JP2022518478A - 抗pd-l1ダイアボディおよびその使用 - Google Patents

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Abstract

疾患または状態を有する個体におけるPD-L1の分布および発現レベルの決定のための、抗PD-L1ダイアボディ、イメージング剤、方法およびキットが提供される。抗PD-L1ダイアボディ剤、および疾患または障害を処置するための方法もまた提供される。本出願は、抗PD-L1ダイアボディ、標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤、イメージング剤(抗PD-L1ダイアボディ剤を含む)を調製する方法、ならびにイメージング剤を使用したイメージングおよび診断の方法を提供する。本出願は、抗PD-L1ダイアボディを個体中に投与することによって疾患または障害を処置するための方法もまた提供する。

Description

ASCIIテキストファイルでの配列表の提出
ASCIIテキストファイルでの以下の提出の内容は、その全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる:コンピュータ可読形態(CRF)の配列表(ファイル名:792572000540SEQLIST.txt、記録日:2018年12月25日、サイズ:35KB)。
発明の分野
本発明は、ダイアボディ(diabody)、イメージング剤、ならびにPD-L1をイメージングする方法および疾患または状態を処置する方法に関する。
プログラム死(PD)ネットワークには、少なくとも5つの相互作用する分子が関与する:PD-1(プログラム細胞死1)、2つのPD-1リガンド(PD-L1およびPD-L2)、およびPD-L1の2つの阻害性受容体(PD-1およびCD80)。感染に対する炎症応答において末梢組織中のT細胞の活性をモジュレートすることおよび自己免疫を制限することにおけるPD経路の重要な機能は、腫瘍細胞によって、および慢性ウイルス感染の間にはウイルスによって、乗っ取られるようである。PD-L1は、複数の組織起源由来の多くの新たに単離されたヒト腫瘍上で過剰発現される(Dong et al. Nature Medicine 2002; 8:793-800;Romano et al. Journal for Immunotherapy of Cancer 2015; 3:15;Hirano et al. Cancer Research 2005; 65:1089-1096)。PD-L1の発現は、ある特定の型のヒトがんの進行および予後不良と相関している(Wang et al. European journal of surgical oncology: the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology 2015; 41:450-456;Cierna et al. Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology / ESMO 2016; 27:300-305;Gandini et al. Critical reviews in oncology/hematology 2016; 100:88-98;Thierauf et al. Melanoma research 2015; 25:503-509;Taube et al. Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research 2014; 20:5064-5074)。慢性ウイルス感染の間、PD-L1は、多くの組織上で永続的に発現されるが、PD-1は、ウイルス特異的CTL上で上方調節される(Yao et al. Trends in molecular medicine 2006; 12:244-246)。腫瘍誘導性またはウイルス誘導性PD-L1は、T細胞アネルギー、アポトーシス、消耗、IL-10産生、DC抑制、ならびにTreg誘導および拡大増殖を含む、宿主免疫監視の回避を促進するための複数の機構を利用し得る(Zou et al. Nature reviews Immunology 2008; 8:467-477)。
免疫組織化学(IHC)を使用して決定されたPD-L1発現レベルは、黒色腫、腎細胞癌(RCC)、非小細胞肺がん(NSCLC)、転移性結腸直腸がん(mCRC)および転移性去勢抵抗性前立腺がん(mCRPC)を含む複数のがん型に対するPD-1/PD-L1指向性治療の臨床試験において予測的バイオマーカーとして評価されている。IHCによって決定されたより高いレベルのPD-L1を有する患者は、PD-1/PD-L1指向性治療に対する優れた応答を有するようであった。しかし、黒色腫を有するPD-L1陰性患者は、抗PD-1/PD-L1治療に対する耐久性のある応答をなおも得ることができるが、PD-L1陰性NSCLC患者における奏効率は、稀である。
ヒト腫瘍検体におけるIHCによるPD-L1検出の正確さは、複数の因子によって混乱される。28-8、22C3、5H1、MIH1および405.9A11を含む、IHC検出のための多数のPD-L1抗体が利用されている。さらに、Ventana SP142およびVentana SP263アッセイなどの、いくつかの独占所有権のあるコンパニオン診断法が、この分野において開発されている。これらのアッセイの比較成績特徴は、周知ではない。腫瘍微小環境内の不均一なPD-L1発現という既存の問題に加えて、腫瘍試料中のIHCによる「陽性」PD-L1染色の明確な定義の欠如もまた存在する。陽性結果についてのカットオフポイントは、染色された腫瘍細胞のパーセントに基づいて、>1%~>50%の範囲であり得る。さらに、PD-L1は、2つの小さい親水性領域しか含まないので、IHC検出抗体に対する制限された結合部位を有し、このことは、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)検体において古典的に使用される免疫組織化学的アプローチの有効性を低くする。PD-L1上の結合部位の欠如に起因して、IHC抗体は、典型的には、治療的PD-L1抗体と比較して、構造的に独自の部位においてPD-L1に結合する。
さらに、PD-L1は、動的IFNγ発現を介してまたは構成的癌遺伝子活性化を介して細胞膜上で発現される場合にのみ、生物学的に活性である。癌遺伝子で駆動されるPD-L1発現は、炎症で駆動されるPD-L1発現と比較して、病理組織学的および生物学的に別個の実体を示す。後者は、IFNγ媒介性の免疫学的攻撃の部位において限局的に生じるが、癌遺伝子で駆動されるPD-L1発現は、構成的かつ散在性である。IFNγ誘導性のPD-L1発現は、動的バイオマーカーを示し、活発な炎症の部位に存在し、生検試料は、空間および時間における腫瘍免疫微小環境のスナップショットを示す。低酸素を含む、腫瘍代謝微小環境中の他の因子は、PD-L1上方調節を生じ得、HIF1aを介したシグナル伝達に依存する。より小さい腫瘍生検は、適正な腫瘍-免疫界面を欠き得、または生検は、生物学的に適切なPD-L1過剰発現が既に起きた後に、実施され得る。PD-L1自体は、2つの潜在的に臨床的に適切な免疫シナプス - 腫瘍/T細胞界面、ならびにAPC/T細胞界面 - において発現される。腫瘍/T細胞界面について、腫瘍/免疫界面の生検捕捉は、黒色腫におけるIHCによるPD-L1検出における重要な決定因子である。転移性黒色腫を有する患者におけるPD-L1発現を評価する研究では、PD-L1過剰発現黒色腫の96%は、リンパ球浸潤物(TIL)を有したが、PD-L1過剰発現黒色腫の残りの4%は、TILを欠如し、これは、癌遺伝子で駆動されるPD-L1発現をおそらくは示す。さらに、PD-L1陰性試料の22%は、TILに関連し、これは、腫瘍免疫妨害の代替的機構を示している。
PD-L1発現の大多数は、IFNγを分泌する免疫細胞との腫瘍界面において生じ、このことは、PD-L1過剰発現が、TILによる首尾よい腫瘍死滅に対する最初は保護的な応答であり得、時間と共に、免疫抑制的腫瘍環境中に吸収されるようになるという、直観に反した仮説をもたらす。さらに、PD-L1検出のための生検のための適切な部位の選択は、謎のままである。事前処置FFPE原発腫瘍試料は、最も容易に入手可能であり得るが、これらの試料は、特に、暫定的処置が投与された場合、所与の患者中に現在存在する全体的な免疫学的状態を反映していない可能性がある。生検された病変におけるPD-L1発現の非存在は、全身の免疫学的状況を反映していない可能性があり、PD-L1シグナル伝達に依存する疾患の他の部位における治療の有益な効果を捕捉していない可能性がある。要約すると、正確かつ代替的なPD-L1検出剤および方法の必要性が満たされていない。
本明細書で言及される全ての刊行物、特許、特許出願および公開された特許出願の開示は、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
Dong et al. Nature Medicine 2002; 8:793-800 Romano et al. Journal for Immunotherapy of Cancer 2015; 3:15 Hirano et al. Cancer Research 2005; 65:1089-1096 Wang et al. European journal of surgical oncology: the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology 2015; 41:450-456 Cierna et al. Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology / ESMO 2016; 27:300-305 Gandini et al. Critical reviews in oncology/hematology 2016; 100:88-98;Thierauf et al. Melanoma research 2015; 25:503-509 Taube et al. Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research 2014; 20:5064-5074 Yao et al. Trends in molecular medicine 2006; 12:244-246
本出願は、抗PD-L1ダイアボディ、標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤、イメージング剤(抗PD-L1ダイアボディ剤を含む)を調製する方法、ならびにイメージング剤を使用したイメージングおよび診断の方法を提供する。本出願は、抗PD-L1ダイアボディを個体中に投与することによって疾患または障害を処置するための方法もまた提供する。
本出願の一態様は、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、ダイアボディを提供する。一部の実施形態では、Vは、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにVは、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む。一部の実施形態では、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのVならびに第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは各々、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。
本出願の別の態様は、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、ダイアボディを提供する。
本出願の別の態様は、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、ダイアボディを提供する。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、共有結合を介して連結される。一部の実施形態では、共有結合は、第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の共有結合を含む、および/または共有結合は、第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間にある。一部の実施形態では、共有結合は、ジスルフィド結合を含む。一部の実施形態では、ジスルフィド結合、または少なくとも2つのジスルフィド結合のうち1つは、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、2つまたはそれよりも多くの共有結合を介して連結される。一部の実施形態では、2つまたはそれよりも多くの共有結合は、a)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第1の共有結合;およびb)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第2の共有結合を含む。一部の実施形態では、共有結合は、ジスルフィド結合を含む。一部の実施形態では、2つまたはそれよりも多くの共有結合は、少なくとも2つのジスルフィド結合を含む。一部の実施形態では、少なくとも2つのジスルフィド結合は、a)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第1のジスルフィド結合;およびb)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第2のジスルフィド結合を含む。一部の実施形態では、ジスルフィド結合、または少なくとも2つのジスルフィド結合のうち1つは、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチド中のVは、Kabat番号付けシステムに従って、G44C変異および/またはQ105C変異を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチド中のVは、Kabat番号付けシステムに従って、Q100C変異および/またはA43C変異を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q105C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、A43C変異を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第2のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、約1~30アミノ酸の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドは、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチドをさらに含む。一部の実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号35のアミノ酸配列を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1および/または第2のポリペプチドのVは、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1および/または第2のポリペプチドのVは、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドは、タグをさらに含む。一部の実施形態では、タグは、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドのC末端に融合される。一部の実施形態では、タグは、His-タグを含む。一部の実施形態では、タグは、第2のリンカーを介してポリペプチドに融合される。一部の実施形態では、第2のリンカーは、約4~15アミノ酸の長さを有する。一部の実施形態では、第2のリンカーは、GGGGSのアミノ酸配列を含む。
上記ダイアボディのいずれかに従う一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドは、配列番号36~43のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
本出願の別の態様は、上記ダイアボディのいずれかおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を提供する。
本出願の別の態様は、上記ダイアボディのいずれかをコードするポリヌクレオチド(例えば、単一のポリヌクレオチドまたは複数のポリペプチド)を提供する。
本出願の別の態様は、上記ポリヌクレオチドのいずれかを含み、必要に応じて、ポリヌクレオチドと作動するように接続したプロモーターをさらに含む、核酸構築物を提供する。
本出願の別の態様は、上記核酸構築物のいずれかを含むベクターを提供する。
本出願の別の態様は、上記ポリヌクレオチドのいずれか、上記核酸構築物のいずれかまたは上記ベクターのいずれかを含む、単離された宿主細胞を提供する。
本出願の別の態様は、上記ダイアボディのいずれか、上記ポリヌクレオチドのいずれか、上記核酸構築物のいずれか、上記ベクターのいずれかまたは上記宿主細胞のいずれかを含む、培養培地を提供する。
本出願の別の態様は、抗PD-L1ダイアボディを産生する方法であって、a)上記単離された宿主細胞のいずれかを、ダイアボディを発現するのに有効な条件下で培養するステップ;およびb)宿主細胞から、発現されたダイアボディを得るステップ、を含む方法を提供する。
本出願の別の態様は、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、a)個体に、標識化剤(例えば、放射性核種)で標識された上記ダイアボディのいずれかを含むイメージング剤を投与するステップ;およびb)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法を提供する。
本出願の別の態様は、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、a)上記個体におけるPD-L1の分布を決定する方法のいずれかを使用して、個体におけるPD-L1の分布を決定するステップ;およびb)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含む方法を提供する。
本出願の別の態様は、疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、a)上記個体を診断する方法のいずれかを使用して、個体を診断するステップ;およびb)個体がPD-L1について陽性と診断される場合に、個体に、有効量のPD-L1を標的化する治療剤を投与するステップ、を含む方法を提供する。
本出願の別の態様は、疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、個体に、有効量の、上記ダイアボディのいずれかまたは上記医薬組成物のいずれかを投与するステップを含む方法を提供する。
本出願の別の態様は、放射性核種で標識された上記ダイアボディのいずれかを含むイメージング剤を提供する。
本出願の別の態様は、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、a)標識を、上記抗PD-L1ダイアボディのいずれかにコンジュゲートし、それによって、イメージング剤を提供するステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、a)キレート化合物を、上記ダイアボディのいずれかにコンジュゲートして、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートを提供するステップ;b)放射性核種を、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートと接触させ、それによって、イメージング剤を提供するステップ、を含む方法が提供される。
本出願の別の態様は、a)上記ダイアボディのいずれか;およびb)キレート剤、を含むキットを提供する。一部の実施形態では、キットは、放射性核種をさらに含む。
本出願の別の態様は、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、個体に、上記ダイアボディのいずれかおよび標識化剤を含む有効量のイメージング剤を投与するステップ;ならびに個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法を提供する。一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、個体に、上記ダイアボディのいずれかおよび第1のコンジュゲーション部分を含む有効量のダイアボディ剤を投与するステップ;個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物を引き続いて投与するステップであって、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、ステップ;ならびに個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は各々、クリックケミストリー対のメンバーを含み、クリックケミストリーを介して互いにコンジュゲートされる。
図1は、例示的な抗PD-L1 scFvの構築物設計の概略図を示す。
図2は、例示的な抗PD-L1ダイアボディに対応するモノマー形態の概略図を示す。
図3A~3Bは、シリカゲル上でのインスタント薄層クロマトグラフィーを使用して測定した、68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvの収量(図3A)および精製後のscFvの放射化学的純度(図3B)を示す。 同上。
図4A~4Bは、未標識の抗PD-L1 scFvの遮断なし(図4A)または未標識の抗PD-L1 scFvの遮断あり(図4B)の、MC38またはMC38-B7H1細胞への68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvの結合を示す。 同上。
図5A~5Bは、未標識の抗PD-L1 scFvの遮断なし(図5A)または未標識の抗PD-L1-scFvの遮断あり(図5B)の、68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvの注射の1時間後(上パネル)または2時間後(下パネル)の、マウスにおける腫瘍のin vivoイメージング結果を示す。腫瘍を、それぞれマウスの左側腹および右側腹中へのMC38細胞およびMC38-B7H1細胞の事前投与によって誘導した。 同上。
図6A~6Bは、シリカゲル上でのインスタント薄層クロマトグラフィーを使用して測定した、68Ga-NOTA-抗PD-L1ダイアボディの収量(図6A)および精製後のダイアボディの放射化学的純度(図6B)を示す。 同上。
図7A~7Bは、未標識の抗PD-L1ダイアボディの遮断なし(図7A)または未標識の抗PD-L1ダイアボディの遮断あり(図7B)の、MC38またはMC38-B7H1細胞への68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの結合を示す。 同上。
図8A~8Bは、未標識の抗PD-L1ダイアボディの遮断なし(図8A)および未標識の抗PD-L1ダイアボディの遮断あり(図8B)の、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの注射の1時間後(上パネル)または2時間後(下パネル)の、マウスにおける腫瘍のin vivoイメージング結果を示す。腫瘍を、それぞれマウスの左側腹および右側腹中へのMC38細胞およびMC38-B7H1細胞の事前投与によって誘導した。 同上。
図9は、68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvまたは68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの注射の1時間後のイメージングの比較を示す。
本出願は、抗PD-L1ダイアボディ、抗PD-L1ダイアボディ剤、イメージング剤、個体におけるPD-L1の検出のための方法、および疾患または障害を処置するための方法を提供する。本明細書に記載されるダイアボディは、標的PD-L1に対する高い結合親和性を提供し、イメージング剤中に取り込まれると、検出のための高い感度、ならびに標的組織の有効な標的化およびその中への透過を提供する。PD-L1の分布および発現レベルは、イメージング剤が投与された個体のin vivo生イメージングによって決定され得る。
本出願の一態様は、抗PD-L1ダイアボディを提供する。一部の実施形態では、ダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vは、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)Vは、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。
本出願の別の態様は、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を提供する。
