JP2023165041A - Cell membrane-permeable molecule and use therefor - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、細胞膜透過性分子、前記細胞膜透過性分子を含むペプチド複合体及びその製造方法、前記ペプチド複合体を含むペプチドライブラリ、及び前記ペプチドライブラリを用いた機能性ペプチドのスクリーニング方法に関する。 The present invention relates to a cell membrane-permeable molecule, a peptide complex containing the cell membrane-permeable molecule, and a method for producing the same, a peptide library containing the peptide complex, and a method for screening functional peptides using the peptide library.
分子量が500程度までの低分子医薬品は、製造コストが安く免疫原性が低いため、これまで多くの医薬品として開発されてきた。しかし、この低分子医薬品は、特異性が低く、オフターゲットによる副作用の問題から近年は次第に開発が難しくなってきている。これに対し、分子量が10,000を超えるような抗体やタンパク質由来の高分子医薬品は、特異性が高く副作用も少ないことから売り上げが伸びている。しかし、高価であること、その大きな分子量から免疫原性を起こす可能性があること、一般に細胞内へ移行しないためその標的となりうる分子が限られることが課題となっている。
そこで近年、ペプチドや核酸などをはじめとする分子量が500~5,000程度の分子、いわゆる中分子医薬品が、安価で免疫原性が低いという低分子医薬品の利点と、標的分子への特異性が高く、副作用が少ないというという高分子医薬品の利点を併せ持つ医薬品として期待されている。
Many low-molecular drugs with a molecular weight of up to about 500 have been developed as drugs due to their low manufacturing cost and low immunogenicity. However, it has become increasingly difficult to develop small-molecule drugs in recent years due to low specificity and side effects caused by off-targets. In contrast, sales of polymeric drugs derived from antibodies and proteins with molecular weights exceeding 10,000 are increasing because they are highly specific and have fewer side effects. However, problems include that they are expensive, that their large molecular weight may cause immunogenicity, and that molecules that can be targeted are limited because they generally do not move into cells.
Therefore, in recent years, so-called middle-molecule drugs, molecules with a molecular weight of about 500 to 5,000, such as peptides and nucleic acids, have been developed. It is expected to be a drug that has the advantages of polymer drugs, such as being expensive and having fewer side effects.
また、中分子医薬品としてのペプチドを取得する技術として、様々なアミノ酸配列から成るペプチド(ポリペプチド)ライブラリを作製しその中から、疾患関連タンパク質などの特定の標的分子に対して高い親和性を持つペプチドを選別する方法が汎用される。 In addition, as a technology to obtain peptides as medium-molecule drugs, we create a peptide (polypeptide) library consisting of various amino acid sequences and select from among them a library with high affinity for a specific target molecule such as a disease-related protein. Methods for selecting peptides are commonly used.
前記ペプチドライブラリの作製方法として、例えば、in vitro翻訳系の方法として、ペプチド鎖、mRNA分子、及びリボソームを含むリボソームディスプレイ複合体を用いるリボソームディスプレイ法(RD法)が知られている(例えば、特許文献1参照)。前記RD法は、in vitro翻訳系とmRNAさえあれば、それらを混合するだけで、1012種類以上のペプチドライブラリを数分で作製することができる非常に優れた有用なものである。 As a method for producing the peptide library, for example, a ribosome display method (RD method) using a ribosome display complex containing a peptide chain, an mRNA molecule, and a ribosome is known as an in vitro translation system method (for example, a patent (See Reference 1). The RD method is an extremely useful method that can create a peptide library of 10 12 or more types in a few minutes by simply mixing an in vitro translation system and mRNA.
一方、ペプチドや核酸などの中分子医薬品は細胞内の分子を標的とする場合、細胞膜を透過させて所望の細胞内標的分子に到達させる手段が必要となる。細胞内には、細胞骨格関連タンパク質やキナーゼ関連因子など種々の疾病治療に際して標的となりうるものが多い。このため、有用な細胞内導入法の確立は、中分子医薬品の適用範囲を大幅に拡大することに繋がる。
有効成分を細胞内に取り込む技術としては、例えば、塩基性アミノ酸を多く含む細胞膜透過ペプチドのアミノ酸配列を融合する方法や、中心から規則的に分枝した構造を有する樹状高分子であるデンドリマーを用いる方法(例えば、特許文献2参照)などが知られている。
On the other hand, when medium-molecule drugs such as peptides and nucleic acids target intracellular molecules, a means of permeating the cell membrane and reaching the desired intracellular target molecules is required. There are many substances within cells that can be targeted in the treatment of various diseases, such as cytoskeleton-related proteins and kinase-related factors. Therefore, the establishment of a useful intracellular introduction method will lead to a significant expansion of the scope of application of middle molecule drugs.
Techniques for introducing active ingredients into cells include, for example, methods that fuse amino acid sequences of cell membrane-penetrating peptides containing many basic amino acids, and methods that incorporate dendrimers, which are dendritic polymers that have a structure that regularly branches from the center. There are known methods for using this method (for example, see Patent Document 2).
上記したように、有効成分を細胞内に取り込む技術として、特許文献2に記載した方法などが検討されているものの、医薬品の開発という観点からは、有効成分を細胞内に取り込む機能を有しつつ、生体に対する毒性が低いことも求められる。
したがって、本発明は、従来における前記諸問題を解決し、以下の目的を達成することを課題とする。即ち、本発明は、有効成分を細胞内に取り込む機能を有しつつ、生体に対する毒性が低い細胞膜透過性分子、前記細胞膜透過性分子を含むペプチド複合体及びその製造方法、前記ペプチド複合体を含むペプチドライブラリ、及び前記ペプチドライブラリを用いた機能性ペプチドのスクリーニング方法を提供することを目的とする。
As mentioned above, the method described in Patent Document 2 is being considered as a technology for taking active ingredients into cells, but from the perspective of drug development, it is difficult to use a method that has the function of taking active ingredients into cells. , low toxicity to living organisms is also required.
Therefore, an object of the present invention is to solve the above-mentioned conventional problems and achieve the following objects. That is, the present invention includes a cell membrane-permeable molecule that has the function of taking an active ingredient into cells and has low toxicity to living organisms, a peptide complex containing the cell membrane-permeable molecule, a method for producing the same, and the peptide complex. The present invention aims to provide a peptide library and a method for screening functional peptides using the peptide library.
前記課題を解決するため、本発明者らは鋭意検討した結果、下記一般式(i)で表される構造を有し、pKaの値が-8.0超4.7未満の酸との塩とすることで、有効成分を細胞内に取り込む機能を有しつつ、生体に対する毒性が低い細胞膜透過性分子とすることができることを知見した。
本発明は、本発明者らの前記知見に基づくものであり、前記課題を解決するための手段としては、以下の通りである。即ち、
<1> 下記一般式(i)で表される構造を有し、pKaの値が-8.0超4.7未満の酸との塩であることを特徴とする細胞膜透過性分子である。
<2> ペプチドと、前記<1>に記載の細胞膜透過性分子とを含むことを特徴とするペプチド複合体である。
<3> 前記<2>に記載のペプチド複合体を含むことを特徴とするペプチドライブラリである。
<4> ペプチドに、前記<1>に記載の細胞膜透過性分子を導入することを含むことを特徴とするペプチド複合体の製造方法である。
<5> 前記<3>に記載のペプチドライブラリを用いて機能性ペプチドをスクリーニングすることを含むことを特徴とする機能性ペプチドのスクリーニング方法である。
The present invention is based on the above findings of the present inventors, and means for solving the above problems are as follows. That is,
<1> A cell membrane permeable molecule having a structure represented by the following general formula (i) and being a salt with an acid having a pK a value of more than -8.0 and less than 4.7. .
<2> A peptide complex comprising a peptide and the cell membrane permeable molecule described in <1> above.
<3> A peptide library characterized by containing the peptide complex described in <2> above.
<4> A method for producing a peptide complex, comprising introducing the cell membrane permeable molecule described in <1> above into the peptide.
<5> A method for screening functional peptides, comprising screening for functional peptides using the peptide library described in <3> above.
本発明によれば、従来における前記諸問題を解決し、前記目的を達成することができ、有効成分を細胞内に取り込む機能を有しつつ、生体に対する毒性が低い細胞膜透過性分子、前記細胞膜透過性分子を含むペプチド複合体及びその製造方法、前記ペプチド複合体を含むペプチドライブラリ、及び前記ペプチドライブラリを用いた機能性ペプチドのスクリーニング方法を提供することができる。 According to the present invention, it is possible to solve the above-mentioned conventional problems and achieve the above-mentioned purpose, and to provide a cell-membrane-permeable molecule that has the function of taking an active ingredient into cells and has low toxicity to living organisms. The present invention can provide a peptide complex containing a sex molecule, a method for producing the same, a peptide library containing the peptide complex, and a method for screening functional peptides using the peptide library.
(細胞膜透過性分子)
本発明の細胞膜透過性分子は、少なくとも下記一般式(i)で表される構造を有し、pKaの値が-8.0超4.7未満の酸との塩である。
The cell membrane permeable molecule of the present invention has at least a structure represented by the following general formula (i), and is a salt with an acid having a pK a value of more than −8.0 and less than 4.7.
<一般式(i)で表される構造>
前記一般式(i)で表される構造における前記X以外の部分は、細胞膜透過性に寄与する部分である。
前記細胞膜透過性分子における一般式(i)で表される構造のX以外の部分の数としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、1つであることが好ましい。即ち、本発明の細胞膜透過性分子は、前記一般式(i)で表される樹状構造を1つ有する態様が好ましい。
<Structure represented by general formula (i)>
The portion other than the X in the structure represented by the general formula (i) is a portion that contributes to cell membrane permeability.
The number of moieties other than X in the structure represented by general formula (i) in the cell membrane permeable molecule is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but is preferably one. . That is, the cell membrane permeable molecule of the present invention preferably has one dendritic structure represented by the general formula (i).
前記一般式(i)で表される構造の前記Xの部分としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ヘテロ原子含有基と結合していることが好ましい。 The part X in the structure represented by the general formula (i) is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but it is preferably bonded to a heteroatom-containing group.
-ヘテロ原子含有基-
前記ヘテロ原子含有基としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、(A)ペプチドと連結するペプチド連結用基と、前記ペプチド連結用基と前記一般式(i)で表す構造とを連結する連結基とからなる態様、(B)ペプチドと連結するペプチド連結用基からなる態様などが挙げられる。また、前記ヘテロ原子含有基は、ペプチドや核酸の骨格を有してもよい。
-Heteroatom-containing group-
The hetero atom-containing group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose. ), and (B) an embodiment consisting of a peptide linking group that connects to the peptide. Furthermore, the heteroatom-containing group may have a peptide or nucleic acid skeleton.
