JP2014517023A - Peptide extraction method and its use in liquid phase peptide synthesis - Google Patents
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Abstract
本発明は、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物からペプチドを抽出する方法であって、
該反応混合物が、ペプチドと、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミドおよびN−メチル−2−ピロリドンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒とを含むこと;ならびに
該方法が、
a)該反応混合物にトルエンである成分a1)と水である成分a2)とを加えて、有機層および水層からなる二相系を得ることを含む工程、および
b)ペプチドを含む有機層と水層を分離することを含む工程
を含むこと
を特徴とする方法に関する。
本発明の特に好ましい実施形態においては、n−ヘプタン、2−メチルテトラヒドロフラン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、アセトニトリルおよびテトラヒドロフランからなる群から選択される有機溶媒1とトルエンとの組み合わせを本発明の抽出方法に使用する。この抽出工程は、液相におけるペプチド調製方法に好ましく使用される。The present invention is a method for extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction,
The reaction mixture comprises a peptide and a polar aprotic solvent selected from the group consisting of N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide and N-methyl-2-pyrrolidone; ,
a) adding to the reaction mixture component a1) which is toluene and component a2) which is water to obtain a two-phase system consisting of an organic layer and an aqueous layer, and b) an organic layer containing a peptide The present invention relates to a method comprising a step including separating an aqueous layer.
In a particularly preferred embodiment of the present invention, the extraction method of the present invention uses a combination of an organic solvent 1 selected from the group consisting of n-heptane, 2-methyltetrahydrofuran, ethyl acetate, isopropyl acetate, acetonitrile and tetrahydrofuran and toluene. use. This extraction step is preferably used in a peptide preparation method in a liquid phase.
Description
本発明は、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物からペプチドを抽出する方法に関する。本発明の方法は液相ペプチド合成(LPPS)法において使用することが好ましい。反応混合物からペプチドを抽出する本発明の方法は、他のペプチド合成法においても使用することができ、たとえば固相ペプチド合成(SPPS)法により調製された合成ペプチドを切断した後、このペプチドを単離する際に使用することができる。また、本発明の方法は固相−液相ハイブリッドペプチド合成法においても使用することができる。さらに、本発明のペプチド抽出方法は、酵母や細菌などの自然源からペプチドを単離するために使用することができ、具体的には、組換え技術によって発現させたペプチドを単離するために使用することができる。 The present invention relates to a method for extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction. The method of the present invention is preferably used in a liquid phase peptide synthesis (LPPS) method. The method of the present invention for extracting a peptide from a reaction mixture can also be used in other peptide synthesis methods. For example, after cleaving a synthetic peptide prepared by the solid phase peptide synthesis (SPPS) method, Can be used when releasing. The method of the present invention can also be used in a solid-liquid phase hybrid peptide synthesis method. Furthermore, the peptide extraction method of the present invention can be used to isolate peptides from natural sources such as yeast and bacteria, specifically to isolate peptides expressed by recombinant techniques. Can be used.
本願明細書においてアミノ酸およびペプチドの命名法は、他に記載がない限り“Nomenclature and symbolism for amino acids and peptides”, Pure & Appl. Chem. 1984, Vol. 56, No. 5, pp. 595-624の記載に従うものとする。 In this specification, the nomenclature of amino acids and peptides is “Nomenclature and symbolism for amino acids and peptides”, Pure & Appl. Chem. 1984, Vol. 56, No. 5, pp. 595-624 unless otherwise stated. Shall be followed.
次の略語は他に記載がない限り以下に示す意味を有する。
ACN アセトニトリル
Boc tert−ブトキシカルボニル
Bsmoc 1,1−ジオキソベンゾ[b]チオフェン−2−イルメチルオキシカルボニル
Bzl ベンジル
Cbz ベンジルオキシカルボニル
DCC N,N’−ジシクロヘキシルカルボジイミド
DCM ジクロロメタン
DEA ジエチルアミン
DIPE ジイソプロピルエーテル
DIPEA N,N−ジイソプロピルエチルアミン
DMA N,N−ジメチルアセトアミド
DMF N,N−ジメチルホルムアミド
EDC 1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド
eq 当量
EtOAc 酢酸エチル
Fmoc フルオレニル−9−メトキシカルボニル
h 時間
HOBt 1−ヒドロキシベンゾトリアゾール
HOBt・H2O 1−ヒドロキシベンゾトリアゾール1水和物
HPLS 高速液体クロマトグラフィー
LPPS 液相ペプチド合成
MeTHF 2−メチルテトラヒドロフラン
min 分
MS 質量分析
NMP N−メチル−2−ピロリドン
OMe メトキシ
OtBu tert−ブトキシ
PG 保護基
PyBOP ベンゾトリアゾール−1−イルオキシ−トリス(ピロリジノ)−ホスホニウムヘキサフルオロホスファート
SPPS 固相ペプチド合成
TAEA トリス(2−アミノエチル)アミン
TBTU O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート
tBu tert−ブチル
TEA トリエチルアミン
TFA トリフルオロ酢酸
THF テトラヒドロフラン
TLC 薄層クロマトグラフィー
TOTU O−[シアノ(エトキシカルボニル)メチレンアミノ]−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート
Trt トリチル
UV 紫外線
The following abbreviations have the following meanings unless otherwise indicated.
ACN Acetonitrile
Boc tert-butoxycarbonyl
Bsmoc 1,1-Dioxobenzo [b] thiophen-2-ylmethyloxycarbonyl
Bzl benzyl
Cbz benzyloxycarbonyl
DCC N, N'-dicyclohexylcarbodiimide
DCM dichloromethane
DEA diethylamine
DIPE Diisopropyl ether
DIPEA N, N-Diisopropylethylamine
DMA N, N-dimethylacetamide
DMF N, N-dimethylformamide
EDC 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide
eq equivalent
EtOAc ethyl acetate
Fmoc Fluorenyl-9-methoxycarbonyl
h hours
HOBt 1-hydroxybenzotriazole
HOBt ・ H 2 O 1-Hydroxybenzotriazole monohydrate
HPLS HPLC
LPPS liquid phase peptide synthesis
MeTHF 2-methyltetrahydrofuran
min minutes
MS mass spectrometry
NMP N-methyl-2-pyrrolidone
OMe Methoxy
OtBu tert-butoxy
PG protecting group
PyBOP Benzotriazol-1-yloxy-tris (pyrrolidino) -phosphonium hexafluorophosphate
SPPS solid phase peptide synthesis
TAEA tris (2-aminoethyl) amine
TBTU O- (Benzotriazol-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate
tBu tert-butyl
TEA Triethylamine
TFA trifluoroacetic acid
THF tetrahydrofuran
TLC thin layer chromatography
TOTU O- [cyano (ethoxycarbonyl) methyleneamino] -1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate
Trt Trityl
UV UV
ペプチドの抽出方法は、通常、液相ペプチド合成(LPPS)、固相ペプチド合成(SPPS)、固相−液相ハイブリッドペプチド合成などの様々なペプチド合成法において使用される。 The peptide extraction method is usually used in various peptide synthesis methods such as liquid phase peptide synthesis (LPPS), solid phase peptide synthesis (SPPS), and solid phase-liquid phase hybrid peptide synthesis.
LPPSはペプチドの工業的大量生産に使用されることが特に多い。LPPSにおいては、通常、部分的に保護された2つのアミノ酸またはペプチド、すなわち、保護されていないC末端カルボン酸基を有するアミノ酸またはペプチドと、保護されていないN末端アミノ基を有するアミノ酸またはペプチドとをカップリングする。カップリング工程の終了後、得られたペプチドのN末端アミノ基またはC末端カルボン酸基の保護基(PG)を特異的に切断することによってN末端アミノ基またはC末端カルボン酸基を脱保護することができ、後続のカップリング工程を行うことができる。通常、LPPSは、残った保護基(PG)すべてを除去する包括的な脱保護工程を行うことによって完了する。 LPPS is particularly often used for industrial mass production of peptides. In LPPS, usually two partially protected amino acids or peptides, ie, an amino acid or peptide having an unprotected C-terminal carboxylic acid group and an amino acid or peptide having an unprotected N-terminal amino group, To couple. After completion of the coupling step, the N-terminal amino group or C-terminal carboxylic acid group is deprotected by specifically cleaving the protecting group (PG) of the N-terminal amino group or C-terminal carboxylic acid group of the obtained peptide. And a subsequent coupling step can be performed. LPPS is usually completed by performing a comprehensive deprotection step that removes all remaining protecting groups (PG).
ペプチドの取り扱い、具体的にはLPPSにおける保護されていないC末端カルボン酸基および/または保護されていないN末端アミノ基を有するペプチドの取り扱いは往々にして困難である。これは、このようなペプチドが一般的な有機溶媒に溶解しにくいことが原因である。概して、一般的な有機溶媒に対するペプチドの溶解性はペプチド鎖が長くなればなるほど低下する。 It is often difficult to handle peptides, particularly peptides with unprotected C-terminal carboxylic acid groups and / or unprotected N-terminal amino groups in LPPS. This is because such peptides are difficult to dissolve in common organic solvents. In general, the solubility of peptides in common organic solvents decreases with increasing peptide chain length.
ジクロロメタン(DCM)は適切な反応溶媒としてLPPSで一般的に使用されている。DCMは溶媒特性に優れ、沸点が低く、水との混和性が低いことから、DCMを用いることで反応混合物の後処理として水溶液による抽出を行うことが可能となる。しかしながら、DCMを工業規模で使用すると環境に悪影響を及ぼす恐れがあり、また、DCMは密度が大きいことから、水溶液を用いてDCM層を抽出しようとすると時間と費用を要するため、工業規模でのDCMの使用は通常限定的である。 Dichloromethane (DCM) is commonly used in LPPS as a suitable reaction solvent. Since DCM has excellent solvent properties, a low boiling point, and low miscibility with water, it is possible to perform extraction with an aqueous solution as a post-treatment of the reaction mixture by using DCM. However, if DCM is used on an industrial scale, the environment may be adversely affected. Also, because DCM has a high density, it takes time and money to extract a DCM layer using an aqueous solution. The use of DCM is usually limited.
さらに、最近開発された高効率なカップリング試薬、たとえば、ベンゾトリアゾール−1−イルオキシ−トリス(ピロリジノ)−ホスホニウムヘキサフルオロホスファート(PyBOP)やO−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート(TBTU)などはDCMに対する溶解性が低い。これらのカップリング試薬は大きなペプチド断片2つをカップリングする際に特に有利であり、このような大きなペプチド断片のカップリングに他のカップリング試薬を使用すると収率が低くなることが知られている。 Furthermore, recently developed highly efficient coupling reagents such as benzotriazol-1-yloxy-tris (pyrrolidino) -phosphonium hexafluorophosphate (PyBOP) and O- (benzotriazol-1-yl) -1,1 3,3-Tetramethyluronium tetrafluoroborate (TBTU) has low solubility in DCM. These coupling reagents are particularly advantageous when coupling two large peptide fragments, and the use of other coupling reagents to couple such large peptide fragments is known to reduce yield. Yes.
さらに、ペプチドの多くは中性および塩基性条件下においてDCMには溶解しにくい一方、たとえばN,N−ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N−ジメチルアセトアミド(DMA)、N−メチル−2−ピロリドン(NMP)などの極性非プロトン性溶媒にはよく溶解する。したがって、これらの極性非プロトン性溶媒は、従来よりLPPSの反応溶媒として単独またはテトラヒドロフラン(THF)などの極性の低い溶媒と混合して使用されている。 In addition, many of the peptides are difficult to dissolve in DCM under neutral and basic conditions, while N, N-dimethylformamide (DMF), N, N-dimethylacetamide (DMA), N-methyl-2-pyrrolidone, for example It dissolves well in polar aprotic solvents such as (NMP). Therefore, these polar aprotic solvents are conventionally used alone or mixed with a low polarity solvent such as tetrahydrofuran (THF) as a reaction solvent for LPPS.
一方、LPPSに極性非プロトン性溶媒を使用することには多くの欠点がある。極性非プロトン性溶媒の沸点は高いため、反応混合物を蒸発濃縮することが難しい。さらに、極性非プロトン性溶媒は水と混和することから、反応混合物の後処理として水溶液による直接抽出を行うことは不可能である。 On the other hand, the use of polar aprotic solvents for LPPS has many drawbacks. Since the polar aprotic solvent has a high boiling point, it is difficult to evaporate and concentrate the reaction mixture. Furthermore, since polar aprotic solvents are miscible with water, it is not possible to perform direct extraction with an aqueous solution as a post-treatment of the reaction mixture.
LPPSを工業規模で実施する場合、通常、各カップリング工程後に中間体ペプチドを直接沈殿させて、反応混合物から単離する。これによって、反応しなかった出発材料、副産物、過剰なカップリング試薬や塩基などの不純物から分離することができる。ペプチドカップリング反応の終了後、通常、反応混合物を貧溶媒(たとえばジエチルエーテルや水など)に添加することによってペプチドを沈殿させる。しかしながら、既知の問題として、反応混合物を貧溶媒に添加するとゲルが形成されることが知られている。 When LPPS is performed on an industrial scale, the intermediate peptide is usually precipitated directly from the reaction mixture after each coupling step. This allows separation from unreacted starting materials, by-products, excess coupling reagents and impurities such as bases. After completion of the peptide coupling reaction, the peptide is usually precipitated by adding the reaction mixture to a poor solvent (such as diethyl ether or water). However, as a known problem, it is known that a gel is formed when the reaction mixture is added to a poor solvent.
さらに、一般的に極性非プロトン性溶媒はペプチドの沈殿過程を阻害するため、ペプチドが粘着性のあるゴム状固形物として沈殿し、濾過および乾燥が難しくなる。場合によっては、沈殿したペプチドを濾過することができず、さらには沈殿したペプチドをフィルター上に移すことができないこともある。特に、工業規模でペプチドを沈殿させることは難しい場合が多く、多大な時間が必要とされ、濾過時間によってリードタイムが左右される。この問題は、沈殿工程において極性非プロトン性溶媒に対する貧溶媒の体積比を増加させることよって部分的に解決することができる。実際上、濾過可能な形態のペプチド沈殿物を得るためには適切な貧溶媒が大量に必要とされる。 Furthermore, since polar aprotic solvents generally inhibit the peptide precipitation process, the peptide precipitates as a sticky rubbery solid, making filtration and drying difficult. In some cases, the precipitated peptide cannot be filtered, and further, the precipitated peptide cannot be transferred onto the filter. In particular, it is often difficult to precipitate peptides on an industrial scale, requiring a lot of time, and the lead time depends on the filtration time. This problem can be partially solved by increasing the volume ratio of antisolvent to polar aprotic solvent in the precipitation step. In practice, a large amount of a suitable antisolvent is required to obtain a filterable form of the peptide precipitate.
さらに、ペプチド沈殿物中に残留する極性非プロトン性溶媒は、トリフルオロ酢酸(TFA)を用いた次の脱保護工程を阻害することが知られている。したがって、酸により切断可能な保護基(PG)、たとえば、tert−ブトキシカルボニル(Boc)、トリチル(Trt)、tert−ブチル(tBu)、tert−ブトキシ(OtBu)などを切断する前に、極性非プロトン性溶媒よりもさらに揮発性の高い溶媒でペプチド沈殿物を洗浄して、残留する極性非プロトン性溶媒を除去する工程がさらに必要とされる。 Furthermore, the polar aprotic solvent remaining in the peptide precipitate is known to inhibit the subsequent deprotection step using trifluoroacetic acid (TFA). Therefore, before cleaving the acid cleavable protecting group (PG), such as tert-butoxycarbonyl (Boc), trityl (Trt), tert-butyl (tBu), tert-butoxy (OtBu), etc. A further step is required to wash the peptide precipitate with a solvent that is more volatile than the protic solvent to remove the remaining polar aprotic solvent.
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J. W. van Nispen(Pure and Appl. Chem. 1987, Vol. 59, No. 3, pp. 331-344)は、(ポリ)ペプチドの合成および分析に関して概説している。この文献においては、ペプチド成分の最適な分離条件を見つけるために、様々な特性を有する溶媒を多様に組み合わせることが可能であることが教示されている。この目的を達成するためにいわゆるCraig装置が一般的に使用されており、この装置では、下相を固定し、上相を移動させることによって多段階的に分配が行われる。 J. W. van Nispen (Pure and Appl. Chem. 1987, Vol. 59, No. 3, pp. 331-344) outlines the synthesis and analysis of (poly) peptides. This document teaches that it is possible to combine various solvents with various properties in order to find optimal separation conditions for peptide components. A so-called Craig device is generally used to achieve this purpose, in which the lower phase is fixed and the upper phase is moved to distribute in multiple stages.
US2010/0184952には、Fmoc基で保護されたアミノ酸化合物をアミンと反応させることにより脱保護して得られる反応混合物からジベンゾフルベンおよび/またはジベンゾフルベンアミン付加体を淘汰する方法であって、該反応混合物を、炭素数5以上の炭化水素溶媒および該炭化水素溶媒に混和しない極性有機溶媒(但し、アミド系有機溶媒を除く)中で攪拌、分層させ、ジベンゾフルベンおよび/またはジベンゾフルベンアミン付加体が溶解した炭化水素溶媒層を除去する工程を含むことを特徴とする方法が開示されている。この方法においては、アミノ酸エステルまたはペプチドは極性有機溶媒中に移行する。かかる極性有機溶媒としては、アセトニトリル、メタノール、アセトン等またはそれらの混合溶媒が挙げられ、アセトニトリルまたはメタノールが好ましい。 US2010 / 0184952 discloses a method for degrading a dibenzofulvene and / or dibenzofulveneamine adduct from a reaction mixture obtained by deprotecting an amino acid compound protected with an Fmoc group with an amine, The mixture is stirred and separated in a hydrocarbon solvent having 5 or more carbon atoms and a polar organic solvent immiscible with the hydrocarbon solvent (excluding an amide organic solvent), and dibenzofulvene and / or dibenzofulveneamine adduct A method is disclosed that includes the step of removing the hydrocarbon solvent layer in which the is dissolved. In this method, the amino acid ester or peptide is transferred into a polar organic solvent. Examples of the polar organic solvent include acetonitrile, methanol, acetone and the like, or a mixed solvent thereof, and acetonitrile or methanol is preferable.
L. A. Carpinoら(Organic Process Research & Development 2003, 7, pp. 28-37)は、高速かつ連続した液相ペプチド合成を報告している。この文献の方法ではトリス(2−アミノエチル)アミンの存在下でペプチド断片のFmoc保護基およびBsmoc保護基の脱保護が行われており、この方法は短ペプチドのグラム単位での高速かつ連続した液相合成および比較的長い(22mer)断片(hPTH 13-34)の合成に使用できることが確認されている。後者の合成の場合、粗生成物の純度は固相法により得られた試料よりも有意に高いことが報告されている。Bsmocを用いたこの方法では、カップリング−脱保護サイクル毎に伸長される部分的に脱保護されたペプチドをシリカゲルショートカラムに通して濾過を行う新たな技法を取り入れることによって最適化がなされている。 L. A. Carpino et al. (Organic Process Research & Development 2003, 7, pp. 28-37) report a rapid and continuous liquid phase peptide synthesis. In the method of this document, the Fmoc protecting group and the Bsmoc protecting group of a peptide fragment are deprotected in the presence of tris (2-aminoethyl) amine, and this method is fast and continuous in grams of a short peptide. It has been identified that it can be used for liquid phase synthesis and the synthesis of relatively long (22mer) fragments (hPTH 13-34). In the latter synthesis, the purity of the crude product has been reported to be significantly higher than the sample obtained by the solid phase method. This method using Bsmoc has been optimized by incorporating a new technique for filtering partially deprotected peptides that are extended during each coupling-deprotection cycle through a silica gel short column. .