本出願の別の態様は、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;およびb)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法を提供する。本出願の別の態様は、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、a)上記方法を使用して、個体におけるPD-L1の分布を決定するステップ;およびb)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含む方法を提供する。
本明細書に記載されるイメージング剤および抗PD-L1ダイアボディまたはダイアボディ剤を含む組成物、キットおよび製造物品、それらを作製する方法、ならびに疾患または状態(例えば、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患)を有する個体を処置する方法もまた提供される。
I.定義
用語「抗体」は、その最も広い意味で使用され、それらが所望の抗原結合活性を示す限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、全長抗体およびそれらの抗原結合性断片が含まれるがこれらに限定されない種々の抗体構造を包含する。
「Fv」は、完全な抗原認識および抗原結合部位を含む最小の抗体断片である。この断片は、緊密に非共有結合的に関連した、1つの重鎖可変領域ドメインおよび1つの軽鎖可変領域ドメインのダイマーからなる。これら2つのドメインのフォールディングから、抗原結合のためのアミノ酸残基に寄与し、抗体に抗原結合特異性を付与する6つの超可変ループ(各々重鎖および軽鎖由来の3つのループ)が発する。しかし、単一の可変ドメイン(または抗原に対して特異的な3つのCDRのみを含むFvの半分)であっても、結合部位全体よりも低い親和性でではあるが、抗原を認識しそれに結合する能力を有する。
「sFv」または「scFv」とも短縮される「単鎖Fv」は、単一のポリペプチド鎖へと接続されたV抗体ドメインおよびV抗体ドメインを含む抗体断片である。一部の実施形態では、scFvポリペプチドは、抗原結合のための所望の構造をscFvが形成することを可能にする、VドメインとVドメインとの間のポリペプチドリンカーをさらに含む。scFvの概説については、Plueckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)を参照のこと。
本明細書に記載される「ダイアボディ(単数または複数)」は、2つのscFvポリペプチドを含む複合体を指す。一部の実施形態では、VドメインおよびVドメインの鎖内対合ではなく鎖間対合が達成され、二価断片、即ち、2つの抗原結合部位を有する断片を生じる。
本明細書で使用される場合、用語「CDR」または「相補性決定領域」は、重鎖および軽鎖の両方のポリペプチドの可変領域内に見出される非連続の抗原組み合わせ部位を意味することが意図される。これらの特定の領域は、Kabat et al., J. Biol. Chem. 252:6609-6616 (1977);Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, ”Sequences of proteins of immunological interest” (1991);Chothia et al., J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987);Al-Lazikani B. et al., J. Mol. Biol., 273: 927-948 (1997);MacCallum et al., J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996);Abhinandan and Martin, Mol. Immunol., 45: 3832-3839 (2008);Lefranc M.P. et al., Dev. Comp. Immunol., 27: 55-77 (2003);およびHonegger and Pluckthun, J. Mol. Biol., 309:657-670 (2001)によって記載されており、これらの文献中で、定義は、互いに対して比較した場合、アミノ酸残基の重複またはサブセットを含む。それにもかかわらず、抗体もしくはグラフト抗体またはそれらのバリアントのCDRを指すためのいずれかの定義の適用は、本明細書で定義され使用される用語の範囲内であることが意図される。上で引用した参考文献の各々によって定義されるCDRを包含するアミノ酸残基は、比較として、以下の表1に示される。CDR予測アルゴリズムおよびインターフェースは、例えば、Abhinandan and Martin, Mol. Immunol., 45: 3832-3839 (2008);Ehrenmann F. et al., Nucleic Acids Res., 38: D301-D307 (2010);およびAdolf-Bryfogle J. et al., Nucleic Acids Res., 43: D432-D438 (2015)を含め、当該分野で公知である。この段落で引用した参考文献の内容は、本発明における使用のためおよび本明細書の1つまたは複数の請求項における可能な包含のために、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
表1: CDR定義
Figure 2022518478000001
残基番号付けは、Kabat et al.、上記の命名法に従う
残基番号付けは、Chothia et al.、上記の命名法に従う
残基番号付けは、MacCallum et al.、上記の命名法に従う
残基番号付けは、Lefranc et al.、上記の命名法に従う
残基番号付けは、Honegger and Pluckthun、上記の命名法に従う
表現「Kabatと同様の可変ドメイン残基番号付け」または「Kabatと同様のアミノ酸位置番号付け」およびそれらの変形形態は、Kabat et al.、上記中の抗体の収集物の重鎖可変ドメインまたは軽鎖可変ドメインのために使用される番号付けシステムを指す。この番号付けシステムを使用すると、実際の直鎖アミノ酸配列は、可変ドメインのFRまたはHVRの短縮またはその中への挿入に対応して、より少ないまたはさらなるアミノ酸を含み得る。例えば、重鎖可変ドメインは、H2の残基52の後ろに単一のアミノ酸挿入物(Kabatに従って残基52a)を含み得、重鎖FR残基82の後ろに挿入された残基(例えば、Kabatに従って残基82a、82bおよび82cなど)を含み得る。残基のKabat番号付けは、抗体の配列の相同性の領域における、「標準的な」Kabat番号付けされた配列とのアラインメントによって、所与の抗体について決定され得る。
本明細書で他に示されない限り、免疫グロブリン重鎖中の残基の番号付けは、Kabat et al.、上記と同様のEUインデックスのものである。「Kabatと同様のEUインデックス」は、ヒトIgG1 EU抗体の残基番号付けを指す。
「フレームワーク」または「FR」残基は、本明細書で定義されるCDR残基以外の可変ドメイン残基である。重鎖または軽鎖中のFR配列FR1、FR2、FR3およびFR4は、一般式:FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4によって定義される。
用語「半合成」は、抗体またはダイアボディに関して、その抗体またはダイアボディが、1つまたは複数の天然に存在する配列および1つまたは複数の天然に存在しない(即ち、合成の)配列を有することを意味する。
非ヒト(例えば、げっ歯類)抗体の「ヒト化」形態は、非ヒト抗体に由来する最低限の配列を含むキメラ抗体である。ほとんどの部分について、ヒト化抗体は、レシピエントの超可変領域(HVR)からの残基が、所望の抗体特異性、親和性および能力を有する、非ヒト種(ドナー抗体)、例えば、マウス、ラット、ウサギまたは非ヒト霊長類の超可変領域からの残基によって置き換えられている、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。一部の例では、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域(FR)残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体中にもドナー抗体中にも見出されない残基を含み得る。これらの改変は、抗体性能をさらに精緻化するためになされる。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つの、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み、ここで、超可変ループの全てまたは実質的に全ては、非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FRの全てまたは実質的に全ては、ヒト免疫グロブリン配列のものである。ヒト化抗体は、必要に応じて、免疫グロブリン定常領域(Fc)、典型的には、ヒト免疫グロブリンのものの、少なくとも一部分もまた含む。さらなる詳細については、Jones et al., Nature 321:522-525 (1986);Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988);およびPresta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)を参照のこと。
本明細書で同定されるポリペプチドおよび抗体配列に関して、「パーセント(%)アミノ酸配列同一性」または「相同性」は、全ての保存的置換を配列同一性の一部として考慮して配列をアラインメントした後の、比較されているポリペプチド中のアミノ酸残基と同一な、候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一性を決定することを目的としたアラインメントは、例えば、公に入手可能なコンピューターソフトウェア、例えば、BLAST、BLAST-2、ALIGN、Megalign(DNASTAR)またはMUSCLEソフトウェアを使用して、当業者の技術範囲内の種々の方法で達成され得る。当業者は、比較されている配列の全長にわたって最大のアラインメントを達成するために必要とされる任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメーターを決定することができる。しかし、本明細書の目的のために、%アミノ酸配列同一性値は、配列比較コンピュータープログラムMUSCLEを使用して生成される(Edgar, R.C., Nucleic Acids Research 32(5):1792-1797, 2004;Edgar, R.C., BMC Bioinformatics 5(1):113, 2004)。
「相同な」は、2つのポリペプチド間または2つの核酸分子間の配列類似性または配列同一性を指す。2つの比較された配列の両方中の位置が、同じ塩基またはアミノ酸モノマーサブユニットによって占められる場合、例えば、2つのDNA分子の各々中の位置がアデニンによって占められる場合、これらの分子は、その位置において相同である。2つの配列間の相同性のパーセントは、比較された位置の数によって除算された、2つの配列によって共有されるマッチするまたは相同な位置の数×100の関数である。例えば、2つの配列中の10個の位置のうち6個がマッチするまたは相同である場合、これら2つの配列は、60%相同である。例として、DNA配列ATTGCCとTATGGCとは、50%の相同性を共有する。一般に、2つの配列が最大の相同性を与えるようにアラインメントされる場合に、比較が行われる。
任意の哺乳動物種由来の抗体(免疫グロブリン)の「軽鎖」は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ(「κ」)およびラムダ(「λ」)と呼ばれる2つの明確に別個の型のうち1つに割り当てられ得る。
用語「エピトープ」は、本明細書で使用される場合、抗体またはダイアボディが結合する抗原上の原子またはアミノ酸の特定の群を指す。2つの抗体または抗体部分は、それらが抗原に対する競合的結合を示す場合、その抗原内の同じエピトープに結合し得る。
本明細書で使用される場合、第1の抗体(例えば、ダイアボディ)は、第1の抗体が、等モル濃度の第1の抗体の存在下で、第2の抗体の標的抗原結合を少なくとも約50%(例えば、少なくとも約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%または99%のうちいずれか1つ)阻害する場合、標的抗原への結合について、第2の抗体(例えば、ダイアボディ)と「競合」し、逆もまた同様である。それらの交差競合に基づいて抗体を「ビニング」するためのハイスループットプロセスは、PCT公開番号WO03/48731に記載されている。
本明細書で使用される場合、用語「特異的に結合する」、「特異的に認識する」および「~に対して特異的である」は、例えば、生物分子を含む分子の不均一な集団の存在下での標的の存在を決定する、測定可能かつ再現性のある相互作用、例えば、標的と抗体(例えば、ダイアボディ)との間の結合を指す。例えば、ある標的(エピトープであり得る)を特異的に認識する抗体は、他の標的へのその結合よりも、より高い親和性、アビディティで、より迅速に、および/またはより長い持続時間で、この標的に結合する抗体(例えば、ダイアボディ)である。一部の実施形態では、無関係の標的への抗体の結合の程度は、例えば、ラジオイムノアッセイ(RIA)によって測定した場合、標的への抗体の結合の約10%未満である。一部の実施形態では、標的に特異的に結合する抗体は、≦10-5M、≦10-6M、≦10-7M、≦10-8M、≦10-9M、≦10-10M、≦10-11Mまたは≦10-12Mの解離定数(KD)を有する。一部の実施形態では、抗体は、異なる種由来のタンパク質間で保存されている、タンパク質上のエピトープに特異的に結合する。一部の実施形態では、特異的結合は、排他的結合を含み得るが、それを要求するわけではない。抗体または抗原結合ドメインの結合特異性は、当該分野で公知の方法によって、実験的に決定され得る。かかる方法は、ウエスタンブロット、ELISA試験、RIA試験、ECL試験、IRMA試験、EIA試験、BIACORETM試験およびペプチドスキャンを含むがこれらに限定されない。
「単離された」抗体(または構築物)は、同定された、その産生環境(例えば、天然または組換え)の成分から分離および/または回収されたものである。好ましくは、単離されたポリペプチドは、その産生環境由来の全ての他の成分に関連していない。
本明細書に記載される構築物または抗体(例えば、ダイアボディ)をコードする「単離された」核酸分子は、同定され、それが産生された環境においてそれが通常関連する少なくとも1つの夾雑物核酸分子から分離された、核酸分子である。好ましくは、単離された核酸は、産生環境に関連する全ての成分に関連していない。本明細書に記載されるポリペプチドおよび抗体をコードする単離された核酸分子は、天然に見出される形態または状況以外の形態にある。したがって、単離された核酸分子は、細胞中に天然に存在する、本明細書に記載されるポリペプチドおよび抗体をコードする核酸から識別される。単離された核酸には、この核酸分子を通常含む細胞中に含まれる核酸分子が含まれるが、この核酸分子は、染色体外に、またはその天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在する。
核酸は、別の核酸配列と機能的に関連するように配置されている場合、「作動可能に連結」している。例えば、プレ配列もしくは分泌リーダーについてのDNAは、ポリペプチドの分泌に関与するプレタンパク質としてそれが発現される場合、そのポリペプチドについてのDNAに作動可能に連結している;プロモーターもしくはエンハンサーは、コード配列の転写にそれが影響を与える場合、その配列に作動可能に連結している;またはリボソーム結合部位は、翻訳を促進するようにそれが位置付けられている場合、コード配列に作動可能に連結している。一般に、「作動可能に連結した」は、連結されているDNA配列が連続しており、分泌リーダーの場合、連続しておりかつリーディング相(reading phase)にあることを意味する。しかし、エンハンサーは、連続している必要はない。連結は、便利な制限部位におけるライゲーションによって達成される。かかる部位が存在しない場合、合成オリゴヌクレオチドアダプターまたはリンカーが、従来実務に従って使用される。
用語「ベクター」は、本明細書で使用される場合、それが連結される別の核酸を増大させることが可能な核酸分子を指す。この用語には、自己複製性核酸構造としてのベクター、ならびにそれが導入された宿主細胞のゲノム中に組み込まれたベクターが含まれる。ある特定のベクターは、それらが動作可能に連結した核酸の発現を指示することが可能である。かかるベクターは、本明細書で「発現ベクター」と称される。
用語「トランスフェクトされた」または「形質転換された」または「形質導入された」は、本明細書で使用される場合、外因性核酸が宿主細胞中に移入または導入されるプロセスを指す。「トランスフェクトされた」または「形質転換された」または「形質導入された」細胞は、外因性核酸でトランスフェクトされた、形質転換されたまたは形質導入された細胞である。細胞には、初代対象細胞およびその子孫が含まれる。
用語「宿主細胞」、「宿主細胞系」および「宿主細胞培養物」は、相互交換可能に使用され、そのような細胞の子孫を含む、外因性核酸が導入された細胞を指す。宿主細胞には、初代の形質転換された細胞、および継代数にかかわらず、それに由来する子孫を含む、「形質転換体」および「形質転換された細胞」が含まれる。子孫は、核酸内容が親細胞と完全に同一でなくてもよく、変異を含み得る。元々形質転換された細胞においてそれについてスクリーニングまたは選択されるものと同じ機能または生物活性を有する変異体子孫が、本明細書に含まれる。
本明細書で使用される場合、「処置」または「処置する」は、臨床結果を含む有益なまたは所望の結果を得るためのアプローチである。本発明の目的のために、有益なまたは所望の臨床結果には、以下のうち1つまたは複数が含まれるがこれらに限定されない:疾患から生じる1つもしくは複数の症状を軽減すること、疾患の程度を弱めること、疾患を安定化すること(例えば、疾患の悪化を予防もしくは遅延すること)、疾患の伝播(例えば、転移)を予防もしくは遅延すること、疾患の再発を予防もしくは遅延すること、疾患の進行を遅延もしくは緩徐化すること、疾患状態を好転させる(ameliorate)こと、疾患の寛解(部分的もしくは完全な)を提供すること、疾患を処置するために必要な1つもしくは複数の他の薬物療法の用量を減少させること、疾患の進行を遅延すること、生活の質を増加もしくは改善すること、体重増加を増加させること、および/または生存を延長すること。がんの病理学的結果(例えば、腫瘍体積など)の低減もまた、「処置」によって包含される。本発明の方法は、処置のこれらの態様のうち任意の1つまたは複数を企図する。
用語「有効量」は、有益なまたは所望の結果をもたらすのに十分な、薬剤の量を指す。この用語は、本明細書に記載されるイメージング方法のうちいずれか1つによる検出のためのイメージを提供する用量にも適用される。具体的な用量は、以下のうち1つまたは複数に依存して変動し得る:選択された特定の薬剤、従う投薬レジメン、他の化合物と組み合わせて投与されるかどうか、投与のタイミング、イメージングされる組織、およびそれを運搬する物理的送達システム。
用語「対象」、「個体」および「患者」は、本明細書で相互交換可能に使用されて、ヒト、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、げっ歯類または霊長類が含まれるがこれらに限定されない哺乳動物を指す。一部の実施形態では、個体は、ヒトである。
本明細書に記載される本発明の実施形態は、実施形態「からなる」および/または「から本質的になる」を含むことが理解される。
本明細書での、「約」ある値またはパラメーターに対する言及は、その値またはパラメーター自体に対する変形形態を含む(および記載する)。例えば、「約X」に言及する記載は、「X」の記載を含む。
本明細書で使用される場合、ある値またはパラメーター「ではない」に対する言及は、一般に、ある値またはパラメーター「以外」であることを意味し、それを記載する。例えば、方法が、型Xのがんを処置するために使用されない、とは、その方法が、X以外の型のがんを処置するために使用されることを意味する。
本明細書で使用される用語「約X~Y」は、「約X~約Y」と同じ意味を有する。
本明細書で使用される用語「約X、YまたはZ」は、「約X、約Yまたは約Z」と同じ意味を有する。
本明細書および添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形「1つの(a)」、「または」および「この(the)」は、文脈が明確に他を示さない限り、複数形の指示対象を含む。
「コンジュゲートされた」は、本明細書で使用される場合、共有結合的または非共有結合的であり得る、2つのコンジュゲーション部分の特定の関連を指す。
II.抗PD-L1-ダイアボディ
本出願の一態様は、単離された抗PD-L1ダイアボディおよび抗PD-L1ダイアボディ剤を提供する。一部の実施形態では、ダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vは、配列番号1~5のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6~10のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11~13のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約3アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vは、配列番号14~16のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17~19のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20~21のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約3アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのVならびに第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは各々、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1~5のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6~10のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11~13のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5、4、3、2もしくは1アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14~16のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17~19のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20~21のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5、4、3、2もしくは1アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、ダイアボディが提供される。一部の実施形態では、置換は、保存的置換物(conservative substitute)(例えば、表2に開示されるもの)からなる。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、少なくとも2つのジスルフィド結合は、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドのVとVとの間のペプチドリンカーは、約1~30アミノ酸(例えば、約1~15アミノ酸または約15~30アミノ酸)の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドは、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチド(例えば、配列番号35のアミノ酸配列を含むシグナルペプチド)をさらに含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのVならびに第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは各々、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5、4、3、2もしくは1アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5、4、3、2もしくは1アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、ダイアボディが提供される。