前記ヘテロ原子含有基の長さとしては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、例えば直鎖上に結合している原子数の下限値としては1原子以上が好ましく、上限値としては50原子以下が好ましく、25原子以下がより好ましい。前記直鎖上に結合している原子数が25原子以下の例としては、後述する細胞膜透過性分子G3-DCXにおけるヘテロ原子含有基などが挙げられる。 The length of the heteroatom-containing group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but for example, the lower limit of the number of atoms bonded in a straight chain is preferably 1 atom or more, The upper limit is preferably 50 atoms or less, more preferably 25 atoms or less. Examples of the linear chain having 25 or less atoms include a heteroatom-containing group in the cell membrane permeable molecule G3-DCX described below.
前記ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、酸素原子、窒素原子、硫黄原子及びリン原子からなる群から選択される少なくとも1種などが挙げられる。前記ヘテロ原子は、1種のみであってもよいし、2種以上であってもよい。 The heteroatom in the heteroatom-containing group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, for example, at least one selected from the group consisting of oxygen atom, nitrogen atom, sulfur atom, and phosphorus atom. Examples include. The number of the heteroatoms may be one, or two or more.
前記ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子の含有割合としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、細胞膜透過性分子の水溶性が高まる点で、10%以上であることが好ましい。前記ヘテロ原子の含有割合の上限としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、60%以下が好ましく、50%以下がより好ましい。前記ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子の含有割合の範囲としては、10%以上60%以下が好ましく、10%以上50%以下がより好ましい。
前記ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子の含有割合は、下記のようにして算出することができる。なお、全原子には、水素原子も含まれる。
ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子の含有割合(%)={(ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子の数)/(ヘテロ原子含有基の全原子数)}×100
The content ratio of heteroatoms in the heteroatom-containing group is not particularly limited and can be selected as appropriate depending on the purpose, but from the viewpoint of increasing the water solubility of the cell membrane permeable molecule, it is preferably 10% or more. preferable. The upper limit of the content of the heteroatoms is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but is preferably 60% or less, more preferably 50% or less. The content ratio of heteroatoms in the heteroatom-containing group is preferably 10% or more and 60% or less, more preferably 10% or more and 50% or less.
The content ratio of heteroatoms in the heteroatom-containing group can be calculated as follows. Note that all atoms also include hydrogen atoms.
Content ratio of heteroatoms in heteroatom-containing group (%) = {(number of heteroatoms in heteroatom-containing group)/(total number of atoms in heteroatom-containing group)}×100
前記ヘテロ原子含有基は、繰返し単位を含むことが好ましい。
前記繰返し単位としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、アルキレンオキサイド、アルキレンイミン、アルキレンスルフィドなどが挙げられる。前記繰返し単位は、1種のみであってもよいし、2種以上であってもよい。また、前記繰返し単位は、置換基を有していてもよい。前記繰り返し単位としては、入手容易性、安定性の観点からアルキレンオキサイドが好ましい。
Preferably, the heteroatom-containing group includes a repeating unit.
The repeating unit is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, and includes, for example, alkylene oxide, alkylene imine, alkylene sulfide, and the like. The number of the repeating units may be one, or two or more. Further, the repeating unit may have a substituent. As the repeating unit, alkylene oxide is preferable from the viewpoint of availability and stability.
前記アルキレンオキサイドとしては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、メチレンオキサイド、エチレンオキサイド及びプロピレンオキサイドからなる群から選択される少なくとも1種などが挙げられる。 The alkylene oxide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, and includes, for example, at least one selected from the group consisting of methylene oxide, ethylene oxide, and propylene oxide.
前記繰返し単位の数としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、前記繰り返し単位の下限としては1以上が好ましく、上限としては10以下が好ましい。 The number of the repeating units is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose. For example, the lower limit of the repeating units is preferably 1 or more, and the upper limit is preferably 10 or less.
前記繰り返し単位が有する置換基としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記置換基としては、例えばアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキル、ヘテロシクリル、ヒドロキシ、メルカプト、アミノ、カルボニル、アミド、チオアミド、ウレア、スルホンアミド、カルボキシ、ニトリルが好ましい。 The substituent that the repeating unit has is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but examples of the substituent include alkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, cycloalkyl, heterocyclyl, Hydroxy, mercapto, amino, carbonyl, amide, thioamide, urea, sulfonamide, carboxy, nitrile are preferred.
--ペプチド連結用基--
前記ペプチド連結用基は、前記ペプチドにおける反応性アミノ酸残基との反応により、細胞膜透過性分子のペプチドへの導入に寄与する。
前記反応性アミノ酸残基は、前記ペプチド連結用基と反応するアミノ酸残基であり、前記ペプチド連結用基と直接反応するアミノ酸残基であってもよいし、前記ペプチド連結用基と反応できるように修飾されたアミノ酸残基であってもよい。
--Peptide linking group--
The peptide linking group contributes to the introduction of a cell membrane permeable molecule into the peptide by reacting with a reactive amino acid residue in the peptide.
The reactive amino acid residue is an amino acid residue that reacts with the peptide linking group, and may be an amino acid residue that reacts directly with the peptide linking group, or may be an amino acid residue that reacts with the peptide linking group, or may be an amino acid residue that reacts with the peptide linking group. It may also be an amino acid residue modified to
前記ペプチド連結用基としては、前記ペプチドと連結することができる限り、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、システイン残基のチオール基、リジン残基の側鎖アミノ基(-NH2)、ヒスチジン残基又はトリプトファン残基の側鎖アミノ基(>NH)、トリプトファン残基のインドール環2位及び3位炭素、チロシン残基又はセリン残基又はスレオニン残基の側鎖水酸基(-OH)、チロシン残基のオルト位炭素、メチオニン残基の側鎖スルフィド基(-SMe)と反応して結合を形成可能な基などが挙げられる。
前記ペプチド連結用基の具体例としては、例えば、国際公開第2017/213158号の段落〔0067〕~〔0076〕に記載されているハロゲン化アルキル基、活性化カルボニル基、不飽和炭化水素基、エポキシ基、スルホニル含有基、イソシアネート基、チオイソシアネート基、カルベン発生基、ジスルフィド結合含有基、チオール基などが挙げられる。
The peptide linking group is not particularly limited as long as it can be linked to the peptide, and can be appropriately selected depending on the purpose.For example, a thiol group of a cysteine residue, a side chain amino group of a lysine residue, etc. group (-NH 2 ), the side chain amino group (>NH) of histidine residue or tryptophan residue, the 2nd and 3rd carbon positions of the indole ring of tryptophan residue, the side of tyrosine residue, serine residue, or threonine residue Examples include a group capable of forming a bond by reacting with a chain hydroxyl group (-OH), the ortho-position carbon of a tyrosine residue, and a side chain sulfide group (-SMe) of a methionine residue.
Specific examples of the peptide linking group include, for example, halogenated alkyl groups, activated carbonyl groups, unsaturated hydrocarbon groups described in paragraphs [0067] to [0076] of International Publication No. 2017/213158, Examples include epoxy groups, sulfonyl-containing groups, isocyanate groups, thioisocyanate groups, carbene-generating groups, disulfide bond-containing groups, and thiol groups.
また、前記ペプチド連結用基は、ペプチドにおける反応性アミノ酸残基との反応により、前記ペプチドの環状化に寄与するもの(以下、「環状化基」と称することがある。)であることが好ましい。
前記環状化基と反応する反応性アミノ酸残基は、前記環状化基と直接反応するアミノ酸残基であってもよいし、前記環状化基と反応できるように修飾されたアミノ酸残基であってもよい。
前記環状化基としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、電子吸引基が好ましい。
Further, the peptide linking group is preferably one that contributes to cyclization of the peptide by reaction with a reactive amino acid residue in the peptide (hereinafter sometimes referred to as a "cyclization group"). .
The reactive amino acid residue that reacts with the cyclization group may be an amino acid residue that directly reacts with the cyclization group, or an amino acid residue that has been modified so that it can react with the cyclization group. Good too.
The cyclization group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but an electron-withdrawing group is preferable.
前記電子吸引基としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ハロゲンを有することが好ましい。前記ハロゲンの種類としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、例えば塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子が好ましい。前記ハロゲンの数としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ハロゲン数の下限としては2以上が好ましく、上限としては、5以下、4以下が好ましい。
前記電子吸引基は、置換基を有していてもよい。前記電子吸引基は、その構造中に不飽和構造を含むとペプチドを環状化させやすい。前記不飽和構造としては、特に制限はないが、例えば芳香環構造、複素環構造、脂環式炭化水素構造、アルケニル構造、アルキニル構造、カルボニル構造、チオカルボニル構造、オキシム構造、シアノ構造、イソシアネート構造を挙げることができる。中でも前記電子吸引基としては、ベンジルハライドがより好ましく、3,5-ビス(ハロメチル)ベンジル基が特に好ましい。前記ハロゲンの種類としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、例えば塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子が好ましく、塩素原子がより好ましい。
The electron-withdrawing group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but preferably contains a halogen. The type of halogen is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but chlorine, bromine, and iodine atoms are preferred, for example. The number of halogens is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but the lower limit of the number of halogens is preferably 2 or more, and the upper limit is preferably 5 or less and 4 or less.
The electron-withdrawing group may have a substituent. When the electron-withdrawing group contains an unsaturated structure in its structure, it tends to cyclize the peptide. The unsaturated structure is not particularly limited, but includes, for example, an aromatic ring structure, a heterocyclic structure, an alicyclic hydrocarbon structure, an alkenyl structure, an alkynyl structure, a carbonyl structure, a thiocarbonyl structure, an oxime structure, a cyano structure, and an isocyanate structure. can be mentioned. Among these, as the electron-withdrawing group, benzyl halide is more preferable, and 3,5-bis(halomethyl)benzyl group is particularly preferable. The type of halogen is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose; for example, chlorine atom, bromine atom, and iodine atom are preferable, and chlorine atom is more preferable.
前記環状化基によるペプチドの環状化は、前記環状化基と、ペプチドに含まれるチオール基、アミノ基、及びヒドロキシ基からなる群から選択される少なくとも1種の基との反応により行われることが好ましい。 Cyclization of the peptide with the cyclization group may be carried out by reaction between the cyclization group and at least one group selected from the group consisting of a thiol group, an amino group, and a hydroxy group contained in the peptide. preferable.
また、例えば、オキシムライゲーション法により、前記ペプチドと前記細胞膜透過性分子とを結合する場合には、下記構造式で表されるものを前記ペプチド連結用基として用いることもできる。
--連結基--
前記連結基は、前記ペプチド連結用基と前記一般式(i)で表す構造とを連結する基である。
前記連結基の構造としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、上記した繰返し単位を含む構造などが挙げられる。
--Linking group--
The linking group is a group that connects the peptide linking group and the structure represented by the general formula (i).
