JP2014521081A - ピレン系糖複合体を含む非共有結合性分子構造体、それを含む装置、及びレクチンを検出するためのその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
前記糖複合体(I)が式:
−(CH2)n−CO−NH−A
{式中、nは1〜9の整数であり、
Aは式:
U’及びUは存在せず、又はCH2であるが、但しm=0である場合、U’又はUの一方が存在しないならば他方はCH2であり、
X=CH2、O、CO(カルボニル)であり、
W=CH2、NHであり、
V=CH2、C6H4(フェニル「Ph」)である)の基であり、
前記装置が、
「ソース」(S)及び「ドレイン」(D)とそれぞれ称される2つの金属電極を架橋する炭素ナノ構造体、
基板層に、又は前記装置を覆う溶液に浸漬された電極に接続される、「ゲート」(G)と称される第3の電極(「液体ゲート」)を含む。
分析するレクチンを前記非共有結合性分子構造体と接触させる工程と、
レクチンと前記非共有結合性分子構造体のピレン系糖複合体(I)の糖との間の分子間相互作用を検出する工程であって、前記分子間相互作用を、前記装置の電気信号の変化をもたらす炭素ナノ構造体の導電性の変化によって検出する工程とを含むことを特徴とする、分析する試料中におけるレクチンの存在の検出方法である。
(G)に接続された基板層上に2つの金属電極(S)及び(D)を形成する工程と、
2つの電極(S)及び(D)の間に炭素ナノ構造体を加え、次いでピレン系糖複合体(I)を加えて前記非共有結合性分子構造体を形成する工程とを含む。
(G)に接続された基板層上に2つの金属電極(S)及び(D)を形成する工程と、
2つの電極(S)及び(D)の間に前記非共有結合性分子構造体を加える工程とを含む。
(化学蒸着(CVD)プロセスによって)(G)に接続された基板層上に炭素ナノ構造体を作成する工程と、
炭素ナノ構造体の周囲に2つの金属電極(S)及び(D)を形成する工程と、
ピレン系糖複合体(I)を加えて前記非共有結合性分子構造体を形成する工程とを含む。
合物5b参照)又はα−L−フコシル(化合物5c参照)、「Ac」(化合物4aから4c中で規定されている)は「アセチル」基(CO―CH3)である。
全ての測定は、PBS(pH7)、Ag/AgCl基準電極、ドレイン発信源電圧50mVにて電解質ゲートFET構造で行った。レクチンの結合の実験は5μM Ca2+の存在下で行った。
3つのピレン糖複合体(I)の製造
一般式(I)で表されるピレン糖複合体(I)を製造するために、この実施例で使用された一般的合成スキームを図1に示している。そこでは、一般式(IV)のアルキニルアミンは、一般式(V)のピレン系カルボン酸と縮合して一般式(III)のアルキニルアミドとなり、次いで、これは式(II)の炭水化物アジド誘導体と結合して一般式(I)のピレン系糖複合体(I)が得られる。
以下の3つのピレン系糖複合体(I)を製造するための一般的な実験方法を述べる。
・N−[1−(2−{2−[2−(β−D−ガラクトピラノシルオキシエトキシ)エトキシ]エチル}−1H−1,2,3−トリアゾールー4−イル)メチル]−4−(ピレンー1−イル)ブタンアミド(図2中、5aと表示)、
・N−[1−(2−{2−[2−(β−D−マンノピラノシルオキシエトキシ)エトキシ]エチル}−1H−1,2,3−トリアゾールー4−イル)メチル]−4−(ピレンー1−イル)ブタンアミド(図2中、5bと表示)、及び
・N−[1−(2−{2−[2−(α−L−フコピラノシルオキシエトキシ)エトキシ]エチル}−1H−1,2,3−トリアゾールー4−イル)メチル]−4−(ピレンー1−イル)ブタンアミド(図2中、5cと表示)。
NMRスペクトルを293Kにて記録した。他に断りのない限り、300MHz又は400MHzのBrukerスペクトロメータを使用した。化学シフトは重溶媒の残余ピークに対して参照される。以下の略号は観察されたマルチプリシティを説明するために使用される。
S、シングレット;d、ダブレット;t、トリプレット;q、カルテット;m、マルチプレット、及びbs、ブロードシングレット。
147.8ppmにおける残余ピークは機械によるものであり、通常、75MHz 13Cスペクトルで観察される。この残余ピークはサンプル分析とは独立してチェックを行った。完全なシグナル帰属は1D及び2D NMR実験に基づいた(COSY、HSQC及びHMBC)。高解像度(HR―ESI―QTOF)マススペクトルはBruker MicroOTOF-Q II XL spectrometerを用いて記録した。炭水化物アジド誘導体3a、13b、2及び3c3は後述する技術文献に記載されており、それに従って作製される。
1)1,3−双極子付加環化反応の一般的手順(方法A)
脱気したDMF中、アルキン官能化ピレン誘導体2(一般式(III))、ヨウ化銅、N,N―ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)及びアジド誘導体3aから3c(一般式(II))をBiotage Initiator2〜5mlのバイアルに導入した。該バイアルをアルゴンでフラッシュし、光から保護し(アルミニウムシート)、その溶液に対し30秒間超音波処理を行った。
