JP2017521747A - 種子を撮像および配向するためのシステムならびに使用の方法 - Google Patents

種子を撮像および配向するためのシステムならびに使用の方法 Download PDF

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Abstract

形質転換およびトランスジェニックエンジニアリングのために種子を準備するための、種子の自動化または半自動化された撮像および配向のための、システムおよび方法。自動化された種子準備のための方法および装置が開示される。1つの態様によれば、方法は、表面または容器上に種子を配置することと、種子を自動化された器具と係合させることと、切断するかまたは傷つけるために種子を配向することと、種子が配向されるとき種子を切断するかまたは傷つけることと、を含む。

Description

本出願は、参照により本明細書に明示的に組み込まれる、2014年5月6日に出願された米国仮特許出願第61/989,266号明細書に対する優先権を主張する。
関連する米国特許出願の相互参照
いずれも参照により本明細書に明示的に組み込まれる、2014年5月6日に出願された、Donald L. McCarty, IIらによる「SYSTEM FOR SEED PREPARATION AND METHOD OF USE」という名称の米国仮特許出願第61/989,275号明細書、および、2014年5月6日に出願された、Donald L.McCarty,IIらによる「SYSTEM FOR CUTTING AND PREPARING SEEDS AND METHOD OF USE」という名称の米国仮特許出願第61/989,276号明細書が相互参照される。
本開示は一般に、植物育種において使用するために種子を準備するためのデバイスに、より詳細には、遺伝子形質転換およびトランスジェニックエンジニアリングのために、種子および種子外植片を準備するためのデバイスに関する。
ダイズ(グリシンマックス(Glycine max))は、最も重要な農作物の1つであり、年間作物収量が2億メートルトンを超え、推定価値が世界中で400億米ドルを超える。ダイズは、全世界的に全ての油糧種子生産の97%超を占める。したがって、この有益な作物の品質および収率を改善するための、信頼性のある、効率的な方法は、大きな関心事である。
ダイズ栽培品種の大部分が、育種に関して狭い生殖質基盤につながる、ほんの2、3種の親株に由来しているので、ダイズを改良するための伝統的な育種方法は、制約を受けてきた。Christou et al., TIBTECH 8:145-151 (1990)。現代の研究の取り組みは、ダイズ生産を改善するための植物遺伝子工学技術に焦点を当ててきた。トランスジェニック法は、所望の遺伝子を作物植物の遺伝生殖系列中に導入して、エリート植物株を生み出すよう設計される。このアプローチは、栄養的価値を改善しながら、いくつかの他の作物植物の、疾患、昆虫および除草剤に対する抵抗性の増大に成功した。
高速マイクロプロジェクション、マイクロインジェクション、エレクトロポレーションおよび直接DNA取り込みを含め、遺伝子を植物組織中に移すためにいくつかの方法が開発されてきた。より最近では、対象の遺伝子をダイズ中に導入するために、アグロバクテリウム媒介性遺伝子形質転換が使用されている。しかしながらダイズは、トランスジェニックエンジニアリングにとって困難な系であることが分かっている。効率的な形質転換およびダイズ外植片の再生は、達成するのが困難であり、反復するのが難しい場合が多い。
アグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)、土壌に生息する病原性の細菌は、T−DNAと呼ばれるそのDNAを宿主植物細胞内に移し、宿主細胞が細菌栄養にとって有用な代謝産物を産生するよう誘導する、固有の能力を有する。組換え技術を使用すると、T−DNAの一部または全てを対象の1つまたは複数の遺伝子と置き換え、宿主植物を形質転換するのに有用な細菌ベクターを創出することができる。アグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介性遺伝子導入は、通常、組織培養中の未分化細胞を対象とするが、植物の葉または茎から採取された分化細胞を対象とする場合もある。ダイズのアグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介性形質転換のために、いくつかの手順が開発されており、これらは、形質転換に付される外植片組織に基づいて大まかに分類され得る。
米国特許第7,696,408号明細書、Olhoftら、には、単子葉植物および双子葉植物の両方を形質転換するための子葉節法が開示されている。「子葉節」法は、子葉節のすぐ下で切断することによって5〜7日齢のダイズ実生から下子葉部を除去すること、子葉を有する残りの下子葉部切片を分割し、分離すること、および子葉から上胚軸を除去することを含む。子葉外植片の腋芽および/または子葉節の領域に傷をつけ、アグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)とともに暗所で5日間栽培する。方法は種子のin−vitro発芽を必要とし、傷をつけるステップは相当なばらつきを取り込む。
米国特許第6,384,301号明細書、Martinelliら、には、ダイズ種子から切り出したダイズ胚から得た生存している成長点組織中へのアグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介性遺伝子送達、ならびに、それに続く、シュート形成を誘導するための選択物質およびホルモンを用いた成長点外植片の培養が開示されている。「子葉節」法と同様に、成長点外植片は、感染に先立って傷をつけることが好ましい。
米国特許第7,473,822号明細書、Pazら、には、「半種子外植片」法と呼ばれる修正された子葉節法が開示されている。成熟ダイズ種子を吸水させ、表面滅菌し、へそに沿って分割する。感染に先立って、胚軸およびシュートを完全に除去するが、他の傷は生じない。アグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介性形質転換が進行し、有望な形質転換体を選択し、外植片を選択培地上で再生させる。
形質転換効率は、これらの方法を用いる場合比較的低いままであり、「子葉節」法について、およそ0.3%〜2.8%であり、「成長点外植片」法について、1.2〜4.7%であり、「半種子外植片」法について、3.2%から8.7%の間(全体に4.9%)である。約3%の形質転換効率が、当技術分野では通常である。
改善された「割れ種子」トランスジェニックプロトコルは、トランスジェニックダイズ製品の将来の製造および開発を加速し得る。ダイズ組織への導入遺伝子の安定な組込みのための効率的なハイスループット法は、育種プログラムを促進し、作物生産性を増大する可能性を有する。
自動化された種子準備のための方法および装置が開示される。1つの態様によれば、方法は、表面または容器上に種子を配置することと、種子を自動化された器具と係合させることと、切断するかまたは傷つけるために種子を配向することと、種子が配向されるとき種子を切断するかまたは傷つけることと、を含む。方法は、種子の胚軸を部分的に切断することも含み得る。いくつかの実施形態では、切断されたまたは傷つけられた種子は、外来性のDNAを用いて形質転換される。
本開示の範囲は、特定された構造または使用される特定の用語に限定されない。たとえば、「ロボットアーム」という用語は、「自動化された器具」という用語で置き換えることができる。加えて、「表面」または「容器」という用語は、「トレイ」という用語を置き換えることができ、また「切断ブロック」という用語は、「切断表面」、「支持ブロック」、または「ブロック」という用語で置き換えることができる。
自動化された種子準備方法は、少なくとも1つの種子を含むトレイの画像を取り込むことと、取り込まれた画像に基づいて表面または容器(たとえばトレイ)上に種子を配置することと、自動化された器具(たとえばロボットアーム)を用いて種子を把持することと、種子を二分するために種子を切断表面(たとえば切断ブロック)上で配向することと、種子が切断表面上で配向されるとき種子を二分することと、を含み得る。いくつかの実施形態では、方法は、種子の胚軸を部分的に切断することも含み得る。いくつかの実施形態では、種子を配置することは、複数の種子が上に置かれたトレイ上に種子を配置することを含み得る。
いくつかの実施形態では、方法は、ロボットアームを操作して種子をトレイから離れた位置へと移動させることと、離れた位置にある種子の複数の画像を取り込むことと、複数の取り込まれた画像に基づいて二分するための種子の適正な配向を判定することと、をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、複数の画像は、1つまたは複数の視点からの画像の組を取り込む1つのカメラによって取り込むことができる。他の実施形態では、複数の画像を取り込むことは、第1のカメラを操作して第1の視点から種子の第1の画像の組を取り込むこと、および、第2のカメラを操作して第1の視点とは異なる第2の視点から種子の第2の画像の組を取り込むことを含み得る。本明細書において使用される場合、画像の組は、1つの画像または複数の画像を含み得る。
加えて、いくつかの実施形態では、種子の適正な配向を判定することは、種子のへその中心および種子の長手軸の位置を特定することを含み得る。
いくつかの実施形態では、種子を二分するために種子を切断表面(たとえば切断ブロック)上で配向することは、種子のへその中心および種子の長手軸によって規定される仮想平面に沿って、種子を切断デバイスの切断ブレードと位置合わせすることを含み得る。
いくつかの実施形態では、方法は、切断表面上に種子が配置されるとき種子の胚軸をトリミングすることをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、複数の取り込まれた画像に基づいて二分するための種子の適正な配向を判定することは、胚軸をトリミングするための種子の適正な配向を判定することも含み得る。種子の胚軸をトリミングすることは、切断ブレードを種子の長手軸に対して垂直に位置付けることを含み得る。
いくつかの実施形態では、切断表面上で種子を二分することは、種子の胚軸をトリミングした後で種子を二分することを含む。いくつかの実施形態では、切断表面上で種子を二分することは、種子の全体までは達しないように切断することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法は、二分された種子をアグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)溶液まで移動させることをさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、方法は、種子を把持することに先立って自動化された器具(たとえばロボットアーム)の把持部を滅菌することを含み得る。方法は、自動化された器具またはロボットアームを操作して切断ブレードを選択することと、切断ブレードを切断デバイス上に位置付けることと、を含み得る。方法は、切断ブレードを種子の中に挿入することによって、種子が切断ブレード上で配向されるとき種子を二分することをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、方法は、種子を二分した後で同じまたは異なる自動化された器具を用いて切断ブレードを把持することと、自動化された器具を操作して切断デバイス上で切断ブレードを第2の切断ブレードと交換することと、を含み得る。
別の態様によれば、種子準備装置は、表面またはトレイ上に置かれた種子の第1の画像の組を取り込むように構成された第1のカメラと、種子を把持し種子を表面またはトレイから照明されるチャンバへと移動させるように動作可能なロボットアームと、照明されるチャンバ内の種子の第2の画像の組を取り込むように構成された第2のカメラと、種子を受容するように構成された切断ブロックと、を備える。ロボットアームは、切断ブロック上の種子を、種子を二分するための適正な配向に位置付けるようにさらに動作可能である。
いくつかの実施形態では、種子準備装置は、トレイの第1の側に位置付けられてトレイ上の種子に照射する光源を備え得る。いくつかの実施形態では、照明されるチャンバは、照明されるドーム内に画定され得る。
いくつかの実施形態では、種子準備装置は、照明されるチャンバ内の種子の第3の画像の組を取り込むように構成された第3のカメラと、第2の画像の組および第3の画像の組を分析して種子の適正な配向を判定するように構成された電子制御装置と、を備え得る。
いくつかの実施形態では、種子準備装置は、照明されるチャンバの内部を照明するように構成された光源を備え得る。いくつかの実施形態では、電子制御装置は、第1の画像の組を分析してトレイ上に種子を配置するようにさらに構成され得る。
別の態様によれば、種子準備装置は、チャンバと、トレイ上の種子の第1の画像の組を取り込むように構成された第1のカメラと、チャンバ内の種子の第2の画像の組を取り込むように構成された第2のカメラと、種子を二分するように構成された切断デバイスと、移動のために種子を把持するための把持デバイスを含むロボットアームと、電子制御装置と、を備える。電子制御装置は、第1の画像の組に基づいてトレイ上に種子を配置し、ロボットアームを操作してトレイ上の種子を握り、種子を第2の画像の組に基づいた配向で切断デバイスへと移動させ、切断デバイスを操作して種子を二分するように構成される。
いくつかの実施形態では、電子制御装置は、ロボットアームを操作して種子をトレイからチャンバへと移動させ、第2のカメラを操作して第2の画像の組を取り込ませるように構成され得る。
いくつかの実施形態では、電子制御装置は、種子の複数の画像を分析して、種子の二分および種子の胚軸のトリミングのための種子の適正な配向を判定するように構成され得る。
いくつかの実施形態では、ロボットアームを、種子を切断デバイスへと移動させて種子を適正な配向に位置付けるように構成することができ、切断デバイスは、種子が切断デバイスにおいて適正な配向に位置付けられている間に種子の胚軸をトリミングするように構成される。
本開示の別の態様によれば、切断ブロックが開示される。切断ブロックは、前方壁および前方壁から離れる方向に延びる実質的に平面状の上方壁を含む本体を備える。前方壁に第1の開口部が画定され、上方壁に第2の開口部が画定され、第1の開口部および第2の開口部から内向きに複数の内壁が延びて、前方壁および上方壁にスロットを画定する。スロットは切断器具を受容するようなサイズとされる。切断器具をスロットに沿って進めて種子と接触させられるように、切断ブロックは、ダイズ種子などの種子またはそのサイズの任意の種子を支持するようなサイズとされる。
いくつかの実施形態では、上方壁は、前方壁から後縁部まで延び得る。本体は、後縁部から上方へ延びる実質的に平面状の側壁をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、側壁は、上方壁の後縁部から上縁部まで延びる第1の側壁であってよい。本体は、第1の側壁の上縁部から延びる第2の側壁をさらに含み得る。第2の側壁は、本体の第1の側壁および上方壁に対して斜めに延び得る。
いくつかの実施形態では、第2の側壁は、第1の側壁の上縁部から頂縁部まで延びてもよく、本体は、第2の側壁の頂縁部から延びる頂部壁をさらに含み得る。頂部壁は、第2の側壁に対して斜めに延び得る。
いくつかの実施形態では、頂部壁は、切断ブロックの上方壁と平行に延び得る。
いくつかの実施形態では、スロットは、前方壁の第1の開口部から、前方壁と上方壁の後縁部との間に位置付けられた後方縁部まで延び得る。
いくつかの実施形態では、第1の開口部を、前方壁の中心に位置付けることができる。いくつかの実施形態では、本体は単一の一体金属本体として形成されてよい。いくつかの実施形態では、本体を、自動化された切断システムとともに表面に固定することができる。
さらなる実施形態では、組み合わせが開示される。組み合わせは、ダイズ種子などの種子またはそのサイズの任意の種子を有する本明細書における各切断ブロックを含む。形質転換のために、ダイズ種子を切断、二分、トリミング、または他の方法で傷つけることができる。いくつかの実施形態では、形質転換のために、種子の胚軸をトリミングすることができる。
本開示の別の態様によれば、切断システムが開示される。切断システムは、切断器具を含む自動化された切断システムと、上方壁および自動化された切断システムの切断器具を受容するようなサイズとされる上方壁に画定されたスロットを含む切断ブロックと、を含む。自動化された切断システムは、切断器具を切断ブロックに対して第1の軸に沿って直線的に移動させ、切断器具を第1の軸を中心に回転させて切断器具をスロット内への挿入のために位置付けるように、動作可能である。
いくつかの実施形態では、自動化された切断システムは、切断器具を第1の軸に沿って直線的に移動させるように動作可能な電動モータ、および切断器具を第1の軸を中心に回転させるように動作可能な空圧デバイスをさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、自動化された切断システムは、切断器具を受容するように構成された1対の可動顎部をさらに含み得る。1対の可動顎部は、切断器具を顎部から取り外し可能なロック解除位置と、切断器具が顎部上に保持されるロック位置との間を移動するように動作可能であってよい。
いくつかの実施形態では、自動化された切断システムは、1対の顎部をロック解除位置とロック位置との間で移動させるように動作可能な第2の空圧デバイスをさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、自動化された切断システムは、プロセッサ、メモリデバイス、およびメモリデバイスに保存された複数の命令を含む電子制御装置をさらに含むことができ、これらの命令は、プロセッサによって実行されると、プロセッサに、1対の顎部をロック解除位置からロック位置へと移動させるように第1の圧縮空気源を動作させ、切断器具を切断器具が鉛直に延びる配向へと第1の軸を中心に回転させるように第2の圧縮空気源を動作させ、切断器具を切断ブロックに画定されたスロット内へと進めるように第1の電動モータを動作させる。いくつかの実施形態では、電子制御装置は、複数の命令をさらに含むことができ、これらの命令は、プロセッサによって実行されると、プロセッサに、切断器具を切断ブロックに画定されたスロットから取り外すように第1の電動モータを動作させ、切断器具を切断器具が水平に延びる第2の配向へと第1の軸を中心に回転させるように第2の圧縮空気源を動作させ、切断器具を切断ブロックの上方壁に渡って進めるように第1の電動モータを動作させる。
いくつかの実施形態では、切断ブロックは前方壁を含むことができ、実質的に平面状の上方壁は前方壁から離れる方向に延び、前方壁に第1の開口部が画定され、上方壁に第2の開口部が画定され、複数の内壁が第1の開口部および第2の開口部から内向きに延びて、前方壁および上方壁にスロットを画定する。
いくつかの実施形態では、切断器具を、自動化された切断システムに取り外し可能に結合することができる。
