JP2012170337A - 核酸配列解析装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】水平駆動ステージ上に冷媒循環型の温度調整ユニットを搭載し、当該温度調整ユニットによりフローセルの載置面温度を所定の温度に調整する、核酸配列解析装置。
【選択図】図1
Description
本明細書において、「核酸配列」は、核酸材料それ自体も含むものとする。また、「核酸配列」は、特定の核酸、例えばDNA又はRNA分子を生化学的にキャラクタライズする配列情報(すなわち、5つの塩基の文字A、G、C、T又はUから選択される文字の連続)に限定されないものとする。
図1に、XYステージを実装するシーケンサの概略構成例を示す。ここでのシーケンサは、XYステージの水平駆動により、反応溶液が注入されたフローセルを所望の反応領域又は観察領域に位置決めする。また、ここでのシーケンサは、核酸配列の増幅(伸張)に、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR:Polymerase Chain Reaction)法を使用する。PCR法は、反応溶液の温度を予め定められた条件に従って制御することにより、所望の核酸配列を選択的に増幅する手法である。
(1)チューブ外径:8mm以下であること。
(2)柔軟性:曲げ半径が20mm以下であること。
(3)耐熱性:230℃以上まで耐えられること。
(4)可撓性:1000万回の湾曲動作後も使用に耐え得ること。
(5)水分透過性:50ml以下であること。
(6)腐食性:ハロゲン溶出が100ppm以下であること。
(7)耐熱温度(1000時間後の伸びが50%に達する温度):120℃以上
(8)耐オゾン性(50pphm、40℃のオゾンに200時間曝した状態で30%伸張させた場合における亀裂の有無):亀裂が無い
(9)圧縮永久歪率:10以下
ここでは、前述したシーケンサのより具体的な構成例を示す。図5に光学系19の具体的な構成を示し、図6に温度調整ユニット13の具体的な構成を示す。なお、図5及び図6には、図1との対応部分に同一符号を付して示す。
ここでは、前述した実施例に対する変形例を説明する。前述の実施例においては、XYステージ11上に、温度調整ユニット13を1台だけ搭載する例について説明した。しかし、複数台の温度調整ユニット13を、XYステージ11上に搭載することもできる。図8に、XYステージ11上に2台の温度調整ユニット13を搭載する例を示す。なお、図8には、図6との対応部分に同一符号を付して表している。
図14に、冷媒循環チューブ23の他の接続例を示す。前述した実施例では、ヒートシンク14と熱交換器24の間、熱交換器24とタンク25の間、タンク25とポンプ26の間、ポンプ26とヒートシンク14の間を、それぞれ1本の冷媒循環チューブ23で接続する場合について説明した。
ここでは、ヒートシンク14に好適な構造例を説明する。前述したように、ヒートシンク14内には、冷媒液を循環させるための流路が形成される。冷媒液を循環させる流路を有するヒートシンク14の製造方法には、例えばヒートシンク14を構成する金属ブロック(例えば銅ブロック)を2つに分割し、分割面に流路を加工した後、再び分割面同士を結合させる方法が考えられる。
本発明は上述した形態例に限定されるものでなく、様々な変形例が含まれる。例えば、上述した形態例は、本発明を分かりやすく説明するために詳細に説明したものであり、必ずしも説明した全ての構成を備えるものに限定されるものではない。また、ある形態例の一部を他の形態例の構成に置き換えることが可能であり、また、ある実施例の構成に他の形態例の構成を加えることも可能である。また、各形態例の構成の一部について、他の構成を追加、削除又は置換することも可能である。
Claims (6)
- 撮像装置と、撮像光学系と、前記撮像装置で撮像された像を処理する計算機と、水平駆動ステージとを有する核酸配列解析装置において、
前記水平駆動ステージ上に搭載される少なくとも1つの温度調整ユニットと、
前記温度調整ユニットに設けられた冷媒循環用の入口及び出口に対し、継ぎ手を通じてそれぞれ連結される可撓性の冷媒循環チューブと、
前記冷媒循環チューブ内の冷媒を循環させるポンプと、
前記冷媒と外気の間で熱量を交換する熱交換器と
を有し、
前記温度調整ユニットは、
前記水平駆動ステージ上に直接搭載されるヒートシンクと、
前記ヒートシンクの上面に配置される少なくとも1つの熱電素子と、
前記熱電素子の上面側に配置され、フローセルを載置するヒートブロックと、
前記ヒートブロックの温度を測定する温度センサとを有する
ことを特徴とする核酸配列解析装置。 - 請求項1に記載の核酸配列解析装置において、
前記冷媒循環チューブを、
耐熱性が230℃以上、かつ、
圧縮永久歪みが10以下、かつ、
対オゾン性及び銅耐腐食性を有する素材により形成する
ことを特徴とする核酸配列解析装置。 - 請求項1に記載の核酸配列解析装置において、
複数の前記冷媒循環チューブは、相互に継ぎ手を通じて接続される
ことを特徴とする核酸配列解析装置。 - 請求項1に記載の核酸配列解析装置において、
前記水平駆動ステージ上に搭載される複数の前記温度調整ユニットは、前記冷媒循環チューブを通じて直列に接続される
ことを特徴とする核酸配列解析装置。 - 請求項1に記載の核酸配列解析装置において、
前記水平駆動ステージ上に搭載される複数の前記温度調整ユニットは、継ぎ手を通じて分岐された前記冷媒循環チューブを通じて並列に接続される
ことを特徴とする核酸配列解析装置。 - 請求項1に記載の核酸配列解析装置において、
前記ヒートシンクは、直方体の金属ブロックの少なくとも2側面に形成された開口と、各開口から金属ブロック内に直線的に延びる孔が金属ブロックの内部で交差する構造と、金属ブロックの内部で前記入口から出口に達する流路が形成されるように、前記開口のうち冷媒循環用の入口及び出口以外の開口を封止する封止部材とを有する
ことを特徴とする核酸配列解析装置。
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Cited By (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2016539657A (ja) * | 2013-09-16 | 2016-12-22 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | サーモサイクラー熱均一性を提供するための器具、システム、及び方法 |
US10471431B2 (en) | 2014-02-18 | 2019-11-12 | Life Technologies Corporation | Apparatuses, systems and methods for providing scalable thermal cyclers and isolating thermoelectric devices |
GB2559526B (en) * | 2015-11-03 | 2021-02-17 | Harvard College | Method and apparatus for volumetric imaging of a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