しかしながら、L. A. Carpinoらによって報告された方法にはいくつかの制約がある。すなわち、この方法は反応溶媒としてDCMを使用しているため、DCMに対して難溶性を示すペプチドの調製に使用することはできない。さらに、高価なトリス(2−アミノエチル)アミン(TAEA)を大量に使用することから、このことによっても工業規模でこの方法を利用することが難しくなっている。 However, the method reported by L. A. Carpino et al. Has some limitations. That is, since this method uses DCM as a reaction solvent, it cannot be used for the preparation of peptides that are sparingly soluble in DCM. Furthermore, the use of large amounts of expensive tris (2-aminoethyl) amine (TAEA) also makes it difficult to utilize this method on an industrial scale.
したがって、特に工業規模での生産を目的とした、ペプチドを調製するための時間効果および費用効果の高い合成方法が強く求められている。このような方法は、LPPSにおけるDCMの使用およびDMF、DMA、NMPなどの極性非プロトン性溶媒の使用により生じる問題点を解決できるものでなければならない。 Therefore, there is a strong need for time-effective and cost-effective synthetic methods for preparing peptides, especially for industrial scale production. Such a method should be able to solve the problems caused by the use of DCM in LPPS and polar aprotic solvents such as DMF, DMA, NMP.
驚くべきことに本発明者らは、構造的に多様なペプチドの多くがトルエンに対して優れた溶解性を示すこと、ならびにトルエンは、n−ヘプタン、2−メチルテトラヒドロフラン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、アセトニトリルおよびテトラヒドロフランからなる群(この群を「有機溶媒1」と呼ぶ)から選択される有機溶媒と組み合わせて用いることが好ましいことを見出した。具体的には、有機溶媒1と組み合わせたトルエンに対するペプチドの溶解性は、トルエン単独に対するものよりも概して高い。さらに本発明者らは、トルエンまたは有機溶媒1と組み合わせたトルエンと水とを含む二相系において、一般的な極性非プロトン性溶媒の大部分は水層に移行することを見出した。 Surprisingly, the inventors have shown that many of the structurally diverse peptides exhibit excellent solubility in toluene, and that toluene is n-heptane, 2-methyltetrahydrofuran, ethyl acetate, isopropyl acetate, It has been found that it is preferable to use in combination with an organic solvent selected from the group consisting of acetonitrile and tetrahydrofuran (this group is referred to as “organic solvent 1”). Specifically, the solubility of peptides in toluene combined with organic solvent 1 is generally higher than that in toluene alone. Furthermore, the present inventors have found that in a two-phase system containing toluene and water combined with toluene or organic solvent 1, most of the common polar aprotic solvent is transferred to the aqueous layer.
したがって、トルエン単独または有機溶媒1と組み合わせたトルエンと水とを含む系は、極性非プロトン性溶媒を含む混合物からのペプチドの抽出に非常に適している。本発明の一実施形態では、ペプチドを含む得られた有機層を部分的に蒸発させ、次いで適切な貧溶媒(この群の溶媒を「有機溶媒2」と呼ぶ)を添加することにより、有機層中に溶解しているペプチドを沈殿させる。ペプチドを沈殿させる際には極性非プロトン性溶媒は実質的に含まれていないため、得られたペプチドを容易に濾過することができる。本発明の抽出方法を使用することによって、ペプチドの濾過に必要とされる時間を大幅に短縮することができる。したがって、本発明の抽出方法を使用することによって、極性非プロトン性溶媒を使用することにより生じるLPPSの問題点を見事に解決することができる。 Therefore, a system containing toluene and water alone or in combination with organic solvent 1 is very suitable for the extraction of peptides from mixtures containing polar aprotic solvents. In one embodiment of the present invention, the organic layer obtained by partially evaporating the peptide-containing organic layer and then adding an appropriate anti-solvent (this group of solvents is referred to as “organic solvent 2”) Peptides dissolved in are precipitated. Since the polar aprotic solvent is substantially not contained when the peptide is precipitated, the obtained peptide can be easily filtered. By using the extraction method of the present invention, the time required for peptide filtration can be significantly reduced. Therefore, by using the extraction method of the present invention, the problem of LPPS caused by using a polar aprotic solvent can be solved brilliantly.
本発明は、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物からペプチドを抽出する方法であって、
該反応混合物が、ペプチドと、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミドおよびN−メチル−2−ピロリドンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒とを含むこと;
該方法が、
a)該反応混合物にトルエンである成分a1)と水である成分a2)とを加えて、有機層および水層からなる二相系を得ることを含む工程、および
b)ペプチドを含む有機層と水層を分離することを含む工程
を含むこと;ならびに
工程a)で得られる該二相系の体積組成比が、
極性非プロトン性溶媒:トルエン=1:20〜1:2、および
極性非プロトン性溶媒:水=1:20〜1:2であること
を特徴とする方法に関する。
The present invention is a method for extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction,
The reaction mixture comprises a peptide and a polar aprotic solvent selected from the group consisting of N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide and N-methyl-2-pyrrolidone;
The method is
a) adding to the reaction mixture component a1) which is toluene and component a2) which is water to obtain a two-phase system consisting of an organic layer and an aqueous layer, and b) an organic layer containing a peptide Including a step comprising separating the aqueous layer; and the volume composition ratio of the two-phase system obtained in step a)
The method is characterized in that polar aprotic solvent: toluene = 1: 20 to 1: 2 and polar aprotic solvent: water = 1: 20 to 1: 2.
本発明の好ましい一実施形態は、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物からペプチドを抽出する方法であって、
該反応混合物が、ペプチドと、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミドおよびN−メチル−2−ピロリドンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒とを含むこと;
該方法が、
a)トルエンである成分a1)と、水である成分a2)と、n−ヘプタン、2−メチルテトラヒドロフラン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、アセトニトリルおよびテトラヒドロフランからなる群から選択される有機溶媒1である成分a3)とを加えて、有機層および水層からなる二相系を得ることを含む工程、および
b)ペプチドを含む有機層と水層を分離することを含む工程
を含むこと;ならびに
工程a)で得られる該二相系の体積組成比が、
極性非プロトン性溶媒:トルエン=1:20〜1:2、
極性非プロトン性溶媒:有機溶媒1=1:5〜30:1、
極性非プロトン性溶媒:水=1:20〜1:2、および
トルエン:有機溶媒1=50:1〜1:1であること
を特徴とする方法に関する。
A preferred embodiment of the present invention is a method for extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction,
The reaction mixture comprises a peptide and a polar aprotic solvent selected from the group consisting of N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide and N-methyl-2-pyrrolidone;
The method is
a) Component a3 which is an organic solvent 1 selected from the group consisting of component a1) which is toluene, component a2) which is water and n-heptane, 2-methyltetrahydrofuran, ethyl acetate, isopropyl acetate, acetonitrile and tetrahydrofuran And b) separating the organic layer containing the peptide and the aqueous layer; and b) separating the organic layer and the aqueous layer comprising the peptide; The volume composition ratio of the obtained two-phase system is
Polar aprotic solvent: toluene = 1: 20-1: 2,
Polar aprotic solvent: organic solvent 1 = 1: 5-30: 1
The method is characterized in that polar aprotic solvent: water = 1: 20 to 1: 2 and toluene: organic solvent 1 = 50: 1 to 1: 1.
好ましい実施形態において、工程a)で得られる二相系の体積組成比は、
極性非プロトン性溶媒:トルエン=1:6〜1:3、
極性非プロトン性溶媒:有機溶媒1=1:1〜4:1、
極性非プロトン性溶媒:水=1:5〜1:3、および
トルエン:有機溶媒1=10:1〜2:1である。
In a preferred embodiment, the volume composition ratio of the two-phase system obtained in step a) is
Polar aprotic solvent: toluene = 1: 6 to 1: 3
Polar aprotic solvent: organic solvent 1 = 1: 1 to 4: 1
Polar aprotic solvent: water = 1: 5 to 1: 3, and toluene: organic solvent 1 = 10: 1 to 2: 1.
特に好ましい実施形態では、極性非プロトン性溶媒はN,N−ジメチルホルムアミドまたはN−メチル−2−ピロリドンである。 In a particularly preferred embodiment, the polar aprotic solvent is N, N-dimethylformamide or N-methyl-2-pyrrolidone.
本発明のさらに別の実施形態では、二相系は有機溶媒1を含んでいない。 In yet another embodiment of the invention, the two-phase system does not contain organic solvent 1.
本発明の好ましい一実施形態では、ペプチドの抽出毎にペプチドの沈殿操作は行わない。すなわち、ペプチドの1つまたは複数の保護基を切断して、これにより得られた部分的に保護されていないペプチドを抽出し、このペプチドを含む有機層を次のペプチドカップリング反応に使用する。したがって、本発明によって、工業規模でのペプチドの調製に適した連続的LPPSを行うための効率的な合成方法が提供される。 In a preferred embodiment of the present invention, the peptide precipitation operation is not performed every time the peptide is extracted. That is, one or more protecting groups of the peptide are cleaved, and the resulting partially unprotected peptide is extracted, and the organic layer containing the peptide is used for the next peptide coupling reaction. Thus, the present invention provides an efficient synthetic method for performing continuous LPPS suitable for the preparation of peptides on an industrial scale.
本発明の連続的LPPSは、後述する実施例において説明されるような、保護基としてBoc、FmocおよびBzlを使用したペプチド合成に非常に適している。 The continuous LPPS of the present invention is very suitable for peptide synthesis using Boc, Fmoc and Bzl as protecting groups, as described in the examples below.
抽出方法
本発明は、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物からペプチドを抽出する方法であって、
該反応混合物が、ペプチドと極性非プロトン性溶媒とを含むこと;ならびに
該方法が、
a)該反応混合物にトルエンである成分a1)と水である成分a2)とを加えて、有機層および水層からなる二相系を得ることを含む工程、および
b)ペプチドを含む有機層と水層を分離することを含む工程
を含むこと
を特徴とする方法に関する。
Extraction method The present invention is a method of extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction,
The reaction mixture comprises a peptide and a polar aprotic solvent; and the method comprises:
a) adding to the reaction mixture component a1) which is toluene and component a2) which is water to obtain a two-phase system consisting of an organic layer and an aqueous layer, and b) an organic layer containing a peptide The present invention relates to a method comprising a step including separating an aqueous layer.
本発明の好ましい一実施形態は、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物からペプチドを抽出する方法であって、
該反応混合物が、ペプチドと、DMF、DMAおよびNMPからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒とを含むこと;ならびに
該方法が、
a)トルエンである成分a1)と、水である成分a2)と、n−ヘプタン、2−メチルテトラヒドロフラン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、アセトニトリルおよびテトラヒドロフランからなる群から選択される有機溶媒1である成分a3)とを加えて、有機層および水層からなる二相系を得ることを含む工程、および
b)ペプチドを含む有機層と水層を分離することを含む工程
を含むこと
を特徴とする方法に関する。
A preferred embodiment of the present invention is a method for extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction,
The reaction mixture comprises a peptide and a polar aprotic solvent selected from the group consisting of DMF, DMA and NMP; and the method comprises:
a) Component a3 which is an organic solvent 1 selected from the group consisting of component a1) which is toluene, component a2) which is water and n-heptane, 2-methyltetrahydrofuran, ethyl acetate, isopropyl acetate, acetonitrile and tetrahydrofuran ) To obtain a two-phase system consisting of an organic layer and an aqueous layer, and b) a step comprising separating the organic layer containing the peptide from the aqueous layer. .
成分a1)、成分a2)および成分a3)は混合してもよく、この混合はどのような順序で行ってもよい。本発明の抽出方法においてペプチドが沈殿しない限り、これらのうち2つの成分または3つの成分すべてを前もって混合してから、これら3成分を添加することもできる。 Component a1), component a2) and component a3) may be mixed, and this mixing may be performed in any order. As long as the peptide does not precipitate in the extraction method of the present invention, these three components can be added after mixing two components or all three components in advance.
極性非プロトン性溶媒を含む混合物は、ペプチドカップリング反応により得られる粗反応混合物であることが好ましい。界面活性剤として作用する化合物がこの混合物に含まれていると本発明の抽出方法における相分離を阻害しうるため、この混合物はこのような化合物を全く含まないことが好ましい。特に好ましい実施形態では、この混合物はカチオン性界面活性剤や非イオン性界面活性剤などの従来技術において公知の界面活性剤を含んでいない。 The mixture containing a polar aprotic solvent is preferably a crude reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction. If a compound that acts as a surfactant is contained in this mixture, phase separation in the extraction method of the present invention can be inhibited. Therefore, it is preferable that this mixture does not contain such a compound at all. In a particularly preferred embodiment, the mixture does not contain surfactants known in the prior art such as cationic surfactants and nonionic surfactants.
ペプチドおよび極性非プロトン性溶媒を含む混合物への成分a1)、成分a2)および成分a3)の添加は、本発明の抽出方法においてペプチドが沈殿しない限り、どのような順序で行ってもよい。たとえば、ペプチドおよび極性非プロトン性溶媒を含む混合物と、トルエンとを混合し、ここに水を加え、最後に有機溶媒1を加えることができる。また、ペプチドおよび極性非プロトン性溶媒を含む混合物を水に加えた後に、トルエンおよび有機溶媒1を添加することもできる。 Addition of component a1), component a2) and component a3) to the mixture containing the peptide and polar aprotic solvent may be performed in any order as long as the peptide does not precipitate in the extraction method of the present invention. For example, a mixture containing a peptide and a polar aprotic solvent can be mixed with toluene, water can be added thereto, and finally the organic solvent 1 can be added. Moreover, toluene and the organic solvent 1 can also be added after adding the mixture containing a peptide and a polar aprotic solvent to water.
本発明の特に好ましい実施形態では、ペプチドおよび極性非プロトン性溶媒を含む混合物と、トルエンおよび有機溶媒1とを混合するが、トルエンおよび有機溶媒1はいずれを先に添加してもよい。次いで水を加える。 In a particularly preferred embodiment of the present invention, a mixture containing a peptide and a polar aprotic solvent is mixed with toluene and the organic solvent 1, which may be added first. Then add water.
添加される水(成分a2))は、塩類(たとえば無機塩類)などの溶存成分を含んでいてもよいと理解される。 It is understood that the added water (component a2)) may contain dissolved components such as salts (eg, inorganic salts).
得られた二相系は激しく攪拌することが好ましい。得られた二相系の攪拌は、抽出操作に一般的に用いられかつ当技術分野において公知の混合機を使用して行うことができる。たとえば、バッチ抽出を行う場合にはジェットミキサーまたは攪拌ミキサーを使用して二相系を攪拌することができる。 The resulting two-phase system is preferably stirred vigorously. Stirring of the resulting two-phase system can be performed using a mixer commonly used in extraction operations and known in the art. For example, when performing batch extraction, a two-phase system can be stirred using a jet mixer or a stirring mixer.
抽出操作に適した機器は、主として本発明の抽出方法を実施する規模および抽出温度に応じて選択される。また、本発明の抽出方法はバッチ抽出法または連続抽出法を使用して行うことができる。ペプチドに最適な抽出を達成するために、必要に応じて本発明の抽出方法を複数回繰り返すことも可能である。 The equipment suitable for the extraction operation is selected mainly depending on the scale for performing the extraction method of the present invention and the extraction temperature. In addition, the extraction method of the present invention can be performed using a batch extraction method or a continuous extraction method. In order to achieve optimal extraction for peptides, the extraction method of the present invention can be repeated multiple times as necessary.
攪拌を行った後、相分離させて、2つの液体層(有機層および水層)を形成させることが好ましい。有機層は水層よりも密度が小さい。相分離は沈降管を使用してまたは遠心分離によって生じさせてもよい。相分離に必要とされる時間は、本発明の抽出方法を実施する規模および使用する機器に左右される。相分離に必要とされる時間は1時間未満であることが好ましく、10分未満であることがより好ましく、1分未満であることが特に好ましい。 After stirring, the phases are preferably separated to form two liquid layers (an organic layer and an aqueous layer). The organic layer is less dense than the aqueous layer. Phase separation may occur using a settling tube or by centrifugation. The time required for phase separation depends on the scale for carrying out the extraction method of the invention and the equipment used. The time required for phase separation is preferably less than 1 hour, more preferably less than 10 minutes, and particularly preferably less than 1 minute.
相分離が生じた後、ペプチドは主として有機層に含まれており、有機層にはトルエンがさらに含まれ、場合によっては有機溶媒1がさらに含まれている。ペプチドを含む上層の有機層は水層と分離されている。本発明の抽出方法を実施後、ペプチド全体の90重量%より多くのペプチドが有機層に含まれ、10重量%未満が水層に含まれることが好ましい。本発明の抽出方法を実施後、ペプチド全体の98重量%より多くのペプチドが有機層に含まれ、2重量%未満が水層に含まれることがさらにより好ましい。本発明の抽出方法を実施後、ペプチド全体の99重量%より多くのペプチドが有機層に含まれ、1重量%未満が水層に含まれることが特に好ましい。 After phase separation occurs, the peptide is mainly contained in the organic layer, which further contains toluene, and optionally further contains the organic solvent 1. The upper organic layer containing the peptide is separated from the aqueous layer. After performing the extraction method of the present invention, it is preferable that more than 90% by weight of the peptide is contained in the organic layer and less than 10% by weight is contained in the aqueous layer. Even more preferably, after performing the extraction method of the present invention, more than 98% by weight of the total peptide is contained in the organic layer and less than 2% by weight is contained in the aqueous layer. After the extraction method of the present invention is carried out, it is particularly preferred that more than 99% by weight of the peptide is contained in the organic layer and less than 1% by weight is contained in the aqueous layer.
本発明の抽出方法によって、ペプチドカップリング反応により得られる粗反応混合物からペプチドを効率的に抽出することができる。有機層に対する極性非プロトン性溶媒の溶解性は水層に対するものよりも大幅に低い。したがって、抽出を行った後、ペプチドを含む有機層は極性非プロトン性溶媒をわずかな量しか含まない。 By the extraction method of the present invention, the peptide can be efficiently extracted from the crude reaction mixture obtained by the peptide coupling reaction. The solubility of the polar aprotic solvent in the organic layer is significantly lower than that in the aqueous layer. Thus, after extraction, the organic layer containing the peptide contains only a small amount of polar aprotic solvent.
本発明の抽出方法を実施後、極性非プロトン性溶媒全体の15体積%未満が有機層に含まれ、極性非プロトン性溶媒全体の85体積%より多くの極性非プロトン性溶媒が水層に含まれることが好ましい。さらに、本発明の抽出方法を実施後、極性非プロトン性溶媒全体の5体積%未満が有機層に含まれ、極性非プロトン性溶媒全体の95体積%より多くの極性非プロトン性溶媒が水層に含まれることがより好ましい。本発明の抽出方法を実施後、極性非プロトン性溶媒全体の2体積%未満が有機層に含まれ、極性非プロトン性溶媒全体の98体積%より多くの極性非プロトン性溶媒が水層に含まれることが特により好ましい。この条件を達成するために繰り返し抽出が必要となる場合がある。 After carrying out the extraction method of the present invention, less than 15% by volume of the whole polar aprotic solvent is contained in the organic layer, and more than 85% by volume of the whole polar aprotic solvent is contained in the aqueous layer. It is preferred that Furthermore, after performing the extraction method of the present invention, less than 5% by volume of the whole polar aprotic solvent is contained in the organic layer, and more than 95% by volume of the whole polar aprotic solvent is contained in the aqueous layer. It is more preferable that it is contained in. After performing the extraction method of the present invention, less than 2% by volume of the total polar aprotic solvent is contained in the organic layer, and more than 98% by volume of the total polar aprotic solvent is contained in the aqueous layer. It is particularly preferred that Repeated extraction may be required to achieve this condition.
