JP2015522173A - 信頼性のある非侵襲的診断検査を提供するための方法 - Google Patents

信頼性のある非侵襲的診断検査を提供するための方法 Download PDF

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Abstract

肝疾患の組み合わせられた診断スコアを評価し、かつモデルから信頼性のないパラメータを除外するための分散およびROC曲線に基づくノンパラメトリックな感度分析を用いて診断の正確性を高めるための、特にエキスパートシステムの形態であるコンピューター化されたシステム。【選択図】図1

Description

本発明は、非侵襲的診断検査の信頼性を高めるための方法に関する。より具体的には、本発明は、疾患の存在および/または重症度を評価する非侵襲的検査を実施して得られた初期指標の信頼性を分析し、かつ前記検査の診断の正確性を高めるための方法に関する。
本発明の方法を、疾患の現在の診断および/または重症度を評価するあらゆる非侵襲的方法の信頼性を高めるために適用してもよく、特に肝疾患に適用する。
肝疾患の診断は、肝線維症の分析によって行うことができる。肝線維症は、例えば、ウイルス(肝炎ウイルスHCVおよびHBVなど)感染、大量のアルコール摂取、毒素または薬物などの様々な病因による肝細胞の損傷に応答して肝臓に線維性の瘢痕組織が蓄積する状態を指す。線維化病変部が進行すると、肝硬変すなわち肝臓が機能する能力が損なわれた状態に至ることがある。線維症の進行を減速または停止することができ、かつ既存の肝臓損傷を回復させることさえできる肝線維症の治療法が存在する。一方、肝硬変は通常、非可逆的であると考えられている。
肝生検は、患者の肝疾患を診断するために従来から行われてきた手段である。線維症および肝硬変を段階評価するために、例えば、MetavirおよびIshak(肝硬変を段階評価する)などの肝生検に基づく各種分類が使用される。例えば、線維症のためのMetavirスコア分類を用いて、5つのクラス(Metavir Fステージと称す)すなわちF0(線維化なし、瘢痕化なし)、F1(門脈の線維化あり、最小の瘢痕化あり)、F2(僅かな隔壁構造あり、瘢痕化が生じ、かつ血管を含む肝臓の領域の外側まで延びている)、F3(多くの隔壁構造あり、線維性架橋形成が拡がり、かつ線維化を含む他の領域に結合している)および最後にF4(肝硬変すなわち肝臓の瘢痕化の進行)に分けられる。本出願におけるF0、F1、F2、F3およびF4という言及は全て、Metavirステージを参照している。
しかし、肝生検は侵襲的かつ高価であるため、肝生検の代わりとして肝線維症の非侵襲的診断が過去10年間にわたってかなりの注目を集めている。第一世代の単純な線維症血液検査は、一般的な間接的血液マーカーをAPRI(Waiら、Hepatology 2003)またはFIB−4(Valley-Pichardら、Hepatology 2007)のような単純な比と組み合わせたものである。第二世代の計算検査は、ロジスティック回帰により間接的および/または直接的線維症マーカーを組み合わせたものであり、Fibrotest(商標)(Imbert-Bismutら、Lancet 2001)、ELFスコア(Rosenbergら、Gastroenterology 2004)、FibroMeter(商標)(Calesら、Hepatology 2005)、FibroSpect(商標)(Patelら、J Hepatol 2004)およびHepascore(Adamsら、Clin Chem 2005)のようなスコアが得られる。例えば、国際公開第2005/116901号は、生物学的変数および臨床的変数などの特定の変数のレベルを測定し、かつ前記変数を数学関数の中に組み合わせて、多くの場合「線維症スコア」と呼ばれるスコアを得て、肝疾患の存在およびその重症度を評価する非侵襲的方法について記載している。
しかし、これらの非侵襲的診断検査は100%正確ではない。実際に、偽陽性または偽陰性の結果が生じ、患者を誤分類してしまうことがある。誤りは主に、基準(肝生検)または検査の構築(学問的データに関する観察)に起因し得る。さらに、誤りのその他の原因は、実施者または患者自体による、検査の基礎をなすマーカーまたは物理的データの測定から生じることもある。
そこで、患者の誤分類の発生を制限し、かつ非侵襲的検査の正確性を高める方法が必要とされている。ROC曲線下面積(AUROC:area under the ROC curve)に基づくFibroscanの信頼性に関する先行技術の仮説の非有効性の例が実施例6に示されており、信頼性のない生検における肝硬度評価(LSE)のAUROCは、信頼性のある生検におけるAUROCとは有意に異なっていなかった。
国際公開第2010/013235号は、標準的な呼気検査由来のデータおよび例えば生理的雑音などの他のパラメータを含む信頼性のあるスコアを計算する工程を含む肝疾患の診断方法について記載している。生理的雑音の測定は、エキスパート決定システムの使用を含んでもよい。但し、国際公開第2010/013235号の方法は、標準的な呼気検査の実施を含む診断検査に特有のものであり、その他の非侵襲的診断方法には適用することができない。
本発明者らは、Liver International ISSN1478-3223 (2008), pp 1352-1362の中で、「Evaluating and increasing the reliable diagnosis rate of blood tests for liver fibrosis in chronic hepatitis C(慢性C型肝炎における肝線維症のための血液検査の信頼性のある診断率の評価および増加)」という表題の論文を公開した。信頼性は、生物統計学では異なる意味を有する言葉であることをここに強調しておく。この先行技術文献では、「信頼性のある」または「信頼性」という用語を、信頼性のある診断間隔(RDI)を定義するために使用されている。RDIは、線維症ステージに関するより正確な診断を取り扱う。従って、F2/F3/F4ステージの広範な診断(患者は、有意な線維症(F2)、進行した線維症(F3)または肝硬変(F4)を有すると診断される)の代わりに、F3/F4診断(患者は、進行した線維症(F3)または肝硬変(F4)を有すると診断される)によりRDIを得ることができ、この先行技術文献では、信頼性は診断の正確性を指す。
本発明では、信頼性は、RDIに関するものではない。本発明は、検査の信頼性を高めるための方法およびエキスパートシステムであり、RDIを定義するために使用することはできない。
本発明では、先行技術文献とは異なり、RDIは定義されておらず、信頼性クラスは、正確性の独立した予測因子により定められる異なる正確性レベルを有する患者群を表すことを強調しておく。例えば、腎不全に罹患している患者では、診断検査は、正常な腎機能を有する患者における同じ検査よりも著しく低い正確性を有する。
また、本発明に記載されている分散指標は、結果の値分散の新しい指標、特に標準偏差に匹敵するスコアであることを強調しておく。
従って、診断検査の信頼性を高めるための方法が必要とされている。
定義
本発明では、以下の用語は以下の意味を有する。
「肝疾患」とは、急性肝機能障害、慢性肝疾患、肝炎ウイルス感染、特にB型肝炎、C型肝炎またはD型肝炎ウイルスによって引き起こされた感染、肝毒性、肝癌、脂肪症、非アルコール性脂肪性肝疾患(NAFLD)、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)、自己免疫疾患、代謝性肝疾患または肝臓の二次的合併症を伴う疾患を指す。
一実施形態によれば、肝毒性は、アルコール誘発性肝毒性および/または薬物誘発性肝毒性(すなわち、アルコールまたは薬物のような生体異物化合物によって誘発されるあらゆる肝毒性)である。
一実施形態によれば、自己免疫疾患は、自己免疫性肝炎(AIH)、原発性胆汁性肝硬変(PBC)および原発性硬化性胆管炎(PSC)からなる群から選択される。
別の実施形態によれば、代謝性肝疾患は、NAFLD、ヘモクロマトーシス、ウィルソン病およびα1抗トリプシン欠乏症からなる群から選択される。
「対象」とは、動物を指す。一実施形態では、動物は哺乳類であり、例えば、ラットあるいはペット(例えば、ネコまたはイヌ)などである。好ましい実施形態によれば、動物はヒトである。
一実施形態によれば、ヒトを含む動物は、本明細書の上に定義した肝疾患に罹患するリスクがあるか罹患している。
「非侵襲的診断検査」とは、疾患の存在および/または重症度を診断または評価するための検査を指し、データ、指標またはスコアが得られる。そのような検査は、バイオマーカー、臨床マーカー、物理データ(例えば、Fibroscanにより得られるもの)の測定値またはスコアを使用してもよい。一実施形態では、データは、バイオマーカー、臨床マーカー、物理データ、指標またはスコアであってもよい。
バイオマーカーの例としては、血糖、総コレステロール、HDLコレステロール(HDL)、LDLコレステロール(LDL)、AST(アスパラギン酸アミノ基転移酵素)、ALT(アラニンアミノ基転移酵素)、AST/ALT、AST.ALT、フェリチン、血小板(PLT)、AST/PLT、プロトロンビン時間(PT)またはプロトロンビン指数(PI)、ヒアルロン酸(HAまたはヒアルロナート)、ヘモグロビン、トリグリセリド、α−2マクログロブリン(A2M)、γグルタミントランスペプチダーゼ(GGT)、尿素、ビリルビン、アポリポタンパク質A1(ApoA1)、プロコラーゲンIII型N末端プロペプチド(P3NP)、γ−グロブリン(GBL)、ナトリウム(Na)、アルブミン(ALB)、フェリチン(Fer)、グルコース(Glu)、アルカリホスファターゼ(ALP)、YKL−40(ヒト軟骨糖タンパク質39)、組織メタロプロテアーゼ阻害物質1(TIMP−1)、TGF、サイトケラチン18およびマトリックスメタロプロテイナーゼ2(MMP−2)〜マトリックスメタロプロテイナーゼ9(MMP−9)、それらの比および数学的組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。
臨床マーカーの例としては、体重、ボディマス指数、年齢、性別、腰回りの長さ、腹部周りの長さまたは身長およびそれらの比、例えば腰回りの長さ/腹部周りの長さなどが挙げられるが、これらに限定されない。
肝疾患を評価するための物理的方法の例としては、医用画像データおよび、例えば、脾臓、特に脾臓長さの測定などの臨床的測定が挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態によれば、物理的方法は、超音波検査、特にドップラー超音波検査、超音波弾性率測定および超音波速度測定を含む群から選択される(前記データを用いる好ましい検査は、Fibroscan(商標)、ARFI、VTE、超音速画像処理、分光法で使用されるMRI(磁気共鳴画像法)およびNMR(核磁気共鳴)、特にNMR弾性率測定または速度測定である)。データは、肝硬度評価(LSE)データまたは脾臓硬度評価データであることが好ましい。本発明の好ましい実施形態によれば、物理的方法から得られるデータは、Fibroscan(商標)から得られる。本発明の好ましい実施形態によれば、Fibroscan(商標)から得られる測定値またはデータは、本発明の方法に関わる指標のうちの1つである。
検査の例としては、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)、FibroMeter(商標)、CirrhoMeter(商標)、CombiMeter(商標)、InflaMeter(商標)が挙げられるが、これらに限定されない。
ELFは、ヒアルロン酸、P3P、TIMP−1および年齢に基づく血液検査である。
FibroSpect(商標)は、ヒアルロン酸、TIMP−1およびA2Mに基づく血液検査である。
APRIは、血小板およびASTに基づく血液検査である。
FIB−4は、血小板、ASAT、ALTおよび年齢に基づく血液検査である。
Hepascoreは、ヒアルロン酸、ビリルビン、α2−マクログロブリン、GGT、年齢および性別に基づく血液検査である。
Fibrotest(商標)は、α2−マクログロブリン、ハプトグロビン、アポリポタンパク質A1、総ビリルビン、GGT、年齢および性別に基づく血液検査である。
FibroMeter(商標)およびCirrhoMeter(商標)は一緒になって血液検査ファミリーを形成し、その内容は、慢性肝疾患の原因および診断標的によって決まり、この血液検査ファミリーはFMファミリーと称され、実施例1に詳述されている。
CombiMeter(商標)は、FMファミリーの変数(実施例1に詳述されている)またはFMファミリーの検査の結果とFibroscan(商標)の結果との数学的組み合わせに基づく検査のファミリーである。一実施形態では、前記数学的組み合わせは、二項ロジスティック回帰である。
