JP2020521457A - アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 - Google Patents
アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2020521457A JP2020521457A JP2019564944A JP2019564944A JP2020521457A JP 2020521457 A JP2020521457 A JP 2020521457A JP 2019564944 A JP2019564944 A JP 2019564944A JP 2019564944 A JP2019564944 A JP 2019564944A JP 2020521457 A JP2020521457 A JP 2020521457A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- array
- wells
- channel
- vacuum
- reaction
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 199
- 238000011049 filling Methods 0.000 claims abstract description 54
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 372
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 370
- 238000004891 communication Methods 0.000 claims description 144
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 97
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims description 67
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 claims description 57
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 55
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 51
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 51
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 47
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 43
- 238000007789 sealing Methods 0.000 claims description 41
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 38
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 37
- 239000006166 lysate Substances 0.000 claims description 30
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 28
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 claims description 27
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims description 27
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 claims description 23
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 23
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 23
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 claims description 20
- 230000036571 hydration Effects 0.000 claims description 19
- 238000006703 hydration reaction Methods 0.000 claims description 19
- 239000002699 waste material Substances 0.000 claims description 17
- 230000000887 hydrating effect Effects 0.000 claims description 16
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims description 16
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 claims description 14
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 claims description 12
- 230000037361 pathway Effects 0.000 claims description 8
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 7
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 6
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims description 5
- 238000007865 diluting Methods 0.000 claims description 5
- 238000011084 recovery Methods 0.000 claims description 5
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 4
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 3
- 230000001934 delay Effects 0.000 claims description 3
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 claims 1
- 238000003491 array Methods 0.000 abstract description 10
- 238000010586 diagram Methods 0.000 abstract description 7
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 430
- 239000010408 film Substances 0.000 description 206
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 143
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 126
- 239000000463 material Substances 0.000 description 64
- 239000003570 air Substances 0.000 description 28
- 239000012790 adhesive layer Substances 0.000 description 19
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 15
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 15
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 15
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 15
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 15
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 14
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 14
- 239000002985 plastic film Substances 0.000 description 14
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 13
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 13
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 12
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 12
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 11
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 11
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 11
- -1 polyethylene terephthalate Polymers 0.000 description 11
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 10
- 239000004820 Pressure-sensitive adhesive Substances 0.000 description 10
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 10
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 9
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 9
- 229920006255 plastic film Polymers 0.000 description 9
- 229920000139 polyethylene terephthalate Polymers 0.000 description 9
- 239000005020 polyethylene terephthalate Substances 0.000 description 9
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 9
- 230000008569 process Effects 0.000 description 9
- 238000003466 welding Methods 0.000 description 9
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 8
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 8
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 8
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 7
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 7
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 7
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 6
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 6
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 6
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 6
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 6
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 5
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 5
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 5
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 5
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 5
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 5
- 239000000155 melt Substances 0.000 description 5
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 5
- 239000004417 polycarbonate Substances 0.000 description 5
- 238000003856 thermoforming Methods 0.000 description 5
- 230000000712 assembly Effects 0.000 description 4
- 238000000429 assembly Methods 0.000 description 4
- 238000010009 beating Methods 0.000 description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 description 4
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 description 4
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 4
- 239000010808 liquid waste Substances 0.000 description 4
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 4
- 229920000515 polycarbonate Polymers 0.000 description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 3
