 2023538900000321
Figure 2023538900000322
Figure 2023538900000323
Figure 2023538900000324
Figure 2023538900000325
Figure 2023538900000326
Figure 2023538900000327
Figure 2023538900000328
Figure 2023538900000329
Figure 2023538900000330
Figure 2023538900000331
Figure 2023538900000332
Figure 2023538900000333
Figure 2023538900000334
Figure 2023538900000335
Figure 2023538900000336
Figure 2023538900000337
Figure 2023538900000338
Figure 2023538900000339
Figure 2023538900000340
Figure 2023538900000341
Figure 2023538900000342
Figure 2023538900000343
Figure 2023538900000344
Figure 2023538900000345
Figure 2023538900000346
Figure 2023538900000347
Figure 2023538900000348
Figure 2023538900000349
Figure 2023538900000350
Figure 2023538900000351
Figure 2023538900000352
Figure 2023538900000353
Figure 2023538900000354
Figure 2023538900000355
Figure 2023538900000356
Figure 2023538900000357
Figure 2023538900000358
Figure 2023538900000359
Figure 2023538900000360
Figure 2023538900000361
Figure 2023538900000362
Figure 2023538900000363
Figure 2023538900000364
Figure 2023538900000365
Figure 2023538900000366
Figure 2023538900000367
Figure 2023538900000368
Figure 2023538900000369
Figure 2023538900000370
Figure 2023538900000371
Figure 2023538900000372
Figure 2023538900000373
Figure 2023538900000374
Figure 2023538900000375
Figure 2023538900000376
Figure 2023538900000377
Figure 2023538900000378
Figure 2023538900000379
Figure 2023538900000380
Figure 2023538900000381
Figure 2023538900000382
Figure 2023538900000383
Figure 2023538900000384
Figure 2023538900000385
Figure 2023538900000386
Figure 2023538900000387
Figure 2023538900000388
Figure 2023538900000389
Figure 2023538900000390
Figure 2023538900000391
Figure 2023538900000392
Figure 2023538900000393
Figure 2023538900000394
Figure 2023538900000395
Figure 2023538900000396
Figure 2023538900000397
Figure 2023538900000398
Figure 2023538900000399
Figure 2023538900000400
Figure 2023538900000401
Figure 2023538900000402
Figure 2023538900000403
Figure 2023538900000404
Figure 2023538900000405
Figure 2023538900000406
Figure 2023538900000407
Figure 2023538900000408
Figure 2023538900000409
Figure 2023538900000410
Figure 2023538900000411
Figure 2023538900000412
Figure 2023538900000413
Figure 2023538900000414
Figure 2023538900000415
Figure 2023538900000416
Figure 2023538900000417
Figure 2023538900000418
Figure 2023538900000419
Figure 2023538900000420
Figure 2023538900000421
Figure 2023538900000422
Figure 2023538900000423
Figure 2023538900000424
Figure 2023538900000425
Figure 2023538900000426
Figure 2023538900000427
Figure 2023538900000428
Figure 2023538900000429
Figure 2023538900000430
Figure 2023538900000431
Figure 2023538900000432
Figure 2023538900000433
Figure 2023538900000434
Figure 2023538900000435
Figure 2023538900000436
Figure 2023538900000437
Figure 2023538900000438
Figure 2023538900000439
Figure 2023538900000440
Figure 2023538900000441
Figure 2023538900000442
Figure 2023538900000443
Figure 2023538900000444
Figure 2023538900000445
Figure 2023538900000446
Figure 2023538900000447
Figure 2023538900000448
Figure 2023538900000449
Figure 2023538900000450
Figure 2023538900000451
Figure 2023538900000452
Figure 2023538900000453
Figure 2023538900000454
Figure 2023538900000455
Figure 2023538900000456
Figure 2023538900000457
Figure 2023538900000458
Figure 2023538900000459
Figure 2023538900000460
Figure 2023538900000461
Figure 2023538900000462
Figure 2023538900000463
Figure 2023538900000464
Figure 2023538900000465
Figure 2023538900000466
Figure 2023538900000467
Figure 2023538900000468
Figure 2023538900000469
Figure 2023538900000470
Figure 2023538900000471
Figure 2023538900000472
Figure 2023538900000473
Figure 2023538900000474
Figure 2023538900000475
Figure 2023538900000476
Figure 2023538900000477
Figure 2023538900000478
Figure 2023538900000479
Figure 2023538900000480
Figure 2023538900000481
