JP2011162567A - 心血管障害の処置のためのヒトgタンパク質共役型レセプターおよびそのモジュレーター - Google Patents
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Abstract
【課題】心血管障害の処置のためのヒトGタンパク質共役型レセプターおよびそのモジュレーターを提供すること。
【解決手段】本発明は、候補化合物がGタンパク質共役型レセプター(GPCR)のモジュレーターであるか否かを同定する方法に関する。いくつかの実施形態において、GPCRは、哺乳動物GPCR、好ましくはヒトGPCRである。いくつかの実施形態において、GPCRは、内因的に心筋細胞により発現される。いくつかの実施形態において、GPCRは、Gqとカップリングされる。本発明は、さらに、GPCRのモジュレーターを用いる方法に関する。好ましいモジュレーターは、逆アゴニストおよびアンタゴニストである。本発明における逆アゴニストおよびアンタゴニストは、肥大性心筋障害および鬱血性心不全、特に、心臓病の予防または治療のための治療剤として有用である。
【選択図】なし
【解決手段】本発明は、候補化合物がGタンパク質共役型レセプター(GPCR)のモジュレーターであるか否かを同定する方法に関する。いくつかの実施形態において、GPCRは、哺乳動物GPCR、好ましくはヒトGPCRである。いくつかの実施形態において、GPCRは、内因的に心筋細胞により発現される。いくつかの実施形態において、GPCRは、Gqとカップリングされる。本発明は、さらに、GPCRのモジュレーターを用いる方法に関する。好ましいモジュレーターは、逆アゴニストおよびアンタゴニストである。本発明における逆アゴニストおよびアンタゴニストは、肥大性心筋障害および鬱血性心不全、特に、心臓病の予防または治療のための治療剤として有用である。
【選択図】なし
Description
本出願は、示された日付でU.S.速達便で介して米国特許商標局に出願された以下の仮出願からの優先権の利益を主張する:2003年6月20日に出願された米国仮出願第60/480,046号。前記出願の開示をここで引用してその全体を援用する。
(発明の分野)
本発明は、候補化合物がGタンパク質共役型レセプター(GPCR)のモジュレーターであるか否かを同定する方法に関する。いくつかの実施形態において、GPCRは哺乳動物、好ましくはヒトである。いくつかの実施形態において、GPCRは心筋細胞によって内因的に発現される。いくつかの実施形態において、GPCRはGqにカップリングする。いくつかの実施形態において、GPCRはイノシトール1,4,5−三リン酸(IP3)の細胞内レベルを増加させる。いくつかの実施形態において、GPCRのモジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。本発明は、さらに、GPCRのモジュレーターを使用する方法に関する。好ましいモジュレーターは逆アゴニストおよびアンタゴニストである。本発明の逆アゴニストおよびアンタゴニストは肥大性心筋障害および鬱血性心不全、特に、心筋梗塞後再形成、心臓弁疾患、維持された心臓後負荷、心筋炎および家族性肥大性心筋障害に由来する肥大性心筋障害を含めた心臓病の予防または治療用の治療剤として有用である。
本発明は、候補化合物がGタンパク質共役型レセプター(GPCR)のモジュレーターであるか否かを同定する方法に関する。いくつかの実施形態において、GPCRは哺乳動物、好ましくはヒトである。いくつかの実施形態において、GPCRは心筋細胞によって内因的に発現される。いくつかの実施形態において、GPCRはGqにカップリングする。いくつかの実施形態において、GPCRはイノシトール1,4,5−三リン酸(IP3)の細胞内レベルを増加させる。いくつかの実施形態において、GPCRのモジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。本発明は、さらに、GPCRのモジュレーターを使用する方法に関する。好ましいモジュレーターは逆アゴニストおよびアンタゴニストである。本発明の逆アゴニストおよびアンタゴニストは肥大性心筋障害および鬱血性心不全、特に、心筋梗塞後再形成、心臓弁疾患、維持された心臓後負荷、心筋炎および家族性肥大性心筋障害に由来する肥大性心筋障害を含めた心臓病の予防または治療用の治療剤として有用である。
(発明の背景)
(A.鬱血性心不全)
鬱血性心不全(CHF)は毎年500,000を超える新しい症例が診断されるほぼ500万人のアメリカ人に罹る。定義によると、CHFは、心臓病が拍出を低下させ、静脈圧を増加させ、不全となる心臓の進行性劣化を引き起こす分子異常を伴う臨床的症候群である(心臓病:Pathophysiology、 Molecular Biology、およびClinical Management、 Katz、AM、Lippincott Williams and Wilkils、2000から)。数十年の研究にもかかわらず、CHFの原因の詳細な理解は依然として不明瞭である。しかしながら、科学的および臨床的知見は、該病気のプロセスの初期相が「心臓肥大」(また、「肥大性心筋障害」)として知られたストレスに対する心筋の適合不良応答よりなることを明瞭に示している。軽減されない高血圧の状況における心臓への慢性的過剰負荷、弁疾患、または組織損傷(心筋梗塞)は肥大性増殖応答をもたらし、これは、心臓拍出が一時的に回復する限りは最初は適合するが、減時に徐々に適合不良となり、その結果、収縮機能が減少し、心臓が拡張され、不全となる。5年の生存率は、一旦心不全が兆候的になれば、50%未満であるので、心筋肥大を加速させる分子的プロセスをコードしない心不全のいずれの定義も、この症候群の主な臨床的特徴を見逃している。
(A.鬱血性心不全)
鬱血性心不全(CHF)は毎年500,000を超える新しい症例が診断されるほぼ500万人のアメリカ人に罹る。定義によると、CHFは、心臓病が拍出を低下させ、静脈圧を増加させ、不全となる心臓の進行性劣化を引き起こす分子異常を伴う臨床的症候群である(心臓病:Pathophysiology、 Molecular Biology、およびClinical Management、 Katz、AM、Lippincott Williams and Wilkils、2000から)。数十年の研究にもかかわらず、CHFの原因の詳細な理解は依然として不明瞭である。しかしながら、科学的および臨床的知見は、該病気のプロセスの初期相が「心臓肥大」(また、「肥大性心筋障害」)として知られたストレスに対する心筋の適合不良応答よりなることを明瞭に示している。軽減されない高血圧の状況における心臓への慢性的過剰負荷、弁疾患、または組織損傷(心筋梗塞)は肥大性増殖応答をもたらし、これは、心臓拍出が一時的に回復する限りは最初は適合するが、減時に徐々に適合不良となり、その結果、収縮機能が減少し、心臓が拡張され、不全となる。5年の生存率は、一旦心不全が兆候的になれば、50%未満であるので、心筋肥大を加速させる分子的プロセスをコードしない心不全のいずれの定義も、この症候群の主な臨床的特徴を見逃している。
細胞培養および小動物実験は、心筋細胞上のGタンパク質共役型レセプターが心臓収縮機能のコードに重要なレギュレーターであり、また、心筋細胞肥大の調節にも関与していることを明瞭に示した(レビューについては;Adams and Brown、 Oncogene、20、1626−1634、2001参照)。事実、ヒトにおけるCHFの治療のためのACE阻害剤の正の効果は、心筋におけるアンジオテンシンIIレセプター活性化の間接的阻害を介して適合不良肥大の低下に少なくとも部分的に関与すると考えられる。
しかしながら、過去10年間にわたるCHF用の薬理学的療法における改善にもかかわらず(ACE阻害剤、データ−遮断剤)、死亡率の20〜30%低下が現在の最適療法で示されているにすぎない。将来、良好な薬物の開発および新しい治療剤の同定は、CHFに罹った患者の臨床的結果を改善するようである。
(B.Gタンパク質共役型レセプター)
多数のレセプタークラスがヒトに存在するが、現在までに、最も豊富であって治療的に関連するのはGタンパク質共役型レセプター(GPCR)クラスによって示される。ヒトゲノム内に30,000〜40,000程の遺伝子があると見積もられ、これらのうち、ほぼ2%がGPCRをコードすると見積もられる。
多数のレセプタークラスがヒトに存在するが、現在までに、最も豊富であって治療的に関連するのはGタンパク質共役型レセプター(GPCR)クラスによって示される。ヒトゲノム内に30,000〜40,000程の遺伝子があると見積もられ、これらのうち、ほぼ2%がGPCRをコードすると見積もられる。
GPCRは医薬製品の開発のための重要な領域を表し;100の公知のGPCRのほぼ20から、全ての処方医薬のほぼ60%が開発されてきた。例えば、1999年においては、トップの100ブランド名処方医薬のうち、以下の薬物がGPCRと相互作用する(薬物に関連して治療される原発性病気および/または障害を括弧に入れて示す):
GPCRは、その各々は膜にわたる7つのアルファラセンを形成する22〜24の間の疎水性アミノ酸の7つの配列を有する共通の構造的モチーフを有する[各スパンは数字によって確認される、すなわち、膜貫通−1(TM−1)膜貫通1(TM−2)等]。膜貫通ラセンは細胞膜の外部または「細胞外」側の膜貫通2および膜貫通−3、膜貫通4および膜貫通5、および膜貫通6および膜貫通7の間のアミノ酸のストランドによって接合される[これらは、各々、「細胞外」領域1、2および3(EC−1,EC−2およびEC−3)といわれる]。また、膜貫通ラセンは細胞膜の内側または「細胞内」側で膜貫通−1および膜貫通2、膜貫通3および膜貫通4、および膜貫通5および膜貫通6の間でアミノ酸のストランドによって接合される[これらは、各々、「細胞内」領域1、2および3(IC−1,IC−2およびIC−3)といわれる]。レセプターの「カルボキシン」(「C」)末端は細胞内の細胞内空間に存在し、レセプターの「アミノ」(「N」)末端は細胞の外側の細胞外空間に存在する。
一般に、リガンドがレセプターに結合すると(しばしば、レセプターの「活性化」といわれる)、レセプターの立体配座が変化し、これは、細胞内領域および細胞内「Gタンパク質」の間のカップリングを促進する。GPCRはGタンパク質に対して「乱交雑」であり、すなわち、GPCRは1を超えるGタンパク質と相互作用できることが報告されている。Kenakin、T.、43 Life Sciences 1095(1988)参照。他のGタンパク質は存在するが、現在、Gq,Gs、Gi、GzおよびGoは同定されているGタンパク質である。Gタンパク質とのリガンド−活性化GPCRカップリングは(「シグナル変換」といわれる)シグナリングカスケードプロセスを開始させる。正常な条件下では、シグナル変換は、結局は、細胞の活性化または細胞の阻害をもたらす。理論に拘束されるつもりはないが、IC−3ループならびにレセプターのカルボキシ末端がGタンパク質と相互作用されると考えられる。
Gs−共役型GPCRは細胞内cAMPレベルを上昇させる。Gi−、Go−,またはGz−共役型GPCRは細胞内cAMPレベルを低下させる。Gq−共役型GPCRは細胞内IP3およびCa2+レベルを上昇させる。
また、G15またはG16のような、GPCRのいくつかのクラスをホスホリパーゼC経路にカップリングさせるように見える乱交雑Gタンパク質[Offermanns & Simon、J Biol Chem (1995)270:15175−80]、または多数の異なるGPCRを同一経路、例えば、ホスホリパーゼCにカップリングさせるように設計されたキメラGタンパク質[Milligan & Rees、Trends in Pharmaceutical Sciences(1999)20:118−24]もある。
メラノフォア技術(後記参照)はGPCRのGタンパク質カップリングを質問するのに、また、ある化合物がGPCRのモジュレーターであるか否かを同定するのに有用である。
生理学的条件下では、GPCRは2つの異なる立体配座:「不活性」状態および「活性」状態の間で平衡して細胞膜に存在する。不活性状態のレセプターは、細胞内シグナリング変換経路にリンクして、生物学的応答に導くシグナル変換を開示させることができない。レセプターの立体配座を活性状態に変化させると、(Gタンパク質を介して)変換経路への連鎖を可能とし、生物学的応答を生じさせる。
レセプターはリガンドまたは薬物のような化合物によって活性状態に安定化させることができる。専らそれに限定されるものではないが、レセプターのアミノ酸配列に対する修飾を含めた最近の発見は、活性状態立体配座にあるレセプターを促進し、安定化させるリガンドまたは薬物以外の手段を提供する。これらの手段は、レセプターへのリガンド結合の効果を刺激することによって、レセプターを活性状態に効果的に安定化させる。そのようなリガンド−非依存性手段による安定化は「構成的レセプター活性化」といわれる(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
(発明の要旨)
RUP40は、セクレチンファミリーのそれと同様なヘプタラセンドメインを含むクラスIIのGPCRである。ヒトRUP40ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は配列番号1に与えられる。該コードされたヒトRUP40ポリペプチドのアミノ酸配列はアミノ酸配列番号2に与えられる。ラットRUP40ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は配列番号3に与えられる。該コードされたラットRUP40ポリペプチドのアミノ酸配列番号4に与えられる。部分的マウスRUP40ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は配列番号5に与えられる。該コードされた部分マウスRUP40ポリペプチドのアミノ酸配列は配列番号6に与えられる。
RUP40は、セクレチンファミリーのそれと同様なヘプタラセンドメインを含むクラスIIのGPCRである。ヒトRUP40ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は配列番号1に与えられる。該コードされたヒトRUP40ポリペプチドのアミノ酸配列はアミノ酸配列番号2に与えられる。ラットRUP40ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は配列番号3に与えられる。該コードされたラットRUP40ポリペプチドのアミノ酸配列番号4に与えられる。部分的マウスRUP40ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は配列番号5に与えられる。該コードされた部分マウスRUP40ポリペプチドのアミノ酸配列は配列番号6に与えられる。
RUP40はシグナルペプチド、SEAモジュール、およびGPCRタンパク質分解部位(GPS)ドメインを有すると予測される。シグナルペプチドのタンパク質分解切断は、ヒトRUP40では配列番号2のほぼアミノ酸21および22の間で、およびラットRUP40では配列番号4のほぼアミノ酸24および25の間で起こると予測される(SignalP;www.cbs.dtu.dk/services/SignalP−2.0/)。SEAモジュール内のタンパク質分解切断が、ヒトRUP40では配列番号2のほぼアミノ酸226および227の間で、およびラットRUP40では配列番号4のほぼアミノ酸223および224の間で起こると予測される[Abe J et al.,(2002)J Biol Chem 277:23391−8;その開示をここで引用してその全体を援用する]。GPSドメインは、ヒトRUP40では配列番号2のアミノ酸954〜997に近似的に、およびラットRUP40では配列番号4のアミノ酸954〜1000にほぼ対応する[Krasnoperov,V et al.,J Biol Chem(2002)277:46518−26;その開示をここで引用してその全体を援用する]。GPSドメイン内でのタンパク質切断はヒトRUP40につき配列番号2のアミノ酸990および991のほぼ間、およびラットRUP40につき配列番号4のアミノ酸993および994のほぼ間で起こると予想される[Krasnoperov,V et al.,J Biol Chem(2002)277:46518−26]。
RUP40は哺乳動物の心臓、肺、大動脈および脂肪で高度に発現される。心臓においては、RUPは左心室によって高度に発現される。心室内では、RUP40は心筋細胞によって発現される。出願人らは、心筋細胞におけるRUP40の過剰発現の結果、増大したIP3蓄積、および心房性ナトリウム利尿因子(ANF)発現および肥大の引き続いての増加が起こると判断した。心臓肥大をもたらす横方向大動脈収縮(TAC)に付されたマウスにおける過剰負荷された圧力の条件下で、RUP40 mRNAのレベルは維持されるか、またはわずかに増大する。高レベルの心筋発現、および肥大シグナリングを生じる能力の組合せは、RUP40を、血液動力学または遺伝的障害からの肥大心筋障害の治療用の魅力的な治療標的とする。本発明の逆アゴニストおよびアンタゴニストは、肥大心筋障害および鬱血性心不全、特に、心筋梗塞後再形成に由来する肥大心筋障害、心臓弁疾患、維持された心臓後負荷、心筋炎、および家族性肥大心筋障害を含めた心臓病の予防または治療用の治療剤として有用である。
第1の局面では、本発明は、候補化合物がRUP40 GPCRの調節因子であるか否かを同定する方法を特徴とする。ここで上記レセプターは、Gタンパク質に結合し、上記レセプターは、以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸配列にコードされたアミノ酸配列であって、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについて、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる、アミノ酸配列。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸配列にコードされたアミノ酸配列であって、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについて、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる、アミノ酸配列。
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1,000
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の生物学的活性フラグメント;または配列番号2もしくは配列番号4の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的活性フラグメント。
上記の方法は、以下の工程:
(i)上記候補化合物を上記レセプターに接触させる工程;
(ii)上記レセプター機能が、調節されているか否かを決定する工程;
を包含し、ここでレセプター機能の変化は、上記候補化合物がRUP40 GPCRの調節因子であることを示す。
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1,000
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の生物学的活性フラグメント;または配列番号2もしくは配列番号4の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的活性フラグメント。
上記の方法は、以下の工程:
(i)上記候補化合物を上記レセプターに接触させる工程;
(ii)上記レセプター機能が、調節されているか否かを決定する工程;
を包含し、ここでレセプター機能の変化は、上記候補化合物がRUP40 GPCRの調節因子であることを示す。
いくつかの実施形態では、配列番号2または配列番号4のRUP40 GPCRの上記生物学的活性フラグメントは、式「n1〜n2」〜「c」により提供される群から選択され、それらの式は、完全長RUP40 GPCRの「n1〜n2」の間のアミノ酸から選択されるN末端アミノ酸と、完全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」で固定されたC末端アミノ酸とを有する、一組のフラグメントを表す。いくつかの実施形態では、「n1」は、完全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」は、GPSドメイン内のほぼ推定タンパク質分解切断部位に対してC末端側のアミノ酸であり、そして「c」は、完全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRに関しては、n1=2、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態では、配列番号4のRUP40 GPCRに関しては、n1=2、n2=994およびc=1,349である。いくつかの実施形態では、RUP40 GPCRの上記生物学的活性フラグメントは、配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346および991〜1,346から選択され、ここでアミノ酸22は、ほぼ推定シグナルペプチドタンパク質分解切断部位であることが分かっており、アミノ酸227は、SEAモジュール内のほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっており、そしてアミノ酸991は、GPSドメイン内のほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっている。いくつかの実施形態では、RUP40 GPCRの上記生物学的活性フラグメントは、配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349および994〜1,349から選択され、ここでアミノ酸25は、ほぼ推定シグナルペプチドのタンパク質分解切断部位であることが分かっており、アミノ酸224は、SEAモジュール内でのほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっており、そしてアミノ酸994は、GPSドメイン内でのほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっている。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRに関しては、n1=22、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRに関しては、n1=227、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態では、配列番号4のRUP40 GPCRに関しては、n1=25、n2=994およびc=1,349である。いくつかの実施形態では、配列番号4のRUP40 GPCRに関しては、n1=224、n2=994およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された改変体を作製する方法は、当業者の範囲内である(例えば、WO98/46995として1998年10月22日に公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339号を参照のこと;それらの開示は、全体として本明細書に参考として援用されている)。
配列番号2、配列番号4または配列番号6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、本発明の範囲内であると考えられている。制限のためではなく、説明の目的であるが、配列番号2のアミノ酸604位にあるメチオニンのスレオニンによる置換を含むか、配列番号2のアミノ酸801位にあるバリンのイソロイシンによる置換を含むか、または配列番号2のアミノ酸856位にあるスレオニンのメチオニンによる置換を含む、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、内因性RUP40レセプターをコードする核酸によりコードされるアミノ酸配列であり、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと、配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについて、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物のオルトログは、本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態では、上記哺乳動物のオルトログは、マウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(a)から(j)のいずれかと、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%。少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%,少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む、上記RUP40 GPCRの改変体は、本発明の範囲内にあると考えられる。同一性%は、公知のコンピュータプログラムを使用して慣習的に決定され得る。そのようなアルゴリズムおよびプログラムとしては、TBLASTIN、BLASTP、FASTA、TFASTAおよびCLUSTALW[PearsonおよびLipman(1988)Proc Natl Acad Sci USA 85:2444〜8;Altschulら(1990)J Mol Biol 215:403〜10;Thompsonら(1994)Nucleic Acids Res 22:4673〜80;Higginsら、(1996)Meth Enzymol 266:383〜402;Altschulら(1997)Nucleic Acids Res 25:3389〜3402;Altschulら(1993)Nature Genetics 3:266〜272;上記開示は、全体として本明細書に参考として援用されている]が、挙げられるが、決してこれらに限定されない。
いくつかの実施形態では、タンパク質配列の相同性は、上記分野では、周知[例えば、KarlinおよびAltschul(1990)Proc Natl Acad Sci USA 87:2264〜8;Altschulら、1990,1993,1997(すべて上述と同じ)を参照のこと]のBasic Local Alignment Search Tool(「BLAST」)を使用して評価される。
いくつかの実施形態では、2つのアミノ酸配列の間の同一性%を決定する方法は、問合せ配列(例えば、配列番号2のアミノ酸配列)と取り出された配列との間の全体として最良な一致を決定する方法であって、Brutlagら[Comp App Biosci(1990)6:237〜245;この開示は、全体として本明細書に参考として援用されている]のアルゴリズムに基づいたFASTDBコンピュータプログラムを用いたグローバル配列アラインメントともいう。配列アラインメントにおいて、問合せ配列と取り出された配列は、両方ともアミノ酸配列である。そのグローバル配列アラインメントの結果が、同一性%である。FASTDBアミノ酸アラインメントで使用される好ましいパラメータは:マトリックス(Matrix)=PAM 0、k−タプル(k−tuple)=2、ミスマッチペナルティ(Mismatch Penalty)=1、ジョイニングペナルティ(Joining Penalty)=20、ランダマイゼーショングループ(Randomization Group)=25、長さ(Length)=0、カットオフスコア(Cutoff Score)=1、ウィンドウサイズ(Window Size)=配列長、ギャップペナルティ(Gap Penalty)=5、ギャップサイズペナルティ(Gap Size Penalty)=0.05、ウィンドウサイズ=247または取り出されたアミノ酸配列の長さのいずれか短い方。