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 3
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 3
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 3
- 238000012864 cross contamination Methods 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 239000013024 dilution buffer Substances 0.000 description 3
- 238000011038 discontinuous diafiltration by volume reduction Methods 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 229920002457 flexible plastic Polymers 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- 238000010030 laminating Methods 0.000 description 3
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 3
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 3
- 238000003825 pressing Methods 0.000 description 3
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 3
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 3
- GFQYVLUOOAAOGM-UHFFFAOYSA-N zirconium(iv) silicate Chemical compound [Zr+4].[O-][Si]([O-])([O-])[O-] GFQYVLUOOAAOGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920002799 BoPET Polymers 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 2
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 239000012807 PCR reagent Substances 0.000 description 2
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 2
- 230000006835 compression Effects 0.000 description 2
- 238000007906 compression Methods 0.000 description 2
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 2
- 238000000151 deposition Methods 0.000 description 2
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 2
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 229920006351 engineering plastic Polymers 0.000 description 2
- 238000001125 extrusion Methods 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 230000009477 glass transition Effects 0.000 description 2
- 238000007849 hot-start PCR Methods 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 238000005286 illumination Methods 0.000 description 2
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 2
- 238000003475 lamination Methods 0.000 description 2
- 238000010329 laser etching Methods 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 2
- 210000002445 nipple Anatomy 0.000 description 2
- 238000001821 nucleic acid purification Methods 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 2
- 229920003229 poly(methyl methacrylate) Polymers 0.000 description 2
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 2
- 239000004926 polymethyl methacrylate Substances 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 238000010926 purge Methods 0.000 description 2
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 2
- 238000005096 rolling process Methods 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 239000010409 thin film Substances 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 239000012780 transparent material Substances 0.000 description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 2
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 2
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 2
- 239000000304 virulence factor Substances 0.000 description 2
- 230000007923 virulence factor Effects 0.000 description 2
- WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 5-bromodeoxyuridine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- 241000238876 Acari Species 0.000 description 1
- 229910018072 Al 2 O 3 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000255925 Diptera Species 0.000 description 1
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 238000007397 LAMP assay Methods 0.000 description 1
- 201000009906 Meningitis Diseases 0.000 description 1
- 229920000134 Metallised film Polymers 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005041 Mylar™ Substances 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 238000002944 PCR assay Methods 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000258242 Siphonaptera Species 0.000 description 1
- 229920003182 Surlyn® Polymers 0.000 description 1
- 239000005035 Surlyn® Substances 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 239000012080 ambient air Substances 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- LFYJSSARVMHQJB-QIXNEVBVSA-N bakuchiol Chemical compound CC(C)=CCC[C@@](C)(C=C)\C=C\C1=CC=C(O)C=C1 LFYJSSARVMHQJB-QIXNEVBVSA-N 0.000 description 1
- 210000000941 bile Anatomy 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 229920001400 block copolymer Polymers 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 210000003850 cellular structure Anatomy 0.000 description 1
- 239000000919 ceramic Substances 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 238000013329 compounding Methods 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 239000013039 cover film Substances 0.000 description 1
- 238000005336 cracking Methods 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 238000013211 curve analysis Methods 0.000 description 1
- 238000013480 data collection Methods 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 229920001971 elastomer Polymers 0.000 description 1
- 239000000806 elastomer Substances 0.000 description 1
- 230000005611 electricity Effects 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 239000013505 freshwater Substances 0.000 description 1
- 244000052637 human pathogen Species 0.000 description 1
- 230000003116 impacting effect Effects 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001746 injection moulding Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000002650 laminated plastic Substances 0.000 description 1
- 238000003698 laser cutting Methods 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 239000011104 metalized film Substances 0.000 description 1
- 238000001465 metallisation Methods 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012009 microbiological test Methods 0.000 description 1
- 238000003801 milling Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000000465 moulding Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 1
- 239000004014 plasticizer Substances 0.000 description 1
- 238000005498 polishing Methods 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 238000007639 printing Methods 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 238000004080 punching Methods 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011897 real-time detection Methods 0.000 description 1
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 239000002356 single layer Substances 0.000 description 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 1
- ISXOBTBCNRIIQO-UHFFFAOYSA-N tetrahydrothiophene 1-oxide Chemical compound O=S1CCCC1 ISXOBTBCNRIIQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005382 thermal cycling Methods 0.000 description 1
- 229920001169 thermoplastic Polymers 0.000 description 1