US11021737B2 (en) | 2011-12-22 | 2021-06-01 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11078520B2 (en) | 2013-03-12 | 2021-08-03 | President And Fellows Of Harvard College | Method for generating a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
US11085072B2 (en) | 2016-08-31 | 2021-08-10 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of generating libraries of nucleic acid sequences for detection via fluorescent in situ sequencing |
US11193163B2 (en) | 2018-07-30 | 2021-12-07 | Readcoor, Llc | Methods and systems for sample processing or analysis |
CN113956967A (zh) * | 2021-09-26 | 2022-01-21 | 武汉红尔生物科技有限公司 | 一种具有加热装置的测序仪 |
US11293054B2 (en) | 2011-12-22 | 2022-04-05 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11312992B2 (en) | 2011-10-14 | 2022-04-26 | President And Fellows Of Harvard College | Sequencing by structure assembly |
US11447807B2 (en) | 2016-08-31 | 2022-09-20 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of combining the detection of biomolecules into a single assay using fluorescent in situ sequencing |
US11473139B2 (en) | 2012-06-05 | 2022-10-18 | President And Fellows Of Harvard College | Spatial sequencing of nucleic acids using DNA origami probes |
US11713485B2 (en) | 2016-04-25 | 2023-08-01 | President And Fellows Of Harvard College | Hybridization chain reaction methods for in situ molecular detection |
US11981917B2 (en) | 2022-10-25 | 2024-05-14 | President And Fellows Of Harvard College | RNA-guided transcriptional regulation |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2021240675A1 (ja) | 2020-05-27 | 2021-12-02 | 株式会社日立ハイテク | 核酸分析装置 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH06327476A (ja) * | 1993-05-21 | 1994-11-29 | Hitachi Ltd | 遺伝子解析装置 |
WO2009005001A1 (ja) * | 2007-06-29 | 2009-01-08 | Toppan Printing Co., Ltd. | 遺伝子検出判定装置、遺伝子反応装置、およびインキュベータ |
JP2009537152A (ja) * | 2006-05-17 | 2009-10-29 | カリフォルニア インスティテュート オブ テクノロジー | 温度サイクルシステム |
JP2010175419A (ja) * | 2009-01-30 | 2010-08-12 | Hitachi High-Technologies Corp | 蛍光分析装置、及び蛍光分析方法 |
JP2010286421A (ja) * | 2009-06-15 | 2010-12-24 | Hitachi High-Technologies Corp | 蛍光分析方法 |
-
2011
- 2011-02-17 JP JP2011032301A patent/JP5687514B2/ja active Active
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH06327476A (ja) * | 1993-05-21 | 1994-11-29 | Hitachi Ltd | 遺伝子解析装置 |
JP2009537152A (ja) * | 2006-05-17 | 2009-10-29 | カリフォルニア インスティテュート オブ テクノロジー | 温度サイクルシステム |
WO2009005001A1 (ja) * | 2007-06-29 | 2009-01-08 | Toppan Printing Co., Ltd. | 遺伝子検出判定装置、遺伝子反応装置、およびインキュベータ |
JP2010175419A (ja) * | 2009-01-30 | 2010-08-12 | Hitachi High-Technologies Corp | 蛍光分析装置、及び蛍光分析方法 |
JP2010286421A (ja) * | 2009-06-15 | 2010-12-24 | Hitachi High-Technologies Corp | 蛍光分析方法 |
Cited By (28)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11312992B2 (en) | 2011-10-14 | 2022-04-26 | President And Fellows Of Harvard College | Sequencing by structure assembly |