The structure of the connecting group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, and includes, for example, a structure containing the above-described repeating unit.
前記細胞膜透過性分子は、ペプチドに導入される際に、前記ペプチドにおける反応性アミノ酸残基と反応する部位の構造が変化してもよい。 When the cell membrane permeable molecule is introduced into a peptide, the structure of a site that reacts with a reactive amino acid residue in the peptide may be changed.
前記細胞膜透過性分子の具体例としては、例えば、以下の構造式で表される化合物などが挙げられる。なお、前記細胞膜透過性分子は、塩の形態とする際に、その構造の一部が変化してもよい。 Specific examples of the cell membrane permeable molecules include compounds represented by the following structural formula. In addition, when the cell membrane permeable molecule is made into a salt form, a part of its structure may be changed.
下記構造式で表される細胞膜透過性分子G3-DCXは、一般式(i)において、Xの部分にヘテロ原子含有基として、3,5-ビス(クロロメチル)ベンジル基である環状化基(ペプチド連結用基)と、連結基とを有している例である。前記細胞膜透過性分子G3-DCXは環状化基を有しているので、ペプチドの環状化と、ペプチドへの細胞膜透過性の付与とを1工程で行うことができる。
下記構造式で表される細胞膜透過性分子G3は、一般式(i)において、Xの部分にヘテロ原子含有基として、オキシムライゲーション法によりペプチドと結合可能なペプチド連結用基と、連結基とを有している例である。
<pKaの値が-8.0超4.7未満の酸>
本発明の細胞膜透過性分子は、pKa(酸解離定数)の値が-8.0超(pKaの値が-8.0よりも大きい)4.7未満の酸との塩である。
本発明において、酸が複数のpKaの値を有している場合には、1段階目の解離におけるpKaの値であるpKa1の値をpKaの値とする。
前記pKaの値が-8.0超4.7未満の酸としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、生体に対してより低毒性である点で、トリフルオロ酢酸(-0.3)、硫酸(-3.0)、硝酸(-1.3)、リン酸(2.1(pKa1))、メシル酸(-2.6)、トシル酸(-2.8)、酒石酸(3.2(pKa1))及びクエン酸(3.1(pKa1))からなる群から選択されるいずれかが好ましい。前記酸の名称の後のかっこ内の数値はpKaの値を表す。なお、pKa1の値の場合は、数値の後にpKa1と記載した。
前記pKaの値が-8.0超4.7未満の酸の中でも、生体に対してより低毒性である点では、pKaの値の下限としては-3.0超(pKaの値が-3.0よりも大きい)が好ましい。また、前記酸におけるpKaの値の上限としては3.5以下が好ましく、3.3未満がより好ましい。
<An acid with a pK a value of more than -8.0 and less than 4.7>
The cell membrane permeable molecule of the present invention is a salt with an acid having a pK a (acid dissociation constant) value of greater than -8.0 (pK a value greater than -8.0) and less than 4.7.
In the present invention, when the acid has a plurality of pK a values, the pK a1 value, which is the pK a value in the first stage of dissociation, is taken as the pK a value.
The acid having a pK a value of more than -8.0 and less than 4.7 is not particularly limited and can be selected as appropriate depending on the purpose; Fluoroacetic acid (-0.3), sulfuric acid (-3.0), nitric acid (-1.3), phosphoric acid (2.1 (pK a1 )), mesylic acid (-2.6), tosylic acid (- 2.8), tartaric acid (3.2 (pK a1 )) and citric acid (3.1 (pK a1 )) is preferred. The number in parentheses after the name of the acid represents the pK a value. In addition, in the case of the value of pK a1 , pK a1 was written after the numerical value.
Among the acids with a pK a value of more than -8.0 and less than 4.7, the lower limit of the pK a value is more than -3.0 (pK a value is larger than -3.0) is preferred. Further, the upper limit of the pK a value of the acid is preferably 3.5 or less, and more preferably less than 3.3.
前記細胞膜透過性分子は、上記した一般式(i)で表される構造を有し、pKaの値が-8.0超4.7未満の酸との塩であって、本発明の効果を損なわない限りにおいて、その他の構成を有していてもよい。 The cell membrane permeable molecule has a structure represented by the above general formula (i) and is a salt with an acid having a pK a value of more than −8.0 and less than 4.7, and the effect of the present invention is Other configurations may be used as long as they do not impair the performance.
<細胞膜透過性分子の製造方法>
前記細胞膜透過性分子の製造方法としては、特に制限はなく、公知の化学合成の技術を適宜選択して行うことができる。例えば、米国特許第7,862,807号明細書などに記載の方法を参考にして、公知の化学合成の技術を適宜選択することにより製造することができる。例えば、塩の形態とする方法としては、塩の形態ではない細胞膜透過性分子の粗生成物を、目的の塩の種類に応じた移動相を用いたHPLCにより精製し、目的とする塩の形態の細胞膜透過性分子とする方法、塩の形態である細胞膜透過性分子を、対イオンを目的の塩のイオンへと置換した陰イオン交換樹脂に通じ、溶出することで目的とする塩の形態の細胞膜透過性分子とする方法などが挙げられる。
<Method for producing cell membrane permeable molecules>
The method for producing the cell membrane permeable molecule is not particularly limited and can be carried out by appropriately selecting known chemical synthesis techniques. For example, it can be produced by appropriately selecting known chemical synthesis techniques with reference to the method described in US Pat. No. 7,862,807. For example, to obtain a salt form, a crude product of a cell membrane permeable molecule that is not in a salt form is purified by HPLC using a mobile phase depending on the type of salt, and the desired salt form is obtained. In this method, a cell membrane permeable molecule in the form of a salt is passed through an anion exchange resin in which counter ions are replaced with ions of the desired salt, and eluted to form the desired salt form. Examples include methods for making molecules permeable to cell membranes.
得られた細胞膜透過性分子が所望の構造を有するか否かを確認する方法としては、特に制限はなく、公知の分析方法を適宜選択することができ、例えば、質量分析法、プロトン核磁気共鳴分光法、炭素13核磁気共鳴分光法、紫外分光法、赤外分光法などの分析方法が挙げられる。 The method for confirming whether the obtained cell membrane permeable molecule has the desired structure is not particularly limited, and any known analysis method can be selected as appropriate, such as mass spectrometry, proton nuclear magnetic resonance, etc. Analytical methods include spectroscopy, carbon-13 nuclear magnetic resonance spectroscopy, ultraviolet spectroscopy, and infrared spectroscopy.
本発明の細胞膜透過分子は、生体への毒性を低減しつつ、ペプチド、核酸、タンパク質及びこれらの複合体などの有効成分に対して優れた細胞膜透過性を付与することができる。 The cell membrane permeable molecule of the present invention can provide excellent cell membrane permeability to active ingredients such as peptides, nucleic acids, proteins, and complexes thereof, while reducing toxicity to living organisms.
(ペプチド複合体)
本発明のペプチド複合体は、ペプチドと、上記した本発明の細胞膜透過性分子とを少なくとも含み、必要に応じて更にその他の構成を含む。
(peptide complex)
The peptide complex of the present invention includes at least the peptide and the cell membrane permeable molecule of the present invention described above, and further includes other components as necessary.
<ペプチド>
前記ペプチドとしては、前記細胞膜透過性分子を導入することができる限り、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記細胞膜透過性分子を導入することにより環状化されるペプチドが好ましい。
前記ペプチドにおけるアミノ酸の種類としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、天然のアミノ酸であってもよいし、非天然のアミノ酸であってもよく、また、D体であってもよいし、L体であってもよい。
前記ペプチドは、リポペプチドなどの修飾型ペプチドであってもよい。
<Peptide>
The peptide is not particularly limited as long as it can introduce the cell membrane permeable molecule, and can be appropriately selected depending on the purpose; however, peptides that can be cyclized by introducing the cell membrane permeable molecule is preferred.
The type of amino acid in the peptide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, and may be a natural amino acid or a non-natural amino acid. It may be present, or it may be an L-form.
The peptide may be a modified peptide such as a lipopeptide.
前記細胞膜透過性分子の導入に利用するアミノ酸残基(以下、「反応性アミノ酸残基」と称することがある。)としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、システイン残基、リジン残基、ヒスチジン残基、トリプトファン残基、チロシン残基、セリン残基、スレオニン残基などが挙げられる。
前記ペプチドとして、細胞膜透過性分子を導入することにより環状化されるペプチドを用いる場合には、前記反応性アミノ酸残基としては、例えば、システイン残基、リジン残基、セリン残基、スレオニン残基などが挙げられる。
また、アミノ酸残基におけるアルコール側鎖を利用してもよい。
前記反応性アミノ酸残基は、1種を単独で使用してもよいし、2種以上を併用してもよい。
The amino acid residues (hereinafter sometimes referred to as "reactive amino acid residues") used for the introduction of the cell membrane permeable molecule are not particularly limited and can be selected as appropriate depending on the purpose, such as , cysteine residue, lysine residue, histidine residue, tryptophan residue, tyrosine residue, serine residue, threonine residue, etc.
When using a peptide that can be cyclized by introducing a cell membrane permeable molecule as the peptide, examples of the reactive amino acid residue include cysteine residue, lysine residue, serine residue, and threonine residue. Examples include.
Alternatively, alcohol side chains in amino acid residues may be utilized.
The reactive amino acid residues may be used alone or in combination of two or more.
前記反応性アミノ酸残基のペプチドにおける数としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
例えば、前記ペプチドとして、細胞膜透過性分子を導入することにより環状化されるペプチドを用いる場合には、前記反応性アミノ酸残基のペプチドにおける数は、2以上が好ましい。前記反応性アミノ酸残基のペプチドにおける数の上限値としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、反応点が多くなるとペプチドに結合する前記細胞膜透過性分子の数や位置が安定せず、アミノ酸配列に由来するペプチドの特性を比較し難くなる場合があるので、10以下が好ましい。
なお、例えば、ペプチド中のシステイン残基がジスルフィド結合により前記ペプチドの高次構造の安定化に関与しているような場合には、別途、上記反応性アミノ酸残基を前記ペプチドに導入することが好ましい。
The number of the reactive amino acid residues in the peptide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose.
For example, when a peptide that is cyclized by introducing a cell membrane permeable molecule is used as the peptide, the number of the reactive amino acid residues in the peptide is preferably 2 or more. The upper limit of the number of reactive amino acid residues in a peptide is not particularly limited and can be selected as appropriate depending on the purpose, but as the number of reactive points increases, the number of cell membrane permeable molecules that bind to the peptide and The number is preferably 10 or less because the position may not be stable and it may be difficult to compare the properties of peptides derived from amino acid sequences.