該バイアルをセプタムキャップ(septum cap)で閉じ、110℃で10分間、マイクロ波を照射して加熱した(溶媒吸収レベル:High)。該バイアルを開封した後、生成物を蒸発させ、次いで、フラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製し、所望するアセチル化ピレン糖複合体4aから4cを得た。
前記アセチル化ピレン糖複合体4aから4cを蒸留MeOH、超純水及び超純トリエチルアミン(10:1:1、v/v/v)に懸濁した。該混合物をアルゴン下、室温下で1〜3日間撹拌した。溶媒を蒸発させ、トルエンと同時蒸発させた。該残留物を超純水(5mL)に溶解し、凍結乾燥させて、純正なピレン糖複合体5aから5cを得た(一般式(I))。
3つのピレン糖複合体5aから5cの合成スキームを図2に示した。図2に記載したステップで用いた試薬と条件は以下のとおりである。
ステップa:N−ヒドロキシーベンゾトリアゾール(HOBt)/O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N’,N’―テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TBTU)、N−メチルモルフォリン、N,N−ジメチルホルムアミド(DMF)/20h/r.t.;
ステップb:ヨウ化銅(CuI)、N,N−ジイソプロピルエチルアミン、DMF、110℃、マイクロ波、15分;
ステップc(脱アセチル化):MeOH、トリエチルアミン(Et3N)、H2O。
N−メチルモルホリン(3.8mL、34.7mmol)を、DMF(80mL)に1―ピレンブチル酸1(2g、6.9mmol)、TBTU(8.9g、27.7mmol)及びHOBt(3.75g、27.7mmol)を溶解した溶液に添加した。該溶液を室温で15分撹拌し、次いで、プロパルギルアミン(2.22mL、34.7mmol)を添加し、さらに16時間室温で撹拌した。該溶液をEtOAc(700ml)に加え、次いで、飽和NaHCO3水溶液(2×200mL)、水(200mL)で洗浄した。該有機層を乾燥し(MgSO4)、ろ過、蒸発させた。粗混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CH2Cl2/EtOAc 2/1)で精製した。CH2Cl2/石油エーテルから沈降させた後、純粋な生成物2(1.52g、67%)を得た。
Rf=0.71(CH2Cl2/EtOAc 2/1)
M.p.=147−149℃
1H NMRと13C NMRのデータを以下に示す。
1 H NMR(400MHz、DMSO―d 6 ):
δ8.37(d、J=9.3Hz、1H、H−ar)、8.33(t、J=5.3Hz、1H、NH)、8.29−8.17(m、4H、H−ar)、8.11(d、J=1.8Hz、1H、H−ar)、8.04(t、J=7.7Hz、1H、H−ar)、7.92(d、J=7.7Hz、1H、H−ar)、3.90(dd、2H、J=2.4Hz、J=5.4Hz、NCH2)、3.31(t、2H、J=7.4Hz、PyrCH2CH2CH2C(O))、3.12(t、1H、J=2.4Hz、C≡CH)、2.27(t、2H、J=7.4Hz、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.05−1.98(m、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))
13 C NMR(100MHz、DMSO―d 6 ):
δ171.7(C=O)、136.5、130.9、130.4、129.3、128.1(CIV−ar)、127.5、127.4、127.2、126.5、126.1、124.9、124.8(CH−ar)、124.2、124.1
(CIV−ar)、123.5(CH−ar)、81.4(C≡CH)、72.8(C≡CH)、34.7(PyrCH2CH2CH2C(O))、32.2(PyrCH2CH2CH2C(O))、27.8(NCH2)、27.4(PyrCH2CH2CH2C(O))。
この化合物は47%の収率で方法Aにより作製している。
Rf=0.25(EtOAc/MeOH 95/5)
1H NMRと13C NMRのデータを以下に示す。
1 H NMR(400MHz、CDCl 3 ):
δ8.25(d、1H、J=8.8Hz、H−ar)、8.16−8.12(m、2H、H−ar)、8.07(d、2H、J=7.6Hz、H−ar)、8.00(s、1H、H−triaz)、7.97(t、3H、J=7.6Hz、H−ar)、7.82(d、1H、J=7.6Hz、H−ar)、6.60−6.40(bs、1H、NH)、5.36(d、1H、J=3.6Hz、H−4)、5.16(dd、1H、J=7.8Hz、J=10.4Hz、H−2)、5.00(dd、1H、J=3.6Hz、J=10.4Hz、H−3)、4.60−4.48(m、4H、OCH2CH2N―triaz、CCH2NH)、4.47(d、1H、J=7.8Hz、H−1)、4.16−4.04(m、2H、H−6)、3.91−3.76(m、4H、H−5、1/2GalOCH2CH2O、OCH2CH2N−triaz)、3.64−3.60(m、1H、1/2GalOCH2CH2O)、3.53−3.42(m、6H、GalOCH2CH2OCH2CH2O)、3.35、2.36、2.20(3bs、6H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.11、2.00、1.99、1.96(4s、4×3H、CH3CO)。