別の態様によれば、種子を切断する方法が開示される。方法は、切断器具を第1の軸に沿って切断ブロックに画定されたスロット内へと進めて種子に第1の切断を行うことと、切断器具を第1の軸を中心に回転させることと、切断器具を種子内に進めて第2の切断を行うことと、を含む。いくつかの実施形態では、圧縮空気源または電動モータを動作させることによって、切断器具を回転させることができる。いくつかの実施形態では、1つまたは複数の電動モータを動作させることによって、切断器具を種子内へと進めることができる。
いくつかの実施形態では、方法は、切断器具を1対の顎部上に位置付けることと、1対の顎部を移動させて切断器具を1対の顎部に固定することと、を含み得る。いくつかの実施形態では、1対の顎部を分かれるように移動させて切断器具に係合させることができる。加えて、いくつかの実施形態では、圧縮空気源を動作させることによって、1対の顎部を移動させることができる。
いくつかの実施形態では、切断器具を1対の顎部上に位置付けることは、切断器具をロボットアームなどの自動化された器具に取り付けることを含み得る。
いくつかの実施形態では、方法は、負圧源を動作させて、切断器具をロボットアームに吸引を介して取り付けることをさらに含み得る。
別の態様によれば、種子を撮像するための方法が開示される。方法は、ロボットアームなどの自動化された器具を使用してドームなどの照明される構造内にへそを含む種子を位置付けること、種子を照明されるドームの中心軸に対して垂直に延びる第1の平面上に投影すること、種子を回転させて種子を第1の平面内に位置付けられた第1の仮想水平線と平行に配向することと、種子を第1の平面に対して垂直に延びる第2の平面上に投影すること、種子を第2の平面内に位置付けられた第2の仮想水平線と平行に配向することと、種子のへそと第2の仮想水平線との間の距離を識別することと、識別された距離に基づいてへそを第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することと、を含む。
上記のように、本開示の範囲は、開示される構造または使用される用語に限定されない。したがって、「照明されるドーム」という用語は、たとえば、「照明される構造」という用語で置き換えることができる。
いくつかの実施形態では、へそを第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することは、へその中心を第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することを含み得る。いくつかの実施形態では、へその中心を第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することは、へその重心が種子の重心と一致するように種子を配向することを含み得る。
加えて、いくつかの実施形態では、方法は、種子の胚の位置を識別することと、識別された位置に最も近いへその縁部および第2の仮想水平線に沿った種子の外縁部を識別することと、へその縁部と種子の外縁部との間の、種子の胚軸をトリミングすべき点を識別することと、をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、胚の位置を識別することは、特徴照合を使用して第2の平面上への1つまたは複数の種子の投影を分析することを含み得る。
いくつかの実施形態では、種子を第1の平面上に投影することは、第1のカメラを用いて第1の画像の組を取り込むことを含むことができ、種子を第2の平面上に投影することは、第2のカメラを用いて第2の画像の組を取り込むことを含むことができる。
いくつかの実施形態では、第1のカメラは、第2のカメラの光軸と平行な光軸を有することができ、第1のカメラを用いて第1の画像の組を取り込むことは、第1のカメラの光軸に対して45度の角度で延びる鏡から反射された光を取り込むことを含み得る。
いくつかの実施形態では、種子を回転させて種子を第1の仮想水平線と平行に配向することは、種子が第1の仮想水平線と平行に配向されていないと判定することに応答して種子を回転させることを含み得る。いくつかの実施形態では、種子を第2の仮想水平線と平行に配向することは、種子が第2の仮想水平線と平行に配向されていないと判定することに応答して種子を配向することを含むことができ、へそを第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することは、へそが第2の仮想水平線上に位置付けられていないと判定することに応答して種子を配向することを含み得る。
いくつかの実施形態では、方法は、第1の平面上への種子の投影に対応する第1の画像の組を分析して、第1の仮想水平線に対する種子の配向を判定することと、第2の平面上への種子の投影に対応する第2の画像の組を分析して、第2の仮想水平線に対する種子の配向を判定することと、をさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、第2の画像の組を分析することは、種子の第1の長手端部および第2の長手端部を識別すること、第1の長手端部における種子の左矩形鉛直断面を識別すること、第2の長手端部における種子の右矩形鉛直断面を識別すること、左矩形鉛直断面および右矩形断面の各々の重心を判定すること、ならびに、左矩形鉛直断面および右矩形断面の重心を仮想線分で相互接続することを含み得る。いくつかの実施形態では、種子を第2の仮想水平線と平行に配向することは、線分が第2の仮想水平線と平行になるように種子を配向することを含み得る。
いくつかの実施形態では、左矩形鉛直断面および右矩形鉛直断面は、少なくとも10個の画像画素に等しい水平幅を有し得る。
いくつかの実施形態では、第2の画像の組を分析することは、第2の仮想水平線に対する線分の角度を判定することをさらに含むことができ、線分を第2の仮想水平線と平行に配向するための種子の回転の量は、判定された角度に基づく。
いくつかの実施形態では、方法は、種子を第2の仮想水平線と平行に配向することに応答して、種子を第2の平面上に投影することと、種子を第2の仮想水平線と平行に配向することに応答して、第2の平面上への種子の投影に対応する第3の画像の組を分析してへそと第2の仮想水平線との間の距離を識別することと、をさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、第3の画像の組を分析することは、種子の長手端部を識別すること、長手端部およびへその各々の重心を判定すること、ならびに、長手端部およびへその重心を仮想線分で相互接続することを含み得る。加えて、いくつかの実施形態では、へそを第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することは、線分が第2の仮想水平線と一致するように種子を配向することを含み得る。
いくつかの実施形態では、第3の画像の組を分析することは、第2の仮想水平線に対する線分の角度を判定することをさらに含むことができ、線分を第2の仮想水平線と一致するように配向するための種子の移動の量は、判定された角度に基づく。
いくつかの実施形態では、方法は、第2の平面上への種子の投影に基づいて切断ブレードを位置付けるための種子の高さを判定することをさらに含み得る。高さは、第2の仮想水平線に対して垂直な方向における種子の幅であってよい。いくつかの実施形態では、方法は、種子をロボットアームに吸引力を介して取り付けることをさらに含み得る。
別の態様によれば、種子を撮像するための方法は、複数の種子の画像を取り込むことと、複数の取り込まれた画像に基づいて種子の配向および種子のへその位置を判定することと、ロボットアームを用いて種子を移動させて、判定された種子の配向およびへその位置に基づいた位置に種子を配向することと、を含む。
いくつかの実施形態では、複数の画像を取り込むことは、種子の第1の画像の組を第1のカメラを用いて第1の視点から取り込むこと、および種子の第2の画像の組を第2のカメラを用いて第1の視点に対して垂直な第2の視点から取り込むことを含み得る。
いくつかの実施形態では、種子の配向を判定することは、第1の取り込まれた画像の組の第1の境界線に対する種子の配向を判定すること、および第2の取り込まれた画像の組の第2の境界線に対する種子の配向を判定することを含み得る。
別の態様によれば、種子撮像装置は、ロボットアームと、1つまたは複数の光源と、中心軸を有しかつ1つまたは複数の光源によって照明されるように構成された中空本体と、中空本体内に位置付けられた種子の第1の画像の組を取り込むように構成された第1のカメラと、を含む。第1の画像の組は、中心軸に沿った第1の視点から取り込まれる。種子撮像装置は、中心軸に対して垂直な第2の軸に沿った第2の視点から種子の第2の画像の組を取り込むように構成された第2のカメラと、第1の画像の組および第2の画像の組を分析して、二分するための種子の適正な配向を判定するようにおよびロボットアームに種子を適正な配向へと移動させるよう命令するように構成された、電子制御装置を含む。
いくつかの実施形態では、第1のカメラの光軸は、第2のカメラの光軸と平行とすることができ、第1のカメラは、第1のカメラの光軸に対して45度の角度で延びる鏡から反射された光を取り込むように構成され得る。
いくつかの実施形態では、ロボットアームは、種子の側部に吸引力を適用することによって種子を固定するように構成され得る。
詳細な説明は、特に以下の図面を参照する。
遺伝子形質転換のために種子を準備するためのシステムの斜視図である。 図1のシステムの頂面図である。 図2のシステムのドックの一部分の分解斜視図である。 図2のシステムの撮像ステーションの斜視図である。 図4の撮像ステーションの分解斜視図である。 図2のシステムの切断デバイスの斜視図である。 図6のシステムの切断デバイスの切断ブロックの分解斜視図である。 図7の切断ブロックの頂面図である。 図7〜図8の切断ブロックの側部立面図である。 係合解除位置にある顎部を示す図6の切断デバイスの頂面図である。 係合解除位置にある顎部を示す図6の切断デバイスの正面斜視図である。 係合位置にある顎部を示す図10Aと同様の図である。 係合位置にある顎部を示す図10Bと同様の図である。 図1のシステムの切断器具トレイの斜視図である。 図1のシステムのロボットアームの把持部組立体の斜視図である。 図1のシステムの単純化したブロック図である。 図1のシステムに関する例示的な操作手順を示すブロック図である。 図1のシステムに関する例示的な操作手順を示すブロック図である。 ダイズ種子に関する所望の切断位置および切断深さを判定するための例示的な手順を示すブロック図である。 ダイズ種子に関する所望の切断位置および切断深さを判定するための例示的な手順を示すブロック図である。 ダイズ種子に関する所望の切断位置および切断深さを判定するための例示的な手順を示すブロック図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図のシステムの把持部を滅菌することおよび切断器具を選択することを含む、図15〜図16の動作手順における様々な予備動作の図である。 図1のシステムが拾い上げるべき種子を識別するための、図15〜図16の操作手順の画像取り込み工程の図である。 図1のシステムが拾い上げるべき種子を識別するための、図15〜図16の操作手順の画像取り込み工程の図である。 図1のシステムが拾い上げるべき種子を識別するための、図15〜図16の操作手順の画像取り込み工程の図である。 図1のシステムが種子をシステムの撮像ステーションへと移動させている図である。 図1のシステムが種子をシステムの撮像ステーションへと移動させている図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図17〜図19の手順の間に創出された画像の図である。 図1のシステムが種子を切断して種子を遺伝子形質転換のために準備している図である。 図1のシステムが種子を切断して種子を遺伝子形質転換のために準備している図である。 図1のシステムが種子を切断して種子を遺伝子形質転換のために準備している図である。 図1のシステムが種子を切断して種子を遺伝子形質転換のために準備している図である。 ダイズ種子の平面図である。 図60のダイズ種子の側部立面図である。 図60における線62−62に沿って取られた、ダイズ種子の立面断面図である。 図57における線63−63に沿って取られた、ダイズ種子の立面断面図である。 図59における線64−64に沿って取られた、ダイズ種子の立面断面図である。 図1のシステムを使用して準備された1対の子葉切片の平面図である。
本開示の概念は様々な修正形態および代替の形態が可能であるが、それらの具体的な例示の実施形態が、図面において例として示されており、また本明細書において詳細に記載されることになる。ただし、本開示の概念を開示される特定の形態に限定する意図はなく、むしろ逆に、付属の特許請求の範囲によって規定されるような本発明の精神および範囲内にある全ての修正形態、等価物、および代替形態を包含することが意図されていることが理解されるべきである。
本明細書において使用される場合、「子葉」は一般に、種子植物の胚の胚葉または「初生葉」を指し得る。子葉はまた、当技術分野で「種子葉」とも呼ばれる。ダイズなどの双子葉種は、2枚の子葉を有する。子葉切片は、完全なもしくは全子葉であれ、または子葉の断片もしくは一部分であれ、子葉の任意の部分を指す。「子葉節」は、種子または実生中の子葉の胚との結合点を指し、全般的に、その結合点と関連している組織を指す場合もある。
本明細書において使用される場合、「握る」という用語とは、ダイズ種子を、器具を用いて保持することまたは捉えることを指す。ダイズ種子がしっかりと掴まれることを可能にする任意のその後の機構または作用は、握るという用語の範囲内にあると考えられる。
本明細書において使用される場合、「切断ブレード」という用語は、剃刀の刃、ナイフ、ウォーターナイフ、外科用メス、のみ、カッター、ランセットなどのような、形質転換のために種子を切断するかまたは傷つけるのに好適な任意の切断器具を指す。本明細書において開示される実施形態では、切断ブレードへの言及の各々を、形質転換のために種子を切断するかまたは傷つけるためのレーザまたはマイクロレーザ出射で置き換えることができる。
本明細書において使用される場合、「種皮」という用語は、種子の保護被膜として働く胚珠の外皮を指す。種皮は、当技術分野で公知の他の同様の用語に加えて、「外種皮(testa)」または「外皮」という代替記述用語によって記載され得る。種皮は、スベリン、クチン、リグニン、カロース、ペクチン、ワックスおよびフェノール酸化の不溶性生成物などの疎水性物質を含有し得る。マメ科植物では、ダイズ同様、外種皮は長形厚壁異形細胞の柵状層を含有し、これらの頂部はスベリン化したクチクラ下層内へと延び、このより厚いスベリン層の外部にろう様クチクラがある。
本明細書において使用される場合、「胚軸(embryonic axis)」または「胚軸(embryo axis)」という用語は、植物の胚の主要部分を指し、一般に、上胚軸および下子葉部を含む。
本明細書において使用される場合、「遺伝子改変された」または「トランスジェニック」植物は、形質転換によって植物細胞、植物組織、植物の部分、植物生殖質、または植物のゲノム中に導入される予め選択されたDNA配列を備える、植物細胞、植物組織、植物の部分、植物生殖質、または植物を指す。
本明細書において使用される場合、「トランスジェニック」、「異種の」、「導入された」または「外来」DNAまたは遺伝子という用語は、組換えDNAまたは遺伝子のレシピエントである植物のゲノム中に天然に生じない、または形質転換されていない植物中とは異なる、ゲノム中の位置もしくは関係でレシピエント植物中に生じる、組換えDNA配列または遺伝子を指す。
本明細書において使用される場合、「外植片」という用語は、ドナー植物から(たとえば、ドナー種子から)採取または単離され、in vitroで培養され、好適な培地中で成長できるダイズ組織の小片を指す。
本明細書において使用される場合、「植物」という用語は、植物全体、植物組織、花粉、種子、もしくは胚を含めた植物の部分、植物生殖質、植物細胞、または植物の群のいずれかを指す。本発明の方法において使用され得る植物の類は、ダイズに限定されず、一般に、単子葉植物および双子葉植物の両方を含めた、形質転換技術を受け入れる任意の植物を含み得る。
本明細書において使用される場合、「形質転換」という用語は、遺伝的に安定な継承をもたらす、宿主生物への核酸または断片の転移および組込みを指す。形質転換核酸断片を含有する宿主生物は、「トランスジェニック」、または「組換え」、または「形質転換された」生物と呼ばれる。形質転換の公知の方法として、アグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)もしくはアグロバクテリウムリゾゲネス(Agrobacterium rhizogenes)媒介性形質転換、リン酸カルシウム形質転換、ポリブレン形質転換、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、超音波法(たとえば、ソノポレーション)、リポソーム形質転換、マイクロインジェクション、裸のDNA、プラスミドベクター、ウイルスベクター、遺伝子銃(微粒子(microparticle)銃)、シリコンカーバイドWHISKERS(商標)媒介性形質転換、エアゾールビーミング、またはPEG形質転換、ならびに他の可能な方法が挙げられる。図1を参照すると、任意の公知の方法で遺伝子形質転換のために種子または種子外植片を準備するためのシステム10が示されている。
システム10は、トランスジェニックプロトコルおよびトランスジェニックダイズ製品の開発の一部としてダイズ種子(以降では種子12)を準備するように、例示的に構成される。例示のトランスジェニックプロトコルが、参照により本明細書に明示的に組み込まれる、「IMPROVED SOYBEAN TRANSFORMATON FOR EFFICIENT AND HIGH−THROUGHPUT TRANSGENIC EVENT PRODUCTION」という名称の米国特許出願第14/133,370号明細書、および「IMPROVED SOYBEAN TRANSFORMATION FOR EFFICIENT AND HIGH−THROUGHPUT TRANSGENIC EVENT PRODUCTION」という名称の米国特許出願第14/134,883号明細書において記載されている。本明細書に記載されるデバイスおよび方法のいずれも、これらの出願において開示される形質転換方法と関連して使用され得る、ということを諒解されたい。他の実施形態では、本明細書に記載されるデバイスおよび方法のいずれも、単子葉植物および双子葉植物の両方を含めた、形質転換技術を受け入れる他の類の植物とともに使用されるように構成され得ることも、認識されるべきである。
システム10は、いくつかの処理ステーション14、および処理ステーション14間で種子12を移動させる1対のロボットアーム16を含む。例示的な実施形態では、各ロボットアーム16は、その他のロボットアームから独立して動作するように構成される、EpsonのC3 6軸関節アームの機種である。他の実施形態では、ロボットアーム16は、本明細書に記載されるものとは異なる自由度の数を有し得る。たとえば、ロボットアーム16は、少なくとも独立した複数の軸を有するロボットアームとして具現化され得る。各アーム16は、種子12を握って保持するように構成された把持部18を含む。システム10は、アーム16のうちの1つが稼働していなくても動作させることができる。他の実施形態では、種子12を処理ステーション14間で移動させるために、システムが単一のロボットアーム16しか含まなくてよいことが、認識されるべきである。加えて、例示的な実施形態では、各ロボットアーム16は、対応する把持部18をその軸を中心に少なくとも180°回転させることができる。
