JP2019505573A - 薬剤としての使用のため、特にパーキンソン病の治療のための新規二環式化合物 - Google Patents
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Abstract
【化1】
(A)
Description
本明細書で使用される場合、別段の指定がない限り、「置換された」という用語は、化学的部分に関連して使用される場合、化学的部分の1または数個の水素原子が、水素以外の置換原子または−D(重水素)、−F、−Cl、−Br、−I、=O、−OH、−OR、=S、−SH、−OSO3H、−OSO3R、−SO3H、−SO2R、−SO2NH2、−SO2NHR、−SO2NR2、−OPO3 2−、−NH2、−NHR、−COOH、−CONH2、−OCOOH、−NHCONH2、−CN、−NC、−CNO、−NCO、−CNS、−SCN、CF3、CHF2、CH2F[式中、Rは、C1−C8アルキル、C2−C8アルケニル、C2−C8アルキニル、C3−C10シクロアルキル、5〜10員のアリールもしくはヘテロアリールである]、ならびにC、N、O、SおよびFから選択される2〜25個の原子と任意の適切な量のH原子から成る置換基部分[ここで置換基部分は29〜400g/molの分子量を有する]から選択される置換基部分で置換されていることを意味する。
本発明の第一の態様によれば、一般式(A):
(A)、
[式中、
−R1は、−OH、−SHおよび−NH2から選択され;
−R2は、−NO2、−SO3H、−SO2−OR11、−SO2−NH2、−SO2−NHR11、−SO2−NR11 2、−PO3H、−PO2−OR11、−CN、−COR11、−CO2R11、−CONHR11、−CONR11 2、−CF3およびハロゲンから選択され;
−R3は、H、−NO2、−SO3H、−SO2−OR11、−SO2−NH2、−SO2−NHR11、−SO2−NR11 2、−PO3H、−PO2−OR11、−CN、−COR11、−CO2R11、−CONHR11、−CONR11 2、−CF3およびハロゲンから選択され;
−R4およびR5は、−H、置換C1−C6アルキル、非置換C1−C6アルキル、置換または非置換C2−C6アルケニル、置換または非置換C3−C6シクロアルキル、ハロゲン、−CNおよび−NO2から独立して選択され;
‐R6およびR7の一方は、−CONR9R11、−CONR9 2、−COR9、−COOR9、−SO2−OH、−SO2R9、−SO2−OR9、−SO2−OR11、−SO2NHR11、−SO2NR9R11、−NO2、−CN、−CF3および−SO2NR9 2から選択され;
‐R6およびR7の他方は、H、−CONH2、COOH、−SO2−OH、−SO2NH2、−Y−R9、−Y−R9 2および−R9から選択され、
ここで、
−R9はR10−(Y−R10)nであり;
−Yは、−CONR11−、−CO−、−COO−、−SO3−、−SO2NH−、−NR11−、−O−、−NR11CO−、−OCO−、−NR11COO−、−NR11CONR11−、−OCONR11−および−OCOO−から選択され;
−nは、0、1、2、3および4から選択される整数であり、
‐それぞれのR10は、他のR10とは独立して、置換または非置換C1−C8アルキル、置換または非置換C2−C8アルケニル、置換または非置換C2−C8アルキニル、置換または非置換C3−C10シクロアルキルおよび置換または非置換5〜10員アリールまたはヘテロアリールから選択され;ならびに
−それぞれのR11は、他のR11とは独立して、Hまたは非置換C1−C6アルキルである]
によって特徴付けられる化合物が提供される。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである。
−R9は(CH2)4−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換メチルまたはエチルである。
−R9は(CH2)4−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換メチルまたはエチルである。
−R9は(CH2)4−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換メチルまたはエチルである。
・N2,N2,N3,N3−テトラエチル−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A1)
(A1)、
・(3−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]プロピルアセタート)(A2)
(A2)、
・N2−(6−アミノヘキシル)−N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A4)
(A4)、
・N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−N2−[4−[メチル(ペンタノイル)アミノ]ブチル]−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A5)