13 C NMR(100MHz、CDCl 3 ):
δ170.5、170.3、170.2、169.6(4s、4C、C=O)、135.9、131.5、131.0、130.0、128.8(CIV−ar)、127.6(CH−ar)、127.47(s、2C、CH−ar、CH−triaz)、127.46(CH−ar)、126.0、125.9(CH−ar)、125.1、125.03(CIV−ar)、124.99、124.89、124.86、123.5(CH−ar)、101.4(C−1)、70.9(C−3)、70.7(C−5)、70.62、70.58、70.2(3s、3C、GalOCH2CH2OCH2CH2O)、69.3(OCH2CH2N−triaz)、69.2(GalOCH2CH2O)、68.9(C−2)、67.3(C−4)、61.3(C−6)、50.9(OCH2CH2N−triaz)、32.9、27.5(PyrCH2CH2CH2C(O))、20.9、20.8、20.7(3s、4C、CH3CO)。
この化合物は99%の収率で方法Aにより作製している。
Rf=0.23(EtOAc/MeOH 95/5)
1H NMRと13C NMRのデータを以下に示す。
1 H NMR(400MHz、CDCl 3 ):
δ8.23(d、J=9.2Hz、1H、H−ar)、8.13(d、J=1.6Hz、1H、H−ar)、8.11(d、J=1.6Hz、1H、H−ar)、8.05(d、J=8.2Hz、2H、H−ar)、7.98(s、1H、H−triaz)、7.95(t、J=7.7Hz、3H、H−ar)、7.79(d、J=7.7Hz、1H、H−ar)、6.66(bs、1H、NH)、5.33−5.25(m、2H、H―3、H―4)、5.24−5.21(m、1H、H―2)、4.82(d、J=1.3Hz、1H、H−1)、4.52(bs、2H、CCH2NH)、4.45(bs、2H、OCH2CH2N−triaz)、4.25(dd、J=12.3Hz、J=5.0Hz、1H、H−6b)、4.14−4.05(m、1H、H−6a)、4.04−3.97(m、1H、H−5)、3.78(bs、2H、OCH2CH2N−triaz)、3.74−3.66(m、1H、1/2ManOCH2CH2O)、3.60−3.52(m、1H、1/2ManOCH2CH2O)、3.52−3.44(m、6H、ManOCH2CH2OCH2CH2O)、3.32(t、J=7.0Hz、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.32、2.17(2bs、4H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.12、2.07、2.01、1.96(4s、4×3H、CH3CO)。
13 C NMR(100MHz、CDCl 3 ):
δ170.7、170.14、170.07、169.8(4s、4C、CH3CO)、135.9(CIV−ar)、131.4(CIV−ar)、130.9(CIV−ar)、129.9(CIV−ar)、128.8(CIV−ar)、127.5(CH−ar)、127.40(s、2C、CH−triaz、CH−ar)、127.41(CH−ar)、126.7(CH−ar)、125.9(CH−ar)、125.1(CIV−ar)、125.0(CIV−ar)、124.9(CH−ar)、124.85(CH−ar)、124.81(CH−ar)、123.4(CH−ar)、97.7(C−1)、70.6、70.5、69.9(3s、3C、ManOCH2CH2OCH2CH2O)、69.6(C−2)、69.4(OCH2CH2N−triaz)、69.1(C−3)、68.5(C−5)、67.3(ManOCH2CH2O)、66.1(C−4)、62.5(C−6)、50.5(OCH2CH2N−triaz)、36.1(PyrCH2CH2CH2C(O))、34.9(CCH2NH)、32.8(PyrCH2CH2CH2C(O))、27.5(PyrCH2CH2CH2C(O))、21.0、20.82、20.77(3s、4C、CH3CO)。
この化合物は75%の収率で方法Aにより作製している。
Rf=0.20(EtOAc/MeOH 95/5)
1 H NMR(400MHz、CDCl 3 ):