- 239000004416 thermosoftening plastic Substances 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 238000007740 vapor deposition Methods 0.000 description 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 239000002351 wastewater Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502761—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip specially adapted for handling suspended solids or molecules independently from the bulk fluid flow, e.g. for trapping or sorting beads, for physically stretching molecules
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5025—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures for parallel transport of multiple samples
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502715—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by interfacing components, e.g. fluidic, electrical, optical or mechanical interfaces
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/50273—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by the means or forces applied to move the fluids
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502738—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by integrated valves
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/02—Adapting objects or devices to another
- B01L2200/026—Fluid interfacing between devices or objects, e.g. connectors, inlet details
- B01L2200/027—Fluid interfacing between devices or objects, e.g. connectors, inlet details for microfluidic devices
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0621—Control of the sequence of chambers filled or emptied
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0642—Filling fluids into wells by specific techniques
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0647—Handling flowable solids, e.g. microscopic beads, cells, particles
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0684—Venting, avoiding backpressure, avoid gas bubbles
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/06—Fluid handling related problems
- B01L2200/0689—Sealing
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/10—Integrating sample preparation and analysis in single entity, e.g. lab-on-a-chip concept
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/16—Reagents, handling or storing thereof
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/04—Closures and closing means
- B01L2300/041—Connecting closures to device or container
- B01L2300/044—Connecting closures to device or container pierceable, e.g. films, membranes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0809—Geometry, shape and general structure rectangular shaped
- B01L2300/0819—Microarrays; Biochips
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0809—Geometry, shape and general structure rectangular shaped
- B01L2300/0829—Multi-well plates; Microtitration plates
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0887—Laminated structure
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0403—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific forces
- B01L2400/043—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific forces magnetic forces
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0475—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure
- B01L2400/0481—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure squeezing of channels or chambers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0475—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure
- B01L2400/0487—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure fluid pressure, pneumatics
- B01L2400/049—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure fluid pressure, pneumatics vacuum
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/06—Valves, specific forms thereof
- B01L2400/0677—Valves, specific forms thereof phase change valves; Meltable, freezing, dissolvable plugs; Destructible barriers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Fluid Mechanics (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)
Abstract
Description
[0001]本出願は、2017年5月24日に出願された米国仮出願第62/510,682の利益および優先権を主張し、その全体は、参照により本明細書に組み込まれている。
[0005]さまざまな分析的なシステムおよび方法は、多数のサンプルに対する分析を実施する手段としてマルチウェルアレイを組み込む。典型的に、サンプル容器などの中のそれぞれのウェルは、スタンドアロン分析を提供することが意図されている。したがって、ウェルおよびその中の分析的な材料は、一般的に、それらの間に実質的なクロストークがない状態で、互いから分離した状態に維持されるように設計されている。この理由のために、アレイのそれぞれのウェルを満たすことは、とりわけ、閉システムにおいて、課題を提示する。たとえば、いくつかの閉アレイシステムでは、ウェルは、ウェルのそれぞれに延在する別個の流体チャネルによって、個別にロードされ得、ウェル間の交差汚染を低減させる。しかし、泡形成なしにそのようなチャネルを充填することは、挑戦的である可能性があり、ウェルの中の泡の存在は、問題のある可能性がある。その理由は、いくつかのウェルは、サンプル体積を減らしている可能性があり、泡の存在は、検出の問題をもたらす可能性があるからである。追加的に、そのようなシステムは、製造するのにコストがかかり面倒である可能性がある。そのうえ、別個の流体チャネルの使用は、ウェルごとの材料の変動を生成させ、したがって、分析的な結果の変動を生成させる可能性がある。
複数のウェルがその中に形成された第3の層であって、第1の層と第2の層との間に配設されている、第3の層と、
複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
それぞれの複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
複数の列の第1の端部に沿って延在する第1のメインチャネルであって、複数の分岐チャネルは、第1のメインチャネルから延在しており、アレイ充填チャネルは、第1のメインチャネルに連通している、第1のメインチャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
複数のウェルがその中に配設されているカード層を提供するステップと、
第1のフィルム層と少なくとも第2のフィルム層との間にカード層を配設するステップと、
第1のフィルム層をカード層の第1の側に結合するステップと、
第2のフィルム層をカード層の第2の側に結合するステップと
を含み、
カード層、および、第1のフィルム層または第2のフィルム層のうちの少なくとも1つは、
(i) 複数のウェルと真空ポートとの間に延在しており、および/または、複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
(ii) 複数のウェルと流体供給源との間に延在しており、および/または、複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を形成している、方法。
(a) アレイアセンブリに流体連通する反応ゾーンを含むサンプルコンテナを提供するステップであって、アレイアセンブリは、
アレイの中に構成されている複数のウェル、
反応ゾーンとアレイとの間のアクセス開口部、
真空ポート、
複数のチャネル
を含み、アレイの中のそれぞれのウェルがアクセス開口部および真空ポートに流体接続されるようになっている、ステップと、
(b) 反応ゾーンの中のサンプルに分析的な方法を実施し、反応混合物を作り出すステップと、
(c) 真空ポートを開放し、アレイアセンブリの上に真空を引くステップであって、空気が複数のウェルおよび複数のチャネルから排出されるようになっている、ステップと、
(d) 複数のウェルが真空下に維持されるように、真空ポートを封止するステップであって、それによって、排出されたアレイを形成する、ステップと、
(e) 反応混合物がアレイ充填チャネルを介して複数のウェルの中へ引き込まれるように、アクセス開口部を開放するステップと
を含む、方法。
(a) 第1の反応ゾーン、第2の反応ゾーン、および、第2の反応ゾーンの中の乾燥した成分を含む、封止されたコンテナを提供するステップと、
(b) 第1の反応ゾーンの中で第1の反応を実施し、反応混合物を発生させるステップと、
(c) 第2の反応ゾーンの中の乾燥した成分を水和流体によって水和し、水和された成分を発生させるステップであって、ステップ(c)は、ステップ(b)の前または間に実施される、ステップと、
(d) 反応混合物の一部分を水和された成分に追加するステップと、
(e) 第2の反応ゾーンの中で第2の反応を実施するステップと
を含む、方法。
反応混合物をアレイに移動させるステップと、
反応混合物の一部分がバリア層を横切って、それぞれのウェルに進入することを可能にするステップと、
アレイから余剰の反応混合物を除去するステップと
を含む、方法。
反応混合物をアレイに移動させるステップと、
バリア層の外側のそれぞれのウェルに隣接する反応混合物の一部分を封止するステップであって、反応混合物および水和された成分がバリア層を通して混合することができるようになっている、ステップと
を含む、方法。
カードの第1の側にあるアクセス開口部と、
アクセス開口部および複数のウェルに流体連通しているチャネルシステムと、
チャネルシステムに流体連通している真空ポートと
を含む、アレイアセンブリ。
複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
複数の列の第1の端部に沿って延在する、アクセス開口部に流体連通している第1のメインチャネルであって、複数の分岐チャネルは、第1のメインチャネルから延在している、第1のメインチャネルと、
複数の分岐チャネルに流体連通し、複数の列の第2の端部に沿って延在している第2のメインチャネルであって、真空ポートは、第2のメインチャネルに連通している、第2のメインチャネルと
を含み、
それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、真空ポートおよびアクセス開口部に流体連通している、アレイアセンブリ。
複数の流体接続された反応チャンバと、
アレイと
を含み、アレイは、
流体接続された反応チャンバのうちの少なくとも1つに流体連通しているアクセス開口部と、
複数の反応ウェルと、
真空ポートと、
アクセス開口部に、複数のウェルに、および真空ポートに流体連通しているチャネルシステムであって、アレイの中のそれぞれの反応ウェルが少なくとも2つの経路によって真空ポートに流体接続されるように、経路を提供しており、また、それぞれの反応ウェルは、少なくとも2つの経路によって流体供給源に接続されている、チャネルシステムと
を含む、反応コンテナ。