(A5)、
・tert−ブチルN−[6−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−
(A6)、
・4−[4−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]ブチル−メチル−アミノ]−4−オキソ−ブタン酸(A8)
(A8)、
・N2−[4−[4−アミノブタノイル(メチル)アミノ]ブチル]−N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A9)
(A9)、
・tert−ブチルN−[4−[4−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−
(A10)、
・N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−N2−[4−[[6−(2−メトキシフェニル)−6−オキソ−ヘキサノイル]−メチル−アミノ]ブチル]−5−ニトロ−ナフタレン‐2,3−ジカルボキサミド(A11)
(A11)および
・tert−ブチルN−[1−シクロヘキシル−2−[4−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]ブチル−メチル−アミノ]−2−オキソ−エチル]カルバマート(A13)
(A13)から選択されて提供される。
(B)、
[式中、
−R8は、C、S、N、O、NR11およびCR11から選択され;
−R1、R2、R3、R9およびR11は、上記で定義したのと同じ意味を有する]
によって特徴付けられる化合物が提供される。
−R1は−OHであり、
−R2は−NO2であり、R3はHであり、および
−R8はSであり;
ならびにR9は上記で定義したのと同じ意味を有する。
項目1:一般式(B):
(B)、
[式中、
−R1は、−OH、−SHおよび−NH2から選択され;
−R2は、−NO2、−SO3H、−SO2−OR11、−SO2−NH2、−SO2−NHR11、−SO2−NR11 2、−PO3H、−PO2−OR11、−CN、−COR11、−CO2R11、−CONHR11、−CONR11 2、−CF3およびハロゲンから選択され;
−R3は、H、−NO2、−SO3H、−SO2−OR11、−SO2−NH2、−SO2−NHR11、−SO2−NR11 2、−PO3H、−PO2−OR11、−CN、−COR11、−CO2R11、−CONHR11、−CONR11 2、−CF3およびハロゲンから選択され;
−R8は、C、S、N、O、NR11およびCR11から選択され;
−R9はR10−(Y−R10)nであり;
−Yは、−CONR11−、−CO−、−COO−、−SO3−、−SO2NH−、−NR11−、−O−、−NR11CO−、−OCO−、−NR11COO−、−NR11CONR11−、−OCONR11−および−OCOO−から選択され;
−nは、0、1、2、3および4から選択される整数であり、
‐それぞれのR10は、他のR10とは独立して、置換または非置換C1−C8アルキル、置換または非置換C2−C8アルケニル、置換または非置換C2−C8アルキニル、置換または非置換C3−C10シクロアルキルおよび置換または非置換5〜10員アリールまたはヘテロアリールから選択され;ならびにそれぞれのR11は、他のR11とは独立して、Hまたは非置換C1−C6アルキルである]
によって特徴付けられる化合物。
−R1は−OHであり、
−R2は−NO2であり、R3はHであり、
−R8はSであり、
およびR9は項目1で定義したのと同じ意味を有する、
化合物。
−R9はR11−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである、
化合物。
−R9は(CH2)4−(Y−R10)nであり、
−Yは、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nは1または2であり、
−R10は、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11は、非置換メチルまたはエチルである、
化合物。
合成:
別段の記載がない限り、すべての反応は、アルゴン下に乾燥ガラス器具中で実施した。市販の高品位試薬および溶媒を、受領したままでそれ以上精製することなく使用した。カラムクロマトグラフィは、予め充填された「GraceResolv(商標)シリカ」カラムを固定相として使用して、Teledyne Isco.の「CombiFlash」Companionシステムで実施した。MPLC精製は、Buechiシステム(BuechiコントロールユニットC−620;2つのBuechiポンプモジュールC−605;カラム−オムニフィット(230×15mm);固定相−LiChroprep RP−select B 25−40μm;Buechi UV光度計C−635;BuechiフラクションコレクタC−660;移動相A:0.1%AcOH(ミリポアグレード);移動相B:MeCN(prepsolvグレード)で実施した。