JP2022524303A - 多量体 - Google Patents
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Abstract
Description
第1の構成では
エフェクタードメイン(例えば、タンパク質ドメインまたはペプチド)の少なくとも第1、第2、第3および第4のコピーのタンパク質多量体であって、多量体が、一緒に会合された第1、第2、第3および第4の自己会合性四量体化ドメイン(TD)によって多量体化され、各四量体化ドメインが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含むそれぞれの操作されたポリペプチドによって構成される、エフェクタードメイン(例えば、タンパク質ドメインまたはペプチド)の少なくとも第1、第2、第3および第4のコピーのタンパク質多量体。
TCR結合部位、インスリンペプチド、インクレチンペプチドまたはペプチドホルモンの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体、あるいは複数の該四量体または八量体。
抗体結合部位または抗体可変ドメイン(例えば、単一の可変ドメイン)の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体、あるいは複数の該四量体または八量体。
例では、四量体または八量体は、水溶液(例えば、水性真核細胞培養培地)に可溶性である。例では、四量体または八量体は、真核細胞中で発現可能である。例証を以下に提供する。
下記の
(a)TCR VドメインまたはTCR結合部位であって、四量体または八量体が、水溶液(例えば、水性真核細胞増殖培地または緩衝液)に可溶性である、TCR VドメインまたはTCR結合部位、
(b)抗体単一可変ドメインであって、四量体または八量体が、水溶液(例えば、水性真核細胞増殖培地または緩衝液)に可溶性である、抗体単一可変ドメイン、
(c)TCR VドメインまたはTCR結合部位であって、四量体または八量体が、HEK293細胞によって細胞内および/または細胞外で発現することができる、TCR VドメインまたはTCR結合部位、あるいは
(d)抗体可変ドメイン(例えば、抗体単一可変ドメイン)であって、四量体または八量体が、HEK293細胞によって細胞内および/または細胞外で発現することができる、抗体可変ドメイン(例えば、抗体単一可変ドメイン)の、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体。
本発明の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)の操作されたポリペプチドもしくは単量体。
操作された(および任意に単離され)操作されたポリペプチド(P1)であって、(N末端からC末端の方向に):-
(a)TCR V1-TCR C1-抗体CH1(例えば、IgG CH1)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、C1がCαであり、
(ii)V1が、Vβであり、C1がCβであり、
(iii)V1が、Vγであり、C1がCγであるか、または
(iv)V1が、Vδであり、C1がCδである、TCR V1-TCR C1-抗体CH1(例えば、IgG CH1)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(b)TCR V1-抗体CH1(例えば、IgG CH1)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、
(i)V1が、Vβであり、
(iii)V1が、Vγであるか、または
(iv)V1が、Vδである、TCR V1-抗体CH1(例えば、IgG CH1)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(c)抗体V1-抗体CH1(例えば、IgG CH1)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V1-抗体CH1(例えば、IgG CH1)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(d)抗体V1--任意の抗体CH1(例えば、IgG CH1)-抗体Fc(例えば、IgG Fc)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V1--任意の抗体CH1(例えば、IgG CH1)-抗体Fc(例えば、IgG Fc)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(e)抗体V1-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V1-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(f)TCR V1-TCR C1-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、C1がCαであり、
(ii)V1が、Vβであり、C1がCβであり、
(iii)V1が、Vγであり、C1がCγであるか、または
(iv)V1が、Vδであり、C1がCδである、TCR V1-TCR C1-任意のリンカー-TD、を含む、操作された(および任意に単離され)操作されたポリペプチド(P1)。
本発明の操作されたポリペプチドまたは単量体をコードする核酸であって、任意に、核酸が、ポリペプチドを発現するための発現ベクターによって構成される、本発明の操作されたポリペプチドまたは単量体をコードする核酸。
細胞内で発現および/または分泌された多量体を産生するためのタンパク質多量体の製造方法における本発明の核酸またはベクターの使用であって、この方法が、核酸またはベクターを含む真核細胞から多量体を発現および/または分泌させることを含む、本発明の核酸またはベクターの使用。
(a)TCR Vドメイン多量体であって、方法が、真核細胞で発現されるTCR V-TD(例えば、NHR2 TDまたはTCR V-p53 TD)融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、TCR Vドメイン多量体、
(a)抗体Vドメイン多量体であって、方法が、真核細胞で発現される抗体V(例えば、単一可変ドメイン)-TD(例えば、V-NHR2 TDまたはV-p53 TD)融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、抗体Vドメイン多量体、
(c)インクレチンペプチド(例えば、GLP-1、GIPまたはインスリン)多量体であって、方法が、HEK293T細胞などの真核細胞で発現されるインクレチンペプチド-TD(例えば、インクレチンペプチド-NHR2 TDまたはインクレチンペプチド-p53 TD)融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、インクレチンペプチド、または
(d)ペプチドホルモン多量体であって、方法が、HEK293T細胞などの真核細胞で発現されるペプチドホルモン-TD(例えば、ペプチドホルモン-NHR2 TDまたはペプチドホルモン-p53 TD)融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、ペプチドホルモン多量体を産生する方法。
核酸またはベクターを含む真核細胞においてグリコシル化多量体を産生するためのタンパク質多量体の製造方法における本発明の核酸またはベクターの使用。
ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログ)の使用。
ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、タンパク質ドメインまたはペプチドの複数のコピーを含むポリペプチドの四量体の製造方法における、操作されたポリペプチドの使用であって、操作されたポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはホモログもしくはオルソログ)をさらに含む、操作されたポリペプチドの使用。
単量体、二量体または三量体との混合物ではない複数の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログ)の使用。
本発明の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体、八量体)、操作されたポリペプチドまたは単量体の細胞内および/または分泌発現のための核酸もしくはベクターを含む宿主真核細胞。
単量体、二量体または三量体との混合物ではない複数の四量体を産生するための、タンパク質ドメインまたはペプチドの複数のコピーを含むポリペプチドの四量体の製造方法における、操作されたポリペプチドの使用であって、操作されたポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはホモログもしくはオルソログ)をさらに含む、操作されたポリペプチドの使用。
pMHC複合体に結合することができる多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体であって、下記の
(i)(TCR細胞外ドメインと、
(ii)免疫グロブリン定常ドメインと、
(iii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体。
多量体免疫グロブリンであって
(i)免疫グロブリン可変ドメインと、
(ii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多量体免疫グロブリン。
可溶性の多量体ポリペプチドを集合化させる方法であって、
(a)ETOのNHR2ドメインに融合された、該多量体ポリペプチドの単量体を提供することと、
(b)該単量体の複数のコピーを会合させ、それにより、多量体可溶性ポリペプチドを得ることと、を含む、方法。
(i)本発明のポリペプチドをコードする細胞株(例えば、真核生物の哺乳動物細胞株、例えば、HEK293、CHOまたはCos細胞株)と、(ii)本発明の四量体と、を含む混合物。
タンパク質エフェクタードメイン(例えば、抗体可変ドメインまたは結合部位)の四量体の収量を向上させるための方法であって、この方法が、細胞株(例えば、哺乳動物細胞、CHO、HEK293またはCos細胞株)からポリペプチドの四量体を発現させることであって、このポリペプチドが、本発明のポリペプチドであり、1つ以上のエフェクタードメインを含む、発現させることと、任意に、該発現された四量体を単離することと、を含む方法。
(N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に)
(i)免疫グロブリンスーパーファミリードメインと、
(ii)任意のリンカーと、
(iii)自己会合性多量体化ドメイン(SAM)(任意に自己会合性四量体化ドメイン(TD))と、を含む、ポリペプチド。
1.エフェクタードメイン(例えば、タンパク質ドメイン)またはペプチドの少なくとも第1、第2、第3および第4のコピーのタンパク質多量体であって、多量体が、一緒に会合された第1、第2、第3および第4の自己会合性四量体化ドメイン(TD)によって多量体化され、各四量体化ドメインが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含むそれぞれの操作されたポリペプチドによって構成される、タンパク質多量体。
2.多量体が、該ドメインまたはペプチドの四量体、八量体、12量体、16量体または20量体(例えば、四量体、八量体、12量体または16量体)である、先行する態様のいずれか1つに記載の多量体。
3.免疫グロブリンスーパーファミリー結合部位(抗体またはTCR結合部位、例えば、scFvまたはscTCR)の四量体、八量体、12量体、16量体または20量体(例えば、四量体、八量体、12量体または16量体)を含む、態様1または2のいずれか1つに記載の多量体。
4.結合部位が、第2の可変ドメインと対合している第1の可変ドメインを含む、態様3に記載の多量体。
例では、この抗原結合部位もしくは各抗原結合部位(またはエフェクタードメイン)は、抗体可変ドメイン(例えば、VLまたはVH、抗体単一可変ドメイン(ドメイン抗体またはdAb)、ラクダVHH抗体単一可変ドメイン、サメ免疫グロブリン単一可変ドメイン(NA V)、Nanobody(商標)またはラクダ化VH単一可変ドメイン);T細胞受容体結合ドメイン;免疫グロブリンスーパーファミリードメイン;アグナサン可変リンパ球受容体(J Immunol;2010 Aug l;185(3):1367-74;「Alternative adaptive immunity in jawless vertebrates」;Herrin BR & Cooper M D.);フィブロネクチンドメイン(例えば、Adnectin(商標));scFv;(scFv)2;sc-ダイアボディ;scFab;センチリンおよびCTLA-4(Evibody(商標))から選択されたスキャフォールドに由来する抗原結合部位;リポカリンドメイン;プロテインAのZドメインなどのプロテインA(例えば、Affibody(商標)またはSpA);Aドメイン(例えば:Avimer(商標)またはMaxibody(商標);熱ショックタンパク質(GroEIおよびGroESに由来するエピトープ結合ドメインなど);トランスフェリンドメイン(例えば、トランスボディ);アンキリンリピートタンパク質(例えば、DARPin(商標));ペプチドアプタマー;C型レクチンドメイン(例えば、Tetranectin(商標)):ヒトγ-クリスタリンまたはヒトユビキチン(アフィリン);PDZドメイン;サソリ毒素;およびヒトプロテアーゼ阻害剤のクニッツ型ドメインからなる群から選択される。
5.各ポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの第1および第2のコピーを含み、ポリペプチドが(N末端からC末端に向かう方向)に(i)該コピーの第1のもの-TD-該コピーの第2のもの、(ii)TD-と第1および第2のコピー、または(iii)該第1および第2のコピー-TDを含む、態様1~4のいずれか1つに記載の多量体。
6.TDがNHR2 TDであり、ドメインまたはペプチドがNHR2ドメインまたはペプチドではないか、あるいはTDがp53 TDであり、ドメインまたはペプチドが、p53ドメインまたはペプチドではない、態様1~5のいずれか1つに記載の多量体。
7.操作されたポリペプチドが、第2のタイプのタンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、第2のタイプのタンパク質ドメインまたはペプチドが、第1のタンパク質ドメインまたはペプチドとは異なる、態様1~6のいずれか1つに記載の多量体。
8.ドメインが、免疫グロブリンスーパーファミリードメインである、態様1~7のいずれか1つに記載の多量体。
9.ドメインまたはペプチドが、抗体可変もしくは定常ドメイン(例えば、抗体単一可変ドメイン)、TCR可変もしくは定常ドメイン、インクレチン、インスリンペプチド、またはホルモンペプチドである、態様1~8のいずれか1つに記載の多量体。
10.多量体が、該操作されたポリペプチドの第1、第2、第3および第4の同一のコピーを含み、ポリペプチドが、TDおよび該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ(ただし、1つ以下)、2つ(ただし2つ以下)、またはそれ以上のコピーを含む、態様1~9のいずれか1つに記載の多量体。
11.操作されたポリペプチドが、抗体またはTCR可変ドメイン(V1)およびNHR2 TDを含む、態様1~10のいずれか1つに記載の多量体。
12.ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)(i)V1-任意のリンカー-NHR2 TD;(ii)V1-任意のリンカー-NHR2 TD-任意のリンカー-V2、あるいは(iii)V1-任意のリンカーカー-V2-任意のリンカー-NHR2 TDを含み、V1およびV2が、TCR可変ドメインであり、同じであるか、または異なり、あるいはV1およびV2が、抗体可変ドメインであり、同じであるか、または異なる、態様11に記載の多量体。
13.V1およびV2が、抗体単一可変ドメインである、態様12に記載の多量体。
14.各操作されたポリペプチドが(N末端からC末端の方向に)V1-任意のリンカー-NHR2 TDを含み、V1が、抗体またはTCR可変ドメインであり、各操作されたポリペプチドが、それぞれの第2の操作されたポリペプチドと対合しており、V2を含むポリペプチド、V2が、それぞれ、V1と対合して抗原またはpMHC結合部位を形成する抗体またはTCR可変ドメインであり、任意に、一方のポリペプチドが、抗体Fcを含むか、または抗体CH1を含み、他方のポリペプチドが、CH1と対合している抗体CLを含む、態様11に記載の多量体。
15.TDが、(i)配列番号10または126と同一であるか、またはそれと少なくとも80%同一であるアミノ酸配列、あるいは(ii)配列番号120または123と同一または少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含む、態様1~14のいずれか1つに記載の多量体。
16.多量体が、ReoPro(商標)、アブシキシマブ、リツキサン(商標)、リツキシマブ、ゼナパックス(商標)、ダクリズマブ、Simulect(商標)、バシリキシマブ、Synagis(商標)、パリビズマブ、Remicade(商標)、インフリキシマブ、Herceptin(商標)、Mylotarg(商標)、ゲムツズマブ、Campath(商標)、アレムツズマブ、Zevalin(商標)、イブリツモマブ、Humira(商標)、アダリムマブ、Xolair(商標)、オマリズマブ、Bexxar(商標)、トシツモマブ、Raptiva(商標)、エファリズマブ、Erbitux(商標)、セツキシマブ、Avastin(商標)、ベバシズマブ、Tysabri(商標)、ナタリズマブ、Actemra(商標)、トシリズマブ、Vectibix(商標)、パニツムマブ、Lucentis(商標)、ラニビズマブ、Soliris(商標)、エクリズマブ、Cimzia(商標)、セルトリズマブ、Simponi(商標)、ゴリムマブ、Ilaris(商標)、カナキヌマブ、Stelara(商標)、ウステキヌマブ、Arzerra(商標)、オファツムマブ、Prolia(商標)、デノスマブ、Numax(商標)、モタビズマブ、ABThrax(商標)、ラキシバクマブ、Benlysta(商標)、ベリムマブ、Yervoy(商標)、イプリズマブ、Adcetris(商標)、ブレンツキシマブ、Vedotin(商標)、Perjeta(商標)、ペルツズムマブ、Kadcyla(商標)、アド-トラスツズマブ、Keytruda(商標)、Opdivo(商標)、Gazyva(商標)およびオビヌツズマブからなる群から選択される抗体の抗原結合部位の四量体、八量体、12量体、16量体、または20量体(例えば、四量体、八量体、12量体または16量体、もしくは四量体または八量体)を含む、態様1~15のいずれか1つに記載の多量体。任意に、多量体のポリペプチドの結合部位は、抗体の結合部位のVHおよび抗体のCH1(すなわち、N末端からC末端の方向に、VH-CH1およびSAM)を含む。実施形態では、ポリペプチドは、(N末端からC末端の方向に、例えば、CLが抗体のCLである、VL-CL)を含むさらなるポリペプチドと対合され得る。
17.TCR結合部位、インスリンペプチド、インクレチンペプチドまたはペプチドホルモンの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体、あるいは複数の該四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
インクレチンの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
インスリンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
GLP-1(グルカゴン様ペプチド-1(GLP-1))ペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
GIP(グルコース依存性インスリン分泌刺激ポリペプチド)ペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
エキセンディン(例えば、エキセンディン-4)ペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
ペプチドホルモンの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
プロラクチンまたはプロラクチンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
ACTHまたはACTHペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
成長ホルモンまたは成長ホルモンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体ペプチド。
バソプレッシンまたはバソプレッシンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
オキシトシンまたはオキシトシンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
グルカゴンまたはグルカゴンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
インスリンまたはインスリンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
ソマトスタチンまたはソマトスタチンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
コレシストキニンまたはコレシストキニンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
ガストリンまたはガストリンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
レプチンまたはレプチンペプチドの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
抗体結合部位(例えば、scFvまたはFab)の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
TCR結合部位(例えば、scTCR)の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
TCR Vα/Vβ結合部位の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
TCR Vγ/Vδ結合部位の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
抗体の単一可変ドメイン結合部位の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
FcAb結合部位の単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
18.多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、
(a)水溶液(例えば、水性真核細胞増殖培地または緩衝液)に可溶であり、
(b)真核細胞から分泌可能であり、および/または
(c)真核細胞の発現産物である、態様1~17のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
19.下記の
(a)TCR VドメインまたはTCR結合部位であって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、水溶液(例えば、水性真核細胞増殖培地または緩衝液)に可溶性である、TCR VドメインまたはTCR結合部位、
(b)抗体単一可変ドメインであって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、水溶液(例えば、水性真核細胞増殖培地または緩衝液)に可溶性である、抗体単一可変ドメイン、
(c)TCR VドメインまたはTCR結合部位であって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、HEK293細胞によって細胞内および/または細胞外で発現することができる、TCR VドメインまたはTCR結合部位、あるいは
(d)抗体可変ドメイン(例えば、抗体単一可変ドメイン)であって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、HEK293細胞によって細胞内および/または細胞外で発現することができる、抗体可変ドメイン(例えば、抗体単一可変ドメイン)の、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)。