複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
複数のウェルがその中に形成されたカード層と、
カード層の第1の側に結合される第1のフィルム層であって、複数のウェルのそれぞれの第1の端部を封止する、第1のフィルム層と、
カード層の第2の側に結合される第2のフィルム層であって、真空ポートは、第1のフィルム層および第2のフィルム層のうちの1つまたは複数の中に開口部を含む、第2のフィルム層と
をさらに含む、アレイアセンブリ。
それぞれの複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
複数の列の第1の端部に沿って延在する第1のメインチャネルであって、複数の分岐チャネルは、第1のメインチャネルから延在しており、アレイ充填チャネルは、第1のメインチャネルから延在している、第1のメインチャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
反応コンテナを提供するステップであって、反応コンテナは、サンプル導入ゾーン、サンプル導入ゾーンに流体連通している少なくとも第1の反応ゾーン、および、第1の反応ゾーンに流体連通している第2の反応ゾーンを含み、第2の反応ゾーンは、複数のウェル、複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネル、複数のウェルと第1の反応ゾーンとの間に延在し、および/または、複数のウェルおよび第1の反応ゾーンに流体連通しているアレイ充填チャネル、ならびに、第1の反応ゾーンと第2の反応ゾーンとの間に配設されている開放可能なシールを含む、ステップと、
分析的な方法のうちの少なくとも1つのステップを反応コンテナによって実施するステップと、
複数のウェルの上に部分的な真空を引くステップであって、複数のウェル、真空チャネル、および、アレイ充填チャネルの少なくとも一部分が、大気圧力に対して低減された圧力下にあるようになっている、ステップと、
真空チャネルの一部分を封止するステップであって、複数のウェルおよびアレイ充填チャネルの少なくとも一部分が、真空下に維持されるようになっており、それによって、排出されたアレイを形成する、ステップと、
流体がアレイ充填チャネルを介して複数のウェルの中へ引き込まれるように、第1の反応ゾーンと第2の反応ゾーンとの間に配設されている開放可能なシールを開放することによって、排出されたアレイに流体を適用するステップと
を含む、方法。
反応コンテナを使用して分析的な方法を実施するように構成されている器具であって、真空システムを含み、分析的な方法のうちの1つまたは複数のステップを実施しながら、反応コンテナの1つまたは複数の部分の中に部分的な真空を引く、器具と
を含む、システム。
[00122]本明細書で使用されているように、方向性の用語および/または任意的な用語、たとえば、「上部」、「底部」、「左」、「右」、「上」、「下」、「上側」、「下側」、「内側」、「外側」、「内」、「外」、「内部」、「外部」、「近位」、「遠位」、「前方」、および「逆方」などは、単に相対的な方向および/または配向を示すためだけに使用され得、本明細書、発明、および/または特許請求の範囲を含む、本開示の範囲を限定することを別段意図していない可能性がある。
[00188]図6Bでは、充填チャネル6012bは、第1のフィルム層6030bと第2のフィルム層6032bとの間に液体が流れることができるギャップを残すことによって形成され得る。図6Cは、第1のフィルム層6030cと第2のフィルム層6032cとの間にギャップを残すことによって形成された同様の充填チャネル6012を示している。充填チャネルは、第1および第2のフィルム層をアレイの周りに一緒に封止する溶接線6026bまたは6026cによって画定され得る。どのようにこれらの溶接が適用され得るかの例は、図6Aにおいて溶接領域6026に示されており、溶接領域6026は、外側溶接6026aおよび内側溶接6026bを含み、外側溶接6026aおよび内側溶接6026bは、充填チャネル6012およびウェルの周りのスペースを画定している。図6Bでは、充填孔部6018bは、第2のフィルム層6032bの中におよび第1の接着剤層6034bの中に選択的なカットアウトを作製することによって形成され得る。図6Cでは、充填孔部6018cは、第1の接着剤層6034cの中の対応するカットアウトに隣接している第2のフィルム層6032cの中に選択的なカットアウトを作製することによって形成され得る。
結論
[形態1]
第1の層および少なくとも第2の層と、
複数のウェルがその中に形成された第3の層であって、前記第1の層と前記第2の層との間に配設されている、第3の層と、
前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
前記複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
[形態2]
形態1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第1の層および前記第2の層は、フィルム層である、アレイアセンブリ。
[形態3]
形態1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第3の層は、前記複数のウェルがその中に形成されたカード層を含む、アレイアセンブリ。
[形態4]
形態3に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第1の層は、前記カード層の第1の側に結合され、前記複数のウェルのそれぞれの第1の端部を封止しており、前記第2の層は、前記カード層の第2の側に結合され、前記複数のウェルのそれぞれの第2の端部を封止している、アレイアセンブリ。
[形態5]
形態1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空ポートは、前記第1の層または前記第2の層のうちの1つまたは複数の中に開口部を含む、アレイアセンブリ。
[形態6]
形態3に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、前記カード層の中に凹んだ導管をさらに含み、前記真空チャネルおよび前記アレイ充填チャネルのうちの1つまたは複数の少なくとも一部分は、前記第2のフィルム層と前記カード層の中の前記凹んだ導管との間に形成されており、前記カード層の中の前記凹んだ導管は、マニホールド構成を有しており、前記マニホールド構成は、少なくとも2つの経路によって前記複数のウェルを前記真空ポートに流体接続しており、また、少なくとも2つの経路によってそれぞれのウェルを前記流体供給源に流体接続している、アレイアセンブリ。
[形態7]
形態1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルの少なくとも一部分は、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分の中に配設されており、および/または、それとともに共局在化される、アレイアセンブリ。
[形態8]
形態1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、前記複数のウェルと前記流体供給源との間の前記アレイ充填チャネルの中に開放可能なシールをさらに含む、アレイアセンブリ。
[形態9]
形態1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルは、それぞれの複数の列で配設されており、前記アレイ充填チャネルは、前記流体供給源およびマニホールドチャネルアセンブリに流体連通しているアクセスチャネルを含み、前記マニホールドチャネルアセンブリは、
前記それぞれの複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
前記複数の列の第1の端部に沿って延在する第1のメインチャネルであって、前記複数の分岐チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在しており、前記アレイ充填チャネルは、前記第1のメインチャネルに連通している、第1のメインチャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
[形態10]
形態9に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルに流体連通している第2のメインチャネルをさらに含み、前記第2のメインチャネルは、前記複数の列の第2の端部に沿って延在しており、前記真空ポートは、前記第2のメインチャネルに連通しており、それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、前記真空ポートおよび前記流体供給源に流体連通している、アレイアセンブリ。
[形態11]
形態10に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルのそれぞれから前記複数のウェルへそれぞれ延在する複数の接続チャネルをさらに含み、前記複数の接続チャネルは、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、アレイアセンブリ。
[形態12]
アレイアセンブリを製造する方法であって、
複数のウェルがその中に配設されているカード層を提供するステップと、
第1のフィルム層と少なくとも第2のフィルム層との間に前記カード層を配設するステップと、
前記第1のフィルム層をカード層の第1の側に結合するステップと、
前記第2のフィルム層を前記カード層の第2の側に結合するステップと
を含み、
前記カード層、および、前記第1のフィルム層または前記第2のフィルム層のうちの少なくとも1つは、
(i) 前記複数のウェルと真空ポートとの間に延在しており、および/または、前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
(ii) 前記複数のウェルと流体供給源との間に延在しており、および/または、前記複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を形成している、方法。
[形態13]
形態12に記載の方法において、前記カード層の中の凹んだ導管は、マニホールド構成を有している、方法。
[形態14]
アレイアセンブリをサンプルに使用する方法であって、
(a) 前記アレイアセンブリに流体連通する反応ゾーンを含むサンプルコンテナを提供するステップであって、前記アレイアセンブリは、
アレイの中に構成されている複数のウェル、
前記反応ゾーンとアレイとの間のアクセス開口部、
真空ポート、
複数のチャネル
を含み、前記アレイの中のそれぞれのウェルが前記アクセス開口部および前記真空ポートに流体接続されるようになっている、ステップと、
(b) 前記反応ゾーンの中の前記サンプルに分析的な方法を実施し、反応混合物を作り出すステップと、
(c) 前記真空ポートを開放し、前記アレイアセンブリの上に真空を引くステップであって、空気が前記複数のウェルおよび前記複数のチャネルから排出されるようになっている、ステップと、
(d) 前記複数のウェルが真空下に維持されるように、真空ポートを封止するステップであって、それによって、排出されたアレイを形成する、ステップと、
(e) 前記反応混合物が前記アレイ充填チャネルを介して前記複数のウェルの中へ引き込まれるように、前記アクセス開口部を開放するステップと
を含む、方法。
[形態15]
形態14に記載の方法において、前記方法は、前記複数のウェルのそれぞれの中に配設されている1つまたは複数の試薬と前記反応混合物とを混合し、第2の混合物を形成するステップと、前記第2の反応混合物の上に第2の分析的な方法を実施するステップとをさらに含む、方法。
[形態16]
形態15に記載の方法において、前記第2の混合物は、PCR混合物である、方法。
[形態17]
形態16に記載の方法において、前記第2の反応混合物をサーモサイクルさせるステップをさらに含む、方法。
[形態18]
形態17に記載の方法において、前記複数のウェルの少なくとも1つの中の増幅生成物を検出するステップをさらに含む、方法。
[形態19]
形態15に記載の方法において、前記サンプルは、微生物を含み、1つまたは複数の試薬は、抗生物質を含む、方法。
[形態20]
形態19に記載の方法において、前記抗生物質は、第1の濃度において、前記複数のウェルのうちの第1のものの中に存在しており、第2の濃度において、前記複数のウェルのうちの第2のものの中に存在しており、前記第2の濃度は、前記第1の濃度よりも低い、方法。
[形態21]
形態14に記載の方法において、ステップ(c)は、約2ミリバールから約150ミリバールの間の真空を前記複数のウェルの中に提供する、方法。
[形態22]
形態14に記載の方法において、ステップ(c)および(d)は、ステップ(b)が完了される前に実施される、方法。
[形態23]
封止されたサンプルコンテナの中でマルチステップの生物学的反応を実施するための方法であって、
(a) 第1の反応ゾーン、第2の反応ゾーン、および、前記第2の反応ゾーンの中の乾燥した成分を含む、封止されたコンテナを提供するステップと、
(b) 前記第1の反応ゾーンの中で第1の反応を実施し、反応混合物を発生させるステップと、
(c) 前記第2の反応ゾーンの中の前記乾燥した成分を水和流体によって水和し、水和された成分を発生させるステップであって、ステップ(c)は、ステップ(b)の前またはステップ(b)の間に実施される、ステップと、
(d) 前記反応混合物の一部分を前記水和された成分に追加するステップと、
(e) 前記第2の反応ゾーンの中で第2の反応を実施するステップと
を含む、方法。
[形態24]
形態23に記載の方法において、前記第2の反応ゾーンは、ウェルのアレイであり、それぞれのウェルは、乾燥した成分を提供されており、少なくとも複数のウェルは、前記複数のウェルの中の他のウェルとは異なる成分を有している、方法。
[形態25]
形態24に記載の方法において、前記ウェルのアレイの中のそれぞれの個々のウェルは、前記ウェルの中への前記水和流体の進入を遅らせるバリア層を提供されている、方法。
[形態26]
形態25に記載の方法において、水和する前記ステップは、前記複数のウェルを前記水和流体によって充填するステップであって、前記ウェルのアレイから余剰の水和流体を除去することがそれに続く、ステップを含む、方法。
[形態27]
形態26に記載の方法において、追加する前記ステップは、
前記反応混合物を前記アレイに移動させるステップと、
前記反応混合物の一部分が前記バリア層を横切って、それぞれのウェルに進入することを可能にするステップと、
前記アレイから余剰の反応混合物を除去するステップと
を含む、方法。
[形態28]
形態26に記載の方法において、追加する前記ステップは、
前記反応混合物を前記アレイに移動させるステップと、
前記バリア層の外側のそれぞれのウェルに隣接する前記反応混合物の一部分を封止するステップであって、前記反応混合物および水和された成分が前記バリア層を通して混合することができるようになっている、ステップと
を含む、方法。
[形態29]
形態25に記載の方法において、前記バリア層は、1つのウェル当たり1つまたは複数の開口部を有する穿孔された層であり、前記開口部は、いくらかの力がないときには、流体が前記開口部を通って容易には流れることができないようにサイズ決めされている、方法。
[形態30]
形態24に記載の方法において、前記第1の反応は、第1段PCRであり、前記第2の反応は、第2段PCRである、方法。
