JP2022516703A - 免疫療法のための微生物由来のペプチドおよびタンパク質 - Google Patents

Abstract

本開示は、様々なヒトの疾患を治療する際の有用性を有する、治療用ペプチドおよび当該ペプチドを含む薬学的組成物を提供する。特定の態様では、開示された治療用ペプチドは、哺乳動物の免疫系の調節分子およびエフェクター分子を調節して疾患を軽減するための免疫療法薬として有用である。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
この出願は、２０１９年１月６日に出願された米国仮特許出願第６２／７８８，９５０号の優先権を主張し、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

電子的に提出されたテキストファイルの説明
本明細書と共に電子的に提出されたテキストファイルの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる：配列リストのコンピュータ可読フォーマットコピー（ファイル名：４７１９２＿００１５ＷＯ１＿ＳＴ２５．ｔｘｔ、データ記録日、２０２０年１月６日、ファイルサイズ：約４キロバイト）。

分野
本開示は、とりわけ、哺乳動物の適応性および先天性免疫系に関連する疾患ならびに免疫学関連障害の治療に適用される、新規ペプチド、および当該ペプチドを含む薬学的組成物に関する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のペプチドおよび薬学的組成物は、原発性および転移性腫瘍性疾患などの免疫腫瘍学疾患状態の治療または予防において特定の用途を有する。

背景
炎症性および免疫関連疾患は、複雑な、しばしば複数の相互接続した生物学的経路の徴候または結果であり、この経路は、正常な生理学において、損傷または傷害への応答、損傷または傷害からの修復の開始、ならびに異物に対する先天的および後天的な防御の開始に不可欠である。疾患または病状は、これらの正常な生理学的経路が、応答の強度と直接関連して、異常な調節もしくは過度の刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組み合わせとして、さらなる損傷または傷害を引き起こす場合に起こる。

これらの疾患の発生は、しばしば、多段階経路、およびしばしば、複数の生物学的系または経路を含むが、これらの経路のうちの１つ以上における決定的な時点での介入は、寛解または治療の効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用、または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって行われ得る。多くの免疫関連疾患は、公知であり、かつ広範に研究されてきた。このような疾患には、炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、腫瘍性疾患などが含まれる。

がんは、２番目に多い死因であり、米国では４人に１人の死亡をもたらす。米国では、毎年１００万人超ががんに罹患しており、２０１６年には５９５，６９０人のがんによる死亡が発生したと推定された。米国では、高齢化が進み続けているため、がんの発生率が上昇し続けるであろうと予想することは理にかなっている。米国がん協会（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｓｏｃｉｅｔｙ）を参照のこと。

がんは、細胞の制御されない成長（すなわち、分裂）を伴う疾患である。がん細胞の制御されない増殖の一因となる既知の機構のうちのいくつかには、成長因子非依存性、ゲノム変異の検出不全、および不適切な細胞シグナル伝達が含まれる。正常な成長制御を無視するがん細胞の能力により、増殖速度が加速し得る。がんの原因は堅固に確立されていないが、がんの一因となるか、または少なくとも対象にがんの素因を与えることが知られている因子がいくつかある。このような要因には、特定の遺伝子の変異（例えば、乳がんのＢＲＣＡ遺伝子変異、大腸がんのＡＰＣ）、がんを誘発する疑いのある物質または発がん性物質への暴露（例えば、アスベスト、ＵＶ放射線）および乳がんなどの特定のがんに関する家族制体質が含まれる。

現在、がんは、外科手術、放射線療法、および化学療法を含む、様々な様式を使用して治療されている。治療様式の選択は、がんの種類、部位、および播種によって異なる。例えば、外科手術および放射線療法は、白血病およびリンパ腫などの非固形腫瘍がんを治療するために使用され得る。外科手術および放射線療法の利点の１つは、治療の効果をある程度制御し、したがって、体内の正常組織への毒性を制限する能力である。しかしながら、外科手術および放射線療法は、あらゆる残存するがん細胞または放射線抵抗性がん細胞に対処するために、化学療法を続けて行うことが多い。化学療法はまた、白血病およびリンパ腫などの播種性がんならびに転移に最も適切な治療法である。

多くの化学療法剤は、それらの増殖プロファイルに基づいてがん細胞を標的とするため、通常は増殖している胃腸管および骨髄などの組織も化学療法の影響を受けやすい。

多くの化学療法剤が、がんの治療のために開発されてきた。しかしながら、すべての腫瘍が化学療法剤などに反応するとは限らないが、最初は化学療法剤に反応しても、耐性を発現し得る。結果として、非特異的毒性の少ないさらに効果的な薬剤を見出すために、効果的な抗がん剤の探索が強化されている。

したがって、哺乳動物の免疫系の態様を活用してがんの治療と予防を支援する、追加のより安全ながん治療法を開発する大きな必要性がある。毎年新しいがん治療薬が市場に出回っているが、これらの治療法は、問題のある副作用をさらに伴っている。

本開示の概要
本開示は、対象の免疫応答を調節することができ、かつ対象において疾患を治療するために有益な方法で当該免疫応答を利用することができる新規ペプチド治療薬を提供することによって、医学界におけるこの重要な必要性に対処する。

本開示は、がん治療ならびに他の免疫関連障害および疾患を支援するために、Ｔ細胞、エフェクターＴ細胞、および樹状細胞を含むがこれらに限定されない、免疫調節細胞を調節する微生物ペプチドおよびそのバリアントを提供する。

したがって、上記で概説した問題に対処するために、本開示は、疾患を治療するために哺乳動物の免疫系の調節細胞およびエフェクター細胞および分子を調節するための、免疫療法薬学的組成物を提供する。いくつかの実施形態では、その疾患は、がんである。

本明細書で提供されるペプチド治療薬は、炎症性免疫応答および免疫腫瘍学に関連する多くの疾患を治療するのに有用である。

いくつかの実施形態では、本開示は、疾患を治療するために哺乳動物の免疫系の調節分子およびエフェクター分子を調節するための免疫療法組成物に向けられ、本明細書で配列番号１またはＳＧ－３－００２０と称されるアミノ酸配列を含む、精製された治療用タンパク質を含む。本開示は、配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質を包含する。いくつかの実施形態では、治療用タンパク質は、配列番号１と１００％未満同一である。他の実施形態では、治療用タンパク質は、配列番号１で同定されたアミノ酸配列に対して１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を含む。さらに他の実施形態では、配列番号１と１００％未満同一である治療用タンパク質は、配列番号１のアミノ酸配列からなる全長ペプチドの１つ以上の活性を保持している。

いくつかの実施形態では、免疫療法組成物（または治療用タンパク質）は、免疫細胞との治療用タンパク質のインキュベーションを含むインビトロアッセイにおいて免疫細胞を活性化する。他の実施形態では、免疫細胞は、ヒトまたはげっ歯類免疫細胞である。さらに他の実施形態では、げっ歯類免疫細胞は、マウス免疫細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）である。他の実施形態では、免疫細胞は、リンパ球および／または単球である。さらに他の実施形態では、免疫細胞は、樹状細胞である。

いくつかの実施形態では、インビトロでの免疫細胞との治療用タンパク質（または治療用タンパク質を含む組成物）のインキュベーションは、免疫細胞によるＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、ＩＬ－２３、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、および／またはＴＧＦ－βの産生または分泌の変化をもたらす。

いくつかの実施形態では、免疫細胞は、Ｔ細胞およびＮＫ細胞からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞は、ＣＤ３活性化Ｔ細胞（抗ＣＤ３免疫グロブリンとの接触によって活性化されるＴ細胞）である。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞の活性化は、１つ以上のサイトカインの分泌の増加を含む。他の実施形態では、１つ以上のサイトカインは、ＩＦＮ－γおよびＩＬ－２からなる群から選択される。

いくつかの実施形態では、免疫療法組成物（または治療用タンパク質）は、インビトロアッセイにおいて、ＣＤ３活性化Ｔ細胞によるサイトカイン分泌を増加させる。他の実施形態では、増加したサイトカイン分泌は、治療用ペプチドの非存在下で、ＣＤ３活性化Ｔ細胞によるサイトカイン分泌と比較される。さらに他の実施形態では、増加したサイトカイン分泌は、治療用ペプチドの非存在下で、ＣＤ３活性化Ｔ細胞によるサイトカイン分泌よりも少なくとも５％、１０％、２０％、２５％、３０％、４０％、または５０％の増加である。いくつかの実施形態では、増加したサイトカイン分泌は、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－２、ＩＬ－１０、およびＴＮＦ－αからなる群から選択されるサイトカインの分泌の増加を含む。

いくつかの実施形態では、組成物は、組成物を投与した対象において免疫細胞を活性化する。他の実施形態では、免疫細胞の活性化は、腫瘍微小環境における免疫細胞の数の増加を含む。さらに他の実施形態では、腫瘍微小環境における免疫細胞の数の増加は、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の免疫細胞頻度の増加を含む。さらに他の実施形態では、ＴＩＬは、ＮＫ細胞および／または活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む。

いくつかの実施形態では、組成物は、薬学的に許容される担体をさらに含む。

一態様では、ポリヌクレオチドが提供され、ポリヌクレオチドは、配列番号２と少なくとも５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列は、配列番号２と９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％未満同一である。例えば、いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、配列番号２と少なくとも５０％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、または９０％同一であり、配列番号２と９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％未満同一であるヌクレオチド配列を含む。

いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド配列は、配列番号１と１００％未満同一であるタンパク質をコードする。例えば、ポリヌクレオチドは、配列番号１と１００％未満同一であり、配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。さらに他の実施形態では、タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列は、配列番号２のコドンが、発現系における配列番号１の最適な発現のために修飾されるようにコドン最適化されるが、コドン最適化ヌクレオチド配列は、配列番号２と１００％同一ではない。さらに他の実施形態では、発現系は、原核生物または真核生物の発現系である。いくつかの実施形態では、原核生物系は、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）を含む。

いくつかの実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、配列番号１に示されるアミノ酸配列と少なくとも７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である。いくつかの実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、配列番号１と１００％の配列同一性を共有する。

いくつかの実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、配列番号１と少なくとも７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であり、配列番号１に示されるアミノ酸配列からなる全長ペプチドの１つ以上の活性を保持しているアミノ酸配列を含む。

いくつかの実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、配列番号１と少なくとも７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であり、投与を必要とする対象に投与された場合、ＩＬ－２および／またはＩＦＮ－γの分泌を増加させる機能的能力を有するアミノ酸配列を含む。

いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物の治療用ペプチドは、ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの炎症誘発性サイトカインの産生を誘導する。いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物のペプチドは、ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの炎症誘発性サイトカインの産生を誘導し、少なくとも１つのサイトカインは、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、およびＩＬ－２３からなる群から選択される。

いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物の治療用ペプチドは、ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの抗炎症性サイトカインの産生を抑制する。いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物のペプチドは、ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの抗炎症性サイトカインの産生を抑制し、少なくとも１つのサイトカインは、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される。

いくつかの実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、投与を必要とする対象に投与された場合、ＣＤ４＋ＣＤ２５＋、ＣＤ４＋ＰＤ－１＋、ＣＤ４＋ＩＣＯＳ＋、ＣＤ４＋ＯＸ４０＋、ＣＤ８＋ＣＤ２５＋、ＣＤ８＋ＰＤ－１＋、ＣＤ８＋ＩＣＯＳ＋、およびＣＤ８＋ＯＸ４０＋からなる群から選択される１つ以上のＴ細胞を増加させる。他の実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、投与を必要とする対象に投与された場合、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－２、ＩＬ－１０、およびＴＮＦ－αからなる群から選択される１つ以上のサイトカインの分泌を増加させる。

いくつかの実施形態では、組成物は、静脈内、皮下、局所、または経口投与のために製剤化された薬学的組成物である。他の実施形態では、組成物は、腫瘍微小環境への投与のために製剤化された薬学的組成物である。

いくつかの実施形態では、組成物は、液体、固体、半固体、ゲル、またはローションとして製剤化される。

一態様では、対象におけるインビボ免疫応答を調節する方法が提供され、この方法は、記載されるように、対象に、ＳＧ－３－００２０タンパク質またはそのバリアントを含む組成物を投与することを含む。

いくつかの実施形態では、インビボ免疫応答の調節は、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、ＩＬ－２３、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される１つ以上のサイトカインの血中または血漿レベルの変化を含む。

一態様では、投与を必要とする対象に、配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質を含む組成物を投与することを含む、治療方法が、提供される。いくつかの実施形態では、投与を必要とする対象は、結腸直腸がん（ＣＲＣ）、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、黒色腫、基底細胞がん、胆道がん、膀胱がん、骨がん、脳および中枢神経系がん、乳がん、子宮頸がん、絨毛がん、結腸直腸がん、結合組織がん、消化器のがん、子宮内膜がん、食道がん、眼がん、頭頸部のがん、胃がん、上皮内新生物、腎臓がん、喉頭がん、白血病、肝がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔がん、卵巣がん、膵臓がん、前立腺がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸がん、腎がん、呼吸器系のがん、肉腫、皮膚がん、胃がん、精巣がん、甲状腺がん、子宮がん、泌尿器系のがん、およびこれらの２つ以上の任意の組み合わせからなる群から選択される、疾患または障害があると診断されているか、またはそれを発症するリスクがある。

いくつかの実施形態では、ＳＧ－３－００２０タンパク質またはそのバリアントは、免疫療法の前におよび／または免疫療法と組み合わせて、対象に投与される。他の実施形態では、免疫療法は、抗がんワクチン、養子免疫細胞療法、免疫チェックポイント調節剤を標的とする薬剤、腫瘍溶解性ウイルス、またはＢｉＴＥのうちの１つ以上である。さらに他の実施形態では、免疫療法標的は、ＣＴＬＡ－４（細胞毒性Ｔリンパ球関連タンパク質４）、ＰＤ－１（プログラムされた細胞死タンパク質１）、ＰＤ－Ｌ１（プログラムされた死リガンド１）、ＢＴＬＡ（ＢおよびＴリンパ球減衰剤）、ＬＡＧ－３（リンパ球活性化遺伝子３）、Ａ２ＡＲ（アデノシンＡ２ａ受容体）、ＴＩＭ－３（Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン－３）、Ｂ７－Ｈ３（Ｂ７ホモログ３；ＣＤ２７６としても知られる）、ＶＩＳＴＡ（Ｔ細胞活性化のＶドメインＩｇサプレッサー）、およびＩＤＯ（インドールアミン２，３－ジオキシゲナーゼ）、または免疫チェックポイント調節因子のうちの１つ以上である。いくつかの実施形態では、免疫療法は、二重ＰＤ－１／ＣＴＬＡ－４遮断療法である。いくつかの実施形態では、免疫療法は、ＰＤＬ１＋腫瘍または二重ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１遮断を有する対象に対するＰＤＬ－１治療である。非限定的な例には、抗体（例えば、ペンブロリズマブ（ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標））、ニボルマブ（ＯＰＤＩＶＯ（登録商標））、セミプリマブ（ＬＩＢＴＡＹＯ（登録商標））、アテゾリズマブ（ＴＥＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標））、アベルマブ（ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標））、およびデュルバルマブ（ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）））などのＰＤ－１およびＰＤＬ－１アンタゴニストが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗体（例えば、イピルムマブ（ＹＥＲＶＯＹ（登録商標）））などのＣＴＬＡ４アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗体などのＢＴＬＡアンタゴニストである。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＬＡＧ－３アンタゴニスト（例えば、ＩＭＰ７０１（ＬＡＧ５２５））である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、Ａ２ＡＲアンタゴニスト（例えば、ＣＰＩ－４４４）である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＴＩＭ－３アンタゴニスト（例えば、ＭＢＧ４５３）である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗体（例えば、エノブリツズマブ）などのＢ７－Ｈ３アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト（例えば、ＪＮＪ－６１６１０５８８）である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＩＤＯアンタゴニスト（例えば、インドキシモド）である。例えば、Ｍａｒｉｎ－Ａｃｅｖｅｄｏ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｈｅｍａｔｏｌ Ｏｎｃｏｌ．１１：３９（２０１８）を参照のこと。いくつかの実施形態では、免疫療法は、キメラ抗原受容体Ｔ細胞（例えば、ＣＡＲ－Ｔ細胞）または操作されたＴＣＲ－Ｔ細胞を含むが、これらに限定されない養子Ｔ細胞療法である。いくつかの実施形態では、免疫療法は、二重特異性Ｔ細胞誘導（ＢｉＴＥ）である。いくつかの実施形態では、免疫療法は、それぞれ単独で、または互いに組み合わせて、および／またはＰＤ－１、ＰＤＬ－１、ＣＴＬＡ－４、もしくは他の治療法のうちの１つ以上と組み合わせて、抗リンパ球活性化遺伝子３（ＬＡＧ－３）療法、抗Ｔ細胞免疫グロブリンムチン－３（ＴＩＭ－３）療法、抗キラー免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）療法、抗４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）刺激（ａｇｏｎｉｚｉｎｇ）／刺激（ｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ）療法、またはグルココルチコイド誘発性ＴＮＦＲファミリー関連遺伝子（ＧＩＴＲ））刺激（ａｇｏｎｉｚｉｎｇ）／刺激（ｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ）療法のうちの１つ以上を含む。

いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物の治療用タンパク質は、ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つのサイトカインの産生を調節する。他の実施形態では、免疫療法薬学的組成物のペプチドは、ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つのサイトカインの産生を調節し、少なくとも１つのサイトカインは、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、ＩＬ－２３、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される。さらに他の実施形態では、少なくとも１つのサイトカインの産生の調節は、対象の血液中の１つ以上のサイトカインの血中および／または血漿レベルを測定することによって測定される。

いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物の治療用タンパク質は、ペプチドを投与された対象において、Ｔｈ１活性化を増加させる。いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物のペプチドは、ペプチドを投与された対象において、樹状細胞の成熟を増加させる。いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物のペプチドは、ペプチドを投与された対象において、ＣＤ７０の発現を増加させる。いくつかの実施形態では、免疫療法薬学的組成物のペプチドは、ペプチドを投与された対象において、Ｔ_ｅｆｆのクローン性増殖を増加させる。

いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、経口投与のために製剤化される。他の実施形態では、薬学的組成物は、非経口投与のために製剤化される。さらに他の実施形態では、非経口投与は、静脈内投与、皮下投与、または経皮投与である。