20.多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、抗原またはpMHC結合に対して二重特異性である、態様1~19のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
21.ドメインが同一である、態様1~20のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
22.多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、真核細胞のグリコシル化を含む、態様1~21のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
23.細胞がHEK293細胞である、態様22に記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
24.態様1~23のいずれか1つに記載の複数の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体、または20量体。
25.態様1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体と、薬学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤と、を含む薬学的組成物。
26.態様1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体を含む化粧品、食品、飲料、洗浄製品、洗剤。
27.態様1~26のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体の該操作された(および任意に単離された)ポリペプチドまたは単量体(任意に単離された)。
28.操作された(および任意に単離され)操作されたポリペプチド(P1)であって、(N末端からC末端の方向に):-
(a)TCR V1-TCR C1-抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、C1がCαであり、
(ii)V1が、Vβであり、C1がCβであり、
(iii)V1が、Vγであり、C1がCγであるか、または
(iv)V1が、Vδであり、C1がCδである、TCR V1-TCR C1-抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-任意のリンカー-TD、
あるいは
(b)TCR V1-抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、
(i)V1が、Vβであり、
(iii)V1が、Vγであるか、または
(iv)V1が、Vδである、TCR V1-抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-任意のリンカー-TD、
あるいは
(c)抗体V1-抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V1-抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-任意のリンカー-TD、
あるいは
(d)抗体V1-任意の抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-抗体Fc(例えば、IgG Fc)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V1-任意の抗体C(例えば、CH、CH1(IgG CH1など)またはCL(CλまたはCκなど))-抗体Fc(例えば、IgG Fc)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(e)抗体V1-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V1-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)-任意のリンカー-TD、
あるいは
(f)TCR V1-TCR C1-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、C1がCαであり、
(ii)V1が、Vβであり、C1がCβであり、
(iii)V1が、Vγであり、C1がCγであるか、または
(iv)V1が、Vδであり、C1がCδである、TCR V1-TCR C1-任意のリンカー-TD、を含む、操作された(および任意に単離され)操作されたポリペプチド(P1)。
29.操作されたポリペプチドP1がさらなるポリペプチド(P2)と対合しており、P2が(N末端からC末端の方向に)、
(g)TCR V2-TCR C2-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)であって、P1が、態様28の(a)に記載されているものであり、
(i)P1が(a)(ii)に従っている場合、V2はVαであり、C2はCαであり、
(ii)P1が(a)(i)に従っている場合、V2はVβであり、C2はCβであり、
(iii)P1が(a)(iv)に従っている場合、V2はVγであり、C2はCγであり、または
(iv)P1が(a)(iii)に従っている場合、V2はVδであり、C2はCδである、TCR V2-TCR C2-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)、
あるいは
(h)TCR V2-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)であって、P1が、態様28に記載の(b)に従っており、
(i)P1が(b)(ii)に従っている場合、V2はVαであり、
(ii)P1が(b)(i)に従っている場合、V2はVβであり、
(iii)P1が(b)(iv)に従っている場合、V2はVγであり、または
(iv)P1が(b)(iii)に従っている場合、V2はVδである、TCR V2-抗体CL(例えば、CλまたはCκ)、
あるいは
(i)抗体V2-CL(例えば、CλまたはCκ)であって、P1が、態様28に記載の(c)に従っており、
(i)P1が(c)(ii)に従っている場合、V2はVHであり、
(ii)P1が(c)(i)に従っている場合、V2はVL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V2-CL(例えば、CλまたはCκ)、
あるいは
(j)抗体V2-任意のCL(例えば、CλまたはCκ)であって、P1が、態様28に記載の(d)に従っており、
(i)P1が(d)(ii)に従っている場合、V2はVHであり、
(ii)P1が(d)(i)に従っている場合、V2はVL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V2-任意のCL(例えば、CλまたはCκ)、
あるいは
(k)抗体V2-CH1(例えば、IgG CH1)であって、P1が、態様28に記載の(e)に従っており、
(i)P1が(e)(ii)に従っている場合、V2はVHであり、
(ii)P1が(e)(i)に従っている場合、V2はVL(例えば、VλまたはVκ)である、抗体V2-CH1(例えば、IgG CH1)、
あるいは
(l)TCR V2-TCR C2であって、P1が、態様28に記載の(f)に従っており、
(i)P1が(f)(ii)に従っている場合、V2はVαであり、C2はCαであり、
(ii)P1が(f)(i)に従っている場合、V2はVβであり、C2はCβであり、
(iii)P1が(f)(iii)に従っている場合、V2はVγであり、C2はCγであり、または
(iv)P1が(f)(iv)に従っている場合、V2はVδであり、C2はCδである、TCR V2-TCR C2を含む、態様28に記載のポリペプチド。
(リンフォテクチン)、XCL2(SCM-lb)、XCR1(GPR5/CCXCR1)、YY1、およびZFPM2からなる群から選択される抗原に特異的に結合することができる(それ自体、単一の可変ドメインの場合、またはV2と対合する場合)。
30.態様28で定義されているP1の、または、態様29で定義されているP2と対合したP1の多量体(例えば、二量体、三量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体)、または、複数の該多量体であって、この多量体が、態様1~24のいずれか1つに記載のものである、多量体。
31.態様27~29のいずれか1つに記載の操作されたポリペプチドまたは単量体をコードする核酸であって、任意に、核酸が、ポリペプチドを発現するための発現ベクターによって構成される、核酸。
32.態様1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体の操作されたポリペプチドもしくは単量体の細胞内発現および/または分泌発現のための、態様31に記載の核酸またはベクターを含む真核宿主細胞。
33.細胞内で発現および/または分泌された多量体を産生するためのタンパク質多量体の製造方法における態様31に記載の核酸またはベクターの使用であって、この方法が、核酸またはベクターを含む真核細胞から多量体を発現および/または分泌させることを含む、核酸またはベクターの使用。
34.核酸またはベクターを含む真核細胞においてグリコシル化多量体を産生するためのタンパク質多量体の製造方法における、態様31に記載の核酸またはベクターの使用。
35.(i)態様27~29のいずれか1つに記載の操作されたポリペプチドをコードする真核細胞株と、(ii)態様1~24のいずれか1つで定義された多量体、単量体、二量体、三量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体と、を含む、混合物。
36.細胞株が、細胞の分泌産物を含む培地中にあり、分泌産物が、該多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体を含む、態様35に記載の混合物。
37.医療用の、態様1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
38.下記を産生する方法であって、
(a)TCR Vドメイン多量体(TCR Vドメイン多量体を産生する方法は、真核細胞で発現されるTCR V-NHR2 TDまたはTCR V-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/または細胞内発現を含み、この方法は、任意に、複数の該多量体を単離することを含む)、
(a)抗体Vドメイン多量体(抗体Vドメイン多量体を産生する方法は、真核細胞で発現される抗体 V(例えば、単一可変ドメイン)-NHR2-TDまたはV-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/または細胞内発現を含み、この方法は、任意に、複数の該多量体を単離することを含む)、
(c)インクレチンペプチド(例えば、GLP-1、GIPまたはインスリン)多量体(インクレチンペプチド多量体を産生する方法は、HEK293T細胞などの真核細胞で発現されるインクレチンペプチド-NHR2 TDまたはインクレチンペプチド-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/または細胞内発現を含み、この方法は、任意に、複数の該多量体を単離することを含む)、あるいは
(a)ペプチドホルモン多量体(ペプチドホルモン多量体を産生する方法は、HEK293T細胞などの真核細胞で発現されるペプチドホルモン-NHR2 TDまたはペプチドホルモン-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/または細胞内発現を含み、この方法は、任意に、複数の該多量体を単離することを含む)を、産生する方法。
39.ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログ)の使用を提供する。
40.ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、タンパク質ドメインまたはペプチドの複数のコピーを含むポリペプチドの四量体の製造方法における、操作されたポリペプチドの使用であって、操作されたポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはホモログもしくはオルソログ)をさらに含む、操作されたポリペプチドの使用を提供する。
41.単量体、二量体または三量体との混合物ではない複数の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログ)の使用。
42.単量体、二量体または三量体との混合物ではない複数の四量体を産生するための、タンパク質ドメインまたはペプチドの複数のコピーを含むポリペプチドの四量体の製造方法における、操作されたポリペプチドの使用であって、操作されたポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、自己会合性四量体化ドメイン(TD)(例えば、NHR2 TD、p53 TD、p63 TDまたはp73 TDまたはホモログもしくはオルソログ)をさらに含む、操作されたポリペプチドの使用。
43.四量体の収量が、単量体および/または二量体の収量の少なくとも10、20、30、40または50倍である、態様39~42のいずれか1つに記載の使用。
44.この方法で産生される四量体:産生される単量体および/または二量体の比が、少なくとも90:10(例えば、少なくとも95:5または98:2、または99:1)である、態様39~43のいずれか1つに記載の使用。
45.各単量体が、40、35、30、25または20kDa以下のサイズを有する、態様39~44のいずれか1つに記載の使用。
46.各四量体が200、160、155または150kDa以下のサイズを有する、態様39~45のいずれか1つに記載の使用。
47.方法が、真核細胞株から四量体を発現することを含む、態様39~46のいずれか1つに記載の使用。
48.pMHC複合体に結合することができる多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体であって、下記の
(i)(TCR細胞外ドメインと、
(ii)免疫グロブリン定常ドメインと、
(iii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体。
49.多量体免疫グロブリンであって
(i)免疫グロブリン可変ドメインと、
(ii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多量体免疫グロブリン。
50.可溶性の多量体ポリペプチドを集合化させる方法であって、
(a)ETOのNHR2ドメインに融合された、該多量体ポリペプチドの単量体を提供することと、
(b)該単量体の複数のコピーを会合させ、それにより、多量体可溶性ポリペプチドを得ることと、を含む、方法。
(i)図1に示すような単量体、
(ii)図1に示すようなホモ二量体、
(iii)図1に示すようなホモ四量体、
(iv)図2に示すような単量体2、
(v)図2に示すようなホモ二量体2、
(vi)図2に示すようなホモ四量体2、
(vii)図11aに示すような単量体、
(viii)図11aに示すようなホモ二量体、
(ix)図11aに示すようなホモ四量体、
(x)図12aに示すような単量体、
(xi)図12aに示すようなホモ二量体、
(xii)図12aに示すようなホモ四量体、
(xiii)図13aに示すような単量体2、
(xiv)図13aに示すようなホモ二量体2、
(xv)図13aに示すようなホモ四量体2、または
(xvi)(i)~(xv)のいずれか1つを含む多量体タンパク質(例えば、Quad3、4、12、13、14、15、16および17のいずれか1つ)または図21に示す任意のタンパク質の多量体(リーダーまたはタグを除く)、
(xvii)(xvi)の複数の多量体、または
(xviii)(i)~(xvii)のいずれか1つと、薬学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤と、含む薬学的組成物、をさらに提供する。
(i)四価または八価の抗体V分子、
(ii)四価または八価の抗体Fab分子、
(iii)四価または八価の抗体dAb分子、
(iv)四価または八価の抗体scFv分子、
(v)四価または八価の抗体TCR V分子、または
(vi)四価または八価の抗体scFv分子、を提供し、
この分子は、
(a)水溶液(例えば、本明細書に開示される溶液または細胞培養培地)に可溶であり、および/または、
(b)HEK293細胞によって細胞内で発現および/または細胞外で発現することができる。
a)水溶液(例えば、本明細書に開示される溶液または細胞培養培地)に可溶であり、および/または、
b)HEK293細胞によって細胞内で発現および/または細胞外で発現することができる、分子である。
(i)細胞、例えば真核細胞、例えば哺乳動物、HEK293、CHOまたはCos細胞からのポリペプチドの多量体の可溶性発現のためのポリペプチドの製造のためのNHR2またはp53(または本明細書に開示される別のTD)の使用。
(ii)細胞、例えば真核細胞、例えば哺乳動物、HEK293、CHOまたはCos細胞中のポリペプチドの多量体の細胞内発現のためのポリペプチドの製造のためのNHR2またはp53(または本明細書に開示される別のTD)の使用。
(iii)細胞内発現産物を含む細胞であって、この産物が、N末端および/またはC末端で、NHR2配列ではない、アミノ酸配列(例えば、ペプチド、タンパク質ドメインまたはタンパク質)に融合されたNHR2またはp53(または本明細書に開示される別のTD)を含むポリペプチドの多量体を含む、細胞。
(iv)宿主細胞から細胞内発現および/または可溶性発現される多量体の製造において、ペプチド、タンパク質ドメイン、ポリペプチドまたはタンパク質を四量体化するためのプロミスキャス(promiscuous)四量体化ドメインとしてのNHR2の使用。
本明細書に例示されるように、1つの構成における本発明は、四量体化ドメイン(TD)、例えば、p53四量体化ドメイン(p53 TD)が、二量体および単量体などの低次構造の産生よりもエフェクタードメインの四量体を優先的に産生するために使用され得るという驚くべき認識に基づく。これは、CHO、HEK293およびCos細胞株などの哺乳動物発現細胞株からの望ましい収量である、四量体の分泌に特に有用である。本発明はまた、サイズが200、160、155または150kDa以下の四量体の産生に特に有用である。
概念
1.ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における、四量体化ドメイン(TD)(例えば、p53 四量体化ドメイン(p53 TD)もしくはNHR2 TD)またはそれらのホモログもしくはオルソログの使用。
2.同一のTDまたはそのホモログもしくはオルソログの第1、第2、第3および第4のコピーが使用される、概念1に記載の使用。
3.TDが、NHR2、p53、p63またはp73四量体化ドメインである、概念1~2のいずれか1つに記載の使用。
例えば、各TDは、p53 TDである。例では、TDは、p53 TDのオルソログまたはホモログ、例えば、ヒトp53 TDである。
4.四量体の収量が、単量体および/または二量体の収量の少なくとも10倍である、概念1~3のいずれか1つに記載の使用。
5.本方法で産生される四量体:産生される単量体および/または二量体の比が、少なくとも90:10(すなわち、単量体の量の9倍、二量体の量の9倍、または単量体と二量体の組み合わせの量の9倍)である、概念1~4のいずれか1つに記載の使用。
6.収量または比が、四量体製造方法の産物のサンプルを得て、四量体、単量体および二量体を分解するためにサンプルに対してタンパク質分離技術を使用し、および四量体の量を単量体と二量体との量と比較することによって決定可能であるか、または決定される、概念4または5に記載の使用。
7.収量または比が、
(a)四量体製造法の産物のサンプルを得ることと、
(b)非還元条件下でポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)を実施して、サンプルを該四量体に対応するバンドおよび該単量体に対応するバンドおよび/または該二量体に対応するバンドに分解することと、
(c)四量体バンドを単量体および/または二量体バンドと比較して、例えば、相対的なバンド強度および/またはバンドサイズを比較することによって、該終了または比を決定することと、によって決定可能であるか、または決定される、概念4または5に記載の使用。
8.収量または比が、
(d)四量体製造法の産物のサンプルを得ること、
(e)非還元条件下でポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)を実行して、サンプルを該四量体に対応するバンドに分解させることであって、例えば、ゲルが非変性条件下(例えば、ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)の非存在下)である、非還元条件下でポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)を実行して、サンプルを該四量体に対応するバンドに分解させること、
(f)該単量体に対応するバンドがないこと、および/または該二量体に対応するバンドがないことを決定すること、によって決定可能であるか、または決定される、概念4または5に記載の使用。
9.
(g)四量体製造法の産物の第2のサンプルを得ることと、
(h)還元条件下でポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)を実行して、第2のサンプルを該単量体に対応するバンドおよび/または該二量体に対応するバンドに分解させることであって、例えば、ゲルが非変性条件下(例えば、ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)の非存在下)である、還元条件下でポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)を実行して、第2のサンプルを該単量体に対応するバンドおよび/または該二量体に対応するバンドに分解させることと、
(i)工程(h)によって生成されたゲルを、工程(b)または(e)のゲルと比較して、工程(b)のゲルにおいて単量体および/または二量体バンドの位置を決定するか、または工程(e)のゲルにおいてそのようなゲルがどこにあるか予想されるかを決定することと、を含む、概念7または8に記載の使用。
10.各単量体が、40kDa以下のサイズを有する、概念1~9のいずれか1つに記載の使用。
11.各単量体が、150kDa以下のサイズを有する、概念1~10のいずれか1つに記載の使用。
12.方法が、哺乳動物細胞株、例えば、HEK293、CHOまたはCos細胞株から四量体を発現することを含む、概念1~11のいずれか1つに記載の使用。
13.方法が、哺乳動物細胞株、例えば、HEK293、CHOまたはCos細胞株から四量体を分泌することを含む、概念1~12のいずれか1つに記載の使用。
14.各ポリペプチドまたは単量体が、該TD、ホモログまたはオルソログ、および1つ以上の抗体ドメイン、例えば、抗原結合部位を形成する1つ以上の抗体ドメインなどの1つ以上のタンパク質エフェクタードメインを含む、概念1~13のいずれか1つに記載の使用。
15.ポリペプチドが、
(i)抗原に特異的に結合することができる抗体単一可変ドメイン(dAbまたはVHHまたはNanobody(商標))、
(ii)抗原に結合できるscFvまたはpMHCに結合できるscTCR、
(iii)抗原に結合することができるFab、または
(iv)TCR可変ドメインまたはpMHC結合部位、のうちの1つ以上を含む、概念14に記載の使用。
16.各ポリペプチドまたは単量体が、該TD、ホモログまたはオルソログ、ならびに1つ以上のインクレチン、インスリン、GLP-1またはエキセンディン-4ドメインを含む、概念1~15のいずれか1つに記載の使用。
17.各ポリペプチドまたは単量体が、該TD、ホモログまたはオルソログ、ならびに第1および第2の抗原結合部位を含む、概念1~16のいずれか1つに記載の使用。
18.各結合部位が、
(i)抗原に特異的に結合することができる抗体単一可変ドメイン(dAbまたはVHHまたはNanobody(商標))、
(ii)抗原に結合できるscFvまたはpMHCに結合できるscTCR、
(iii)抗原に結合することができるFab、または
(iv)TCR可変ドメインまたはpMHC結合部位、によって提供される、概念17に記載の使用。
19.各結合部位が、抗体単一可変ドメインによって提供される、概念18に記載の使用。
20.TD、ホモログまたはオルソログが、該さらなるドメインに直接融合される、概念14~18のいずれか1つに記載の使用。
