JP2023522326A - 条件付き不死化に関する制御可能な導入遺伝子を含む人工多能性細胞 - Google Patents
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Abstract
本発明は、条件付きで不死化可能な、細胞、例えば、成体幹細胞から形成される人工多能性幹細胞に関する。特に、本発明は、条件付き不死化に関する制御可能な導入遺伝子を含む幹細胞株から形成される人工多能性幹細胞、およびそれらの人工多能性幹細胞の後代、例えば、造血系の細胞に関する。人工多能性幹細胞、それらの多能性細胞由来の造血後代細胞、それらの細胞を含む組成物、それらの細胞のすべてを生成する方法、およびそれらの細胞のすべての使用も記載されている。
Description
本発明は、条件付きで不死化可能な、細胞、例えば、成体幹細胞から形成される人工多能性幹細胞(induced pluripotent stem cell)に関する。特に、本発明は、条件付き不死化に関する制御可能な導入遺伝子を含む細胞から形成される人工多能性幹細胞、およびそれらの人工多能性幹細胞の後代、例えば、造血系の細胞に関する。
ヒト多能性幹細胞(hPSC)は、生体に見られるあらゆる細胞タイプに分化できる特性である多能性の特性によって定義される。これらは、初期胚(胚盤胞、受精後およそ6.5日)の内部細胞塊由来の胚性幹細胞(hESC)、ならびに特定の転写因子のトランスダクションおよび外因性発現により体細胞を多能性表現型にリプログラミングすることによって形成される人工多能性細胞(hiPSC)を含む。
多能性にリプログラミングすることができるような転写因子の基本セットがOKSM(OCT4、KLF4、SOX2、C-MYC)として知られているが、O、K、SもしくはMの代わりになり得るか、またはリプログラミング、確率過程が生じる効率を調節することができる他の因子も知られている。
一般に、低継代一次細胞が、人工多能性幹細胞(iPSC)を形成するリプログラミングのための好ましい基体となる。そのような細胞は、より高継代の細胞よりも速く分裂する傾向があるという利点を有し、非分裂細胞はリプログラミングを受けにくい。これらはまた、正倍数体である可能性が高い。成体幹細胞(ASC)も多能性にリプログラミングするための有望な基礎をもたらし、リプログラミング因子(例えば、SOX2、KLF4)の内因性発現および(多/複)能性と関連するよりオープンなクロマチン構造のため、より少数の転写因子およびより穏やかなリプログラミング事象のみを必要とする場合が多い。
一次細胞よりむしろ不死の哺乳動物細胞から形成されるiPSCのいくつかの例(一般にEBV不死化血液細胞)が存在する。そのような細胞は、一般にEBVまたはがん遺伝子、例えば、シミアンウイルス40ラージT抗原の安定なゲノムの組み込みによって不死化されるため、その臨床的有用性は不確実である。例えば、293FT細胞株は、SV40ラージT抗原を安定して発現し、リプログラミング転写因子のトランスフェクション時に表現型が変化するが、これは、真のiPSCよりもむしろ異常なコロニーを形成する。国際公開第2014/186766号パンフレットは、不死化体細胞からiPSCを形成する別の例について記載しており、ここでは、体細胞は、CMV-hTERTの感染によって不死化され、体細胞自体は、iPSCから分化させられた。同様に、中国特許出願公開第110628821号明細書は、早老ウェルナー症候群の患者から採取した線維芽細胞からiPSCを作り出す方法について記載しており、ここでは、採取された線維芽細胞のhTERT不死化は、疾患のインビトロ研究のためにこうした患者のiPSCの集団を形成するために使用される。
したがって、そのような不死化細胞由来のiPSC株は、一般に、疾患モデリング、薬物の発見および発生的研究などのインビトロ用途に限定される。
さらに、Skvortsovaらによる研究(Oncotarget, 2018, Vol.9 (No.81), pp35241-35250)は、不死化マウス線維芽細胞株が多能性状態へのリプログラミングに不応性であること、および不死化と関連する異数性およびインビトロ選択がそのような不応性の原因ではなさそうであることを報告している。したがって、多能性状態へのリプログラミングに適した細胞を特定しようとする場合、重大な技術的課題があり、少なくとも一部の不死化細胞はリプログラミングに対して不応性である。
多能性幹細胞は、安定であり、インビトロにおいて無制限に培養され得る。しかしながら、その奇形腫形成の能力などの臨床用途に対する課題および大半の分化プロトコルが所望のエンドポイントに対して100%未満の分化をもたらすという問題がある。したがって、治療用集団において残存する多能性細胞からの奇形腫形成の型式上のリスク、および望ましくない細胞タイプを患者にともに移植する問題が依然としてある。そのような望ましくない部分集団は、治療の効率の低下だけであっても、不明確または負の影響がある可能性もある。これは、所望の治療用細胞タイプが、多くの場合、慢性または急性の減少が患者における病状の原因となる高分化細胞タイプではなく、むしろ、患者の適した組織において最終の細胞タイプを生じる後期組織前駆細胞/成体幹細胞集団であるという事実によって悪化する。後期前駆細胞集団は、インビトロ培養では安定でない場合が多いため、上記の純度問題に加えて、理論において多能性細胞からのその生成が事実上無制限であっても、臨床的使用に許容できるレベルの純度でのスケーラブルな生成は少なからぬ課題である。
そのような前駆細胞集団はまた、一般に取り扱いが非常に難しい。それらの細胞が移植に先立って患者または別の人のいずれかから単離される場合(例えば、骨髄細胞)、材料の非常に制限された利用可能性、両人が同時に同じ場所での操作に応じられる要件、適した(例えば、免疫適合性の(immunocompatible))ドナーが得られること、細胞の混合集団、移植される材料純度およびQCの欠如のすべてに関連する困難がそのような処置の一般化を制限するのに寄与する。理論上は、hiPSCなどのhPSCを分化させることによってそのような細胞集団を形成する可能性は、そのような問題を改善するであろうが、その他の課題を提示する。重要な点として、前駆細胞集団は、インビトロで取り扱うのが難しく、時間とともに安定でなくなる。したがって、その均一でGMPに準拠したスケーラブルな生成は、GMP(医薬品および医薬部外品の製造管理および品質管理規則)品質のiPSCが利用可能であっても、一般に不可能である。大半の分化プロトコルは、100%の効率ではないため、汚染部分集団が治療用細胞集団に存在する可能性がある。
特に、治療用途の造血系の細胞が特に対象となる。造血系(haematopoietic system)は、感染症またはがんに対する自然および獲得免疫の両方、血液凝固ならびに赤血球の産生を含む、さまざまな機能を有する細胞タイプの大きな群からなる。これらの細胞タイプのすべては、最終的に骨髄に存在する多能性(multipotent)の成体幹細胞タイプ(ASC)である造血幹細胞(HSC)に由来する単一の系列を含む。造血系細胞は、がんに対する免疫療法ならびに自己免疫疾患、貧血、および外傷の処置を含む、さまざまな状態に対する治療薬として有用である。
造血系の細胞は、さまざまな状態に対する治療として使用される。これらとしては、抗腫瘍治療薬としてのキラー細胞、例えば、CD8+T細胞またはナチュラルキラー(NK)細胞、おそらく特に腫瘍細胞を標的とする遺伝子操作したレセプターをもつキラー細胞(例えば、キメラ抗原レセプターT細胞)、自己免疫性障害の処置のためのT-Reg、ならびに血小板、例えば、特定のがん患者または外傷患者などの凝固障害のある患者のための血小板、赤血球、例えば、貧血の処置および戦場または外傷医療のための赤血球、ならびにがんを含むさまざまな状態の処置のため、または抗体の産生のためのBリンパ球、がんの処置のための樹状細胞(例えば、プロベンジ(シプロイセルT))ならびにその他の使用が挙げられる。これらの細胞タイプのすべては、造血系の一部を含み、最終的に造血幹細胞、HSCに由来する。HSCは、骨髄のニッチに存在する希少な細胞タイプであり、例えば、がんに対する放射線療法処置後の致命的な放射線を受けた(完全に免疫系が除去された)動物の免疫系を再構成する能力によって定義される。これらは、表面レセプターCD34およびKIT(CD117)などのタンパク質マーカーの存在、ならびにT細胞レセプターなどの成熟造血性マーカーおよびBリンパ球によって成熟した抗原特異的抗体分子を産生することができる再構成された遺伝子座の両方の不在によって特定することができる。
HSCの臨床利用は些細なことではない。これは、成人では希少で、インビトロで単離するのが難しく、一般に増殖速度が遅い。能力がさまざまなHSCのいくつかのサブタイプがあることが知られているが、すべてが易感染性生物の免疫系を完全に再構成することができる訳ではないようである。
したがって、HSCは、ある範囲の疾患の処置に有用な、治療に有用な製品を形成するメディエーターとしておよび調査ツールとして有用な広い範囲の造血系細胞を形成することができる。HSCは、自家療法をもたらすために患者特異的なソースから形成することができ、あるいは(任意のまたは広い範囲の患者を処置するための)同種異系細胞療法として使用するために単一の細胞株が発生させられる場合、同種異系の人工多能性細胞(iPSC)から形成されてもよい。しかしながら、今までHSCは、有意な数および純度で患者から単離するのが難しく、その後も、生物の外で安定な形態で回収および維持するのが難しかった。安定で増殖可能なHSCあるいはそのようなHSCの系列依存的な分化した後代を、単一の安定で増殖可能な細胞系または細胞株として維持するのが望ましいであろう。これは、免疫療法をもたらすため、ならびに処置におよび調査ツールとして使用するための生物製剤のための産生細胞として商業的および臨床的に有益であろう。今までそのような細胞株は、広範囲にわたる努力にもかかわらず、iPSCからそのようなものをなかなか形成できないことがわかった。
臨床的有用性を有する幹細胞、特に、造血系の幹細胞を形成することに対するニーズが依然としてある。
本発明は、人工多能性幹細胞(iPSC)技術が、条件付き不死化細胞、特に、条件付き不死化幹細胞からiPSCを形成することによって改善され得るという驚くべき認識に基づくものである。本発明の特定の態様において、iPSCは、その後、造血系に向けられる。したがって、いくつかの態様は、条件付き不死化カセットをもつ哺乳動物のiPSC、例えば、CTX-iPSCから造血幹細胞を形成し、任意にこれらのHSCをさらに特定の運命、例えば、B細胞、T細胞、樹状細胞、NK細胞または好中球に向かう系列にさらに分化させる方法に関する。
本発明の第1の態様は、条件付き不死化に関する制御可能な導入遺伝子を含む人工多能性幹細胞を提供する。制御可能な導入遺伝子は、一般に人工多能性幹細胞由来の下流の(より分化した)細胞を条件付きで不死化することができる。こうした下流の細胞は、一般に造血系の細胞である。こうした下流の細胞は、そうでなければ取り扱うのが難しいこともあるため、条件付き不死化導入遺伝子の存在が改善点である。
特定の実施形態において、造血系の細胞は、CD34+CD43+造血幹細胞、CD4+T細胞、CD8+T細胞、制御性T細胞、CD56highCD16±ナチュラルキラー細胞、CD56lowCD16highナチュラルキラー細胞、CD19+B細胞、骨髄系樹状細胞、プラズマ細胞様樹状細胞、または好中球であってもよい。
いくつかの実施形態において、造血系の細胞は、CD49FおよびCD90も陽性で、マーカーCD38およびCD45RAが陰性であるCD34+細胞であってもよい。
いくつかの実施形態において、造血系の細胞は、長期造血幹細胞(「LT-HSC」)であってもよい。
本発明の第2の態様は、条件付き不死化細胞、一般に条件付き不死化幹細胞から得ることができるか、または得られる多能性幹細胞を提供する。この多能性幹細胞は、造血系の細胞を含む、他の細胞の有用なソースである。
本発明の第3の態様は、多能性幹細胞を生成する方法であって、条件付き不死化細胞、一般に条件付き不死化幹細胞をリプログラミングするステップを含む、方法を提供する。本方法は、多能性幹細胞からさまざまな細胞タイプを形成する、一般に造血系の細胞を形成する続くステップをさらに含んでもよい。下記の実施例6は、特に人工多能性幹細胞からの造血幹細胞の形成、およびその後さらに造血系へ、例えば、T細胞運命へのHSCの分化を示している。
特定の実施形態において、第3の態様の方法は、多能性細胞をHSCに、任意にさらに造血系に分化させるステップを含む。特定の実施形態において、この方法は、(i)アクチビンA、VEGF、SCFおよびBMP4を含む培地において培養して、中胚葉細胞を形成した後、(ii)中胚葉細胞をFLT3、SCF、BMP-4、ならびにインターロイキン3および6の存在下において培養して、HSCを形成することによってHSCに分化させられる多能性細胞を含んでもよい。
得られたHSCは、その後、いくつかの実施形態において、(i)培養物にDLL-1もしくはDLL-4タンパク質を供給して、HSCにおけるNOTCHシグナル伝達を活性化すること、または(ii)間質細胞と、任意にNotchリガンドDLL1もしくはDLL4を発現するよう操作された間質細胞とHSCとを共培養すること、または(iii)結合したVCAMおよびDLL4タンパク質の単層上でHSCを培養することによって、Tリンパ球の運命に分化させられてもよい。分化のための培養期間は、少なくとも7日、少なくとも14日または少なくとも21日、例えば、25日以上であってもよい。他の細胞の運命への分化については本明細書に記載されており、当業者には明らかであろう。
一実施形態において、CTX-HSCから前駆T細胞を形成する方法は、HSCを、HSCにVCAMおよびDLL4を提示する結合したキメラタンパク質の層上で14日の期間培養することによって提供される。14日の期間の終わりに、付着および懸濁細胞の不均質な集団が得られる。この細胞集団は、一般にCD3(T細胞レセプター関連タンパク質)、CD43(白血球マーカー)、CD5(リンパ球、主に初期T細胞マーカー)、CD7(未成熟T細胞マーカーおよびNK細胞マーカー)およびCD25(インターロイキン2レセプター)を発現する場合もある。成熟T細胞よりもむしろT前駆細胞表現型の解釈と一致して、CD5およびCD7の発現に加えて、この実施形態の細胞はT細胞レセプター自体も関連分子CD4もしくはCD8も発現しない。
結合したFc-DLL4およびFc-VCAMタンパク質上におけるTリンパ球前駆細胞(progenitor T lymphocyte cell)の長期間の培養は、より均質になりより成熟した表現型を有する細胞集団をもたらすことができる。そのような細胞は、より均一(例えば、60%を超える細胞が白血球マーカーCD43を発現した)であり、それらが、CD3に加えてCD8も発現したが、CD5およびCD7の発現は失われた、より成熟したリンパ球集団となるという解釈と一致し得る。
条件付き不死化hiPSC由来のHSCからより成熟したリンパ球集団を作り出すために分化の代替的な方法も使用されてきた。ヒトNOTCHリガンドDLL1を発現するように操作されたマウスMS5間質細胞とのCTX-HSCの共培養またはMS5-DLL1細胞の単層上でのCTX-HSCの共培養は、小さな非付着性細胞集団において高い増殖を引き起こした。この集団は、分化の過程で成熟して、CD34発現を失ったが、初期マーカーCD5およびCD7発現レベルが低下したものの、CD8発現は観察されなかった。したがって、この方法によって生成されたT細胞前駆細胞は、おそらく(上記の)結合タンパク質アプローチによって生成されるものよりもT細胞の発生の早い段階を表す。これらの結果は、例えば、図17、18、20および21において見ることができる。
本発明のさらなる態様は、本発明の任意の方法によって生成される細胞、特に、造血系の細胞、および任意のこれらの細胞によって産生される細胞外小胞に関する。
本発明者らは、条件付き不死化細胞、例えば、幹細胞、例えば、CTX0E03またはSTR0C05細胞株由来の細胞の多能性へのリプログラミングが、他の成体幹細胞または組織前駆細胞集団の形成を可能にすることを発見した。多能性細胞が一旦形成されると、任意の所望の系列、例えば、外胚葉、内胚葉または中胚葉系の細胞を得るために、従来の分化プロトコルが使用できる。中胚葉系は造血細胞を生じ、本発明によると典型的である。特定の実施形態において、多能性細胞は、元の条件付き不死化幹細胞の系列とは異なる系列に向けられる。特定の実施形態において、人工多能性細胞は、間葉系幹細胞、または神経幹細胞へ分化させることができる。
一般に、人工多能性細胞は、Tリンパ球、Bリンパ球、NK細胞、好中球および樹状細胞などの免疫系の細胞へのさらなる分化を含む、造血幹細胞に分化させられる。これらの細胞は、中胚葉起源のものである。
特定の実施形態において、人工多能性細胞は、体細胞(成体)幹細胞、多能性細胞、少能性細胞もしくは単能性細胞、または高分化細胞に分化させられてもよい。これらの細胞のすべては、一般に造血系のものである。
下記の実施例1~5は、さまざまな条件付き不死化細胞から本発明により形成されたiPSCが多能性であり、内胚葉、中胚葉および外胚葉系になることができることを示している。実施例は、成体幹細胞(MSC)が本発明のiPSCから形成され得ることをさらに示している。これらのMSCは、多能性であること、ならびに軟骨、脂肪および骨細胞に分化できることが示されている。
本発明の人工多能性細胞の、免疫系の機能細胞への分化も記載され、例示されている。これらの免疫細胞としては、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞および樹状細胞が挙げられる。当業者には理解されるであろうとおり、これらの細胞は、通常、造血系を介して到達することになる。T細胞としては、CD4+T細胞(「ヘルパーT細胞」と広く呼ばれることが多い)、マーカーFoxP3によって特徴づけられることが多い制御性T細胞(Treg)、およびCD8+T細胞(例えば、CD8+細胞傷害性Tリンパ球)を挙げることができる。造血系由来の別の細胞は好中球である。造血系由来のさらに別の細胞はマクロファージである。これらの細胞のそれぞれは、任意に遺伝子操作されていても、または別の方法で改変されていてもよい。特に、細胞は、キメラ抗原レセプターを発現して、CAR-T細胞、CAR-NK細胞、または任意の他のCAR-改変免疫細胞を形成するよう改変されてもよい。キメラ抗原レセプターは、一般に標的細胞、通常、腫瘍細胞上のタンパク質または他のマーカーに向けられる。例は、CD19であり、これは、B細胞悪性腫瘍、例えば、リンパ性白血病(急性(ALL)および慢性(CLL))ならびにリンパ腫を処置するためにCAR-細胞(例えば、CART-T細胞)によって標的とされる。本発明による造血系の対象の他の細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。治療に使用される場合、これらの細胞のそれぞれは一般に患者と同種異系のものである。それでもなお、状況によって細胞は、患者の自己由来のものであってもよく、例えば、CAR-TまたはCAR-NK療法においてなど患者細胞が抽出され、操作され、再投与される。CAR-NK細胞タイプの1つは、Li et al., 2018, Cell Stem Cell 23 181-92によって示されるscFv-NKG2D-2B4-CD3ζ細胞である。
本発明により生成され得る造血系の他の細胞は、赤血球(red blood cell)(赤血球(erythrocyte))である。ドナー血液に対する絶え間ないニーズが依然としてあり、そのニーズのかなりの割合が赤血球成分に対するものである。単にバイオリアクターに前駆細胞の標準的なバイアルを播種することにより、ドナー血液として働くことができる赤血球を大量に供給する能力は極めて有利である。「ドナー」という語が示す場合、これらの赤血球は、レシピエントと同種異系のものである。
細胞、例えば、幹細胞は、c-myc-ERTAM導入遺伝子により条件付きで不死化可能にすることができる。この導入遺伝子は、表現型にいかなる変化も与えることなく増殖および細胞分裂を促進する4-ヒドロキシタモキシフェンを細胞培養培地に添加することによって、神経幹細胞株CTX0E03およびSTR0C05などの幹細胞株の安定でスケーラブルな生成を可能にすることが既に示された。
条件付き不死化幹細胞は、一般に、体細胞の幹細胞とも呼ばれる成体幹細胞である。例えば、それは、CTX0E03幹細胞株などの神経幹細胞である場合もあるであろう。CTX0E03神経幹細胞株は、本出願人(ReNeuron Limited)によってEuropean Collection of Authenticated Cell Cultures(ECACC)、Porton Down、UKに寄託され、ECACC受託番号04091601を有する。他の実施形態において、神経幹細胞株は、「STR0C05」細胞株、「HPC0A07」細胞株(これも本出願人によってECACCに寄託された)またはMiljan et al Stem Cells Dev. 2009に開示されている神経幹細胞株であってもよい。
条件付き不死化幹細胞は、多能性にリプログラミングされる。多能性表現型を誘導することは、一般に特定のセットの多能性関連遺伝子の生成物、または「リプログラミング因子」を所与の細胞タイプに導入することを伴う。リプログラミング因子の元のセット(山中因子とも呼ばれる)は、転写因子Oct4、Sox2、cMyc、およびKlf4である。リプログラミング因子は、当該技術分野において周知であるとおり、一般にウイルスまたはエピソームベクターを使用して、細胞中に導入される。
リプログラミング因子を細胞に導入するのに適したウイルスベクターとしては、レンチウイルス、レトロウイルスおよびセンダイウイルスが挙げられる。リプログラミング因子を導入するための他の技術としては、mRNAトランスフェクションが挙げられる。
驚くべきことに、CTX0E03などの特定の条件付き不死化幹細胞を多能性にリプログラミングするためにたった1つの転写因子しか必要とされないことが確認された。例えば、図2B~Dは、OCT4単独でCTX0E03の多能性を誘導することができることを示す。多能性を実現することが確認された転写因子の組み合わせとしては、OCT4およびSOX2;OCT、KLF4およびSOX2;OCT4、KLF4、SOX2およびMYCが挙げられる。したがって、これらの組み合わせを含むか、またはそれからなるリプログラミング因子が本発明に使用するために提供される。図2Cにおいて多能性を首尾よく誘導する因子の組み合わせのそれぞれが、本発明の個々の実施形態として提供される。条件付き不死化幹細胞を多能性に誘導する際に使用するためのリプログラミング因子は、例示された組み合わせを含むか、またはそれからなってもよい。
他の不死化因子も当該技術分野において知られており、当業者には明らかであろう。因子の任意の適した組み合わせが使用されてもよく、これは、十分に当業者の能力の範囲内である。例えば、小分子阻害剤によるリプログラミングは、当該技術分野において知られており、同時に、NANOGおよびTET1が他の適したリプログラミング因子として知られている。例として、Thomsonおよび同僚は、OKSMの代替物としてNANOG、KLF4、SOX2およびLIN28を使用した。別の例において、TET1は、OCT4の代わりにすることができることが示された。
c-myc-ERTAM導入遺伝子の活性は、細胞のMYC活性を再現するため、c-myc-ERTAM誘導性不死化幹細胞をリプログラミングする場合、MYCがん遺伝子を発現するベクターは必須でなく、その理由は、必要とされる場合、この活性は、培地に4-OHTを供給することによってもたらされ、c-myc-ERTAM融合タンパク質を活性化することができるからである。したがって、いくつかの実施形態において、MYC(例えば、MYCリプログラミングベクター)は、別個のリプログラミング因子として使用されない。当業者は、MYC以外の遺伝子を使用する条件付き不死化システムが、それらをリプログラミングするために外因性MYCを必要とする場合もあることを当然認識するであろう。
人工多能性細胞は、任意の所望の細胞タイプに分化させることができる。細胞系列または細胞タイプを判定するための技術は、当該技術分野において周知である。一般に、これらの技術は、細胞表面(および/またはOct4などの多能性のマーカーの不在)または細胞内のいずれかの分化のマーカー、例えば、系列特異的な転写因子、細胞形態および機能の存在の判定を伴う。例えば、多能性幹細胞は、一般にカノニカル多能性転写因子OCT4、および細胞表面抗原TRA-1-60およびSSEA-4が陽性であるが、初期分化マーカーSSEA-1を発現しない。
内胚葉系のマーカーとしては、GATA6、AFPまたはHNF-αが挙げられる。他の内胚葉マーカーとしては、クローディン-6、サイトケラチン19、EOMES、SOX7およびSOX17の1つ以上を挙げることができる。
中胚葉系のマーカーとしては、BMP2、ブラキュリまたはVEGFが挙げられる。他の中胚葉マーカーとしては、アクチビンA、GDF-1、GDF-3、およびTGF-βのうちの1つ以上を挙げることができる。
外胚葉系のマーカーとしては、PAX6、ネスチンまたはTubIIIが挙げられる。他の外胚葉マーカーとしては、ノギン、PAX2およびコーディンのうちの1つ以上を挙げることができる。
さまざまな系列への分化は、例えば、図3Dに示される。CTX-iPSCおよびSTR0C-iPSCの内胚葉、中胚葉および外胚葉系への分化は、実施例2(図7)および実施例3(図9)にも示される。実施例2は、以下のマーカーを使用する。
多能性細胞は、任意の所望の細胞タイプに分化させることができる。これは、間葉系幹細胞、神経幹細胞、または造血幹細胞を含むことがある。別の実施形態において、体細胞(成体)幹細胞は、本発明の人工多能性細胞の分化から生じる。他の実施形態において、本方法によってもたらされる細胞は、多能性細胞、少能性細胞または単能性細胞である。この実施形態の例は、前駆細胞、例えば、神経前駆細胞の生成であろう。神経前駆細胞は、PloS One (2011) vol. 6 e20692においてNistorおよび同僚によって、場合によって神経変性疾患の処置に使用するものであると記載されている。もたらされる細胞はまた、分化のための既知の技術を使用して、高分化細胞に完全に分化させることができる。この実施形態の例は、Carriおよび同僚(2013年)によって示されるとおり、ハンチントン病において脱落している中型有棘ニューロンへの分化およびそのスケーラブルな生成である。Stem Cell Review and Reports, DOI 10.1007/s12015-013-9441-8を参照。特定の実施形態において、造血幹細胞は、T細胞、NK細胞および/または樹状細胞に分化させることができる。したがって、T細胞は、一実施形態として提供される。ナチュラルキラー細胞は、別の実施形態として提供される。樹状細胞がさらに提供される。
CTX-iPSCの間葉系幹細胞への分化は、実施例1および図5において示されている。この例において、MSC表現型は、マーカーCD73、CD90およびCD105が存在するが、CD14、CD20、CD34またはCD45は存在しないことによって特定される。
CTX-iPSC-MSCの軟骨、脂肪および骨細胞への分化は、実施例3および図10において示されている。
(必要に応じて)c-myc-ERTAM導入遺伝子の再活性化に続く4-OHTの培地への添加は、誘導される細胞集団の無限の増殖を可能にするはずである。CTX0E03自体と類似していることから、これは、事実上無制限の量の治療に有用な細胞集団のインビトロにおけるスケーラブルな生成を可能にすることが予想され、これは、細胞療法が存在しないか、または組織ドナーの利用可能性もしくはhPSCからの分化プロトコルの技術的な制約によって制限されるかのいずれかの、急性または慢性の細胞損失によって特徴づけられる任意の状態のための「すぐに利用できる(off-the-shelf)」療法として使用することができる。
本発明の方法は、所望の生成物を得るために必要な場合もある処理、培養または製剤化ステップをさらに含んでもよい。特定の実施形態において、本発明の方法は、典型的には方法の終わりに、以下のステップの1つ以上を含んでもよい:
本方法の結果もたらされる細胞を培養するステップ、
本方法の結果もたらされる細胞を継代するステップ、
本方法の結果もたらされる細胞を収集するステップもしくは回収するステップ、
本方法の結果もたらされる細胞を1つ以上の容器に包装するステップ、および/または
本方法の結果もたらされる細胞を1つ以上の賦形剤、安定剤もしくは保存料とともに製剤化するステップ。
本方法の結果もたらされる細胞を培養するステップ、
本方法の結果もたらされる細胞を継代するステップ、
本方法の結果もたらされる細胞を収集するステップもしくは回収するステップ、
本方法の結果もたらされる細胞を1つ以上の容器に包装するステップ、および/または
本方法の結果もたらされる細胞を1つ以上の賦形剤、安定剤もしくは保存料とともに製剤化するステップ。
条件付き不死化幹細胞、リプログラミングの結果もたらされる多能性細胞、および多能性細胞から得ることができるさらに分化した細胞は、一般に単離または精製される。これらの細胞のいずれかによって産生される細胞外小胞、例えば、エクソソームも、一般に単離または精製される。
分化後にもたらされる細胞、およびそれらによって産生される細胞外小胞は、治療に使用することができる。治療は、一般にそれを必要とする個体の疾患または障害のものになる。患者は、一般にヒトになる。
さらなる態様において、本発明は、条件付き不死化幹細胞;リプログラミングの結果もたらされる多能性細胞;多能性細胞から得ることができるさらに分化した細胞;または任意のこれらの細胞によって産生される細胞外小胞、例えば、エクソソーム;および薬学的に許容される賦形剤、担体もしくは希釈剤を含む組成物を提供する。
本発明者らは、驚くべきことに、条件付き不死化細胞が多能性幹細胞表現型にリプログラミングされ得ることを明らかにした。これは、既存の人工多能性幹細胞を超えた利点を提供する。特に、インビトロにおける不死化および長期培養にもかかわらず、驚くべきことに、神経幹細胞株CTX0E03およびSTR0C05が外因性転写因子によってリプログラミングされ得ることが示された。さらに、条件付きで制御される遺伝子がリプログラミング後も、依然として活性化および発現停止可能なままであることも驚きであったので、リプログラミング前に、ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)の添加時に転写され得る同じ機能的な条件付き不死化遺伝子、C-MYC-ERTAMをリプログラミングされた細胞に与える。これの利点は、リプログラミングされた細胞も、細胞培養において他の場合に可能である細胞よりも長い間安定して増殖するよう制御可能であることであり、単一のバッチでより多くの患者を処置するためまたは細胞の任意の副生成物の収率を増加させるための工業的スケールアップに適したリプログラミングされた細胞を生産する。
有利にも、条件付き不死化細胞のリプログラミングは、標準的な(条件付きで不死化されていない)細胞においてよりも少ないリプログラミング因子により達成できることが多い。特定の実施形態における成体幹細胞の使用は、同様の利点をもたらす。
さらに、細胞の条件付き不死化の性質は、細胞および不死化システムにわたって有益な制御性を提供する。いくつかの実施形態において、これらの利点は、C-MYC-ERTAM条件付き不死化システムによってもたらされる。理論に縛られることを望まないが、多能性にリプログラミングするためのソースとしての条件付き不死化細胞の使用は、不死化(すなわち、永続的に不死化された)細胞を使用した以前の試みを超える、実証された利点をもたらすと考えられる。
hiPSCは、(Heo et al., 2018, Cell Death Dis 9 1090. “Reprogramming method influences efficiency of generating haematopoietic progenitors by differentiation”)核移植胚由来のhESCよりも有効でないことが示された。これは、従来のiPSC技術を造血系用途に適用することに対する問題を示すが、この問題は本発明の細胞によって回避されるものであり、非常に不十分な(非効率な)分化システムであっても、貯蔵および患者移植に先立って、より運命拘束された、またはされていない前駆細胞および成体幹細胞(例えば、MYC-ERTAM/4-OHTシステムによって均質の集団として増殖させられた「部分的に分化した」細胞)を増殖させる能力において有用であり得る。
実施例のCTX-iPSCおよびSTR0C-iPSCなどの本発明の人工多能性細胞は、非常に有用な臨床的供給源である。これらは、所望の系列に沿って分化させて、組織前駆細胞タイプまたは成体幹細胞集団などの標的集団を形成することができる。典型的には、本明細書に記載されているiPSCは、造血系に分化させられる。その結果、継続的な増殖を促進し、細胞周期逸脱および関連するさらなる分化を防ぐための不死化剤(例えば、4-OHT)の供給は、毎回、細胞療法生成物の新しいバッチが必要とされる、原材料からの繰り返される細胞単離なく、または人工多能性幹細胞から再び分化プロトコルを繰り返すことなく、以前は実現不可能だった臨床的に関連した部分集団の定型化したスケーラブルな生成を可能にするであろう。これは、例えば、同種異系細胞療法、例えば、同種異系T細胞療法、CAR-T療法、NK療法もしくはCAR-NK細胞療法用、あるいは抗体の産生のためのB細胞、または治療用ワクチンの形成のための好中球もしくは樹状細胞のすぐに利用できる細胞供給源の可能性を提供する。
同種異系のすぐに利用できる成体幹細胞療法用集団、特に、造血系の集団を大規模に生成するために誘導性不死化を再適用する能力が、特に有益であることが予想される。
特定の態様において、本発明は、有利にも商業または臨床関連スケールで培養可能な、安定な造血系細胞が形成される条件付き不死化iPS細胞を提供する。
CAR-T療法を使用したがんの処置など、以前は自家療法が唯一の利用可能な認可された処置であった場合での同種異系細胞療法の提供は、際立った利点である。本発明による細胞のクローン増殖可能なバンクは、自家細胞療法と比較して、工業的製造および臨床利用を向上させる。これは、各患者ベースで新たに生成される自家療法よりも、生成過程におけるより大規模バッチ、1人の患者よりもむしろ任意の数の患者への広い適用、向上した分布およびアベイラビリティ、患者を処置するための短い所要時間、より低コスト、ならびに優れた一貫性、品質および安全性プロフィールをもたらす能力を含む。
元の条件付き不死化細胞(例えば、CTX0E03)自体は適していない条件に対するすぐに利用できる処置の大規模生成のために、クローニングまたは精製ステップを使用して、多かれ少なかれ均質でない分化培養物から所望の治療タイプの純粋な集団を形成することができ、分化プロトコルの効率が不十分な技術に見られる欠点を回避する。これは、細胞自体または、CTX細胞自体によって産生されるものに対する代替レパートリーのペイロード分子を有するさまざまな細胞タイプによって産生される細胞外小胞(例えば、エクソソーム)部分の両方に当てはまる。
さらに、これらのCTX-iPSC由来の亜株は既に臨床安全性試験(clinical phase safety trial)に合格した細胞株(CTX)から誘導されるため、新しい適応症における効力に関する臨床試験への移行が加速される可能性がある。
特定の態様において、本発明は、皮質組織および線条体組織由来でそれぞれが異なるヒトドナーに由来するCTX0E03またはSTR0C05神経幹細胞株などの、条件付き不死化に関する制御可能な導入遺伝子を含むさまざまな神経幹細胞から形成される人工多能性幹細胞、ならびにそれらの人工多能性幹細胞の後代に関する。
造血系の細胞
本発明は、特に、多能性細胞からの造血系の細胞の生成に関する。造血系は、本明細書中の別の場所で詳細に記載されているとおりに特定可能である中胚葉(mesoderm germ layer)から誘導される。
本発明は、特に、多能性細胞からの造血系の細胞の生成に関する。造血系は、本明細書中の別の場所で詳細に記載されているとおりに特定可能である中胚葉(mesoderm germ layer)から誘導される。
造血系(haematopoietic system)は、感染症またはがんに対する自然および獲得免疫の両方、血液凝固ならびに赤血球の産生を含む、さまざまな機能を有する細胞タイプの大きな群からなる。これらの細胞タイプのすべては、最終的に骨髄に存在する多能性成体幹細胞タイプ(ASC)である造血幹細胞(HSC)に由来する単一の系列を含む。造血系細胞は、がんに対する免疫療法ならびに自己免疫疾患、貧血、外傷および感染症の処置を含む、さまざまな状態に対する治療薬として有用である。
この系列由来の細胞の治療用途としては、抗腫瘍治療薬としてのキラー細胞、例えば、CD8+ T細胞またはナチュラルキラー(NK)細胞、おそらく特に腫瘍細胞を標的とする遺伝子操作レセプターをもつキラー細胞(例えば、キメラ抗原レセプターT細胞)、自己免疫性障害の処置のためのT-Reg、ならびに血小板、例えば、特定のがん患者または外傷患者などの凝固障害のある患者のための血小板、赤血球、例えば、貧血の処置および戦場または外傷医療のための赤血球、ならびにがんを含むさまざまな状態の処置のため、または抗体の産生のためのBリンパ球、がんの処置のための樹状細胞、例えば、プロベンジ(シプロイセルT)ならびにその他の使用が挙げられる。これらの細胞タイプのすべては、造血系の一部を含み、最終的に造血幹細胞、HSCに由来する。HSCは、骨髄のニッチに存在する希少な細胞タイプであり、例えば、がんに対する放射線療法処置後の致命的な放射線を受けた(完全に免疫系が除去された)動物の免疫系を再構成する能力によって定義される。これらは、表面レセプターCD34およびc-KIT(CD117)などのタンパク質マーカーの存在、ならびにT細胞レセプターなどの成熟造血性マーカーまたはBリンパ球によって成熟した抗原特異的抗体分子を産生することができる再構成された遺伝子座の両方の不在によって特定することができる。
図23は、造血系の細胞の概要を示す。この図において言及されるすべての細胞タイプは、明確に本発明の一部として提供され、本明細書に記載されている方法により生成することができる。
造血系の細胞またはそれらの後代は、少なくとも以下のものを含む:多能性造血幹細胞(「HSC」、血球芽細胞としても知られている);骨髄系共通前駆細胞(骨髄芽球、単芽球、赤芽球および巨核芽球を生じることができる);骨髄芽球(顆粒球(好中球、好酸球、好塩基球)になる);単芽球(組織においてマクロファージおよび樹状細胞に分化することができる単球になる);リンパ系共通前駆細胞;リンパ芽球;巨核球;血小板;赤芽球;赤血球;マスト細胞;好塩基球、好中球、好酸球を含む骨髄芽球由来細胞;単芽球由来細胞、例えば、単球およびマクロファージ;リンパ芽球由来細胞;大型顆粒リンパ球、例えば、ナチュラルキラー細胞(一般に、CD56+);小リンパ球、例えば、Tリンパ球およびBリンパ球;プラズマB細胞;ならびに樹状細胞(DC)、例えば、骨髄系DC(例えば、mDC-1もしくはさらにまれなmDC-2)またはプラズマ細胞様DC。
特定の実施形態において、造血系の細胞は、任意に骨髄芽球、リンパ芽球、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、単球、マクロファージ、CD56DIMナチュラルキラー細胞、CD56BRIGHTナチュラルキラー細胞、CD56highCD16±ナチュラルキラー細胞、CD56lowCD16highナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、CD161を発現するNKT細胞、CD4+T細胞、CD8+T細胞、メモリT細胞、B-2細胞、B-1細胞、メモリB細胞、プラズマB細胞、骨髄系樹状細胞、またはプラズマ細胞様DCから選択される。
CD4+T細胞は、Th1タイプ、Th2タイプ、Th17タイプ、Th9タイプ、Th22タイプ、またはTfhタイプのものであってもよい。制御性T細胞も、一般にCD4+である。
一実施形態において、FoxP3+制御性T細胞が提供される。
特定の実施形態において、造血系の細胞は、例えば、実施例7に示されるとおりの長期造血幹細胞(Long Term repopulating Haematopoietic Stem Cell)(LT-HSC)である。これらのLT-HSCは、CD34+CD49f+CD90+CD38-CD45RA- LT-HSCであってもよい。
いくつかの実施形態において、造血系の細胞は、CD7+リンパ系前駆細胞である。これらの前駆細胞は、それぞれ14または21日間分化させられて、ナチュラルキラーまたはCD3+CD4-CD8+TCR+細胞傷害性T細胞を生成し、これも特定の実施形態において提供される。
CD8+ T細胞がいくつかの実施形態において提供される。これらは、CD8+エフェクター細胞またはCD8+メモリ細胞であってもよい。CD8+エフェクターT細胞の例は、CD8+CD45RA+エフェクター細胞、例えば、CD8+CD45RA+CD62L-CCR7-CD45RO-細胞である。CD8+メモリT細胞の例は、CD8+CD45RA+CD62L+CCR7+CD45RO+細胞である。
いくつかの実施形態において、造血系の細胞は、CD3+CD8+TCR+細胞傷害性T細胞である。
ナチュラルキラー細胞は、特定の実施形態では、CD56+ナチュラルキラー細胞、CD56DIMナチュラルキラー細胞、CD56BRIGHTナチュラルキラー細胞、CD56highCD16±ナチュラルキラー細胞、またはCD56lowCD16highナチュラルキラー細胞であってもよい。いくつかの実施形態において、NK細胞は、CD56、CD16、IL2-RβおよびCD94が陽性である。
B細胞は、未成熟B細胞または成熟B細胞であってもよい。未成熟B細胞は、CD19、CD20、CD34、CD38、およびCD45Rを発現するが、IgMは発現しない。最も成熟したB細胞に関する重要なマーカーとしては、IgMおよびCD19が挙げられる。活性化B細胞は、アポトーシスの制御因子であるCD30を発現する。プラズマB細胞は、CD19発現を失うが、CD78を得、これは、これらの細胞を定量するために使用される。メモリB細胞は、CD20およびCD40発現を使用して免疫表現型が決定可能である。細胞は、細胞表面に存在する免疫グロブリンのタイプにかかわらず、CD80およびPDL-2を使用してさらに分類可能である(Zuccarino-Catania GV et al. Nat Immunol. 2014.)。
B細胞は、B-2細胞、B-1細胞、メモリB細胞またはプラズマB細胞であってもよい。B細胞(プラズマ細胞を除いて)は、一般にIgM+CD19+である。活性化B細胞は、一般にCD19+CD25+CD30+である。一部のプラズマ細胞は、IgG、CD27、CD38、CD78、CD138およびCD319が陽性である一方で、他のプラズマ細胞は、IL-6が陽性であるか、またはCD138が陽性であると特徴づけられる場合もある。さらなる実施形態において、細胞は、濾胞性B細胞(例えば、IgG、CD21、CD22およびCD23が陽性)であってもよい。さらに別の実施形態において、B細胞は、制御性B細胞であり、これは、IgD、CD1、CD5、CD21、CD24、TLR4が陽性である場合もあり、またはIL-10およびTGF-βが陽性である場合もある。いくつかの実施形態において、B細胞は、メモリ細胞、例えば、IgA、IgG、IgE、CD20、CD27、CD40、CD80、PDL-2が陽性のもの、またはCXCR3、CXCR4、CXCR5およびCXCR6が陽性のメモリB細胞である。
造血系の典型的な細胞は、造血幹細胞(HSC)である。これらの細胞は、通常、CD34+多能性細胞であると定義される。CD34+CD43+ HSCも提供される。本発明の細胞は、HSCおよびHSCから分化可能な細胞と特徴づけることができる。本発明の細胞は、骨髄系細胞またはリンパ球様細胞であってもよい。
HSCの骨髄芽球またはリンパ芽球への分化は、骨髄で起こる。
骨髄系共通前駆細胞は、単球(末梢血)、マクロファージ(組織)、ならびに骨髄芽球および得られる顆粒球(血液では好中球、好酸球、好塩基球であるが、組織ではマスト細胞が存在する)を含む骨髄系細胞を生じることになる。
リンパ芽球(リンパ系共通前駆細胞)は、リンパ球(TおよびB細胞)ならびにNK細胞を形成することになる。CD7は、骨髄芽球に対する通常のマーカーではないが、T細胞の発生過程でそれが見られる。それは、骨髄性白血病において見られるため、その発現は、骨髄系細胞においては異常である。中でも一般的な骨髄系前駆細胞マーカーは、CD36、CD163およびCCR2である。
免疫系の機能細胞は、造血系のものである。これらの免疫細胞としては、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、樹状細胞、マクロファージ、単球および顆粒球が挙げられる。T細胞としては、CD4+T細胞(「ヘルパーT細胞」と広く呼ばれることが多い)、マーカーFoxP3によって特徴づけられることが多い制御性T細胞(Treg)、CD8+ T細胞(例えば、CD8+細胞傷害性Tリンパ球)を挙げることができる。造血系由来の別の細胞は好中球である。造血系由来のさらに別の細胞はマクロファージである。これらの細胞のそれぞれは、任意に遺伝子操作されていても、または別の方法で改変されていてもよい。特に、細胞は、キメラ抗原レセプターを発現して、CAR-T細胞、CAR-NK細胞、または任意の他のCAR-改変免疫細胞を形成するよう改変されてもよい。キメラ抗原レセプターは、一般に標的細胞、通常、腫瘍細胞上のタンパク質または他のマーカーに向けられる。一般的な標的タンパク質は、CD19であり、これは、白血病を処置するためにCAR-細胞(例えば、CAR-T細胞)を標的とする。本発明による造血系の対象の他の細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。治療に使用される場合、これらの細胞のそれぞれが一般に患者と同種異系のものである。それでもなお、状況によって、細胞は、患者の自己由来のものであってもよく、例えば、CAR-TまたはCAR-NK療法においてなど患者細胞が抽出され、操作され、再投与される。
赤血球(red blood cell)(赤血球(erythrocyte))も造血系の細胞である。
樹状細胞(DC)は、骨髄系DC、例えば、mDC-1またはさらにまれなmDC-2であってもよい。DCはまた、プラズマ細胞様DCであってもよい。マーカーBDCA-2、BDCA-3、およびBDCA-4は、DCタイプ間で識別するために使用することができる。リンパ系および骨髄系DCは、それぞれリンパ系および骨髄系前駆細胞から進化するため、造血系起源のものである。
一実施形態において、本発明の細胞は、赤血球/骨髄およびTリンパ系の潜在性を有するCD34+細胞である。別の実施形態において、細胞は、赤血球/骨髄系前駆細胞であるCD43+細胞である。さらなる実施形態において、細胞は、CD45+白血球である。
一実施形態において、細胞は、CD5および/またはCD7を発現しないT細胞である。他の実施形態において、T細胞は、T細胞前駆細胞であり、CD5および/またはCD7を発現する。
造血系の細胞は、治療に有用である。例えば、がん治療に使用するためのCD8+ CTLおよびNK細胞が知られている(特にCARを用いて改変された場合)。好中球は、がん処置および感染性疾患の処置を含む多くの治療において有用である。自己免疫療法のためのTregが開発中である。免疫細胞、例えば、CD8細胞、NKならびにB細胞(およびそれによって産生された抗体)は、当然、細菌感染症、真菌感染症およびウイルス感染症を含む感染性疾患の処置にも有用である。
T細胞免疫は、多くのウイルス病原体の抑制に寄与するため、ウイルス特異的T細胞(VST)を用いた養子免疫療法は、特に、免疫不全患者において、深刻なウイルス性疾患と闘う論理的で、効果的な方法であった。いくつかの実施形態において、ウイルス、例えば、コロナウイルスまたは他のウイルス、例えば、サイトメガロウイルス(CMV)、アデノウイルス(AdV)、エプスタインバーウイルス(EBV)、ヒトヘルペスウイルス6(HHV6)およびBKウイルスは、Riddell and Greenberg “Principles for adoptive T cell therapy of human viral diseases” Annu Rev Immunol. 1995;13:545-86、およびさらに最近のOttaviano, Giorgio et al. “Adoptive T Cell Therapy Strategies for Viral Infections in Patients Receiving Haematopoietic Stem Cell Transplantation.” Cells vol. 8,1 47. 14 Jan. 2019に記載されている養子T細胞療法を使用して処置される。
ウイルス特異的Tリンパ球投与によるウイルス特異的な免疫の回復は、かなりの毒性または効果のない長期保護を特徴とする従来の薬物に対する魅力的な代案を提供した。大半の研究は、同種異系の幹細胞ドナー由来のウイルス特異的T細胞(VST)を使用し、部分的HLA適合ドナー由来の貯蔵されたVSTの使用は、多施設環境で有効性を示してきた。したがって、このアプローチは、患者がVST療法を受ける時間を短縮することができ、よって利用しやすさを向上させた。生存転帰を向上させるために、抗ウイルス特異的T細胞療法が現在、臨床開発中である。
したがって、本発明の方法によりもたらされる抗ウイルスT細胞療法が提供される。これは、一般に、1つ以上のウイルス抗原によって刺激されたか、または一般にウイルス抗原を標的とするキメラ抗原レセプターを使用して、標的ウイルスを認識するよう操作された、本発明によるCD4+および/またはCD8+細胞を含んでもよい。
本発明により作製されるT細胞は、任意にコロナウイルスを含んでもよい、複数の異なるウイルスに対して特異性を有してもよい。多ウイルス特異的T細胞は、当該技術分野において知られており、例えば、サイトカイン捕捉技術(Kallay et al, “Early experience with CliniMACS prodigy CCS (IFN-gamma) system in selection of virus-specific T cells from third-party donors for pediatric patients with severe viral infections after hematopoietic stem cell transplantation”. J Immunother. 2018;41(3):158-63)による直接的な単離を使用して生成され、さらにCD154を発現する多病原体特異的T細胞が磁気細胞分離(Khanna et al “Generation of a multipathogen-specific T-cell product for adoptive immunotherapy based on activation-dependent expression of CD154”. Blood. 2011;118(4):1121-31)により直接単離されるプロトコルでも生成されてきた。
抗ウイルスT細胞は、一般に同種異系のものであり、大規模で生成および保管することができ、任意に例えば、凍結される場合は長期に保管することができ、これは、特に伝染性疾患のアウトブレイク、例えば、エピデミックまたはパンデミック時に非常に多くの処置を提供するのに有用である。
いくつかの実施形態において、処置は、コロナウイルスによる疾患(「Covid」)、例えば、Covid-19に対するものである。CD4+および/またはCD8+T細胞は、一般に、主要組織適合抗原(例えば、MHCクラスIまたはII)と結合したコロナウイルス由来のペプチドを認識し、それと結合することになる。このペプチドは、外部のペプチド、例えば、スパイクタンパク質、または内部のタンパク質、例えば、RNA結合タンパク質が可能であろう。したがって、この実施形態は、特にCovid-19またはコロナウイルスが原因の他の疾患の処置における、治療的使用のためのウイルス特異的T細胞集団を提供する。
RuellaおよびKenderian(BioDrugs. 2017 Dec;31(6):473-481)によって述べられているとおり、同種異系のウイルス特異的T細胞を使用した成功実績は、同種異系のすぐに利用できるCAR-T細胞の開発に対する説得力のある論理的根拠を提供する。第三者の出願、すぐに利用できるウイルス特異的T細胞は、とりわけ、同種異系移植後のウイルス感染症の予防および処置における有効な戦略であることが証明された。したがって、本発明のCAR-T細胞はまた、抗ウイルス療法として使用されてもよい。
他の実施形態において、本発明のNK細胞は、ウイルス性疾患、例えば、Covid-19などのコロナウイルスによる疾患を処置することができる。これらのNK細胞は、任意に、コロナウイルスなどのウイルスを標的とするレセプターを含むCAR-NK細胞であってもよい。NK細胞は、例えば、IL-15を発現するよう、さらに操作されてもよい。
いくつかの実施形態において、本発明によるiPSC由来のHSCから以下の細胞が生成される:
T細胞、任意にCD8+、CD4+もしくは制御性T細胞(Treg)、例えば、FoxP3+ Treg;
B細胞;
NK細胞;
赤血球;
好中球;
樹状細胞または
マクロファージ。
T細胞、任意にCD8+、CD4+もしくは制御性T細胞(Treg)、例えば、FoxP3+ Treg;
B細胞;
NK細胞;
赤血球;
好中球;
樹状細胞または
マクロファージ。
いくつかの実施形態において、本発明のHSCを含むプロセスにおいて血小板が形成される。
一実施形態において、CAR-T細胞の治療用生成物が生成される。これは、同種異系のものであってもよい。ここでは、本方法の生成物として形成されたT細胞は、その後、改変される。別の実施形態は、例えば、同種異系療法用のNK細胞の形成を提供する。本明細書に記載されている方法により生成されたNK細胞は、任意に、例えば、遺伝子操作によって、改変される。一般に、所望の改変を有する適したT細胞またはNK細胞クローンの選択に続いて、工業的サイズのバッチを生成するスケールでクローンを増殖させるための、条件付き不死化剤(例えば、c-Myc-ERの場合、タモキシフェンまたは4-OHT)の添加を使用した細胞数のさらなる拡大が行われる。そのような細胞改変としては、以下のものが挙げられる:
a.キメラ抗原レセプター、例えば、任意に適したプロモーターの制御下でCARをコードする遺伝子をコードするベクターを使用した、本発明の形成されたT細胞のトランスフェクションにより発現される、以下に限定されないCD19、CD20、CD1またはMR1を含むキメラ抗原レセプター
b.CARタンパク質の発現を制御するための改変
c.患者に対する毒性を低減するための改変
d.患者が投与後に重篤な有害事象、例えば、サイトカインストームに苦しむ場合に、自殺遺伝子を導入するための改変。
a.キメラ抗原レセプター、例えば、任意に適したプロモーターの制御下でCARをコードする遺伝子をコードするベクターを使用した、本発明の形成されたT細胞のトランスフェクションにより発現される、以下に限定されないCD19、CD20、CD1またはMR1を含むキメラ抗原レセプター
b.CARタンパク質の発現を制御するための改変
c.患者に対する毒性を低減するための改変
d.患者が投与後に重篤な有害事象、例えば、サイトカインストームに苦しむ場合に、自殺遺伝子を導入するための改変。
別の実施形態において、本明細書に記載されるとおりに、本発明のHSCからB細胞が形成される。B細胞は、その後、抗体(または抗体フラグメント)を生成するために使用され、培養培地中に不死化因子(例えば、4-OHT)を維持することによって不死化状態に維持される。
いくつかの実施形態において、本発明により生成される造血系の細胞は、目的とするタンパク質、糖タンパク質、またはペプチドを生成するために使用される。これは、生物学的治療薬である場合がある。
いくつかの実施形態において、本発明により生成される造血系の細胞は、細胞外小胞、一般にエクソソームを生成するために使用される。
いくつかの実施形態において、本発明により生成される造血系の細胞は、核酸薬物、例えば、siRNAまたはmRNAを生成するために使用される。
本明細書に記載されている任意の療法の組み合わせが提供される。単独、および互いに組み合わせた療法のそれぞれは、他の治療用薬剤と組み合わされてもよい。一実施形態において、本発明により生成される治療用細胞は、例えば、チェックポイント阻害剤、例えば、抗PD1抗体、抗PD-L1抗体、抗TIM3抗体、抗LAG3抗体、または抗CTLA4抗体であってもよい異なる免疫療法と組み合わされる。
いくつかの実施形態において、がんを処置するための併用療法は、本発明により生成されるT細胞(例えば、CD8+ T細胞)およびチェックポイント阻害剤、例えば、抗PD1抗体、抗PD-L1抗体、抗TIM3抗体、抗LAG3抗体、または抗CTLA4抗体を含む。特定の併用療法としては、以下のものが挙げられる:CAR-T細胞および抗PD1抗体;CAR-T細胞および抗PDL1抗体;CAR-T細胞および抗CTLA4抗体。他の併用療法としては、本明細書に記載されている他の免疫細胞、例えば、CAR-NK細胞および抗PD1抗体;CAR-NK細胞および抗PDL1抗体;CAR-NK細胞および抗CTLA4抗体;T細胞および抗PD1抗体;NK細胞および抗PD1抗体を挙げることができる。
一実施形態において、本発明によるTregは、別の治療用薬剤と組み合わされてもよい。Tregは、一般にFoxP3+ Tregである。併用療法の例は、免疫抑制薬または抗炎症薬と組み合わされるTregである。
本発明によって生成可能な造血系の多くの他の細胞タイプが以下に示される。
骨髄系前駆細胞、例えば、骨髄系・赤血球系前駆細胞(Myeloid-erythroid progenitor)(MEP、赤血球および単球の前駆細胞、以下)、および赤血球の単能性前駆細胞である赤芽球。赤芽球は、インビトロで増殖させるのが難しい。赤芽球のスケーラブルな増殖および凍結保存の後に続く輸血のための赤血球(red blood cell)(赤血球(erythrocyte))への分化は、広範な医学的適用可能性を有し、現行の献血システムと関連する多くの問題を改善するであろう(Focosi and Amabile, 2018, in Cells v7 2;Bernecker et al,. 2019 Stem Cells Dev v28 1540-51によって概説される)。
血小板のための巨核球。血小板は、巨核球由来の小さな脱核した血液構造であり、止血に極めて重要な役割を有する。現在、これらは、がん化学療法もしくは放射線療法または供血からの大外傷などの状態が原因の出血性合併症の処置のために献血から回収される。しかしながら、これらは、非常に短い保存可能期間(5日)を特徴とし、このことは、供給の大規模な多数ドナーのシステムと相まって、利用可能性および安全性に関する問題につながる可能性がある。血小板の単能性前駆細胞である巨核球(MK)は、成体前駆細胞タイプの例であり、これは、骨髄における希少な部分集団である。巨核球は、iPSCから作り出すことができ(Eto et al., 2010, J Exp Med, 207 2817-30)、凍結保存可能であるが、細胞増殖の低いレベルに関する問題が確認されている。hiPSC由来のMKをスケーラブルに増殖させ、必要に応じた血小板生成のためにそれらを冷凍保存する能力は、著しい利益になるであろう。
骨髄芽球は好中球の起源となる。
a.好中球(およびそれらと骨髄芽球の間の前駆細胞)。好中球は、iPSCのCD34+ HSCへの分化(以下参照)の後、SCF、IL-6、トロンボポエチン、IL-3、Flt-3リガンドの存在下においてOP9間質細胞上でHSCを培養し、その後、OP9細胞上のそれらをG-CDFの存在下において成熟させることによって生成されてもよい(Brault et al, 2012, Bioresearch Open Access 3 311-26)。
a.好中球(およびそれらと骨髄芽球の間の前駆細胞)。好中球は、iPSCのCD34+ HSCへの分化(以下参照)の後、SCF、IL-6、トロンボポエチン、IL-3、Flt-3リガンドの存在下においてOP9間質細胞上でHSCを培養し、その後、OP9細胞上のそれらをG-CDFの存在下において成熟させることによって生成されてもよい(Brault et al, 2012, Bioresearch Open Access 3 311-26)。
単芽球は単球の起源となる。
b.単球。単球(マクロファージの前駆細胞)は、多段階プロトコルを使用してiPSCから分化させられることが示されてきた。その多段階プロトコルによってアクチビン-A、BMP4およびCHIR99021の作用により多能性細胞から形成される中胚葉が、SB431542、VEGF、bFGFおよびSCFの添加によって造血性上皮(hemogenic epithelium)にさらに分化させられる。それに続くTPOならびにインターロイキン-3、インターロイキン-6、およびM-CSFによる処理は、骨髄系前駆細胞へのさらなる分化を誘導し、その後、マクロファージを成熟させる(Cao et al., 2019, Stem Cell Reports 12 1282-97)。
i.マクロファージ;例えば、iPSC由来の中胚葉を含む胚様体の形成に続く、Mukherjeeおよび同僚(2018)によってMeth Mol Biol 1784 13-28に記載されているとおりの、M-CSFおよびインターロイキン-3の存在下における多段階インビトロ培養、または共培養(Brault et al, 2012, Bioresearch Open Access 3 311-26)もしくはバイオリアクター(Ackermann et al., 2018 Nature Comms 9 5088)を含む類似の方法による。
ii.ミクログリア(脳マクロファージ)。
b.単球。単球(マクロファージの前駆細胞)は、多段階プロトコルを使用してiPSCから分化させられることが示されてきた。その多段階プロトコルによってアクチビン-A、BMP4およびCHIR99021の作用により多能性細胞から形成される中胚葉が、SB431542、VEGF、bFGFおよびSCFの添加によって造血性上皮(hemogenic epithelium)にさらに分化させられる。それに続くTPOならびにインターロイキン-3、インターロイキン-6、およびM-CSFによる処理は、骨髄系前駆細胞へのさらなる分化を誘導し、その後、マクロファージを成熟させる(Cao et al., 2019, Stem Cell Reports 12 1282-97)。
i.マクロファージ;例えば、iPSC由来の中胚葉を含む胚様体の形成に続く、Mukherjeeおよび同僚(2018)によってMeth Mol Biol 1784 13-28に記載されているとおりの、M-CSFおよびインターロイキン-3の存在下における多段階インビトロ培養、または共培養(Brault et al, 2012, Bioresearch Open Access 3 311-26)もしくはバイオリアクター(Ackermann et al., 2018 Nature Comms 9 5088)を含む類似の方法による。
ii.ミクログリア(脳マクロファージ)。
NK細胞およびTまたはBリンパ球を生成するためのリンパ系前駆細胞(下記実施例を参照)。
さまざまな造血系の細胞を生成するための例となる方法の概要を下記表に示す。それぞれの細胞タイプを生成するためのこの表の各行に示される方法欄の情報は、本発明の実施形態として明確に示される。最後の欄の参考文献は、さらなる手引きを提供する。
例えば、NK細胞は、SCF、VEGF、BMP4とともに培養して、CD34+/CD43+細胞を作り出した後、IL-3、IL-15、SCF、FLT3リガンドとの培養、および人工APC上での増殖によって本発明のiPSCから分化させることができる。
別の例において、T細胞は、間質細胞(OP9)上での共培養し、その後、FLT3-L、IL-7、SCFの存在下でのOP9-DLL1間質細胞に移して共培養することによって本発明のiPSCから誘導することができる。
さらなる例において、B細胞は、IL-7、IL-3、FLT3-L、SCFの存在下、Notchリガンドの非存在下において培養することによって本発明のiPSCから誘導することができる。
下記表から引用するさらに別の例において、赤血球は、IL-3、SCF、IGF-1、EPO、デキサメタゾンの存在下において培養することによって本発明のiPSCから誘導することができる。
下記表に記載されている他の実施形態において、本発明の赤血球細胞、巨核球および骨髄系細胞は、それぞれEPO、IL-1βまたはG-CSF(もしくはGM-CSF)の存在下においてHSCを培養することによって本発明のHSCから誘導することができる。
いくつかの実施形態において、本発明のiPSCは、FLT3-L、IL-3、IL-7、SCF、TPOのうちの1つ、2つ、3つ、4つ、またはすべての存在下において培養して分化され、例えば、骨髄系細胞に分化される。
本発明の一部の実施形態において、CD31+/34+ HE細胞が提供される。これらは、iPSCにおいてGSK3を阻害することによってもたらされてもよい。これらのCD31+/34+ HE細胞は、FLT3-L、IL-3、IL-7、SCF、TPOと培養することによって(例えば、骨髄系細胞に)またはDLL-4発現間質細胞、SCF、FLT3-L、IL-3およびIL-7との共培養によって(例えば、リンパ球様細胞に)分化させることができる。
略語
HE 造血性内皮細胞(Hemogenic endothelium)
FLT3-L fms様チロシンキナーゼ3レセプターリガンド(FLT3リガンド)
SCF 幹細胞因子
bFGF 塩基性線維芽細胞成長因子、(別名FGF2)
TPO トロンボポエチン
EPO エリスロポエチン
ILx インターロイキン、例えば、IL6:インターロイキン-6
ucHSC 臍帯血造血幹細胞
HSC 造血幹細胞
mAb モノクローナル抗体
α 抗、例えば、α-CD3mAb=抗CD3モノクローナル抗体
HE 造血性内皮細胞(Hemogenic endothelium)
FLT3-L fms様チロシンキナーゼ3レセプターリガンド(FLT3リガンド)
SCF 幹細胞因子
bFGF 塩基性線維芽細胞成長因子、(別名FGF2)
TPO トロンボポエチン
EPO エリスロポエチン
ILx インターロイキン、例えば、IL6:インターロイキン-6
ucHSC 臍帯血造血幹細胞
HSC 造血幹細胞
mAb モノクローナル抗体
α 抗、例えば、α-CD3mAb=抗CD3モノクローナル抗体
多能性の誘導およびiPS細胞
高橋および山中が、同時に4つの遺伝子を導入することによってマウス線維芽細胞から胚性幹細胞と類似の特性を有する幹細胞を形成することができることを示したため、人工多能性細胞の形成は、当該技術分野において知られている(Cell. 2006; 126: 663-676)。この原理が2007年にヒト細胞に適用された(Takahashi et al Cell. 2007; 131: 861-872;Yu et al Science. 2007; 318: 1917-1920)。最近の概説が、Shi et al, Nature Reviews Drug Discovery volume 16, pages 115-130 (2017)によって提供される。
高橋および山中が、同時に4つの遺伝子を導入することによってマウス線維芽細胞から胚性幹細胞と類似の特性を有する幹細胞を形成することができることを示したため、人工多能性細胞の形成は、当該技術分野において知られている(Cell. 2006; 126: 663-676)。この原理が2007年にヒト細胞に適用された(Takahashi et al Cell. 2007; 131: 861-872;Yu et al Science. 2007; 318: 1917-1920)。最近の概説が、Shi et al, Nature Reviews Drug Discovery volume 16, pages 115-130 (2017)によって提供される。
iPSCは、一般に、特定のセットの多能性関連遺伝子の生成物、または「リプログラミング因子」を所与の細胞タイプに導入することによって誘導される。リプログラミング因子の元のセット(山中因子とも呼ばれる)は、転写因子Oct4、Sox2、cMyc、およびKlf4である。
iPS細胞の形成は、誘導に使用される転写因子に依存する。Oct-3/4およびSox遺伝子ファミリー(Sox1、Sox2、Sox3、およびSox15)の特定の生成物は、誘導プロセスに関与する非常に重要な転写制御因子として特定され、それが存在しないと誘導が不可能になる。しかしながら、Klfファミリー(Klf1、Klf2、Klf4、およびKlf5)、Mycファミリー(c-myc、L-myc、およびN-myc)、Nanog、およびLIN28の特定のメンバーを含む付加的な遺伝子が誘導効率を高めることが特定された。
「POU5F1」、「OCT4」および「OCT3/4」は、同じ転写因子に対する同義語である。これは、当該技術分野において一般的にOCT4と呼ばれる転写因子であるが、さらに最近、POU5F1(POUクラス5ホメオボックス1)と改名されている。これらの名称は、当業者には明白なとおり、本明細書においては同義に使用される。
リプログラミング因子は、細胞中に、当該技術分野において周知であるとおり、一般にウイルスまたはエピソームベクターを使用して導入される。細胞中にリプログラミング因子を導入するのに適したウイルスベクターとしては、レンチウイルス、レトロウイルスおよびセンダイウイルスが挙げられる。リプログラミング因子を導入するための他の技術としては、mRNAトランスフェクションが挙げられる。
例えば、Schlaeger et al Nat Biotechnol. 2015 Jan; 33(1): 58-63によって概説されるとおり、非組み込み型リプログラミング法が当該技術分野において知られている。センダイウイルスリプログラミングでは、リプログラミング因子のセットをコードする複製可能なRNAを標的細胞に形質導入するためにセンダイウイルス粒子が一般に使用される。エピソームリプログラミングでは、長期のリプログラミング因子の発現は、一般に分裂細胞においてエピソームプラスミドDNA複製を促進するエプスタインバーウイルス由来の配列によって達成される。mRNAリプログラミングでは、細胞は、一般にリプログラミング因子をコードするインビトロ転写mRNAによりトランスフェクションされ、外来性の核酸による自然免疫系の活性化を制限するために化学的手段が利用される場合が多い。mRNAの半減期は非常に短いため、hiPSCを誘導するためには、毎日のトランスフェクションが必要とされることが多い。
リプログラミング因子のトランスフェクションは、当該技術分野において既知のさまざまな方法において、例えば、リポフェクション、ヌクレオフェクションまたはエレクトロポレーションによって実現されてもよい。
下記の一実施例において、条件付きで不死のCTX0E03細胞は、「山中因子」、OCT4、L-MYC、KLF4およびSOX2、ならびにLIN28をコードする標準的な非組み込み型エピソームベクターを使用して多能性にリプログラミングされた。別の実施例において、OCT4単独でCTX0E03の多能性を誘導することが示されている。多能性を実現することが同じく確認された転写因子の組み合わせとしては、OCT4およびSOX2;OCT、KLF4およびSOX2;OCT4、KLF4、SOX2およびMYCが挙げられる。
特定の実施形態において、条件付き不死化細胞を多能性にリプログラミングするために、OCT4、L-MYC、KLF4およびSOX2のうちの1、2、3または4つ、ならびにLIN28が使用される。特定の実施形態において、OCT4ならびにL-MYC、KLF4およびSOX2のうちの1つ以上、ならびにLIN28が使用される。いくつかの実施形態において、これらの因子がcMYC-ERTAM条件付き不死化システムと組み合わせて使用される。
下記の別の実施例(実施例3)において、STR0C05細胞は、転写因子POU5F1、SOX2、KLF4、L-MYC、LIN28およびp53のドミナントネガティブインヒビターを発現するリプログラミングプラスミドpCE-hOCT3/4、pCE-hSK、pCE-hULおよびpCEmP53DDによりリプログラミングされた。したがって、特定の実施形態において、本発明による使用のための転写因子は、POU5F1、SOX2、KLF4、L-MYC、LIN28およびp53のドミナントネガティブ阻害因子を含んでも、またはそれらからなってもよい。当業者には明白であろうとおり、これらの1、2、3つ以上が除去されるか、または置き換えられてもよい。特定の実施形態において、POU5F1、SOX2、KLF4、L-MYC、LIN28およびp53のドミナントネガティブ阻害因子のうちの1、2、3、4つ以上が、条件付き不死化細胞を多能性にリプログラミングするために使用される。いくつかの実施形態において、これらの因子がc-myc-ERTAM条件付き不死化システムと組み合わせて使用される。
いくつかの実施形態において、MYC活性は、リプログラミングされる幹細胞においてc-myc-ERTAM導入遺伝子を活性化するために培地に4-OHTを供給することによってもたらされ、リプログラミングプロセスを促進する。したがって、特定の実施形態において、個別に添加されるMYCは必要ない。
条件付き不死化細胞
本発明は、条件付き不死化細胞を採取し、それが多能性表現型を有するよう誘導する。条件付き不死化細胞は、一般に条件付き不死化幹細胞、例えば、条件付き不死化成体幹細胞である。
本発明は、条件付き不死化細胞を採取し、それが多能性表現型を有するよう誘導する。条件付き不死化細胞は、一般に条件付き不死化幹細胞、例えば、条件付き不死化成体幹細胞である。
条件付き不死化細胞は、一般に哺乳動物のもの、より一般にヒトのものである。
幹細胞は、当該技術分野において知られている。幹細胞は、増殖する能力、生物の寿命を超えて自己維持または再生を示す能力およびクローン的に関連する後代を形成する能力を有する細胞である。本発明によりリプログラミングされた幹細胞は、一般に多能性細胞である。本発明によりリプログラミングされた幹細胞は、一般に成体(体細胞)幹細胞である。
本発明に使用するための幹細胞は、単離される。「単離される」という用語は、それが言及する細胞または細胞集団が天然の環境内にないことを示す。細胞または細胞集団は、周辺組織から実質的に分離されている。いくつかの実施形態において、細胞または細胞集団は、サンプルが少なくとも約75%、いくつかの実施形態において、少なくとも約85%、いくつかの実施形態において、少なくとも約90%、およびいくつかの実施形態において、少なくとも約95%幹細胞を含む場合に、周辺組織から実質的に分離されている。言い換えると、サンプルは、サンプルが約25%未満、いくつかの実施形態において、約15%未満、およびいくつかの実施形態において、約5%未満の幹細胞以外の材料を含む場合に、周辺組織から実質的に分離されている。そのようなパーセンテージの値は、重量パーセンテージを指す。この用語は、細胞が由来する生物から取り出されて、培養物中に存在する細胞を包含する。この用語はまた、細胞が由来する生物から取り出されて、その後、その生物に再び挿入された細胞も包含する。再び挿入された細胞を含む生物は、細胞が取り出された同じ生物であってもよく、または異なる生物であってもよい。
幹細胞は、一般に本発明により生成される後代細胞の任意の将来的なレシピエントと同種異系である。
本発明は、不死化因子の発現が治療に有効な幹細胞の生成に悪影響を及ぼすことなく制御され得る条件付き不死化幹細胞、例えば、幹細胞株を使用する。これは、細胞が活性化薬剤を供給されない場合に不活性である不死化因子を導入することによって実現されてもよい。そのような不死化因子は、c-mycERなどの遺伝子であってもよい。c-MycER遺伝子産物は、変異エストロゲンレセプターのリガンド結合ドメインと融合したc-Mycバリアントを含む融合タンパク質である。C-MycERのみが、合成ステロイド4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)の存在下において細胞増殖を駆動する(Littlewood et al. 1995)。このアプローチは、インビトロにおける神経幹細胞の制御された増殖を可能にすると同時に、c-Mycまたは神経幹細胞株中のそれをコードする遺伝子の存在に起因するホストの細胞増殖に対するインビボでの望ましくない影響(例えば、腫瘍形成)を回避する。
Mycがん遺伝子ファミリーの他のメンバーがc-Mycと同等の様式で条件付き不死化剤として使用されてもよい。したがって、不死化因子は、L-Myc、N-MycまたはV-Mycを含んでもよい。Mycがん遺伝子は、一般に、変異エストロゲンレセプターのリガンド結合ドメインと融合されて、L-MycER、N-MycERまたはV-MycERを形成することになる。本発明者らは、図24に示される、L-MYC-ERTAMコンストラクトを首尾よく作り出した。
MYC-ERTAMコンストラクトに関する特有の利点は、制御性および関連する安全性の特徴である。
条件付き不死化のために使用可能な別の遺伝子は、TERT(テロメラーゼ逆転写酵素)である。また、条件付き不死化はSV40ラージT抗原およびその温度感受性バリアントを使用して首尾よく達成された。例えば、国際公開第01/21790号パンフレット(ReNeuron Limited)に記載されているとおりのこれらのアプローチは、当該技術分野において知られている。
不死化遺伝子は、任意に、条件付きで不死化されるよう操作される細胞のゲノム内のセーフハーバー部位(safe harbour site)に組み込まれてもよい。セーフハーバーゲノム部位は、他の遺伝要素の発現に著しい変化を引き起こすことなく導入遺伝子が挿入され、発現され得る部位である。既知のセーフハーバー部位の例は、ヒト染色体19上のPPP1R12Cとしても知られているAAVS1である。セーフハーバーの別の例は、本明細書に記載されているCTX0E03細胞株のc-MycERTAM導入遺伝子に関する挿入部位であり、これは、ヒト染色体13q12.12上のSPATA13遺伝子内にある。CTX0E03細胞における挿入の正確な位置は、P末端からヌクレオチド24,083,331~332bpの間の(GRCh38)染色体13q12.12上である。ただし、例えば、その特定の部位の10kb以内、もしくは5kb以内、2.5kb以内、例えば、1000bp以内もしくは500bp以内のそのおおまかな領域の部位が本発明により標的とされる場合、同等の結果が得られる可能性があることが予測される。特定の実施形態において、改変のために標的とされる遺伝子座は、SPATA13遺伝子のイントロン内にある場合がある。さらなる実施形態において、遺伝子座は、SPATA13遺伝子の第3のイントロン内にある。一般に、遺伝子座は、Genbank受託番号BX648244のcDNAクローンの第3のイントロン内にある。さらに具体的には、遺伝子座は、染色体13q12.12上のP末端からヌクレオチド24,083,250~400bpの間の任意の場所、P末端からヌクレオチド24,083,300~350bpの間の任意の場所、またはP末端からヌクレオチド24,083,325~335bpの間の任意の場所にあってもよい。
挿入部位は、「GRCh38:13:24083331~24083332」と言及される。当業者には明白であろうとおり、GRCh38は、UCSCブラウザによって現在使用されているヒトゲノムリファレンスのバージョンを指す。
特定の実施形態において、条件付き不死化幹細胞は、以下のものであってもよい:
間葉系幹細胞、任意に骨髄由来幹細胞、子宮内膜再生細胞、間葉系前駆細胞または多能性成体前駆細胞から選択される;
神経幹細胞;
造血幹細胞、任意にCD34+細胞および/または臍帯血から単離されたか、あるいは任意にCD34+/CXCR4+細胞である;
非造血性臍帯血幹細胞(non-haematopoietic umbilical cord blood stem cell);あるいは
脂肪組織由来の間葉系幹細胞。
間葉系幹細胞、任意に骨髄由来幹細胞、子宮内膜再生細胞、間葉系前駆細胞または多能性成体前駆細胞から選択される;
神経幹細胞;
造血幹細胞、任意にCD34+細胞および/または臍帯血から単離されたか、あるいは任意にCD34+/CXCR4+細胞である;
非造血性臍帯血幹細胞(non-haematopoietic umbilical cord blood stem cell);あるいは
脂肪組織由来の間葉系幹細胞。
これらの実施形態のそれぞれにおいて、細胞は、一般に哺乳動物のもの、より一般にヒトのものである。
一般に、条件付き不死化幹細胞は、神経幹細胞、例えば、ヒト神経幹細胞である。
神経幹細胞は、発生の過程においてニューロン、星状細胞および乏突起膠細胞を生じ、成体の脳において多くの神経系細胞を置き換えることができる。本発明による特定の態様に使用するための典型的な神経幹細胞、とりわけ、神経系の表現型マーカー、Musashi-1、ネスチン、NeuN、クラスIII β-チューブリン、GFAP、NF-L、NF-M、微小管結合タンパク質(MAP2)、S100、CNPase、グリピカン、(とりわけ、グリピカン4)、神経型ペントラキシンII、神経型PAS1、神経成長関連タンパク質43、神経突起成長伸長タンパク質(neurite outgrowth extension protein)、ビメンチン、Hu、インターネキシン、04、ミエリン塩基性タンパク質およびプレイオトロフィンのうちの1つ以上を呈する細胞である。
神経幹細胞は、幹細胞株、すなわち、安定して分裂する幹細胞の培養物由来であってもよい。幹細胞株は、単一の定義されたソースを使用して大量で増殖させられてもよい。
好ましい条件付き不死化神経幹細胞株としては、CTX0E03、STR0C05およびHPC0A07神経幹細胞株が挙げられ、これらは、本特許出願の出願人、ReNeuron Limitedによって、European Collection of Animal Cultures(ECACC)、Vaccine Research and Production laboratories、Public Health Laboratory Services、Porton Down、Salisbury、Wiltshire、SP4 0JGに受託番号04091601(CTX0E03);受託番号04110301(STR0C05);および受託番号04092302(HPC0A07)で寄託された。これらの細胞の由来および起源は、欧州特許第1645626号明細書および米国特許第7416888号明細書に記載されており、ともに参照によってその全体が本明細書に組み込まれる。
CTX0E03(ECACC寄託番号04091601)
CTX0E03は、虚血性脳卒中および肢損傷の治療としての臨床試験中の神経幹細胞株である。これは、C-MYC-ERTAM融合タンパク質の組み込みによって制御可能に不死化され、この融合タンパク質は、ERTAMドメインの合成エストロゲン誘導体4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)との結合時に核に移動し、そこでC-MYCドメインが無限の細胞周期を助長する。C-MYC-ERTAMの発現は、細胞表現型に影響を及ぼさないようである。したがって、無制限に多くの患者が、「すぐに利用できる」同種異系療法としてCTXにより処置可能である。導入遺伝子は、4-OHTの除去時および/または患者への送達の除去時に発現停止することが示された。
CTX0E03は、虚血性脳卒中および肢損傷の治療としての臨床試験中の神経幹細胞株である。これは、C-MYC-ERTAM融合タンパク質の組み込みによって制御可能に不死化され、この融合タンパク質は、ERTAMドメインの合成エストロゲン誘導体4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)との結合時に核に移動し、そこでC-MYCドメインが無限の細胞周期を助長する。C-MYC-ERTAMの発現は、細胞表現型に影響を及ぼさないようである。したがって、無制限に多くの患者が、「すぐに利用できる」同種異系療法としてCTXにより処置可能である。導入遺伝子は、4-OHTの除去時および/または患者への送達の除去時に発現停止することが示された。
CTX0E03細胞株の細胞は、以下の培養条件において培養されてもよい:
・ヒト血清アルブミン 0.03%
・トランスフェリン、ヒト 5μg/ml
・プトレシン二塩酸塩 16.2μg/ml
・インスリンヒト組み換え型 5μ/ml
・プロゲステロン 60ng/ml
・L-グルタミン 2mM
・亜セレン酸ナトリウム(セレン) 40ng/ml
加えて、細胞増殖のための塩基性線維芽細胞成長因子(10ng/ml)、上皮成長因子(20ng/ml)および4-ヒドロキシタモキシフェン(100nM)。細胞は、4-ヒドロキシタモキシフェンの除去によって分化させることができる。一般に、細胞は、5% CO2/37℃または5%、4%、3%、2%もしくは1% O2の低酸素条件下のいずれかで培養することができる。これらの細胞株は、首尾よく培養するために血清を必要としない。血清は、多くの細胞株の順調な培養に必要とされるが、多くの混入物を含む。CTX0E03、STR0C05もしくはHPC0A07神経幹細胞株、または血清を必要としない任意の他の細胞株の別の利点は、血清による汚染が回避されることである。本発明の一部の実施形態において、例えば、リプログラミングのステップおよび人工多能性幹細胞の培養のステップのためにE8培地を使用することによって、系内に血清がない状態を維持することができる。
・ヒト血清アルブミン 0.03%
・トランスフェリン、ヒト 5μg/ml
・プトレシン二塩酸塩 16.2μg/ml
・インスリンヒト組み換え型 5μ/ml
・プロゲステロン 60ng/ml
・L-グルタミン 2mM
・亜セレン酸ナトリウム(セレン) 40ng/ml
加えて、細胞増殖のための塩基性線維芽細胞成長因子(10ng/ml)、上皮成長因子(20ng/ml)および4-ヒドロキシタモキシフェン(100nM)。細胞は、4-ヒドロキシタモキシフェンの除去によって分化させることができる。一般に、細胞は、5% CO2/37℃または5%、4%、3%、2%もしくは1% O2の低酸素条件下のいずれかで培養することができる。これらの細胞株は、首尾よく培養するために血清を必要としない。血清は、多くの細胞株の順調な培養に必要とされるが、多くの混入物を含む。CTX0E03、STR0C05もしくはHPC0A07神経幹細胞株、または血清を必要としない任意の他の細胞株の別の利点は、血清による汚染が回避されることである。本発明の一部の実施形態において、例えば、リプログラミングのステップおよび人工多能性幹細胞の培養のステップのためにE8培地を使用することによって、系内に血清がない状態を維持することができる。
CTX培養培地は、所望の場合、c-myc-ERTAM導入遺伝子によりMYC活性を得るために、4-OHTが加えられても、または加えられなくてもよい。
CTX0E03細胞株の細胞は、元は12週ヒト胎児の大脳皮質由来の多能性細胞である。CTX0E03細胞株に関する単離、製造およびプロトコルは、Sindenらによって詳細に記載されている(米国特許第7,416,888号明細書および欧州特許第1645626号明細書)。CTX0E03細胞は、「胚性幹細胞」ではない。すなわち、それらは、胚盤胞の内部細胞塊由来の多能性細胞ではない。元の細胞の単離は、胚の破壊を招かなかった。増殖培地では、CTX0E03細胞は、ネスチン陽性で、GFAP陽性細胞は低いパーセンテージである(すなわち、集団は、GFAPに関して陰性である)。
CTX0E03は、レトロウイルス感染によって送達されたc-mycER導入遺伝子の単一コピーを含むクローン細胞株であり、4-OHT(4-ヒドロキシタモキシフェン)によって条件付きで制御される。C-mycER導入遺伝子は、4-OHTの存在下において細胞増殖を刺激する融合タンパク質を発現するため、4-OHTの存在下で培養される場合、制御された増殖を可能にする。この細胞株は、クローンであり、培養において急速に増え(倍加時間50~60時間)、正常なヒト核型(46XY)を有する。これは、遺伝学的に安定で、大量に増殖させることができる。この細胞は、安全で、腫瘍形成性ではない。成長因子および4-OHTの非存在下では、この細胞は、増殖停止を受けて、ニューロンおよび星状細胞に分化する。虚血性損傷脳に移植されると、これらの細胞は、組織損傷の領域にのみ遊走する。
CTX0E03細胞株の開発は、臨床的使用のための一貫した生産のスケールアップを可能にした。保存された材料からの細胞の生産は、商業用途用の量で細胞を形成することを可能にする(Hodges et al, 2007)。
CTX0E03医薬品は、生細胞の得られたばかりのものとして(PISCES試験の場合と同様に)または米国特許第9265795号明細書に記載され、PISCES II試験に使用されたとおり、凍結懸濁液として提供されてもよい。医薬品は、一般に≦37の継代のCTX0E03細胞を含む。
CTX臨床医薬品は、一般に何か月もの品質保持期間を有する、溶媒を含まない賦形剤中の「すぐに利用できる」凍結保存製品(例えば、米国特許第9265795号明細書に記載されているとおり)として製剤化される。この製剤は、一般にトロロクス(6-ヒドロキシ-2,5,7,8-テトラメチルクロマン-2-カルボン酸)、Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Cl-、H2PO4
-、HEPES、ラクトビオナート、スクロース、マンニトール、グルコース、デキストラン-40、アデノシンおよびグルタチオンを含む。これらの賦形剤のうちの1つ以上、例えば、2、3または4つが任意に除去されても、または置き換えられてもよい。一般に、本製剤は、両性非プロトン溶媒、特に、DMSOを含まない。
幹細胞製品に対する臨床発売基準は、一般に無菌性、純度(細胞数、細胞生存率)、ならびに臨床製品発売のため、または規制当局に要求される情報のために必要とされる同一性、安定性、および効力の多くの他の試験の基準を含む。CTX0E03に利用される試験の概要を、下記表1に示す。
CTX0E03細胞株は、ヒトPBMCアッセイを使用して免疫原性でないことが以前に証明された。免疫原性がないことは、細胞がホスト/患者免疫系による排除を回避するのを可能にし、それによって有害な免疫および炎症応答なくその治療効果を発揮する。
Pollock et al 2006は、脳卒中のラットモデル(MCAo)におけるCTX0E03の移植が、移植後6~12週に感覚運動機能および粗大運動の非対称性の両方において統計学的に有意な改善をもたらしたことを示している。これらのデータは、CTX0E03が治療用細胞株として開発するために必要な適した生物学的および製造特性を有することを示す。
Stevanato et al 2009は、CTX0E03細胞が、EGF、bFGFおよび4-OHT除去後インビトロにおいて、およびMCAoラット脳に移植後インビボにおいての両方でc-mycERTAM導入遺伝子発現をダウンレギュレートしたことを確認している。インビボにおけるc-mycERTAM導入遺伝子のサイレンシングは、潜在的な臨床用途に対してCTX0E03細胞のさらなる安全性の特徴をもたらす。
Smith et al 2012は、脳卒中(一過性中大脳動脈閉塞)のラットモデルにおけるCTX0E03の前臨床効力試験について記載している。この結果は、CTX0E03移植が、行動機能障害を3か月の時間枠にわたって大きく回復させ、この効果は、その移植の部位に特異的であることを示す。病変のトポロジーが、回復における潜在的に重要な要素であり、線条体に限られた脳卒中はより大きな領域の損傷と比較して良好な予後を示す。
STR0C05(ECACC寄託番号04110301)
このc-MycERTAM形質導入神経幹細胞株は、12週胎児の線条体由来であった。この株は、bFGF、EGFおよび4-ヒドロキシタモキシフェンの存在下の合成無血清「ヒト培地」を使用して、ラミニンコーティング培養フラスコにおいて維持される。通常の培養において、この細胞株は、3~4日の倍加時間を有するが、短期間培養では、20~30時間の倍加時間が見られた。
このc-MycERTAM形質導入神経幹細胞株は、12週胎児の線条体由来であった。この株は、bFGF、EGFおよび4-ヒドロキシタモキシフェンの存在下の合成無血清「ヒト培地」を使用して、ラミニンコーティング培養フラスコにおいて維持される。通常の培養において、この細胞株は、3~4日の倍加時間を有するが、短期間培養では、20~30時間の倍加時間が見られた。
増殖培地において、この細胞は、ネスチン陽性、ベータ-IIIチューブリン陰性であり、GFAP陽性細胞は低いパーセンテージである。7日間の分化後、ベータIIIチューブリンの低レベル発現およびGFAPの高発現を伴いネスチンがダウンレギュレートされ、これは、この細胞株の大部分が星状細胞になること示唆する。
この細胞株は、遺伝学的に正常、男性XYで、50集団倍加にわたって安定なものである。
ここに記載される株は、臨床的使用に指定された株を発展させるのに適した品質が保証された条件下で誘導された。ソース材料として、ヒト神経幹細胞は、機械的粉砕と組み合わせたトリプシンによる酵素消化によって、妊娠12週の胎児GS006の線条体から死後に単離された。培養において確立されると、これらの一次神経系細胞は、c-MycERTAMがん遺伝子によるレトロウイルストランスダクションによって形質転換され(上でCTX0E03細胞株に関して記載されているとおり)、ある範囲のクローン性および混合性集団細胞株が単離された。この系統のすべての株は、ラミニンコーティング培養製品において、ヒト培地(HM);DMEM:F12プラス以下に示される指定された補充物を使用して誘導された。
ヒト培地(HM)
以下に列挙される成分を加えたDMEM:F12:
ヒト血清アルブミン 0.03%。
トランスフェリン、ヒト 100μg/ml。
プトレシン二塩酸塩 16.2μg/ml。
インスリン、ヒト組み換え型 5μg/ml。
L-チロキシン(T4) 400ng/ml。
トリヨードサイロニン(T3) 337ng/ml。
プロゲステロン 60ng/ml。
L-グルタミン 2mM。
亜セレン酸ナトリウム(セレン) 40ng/ml。
ヘパリン、ナトリウム塩 10単位/ml。
コルチコステロン 40ng/ml。
加えて、細胞増殖のための塩基性線維芽細胞成長因子(10ng/ml)および上皮成長因子(20ng/ml)。
以下に列挙される成分を加えたDMEM:F12:
ヒト血清アルブミン 0.03%。
トランスフェリン、ヒト 100μg/ml。
プトレシン二塩酸塩 16.2μg/ml。
インスリン、ヒト組み換え型 5μg/ml。
L-チロキシン(T4) 400ng/ml。
トリヨードサイロニン(T3) 337ng/ml。
プロゲステロン 60ng/ml。
L-グルタミン 2mM。
亜セレン酸ナトリウム(セレン) 40ng/ml。
ヘパリン、ナトリウム塩 10単位/ml。
コルチコステロン 40ng/ml。
加えて、細胞増殖のための塩基性線維芽細胞成長因子(10ng/ml)および上皮成長因子(20ng/ml)。
STR0C05増殖特性
通常の培養条件下において、細胞は、T180培養フラスコ中で凍結ストック、一般には2~4百万細胞から増殖させる。数回の培地変更後、コンフルエントなときに細胞を継代する。経過記録から、STR0C05に関する集団倍加時間は、下記グラフに示されるとおり3~4日と推定された。この倍加時間は、対数期増殖よりもゆっくりであり、継代中の細胞喪失も含む。
通常の培養条件下において、細胞は、T180培養フラスコ中で凍結ストック、一般には2~4百万細胞から増殖させる。数回の培地変更後、コンフルエントなときに細胞を継代する。経過記録から、STR0C05に関する集団倍加時間は、下記グラフに示されるとおり3~4日と推定された。この倍加時間は、対数期増殖よりもゆっくりであり、継代中の細胞喪失も含む。
STR0C05に関する対数期増殖のより代表的な評価として、Cyquant蛍光色素(Molecular Probes)を使用した細胞増殖アッセイを設定した。細胞数をTecan Magellan蛍光プレートリーダー(励起480nm、蛍光520nm)を使用して測定する。
STR0C05細胞を継代し、HM+成長因子中に再懸濁させ、ラミニンコーティング96ウェルストリップウェルプレートに5000細胞/ウェルで播いた。毎日プレートからストリップを取り出し(各時点につきn=16ウェル)、培地を除去し、-70℃で細胞を凍結することによって、経時的研究を行った。
時間経過の終わりに、凍結したすべてのストリップをプレートに一緒に戻し、Cyquantアッセイにより分析した。簡単に言えば、細胞を溶解バッファーに溶解させた後、Cyquant試薬を添加し、暗所に5分間置いた。各ウェルの150ulのサンプルを、その後、Tecan Magellanプレートリーダーにおける読み取りのために黒色のOptiluxプレートに移した。数値平均化のためにExcelスプレッドシートにデータをエクスポートし、解析のためにGraphPad Prismにさらにエクスポートした。
これらの結果は、細胞が7日間にわたり着実に増殖し、推定される倍加時間が20~30時間であったことを示した。
STR0C05表現型
神経幹細胞マーカー、ネスチンを染色するため、および分化の成熟マーカー、β-IIIチューブリン(神経細胞)およびGFAP(星状細胞)を染色するために免疫細胞化学を使用してSTR0C05の表現型をプロファイリングした。
神経幹細胞マーカー、ネスチンを染色するため、および分化の成熟マーカー、β-IIIチューブリン(神経細胞)およびGFAP(星状細胞)を染色するために免疫細胞化学を使用してSTR0C05の表現型をプロファイリングした。
STR0C05の表現型を、成長因子+4-OHTの存在下および非存在下において判定した。細胞を、最初はSTR0C05ワーキングストックから得た。細胞を継代し、96ウェルプレートに播いた。
細胞を、4%パラホルムアルデヒド中において室温で15分間固定し、PBSで洗浄し、0.1% Triton X100/PBSで15分間透過処理をした。非特異的結合を、その後、PBS中の10%正常ヤギ血清(NGS)で室温において1時間ブロッキングした。細胞を、その後、ネスチン(1:200、Chemicon)、β-IIIチューブリン(1:500;Sigma)およびGFAP(1:5000;DAKO)に対する抗体を用いて室温で一晩プローブ付けした(probed)。PBSで洗浄した後、それらを、その後、1%NGS/PBS中に溶解させたろ過済みAlexa Goat α Mouse 488(1:200;Molecular Probes)およびAlexa Goat α Rabbit 568(1:2500;Molecular Probes)により室温で1時間処理した。それらを、その後、PBSで洗浄し、蛍光顕微鏡において分析する前にHoechst33342(Sigma)で2分間対比染色した。
培地からの成長因子および4-OHTの除去が、細胞における形態的および表現型の変化を誘導し、これは、ネスチンのダウンレギュレーションに付随して起こる。特に、小さな割合の細胞が神経細胞マーカー、β-IIIチューブリンに関して陽性になり、樹状/軸索突起に延びる丸い細胞体を有する神経細胞の形態を獲得する。しかしながら、より主要な表現型変化は、GFAPのアップレギュレーションであり、これは、星状細胞系列の優勢を示唆する。
クローン性
STR0C05に対するサザンブロット
2つの別々の実験では、他の細胞株に見られる明らかなバンドとは対照的にプローブハイブリダイゼーションの証拠がない。
STR0C05に対するサザンブロット
2つの別々の実験では、他の細胞株に見られる明らかなバンドとは対照的にプローブハイブリダイゼーションの証拠がない。
細胞集団
本発明は、単離された幹細胞の集団を使用し、それに関し、この集団は、基本的に本発明の幹細胞のみを含み、すなわち、幹細胞集団は実質的に純粋である。多くの態様において、幹細胞集団は、全細胞集団を構成する他の細胞に対して、少なくとも約75%、または少なくとも80%(他の態様において、少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%、99.9%または100%)の本発明の幹細胞を含む。例えば、神経幹細胞集団に関して、この用語は、全細胞集団を構成する他の細胞と比較して、少なくとも約75%、いくつかの実施形態において、少なくとも約85%、いくつかの実施形態において、少なくとも約90%、およびいくつかの実施形態において、少なくとも約95%純粋な神経幹細胞が存在することを意味する。したがって、「実質的に純粋な」という用語は、約25%未満、いくつかの実施形態において、約15%未満、およびいくつかの実施形態において、約5%未満の神経幹細胞ではない細胞を含む本発明の幹細胞の集団を指す。
本発明は、単離された幹細胞の集団を使用し、それに関し、この集団は、基本的に本発明の幹細胞のみを含み、すなわち、幹細胞集団は実質的に純粋である。多くの態様において、幹細胞集団は、全細胞集団を構成する他の細胞に対して、少なくとも約75%、または少なくとも80%(他の態様において、少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%、99.9%または100%)の本発明の幹細胞を含む。例えば、神経幹細胞集団に関して、この用語は、全細胞集団を構成する他の細胞と比較して、少なくとも約75%、いくつかの実施形態において、少なくとも約85%、いくつかの実施形態において、少なくとも約90%、およびいくつかの実施形態において、少なくとも約95%純粋な神経幹細胞が存在することを意味する。したがって、「実質的に純粋な」という用語は、約25%未満、いくつかの実施形態において、約15%未満、およびいくつかの実施形態において、約5%未満の神経幹細胞ではない細胞を含む本発明の幹細胞の集団を指す。
単離された幹細胞は、特定のマーカーに関する特有の発現プロフィールによって特徴づけることができ、他の細胞タイプの幹細胞と識別される。マーカーが本明細書に記載されている場合、その有無が神経幹細胞を識別するために使用されてもよい。
神経幹細胞集団は、いくつかの実施形態において、集団の細胞が、マーカー、ネスチン、Sox2、GFAP、βIIIチューブリン、DCX、GALC、TUBB3、GDNFおよびIDOのうちの1、2、3、4、5つ以上、例えば、すべてを発現することを特徴としてもよい。
一般に、神経幹細胞は、ネスチン陽性である。
「マーカー」とは、生体分子を指し、その存在、濃度、活性、またはリン酸化状態を検出することができ、細胞の表現型を特定するために使用することができる。
本発明の細胞は、一般に集団の細胞の少なくとも約70%が検出可能なレベルのマーカーを示す場合に、マーカーをもつと見なされる。他の態様において、集団の少なくとも約80%、少なくとも約90%または少なくとも約95%または少なくとも約97%または少なくとも約98%以上が検出可能なレベルのマーカーを示す。特定の態様において、集団の少なくとも約99%または100%が、検出可能なレベルのマーカーを示す。マーカーの定量は、定量的RT-PCR(qRT-PCR)の使用により、または蛍光活性化細胞選別(FACS)により検出することができる。当然のことながら、このリストは例として提供されたものに過ぎず、限定することを意図しない。一般に、本発明の神経幹細胞は、集団の細胞の少なくとも約90%が、FACSによって検出される検出可能なレベルのマーカーを示す場合に、マーカーをもつと見なされる。
「発現される」という用語は、細胞内のマーカーの存在を示すために使用される。発現されると見なされるためには、マーカーは、検出可能なレベルで存在しなければならない。「検出可能なレベル」とは、マーカーが、qRT-PCR、またはRT-PCR、ブロッティング、マススペクトロメトリーまたはFACS分析などの標準的な実験室的手法のうちの1つを使用して検出することができることを意味する。遺伝子は、発現が35以下のクロッシングポイント(cp)値(qRT-PCRアレイに対する標準的なカットオフ)で適度に検出できる場合に、本発明の細胞の集団によって発現されると見なされる。Cpは、増幅曲線が検出閾値と交差する点を表し、交差閾値(crossing threshold)(ct)として報告される場合もある。
「発現する」および「発現」という用語は、対応する意味を有する。このcp値未満の発現レベルでは、マーカーは、発現されていないと見なされる。本発明の幹細胞におけるマーカーの発現レベルと、例えば、間葉系幹細胞などの別の細胞における同じマーカーの発現レベルとの間の比較は、好ましくは、同じ種から単離された2つの細胞タイプを比較することによって行われてもよい。好ましくは、この種は哺乳動物であり、より好ましくは、この種はヒトである。そのような比較は、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)実験を使用して都合よく行える。
本明細書中で使用される場合、マーカーに関して使用されるとき、「著しい発現」という用語またはその同等の用語「陽性」および「+」は、細胞集団において、細胞のうちの20%超、好ましくは、30%超、40%超、50%超、60%超、70%超、80%超、90%超、95%超、98%超、99%超またはさらにはすべての細胞が前記マーカーを発現することを意味するものと解釈される。
本明細書中で使用される場合、マーカーに対して使用されるとき、「陰性」または「-」は、細胞集団において、細胞の20%未満、10%未満、好ましくは、9%未満、8%未満、7%未満、6%未満、5%未満、4%未満、3%未満、2%未満、1%未満が前記マーカーを発現するか、または発現していないことを意味するものと解釈される。
細胞表面マーカーの発現は、特定の細胞表面マーカーに対するシグナルがバックグラウンドシグナルよりも大きいかどうかを判定するために、例えば、従来法および装置(例えば、市販の抗体および当該技術分野において知られている標準的なプロトコルとともに使用されるBeckman Coulter Epics XL FACSシステム)を使用した特定の細胞表面マーカーに対するフローサイトメトリーおよび/または蛍光活性化細胞選別(FACS)によって判定されてもよい。バックグラウンドシグナルは、各表面マーカーを検出するために使用される特異的抗体と同じアイソタイプの非特異的抗体によって形成されるシグナル強度と定義される。陽性と見なされるマーカーに対して観察される特定のシグナルは、一般にバックグラウンドシグナル強度と比較して、20%超、好ましくは、30%超、40%超、50%超、60%超、70%超、80%超、90%超、100%超、500%超、1000%超、5000%超、10000%超またはそれ以上大きい。目的とする細胞表面マーカーの発現を分析するための代替的な方法としては、目的とする細胞表面マーカーに対する抗体を使用した電子顕微鏡法による視覚的分析が挙げられる。
幹細胞培養および生成
幹細胞培養用の単純なバイオリアクターは、一般的に使用されるT-175フラスコ(例えば、BD Falcon(商標)175cm2細胞培養フラスコ、750ml、組織培養処理ポリスチレン、ストレートネック、青いプラグシールスクリューキャップ、BD製品コード353028)などのシングルコンパートメントフラスコである。
幹細胞培養用の単純なバイオリアクターは、一般的に使用されるT-175フラスコ(例えば、BD Falcon(商標)175cm2細胞培養フラスコ、750ml、組織培養処理ポリスチレン、ストレートネック、青いプラグシールスクリューキャップ、BD製品コード353028)などのシングルコンパートメントフラスコである。
条件付き不死化幹細胞は、一般にT-175またはT-500フラスコ中で培養される増殖性幹細胞から採取されてもよい。
バイオリアクターはまた、当該技術分野において知られているとおり複数のコンパートメントを有してもよい。これらのマルチコンパートメントバイオリアクターは、一般に気体および/または培養培地を収容する1つ以上のコンパートメントから細胞を収容するコンパートメントを分離する1つ以上の膜または仕切りによって分離された少なくとも2つのコンパートメントを含む。マルチコンパートメントバイオリアクターは、当該技術分野において周知である。マルチコンパートメントバイオリアクターの例は、Integra CeLLineバイオリアクターであり、これは、10kDa半透膜によって分離された培地コンパートメントおよび細胞コンパートメントを含み、この膜は、任意の阻害性廃棄物の同時除去とともに細胞コンパートメントへの栄養素の継続的な拡散を可能にする。コンパートメントの個々へのアクセス性は、培養を機械的に妨げることなく新しい培地を細胞に供給することを可能にする。シリコーン膜は、細胞コンパートメント底部を形成し、細胞コンパートメントに短い拡散経路を与えることによって最適な酸素供給および二酸化炭素レベルの制御をもたらす。任意のマルチコンパートメントバイオリアクターを本発明に従って使用することができる。
「培養培地」または「培地」という用語は、当該技術分野において認識され、一般に生細胞の培養に使用される任意の物質または調製物を指す。細胞培養を言及する際に使用される「培地」という用語は、細胞周辺の環境の成分を含む。培地は、固体、液体、気体または相および材料の混合物であってもよい。培地としては、液体増殖培地ならびに細胞増殖を持続しない液体培地が挙げられる。培地としてはまた、寒天、アガロース、ゼラチンおよびコラーゲンマトリックスなどのゼラチン状の培地も挙げられる。例となる気体培地としては、ペトリ皿または他の固体もしくは半固体支持体上で増殖している細胞が曝露される気相が挙げられる。「培地」という用語はまた、それが、まだ細胞と接触させられていなくても細胞培養への使用が意図される材料も指す。言い換えると、培養のために調製される栄養素が豊富な液体が培地である。同様に、水またはその他の液体と混合されたときに細胞培養に適するようになる粉末混合物が「粉末培地」と呼ばれる場合もある。「合成培地」は、化学的に定義された(通常、精製された)成分から生成される培地を指す。「合成培地」は、酵母抽出物およびビーフブロスなどの十分に特徴づけられていない生物抽出物を含まない。「富栄養培地」は、特定の種のほとんどまたはすべての生存可能な形態の増殖を助けるよう設計された培地を含む。富栄養培地は、複雑な生物抽出物を含む場合も多い。「高密度培養の増殖に適した培地」は、他の条件(温度および酸素移動速度など)がそのような増殖を可能にする場合、3以上のOD600に達する細胞培養を可能にする任意の培地である。「基本培地」という用語は、いかなる特別な栄養補助剤も必要としない、多くのタイプの微生物の増殖を促進する培地を指す。大半の基本培地は、一般に4つの基本的な化学物質のグループ:アミノ酸、炭水化物、無機塩、およびビタミンから構成される。基本培地は、一般に、血清、バッファー、成長因子、脂質などの補充物が添加されるより複雑な培地の基礎としての役割を果たす。一態様において、増殖培地は、本発明の細胞の増殖および拡大を助けると同時にその自己再生能力を維持する必須の成長因子を含む複合培地であってもよい。基本培地の例としては、イーグル基本培地、最小必須培地、ダルベッコ改変イーグル培地、Medium 199、Nutrient Mixtures Ham’s F-10およびHam’s F-12、McCoy’s 5A、Dulbecco’s MEM/F-I 2、RPMI 1640、およびイスコフ改変ダルベッコ培地(IMDM)が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明の多能性細胞およびそれらの後代によって産生される細胞外小胞
本発明の多能性幹細胞、およびそれらの細胞から形成される分化細胞は、細胞外小胞を産生することになる。一態様において、本発明は、本発明の人工多能性幹細胞から、またはそれらのiPS細胞から形成される分化細胞から得ることができる細胞外小胞を提供する。これらの微粒子は、治療に使用することができる。
本発明の多能性幹細胞、およびそれらの細胞から形成される分化細胞は、細胞外小胞を産生することになる。一態様において、本発明は、本発明の人工多能性幹細胞から、またはそれらのiPS細胞から形成される分化細胞から得ることができる細胞外小胞を提供する。これらの微粒子は、治療に使用することができる。
本発明の細胞から得られる細胞外小胞はまた、外来性カーゴのための送達ビヒクルとしても使用することができる。カーゴは、いくつかの実施形態において、外来性核酸(例えば、DNAまたはRNA、特に、RNAi薬剤、例えば、siRNAまたは化学修飾siRNA)、外来性タンパク質(例えば、抗体もしくは抗体フラグメント、シグナル伝達タンパク質、またはタンパク質薬物)であってもよい。例えば、トランスフェクションまたはエレクトロポレーションによって、カーゴを細胞外小胞に直接入れることができることが当該技術分野において知られている。細胞外小胞を産生する細胞を操作することにより細胞外小胞の内容物を変えることができることも知られている。
細胞外小胞の性質、内容物および特徴は、それらを産生する細胞の影響を受ける。したがって、本発明は、有利にも単一の十分に特徴づけられた出発材料(すなわち、条件付き不死化細胞)から産生される多様な範囲の細胞外小胞を提供する。例えば、細胞外小胞は、iPS細胞、または内胚葉、中胚葉もしくは外胚葉系になった細胞などのその細胞由来の任意のさらに分化した細胞から単離することができる。これは、単一の既知の開始細胞からの多くの異なる細胞外小胞の供給を可能にする。
「細胞外小胞」(過去の公報では、一般用語「微粒子」によって言及される場合もある)は、細胞から放出される直径30から1000nmの脂質二重膜粒子である。これは、生体分子を封入する脂質二重膜によって限定される。「細胞外小胞」という用語は、当該技術分野において知られており、膜粒子、膜小胞、微小胞、エクソソーム様小胞、エクソソーム、エクトソーム様小胞、エクトソームまたはエキソベシクル(exovesicle)を含む、多くの異なる種の細胞外小胞を包含する。さまざまな異なるタイプの細胞外小胞は、直径、細胞内起源、スクロース中におけるその密度、形状、沈殿速度、脂質組成物、タンパク質マーカーおよび分泌の様式(すなわち、シグナルに従う(誘導型)か、または自然に(構成型)か)に基づいて識別される。細胞外小胞の3つの主要なタイプは、現在、一般に生合成および小胞のサイズに基づいて認識されている:1)エクソソーム、2)微小胞(微粒子として知られている場合もある)および3)アポトーシス小体。
一般的な細胞外小胞およびそれらの際だった特徴を下記表1に記載する。特定の実施形態において、細胞外小胞は、エクソソームである。
細胞外小胞は、直接的および間接的なメカニズムによりドナー細胞とレシピエント細胞の間でビヒクルの役割を果たすことによって細胞間伝達に関与すると考えられる。直接的なメカニズムは、レシピエント細胞による細胞外小胞およびそのドナー細胞由来の成分(タンパク質、脂質または核酸など)の取り込みを含み、その成分は、レシピエント細胞において生物学的活性を有する。間接的なメカニズムは、微小胞-レシピエント細胞表面相互作用、およびレシピエント細胞の細胞内シグナル伝達の調節をもたらすことを含む。したがって、細胞外小胞は、レシピエント細胞による1つ以上のドナー細胞由来の特性の獲得をもたらすこともある。動物モデルにおける幹細胞療法の効力にもかかわらず、幹細胞は、ホストに生着しないようであることが確認された。したがって、幹細胞療法が有効なメカニズムは、明らかでない。理論に縛られることを望まないが、本発明者らは、神経幹細胞によって分泌される細胞外小胞がそれらの細胞の治療有用性に関与し、したがって、それら自体が治療的に有用であると考える。
本発明の細胞外小胞は、細胞に関して本明細書中で定義されるとおり単離される。
本発明は、本発明の細胞によって産生される単離された幹細胞細胞外小胞の集団を提供し、その集団は、基本的に本発明の細胞外小胞のみを含み、すなわち、細胞外小胞集団は、純粋である。多くの態様において、細胞外小胞集団は、少なくとも約80%(他の態様において、少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%、99.9%または100%)の本発明の細胞外小胞を含む。
特定の実施形態において、細胞外小胞は、エクソソームである。エクソソームの脂質二重膜は、一般にコレステロール、スフィンゴミエリンおよびセラミドが豊富である。エクソソームはまた、1つ以上のテトラスパニンマーカータンパク質を発現する。テトラスパニンとしては、CD81、CD63、CD9、CD53、CD82およびCD37が挙げられる。CD63は、典型的なエクソソームマーカーである。エクソソームはまた、成長因子、サイトカインおよびRNA、特にmiRNAを含む場合もある。エクソソームは、一般にマーカーTSG101、Alix、CD109、thy-1およびCD133のうちの1つ以上を発現する。Alix(Uniprot受託番号Q8WUM4)、TSG101(Uniprot受託番号Q99816)ならびにテトラスパニンタンパク質CD81(Uniprot受託番号P60033)およびCD9(Uniprot受託番号P21926)は、特徴的なエクソソームマーカーである。
Alixは、エンドソームの経路マーカーである。本発明のエクソソームは、一般にAlixが陽性である。微小胞は、一般にAlixが陰性である。
いくつかの実施形態において、エクソソームなどの細胞外小胞は、外来性カーゴを搭載できる。外来性カーゴは、タンパク質(例えば、抗体)、ペプチド、薬物、プロドラッグ、ホルモン、診断用薬剤、核酸(例えば、miRNA、siRNAもしくはshRNAなどのRNAi薬剤、またはDNAもしくはRNAベクター)、炭水化物あるいは他の目的とする分子が可能である。カーゴは、例えば、エレクトロポレーションもしくはトランスフェクションによってエクソソームに直接入れることができ、またはエクソソーム放出前に細胞がカーゴをエクソソームにカプセル化するようにエクソソームを産生する細胞を操作することによってエクソソームに入れることができる。カーゴをエクソソームなどの細胞外小胞に入れることは、当該技術分野において知られている。
医薬組成物
本発明の多能性幹細胞は、治療に有用であり一般に造血系のものである細胞を形成するために分化させられてもよく、したがって、医薬組成物として製剤化することができる。本発明の多能性幹細胞、およびそれらの細胞から形成される分化細胞は、本明細書中の別の場所に記載されているとおり細胞外小胞を産生することになり、それも治療に有用であるため、医薬組成物として製剤化することができる。特に、事実上無制限の量の造血系の細胞、特に、本明細書に記載されている免疫系細胞のスケーラブルな生成は、これらの細胞の配合物をすぐに利用できる医薬製品にすることができる。例えば、細胞は、多くの患者の迅速な「すぐに利用できる」同種異系の処置用に一定分量(例えば、個々の投与量)で凍結保存されてもよい。この用途に特に適した細胞としては、高分化細胞、例えば、特定の操作された腫瘍レセプターをもつCAR-T細胞、またはHSCもしくはさまざまな範囲の能力および増殖潜在性を有する系列前駆細胞の両方が挙げられる。
本発明の多能性幹細胞は、治療に有用であり一般に造血系のものである細胞を形成するために分化させられてもよく、したがって、医薬組成物として製剤化することができる。本発明の多能性幹細胞、およびそれらの細胞から形成される分化細胞は、本明細書中の別の場所に記載されているとおり細胞外小胞を産生することになり、それも治療に有用であるため、医薬組成物として製剤化することができる。特に、事実上無制限の量の造血系の細胞、特に、本明細書に記載されている免疫系細胞のスケーラブルな生成は、これらの細胞の配合物をすぐに利用できる医薬製品にすることができる。例えば、細胞は、多くの患者の迅速な「すぐに利用できる」同種異系の処置用に一定分量(例えば、個々の投与量)で凍結保存されてもよい。この用途に特に適した細胞としては、高分化細胞、例えば、特定の操作された腫瘍レセプターをもつCAR-T細胞、またはHSCもしくはさまざまな範囲の能力および増殖潜在性を有する系列前駆細胞の両方が挙げられる。
特定の実施形態において、医薬組成物は、凍結されている。
特定の実施形態において、医薬組成物は、凍結保存されている。
特定の実施形態において、医薬組成物は、凍結乾燥されている。
医薬組成物が、凍結、凍結保存または凍結乾燥されている場合、これは、一般に患者への投与に先立って、必要に応じて解凍、または復元される。
いくつかの実施形態において、非高分化細胞の集団が、保管、例えば、凍結される。一実施形態において、これは、後で患者に移植される好中球を形成するために、必要とされるときに適切な提供された試薬を用いて短期間で(例えば、病院またはクリニックにおいて)解凍および培養される骨髄芽球である場合もあるであろう。下記実施例において示されるとおり、一部の筋芽細胞は、CD7およびCD34を発現する。好中球は、がん処置および感染性疾患の処置を含む多くの治療において有用である。
多量に生成するのが難しいことの多い成体幹細胞または組織前駆細胞タイプのスケーラブルな増殖が本発明の特有の利点である。例えば、骨髄芽球は、それ自体が全造血系を形成することができる多能性HSCの下流の少能性ASCタイプであり、したがって、特に有用であることが予想される。
好中球に関して、これらの細胞内の顆粒は、壊れやすく、好中球を凍結/解凍した後の脱顆粒の潜在的な問題は、処置のために患者に投与する直前に解凍し、凍結されていた骨髄芽球を分化させることによって回避することができる。好中球は、SCFおよびG-CSFを使用して条件付きHoxb8不死化前駆細胞からインビトロで分化させることができる。
薬学的に許容される組成物は、一般に、治療用細胞または細胞外小胞に加えて少なくとも1つの薬学的に許容される担体、希釈剤、ビヒクルおよび/または賦形剤を含む。適した担体の例は、乳酸リンゲル液である。そのような成分の十分な解説は、Gennaro (2000) Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20th edition, ISBN: 0683306472に示されている。
「薬学的に許容される」という語句は、適切な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激症状、アレルギー反応、またはその他の問題もしくは合併症なく、釣り合いのとれた妥当な利益/リスク比で、ヒトおよび動物の組織と接触させる使用に適した化合物、材料、組成物、および/または剤形を指すよう本明細書において利用される。
本組成物は、必要に応じて、少量のpH緩衝剤も含んでもよい。本組成物は、BioLife Solutions Inc.、USAから商業的に入手可能なHypothermosol(登録商標)などの保存培地を含んでもよい。適した医薬担体の例は、"Remington's Pharmaceutical Sciences" by E W Martinに記載されている。そのような組成物は、予防または治療有効量の予防または治療用幹細胞を、好ましくは、精製された形態で、対象への投与に適した形態を提供されるよう適した量の担体とともに含むことになる。製剤は、投与様式に適合させるべきである。好適な実施形態において、医薬組成物は、無菌で、対象、好ましくは、動物対象、より好ましくは、哺乳動物対象、および最も好ましくは、ヒト対象への投与に適した形態である。
本発明の医薬組成物は、さまざまな形態であってもよい。これらは、例えば、半固体、および液体剤形、例えば、凍結乾燥調製物、凍結調製物、液体溶液または懸濁液、注射可能および注入可能な溶液を含む。医薬組成物は、注射可能であるのが好ましい。
医薬組成物は、一般に水性形態になることになる。組成物は、保存料および/または酸化防止剤を含んでもよい。
張力を制御するために、医薬組成物は、ナトリウム塩などの生理的塩を含んでもよい。塩化ナトリウム(NaCl)が好ましく、1~20mg/mlの間で存在してもよい。存在してもよい他の塩としては、塩化カリウム、リン酸二水素カリウム、リン酸二ナトリウム二水和物、塩化マグネシウムおよび塩化カルシウムが挙げられる。
本組成物は、1つ以上のバッファーを含んでもよい。典型的なバッファーとしては、リン酸バッファー、トリスバッファー、ホウ酸バッファー、コハク酸バッファー、ヒスチジンバッファー、またはクエン酸バッファーが挙げられる。バッファーは、一般に5~20mMの範囲の濃度で含まれることになる。本組成物のpHは、一般に、5から8の間、およびより一般に6から8の間、例えば、6.5から7.5の間、または7.0から7.8の間になる。
本組成物は、好ましくは無菌である。本組成物は、好ましくは、非発熱性である。
一般的な実施形態において、細胞または細胞外小胞は、6-ヒドロキシ-2,5,7,8-テトラメチルクロマン-2-カルボン酸(Trolox(登録商標))、Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Cl-、H2P04
-、HEPES、ラクトビオナート、スクロース、マンニトール、グルコース、デキストラン-40、アデノシンおよびグルタチオンから選択される1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個以上の賦形剤を含む組成物中に懸濁している。一実施形態において、本組成物は、これらの賦形剤のすべてを含む。一般に、本組成物は、両性非プロトン溶媒、例えば、DMSOを含まないことになる。適した組成物、例えば、HypoThermasol(登録商標)-FRSは、商業的に入手可能である。そのような組成物は、細胞が長期間(何時間から何日間)4℃から25℃で保管されるのを可能にするか、または凍結温度(cryothermic temperature)、すなわち、-20℃より低い温度で保存されるのを可能にするため、有利である。解凍後のこの組成物中の幹細胞を、その後、投与することができる。
本発明は、理解を明確にするために詳細に記載されてきたが、一定の改変が添付の特許請求の範囲内で行われてもよい。本出願において引用されるすべての刊行物、受託番号、および特許文献は、それぞれが個別にそうであることが示されているのと同じ程度までその全体をあらゆる目的のために参照により本明細書に組み込んだものとする。2つ以上の配列が異なる時点の受託番号と関連づけられる限りにおいて、本出願の有効な出願日の時点の受託番号と関連づけられる配列が意図される。有効な出願日は、取り上げた受託番号を開示している最先の優先出願の日付である。文脈からそうでないことが明らかでない限り、本発明の任意の要素、実施形態、ステップ、特徴または態様は、任意の他のものと組み合わせて実施されてもよい。
本発明は、以下の非限定的実施例に関してさらに記載されている。これらの実施例において、本発明者らは、まず最初に、条件付き不死化神経幹細胞(CTX0E03;本特許出願の出願人、ReNeuron Limitedによって、European Collection of Animal Cultures(ECACC)に受託番号04091601で2004年9月16日に寄託された)が多能性にリプログラミングされ得ることを、いくつかの独立した反復実験に基づいて実証する。これらのiPSCは、その後、間葉系幹細胞(MSC)に分化させられる。CTX-iPSCの遺伝子リプログラミングおよび多能性も確認される。
本発明者らは、その後、別の条件付き不死化成体幹細胞タイプの成功したリプログラミングを実証する。この株は、STR0C05であり、胎児の線条体細胞由来である(さらに本特許出願の出願人、ReNeuron LimitedによってEuropean Collection of Animal Cultures(ECACC)に受託番号04110301で2004年11月3日に寄託された)。STR0C05からのiPSCの形成およびそれに続くこれらSTR0C-iPSCの内胚葉、中胚葉および外胚葉系への分化が示される。これらのデータは、本発明によって提供される利点が、本発明者らがそれを最初に証明したCTX細胞株に限定されず、任意の条件付きで不死化された成体細胞タイプに広く当てはまることを確認する。
実施例は、その後、リプログラミングされたiPSC由来のMSC細胞のさらなる特徴付けを提供し、そのような細胞の通常の限界を超えて、これらのiPSCから誘導される成体幹細胞タイプを増やすことができ、それによって、そのような株から多くの患者の処置を可能にするという発見をより説得力のあるものにする。これらのCTX-iPSC-MSCは、軟骨(シアログリカン(sialoglycan)のアルシアンブルー染色によって示される)、脂肪(オイルレッドOによる細胞内脂質滴の染色によって示される)および骨(沈着したカルシウムのアリザリンレッド染色によって示される)細胞に分化することが示される(図10)。
最後に、CTX-iPSC細胞のさらにいっそう詳細な特徴づけが提供され、実施例6において、条件付きで不死化可能なhiPSCから誘導される、HSCおよび高分化造血細胞を含む造血系が詳細に例示される。
[実施例1]
同種異系細胞療法の臨床スケール製造用のソースとしての誘導的に不死化された成体幹細胞由来のiPSC
序論
・人工多能性幹細胞(iPSC)は、細胞療法のソース材料として大きな可能性をもつ
・候補治療用集団は、一般に、高分化細胞ではなく成体幹細胞または組織前駆体(ASC/TP)である
・ASC/TPは、培養および精製するのが難しいことが多い
・ASC/TPの条件付き不死化は、同種異系細胞療法のための細胞のスケーラブルな生成に有益であろう
・CTXは、虚血性脳卒中に対する臨床試験における神経幹細胞株である。これは、培養培地への4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)の添加によって制御可能なc-myc-ERTAM導入遺伝子により不死化される
同種異系細胞療法の臨床スケール製造用のソースとしての誘導的に不死化された成体幹細胞由来のiPSC
序論
・人工多能性幹細胞(iPSC)は、細胞療法のソース材料として大きな可能性をもつ
・候補治療用集団は、一般に、高分化細胞ではなく成体幹細胞または組織前駆体(ASC/TP)である
・ASC/TPは、培養および精製するのが難しいことが多い
・ASC/TPの条件付き不死化は、同種異系細胞療法のための細胞のスケーラブルな生成に有益であろう
・CTXは、虚血性脳卒中に対する臨床試験における神経幹細胞株である。これは、培養培地への4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)の添加によって制御可能なc-myc-ERTAM導入遺伝子により不死化される
CTX0E03の多能性へのリプログラミング
CTX0E03細胞を、「山中因子」(OCT4、L-MYC、KLF4およびSOX2、「OKSM」、ならびにLIN28)をコードする標準的な非組み込み型エピソームベクターを使用して多能性にリプログラミングした(図1)。
CTX0E03細胞を、「山中因子」(OCT4、L-MYC、KLF4およびSOX2、「OKSM」、ならびにLIN28)をコードする標準的な非組み込み型エピソームベクターを使用して多能性にリプログラミングした(図1)。
CTX細胞は、独立して、数回うまくリプログラミングされた。
CTX-iPSCは、ヒトiPSCおよびESCに典型的な多くの特徴を共有する。リプログラミング後、細胞形態は、CTX細胞に典型的な伸長した突起を有する神経細胞の表現型から、目立つ核小体およびヒト多能性幹細胞に典型的な「細胞群」に高密度に詰め込まれた細胞間で識別が難しい区画を有する、1つの小さな丸い未分化細胞に劇的に変化する(図1C、図2)。CTX-iPSCは、21日目の終了点に組織非特異的なアルカリホスファターゼ酵素マーカーを発現する(図1D、図3)。
CTXリプログラミング要件を分析するためのさまざまな転写因子の組み合わせ。
図2は、CTX0E03細胞がさらに少数の因子によりリプログラミング可能であることを示す。(A)1つの因子を発現するベクター、pCE-OCT3/4、pCE-SOX2およびpCE-KLF4;4-OHT供給はc-myc-ERTAMによりMYCを模倣する。(B)挿入図:コロニーカウントのための例のAP染色プレート。中心の画像:転写因子OCT4単独によりリプログラミングされたコロニー。(C)さまざまな因子の組み合わせにより得られたコロニー数(S-K:pCE-SK、M-L:pCE-UL、S:pCE-SOX2、K:pCE-KLF4、M:4-OHT→d14)。(D)組み合わせの効果を示すベン図(数:x個のコロニーが得られた;ゼロ:コロニーなし)。
図2は、CTX0E03細胞がさらに少数の因子によりリプログラミング可能であることを示す。(A)1つの因子を発現するベクター、pCE-OCT3/4、pCE-SOX2およびpCE-KLF4;4-OHT供給はc-myc-ERTAMによりMYCを模倣する。(B)挿入図:コロニーカウントのための例のAP染色プレート。中心の画像:転写因子OCT4単独によりリプログラミングされたコロニー。(C)さまざまな因子の組み合わせにより得られたコロニー数(S-K:pCE-SK、M-L:pCE-UL、S:pCE-SOX2、K:pCE-KLF4、M:4-OHT→d14)。(D)組み合わせの効果を示すベン図(数:x個のコロニーが得られた;ゼロ:コロニーなし)。
CTX-iPSCは、古典的なhPSCと多くの特徴を共有する
CTX-iPSCの多能性表現型を図3に示す。
CTX-iPSCの多能性表現型を図3に示す。
(A)OKSML転写因子セットのトランスフェクションによる多能性へのリプログラミングによってCTX細胞から誘導された2つの異なる細胞株(ii、iii)についてのCTX-iPSCの細胞およびコロニー形態評価は、これらのリプログラミングされた細胞株が、hPSCに典型的な目立つ核小体を有する小さな緊密に詰め込まれた細胞の高密度のコロニーを再現し、親CTX細胞(i)の神経細胞の表現型とは著しく異なる。
CTX-iPSC株は、図3Bに示されるとおり酵素マーカーアルカリホスファターゼ(ピンク染色)を発現する。
ヒト多能性幹細胞に関して予想されるとおり、フローサイトメトリーは、CTX-iPSCは、カノニカル多能性転写因子OCT4、ならびに細胞表面抗原TRA-1-60およびSSEA-4が陽性であるが、初期分化マーカーSSEA-1は発現していないことを示している。(図3C)。
(D)RT-qPCRは、内胚葉、中胚葉および外胚葉へのインビトロ分化時の系列特異的なマーカーのアップレギュレーションを示す(個々のCTX-iPSC株は色調によって示される)。
CTX-iPSCにおけるc-myc-ERTAM導入遺伝子の状態
CTX-iPSCにおける導入遺伝子座の評価を図4に示す。
CTX-iPSCにおける導入遺伝子座の評価を図4に示す。
(A)G418における親CTX0E03細胞(1行目、4日目、2行目、10日目)および4日目の5つのCTX-iPSC株(3~7行目)のギムザ染色は、c-myc-ERTAM関連NeoR遺伝子の発現活性を示す。
(B)c-myc-ERTAM導入遺伝子を駆動するCMV-IEプロモーターのバイサルファイト変換は、その座位におけるシトシンメチル化状態を示す(白丸、非メチル化CpG;黒円、メチル化CpG;カンマ、不確定な読み取り)。
CTX-iPSCからの治療用細胞集団の誘導
3つの生殖系列(内胚葉、中胚葉、外胚葉)に沿った分化が達成されることをRT-qPCRを使用して示すことができる。CTX-iPSCの治療に関連した細胞タイプへの分化も確認できた。これは、成体幹細胞タイプ(間葉系幹細胞)に関して証明された。当業者には明白であろうとおり、他の細胞タイプも適した培養条件によって形成することができる。特に、Tリンパ球、NK細胞および樹状細胞などの免疫系の細胞は、Themeli et al. (2013) Nature Biotechnology (31), 928-933に開示されている方法によって分化させることができる。
3つの生殖系列(内胚葉、中胚葉、外胚葉)に沿った分化が達成されることをRT-qPCRを使用して示すことができる。CTX-iPSCの治療に関連した細胞タイプへの分化も確認できた。これは、成体幹細胞タイプ(間葉系幹細胞)に関して証明された。当業者には明白であろうとおり、他の細胞タイプも適した培養条件によって形成することができる。特に、Tリンパ球、NK細胞および樹状細胞などの免疫系の細胞は、Themeli et al. (2013) Nature Biotechnology (31), 928-933に開示されている方法によって分化させることができる。
図5は、CTX-iPSC由来の治療用細胞集団の生成を示す。(A)mTeSR1培地のラミニン-521上のCTX-iPSC。(B)MSC培地(α-MEM、10% FCS、25mM HEPES)において(A)の細胞から誘導されるプラスチック付着性の候補間葉系幹細胞(MSC)。(C)CTX-iPSC-MSCのフローサイトメトリーは、それらが、ISCT基準に従って、MSCマーカーCD73、CD90およびCD105を発現するが、CD14、CD20、CD34またはCD45を発現しないことを示す(青、染色;赤、アイソタイプ対照)。
結論
インビトロにおける不死化および長期培養にもかかわらず、驚くべきことに、神経幹細胞株CTX0E03が外因性転写因子によってリプログラミングできることを示した。
インビトロにおける不死化および長期培養にもかかわらず、驚くべきことに、神経幹細胞株CTX0E03が外因性転写因子によってリプログラミングできることを示した。
CTX-iPSCは、細胞形態、細胞表面の発現、転写因子および酵素マーカー、ならびに多能性によって定義される、低継代の一次細胞から形成される従来のiPSCと外見上、見分けがつかない。
CTX-iPSCにおけるc-myc-ERTAM遺伝子座は、少なくとも一部の株において依然として活性のままである。
臨床に関連する細胞タイプ(例えば、MSC、免疫細胞、例えば、T細胞、NK細胞および樹状細胞)は、CTX-iPSCから形成されてもよい。
CTX-iPSC-MSCにおける4-OHT/c-myc-ERTAM系による細胞周期の誘導は、同種異系療法用のスケーラブルな生成を可能にするであろう。
したがって、CTX-iPSCは、非常に有用な臨床的資源である。これらは、所望の系列に沿って分化させて、組織前駆細胞タイプまたは成体幹細胞集団などの標的集団を形成することができ、その後、継続的な増殖を促進し、細胞周期逸脱および関連するさらなる分化を防ぐための4-OHTの供給が、原材料からの繰り返される細胞単離を伴わず、以前は実現不可能だった臨床に関連する部分集団の定型化したスケーラブルな生成を可能にするであろう。
CTX自体は適していない条件に対するすぐに利用できる処置の大規模生成のために、クローニングまたは精製ステップを使用して、多かれ少なかれ均質でない分化培養物から所望の治療タイプの純粋な集団を形成することができ、分化プロトコルの効率が不十分な当該技術分野に見られる欠点を未然に防ぐ。これは、細胞自体または、CTX細胞自体によって産生されるものに対する代替レパートリーのペイロード分子を有するさまざまな細胞タイプによって産生されるエクソソーム部分の両方に当てはまる。
さらに、これらのCTX-iPSC由来の亜株は既に臨床安全性試験に合格した細胞株(CTX)から誘導されるため、新しい適応症における効力に関する臨床試験への移行が加速される可能性がある。
[実施例2]
リプログラミングされたCTX-iPSCの特徴づけ
重要な遺伝子の発現の、リプログラミングにより誘導された調節が示され、これは、CTX細胞の証拠が適切にリプログラミングされたことを確認する。
リプログラミングされたCTX-iPSCの特徴づけ
重要な遺伝子の発現の、リプログラミングにより誘導された調節が示され、これは、CTX細胞の証拠が適切にリプログラミングされたことを確認する。
その結果を図6に示す。各パネルは、CTXから作成されたシングルセルトランスクリプトームデータの「tSNE」プロットである。左上の色調は、緑の「雲状のもの」がCTXであり、CTX-iPSCは青であり、皮質分化プロトコルに供された後、そのトランスクリプトームがCTX自体に可能な限り近づいたときに分析されたCTX-iPSCは赤であることを示す。それぞれの雲状のものは、1つの細胞を示す点からなる。グレー:発現なし、オレンジ:中程度の発現;赤:高発現。プロットは、CTXにおいて不活性の多能性遺伝子:POU5F1、NANOG、UTF1、TET1、DPP4、TDGF1、ZSCAN10およびGALが、リプログラミングされた細胞では活性化されたことを示す。重要なことに、これらの遺伝子のうち、POU5F1のみが、リプログラミングの間に外因的に与えられた。反対に、CTXによって発現されるいくつかの神経系遺伝子は、多能性へのリプログラミング時に、ダウンレギュレートされる(NOGGIN、ADAM12、OCIAD2、NTRK3、PAX6)。最後に、GLI3(および大きな程度にPAX6)が、多能性細胞の皮質分化時にアップレギュレートされる。
人工多能性幹細胞の生殖系列分化およびその染色(図7および図9)
方法
1.CTX-iPSCまたはSTR0C05-iPSCを、必要に応じてヒトラミニン-521コーティング8ウェルチャンバースライドに播いた。その後、それらを、必要に応じて、適した分化培地(StemCell Technologies、カタログ番号05230)で5~7日間処理した後、リン酸緩衝食塩水(PBS)中の4%ホルムアルデヒドにおいて固定し、免疫染色まで4℃で保存した。
2.ウェルを、以下のとおり免疫染色した:
1. 10% NGS/PBS中において室温で30分間インキュベーションすることによって正常ヤギ血清(NGS)でブロッキングした。
2. ウェルを、必要に応じて希釈された(下記表を参照)0.1% PBST(0.1% Triton-X-100/PBS)中の一次抗体:マウス抗-xおよびウサギ抗-yとともに、室温で2~4時間または4℃で一晩インキュベーションした。
3. ウェルを、PBSで10分間、3回洗浄するか、またはPBS中4℃で一晩維持した。
4. ウェルを、PBS中の二次抗体:ヤギ抗マウスIgG-Alexafluor-488(1:300希釈)および/またはヤギ抗ウサギIgG Alexafluor-568(1:2000希釈)とともに室温で2時間インキュベーションした。
5. ウェルを、室温のPBSで3回洗浄した。
6. ウェルを、PBS中で1:10,000に希釈されたHoechst33342で、5分間染色した。
7. ウェルを、PBSで3回、5分間洗浄した。
8. ウェルを、スライドから取り除き、2滴のVectashieldを添加し、カバーガラスを上に置いた後、蛍光顕微鏡法によって調べた。
3.利用した抗体を下記表に示す。
方法
1.CTX-iPSCまたはSTR0C05-iPSCを、必要に応じてヒトラミニン-521コーティング8ウェルチャンバースライドに播いた。その後、それらを、必要に応じて、適した分化培地(StemCell Technologies、カタログ番号05230)で5~7日間処理した後、リン酸緩衝食塩水(PBS)中の4%ホルムアルデヒドにおいて固定し、免疫染色まで4℃で保存した。
2.ウェルを、以下のとおり免疫染色した:
1. 10% NGS/PBS中において室温で30分間インキュベーションすることによって正常ヤギ血清(NGS)でブロッキングした。
2. ウェルを、必要に応じて希釈された(下記表を参照)0.1% PBST(0.1% Triton-X-100/PBS)中の一次抗体:マウス抗-xおよびウサギ抗-yとともに、室温で2~4時間または4℃で一晩インキュベーションした。
3. ウェルを、PBSで10分間、3回洗浄するか、またはPBS中4℃で一晩維持した。
4. ウェルを、PBS中の二次抗体:ヤギ抗マウスIgG-Alexafluor-488(1:300希釈)および/またはヤギ抗ウサギIgG Alexafluor-568(1:2000希釈)とともに室温で2時間インキュベーションした。
5. ウェルを、室温のPBSで3回洗浄した。
6. ウェルを、PBS中で1:10,000に希釈されたHoechst33342で、5分間染色した。
7. ウェルを、PBSで3回、5分間洗浄した。
8. ウェルを、スライドから取り除き、2滴のVectashieldを添加し、カバーガラスを上に置いた後、蛍光顕微鏡法によって調べた。
3.利用した抗体を下記表に示す。
結果:
CTX-iPSCの多能性のさらなる確認は、3つの一次胚葉を特定するタンパク質マーカー(一般に、転写因子)の同時発現によって示される内胚葉、中胚葉および外胚葉への分化の証拠によって得られる。図7のこれらのデータは、先に示したRT-qPCRデータを補足するものである。
CTX-iPSCの多能性のさらなる確認は、3つの一次胚葉を特定するタンパク質マーカー(一般に、転写因子)の同時発現によって示される内胚葉、中胚葉および外胚葉への分化の証拠によって得られる。図7のこれらのデータは、先に示したRT-qPCRデータを補足するものである。
[実施例3]
胎児の線条体細胞のリプログラミング
別の条件付き不死化成体幹細胞タイプも、うまくリプログラミングされた。この株は、胎児の線条体細胞由来のSTR0C05である。
胎児の線条体細胞のリプログラミング
別の条件付き不死化成体幹細胞タイプも、うまくリプログラミングされた。この株は、胎児の線条体細胞由来のSTR0C05である。
方法-STR0C05細胞の多能性へのリプログラミング
1.Thermofisher.comによって販売されているNeonエレクトロポレーション機器を使用して、STR0C05細胞に特異的なトランスフェクション条件の最適な範囲を特定した。この細胞株に適したトランスフェクション条件を特定するために、機器の製造業者によって推奨されているとおり、電圧、パルス持続時間などのさまざまなパラメーターの範囲を使用して、GFP発現プラスミドを細胞にトランスフェクションした場合に得られた緑色の生細胞の発生頻度を評価した。
2.その後、STR0C05細胞を、(1)で特定した条件を使用して、Epi5リプログラミングキット(Thermofisherカタログ番号A15960;転写因子POU5F1、SOX2、KLF4、L-MYC、LIN28およびp53のドミナントネガティブ阻害因子を発現するリプログラミングプラスミド、pCE-hOCT3/4、pCE-hSK、pCE-hULおよびpCEmP53DDを含む)のプラスミドでエレクトロポレーションし、ヒトラミニン-521上に播いた。インキュベーター内で作動するIncucyte Zoom自動化位相差顕微鏡により、ウェルを毎日観察した。
3.1週間後、その細胞を再播種するか、同じウェルに残し、培地をmTeSR1(StemCell Technologiesカタログ番号85850)に変えた。
4.多能性表現型コロニーが生じるまで、ウェルを観察した。
5.十分大きくなったら、個々のコロニーを、ピペットの先端でhLn-521でもコーティングされた24ウェルプレートのウェルに採取し、凍結または分析まで増殖させた。
6.以前の研究と同様に、ともに製造業者の説明書に従って、アルカリホスファターゼ染色をStemgentアルカリホスファターゼ染色キット(カタログ番号00-0055)で実施し、FITC結合マウス抗ヒトTRA-1-60抗体(BDカタログ番号560380)を加えたBecton Dickinson Stemflow抗体キット(カタログ番号560477)を用いて、SSEA1およびSSEA4などの多能性幹細胞マーカーに対するフローサイトメトリーを実施した。フローサイトメトリーサンプルをMiltenyi MACSQuant 10フローサイトメーターにおいて分析した。
1.Thermofisher.comによって販売されているNeonエレクトロポレーション機器を使用して、STR0C05細胞に特異的なトランスフェクション条件の最適な範囲を特定した。この細胞株に適したトランスフェクション条件を特定するために、機器の製造業者によって推奨されているとおり、電圧、パルス持続時間などのさまざまなパラメーターの範囲を使用して、GFP発現プラスミドを細胞にトランスフェクションした場合に得られた緑色の生細胞の発生頻度を評価した。
2.その後、STR0C05細胞を、(1)で特定した条件を使用して、Epi5リプログラミングキット(Thermofisherカタログ番号A15960;転写因子POU5F1、SOX2、KLF4、L-MYC、LIN28およびp53のドミナントネガティブ阻害因子を発現するリプログラミングプラスミド、pCE-hOCT3/4、pCE-hSK、pCE-hULおよびpCEmP53DDを含む)のプラスミドでエレクトロポレーションし、ヒトラミニン-521上に播いた。インキュベーター内で作動するIncucyte Zoom自動化位相差顕微鏡により、ウェルを毎日観察した。
3.1週間後、その細胞を再播種するか、同じウェルに残し、培地をmTeSR1(StemCell Technologiesカタログ番号85850)に変えた。
4.多能性表現型コロニーが生じるまで、ウェルを観察した。
5.十分大きくなったら、個々のコロニーを、ピペットの先端でhLn-521でもコーティングされた24ウェルプレートのウェルに採取し、凍結または分析まで増殖させた。
6.以前の研究と同様に、ともに製造業者の説明書に従って、アルカリホスファターゼ染色をStemgentアルカリホスファターゼ染色キット(カタログ番号00-0055)で実施し、FITC結合マウス抗ヒトTRA-1-60抗体(BDカタログ番号560380)を加えたBecton Dickinson Stemflow抗体キット(カタログ番号560477)を用いて、SSEA1およびSSEA4などの多能性幹細胞マーカーに対するフローサイトメトリーを実施した。フローサイトメトリーサンプルをMiltenyi MACSQuant 10フローサイトメーターにおいて分析した。
結果
その結果を図8に示す。
パネルAは、リプログラミング因子によるトランスフェクションの24日後のリプログラミングされたSTR0C05細胞のコロニーを示し、
パネルBは、リプログラミングの初期の段階のアルカリホスファターゼ(赤)染色STR0C05細胞を示し、いくつかが多能性マーカーアルカリホスファターゼを発現することを示し、
パネルCは、確立されたSTR0C05-iPSC株を示し、
パネルDは、AP陽性コロニーがさまざまなトランスフェクション条件に供されたウェルでさまざまな頻度で出現していることを示し、コロニーのないウェル1は、対照としてGFP非リプログラミングプラスミドでトランスフェクションし、リプログラミングされた細胞がなく、ウェル4および6は、生存細胞がほとんどなく、
パネルEは、確立されたSTR0C05-iPSC株がアルカリホスファターゼ陽性であることを示し、
パネルFは、それが、多能性マーカーSSEA4も陽性であるが、初期分化マーカーSSEA1に関しては陰性であることを示す。
その結果を図8に示す。
パネルAは、リプログラミング因子によるトランスフェクションの24日後のリプログラミングされたSTR0C05細胞のコロニーを示し、
パネルBは、リプログラミングの初期の段階のアルカリホスファターゼ(赤)染色STR0C05細胞を示し、いくつかが多能性マーカーアルカリホスファターゼを発現することを示し、
パネルCは、確立されたSTR0C05-iPSC株を示し、
パネルDは、AP陽性コロニーがさまざまなトランスフェクション条件に供されたウェルでさまざまな頻度で出現していることを示し、コロニーのないウェル1は、対照としてGFP非リプログラミングプラスミドでトランスフェクションし、リプログラミングされた細胞がなく、ウェル4および6は、生存細胞がほとんどなく、
パネルEは、確立されたSTR0C05-iPSC株がアルカリホスファターゼ陽性であることを示し、
パネルFは、それが、多能性マーカーSSEA4も陽性であるが、初期分化マーカーSSEA1に関しては陰性であることを示す。
STR0C05-iPSCの多能性も上の実施例2に記載されている生殖系列分化方法を使用して確認し、その結果を図9に示す。CTXに関する図7のとおり、3つの一次胚葉を特定するタンパク質マーカー(一般に、転写因子)の同時発現によって示される内胚葉、中胚葉および外胚葉への分化が示されている。
[実施例4]
リプログラミングされたiPSC由来の成体幹細胞は多能性である
CTX-iPSC由来の成体幹細胞の多能性を確認した。予め本発明者らは、候補CTX-iPSC-MSC(間葉系幹細胞)に関する適したマーカー発現およびプラスチックに付着する能力を示す例のフローサイトメトリープロフィールを示した。この実験は、CTX-iPSC-MSCがいくつかの異なる細胞タイプに分化する能力を確認する。
リプログラミングされたiPSC由来の成体幹細胞は多能性である
CTX-iPSC由来の成体幹細胞の多能性を確認した。予め本発明者らは、候補CTX-iPSC-MSC(間葉系幹細胞)に関する適したマーカー発現およびプラスチックに付着する能力を示す例のフローサイトメトリープロフィールを示した。この実験は、CTX-iPSC-MSCがいくつかの異なる細胞タイプに分化する能力を確認する。
方法-多能性を確認するためのCTX-iPSC-MSCの分化
1.脂肪および骨細胞形成の評価のために、CTX-iPSC-MSCを、6ウェル組織培養処理プレートに播き、脂肪生成および骨形成を促進する市販の培地(脂肪生成:StemCell Technologiesカタログ番号05412、骨形成:StemCell Technologiesカタログ番号05465またはR&D systemsカタログ番号CCMN007およびCCM008)とともに最大28日間インキュベーションした後、固定および染色を行った。軟骨形成の評価のために、CTX-iPSC-MSCを、15mlチューブの底にある集塊としてペレット状にし、軟骨形成培地(StemCell Technologiesカタログ番号05455)とともに培養し、続いて標準的な方法を使用してホルムアルデヒド固定、パラフィン包埋および切片作製を行った。
2.アルシアンブルー染色(軟骨形成):スライド上の切片に蒸留水で水分を与え、3%酢酸で3分間処理した後、3%酢酸中の1%アルシアンブルー、pH2.5で30分間染色した。そのスライドを、その後、流水中で5分間洗浄し、蒸留水中ですすぎ、5%硫酸アルミニウム溶液中の0.1%ヌクレアファストレッドで5分間対比染色した後、画像化した。
3.オイルレッドO染色(脂肪生成):6ウェルプレート中の細胞を、PBSで洗浄し、室温で10分間10%ホルムアルデヒドで固定し、PBSで2回洗浄した。それらを、60%イソプロパノール/40%水中の0.3%オイルレッドOで15分間染色し、再蒸留水で洗浄した後、画像化した。
4.アリザリンレッドS染色(骨形成):6ウェルプレート中の細胞を、PBSで洗浄し、室温で10分間10%ホルムアルデヒドで固定し、PBSで2回洗浄した。それらを、室温において2%アリザリンレッドS溶液、pH4.2で15分間染色し、水で洗浄し、画像化した。
1.脂肪および骨細胞形成の評価のために、CTX-iPSC-MSCを、6ウェル組織培養処理プレートに播き、脂肪生成および骨形成を促進する市販の培地(脂肪生成:StemCell Technologiesカタログ番号05412、骨形成:StemCell Technologiesカタログ番号05465またはR&D systemsカタログ番号CCMN007およびCCM008)とともに最大28日間インキュベーションした後、固定および染色を行った。軟骨形成の評価のために、CTX-iPSC-MSCを、15mlチューブの底にある集塊としてペレット状にし、軟骨形成培地(StemCell Technologiesカタログ番号05455)とともに培養し、続いて標準的な方法を使用してホルムアルデヒド固定、パラフィン包埋および切片作製を行った。
2.アルシアンブルー染色(軟骨形成):スライド上の切片に蒸留水で水分を与え、3%酢酸で3分間処理した後、3%酢酸中の1%アルシアンブルー、pH2.5で30分間染色した。そのスライドを、その後、流水中で5分間洗浄し、蒸留水中ですすぎ、5%硫酸アルミニウム溶液中の0.1%ヌクレアファストレッドで5分間対比染色した後、画像化した。
3.オイルレッドO染色(脂肪生成):6ウェルプレート中の細胞を、PBSで洗浄し、室温で10分間10%ホルムアルデヒドで固定し、PBSで2回洗浄した。それらを、60%イソプロパノール/40%水中の0.3%オイルレッドOで15分間染色し、再蒸留水で洗浄した後、画像化した。
