JP2018054537A - 卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための情報提供方法 - Google Patents
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Abstract
Description
しかし今日まで、TFPI2と卵巣明細胞癌罹患者の予後との関連は不明であった。
[1]卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための情報を提供する方法であって、
前記患者由来の検体中のTFPI2量を測定すること、及び
前記TFPI2量の測定値と前記患者の予後との関連付けをすること、を含む方法。
[2]前記関連付けにおいて、前記TFPI2量の測定値が、予め設定した基準値を超えた場合に、当該患者に予後不良の可能性があると関連付ける、[1]に記載の方法。
[3]前記TFPI2量が、TFPI2プロセシングポリペプチド量及びインタクトTFPI2量の合計である、[1]又は[2]に記載の方法。
[4]前記TFPI2量の測定が、配列番号1のアミノ酸配列の23残基目のアスパラギン酸から131残基目のヒスチジン又は130残基目のシステインまでの領域内の抗原決定基に結合する抗体を用いた抗原抗体反応により行われるものである、[1]〜[3]のいずれかに記載の方法。
[5]前記抗体が、TFPI2のクニッツドメイン1を認識する抗体である、[4]に記載の方法。
[6]質量分析法を用いて測定を行う、[1]〜[3]のいずれかに記載の方法。
[7]配列番号1に示すアミノ酸配列の23残基目のアスパラギン酸から131残基目のヒスチジン又は130残基目のシステインまでの領域内の抗原決定基に結合する抗体を含む、卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための試薬。
制を整えることが可能となる等、明細胞癌のより的確な管理ができるようになると期待できる。
本発明の卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための情報を提供する方法は、前記患者由来の検体中のTFPI2量を測定すること、及び前記TFPI2量の測定値と前記患者の予後との関連付けをすること、を含む。
これは、TFPI2量と卵巣明細胞癌患者の予後との間に相関関係があることに基づく方法である。
本発明の方法により、後述する実施例が示すように、従来知られた腫瘍マーカーであるCA125を測定した場合に比べて、卵巣明細胞癌患者の予後をより的確に予測するための情報が提供される。医師は、提供された情報等を参照して、卵巣明細胞癌患者の予後を予測する。すなわち、本発明の方法自体は、予後の予測に関する最終的な判断行為は含まず、医師に判断材料を提供する段階までを含む。
なお、本明細書において「予後」とは、例えば患者の今後の生存期間(日数)、生存率や、生存/死亡の見通しの鑑別などをいう。
「インタクトTFPI2」とは、配列番号1のアミノ酸配列の23残基目から235残基目で表されるペプチドをいう。
また、「NT−TFPI2」は、特許文献3に記載されるように、インタクトTFPI2のN末端側に位置するクニッツドメイン1を含むペプチド断片をいう。より具体的には、NT−TFPI2は、配列番号1のアミノ酸配列の23残基目のアスパラギン酸から131残基目のヒスチジン又は130残基目のシステインまでの配列を少なくとも含むペプチド、または、前記配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むペプチドである。前記同一性は、好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上である。また、このポリペプチドは、前記配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入、及び/又は付加されたアミノ酸配列からなるポリペプチドであってもよい。なお、数個とは、好
ましくは2〜20個、より好ましくは2〜10個、さらに好ましくは2〜5個をいう。また、前記配列の両側に他のペプチドフラグメントを有していてもよいが、TFPI2のクニッツドメイン3を認識する抗体の抗原決定基を有しないことが好ましい。
判定に用いる基準値は、測定値もしくは換算濃度値のいずれでもよい。なお、換算濃度値は、TFPI2を標準試料として作成された検量線に基づいて測定値から換算される値をいう。