21.各単量体またはポリペプチドが、直接的に、またはペプチドリンカーを介して該さらなるドメインのC末端に融合されたTD、ホモログまたはオルソログを含む、概念20に記載の使用。
22.ポリペプチドの四量体であって、各ポリペプチドが、
(i)四量体化ドメイン(TD)(例えば、p53 TDまたはNHR2 TD)またはそのホモログもしくはオルソログと、
(ii)1つ以上のタンパク質エフェクタードメインと、
(iii)任意に、(i)を(ii)に連結するリンカー(例えば、(ii)のC末端を(i)のN末端に連結する)と、を含み、
任意に、各四量体が、150または200kDa以下のサイズを有する、四量体。
23.各ポリペプチドが、
(i)抗原に特異的に結合することができる抗体単一可変ドメイン(dAbまたはVHHまたはNanobody(商標))、
(ii)抗原に結合できるscFvまたはpMHCに結合できるscTCR、
(iii)抗原に結合することができるFab、または
(iv)TCR可変ドメインまたはpMHC結合部位、のうちの1つ以上を含む、概念22に記載の四量体。
24.各ポリペプチドが、該TD、ホモログまたはオルソログ、ならびに1つ以上のインクレチン、インスリン、GLP-1またはエキセンディン-4ドメインを含む、概念22または23に記載の四量体。
25.各ポリペプチドが、該TD、ホモログまたはオルソログ、ならびに第1および第2の抗原結合部位を含む、概念22または23に記載の四量体。
26.各結合部位が、
(i)抗原に特異的に結合することができる抗体単一可変ドメイン(dAbまたはVHHまたはNanobody(商標))、
(ii)抗原に結合できるscFvまたはpMHCに結合できるscTCR、
(iii)抗原に結合することができるFab、または
(iv)TCR可変ドメインまたはpMHC結合部位、によって提供される、概念25に記載の四量体。
27.各結合部位が、抗体単一可変ドメインによって提供される、概念26に記載の四量体。
28.TD、ホモログまたはオルソログが、該エフェクタードメインに直接融合される、概念22~27のいずれか1つに記載の四量体。
29.各ポリペプチドが、直接的に、またはペプチドリンカーを介して該エフェクタードメインのC末端に融合されたTD、ホモログまたはオルソログを含む、概念22~27のいずれか1つに記載の四量体。
30.概念22~29のいずれか1つに記載の四量体と、薬学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤とを含む薬学的組成物。
31.概念22~29のいずれか1つに記載の四量体を含む化粧品、食品、飲料、洗浄用製品、洗剤。
32.概念1~31のいずれか1つに記載のポリペプチドをコードする細胞株(例えば、哺乳動物細胞株、例えば、HEK293、CHOまたはCos細胞株)と、概念1~31のいずれか1つに定義された四量体と、を含む混合物。
33.細胞株が、細胞の分泌産物を含む培地中にあり、分泌産物が、該四量体を含む、概念32に記載の混合物。
34.分泌産物が、概念1~31のいずれか1つで定義されるような単量体および/または二量体を含まない、概念33に記載の混合物。
35.分泌産物が、単量体および/または二量体の量の少なくとも10倍の量の該四量体を含む、概念33に記載の混合物。
36.分泌産物が、少なくとも90:10の四量体:単量体および/または二量体の比で該四量体を含む、概念33に記載の混合物。
37.タンパク質エフェクタードメイン(例えば、抗体可変ドメインまたは結合部位)の四量体の収量を向上させるための方法であって、この方法が、細胞株(例えば、哺乳動物細胞、CHO、HEK293またはCos細胞株)からポリペプチドの四量体を発現させることであって、このポリペプチドが、概念1~36のいずれか1つで定義されるものであり、1つ以上のエフェクタードメインを含む、発現させることと、任意に、該発現された四量体を単離することと、を含む方法。
-哺乳動物または他の真核細胞、例えば、CHO、HEK293またはCosなどの本明細書に開示される哺乳動物細胞からの四量体の分泌、
-分泌された四量体の単量体に対比する収量の向上、
-分泌された四量体の二量体に対比する収量の向上、
-分泌された四量体の三量体に対比する収量の向上、
-分泌された四量体の組み合わされた単量体と二量体に対比する収量の向上、
-分泌された四量体の組み合わされた二量体と三量体に対比する収量の向上、
-抗原結合部位を含む四量体における抗原結合の親和性または結合活性の向上、
-向上された四量体の産生および/または発現であって、この四量体のサイズは、200以下または160以下または150kDa以下である。
例では、各ポリペプチドまたは単量体は、ReoPro(商標)、アブシキシマブ、リツキサン(商標)、リツキシマブ、ゼナパックス(商標)、ダクリズマブ、Simulect(商標)、バシリキシマブ、Synagis(商標)、パリビズマブ、Remicade(商標)、インフリキシマブ、Herceptin(商標)、Mylotarg(商標)、ゲムツズマブ、Campath(商標)、アレムツズマブ、Zevalin(商標)、イブリツモマブ、Humira(商標)、アダリムマブ、Xolair(商標)、オマリズマブ、Bexxar(商標)、トシツモマブ、Raptiva(商標)、エファリズマブ、Erbitux(商標)、セツキシマブ、Avastin(商標)、ベバシズマブ、Tysabri(商標)、ナタリズマブ、Actemra(商標)、トシリズマブ、Vectibix(商標)、パニツムマブ、Lucentis(商標)、ラニビズマブ、Soliris(商標)、エクリズマブ、Cimzia(商標)、セルトリズマブ、Simponi(商標)、ゴリムマブ、Ilaris(商標)、カナキヌマブ、Stelara(商標)、ウステキヌマブ、Arzerra(商標)、オファツムマブ、Prolia(商標)、デノスマブ、Numax(商標)、モタビズマブ、ABThrax(商標)、ラキシバクマブ、Benlysta(商標)、ベリムマブ、Yervoy(商標)、イプリズマブ、Adcetris(商標)、ブレンツキシマブ、Vedotin(商標)、Perjeta(商標)、ペルツズムマブ、Kadcyla(商標)、アド-トラスツズマブ、Gazyva(商標)およびオビヌツズマブからなる群から選択される抗体のVH、VLまたはVH/VL結合部位を含む。別の方法では、(例えば、ヒトのがんを治療または予防するために)、各ポリペプチドまたは単量体は、イピリムマブ(またはYERVOY(商標))、トレメリムマブ、ニボルマブ(またはOPDIVO(商標))、ペムブロリズマブ(またはKEYTRUDA(商標))、ピジリズマブ、BMS-936559、デュルバルマブおよびアテゾリズマブから選択される抗体の1つ以上のVH、VLまたVH/VL結合部位を含む。任意に、多量体のポリペプチドの結合部位は、抗体の結合部位のVHおよび抗体のCH1(すなわち、N末端からC末端の方向に、VH-CH1およびSAM)を含む。一実施形態では、ポリペプチドは、(N末端からC末端の方向に、例えば、CLが抗体のCLである、VL-CL)を含むさらなるポリペプチドと対合され得る。
ポリペプチド、多量体は、1つ以上の抗原またはエピトープに結合することができ、または本明細書の各結合部位(例えば、dAbまたはscFv結合部位)は、抗原またはエピトープに結合することができる。例では、本明細書の(または各)抗原は、以下のリストから選択される。例では、本明細書の(または各)エピトープは、以下のリストから選択される抗原のエピトープである。
本発明のポリペプチド単量体または多量体(例えば、二量体、三量体、四量体または八量体)は、対象の疾患または状態を治療または予防するために、ヒトまたは動物の対象に投与するための方法で使用することができる。
(a)神経変性疾患または状態、
(b)脳疾患または状態、
(c)CNS疾患または状態、
(d)記憶喪失または障害、
(e)心臓もしくは心血管疾患または状態、例えば、心臓発作、脳卒中、心房細動、
(f)肝臓疾患または状態;
(g)腎臓疾患または状態、例えば、慢性腎臓病(CKD)、
(h)膵臓疾患または状態、
(i)肺疾患または状態、例えば、嚢胞性線維症またはCOPD、
(j)胃腸疾患または状態;
(k)喉もしくは口腔の疾患または状態、
(l)眼疾患または状態、
(m)生殖器の疾患または状態、例えば、膣、陰唇、陰茎もしくは陰嚢の疾患または状態、
(n)性感染症または状態、例えば、淋病、HIV感染症、梅毒またはクラミジア感染症、
(o)耳の疾患または状態、
(p)皮膚の疾患または状態、
(q)心臓疾患または状態、
(r)鼻の疾患または状態、
(s)血液学的疾患または状態、例えば貧血、例えば慢性疾患またはがんの貧血、
(t)ウイルス感染、
(u)病原性細菌感染、
(v)がん、
(w)自己免疫疾患または状態、例えば、SLE、
(x)炎症性疾患または状態、例えば、関節リウマチ、乾癬、湿疹、喘息、潰瘍性大腸炎、大腸炎、クローン病またはIBD、
(y)自閉症、
(z)ADHD、
(aa)双極性障害、
(bb)ALS[筋萎縮性側索硬化症]、
(cc)変形性関節症、
(dd)先天性障害もしくは発達障害または状態、
(ee)流産、
(ff)血液凝固状態、
(gg)気管支炎、
(hh)ドライ型またはウェット型AMD、
(ii)血管新生(例えば、腫瘍の、または眼の)、
(jj)感冒、
(kk)てんかん、
(ll)線維症、例えば、肝臓または肺線維症、
(mm)真菌性疾患または状態、例えば、鵞口瘡、
(nn)代謝性疾患または状態、例えば、肥満症、食欲不振、糖尿病、I型またはII型糖尿病。
(oo)潰瘍、例えば、胃潰瘍または皮膚潰瘍、
(pp)乾燥肌、
(qq)シェーグレン症候群、
(rr)サイトカインストーム、
(ss)難聴、聴覚損失または聴覚障害、
(tt)低代謝または高代謝(すなわち、対象の体重、性別、年齢についての平均よりも遅いか、または速い)。
(uu)受胎障害、例えば、不妊症または低受精率、
(vv)黄疸、
(ww)皮膚の発疹、
(xx)川崎病、
(yy)ライム病、
(zz)アレルギー、例えば、木の実、花粉、チリダニ、ネコもしくはイヌの毛皮または皮屑アレルギー、
(aaa)マラリア、腸チフス、結核またはコレラ、
(bbb)うつ病、
(ccc)精神遅滞、
(ddd)小頭症、
(eee)栄養失調、
(fff)結膜炎、
(ggg)肺炎、
(hhh)肺塞栓症、
(iii)肺高血圧症、
(jjj)骨障害、
(kkk)敗血症または敗血症性ショック、
(lll)副鼻腔炎、
(mmm)ストレス(例えば、職業性ストレス)、
(nnn)サラセミア、貧血、ヴォン・ヴィレブランド病、または血友病、
(ooo)帯状疱疹または口唇ヘルペス、
(ppp)月経、
(qqq)精子数減少。
例では、神経変性もしくはCNSの疾患または状態は、アルツハイマー病、生殖精神病、ダウン症候群、パーキンソン病、クロイツフェルト・ヤコブ病、糖尿病性ニューロパチー、パーキンソン症候群、ハンチントン舞踏病、マチャド・ジョセフ病、筋委縮性側策硬化症、糖尿病性ニューロパチー、およびクロイツフェルトクロイツフェルトヤコブ病からなる群から選択される。例えば、疾患はアルツハイマー病である。例えば、疾患はパーキンソン症候群である。
治療され得るがんとしては、血管新生されていないか、または実質的に血管新生されていない腫瘍、ならびに血管新生された腫瘍が挙げられる。がんは、非固形腫瘍(例えば、白血病およびリンパ腫などの血液腫瘍)を含み得るか、または固形腫瘍を含み得る。本発明で治療されるがんの種類としては、がん腫、芽細胞腫、および肉腫、ならびに特定の白血病またはリンパ性悪性腫瘍、良性および悪性腫瘍、ならびに肉腫、がん腫、および黒色腫などの悪性腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない。成人の腫瘍/がんおよび小児の腫瘍/がんも含まれる。
・急性散在性脳脊髄炎(ADEM)
・急性壊死性出血性白質脳炎
・アジソン病
・無ガンマグロブリン血症
・円形脱毛症
・アミロイドーシス
・強直性脊椎炎
・抗GBM/抗TBM腎炎
・抗リン脂質抗体症候群(APS)
・自己免疫性血管性浮腫
・自己免疫性再生不良性貧血
・自己免疫性自律神経失調症
・自己免疫性肝炎
・自己免疫性高脂血症
・自己免疫免疫不全
・自己免疫性内耳疾患(AIED)
・自己免疫性心筋炎
・自己免疫性卵巣炎
・自己免疫性膵炎
・自己免疫性網膜症
・自己免疫性血小板減少性紫斑病(ATP)
・自己免疫性甲状腺疾患
・自己免疫性蕁麻疹
・軸索およびニューロンニューロパチー
・バロ病
・ベーチェット病
・水疱性類天疱瘡
・心筋症
・キャッスルマン病
・セリアック病
・シャーガス病
・慢性疲労症候群
・慢性炎症性脱髄性多発神経障害(CIDP)
・慢性再発性多発性骨髄炎(CRMO)
・チャーグ-ストラウス症候群
・瘢痕性類天疱瘡/良性粘膜類天疱瘡
・クローン病
・コーガン症候群
・寒冷凝集素症
・先天性心ブロック
・コクサッキー心筋炎
・CREST病
・本質的混合クリオグロブリン血症
・脱髄性ニューロパチー
・疱疹状皮膚炎
・皮膚筋炎
・デビック病(視神経脊髄炎)
・円板状エリテマトーデス
・ドレスラー症候群
・子宮内膜症
・好酸球性食道炎
・好酸球性筋膜炎
・結節性紅斑
・実験的アレルギー性脳脊髄炎
・エヴァンス症候群
・線維筋痛症
・線維化性肺胞炎
・巨細胞性動脈炎(側頭動脈炎)
・巨大細胞心筋炎
・糸球体腎炎
・グッドパスチャー症候群
・多発血管炎性肉芽腫症(GPA)(旧ウェゲナー肉芽腫症)
・バセドウ病
・ギランバレー症候群
・橋本脳炎
・橋本甲状腺炎
・溶血性貧血
・ヘノッホシェーンライン紫斑病
・妊娠性疱疹
・低ガンマグロブリン血症
・特発性血小板減少性紫斑病(ITP)
・IgA腎症
・IgG4関連硬化性疾患
・免疫調節性リポタンパク質
・封入体筋炎
・間質性膀胱炎
・若年性関節炎
・若年性糖尿病(1型糖尿病)
・若年性筋炎
・川崎症候群
・ランバート・イートン症候群
・白血球破砕性血管炎
・扁平苔癬
・硬化性苔癬
・木質結膜炎
・線状IgA病(LAD)
・ループス(SLE)
・ライム病、慢性
・メニエール病
・顕微鏡的多発血管炎
・混合性結合組織病(MCTD)
・モーレン潰瘍
・ムッカハーベルマン病
・多発性硬化症
・重症筋無力症
・筋炎
・ナルコレプシー
・視神経脊髄炎(デビック病)
・好中球減少症
・眼の瘢痕性類天疱瘡
・視神経炎
・回帰性リウマチ
・PANDAS(小児自己免疫性溶連菌感染関連性精神神経障害)
・腫瘍随伴性小脳変性症
・発作性夜間ヘモグロビン尿症(PNH)
・パリーロンベルグ症候群
・神経痛性筋萎縮症
・扁平部炎(周辺部ブドウ膜炎)
・天疱瘡
・末梢性ニューロパチー
・静脈周囲脳炎
・悪性貧血
・POEMS症候群
・結節性多発性動脈炎
・多腺性自己免疫症候群I型、II型およびIII型
・リウマチ性多発筋痛
・多発性筋炎
・心筋梗塞後症候群
・心膜切開後症候群
・プロゲステロン皮膚炎
・原発性胆汁性肝硬変
・原発性硬化性胆管炎
・乾癬
・乾癬性関節炎
・特発性肺線維症
・壊疽性膿皮症
・赤芽球癆
・レイノー現象
・反応性関節炎
・反射性交感神経性ジストロフィー
・ライター症候群
・再発性多発性軟骨炎
・むずむず脚症候群
・後腹膜線維症
・リウマチ熱
・関節リウマチ
・サルコイドーシス
・シュミット症候群
・強膜炎
・強皮症
・シェーグレン症候群
・精液精巣自己免疫
・スティッフパーソン症候群
・亜急性細菌性心内膜炎(SBE)
・スザック症候群
・交感性眼炎
・高安動脈炎
・側頭動脈炎/巨細胞性動脈炎
・血小板減少性紫斑病(TTP)
・トロサ・ハント症候群
・横断性脊髄炎
・1型糖尿病
・潰瘍性大腸炎
・未分化型結合組織病(UCTD)
・ブドウ膜炎
・血管炎
・水疱性皮膚症
・白斑
・ウェゲナー肉芽腫症(現在、多発血管炎性肉芽腫症(GPA)と呼ばれている。
・アルツハイマー病
・強直性脊椎炎
・関節炎(変形性関節症、関節リウマチ(RA)、乾癬性関節炎)
・喘息
・アテローム性動脈硬化症
・クローン病
・大腸炎
・皮膚炎
・憩室炎
・線維筋痛症
・肝炎
・過敏性腸症候群(IBS)
・全身性エリテマトーデス(SLE)
・腎炎
・パーキンソン病
・潰瘍性大腸炎。
本構成は、多価可溶性TCRタンパク質に関する。一態様では、本発明は、四価および八価の可溶性TCR類似体に関する。本発明のTCRタンパク質は、単量体からの自己集合が可能であり、完全にヒト起源である。このタンパク質は、ETO NHR2多量体化ドメインを構成する多量体である。本発明はまた、多量体可溶性TCRを構築する方法、およびそのようなタンパク質を使用する方法に関する。
(i)TCR細胞外ドメインと、
(ii)(ii)免疫グロブリン定常ドメインと、
(iii)(iii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体が提供される。
(i)免疫グロブリン可変ドメインと、
(ii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多量体免疫グロブリンが提供される。
TCR細胞外ドメイン
抗体可変ドメインは当技術分野において既知であり、多種多様な供給源から入手可能である。IMGTおよびKabatなどの抗体可変ドメインの配列のデータベースが存在し、可変ドメインは、天然配列のクローニングおよび発現、または確立された技術に従った人工核酸の合成によって産生することができる。
本明細書で言及される免疫グロブリン定常ドメインは、好ましくは抗体定常ドメインである。定常ドメインは、抗体サブタイプ間で配列が異なり、好ましくは、定常ドメインは、IgG定常ドメインである。好ましくは、定常ドメインは、CH1定常ドメインである。抗体定常ドメインは当該技術分野において周知であり、IMGTおよびKabatデータベースを含む多くの供給源およびデータベースから入手可能である。
柔軟なリンカーを使用して、TCR可変ドメイン(Ig定常ドメイン)を、NHR2多量体化ドメインに接続することができる。これにより、TCRドメインおよび多量体化ドメインが、互いにまたは多量体複合体の他の分子からの立体障害なしに機能することを可能にする。適切なリンカーは、例えば、グリシンリピート、グリシン-アラニンリピート、Gly(4)Serリンカー、またはReddy Chichili et al.,2012 Protein Science 22:153-167に記載されているような柔軟なポリペプチドリンカーを含む。
Igヒンジドメイン、本明細書では好ましくは抗体ヒンジドメインは、天然抗体の抗体定常領域を連結するドメインである。したがって、このドメインは、抗体定常ドメインを含む分子の自然な二量体化を提供する。これは、例えば、F(ab)2抗体フラグメント、ならびにIgGなどの抗体全体に存在する。この領域は、2つのCH1定常ドメインを接続する2つの天然の鎖間ジスルフィド結合を構成する。
1つ以上の生物学的に活性な分子またはエフェクター分子(EM)を、本発明の多量体、例えば、多量体TCRタンパク質に取り付けることができる。そのような分子は、例えば、抗体、特に、抗CD3抗体または抗体フラグメントなどの、TCRの免疫認識および機能を支援し得る抗体であり得る。
AML1/ETOは、M2サブタイプの急性骨髄性白血病(AML)に見られるt(8:21)に起因する融合タンパク質である。AML1/ETOは、ETOのほとんど(575aa)とインフレームで融合したRUNX1のN末端177アミノ酸を含有している。ETOの神経相同性ドメイン2は、オリゴマー化およびタンパク質間相互作用を含む、AML1/ETOに関連する多くの生物学的活性に関与している。このドメインは、Liu et al(2006)で詳細に特徴付けられている。Genbankアクセッション番号NG_023272.2を参照されたい。
1.Vα-CLおよびVβCH1
2.Vα-CH1およびVβ-CL
3.VαCα-CLおよびVβCβ-CH1
4.VαCαCH1およびVβCβCL
1.Vα-(L)-CLおよびVβ-(L)-CH1
2.Vα-(L)-CH1およびVβ-(L)-CL
3.VαCα-(L)-CLおよびVβCβ-(L)-CH1
4.VαCα-(L)-CH1およびVβCβ-(L)-CL
1.Vα-(L)-CLおよびVβ-(L)-CH1-(L)-TD
2.Vα-(L)-CH1-(L)-TDおよびVβ-(L)-CL
3.VαCα-(L)-CLおよびVβCβ-(L)-CH1-(L)-TD
4.VαCα-(L)-CH1-(L)-TDおよびVβCβ-(L)-CL
5.Vα-(L)-CL-(L)-TDおよびVβ-(L)-CH1
6.Vα-(L)-CH1およびVβ-(L)-CL-(L)-TD
7.VαCα-(L)-CL-(L)-TDおよびVβCβ-(L)-CH1
8.VαCα-(L)-CH1およびVβCβ-(L)-CL-(L)-TD
1.Vα-(L)-CLおよびVβ-(L)-CH1-ヒンジ-(L)-TD
2.Vα-(L)-CH1-ヒンジ-(L)-TDおよびVβ-(L)-CL
3.Vα-Cα-(L)-CLおよびVβ-Cβ-(L)-CH1-ヒンジ-(L)-TD
4.VαCα-(L)-CH1-ヒンジ-(L)-TDおよびVβCβ-(L)-CL
5.Vα-(L)-CL-(L)-TDおよびVβ-(L)-CH1-ヒンジ
6.Vα-(L)-CH1-ヒンジおよびVβ-(L)-CL-(L)-TD
7.Vα-Cα-(L)-CL-(L)-TDおよびVβ-Cβ(L)-CH1-ヒンジ
8.Vα-Cα-(L)-CH1-ヒンジおよびVβ-Cβ-(L)-CL-(L)-TD
1.Vα-(L)-CLおよびVβ-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EM
2.Vα-(L)-CH1-(L)-TD-EMおよびVβ-(L)-CL
3.Vα-Cα-(L)-CLおよびVβ-Cβ-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EM
4.Vα-Cα-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-Cβ-(L)-CL
5.Vα-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-(L)-CH1
6.Vα-(L)-CH1およびVβ-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EM
7.Vα-Cα-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-Cβ-(L)-CH1
8.Vα-Cα-(L)-CH1およびVβ-Cβ-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EM
9.Vα-(L)-CL-(L)-EMおよびVβ-(L)-CH1-(L)-TD
10.Vα-(L)-CH1-(L)-TDおよびVβ-(L)-CL-(L)-EM
11.Vα-Cα-(L)-CL-(L)-EMおよびVαβ-Cβ-(L)-CH1-(L)-TD
12.Vα-Cα-(L)-CH1-(L)-TDおよびVβ-Cβ-(L)-CL-(L)-EM
13.Vα-(L)-CL-(L)-TDおよびVβ-(L)-CH1-(L)-EM
14.Vα-(L)-CH1-(L)-EMおよびVβ-(L)-CL-(L)-TD
15.Vα-Cα-(L)-CL-(L)-TDおよびVβ-Cβ-(L)-CH1--(L)-EM
16.Vα-Cα-(L)-CH1-(L)-EMおよびVβ-Cβ-(L)-CL-(L)-TD
17.Vα-(L)-CL-(L)-EMおよびVβ-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EM
18.Vα-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-(L)-CL-(L)-EM
19.Vα-Cα-(L)-CL-(L)-EMおよびVβCβ-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EM
20.Vα-Cα-(L)-CH1-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-Cβ-(L)-CL-(L)-EM
21.Vα-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-(L)-CH1-(L)-EM
22.Vα-(L)-CH1-(L)-EMおよびVβ-(L)-CL-(L-)TD-(L)-EM
23.Vα-Cα-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EMおよびVβ-Cβ-(L)-CH1-(L)-EM
24.Vα-(L)-CH1-(L)-EMおよびVβ-Cβ-(L)-CL-(L)-TD-(L)-EM
本発明は、複数の相互作用ドメインまたは抗原に結合する可能性のある可溶性多価フォーマットでタンパク質を組み立てるための独特の方法を提供する。タンパク質は、免疫系に直接的または間接的に優先的に関与する、または免疫応答を調節する可能性を有する単量体、ホモ二量体、ヘテロ二量体またはオリゴマーであり得る。例としては、TCR、ペプチドMHCクラスIおよびクラスII、それらの抗体または抗原結合部分、ならびに代替の非抗体タンパク質スキャフォールドを有する結合タンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。
25.VH-(L)-NHR2
26.VL(λまたはκ)-(L)-NHR2
27.VH-(L)-NHR2-(L)-EM
28.VL(λまたはκ)-(L)-NHR2-(L)-EM