δ8.22(d、J=9.2Hz、1H、H−ar)、8.15−8.08(m、2H、H−ar)、8.04(d、J=8.1Hz、2H、H−ar)、7.97(s、1H、H−triaz)、7.97−7.92(m、3H、H−ar)、7.79(d、J=7.7Hz、1H、H−ar)、6.73(bs、1H、NH)、5.33(dd、J=9.8Hz、J=3.0Hz、1H、H−3)、5.26(d、J=3.0Hz、1H、H−4)、5.12−5.04(m、2H、H−1、H−2)、4.51(bs、2H、OCH2NH)、4.43(bs、2H、OCH2CH2N−triaz)、4.16(q、J=6.4Hz、1H、H−5)、3.76(bs、2H、OCH2CH2N−triaz)、3.73−3.64(m、1H、1/2FucOCH2CH2O)、3.61―3.52(m、1H、1/2FucOCH2CH2O)、3.52―3.44(m、6H、FucOCH2CH2OCH2CH2O)、3.31(t、J=6.6Hz、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.32、2.17(2bs、4H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.13、2.00、1.96(3s、3×3H、CH3CO)、1.08(d、J=6.4Hz、3H、CH3)。
13 C NMR(100MHz、CDCl 3 ):
δ170.7、170.5、170.2(3s、3C、CH3CO)、135.9(CIV−ar)、131.4(CIV−ar)、130.9(CIV−ar)、129.9(CIV−ar)、128.7(CIV−ar)、127.5(CH−ar)、127.40(s、2C、CH−ar、CH−triaz)、127.38(CH−ar)、126.7(CH−ar)、125.9(CH−ar)、125.1(CIV−ar)、125.0(CIV−ar)、124.9(CH−ar)、124.83(CH−ar)、124.79(CH−ar)、123.4(CH−ar)、96.2(C−1)、71.2(C−4)、70.55、70.53、70.2(3s、3C、FucOCH2CH2OCH2CH2O)、69.3(OCH2CH2N−triaz)、68.2(C−2)、68.0(C−3)、67.3(FucOCH2CH2O)、64.4(C−5)、50.5(OCH2CH2N−triaz)、36.1(PyrCH2CH2CH2C(O))、35.1(CCH2NH)、32.8(PyrCH2CH2CH2C(O))、27.5(PyrCH2CH2CH2C(O))、20.9、20.8、20.7(3s、3C、CH3CO)、15.9(CH3)。
この化合物は70%の収率で方法Bにより作製している。
1 H NMR(400MHz、MeOD):
δ8.23(d、J=9.3Hz、1H、H−ar)、8.13(d、J=3.0Hz、1H、H−ar)、8.11(d、J=3.0Hz、1H、H−ar)、8.08−8.02(m、2H、H−ar)、7.97(s、1H、H−triaz)、7.94(t、J=7.7Hz、3H、H−ar)、7.89(bs、1H、NH)、7.81(d、J=7.7Hz、1H、H−ar)、4.49−4.44(m、4H、OCH2CH2N−triaz、CCH2NH)、4.16(d、J=7.5Hz、1H、H−1)、3.87−3.80(m、2H、H−4、1/2GalOCH2CH2O)、3.78−3.69(m、4H、H−6、OCH2CH2N−triaz)、3.56−3.48(m、2H、H−2、1/2GalOCH2CH2O)、3.48−3.41(m、2H、H−3、H−5)、3.40−3.34(m、6H、GalOCH2CH2OCH2CH2O)、3.31−3.27(m、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.38(t、J=7.3Hz、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.19−2.06(m、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))。
13 C NMR(100MHz、MeOD):
δ175.7(C(O)NH)、137.3(CIV−ar)、132.7(CIV−ar)、132.2(CIV−ar)、131.2(CIV−ar)、129.8(CIV−ar)、128.51(CH−ar)、128.48(CH−ar)、128.4(CH−ar)、127.6(CH−ar)、127.0(CH−ar)、126.1(CIV−ar)、126.0(CIV−ar)、125.9(s、2C、
CH−ar)、125.8(CH−ar)、124.4(CH−ar)、105.0(C−1)、76.6(C−5)、74.8(C−3)、72.4(C−2)、71.21、71.17、71.1(3s、3C、GalOCH2CH2OCH2CH2O)、70.24(C−4)、70.21(OCH2CH2N−triaz)、
69.5(GalOCH2CH2O)、62.5(C−6)、51.3(OCH2CH2N−triaz)、36.6(PyrCH2CH2CH2C(O))、35.6(CCH2NH)、33.7(PyrCH2CH2CH2C(O))、29.0(PyrCH2CH2CH2C(O))。
この化合物は99%の収率で方法Bにより作製している。
1 H NMR(400MHz、DMSO―d 6 +εD 2 O):
