JP2020193877A - 分取装置、分取システム、及びプログラム - Google Patents
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Abstract
Description
1.分取システムの構成
2.情報処理装置の構成
3.分取システムの動作
4.分取システムの変形例
5.ハードウェア構成例
まず、図1を参照して、本開示の一実施形態に係る分取システム1の構成について説明する。図1は、本実施形態に係る分取システム1の構成例を示すブロック図である。
続いて、図3を参照して、本実施形態に係る分取システム1に含まれる情報処理装置20のより具体的な構成について説明する。図3は、本実施形態に係る情報処理装置20の構成例を示すブロック図である。
次に、図8A及び図8Bを参照して、本実施形態に係る分取システム1の動作の流れについて説明する。図8Aは、本実施形態に係る分取システム1の学習モデルを構築する動作の流れを説明するフローチャート図である。図8Bは、本実施形態に係る分取システム1の生体由来粒子を分取する動作の流れを説明するフローチャート図である。
(第1の変形例)
続いて、図9A及び図9Bを参照して、本実施形態に係る分取システム1の第1の変形例について説明する。図9A及び図9Bは、第1の変形例に係る分取システム1にてユーザに提示される画像の一例を示す説明図である。
次に、図10及び図11を参照して、本実施形態に係る分取システム1の第2の変形例について説明する。図10は、第2の変形例に係る分取システム1Aの構成例を示すブロック図である。図11は、第2の変形例に係る情報処理装置20A及び情報処理サーバ30Aの構成例を示すブロック図である。
続いて、図12を参照して、本実施形態に係る情報処理装置20等のハードウェア構成の一例について説明する。図12は、本実施形態に係る情報処理装置20のハードウェア構成の一例を示すブロック図である。
(1)
生体由来粒子からの光情報に対してデータ圧縮処理を施し、前記データ圧縮処理により得られた情報に基づいて特定された分取対象となる前記生体由来粒子の前記データ圧縮処理を施す前の光情報を用いて機械学習を行うことで、前記分取対象となる生体由来粒子から発せられる光情報を判別する学習モデルを構築する学習部と、
前記学習モデルを出力する出力部と、
を備える、分取装置。
(2)
前記データ圧縮処理は、クラスタリング処理である、前記(1)に記載の分取装置。
(3)
前記データ圧縮処理は、次元圧縮処理である、前記(1)に記載の分取装置。
(4)
前記次元圧縮処理は、前記生体由来粒子からの光情報の次元を三次元以下に圧縮する、前記(3)に記載の分取装置。
(5)
前記光情報は、前記生体由来粒子からの蛍光を各色の蛍光色素の発現量に蛍光分離した情報である、前記(1)〜(4)のいずれか一項に記載の分取装置。
(6)
前記蛍光分離は、重み付け最小二乗法によって行われる、前記(5)に記載の分取装置。
(7)
前記機械学習は、教師あり学習である、前記(1)〜(6)のいずれか一項に記載の分取装置。
(8)
前記機械学習のアルゴリズムは、ランダムフォレストである、前記(7)に記載の分取装置。
(9)
前記生体由来粒子は、複数の集団に分けられて分取される、前記(1)〜(8)のいずれか一項に記載の分取装置。
(10)
前記データ圧縮処理を施した後の情報をユーザに提示するインタフェース部をさらに備える、前記(1)〜(9)のいずれか一項に記載の分取装置。
(11)
前記インタフェース部は、前記データ圧縮処理を施した後の情報を三次元以下の領域にマッピングすることで、前記ユーザに提示する、前記(10)に記載の分取装置。
(12)
前記インタフェース部は、前記機械学習に用いられた前記生体由来粒子の集団と、分取された前記生体由来粒子の集団とを同一の処理を施して、前記ユーザに視覚的に提示する、前記(10)又は(11)に記載の分取装置。
(13)
前記学習部は、前記機械学習に用いられた前記生体由来粒子の数又は全体に対する割合が閾値を超えた場合、前記機械学習の完了を通知する、前記(1)〜(12)のいずれか一項に記載の分取装置。
(14)
前記学習部は、構築された前記学習モデルの正答率が閾値を超えた場合、前記機械学習の完了を通知する、前記(1)〜(12)のいずれか一項に記載の分取装置。
(15)
前記生体由来粒子は、細胞である、前記(1)〜(14)のいずれか一項に記載の分取装置。
(16)
生体由来粒子に光線を照射し、前記生体由来粒子からの蛍光に基づいて、前記生体由来粒子を分取する分取装置と、
を含み、
前記分取装置は、