29.VH-CH1-(L)-NHR2
30.VL(λまたはκ)-CL-(L)-NHR2
31.VH-CH1-(L)-NHR2-(L)-EM
32.VL(λまたはκ)-CL-(L)-NHR2-(L)-EM
33.VH-CH1-(L)-NHR2およびVL(λまたはκ)-CL
34.VL(λまたはκ)-CL-(L)-NHR2およびVH-CH1
35.VH-CH1-ヒンジ-(L)-NHR2およびVL(λまたはκ)-CL
36.VL(λまたはκ)-CL-ヒンジ-(L)-NHR2およびVH-CH1
37.VH-CH1-(L)-NHR2-(L)-EMおよびVL(λまたはκ)-CL
38.VL(λまたはκ)-CL-(L)-NHR2-(L)-EMおよびVH-CH1
39.VH-CH1-ヒンジ-(L)-NHR2-(L)-EMおよびVL(λまたはκ)-CL
40.VL(λまたはκ)-CL-ヒンジ-(L)-NHR2-(L)-EMおよびVH-CH1
41.VH-CH1-(L)-NHR2およびVL(λまたはκ)-CL-(L)-EM
42.VL(λまたはκ)-CL-(L)-NHR2およびVH-CH1-(L)-EM
43.VH-CH1-ヒンジ-(L)-NHR2およびVL(λまたはκ)-CL-(L)-EM
44.VL(λまたはκ)-CL-ヒンジ-(L)-NHR2およびVH-CH1-(L)-EM
本発明による多量体TCRタンパク質は、可溶性TCRタンパク質が示される任意の用途において有用である。本発明のTCRタンパク質の特定の利点には、選択された標的に対する結合活性の増加、および/または複数の標的に結合する能力が含まれる。
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、CH2、CH3およびSAM、
G.第1のscFv、CH2、CH3およびSAM、
H.VH、CH1、CH2、CH3およびSAM、
I.VL、CL、CH2、CH3およびSAM、
J.dAb、SAM、CH2およびCH3、
K.scFv、SAM、CH2およびCH3、
L.VH、CH1、SAM、CH2およびCH3
M.VL、CL、SAM、CH2およびCH3、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、または
AA.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb。
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、CH2、CH3およびSAM、
G.第1のscFv、CH2、CH3およびSAM、
H.VH、CH1、CH2、CH3およびSAM、
I.VL、CL、CH2、CH3およびSAM、
J.dAb、SAM、CH2およびCH3、
K.scFv、SAM、CH2およびCH3、
L.VH、CH1、SAM、CH2およびCH3
M.VL、CL、SAM、CH2およびCH3、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、または
AA.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAM、第3のdAbおよび第4のdAbを含むか、
あるいは(ii)ポリペプチドは(C末端からN末端の方向に)、
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、CH2、CH3およびSAM、
G.第1のscFv、CH2、CH3およびSAM、
H.VH、CH1、CH2、CH3およびSAM、
I.VL、CL、CH2、CH3およびSAM、
J.dAb、SAM、CH2およびCH3、
K.scFv、SAM、CH2およびCH3、
L.VH、CH1、SAM、CH2およびCH3
M.VL、CL、SAM、CH2およびCH3、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、または
AA.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAM、第3のdAbおよび第4のdAbを含む。
例として、本発明は以下の態様を提供し、それらのいくつかは本明細書で例示されている。
1.(N末端からC末端の方向に、またはC末端からN末端の方向に)
(a)免疫グロブリンスーパーファミリードメインと、
(b)任意のリンカーと、
(c)自己会合性多量体化ドメイン(SAM)(任意に自己会合性四量体化ドメイン(TD))と、を含む、ポリペプチド。
例では、各リンカーは、40、30、25、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4個のアミノ酸を含む(または最大それを含むか、またはそれからなる)。
別の方法では、(a)のドメインは非Igドメインであるか、または非Igスキャフォールドを含む。
2.(a)ドメインが、抗体可変ドメインである、態様1に記載のポリペプチド。
3.(a)の可変ドメインが、抗体単一可変ドメイン、VHおよびVLから選択されるか、または、ドメインが、scFvによって構成されている、態様1~2のいずれか1つに記載のポリペプチド。
4.(a)が(c)に直接結合しているか、または、(b)が(a)および(c)に直接結合されている、態様1~3のいずれか1つに記載のポリペプチド。
5.(N末端からC末端の方向に)SAM、(d)任意の第2のリンカー、および(e)第2の免疫グロブリンスーパーファミリードメインを含む、態様1~4のいずれか1つに記載のポリペプチド。
6.第2のドメインが、抗体単一可変ドメイン、VHおよびVLから選択されるか、または、ドメインが、scFvによって構成されている、態様5に記載のポリペプチド。
7.第2のドメインが、抗体単一可変ドメインまたは抗体定常ドメインである、態様5に記載のポリペプチド。
8.定常ドメインが、抗体Fc領域によって構成されている、態様7に記載のポリペプチド。
9.(c)が(e)に直接結合しているか、または、(d)が(c)および(e)に直接結合されている、態様5~8のいずれか1つに記載のポリペプチド。
10.TDが、p53、p63またはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログであるか、または、TDが、NHR2 TDまたはそのホモログもしくはオルソログである、態様1~9のいずれか1つに記載のポリペプチド。
11.TDが、配列番号10または126と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、態様1~10のいずれか1つに記載のポリペプチド。
12.(a)と(c)との間に(f)抗体可変ドメイン、抗体定常領域、または抗体Fc領域を含む、態様1~11のいずれか1つに記載のポリペプチド。
13.(f)が、(i)抗体CH1定常ドメインを含むか、または(ii)抗体Fc領域(すなわち、CH2-CH3を含む)、態様12に記載のポリペプチド。
14.ポリペプチドが、第2のポリペプチドと会合しており、(iii)第2のポリペプチドが、(i)のCH1ドメインと対合している抗体CL定常ドメインを含むか、または(iv)第2のポリペプチドが、(ii)のFc領域と対合している第2の抗体のFc領域を含む、態様13に記載のポリペプチド。
15.(f)の可変ドメインが、抗体単一可変ドメインである、態様12に記載のポリペプチド。
16.ポリペプチド(第1のポリペプチド)が、(N末端からC末端の方向に)、
A.第1の抗体単一可変ドメイン(dAb)、任意のリンカー、および該SAM、
B.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、該SAMおよび第2の抗体単一可変ドメイン、
C.第1のscFv、任意のリンカーおよび該SAM、
D.第1のscFv、任意のリンカー、該SAMおよび第2のscFv、
E.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、該SAMおよび第1のscFv、
F.第1のscFv、任意のリンカー、該SAMおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
G.第1の抗体可変ドメイン、任意の第1のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカー、および該SAM、
H.該SAM、任意のリンカーおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
I.該SAM、任意のリンカーおよび第1のscFv、
J.該SAM、任意のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体可変ドメイン、または
K.該SAM、任意のリンカー、第1の抗体可変ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体定常ドメイン、を含むか、またはこれらからなる、態様1~15のいずれか1つに記載のポリペプチド。
17.
(i)該ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)、
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、CH2、CH3およびSAM、
G.第1のscFv、CH2、CH3およびSAM、
H.VH、CH1、CH2、CH3およびSAM、
I.VL、CL、CH2、CH3およびSAM、
J.dAb、SAM、CH2およびCH3、
K.scFv、SAM、CH2およびCH3、
L.VH、CH1、SAM、CH2およびCH3
M.VL、CL、SAM、CH2およびCH3、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、または
AA.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAM、第3のdAbおよび第4のdAbを含むか、
または
(ii)ポリペプチドが(C末端からN末端の方向に)、
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、CH2、CH3およびSAM、
G.第1のscFv、CH2、CH3およびSAM、
H.VH、CH1、CH2、CH3およびSAM、
I.VL、CL、CH2、CH3およびSAM、
J.dAb、SAM、CH2およびCH3、
K.scFv、SAM、CH2およびCH3、
L.VH、CH1、SAM、CH2およびCH3
M.VL、CL、SAM、CH2およびCH3、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAMおよび第1のscFv、または
AA.第1のdAb、第2のdAb、CH2、CH3、SAM、第3のdAbおよび第4のdAbを含む、態様1~15のいずれか1つに記載のポリペプチド。
18.単一可変ドメイン(dAb)が、同一であるか、またはscFvが同一である、態様16B、16D、(i)17B、(i)17D、(i)17N、(i)17S、(i)17T、(i)17U、(i)17X、(i)17Y、(i)17Z、(i)17AA、(ii)17B、(ii)17D、(ii)17N、(ii)17S、(ii)17T、(ii)17U、(ii)17X、(ii)17Y、(ii)17Zまたは(ii)17AAに記載のポリペプチド。
19.単一可変ドメインが異なるか、またはscFvが異なる、態様16B、16D、(i)17B、(i)17D、(i)17N、(i)17S、(i)17T、(i)17U、(i)17X、(i)17Y、(i)17Z、(i)17AA、(ii)17B、(ii)17D、(ii)17N、(ii)17S、(ii)17T、(ii)17U、(ii)17X、(ii)17Y、(ii)17Zまたは(ii)17AAに記載のポリペプチド。
20.(i)第1の可変ドメインがVHドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCH1ドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CH1ドメインと対合している抗体CL定常ドメインを含み、(ii)第1の可変ドメインがVHドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCLドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CLドメインと対合している抗体CH1定常ドメインを含み、(iii)第1の可変ドメインがVLドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCH1ドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CH1ドメインと対合している抗体CL定常ドメインを含み、または(iv)第1の可変ドメインがVLドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCLドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CLドメインと対合している抗体CH1定常ドメインを含む、態様16G、16J、16K、(i)17H、(i)17I、(i)17L、(i)17M、(i)17O、(i)17P、(i)17Q、(i)17R、(ii)17H、(ii)17I、(ii)17L、(ii)17M、(ii)17O、(ii)17P、(ii)17Qまたは(ii)17Rに記載のポリペプチド。
21.(v)第1の可変ドメインまたはscFvと(vi)SAMとの間に抗体Fc領域またはさらなる抗体単一可変ドメインを含み、FcがCH2およびCH3を含む、態様16~20のいずれか1つに記載のポリペプチド。
22.(vii)SAMと(viii)最もC末端の可変ドメインとの間に抗体Fc領域または抗体単一可変ドメインを含み、FcがCH2およびCH3を含む、態様16~21のいずれか1つに記載のポリペプチド。
23.N末端からC末端の方向に、抗体Fc領域および最もN末端の可変ドメインまたはscFvを含み、FcがCH2およびCH3を含む、態様16~22のいずれか1つに記載のポリペプチド。
24.N末端からC末端の方向に、SAMおよび抗体Fc領域を含み、FcがCH2およびCH3を含む、態様16~23のいずれか1つに記載のポリペプチド。
25.CH2が、アミノ酸配列CXXCまたは配列番号180~182から選択されるアミノ酸配列を欠いており、任意に、アミノ酸配列の配列番号183~187を欠いている、態様17~24のいずれか1つに記載のポリペプチド。
26.第1または各リンカーが、(G4S)nリンカーであり、ここで、n=1、2、3、4、5、6、7、8、9または10である、態様1~25のいずれか1つに記載のポリペプチド。
27.各ドメインおよびSAMが、それぞれヒトドメインおよびSAMである、態様1~26のいずれか1つに記載のポリペプチド。
28.各可変ドメインまたはscFvが、抗原に結合することができる、態様1~27のいずれか1つに記載のポリペプチド。
29.ポリペプチドが2つ以上の抗原、任意に、2、3または4つの異なる抗原に対する結合特異性を含む、態様1~28のいずれか1つに記載のポリペプチド。
30.態様1~29のいずれか1つに記載のポリペプチドの多量体(任意に四量体)。
31.真核細胞のグリコシル化を含む、態様1~30のいずれか1つに記載のポリペプチドまたは多量体。
32.細胞が、HEK293、CHOまたはCos細胞である、態様31に記載のポリペプチドまたは多量体。
33.医療用の、態様1~32のいずれか1つに記載のポリペプチドまたは多量体。
34.態様1~33のいずれか1つに記載のポリペプチドまたは多量体を含む薬学的組成物。
35.態様1~29および31~33のいずれか1つに記載のポリペプチドをコードする核酸。
36.態様35の核酸を含む真核細胞またはベクター。
37.抗原の複数のコピーを結合する方法であって、方法が、コピーを態様30~33のいずれか1つに記載の多量体と組み合わせることを含み、コピーが、多量体のポリペプチドによって結合されており、任意に、方法が、抗原コピーに結合した多量体を単離することを含む、方法。
38.方法が、サンプル中の物質の存在を検出するための診断方法であり、物質が抗原を含み、方法がサンプル(例えば、体液、食品、食品成分、飲料、飲料成分、土壌または法医学サンプル)を提供することと、サンプルを態様30~33のいずれか1つに記載の多量体と混合することと、サンプル中の抗原への多量体の結合を検出することと、を含む、態様37に記載の方法。
39.ヒトまたは動物の対象における疾患もしくは状態のリスクを治療または低減する方法であって、方法が、態様34に記載の組成物を、対象に投与することを含み、組成物に含まれる多量体が、対象の標的抗原に特異的に結合し、該結合が、リスクの治療または低減を媒介する、方法。
40.抗原が、免疫チェックポイントまたはT細胞共刺激抗原(例えば、PD-L1、PD-1もしくはCTLA4)であるか、または抗原が、TNFアルファもしくはIL-17Aである、態様39に記載の方法。
41.抗原が対象の疾患または状態を媒介し、任意に、結合が抗原に拮抗する、態様39に記載の方法。
42.態様1~29および31~33のいずれか1つに記載の複数のポリペプチドを含む組成物であって、ポリペプチドの少なくとも90%が、該ポリペプチドの四量体によって構成されている、組成物。
43.ポリペプチドの少なくとも98%が、該ポリペプチドの四量体によって構成されている、態様42に記載の組成物。
44.残りの(すなわち、ポリペプチドの100%に対する残部)ポリペプチドが、ポリペプチド単量体、二量体および三量体のうちの1つ以上から選択される、態様42または43に記載の組成物。
45.態様1~29および31~33のいずれか1つに記載の複数のポリペプチドを含む組成物(任意に、態様42~44のいずれか1つに記載の組成物)を産生する方法であって、方法が、態様34に記載の真核宿主細胞を提供することと、宿主細胞を培養することと、ポリペプチドの四量体の細胞からの発現および分泌を可能にすることと、任意に、四量体を単離または精製することと、を含む、方法。
これらの態様のいずれかは、本明細書の他の開示、例えば、項目またはパラグラフのいずれかと組み合わせることができる。
本発明はまた、抗体Fc領域を含むポリペプチドおよび多量体を提供する。これは、例えば、ヒトまたは動物などの対象に投与されたときに、FcRnリサイクルを利用するのに有用であり、これは、インビボでの望ましい半減期に寄与し得る。Fc領域は、Fcエフェクター機能を提供するのにも有用である。例えば、IgG1 Fcは、多量体ががんを治療するために使用される場合、または例えばADCCによって細胞殺傷が望まれる場合に有用であり得る。
抗体Fc領域を含むポリペプチドであって、Fc領域が、抗体CH2および抗体CH3を含む、抗体Fc領域と、自己会合性多量体化ドメイン(SAM)とを含むポリペプチドを提供し、CH2は、抗体ヒンジ配列を含み、コアヒンジ領域を欠いている。
A.アミノ酸配列APELLGGPSV(配列番号:163)、またはPAPELLGGPSV(配列番号:164)、
B.アミノ酸配列APPVAGPSV(配列番号:165)、またはPAPPVAGPSV(配列番号:166)、
C.アミノ酸配列APEFLGGPSV(配列番号:175)、またはPAPEFLGGPSV(配列番号:176)、
D.アミノ酸配列EPKSCDKTHT[P]APELLGGPSV(配列番号:167、または168)(括弧で囲まれたPは任意である)、
E.アミノ酸配列ERKCCVE[P]APPVAGPSV(配列番号:169、または170)(括弧で囲まれたPは任意である)、
F.アミノ酸配列ELKTPLGDTTHT[P]APELLGGPSV(配列番号:171、または172)(括弧で囲まれたPは任意である)、
G.アミノ酸配列EPKSCDTPPP[P]APELLGGPSV(配列番号:173、または174)(括弧で囲まれたPは任意である)、あるいは
H.アミノ酸配列ESKYGPP[P]APEFLGGPSV(配列番号:177、または178)(括弧で囲まれたPは任意である)を含む。
A.ヒトIgG1 CH2およびCH3ドメイン、
B.ヒトIgG2 CH2およびCH3ドメイン、
C.ヒトIgG3 CH2およびCH3ドメイン、または
D.ヒトIgG4 CH2およびCH3ドメイン、を含む。
(a)ヒトIgG1 CH2およびCH3ドメインならびにヒトIgG1ヒンジ配列およびヒンジ領域であるヒンジ配列およびコアヒンジ領域、
(b)ヒトIgG2 CH2およびCH3ドメインならびにヒトIgG2ヒンジ配列およびヒンジ領域であるヒンジ配列およびコアヒンジ領域、
(c)ヒトIgG3 CH2およびCH3ドメインならびにヒトIgG31ヒンジ配列およびヒンジ領域であるヒンジ配列およびコアヒンジ領域、または
(d)ヒトIgG4 CH2およびCH3ドメインならびにヒトIgG4ヒンジ配列およびヒンジ領域であるヒンジ配列およびコアヒンジ領域を含む。
A.CH2ドメインが、ヒトIgG1 CH2ドメインを含み、コアヒンジi領域アミノ酸配列が、配列番号180であり、任意に、CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列EPKSCDKTHT(配列番号183)を欠いているか、
B.CH2ドメインが、ヒトIgG2 CH2ドメインを含み、コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号180であり、任意に、CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列ERKCCVE(配列番号184)を欠いているか、
C.CH2ドメインが、ヒトIgG3 CH2ドメインを含み、コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号181であり、任意に、CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列ELKTPLGDTTHT(配列番号:185)もしくは上部ヒンジ領域アミノ酸配列EPKSCDTPPP(配列番号:186)を欠いているか、または
D.CH2ドメインが、ヒトIgG4 CH2ドメインであり、該コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号182であり、任意に、CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列ESKYGPP(配列番号187)を欠いている。
、XCL1(リンフォテクチン)、XCL2(SCM-lb)、XCR1(GPR5/CCXCR1)、YY1、およびZFPM2からなる群から選択される抗原(例えば、ヒト抗原)によって構成される。任意に、第2のエピトープ(以下で論じられるように)は、第1のエピトープと同じ抗原によって構成されている(例えば、同じ抗原分子によって構成されている)。別の例では、第2の抗原は、該グループによって構成される。例では、第1および第2のエピトープは、該グループ群から選択される異なる抗原によって構成されている。
A.可変ドメイン、SAMおよびFc領域、
B.Fc領域、SAMおよび可変ドメイン、
C.可変ドメイン、Fc領域およびSAM、
D.SAM、可変ドメインおよびFc領域、または
E.SAM、Fc領域および可変ドメインを含む。
(i)ポリペプチドは(N末端からC末端の方向に)、
A.第1の抗体単一可変ドメイン(dAb)、任意のリンカー、および該SAM、
B.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、該SAMおよび第2の抗体単一可変ドメイン、
C.第1のscFv、任意のリンカーおよび該SAM、
D.第1のscFv、任意のリンカー、該SAMおよび第2のscFv、
E.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、該SAMおよび第1のscFv、
F.第1のscFv、任意のリンカー、該SAMおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
G.第1の抗体可変ドメイン、任意の第1のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカー、および該SAM、
H.該SAM、任意のリンカーおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
I.該SAM、任意のリンカーおよび第1のscFv、
J.該SAM、任意のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体可変ドメイン、もしくは
K.該SAM、任意のリンカー、第1の抗体可変ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体定常ドメイン、を含むか、
または
(ii)ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)、
A.dAbおよびSAM、
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、Fc領域およびSAM、
G.第1のscFv、Fc領域およびSAM、.