一実施形態では、CombiMeterは、肝臓または脾臓の弾性率測定から得られた物理データ、例えばIQRまたはIQR/中央値または中央値などのFibroscan(商標)から得られた分散指標、好ましくはFibroscan(商標)中央値と、血糖、総コレステロール、HDLコレステロール(HDL)、LDLコレステロール(LDL)、AST(アスパラギン酸アミノ基転移酵素)、ALT(アラニンアミノ基転移酵素)、AST/ALT、AST.ALT、フェリチン、血小板(PLT)、AST/PLT、プロトロンビン時間(PT)またはプロトロンビン指数(PI)、ヒアルロン酸(HAまたはヒアルロナート)、ヘモグロビン、トリグリセリド、α−2マクログロブリン(A2M)、γグルタミントランスペプチダーゼ(GGT)、尿素、ビリルビン、アポリポタンパク質A1(ApoA1)、プロコラーゲンIII型N末端プロペプチド(P3NP)、γ−グロブリン(GBL)、ナトリウム(Na)、アルブミン(ALB)、フェリチン(Fer)、グルコース(Glu)、アルカリホスファターゼ(ALP)、YKL−40(ヒト軟骨糖タンパク質39)、組織メタロプロテアーゼ阻害物質1(TIMP−1)、TGF、サイトケラチン18およびマトリックスメタロプロテイナーゼ2(MMP−2)〜9(MMP−9)、糖尿、体重、ボディマス指数、年齢、性別、腰回りの長さ、腹部周りの長さまたは身長およびそれらの比ならびにそれらの数学的組み合わせを含む一覧から選択される少なくとも3種、好ましくは少なくとも4種、5種、6種、7種またはそれ以上、より好ましくは7種または8種または9種のバイオマーカーおよび/または臨床的データとの数学的組み合わせに基づくスコアである。
一実施形態では、CombiMeterは、Fibroscan(商標)中央値と、α−2−マクログロブリン(A2M)、ヒアルロン酸(HA)、プロトロンビン指数(PI)、血小板(PLT)、AST、尿素、GGT、ビリルビン(Bili)、ALT、フェリチン、グルコース、年齢、性別および体重を含む一覧から選択される少なくとも3種、好ましくは少なくとも4種、5種、6種、7種またはそれ以上、より好ましくは7種または8種または9種のバイオマーカーおよび/または臨床的データとの数学的組み合わせに基づくスコアである。
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、血小板、PI、AST、HA、A2M、性別および年齢との数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。好ましい実施形態では、CombiMeter(商標)は、Fibroscan(商標)中央値(肝硬度)と以下の表の中でチェックされているマーカーを用いるFibroMeterとの数学的組み合わせに基づくスコアである。
Figure 2015522173
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、血小板、PI、AST、HA、A2M、尿素、ALT、性別および年齢との数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、血小板、PI、AST、HA、A2M、尿素、性別および年齢との数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、血小板、PI、AST、HA、A2M、ALT、性別および年齢との数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、PI、AST、A2M、糖尿および年齢との数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、PI、AST/ALT、A2M、血小板および糖尿との数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
一実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、PI、HAおよびA2Mとの数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
別の実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、CirrhoMeter(商標)のスコア、好ましくはCirrhoMeter2Gのスコアとの数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
別の実施形態では、CombiMeter(商標)により、Fibroscan(商標)中央値と、FibroMeter(商標)のスコア、好ましくはFibroMeter2Gのスコアとの数学的組み合わせに基づくスコアが得られる。
InflaMeter(商標)は、ALT、A2M、PIおよび血小板を含む壊死性炎症活性を反映するコンパニオン検査である。
本発明の好ましい実施形態によれば、FMファミリーのうちの少なくとも1つの検査が本発明の方法に関わる。
「指標」とは、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含む、疾患の存在および/または重症度を診断または評価するための検査により得られる任意の数値を指す。本発明の一実施形態では、数学的組み合わせは、a+bx+cy(a、b、c...は係数である)のようないくつかのマーカー(x、y...)の一次結合、好ましくは二項ロジスティック回帰または複数の線形回帰である。一実施形態では、指標は、数値、好ましくは非束縛数値である。一実施形態では、スコアは、束縛数値である。一実施形態では、スコアは、例えばロジット関数などの数学関数による非束縛指標から束縛値への変換から得られる。好ましくは、スコアは、0〜1の範囲である。一実施形態では、指標、好ましくはスコアにおいて数学的に組み合わせられたデータは独立しており、すなわちその他のデータによって得られる情報とは異なり、かつ関連していない各情報が得られる。当業者に知られているように、ELF、FibroSpect(商標)、Hepascore、Fibrotest(商標)、FibroMeter(商標)、InflaMeter(商標)、CirrhoMeter(商標)およびCombiMeter(商標)の実施により、束縛値を有するスコアが得られ、APRIおよびFIB−4により指標が得られる。本発明によれば、指標またはスコアは、少なくとも1種のバイオマーカー、少なくとも1種の臨床マーカー、肝疾患を評価するための物理的方法から得られる少なくとも1種のデータの測定値および/またはそれらの任意の数学的組み合わせであってもよい。
「被説明データ」は、疾患を決定するための非侵襲的方法を実施して得られたデータ、指標またはスコアに対応する。被説明データを生データとみなしてもよい。被説明データがスコアまたは指標である場合、それを「初期指標」と呼ぶ。
「説明データ」は、被説明データの信頼性を評価するために使用される基準データ、指標またはスコアであるデータ、指標またはスコアに対応する。説明データは、基準集団におけるデータのレベルであってもよい。説明データは、例えば、基準集団における期待データまたは信頼性予測因子などの内部もしくは外部データであってもよい。
「最終指標または最終データ」は、本発明の方法により初期指標または被説明データをそれぞれ処理して得られる指標またはデータに対応する。一実施形態では、最終指標または最終データは、エキスパートシステムにより実施者に提供される診断検査結果の最終値を指す。一実施形態では、エキスパートシステムが、初期指標または被説明データを信頼性のあるものとみなした場合、最終指標または最終データはそれぞれ、初期指標または被説明データに等しい。別の実施形態では、エキスパートシステムが、初期指標または被説明データを信頼性のないものとみなした場合、最終指標または最終データはそれぞれ、初期指標または被説明データとは異なる(差が有意でないとみなされない限り)。最終指標または最終データを処理データとみなしてもよい。
「内部データ」とは、所与の検査において数学的に組み合わせられたデータを指す。
「外部データ」とは、対応する指標を計算するために所与の検査で使用されないデータを指す。
「正確性」とは、診断検査により正確に分類される患者の割合を指す。
「検査の信頼性を分析する」とは、診断検査の信頼性を分析することを意味し、ここでは、信頼性は、個々の対象または対象のサブグループに対する診断検査結果が正確である確率である。従って、本発明によれば、個々の対象または対象のサブグループに対する検査の信頼性を測定し、集団全体に対して正確性を測定する。本出願では、「信頼性が低い」「信頼できない」および「信頼性の(が)ない」は、同じ意味を有し、すなわち、診断検査結果が正確ではない(正確性<50%)とみなされる確率を表す。本発明の一実施形態では、検査の信頼性を分析することは、前記検査に関する診断の誤りの確率を評価すること、すなわち前記検査から得られたデータが誤っている確率を確認することに対応する。検査の信頼性が高くなる程、分類の誤りの確率は低くなる。従って、信頼性は、患者の小集団における診断の正確性にも対応し得、診断の正確性とは、集団全体において正しく診断された患者の割合を指す。
「データの信頼性を確認する」とは、異常データ、不整合データおよび/または不均質データを特定することを意味する。本出願では、「信頼性が低い」および「信頼できない」は同じ意味を有し、データに当てはめると、異常データ、不整合データまたは不均質データを指す。
「イベント警告」は、信頼できないデータまたは信頼できない検査が特定された場合に発行される警告に対応する。イベント警告は応答を誘発する。一実施形態では、イベント警告により、実施者または専門医師への警告メッセージまたは信号の送信を誘発してもよい。
「エキスパートシステム」とは、コンピュータシステムを指す。一実施形態では、エキスパートシステムは、エキスパート規則および自動化分析を含む。
従って、本発明は、疾患を決定するための非侵襲的方法を実施して得られるデータ、指標またはスコアである被説明データが得られる信頼性のある非侵襲的診断検査を提供するための方法に関し、前記方法は、
a.被説明データを収集する工程と、
b.被説明データの信頼性を分析する工程と、
c.被説明データが信頼性のあるものであるか否かの情報を提供し、信頼性が低い場合、信頼性のある最終データを提供する工程と、
を含む。
一実施形態では、本方法は、
a.少なくとも1種のバイオマーカー、少なくとも1種の臨床マーカー、疾患を評価するための物理的方法から得られた少なくとも1種のデータおよび/または少なくとも1種のスコアまたは指標から選択される少なくとも1種、好ましくは少なくとも2種のデータの測定値を収集することを意味する、被説明データを収集する工程と、
b.例えば基準集団における期待データなどの内部もしくは外部データであってもよい少なくとも1種の説明データまたは信頼性予測因子のいずれかと比較して、工程a)で収集したデータが異常データ、不整合データおよび/または不均質データであるか否かを特定し、かつ/または分散指標を計算することにより、各データの信頼性を分析することを意味する、被説明データの信頼性を分析する工程と、
c.被説明データが信頼性のあるものであるか否かの情報を提供し、信頼性が低い場合、被説明データを交換して信頼性のある最終データを提供する工程と、
を含む。
本発明の一実施形態では、工程c)すなわち被説明データが信頼性のあるものであるか否かの情報を提供し、かつ信頼性が低い場合、信頼性のある最終指標を提供する工程は、
a.その説明データまたは信頼性予測因子に従ってデータが信頼できない場合および/または被説明データが信頼できない場合には必ずイベント警告を生成し、かつイベント警告が発行された場合、イベント警告の予備分析を行う工程と、
b.イベント警告の存在または不存在への応答を誘発する工程であって、
i.イベント警告が生じなかった場合または前処理後のままである場合に被説明データを最終データとして公開すること、または
ii.コメントと共に被説明データよりも信頼性の高い最終データを計算および公開すること
であってもよい工程と、
を含む。
一実施形態では、本発明の方法は、
− データが異常データであるか否かを特定し、かつ異常データ警告であるイベント警告を発行する工程、および/または
− データが不整合データであるか否かを特定し、かつ不整合データ警告であるイベント警告を発行する工程、および/または
− データが不均質データであるか否かを特定し、不均質データ警告であるイベント警告を発行する工程、
を含む。
一実施形態では、発行されたイベント警告を処理し、この処理は、
− 1つ以上のイベント警告を抑制する工程、および/または
− いくつかのイベント警告が発行された場合に、前記イベント警告の優先順位づけを行って主要イベント警告を特定する工程、
を含む。
本発明の一実施形態では、応答を誘発する工程は、イベント警告が発行され、かつ前処理した後に、新しい指標、好ましくは新しいスコアを計算する工程を含む。
一実施形態では、被説明データを収集する工程は、初期指標と呼ばれる診断指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)を含む血液検査から選択されるスコアまたはFibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がマーカーから削除されている)あるいは別の診断検査から得られたスコアを収集する工程を意味し、前記指標は、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含み、前記指標を初期指標と呼ぶ。
被説明データが初期指標である一実施形態では、1種のイベント警告が発行された場合、以下の新しい指標:
− イベント警告を発行したデータが抑制されている代替指標、好ましくは代替スコア、および/または
− イベント警告を発行したデータが、例えばその平均値などのその代表値で置換されている推定指標、好ましくは推定スコア
のうちの少なくとも1つを計算する。
被説明データが初期指標である別の実施形態では、少なくとも2種のイベント警告が発行された場合、以下の指標、好ましくはスコア:
− 主要イベント警告を発行したデータが抑制され、二次イベント警告を発行したデータが、例えばそれらの平均値などのそれらの代表値で置換されている混合指標、好ましくは混合スコア、および/または