[形態31]
形態30に記載の方法において、前記第2の反応ゾーンは、ステップ(d)の前に冷たい温度に維持される、方法。
[形態32]
形態23に記載の方法において、ステップ(c)の前に部分的な真空によって少なくとも前記第2の反応ゾーンを排出させるステップをさらに含む、方法。
[形態33]
アレイの中に配置されている複数のウェルを有するカードと、
前記カードの第1の側にあるアクセス開口部と、
前記アクセス開口部および前記複数のウェルに流体連通しているチャネルシステムと、
前記チャネルシステムに流体連通している真空ポートと
を含む、アレイアセンブリ。
[形態34]
形態33に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイは、複数の列を含み、前記複数の列のそれぞれは、1つまたは複数のウェルを含み、前記チャネルシステムは、マニホールドチャネルアセンブリを含み、前記マニホールドチャネルアセンブリは、
前記複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
前記複数の列の第1の端部に沿って延在する、前記アクセス開口部に流体連通している第1のメインチャネルであって、前記複数の分岐チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在している、第1のメインチャネルと、
前記複数の分岐チャネルに流体連通し、前記複数の列の第2の端部に沿って延在している第2のメインチャネルであって、前記真空ポートは、前記第2のメインチャネルに連通している、第2のメインチャネルと
を含み、
それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、前記真空ポートおよび前記アクセス開口部に流体連通している、アレイアセンブリ。
[形態35]
形態33または34に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、第1のフィルム層および第2のフィルム層をさらに含み、第1のフィルム層および第2のフィルム層は、パウチを形成しており、前記カード層は、前記パウチの内側に少なくとも部分的に封止されている、アレイアセンブリ。
[形態36]
反応コンテナであって、
複数の流体接続された反応チャンバと、
アレイと
を含み、前記アレイは、
前記流体接続された反応チャンバのうちの少なくとも1つに流体連通しているアクセス開口部と、
複数の反応ウェルと、
真空ポートと、
前記アクセス開口部に、前記複数のウェルに、および前記真空ポートに流体連通しているチャネルシステムであって、前記アレイの中のそれぞれの反応ウェルが少なくとも2つの経路によって前記真空ポートに流体接続されるように、経路を提供しており、また、それぞれの反応ウェルは、少なくとも2つの経路によって前記流体供給源に接続されている、チャネルシステムと
を含む、反応コンテナ。
[形態37]
形態36に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空ポートは、可逆的にシール可能であり、前記アクセス開口部は、可逆的にシール可能である、アレイアセンブリ。
[形態38]
アレイの中に配置されている複数のウェルと、
前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
前記複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
[形態39]
形態38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、
前記複数のウェルがその中に形成されたカード層と、
前記カード層の第1の側に結合される第1のフィルム層であって、前記複数のウェルのそれぞれの第1の端部を封止する、第1のフィルム層と、
前記カード層の第2の側に結合される第2のフィルム層であって、前記真空ポートは、前記第1のフィルム層および前記第2のフィルム層のうちの1つまたは複数の中に開口部を含む、第2のフィルム層と
をさらに含む、アレイアセンブリ。
[形態40]
形態39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルおよび前記アレイ充填チャネルのうちの1つまたは複数の少なくとも一部分は、(i)前記カード層の中に形成されているか、(ii)前記第2のフィルム層の中に形成されているか、または、(iii)前記カード層と前記第2のフィルム層との間に形成されている、アレイアセンブリ。
[形態41]
形態39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルおよび前記アレイ充填チャネルのうちの1つまたは複数の少なくとも一部分は、前記第1のフィルム層と前記第2のフィルム層との間に形成されている、アレイアセンブリ。
[形態42]
形態39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイ充填チャネルの一部分は、前記第1のフィルム層と前記第2のフィルム層との間に形成されており、前記カード層の周囲の少なくとも一部分の周りに配設されている、アレイアセンブリ。
[形態43]
形態39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、前記カード層の中に凹んだ導管をさらに含み、前記カード層の中の前記凹んだ導管は、マニホールド構成を有しており、前記アレイの中のそれぞれのウェルは、少なくとも2つの経路によって前記真空ポートに流体接続されており、また、それぞれのウェルは、少なくとも2つの経路によって前記流体供給源に接続されている、アレイアセンブリ。
[形態44]
形態43に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第2のフィルム層は、その中に形成された凹んだ導管を有しており、前記アレイアセンブリは、前記第2のフィルム層と前記カード層との間に配設されている第3のフィルム層をさらに含み、前記第3のフィルム層は、それを通って延在する複数の穿孔部を有しており、前記複数の穿孔部は、前記第2のフィルム層の中の前記凹んだ導管に流体連通している、アレイアセンブリ。
[形態45]
形態44に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分は、前記第2のフィルム層の中の前記凹んだ導管と、前記第3のフィルム層と前記第2のフィルム層の中の前記凹んだ導管の2つ以上の部分の間の前記第2のフィルム層との間の結合部との間に配設されている、アレイアセンブリ。
[形態46]
形態38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルの少なくとも一部分は、前記アレイ充填チャネルの一部分として提供されており、前記アレイ充填チャネルを開位置に維持するように構成されている、アレイアセンブリ。
[形態47]
形態38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルと前記流体供給源との間の前記アレイ充填チャネルの中に開放可能なシールをさらに含む、アレイアセンブリ。
[形態48]
形態38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルのそれぞれの中に配設されている1つまたは複数の試薬をさらに含む、アレイアセンブリ。
[形態49]
形態38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルは、それぞれの複数の列で配設されており、前記アレイ充填チャネルは、前記流体供給源およびマニホールドチャネルアセンブリに流体連通しているアクセスチャネルを含み、前記マニホールドチャネルアセンブリは、
前記それぞれの複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
前記複数の列の第1の端部に沿って延在する第1のメインチャネルであって、前記複数の分岐チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在しており、前記アレイ充填チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在している、第1のメインチャネルと
を含む、アレイアセンブリ。
[形態50]
形態49に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルに流体連通している第2のメインチャネルをさらに含み、前記第2のメインチャネルは、前記複数の列の第2の端部に沿って延在しており、前記真空ポートは、前記第2のメインチャネルに連通しており、それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、前記真空ポートおよび前記流体供給源に流体連通している、アレイアセンブリ。
[形態51]
形態49に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルのそれぞれから前記複数のウェルへそれぞれ延在する複数の接続チャネルをさらに含み、前記複数の接続チャネルは、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、アレイアセンブリ。
[形態52]
分析的な方法を実施している間に現場で反応コンテナの上に真空を引く方法であって、
反応コンテナを提供するステップであって、前記反応コンテナは、サンプル導入ゾーン、前記サンプル導入ゾーンに流体連通している少なくとも第1の反応ゾーン、および、前記第1の反応ゾーンに流体連通している第2の反応ゾーンを含み、前記第2の反応ゾーンは、複数のウェル、前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネル、前記複数のウェルと前記第1の反応ゾーンとの間に延在し、および/または、前記複数のウェルおよび前記第1の反応ゾーンに流体連通しているアレイ充填チャネル、ならびに、前記第1の反応ゾーンと前記第2の反応ゾーンとの間に配設されている開放可能なシールを含む、ステップと、
前記分析的な方法のうちの少なくとも1つのステップを前記反応コンテナによって実施するステップと、
前記複数のウェルの上に部分的な真空を引くステップであって、前記複数のウェル、前記真空チャネル、および、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分が、大気圧力に対して低減された圧力下にあるようになっている、ステップと、
前記真空チャネルの一部分を封止するステップであって、前記複数のウェルおよび前記アレイ充填チャネルの少なくとも前記一部分が、前記真空下に維持されるようになっており、それによって、排出されたアレイを形成する、ステップと、
流体が前記アレイ充填チャネルを介して前記複数のウェルの中へ引き込まれるように、前記第1の反応ゾーンと前記第2の反応ゾーンとの間に配設されている前記開放可能なシールを開放することによって、前記排出されたアレイに前記流体を適用するステップと
を含む、方法。
[形態53]
形態52に記載の方法において、前記分析的な方法のうちの少なくとも1つのステップは、周囲圧力パッケージから前記反応コンテナを除去するステップ、前記サンプル導入ゾーンの中へサンプルを導入するステップ、前記反応コンテナを器具の中へ挿入するステップであって、前記器具は、前記分析的な方法を実施するように構成されており、前記排出されたアレイを形成するために部分的な真空を引くように構成されている、ステップ、前記第1の反応ゾーンの中で1つまたは複数の反応を実施するステップ、または、前記排出されたアレイに前記流体を適用するために準備するステップを含む、方法。
[形態54]
形態53に記載の方法において、前記第1の反応ゾーンの中で1つまたは複数の反応を実施するステップは、溶解物を発生させるためにサンプル溶解を実施するステップ、前記溶解物から溶解粒子を隔離するステップ、シリカ磁気ビーズを前記溶解物と混合するステップ、核酸捕獲の後の残留溶解物を前記シリカ磁気ビーズとともに廃棄物チャンバへ移動させるステップ、前記磁気ビーズの少なくとも1つの洗浄を実施し、および、前記洗浄液体を前記廃棄物チャンバへ移動させるステップ、前記シリカ磁気ビーズから核酸を溶出させるステップ、第1のシングルプレックスもしくはマルチプレックスPCR反応を実施するステップ、または、前記第2の反応ゾーンの前記複数のウェルの中で第2のPCR反応を実施するのに備えて、前記第1のPCR反応の生成物を希釈するステップのうちの1つまたは複数を含む、方法。
[形態55]
形態52に記載の方法において、前記反応コンテナは、1つまたは複数の試薬ブリスタをさらに含み、前記1つまたは複数の試薬ブリスタは、前記サンプル導入ゾーン、前記第1の反応ゾーン、または前記第2の反応ゾーンのうちの1つまたは複数に流体接続されている、方法。
[形態56]
形態55に記載の方法において、前記1つまたは複数の試薬ブリスタのうちの少なくとも1つは、乾燥した試薬を含み、前記方法は、前記乾燥した試薬を含む前記1つまたは複数の試薬ブリスタの上に部分的な真空を引くステップをさらに含む、方法。
[形態57]
形態56に記載の方法において、前記乾燥した試薬と流体を混合し、第1の混合物を形成するステップをさらに含む、方法。
[形態58]
形態56に記載の方法において、前記1つまたは複数の試薬ブリスタは、サンプル調製、核酸回収、第1段PCR、および第2段PCRのための試薬を含む、方法。
[形態59]
反応コンテナであって、サンプル導入ゾーン、前記サンプル導入ゾーンに流体連通している少なくとも第1の反応ゾーン、および、前記第1の反応ゾーンに流体連通している第2の反応ゾーンを含み、前記第2の反応ゾーンは、複数のウェル、前記複数のウェルと真空ポートとの間に延在し、および/または、前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネル、前記複数のウェルと前記第1の反応ゾーンとの間に延在し、および/または、前記複数のウェルおよび前記第1の反応ゾーンに流体連通しているアレイ充填チャネル、ならびに、前記第1の反応ゾーンと前記第2の反応ゾーンとの間に配設されている開放可能なシールを含む、反応コンテナと、
前記反応コンテナを使用して分析的な方法を実施するように構成されている器具であって、真空システムを含み、前記分析的な方法のうちの1つまたは複数のステップを実施しながら、前記反応コンテナの1つまたは複数の部分の中に部分的な真空を引く、器具と
を含む、システム。
[形態60]
形態59に記載のシステムにおいて、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分は、実質的に乾燥しており、前記部分的な真空が水の分圧に対して引かれないようになっている、システム。
[形態61]
形態60に記載のシステムにおいて、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分の中の前記部分的な真空は、約2ミリバールから約150ミリバールの間の範囲の中にある、システム。
[形態62]
形態59に記載のシステムにおいて、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分は、前記複数のウェル、前記真空チャネル、および、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分を含む、システム。
[形態63]