図2に示すように、処理ステーション14およびロボットアーム16は、テーブル20上に配設される。処理ステーション14は、テーブル20の前部に位置付けられたドック22を含む。ドック22は、種子12がシステム10による処理のために位置付けられ得る1対の送達区域24、および種子12がシステム10による処理の後で位置付けられ得る1対の受容区域26を含む。ステーション14は、いくつかの種子12の画像を取り込むように動作可能な撮像ステーション28も含む。システム10は、ステーション28によって取り込まれた画像に基づいて各種子12を切断するように動作可能な切断ステーション30も含む。システム10は、ロボットアーム16の各把持部18を滅菌するように構成される滅菌デバイス32、および切断ステーション30において使用するための切断ブレードを受容する収容容器またはトレイ34も含む。
使用時には、システム10を、形質転換のためにいくつかのダイズ種子12を自動的に切断するように動作させることができる。そのようにするために、システム10は、ドック22の送達区域24のうちの1つの上に位置付けられたプレート36上に、種子12のうちの1つを配置することができる。システム10は次いで、選択された種子12を把持部18で握り、種子12を撮像ステーション28へと移動させるように、プレート36に最も近いロボットアーム16を動作させることができる。種子12の一連の画像が撮られた後で、アーム16は種子12を切断ステーション30まで進めることができ、形質転換のために種子12を準備するために、これに1回または複数回の切断を行うことができる。種子12を切断した後で、アーム16は、種子12を、ドック22の受容区域26のうちの1つの上に位置付けられた別のプレート38へと移動させることができる。使用者は次いで、切断された種子を含むプレート38を取り出して、トランスジェニックプロトコルに従って種子をさらに処理することができる。これらの処理ステップの各々およびシステム10の様々な構成要素が、図3〜図59を参照して、以下でより詳細に記載される。
ここで図3を参照すると、ドック22の一部分および送達区域24のうちの1つが、より詳細に示されている。例示的な実施形態では、その他の送達区域24は、図3に示す送達区域と同一である。送達区域24は、ドック22のプレート46内に画定される開口部内に位置付けられる円形基部40を含む。基部40は、プレート36のうちの1つを受容するようなサイズとされ、たとえばガラス、プレキシグラス、またはアクリルなどの、透明な材料で構築される。基部40は、頂部表面42からプレート46の下方に位置付けられた底部表面(図示せず)まで延びる。基部40は透明なので、基部40の頂部表面42上に静止している物体は、底部表面を通して(すなわちプレート46の下から)見ることができる。プレート46の底部に発光ダイオード(LED)パネル50が結合され、これは透明な基部40を通して、基部の頂部表面42上に静止している物体に照射するように構成される。例示的な実施形態では、以下でより詳細に記載されるように、LEDパネルは、十分に散乱されて反射率を最小化しかつ電子制御装置400によって制御され得る(図14を参照)変動可能な強度を有する、赤色光を放射する。
各種子担持プレート36はそこに、種子12を受容する収容容器44が画定されている。ドック22は、円形基部40を取り囲む複数の柱体またはガイドピン48を含む。図3に示すように、ピン48は、プレート46から上方へ延び、プレート36を基部40上で支持および/または固定するように設計される。他の実施形態では、ドック22は、プレート36を基部40上で案内、支持、および/または固定するための他の支持構造を含み得る。
上で示されたように、システム10は、プレート36が送達区域24に位置付けられるとき、または、より具体的には、プレート36が基部40上に位置付けられるとき、プレート36上に種子12を配置するように構成される。例示的な実施形態では、図1に示すように、送達区域24の上方に、カメラ52が位置付けられる。カメラ52は、電子制御装置400に電気的に結合され(図14を参照)、プレート36および種子12の画像を取り込むように動作可能である。以下でより詳細に記載されるように、システム10が処理のためにロボットアーム16を種子へと導くことができるよう、プレート36上の種子12の相対的な位置および配向を判定するために、画像は制御装置400に送られる。カメラ52は、スチルカメラ、ビデオカメラ、または動画および/または画像を取り込むことが可能な他のデバイスなどの、画像を取り込むのに好適な任意のデバイスとして具現化され得る。さらに、カメラによって取り込まれた画像を、カメラの光軸に対して垂直な平面上への、カメラの視野中の光景(たとえば前景の物体および背景)の投影として記載できることが、諒解されるであろう。
図2に戻ると、ドック22は、システム10による処理の後で種子12を位置付け得る場所である、1対の受容区域26も含む。送達区域24と同様に、各受容区域26は、プレート38のうちの1つを受容するようなサイズとされた区域を画定する、複数の柱体またはガイドピン48を含む。各ピン48はプレート46からから上方へ延び、ピン48は協働して、受容区域26内でプレート38を支持および/または固定する。
上記のように、システム10は、いくつかの種子12の画像を取り込むように動作可能な撮像ステーション28も含み、これらの画像は、各種子12に関する切断平面を判定するために使用される。ここで図4〜図5を参照すると、撮像ステーション28は、照明されるドーム54、およびテーブル20に固定される2つのカメラ56、58を含む。カメラ56、58は、電子制御装置400に電気的に結合され(図14を参照)、ドーム54の内部チャンバ62の画像を取り込むように動作可能である。例示的な実施形態では、照明されるドーム54は、バーモント州RochesterのAdvanced Illuminationによって製造された、直径8インチの白色LEDドーム照明である。照明されるドーム54は、椀形状のチャンバ62およびチャンバ62へのアクセスを可能にする円形開口部64を画定する、凹状の内部壁60を含む。
図5に示すように、ドーム54は、動作中にチャンバ62を照明するための、壁60に結合された複数のLED78も含む。例示的な実施形態では、LED78は、約20個のLEDのリングとして形成され、これらは、ドーム54内の物体上への反射を防止するために十分に散乱され、LED78から放射される光の強度を変更するために制御装置400によって制御可能である。リングは、ドーム54の上側内側縁部の周囲に装着される。他の実施形態では他の照明源を使用できることが、認識されるべきである。
ドーム54は、凸状の外部壁66、および壁66からテーブル20まで下方へ延びる複数の脚部68を含む。ドーム54は、凸状の外部壁66の頂点に、壁60、66を貫通して延びる下側開口部70を有する。例示的な実施形態では、上側開口部64および下側開口部70の中心を貫通して、中心軸72が延びる。ドーム54のカメラ56、58に面する側に、壁60、66を貫通して、別の開口部74が延びる。開口部74は、中心軸72と直交して延びる長手軸76を有する。
カメラ56、58の各々は、スチルカメラ、ビデオカメラ、または動画および/または画像を取り込むことが可能な他のデバイスなどの、画像を取り込むのに好適な任意のデバイスとして具現化され得る。カメラ56、58は、光軸80、82をそれぞれ含み、これらはドーム54の開口部70、74と位置合わせされる。例示的な実施形態では、光軸80、82は互いと平行であり、かつドーム54の中心軸72に対して垂直である。図4〜図5に示すように、開口部74の長手軸76は、カメラ58の軸82と一致する。加えて、いくつかの実施形態では、カメラ56、58の各々は、レンズを含むことができ、照明されるドーム54内に位置付けられた種子12の取り込まれた画像において、種子12が対応するカメラ56、58の視野の少なくとも半分内にあるように位置付けられ得る。
撮像ステーション28は、ドーム54の下側開口部70の下方に位置付けられる、角度の付いた鏡84を含む。角度の付いた鏡84は、チャンバ62からの光をカメラ56に向けて反射するように構成される。例示的な実施形態では、鏡84の表面86は、中心軸72およびカメラ56の光軸80の各々に対して、45度の角度で角度を付けられる。結果として、チャンバ62からの光は、光軸80に沿ってカメラ56に向かって反射される。他の実施形態では、鏡を省略すること、およびカメラ56をドーム54の直下に位置付けることができることが、認識されるべきである。加えて、他の実施形態では、カメラ58を、ドーム54の別の側に隣接して位置付けることができる。さらに他の実施形態では、カメラ56、58のうちの一方を省略することができる。
例示的な実施形態では、撮像ステーション28は、迷光のドーム54への進入の発生を低減し、撮像ステーション28において行われる撮像の品質を改善するための、追加の構成要素を含む。たとえば、(たとえば撮像ステーション28の環境からの)迷光がドーム54の中に入る機会を低減するために、ドーム54の円形開口部64を覆って、カバー90が位置付けられる。図5に示すように、ドーム54は、ドーム54のへり94に画定された複数のねじ山付き孔92を含む。各孔92は、カバー90をドーム54に固定するための対応する固定具96を受容するようなサイズとされる。
カバー90は、パッド102に固定される布帛シート100を含む。パッド102は、高温可撓性シリコンパッドから形成される。例示的な実施形態では、パッド102は、これがカメラ56によって撮像される画像の品質を改善するためのコントラストを成す背景として機能するように、黒色である。他の実施形態では、パッドをコントラストを成す別の色で作成できることが、認識されるべきである。さらに他の実施形態では、撮像ステーション28からパッドおよび/またはカバーを省略することができる。図5に示すように、カバー90は、ロボットアーム16が種子12をドーム54内へと進めることを可能にする、中心開口部108を有する。
撮像の品質を改善するための別の構成要素は、ドーム54に固定されたバックストップ54である。図5に示すように、バックストップ106は、ドーム54のチャンバ62内に位置付けられる。バックストップ106は、パッド102と同様に、カメラ58によって取り込まれる種子12の画像のためのコントラストを成す背景として働くように構成される。他の実施形態では、バックストップをコントラストを成す別の色で作成できることが、認識されるべきである。さらに他の実施形態では、撮像ステーション28からバックストップを省略することができる。さらなる他の実施形態では、撮像ステーション28は、照明されるドーム54に加えてまたはその代替として、たとえば別の照明される中空体構造、平面状の単色の背景幕、または何らかの他の好適な撮像環境のなどの、種子12の画像を取り込むための環境を含み得る。
上記のように、システム10は、ステーション28によって取り込まれた画像に基づいて各種子12を切断するように動作可能な切断ステーション30も含む。ここで図6を参照すると、切断ステーション30は、プラットフォーム110、およびプラットフォーム110上の種子12を切断するように動作可能な切断デバイス112を含む。プラットフォーム110は、テーブル20から上方へ延びる台座114、および台座114の上側端部118に固定された種子切断ブロック116を含む。台座114は、たとえばステンレス鋼またはアルミニウムなどの、金属材料から形成される。例示的な実施形態では、切断ブロック116は、たとえばステンレス鋼などの磁性金属材料から形成される。他の実施形態では、台座および/または切断ブロックが、プラスチック、テフロン、またはセラミックなどの他の剛性材料から形成され得ることが、認識されるべきである。
図7に示すように、切断ブロック116は、滅菌または修理のために台座114から取り外されるように構成される。例示的な実施形態では、台座114は、上側端部118に隣接して位置付けられる永久磁石120を含む。切断ブロック116が台座114上に位置付けられるとき、磁石120は、切断ブロック116を台座114上に保持するような力を及ぼす。磁石がブロック116を台座114上に保持するために必須ではないことを諒解されたい。例示的な実施形態では、台座114の設計は、その上にブロック116を保持するのに十分である。
例示的な実施形態では、切断ブロック116は、本体122、および本体122から外向きに延びるフランジ124を有する。本体122の下側端部126は、実質的に平面上の底部表面128を有し、本体122は、実質的に平面状の頂部表面130を有する。底部表面128から上方へ、1対の角度の付いた表面132、134が延びる。角度の付いた表面132は、頂部表面130まで鉛直に延びる背部表面136に接続される。図7に示すように、角度の付いた表面132および背部表面136は、それらにスロット138が画定されている。
図7に示すように、台座114の上側端部118に溝140が画定され、溝140は、ブロック本体122の下側端部126を受容するように構成される。例示的な実施形態では、溝140は、実質的に平面状の表面142、および表面142から上方へ延びる1対の角度の付いた表面144、146によって画定される。そのようにして、溝140の構成は、ブロック本体122の下側端部126の構成に適合する。
台座114は、ブロック116が溝140内に位置付けられるとき切断ブロック116の背部表面136に面する、後方壁148も含む。後方壁148から外向きに、位置合わせピン150が延びる。位置合わせピン150は、切断ブロック116が台座114上に適正に位置付けられることを保証するために、ブロック116に画定されたスロット138内に受容されるようなサイズとされる。
図7〜図8に示すように、切断ブロック116のフランジ124は、本体122から前方壁154まで外向きに延びる。フランジ124は、実質的に平面状の上方壁156、および上方壁156の反対側に位置付けられる実質的に平面状の下方壁158を含む。上方壁156は、ダイズ種子12を受容するようなサイズとされる。他の実施形態では、切断されるべき種子のサイズに従って上方壁156をサイズ変更できることが、認識されるべきである。
前方壁154に開口部160が画定される。フランジ124の前方壁154から内向きに、複数の内壁162が延びて、壁156、158の各々を貫通するようにスロット164を画定する。図8に示すように、スロット164は、フランジ124において中心に配置され、フランジ124の後縁部174と前方壁154との間に位置付けられた後方縁部166まで延びる。以下でより詳細に記載されるように、スロット164は、切断ブレード170を、このブレードが鉛直方向に回転されるときに受容するようなサイズとされる。
図9に示すように、ブロック本体122は、フランジ124の後縁部174から上側縁部176まで上方へ延びる、実質的に平面状の側壁172を有する。例示的な実施形態では、側壁172は、上方壁156と直交するように延びる。側壁172の上側縁部176に、別の側壁178が接続される。側壁178は、壁156、172に対して斜めに、ブロック116の頂部表面130に接続された頂縁部180まで延びる。
図6に戻ると、切断ステーション30は、プラットフォーム110上の種子12を切断するように動作可能な切断デバイス112も含む。切断デバイス112は、切断ブレード170を受容するように構成された支持アーム190、および切断動作中に切断ブレード170を移動させるように構成された駆動組立体192を含む。駆動組立体192は、テーブル20に固定される駆動ステージ194を含む。駆動ステージ194は、下側本体196、および下側本体196に対して図6において矢印200で示す方向に摺動するように構成された上側本体198を含む。駆動ステージ194は、制御装置400に電気的に接続され上側本体198を下側本体196に対して移動させるように動作可能な、リニア駆動電動モータ(図示せず)を含む。例示的な実施形態では、駆動ステージ194は、約50ミリメートルの移動距離を有する、AerotechのANT95−50−Lの機種である。
切断デバイス112の駆動組立体192は、駆動ステージ194とともに移行する中間駆動ステージ210を含む。中間駆動ステージ210は、駆動ステージ194の上側本体198に接続される基部212を含む。駆動ステージ210は、基部212へと移動可能に結合されるプラットフォーム214も含む。例示的な実施形態では、プラットフォーム214は、図6において矢印216で示す方向において鉛直方向に移動するように構成される。駆動ステージ210は、制御装置400に電気的に接続されプラットフォーム214を基部212に対して移動させるように動作可能な、リニア駆動電動モータ(図示せず)を含む。駆動ステージ210は例示的に、約3ミリメートルの移動距離を有する、Aerotechの機種ANT95−3−Vとして具現化されている。
図6に示すように、駆動組立体192は、他のステージ194、210とともに移行する回転ステージ220を含む。回転ステージ220は、駆動ステージ210のプラットフォーム214に接続される主本体222を含む。回転ステージ220は、主本体222に枢動するように結合される装着シャフト224も含む。装着シャフト224によって軸226が規定され、シャフト224は、軸226を中心に矢印228で示す方向に回転するように構成される。例示的な実施形態では、回転ステージ220は、たとえば圧縮機などの、圧縮空気の供給源230に接続される。供給源230は、制御装置400に電気的に接続される。制御装置400によって操作されるとき、供給源230は、圧縮空気をステージ220へと進め、このことにより、シャフト224は、軸226を中心に空圧により駆動される。回転ステージ220は例示的に、EMIのPlastics Equipment Swiveling Rotary、型式RT25として具現化されている。
切断デバイス112の支持アーム190は、回転ステージ220に固定される。図6に示すように、支持アーム190は、ステージ220の装着シャフト224に固定された端部242を有する、細長い本体240を含む。支持アーム190は、本体240の反対側の端部248に固定される1対の顎部244、246も含む。例示的な実施形態では、顎部244、246の各々は、細長い本体240に画定された溝252内に受容される端部250を有する。溝252は長手軸254を規定し、顎部244、246は、溝252に沿って互いに向かっておよび互いから離れるように移動するように構成される。そのようにして、顎部244、246を開閉することができる。例示的な実施形態では、支持アーム190は、圧縮空気の供給源256に接続される。供給源256は、制御装置400に電気的に接続される。制御装置400によって操作されるとき、供給源256は、圧縮空気を支持アーム190へと進め、このことにより、顎部244、246は、溝252に沿って空圧により駆動される。支持アーム190は例示的に、SMCのMHZ2−20C1−M9PZ把持装置として具現化されている。
