JP2019027980A - 生体試料分析装置、及び方法 - Google Patents
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Abstract
本発明は、環境振動により塩基配列解読精度低下するという課題を解決した生体試料分析装置、及び方法を提供する。
【解決手段】
測定対象物が通過するナノメートルサイズのナノポアを有するナノポア基板である仕切り体101と、ナノポア基板により内部が区切られ、電解質溶液で満たされた槽102A、102Bと、ナノポア基板に対向して位置し、DNAが固定されるDNA固定基板108と、DNA固定基板を駆動する駆動機構109と、ナノポア基板の両側に電圧を印加する電極104と、DNAの塩基配列をDNAがナノポア基板へ通過する際のイオン電流により検出する電流計105Aと、分析装置の振動を検知する加速度計501と、PC503を備え、PC503は検知した振動情報を記録する記録部と、振動検知に対応する電流値を削除したり、補正したりする警報部504を構成する。
【選択図】図5
Description
100A 生体試料分析装置一部拡大図
101:ナノポアデバイスが形成される仕切り体
102A、102B 槽
103 電解質溶液
104 電極
105A 電源
105B 電流計
106 フローセル
107 プローブ
108 DNA固定基板
109 駆動機構
110 フローセル開口部
111 DNA
112 ナノポア
113 ナノポア薄膜
200 配列読取例
301 DNA111の拡大図
302 電流波形(振動無し)
401 床振動
402 音響振動
403、1000 電流波形(振動有り)
501 加速度計
502 A/Cコンバータ
503 PC
504 警報部
600 配列読取例
801 アクティブ除振台
802 定盤
803 バネ
804 アクチュエータ
805、901 センサ
902 変位計
903 伝達関数
1001 ナノポアデバイスの拡大図
1100 生体試料分析方法
1101 マルチナノポア基板
1102 未知DNA
1103 既知DNA
Claims (15)
- DNAの塩基配列を分析する生体分析装置の生体分析装置であって、
測定対象物が通過するナノメートルサイズの穴を有するナノポア基板と、
前記ナノポア基板により内部が区切られ、電解質溶液で満たされる槽と、
前記ナノポア基板に対向して位置し、前記DNAが固定されるDNA固定基板と、
前記DNA固定基板を駆動する駆動機構と、
前記ナノポア基板の両側に電圧を印加する電圧印加部と、
前記DNAが前記ナノポア基板を通過する際のイオン電流を検出する検出部と、
前記生体分析装置の振動を検知する振動検知部と、
前記振動検知部によって検知した振動情報を記録する記録部と、を備える、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項1に記載の生体試料分析装置であって、
前記振動検知部により振動を検知した場合に警報を発する警報部を備え、
前記警報部は、警報を発している際に検出した前記イオン電流を塩基配列解読に使用しないよう制御する、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項2に記載の生体試料分析装置であって、
前記警報部は、警報を発している間は、前記駆動機構による前記DNA固定基板の駆動を停止するよう制御する、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項3に記載の生体試料分析装置であって、
前記警報部は、前記振動検知部により振動の収まりを検出した場合に、前記駆動機構による前記DNA固定基板の駆動を再開し、前記検出部により前記イオン電流を検出するよう制御する、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項2に記載の生体試料分析装置であって、
前記警報部は、前記振動検知部により振動を検知した場合に、前記振動情報を伝達関数により前記駆動機構へフィードバック制御し、前記DNAの振動を抑制するよう前記DNA固定基板を駆動する、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項2に記載の生体試料分析装置であって、
前記警報部は、前記振動検知部により振動を検知し、かつ前記DNAの配列順序の反転を検知した場合に、前記検出部により検出した前記イオン電流を補正する、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項2に記載の生体試料分析装置であって、
前記ナノポア基板は、前記ナノメートルサイズの穴を複数備えており、
前記DNA固定基板は、未知配列のDNAと既知配列のDNAとが固定され、
前記警報部は、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - 請求項2に記載の生体試料分析装置であって、
前記振動検知部は、前記既知配列のDNAに対する前記イオン電流を用いて振動を検知する、
ことを特徴とする生体試料分析装置。 - DNAの塩基配列を分析する生体分析装置の生体分析方法であって、
前記生体分析装置は、測定対象物が通過するナノメートルサイズの穴を有し、両側に電圧が印加されるナノポア基板により内部が区切られ、電解質溶液で満たされる槽と、前記ナノポア基板に対向して位置し、前記DNAが固定されるDNA固定基板と、前記DNA固定基板を駆動させる駆動機構と、前記DNAが前記ナノポア基板を通過する際のイオン電流を検出する検出部と、前記生体分析装置の振動情報を検知する振動検知部と、を備えており、
検出した前記イオン電流と、検知した前記振動情報を用いて前記塩基配列の分析を行う、
ことを特徴とする生体試料分析方法。 - 請求項9に記載の生体試料分析方法であって、
前記振動情報を検知した場合に警報を発し、前記警報を発している際に検出した前記イオン電流を塩基配列解読に使用しない、
ことを特徴とする生体試料分析方法。 - 請求項10に記載の生体試料分析方法であって、
前記警報を発している間は、前記駆動機構による前記DNA固定基板の駆動を停止する、
ことを特徴とする生体試料分析方法。 - 請求項11に記載の生体試料分析方法であって、
前記振動情報により、振動の収まりを検出したら、前記駆動機構による前記DNA固定基板の駆動を再開し、前記イオン電流を検出する、
ことを特徴とする生体試料分析方法。 - 請求項12に記載の生体試料分析方法であって、
前記振動情報を検知し、かつ前記DNAの配列順序の反転を検知した場合に、前記検出部により検出した前記イオン電流を補正する、
ことを特徴とする生体試料分析方法。 - 請求項9に記載の生体試料分析方法であって、
前記ナノポア基板は、前記ナノメートルサイズの穴を複数備えており、
前記DNA固定基板は、未知配列と既知配列のDNAとが固定される、
ことを特徴とする生体試料分析方法。 - 請求項14に記載の生体試料分析方法であって、
前記振動検知部は、前記既知配列のDNAに対する前記イオン電流を用いて振動を検知する、
ことを特徴とする生体試料分析方法。
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