内部欠失ではなくN末端またはC末端の欠失に起因して、上記取り出された配列が、問合せ配列より短い場合は、同一性%における結果は、手作業で補正されなければならない。なぜなら、上記FASTDBプログラムは、グローバル同一性%を計算する場合、上記取り出された配列のN末端およびC末端の切断を計数しないからである。上記問合せ配列に対してN末端およびC末端で切断されている上記取り出された配列について、同一性%は、取り出された配列のN末端およびC末端と同じである上記問合せ配列の残基数(それは対応する取り出された配列の残基と一致/整列したものではない)を上記問合せ配列の全塩基の%として計算することによって補正される。残基が一致/整列しているか否かについては、FASTDB配列アラインメントの結果により決定される。その後、この%が同一性%から引かれ、上記特定のパラメータを使用した上記FASTDBプログラムにより計算され、最終的な同一性%スコアに到達する。この最終同一性%スコアは、本発明の目的のために使用されるものである。上記取り出された配列のN末端側およびC末端側の残基のみが、それらは上記問合せ配列と一致/整列していないが、上記同一性%スコアを手作業で調整する目的のために考慮される。即ち、問合せアミノ酸残基のみが、上記取り出された配列の最もN末端側の残基および最もC末端側の残基の外側にある。
例えば、90アミノ酸残基の取り出された配列は、同一性%を決定するために100残基の問合せ配列と整列される。上記取り出された配列のN末端において、欠失が起こり、従って、上記FASTDBアラインメントは、N末端における第1の残基と一致/整列しない。10個の不対残基は、上記配列の10%((一致しないN末端およびC末端の残基数)/(問合せ配列の全残基数))を示し、従って、FASTCBプログラムで計算された同一性%スコアから10%を差引く。残りの90残基が完全一致すると、最終同一性%は、90%である。
別の例では、90残基の取り出された配列が、100残基の問合せ配列と比較される。今回は、上記欠失が内部であり、従って、上記問合せ配列と一致/整列しない、取り出された配列のN末端またはC末端の残基はない。この場合、FASTDBにより計算された同一性%は、手作業補正されない。前と同じように、対象配列のN末端およびC末端の外側の残基位置のみが、FASTDBアラインメントにおいて示されたように、問合せ配列と一致/整列されず、それらが手作業で補正される。他の補正は、本発明の目的のためにはなされない。
いくつかの実施形態では、上記RUP40は、組換え体である。
いくつかの実施形態では、上記RUP40 GPCRは、異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、上記異種アミノ酸配列は、エピトープタグである。いくつかの実施形態では、上記エピトープタグは、赤血球凝集素(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態では、上記エピトープタグは、c−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態では、上記エピトープタグは、V5エピトープタグである。上記HAタグ、c−mycタグまたはV5タグを提供する手順は、当業者には周知である(例えば、Clontech、Palo Alto、CAおよびInvitrogen、Carlsbad、CA)
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、SEAモジュール内のタンパク分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、GPSドメイン内のタンパク質分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記接触させる工程が、GPCRの既知のリガンドの存在下で行われる。いくつかの実施形態では、上記既知のリガンドは、GPCRのアゴニストである。
本発明はまた、候補化合物が心血管障害の調節因子であるか否かを同定する方法に関し、この方法は、以下の工程:
(a)候補化合物とRUP40 GPCRとを接触させる工程(上記レセプターがGタンパク質に結合し、上記レセプターは、以下の群:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸にコードされたアミノ酸配列であって、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる、アミノ酸配列;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1,000;
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の生物学的活性フラグメント;または配列番号2もしくは配列番号4の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的活性フラグメント;
から選択されるアミノ酸配列を含む);
(a)候補化合物とRUP40 GPCRとを接触させる工程(上記レセプターがGタンパク質に結合し、上記レセプターは、以下の群:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸にコードされたアミノ酸配列であって、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる、アミノ酸配列;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1,000;
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の生物学的活性フラグメント;または配列番号2もしくは配列番号4の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的活性フラグメント;
から選択されるアミノ酸配列を含む);
(b)上記レセプター機能が調節されているか否かについて決定する工程;
を包含し、ここでレセプター機能の変化は、上記候補化合物が、心血管障害の調節因子であることを示す。
を包含し、ここでレセプター機能の変化は、上記候補化合物が、心血管障害の調節因子であることを示す。
いくつかの実施形態では、配列番号2または配列番号4のRUP40 GPCRの上記生物学的活性フラグメントは、式「n1〜n2」〜「c」により提供される群から選択され、それらの式は、完全長RUP40 GPCRの「n1〜n2」の間のアミノ酸から選択されるN末端アミノ酸と、完全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」で固定されたC末端アミノ酸とを有する、一組のフラグメントを表す。いくつかの実施形態では、「n1」は、完全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」は、GPSドメイン内のほぼ推定タンパク質分解切断部位に対してC末端側のアミノ酸であり、そして「c」は、完全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRに関しては、n1=2、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態では、配列番号4のRUP40 GPCRに関しては、n1=2、n2=994およびc=1,349である。いくつかの実施形態では、RUP40 GPCRの上記生物学的活性フラグメントは、配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346および991〜1,346から選択され、ここでアミノ酸22は、ほぼ推定シグナルペプチドのタンパク質分解切断部位であることが分かっており、アミノ酸227は、SEAモジュール内でのほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっており、そしてアミノ酸991は、GPSドメイン内のほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっている。いくつかの実施形態では、RUP40 GPCRの上記生物学的活性フラグメントは、配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349および994〜1,349から選択され、ここでアミノ酸25は、ほぼ推定シグナルペプチドタンパク質分解切断部位であることが分かっており、アミノ酸224は、SEAモジュール内のほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっており、そしてアミノ酸994は、GPSドメイン内のほぼ推定タンパク質分解切断部位であることが分かっている。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRに関しては、n1=22、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRに関しては、n1=227、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態では、配列番号4のRUP40 GPCRに関しては、n1=25、n2=994およびc=1,349である。いくつかの実施形態では、配列番号4のRUP40 GPCRに関しては、n1=224、n2=994およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体を作製する方法は、当業者の範囲内である(例えば、WO98/46995として1998年10月22日に公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339号を参照のこと;それらの開示は、全体として本明細書に参考として援用されている)。
配列番号2、配列番号4または配列番号6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、本発明の範囲内にあると考えられている。制限のためではなく、説明の目的であるが、配列番号2のアミノ酸604位にあるメチオニンのスレオニンによる置換を含むか、配列番号2のアミノ酸801位にあるバリンのイソロイシンによる置換を含むか、または配列番号2のアミノ酸856位にあるスレオニンのメチオニンによる置換を含む、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、内因性RUP40レセプターをコードする核酸によりコードされるアミノ酸配列であり、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと、配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについて、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物のオルトログは、本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態では、上記哺乳動物のオルトログは、マウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(i)から(x)のいずれかと、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%。少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%,少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む、上記RUP40 GPCRの改変体は、本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態では、上記RUP40 GPCRは、組換え体である。
いくつかの実施形態では、上記RUP40 GPCRは、異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、上記異種アミノ酸配列は、エピトープタグである。いくつかの実施形態では、上記エピトープタグは、赤血球凝集素(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態では、上記エピトープタグは、c−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態では、上記エピトープタグは、V5エピトープタグである。上記HAタグ、c−mycタグまたはV5タグを提供する手順は、当業者には周知である(例えば、Clontech、Palo Alto、CAおよびInvitrogen、Carlsbad、CA)
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、SEAモジュール内のタンパク分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記レセプターは、GPSドメイン内のタンパク質分解切断を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記接触させる工程が、GPCRの既知のリガンドの存在下で行われる。いくつかの実施形態では、上記既知のリガンドは、GPCRのアゴニストである。
いくつかの実施形態では、上記心血管障害が、心疾患である。心疾患としては、うっ血性心不全、うっ血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂(post−infarction heart rupture)、心室中隔破裂(ventricular septal rupture)、心内膜炎(細菌性を含む)、心臓動脈瘤(heart aneurysm)、右心疾患(pulmonary heart disease)、リウマチ性心疾患、心室機能不全が挙げられるが、決してこれらに限定されない。心疾患としてはまた、決してこれらに限定されないが、大動脈弁不全、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱症(aortic valve prolapse)、僧帽弁逸脱症、三尖弁逸脱症(tricuspid valve prolapse)、僧帽弁機能不全、僧帽弁狭窄、三尖弁狭窄を含む弁疾患を包含する。心疾患は、決してこれらに限定されないが、肥大型心筋症、うっ血性心筋症、弁下部性大動脈狭搾症、弁下部性肺動脈狭窄(pulmonary subvalvular stenosis)、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋疾患を、さらに包含する。
いくつかの実施形態では、上記心血管障害は、肥大性心筋症である。いくつかの実施形態では、上記肥大性心筋症は、血流力学的障害から発症する。いくつかの実施形態では、上記肥大性心筋症は、遺伝的障害から発症する。
いくつかの実施形態では、上記肥大性心筋症は、以下:
(a)心筋梗塞後のリモデリング;
(b)弁疾患;
(c)持続性心後負荷(sustained cardiac afterload)
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋症
からなる群より選択される障害から発症する、肥大性心筋症である。
(a)心筋梗塞後のリモデリング;
(b)弁疾患;
(c)持続性心後負荷(sustained cardiac afterload)
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋症
からなる群より選択される障害から発症する、肥大性心筋症である。
いくつかの実施形態では、上記心血管障害は、先天性心欠損症(congenital heart defect)である。先天性心欠損症としては、大動脈縮窄症、大動脈肺動脈中隔欠損症、ファロー三徴症、心室性心臓中隔欠損症(ventricular heart septal defect)および家族性肥大心筋症が挙げられるが、決して限定されるものではない。
特定の実施形態では、レセプター機能の減少は、候補化合物が心筋細胞肥大をブロックするかまたは減少させる化合物であることを示している。
特定の実施形態では、レセプター機能の減少は、候補化合物が哺乳動物の肥大性心筋症をブロックするかまたは減少させる化合物であることを示している。
特定の実施形態では、レセプター機能の減少は、候補化合物が哺乳動物の肥大性心筋症の予防または処置のために有用であることを示している。
本発明はまた、候補化合物がRUP40 GPCRの調節因子であるか否かを同定する方法に関し、この方法は、以下の工程:
(a)組換えRUP40 GPCRの発現が可能な条件下で、RUP40 GPCR発現宿主細胞を培養する工程(上記宿主細胞は、
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸にコードされたアミノ酸配列であって、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる、アミノ酸配列;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1,000;
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の生物学的活性フラグメント;または配列番号2もしくは配列番号4の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的活性フラグメント;
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、上記組換えRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされる);
(b)工程(a)のRUP40 GPCR発現宿主細胞と候補化合物とを接触させる工程;
(c)コントロール宿主細胞と工程(b)の候補化合物とを接触させる工程であって、上記コントロール宿主細胞は、組換えRUP40 GPCRタンパク質を発現しない、工程;
(d)工程(a)の宿主細胞および工程(c)のコントロール宿主細胞からの上記組換えRUP40 GPCRと相互作用する上記候補化合物の調節作用を測定する工程;ならびに
(e)上記宿主細胞に対する候補化合物の調節効果をコントロール宿主細胞に対する候補化合物の調節効果と比較する工程
を包含する、方法。
(a)組換えRUP40 GPCRの発現が可能な条件下で、RUP40 GPCR発現宿主細胞を培養する工程(上記宿主細胞は、
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸にコードされたアミノ酸配列であって、その核酸配列は、配列番号7に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーと配列番号8に示されるヌクレオチド配列を含む特異的プライマーとを使用して、ヒトcDNAサンプルについてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことにより得られる、アミノ酸配列;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1,000;
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
または配列番号2もしくは配列番号4のアミノ酸配列の生物学的活性フラグメント;または配列番号2もしくは配列番号4の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的活性フラグメント;
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、上記組換えRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされる);
(b)工程(a)のRUP40 GPCR発現宿主細胞と候補化合物とを接触させる工程;
(c)コントロール宿主細胞と工程(b)の候補化合物とを接触させる工程であって、上記コントロール宿主細胞は、組換えRUP40 GPCRタンパク質を発現しない、工程;
(d)工程(a)の宿主細胞および工程(c)のコントロール宿主細胞からの上記組換えRUP40 GPCRと相互作用する上記候補化合物の調節作用を測定する工程;ならびに
(e)上記宿主細胞に対する候補化合物の調節効果をコントロール宿主細胞に対する候補化合物の調節効果と比較する工程
を包含する、方法。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されたN末端アミノ酸および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994であって、c=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2の2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解の近似的部位であると理解され、アミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解の近似的部位であると予測される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAドメイン内の予測されたタンパク質切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体を作製する方法は当業者の範囲内のものである(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339号参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの変異体改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではないが例示として、配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンの代わりにスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりにイソロイシンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりにメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの変異体改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(i)〜(x)のいずれかに対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸配列はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチミン(HAエピトープタグ)である。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、SEAモジュール内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、GPSドメイン内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該トランスフェクションは一過性である。他のいくつかの実施形態において、該トランスフェクションは安定である。
いくつかの実施形態において、該発現ベクターはpCMVである。いくつかの他の実施形態において、該発現ベクターはアデノウイルスである。例示的アデノウイルスベクターはQbiogene(Carlsbad,CA)からのAdEasyTMとして購入することができる。[He,TC et al.,Proc.Natl,Acad.Sci.USA(1998)95:2509−14;および米国特許第5,922,576号;その開示をここで引用してその全体を援用する]。他の適当なベクターは当業者に容易に明らかであろう。
いくつかの実施形態において、該宿主細胞は哺乳動物であって、293、293T、CHOおよびCOS−7からなる群より選択される。他のいくつかの実施形態において、該宿主細胞はメラノフォアである。他のいくつかの実施形態において、該宿主細胞は心筋細胞である。他の適当な宿主細胞は当業者に容易に明らかであろう。
また、本発明は:
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40
GPCRをコードするヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第一の集団を該RUP40 GPCRの公知のリガンドと接触させ;
(c)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第二の集団を候補化合物と、およびヒトRUP40 GPCRリガンドと接触させ;
(d)工程(c)の候補化合物とコントロール宿主細胞を接触させ、ここで、該コントロール宿主細胞は組換えRUP40 GPCRタンパク質を発現せず;
(e)工程(b)、工程(c)および工程(d)の細胞からの、既知のRUP40 GPCRリガンドの存在下または不存在下で、組換えRUP40 GPCRと相互作用する候補化合物の調節効果を測定し;次いで
(f)工程(b)、工程(c)および工程(d)から決定された候補化合物の調節効果を比較する;
工程を含む、候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであるか否かを決定する方法に関する。
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40
GPCRをコードするヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第一の集団を該RUP40 GPCRの公知のリガンドと接触させ;
(c)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第二の集団を候補化合物と、およびヒトRUP40 GPCRリガンドと接触させ;
(d)工程(c)の候補化合物とコントロール宿主細胞を接触させ、ここで、該コントロール宿主細胞は組換えRUP40 GPCRタンパク質を発現せず;
(e)工程(b)、工程(c)および工程(d)の細胞からの、既知のRUP40 GPCRリガンドの存在下または不存在下で、組換えRUP40 GPCRと相互作用する候補化合物の調節効果を測定し;次いで
(f)工程(b)、工程(c)および工程(d)から決定された候補化合物の調節効果を比較する;