顎部244、246は、切断ブレード170を受容するように構成される。ここで図10〜図11を参照すると、各切断ブレードは、本体260、および本体260の長さだけ延びる切断縁部262を含む。切断縁部262は、切断ブレード170が顎部244、246に固定されるとき、回転軸226からずれている。本体260は、切断ブレード170をデバイス112に固定するために顎部244、246が係合する、1対の楕円形の装着穴264も含む。切断ブレード170は例示的に、鋼などの金属材料からから形成される。
顎部244、246の各々は、端部250から先端部270まで延びる。顎部244、246の各々は、先端部270の内側縁部274に沿って位置付けられた内側タブ272を含む。各タブ272は、切断ブレード170の穴264のうちの1つの中に位置付けられるようなサイズとされる。例示的な実施形態では、顎部244、246の各々は、各タブ272の基部に形成されるスロット276(図10Bを参照)も含む。例示的な実施形態では、各スロットは、ブレードを捕捉しこれを水平に保持するように構成される。図11Aおよび図11Bに示すように、ブレード170は、顎部244、246が離れるように移動されるときにスロット276内へと進められ、このことによりブレードが顎部244、246に固定される。顎部244、246の各々は、先端部270の外側縁部280に沿って位置付けられる外側タブ278も含む。外側タブ278は、ブレード170が顎部244、246上に挿入される際にその位置合わせを補助するための、面取りされた縁部282を含む。
図11Aに示すように、支持アーム190の細長い本体240は、長手軸284を有する。例示的な実施形態では、切断ブレード170は、顎部244、246に固定されるとき、軸284からずらされている。動作中、軸284からの切断ブレード170のずれにより切断ブレード170は低くなり、切断ブレードがダイズ種子を切断するときにロボットアームに接触することになるリスクを低減する。
ここで図12を参照すると、ロボットアーム16同士の間に、未使用の切断ブレード170を保持するためのトレイ34が位置付けられている。トレイ34は、光源304の上方に位置付けられた容器302を含む。容器302は例示的に、たとえばプレキシグラスなどの透明な材料から形成される。容器302は、底部壁306、および底部壁306から上方へ延びる複数の側壁308を含む。壁306、308は協働して、未使用の切断ブレード170を受容するようなサイズとされたチャンバ310を画定する。
例示的な実施形態では、トレイ34の光源304は、底部壁306の下方に位置付けられる。光源304は、底部壁306を通してチャンバ310内へと光を投影するように動作可能である。光源304は例示的に、赤色発光ダイオード(LED)として具現化されている。他の実施形態では他の色のLEDを使用できることが、認識されるべきである。さらに他の実施形態では、他の光源を使用してもよい。
システム10は、トレイ34の上方に装着される、トレイカメラ312を含む。カメラ312は、チャンバ310の内容物の画像を取り込むように動作可能である。カメラ312は、電子制御装置400に電気的に結合される(図14を参照)。以下でより詳細に記載されるように、システム10が取り出しのためにロボットアーム16をブレード170へと導くことができるよう、トレイ34内のブレード170の相対的な位置および配向を判定するために、画像を制御装置400に送ることができる。
ここで図13を参照すると、システム10の各ロボットアーム16は、ダイズ種子12を握って保持するように構成された把持部組立体320を含む。例示的な実施形態では、把持部組立体320は、各アーム16の遠位部分324に取り付けられる本体322を含む。把持部組立体320は、本体322を把持部18に接続する緩衝機構326も含む。本体322は、遠位アーム部分324に固定される近位ディスク328、およびディスク328から遠位ディスク332まで延びる複数の柱体330を有する。
緩衝機構326は、ディスク332に固定される近位端334から遠位端336まで延びる。図13に示すように、把持部18は、緩衝機構326の遠位端336に固定される。緩衝機構326は、矢印338、340で示すような、把持部18のある程度の軸方向移動を可能にするように構成され、このことにより、種子を破壊することなく、把持部18を進めてダイズ種子12と接触させることができる。例示的な実施形態では、緩衝機構326は、たとえばコイルばね342などの、把持部18を外向きに、矢印340で示される方向に付勢する、付勢要素を含む。
組立体320の把持部18は、種子12を握って掴み保持するように構成される。例示的な実施形態では、把持部18は、緩衝機構326の遠位端336に固定される、円筒形本体350を含む。本体350は、たとえばDuPont Corporationから市販されているVitonなどの、エラストマー材料から形成される。他の実施形態では他の色のエラストマー材料を使用できることが、認識されるべきである。本体350は、本体350に限定された可撓性を与える蛇腹部を含む。本体350は、把持部18の滅菌を可能にするための高い温度定格も有する。例示的な実施形態では、温度定格は華氏446度である。他の実施形態では他の色のエラストマー材料を使用できることが、認識されるべきである。
把持部組立体320は、真空を介して種子12を握って保持するように構成される。そのようにするために、把持部18は、軸358に沿って本体350を通って長手方向に延びる中空の通路352を含む。通路352は、緩衝機構326に画定された通路354と把持部組立体320の本体322と負圧源356とに接続される。負圧源356は例示的にポンプとして具現化されており、制御装置400に電気的に結合されている。制御装置400は、通路352、354を通して真空を引き、種子12を把持部18に固定させるように、負圧源356を動作させることができる。例示的な実施形態では、把持部18は、種子12の平均長さの50%未満の半径を有するが、これは、たとえば種子12の特定の種に応じて変動し得る。
図13に示すように、駆動組立体320は、本体350に固定される2次カバー360も含む。2次カバー360は、種子12の撮像中に迷光が照明されるドーム54の中に入ることを防止するように設計される。カバー360は、黒色の発泡材から形成された底部パッド362、および黒色のフェルトから形成される頂部パッド364を含む。例示的な実施形態では、カバー360は、接着剤を介して遠位ディスク332に固定される。他の実施形態では、カバー360をねじまたはボルトなどの固定具を用いて固定できることが、認識されるべきである。カバー360は、ドーム54のカバー90の中心開口部108を包囲するのに十分である、約3.5インチの直径を有する。
ここで図14を参照すると、システム10は、電子制御装置400を含む。制御装置400は、本質的には、システム10と関連付けられたセンサによって送られた電気信号の翻訳と、システム10と関連付けられた電子制御式構成要素の作動または電力供給とを担う、マスタコンピュータである。たとえば、電子制御装置400は、カメラ52、56、58、312、ドームの照明78、ロボットアーム16、駆動ステージ194、210、などの動作を制御するように構成される。図14では電子制御装置400は単一のユニットとして示されているが、制御装置400は、様々な構成要素のためのいくつかの個々の制御装置、ならびに様々な個々の制御装置からの信号を送信および受信する中心のコンピュータを含み得る。電子制御装置400は、システム10の様々な動作がいつ行われるべきかの判定も行う。以下により詳細に記載されるように、電子制御装置400は、システム10がトランスジェニックプロトコルにおいて使用するためのダイズ種子12を選択および処理するよう、システム10の構成要素を制御するように、動作可能である。
そのようにするために、電子制御装置400は、電気機械システムの制御において利用される電子ユニットと一般に関連付けられる、いくつかの電子構成要素を含む。たとえば、電子制御装置400は、そのようなデバイスに慣例的に含まれる構成要素の中でもとりわけ、マイクロプロセッサ402などのプロセッサ、および消去可能PROM(EPROMまたはEEPROM)を含むプログラム可能読み取り専用メモリデバイス(「PROM」)などの、メモリデバイス404を含み得る。メモリデバイス404は、とりわけ、たとえばマイクロプロセッサ402によって実行されると電子制御装置400がシステム10の動作を制御するのを可能にする1つの(または複数の)ソフトウェアルーチンの形態の、命令を保存するために提供される。
電気的コンタクト400は、アナログインターフェース回路406も含む。アナログインターフェース回路406は、様々な構成要素からの出力信号を、マイクロプロセッサ402の入力部に与えるのに好適な信号へと変換する。特に、アナログインターフェース回路406は、アナログ−デジタル(A/D)変換器(図示せず)などの使用により、センサによって生成されたアナログ信号を、マイクロプロセッサ402が使用するためのデジタル信号へと変換する。A/D変換器を、個別のデバイスもしくはいくつかのデバイスとして具現化できるか、またはマイクロプロセッサ402に組み込むことができることを諒解されたい。システム10と関連付けられたセンサのうちのいずれか1つまたは複数がデジタル出力信号を生成する場合、アナログインターフェース回路406を迂回してもよいことも諒解されたい。
同様に、アナログインターフェース回路406は、マイクロプロセッサ402からの信号を、システム10と関連付けられた電子制御式構成要素(たとえばロボットアーム16)に与えるのに好適な出力信号へと変換する。特に、アナログインターフェース回路406は、デジタル−アナログ(D/A)変換器(図示せず)などの使用により、マイクロプロセッサ402によって生成されたデジタル信号を、システム10と関連付けられた電子制御式構成要素が使用するためのアナログ信号へと変換する。上記のA/D変換器と同様に、D/A変換器を、個別のデバイスもしくはいくつかのデバイスとして具現化できるか、またはマイクロプロセッサ402に組み込むことができることを諒解されたい。システム10と関連付けられた電子制御式構成要素のうちのいずれか1つまたは複数がデジタル入力信号に基づいて動作する場合、アナログインターフェース回路406を迂回してもよいことも諒解されたい。
このように、電子制御装置400は、システム10の動作を制御するように動作し得る。特に、電子制御装置400は、とりわけ電子制御装置400がシステム10と関連付けられたセンサの出力を監視しシステム10の電子制御式構成要素への入力を制御する制御スキームを含む、ルーチンを実行する。そのようにするために、ロボットアーム16の電力供給、カメラ52、56、58、312の作動、駆動ステージ194、210の電力供給、画像コントラストを改善するためのLED78およびLEDパネル50の光強度の変更、などのような機能を実行するためのアルゴリズムを実行するために、電子制御装置400は、連続的にかまたは間欠的にかのいずれかで、事前にプログラムされたテーブル中の値の検索を含む多数の計算を行う。
動作時には、システム10を、図15〜図19において概説される例示の手順に従って動作させて、トランスジェニックプロトコルにおいて使用するためのダイズ種子12を、自動的に選択および処理することができる。たとえば、種子12の子葉をへそに沿って分割して子葉を分離することによって、ダイズを準備することができる。胚軸の一部分を除去すると、形質転換に先立って、この軸の一部は子葉と結合したまま残る。胚軸の除去を、切断デバイス112を用いて胚軸をトリミングすることによって行うことができる。典型的には、1/3から1/2の間の胚軸が、子葉の節の端部において結合したまま残る。
図20〜図29に示すように、システム10は、予備ステップにおいて、ロボットアーム16の把持部18を滅菌し、切断ステーション30のための切断ブレード170を選択し、送達区域24内に配置された種子12の画像を取り込む。その後、システム10は、図27〜図31に示すように、送達区域24のうちの1つから種子12を拾い上げ、種子12を撮像ステーション28へと進めるように、ロボットアーム16のうちの1つを動作させる。種子12が切断ステーション30へと進められる前に、図32〜図55に示すように、撮像ステーション28によっていくつかの画像を取り込むことができる。図56〜図59に示すように、形質転換のために種子12を準備するために、これに1回または複数回の切断を行うように、切断ステーション30を動作させることができる。次いで切断された種子を、受容区域26のうちの1つへと進めることができる。次いで使用者は、さらなる処理のために、種子をシステム10から取り出すことができる。次いでシステム10は、別の種子12を拾い上げ処理する前に、いくつかの清掃および保守作業を行うことができる。
図60〜図62に示すように、ダイズ種子12は、種皮416内に包まれている1対の子葉412、414を含む。ダイズ種子12は、その最大寸法に沿って規定される長手軸418を有し、ダイズ種子12の対向する長手端部420、422を通って延びる。図60に示すように、軸418は、子葉412、414の間に延びる。
ダイズ種子12は、ダイズ種子12の端部420、422の間に位置付けられたへそ424も含む。例示的な実施形態では、へそ424は、種皮416の外側に位置付けられる外側部分426、および種皮416の下に位置付けられる内側部分428を含む。
図60〜図61に示すように、へそ424は、子葉412、414の上方で背面側に配置される。へそ424の外側部分426は、ダイズ種子12の背面側430に位置付けられる。へそ424は、ダイズ種子12の外方側432(図61を参照)または内方側434(図5を参照)から見ることもできる。図61に示すように、へそ424は、種子12の全体的な長手軸418と平行に延びる長手軸436を有する。図60に示すように、長手軸436は、種子12の軸418と共通の平面438内に存在する。
ダイズ種子12の胚軸440は、子葉412を子葉414に接続している。胚軸440は、子葉412、414とともに種皮416内に包まれている。図60に示すように、胚軸440は、へそ424と同様に、ダイズ種子12の長手軸418上に中心が置かれている。図62に示すように、胚軸440は、へそ424の内側部分428の上方に位置付けられた先端部442から、種子12の長手端部420に隣接して位置付けられた基部444まで延びる。他の実施形態では、胚軸440がへそ424と重ならない場合があり、その場合、軸の先端部442がへその内側部分428から離間されていることが、認識されるべきである。
図62を参照すると、ダイズ種子12の内部構造がより詳細に示されている。種皮416は、子葉412、414および胚軸440を取り囲む、薄い外側層450を含む。へそ424の内側部分428は、層450の下面に結合しており、一方、へそ424の外側部分426は、外側層450の縁部452に接続している。胚軸440は、その先端部442から種子の端部420に隣接して位置付けられたその基部444まで、種子12の外周の一部分の周囲に延びる。
ここで図15〜図16を参照すると、システム10を用いる、形質転換のためにダイズ種子12を準備するための例示的な操作手順1000が示されている。手順1000の開始に先立って、制御装置400が、システム10の較正、使用者へのメッセージの提供、使用者入力の取得、安全機構(たとえば光カーテン)の初期化、および他の設定機能の実行を行えることが諒解されるであろう。たとえば、まだ行われていない場合、制御装置400は、ロボットアーム16の座標系を様々なカメラ52、56、58、312にマッピングするかまたはその他の方法で相互に関連付けて、画像に取り込まれた物体の位置をアーム16に対するその物体の位置に読み替えできるようにするための、任意の好適なプロトコルを使用して、システム10を較正することができる。さらに、制御装置400は、ディスプレイ460上での使用者への(たとえばプレート36を送達区域24上に置くための)設定指示の提供、使用者入力デバイス462を介した使用者からの入力(たとえば種子12の胚の節の所望のトリミング深さ、種子12の二分の深さ、等)の取得を行うことができる。使用者入力デバイス462を、キーボード、マウス、タッチスクリーン、および/または本明細書に記載される機能を実行するように構成された他の入力デバイスなどの、任意の組み込まれたまたは周辺のデバイスとして具現化することができる。
ブロック1002では、システム10は、ロボットアーム16の把持部18を滅菌する。そのようにするために、制御装置400は、各ロボットアーム16を、その対応する把持部18をエタノールまたは別の好適な滅菌溶液で充填された容器内に挿入するように動作させる。溶液は例示的に、70%のアルコールを含有する。図20に示すように、把持部18を滅菌装置32内へと進める前に、把持部18をエタノール中である程度の時間の間上下および左右に移動させるように、ロボットアーム16を動作させることができる。例示的な実施形態では、各滅菌装置32は、たとえばInoTech BioScienceのSteri 250のような、乾熱式ガラスビーズ滅菌装置である。例示的な実施形態では、ロボットアーム16をやはり、把持部18を滅菌装置32内で数秒間上下に移動させるように動作させることができる。次いでアーム16は、把持部18を冷却できるように、把持部18を滅菌装置32から引き出すことができる。
滅菌装置32によって生成される熱により、把持部18の蛇腹部が1つにくっついてしまう場合があり、この結果、把持部18の性能が損なわれる場合がある。蛇腹部を分離させるために、ロボットアーム16はその場合、把持部18を移動させて、たとえば図21に示すような切断ブロック116の頂部表面130などの、平坦な無菌表面に接触させることができる。次いで制御装置400は、負圧源356を作動させて、把持部18を切断ブロック116に封止する。図22〜図23に示すように、把持部18は、吸引が破れるまで、1mmずつの増分で切断ブロック116から離れるように移動される。
図15に戻ると、手順1000は次いで、ブロック1004に進むことができる。ブロック1004では、切断ブレード170が選択され、トレイ34から取り出される。そのようにするために、制御装置400は、トレイ34内のブレード170の画像を取り込むようにカメラ312を動作させる。1つのそのような画像500が、図24に示されている。図24〜図25に示すように、ブレード170を、トレイ34内に、互いに対して無作為の位置および配向で位置付けることができる。制御装置400は、取り込まれた画像500を処理して、トレイ34内のブレード170のうちの1つの位置516を識別することができ、これは、図25に示すような分析される画像518によって反映され得る。
たとえば、例示的な実施形態では、制御装置400は、EpsonのC3 6軸関節アームの機種に付属のソフトウェアパッケージの、幾何学的物体識別機能を利用する。特に、使用者がロードし制御装置400のメモリデバイス404に保存されたブレードの基準画像(図示せず)が、一致502を識別するために、ブレード170の取り込まれた画像500と比較される。幾何学的物体識別機能は、縁部に基づいた幾何学的特徴を使用することによって基準画像(すなわち物体モデル)との一致を識別する、アルゴリズム的手法を採用する。さらに、幾何学的物体識別機能は、別の画像との比較のために使用されることになる基準画像、および一致502に関して要求される容認または許容レベルなどの、様々なパラメータを含む。容認レベルは一致502の尤度に対応し、本明細書において、一般性を失うことなく、0から1の間の正規化された値と見なすことができる。したがって、容認レベルが0.5に設定される場合、分析される画像中の、好適な画像化アルゴリズムに基づく基準画像との一致502の尤度が少なくとも50%である物体のみが、制御装置400によって識別されることになる。具体的な実施形態では、容認レベルは、一致502を構成する、分析される画像の連続的な領域における、識別されねばならない基準画像のパーセンテージに対応していてよい。