− イベント警告を発行した全てのデータが、例えばそれらの平均値などのそれらの代表値で置換されている推定指標、好ましくは推定スコア
のうちの少なくとも1つを計算する。
被説明データが初期指標である本発明の一実施形態では、前記イベント警告への応答を誘発する工程は、初期指標および新しい指標の中で最も信頼性のある指標、好ましくはスコアを特定する工程をさらに含む。
本発明の一実施形態では、説明データは、少なくとも1つの信頼性予測因子である。本発明によれば、信頼性予測因子は、以下に記載する非侵襲的検査に含まれるかそれに由来する変数と呼ばれるデータ群、好ましくはFibroMeter(商標)、InflaMeter(商標)およびFibroscan(商標)、より好ましくは、尿素、ALT、AST、CirrhoMeter2Gのスコア、FibroMeter2Gのスコア、Fibroscan(商標)クラス、FibroMeter(商標)クラス、CirrhoMeter(商標)クラス、Fibroscan(商標)中央値、IQR、IQR/M、血小板、A2M、尿素/Fibroscan(商標)の比および初期指標の分散指標から選択される。
一実施形態では、被説明データは、指標またはスコア(「初期指標」)であり、初期指標の分散指標を計算し、初期指標に含まれる各データの信頼性を、分散指標に対するその影響により評価する。分散指標に対するデータの影響を評価する工程は、初期指標の1〜(n−2)個のデータが削除されているn個のデータを含む初期指標の分散指標の一連の計算を行い、それにより、分散指標を最も低下させているデータを特定およびランクづけする工程を意味する。一連の中の最も低い分散指標は、どのデータを削除すべきかを示す。従って、本発明の方法は、この評価を含み、データを特定したら、分散指標を低下させている(応答を誘発した)データが削除されている代替指標の計算を行う。
一実施形態では、疾患の存在および/または重症度に関する信頼性のある非侵襲的診断検査を提供するための本発明の方法は、
a.初期指標と呼ばれる診断指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)を含む血液検査から選択されるスコアまたはFibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がマーカーから削除されている)あるいは別の診断検査から得られたスコアを収集する工程であって、前記指標は、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含み、前記指標を初期指標と呼ぶ工程と、
b.以下の行為:
i.各データを基準集団における期待データと比較すること、
ii.内部または外部の信頼性予測因子に対して工程a)の指標を予測すること、
iii.初期指標の分散指標を計算した後、1〜(n−2)個のデータが削除されているn個のデータを含む初期指標に対応する代替指標の分散指標の一連の計算を行い、それにより、分散指標を最も低下させているデータを特定およびランクづけすること、あるいは
iv.基準集団において得られたデータに基づいて、この指標を信頼性分類の信頼性クラスに位置づけること
により、工程a)で収集した指標の少なくとも1つのデータが異常データ、不整合データおよび/または不均質データであるか否か、あるいは、他のデータで観察されたものよりも分散指標を最も低下させているものであるか否かを特定することにより、各データの信頼性を分析する工程と、
c.データが、異常データ、不整合データおよび/または不均質データあるいは分散指標を低下させているデータである場合、イベント警告を生成する工程と、
d.イベント警告を生成した場合、まだ行っていなければ、
i.異常データ、不整合データおよび/または不均質データが抑制されている(代替指標)、その代表値、好ましくはその平均値で置換されている(推定指標)、あるいは少なくとも2種のデータが異常、不整合または不均質である場合には、最も不調和なものが抑制され、かつその他は、その/それらの代表値、好ましくはその/それらの平均値で置換されている(混合指標)こと以外は初期指標と同じ指標、あるいは
ii.最も低い分散指標の原因となるデータが削除されている代替指標に対応する指標
である、新しい指標、好ましくは新しいスコアを計算する工程と、
e.異常データ、不整合データおよび/または不均質データあるいは分散指標を低下させているデータを含む初期指標を、代替指標、推定指標または混合指標で置換する工程と、
を含む。
一実施形態では、本発明の方法は、
− FibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がマーカーから削除されている)から得られる、初期指標と呼ばれる指標を収集する工程と、
− 工程a)で収集した初期指標の分散指標を計算し、かつ初期指標の1〜(n−2)個のデータが削除されているn個のデータを含む初期指標の分散指標の一連の計算を行って分散指標に影響を与えているデータを特定する工程と、
− DIを低下させているデータが削除されている代替指標を含む初期指標を置換する工程と、
を含む。
一実施形態では、初期指標の分散指標が、その中間十分位数の指標、好ましくは、基準集団の第2〜9、2〜8、2〜7、3〜9、3〜8、3〜7、4〜9、4〜8、4〜7十分位数(初期指標の分散指標の患者分位数による十分位数−10%−)に対応しているか否かを計算した後に、工程c)を行う。
本発明の一実施形態では、検査結果は、スコアまたは指標であり、検査の信頼性を、前記スコアまたは指標の内部データを考慮して分析する。本発明の第2の実施形態では、検査結果は、スコアまたは指標であり、検査の信頼性を、外部データ(内部データを含む場合と含まない場合)を考慮して分析する。
[第1の実施形態−ES2G]
一実施形態では、本発明は、
a1.少なくとも1種のバイオマーカー、少なくとも1種の臨床マーカー、疾患を評価するための物理的方法から得られた少なくとも1種のデータおよび/または少なくとも1種のスコアまたは指標から選択される少なくとも2種のデータの測定値を収集する工程、
a2.好ましくはFibroMeter(商標)ファミリー由来の検査により工程(a)で収集した測定値または指標またはスコアを用いて初期指標(被説明データ)を計算する工程、
b1.上記検査で使用した各データの信頼性を確認する工程、および/または
b2.例えば、内部データおよび/または信頼性予測因子を考慮して、初期指標の信頼性を分析する工程、
c1.データが信頼できない場合および/または初期指標が信頼できない場合には常にイベント警告を生成する工程、
d1.最終指標を提供する工程を含む、前記イベント警告への応答を誘発する工程、
を含む、非侵襲的診断検査の信頼性を高めるための方法に関する。
データを収集する工程(工程a)および初期指標を計算する工程(工程b)
一実施形態では、本方法は、少なくとも1種のバイオマーカー、少なくとも1種の臨床マーカー、疾患を評価するための物理的方法から得られた少なくとも1種のデータおよび/またはスコアまたは指標から選択される少なくとも2種のデータの測定値を対象から収集する工程で開始する。
本実施形態では、好ましくは少なくとも3種のデータ、より好ましくは少なくとも4種のデータ、さらにより好ましくは少なくとも5種のデータを測定すると有利である。本発明の一実施形態では、2種のデータ、好ましくは3、4、5、6、7種またはそれ以上のデータを収集する。
少なくとも2種のデータを数学的に1つにまとめて、指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)から選択されるスコアを得る。
各データの信頼性を確認する前にこの指標を計算するので、本明細書ではこれを初期指標と称す。
本実施形態では、指標の内部データを考慮して、上記検査の信頼性を分析してもよい。
異常データ、不整合データおよび/または不均質データを特定する工程
異常データ
本明細書に使用されている「データ」という用語の前の「異常な」という用語(「異常データ」)は、基準集団において測定されたこのデータの通常の数値の範囲内に入らない数値を指し、異常データは一般に、測定誤差または誤った記録から生じる。
一実施形態では、異常データは、基準集団において測定された最も小さい期待データよりもよりも小さく、好ましくは2倍小さく、より好ましくは3倍小さく、さらにより好ましくは5または10倍小さい。
別の実施形態では、異常データは、基準集団において測定された最も高い期待データよりも高く、好ましくは2倍高く、より好ましくは3倍高く、さらにより好ましくは5または10倍高い。
一実施形態では、基準集団は、少なくとも500人の対象、好ましくは少なくとも1000人の対象からなる集団である。一実施形態では、基準集団は、健康な対象で構成されている。別の実施形態では、基準集団は、健康でない対象で構成されており、前記健康でない対象は、肝疾患に罹患していることが好ましい。別の実施形態では、基準集団は、健康な対象と健康でない対象の両方で構成されている。
実施例3は、いくつかのバイオマーカーおよび臨床的データについて異常であるとみなされるデータの例を示す。
不整合データ
本明細書に使用されている「不整合データ」は、指標を参照して使用し、前記データが整合範囲外であるデータのことであり、以下のとおり測定する。
− 指標の結果がこの指標にとって高いまたは低い値になるように、前記指標内の数学的に組み合わせられた全てのデータの値を任意に固定する。一例として、指標が0〜1の範囲のスコアである場合、スコアに関わる各データの値を、0.6〜0.9の範囲、好ましくは0.7または0.8のスコア(高い値)、あるいは0.1〜0.4の範囲、好ましくは0.2または0.3のスコア(低い値)が得られるように任意に固定し、
− データの1つの値を任意に変動させ、それ以外を一定にし、指標に対する前記変動の影響を測定し、
− 前記データに対して、誤りに導く、すなわち信頼性の点で指標に影響を与えるものとみなされるデータの値に対応する2種類の「影響の閾値」すなわち高い閾値および低い閾値を固定し、すなわち偽陽性または偽陰性の結果を与えるリスクのある指標を入れる。
本発明によれば、データの整合範囲は指標に依存している。例えば、ELFスコア内のバイオマーカーTIMP−1について測定した整合範囲は、FibroSpect(商標)スコア内のTIMP−1の整合範囲とは異なってもよい。
一実施形態では、指標はスコアであり、影響の閾値は、±0.05、±0.1、±0.2、±0.3または±0.35よりも大きいスコアの変動が生じるデータの値である。
診断方法では、スコアを測定する場合、0のスコアは通常、疾患の不存在(または診断標的の0%の確率または欠如)を表し、1のスコアは、疾患のより深刻な形態(または診断標的の100%の確率または存在)を表す。
従って、一実施形態では、このスコア計算のために使用される他のデータを、例えば0.2などの低い値または例えば0.8などの高い値が生じるように任意に固定した場合に、0.05、0.1、0.2、0.3または0.35を超えるスコアの減少または上昇を引き起こすデータにより、偽陰性または偽陽性が生じる可能性がある。
偽陽性の不整合は、その他のデータによって得られた検査結果から臨床的に有意な正(上昇)の偏差を生じるデータ値である。例えば、8種のマーカーを含む指標では、7種のマーカーにより得られたスコア結果が0.6である場合、その入力により0.75以上のスコア結果が生じた場合、8番目のマーカーが陽性の結果の原因である。
偽陰性の不整合は、他のデータによって得られた検査結果から臨床的に有意な負(減少)の偏差を生じるデータ値である。例えば、8種のマーカーを含む指標では、7種のマーカーにより得られたスコア結果が0.6である場合、その入力により0.45以下のスコア結果が得られた場合、8番目のマーカーが陰性の結果の原因である。
どちらの場合も、マーカー/データの有意な偏差の計算は、シミュレーションにより行う。以下の異なる設定値:
− 2種類のスコア値:低いスコア値(0.1〜0.3)と高いスコア値(0.6〜0.8)、
− 2種類の偏差の有意性の程度:低い有意性と高い有意性(例えば、0〜1のスコアに対してそれぞれ0.15〜<0.30および≧0.30)、
を用いてシミュレーションを行う。
一実施形態では、偽陰性の不整合範囲を不整合の程度が増加するいくつかの範囲に分割してもよい。一実施形態では、偽陰性の不整合範囲を以下の2つの範囲:
− スコア計算のために使用される他のデータの値を、例えば0.3のスコアなどの低いスコアおよび例えば0.7のスコアなどの高いスコアを生じるように任意に固定した場合(好ましくは臨床的にもっともらしい設定値を模倣している)に0.15〜≦0.30の範囲の負(減少)のスコア偏差を生じるデータの値に対応する緑色の区域と、
− スコア計算のために使用される他のデータの値を、例えば、0.3のスコアなどの低いスコアおよび例えば0.7のスコアなど高いスコアを生じるように任意に固定した場合に≧0.3の負(減少)のスコア偏差を生じるデータの値に対応する青色の区域と、
に分割してもよい。
本発明の一実施形態では、緑色の区域のデータは、青色の区域のデータよりも不整合が小さいとみなされる。
一実施形態では、偽陽性の不整合範囲を不整合の程度が増加するいくつかの範囲に分割してもよい。一実施形態では、偽陽性の不整合範囲を以下の2つの範囲:
− スコア計算のために使用される他のデータの値を、例えば0.3のスコアなどの低いスコアおよび例えば0.7のスコアなどの高いスコアを生じるように任意に固定した場合に0.15〜≦0.30の範囲の正(上昇)のスコア偏差を生じるデータの値に対応する黄色の区域と、