LC−MSは、ESIイオン源を介してBruker amaZon Speedイオントラップに接続されたDionex Ultimate 3000 RS HPLCで行った。LC法:化合物を20%MeCN中で約5μMに希釈し、その50μLを注入した。試料をPhenomenex Luna PFPカラム(50×2mm、3μm、100Å)上で、5.5分で10%〜100%Bの直線勾配で分離した。移動相A:0.1%HCOOH(ミリポアグレード);移動相B:MeCN(LC MSグレード)。BrukerのAvance 400(400MHz)で、プロトン核磁気共鳴(1H NMR)スペクトルおよび炭素核磁気共鳴(13C NMR)スペクトルを記録した。化学シフトは、1H NMRについてd−DMSO(δ2.50)およびCDCl3(δ7.27)に対してppmで報告する。
洗練された実験設定でのトルカポンの特異的結合剤を、はるかに大きなセットの複製試料にわたる、いわゆる示差競合実験、用量依存性CCMS実験および質量分析データの改善された分析を用いて分析した。この試験の焦点は、ヒト肝細胞株HepG2由来の全細胞溶解物に関するものであった。先に報告したように、カテコール部分はCOMT結合ポケットを標的とすると予想され、一方、トルカポンのベンジル側はタンパク質の外側に突出し、カテコール基と反対の方向を向いている。
トルカポンのHIBCHへの結合をさらに調べるために、用量依存性捕獲を実施した。5μM〜40nMの種々の濃度のCPT−220またはCPT−224および競合物質としてトルカポンまたはCPT−401(A1)を使用した用量依存性捕獲実験の結果を図5Bに示す。予想されたように、COMTタンパク質は、最高濃度のCPT−220(5μM)での弱い非特異的相互作用を除いて、活性方向の捕獲化合物でのみ再び捕獲され、両方の競合物質(トルカポンおよびCPT−401(A1))との完全な競合が観察された。HIBCHタンパク質については異なる方向で同じことが観察され、HIBCHは不活性方向のトルカポン−CC(CPT−220)では同定されなかった。対照的に、HIBCHは、活性方向のトルカポン−CC(CPT−224)のみと競合し、CPT−401(A1)とは競合しなかった。この実験における結合強度の明確な用量依存性および一貫した競合パターンは、dCCMSアッセイの妥当性をさらに強化する。
以前の公表文献において、本発明者らは、エンタカポンのタンパク質結合剤の細胞分布はミトコンドリア機能への関連性を示さないが、トルカポンのタンパク質結合剤の大部分はミトコンドリア起源、特にミトコンドリア膜であると報告した(Fischer,Toxicol Sci,2010.113(1):243−53)。細胞ベースのアッセイにおいて新規COMT阻害剤の可能性のあるミトコンドリア毒性を評価するために、Mitochondrial ToxGlo(商標)アッセイを実施し、HepG2細胞をガラクトース含有培地またはグルコース含有培地で増殖させ、細胞のATP含量の測定に基づいてミトコンドリア毒性を検出した。ATP産生の減少は、ガラクトース含有培地での増殖のみに関連し、したがって、おそらくミトコンドリア機能不全の結果である。トルカポンおよびエンタカポンに加えて、CPT−401(A1)およびCPT−212(B1)の2つの新しい小分子COMT阻害剤を分析に含めた。上記で報告したように、これらは強力なCOMT結合剤であるが、そのオフターゲットプロフィールに関して異なる。CPT−212(B1)のプロフィールはトルカポンのプロフィールに類似し、CPT−401(A1)はエンタカポンのプロフィールに類似していた。
His−S−COMT発現ベクターをOrigene(NM_007310)から購入し、HIBCHのクローニングのためにRNeasymini Kit(Qiagen)を用いてRNAをHepG2細胞から単離し、SuperScript III逆転写酵素(Invitrogen)を用いてこのRNAからcDNAを合成した。HepG2 cDNAを鋳型として使用し、以下のプライマー:5’−gatcgaattcatggggcagcgcgagatg−3’(HIBCH順方向)、5’−gatcctcgagtcaaaatttcaaatcactgcttcccaaa−3’(HIBCH逆方向)を用いてPCR反応を行い、EcoRIおよびXhoI制限部位を挿入した。以下のプライマー:5’−tgaaggtcggagtcaacggatttggt−3’(G3PDH順方向)および5’−catgtgggccatgaggtccaccac−3’(G3PDH逆方向)を用いたG3PDH PCR反応を、対照として平行して行った。PCR産物および制限産物を、peqGOLD Gel Extraction Kit(peqlab)を用いて精製した。FastDigest制限酵素およびFastDigest Green Buffer(Thermo Scientific)の存在下に、37℃で2時間、PCRフラグメントおよび標的ベクター(pET28a+、Merck Millipore)の制限を実施した。1時間40分後、CIP酵素をベクター反応に加え、37℃でさらに20分間インキュベートした。