例示的な実施形態では、制御装置400は、照合アルゴリズム、ブレードの基準画像、および0.4(すなわち1000中400)である正規化された容認レベルを使用して取り込まれた画像500を分析して、トレイ34上にいくつかのブレード170が存在するかどうかを判定する。いくつかのブレード170がトレイ34上にある場合、ブレード170が重なり合う場合でも、そのような容認レベルはトレイ34上のそれらのブレード170の識別される位置を返すべきである、ということが前提とされる。したがって、別の実施形態では、異なる容認レベルを使用することができる。ブレード170が1つもが識別されない場合、制御装置400は、トレイ34上にブレード170が1つも配置されていないと判定し、このエラーを処理する。たとえば、制御装置400は、ディスプレイ460を介してシステム10の使用者に、トレイ34上に追加のブレード170を置くかまたは他の方法でエラーを修正するように指示することができる。
制御装置400が、トレイ34上に少なくとも1つのブレード170が配置されていると判定する場合、制御装置400は、トレイ34上の別のブレード170と重ならないブレード170を識別するために、取り込まれた画像500を、0.95(すなわち1000中950)などのより高い閾値に設定された容認レベルで再度分析する。少なくとも1つの重なっていないブレード170が識別される場合、制御装置400は、そのブレード170を選択して使用する。しかしながら、重なっていないブレード170が識別される場合は、制御装置400は、重なっているブレード170を分離するプロトコルを実行する。
そのようにする際に、制御装置400は、トレイ34上の別のブレード170と重なるブレード170の位置を識別する。たとえば、制御装置400は、保存されていれば0.4に設定された正規化された容認レベルで識別された画像位置を使用できるか、または、画像500を同様に分析することができる。ブレード170の集まりが識別されると、制御装置400は、好適な画像化アルゴリズムを使用して(たとえば集まり重心を検出することによって)集まりの幾何学上の中心を判定し、把持部組立体320をブレード170の集まりを識別された重心において握るための位置へと移動させるように、対応するロボットアーム16に命令する。
トレイ34またはプレート36から物体を握るために、把持部組立体320は、把持部組立体の中空の通路352が点504とほぼ同一直線上にあるように、物体の把持の位置または点504の上方に位置付けられる。次いで把持部組立体320は、把持部18が物体の外部表面と完全に接触するまで、物体に向かって下方へ進められる。上記のように、緩衝機構326は、把持部18が物体の表面と完全に接触して吸引力の損失が限定されるようにするのを保証しつつ、物体が破壊されるのを防止するように動作する。次いで負圧源356を作動させて、物体を把持部18に固定することができる。
同様に、重なっていないブレードが存在しない場合、把持部組立体320は、識別された重心においてブレード170の集まりを握ることができる。次いで制御装置400は、把持部組立体320を、トレイ34の表面の上方で鉛直方向に短い距離(たとえば1インチ)だけおよび水平方向に短い距離だけ、ただし依然としてトレイ34の外周内で移動させるように、アーム16を動作させることができる。次いで制御装置400は、負圧源356の動作を停止させて、ブレード170の集まりを落下させてトレイ34上へと戻す。集まりの中のブレード170のうちの1つまたは複数が、移送中に落ちる場合があることが諒解されるであろう。制御装置400は、トレイ34内のブレード170の別の画像を取り込むようにカメラ312を動作させ、上記したものと同様に新しい画像を分析して、重なっていないブレード170を識別する。重なっていないブレード170が1つも識別されない場合、制御装置400は、ブレード170の集まりを握ってブレード170をトレイ34内の別の位置上に落下させるように、把持部組立体320に再度命令することができる。制御装置400は、重なっていないブレード170が識別され使用のために選択されるまで、このルーチンの反復を継続することができる。
別の実施形態では、制御装置400は、重なっているブレード170を分離し特定のブレード170を識別して選択するための他の手順を実施できる。さらに、制御装置400は、トレイ34内のブレード170の位置を識別するための任意の好適な画像処理アルゴリズムおよび技術を利用することができる。たとえば、制御装置400は、Speeded Up Robust Features(SURF)、Scale−Invariant Feature Transform(SIFT)、Multi−Scale Oriented Patches(MOPS)、Canny、画像勾配演算子、およびソーベルフィルタなどの特徴検出アルゴリズム、技術、およびフィルタを利用して、画像500およびブレードの基準画像の特徴(たとえば角部、縁部、ブロブ等のような関心点)を識別することができる。いくつかの実施形態では、制御装置400は、Random Sample Consensus(RANSAC)アルゴリズムなどの特徴照合アルゴリズムを利用して、画像500およびブレードの基準画像中の識別されたいずれかの特徴が互いに対応するかを、および対応する場合、これらの特徴の対応する位置を、判定することができる。加えてまたは別法として、制御装置400は、画像分割アルゴリズム(たとえば、ピラミッド分割、ウォーターシェッドアルゴリズム、等)を利用して、画像中の物体を識別することができる。特定の実施形態に応じて、制御装置400が、取り込まれた画像の分析中に、上記のアルゴリズムのうちのいずれか1つまたは複数を利用できることが諒解されるであろう。
制御装置400がブレード170を識別した後で、制御装置400は、たとえばブレード170の装着穴264などのブレードの特徴を使用して、ブレードの切断縁部262の位置を特定する。次いで制御装置400は、把持部組立体320に対するブレード170の回転角度を計算し、把持部18の取り付けのためのブレード上の正しい配置点504を計算することができる。把持部組立体320は、上記のものと同様に、点504においてブレードを握る。
図15に戻ると、把持部18がブレード170を拾い上げると、手順1000はブロック1006に進む。ブロック1006では、制御装置400は、切断ブレード170を切断デバイス112に固定するように、ロボットアーム16および切断デバイス112を動作させる。そのようにするために、制御装置400は、ロボットアーム16を作動させて、切断ブレード170を切断ステーション30へと移動させ、切断ブレード170を、切断デバイス112の顎部244、246の上方に位置付ける。切断ブレード170を顎部244、246上に位置付けるために、ロボットアーム16を円形の動きで移動させて、ブレード170の楕円形の装着穴264を、顎部244、246のタブ272と位置合わせすることができる。外側タブ278の面取りされた縁部282は、ブレード170をタブ272上に案内するのを補助する。ブレード170がタブ272上に位置付けられるとき、把持部18は下方へ移動されて、ブレード170を僅かに偏向させる。図26に示すように、次いで制御装置400は、ブレード170を切断デバイス112に固定するように、顎部244、246を動作させることができる。カメラ(図示せず)を使用して、切断デバイス112上に位置付けられたブレード170の画像を取り込むことができ、また制御装置400は、上記のものと同様の画像処理技術を使用して、ブレード170が顎部244、246上に適正に位置付けられていることを確認することができる。
ブレード170が顎部244、246上に位置付けられた状態で、制御装置400は、顎部244、246を細長い本体240の溝252に沿って外向きに移動させるように、圧縮空気源256を動作させることができる。顎部244、246が外向きに進められるにつれ、切断ブレード170の部分がタブ272の基部に形成されたスロット276内へと進められ、このことにより切断ブレード170を顎部244、246に固定する。制御装置400は、真空源356の動作を停止させて把持部18から切断ブレード170を解放し、把持部18を切断ステーション30から外に移動させるようにロボットアーム16を動作させることができる。
図15に戻ると、手順1000はブロック1008に進み、ここでは制御装置400は、対応する送達区域24内に位置付けられたプレート36上の種子12の画像を取り込むように、カメラ52を動作させる。1つのそのような画像510が、図27に示されている。図27に示すように、およびトレイ34内のブレード170に関して上記したものと同様に、種子12を、プレート36内に、互いに対して無作為に位置付けることができる。
ブロック1010では、制御装置400は、取り込まれた画像510を処理して、選択するためにプレート36上の種子12のうちの1つの位置を判定することができる。そのようにするために、制御装置400は、照合アルゴリズム(たとえば上記の幾何学的物体識別機能)を使用して取り込まれた画像510を分析して、図28に示すような側部を下にしている種子12の基準画像512を、取り込まれた画像510と比較することができる。例示的な実施形態では、制御装置400は、システム10の使用者が、種子12の各々を、プレート36内に側部を下にして単一の層として置いたことを前提としている。したがって、一致522を検出する尤度は高い。しかしながら、他の実施形態では、制御装置400は、そのような前提を行わなくてもよい。そうではなく、制御装置400は、たとえば、存在する場合、適切に配向されていないのはどの種子12であるかを判定し、これらの種子12を無視することができる。システム10は、警告を生成するかまたは状況を修正するように(たとえばディスプレイ460を介して)使用者に指示することができるか、あるいはその他の方法でエラーに対処することができる。他の実施形態では、制御装置400は、ブロブ検出または他の画像分析アルゴリズムを使用して、プレート36上の種子12の位置を判定することができる。
いずれの場合でも、制御装置400は、プレート36上の1つまたは複数の種子12の位置520を判定し、これを、図29に示すような分析される画像514が反映することができる。さらに、いくつかの実施形態では、制御装置400は、基準画像512において描写された種子12に対する、プレート36上の識別された種子12の回転の角度を判定する。この情報に基づいて、制御装置400は、固定された種子12を把持部18の表面に事前に規定された配向(たとえばロボットアーム16の座標系に対してゼロ度の角度)で置くために把持部18を回転させるべき量を、判定することができる。そのようにすることにより、制御装置400を、以下に述べるように種子12のへそおよび胚軸(embryo axis)(すなわち胚に関する軸(embryonic axis))識別し、処理時間を短縮することができる。
図15に戻ると、手順1000はブロック1012に進む。ブロック1012では、制御装置400は、システム10によってトリミングおよび二分するために、種子のうちの1つを(たとえば無作為にまたはアルゴリズムを使用して)識別および選択する。例示的な実施形態では、制御装置400は、選択された種子12の重心を識別し、これを図30に示すような把持部18を取り付けるための点504として使用する。ブロック1014では、把持部組立体320は、選択された種子12をその重心において握る。そのようにするために、把持部組立体320は、把持部組立体の中空の通路352が点504とほぼ同一直線上にあるように、重心(すなわち点504)の上方に位置付けられる。次いで把持部組立体320は、把持部18が種子の外部表面と完全に接触するまで、選択された種子に向かって下方へ進められる。上記のように、緩衝機構326は、把持部18が種子の表面と完全に接触して吸引力の損失が限定されるようにするのを保証しつつ、種子が破壊されるのを防止するように動作する。次いで負圧源356を作動させて、種子を把持部18に固定することができる。次いで手順1000はブロック1016に進み、ここでは、図31に示すように、ロボットアーム16は、把持された種子12をカバー90の中心開口部108を通して照明されるドーム54のチャンバ62内へと移動させる。例示的な実施形態では、把持された種子12は、チャンバ62内でカメラ56、58の各々の視野内の位置(たとえば光軸80、82の交差点)に位置付けられる。たとえば、いくつかの実施形態では、把持された種子12は、少なくとも部分的に、チャンバ56、58の各々の焦点面内に位置付けられる。
図15に示すように、種子12が照明されるドーム54のチャンバ62内に位置付けられると、手順はブロック1018に進む。ブロック1018では、制御装置400は、切断デバイス112を用いて種子12をトリミングおよび二分するための、把持された種子12の適正な配向を判定する。すなわち、制御装置400は、種子12の胚をトリミングおよび二分するためにロボットアーム16が種子12を切断ブロック116上に適正に位置付けることができるように、種子12が把持部18に対してどのように位置付けられているかを判定する。そのようにするために、図17に示すような例示的な操作手順1200を使用できる。手順1200は本明細書では、いくつかの静止画像を直線的に分析することに関して記載されているが、いくつかの実施形態では、たとえば、制御装置400が複数の画像分析を並列して行えるかまたは動画を連続的に分析できることが、諒解されるであろう。
手順1200はブロック1202で始まることができ、ここでは、制御装置400は、側方の視点からの把持された種子12の画像530を取り込むように、カメラ58を動作させる。ブロック1204では、制御装置400は、画像530を分析して、種子12のへそ424が種子12上に見えるかどうかを判定する。すなわち、制御装置400は、へそ424(図32を参照)がカメラ58の視野内にあるかどうかを判定する。そのようにするために、制御装置400は、本明細書に記載のものなどの任意の好適な画像処理アルゴリズムを利用することができる。たとえば、例示的な実施形態では、制御装置400は、陰影(たとえばグレースケールの画素強度)を利用して、種子12をモデル化し、図32に示すように、存在する場合、種子12と種子のへその基準画像536との間の一致534を識別する、相関モデルを利用する。特に、相関モデルは、取り込まれた画像530に対する基準画像536の画素対画素の照合を行う。
ブロック1206では、制御装置400は、種子12のへそ424がカメラ58の視野内にあるかどうかを判定する。ある場合、手順1200はブロック1210に進む。しかしながら、制御装置400がへそ424がカメラ58の視野内にないと判定する場合、手順はブロック1208に進む。
ブロック1208では、制御装置400は、種子12を再配向して、へそがカメラ58の視野内にあるようにする。特に、制御装置400は、へそ424がカメラ58の視野内に入るまで種子12を把持部18の軸358を中心に回転させるように、ロボットアーム16を動作させる。いくつかの実施形態では、ロボットアーム16は種子12を増分の角度だけ回転させ、カメラ58は把持された種子12の新しい画像を取り込み、制御装置400は新しい画像を分析して、へそ424がその時点でカメラ58の視野内にあるかどうかを判定する。もしなければ、へそ424がカメラ58の視野内に入るまで、このルーチンを繰り返すことができる。ある実施形態では、ロボットアーム16は、へそ424の位置を特定する工程を迅速化するために、最初に種子12を180°の角度だけ回転させてもよい。へそ424がカメラ58の視野内あると判定されると、手順1200はブロック1210に進むことができる。
ブロック1210では、制御装置400は、図33に示すような底部の視点からの把持された種子12の画像540を取り込むように、カメラ56を動作させる。次いで手順1200は、図18のブロック1212に進む。ブロック1212では、制御装置400は、取り込まれた画像540を分析して、画像540中の種子12の長手軸542(すなわち長軸)を識別する。例示的な実施形態では、制御装置400は、ブロブ検出アルゴリズムを利用して、取り込まれた画像540中の種子12の位置を特定し、種子12の主要な軸(すなわち長軸および短軸)を判定する。たとえば、ブロブ検出アルゴリズムは、取り込まれた画像540中の種子12をブロブとして識別すること、そのブロブの重心および縁部を判定すること、ならびにその情報に基づいて長軸および短軸を近似することができる。
利用される特定のブロブ検出アルゴリズムが、特定の実施形態に応じて変動し得ることが諒解されるであろう。たとえば、例示的な実施形態では、制御装置400は、EpsonのC3 6軸関節アームの機種に付属のソフトウェアパッケージの、ブロブ検出アルゴリズムを利用する。いくつかの実施形態では、ブロブ検出アルゴリズムは、ガウシアン差分(DoG(Difference of Gaussian))、ラプラシアン・ガウシアン(LoG(Laplacian of Gaussian))、ヘシアン行列式、および/または他の演算子に基づくことができる。ある実施形態では、制御装置400は、たとえばLindeberg, Detecting Salient Blob-Like Image Structures and Their Scales with a Scale-Space Primal Sketch: A Method for Focus-of-Attention, 11(3) International Journal of Computer Vision, 283-318 (1993)において記載されているブロブ検出アルゴリズムのうちの1つまたは複数を利用することができる。さらに、いくつかの実施形態では、制御装置400は、取り込まれた画像540の処理された版において、種子12(または他の物体)の周囲に、識別された種子12(または他の物体)の位置を示すための矩形の境界線548を引くことができる。他の実施形態では、制御装置400は、他の画像分析アルゴリズム(たとえば画像分割)を利用して、種子12および/または長手軸542を識別することができる。
制御装置400はさらに、取り込まれた画像540の水平軸546または他の水平線554に対する、種子12の長軸または長手軸542回転の角度544を判定する。言い換えれば、長手軸542と水平軸546または他の水平線554との間で画定された角度544が判定される。例示的な実施形態では、カメラ56は、直線で構成される画像を取り込むように構成される。したがって、取り込まれた画像540の水平軸546は、カメラ56の縁部と平行であると見なすことができる。