調節性Ｔ細胞とエフェクターＴ細胞のバランスを示す。 ＣＤ４（図２Ａ）細胞の頻度に対するビフィドバクテリウム・ブレベ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）由来ペプチドの効果を示す。 ＣＤ８（図２Ｂ）細胞の頻度に対するＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ由来ペプチドの効果を示す。 ＩＬ－２（図２Ｃ）細胞の分泌に対するＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ由来ペプチドの効果を示す。 ＩＬ－１７（図２Ｄ）細胞の分泌に対するＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ由来ペプチドの効果を示す。 ＣＤ８細胞でのグランザイムＢの発現に対するＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ由来ペプチドの効果を示す。 Ｔ_ａｃｔＣＤ８細胞の頻度（図３Ａ）、ＣＤ８細胞によるグランザイムＢ発現（図３Ｂ）、およびＩＬ－２の分泌（図３Ｃ）に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドの効果を示す。 図３Ａの説明を参照のこと。 図３Ａの説明を参照のこと。 ヒトＴ細胞活性化アッセイの概略図である。 ヒトＴ細胞のインビトロ活性化のプロトコルを示す。 フローサイトメトリー分析に使用されるプロトコルを示す。 ヒトＴ細胞の活性化に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドの効果を示す。 図６－１の説明を参照のこと。 図６－１の説明を参照のこと。 図７Ａおよび７Ｂは、マウス腫瘍モデルに対するヒトの活性化に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドのインビボ研究および例示的な投与の結果を示す。 ＡＨ－１四量体染色の例示的なプロトコルを示す。 マウス腫瘍モデルに対するヒトの活性化に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドのインビボ研究および例示的な投与の結果を示す。 マウス腫瘍モデルに対するヒトの活性化に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドのインビボ研究および例示的な投与の結果を示す。 マウスＴ細胞の活性化に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドの効果を示す。 図１１Ａの説明を参照のこと。 ヒトＴ細胞の活性化に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドの効果を示す。 図１２Ａの説明を参照のこと。 活性化マーカーに対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドの効果を示す。 図１３Ａの説明を参照のこと。 図１３Ａの説明を参照のこと。 図１３Ａの説明を参照のこと。 ヒトＴ細胞におけるＣＤ－３依存性エフェクターサイトカイン分泌に対するＳＧ－３－００２０などの治療用ペプチドの効果を示す。 ＳＧ－３－００２０が抗ＣＤ２８活性化と組み合わせて活性を増加させることを示す。 ＳＧ－３－００２０は、インビトロで活性化されたヒトＴ細胞による重要な免疫遺伝子の発現を調節する。図１６Ａは、ビヒクル処置群と比較して、ＳＧ－３－００２０処置群（１０μＭ）においてアップレギュレートした（右）およびダウンレギュレートした（左）差次的発現遺伝子（ＤＥＧ）を示すボルケーノプロットである。２倍を超える変化（対数２ＦＣ＝１）で有意（ｐ＜０．０５）の遺伝子にラベルを付ける。図１６Ｂは、免疫腫瘍学に関連するＤＥＧの選択された例を示す。 図１６Ａの説明を参照のこと。 図１６Ａの説明を参照のこと。 ＳＧ－３－００２０がヒトＴ細胞に結合することを示す。ＳＥＢは、ブドウ球菌エンテロトキシンＢに由来するペプチドであり、Ｔ細胞に結合すると予想される。Ｂ７－１は、Ｔ細胞に結合する可能性を有し得るＢ７－１タンパク質に由来するペプチドである。２０－ｓｃは、ＳＧ－３－００２０（陰性対照）のスクランブルバージョンである。

詳細な説明
定義
本明細書で別段の定義がない限り、本出願で使用される科学的および技術的用語は、当業者によって一般的に理解される意味を有するものとする。一般に、本明細書に記載の、化学、分子生物学、細胞およびがん生物学、免疫学、微生物学、薬理学、ならびにタンパク質および核酸化学に関連して使用される命名法、およびそれらの技術は、当該技術分野で周知であり、一般的に使用されるものである。したがって、以下の用語は、当業者によって十分に理解されると考えられているが、以下の定義は、現在開示されている主題の説明を容易にするために明記される。

本明細書全体で、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」という単語または「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」もしくは「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」などの変形は、いかなる他の構成要素または構成要素の群も除外することなく、記載された構成要素または構成要素の群の包含を意味すると理解すべきである。

「１つの（ａ）」または「１つの（ａｎ）」という用語は、その実体のうちの１つ以上を指し、すなわち、複数の指示対象を指し得る。したがって、「１つの（ａ）」または「１つの（ａｎ）」、「１つ以上」、および「少なくとも１つ」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。加えて、「１つの（ａ）」または「１つの（ａｎ）」という不定冠詞による「要素」に対する言及は、文脈が１つまたはただ１つの要素が存在することを明確に要求しない限り、１つを超える要素が存在する可能性を排除しない。

「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語は、「含むが、これに限定されない」ことを意味するために使用される。「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」および「含むが、これに限定されない」は、交換可能に使用される。

「ペプチド」、「ポリペプチド」、および「タンパク質」という用語は、本明細書では交換可能に使用され、それぞれは、通常の当業者によってよく理解されるように、ペプチド結合によって一緒に結合されたアミノ酸の配列を広く指す。この用語は、アミノ酸のポリマーの特定の長さを暗示するものではないことを理解されたい。

「シグナル配列」（「プレ配列」、「シグナルペプチド」、「リーダー配列」、または「リーダーペプチド」とも称される）は、タンパク質のＮ末端部分に結合し、細胞からのタンパク質の成熟型の分泌を促進する、アミノ酸の配列を指す。細胞外タンパク質の成熟型は、シグナル配列を欠失しているが、これは、分泌プロセス中に切断される。

「アミノ酸」または「任意のアミノ酸」という用語は、自然に存在するアミノ酸（例えば、α－アミノ酸）、非天然アミノ酸、修飾アミノ酸、および非自然的アミノ酸を含む、ありとあらゆるアミノ酸を指す。それには、Ｄ－アミノ酸およびＬ－アミノ酸の両方が含まれる。

本明細書で使用される「配列同一性」、「パーセント同一性」、「パーセント相同性」、または例えば「と５０％同一の配列」を含む記述は、アミノ酸ごと、ヌクレオチドごと、または比較ウィンドウにわたって配列が同一である程度を指す。したがって、「配列同一性のパーセンテージ」は、比較ウィンドウにわたって２つの最適に整列された配列を比較し、両方の配列に同一核酸塩基（例えば、Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｇ、Ｕ）または同一アミノ酸残基（例えば、Ａｌａ、Ｐｒｏ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｇｌｙ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｈｉｓ、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｃｙｓ、およびＭｅｔ）が生じた位置の数を決定して、マッチした位置の数を得て、マッチした位置の数を比較ウィンドウにおける位置の総数（すなわち、ウィンドウサイズ）で割り、結果に１００を掛けて、配列同一性のパーセンテージを得ることにより計算することができる。

配列間の配列相同性または配列同一性（これらの用語は本明細書では互換的に使用される）の計算は、以下のように実行することができる。２つのアミノ酸配列または２つの核酸配列のパーセント同一性を決定するために、配列を最適な比較の目的でアラインメントすることができる（例えば、最適のアラインメントのために、第１および第２のアミノ酸または核酸配列の一方または両方にギャップを導入することができ、非相同配列は、比較目的のために無視することができる。配列の比較および２つの配列間のパーセント同一性の決定は、数学的アルゴリズムを使用して実施することができる。いくつかの実施形態では、２つのアミノ酸配列間のパーセント同一性は、ＧＣＧソフトウェアパッケージのＧＡＰプログラムに組み込まれているＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（１９７０，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４４－４５３）アルゴリズムを使用し、ＢＬＯＳＵＭ ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックスのいずれか、ならびにギャップ重み付け１６、１４、１２、１０、８、６、または４および長さ重み付け１、２、３、４、５、または６．０）を使用し、ＰＡＭ１２０重み付け残基表（ｗｅｉｇｈｔ ｒｅｓｉｄｕｅ ｔａｂｌｅ）、ギャップ長ペナルティ１２、およびギャップペナルティ４を使用する。

少なくとも２つの核酸またはポリペプチドの文脈における「実質的に類似する」および「実質的に同一」という句は、典型的には、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが、参照ポリヌクレオチドまたはポリペプチドと比較して、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、またはさらに９９．５％の配列同一性を有する配列を含むことを意味する。

関連（および誘導体）タンパク質／ペプチドは、「バリアント」タンパク質／ペプチドを包含する。バリアントタンパク質／ペプチドは、別の（すなわち、親の）タンパク質／ペプチドおよび／または少数のアミノ酸残基によって互いに異なる。バリアントは、それが由来する親タンパク質／ペプチドと比較して、１つ以上のアミノ酸変異（例えば、アミノ酸の欠失、挿入、または置換）を含み得る。いくつかの実施形態では、異なるアミノ酸残基の数は、約１、２、３、４、５、１０、２０、２５、３０、３５、４０、４５、または５０のいずれかである。いくつかの実施形態では、バリアントは、約１～約１０個のアミノ酸が異なる。代替的にまたは加えて、バリアントは、例えば、前述のＢＬＡＳＴ、ＡＬＩＧＮ、およびＣＬＵＳＴＡＬなどの配列アラインメントツールを使用して決定されるように、参照タンパク質／ペプチドまたは核酸と特定の程度の配列同一性を有し得る。例えば、バリアントタンパク質／ペプチドまたは核酸は、参照配列に対して少なくとも約３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、またはさらには９９．５％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの実施形態では、バリアントタンパク質／ペプチドまたは核酸は、参照配列と１００％同一ではない。

本明細書で使用される「薬学的に許容される塩」という用語は、水溶性もしくは油溶性あるいは分散性であり、過度の毒性、刺激、およびアレルギー応答なく疾病の治療に好適であり、妥当なベネフィット／リスク比に見合っており、かつそれらの意図される使用にとって有効である、本開示のペプチド、タンパク質、または化合物の塩または両性イオン形態を表す。塩は、化合物の最終単離および精製中に、またはアミノ基を好適な酸と反応させることによって別個に調製され得る。代表的な酸付加塩には、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、クエン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、重硫酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、樟脳スルホン酸塩、ジグルコン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩（ｈｅｍｉｓｕｌｆａｔｅ）、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、２－ヒドロキシエタンスルホン酸塩（イセチオン酸塩）、乳酸塩、マレイン酸塩、メシチレンスルホン酸塩、メタンスルホン酸塩、ナフチレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、２－ナフタレンスルホン酸塩、シュウ酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、３－フェニルプロピオン酸塩（３－ｐｈｅｎｙｌｐｒｏｐｒｉｏｎａｔｅ）、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、トリクロロ酢酸塩、トリフルオロ酢酸塩、リン酸塩、グルタミン酸塩、炭酸水素塩、パラ－トルエンスルホン酸塩、およびウンデカン酸塩が挙げられる。また、本開示の化合物中のアミノ基は、メチル、エチル、プロピル、およびブチルの塩化物、臭化物、ならびにヨウ化物；硫酸ジメチル、硫酸ジエチル、硫酸ジブチル、および硫酸ジアミル；デシル、ラウリル、ミリスチル、およびステリルの塩化物、臭化物、ならびにヨウ化物；ならびに臭化ベンジルおよび臭化フェネチルで四級化することができる。治療的に許容される付加塩を形成するために用いることができる酸の例としては、塩酸、臭化水素酸、硫酸、およびリン酸などの無機酸、ならびにシュウ酸、マレイン酸、コハク酸、およびクエン酸などの有機酸が挙げられる。薬学的に許容される塩は、好適に、例えば、酸付加塩および塩基性塩の中から選択される塩であり得る。酸付加塩の例としては、塩化物塩、クエン酸塩、および酢酸塩が挙げられる。塩基性塩の例には、カチオンが、ナトリウムまたはカリウムイオンなどのアルカリ金属カチオン、カルシウムまたはマグネシウムイオンなどのアルカリ土類金属カチオン、および置換アンモニウムイオン、例えば、Ｎ（Ｒ１）（Ｒ２）（Ｒ３）（Ｒ４）＋型（式中、Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、およびＲ４は独立して、典型的には、水素、任意に置換されたＣ１－６－アルキルまたは任意に置換されたＣ２－６－アルケニルを指定する）のイオンなどの置換されたアンモニウムイオンのうちから選択される塩が挙げられる。関連するＣ１－６－アルキル基の例には、メチル、エチル、１－プロピル、および２－プロピル基が含まれる。可能な関連性のあるＣ２－６－アルケニル基の例には、エテニル、１－プロペニル、および２－プロペニルが含まれる。薬学的に許容される塩の他の例は、“Ｅｎｃｙｃｌｏｐａｅｄｉａ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ”，３ｒｄ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｊａｍｅｓ Ｓｗａｒｂｒｉｃｋ（Ｅｄ．）中の“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ”，１７ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａｌｆｏｎｓｏ Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ（Ｅｄ．），Ｍａｒｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，ＵＳＡ，１９８５（およびそのより最近の版）、Ｉｎｆｏｒｍａ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ ＵＳＡ（Ｉｎｃ．），ＮＹ，ＵＳＡ，２００７、ならびにＪ．Ｐｈａｒｍ．Ｓｃｉ．６６：２（１９７７）に記載されている。また、好適な塩の概説については、Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓａｌｔｓ：Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ，Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ，ａｎｄ Ｕｓｅ ｂｙ Ｓｔａｈｌ ａｎｄ Ｗｅｒｍｕｔｈ（Ｗｉｌｅｙ－ＶＣＨ，２００２）を参照されたい。他の好適な塩基塩は、非毒性塩を形成する塩基から形成される。代表的な例としては、アルミニウム、アルギニン、ベンザチン、カルシウム、コリン、ジエチルアミン、ジオールアミン、グリシン、リシン、マグネシウム、メグルミン、オラミン、カリウム、ナトリウム、トロメタミン、および亜鉛塩が挙げられる。酸および塩基のヘミ塩、例えば、ヘミ硫酸塩およびヘミカルシウム塩もまた形成され得る。

本明細書で使用される場合、「個々の単離株」は、１つ以上の他の微生物からの分離後の、微生物の単一の属、種、または株の優勢を含む組成物または培養物を意味すると解釈されるべきである。この語句は、微生物が単離または精製された程度を示すものと解釈されるべきではない。しかしながら、「個々の単離株」は、実質的にただ１つの微生物の属、種、または株を含むことができる。

本明細書で使用される場合、「キメラ」または「組換え体」という用語は、核酸配列またはタンパク質／ペプチド配列を記述するとき、少なくとも２つの異種ポリヌクレオチドもしくは２つの異種ポリペプチドを連結して単一の巨大分子にする、または少なくとも１つの自然の核酸もしくはタンパク質／ペプチド配列の１つ以上の要素を再編成することができる核酸またはタンパク質／ペプチド配列を指す。例えば、「組換え体」という用語は、例えば、化学合成による、または遺伝子操作技術による核酸の単離されたセグメントの操作による、配列の２つの別の方法で分離されたセグメントの人工の組み合わせを指すことができる。

本明細書で使用される場合、「タンパク質修飾」という用語は、当技術分野でよく理解されているように、例えば、アミノ酸置換、アミノ酸修飾、欠失、および／または挿入を指す。

「培養すること」という用語は、液体または固体培地中で、増殖に適した条件下で、細胞の集団、例えば微生物細胞を増殖させることを指す。

本明細書で使用される「単離された」、「精製された」、「分離された」、および「回収された」という用語は、例えば、それが含まれるサンプルの少なくとも９０重量％、または少なくとも９５重量％、または少なくとも９８重量％の濃度で、それが天然に関連する少なくとも１つの成分から除去される材料（例えば、タンパク質、核酸、または細胞）を指す。例えば、これらの用語は、例えば、無傷の生物学的システムなど、その天然状態で見られるように、通常はそれに付随する成分を実質的または本質的に含まない材料を指し得る。

「対象」という用語は、ヒト、非ヒト霊長類、家畜動物（例えば、ウシ、ブタ）、コンパニオンアニマル（例えば、イヌ、ネコ）、およびげっ歯類（例えば、マウスおよびラット）などの哺乳動物を指す。いくつかの実施形態では、この用語は、ヒト対象を指す。例示的な実施形態では、この用語は、胃腸の炎症状態を患っているヒト対象を指す。

本明細書で使用される場合、「宿主細胞」という用語は、ペプチドを産生するための組換え発現ベクターがペプチドの発現のために導入され得る細胞または細胞株を指す。組換えベクターを含む宿主細胞は、「組換え宿主細胞」と称され得る。

本明細書で使用される場合、「改善された」は、病状の特定された特徴の改善を包含すると広く解釈されるべきであり、当該特徴は、対照と比較して、または問題の特徴に関連する既知の平均量と比較して、一般に問題の疾患と相関する、またはそれを示すと当業者によって見なされる。例えば、本開示のタンパク質の適用に関連する「改善された」機能は、治療されていないヒトのデータと比較して、本開示のタンパク質で治療されたヒトからのデータを比較することによって実証され得る。本開示において、「改善された」は、データが統計的に有意であることを必ずしも要求せず（すなわち、ｐ＜０．０５）、むしろ、ある値（例えば、平均治療値）が別の値（例えば、平均対照値）と異なることを示す任意の定量化可能な差異は、「改善された」レベルまで上昇し得る。

本明細書で使用される場合、「阻害および抑制」などの用語は、完全な阻害または抑制を必要とすると解釈されるべきではないが、これはいくつかの実施形態では望ましいことであり得る。したがって、「阻害された免疫応答」または「炎症性サイトカインの阻害」は、絶対的な阻害を必要としていない。

したがって、本明細書で使用される場合、「増加する」または「減少する」という用語、または文法的同等物は、比較可能な条件下で行われた測定（例えば、本明細書に記載の治療の開始前の同じ対象において、または本明細書に記載の治療がない場合の対照対象（または複数の対照対象）における測定）などの、参照（例えば、ベースライン）測定に関連する値を示す。いくつかの実施形態では、適切な対照は、本明細書に記載の治療の開始前の同じ対象における測定、または本明細書に記載の治療がない場合の対照対象（または複数の対照対象）における測定などのベースライン測定である。