− スコア計算のために使用される他のデータの値を、例えば0.3のスコアなどの低いスコアおよび例えば0.7のスコアなどの高いスコアを生じるように任意に固定した場合に≧0.3の正(上昇)のスコア偏差を生じるデータの値に対応する赤い区域と、
に分割してもよい。
本発明の一実施形態では、黄色の区域のデータは、赤い区域のデータよりも不整合が小さいとみなされる。
実施例3は、FibroMeter(商標)のいくつかのバイオマーカーおよび臨床的データの整合範囲、偽陽性の不整合範囲および偽陰性の不整合範囲の例を示す。
不均質データ
本明細書に使用されている「不均質データ」は、指標またはスコアを計算するために検査で測定した他のデータと不均質すなわち調和または一貫していないデータである。
一実施形態では、あるデータを除くと実際の指標(またはスコア)の10%の変動、より好ましくは20%の変動、好ましくは30%の変動が生じる場合、前記データを他のデータと不均質であるとみなす。そうでない場合は、データを均質であるとみなす。
別の実施形態では、当業者によって知られているか計算された前記検査の分散指標の閾値未満である場合、データを不均質であるとみなす。前記検査の分散指標の閾値を超える場合、データを均質であるとみなす。
分散指標
本発明の一実施形態では、本方法で使用されるデータまたは検査の分散指標(DI)を測定して(バイオマーカー、臨床マーカー、疾患を評価するための物理的方法から得られたデータおよび/またはそれらの任意の数学的組み合わせの測定)、検査の信頼性を確認する。
分散指標は、前記データの分散を表す指標であり、一実施形態では、前記データを数学的に組み合わせて指標(例えば初期指標)を得る。一実施形態では、上記指標がn個のデータの組み合わせを含む場合、これらのn個のデータのn−1個の数学的組み合わせを用いる別の診断指標を測定して分散指標を決定する。1(100%)の分散指標は、データの完全な均質性に対応し、0の分散指標は、データの全分散に対応する。
指標値は、分散閾値に到達した場合に、信頼性がないものとみなす。上に定義した初期指標と最終指標との絶対差δに対するDIのプロットによって、DIの分散閾値を計算する(実施例2および図1に示す)。
例えば、FibroMeter2Gの場合、DIの信頼性閾値は0.81である。
従って、本発明は、
− DIが分散閾値以上である場合(すなわち、データが均質である場合)、初期指標は影響をほとんど受けず、これは、初期指標が信頼性のあるものであることを意味していること、
− DIが分散閾値未満である場合、初期指標は信頼性が低く、代替指標または推定指標が要求されること、
を示す。
一実施形態では、前記分散指標を以下のように測定してもよい。Xは指標のn個のx値のサンプルであり、ここでは、xの値はa〜bの範囲であり、従って
RI=s(X)/s(a,b)
(式中、s(X)は、Xの経験的標準偏差であり、s(a,b)は、nが奇数である場合はn個の値またはnが偶数である場合はn+1個の値を含むサンプルの[a,b]に対する最大の経験的標準偏差である)。
一実施形態では、分散指標を使用する場合、本発明の方法は、
(a)指標において数学的に組み合わせられたn個のデータを全て使用して、本明細書の上に記載したように分散指標を計算する工程と、
(b)分散指標の閾値(それに満たない場合は診断検査の正確性の割合は有意に減少する)を決定する工程と、
(c)この分散閾値に到達した場合、n個の代替指標(本明細書の上に記載したn−1個のデータの数学的組み合わせに対応する指標)を比較する工程と、
(d)分散指標における最大の変化の原因である代替指標すなわち初期指標(または工程fのための過去の指標)と比較して最も分散した値を有するデータを決定し、そのデータを除外する工程と、
(e)工程(d)の除外されたデータを含めずに新しい分散指標を計算する工程と、
(f)分散閾値になお到達している場合、分散指標の閾値に到達しなくなるまで、あるいは残りのデータの数が4未満になるまで、工程(b)〜(e)を繰り返す工程と、
を含む。
一実施形態では、n個のデータの組み合わせから得られる指標では、除外されるデータの最大数は、n/3以下、好ましくはn/4以下である。
分散閾値に到達しない分散指標を生じさせる初期指標または代替指標を、最終指標とみなす。
従って、前記最終指標を、対象における肝疾患の存在および/または重症度を評価するために最終的に使用してもよい。一実施形態では、前記評価は、対象を線維症ステージ分類のクラスすなわち各クラスが例えば1つ以上のMetavir Fステージなどの線維症ステージに関連づけられている分類のクラスに分類することを含む。
一実施形態では、本発明の方法は、
− イベント警告の数を示す工程、
− イベント警告または主要イベント警告を発行したデータを示す工程、
− データのうちのどのデータを除外するかを示す工程、
− 最終指標を示す工程、
のうちの1つを含む信頼性に関するコメントを公開する工程を含む。
イベント警告
イベント警告の種類
本発明の一実施形態によれば、信頼できないデータが特定された場合に、イベント警告が発行される。
一実施形態では、前記イベント警告は、異常データ(異常データ警告)、不整合データ(不整合データ警告)および/または不均質データ(不均質データ警告)の特定に対応してもよい。
一実施形態では、データは、不整合データ警告および不均質データ警告の両方を生成してもよい。
一実施形態では、本明細書の上に記載した不整合範囲に従って、不整合データ警告は、
− 偽陽性の不整合データ警告(データが偽陽性の不整合範囲に属する場合)、または
− 偽陰性の不整合データ警告(データが偽陰性の不整合範囲に属する場合)
であってもよい。
一実施形態では、偽陽性の不整合データ警告は、
− 赤色の警告(データが赤色の偽陽性の不整合区域に属する場合)、または
− 黄色の警告(データが黄色の偽陽性の不整合区域に属する場合)
であってもよい。
一実施形態では、偽陰性の不整合データ警告は、
−青色の警告(データが赤色の偽陰性の不整合区域に属する場合)、または
−緑色の警告(データが黄色の偽陰性の不整合区域に属する場合)
であってもよい。
イベント警告の予備分析
一実施形態では、前記イベント警告への応答を誘発する前に、イベント警告の予備分析を行ってもよい。
一実施形態では、前記予備分析は、イベント警告の抑制(すなわち、イベント警告を発行したデータを最終的に信頼性のあるものとみなす)または前記警告の優先順位づけに対応していてもよく、それにより、「主要イベント警告」および「二次イベント警告」を定める。
イベント警告の抑制
一実施形態では、各データを別々に検討し、1つのデータが不整合データ警告を生成するが不均質データ警告を生成しない場合すなわちデータが指標内の数学的に組み合わせられた他のデータと不整合であるが均質である場合、不整合データ警告をその後に抑制する(すなわち、スコア変化を生じさせない)。指標の各データに対して、この実施形態を繰り返す。
本発明の別の実施形態では、いくつかのデータを同時に検討し、同じ種類の少なくとも2つ、好ましくは少なくとも3つ、より好ましくは少なくとも4つのデータ不整合警告、すなわち2つまたは3つまたは4つまたはそれ以上の偽陽性または偽陰性の不整合データ警告を同時に誘発し、前記不整合データ警告を、その後に抑制してもよい(すなわち、スコア変化を生じさせない)。本発明の一実施形態では、少なくとも2つ、好ましくは少なくとも3つ、より好ましくは少なくとも4つの陰性の不整合データ警告を同時に誘発する場合、前記不整合データ警告を抑制しない。
当業者は、上記内容を考慮して、データを前処理するためのさらなる規則(例えば、特定のバイオマーカーまたは臨床的データ(例えば、年齢、性別またはASATなど)が関わる場合に単一のイベント警告を抑制する、偽陰性の不整合データ警告を決して抑制しない等)を作成することができる。FibroMeter(商標)を行う場合のそのような規則の例が実施例4に示されている。
優先順位づけ
一実施形態では、いくつかのイベント警告が発行された場合、前記警告の優先順位づけを含む予備分析を行い、それにより「主要イベント警告」および「二次イベント警告」を定めてもよい。
いくつかの不整合データ警告が発行された場合の予備分析の規則の例を以下に示す。
− ある偽陽性の不整合データ警告(すなわち「主要警告」)を、ある偽陽性の不整合データ警告(故に、これが「二次警告」となる)よりも重要なものとみなしてもよい、
− 青色の警告は緑色の警告よりも重要であってもよい、
− 赤色の警告は黄色の警告よりも重要であってもよい、
− 例えば、2つの青色の警告などの2つの同様のイベント警告が発行された場合、主要警告は、中間値のようなその代表値から最も離れているデータまたはスコア値に最大の影響を有するデータによって発行されたものであってもよい等。
FibroMeter(商標)を行う場合のイベント警告の予備分析規則のその他の例は、実施例4に示されている。
新しい指標−データの処理
本発明の一実施形態では、イベント警告が発行され、かつ前処理した後に、前記予備分析後にいくつかのイベント警告が存続する場合、新しい指標、好ましくは新しいスコアを計算する。
一実施形態では、単一のイベント警告が発行されると、以下の指標、好ましくはスコア:
− イベント警告を発行したデータが抑制されている代替指標、好ましくは代替スコア、および/または
− イベント警告を発行したデータが例えばその平均値などのその代表値で置換されている推定指標、好ましくは推定スコア
のうちの少なくとも1つを計算する。
一実施形態では、少なくとも2種のイベント警告が発行されると、以下の指標、好ましくはスコア:
− 主要イベント警告を発行したデータが抑制され、かつ二次イベント警告を発行したデータが平均値のようなそれらの代表値で置換されている混合指標、好ましくは混合スコア、および/または
− イベント警告を発行したデータが全て、例えばそれらの平均値などのそれらの代表値で置換されている推定指標、好ましくは推定スコア
のうちの少なくとも1つを計算する。
本発明の一実施形態では、データの平均値は、基準集団で測定された前記データの平均値(好ましくは算術平均値)に対応する。
誘発される応答
本発明の一実施形態では、新しい指標、好ましくは新しいスコアの前処理または計算および好ましくはコメントと共に初期指標(代替指標または推定指標)とは異なる最終指標の公開後にイベント警告が残っていない場合には、応答は、最終指標としての初期指標の公開であってもよい。
最も信頼性のある指標の選択
一実施形態では、単一のイベント警告が発行されると、初期指標(II)の値を代替指標(AI)および/または推定指標(EI)の値と比較して、最も適当な指標の選択を行う。
一実施形態では、|II−AI|がδ(δは臨床的有意差である)よりも大きい場合、AIを最も信頼性のある指標とみなす。一実施形態では、δは0.05〜0.3、好ましくは0.1〜0.2の範囲であり、より好ましくは約0.15である。
一実施形態では、|II−AI|がδ(ここで、δは本明細書の上に記載したとおりである)以下である場合、以下の6つの状況に分けられる。
− II<Ct≦AIである場合、AIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは臨界閾値を表し、指標の肝硬変閾値すなわち対象を肝硬変またはF4のMetavirステージに分類する前記指標の数値に対応する)
− AI≦Ct<IIである場合、AIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− Ct≦II≦AIである場合、AIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− Ct≦AI≦IIである場合、AIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− AI≦II≦Ctである場合、IIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− II≦AI≦Ctである場合、IIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
本発明の一実施形態では、当該検査はFibroMeter1Gであり、Ctは約0.88である。
一実施形態では、少なくとも2種のイベント警告が発行されると、初期指標(II)の値を混合指標(MI)および/または推定指標(EI)の値と比較して、最も適当な指標の選択を行う。
一実施形態では、|II−MI|がδ(ここで、δは臨床的有意差である)よりも大きい場合、MIを最も信頼性のある指標とみなす。一実施形態では、δは、0.05〜0.3、好ましくは0.1〜0.2の範囲、より好ましくは約0.15である。
一実施形態では、|II−MI|がδ(ここで、δは本明細書の上に記載したとおりである)以下である場合、以下の6つの状況に分けられる。
− II<Ct≦MIである場合、MIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは臨界閾値を表し、指標の肝硬変閾値すなわち対象を肝硬変またはF4のMetavirステージに分類する前記指標の数値に対応する)
− MI≦Ct<IIである場合、MIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− Ct≦II≦MIである場合、MIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− Ct≦MI≦IIである場合、MIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− MI≦II≦Ctである場合、IIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