Note that, for example, in cases where cysteine residues in the peptide are involved in stabilizing the higher-order structure of the peptide through disulfide bonds, it is possible to separately introduce the above-mentioned reactive amino acid residue into the peptide. preferable.
前記反応性アミノ酸残基の前記ペプチドにおける位置としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。 The position of the reactive amino acid residue in the peptide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose.
例えば、前記ペプチドとして、mRNA分子、その翻訳物であるペプチド鎖(以下、「ポリペプチド鎖」と称することもある。)、及びリボソームを含むリボソームディスプレイ複合体(以下、「RD複合体」と称することがある。)を用いる場合には、例えば、リボソームの出口トンネル(exit tunnel)から外に出ている部分であり、具体的にはN末端から2番目~C末端から30番目の位置(N末端から2番目の位置及びC末端から30番目の位置を含む)の間とすることが、前記リンカー分子による修飾反応がリボソームにより立体的に阻害され難くなり得る点で、好ましい。
前記C末端からの位置としては、C末端から50番目が好ましく、100番目がより好ましい。
また、前記反応性アミノ酸残基の位置をN末端側から数えた場合、その位置は、ペプチドの鎖長に応じて適宜設定できるが、例えば、N末端から2~1,000番目の位置であり、N末端から2~100番目の位置が好ましく、N末端から2~50番目の位置がより好ましい。
For example, the peptide may include an mRNA molecule, a peptide chain (hereinafter sometimes referred to as a "polypeptide chain") that is a translation product thereof, and a ribosome display complex containing ribosomes (hereinafter referred to as an "RD complex"). ), for example, the part that exits from the exit tunnel of the ribosome, specifically the 2nd position from the N-terminus to the 30th position from the C-terminus (N (including the second position from the end and the 30th position from the C-terminus) is preferable in that the modification reaction by the linker molecule is less likely to be sterically inhibited by ribosomes.
The position from the C-terminus is preferably the 50th position, more preferably the 100th position from the C-terminus.
Furthermore, when counting the position of the reactive amino acid residue from the N-terminus side, the position can be set as appropriate depending on the chain length of the peptide, but for example, it is the 2nd to 1,000th position from the N-terminus. , the 2nd to 100th positions from the N-terminus are preferred, and the 2nd to 50th positions from the N-terminus are more preferred.
前記RD複合体の製造方法としては、特に制限はなく、公知の方法を適宜選択することができ、例えば、国際公開第2017/213158号に記載の方法などが挙げられる。また、市販のキットを利用して製造することもできる。 The method for producing the RD complex is not particularly limited, and any known method can be selected as appropriate, such as the method described in International Publication No. 2017/213158. It can also be manufactured using a commercially available kit.
前記ペプチドのアミノ酸配列としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ペプチドライブラリとして有用であるように、特定の位置にランダム配列を含むものが好ましい。かかるランダム配列の中から、所定の目的に応じて有用なアミノ酸配列を特定し得る。 The amino acid sequence of the peptide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but it is preferable that the peptide contains a random sequence at a specific position so that it is useful as a peptide library. Among such random sequences, useful amino acid sequences can be identified depending on a given purpose.
前記ランダム配列の前記ペプチドにおける位置としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、前記反応性アミノ酸残基の位置と同様に、RD複合体を用いる場合には、N末端から2番目~C末端から30番目の位置(N末端から2番目の位置及びC末端から30番目の位置を含む)の間とすることが好ましい。即ち、反応性アミノ酸残基は、ランダム配列内に含まれることが好ましい。従ってランダム配列の好ましい位置は、反応性アミノ酸残基の好ましい位置と同じ範囲から設定できる。 The position of the random sequence in the peptide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose. For example, similarly to the position of the reactive amino acid residue, when using an RD complex, It is preferably between the 2nd position from the N-terminus to the 30th position from the C-terminus (including the 2nd position from the N-terminus and the 30th position from the C-terminus). That is, the reactive amino acid residues are preferably contained within a random sequence. Therefore, the preferred positions of the random sequence can be set from the same range as the preferred positions of the reactive amino acid residues.
前記ランダム配列の前記ペプチドにおける数は、1つであってもよく、2つ以上であってもよい。前記ランダム配列の数の上限としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、10以下が好ましい。
前記ランダム配列1つあたりのアミノ酸残基数としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、1以上、30以下とすることができる。
1つのランダム配列が長くなるほど、またランダム配列の数が多くなるほど、ペプチドライブラリの多様性を高めることができる。
The number of the random sequences in the peptide may be one, or two or more. The upper limit of the number of random arrays is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, but is preferably 10 or less.
The number of amino acid residues per random sequence is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, and can be, for example, 1 or more and 30 or less.
The longer one random sequence and the greater the number of random sequences, the more diverse the peptide library can be.
前記ペプチドは、更に、FLAG(登録商標)配列やポリHis配列等のポリペプチド鎖の精製のための配列、プロテアーゼなどにより選択的に切断される配列、スペーサー配列などを含んでいてもよい。 The peptide may further include a sequence for purifying a polypeptide chain such as a FLAG (registered trademark) sequence or a poly-His sequence, a sequence that can be selectively cleaved by protease, a spacer sequence, and the like.
前記ペプチドのアミノ酸残基数としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、10以上、5,000以下とすることができる。
前記ペプチドのアミノ酸残基数の下限値としては、150以上が好ましく、200以上がより好ましい。また、ペプチドのアミノ酸残基数の上限値としては、800以下が好ましく、600以下がより好ましく、500以下が特に好ましい。前記下限値と上限値とは、適宜組み合わせて選択することができる。
The number of amino acid residues in the peptide is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, for example, 10 or more and 5,000 or less.
The lower limit of the number of amino acid residues in the peptide is preferably 150 or more, more preferably 200 or more. Furthermore, the upper limit of the number of amino acid residues in the peptide is preferably 800 or less, more preferably 600 or less, and particularly preferably 500 or less. The lower limit value and upper limit value can be selected in combination as appropriate.
前記ペプチドの合成方法としては、特に制限はなく、公知の方法を適宜選択することができる。 The method for synthesizing the peptide is not particularly limited, and any known method can be selected as appropriate.
<細胞膜透過性分子>
前記細胞膜透過性分子は、上記した本発明の細胞膜透過性分子である。
前記細胞膜透過性分子は、ペプチドに導入される際に、前記ペプチドにおける反応性アミノ酸残基と反応する部位の構造が変化してもよい。
<Cell membrane permeable molecules>
The cell membrane permeable molecule is the above cell membrane permeable molecule of the present invention.
When the cell membrane permeable molecule is introduced into a peptide, the structure of a site that reacts with a reactive amino acid residue in the peptide may be changed.
<その他の構成>
前記ペプチド複合体におけるその他の構成としては、本発明の効果を損なわない限り、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、蛍光物質などの発光物質、色素、放射性物質、薬剤、毒素、核酸、アミノ酸、糖類、脂質、各種ポリマーなどが挙げられる。これらは、1種単独で使用してもよいし、2種以上を併用してもよい。
前記蛍光物質としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、フルオレセイン類、ローダミン類、クマリン類、ピレン類、シアニン類などの蛍光色素が挙げられる。
前記その他の構成は、例えば、上記したペプチドに、直接又は連結基などを介して結合させることができる。
<Other configurations>
Other components of the peptide complex are not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose as long as they do not impair the effects of the present invention. For example, luminescent substances such as fluorescent substances, dyes, radioactive substances, Examples include drugs, toxins, nucleic acids, amino acids, saccharides, lipids, and various polymers. These may be used alone or in combination of two or more.
The fluorescent substance is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, and includes, for example, fluorescent dyes such as fluoresceins, rhodamines, coumarins, pyrenes, and cyanines.
The other configurations described above can be bonded to the above-mentioned peptide, for example, directly or via a linking group.
本発明のペプチド複合体は、優れた細胞透過性を有しつつ、生体への毒性も低い。したがって、例えば、ランダム配列を含むペプチド複合体ライブラリとし、スクリーニングを行うことで、優れた細胞透過性を有しつつ、生体への毒性も低く、かつ対象物質への親和性が高い等の有用なアミノ酸配列を特定し得る。 The peptide complex of the present invention has excellent cell permeability and low toxicity to living organisms. Therefore, for example, by screening a peptide complex library containing random sequences, it is possible to find useful compounds that have excellent cell permeability, low toxicity to living organisms, and high affinity for target substances. Amino acid sequences can be specified.
(ペプチド複合体の製造方法)
本発明のペプチド複合体の製造方法は、ペプチドに、本発明の細胞膜透過性分子を導入する導入工程を少なくとも含み、必要に応じて更にその他の工程を含む。
(Method for producing peptide complex)
The method for producing a peptide complex of the present invention includes at least an introduction step of introducing the cell membrane permeable molecule of the present invention into a peptide, and further includes other steps as necessary.
<導入工程>
前記導入工程は、ペプチドに、本発明の細胞膜透過性分子を導入する(以下、「結合する」、「挿入する」、「連結する」と称することもある。)工程である。
前記導入工程により、ペプチドへ細胞膜透過性を付与することができる。また、上記した環状化基を有する細胞膜透過性分子を導入する場合には、ペプチドの環状化と、ペプチドへの細胞膜透過性の付与とを同時に行うことができる。
前記導入工程では、反応物中における少なくとも1つのペプチドに細胞膜透過性分子が導入されればよいが、全てのペプチドに細胞膜透過性分子が導入されることが好ましい。
<Introduction process>
The introduction step is a step of introducing the cell membrane permeable molecule of the present invention into the peptide (hereinafter sometimes referred to as "binding", "inserting", or "linking").
Through the introduction step, cell membrane permeability can be imparted to the peptide. Furthermore, when introducing a cell membrane permeable molecule having the above-described cyclization group, cyclization of the peptide and imparting cell membrane permeability to the peptide can be performed simultaneously.
In the introduction step, it is sufficient that a cell membrane permeable molecule is introduced into at least one peptide in the reaction product, but it is preferable that a cell membrane permeable molecule is introduced into all peptides.
-ペプチド-
前記ペプチドは、上記した(ペプチド複合体)の<ペプチド>の項目に記載したものと同様である。前記導入工程に用いるペプチドは、ペプチドライブラリの態様であってもよい。なお、このペプチドライブラリにおけるペプチドは本発明の細胞膜透過性分子が導入されていない状態のものである。
-peptide-
The peptide is the same as that described in the <Peptide> section of (Peptide Complex) above. The peptide used in the introduction step may be in the form of a peptide library. Note that the peptides in this peptide library are those in which the cell membrane permeable molecules of the present invention have not been introduced.
-細胞膜透過性分子-
前記細胞膜透過性分子は、上記した本発明の細胞膜透過性分子である。
-Cell membrane permeable molecules-
The cell membrane permeable molecule is the above cell membrane permeable molecule of the present invention.