一部の実施形態では、置換は、保存的置換物(例えば、表2に開示される)からなる。一部の実施形態では、Vは、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにVは、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、少なくとも2つのジスルフィド結合は、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドのVとVとの間のペプチドリンカーは、約1~30アミノ酸(例えば、約1~15アミノ酸または約15~30アミノ酸)の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドは、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチド(例えば、配列番号35のアミノ酸配列を含むシグナルペプチド)をさらに含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのVならびに第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは各々、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、ダイアボディが提供される。一部の実施形態では、結合ドメインは、第1のポリペプチドのVおよびVまたは第2のポリペプチドのVおよびVによって形成される。一部の実施形態では、結合ドメインは、第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、または第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVによって形成される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、少なくとも2つのジスルフィド結合は、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドのVとVとの間のペプチドリンカーは、約1~30アミノ酸(例えば、約1~15アミノ酸または約15~30アミノ酸)の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドは、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチド(例えば、配列番号35のアミノ酸配列を含むシグナルペプチド)をさらに含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、ダイアボディが提供される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、少なくとも2つのジスルフィド結合は、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドのVとVとの間のペプチドリンカーは、約1~30アミノ酸(例えば、約1~15アミノ酸または約15~30アミノ酸)の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドは、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチド(例えば、配列番号35のアミノ酸配列を含むシグナルペプチド)をさらに含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、Vは、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのVならびに第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは各々、PD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成する。
一部の実施形態では、本明細書に記載されるダイアボディの第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、共有結合を介して連結される。一部の実施形態では、共有結合は、第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の共有結合を含む、および/または共有結合は、第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間にある。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、2つまたはそれよりも多くの共有結合を介して連結される。一部の実施形態では、2つまたはそれよりも多くの共有結合は、a)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第1の共有結合;およびb)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第2の共有結合を含む。一部の実施形態では、共有結合は、ジスルフィド結合を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは、少なくとも2つのジスルフィド結合を介して連結される。一部の実施形態では、少なくとも2つのジスルフィド結合は、a)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第1のジスルフィド結合;およびb)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第2のジスルフィド結合を含む。一部の実施形態では、ジスルフィド結合、または少なくとも2つのジスルフィド結合のうち1つは、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチド中のVは、Kabat番号付けシステムに従って、G44C変異またはQ105C変異を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチド中のVは、Kabat番号付けシステムに従って、Q100C変異またはA43C変異を含む。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q105C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、A43C変異を含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、第2のポリペプチドのVおよびVは、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドのVとVとの間のペプチドリンカーは、約1~30アミノ酸の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、約15アミノ酸以下(例えば、15、14、13、12、11、10または9アミノ酸以下)の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、少なくとも約15アミノ酸(例えば、少なくとも約15、18、20、22、25または27アミノ酸)の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、約1~5、5~10、10~15、15~20、20~25、25~30アミノ酸の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、約1~15、2~12、4~10アミノ酸の長さを有する。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドは、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチドをさらに含む。一部の実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号35のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、第1および/または第2のポリペプチドのVは、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、第1および/または第2のポリペプチドのVは、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドは、タグをさらに含む。一部の実施形態では、タグは、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドのC末端に融合される。一部の実施形態では、タグは、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドのN末端に融合される。一部の実施形態では、タグは、His-タグを含む。一部の実施形態では、タグは、第2のリンカーを介してポリペプチドに融合される。一部の実施形態では、第2のリンカーは、約1~30アミノ酸、例えば、約4~15アミノ酸、約4~10アミノ酸の長さを有する。一部の実施形態では、第2のリンカーは、GGGGSのアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドは、配列番号36~43のうちいずれか1つのアミノ酸配列、または配列番号36~43のうちいずれか1つのアミノ酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。
一部の実施形態では、ダイアボディは、酸性pH(例えば、約6.5、6.0、5.5または5.0よりも低いpH)において安定である。一部の実施形態では、ダイアボディは、約55~70C(例えば、約55~60、60~65または65~70℃のうちいずれか1つ)の融解温度(Tm)を有する。
一部の実施形態では、ダイアボディは、ヒト化される。
a)置換、挿入、欠失およびバリアント
一部の実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸置換を有する抗PD-L1ダイアボディバリアントが提供される。置換変異誘発のための目的の部位には、HVR(またはCDR)およびFRが含まれる。例示的な保存的置換は、「好ましい置換」の見出しの下に、表2中に示される。より実質的な変化は、「例示的な置換」の見出しの下に表2中で提供され、アミノ酸側鎖クラスに関して以下にさらに記載される。アミノ酸置換は、所望の活性、例えば、保持/改善された抗原結合、減少した免疫原性、または改善されたADCCもしくはCDCについてスクリーニングされる目的のダイアボディおよび産物中に導入され得る。
表2.アミノ酸置換
Figure 2022518478000002
Figure 2022518478000003
アミノ酸は、共通の側鎖特性に従ってグループ分けされ得る:(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)塩基性:His、Lys、Arg;(5)鎖の配向に影響する残基:Gly、Pro;および(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
非保存的置換は、これらのクラスのうち1つのメンバーを、別のクラスに交換することを必然的に伴う。
置換バリアントの1つの型には、親抗体の1つまたは複数の超可変領域残基を置換することが関与する(例えば、ヒト化ダイアボディ)。一般に、さらなる研究のために選択される得られたバリアント(複数可)は、親抗体と比較して、ある特定の生物特性における改変(例えば、改善)(例えば、増加した親和性、低減された免疫原性)を有する、および/または親抗体の実質的に保持されたある特定の生物特性を有する。例示的な置換バリアントは、例えば、本明細書に記載されるものなどの、ファージディスプレイベースの親和性成熟技法を使用して簡便に生成され得る、親和性成熟された抗体である。簡潔に述べると、1つまたは複数のHVR残基は、変異され、バリアント抗体は、ファージ上にディスプレイされ、特定の生物活性(例えば、結合親和性)についてスクリーニングされる。
変更(例えば、置換)が、例えば、ダイアボディ親和性を改善するために、HVRにおいてなされ得る。かかる変更は、HVR「ホットスポット」、即ち、体細胞成熟プロセスの間に高い頻度で変異を受けるコドンによってコードされる残基(例えば、Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)を参照のこと)、および/またはSDR(a-CDR)においてなされ得、得られたバリアントVまたはVは、結合親和性について試験される。二次ライブラリーを構築しそこから再選択することによる親和性成熟は、例えば、Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O’Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, (2001))に記載されている。親和性成熟の一部の実施形態では、多様性は、種々の方法(例えば、エラープローンPCR、鎖シャッフリングまたはオリゴヌクレオチド指向性変異誘発)のいずれかによって、成熟化のために選択された可変遺伝子中に導入される。次いで、二次ライブラリーが創出される。次いで、ライブラリーは、所望の親和性を有する任意のダイアボディバリアントを同定するためにスクリーニングされる。多様性を導入するための別の方法には、HVR指向性アプローチが関与し、そこでは、いくつかのHVR残基(例えば、一度に4~6残基)がランダム化される。抗原結合に関与するHVR残基は、例えば、アラニンスキャニング変異誘発またはモデリングを使用して、具体的に同定され得る。特に、CDR-H3およびCDR-L3が、しばしば標的化される。
一部の実施形態では、置換、挿入または欠失は、かかる変更が、抗原に結合する抗体の能力を実質的に低減させない限り、1つまたは複数のHVR内に存在し得る。例えば、結合親和性を実質的に低減させない保存的変更(例えば、本明細書で提供される保存的置換)が、HVRにおいてなされ得る。かかる変更は、HVR「ホットスポット」またはCDRの外側であり得る。
変異誘発のために標的化され得る抗体の残基または領域の同定のための有用な方法は、「アラニンスキャニング変異誘発」と呼ばれ、Cunningham and Wells (1989) Science, 244:1081-1085によって記載される。この方法では、抗体と抗原との相互作用が影響を受けるかどうかを決定するために、残基または標的残基の群(例えば、荷電した残基、例えば、Arg、Asp、His、LysおよびGlu)が同定され、中性または負に荷電したアミノ酸(例えば、アラニンまたはポリアラニン)によって置き換えられる。この方法は、本明細書に記載されるダイアボディに適用可能である。さらなる置換が、初回の置換に対する機能的感度を実証するアミノ酸位置において導入され得る。あるいは、またはさらに、抗体と抗原との間の接触点を同定するための、抗原-抗体複合体の結晶構造。かかる接触残基および近隣残基は、置換のための候補として標的化または除外され得る。バリアントは、それらが所望の特性を含むかどうかを決定するためにスクリーニングされ得る。
b)グリコシル化バリアント
一部の実施形態では、ダイアボディは、構築物がグリコシル化される程度を増加または減少させるために変更される。ダイアボディへのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つまたは複数のグリコシル化部位が創出または除去されるようにアミノ酸配列を変更させることによって、簡便に達成され得る。
哺乳動物細胞によって産生されるネイティブ抗体は、典型的には、Fc領域のC2ドメインのAsn297へのN連結によって一般に結合される、分岐鎖の二分岐オリゴ糖(biantennary oligosaccharide)を含む。例えば、Wright et al. TIBTECH 15:26-32 (1997)を参照のこと。オリゴ糖は、二分岐オリゴ糖構造の「幹(stem)」中のGlcNAcに結合した、種々の炭水化物、例えば、マンノース、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、ガラクトースおよびシアル酸、ならびにフコースを含み得る。一部の実施形態では、ダイアボディ中のオリゴ糖の改変は、ある特定の改善された特性を有する抗体バリアントを創出するためになされ得る。
一部の実施形態では、ダイアボディは、Fc領域に(直接的または間接的に)結合したフコースを欠く炭水化物構造を有する。例えば、かかる抗体中のフコースの量は、1%~80%、1%~65%、5%~65%または20%~40%であり得る。フコースの量は、例えば、WO2008/077546に記載されるように、MALDI-TOF質量分析によって測定した場合、Asn297に結合した全ての糖構造(glycostructure)(例えば、複合型、ハイブリッド型および高マンノース型構造)の合計と比較した、Asn297における糖鎖内のフコースの平均量を計算することによって決定される。Asn297は、Fc領域中の約297位(Fc領域残基のEU番号付け)に位置するアスパラギン残基を指す;しかし、Asn297は、抗体における軽微な配列バリエーションに起因して、297位の上流または下流約±3アミノ酸、即ち、294位と300位との間に位置してもよい。かかるフコシル化バリアントは、改善されたADCC機能を有し得る。例えば、米国特許出願公開第2003/0157108号(Presta,L.);同第2004/0093621号(Kyowa Hakko Kogyo Co.,Ltd)を参照のこと。「脱フコシル化」または「フコース欠損」抗体バリアントに関する公報の例には、以下が含まれる:米国特許出願公開第2003/0157108号;WO2000/61739;WO2001/29246;米国特許出願公開第2003/0115614号;米国特許出願公開第2002/0164328号;米国特許出願公開第2004/0093621号;米国特許出願公開第2004/0132140号;米国特許出願公開第2004/0110704号;米国特許出願公開第2004/0110282号;米国特許出願公開第2004/0109865;WO2003/085119;WO2003/084570;WO2005/035586;WO2005/035778;WO2005/053742;WO2002/031140;Okazaki et al. J. Mol. Biol. 336:1239-1249 (2004);Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004)。脱フコシル化抗体を産生することが可能な細胞系の例には、タンパク質フコシル化が欠損したLec13 CHO細胞(Ripka et al. Arch. Biochem. Biophys. 249:533-545 (1986);米国特許出願公開第2003/0157108号A1、Presta,L;およびWO2004/056312 A1、Adamsら、特に実施例11)、およびノックアウト細胞系、例えば、アルファ-1,6-フコシルトランスフェラーゼ遺伝子FUT8ノックアウトCHO細胞(例えば、Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004);Kanda, Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4):680-688 (2006);およびWO2003/085107を参照のこと)が含まれる。
c)ダイアボディ誘導体
一部の実施形態では、本明細書に記載されるダイアボディは、当業者で公知であり容易に入手可能なさらなる非タンパク質性部分を含むようにさらに改変され得る。ダイアボディの誘導体化のために適切な部分には、水溶性ポリマーが含まれるがこれらに限定されない。水溶性ポリマーの非限定的な例には、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ-1,3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか)、およびデキストランまたはポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、ポリプロピレン(propropylene)グリコールホモポリマー、ポリプロピレン(prolypropylene)オキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール、ならびにそれらの混合物が含まれるがこれらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中でのその安定性に起因して、製造における利点を有し得る。ポリマーは、任意の分子量のものであり得、分岐鎖でも非分岐鎖でもよい。ダイアボディに結合されるポリマーの数は、変動し得、1つよりも多くのポリマーが結合される場合、それらは、同じ分子でも異なる分子でもよい。一般に、誘導体化のために使用されるポリマーの数および/または型は、改善されるダイアボディの特定の特性または機能、ダイアボディ誘導体が規定された条件下で診断において使用されるかどうかなどが含まれるがこれらに限定されない検討事項に基づいて決定され得る。
一部の実施形態では、ダイアボディは、1つまたは複数の生物学的に活性なタンパク質、ポリペプチドまたはそれらの断片を含むように、さらに改変され得る。「生理活性」または「生物学的に活性な」は、本明細書で相互交換可能に使用される場合、特定の機能を実行する身体中での生物活性を示すことを意味する。例えば、これは、特定の生体分子、例えば、タンパク質、DNAなどとの組合せを意味し得、次いで、かかる生体分子の活性の促進または阻害を意味し得る。一部の実施形態では、生理活性タンパク質またはその断片には、疾患または状態の予防または処置のための活性薬物物質として患者に投与されるタンパク質およびポリペプチド、ならびに診断試験またはin vitroアッセイにおいて使用される酵素などの、診断目的で使用されるタンパク質およびポリペプチド、ならびにワクチンなどの、疾患を予防するために患者に投与されるタンパク質およびポリペプチドが含まれる。
III.イメージング剤および抗PD-L1ダイアボディ剤
本出願の一態様は、標識化剤(例えば、放射性核種)で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を提供する。このセクションに記載されるイメージング剤のいずれか1つが、本明細書に記載される、PD-L1の分布および/もしくは発現レベルを決定する方法、または診断もしくは処置の方法において使用され得る。
一部の実施形態では、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディ(例えば、本明細書に記載されるダイアボディのいずれか)を含むイメージング剤が提供される。一部の実施形態では、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤であって、ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、イメージング剤が提供される。一部の実施形態では、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤であって、ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、イメージング剤が提供される。一部の実施形態では、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤であって、ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、イメージング剤が提供される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、ダイアボディは、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、キレート化合物は、1,4,7-トリアザシクロノナン-l,4,7-トリス酢酸(NOTA)、1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-1,4,7,10-四酢酸(DOTA)またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、ダイアボディは、非ヒト哺乳動物(例えば、マウス、ラットまたはサル)由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、ダイアボディは、ヒト化される。