δ8.35(d、J=9.3Hz、1H、H−ar)、8.26(dd、J=7.0Hz、J=5.5Hz、2H、H−ar)、8.20(dd、J=8.5Hz、J=5.4Hz、2H、H−ar)、8.12(d、J=2.0Hz、2H、H−ar)、8.05(t、J=7.6Hz、1H、H−ar)、7.92(d、J=7.8Hz、1H、H−ar)、7.87(s、1H、H−triaz)、4.60(d、J=1.3Hz、1H、H−1)、4.46(t、J=5.2Hz、2H、OCH2CH2N−triaz)、4.31(s、2H、CCH2NH)、3.75(t、J=5.2Hz、2H、OCH2CH2N−triaz)、3.66−3.26(m、16H、H−2、H−3、H−4、H−5、H−6、ManOCH2CH2OCH2CH2O、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.28(t、J=7.3Hz、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.06−1.95(m、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))。
13 C NMR(100MHz、DMSO―d 6 +εD 2 O):
δ172.3(C(O)NH)、136.7(CIV−ar)、131.1(CIV−ar)、130.6(CIV−ar)、129.5(CIV−ar)、128.3(CIV−ar)、127.8(CH−ar)、127.7(CH−ar)、127.4(CH−ar)、126.7(CH−ar)、126.4(CH−ar)、125.2(2C、CH−ar)、125.0(CH−ar)、124.4(CIV−ar)、124.3(CIV−ar)、123.7(CH−ar)、123.3(CH−triaz)、100.1(C−1)、74.0、70.9、70.3(C−5、C−2、C−3)、69.8、69.7、69.6(ManOCH2CH2OCH2CH2O)、69.0(OCH2CH2N−triaz)、67.0(C−4)、65.8(GalOCH2CH2O)、61.3(C−6)、49.5(OCH2CH2N−triaz)、35.1(PyrCH2CH2CH2C(O))、34.2(CCH2NH)、32.4(PyrCH2CH2CH2C(O))、27.8(PyrCH2CH2CH2C(O))。
この化合物は99%の収率で方法Bにより作製している。
1 H NMR(400MHz、DMSO―d 6 +εD 2 O):
δ8.35(d、J=9.3Hz、1H、H−ar)、8.30−8.24(m、2H、H−ar)、8.22(d、J=4.2Hz、1H、H−ar)、8.20(d、J=5.8Hz、1H、H−ar)、8.12(d、J=2.0Hz、2H、H−ar)、8.05(t、J=7.8Hz、1H、H−ar)、7.93(d、J=7.8Hz、1H、H−ar)、7.88(s、1H、H−triaz)、4.59(d、J=2.7Hz、1H、H−1)、4.46(t、J=5.2Hz、2H、OCH2CH2N−triaz)、4.32(s、2H、CCH2NH)、3.76(t、J=5.2Hz、3H、OCH2CH2N−triaz、H−5)、3.59−3.37(m、14H、H−2、H−3、H−4、H−6、ManOCH2CH2OCH2CH2O)、3.33−3.26(m、2H、
PyrCH2CH2CH2C(O))、2.28(t、J=7.3Hz、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、2.06−1.96(m、2H、PyrCH2CH2CH2C(O))、1.03(d、J=6.5Hz、3H、CH3)。
13 C NMR(100MHz、DMSO―d 6 +εD 2 O):
δ172.1(C(O)NH)、136.7(CIV−ar)、131.0(CIV−−ar)、130.6(CIV−ar)、129.4(CIV−ar)、128.3(CIV−ar)、127.7(CH−ar)、127.6(CH−ar)、127.4(CH−ar)、126.7(CH−ar)、126.3(CH−ar)、125.1(2C、CH−ar)、124.9(CH−ar)、124.4(CIV−ar)、124.3(CIV−ar)、123.7(CH−ar)、123.3(CH−triaz)、99.4(C−1)、71.6(C−4)、69.8、69.6(2s、3C、FucOCH2CH2OCH2CH2O)、69.58(C−2又はC−3)、68.9(OCH2CH2N−triaz)、68.0(C−2又はC−3)、66.7(GalOCH2CH2O)、66.0(C−5)、49.5(OCH2CH2N−triaz)、35.0(PyrCH2CH2CH2C(O))、34.2(CCH2NH)、32.4(PyrCH2CH2CH2C(O))、27.7(PyrCH2CH2CH2C(O))、16.6(CH3)。
電子ナノ検出装置の製造及びレクチン検出のためのその使用
1)「SWNT−FET」、「CCG−FET」とそれぞれ名付けた電子ナノ検出装置の製造
使用した炭素ナノ構造体は、それぞれカーボンナノチューブ(より詳しくは、単一壁カーボンナノチューブ(SWNT))及びグラフェンである。