-導入-
前記導入の方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、前記細胞膜透過性分子におけるペプチド連結用基と、前記ペプチドにおける反応性アミノ酸残基とを反応させる方法などが挙げられる。例えば、還元剤の存在下で、前記細胞膜透過性分子と、前記ペプチドとを反応させる方法などが挙げられる。前記還元剤としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩などが挙げられる。
前記反応の温度、時間等の条件としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
-introduction-
The method of introduction is not particularly limited and can be selected as appropriate depending on the purpose, for example, a method of reacting a peptide linking group in the cell membrane permeable molecule with a reactive amino acid residue in the peptide. Examples include. For example, a method may be used in which the cell membrane permeable molecule and the peptide are reacted in the presence of a reducing agent. The reducing agent is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose, such as tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride.
Conditions such as temperature and time for the reaction are not particularly limited and can be appropriately selected depending on the purpose.
前記ペプチド複合体を塩の形態とする方法としては、特に制限はなく、公知の化学合成の技術を適宜選択して行うことができ、例えば、上記した<細胞膜透過性分子の製造方法>の項目に記載した方法と同様の方法などが挙げられる。 The method for converting the peptide complex into a salt form is not particularly limited and can be carried out by appropriately selecting known chemical synthesis techniques. Examples include methods similar to those described in .
<その他の工程>
前記その他の工程としては、本発明の効果を損なわない限り、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
<Other processes>
The other steps mentioned above are not particularly limited as long as they do not impair the effects of the present invention, and can be appropriately selected depending on the purpose.
得られたペプチド複合体が所望の構造を有するか否かを確認する方法としては、特に制限はなく、公知の分析方法を適宜選択することができ、例えば、質量分析法、プロトン核磁気共鳴分光法、炭素13核磁気共鳴分光法、紫外分光法、赤外分光法などの分析方法が挙げられる。 The method for confirming whether the obtained peptide complex has the desired structure is not particularly limited, and any known analysis method can be selected as appropriate, such as mass spectrometry, proton nuclear magnetic resonance spectroscopy, etc. Analytical methods include carbon-13 nuclear magnetic resonance spectroscopy, ultraviolet spectroscopy, and infrared spectroscopy.
(ペプチドライブラリ)
本発明のペプチドライブラリは、本発明のペプチド複合体を少なくとも含み、必要に応じて更にその他の構成を含む。即ち、本発明のペプチドライブラリは、本発明の細胞膜透過性分子が導入されたペプチド複合体を含むものである。
前記ペプチドライブラリは、本発明のペプチド複合体のみからなるものであってもよいし、前記細胞膜透過性分子が導入されていないペプチドが含まれていてもよい。
(peptide library)
The peptide library of the present invention includes at least the peptide complex of the present invention, and further includes other components as necessary. That is, the peptide library of the present invention contains a peptide complex into which the cell membrane permeable molecule of the present invention is introduced.
The peptide library may consist only of the peptide complex of the present invention, or may include peptides into which the cell membrane permeable molecule has not been introduced.
前記ペプチドライブラリは、上記した(ペプチド複合体の製造方法)と同様にして、製造することができる。 The peptide library can be produced in the same manner as described above (method for producing a peptide complex).
(機能性ペプチドのスクリーニング方法)
本発明の機能性ペプチドのスクリーニング方法は、本発明のペプチドライブラリを用いて機能性ペプチドをスクリーニングする工程を少なくとも含み、必要に応じて更にその他の工程を含む。
前記スクリーニングの方法としては、本発明のペプチドライブラリを用いる限り、特に制限はなく、公知の方法を適宜選択することができる。例えば、所望の対象物質と、前記ペプチドライブラリとを混合し、結合したペプチド複合体(例えば、RD複合体)を選択し、前記RD複合体からRNAを解離させ、前記RNAからDNAを調製し、増幅した後、mRNAに転写し、再度RD複合体ライブラリを作製するという工程を繰り返し、前記対象物質に対する親和性を有する機能性ペプチドをスクリーニングする、リボソームディスプレイ法によるスクリーニング方法が挙げられる。また、ファージディスプレイ法、mRNAディスプレイ法、DNAディスプレイ法、1ビーズ1化合物(one-bead one-compound)法などを用いたスクリーニング方法なども挙げられる。
前記スクリーニング方法では、スクリーニング工程を繰返す過程などにおいて、選択されたペプチドに、本発明の細胞膜透過性分子を導入する導入工程を含んでいてもよい。前記導入工程は、上記した(ペプチド複合体の製造方法)における<導入工程>と同様にして行うことができる。
(Screening method for functional peptides)
The method for screening functional peptides of the present invention includes at least the step of screening for functional peptides using the peptide library of the present invention, and further includes other steps as necessary.
The screening method is not particularly limited as long as the peptide library of the present invention is used, and any known method can be selected as appropriate. For example, mixing a desired target substance and the peptide library, selecting a bound peptide complex (e.g., RD complex), dissociating RNA from the RD complex, and preparing DNA from the RNA; Examples include a screening method using ribosome display, which repeats the steps of amplifying, transcribing into mRNA, and creating an RD complex library again, and screening for a functional peptide that has an affinity for the target substance. Other examples include screening methods using phage display methods, mRNA display methods, DNA display methods, one-bead one-compound methods, and the like.
The screening method may include an introduction step of introducing the cell membrane permeable molecule of the present invention into the selected peptide during the process of repeating the screening step. The introduction step can be performed in the same manner as the <introduction step> in the above-mentioned (method for producing a peptide complex).
以下に実施例等を挙げて本発明をより具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例等に何ら限定されるものではない。 The present invention will be described in more detail below with reference to Examples, but the present invention is not limited to these Examples.
(実施例1:細胞膜透過性分子G3-DHXトリフルオロ酢酸塩の合成)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHXトリフルオロ酢酸塩を下記のようにして合成した。
(Example 1: Synthesis of cell membrane permeable molecule G3-DHX trifluoroacetate)
For toxicity evaluation, G3-DHX trifluoroacetate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was synthesized as follows.
<化合物G3-DCXの合成>
-化合物C1の合成-
米国特許第7,862,807号明細書に記載の方法と同様の方法により、下記構造式で表される化合物C1を合成した。
なお、構造式中の「Boc」は、「tert-ブトキシカルボニル基」を表す。
-Synthesis of compound C1-
Compound C1 represented by the following structural formula was synthesized by a method similar to that described in US Pat. No. 7,862,807.
Note that "Boc" in the structural formula represents a "tert-butoxycarbonyl group."
-化合物C3の合成-
上記反応式のようにして、上記構造式で表される化合物C3を合成した。
具体的には、化合物C1(500mg,0.42mmol)の塩化メチレン溶液(15mL)を0℃に冷却し、化合物C2(東京化成工業株式会社製、製品番号A2293)(117.5mg,0.504mmol)と1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBT)(85.1mg,0.630mmol)と1-(3-ジメチルアミノプロピル)-3-エチルカルボジイミド塩酸塩(EDC/HCl)(120mg,0.630mmol)を加えて25℃で17時間撹拌した。ここにH2O(20mL)を加え、塩化メチレンで抽出を行い(30mLで3回)、有機層は1N塩酸(20mLで2回)と飽和重曹水(20mLで2回)と水(20mLで2回)で洗浄した。Na2SO4で乾燥しろ過と濃縮を行い、得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィー精製(メタノール(MeOH)/CH2Cl2=1/10)することにより、化合物C3を白色固体として取得した(533mg,0.379mmol,収率90%)。
前記化合物C3の1H NMRによる同定データは、以下のとおりであった。
1H NMR(CDCl3): δ 11.4(s, 3H), 8.58(t, 3JHH=6.0Hz, 3H), 7.69(t, 3JHH=5.0Hz, 3H), 6.84(s, 1H), 3.89(s, 2H), 3.71-3.65(m, 22H), 3.56-3.53(m, 6H), 3.42-3.38(m, 8H), 2.43(t, 3JHH=6.0Hz, 6H), 1.49(s, 27H), 1.48(s, 27H)
Compound C3 represented by the above structural formula was synthesized according to the above reaction formula.
Specifically, a methylene chloride solution (15 mL) of compound C1 (500 mg, 0.42 mmol) was cooled to 0°C, and compound C2 (manufactured by Tokyo Kasei Kogyo Co., Ltd., product number A2293) (117.5 mg, 0.504 mmol) was cooled to 0°C. ), 1-hydroxybenzotriazole (HOBT) (85.1 mg, 0.630 mmol), and 1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochloride (EDC/HCl) (120 mg, 0.630 mmol) were added. The mixture was stirred at 25°C for 17 hours. H 2 O (20 mL) was added thereto, and extraction was performed with methylene chloride (3 times with 30 mL), and the organic layer was extracted with 1N hydrochloric acid (2 times with 20 mL), saturated aqueous sodium bicarbonate (2 times with 20 mL), and water (2 times with 20 mL). Washed twice). After drying with Na 2 SO 4 , filtration and concentration, the resulting residue was purified by silica gel chromatography (methanol (MeOH)/CH 2 Cl 2 = 1/10) to obtain compound C3 as a white solid ( 533 mg, 0.379 mmol, yield 90%).
Identification data of the compound C3 by 1H NMR were as follows.
1H NMR ( CDCl3 ): δ 11.4 (s, 3H), 8.58 (t, 3 J HH =6.0Hz, 3H), 7.69 (t, 3 J HH =5.0Hz, 3H) , 6.84 (s, 1H), 3.89 (s, 2H), 3.71-3.65 (m, 22H), 3.56-3.53 (m, 6H), 3.42-3 .38 (m, 8H), 2.43 (t, 3 J HH =6.0Hz, 6H), 1.49 (s, 27H), 1.48 (s, 27H)
-化合物DBXAの合成-
水素化ナトリウム(132mg,3.02mmol)をテトラヒドロフラン(THF)(6mL)に懸濁させ0℃に冷却した。ここに2-プロピン-1-オール(0.165mL,2.80mmol)を加え0℃で30分間撹拌した。1,3,5-トリス(ブロモメチル)ベンゼン(1.00g,2.80mmol)を加え25℃で20時間撹拌した。酢酸エチル(100mL)を加えてから水(100mL)と飽和食塩水(100mL)で洗浄し、有機層を硫酸マグネシウムで洗浄した。ろ過と濃縮を行い得られた残渣を分取薄層クロマトグラフィー(PTLC)で精製し(塩化メチレン/ヘキサン=1/2)、下記構造式で表される化合物DBXA(416.6mg,1.25mmol,収率45%)を淡黄色油状物として取得した。
前記化合物DBXAの1H NMRによる同定データは、以下のとおりであった。
1H NMR(CDCl3): δ 7.29(s, 1H), 7.26(s, 2H), 4.53(s, 2H), 4.40(s, 4H), 4.15(4JHH=2.5Hz, 2H), 2.43(4JHH=2.0Hz, 1H)
Sodium hydride (132 mg, 3.02 mmol) was suspended in tetrahydrofuran (THF) (6 mL) and cooled to 0°C. 2-Propyn-1-ol (0.165 mL, 2.80 mmol) was added thereto and stirred at 0° C. for 30 minutes. 1,3,5-tris(bromomethyl)benzene (1.00 g, 2.80 mmol) was added and stirred at 25° C. for 20 hours. After adding ethyl acetate (100 mL), the mixture was washed with water (100 mL) and saturated brine (100 mL), and the organic layer was washed with magnesium sulfate. The residue obtained by filtration and concentration was purified by preparative thin layer chromatography (PTLC) (methylene chloride/hexane = 1/2) to obtain a compound DBXA (416.6 mg, 1.25 mmol) represented by the following structural formula. , yield 45%) was obtained as a pale yellow oil.