図34に示すように、ロボットアーム16は、照明されるドーム54内で把持された種子12を再配向することができる。たとえば、必要な再配向に応じて、ロボットアーム16は、種子12を回転および/または並進させることによって、種子12の配向を変えることができる。したがって、図18のブロック1214では、制御装置400は、図35に示すように長手軸542が水平軸546と平行となるように種子12を配向するように、ロボットアーム16を動作させる。特に、ロボットアーム16は、種子12を軸358を中心に回転させる。いくつかの実施形態では、制御装置400は、精確な平行性を必要としない場合があり、角度544に関する公差を定めてよい。いくつかの実施形態では、公差は1.0度以下であってよい。他の実施形態では、公差は0.5度以下であってよい。さらに他の実施形態では、角度544に関する公差は、0.3度以下であってよい。本明細書に記載の測定値のいずれに関しても、同様の公差を定めることができることを諒解されたい。上で示されたように、カメラ56およびロボットアーム16は、これらの座標系が互いにマッピングされ、この結果種子12の長手軸542をロボットアームの座標系の軸と有効に位置合わせするような方法で種子12を配向するように、較正される。
図18に戻ると、手順1200はブロック1216に進むことができ、ここでは、制御装置400は、把持された種子12の画像550を取り込むように、カメラ58を動作させる。図36に示すように、画像550は、カメラ58の視点からの種子の側部立面図である。ブロック1218において画像550を分析して、把持された種子12および種子12の長手軸552を識別することができる。種子12の形状が不規則であるために、長手軸552、578が互いと一致する場合も一致しない場合もあることが、諒解されるであろう。制御装置400は、ブロブ検出アルゴリズムを利用して、取り込まれた画像540の分析に関して上記と同様に、種子12の位置556を識別すること、および/または取り込まれた画像550中の長手軸552の位置を特定することができる。
例示的な実施形態では、制御装置400は、取り込まれた画像550中の、種子12の左長手端部562における種子12の左鉛直スライス560または断面、および種子12の右長手端部566における種子12の右鉛直スライス564または断面を識別する。図37に示すように、鉛直スライス560、564は、少なくとも1画素の幅である。例示的な実施形態では、スライスの幅は25画素であるが、この幅は他の実施形態では変動し得る。制御装置400は、種子12の左鉛直スライス560の重心570、および種子12の右鉛直スライス564の重心572を判定する。取り込まれた画像550中の種子12の長手軸552は、両方の重心570、572と交差する線として規定される。言い換えれば、長手軸552は、種子12の長手端部562、566の重心を通って延びる。制御装置400はさらに、取り込まれた画像550の水平軸576または他の水平線578に対する、長手軸552の角度574を判定する。
手順1200はブロック1220に進むことができ、ここでは、種子12が再配向される。特に、制御装置400は、図38に示すように、長手軸552が水平軸576と平行となるように種子12を配向するように、ロボットアーム16を動作させる。具体的には、ロボットアーム16は、種子12を、(たとえば1平行度以内などの公差レベルの条件下で)長手軸552が水平軸576と平行になるまで、取り込まれた画像550に対して回転させる。種子12が適正に配向されると、手順1200はブロック1222に続く。
ブロック1222では、制御装置400は、図39に示すような側部立面(すなわちカメラ58の視野)からの把持された種子12の別の画像580を取り込むように、カメラ58を動作させる。画像580はブロック1224において分析されて、把持された種子12、および種子12の長手軸の重心に対する種子12のへそ424の位置596を識別する。例示的な実施形態では、制御装置400は、ブロブ検出を利用して、取り込まれた画像580中の種子12の位置598を判定する。加えて、制御装置400は、好適なアルゴリズムを利用して、取り込み画像580中の種子12上のへそ424の位置を判定する。たとえば、制御装置400は、へその基準画像536(図32を参照)、および/または上記のような画像特徴照合アルゴリズムを使用して、へそ424の位置596を判定することができる。制御装置400は、上記と同様に、種子12の長手端部582(たとえば右端部または左端部のいずれか)、および種子12の長手端部582の鉛直スライス584を識別する。図40に示すように、制御装置400は、種子12の鉛直スライス584の重心586およびへそ424の重心588を識別し、重心586、588の間に仮想線590を引く。制御装置400はさらに、取り込まれた画像580の水平軸594または種子12の長手軸552に対する、線590の角度592を判定する。
図18に戻ると、手順1200はブロック1226に進み、ここでは、制御装置400は、図41に示すように、へそ424の重心588を種子12の長手軸552と位置合わせするよう種子12を配向するように、ロボットアーム16を動作させる。特に、ロボットアーム16は、重心586、588の間の線590が取り込まれた画像580の水平軸594と平行になるまで、カメラ58に向かってまたはこれから離れるように、種子12を回転させる。この時点で、線590はへそ424の長手軸436に対応しており、この結果、へそ424の長手軸436および種子12の長手軸436によって規定される種子の平面438が、ロボットアーム16の座標系の規定された平面と位置合わせされることになる。
次いで手順1200は、図19のブロック1228に進むことができる。ブロック1228では、制御装置400は、側部立面からの把持された種子12の画像を取り込むように、カメラ58を動作させる。そのような画像600が、図43〜図48に示されている。図19に戻ると、ブロック1230では、制御装置400は、取り込まれた画像600を分析して、種子12の胚軸440の位置を判定する。制御装置400は、そのようにするために、任意の好適なアルゴリズムを使用することができる。
たとえば、例示的な実施形態では、制御装置400は、上記の幾何学的物体識別機能および/または相関モデルと併せて、図42に示すような胚軸の基準画像612を利用して、胚軸440を識別することができる。示されるような図46〜図48の各々において、制御装置400が胚軸440に関して一致602を識別していることが諒解されるであろう。しかしながら、胚軸440のかなりの部分がカメラ58の視野内にないので、制御装置400は、図43〜図45の各々においては胚軸440を識別できていない。これらの状況では、制御装置400は、胚軸440がカメラ58の視野内に入り制御装置400によって検出されるまで種子12を回転させるように、ロボットアーム16を動作させる。
図19に戻ると、手順1200はブロック1232に進み、ここでは、制御装置400は、種子12の胚軸440をトリミングすべき位置を判定する。そのようにするために、制御装置400は、取り込まれた画像600または図49〜図52に示すようなカメラ58によって取り込まれた新しい画像中の、種子12の位置708、胚軸440の位置602、および種子12のへそ424の位置710を判定する。特に、制御装置400は、図51に示すような、胚軸440に最も近いへそ424の縁部620、および胚軸440と同じ側にある種子12の縁部622を識別する。さらに、例示的な実施形態では、制御装置400は、縁部620、622の間の半分のところにある鉛直断面624を判定する。鉛直断面624は、システム10が種子12の胚軸440をトリミングすることになる位置に対応する。他の実施形態では、制御装置400は、(たとえば使用者の入力に基づいて)縁部620、622の間の中間点以外の点を識別することができる。
上で示されたように、制御装置400は、ロボットアーム16に関する座標系およびカメラ58の座標系が互いにマッピングされるように、システム10を較正している。ロボットアーム16の座標系が知られているので、制御装置400は、取り込まれた画像600に対する把持部18の中心626の位置を知っている。制御装置400は、ロボットアーム16の座標系における(たとえばミリメートル単位の)物理的距離と、カメラ58の座標系における(たとえば画素単位の)距離との間の対応も知っている。この情報は、図52に示すような、取り込まれた画像600中の中心626と鉛直断面624との間の水平距離628を決定するために使用される。制御装置400はさらに、把持部18の中心626に対する胚のトリミングの切断の距離を計算する。
図19に戻ると、ブロック1234では、制御装置400は、切断ステーション30の切断ブロック116上の、切断ブレード170によってトリミングされ二分されることになる握られた種子12を置くべき位置を判定する。そのようにするために、制御装置400は、底部の視点からの種子12の画像640を取り込むように、カメラ56を動作させる。上で示されたように、ロボットアーム16の座標系とカメラ56との間のマッピングが知られているので、把持部の軸358に沿って取り込まれた画像640に投影された点642が判定され得る。図53に示すように、制御装置400は、取り込まれた画像640をさらに分析して、種子12の後方縁部644(すなわちへそ424および胚軸440の反対側)、および点642と後方縁部644との間の距離646を識別する。制御装置400は切断ブロック116の前方壁154の位置をメモリに保存しているので、制御装置400は、種子12を切断ブロック116上に適正に位置付けることができる。特に、制御装置400は、種子12を、把持部の軸358によって規定される把持部18の中心が判定された距離646だけ前方壁154から離れて位置付けられる状態で、フランジ124上に位置付けるように、ロボットアーム16を動作させる。
図19に戻ると、ブロック1236では、制御装置400は、トリミングおよび/または二分の切断の深さ、ならびに種子12を切断するためのブレード170の位置付けを判定する。上で示されたように、制御装置400は、胚軸をトリミングすべき点(すなわち図52に示すような鉛直断面624)を前もって決定した。例示的な実施形態では、制御装置400は、カメラ56、58の各々の知られている座標系によって、鉛直断面624を、異なる視点から撮られた取り込まれた画像640上の対応する位置650へとマッピングする。さらに、制御装置400は、図54に示すような対応する位置650における種子12の幅652を判定する。制御装置400は、種子12の後方縁部644の位置も識別する。この情報、ならびにトリミングの切断および/または二分の切断の(たとえば使用者の入力からの)所望の深さに基づいて、制御装置400は、胚軸440をトリミングおよび/または二分するときに切断ブレード170を前方壁154に向かって移動させるべき距離を、判定することができる。
制御装置400は、種子12を二分するための切断ブレード170の適切な位置付けを判定することもできる。そのようにするために、制御装置400は、種子12の画像660を取り込み、取り込まれた画像660を分析して図55に示すような胚軸440の重心662の位置を特定するように、カメラ58を動作させる。上で示されたように、制御装置400は最初に、たとえば特徴照合アルゴリズムを基準画像612(図42を参照)と併せて使用して、取り込まれた画像660中の胚軸440の位置602を判定することができる。さらに、制御装置400は、種子12の底縁部666と胚軸440の重心662との間の距離664を判定する。上で示されたように、制御装置400は、画素距離を物理的距離に変換することができる。したがって、水平方向の二分の切断が行われるフランジ124の上方の距離を判定するために、距離664が使用される。
戻って図15を参照すると、制御装置400がトリミングおよび二分するための種子12の適正な配向を判定すると、手順1000は、図16のブロック1020に進む。ブロック1020では、制御装置400は、把持された種子12を切断ブロック116上に位置付けるように、ロボットアーム16を動作させる。上記のように、メモリに保存された構造データに基づいて、制御装置400は、把持部の軸358と把持された種子12の後方縁部644との間の距離646を判定することができる。したがって、例示的な実施形態では、制御装置400は、種子12を、フランジ124上の、把持部の軸358が判定された距離646だけ切断ブロック116の前方壁154から離れて位置付けられる点に位置付けるように、ロボットアーム16を動作させる。距離646において、種子12は、適正な深さおよび配向で切断されるように位置付けられる。例示的な実施形態では、種子12は、種子12の後方縁部644が切断ブロック116の前方壁154にちょうど接触するように位置付けられる。
ブロック1022では、制御装置400は、胚軸440をトリミングするように切断デバイス112を動作させる。そのようにするために、制御装置400は、圧縮空気源230を作動させて、シャフト224(およびしたがって顎部244、246)を軸226を中心に回転させる。シャフト224は、切断ブレード170を鉛直に(すなわち切断ブロック116のフランジ124に対して垂直に)位置付けるように回転される。図56に示すように、切断ブレード170は、フランジ124に画定されたスロット164と位置合わせされる。
制御装置400は、図56において矢印700で示すように、切断ブレード170を上昇または下降させるように、中間駆動ステージ210を動作させることもできる。胚軸440をトリミングするために、制御装置400は、切断ブレード170をブロック116上の種子12に向かって軸226に沿って直線的に進めるように、切断デバイス112の駆動ステージ194を動作させる。図57に示すように、切断ブレード170は、切断ブレード170が(たとえば前方壁154に対する)前もって決定された切断距離に達するまで、スロット164および種子12の中へと進められ、このことにより胚軸440をトリミングする。
図63に示すように、切断ブレード170は、胚軸440を通して進められて、軸440の先端部442を軸440の残りの部分から分離する。上記のように、典型的には、1/3から1/2の間の胚軸440が、結合したまま残る可能性がある。言い換えれば、1/2から2/3の間の胚軸440が、先端部442とともに胚軸440の残りの部分からトリミングされる可能性がある。例示的な実施形態では、胚軸440がトリミングされるとき、切断ブレード170は、子葉412、414を貫通しない。いくつかの実施形態では、切断ブレード170を種子12のさらに中へと進めることによって、子葉412、414に傷をつけるのが望ましい場合がある。次いで制御装置400は、切断ブレード170を種子12から離してスロット164の外へ移動させるように、駆動ステージ194を動作させる。
次いで手順1000はブロック1024に進むことができ、ここでは、制御装置400は、種子12を二分するために切断ブレード170を水平に位置付けるように、切断デバイス112を動作させる。そのようにするために、制御装置400は、圧縮空気源230を作動させて、シャフト224(およびしたがって顎部244、246)を、軸226を中心に、図56〜図57に示す鉛直な位置から図58に示す水平な位置へと回転させる。制御装置400は、切断ブレード170を上昇または下降させて切断ブレード170を種子12の長手軸418と位置合わせするように、中間駆動ステージ210を動作させることもできる。上記のように、制御装置400は、距離664および他の知られている物理的寸法を使用して、切断ブレード170が位置付けられることになるフランジ124の上方の距離を判定することができる。
手順1000のブロック1026では、制御装置400は、種子12を二分するために、切断ブレード170を前方壁154に向かって移動させる。そのようにするために、制御装置400は、切断ブレード170をブロック116上の種子12に向かって軸226に沿って直線的に進めるように、切断デバイス112の駆動ステージ194を動作させる。図59に示すように、切断ブレード170は、切断ブレード170が上記のような(たとえば前方壁154に対する)前もって決定された二分距離に達するまで、種子12の中へと進められる。
図64に示すように、切断ブレード170は、へそ424の長手軸436および種子12の長手軸418によって規定される平面438と位置合わせされ、平面438に沿って種皮416およびへそ424を貫通して進められ、このことにより種子12に開口部702を創出する。胚軸440は、子葉412と結合した内方部分704および子葉414と結合した外方部分706へとスライスされる。図64に示すように、切断ブレード170は、胚軸440の基部444を通過する。例示的な実施形態では、切断ブレード170は種子12を2つの個片へと完全には二分しないことが諒解されるであろう。そうではなく、胚のトリミングおよび二分の後で、種子12は、依然として単一の個片として把持部18によって移送され得る。次いで制御装置400は、切断ブレード170を種子12から離れるように移動させるように、駆動ステージ194を動作させることができる。
手順1000のブロック1028では、制御装置400は、二分された種子12を対応する受容区域26に配置されたプレート38へと移動させるように、ロボットアーム16を動作させる。次いで制御装置400は、負圧源356の動作を停止させて、二分された種子12をプレート38上へと落下させる。ブロック1030では、制御装置400は、切断ブロック116から何らかの残骸を取り除くように、ロボットアーム16を動作させる。いくつかの実施形態では、ロボットアーム16は、残骸を取り除くために、フランジ124の上方壁156に沿って把持部18を1回または複数回通過させることができる。他の実施形態では、把持部組立体320は、制御装置400に電気的に結合され、かつ加圧された流体(たとえば圧縮空気)を通路352、354を通して送達して残骸などの軽い物体を跳ねのけるように構成される、圧力源を含む。そのような実施形態では、制御装置400は、把持部18がフランジ124に沿って通過する際に、加圧された流体を切断ブロック116に送達するように、圧力源を動作させることができる。
ブロック1032では、制御装置400は、切断ブレード170を定期的に交換するように、ロボットアーム16および切断デバイス112を動作させることができる。特定の実施形態に応じて、切断ブレード170を、事前に規定された時間の量が経過した後で、閾値数の種子12が処理された後で、および/または別の条件に応答して、交換することができる。
送達区域24内のプレート36上の各種子12に関して、手順1000または手順1000の部分を繰り返すことができることが、諒解されるであろう。さらに、手順1000を、アーム16がステーション28、30を交互に使用するように、両方のロボットアーム16を使用して実施できる。さらに、この手順を、各々がそれ自体の専用のステーション28、30を利用する、1つまたは複数のロボットアーム16を用いて実施できることを諒解されたい。
切断された種子12のうちの1つまたは複数が受容区域26内に置かれた後で、使用者は、さらなる処理のために、種子12をシステム10から取り出すことができる。とりわけ、使用者は、種皮から子葉を取り出して分離するか、追加的に子葉に傷をつけるか、または子葉にアグロバクテリウム(Agrobacterium)培養物を接種することができる。種皮416を子葉412、414から分離するために、使用者は、開口部702を広くして、子葉412、414をさらに露出させることができる。子葉412、414を種皮416から取り出すこと、および種皮416を廃棄することができる。図65に示すように、各子葉は、分割されたダイズ種子または子葉切片と呼ばれる場合があり、胚軸の部分を含む。例示的な実施形態では、子葉切片412は、胚軸440の部分704を含み、一方、子葉切片414は、胚軸440の部分706を含む。子葉切片412、414の各々はその場合、追加的に傷をつけることまたはアグロバクテリウム(Agrobacterium)培養物の接種を含む、さらなる処理の準備ができている。