工程を含む、候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであるか否かを決定する方法に関する。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体を作製する方法は当業者の範囲内にある(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339号参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定するものではなく例示として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりにスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801のバリンの代わりにイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりにメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内であると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は内因性RUP40レセプターをコードするアミノ酸によってコードされたアミノ酸配列であり、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内と考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(i)〜(x)のいずれかに対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミン酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸配列はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチミン(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、SEAモジュール内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、GPSドメイン内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該リガンドは該RUP40 GPCRのアゴニストである。
いくつかの実施形態において、該トランスフェクションは一過性である。他のいくつかの実施形態において、該トランスフェクションは安定である。
いくつかの実施形態において、該発現ベクターはpCMVである。いくつかの他の実施形態において、該発現ベクターはアデノウイルスである。他の適当なベクターは当業者に容易に明らかであろう。
いくつかの実施形態において、該宿主細胞は哺乳動物であって、293、293T、CHOおよびCOS−7からなる群より選択される。他のいくつかの実施形態において、該宿主細胞はメラノフォアである。他のいくつかの実施形態において、該宿主細胞は心筋細胞である。他の適当な宿主細胞は当業者に容易に明らかであろう。
また、本発明は:
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現宿主細胞の第一の集団を候補化合物と接触させ;
(c)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第二の集団を工程(b)の候補化合物と接触させず;
(d)工程(b)の候補化合物にコントロール宿主細胞を接触させ、ここで、該コントロール宿主細胞は組換えRUP40 GPCRタンパク質を発現せず;
(e)工程(b)および工程(c)の細胞からの、および工程(d)の細胞からの、組換えRUP40 GPCRタンパク質と相互作用する、候補化合物の調節効果を測定し;次いで、
(f)工程(b)および工程(c)から、および工程(d)から決定された候補化合物の調節効果を比較する;
工程を含む、候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであるかないかを決定する方法に関する。
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現宿主細胞の第一の集団を候補化合物と接触させ;
(c)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第二の集団を工程(b)の候補化合物と接触させず;
(d)工程(b)の候補化合物にコントロール宿主細胞を接触させ、ここで、該コントロール宿主細胞は組換えRUP40 GPCRタンパク質を発現せず;
(e)工程(b)および工程(c)の細胞からの、および工程(d)の細胞からの、組換えRUP40 GPCRタンパク質と相互作用する、候補化合物の調節効果を測定し;次いで、
(f)工程(b)および工程(c)から、および工程(d)から決定された候補化合物の調節効果を比較する;
工程を含む、候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであるかないかを決定する方法に関する。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RUP40
GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPCドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40
GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPCドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40
GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体を作製する方法は当業者の範囲内である(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの変異体改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではなく、例示として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりのスレオニンの置換、配列番号2のアミノ酸位置801のバリンの代わりのイソロイシンの置換、または配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりのメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの変異体改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを用い、ヒトcDNAサンプルに対してポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(i)〜(x)のいずれかに対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内であると考えられる。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸配列はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチミン(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、SEAモジュール内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、GPSドメイン内にタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該トランスフェクションは一過性である。他のいくつかの実施形態において、該トランスフェクションは安定である。
いくつかの実施形態において、該発現ベクターはpCMVである。いくつかの他の実施形態において、該発現ベクターはアデノウイルスである。他の適当なベクターは当業者に容易に明らかであろう。
いくつかの実施形態において、該宿主細胞は293、293T、CHOおよびCOS−7からなる群より選択される。他のいくつかの実施形態において、該宿主細胞はメラノフォアである。他のいくつかの実施形態において、該宿主細胞は心筋細胞である。他の適当な宿主細胞は当業者に容易に明らかであろう。
いくつかの実施形態において、該Gタンパク質はGqである。
いくつかの実施形態において、該Gタンパク質は細胞内IP3のレベルを上昇させる。
いくつかの実施形態において、該Gタンパク質は細胞内Ca2+のレベルを上昇させる。
他のいくつかの実施形態において、該決定はメラノフォアアッセイの使用を介する。
他のいくつかの実施形態において、該決定は環状AMP(cAMP)、環状GMP(cGMP)、イノシトール1,4,5−三リン酸(IP3)、ジアシルグリセロール(DAG)、MAPキナーゼ活性、MAPK/ERKキナーゼキナーゼ−1(MEKK1)活性、およびCa2+からなる群より選択される二次メッセンジャーのレベルの測定を介するものである。いくつかの好ましい実施形態において、該二次メッセンジャーはIP3である。いくつかの好ましい実施形態において、IP3のレベルは低下する。いくつかの好ましい実施形態において、心筋細胞IP3のレベルは低下する。いくつかの実施形態において、該二次メッセンジャーはMEKK1活性である。いくつかの実施形態において、MEKK1活性のレベルは低下する。いくつかの実施形態において、心筋細胞MEKK1活性のレベルは低下する。いくつかの好ましい実施形態において、該二次メッセンジャーはCa2+である。いくつかの好ましい実施形態において、細胞内Ca2+のレベルは低下する。いくつかの好ましい実施形態において、心筋細胞Ca2+のレベルは低下する。いくつかの実施形態において、該Ca2+測定はFLIPRによって行われる。
いくつかの実施形態において、該決定は該GPCRを含む膜で行われる。いくつかの実施形態において、該膜はBrinkman PolytronTMでの細胞のホモゲナイゼーションによって作製される。いくつかの実施形態において、該膜調製は該ポリトロンの各々の10〜20秒持続の3バーストでのホモゲナイゼーションによってなされる。
いくつかの実施形態において、該決定は細胞内IP3レベルの低下によって媒介される活性の測定を介する。いくつかの実施形態において、該活性は心筋細胞肥大の阻害である。
いくつかの実施形態において、該決定はAP1−レポーターアッセイを介する。他のいくつかの実施形態において、該決定はSRFレポーターアッセイを介する。いくつかの実施形態において、該レポーターはルシフェラーゼである。いくつかの実施形態において、該レポーターはβ−ガラクトシダーゼである。
いくつかの実施形態において、該組換え宿主細胞は、さらに、乱交雑G15またはG16アルファサブユニットを含み、該決定は細胞内Ca2+の測定を介する。いくつかの実施形態において、該Ca2+測定はFLIPRによって行われる。
いくつかの実施形態において、該組換え宿主細胞は、さらに、乱交雑G15またはG16サブユニットを含み、該決定は細胞内IP3の測定を介する。
いくつかの好ましい実施形態において、該測定は、該GPCRを含む膜へのGTPγS結合の測定を介する。いくつかの好ましい実施形態において、該GTPγSは[35S]で標識される。いくつかの好ましい実施形態において、該GPCRを含む膜への該GTPγSの結合は低下する。
いくつかの実施形態において、該方法は、さらに、候補化合物によって引き起こされたレセプターの調節を、レセプターの既知のモジュレーターとレセプターとを接触させることによって引き起こされたレセプターの第二の調節を比較する工程を含む。いくつかの実施形態において、該公知のモジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、候補化合物はポリペプチドではない。
いくつかの実施形態において、候補化合物は抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、候補化合物は低分子である。
いくつかの実施形態において、候補化合物は低分子であり、但し、低分子はポリペプチドではない。
いくつかの実施形態において、候補化合物は低分子であり、但し、該低分子は抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、候補化合物はポリペプチドであり、但し、ポリペプチドは抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、候補化合物は脂質である。
いくつかの実施形態において、候補化合物は抗体またはその抗原結合フラグメントである。
いくつかの実施形態において、該方法は、さらに、該同定されたモジュレーターの合成を含む。
いくつかの実施形態において、該方法はさらに:所望により、化合物の構造を決定し;次いで、化合物またはモジュレーター、あるいは化合物の名称または構造を供することを含む。
いくつかの実施形態において、該方法はさらに:所望により、化合物の構造を決定し;所望により、化合物の名称または構造を供し;次いで、化合物を生産しまたは合成することを含む。
第二の局面において、本発明は第一の局面の方法に従って同定された、または23番目の局面に従ってスクリーニングされたGPCRのモジュレーターをその要旨とする。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアゴニスト、部分的アゴニスト、逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される。いくつかの好ましい実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは配列番号2のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストまたはアンタゴニストであり、IC50は100μM未満、10μM未満、または1μM未満である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、1μM〜100μMの間隔から選択された値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、一過的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行われたGTPγS結合アッセイにおいて、一過的にトランスフェクトされたメラノフォアで行われた色素分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRに対して選択的である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的に利用可能である。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはポリペプチドではない。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは低分子である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは低分子であり、但し、該低分子はポリペプチドではない。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは低分子であり、但し、該低分子は抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはポリペプチドであり、但し、該ポリペプチドは抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは脂質である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは抗体またはその抗原結合フラグメントである。
第三の局面において、本発明はRUP40 GPCRの活性を調節する方法をその要旨とし、ここで、該レセプターはGタンパク質にカップリングし、該レセプターは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み;該方法はレセプターを第二の局面のモジュレーターと接触させる工程を含む。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み;該方法はレセプターを第二の局面のモジュレーターと接触させる工程を含む。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体を作製する方法は当業者の範囲内である(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではなくその例として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりのスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801のバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりのメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(a)〜(j)のいずれかに対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチミン(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、SEAモジュール内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、GPSドメイン内のタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該Gタンパク質はGqである。
いくつかの実施形態において、該Gタンパク質は細胞内IP3レベルを上昇させる。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRにつき選択的である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ配列番号2のアミノ酸配列を有する逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、一過的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行ったGTPγS結合アッセイにおいて、一過的にトランスフェクトされたメラノフォアで行った色素分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μMナイシ100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストはアンタゴニストである。
他のいくつかの実施形態において、該接触は該モジュレーターのレセプターを含む膜への投与を含む。
他のいくつかの実施形態において、該接触は該モジュレーターのレセプターを含む細胞への投与を含む。
他のいくつかの実施形態において、該接触は該モジュレーターのレセプターを含む組織への投与を含む。
他のいくつかの実施形態において、該接触はモジュレーターのレセプターを含む個体への投与を含む。なおいくつかの実施形態において、該個体は哺乳動物である。他のなおいくつかの実施形態において、該哺乳動物はウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ネコ、イヌ、ウサギ、マウス、ラット、非ヒト霊長類またはヒトである。なおより好ましいのはマウス、ラット、非ヒト霊長類またはヒトである。最も好ましいのはヒトである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的に利用可能である。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、は少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であることを示すことができる。
いくつかの実施形態において、該投与は経口である。
いくつかの実施形態において、該個体は心血管障害に対する予防または治療を必要とするものである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋傷害、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺心臓病、リウマチ性心臓病、および心室性機能不全を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全、大動脈弁狭窄、大動脈弁脱出症、僧帽弁脱出症、三尖弁脱出症、僧帽弁不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大性心筋障害、鬱血性心筋障害、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、制限性心筋障害、シャガス心筋障害を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は血流力学障害に由来する。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は遺伝的障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は:
(a)心梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する肥大性心筋障害に対する予防または治療を必要とするものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
(a)心梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する肥大性心筋障害に対する予防または治療を必要とするものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は先天性心臓機能障害である。先天性心臓機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺中隔機能障害、ファロー3徴症、心室性心臓中隔機能障害、および家族性肥大性心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は拡大された心臓を呈する障害に対する予防または治療が必要なものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
第4の局面において、本発明は治療上有効量の第2の局面のモジュレーターをRUP40 GPCRと接触させることを含む、心血管障害の予防または治療が必要な個体において該予防または治療の方法をその要旨とし、該レセプターは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化されて変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化されて変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RU40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RU40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RU40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されるタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であり、「c」は全長RU40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRU40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RU40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349であるいくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体を作製する方法は当業者の範囲内のものである(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339号参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではなく例として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりのスレオニンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置801のバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりのメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(a)〜(j)のいずれかに対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRに対して選択的である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的に利用可能である。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ配列番号2のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。ある実施形態において、該モジュレーターは一過的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行ったGTPγS結合アッセイにおいて、一過的にトランスフェクトされたメラノフォアでおこなった色素分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該接触は該モジュレーターの該個体への経口投与を含む。
いくつかの実施形態において、該個体は心血管障害に対する予防または治療の必要があるものである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋傷害、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺心臓病、リウマチ性心臓病、および心室性機能不全を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全、大動脈弁狭窄、大動脈弁脱出症、僧帽弁脱出症、三尖弁脱出症、僧帽弁不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大性心筋障害、鬱血性心筋障害、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、制限性心筋障害、シャガス心筋障害を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は血流力学障害に由来する。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は遺伝的疾患に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである.