本明細書で使用される場合、「治療有効量」という用語は、任意の医学的治療に適用される妥当な利益／リスク比において、治療された対象に治療効果を与える治療剤（例えば、本開示のペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質）の量を指す。そのような治療効果は、客観的（すなわち、何らかの試験またはマーカーによって測定可能）または主観的（すなわち、対象が効果の指標を与える、もしくは効果を感じる）であり得る。いくつかの実施形態では、「治療有効量」は、関連する疾患もしくは状態を治療もしくは改善する、ならびに／または疾患に関連する症状を改善すること、および／または疾患の症状の重症度もしくは頻度を軽減することなどによる検出可能な治療もしくは予防効果を示すのに有効な治療剤または組成物の量を指す。治療有効量は、一般的に、複数の単位用量を含み得る投薬レジメンで投与される。任意の特定の治療剤について、治療有効量（および／または有効投与レジメン内の適切な単位用量）は、例えば、投与経路に応じて、または他の治療剤との組み合わせに応じて変動し得る。代替的にまたは加えて、任意の特定の対象に対する特定の治療有効量（および／または単位用量）は、治療される特定の形態の疾患；状態もしくは前提条件の重大度；用いられる特定の治療剤の活性；用いられる特定の組成物；対象の年齢、体重、一般的な健康状態、性別、および食事；投与時間、投与経路、および／または用いられる特定の治療剤の排泄もしくは代謝速度；治療期間；医療の分野において周知の同様の要因を含む、様々な要因に依存し得る。本開示は、治療有効量の新規のペプチド、およびそれを含む組成物を利用して、様々ながんなどの様々な疾患を治療する。治療有効量の、投与されたペプチドまたはそれを含む組成物は、いくつかの実施形態では、当該がんの発生率を減少させるであろう。

本明細書で使用される場合、「治療（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）」（また、「治療する（ｔｒｅａｔ）」または「治療すること（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」）という用語は、特定の疾患、障害、および／または状態（例えば、慢性または再発性の免疫応答および胃腸（ＧＩ）管の炎症）の１つ以上の症状もしくは特徴を部分的もしくは完全に軽減する、改善する、緩和する、阻害する、その発症を遅延させる、その重症度を減少させる、および／もしくはその発生率を低下させるという点で、所望の効果を達成する治療レジメンに従った治療剤（例えば、本開示のペプチド、ポリペプチド、もしくはタンパク質）の任意の投与を指し、いくつかの実施形態では、治療レジメンに従った治療剤の投与は、所望の効果の達成と相関している。そのような治療は、関連する疾患、障害、および／もしくは状態の兆候を示さない対象、ならびに／または疾患、障害、および／もしくは状態の初期の兆候のみを示す対象のものであり得る。代替的にまたは加えて、そのような治療は、関連する疾患、障害、および／または状態の１つ以上の確立された兆候を示す対象のものであり得る。いくつかの実施形態では、治療は、関連する疾患、障害、および／または状態に罹患していると診断された対象のものであり得る。いくつかの実施形態では、治療は、関連する疾患、障害、および／または状態の発症の増加したリスクと統計的に相関する１つ以上の感受性因子を有することが知られている対象のものであり得る。

「薬学的」とは、組成物、試薬、方法などが薬学的効果を可能にするか、また、組成物を対象に安全に投与することができることを意味する。「薬学的効果」は、限定されないが、組成物、試薬、または方法が、哺乳動物対象、例えば、対象の集団の少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも５０％の対象などにおけるヒトなどの少なくとも１人の対象において、所望の生化学的、遺伝的、細胞的、生理学的、または臨床的効果を刺激することができることを意味し得る。

「薬学的に許容される」とは、動物における安全な使用、より具体的にはヒトにおける安全な使用のために、連邦政府もしくは州政府の規制省庁によって認可されている、または米局薬局方もしくは他の一般に承認されている薬局方において列挙されることを意味する。「薬学的に許容されるビヒクル」または「薬学的に許容される賦形剤」は、本明細書に記載のペプチドが投与される希釈剤、アジュバント、賦形剤、または担体を指す。

「予防」とは、疾患もしくは状態、またはその少なくとも１つの症状を予防するために講じられる手段を意味する。

「予防すること（Ｐｒｅｖｅｎｔｉｎｇ）」または「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」とは、疾患または障害を獲得するリスクの減少を指す（すなわち、疾患の臨床症状の少なくとも１つを、疾患にさらされているか、または罹患しやすい可能性があるが、まだ疾患の症状を経験していないまたは疾患の症状が表われていない対象において疾患を発症しないようにする、または治療しない場合よりも重症度が低い症状を発症させない）。「予防（Ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」または「予防（ｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）」は、疾患または障害の発症を遅延させることを指し得る。

「予防的有効量」とは、疾患または状態の予防のために対象に投与された場合に、疾患または状態のそのような予防に影響を与える、または化合物の投与がない場合よりも低いレベルの重症度で、疾患または状態の少なくとも１つの症状の発症を防ぐのに十分である、本明細書に記載の、化合物、すなわち、ペプチドの量を意味する。「予防的有効量」は、化合物、疾患およびその重症度、ならびに治療される対象の年齢、体重などに応じて変化し得る。

本明細書で提供される治療用薬学的組成物は、１つ以上の天然産物に由来するか、またはそれを含み得る。しかしながら、いくつかの実施形態では、治療用薬学的組成物自体は、自然界には存在しない。さらに、いくつかの実施形態では、治療用薬学的組成物は、自然界に存在し得る任意の個々の自然に存在する対応物または組成物成分と比較して、著しく異なる特徴を有する。すなわち、いくつかの実施形態では、治療有効量の精製タンパク質またはペプチドを含む、本明細書で提供される薬学的組成物は、自然に存在し得るため、組成物の任意の単一の個々の成分と比較して、全体として組成物に著しく異なる特性を与える少なくとも１つの構造的および／または機能的特性を有する。裁判所は、自然に存在し得る任意の個々の成分と比較して著しく異なる特徴を有する天然物を含む組成物は、法定の主題であると判断した。したがって、開示された治療用薬学的組成物は、全体として、著しく異なる特徴を有する。これらの特徴は、本明細書で提供されるデータおよび実施例に示されている。

「Ｔ細胞媒介性疾患」という用語は、Ｔ細胞が直接的または間接的に哺乳動物の罹患を媒介するか、さもなければ一因となる疾患を意味する。Ｔ細胞媒介性疾患は、細胞媒介性効果、リンホカイン媒介性効果、およびＢ細胞が、例えば、Ｔ細胞によって分泌されるリンホカインによって刺激される場合、Ｂ細胞に関連する効果にさえ関連し得るが、これらに限定されない。

本開示の詳細は、本明細書に記載されている。本明細書に記載されているものと類似または同等の方法および材料を本開示の実施または試験に使用することができるが、例示的な方法および材料がここに記載されている。本開示の他の特性、目的、および利点は、説明および特許請求の範囲から明らかになるであろう。

治療用ポリペプチドおよび対応するポリヌクレオチド
共生細菌であるＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍは、抗腫瘍免疫を促進し、抗プログラム細胞死タンパク質リガンド１（ＰＤ－Ｌ１）の有効性を促進することが示されている。実際、この細菌は、抗ＰＤ－Ｌ１との相加効果を引き出し、樹状細胞のＭＨＣ－ＩＩを増加させる。Ｓｉｖａｎ ｅｔ ａｌ．（２０１５．Ｓｃｉｅｎｃｅ．３５０（６２６４）：１０８４－１０８９）を参照のこと。

Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍに由来する組成物、例えば、腫瘍細胞の破壊を促進することができる活性化免疫細胞を促進することができる、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍによって発現されるタンパク質またはその断片を、同定および特徴付けるための研究が行われた。例えば、図１に示されるように、本開示の治療用組成物は、エフェクターＴ細胞（Ｔ_ｅｆｆ）とレギュレーターＴ細胞（Ｔ_ｒｅｇ）との比率を変えることができる。Ｔ_ｅｆｆ：Ｔ_ｒｅｇ細胞の比率を増加させると、腫瘍細胞が免疫学的監視から逃れるのを防ぎ、対象の免疫系による腫瘍細胞の破壊につながり得る。いくつかの実施形態では、本開示の組成物はまた、ナイーブ骨髄細胞からの樹状細胞成熟を活性化することができ、対象の免疫系の抗腫瘍活性をさらに促進する。

したがって、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍゲノムまたはその断片によってコードされるポリペプチドは、例えば、ナイーブＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞（Ｔｈ０）からＣＤ４＋およびＣＤ８＋活性化Ｔ細胞（Ｔ_ａｃｔ）への分化を刺激するそれらの能力についてインビトロで試験される。例えば、ＣＤ２５＋／ＦｏｘＰ３－表現型を有するＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞の数の増加をもたらす目的のＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍポリペプチドと、ナイーブＴ細胞のインキュベーションは、ＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍポリペプチドがＴ_ｅｆｆ：Ｔ_ｒｅｇの比率が増加していることを示唆している。この増加したＴ_ｅｆｆ：Ｔ_ｒｅｇの比のさらなる証拠は、サイトカインＩＬ－２およびＩＬ－１７の処理されたナイーブマウス脾細胞による分泌の増加、ならびにグランザイムＢの発現によって示唆されている。加えて、樹状細胞（ＤＣ）を活性化する開示されたペプチドの能力を示すための研究を行うことができる。ＤＣの活性化は、例えば、ＴＮＦ、ＩＬ－１β、および／またはＭＨＣ Ｉの増加した発現を通じて実証することができる。

そのようなインビトロの特徴付けは、本明細書でＳＧ－３－００２０と称されるタンパク質の同定をもたらした。ＳＧ－３－００２０は、ナイーブマウスから単離された脾細胞とインキュベートした場合、活性化されたＣＤ４およびＣＤ８細胞の頻度を増加させることが示された（実施例１および図２Ａ～２Ｂを参照のこと）。ＳＧ－３－００２０のアミノ酸配列およびそのコードヌクレオチド配列を、以下の表１に提供する。「ＳＧ－３－００２０」および「配列番号１」という用語は、本明細書では交換可能に使用される。

（表１）ＳＧ－３－００２０およびそのコードされた核酸配列

以下の実施例２および３に記載されるその後の実験は、ＳＧ－３－００２０がインビトロでヒトＴ細胞の活性化を増強し、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）区画内のＮＫ細胞および活性化ＣＤ８＋Ｔ細胞頻度を増加させることを示す（図６Ａおよび６Ｂを参照のこと）。具体的には、ＳＧ－３－００２０は、Ｔ細胞の調節を通じて適応免疫に影響を与えることが示された。実施例２において、５人の個々のヒトドナーから得られた精製されたＴ細胞は、抗ＣＤ３抗体で刺激され、ＳＧ－３－００２０の有無にかかわらずインキュベートされた。ＳＧ－３－００２０の存在は、ＣＤ４＋細胞とＣＤ８＋細胞の両方で、表面ＰＤ－１の発現の増加をもたらした。さらに、ＳＧ－３－００２０を用いた活性化されたＴ細胞のインキュベーションは、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－２、ＩＬ－１０、ＴＮＦ－αの分泌を増加させた。ＣＤ４＋ＣＤ２５＋、ＣＤ４＋ＩＣＯＳ＋、ＣＤ４＋ＯＸ４０＋、ＣＤ８ＣＤ２５＋、ＣＤ８＋ＩＣＯＳ＋、およびＣＤ８＋ＯＸ４０＋（データは示さず）であるＴ細胞における増加は、ＳＧ－３－００２０の存在下でも観察された（ＳＧ－３－００２０の非存在下での活性化されたＴ細胞と比較して）。

インビボ研究も実施され、ＳＧ－３－００２０の腫瘍周囲投与が、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）における免疫活性化を増加させることが示された。１日２回（ｂ．ｉ．ｄ．）の腫瘍周囲注射は、ＮＫ細胞を増加させ、ＴＩＬ区画でＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度が活性化された（図７Ｂ）。

上記の研究は、同等の生物学的活性を有するＳＧ－３－００２０およびそのバリアントが、対象の免疫系を調節するのに有効であり、したがって、がんの治療および／または腫瘍体積および／または腫瘍成長の減少のための治療剤として実行可能であり得る。

ペプチドバリアント
前述のように、修飾および／または変更は、本明細書に開示される治療用タンパク質、例えば、ＳＧ－３－００２０の構造においてなされ得る。したがって、本開示は、これらのタンパク質の配列の変化、したがってそれらをコードする核酸を企図し、それにもかかわらず、それらは、本開示の予防的および治癒的態様において評価される機能的活性に関して実質的な活性を保持することができる。

Ａ．修飾ペプチド
ＳＧ－３－００２０のある特定のアミノ酸は、例えば、基質分子上の結合部位、受容体などの構造との相互作用結合能力を相当量失うことなく、タンパク質／ペプチド構造の他のアミノ酸で置換され得る。したがって、これらのタンパク質／ペプチドは、ＳＧ－３－００２０（例えば、配列番号１）の生物学的に機能的な等価物であり得る。アミノ置換は、保存された置換であっても、保存された置換でなくてもよい。したがって、構造変化はタンパク質の設計された機能、例えば、別の部分との相互作用から生じる機能を実行する能力に影響を与えるものではないため、「保存的」変化は、ペプチドの生物学的活性を破壊しない。

本開示によるＳＧ－３－００２０のバリアントは、配列番号１に対して１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０個のアミノ酸置換を有するタンパク質であり得る。換言すれば、バリアントは、配列番号１と少なくとも７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、または９７％同一であり得る。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、配列番号１の１、２、３、４、または５個のＮ末端またはＣ末端残基の欠失を有する。代替的にまたは加えて、配列番号１と比較して、１、２、３、４、または５個のアミノ酸の内部欠失がある。

ＳＧ－３－００２０の保守的に修飾されたバリアントが、本明細書で企図されている。「保存的に修飾されたバリアント」は、アミノ酸配列と核酸配列の両方に適用される。特定の核酸配列に関して、保存的に修飾されたバリアントは、同一のアミノ酸配列、または１つ以上の保存的置換を有するアミノ酸配列をコードする核酸を指す。保存的置換の例は、以下の群のうちの１つのアミノ酸を同じ群の別のアミノ酸に交換することである（米国特許第５，７６７，０６３号、Ｋｙｔｅ ａｎｄ Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ（１９８２）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５７：１０５－１３２を参照のこと）。（１）疎水性：ノルロイシン、Ｉｌｅ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｐｈｅ、Ｃｙｓ、Ｍｅｔ；（２）中性親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ；（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；［００９３］（４）塩基性：Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ；（５）鎖配向に影響を及ぼす残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ；（６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ；および（７）小アミノ酸：Ｇｌｙ、Ａｌａ、Ｓｅｒ。したがって、アミノ酸に関する「保存的置換」という用語は、１つ以上のアミノ酸が別の生物学的に同様の残基によって置換されることを意味し、当該置換は、一般に、タンパク質の機能特性に影響を及ぼさない。いくつかの実施形態では、本開示は、配列番号１で同定されたアミノ酸配列と比較して、少なくとも１つの自然に存在しない保存的アミノ酸置換を有するタンパク質を提供する。

治療用タンパク質の修飾も、企図されている。例えば、タンパク質のＣ末端および／またはＮ末端にアセチル（Ａｃ）および／またはアミド基が存在し得る。いくつかの実施形態では、タンパク質は、「環化」され得、例えば、ジスルフィド架橋または他の同様の結合を形成することによって、ポリペプチド分子の一部がポリペプチド分子の別の一部に連結して、閉環を形成する反応を指す。ＳＧ－３－００２０タンパク質またはそのバリアントは、リンカーによって、別の分子、例えば、タンパク質（例えば、ＢＳＡまたはＦｃドメイン）またはＰＥＧ分子などの安定化基に連結され得る。本明細書で使用される「リンカー部分」は、広く、２つのペプチドモノマーサブユニットを連結または結合して、二量体を形成することができる化学構造を指す。

いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、未修飾ペプチドと比較して、水溶液中のペプチドの溶解度を増加させるように修飾されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、未修飾ペプチドと比較して、水溶液中のペプチドの溶解度を減少させるように修飾されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、未修飾ペプチドと比較して、極性溶媒中のペプチドの溶解度を増加させるように修飾されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、未修飾ペプチドと比較して、極性溶媒中のペプチドの溶解度を減少させるように修飾されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、未修飾ペプチドと比較して、無極性溶媒中のペプチドの溶解度を増加させるように修飾されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、未修飾ペプチドと比較して、無極性溶媒中のペプチドの溶解度を減少させるように修飾されている。

いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、ヒト生理学的ｐＨでの未修飾ペプチドと比較して、ヒト生理学的ｐＨでのペプチドの正味荷電を増加させるように修飾されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドは、ヒト生理学的ｐＨでの未修飾ペプチドと比較して、ヒト生理学的ｐＨでのペプチドの正味荷電を減少させるように修飾されている。

いくつかの実施形態では、本明細書に記載のペプチドは、翻訳後修飾（ＰＴＭ）を有し得る。タンパク質ＰＴＭは、インビボで発生し、官能基またはタンパク質の共有結合による付加、調節サブユニットのタンパク質分解的切断、またはタンパク質全体の分解によって、プロテオームの機能的多様性を増加させ得る。本開示に従って調製された単離されたタンパク質は、インビボまたはインビトロで１つ以上のＰＴＭを受け得る。修飾（複数可）のタイプは、タンパク質が発現される宿主細胞に依存し、リン酸化、グリコシル化、ユビキチン化、ニトロシル化（例えば、Ｓ－ニトロシル化）、メチル化、アセチル化（例えば、Ｎ－アセチル化）、脂質化（ミリストイル化、Ｎ－ミリストイル化、Ｓ－パルミトイル化、ファルネシル化、Ｓ－プレニル化、Ｓ－パルミトイル化）を含むが、これらに限定されず、タンパク質分解は、正常な細胞生物学および病因のほぼすべての態様に影響を与え得る。本明細書に開示される単離および／または精製されたＳＧ－３－００２０タンパク質またはそのバリアントもしくは断片は、１つ以上の上記の翻訳後修飾を含み得る。

上記のＳＧ－３－００２０のバリアントの各々について、当業者は、本明細書に開示されるアッセイ（例えば、腫瘍体積に対する効果を評価するＴ細胞活性化アッセイまたはインビボアッセイ）に従って生物学的活性を評価および比較することができる。

ＳＧ－３－００２０またはそのバリアントを含む組成物を使用する免疫療法
いくつかの実施形態では、本開示のポリペプチドまたはペプチド（例えば、ＳＧ－３－００２０および／またはそのバリアント）を含む組成物は、それを必要とする対象における免疫療法に有用である。「免疫療法」は、対象において免疫応答を誘導、増強、または抑制することによって疾患または障害を治療することを指す。免疫応答を誘発または増幅するように設計された免疫療法は、活性化免疫療法として知られている。免疫応答を減少または抑制するように設計された免疫療法は、抑制免疫療法として知られている。例えば、悪性腫瘍、自己免疫反応、および慢性感染症の免疫療法の成功は、免疫応答を誘導または制御するための効率的な手段の新しいアプローチの開発に依存している。