アグロバクテリウム(Agrobacterium)培養物は、発現ベクターを植物中に導入するために広く利用される方法であり、アグロバクテリウム(Agrobacterium)の天然形質転換システムに基づいている。Horsch et al., Science 227:1229 (1985)。A.ツメファシエンス(A. tumefaciens)およびA.リゾゲネス(A. rhizogenes)は、植物細胞を遺伝的に形質転換するのに有用であることが知られている、植物病原性土壌細菌である。A.ツメファシエンス(A. tumefaciens)およびA.リゾゲネス(A. rhizogenes)のTiおよびRiプラスミドは、それぞれ、植物の遺伝子形質転換に関与する遺伝子を保持する。Kado, C. I., Crit. Rev. Plant. Sci. 10:1 (1991)。アグロバクテリウム(Agrobacterium)ベクター系およびアグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介性遺伝子導入のための方法の記載はまた、たとえば、Gruber et al.、前掲、Miki et al.、前掲、Moloney et al., Plant Cell Reports 8:238 (1989)、および米国特許第4,940,838号明細書および第5,464,763号明細書において入手可能である。
形質転換にアグロバクテリウム(Agrobacterium)が使用される場合には、挿入されるべきDNAは、特別なプラスミドに、すなわち、中間体ベクターまたはバイナリーベクターのいずれかにクローニングされるべきである。中間体ベクターは、アグロバクテリウム(Agrobacterium)中では自身で複製できない。中間体ベクターは、ヘルパープラスミド(コンジュゲーション)によってアグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)中に転移され得る。日本たばこスーパーバイナリー系は、このような系の一例である(Komari et al. (2006) In: Methods in Molecular Biology (K. Wang, ed.) No. 343: Agrobacterium Protocols (2nd Edition, Vol. 1) HUMANA PRESS Inc., Totowa, NJ, pp.15-41、およびKomori et al. (2007) Plant Physiol. 145:1155-1160によって総説されている)。バイナリーベクターは、大腸菌(E. coli)およびアグロバクテリウム(Agrobacterium)の両方において、自身を複製できる。バイナリーベクターは、右および左のT−DNA境界領域によって囲まれている、選択マーカー遺伝子およびリンカーまたはポリリンカーを含む。これらは、アグロバクテリウム(Agrobacterium)中に直接、形質転換され得る(Holsters、1978)。宿主細胞として使用されるアグロバクテリウム(Agrobacterium)は、vir領域を保持するプラスミドを含むこととなる。TiまたはRiプラスミドはまた、T−DNAの転移に必要なvir領域を含む。vir領域は、T−DNAの、植物細胞中への転移にとって必要である。さらなるT−DNAが含有される場合もある。
アグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)宿主の病原性機能は、細胞が、バイナリーT DNAベクター(Bevan (1984) Nuc. Acid Res. 12:8711-8721)または同時培養手順(Horsch et al. (1985) Science 227:1229-1231)を使用して細菌に感染すると、構築物および隣接するマーカーを含有するT−鎖の、植物細胞DNAへの挿入を指示する。一般に、アグロバクテリウム(Agrobacterium)形質転換系は、双子葉植物を操作するために使用される(Bevan et al. (1982) Ann. Rev. Genet 16:357-384、および Rogers et al. (1986) Methods Enzymol. 118:627-641)。アグロバクテリウム(Agrobacterium)形質転換系はまた、単子葉植物および植物細胞を形質転換するため、ならびに単子葉植物および植物細胞にDNAを転移するために使用され得る。米国特許第5,591,616号明細書、Hernalsteen et al. (1984) EMBO J 3:3039-3041、Hooykass-Van Slogteren et al. (1984) Nature 311:763-764、Grimsley et al. (1987) Nature 325:1677-179、Boulton et al.(1989) Plant Mol. Biol. 12:31-40、およびGould et al. (1991) Plant Physiol. 95:426-434を参照されたい。
胚軸の一部分を備える分割されたダイズ種子に、典型的には、好適な遺伝構築物を含有するアグロバクテリウム(Agrobacterium)培養物を約0.5から3.0時間、より典型的には約0.5時間接種することができ、その後に、好適な培地上での同時培養の期間を最大約5日間続ける。推定上、導入遺伝子のコピーを含有する外植片が、形質転換された、胚軸の一部分を備えるダイズ種子を培養することから生じる。さらなる組織増殖のために、これらの外植片を同定し、単離する。
DNAを宿主植物細胞中に挿入するために、いくつかの代替の技術を使用することもできる。これらの技術は、限定するものではないが、形質転換剤としてアグロバクテリウムツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)またはアグロバクテリウムリゾゲネス(Agrobacterium rhizogenes)によって送達されたT−DNAを用いる形質転換を含む。アグロバクテリウム(Agrobacterium)技術の例としては、たとえば、米国特許第5,177,010号明細書、米国特許第5,104,310号明細書、欧州特許第0131624号明細書、欧州特許出願公開第120516号明細書、欧州特許第159418号明細書、欧州特許出願公開第176112号明細書、米国特許第5,149,645号明細書、米国特許第5,469,976号明細書、米国特許第5,464,763号明細書、米国特許第4,940,838号明細書、米国特許第4,693,976号明細書、欧州特許出願公開第116718号明細書、欧州特許出願公開第290799号明細書、欧州特許出願公開第320500号明細書、欧州特許出願公開第604662号明細書、欧州特許出願公開第627752号明細書、欧州特許出願公開第0267159号明細書、欧州特許出願公開第0292435号明細書、米国特許第5,231,019号明細書、米国特許第5,463,174号明細書、米国特許第4,762,785号明細書、米国特許第5,004,863号明細書、および米国特許第5,159,135号明細書に記載されている。植物細胞の形質転換のためのT−DNA含有ベクターは、欧州特許出願公開第120516明細書、An et al, (1985, EMBO J. 4:277-284)、Fraley et al, (1986, Crit. Rev. Plant Sci. 4: 1-46)、およびLee and Gelvin (2008, Plant Physiol. 146: 325- 332)において集中的に研究されかつ十分に記載されており、当分野で十分に確立されている。
植物形質転換の別の公知の方法は、DNAが微粒子(microprojectile)の表面上で運ばれる、微粒子(microprojectile)媒介性形質転換である。この方法では、発現ベクターは、微粒子(microprojectile)を、植物細胞壁および細胞膜を貫通するのに十分な速度に加速させる遺伝子銃デバイスを用いて、植物組織中に導入される。Sanford et al., Part. Sci. Technol. 5:27 (1987)、Sanford, J. C., Trends Biotech. 6:299 (1988)、Sanford, J. C., Physiol. Plant 79:206 (1990)、Klein et al., Biotechnology 10:268 (1992)。
別法として、遺伝子導入および形質転換法として、限定するものではないが、塩化カルシウム沈殿によるプロトプラスト形質転換、裸のDNAのポリエチレングリコール(PEG)またはエレクトロポレーション媒介性取り込み(Paszkowski et al. (1984) EMBO J 3:2717-2722、Potrykus et al. (1985) Molec. Gen. Genet. 199:169-177、Fromm et al. (1985) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 82:5824-5828、およびShimamoto (1989) Nature 338:274-276を参照のこと)ならびに植物組織のエレクトロポレーション(D’Halluin et al. (1992) Plant Cell 4:1495-1505)が挙げられる。
本開示が図面および先述の説明において詳細に例示され記載されてきたが、そのような例示および説明は、限定ではなく例示となる性質のものと見なされるべきであり、例示的な実施形態のみが示され記載されていること、ならびに本開示の精神から逸脱しない全ての変更および修正の保護が望まれることが理解される。
本明細書に記載された方法、装置、およびシステムの様々な特徴から生じる、本開示の複数の利点が存在する。本開示の方法、装置、およびシステムの代替の実施形態が、記載された特徴の全てを含むわけではないものの依然としてそのような特徴の利点のうちの少なくともいくつかから恩恵を受ける場合のあることが、留意されよう。当業者は、本発明の特徴のうちの1つまたは複数を組み込みかつ付属の特許請求の範囲によって規定されるような本開示の精神および範囲内にある、方法、装置、およびシステムの独自の実施形態を、容易に考案することができる。
10 システム
12 ダイズ種子、種子
14 処理ステーション
16 ロボットアーム
18 把持部
20 テーブル
22 ドック
24 送達区域
26 受容区域
28 撮像ステーション
30 切断ステーション
32 滅菌デバイス、滅菌装置
34 トレイ
36 種子担持プレート
38 プレート
40 透明な基部
42 頂部表面
44 収容容器
46 プレート
48 ガイドピン
50 LEDパネル
52 カメラ
54 照明されるドーム
56 カメラ
58 カメラ
60 内部壁
62 チャンバ
64 円形開口部、上側開口部
66 外部壁
68 脚部
70 下側開口部
72 中心軸
74 別の開口部
76 長手軸
78 LED、ドームの照明
80 光軸
82 光軸
84 角度の付いた鏡
86 表面
90 カバー
92 ねじ山付き孔
94 へり
96 固定具
100 布帛シート
102 パッド
106 バックストップ
108 中心開口部
110 プラットフォーム
112 切断デバイス
114 台座
116 種子切断ブロック
118 上側端部
120 永久磁石
122 ブロック本体
124 フランジ
126 下側端部
128 底部表面
130 頂部表面
132 角度の付いた表面
134 角度の付いた表面
136 背部表面
138 スロット
140 溝
142 実質的に平面状の表面
144 角度の付いた表面
146 角度の付いた表面
148 後方壁
150 位置合わせピン
154 前方壁
156 上方壁
158 下方壁
160 開口部
162 内壁
164 スロット
166 後方縁部
170 切断ブレード
172 側壁
174 後縁部
176 上側縁部
178 側壁
180 頂縁部
190 支持アーム
192 駆動組立体
194 駆動ステージ
196 下側本体
198 上側本体
200 矢印
210 中間駆動ステージ
212 下側本体、基部
214 上側本体、プラットフォーム
216 矢印
220 回転ステージ
222 基部、主本体
224 装着シャフト
226 軸、回転軸
228 矢印
230 供給源、圧縮空気源
240 細長い本体
242 端部
244 顎部
246 顎部
248 反対側の端部
250 端部
252 溝
254 長手軸
256 供給源、圧縮空気源
260 本体
262 切断縁部
264 装着穴
270 先端部
272 内側タブ
274 内側縁部
276 スロット
278 外側タブ
280 外側縁部
282 面取りされた縁部
284 長手軸
302 容器
304 光源
306 低壁
308 側壁
310 チャンバ
312 トレイカメラ
320 把持部組立体
322 本体
324 遠位部分、遠位アーム部分
326 緩衝機構
328 近位ディスク
330 柱体
332 遠位ディスク
334 近位端
336 遠位端
338 矢印
340 矢印
342 コイルばね
350 本体、円筒形本体
352 中空の通路
354 通路
356 負圧源、真空源
358 把持部の軸
360 2次カバー
362 底部パッド
364 頂部パッド
400 電子制御装置
402 マイクロプロセッサ
404 メモリデバイス
406 アナログインターフェース回路
412 子葉、子葉切片
414 子葉、子葉切片
416 種皮
418 長手軸
420 長手端部
422 長手端部
424 へそ
426 外側部分
428 内側部分
430 背面側
432 外方側
434 内方側
436 長手軸
438 平面
440 胚軸
442 先端部
444 基部
450 外側層
452 縁部
460 ディスプレイ
462 使用者入力デバイス
500 画像
502 一致
504 点
516 位置
522 一致
530 画像
534 一致
536 基準画像
542 長手軸
544 角度
546 水平軸
548 矩形の境界線
550 画像
552 長手軸
554 水平線
556 位置
560 左鉛直スライス
562 左長手端部
564 右鉛直スライス
566 右長手端部
570 重心
572 重心
574 角度
576 水平軸
578 長手軸、水平線
580 画像
584 鉛直スライス
586 重心
588 重心
590 仮想線
592 角度
594 水平軸
596 位置
598 位置
600 画像
602 一致、位置
612 基準画像
620 縁部
622 縁部
624 鉛直断面
626 中心
628 水平距離
640 画像
642 点
644 後方縁部
646 距離
650 対応する位置
652 幅
660 画像
662 重心
664 距離
666 底縁部
700 矢印
702 開口部
704 内方部分
706 外方部分
708 位置
710 位置
1000 操作手順
1200 操作手順

Claims (23)

  1. ロボットアームを使用して、照明される区域内にへそを含む種子を位置付けることと、
    前記照明される区域の中心軸に対して垂直に延びる第1の平面上に前記種子を投影することと、
    前記種子を回転させて前記第1の平面内に位置付けられた第1の仮想水平線と平行に前記種子を配向することと、
    前記第1の平面に対して垂直に延びる第2の平面上に前記種子を投影することと、
    前記第2の平面内に位置付けられた第2の仮想水平線と平行に前記種子を配向することと、
    前記種子の前記へそと前記第2の仮想水平線との間の距離を識別することと、
    前記識別された距離に基づいて前記第2の仮想水平線上に前記へそを位置付けるように前記種子を配向することと、を含む、種子を撮像する方法。
  2. 前記第2の仮想水平線上に前記へそを位置付けるように前記種子を配向することが、前記へその中心を前記第2の仮想水平線上に位置付けるように前記種子を配向することを含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記へその前記中心を前記第2の仮想水平線上に位置付けるように前記種子を配向することが、前記へその重心が前記種子の重心と一致するように前記種子を配向することを含む、請求項2に記載の方法。
  4. 前記種子の胚の位置を識別することと、
    前記識別された位置に最も近い前記へその縁部および前記第2の仮想水平線に沿った前記種子の外縁部を識別することと、
    前記へその前記縁部と前記種子の前記外縁部との間の、前記種子の胚軸をトリミングすべき点を識別することと、
    を含む、請求項1に記載の方法。
  5. 前記胚の前記位置を識別することが、特徴照合を使用して前記第2の平面上への1つまたは複数の前記種子の投影を分析することを含む、請求項4に記載の方法。
  6. 前記種子を前記第1の平面上に投影することが、第1のカメラを用いて第1の画像を取り込むことを含み、
    前記種子を前記第2の平面上に投影することが、第2のカメラを用いて第2の画像を取り込むことを含む、
    請求項1に記載の方法。
  7. 前記第1のカメラが前記第2のカメラの光軸と平行な光軸を有し、
    前記第1のカメラを用いて前記第1の画像を取り込むことが、前記第1のカメラの前記光軸に対して45度の角度で延びる鏡から反射された光を取り込むことを含む
    請求項6に記載の方法。
  8. 前記種子を回転させて前記種子を前記第1の仮想水平線と平行に配向することが、前記種子が前記第1の仮想水平線と平行に配向されていないと判定することに応答して前記種子を回転させることを含み、
    前記種子を前記第2の仮想水平線と平行に配向することが、前記種子が前記第2の仮想水平線と平行に配向されていないと判定することに応答して前記種子を配向することを含み、
    前記へそを前記第2の仮想水平線上に位置付けるように種子を配向することが、前記へそが前記第2の仮想水平線上に位置付けられていないと判定することに応答して前記種子を配向することを含む、
    請求項1に記載の方法。
  9. 前記第1の平面上への前記種子の前記投影に対応する第1の画像を分析して、前記第1の仮想水平線に対する前記種子の配向を判定することと、
    前記第2の平面上への前記種子の前記投影に対応する第2の画像を分析して、前記第2の仮想水平線に対する前記種子の配向を判定することと、
    をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  10. 前記第2の画像を分析することが、(i)前記種子の第1の長手端部および第2の長手端部を識別すること、(ii)前記第1の長手端部における前記種子の左矩形鉛直断面を識別すること、(iii)前記第2の長手端部における前記種子の右矩形鉛直断面を識別すること、(iv)前記左矩形鉛直断面および前記右矩形断面の各々の重心を判定すること、ならびに(v)前記左矩形鉛直断面および前記右矩形断面の前記重心を仮想線分で相互接続することを含み、
    前記種子を前記第2の仮想水平線と平行に配向することが、前記線分が前記第2の仮想水平線と平行になるように前記種子を配向することを含む、
    請求項9に記載の方法。
  11. 前記左矩形鉛直断面および前記右矩形断面が、少なくとも10個の画像画素に等しい水平幅を有する、請求項10に記載の方法。
  12. 前記第2の画像を分析することが、前記第2の仮想水平線に対する前記線分の角度を判定することをさらに含み、
    前記線分を前記第2の仮想水平線と平行に配向するための前記種子の回転の量が、前記判定された角度に基づく、
    請求項10に記載の方法。
  13. 前記種子を前記第2の仮想水平線と平行に配向することに応答して、前記種子を前記第2の平面上に投影することと、
    前記種子を前記第2の仮想水平線と平行に配向することに応答して、前記第2の平面上への前記種子の前記投影に対応する第3の画像を分析して、前記へそと前記第2の仮想水平線との間の距離を識別することと、
    をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  14. 前記第3の画像を分析することが、(i)前記種子の長手端部を識別すること、(ii)前記長手端部および前記へその各々の重心を判定すること、ならびに(iii)前記長手端部および前記へその前記重心を仮想線分で相互接続することを含み、
    前記へそを前記第2の仮想水平線上に位置付けるように前記種子を配向することが、前記線分が前記第2の仮想水平線と一致するように前記種子を配向することを含む、
    請求項13に記載の方法。
  15. 前記第3の画像を分析することが、前記第2の仮想水平線に対する前記線分の角度を判定することをさらに含み、
    前記線分を前記第2の仮想水平線と一致するように配向するための前記種子の移動の量が、前記判定された角度に基づく、
    請求項14に記載の方法。
  16. 前記第2の平面上への前記種子の前記投影に基づいて切断ブレードを位置付けるための前記種子の高さを判定することをさらに含み、前記高さが前記第2の仮想水平線に対して垂直な方向における前記種子の幅である、請求項1に記載の方法。
  17. 前記種子を前記ロボットアームに吸引力を介して取り付けることをさらに含む、請求項1に記載の方法。
  18. 種子を撮像するための方法であって、
    種子の複数の画像を取り込むことと、
    前記複数の取り込まれた画像に基づいて前記種子の配向および前記種子のへその位置を判定することと、
    ロボットアームを用いて前記種子を移動させて、前記種子の前記判定された配向および前記へその前記位置に基づく位置に前記種子を配向することと、を含む、方法。
  19. 前記複数の画像を取り込むことが、
    前記種子の第1の画像を第1のカメラを用いて第1の視点から取り込むこと、および
    前記種子の第2の画像を第2のカメラを用いて前記第1の視点に対して垂直な第2の視点から取り込むことを含む、請求項18に記載の方法。
  20. 前記種子の配向を判定することが、
    前記第1の取り込まれた画像の第1の境界線に対する前記種子の配向を判定すること、および
    前記第2の取り込まれた画像の第2の境界線に対する前記種子の配向を判定することを含む、請求項19に記載の方法。
  21. ロボットアームと、
    1つまたは複数の光源と、
    中心軸を有しかつ前記1つまたは複数の光源によって照明されるように構成された中空本体と、
    前記中空本体内に位置付けられた種子の第1の画像を取り込むように構成された第1のカメラであって、前記画像が前記中心軸に沿った第1の視点から取り込まれる、第1のカメラと、
    前記中心軸に対して垂直な第2の軸に沿った第2の視点から前記種子の第2の画像を取り込むように構成された第2のカメラと、
    前記第1の画像および前記第2の画像を分析して、二分するための前記種子の適正な配向を判定するようにおよび前記ロボットアームに前記種子を前記適正な配向へと移動させるよう命令するように構成された、電子制御装置と、
    を備える、種子撮像装置。
  22. 前記第1のカメラの光軸が前記第2のカメラの光軸と平行であり、
    前記第1のカメラが、前記第1のカメラの光軸に対して45度の角度で延びる鏡から反射された光を取り込むように構成される、請求項21に記載の種子撮像装置。
  23. 前記ロボットアームが前記種子の側部に吸引力を適用することによって前記種子を固定するように構成される、請求項21に記載の種子撮像装置。
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2021175372A (ja) * 2020-05-01 2021-11-04 株式会社アグリ技術研究所 植物の発根力を向上させるための種子処理方法及び発根力を向上させるための処理を施した種子
US11419259B2 (en) * 2018-08-22 2022-08-23 Shandong Academy Agricultural Machinery Sciences Directional garlic seed throwing mechanism and control method of the same

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MX2016014312A (es) 2014-05-06 2017-04-27 Dow Agrosciences Llc Sistema para preparacion de semillas y metodo de uso.
JP2016221645A (ja) * 2015-06-02 2016-12-28 セイコーエプソン株式会社 ロボット、ロボット制御装置およびロボットシステム
US11890750B2 (en) 2016-05-06 2024-02-06 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Systems and methods for maize embryo plating and replating
US11324162B2 (en) 2016-07-14 2022-05-10 Precision Planting Llc Seed firmer for seed orientation adjustment in agricultural fields
CN109714947B (zh) 2016-07-14 2022-10-11 精密种植有限责任公司 用于农田内被动种子定向的系统、机具和方法
EP3484262B1 (en) 2016-07-14 2021-03-03 Precision Planting LLC System for seed orientation with adjustable singulators during planting
EP3484263B1 (en) 2016-07-14 2021-06-02 Precision Planting LLC System for seed orientation within agricultural fields
WO2018236874A1 (en) * 2017-06-21 2018-12-27 Monsanto Technology Llc AUTOMATED SYSTEMS FOR PREPARING SEED TISSUE SAMPLES, AND ASSOCIATED METHODS
AR114624A1 (es) * 2018-02-08 2020-09-30 Monsanto Technology Llc Análisis de semillas
EP3764766A4 (en) 2018-03-14 2022-02-23 Monsanto Technology LLC SEED IMAGING
KR20210016369A (ko) 2018-06-11 2021-02-15 몬산토 테크놀로지 엘엘씨 종자 선별
CN109115774B (zh) * 2018-08-02 2020-09-29 长江大学 一种作物育种进程的监测方法、监测系统及监测装置
WO2021097093A1 (en) 2019-11-13 2021-05-20 Monsanto Technology Llc X-ray seed imaging system, cabinet x-ray device, and methods of evaluating seeds
CN110809937B (zh) * 2019-12-03 2021-01-29 中国农业大学 基于延时摄影技术定量分析根系植物生长特征的方法
WO2021219150A1 (en) * 2020-04-28 2021-11-04 Univerzita Palackeho V Olomouci Device and method for automatic preparation of seed samples, in particular for plant phenotyping
CN115918321B (zh) * 2022-09-27 2024-04-02 山东大学 一种规模化种子培育及质量检验装置及方法

Family Cites Families (30)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5015580A (en) 1987-07-29 1991-05-14 Agracetus Particle-mediated transformation of soybean plants and lines
US5051825A (en) 1989-04-07 1991-09-24 Pressco, Inc. Dual image video inspection apparatus
BR9306802A (pt) 1992-07-27 1998-12-08 Pioneer Hi Bred Int Processo independente de genótipos para produção de planta de soja transgénica e processo de regeneração de plantas de soja a partir de nodos cotiledonais
US5542795A (en) 1995-01-30 1996-08-06 Kennametal Inc. Plunge and face milling cutter with universal insert seats
US5655354A (en) 1995-03-27 1997-08-12 Tycom Corporation Method and apparatus for automated verification and loading of precision drill bits into a drilling machine package
CA2359868A1 (en) 1999-01-14 2000-07-20 Monsanto Company Soybean transformation method
BR0016367B1 (pt) 1999-12-15 2013-09-03 mÉtodo para transformar tecido de explante de soja
SE0002171L (sv) 2000-06-09 2001-08-20 Megascale Ab Förfarande och anordning för inriktning av objekt relativt ljusmärke
NL1020698C2 (nl) * 2002-05-28 2003-12-11 Arie Van Der Knijff Inrichting voor het bewerken van bol- of knolgewassen.
CA2484533C (en) 2003-11-25 2008-12-02 Weyerhaeuser Company Systems and method of embryo delivery for manufactured seeds
MXPA06013357A (es) 2004-06-07 2007-03-01 Basf Plant Science Gmbh Transformacion mejorada de porotos de soja.
UA90860C2 (ru) 2004-06-07 2010-06-10 Басф Плант Саенс Гмбх Способ получения трансгенной сои
US7473822B1 (en) 2005-06-27 2009-01-06 Iowa State University Research Foundation, Inc. Soybean transformation and regeneration using half-seed explant
JP4452691B2 (ja) 2005-08-04 2010-04-21 リンテック株式会社 シート切断装置及び切断方法
US7998669B2 (en) * 2006-03-02 2011-08-16 Monsanto Technology Llc Automated contamination-free seed sampler and methods of sampling, testing and bulking seeds
US7798042B2 (en) 2006-05-08 2010-09-21 Gerber Scientific International, Inc. Reciprocated knife having an integral tangent axis orientation drive
US7577718B2 (en) 2006-07-31 2009-08-18 Microsoft Corporation Adaptive dissemination of personalized and contextually relevant information
US7915006B2 (en) 2006-11-13 2011-03-29 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methodologies, processes and automated devices for the orientation, sampling and collection of seed tissues from individual seed
US8044260B2 (en) 2007-03-09 2011-10-25 Monsanto Technology Llc Method of meristem excision and transformation
US20080229447A1 (en) 2007-03-12 2008-09-18 Syngenta Participations Ag Transformation of immature soybean seeds through organogenesis
CA2699976A1 (en) 2007-09-24 2009-04-02 Arborgen, Llc Apparatus for and method of preparing plant tissue for plant production
CN102711489B (zh) 2009-10-28 2015-10-21 加拿大北大西洋海鲜渔业公司 贝类加工装置和相关方法
AR080105A1 (es) 2010-02-02 2012-03-14 Bayer Cropscience Ag Transformacion de soja usando inhibidores de hidrofenil piruvato dioxigenasa (hppd) como agentes de seleccion
EP2595465B1 (en) * 2010-07-20 2021-06-02 Monsanto Technology LLC Automated systems for removing tissue samples from seeds, and related methods
US8504204B2 (en) * 2010-07-22 2013-08-06 Cognisense Labs, Inc. Automated positioning of an organic polarized object
US9165189B2 (en) * 2011-07-19 2015-10-20 Ball Horticultural Company Seed holding device and seed classification system with seed holding device
US20130176553A1 (en) * 2012-01-09 2013-07-11 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Method and apparatus for non-destructive testing of a seed
US8937654B2 (en) 2012-08-22 2015-01-20 Mitutoyo Corporation Machine vision inspection system comprising two cameras having a rotational offset
MX2016014312A (es) * 2014-05-06 2017-04-27 Dow Agrosciences Llc Sistema para preparacion de semillas y metodo de uso.
US20150322443A1 (en) * 2014-05-06 2015-11-12 Dow Agrosciences Llc System for cutting and preparing seeds and method of use

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11419259B2 (en) * 2018-08-22 2022-08-23 Shandong Academy Agricultural Machinery Sciences Directional garlic seed throwing mechanism and control method of the same
JP2021175372A (ja) * 2020-05-01 2021-11-04 株式会社アグリ技術研究所 植物の発根力を向上させるための種子処理方法及び発根力を向上させるための処理を施した種子
JP7201249B2 (ja) 2020-05-01 2023-01-10 株式会社アグリ技術研究所 植物の発根力を向上させるための種子処理方法及び発根力を向上させるための処理を施した種子

Also Published As

Publication number Publication date
AR100290A1 (es) 2016-09-21
AU2015256246C1 (en) 2018-05-31
US20180199504A1 (en) 2018-07-19
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