JP2013509415A - 抗体グリコシル化変異型 - Google Patents
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Abstract
Description
AA=アントラニル酸、α1,3GT=α−1,3−ガラクトシルトランスフェラーゼ、ARD=急性呼吸困難、β1,4GT=β−1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼ、α2,3ST=α−2,3−シアリルトランスフェラーゼ、ADCC=抗体依存性細胞毒性、CDC=補体依存性細胞毒性、CMP−Sia=シチジンリン酸N−アセチルノイラミン酸、FBS=ウシ胎児血清、IgG=免疫グロブリンG、MALDI−TOF−MS=マトリックス支援レーザー/脱着イオン化時間のフライト質量分析、NANA=シアル酸のN−アセチルノイラミン酸異性体、NGNA=シアル酸のN−グリコノイラミン酸異性体、OA=変形性関節症、PNGase F=ペプチドN−グリコシダーゼF、HPLC=逆相高性能液体クロマトグラフィー、RA=関節リウマチ、SA=シナピン酸、Sia=シアル酸、SDHB=塩化ナトリウムを含有するジヒドロキシ安息香酸、UDP−Gal=ウリジン二リン酸ガラクトース、UDP−GlcNAc=ウリジン二リン酸N−アセチルグルコサミン。
本明細書で使用するとき、「Fc」、「Fc含有タンパク質」又は「Fc含有分子」という用語は、少なくとも免疫グロブリンCH2及びCH3ドメインを有する単量体、二量体、又はヘテロ二量体タンパク質を指す。CH2及びCH3ドメインは、タンパク質/分子(例えば、抗体)の二量体領域の少なくとも一部を形成することができる。
本発明は、PEG化のためのFcドメイン上の新しい部位を識別することにおける関心により促進された。修飾のための特定標的部位を提供する、PEG部分のタンパク質のグリカンへの接合のための技術が知られていることから、Asn297位での天然グリカンの使用が試みられたが、Fc二量体構造の三級及び四級構造に起因して、天然Fcグリカンは、大きいPEG構造の接合を可能にするために十分にはアクセス可能でないことが示された。
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細胞からの輸送のための信号配列によって指定されたタンパク質の通常処理として、真核細胞の小胞体内で起こるグリコシル化の結果として、分泌されたタンパク質上に特定のオリゴ糖が存在する。タンパク質に付着したオリゴ糖組成物は、タンパク質の性質、細胞の起源の種、培養状態、及び細胞外環境等の因子によって影響を受ける。種による、又は更には個人による「グライコーム」の性質は、抗原エピトープ、例えば、ヒト血液基の源として長く認識されている。したがって、タンパク質表面グリコシル化は、特定のグリカン構造又は末端サッカリドの特異的又は非特異的受容体を標的することによって、タンパク質の認識を変更する方法を表す。哺乳類受容体のオリゴ糖又はリガンドは、セレクチン等のレクチン、例えば、マンノース結合タンパク質、L−セレクチン、及びP−セレクチンに類似する。
付加的なグリコシル化の部位は、Fc構造又は機能に影響することなく、Asn連結グリカンを付加するという要望に基づいて選択された。IgG4 Fc構造(1adq)(Corperら(1997)Nat Struct Biol.4:374)を分析して、修飾の潜在的部位を分析した。下部ヒンジにおいてFc(γ)R結合部位から遠位にあり、及びCH2−CH3接合領域においてFcRn結合部位から遠位にある、CH3ドメインのループ領域が標的とされた。359−TKNQVS−364、382−ESNGQP−387、及び419−EGNVFS−424ループは、修飾の影響を受けやすいと思われる残基を含有する。これらのループ内で、残基359、382、及び419は、曝露される表面に基づいて、及び得られるグリコシル化によるAsn置換は、構造的に適合性があるという予測に基づいて、グリコシル化を導入するために魅力的な部位として同定された。次に、多数のN−グリコシル化配列モチーフ(NXS/T)が、これらの位置にコンピュータ的に作られ、及び配列をNetNGlycサーバ(www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc)に提出することによってグリコシル化に対するそれらの可能性を推定した。スコアが0.5以下のモチーフは末梢された。試験分子への導入のために選択されたモチーフは、359NKT及び419NGTであった(図1)。382部位は、新しいグリカンがFcRn結合を干渉する方向を指し得ることを考慮して、遂行されなかった。しかしながら、残基382におけるグリコシル化部位の導入は、完全に機能的なFcドメインを産出することが可能である。
特定のグリカン構造又は特定のオリゴ糖含有量を有するFc含有タンパク質を調製するための一方法は、Fc含有タンパク質調製物をサッカラーゼ、例えば、フコシダーゼ又はシアリダーゼ酵素で処理することにより、それによって、特定の糖残基、例えば、フコース又はシアル酸を除去する。糖をFc領域に付加することは、インビトログリコシル化方法を使用して達成することもできる。
ペプシンは、食後に胃の内腔に分泌される胃液の通常構成成分であるため、自己活性化され、及び低pHで活性である。低レベルの前駆体酵素ペプシノゲンは、血清中で認めることができるが、活性化及び活性は酸依存であるため、循環する抗体に生理学的に関連しない。ペプシンは、下部ヒンジにおいてロイシン234とロイシン235の間のヒトIgG1を開裂する。この開裂部位は、抗原結合に対して二価である、F(ab’)2分子を形成するジスルフィド結合を介して、2つの重鎖を連結する、2つのシステイン残基を含有するヒンジコア(−C−P−P−C−)から下流にある。
Fc含有タンパク質は、幾つかのよく知られているインビトロアッセイによって、機能性について比較することができる。特に、Fcv受容体のFcγRI、FcγRII、及びFcγRIII群のメンバーに対する親和性が関心対象である。これらの測定値は、受容体の組み換え可溶型又は受容体の細胞結合型を使用して形成することができる。更に、FcRnに対する親和性、IgGの延長された循環半減期に応答可能な受容体は、組み換え可溶型FcRnを使用して、例えば、BIAcoreによって測定することができる。ADCCアッセイ及びCDCアッセイ等の細胞ベースの機能性アッセイは、特定の変異型構造の可能な機能性の結果に関する見識を提供する。一実施形態において、ADCCアッセイは、主要なエフェクター細胞であるNK細胞を有するように構成され、それによって、FcγRIIIA受容体上で機能的効果を反映させる。過酸化又は炎症媒介放出等の細胞応答を測定できるように、食作用アッセイを使用して、異なる変異型の免疫エフェクター機能を比較することもできる。インビボモデルも同様に、例えば、抗CD3抗体の変異型を使用して、マウスにおけるT細胞活性を測定する場合に使用することができ、活性は、Fcγ受容体等の特定リガンドを係合するFcドメインに依存する。
Fc含有タンパク質の生成に関与する異なるプロセスは、Fcオリゴ糖構造に影響を及ぼし得る。一例では、Fc含有タンパク質を分泌する宿主細胞は、以前には、高い熱処理(例えば、56℃で30分間)に供されていなかった血清、例えば、ウシ胎児血清(FBS)の存在下で培養される。これは、それらの細胞から分泌されたFc含有タンパク質からシアル酸を除去することができる、活性シアリダーゼ酵素の血清中に自然に存在することに起因して、シアル酸を含有しないか、又は極めて少量を含有するFc含有タンパク質をもたらし得る。別の実施形態において、Fc含有タンパク質を分泌する細胞は、上昇した熱処理に供され、それによってシアリダーゼ酵素を不活性化する血清の存在下、又はシアリダーゼ酵素を含有し得る血清若しくは他の媒質構成成分の非存在下のいずれかで培養され、Fc含有タンパク質が、より高いか又は低いレベルのグリコシル化若しくはグリコシル化変異型を有するようにする。
本明細書に記載されるように、組み換えFc含有タンパク質又はモノクローナル抗体の発現に対して選択される宿主細胞は、最終組成物に対する重要な寄与因子であり、免疫グロブリンCH2ドメインにおいてタンパク質を修飾するオリゴ糖部分の組成物における変異を含むが、これに限定されない。したがって、本発明の一態様は、所望の治療的タンパク質を発現する生成細胞の使用及び/開発に適切な宿主細胞の選択を伴う。
本出願に記載される抗体は、あらゆる哺乳類、例えば、非限定的にヒト、マウス、ウサギ、ラット、げっ歯類、霊長類、ヤギ、若しくはそれらの組み合わせを含むか、又はそれらに由来することができ、単離されたヒト、霊長類、げっ歯類、哺乳類、キメラ、ヒト化及び/又はCDR移植された抗体、免疫グロブリン、開裂生成物、及び他の特定部分、ならびにそれらの変異型を含む。
上述される方法のいずれかによって生成される組成物(抗体、Fc融合、Fc断片)を使用して、細胞、組織、器官、流体、又は一般的に宿主において、ヒト疾患又は特定病理を診断、治療、検出、又は調節してもよい。本明細書で教示されるように、抗体のFc部分、Fc融合タンパク質、又はFc断片のグリコシル化を修飾して、治療の標的である流体、区画、組織、又は器官中に存在することが知られているプロテアーゼによるタンパク質分解消化に対する耐性を使用して、治療的分子を生成することができ、これらの分子は、それらの元の標的特性を維持してもよく、これらのプロテアーゼによる分解を起こす傾向が低下する。
米国特許第7,393,662号において、EPO MIMETIBODY(商標)構造物(Fc融合)として記載されるEMP−1Fc融合(CNTO530)、及び国際特許第WO/05097175号に記載されるGLP−1 MIMETIBODY(商標)構造物(Fc融合)(CNTO736)に関して実験を行った。両方の構造物は、図1に示されるように、ヒトIgG4抗体に由来するFc領域を含有する。
プラスミドコード化CNTO530、p2630を出発物質として使用し、標準組み換えPCR及びクローニング方法を使用して、NEM2631を調製した。T359N/N361T置換をEPO MIMETIBODY(商標)構造物CNTO 530に導入するために、CH3コード化制限断片を、NEM 2631 T359N/N361Tプラスミドp3051から単離し、プラスミドp2630コード化CNTO 530において対応する断片の代わりにクローン化した。得られるプラスミド、p3201は、タンパク質CNTO 530 T359N/N361Tをコード化し、本明細書において、CNTO 5303と称される(図2及び表1を参照)。
T359N/N361T置換をCNTO 736に導入するために、CH3コード化制限断片を、NEM 2631 T359N/N361Tプラスミドp3051から単離し、プラスミドp2538コード化CNTO 736において対応する断片の代わりにクローン化した。得られるプラスミドは、CNTO 736 T359N/N361Tをコード化するp3349であり、本明細書においてCNTO 7363と称される(表1)。
一連の分析的な生物物理学的な生物活性試験は、実施例1の発現構造物に関して行った。
精製したCNTO 530、CNTO 5303、及びCNTO 5304は、SDS−PAGEによって、非還元条件下、1.0mm厚のBisTris 4〜12%勾配ゲルに1μg/レーンを負荷し、MOPS SDSランニング緩衝液中の分留を200Vで50分間実行することによって分析された。ゲルは、クマシーG250(SimplyBlue Safe Stain,Invitrogen)で染色し、得られた画像は、Alphalmager 2200撮像システム(Alpha Innotech)を使用して捕捉した(図4)。
新しいグリコシル化を導入する場所の選択における1つの要因は、FcRn結合領域を回避するという要請であり、CNTO 5303によるFcRnへの結合は、AlphaScreenを使用してCNTO 530と比較した。2つのMIMETIBODY(商標)構造物試料は、パッケージの指示書のとおり、Slide−A−Lyzer MINI透析ユニット(10K MWCO、Thermo Scientific(Pierce))を使用して、pH 6.0アッセイ緩衝液(0.05M MES、0.025% BSA、0.001% Tween 20、pH 6.0)中、4℃で一晩透析した。抗体濃度は、OD280によって決定した。次に、96ウェル、半領域、平底、非結合、白色ポリスチレンアッセイプレートにおいて室温で1時間混合しながら以下の成分を共インキュベートした:ビオチニル化ヒトIgG1 mAb(CNTO 6234、最終濃度4μg/mL)、連続希釈した試験試料、ポリヒスチジンタグ付けされたヒトFcRn(最終濃度8μg/mL)、AlphaScreenニッケルキレート受容体ビーズ(最終濃度100μg/mL)、及びAlphaScreenストレプトアビジンコーティングされたドナービーズ(最終希釈1:250)。すべての材料は、上述されるように、アッセイ緩衝液を使用して希釈した。インキュベーション後、プレートは、AlphaAcreenプロトコルを使用して、EnVision器具上で読み取った。結果(図5)は、CNTO 5303が、類似する親和性(KD CNTO 530よりもわずか2倍弱い)を有するFcRnと結合したことを示し、FcRn結合がCNTO 5303において保存されたことを示す。
次に、精製したMIMETIBODY(商標)分子は、2つのヒトプロテアーゼ、組み換えマトリックスメタロプロテイナーゼ−3(MMP−3)及び好中球エラスターゼ(NE)に対するそれらの相対感受性について評価した。下部ヒンジにおける228SCPAP配列後に開裂すると考えられるMMP−3は、ポリHisタグ付プロMMP−3としてHEK細胞内の一時発現、Talon親和性カラムによる精製、及びアリコート中の凍結によって、Centocorにおいて調製された。通常、220CDKT上部ヒンジ配列後に主に開裂するが、下部ヒンジにおける二次部位で開裂することもできる(以下参照)ヒトNEは、Athens Research and Technologies(Athens,GA)から得られた。
MMP−3.凍結MMP−3を融解した後、MMP−3消化を行う前に、55℃で25分間インキュベートすることによって活性化した。最大1mg/mLの精製MIMETIBODY(商標)構造物試料は、2mM塩化カルシウムを含有するpH 7.0の20mMトリスHCl緩衝液中の活性化MMP3(1:50、w/w)を用いて37℃で処理した。アリコート(最大2μl)を固定した時間間隔(0、0.5、1、2、4、6、8、及び24時間)で採取し、2μlのマトリックス溶液で即時に混合した(マトリックス溶液は、0.1%トリフルオロ酢酸を含有する水中の1.0mL 50%アセトニトリルに10mgのシナピン酸を溶解することによって調製した)。2μlのこの溶液をMALDI標的プレート上に装填し、以下に記述される質量スペクトル解析の前に空気乾燥させた。
この研究において、CNTO 530のグリコシル化変異体の薬物動態を、マウスにおいて比較した。Charles Rivers Laboratories(Raleigh,NC)からの通常の健康な雌Balb/cマウス、8〜12週齢(約18〜22g)を、体重別にランダム化し、プラスチックフィルターで蓋をしたケージに群で収容し(4匹/ケージ)、市販のげっ歯類食餌及び酸性化水を不断供給した。マウス(4匹/試験物品)に、1mg/kgの投与量を達成するために、Dulbecco PBS中0.1mg/mLで製剤された10mL/kg投与量のCNTO 530又はCNTO 5303のいずれかを腹腔内注入した。
Claims (27)
- ループ構造の末端においてN−グリコシル化部位を有する抗体Fcドメインを含むプロテアーゼに対する増大した耐性を有するFc含有分子。
- FcドメインがIgG4であり、前記N−グリコシル化部位がCH3ドメイン内にある、請求項1に記載のFc含有分子。
- 前記N−グリコシル化部位が、タンパク質分解開裂部位から遠位にある、請求項1に記載のFc含有分子。
- 前記Fcドメインが、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4分子のうちのいずれかに由来する、請求項1に記載のFc含有分子。
- 前記Fc含有分子が、抗体又はFc融合タンパク質である、請求項1に記載のFc含有分子。
- 前記プロテアーゼが、ペプシン、プラスミン、トリプシン、キモトリプシン、マトリックスメタロプロテイナーゼ、セリンエンドペプチダーゼ、及びシステインプロテアーゼからなる群から選択される、請求項1に記載のFc含有分子。
- 前記プロテアーゼが、ゼラチナーゼA(MMP2)、ゼラチナーゼB(MMP−9)、マトリックスメタロプロテイナーゼ−7(MMP−7)、ストロメライシン(MMP−3)、及びマクロファージエラスターゼ(MMP−12)からなる群から選択されるマトリックスメタロプロテイナーゼである、請求項6に記載のFc含有分子。
- 前記Fcドメインが、残基359、382、及び419のうちの少なくとも1つにおけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を呈する、請求項1に記載のFc含有分子。
- 前記Fcドメインが、前記Fcドメインの残基359、382、及び419におけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を呈する、請求項8に記載のFc含有分子。
- 前記Fcドメインが、前記Fcドメインの残基359、382、及び419におけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を呈し、前記Fcドメインの残基297におけるN−グリコシル化部位が除去される、請求項8に記載のFc含有分子。
- 残基299がThrからAsnに変更され、残基359がThrからAsnに変更され、残基361がAsnからThrに変更され、残基419がThrからAsnに変更され、及び残基421がAsnからThrに変更される、請求項10に記載のFc含有分子。
- 前記Fcドメインが、残基359、361、419、及び421のうちの少なくとも1つにおいて、野生型からの変更を有する、請求項8に記載のFc含有分子。
- 残基359がThrからAsnに変更され、及び残基361がAsnからThrに変更され、及び/又は残基419がThrからAsnに変更され、及び残基421がAsnからThrに変更される、請求項12に記載のFc含有分子。
- 前記Fcドメインが、残基359、361、419、及び421において、野生型からの変更を有する、請求項12に記載のFc含有分子。
- 残基359がThrからAsnに変更され、残基361がAsnからThrに変更され、残基419がThrからAsnに変更され、及び残基421がAsnからThrに変更される、請求項14に記載のFc含有分子。
- EU番号付けに相関して、ヒンジ領域内の残基228、234、及び235のうちの少なくとも1つが変更される、請求項1に記載のFc含有分子。
- プロテアーゼに対して増大した耐性を有するFc含有分子であって、抗体Fcドメインの残基359、382、及び419におけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を有する前記Fcドメインを含み、前記Fcドメインの残基297におけるN−グリコシル化部位が除去され、前記Fcドメインが、残基299、359、361、419、及び421において、野生型からの変更を有する、Fc含有分子。
- EU番号付けに相関して、ヒンジ領域内の残基228、234、及び235のうちの少なくとも1つが変更される、請求項17に記載のFc含有分子。
- プロテアーゼの放出を特徴とする疾患を治療するための方法であって、対象又は患者にグリコシル化Fc含有タンパク質調製物を投与する工程を含み、前記抗体調製物が、野生型から変更された残基を有し、前記残基が、下部ヒンジ内のFcγR結合部位から遠位にあるか又はCH2〜CH3接合領域においてFcRn結合領域から遠位にある、方法。
- プロテアーゼによる開裂に対するFc含有タンパク質の耐性を増大させる方法であって、359位、382位、及び419位のうちの少なくとも1つにおけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を前記Fc含有タンパク質に付加する工程を含む、方法。
- 359位、382位、及び419位におけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を前記Fc含有タンパク質に付加する工程を含む、請求項20に記載の方法。
- 297位におけるEU番号付けに相関する前記N−グリコシル化部位を除去する工程を更に含む、請求項21に記載の方法。
- プロテアーゼによる開裂に対するFc含有タンパク質の感受性を変更する方法であって、残基359、382、及び419におけるEU番号付けに相関する前記Fc含有タンパク質配列のN−グリコシル化部位を変更する工程を含む、方法。
- 359位、382位、及び419位におけるEU番号付けに相関するN−グリコシル化部位を前記Fc含有タンパク質に付加する工程を含む、請求項23に記載の方法。
- 297位におけるEU番号付けに相関する前記N−グリコシル化部位を除去する工程を更に含む、請求項24に記載の方法。
- EU番号付けに相関して、ヒンジ領域内の残基228、234、及び235のうちの少なくとも1つを、野生型から変更する工程を更に含む、請求項23に記載の方法。
- 本明細書に記載されたいずれかの発明。
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