Figure 2023538900000482
Figure 2023538900000483
Figure 2023538900000484
Figure 2023538900000485
Figure 2023538900000486
Figure 2023538900000487
Figure 2023538900000488
Figure 2023538900000489
Figure 2023538900000490
Figure 2023538900000491
Figure 2023538900000492
Figure 2023538900000493
Figure 2023538900000494
Figure 2023538900000495
Figure 2023538900000496
Figure 2023538900000497
Figure 2023538900000498
Figure 2023538900000499
Figure 2023538900000500
Figure 2023538900000501
Figure 2023538900000502
Figure 2023538900000503
Figure 2023538900000504
Figure 2023538900000505
Figure 2023538900000506
Figure 2023538900000507
Figure 2023538900000508
Figure 2023538900000509
Figure 2023538900000510
Figure 2023538900000511
Figure 2023538900000512
Figure 2023538900000513
Figure 2023538900000514
Figure 2023538900000515
Figure 2023538900000516
Figure 2023538900000517
Figure 2023538900000518
Figure 2023538900000519
Figure 2023538900000520
Figure 2023538900000521
Figure 2023538900000522
Figure 2023538900000523
Figure 2023538900000524
Figure 2023538900000525
Figure 2023538900000526
Figure 2023538900000527
Figure 2023538900000528
Figure 2023538900000529
Figure 2023538900000530
Figure 2023538900000531
Figure 2023538900000532
Figure 2023538900000533
Figure 2023538900000534
Figure 2023538900000535
Figure 2023538900000536
Figure 2023538900000537
Figure 2023538900000538
Figure 2023538900000539
Figure 2023538900000540
Figure 2023538900000541
Figure 2023538900000542
Figure 2023538900000543
Figure 2023538900000544
Figure 2023538900000545
Figure 2023538900000546
Figure 2023538900000547
Figure 2023538900000548
Figure 2023538900000549
Figure 2023538900000550
Figure 2023538900000551
Figure 2023538900000552
Figure 2023538900000553
Figure 2023538900000554
Figure 2023538900000555
Figure 2023538900000556
Figure 2023538900000557
Figure 2023538900000558
Figure 2023538900000559
Figure 2023538900000560
Figure 2023538900000561
Figure 2023538900000562
Figure 2023538900000563
Figure 2023538900000564
Figure 2023538900000565
Figure 2023538900000566
Figure 2023538900000567
Figure 2023538900000568
Figure 2023538900000569
Figure 2023538900000570
Figure 2023538900000571
Figure 2023538900000572
Figure 2023538900000573
Figure 2023538900000574
Figure 2023538900000575
Figure 2023538900000576
Figure 2023538900000577
Figure 2023538900000578
Figure 2023538900000579
Figure 2023538900000580
Figure 2023538900000581
Figure 2023538900000582
Figure 2023538900000583
Figure 2023538900000584
Figure 2023538900000585
Figure 2023538900000586
Figure 2023538900000587
Figure 2023538900000588
Figure 2023538900000589
Figure 2023538900000590
Figure 2023538900000591
Figure 2023538900000592
Figure 2023538900000593
Figure 2023538900000594
Figure 2023538900000595
Figure 2023538900000596
Figure 2023538900000597
Figure 2023538900000598
Figure 2023538900000599
Figure 2023538900000600
Figure 2023538900000601
Figure 2023538900000602
Figure 2023538900000603
Figure 2023538900000604
Figure 2023538900000605
Figure 2023538900000606
Figure 2023538900000607
Figure 2023538900000608
Figure 2023538900000609
Figure 2023538900000610
Figure 2023538900000611
Figure 2023538900000612
Figure 2023538900000613
Figure 2023538900000614
Figure 2023538900000615
Figure 2023538900000616
Figure 2023538900000617
Figure 2023538900000618
Figure 2023538900000619
Figure 2023538900000620
Figure 2023538900000621
Figure 2023538900000622
Figure 2023538900000623
Figure 2023538900000624
Figure 2023538900000625
Figure 2023538900000626
Figure 2023538900000627
Figure 2023538900000628
Figure 2023538900000629
Figure 2023538900000630
Figure 2023538900000631
Figure 2023538900000632
Figure 2023538900000633
Figure 2023538900000634
Figure 2023538900000635
Figure 2023538900000636
Figure 2023538900000637
Figure 2023538900000638
Figure 2023538900000639
Figure 2023538900000640
Figure 2023538900000641
Figure 2023538900000642