重要なことには、本発明による抽出方法は、極性非プロトン性溶媒の大部分からペプチドを分離できるだけでなく、カップリング試薬(尿素、テトラフルオロホウ酸塩など)に由来する塩および副産物からもペプチドを分離することができる。ペプチドカップリング反応により得られる粗反応混合物にn−ヘプタンまたはジエチルエーテルなどの疎水性貧溶媒を添加してペプチドを直接沈殿させた場合、塩および副産物は通常除去することができない。さらに、これらの塩および副産物は、ペプチドの後処理に使用されるクロマトグラフィーカラムの性能を低下させることが知られている。調製したペプチドを医薬品有効成分として使用する場合、カラムクロマトグラフィーによりさらに精製することが必須とされる。 Importantly, the extraction method according to the present invention can not only separate peptides from the majority of polar aprotic solvents, but also from salts and by-products derived from coupling reagents (urea, tetrafluoroborate, etc.). Peptides can be separated. When a hydrophobic antisolvent such as n-heptane or diethyl ether is added to the crude reaction mixture obtained by the peptide coupling reaction to precipitate the peptide directly, salts and by-products cannot usually be removed. In addition, these salts and by-products are known to reduce the performance of chromatographic columns used for peptide workup. When the prepared peptide is used as an active pharmaceutical ingredient, it is essential to further purify by column chromatography.
したがって、ペプチドを沈殿させた後、必要に応じてカラムクロマトグラフィーで精製してもよい。ペプチドを医薬品有効成分として使用する場合、このような精製工程をさらに追加する。したがって、本発明による抽出方法は、反応混合物から直接沈殿させる方法よりも高純度のペプチドを単離することができる。 Therefore, the peptide may be precipitated and then purified by column chromatography as necessary. Such a purification step is further added when the peptide is used as an active pharmaceutical ingredient. Therefore, the extraction method according to the present invention can isolate peptides with higher purity than the method of directly precipitating from the reaction mixture.
本発明の抽出方法により得られる二相系の組成は、有機層と水層の間における、ペプチドおよび極性非プロトン性溶媒の分配係数に大きな影響を及ぼす。以下において比率は体積/体積比で示す。 The composition of the two-phase system obtained by the extraction method of the present invention greatly affects the partition coefficient of the peptide and the polar aprotic solvent between the organic layer and the aqueous layer. In the following, the ratio is expressed as a volume / volume ratio.
極性非プロトン性溶媒:トルエンの体積比は、1:20〜1:2の範囲であることが好ましい。この体積比は1:10〜1:2の範囲であることが好ましく、1:6〜1:3の範囲であることが特に好ましい。 The volume ratio of polar aprotic solvent: toluene is preferably in the range of 1:20 to 1: 2. The volume ratio is preferably in the range of 1:10 to 1: 2, particularly preferably in the range of 1: 6 to 1: 3.
トルエンおよび有機溶媒1の組み合わせに対するペプチドの溶解性は、トルエン単独に対するものよりも高いことが確認されている。したがって、使用する有機溶媒1の量が十分に多い場合、本発明の抽出方法において得られる有機層に対するペプチドの溶解性はとりわけ高い。極性非プロトン性溶媒:有機溶媒1の体積比は1:5〜30:1の範囲であることが好ましい。この体積比は1:3〜10:1の範囲であることが好ましく、1:1〜4:1の範囲であることが特に好ましい。 It has been confirmed that the solubility of the peptide in the combination of toluene and organic solvent 1 is higher than that in toluene alone. Therefore, when the amount of the organic solvent 1 used is sufficiently large, the solubility of the peptide in the organic layer obtained in the extraction method of the present invention is particularly high. The volume ratio of polar aprotic solvent: organic solvent 1 is preferably in the range of 1: 5 to 30: 1. This volume ratio is preferably in the range of 1: 3 to 10: 1, particularly preferably in the range of 1: 1 to 4: 1.
トルエン:有機溶媒1の体積比は50:1〜1:1の範囲であることが好ましい。この体積比は20:1〜2:1の範囲であることが好ましく、10:1〜2:1の範囲であることが特に好ましい。 The volume ratio of toluene: organic solvent 1 is preferably in the range of 50: 1 to 1: 1. This volume ratio is preferably in the range of 20: 1 to 2: 1, particularly preferably in the range of 10: 1 to 2: 1.
極性非プロトン性溶媒:水の体積比は、本発明の抽出方法の効率および水層に対するペプチドの溶解性に大きな影響を及ぼす。具体的には、二相系における極性非プロトン性溶媒:水の体積比が1:2より高い場合、すなわち、水層に含まれる極性非プロトン性溶媒が34体積%よりも多い場合、水層へのペプチドの溶解性はかなり高くなる。したがって、極性非プロトン性溶媒:水の体積比は1:20〜1:2の範囲であることが好ましい。この体積比は1:10〜1:3の範囲であることが好ましく、1:5〜1:3の範囲であることが特に好ましい。 The volume ratio of polar aprotic solvent: water greatly affects the efficiency of the extraction method of the present invention and the solubility of the peptide in the aqueous layer. Specifically, when the volume ratio of polar aprotic solvent: water in the two-phase system is higher than 1: 2, that is, when the amount of polar aprotic solvent contained in the aqueous layer is more than 34% by volume, the aqueous layer The solubility of the peptide in is considerably higher. Accordingly, the volume ratio of polar aprotic solvent: water is preferably in the range of 1:20 to 1: 2. This volume ratio is preferably in the range of 1:10 to 1: 3, particularly preferably in the range of 1: 5 to 1: 3.
ペプチドを含む混合物中の極性非プロトン性溶媒は、DMFおよびNMPからなる群から選択されることが好ましい。 The polar aprotic solvent in the mixture comprising the peptide is preferably selected from the group consisting of DMF and NMP.
したがって、トルエン単独および有機溶媒1と組み合わせたトルエンはいずれも本発明のペプチド抽出方法に特に適している。トルエンは容易に再利用可能で安価な溶媒であり、ヒトおよび水生生物に対して比較的毒性が低い。したがって、本発明は工業規模で有利に使用することができる。 Therefore, both toluene alone and toluene combined with organic solvent 1 are particularly suitable for the peptide extraction method of the present invention. Toluene is an easily reusable and inexpensive solvent and is relatively toxic to humans and aquatic organisms. Therefore, the present invention can be used advantageously on an industrial scale.
有機溶媒1が、n−ヘプタン、2−メチルテトラヒドロフラン、酢酸エチル(EtOAc)、酢酸イソプロピル、アセトニトリル(ACN)およびテトラヒドロフラン(THF)からなる群、より好ましくはEtOAc、酢酸イソプロピル、ACNおよびTHFからなる群、特に好ましくはACNおよびTHFからなる群から選択される場合、トルエンと有機溶媒1との組み合わせに対するペプチドの溶解性は特に高い。本発明のペプチド抽出方法の特に好ましい実施形態においては、有機溶媒1はACNおよびTHFからなる群から選択される。 Organic solvent 1 is a group consisting of n-heptane, 2-methyltetrahydrofuran, ethyl acetate (EtOAc), isopropyl acetate, acetonitrile (ACN) and tetrahydrofuran (THF), more preferably a group consisting of EtOAc, isopropyl acetate, ACN and THF In particular, when selected from the group consisting of ACN and THF, the solubility of the peptide in the combination of toluene and organic solvent 1 is particularly high. In a particularly preferred embodiment of the peptide extraction method of the invention, the organic solvent 1 is selected from the group consisting of ACN and THF.
本発明のペプチド抽出方法において使用される成分a2)は、水のみからなっていてもよい。しかしながら、成分a2)が少なくとも1種の無機塩類をさらに含んでいる場合、成分a2)とトルエンとの混和性および成分a2)と有機溶媒1との混和性、すなわち水層へのペプチドの溶解性を大幅に低下させることができる。さらに、成分a2)が少なくとも1種の無機塩類を含んでいる場合、有機層中の水の含有量は低下する。 Component a2) used in the peptide extraction method of the present invention may consist only of water. However, when component a2) further comprises at least one inorganic salt, the miscibility of component a2) with toluene and the miscibility of component a2) with organic solvent 1, ie the solubility of the peptide in the aqueous layer Can be greatly reduced. Furthermore, when component a2) contains at least one inorganic salt, the water content in the organic layer is reduced.
好ましい一実施形態においては、成分a2)は、塩化ナトリウム、硫酸水素ナトリウム、硫酸水素カリウム、炭酸水素ナトリウムおよびリン酸水素ナトリウムからなる群から選択される少なくとも1種の無機塩類を含んでいる。別の実施形態では、成分a2)は酸などの他の化合物をさらに含む。 In a preferred embodiment, component a2) comprises at least one inorganic salt selected from the group consisting of sodium chloride, sodium hydrogen sulfate, potassium hydrogen sulfate, sodium hydrogen carbonate and sodium hydrogen phosphate. In another embodiment, component a2) further comprises other compounds such as acids.
具体的には、成分a2)は、pH2〜11の範囲において、緩衝剤として作用しない無機塩類を含んでいてもよい。そのような無機塩類を添加すると、水層へのペプチドの溶解性を低下させることができ、本発明の抽出方法において相分離に必要とされる時間を短縮させることができる。たとえば、成分a2)は塩化ナトリウムまたは硫酸ナトリウムを含んでいてもよい。成分a2)中に含まれる無機塩類の濃度は、1〜20重量%の範囲であることが好ましく、5〜15重量%の範囲であることがより好ましい。塩化ナトリウムのような塩は二相分離を促進するために使用され、緩衝剤として作用する塩は水層中の酸または塩基を選択的に抽出するために使用される。 Specifically, component a2) may contain inorganic salts that do not act as buffers in the range of pH 2-11. When such inorganic salts are added, the solubility of the peptide in the aqueous layer can be reduced, and the time required for phase separation in the extraction method of the present invention can be shortened. For example, component a2) may contain sodium chloride or sodium sulfate. The concentration of inorganic salts contained in component a2) is preferably in the range of 1 to 20% by weight, more preferably in the range of 5 to 15% by weight. Salts such as sodium chloride are used to promote two-phase separation, and salts that act as buffers are used to selectively extract acids or bases in the aqueous layer.
成分a2)のpHは、水層へのペプチドの溶解性およびいくつかの不純物の溶解性に大きな影響を及ぼす。さらに、成分a2)のpHは、ペプチドの化学的安定性およびその保護基(PG)の化学的安定性に応じて選択される。本発明の抽出方法において、ペプチドカップリング反応に使用した第三級塩基の大部分が水層中に含まれるように、成分a2)のpHは2〜11の範囲であることが好ましく、5〜8の範囲であることが特に好ましい。成分a2)のpHは、酸または塩基を添加することによって、かつ/または緩衝剤を使用することによって調整することができる。 The pH of component a2) has a great influence on the solubility of the peptide in the aqueous layer and the solubility of some impurities. Furthermore, the pH of component a2) is selected according to the chemical stability of the peptide and the chemical stability of its protecting group (PG). In the extraction method of the present invention, the pH of component a2) is preferably in the range of 2-11 so that most of the tertiary base used in the peptide coupling reaction is contained in the aqueous layer. A range of 8 is particularly preferred. The pH of component a2) can be adjusted by adding acids or bases and / or by using buffers.
成分a2)のpHの調整に使用することができる酸は、成分a2)に含まれる該酸が本発明のペプチド抽出方法を阻害せず、かつペプチドの分解を引き起こさないものであれば特に限定されず自由に選択することができる。たとえば、硫酸、塩酸、リン酸、トリフルオロ酢酸およびクエン酸などのブレンステッド酸をこの目的のために使用することができる。 The acid that can be used for adjusting the pH of component a2) is not particularly limited as long as the acid contained in component a2) does not inhibit the peptide extraction method of the present invention and does not cause peptide degradation. You can choose freely. For example, Bronsted acids such as sulfuric acid, hydrochloric acid, phosphoric acid, trifluoroacetic acid and citric acid can be used for this purpose.
成分a2)のpHの調整に使用することができる塩基は、成分a2)に含まれる該塩基が本発明のペプチド抽出方法を阻害せず、かつペプチドの分解を引き起こさないものであれば特に限定されず自由に選択することができる。たとえば、水酸化ナトリウム、水酸化カリウムおよび水酸化リチウムなどのアルカリ金属の水酸化物は、成分a2)のpHを調整するのに適している。 The base that can be used for adjusting the pH of component a2) is not particularly limited as long as the base contained in component a2) does not inhibit the peptide extraction method of the present invention and does not cause degradation of the peptide. You can choose freely. For example, alkali metal hydroxides such as sodium hydroxide, potassium hydroxide and lithium hydroxide are suitable for adjusting the pH of component a2).
本発明の抽出方法において水層のpHが所望の範囲内に維持されるように、成分a2)は緩衝剤を含むことが好ましい。緩衝剤は、塩化アンモニウム、硫酸水素ナトリウム、硫酸水素カリウム、炭酸水素ナトリウム、炭酸ナトリウム、リン酸水素ナトリウム、リン酸二水素ナトリウムおよびリン酸ナトリウムからなる群から選択されることが好ましい。成分a2)に含まれる緩衝剤の濃度は、1〜10重量%の範囲が好ましく、3〜8重量%の範囲がさらにより好ましい。 In order to maintain the pH of the aqueous layer within a desired range in the extraction method of the present invention, the component a2) preferably contains a buffer. The buffer is preferably selected from the group consisting of ammonium chloride, sodium hydrogen sulfate, potassium hydrogen sulfate, sodium hydrogen carbonate, sodium carbonate, sodium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate and sodium phosphate. The concentration of the buffer contained in component a2) is preferably in the range of 1 to 10% by weight, and more preferably in the range of 3 to 8% by weight.
必要に応じて、ペプチドを含む得られた有機層はさらに水溶液で少なくとも1回洗浄してもよい。この目的に使用する水溶液のpHは2〜11の範囲であることが好ましい。 If necessary, the obtained organic layer containing the peptide may be further washed with an aqueous solution at least once. The pH of the aqueous solution used for this purpose is preferably in the range of 2-11.
ペプチドカップリング反応の条件および使用する試薬によっては、有機層は、遊離の第1級、第2級または第3級アミノ基を有する化合物、たとえば保護されていないN末端アミノ基を有するペプチドまたは第三級塩基を不純物として含みうる。このような場合、pH2〜7の水溶液で有機層を洗浄することが好ましい。 Depending on the conditions of the peptide coupling reaction and the reagents used, the organic layer may be a compound having a free primary, secondary or tertiary amino group, such as a peptide having an unprotected N-terminal amino group or A tertiary base may be included as an impurity. In such a case, it is preferable to wash the organic layer with an aqueous solution of pH 2-7.
また、有機層が、遊離のカルボン酸基を有する化合物、たとえば保護されていないC末端カルボン酸基を有するペプチドを含む場合もある。このような場合は、pH7〜11の水溶液で有機層を洗浄することが好ましい。 The organic layer may also contain a compound having a free carboxylic acid group, such as a peptide having an unprotected C-terminal carboxylic acid group. In such a case, it is preferable to wash the organic layer with an aqueous solution having a pH of 7 to 11.
本発明のペプチド抽出方法を実施するのに好ましい温度(以下「抽出温度」と呼ぶ)は、使用する溶媒の選択およびペプチドの特性に左右される。抽出温度は、使用する溶媒の混和性、ならびに有機層および水層に対するペプチドの溶解性に大きな影響を及ぼす。したがって、本発明の抽出方法において二相系が形成され、かつ有機層に対するペプチドの溶解性が十分に高くなるように抽出温度を選択する。本発明のペプチド抽出方法は、0〜60℃の抽出温度において行うことが好ましい。抽出温度は20〜30℃の範囲であることが特に好ましい。 The preferred temperature for carrying out the peptide extraction method of the present invention (hereinafter referred to as “extraction temperature”) depends on the choice of the solvent used and the characteristics of the peptide. The extraction temperature greatly affects the miscibility of the solvent used and the solubility of the peptide in the organic and aqueous layers. Therefore, the extraction temperature is selected so that a two-phase system is formed in the extraction method of the present invention and the solubility of the peptide in the organic layer is sufficiently high. The peptide extraction method of the present invention is preferably performed at an extraction temperature of 0 to 60 ° C. The extraction temperature is particularly preferably in the range of 20-30 ° C.
ペプチドカップリング反応の条件および使用するカップリング試薬によっては、本発明の抽出方法を実施する前および/または実施している最中に固形物が形成されることがある。たとえば、カルボジイミドをカップリング試薬として使用する場合がこれに当てはまる。このため、ペプチドを含む混合物、極性非プロトン性溶媒、トルエン、(必要に応じて有機溶媒1)、および成分a2)を混合することにより得られる二相系の濾過が必要となる場合がある。したがって、本発明の一実施形態では、ペプチドを含む有機層を分離する前に二相系の濾過を行う。 Depending on the conditions of the peptide coupling reaction and the coupling reagent used, solids may be formed before and / or during the extraction method of the present invention. This is the case, for example, when carbodiimide is used as a coupling reagent. This may require a two-phase filtration obtained by mixing the peptide-containing mixture, polar aprotic solvent, toluene, (optional organic solvent 1), and component a2). Accordingly, in one embodiment of the present invention, a two-phase filtration is performed before separating the organic layer containing the peptide.
本発明の抽出方法によって抽出されるペプチドはどのようなペプチドであってもよい。本発明の抽出方法によって抽出されるペプチドは100個以下のアミノ酸残基を含むことが好ましく、50個以下のアミノ酸残基を含むことがより好ましく、20個以下のアミノ酸残基を含むことが最も好ましい。該ペプチドのアミノ酸は、D−α−アミノ酸および/またはL−α−アミノ酸、β−アミノ酸であってもよく、少なくとも1個の第1級および/または第2級アミノ基と少なくとも1個のカルボン酸基とを含む他の有機化合物であってもよい。アミノ酸はα−アミノ酸であることが好ましく、L−α−アミノ酸であることがさらにより好ましく、これらの中でもタンパク質を構成するアミノ酸が特に好ましい。 The peptide extracted by the extraction method of the present invention may be any peptide. The peptide extracted by the extraction method of the present invention preferably contains 100 amino acid residues or less, more preferably contains 50 amino acid residues or less, and most preferably contains 20 amino acid residues or less. preferable. The amino acids of the peptide may be D-α-amino acids and / or L-α-amino acids, β-amino acids, at least one primary and / or secondary amino group and at least one carboxylic acid. Other organic compounds containing an acid group may be used. The amino acid is preferably an α-amino acid, more preferably an L-α-amino acid, and among these, an amino acid constituting a protein is particularly preferable.
ペプチドの調製
本発明の別の態様は、液相におけるペプチドの調製方法であって、
aa)カップリング試薬および必要に応じて第三級塩基の存在下において、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミドおよびN−メチル−2−ピロリドンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒中でペプチドカップリング反応を行う工程;
bb)得られたペプチドを上記の方法によって抽出する工程;ならびに
cc)工程bb)において得られた有機層の少なくとも一部を蒸発させる工程
を含む方法に関する。
Peptide Preparation Another aspect of the present invention is a method for preparing a peptide in a liquid phase comprising:
aa) Polar aprotic selected from the group consisting of N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide and N-methyl-2-pyrrolidone in the presence of a coupling reagent and optionally a tertiary base Performing a peptide coupling reaction in an acidic solvent;
bb) extracting the obtained peptide by the above method; and cc) evaporating at least part of the organic layer obtained in step bb).
工程aa)のペプチドカップリング反応のための出発材料として、部分的に保護された2つのアミノ酸の組み合わせ、部分的に保護された2つのペプチドの組み合わせ、または部分的に保護されたアミノ酸1つと部分的に保護されたペプチド1つの組み合わせが使用される。 As starting material for the peptide coupling reaction of step aa), a combination of two partially protected amino acids, a combination of two partially protected peptides, or a partially protected amino acid and one A single protected peptide combination is used.
本発明による液相ペプチド調製方法は、液相ペプチド合成(LPPS)に非常に適している。本発明の一実施形態では、工程aa)のペプチドカップリング反応において、SPPSにより調製され部分的に保護された2つのペプチドの組み合わせが使用される。したがって、本発明の方法はペプチド断片のカップリングを行うことができ、SPPSと組み合わせて使用することができる。 The liquid phase peptide preparation method according to the present invention is very suitable for liquid phase peptide synthesis (LPPS). In one embodiment of the invention, a combination of two peptides prepared by SPPS and partially protected is used in the peptide coupling reaction of step aa). Therefore, the method of the present invention can couple peptide fragments and can be used in combination with SPPS.