本発明において、検体中のNT−TFPI2量又はインタクトTFPI2量を個別に測定してもよく、またその値を合計して合計量としてもよい。また、検体中のNT−TFPI2とインタクトTFPI2の合計量を1度に測定できる測定系で測定してもよい。あるいは、後述するように、両方の測定による合計量とインタクトTFPI2単独の測定量とから間接的にNT−TFPI2量を測定してもよい。
本発明の方法において、NT−TFPI2量及び/又はインタクトTFPI2量を測定する方法は特に制限されない。例えば、NT−TFPI2及び/又はインタクトTFPI2を認識する抗体を用いる抗原抗体反応を利用した方法や、質量分析法を利用した方法が例示できる。
(a)標識した測定対象及び測定対象を認識する抗体を用い、標識した測定対象及び検体に含まれる測定対象が、前記抗体に競合的に結合することを利用した競合法。
(b)測定対象を認識する抗体を固定化したチップに検体を接触させ、当該抗体と測定対象との結合に依存したシグナルを検出する表面プラズモン共鳴を用いた方法。
(c)蛍光標識した測定対象を認識する抗体を用い、当該抗体と測定対象とが結合することで蛍光偏光度が上昇することを利用した蛍光偏光免疫測定法。
(d)エピトープの異なる2種類の、測定対象を認識する抗体(うち1つは標識した抗体)を用い、当該2つの抗体と測定対象との3者の複合体を形成させるサンドイッチ法。
(e)前処理として測定対象を認識する抗体により検体中の測定対象を濃縮後、その結合タンパクのポリペプチドを質量分析装置等により検出する方法。
(d)、(e)の方法が簡便かつ汎用性が高いが、多検体を処理する上では(d)の方法が試薬及び装置に関する技術が十分確立されている点でより好ましい。
(A)NT−TFPI2とインタクトTFPI2の両方を認識する抗体を用いて、NT−TFPI2及びインタクトTFPI2の合計量を測定する方法(NT+I−TFPI2測定系)。なお、前記NT−TFPI2とインタクトTFPI2の両方を認識する抗体は、配列番号1で表されるアミノ酸配列の23残基目のアスパラギン酸から131残基目のヒスチジン又は130残基目のシステインまでの領域内の抗原決定基に結合する抗体であることが好ましく、TFPI2のクニッツドメイン1に抗原認識部位を有する抗体であることがさらに好ましい。また、この方法で前述したサンドイッチ法を用いる場合は、通常、前記抗体はエピトープの異なる2種類を用いる。
(D)インタクトTFPI2を認識せずNT−TFPI2を認識する抗体を用いて、NT−TFPI2単独の量を測定する方法。なお、前記インタクトTFPI2を認識せずNT−TFPI2を認識する抗体は、例えば、NT−TFPI2のC末端部分のペプチド配列を特異的に認識する抗体が挙げられる。前述したサンドイッチ法を用いる場合は、例えば、当該抗体を固相抗体とし、クニッツドメイン1に認識部位を有する抗体を検出抗体とする。
2ポリペプチド又はインタクトTFPI2タンパク質そのもの、NT−TFPI2ポリペプチド又はインタクトTFPI2タンパク質の部分領域からなるオリゴペプチド、NT−TFPI2ポリペプチド又はインタクトTFPI2タンパク質のインタクトまたは部分領域をコードするポリヌクレオチドなどを免疫原として、動物に免疫することで得ることができる。
免疫に用いる動物は、抗体産生能を有するものであれば特に限定はなく、マウス、ラット、ウサギなど通常免疫に用いる哺乳動物でもよいし、ニワトリなど鳥類を用いてもよい。
NT−TFPI2及び/又はインタクトTFPI2を認識する抗体を産生するハイブリドーマ細胞の樹立は、技術が確立された方法の中から適宜選択して行えばよい。一例として、前述した方法で免疫した動物からB細胞を採取し、前記B細胞とミエローマ細胞とを電気的にまたはポリエチレングリコール存在下で融合させ、HAT培地により所望の抗体を産生するハイブリドーマ細胞の選択を行ない、選択したハイブリドーマ細胞を限界希釈法によりモノクローン化を行なうことで、NT−TFPI2及び/又はインタクトTFPI2を認識するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞を樹立することができる。
なお、前記宿主としては特に限定はなく、当業者がタンパク質の発現に通常用いる、大腸菌や酵母などの微生物細胞、昆虫細胞、動物細胞の中から適宜選択すればよいが、ジスルフィド結合もしくは糖鎖付加といった翻訳後修飾により、天然型のNT−TFPI2及び/又はインタクトTFPI2に近い構造を有するタンパク質の発現が可能な、哺乳細胞を宿主として用いると好ましい。哺乳細胞の一例としては、従来用いられている、ヒト胎児腎臓由来細胞(HEK)293T細胞株、サル腎臓細胞COS7株、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞またはヒトから単離された癌細胞などが挙げられる。