− II≦MI≦Ctである場合、IIを最も信頼性のある指標であるとみなす(ここで、Ctは本明細書の上に記載したとおりである)
本発明の一実施形態では、当該検査はFibroMeter1Gであり、Ctは約0.88である。
本発明の一実施形態では、選択した指標を最終指標と呼ぶ。従って、対象における肝疾患の存在および/または重症度を評価するために、前記指標を最終的に使用してもよい。一実施形態では、前記評価は、対象を線維症ステージ分類のクラス、すなわち、各クラスが例えば1つ以上のMetavir Fステージなどの線維症ステージに関連づけられている分類のクラスに分類することを含む。
一実施形態では、本発明の方法は、コメントを公開する工程を含む。一実施形態では、前記コメントは、イベント警告の数およびイベント警告または主要イベント警告を発行したデータを示すことを含む。一実施形態では、前記コメントは、指標のうちのどの指標を最も信頼性のあるものとみなしたかを示すことを含む。一実施形態では、前記コメントは警告メッセージを含み、ここでは、警告の数が多い程、より多くの結果を慎重に検討しなければならない。
[第2の実施形態−ES3G]
本発明は
a’1−対象において実施された非侵襲的検査から得られた少なくとも1種、好ましくは少なくとも2種の指標またはスコアまたは物理データを収集する工程と、
b’1−各指標またはスコアの信頼性を分析する工程と、
c’1−検査が信頼できない場合はイベント警告を生成する工程と、
d’1−前記イベント警告への応答を誘発する工程と、
を含む、信頼性のある診断検査を提供するための方法に関する。
データ
本実施形態では、工程a’1では、好ましくは少なくとも2、3、4、5種またはそれ以上の指標またはスコアまたは物理データを測定する。本発明の一実施形態では、前記指標またはスコアまたは物理データは、好ましくは指標、より好ましくはスコアおよび/または物理データである。
一実施形態では、本発明の方法は、FibroMeterファミリー由来の検査から得られた少なくとも1種のスコアと、Fibroscan(商標)から得られた少なくとも1種の物理データとを含む。特定の実施形態によれば、FibroMeter(商標)(スコア)およびFibroscan(商標)(物理データ)から収集した結果は、6ヶ月以内、好ましくは2ヶ月以内に同じ対象から得たものである。
信頼性の分析
一実施形態では、検査の信頼性を分析することは、1つのデータ(本発明者らの実施形態におけるスコアまたは物理データ)を被説明データとみなし、それ以外のデータは説明データであることを意味する。
本実施形態では、指標の内部および/または外部データを考慮して、検査の信頼性を分析する。
信頼性予測因子
一実施形態では、スコアという用語は、二項ロジスティック回帰に含まれるロジット関数により得られるスコアを意味し、ここで、ロジット関数は、1/1−eR(式中、R=c+ax+by...である)である。これらのスコアにより独立した信頼性予測因子が得られる。従って、それらにより、信頼性のない診断検査結果から非常に信頼性のある診断検査結果までの定性的信頼性記述子により、信頼性クラスを決定する。大部分の結果を、以下の診断標的に基づき、特に明記しない限り詳細な線維症分類(例えば、2つの標的および/または存在または不存在など)により正確に診断する。
区分けを有しない(集団全体に対する)信頼性予測因子
信頼性予測因子の例は、スコア、AST、ALT、分散指標とASTとを組み合わせたスコアの分散指標である。
区分けを有する(患者の小集団に対する)信頼性予測因子
患者の特定の小集団では、検査(例えば、Fibroscan(商標)、FibroMeter(商標)、CirrhoMeter(商標)、CombiMeter(商標)など)の信頼性予測因子の例は、Fibroscan(商標)中央値、Fibroscan(商標)分類、IQR/M、IQR、FibroMeter(商標)分類、CirrhoMeter(商標)分類、尿素、ALT、AST、CirrhoMeter2Gのスコア、FibroMeter2Gのスコアであり、信頼性予測因子により、陰性の予測値のための閾値および陽性の予測値のための別の閾値を定めてもよい。
一実施形態では、信頼性分析は、以下の2つの工程を含む。
− 第1の工程は、信頼性クラスを決定するランクづけされた確率の計算に対応する。例えば、対象サブグループにおける大多数の対象の結果が誤分類されている場合、その結果を信頼性のないものとみなす。一実施形態では、正確な結果の確率または頻度が90%以上である場合、その結果は非常に信頼性のあるものと言える。
− 第2の工程は、信頼性クラスの予測因子の決定を含む。これは、信頼性クラスを特定するために必須である。この工程は、正確性と信頼性との主な違いである。例えば、診断の正確性が90%である診断検査は、当該検査により、90%の患者で正しい分類が得られることを意味する。当該検査は、集団全体の患者の10%において不正確である、すなわち、かなり(100%)信頼性がない。信頼性評価により、対象サブグループ(例えば2%の患者)において確度が30%であれば(すなわち集団全体における不確度よりも高ければ)、それを信頼性のない結果であると決定してもよい。この信頼性のない結果は、他のマーカーと比べて高い体重および/または不一致なマーカーなどの1種または数種の有意な信頼性予測因子によって診断する(例えば、第1のマーカーは極めて異常であるが、全ての他のマーカーは正常であるかそれほど異常ではない)。
一実施形態では、検査の正確性が50%超、好ましくは60、70、75、80、85、90または95%超である場合、検査を、診断にとって十分に信頼性のあるものとみなす。従って、診断にとって許容される確率よりも高いとみなされる診断の誤りの確率は、50%、40%、30%、20%、15%、10%または5%である。言い換えると、誤診断された対象の割合が50%未満、好ましくは40、30、20、15、10または5%未満である場合、検査を十分に信頼性のあるものとみなす。
一実施形態によれば、本発明の方法は、
a.初期指標と呼ばれる診断指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)を含む血液検査から選択されるスコアまたはFibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がマーカーから削除されている)あるいは別の診断検査から得られたスコアを収集する工程であって、前記指標は、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含み、前記指標を初期指標と呼ぶ工程と、
b.基準集団において得られたデータに基づいて指標を信頼性分類の信頼性クラスに位置づけることにより各データの信頼性を分析する工程と、
を含む。
本実施形態によれば、被説明データの信頼性を、前記データを信頼性分類の信頼性クラスに位置づけることにより決定する。一実施形態では、前記信頼性分類により、各データセット(すなわち、被説明データと説明データとの各組み合わせ)に対して、被説明データの信頼性が得られる。一実施形態では、基準集団において得られたデータに基づいて、前記信頼性分類を確立した。一実施形態では、初期指標の信頼性を、前記指標を基準集団に基づいて確立された被説明データおよび説明データ(予測因子)の二項目表を含む信頼性分類の信頼性クラスに位置づけることにより決定し、この表の中の指標の位置を読み出すことにより、説明データを考慮した指標の信頼性が得られる。一実施形態では、実施される異なる検査は、正しく分類された患者の好ましくは独立した予測因子である。一実施形態では、被説明データにより正しく分類された患者の独立した予測因子は、例えば二項ロジスティック回帰などの多変量解析により決定されたものである。
一実施形態では、患者の結果(被説明データ)と信頼性クラスとの比較に基づいて検査の信頼性を決定し、ここでは、信頼性クラスは、基準データベースにおいて決定された検査結果(被説明データ)の信頼性レベルに基づく分類の一部である。
一実施形態では、この基準データベースにおいて、正しく分類された患者の独立した予測因子は、多変量解析(例えば、二項ロジスティック回帰すなわちRLB)により決定されたものであり、ここでは、従属変数は、診断検査により正しく分類された患者であり、独立変数は、当該検査に含まれる全ての複合変数(内部データ)、人口統計データにより得られた利用可能な変数、および他の利用可能な検査に含まれる複合変数(外部データ)である。RLBにより、いくつかの変数または区分けされた分類を含むスコアが得られる。どちらによっても、信頼性分類が得られる。
− 上記スコアを正しく分類された患者の割合に対してプロットし、このグラフに対してエキスパートにより選択された閾値によりクラスを決定する(図3の例を参照)。
− 独立変数間の関係により変数を区分けすることにより、区分けされた分類を決定する。両方の変数をプロットしているグラフまたはヨーデン指標のような古典的な指標により、閾値を決定することができる。この分類は、2つの独立変数間に有意な相互作用が存在する場合に得られることが好ましい。
− RLBにより決定された信頼性クラスと、単一の変数により得られた信頼性クラス(例えば、本明細書の上に定義されているような不整合な変数など)とを含む混合されたモデルが生じ得る。
最後に、患者の結果(被説明データ)をこれらの信頼性クラスと比較し、この検査を受けるこの患者のために、その後の信頼性レベルを固定する。
一実施形態では、被説明データは、診断検査結果または指標、好ましくはスコアであり、それらが独立した予測因子であるか否かを定めるために検査される予測因子は、
− 指標(内部データ)を計算するための数学的に組み合わせられたデータ、および
− 本明細書の上に記載したような説明データ(外部データ)、および/または
− 診断検査により利用可能な外部データ
である。
検査の内部変数の例は、本明細書の上に記載したような分散指標(DI)である。
信頼性予測因子の例としては、以下に記載するような非侵襲的検査に含まれるかそれに由来する変数、好ましくはFibroMeter、InflaMeterおよびFibroscan、より好ましくは、尿素、ALT、AST、分散指標、CirrhoMeter2Gのスコア、FibroMeter2Gのスコア、Fibroscan(商標)クラス、FibroMeter(商標)クラス、CirrhoMeter(商標)クラス、Fibroscan(商標)中央値、IQR、IQR/M、血小板、A2Mおよびt=尿素/Fibroscanの比が挙げられるが、これらに限定されない。
FibroMeter2GおよびCombiMeter(商標)の信頼性予測因子の例は、実施例6に示されている。
イベント警告
一実施形態では、被説明データが信頼できない場合に、イベント警告が発行される。
誘発される応答
一実施形態では、イベント警告が被説明データに対して発行された場合、説明データを被説明データとしてそれぞれを順番に検討し、本明細書の上に記載したようにそれらの信頼性を確認する。
例示的な一実施形態では、第1の工程において被説明データとして検討されるFibroMeter(商標)の結果を用いて、FibroMeter(商標)およびFibroscan(商標)を行う。イベント警告がFibroMeter(商標)に対して発行された場合、FibroMeter(商標)の結果を説明データとして用いて、第2の工程において、Fibroscan(商標)の結果を被説明データとして検討し、Fibroscan(商標)の信頼性を確認する。
本発明の一実施形態では、1つの検査のみが信頼性のあるものである場合、その結果を最終データとして検討する。本発明の別の実施形態では、いくつかの検査が信頼性のあるものである場合、最も信頼性のあるものを所与の最終データとして検討する。本発明の別の実施形態では、いくつかの検査が信頼性のあるものである場合、それらの組み合わせを所与の最終データとして検討する。例えば、一実施形態では、Fibroscan(商標)およびFibroMeter(商標)またはCirrhoMeter(商標)が信頼性のあるものである場合、対応するCombiMeter(商標)を所与の最終データとして検討する。
従って、一実施形態では、対象における肝疾患の存在および/または重症度を評価するために、最終データを最終的に使用してもよい。一実施形態では、前記評価は、線維症ステージ分類のクラス、すなわち、各クラスが例えば1つ以上のMetavir Fステージなどの線維症ステージに関連づけられている分類のクラスに対象を分類することを含む。
一実施形態では、本発明の方法は、コメントを公開する工程を含む。一実施形態では、前記コメントは、データのうちのどのデータが最も信頼性のあるものとして検討されたかを示すことを含む。一実施形態では、前記コメントは、警告メッセージを含み、ここでは、信頼できないものとして検討されたデータが多い程、より多くの結果を慎重に検討しなければならない。
FibroMeter(商標)およびFibroscan(商標)を実施する工程を含む本発明の方法の例が、実施例5に示されており、信頼性分類の確立は、実施例7に示されている。
一実施形態では、本発明の方法は、予測値により診断の正確性を高める。一実施形態では、基準データベースにおいて以前に得られたいくつかの診断検査を用いて、主要な診断標的に対して100%の予測値の閾値を固定する。一実施形態では、患者の結果が100%陽性の予測値に対応する閾値以上である場合、診断標的を肯定する。別の実施形態では、患者の結果が100%陰性の予測値に対応する閾値以上である場合、診断標的を除外する。
本発明は、本発明の方法を実施するエキスパートシステムにも関する。
本発明は、本発明の方法を実施するためのソフトウェアにも関する。
一実施形態では、エキスパートシステムは、