いくつかの実施形態において、該個体は:
(a)心筋梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する肥大性心筋障害に対する予防または治療を必要とするものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は:
(a)心筋梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する肥大性心筋障害に対する予防または治療を必要とするものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は先天性心臓機能障害である。先天性心臓機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺中隔機能障害、ファロー3徴症、心室性心臓中隔機能障害、および家族性肥大性心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は拡大された心臓を呈する障害に対する予防または治療が必要なものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は哺乳動物である。なおいくつかの実施形態において、該哺乳動物は、ウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ネコ、イヌ、ウサギ、マウス、ラット、非ヒト霊長類またはヒトである。なおより好ましいのは、マウス、ラット、非ヒト霊長類またはヒトである。最も好ましいのはヒトである。
第5の局面において、本発明はRUP40 GPCRのモジュレーターを同定し、次いで、キャリアおよび該モジュレーターを混合することを含む組成物の調製方法をその要旨とし、ここで、該モジュレーターは第1の局面の方法によって同定可能である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアゴニスト、部分的アゴニスト、逆アゴニストまたはアンタゴニストからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ配列番号2のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。ある実施形態において、該モジュレーターは一過的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行ったGTPγS結合アッセイにおいて、一過的にトランスフェクトされたメラノフォアでおこなった色素分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRに対して選択的である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的に利用可能である。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、は少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であることを示すことができる。
いくつかの実施形態において、第1の局面の方法によって同定可能な該モジュレーターは第1の局面の方法によって同定される。
第6の局面において、本発明は、第2の局面のモジュレーターを含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる医薬または生理学的に受容可能な組成物をその要旨とする。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、医薬または生理学的に受容可能な組成物は薬学的組成物である。いくつかの実施形態において、医薬または生理学的に受容可能な組成物は生理学的に受容可能な組成物である。いくつかの実施形態において、医薬または生理学的に受容可能な組成物は第2の局面によるモジュレーターを含む。いくつかの実施形態において、該医薬または生理学的に受容可能な組成物は第2の局面によるモジュレーターより実質的になる。いくつかの実施形態において、医薬または生理学的に受容可能な組成物は第2の局面によるモジュレーターよりなる。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRに対して選択的である。
いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、は少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であることを示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であることを示すことができる。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ配列番号2のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。ある実施形態において、該モジュレーターは一過的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行ったGTPγS結合アッセイにおいて、一過的にトランスフェクトされたメラノフォアでおこなった色素分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アンタゴニストである。
第7の局面において、本発明は、第6の局面の該医薬または生理学的に受容可能な組成物を心血管障害の予防または治療を必要とする個体に供するまたは投与することを含む該防または治療の方法をその要旨とする。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋傷害、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺心臓病、リウマチ性心臓病、および心室性機能不全を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全、大動脈弁狭窄、大動脈弁脱出症、僧帽弁脱出症、三尖弁脱出症、僧帽弁不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大性心筋障害、鬱血性心筋障害、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、制限性心筋障害、シャガス心筋障害を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は血流力学障害に由来する。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は遺伝的障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
また、本発明は、第6の局面の該医薬または生理学的に受容可能な組成物を肥大性心筋障害の予防または治療を必要とする個体に供するまたは投与することを含む該予防または治療の方法に関し、該肥大性心筋障害は:
(a)心筋梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
(a)心筋梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は先天性心臓機能障害であり、第6の局面の該医薬または生理学的に受容可能な組成物を該予防または治療を必要とする個体に供するまたは投与することを含む。先天性心臓機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺中隔機能障害、ファロー3徴症、心室性心臓中隔機能障害、および家族性肥大性心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
また、本発明は、第6の局面の該医薬または生理学的に受容可能な組成物を障害の予防または治療を必要とする個体に供するまたは投与することを含む該予防または治療の方法に関し、ここで、該障害は拡大された心臓と共に呈される。いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアゴニストまたは逆アゴニストである。
いくつかの実施形態において、治療上有効量の該医薬または生理学的に受容可能な組成物が該個体に供され、または投与される。
いくつかの実施形態において、該医薬または生理学的に受容可能な組成物の該供与または投与は経口である。
いくつかの実施形態において、該個体は哺乳動物である。なお、いくつかの実施形態において、該哺乳動物は、ウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ネコ、イヌ、ウサギ、マウス、ラット、非ヒト霊長類、またはヒトである。なおより好ましいのはマウス、ラット、非ヒト霊長類、またはヒトである。より好ましいのはヒトである。
第8の局面において、本発明は、心血管障害の予防または治療用の医薬の調製のための第2の局面のモジュレーターを使用する方法をその要旨とする。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRに対して選択的である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的に利用可能である。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心疾患である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大性心筋障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは配列番号2のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストまたはアンタゴニストであり、IC50は100μM未満、10μM未満、または1μM未満である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、1μM〜100μMの間隔から選択された値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、一価的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行われたGTPγS結合アッセイにおいて、一価的にトランスフェクトされたメラノフォアで行われたブタ分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該治療は該医薬の該個体への経口投与を含む。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋傷害、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺心臓病、リウマチ性心臓病、および心室性機能不全を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全、大動脈弁狭窄、大動脈弁脱出症、僧帽弁脱出症、三尖弁脱出症、僧帽弁不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大性心筋障害、鬱血性心筋障害、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、制限性心筋障害、シャガス心筋障害を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは、逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は肥大性心筋障害であり、第6の局面の該医薬または生理学的に受容可能な組成物を該予防または治療を必要とする個体に供するまたは投与することを含む。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は血流力学障害に由来する。いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は遺伝的障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該肥大性心筋障害は:
(a)心筋梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
(a)心筋梗塞後再形成;
(b)心臓弁疾患;
(c)維持された心臓後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大性心筋障害
からなる群より選択される障害に由来する。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は先天性心臓機能障害である。先天性心臓機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺中隔機能障害、ファロー3徴症、心室性心臓中隔機能障害、および家族性肥大性心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は拡大された心臓と共に呈される障害の予防または治療を必要とするものである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアゴニストである。
いくつかの実施形態において、該個体は哺乳動物である。なおいくつかの実施形態において、該哺乳動物は、ウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ネコ、イヌ、ウサギ、マウス、ラット、非ヒト霊長類、またはヒトである。なおより好ましいのは、マウス、ラット、非ヒト霊長類、またはヒトである。最も好ましいのは、ヒトである。
第9の局面において、本発明は、候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを同定する方法をその要旨とし、該レセプターは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体;またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み;該方法は
(a)候補化合物の存在下、または不存在下でレセプターをGPCRの標識された既知のリガンドと接触させ;次いで、
(b)該標識された既知のリガンドの結合が候補化合物の存在下で阻害されるか否かを決定する;
工程を含み、ここで、該阻害はRUP40 GPCRのリガンドである候補化合物を示す。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体;またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み;該方法は
(a)候補化合物の存在下、または不存在下でレセプターをGPCRの標識された既知のリガンドと接触させ;次いで、
(b)該標識された既知のリガンドの結合が候補化合物の存在下で阻害されるか否かを決定する;
工程を含み、ここで、該阻害はRUP40 GPCRのリガンドである候補化合物を示す。
いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRは組換えのものである。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは1以上のエピトープタグを含む。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチニン(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
また、本発明は;
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40
GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第1の集団を該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(c)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第2の集団を該化合物および工程(b)の該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(d)工程(b)および工程(c)の該RUP40 GPCR−発現細胞の標識された既知のリガンドの結合を測定し;次いで、
(e)該RUP40 GPCRへの標識された既知のリガンドの結合を、工程(b)および工程(c)のRUP40 GPCR−発現細胞と比較する;
工程を含み、ここで、該化合物の存在下における該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの結合の阻害はRUP40 GPCRのリガンドである該化合物を示すことを特徴とする候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを決定する方法に関する。
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40
GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第1の集団を該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(c)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞の第2の集団を該化合物および工程(b)の該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(d)工程(b)および工程(c)の該RUP40 GPCR−発現細胞の標識された既知のリガンドの結合を測定し;次いで、
(e)該RUP40 GPCRへの標識された既知のリガンドの結合を、工程(b)および工程(c)のRUP40 GPCR−発現細胞と比較する;
工程を含み、ここで、該化合物の存在下における該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの結合の阻害はRUP40 GPCRのリガンドである該化合物を示すことを特徴とする候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを決定する方法に関する。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸配列はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチニン(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
また、本発明は:
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は;
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2または4のアミノ酸配列のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞からの膜を調製し;
(c)工程(b)の膜調製物の第1の集団を工程(b)の該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(d)工程(b)の膜調製物の第2の集団を候補化合物および該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(e)工程(c)および工程(d)の膜調製物への該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの結合を測定し;次いで、
(f)該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの、工程(c)および工程(d)の膜調製物への結合を比較する;工程を含み、ここで、該化合物の存在下における該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの結合の阻害はRUP40 GPCRのリガンドである該化合物を示すことを特徴とする、候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを決定する方法に関する。
(a)組換えRUP40 GPCRの発現を可能とするであろう条件下でRUP40 GPCR−発現宿主細胞を培養し、該宿主細胞は;
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2または4のアミノ酸配列のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む該組換えRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターでトランスフェクトされており;
(b)工程(a)のRUP40 GPCR−発現細胞からの膜を調製し;
(c)工程(b)の膜調製物の第1の集団を工程(b)の該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(d)工程(b)の膜調製物の第2の集団を候補化合物および該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドに暴露し;
(e)工程(c)および工程(d)の膜調製物への該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの結合を測定し;次いで、
(f)該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの、工程(c)および工程(d)の膜調製物への結合を比較する;工程を含み、ここで、該化合物の存在下における該RUP40 GPCRの標識された既知のリガンドの結合の阻害はRUP40 GPCRのリガンドである該化合物を示すことを特徴とする、候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを決定する方法に関する。
いくつかの実施形態において、該膜調製物はBrinkman PolytronTMでの細胞のホモゲナイゼーションによって作製される。いくつかの実施形態において、該膜調製物はポリトロンの各々の10〜20秒持続の3バーストでのホモゲナイゼーションによって作製される。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、該「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC−アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつき、n1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつき、n1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつき、n1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体の作製方法は当業者の範囲内にある(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではなく、例として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりのスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801のバニンの代わりのイソロイシンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりのメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(i)〜(x)に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸配列はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチミン(HAエピトープタグ)である。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。
いくつかの実施形態において、該既知のリガンドは第2の局面のモジュレーターである。
他の実施形態において、該既知のリガンドはGPCRに対して特異的な抗体、または該抗体の誘導体である。
いくつかの実施形態において、該標識は:
(a)放射性同位体;
(b)酵素;および
(c)フルオロフォア
からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、該標識は放射性同位体である。なおいくつかの実施形態において、該標識は3H、14C、35S、および125Iからなる群より選択される。
(a)放射性同位体;
(b)酵素;および
(c)フルオロフォア
からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、該標識は放射性同位体である。なおいくつかの実施形態において、該標識は3H、14C、35S、および125Iからなる群より選択される。
他の実施形態において、該方法は、さらに、候補化合物による標識された第1の既知のリガンドの結合の阻害のレベルを、GPCRに結合することが知られている第2のリガンドによる該標識された第1の既知のリガンドの結合の阻害の第2のレベルと比較する工程を含む。
第10の局面において、本発明は、ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物をその要旨とし、該レセプターは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;および
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;および
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、該「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC−アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSFAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつき、n1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつき、n1=227、n2=991、およびc=1,346である。
GPCRの構成的に活性化された変異体の作製方法は当業者の範囲内にある(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではなく、例として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりのスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801のバニンの代わりのイソロイシンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりのメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は、内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
(a)〜(d)に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、該非ヒト哺乳動物は、マウス、ラットまたはブタである。
いくつかの実施形態において、ヒトRUP40 GPCRの該発現は心筋細胞−選択的である。
いくつかの実施形態において、該ヒトRUP40 GPCRの該心筋細胞−選択的発現はアルファミオシン重鎖プロモーターによって付与される[Subramaniam A et al.,J Biol Chem(1991)266:24613−20;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
いくつかの実施形態において、該トランスジェニック非ヒト哺乳動物は野生型コントロール哺乳動物に対して鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する素因を呈するか、または鬱血性心不全または肥大性心筋障害を発現する。
第11の局面において、本発明は、:
(a)第2の局面のモジュレーターをトランスジェニック非ヒト哺乳動物に投与し、または投与せず;
(b)該モジュレーターの投与が;
(i)湿潤または乾燥心臓重量の低下;
(ii)湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率の低下;
(iii)心筋細胞の断面積の低下;および
(iv)ANF遺伝子の誘導のレベルの低下;
からなる群より選択される効果を有するか否かを決定する;
工程を含む、ここで、該決定は、鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する予防または治療で効果を有するモジュレーターを示すことを特徴とする、第2の局面のモジュレーターが鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する予防または治療で効果を有するか否かを同定するための、鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する該素因を呈し、または鬱血性心不全または肥大性心筋障害を発現する第10の局面のトランスジェニック非ヒト哺乳動物の使用方法をその要旨とする。
(a)第2の局面のモジュレーターをトランスジェニック非ヒト哺乳動物に投与し、または投与せず;
(b)該モジュレーターの投与が;
(i)湿潤または乾燥心臓重量の低下;