単一壁カーボンナノチューブ(SWNT)はCarbon Solutions Inc.が製造し、後述するように、電界効果トランジスタ(FET)装置(FETs)における伝導チャネルとして使用した。化学的に変換されたグラフェン(CCG)としても下記文献において知られている、化学的に還元された酸化グラフェンは、後記の文献4−6で以前に述べられた方法で作製した。
簡潔に述べると、プレ酸化工程処理を行ったグラファイト薄片(Sigma-Aldrich)をmodified Hummers法を用いて酸化グラファイトを合成した。超音波処理を30分間行い、次いで、3400回転/分(r.p.m)で遠心分離を30分間行い、剥離しない酸化グラファイト(GO)を除去することにより、酸化グラファイト(〜0.125%)を剥離させて、酸化グラフェンを形成した。酸化グラフェンは、その後、公知手順に従い4,6、ヒドラジン水和物(Sigma-Aldrich)を用いてRGOに還元した。こうして得られた化学的に変換されたグラフェン(CCG)は次いでFETsにおける伝導チャネルとして使用した。
電極間の間隔が10μmである金属櫛歯装置(Au/Ti、100nm/30nm)を、従来のフォトリソグラフィー(図3(c)及び3(d))により、Si/SiO2基板にパターン化した。次いで、4つの等しい装置を含む各チップ(2mm×2mm)を40ピンのセラミックデュアルインラインパッケージ(CERDIP)にセットし、Auワイヤを用いてワイヤボンディングした。次いで、内部のキャビティーをエポキシ樹脂で封止してパッケージから装置を分離した。
SWNTを交流の誘電泳動(DEP)法により、N,N―ジメチルホルムアミド(DMF)の懸濁液より各櫛歯微小電極パターン上に堆積させた(図3(b))(Agilent 33250A 80MHz Function/Arbitrary Waveform Generator, 交流周波数(10MHz), バイアス電圧 (8Vpp), バイアス期間 (60s))7。
CCG装置は、異なるパラメータ(交流周波数(300kHz), バイアス電圧 (10.00Vpp), バイアス期間 (120s))8を用いて、同じDEP技術(図3(b))により作製した。
選択的にレクチンを検出するため、得られた上記のSWNT−FET装置又はCCG−FET装置を、実施例1で作製した3つのピレン系糖複合体(I)(5aから5c)でそれぞれ非共有結合性官能化を行った。
ぞれβ−D−ガラクトシル(糖複合体5aに対し)、α―D−マンノシル(5bに対し)、及びα−L−フコシル(5cに対し)である。
3つの異なる糖、すなわち、β−D−ガラクトース、α―D−マンノース、及びα−L−フコースのそれぞれと3つの以下のレクチン:PA−IL、ConA及びPA−IILとの間の相互作用を、上記非共有結合性官能化SWNT−FET装置又はCCG−FET装置を用いてここに検討した(図3(a))。
PA−ILは、β−D−ガラクトースに特異的な、緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)から単離した細菌レクチンであり、組み換え大腸菌(Escherichia coli)に発現する。
PA−IILは、α−L−フコースに特異的な、緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)から単離した細菌レクチンであり、組み換え大腸菌(Escherichia coli)に発現する。
これらのレクチンPA−IL、PA−IILは、以前に報告された手順9に従って作製した。
ConA(25kDa)は、α―D−マンノースに特異的な、タチナタマメ(Canavalia ensiformis)由来の植物レクチンであり、市販のものが利用できる。Sigma社から購入し、さらに精製することなく使用した。
各ピレン系糖複合体(I)(5aから5c)によるSWNT−FET装置又はCCG−FET装置の表面官能化は、20μMの該ピレン糖複合体溶液(純水)中でチップを2時間インキュベートし、その後、再蒸留水で3回リンスすることにより行った。トランスファ特性をテストした後、PBSと5μMのCaCl2で調製した異なる濃度のレクチン溶液中で、該チップを40分間インキュベートし、その後、PBS溶液で3回洗浄した。各糖複合体官能化装置に対し、非特異的レクチンを最初にテストし、その後、洗浄作業、特異的レクチンの測定を行った。再び、上記構成にて最終的なトランスファ特性をテストした。
イメージングに関する検討:走査型電子顕微鏡観察(SEM)をPhillips XL30 FEG(加速電圧10keV)を用いて行った(図3(d))。
原子間力顕微鏡(AFM)画像(図5、7)を、タッピングモードにて、走査型プローブ顕微鏡(Veeco Nanoscope II)を用いて得た。ポリーL−リシン処理したマイカ基板の新しい劈開シート上に裸のSWNT又はCGSをスピンコーティングすることによりサンプルを作製した。裸のSWNT又はCGSの画像を周囲に45分間乾燥した後撮影した。糖複合体官能化は、SWNT又はRGOを堆積したマイカ基板と20μMの糖複合体を室温で2時間、純水溶液中でインキュベートすることにより行った。官能化SWNTとRGOの画像を、該基板を純水で洗浄して45分間周囲で乾燥した後、撮影した。特異的レクチンとの相互作用を、処理基板を2μMのレクチン溶液(5μMのCaCl2を含むPBS)でインキュベートし、次いで、PBS溶液で洗浄し、45分間周囲で乾燥することにより検討した。