Ｔ細胞
哺乳動物における免疫応答を開始するための重要なステップは、疾患または障害に関連する抗原を認識することができる適切なＴ細胞のセットの活性化である。Ｔ細胞は、ヘルパーＴ細胞、調節性Ｔ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、またはメモリーＴ細胞に分化することができる。ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞は、Ｔ細胞の大部分を構成する。ＣＤ４＋ヘルパーＴ細胞は、樹状細胞（ＤＣ）などの抗原提示細胞の細胞エンドソーム経路で捕捉および処理されたＭＨＣ－ＩＩ制限外因性抗原を認識し、ゴルジ画分のＭＨＣ－ＩＩと複合体を形成して、抗原－ＭＨＣ－ＩＩ複合体を形成する。細胞表面に発現するこの複合体は、ＣＤ４＋エフェクターＴ細胞の活性化を誘導することができる。

ＣＤ４＋Ｔ細胞は、活性化され、Ｔヘルパー１（Ｔｈ１）、Ｔヘルパー２（Ｔｈ２）、Ｔヘルパー１７（Ｔｈ１７）、濾胞性ヘルパーＴ細胞（Ｔｆｈ）、誘導Ｔ制御性細胞（ｉＴｒｅｇ）、および制御性１型細胞（Ｔｒ１）を含む異なるエフェクターサブタイプに分化することができる。ＣＤ４＋Ｔ細胞（Ｔｈ細胞）は、インターロイキンを産生し、インターロイキンは、免疫系の他のアームを活性化するのに役立つ。例えば、Ｔｈ細胞は、Ｂ細胞が抗体を産生する助けをするインターロイキン－４（ＩＬ－４）およびＩＬ－５、ならびにＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞を活性化するＩＬ－２を産生する。インターロイキン－１２（ＩＬ１２）およびインターフェロンγ（ＩＦＮγ）は、Ｔｈ１細胞を発達させるために下流のシグナル伝達カスケードを開始する重要なサイトカインである。同様に、ＩＬ１２は、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ）を誘導して、ＩＦＮγを産生する。ＭＨＣ－ＩＩ制限抗原を認識するＴｈ細胞が、細胞傷害性Ｔ細胞、マクロファージ、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、およびＢ細胞の活性化とクローン性増殖において中心的な役割を果たしているため、抗原に応答してヘルパーＴ細胞を活性化する初期事象は、その抗原に向けられた効果的な免疫応答を誘導するために重要である。

ＣＤ８＋Ｔ細胞（細胞傷害性Ｔリンパ球）は、細胞内病原体に対する免疫防御および腫瘍監視に重要である。ＣＤ８＋細胞は、ＭＨＣ－Ｉ抗原と複合体を形成したプロセシングされたタンパク質／ペプチドとして細胞表面に提示されるような様式において、所望のタンパク質／ペプチドが細胞内を通過するときに活性化される。ＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞は、パーフォリン、グランザイム、および顆粒化（granulysis）の放出を介して、感染した標的細胞を破壊する。

制御性Ｔ細胞（Ｔ_ｒｅｇ）は、主にＴｈ細胞の潜在的に有害な活動を抑制するように機能する。Ｔ_ｒｅｇは、ＦＯＸタンパク質ファミリーのメンバーであるフォークヘッドボックスＰ３（ＦＯＸＰ３）を発現し得、これは、制御性Ｔ細胞の発達および機能における制御性経路のマスターレギュレーターとして機能する。Ｔ_ｒｅｇは、しばしば、免疫応答のダイヤルダウンに関与する。がんの場合、過剰なＴ_ｒｅｇ活性は、免疫系ががん細胞を破壊するのを防ぐことができる。

樹状細胞
Ｔ細胞が免疫応答において果たす重要な役割に加えて、樹状細胞（ＤＣ）も同様に重要である。ＤＣは、抗原物質を処理し、細胞表面でＴ細胞に提示するプロの抗原提示細胞である。自己抗原に対する耐性の維持ならびに先天性免疫および適応免疫の活性化において重要な調節的役割を有するＤＣ（Ｂａｎｃｈｅｒｅａｕ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｎａｔｕｒｅ ３９２：２４５－５２、Ｓｔｅｉｎｍａｎ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２１：６８５－７１１）。

ＤＣは、造血骨髄前駆細胞に由来し、最初は未成熟な樹状細胞に変化する。未成熟な樹状細胞は、トール様受容体（ＴＬＲ）などのパターン認識受容体を介してダウンしている病原体の周囲の環境を絶えずサンプリングする。ＤＣおよびマクロファージなどの抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、先天性免疫および適応免疫の活性化、ならびに免疫学的耐性の維持に重要な役割を果たす。

ＤＣが微生物産物などの炎症誘発性刺激に遭遇すると、細胞の成熟プロセスは、細胞表面に発現する抗原ペプチドをロードしたＭＨＣ分子および共刺激分子をアップレギュレートすることによって開始される。成熟および局所リンパ節へのホーミングに続いて、ＤＣは、免疫学的シナプスを形成することによってＴ細胞との接触を確立し、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）および共刺激分子が接着分子で囲まれる中央領域に集まる（Ｄｕｓｔｉｎ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１：２３－９）。ＤＣの存在下で活性化されると、例えば、ＣＤ８＋Ｔ細胞は、数世代にわたって自律的に増殖し、さらなる抗原刺激なしに細胞傷害性機能を獲得することができる（Ｋａｅｃｈ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：４１５－２２、ｖａｎ Ｓｔｉｐｄｏｎｋ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：４２３－９）。したがって、ＤＣによって提供されるペプチド－ＭＨＣ複合体（シグナル１）および共刺激分子（シグナル２）のレベルおよび持続時間が、抗原特異的Ｔ細胞応答の大きさおよび運命を決定するために不可欠であることが提案されている（Ｌａｎｚａｖｅｃｃｈｉａ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２：４８７－９２、Ｇｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４：３５５－６０）。

ＤＣは、リポ多糖（ＬＰＳ）などの保存された微生物構造を認識するＴＬＲを使用して、核因子－κＢ（ＮＦ－κＢ）シグナル伝達経路を活性化することによってＤＣの成熟を促進する（Ａｋｉｒａ ｅｔ ａｌ．，２００４，Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４：４９９－５１ １）。腫瘍に対する免疫を誘導するための努力は、抗腫瘍免疫を増強する手段として、ＤＣの成熟および共刺激を促進することを試みてきた。

炎症誘発性シグナル伝達にも多くの注意が向けられてきたが、炎症を抑制および解決する機序についてはあまり知られていない。ＴＬＲによって開始される免疫応答の大きさおよび持続時間は、炎症誘発性シグナル伝達の強度および持続時間、ならびにシグナル伝達経路の調節によって決定される。転写因子ＮＦ－κＢのＴＬＲ誘導性活性化は、多数の炎症誘発性遺伝子の転写に不可欠であるため、複数の機構を利用して、敗血症性ショックなどの過剰な免疫応答から対象を保護するために、および腸の微小環境などの慢性的な微生物曝露の状況で免疫ホメオスタシスを維持するために、ＴＬＲシグナル伝達を複数のレベルで負に調節する。

サイトカイン
サイトカインは、細胞間の相互作用および伝達に特異的効果を有する細胞から放出される小さな分泌タンパク質である。サイトカインは、一般的な名称であり、他の名称には、リンホカイン（リンパ球によって作製されるサイトカイン）、モノカイン（単球によって作製されるサイトカイン）、ケモカイン（走化性活性を伴うサイトカイン）、およびインターロイキン（１つの白血球によって作製され、他の白血球に作用するサイトカイン）が含まれる。サイトカインは、それらを分泌する細胞（オートクリン作用）、近くの細胞（パラクリン作用）、または場合によっては遠隔の細胞（内分泌作用）に作用し得る。炎症誘発性サイトカインおよび抗炎症性サイトカインの両方がある。Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．，“Ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ，Ｉｎｆｌａｍｍａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐａｉｎ，” Ｉｎｔ．Ａｎｅｓｔｈｅｓｉｏｌ．Ｃｌｉｎ．，Ｖｏｌ．４５（２）：２７－３７（Ｓｐｒｉｎｇ ２００７）．サイトカインは一般に、造血系細胞の増殖もしくは分化を刺激するか、または体内の免疫および炎症反応機構に関与する。

サイトカインは、複数の免疫細胞機能の調節に決定的に関与する（Ｃｕｒｔｓｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１９７：１１４１－５１、Ｖａｌｅｎｚｕｅｌａ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：６８４２－９）。上記のように、様々な免疫細胞の表現型は、それらが分泌するサイトカインの観点から特徴付けられる。サイトカインは、しばしば、炎症誘発性または抗炎症性のいずれかに分類される。

インターロイキンは、免疫学的応答を仲介するサイトカインのファミリーである。免疫応答の中心は、Ｔ細胞であり、この細胞は多くのサイトカインを産生して抗原に対して適応免疫を生じる。Ｔ細胞によって産生されるサイトカインは、１型および２型として分類されている（Ｋｅｌｓｏ ｅｔ ａｌ．，１９９８．Ｉｍｍｕｎ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．７６：．００－３１７）。１型サイトカインには、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＬＴ－αが含まれ、炎症反応、ウイルス免疫、細胞内の寄生生物免疫、および同種移植片拒絶反応に関与する。２型サイトカインには、ＩＬ－４、ＩＬ－５、ＩＬ－６、ＩＬ－１０、およびＩＬ－１３が含まれ、体液性の反応、蠕虫免疫、およびアレルギー応答に関与する。

炎症誘発性サイトカイン
炎症誘発性サイトカインは、細胞シグナル伝達に重要であり、全身性炎症を促進するサイトカインである。それらは、主に活性化されたマクロファージによって産生され、炎症反応のアップレギュレーションに関与している。炎症誘発性サイトカインは、アップレギュレーション後に応答を誘導する小さなメディエーター分子の翻訳をコードする遺伝子から生じる。インターロイキン－１（ＩＬ－１）、ΙＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－１７、ＩＬ－１８、ＩＬ－２３、ＣＤ４０Ｌ、ＴＮＦ－αなどの腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）、ガンマ－インターフェロン（ＩＦＮ－ガンマ）、顆粒球－マクロファージコロニー刺激因子、ＭＣＰ－１、ＴＮＦ関連アポトーシス誘導リガンド、ＲＡＮＫ－リガンド、およびＴＡＬＬ－１／ＢＡＦＦは、炎症誘発性サイトカインとしてよく特徴付けられている。炎症は、炎症誘発性サイトカインと抗炎症性サイトカインとの間の相互作用によって特徴付けられる。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドの投与は、炎症誘発性サイトカインの増加を伴う。

抗炎症性サイトカイン
抗炎症性サイトカインは、炎症誘発性サイトカイン応答を制御する一連の免疫調節分子である。したがって、これらの分子は、炎症誘発性サイトカインによって生成される炎症誘発性応答を調節し、それを減少させるのを助ける。ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α（ＩＦＮ）、およびトランスフォーミング成長因子ベータ（ＴＧＦ－β）は、抗炎症性サイトカインとして認識されている。いくつかの実施形態では、本開示のペプチドの投与は、抗炎症性サイトカインの減少を伴う。

サイトカインの効果に関して強い相互作用があることが理解される。例えば、あるサイトカインの炎症誘発性活性は、別のサイトカインの抗炎症活性によって弱められるか、または排除され得る。

本開示は、ポリペプチドおよび／または他の化合物もしくはその組成物を使用して、炎症性細胞の組織への浸潤、Ｔ細胞増殖の刺激、Ｔ細胞増殖の阻害、血管透過性の増加もしくは減少、またはそれらの阻害によって特徴付けられるものを含む、がんならびに様々な免疫関連疾患および状態、例えば、Ｔ細胞媒介性疾患を治療することができる。

がん
網羅的に抑制されたＴ細胞機能は、がんを患う多くの対象において、臨床的に効率的ながん免疫療法の開発の大きな障害であると説明されている。抗腫瘍免疫応答の阻害は、主に、がんを呈する対象に存在する阻害因子に関係している。「腫瘍性障害」は、細胞増殖、特に新生物に関連する任意の障害である。「新生物（ｎｅｏｐｌａｓｍ）」または「新生物（ｎｅｏｐｌａｓｉａ）」は、良性または悪性であり得る、組織の異常な塊である。ほぼすべての良性腫瘍は、カプセル化されており、非侵襲的である。対照的に、悪性腫瘍は、ほとんどカプセル化されず、浸潤性の破壊的増殖によって隣接する組織に侵入する。この浸潤性増殖の後に、元の腫瘍と不連続な部位に腫瘍細胞を移植することができる。

新生物または腫瘍性障害は、がんであり得る。本明細書で使用される「がん」は、身体の器官およびシステムの正常な機能を妨害する、細胞の制御されていない増殖を指す。白血病などの造血器がんは、対象の正常な造血区画を打ち負かすことができ、それにより、貧血、血小板減少症、および好中球減少症の形態で造血不全を引き起こし、最終的に死をもたらす。

元の場所から移動して生体器官に蔓延するがんは、罹患した臓器（複数可）の機能的悪化を介して対象の死を最終的にもたらし得る。転移は、原発腫瘍から身体の他の部分にまでがん細胞が蔓延することで生ずる、原発腫瘍の位置とは異なるがん細胞の領域である。原発腫瘍塊の診断時に、対象は、転移の存在についてモニタリングされ得る。転移は、特定の症状のモニタリングに加え、磁気共鳴画像（ＭＲＩ）走査、コンピュータ断層撮影（ＣＴ）走査、血球数および血小板数、肝機能検査、胸部Ｘ線、および骨走査を単独または組み合わせて使用することで、最もよく検出される。

本開示の方法は、肉腫、がん腫、線維腫、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、横紋筋肉腫、網膜芽細胞腫、および神経膠腫などのがんを含むが、これらに限定されない、ヒトにおける腫瘍性障害を治療または予防するために利用され得る。がんとしては、基底細胞がん、胆道がん、膀胱がん、骨がん、脳および中枢神経系（ＣＮＳ）がん、乳がん、子宮頸がん、絨毛がん、結腸直腸がん、結合組織がん、消化器のがん、子宮内膜がん、食道がん、眼がん、頭頸部のがん、胃がん、上皮内新生物、腎臓がん、喉頭がん、白血病、肝がん、小細胞肺がん（小細胞および非小細胞）、リンパ腫（ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫）、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔がん（例えば、唇、舌、口、および喉）、卵巣がん、膵臓がん、前立腺がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸がん、腎がん、呼吸器系のがん、肉腫、皮膚がん、胃がん、精巣がん、甲状腺がん、子宮がん、または泌尿器系のがん、ならびに他のがん腫および肉腫が挙げられるが、これらに限定されない。

「がんを有する対象」は、がんと診断された対象である。いくつかの実施形態では、対象は、固形腫瘤腫瘍を特徴とするがん型を有する。固形腫瘍塊は、存在する場合、原発腫瘍塊であり得る。原発腫瘍塊とは、その組織の正常細胞の形質転換に起因する、組織内のがん細胞の増殖を指す。ほとんどの場合、原発腫瘍の塊は、視覚的または触診法によって見つけることができる嚢胞の存在によって、または組織の形状、質感、もしくは重量の不規則性によって識別される。

いくつかの原発腫瘍は、触診できず、Ｘ線などの医学的画像技術または針穿刺吸引によってのみ検出することができる。これらの後者の技術の使用は、早期発見において、より一般的である。組織内のがん細胞の分子的および表現型分析により、通常、がんが組織に内因性であるかどうか、または病変が別の部位からの転移によるものであるかどうかを確認することになる。

現在診断されているすべてのがんのほぼ半数が、何らかの形のがん治療薬（ｃａｎｃｅｒ ｍｅｄｉｃａｍｅｎｔ）で治療されると推定されている。しかしながら、黒色腫、結腸直腸がん、前立腺がん、子宮内膜がん、子宮頸がん、および膀胱がんを含む多くの型のがんは、がん治療薬による治療にうまく反応しない。実際、がん治療薬のみを使用して治癒することができるのは、がんの約５～１０パーセントだけである。これらには、白血病およびリンパ腫、精巣がん、絨毛がん、ウィルムス腫瘍、ユーイング肉腫、神経芽細胞腫、小細胞肺がん、および卵巣がんのいくつかの形態が含まれる。乳がんを含むさらに他のがんの治療は、がん治療薬と組み合わせた外科手術または放射線療法の組み合わせが必要である。ＢｒａｔｚｌｅｒおよびＰｅｔｅｒｓｏｎを参照のこと。

腫瘍環境は、しばしば、免疫学的攻撃に不応性である。腫瘍環境をより応答性にして腫瘍内のＣＴＬまたは他のエフェクターＴ細胞の活性を増加させ、全体的な治療の有効性を改善することががん免疫療法では望ましい。本明細書で使用される場合、「有効性」は、化学療法および／または免疫学的組成物またはそれらの併用治療が所望の作用または結果を達成する能力を指す。

ヒトがん患者によっては、腫瘍性細胞上の抗原に対する抗体および／またはＴリンパ球応答を発現することが実証されている。また、新生組織形成の動物モデルでは、免疫応答の増強がその特定の新生物の拒絶または退縮をもたらし得ることも示されている。混合リンパ球反応（ＭＬＲ）でＴリンパ球応答を増強する分子は、新生物に対する免疫応答を増強するのにインビボで有用性を有する。ＭＬＲのＴリンパ球増殖反応を増強する分子（または小分子アゴニストもしくはアゴニスト様式で同じ受容体に影響を与えた抗体）は、がんを治療するために治療的に使用することができる。ＭＬＲのリンパ球応答を阻害する分子は、新生組織形成中にインビボでも機能し、新生物に対する免疫応答を抑制し、そのような分子は、腫瘍性細胞自体によって発現され得るか、またはそれらの発現は、他の細胞の新生物によって誘導され得る。そのような阻害分子の拮抗作用（抗体、小分子アゴニスト、または他の手段のいずれかによる）は、免疫介在性の腫瘍拒絶反応を増強する。