生体由来粒子からの光情報に対してデータ圧縮処理を施し、前記データ圧縮処理により得られた情報に基づいて特定された分取対象となる前記生体由来粒子の前記データ圧縮処理を施す前の光情報を用いて機械学習を行うことで、前記分取対象となる生体由来粒子から発せられる光情報を判別する学習モデルを構築する学習部と、
前記学習モデルを出力する出力部と、
としてコンピュータを機能させるプログラムを読み取らせた前記コンピュータが前記分取対象と判別した前記生体由来粒子を分取する、分取システム。
(17)
コンピュータに読み取られることで、前記コンピュータを、
生体由来粒子からの光情報に対してデータ圧縮処理を施し、前記データ圧縮処理により得られた情報に基づいて特定された分取対象となる前記生体由来粒子の前記データ圧縮処理を施す前の光情報を用いて機械学習を行うことで、前記分取対象となる生体由来粒子から発せられる光情報を判別する学習モデルを構築する学習部と、
として機能させる、プログラム。
10 分取装置
11 光源
13 流路
15A、15B、15C ダイクロイックミラー
16 プリズム
17A、17B、17C 光検出器
18 光検出器アレイ
20、20A 情報処理装置
30A 情報処理サーバ
40 ネットワーク
201 取得部
203 解析部
205 リファレンススペクトル記憶部
207 データ圧縮処理部
209 インタフェース部
211 学習部
213 学習モデル記憶部
215 判別部
Claims (17)
- 生体由来粒子からの光情報に対してデータ圧縮処理を施し、前記データ圧縮処理により得られた情報に基づいて特定された分取対象となる前記生体由来粒子の前記データ圧縮処理を施す前の光情報を用いて機械学習を行うことで、前記分取対象となる生体由来粒子から発せられる光情報を判別する学習モデルを構築する学習部と、
前記学習モデルを出力する出力部と、
を備える、分取装置。 - 前記データ圧縮処理は、クラスタリング処理である、請求項1に記載の分取装置。
- 前記データ圧縮処理は、次元圧縮処理である、請求項1に記載の分取装置。
- 前記次元圧縮処理は、前記生体由来粒子からの光情報の次元を三次元以下に圧縮する、請求項3に記載の分取装置。
- 前記光情報は、前記生体由来粒子からの蛍光を各色の蛍光色素の発現量に蛍光分離した情報である、請求項1に記載の分取装置。
- 前記蛍光分離は、重み付け最小二乗法によって行われる、請求項5に記載の分取装置。
- 前記機械学習は、教師あり学習である、請求項1に記載の分取装置。
- 前記機械学習のアルゴリズムは、ランダムフォレストである、請求項7に記載の分取装置。
- 前記生体由来粒子は、複数の集団に分けられて分取される、請求項1に記載の分取装置。
- 前記データ圧縮処理を施した後の情報をユーザに提示するインタフェース部をさらに備える、請求項1に記載の分取装置。
- 前記インタフェース部は、前記データ圧縮処理を施した後の情報を三次元以下の領域にマッピングすることで、前記ユーザに提示する、請求項10に記載の分取装置。
- 前記インタフェース部は、前記機械学習に用いられた前記生体由来粒子の集団と、分取された前記生体由来粒子の集団とを同一の処理を施して、前記ユーザに視覚的に提示する、請求項10に記載の分取装置。
- 前記学習部は、前記機械学習に用いられた前記生体由来粒子の数又は全体に対する割合が閾値を超えた場合、前記機械学習の完了を通知する、請求項1に記載の分取装置。
- 前記学習部は、構築された前記学習モデルの正答率が閾値を超えた場合、前記機械学習の完了を通知する、請求項1に記載の分取装置。
- 前記生体由来粒子は、細胞である、請求項1に記載の分取装置。
- 生体由来粒子に光線を照射し、前記生体由来粒子からの蛍光に基づいて、前記生体由来粒子を分取する分取装置と、
を含み、
前記分取装置は、
生体由来粒子からの光情報に対してデータ圧縮処理を施し、前記データ圧縮処理により得られた情報に基づいて特定された分取対象となる前記生体由来粒子の前記データ圧縮処理を施す前の光情報を用いて機械学習を行うことで、前記分取対象となる生体由来粒子から発せられる光情報を判別する学習モデルを構築する学習部と、
前記学習モデルを出力する出力部と、
としてコンピュータを機能させるプログラムを読み取らせた前記コンピュータが前記分取対象と判別した前記生体由来粒子を分取する、分取システム。 - コンピュータに読み取られることで、前記コンピュータを、
生体由来粒子からの光情報に対してデータ圧縮処理を施し、前記データ圧縮処理により得られた情報に基づいて特定された分取対象となる前記生体由来粒子の前記データ圧縮処理を施す前の光情報を用いて機械学習を行うことで、前記分取対象となる生体由来粒子から発せられる光情報を判別する学習モデルを構築する学習部と、
として機能させる、プログラム。
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