糖複合体(I)の糖(炭水化物)とレクチン分子との間の相互作用の電子的検出について図4及び6の曲線に示している。
図4及び6は、糖複合体−レクチン相互作用の各種ステージにおいて、それぞれCCG−FET及びSWNT−FETに対するコンダクタンスG vs. Vg曲線を示している。
ピレン系糖複合体(I)(5aから5c)と相互作用すると、ゲート電圧がわずかに負にシフトし、CCG−FET装置のコンダクタンスの減少が観察された(図4)。装置のコンダクタンスの減少はピレン分子からCCG伝導チャネルへの電子供与が原因であると考えられる。
糖複合体官能化後のCCG−FET装置の応答はレクチンに選択的であった。例えば、図4(b)は、β−D−ガラクトースピレン系糖複合体(5a)装置の2つのレクチンへの応答を示している。非特異的レクチン(ConA)とインキュベートすると、トランスファ特性は変化がなかった。しかしながら、ガラクトース特異的レクチン(PA−IL)と処理すると、コンダクタンスの減少が観察され、糖複合体とレクチンの間の選択的相互作用を示した。同様の結果が、α−D−マンノースとα−L−フコースピレン系糖複合体で観察された(図4(a)及び図4(c))。
同様の実験をSWNT−FET装置で行った。図6に示したように、装置のコンダクタンスの減少は、ピレン−糖複合体との相互作用で観察された(5a及び5b)。非特異的レクチンとの処理では、SWNT−FET装置のトランスファ特性は変化がなかった。装置のコンダクタンスの減少は、特異的レクチンとの処理後に観察され、レクチンと糖複合体との間の選択的な相互作用を示している。
さらに、β−D−ガラクトース糖複合体(5a)官能化装置(10μMのConAでコントロール測定)に対し、特異的レクチンPA−ILの濃度(2nMから10μM)を変動させて(図4(d))、G vs. Vgをプロットすることにより、CCG−FET装置の感度を検討した。10μMの特異的レクチンPA−ILに対するCCG−FET装置の応答は、10μMの非特異的レクチンConAに対する応答よりも約2倍高く、良好な感度を証明している。
原子間力顕微鏡(AFM)イメージングを、官能化の各種ステージにおいてCCGの表面モルホロジーを検討するために行った。裸のCCGは厚さ0.67±0.15nmであると観察された(図5(a))。α−D−マンノース糖複合体(5b)との官能化の後、全体の高さは2.44±0.35nmに増加した(図5(b))。その後、糖複合体官能化CCGを特異的結合レクチン(α−D−マンノースに対しConA)に曝した後、高さが8.25±1.73nmに増加することが観察された(図5(c))。典型的には、ConAはpH≧7において溶液中で四量体として観察され、該四量体の分子の大きさは、X線回折により60×70×70Å(Protein DataBank, 1CN1)である。AFMで得られた高さの測定値は文献値とかなり一致していた。
さらに、AFMイメージングを行い、官能化の各種ステージにおけるSWNTの表面モルホロジーについて検討した。SWNTの高さは約3−4nmであることが観察され、SWNTの束の存在が示された(図7(a))。α−D−マンノース糖複合体5(b)との官能化の後、全体の高さは5−7nmに増加した(図7(b))。その後、該糖複合体官能化SWNTを特異的結合レクチン(α−D−マンノースに対しConA)に曝した後、10nmを超える高さの増加が観察され(図7(c))、SWNTネットワーク上へのレクチンの吸着が示された。
結論として、CCG−FET及びSWNT−FET装置を用いた、ピレン系糖複合体と細菌レクチンとの間の相互作用の電子的検出について明確に示した。レクチンと糖複合体との間の相互作用は、CCG−FET及びSWNT−FET装置におけるコンダクタンス変化として変換された。
文献
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Claims (17)
- 炭素ナノ構造体と、非共有結合によって前記炭素ナノ構造体に結合しているピレン系糖複合体(I)とを含み、
前記糖複合体(I)が式:
−(CH2)n−CO−NH−A
{式中、nは1〜9の整数であり、
Aは式:
U’及びUは存在せず、又はCH2であるが、但しm=0である場合、U’又はUの一方が存在しないならば他方はCH2であり、
X=CH2、O、CO(カルボニル)であり、
W=CH2、NHであり、
V=CH2、C6H4(フェニル「Ph」)である)の基であり、
- ・m=0であり、U’は存在せず、及びU=CH2である、
・m=0であり、U’=U=CH2である、
・m=1であり、U’及びUは存在せず、X=W=V=CH2である、
・m=2であり、U’及びUは存在せず、X=W=V=CH2である、
・m=1であり、U’=CH2であり、Uは存在せず、X=Oであり、W=V=CH2である、
・m=2であり、U’=CH2であり、Uは存在せず、X=Oであり、W=V=CH2である、
・m=2であり、U’は存在せず、U=V=CH2であり、X=COであり、W=NHである、並びに