連結反応物をT4 DNAリガーゼ(Roche)を用いて16℃で一晩インキュベートした。S−COMTおよびHIBCHを含むDNA構築物500ngをコンピテントBL21大腸菌(E.coli)細胞の形質転換に使用し、組換えタンパク質の発現をIPTGによって誘導した。遠心分離(15分、4000g、4℃)によって細胞を回収した。細胞を緩衝液(COMT:50mMリン酸塩、300mM NaCl、5mM MgCl2、pH7.4、HIBCH:20mM Tris、500mM NaCl、10mMイミダゾール、0.5%(w/v)Triton X−100、pH8.0)5mlに再懸濁し、リゾチームおよびDNアーゼIで処理し、続いて超音波処理することによって破壊した。続く遠心分離からの上清(サイトゾル画分)を、その後の実験におけるタンパク質源として使用した。
COMT活性測定実験は、基本的に以前に記述されているように実施した(Kurkela,Anal Biochem,2004.331(1):198−200)。手短に述べると、エスクレチン(Sigma−Aldrich)および競合するカテコール基質をジメチルスルホキシド(DMSO)に溶解し、緩衝水溶液(100mMリン酸塩、5mM MgCl2、20mM L−システイン、pH7.4)で反応混合物100μl中2%の最終DMSO濃度に希釈した。すべての試薬を同じ緩衝液に溶解した。各試料について、阻害剤およびエスクレチン溶液を、黒色丸底96ウェルプレートに3組重複してピペットで分注した。阻害剤またはAdoMetを含まない対照を各マイクロプレートに含めた。プレートを氷上に置き、酵素を含むサイトゾル画分を15μg/mlの最終タンパク質濃度になるように添加した。マイクロプレートを37℃に置くことによって5分間のプレインキュベーションを開始し、10μMの最終濃度になるように37℃でAdoMetを添加することによって反応を開始させた。CARY Eclipse蛍光分光光度計を用いて反応の開始時および60分目に蛍光を測定した。励起波長および発光波長は、それぞれ355nmおよび460nmであった。酵素活性は、60分目の蛍光からアッセイの開始時の蛍光を差し引くことによって評価し、GraphPad Prismを用いて阻害曲線を作成した。
AdoMet 5μM(Sigma−Aldrich)、5×捕獲緩衝液(caprotec bioanalytics GmbH)20μlを補充した、HepG2溶解物500μg(InVivo,Germany)またはヒト組換えCOMT 1μgまたはヒト組換えHIBCHタンパク質1μgを用いて捕獲実験を実施し、総容量100μlで4℃にて30分間、DMSOまたは競合物質50μMと共にインキュベートした。捕獲化合物と共に4℃で1時間インキュベートした後、caproBox(Caprotec Bioanalytics GmbH)を用いて試料に10分間照射した。続いて、各々の反応に5×洗浄緩衝液(WB,caprotec bioanalytics GmbH,Berlin,Germany)25μLを添加することによって緩衝液条件を調整した。次いで、試料をDynabeads MyOne Streptavidin C1(Invitrogen,Karlsruhe,Germany)50μLと共に回転ホイール上で4℃にて1時間インキュベートした。次いで、磁気ビーズ(caprotec bioanalytics GmbH,Berlin,Germany)を使用する場合に生体分子の便利で効率的な単離のための装置であるcaproMagを使用して、CC−タンパク質コンジュゲートを含むビーズを収集し、1×WB 200μLで最初に6回洗浄し、次にMSグレードの水で洗浄した。このビーズを、SDS−PAGEまたはタンパク質消化とそれに続くLC−MSによるさらなる分析まで、脱イオン水中に4℃で保存した。
タンパク質捕獲後、ストレプトアビジン磁気ビーズをLC−MSグレードの水(Fluka,St.Louis,MO,USA)200μLで2回洗浄した。トリプシン消化のために、ストレプトアビジン磁気ビーズに結合したタンパク質を、50mM重炭酸アンモニウム9μLおよびトリプシン1μL(0.5μg/μL)(Roche,Germany)と共に温度制御されたシェーカーで37℃にて16時間インキュベートした。上清を取り出し、miVac DNA真空遠心機(Genevac、UK)で蒸発乾固させ、質量分析に直接使用した。トリプシン消化物を、Proxeonナノエレクトロスプレーイオン源(Thermo Fisher Scientific,Germany)を介してLTQ−Orbitrap Velos装置(Thermo Fisher Scientific,Germany)に接続されたUltiMate 3000 RSLCnanoシステムで、オンラインナノリットル液体クロマトグラフィタンデム質量分析(nl LC−MS/MS)によって分析した。クロマトグラフィ分離のために、試料を最初に逆相(RP)プレカラム(Acclaim PepMap100)に充填し、RP分析カラム(Acclaim PepMap RSLC C18,Dionex,Thermo Fisher Scientific,Germany)で分離した。質量分析をデータ依存モードで実施し、その後の衝突誘起解離(CID)フラグメンテーションでのフルスキャンのためにOrbitrap−MSとLTQ−MS/MS取得の間で自動切り替えを可能にした。OrbitrapアナライザでフルスキャンMSスペクトル(m/z 300〜2000)を取得した。20個の最も強いイオンを連続的に単離し、CIDを用いて線形イオントラップでフラグメント化した。