検体が血液である場合は、前処理工程として血液に多く含まれるアルブミン、イムノグロブリン、トランスフェリン等の主要タンパク質をAgilent Human 14等で除去した後、イオン交換、ゲル濾過または逆相HPLC等でさらに分画することが好ましい。または、抗TFPI2抗体を用いた免疫的手法によりTFPI2のみを特異的に回収することも可能である。
本発明の卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための試薬は、配列番号1で表されるアミノ酸配列TFPI2の23残基目のアミノ酸から131残基目又は130残基目のアミノ酸までの領域内の抗原決定基に結合する抗体を含む。前記抗体は好ましくは、TFPI2のクニッツドメイン1を認識する抗体である。これらの抗体はNT−TFPI2及びインタクトTFPI2の両方を認識することができる。
本発明の試薬に含まれる抗体は、抗体そのものであってもよく、標識されていてもよく、固相に固定化されていてもよい。
まず、本発明の試薬は、以下の(I)から(III)に示す方法で作製することができる。
(I)まず、サンドイッチ法で用いる、NT−TFPI2及びインタクトTFPI2を認識する、エピトープの異なる2種類の抗体(以下、「抗体1」及び「抗体2」とする)のうち、抗体1をイムノプレートや磁性粒子等のB/F(Bound/Free)分離可能な担体に結合させる。結合方法は、疎水結合を利用した物理的結合であってもよいし、2物質間を架橋可能なリンカー試薬などを用いた化学的結合であってもよい。
(II)担体に前記抗体1を結合させた後、非特異的結合を避けるため、担体表面を牛血清アルブミン、スキムミルク、市販のイムノアッセイ用ブロッキング剤などでブロッキング処理を行ない1次試薬とする。
(III)他方の抗体2を標識し、得られた標識抗体を含む溶液を2次試薬として準備する。抗体2に標識する物質としては、ペルオキシダーゼ、アルカリ性ホスファターゼといった酵素、蛍光物質、化学発光物質、ラジオアイソトープなどの検出装置で検出可能な物質、又はビオチンに対するアビジンなど特異的に結合する相手が存在する物質等が好ましい。また、2次試薬の溶液としては、抗原抗体反応が良好に行える緩衝液、例えばリン酸緩衝液、Tris−HCl緩衝液などが好ましい。このようにして作製した本発明の試薬は必要に応じ凍結乾燥させてもよい。
次に、前述した方法で得られた試薬を用いて、2ステップサンドイッチ法でNT−TFPI2及びインタクトTFPI2を検出し測定するには、以下の(IV)から(VI)に示す方法で行なえばよい。
(IV)(II)で作製した1次試薬と検体とを一定時間、一定温度のもと接触させる。反応条件は、温度4℃から40℃の範囲で、5分から180分間反応させればよい。
(V)未反応物質をB/F分離により除去し、続いて(III)で作製した2次試薬と一定時間、一定温度のもと接触させ、サンドイッチ複合体を形成させる。反応条件は、温度4℃から40℃の範囲で、5分から180分間反応させればよい。
(VI)未反応物質をB/F分離により除去し、標識抗体の標識物質を定量し、既知濃度のTFPI2溶液を標準とし作成した検量線により、検体中のヒトNT−TFPI2及びインタクトTFPI2を定量する。
<実施例1> DNA免疫用のTFPI2発現プラスミドの構築
特許文献2の方法に従い、DNA免疫用のTFPI2発現プラスミドを構築した。
(1)下記(a)のプライマーを用いて、TFPI2 cDNA(GenBank No.NM_006528)の73から705塩基からなるポリヌクレオチドを、常法に従いRT−PCR法により増幅した。
(a)GPIアンカー型TFPI2発現プラスミド用プライマー
Forward:
5’−cgatgacgacaagcttgctcaggagccaaca−3’(配列番号2、3’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の73か
ら87番目の塩基配列に相当)
Reverse:
5’−catcagtggtgaattcaaattgcttcttccg−3’(配列番号3、5’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の691から705番目の塩基配列に相当)
特許文献2の方法に従い、TFPI2発現プラスミドをマウスおよびラットに免疫した。GPIアンカー型TFPI2発現CHO−K1細胞を用いた細胞酵素免疫測定法(CELISA)、並びに、分泌型TFPI2溶液を用いたELISAによりTFPI2特異的な抗体価の上昇を確認した。
特許文献2の方法に従い、TFPI2に対する抗体を産生するハイブリドーマを樹立した。各抗体の抗原認識部位を、TFPI2の各クニッツドメインであるKD1、KD2及びKD3のバリアント発現細胞により同定した。各バリアント発現用プラスミドの具体的調製方法を以下に示す。