Figure 2023538900000643
Figure 2023538900000644
Figure 2023538900000645
Figure 2023538900000646
Figure 2023538900000647
Figure 2023538900000648
Figure 2023538900000649
Figure 2023538900000650
Figure 2023538900000651
Figure 2023538900000652
Figure 2023538900000653
Figure 2023538900000654
Figure 2023538900000655
Figure 2023538900000656
Figure 2023538900000657
Figure 2023538900000658
Figure 2023538900000659
Figure 2023538900000660
Figure 2023538900000661
Figure 2023538900000662
Figure 2023538900000663
Figure 2023538900000664
Figure 2023538900000665
Figure 2023538900000666
Figure 2023538900000667
Figure 2023538900000668
Figure 2023538900000669
Figure 2023538900000670
Figure 2023538900000671
Figure 2023538900000672
Figure 2023538900000673
Figure 2023538900000674
Figure 2023538900000675
Figure 2023538900000676
Figure 2023538900000677
Figure 2023538900000678
Figure 2023538900000679
Figure 2023538900000680
Figure 2023538900000681
Figure 2023538900000682
Figure 2023538900000683
Figure 2023538900000684
Figure 2023538900000685
Figure 2023538900000686
Figure 2023538900000687
Figure 2023538900000688
Figure 2023538900000689
Figure 2023538900000690
Figure 2023538900000691
Figure 2023538900000692
Figure 2023538900000693
Figure 2023538900000694
Figure 2023538900000695
Figure 2023538900000696
Figure 2023538900000697
Figure 2023538900000698
Figure 2023538900000699
Figure 2023538900000700
Figure 2023538900000701
Figure 2023538900000702
Figure 2023538900000703
Figure 2023538900000704
Figure 2023538900000705
Figure 2023538900000706
Figure 2023538900000707
Figure 2023538900000708
Figure 2023538900000709
Figure 2023538900000710
Figure 2023538900000711
Figure 2023538900000712
Figure 2023538900000713
Figure 2023538900000714
Figure 2023538900000715
Figure 2023538900000716
Figure 2023538900000717
Figure 2023538900000718
Figure 2023538900000719
Figure 2023538900000720
参考文献
Figure 2023538900000721
Figure 2023538900000722
Figure 2023538900000723
本開示はまた、例えば、配列番号６８３５～配列番号１８６７６から選択される１つ又は複数のｃＤＮＡを含むか、又はそれらから本質的になる、キット、チューブ、又はシステムを含む、組成物に関する。いくつかの実施形態では、組成物は、配列番号６８３５～配列番号１８６７６に対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を有するｃＤＮＡを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、蛍光部分で標識された１つ又は複数のｃＤＮＡ分子を含む。
[本発明１００１]
良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞を有する対象を診断する方法であって、
前記対象の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出すること
を含む、前記方法。
[本発明１００２]
前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１００１の方法。
[本発明１００３]
前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１００１又は１００２の方法。
[本発明１００４]
前記検出するステップが、前記対象から前記試料を取得するステップの後に行われる、本発明１００１～１００３のいずれかの方法。
[本発明１００５]
前記試料を、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の非コードＲＮＡ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の非コード核酸配列に相補的な少なくとも１つの核酸分子に曝露することを更に含む、本発明１００１～１００４のいずれかの方法。
[本発明１００６]
前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップが、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブと接触させること、及び前記試料中の前記量を、対照試料から得た測定値で正規化することを含む、本発明１００１～１００５のいずれかの方法。
[本発明１００７]
対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量の測定値を基準として、前記対象が良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞増殖を有する確率又は尤度と、前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を相関させることを更に含む、本発明１００１～１００６のいずれかの方法。
[本発明１００８]
前記良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮から選択される組織からのものである、本発明１００１～１００７のいずれかの方法。
[本発明１００９]
前記試料が、前記対象からの血液又は血清である、本発明１００１～１００８のいずれかの方法。
[本発明１０１０]
１つ又は複数の基底（ｂａｓａｌ）がん又は管腔（ｌｕｍｉｎａｌ）がんから選択される、前記対象における前悪性又は悪性の過剰増殖細胞の存在を診断する、本発明１００１～１００９のいずれかの方法。
[本発明１０１１]
前記試料が、前記対象からの少なくとも１つの細胞によって播種又は接種された細胞の培養物から採取される、本発明１００１～１０１０のいずれかの方法。
[本発明１０１２]
副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮から選択される前記対象の組織からの少なくとも１つの細胞を増殖させるのに十分な条件下かつ期間にわたって、培養培地で前記対象からの少なくとも１つの生検を培養することを更に含む、本発明１００１～１０１１のいずれかの方法。
[本発明１０１３]