工程aa)のペプチドカップリング反応は、ペプチドカップリング反応に通常用いられる慣用の反応条件および試薬を使用して行う。 The peptide coupling reaction in step aa) is performed using conventional reaction conditions and reagents usually used for peptide coupling reactions.
ペプチドカップリング反応は、極性非プロトン性溶媒中において1以上のカップリング試薬を使用することにより従来実施されており、好ましくは1以上のカップリング添加剤の存在下、好ましくは1以上の第三級塩基の存在下で実施される。 Peptide coupling reactions are conventionally performed by using one or more coupling reagents in a polar aprotic solvent, preferably in the presence of one or more coupling additives, preferably one or more thirds. Performed in the presence of a secondary base.
ペプチドカップリング反応に使用されるカップリング試薬は、ペプチドカップリング反応条件下において極性非プロトン性溶媒と反応しないものであり、かつ活性カルボン酸基に隣接した立体中心のエピマー化が実質的に起こらないものが選択される。したがって、カップリング試薬としては、O−1H−ベンゾトリアゾールのホスホニウム塩またはウロニウム塩およびカルボジイミドカップリング試薬が好ましい。 Coupling reagents used for peptide coupling reactions are those that do not react with polar aprotic solvents under peptide coupling reaction conditions and substantially undergo epimerization of the stereocenter adjacent to the active carboxylic acid group. The one that does not exist is selected. Therefore, as the coupling reagent, O-1H-benzotriazole phosphonium salt or uronium salt and carbodiimide coupling reagent are preferable.
上記ホスホニウム塩およびウロニウム塩は、BOP(ベンゾトリアゾール−1−イル−オキシ−トリス−(ジメチルアミノ)−ホスホニウムヘキサフルオロホスファート)、PyBOP(ベンゾトリアゾール−1−イル−オキシ−トリスピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスファート)、HBTU(O−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート)、HCTU(O−(1H−6−クロロ−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート)、TCTU(O−(1H−6−クロロベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート)、HATU(O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート)、TATU(O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート)、TBTU(O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート)、TOTU(O−[シアノ(エトキシカルボニル)メチレンアミノ]−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラート)、HAPyU(O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)オキシビス−(ピロリジノ)−ウロニウムヘキサフルオロホスファート)、PyAOP(ベンゾトリアゾール−1−イル−オキシ−トリス−ピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスファート)、COMU(1−[(1−(シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデンアミノオキシ)−ジメチルアミノ−モルホリノメチレン)]−メタンアミニウムヘキサフルオロホスファート)、PyClock(6−クロロ−ベンゾトリアゾール−1−イル−オキシ−トリス−ピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスファート)、PyOxP(O−[(1−シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデン)アミノ]−オキシトリ(ピロリジン−1−イル)−ホスホニウムヘキサフルオロホスファート)、およびPyOxB(O−[(1−シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデン)アミノ]−オキシトリ(ピロリジン−1−イル)−ホスホニウムテトラフルオロボラート)からなる群から選択されることが好ましい。 The phosphonium salts and uronium salts are BOP (benzotriazol-1-yl-oxy-tris- (dimethylamino) -phosphonium hexafluorophosphate), PyBOP (benzotriazol-1-yl-oxy-trispyrrolidinophosphonium hexafluoro). Phosphate), HBTU (O- (1H-benzotriazol-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophosphate), HCTU (O- (1H-6-chloro-benzotriazole) -1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophosphate), TCTU (O- (1H-6-chlorobenzotriazol-1-yl) -1,1,3,3- Tetramethyluronium tetrafluoroborate), HATU (O- (7-azabenzotriazol-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophos ), TATU (O- (7-azabenzotriazol-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate), TBTU (O- (benzotriazol-1-yl)- 1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate), TOTU (O- [cyano (ethoxycarbonyl) methyleneamino] -1,1,3,3-tetramethyluronium tetrafluoroborate), HAPyU (O- (benzotriazol-1-yl) oxybis- (pyrrolidino) -uronium hexafluorophosphate), PyAOP (benzotriazol-1-yl-oxy-tris-pyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate), COMU ( 1-[(1- (Cyano-2-ethoxy-2-oxoethylideneaminooxy) -dimethylamino-morpholinomethylene)]-methanaminium hexafluoro Phosphate), PyClock (6-chloro-benzotriazol-1-yl-oxy-tris-pyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate), PyOxP (O-[(1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidene) amino] -Oxytri (pyrrolidin-1-yl) -phosphonium hexafluorophosphate), and PyOxB (O-[(1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidene) amino] -oxytri (pyrrolidin-1-yl) -phosphonium It is preferably selected from the group consisting of (tetrafluoroborate).
ホスホニウムカップリング試薬またはウロニウムカップリング試薬から選択される好ましいカップリング試薬はTBTU、TOTUおよびPyBOPである。 Preferred coupling reagents selected from phosphonium coupling reagents or uronium coupling reagents are TBTU, TOTU and PyBOP.
カルボジイミドカップリング試薬は、ジイソプロピル−カルボジイミド(DIC)、ジシクロヘキシル−カルボジイミド(DCC)、および水溶性カルボジイミド(WSCDI)(たとえば1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド(EDC)など)からなる群から選択されることが好ましい。 Carbodiimide coupling reagents are from diisopropyl-carbodiimide (DIC), dicyclohexyl-carbodiimide (DCC), and water-soluble carbodiimide (WSCDI) (such as 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) -carbodiimide (EDC), etc.) Is preferably selected from the group consisting of
水溶性カルボジイミドはカルボジイミドカップリング試薬として特に好ましく、水溶性カルボジイミドのうちEDCが最も好ましい。 Water-soluble carbodiimide is particularly preferable as a carbodiimide coupling reagent, and EDC is most preferable among water-soluble carbodiimides.
ペプチドカップリング反応で使用される第三級塩基は、ペプチドおよびカップリング試薬と適合することが好ましく、本発明の抽出方法を阻害するような界面活性剤としての作用を持たないことが好ましい。 The tertiary base used in the peptide coupling reaction is preferably compatible with the peptide and the coupling reagent, and preferably does not act as a surfactant that inhibits the extraction method of the present invention.
ペプチドカップリング反応で使用される第三級塩基の共役酸のpKaは7.5〜15が好ましく、7.5〜10がより好ましい。第三級塩基は、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)およびトリエチルアミン(TEA)などのトリアルキルアミン、N,N−ジエチルアニリンなどのN,N−ジ−C1-4アルキルアニリン、コリジン(2,4,6−トリメチルピリジン)などの2,4,6−トリ−C1-4アルキルピリジン、ならびにN−メチルモルホリンなどのN−C1-4アルキルモルホリン(C1-4アルキルはそれぞれ独立して同一でも異なっていてもよい直鎖または分岐鎖C1-4アルキル)からなる群から選択されることが好ましい。ペプチドカップリング反応に使用される第三級塩基として、DIPEA、TEAおよびN−メチルモルホリンが特に好ましい。 The pKa of the tertiary base conjugate acid used in the peptide coupling reaction is preferably 7.5 to 15, and more preferably 7.5 to 10. Tertiary bases include trialkylamines such as N, N-diisopropylethylamine (DIPEA) and triethylamine (TEA), N, N-di-C 1-4 alkylanilines such as N, N-diethylaniline, collidine (2 2,4,6-tri-C 1-4 alkyl pyridine such as 4,4,6-trimethylpyridine) and N—C 1-4 alkyl morpholine such as N-methylmorpholine (C 1-4 alkyl) are independent of each other. Are preferably selected from the group consisting of linear or branched C 1-4 alkyl, which may be the same or different. As the tertiary base used in the peptide coupling reaction, DIPEA, TEA and N-methylmorpholine are particularly preferable.
カップリング添加剤は、活性化エステルを形成する求核性ヒドロキシ化合物であることが好ましく、この化合物は酸性求核性N−ヒドロキシ基(Nはイミド、またはN−アシルもしくはN−アリール置換トリアゼノである)を有していることがより好ましく、トリアゼノ型カップリング添加剤は、N−ヒドロキシベンゾトリアゾール誘導体(もしくは1−ヒドロキシベンゾトリアゾール誘導体)またはN−ヒドロキシベンゾトリアジン誘導体であることが好ましい。このようなカップリング添加剤はWO94/07910およびEP 0 410 182に記載されている。 The coupling additive is preferably a nucleophilic hydroxy compound that forms an activated ester, which is an acidic nucleophilic N-hydroxy group (N is an imide, or an N-acyl or N-aryl substituted triazeno). The triazeno-type coupling additive is preferably an N-hydroxybenzotriazole derivative (or 1-hydroxybenzotriazole derivative) or an N-hydroxybenzotriazine derivative. Such coupling additives are described in WO94 / 07910 and EP 0 410 182.
好ましいカップリング添加剤は、N−ヒドロキシスクシンイミド(HOSu)、6−クロロ−1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(Cl-HOBt)、N−ヒドロキシ−3,4−ジヒドロ−4−オキソ−1,2,3−ベンゾトリアジン(HOOBt)、1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(HOAt)、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)およびエチル−2−シアノ−2−ヒドロキシイミノアセタート(CHA)からなる群から選択される。CHAはOXYMAPURE(登録商標)の商品名で入手可能である。CHAは、ベンゾトリアゾールベースのカップリング添加剤と比較して活性カルボン酸の立体中心のエピマー化をより抑制することから、効果的なカップリング添加剤であることが判明している。さらに、CHAはたとえばHOBtまたはCl-HOBtよりも爆発性が低いため取り扱いが容易であり、また、カップリング反応の進行を反応混合物の色変化によって視覚的にモニタリングすることができるというさらなる利点を有する。カップリング添加剤としてHOBtをペプチドカップリング反応に使用することが好ましい。 Preferred coupling additives are N-hydroxysuccinimide (HOSu), 6-chloro-1-hydroxybenzotriazole (Cl-HOBt), N-hydroxy-3,4-dihydro-4-oxo-1,2,3- Selected from the group consisting of benzotriazine (HOOBt), 1-hydroxy-7-azabenzotriazole (HOAt), 1-hydroxybenzotriazole (HOBt) and ethyl-2-cyano-2-hydroxyiminoacetate (CHA) . CHA is available under the trade name OXYMAPURE®. CHA has been found to be an effective coupling additive because it more suppresses the epimerization of the stereocenter of the active carboxylic acid compared to benzotriazole-based coupling additives. In addition, CHA is easier to handle because it is less explosive than, for example, HOBt or Cl-HOBt, and has the additional advantage that the progress of the coupling reaction can be visually monitored by the color change of the reaction mixture. . It is preferred to use HOBt as a coupling additive in the peptide coupling reaction.
本発明の好ましい実施形態では、ペプチドカップリング反応における試薬の組み合わせは、TBTU/HOBt/DIPEA、PyBOP/TEA、EDC/HOBtおよびEDC/HOBt/DIPEAからなる群から選択される。 In a preferred embodiment of the invention, the combination of reagents in the peptide coupling reaction is selected from the group consisting of TBTU / HOBt / DIPEA, PyBOP / TEA, EDC / HOBt and EDC / HOBt / DIPEA.
ペプチドカップリング反応の反応溶媒は、DMF、DMA、NMPおよびこれらの混合物からなる群から選択される。ペプチドカップリング反応に使用するのに特に好ましい反応溶媒は、DMFおよびNMPからなる群から選択される。 The reaction solvent for the peptide coupling reaction is selected from the group consisting of DMF, DMA, NMP, and mixtures thereof. Particularly preferred reaction solvents for use in the peptide coupling reaction are selected from the group consisting of DMF and NMP.
反応溶媒は実質的に水を含まないことが好ましい。反応溶媒中の水の含有量は1重量%未満であることが好ましく、0.1重量%未満であることがより好ましく、0.01重量%未満であることがさらにより好ましく、0.001重量%未満であることが特に好ましい。溶媒中の水の含有量は、従来技術において公知の標準試験法ASTM E203-8に従いカールフィッシャー滴定法によって決定することができる。 The reaction solvent is preferably substantially free of water. The water content in the reaction solvent is preferably less than 1% by weight, more preferably less than 0.1% by weight, even more preferably less than 0.01% by weight, and 0.001% by weight. It is particularly preferred that it is less than%. The water content in the solvent can be determined by Karl Fischer titration according to standard test method ASTM E203-8 known in the prior art.
ペプチドカップリング反応の反応溶媒は、第1級アミン、第2級アミン、カルボン酸および脂肪族アルコールからなる群から選択される不純物を実質的に含まないことが好ましい。準化学量論量または化学量論量で使用されるいずれの出発材料においても、ペプチドカップリング反応中にこれらの不純物との望ましくない反応を起こす割合が1mol%未満であれば、ペプチドカップリング反応の反応溶媒はこれらの不純物を実質的に含まないと見なされる。 It is preferable that the reaction solvent for the peptide coupling reaction does not substantially contain impurities selected from the group consisting of primary amines, secondary amines, carboxylic acids and aliphatic alcohols. In any starting material used in substoichiometric or stoichiometric amounts, the peptide coupling reaction is less than 1 mol% that causes an undesirable reaction with these impurities during the peptide coupling reaction. The reaction solvent is considered to be substantially free of these impurities.
適切な反応温度は、使用するカップリング試薬およびペプチドの安定性に応じて選択される。ペプチドカップリング反応を行う反応温度は、−15℃〜50℃であることが好ましく、−10℃〜30℃であることがより好ましく、0℃〜25℃であることがさらに好ましい。 The appropriate reaction temperature is selected depending on the coupling reagent used and the stability of the peptide. The reaction temperature for performing the peptide coupling reaction is preferably -15 ° C to 50 ° C, more preferably -10 ° C to 30 ° C, and further preferably 0 ° C to 25 ° C.
ペプチドカップリング反応は大気圧において行うことが好ましい。しかしながら、大気圧よりも高いまたはわずかに低い圧力下でペプチドカップリング反応を行うことも可能である。 The peptide coupling reaction is preferably performed at atmospheric pressure. However, it is also possible to carry out the peptide coupling reaction under pressures above or slightly below atmospheric pressure.
ペプチドカップリング反応は周囲雰囲気下で行うことが好ましい。しかしながら、窒素およびアルゴンなどの保護ガス雰囲気下も好ましい。 The peptide coupling reaction is preferably performed in an ambient atmosphere. However, a protective gas atmosphere such as nitrogen and argon is also preferable.
本願において「反応時間」は、反応による変換が実質的に完了するのに必要とされる時間を指す。準化学量論量または化学量論量で使用される出発材料の量が最初の量の5mol%未満、好ましくは最初の量の2mol%未満に減少すれば、反応による変換が実質的に完了したと見なされる。反応の進行は当技術分野で公知の分析法を用いてモニタリングすることができ、たとえば、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)分析、薄層クロマトグラフィー(TLC)、質量分析(MS)またはHPLC-MSを用いることができ、この目的に対してはHPLCが特に好ましい。 As used herein, “reaction time” refers to the time required for the conversion by reaction to be substantially complete. If the amount of starting material used in substoichiometric or stoichiometric amounts is reduced to less than 5 mol% of the initial amount, preferably less than 2 mol% of the initial amount, the conversion by reaction is substantially complete. Is considered. The progress of the reaction can be monitored using analytical methods known in the art, such as high performance liquid chromatography (HPLC) analysis, thin layer chromatography (TLC), mass spectrometry (MS) or HPLC-MS. HPLC is particularly preferred for this purpose.
ペプチドカップリング反応の反応時間は15分〜20時間の範囲であることが好ましく、30分〜5時間の範囲がより好ましく、30分〜2時間の範囲がさらにより好ましい。 The reaction time of the peptide coupling reaction is preferably in the range of 15 minutes to 20 hours, more preferably in the range of 30 minutes to 5 hours, and still more preferably in the range of 30 minutes to 2 hours.
ペプチドカップリング反応の反応条件の説明における「部」は、ペプチドカップリング反応の出発材料として使用されるペプチドおよび/またはアミノ酸の総重量に対する割合を意味する。反応溶媒の使用量は、1〜30部が好ましく、5〜10部がより好ましい。 “Part” in the description of the reaction conditions for the peptide coupling reaction means the ratio of the peptide and / or amino acid used as the starting material for the peptide coupling reaction to the total weight. The amount of reaction solvent used is preferably 1-30 parts, more preferably 5-10 parts.
カップリング試薬の使用量は、反応性C末端カルボン酸基に対して0.9〜5モル当量が好ましく、1〜1.5モル当量がより好ましい。 The amount of the coupling reagent used is preferably 0.9 to 5 molar equivalents, more preferably 1 to 1.5 molar equivalents with respect to the reactive C-terminal carboxylic acid group.
カップリング添加剤の使用量は、カップリング試薬に対して0.1〜5モル当量が好ましく、0.5〜1.5モル当量がより好ましい。 0.1-5 molar equivalent is preferable with respect to a coupling reagent, and, as for the usage-amount of a coupling additive, 0.5-1.5 molar equivalent is more preferable.
第三級塩基の使用量は、カップリング試薬に対して1〜10モル当量が好ましく、2〜3モル当量がより好ましい。 1-10 molar equivalent is preferable with respect to a coupling reagent, and, as for the usage-amount of a tertiary base, 2-3 molar equivalent is more preferable.
本発明の液相ペプチド調製方法により、あらゆるペプチドを得ることができる。 Any peptide can be obtained by the liquid phase peptide preparation method of the present invention.
本発明の液相ペプチド調製方法により得られるペプチドは、100個以下のアミノ酸残基を含むことが好ましく、50個以下のアミノ酸残基を含むことがより好ましく、20個以下のアミノ酸残基を含むことが最も好ましい。該ペプチドのアミノ酸は、D−α−アミノ酸、L−α−アミノ酸、またはβ−アミノ酸であってもよく、少なくとも1個の第1級および/または第2級アミノ基と少なくとも1個のカルボン酸基とを含む他の有機化合物であってもよい。本発明の液相ペプチド調製方法により得られるペプチドのアミノ酸はα−アミノ酸であることが好ましく、L−α−アミノ酸であることがさらにより好ましく、これらの中でもタンパク質を構成するアミノ酸が特に好ましい。 The peptide obtained by the liquid phase peptide preparation method of the present invention preferably contains 100 amino acid residues or less, more preferably contains 50 amino acid residues or less, and contains 20 amino acid residues or less. Most preferred. The amino acid of the peptide may be a D-α-amino acid, an L-α-amino acid, or a β-amino acid, at least one primary and / or secondary amino group and at least one carboxylic acid Other organic compounds containing a group may be used. The amino acid of the peptide obtained by the liquid phase peptide preparation method of the present invention is preferably an α-amino acid, more preferably an L-α-amino acid, and among these, an amino acid constituting a protein is particularly preferable.
抽出工程の後、ペプチドを含む有機層を部分的に蒸発させることが好ましい。したがって、本願において、このようにして得られた有機層を「部分的に蒸発させた有機層」と呼ぶ。部分的な蒸発を行う温度は特に限定されず、ペプチドの熱安定性、およびトルエンの特性またはトルエンと有機溶媒1との混合物の特性に応じて選択される。有機層の部分的な蒸発は30〜50℃の温度で行うことが好ましい。必要に応じて、有機層の部分的な蒸発は20〜1000mbar(20〜1000hPa)の減圧下、好ましくは50〜200mbar(50〜200hPa)の減圧下で行う。当業者であれば、有機層の部分的な蒸発を行う圧力は蒸発操作を行う所望の温度に応じて調整することが好ましいことは理解できるであろう。 After the extraction step, the organic layer containing the peptide is preferably partially evaporated. Therefore, in the present application, the organic layer thus obtained is referred to as a “partially evaporated organic layer”. The temperature at which the partial evaporation is performed is not particularly limited, and is selected depending on the thermal stability of the peptide and the characteristics of toluene or the characteristics of the mixture of toluene and organic solvent 1. The partial evaporation of the organic layer is preferably performed at a temperature of 30 to 50 ° C. If necessary, the partial evaporation of the organic layer is carried out under reduced pressure of 20 to 1000 mbar (20 to 1000 hPa), preferably under reduced pressure of 50 to 200 mbar (50 to 200 hPa). One skilled in the art will appreciate that the pressure at which the organic layer is partially evaporated is preferably adjusted according to the desired temperature at which the evaporation operation is performed.