一部の実施形態では、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされた抗PD-L1ダイアボディ(例えば、本明細書に記載されるダイアボディのいずれか)を含むイメージング剤が提供される。一部の実施形態では、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされた抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤であって、ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、イメージング剤が提供される。一部の実施形態では、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされた抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤であって、ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、イメージング剤が提供される。一部の実施形態では、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされた抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤であって、ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、イメージング剤が提供される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、ダイアボディは、非ヒト哺乳動物(例えば、マウス、ラットまたはサル)由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、ダイアボディは、ヒト化される。
企図されるダイアボディには、ヒト化ダイアボディ、部分的にヒト化されたダイアボディ、完全にヒト化されたダイアボディ、半合成ダイアボディ、ならびに例えば、「抗PD-L1ダイアボディ」のセクションにおいて本明細書で議論される重鎖および/または軽鎖CDRを含むダイアボディが含まれるがこれらに限定されない。
一部の実施形態では、ダイアボディは、ヒト由来のPD-L1を特異的に認識する。一部の実施形態では、ダイアボディは、2つまたはそれよりも多くの種由来のPD-L1と交差反応する。モデル動物およびヒトとのダイアボディの交差反応性は、イメージング剤の臨床研究を促進する。一部の実施形態では、ダイアボディは、非ヒト動物、例えば、哺乳動物由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、ダイアボディは、げっ歯類、例えば、マウスまたはラット由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、ダイアボディは、非ヒト霊長類、例えば、カニクイザル由来のPD-L1と交差反応する。
放射性核種
本明細書に記載されるイメージング剤は、標識化剤を含む。診断目的のために、標識化剤は、放射性核種、放射線造影剤、常磁性イオン、金属、蛍光標識、化学発光標識、超音波造影剤および光活性剤であり得る。かかる診断標識は周知であり、任意のかかる公知の標識が使用され得る。
一部の実施形態では、イメージング剤は、放射性核種を含む。「放射性核種」は、「放射活性同位体」または「放射性同位体」と称される場合が多い。本明細書に記載される抗体部分に結合され得る例示的な放射性核種または安定な同位体には、110In、111In、177Lu、18F、52Fe、62Cu、64Cu、67Cu、67Ga、68Ga、86Y、90Y、89Zr、94mTc、94Tc、99mTc、120I、123I、124I、125I、131I、154-158Gd、32P、11C、13N、15O、186Re、188Re、51Mn、52mMn、55Co、72As、75Br、76Br、82mRb、83Sr、または他のガンマ放射体、ベータ放射体もしくは陽電子放射体が含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。
使用される常磁性イオンには、クロム(III)、マンガン(II)、鉄(III)、鉄(II)、コバルト(II)、ニッケル(II)、銅(II)、ネオジム(III)、サマリウム(III)、イッテルビウム(III)、ガドリニウム(III)、バナジウム(II)、テルビウム(III)、ジスプロシウム(III)、ホルミウム(III)またはエルビウム(III)が含まれ得る。金属造影剤には、ランタン(III)、金(III)、鉛(II)またはビスマス(III)が含まれ得る。放射線不透過性診断剤は、化合物、バリウム化合物、ガリウム化合物およびタリウム化合物から選択され得る。フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン(phycoe1ytherin)、フィコシアニン、アロフィコシアニン、o-フタルアルデヒド(ophthaldehyde)およびフルオレスカミンが含まれるがこれらに限定されない広範な種々の蛍光標識が、当該分野で公知である。使用される化学発光標識には、ルミノール、イソルミノール、芳香族アクリジニウムエステル、イミダゾール、アクリジニウム塩またはシュウ酸エステルが含まれ得る。
放射免疫検出(RAID)は、過去35年の間に、臨床的に有用な分野として浮上してきた。RAIDを使用するほぼ1000の臨床試験が、いくらかの明確かつ重要な知見を伴って、この期間の間実施されてきた。従来のイメージングによって「潜在性」とみなされた病変を検出するためのこの技法のより高い能力は、初期の研究においてさえ認識されており、抗体、腫瘍または放射性核種の型にかかわらず、研究によって反復して確認されてきた。
多くの放射性核種、例えば、68Ga、99Tc、64Cuおよび18Fは、選択される優れたイメージング剤である。これらは通常、安全なイメージングにとって理想的なガンマまたはベータエネルギーを有し、安価であり、容易に入手可能であり、ジェネレーターで産生され、担体を含まない。それらの短い半減期(6時間未満)は、容易に、それらを、初期のイメージング研究のための抗体断片とのカップリングに適したものにしている。
一部の実施形態では、イメージング剤は、放射性核種をキレートするキレート化合物を含む。一部の実施形態では、キレート化合物は、放射活性金属をキレートする。一部の実施形態では、キレート化合物は、金属18Fをキレートする。一部の実施形態では、キレート化合物は、金属イオンに結合でき、迅速なin vivoクリアランスを確実にすることを助けることができる、親水性キレート化合物である。適切なキレート化合物は、それらの特定の金属結合特性について選択され得、公知の化学的架橋技法によるまたは側鎖反応性基を有するキレーター(例えば、二機能性キレート化合物)の使用による置換は、慣用的に過ぎない実験を用いて実施され得る。
特に有用な金属-キレート化合物の組合せには、放射性イメージングのための、60~4,000keVの一般的なエネルギー範囲の診断的同位体、例えば、125I、131I、123I、124I、62Cu、64Cu、18F、111In、67Ga、68Ga、99Tc、94Tc、11C、13N、15O、76Brと共に使用される、2-ベンジル-DTPA(ジエチレントリアミン五酢酸)ならびにそのモノメチルおよびシクロヘキシルアナログが含まれる。同じキレート化合物は、非放射活性金属、例えば、マンガン、鉄およびガドリニウムと錯体化されると、MRIのために有用である。大環状キレート化合物、例えば、NOTA(1,4,7-トリアザシクロノナン-1,4,7-三酢酸)、DOTA(1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-N,N’,N”,N”’-四酢酸)、TETA(ブロモアセトアミド-ベンジル-テトラエチルアミン四酢酸)およびNETA({4-[2-(ビス-カルボキシメチル-アミノ)-エチル]-7-カルボキシメチル-[1,4,7]トリアゾナン-1-イル}-酢酸)は、種々の診断的放射性金属、例えば、ガリウム、イットリウムおよび銅と共に使用される。かかる金属-キレート錯体は、環サイズを目的の金属に合わせることによって、非常に安定にされ得る。当業者は、NOTAなどの大環状環構造に結合される基を変動させることによって、異なる金属および/または放射性核種に対する結合特徴および親和性が変化し得、したがって、例えばNOTAのかかる誘導体またはアナログが、本明細書で議論される金属または放射性核種のいずれかに結合するように設計され得ることが理解される。
DTPAおよびDOTA型キレーターは、リガンドが硬い塩基キレート性官能基、例えば、カルボキシレートまたはアミン基を含む場合、硬い酸カチオン、特に、IIa族およびIIIa族金属カチオンをキレートするのに最も有効である。かかる金属-キレート錯体は、環サイズを目的の金属に合わせることによって、非常に安定にされ得る。他の環型キレーター、例えば、大環状ポリエーテルは、核種に安定に結合するために目的とされる。ポルフィリンキレーターは、多数の金属錯体と共に使用され得る。1つよりも多くの型のキレーターが、複数の金属イオンを結合するために、ペプチドにコンジュゲートされ得る。キレーター、例えば、米国特許第5,753,206号に開示されるもの、特に、チオセミカルバゾニルグリオキシルシステイン(thiosemicarbazonylglyoxylcysteine)(Tscg-Cys)およびチオセミカルバジニル(thiosemicarbazinyl)-アセチルシステイン(Tsca-Cys)キレーターは、軟らかい塩基リガンドに緊密に結合されるTc、Re、Biならびに他の遷移金属、ランタニドおよびアクチニドの軟らかい酸カチオンを結合するために、有利に使用される。他の硬い酸キレーター、例えば、DOTA、TETAなどが、DTPAおよび/またはTscgCys基を置換し得る。
一部の実施形態では、キレート化合物は、抗PD-L1ダイアボディにコンジュゲートされ得る官能基を含む。一部の実施形態では、キレート化合物は、抗PD-L1ダイアボディ中の第1級アミン(-NH)基と反応性の官能基を含む。第1級アミンは、各ポリペプチド鎖のN末端に、およびリシン(Lys)アミノ酸残基の側鎖中に存在する。抗PD-L1ダイアボディの第1級アミン、例えば、リシン側鎖にコンジュゲートされ得る例示的な官能基には、イソチオシアネート、イソシアネート、アシルアジド、N-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル、スルホニルクロリド、アルデヒド、グリオキサール、エポキシド、オキシラン、カーボネート、アリールハライド、イミドエステル、カルボジイミド、無水物およびフルオロフェニルエステルが含まれるがこれらに限定されない。これらの官能基のほとんどは、アシル化またはアルキル化のいずれかによって、アミンにコンジュゲートする。
一部の実施形態では、キレート化合物は、抗PD-L1ダイアボディ中のシステイン側鎖(即ち、スルフヒドリル基)と反応性の官能基を含む。例示的なスルフヒドリル反応性基には、ハロアセチル、マレイミド、アジリジン、アクリロイル、アリール化剤、ビニルスルホン、ピリジルジスルフィド、TNB-チオールおよびジスルフィド還元剤が含まれるがこれらに限定されない。これらの基のほとんどは、アルキル化(通常、チオエーテル結合の形成)またはジスルフィド交換(ジスルフィド結合の形成)のいずれかによって、スルフヒドリルにコンジュゲートする。
一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA誘導体を含むNOTAである。例えば、アミノ酸側鎖、例えば、リシンおよびシステインを介した抗体部分へのコンジュゲーションに適切な官能基を有する例示的なNOTA化合物は、図10に示される。一部の実施形態では、イメージング剤は、抗PD-L1ダイアボディにコンジュゲートされたNOTAを含む。一部の実施形態では、NOTA化合物は、イソチオシアネート(-SCN)基を含む。一部の実施形態では、NOTA化合物は、p-SCN-Bn-NOTAである。一部の実施形態では、キレート化合物は、抗PD-L1ダイアボディ中のリシン残基にコンジュゲートされるNOTAを含み、NOTAは、68Gaをキレートする。一部の実施形態では、NOTA化合物は、放射活性金属、例えば、68Gaまたは18F-金属で最初に標識され、次いで、抗PD-L1ダイアボディにコンジュゲートされる。
抗PD-L1ダイアボディ剤
一部の実施形態では、セクションIIに記載される抗PD-L1ダイアボディを含む抗PD-L1ダイアボディ剤が提供される。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、以下に記載される第1のコンジュゲーション部分をさらに含む。
コンジュゲーション部分
本出願の一態様は、ダイアボディおよび/または標識化剤(例えば、放射性核種)中に取り込まれ得るコンジュゲーション部分を提供する。一部の実施形態では、ダイアボディ剤中に取り込まれたコンジュゲーション部分(例えば、第1のコンジュゲーション部分)は、標識化剤(例えば、放射性核種化合物)中に取り込まれたコンジュゲーション部分(例えば、第2のコンジュゲーション部分)にin vivoでコンジュゲートされることが可能である。
一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分のコンジュゲーションは、非共有結合的である。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分のコンジュゲーションは、共有結合的である。
一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および/または第2のコンジュゲーション部分は各々、互いに相補的な核酸を含む。一部の実施形態では、核酸は、DNAである。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は、DNA-DNAハイブリダイゼーションを介して互いにコンジュゲートされる。
一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は、2つのコンジュゲーション部分間の共有結合を介してコンジュゲートされる。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分または第2のコンジュゲーション部分は、システイン残基、リシン残基またはチロシン残基を含む。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は、システイン残基のカップリングに基づいて(例えば、ジスルフィド結合を介して)コンジュゲートされる。
一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は、抗体-薬物コンジュゲートに基づいてコンジュゲートされる。
クリックケミストリー
一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は各々、クリックケミストリー対のメンバーを含み、クリックケミストリーを介して互いにコンジュゲートされる。本明細書に記載されるクリックケミストリー対は、クリックケミストリーを介して互いに排他的に反応することが可能な2つの化学的部分である。
一部の実施形態では、クリックケミストリー対は、アジド-アルキン対、アルキン-ニトロン対、アルケンおよびテトラゾール対、ならびにイソニトリル(例えば、イソシアニド)およびテトラジン対からなる群より選択される。
一部の実施形態では、クリックケミストリーは、アジド-アルキンHuisgen環化付加に基づく。一部の実施形態では、アジド-アルキンHuisgen環化付加は、銅で触媒される。一部の実施形態では、アジド-アルキンHuisgen環化付加は、銅を含まない。一部の実施形態では、コンジュゲーション部分は、アルキニル基の環式誘導体を含む。一部の実施形態では、アルキニル基の環式誘導体は、シクロオクチン、二フッ素化シクロオクチンおよびジベンゾシクロオクチンから選択される。一部の実施形態では、クリックケミストリーは、アジドの歪み促進型Huisgen環化付加に基づく。一部の実施形態では、クリックケミストリーは、歪みアルケンの反応に基づく。
一部の実施形態では、クリックケミストリーは、Staudinger-Bertozziライゲーションに基づき、このとき、クリックケミストリーには、アジドとホスフィンとの間のカップリング反応が関与する。
一部の実施形態では、クリックケミストリーは、逆電子要請型Diels-Alder環化付加に基づき、このとき、クリックケミストリーには、歪みアルケンとテトラジンとの間のカップリング反応が関与する。一部の実施形態では、コンジュゲーション部分は、トランス-シクロオクテン(TCO)もしくはテトラジン(Tz)を含むまたはトランス-シクロオクテン(TCO)もしくはテトラジン(Tz)である。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分は、トランス-シクロオクテン(TCO)を含むまたはトランス-シクロオクテン(TCO)であり、第2のコンジュゲーション部分は、テトラジン(Tz)を含むまたはテトラジン(Tz)である。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分は、Tzを含むまたはTzであり、第2のコンジュゲーション部分は、TCOを含むまたはTCOである。一部の実施形態では、Tzは、6-メチル置換されたテトラジン(6-Meテトラジン)である。一部の実施形態では、Tzは、6-水素置換されたテトラジン(6-Hテトラジン)である。
一部の実施形態では、コンジュゲーション部分(例えば、テトラジン)は、スペーサーをさらに含む。一部の実施形態では、スペーサーは、コンジュゲーション部分と抗PD-L1ダイアボディとの間にある。一部の実施形態では、スペーサーは、コンジュゲーション部分と標識化剤との間にある。一部の実施形態では、スペーサーは、アルキルスペーサーである。一部の実施形態では、スペーサーは、PEGスペーサーである。一部の実施形態では、PEGスペーサーは、少なくとも約1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個のエチレングリコール単位を含む。一部の実施形態では、PEGスペーサーは、約1~20、5~15、8~12または約10個のエチレングリコール単位を含む。
IV.イメージングおよび処置の方法
本出願の一態様は、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を使用して、個体におけるPD-L1の分布および/または発現レベルを決定する方法を提供する。
一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディ(例えば、本明細書に記載されるダイアボディのうちいずれか1つ)を含むイメージング剤を投与するステップ;および(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、この方法は、組織からイメージング剤によって放射されるシグナルに基づいて、個体中の目的の組織におけるPD-L1の発現レベルを決定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、この方法は、抗PD-L1ダイアボディを放射性核種で標識することによって、イメージング剤を調製するステップをさらに含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、単一光子放射コンピュータ断層撮影(SPECT)イメージングまたは陽電子放射断層撮影(PET)イメージングを含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、コンピュータ断層撮影イメージング、磁気共鳴イメージング、化学発光イメージングまたは電気化学発光イメージングをさらに含む。一部の実施形態では、イメージング剤は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下または経口投与される。一部の実施形態では、イメージングは、イメージング剤の投与の約10分後~約24時間後の間に実施される。一部の実施形態では、この方法は、一定期間にわたって個体をイメージングするステップを含む。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、キレート化合物は、1,4,7-トリアザシクロノナン-l,4,7-トリス酢酸(NOTA)、1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-1,4,7,10-四酢酸(DOTA)またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、非ヒト哺乳動物(例えば、マウス、ラットまたはサル)由来のPD-L1と交差反応する。
一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;および(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップを含み、抗PD-L1ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、方法が提供される。一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;および(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップを含み、抗PD-L1ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、方法が提供される。一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;および(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップを含み、抗PD-L1ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、方法が提供される。
一部の実施形態では、この方法は、組織からイメージング剤によって放射されるシグナルに基づいて、個体中の目的の組織におけるPD-L1の発現レベルを決定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、この方法は、抗PD-L1ダイアボディを放射性核種で標識することによって、イメージング剤を調製するステップをさらに含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、単一光子放射コンピュータ断層撮影(SPECT)イメージングまたは陽電子放射断層撮影(PET)イメージングを含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、コンピュータ断層撮影イメージング、磁気共鳴イメージング、化学発光イメージングまたは電気化学発光イメージングをさらに含む。一部の実施形態では、イメージング剤は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下または経口投与される。一部の実施形態では、イメージングは、イメージング剤の投与の約10分後~約24時間後の間に実施される。一部の実施形態では、この方法は、一定期間にわたって個体をイメージングするステップを含む。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、非ヒト哺乳動物(例えば、マウス、ラットまたはサル)由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、ヒト化される。
本明細書に記載される方法は、個体におけるまたは個体中の目的の組織におけるPD-L1の分布を決定するために使用され得る。この方法は、個体の1つまたは複数の組織または臓器におけるPD-L1の発現レベルについての定性的または定量的情報もまた提供し得る。さらに、本明細書に記載される方法は、例えば、個体へのイメージング剤の投与後の異なる時点において、イメージング結果の複数のセットを提供することによって、一定期間にわたって個体をイメージングすることを可能にし得る。一部の実施形態では、イメージングは、約10分間~約24時間(例えば、約10分間~1時間、1時間~2時間、2時間~4時間、4時間~8時間、8時間~12時間、12時間~24時間、1時間~4時間または1時間~8時間のうちいずれか1つ)の間の期間にわたって、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれよりも多くの回数実施される。一部の実施形態では、イメージングは、イメージング剤の投与の約10分後~約24時間後の間、例えば、約10分後~1時間後、1時間後~2時間後、2時間後~4時間後、4時間後~8時間後、8時間後~12時間後、12時間後~24時間後、1時間後~4時間後または1時間後~8時間後のうちいずれか1つの間に実施される。
標識されたポリペプチドを使用してイメージングする方法は、当該分野で周知であり、任意のかかる公知の方法が、本明細書に開示されるイメージング剤と共に使用され得る。例えば、Srivastava (ed.), Radiolabeled Monoclonal Antibodies for Imaging and Therapy (Plenum Press 1988), Chase, ”Medical Applications of Radioisotopes”、Remington’s Pharmaceutical Sciences, 18th Edition, Gennaro et al. (eds.), pp. 624-652 (Mack Publishing Co., 1990)およびBrown, ”Clinical Use of Monoclonal Antibodies”、Biotechnology and Pharmacy 227-49, Pezzuto et al. (eds.) (Chapman & Hall 1993)を参照のこと。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、例えば、約511keVのエネルギーを有する陽電子放射放射性核種(PET同位体)、例えば、18F、68Ga、64Cuおよび124Iを使用する。かかる放射性核種は、周知のPETスキャニング技法によってイメージングされ得る。これにより参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第6,953,567号;同第9,884,131号および国際特許出願公開番号WO2016149188 A1、ならびにKim HY. et al., (2018) PLoS ONE 13(3): e0192821もまた参照のこと。