前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を測定するステップが、前記試料をデジタル撮像すること、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片のエピトープに特異的な既知の量の標識された抗体に曝露すること、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的な１つ又は複数の色素に曝露すること、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の配列に相補的なｓヌクレオチド配列を含む少なくとも１つの標識されたプローブに曝露すること、前記試料をクロマトグラフィーに曝露すること、前記試料の全ＲＮＡを単離すること、及び前記全ＲＮＡを配列決定分析に曝露すること、並びに／又は前記試料を質量分析に曝露すること、のうちの１つ又は組み合わせを含む、本発明１００１～１０１２のいずれかの方法。
[本発明１０１４]
前記試料からの細胞の形態を分析することを更に含む、本発明１０１３の方法。
[本発明１０１５]
前記試料が、前記対象の血漿、血清若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの組織又は液体試料を含む、ヒト組織試料である、本発明１００１～１０１４のいずれかの方法。
[本発明１０１６]
前記試料が、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞を含む、本発明１００１～１０１５のいずれかの方法。
[本発明１０１７]
前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップが、化学発光プローブ、蛍光プローブ、及び／又は蛍光顕微鏡を使用することを含む、本発明１００１～１０１６のいずれかの方法。
[本発明１０１８]
前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップが、前記試料の全ＲＮＡを、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の非コードＲＮＡ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の非コード核酸配列に相補的なヌクレオチド配列を含む少なくとも１つのプローブと接触させることを更に含む、本発明１００１～１０１７のいずれかの方法。
[本発明１０１９]
対象におけるがん細胞を検出する方法であって、
試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ配列に相補的なヌクレオチド配列を含む１つ又は複数のプローブと接触させることによって、前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出すること
を含む、前記方法。
[本発明１０２０]
前記検出するステップが、前記対象から前記試料を得るステップの後に行われる、本発明１０１９の方法。
[本発明１０２１]
ａ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを算出することと、
ｂ）前記少なくとも非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、前記対象が、がんを有すると診断されるように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと
を更に含む、本発明１０１９又は１０２０の方法。
[本発明１０２２]
前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片が、配列番号１～配列番号１５４３のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を含む、本発明１０１９～１０２１のいずれかの方法。
[本発明１０２３]
前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片が、配列番号１～配列番号１５４３から選択される、本発明１０１９～１０２２のいずれかの方法。
[本発明１０２４]
前記試料が、対象の血清若しくは血漿若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの組織を含む、ヒト組織試料である、本発明１０１９～１０２３のいずれかの方法。
[本発明１０２５]
前記試料が、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞からの全ＲＮＡを含む、本発明１０１９～１０２４のいずれかの方法。
[本発明１０２６]
前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片を定量化するステップが、前記試料から全ＲＮＡを単離することを含む、本発明１０１９～１０２５のいずれかの方法。
[本発明１０２７]
前記試料が、血漿、血液又は血清である、本発明１０１９～１０２６のいずれかの方法。
[本発明１０２８]
前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０１９～１０２７のいずれかの方法。
[本発明１０２９]
前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０１９～１０２８のいずれかの方法。
[本発明１０３０]
がんを有する対象を診断する方法であって、
ａ）前記対象の試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブと接触させることによって、前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出することと、
ｂ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在又は量が、前記試料中で検出される場合、前記対象を、がんを有すると診断することと
を含む、前記方法。
[本発明１０３１]
前記検出するステップが、前記対象から前記試料を取得するステップの後に行われる、本発明１０３０の方法。
[本発明１０３２]
前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、本発明１０３０又は１０３１の方法。
[本発明１０３３]
ステップａ）が、
ｉ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを算出することと、
ｉｉ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、前記対象が、がんを有すると診断されるように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと
を更に含む、本発明１０３０～１０３２のいずれかの方法。
[本発明１０３４]
がんの抗原の存在、非存在、又は量を検出することを更に含む、本発明１０３０～１０３３のいずれかの方法。
[本発明１０３５]
前記試料が、前記対象の血漿、血清若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの細胞又は組織を含む、ヒト組織試料である、本発明１０３０～１０３４のいずれかの方法。
[本発明１０３６]
前記試料が、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、及び／又はパラフィン包埋された細胞からの全ＲＮＡを含む、本発明１０３０～１０３５のいずれかの方法。
[本発明１０３７]
前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片を定量化するステップが、蛍光及び／又はデジタル撮像を使用することを含む、本発明１０３０～１０３６のいずれかの方法。
[本発明１０３８]
前記試料が、ヒト血清である、本発明１０３０～１０３７のいずれかの方法。
[本発明１０３９]
前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０３０～１０３８のいずれかの方法。
[本発明１０４０]
前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０３０～１０３９のいずれかの方法。
[本発明１０４１]
がんと診断されたか、又はそれを有することが疑われる、治療を必要とする対象を治療する方法であって、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブを、前記対象からの試料と接触させることと、
ｂ）前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を定量化することと、
ｃ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを算出することと、