ＳＧ－３－００２０およびそのバリアントの産生または合成
ＳＧ－３－００２０タンパク質およびその任意の置換バリアントは、当業者に容易に知られている組換え技術を使用して生成することができる。例えば、治療用タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列、例えば、配列番号２は、適切な宿主細胞、例えば、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＢＬ２１細胞を形質転換するために使用される発現ベクターにサブクローニングすることができ、細胞は、細胞の成長およびタンパク質の発現を可能にするために培養することができる。次いで、発現されたタンパク質は、当業者に容易に知られている様々な方法を再び使用して精製することができる。一般に、「精製された」とは、非タンパク質性成分および様々な他のタンパク質、ポリペプチド、またはペプチドを除去するように分画を施した特定のタンパク質／ペプチド組成物を指し、その組成物は、例えば、以下の本明細書に記載されるように、または所望のタンパク質、ポリペプチド、もしくはペプチドについて当業者に公知であろうタンパク質アッセイによって評価され得るように、その活性を実質的に保持する。

いくつかの実施形態では、宿主細胞は、少なくとも１つの生物であり得る。いくつかの実施形態では、生物は、原核生物（例えば、真核生物、古細菌）または真核生物（酵母）であり得るが、これらに限定されない。

多数の細胞株および培養物が、宿主細胞として使用可能であり、それらは、例えば、生きている培養物および遺伝物質のアーカイブとして機能する組織であるｔｈｅ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）を通じて入手することができる。適切な宿主は、ベクターバックボーンおよび所望の結果に基づいて当業者によって決定され得る。例えば、プラスミドまたはコスミドは、多くのベクターの複製のために原核生物の宿主細胞に導入することができる。ベクターの複製および／または発現に利用可能な細胞型には、Ｅ．ｃｏｌｉなどの細菌（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ株ＲＲ１、Ｅ．ｃｏｌｉ ＬＥ３９２、Ｅ．ｃｏｌｉ Ｂ、Ｅ．ｃｏｌｉ Ｘ １７７６（ＡＴＣＣ番号３１５３７）、ならびにＥ．ｃｏｌｉ Ｗ３１１０（Ｆ－、ラムダ－、原栄養性、ＡＴＣＣ番号２７３３２５）、ＤＨ５α、ＪＭ１０９、およびＫＣ８、枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）などの細菌、サルモネラ・チフィリウム（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、セラチア・マルセッセンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ）などの他の腸内細菌、様々なシュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）種、ならびにＳＵＲＥ（登録商標）Ｃｏｍｐｅｔｅｎｔ ＣｅｌｌｓおよびＳＯＬＯＰＡＣＫ（商標）Ｇｏｌｄ Ｃｅｌｌｓ（ＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ（登録商標）、Ｌａ Ｊｏｌｌａ）などの多くの市販の細菌宿主が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、Ｅ．ｃｏｌｉなどの細菌細胞は、宿主細胞として特に企図されている。

ベクターの複製および／または発現のための真核生物宿主細胞の例には、ＨｅＬａ、ＮＩＨ３Ｔ３、Ｊｕｒｋａｔ、２９３、Ｃｏｓ、ＣＨＯ、Ｓａｏｓ、およびＰＣ１２が含まれるが、これらに限定されない。様々な細胞型および生物からの多くの宿主細胞が利用可能であり、当業者に周知であり得る。同様に、ウイルスベクターは、真核生物または原核生物の宿主細胞のいずれか、特に、ベクターの複製または発現のために許容されるものと共に使用され得る。

所与のアミノ酸配列（例えば、配列番号１）から、配列を取得し、ヌクレオチド配列を生成するためにコドン最適化アルゴリズムを利用する方法が、当業者には公知であろう。コドン最適化アルゴリズムは、発現宿主のコドン使用バイアスに基づいて所与のアミノ酸に適切なコドンを選択する。多くのコドン最適化アルゴリズムは、ｍＲＮＡ構造、宿主ＧＣ含量、リボソーム侵入部位などの他の要因も考慮に入れる。コドン最適化アルゴリズムおよび遺伝子合成サービスプロバイダーのいくつかの例は、ＧｅｎＳｃｒｉｐｔ：ｗｗｗ．ｇｅｎｓｃｒｉｐｔ．ｃｏｍ／ｃｏｄｏｎ－ｏｐｔ．ｈｔｍｌ、ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ：ｗｗｗ．ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ．ｃｏｍ／ｕｓ／ｅｎ／ｈｏｍｅ／ｌｉｆｅ－ｓｃｉｅｎｃｅ／ｃｌｏｎｉｎｇ／ｇｅｎｅ－ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ／ｇｅｎｅａｒｔ－ｇｅｎｅ－ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ／ｇｅｎｅｏｐｔｉｍｉｚｅｒ．ｈｔｍｌ、およびＩｎｔｅｇｒａｔｅｄ ＤＮＡ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ：ｗｗｗ．ｉｄｔｄｎａ．ｃｏｍ／ＣｏｄｏｎＯｐｔである。次いで、ヌクレオチド配列が合成され、適切な発現ベクターにクローン化される。

「実質的に精製された」という用語が使用される場合、これは、特定のタンパク質、ポリペプチド、またはペプチドが、組成物中のペプチドの約５０％以上を構成するような、組成物の主成分を形成する組成物を指す。好ましい実施形態では、実質的に精製されたペプチドは、組成物中のペプチドの６０％超、７０％、８０％、９０％、９５％、９９％、またはそれ以上を構成するであろう。

本開示に適用される「均一に精製された」ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質は、ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質が、ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質が他のタンパク質／ペプチドおよび生物学的成分から実質的に精製されているかまたはそれらを含まないレベルの純度を有することを意味する。例えば、精製されたペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質は、分解配列決定を首尾よく実行することができるように十分に、他のタンパク質／ペプチド成分を含まないことが多い。

タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドの精製の程度を定量化するための様々な方法が、本開示を考慮して当業者には公知であろう。これらには、例えば、画分の特定のタンパク質活性を決定すること、またはゲル電気泳動によって画分内のポリペプチドの数を評価することが含まれる。

いくつかの実施形態での使用に好ましいが、タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドが常に最も精製された状態で提供されるという一般的な要件はない。実際、それにもかかわらず、自然状態と比較して、所望のペプチド組成物が豊富である、実質的に精製されていないタンパク質、ポリペプチド、またはペプチドは、いくつかの実施形態では有用性を有することが企図されている。

より低い程度の相対的精製を示す方法は、ペプチド産物の総回収率において、または、発現されたペプチドの活性を維持することにおいて利点を有し得る。不活性生成物はまた、例えば、抗体生成を介して抗原性を決定することなど、いくつかの実施形態では有用性を有する。

他の実施形態では、ペプチドで強化された調製物は、精製された調製物の代わりに使用され得る。この文書では、精製されたものが使用されるときはいつでも、強化されたものも使用され得る。調製物は、精製方法だけでなく、野生型と比較した場合の細菌によるペプチドの過剰発現または過剰産生によっても強化され得る。これは、組換え法を使用するか、または野生型細胞からペプチドの発現を誘導する条件を選択することによって達成することができる。

代替の実施形態では、ＳＧ－３－００２０タンパク質またはそのバリアントは、当業者に容易に知られている方法によって化学的に合成することができる。

発現系
本開示のタンパク質を産生するための組成物および方法、ならびにタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター、および発現ベクターを含む宿主細胞が、本明細書に提供される。本開示のタンパク質は、通常の組換え法、例えば、本明細書に記載の治療用タンパク質をコードする核酸を含む発現ベクターで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を培養することによって調製することができる。上記のように、ペプチドを生成するために多くの発現系を使用することができる。原核生物および／または真核生物に基づくシステムを、本開示と共に使用して、核酸配列、またはそれらの同族のポリペプチド、タンパク質、およびペプチドを生成するために使用することができる。多くのそのような系は、市販されており、広く入手可能である。発現系には、昆虫細胞／バキュロウイルス系および誘導性哺乳動物発現系が含まれるが、これらに限定されないが、本開示の方法によって産生されるタンパク質、ポリペプチド、またはペプチドは「過剰発現」され得ると企画されている。例えば、タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドは、細胞におけるその自然な発現と比較して増加したレベルで発現され得る。

したがって、本明細書に記載のタンパク質のうちのいずれかを産生するための方法であって、所望のタンパク質の発現に適した条件下で宿主細胞を培養することと、細胞培養物から所望のタンパク質を回収することと、を含む、方法が、さらに提供される。次いで、回収されたタンパク質は、インビトロおよびインビボの方法で使用するために、ならびに薬学的に許容される組成物に製剤化するために、単離および／または精製することができる。いくつかの実施形態では、タンパク質は、Ｅ．ｃｏｌｉ、ラクトコッカス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ストレプトマイセスの種（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｓｐｅｃｉｅｓ）（例えば、Ｓ．セリカラー（Ｓ．ｃｏｅｌｉｃｏｌｏｒ）、Ｓ．リビダンス（Ｓ．ｌｉｖｉｄａｎｓ）、Ｓ．アルバス（Ｓ．ａｌｂｕｓ）、もしくはＳ．ベネズエラエ（Ｓ．ｖｅｎｅｚｕｅｌａｅ））、またはバチルスの種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐｅｃｉｅｓ）（例えば、枯草菌（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ））などの原核細胞で発現される。いくつかの実施形態では、タンパク質は、酵母（例えば、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）、ヤロウィア・リポリティカ（Ｙａｒｒｏｗｉａ ｌｉｐｏｌｙｔｉｃａ）、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）、ハンゼニュラ・ポリモルファ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ））または昆虫細胞（例えば、ｓｆ９、ｓｆ２１、Ｔｎｉ、およびＳ２）などの真核細胞で発現される。いくつかの実施形態では、タンパク質の単離および精製は、エンドトキシンをヒトまたは他の動物における治療的使用に許容できるレベルに減少させる１つ以上のステップを含む。

本開示のタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を含む発現ベクターも、本明細書で提供される。本開示のタンパク質をコードするポリヌクレオチド配列は、標準的な組換え技術を使用して得ることができる。所望のコードされたポリヌクレオチド配列は、発生源細菌、すなわち、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅのゲノムＤＮＡから増幅され得る。代替的に、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチドシンセサイザーを使用して合成することができる。得られると、ポリペプチドをコードする配列を、宿主細胞内で異種（外因性）ポリペプチドを複製および発現することができる組換えベクターに挿入することができる。当該技術分野で利用可能であり、既知である多くのベクターを、本開示の目的のために使用することができる。適切なベクターの選択は、ベクター中に挿入する核酸のサイズ、およびベクターで形質転換される特定の宿主細胞に主として依存するであろう。各ベクターは、その機能（異種ポリヌクレオチドの増幅もしくは発現、またはこれらの両方）およびそれが存在する特定の宿主細胞との適合性に応じて、様々な成分を含有する。ベクター成分には、一般に、複製起点、選択マーカー遺伝子、プロモーター、リボソーム結合部位（ＲＢＳ）、シグナル配列、異種核酸挿入物、および転写終結配列が含まれるが、これらに限定されない。

一般に、宿主細胞と適合性のある種に由来するレプリコンおよび制御配列を含有するプラスミドベクターが、これらの宿主に関連して使用される。このベクターは、通常、複製部位、および形質転換細胞において表現型選択を提供することができるマーキング配列を持つ。例えば、Ｅ．ｃｏｌｉは、典型的には、ｐＢＲ３２２、ｐＵＣ、ｐＥＴ、またはｐＧＥＸベクター、Ｅ．ｃｏｌｉ種に由来するプラスミドを使用して形質転換される。このようなベクターは、アンピシリン（Ａｍｐ）およびテトラサイクリン（Ｔｅｔ）耐性をコードする遺伝子を含有し、それ故に、形質転換細胞を特定するための容易な手段を提供する。これらのベクター、ならびにそれらの誘導体または他の微生物プラスミドもしくはバクテリオファージはまた、内因性タンパク質の発現のための微生物によって使用され得るプロモーターも含有し得るか、またはそれを含有するように修飾され得る。

本開示の発現ベクターは、プロモーター、上流（５’）に位置する非翻訳調節配列、およびプロモーターがそのコード配列の転写を調節するように作動可能に連結されたタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含み得る。原核生物プロモーターは、典型的には、誘導性および構成性の２つのクラスに分類される。誘導性プロモーターは、培養条件の変化、例えば、栄養素の存在もしくは不在、または温度の変化に応答して、その制御下で増加したレベルの、コードされたポリヌクレオチドの転写を開始するプロモーターである。様々な潜在的な宿主細胞によって認識される多数のプロモーターが、公知であり、当業者は、所望の発現レベルに従ってプロモーターを選択することができる。原核生物宿主での使用に好適なプロモーターには、ｌａｃ、ｔｒｐ、ｔａｃ、ｔｒｃ、およびａｒａなどのＥ．ｃｏｌｉプロモーター、ラムダおよびＴ５プロモーターなどのＥ．ｃｏｌｉによって認識されるウイルスプロモーター、ならびにＴ７バクテリオファージに由来するＴ７およびＴ７ｌａｃプロモーターが含まれる。例えば、Ｔ７プロモーターを含むベクターを保有する宿主細胞は、Ｔ７ポリメラーゼを発現するように操作されている。このような宿主細胞には、Ｅ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１（ＤＥ３）、Ｌｅｍｏ２１（ＤＥ３）、およびＮｉＣｏ２１（ＤＥ３）細胞が含まれる。酵母宿主での使用に好適なプロモーターには、酵母アルコールデヒドロゲナーゼ１（ＡＤＨ１）プロモーター、酵母ホスホグリセリン酸キナーゼ（ＰＧＫ１）プロモーター、および翻訳伸長因子ＥＦ－１アルファプロモーターなどのプロモーターが含まれる。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、Ｈ．ポリモルファ（Ｈ．ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ）細胞であり、プロモーターは、ＭＯＸプロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、化学的または環境的要因の制御下にある誘導性プロモーターである。

さらに有用なプラスミドベクターには、ｐＩＮベクター（Ｉｎｏｕｙｅ ｅｔ ａｌ．，１９８５）、ならびに後の精製および分離または切断のためのグルタチオンＳ－トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）可溶性融合タンパク質の生成に使用するためのｐＧＥＸベクターが含まれる。他の好適な融合タンパク質は、β－ガラクトシダーゼ、ユビキチンなどを有するものである。

原核生物および真核生物の両方の宿主細胞での発現に好適なベクターは、当該技術分野で周知である。

本開示のベクターは、宿主細胞によって翻訳された組換えタンパク質が認識および処理される（すなわち、シグナルペプチダーゼによって切断される）ことを可能にするシグナル配列をさらに含み得る。異種ポリペプチドを原産とするシグナル配列を認識も処理もされない原核生物宿主細胞については、シグナル配列は、例えば、アルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、Ｉｐｐ、または熱安定性エンテロトキシンＩＩ（ＳＴＩＩ）リーダー、ＬａｍＢ、ＰｈｏＥ、ＰｅＩＢ、ＯｍｐＡ、およびＭＢＰからなる群から選択される原核生物シグナル配列によって置換される。真核生物発現系で使用するために公知のシグナル配列には、インターロイキン－２、ＣＤ５、免疫グロブリンカッパ軽鎖、トリプシノーゲン、血清アルブミン、およびプロラクチンが含まれるが、これらに限定されない。

本明細書に記載のタンパク質（例えば、ＳＧ－３－００２０）は、融合タンパク質またはポリペプチドとして発現させることができる。一般的に使用される融合パートナーには、ヒト血清アルブミンおよび結晶化可能な断片、またはＩｇＧの定常ドメイン、Ｆｃが含まれるが、これらに限定されない。ヒスチジンタグまたはＦＬＡＧタグを使用して、発現培地または組換え細胞溶解物からの組換えタンパク質の精製を簡素化することもできる。融合パートナーは、目的のタンパク質のＮ末端および／またはＣ末端に融合させることができる。

ＤＮＡが染色体外要素または染色体成分のいずれかとして複製可能であり、それによって目的の発現ベクターを収容する宿主細胞を生成することができるように、組換えＤＮＡ、すなわち、発現ベクターを宿主細胞に導入するための方法は、公知である。トランスフェクションの方法は、例えば、ＣａＰＯ_４およびエレクトロポレーションによるものが、当業者に周知である。使用される宿主細胞に応じて、そのような細胞に適した標準的な技術を使用して形質転換が、行われる。上記のＳａｍｂｒｏｏｋらに記載されるように、塩化カルシウムを用いるカルシウム処理、またはエレクトロポレーションは、一般に、実質的な細胞壁バリアを含む原核生物または他の細胞に使用される。哺乳動物細胞宿主系の形質転換の一般的な態様は、米国特許第４，３９９，２１６号に記載されている。酵母への形質転換は、Ｖａｎ Ｓｏｌｉｎｇｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂａｃｔ，１３０：９４６（１９７７）およびＨｓｉａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ），７６：３８２９（１９７９）の方法に従って実施され得る。ＤＮＡを細胞に導入するための他の方法には、核マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、無傷の細胞との細菌プロトプラスト融合、またはポリカチオン、例えば、ポリブレン、ポリオルニチンを使用した導入が含まれる。哺乳動物細胞を形質転換するための様々な技術については、Ｋｅｏｗｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ．１８５：５２７－５３７（１９９０）およびＭａｎｓｏｕｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３３６：３４８－３５２（１９８８）を参照のこと。

したがって、上記の、および目的の治療用タンパク質配列（例えば配列番号１）をコードするポリヌクレオチドを含む、組換えベクターまたは発現ベクターが、本明細書で提供される。ポリヌクレオチドは、配列番号２であり得る。さらに、本開示は、ベクターを収容する宿主細胞を提供する。宿主細胞は、上で詳述したように、真核細胞または原核細胞であり得る。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、原核細胞である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｌ．ラクティス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ）、Ｓ．ｃｏｅｌｉｃｏｌｏｒ、Ｓ．ｌｉｖｉｄａｎｓ、Ｓ．ａｌｂｕｓ、Ｓ．ｖｅｎｅｚｕｅｌａｅ、またはＢ．ｓｕｂｔｉｌｉｓである。

治療用ペプチドを含む薬学的組成物
本明細書に記載のペプチドを含む組成物が、提供される。実施形態では、本明細書に記載の組成物は、ヒトへの投与に適しており、それを必要とするヒトに投与されたときに治療効果を示す薬学的組成物である。本開示の薬学的組成物は、治療有効量の、薬学的に許容される担体中の治療用ペプチドを含み得る。