a.ソフトウェアに入力データ(バイオマーカー、物理データ、臨床的データ、スコアのレベルなど)を入力し、
b.上記ソフトウェアは、入力データ(バイオマーカー、物理データ、臨床的データ、スコアのレベルなど)に基づいて個々の対象のために、各種戦略を用いる各種検査を実行し、
b.上記ソフトウェアは、各検査の入力データの信頼性を確認し、
c.上記ソフトウェアは、工程a)で実行した各検査の信頼性を分析し、
d.上記ソフトウェアは、この個人に対して最も信頼性のある検査に対応する最終検査、および任意に最終検査の信頼性に関するコメントを出力する、
ソフトウェアである。
別の実施形態では、エキスパートシステムは、
a.上記ソフトウェアに、被説明データと呼ばれる入力検査(物理データ、スコアなど)を入力し、
b.上記ソフトウェアは、説明データを用いて被説明データの信頼性を分析し、
d.上記ソフトウェアは、任意に最終検査の信頼性に関するコメントと共に、この個人に対して最も信頼性のある検査に対応する最終検査を出力する、
ソフトウェアである。
初期のFibroMeter(商標)の分散指標が、初期のFibroMeter(商標)(エキスパートシステム(ES)なし)と本発明の方法に従って修正された最終のFibroMeter(商標)(ESあり)との差と十分に相関していること(斜めの破線)を示すグラフである。水平線は平均を示す。慢性C型肝炎に罹患している825人の患者集団。 分散指標が、本発明の方法により修正されていないFibroMeter(ESなし)または修正されたFibroMeter(ESあり)(右の箱は9.2%の事例)の値の間で有意に異なることを示すグラフである。箱ひげ図:中央値、四分位数間範囲および極値。慢性C型肝炎に罹患している825人の患者集団。 FibroMeter2Gの信頼性スコアに従い、FibroMeter2G(FM2G)を用いて、Fibroscan(商標)クラス<3(A)または>2(B)に正確に分類された患者の割合を示すグラフの組み合わせである。 信頼性クラスの関連性を示すグラフの組み合わせである。(4A)は、X軸上のFibroMeterの10個の信頼性クラスの関数としてY軸上にFibroMeterスコア(連続した線)と正確性(破線)との関係を示す。X軸上の信頼性クラスは、FibroMeterスコアの増加に従ってランクづけされている。(4B)は、FibroMeterの10個の信頼性クラスの関数としてFibroMeterスコアの正確性を示す。図の中で、最初の5個のクラスは、FSクラスが<3(p<0.001)のクラスであり、後の5個のクラスはFSクラスが≧3(p<0.001)のクラスである。 3つのクラス分類およびIQR/Mの関数として、Casteraらのカットオフ値に由来する肝硬度評価(LSE)分類により正しく分類された患者の割合を示すグラフであり、IQR/Mは良好な信頼性予測因子であることを示している。 LSE中央値およびIQR/Mの関数として、(A)有意な線維症(診断のカットオフ値:7.1kPa)または(B)肝硬変(診断のカットオフ値:12.5kPa)の診断のためのLSEにより正しく分類された患者の割合を示すグラフの組み合わせである。
以下の実施例により本発明をさらに例示する。
実施例1:FMファミリーの組成
Figure 2015522173
FM:FibroMeter、CM:CirrhoMeter
A2M:α−2マクログロブリン、HA:ヒアルロン酸、PI:プロトロンビン指数、PLT:血小板、Bili:ビリルビン、Fer:フェリチン、Glu:グルコース、FS:Fibroscan
変数の数
HAをGGTで置き換えてもよい
一実施形態では、被説明データは、FibroMeterファミリー由来の検査であり、ここでは、尿素はマーカーから削除されている。
参考文献
1. Cales P, Oberti F, Michalak S, Hubert-Fouchard I, Rousselet MC, Konate A, Gallois Y, et al. A novel panel of blood markers to assess the degree of liver fibrosis. Hepatology 2005; 42:1373-1381.
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実施例2:本発明の方法により修正されたFibroMeterの分散指標
図1および図2は、本発明の方法を行う前(すなわち初期スコア)および本発明の方法を行った後(すなわち最終スコア)のFibroMeter(商標)の分散指標の分析により示されるように、本発明の方法により、FibroMeter(商標)の信頼性の測定が向上することを示している。分散閾値(Y軸)に満たない患者は、低い信頼性を有している。この825人の患者集団において、大部分の患者の記号が左上の角で重なり合っていることに留意されたい。
図1は、分散指標(DI)が高い場合、本発明のエキスパートシステムにより代替指標または推定指標が得られず、最終指標は初期指標であることを示している。言い換えると、DIは、肝疾患の存在および/または重症度を評価するための非侵襲的方法の良好な信頼性予測因子である。図1は、本発明の方法の有効性を示している。
実施例3:FibroMeter(商標)の異常データ、整合および不整合範囲(表1)
Figure 2015522173
A2M:α−2マクログロブリン、HA:ヒアルロン酸、PI:プロトロンビン指数、PLT:血小板、AST:アスパラギン酸アミノ基転移酵素
実施例4:FibroMeter(商標)を行った場合に発行されたイベント警告の予備分析規則の例
ここに、FibroMeter(商標)を行った場合に発行された不整合データイベント警告のいくつかの予備分析規則を示す。この実施例では、実施例1の表による4種類すなわち赤色、黄色、緑色および青色の不整合データ警告が発行される。
イベント警告の抑制
− ASTがたった1つの赤色の警告であり、かつ黄色の警告がない場合、赤色の警告を抑制する。
− 1つの赤色の警告および1つの黄色の警告がある場合、「年齢」データによりこれらのイベント警告のうちの1つが発行された場合を除き、どちらも抑制してもよい。この状況では、年齢により発行されるイベント警告のみを抑制する。
− 2つ以上の赤色または2つの黄色の警告がある場合、これらの警告を抑制する。
− 「年齢」データによりイベント警告が発行された場合、前記イベント警告を抑制する。
イベント警告の優先順位づけ
本明細書の上に記載したようなイベント警告の抑制後にいくつかの不整合データ警告が存続する場合、以下のように、前記イベント警告の優先順位づけ(すなわち、主要警告の選択)を行う(表2−全ての状況は示さず)
Figure 2015522173
同じ種類のいくつかのイベント警告(例えば、2つの赤色の警告または2つの緑色の警告など)が発行された場合、主要なものは、その平均値から最も離れているデータにより発行されたものである。
実施例5:信頼性分類の例
以下の表では、「信頼性」は、所与のクラスにおいて正確に分類された患者の割合に対応する。「患者の割合(%)」は、この所与のクラスにおいて分類された基準集団に対する患者の割合に対応する。「F」クラスに対する言及は全て、推定されるMetavir Fステージを参照している。基準集団は約600人の患者を含む。
Fibroscanの信頼性(表3)
被説明データは、Fibroscanに基づく分類であり、説明データは、CirrhoMeter2G(CM2G)のスコア、FibroMeter2G(FM2G)のスコア、ASTおよびALTである。
Figure 2015522173
結論として、表3に示すように、Fibroscanを行った後に≦F2として分類され、かつ0.13以下のCirrhoMeter2Gスコアおよび26IU/L以上のASAT定量を有する92%超の患者が正しく分類されている。この状況は、約60%の患者に関する。
一方、Fibroscan後に≧F3に分類され、かつ0.40未満のFibroMeter2Gスコアを有する約80%の患者が誤診断されている。従って、約2%の患者を表すこれらの患者にとってFibroscanは信頼性のある検査ではない。
FibroMeter2Gの信頼性(表4)
被説明データは、FibroMeter2G(FM2Gクラス)に基づく分類であり、説明データは、Fibroscanによる分類(FSクラス)、FibroMeter2G(FM2G)のスコア、尿素/Fibroscanから得られたスコアの比(尿素/FS)、IQR(Fibroscanの四分位数間範囲)および血小板である。
Figure 2015522173
結論として、表4に示すように、FibroMeter2Gを行った後に≦F2として分類され、かつ1.0以下のIQRによりFibroscan後にF<2として分類された91%超の患者は、正しく分類されている。従って、集団の約23%を表すこれらの患者にとって、FibroMeter2Gは信頼性のある検査である。FibroMeter2Gを行った後に≧F3として分類され、かつ1.015未満の尿素/FS比を有する患者に対して同じ結論を下すことができる。
一方、FibroMeter2G後に≧F3に分類され、かつ0.43未満のFibroMeter2Gスコアを有する約78%の患者は、誤診断されている。従って、集団の約2.5%を表すこれらの患者にとって、FibroMeter2Gは信頼性のある検査ではない。
実施例6:信頼性予測因子の例
FibroMeter2Gの信頼性予測因子(表5)
FibroMeter2Gの信頼性予測因子の例を以下の表5に示す。慢性C型肝炎に罹患している597人の患者集団。FS:Fibroscan、FM:FibroMeter。
Figure 2015522173
患者のためにFibroMeter2Gの信頼性を測定するための本発明の方法は、この例では、以下の2つの工程を含む。
1.100%誤分類される患者を決定する変数閾値(ASTまたはALTの変数閾値)を当てはめる工程
2.次いで、多変量スコアを他の患者に当てはめる工程
図3および図4は、信頼性クラスの関連性を示す。
Fibroscan(FS)線維症クラス<3に分類された患者について、3種類の予測因子を含む予測スコア(スコア#1)の有効性が図3Aに示されており、ここでは、スコアは、X軸上で4つの信頼性クラス(信頼性スコア)に分けられている(ANOVAによりp<0.001)。
FSクラス>2に分類された患者について、3種類の予測因子を含む予測スコア(スコア#2)の有効性が図3Bに示されており、ここでは、スコアは、X軸上で4つの信頼性クラス(信頼性スコア)に分られている(ANOVAによりp<0.001)。
図4では、最初の5つのクラスは、FSクラスが<3(p<0.001)であり、後の5つはFSクラスが≧3(p<0.001)である。図4Aは、X軸上のFibroMeterの10個の信頼性クラスの関数として、Y軸にFibroMeterスコア(連続した線)と正確性(破線)との関係を示す。X軸上の信頼性クラスは、FibroMeterスコアの増加に従ってランクづけされている。図4Bは、FibroMeterの10個の信頼性クラスの関数としてFibroMeterスコアの正確性を示す。
CombiMeter(商標)の信頼性予測因子(表6)
CombiMeter(商標)の信頼性予測因子の例を、以下の表6に示す。ここには、Fibroscanクラス、Fibroscan中央値、尿素、FibroMeter2G(FM2G)のスコア、CirrhoMeter2Gクラス(CM2Gクラス)およびASTが含まれている。
Figure 2015522173
実施例7:LSEの正確性の分類
患者および方法
患者
肝生検およびLSEを行う2つの集団を本調査に含めた。LSEは、肝硬度評価(LSE)を表し、Fibroscan装置による検査の間に記録される全ての測定値に対応する。第1の集団は、2004年〜2009年の間にフランスの3箇所の施設(アンジェー:n=383、ボルドー:n=309およびグルノーブル:n=142)でリクルートした慢性肝疾患に罹患している患者で構成されていた。アンジェーおよびボルドーの施設に含まれる患者は、様々な原因の慢性肝疾患に罹患しており、グルノーブルからの患者はCHCに罹患していた。第2の集団は、フランスのエイズおよび肝炎における国立調査機関(French National Agency for Research in AIDS and Hepatitis)によって推進されている多施設ANRS/HC/EP23 Fibrostar研究(Zarskiら, J Hepatol 2012; 56:55-62)の患者であった。両集団に含まれる患者を特定し、かつ最終的に、統計学的分析のための単一観察としてグループ化した。全ての患者がそれらの書面によるインフォームドコンセントに同意した。調査手順は、現在のヘルシンキ宣言の倫理指針に準拠しており、地域の倫理委員会から認可を受けていた。
組織学的評価
Metavir線維症(F)病期分類に従って肝線維症を評価した。有意な線維症をMetavir FM≧2とし、深刻な線維症をMetavir FM≧3とし、肝硬変をMetavir FM4として定めた。第1の集団では、肝臓学を専門とする盲検化された上級病理学者により各施設で組織学的評価を行った。Fibrostar研究では、不一致の場合はコンセンサス読影により、2人の上級の専門家が組織学的病変部を中心的に評価した。肝臓標本の長さが15mm以上であり、かつ/または門脈路の数が8以上である場合に、線維症病期分類を信頼性のあるものとみなした。
肝硬度の評価