ｄ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、前記対象が、がんを有すると診断されるように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと、
ｅ）前記対象に、前記がんのための治療有効量の治療を投与することと
を含む、前記方法。
[本発明１０４２]
前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、本発明１０４１の方法。
[本発明１０４３]
フルオロフォア、化学発光剤、及び／又はクエンチング剤を含む少なくとも１つの基質が、検出するステップに使用される、本発明１０４１又は１０４２の方法。
[本発明１０４４]
前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０４１～１０４３のいずれかの方法。
[本発明１０４５]
前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０４１～１０４４のいずれかの方法。
[本発明１０４６]
ａ）試料、
ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に結合する１つ又は複数のプローブ及び／又は染色剤、並びに
ｃ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ及び／又はその機能的断片に結合する少なくとも１つの前記プローブ又は染色剤の存在、非存在及び／又は量を定量化することができる１つ以上のデバイス
を含む、システム。
[本発明１０４７]
前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、本発明１０４６のシステム。
[本発明１０４８]
前記試料が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される、本発明１０４６又は１０４７のシステム。
[本発明１０４９]
前記試料が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される、本発明１０４６～１０４８のいずれかのシステム。
[本発明１０５０]
過剰増殖細胞を含む試料の発達段階又は病理を特徴付けるための方法であって、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な複数のプローブを、前記試料と接触させることと、
ｂ）前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を定量化することと、
ｃ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上の正規化スコアを算出することと、
ｄ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量よりも多い場合、相関させるステップが、前記試料を、過剰増殖細胞を含むとして特徴付けることを含むように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量と相関させることと
を含む、前記方法。
[本発明１０５１]
前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、本発明１０５０の方法。
[本発明１０５２]
前記試料が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒト対象から得られる、本発明１０５０又は１０５１の方法。
[本発明１０５３]
前記試料が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒト対象から得られる、本発明１０５０～１０５２のいずれかの方法。
[本発明１０５４]
対象が悪性増殖を有するかどうかを決定する方法であって、試料を、
ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的なプローブ、又は
ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的な基質
と接触させることによって、前記対象の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量を検出することを含む、前記方法。
[本発明１０５５]
前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、本発明１０５４の方法。
[本発明１０５６]
前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０５４又は１０５５の方法。
[本発明１０５７]
前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、本発明１０５４～１０５６のいずれかの方法。
[本発明１０５８]
対象の試料からのＲＮＡを処理する方法であって、
（ｉ）全ＲＮＡ中の小さい非コードＲＮＡを、全ｍＲＮＡから分離すること、
（ｉｉ）前記小さい非コードＲＮＡを分析すること
を含む、前記方法。
[本発明１０５９]
前記試料中の全ＲＮＡを、遠心分離によって前記試料の他の成分から単離するステップを更に含む、本発明１０５８の方法。
[本発明１０６０]
前記試料から前記小さい非コードＲＮＡを分離するステップが、前記試料の遠心分離及び細胞全体の除去を含む、本発明１０５８の方法。
[本発明１０６１]
前記試料から前記小さい非コードＲＮＡを分離する前記ステップが、前記対象の全血からのエクソソームの除去を含む、本発明１０５８の方法。
[本発明１０６２]
分析ステップが、前記試料中のｏｎｃＲＮＡの存在、非存在、又は量を検出することを含む、本発明１０５８の方法。
[本発明１０６３]
前記検出することが、ＲＮＡ中の単離された小さい非コードＲＮＡのプールから前記ＲＮＡを配列決定することを含む、本発明１０６２の方法。
[本発明１０６４]
前記検出することが、単離された小さい非コードＲＮＡのプールを、配列番号１～配列番号１５４３のうちのいずれかのＲＮＡ配列、又は表２のＲＮＡ配列に特異的な１つのプローブ又は複数のプローブに曝露することを含む、本発明１０６２の方法。
[本発明１０６５]
前記１つ又は複数のプローブが、表２の１つ又は複数のＤＮＡ配列を含む、本発明１０６４の方法。
[本発明１０６６]
前記プローブ又は複数のプローブが、蛍光標識を含む、本発明１０６５の方法。
[本発明１０６７]
前記検出することが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって、ｏｎｃＲＮＡのＲＮＡ又はｃＤＮＡ配列を増幅することを含む、本発明の方法。
[本発明１０６８]
表２から選択されるいずれか１つ又は複数のｃＤＮＡを含む、組成物。
[本発明１０６９]
前記１つ又は複数のｃＤＮＡが、配列番号６８３５～配列番号１８６７６から選択される、本発明１０６８の組成物。
配列識別子は、配列番号１５４４から配列番号６，８３４まで連続して分離された各ＲＮＡ配列に、以下の副腎皮質がん配列から始まる表２のそれらの出現の順序で割り当てられる。配列識別子は、表２の各ＤＮＡに、それらが上から下に現れる順序で割り当てられる。したがって、以下の第１の出現ＲＮＡは、配列番号１５４４であり、第２の出現配列、ＣＡＵＣＵＵＵＵＵＵＵＣＵＣＵＡＧＣＵＧＵＵＵＧＡＡＧＡＵＵＵＵＣＵＣＵＵＵＡＵＣＡＣＵＧＧＵＵＣＵＡＡＧＵＡＡＡＵＵＧＡＵＵＡＵＧＧＵＧＵＧＣＣＵＵＡＧＵＧＵＧＵＵＧＵＣＵＡが続き、これは配列番号１５４７である。このパターンは、配列番号６，８３４である、表の上から下まで列挙される最後のＲＮＡ配列まで続く。以下の最初に同定されたｃＤＮＡ配列は、配列番号６８３５であり、第２のＡＡＴＡＡＴＡＣＡＧＧＴＡＧＡＴＡＡＡＣＣＡＡＧＡＧは、配列番号１５４６である。このパターンは、配列番号１８，６７６である、表２の最後に同定された配列まで続く。したがって、表２のｏｎｃＲＮＡは、配列番号１５４４～配列番号６８３４である。ｏｎｃＲＮＡに対応するＤＮＡ配列は、配列番号６８３５～配列番号１８６７６である。

Claims (69)

  1. 良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞を有する対象を診断する方法であって、
    前記対象の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出すること
    を含む、前記方法。
  2. 前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項１に記載の方法。