(ii)湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率の低下;
(iii)心筋細胞の断面積の低下;および
(iv)ANF遺伝子の誘導のレベルの低下;
からなる群より選択される効果を有するか否かを決定する;
工程を含む、ここで、該決定は、鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する予防または治療で効果を有するモジュレーターを示すことを特徴とする、第2の局面のモジュレーターが鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する予防または治療で効果を有するか否かを同定するための、鬱血性心不全または肥大性心筋障害に対する該素因を呈し、または鬱血性心不全または肥大性心筋障害を発現する第10の局面のトランスジェニック非ヒト哺乳動物の使用方法をその要旨とする。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該哺乳動物はマウスである。いくつかの実施形態において、該該哺乳動物はラットである。いくつかの実施形態において、該該哺乳動物はブタである。
第12の局面において、本発明は、RUP40遺伝子中に破壊を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物をその要旨とする。いくつかの実施形態において、本発明は、RUP40遺伝子中に破壊を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物をその要旨とし、ここで、内因性RUP40遺伝子の天然の発現はない。いくつかの実施形態において、本発明は、RUP40遺伝子の心筋細胞−選択的破壊を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物をその要旨とする。いくつかの実施形態において、本発明は、RUP40遺伝子の心筋細胞−選択的破壊を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物をその要旨とし、ここで、内因性RUP40遺伝子の天然の心筋細胞の発現はない。内因性RUP遺伝子の天然発現を評価する方法は当業者の範囲内にあり、限定されるものではないが、RP−PCR、ノーザンブロット、インサイチュハイブリダイゼーション、および免疫細胞化学を含む。
いくつかの実施形態において、該非ヒト哺乳動物はマウス、ラットまたはブタである。
いくつかの実施形態において、該心筋細胞−選択的破壊はミオシン軽鎖2(mlc−2v)の心室特異的イソ形態についてのプロモーターによって付与される[Minamisawa S et al.,J Biol Chem (1999)274:10066−70;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
いくつかの実施形態において、該哺乳動物はマウスであって、該RUP40遺伝子は配列番号6のアミノ酸配列、または該アミノ酸配列の対立遺伝子改変体を含むポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態において、該哺乳動物はラットであって、該RUP40遺伝子は配列番号4のアミノ酸配列、または該アミノ酸配列の対立遺伝子改変体を含むポリペプチドをコードする。
いくつかの実施形態において、RUP40遺伝子中に破壊を含む該トランスジェニック非ヒト哺乳動物は、野生型コントロール哺乳動物に対して横方向大動脈収縮(TAC)につき低下した肥大性心筋障害を発現する。
第13の局面において、本発明は、配列番号2のアミノ酸配列、または該アミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または該アミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的に活性なフラグメントを含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単離されたポリヌクレオチドをその要旨とし、ここで、該生物学的に活性なフラグメントまたは構成的に活性な変異体は配列番号2の位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含み、または配列番号2の位置604にメチオニン、および位置856にスレオニンを含む。いくつかの実施形態において、該単離されたポリヌクレオチドは配列番号1のポリヌクレオチドを含み、実質的にそれよりなり、またはそれよりなる。また、本発明は、該単離されたポリヌクレオチドの相補体に関する。いくつかの実施形態において、該単離されたポリヌクレオチドまたはその相補体は精製されたものである。
上記対立遺伝子改変体が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2アミノ酸配列の対立遺伝子改変体をコードするヌクレオチド配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単離されたポリヌクレオチドは本発明の範囲内にあると考えられる。
上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であり、かつ上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含み、または配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニン、およびアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2のアミノ酸配列の改変体をコードするヌクレオチド配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなる単離されたポリヌクレオチドは本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=856およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCR該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、および227〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=856、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=856、およびc=1,346である。
本発明はまた、配列番号1の少なくとも18ヌクレオチドの連続スパンを含む単離されたポリペプチドに関し、ここで、この連続スパンは、配列番号1のヌクレオチド1,810〜1,812を含むか、配列番号1のヌクレオチド2,566〜2,568を含むか、または配列番号1のヌクレオチド1,810〜1,812およびヌクレオチド2,566〜2,568を含む。いくつかの実施形態において、この単離されたポリヌクレオチドは、精製されている。
第14の局面において、本発明は、第13の局面の単離されたポリヌクレオチドを含むベクターをその要旨とする。
いくつかの好ましい実施形態において、このベクターは、発現ベクターである。いくつかの好ましい実施形態において、この発現ベクターは、真核生物発現ベクターである。いくつかの好ましい実施形態において、この発現ベクターは、pCMVである。いくつかの好ましい実施形態において、この発現ベクターは、アデノウイルス発現ベクターである。他の適切な発現ベクターは、当業者に容易に認識される。
第15の局面において、本発明は、第14の局面の発現ベクターで形質転換されたか、トランスフェクトされたか、または感染された宿主細胞をその要旨とする。
いくつかの実施形態において、この宿主細胞は、真核生物である。いくつかの実施形態において、この真核生物宿主細胞は、E.coliである。いくつかの好ましい実施形態において、この宿主細胞は、真核生物であり、より好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは293、293T、CHO、およびCOS−7細胞からなる群より選択される。他の好ましい実施形態において、この宿主細胞は、真核生物であり、より好ましくはメラノフォアである。他の適切な宿主細胞は、当業者に容易に認識される。
いくつかの実施形態において、本発明は、形質転換されたか、このトランスフェクトされたか、または感染された宿主細胞の精製された集団に関する。
第16の局面において、本発明は、配列番号2のRUP40 GPCRのアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的に活性なフラグメントを含む組換えポリペプチドを発現する組換え宿主細胞をその要旨とする。
上記対立遺伝子改変体が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2アミノ酸配列の対立遺伝子改変体は、本発明の範囲内にあると考えられる。
上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であり、かつ上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含み、または配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニン、およびアミノ酸位置856にスレオニンを含む、配列番号2のアミノ酸配列の改変体は、本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=856およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCR該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、および227〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=856、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=856、およびc=1,346である。
いくつかの実施形態において、本発明は、該組換えポリペプチドを発現する該組換え宿主細胞の精製された集団に関する。
第17の局面において、本発明は、第16の局面の組換え宿主細胞の膜をその要旨とする。
第18の局面において、本発明は、配列番号2のRUP40 GPCRのアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的に活性なフラグメントを含む単離されたポリペプチドをその要旨とする。いくつかの実施形態において、該単離されたポリペプチドは精製されている。
上記対立遺伝子改変体が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2のアミノ酸配列の対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であって、上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2のアミノ酸配列の改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=856およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCR該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、および227〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=856、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=856、およびc=1,346である。
また、本発明は、配列番号2の少なくとも6つのアミノ酸の連続スパンを含む単離されたポリペプチドに関し、ここで、該連続スパンは配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含み、または配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニン、およびアミノ酸位置856にスレオニンを含む。
第19の局面において、本発明は、適当な条件下で、宿主細胞が配列番号2のアミノ酸配列、または該アミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または該アミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその生物学的に活性なフラグメントを含むポリペプチドを生産するように、第14の局面の発現ベクターで細胞を形質転換し、トランスフェクトし、または感染させることを含む組換え宿主細胞の生産方法をその要旨とし、ここで、該生物学的に活性なフラグメントまたは構成的に活性な変異体は配列番号2の位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含み、または配列番号2の位置604にメチオニン、位置856にスレオニンを含む。
上記対立遺伝子改変体が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2のアミノ酸配列の対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であって、上記改変体アミノ酸配列が配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニンを含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニンを含む配列番号2のアミノ酸配列の改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。
いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および配列番号2の全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=856およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCR該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、および227〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=856、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=856、およびc=1,346である。
第20の局面において、本発明は、配列番号2のアミノ酸配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるポリペプチドに対して特異的に結合するが、配列番号2のアミノ酸位置604にメチオニン以外のアミノ酸置換よりなり、配列番号2のアミノ酸位置856にスレオニン以外のアミノ酸置換よりなり、または配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニン以外のアミノ酸置換、およびアミノ酸位置856のスレオニン以外のアミノ酸置換よりなる該ポリペプチドの改変体に対しては特異的に結合しない抗体、または該抗体の抗原結合フラグメントをその要旨とする。いくつかの実施形態において、抗体はモノクローナルである。いくつかの実施形態において、該モノクローナル抗体は精製されている。抗体を作製する方法は当業者の範囲内のものである(例えば、2002年8月29日にWO 02/066505として公開されたPCT出願番号PCT/IB02/01461参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
第21の局面において、本発明は、上記抗体が上記ポリペプチドに特異的に結合することができる条件下で、該抗体を該ポリペプチドと接触させることを含む、第20の局面の抗体に、配列番号2のアミノ酸配列を含む、実質的にそれよりなる、またはそれよりなるポリペプチドを結合させる方法をその要旨とする。
第22の局面において、本発明は、;
(a)請求項1の方法による上記モジュレーターを同定し;次いで、
(b)(a)で同定されたモジュレーターを合成する;
工程を含む、RUP40 GPCRのモジュレーターの製法をその要旨とする。
(a)請求項1の方法による上記モジュレーターを同定し;次いで、
(b)(a)で同定されたモジュレーターを合成する;
工程を含む、RUP40 GPCRのモジュレーターの製法をその要旨とする。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはアゴニスト、部分的アゴニスト、逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ配列番号2のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択される値未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは一過的にまたは安定にトランスフェクトされたCHO細胞からの膜で行ったGTPγS結合アッセイにおいて、一過的にトランスフェクトされたメラノフォアで行った色素分散アッセイにおいて、または配列番号2のアミノ酸配列を有する組換えRUP40 GPCRポリペプチドを発現するアデノウイルス感染心筋細胞におけるIP3アッセイによって、100μM未満の、10μM未満の、または1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて100μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて90μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて80μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて70μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて60μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて50μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて40μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて30μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて20μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて10μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて9μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて8μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて7μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて6μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて5μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて4μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて3μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて2μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは該アッセイにおいて1μM未満のIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜100μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは1μM〜10μMの間隔から選択された値未満の該アッセイにおけるIC50を持つ逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストは逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、該逆アゴニストまたはアンタゴニストはアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターはGPCRに対して選択的である。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心臓病のモジュレーターである。いくつかの実施形態において、該心臓病は鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、該心臓病は肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは心筋細胞肥大のモジュレーターである。
いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的に利用可能である。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は腹腔内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも45%であると示すことができる。いくつかの実施形態において、該経口生物学的利用性は静脈内投与に対して少なくとも1%、少なくとも5%、少なくとも10%、または少なくとも15%であると示すことができる。
第23の局面において、本発明は、心血管障害用の薬学的薬剤としての候補化合物をスクリーニングするためのRUP40 GPCRの使用をその要旨とし、ここで該RUP40 GPCRは;
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含むレセプターである。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント、または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含むレセプターである。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつき、n1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346,22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物的学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349,25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されるシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されるタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、およびアミノ酸994はGPSドメイン内の予測されるタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体の作製方法は当業者の範囲内にある(例えば、1998年10月22日にWO 98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6,555,339参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。限定されるものではなく、例として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりにスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801のバリンの代わりのイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりのメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCR対立遺伝子改変体は内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であり、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
(a)〜(j)のいずれかに対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。パーセント同一性は公知のコンピュータプログラムを用いて慣用的に決定することができる。そのようなアルゴリズムおよびプログラムは、断じて限定されるものではないが、TBLASTN、BLASTP、FASTA、TFASTAおよびCLUSTALWを含む[Pearson and Lipman(1988)Proc Natl Acad Sci USA 85:2444−8;Altschul et al.(1990)J Mol Biol 215:403−10;Thompson et al.(1994)Nucleic Acids Res 22:4673−80;Higgins et al.(1996)Meth Enzymol 266:383−402;Altschul et al.(1997)Nucleic Acids Res 25:3389−3402;Altschul et al.(1993)Nature Genetics 3:266−272;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
いくつかの実施形態において、タンパク質配列の相同性は上記分野でよく知られた基本的局所整列サーチツール(Basic Local Alignment Search Tool)(「BLAST」)を用いて評価される。[例えば、Karlin and Altschul (1990)Proc Natl Acad Sci USA 87:2264−8;Altschul et al.,1990,1993,1997,全て前掲]。
いくつかの実施形態において、2つのアミノ酸配列の間のパーセント同一性を決定するための方法は、問い合わせ配列(例えば、配列番号2のアミノ酸配列)およびBrutlag et al.[Comp App Biosci (1990)6:237−245;その開示をここで引用してその全体を援用する]のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータプログラムを用い、全体的配列整列ともいう質問するべき配列の間の最良の総じてのマッチを決定する方法である。配列整列において、問い合わせ配列および質問配列はともにアミノ酸配列である。該全体的配列整列の結果はパーセント同一性で表す。FASTDBアミノ酸整列で用いられる好ましいパラメータは;マトリックス=PAM 0、k−tuple=2、ミスマッチペナルティ=1、接合ペナルティ=20、ランダム化群=25、長さ=0、カットオフスコア=1、ウィンドウサイズ=配列の長さ、ギャップペナルティ=5、ギャップサイズペナルティ=0.05、ウィンドウサイズ=247、または質問アミノ酸配列の長さいずれか短いほうである。
もし質問配列が内部欠失のためではなくN−またはC末端欠失のため問い合わせ配列よりも短ければ、パーセント同一性における結果は手動で修正しなければならない。なぜならば、全体的パーセント同一性を計算する場合には、FASTDBプログラムは質問配列のN−およびC末端切形を考慮しないためである。問い合わせ配列に対するN−およびC末端で切形された質問配列では、対応する質問配列残基とマッチ/整列しない、質問配列のN−およびC末端である問い合わせ配列の残基の数を、問い合わせ配列の合計塩基の数として計算することによって、パーセント同一性は修正される。残基がマッチ/整列したか否かは、FASTDB配列整列の結果によって決定される。次いで、特定のパラメータを用いて前記FASTDBプログラムによって計算されたパーセント同一性からこのパーセンテージを差し引いて最終のパーセント同一性スコアに到達する。この最終のパーセント同一性スコアは、本発明の目的で用いられるものである。問い合わせ配列とマッチ/整列しない質問配列のN−およびC末端に対する残基のみが、パーセント同一性スコアを手動で調整する目的で考慮される。すなわち、質問配列の最も遠いN−およびC末端残基の外側にある問い合わせアミノ酸残基のみ。
例えば、90アミノ酸残基の質問配列は100−残基の問い合わせ配列と整列させて、パーセント同一性を決定する。欠失は質問配列のN末端で起こり、従って、FASTDB整列はN末端の最初の残基とはマッチ/整列しない。10の不対残基は配列の10%を表し(マッチしなかったN−およびC末端における残基の数/問い合わせ配列における残基の合計数)、従って、FASTDBプログラムによって計算されたパーセント同一性スコアから10%を差し引く。もし残存する90残基が完全にマッチすれば、最終パーセント同一性は90%であろう。
もう一つの例において、90−残基の質問配列を100−残基の問い合わせ配列と比較する。このとき欠失は内部にあり、従って、問い合わせとマッチ/整列しない配列は、質問配列のN−またはC末端には残基はない。この場合、FASTDBによって計算されたパーセント同一性は手動で修正されない。再度、問い合わせ配列とマッチ/整列しないFASTDB整列で提示される、対象の配列のN−およびC末端の外側にある残基位置のみが手動で修正される。他の修正は本発明の目的ではなされない。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは組換えのものである。