検査条件−患者データに対して盲検化された経験豊富な観察者(本調査の前に50回を超える検査経験)により、Mプローブ(Mプローブは標準的なプローブであり、肥満の患者または児童に特異的なプローブである)を用いて、Fibroscan(Echosens社、フランスのパリ)によりLSEを行った。本調査の目的では、肝生検とLSEとの間の3ヶ月以下の時間間隔を容認可能なものとみなした。検査条件は、少なくとも10個の有効な測定値を得るために、製造業者によって推奨されるものであった。LSE測定は、単一すなわちFibroscanプローブのボタンを押した後の肝硬度測定に対応する。Fibroscan製造業者によって定められた内部プロセスにより測定値の有効性を決定した。各LSE測定値の有効性を評価する。測定値を「有効」とみなした場合に肝硬度を画面に表示し、「無効」とみなした場合は表示しない。結果を、全ての有効な測定値の中央値およびIQR(キロパスカル)として表した。LSE中央値(kPa)は、LSEの間に行われた全ての有効な測定値の中央値に対応し、LSE四分位数間範囲(IQR)(kPa)は、第25〜第75百分位数の間の50%の有効な測定値を含むLSE中央値の周りの間隔に対応する。
通常の定義に従って、60%以上の成功率および0.30以下のIQR/Mを有する10個以上の有効な測定値を含んでいた場合に、LSEを信頼性のあるものとみなし、有効な測定値の数のLSEの間に行われた測定値の総数に対する比として成功率(%)を計算する。
LSEの結果の解釈−過去の調査で公開された診断のカットオフ値に従って、LSE中央値を解釈した。本発明者らの調査対象母集団(68%)において、慢性C型肝炎(CHC)は肝疾患の主要な原因であったため、本発明者らは、Casteraらによって公開されたカットオフ値(Casteraら, Gastroenterology, 2005; 128:343-50)すなわちF≧2では7.1kPa以上、F4では12.5kPa以上、Ziolらによるカットオフ値(Hepatology 2005; 41:48-54)すなわちF≧2では8.8kPa以上、F4では14.6kPa以上ならびにStebbingらのメタ分析においてCHCのために具体的に計算されたカットオフ値(Journal of Clinical Gastroenterology 2010; 44:214-9)すなわちF≧2では8.5kPa以上、F4では16.2kPa以上を検査した。本発明者らの調査対象母集団における慢性肝疾患には様々な原因があるため、本発明者らは、Friedrich−Rustらのメタ分析において公開されたカットオフ値(Gastroenterology 2008; 134:960-74)すなわちF≧2では7.7kPa以上、F4では13.1kPa以上も検査した。診断のカットオフ値を用いて、LSE中央値を、最も可能性の高いMetavir Fステージに従って、推定されるFFSステージに分類した。この手法により、以下のLSE分類:LSEの結果がF≧2のカットオフ値未満:FFS0/1、F≧2のカットオフ値以上であってF4のカットオフ値未満:FFS2/3、F4のカットオフ値以上:FFS4が得られた。
統計分析
大部分の定量的変数の分布が歪んでいたため、それらを中央値として第1四分位数および第3四分位数をカッコに入れて表した。診断の正確性を主に、AUROC(有意な線維症、深刻な線維症または肝硬変の二項診断)またはLSE分類により正しく分類された患者の割合として表した。対である群はDelongら(Biometrics 1988; 44:837-45)に従って比較し、対でない群はHanleyら(Radiology 1982; 143:29-36)に従って、AUROCを比較した。
LSEの正確性に影響を与えている因子を特定するために、本発明者らは、段階的順方向二項ロジスティック回帰により、以下の診断標的:有意な線維症、深刻な線維症または肝硬変に独立して関連づけられた変数を決定した。実際には、定義上、多変量解析により選択された各変数は、調査される診断標的の独立した予測因子である。言い換えると、LSE中央値により選択した場合、独立した予測因子は、肝硬度の各固定されたレベルに対する結果(診断標的)に影響を与える。従って、多変量解析により、線維症病期分類に関するLSEの正確性に影響を与える予測因子を識別することができた。本調査では、以下の独立変数:年齢、性別、ボディマス指数、慢性肝疾患の原因(CHC対その他の疾患)、10個以上のLSE有効測定値、LSE成功率、IQR/M(ここでは、IQR/Mは、LSEのIQR/LSE中央値の比に対応する)、および推定上の交絡変数としての生検長さを用いて、従属変数(LSE中央値)を検査した。SPSSバージョン18.0ソフトウェア(IBM社、米国ニューヨーク州アーモンク)およびSAS9.1(SAS Institute社、米国ノースカロライナ州ケアリー)を用いて、統計学的分析を行った。
結果
患者
本調査に含まれていた1165人の患者の主要な特性を表7に示す。慢性肝疾患の原因は、CHCが患者の68.5%、B型肝炎単一菌感染が5.7%、アルコールが12.4%、非アルコール性脂肪性肝疾患が3.3%およびその他が10.1%であった。肥満状態(ボディマス指数が25.0kg/m以上)が44.0%の患者に存在した。症例の92.0%において肝生検を信頼性のあるものとみなした。有意な線維症、深刻な線維症および肝硬変の有病率はそれぞれ、63.3%、38.9%および21.0%であった。
Figure 2015522173
CHC:慢性C型肝炎単一菌感染、IQR/M:LSE四分位数間範囲/LSE中央値、CHCと肝疾患の他の原因との間、LSE信頼性の通常の定義に従う(10個以上の有効測定値および60%以上の成功率および0.30以下のIQR/M)
LSEの正確性
有意な線維症、深刻な線維症および肝硬変の診断のためのLSEのAUROC(±標準偏差)はそれぞれ、0.822±0.012、0.872±0.010および0.910±0.011であった(表8)。
Figure 2015522173
CHC:慢性C型肝炎単一菌感染、LSE信頼性のための通常の定義に従う(10個以上の有効測定値および60%以上の成功率および0.30以下のLSE四分位数間範囲/LSE中央値を有するLSE)、信頼性があるLSEと信頼性がないLSEとの間、CHC患者に対してp≦10−3CHC患者に対してp≦0.010、CHC患者に対してp≦0.05
信頼性のない生検におけるLSEのAUROCは、信頼性のない生検とは有意に異なっていなかった(詳細は示さず)。検査した各種診断のカットオフ値に従って正しく分類された患者の割合を表9に示す。
Figure 2015522173
CHC:慢性C型肝炎単一菌感染、CHCとその他との間、その他に対してp<0.05、Ziolに対してp<0.05、ZiolまたはStebbingに対してp≦0.05、Stebbingに対してp≦0.05、fLSE分類は、以下のとおり有意な線維症カットオフ値および肝硬変のカットオフ値に由来している:7.1kPa未満:FFS0/1、7.1kPa以上であって12.5kPa未満:FFS2/3、12.5kPa以上:FFS4、LSE分類:8.8kPa未満:FFS0/1、8.8kPa以上であって14.6kPa未満:FFS2/3、14.6kPa以上:FFS4、LSE分類:8.5kPa未満:FFS0/1、8.5kPa以上であって16.2kPa未満:FFS2/3、16.2kPa以上:FFS4、LSE分類:7.7kPa未満:FFS0/1、7.7kPa以上であって13.1kPa未満:FFS2/3、13.1kPa以上:FFS
Casteraらによって公開されたカットオフ値により、有意な線維症およびLSE分類のために最も高い正確性が得られたため、それをさらなる統計分析に使用した。
LSE信頼性の通常の定義
92.8%のLSEには少なくとも10個の有効な測定値が含まれ、89.8%が60%以上の成功率で達成され、85.5%が0.30以下のIQR/Mを有していた(表7)。これらの条件はいずれもLSEのAUROCにおける有意な増加を引き起こさなかった。
75.7%のLSEがこれらの3つの診断基準を満たしていた。従って、それらを、LSE信頼性の通常の定義に従って、信頼性のあるものとみなした。単一のLSE測定値は、各種条件(プローブ位置または傾斜、呼吸運動など)が原因で、誤っていることがある。従って、LSEの信頼性診断基準は、LSE中央値を「真の」肝硬度とみなす前に必要な条件に対応する。この設定では、肝硬度評価は通常、以下の全ての診断基準:10個以上の有効な測定値、60%以上の成功率および0.30以下のIQR/中央値の比(IQR/M)を満たす場合に、信頼性のあるものとみなす。
有意な線維症、深刻な線維症または肝硬変のAUROCは、信頼性のあるLSEと信頼性のないLSEとの間で有意に異なっていなかった(表8)。Casteraらのカットオフ値(F≧2では7.1kPa以上、F4では12.5kPa以上)を用いて、LSEの正確性は、有意な線維症(それぞれ75.5%対72.1%、p=0.255)または肝硬変(85.8%対81.5%、p=0.082)の診断では、信頼性のあるLSEと信頼性のないLSEとの間で有意に異なっていなかった。同様に、Casteraのカットオフ値に由来するLSE分類(FFS0/1、FFS2/3、FFS4)により正しく分類された患者の割合は、信頼性のあるLSEと信頼性のないLSEとの間で有意に異なっていなかった(それぞれ63.5%対57.2%、p=0.064)。
線維症病期分類の独立した予測因子
有意な線維症、深刻な線維症または肝硬変の独立した予測因子を表10に詳細に示す。
Figure 2015522173
簡単に言うと、LSE中央値に加えて、IQR/Mは、LSEの有効な測定値の数、LSE成功率または肝疾患の原因の有意な影響のない、線維症の3つの診断標的に独立して関連づけられた唯一のLSE特性であった。LSE中央値とIQR/Mとの間に共直線性はなかった(スピアマン相関係数=0.047、p=0.109)。多変量解析において(詳細は示さず)、変数を二分の結果として導入した場合、独立した予測因子は同じであった(IQR/M:0.30以下、LSE成功率:60%以上、「信頼性のある生検」対「信頼性のない生検」)。
LSEの正確性の分類
本発明者らは、正確性の上記独立した予測因子を用いる分類をここで開発する。
IQR/M−LSEの正確性は、IQR/Mが上昇した際に低下し、LSEの3つのサブグループを、IQR/Mが0.10以下(16.6%の患者)、IQR/Mが0.10超であって0.30以下(69.0%)、IQR/Mが0.30超(14.5%)として特定した。IQR/Mが0.10以下のLSEは、IQR/Mが0.10超のLSEよりも有意に高い正確性を有していた(表11)。
Figure 2015522173
有意な線維症(F≧2)の診断のためにLSEカットオフ値として7.1kPa、肝硬変(FM4)の診断のために12.5kPaまたは2種類の上記診断のカットオフ値に由来するLSE分類(FFS0/1、FFS2/3、FFS4)(Casteraら)を用いて正しく分類された患者の割合、IQR/Mの3つのサブグループにまたがる線形トレンドのp
IQR/Mが0.10超であって0.30以下のLSEは、IQR/Mが0.30超のLSEよりも高い正確性を有していたが、その差は統計的有意性に到達していなかった。
LSE中央値−診断のカットオフ値として7.1kPaを用いて(Casteraら、Friedrich−Rustら)、有意な線維症について正しく分類された患者の割合は、LSE中央値が7.1kPa以上の場合は非常に良好であったが、LSE中央値が7.1kPa未満の場合は単に中程度であった(それぞれ81.5%対64.5%、p<10−3)。診断のカットオフ値として12.5kPaを用いることにより(Casteraら、Friedrich−Rustら)、肝硬変について正しく分類された患者の割合は、LSE中央値が12.5kPa未満の場合は優れていたが、LSE中央値が12.5kPa以上の場合は単に中程度であった(それぞれ94.3%対60.4%、p<10−3)。従って、LSEは、肝硬変に対して優れた陰性の予測値と、有意な線維症に対して非常に良好な陽性の予測値とを実証した。一方、LSEは、肝硬変に対する陽性の予測値および有意な線維症に対する陰性の予測値に対しては不十分であった。最終的に、Casteraらのカットオフ値に由来するLSE分類により正しく分類された患者の割合は、その3つのクラスの中で有意に異なっていなかった(FFS0/1:64.5%、FFS2/3:60.4%およびFFS4:60.4%、p=0.379)。
IQR/MおよびLSE中央値−LSE中央値が7.1kPa未満である患者では、Casteraらのカットオフ値に由来するLSE分類の診断の正確性は、3つのIQR/Mサブグループの中で有意に異なっていなかった(p=0.458、図5)。一方、LSE中央値が7.1kPa以上の患者では、LSE分類の診断の正確性は、IQR/Mが0.30以下のLSEと比較してIQR/Mが0.30超のLSEでは有意に低かった(43.8%対64.1%、p<10−3、図5)。IQR/MおよびLSE中央値の関数として、有意な線維症または肝硬変の二項診断に対して正しく分類された患者の割合が図6に詳細に示されている。簡単に言うと、LSE中央値が7.1kPa以上の患者では、IQR/Mが0.30超のLSEは、IQR/Mが0.30以下のLSEよりも有意な線維症の正確性が低かった(67.6%対84.3%、p<10−3)。LSE中央値が12.5kPa以上の患者では、IQR/Mが0.30超のLSEは、IQR/Mが0.30以下のLSEよりも肝硬変の正確性が低かった(45.1%対64.0%、p=0.011)。
LSEにおける新しい信頼性診断基準の提案
上記発見により、本発明者らは、LSEの結果の解釈のために新しい診断基準を開発することができた(表12)。
Figure 2015522173