トルエンおよび有機溶媒1は十分な揮発性を有するため、ペプチドを含む有機層の部分的な蒸発は容易に実施することができる。 Since toluene and organic solvent 1 have sufficient volatility, partial evaporation of the organic layer containing the peptide can be easily performed.
本発明の一実施形態では、ペプチドを含む有機層を直接、蒸発乾固させ、残った残渣をトルエンでも有機溶媒1でもない溶媒中に溶解する。しかしながら、ペプチドを含む有機層がMeTHFおよびTHFからなる群から選択される溶媒を30体積%よりも多く含んでいる場合、安全上の理由により完全に蒸発乾固させないことが好ましい。その代わり、ペプチドを含む有機層を部分的に蒸発させ、トルエンを添加してから蒸発乾固を行うことが可能である。 In one embodiment of the present invention, the organic layer containing the peptide is directly evaporated to dryness and the remaining residue is dissolved in a solvent other than toluene or organic solvent 1. However, when the organic layer containing the peptide contains more than 30% by volume of a solvent selected from the group consisting of MeTHF and THF, it is preferable not to evaporate and dry completely for safety reasons. Instead, it is possible to evaporate to dryness after partially evaporating the organic layer containing the peptide and adding toluene.
有機層中に含まれるトルエンは水との共沸混合物を形成するので、ペプチドを含む有機層中に微量に存在する水は有機層を部分的に蒸発させる工程において効果的に除去される。 Since toluene contained in the organic layer forms an azeotrope with water, water present in a trace amount in the organic layer containing the peptide is effectively removed in the step of partially evaporating the organic layer.
好ましい一実施形態では、部分的に蒸発させた有機層と有機溶媒2とを混合することによってペプチドの大部分が沈殿する。 In a preferred embodiment, the majority of the peptide is precipitated by mixing the partially evaporated organic layer and the organic solvent 2.
本発明の別の好ましい実施形態では、ペプチドを含む有機層を蒸発乾固させ、残った残渣をトルエンでも有機溶媒1でもない溶媒中に溶解する。次いで、得られた溶液を有機溶媒2と混合することによってペプチドを沈殿させる。 In another preferred embodiment of the invention, the organic layer containing the peptide is evaporated to dryness and the remaining residue is dissolved in a solvent that is neither toluene nor organic solvent 1. The resulting solution is then mixed with the organic solvent 2 to precipitate the peptide.
部分的に蒸発させた有機層:ペプチドを沈殿させるために使用される有機溶媒2の体積比は、沈殿工程の完全性および沈殿させたペプチドの特性に大きな影響を及ぼす。以下において比率は体積/体積比で示す。 The volume ratio of partially evaporated organic layer: organic solvent 2 used to precipitate the peptide has a significant effect on the integrity of the precipitation process and the properties of the precipitated peptide. In the following, the ratio is expressed as a volume / volume ratio.
部分的に蒸発させた有機層:有機溶媒2の体積比は、1:20〜1:1の範囲であることが好ましい。この体積比は1:12〜1:2の範囲であることが好ましく、1:6〜1:3の範囲であることが特に好ましい。 The volume ratio of the partially evaporated organic layer: organic solvent 2 is preferably in the range of 1:20 to 1: 1. This volume ratio is preferably in the range of 1:12 to 1: 2, particularly preferably in the range of 1: 6 to 1: 3.
有機溶媒2は、大気圧における沸点が160℃未満の有機溶媒から選択されることが好ましい。有機溶媒2に対するペプチドの溶解性は、トルエンに対する溶解性および/またはトルエンと有機溶媒1との混合物に対する溶解性よりも低いことが好ましい。有機溶媒2は、アセトニトリル、ジエチルエーテル、ジイソプロピルエーテルおよびn−ヘプタンからなる群から選択されることが好ましく、アセトニトリル、ジエチルエーテルおよびジイソプロピルエーテルからなる群から選択されることがより好ましく、ジイソプロピルエーテルおよびn−ヘプタンからなる群から選択されることが特に好ましい。 The organic solvent 2 is preferably selected from organic solvents having a boiling point of less than 160 ° C. at atmospheric pressure. The solubility of the peptide in the organic solvent 2 is preferably lower than the solubility in toluene and / or the solubility in a mixture of toluene and the organic solvent 1. The organic solvent 2 is preferably selected from the group consisting of acetonitrile, diethyl ether, diisopropyl ether and n-heptane, more preferably selected from the group consisting of acetonitrile, diethyl ether and diisopropyl ether, diisopropyl ether and n It is particularly preferred that it is selected from the group consisting of heptane.
ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層は極性非プロトン性溶媒を実質的に含んでいないため、ペプチドの沈殿に必要とされる有機溶媒2の量は、ペプチドカップリング反応により得られる粗反応混合物を使用する従来の沈殿工程において使用される量よりも顕著に少ない。さらに、従来の沈殿工程とは異なり、ペプチドは粘着性を有さない固形物として沈殿する。 Since the partially evaporated organic layer containing peptide is substantially free of polar aprotic solvent, the amount of organic solvent 2 required for peptide precipitation is a crude reaction obtained by peptide coupling reaction. Significantly less than the amount used in conventional precipitation processes using mixtures. Furthermore, unlike the conventional precipitation process, the peptide precipitates as a non-sticky solid.
沈殿工程において、部分的に蒸発させた有機層中に含まれるペプチドの少なくとも80重量%が固形物として沈殿することが好ましい。部分的に蒸発させた有機層中に含まれるペプチドの少なくとも90重量%が固形物として沈殿することがより好ましい。部分的に蒸発させた有機層中に含まれるペプチドの少なくとも95重量%が固形物として沈殿することがさらにより好ましい。部分的に蒸発させた有機層中に含まれるペプチドの少なくとも98重量%が固形物として沈殿することが特に好ましい。 In the precipitation step, it is preferred that at least 80% by weight of the peptide contained in the partially evaporated organic layer is precipitated as a solid. More preferably, at least 90% by weight of the peptide contained in the partially evaporated organic layer precipitates as a solid. Even more preferably, at least 95% by weight of the peptide contained in the partially evaporated organic layer precipitates as a solid. It is particularly preferred that at least 98% by weight of the peptide contained in the partially evaporated organic layer is precipitated as a solid.
沈殿工程を行う温度(この温度を以下「沈殿温度」と呼ぶ)は、部分的に蒸発させた有機層の組成、有機溶媒2の選択およびペプチドの特性に左右される。 The temperature at which the precipitation step is performed (this temperature is hereinafter referred to as “precipitation temperature”) depends on the composition of the partially evaporated organic layer, the choice of the organic solvent 2 and the properties of the peptide.
沈殿温度は、ペプチドの沈殿の完全性および沈殿したペプチドの物理的特性に大きな影響を及ぼす。沈殿工程は−10〜60℃の沈殿温度で行うことが好ましく、−10〜30℃の沈殿温度で行うことがさらにより好ましい。しかしながら、沈殿温度は−10〜0℃の範囲であることが特に好ましい。 The precipitation temperature has a great influence on the integrity of the precipitation of the peptide and the physical properties of the precipitated peptide. The precipitation step is preferably performed at a precipitation temperature of −10 to 60 ° C., and more preferably performed at a precipitation temperature of −10 to 30 ° C. However, the precipitation temperature is particularly preferably in the range of −10 to 0 ° C.
ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層は極性非プロトン性溶媒を実質的に含んでいないため、沈殿したペプチドは容易に濾別することができる。したがって、濾過工程に必要とされる時間は大幅に短縮される。沈殿したペプチドは、濾別し減圧下で乾燥させることが好ましい。 Since the partially evaporated organic layer containing the peptide is substantially free of polar aprotic solvent, the precipitated peptide can be easily filtered off. Thus, the time required for the filtration process is greatly reduced. The precipitated peptide is preferably filtered off and dried under reduced pressure.
しかしながら、沈殿したペプチドを遠心分離により分離することも可能である。 However, it is also possible to separate the precipitated peptides by centrifugation.
所望であれば、濾過により回収した濾液を再度部分的に蒸発させてから沈殿工程に付することができ、このようにして第2バッチのペプチド沈殿物を回収することができる。 If desired, the filtrate recovered by filtration can be partially evaporated again before being subjected to a precipitation step, and thus a second batch of peptide precipitate can be recovered.
本発明の別の実施形態では、ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層を、ペプチドの1つまたは複数の保護基(PG)を切断する試薬で直接処理する。ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層は極性非プロトン性溶媒を実質的に含んでいないため、ペプチドの1つまたは複数のPGを切断する試薬は特に限定されず自由に選択することができる。たとえば、ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層を酸分解試薬で処理することができ、この処理においては酸分解試薬と極性非プロトン性溶媒との間の望ましくない反応も保護基の切断の抑制も起こらない。ペプチドのN末端PGがtert−ブトキシカルボニル(Boc)基である場合、本発明のこの実施形態は特に好ましい。 In another embodiment of the invention, the partially evaporated organic layer containing the peptide is treated directly with a reagent that cleaves one or more protecting groups (PG) of the peptide. Since the partially evaporated organic layer containing the peptide is substantially free of polar aprotic solvent, the reagent for cleaving one or more PGs of the peptide is not particularly limited and can be freely selected. . For example, a partially evaporated organic layer containing a peptide can be treated with an acid decomposing reagent, in which an undesirable reaction between the acid decomposing reagent and a polar aprotic solvent can also result in cleavage of the protecting group. There is no suppression. This embodiment of the invention is particularly preferred when the N-terminal PG of the peptide is a tert-butoxycarbonyl (Boc) group.
本発明の別の実施形態では、部分的に蒸発させた有機層をジスルフィド架橋形成などの他の反応を行うために使用する。 In another embodiment of the invention, the partially evaporated organic layer is used to perform other reactions such as disulfide bridge formation.
本発明の別の実施形態では、ペプチドの1つまたは複数のPGを切断する試薬を、ペプチドカップリング反応により得られる反応混合物に直接添加する。標的とするPGの切断の完了後、得られたペプチドを反応混合物から抽出する。ペプチドのN末端PGがフルオレニル−9−メトキシカルボニル(Fmoc)基である場合、本発明のこの実施形態は特に好適である。 In another embodiment of the invention, a reagent that cleaves one or more PGs of a peptide is added directly to the reaction mixture obtained by the peptide coupling reaction. After completion of cleavage of the targeted PG, the resulting peptide is extracted from the reaction mixture. This embodiment of the invention is particularly suitable when the N-terminal PG of the peptide is a fluorenyl-9-methoxycarbonyl (Fmoc) group.
特定の一実施形態では、PG切断後のペプチドをトルエンまたはトルエンと有機溶媒1との混合物で抽出する。これは、NMPまたはDMFを含まない溶液中に保持することが難しいFmoc保護ペプチドに対して通常行われる。Fmocの切断後、このようなペプチドはトルエンと必要に応じて有機溶媒1とを含む有機層中に抽出することができる。 In one particular embodiment, the peptide after PG cleavage is extracted with toluene or a mixture of toluene and organic solvent 1. This is usually done for Fmoc protected peptides that are difficult to keep in a solution that does not contain NMP or DMF. After cleavage of Fmoc, such peptides can be extracted into an organic layer containing toluene and optionally organic solvent 1.
Bocで保護したペプチドの場合は上記とは逆に、Bocを切断する前にNMPおよびDMFを除去しなければならない。このようなペプチドは通常、>5体積%のTFAの存在下でトルエン、酢酸エチルまたはヘプタンに溶解する。 In the case of peptides protected with Boc, contrary to the above, NMP and DMF must be removed before cleaving Boc. Such peptides are usually dissolved in toluene, ethyl acetate or heptane in the presence of> 5% by volume TFA.
本発明のさらに別の実施形態では、ペプチドを含む有機層を上述のように蒸発乾固し、残った残渣をトルエンでも有機溶媒1でもない溶媒に溶解させ、次いでペプチドの1つまたは複数のPGを切断する試薬を加える。 In yet another embodiment of the invention, the organic layer comprising the peptide is evaporated to dryness as described above, the remaining residue is dissolved in a solvent other than toluene or organic solvent 1, and then one or more PGs of the peptide Add reagent to cleave.
保護基
アミノ酸もしくはペプチドの側鎖官能基の保護、またはアミノ酸もしくはペプチドのN末端アミノ基またはC末端カルボン酸基の保護のために本発明において使用される保護基(PG)は、以下の4つの異なる群に分類される。
1.塩基性の切断条件下で切断可能なPG(以下「塩基型PG」と呼ぶ)
2.強酸性の切断条件下で切断可能であるが、弱酸性の切断条件下では切断不可能なPG(以下「強力型PG」と呼ぶ)
3.弱酸性の切断条件下で切断可能なPG(以下「弱力型PG」と呼ぶ)
4.還元性の切断条件下で切断可能なPG(以下「還元型PG」と呼ぶ)
5.鹸化性の切断条件下で切断可能なPG(以下「鹸化型PG」と呼ぶ)
Protecting group The protecting group (PG) used in the present invention for protecting the side chain functional group of an amino acid or peptide, or protecting the N-terminal amino group or C-terminal carboxylic acid group of an amino acid or peptide includes the following four groups: Classified into different groups.
1. PG that can be cleaved under basic cleavage conditions (hereinafter referred to as “basic PG”)
2. PG that can be cleaved under strongly acidic cutting conditions but cannot be cleaved under weakly acidic cutting conditions (hereinafter referred to as “strong PG”)
3. PG that can be cut under mildly acidic cutting conditions (hereinafter referred to as “weak PG”)
4). PG that can be cleaved under reducing conditions (hereinafter referred to as "reduced PG")
5. PG cleavable under saponifiable cutting conditions (hereinafter referred to as “saponified PG”)
本発明の液相ペプチド調製方法において、従来の方法に従って使用されるPG、ならびにPGを切断するための典型的な反応条件、パラメータおよび試薬は当技術分野において公知であり、たとえば、T. W. Greene, P. G. M. Wuts “Greene's Protective Groups in Organic Synthesis” John Wiley & Sons, Inc., 2006;またはP. Lloyd-Williams, F. Albericio, E. Giralt, “Chemical Approaches to the Synthesis of Peptides and Proteins” CRC: Boca Raton, Florida, 1997に記載されている。 In the liquid phase peptide preparation method of the present invention, PG used according to the conventional method, and typical reaction conditions, parameters and reagents for cleaving PG are known in the art, for example, TW Greene, PGM Wuts “Greene's Protective Groups in Organic Synthesis” John Wiley & Sons, Inc., 2006; or P. Lloyd-Williams, F. Albericio, E. Giralt, “Chemical Approaches to the Synthesis of Peptides and Proteins” CRC: Boca Raton, Florida, 1997.
塩基性の切断条件は、塩基性切断溶液によるペプチドの処理を含む。塩基性切断溶液は、塩基性試薬および溶媒からなることが好ましい。本発明において使用される塩基性試薬は第2級アミンが好ましく、ジエチルアミン(DEA)、ピペリジン、4−(アミノメチル)ピペリジン、トリス(2−アミノエチル)アミン(TAEA)、モルホリン、ジシクロヘキシルアミン、1,3−シクロヘキサンビス(メチルアミン)−ピペラジン、1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エンおよびこれらの混合物からなる群から選択されることがより好ましい。本発明の液相ペプチド調製方法に使用される塩基性試薬は、DEA、TAEAおよびピペリジンからなる群から選択されることがさらにより好ましい。 Basic cleavage conditions include treatment of the peptide with a basic cleavage solution. The basic cleavage solution is preferably composed of a basic reagent and a solvent. The basic reagent used in the present invention is preferably a secondary amine, such as diethylamine (DEA), piperidine, 4- (aminomethyl) piperidine, tris (2-aminoethyl) amine (TAEA), morpholine, dicyclohexylamine, 1 More preferably, it is selected from the group consisting of 1,3-cyclohexanebis (methylamine) -piperazine, 1,8-diazabicyclo [5.4.0] undec-7-ene and mixtures thereof. Even more preferably, the basic reagent used in the method for preparing a liquid phase peptide of the present invention is selected from the group consisting of DEA, TAEA and piperidine.
塩基性切断溶液は添加剤をさらに含んでもよく、該添加剤は、6−クロロ−1−ヒドロキシ−ベンゾトリアゾール、1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール、エチル−2−シアノ−2−ヒドロキシイミノアセタートおよびこれらの混合物からなる群から選択されることが好ましい。 The basic cleavage solution may further comprise additives, which are 6-chloro-1-hydroxy-benzotriazole, 1-hydroxy-7-azabenzotriazole, 1-hydroxybenzotriazole, ethyl-2-cyano. It is preferably selected from the group consisting of -2-hydroxyiminoacetate and mixtures thereof.
塩基性切断溶液の溶媒は、ペプチドカップリング反応に使用された極性非プロトン性溶媒と同一であることが好ましい。したがって、塩基性切断溶液の溶媒は、DMF、DMAおよびNMPからなる群から選択されることが好ましい。別法として、ペプチドカップリング反応後の反応混合物からペプチドを抽出する方法によって得られたペプチド含有有機層を上述のように蒸発乾固して、残った残渣を、DMF、DMA、ピリジン、NMP、アセトニトリルおよびこれらの混合物からなる群から選択される溶媒のいずれか1つに溶解し、次いで塩基性切断溶液で処理することもできる。実施例1に記載のように、Fmoc切断反応の反応混合物溶液中にペプチドを保持するためにDMFまたはNMPが必要とされる場合がある。 The solvent of the basic cleavage solution is preferably the same as the polar aprotic solvent used in the peptide coupling reaction. Accordingly, the solvent of the basic cleavage solution is preferably selected from the group consisting of DMF, DMA and NMP. Alternatively, the peptide-containing organic layer obtained by the method of extracting the peptide from the reaction mixture after the peptide coupling reaction is evaporated to dryness as described above, and the remaining residue is DMF, DMA, pyridine, NMP, It can also be dissolved in any one of the solvents selected from the group consisting of acetonitrile and mixtures thereof and then treated with a basic cleavage solution. As described in Example 1, DMF or NMP may be required to retain the peptide in the reaction mixture solution of the Fmoc cleavage reaction.
塩基性、強酸性、弱酸性、または還元性の切断条件に関する説明において「部」および「重量%」は、それぞれの切断条件に対応する群のPGを有するペプチドの重量に対する割合を意味する。たとえば、「5部の塩基性切断溶液を使用する」は、塩基型PGを有するペプチド1gの処理に塩基性切断溶液5gを使用することを意味する。 In the description of basic, strongly acidic, weakly acidic, or reducing cleavage conditions, “parts” and “% by weight” mean a ratio to the weight of peptides having a group of PG corresponding to each cleavage condition. For example, “use 5 parts of basic cleavage solution” means that 5 g of basic cleavage solution is used to treat 1 g of peptide having base type PG.
塩基性切断溶液の使用量は5〜20部が好ましく、5〜15部がより好ましい。塩基性試薬の量は、塩基性切断溶液の総重量に対して1〜30重量%の範囲であることが好ましく、10〜25重量%の範囲であることがより好ましく、15〜20重量%の範囲であることがさらにより好ましい。 The amount of basic cleavage solution used is preferably 5 to 20 parts, more preferably 5 to 15 parts. The amount of the basic reagent is preferably in the range of 1 to 30% by weight, more preferably in the range of 10 to 25% by weight, more preferably in the range of 15 to 20% by weight with respect to the total weight of the basic cleavage solution. Even more preferred is a range.