(1)下記(c)、(d)及び(e)記載のプライマーを用いて、TFPI2のKD1領域、KD2領域及びKD3からC末端領域に相当するポリヌクレオチドを、常法に従いRT−PCR法により増幅した。
(c)GPIアンカー型TFPI2−KD1用プライマー
Forward:
5’−cgatgacgacaagcttgctcaggagccaaca−3’(配列番号4、3’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の73から87番目の塩基配列に相当)
Reverse:
5’−catcagtggtgaattctttttctatcctcca−3’(配列番号5、5’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の259から273番目の塩基配列に相当)
(d)GPIアンカー型TFPI2−KD2用プライマー
Forward:
5’−cgatgacgacaagcttgttcccaaagtttgc−3’(配列番号6、3’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の274から288番目の塩基配列に相当)
Reverse:
5’−catcagtggtgaattctttctttggtgcgca−3’(配列番号7、5’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の445から459番目の塩基配列に相当)
(e)GPIアンカー型TFPI2−KD3用プライマー
Forward:
5’−cgatgacgacaagcttattccatcattttgc−3’(配列番号8、3’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の460から474番目の塩基配列に相当)
Reverse:
5’−catcagtggtgaattcaaattgcttcttccg−3’(配列番号9、5’末端側15塩基はGenBank No.NM_006528の691から705番目の塩基配列に相当)
(3)(2)で構築した3種のGPIアンカー型TFPI2発現プラスミドに挿入されているポリヌクレオチドにより発現されるTFPI2が、想定通り細胞表面に局在していることを確認するために、一過性発現細胞である293T細胞株を用い、下記の方法で検証した。
(3−1)(2)で構築したGPI型TFPI2発現プラスミドを常法に従い293T細胞株へ導入した。
(3−2)前記発現プラスミドが導入された293T細胞株を、5%CO2インキュベータにて、10%FBS(Fetal Bovine Serum)添加D−MEM培地(和光純薬社製)を用いて、24時間・37℃で培養し、TFPI2を一過性発現させた。(3−3)(3−2)で得られた培養細胞に、FLAGタグと特異的に結合するSIGMA社製マウス抗FLAG M2抗体、または、陰性対照としてFLAGタグとは結合しないマウス抗BNC抗体を添加し、30分静置した。なお、BNCとは、BNP(脳性ナトリウム利尿ペプチド)のC末端側7アミノ酸からなるペプチドである(特開2009−240300号公報)。
(3−4)静置後、蛍光標識した抗マウスIgG抗体(BECKMAN COULTER社製)を添加し、さらに30分間静置後、FACS(Fluorescence Activated Cell Sorting)解析を行ない、10種のモノクローナル抗体の抗原認識部位を同定した。
FACS解析の結果から判明した各抗体の抗原認識部位を表1に示す。
固相側をクニッツドメイン1に抗原認識部位を有するTS−TF04抗体、検出側にクニッツドメイン1に抗原認識部位を有するTS−TF01抗体を用いて、インタクトTFPI2及びNT−TFPI2を包括的に測定対象とする「NT+I−TFPI2測定系」の測定試薬を以下の通り調製した。
(1)水不溶性フェライト担体に抗TFPI2モノクローナル抗体(TS−TF04)を100ng/担体になるように室温にて一昼夜物理的に吸着させ、その後1%BSAを含む100mMトリス緩衝液(pH8.0)にて53℃・4時間ブロッキングを行なうことで、抗TFPI2抗体固定化担体を調製した。
(2)抗TFPI2モノクローナル抗体(TS−TF01)をアルカリフォスファターゼ
標識キット(同仁化学社製)にて、アルカリフォスファターゼ標識抗TFPI2抗体を調製した。
本実施例で使用した卵巣明細胞癌18例は2003年から2014年にかけて横浜市立大婦人科にて同一プロトコルにて収集された血清検体であり、インフォームドコンセントの承諾及び横浜市立大学倫理委員会の承認を受けている。