化合物トルカポン、エンタカポン、CPT−401(A1)およびCPT−212(B1)のミトコンドリア毒性評価(Glu/Gal)はPharmacelcus GmbHによって実施された。簡単に述べると、グルコース培地(22mMグルコース、1mMピルビン酸ナトリウム、5mM Hepes、2mM L−グルタミン、10%FCSおよび1%ペニシリン/ストレプトマイシンを含む高グルコースDMEM)またはガラクトース培地(10mMガラクトース、1mMピルビン酸ナトリウム、5mM Hepes、2mM L−グルタミン、10%FCSおよび1%ペニシリン/ストレプトマイシンを含む高グルコースDMEM)で培養したHepG2細胞を96ウェルプレートに添加した(100μL、4×104細胞/ウェル)。薬剤処理のために、DMSO中で化合物原液を調製し、ウェルに添加して、示されている最終薬剤濃度を得た。発光ATP検出試薬の添加後の各ウェルの最終DMSO濃度は0.5%であった。合計100μLの発光ATPlite(PerkinElmer)検出試薬を各ウェルに添加した。プレートシェーカー上で簡単に混合した後、反応物を室温で2分間インキュベートし、2分後にVictor X5プレートリーダーを用いて発光を測定した。
TMREミトコンドリア膜電位アッセイのために、HepG2細胞を種々の濃度の4つのCOMT阻害剤で処理した。相対的な負電荷のために活性ミトコンドリアに容易に蓄積する、細胞透過性の正に荷電した赤橙色の色素であるTMRE(テトラメチルローダミンエチルエステル)を使用して、活性ミトコンドリアを標識した。4つのCOMT阻害剤間でミトコンドリア膜電位状態の有意差が観察された(図9)。50μMの濃度で、化合物トルカポンおよびCPT212は、膜電位を未処理HepG2細胞の20〜30%未満に抑制したが、化合物エンタカポンまたはCPT401を用いると、まだ50%を超える膜電位が観察された。100μMの濃度のCPT212およびトルカポンは、膜電位を対照の0〜5%に低下させたが、CPT401およびエンタカポンについては、この濃度で膜電位の40〜50%が残存した。データは、10〜100μMの濃度でのミトコンドリア膜電位に関して、エンタカポンとCPT401との間、およびトルカポンとCPT212との間の密接な類似性を明らかにする。ミトコンドリア膜電位(MMP)は、活性ミトコンドリアに容易に蓄積する、正に荷電した蛍光色素TMREを用いて測定した。酸化的リン酸化のイオノホア脱共役剤であるFCCPを陽性対照として用いた。HepG2細胞をμClear有底黒色96ウェルプレート(約4×104細胞/ウェル)に播種した。集密に達した後、細胞を個々の規定最終濃度の4つのCOMT阻害剤(トルカポン、エンタカポン、CPT401または3)で、37℃および5%CO2で一晩処理した。培養培地を除去し、新鮮培地と交換し、TMREを200nMの最終濃度で培地に添加し、細胞を37℃および5%CO2で30分間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を、0.2%BSAを含むPBSで洗浄し、それぞれ549nmおよび575nmの励起フィルタおよび発光フィルタを備えたCary Eclipse蛍光マイクロプレートリーダーを用いて蛍光強度を測定した。
使用されているすべてのソフトウェアツールは、SYBYLx1.2パッケージ(Tripos Inc.St.Louis,MO)に含まれている。分子構造の調製のために、ケルセチン(QUE)および(2R)−3−ヒドロキシ−2−メチルプロパン酸(HIU)との複合体におけるヒトβ−ヒドロキシイソブチリルCoA加水分解酵素(HIBCH_HUMAN)の原子座標をPDBファイル3BUTから入手した。構造を、Prepare Proteinツールを使用して前処理し、MMFF力場、MMFF電荷およびPowell勾配アルゴリズム(rmsd 0.5)を用いて最小化した。最小化の間、すべての重原子を凍結した。QUEを除去して触媒部位にアクセスした。配位子構造は、Ligand Toolを用いて2Dスケッチ(ChemDraw)から得た:構造を標準化し、互変異性体を生成した(荷電原子の数=4)。カテコールジアニオンを部分構造SMARTSフィルタ(O[−1]C:CO[−1])で除去し、Concord Standaloneを用いて互変異性体当り1つの3D構造を生成した。カテコールおよびニトロ基上の原子タイプは以下のように設定した:SPLスクリプトを使用して、O− −>O.co2;N−>N.pl3。得られた構造を、デフォルト設定(Tripos FF、rmsd=0.05)およびGasteiger−Marsiliの電荷を使用して最小化した。HIBCHと、推定阻害剤であるトルカポン、エンタカポン、CPT−212(B1)およびCPT−401(A1)との間の無制限のフレキシブルドッキングをSurflex−Dockで実施した。共結晶生成物HIUを抽出し、HIUに基づいてプロトモルを生成した。タンパク質の柔軟性(水素および重原子)を許容し、10個の開始立体配座を生成した。それ以外は、デフォルト設定を使用した。ドッキングスコア、カテコール位置およびタンパク質に関して、100ポーズをサンプリングし、検討した。トルカポンの最良ドッキングポーズをカテコールフラグメントの基礎として使用した。弱く制限されたフラグメント配置(cpen=10)を用いてドッキングを繰り返した。