H.VH、CH1、Fc領域およびSAM、
I.VL、CL、Fc領域およびSAM、
J.dAb、SAMおよびFc領域、
K.scFv、SAMおよびFc領域、
L.VH、CH1、SAMおよびFc領域、
M.VL、CL、SAMおよびFc領域、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、もしくは
AA.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、を含むか、
または
(iii)ポリペプチドは(C末端からN末端の方向に)、
A.dAbおよびSAM、
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、Fc領域および該SAM、
G.第1のscFv、Fc領域および該SAM、.
H.VH、CH1、Fc領域、およびSAM、
I.VL、CL、Fc領域およびSAM、
J.dAb、SAMおよびFc領域、
K.scFv、SAMおよびFc領域、
L.VH、CH1、SAMおよびFc領域、
M.VL、CL、SAMおよびFc領域、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、もしくは
AA.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、を含む。
本発明によるのポリペプチドの多量体(任意に四量体)であって、任意に、多量体が、医療用である、多量体。例では、本明細書の医療用とは、がん、自己免疫疾患または状態、もしくは本明細書に開示される任意の他の疾患または状態の治療または予防である。
複数の抗体Fc領域の多量体であって、各Fcが、それぞれのポリペプチドによって構成され、別のFc領域と対合せず、任意に、多量体が医療用である、多量体。任意選択で、各ポリペプチドは、本明細書に開示されるようなエピトープ結合ドメインまたは部位を含む。
本発明のポリペプチドまたは多量体を含む薬学的組成物。
本発明のポリペプチドをコードする核酸であって、任意に、核酸が、真核細胞またはベクターによって構成される、核酸。
抗原の複数のコピーを結合する方法であって、方法が、コピーを本発明の組成物と組み合わせることを含み、コピーが、多量体のポリペプチドによって結合されており、任意に、方法が、抗原コピーに結合した多量体を単離することを含む、方法。例では、多量体は、抗原のコピーを含むサンプルと接触され、抗原のコピーは、多量体に結合することによってサンプル中に封鎖される。例えば、多量体は、ヒトまたは動物の患者に投与され(または環境が多量体に曝露される)、抗原コピーは、ヒト(例えば、該医療用に)、動物(例えば、該医療用に)または環境に封鎖される。例えば、環境は、例えば、抗原が環境汚染物質または汚染物によって構成される場合などの環境修復のために、土壌、水源、水路または工業用流体によって構成される。例では、この方法は、サンプルを精製するため、またはサンプルに含まれる抗原を単離するためのものである。
ヒトまたは動物の対象における疾患もしくは状態のリスクを治療または低減する方法であって、方法が、本発明の組成物を、対象に投与することを含み、組成物に含まれる多量体が、対象の標的抗原に特異的に結合し、結合が、疾患もしくは状態のリスクの治療または低減を媒介する、方法。
SAMが自己会合性四量体化ドメイン(TD)である場合の、本発明の複数のポリペプチドを含む組成物を生成する方法であって、方法が、本発明による真核宿主細胞を提供することと、宿主細胞を培養することと、ポリペプチドの四量体の細胞からの発現および分泌を可能にすることと、任意に、四量体を単離または精製することと、を含む、方法。
本発明は、以下のパラグラフを提供する。
1.
(a)抗体Fc領域であって、Fc領域が、抗体CH2ドメインおよび抗体CH3ドメインを含む、抗体Fc領域と、
(b)自己会合性多量体化ドメイン(SAM)と、を含む、ポリペプチド(任意に、本明細書の任意のポリペプチド)であって、
CH2が、コアヒンジCXXCアミノ酸配列を欠いており、式中、Xは、任意のアミノ酸である、ポリペプチド。
2.各アミノ酸Xが、P、RおよびSから選択される、パラグラフ1のポリペプチド。
3.CH2が、完全な上部ヒンジ配列を欠いている、パラグラフ1または2に記載のポリペプチド。
4.CH2が、
(a)APELLGGPSVアミノ酸配列、またはPAPELLGGPSVアミノ酸配列、
(b)APPVAGPSVアミノ酸配列、またはPAPPVAGPSVアミノ酸配列、
(c)APEFLGGPSVアミノ酸配列、またはPAPEFLGGPSVアミノ酸配列を含む、パラグラフ1~3のいずれか1つに記載のポリペプチド。
5.CH2およびCH3が、
(a)ヒトIgG1 CH2およびCH3ドメイン、
(b)ヒトIgG2 CH2およびCH3ドメイン、
(c)ヒトIgG3 CH2およびCH3ドメイン、または
(d)ヒトIgG4 CH2およびCH3ドメインを含む、パラグラフ1~4のいずれか1つに記載のポリペプチド。
6.CH2がCPPC配列を欠いている、パラグラフ5(a)または(b)のポリペプチド、あるいはCH2がCPRC配列を欠いている、パラグラフ5(c)のポリペプチド、あるいは、CH2がCPSC配列を欠いている、パラグラフ5(d)のポリペプチド。
7.CH2が、
(a)APELLGGPSVアミノ酸配列、
(b)EPKSCDKTHT[P]APELLGGPSVアミノ酸配列、括弧で囲まれたPは任意であり、
(c)APPVAGPSVアミノ酸配列、
(d)ERKCCVE[P]APPVAGPSVアミノ酸配列を含み、括弧で囲まれたPは任意であり、
(e)ELKTPLGDTTHT[P]APELLGGPSVアミノ酸配列、括弧で囲まれたPは任意であり、
(f)EPKSCDTPPP[P]APELLGGPSVアミノ酸配列、括弧で囲まれたPは任意であり、
(g)APEFLGGPSVアミノ酸配列、または
(h)ESKYGPP[P]APEFLGGPSVアミノ酸配列、括弧で囲まれたPは任意である、を含む、パラグラフ1~4のいずれか1つに記載のポリペプチド。
8.CH2が、本明細書に開示されるCXXCおよび配列番号180~182から選択される配列を欠いている、パラグラフ1~7のいずれか1つに記載のポリペプチド。
9.ポリペプチドが、第1のエピトープに特異的に結合することができる抗体可変ドメインを含む、パラグラフ1~8のいずれか1つに記載のポリペプチド。
10.可変ドメインが、抗体単一可変ドメイン、VHおよびVLから選択されるか、または、ドメインが、scFvによって構成されている、パラグラフ9に記載のポリペプチド。
11.Fc領域が、SAMの3’にある、パラグラフ1~10のいずれか1つに記載のポリペプチド。
12.
(a)可変ドメインが、SAMの5’にあり、およびFc領域が、SAMの3’にあり、
(b)可変ドメインが、SAMの3’にあり、およびFc領域が、SAMの5’にあり、
(c)可変ドメインおよびFc領域が、SAMの5’にあり、または
(d)可変ドメインおよびFc領域が、SAMの3’にある、パラグラフ9、10または11に記載のポリペプチド。
13.SAMの5’または3’の第2の可変ドメインを含み、第2の可変ドメインが、第2のエピトープに特異的に結合することができ、第1および第2のエピトープが、同一または異なる、パラグラフ12に記載のポリペプチド。
14.エピトープが同じ抗原の異なるエピトープであるか、または異なる抗原のエピトープである、パラグラフ13に記載のポリペプチド。
15.第2の可変ドメインが、抗体単一可変ドメイン、VHおよびVLから選択されるか、または、ドメインが、scFvによって構成されている、パラグラフ13または14に記載のポリペプチド。
16.第2の可変ドメインが、抗体単一可変ドメインまたは抗体定常ドメインである、パラグラフ15に記載のポリペプチド。
17.SAMが、自己会合性四量体化ドメイン(TD)である、パラグラフ1~16のいずれか1つに記載のポリペプチド。
18.TDが、p53、p63またはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログであるか、または、TDが、NHR2 TDまたはそのホモログもしくはオルソログである、パラグラフ17に記載のポリペプチド。
19.TDが、配列番号10または126と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、パラグラフ17または18に記載のポリペプチド。
20.抗体CH1定常ドメイン、任意にCH1-CH2-CH3を含み、CH2およびCH3が、該Fc領域によって構成される、パラグラフ1~19のいずれか1つに記載のポリペプチド。
21.ポリペプチド(第1のポリペプチド)が、(N末端からC末端の方向に)、
A.第1の抗体単一可変ドメイン(dAb)、任意のリンカー、および該SAM、
B.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、該SAMおよび第2の抗体単一可変ドメイン、
C.第1のscFv、任意のリンカーおよび該SAM、
D.第1のscFv、任意のリンカー、該SAMおよび第2のscFv、
E.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、該SAMおよび第1のscFv、
F.第1のscFv、任意のリンカー、該SAMおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
G.第1の抗体可変ドメイン、任意の第1のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカー、および該SAM、
H.該SAM、任意のリンカーおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
I.該SAM、任意のリンカーおよび第1のscFv、
J.該SAM、任意のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体可変ドメイン、もしくは
K.該SAM、任意のリンカー、第1の抗体可変ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体定常ドメイン、を含むか、またはこれらからなる、パラグラフ1~20のいずれか1つに記載のポリペプチド。
22.
(i)ポリペプチドが(N末端からC末端の方向に)、
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)、
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、Fc領域およびSAM、
G.第1のscFv、Fc領域およびSAM、.
H.VH、CH1、Fc領域およびSAM、
I.VL、CL、Fc領域およびSAM、
J.dAb、SAMおよびFc領域、
K.scFv、SAMおよびFc領域、
L.VH、CH1、SAMおよびFc領域、
M.VL、CL、SAMおよびFc領域、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、もしくは
AA.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、を含むか、
または
(ii)ポリペプチドが(C末端からN末端の方向に)、
A.dAbおよび自己会合性多量体化ドメイン(SAM)、
B.第1のdAb、SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよびSAM、
D.第1のscFv、SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、Fc領域およびSAM、
G.第1のscFv、Fc領域およびSAM、.
H.VH、CH1、Fc領域、およびSAM、
I.VL、CL、Fc領域およびSAM、
J.dAb、SAMおよびFc領域、
K.scFv、SAMおよびFc領域、
L.VH、CH1、SAMおよびFc領域、
M.VL、CL、SAMおよびFc領域、
N.第1のdAb、第2のdAbおよびSAM、
O.VH、CH1およびSAM、
P.VL、CLおよびSAM、
Q.VH、CH1、SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域およびSAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAMおよび第1のscFv、もしくは
AA.第1のdAb、第2のdAb、Fc領域、SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、を含む、パラグラフ1~20のいずれか1つに記載のポリペプチド。
23.単一可変ドメイン(dAb)が、同一であるか、またはscFvが同一である、パラグラフ21B、21D、(i)22B、(i)22D、(i)22N、(i)22S、(i)22T、(i)22U、(i)22X、(i)22Y、(i)22Z、(i)22AA、(ii)22B、(ii)22D、(ii)22N、(ii)22S、(ii)22T、(ii)22U、(ii)22X、(ii)22Y、(ii)22Zまたは(ii)22AAに記載のポリペプチド。
24.単一可変ドメインが異なるか、またはscFvが異なる、パラグラフ21B、21D、(i)22B、(i)22D、(i)22N、(i)22S、(i)22T、(i)22U、(i)22X、(i)22Y、(i)22Z、(i)22AA、(ii)22B、(ii)22D、(ii)22N、(ii)22S、(ii)22T、(ii)22U、(ii)22X、(ii)22Y、(ii)22Zまたは(ii)22AAに記載のポリペプチド。
25.(i)第1の可変ドメインがVHドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCH1ドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CH1ドメインと対合している抗体CL定常ドメインを含み、(ii)第1の可変ドメインがVHドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCLドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CLドメインと対合している抗体CH1定常ドメインを含み、(iii)第1の可変ドメインがVLドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCH1ドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CH1ドメインと対合している抗体CL定常ドメインを含み、または(iv)第1の可変ドメインがVLドメインであり、かつ第1の定常ドメインがCLドメインであり、任意に、ポリペプチドが第2のポリペプチドと会合しており、第2のポリペプチドが、CLドメインと対合している抗体CH1定常ドメインを含む、パラグラフ21G、21J、21K、(i)22H、(i)22I、(i)22L、(i)22M、(i)22O、(i)22P、(i)22Q、(i)22R、(ii)22H、(ii)22I、(ii)22L、(ii)22M、(ii)22O、(ii)22P、(ii)22Qまたは(ii)22Rに記載のポリペプチド。
26.(v)第1の可変ドメインまたはscFvと(vi)SAMとの間に抗体Fc領域または抗体単一可変ドメインを含み、FcがCH2およびCH3を含む、パラグラフ21~25のいずれか1つに記載のポリペプチド。
27.(i)SAMと(ii)最もC末端の可変ドメインとの間にFc領域または抗体単一可変ドメインを含むパラグラフ21~26のいずれか1つに記載のポリペプチド。
28.N末端からC末端の方向に、抗体Fc領域および最もN末端の可変ドメインまたはscFvを含む、パラグラフ21~27のいずれか1つに記載のポリペプチド。
29.SAMおよび抗体Fc領域をN末端からC末端の方向に含む、パラグラフ21から28のいずれか1つに記載のポリペプチド。
30.第1または各リンカーが、(G4S)nリンカーであり、ここで、n=1、2、3、4、5、6、7、8、9または10である、パラグラフ21~29のいずれか1つに記載のポリペプチド。
31.各ドメインおよびSAMが、それぞれヒトドメインおよびSAMである、パラグラフ1~30のいずれか1つに記載のポリペプチド。
32.ポリペプチドが2つ以上の抗原、任意に、2、3または4つの異なる抗原に対する結合特異性を含む、パラグラフ1~31のいずれか1つに記載のポリペプチド。
33.パラグラフ1~32のいずれか1つに記載のポリペプチドの多量体(任意に四量体)。
34.複数の抗体Fc領域の多量体であって、各Fcが、それぞれのポリペプチドによって構成され、別のFc領域と対合していない、多量体。
35.多量体が、少なくとも4つのFc領域を含むポリペプチド四量体である、パラグラフ34に記載の多量体。
36.各Fc領域が同一である、パラグラフ34または35に記載の多量体。
37.各Fcが、CH2およびCH3を含み、各CH2がパラグラフ1~32のいずれか1つに記載されているようなCH2である、パラグラフ1~36のいずれか1つに記載の多量体。
38.真核細胞のグリコシル化を含む、パラグラフ1~37のいずれか1つに記載のポリペプチドまたは多量体。
39.細胞が、HEK293、CHOまたはCos細胞である、パラグラフ38に記載のポリペプチドまたは多量体。
40.医療用のためのパラグラフ1~39のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは多量体。
41.パラグラフ1~40のいずれか1つに記載のポリペプチドまたは多量体を含む薬学的組成物。
42.パラグラフ1~32および38~40のいずれか1つに記載のポリペプチドをコードする核酸。
43.パラグラフ42に記載の核酸を含む真核細胞またはベクター。
44.抗原の複数のコピーを結合する方法であって、方法が、コピーをパラグラフ33~40のいずれか1つに記載の多量体と組み合わせることを含み、コピーが、多量体のポリペプチドによって結合されており、任意に、方法が、抗原コピーに結合した多量体を単離することを含む、方法。
45.方法が、サンプル中の物質の存在を検出するための診断方法であり、物質が抗原を含み、方法がサンプル(例えば、体液、食品、食品成分、飲料、飲料成分、土壌または法医学サンプル)を提供することと、サンプルをパラグラフ33~40のいずれか1つに記載の多量体と混合することと、サンプル中の抗原への多量体の結合を検出することと、を含む、パラグラフ37に記載の方法。
46.ヒトまたは動物の対象における疾患もしくは状態のリスクを治療または低減する方法であって、方法が、パラグラフ41に記載の組成物を、対象に投与することを含み、組成物に含まれる多量体が、対象の標的抗原に特異的に結合し、該結合が、リスクの治療または低減を媒介する、方法。
47.抗原が、免疫チェックポイント(例えば、PD-L1、PD-1もしくはCTLA4)であるか、または抗原が、TNFアルファもしくはIL-17Aである、パラグラフ46に記載の方法。
48.抗原が対象の疾患または状態を媒介し、任意に、結合が抗原に拮抗する、パラグラフ46に記載の方法。
49.パラグラフ1~32および38~40のいずれか1つに記載の複数のポリペプチドを含む組成物であって、ポリペプチドの少なくとも90%が、該ポリペプチドの四量体によって構成されている、組成物。
50.ポリペプチドの少なくとも98%が、該ポリペプチドの四量体によって構成されている、パラグラフ49に記載の組成物。
51.残りのポリペプチドが、ポリペプチド単量体、二量体および三量体のうちの1つ以上から選択される、パラグラフ49または50に記載の組成物。
52.パラグラフ1~32および38~40のいずれか1つに記載の複数のポリペプチドを含む組成物(任意に、パラグラフ49~51のいずれか1つに記載の組成物)を産生する方法であって、方法が、パラグラフ34に記載の真核宿主細胞を提供することと、宿主細胞を培養することと、ポリペプチドの四量体の細胞からの発現および分泌を可能にすることと、任意に、四量体を単離または精製することと、を含む、方法。
ある特定の実施形態では、本発明は、ヒトまたは動物におけるがんを治療するための多量体を提供するために有用である。この点で、腫瘍関連抗原に結合することによって腫瘍を標的化するために、および/またはそれらの活性を調節するようにT細胞に結合するために、多量体を使用することが有用であり得る。例えば、多量体は、T制御性細胞(Treg)上の抗原に結合して、それらの活性をダウンレギュレートし得る。追加的または代替的に、多量体は、それらの活性をアップレギュレートするために、Tエフェクター(Teff)細胞に結合し得る。多量体のポリペプチドにおける抗体Fc領域の提供は、腫瘍細胞を殺傷するためのFcエフェクター機能および/または細胞傷害性を提供するために有利であり得る。1つの有利な構成では、本発明は、腫瘍細胞上の同じ抗原またはエピトープのいくつかのコピーに結合するために使用できる複数の同一の抗原またはエピトープ結合部位を提供する能力を利用し、それにより、多量体が任意の非標的細胞または正常細胞よりも優先的に腫瘍細胞結合する結合力効果を提供し、なぜなら、前者の表面は正常細胞よりも多くの抗原のコピーを発現するためである。一構成では、多量体が免疫チェックポイント調節剤の結合部位も含む場合である。一例では、調節因子は免疫チェックポイント阻害剤であり、結合部位は阻害剤に拮抗する。これは、例えば、阻害剤がTeff細胞によって発現される場合、多量体によって標的とされる腫瘍細胞の近くでTeff活性をアップレギュレートするために(例えば、腫瘍細胞にTAAを結合させることによって)有用である。別の例では、調節因子は免疫チェックポイント刺激剤であり、結合部位は阻害剤に作動する。これは、例えば、阻害剤がTeff細胞によって発現される場合、多量体によって標的とされる腫瘍細胞の近くでTeff活性をアップレギュレートするために(例えば、腫瘍細胞にTAAを結合させることによって)有用である。したがって、T細胞活性のアップレギュレーションは、非標的(例えば、正常または非がん性)細胞の近くではなく、腫瘍細胞の近くで刺激され得る。この目的のために、本発明は以下の概念を提供する。