  3. 前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項１又は２に記載の方法。
  4. 前記検出するステップが、前記対象から前記試料を取得するステップの後に行われる、請求項１～３のいずれか一項に記載の方法。
  5. 前記試料を、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の非コードＲＮＡ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の非コード核酸配列に相補的な少なくとも１つの核酸分子に曝露することを更に含む、請求項１～４のいずれか一項に記載の方法。
  6. 前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップが、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブと接触させること、及び前記試料中の前記量を、対照試料から得た測定値で正規化することを含む、請求項１～５のいずれか一項に記載の方法。
  7. 対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量の測定値を基準として、前記対象が良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞増殖を有する確率又は尤度と、前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を相関させることを更に含む、請求項１～６のいずれか一項に記載の方法。
  8. 前記良性、前悪性、又は悪性の過剰増殖細胞が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮から選択される組織からのものである、請求項１～７のいずれか一項に記載の方法。
  9. 前記試料が、前記対象からの血液又は血清である、請求項１～８のいずれか一項に記載の方法。
  10. １つ又は複数の基底（ｂａｓａｌ）がん又は管腔（ｌｕｍｉｎａｌ）がんから選択される、前記対象における前悪性又は悪性の過剰増殖細胞の存在を診断する、請求項１～９のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記試料が、前記対象からの少なくとも１つの細胞によって播種又は接種された細胞の培養物から採取される、請求項１～１０のいずれか一項に記載の方法。
  12. 副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮から選択される前記対象の組織からの少なくとも１つの細胞を増殖させるのに十分な条件下かつ期間にわたって、培養培地で前記対象からの少なくとも１つの生検を培養することを更に含む、請求項１～１１のいずれか一項に記載の方法。
  13. 前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を測定するステップが、前記試料をデジタル撮像すること、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片のエピトープに特異的な既知の量の標識された抗体に曝露すること、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的な１つ又は複数の色素に曝露すること、前記試料を、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の配列に相補的なｓヌクレオチド配列を含む少なくとも１つの標識されたプローブに曝露すること、前記試料をクロマトグラフィーに曝露すること、前記試料の全ＲＮＡを単離すること、及び前記全ＲＮＡを配列決定分析に曝露すること、並びに／又は前記試料を質量分析に曝露すること、のうちの１つ又は組み合わせを含む、請求項１～１２のいずれか一項に記載の方法。
  14. 前記試料からの細胞の形態を分析することを更に含む、請求項１３に記載の方法。
  15. 前記試料が、前記対象の血漿、血清若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの組織又は液体試料を含む、ヒト組織試料である、請求項１～１４のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記試料が、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞を含む、請求項１～１５のいずれか一項に記載の方法。
  17. 前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップが、化学発光プローブ、蛍光プローブ、及び／又は蛍光顕微鏡を使用することを含む、請求項１～１６のいずれか一項に記載の方法。
  18. 前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出するステップが、前記試料の全ＲＮＡを、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の非コードＲＮＡ、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の非コード核酸配列に相補的なヌクレオチド配列を含む少なくとも１つのプローブと接触させることを更に含む、請求項１～１７のいずれか一項に記載の方法。
  19. 対象におけるがん細胞を検出する方法であって、
    試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ配列に相補的なヌクレオチド配列を含む１つ又は複数のプローブと接触させることによって、前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出すること
    を含む、前記方法。
  20. 前記検出するステップが、前記対象から前記試料を得るステップの後に行われる、請求項１９に記載の方法。
  21. ａ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを算出することと、
    ｂ）前記少なくとも非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、前記対象が、がんを有すると診断されるように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと
    を更に含む、請求項１９又は２０に記載の方法。
  22. 前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片が、配列番号１～配列番号１５４３のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の配列同一性を含む、請求項１９～２１のいずれか一項に記載の方法。
  23. 前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片が、配列番号１～配列番号１５４３から選択される、請求項１９～２２のいずれか一項に記載の方法。
  24. 前記試料が、対象の血清若しくは血漿若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの組織を含む、ヒト組織試料である、請求項１９～２３のいずれか一項に記載の方法。
  25. 前記試料が、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、かつ／又はパラフィン包埋された細胞からの全ＲＮＡを含む、請求項１９～２４のいずれか一項に記載の方法。
  26. 前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片を定量化するステップが、前記試料から全ＲＮＡを単離することを含む、請求項１９～２５のいずれか一項に記載の方法。
  27. 前記試料が、血漿、血液又は血清である、請求項１９～２６のいずれか一項に記載の方法。
  28. 前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項１９～２７のいずれか一項に記載の方法。
  29. 前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項１９～２８のいずれか一項に記載の方法。
  30. がんを有する対象を診断する方法であって、