一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、単一光子放射コンピュータ断層撮影(SPECT)イメージングを含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、陽電子放射断層撮影(PET)イメージングを含む。一部の実施形態では、SPECまたはPETイメージングは、イメージング剤からのシグナルに基づいても基づかなくてもよい1つまたは複数の他の非侵襲性イメージング方法と組み合わされる。例えば、PETは、コンピュータ断層撮影(CT)イメージング、磁気共鳴イメージング(MRI)、化学発光イメージングまたは電気化学発光イメージングと組み合わされ得る。
本明細書に記載されるイメージング方法は、低い、中程度のまたは高い発現レベルでPD-L1を検出するために適切である。一部の実施形態では、イメージング方法は、PD-L1の発現レベルおよび分布についての動的情報を提供する。一部の実施形態では、イメージング方法は、検出の他の方法、例えば、免疫組織化学(IHC)にとっては困難であり得る状況で、PD-L1を検出することが可能である。例えば、一部の実施形態では、目的の組織は、免疫組織化学(IHC)アッセイまたは別のアッセイに基づくと、PD-L1について陰性である。PD-L1の存在または非存在を検出するために使用され得る分子アッセイには、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのアッセイ、次世代配列決定(NGS)アッセイ、ハイブリダイゼーションアッセイおよびELISAが含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、目的の組織は、低い発現レベルのPD-L1を有する。一部の実施形態では、目的の組織は、免疫細胞の浸潤の際にのみPD-L1を発現する。
イメージング剤は、任意の適切な投薬量および投与経路を使用して、個体に投与され得る。投与経路は、適切な様式、例えば、皮下、静脈内、腹腔内、筋肉内、動脈内、病変内、関節内、腫瘍内による注射もしくは注入、または経口経路での、一定期間にわたる、例えば、単一のまたは複数のボーラスまたは注入による、公知の受容された方法に従う。適切な投薬量または投与経路の決定は、十分に当業者の技術範囲内である。動物実験は、ヒト診断適用のための有効用量の決定のための信頼性のあるガイダンスを提供する。有効用量の種間スケーリングは、Mordenti, J. and Chappell, W. ”The Use of Interspecies Scaling in Toxicokinetics”、Toxicokinetics and New Drug Development, Yacobi et al., Eds, Pergamon Press, New York 1989, pp. 42-46によって記された原理に従って実施され得る。
診断および処置
本明細書に記載される方法は、異常な免疫応答に関連する種々の疾患および状態の診断のために、ならびにその処置のためのコンパニオン診断方法として、有用である。一部の実施形態では、疾患または状態は、免疫不全に関連する。一部の実施形態では、疾患または状態は、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患である。
一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、(a)本明細書に記載されるPD-L1の分布を決定するための方法のうちいずれか1つを使用して、個体におけるPD-L1の分布を決定するステップ;および(b)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、疾患または状態は、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患である。
一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ;および(c)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、この方法は、組織からイメージング剤によって放射されるシグナルに基づいて、個体中の目的の組織におけるPD-L1の発現レベルを決定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、この方法は、抗PD-L1ダイアボディを放射性核種で標識することによって、イメージング剤を調製するステップをさらに含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、単一光子放射コンピュータ断層撮影(SPECT)イメージングまたは陽電子放射断層撮影(PET)イメージングを含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、コンピュータ断層撮影イメージング、磁気共鳴イメージング、化学発光イメージングまたは電気化学発光イメージングをさらに含む。一部の実施形態では、イメージング剤は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下または経口投与される。一部の実施形態では、イメージングは、イメージング剤の投与の約10分後~約24時間後の間に実施される。一部の実施形態では、この方法は、一定期間にわたって個体をイメージングするステップを含む。一部の実施形態では、放射性核種は、664Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、非ヒト哺乳動物(例えば、マウス、ラットまたはサル)由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、ダイアボディは、ヒト化される。一部の実施形態では、疾患または状態は、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患である。
一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ;および(c)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含み;抗PD-L1ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、方法が提供される。一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ;および(c)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含み;抗PD-L1ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、方法が提供される。一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ;および(c)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含み;抗PD-L1ダイアボディが、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、方法が提供される。一部の実施形態では、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVは各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cは、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cは、第2のジスルフィド結合を形成する。
一部の実施形態では、この方法は、組織からイメージング剤によって放射されるシグナルに基づいて、個体中の目的の組織におけるPD-L1の発現レベルを決定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、この方法は、ダイアボディを放射性核種で標識することによって、イメージング剤を調製するステップをさらに含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、単一光子放射コンピュータ断層撮影(SPECT)イメージングまたは陽電子放射断層撮影(PET)イメージングを含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、コンピュータ断層撮影イメージング、磁気共鳴イメージング、化学発光イメージングまたは電気化学発光イメージングをさらに含む。一部の実施形態では、イメージング剤は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下または経口投与される。一部の実施形態では、イメージングは、イメージング剤の投与の約10分後~約24時間後の間に実施される。一部の実施形態では、この方法は、一定期間にわたって個体をイメージングするステップを含む。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、ヒト化される。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、疾患または状態は、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患である。
本出願の一態様は、a)抗PD-L1ダイアボディ(例えば、本明細書に記載されるダイアボディのいずれか)および第1のコンジュゲーション部分を含む有効量の抗PD-L1ダイアボディ剤、ならびにb)標識(例えば、放射性核種)および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の標識化剤(例えば、放射性核種化合物)を使用して、個体におけるPD-L1の分布および/または発現レベルを決定する方法であって、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、方法を提供する。一部の実施形態では、この方法は、個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップをさらに含む。
一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、a)個体に、抗PD-L1ダイアボディ(例えば、本明細書に記載される抗PD-L1ダイアボディのいずれか)および第1のコンジュゲーション部分を含む有効量の抗PD-L1ダイアボディ剤を投与するステップ;b)個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物を引き続いて投与するステップであって、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、ステップ;ならびにc)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、個体に、抗PD-L1ダイアボディおよび第1のコンジュゲーション部分を含む有効量の抗PD-L1ダイアボディ剤を投与するステップを含み、個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物が投与され、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、方法が提供される。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディおよび第1のコンジュゲーション部分を含む有効量の抗PD-L1ダイアボディ剤が投与された個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物を投与するステップを含み、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、方法が提供される。
一部の実施形態では、個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、a)個体に、抗PD-L1ダイアボディおよび第1のコンジュゲーション部分を含む有効量の抗PD-L1ダイアボディ剤を投与するステップ;b)個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物を引き続いて投与するステップであって、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、ステップ;ならびにc)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vは、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vは、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVは、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2は、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2は、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドは各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vは、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vは、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分は各々、クリックケミストリー対のメンバーを含み、クリックケミストリーを介して互いにコンジュゲートされる。一部の実施形態では、第1のコンジュゲーション部分は、トランス-シクロオクテン(TCO)であり、第2のコンジュゲーション部分は、テトラジン(Tz)である、または第1のコンジュゲーション部分は、Tzであり、第2のコンジュゲーション部分は、TCOである。一部の実施形態では、放射性核種化合物は、ダイアボディ剤の投与後即座に投与される。一部の実施形態では、放射性核種化合物は、ダイアボディ剤の投与の約1時間後と約100時間後との間に投与される。一部の実施形態では、放射性核種化合物および/またはダイアボディ剤は、放射性核種をキレートするキレート化合物を含む。一部の実施形態では、キレート化合物は、1,4,7-トリアザシクロノナン-l,4,7-トリス酢酸(NOTA)、1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-1,4,7,10-四酢酸(DOTA)またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、個体は、固形腫瘍、血液学的悪性疾患、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患を有する。
処置
一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、(a)本明細書に記載される任意の診断方法を使用して、個体を診断するステップ;および(b)個体がPD-L1について陽性と診断される場合に、個体に、有効量のPD-L1またはPD-1を標的化する治療剤を投与するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、治療剤は、PD-L1またはPD-1の阻害剤である。一部の実施形態では、治療剤は、PD-L1またはPD-1に特異的に結合する放射性標識された分子である。一部の実施形態では、疾患または状態は、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患である。一部の実施形態では、疾患または状態は、膀胱、卵巣または前立腺疾患である。
一部の実施形態では、疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、(a)個体に、放射性核種で標識された抗PD-L1ダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;(b)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ;(c)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ;および(d)個体がPD-L1について陽性と診断される場合に、個体に、PD-L1またはPD-L1受容体を標的化する有効量の治療剤(例えば、PD-L1もしくはPD-1の阻害剤、またはPD-L1もしくはPD-1に特異的に結合する放射性標識された分子)を投与するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、この方法は、組織からイメージング剤によって放射されるシグナルに基づいて、個体中の目的の組織におけるPD-L1の発現レベルを決定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、この方法は、PD-L1を放射性核種で標識することによって、イメージング剤を調製するステップをさらに含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、単一光子放射コンピュータ断層撮影(SPECT)イメージングまたは陽電子放射断層撮影(PET)イメージングを含む。一部の実施形態では、非侵襲性イメージング技法は、コンピュータ断層撮影イメージング、磁気共鳴イメージング、化学発光イメージングまたは電気化学発光イメージングをさらに含む。一部の実施形態では、イメージング剤は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下または経口投与される。一部の実施形態では、イメージングは、イメージング剤の投与の約10分後~約24時間後の間に実施される。一部の実施形態では、この方法は、一定期間にわたって個体をイメージングするステップを含む。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、ダイアボディは、放射性核種をキレートするキレート化合物にコンジュゲートされる。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディは、非ヒト哺乳動物(例えば、マウス、ラットまたはサル)由来のPD-L1と交差反応する。一部の実施形態では、ダイアボディは、ヒト化される。一部の実施形態では、疾患または状態は、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患である。
一部の実施形態では、個体は、がんを有する。がんは、非固形腫瘍(例えば、血液学的腫瘍、例えば、白血病およびリンパ腫)を含み得、または固形腫瘍を含み得る。本明細書に記載される方法を使用して診断され得る例示的ながんには、癌腫、芽腫および肉腫、ならびにある特定の白血病またはリンパ系悪性疾患、良性および悪性腫瘍、ならびに悪性疾患、例えば、肉腫、癌腫および黒色腫が含まれるがこれらに限定されない。成人腫瘍/がんおよび小児腫瘍/がんもまた含まれる。本明細書で議論される固形または血液学的がんには、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、肉腫および癌腫、例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫(endotheliosarcoma)、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫(lymphangioendotheliosarcoma)、カポジ肉腫、軟部組織肉腫、子宮滑膜肉腫(uterine sacronomasynovioma)、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、膵がん、乳がん、卵巣がん、前立腺がん、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、ヘパトーマ、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胎生期癌、ウィルムス腫瘍、子宮頸がん、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌および黒色腫が含まれるがこれらに限定されない。
本明細書に記載される方法は、American Joint Committee on Cancer(AJCC)ステージ分類群に従う、ステージI、II、IIIおよびIVを含む全てのステージの固形または血液学的がんに適用可能である。一部の実施形態では、固形または血液学的がんは、早期がん、非転移性がん、原発性がん、進行がん、局所進行がん、転移性がん、または寛解状態のがんである。
一部の実施形態では、個体は、血液学的がんを有する。本明細書に記載される方法を使用して診断され得る例示的な血液学的がんには、白血病、リンパ腫、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性非リンパ芽球性白血病(ANLL)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、非ホジキンリンパ腫およびホジキンリンパ腫が含まれるがこれらに限定されない。
一部の実施形態では、個体は、固形腫瘍を有する。本明細書に記載される方法を使用して診断され得る例示的な固形腫瘍には、結腸腫瘍、黒色腫、腎臓腫瘍、卵巣腫瘍、肺腫瘍、乳房腫瘍および膵腫瘍が含まれるがこれらに限定されない。
がん処置は、例えば、腫瘍退縮、腫瘍重量もしくはサイズ収縮、進行までの時間、生存の持続時間、無進行生存、全奏効率、応答の持続時間、生活の質、タンパク質発現および/または活性によって評価され得る。例えば、放射線イメージングを介した応答の測定を含む、治療の有効性を決定するためのアプローチが使用され得る。
