JP2020191841A - マイコプラズマ検査装置、マイコプラズマ表示装置、マイコプラズマ検査システム、マイコプラズマ表示システム、学習器、コンピュータプログラム、マイコプラズマ検査方法及び学習器の生成方法 - Google Patents
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Abstract
Description
50 検査装置
51 制御部
52 入力部
53 マイコプラズマ画像生成部
54 汚染結果画像生成部
55 記憶部
56 細胞塊抽出部
57 インタフェース部
58 学習器
581 第1学習器
582 第2学習器
583 第3学習器
59 決定部
100 表示装置
101 制御部
102 インタフェース部
103 表示画面
104 操作部
200 培養装置
201、202 培養ユニット
203 コントローラ
204 操作部
300 撮像装置
Claims (25)
- 細胞核が撮影された検査対象画像を取得する取得部と、
前記取得部で取得した検査対象画像に基づいてマイコプラズマを検出すべく学習された第1学習器と、
前記第1学習器で検出したマイコプラズマ及び前記取得部で取得した検査対象画像に基づいてマイコプラズマ画像を生成するマイコプラズマ画像生成部と
を備えるマイコプラズマ検査装置。 - 前記マイコプラズマ画像生成部で生成したマイコプラズマ画像に基づいて前記細胞核がマイコプラズマ汚染されているか否か判定すべく学習された第2学習器と、
前記第2学習器の判定結果に基づいて汚染細胞核及び非汚染細胞核の少なくとも一方を含むマイコプラズマ汚染結果画像を生成する汚染結果画像生成部と
を備える請求項1に記載のマイコプラズマ検査装置。 - 前記汚染結果画像生成部で生成したマイコプラズマ汚染結果画像に基づいて細胞核の数を検出すべく学習された第3学習器を備える請求項2に記載のマイコプラズマ検査装置。
- 前記第3学習器は、
前記汚染結果画像生成部で生成した複数のマイコプラズマ汚染結果画像それぞれで検出した細胞核の数に基づく代表値を細胞核の数として検出する請求項3に記載のマイコプラズマ検査装置。 - 前記第1学習器は、
細胞核が撮影され、マイコプラズマが存在する第1画像と前記第1画像からマイコプラズマを抽出した抽出画像とを含む学習データ、及び細胞核が撮影され、マイコプラズマが存在しない第2画像とマイコプラズマが存在しない所定画像とを含む学習データを用いて生成してある請求項3又は請求項4に記載のマイコプラズマ検査装置。 - 前記第2学習器は、
前記第1画像及び前記抽出画像の組で構成される学習用入力画像と所定の汚染細胞核画像とを含む学習データ、及び前記第2画像及び前記所定画像の組で構成される学習用入力画像と所定の非汚染細胞核画像とを含む学習データを用いて生成してある請求項5に記載のマイコプラズマ検査装置。 - 前記第3学習器は、
所定の汚染細胞核画像、所定の非汚染細胞核画像、及び細胞核数を示す教師ラベルを用いて生成してある請求項3から請求項6のいずれか一項に記載のマイコプラズマ検査装置。 - 所定数の細胞核と汚染細胞核の数とを対応付けた細胞核数情報を出力する出力部を備える請求項7に記載のマイコプラズマ検査装置。
- 前記汚染結果画像生成部で生成したマイコプラズマ汚染結果画像に基づいて1又は複数の細胞核が集まった細胞塊を抽出する細胞塊抽出部を備え、
前記第3学習器は、
前記細胞塊抽出部で抽出した細胞塊ごとに細胞核の数を検出する請求項3から請求項8のいずれか一項に記載のマイコプラズマ検査装置。 - 前記細胞塊抽出部で抽出した細胞塊に汚染細胞核及び非汚染細胞核の両方が含まれる場合、所定の条件に基づいて前記細胞塊を汚染細胞核又は非汚染細胞核のいずれかに決定する決定部を備える請求項9に記載のマイコプラズマ検査装置。
- 細胞核が撮影された検査対象画像を取得する取得部と、
前記取得部で取得した検査対象画像に基づいてマイコプラズマを検出すべく学習された第1学習器が検出したマイコプラズマ及び前記取得部で取得した検査対象画像に基づいてマイコプラズマ画像を表示するマイコプラズマ画像表示部と