形態59に記載のシステムにおいて、前記器具は、前記反応コンテナの1つまたは複数の部分に引かれる前記部分的な真空を保存するためにシールを適用するシールデバイスを含む、システム。
[形態64]
形態59に記載のシステムにおいて、前記反応コンテナは、1つまたは複数の試薬ブリスタをさらに含み、前記1つまたは複数の試薬ブリスタは、前記サンプル導入ゾーン、前記第1の反応ゾーン、または前記第2の反応ゾーンのうちの1つまたは複数に流体接続されている、システム。
[形態65]
形態64に記載のシステムにおいて、前記1つまたは複数の試薬ブリスタのうちの少なくとも1つは、乾燥した試薬を含み、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分は、前記乾燥した試薬を含む前記1つまたは複数の試薬ブリスタを含む、システム。
[形態66]
形態59に記載のシステムにおいて、前記器具は、PCR器具であり、前記PCR器具は、少なくとも1つの加熱器を含み、前記少なくとも1つの加熱器は、前記反応コンテナの少なくとも1つの部分をサーモサイクルさせるように位置決めおよび配置されている、システム。
[形態67]
形態59に記載のシステムにおいて、前記器具は、少なくとも1つの加熱器を含み、前記少なくとも1つの加熱器は、等温反応を実施するために、前記反応コンテナの少なくとも1つの部分の中の温度を制御するように位置決めおよび配置されている、システム。
[形態68]
形態59に記載のシステムにおいて、前記器具は、前記反応コンテナの少なくとも1つの部分の温度を制御するように位置決めおよび配置されている少なくとも1つの加熱器と、前記反応コンテナの中の流体を移動させるための1つまたは複数のアクチュエータと、前記反応コンテナの1つまたは複数の部分の中の流体の移動を制御するための1つまたは複数のシールとを含む、システム。
Claims (68)
- 第1の層および少なくとも第2の層と、
複数のウェルがその中に形成された第3の層であって、前記第1の層と前記第2の層との間に配設されている、第3の層と、
前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
前記複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を含む、アレイアセンブリ。 - 請求項1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第1の層および前記第2の層は、フィルム層である、アレイアセンブリ。
- 請求項1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第3の層は、前記複数のウェルがその中に形成されたカード層を含む、アレイアセンブリ。
- 請求項3に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第1の層は、前記カード層の第1の側に結合され、前記複数のウェルのそれぞれの第1の端部を封止しており、前記第2の層は、前記カード層の第2の側に結合され、前記複数のウェルのそれぞれの第2の端部を封止している、アレイアセンブリ。
- 請求項1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空ポートは、前記第1の層または前記第2の層のうちの1つまたは複数の中に開口部を含む、アレイアセンブリ。
- 請求項3に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、前記カード層の中に凹んだ導管をさらに含み、前記真空チャネルおよび前記アレイ充填チャネルのうちの1つまたは複数の少なくとも一部分は、前記第2のフィルム層と前記カード層の中の前記凹んだ導管との間に形成されており、前記カード層の中の前記凹んだ導管は、マニホールド構成を有しており、前記マニホールド構成は、少なくとも2つの経路によって前記複数のウェルを前記真空ポートに流体接続しており、また、少なくとも2つの経路によってそれぞれのウェルを前記流体供給源に流体接続している、アレイアセンブリ。
- 請求項1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルの少なくとも一部分は、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分の中に配設されており、および/または、それとともに共局在化される、アレイアセンブリ。
- 請求項1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、前記複数のウェルと前記流体供給源との間の前記アレイ充填チャネルの中に開放可能なシールをさらに含む、アレイアセンブリ。
- 請求項1に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルは、それぞれの複数の列で配設されており、前記アレイ充填チャネルは、前記流体供給源およびマニホールドチャネルアセンブリに流体連通しているアクセスチャネルを含み、前記マニホールドチャネルアセンブリは、
前記それぞれの複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
前記複数の列の第1の端部に沿って延在する第1のメインチャネルであって、前記複数の分岐チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在しており、前記アレイ充填チャネルは、前記第1のメインチャネルに連通している、第1のメインチャネルと
を含む、アレイアセンブリ。 - 請求項9に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルに流体連通している第2のメインチャネルをさらに含み、前記第2のメインチャネルは、前記複数の列の第2の端部に沿って延在しており、前記真空ポートは、前記第2のメインチャネルに連通しており、それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、前記真空ポートおよび前記流体供給源に流体連通している、アレイアセンブリ。
- 請求項10に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルのそれぞれから前記複数のウェルへそれぞれ延在する複数の接続チャネルをさらに含み、前記複数の接続チャネルは、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、アレイアセンブリ。
- アレイアセンブリを製造する方法であって、
複数のウェルがその中に配設されているカード層を提供するステップと、
第1のフィルム層と少なくとも第2のフィルム層との間に前記カード層を配設するステップと、
前記第1のフィルム層をカード層の第1の側に結合するステップと、
前記第2のフィルム層を前記カード層の第2の側に結合するステップと
を含み、
前記カード層、および、前記第1のフィルム層または前記第2のフィルム層のうちの少なくとも1つは、
(i) 前記複数のウェルと真空ポートとの間に延在しており、および/または、前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
(ii) 前記複数のウェルと流体供給源との間に延在しており、および/または、前記複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を形成している、方法。 - 請求項12に記載の方法において、前記カード層の中の凹んだ導管は、マニホールド構成を有している、方法。
- アレイアセンブリをサンプルに使用する方法であって、
(a) 前記アレイアセンブリに流体連通する反応ゾーンを含むサンプルコンテナを提供するステップであって、前記アレイアセンブリは、
アレイの中に構成されている複数のウェル、
前記反応ゾーンとアレイとの間のアクセス開口部、
真空ポート、
複数のチャネル
を含み、前記アレイの中のそれぞれのウェルが前記アクセス開口部および前記真空ポートに流体接続されるようになっている、ステップと、
(b) 前記反応ゾーンの中の前記サンプルに分析的な方法を実施し、反応混合物を作り出すステップと、
(c) 前記真空ポートを開放し、前記アレイアセンブリの上に真空を引くステップであって、空気が前記複数のウェルおよび前記複数のチャネルから排出されるようになっている、ステップと、
(d) 前記複数のウェルが真空下に維持されるように、真空ポートを封止するステップであって、それによって、排出されたアレイを形成する、ステップと、
(e) 前記反応混合物が前記アレイ充填チャネルを介して前記複数のウェルの中へ引き込まれるように、前記アクセス開口部を開放するステップと
を含む、方法。 - 請求項14に記載の方法において、前記方法は、前記複数のウェルのそれぞれの中に配設されている1つまたは複数の試薬と前記反応混合物とを混合し、第2の混合物を形成するステップと、前記第2の反応混合物の上に第2の分析的な方法を実施するステップとをさらに含む、方法。
- 請求項15に記載の方法において、前記第2の混合物は、PCR混合物である、方法。
- 請求項16に記載の方法において、前記第2の反応混合物をサーモサイクルさせるステップをさらに含む、方法。
- 請求項17に記載の方法において、前記複数のウェルの少なくとも1つの中の増幅生成物を検出するステップをさらに含む、方法。
- 請求項15に記載の方法において、前記サンプルは、微生物を含み、1つまたは複数の試薬は、抗生物質を含む、方法。
- 請求項19に記載の方法において、前記抗生物質は、第1の濃度において、前記複数のウェルのうちの第1のものの中に存在しており、第2の濃度において、前記複数のウェルのうちの第2のものの中に存在しており、前記第2の濃度は、前記第1の濃度よりも低い、方法。
- 請求項14に記載の方法において、ステップ(c)は、約2ミリバールから約150ミリバールの間の真空を前記複数のウェルの中に提供する、方法。
- 請求項14に記載の方法において、ステップ(c)および(d)は、ステップ(b)が完了される前に実施される、方法。
- 封止されたサンプルコンテナの中でマルチステップの生物学的反応を実施するための方法であって、
(a) 第1の反応ゾーン、第2の反応ゾーン、および、前記第2の反応ゾーンの中の乾燥した成分を含む、封止されたコンテナを提供するステップと、
(b) 前記第1の反応ゾーンの中で第1の反応を実施し、反応混合物を発生させるステップと、
(c) 前記第2の反応ゾーンの中の前記乾燥した成分を水和流体によって水和し、水和された成分を発生させるステップであって、ステップ(c)は、ステップ(b)の前またはステップ(b)の間に実施される、ステップと、
(d) 前記反応混合物の一部分を前記水和された成分に追加するステップと、
(e) 前記第2の反応ゾーンの中で第2の反応を実施するステップと
を含む、方法。 - 請求項23に記載の方法において、前記第2の反応ゾーンは、ウェルのアレイであり、それぞれのウェルは、乾燥した成分を提供されており、少なくとも複数のウェルは、前記複数のウェルの中の他のウェルとは異なる成分を有している、方法。
- 請求項24に記載の方法において、前記ウェルのアレイの中のそれぞれの個々のウェルは、前記ウェルの中への前記水和流体の進入を遅らせるバリア層を提供されている、方法。
- 請求項25に記載の方法において、水和する前記ステップは、前記複数のウェルを前記水和流体によって充填するステップであって、前記ウェルのアレイから余剰の水和流体を除去することがそれに続く、ステップを含む、方法。
- 請求項26に記載の方法において、追加する前記ステップは、
前記反応混合物を前記アレイに移動させるステップと、
前記反応混合物の一部分が前記バリア層を横切って、それぞれのウェルに進入することを可能にするステップと、
前記アレイから余剰の反応混合物を除去するステップと
を含む、方法。 - 請求項26に記載の方法において、追加する前記ステップは、
前記反応混合物を前記アレイに移動させるステップと、
前記バリア層の外側のそれぞれのウェルに隣接する前記反応混合物の一部分を封止するステップであって、前記反応混合物および水和された成分が前記バリア層を通して混合することができるようになっている、ステップと
を含む、方法。 - 請求項25に記載の方法において、前記バリア層は、1つのウェル当たり1つまたは複数の開口部を有する穿孔された層であり、前記開口部は、いくらかの力がないときには、流体が前記開口部を通って容易には流れることができないようにサイズ決めされている、方法。
- 請求項24に記載の方法において、前記第1の反応は、第1段PCRであり、前記第2の反応は、第2段PCRである、方法。
- 請求項30に記載の方法において、前記第2の反応ゾーンは、ステップ(d)の前に冷たい温度に維持される、方法。
- 請求項23に記載の方法において、ステップ(c)の前に部分的な真空によって少なくとも前記第2の反応ゾーンを排出させるステップをさらに含む、方法。
- アレイの中に配置されている複数のウェルを有するカードと、
前記カードの第1の側にあるアクセス開口部と、
前記アクセス開口部および前記複数のウェルに流体連通しているチャネルシステムと、
前記チャネルシステムに流体連通している真空ポートと
を含む、アレイアセンブリ。 - 請求項33に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイは、複数の列を含み、前記複数の列のそれぞれは、1つまたは複数のウェルを含み、前記チャネルシステムは、マニホールドチャネルアセンブリを含み、前記マニホールドチャネルアセンブリは、
前記複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
前記複数の列の第1の端部に沿って延在する、前記アクセス開口部に流体連通している第1のメインチャネルであって、前記複数の分岐チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在している、第1のメインチャネルと、
前記複数の分岐チャネルに流体連通し、前記複数の列の第2の端部に沿って延在している第2のメインチャネルであって、前記真空ポートは、前記第2のメインチャネルに連通している、第2のメインチャネルと
を含み、
それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、前記真空ポートおよび前記アクセス開口部に流体連通している、アレイアセンブリ。 - 請求項33または34に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、第1のフィルム層および第2のフィルム層をさらに含み、第1のフィルム層および第2のフィルム層は、パウチを形成しており、前記カード層は、前記パウチの内側に少なくとも部分的に封止されている、アレイアセンブリ。
- 反応コンテナであって、
複数の流体接続された反応チャンバと、
アレイと
を含み、前記アレイは、
前記流体接続された反応チャンバのうちの少なくとも1つに流体連通しているアクセス開口部と、
複数の反応ウェルと、
真空ポートと、
前記アクセス開口部に、前記複数のウェルに、および前記真空ポートに流体連通しているチャネルシステムであって、前記アレイの中のそれぞれの反応ウェルが少なくとも2つの経路によって前記真空ポートに流体接続されるように、経路を提供しており、また、それぞれの反応ウェルは、少なくとも2つの経路によって前記流体供給源に接続されている、チャネルシステムと