・m=1であり、U’及びUは存在せず、X=COであり、W=NHであり、及びV=Phである
を含む群において選択される、請求項1から3のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体。 - 炭素ナノ構造体が、カーボンナノチューブ、グラフェン、グラファイトオニオン、コーン、ナノホーン、ナノ螺旋体、ナノバレル及びフラーレンを含む群において選択される、請求項1から6のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体。
- 炭素ナノ構造体が、グラフェン及びカーボンナノチューブであり、前記カーボンナノチューブが、単一壁カーボンナノチューブ(SWCNT)、二重壁カーボンナノチューブ(DWCNT)、三重壁カーボンナノチューブ(TWCNT)及び多重壁カーボンナノチューブ(MWCNT)を含む群において選択される、請求項7に記載の非共有結合性分子構造体。
- 請求項1から8のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体を含むことを特徴とする、レクチンを検出するための装置。
- 装置が電子ナノ検出装置であり、かつ電界効果トランジスタ(FET)を含み、
前記装置が、
「ソース」(S)及び「ドレイン」(D)とそれぞれ称される2つの金属電極を架橋する炭素ナノ構造体、
基板層に、又は前記装置を覆う溶液に浸漬された電極に接続される、「ゲート」(G)と称される第3の電極(「液体ゲート」)を含む、請求項9に記載の装置。 - 2つの金属電極(S)及び(D)が互いに1nm〜10cm、好ましくは1cm〜2.5cm、及びより好ましくは1μm〜10μmの間隔を空けている、請求項10に記載の装置。
- 基板層が絶縁体である、請求項10又は11のいずれか1項に記載の装置。
- 請求項9から12のいずれか1項に記載の装置を用いる工程と、
分析するレクチンを請求項1から8のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体と接触させる工程と、
レクチンと前記非共有結合性分子構造体のピレン系糖複合体(I)の糖との間の分子間相互作用を検出する工程であって、前記分子間相互作用を、前記装置の電気信号の変化をもたらす炭素ナノ構造体の導電性の変化によって検出する工程とを含むことを特徴とする、分析する試料中におけるレクチンの存在の検出方法。 - レクチンが、緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)第1のレクチン(PA−IL)、緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)第2のレクチン(PA−IIL)、コンカナバリンA(Con A)レクチン、バークホルデリア・セノセパシア(Burkholderia cenocepacia)A(Bc2L−A)レクチン、バークホルデリア・セノセパシア(Burkholderia cenocepacia)B(Bc2L−B)レクチン、バークホルデリア・セノセパシア(Burkholderia cenocepacia)C(Bc2L−C)レクチン、バークホルデリア・アムビファリア(Burkholderia ambifaria)(Bamb541)レクチン、青枯病菌(Ralstonia solanacearum)(RSL)レクチン、青枯病菌(Ralstonia solanacearum)第2のレクチン(RS−IIL)及びクロモバクテリウム・ビオラセウム(Chromobacterium violaceum)(CV−IIL)レクチンを含む群において選択される、請求項13に記載の方法。
- 請求項10から12のいずれか1項に記載の装置の製造が、
(G)に接続された基板層上に2つの金属電極(S)及び(D)を形成する工程と、
2つの電極(S)及び(D)の間に炭素ナノ構造体を加え、次いでピレン系糖複合体(I)を加えて請求項1から8のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体を形成する工程とを含む、請求項13又は14のいずれか1項に記載の方法。 - 請求項10から12のいずれか1項に記載の装置の製造が、
(G)に接続された基板層上に2つの金属電極(S)及び(D)を形成する工程と、
2つの電極(S)及び(D)の間に請求項1から8のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体を加える工程とを含む、請求項13又は14のいずれか1項に記載の方法。 - 請求項10から12のいずれか1項に記載の装置の製造が、
(化学蒸着(CVD)プロセスによって)(G)に接続された基板層上に炭素ナノ構造体を作成する工程と、
炭素ナノ構造体の周囲に2つの金属電極(S)及び(D)を形成する工程と、
ピレン系糖複合体(I)を加えて請求項1から8のいずれか1項に記載の非共有結合性分子構造体を形成する工程とを含む、請求項13又は14のいずれか1項に記載の方法。
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