「薬学的または薬理学的に許容される」という句は、必要に応じて、例えば、ヒトなどの動物への投与に適している分子実体および組成物を指す。薬学的組成物または追加の活性成分の調製は本開示を考慮して、参照により本明細書に組み込まれるＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８^ｔｈ Ｅｄ．Ｍａｃｋ Ｐｒｉｎｔｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，１９９０によって例示されるように、当業者に公知であろう。さらに、動物（例えば、ヒト）投与のためには、調製物は、ＦＤＡ生物基準局（Ｏｆｆｉｃｅ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｔａｎｄａｒｄｓ）によって要求されるような滅菌度、発熱性、一般的安全性および純度基準を満たすべきであることが理解されるであろう。

本明細書で使用する場合、「薬学的に許容される担体」には、当業者に周知であり得るように、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、界面活性剤、抗酸化剤、防腐剤（例えば、抗菌剤、抗真菌剤）、等張剤、吸収遅延剤、塩、防腐剤、薬物、薬物安定剤、ゲル、結合剤、賦形剤、崩壊剤、滑沢剤、甘味剤、香味剤、染料、このような同様の材料およびこれらの組み合わせが含まれる（例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８^ｔｈ Ｅｄ．Ｍａｃｋ Ｐｒｉｎｔｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，１９９０，ｐｐ．１２８９－１３２９を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる）。任意の従来の担体が有効成分と適合しない場合を除いて、治療用または薬学的組成物におけるその使用が企図されている。

本開示の薬学的組成物は、それが、固体、液体、またはエアロゾルの形態で投与されるか、および注射などの投与経路のために滅菌を必要とするかに応じて、異なる種類の担体を含み得る。本開示のペプチドは、経口または直腸に投与することができるが、髄腔内に、鼻腔内に、皮下に、粘膜によって、吸入（例えば、エアロゾル吸入）によって、注射によって、注入または持続注入によって、標的細胞を直接浸す局所的灌流で、カテーテルを介して、洗浄を介して、または当業者に公知であろう他の方法もしくは前述の任意の組み合わせによって局所的に投与され得る（例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８^ｔｈ Ｅｄ．Ｍａｃｋ Ｐｒｉｎｔｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，１９９０を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる）。

本開示のペプチドは、遊離塩基、中性、または塩の形態で組成物に製剤化され得る。薬学的に許容される塩には、酸付加塩、例えば、タンパク質性組成物の遊離アミノ基で形成されるもの、または例えば、塩酸もしくはリン酸などの無機酸、または酢酸、シュウ酸、酒石酸、もしくはマンデル酸などの有機酸で形成されるものが含まれる。遊離カルボキシル基で形成された塩はまた、例えば、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、もしくは水酸化第二鉄などの無機塩基、またはイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、もしくはプロカインなどの有機塩基にも由来し得る。

組成物が液体形態である実施形態では、担体は、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコールなど）、脂質（例えば、トリグリセリド、植物油、リポソーム）およびそれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用によって、例えば液体ポリオールまたは脂質などの担体での分散による、必要とされる粒子サイズの維持によって、例えば、ヒドロキシプロピルセルロースなどの界面活性剤の使用によって、またはそのような方法の組み合わせによって維持することができる。多くの場合において、例えば、糖、塩化ナトリウム、またはそれらの組み合わせなどの等張剤を含むことが好ましいであろう。

特定の実施形態では、本開示のペプチド組成物は、経口摂取のような経路による投与のために調製される。これらの実施形態では、固体組成物は、例えば、溶液、懸濁液、エマルジョン、錠剤、丸剤、カプセル剤（例えば、ハードもしくはソフトシェルゼラチンカプセル）、遅延放出カプセル、徐放性製剤、頬側組成物、トローチ剤、エリキシル剤、懸濁液、シロップ剤、ウエハース、またはそれらの組み合わせを含んでもよい。経口組成物は、食事の食物と共に直接取り入れてもよい。経口投与のための好ましい担体は、不活性希釈剤、吸収可能な食用担体、またはそれらの組み合わせを含む。本開示の他の態様では、経口組成物は、シロップ剤またはエリキシル剤として調製されてもよい。シロップ剤またはエリキシル剤であり、例えば、少なくとも１つの活性剤、甘味剤、保存剤、着香剤、色素、保存剤、またはそれらの組み合わせを含んでもよい。

いくつかの実施形態では、経口組成物は、１つ以上の結合剤、賦形剤、崩壊剤、潤滑剤、着香剤、およびそれらの組み合わせを含んでもよい。いくつかの実施形態では、組成物は、例えば、トラガカントガム、アカシア、トウモロコシデンプン、ゼラチン、もしくはそれらの組み合わせなどの結合剤、例えば、リン酸二カルシウム、マンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム、もしくはそれらの組み合わせなどの賦形剤、例えば、トウモロコシデンプン、ジャガイモデンプン、アルギン酸、もしくはそれらの組み合わせなどの崩壊剤、例えば、ステアリン酸マグネシウムなどの潤滑剤、例えば、スクロース、ラクトース、サッカリン、もしくはそれらの組み合わせなどの甘味料、例えば、ペパーミント、ウィンターグリーン油、チェリーフレーバー、オレンジフレーバーなどの着香剤、または前述のそれらの組み合わせのうちの１つ以上を含み得る。投与単位形態がカプセル剤である場合、上記のタイプの材料に加えて、液体担体などの担体を含有してもよい。様々な他の材料が、コーティング剤として、または投与単位の物理的形態を他の方法で修飾するために存在してもよい。例えば、錠剤、丸剤、またはカプセル剤は、シェラック、糖、またはその両方でコーティングされてもよい。

他の投与様式に適しているさらなる製剤には、坐剤が含まれる。坐剤は、様々な重量および形状の固形剤形であり、直腸に挿入するために、通常投薬される。挿入後、坐剤は、腔液中で軟化、融解、または溶解される。概して、坐剤では、従来の担体には、例えば、ポリアルキレングリコール、トリグリセリド、またはそれらの組み合わせが含まれ得る。いくつかの実施形態では、坐剤は、例えば、約０．５％～約１０％、好ましくは約１％～約２％の範囲で活性成分を含有する混合物から形成され得る。

いくつかの実施形態では、非経口投与に適している組成物が、提供される。注射可能な製剤は、１つ以上の薬学的に許容される滅菌の等張水溶液もしくは非水溶液、分散液、懸濁液、もしくはエマルジョン、または使用直前に滅菌注射可能な溶液もしくは分散剤に再構成され得る滅菌散剤と組み合わせて１つ以上の記載の化合物を含み、これらは、糖、アルコール、アミノ酸、抗酸化剤、緩衝化剤、静菌剤、意図されたレシピエントの血液と等張である製剤にする溶質、または懸濁剤もしくは濃化剤を含み得る。本発明の薬学的組成物において使用され得る好適な水性および非水性担体の例には、水、エタノール、ポリオール（グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど）、およびそれらの適切な混合物、オリーブオイルなどの植物油、およびオレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステルが含まれる。

これらの薬学的組成物はまた、保存剤、湿潤剤、乳化剤、および分散剤などのアジュバントを含有し得る。記載された化合物に対する微生物の作用の防止は、様々な抗菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノールソルビン酸などを含めることによって確実にされ得る。糖、塩化ナトリウムなどの等張性を制御するための薬剤を組成物に含めることも望ましくあり得る。加えて、注射可能な剤形の長期吸収は、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンなどの吸収を遅延させる薬剤を含めることによってもたらされ得る。

滅菌注射液は、上に列挙した他の成分の様々な組み合わせと共に適切な溶媒において必要量の活性化合物を組み入れて、必要に応じてその後濾過滅菌することによって調製される。一般的に、分散液は、様々な滅菌された活性成分を、基本分散媒および／または他の成分を含有する滅菌ビヒクルに組み込むことによって調製される。滅菌注射液を調製するための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、活性成分に加えて、予め濾過滅菌したその液体媒体からの任意のさらなる所望の成分の粉末を生じる、真空乾燥または凍結乾燥技術である。液体媒体は、必要であれば適切には緩衝化されるべきであり、液体希釈剤は、注射の前に十分な食塩水またはグルコースによってまず等張にされるべきである。溶媒としてＤＭＳＯを用いることによって極めて迅速な浸透が起こると想定され、小さい領域に高濃度の活性剤を送達する、直接注射のための高濃度組成物の調製も企図されている。

組成物は、製造および保管条件下で安定でなければならず、細菌および真菌のような微生物の混入作用に対して保護されなければならない。エンドトキシンの混入は、安全なレベル、例えば、０．５ｎｇ／ｍｇタンパク質／ペプチド未満で、最小限維持されるべきであることが理解されよう。

いくつかの実施形態では、組成物は、上記の配列番号１に示されるアミノ酸配列またはそのバリアントを含むか、それからなるか、または本質的にそれからなる精製ペプチドを含む。

治療用ペプチドを含む併用療法
治療用タンパク質を含む本明細書で提供される薬学的組成物は、他の治療療法および／または薬学的組成物と組み合わせることができる。例えば、免疫学的関連疾患または障害、またはがんを患っている患者は、その状態を治療するために医師によって処方された医薬品をすでに服用している可能性がある。実施形態では、本明細書で提供される薬学的組成物は、患者の既存の薬物と併せて投与することができる。

例えば、本明細書で提供される治療用ペプチドは、５－アミノサリチル酸化合物、抗炎症剤、抗生物質、抗体（例えば、炎症性サイトカインを標的とする抗体、例えば、アダリムマブ、ペゴール、ゴリムマブ、インフリキシマブ、およびセルトリズマブなどのＴＮＦ－αを標的とする抗体）、抗サイトカイン剤、抗炎症性サイトカイン剤、ステロイド、コルチコステロイド、免疫抑制剤（例えば、アザチオプリンおよびメルカプトプリン）、ビタミン、および／または特殊な食事、のうちの１つ以上と組み合わせられ得る。いくつかの実施形態では、本開示の治療用ペプチドは、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＣＴＬＡ－４、ＢＴＬＡ、ＬＡＧ－３、Ａ２ＡＲ、ＴＩＭ－３、Ｂ７－Ｈ３、ＶＩＳＴＡ、またはＩＤＯを標的とする薬剤などのチェックポイント阻害剤と共に投与される。このような薬物には、ペンブロリズマブ、ニボルマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、セミプリマブ、およびイピリムマブが含まれるが、これらに限定されない。本明細書で提供される治療用ペプチドは、自己細胞免疫療法（例えば、ｓｉｐｕｌｅｕｃｅｌ－Ｔ）と組み合わせることができる。いくつかの実施形態では、他の治療療法および／または薬学的組成物は、ＮＫ細胞を活性化し、抗体依存性細胞傷害を増強するモノクローナル抗体、がん抗原特異的な体液性免疫応答を刺激するアジュバントを含むまたは含まないがんワクチン、カルボプラチンおよび／またはミトタンなどの化学療法剤、アドレナリンコルチコステロイドまたはフルオキシメステロンなどのホルモン、または、エリスロポエチンもしくはＧＭ－ＣＳＦなどのがん細胞の直接的な細胞毒性によってではなく、がんに対する対象の応答を変化させる生物学的反応修飾因子、などのがん免疫療法から選択され得る。治療療法、薬学的組成物／医薬品の広範であるが、非限定的なリストは、ＢｒａｔｚｌｅｒおよびＰｅｔｅｒｓｏｎに開示されている。

いくつかの実施形態では、相乗効果は、開示された治療用ペプチドを１つ以上のさらなる治療剤と組み合わせることで達成される。

いくつかの実施形態では、１つ以上の腫瘍または腫瘍性組織は、免疫療法の前または免疫療法中に減量される。いくつかの実施形態では、免疫療法の前または免疫療法中の、１つ以上の腫瘍の減量は、疾患の進行の遅延または停止のいずれかをもたらす。いくつかの実施形態では、免疫療法の前または免疫療法中の、１つ以上の腫瘍の減量は、腫瘍の退縮または排除をもたらす。

いくつかの実施形態では、疾患の進行の遅延は、腫瘍の成長または増殖の速度において、少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の減少を含む。

いくつかの実施形態では、腫瘍の退縮は、腫瘍数、腫瘍サイズ、または腫瘍体積において、少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の減少を含む。

腫瘍または損傷範囲の評価を可能にする任意の手順を使用することができる。非限定的な例には、直腸指診、内視鏡検査（例えば、結腸内視鏡検査）、および画像診断（例えば、ＰＥＴ、ＭＲＩ、ＥＲＵＳ、ＤＲＥ、ＣＴ）が含まれる。例えば、ＭｃＫｅｏｗｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｃａｎｃｅｒ．２０１４；５（１）：３１－４３を参照のこと。いくつかの実施形態では、腫瘍負荷は、ＲＥＣＩＳＴ（例えば、ＲＥＣＩＳＴバージョン１またはバージョン１．１）を使用して評価することができる。例えば、Ｅｉｓｅｎｈａｕｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ．４５（２）：２２８－４７（２００９）を参照のこと。

免疫療法を評価するための基準も開発されている。非限定的な例には、免疫関連応答基準（ｉｒＲＣ）（Ｗｏｌｃｈｏｋ ｅｔ ａｌ．Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．２００９ Ｄｅｃ １；１５（２３）：７４１２－２０を参照のこと）および固形腫瘍における免疫応答基準（ｉＲＥＣＩＳＴ）基準（Ｓｅｙｍｏｕｒ ｅｔ ａｌ．Ｌａｎｃｅｔ Ｏｎｃｏｌ．２０１７ Ｍａｒ；１８（３）：ｅ１４３－ｅ１５２を参照のこと）が含まれる。Ｔｈａｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｗｉｅｎ Ｋｌｉｎ Ｗｏｃｈｅｎｓｃｈｒ．２０１８；１３０（３）：８５－９１も参照のこと。

ＮＫ細胞および内因性樹状細胞を活性化し、ＩＦＮレベルを上昇させることに加えて、抗原特異的な体液性および細胞媒介性免疫応答を有することは、がんを治療するのに役立ち得る。いくつかのがん細胞は、抗原性であるため、免疫系の標的となり得る。一態様では、本開示のペプチド、または本開示のペプチドに加えて１つ以上のがん治療薬は、がんに対する免疫応答を刺激するために特に有用である。本明細書で使用される「がん抗原」は、腫瘍またはがん細胞表面に関連し、樹状細胞などの抗原提示細胞の表面に発現される場合に、免疫応答を誘発することができるペプチドなどの化合物である。いくつかの態様では、抗原は、ＭＨＣ分子を介してＡＰＣ上に提示される。がんワクチンに存在するものまたはがん免疫療法を調製するために使用されるものなどのがん抗原は、がん細胞粗抽出物から、または組換え技術もしくは既知の抗原の新規合成を使用して抗原を部分的に精製することによって、調製することができる。いくつかの態様では、他の生物から単離されたタンパク質または当該タンパク質とある程度の相同性を共有する合成タンパク質は、がん免疫療法を調製するために使用される。

ナチュラルキラー細胞（ＮＫ細胞）、細胞溶解性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）、リンホカイン活性化キラー細胞（ＬＡＫ）、および活性化マクロファージなど、インビトロおよびインビボで腫瘍標的を死滅させることができる異なる細胞型が、同定されている。ＮＫ細胞は、特定の抗原に対して事前に感作されることなく腫瘍細胞を死滅させることができ、その活性は、標的細胞上の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）によってコードされるクラスＩ抗原の存在を必要としない。ＮＫ細胞は、発生期の腫瘍の制御および転移性増殖の制御に関係していると考えられている。ＮＫ細胞とは対照的に、ＣＴＬは腫瘍抗原に対する感作後およびＭＨＣクラスＩも発現する腫瘍細胞上で標的抗原が発現される場合にのみ、腫瘍細胞を死滅させることができる。ＣＴＬは、移植された腫瘍およびＤＮＡウイルスによって引き起こされた腫瘍の拒絶におけるエフェクター細胞であると考えられている。ＬＡＫ細胞は、ＮＫおよびＣＴＬ集団とは異なったヌルリンパ球のサブセットである。活性化されたマクロファージは、抗原非依存的でもなく、一旦制限されたＭＨＣが活性化することもない様式において、腫瘍細胞を死滅させることができる。活性化されたマクロファージは、これらのマクロファージが浸潤した腫瘍の成長速度を減少させると考えられている。インビトロアッセイによって、別の免疫機構、例えば、抗体依存性反応、細胞媒介性細胞傷害性反応、および抗体＋補体による溶解が確認されている。しかしながら、これらの免疫エフェクター機構は、ＮＫ、ＣＴＬ、ＬＡＫ、およびマクロファージの機能よりもインビボでの重要性が劣るものと考えられている。

がんワクチンと組み合わせた本開示のペプチドの使用は、ＮＫ細胞および内因性樹状細胞を活性化し、ＩＦＮレベルを増加させることに加えて、改善された抗原特異的体液性および細胞媒介性免疫応答を提供する。そのような増強は、同じ有益な効果を達成するために、減少した抗原用量を有するワクチンの使用を可能にすることができる。

治療用ペプチドを利用した治療方法
疾患または状態の少なくとも１つの症状を治療、予防、または改善するための方法であって、本明細書に記載の治療的または予防的に有効な量のペプチドを、それを必要とする対象、すなわち、疾患もしくは状態、または疾患もしくは状態の少なくとも１つの症状を患っている、またはそれらを発症するリスクがある対象に投与することを含む、方法が提供される。

ペプチドの投与は、対象において疾患または状態の少なくとも１つの症状を予防する、その重症度を軽減させる、またはその少なくとも１つの症状を排除することができる。対象は、動物であり得る。対象は、哺乳動物であり得る。対象は、ヒト対象であり得る。

いくつかの実施形態では、疾患または状態は、がん、例えば、本明細書に記載のがんのうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、疾患または状態は、自己免疫性甲状腺炎である。いくつかの実施形態では、疾患または状態は、ホジキンリンパ腫である。

本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、治療用ペプチドを含む薬学的組成物は、胃腸管内部への投与のための、または腸、回腸末端、もしくは結腸内での遅延放出のために製剤化される。本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、治療用ペプチドを含む薬学的組成物は、腸溶コーティングで製剤化される。

本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、治療用ペプチドを含む薬学的組成物は、組成物を投与した対象においてがんを治療することができる。本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、治療用ペプチドを含む薬学的組成物は、組成物を投与した対象において、免疫細胞によって少なくとも１つの炎症誘発性サイトカイン（例えば、ＴＮＦ－αおよび／またはＩＬ－２３）の産生の誘導または増加をもたらし得る。本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、治療用ペプチドを含む薬学的組成物は、組成物を投与した対象において、免疫細胞によって少なくとも１つの抗炎症性サイトカイン（例えば、ＩＬ－１０）を抑制し得る。