    ａ）前記対象の試料を、少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブと接触させることによって、前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、及び／又は量を検出することと、
    ｂ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在又は量が、前記試料中で検出される場合、前記対象を、がんを有すると診断することと
    を含む、前記方法。
  31. 前記検出するステップが、前記対象から前記試料を取得するステップの後に行われる、請求項３０に記載の方法。
  32. 前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項３０又は３１に記載の方法。
  33. ステップａ）が、
    ｉ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを算出することと、
    ｉｉ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、前記対象が、がんを有すると診断されるように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと
    を更に含む、請求項３０～３２のいずれか一項に記載の方法。
  34. がんの抗原の存在、非存在、又は量を検出することを更に含む、請求項３０～３３のいずれか一項に記載の方法。
  35. 前記試料が、前記対象の血漿、血清若しくは血液の採取、ブラッシング、生検、又は外科的切除からの細胞又は組織を含む、ヒト組織試料である、請求項３０～３４のいずれか一項に記載の方法。
  36. 前記試料が、新たに得られた、ホルマリン固定された、アルコール固定された、及び／又はパラフィン包埋された細胞からの全ＲＮＡを含む、請求項３０～３５のいずれか一項に記載の方法。
  37. 前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片を定量化するステップが、蛍光及び／又はデジタル撮像を使用することを含む、請求項３０～３６のいずれか一項に記載の方法。
  38. 前記試料が、ヒト血清である、請求項３０～３７のいずれか一項に記載の方法。
  39. 前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項３０～３８のいずれか一項に記載の方法。
  40. 前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項３０～３９のいずれか一項に記載の方法。
  41. がんと診断されたか、又はそれを有することが疑われる、治療を必要とする対象を治療する方法であって、
    ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な１つ又は複数のプローブを、前記対象からの試料と接触させることと、
    ｂ）前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を定量化することと、
    ｃ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上のスコアを算出することと、
    ｄ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量よりも多い場合、又は前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量が、がんを有することが知られている対象から採取された試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片の量と実質的に等しい場合、前記対象が、がんを有すると診断されるように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量と相関させることと、
    ｅ）前記対象に、前記がんのための治療有効量の治療を投与することと
    を含む、前記方法。
  42. 前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項４１に記載の方法。
  43. フルオロフォア、化学発光剤、及び／又はクエンチング剤を含む少なくとも１つの基質が、検出するステップに使用される、請求項４１又は４２に記載の方法。
  44. 前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項４１～４３のいずれか一項に記載の方法。
  45. 前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項４１～４４のいずれか一項に記載の方法。
  46. ａ）試料、
    ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に結合する１つ又は複数のプローブ及び／又は染色剤、並びに
    ｃ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ及び／又はその機能的断片に結合する少なくとも１つの前記プローブ又は染色剤の存在、非存在及び／又は量を定量化することができる１つ以上のデバイス
    を含む、システム。
  47. 前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項４６に記載のシステム。
  48. 前記試料が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される、請求項４６又は４７に記載のシステム。
  49. 前記試料が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんを有すると特定されたか、又はそれを有することが疑われる対象から採取される、請求項４６～４８のいずれか一項に記載のシステム。
  50. 過剰増殖細胞を含む試料の発達段階又は病理を特徴付けるための方法であって、
    ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片に特異的な複数のプローブを、前記試料と接触させることと、
    ｂ）前記試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量を定量化することと、
    ｃ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量に基づいて１つ以上の正規化スコアを算出することと、
    ｄ）前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量が、対照試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量よりも多い場合、相関させるステップが、前記試料を、過剰増殖細胞を含むとして特徴付けることを含むように、前記１つ以上のスコアを、前記少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の量と相関させることと
    を含む、前記方法。
  51. 前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項５０に記載の方法。
  52. 前記試料が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒト対象から得られる、請求項５０又は５１に記載の方法。
  53. 前記試料が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒト対象から得られる、請求項５０～５２のいずれか一項に記載の方法。
  54. 対象が悪性増殖を有するかどうかを決定する方法であって、試料を、
    ａ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的なプローブ、又は
    ｂ）少なくとも１つの非コードＲＮＡ若しくはその機能的断片に特異的な基質
    と接触させることによって、前記対象の試料中の少なくとも１つの非コードＲＮＡ又はその機能的断片の存在、非存在、又は量を検出することを含む、前記方法。
  55. 前記１つ又は複数のプローブが、配列番号１～配列番号１５４３から選択される１つ若しくは複数の配列、又は配列番号１～配列番号１５４３から選択される核酸のうちのいずれかに対して、少なくとも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％若しくは９９％の配列同一性を含む１つ若しくは複数の配列に相補的なヌクレオチド配列を含む、請求項５４に記載の方法。