aCasteraらの診断のカットオフ値すなわち有意な線維症に対して7.1kPa、肝硬変に対して12.5kPa(Casteraら)に従って、LSE中央値を推定されるMetavir Fステージ(FFS)に分類した後のLSE診断、IQR/Mが0.30超であり、かつLSE中央値が7.1未満であるサブグループを含む
IQR/Mが0.10以下のLSEを有するサブグループにおけるLSEの正確性は、集団全体における正確性よりも高かった(表13)。
Figure 2015522173
有意な線維症(F≧2)の診断のためにLSEカットオフ値として7.1kPa、肝硬変(F4)の診断のために12.5kPaまたは2種類の上記診断のカットオフ値(Casteraら)に由来するLSE分類(FFS0/1、FFS2/3、FFS4)を用いて正しく分類された患者の割合、既に表2に示されているこの結果をサブグループとの比較のためにここに示す、LSEの3つのサブグループにまたがる線形トレンドのp
従って、このサブグループ内のLSEを「非常に信頼性がある」ものとみなした。IQR/Mが0.10超であって0.30以下またはIQR/Mが0.30超であり、かつLSE中央値が7.1kPa未満のLSEにより、集団全体の正確性と同様の正確性が得られたため、これを「信頼性がある」ものとみなした。最終的に、IQR/Mが0.30超であり、かつLSE中央値が7.1kPa以上のLSEにより、集団全体の正確性よりも低い正確性が得られたため、これを「信頼性が乏しい」ものとみなした。文献データおよび/またはカットオフ値の決定のための古典的な統計学的技術の関数として閾値を決定した。IQR/Mが0.10以下のLSEを有するサブグループにおけるLSEの正確性は、集団全体における正確性よりも高かった。従って、このサブグループにおけるLSEを「非常に信頼性がある」ものとみなした。IQR/Mが0.10超であって0.30以下またはIQR/Mが0.30超であり、かつLSE中央値が7.1kPa未満のLSEにより、集団全体の正確性と同様の正確性が得られたため、これを「信頼性がある」ものとみなした。最終的に、IQR/Mが0.30超であり、かつLSE中央値が7.1kPa以上のLSEにより、集団全体の正確性よりも低い正確性が得られたため、これを「信頼性が乏しい」ものとみなした。
これらの新しい診断基準に従って、LSEの16.6%を「非常に信頼性がある」、74.3%を「信頼性がある」、9.1%を「信頼性が乏しい」ものとみなした。重要なことに、LSEのAUROCおよび診断の正確性はこれらの3つのサブグループの中で有意に異なった(表13)。最終的に、新しい診断基準による信頼性が乏しいLSEの割合は、通常の定義による信頼性のないLSEの割合よりも有意に低かった(9.1%対24.3%、p<10−3)。
感度分析
本発明者らは、本発明者らの新しい診断基準を、いくつかの潜在的に影響を与える特性:肝疾患の原因(CHC対その他)、診断指標(AUROC、有意な線維症または肝硬変の二項診断、LSE分類)ならびにZiolら、StebbingらおよびFriedrich−Rustらによって公開されている診断のカットオフ値の関数として、LSEの信頼性について評価した。簡単に言うと、潜在的に影響を与える因子が何であっても、本発明者らの新しい診断基準によるLSEの信頼性の低下は、LSEの正確性の低下と関連していた。BMI(「25kg/m未満」対「25kg/m以上」)はLSEの信頼性の3つの新しい分類のいずれにおいても、LSEの正確性に影響を与えなかった。B型肝炎、アルコール中毒またはNAFLDを有する患者の数が少なかったため、慢性肝疾患のこれらの原因について感度分析を行うことはできなかった。

Claims (12)

  1. 疾患の存在および/または重症度に関する信頼性のある非侵襲的診断検査を提供するための方法であって、
    a.初期指標と呼ばれる診断指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)を含む血液検査から選択されるスコアまたはFibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がそのマーカーから削除されている)あるいは別の診断検査から得られたスコアを収集する工程であって、前記指標は、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含み、前記指標を初期指標と呼ぶ工程、
    b.以下の行為:
    i.各データをその基準集団における期待データと比較すること、
    ii.内部または外部の信頼性予測因子を考慮して、工程a)の前記指標を予測すること、
    iii.工程a)で収集した前記初期指標の分散指標(高い分散指標は前記初期指標の均質なデータを意味する)を計算し、かつ前記初期指標の1〜(n−2)個のデータが削除されているn個のデータを含む前記初期指標の分散指標の一連の計算を行い、それにより、前記分散指標を最も低下させているデータをランクづけすること、あるいは
    iv.基準集団において得られたデータに基づいて、前記指標をその信頼性分類の信頼性クラスに位置づけること
    により、工程a)で収集した指標の少なくとも1つのデータが異常データ、不整合データおよび/または不均質データであるか否か、あるいは、その他のデータで観察される低下よりも大きな前記分散指標の低下に寄与しているか否かを特定することにより、各データの信頼性を分析する工程、
    c.データが異常データ、不整合データおよび/または不均質データである場合に、イベント警告を生成する工程、
    d.イベント警告を生成した場合は、新しい指標、好ましくは新しいスコアを計算する工程であって、前記新しい指標は、前記初期指標と同じ指標であるが、前記異常データ、不整合データおよび/または不均質データが抑制されている(代替指標)か、その代表値、好ましくはその平均値で置換されている(推定指標)か、少なくとも2種のデータが異常、不整合または不均質である場合は、最も不調和なものが抑制され、かつそれ以外のデータは、その/それらの代表値、好ましくはその/それらの平均値で置換されている(混合指標)工程、または
    e.異常データ、不整合データおよび/または不均質データを含む前記初期指標または前記分散指標に影響を与えているデータを、代替指標、推定指標または混合指標で置換する工程
    を含む方法。
  2. − FibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標))またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がそのマーカーから削除されている)から得られる初期指標と呼ばれる指標を収集する工程と、
    − 工程a)で収集した前記初期指標の分散指標を計算し、前記初期指標の1〜(n−2)個のデータが削除されているn個のデータを含む前記初期指標の分散指標の一連の計算を行うことにより、前記データのどのデータが前記分散指標を最も低下させているかを特定する工程と、
    − 前記分散指標を最も低下させているデータを含む前記初期指標を、前記分散指標を低下させている前記データが削除されている代替指標で置換する工程と、
    を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記初期指標の前記分散指標が、その基準集団のその中間十分位数の指標、好ましくは第2〜9十分位数に対応しているか否かを計算した後に、工程c)を行う、請求項1または請求項2に記載の方法。
  4. a.初期指標と呼ばれる診断指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)を含む血液検査から選択されるスコアまたはFibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がそのマーカーから削除されている)あるいは別の診断検査から得られたスコアを収集する工程であって、前記指標は、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含み、前記指標を初期指標と呼ぶ工程と、
    b.基準集団において得られたデータに基づいて前記指標をその信頼性分類の信頼性クラスに位置づけることにより、各データの信頼性を分析する工程と、
    c.異常データ、不整合データおよび/または不均質データを含む前記初期指標を、代替指標、推定指標または混合指標で置換する工程と、
    を含む、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
  5. データが異常データである場合、前記イベント警告は異常データ警告であり、データが不整合データである場合、前記イベント警告は不整合データ警告であり、データが不均質データである場合、前記イベント警告は不均質データ警告である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
  6. 工程c)で発行されたイベント警告を工程d)の前に予備分析し、かつ前記処理は、
    − 前記イベント警告を誘発したデータが信頼性のあるものであると分かった場合に1つ以上のイベント警告を抑制すること、および/または
    − いくつかのイベント警告が発行された場合に、前記イベント警告の優先順位づけを行って、初期指標に対するその影響に従って主要イベント警告を特定すること、
    を含む、請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
  7. 信頼性予測因子を、FibroMeter、InflaMeterおよびFibroscan、より好ましくは、尿素、ALT、AST、CirrhoMeter2Gスコア、FibroMeter2Gスコア、Fibroscan(商標)クラス(線維症病期分類による)、FibroMeter(商標)クラス、CirrhoMeter(商標)クラス、Fibroscan(商標)中央値、IQR、IQR/M、血小板、A2M、尿素/Fibroscanの比および前記初期指標の分散指標を含む群から選択する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
  8. a.初期指標と呼ばれる診断指標、好ましくはスコア、より好ましくは、ELF、FibroSpect(商標)、APRI、FIB−4、Hepascore、Fibrotest(商標)を含む血液検査から選択されるスコアまたはFibroMeterファミリー(例えば、FibroMeter(商標)+CirrhoMeter(商標)など)またはCombiMeter(商標)またはFibroMeterファミリー由来の検査(ここでは、尿素がそのマーカーから削除されている)あるいは別の診断検査から得られたスコアを収集する工程であって、前記指標は、少なくとも2種のデータ、好ましくは少なくとも2種のバイオマーカー、臨床マーカーおよび/または物理的方法から得られたデータの数学的組み合わせを含み、前記指標を初期指標と呼ぶ工程と、
    b.以下の行為:
    i.各データをその基準集団における期待データと比較すること、あるいは
    ii.内部または外部の信頼性予測因子を考慮して、工程a)の前記指標を予測すること
    により、工程a)で収集した指標の少なくとも1つのデータが異常データ、不整合データおよび/または不均質データであるか否か、あるいは、その他のデータで観察される低下よりも大きな前記分散指標の低下に寄与しているか否かを特定することにより、各データの信頼性を分析する工程、
    c.データが異常データ、不整合データおよび/または不均質データである場合、イベント警告を生成する工程、
    d.イベント警告を生成した場合は、新しい指標、好ましくは新しいスコアを計算する工程であって、前記新しい指標は、
    i.前記初期指標と同じ指標であるが、前記異常データ、不整合データおよび/または不均質データが抑制されている(代替指標)か、その代表値、好ましくはその平均値で置換されている(推定指標)か、少なくとも2種のデータが異常、不整合または不均質である場合、最も不調和なものが抑制され、かつそれ以外のデータは、その/それらの代表値、好ましくはその/それらの平均値で置換されている(混合指標)工程、または
    e.異常データ、不整合データおよび/または不均質データを含む前記初期指標を、代替指標、推定指標または混合指標で置換する工程と、
    を含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。
  9. 前記指標を、基準集団に基づいて確立された被説明データおよび説明データ(予測因子)の二項目表を含む信頼性分類の信頼性クラスに位置づけることにより、初期指標の信頼性を決定し、前記表内の前記指標の位置を読み取ることにより、前記説明データを考慮した前記指標の信頼性が得られる、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
  10. 工程f)で、前記初期指標を、代替指標、推定指標または混合指標からなる群から選択される最も信頼性のある指標で置換する工程を含む、請求項1〜9のいずれか1項に記載の方法。
  11. 請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法を実行するエキスパートシステム。
  12. 請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法を実行するソフトウェア。
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