本明細書の方法のいくつかの実施形態では、第２の治療剤または予防剤は、本明細書に記載のペプチドと組み合わせて、同時にまたは順次のいずれかで投与される。いくつかの実施形態では、ペプチドおよび第２の薬剤は、疾患、または状態、または症状の治療または予防のために相乗的に作用する。他の実施形態では、ペプチドおよび第２の薬剤は、疾患、または状態、または症状の治療または予防のために相加的に作用する。

新生物を治療するための臨床的パラメーター
本開示のペプチドを含む組成物の投与は、対象／対象の細胞において生物学的応答をもたらす。いくつかの実施形態では、本開示の１つ以上のペプチドの投与により、対象またはそこから単離された細胞において、ＩＬ－１０の発現の減少、炎症性（炎症誘発性）サイトカインの増加、ＴＮＦ－αの増加、抗炎症性サイトカインの減少、寛容原性樹状細胞増殖の制限、ＩＬ－１０：ＴＮＦの比の減少、ＩＬ－１２の発現の増加、Ｔｈ１活性化の増加または促進、ＴＮＦの増加、樹状細胞成熟の増加または増強、ＣＤ７０の発現の増加、Ｔ細胞活性化の増加、ＣＤ２７を介した共刺激を伴うＴ細胞活性化の増加、ＣＤ８０および／またはＣＤ８６の発現の増加、Ｔ細胞活性化の増加または増強、ＣＤ２８を介した共刺激を伴うＴ細胞活性化の増加、ＭＨＣ Ｉおよび／またはＭＨＣ ＩＩの発現の増加、ＭＨＣに関与する抗原提示の増加によるＴ細胞活性化の増加または増強、Ｔ_ｒｅｇ細胞の数の減少、Ｔ_ｒｅｇ細胞のクローン性増殖の予防および／またはＴ_ｅｆｆ細胞のクローン性増殖の促進、Ｔ_ａｃｔ細胞の数の増加、ＣＴＬ細胞の数の増加、腫瘍性組織のサイズおよび／または体積の減少、腫瘍性組織または細胞の転移の防止、腫瘍性細胞におけるアポトーシスの誘導、腫瘍性細胞のアポトーシスの速度の増加、１つ以上の組織における腫瘍性腫瘤の数の減少、腫瘍性病変のサイズの減少、ならびにＴ_ａｃｔ、Ｔ_{ｅｆｆ／ｍｅｍ}、および／またはＣＴＬ細胞のクローン性増殖の増加、のうちの１つ以上を示す。いくつかの実施形態では、本開示の１つ以上のペプチドの対象への投与は、対象（例えば、対象のＴ細胞などの細胞）において、シグナル伝達および転写活性化因子１（ＳＴＡＴ１）、インターフェロン調節因子１（ＩＲＦ１）、分化クラスター９６（ＣＤ９６）、ｍｏｔｈｅｒｓ ａｇａｉｎｓｔ ｄｅｃａｐｅｎｔａｐｌｅｇｉｃ ｈｏｍｏｌｏｇ ３（ＳＭＡＤ３）、Ｃ－Ｘ－Ｃモチーフケモカイン受容体６（ＣＸＣＲ６）、転写因子７（ＴＣＦ７）、リンパ球抗原９（ＬＹ９）、Ｃ－Ｘ－Ｃモチーフケモカイン１０（ＣＸＣＬ１０）、グランザイムＫ（ＧＺＭＫ）、インターフェロン刺激エキソヌクレアーゼ遺伝子２０（ＩＳＧ２０）、およびシグナル伝達リンパ球活性化分子Ｆ７（ＳＬＡＭＦ７）からなる群から選択される１つ以上の遺伝子の発現の減少をもたらす。いくつかの実施形態では、本開示の１つ以上のペプチドの対象への投与は、対象（例えば、対象のＴ細胞などの細胞）において、二重特異性ホスファターゼ６（ＤＵＳＰ６）、カテプシンＬ（ＣＴＳＬ）、ＩＬ－９、ＩＬ－２、ＩＬ－１０、ＩＬ－２４、ＩＬ－２１、およびＩＬ－３からなる群から選択される１つ以上の遺伝子の発現の増加をもたらす。

いくつかの実施形態では、本開示の１つ以上のペプチドの対象への投与は、対象の血漿中のＤＵＳＰ６、ＣＴＳＬ、ＩＬ－９、ＩＬ－２、ＩＬ－１０、ＩＬ－２４、ＩＬ－２１、およびＩＬ－３からなる群から選択される１つ以上の遺伝子の発現の増加をもたらす。

いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、対象において少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、または５２週間の増加した平均余命をもたらす。いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、対象において少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、または４８カ月間の増加した平均余命をもたらす。いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、対象において少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、または５０年間の増加した平均余命をもたらす。

いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、１つ以上の新生物の体積の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９８％の１つ以上の新生組織形成の体積の減少をもたらす。

いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、１つ以上の腫瘍性病変の体積の少なくとも１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９８％の１つ以上の腫瘍性病変のサイズの減少を含む。

いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、新生組織形成の１つ以上のマイナスの副作用の少なくとも５％、１０％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、または９５％の減少をもたらし、このマイナスの副作用には、吐き気、疼痛、不快感、嘔吐、下痢、めまい、食欲不振、神経痛、発作、定期的な意識喪失、歩行運動の喪失または欠如、身体的協調の喪失または欠如、および視力の喪失または欠如が含まれる。

いくつかの実施形態では、ペプチドを含む組成物の対象への投与は、１つ以上の新生組織形成と接触してＴ_ｒｅｇおよびＴ_ｅｆｆ細胞のクローン集団における変化をもたらし、Ｔ_ｅｆｆの集団は、Ｔ_ｒｅｇの集団と比較して少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、または３０倍増加する。

微生物培養
本明細書に記載のペプチドを産生するための方法が、提供される。この方法は、ペプチドがそれをコードする外因性ポリヌクレオチドから発現される条件下で、上記のように宿主細胞を培養することを含む。

Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ（ＡＴＣＣ １５７００）は、配列番号１をコードする配列番号２の起源である。配列番号１の配列を有するＳＧ－３－００２０タンパク質は、以下の実施例で使用するための通常の装置およびペプチド合成の方法に従って化学的に合成された。

以下の実施例は、本開示を説明することを意図しているが、これに限定されない。

実施例１．マウスナイーブ脾細胞の刺激に対するＳＧ－３－００２０の効果
この実施例は、エフェクターＴ細胞、具体的には、ＣＤ４^＋ ＣＤ２５^＋ ＦｏｘＰ３^－表現型によって部分的に特徴付けられるＣＤ４エフェクターＴ細胞、およびＣＤ８^＋ ＣＤ２５^＋ ＦｏｘＰ３^－表現型によって部分的に特徴付けられるＣＤ８エフェクター細胞を活性化することができる、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ由来のペプチドを同定するための、初期スクリーニングアッセイを説明する。ナイーブ雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（Ｔａｃｏｎｉｃ、８～１４週齢）から単離した脾細胞を、平底９６ウェルプレート中で最終的な数の８×１０^５個の細胞／ウェルに、完全ＲＰＭＩ（１０％ ＦＢＳ＋１％ ペニシリン／ストレプトマイシンを含有するＲＰＭＩ）中に再懸濁した。次いで、細胞を、各ペプチド（水中１０μＭ）またはオバルブミンペプチドアミノ酸３２３－３３９（水中１０μＭ）、水（Ｔｈ０ ｍｉｎ Ｈ_２Ｏ）、抗ＣＤ３抗体単独（Ｔｈ０ ｍｉｎ）、または１μｇ／ｍｌの抗ＣＤ３、ＩＬ－１２（１０ｎｇ／ｍｌ）、および５μｇ／ｍｌの抗ＩＬ－４抗体（Ｔｈ１細胞を生成するための陽性対照）の存在下で、０．０５μｇ／ｍｌの抗ＣＤ３抗体で刺激した。細胞を、３７℃、５％ＣＯ_２で４８時間インキュベートした。図２Ａ、図２Ｂ、および図２Ｃを参照のこと。

ＦｏｘＰ３の不在および高いＣＤ２５の発現によって定義される、活性化された（T_act）ＣＤ４（図２Ａ）およびＣＤ８（図２Ｂ）Ｔ細胞のレベルは、多色フローサイトメトリーによって決定した。次いで、Ｔ細胞のレベルを、脾細胞をＯＶ_{３２３－３３９}陰性対照ペプチドで処理した場合のＴ細胞のレベルに対して正規化した。Ｌｕｍｉｎｅｘ分析によって定量化した、培養上清中のＩＬ－２（図２Ｃ）およびＩＬ－１７（図２Ｄ）のレベルを参照のこと。ゲートしたＣＤ８ ＦｏｘＰ３^－Ｔ細胞でのグランザイムＢの発現のレベルを、フローサイトメトリーによって分析した。図２Ｅを参照のこと。バーは、平均±標準偏差を表す。（ｖｓ．Ｔｈ０＋Ｈ_２Ｏ）Ｋｒｕｓｋａｌｌ－Ｗａｌｌｉｓによる、未補正のＤｕｎｎ検定。

ＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞活性化（図２Ａおよび図２Ｂ）に関連する細胞表面マーカープロファイル（ＣＤ２５＋／ＦｏｘＰ３－）のインビトロ発現を増強するＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ由来ＳＧ－３－００２０の能力は、Ｔエフェクター細胞サイトカイン分泌（ＩＬ－２およびＩＬ－１７）（図２Ｃおよび図２Ｄ）を促進し、ＣＤ８ Ｔ細胞（図２Ｅ）における重要なエフェクター分子（グランザイムＢ）の誘導を促進し、ＳＧ－３－００２０またはそのバリアントが、Ｔ細胞の増殖または増加した活性を促進することができ、それが次に腫瘍細胞の死滅を促進することができることを示唆している。

ナイーブマウス脾細胞を、ＳＧ－３－００２０の用量を増加させて（１μＭ、５μＭ、または１０μＭ）処理する上記の方法を使用して、用量反応研究も実施した。フローサイトメトリー分析は、エフェクターＣＤ８ Ｔ細胞（ＣＤ８^＋、ＣＤ２５^＋、ＦｏｘＰ３）の頻度、エフェクターＣＤ８ Ｔ細胞での、グランザイムＢの発現、およびＩＬ－２の発現を測定するために行われた。図３Ａ、図３Ｂ、および図３Ｃに示されるように、ＳＧ－３－００２０の用量反応が観察され、腫瘍細胞の死滅を促進することができるＴ細胞の増殖または増加した活性を促進することができる活性免疫調節剤としてのＳＧ－３－００２０の使用を支持している。

実施例２．ヒトＴ細胞の活性化におけるＳＧ－３－００２０の効果
ＳＧ－３－００２０がヒトＴ細胞を活性化し、Ｔ細胞の調節を通じて適応免疫に影響を与える能力を実証するための研究が、行われた。ＰＢＭＣは、５人の個々のヒトドナーから得られた。Ｔ細胞を、凍結ＰＢＭＣ（ＥａｓｙＳｅｐ（商標）Ｈｕｍａｎ Ｔ Ｃｅｌｌ Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ Ｋｉｔ（カタログ番号１７９５１、ＳｔｅｍＣｅｌｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）から精製した。プロトコルの要約を図４に提供する。ヒトＴ細胞のインビトロ活性化を、図５Ａに提供されたプロトコルに従って実行した。フローサイトメトリー分析に使用されるプロトコルを、図５Ｂに提供する。要約すると、精製されたＴ細胞を、ＳＧ－３－００２０を含む抗ＣＤ３抗体または対照としての抗ＣＤ２８抗体と共にインキュベートした。図６Ａ、６Ｂ、６Ｃ、および６Ｄに提供される結果は、ＳＧ－３－００２０を用いたＴ細胞のインキュベーションにより、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋細胞の両方で、ＰＤ－１の発現が増加したことを示す（図６Ａ）。さらに、ＳＧ－３－００２０を用いたＴ細胞のインキュベーションにより、ＩＬ－２およびＩＦＮ－γの分泌が増加した（図６Ｂ）。ＳＧ－３－００２０は、抗ＣＤ３抗体の存在下で精製したＴ細胞系の５／５のドナーにおいて、サイトカイン刺激活性を示した（図６Ｃおよび６Ｄ、図１２Ａおよび１ovalbumin２Ｂ）。これらのデータは、ＳＧ－３－００２０がヒトＴ細胞の活性化を増強することを示す。そのような活性化は、併用療法の有無にかかわらず、インビボで腫瘍に対する免疫作用を増強し得る。

実施例３．インビボでの免疫細胞調節に対するＳＧ－３－００２０の効果
例えば、免疫細胞活性化および腫瘍サイズに対するＳＧ－３－００２０投与の効果を研究し、ＣＴ２６担がんＢａｌｂ／ｃマウスにおいてＳＧ－３－００２０の異なる投与経路および免疫調節におけるその効果を試験するために、インビボ研究を実施した。このマウスモデルは、新しい免疫療法薬の前臨床試験に最も広く使用されているマウスモデルの１つである（Ｇｒｏｓｓｏ ａｎｄ Ｊｕｒｅ－Ｋｕｎｋｅｌ，２０１３，Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎ，１３：５）。

マウスに、ＳＧ－３－００２０またはＰＢＳを、静脈注射で、腹腔内に、腫瘍周辺に（ｐ．ｔ．）投与した。比較のために、マウスに、ＣＤ８０－ＦｃまたはＩｇＧ１－Ｆｃを静脈注射で投与した。７日目に、腫瘍サンプルを、フローサイトメトリーによって腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の組成／活性化について分析した。この実験で使用されたプロトコルを、図７Ａに示す。

図７Ｂは、ＳＧ－３－００２０ ＴＩＬ免疫活性化を示す。例えば、ＮＫ細胞、ＣＤ８＋ＣＤ２５＋細胞、ＣＤ８＋Ｋｉ６７＋細胞、およびＣＤ８＋ＯＸ４０＋細胞の増加があり、これらはすべて、腫瘍の成長および／または生存能と戦い得る、免疫細胞の増加した活性化を示す。

四量体染色（ＡＨ１エピトープ）も実施され（プロトコルを図８に提供した）、ＳＧ－３－００２０投与もがんの免疫療法に対するこのタンパク質の治療可能性を支持する明白な効果を有することが示された（図１０を参照のこと）。

ＣＴ２６マウスモデルを使用して実施された同様の実験が実施され、予備的結果が、単剤療法としてのＳＧ－３－００２０の投与が腫瘍体積の減少をもたらしたことを示唆した（データは示さず）。

実施例４．マウスＴ細胞に対するＳＧ－３－００２０の効果
９６ウェル培養プレートを、２００ｍｃＬの抗ＣＤ３（０．１ｍｃｇ／ｍＬ）を用いてプレコーティングした。プレートを、４℃で一晩インキュベートした。プレートをＰＢＳで３回洗浄した後、細胞をプレーティングした（ＥａｓｙＳｅｐ（商標）＃１９８５１によるＴ細胞分離のためのＢａｌｂ／ｃ脾細胞）。細胞を、１００～２００Ｋ／ウェルで、２００ｍｃＬの最終容量のＡＩＭ－Ｖにプレーティングした。ペプチド（１０ｍｃＭ）または２ｍｃｇ／ｍＬの抗ＣＤ２８を、細胞に加えた。細胞を、３７℃で４８時間インキュベートした。

インキュベートした細胞を、フローサイトメトリー分析に使用した。ＳＧ－３－００２０は、Ｔ細胞活性化マーカーの発現およびマウス脾臓から単離されたＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞の増殖を増加させた（図１１Ａ）。

上清を、ＭＳＤ分析のために使用した。ＳＧ－３－００２０は、マウス脾臓から単離されたＴ細胞によるエフェクターサイトカインの分泌を増加させた。（図１１Ｂ）

実施例５．抗ＣＤ３抗体を用いてインキュベートした細胞に対するＳＧ－３－００２０の効果
ペプチド（１０ｍｃＭ）または抗ＣＤ２８（１０ｍｃｇ／ｍＬ）の存在下での、Ｔ細胞およびＰＢＭＣでの活性化されたマーカーの発現を、０．１ｍｃｇ／ｍＬの抗ＣＤ３の有無にかかわらず、４８時間のインキュベーション後に判定した。データを、フローサイトメトリーによって分析した（図１３Ａ～Ｄ）。

０．１ｍｃｇ／ｍＬの抗ＣＤ３の有無にかかわらず、４８時間のインキュベーション後の、ペプチド（１０ｍｃＭ）または抗ＣＤ２８（１０ｍｃｇ／ｍＬ）の存在下でのＴ細胞上のサイトカイン分泌を判定した。データを、ＭＳＤによって分析した（図１４）。

ヒトＴ細胞を、ペプチド（１０ｍｃＭ）の存在下で、ＩｍｍｕｎｏＣｕｌｔ（商標）Ｈｕｍａｎ ＣＤ３／ＣＤ２８ Ｔ Ｃｅｌｌ Ａｃｔｉｖａｔｏｒを用いて活性化し、サイトカイン分泌を、ＭＳＤによる４８時間のインキュベーション後に分析した。ＳＧ－３－００２０は、抗ＣＤ２８活性化と組み合わせて増加した活性を示した（図１５）。ＳＧ－３－００２０を媒介した効果には、単離されたＴ細胞およびＰＢＭＣの両方での抗ＣＤ３による活性化が必要であった。

実施例６．ＳＧ－３－００２０は、重要な免疫遺伝子の発現を調節する
Ｔ細胞は、５人の個々の血液提供者から単離され、前述のように活性化された。ＲＮＡ発現レベルは、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ ｎＣｏｕｎｔｅｒ Ｈｕｍａｎ ＰａｎＣａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｅプロファイリングによって決定された。生データは、組み込みの陽性対照およびハウスキーピング遺伝子（ｎＣｏｕｎｔｅｒ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｇｕｉｄｅ、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ）を使用して正規化された。ＳＧ－３－００２０は、インビトロで活性化されたヒトＴ細胞による重要な免疫遺伝子の発現を調節した（図１６Ａおよび１６Ｂ）。発現の減少は、シグナル伝達および転写活性化因子１（ＳＴＡＴ１）、インターフェロン調節因子１（ＩＲＦ１）、分化クラスター９６（ＣＤ９６）、ｍｏｔｈｅｒｓ ａｇａｉｎｓｔ ｄｅｃａｐｅｎｔａｐｌｅｇｉｃ ｈｏｍｏｌｏｇ ３（ＳＭＡＤ３）、Ｃ－Ｘ－Ｃモチーフケモカイン受容体６（ＣＸＣＲ６）、転写因子７（ＴＣＦ７）、リンパ球抗原９（ＬＹ９）、Ｃ－Ｘ－Ｃモチーフケモカイン１０（ＣＸＣＬ１０）、グランザイムＫ（ＧＺＭＫ）、インターフェロン刺激エキソヌクレアーゼ遺伝子２０（ＩＳＧ２０）、およびシグナル伝達リンパ球活性化分子Ｆ７（ＳＬＡＭＦ７）において観察された。発現の増加は、二重特異性ホスファターゼ６（ＤＵＳＰ６）、カテプシンＬ（ＣＴＳＬ）、ＩＬ－９、ＩＬ－２、ＩＬ－１０、ＩＬ－２４、ＩＬ－２１、およびＩＬ－３において観察された。