(1)サンプル20μLと界面活性剤を含む希釈液80μLを、実施例4で作製したTFPI2測定試薬を収容した容器に自動で分注し、
(2)37℃恒温下で10分間の抗原抗体反応を行ない、
(3)B/F分離後、界面活性剤を含む緩衝液にて8回の洗浄を行ない、
(4)4−メチルウンベリフェリルリン酸塩を添加し、
単位時間当たりのアルカリフォスファターゼによる4−メチルウンベリフェロン生成濃度をもって測定値(nmol/(L・s))とし、市販TFPI2組み換えタンパク(R&D社)を標準品として検量線を作成し、検体中のTFPI2濃度を算出した。
CA125の測定はEテストTOSOHII CA125測定試薬(東ソー社製、承認番号20700AMZ00504000)を用いて測定した。
卵巣明細胞癌検体(2003年から2014年に収集された計18症例)の臨床病期(FIGO分類)におけるTFPI2およびCA125を図1に示す。TFPI2およびCA125の中央値はいずれも臨床病期(FIGO分類)との明瞭な相関性は認められず、癌の進行に伴う血中濃度向上傾向は認められなかった。TFPI2およびCA125の相関解析結果を図2に示す。今回の解析では、TFPI2とCA125には全く相関が認められないことから、TFPI2とCA125の血中動態は相関関係にないことが示唆された。
卵巣明細胞癌検体(2003年から2010年に収集された計11症例)に対し、2014年12月の調査研究結果に基づいて生存群(n=4)と死亡群(n=7)に分け、双群における血中TFPI2値および血中CA125測定値を図3に示す。また、生存群と死亡群の比較におけるROC解析の結果を図4に示す。TFPI2は、生存群に比して死亡群にて有意に高値を示すことが明らかとなった(マン=ホイットニーのU検定、p=0
.0424)。さらに、ROC解析を行った結果(図4)、AUC(曲線下面積)の値が0.8929、カットオフ値(基準値)を437pg/mLとした場合では、感度100%、特異度75%となり、TFPI2は明瞭に生存群と死亡群の鑑別できることが明らかとなった。一方、CA125は生存群と死亡群との間に統計的有意差は認められず(p=0.4848)、ROC解析においてもTFPI2のような鑑別性能は認められなかった。
卵巣明細胞癌検体(2003年から2010年に収集された計11症例)の術後生存日数と血中TFPI2値および血中CA125測定値の関係を図5に示す。血中TFPI2値は術後生存日数に対して高い負の相関を示したが(スピアマン順位相関係数、rs=−
0.76)、CA125値には相関性は認められなかった(rs=−0.236)。
卵巣明細胞癌検体(2003年から2010年に収集された計11症例)を対象に、血中TFPI2が430pg/mL未満(4例)、および以上の群(7例)に分け、カプランマイヤー法を用いた生存曲線を図6に示した。血中TFPI2が430pg/mL以上の患者群において著しい生存率の低下傾向が認められ、それは、35U/mL(臨床現場で用いられる基準値)以上(10例)の血中CA125値を持つ患者群よりも低かった。
Claims (7)
- 卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための情報を提供する方法であって、
前記患者由来の検体中のTFPI2量を測定すること、及び
前記TFPI2量の測定値と前記患者の予後との関連付けをすること、を含む方法。 - 前記関連付けにおいて、前記TFPI2量の測定値が、予め設定した基準値を超えた場合に、当該患者に予後不良の可能性があると関連付ける、請求項1に記載の方法。
- 前記TFPI2量が、TFPI2プロセシングポリペプチド量及びインタクトTFPI2量の合計である、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記TFPI2量の測定が、配列番号1のアミノ酸配列の23残基目のアスパラギン酸から131残基目のヒスチジン又は130残基目のシステインまでの領域内の抗原決定基に結合する抗体を用いた抗原抗体反応により行われるものである、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体が、TFPI2のクニッツドメイン1を認識する抗体である、請求項4に記載の方法。
- 質量分析法を用いて測定を行う、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 配列番号1に示すアミノ酸配列の23残基目のアスパラギン酸から131残基目のヒスチジン又は130残基目のシステインまでの領域内の抗原決定基に結合する抗体を含む、卵巣明細胞癌患者の予後を予測するための試薬。
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