本発明において定義されているように、強酸性の切断条件は強酸性切断溶液によるペプチドの処理を含む。強酸性切断溶液は酸分解試薬を含む。酸分解試薬は、TFA、塩酸(HCl)、塩酸(HCl)水溶液、フッ化水素酸(HF)溶液およびトリフルオロメタンスルホン酸などのブレンステッド酸;トリフルオロボラート・ジエチルエーテル付加物およびトリメチルシリルブロミドなどのルイス酸;ならびにこれらの混合物からなる群から選択されることが好ましい。 As defined in the present invention, strongly acidic cleavage conditions include treatment of the peptide with a strongly acidic cleavage solution. The strongly acidic cleavage solution contains an acid degradation reagent. Acid decomposing reagents include TFA, hydrochloric acid (HCl), hydrochloric acid (HCl) aqueous solution, hydrofluoric acid (HF) solution and Bronsted acids such as trifluoromethanesulfonic acid; trifluoroborate-diethyl ether adduct and trimethylsilyl bromide Preferably selected from the group consisting of Lewis acids; and mixtures thereof.
強酸性切断溶液は、ジチオトレイトール、エタンジチオール、硫化ジメチル、トリイソプロピルシラン、トリエチルシラン、1,3−ジメトキシベンゼン、フェノール、アニソール、p−クレゾールおよびこれらの混合物からなる群から選択される1以上の捕捉剤を含むことが好ましい。強酸性切断溶液は水、溶媒またはこれらの混合物をさらに含んでいてもよく、この溶媒は強力な切断条件下において安定性を示す溶媒である。 The strongly acidic cleavage solution is one or more selected from the group consisting of dithiothreitol, ethanedithiol, dimethyl sulfide, triisopropylsilane, triethylsilane, 1,3-dimethoxybenzene, phenol, anisole, p-cresol, and mixtures thereof. It is preferable to contain the capture agent. The strongly acidic cleavage solution may further comprise water, a solvent or a mixture thereof, which is a solvent that is stable under strong cleavage conditions.
強酸性切断溶液の溶媒は、ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層に含まれる溶媒と同一であることが好ましい。したがって、強酸性切断溶液の溶媒は、トルエンまたはトルエンと有機溶媒1の組み合わせである。別法として、ペプチドを含む有機層を上述のように蒸発乾固し、残った残渣をACN、トルエン、DCM、TFAおよびこれらの混合物からなる群から選択される溶媒のいずれか1つに溶解することもできる。トルエンおよび有機溶媒1は十分な揮発性を有するため、有機層は容易に蒸発させることができる。 The solvent of the strongly acidic cleavage solution is preferably the same as the solvent contained in the partially evaporated organic layer containing the peptide. Therefore, the solvent of the strongly acidic cleavage solution is toluene or a combination of toluene and organic solvent 1. Alternatively, the organic layer containing the peptide is evaporated to dryness as described above and the remaining residue is dissolved in any one of the solvents selected from the group consisting of ACN, toluene, DCM, TFA, and mixtures thereof. You can also. Since toluene and organic solvent 1 have sufficient volatility, the organic layer can be easily evaporated.
強酸性切断溶液の使用量は、10〜30部が好ましく、15〜25部がより好ましく、19〜21部がさらにより好ましい。酸分解試薬の量は強酸性切断溶液の総重量に対して30〜350重量%の範囲であることが好ましく、50〜300重量%の範囲であることがより好ましく、70〜250重量%の範囲であることがさらにより好ましく、100〜200重量%の範囲であることが特に好ましい。捕捉剤の総使用量は強酸性切断溶液の総重量に対して1〜25重量%であることが好ましく、5〜15重量%であることがより好ましい。 The amount of the strongly acidic cleavage solution used is preferably 10 to 30 parts, more preferably 15 to 25 parts, and even more preferably 19 to 21 parts. The amount of the acid decomposing reagent is preferably in the range of 30 to 350% by weight, more preferably in the range of 50 to 300% by weight, and in the range of 70 to 250% by weight with respect to the total weight of the strongly acidic cleavage solution. It is even more preferable that it is in the range of 100 to 200% by weight. The total amount of scavenger used is preferably 1 to 25% by weight, more preferably 5 to 15% by weight, based on the total weight of the strongly acidic cleavage solution.
本発明による弱酸性の切断条件は、弱酸性切断溶液によるペプチドの処理を含む。弱酸性切断溶液は酸分解試薬を含む。酸分解試薬は、TFA、トリフルオロエタノール、塩酸(HCl)、酢酸(AcOH)、これらの混合物、および/またはこれらの含水混合物などのブレンステッド酸からなる群から選択されることが好ましい。 The weakly acidic cleavage conditions according to the present invention include treatment of the peptide with a weakly acidic cleavage solution. The weakly acidic cleavage solution contains an acid degradation reagent. The acid decomposing reagent is preferably selected from the group consisting of Bronsted acids such as TFA, trifluoroethanol, hydrochloric acid (HCl), acetic acid (AcOH), mixtures thereof, and / or aqueous mixtures thereof.
弱酸性切断溶液は水、溶媒またはこれらの混合物をさらに含んでいてもよく、この溶媒は弱い切断条件下において安定性を示す溶媒である。弱酸性切断溶液の溶媒は、ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層に含まれる溶媒と同一であることが好ましい。したがって、弱酸性切断溶液の溶媒は、トルエンまたはトルエンと有機溶媒1の組み合わせである。別法として、ペプチドを含む有機層を上述のように蒸発乾固し、残った残渣をACN、トルエン、DCM、TFAおよびこれらの混合物からなる群から選択される溶媒のいずれか1つに溶解することもできる。 The weakly acidic cleavage solution may further comprise water, a solvent or a mixture thereof, which is a solvent that is stable under weak cleavage conditions. The solvent of the weakly acidic cleavage solution is preferably the same as the solvent contained in the partially evaporated organic layer containing the peptide. Therefore, the solvent of the weakly acidic cleavage solution is toluene or a combination of toluene and organic solvent 1. Alternatively, the organic layer containing the peptide is evaporated to dryness as described above and the remaining residue is dissolved in any one of the solvents selected from the group consisting of ACN, toluene, DCM, TFA, and mixtures thereof. You can also
弱酸性切断溶液の使用量は4〜20部が好ましく、5〜10部がより好ましい。酸分解試薬の量は、弱酸性切断溶液の総重量に対して0.01〜5重量%の範囲であることが好ましく、0.1〜5重量%の範囲であることがより好ましく、0.15〜3重量%の範囲であることがさらにより好ましい。 The amount of the weakly acidic cleavage solution used is preferably 4 to 20 parts, and more preferably 5 to 10 parts. The amount of the acid decomposing reagent is preferably in the range of 0.01 to 5% by weight, more preferably in the range of 0.1 to 5% by weight, based on the total weight of the weakly acidic cleavage solution. Even more preferably, it is in the range of 15 to 3% by weight.
本発明の一実施形態において使用される還元性の切断条件は、還元性切断用混合物によるペプチドの処理を含む。還元性切断用混合物は触媒、還元剤および溶媒を含む。 The reducing cleavage conditions used in one embodiment of the present invention include treatment of the peptide with a reducing cleavage mixture. The reducing cleavage mixture includes a catalyst, a reducing agent and a solvent.
還元性の切断条件に使用される触媒は、Pd(0)の誘導体、Pd(II)の誘導体および金属パラジウム含有触媒からなる群から選択され、Pd[PPh3]4、PdCl2[PPh3]2、Pd(OAc)2およびパラジウム−炭素(Pd/C)からなる群から選択されることがより好ましい。Pd/Cが特に好ましい。 The catalyst used for the reductive cleavage conditions is selected from the group consisting of Pd (0) derivatives, Pd (II) derivatives and metal palladium-containing catalysts, Pd [PPh 3 ] 4 , PdCl 2 [PPh 3 ] 2 , more preferably selected from the group consisting of Pd (OAc) 2 and palladium-carbon (Pd / C). Pd / C is particularly preferred.
還元剤は、Bu4N+BH4 -;NH3BH3;Me2NHBH3;tBu-NH2BH3;Me3NBH3;HCOOH/DIPEA;PhSO2H、tolSO2Naまたはi-BuSO2Naを含むスルフィン酸;これらの混合物;ならびに水素分子からなる群から選択されることが好ましく、tolSO2Naまたは水素分子であることがより好ましい。 Reducing agents are Bu 4 N + BH 4 − ; NH 3 BH 3 ; Me 2 NHBH 3 ; tBu-NH 2 BH 3 ; Me 3 NBH 3 ; HCOOH / DIPEA; PhSO 2 H, tolSO 2 Na or i-BuSO 2 It is preferably selected from the group consisting of sulfinic acid containing Na; mixtures thereof; and hydrogen molecules, more preferably tolSO 2 Na or hydrogen molecules.
還元性の切断条件下で使用される溶媒は、ペプチドを含む部分的に蒸発させた有機層に含まれる溶媒と同一であることが好ましい。したがって、還元性の切断条件下で使用される溶媒は、トルエンまたはトルエンと有機溶媒1の組み合わせであることが好ましい。別法として、ペプチドを含む有機層を上述のように蒸発乾固し、残った残渣をNMP、DMF、DMA、ピリジン、ACNおよびこれらの混合物からなる群から選択される溶媒のいずれか1つ、より好ましくはNMP、DMFまたはこれらの混合物に溶解することもできる。還元性の切断条件下で使用されるこれらの溶媒に対してペプチドが溶解性を示し、このような溶媒中に溶解することが好ましい。 The solvent used under reducing cleavage conditions is preferably the same as the solvent contained in the partially evaporated organic layer containing the peptide. Therefore, the solvent used under reducing cleavage conditions is preferably toluene or a combination of toluene and organic solvent 1. Alternatively, the organic layer containing the peptide is evaporated to dryness as described above, and the remaining residue is any one of the solvents selected from the group consisting of NMP, DMF, DMA, pyridine, ACN and mixtures thereof, More preferably, it can be dissolved in NMP, DMF or a mixture thereof. Peptides are preferably soluble in these solvents used under reducing cleavage conditions and are preferably dissolved in such solvents.
還元性切断溶液の使用量は4〜20部が好ましく、5〜10部がより好ましい。 The amount of reducing cutting solution used is preferably 4 to 20 parts, more preferably 5 to 10 parts.
鹸化性の切断条件は、鹸化性切断溶液によるペプチドの処理を含む。鹸化性切断溶液は、鹸化試薬および溶媒からなることが好ましい。本発明において使用される鹸化試薬は、アルカリ金属の水酸化物またはアルカリ土類金属の水酸化物であることが好ましく、水酸化ナトリウム、水酸化リチウムおよび水酸化カリウムからなる群から選択されることがより好ましい。本発明の液相ペプチド調製方法において使用される鹸化試薬は、水酸化ナトリウムであることがさらにより好ましい。 Saponifiable cleavage conditions include treatment of the peptide with a saponifiable cleavage solution. The saponifiable cleavage solution preferably comprises a saponification reagent and a solvent. The saponification reagent used in the present invention is preferably an alkali metal hydroxide or an alkaline earth metal hydroxide, and is selected from the group consisting of sodium hydroxide, lithium hydroxide and potassium hydroxide. Is more preferable. Even more preferably, the saponification reagent used in the liquid phase peptide preparation method of the present invention is sodium hydroxide.
鹸化性切断溶液の溶媒は、THF、MeTHF、エタノール、メタノールおよびジオキサンからなる群から選択される溶媒と水との混合物を含むことが好ましい。 The solvent of the saponifiable cleavage solution preferably contains a mixture of a solvent selected from the group consisting of THF, MeTHF, ethanol, methanol and dioxane and water.
本発明によれば、塩基型PGは強酸性の切断条件下および弱酸性の切断条件下では切断できない。塩基型PGは、強酸性の切断条件下、弱い切断条件下、および還元性の切断条件下では切断できないことが好ましい。 According to the present invention, base type PG cannot be cleaved under strongly acidic cleavage conditions and weakly acidic cleavage conditions. It is preferable that the basic PG cannot be cleaved under strongly acidic cleavage conditions, weak cleavage conditions, and reducing cleavage conditions.
「強力型PG」は、弱酸性の切断条件下および塩基性の切断条件下では切断できない保護基であると理解される。強力型PGは、弱酸性の切断条件下、塩基性の切断条件下、および還元性の切断条件下では切断できないことが好ましい。Bzlのような強酸性PGは通常、水素化によって切断される。通常、ペプチドの包括的な脱保護は非常に温和な条件下における水素化によって行われる。 “Strong PG” is understood to be a protecting group that cannot be cleaved under mildly acidic and basic cleavage conditions. It is preferable that the strong PG cannot be cleaved under mildly acidic cleavage conditions, basic cleavage conditions, and reducing cleavage conditions. Strongly acidic PGs such as Bzl are usually cleaved by hydrogenation. Normally, comprehensive deprotection of peptides is performed by hydrogenation under very mild conditions.
弱力型PGは塩基性の切断条件下では切断できないが、強酸性の切断条件下では切断可能である。好ましくは、弱力型PGは塩基性の切断条件下および還元性の切断条件下では切断できないが、強酸性の切断条件下では切断可能である。 Weak PG cannot be cleaved under basic cleavage conditions, but can be cleaved under strongly acidic cleavage conditions. Preferably, the weak PG cannot be cleaved under basic or reducing cleavage conditions, but can be cleaved under strongly acidic cleavage conditions.
本発明の一実施形態によれば、塩基型PGはFmocであることが好ましい。強力型PGは、Boc、tBu、OtBuおよびCbzからなる群から選択されることが好ましい。弱力型PGはTrtおよび2−クロロフェニルジフェニルメチル基からなる群から選択されることが好ましい。還元型PGは、Bzl、N−メチル−9H−キサンテン−9−アミノ基およびCbzからなる群から選択されることが好ましい。鹸化型PGはOMeであることが好ましい。 According to one embodiment of the present invention, the base PG is preferably Fmoc. The strong PG is preferably selected from the group consisting of Boc, tBu, OtBu and Cbz. The weak PG is preferably selected from the group consisting of Trt and a 2-chlorophenyldiphenylmethyl group. The reduced PG is preferably selected from the group consisting of Bzl, N-methyl-9H-xanthene-9-amino group and Cbz. The saponified PG is preferably OMe.
本発明の液相ペプチド調製方法においては、次のペプチドカップリング反応を行う前に、ペプチドのN末端PGを脱保護反応により除去する。本発明によれば、N末端PGはFmocまたはBocであることが好ましい。 In the liquid phase peptide preparation method of the present invention, before the next peptide coupling reaction, the N-terminal PG of the peptide is removed by a deprotection reaction. According to the invention, the N-terminal PG is preferably Fmoc or Boc.
本発明の一実施形態において、Fmocは塩基性条件下で容易に除去することができるため、LPPSにおけるN末端PGとして非常に好ましい。さらに、ペプチドのN末端PGとしてFmocを使用すると、orthogonal systemにおいて側鎖PGと適合する。「orthogonal system」は、G. BaranayおよびR. B. Merrifield (JACS, 1977, 99, 22, pp. 7363-7365)によって定義されている。 In one embodiment of the invention, Fmoc is highly preferred as the N-terminal PG in LPPS because it can be easily removed under basic conditions. Furthermore, the use of Fmoc as the N-terminal PG of the peptide is compatible with the side chain PG in the orthogonal system. The “orthogonal system” is defined by G. Baranay and R. B. Merrifield (JACS, 1977, 99, 22, pp. 7363-7365).
本発明のさらに別の実施形態では、Bocは液相ペプチド調製方法に使用されるペプチドのN末端PGとして非常に好ましい。その除去は強酸性条件下で行うことができる。さらに、N末端PGとしてBocを使用した場合も、orthogonal systemにおいて側鎖PGと適合する。 In yet another embodiment of the invention, Boc is highly preferred as the N-terminal PG of peptides used in the liquid phase peptide preparation method. The removal can be performed under strongly acidic conditions. Furthermore, when Boc is used as the N-terminal PG, it is compatible with the side chain PG in the orthogonal system.
本発明によれば、ペプチドのC末端PGは最終的な脱保護工程で除去される。 According to the present invention, the C-terminal PG of the peptide is removed in the final deprotection step.
C末端PGとして、OtBu、Blz、OMe、NH2、2−クロロフェニル−ジフェニルメチルエステルまたはN−メチル−9H−キサンテン−9−アミドが好ましい。 As C-terminal PG, OtBu, Blz, OMe, NH 2, 2- chlorophenyl - diphenylmethyl ester or N- methyl -9H- xanthene-9-amides are preferred.
本発明の一実施形態において、Bzlは上記の還元性切断条件下で容易に除去することができるため、液相ペプチド調製方法におけるC末端PGとして非常に好ましい。さらに、C末端PGとしてBzlを使用するとorthogonal systemにおいて側鎖PGと適合する。 In one embodiment of the present invention, Bzl can be easily removed under the reductive cleavage conditions described above, and is therefore highly preferred as the C-terminal PG in the liquid phase peptide preparation method. Furthermore, the use of Bzl as the C-terminal PG is compatible with the side chain PG in the orthogonal system.
本発明の別の実施形態では、液相ペプチド調製方法のC末端PGとしてOtBuが使用される。その除去は上記の強酸性切断条件下で行うことができる。さらに、C末端PGとしてOtBuを使用した場合も、orthogonal systemにおいて側鎖PGと適合する。 In another embodiment of the invention, OtBu is used as the C-terminal PG in the liquid phase peptide preparation method. The removal can be performed under the above-mentioned strongly acidic cleavage conditions. Furthermore, when OtBu is used as the C-terminal PG, it is compatible with the side chain PG in the orthogonal system.
本発明の別の実施形態では、液相ペプチド調製方法のC末端PGとしてOMeが使用される。OMeは鹸化によって容易に切断することができ、ペプチドのN末端PGがBocである場合において特に有用である。 In another embodiment of the invention, OMe is used as the C-terminal PG of the liquid phase peptide preparation method. OMe can be easily cleaved by saponification and is particularly useful when the N-terminal PG of the peptide is Boc.
本発明のさらに別の実施形態では、疎水性PGをペプチドのC末端に使用することによって有機層へのペプチドの溶解性をさらに高めることができる。この目的のために、弱酸性条件下で切断可能な弱力型PGを用いてペプチドのC末端カルボン酸基を保護してもよい。このような弱力型PGとして2−クロロフェニルジフェニルメチルエステルおよびN−メチル−9H−キサンテン−9−アミドなどが挙げられる。これらのPGはペプチド断片の合成に特に有用であり、得られたペプチド断片はconvergent法によるペプチド合成に使用することができる。また、これらのC末端カルボン酸保護基(PG)は別の重要な利点を有する。すなわち、これらのC末端カルボン酸保護基(PG)は弱酸性条件下で切断されるため、convergent合成法においてペプチド断片として使用する保護されたペプチドをSPPSの代わりに液相合成を用いて合成することができる。実際に、2−クロロフェニルジフェニルメチルエステルおよびN−メチル−9H−キサンテン−9−アミドは、保護されたペプチド断片を合成する目的でSPPS用樹脂のリンカーとして使用される化学官能基である。 In yet another embodiment of the invention, the solubility of the peptide in the organic layer can be further enhanced by using hydrophobic PG at the C-terminus of the peptide. For this purpose, weak CPG cleavable under mildly acidic conditions may be used to protect the C-terminal carboxylic acid group of the peptide. Examples of such weak PG include 2-chlorophenyldiphenylmethyl ester and N-methyl-9H-xanthene-9-amide. These PGs are particularly useful for the synthesis of peptide fragments, and the obtained peptide fragments can be used for peptide synthesis by the convergent method. These C-terminal carboxylic acid protecting groups (PG) also have another important advantage. That is, since these C-terminal carboxylic acid protecting groups (PG) are cleaved under weakly acidic conditions, a protected peptide used as a peptide fragment in a convergent synthesis method is synthesized using liquid phase synthesis instead of SPPS. be able to. Indeed, 2-chlorophenyldiphenylmethyl ester and N-methyl-9H-xanthene-9-amide are chemical functional groups used as linkers for SPPS resins for the purpose of synthesizing protected peptide fragments.