CAN、硝酸第二セリウムアンモニウム;CC、捕獲化合物;CCMS、捕獲化合物質量分析法;dCCMS、示差競合捕獲化合物質量分析法;DCM、ジクロロメタン;DIPEA、N,N−ジイソプロピルエチルアミン;DMF、N,N−ジメチルホルムアミド;DMSO、ジメチルスルホキシド;HATU、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート;TEA、トリエチルアミン;THF、テトラヒドロフラン。
Claims (15)
- 一般式(A)、
(A)、
[式中、
−R1は、−OH、−SHおよび−NH2から選択され;
−R2は、−NO2、−SO3H、−SO2−OR11、−SO2−NH2、−SO2−NHR11、−SO2−NR11 2、−PO3H、−PO2−OR11、−CN、−COR11、−CO2R11、−CONHR11、−CONR11 2、−CF3およびハロゲンから選択され;
−R3は、H、−NO2、−SO3H、−SO2−OR11、−SO2−NH2、−SO2−NHR11、−SO2−NR11 2、−PO3H、−PO2−OR11、−CN、−COR11、−CO2R11、−CONHR11、−CONR11 2、−CF3およびハロゲンから選択され;
−R4およびR5は、−H、置換C1−C6アルキル、非置換C1−C6アルキル、置換または非置換C2−C6アルケニル、置換または非置換C3−C6シクロアルキル、ハロゲン、−CNおよび−NO2から独立して選択され;
‐R6およびR7の一方は、−CONR9R11、−CONR9 2、−COR9、−COOR9、−SO2−OH、−SO2R9、−SO2−OR9、−SO2−OR11、−SO2NHR11、−SO2NR9R11、−NO2、−CN、−CF3および−SO2NR9 2から選択され;
‐R6およびR7の他方は、H、−CONH2、COOH、−SO2−OH、−SO2NH2、−Y−R9、−Y−R9 2および−R9から選択され、
ここで、
−R9はR10−(Y−R10)nであり;
−Yは、−CONR11−、−CO−、−COO−、−SO3−、−SO2NH−、−NR11−、−O−、−NR11CO−、−OCO−、−NR11COO−、−NR11CONR11−、−OCONR11−および−OCOO−から選択され;
−nは、0、1、2、3および4から選択される整数であり、
‐それぞれのR10は、他のR10とは独立して、置換または非置換C1−C8アルキル、置換または非置換C2−C8アルケニル、置換または非置換C2−C8アルキニル、置換または非置換C3−C10シクロアルキルおよび置換または非置換5〜10員アリールまたはヘテロアリールから選択され;ならびに
−それぞれのR11は、他のR11とは独立して、Hまたは非置換C1−C6アルキルである]
によって特徴付けられる化合物。 - R7が、−CONR11R9、−CONR9 2、−COR9、−COOR9、−SO2−OH、−SO2R9、−SO2−OR11、−SO2NH2、−SO2−NHR11、−SO2NR11R9および−SO2NR9 2から選択され、R9が上記で定義したのと同じ意味を有する、請求項1に記載の化合物。
- −R1が−OHであり、
−R2が−NO2であり、R3がHであり、
−R4およびR5がHであり、
−R6が、H、−CONH2および−CONR9 2から選択され、
−R7が、−CONR9 2および−CONR11R9から選択され、
R9およびR11が上記で定義したのと同じ意味を有する、
請求項1または2のいずれか一項に記載の化合物。 - nが0である、請求項1から3のいずれか一項に記載の化合物。
- nが1である、請求項1から4のいずれか一項に記載の化合物。
- nが2である、請求項1から5のいずれか一項に記載の化合物。
- R6が−CONR11R11であり、R7が−CONR9R11であり、ここで、
−それぞれのR11が、他のR11とは独立して、Hまたは非置換C1−C4アルキルであり、および
−R9が上記で定義したのと同じ意味を有する、
請求項1から6のいずれか一項に記載の化合物。 - R6およびR7が−CONR9R11であり、ならびにここで、
−R9がR11−(Y−R10)nであり、
−Yが、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nが1または2であり、
−R10が、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、および
−R11が、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである、