Identification data of the compound DBXA by 1H NMR were as follows.
1H NMR ( CDCl3 ): δ 7.29 (s, 1H), 7.26 (s, 2H), 4.53 (s, 2H), 4.40 (s, 4H), 4.15 ( 4 J HH = 2.5Hz, 2H), 2.43 ( 4 J HH = 2.0Hz, 1H)
-化合物C4の合成-
上記反応式のようにして、上記構造式で表される化合物C4を合成した。
具体的には、化合物C3(533mg, 0.379mmol)と化合物DBXA(188mg, 0.568mmol)とTHF(40mL)からなる溶液に窒素ガスバブリングを行い、窒素雰囲気下とした。ここに、硫酸銅水溶液(200mM; 1.89mL,0.379mmol)とアスコルビン酸ナトリウム水溶液(100mM; 7.58mL,0.758mmol)を加え、25℃で3時間撹拌した。反応液に水を加え塩化メチレンで抽出を行い(20mLで3回)、有機層をNa2SO4で乾燥しろ過と濃縮を行い、得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィー精製(MeOH/CH2Cl2=1/20)することにより、化合物C4を白色固体として取得した(497mg,0.286mmol,収率76%)。
前記化合物C4の1H NMRによる同定データは、以下のとおりであった。
1H NMR(CDCl3): δ 8.58(t, 3JHH=5.5Hz, 3H), 7.77(s, 1H), 7.74(t, 3JHH=5.0Hz, 3H), 7.34(s, 1H), 7.32(s, 2H), 6.82(s, 1H), 4.69(s, 2H), 4.58(s, 2H), 4.56(t, 3JHH=5.0Hz, 2H), 4.47(s, 4H), 3.89(t, 3JHH=5.0Hz, 2H), 3.87(s, 2H), 3.69(t, 3JHH=6.0Hz, 6H), 3.66(s, 6H), 3.61(s, 8H), 3.56-3.52(m, 6H), 3.41-3.38(m, 6H), 2.42(t, 3JHH=6.0Hz, 6H), 1.49(s, 27H), 1.48(s, 27H)
Compound C4 represented by the above structural formula was synthesized according to the above reaction formula.
Specifically, nitrogen gas was bubbled into a solution consisting of compound C3 (533 mg, 0.379 mmol), compound DBXA (188 mg, 0.568 mmol), and THF (40 mL) to create a nitrogen atmosphere. A copper sulfate aqueous solution (200mM; 1.89mL, 0.379mmol) and a sodium ascorbate aqueous solution (100mM; 7.58mL, 0.758mmol) were added thereto, and the mixture was stirred at 25°C for 3 hours. Water was added to the reaction solution and extracted with methylene chloride (20 mL x 3), the organic layer was dried over Na 2 SO 4 , filtered and concentrated, and the resulting residue was purified by silica gel chromatography (MeOH/CH 2 Cl). 2 = 1/20), compound C4 was obtained as a white solid (497 mg, 0.286 mmol, yield 76%).
Identification data of the compound C4 by 1H NMR were as follows.
1H NMR ( CDCl3 ): δ 8.58 (t, 3 J HH =5.5Hz, 3H), 7.77 (s, 1H), 7.74 (t, 3 J HH =5.0Hz, 3H) , 7.34 (s, 1H), 7.32 (s, 2H), 6.82 (s, 1H), 4.69 (s, 2H), 4.58 (s, 2H), 4.56 ( t, 3 J HH =5.0Hz, 2H), 4.47 (s, 4H), 3.89 (t, 3 J HH =5.0Hz, 2H), 3.87 (s, 2H), 3. 69 (t, 3 J HH =6.0Hz, 6H), 3.66 (s, 6H), 3.61 (s, 8H), 3.56-3.52 (m, 6H), 3.41- 3.38 (m, 6H), 2.42 (t, 3 J HH =6.0Hz, 6H), 1.49 (s, 27H), 1.48 (s, 27H)
-化合物G3-DCXの合成-
上記反応式のようにして、上記構造式で表される化合物G3-DCXを合成した。
具体的には、化合物C4(497mg,0.286mmol)と4N塩酸ジオキサン溶液(30mL)を混合し、25℃で46時間撹拌した。反応後、白色固体が析出した。上清を除去し、化合物G3-DCXの粗生成物を取得した。分取HPLC(high performance liquid chromatography)で精製し、化合物G3-DCXを白色固体として取得した(116mg, 0.110mmol, 収率54%)。
前記化合物G3-DCXのマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間質量分析(MALDI-TOF MS)による同定データは、以下のとおりであった。
MALDI-TOF MS C24H51N14O8 計算値([M+H]+)1047.502、測定値1047.953
Compound G3-DCX represented by the above structural formula was synthesized according to the above reaction formula.
Specifically, compound C4 (497 mg, 0.286 mmol) and 4N hydrochloric acid dioxane solution (30 mL) were mixed and stirred at 25° C. for 46 hours. After the reaction, a white solid precipitated. The supernatant was removed to obtain a crude product of compound G3-DCX. It was purified by preparative HPLC (high performance liquid chromatography) to obtain compound G3-DCX as a white solid (116 mg, 0.110 mmol, yield 54%).
Identification data of the compound G3-DCX by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) were as follows.
MALDI-TOF MS C 24 H 51 N 14 O 8 Calculated value ([M+H] + ) 1047.502, Measured value 1047.953
<G3-DHXトリフルオロ酢酸塩の合成>
上記反応式のようにして、上記構造式で表される細胞膜透過性分子G3-DHXトリフルオロ酢酸塩を合成した。
具体的には、化合物G3-DCX(506mg,0.480mmol)とH2O(6mL)を混合し、80℃で2時間撹拌した。反応液を濃縮し、化合物G3-DHX粗生成物を取得した。トリフルオロ酢酸(TFA)を含む移動相を用いたHPLC(high performance liquid chromatography)で精製し、細胞膜透過性分子G3-DHXトリフルオロ酢酸塩を白色固体として取得した(224.6mg, 0.169mmol, 収率35%)。
前記G3-DHXトリフルオロ酢酸塩のマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間質量分析(MALDI-TOF MS)による同定データは、以下のとおりであった。
MALDI-TOF MS C42H74N16O13 計算値([M+H]+)1011.153、測定値1011.550。
A cell membrane permeable molecule G3-DHX trifluoroacetate represented by the above structural formula was synthesized according to the above reaction formula.
Specifically, compound G3-DCX (506 mg, 0.480 mmol) and H 2 O (6 mL) were mixed and stirred at 80° C. for 2 hours. The reaction solution was concentrated to obtain a crude product of Compound G3-DHX. It was purified by HPLC (high performance liquid chromatography) using a mobile phase containing trifluoroacetic acid (TFA) to obtain cell membrane permeable molecule G3-DHX trifluoroacetate as a white solid (224.6 mg, 0.169 mmol, yield 35%).
Identification data of the G3-DHX trifluoroacetate by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) were as follows.
MALDI-TOF MS C 42 H 74 N 16 O 13 calculated value ([M+H] + ) 1011.153, measured value 1011.550.
(実施例2:細胞膜透過性分子G3-DHX硝酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHX硝酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(1.5mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンを硝酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、白色乃至オフホワイト色粉末としてG3-DHX硝酸塩(0.9mg)を得た。
(Example 2: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX nitrate)
For toxicity evaluation, G3-DHX nitrate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (1.5 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and an anion exchange resin (diamond) in which the counter ion was replaced with nitrate ion was added. Ion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to yield G3-DHX nitrate (0.9 mg) as a white to off-white powder.
(実施例3:細胞膜透過性分子G3-DHX硫酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHX硫酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(1.5mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンを硫酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、白色乃至オフホワイト色粉末としてG3-DHX硫酸塩(1.0mg)を得た。
(Example 3: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX sulfate)
For toxicity evaluation, G3-DHX sulfate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (1.5 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and anion exchange resin (diamond) in which the counter ion was replaced with sulfate ion was added. Ion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to yield G3-DHX sulfate (1.0 mg) as a white to off-white powder.
(実施例4:細胞膜透過性分子G3-DHXリン酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHXリン酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(1.5mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンをリン酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、白色乃至オフホワイト色粉末としてG3-DHXリン酸塩(1.4mg)を得た。
(Example 4: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX phosphate)
For toxicity evaluation, G3-DHX phosphate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (1.5 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and anion exchange resin (2 mg/mL) in which the counter ions were replaced with phosphate ions ( Diaion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to yield G3-DHX phosphate (1.4 mg) as a white to off-white powder.
(実施例5:細胞膜透過性分子G3-DHXメシル酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHXメシル酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(2.2mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンをメシル酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、無色液体としてG3-DHXメシル酸塩(2.2mg)を得た。
(Example 5: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX mesylate)
For toxicity evaluation, G3-DHX mesylate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (2.2 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and anion exchange resin (2 mg/mL) in which the counter ion was replaced with mesylate ion ( Diaion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to yield G3-DHX mesylate (2.2 mg) as a colorless liquid.
(実施例6:細胞膜透過性分子G3-DHXトシル酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHXトシル酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(2.2mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンをトシル酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、白色粉末としてG3-DHXトシル酸塩(2.4mg)を得た。
(Example 6: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX tosylate)
For toxicity evaluation, G3-DHX tosylate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (2.2 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and anion exchange resin (2 mg/mL) in which the counter ion was replaced with tosylate ion ( Diaion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to obtain G3-DHX tosylate (2.4 mg) as a white powder.
(実施例7:細胞膜透過性分子G3-DHX酒石酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHX酒石酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(2.2mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンを酒石酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、淡黄色粉末としてG3-DHX酒石酸塩(1.8mg)を得た。
(Example 7: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX tartrate)
For toxicity evaluation, G3-DHX tartrate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (2.2 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and an anion exchange resin (diamond) in which the counter ion was replaced with tartrate ion was added. Ion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to give G3-DHX tartrate (1.8 mg) as a pale yellow powder.
(実施例8:細胞膜透過性分子G3-DHXクエン酸塩の調製)
毒性評価用として、細胞膜透過性分子の一例であるG3-DHXクエン酸塩を下記のようにして調製した。
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(2.2mg)を、超純水に溶解し(2mg/mL)、対イオンをクエン酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、淡黄色粉末としてG3-DHXクエン酸塩(1.6mg)を得た。
(Example 8: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX citrate)
For toxicity evaluation, G3-DHX citrate, which is an example of a cell membrane permeable molecule, was prepared as follows.
G3-DHX trifluoroacetate (2.2 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (2 mg/mL), and anion exchange resin (2.2 mg) in which the counter ion was replaced with citrate ion ( Diaion PA306S). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to give G3-DHX citrate (1.6 mg) as a pale yellow powder.
(比較例1:細胞膜透過性分子G3-DHX酢酸塩の調製)
実施例1と同様にして合成したG3-DHXトリフルオロ酢酸塩(43mg)を、超純水に溶解し(5mg/mL)、対イオンを酢酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)に通じた。溶出には超純水を用いた。得られた溶液を凍結乾燥して、白色乃至オフホワイト色粉末としてG3-DHX酢酸塩(36mg)を得た。
(Comparative Example 1: Preparation of cell membrane permeable molecule G3-DHX acetate)
G3-DHX trifluoroacetate (43 mg) synthesized in the same manner as in Example 1 was dissolved in ultrapure water (5 mg/mL), and an anion exchange resin (Diaion PA306S) in which the counter ion was replaced with acetate ion was added. ). Ultrapure water was used for elution. The resulting solution was lyophilized to yield G3-DHX acetate (36 mg) as a white to off-white powder.
(実施例9:ペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩の合成)
細胞膜透過性分子とペプチドとの複合体の一例であるペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩を下記のようにして合成した。
(Example 9: Synthesis of peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate)
A peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate, which is an example of a complex between a cell membrane permeable molecule and a peptide, was synthesized as follows.
<ペプチドの合成>
マイクロウェーブを用いた固相合成法により、リンクアミド(Rink Amide)樹脂(0.2mmol/g)上で、以下の配列を有するペプチドを合成した。
FITC-Ahx-Cys-Gly-Ser-Gly-Leu-Ala-Ser-Pro-Asn-Gly-Tyr-Cys-NH2
(上記配列中、「FITC」はフルオレセインイソチオシアネートを表し、「Ahx」は6-アミノヘキサン酸を表す。)
<Synthesis of peptide>
A peptide having the following sequence was synthesized on Rink Amide resin (0.2 mmol/g) by solid phase synthesis using microwaves.
FITC-Ahx-Cys-Gly-Ser-Gly-Leu-Ala-Ser-Pro-Asn-Gly-Tyr-Cys- NH2
(In the above sequence, "FITC" represents fluorescein isothiocyanate, and "Ahx" represents 6-aminohexanoic acid.)
前記ペプチドを形成した樹脂を、TFA/水/トリイソプロピルシラン/3,6-ジオキサ-1,8-オクタンジチオール(92.5/2.5/2.5/2.5(容量比))に3時間浸漬し、前記ペプチドを樹脂から切り出した。得られたペプチドをHPLCで精製し凍結乾燥することにより、上記配列を有するペプチド(以下、「P」と表すことがある。下記構造式参照。)を取得した。前記ペプチドPのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)による同定データは、以下のとおりであった。
ESI-MS C72H92N16O22O3 計算値([M+2H]2+)815.295、測定値814.67
ESI-MS C 72 H 92 N 16 O 22 O 3 Calculated value ([M+2H] 2+ ) 815.295, Measured value 814.67
<ペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩の合成>
上記反応式のようにして、上記構造式で表されるペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩を合成した。
具体的には、上記で合成したペプチドP(11.0mg,6.75μmol)を20mM重炭酸アンモニウム緩衝液(11.8mL)とアセトニトリル(MeCN)(1.7mL)の混合溶液に溶解させた。この溶液に、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)(500mM in H2O;14.8μL,7.4μmol)を添加し、25℃下で15分間撹拌した。続いて、上記で合成したG3-DCX(10.6mg,10.1μmol)と25℃下で24時間撹拌した。その後、反応液を、TFAを含む移動相を用いたHPLCで精製することにより、環状ペプチド(ペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩)を取得した(3.25mg,1.10μmol,収率16%)。
前記ペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩のMALDI-TOF MSによる同定データは、以下のとおりであった。
MALDI-TOF MS C114H163N32O33S3 計算値([M+H]+)2604.92、測定値2604.330
A peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate represented by the above structural formula was synthesized according to the above reaction formula.
Specifically, peptide P (11.0 mg, 6.75 μmol) synthesized above was dissolved in a mixed solution of 20 mM ammonium bicarbonate buffer (11.8 mL) and acetonitrile (MeCN) (1.7 mL). Tris(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP) (500 mM in H 2 O; 14.8 μL, 7.4 μmol) was added to this solution, and the mixture was stirred at 25° C. for 15 minutes. Subsequently, the mixture was stirred with G3-DCX (10.6 mg, 10.1 μmol) synthesized above at 25° C. for 24 hours. Thereafter, the reaction solution was purified by HPLC using a mobile phase containing TFA to obtain a cyclic peptide (peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate) (3.25 mg, 1.10 μmol, yield). rate 16%).
The identification data of the peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate by MALDI-TOF MS was as follows.
MALDI-TOF MS C 114 H 163 N 32 O 33 S 3 Calculated value ([M+H] + ) 2604.92, Measured value 2604.330
(比較例2:ペプチド複合体G3-DCX-P酢酸塩の調製)
実施例9と同様にして合成したペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩(1.0mg)を、超純水に溶解し(0.5mg/mL)、対イオンを酢酸イオンへと置換した陰イオン交換樹脂(ダイヤイオン PA306S)を添加した。1時間振とうしたのち、陰イオン交換樹脂を濾別し、超純水で溶出した。得られた溶液を凍結乾燥して、白色乃至オフホワイト色粉末としてG3-DCX-P酢酸塩(0.9mg)を得た。
(Comparative Example 2: Preparation of peptide complex G3-DCX-P acetate)
Peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate (1.0 mg) synthesized in the same manner as in Example 9 was dissolved in ultrapure water (0.5 mg/mL), and the counter ion was replaced with acetate ion. An anion exchange resin (Diaion PA306S) was added. After shaking for 1 hour, the anion exchange resin was filtered off and eluted with ultrapure water. The resulting solution was lyophilized to give G3-DCX-P acetate (0.9 mg) as a white to off-white powder.
(試験例1:細胞膜透過性分子の毒性評価)
<マウスでのin vivo毒性評価>
供与動物は、7週齢のマウス(雌性、15~25g、日本チャールズ・リバー社)を購入し、約7日間、環境馴化させたものを用いた。
実施例及び比較例で合成した細胞膜透過性分子G3-DHXの各種酸塩(トリフルオロ酢酸塩、硫酸塩、リン酸塩、メシル酸塩、トシル酸塩、酒石酸塩、クエン酸塩、酢酸塩)は、0.1%(v/v)DMSO PBSに1~10mg/mLで溶解後、シリンジフィルターユニット(酢酸セルロース製、0.22μm)でろ過した。
マウスに、下記の表1に記載の量となるように調製した細胞膜透過性分子G3-DHXの各種酸塩又はプラセボ緩衝液対照(0.1%(v/v)DMSO PBS)を尾静脈に単回投与し、投与後30分間については一般症状及び生死等について経時的に観察し、その後7日間については1回/日のペースで継続的に一般症状及び生死等について観察した。細胞膜透過性分子G3-DHXの各種酸塩及びプラセボ緩衝液対照は、各群3匹のマウスに投与し、観察を実施した。また、投与日及び投与後1、2、7日後には体重測定を行い、体重の著しい増減を調査した。死亡例がみられた場合には、その都度解剖を実施した。また、生存例では、観察最終日(投与後7日目)に、全例についてイソフルラン吸入麻酔下で腹大動脈及び後大静脈より放血させ、安楽死させたうえで解剖し、肉眼的観察を行った。表1には投与5分後の一般症状の観察結果を示す。
(Test Example 1: Toxicity evaluation of cell membrane permeable molecules)
<In vivo toxicity evaluation in mice>
The donor animals used were 7-week-old mice (female, 15-25 g, Charles River Japan) that were purchased and acclimated to the environment for about 7 days.
Various acid salts (trifluoroacetate, sulfate, phosphate, mesylate, tosylate, tartrate, citrate, acetate) of cell membrane permeable molecule G3-DHX synthesized in Examples and Comparative Examples was dissolved in 0.1% (v/v) DMSO PBS at 1 to 10 mg/mL, and then filtered through a syringe filter unit (made of cellulose acetate, 0.22 μm).
Mice were injected into the tail vein with various acid salts of the cell membrane permeable molecule G3-DHX or a placebo buffer control (0.1% (v/v) DMSO PBS) prepared in the amounts listed in Table 1 below. A single dose was administered, and general symptoms, life and death, etc. were observed over time for 30 minutes after administration, and general symptoms, life and death, etc. were observed continuously for 7 days thereafter at a pace of once/day. Various acid salts of the cell membrane permeable molecule G3-DHX and a placebo buffer control were administered to three mice in each group, and observations were performed. In addition, body weight was measured on the day of administration and 1, 2, and 7 days after administration to investigate significant changes in body weight. Autopsies were performed in each case of death. For surviving cases, on the final day of observation (7 days after administration), all cases were exsanguinated from the abdominal aorta and posterior vena cava under isoflurane inhalation anesthesia, euthanized, and dissected for gross observation. Ta. Table 1 shows the observation results of general symptoms 5 minutes after administration.
表1に示されるとおり、G3-DHXトシル酸塩、G3-DHXメシル酸塩、G3-DHXリン酸塩、G3-DHXクエン酸塩、又はG3-DHX酒石酸塩を10mg/kgの用量で投与した群では、いずれに個体においても歩行障害や呼吸不整等の症状や体重の著しい増減は認められなかった。また投与後7日間にわたって生存を確認できた。
また、G3-DHXトリフルオロ酢酸塩については、10mg/kg又は20mg/kgのいずれの用量で投与しても、歩行障害や呼吸不整等症状や体重の著しい増減は認められなかった。
また、G3-DHX硫酸塩を投与した個体は、投与直後には呼吸不整が認められたが3分後には回復した。その後7日間にわたって異常症状は認められ体重の著しい増減もなかった。
一方、G3-DHX酢酸塩を10mg/kgの用量で投与した個体は、投与直後から振戦がみられ、投与から2分後に死亡した。
G3-DHX tosylate, G3-DHX mesylate, G3-DHX phosphate, G3-DHX citrate, or G3-DHX tartrate was administered at a dose of 10 mg/kg as shown in Table 1 No symptoms such as gait disturbance or breathing irregularities or significant changes in body weight were observed in any individual in the group. In addition, survival was confirmed for 7 days after administration.