本発明によれば、液相ペプチド調製方法によって得られたペプチドのアミノ酸側鎖のヒドロキシ基、アミノ基、チオ基およびカルボン酸基を適切なPGで保護することによって望ましくない副反応を回避することが望ましい。さらに、側鎖にPGを使用することによって、通常、極性非プロトン性溶媒に対するペプチドの溶解性、ならびにトルエンおよび/またはトルエンと有機溶媒1の組み合わせに対するペプチドの溶解性が向上する。 According to the present invention, undesirable side reactions are avoided by protecting the hydroxy group, amino group, thio group and carboxylic acid group of the amino acid side chain of the peptide obtained by the liquid phase peptide preparation method with an appropriate PG. Is desirable. Furthermore, the use of PG in the side chain usually improves the solubility of the peptide in polar aprotic solvents and the solubility of the peptide in toluene and / or a combination of toluene and organic solvent 1.
通常、側鎖のPGは、液相ペプチド調製方法におけるN末端アミノ基の脱保護工程中に除去されないものが選択される。したがって、N末端アミノ基またはC末端カルボン酸基のPGと側鎖のPGは通常異なるものであり、これらのPGはorthogonal systemにおいて適合することが好ましい。 Usually, the side chain PG is selected so as not to be removed during the N-terminal amino group deprotection step in the liquid phase peptide preparation method. Therefore, the PG of the N-terminal amino group or C-terminal carboxylic acid group and the PG of the side chain are usually different, and these PGs are preferably compatible in the orthogonal system.
本発明によれば、好ましい側鎖基はtBu、Trt、Boc、OtBuおよびCbzである。 According to the invention, preferred side groups are tBu, Trt, Boc, OtBu and Cbz.
液相ペプチド調製方法によって目的とするペプチドのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列が得られれば、N末端のPG、C末端のPGおよび側鎖のPGを除去して、保護されていない目的のペプチドを得ることが好ましい。この工程を「包括的な脱保護」と呼ぶ。液相ペプチド調製方法においては、PGの特性に応じて上記の弱酸性、強酸性、または還元性の切断条件下で包括的な脱保護を行えるようなPGを選択することが好ましい。 If the amino acid sequence identical to the amino acid sequence of the target peptide is obtained by the liquid phase peptide preparation method, the N-terminal PG, the C-terminal PG and the side chain PG are removed, and the unprotected target peptide is removed. It is preferable to obtain. This process is called “global deprotection”. In the liquid phase peptide preparation method, it is preferable to select a PG that can perform comprehensive deprotection under the above-mentioned weakly acidic, strongly acidic, or reducing cleavage conditions depending on the characteristics of the PG.
側鎖のPGは通常LPPSが完了するまで保持される。包括的な脱保護は、使用された種々の側鎖PGに適用可能な条件下で実施することができる。異なる種類の側鎖PGを選択した場合、これらのPGを連続的に切断してもよく、これはたとえば分岐ペプチドを合成する場合に行われる。同時に切断可能な側鎖PGを選択すると有利であり、これに加えて、LPPSによって調製したペプチドのN末端PGまたはC末端PGも同時に切断できる側鎖PGを選択するとさらに有利である。 The side chain PG is usually retained until LPPS is complete. Comprehensive deprotection can be performed under conditions applicable to the various side chain PGs used. If different types of side chain PGs are selected, these PGs may be cleaved continuously, for example when synthesizing branched peptides. It is advantageous to select side chain PG that can be cleaved at the same time, and in addition, it is further advantageous to select side chain PG that can also cleave N-terminal PG or C-terminal PG of peptides prepared by LPPS at the same time.
本発明の一実施形態では、部分的に蒸発させた有機層中のペプチドのN末端PGを直接除去することができる。したがって、この場合、有機溶媒2を使用してペプチドを沈殿させる必要がなく、中間体ペプチドを単離することなくたとえば連続的LPPSとして本発明のLPPSを実施することができる。 In one embodiment of the invention, the N-terminal PG of the peptide in the partially evaporated organic layer can be removed directly. Therefore, in this case, it is not necessary to precipitate the peptide using the organic solvent 2, and the LPPS of the present invention can be carried out, for example, as continuous LPPS without isolating the intermediate peptide.
ペプチドのN末端PGの特性に応じて、この工程に適切な切断条件を選択することができる。 Depending on the properties of the N-terminal PG of the peptide, suitable cleavage conditions for this step can be selected.
ペプチドのN末端PGが上述したような強力型PGまたは弱力型PGである場合、ペプチドを含む有機層をTFAまたはHClで処理することが好ましい。ペプチドを含む有機層は極性非プロトン性溶媒を実質的に含んでいないため、ペプチドのN末端PGの除去は、TFAまたはHClと極性非プロトン性溶媒との間の望ましくない反応によって抑制されない。本発明の一実施形態においては、ペプチドのN末端PGはBoc基である。 When the N-terminal PG of the peptide is a strong PG or a weak PG as described above, the organic layer containing the peptide is preferably treated with TFA or HCl. Since the organic layer containing the peptide is substantially free of polar aprotic solvent, removal of the N-terminal PG of the peptide is not inhibited by undesired reactions between TFA or HCl and the polar aprotic solvent. In one embodiment of the invention, the N-terminal PG of the peptide is a Boc group.
ペプチドのN末端PGが上述したような塩基型PGである場合、従来技術において知られているように有機塩基を使用してペプチドを脱保護することができる。この目的のために、ペプチドカップリング反応により得られた反応混合物を、DEA、TAEAおよびピペリジンからなる群から選択される塩基性試薬で直接処理し、次いで保護されていないN末端を有するペプチドを反応混合物から抽出することが好ましい。別法では、ペプチドを含む有機層を塩基性試薬で処理する。さらに別法として、ペプチドを含む有機層を上述のように蒸発乾固し、残った残渣をDMF、DMA、ピリジン、NMPおよびこれらの混合物からなる群から選択される溶媒のいずれか1つに溶解し、次いで塩基性試薬で処理することもできる。 If the N-terminal PG of the peptide is a base PG as described above, the peptide can be deprotected using an organic base as is known in the art. For this purpose, the reaction mixture obtained by the peptide coupling reaction is treated directly with a basic reagent selected from the group consisting of DEA, TAEA and piperidine and then reacted with a peptide having an unprotected N-terminus. Extraction from the mixture is preferred. Alternatively, the organic layer containing the peptide is treated with a basic reagent. As another alternative, the organic layer containing the peptide is evaporated to dryness as described above and the remaining residue is dissolved in one of the solvents selected from the group consisting of DMF, DMA, pyridine, NMP and mixtures thereof. Can then be treated with a basic reagent.
本発明の好ましい一実施形態においては、ペプチドのN末端PGはフルオレニル−9−メトキシカルボニル(Fmoc)基である。ペプチドのFmoc基の切断にはジベンゾフルベンの形成が伴う。塩基性試薬としてDEAまたはピペリジンを使用し、塩基性切断溶液の溶媒がアセトニトリルである場合、保護されていないN末端を有するペプチドを含む得られた溶液をたとえばn−ヘプタンなどの炭化水素で洗浄することによりジベンゾフルベンを実質的に除去する。Fmoc基を切断するための塩基性試薬としてTAEAを使用した場合、得られた溶液は本発明の抽出方法で処理する。したがって、後続のペプチドカップリング反応を行う前に、保護されていないN末端を有するペプチドを含む溶液からはジベンゾフルベンが実質的に除去されている。 In a preferred embodiment of the invention, the N-terminal PG of the peptide is a fluorenyl-9-methoxycarbonyl (Fmoc) group. Cleavage of the Fmoc group of the peptide is accompanied by the formation of dibenzofulvene. When DEA or piperidine is used as the basic reagent and the solvent of the basic cleavage solution is acetonitrile, the resulting solution containing the unprotected N-terminal peptide is washed with a hydrocarbon such as n-heptane. This substantially removes dibenzofulvene. When TAEA is used as a basic reagent for cleaving the Fmoc group, the resulting solution is treated with the extraction method of the present invention. Thus, the dibenzofulvene is substantially removed from the solution containing the peptide having an unprotected N-terminus prior to performing a subsequent peptide coupling reaction.
ペプチドのN末端PGの切断後、保護されていないN末端を有するペプチドを含む溶液を少なくとも部分的に蒸発させ、次のペプチドカップリング反応あるいは包括的な脱保護工程に使用することができる。 After cleavage of the N-terminal PG of the peptide, the solution containing the peptide having an unprotected N-terminus can be at least partially evaporated and used for the next peptide coupling reaction or a comprehensive deprotection step.
したがって、本発明は、一般的に用いられるSPPS法と比べて多くの利点を有する連続的LPPS法を提供する。 Thus, the present invention provides a continuous LPPS method that has many advantages over commonly used SPPS methods.
本発明の連続的LPPSの場合、ペプチドカップリング反応および脱保護反応における反応混合物中の試薬の濃度はSPPSの場合よりも高い。結果として、反応時間はより短くなり、より少ない容量のバッチ式反応器を使用して所定量の目的とするペプチドを合成することができる。本発明の連続的LPPSによるペプチド合成に必要とされる総時間は、SPPSを使用して合成を行う場合に必要とされる総時間とほぼ同じである。したがって、本発明の連続的LPPSを使用することによって作業コストを節約できる。 In the case of the continuous LPPS of the present invention, the concentration of the reagent in the reaction mixture in the peptide coupling reaction and the deprotection reaction is higher than in the case of SPPS. As a result, the reaction time is shorter and a smaller volume of the batch reactor can be used to synthesize a predetermined amount of the desired peptide. The total time required for peptide synthesis by continuous LPPS of the present invention is approximately the same as the total time required for synthesis using SPPS. Thus, working costs can be saved by using the continuous LPPS of the present invention.
本発明のLPPSのペプチドカップリング反応において必要とされる、保護されていないC末端カルボン酸基を有するアミノ酸またはペプチドの過剰量(1.1〜1.2当量)は、対応するSPPSのペプチドカップリング反応におけるアミノ酸またはペプチドの過剰量(1.5当量以上)よりも少ない。さらに、SPPSにおいては各ペプチドカップリング工程の後に樹脂をすすぐため大量の溶媒が必要とされる。したがって、SPPSに必要とされる溶媒の量は本発明の連続的LPPSよりも顕著に多い。したがって、SPPSを使用した場合と比較して、本発明の連続的LPPSを使用した場合は材料費を大幅に節約できる。 The excess of amino acids or peptides having an unprotected C-terminal carboxylic acid group (1.1-1.2 equivalents) required in the peptide coupling reaction of LPPS of the present invention is the corresponding SPPS peptide cup. Less than the excess of amino acids or peptides in the ring reaction (1.5 equivalents or more). In addition, SPPS requires a large amount of solvent to rinse the resin after each peptide coupling step. Thus, the amount of solvent required for SPPS is significantly higher than the continuous LPPS of the present invention. Thus, material costs can be saved significantly when using the continuous LPPS of the present invention compared to using SPPS.
上記に加えて、本発明の連続的LPPS法のスケールアップは、対応するSPPS法のスケールアップよりも容易であることが知られており、本発明の連続的LPPSによって調製された目的のペプチドは、SPPSによって調製された同一のペプチドよりも純度が高い。 In addition to the above, it is known that the scale-up of the continuous LPPS method of the present invention is easier than the scale-up of the corresponding SPPS method, and the target peptide prepared by the continuous LPPS of the present invention is Higher purity than the same peptide prepared by SPPS.
要約すると、本発明の連続的LPPSは、従来技術において公知の他のペプチド合成方法よりも多くの利点を備えており、工業規模におけるペプチドの調製に特に有用である。 In summary, the continuous LPPS of the present invention has many advantages over other peptide synthesis methods known in the prior art and is particularly useful for the preparation of peptides on an industrial scale.
以下の実施例により本発明の代表的な実施形態を詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されない。 The following examples explain in detail typical embodiments of the present invention, but the present invention is not limited thereto.
他に記載がない限り実験はすべて室温(20±3℃)および大気圧(1013±50kPa)で行った。 Unless otherwise stated, all experiments were performed at room temperature (20 ± 3 ° C.) and atmospheric pressure (1013 ± 50 kPa).
方法の説明
A)HPLC分析
HPLC法Aにおける検出はUVフォトダイオードアレイ検出器を用いて行った。
工程1 試料調製:
移動相A:0.1体積%TFAを含む水
移動相B:0.085体積%TFAを含むACN
工程2 クロマトグラフィーの条件:
MIH-009-2TG11法
カラム: Purospher Star RP18 55×4mm
オーブン温度: 40℃
流速: 2.0mL/分
検出器波長: 215nm
グラジエント時間: 15分
グラジエント組成: 2〜78%B(5分)→78〜98%B(10分)
工程3 クロマトグラフィーによるプロファイル分析:
単離された生成物の組成はクロマトグラフィーにおける全てのピークの面積を測定することにより決定した。決定された予測生成物の純度は該生成物に対応するピーク面積(%)に一致する。
Description of method
A) HPLC analysis
Detection in HPLC method A was performed using a UV photodiode array detector.
Step 1 Sample preparation:
Mobile phase A: water containing 0.1% by volume TFA Mobile phase B: ACN containing 0.085% by volume TFA
Step 2 Chromatographic conditions:
MIH-009-2TG11 Column: Purospher Star RP18 55 × 4mm
Oven temperature: 40 ℃
Flow rate: 2.0mL / min Detector wavelength: 215nm
Gradient time: 15 minutes Gradient composition: 2 to 78% B (5 minutes) → 78 to 98% B (10 minutes)
Step 3 Chromatographic profile analysis:
The composition of the isolated product was determined by measuring the area of all peaks in the chromatography. The predicted product purity determined corresponds to the peak area (%) corresponding to the product.
1.装置および機器
ガスクロマトグラフ: 水素炎イオン化検出器およびオートインジェクターシステムを備え、データ収集ソフトウェアと接続したGC
分析用GCカラム: 溶融シリカカラム
長さ50m;内径0.53mm;固定相:CP SIL 8CB DF=5.0μm
試薬: メタノール(分析等級)
1. Equipment and instruments Gas chromatograph: GC equipped with a flame ionization detector and autoinjector system, connected to data acquisition software
GC column for analysis: fused silica column
Length 50m; Inner diameter 0.53mm; Stationary phase: CP SIL 8CB DF = 5.0μm
Reagent: Methanol (analysis grade)
2.試料の調製
試験溶液および対照溶液
10mLのメスフラスコに試料400μLを正確に入れ、メタノールを標線まで加えた。
2. Sample preparation Test solution and control solution
A sample of 400 μL was accurately placed in a 10 mL volumetric flask, and methanol was added up to the marked line.
3.クロマトグラフィーの条件
キャリアガス: ヘリウム 30kPa
オーブン温度: 35℃(14分)→(5℃/分)→55℃(3分)→(5℃/分)→110℃(5分)→(10℃/分)→225℃(5分)
インジェクター温度: 225℃
検出器温度: 260℃
注入量: 1μL
注入方法: スプリット
スプリット流量: 85mL/分
比率: 24
3. Chromatographic conditions Carrier gas: Helium 30kPa
Oven temperature: 35 ℃ (14 minutes) → (5 ℃ / minute) → 55 ℃ (3 minutes) → (5 ℃ / minute) → 110 ℃ (5 minutes) → (10 ℃ / minute) → 225 ℃ (5 minutes) )
Injector temperature: 225 ° C
Detector temperature: 260 ℃
Injection volume: 1μL
Injection method: Split Split flow rate: 85mL / min Ratio: 24
濾過性の測定
沈殿したペプチドを含む混合物を、孔径20μmのフィルターを備えた直径2.7cmの濾過カラムに移した。20℃、圧力50mbarの条件で濾過を行った。流速およびケーキの高さを測定し、濾過係数Kを次式により求めた。
K=母液量(mL)×ケーキの高さ(cm)/フィルターの面積(cm2)/圧力(bar)/濾過時間(分)
Measurement of filterability The mixture containing the precipitated peptide was transferred to a 2.7 cm diameter filtration column equipped with a 20 μm pore size filter. Filtration was carried out at 20 ° C. and a pressure of 50 mbar. The flow rate and cake height were measured, and the filtration coefficient K was determined by the following equation.
K = amount of mother liquor (mL) x cake height (cm) / filter area (cm 2 ) / pressure (bar) / filtration time (min)
実施例1 MeTHF/THF/NaCl溶液系、EtOAc/THF/NaCl溶液系およびトルエン/THF/NaCl溶液系におけるNMPの抽出
トルエン/THF混合溶媒(本発明)の抽出性をMeTHF/THF混合溶媒およびEtOAc/THF混合溶媒(比較例)の抽出性と比較した。実験は150g/LのNaClを含む水溶液を用いて行った。この実施例の系にペプチドは含まれていなかった。
体積比は以下のとおりであった。
NMP:EtOAc:THF:NaCl溶液=1:3:3:3
NMP:MeTHF:THF:NaCl溶液=1:3:3:3
NMP:トルエン:THF:NaCl溶液=1:3:3:3
水層中のNMP分率をGCによって測定した。実験結果を表1に要約する。
Example 1 Extraction of NMP in MeTHF / THF / NaCl Solution System, EtOAc / THF / NaCl Solution System, and Toluene / THF / NaCl Solution System The extractability of toluene / THF mixed solvent (invention) was measured as MeTHF / THF mixed solvent and EtOAc. Comparison with extractability of / THF mixed solvent (comparative example). The experiment was performed using an aqueous solution containing 150 g / L NaCl. No peptide was included in the system of this example.
The volume ratio was as follows.
NMP: EtOAc: THF: NaCl solution = 1: 3: 3: 3
NMP: MeTHF: THF: NaCl solution = 1: 3: 3: 3
NMP: toluene: THF: NaCl solution = 1: 3: 3: 3
The NMP fraction in the aqueous layer was measured by GC. The experimental results are summarized in Table 1.
上記の表1から明らかなように、トルエン/THF混合溶媒を用いて抽出を行うと、EtOAc/THFまたはMeTHF/THFを用いて抽出した場合よりも水層中のNMP分率が増加した。これに応じて、トルエン/THFを用いて抽出した後の有機層中のNMP含有量は、MeTHF/THFまたはEtOAc/THFを用いて抽出した場合よりも減少した。 As is clear from Table 1 above, when extraction was performed using a toluene / THF mixed solvent, the NMP fraction in the aqueous layer increased as compared with the case where extraction was performed using EtOAc / THF or MeTHF / THF. Correspondingly, the NMP content in the organic layer after extraction with toluene / THF was less than when extracted with MeTHF / THF or EtOAc / THF.
実施例2 H-Tyr(Bzl)-Leu-OBzlの合成
実施例2.1 Boc-Tyr(Bzl)-Leu-OBzlのLPPS
Boc-Tyr(Bzl)-OH(4.7g、12.7mmol)およびH-Leu-OBzl・Tos(5.0g、12.7mmol)を20℃でDMF(25mL)中に溶解した。反応混合物を-8℃に冷却し、次いでHOBt・H2O(2.0g、13.1mmol、1.0当量)およびEDC・HCl(2.8g、14.6mmol)を加えた。HPLCにより反応の完了が確認されるまで反応温度を-5〜-10℃の範囲に維持した。反応の進行は、反応混合物から得た試料5μLを酢酸:水(9:1)で50倍に希釈し、上記のMIH-009-2TG11法に従って分析することによりモニタリングした。
Example 2 Synthesis of H-Tyr (Bzl) -Leu-OBzl
Example 2.1 LPPS of Boc-Tyr (Bzl) -Leu-OBzl
Boc-Tyr (Bzl) -OH (4.7 g, 12.7 mmol) and H-Leu-OBzl · Tos (5.0 g, 12.7 mmol) were dissolved in DMF (25 mL) at 20 ° C. The reaction mixture was cooled to −8 ° C. and then HOBt · H 2 O (2.0 g, 13.1 mmol, 1.0 equiv) and EDC · HCl (2.8 g, 14.6 mmol) were added. The reaction temperature was maintained in the range of -5 to -10 ° C until the completion of the reaction was confirmed by HPLC. The progress of the reaction was monitored by diluting 5 μL of the sample obtained from the reaction mixture 50 times with acetic acid: water (9: 1) and analyzing according to the above-mentioned MIH-009-2TG11 method.