請求項1から7のいずれか一項に記載の化合物。 - R6が−CONR11 2であり、R7が−CONR9R11であり、ここで、
−R9がR11−(Y−R10)nであり、
−Yが、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nが1または2であり、
−R10が、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、ならびに
−R11が、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである、
請求項1から8のいずれか一項に記載の化合物。 - R6がHであり、R7が−CONR9R11であり、ここで、
−R9がR11−(Y−R10)nであり、
−Yが、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nが1または2であり、
−R10が、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、ならびに
−R11が、非置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルである、
請求項1から9のいずれか一項に記載の化合物。 - R7が−CONR9R11であり、ここで、
−R9が(CH2)4−(Y−R10)nであり、
−Yが、−CONR11−、−NR11CO−、−NR11COO−および−NR11CONR11−から選択され、
−nが1または2であり、
−R10が、非置換または一置換C1−、C2−、C3−またはC4アルキルであり、
−R11が、非置換メチルまたはエチルである、
請求項1から10のいずれか一項に記載の化合物。 - 以下の式:
・N2,N2,N3,N3−テトラエチル−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A1)、
・(3−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]プロピルアセタート)(A2)、
・N2−(6−アミノヘキシル)−N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A4)、
・N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−N2−[4−[メチル(ペンタノイル)アミノ]ブチル]−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A5)、
・tert−ブチルN−[6−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]ヘキシル]カルバマート(A6)、
・4−[4−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]ブチル−メチル−アミノ]−4−オキソ−ブタン酸(A8)、
・N2−[4−[4−アミノブタノイル(メチル)アミノ]ブチル]−N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2,3−ジカルボキサミド(A9)、
・tert−ブチルN−[4−[4−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]ブチル−メチル−アミノ]−4−オキソ−ブチル]カルバマート(A10)、
・N2,N3,N3−トリエチル−6,7−ジヒドロキシ−N2−[4−[[6−(2−メトキシフェニル)−6−オキソ−ヘキサノイル]−メチル−アミノ]ブチル]−5−ニトロ−ナフタレン‐2,3−ジカルボキサミド(A11)および
・tert−ブチルN−[1−シクロヘキシル−2−[4−[[3−(ジエチルカルバモイル)−6,7−ジヒドロキシ−5−ニトロ−ナフタレン−2−カルボニル]−エチル−アミノ]ブチル−メチル−アミノ]−2−オキソ−エチル]カルバマート(A13)
から選択される化合物。 - 薬剤として使用するための、請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物。
- パーキンソン病、アルツハイマー病、多剤耐性結核および肥満関連障害を含む群から選択される状態の予防または治療において使用する薬剤としての使用のための、請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物。
- パーキンソン病、アルツハイマー病、多剤耐性結核および肥満関連障害を含む群から選択される状態の予防または治療に使用するための、請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物を含有する剤形であって、吸入または経口投与に適しており、特に錠剤、カプセル、ロゼンジ、粉末、溶液、懸濁液またはシロップである、剤形。
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