一部の実施形態では、個体は、感染性疾患を有する。感染は、ウイルス、細菌、原生生物または寄生生物によって引き起こされ得る。例示的な病原体には、Acinetobacter baumannii、アナプラズマ属、Anaplasma phagocytophilum、Ancylostoma braziliense、Ancylostoma duodenale、Arcanobacterium haemolyticum、Ascaris lumbricoides、アスペルギルス属、アストロウイルス科、バベシア属、Bacillus anthracis、Bacillus cereus、Bartonella henselae、BKウイルス、Blastocystis hominis、Blastomyces dermatitidis、Bordetella pertussis、Borrelia burgdorferi、ボレリア属、Borrelia spp、ブルセラ属、Brugia malayi、ブニヤウイルス科、Burkholderia cepaciaおよび他のBurkholderia種、Burkholderia mallei、Burkholderia pseudomallei、カリシウイルス科、カンピロバクター属、Candida albicans、Candida spp、Chlamydia trachomatis、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydophila psittaci、CJDプリオン、Clonorchis sinensis、Clostridium botulinum、Clostridium difficile、Clostridium perfringens、Clostridium perfringens、Clostridium spp、Clostridium tetani、Coccidioides spp、コロナウイルス、Corynebacterium diphtheriae、Coxiella burnetii、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、Cryptococcus neoformans、クリプトスポリジウム属、サイトメガロウイルス(CMV)、デングウイルス(DEN-1、DEN-2、DEN-3およびDEN-4)、Dientamoeba fragilis、エボラウイルス(EBOV)、エキノコッカス属、Ehrlichia chaffeensis、Ehrlichia ewingii、エールリヒア属、Entamoeba histolytica、エンテロコッカス属、エンテロウイルス属、エンテロウイルス、主にコクサッキーAウイルスおよびエンテロウイルス71(EV71)、Epidermophyton spp、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、Escherichia coli O157:H7、O111およびO104:H4、Fasciola hepaticaおよびFasciola gigantica、FFIプリオン、フィラリア上科、フラビウイルス、Francisella tularensis、.フゾバクテリウム属、Geotrichum candidum、Giardia intestinalis、Gnathostoma spp、GSSプリオン、グアナリトウイルス、Haemophilus ducreyi、Haemophilus influenzae、Helicobacter pylori、ヘニパウイルス(ヘンドラウイルス ニパウイルス)、A型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス(HBV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、D型肝炎ウイルス、E型肝炎ウイルス、単純ヘルペスウイルス1および2(HSV-1およびHSV-2)、Histoplasma capsulatum、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)、Hortaea werneckii、ヒトボカウイルス(HBoV)、ヒトヘルペスウイルス6(HHV-6)およびヒトヘルペスウイルス7(HHV-7)、ヒトメタニューモウイルス(hMPV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒトパラインフルエンザウイルス(HPIV)、ヒトT細胞白血病ウイルス1(HTLV-1)、日本脳炎ウイルス、JCウイルス、フニンウイルス、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス(KSHV)、Kingella kingae、Klebsiella granulomatis、Kuruプリオン、ラッサウイルス、Legionella pneumophila、リーシュマニア属、レプトスピラ属、Listeria monocytogenes、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、マチュポウイルス、Malassezia spp、マールブルグウイルス、麻疹ウイルス、Metagonimus yokagawai、Microsporidia phylum、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ムンプスウイルス、Mycobacterium lepraeおよびMycobacterium lepromatosis、Mycobacterium tuberculosis、Mycobacterium ulcerans、Mycoplasma pneumoniae、Naegleria fowleri、Necator americanus、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Nocardia asteroides、Nocardia spp、Onchocerca volvulus、Orientia tsutsugamushi、オルトミクソウイルス科(インフルエンザ)、Paracoccidioides brasiliensis、Paragonimus spp、Paragonimus westermani、パルボウイルスB19、パスツレラ属、プラスモディウム属、Pneumocystis jirovecii、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、呼吸器多核体ウイルス(RSV)、ライノウイルス、ライノウイルス、Rickettsia akari、リケッチア属、Rickettsia prowazekii、Rickettsia rickettsii、Rickettsia typhi、リフトバレー熱ウイルス、ロタウイルス、風疹ウイルス、サビアウイルス、サルモネラ属、Sarcoptes scabiei、SARSコロナウイルス、住血吸虫属、赤痢菌属、シンノンブルウイルス、ハンタウイルス、Sporothrix schenckii、ブドウ球菌属、ブドウ球菌属、Streptococcus agalactiae、Streptococcus pneumoniae、Streptococcus pyogenes、Strongyloides stercoralis、テニア属、Taenia solium、ダニ媒介脳炎ウイルス(TBEV)、Toxocara canisまたはToxocara cati、Toxoplasma gondii、Treponema pallidum、Trichinella spiralis、Trichomonas vaginalis、Trichophyton spp、Trichuris trichiura、Trypanosoma brucei、Trypanosoma cruzi、Ureaplasma urealyticum、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、大痘瘡または小痘瘡、vCJDプリオン、ベネズエラウマ脳炎ウイルス、Vibrio cholerae、ウエストナイルウイルス、西部ウマ脳炎ウイルス、Wuchereria bancrofti、黄熱病ウイルス、Yersinia enterocolitica、Yersinia pestisならびにYersinia pseudotuberculosisが含まれるがこれらに限定されない。
一部の実施形態では、個体は、自己免疫性疾患を有する。例示的な自己免疫性疾患には、ベーチェット病、全身性エリテマトーデス、多発性硬化症(全身性強皮症および進行性全身性強皮症)、強皮症、多発性筋炎、皮膚筋炎、結節性動脈周囲炎(結節性多発動脈炎および顕微鏡的多発血管炎)、大動脈炎症候群(高安動脈炎)、悪性関節リウマチ、関節リウマチ、ウェゲナー肉芽腫症、混合性結合組織病、シェーグレン症候群、成人発症スチル病、アレルギー性肉芽腫性血管炎、過敏性血管炎、コーガン症候群、RS3PE、側頭動脈炎、リウマチ性多発筋痛、線維筋痛症候群、抗リン脂質抗体症候群、好酸球性筋膜炎、IgG4関連疾患(例えば、原発性硬化性胆管炎および自己免疫性膵炎)、ギラン・バレー症候群、重症筋無力症、慢性萎縮性胃炎、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、大動脈炎症候群、グッドパスチャー症候群、急速進行性糸球体腎炎、巨赤芽球性貧血、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性好中球減少症、特発性血小板減少性紫斑病、グレーブス病(甲状腺機能亢進症)、橋本甲状腺炎、自己免疫性副腎機能不全、原発性甲状腺機能低下症、特発性アジソン病(慢性副腎機能不全)、I型糖尿病、慢性円板状エリテマトーデス、限局性強皮症、乾癬、乾癬性関節炎、天疱瘡、類天疱瘡、妊娠性疱疹、線状IgA水疱性皮膚疾患、後天性表皮水疱症、円形脱毛症、白斑、原田病、自己免疫性視神経症、特発性無精子症、再発性胎児喪失および炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎およびクローン病)が含まれるがこれらに限定されない。
一部の実施形態では、個体は、異常な免疫応答に関連する代謝疾患を有する。例示的な代謝疾患には、炎症性腸疾患、多発性硬化症、乾癬、関節リウマチおよび全身性エリテマトーデスが含まれるがこれらに限定されない。
V.調製の方法
イメージング剤を調製する方法
一部の実施形態では、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法が提供される。本明細書に記載されるイメージング剤は、以下に概して記載され、実施例でより具体的に記載されるいくつかのプロセスによって調製され得る。
一部の実施形態では、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、a)キレート化合物を、本明細書に記載されるダイアボディにコンジュゲートして、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートを提供するステップ;b)放射性核種を、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートと接触させ、それによって、イメージング剤を提供するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、キレート化合物は、ダイアボディ部分のリシンにコンジュゲートされる。一部の実施形態では、この方法は、キレート化合物および/または放射性核種からイメージング剤を単離するステップをさらに含む。
一部の実施形態では、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、(a)キレート化合物を、抗PD-L1ダイアボディ(例えば、本明細書に記載されるダイアボディのいずれか)にコンジュゲートして、ダイアボディコンジュゲートを提供するステップ;および(b)放射性核種を、ダイアボディコンジュゲートと接触させ、それによって、イメージング剤を提供するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、この方法は、ダイアボディを、キレート化合物と共に37℃でインキュベートするステップを含む。一部の実施形態では、インキュベーションは、少なくとも約20分間、40分間または60分間持続する。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、キレート化合物は、ダイアボディのリシンにコンジュゲートされる。一部の実施形態では、この方法は、キレート化合物および/または放射性核種からイメージング剤を単離するステップをさらに含む。
一部の実施形態では、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、(a)キレート化合物を放射性核種と接触させるステップ;(b)放射性核種をキレートするキレート化合物を、本明細書に記載される抗PD-L1ダイアボディのうちいずれか1つにコンジュゲートし、それによって、イメージング剤を提供するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、キレート化合物は、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、放射性核種は、64Cu、18F、67Ga、68Ga、111In、177Lu、90Y、89Zr、61Cu、62Cu、67Cu、19F、66Ga、72Ga、44Sc、47Sc、86Y、88Yおよび45Tiからなる群より選択される。一部の実施形態では、放射性核種は、68Gaである。一部の実施形態では、キレート化合物は、ダイアボディのリシンにコンジュゲートされる。一部の実施形態では、この方法は、キレート化合物および/または放射性核種からイメージング剤を単離するステップをさらに含む。
一部の実施形態では、PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、(a)本明細書に記載される抗PD-L1ダイアボディをp-SCN-Bn-NOTAにコンジュゲートして、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートを提供するステップ;(b)68Gaを、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートと接触させ、それによって、イメージング剤を提供するステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、この方法は、ダイアボディを、p-SCN-Bn-NOTAと共に37℃でインキュベートするステップを含む。一部の実施形態では、インキュベーションは、少なくとも約20分間、40分間または60分間持続する。一部の実施形態では、ダイアボディコンジュゲートは、ダイアボディおよびp-SCN-Bn-NOTAの混合物をカラム(例えば、NAP-5カラム)に通過させることによって、単離される。一部の実施形態では、イメージング剤は、68Gaとダイアボディコンジュゲートとの混合物をカラム(例えば、NAP-5カラム)に通過させることによって、単離される。
ダイアボディの発現および産生
本明細書に記載されるダイアボディは、以下および実施例に記載されるものを含む、当該分野で公知の任意の方法を使用して調製され得る。
一部の実施形態では、抗PD-L1ダイアボディを産生する方法であって、a)本明細書に記載される単離された宿主細胞を、ダイアボディを発現するのに有効な条件下で培養するステップ;およびb)宿主細胞から、発現されたダイアボディを得るステップ、を含む方法が提供される。一部の実施形態では、宿主細胞は、CHO細胞である。
ダイアボディをコードする核酸分子
本出願は、本明細書に記載されるダイアボディまたはダイアボディの一部分をコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子をさらに提供する。一部の実施形態では、核酸分子は、第1または第2のポリペプチドの重鎖可変領域または軽鎖可変領域をコードするポリヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、核酸分子は、本明細書に記載されるダイアボディの第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、第1の核酸分子は、本明細書に記載される抗PD-L1ダイアボディの第1のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含み、第2の核酸分子は、同じダイアボディの第2のポリヌクレオチドを含む。
一部の実施形態では、核酸分子は、シグナル配列(例えば、配列番号35のシグナル配列)をコードするポリヌクレオチドをさらに含む。
一部の実施形態では、核酸分子は、タグ(例えば、His-タグ)をコードする第2のポリヌクレオチドをさらに含む。
一部の実施形態では、核酸分子は、配列番号44、45、48~51のうちいずれか1つの核酸配列、または配列番号22~24のうちいずれか1つの核酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有するそれらのバリアントを含む。
核酸分子は、当該分野で従来の組換えDNA技法を使用して構築され得る。一部の実施形態では、核酸分子は、選択された宿主細胞における発現に適切な発現ベクターである。
ベクター
本明細書に記載されるダイアボディ(例えば、抗PD-L1抗体部分)をコードするポリヌクレオチドを含むベクターが提供される。本明細書に記載されるダイアボディの一部分(例えば、ダイアボディの第1または第2のポリペプチドの重鎖可変領域または軽鎖可変領域)をコードするポリヌクレオチドを含むベクターもまた提供される。かかるベクターには、DNAベクター、ファージベクター、ウイルスベクター、レトロウイルスベクターなどが含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、ベクターは、ダイアボディの第1または第2のポリペプチドの重鎖可変領域または軽鎖可変領域をコードするポリヌクレオチド配列を含む。一部の実施形態では、ベクターは、ダイアボディの第1または第2のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む。
一部の実施形態では、CHOもしくはCHO由来細胞、またはNSO細胞におけるポリペプチドの発現のために最適化されたベクターが選択される。例示的なかかるベクターは、例えば、Running Deer et al., Biotechnol. Prog. 20:880-889 (2004)に記載されている。
宿主細胞
一部の実施形態では、本明細書に記載されるダイアボディは、原核生物細胞、例えば、細菌細胞において;または真核生物細胞、例えば、真菌細胞(例えば、酵母)、植物細胞、昆虫細胞および哺乳動物細胞において、発現され得る。かかる発現は、例えば、当該分野で公知の手順に従って、実施され得る。ポリペプチドを発現するために使用され得る例示的な真核生物細胞には、COS7細胞を含むCOS細胞;293-6E細胞を含む293細胞;CHO-S、DG44.Lec13 CHO細胞およびFUT8 CHO細胞を含むCHO細胞;PER.C6(登録商標)細胞(Crucell);ならびにNSO細胞が含まれるがこれらに限定されない。一部の実施形態では、本明細書に記載されるダイアボディは、酵母において発現され得る。例えば、米国特許出願公開第2006/0270045号A1を参照のこと。一部の実施形態では、特定の真核生物宿主細胞が、ダイアボディの第1および/または第2のポリペプチドに対する所望の翻訳後改変を行うその能力に基づいて選択される。例えば、一部の実施形態では、CHO細胞は、293細胞において産生された同じポリペプチドよりも高いレベルのシアリル化を有するポリペプチドを産生する。
所望の宿主細胞中への1つまたは複数の核酸の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE-デキストラン媒介性トランスフェクション、カチオン性脂質媒介性トランスフェクション、電気穿孔、形質導入、感染などが含まれるがこれらに限定されない任意の方法によって達成され得る。非限定的な例示的な方法は、例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press (2001)に記載されている。核酸は、任意の適切な方法に従って、所望の宿主細胞において一過的にまたは安定にトランスフェクトされ得る。
本発明は、本明細書に記載されるポリヌクレオチドまたはベクターのいずれかを含む宿主細胞もまた提供する。一部の実施形態では、本発明は、抗PD-L1抗体を含む宿主細胞を提供する。異種DNAを過剰発現することが可能な任意の宿主細胞が、目的のダイアボディ、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする遺伝子を単離することを目的として使用され得る。哺乳動物宿主細胞の非限定的な例には、COS、HeLaおよびCHO細胞が含まれるがこれらに限定されない。PCT公開番号WO87/04462もまた参照のこと。適切な非哺乳動物宿主細胞には、原核生物(例えば、E.coliまたはB.subtillis)および酵母(例えば、S.cerevisae、S.pombe;またはK.lactis)が含まれる。
一部の実施形態では、ダイアボディは、無細胞系において産生される。非限定的な例示的な無細胞系は、例えば、Sitaraman et al., Methods Mol. Biol. 498: 229-44 (2009);Spirin, Trends Biotechnol. 22: 538-45 (2004);Endo et al., Biotechnol. Adv. 21: 695-713 (2003)に記載されている。
ダイアボディの精製
抗PD-L1ダイアボディは、当該分野で公知の任意の適切な方法によって精製され得る。かかる方法には、親和性マトリックスまたは疎水性相互作用クロマトグラフィーの使用が含まれるがこれらに限定されない。例示的な親和性精製方法には、His-タグ付きタンパク質精製が含まれるがこれに限定されない。疎水性相互作用クロマトグラフィー、例えば、ブチルまたはフェニルカラムは、ダイアボディを精製するために適切であり得る。イオン交換クロマトグラフィー(例えば、アニオン交換クロマトグラフィーおよび/またはカチオン交換クロマトグラフィー)もまた、ダイアボディを精製するために適切であり得る。混合モードのクロマトグラフィー(例えば、逆相/アニオン交換、逆相/カチオン交換、親水性相互作用/アニオン交換、親水性相互作用/カチオン交換など)もまた、ダイアボディを精製するために適切であり得る。
VI.ポリヌクレオチド、核酸構築物、ベクター、宿主細胞および培養培地
ポリヌクレオチド
一部の実施形態では、本明細書に記載されるダイアボディのうちいずれか1つまたはそれらの一部分をコードするポリヌクレオチドが提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される方法のうちいずれか1つを使用して調製されたポリヌクレオチドが提供される。
一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、DNAである。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、RNAである。一部の実施形態では、RNAは、mRNAである。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、配列番号2、4、6、8、10、12、14、16、18および20のうちいずれか1つの核酸配列に対して少なくとも約80%(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%のうちいずれか1つ)の配列同一性を有する核酸配列を含む。
核酸構築物
一部の実施形態では、本明細書に記載されるポリヌクレオチドのうちいずれか1つを含む核酸構築物が提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される任意の方法を使用して調製された核酸構築物が提供される。
一部の実施形態では、核酸構築物は、ポリヌクレオチドに作動可能に連結したプロモーターをさらに含む。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドは、遺伝子に対応し、ここで、プロモーターは、その遺伝子についての野生型プロモーターである。
ベクター
一部の実施形態では、本明細書に記載される任意の核酸構築物を含むベクターが提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される任意の方法を使用して調製されたベクターが提供される。
一部の実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。
一部の実施形態では、ベクターは、プラスミド、バクテリオファージ、コスミド、S因子、レトロエレメント、レトロウイルス、ウイルス、人工染色体(例えば、YAC、BACまたはMAC)、ミニ染色体および染色体からなる群より選択される。
宿主細胞
一部の実施形態では、本明細書に記載される任意のポリペプチド、核酸構築物および/またはベクターを含む宿主細胞が提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される任意の方法を使用して調製されたベクターが提供される。
一部の実施形態では、宿主細胞は、発酵条件下で本明細書に記載される任意の抗PD-L1ダイアボディを産生することが可能である。
一部の実施形態では、宿主細胞は、原核生物細胞である。一部の実施形態では、宿主細胞は、細菌細胞(例えば、E.coli細胞)である。一部の実施形態では、宿主細胞は、真核生物細胞である。一部の実施形態では、宿主細胞は、酵母細胞である。一部の実施形態では、宿主細胞は、動物細胞である。一部の実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、宿主細胞は、CHO細胞である。
培養培地
一部の実施形態では、本明細書に記載される任意のダイアボディ、ポリヌクレオチド、核酸構築物、ベクター、および/または宿主細胞を含む培養培地が提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される任意の方法を使用して調製された培養培地が提供される。
一部の実施形態では、培地は、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよび/またはチミジンを含む(例えば、HAT培地)。一部の実施形態では、培地は、血清を含まない。一部の実施形態では、培地は、血清を含む。一部の実施形態では、培地は、D-MEMまたはRPMI-1640培地である。
VII.組成物、キットおよび製造物品
本明細書に記載されるダイアボディおよび/もしくは標識化剤(例えば、放射性核種化合物)のうちいずれか1つを含む組成物(例えば、製剤)、ダイアボディのうちいずれか1つをコードする核酸、ダイアボディのうちいずれか1つをコードする核酸を含むベクター、または核酸もしくはベクターを含む宿主細胞もまた、本明細書で提供される。
本明細書に記載される抗PD-L1ダイアボディおよび/または標識化剤(例えば、放射性核種化合物)の適切な製剤は、所望の程度の純度を有する抗体剤(例えば、抗PD-L1抗体剤)および/または標識化剤(例えば、放射性核種化合物)を、凍結乾燥された製剤または水溶液の形態の、必要に応じた薬学的に許容される担体、賦形剤または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980))と混合することによって得られ得る。許容される担体、賦形剤または安定剤は、使用される投薬量および濃度でレシピエントにとって非毒性であり、これには、緩衝液、例えば、リン酸、クエン酸および他の有機酸;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(例えば、塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム(octadecyldimethylbenzyl ammonium chloride);塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルもしくはベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えば、メチルもしくはプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾール);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチンもしくは免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドン(olyvinylpyrrolidone);アミノ酸、例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンもしくはリシン;グルコース、マンノースもしくはデキストリンを含む、単糖、二糖および他の炭水化物;キレート剤、例えば、EDTA;糖、例えば、スクロース、マンニトール、トレハロースもしくはソルビトール;塩形成性対イオン、例えば、ナトリウム;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);ならびに/または非イオン性界面活性剤、例えば、TWEEN(商標)、PLURONICS(商標)もしくはポリエチレングリコール(PEG)が含まれる。皮下投与のために適合された凍結乾燥された製剤は、WO97/04801に記載されている。かかる凍結乾燥された製剤は、適切な希釈剤によって、高いタンパク質濃度になるように再構成され得、再構成された製剤は、本明細書でイメージング、診断または処置される個体に、皮下投与され得る。
in vivo投与に使用される製剤は、無菌でなければならない。これは、例えば、無菌濾過メンブレンを介した濾過によって、容易に達成される。
一部の実施形態では、本明細書に記載されるダイアボディのいずれかおよびキレート剤を含むキットが提供される。一部の実施形態では、キットは、標識化剤(例えば、放射性核種)をさらに含む。
本明細書に記載される抗PD-L1ダイアボディもしくはダイアボディ剤のうちいずれか1つおよび/または標識化剤(例えば、放射性核種化合物)を含むキットもまた提供される。キットは、本明細書に記載されるイメージング、診断および処置の方法のいずれかのために有用であり得る。
一部の実施形態では、PD-L1に特異的に結合する抗PD-L1ダイアボディ、およびコンジュゲーション部分(例えば、TCOまたはTz)、を含むキットが提供される。
一部の実施形態では、標識(例えば、放射性核種、例えば、68Ga)を含む標識化剤、およびコンジュゲーション部分(例えば、TCOまたはTz)、を含むキットが提供される。一部の実施形態では、コンジュゲーション部分は、放射性核種をキレートするキレート剤(例えば、NOTA、DOTAまたはそれらの誘導体)をさらに含む。
一部の実施形態では、キットは、ダイアボディもしくはダイアボディ剤および/または標識化剤を送達することが可能なデバイスをさらに含む。非経口送達などの適用のためのデバイスの1つの型は、対象の身体中に組成物を注射するために使用されるシリンジである。吸入デバイスもまた、ある特定の適用のために使用され得る。
一部の実施形態では、キットは、疾患または状態、例えば、がん、感染性疾患、自己免疫性疾患または代謝疾患を処置するための治療剤をさらに含む。一部の実施形態では、治療剤は、PD-L1またはその受容体(例えば、PD-1)の阻害剤である。一部の実施形態では、治療剤は、PD-L1またはその受容体(例えば、PD-1)に特異的に結合する放射性標識された分子である。
本出願のキットは、適切な包装材料(packaging)中にある。適切な包装材料には、バイアル、ボトル、ジャー、可撓性包装材料(例えば、密封Mylarまたはプラスチックバッグ)などが含まれるがこれらに限定されない。キットは、必要に応じて、さらなる成分、例えば、緩衝液および説明情報を提供し得る。
したがって、本出願は、製造物品もまた提供する。製造物品は、容器、および容器上のまたは容器に関連する標識または添付文書を含み得る。適切な容器には、バイアル(例えば、密封バイアル)、ボトル、ジャー、可撓性包装材料などが含まれる。一般に、容器は、組成物を保持し、無菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、皮下注射針によって貫通可能なストッパーを有する静脈内溶液バッグまたはバイアルであり得る)。標識または添付文書は、組成物が、個体における特定の状態をイメージング、診断または処置するために使用されることを示す。標識または添付文書は、個体に組成物を投与するためおよび個体をイメージングするための指示をさらに含む。標識は、再構成および/または使用のための指示を示し得る。組成物を保持している容器は、再構成された製剤の反復投与(例えば、2~6回の投与)を可能にする、複数回使用バイアルであり得る。添付文書は、そのような診断用製品の使用に関する適応症、用法、投薬量、投与、禁忌および/または警告についての情報を含む診断用製品の市販の包装中に通例含まれる指示を指す。さらに、製造物品は、薬学的に許容される緩衝液、例えば、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝食塩水、リンゲル溶液およびデキストロース溶液を含む第2の容器をさらに含み得る。これは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針およびシリンジを含む、商業的観点およびユーザーの観点から望ましい他の材料をさらに含み得る。
キットまたは製造物品は、病院の薬局および調合薬局などの薬局での貯蔵および使用のために十分な量で包装された、複数の単位用量の組成物および使用のための指示を含み得る。
当業者は、いくつかの実施形態が、本発明の範囲および精神の範囲内で可能であることを認識するであろう。本発明は、ここに、以下の非限定的な例を参照して、より詳細に記載される。以下の例は、本発明をさらに例示するが、当然、その範囲を限定すると決して解釈すべきではない。
例示的な実施形態
1.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、またはHC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、またはLC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、ダイアボディ。
2.a)Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、実施形態1に記載のダイアボディ。
3.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)第1のポリペプチドのVおよびV、b)第2のポリペプチドのVおよびV、c)第1のポリペプチドのVおよび第2のポリペプチドのV、またはd)第2のポリペプチドのVおよび第1のポリペプチドのVが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、a)VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびにb)VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、ダイアボディ。
4.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびにb)Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、ダイアボディ。
5.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、共有結合を介して連結される、実施形態1~4のいずれか1つに記載のダイアボディ。
6.共有結合が、第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の共有結合を含む、および/または共有結合が、第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間にある、実施形態5に記載のダイアボディ。
7.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、2つまたはそれよりも多くの共有結合を介して連結される、実施形態1~6のいずれか1つに記載のダイアボディ。
8.2つまたはそれよりも多くの共有結合が、a)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第1の共有結合;およびb)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第2の共有結合を含む、実施形態7に記載のダイアボディ。
9.共有結合が、ジスルフィド結合を含む、実施形態5~8のいずれか1つに記載のダイアボディ。
10.2つまたはそれよりも多くの共有結合が、少なくとも2つのジスルフィド結合を含む、実施形態7に記載のダイアボディ。
11.少なくとも2つのジスルフィド結合が、a)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第1のジスルフィド結合;およびb)第1のポリペプチドのVと第2のポリペプチドのVとの間の第2のジスルフィド結合を含む、実施形態10に記載のダイアボディ。
12.ジスルフィド結合、または少なくとも2つのジスルフィド結合のうち1つが、a)第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される、実施形態9~11のいずれか1つに記載のダイアボディ。
13.第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチド中のVが、Kabat番号付けシステムに従って、G44C変異またはQ105C変異を含む、実施形態1~12のいずれか1つに記載のダイアボディ。
14.第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチド中のVが、Kabat番号付けシステムに従って、Q100C変異またはA43C変異を含む、実施形態1~13のいずれか1つに記載のダイアボディ。
15.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVが各々、G44C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVが各々、Q100C変異を含み、第1のポリペプチドのV中のG44Cおよび第2のポリペプチドのV中のQ100Cが、第1のジスルフィド結合を形成し、第1のポリペプチドのV中のQ100Cおよび第2のポリペプチドのV中のG44Cが、第2のジスルフィド結合を形成する、実施形態1~14のいずれか1つに記載のダイアボディ。
16.第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVが各々、Q105C変異を含み、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド中のVが各々、A43C変異を含む、実施形態1~14のいずれか1つに記載のダイアボディ。
17.第1のポリペプチドのVおよびVが、ペプチドリンカーを介して互いに融合される、実施形態1~16のいずれか1つに記載のダイアボディ。
18.第2のポリペプチドのVおよびVが、ペプチドリンカーを介して互いに融合される、実施形態1~17のいずれか1つに記載のダイアボディ。
19.ペプチドリンカーが、約1~30アミノ酸の長さを有する、実施形態17または実施形態18に記載のダイアボディ。
20.ペプチドリンカーが、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態17~19のいずれか1つに記載のダイアボディ。
21.第1のポリペプチドまたは第2のポリペプチドが、ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチドをさらに含む、実施形態1~20のいずれか1つに記載のダイアボディ。
22.シグナルペプチドが、配列番号35のアミノ酸配列を含む、実施形態21に記載のダイアボディ。
23.Vが、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態1~22のいずれか1つに記載のダイアボディ。
24.Vが、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態1~23のいずれか1つに記載のダイアボディ。
25.第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドが、タグをさらに含む、実施形態1~24のいずれか1つに記載のダイアボディ。
26.タグが、第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドのC末端に融合される、実施形態25に記載のダイアボディ。
27.タグが、His-タグを含む、実施形態25または実施形態26に記載のダイアボディ。
28.タグが、第2のリンカーを介してポリペプチドに融合される、実施形態25~27のいずれか1つに記載のダイアボディ。
29.第2のリンカーが、約4~15アミノ酸の長さを有する、実施形態28に記載のダイアボディ。
30.第2のリンカーが、GGGGSのアミノ酸配列を含む、実施形態28または実施形態29に記載のダイアボディ。
31.第1のポリペプチドおよび/または第2のポリペプチドが、配列番号36~43のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態1~30のいずれか1つに記載のダイアボディ。
32.実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
33.実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディをコードするポリヌクレオチド。
34.実施形態33に記載のポリヌクレオチドを含み、必要に応じて、ポリヌクレオチドと作動するように接続したプロモーターをさらに含む、核酸構築物。
35.実施形態34に記載の核酸構築物を含むベクター。
36.実施形態33に記載のポリヌクレオチド、実施形態34に記載の核酸構築物または実施形態35に記載のベクターを含む、単離された宿主細胞。
37.実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディ、実施形態33に記載のポリヌクレオチド、実施形態34に記載の核酸構築物、実施形態35に記載のベクターまたは実施形態36に記載の宿主細胞を含む、培養培地。
38.抗PD-L1ダイアボディを産生する方法であって、a)実施形態36に記載の単離された宿主細胞を、ダイアボディを発現するのに有効な条件下で培養するステップ;およびb)宿主細胞から、発現されたダイアボディを得るステップ、を含む、方法。
39.個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、a)個体に、放射性核種で標識された実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;およびb)個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む、方法。
40.疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、a)実施形態39に記載の方法を使用して、個体におけるPD-L1の分布を決定するステップ;およびb)イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、個体を、PD-L1について陽性と診断する、またはイメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、を含む、方法。
41.疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、a)実施形態40に記載の方法を使用して、個体を診断するステップ;およびb)個体がPD-L1について陽性と診断される場合に、個体に、有効量のPD-L1を標的化する治療剤を投与するステップ、を含む、方法。
42.疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、個体に、有効量の、実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディまたは実施形態32に記載の医薬組成物を投与するステップを含む、方法。
43.放射性核種で標識された実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディを含むイメージング剤。
44.PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、a)キレート化合物を、実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディにコンジュゲートして、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートを提供するステップ;b)放射性核種を、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートと接触させ、それによって、イメージング剤を提供するステップ、を含む、方法。
45.a)実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディ;b)キレート剤、を含む、キット。
46.放射性核種をさらに含む、実施形態45に記載のキット。
47.個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、個体に、実施形態1~31のいずれか1つに記載のダイアボディおよび第1のコンジュゲーション部分を含む有効量のダイアボディ剤を投与するステップ;個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物を引き続いて投与するステップであって、第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、ステップ;ならびに個体中のイメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、を含む、方法。
48.第1のコンジュゲーション部分および第2のコンジュゲーション部分が各々、クリックケミストリー対のメンバーを含み、クリックケミストリーを介して互いにコンジュゲートされる、実施形態47に記載の方法。
以下の実施例は、純粋に本発明の例示を意図し、したがって、本発明を限定すると決して解釈すべきではない。以下の実施例および詳細な説明は、例示として提供されるのであって、限定としてではない。
(実施例1)
抗hPD-L1 scFvの生成
抗hPD-L1 scFvのための構築物設計の概略図は、図1に示される。具体的には、ヒト化抗hPD-L1抗体由来のVおよびV抗原結合ドメインならびにその間のペプチドリンカーを含む断片を、人工的に合成した。図1中の構築物Aを参照のこと。さらに、単鎖ジスルフィド安定化Fv断片(sc-dsFv)もまた、V44/V100またはV105/V43(Kabat番号付けシステムに従う)において単一の変異を導入することによって構築した。図1中の構築物Bおよび構築物Cを参照のこと。3つの構築物のVおよびV配列については、表3を参照のこと。VおよびVを含む断片は、それぞれ5’および3’末端における制限エンドヌクレアーゼHindIIIおよびEcoRI認識部位、ならびに短いペプチドリンカーを介してC末端に融合されたHisタグ配列もまた含んだ。次いで、融合された重鎖および軽鎖を、PXC17.4発現ベクターの対応するHindIIIおよびEcoRI認識部位中にクローニングした。
表3.抗PD-L1 scFvの配列
Figure 2022518478000004
Figure 2022518478000005
(実施例2)
抗PD-L1ダイアボディの構築および発現
ダイアボディ構築に対応するモノマー形態の模式図を図2に示した。具体的には、V(G44C)およびV(Q100C)遺伝子断片を、図1中の構築物Bから、PCRによって生成した。V(Q105C)およびV(A43C)遺伝子断片を、図1中の構築物Cから、PCRによって生成した。V(G44C)およびV(Q100C)遺伝子断片を、重複PCRによって一緒に融合させ、H44/L100と命名した;V(Q105C)およびV(A43C)遺伝子断片を、重複PCRによって一緒に融合させ、H105/L43と命名した。PCRおよび重複PCRの間に使用したPCRプライマーについては、表4を参照のこと。
表4. PCRプライマー
Figure 2022518478000006
H44/L100およびH105/L43 PCR産物を、それぞれ、HindIIIおよびEcoRIによって消化した。消化された産物を、PXC17.4発現ベクター中に挿入した。2つの産物の発現を、一過的トランスフェクションの5日後に、CHO細胞において評価した。細胞培養上清を回収し、消化されたH44/L100またはH105/L43 PCR産物の発現から生成されたタンパク質産物を、CaptoL親和性カラムによって精製した。発現結果を表5に示した。H44/L100についての精製されたタンパク質を、ダイアボディ形態およびモノマー形態の比率について分析した。総タンパク質のうち約85%は、ダイアボディ形態にある。ダイアボディ形態を、サイズ排除クロマトグラフィーまたはイオン交換クロマトグラフによって、100%の純度で精製した。
表5
Figure 2022518478000007
(実施例3)
抗PD-L1-ダイアボディおよび抗PD-L1 scFvのPD-L1結合親和性
実施例2に例示したように生成した抗PD-L1ダイアボディ(H44/L100)、図1中の構築物Aから生成した抗PD-L1 scFv、および抗PD-L1 IgG抗体(同じCDRを有する)を、それらのPD-L1結合親和性について試験した。表6に示されるように、ダイアボディ形態は、scFv形態よりも、PD-L1に対する予想外に高い結合親和性を有する。
表6
Figure 2022518478000008
(実施例4)
抗PD-L1-ScFvおよびNOTAのカップリング、ならびに68GaによるNOTA-抗PD-L1 scFvの標識化
NOTAを、図1中の構築物Aから生成した抗PD-L1 scFvとカップリングさせた。カップリング後、抗PD-L1 scFvを、同位体68Gaで標識した。具体的には、400μLの総体積の抗PD-L1-scFvを、8.7のpHを有する0.05M NaHCO-NaCO緩衝液100μL中に添加し、その後、16000rpmで20分間遠心分離した。上清を除去して、100μLの最終体積を達成した。上記ステップを一回よりも多く反復し、最終溶液を、1.5mL遠心分離管に移した。次いで、2.75μLの体積のp-SCN-Bn-NOTAを、遠心分離管に添加し、その後、37℃で1時間インキュベートした。
scFv/NOTA溶液を、PBSで事前に平衡したNAP-5カラムに添加した。次いで、カラムを、0.4mLのPBSで洗浄し、0.5mLのPBSで溶出させた。溶出液を、0.05mLの体積を有する部分へとアリコートにし、-20℃で貯蔵した。
68Gaは、2.4mCi/1mL HClの最終濃度で、0.05N HClに溶出された。次いで、93μLの体積の1.25M酢酸ナトリウムを添加して、68Ga溶液のpHを4.0に調整した。50μLの体積のNOTA-抗PD-L1 scFv(0.05mg/ml)を、350uL 68Ga溶液と混合し、その後、25℃で10分間インキュベートした。標識化率を、0.1Mクエン酸ナトリウムを展開溶媒として使用する薄層クロマトグラフィー紙上での展開によって決定した。NAP-5カラムを、PBSで平衡化し、次いで、400uLの体積の標識された産物を添加した。濾過後、400uL PBSを添加した。濾液は収集しなかった。次いで、400uL PBSを添加し、濾液を収集した。産物の放射化学的純度を、0.1Mクエン酸ナトリウムを展開溶媒として使用するインスタント薄層クロマトグラフィー-シリコーンゲル(ITLC-SG)上での展開によって決定した。起点は、産物に対応し、展開溶媒フロントは、遊離68Gaに対応した。
図3A~3Bに示されるように、68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvの標識化率は、66.9%であった。精製後、放射化学的純度は、95.9%であった。
(実施例5)
68Ga-抗PD-L1-ScFvの細胞結合
MC38およびMC38-B7H1細胞を、トリプシンで消化し、次いで、培養し、計数した。各型の細胞を、1ウェル当たり2.5×10細胞/0.5mLで、24ウェルプレート中にプレートした。37℃での一晩のインキュベーション後、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ScFvを、36nMの最終濃度で各型の細胞に添加し、細胞を37℃で0.5時間維持した。引き続いて、氷冷PBSを添加して、細胞を3回洗浄した。次いで、細胞を、0.1M NaOHで溶解させた。細胞溶解物を収集し、計数した。データ分析およびプロッティングを、GraphPad Prismソフトウェアを使用して実施した。MC38-B7H1細胞またはMC38細胞への68Ga-NOTA-抗PD-L1-ScFvの結合を、図4Aに示した。