1.自己会合性多量体化ドメイン(SAM)、第1の抗原結合部位および第2の抗原結合部位を含むポリペプチドであって、第1の部位が、第1の抗原もしくはエピトープに特異的に結合し、第2の結合部位が、第2の抗原もしくはエピトープに特異的に結合し、各抗原もしくはエピトープが、腫瘍関連抗原(TAA)もしくはエピトープ、または免疫チェックポイント調節因子(例えば、阻害剤)抗原もしくはエピトープである、ポリペプチド。
2.第1の抗原が、TAAであり、第2の抗原が、免疫チェックポイント調節因子(例えば、阻害剤)である、概念1に記載のポリペプチド。
3.第1の抗原が、TAAであり、第2の抗原が、TAAである、概念1に記載のポリペプチド。
4.第1の抗原が、免疫チェックポイント阻害剤であり、第2の抗原が、免疫チェックポイント調節因子(例えば、阻害剤)である、概念1に記載のポリペプチド。
5.結合部位が、同じ抗原の同じエピトープに特異的に結合することができる、概念3または4に記載のポリペプチド。
6.結合部位が、同じ抗原の異なるエピトープに特異的に結合することができる、概念3または4に記載のポリペプチド。
7.第1の抗原が、4-1BB、4-1BBL、CD28、OX40、OX40L、ICOS、ICOSL、GITR、CD40、CD27、CD27L、CD40L、LIGHT、CD70、CD80、CD86、HER2、HER3、PSMA、WT1、MUC1、LMP2、EGFRvIII、MAGE A3、GD2、CEA、Melan a/MART1、Bcr-Abl、Survivin、PSA、hTERT、EphA2、PAP、EpCAM、ERG、PAX3、ALK、アンドロゲン受容体、サイクリンB1、RhoC、GD3、PSCA、PAX5、LCK、VEGFR2、MAD CT-1、FAP、MAD CT-2、PDGFR-ベータ、Fos関連抗原1、NY-BR-1、ETV6-AML、RGS5、SART3、SSX2、XAGE-1、STn、PAPおよびBCMAから選択される、概念1~6のいずれか1つに記載のポリペプチド。
8.第2の抗原が、PDL1、PD1、CTLA4、BTLA、KIR、LAG3、TIM3、A2aR、HVEM、GAL9、VISTA、SIRPa、CD47、CD160、CD155、IDO、CEACAM1、2B4、CD48およびTIGITから選択される、概念1~7のいずれか1つに記載のポリペプチド。
9.ポリペプチドが、第3の抗原またはエピトープに特異的に結合することができる第3の抗原結合部位を含む、概念1~8のいずれか1つに記載のポリペプチド。
10.第3の抗原が、TAAである、概念9に記載のポリペプチド。
11.第3の抗原が、免疫チェックポイント調節因子(例えば、阻害剤)である、概念9に記載のポリペプチド。
12.第3の抗原が、第1または第2の抗原と同じである、概念9~11のいずれか1つに記載のポリペプチド。
13.第3の抗原が、CD3(例えば、CD3e)またはCD28である、概念9~12のいずれか1つに記載のポリペプチド。
14.ポリペプチドが、第4の抗原もしくはエピトープに特異的に結合することができる第4の抗体結合部位を含む、概念9~13のいずれか1つに記載のポリペプチド。
15.第4の抗原がTAAである、概念14に記載のポリペプチド。
16.第4の抗原が、免疫チェックポイント調節因子(例えば、阻害剤)である、概念14に記載のポリペプチド。
17.ポリペプチドが、本明細書に開示されるいずれかのポリペプチドによるものである、概念1~16のいずれか1つに記載のポリペプチド。
18.概念1~17のいずれか1つに記載のポリペプチドの多量体。
19.がんの治療のための免疫チェックポイント阻害剤および免疫共刺激分子を標的化するためのヒトまたは動物対象への投与のための、概念18に記載の多量体。
20.ヒトまたは動物の対象におけるがんを治療する方法であって、請求項18に記載の多量体を対象に投与することを含む、方法。
構成において、本発明は以下の項目を提供する。
1.エフェクタードメイン(例えば、タンパク質ドメインまたはペプチド)の少なくとも第1、第2、第3および第4のコピーのタンパク質多量体であって、多量体が、一緒に会合された第1、第2、第3および第4の自己会合性四量体化ドメイン(TD)によって多量体化され、各四量体化ドメインが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含むそれぞれの操作されたポリペプチドによって構成される、エフェクタードメイン(例えば、タンパク質ドメインまたはペプチド)の少なくとも第1、第2、第3および第4のコピーのタンパク質多量体。
2.多量体が、該ドメインまたはペプチドの四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体、八量体)である、項目1に記載の多量体。
3.免疫グロブリンスーパーファミリー結合部位の四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体、八量体)を含む、項目1または2に記載の多量体。
4.結合部位が、第2の可変ドメインと対合している第1の可変ドメインを含む、項目3に記載の多量体。
5.各ポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの第1および第2のコピーを含み、ポリペプチドが(N末端からC末端に向かう方向)に(i)該コピーの第1のもの-TD-該コピーの第2のもの、(ii)TD-と第1および第2のコピー、または(iii)該第1および第2のコピー-TDを含む、項目1~4のいずれか1つに記載の多量体。
6.TDがNHR2 TDであり、ドメインまたはペプチドがNHR2ドメインまたはペプチドではないか、あるいはTDがp53 TDであり、ドメインまたはペプチドが、p53ドメインまたはペプチドではない、項目1~5のいずれかに記載の多量体。
7.操作されたポリペプチドが、第2のタイプのタンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、第2のタイプのタンパク質ドメインまたはペプチドが、第1のタンパク質ドメインまたはペプチドとは異なる、項目1~6のいずれか1つに記載の多量体。
8.ドメインが、免疫グロブリンスーパーファミリードメインである、項目1~7のいずれか1つに記載の多量体。
9.ドメインまたはペプチドが、抗体可変もしくは定常ドメイン、TCR可変もしくは定常ドメイン、インクレチン、インスリンペプチド、またはホルモンペプチドである、項目1~8のいずれか1つに記載の多量体。
10.多量体が、該操作されたポリペプチドの第1、第2、第3および第4の同一のコピーを含み、ポリペプチドが、TDおよび該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ(ただし、1つ以下)、2つ(ただし2つ以下)、またはそれ以上のコピーを含む、項目1~9のいずれか1つに記載の多量体。
11.操作されたポリペプチドが、抗体またはTCR可変ドメイン(V1)およびNHR2 TDを含む、項目1~10のいずれか1つに記載の多量体。
12.ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)(i)V1-任意のリンカー-NHR2 TD;(ii)V1-任意のリンカー-NHR2 TD-任意のリンカー-V2、あるいは(iii)V1-任意のリンカーカー-V2-任意のリンカー-NHR2 TDを含み、V1およびV2が、TCR可変ドメインであり、同じであるか、または異なり、あるいはV1およびV2が、抗体可変ドメインであり、同じであるか、または異なる、項目11に記載の多量体。
13.V1およびV2が、抗体単一可変ドメインである項目12に記載の多量体。
14.各操作されたポリペプチドが(N末端からC末端の方向に)V1-任意のリンカー-TDを含み、V1が、抗体またはTCR可変ドメインであり、各操作されたポリペプチドが、それぞれの第2の操作されたポリペプチドと対合しており、V2を含むポリペプチド、V2が、それぞれ、V1と対合して抗原またはpMHC結合部位を形成する抗体またはTCR可変ドメインであり、任意に、一方のポリペプチドが、抗体Fcを含むか、または抗体CH1を含み、他方のポリペプチドが、CH1と対合している抗体CLを含む、項目11に記載の多量体。
15.TDが、(i)配列番号10または126と同一であるか、またはそれと少なくとも80%同一であるアミノ酸配列、あるいは(ii)配列番号120または123と同一または少なくとも80%同一のアミノ酸配列を含む、項目1~14のいずれか1つに記載の多量体。
16.多量体が、ReoPro(商標)、アブシキシマブ、リツキサン(商標)、リツキシマブ、ゼナパックス(商標)、ダクリズマブ、Simulect(商標)、バシリキシマブ、Synagis(商標)、パリビズマブ、Remicade(商標)、インフリキシマブ、Herceptin(商標)、Mylotarg(商標)、ゲムツズマブ、Campath(商標)、アレムツズマブ、Zevalin(商標)、イブリツモマブ、Humira(商標)、アダリムマブ、Xolair(商標)、オマリズマブ、Bexxar(商標)、トシツモマブ、Raptiva(商標)、エファリズマブ、Erbitux(商標)、セツキシマブ、Avastin(商標)、ベバシズマブ、Tysabri(商標)、ナタリズマブ、Actemra(商標)、トシリズマブ、Vectibix(商標)、パニツムマブ、Lucentis(商標)、ラニビズマブ、Soliris(商標)、エクリズマブ、Cimzia(商標)、セルトリズマブ、Simponi(商標)、ゴリムマブ、Ilaris(商標)、カナキヌマブ、Stelara(商標)、ウステキヌマブ、Arzerra(商標)、オファツムマブ、Prolia(商標)、デノスマブ、Numax(商標)、モタビズマブ、ABThrax(商標)、ラキシバクマブ、Benlysta(商標)、ベリムマブ、Yervoy(商標)、イプリズマブ、Adcetris(商標)、ブレンツキシマブ、Vedotin(商標)、Perjeta(商標)、ペルツズムマブ、Kadcyla(商標)、アド-トラスツズマブ、Keytruda(商標)、Opdivo(商標)、Gazyva(商標)およびオビヌツズマブからなる群から選択される抗体の抗原結合部位の四量体、八量体、十二量体、十六量体、または20量体(例えば、四量体または八量体)を含む、項目1~15のいずれか1つに記載の多量体。
17.TCR結合部位、インスリンペプチド、インクレチンペプチドまたはペプチドホルモンの単離された四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体、あるいは複数の該四量体または八量体。
18.多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、
(a)水溶液に可溶生であり、
(b)真核細胞から分泌可能であり、および/または
(c)真核細胞の発現産物である、項目1~17のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)。
19.下記の
(a)TCR VドメインまたはTCR結合部位であって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、水溶液に可溶性である、TCR VドメインまたはTCR結合部位、
(b)抗体単一可変ドメインであって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が水溶液に可溶性である、抗体単一可変ドメイン、
(c)TCR VドメインまたはTCR結合部位であって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、HEK293細胞によって細胞内および/または細胞外で発現することができる、TCR VドメインまたはTCR結合部位、あるいは
(d)抗体可変ドメインであって、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、HEK293細胞によって細胞内および/または細胞外で発現することができる、抗体可変ドメインの、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)。
20.多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、抗原またはpMHC結合に対して二重特異性である、項目1~19のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
21.ドメインが同一である、項目1~20のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
22.多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体が、真核細胞のグリコシル化を含む、項目1~21のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
23.細胞がHEK293細胞である、項目22に記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体。
24.項目1~23のいずれか1つに記載の複数の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)。
25.項目1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)と、薬学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤と、を含む薬学的組成物。
26.項目1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)を含む化粧品、食品、飲料、洗浄製品、洗剤。
27.項目1~26のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体の該操作された(および任意に単離された)ポリペプチドまたは単量体(任意に単離された)。
28.操作された(および任意に単離された)ポリペプチド(P1)であって、(N末端からC末端の方向に):-
(a)TCR V1-TCR C1-抗体CH1-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、C1がCαであり、
(ii)V1が、Vβであり、C1がCβであり、
(iii)V1が、Vγであり、C1がCγであるか、または
(iv)V1が、Vδであり、C1がCδである、TCR V1-TCR C1-抗体CH1-任意のリンカー-TD、
あるいは
(b)TCR V1-抗体CH1-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、
(i)V1が、Vβであり、
(iii)V1が、Vγであるか、または
(iv)V1が、Vδである、TCR V1-抗体CH1-任意のリンカー-TD、
あるいは
(c)抗体V1-抗体CH1-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VLである、抗体V1-抗体CH1-任意のリンカー-TD、
あるいは
(d)抗体V1-任意の抗体CH1-抗体Fc-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VLである、抗体V1-任意の抗体CH1-抗体Fc-任意のリンカー-TD、
あるいは
(E)抗体V1-抗体CL-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、VHであるか、または
(ii)V1が、VLである、抗体V1-抗体CL-任意のリンカー-TD、
あるいは
(f)TCR V1-TCR C1-任意のリンカー-TDであって、
(i)V1が、Vαであり、C1がCαであり、
(ii)V1が、Vβであり、C1がCβであり、
(iii)V1が、Vγであり、C1がCγであるか、または
(iv)V1が、Vδであり、C1がCδである、TCR V1-TCR C1-任意のリンカー-TD、を含む、操作された(および任意に単離され)操作されたポリペプチド(P1)。
29.操作されたポリペプチドP1がさらなるポリペプチド(P2)と対合しており、P2が(N末端からC末端の方向に)、
(g)TCR V2-TCR C2-抗体CLであって、P1が、項目28で記載の(a)に従っており、
(i)P1が(a)(ii)に従っている場合、V2はVαであり、C2はCαであり、
(ii)P1が(a)(i)に従っている場合、V2はVβであり、C2はCβであり、
(iii)P1が(a)(iv)に従っている場合、V2はVγであり、C2はCγであり、または
(iv)P1が(a)(iii)に従っている場合、V2はVδであり、C2はCδである、TCR V2-TCR C2-抗体CL、
あるいは
(h)TCR V2-抗体CLであって、P1が、項目28で記載の(b)に従っており、
(i)P1が(b)(ii)に従っている場合、V2はVαであり、
(ii)P1が(b)(i)に従っている場合、V2はVβであり、
(iii)P1が(b)(iv)に従っている場合、V2はVγであり、または
(iv)P1が(b)(iii)に従っている場合、V2はVδである、TCR V2-抗体CL、
あるいは
(i)抗体V2-CLであって、P1が、項目28に記載の(c)に従っており、
(i)P1が(c)(ii)に従っている場合、V2はVHであり、
(ii)P1が(c)(i)に従っている場合、V2はVLである、抗体V2-CL、
あるいは
(j)抗体V2-任意のCLであって、P1が、項目28に記載の(d)に従っており、
(i)P1が(d)(ii)に従っている場合、V2はVHであり、
(ii)P1が(d)(i)に従っている場合、V2はVLである、抗体V2-任意のCL、
あるいは
(k)抗体V2-CH1であって、P1が、項目28に記載の(e)に従っており、
(i)P1が(e)(ii)に従っている場合、V2はVHであり、
(ii)P1が(e)(i)に従っている場合、V2はVLである、抗体V2-CH1、
あるいは
(l)TCR V2-TCR C2であって、P1が、項目28に記載の(f)に従っており、
(i)P1が(f)(ii)に従っている場合、V2はVαであり、C2はCαであり、
(ii)P1が(f)(i)に従っている場合、V2はVβであり、C2はCβであり、
(iii)P1が(f)(iv)に従っている場合、V2はVγであり、C2はCγであり、または
(iv)P1が(f)(iii)に従っている場合、V2はVδであり、C2はCδである、TCR V2-TCR C2、を含む、項目28に記載のポリペプチド。
30.項目28で定義されているP1の、または、項目29で定義されているP2と対合したP1の多量体、または、複数の該多量体であって、この多量体が、項目1~24のいずれか1つに記載のものである、多量体。
31.項目27~29のいずれか1つに記載の操作されたポリペプチドまたは単量体をコードする核酸であって、任意に、核酸が、ポリペプチドを発現するための発現ベクターによって構成される、核酸。
32.項目1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体、八量体)の操作されたポリペプチドもしくは単量体の細胞内発現および/または分泌発現のための、項目31に記載の核酸またはベクターを含む真核宿主細胞。
33.細胞内で発現および/または分泌された多量体を産生するためのタンパク質多量体の製造方法における項目31に記載の核酸またはベクターの使用であって、この方法が、核酸またはベクターを含む真核細胞から多量体を発現および/または分泌させることを含む、核酸またはベクターの使用。
34.核酸またはベクターを含む真核細胞においてグリコシル化多量体を産生するためのタンパク質多量体の製造方法における、項目31に記載の核酸またはベクターの使用。
35.(i)項目27~29のいずれか1つに記載の操作されたポリペプチドをコードする真核細胞株と、(ii)項目1~24のいずれか1つで定義された多量体、単量体、二量体、三量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)と、を含む、混合物。
36.細胞株が、細胞の分泌産物を含む培地中にあり、分泌産物が、該多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)を含む、項目35に記載の混合物。
37.医療用の、項目1~24のいずれか1つに記載の多量体、四量体、八量体、十二量体、十六量体または20量体(例えば、四量体または八量体)。
38.