実施例７．ＳＧ－３－００２０は、ヒトＴ細胞に結合する
ＳＧ－３－００２０ファージの標的細胞（ナイーブＴ細胞、活性化Ｔ細胞）への結合を、試験した。

ファージ結合およびビオチン化ペプチド結合
ビオチン化ペプチドストック（１ｍＭ）を、１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡを用いて１ｕＭ（Ｘ１，０００倍）に希釈した。１５０ｍｃＬのファージ（多価ディスプレイ）を、７０ｍｃＬの１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡと混合した。溶液を、室温で１時間回転させた。

細胞は、ナイーブＴ細胞（約１３ｘ１０^６細胞）または活性化Ｔ細胞（約１６ｘ１０^６細胞）のいずれかを解凍した。次いで、細胞を１，５００で、４℃で５分間遠心分離し、上清を吸引除去した。ピペッティングによって、５ｍＬの１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡを用いて、細胞ペレットを洗浄した。ペレットを遠心分離し、合計３回洗浄するように、これを繰り返した。

細胞ペレットを、１０５０ｍｃＬの１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡで再懸濁し、１００ｍｃＬのファージ（ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ－ｏｎｌｉｎｅ Ｉｎｃ（カタログ番号ＡＢＩＮ １２５９６６）からのＭ１３バクテリオファージＧ８Ｐキャプシド抗体ＦＩＴＣ）を、９６ウェルプレート（ファージ結合）のウェルに添加した。１５０ｍｃＬの希釈ビオチン化ペプチドを、９６ウェルプレートのウェルに添加した（ビオチン化ペプチド結合）。ファージ結合のために１００ｍｃＬの再懸濁細胞をウェルに添加し、ビオチン化ペプチド結合のために５０ｍｃＬの再懸濁細胞をウェルに添加した。

細胞を振とう器に置き、結合のために４℃で２時間インキュベートした後、１，５００で、４℃で５分間遠心分離した。上清は、廃棄した。細胞ペレットを、ピペッティングによって２５０ｍｃＬの１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡを用いて洗浄した。細胞を、ファージ結合のために２００ｍｃＬの１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡで再懸濁し、次いで溶出およびフローサイトメトリーのために分割した。細胞を、ビオチン化ペプチド結合のために１００ｍｃＬの１×ＰＢＳ＋２％ＢＳＡで再懸濁し、１，５００で、４℃で５分間遠心分離した。

ファージの溶出
細胞を、溶出のために２５０ｍｃＬの１×ＰＢＳを用いて洗浄した。１４０ｍｃＬの７．１８Ｍトリエチルアミン（ＴＥＡ）を、１０ｍＬのＨ_２Ｏに添加して、０．１Ｍ ＴＥＡを作製した。溶出は、１００ｍｃＬの新たに調製した０．１Ｍ ＴＥＡを使用して実施した。これは、１００ｍｃＬの１Ｍ ＴＲＩＳ ｐＨ８．０を添加することによって直ちに中和した。

ファージの力価（入力（ｉｎｐｕｔ）および溶出）
ファージを１０倍に希釈した（入力をブロックし、溶出）（１０ｍｃＬのファージ溶液＋９０ｍｃＬの２ｘＹＴ）。溶液を、１０^－１～１０^－１０に連続的に１０倍希釈した。１００ｍｃＬの氷冷ＴＧ１細胞を添加し、室温で５分間インキュベートした。１０ｍｃＬを、入力ファージについては１０^－５～１０^－１０を取り出し、溶出ファージについては１０^－１～１０^－６を取り出した。ファージを、１５ｃｍ ２×ＹＴ＋Ｃａｒｂ＋２％グルコース寒天プレート上にストリーキングし、３０℃で一晩インキュベートした。

図１７は、ＷＴ ＳＧ－３－００２０をコードする多価ディスプレイファージの、刺激されていない細胞および抗ＣＤ３刺激された細胞への結合の力価の結果を示す。力価の結果はまた、スクランブリングした、ＳＧ－３－００２０、ＳＥＢ、およびＳＧ－３－００２０が空のファージと比較して活性化Ｔ細胞により多く結合していることを示した。

実施例９．腫瘍内Ｔ細胞に対するＳＧ－３－００２０の効果
ＢＡＬＢ／ｃ雄マウス（ｎ＝５～６／群、８週齢）に、ＣＴ２６結腸がん細胞を皮下接種した。ＳＧ－Ｂを、ＰＢＳで腫瘍周囲に２．５ｍｇ／ｋｇで毎日投与した。対照マウスには、対応する量のＰＢＳを注射した。１３日目（ＡＨ１染色）または７日目（Ｋｉ６７、ＣＤ２５、ＯＸ４０染色）に切除した腫瘍を、ＰＢＳを用いて洗浄し、外科用メスを使用して小さな断片に切り、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｔｕｍｏｒ Ｄｉｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ＫｉｔおよびＧｅｎｔｌｅＭＡＣＳ Ｏｃｔｏ解離剤を使用して単一細胞懸濁液にさらに解離させた。消化された腫瘍は、前分離フィルターを通して濾過し、ＰＢＳを用いて洗浄し、フローサイトメトリーベースの分析のために使用した。Ｔリンパ球を、ＣＤ４＋またはＣＤ８＋としてゲートし、次いでＦｌｏｗＪｏ １０．５．３によって表面マーカーの発現を分析した。ｐ値は、マンホイットニー検定によって計算した。

参照による組み込み
本明細書に引用したすべての参考文献、論文、刊行物、特許、特許公開、および特許出願は、あらゆる目的のために参照によりそれらの全体が組み込まれる。

しかしながら、本明細書に引用した任意の参考文献、論文、刊行物、特許、特許公開、および特許出願の言及は、これらが有効な先行技術を構成するか、または世界のいずれかの国における共通の一般的知識の一部を形成するという承認または何らかの形式の示唆として解釈されず、かつそのように解釈されるべきでない。

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Ｃｈａｎ ｅｔ ａｌ．“Ａ ｓｉｍｐｌｅ ｇｕｉｄｅ ｔｏ ｔｈｅ ｔｅｒｍｉｎｏｌｏｇｙ ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｌｅｕｃｏｃｙｔｅ ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ．” Ｈｉｓｔｏｐａｔｈｏｌｏｇｙ，１９８８，Ｖｏｌ．１２，Ｉｓｓｕｅ ５，ｐｇｓ．４６１－４８０．

Ｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．“ＣＤ Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ ２０５：Ｈｕｍａｎ Ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ Ａｎｔｉｇｅｎ Ｗｏｒｋｓｈｏｐｓ ａｓ ａ Ｄｒｉｖｉｎｇ Ｆｏｒｃｅ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．” Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，２０１５，Ｖｏｌｕｍｅ １９５，Ｉｓｓｕｅ １０，ｐｇｓ．４５５５－４５６３．

Ｓａｔｏ ａｎｄ Ｆｕｊｉｔａ．“Ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ Ｃｅｌｌｓ － Ｎａｔｕｒｅ ａｎｄ Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ．” Ａｌｌｅｒｇｏｌｏｇｙ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ，２００７，Ｖｏｌｕｍｅ ５６，Ｉｓｓｕｅ ３，ｐｇｓ．１８３－１９１．

Ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄｓ ａｎｄ ｃａｎｃｅｒ ｍｅｄｉｃａｍｅｎｔ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｃａｎｃｅｒ（Ｕ．Ｓ．Ａｐｐ．Ｎｏ．１０／６６８，０５０，ＵＳ ２００６－０２１１６３９ Ａ１）．

Ｒｏｙｃｈｏｕｄｈｕｒｉ ｅｔ ａｌ．“Ｉｎｔｅｒｐｌａｙ ｏｆ ｅｆｆｅｃｔｏｒ ａｎｄ ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ Ｔ ｃｅｌｌｓ ｉｎ ｃａｎｃｅｒ．” Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，２０１５，Ｖｏｌｕｍｅ ３３，ｐｇｓ．１０１－１１１．

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Claims (68)

1. 哺乳動物の免疫系の調節分子およびエフェクター分子を調節して疾患を治療するための免疫療法薬学的組成物であって、
   （ａ）配列番号１に対して少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、精製された治療用ペプチドと、
   （ｂ）薬学的に許容される担体と
   を含む、免疫療法薬学的組成物。
2. （ａ）配列番号１に対して少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、治療用ペプチドと、
   （ｂ）薬学的に許容される担体と
   を含む、薬学的組成物。
3. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１または２に記載の薬学的組成物。
4. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１～３のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
5. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１～４のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
6. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１～５のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
7. 前記ペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含む、請求項１～６のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
8. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つのサイトカインの産生を調節する、請求項１～７のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
9. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つのサイトカインの産生を調節し、前記少なくとも１つのサイトカインが、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、ＩＬ－２３、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される、請求項１～８のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
10. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの炎症誘発性サイトカインの産生を誘導する、請求項１～９のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
11. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの炎症誘発性サイトカインの産生を誘導し、前記少なくとも１つのサイトカインが、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、およびＩＬ－２３からなる群から選択される、請求項１～１０のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
12. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの抗炎症性サイトカインの産生を抑制する、請求項１～１１のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
13. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの抗炎症性サイトカインの産生を抑制し、前記少なくとも１つのサイトカインが、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される、請求項１～１２のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
14. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、Ｔｈ１活性化を増加させる、請求項１～１３のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
15. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、樹状細胞の成熟を増加させる、請求項１～１４のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
16. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、ＣＤ７０の発現を増加させる、請求項１～１５のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
17. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、Ｔ_ｅｆｆのクローン性増殖を増加させる、請求項１～１６のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
18. 経口投与のために製剤化されている、請求項１～１７のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
19. 前記ペプチドによって治療可能な疾患が、新生物である、請求項１および３～１８のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
20. 前記疾患が、基底細胞がん、胆道がん、膀胱がん、骨がん、脳および中枢神経系がん、乳がん、子宮頸がん、絨毛がん、結腸直腸がん、結合組織がん、消化器のがん、子宮内膜がん、食道がん、眼がん、頭頸部のがん、胃がん、上皮内新生物、腎臓がん、喉頭がん、白血病、肝がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔がん、卵巣がん、膵臓がん、前立腺がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸がん、腎がん、呼吸器系のがん、肉腫、皮膚がん、胃がん、精巣がん、甲状腺がん、子宮がん、泌尿器系のがん、およびこれらの２つ以上の任意の組み合わせからなる群から選択される、請求項１および３～１９のいずれか一項に記載の薬学的組成物。
21. 治療を必要とする対象において、疾患を治療するための方法であって、
    （ａ）前記対象に、
    ｉ．配列番号１に対して少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、精製された治療用ペプチドと、
    ｉｉ．薬学的に許容される担体と
    を含む、免疫療法薬学的組成物
    を投与することを含む、方法。
22. 治療を必要とする対象において、疾患を治療するための方法であって、
    （ａ）前記対象に、
    ｉ．配列番号１に対して少なくとも７０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、治療用ペプチドと、
    ｉｉ．薬学的に許容される担体と
    を含む、薬学的組成物
    を投与することを含む、方法。
23. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２１または２２に記載の方法。
24. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２１～２３のいずれか一項に記載の方法。
25. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２１～２４のいずれか一項に記載の方法。
26. 前記ペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２１～２５のいずれか一項に記載の方法。
27. 前記ペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含む、請求項２１～２６のいずれか一項に記載の方法。
28. 前記ペプチドが、前記対象において、少なくとも１つのサイトカインの産生を調節する、請求項２１～２７のいずれか一項に記載の方法。
29. 前記ペプチドが、前記対象において、少なくとも１つのサイトカインの産生を調節し、前記サイトカインが、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、ＩＬ－２３、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される、請求項２１～２８のいずれか一項に記載の方法。
30. 前記ペプチドが、前記対象において、少なくとも１つの炎症誘発性サイトカインの産生を誘導する、請求項２１～２９のいずれか一項に記載の方法。
31. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの炎症誘発性サイトカインの産生を誘導し、前記少なくとも１つのサイトカインが、ＴＮＦ－α、ＩＬ－１７、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、ＩＬ－２５、ＩＬ－３３、ＩＬ－８、ＭＣＰ－１、ＭＩＰ－３α、ＣＸＣＬ１、およびＩＬ－２３からなる群から選択される、請求項２１～３０のいずれか一項に記載の方法。
32. 前記ペプチドが、前記対象において、少なくとも１つの抗炎症性サイトカインの産生を抑制する、請求項２１～３１のいずれか一項に記載の方法。
33. 前記ペプチドが、前記ペプチドを投与された対象において、少なくとも１つの抗炎症性サイトカインの産生を抑制し、前記少なくとも１つのサイトカインが、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＦＮ－α、およびＴＧＦ－βからなる群から選択される、請求項２１～３２のいずれか一項に記載の方法。
34. 前記ペプチドが、前記対象において、Ｔｈ１活性化を増加させる、請求項２１～３３のいずれか一項に記載の方法。
35. 前記ペプチドが、前記対象において、樹状細胞の成熟を増加させる、請求項２１～３４のいずれか一項に記載の方法。
36. 前記ペプチドが、前記対象において、ＣＤ７０の発現を増加させる、請求項２１～３５のいずれか一項に記載の方法。
37. 前記ペプチドが、前記対象において、Ｔ_ｅｆｆのクローン性増殖を増加させる、請求項２１～３６のいずれか一項に記載の方法。
38. 前記免疫療法薬学的組成物が、経口投与のために製剤化されている、請求項２１～３７のいずれか一項に記載の方法。
39. 前記疾患が、新生物である、請求項２１～３８のいずれか一項に記載の方法。
40. 前記疾患が、がんである、請求項２１～３９のいずれか一項に記載の方法。
41. 前記疾患が、基底細胞がん、胆道がん、膀胱がん、骨がん、脳および中枢神経系がん、乳がん、子宮頸がん、絨毛がん、結腸直腸がん、結合組織がん、消化器のがん、子宮内膜がん、食道がん、眼がん、頭頸部のがん、胃がん、上皮内新生物、腎臓がん、喉頭がん、白血病、肝がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔がん、卵巣がん、膵臓がん、前立腺がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸がん、腎がん、呼吸器系のがん、肉腫、皮膚がん、胃がん、精巣がん、甲状腺がん、子宮がん、または泌尿器系のがんからなる群から選択される少なくとも１つである、請求項２１～４０のいずれか一項に記載の方法。
42. 配列番号１のアミノ酸配列を含む、単離されたペプチド。
43. 配列番号１のアミノ酸配列を含む単離されたペプチドを含む、組成物。
44. 外因性ポリヌクレオチドを含む宿主細胞であって、前記ポリヌクレオチドが、配列番号１に対して少なくとも約８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする、宿主細胞。
45. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項４４に記載の宿主細胞。
46. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項４４または４５に記載の宿主細胞。
47. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項４４～４６のいずれか一項に記載の宿主細胞。
48. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項４４～４７のいずれか一項に記載の宿主細胞。
49. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項４４～４８のいずれか一項に記載の宿主細胞。
50. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１のアミノ酸配列を含む、請求項４４～４９のいずれか一項に記載の宿主細胞。
51. 前記外因性ポリヌクレオチドが、宿主細胞特異的シグナル配列をさらにコードする、請求項４４～５０のいずれか一項に記載の宿主細胞。
52. 前記外因性ポリヌクレオチドが、異種プロモーターをさらにコードする、請求項４４～５１のいずれか一項に記載の宿主細胞。
53. 前記異種プロモーターが、構成的プロモーターである、請求項５２に記載の宿主細胞。
54. 前記異種プロモーターが、誘導性プロモーターである、請求項５２に記載の宿主細胞。
55. 前記外因性ポリヌクレオチドが、配列番号２からなる群から選択される核酸配列に対して少なくとも約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の配列同一性を有する核酸配列を含む、請求項４４～５４のいずれか一項に記載の宿主細胞。
56. 原核細胞である、請求項４４～５６のいずれか一項に記載の宿主細胞。
57. 大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）細胞、ラクトコッカス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）細胞、ストレプトマイセス・セリカラー（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｃｏｅｌｉｃｏｌｏｒ）細胞、ストレプトマイセス・リビダンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｌｉｖｉｄａｎｓ）細胞、ストレプトマイセス・アルバス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ａｌｂｕｓ）細胞、ストレプトマイセス・ベネズエラエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｖｅｎｅｚｕｅｌａｅ）細胞、または枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）細胞からなる群から選択される、請求項４４～５６のいずれか一項に記載の宿主細胞。
58. 真核細胞である、請求項４４～５７のいずれか一項に記載の宿主細胞。
59. チャイニーズハムスター卵巣細胞である、請求項４４～５８のいずれか一項に記載の宿主細胞。
60. サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）細胞、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）細胞、ヤロウィア・リポリティカ（Ｙａｒｒｏｗｉａ ｌｉｐｏｌｙｔｉｃａ）細胞、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）細胞、またはハンゼニュラ・ポリモルファ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ）細胞である、請求項４４～５８のいずれか一項に記載の宿主細胞。
61. タンパク質を産生する方法であって、前記コードされたタンパク質の発現に十分な条件下で、請求項４４～６０のいずれか一項に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
62. 配列番号１に対して少なくとも約８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
63. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項６２に記載の発現ベクター。
64. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項６２または６２に記載の発現ベクター。
65. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項６２～６４のいずれか一項に記載の発現ベクター。
66. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項６２～６５のいずれか一項に記載の発現ベクター。
67. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１に対して少なくとも約９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項６２～６６のいずれか一項に記載の発現ベクター。
68. 前記コードされたタンパク質が、配列番号１のアミノ酸配列を含む、請求項６２～６７のいずれか一項に記載の発現ベクター。

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