を備えるマイコプラズマ表示装置。 - 前記マイコプラズマ画像に基づいて細胞核がマイコプラズマ汚染されているか否か判定すべく学習された第2学習器の判定結果に基づいて汚染細胞核及び非汚染細胞核の少なくとも一方を含むマイコプラズマ汚染結果画像を表示する汚染結果画像表示部を備える請求項11に記載のマイコプラズマ表示装置。
- 前記汚染結果画像表示部は、
汚染細胞核及び非汚染細胞核の少なくとも一方に細胞核を識別する識別子を付与してマイコプラズマ汚染結果画像を表示する請求項12に記載のマイコプラズマ表示装置。 - 前記識別子の表示・非表示を設定する設定部を備える請求項13に記載のマイコプラズマ表示装置。
- 前記汚染結果画像表示部は、
汚染細胞核と非汚染細胞核とを異なる表示態様にしてマイコプラズマ汚染結果画像を表示する請求項12から請求項14のいずれか一項に記載のマイコプラズマ表示装置。 - 前記汚染結果画像表示部は、
1又は複数の細胞核が集まった細胞塊に汚染細胞核及び非汚染細胞核の両方が含まれる場合、所定の条件に基づいて前記細胞塊を汚染細胞核又は非汚染細胞核のいずれかとしてマイコプラズマ汚染結果画像を表示する請求項12から請求項15のいずれか一項に記載のマイコプラズマ表示装置。 - 所定の細胞核数と汚染細胞核の数とを対応付けた細胞核数情報を表示する表示部を備える請求項12から請求項16のいずれか一項に記載のマイコプラズマ表示装置。
- 前記表示部は、
細胞核を識別する識別子と、前記細胞核が汚染細胞核であるか非汚染細胞核であるかを示す符号とを対応付けて表示する請求項17に記載のマイコプラズマ表示装置。 - 前記表示部は、
1又は複数の汚染細胞核が集まった細胞塊の画像を前記識別子に対応付けて表示する請求項18に記載のマイコプラズマ表示装置。 - 細胞核を撮像する撮像装置と、請求項1から請求項10のいずれか一項に記載のマイコプラズマ検査装置とを備え、
前記マイコプラズマ検査装置は、前記撮像装置で撮像された検査対象画像を取得するマイコプラズマ検査システム。 - 細胞核を撮像する撮像装置と、請求項11から請求項19のいずれか一項に記載のマイコプラズマ表示装置とを備え、
前記マイコプラズマ表示装置は、前記撮像装置で撮像された検査対象画像を取得するマイコプラズマ表示システム。 - 細胞核が撮影された検査対象画像に基づいてマイコプラズマを検出すべく学習された第1学習器と、
前記第1学習器で検出したマイコプラズマ及び前記検査対象画像に基づいて前記細胞核がマイコプラズマ汚染されているか否か判定すべく学習された第2学習器と、
前記第2学習器の判定結果に基づいて生成される、汚染細胞核及び非汚染細胞核の少なくとも一方を含むマイコプラズマ汚染結果画像を用いて細胞核の数を検出すべく学習された第3学習器と
を備える学習器。 - コンピュータに、
細胞核が撮影された検査対象画像を取得する処理と、
取得した検査対象画像を用いて学習された第1学習器が検出したマイコプラズマ及び前記検査対象画像に基づいてマイコプラズマ画像を生成する処理と
を実行させるコンピュータプログラム。 - 細胞核が撮影された検査対象画像を取得し、
取得された検査対象画像を用いて学習された第1学習器が検出したマイコプラズマ及び前記検査対象画像に基づいてマイコプラズマ画像を生成するマイコプラズマ検査方法。 - 第1学習器、第2学習器及び第3学習器を備える学習器の生成方法であって、
細胞核が撮影され、マイコプラズマが存在する第1画像と前記第1画像からマイコプラズマを抽出した抽出画像とを含む学習データ、及び細胞核が撮影され、マイコプラズマが存在しない第2画像とマイコプラズマが存在しない所定画像とを含む学習データを用いて前記第1学習器を生成し、
前記第1画像及び前記抽出画像の組で構成される学習用入力画像と所定の汚染細胞核画像とを含む学習データ、及び前記第2画像及び前記所定画像の組で構成される学習用入力画像と所定の非汚染細胞核画像とを含む学習データを用いて前記第2学習器を生成し、
所定の汚染細胞核画像、所定の非汚染細胞核画像、及び細胞核数を示す教師ラベルを用いて前記第3学習器を生成する学習器の生成方法。
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