JP2023507742A - 組織の音速および硬度を使用した癌リスク評価のための方法およびシステム - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2019年12月17日に出願された米国仮特許出願第62/948,993号、2019年12月17日に出願された米国仮特許出願第62/949,004号および2019年12月20日に出願された米国仮特許出願第62/952,000号の優先権を主張し、その全内容は参照により本明細書中に組み込まれる。
本開示は、特に、癌リスク、検出および処置後の監視を含む、乳房組織などの組織を診断および監視するための医療システム、装置および方法に関する。
本開示は、特にリスク評価、癌検出および/または処置プロトコール中および/または処置プロトコール後の監視のために、乳房組織などの組織を特徴付ける、および/または診断するための、改善されたシステム、装置および方法に関する。
本明細書中で言及される全ての刊行物、特許および特許出願は、各個々の刊行物、特許または特許出願が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているのと同程度に、参照により本明細書中に組み込まれる。
ここで、様々な実施形態を詳細に参照し、その例が添付の図面で示される。以下の詳細な説明では、本開示および記載された実施形態の完全な理解を提供するために、多数の具体的な詳細が記載される。しかし、本発明の実施形態は、必要に応じて、これらの具体的な詳細なく実施される。他の例では、実施形態の態様を不必要に不明瞭にしないように、周知の方法、手順、構成要素および回路は詳細に説明していない。図面において、同様の参照番号は、同様または類似の段階または構成要素を示す。
臨床的乳癌リスク評価は、家族歴、生殖およびライフサイクル因子、ならびに過去の放射線学的所見などの確立された乳癌リスク因子を含むモデルに基づく。GailモデルおよびTyrer-Cuzickモデルは、本開示のシステムおよび方法と組み合わせて使用され得る2つのツールの例である。例えば、Gail MHら(1989)Projecting individualized probabilities of developing breast cancer for white females who are being examined annually.Journal of the National Cancer Institute 81(24):1879-1886およびBrentnall,A.R.ら(2015年12月),Mammographic density adds accuracy to both the Tyrer-Cuzick and Gail breast cancer risk models in a prospective UK screening cohort.Breast Cancer Research 17(1)、147+を参照のこと(これらの各々は、参照によりその全体が本明細書中に組み込まれる)。そのようなモデルは、集団レベルで寿命リスクの正確な推定値を提供し得る一方で、個別化されたリスク予測は、少なくとも一部の例では不十分である。識別力の尺度の例は、受信者動作特性曲線下面積を表すコンコーダンス(c)統計量である。ほとんどの乳癌リスクモデルに対するC統計量は平均0.6前後であり、リスク予測モデルが正確であるのは60%の時間のみであることを示す。したがって、それらの識別精度を向上させることを期待して、現在のモデルに新しいリスク要因を追加することに関心が寄せられている。
図2は、マンモグラム201の一例を、Volpara読み取り202後の出力と共に示す。示されるように、Volpara読み取り出力は、幾分かの乳房密度情報を出力する。マンモグラフィ乳房密度(BD)の上昇は、乳癌を発症するリスクを上昇させ得る。いくつかの態様では、BDのイメージングバイオマーカーとしての音速の実行可能性を評価するためのマンモグラフィ(Volpara)での密度判定のための確立された3D法に対する超音波断層撮影(UST)の直接比較が本明細書中で開示される。
マンモグラフィにおける乳房のX線写真の様相は、女性の間で異なり、乳房組織組成の変動、およびこれらの組織の異なるX線減衰特性を反映する。マンモグラフィにおけるBDの変動は、乳房におけるコラーゲンの量および上皮細胞および非上皮細胞の両方の細胞数の変動を反映する。マンモグラフィの主要な目標である乳癌の検出を支援するために、画像処理が最大化される。処理は空間的に変動性であり、処理が画像全体にわたって均一ではないことを意味する。さらに、各製造者は独自の処理を行う。処理された画像の生成における製造者間の相違および癌検出をさらに改善するための技術の予想される将来的な進化は、マンモグラフィがBDの測定のための「動く目標」のままである可能性が高いことを意味する。
従来の乳房超音波全体は、放射線を使用せず、MRIと比較して低コストである。しかしながら、乳房は検査中に歪み、高密度組織を脂肪から分離する能力は制限され得る。発明者らは、透過撮像を使用する新しい超音波法を提案した。これは、USTの原理に基づいており、乳房組織の音速特性を測定する。この方法は、真の体積測定値を使用し、マンモグラフィとは異なり、密度測定値は定量的である。この研究では、乳房の体積音速特性を体積MPDと比較するために、USTからの乳房撮像データおよびマンモグラフィからのおよびVolparaデータを使用した。