いくつかの実施形態において、該RUP40 GPCRは異種アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、該異種アミノ酸配列はエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはヘマグルチニン(HA)エピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはc−mycエピトープタグである。いくつかの実施形態において、該エピトープタグはV5エピトープタグである。該HA、c−mycまたはV5タグを供するための手法は、当業者によく知られている(例えば、Clontech,Palo Alto,CA およびInvitrogen,Carlsbad,CA)。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、シグナルペプチドのタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、SEAモジュール内にタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該レセプターは、さらに、GPSドメイン内にタンパク質分解切断を含む。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室中隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺性心、リウマチ性心疾患、および心室機能障害を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全症、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱、僧帽弁逸脱、三尖弁逸脱、僧帽弁閉鎖不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大型心筋症、鬱血性心筋症、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋症を含む。
いくつかの実施形態において、心血管障害は肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、該肥大型心筋症は血行動態障害に由来する。いくつかの実施形態において、該肥大型心筋症は遺伝性疾患に由来する。いくつかの実施形態において、肥大型心筋症は心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、または家族性肥大型心筋症に由来する。
いくつかの実施形態において、該心血管障害は先天性心臓欠陥である。先天性心臓欠陥は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺動脈中隔欠損、ファロー三徴症、心室中隔欠損症、および家族性肥大型心筋症を含む。
いくつかの実施形態において、心血管障害は肥大した心臓と共に呈される心血管障害である。
いくつかの実施形態において、心血管障害は心臓病である。いくつかの実施形態において、心臓病は肥大型心筋症または鬱血性心不全である。いくつかの実施形態において、肥大型心筋症は心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、または家族性肥大型心筋症に由来する。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤は抗体またはその抗原結合部位ではない。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤は低分子であり、但し、低分子は抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はポリペプチドであり、但し、ポリペプチドは抗体またはその抗原結合フラグメントではない。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤は脂質である。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤は抗体またはその抗原結合フラグメントである。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はレセプターのリガンドである。
いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はレセプターのモジュレーターである。いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はレセプターのアゴニスト、部分的アゴニスト、逆アゴニスト、またはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はレセプターの逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はレセプターの逆アゴニストである。いくつかの実施形態において、薬学的薬剤はレセプターのアンタゴニストである。
いくつかの実施形態において、該使用は、さらに、該スクリーニングされた薬学的薬剤の合成を含む。
いくつかの実施形態において、該使用はさらに:
(a)所望により、化合物の構造を決定し、次いで、
(b)化合物または薬学的薬剤、または化合物の名称または構造を供する;
ことを含む。
(a)所望により、化合物の構造を決定し、次いで、
(b)化合物または薬学的薬剤、または化合物の名称または構造を供する;
ことを含む。
いくつかの実施形態において、該使用はさらに;
(a)所望により、化合物の構造を決定し;
(b)所望により、化合物の名称または構造を供し;次いで、
(c)化合物を供し、または合成する;
ことを含む。
本発明は例えば、以下の項目を提供する:
(項目1)
候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであるか否かを同定する方法であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み、該方法は、以下の工程:
(i)該候補化合物を該レセプターと接触させる工程;および
(ii)該レセプター機能性が調節されるか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、レセプター機能の変化は、該候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであることを示す、方法。
(項目2)
候補化合物が心血管障害のモジュレーターであるか否かを同定する方法であって、該方法は、以下の工程:
(a)該候補化合物をRUP40 GPCRと接触させる工程であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、工程;
(b)該レセプターの機能が調節されるか否かを決定する工程;
を包含し、
ここで、レセプター機能の変化は、該候補化合物が心血管障害のモジュレーターであることを示す、方法。
(項目3)
項目1または2に記載の方法に従って同定されたモジュレーター。
(項目4)
アゴニスト、部分アゴニスト、逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目3に記載のモジュレーター。
(項目5)
逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目3に記載のモジュレーター。
(項目6)
RUP40 GPCRの活性を調節する方法であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを用いてヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み;
該方法は、該レセプターを項目3に記載のモジュレーターと接触させる工程を含む、方法。
(項目7)
前記接触させる工程が、前記モジュレーターを、前記レセプターを含む個体に投与する工程を包含し、ここで、該個体は、心臓病の予防または治療を必要としている、項目6の記載の方法。
(項目8)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目7記載の方法。
(項目9)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目7記載の方法。
(項目10)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目7に記載の方法。
(項目12)
心臓病の予防または治療を必要とする個体において該心臓病を予防するか、または治療する方法であって、該方法は、治療上有効量の項目3に記載のモジュレーターをRUP40 GPCRと接触させる工程を包含し、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、方法。
(項目13)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目12に記載の方法。
(項目14)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目12に記載の方法。
(項目15)
前記肥大型心筋症が:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目12に記載の方法。
(項目17)
組成物を調製する方法であって、該方法は、モジュレーターを同定する工程、次いで、キャリアおよびモジュレーターを混合する工程を包含し、ここで、モジュレーターは、項目1または2に記載の方法によって同定可能である、方法。
(項目18)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目17に記載の方法。
(項目19)
項目3に記載のモジュレーターを含むか、項目3に記載のモジュレーターで実質的に構成されるか、または項目3に記載のモジュレーターで構成される薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目20)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目19に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目21)
項目19に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物を心臓病の予防または治療を必要とする個体に提供する工程、または投与する工程を包含する、該心臓病を予防するか、または治療する方法。
(項目22)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目21記載の方法。
(項目23)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目21記載の方法。
(項目24)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目23に記載の方法。
(項目25)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目21に記載の方法。
(項目26)
心臓病の予防または治療のための医薬の調製のための項目3に記載のモジュレーターの使用方法。
(項目27)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目26に記載の方法。
(項目28)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目26に記載の方法。
(項目29)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目26記載の方法。
(項目31)
候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを同定する方法であって、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1、346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み、該方法は、以下の工程:
(i)該候補化合物の存在下または不存在下で、該レセプターを該GPCRの標識された既知のリガンドと接触させる工程;および
(ii)該標識された既知のリガンドの該レセプターへの結合が、該候補化合物の存在下で阻害されるか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、該阻害は、候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであることを示す、方法。
(項目32)
ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;および
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
からなる群より選択されるアミノ酸、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目33)
前記哺乳動物が、マウス、ラット、およびブタからなる群より選択される、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目34)
前記発現が、心筋細胞選択的である、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目35)
前記トランスジェニック非ヒト哺乳動物が、野生型コントロール哺乳動物に対して、鬱血性心不全または肥大型心筋症に対する素因を呈するか、または鬱血性心不全または肥大型心筋症を現す、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目36)
項目3に記載のモジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療に効果を有するか否かを同定するために項目35記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物を使用する方法であって、該方法は、以下の工程:
(a)該モジュレーターをトランスジェニック非ヒト哺乳動物するか、または投与しない工程;
(b)該モジュラーターの投与が、以下;
(i)湿潤または乾燥心臓重量の低下;
(ii)湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率の低下;
(iii)心筋細胞の断面積の低下;および
(iv)ANF遺伝子の誘導のレベルの低下;
からなる群より選択される効果を有するか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、該決定は、該モジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療についての効果を有することを示す、方法。
(項目37)
該モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目36記載の方法。
(項目38)
RUP40遺伝子に破壊を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目39)
前記破壊が、心筋細胞選択的である、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目40)
前記哺乳動物が、マウス、ラットおよびブタからなる群より選択される、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目41)
前記哺乳動物が、マウスであり、かつ前記RUP40遺伝子が、配列番号6のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目42)
前記哺乳動物が、ラットであり、かつ前記RUP40遺伝子が、配列番号4のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目43)
前記哺乳動物が、野生型コントロール哺乳動物に対して、横方向大動脈収縮(TAC)につき低下した肥大型心筋症を発現する項目38〜42のいずれか1項に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目44)
心臓病のための薬学的薬剤としての候補化合物をスクリーニングするためのRUP40
GPCRの使用であって、ここで、該RUP40 GPCRは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド度配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含むレセプターである、使用。
(項目45)
前記心血管障害が、心臓病である、項目44に記載の使用。
(項目46)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、請求候45に記載の方法。
(項目47)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目45に記載の方法。
(項目48)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目45に記載の方法。
(項目50)
前記薬学的薬剤が、前記レセプターのリガンドである、項目44に記載の使用。
(項目51)
前記薬学的薬剤が、前記レセプターのモジュレーターである、項目44に記載の使用。
(項目52)
アゴニスト、部分アゴニスト、逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目51に記載のモジュレーター。
(項目53)
逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目51に記載のモジュレーター。
(項目54)
RUP40 GPCRの活性を調節する方法であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1、346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み、該方法は、該レセプターを、項目51に記載のモジュレーターと接触させる工程を包含する、方法。
(項目55)
前記接触させる工程が、前記モジュレーターを、前記レセプターを含む個体に投与する工程を包含し、ここで、該個体は、心臓病の予防または治療を必要とする、項目54に記載の方法。
(項目56)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目55に記載の方法。
(項目57)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目55に記載の方法。
(項目58)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目57に記載の方法。
(項目59)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目55に記載の方法。
(項目60)
心臓病の予防または治療を必要とする個体において該心臓病を予防するか、または治療する方法であって、該方法は、治療上有効量の項目51に記載のモジュレーターをRUP40 GPCRと接触させる工程を包含し、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1、346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、方法。
(項目61)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目60記載の方法。
(項目62)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目60記載の方法。
(項目63)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目62に記載の方法。
(項目64)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目60に記載の方法。
(項目65)
組成物を調製する方法であって、該方法は、モジュレーターを得る工程、次いで、キャリア、および該モジュレーターを混合する工程を包含し、ここで、該モジュレーターは、項目51に記載の使用に従う、方法。
(項目66)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目65に記載の方法。
(項目67)
項目51に記載のモジュレーターを含むか、項目51に記載のモジュレーターで実質的に構成されるか、または項目51に記載のモジュレーターで構成される薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目68)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目67に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目69)
心臓病について予防するか、または治療する方法であって、該方法は、該予防または治療を必要とする個体に項目67に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物を提供する工程または投与する工程を包含する、方法。
(項目70)
前記心臓病が、先天性心不全である、項目69記載の方法。
(項目71)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目69記載の方法。
(項目72)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目71に記載の方法。
(項目73)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目69に記載の方法。
(項目74)
心臓病についての予防または治療のための医薬を調製するための項目51に記載のモジュレーターを使用する方法。
(項目75)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目74に記載の方法。
(項目76)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目74に記載の方法。
(項目77)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目76に記載の方法。
(項目78)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目74に記載の方法。
(項目79)
項目51に記載の前記モジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療に対して効果を有するか否かを同定するために、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物を使用する方法であって、該方法は、以下の工程:
(a)該モジュレーターを項目32記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物に投与するか、または投与しない工程;
(b)該モジュレーターの投与が、以下:
(i)湿潤または乾燥心臓重量の低下;
(ii)湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率の低下;
(iii)心筋細胞の断面積の低下;および
(iv)ANF遺伝子の誘導のレベルの低下;
からなる群より選択される効果を有するか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、該決定は、該モジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療に効果を有することを示す、方法。
(項目80)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目79に記載の方法。
(項目81)
前記個体が、哺乳動物である、項目7〜16、21〜25、55〜64、および69〜73のいずれか1項に記載の方法。
(項目82)
前記哺乳動物が、非ヒト哺乳動物である、項目81に記載の方法。
(項目83)
前記哺乳動物が、ヒトである、項目81に記載の方法。
(a)所望により、化合物の構造を決定し;
(b)所望により、化合物の名称または構造を供し;次いで、
(c)化合物を供し、または合成する;
ことを含む。
本発明は例えば、以下の項目を提供する:
(項目1)
候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであるか否かを同定する方法であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み、該方法は、以下の工程:
(i)該候補化合物を該レセプターと接触させる工程;および
(ii)該レセプター機能性が調節されるか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、レセプター機能の変化は、該候補化合物がRUP40 GPCRのモジュレーターであることを示す、方法。
(項目2)
候補化合物が心血管障害のモジュレーターであるか否かを同定する方法であって、該方法は、以下の工程:
(a)該候補化合物をRUP40 GPCRと接触させる工程であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(i)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(ii)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(iii)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(iv)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(v)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(vi)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(vii)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(viii)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(ix)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(x)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、工程;
(b)該レセプターの機能が調節されるか否かを決定する工程;
を包含し、
ここで、レセプター機能の変化は、該候補化合物が心血管障害のモジュレーターであることを示す、方法。
(項目3)
項目1または2に記載の方法に従って同定されたモジュレーター。
(項目4)
アゴニスト、部分アゴニスト、逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目3に記載のモジュレーター。
(項目5)
逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目3に記載のモジュレーター。
(項目6)
RUP40 GPCRの活性を調節する方法であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを用いてヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み;
該方法は、該レセプターを項目3に記載のモジュレーターと接触させる工程を含む、方法。
(項目7)
前記接触させる工程が、前記モジュレーターを、前記レセプターを含む個体に投与する工程を包含し、ここで、該個体は、心臓病の予防または治療を必要としている、項目6の記載の方法。
(項目8)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目7記載の方法。
(項目9)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目7記載の方法。
(項目10)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目7に記載の方法。
(項目12)
心臓病の予防または治療を必要とする個体において該心臓病を予防するか、または治療する方法であって、該方法は、治療上有効量の項目3に記載のモジュレーターをRUP40 GPCRと接触させる工程を包含し、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、方法。
(項目13)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目12に記載の方法。
(項目14)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目12に記載の方法。
(項目15)
前記肥大型心筋症が:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目12に記載の方法。
(項目17)
組成物を調製する方法であって、該方法は、モジュレーターを同定する工程、次いで、キャリアおよびモジュレーターを混合する工程を包含し、ここで、モジュレーターは、項目1または2に記載の方法によって同定可能である、方法。