(a)TCR Vドメイン多量体であって、方法が、真核細胞で発現されるTCR V-NHR2 TDまたはTCR V-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、TCR Vドメイン、
(b)抗体Vドメイン多量体であって、方法が、真核細胞で発現される抗体 V-NHR2-TDまたはV-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、抗体Vドメイン多量体、
(c)インクレチンペプチド多量体であって、方法が、HEK293T細胞などの真核細胞で発現されるインクレチンペプチド-NHR2 TDまたはインクレチンペプチド-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、インクレチンペプチド多量体、または
(d)ペプチドホルモン多量体であって、方法が、HEK293T細胞などの真核細胞で発現されるペプチドホルモン-NHR2 TDまたはペプチドホルモン-p53 TD融合タンパク質の可溶性および/もしくは細胞内発現を含み、方法が、任意に、複数の該多量体を単離することを含む、ペプチドホルモン多量体を、産生する方法。
39.ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における自己会合性四量体化ドメイン(TD)の使用。
40.ポリペプチドの単量体および/または二量体と対比してより高い収量の四量体を産生するための、タンパク質ドメインまたはペプチドの複数のコピーを含むポリペプチドの四量体の製造方法における、操作されたポリペプチドの使用であって、操作されたポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、自己会合性四量体化ドメイン(TD)をさらに含む、操作されたポリペプチドの使用。
41.単量体、二量体または三量体との混合物ではない複数の四量体を産生するための、ポリペプチドの四量体の製造方法における自己会合性四量体化ドメイン(TD)の使用。
42.単量体、二量体または三量体との混合物ではない複数の四量体を産生するための、タンパク質ドメインまたはペプチドの複数のコピーを含むポリペプチドの四量体の製造方法における、操作されたポリペプチドの使用であって、操作されたポリペプチドが、該タンパク質ドメインまたはペプチドの1つ以上のコピーを含み、自己会合性四量体化ドメイン(TD)をさらに含む、操作されたポリペプチドの使用。
43.四量体の収量が、単量体および/または二量体の収量の少なくとも10倍である、項目39~42のいずれか1つに記載の使用。
44.この方法で産生される四量体:産生される単量体および/または二量体の比が、少なくとも90:10である、項目39~43のいずれか1つに記載の使用。
45.各単量体が、40kDa以下のサイズを有する、項目39~44のいずれか1つに記載の使用。
46.各四量体が150kDa以下のサイズを有する、項目39~45のいずれか1つに記載の使用。
47.方法が、真核細胞株から四量体を発現することを含む、項目39~46のいずれか1つに記載の使用。
48.pMHC複合体に結合することができる多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体であって、下記の
(a)TCR細胞外ドメインと、
(b)免疫グロブリン定常ドメインと、
(c)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多価ヘテロ二量体可溶性T細胞受容体。
49.多量体免疫グロブリンであって
(i)免疫グロブリン可変ドメインと、
(ii)ETOのNHR2多量体化ドメインと、を含む、多量体免疫グロブリン。
50.可溶性の多量体ポリペプチドを集合化させる方法であって、
(a)ETOのNHR2ドメインに融合された、該多量体ポリペプチドの単量体を提供することと、
(b)該単量体の複数のコピーを会合させ、それにより、多量体可溶性ポリペプチドを得ることと、を含む、方法。
この実施例は、それぞれts-NY-ESO-1 TCRおよびos-NY-ESO-1 TCRと称される四価および八価の可溶性ヘテロ二量体TCR分子を生成する方法を示している。これらのフォーマットは、標的部位での同族リガンドについての溶解性および結合活性に関連する問題を克服する。
ts-NY-ESO-1 TCRおよびos-NY-ESO-1 TCRの機能的発現は、懸濁液に適応したHEK293 EBNA細胞で実行する。HEK293-EBNA細胞を、無血清ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM、2mMのL-グルタミンを有する高グルコース(4.5G/L))中で、37℃、5%CO2および95%の湿度で培養する。
上清に分泌されたts-NY-ESO-1TCRおよびos-NY-ESO-1TCRタンパク質分子は、ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)によって直接的に分析されるか、タンパク質精製後に分析される。タンパク質サンプルと標準は、還元条件下と非還元条件下の両方で調製される。SDS-PAGEは、Mini-PROTEAN Tetra細胞電気泳動システム(Bio-Rad)でのタンパク質電気泳動用のキャストミニゲルを使用して実施した。クマシーブルー色素を使用して、SDS-PAGEゲルでタンパク質を染色した。
細胞上清からの可溶性ts-NY-ESO-1 TCRおよびos-NY-ESO-1 TCRは、2段階で精製される。最初の工程では、固定化金属親和性クロマトグラフィー(IMAC)を、ニッケルを充填されたニトリロ三酢酸(NTA)アガロース樹脂(HisPur Ni-NTAスーパーフローアガロース-Thermo fisher)とともに使用する。結合および洗浄緩衝液は、低濃度のイミダゾール(10~25mM)を含有するpH7.2のトリス緩衝食塩水(TBS)からなる。IMACカラムからのHisタグ付きts-NY-ESO-1TCRおよびos-NY-ESO-1TCRの溶出および回収は、高濃度のイミダゾール(>200mM)で洗浄することによって達成される。溶出したタンパク質画分をSDS-PAGEで分析し、目的のタンパク質を含む画分をプールする。プールされたタンパク質画分は、結合アッセイで直接使用されるか、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を伴う2番目の工程でさらに精製する。Superdex200増加の事前充填カラム(Gelifesciences)は、単量体、オリゴマー、および標的タンパク質の凝集形態を分離するために使用される。
ts-NY-ESO-1 TCRおよびos-NY-ESO-1 TCRのpMHCへの特異的結合および親和性分析は、BIAcoreを使用して実行される。簡単に説明すると、精製されたヒスチジンタグ付きts-NY-ESO-1 TCRおよびos-NY-ESO-1 TCRタンパク質は、ニトリロ三酢酸(NTA)のNi2+キレート化を介してセンサー表面に捕捉される。NY-ESO pep(SLLMWITQV)-MHC(ProImmune)を含有するさまざまな濃度の分析物を注入し、結合シグナルをモニターした。
ts-NY-ESO-1 TCR-IL2およびos-NY-ESO-1 TCR-IL2タンパク質複合体の発現に必要とされるドメインをコードするDNAを合成し、上記のように発現ベクターpTT5にクローニングする。ts-NY-ESO-1 TCR-IL2およびos-NY-ESO-1 TCR-IL2のTCRαβ鎖内のドメインの概略図を図7および8に示し、アミノ酸配列を図9および10に示す。
簡単に説明すると、従来の遺伝子工学技術を使用して、Quad16(図14および15)をコードするHEK293-T細胞株を作製し、Quad17(図14および15)をコードする別のHEK293-T細胞株を作製した。
発現ベクター
すべてのDNAフラグメントは、Twist Bioscience(California)によって合成され、発現ベクターpEF/myc/cyto(Invitrogen)にクローン化された。合成されたDNAフラグメントおよびQuadポリペプチドの概略図ならびに配列を図21に示し、本明細書の配列表に示す。
Twist Bioscienceによって合成された凍結乾燥プラスミドDNAを、MQ水を用いて50ng/μlの濃度に再懸濁した。従来の熱ショック法を使用して、50ngのDNAを50μlのコンピテントDH5α細胞に形質転換した。細胞を100μg/mLアンピシリンを含有するLB寒天プレートにプレーティングし、37℃で一晩増殖させた。個々のコロニーを選定し、37℃、220rpmで一晩増殖させた。DNAは、QIAprep Spin Miniprep Kitを製造元の指示(Qiagen)に従って使用して、細胞から精製した。
簡単に説明すると、HEK293T細胞は、10%のFBSおよびPen/Strepを添加した高グルコースDMEMで維持された。細胞を、2ml培地中、6ウェルプレートのウェル当たり6×105細胞で播種し、37℃、5%CO2で一晩接着させた。7.5μlのリポフェクタミン2000を、150μlのOptiMemで希釈し、室温で5分間インキュベートした。プラスミドDNA(2.5μg)を150μlのOptiMemで希釈した。希釈したDNAを希釈したリポフェクタミン2000と組み合わせて、穏やかに混合し、室温で20分間インキュベートした。300μlの複合体を6ウェルプレートの1つのウェルに添加した。分析で培地に無血清が必要な場合、トランスフェクションの6時間後に培地を吸引し、CD293培地と交換した。細胞を、37℃、5%CO2で48時間インキュベートした後、分析した。
・5mlの30%ビス-アクリルアミド
・2.6mlの1.5Mトリス(pH8.8)
・50μlの20%SDS
・100μlの10%APS
・10μlのTEMED
・2.2mlのMQ水
・0.75mlの30%ビス-アクリルアミド
・1.25mlの1.5Mトリス(pH8.8)
・25μlの20%SDS
・50μlの10%APS
・5μlのTEMED
・2.9mlのMQ水
TCR-NHR2 TD融合タンパク質は、実施例4において、HEK293T細胞では細胞内で発現されることが示された。ここでも、Quad3、4、12、および13が、これらの融合タンパク質の可溶性発現を実証するために使用された。上記のように、Quad3、4、12、および13をHEK293T細胞にトランスフェクトし、細胞上清からの可溶性タンパク質を濃縮した。簡単に説明すると、トランスフェクションの48時間後に培地を回収し、2,000rpmで5分間遠心分離して、細胞または破片を全て除去した。典型的には、500μlの培地は、MWCOが10kDaのAmicon(商標)Ultra0.5遠心ユニットを使用して100μlに濃縮された。25μlのp5×SDSローディング緩衝液をサンプルに添加し、ゲル/ウエスタンブロット分析の前に95℃で5分間インキュベートした。濃縮したタンパク質サンプルをSDS-PAGEゲルで分離し、Amersham Hybondの0.45μMのPVDF膜に転写した。ウエスタンブロッティングおよびタンパク質検出は、上記の方法を使用して抗ヒトIgG HRPを使用して行われた。
NHR2 TDの多様性をさらに例示するため、HEK293T細胞での発現を試験するために、NHR2 TDに融合したいくつかの異なる抗体フラグメントフォーマットを構築した。
NHR2 TDは、ETOの四量体複合体へのオリゴマー化を担っている。NHR2 TDドメインを使用すると、実施例4~6に示すように、発現に影響を与えることなく、結合ドメインとエフェクター分子とを、N末端またはC末端、あるいはN末端とC末端の両方に融合させることができる。結合ドメインは、TCR可変および定常ドメイン、抗体および抗体フラグメント、またはIL2などのエフェクター分子であり得る。NHR2 TDは細胞内で発現するタンパク質の一部であり、本来は細胞内でのみ発現するにもかかわらず、NHR2 TDと融合すると可溶性フォーマットでタンパク質を発現することも可能である(図18)。
方法
発現ベクター
すべてのDNAフラグメントは、Twist Bioscience(California)によって合成され、発現ベクターpEF/myc/cyto(Invitrogen)にクローン化された。合成されたDNAフラグメントの概略図および配列を、それぞれ図22および表8~10に示す。
Twist Bioscienceによって合成された凍結乾燥プラスミドDNAを、MQ水を用いて50ng/μlの濃度に再懸濁した。コンピテントE.coliのDH5α細胞は、従来のヒートショック法を使用して50ngのDNAで形質転換された。形質転換細胞を100μg/mLアンピシリンを含有するLB寒天プレートにプレーティングし、37℃で一晩増殖させた。個々のコロニーを選定し、LBブロス中で37℃、220rpmで一晩増殖させた。プラスミドDNAは、Qiagenプラスミド抽出キット、を製造元の指示(Qiagen)に従って使用して、細胞から精製した。
Expi293F(商標)細胞(Thermo Fisher Scientific)を、Expi293(商標)発現培地(Thermo Fisher Scientific)中で、製造元の推奨に従って培養した。唯一の例外は、細胞が分裂し、非通気キャップを使用した場合、5%CO2をフラスコに直接添加したことであった。
4000rpmで10分間の遠心分離により細胞を回収した。約30mlの上清を0.22μmのフィルタで濾過し、カラムへの結合を促進するためのComplete(商標)EDTAフリープロテアーゼ阻害剤(Roche)を含有する結合緩衝液(50mMのHEPES、pH7.4、250mMのNaCl、20mMのイミダゾール)で50mlに希釈した。1mlのHisTrap(商標)HPカラム(GE Healthcare)をAKTA Start(GE Healthcare)に接続し、結合緩衝液で事前に平衡化した。タンパク質含有培地を、1ml/分の流速を使用してカラムに充填した。カラムを>10CVの結合緩衝液で洗浄した後、12ml超の20~300mMのイミダゾールグラジエントを使用してタンパク質を溶出した。0.5mlの画分を採集し、SDS-PAGEで分析した。タンパク質含有画分をプールし、Amicon登録商標超遠心フィルターユニット(Millipore)を使用して濃縮した。
変性条件下でSDS-PAGEで分離することにより、精製されたタンパク質を分析した。典型的には、1レーンあたり1~2μgの精製タンパク質をSDS-PAGEゲルに装填した。ゲルは、0.1%SDSを含むトリス-グリシン緩衝液で泳動させた。150ボルトの定電圧を使用し、染料フロントが完全に移動するまでゲルを約70分間泳動させた。
・5mlの30%ビス-アクリルアミド
・2.6mlの1.5Mトリス(pH8.8)
・50μlの20%SDS
・100μlの10%APS
・10μlのTEMED
・2.2mlのMQ水
・0.75mlの30%ビス-アクリルアミド
・1.25mlの1.5Mトリス(pH8.8)
・25μlの20%SDS
・50μlの10%APS
・5μlのTEMED
・2.9mlのMQ水
精製されたQuadタンパク質がその標的タンパク質に結合する可能性を、結合ELISAを方向付けることによって確認した。簡単に説明すれば、高結合96ウェルプレート(Corning)を、組換え標的タンパク質をコーティングするために使用し(PBS中で1~5ug/mlに希釈するか、または指示されたように希釈)、これを、典型的には、4℃で一晩保存した。次いで、プレートを200ulの洗浄緩衝液(PBS+0.1%のTween)で3回洗浄し、200ulのブロッキング緩衝液(PBS+1%のBSA)を使用して室温で1時間遮蔽した。精製されたタンパク質サンプルは典型的には、希釈緩衝液(PBS+0.1%のBSA)で連続希釈され、100ul/ウェルで添加される。サンプルを室温で1時間インキュベートした後、200ulの洗浄緩衝液を使用してプレートを再度3回洗浄する。製造元の推奨に従って希釈した抗His HRP(Abcam)検出抗体を添加し、室温で1時間インキュベートする。プレートを最後に3×200ulの洗浄緩衝液を使用して洗浄し、ウェル当たり50ulの予熱した検出試薬(TMB-Sigma)を添加し、プレートを暗所で10~30分間インキュベートする。25ul/ウェルの1Mの硫酸を添加することにより反応を停止させる。CLARIOstarマイクロプレートリーダー(BMG Labtech)を使用して、450nmでの吸光度を読み取った。
この実施例では、p53四量体化ドメインに融合した抗体可変フラグメント(dAb)(VHまたはVL、VκまたはVλ)の単一ドメインが融合した多量体フォーマット(「Quad」フォーマット)が例示されている。
二重特異性四価dAb Quadは、2つの異なるdAb結合ドメインがN末端およびC末端を介してp53四量体化ドメインに連結され、図22-C(すなわち、図22Aの実施形態C)に概略的に示されるように、この実施例で例示されている。
この実施例では、2つの異なる標的のscFv結合ドメインが選択され、p53四量体化ドメインのN末端に個別に接続されて、図22-D(すなわち、図22Bの実施形態D)に概略的に示される単一特異性四価scFv Quadが生成される。
この実施例では、scFv結合ドメインの原子価が4(四価)から8(八価)に増加した。これは、図22-Eに概略的に示されているように、scFvをp53四量体化ドメインのN末端とC末端の両方に連結することによって達成された。
この実施例では、2つの異なる標的タンパク質に対して特異性を有する2つの異なるscFv結合ドメインが、N末端とC末端を介してp53四量体化ドメインに接続され、図22-Fに概略的に例示されているように二重特異性四価scFv Quadが得られた。
この実施例では、図22-Gに概略的に例示されているように、2つの異なる標的タンパク質に対して特異性を有する2つの異なる結合ドメインフォーマットが、それぞれp53四量体化ドメインのN末端およびC末端に連結された。
この実施例では、scFv結合ドメインがコアヒンジおよび上部ヒンジ領域なしでIgG1 Fcの下部ヒンジ/CH2ドメインに連結され、scFv単量体Ig Fc(scFv-mFc)が生成され、すなわち、ここで、ポリペプチド単量体を使用して多量体が形成されるとき、Fcは別のFcと対合しない。典型的には、コアヒンジ領域に存在するシステイン残基を含むCXXCモチーフは、鎖間ジスルフィド結合の形成に関与する。したがって、コアヒンジ領域を除外することにより、Fc領域は、天然IgG抗体に通常見られる密に詰まったホモ二量体構造を形成することが抑制される。エフェクター機能に必要なFcγ受容体との適切な相互作用を可能にするために、下部ヒンジ/CH2ドメインはそのままの状態保つ。
この実施例では、実施例14に記載される四価単量体Ig scFv Quadの異なるバージョンが構築され、抗CD20 scFv結合ドメインは、p53四量体化ドメインのN末端に直接連結された。下部ヒンジ、CH2およびCH3ドメインを含有するmFcは、p53四量体化ドメインのC末端に直接連結された。このバージョンの四価単量体Ig scFv Quadはバージョン2と称され、図22-Mに概略的に表示されている(すなわち、図22Fに示されている実施形態M)。
八価の二重特異性Quadの特定の実施例では、PD-L1および4-1BBのdAb結合ドメインを、がん治療のための免疫チェックポイント阻害剤と免疫共刺激分子の二重標的化のために使用した。他の例では、dAb結合ドメインは、二重チェックポイント阻害剤の二重特異性多量体(例えば、PD-L1×CTLA-4)または二重チェックポイント阻害剤と免疫共刺激二重特異性多量体(例えば、PD-L1×4-1BB)または二重免疫共刺激二重特異性多量体(例えば、4-1BB×OX40)を提供するための、任意の免疫チェックポイント阻害剤および任意の共刺激分子またはそれらの混合物に特異性を有し得る。
実施例9に詳述されるようなTNFαに対する特異性を有するdAb VHもまた、この実施例において、単量体Ig dAb Quadの2つの新しいバージョンを生成するために使用された。第1のバージョンでは、抗TNFα dAb VHがIgG CH1に直接連結された。CH1領域は、コアヒンジが除去されるようにヒンジ領域が改変されたIgG1 Fcに連結された(配列番号168ヒンジ配列が使用された)。Fc領域はp53 TDドメインのN末端に連結しており、Quad92を生じた。Q92におけるCH1領域の存在は、Q92がカッパ軽鎖定常ドメインに接続された抗TNFα dAbと共発現させたときに、図33Aに概略的に示されているような八価の抗TNFα Fab様dAb単量体Ig Quad(Q93)が生成する、単量体Ig Quadの第2バージョンの生成を可能にした。Q92およびQ93の分子設計は、図33BおよびCに概略的に示されている。
この実施例では、実施例14で例示されたものと同様に、2つの異なるバージョンの単量体Ig Quadを生成した。しかしながら、結合ドメインとしてscFvを使用する代わりに、この特定の実施例では、抗体の単一ドメイン(VH)が、PDL1のみ、またはPDL1に加えて4-1BBのいずれかに対する特異性でタンデムに連結された。これらの例の最初の例では、二重特異性八価抗PDL1/4-1BB単量体Ig dAb Quad(Q113)が、抗PDL1 dAbと可撓性のリンカーによって分離された抗4-1BB dAbをタンデムに連結することによって生成された。このタンデム二重特異性結合モジュールは、コアヒンジ領域なしでIgG1 Fcの下部ヒンジ/CH2領域に連結され、タンデムdAb単量体Ig Fc(すなわち、(N末端~C末端方向に)抗PDL1 dAb、抗4-1BB dAb、コアヒンジ領域およびIgG1 CH3なしのIgG1 Fcの下部ヒンジ/CH2領域)を生成した。Fc領域はp53-TDドメインのN末端に連結され、図22Oに概略的に示されるように、二重特異性タンデムdAb単量体Ig Fc Quadを生成した。この例では、抗PDL1ドメインと抗4-1BB dAbドメインの両方の結合価は、それらの標的タンパク質に対して四価であった。これは、Ig Fc領域を含有する多価4+4(八価)二重特異性抗体の例である。2番目の例は、タンデムdAbが八価の抗PDL1単量体Ig Quad(Q114)を生成する抗PDL1 dAbドメインのみで構成されていることを除いて、Q113とまったく同じであった。
この特定の実施例では、単量体IgQuadは、可変重鎖(VH)と可変軽鎖(VL)の天然の対合がそのまま維持されているIgGモノクローナル抗体から生成された。これは、IgGモノクローナル抗体のFabフラグメントを取得し、図22E(図にJとして埋め込まれている)に概略的に示されるように、単量体のIg Quadに変換することによって達成された。このようなQuadフォーマットを例示するために、2つの臨床的に承認されたモノクローナル抗体(アダリムマブ(Humira(商標))およびアベルマブ(Bavencio(商標)))からのFabフラグメントを使用した。HumiraまたはAvelumabのいずれかのVH-CH1ドメインは、コアヒンジ領域無しでIgG1 Fcの下部ヒンジ/CH2領域に連結された。Fc領域はp53-TDドメインのN末端に連結され、単量体のIg Quad鎖を生成した。HumiraおよびアベルマブFab単量体Ig Quadを生成するために、ネイティブ軽鎖VL-CLをHEK293細胞でそれぞれの単量体Ig Quad鎖と共発現させた。
上記の実施例では、抗体フラグメントを使用してQuadを生成した。この特定の実施例では、p53 TDドメインの多様性がさらに実証され、それにより、細胞表面受容体の細胞外ドメインが、その天然リガンドに結合するその能力に影響を与えることなく、Quadフォーマットに多量体化された。これを例示するために、VEGFトラップアフリベルセプト(Eylea(商標))で使用される可溶性細胞外ドメインを、例として使用した。VEGFR1からのIgドメイン2およびVEGFR2からのIgドメイン3を、Eyleaと同様に、実施例17~19に例示されたものと同様に、図36A(Q96)に概略的に示されているように、単量体Ig Quadに連結した。