  56. 前記対象が、副腎、胆管、膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房、頸部、結腸、食道、眼、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、リンパ系、肝臓、肺、腎臓、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ）、前立腺（ｐｒｏｓｔａｔｅ ｇｌａｎｄ）、直腸、唾液腺、皮膚、脊椎、胃、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、又は子宮のがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項５４又は５５に記載の方法。
  57. 前記対象が、副腎がん、胆管がん、血液がん、脳がん、乳がん、骨がん、膀胱がん、子宮頸がん、結腸がん、食道がん、婦人科腫瘍、腎臓がん、肝臓がん、肺がん、リンパ球性リンパ腫、卵巣がん、膵臓がん、副甲状腺がん、前立腺がん、直腸がん、皮膚がん、胃がん、軟組織肉腫、甲状腺がん、精巣がん、子宮がん、眼がん、頭頸部がん、及び中枢神経系の新生物から選択されるがんと診断されたか、又はそれを有することが疑われるヒトである、請求項５４～５６のいずれか一項に記載の方法。
  58. 対象の試料からのＲＮＡを処理する方法であって、
    （ｉ）全ＲＮＡ中の小さい非コードＲＮＡを、全ｍＲＮＡから分離すること、
    （ｉｉ）前記小さい非コードＲＮＡを分析すること
    を含む、前記方法。
  59. 前記試料中の全ＲＮＡを、遠心分離によって前記試料の他の成分から単離するステップを更に含む、請求項５８に記載の方法。
  60. 前記試料から前記小さい非コードＲＮＡを分離するステップが、前記試料の遠心分離及び細胞全体の除去を含む、請求項５８に記載の方法。
  61. 前記試料から前記小さい非コードＲＮＡを分離する前記ステップが、前記対象の全血からのエクソソームの除去を含む、請求項５８に記載の方法。
  62. 分析ステップが、前記試料中のｏｎｃＲＮＡの存在、非存在、又は量を検出することを含む、請求項５８に記載の方法。
  63. 前記検出することが、ＲＮＡ中の単離された小さい非コードＲＮＡのプールから前記ＲＮＡを配列決定することを含む、請求項６２に記載の方法。
  64. 前記検出することが、単離された小さい非コードＲＮＡのプールを、配列番号１～配列番号１５４３のうちのいずれかのＲＮＡ配列、又は表２のＲＮＡ配列に特異的な１つのプローブ又は複数のプローブに曝露することを含む、請求項６２に記載の方法。
  65. 前記１つ又は複数のプローブが、表２の１つ又は複数のＤＮＡ配列を含む、請求項６４に記載の方法。
  66. 前記プローブ又は複数のプローブが、蛍光標識を含む、請求項６５に記載の方法。
  67. 前記検出することが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって、ｏｎｃＲＮＡのＲＮＡ又はｃＤＮＡ配列を増幅することを含む、請求項に記載の方法。
  68. 表２から選択されるいずれか１つ又は複数のｃＤＮＡを含む、組成物。
  69. 前記１つ又は複数のｃＤＮＡが、配列番号６８３５～配列番号１８６７６から選択される、請求項６８に記載の組成物。
JP2023511821A 2020-08-16 2021-08-16 がん診断のためのｏｎｃＲＮＡの検出のシステム及び方法 Pending JP2023538900A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US202063066269P 2020-08-16 2020-08-16
US63/066,269 2020-08-16
PCT/US2021/046186 WO2022040106A2 (en) 2020-08-16 2021-08-16 System and methods of detection of oncrnas for cancer diagnosis

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2023538900A true JP2023538900A (ja) 2023-09-12

Family

ID=80323194

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2023511821A Pending JP2023538900A (ja) 2020-08-16 2021-08-16 がん診断のためのｏｎｃＲＮＡの検出のシステム及び方法

Country Status (8)

Country Link
US (1) US20240150829A1 (ja)
EP (1) EP4196616A2 (ja)
JP (1) JP2023538900A (ja)
CN (1) CN116261600A (ja)
AU (1) AU2021329814A1 (ja)
CA (1) CA3192008A1 (ja)
MX (1) MX2023001973A (ja)
WO (1) WO2022040106A2 (ja)

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3707259A4 (en) * 2017-11-12 2021-08-11 The Regents of the University of California NON-CODING RNA FOR CANCER DETECTION

Also Published As

Publication number Publication date
AU2021329814A1 (en) 2023-03-23
WO2022040106A3 (en) 2022-03-31
CN116261600A (zh) 2023-06-13
EP4196616A2 (en) 2023-06-21
MX2023001973A (es) 2023-04-25
US20240150829A1 (en) 2024-05-09
CA3192008A1 (en) 2022-02-24
WO2022040106A2 (en) 2022-02-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2012275556B2 (en) MicroRNA biomarkers indicative of Alzheimer's Disease
US20220325359A1 (en) Non-coding rna for detection of cancer
US20200131586A1 (en) Methods and compositions for diagnosing or detecting lung cancers
US20110159498A1 (en) Methods, agents and kits for the detection of cancer
US10480033B2 (en) MiRNA-based predictive models for diagnosis and prognosis of prostate cancer
CN107406880A (zh) 用于检测癌症的生物标志物组
AU2017281099A1 (en) Compositions and methods for diagnosing lung cancers using gene expression profiles
JP5858405B2 (ja) 肺腺がんの予後予測方法、および、肺腺がんの検出キット
JP7210030B2 (ja) 早期膵がんを診断するための方法およびキット
CA3085464A1 (en) Compositions and methods for diagnosing lung cancers using gene expression profiles
JP2023538900A (ja) がん診断のためのｏｎｃＲＮＡの検出のシステム及び方法
CN106811548B (zh) Slc38a4作为结肠腺癌的诊治靶标
AU2013204118A1 (en) MicroRNA biomarkers indicative of Alzheimer's Disease

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20230530

RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20230620