臨床的意思決定を支援するイメージングデータも限られており、標準化された方法で日常的に使用されていない。ハンドヘルド超音波(HHUS)が腫瘍サイズを監視するために使用されることが多いが、このアプローチは固有の腫瘍特性を測定せず、したがって、処置の初期段階における応答の高感度の尺度とはならない。例えば、162名の乳癌患者からのインビボ腫瘍測定値を外科手術後の病理学的残存腫瘍サイズと比較し、Peintinger F,Kuerer HM,Anderson Kら、’’Accuracy of Combination of Mammography and Sonography in Predicting Tumor Response in BC Pts After Neoadjuvant Chemotherapy,’’Ann Surg.Oncol 2006 Nov;13:1443-9.Epub 2006 Sep 21に記載のように、標準的なマンモグラフィを乳房超音波と組み合わせた場合に、67%の最良の一致(ベンチマーク)が認められた。
しかしながら、副作用を最小限に抑え、処置および手術計画を最適化するために、療法に対する腫瘍の応答の正確な早期評価が必要とされる。
本開示のシステムおよび方法はまた、良性および悪性の腫瘤における高密度実質パターン分布に関連して、超音波断層撮影(UST)による乳房全体の硬さの潜在的な役割を評価するために役立ち得る。本開示のシステムおよび方法は、USTの圧縮性イメージングの表示を改善する。診断情報の表示を改善するために、様々な画像モダリティが評価されている。既知の良性および悪性の腫瘤を有する患者について、相対的な乳房の硬度および実質分布の定量的および定性的両方の体積評価を本明細書中で評価する。改善されたイメージングモダリティは、高密度乳房スクリーニングおよび/または腫瘤の特徴付けのためのトレーニングおよび将来のUST適用を導くために役立ち得る。本明細書中で提供されるシステムおよび方法は、コンピュータ支援検出および/または診断のためのさらなる硬度体積パラメータを提供し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書中に記載のプラットフォーム、システム、媒体および方法は、デジタル処理装置または同等物のプロセッサを含む。さらなる実施形態では、プロセッサは、装置の機能を実行する1またはそれを超えるハードウェア中央処理装置(CPU)または汎用グラフィックス処理装置(GPGPU)を含む。またさらなる実施形態では、デジタル処理装置は、実行可能な命令を実行するように構成されたオペレーティングシステムをさらに含む。いくつかの実施形態では、デジタル処理装置は、必要に応じてコンピュータネットワークに接続される。さらなる実施形態では、デジタル処理装置は、必要に応じて、ワールドワイドウェブにアクセスするようにインターネットに接続される。またさらなる実施形態では、デジタル処理装置は、必要に応じてクラウドコンピューティングインフラストラクチャに接続される。他の実施形態では、デジタル処理装置は、必要に応じてイントラネットに接続される。他の実施形態では、デジタル処理装置は、必要に応じてデータ記憶装置に接続される。
いくつかの実施形態では、本明細書中で開示されるプラットフォーム、システム、媒体および方法は、少なくとも1つのコンピュータプログラムまたはその使用を含む。コンピュータプログラムは、指定されたタスクを実行するように書かれた、プロセッサのCPUで実行可能な一連の命令を含む。コンピュータ可読命令は、特定のタスクを実行する、または特定の抽象データ型を実装する、関数、オブジェクト、アプリケーションプログラミングインターフェース(API)、データ構造などのプログラムモジュールとして実装され得る。本明細書中で提供される開示に照らして、当業者は、コンピュータプログラムが様々な言語の様々なバージョンで書かれ得ることを認識するであろう。
いくつかの実施形態では、コンピュータプログラムはウェブアプリケーションを含む。本明細書中で提供される開示に照らして、当業者は、ウェブアプリケーションが、様々な実施形態において、1またはそれを超えるソフトウェアフレームワークおよび1またはそれを超えるデータベースシステムを利用することを認識するであろう。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、Microsoft(登録商標).NETまたはRuby on Rails(RoR)などのソフトウェアフレームワーク上に作成される。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、非限定例として、リレーショナル、非リレーショナル、オブジェクト指向、連想およびXMLデータベースシステムを含む1またはそれを超えるデータベースシステムを利用する。さらなる実施形態では、適切なリレーショナルデータベースシステムは、非限定例として、Microsoft(登録商標)SQL Server、mySQL(商標)およびOracle(登録商標)を含む。当業者はまた、ウェブアプリケーションが、様々な実施形態において、1またはそれを超える言語の1またはそれを超えるバージョンで書かれていることも認識するであろう。ウェブアプリケーションは、1またはそれを超えるマークアップ言語、プレゼンテーション記述言語、クライアントサイドスクリプト言語、サーバサイドコーディング言語、データベース照会言語またはそれらの組み合わせで書かれ得る。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、ハイパーテキストマークアップ言語(HTML)、拡張可能なハイパーテキストマークアップ言語(XHTML)または拡張可能マークアップ言語(XML)などのマークアップ言語である程度書かれる。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、カスケーディングスタイルシート(CSS)などのプレゼンテーション定義言語である程度書かれる。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、非同期Javascript(登録商標)およびXML(AJAX)、Flash(登録商標)Actionscript、Javascript(登録商標)またはSilverlight(登録商標)などのクライアントサイドスクリプト言語である程度書かれる。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、アクティブサーバページ(ASP)、ColdFusion(登録商標)、Perl、Java(登録商標)、Java(登録商標)Server Pages(JSP)、ハイパーテキストプリプロセッサ(PHP)、Python(商標)、Ruby、Tel、Smalltalk、WebDNA(登録商標)またはGroovyなどのサーバサイドコーディング言語である程度書かれる。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、構造化照会原語(SQL)などのデータベース照会言語である程度書かれる。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションは、IBM(商標)Lotus Domino(商標)などの企業サーバ製品を統合する。いくつかの実施形態では、ウェブアプリケーションはメディアプレーヤ要素を含む。様々なさらなる実施形態では、メディアプレーヤ要素は、非限定例として、Adobe(登録商標)Flash(登録商標)、HTML5、Apple(登録商標)QuickTime(登録商標)、Microsoft(登録商標)Silverlight(登録商標)、Java(登録商標)およびUnity(登録商標)を含む多くの適切なマルチメディア技術のうちの1またはそれを超えるものを利用する。
いくつかの実施形態では、コンピュータプログラムは、モバイルプロセッサに提供されるモバイルアプリケーションを含む。いくつかの実施形態では、モバイルアプリケーションは、製造時にモバイルプロセッサに提供される。他の実施形態では、モバイルアプリケーションは、本明細書中に記載のコンピュータネットワークを介してモバイルプロセッサに提供される。
いくつかの実施形態では、本明細書中で開示されるプラットフォーム、システム、媒体および方法は、ソフトウェア、サーバおよび/またはデータベースモジュールまたはその使用を含む。本明細書中で提供される開示を考慮して、ソフトウェアモジュールは、当業者にとって公知のマシン、ソフトウェアおよび言語を使用して、当業者にとって公知の技術によって作成される。本明細書中で開示されるソフトウェアモジュールは、多数の方法で実装される。様々な実施形態では、ソフトウェアモジュールは、ファイル、コードセクション、プログラミングオブジェクト、プログラミング構造またはそれらの組み合わせを含む。さらに様々な実施形態では、ソフトウェアモジュールは、複数のファイル、複数のコードセクション、複数のプログラミングオブジェクト、複数のプログラミング構造またはそれらの組み合わせを含む。様々な実施形態では、1またはそれを超えるソフトウェアモジュールは、非限定例として、ウェブアプリケーション、モバイルアプリケーションおよびスタンドアロンアプリケーションを含む。いくつかの実施形態では、ソフトウェアモジュールは、1つのコンピュータプログラムまたはアプリケーション内にある。他の実施形態では、ソフトウェアモジュールは、複数のコンピュータプログラムまたはアプリケーション内にある。いくつかの実施形態では、ソフトウェアモジュールは1つのマシン上でホストされる。他の実施形態では、ソフトウェアモジュールは複数のマシン上でホストされる。さらなる実施形態では、ソフトウェアモジュールはクラウドコンピューティングプラットフォーム上でホストされる。いくつかの実施形態では、ソフトウェアモジュールは、1つの場所で、1またはそれを超えるマシン上でホストされる。他の実施形態では、ソフトウェアモジュールは、1またはそれを超える場所で、1またはそれを超えるマシン上でホストされる。
いくつかの実施形態では、本明細書中で開示されるプラットフォーム、システム、媒体および方法は、1またはそれを超えるデータベースまたはその使用を含む。本明細書中で提供される開示を考慮して、当業者は、多くのデータベースが生画像データ、再構築画像データ、ROI、訓練データ、ラベルまたは分類、特性、特性のサブカテゴリー、機械学習アルゴリズムなどの記憶および検索に適していることを認識するであろう。様々な実施形態では、適切なデータベースは、非限定例として、リレーショナルデータベース、非リレーショナルデータベース、オブジェクト指向データベース、オブジェクトデータベース、エンティティ・リレーションシップモデルデータベース、連想データベースおよびXMLデータベースを含む。さらなる非限定例としては、SQL、PostgreSQL、MySQL、Oracle、DB 2およびSybaseが挙げられる。いくつかの実施形態では、データベースはインターネットベースである。さらなる実施形態では、データベースはウェブベースである。またさらなる実施形態では、データベースはクラウドコンピューティングベースである。他の実施形態では、データベースは、1またはそれを超えるローカルコンピュータ記憶装置に基づく。
体積平均音速を使用した癌リスク評価
音速およびMPDに関連する乳癌リスクを、最近乳癌と診断された61名の参加者(症例)および乳癌の病歴がない165名の参加者(対照)を含む症例対照研究で試験した。MPDおよび音速の四分位数と乳癌リスクとの関係について、マッチング因子に対して調整されたオッズ比(OR)および95%信頼区間(CI)を計算した。MPDは、対照と比較して乳癌リスクの上昇に関連していたが、この傾向は統計学的有意性に達しなかった(p=0.10)。それに対して、音速の上昇は、用量反応方式で乳癌リスクと有意に関連していた(p=0.0003)。症例対照研究は、全乳房音速がMPDよりも乳癌リスクとより強く関連することを示した。
定期的なスクリーニング後の乳癌の最近の診断に基づいて症例を特定した。除外基準は以下の通りであった:1)妊娠;2)授乳;3)イメージングタンク中の水との界面が開いているため、活動性皮膚感染症または開放性胸部創傷を有すること;4)直径22cm超の乳房サイズ(リング超音波トランスデューサのサイズの限界)および5)体重350ポンド(lb)超)(台の製造者によって指定された体重制限)。さらに、発明者らは、6)両側性同期乳癌(癌の放射線学的徴候のないマンモグラムが入手可能ではない)を有する症例;7)乳癌に対する何らかの全身療法を受けたことがある対象;および8)乳房インプラントを有するかまたは縮小乳房形成術を受けた対象を除外した。
対照は、マンモグラフィまたはSoftVueのいずれかで良性または悪性の所見がなかった参加者から選択した。さらに、適格対照は、乳癌の既往歴または現在の病歴がなく、症例について上に与えられた除外基準がなかった。発明者らはまた、乳房密度を調節し得るので、内因性ホルモンを現在服用している(すなわち、経口避妊薬および閉経期ホルモン療法)スクリーニング陰性女性も除外した。
USTによって収集された生データからデータを再構成し、標準的なディスプレイワークステーションで見られたDICOM画像として出力した。本明細書で要約した技術を使用して、乳房の体積平均音速(VASS)を計算した。
・ 発明者らの以前に開発された自動化スクリプトを使用して、直接画素数を通じて乳房の体積Vを計算する。
・ 全ての画素値を合計し、発明者らの自動化スクリプトを使用して上記で決定された体積で除することによって、各スタックに対して体積平均音速(VASS)を計算する。
・ この計算を全ての症例および対照の画像スタックに適用する。
マンモグラフィのBDパーセントの推定値を生成させるために、Cumulusソフトウェアパッケージを使用してマンモグラムを分析した。Boyd NFら(2007)Mammographic density and the risk and detection of breast cancer.The New England journal of medicine 356(3):227-236.doi:10.1056/NEJMoa062790およびBoyd,N.F.ら(2014).Evidence that breast tissue stiffness is associated with risk of breast cancer.PloS one,9(7),p.e100937(それぞれ参照により本明細書中に組み込まれる)を参照のこと。
人口統計(年齢、人種、教育)、身長、体重、スクリーニングおよび乳癌の病歴、閉経状態、未経産および授乳(今まで/一度も)を、全ての研究参加者によって記入された質問票から得た。VASSおよびMDの傾向をBCリスクと比較する前に、症例を対照と照合し、データを調整するために、これらを使用した。
乳癌に対するリスク因子としてのUST測定とマンモグラフィによるBDとの比較のためのデータは、症例対照画像から構成された。観察者を症例または対照状態について「分からない」ようにするために、発明者らは、測定のために、症例(反対側の乳房)および対照(無作為に選択された偏側性)からのマンモグラムおよびUST画像スタックのラベルなしの対を選択した。この研究はHIPPAに準拠しており、発明者らの地域IRBによって承認された。
VASSと月経(初経年齢および閉経年齢)および生殖変数(経産回数および出生数)、乳癌および卵巣癌の両方についての、罹患した血縁者の数および種類ならびにその発症年齢を含む家族歴、体格指数(BMI)、ホルモン療法の使用および面接時の年齢のリスク因子との間の関連性は、必要に応じ、t検定、ピアソン相関係数または分散分析(ANOVA)を用いて評価した。VASSと乳癌との関連の統計的評価は、条件なしロジスティック回帰を使用した。未調整解析および調整解析を行った。調整解析は、月経(初経年齢および閉経年齢)および生殖変数(経産回数および出生数)、乳癌および卵巣癌の両方について、罹患した血縁者の数および種類ならびにその発症年齢を含む家族歴、体格指数(BMI)、ホルモン療法の使用および面接時の年齢のリスク因子を含んだ。VASSおよびBDの四分位数は、対照におけるこれらの変数の分布に基づいて計算した。
症例および対照の疫学的属性を表1に要約する。表2では、これらの特徴を音速の四分位数に従って分類している。これらの四分位数は、対照を4つの等しく投入されたビンに分配することによって決定した。
患者の募集およびデータ収集
100名の女性の群が、UST乳房スキャンおよび発明者らの地域の癌センターでのマンモグラムのVolpara読み取りの両方を受けた。スピアマン相関係数を計算して、乳房密度のVolpara評価とUST評価との間の相関の強さを決定した。Volpara体積パーセント密度とUST全乳房音速値との間には相関(rS=0.85)がある。この相関は、以前の2D研究からの相関よりも有意に強い(それぞれrS=0.85対rS=0.7)。強い相関は、UST音速がBDを測定するための実行可能なイメージングバイオマーカーであることを示唆する。この結果は、BDのバイオマーカーとしての音速の潜在的な役割を強化する。
通常のスクリーニングプロトコールの一部として、2015年のほとんどの間に、マンモグラムを受けた患者はVolpara分析も受けた。総高密度体積、総乳房体積、パーセント密度および密度グレードの測定値を、USTでまたスキャンした乳房から記録した(図2)。
図6は、USTデータの分析を示す一連の画像を示す。図6は、次のことを示す:(上:左から右)-Waferバスが容易に閾値処理され得るWafer画像、601;形態学的演算子が閾値処理に適用された後の得られたマスク、602;元の音速画像、603;およびその後の全ての測定が行われたマスクされた音速画像604および(下:左から右)-元の音速画像605およびマスクされたUST画像であって、高密度組織および非高密度組織のセグメンテーションが重ね合わされた画像606。1時00分の方向にある高密度組織の小さな塊に注目されたい。
対応のあるt検定をUST測定とVolpara測定との間で行った。スピアマン相関係数を計算して、BDのVolpara MPDとUST(VASSおよびPHSST)測定との間の相関の強さを決定した。
この研究で使用されたUSTスキャンデータは、最初に、マンモグラム後に疑いを有することに基づいて患者を選択した並行研究から取得された。その結果、ほとんどの対象は、乳房密度とは無関係に、乳房内に、VASS測定に寄与する腫瘤があった。線維腺腫または癌などの1cm3の病変は、高密度線維腺組織に類似した音速を有する。体積が1000cm3である典型的な乳房の場合、これは、乳房の体積上の0.1%の揺らぎおよび平均音速の1.5m/sの揺らぎに相当する。後に示すように、上記の不確実性は、UST測定値とMPD測定値との間の観測された相関における散乱をはるかに下回る。
USTスキャンとマンモグラフィとの間の平均遅延は27日であった。66名の患者については、マンモグラムの後にUSTスキャンが行われ、32名の患者は最初にUSTスキャンを受け、4名の患者が同じ日に両方を受けた。患者の平均年齢、身長、体重およびBMIは、USTスキャン時にそれぞれ、51.2歳、179.7ポンド、64.7インチおよび30.2kg/m2であった。参加者の74%がアフリカ系アメリカ人であり、19%が白人であり、7%がその他であった。
結果-マンモグラフィによる体積とUST体積との比較
図7は、(左)Volparaの体積測定と比較したVAS、および(右)Volparaと比較したPHSSTを示す。次いで、平均音のUST乳房密度測定値と乳房密度のVolpara測定でのパーセント密度との間の比較を行った。図7は、パーセント密度比較を示し、VASS対MPDとPHSST対MPDとの間の強い相関を示す。
図8は、Volpara密度のグレードによって分類された場合のVASS(左)およびPHSST(右)の箱ひげ図を示す。Volparaはまた、そのパーセント密度測定値に基づいて4点スケールで各乳房の密度をスコア化する。各群について、音速データから、平均音速、パーセント密度および高密度体積測定値を計算した。結果の箱ひげ図を図8に示す。Volpara密度スコアはVolparaグレードと最も強く相関しているが、PHSSTも群分けと強い相関を示す。UST体積は、Volparaによって測定されたものよりもわずかに低かった。高密度組織の総体積は、乳房が非常に高密度になるまで密度が増加するにつれて上昇し、プラトーがある。USTは、Volparaよりも多くの組織を高密度組織として分類する。
平均UST乳房体積は、Volparaによって測定されたものよりもわずかに低かった。この違いは、乳房の位置決めが、UST画像の場合、マンモグラムの場合とは異なるという事実ならびに異なるセグメンテーション方法が使用されることによって説明されると思われる。
発明者らは、症例対照研究において、タモキシフェン療法に応答した体積平均音速(VASS)バイオマーカーの反復測定を評価した。発明者らは、タモキシフェン療法を受けることを医療専門家によって言及された74名の参加者(症例)およびDetroit,MIの乳癌歴のない150名の対照を募集した。対照は、年齢、人種および閉経状態において症例と一致させた。タモキシフェン開始後、ベースライン、3カ月、6カ月および12カ月で症例の画像を得た。対照は、ベースラインおよび12カ月で画像を得た。
実施例4
DetroitのKarmanos Cancer InstituteのAlexander J.Walt Comprehensive Breast Centerの患者を、Wayne State University Institutional Review Board(IRB)が承認したプロトコール(#056707MP4F)の下で募集した。患者は最初に、電子医療記録(EMR)のHIPAA準拠検査を通じて、有望なNAC患者として特定された。NACを受ける可能性があると思われ、この試験に参加することを承諾した患者を、参加に適格である可能性があるものとして特定した。適格基準は以下の通りである:a)≧18歳;b)局所進行乳癌の確定診断;c)NACに適格であるが、NACをまだ受けていない;d)英語の読み書き能力;e)UST装置上に横たわる能力を妨げる身体的または精神症状がないこと。ベースライン測定値(第0日)は、最初の試験来院として定義され、USTスキャンは同じ日および最初の化学療法来院の直前に実施された。患者に対してその最初の医師ミーティング時にスキャンが行われ、およびその日にスキャンされた場合、患者には負の日数が割り当てられた(例えば、-10日間とは、最初の化学療法来院の10日前にスキャンが行われたことを意味する)。
発明者らは、症例対照研究において、タモキシフェン療法に応答した体積平均音速(VASS)バイオマーカーの反復測定を評価した。発明者らは、タモキシフェン療法を受けることを医療専門家によって言及された74名の参加者(症例)およびDetroit,MIの乳癌歴のない150名の対照を募集した。対照は、年齢、人種および閉経状態において症例と一致させた。タモキシフェン開始後、ベースライン、3カ月、6カ月および12カ月で症例の画像を得た。対照は、ベースラインおよび12カ月で画像を得た。
実施例6
材料および方法の概要-2017年1月~2018年11月の期間中のマンモグラフィでの所見を有する患者をSoftVueでスキャンした。生検前の標準的な乳房イメージング評価によって、触知可能または視認可能な腫瘤のいずれかを有することに基づいて患者を選択した。注目すべき除外基準は、年齢<18歳、体重>350ポンド(すなわち、SoftVueスキャニング台の予測される限界(projected limit))、インフォームドコンセントの提出不能、USTテーブル上での伏臥位不能および、患者自身の安全のために(すなわち、消毒された水は各患者間でシステムによって交換される)、乳房においてUST水浴への浸漬を妨げる何らかの開放創または創傷があること。サイズが<1.5cmの240個の腫瘤(79例が癌、88例が線維腺腫、52例が嚢胞および21例が他の良性所見)を含んだ病変タイプを検証するためのグランドトゥルースとして、病理学および/または放射線学の報告を使用した。病変の局在化およびUST評価は、専門委員会により認定された乳房放射線科医によって提供された。SoftVueによるUST硬度測定は、組織体積弾性率に関する情報を抽出し、次いでこれを相対的な組織の硬度指標(0=非常に軟らかい~1=非常に硬い)に変換し、K平均クラスタリングによって3つのパーセンテージ群(すなわち、軟らかい、中間および硬い)に分類した。さらに、グレーレベル同時発生行列(GLCM)アプローチを使用して各腫瘤に対して硬度の平均均一性を計算した。
四象限の解剖学的分布(表13)は、他の象限と比較して、外側上部象限内で43.6%(34/78)の有意に大きい癌発生を示した(カイ二乗、p=0.001)。同様に、線維腺腫の37.1%(39/05)および嚢胞の42.9%(39/91)もまた、外側上部象限で好発し(それぞれカイ二乗p=0.003およびp=1x10-5)、外側上部象限で腫瘍タイプを分離する有意な傾向は認められなかった(p=0.66)。全ての腫瘍が、内側下部象限に位置することは極めてまれ(wer eat least commonly located)であった。
高密度組織成分および非高密度組織成分の全乳房体積を定量化するUSTの詳細が記載されている。しかしながら、それらの硬さのサブ成分の相対分布は、これまで評価されていない。このシリーズは異なる腫瘤タイプを含むため、各腫瘤の体積分布の有無で全体の体積硬度分布を考慮した。腫瘤の割合を総硬度体積分布から減算した時点で、以下のように、実質パターン内の異なる腫瘤タイプのさらなる出現を考慮した。嚢胞は乳房全体にわたって多数である可能性がより高かったが、少数のみが腫瘤評価の代表とみなされ、全ての嚢胞の硬さの寄与が全体積から差し引かれたわけではなかった。これは、総体積に対して、嚢胞が有するより高い硬さの寄与が最小限であったため、妥当であると考えられた。
信頼区間:
フィルタリングされた小さな腫瘤5%-95%信頼区間
癌:0.1247-0.6967
FA:0.1704-0.5303
嚢胞:0.001-0.3618
フィルタリングされた大きな腫瘤5%-95%信頼区間
癌:0.0826-0.8104
FA:0.0197-0.4830
嚢胞:0.00005-0.0691
元の小さな腫瘤5%-95%信頼区間
癌:0.1256-0.8585
FA:0.0021-0.8634
嚢胞:0.00012-0.6499
元の大きな腫瘤5%-95%信頼区間
癌:0.1916-0.8288
FA:0.036-0.7005
嚢胞:0.00034-0.2364
P値:
元の小さい:
癌対嚢胞:0.000000001
癌対FA:0.08
嚢胞対FA:0.0000017
元の大きい:
癌対嚢胞:0.0000000002
癌対FA:0.037
嚢胞対FA:0.00013
フィルタリングされた小さい:
癌対嚢胞:0.00000000006
癌対FA:0.000036
嚢胞対FA:0.00028
フィルタリングされた大きい:
癌対嚢胞:0.00000021
癌対FA:0.127
嚢胞対FA:0.000025
Claims (67)
- 乳房組織のボリュームの画像を分析する方法であって、
コンピュータシステムで前記ボリュームの少なくとも1つの超音波断層撮影画像を受信することと、
前記コンピュータシステムを使用して前記ボリューム内の体積平均音速を決定することと、
前記体積平均音速から乳癌を発症するリスクを判定することと、
を含む、方法。 - 前記ボリュームが、前記乳房の体積全体の少なくとも30%を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記乳房の前記画像が癌性腫瘤を含まない、請求項1に記載の方法。
- 前記乳房の前記画像が、40歳未満の患者の乳房を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記乳房の前記画像が、癌に罹患した乳房の反対側の乳房の画像を含む、請求項1に記載の方法。
- 2D画像のスタック内の複数の2D画像の直接画素数によって組織の前記ボリュームの体積(V)を決定することと、前記直接画素数内の各画素に対する音速を合計し、前記体積で除することによって、前記体積平均音速を決定することと、をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記リスクに関連するパラメータをリスクモデルに組み込むことをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記リスクモデルが、GailモデルまたはTyrer-Cuzikモデルを含む、請求項7に記載の方法。
- 前記ボリュームの少なくとも1つの超音波断層撮影画像から前記乳房の高音速組織のパーセントを決定することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記高音速組織のパーセントを決定することが、前記高音速組織を含むマスクを作成することを含む、請求項9に記載の方法。
- 前記マスクが、音声反射画像から作成される、請求項10に記載の方法。
- 前記マスクが、k平均セグメンテーションアルゴリズムを使用して作成される、請求項10に記載の方法。
- 体積平均音速または高音速組織のパーセントをマンモグラフィパーセント密度と比較することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記リスクがマンモグラフィデータなしで計算される、請求項1に記載の方法。
- 前記リスクがスコアを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記スコアが1~5のスケールの数字である、請求項15に記載の方法。
- 乳癌を発症する前記リスクが、乳癌を再発症するリスクである、請求項1に記載の方法。
- 複数の時点にわたる前記ボリューム内の前記体積平均音速を決定することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記複数の時点が、処置が提供される持続時間の少なくとも一部を含む、請求項18に記載の方法。
- 前記持続時間が、予防期間またはアジュバント期間中である、請求項19に記載の方法。
- 前記処置が、化学療法処置、放射線療法処置、凍結療法処置、高周波アブレーション処置、集束超音波処置およびエレクトロポレーション処置からなる群から選択される少なくとも1つの要素を含む、請求項19に記載の方法。
- 前記処置が予防的処置である、請求項19に記載の方法。
- 前記処置が、タモキシフェン、ラロキシフェン、他の抗エストロゲン薬、食事療法および/または生活様式介入の使用を含む、請求項22に記載の方法。
- 前記ボリュームが、少なくとも20%の非癌性組織を含む、請求項1に記載の方法。
- 実行される際に請求項1~24のいずれか1項に記載の方法を実行する命令を含む、コンピュータシステム。
- 処置計画に対する応答を判定する方法であって、
乳房組織のボリュームから複数の画像を受信することであって、前記複数の画像が、超音波断層撮影画像を含み、前記複数の画像が複数の時点に対応することと、
乳房組織の前記ボリューム内の関心領域の、組織体積、体積平均音速および硬度を決定することと、
前記複数の時点にわたる前記体積、前記体積平均音速および硬度から複合メトリックを生成することと、
前記複数の時点にわたる前記複合メトリックに基づいて処置計画に対する非奏効、部分奏効または完全奏効のうち1つとして前記組織を特徴付けることと、
を含む、方法。 - 前記特徴付けることが、処置計画の開始前および/または開始から30日以内に行われる、請求項26に記載の方法。
- 前記特徴付けることが、処置計画の開始前および/または開始から14日以内に行われ
る、請求項27に記載の方法。 - 前記処置計画が、ネオアジュバント化学療法を含む、請求項26に記載の方法。
- 前記複数の時点が、予防期間またはアジュバント期間中である、請求項26に記載の方法。
- 前記処置計画が、化学療法処置、放射線療法処置、凍結療法処置、高周波アブレーション処置、集束超音波処置およびエレクトロポレーション処置からなる群から選択される少なくとも1つの要素を含む、請求項26に記載の方法。
- 前記処置計画が、予防的処置である、請求項26に記載の方法。
- 前記処置計画が、タモキシフェン、ラロキシフェン、他の抗エストロゲン薬、食事療法および/または低生活様式介入の使用を含む、請求項26に記載の方法。