4.アリザリンレッドS染色(骨形成):6ウェルプレート中の細胞を、PBSで洗浄し、室温で10分間10%ホルムアルデヒドで固定し、PBSで2回洗浄した。それらを、室温において2%アリザリンレッドS溶液、pH4.2で15分間染色し、水で洗浄し、画像化した。
結果
図10は、iPSC由来のMSCが、軟骨(シアログリカンのアルシアンブルー染色によって示される)、脂肪(オイルレッドOによる細胞内脂質滴の染色によって示される)および骨(沈着したカルシウムのアリザリンレッド染色によって示される)へ分化する能力を示す。
図10は、iPSC由来のMSCが、軟骨(シアログリカンのアルシアンブルー染色によって示される)、脂肪(オイルレッドOによる細胞内脂質滴の染色によって示される)および骨(沈着したカルシウムのアリザリンレッド染色によって示される)へ分化する能力を示す。
その後、4-OHTの存在下または非存在下において高継代(20継代)まで培養したCTX-iPSC-MSCに関するフローサイトメトリープロフィールを得た。その結果を図11に示す。この試験株は、先に作成したバイサルファイトデータが脱メチル化C-MYC-ERTAMプロモーターを有したことを示した株であり、その結果、プロモーターがこれらの細胞において依然として活性であるはずであることを示唆するものである。興味深いことに、この株は、4-OHTが細胞周期を誘導しているとき、そのマーカープロフィールをよりよく維持するようであり、CD90およびCD105発現はより一定でより高く、陰性マーカーCD14、20、34および45は、より厳重に「オフ」である(この株は、常により低いCD73発現を示す、場合によって、抗体のアーティファクト)。第2のパネルにおいて、4-OHT処理細胞は、分化時に骨を形成するのにより有効であるようであり、4-OHTが関係する細胞周期の強制が周期からの逸脱および能力の喪失を改善することを示唆する。
[実施例5]
リプログラミングされたCTX-iPSC-MSCのさらなる特徴づけ
CTX-iPSC-MSC株を、4-OHTの非存在下または存在下で培養した。図12および13の2つの異なるCTX-iPSC-MSC細胞培養を用いた実験の結果は、4-OHT/C-MYC-ERTAMの存在および活性により向上したより一貫した長期にわたる増殖を示す。
リプログラミングされたCTX-iPSC-MSCのさらなる特徴づけ
CTX-iPSC-MSC株を、4-OHTの非存在下または存在下で培養した。図12および13の2つの異なるCTX-iPSC-MSC細胞培養を用いた実験の結果は、4-OHT/C-MYC-ERTAMの存在および活性により向上したより一貫した長期にわたる増殖を示す。
この実施例は、条件付きで不死化されたiPSC-ASCが、より確実により長く増殖させることができることを示す。
[実施例6]
同種異系免疫療法のスケーラブルな生成のために条件付きで不死化可能なhiPSCから誘導される造血系
方法および裏付けデータ
この実施例は、CTX-iPSCが中胚葉細胞、HSCおよび高分化造血細胞(例えば、キラーT細胞)を形成することができることを示す。本発明者らは、専用の培地などの市販のシステムおよび文献において公開されているプロトコルの両方を含む、さまざまな方法を使用した。どちらの場合も、確立されたシステムは、別のドナー細胞タイプ、例えば、hPSCではなく骨髄または臍帯血由来のHSCを念頭において一般に設計されているため、本発明者らは、必要な場合、確立された技術に独自の改変を行った。
同種異系免疫療法のスケーラブルな生成のために条件付きで不死化可能なhiPSCから誘導される造血系
方法および裏付けデータ
この実施例は、CTX-iPSCが中胚葉細胞、HSCおよび高分化造血細胞(例えば、キラーT細胞)を形成することができることを示す。本発明者らは、専用の培地などの市販のシステムおよび文献において公開されているプロトコルの両方を含む、さまざまな方法を使用した。どちらの場合も、確立されたシステムは、別のドナー細胞タイプ、例えば、hPSCではなく骨髄または臍帯血由来のHSCを念頭において一般に設計されているため、本発明者らは、必要な場合、確立された技術に独自の改変を行った。
中胚葉。図14は、インビトロでのhPSCからの造血系細胞の生成における最初の必須のステップを示し、それによって、アクチビンA、VEGF、SCFおよびBMP4を加えた市販の培地は、CTX-iPSC分化を中胚葉に誘導する(Jung M et al. [2018] Blood Advances 2 3553)。
造血幹細胞。HSCを、図15Aに示されるとおりCTX-iPSC由来の中胚葉細胞(図14B)から形成した。CTX-iPSC-中胚葉細胞を、FLT3、SCF、BMP-4、ならびにインターロイキン3および6の存在下において14日間培養した。本発明者らは、この時点で最大およそ60%のCD34が陽性の細胞を観察している。これらの細胞の大きな割合が(図15B)CD43も陽性であった。これは、CD43+ HSCが、CD34単独陽性の細胞よりも広い能力を有するようであり、赤血球系細胞(Kessel et al., 2017, Transfus Med Haemother 44 143-50)および骨髄系細胞ならびにリンパ系細胞も形成することができるようであるため注目すべきである。白血球マーカーCD45は、この段階では細胞の未成熟さと一致して非常に低いレベルで発現し(図15B)、したがって成熟マーカーの発現が低いが、本発明者らは、この分化段階からの細胞においてNKマーカーCD56を発現する細胞を確認した。これは、CTX-HSCもナチュラルキラー細胞を生成する潜在性があることを示唆する。
リンパ球。CTX-iPSC-HSCを、共培養方法(Montel-Hagen et al., 2019 Cell Stem Cell 24 1-14)、および臍帯血HSCを、結合したVCAMおよびDLL4タンパク質の単層上で培養した(Shukla et al., 2017 Nature Methods 14 531-538)方法の適合の両方を使用してTリンパ球細胞運命に分化させた(図16)。どちらの場合も、HSCにおけるNOTCHシグナル伝達を活性化し、Tリンパ球運命への分化を誘導するために、関連タンパク質DLL-1またはDLL-4の一方を供給した。
図17Aは、CTX-HSCを、HSCにVCAMおよびDLL4を提示する結合したキメラタンパク質の層上で14日の期間培養することによってCTX-HSCから前駆T細胞を形成する方法を示す。14日の期間の終わりに、付着および懸濁細胞の不均質な集団が得られた。これらの細胞は、フローサイトメトリーによって(図17B)、前駆リンパ球集団を含むより小さな懸濁細胞(「単一細胞2」集団、図17)と区別することができた。この細胞集団は、CD3(T細胞レセプター関連タンパク質)、CD43(白血球マーカー)、CD5(リンパ球、主に初期T細胞マーカー)、CD7(未成熟T細胞マーカーおよびNK細胞マーカー)およびCD25(インターロイキン2レセプター)を発現した。しかしながら、成熟T細胞の表現型よりもむしろそのT前駆細胞の表現型の解釈と一致して、CD5およびCD7の発現に加えて、それらはT細胞レセプター自体も関連分子CD4もしくはCD8も発現しなかった。これは、前駆細胞表現型を維持しながら細胞集団を増殖させるサイクルを誘導するために条件付き不死化システムを使用して、初期のリンパ系またはリンパ球(例えば、具体的にはT前駆細胞および/またはB前駆細胞)を単離する興味深い可能性を示唆する。
結合したFc-DLL4およびFc-VCAMタンパク質上におけるTリンパ球前駆細胞のより長期間の培養(図18A、25日、14日とは対照的)は、いくぶんより均質になり(図18B)、より成熟した表現型に達した(図18C~E)細胞集団をもたらした。これらの細胞は、より均一(例えば、60%を超える細胞が白血球マーカーCD43を発現した)であり、それらが、CD3に加えてCD8も発現したが、CD5およびCD7の発現は失われたより成熟したリンパ球集団を表すという解釈と一致する。したがって、このプロトコルは、例えば、現在のところCAR-T抗腫瘍治療薬の基礎を形成するなど、細胞傷害性T細胞と最も類似したリンパ球の集団を形成した。
条件付き不死化hiPSC由来のHSCからより成熟したリンパ球集団を作り出すために分化の代替的な方法も使用した。ヒトNOTCHリガンドDLL1を発現するように操作されたマウスMS5間質細胞とのCTX-HSCの共培養(図19)またはMS5-DLL1細胞の単層上でのCTX-HSCの共培養は、小さな非付着性細胞集団の高い増殖を引き起こした(図20B)。この集団は、分化の過程で成熟して、CD34発現を失った(図20C)が、初期マーカーCD5およびCD7発現レベルが低下したものの、CD8発現は観察されなかった(図20D~F)。したがって、この方法によって生成されたT細胞前駆細胞は、おそらく上記の結合タンパク質アプローチによって生成されるものよりもT細胞の発生の早い段階を表す(図21)。
図22は、本発明のHSCにおけるCD56の発現の増加を示し、したがって、NK細胞などの非抗原特異的なリンパ球を生成するための本発明のHSCの潜在性を強調する。
条件付き不死化を使用した集団のスケーラブルな増殖に先立って分化経路が辿る段階を「細かく調整する」この能力は、患者に提供されるであろう細胞に対する絶妙な制御レベルを提供する非常に強力なシステムを示す。
結論
CTX-iPSC-HSCおよびその分化誘導体は、場合によっては、非常に有用な臨床的リソースとなる。それらを、凍結保存用に条件付き不死化システムを使用して大規模な細胞バンクを形成するために増殖させてもよく、または治療用に純粋でGMP標準的な細胞の標的集団を形成するために、おそらく遺伝子改変を伴い、さらに分化させてもよい。これは、各患者に対して免疫適合ドナー(immunocompatible donor)の特定およびドナーからの原材料の細胞単離を必要とせずに、以前は実現不可能だった臨床的に関連した部分集団の定型化したスケーラブルな生産を可能にするであろう。さらに、これらのCTX-iPSC-HSCおよびその誘導体サブタイプは既に臨床安全性試験に合格した細胞株(CTX)から誘導されるため、新しい適応症における効力に関する臨床試験への移行が加速される可能性がある。
CTX-iPSC-HSCおよびその分化誘導体は、場合によっては、非常に有用な臨床的リソースとなる。それらを、凍結保存用に条件付き不死化システムを使用して大規模な細胞バンクを形成するために増殖させてもよく、または治療用に純粋でGMP標準的な細胞の標的集団を形成するために、おそらく遺伝子改変を伴い、さらに分化させてもよい。これは、各患者に対して免疫適合ドナー(immunocompatible donor)の特定およびドナーからの原材料の細胞単離を必要とせずに、以前は実現不可能だった臨床的に関連した部分集団の定型化したスケーラブルな生産を可能にするであろう。さらに、これらのCTX-iPSC-HSCおよびその誘導体サブタイプは既に臨床安全性試験に合格した細胞株(CTX)から誘導されるため、新しい適応症における効力に関する臨床試験への移行が加速される可能性がある。
[実施例7]
CTX-iPSCの造血分化は、HSC、リンパ系前駆細胞およびエフェクターを生成する
多くのさらなる実験は、造血系のさまざまな細胞に分化するCTX-iPSC-HSCの能力を確認した。これらのさらなる実験の結果を図25に示す。
CTX-iPSCの造血分化は、HSC、リンパ系前駆細胞およびエフェクターを生成する
多くのさらなる実験は、造血系のさまざまな細胞に分化するCTX-iPSC-HSCの能力を確認した。これらのさらなる実験の結果を図25に示す。
簡単に言えば、これらの実験は、以下のことを示す:
- CD34+細胞(血管内皮性(hemoendothelial)前駆細胞および幹細胞)へのCTX-iPSC分化の確認。
- 一部のCD34+細胞はCD49FおよびCD90も陽性で、マーカーCD38およびCD45RAが陰性であることの確認。まとめると、これらの結果は、作り出された細胞が、免疫系全体を再構成することができる細胞およびこの系列のすべてのエフェクター細胞タイプの前駆細胞である、真の長期造血幹細胞(LT-HSC)であることを強く示唆する。これは、重要な結果である。
- CTX-iPSC由来のCD34+細胞(おそらく上記のCD34+CD49F+C45RA-CD90+CD38- LT-HSC)のさらなる分化によるリンパ系前駆細胞(LP)の生成。
- 上記CTX-LPからのCD3+CD8+TCR+細胞傷害性T細胞の生成。
- CTX-LPからのナチュラルキラー細胞の生成のさらなる証拠。
- CD34+細胞(血管内皮性(hemoendothelial)前駆細胞および幹細胞)へのCTX-iPSC分化の確認。
- 一部のCD34+細胞はCD49FおよびCD90も陽性で、マーカーCD38およびCD45RAが陰性であることの確認。まとめると、これらの結果は、作り出された細胞が、免疫系全体を再構成することができる細胞およびこの系列のすべてのエフェクター細胞タイプの前駆細胞である、真の長期造血幹細胞(LT-HSC)であることを強く示唆する。これは、重要な結果である。
- CTX-iPSC由来のCD34+細胞(おそらく上記のCD34+CD49F+C45RA-CD90+CD38- LT-HSC)のさらなる分化によるリンパ系前駆細胞(LP)の生成。
- 上記CTX-LPからのCD3+CD8+TCR+細胞傷害性T細胞の生成。
- CTX-LPからのナチュラルキラー細胞の生成のさらなる証拠。
さらに具体的には、図25は、CTX-iPSCの造血分化が、HSC、リンパ系前駆細胞およびエフェクターを生成することを示す。
パネルAは、胚様体が、単一細胞懸濁液を非付着性マイクロウェルプレートに播くことによってCTX-iPSCから形成されたことを示す。
パネルBでは、EBを、中胚葉促進培地の存在下において(3日目まで)培養した後、造血系規定培地において(10日目まで)培養して、(パネルC)CD34+細胞を形成し、そのおよそ5%がCD34+CD49f+CD90+CD38-CD45RA- LT-HSCであった。パネルDは、このように誘導されたCD34+細胞を、抗CD34磁気ビーズを用いて単離した後、さらに14日間分化させて、(E)CD7+リンパ球前駆細胞を形成し、これは、いくらか低下した多能性を保持し、その結果、それぞれ14または21日間分化させることができ、ナチュラルキラーまたはCD4-CD8+TCRαβ細胞傷害性T細胞を生成したことを示す。
選択参考文献
Claims (29)
- 条件付き不死化に関する制御可能な導入遺伝子を含む、人工多能性幹細胞から誘導される、造血系の細胞。
- 前記細胞は、
CD34+CD43+造血幹細胞;
CD4+T細胞;
CD8+T細胞;
制御性T細胞;
CD56highCD16±ナチュラルキラー細胞;
CD56lowCD16highナチュラルキラー細胞;
CD19+B細胞;
骨髄系樹状細胞;
プラズマ細胞様樹状細胞;
好中球;または
CD34+CD49f+CD90+CD38-CD45RA-長期HSC
である、請求項1に記載の造血系の細胞。 - 前記細胞は、骨髄芽球、リンパ芽球、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、単球、マクロファージ、CD56DIMナチュラルキラー細胞、CD56BRIGHTナチュラルキラー細胞、CD56highCD16±ナチュラルキラー細胞、CD56lowCD16highナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、CD161を発現するNKT細胞、CD4+T細胞、CD8+T細胞、メモリT細胞、B-2細胞、B-1細胞、メモリB細胞、プラズマB細胞、骨髄系樹状細胞、またはプラズマ細胞様DCである、請求項1に記載の造血系の細胞。
- 前記多能性幹細胞は、条件付き不死化細胞または条件付き不死化幹細胞から得ることができるか、または得られる、請求項1~3のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 前記多能性幹細胞は、1つ以上の転写因子により条件付き不死化幹細胞をリプログラミングすることによって得ることができるか、または得られる、請求項1~4のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 前記多能性幹細胞は、C-MYC-ER融合タンパク質を含む、請求項1~5のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 前記多能性幹細胞は、任意にそのゲノム中に、c-mycER導入遺伝子を含む、請求項1~6のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 前記多能性幹細胞は、条件付き不死化神経幹細胞から得ることができるか、または得られる、請求項1~7のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 請求項1~8のいずれかに記載の前記多能性幹細胞は、条件付き不死化幹細胞株から得ることができるかまたは得られる、請求項1~8のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 前記幹細胞株は、ECACC受託番号04091601を有するCTX0E03またはECACC受託番号04110301を有するSTR0C05である、請求項9に記載の造血系の細胞。
- 前記細胞は、造血分化の1つ以上のマーカーを発現する造血幹細胞である、請求項1~10のいずれかに記載の造血系の細胞。
- 多能性幹細胞から造血系の細胞を生成する方法であって、(i)条件付き不死化幹細胞をリプログラミングして、多能性細胞を形成するステップ;および(ii)前記多能性細胞を造血系の細胞に分化させるステップを含む、方法。
- 前記リプログラミングするステップは、前記条件付き不死化幹細胞に、転写因子OCT4、L-MYC、KLF4およびSOX2のうちの1つ以上、および任意にRNA結合LIN28を導入することを含む、請求項12に記載の方法。
- 前記導入された転写因子は、OCT4を含むか、もしくはそれからなる、
前記導入された転写因子は、OCT4およびSOX2を含むか、もしくはそれらからなる、
前記導入された転写因子は、OCT、KLF4およびSOX2を含むか、もしくはそれらからなる、
前記導入された転写因子は、OCT4、KLF4、SOX2およびMYCを含むか、もしくはそれらからなる、または
MYC活性は、リプログラミングされる前記幹細胞においてc-myc-ERTAM導入遺伝子を活性化するために培地に4-OHTを供給することによってもたらされ、リプログラミングプロセスを促進する、請求項13に記載の方法。 - 前記転写因子および任意のLIN28は、前記条件付き不死化幹細胞中に、1つ以上のエピソームプラスミド、または1つ以上のウイルスベクター、任意にレンチウイルス、レトロウイルスもしくはセンダイウイルスから選択される1つ以上のウイルスベクターを使用して、またはmRNAトランスフェクションによって導入される、請求項13または請求項14に記載の方法。
- 前記分化ステップは、前記多能性細胞をHSCおよび任意にさらに後の系列に分化させるステップを含む、請求項12から15のいずれかに記載の方法。
- 前記多能性細胞を、(i)アクチビンA、VEGF、SCFおよびBMP4を含む培地において培養して、中胚葉細胞を形成した後、(ii)前記中胚葉細胞をFLT3、SCF、BMP-4、ならびにインターロイキン3および6の存在下において培養して、HSCを形成することによって、前記HSCに分化させる、請求項16に記載の方法。
- 前記HSCを、(i)培養物にDLL-1もしくはDLL-4タンパク質を供給して、前記HSCにおけるNOTCHシグナル伝達を活性化すること、または(ii)任意にNotchリガンドDLL1を発現するよう操作された、間質細胞と前記HSCを共培養すること、または(iii)結合したVCAMおよびDLL4タンパク質の単層上で前記HSCを培養することによって、Tリンパ球運命に分化させる、請求項16または請求項17に記載の方法。
- 前記造血系は、リプログラミングされた前記条件付き不死化幹細胞の系列とは異なる、請求項12から18のいずれかに記載の方法。
- 前記造血系の細胞は、請求項2または請求項3のいずれかにおいて定義されるとおりである、請求項12から19のいずれかに記載の方法。
- 前記方法の結果もたらされる前記造血系の細胞の条件付きで不死化された表現型を再活性化するステップを含む、請求項12から20のいずれかに記載の方法。
- リプログラミングされる前記条件付き不死化幹細胞は、請求項4から10のいずれかにおいて定義されるとおりである、請求項12から21のいずれかに記載の方法。
- 前記方法によって得られる前記細胞を培養するステップ;
前記方法によって得られる前記細胞を継代するステップ;
前記方法によって得られる前記細胞を収集するステップもしくは回収するステップ;
前記方法によって得られる前記細胞を1つ以上の容器に包装するステップ;および/または
前記方法によって得られる前記細胞を1つ以上の賦形剤、安定剤もしくは保存料とともに製剤化するステップ
から選択される1つ以上のステップを含む、請求項12から22のいずれかに記載の方法。 - 請求項12から23に記載の方法によって得られるか、または得ることができる、造血系の細胞。
- 請求項1から11、または24のいずれかに記載の細胞によって産生される、細胞外小胞。
- エクソソームである、請求項25に記載の細胞外小胞。
- 請求項1から11または24のいずれかに記載の細胞あるいは請求項25または請求項26に記載の細胞外小胞、および1つ以上の薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
- 凍結、凍結保存または凍結乾燥されている、請求項27に記載の医薬組成物。
- 疾患または障害を、必要とする患者において処置する方法において使用するための、任意に前記疾患または障害はがん、自己免疫疾患または感染症であり、任意に前記感染症は、任意に前記ウイルスがコロナウイルスであるウイルス感染症または他のウイルス性気道感染症である、請求項24に記載の細胞、請求項25または26に記載の細胞外小胞、あるいは請求項27または請求項28に記載の医薬組成物。
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