実施例2.2 Bocの切断:H-Tyr(Bzl)-Leu-OBzl
実施例2.1に従って調製した混合物にトルエン(90mL)を加え、以下のものにより反応混合物から順次抽出を行った。
1)20g/L NaClを含む水溶液(90mL)
2)150g/L NaClおよび50g/L NaHCO3を含む水溶液(90mL)
3)20g/L NaClおよび50g/L NaHCO3を含む水溶液(90mL)
4)20g/L NaClおよび50g/L NaHCO3を含む水溶液(90mL)
5)150g/L NaClを含む水溶液(90mL)
Example 2.2 Boc cleavage: H-Tyr (Bzl) -Leu-OBzl
Toluene (90 mL) was added to the mixture prepared according to Example 2.1 and extracted sequentially from the reaction mixture with:
1) Aqueous solution (90mL) containing 20g / L NaCl
2) Aqueous solution (90 mL) containing 150 g / L NaCl and 50 g / L NaHCO 3
3) Aqueous solution (90 mL) containing 20 g / L NaCl and 50 g / L NaHCO 3
4) Aqueous solution (90 mL) containing 20 g / L NaCl and 50 g / L NaHCO 3
5) Aqueous solution (90mL) containing 150g / L NaCl
次いで、合わせた有機層を体積が20mLになるまで減圧下35℃で濃縮した。 The combined organic layers were then concentrated under reduced pressure at 35 ° C. until the volume was 20 mL.
15℃でフェノール(0.25g、2.6mmol)およびTFA(20mL)を加えることによってBoc保護基を除去した。反応が完了したことをHPLCにより確認した後、減圧下35℃で反応混合物を蒸発させた。トルエン(3×25mL)と共蒸発させることによって残留TFAを除去した。反応の進行は、反応混合物から得た試料5μLをメタノールで30倍に希釈し、上記のMIH-009-2TG11法に従って分析することによりモニタリングした。 The Boc protecting group was removed by adding phenol (0.25 g, 2.6 mmol) and TFA (20 mL) at 15 ° C. After confirming the completion of the reaction by HPLC, the reaction mixture was evaporated at 35 ° C. under reduced pressure. Residual TFA was removed by coevaporation with toluene (3 × 25 mL). The progress of the reaction was monitored by diluting a sample of 5 μL obtained from the reaction mixture 30-fold with methanol and analyzing according to the above-mentioned MIH-009-2TG11 method.
実施例3(比較例) Boc保護基の除去に対する残留DMFの影響:H-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu-OBzl
Boc-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-OH(3.5g)、H-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu-OBzl(5.0g)およびHOBt(0.88g)をDMF(20mL)中に溶解した。EDC・HCl(1.2g)およびTEA(1.5mL)を加えて-6〜0℃で攪拌しながら一晩かけてカップリング反応を行った。HPLC(MIH-009-2TG11法)により反応の完了を確認した。
Example 3 (Comparative) Effect of residual DMF on removal of Boc protecting group: H-Pro-Ile-Leu-Pro-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu-OBzl
Boc-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-OH (3.5g), H-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu-OBzl (5.0g) and HOBt (0.88g) in DMF Dissolved in (20 mL). EDC.HCl (1.2 g) and TEA (1.5 mL) were added, and the coupling reaction was performed overnight with stirring at -6 to 0 ° C. Completion of the reaction was confirmed by HPLC (MIH-009-2TG11 method).
反応混合物を濾過して不溶性塩類を除去した。反応混合物から得た試料1mLを以下の表2に記載の有機溶媒と混合し、次いでNaCl(15%w/v)およびNa2CO3(2.5%w/v)からなる水溶液3mLによる抽出を行った。有機層中のDMF含有量はGCによって決定した。 The reaction mixture was filtered to remove insoluble salts. 1 mL of a sample obtained from the reaction mixture is mixed with the organic solvent described in Table 2 below, and then extracted with 3 mL of an aqueous solution consisting of NaCl (15% w / v) and Na 2 CO 3 (2.5% w / v). It was. The DMF content in the organic layer was determined by GC.
EtOAcにより抽出(試験No.2)を行うと、DCMにより抽出(試験No.1)を行った場合よりも有機層中のDMF含有量が減少した。 Extraction with EtOAc (Test No. 2) reduced the DMF content in the organic layer compared to extraction with DCM (Test No. 1).
試験No.1および2で得られた材料を以下のようにさらに処理した。有機層を分離し、トルエンとの共蒸発を3回行うことによって溶媒を交換した(浴温=40℃、圧力=50mbar)。揮発性溶媒を完全に蒸発させた後、トルエン(4mL)およびフェノール(0.05g)を蒸発残留物に加えた。TFA(3.5mL)を加えることによってBocの切断を0℃で行った。この反応はHPLC(MIH-009-2TG11法)によりモニタリングした。 The materials obtained in tests No. 1 and 2 were further processed as follows. The organic layer was separated and the solvent was changed by co-evaporation with toluene three times (bath temperature = 40 ° C., pressure = 50 mbar). After complete evaporation of the volatile solvent, toluene (4 mL) and phenol (0.05 g) were added to the evaporation residue. Boc cleavage was performed at 0 ° C. by adding TFA (3.5 mL). This reaction was monitored by HPLC (MIH-009-2TG11 method).
得られた結果を表3に要約し図1のグラフに示す。 The results obtained are summarized in Table 3 and shown in the graph of FIG.
結果
得られた材料中の微量のDMFはBoc保護基の除去を著しく抑制した。したがって、DCMを用いて抽出した材料におけるBocの切断の進行は、EtOAcを用いて抽出した材料の場合と比較して顕著に遅かった。
Traces of DMF results obtained in the material significantly inhibited the removal of the Boc protecting group. Therefore, the progress of Boc cleavage in the material extracted with DCM was significantly slower than that of the material extracted with EtOAc.
本発明の抽出方法を使用することによって、単離したペプチドからDMFなどの極性非プロトン性溶媒を効率的に分離することができる。したがって、本発明の抽出方法により単離したペプチド材料の酸分解切断は速やかに進行すると予想される。 By using the extraction method of the present invention, a polar aprotic solvent such as DMF can be efficiently separated from the isolated peptide. Therefore, it is expected that the acidolytic cleavage of the peptide material isolated by the extraction method of the present invention will proceed rapidly.
実施例4(比較例) Boc-Ser(OBzl)-OHとH-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr-Leu(OBzl)とのカップリング
Boc-Ser(OBzl)-OH(1.62g、5.5mmol)を20℃でDMF(25mL)中に溶解し、粗生成物であるH-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr-Leu(OBzl)に加えた。HOBt・H2O(0.89g、5.8mmol)およびEDC・HCl(1.2g、6.3mmol)を加え、反応混合物を5℃に冷却した。反応の完了がHPLCにより確認されるまで反応混合物をこの温度で維持した。反応の進行は、反応混合物から得た試料5μLを酢酸:水(9:1)で50倍に希釈し、上記のMIH-009-2TG11法に従って分析することによりモニタリングした。
Example 4 (Comparative Example) Coupling of Boc-Ser (OBzl) -OH with H-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr-Leu (OBzl)
Boc-Ser (OBzl) -OH (1.62 g, 5.5 mmol) was dissolved in DMF (25 mL) at 20 ° C. and the crude product H-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl ) -Glu (OBzl) -Tyr-Leu (OBzl). HOBt · H 2 O (0.89 g, 5.8 mmol) and EDC · HCl (1.2 g, 6.3 mmol) were added and the reaction mixture was cooled to 5 ° C. The reaction mixture was maintained at this temperature until completion of the reaction was confirmed by HPLC. The progress of the reaction was monitored by diluting 5 μL of the sample obtained from the reaction mixture 50 times with acetic acid: water (9: 1) and analyzing according to the above-mentioned MIH-009-2TG11 method.
a)MeTHFによる抽出およびDIPE中における沈殿
Boc-Ser(Bzl)-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu(OBzl) 5gを含む反応混合物25mLを、100g/L NaClを含む水溶液(75mL)およびMeTHF(75mL)と混合した。十分に混合し相分離(約4分間)させた後、下層の水層を除去した。さらに、100g/L NaClを含む水溶液(3×75mL)を用いて上層の有機層からの抽出を3回行った。次いで有機層を単離し、残量が10mLになるまで30℃、60mbarで部分的に蒸発させた。0℃においてDIPE(250mL)を攪拌しながら、部分的に蒸発させた有機層を滴下することによってペプチドを沈殿させた。得られた混合物を、孔径20μmのフィルターを備えた直径2.7cmの濾過カラムに移した。50mbarの圧力下で濾過を行った。沈殿母液の全量(260mL)を濾過するのに3分45秒を要した。濾過後のケーキの高さは3.5cmであり、これより濾過係数(K)=848が得られた。固形物を回収し減圧下で乾燥した。ペプチド4.5gを固形物として単離した。
a) Extraction with MeTHF and precipitation in DIPE
25 mL of a reaction mixture containing 5 g of Boc-Ser (Bzl) -Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu (OBzl), 100 g / L NaCl Mixed with an aqueous solution containing (75 mL) and MeTHF (75 mL). After thoroughly mixing and phase separation (about 4 minutes), the lower aqueous layer was removed. Furthermore, extraction from the upper organic layer was performed three times using an aqueous solution (3 × 75 mL) containing 100 g / L NaCl. The organic layer was then isolated and partially evaporated at 30 ° C. and 60 mbar until the remaining volume was 10 mL. The peptide was precipitated by dropwise addition of the partially evaporated organic layer while stirring DIPE (250 mL) at 0 ° C. The resulting mixture was transferred to a 2.7 cm diameter filtration column equipped with a 20 μm pore size filter. Filtration was carried out under a pressure of 50 mbar. It took 3 minutes and 45 seconds to filter the entire amount (260 mL) of the precipitated mother liquor. The height of the cake after filtration was 3.5 cm, and from this, a filtration coefficient (K) = 848 was obtained. The solid was collected and dried under reduced pressure. Peptide 4.5 g was isolated as a solid.
図2に、単離したペプチドの写真(40倍拡大)を示す。 FIG. 2 shows a photograph of the isolated peptide (magnification 40 times).
抽出工程により得られた水層および沈殿母液をHPLCで分析した。検出されたペプチドの量は、実施例4により得られた反応混合物25mLに含まれる総ペプチド量の0.5重量%未満であった。 The aqueous layer and precipitated mother liquor obtained by the extraction process were analyzed by HPLC. The amount of peptide detected was less than 0.5% by weight of the total amount of peptide contained in 25 mL of the reaction mixture obtained in Example 4.
b)比較例:沈殿母液へのDMF添加による影響
ペプチドの濾過を行う前にDMF(2.5mL)を沈殿混合物に加えたこと以外は上記a)と同様に抽出および沈殿操作を行った。固形沈殿は直ちにゴム状固形物を形成し、濾過を行うことはできなかった。
b) Comparative example: Effect of addition of DMF to the precipitation mother liquor Extraction and precipitation were carried out in the same manner as in a) above except that DMF (2.5 mL) was added to the precipitation mixture before the peptide was filtered. The solid precipitate immediately formed a rubbery solid and could not be filtered.
c)比較例:DIPE中における直接沈殿
0℃においてDIPE(250mL)を攪拌しながら、Boc-Ser(Bzl)-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu(OBzl) 5gを含む実施例4において得られた反応混合物25mLを滴下し、沈殿物を生じさせた。粘着性を有するゴム状固形物としてペプチド沈殿物が得られた。二層分離後、上清をポンプで吸引して第2バッチ用のDIPE(250mL)と交換した。得られた混合物を1時間攪拌して、粘着性を有するゴム状固形物の凝集を解砕させた。二層分離後、上清を第3バッチ用のDIPE(250mL)と再度交換した。混合物を再度1時間攪拌し、次いで濾過カラムに移した。しかしながら、固形物の大部分は沈殿容器に付着したまま粘着性ゴム状固形物の形態を保ち、移動させることは不可能であった。母液の濾過には2分30秒を要し、ケーキの高さは1.75cmであった。これより濾過係数(K)=636が得られた。回収した固形物を減圧下で乾燥させた。
c) Comparative example: direct precipitation in DIPE
While stirring DIPE (250 mL) at 0 ° C., Boc-Ser (Bzl) -Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu (OBzl) 25 mL of the reaction mixture obtained in Example 4 containing 5 g was added dropwise to form a precipitate. Peptide precipitates were obtained as sticky rubbery solids. After bilayer separation, the supernatant was aspirated with a pump and replaced with a second batch of DIPE (250 mL). The resulting mixture was stirred for 1 hour to break up the aggregation of sticky rubber-like solids. After bilayer separation, the supernatant was replaced again with DIPE (250 mL) for the third batch. The mixture was stirred again for 1 hour and then transferred to a filtration column. However, most of the solids remain in the form of sticky rubbery solids while remaining attached to the precipitation vessel, and cannot be moved. Filtration of the mother liquor took 2 minutes 30 seconds, and the cake height was 1.75 cm. As a result, a filtration coefficient (K) = 636 was obtained. The collected solid was dried under reduced pressure.
ペプチド2.45gが単離された。 2.45 g of peptide was isolated.
d)比較例:水中における直接沈殿
0℃において水(250mL)を攪拌しながら、Boc-Ser(Bzl)-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu(OBzl) 5gを含む実施例4において得られた反応混合物25mLを滴下し、沈殿物を生じさせた。非常に薄い沈殿物の層が得られ、次いでこれを濾過カラムに移した。濾過速度は非常に遅く(<3mL/h)、濾過の最初の段階において多量の沈殿物がフィルターを通過し、約65分後には明らかなフィルターの閉塞が見られた。さらに、透明な沈殿上清は得られなかった。したがって、得られた沈殿物を回収することは不可能であった。
d) Comparative example: direct precipitation in water
While stirring water (250 mL) at 0 ° C, Boc-Ser (Bzl) -Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu (OBzl) 25 mL of the reaction mixture obtained in Example 4 containing 5 g was added dropwise to form a precipitate. A very thin layer of precipitate was obtained, which was then transferred to a filtration column. The filtration rate was very slow (<3 mL / h), with a large amount of precipitate passing through the filter in the first stage of filtration, and apparent filter clogging after about 65 minutes. Furthermore, a clear precipitation supernatant was not obtained. Therefore, it was impossible to recover the obtained precipitate.
結果
DMFの存在下でペプチドBoc-Ser(Bzl)-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu(OBzl)を沈殿させると(実施例b)〜d))、ゴム状固形物が形成された。この固形物は取り扱いが困難であった。実施例a)では、微量に含まれていたDMFを抽出により実質的に除去した後、ペプチドBoc-Ser(Bzl)-Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu(OBzl)-Glu(OBzl)-Tyr(Bzl)-Leu(OBzl)を沈殿させた。得られた生成物は良好な収率で単離することができ、容易に濾過することができた。
result
Peptide Boc-Ser (Bzl) -Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl) -Glu (OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu (OBzl) in the presence of DMF Examples b) to d)), rubbery solids were formed. This solid was difficult to handle. In Example a), DMF contained in a trace amount was substantially removed by extraction, and then the peptide Boc-Ser (Bzl) -Phe-Pro-Ile-Leu-Pro-Pro-Glu (OBzl) -Glu ( OBzl) -Tyr (Bzl) -Leu (OBzl) was precipitated. The resulting product could be isolated in good yield and easily filtered.
本発明の抽出方法を使用することによって、ペプチドからDMFなどの極性非プロトン性溶媒を効率的に分離することができる。したがって、ペプチドの沈殿過程を阻害するといった極性非プロトン性溶媒が及ぼす望ましくない影響を排除することができる。 By using the extraction method of the present invention, polar aprotic solvents such as DMF can be efficiently separated from peptides. Thus, the undesirable effects of polar aprotic solvents such as inhibiting the peptide precipitation process can be eliminated.
Claims (16)
該反応混合物が、ペプチドと、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミドおよびN−メチル−2−ピロリドンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒とを含むこと;
該方法が、
a)該反応混合物にトルエンである成分a1)と水である成分a2)とを加えて、有機層および水層からなる二相系を得ることを含む工程、および
b)ペプチドを含む有機層と水層を分離することを含む工程
を含むこと;ならびに
工程a)で得られる該二相系の体積組成比が、
極性非プロトン性溶媒:トルエン=1:20〜1:2、および
極性非プロトン性溶媒:水=1:20〜1:2であること
を特徴とする方法。 A method for extracting a peptide from a reaction mixture obtained by a peptide coupling reaction,
The reaction mixture comprises a peptide and a polar aprotic solvent selected from the group consisting of N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide and N-methyl-2-pyrrolidone;
The method is
a) adding to the reaction mixture component a1) which is toluene and component a2) which is water to obtain a two-phase system consisting of an organic layer and an aqueous layer, and b) an organic layer containing a peptide Including a step comprising separating the aqueous layer; and the volume composition ratio of the two-phase system obtained in step a)
A polar aprotic solvent: toluene = 1: 20 to 1: 2, and a polar aprotic solvent: water = 1: 20 to 1: 2.
工程a)で得られる該二相系の体積組成比が、
極性非プロトン性溶媒:トルエン=1:20〜1:2、
極性非プロトン性溶媒:有機溶媒1=1:5〜30:1、および
極性非プロトン性溶媒:水=1:20〜1:2であること
を特徴とする請求項1に記載の方法。 In step a), component a3) which is an organic solvent 1 selected from the group consisting of n-heptane, 2-methyltetrahydrofuran, ethyl acetate, isopropyl acetate, acetonitrile and tetrahydrofuran is further added to the reaction mixture, the organic layer and Obtaining a two-phase system comprising an aqueous layer; and the volume composition ratio of the two-phase system obtained in step a)
Polar aprotic solvent: toluene = 1: 20-1: 2,
The method according to claim 1, wherein polar aprotic solvent: organic solvent 1 = 1: 5 to 30: 1 and polar aprotic solvent: water = 1: 20 to 1: 2.
極性非プロトン性溶媒:トルエン=1:6〜1:3、
極性非プロトン性溶媒:有機溶媒1=1:1〜4:1、および
極性非プロトン性溶媒:水=1:5〜1:3であること
を特徴とする請求項2に記載の方法。 The volume composition ratio of the two-phase system obtained in step a) is
Polar aprotic solvent: toluene = 1: 6 to 1: 3
3. The method according to claim 2, wherein the polar aprotic solvent: organic solvent 1 = 1: 1 to 4: 1, and the polar aprotic solvent: water = 1: 5 to 1: 3.
aa)カップリング試薬の存在下において、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミドおよびN−メチル−2−ピロリドンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒中でペプチドカップリング反応を行う工程;
bb)得られたペプチドを、請求項1〜10の1項以上に記載の方法によって抽出する工程;ならびに
cc)工程bb)において得られた有機層の少なくとも一部を蒸発させる工程
を含む方法。 A method for preparing a peptide in a liquid phase, comprising:
aa) In the presence of a coupling reagent, the peptide coupling reaction is carried out in a polar aprotic solvent selected from the group consisting of N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide and N-methyl-2-pyrrolidone. Performing steps;
bb) extracting the obtained peptide by the method according to one or more of claims 1 to 10; and cc) evaporating at least part of the organic layer obtained in step bb).
ee)前記ペプチドの少なくとも大部分を沈殿させる工程;ならびに
ff)沈殿させたペプチドを濾別する工程
をさらに含む請求項10〜12の1項以上に記載の方法。 dd) mixing the organic layer obtained in step cc) with an organic solvent 2 selected from the group consisting of acetonitrile, diethyl ether, diisopropyl ether and n-heptane;
13. The method according to one or more of claims 10 to 12, further comprising: ee) precipitating at least a majority of the peptide; and ff) filtering the precipitated peptide.
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