別々の実験において、MC38-B7H1細胞を、トリプシンで消化し、次いで、培養し、計数した。細胞を、1ウェル当たり2.5×10細胞/0.5mLで、24ウェルプレート中にプレートした。37℃での一晩のインキュベーション後、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ScFvを、1.8μMの最終濃度の未標識の抗PD-L1 scFvの存在下または非存在下で、36nMの最終濃度で細胞に添加した。次いで、細胞を37℃で0.5時間維持した。引き続いて、氷冷PBSを添加して、細胞を3回洗浄した。次いで、細胞を、0.1M NaOHで溶解させた。細胞溶解物を収集し、計数した。データ分析およびプロッティングを、GraphPad Prismソフトウェアを使用して実施した。図4Bに示されるように、MC38-B7H1細胞への68Ga-NOTA-抗PD-L1-ScFvの結合は、未標識の抗PD-L1-scFvによって有意に遮断された。
(実施例6)
68Ga-抗PD-L1-scFvのin vivoイメージング
約6~8週齢の合計10匹の雄性マウスに、MC38細胞およびMC38-B7H1細胞を同時に投与した。具体的には、40万個のMC38細胞を、マウスの左側腹中に注射し、40万個のMC38-B7H1細胞を、右側腹中に注射した。注射の7日後、腫瘍は、直径約0.5cmのサイズまで成長した。次いで、マウスをin vivoイメージングに使用した。5匹のマウスに、尾静脈を介して40μCi 68Ga-抗抗PD-L1-scFvを投与した。他の5匹のマウスに、1:50のモル比で、40μCi 68Ga-抗抗PD-L1-scFvおよび未標識の非放射性抗PD-L1抗体を同時発生的に投与した。マウスを、注射の1時間後および2時間後にイメージングした。
68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvのみの注射後、MC38-B7H1腫瘍(右側腹)は、強く染色された。MC38腫瘍(左側腹)は、腎臓における最も高い摂取を伴って、弱く染色された。注射の120分後のイメージは、注射の60分後のイメージよりも、増加した感度を有した。図5Aを参照のこと。図5Bに示されるように、50倍過剰の未標識の抗PD-L1抗体は、未標識の抗PD-L1抗体および68Ga-NOTA-抗PD-L1-scFvの両方を注射したマウスにおいて、B7-H1陽性腫瘍のイメージングを遮断した。図5Bを参照のこと。
(実施例7)
抗PD-L1ダイアボディおよびNOTAのカップリング、ならびにNOTA-抗PD-L1-ダイアボディの68Ga標識化
NOTAを、実施例2に例示したようにH44/L100産物から産生した抗PD-L1ダイアボディとカップリングした。カップリング後、抗PD-L1ダイアボディを、同位体68Gaで標識した。具体的には、400μL抗PD-L1ダイアボディを、8.7のpHを有する0.05M NaHCO-NaCO緩衝液100μL中に添加し、その後、16000rpmで20分間遠心分離し、100μLに濃縮した。次いで、これを、16000rpmで20分間の遠心分離のために、0.05M NaHCO-NaCO緩衝液400μL中に添加する。上清を除去して、100μLの最終体積を達成した。最終溶液を、1.5mL遠心分離管に移した。次いで、2.75μLの体積のp-SCN-Bn-NOTAを、遠心分離管に添加し、その後、37℃で1時間インキュベートした。
ダイアボディ/NOTA溶液を、PBSで事前に平衡したNAP-5カラムに添加した。次いで、カラムを、0.4mLのPBSで洗浄し、0.5mLのPBSで溶出させた。溶出液を、0.05mLの体積を有する部分へとアリコートにし、-20℃で貯蔵した。
68Gaは、2.4mCi/1mL HClの最終濃度で、0.05N HClに溶出された。次いで、93μLの体積の1.25M酢酸ナトリウムを添加して、68Ga溶液のpHを4.0に調整した。50μLの体積のNOTA-抗PD-L1ダイアボディ(1.0mg/ml)を、350uL 68Ga溶液と混合し、その後、25℃で10分間インキュベートした。標識化率を、0.1Mクエン酸ナトリウムを展開溶媒として使用する薄層クロマトグラフィー紙上での展開によって決定した。NAP-5カラムを、PBSで平衡化し、次いで、400uLの体積の標識された産物を添加した。濾過後、400μL PBSを添加した。濾液は収集しなかった。次いで、400μL PBSを添加し、濾液を収集した。産物の放射化学的純度を、0.1Mクエン酸ナトリウムを展開溶媒として使用するインスタント薄層クロマトグラフィー-シリコーンゲル(ITLC-SG)上での展開によって決定した。起点は、産物に対応し、展開溶媒フロントは、遊離68Gaに対応した。
図6A~6Bに示されるように、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの標識化率は、62.0%であった。精製後、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの放射化学的純度は、98.1%であった。
(実施例8)
68Ga-抗PD-L1-ダイアボディについての細胞結合実験
MC38およびMC38-B7H1細胞を、トリプシンで消化し、次いで、培養し、計数した。各型の細胞を、1ウェル当たり2.5×10細胞/0.5mLで、24ウェルプレート中にプレートした。37℃での一晩のインキュベーション後、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディを、36nMの最終濃度で各型の細胞に添加し、細胞を37℃で0.5時間維持した。引き続いて、氷冷PBSを添加して、細胞を3回洗浄した。次いで、細胞を、0.1M NaOHで溶解させた。細胞溶解物を収集し、計数した。データ分析およびプロッティングを、GraphPad Prismソフトウェアを使用して実施した。図7Aに示されるように、MC38-B7H1細胞への68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの結合は、MC38細胞へのその結合よりも高かった。
別々の実験において、MC38-B7H1細胞を、トリプシンで消化し、次いで、培養し、計数した。細胞を、1ウェル当たり2.5×10細胞/0.5mLで、24ウェルプレート中にプレートした。37℃での一晩のインキュベーション後、68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディを、1.8μMの最終濃度の未標識の抗PD-L1ダイアボディの存在下または非存在下で、36nMの最終濃度で細胞に添加した。次いで、細胞を37℃で0.5時間維持した。引き続いて、氷冷PBSを添加して、細胞を3回洗浄した。次いで、細胞を、0.1M NaOHで溶解させた。細胞溶解物を収集し、計数した。データ分析およびプロッティングを、GraphPad Prismソフトウェアを使用して実施した。MC38-B7H1細胞への68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディの結合は、未標識の抗PD-L1ダイアボディによって有意に遮断された。図7Bを参照のこと。
(実施例9)
68Ga-抗PD-L1-ダイアボディのin vivoイメージング
約6~8週齢の合計10匹の雄性マウスに、MC38細胞およびMC38-B7H1細胞を同時に投与した。具体的には、40万個のMC38細胞を、マウスの左側腹中に注射し、40万個のMC38-B7H1細胞を、右側腹中に注射した。注射の7日後、腫瘍は、直径約0.5cmのサイズまで成長した。次いで、マウスをin vivoイメージングに使用した。5匹のマウスに、尾静脈を介して40uCi 68Ga-抗抗PD-L1-ダイアボディを投与した。他の5匹のマウスに、1:50のモル比で、40uCi 68Ga-抗抗PD-L1-ダイアボディおよび未標識の非放射性抗PD-L1抗体を同時発生的に投与した。マウスを、注射の1時間後および2時間後にイメージングした。
68Ga-NOTA-抗PD-L1-ダイアボディのみの注射後、MC38-B7H1腫瘍(右側腹)は、強く染色された。MC38腫瘍(左側腹)は、腎臓における最も高い摂取を伴って、弱く染色された。注射の120分後のイメージは、注射の60分後のイメージよりも、増加した感度を有した。図8Aを参照のこと。50倍過剰の未標識の抗PD-L1抗体は、未標識の抗PD-L1抗体および68Ga-NOTA-抗PD-L1ダイアボディの両方を注射したマウスにおいて、B7H1陽性腫瘍のイメージングを遮断した。図8Bを参照のこと。
(実施例10)
68Ga-抗PD-L1-scFvおよび68Ga-抗PD-L1-ダイアボディによるイメージングの比較
68Ga-抗PD-L1-scFvおよび68Ga-抗PD-L1-ダイアボディの注射の1時間後の代表的イメージングの比較は、68Ga-抗PD-L1-ダイアボディが、より明確なイメージングを伴って、68Ga-抗PD-L1-scFvよりも良好であったことを示した。図9を参照のこと。これは、より高い肝臓摂取もまた有した。
上の実施例は、68Ga標識されたダイアボディがPD-L1陽性腫瘍をイメージングするために使用され得ることを少なくとも実証した。
配列表
Figure 2022518478000009
Figure 2022518478000010
Figure 2022518478000011
Figure 2022518478000012
Figure 2022518478000013
Figure 2022518478000014
Figure 2022518478000015

Claims (48)

  1. 第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、
    a)前記Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むHC-CDR3、または前記HC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む;ならびに
    b)前記Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含むLC-CDR3、または前記LC-CDR中に最大で合計約5アミノ酸の置換を含むそれらのバリアントを含む、
    ダイアボディ。
  2. a)前記Vが、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびに
    b)前記Vが、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、
    請求項1に記載のダイアボディ。
  3. 第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、a)前記第1のポリペプチドの前記Vおよび前記V、b)前記第2のポリペプチドの前記Vおよび前記V、c)前記第1のポリペプチドの前記Vおよび前記第2のポリペプチドの前記V、またはd)前記第2のポリペプチドの前記Vおよび前記第1のポリペプチドの前記Vが、第2の重鎖可変領域(VH-2)および第2の軽鎖可変領域(VL-2)を含む抗PD-L1抗体と競合的にPD-L1に特異的に結合する結合ドメインを形成し、
    a)前記VH-2が、配列番号1のアミノ酸配列を含むHC-CDR1、配列番号6のアミノ酸配列を含むHC-CDR2および配列番号11のアミノ酸配列を含むHC-CDR3を含む;ならびに
    b)前記VL-2が、配列番号14のアミノ酸配列を含むLC-CDR1、配列番号17のアミノ酸配列を含むLC-CDR2および配列番号20のアミノ酸配列を含むLC-CDR3を含む、
    ダイアボディ。
  4. 第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む単離された抗PD-L1ダイアボディであって、前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチドが各々、重鎖可変領域(V)および軽鎖可変領域(V)を含み、
    a)前記Vが、配列番号22~24のいずれかに示される配列を有する第2の重鎖可変領域(VH-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むHC-CDR1、HC-CDR2およびHC-CDR3を含む;ならびに
    b)前記Vが、配列番号25~27のいずれかに示される配列を有する第2の軽鎖可変領域(VL-2)内のCDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列をそれぞれ含むLC-CDR1、LC-CDR2およびLC-CDR3を含む、
    ダイアボディ。
  5. 前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチドが、共有結合を介して連結される、請求項1から4のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  6. 前記共有結合が、前記第1のポリペプチドの前記Vと前記第2のポリペプチドの前記Vとの間の共有結合を含む、および/または共有結合が、前記第1のポリペプチドの前記Vと前記第2のポリペプチドの前記Vとの間にある、請求項5に記載のダイアボディ。
  7. 前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチドが、2つまたはそれよりも多くの共有結合を介して連結される、請求項1から6のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  8. 前記2つまたはそれよりも多くの共有結合が、a)前記第1のポリペプチドの前記Vと前記第2のポリペプチドの前記Vとの間の第1の共有結合;およびb)前記第1のポリペプチドの前記Vと前記第2のポリペプチドの前記Vとの間の第2の共有結合を含む、請求項7に記載のダイアボディ。
  9. 前記共有結合が、ジスルフィド結合を含む、請求項5から8のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  10. 前記2つまたはそれよりも多くの共有結合が、少なくとも2つのジスルフィド結合を含む、請求項7に記載のダイアボディ。
  11. 前記少なくとも2つのジスルフィド結合が、a)前記第1のポリペプチドの前記Vと前記第2のポリペプチドの前記Vとの間の第1のジスルフィド結合;およびb)前記第1のポリペプチドの前記Vと前記第2のポリペプチドの前記Vとの間の第2のジスルフィド結合を含む、請求項10に記載のダイアボディ。
  12. 前記ジスルフィド結合、または前記少なくとも2つのジスルフィド結合のうち1つが、a)前記第1のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基および前記第2のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基、ならびに/またはb)前記第1のポリペプチドのLC-FR4中のシステイン残基および前記第2のポリペプチドのHC-FR2中のシステイン残基によって形成される、請求項9から11のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  13. 前記第1のポリペプチドおよび/または前記第2のポリペプチド中の前記Vが、Kabat番号付けシステムに従って、G44C変異またはQ105C変異を含む、請求項1から12のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  14. 前記第1のポリペプチドおよび/または前記第2のポリペプチド中の前記Vが、Kabat番号付けシステムに従って、Q100C変異またはA43C変異を含む、請求項1から13のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  15. 前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチド中の前記Vが各々、G44C変異を含み、前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチド中の前記Vが各々、Q100C変異を含み、前記第1のポリペプチドの前記V中の前記G44Cおよび前記第2のポリペプチドの前記V中の前記Q100Cが、第1のジスルフィド結合を形成し、前記第1のポリペプチドの前記V中の前記Q100Cおよび前記第2のポリペプチドの前記V中の前記G44Cが、第2のジスルフィド結合を形成する、請求項1から14のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  16. 前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチド中の前記Vが各々、Q105C変異を含み、前記第1のポリペプチドおよび前記第2のポリペプチド中の前記Vが各々、A43C変異を含む、請求項1から14のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  17. 前記第1のポリペプチドの前記Vおよび前記Vが、ペプチドリンカーを介して互いに融合される、請求項1から16のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  18. 前記第2のポリペプチドの前記Vおよび前記Vが、ペプチドリンカーを介して互いに融合される、請求項1から17のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  19. 前記ペプチドリンカーが、約1~30アミノ酸の長さを有する、請求項17または請求項18に記載のダイアボディ。
  20. 前記ペプチドリンカーが、配列番号28~34のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項17から19のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  21. 前記第1のポリペプチドまたは前記第2のポリペプチドが、前記ポリペプチドのN末端に融合されたシグナルペプチドをさらに含む、請求項1から20のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  22. 前記シグナルペプチドが、配列番号35のアミノ酸配列を含む、請求項21に記載のダイアボディ。
  23. 前記Vが、配列番号22~24のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項1から22のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  24. 前記Vが、配列番号25~27のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項1から23のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  25. 前記第1のポリペプチドおよび/または前記第2のポリペプチドが、タグをさらに含む、請求項1から24のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  26. 前記タグが、前記第1のポリペプチドおよび/または前記第2のポリペプチドのC末端に融合される、請求項25に記載のダイアボディ。
  27. 前記タグが、His-タグを含む、請求項25または請求項26に記載のダイアボディ。
  28. 前記タグが、第2のリンカーを介して前記ポリペプチドに融合される、請求項25から27のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  29. 前記第2のリンカーが、約4~15アミノ酸の長さを有する、請求項28に記載のダイアボディ。
  30. 前記第2のリンカーが、GGGGSのアミノ酸配列を含む、請求項28または請求項29に記載のダイアボディ。
  31. 前記第1のポリペプチドおよび/または前記第2のポリペプチドが、配列番号36~43のうちいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項1から30のいずれか一項に記載のダイアボディ。
  32. 請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
  33. 請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディをコードするポリヌクレオチド。
  34. 請求項33に記載のポリヌクレオチドを含み、必要に応じて、前記ポリヌクレオチドと作動するように接続したプロモーターをさらに含む、核酸構築物。
  35. 請求項34に記載の核酸構築物を含むベクター。
  36. 請求項33に記載のポリヌクレオチド、請求項34に記載の核酸構築物または請求項35に記載のベクターを含む、単離された宿主細胞。
  37. 請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディ、請求項33に記載のポリヌクレオチド、請求項34に記載の核酸構築物、請求項35に記載のベクターまたは請求項36に記載の宿主細胞を含む、培養培地。
  38. 抗PD-L1ダイアボディを産生する方法であって、
    a)請求項36に記載の単離された宿主細胞を、前記ダイアボディを発現するのに有効な条件下で培養するステップ;および
    b)前記宿主細胞から、発現された前記ダイアボディを得るステップ、
    を含む、方法。
  39. 個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、
    a)前記個体に、放射性核種で標識された請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディを含むイメージング剤を投与するステップ;および
    b)前記個体中の前記イメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を用いてイメージングするステップ、
    を含む、方法。
  40. 疾患または状態を有する個体を診断する方法であって、
    a)請求項39に記載の方法を使用して、前記個体におけるPD-L1の分布を決定するステップ;および
    b)前記イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出される場合に、前記個体を、PD-L1について陽性と診断する、または前記イメージング剤のシグナルが目的の組織において検出されない場合に、前記個体を、PD-L1について陰性と診断するステップ、
    を含む、方法。
  41. 疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、
    a)請求項40に記載の方法を使用して、前記個体を診断するステップ;および
    b)前記個体がPD-L1について陽性と診断される場合に、前記個体に、有効量のPD-L1を標的化する治療剤を投与するステップ、
    を含む、方法。
  42. 疾患または状態を有する個体を処置する方法であって、前記個体に、有効量の、請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディまたは請求項32に記載の医薬組成物を投与するステップを含む、方法。
  43. 放射性核種で標識された請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディを含むイメージング剤。
  44. PD-L1を標的化するイメージング剤を調製する方法であって、
    a)キレート化合物を、請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディにコンジュゲートして、抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートを提供するステップ;
    b)放射性核種を、前記抗PD-L1ダイアボディコンジュゲートと接触させ、それによって、前記イメージング剤を提供するステップ、
    を含む、方法。
  45. a)請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディ;
    b)キレート剤
    を含む、キット。
  46. 放射性核種をさらに含む、請求項45に記載のキット。
  47. 個体におけるPD-L1の分布を決定する方法であって、
    (a)前記個体に、請求項1から31のいずれか一項に記載のダイアボディおよび第1のコンジュゲーション部分を含む有効量のダイアボディ剤を投与するステップ;
    (b)前記個体に、放射性核種および第2のコンジュゲーション部分を含む有効量の放射性核種化合物を引き続いて投与するステップであって、前記第1のコンジュゲーション部分および前記第2のコンジュゲーション部分が、互いにin vivoでコンジュゲートされて、イメージング剤を提供する、ステップ;ならびに
    (c)前記個体中の前記イメージング剤を、非侵襲性イメージング技法を使用してイメージングするステップ、
    を含む、方法。
  48. 前記第1のコンジュゲーション部分および前記第2のコンジュゲーション部分が各々、クリックケミストリー対のメンバーを含み、クリックケミストリーを介して互いにコンジュゲートされる、請求項47に記載の方法。
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