- 実行される際に請求項26~33のいずれか1項に記載の方法を実行する命令を含む、コンピュータシステム。
- 乳房組織のボリュームの画像を分析する方法であって、
コンピュータシステムで前記ボリュームの少なくとも1つの超音波断層撮影画像を受信することと、
前記少なくとも1つの超音波断層撮影画像から硬度マップを作成することと、
前記コンピュータシステムを使用して、第1のタイプの組織および第2のタイプの組織の相対的硬度パーセンテージを定量化することと、
を含む、方法。 - 前記第1のタイプの組織が線維腺組織である、請求項35に記載の方法。
- 前記第2のタイプの組織が脂肪組織である、請求項35に記載の方法。
- 前記方法が、組織、硬度またはその両方のタイプによって組織群を生成するために画像分割工程を適用することをさらに含む、請求項35に記載の方法。
- 組織のタイプによって組織群を生成するための前記画像分割工程が、音速画像を使用することを含む、請求項38に記載の方法。
- 硬度によって組織群を生成するための前記画像分割工程が、音速および減衰データを組み合わせることを含む、請求項38に記載の方法。
- 前記定量化することが、組織の前記ボリューム内の関心領域に対して前記相対的硬度パーセンテージを定量化することを含む、請求項35に記載の方法。
- 前記定量化することが、組織の前記ボリュームの少なくとも30%に対して前記相対的硬度パーセンテージを定量化することを含む、請求項35に記載の方法。
- 前記方法が、空間フィルタを除去し、フィルタリングされた画像をフィルタリングされていない画像と比較することをさらに含む、請求項35に記載の方法。
- 前記フィルタリングされた画像を前記フィルタリングされていない画像と前記比較することが、加算、減算、除算、乗算、平均化および重畳のうちの1またはそれを超えるものを含む、請求項43に記載の方法。
- 前記方法が、前記フィルタリングされた画像を使用して、組織の前記ボリューム内の関心領域の前記相対的硬度パーセンテージを定量化することをさらに含む、請求項43に記載の方法。
- 前記方法が、前記フィルタリングされていない画像を使用して、組織の前記ボリュームの少なくとも30%に対して前記相対的硬度パーセンテージを定量化することをさらに含む、請求項43に記載の方法。
- 前記方法が、硬度分布を定量化するための硬度指標または別のパラメータによって前記硬度分布を定量化することをさらに含む、請求項43に記載の方法。
- 同定することが、相対的硬度パーセンテージに基づいて、腫瘤を嚢胞、線維腺腫、癌、良性腫瘤または未同定の腫瘤のうちの少なくとも1つとして特徴付けることを含む、請求項35に記載の方法。
- 前記方法が、組織の前記ボリューム内の硬度の統計学的パターンを分析することをさらに含む、請求項35に記載の方法。
- 前記統計学的パターンが、2次統計量、3次統計量またはラジオミクスのうちの少なくとも1つを含む、請求項49に記載の方法。
- 前記分析することが、少なくとも部分的に機械学習システムを用いて実施される、請求項49に記載の方法。
- 前記分析することが、硬度画像の質感を定量化するための均一性指標または別のパラメータの計算を含む、請求項49に記載の方法。
- 前記硬度画像の質感を前記定量化することが、2次統計量、3次統計量またはラジオミクスのうちの少なくとも1つを含む、請求項52に記載の方法。
- 前記硬度マップが、音速マップおよび音波減衰マップから導出される、請求項35に記載の方法。
- アジュバント療法およびネオアジュバント療法に対する応答を監視するために、前記関心領域に対して前記相対的硬度パーセンテージを定量化することが使用される、請求項42に記載の方法。
- 化学的予防、食事療法介入およびタモキシフェン、ラロキシフェンまたは他のホルモン操作などのアジュバント療法を監視するために、組織の前記ボリュームの少なくとも30%に対する前記相対的硬度パーセンテージを前記定量化することが使用される、請求項43に記載の方法。
- 前記相対的硬度パーセンテージに基づいて乳癌のリスクを決定することをさらに含む、請求項35に記載の方法。
- 前記リスクに関連するパラメータをリスクモデルに組み込むことをさらに含む、請求項57に記載の方法。
- 前記リスクモデルが、GailモデルまたはTyrer-Cuzikモデルを含む、請求項58に記載の方法。
- 前記コンピュータシステムで少なくとも1つの超音波断層撮影画像に空間フィルタを適用することをさらに含む、請求項35に記載の方法。
- 前記硬度指標がBI-RADSカテゴリーを含む、請求項47に記載の方法。
- 前記BI-RADSカテゴリーが、硬い、中間、または軟らかい、を含む、請求項61に記載の方法。
- 腫瘍周囲領域の位置を定量化することをさらに含む、請求項35に記載の方法。
- 前記腫瘍周囲領域を癌または嚢胞として同定するために、前記腫瘍周囲領域の位置を使用することをさらに含む、請求項63に記載の方法。
- 前記腫瘍周囲領域が、脂肪組織と線維腺組織との境界の癌として同定される、請求項64に記載の方法。
- 前記腫瘍周囲領域が、線維腺組織により取り囲まれる嚢胞として同定される、請求項64に記載の方法。
- 実行される際に請求項35~66のいずれか1項に記載の方法を実行する命令を含む、コンピュータシステム。
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