を含む、反応コンテナ。 - 請求項36に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空ポートは、可逆的にシール可能であり、前記アクセス開口部は、可逆的にシール可能である、アレイアセンブリ。
- アレイの中に配置されている複数のウェルと、
前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネルと、
前記複数のウェルおよび流体供給源に流体連通しているアレイ充填チャネルと
を含む、アレイアセンブリ。 - 請求項38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、
前記複数のウェルがその中に形成されたカード層と、
前記カード層の第1の側に結合される第1のフィルム層であって、前記複数のウェルのそれぞれの第1の端部を封止する、第1のフィルム層と、
前記カード層の第2の側に結合される第2のフィルム層であって、前記真空ポートは、前記第1のフィルム層および前記第2のフィルム層のうちの1つまたは複数の中に開口部を含む、第2のフィルム層と
をさらに含む、アレイアセンブリ。 - 請求項39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルおよび前記アレイ充填チャネルのうちの1つまたは複数の少なくとも一部分は、(i)前記カード層の中に形成されているか、(ii)前記第2のフィルム層の中に形成されているか、または、(iii)前記カード層と前記第2のフィルム層との間に形成されている、アレイアセンブリ。
- 請求項39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルおよび前記アレイ充填チャネルのうちの1つまたは複数の少なくとも一部分は、前記第1のフィルム層と前記第2のフィルム層との間に形成されている、アレイアセンブリ。
- 請求項39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイ充填チャネルの一部分は、前記第1のフィルム層と前記第2のフィルム層との間に形成されており、前記カード層の周囲の少なくとも一部分の周りに配設されている、アレイアセンブリ。
- 請求項39に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイアセンブリは、前記カード層の中に凹んだ導管をさらに含み、前記カード層の中の前記凹んだ導管は、マニホールド構成を有しており、前記アレイの中のそれぞれのウェルは、少なくとも2つの経路によって前記真空ポートに流体接続されており、また、それぞれのウェルは、少なくとも2つの経路によって前記流体供給源に接続されている、アレイアセンブリ。
- 請求項43に記載のアレイアセンブリにおいて、前記第2のフィルム層は、その中に形成された凹んだ導管を有しており、前記アレイアセンブリは、前記第2のフィルム層と前記カード層との間に配設されている第3のフィルム層をさらに含み、前記第3のフィルム層は、それを通って延在する複数の穿孔部を有しており、前記複数の穿孔部は、前記第2のフィルム層の中の前記凹んだ導管に流体連通している、アレイアセンブリ。
- 請求項44に記載のアレイアセンブリにおいて、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分は、前記第2のフィルム層の中の前記凹んだ導管と、前記第3のフィルム層と前記第2のフィルム層の中の前記凹んだ導管の2つ以上の部分の間の前記第2のフィルム層との間の結合部との間に配設されている、アレイアセンブリ。
- 請求項38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記真空チャネルの少なくとも一部分は、前記アレイ充填チャネルの一部分として提供されており、前記アレイ充填チャネルを開位置に維持するように構成されている、アレイアセンブリ。
- 請求項38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルと前記流体供給源との間の前記アレイ充填チャネルの中に開放可能なシールをさらに含む、アレイアセンブリ。
- 請求項38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルのそれぞれの中に配設されている1つまたは複数の試薬をさらに含む、アレイアセンブリ。
- 請求項38に記載のアレイアセンブリにおいて、前記複数のウェルは、それぞれの複数の列で配設されており、前記アレイ充填チャネルは、前記流体供給源およびマニホールドチャネルアセンブリに流体連通しているアクセスチャネルを含み、前記マニホールドチャネルアセンブリは、
前記それぞれの複数の列に沿って延在する複数の分岐チャネルであって、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、複数の分岐チャネルと、
前記複数の列の第1の端部に沿って延在する第1のメインチャネルであって、前記複数の分岐チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在しており、前記アレイ充填チャネルは、前記第1のメインチャネルから延在している、第1のメインチャネルと
を含む、アレイアセンブリ。 - 請求項49に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルに流体連通している第2のメインチャネルをさらに含み、前記第2のメインチャネルは、前記複数の列の第2の端部に沿って延在しており、前記真空ポートは、前記第2のメインチャネルに連通しており、それぞれのウェルは、少なくとも2つの異なる経路によって、前記真空ポートおよび前記流体供給源に流体連通している、アレイアセンブリ。
- 請求項49に記載のアレイアセンブリにおいて、前記マニホールドチャネルアセンブリは、前記複数の分岐チャネルのそれぞれから前記複数のウェルへそれぞれ延在する複数の接続チャネルをさらに含み、前記複数の接続チャネルは、前記複数のウェルにそれぞれ流体連通している、アレイアセンブリ。
- 分析的な方法を実施している間に現場で反応コンテナの上に真空を引く方法であって、
反応コンテナを提供するステップであって、前記反応コンテナは、サンプル導入ゾーン、前記サンプル導入ゾーンに流体連通している少なくとも第1の反応ゾーン、および、前記第1の反応ゾーンに流体連通している第2の反応ゾーンを含み、前記第2の反応ゾーンは、複数のウェル、前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネル、前記複数のウェルと前記第1の反応ゾーンとの間に延在し、および/または、前記複数のウェルおよび前記第1の反応ゾーンに流体連通しているアレイ充填チャネル、ならびに、前記第1の反応ゾーンと前記第2の反応ゾーンとの間に配設されている開放可能なシールを含む、ステップと、
前記分析的な方法のうちの少なくとも1つのステップを前記反応コンテナによって実施するステップと、
前記複数のウェルの上に部分的な真空を引くステップであって、前記複数のウェル、前記真空チャネル、および、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分が、大気圧力に対して低減された圧力下にあるようになっている、ステップと、
前記真空チャネルの一部分を封止するステップであって、前記複数のウェルおよび前記アレイ充填チャネルの少なくとも前記一部分が、前記真空下に維持されるようになっており、それによって、排出されたアレイを形成する、ステップと、
流体が前記アレイ充填チャネルを介して前記複数のウェルの中へ引き込まれるように、前記第1の反応ゾーンと前記第2の反応ゾーンとの間に配設されている前記開放可能なシールを開放することによって、前記排出されたアレイに前記流体を適用するステップと
を含む、方法。 - 請求項52に記載の方法において、前記分析的な方法のうちの少なくとも1つのステップは、周囲圧力パッケージから前記反応コンテナを除去するステップ、前記サンプル導入ゾーンの中へサンプルを導入するステップ、前記反応コンテナを器具の中へ挿入するステップであって、前記器具は、前記分析的な方法を実施するように構成されており、前記排出されたアレイを形成するために部分的な真空を引くように構成されている、ステップ、前記第1の反応ゾーンの中で1つまたは複数の反応を実施するステップ、または、前記排出されたアレイに前記流体を適用するために準備するステップを含む、方法。
- 請求項53に記載の方法において、前記第1の反応ゾーンの中で1つまたは複数の反応を実施するステップは、溶解物を発生させるためにサンプル溶解を実施するステップ、前記溶解物から溶解粒子を隔離するステップ、シリカ磁気ビーズを前記溶解物と混合するステップ、核酸捕獲の後の残留溶解物を前記シリカ磁気ビーズとともに廃棄物チャンバへ移動させるステップ、前記磁気ビーズの少なくとも1つの洗浄を実施し、前記洗浄液体を前記廃棄物チャンバへ移動させるステップ、前記シリカ磁気ビーズから核酸を溶出させるステップ、第1のシングルプレックスもしくはマルチプレックスPCR反応を実施するステップ、または、前記第2の反応ゾーンの前記複数のウェルの中で第2のPCR反応を実施するのに備えて、前記第1のPCR反応の生成物を希釈するステップのうちの1つまたは複数を含む、方法。
- 請求項52に記載の方法において、前記反応コンテナは、1つまたは複数の試薬ブリスタをさらに含み、前記1つまたは複数の試薬ブリスタは、前記サンプル導入ゾーン、前記第1の反応ゾーン、または前記第2の反応ゾーンのうちの1つまたは複数に流体接続されている、方法。
- 請求項55に記載の方法において、前記1つまたは複数の試薬ブリスタのうちの少なくとも1つは、乾燥した試薬を含み、前記方法は、前記乾燥した試薬を含む前記1つまたは複数の試薬ブリスタの上に部分的な真空を引くステップをさらに含む、方法。
- 請求項56に記載の方法において、前記乾燥した試薬と流体を混合し、第1の混合物を形成するステップをさらに含む、方法。
- 請求項56に記載の方法において、前記1つまたは複数の試薬ブリスタは、サンプル調製、核酸回収、第1段PCR、および第2段PCRのための試薬を含む、方法。
- 反応コンテナであって、サンプル導入ゾーン、前記サンプル導入ゾーンに流体連通している少なくとも第1の反応ゾーン、および、前記第1の反応ゾーンに流体連通している第2の反応ゾーンを含み、前記第2の反応ゾーンは、複数のウェル、前記複数のウェルと真空ポートとの間に延在し、および/または、前記複数のウェルおよび真空ポートに流体連通している真空チャネル、前記複数のウェルと前記第1の反応ゾーンとの間に延在し、および/または、前記複数のウェルおよび前記第1の反応ゾーンに流体連通しているアレイ充填チャネル、ならびに、前記第1の反応ゾーンと前記第2の反応ゾーンとの間に配設されている開放可能なシールを含む、反応コンテナと、
前記反応コンテナを使用して分析的な方法を実施するように構成されている器具であって、真空システムを含み、前記分析的な方法のうちの1つまたは複数のステップを実施しながら、前記反応コンテナの1つまたは複数の部分の中に部分的な真空を引く、器具と
を含む、システム。 - 請求項59に記載のシステムにおいて、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分は、実質的に乾燥しており、前記部分的な真空が水の分圧に対して引かれないようになっている、システム。
- 請求項60に記載のシステムにおいて、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分の中の前記部分的な真空は、約2ミリバールから約150ミリバールの間の範囲の中にある、システム。
- 請求項59に記載のシステムにおいて、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分は、前記複数のウェル、前記真空チャネル、および、前記アレイ充填チャネルの少なくとも一部分を含む、システム。
- 請求項59に記載のシステムにおいて、前記器具は、前記反応コンテナの1つまたは複数の部分に引かれる前記部分的な真空を保存するためにシールを適用するシールデバイスを含む、システム。
- 請求項59に記載のシステムにおいて、前記反応コンテナは、1つまたは複数の試薬ブリスタをさらに含み、前記1つまたは複数の試薬ブリスタは、前記サンプル導入ゾーン、前記第1の反応ゾーン、または前記第2の反応ゾーンのうちの1つまたは複数に流体接続されている、システム。
- 請求項64に記載のシステムにおいて、前記1つまたは複数の試薬ブリスタのうちの少なくとも1つは、乾燥した試薬を含み、部分的な真空がその上に引かれるように構成されている前記反応コンテナの前記1つまたは複数の部分は、前記乾燥した試薬を含む前記1つまたは複数の試薬ブリスタを含む、システム。
- 請求項59に記載のシステムにおいて、前記器具は、PCR器具であり、前記PCR器具は、少なくとも1つの加熱器を含み、前記少なくとも1つの加熱器は、前記反応コンテナの少なくとも1つの部分をサーモサイクルさせるように位置決めおよび配置されている、システム。
- 請求項59に記載のシステムにおいて、前記器具は、少なくとも1つの加熱器を含み、前記少なくとも1つの加熱器は、等温反応を実施するために、前記反応コンテナの少なくとも1つの部分の中の温度を制御するように位置決めおよび配置されている、システム。
- 請求項59に記載のシステムにおいて、前記器具は、前記反応コンテナの少なくとも1つの部分の温度を制御するように位置決めおよび配置されている少なくとも1つの加熱器と、前記反応コンテナの中の流体を移動させるための1つまたは複数のアクチュエータと、前記反応コンテナの1つまたは複数の部分の中の流体の移動を制御するための1つまたは複数のシールとを含む、システム。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2021001722A JP6963127B2 (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201762510682P | 2017-05-24 | 2017-05-24 | |
US62/510,682 | 2017-05-24 | ||
PCT/US2018/034194 WO2018217929A1 (en) | 2017-05-24 | 2018-05-23 | Systems and methods for point of use evacuation of an array |
Related Child Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021001250A Division JP2021060423A (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
JP2021001722A Division JP6963127B2 (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2020521457A true JP2020521457A (ja) | 2020-07-27 |
JP6823204B2 JP6823204B2 (ja) | 2021-01-27 |
Family
ID=64395981
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019564944A Active JP6823204B2 (ja) | 2017-05-24 | 2018-05-23 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