Furthermore, with regard to G3-DHX trifluoroacetate, no symptoms such as gait disturbance or respiratory irregularity, or significant changes in body weight were observed, regardless of whether the dose was 10 mg/kg or 20 mg/kg.
In addition, in the individual to which G3-DHX sulfate was administered, respiratory irregularity was observed immediately after administration, but the animal recovered after 3 minutes. No abnormal symptoms were observed over the next 7 days, and there was no significant increase or decrease in weight.
On the other hand, the animal to which G3-DHX acetate was administered at a dose of 10 mg/kg exhibited tremor immediately after administration, and died 2 minutes after administration.
以上より、マウス単回静脈投与時の毒性は、G3-DHX酢酸塩が最も高く、オクタアルギニン(構造式は下記参照)と同程度である(Marcel Groggら, Cell Penetration, Herbicidal Activity, and in‐vivo‐Toxicity of Oligo‐Arginine Derivatives and of Novel Guanidinium‐Rich Compounds Derived from the Biopolymer Cyanophycin, Helv Chim Acta. 2018 October ; 101(10),e1800112)ことが分かった。
これに対し、G3-DHXトリフルオロ酢酸塩、G3-DHX硫酸塩、G3-DHXリン酸塩、G3-DHXメシル酸塩、G3-DHXトシル酸塩、G3-DHX酒石酸塩、及びG3-DHXクエン酸塩は、G3-DHX酢酸塩よりも低毒性であることが分かった。各酸のpKaの値と各酸塩の毒性の結果から、pKaの値が4.7の酢酸が最も毒性が高く、pKaの値が酢酸より小さい酸については毒性が低いことが分かる。すなわち、細胞膜透過性分子は、pKaの値が-8.0超4.7未満の酸との塩とすることで低毒性となることが示唆された。また、G3-DHX硫酸塩については、投与直後に僅からながらも症状が認められており、低毒性という観点からはpKaの値が-3.0超の酸との塩がより好ましいことが明らかとなった。
In contrast, G3-DHX trifluoroacetate, G3-DHX sulfate, G3-DHX phosphate, G3-DHX mesylate, G3-DHX tosylate, G3-DHX tartrate, and G3-DHX citrate The acid salt was found to be less toxic than G3-DHX acetate. From the results of the pK a value of each acid and the toxicity of each acid salt, it can be seen that acetic acid with a pK a value of 4.7 is the most toxic, and acids with a pK a value smaller than acetic acid are less toxic. . In other words, it was suggested that cell membrane permeable molecules become less toxic when they are made into a salt with an acid having a pK a value of more than -8.0 and less than 4.7. Regarding G3-DHX sulfate, slight symptoms were observed immediately after administration, and from the viewpoint of low toxicity, salts with acids with a pKa value of over -3.0 are more preferable. It became clear.
(試験例2:ペプチド複合体の細胞膜透過能評価)
実施例9で合成したペプチドP及び実施例9で合成したペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩のいずれかを2μM含む細胞培養液中、5%(v/v)CO2、37℃の条件下で、HeLa細胞(Human cervix adenocarcinoma cell)を2時間培養した。HeLa細胞の培養には、FluoroBrite D-MEM(ThermoFisher社製)(10%(v/v)FCS(ウシ胎児血清)、10%(v/v)GlutaMax(ThermoFisher社製)添加)を用いた。
次いで、D-PBS(-)(ヘパリン(20units/mL)添加)で細胞表面を洗浄後、細胞を回収し、D-PBS(-)(0.5%(v/v)BSA(ウシ血清アルブミン)、200mM EDTA(エチレンジアミン四酢酸)、0.2%(v/v)ヨウ化プロピジウム(Sigma-Aldrich社製)添加)に懸濁させ、フローサイトメーター(BD FACS AriaIII)を用いて蛍光強度を測定した。フローサイトメトリー解析時には、ヨウ化プロピジウム陽性の死細胞を除いた生細胞集団に対し、蛍光強度最頻値を算出した。結果を表2に示す。
(Test Example 2: Evaluation of cell membrane permeability of peptide complex)
In a cell culture medium containing 2 μM of either peptide P synthesized in Example 9 or peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate synthesized in Example 9, 5% (v/v) CO 2 , 37° C. HeLa cells (Human cervix adenocarcinoma cells) were cultured for 2 hours under these conditions. For culturing HeLa cells, FluoroBrite D-MEM (manufactured by ThermoFisher) (supplemented with 10% (v/v) FCS (fetal calf serum) and 10% (v/v) GlutaMax (manufactured by ThermoFisher)) was used.
Next, after washing the cell surface with D-PBS(-) (added with heparin (20 units/mL)), the cells were collected, and D-PBS(-) (0.5% (v/v) BSA (bovine serum albumin) was added). ), 200mM EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid), 0.2% (v/v) propidium iodide (Sigma-Aldrich)), and the fluorescence intensity was measured using a flow cytometer (BD FACS AriaIII). It was measured. At the time of flow cytometry analysis, the mode of fluorescence intensity was calculated for the live cell population excluding propidium iodide-positive dead cells. The results are shown in Table 2.
表2に示されるとおり、培養2時間後において、実施例9で合成したペプチドPはほぼ膜透過しないのに対し、実施例9で合成したペプチド複合体G3-DCX-Pトリフルオロ酢酸塩は膜透過していた。このことから、本発明の細胞膜透過性分子をペプチドに導入することにより、細胞膜透過性を獲得したことが実証された。 As shown in Table 2, after 2 hours of culture, peptide P synthesized in Example 9 hardly permeates the membrane, whereas peptide complex G3-DCX-P trifluoroacetate synthesized in Example 9 It was transparent. This demonstrated that cell membrane permeability was obtained by introducing the cell membrane permeable molecule of the present invention into the peptide.
本発明の態様としては、例えば、以下のものなどが挙げられる。
<1> 下記一般式(i)で表される構造を有し、pKaの値が-8.0超4.7未満の酸との塩であることを特徴とする細胞膜透過性分子である。
<2> 前記一般式(i)で表される構造の前記Xの部分が、ヘテロ原子含有基と結合している前記<1>に記載の細胞膜透過性分子である。
<3> 前記ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子の含有割合が、10%以上である前記<2>に記載の細胞膜透過性分子である。
<4> 前記ヘテロ原子含有基におけるヘテロ原子が、酸素原子、窒素原子、硫黄原子及びリン原子からなる群から選択される少なくとも1種である前記<2>から<3>のいずれかに記載の細胞膜透過性分子である。
<5> 前記ヘテロ原子含有基が、繰返し単位を含む前記<2>から<4>のいずれかに記載の細胞膜透過性分子である。
<6> 前記繰返し単位が、アルキレンオキサイドである前記<5>に記載の細胞膜透過性分子である。
<7> 前記アルキレンオキサイドが、メチレンオキサイド、エチレンオキサイド及びプロピレンオキサイドからなる群から選択される少なくとも1種である前記<6>に記載の細胞膜透過性分子である。
<8> 前記pKaの値が-8.0超4.7未満の酸が、トリフルオロ酢酸、硫酸、硝酸、リン酸、メシル酸、トシル酸、酒石酸及びクエン酸からなる群から選択されるいずれかである前記<1>から<7>のいずれかに記載の細胞膜透過性分子である。
<9> ペプチドと、前記<1>から<8>のいずれかに記載の細胞膜透過性分子とを含むことを特徴とするペプチド複合体である。
<10> 前記<9>に記載のペプチド複合体を含むことを特徴とするペプチドライブラリである。
<11> ペプチドに、前記<1>から<8>のいずれかに記載の細胞膜透過性分子を導入することを含むことを特徴とするペプチド複合体の製造方法である。
<12> 前記ペプチドが、ペプチドライブラリに含まれるペプチドである前記<11>に記載のペプチド複合体の製造方法である。
<13> 前記<10>に記載のペプチドライブラリを用いて機能性ペプチドをスクリーニングすることを含むことを特徴とする機能性ペプチドのスクリーニング方法である。
<14> ペプチドに、前記<1>から<8>のいずれかに記載の細胞膜透過性分子を導入することを含む前記<13>に記載の機能性ペプチドのスクリーニング方法である。
Examples of aspects of the present invention include the following.
<1> A cell membrane permeable molecule having a structure represented by the following general formula (i) and being a salt with an acid having a pK a value of more than -8.0 and less than 4.7. .
<2> The cell membrane permeable molecule according to <1> above, wherein the X portion of the structure represented by the general formula (i) is bonded to a heteroatom-containing group.
<3> The cell membrane permeable molecule according to <2> above, wherein the heteroatom-containing group has a heteroatom content of 10% or more.
<4> The heteroatom according to any one of <2> to <3> above, wherein the heteroatom in the heteroatom-containing group is at least one selected from the group consisting of an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, and a phosphorus atom. It is a cell membrane permeable molecule.
<5> The cell membrane permeable molecule according to any one of <2> to <4>, wherein the heteroatom-containing group includes a repeating unit.
<6> The cell membrane permeable molecule according to <5> above, wherein the repeating unit is alkylene oxide.
<7> The cell membrane permeable molecule according to <6>, wherein the alkylene oxide is at least one selected from the group consisting of methylene oxide, ethylene oxide, and propylene oxide.
<8> The acid having a pK a value of more than −8.0 and less than 4.7 is selected from the group consisting of trifluoroacetic acid, sulfuric acid, nitric acid, phosphoric acid, mesylic acid, tosylic acid, tartaric acid, and citric acid. The cell membrane permeable molecule according to any one of <1> to <7> above.
<9> A peptide complex comprising a peptide and the cell membrane permeable molecule according to any one of <1> to <8>.
<10> A peptide library comprising the peptide complex described in <9> above.
<11> A method for producing a peptide complex, comprising introducing the cell membrane permeable molecule according to any one of <1> to <8> above into the peptide.
<12> The method for producing a peptide complex according to <11> above, wherein the peptide is a peptide included in a peptide library.
<13> A method for screening functional peptides, comprising screening for functional peptides using the peptide library described in <10> above.
<14> The method for screening a functional peptide according to <13> above, which comprises introducing into the peptide the cell membrane permeable molecule according to any one of <1> to <8> above.
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