(項目18)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目17に記載の方法。
(項目19)
項目3に記載のモジュレーターを含むか、項目3に記載のモジュレーターで実質的に構成されるか、または項目3に記載のモジュレーターで構成される薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目20)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目19に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目21)
項目19に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物を心臓病の予防または治療を必要とする個体に提供する工程、または投与する工程を包含する、該心臓病を予防するか、または治療する方法。
(項目22)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目21記載の方法。
(項目23)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目21記載の方法。
(項目24)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目23に記載の方法。
(項目25)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目21に記載の方法。
(項目26)
心臓病の予防または治療のための医薬の調製のための項目3に記載のモジュレーターの使用方法。
(項目27)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目26に記載の方法。
(項目28)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目26に記載の方法。
(項目29)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目26記載の方法。
(項目31)
候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであるか否かを同定する方法であって、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1、346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み、該方法は、以下の工程:
(i)該候補化合物の存在下または不存在下で、該レセプターを該GPCRの標識された既知のリガンドと接触させる工程;および
(ii)該標識された既知のリガンドの該レセプターへの結合が、該候補化合物の存在下で阻害されるか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、該阻害は、候補化合物がRUP40 GPCRのリガンドであることを示す、方法。
(項目32)
ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;および
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸配列は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
からなる群より選択されるアミノ酸、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目33)
前記哺乳動物が、マウス、ラット、およびブタからなる群より選択される、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目34)
前記発現が、心筋細胞選択的である、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目35)
前記トランスジェニック非ヒト哺乳動物が、野生型コントロール哺乳動物に対して、鬱血性心不全または肥大型心筋症に対する素因を呈するか、または鬱血性心不全または肥大型心筋症を現す、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目36)
項目3に記載のモジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療に効果を有するか否かを同定するために項目35記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物を使用する方法であって、該方法は、以下の工程:
(a)該モジュレーターをトランスジェニック非ヒト哺乳動物するか、または投与しない工程;
(b)該モジュラーターの投与が、以下;
(i)湿潤または乾燥心臓重量の低下;
(ii)湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率の低下;
(iii)心筋細胞の断面積の低下;および
(iv)ANF遺伝子の誘導のレベルの低下;
からなる群より選択される効果を有するか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、該決定は、該モジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療についての効果を有することを示す、方法。
(項目37)
該モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目36記載の方法。
(項目38)
RUP40遺伝子に破壊を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目39)
前記破壊が、心筋細胞選択的である、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目40)
前記哺乳動物が、マウス、ラットおよびブタからなる群より選択される、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目41)
前記哺乳動物が、マウスであり、かつ前記RUP40遺伝子が、配列番号6のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目42)
前記哺乳動物が、ラットであり、かつ前記RUP40遺伝子が、配列番号4のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、項目38に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目43)
前記哺乳動物が、野生型コントロール哺乳動物に対して、横方向大動脈収縮(TAC)につき低下した肥大型心筋症を発現する項目38〜42のいずれか1項に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目44)
心臓病のための薬学的薬剤としての候補化合物をスクリーニングするためのRUP40
GPCRの使用であって、ここで、該RUP40 GPCRは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド度配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含むレセプターである、使用。
(項目45)
前記心血管障害が、心臓病である、項目44に記載の使用。
(項目46)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、請求候45に記載の方法。
(項目47)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目45に記載の方法。
(項目48)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目45に記載の方法。
(項目50)
前記薬学的薬剤が、前記レセプターのリガンドである、項目44に記載の使用。
(項目51)
前記薬学的薬剤が、前記レセプターのモジュレーターである、項目44に記載の使用。
(項目52)
アゴニスト、部分アゴニスト、逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目51に記載のモジュレーター。
(項目53)
逆アゴニストおよびアンタゴニストからなる群より選択される項目51に記載のモジュレーター。
(項目54)
RUP40 GPCRの活性を調節する方法であって、ここで、該レセプターは、Gタンパク質にカップリングし、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1、346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含み、該方法は、該レセプターを、項目51に記載のモジュレーターと接触させる工程を包含する、方法。
(項目55)
前記接触させる工程が、前記モジュレーターを、前記レセプターを含む個体に投与する工程を包含し、ここで、該個体は、心臓病の予防または治療を必要とする、項目54に記載の方法。
(項目56)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目55に記載の方法。
(項目57)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目55に記載の方法。
(項目58)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目57に記載の方法。
(項目59)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目55に記載の方法。
(項目60)
心臓病の予防または治療を必要とする個体において該心臓病を予防するか、または治療する方法であって、該方法は、治療上有効量の項目51に記載のモジュレーターをRUP40 GPCRと接触させる工程を包含し、該レセプターは、以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1、346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列であって、該核酸は、配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得られる、アミノ酸配列;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;または配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む、方法。
(項目61)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目60記載の方法。
(項目62)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目60記載の方法。
(項目63)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目62に記載の方法。
(項目64)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目60に記載の方法。
(項目65)
組成物を調製する方法であって、該方法は、モジュレーターを得る工程、次いで、キャリア、および該モジュレーターを混合する工程を包含し、ここで、該モジュレーターは、項目51に記載の使用に従う、方法。
(項目66)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目65に記載の方法。
(項目67)
項目51に記載のモジュレーターを含むか、項目51に記載のモジュレーターで実質的に構成されるか、または項目51に記載のモジュレーターで構成される薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目68)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目67に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物。
(項目69)
心臓病について予防するか、または治療する方法であって、該方法は、該予防または治療を必要とする個体に項目67に記載の薬学的または生理学的に受容可能な組成物を提供する工程または投与する工程を包含する、方法。
(項目70)
前記心臓病が、先天性心不全である、項目69記載の方法。
(項目71)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目69記載の方法。
(項目72)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目71に記載の方法。
(項目73)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目69に記載の方法。
(項目74)
心臓病についての予防または治療のための医薬を調製するための項目51に記載のモジュレーターを使用する方法。
(項目75)
前記心臓病が、鬱血性心不全である、項目74に記載の方法。
(項目76)
前記心臓病が、肥大型心筋症である、項目74に記載の方法。
(項目77)
前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、項目76に記載の方法。
(項目78)
前記心臓病が、先天性心臓欠陥である、項目74に記載の方法。
(項目79)
項目51に記載の前記モジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療に対して効果を有するか否かを同定するために、項目32に記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物を使用する方法であって、該方法は、以下の工程:
(a)該モジュレーターを項目32記載のトランスジェニック非ヒト哺乳動物に投与するか、または投与しない工程;
(b)該モジュレーターの投与が、以下:
(i)湿潤または乾燥心臓重量の低下;
(ii)湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率の低下;
(iii)心筋細胞の断面積の低下;および
(iv)ANF遺伝子の誘導のレベルの低下;
からなる群より選択される効果を有するか否かを決定する工程;
を包含し、ここで、該決定は、該モジュレーターが鬱血性心不全または肥大型心筋症の予防または治療に効果を有することを示す、方法。
(項目80)
前記モジュレーターが、逆アゴニストまたはアンタゴニストである、項目79に記載の方法。
(項目81)
前記個体が、哺乳動物である、項目7〜16、21〜25、55〜64、および69〜73のいずれか1項に記載の方法。
(項目82)
前記哺乳動物が、非ヒト哺乳動物である、項目81に記載の方法。
(項目83)
前記哺乳動物が、ヒトである、項目81に記載の方法。
出願人は、本発明の実施形態のいずれかからのいずれかの1以上の候補化合物を排除する権利を留保する。また、出願人は、本発明の実施形態のいずれかからのいずれかの1以上のモジュレーターを排除する権利を留保する。出願人は、さらに、本発明の実施形態のいずれかから、いずれかの1以上のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、または該ポリヌクレオチドまたは該ポリペプチドのいずれかの1以上のフラグメントを排除する権利を留保する。出願人は、加えて、本発明の実施形態のいずれかからいずれかの1以上の心血管障害を排除する権利を留保する。
本出願を通じて、種々の刊行物、特許および公表された特許出願が引用される。本出願中で言及されたこれらの刊行物、特許および公表された特許出願の開示は、ここで引用してその全体を本開示に一体化させる。公開、特許、または公開された特許出願の出願人によるここでの引用は、先行技術としての該刊行物、特許または公開された特許出願の出願人による自認ではない。
当業者の範囲内にある開示された発明の修飾および延長は、前記開示および後の請求の範囲に含まれる。
当業者の範囲内にある開示された発明の修飾および延長は、前記開示および後の請求の範囲に含まれる。
(詳細な説明)
(定義)
レセプターに関連する科学文献は、レセプターに対して種々の効果を有するリガンドに言及するのに多数の用語を採用している。明瞭性および整合性のため、以下の定義を本特許書類を通じて用いる。これらの定義がこれらの用語についての他の定義とコンフリクトする程度に、以下の定義が支配する。
(定義)
レセプターに関連する科学文献は、レセプターに対して種々の効果を有するリガンドに言及するのに多数の用語を採用している。明瞭性および整合性のため、以下の定義を本特許書類を通じて用いる。これらの定義がこれらの用語についての他の定義とコンフリクトする程度に、以下の定義が支配する。
アゴニストは、それがレセプターに結合した場合に細胞内応答を活性化する物質(例えば、リガンド、候補化合物)を意味する。いくつかの実施形態において、アゴニストは、それがレセプターに結合して(例えば、膜へのGTPγS結合を増強させ、または細胞内IP3レベルを増強させる)場合に細胞内応答を活性化することが従前には知られていなかった物質である。
本明細書中で用いるアミノ酸省略を表に記載する:
アンタゴニストは、アゴニストと同一の部位においてレセプターに競合的に結合するが、細胞内応答を活性化せず、従って、アゴニストによって誘導された細胞内応答を阻害することができる物質(例えば、リガンド、候補化合物)を意味する。アンタゴニストは、アゴニストの不存在下においてベースライン細胞内応答を減少させない。いくつかの実施形態において、アンタゴニストは、アゴニストと競合して、それらがレセプターに結合する場合、細胞応答を阻害することが従前には知られていなかった物質であり、例えば、ここで、該細胞応答は膜へのGTPγS結合、または細胞内IP3レベルの上昇である。
抗体とは、本明細書中においては、モノクローナル抗体およびポリクローナル抗体を含むことを意図する。抗体は、さらに、IgG、IgA、IgD、IgE、およびIgMを含むことを意図する。抗体は、一本鎖の全抗体を含めた全抗体、およびFab、Fab’、F(ab)2およびF(ab’)2を含めたその抗原結合フラグメントを含む。抗体はいずれの動物起源のものであってもよい。好ましくは、抗体はヒト、ネズミ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ハムスター、ラクダ、ラバ、ヒツジ、ウマまたはニワトリである。好ましくは、抗体は、5×10−6M、10−6M、5×10−7M、10−7M、5×10−8M、10−8M、5×10−9M、10−9M、5×10−10M、10−10M、5×10−11M、10−11M、5×10−12M、10−12M、5×10−13M、10−13M、5×10−14M、10−14M、5×10−15M、および10−15M未満の解離定数またはKd値を持つ結合親和性を有する。本発明の抗体は上記分野で知られたいずれかの適当な方法によって調製することができる。
生物学的に活性なフラグメントは、全長ポリペプチドまたはアミノ酸配列の機能の一部または全てを保持する全長ポリペプチドまたはアミノ酸配列のフラグメントを意味する。特別な実施形態において、全長GPCRポリペプチドまたはアミノ酸配列の活性なフラグメントは、全長GPCRポリペプチドまたはアミノ酸配列の機能の一部または全てを保持する。該GPCR機能は、限定されるものではないが、リガンド結合、Gタンパク質カップリング、およびGタンパク質へのリガンド−促進カップリングを含むと理解される。いくつかの実施形態において、該GPCR機能はGタンパク質カップリングである。いくつかの実施形態において、該GPCR機能はGタンパク質へのリガンド−促進カップリングである。限定されるものではなく、例として、生物学的に活性なフラグメントは、本明細書中において、N末端メチオニンが存在しない全長GPCRポリペプチドを含むことを意図する。
候補化合物は、スクリーニング技術に適応できる分子(限定されるものではないが、例えば、化学化合物)を意味する。候補化合物は、例えば、ポリペプチド、脂質、低分子、抗体、ポリヌクレオチドであり得る。
心駆出分画率は、単一収縮で左心室から拍出される血液の分率をいうために採用する。例えば、もし100mLの血液が左心室にあって、収縮に際して90mLが拍出されるならば、心駆出分画率は90%である。
心臓肥大は、心臓の筋肉(心筋)の肥大をいうために採用する。心臓肥大は、通常、必ずしも常ではないが、心筋に課された増大した血行動態的負荷に対する適合応答である。
心臓弁疾患は、病原性心臓血行動態をもたらす心臓中の弁の1以上の異常な構造または機能をいうために採用する。
コドンは、リン酸基に結合されたヌクレオシド[アデノシン(A)、グアノシン(G)、シチジン(C)、ウリジン(U)およびチミジン(T)]を一般に含み、翻訳された場合に、アミノ酸をコードする3つのヌクレオチド(またはヌクレオチドに対する同等体)のグループを意味する。
組成物は少なくとも1つの成分を含む物質を意味する。「薬学的組成物」は組成物の例である。
化合物の効率は、レセプターの機能を阻害し、または刺激する化合物の能力;すなわち、レセプター結合親和性とはコントロール的にシグナル変換経路を活性化し/阻害する能力の尺度を意味する。化合物効率を検出する例示的手段は、本特許書類の実施例のセクションに開示される。
を含む(comprising)、実質的になる(consinting essentially of)、およびなる(consinsting of)とは、本明細書中においては、その標準的意味に従って定義される。M.P.E.P.に記載された定義された意味は上記分野における定義された意味を支配し、連邦巡回裁判所判例に記載された定義された意味はM.P.E.P.に記載された意味を支配する。
先天性心臓欠陥とは、例えそれがかなり遅く発見されたとしても、誕生時に存在する心臓循環の構造または機能における異常をいう。
鬱血性心不全とは、血液を効果的に送液するその能力を心臓が失う障害をいう。鬱血性心不全は年齢をとると共により頻繁となる。虚血性心疾患は、鬱血性心不全の最も普通の原因であり、全ての場合の60〜70%を占める。12mmHgより大きな増大した静脈圧力は、25秒よりも長い循環時間と同等な心拍出量の低下のように、鬱血性心不全についての主なFramingham基準の1つである。
構成的に活性なレセプターは、そのリガンドまたはその化学的同等体へのレセプターへの結合を介する以外の手段によって活性な状態に安定化されたレセプターを意味する。構成的に活性なレセプターは内因性または非内因性であってよい。
構成的に活性化されたレセプターは、構成的に活性なように修飾されている内因性レセプターを意味する。
構成的レセプター活性化は、そのリガンドまたはその化学的同等体への結合の不存在下におけるレセプターの活性化を意味する。
接触、または接触するとはインビトロ系であるかまたはインビトロ系であるかを問わず、少なくとも二つの存在を一緒にすることを意味する。
減少(decrease)は、測定可能な量の低下をいうのに用いられ、用語「低下(reduce)」、「減少(diminish)」、「降下(lower)」、および「少量化(lessen)」と同義に用いられる。
超音波心臓検査とは、超音波を用いて、生きた動物において心臓の構造および機能を測定する方法をいうのに採用される。限定するものではなく例として、超音波心臓検査は肥大した心臓の測定で用いることができる。
内因性とは、哺乳動物が天然で生産する物質を意味する。限定されるものではなく例えば、用語「レセプター」に関する内因性は、哺乳動物(限定されるものではないが例えばヒト)によって天然で生産されることを意味する。内因性は、遺伝子の対立遺伝子改変体ならびにそのようにコードされた対立遺伝子ポリペプチド改変体を含むと理解される。コントロール的に、この意味において用語非−内因性とは、哺乳動物(限定されるものではないが例えば、ヒト)によって天然で生産されないことを意味する。例えば、限定されるものではないが、構成的に活性となるように操作される場合を除き、その内因性形態では構成的に活性ではないレセプターは、もっとも好ましく、本明細書中においては「非−内因性の構成的に活性化されたレセプター」をいう。
肥大した心臓は、心室壁の厚みの増大(身体サイズに基づく正常な範囲を超える)をいうのに採用される。
発現ベクターは、本明細書中においては、上記発現ベクター用の適当な宿主細胞組換体においてクローン化されたDNAの転写および転写されたmRNAの翻訳に必要なDNA配列として定義される。適当に構築された発現ベクターは、宿主細胞中での自律複製のための複製起点、選択マーカー、限定された数の有用な制限酵素部位、高コピー数の可能性、および活性なプロモーターを含有すべきである。転写すべき該クローン化されたDNAは、上記発現ベクター内の構成的にまたは条件付きで活性なプロモーターに操作可能に連結される。限定されるのではなくその例として、pCMVは発現ベクターである。
本明細書中で開示する発明の関係では、Gタンパク質共役型レセプター融合タンパク質およびGPCR融合タンパク質は、各々、少なくとも一つのGタンパク質、もっとも好ましくはそのようなGタンパク質のアルファ(α)サブユニット(これは、GTPに結合するサブユニットである)に融合した内因性の構成的に活性なGPCR、または非−内因性の構成的に活性化されたGPCRを含む非内因性タンパク質を意味し、Gタンパク質は好ましくは内因性GPCRに天然でカップリングするGタンパク質と同一のタイプである。例えば、限定されるものではないが、内因性状態においては、もしGタンパク質「Gsα」がGPCRとカップリングする支配的Gタンパク質であれば、特異的GPCRに基づきGPCR融合タンパク質は、Gsαに融合したGPCRを含む非内因性タンパク質であろう;いくつかの状況においては、以下に記載するように、非支配的Gタンパク質はGPCRに融合させることができる。Gタンパク質には構成的に活性なGPCRのC末端に直接的に融合することができるか、あるいは二つの間にスペーサーがあり得る。
血行動態は、循環系を通じての血液の運動、およびそれに関連する力に関するように採用される。限定されるものではなくその例として、心筋に課される上昇した要求をもたらす保持された血行動態摂動は、心臓肥大の結果となる。あるいは、心筋の細胞内の遺伝的異常は、血行動態とは独立した心臓肥大をもたらし得る。限定されるものではなくその例として、筋節タンパク質における突然変異のような遺伝性疾患は家族性肥大型心筋症をもたらす[例えば、Bashyam et al.、J Hum Genet(2003)48:55−64参照]。
宿主細胞は、その中に取り込まれた発現ベクターを有することができる細胞を意味する。該取り込みは、限定されるものではなくその例として、形質転換、トランスフェクションまたは感染を通じて起こり得る。いくつかの実施形態において、宿主細胞は真核生物、より好ましくは哺乳動物であり、より好ましくは、293.293T.CHOおよびCOS−7細胞からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、宿主細胞は心筋細胞である。他の実施形態において、宿主細胞は真核生物、より好ましくはメラノフォアである。
肥大型心筋症は、心筋を形成する細胞のサイズの増加による心臓の肥大をいうために採用される。
本明細書中で用いられる予防または治療が必要とは、本明細書中においては、個体または動物が処置を必要とする、または処置が有益である世話人(例えば、ヒトにおける医師、看護士、看護従事者等;非ヒト哺乳動物を含めた動物の場合には獣医)によってなされる判断をいう。この判断は、世話人の技量の範囲にあるが、個体または動物が病気である、または病気になりうるという知識を含む種々の因子に基づき、本発明の化合物によって治療できる疾患の結果としてなされる。
増加した静脈圧は、循環系の弱化によって引き起こされたそこでの血液のプーリングによる静脈系(静脈)で発生する上昇した血圧をいうように採用される。
本明細書中で用いる個体は、哺乳動物を含めたいずれの動物も、好ましくはマウス、ラット、他のげっ歯類、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタ、ウシ、ヒツジ、ウマ、または霊長類、もっとも好ましくはヒトをいう。
用語「応答」との関係で、阻害する、または阻害しているとは、化合物の不存在下におけるのとは反対に、化合物の存在下で応答が減少し、または妨げられることを意味する。
逆アゴニストは、内因性形態、またはレセプターの構成的に活性化された形態いずれかに結合して、アゴニストの不存在下で観察されたレセプターのベースライン細胞内応答を低下させる物質(例えば、リガンド、候補化合物)を意味する。
虚血性心疾患とは、心臓の組織への酸素の欠如によって引き起こされる障害をいい、ここで、心筋は影響され、心臓は適切には拍出できない。虚血性心疾患は、合衆国における最も一般的な心筋症である。
単離されたとは、その元来の環境(例えば、もしそれが天然で生じるならば天然環境)から物質が取り出されていることを意味する。例えば、生きた動物に存在する天然に生じるポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されていないが、天然系において共存する物質のいくらかまたは全てから分離された同一のポリヌクレオチドまたはDNAまたはポリペプチドは単離されている。そのようなポリヌクレオチドはベクターの一部でありおよび/またはそのようなポリヌクレオチドまたはポリペプチドは組成物の一部であり、ベクターまたは組成物がその天然環境の一部ではない点で依然として単離されている。
リガンドはGPCRに特異的に結合する分子を意味する。リガンドは、例えば、ポリペプチド、脂質、低分子および抗体であり得る。内因性リガンドは天然GPCRについての内因性天然リガンドである。リガンドはGPCRの「アンタゴニスト」、「アゴニスト」、「部分的アゴニスト」または「逆アゴニスト」などであり得る。