JP2021001250A Pending JP2021060423A (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
JP2021001722A Active JP6963127B2 (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021001250A Pending JP2021060423A (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
JP2021001722A Active JP6963127B2 (ja) | 2017-05-24 | 2021-01-07 | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US11305276B2 (ja) |
EP (1) | EP3630359A4 (ja) |
JP (3) | JP6823204B2 (ja) |
KR (1) | KR102205804B1 (ja) |
CN (2) | CN113564037A (ja) |
WO (1) | WO2018217929A1 (ja) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3611508B1 (en) * | 2017-05-16 | 2022-08-03 | SK Telecom Co., Ltd. | Nucleic acid analysis apparatus using catridge |
KR102205804B1 (ko) * | 2017-05-24 | 2021-01-22 | 바이오파이어 디펜스, 엘엘씨 | 사용 시점에서 어레이의 배기를 위한 시스템 및 방법 |
WO2020132421A1 (en) * | 2018-12-21 | 2020-06-25 | Biofire Diagnostics, Llc | Apparatuses, methods, and systems for in-situ sealing of reaction containers |
CN113528317A (zh) * | 2020-04-15 | 2021-10-22 | 拓原合壹(宁波)生物技术有限公司 | 核酸提取方法 |
CN115734819A (zh) * | 2020-05-13 | 2023-03-03 | 奎多公司 | 用于样本测试的系统和测试盒 |
KR102263837B1 (ko) * | 2020-11-05 | 2021-06-11 | 주식회사 미코바이오메드 | 현장진단용 다중 초고속 핵산 추출 및 증폭이 가능한 통합칩 |
CN113005117B (zh) * | 2021-02-26 | 2021-11-09 | 北京中科生仪科技有限公司 | 一种磁珠干化保护液、干化磁珠及其制备方法 |
WO2023247845A1 (fr) * | 2022-06-21 | 2023-12-28 | bioMérieux | Procédé de fabrication d'une carte d'analyse biologique impliquant un bloc de chauffe |
WO2024020414A1 (en) * | 2022-07-22 | 2024-01-25 | Biofire Diagnostics, Llc | Cell lysis and nucleic acid recovery |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20090226900A1 (en) * | 2008-03-05 | 2009-09-10 | Helicos Biosciences Corporation | Methods for Reducing Contaminants in Nucleic Acid Sequencing by Synthesis |
JP2010509918A (ja) * | 2006-11-15 | 2010-04-02 | アイダホ テクノロジー インコーポレーテッド | 高密度内蔵型生物学的分析 |
Family Cites Families (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6645758B1 (en) | 1989-02-03 | 2003-11-11 | Johnson & Johnson Clinical Diagnostics, Inc. | Containment cuvette for PCR and method of use |
US6780617B2 (en) | 2000-12-29 | 2004-08-24 | Chen & Chen, Llc | Sample processing device and method |
US6303305B1 (en) | 1999-03-30 | 2001-10-16 | Roche Diagnostics, Gmbh | Method for quantification of an analyte |
US6485690B1 (en) * | 1999-05-27 | 2002-11-26 | Orchid Biosciences, Inc. | Multiple fluid sample processor and system |
EP1952886B1 (en) | 2001-07-16 | 2021-06-23 | BioFire Defense, LLC | Thermal cycling system and method of use |
WO2003053586A1 (en) * | 2001-12-19 | 2003-07-03 | Affymetrix, Inc. | Array plates and method for constructing array plates |
GB2403536B (en) * | 2002-04-23 | 2006-11-08 | Idaho Technology Inc | Sample withdrawal and dispensing device |
US7387887B2 (en) | 2004-04-20 | 2008-06-17 | University Of Utah Research Foundation | Nucleic acid melting analysis with saturation dyes |
WO2006121997A2 (en) * | 2005-05-09 | 2006-11-16 | Idaho Technology, Inc. | Self-contained biological analysis |
US7976795B2 (en) * | 2006-01-19 | 2011-07-12 | Rheonix, Inc. | Microfluidic systems |
EP2117713B1 (en) * | 2006-12-22 | 2019-08-07 | DiaSorin S.p.A. | Thermal transfer methods for microfluidic systems |
KR20120031218A (ko) * | 2009-06-05 | 2012-03-30 | 인터젠엑스 인크. | 만능 샘플 제조 시스템 및 집적 분석 시스템에서의 사용 |
CN103154744B (zh) * | 2010-10-08 | 2015-05-20 | 生物梅里埃有限公司 | 改进的样品测试卡 |
JP6231989B2 (ja) | 2011-11-10 | 2017-11-15 | バイオファイア・ダイアグノスティクス,リミテッド・ライアビリティ・カンパニー | 充填バイアル |
US9050593B2 (en) * | 2011-11-23 | 2015-06-09 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Self-loading microfluidic device and methods of use |
WO2013158740A1 (en) | 2012-04-18 | 2013-10-24 | Biofire Diagnostics, Inc. | Microspotting device |
AU2016350734B2 (en) * | 2015-11-02 | 2021-04-08 | Biofire Diagnostics, Llc | Sample preparation for difficult sample types |
US10875026B2 (en) | 2016-02-22 | 2020-12-29 | Biofire Defense, Llc | Devices and methods for rapid PCR |
KR102205804B1 (ko) * | 2017-05-24 | 2021-01-22 | 바이오파이어 디펜스, 엘엘씨 | 사용 시점에서 어레이의 배기를 위한 시스템 및 방법 |
-
2018
- 2018-05-23 KR KR1020197038151A patent/KR102205804B1/ko active IP Right Grant
- 2018-05-23 US US16/606,618 patent/US11305276B2/en active Active
- 2018-05-23 CN CN202110685515.XA patent/CN113564037A/zh active Pending
- 2018-05-23 JP JP2019564944A patent/JP6823204B2/ja active Active
- 2018-05-23 EP EP18806560.1A patent/EP3630359A4/en active Pending
- 2018-05-23 CN CN201880034455.1A patent/CN110719813B/zh active Active
- 2018-05-23 WO PCT/US2018/034194 patent/WO2018217929A1/en active Application Filing
-
2021
- 2021-01-07 JP JP2021001250A patent/JP2021060423A/ja active Pending
- 2021-01-07 JP JP2021001722A patent/JP6963127B2/ja active Active
-
2022
- 2022-03-14 US US17/694,020 patent/US20220203355A1/en active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010509918A (ja) * | 2006-11-15 | 2010-04-02 | アイダホ テクノロジー インコーポレーテッド | 高密度内蔵型生物学的分析 |
US20090226900A1 (en) * | 2008-03-05 | 2009-09-10 | Helicos Biosciences Corporation | Methods for Reducing Contaminants in Nucleic Acid Sequencing by Synthesis |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN110719813B (zh) | 2021-06-22 |
JP6823204B2 (ja) | 2021-01-27 |
CN113564037A (zh) | 2021-10-29 |
EP3630359A1 (en) | 2020-04-08 |
US20220203355A1 (en) | 2022-06-30 |
WO2018217929A1 (en) | 2018-11-29 |
EP3630359A4 (en) | 2021-02-24 |
KR102205804B1 (ko) | 2021-01-22 |
JP2021060424A (ja) | 2021-04-15 |
CN110719813A (zh) | 2020-01-21 |
US11305276B2 (en) | 2022-04-19 |
JP2021060423A (ja) | 2021-04-15 |
KR20200033808A (ko) | 2020-03-30 |
JP6963127B2 (ja) | 2021-11-05 |
US20210031183A1 (en) | 2021-02-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6963127B2 (ja) | アレイのポイント・オブ・ユース排出のためのシステムおよび方法 | |
US10913060B2 (en) | Loading vials | |
US20220034770A1 (en) | Sample preparation for difficult sample types | |
US20190046989A1 (en) | Devices and methods for rapid pcr | |
CN107367626B (zh) | 微点样装置 | |
US20240123452A1 (en) | Assay devices and methods of use thereof | |
US20170297028A1 (en) | Rapid Response Resistive Heater | |
US11590493B2 (en) | Assay devices and methods of manufacture | |
US20220080403A1 (en) | Apparatuses, methods, and systems for in-situ sealing of reaction containers | |
CN113727841B (zh) | 用于反应容器的原位密封的设备、方法和系统 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200123 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20200611 |
|
A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20200611 |
|
A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20200623 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200715 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20201015 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20201210 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210107 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6823204 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |