JP2018532116A5

JP2018532116A5 -

Info

Publication number: JP2018532116A5
Application number: JP2018520515A
Authority: JP
Filing date: 2016-10-28
Publication date: 2019-04-11
Anticipated expiration: 2036-10-28

Claims

細胞試料の品質状態を評価する自動化法であって：
（ａ）細胞試料の中赤外分光（ＭＩＲ）スペクトル（２２０）（試験スペクトル）において、品質シグネチャー（２２１）を同定し；そして
（ｂ）分類（２１１）または定量化（２３１）アルゴリズムを試験スペクトル中の品質シグネチャーに適用して、細胞試料の品質状態を決定する、ここで該細胞試料が固定細胞試料であり、該品質状態が固定状態であり、そして該品質シグネチャーが固定シグネチャーである
工程を含む、前記方法。
試験スペクトル中の固定シグネチャーと、少なくとも１つの参照ＭＩＲスペクトル（参照スペクトル）中の固定シグネチャーの間に、相違が存在するかどうかを決定することによって、該試験スペクトル中の固定シグネチャーを固定組織試料の固定状態と相関させる、請求項１の方法。
前記少なくとも１つの参照スペクトルが、許容可能に固定された組織試料と相関する、請求項２の方法。
固定シグネチャーにおける前記相違が、二次微分スペクトルにおける１６１５ｃｍ^−１〜１６４０ｃｍ^−１の間の振幅および／またはピーク位の変化である、請求項２または請求項３の方法。
多変数評価法において、固定シグネチャーにおける相違が、１６１５ｃｍ^−１〜１６４０ｃｍ^−１の間のスペクトルシフトまたは振幅変化に基づく、請求項２または請求項３の方法。
前記固定組織試料が、架橋固定剤で固定されている、請求項４または請求項５の方法。
前記試験スペクトルが、量子カスケードレーザー（ＱＣＬ）に基づく顕微鏡によって得られる、前述の請求項のいずれかの方法。
前記試験スペクトル（２２０）が３０分またはそれ未満で得られる、請求項７の方法。
前記試験スペクトルが、ワックス包埋細胞試料から、脱ワックス前または脱ワックス後に得られる、請求項７または８の方法。
前記試料が低温凍結試料であり、そして試験スペクトルが融解前または後のいずれかに得られる、請求項７または８の方法。
前記品質状態を、細胞試料の１またはそれより多い視野内の複数の位置で評価する、請求項１〜１０のいずれかの方法。
（ｃ）細胞試料の１またはそれより多い視野内の複数の位置各々で評価した品質状態を、視野のデジタル画像にマッピングする
工程をさらに含む、請求項１１の方法。
（ｄ）あらかじめ定義した品質状態を満足する視野の総面積を自動的に計算する
工程をさらに含む、請求項１１または１２の方法。
前述の請求項のいずれかの方法であって：
前記固定状態は過少固定、過剰固定、または許容可能固定に分類され、該方法は以下：
（ｃ）該試料が過剰固定または過少固定と決定された場合、１またはそれより多い是正組織プロセスを実行し、そして許容可能に固定された組織試料が得られるまで、（ａ）〜（ｃ）を反復し、ここで該是正組織プロセスは：
（ｃ１）過少固定組織試料のさらなる固定；または
（ｃ２）過剰組織試料の拒絶および新規試料の獲得
を含む；そして
（ｄ）許容可能に固定された組織試料に対する標識プロセスを実行する
の工程を含む、前記方法。
細胞試料品質の自動化分析のためのシステム（１００）であって、プロセッサ（２００）およびメモリを含み、メモリが解釈可能な命令を含み、該命令が、プロセッサによって実行された際、プロセッサに：
（ａ）特徴抽出機能（２１０）を実行して、細胞試料の中赤外分光（ＭＩＲ）スペクトル（２２０）（試験スペクトル）から、品質シグネチャーの特徴（２２１）を抽出し；そして
（ｂ）分類子機能を実行して、前記試験スペクトルから抽出された品質シグネチャーの特徴に、分類（２１１）または定量化（２３１）アルゴリズムを適用する、ここで該分類または定量化アルゴリズムは、品質シグネチャーが細胞試料の複数のあらかじめ定義された品質状態の１つの指標となる可能性の指標となる、信頼スコアを計算する、ここで該細胞試料が固定細胞試料であり、該品質状態が固定状態であり、そして該品質シグネチャーが固定シグネチャーである、
工程を含む方法を実行させる、前記システム。