US11566276B2 (en) | 2011-12-22 | 2023-01-31 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11293051B2 (en) | 2011-12-22 | 2022-04-05 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11293054B2 (en) | 2011-12-22 | 2022-04-05 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11021737B2 (en) | 2011-12-22 | 2021-06-01 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11549136B2 (en) | 2011-12-22 | 2023-01-10 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11111521B2 (en) | 2011-12-22 | 2021-09-07 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11639518B2 (en) | 2011-12-22 | 2023-05-02 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11976318B2 (en) | 2011-12-22 | 2024-05-07 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11566277B2 (en) | 2011-12-22 | 2023-01-31 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11293052B2 (en) | 2011-12-22 | 2022-04-05 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
US11473139B2 (en) | 2012-06-05 | 2022-10-18 | President And Fellows Of Harvard College | Spatial sequencing of nucleic acids using DNA origami probes |
US11078520B2 (en) | 2013-03-12 | 2021-08-03 | President And Fellows Of Harvard College | Method for generating a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
US11299767B2 (en) | 2013-03-12 | 2022-04-12 | President And Fellows Of Harvard College | Method for generating a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
JP2016539657A (ja) * | 2013-09-16 | 2016-12-22 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | サーモサイクラー熱均一性を提供するための器具、システム、及び方法 |
US10835901B2 (en) | 2013-09-16 | 2020-11-17 | Life Technologies Corporation | Apparatuses, systems and methods for providing thermocycler thermal uniformity |
US10471431B2 (en) | 2014-02-18 | 2019-11-12 | Life Technologies Corporation | Apparatuses, systems and methods for providing scalable thermal cyclers and isolating thermoelectric devices |
US11118220B2 (en) | 2015-11-03 | 2021-09-14 | President And Fellows Of Harvard College | Method and apparatus for volumetric imaging of a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
US11542554B2 (en) | 2015-11-03 | 2023-01-03 | President And Fellows Of Harvard College | Method and apparatus for volumetric imaging |
GB2559526B (en) * | 2015-11-03 | 2021-02-17 | Harvard College | Method and apparatus for volumetric imaging of a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
US11713485B2 (en) | 2016-04-25 | 2023-08-01 | President And Fellows Of Harvard College | Hybridization chain reaction methods for in situ molecular detection |
US11718874B2 (en) | 2016-04-25 | 2023-08-08 | President And Fellows Of Harvard College | Hybridization chain reaction methods for in situ molecular detection |
US11447807B2 (en) | 2016-08-31 | 2022-09-20 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of combining the detection of biomolecules into a single assay using fluorescent in situ sequencing |
US11085072B2 (en) | 2016-08-31 | 2021-08-10 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of generating libraries of nucleic acid sequences for detection via fluorescent in situ sequencing |
US11193163B2 (en) | 2018-07-30 | 2021-12-07 | Readcoor, Llc | Methods and systems for sample processing or analysis |
CN113956967A (zh) * | 2021-09-26 | 2022-01-21 | 武汉红尔生物科技有限公司 | 一种具有加热装置的测序仪 |
CN113956967B (zh) * | 2021-09-26 | 2024-02-23 | 皖西学院 | 一种具有加热装置的测序仪 |
US11981917B2 (en) | 2022-10-25 | 2024-05-14 | President And Fellows Of Harvard College | RNA-guided transcriptional regulation |
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Publication number | Publication date |
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