実施例8と同様に、抗体単一ドメインを使用して、IgG Fcを含まない単一特異性の四価および八価のQuadを生成した(本明細書では、略記により「非Ig」と称される)。抗TNFα dAb VHは、N末端でp53 TDに直接連結して四価のQuad(Q88四価)を生成するか、またはN末端とC末端の両方で図22Aに例示的に示されるような八価の抗TNFα dAb Quad(Q88八価)を生成する(それぞれ、AおよびBとして図に埋め込まれている)。TDドメインを含まない元の抗TNFα dAbも、一価の対照(Q88一価)として使用するために製造した。分子設計を図37Aに模式的に示しし、これは、これらのQuadのモジュラー設計も強調している。
多価の概念をさらに四価および八価を超えて拡張するために、12(別名ドデカ、12価もしくは12量体)または16(本明細書ではヘキサデカ、16価もしくは16量体)抗TNFα dAb結合ドメインのいずれかを有する、抗TNFα dAb Quadの2つのさらなるフォーマットを、非Igフォーマットで生成した。これらのQuadのモジュラー設計および構造配置を、図38AおよびBに概略図に示す。
実施例19では、四価のHumira Fab単量体Ig Quadの生成が例示された。この特定の実施例では、完全な軽鎖(LC)と重鎖(HC)を含むが、Fc領域を含まない(非Igバージョン)、Humira Fabを生成した。p53 TDドメインは、ヒンジ領域がコアヒンジを欠くように改変されたHumira HC CH1ドメインのC末端で連結された(すなわち、コアのない上部ヒンジ配列または下部ヒンジ配列;配列番号183が使用された)。この改変HCと天然Humira LCとの共発現により、Humira Fab単量体Ig-TDバージョンと比較して分子サイズが大幅に縮小された四価のHumira Fab-TDの生成が可能になった。Humira Fab-TDの概略構造図を図40Aに示す。「非Ig」多量体は、開始単量体ビルディングブロックがFcを含有する「Ig様」多量体で想定されたように、開始単量体ブルディングブロックがFcを含有しないQuad多量体を指す。
上記の実施例では、抗体からのFabは、Ig様(実施例19)または非Ig様(実施例23)のいずれかとして四価のQuadを生成するために使用された。Fab Quadをさらに繰り返して、Ig様または非Ig様のいずれかの八価の原子価を有するFabを生成することができる。
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配列番号163:APELLGGPSV
配列番号164:PAPELLGGPSV
配列番号165:APPVAGPSV
配列番号166:PAPPVAGPSV
配列番号167:EPKSCDKTHTPAPELLGGPSV
配列番号168:EPKSCDKTHTAPELLGGPSV
配列番号169:ERKCCVEPAPPVAGPSV
配列番号170:ERKCCVEAPPVAGPSV
配列番号171:ELKTPLGDTTHTPAPELLGGPSV
配列番号172:ELKTPLGDTTHTPAPELLGGPSV
配列番号173:EPKSCDTPPPPAPELLGGPSV
配列番号174:EPKSCDTPPPAPELLGGPSV
配列番号175:APEFLGGPSV
配列番号176:PAPEFLGGPSV
配列番号177:ESKYGPPPAPEFLGGPSV
配列番号178:ESKYGPPAPEFLGGPSV
配列番号179:Humira軽鎖(表18を参照)
配列番号180:CPPC
配列番号181:CPRC
配列番号182:CPSC
配列番号183:EPKSCDKTHT
配列番号184:ERKCCVE
配列番号185:ELKTPLGDTTHT
配列番号186:EPKSCDTPPP
配列番号187:ESKYGPP
配列番号188(Quad68ヌクレオチド配列)
ATGGGTTGGAGTTGTATAATTCTCTTCCTCGTCGCTACTGCTACTGGTGTTCATTCTGAGGTCCAATTGTTGGAGTCCGGCGGCGGCGAGGTGCAACCAGGTGGTTCACTCCGGTTGAGTTGCGCCGCGTCAGGCGGGATTTTCGCGATTAAACCAATATCATGGTATAGGCAAGCGCCCGGGAAACAACGCGAATGGGTGTCTACTACCACCAGTTCCGGGGCGACTAACTATGCGGAATCAGTAAAAGGGCGCTTTACAATATCTCGCGATAATGCGAAGAATACTTTGTATTTGCAAATGTCATCTCTCAGGGCGGAAGACACTGCTGTTTATTATTGTAATGTCTTTGAATACTGGGGTCAAGGTACGTTGGTGACTGTTAAGCCCGGTGGCAGTGGCGGCTCAGAGGTTCAACTCCTTGAATCCGGAGGAGGTGAGGTCCAACCAGGCGGAAGTCTCCGCCTTTCATGCGCAGCGTCCGGGTTTAGTTTCTCCATTAACGCAATGGGATGGTATCGCCAAGCACCGGGTAAAAGGCGCGAGTTCGTTGCTGCTATTGAATCAGGTAGGAACACGGTTTACGCTGAATCCGTCAAAGGGCGATTTACAATATCCCGTGATAATGCGAAGAATACAGTTTATTTGCAAATGAGTTCACTCAGGGCAGAAGACACGGCGGTTTATTACTGTGGACTGCTTAAAGGAAATCGGGTCGTCTCCCCCTCTGTCGCGTACTGGGGACAAGGAACCCTCGTGACCGTTAAACCCAAGAAGAAACCTCTCGATGGGGAGTACTTCACTCTCCAAATTCGAGGTAGGGAGAGGTTTGAAATGTTTAGGGAACTCAATGAAGCTCTCGAGCTTAAAGACGCGCAAGCTGGTAAGGAACCAGGGCATCATCACCATCATCAT
配列番号189(Quad69ヌクレオチド配列)
ATGGGATGGTCCTGTATTATACTCTTCTTGGTCGCAACCGCGACCGGGGTACATAGTGAGGTTCAACTCTTGGAGAGCGGCGGCGGCGAGGTCCAACCCGGTGGTTCACTCAGGTTGTCCTGCGCAGCAAGTGGCGGAATTTTCGCGATTAAACCTATTTCATGGTATAGGCAAGCTCCCGGGAAACAACGCGAATGGGTCTCAACAACGACTTCATCTGGAGCTACAAACTATGCTGAATCAGTTAAAGGTCGCTTTACAATTTCTCGTGATAATGCGAAGAATACTCTCTATCTGCAAATGTCATCATTGAGGGCTGAAGACACTGCTGTCTATTACTGTAATGTATTTGAATACTGGGGACAAGGGACTCTCGTGACCGTTAAGCCCAAGAAGAAACCACTCGATGGAGAGTACTTCACTCTTCAAATACGCGGAAGGGAGCGGTTTGAAATGTTTCGAGAATTGAATGAAGCGTTGGAGTTGAAAGACGCACAAGCTGGCAAGGAACCAGGTGAGGTTCAATTGCTTGAGAGCGGCGGCGGGGAAGTGCAACCAGGCGGTTCCCTCAGATTGAGCTGCGCTGCATCCGGATTTTCCTTTTCAATTAACGCGATGGGTTGGTATCGACAAGCACCCGGGAAACGTCGAGAGTTCGTTGCTGCGATAGAATCTGGAAGGAACACTGTTTACGCTGAAAGTGTTAAAGGAAGGTTTACAATTTCCCGCGATAATGCAAAGAATACAGTCTATCTTCAAATGTCCAGTCTTCGCGCGGAAGACACTGCAGTCTATTACTGTGGTCTTCTCAAAGGGAATAGGGTTGTCTCCCCATCCGTCGCTTACTGGGGACAAGGTACGCTCGTAACTGTCAAACCCCATCATCACCATCATCAT
SEQ配列番号190(アミノ酸配列アミノQuad68)
MGWSCIILFLVATATGVHSEVQLLESGGGEVQPGGSLRLSCAASGGIFAIKPISWYRQAPGKQREWVSTTTSSGATNYAESVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCNVFEYWGQGTLVTVKPGGSGGSEVQLLESGGGEVQPGGSLRLSCAASGFSFSINAMGWYRQAPGKRREFVAAIESGRNTVYAESVKGRFTISRDNAKNTVYLQMSSLRAEDTAVYYCGLLKGNRVVSPSVAYWGQGTLVTVKPKKKPLDGEYFTLQIRGRERFEMFRELNEALELKDAQAGKEPG
配列番号191(Quad69アミノ酸配列)
MGWSCIILFLVATATGVHSEVQLLESGGGEVQPGGSLRLSCAASGGIFAIKPISWYRQAPGKQREWVSTTTSSGATNYAESVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCNVFEYWGQGTLVTVKPKKKPLDGEYFTLQIRGRERFEMFRELNEALELKDAQAGKEPGEVQLLESGGGEVQPGGSLRLSCAASGFSFSINAMGWYRQAPGKRREFVAAIESGRNTVYAESVKGRFTISRDNAKNTVYLQMSSLRAEDTAVYYCGLLKGNRVVSPSVAYWGQGTLVTVKP
Claims (20)
- (a)抗体Fc領域であって、前記Fc領域が、抗体CH2および抗体CH3を含む、抗体Fc領域と、
(b)自己会合性多量体化ドメイン(SAM)と、を含み、
前記CH2が、抗体ヒンジ配列を含み、コアヒンジ領域を欠いている、ポリペプチド。 - 前記CH2が、
(i)コアヒンジCXXCアミノ酸配列であって、式中、Xが、任意のアミノ酸であるか、もしくは各アミノ酸Xが、P、RおよびSから選択される、コアヒンジCXXCアミノ酸配列、ならびに/または
(ii)上部ヒンジアミノ酸配列を欠いている、請求項1に記載のポリペプチド。 - (a)前記CXXC配列が、配列番号180~182から選択されるか、または
(b)前記CH2が、配列番号183~187のアミノ酸配列を欠いている、請求項1(i)に記載のポリペプチド。 - 前記CH2が、
(a)アミノ酸配列APELLGGPSV(配列番号:163)、またはPAPELLGGPSV(配列番号:164)、
(b)アミノ酸配列APPVAGPSV(配列番号:165)、またはPAPPVAGPSV(配列番号:166)、
(c)アミノ酸配列APEFLGGPSV(配列番号:175)、またはPAPEFLGGPSV(配列番号:176)、
(d)アミノ酸配列EPKSCDKTHT[P]APELLGGPSV(配列番号:167、または168)(括弧で囲まれたPは任意である)、
(e)アミノ酸配列ERKCCVE[P]APPVAGPSV(配列番号:169、または170)(括弧で囲まれたPは任意である)、
(f)アミノ酸配列ELKTPLGDTTHT[P]APELLGGPSV(配列番号:171、または172)(括弧で囲まれたPは任意である)、
(g)アミノ酸配列EPKSCDTPPP[P]APELLGGPSV(配列番号:173、または174)(括弧で囲まれたPは任意である)、あるいは
(h)アミノ酸配列ESKYGPP[P]APEFLGGPSV(配列番号:177、または178)(括弧で囲まれたPは任意である)を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - 前記CH2およびCH3が、
(a)ヒトIgG1 CH2およびCH3ドメイン、
(b)ヒトIgG2 CH2およびCH3ドメイン、
(c)ヒトIgG3 CH2およびCH3ドメイン、または
(d)ヒトIgG4 CH2およびCH3ドメインを含む、請求項1~4のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - (a)前記CH2ドメインが、ヒトIgG1 CH2ドメインを含み、前記コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号180であり、任意に、前記CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列EPKSCDKTHT(配列番号183)を欠いているか、
(b)前記CH2ドメインが、ヒトIgG2 CH2ドメインを含み、前記コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号180であり、任意に、前記CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列ERKCCVE(配列番号184)を欠いているか、
(c)前記CH2ドメインが、ヒトIgG3 CH2ドメインを含み、前記コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号181であり、任意に、前記CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列ELKTPLGDTTHT(配列番号:185)もしくは上部ヒンジ領域アミノ酸配列EPKSCDTPPP(配列番号:186)を欠いているか、または
(d)前記CH2ドメインが、ヒトIgG4 CH2ドメインであり、前記コアヒンジ領域アミノ酸配列が、配列番号182であり、任意に、前記CH2が、上部ヒンジ領域アミノ酸配列ESKYGPP(配列番号187)を欠いている、請求項1~5のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - 前記ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)前記Fc領域および前記SAMを含み、前記Fc領域が、(N末端からC末端の方向に)前記ヒンジ配列、CH2ドメインおよびCH3ドメインを含む、請求項1~6のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、1つ以上のエピトープ結合部位を含み、任意に、第1のエピトープに特異的に結合することができる抗体可変ドメインを含む、請求項1~7のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記可変ドメインが、抗体単一可変ドメイン、VHおよびVLから選択されるか、または、前記ドメインが、scFvによって構成されている、請求項8に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)
(a)前記可変ドメイン、前記SAMおよび前記Fc領域、
(b)前記Fc領域、前記SAMおよび前記可変ドメイン、
(c)前記可変ドメイン、前記Fc領域および前記SAM、
(d)前記SAM、前記可変ドメインおよび前記Fc領域、または
(e)前記SAM、前記Fc領域および前記可変ドメインを含む、請求項8または9に記載のポリペプチド。 - 前記SAMのN末端またはC末端に第2の抗体可変ドメインを含み、前記第2の可変ドメインが、第2のエピトープに特異的に結合することができ、前記第1および第2のエピトープが、同一または異なる、請求項8、9または10に記載のポリペプチド。
- 前記SAMが、自己会合性四量体化ドメイン(TD)であり、任意に、前記TDが、p53、p63もしくはp73 TDまたはそれらのホモログもしくはオルソログであるか、あるいは、前記TDが、NHR2 TDまたはそのホモログもしくはオルソログであるか、あるいは、前記TDが、配列番号10または126と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項1~11のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- (i)前記ポリペプチドが(N末端からC末端の方向に)、
A.第1の抗体単一可変ドメイン(dAb)、任意のリンカー、および前記SAM、
B.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、前記SAMおよび第2の抗体単一可変ドメイン、
C.第1のscFv、任意のリンカーおよび前記SAM、
D.第1のscFv、任意のリンカー、前記SAMおよび第2のscFv、
E.第1の抗体単一可変ドメイン、任意のリンカー、前記SAMおよび第1のscFv、
F.第1のscFv、任意のリンカー、前記SAMおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
G.第1の抗体可変ドメイン、任意の第1のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカー、および前記SAM、
H.前記SAM、任意のリンカーおよび第1の抗体単一可変ドメイン、
I.前記SAM、任意のリンカーおよび第1のscFv、
J.前記SAM、任意のリンカー、第1の抗体定常ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体可変ドメイン、もしくは
K.前記SAM、任意のリンカー、第1の抗体可変ドメイン、第2の任意のリンカーおよび第1の抗体定常ドメイン、を含むか、
または
(ii)前記ポリペプチドが、(N末端からC末端の方向に)、
A.dAbおよび前記SAM、
B.第1のdAb、前記SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよび前記SAM、
D.第1のscFv、前記SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、前記SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、前記Fc領域および前記SAM、
G.第1のscFv、前記Fc領域および前記SAM、
H.VH、CH1、前記Fc領域および前記SAM、
I.VL、CL、前記Fc領域および前記SAM、
J.dAb、前記SAMおよび前記Fc領域、
K.scFv、前記SAMおよび前記Fc領域、
L.VH、CH1、SAMおよびFc領域、
M.VL、CL、前記SAMおよび前記Fc領域、
N.第1のdAb、第2のdAbおよび前記SAM、
O.VH、CH1および前記SAM、
P.VL、CLおよび前記SAM、
Q.VH、CH1、前記SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、前記SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、前記SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、前記SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、前記SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域および前記SAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第1のscFv、もしくは
AA.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域、前記SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、を含むか、
または
(iii)前記ポリペプチドが、(C末端からN末端の方向に)、
A.dAbおよび前記SAM、
B.第1のdAb、前記SAMおよび第2のdAb、
C.第1のscFvおよび前記SAM、
D.第1のscFv、前記SAMおよび第2のscFv、
E.第1のscFv、前記SAMおよび第1のdAb、
F.第1のdAb、前記Fc領域および前記SAM、
G.第1のscFv、前記Fc領域および前記SAM、
H.VH、CH1、前記Fc領域、および前記SAM、
I.VL、CL、前記Fc領域および前記SAM、
J.dAb、前記SAMおよび前記Fc領域、
K.scFv、前記SAMおよび前記Fc領域、
L.VH、CH1、前記SAMおよびFc領域、
M.VL、CL、前記SAMおよび前記Fc領域、
N.第1のdAb、第2のdAbおよび前記SAM、
O.VH、CH1および前記SAM、
P.VL、CLおよび前記SAM、
Q.VH、CH1、前記SAMおよび第1のdAb、
R.VL、CL、前記SAMおよび第1のdAb、
S.第1のdAb、第2のdAb、前記SAMおよび第3のdAb、
T.第1のdAb、第2のdAb、前記SAMおよび第1のscFv、
U.第1のdAb、第2のdAb、前記SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、
V.第1のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第2のdAb、
W.第1のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第1のscFv、
X.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域および前記SAM、
Y.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第3のdAb、
Z.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域、前記SAMおよび第1のscFv、もしくは
AA.第1のdAb、第2のdAb、前記Fc領域、前記SAM、第3のdAbおよび第4のdAb、を含む、請求項1~12のいずれか一項に記載のポリペプチド。 - 請求項1~13のいずれか一項に記載のポリペプチドの多量体(任意に四量体)であって、任意に、前記多量体が、医療用である、多量体。
- 複数の抗体Fc領域の多量体であって、各Fcが、それぞれのポリペプチドによって構成され、別のFc領域と対合せず、任意に、前記多量体が医療用である、多量体。
- 請求項1~15のいずれか一項に記載のポリペプチドまたは多量体を含む薬学的組成物。
- 請求項1~14のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸であって、任意に、前記核酸が、真核細胞またはベクターによって構成される、核酸。
- 抗原の複数のコピーを結合する方法であって、前記方法が、前記コピーを請求項14もしくは15に記載の多量体または請求項16に記載の組成物と組み合わせることを含み、前記コピーが、前記多量体のポリペプチドによって結合されており、任意に、前記方法が、前記抗原コピーに結合した前記多量体を単離することを含む、方法。
- ヒトまたは動物の対象における疾患もしくは状態のリスクを治療または低減する方法であって、前記方法が、請求項16に記載の組成物を、前記対象に投与することを含み、前記組成物に含まれる多量体が、前記対象の標的抗原に特異的に結合し、前記結合が、疾患もしくは状態のリスクの治療または低減を媒介する、方法。
- 前記SAMが自己会合性四量体化ドメイン(TD)である場合の、請求項1~14のいずれか一項に記載の複数のポリペプチドを含む組成物を生成する方法であって、前記方法が、請求項17に記載の真核宿主細胞を提供することと、前記宿主細胞を培養することと、前記ポリペプチドの四量体の前記細胞からの発現および分泌を可能にすることと、任意に、前記四量体を単離または精製することと、を含む、方法。
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