本明細書中で用いるように、用語調節または修飾とは、特定の活性の量、質、または効果、機能または分子の増加または減少をいう。
心筋梗塞とは、その領域への酸素の不適切な供給による心筋の領域の損傷または死滅をいう。心筋梗塞は、しばしば、冠動脈(血液および酸素を心筋に運ぶ血管)の一つをブロックする血餅によって引き起こされる。血餅が、血液および酸素が心臓のその領域に到達するのを妨げ、その領域における心臓細胞の死滅に至る。
心筋炎は、細菌、ウィルスまたは未知の病原体の心筋の炎症をいうために採用される。
オーファンレセプターは、そのレセプターに特異的な内因性リガンドが同定されていない、または知られていない内因性レセプターを意味する。
部分的アゴニストは、それが十分なアゴニストが行う程度よりも低くレセプターに結合する場合に細胞内応答を活性化させる物質(例えば、リガンド、候補化合物)を意味する。
薬学的薬剤は、薬学的組成物中の有効成分として用いることができる化合物を意味する。
薬学的組成物は、少なくとも一つの有効成分を含み、それにより、上記組成物は哺乳動物(例えば、限定されるものではないがヒト)において特定の効果的な結果のための調査に使用できる組成物を意味する。当業者であれば、有効成分が当業者の要求に基づく所望の効果的な結果を有するか否かを判断するのに適当な技術を理解し、認識するであろう。
ポリヌクレオチドは、一本鎖またはデュプレクス形態のいずれかである1を超えるヌクレオチドのRNA、DNA、またはRNA/DNAハイブリッド配列を意味する。本発明のポリヌクレオチドは、合成、組換え、エクス・ビボ生成、その組み合わせを含めたいずれかの公知の方法によって、ならびに上記分野で知られたいずれかの精製方法を利用して調製することができる。
ポリペプチドは、ポリマーの長さには関係せずアミノ酸のポリマーをいう。かくして、ペプチド、オリゴペプチド、およびタンパク質はポリペプチドの定義内に含まれる。この用語は、ポリペプチドの発現後修飾を特定せず、または排除しない。例えば、グリコシル基、アセチル基、リン酸基、脂質基などの共有結合を含むポリペプチドは用語ポリペプチドに明示的に含まれる。
(心筋梗塞後リモデリング)
心筋梗塞による心筋組織の喪失は、心室に課される維持された過剰の血行動態負荷をもたらす。心室肥大は、心臓が増大した負荷を補償する主なメカニズムの一つを構成する。しかしながら、血行動態過剰負荷に直面して心臓性能を維持するためのこの適合の能力は有限であり、慢性的に維持される場合、適合不良となる。徐々に、適合した肥大表現型は、肥大した心室が暫時膨張し、収縮機能が弱まるにつれ、明白な心不全に転じる。心臓における心筋梗塞に対する適合したおよび適合不良の応答の自然歴を「リモデリング」という。
心筋梗塞による心筋組織の喪失は、心室に課される維持された過剰の血行動態負荷をもたらす。心室肥大は、心臓が増大した負荷を補償する主なメカニズムの一つを構成する。しかしながら、血行動態過剰負荷に直面して心臓性能を維持するためのこの適合の能力は有限であり、慢性的に維持される場合、適合不良となる。徐々に、適合した肥大表現型は、肥大した心室が暫時膨張し、収縮機能が弱まるにつれ、明白な心不全に転じる。心臓における心筋梗塞に対する適合したおよび適合不良の応答の自然歴を「リモデリング」という。
プライマーは、本明細書中においては、標的ヌクレオチド配列に相補的であって、標的ヌクレオチド配列にハイブリダイズするのに用いられる特異的オリゴヌクレオチド配列を示すように用いられる。プライマーは、DNAポリメラーゼ、RNAポリメラーゼ、または逆転写酵素によって触媒されるヌクレオチド重合のための開始点として働く。
精製されたとは、本明細書中においては、限定されるのではないが、他の核酸、炭水化物、脂質および(ポリヌクレオチドの合成で用いられる酵素のような)タンパク質を含めた他の化合物から分離されている本発明のポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドベクターを記載するのに用いられる。少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約75%、または少なくとも約90%のサンプルが単一のポリヌクレオチド配列を含む場合に、ポリヌクレオチドは実質的に純粋である。実質的に純粋なポリヌクレオチドは、典型的には、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約95%、または約99%重量/核酸サンプルの重量を含む。ポリヌクレオチドの純度または均質性は、例えばサンプルのアガロースまたはポリアクリルアミドゲル電気泳動のような上記分野でよく知られた多数の手段により、続いて、ゲルを染色するに際して単一のポリヌクレオチドバンドを可視化することによって示すことができる。
同様に、用語精製されたとは、本明細書中においては、限定されているものではないが、核酸、脂質、炭水化物および他のタンパク質を含めた他の化合物から分離されている本発明のポリペプチドを記載するために本発明で用いられる。いくつかの好ましい実施形態において、ポリペプチドは、サンプルのポリペプチド分子の少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約75%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%または少なくとも約99.5%が単一アミノ酸配列を有する場合に実質的に純粋である。いくつかの好ましい実施形態において、実質的に純粋なポリペプチドは、典型的には、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%または約99.5%重量/タンパク質サンプルの重量を含む。ポリペプチドの純度または均質性はサンプルのアガロースまたはポリアクリルアミドゲル電気泳動のような上記分野でよく知られた多数の方法、続いて、ゲルを染色する際に単一ポリペプチドバンドを可視化することによって示される。
同様に、用語精製されたとは、本明細書中においては、発現ベクターで形質転換された、トランスフェクトされた、または感染された宿主細胞の集団を記載するのに用いられる。いくつかの好ましい実施形態においては、該集団は、該形質転換され、トランスフェクトされ、または感染された宿主細胞の少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%を含む。
同様に、用語精製されたとは、本明細書中においては、組換えポリペプチドを発現する宿主細胞の集団を記載するのに用いられる。いくつかの好ましい実施形態においては、該集団は、該組換えポリペプチドを発現する該宿主細胞の少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なくとも約99%を含む。
さらに、本明細書中で用いるように、用語精製されたとは、絶対的な純度を求めるのではなく;むしろ、相対的な定義を意図している。
レセプター機能とは、限定されるものではないが、遺伝子転写の調節、イオンの流入または流出の調節、触媒反応の実行、および/またはGタンパク質を介する活性の調節を含めた、細胞において刺激を受け取り、効果を適度にするレセプターの正常な操作をいう。
低下した心拍出量は、心臓の心室の各収縮に伴い、より少量の血液が循環系(動脈)に拍出されるように、心不全により減少した拍出能力をいうために採用される。
二次メッセンジャーは、レセプター活性化の結果として生じた細胞内応答を意味する。二次メッセンジャーは、例えば、イノシトール三リン酸(IP3)、ジアシルグリセロール(DAG)、環状AMP(cAMP)、環状GMP(cGMP)、MAPキナーゼ活性、MAPK/ERKキナーゼキナーゼ−1(MEKK1)活性、およびCa2+を含むことができる。二次メッセンジャー応答はレセプター活性化の決定のために測定することができる。加えて、二次メッセンジャー応答は、例えば、逆アゴニスト、部分的アゴニスト、アゴニストおよびアンタゴニストを含めた候補化合物の同定のために測定することができる。
シグナル/ノイズ比率とは、活性化、増幅または刺激に応答して生じたシグナルを意味し、ここで、シグナルはバックグラウンドノイズ、または非−活性化、非−増幅、または非刺激に応答しての基礎レベルを超える。
低分子は、ペプチド、ペプチドミメティック、アミノ酸、アミノ酸アナログ、ポリヌクレオチド、ポリヌクレオチドアナログ、ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ、有機化合物または無機化合物(すなわち、ヘテロ有機化合物または有機金属化合物を含む)、およびその塩、エステルおよび他の薬学的に受容可能な形態を含めた、1モル当たり約10、000グラム未満の分子を有する化合物を意味するように採用される。ある好ましい実施形態においては、低分子は、1モル当たり約5,000グラム未満の分子量を有する有機または無機化合物である。ある好ましい実施形態においては、低分子は1モル当たり約1,000グラム未満の分子量を有する有機または無機化合物である。ある好ましい実施形態において、低分子は、1モル当たり約500グラム未満の分子量を有する有機または無機化合物である。
スペーサーは、注目するGタンパク質の開始コドンまたは開始領域の前を除いた、遺伝子、例えば注目するGPCRの最後のコドンまたは最後のアミノ酸後に位置するアミノ酸の翻訳された数を意味し、ここで、アミノ酸の翻訳された数は注目するGタンパク質の開始領域とイン−フレームにて置かれる。翻訳されたアミノ酸の数は1、2、3、4、など、12までであり得る。
用語「応答」との関係で、刺激する、または刺激しつつあるとは、化合物の不存在下におけるのとは反対に、化合物の存在下で応答が増加することを意味する。
被験体は、限定されるものではないが、ヒトおよびヒヒを含めた霊長類、ならびにイヌおよびネコのようなペット動物、ラットおよびマウスのような実験的動物、およびウマ、ヒツジおよびウシのような農場動物を意味する。
(持続した心後負荷)
後負荷は、心臓から循環系への血液の流れに対する抵抗性の尺度である。高い全身血圧または大動脈の異常な狭化(縮窄)は心臓に課される後負荷を増加させる。
後負荷は、心臓から循環系への血液の流れに対する抵抗性の尺度である。高い全身血圧または大動脈の異常な狭化(縮窄)は心臓に課される後負荷を増加させる。
本明細書中で用いる治療上有効量とは、研究者、獣医、医療医師または他の臨床家によって求められている、組織、系、動物、個体またはヒトにおいて生物学的または医学的応答を誘導する活性化合物または薬学的薬剤の量をいい、これは、以下のうちの一以上を含む;
(1)病気の予防;例えば、病気、疾患または障害に対して素因があり得るが、病気の病理学または徴候学を未だ経験または表示しない個体において病気、疾患または障害を予防すること、
(2)病気の阻害;例えば、病気、疾患または障害の病理学または徴候学を経験している、または表示している個体において病気、疾患、または障害を阻害すること(すなわち、病理学および/または徴候学のさらなる発展の組織)、および
(3)病気の軽減;例えば、病気、疾患または障害の病理学または徴候学を経験または表示している個体において病気、疾患または障害を軽減すること(すなわち、病理学および/または徴候学の逆行)。
(1)病気の予防;例えば、病気、疾患または障害に対して素因があり得るが、病気の病理学または徴候学を未だ経験または表示しない個体において病気、疾患または障害を予防すること、
(2)病気の阻害;例えば、病気、疾患または障害の病理学または徴候学を経験している、または表示している個体において病気、疾患、または障害を阻害すること(すなわち、病理学および/または徴候学のさらなる発展の組織)、および
(3)病気の軽減;例えば、病気、疾患または障害の病理学または徴候学を経験または表示している個体において病気、疾患または障害を軽減すること(すなわち、病理学および/または徴候学の逆行)。
本明細書中で用いる用語としての改変体は、各々、参照ポリヌクレオチドまたはポリペプチドとは異なるが、本質的な特性を保持するポリヌクレオチドまたはポリペプチドである。ポリヌクレオチドの典型的な改変体は、もう一つの参照ポリヌクレオチドとはヌクレオチド配列が異なる。改変体のヌクレオチド配列の変化は、参照ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列を変化させてもさせなくてもよい。ポリペプチドの典型的な改変体は、もう一つの参照ポリペプチドとはアミノ酸配列が異なる。改変体および参照ポリペプチドは、いずれかの組合せにて一以上の置換、付加、欠失によってアミノ酸配列が異なり得る。ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの改変体は対立遺伝子改変体のような天然で起こるものであってよいか、またはそれは天然で生じることが知られていない改変体であり得る。ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの非天然改変体は、突然変異誘発技術によって、または直接的合成によってなすことができる。
心室容量は、心臓の左および右心室の内部寸法の尺度をいうために採用される。心不全においては、心室の肥大である。
(A.導入)
以下のセクションの順序は表象的な効率のために記載され、開示または後の請求の範囲を制限することを意図せず、またはそのように解釈されるべきではない。
以下のセクションの順序は表象的な効率のために記載され、開示または後の請求の範囲を制限することを意図せず、またはそのように解釈されるべきではない。
(B.レセプター発現)
(1.注目するGPCRポリペプチド)
本発明のRUP40 GPCRは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることでき;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むことができる。
(1.注目するGPCRポリペプチド)
本発明のRUP40 GPCRは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることでき;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むことができる。
本発明のRUP40 GPCRは配列番号2または4のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメントを含むことができる。本発明のRUP40 GPCRは配列番号2または4のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、または配列番号2または4のアミノ酸配列の該生物学的に活性なフラグメントを含むことができる。
いくつかの実施形態において、配列番号2または4のRUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは、全長RUP40 GPCRのアミノ酸間隔「n1〜n2」から選択されるN末端アミノ酸、および全長RUP40 GPCRのアミノ酸「c」に固定されたC末端アミノ酸を持つフラグメントの組を表す、式「n1−n2」〜「c」によって供される群から選択される。いくつかの実施形態において、「n1」は全長RUP40 GPCRのアミノ酸2であり、「n2」は、GPSドメイン内の予測されるタンパク質分解切断の近似的部位に対してC末端側のアミノ酸であって、「c」は全長RUP40 GPCRのC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=2、n2=994、およびc=1,349である。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号2のアミノ酸2〜1,346、22〜1,346、227〜1,346、および991〜1,346から選択され、ここで、アミノ酸22は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸227はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸991はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、RUP40 GPCRの該生物学的に活性なフラグメントは配列番号4のアミノ酸2〜1,349、25〜1,349、224〜1,349、および994〜1,349から選択され、ここで、アミノ酸25は予測されたシグナルペプチド切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸224はSEAモジュール内の予測されたタンパク質分解切断の近似的部位であると理解され、アミノ酸994はGPSドメイン内の予測されたタンパク質分解の近似的部位であると理解される。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=22、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号2のRUP40 GPCRにつきn1=227、n2=991、およびc=1,346である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=25、n2=994、およびc=134,9である。いくつかの実施形態において、配列番号4のRUP40 GPCRにつきn1=224、n2=994、およびc=1,349である。
GPCRの構成的に活性化された変異体の作製方法は当業者の範囲内にある(例えば、1998年10月22日にWO98/46995として公開されたPCT出願番号PCT/US98/07496;および米国特許第6、555、339号参照;その開示をここで引用してその全体を援用する)。
配列番号2、4または6のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内に考えられる。限定されるものではなく例として、配列番号2のアミノ酸位置604のメチオニンの代わりにスレオニンの置換を含み、配列番号2のアミノ酸位置801にバリンの代わりにイソロイシンの置換を含み、または配列番号2のアミノ酸位置856のスレオニンの代わりにメチオニンの置換を含む配列番号2のRUP40 GPCRの対立遺伝子改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。ある実施形態においては、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸配列の対立遺伝子改変体を含むことができる。ある実施形態において、配列番号2のアミノ酸配列の対立遺伝子改変体は、特異的プライマー配列番号7および配列番号8を用いてヒトDNAサンプルに対してポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる内因性RUP40 GPCRヌクレオチド配列によってコードされる。いくつかの実施形態において、配列番号2のアミノ酸配列の対立遺伝子改変体は、配列番号7を含む特異的プライマーおよび配列番号8を含む特異的プライマーを用いてヒトDNAサンプルに対してポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる内因性RUP40 GPCRヌクレオチド配列によってコードされる。
配列番号2のヒトRUP40 GPCRの哺乳動物オルソログは本発明の範囲内にあると考えられる。いくつかの実施形態において、該哺乳動物オルソログはマウスRUP40、ラットRUP40、ブタRUP40、および非ヒト霊長類RUP40を含む。
以下:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。パーセント同一性は公知コンピュータプログラムを用いて慣用的に決定することができる。
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
(e)内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができ;
(f)配列番号4のアミノ酸1〜1,349;
(g)配列番号4のアミノ酸1〜993;
(h)配列番号4のアミノ酸994〜1,349;
(i)配列番号4のアミノ酸954〜1000;および
(j)配列番号6のアミノ酸1〜141;
からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.1%、少なくとも99.2%、少なくとも99.3%、少なくとも99.4%、少なくとも99.5%、少なくとも99.6%、少なくとも99.7%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%同一であるアミノ酸配列を含む該RUP40 GPCRの改変体は本発明の範囲内にあると考えられる。パーセント同一性は公知コンピュータプログラムを用いて慣用的に決定することができる。
ある実施形態において、対象の方法で用いることができるRUP40 GPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、少なくとも約99.1%、少なくとも約99.2%、少なくとも約99.3%、少なくとも約99.4%、少なくとも約99.5%、少なくとも約99.6%、少なくとも約99.7%、少なくとも約99.8%、または少なくとも約99.9%同一であるアミノ酸配列を含むことができ、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーおよび配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約95%同率のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約96%同一であるアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約97%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約98%同一性アミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.1%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.2%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.3%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.4%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.5%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.6%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.7%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.8%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、または内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約99.9%同一性のアミノ酸配列を含み、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して少なくとも、例えば、95%「同一性」を有するアミノ酸配列とは、それが、配列番号2のアミノ酸1〜1,346のうちの各100アミノ酸当たり5つまでのアミノ酸変化を含んでよい以外は配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して、あるいは内因性RUP40レセプターをコードする核酸によってコードされるアミノ酸配列に対して同一であることを意味し、該核酸配列は配列番号7に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマー、および配列番号8に記載されたヌクレオチド配列を含む特異的プライマーを使用してヒトcDNAサンプルに対するポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行うことによって得ることができる。かくして、例えば、配列番号2のアミノ酸1〜1,346に対して少なくとも95%同一性を有するアミノ酸配列を得るためには、配列番号2のアミノ酸1〜1,346と比較して、該配列中のアミノ酸残基の5%(100のうち5)までを挿入し、欠失し、またはもう1つのアミノ酸で置換することができる。これらの変化は、アミノまたはカルボキシ末端で、あるいはそれらの末端位置の間で起こることができ、該配列中の残基の間で個々に、または該配列内の1以上の連続基において散在させ得る。
ある実施形態において、対象の方法で用いることができるRUP40 GPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、少なくとも約99.1%、少なくとも約99.2%、少なくとも約99.3%、少なくとも約99.4%、少なくとも約99.5%、少なくとも約99.6%、少なくとも約99.7%、少なくとも約99.8%、または少なくとも約99.9%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約95%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約96%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約97%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約98%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.1%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.2%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.3%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.4%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.5%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.6%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.7%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.8%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。ある実施形態において、対象の方法で用いることができるGPCRは、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも約99.9%同一であるアミノ酸配列を含むことができる。配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも、例えば、95%「同一性」を有するアミノ酸配列とは、アミノ酸配列が、それが、配列番号2のアミノ酸991〜1,346の各100アミノ酸当たり5つまでのアミノ酸変化を含むことができる以外は、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して同一であることを意味する。かくして、配列番号2のアミノ酸991〜1,346に対して少なくとも95%同一性を有するアミノ酸配列を得るためには、配列番号2のアミノ酸991〜1,346と比較して、該配列中のアミノ酸残基の5%(100のうちの5)までを挿入し、欠失し、またはもう1つのアミノ酸で置換することもできる。これらの変化はアミノまたはカルボキシ末端において、あるいはそれらの末端位置の間のどこかで起こることができ、該配列中の残基の間で個々に、あるいは該配列内の1以上の連続基において散在させることができる。
いくつかの実施形態において、対象の方法で用いることができるRUP40 GPCRは、ストリンジェントな条件下で、配列番号1に記載された配列を有するフィルター−結合DNAにハイブリダイズするポリヌクレオチドの配列に対して相補的な配列によってコードされたGタンパク質共役型レセプターのアミノ酸配列を含む。ハイブリダイゼーション技術は当業者によく知られている。好ましいストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、50%ホルムアミド、5×SSC(150mM NaCl、15mMクエン酸三ナトリウム)、50mMリン酸ナトリウム(pH7.6)、5×デンハルトの溶液、10%硫酸デキストラン、および20μg/mLの変性され、剪断された鮭精子DNAを含む溶液中での42℃における一晩のインキュベーション;引き続いての、約65℃における0.1〜0.2×SSCにおける上記フィルターの洗浄を含む。
(a.配列同一性)
いくつかの実施形態において、2つのアミノ酸配列の間のパーセント同一性を決定するための方法は、Brutlag et al.[Comp App Biosci(1990)6:237−245;その開示をここで引用してその全体を援用する]のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータプログラムを用いて、全体的配列整列ともいう、問い合わせ配列(例えば、配列番号2のアミノ酸配列)および質問すべき配列の間の最良の総じてのマッチを決定する方法である。配列整列においては、問い合わせおよび質問配列は共にアミノ酸配列である。該全体的配列整列の結果は、パーセント同一性で表される。FASTDBアミノ酸整列で用いられる好ましいパラメータは:マトリックス=PAM 0、k−tuple=2、ミスマッチペナルティ=1、接合ペナルティ=20、ランダム化グループ25、長さ=0、カットオフスコア=1、ウィンドウサイズ=配列の長さ、ギャップペナルティ=5、ギャップサイズペナルティ=0.05、ウィンドウサイズ=247または質問されたアミノ酸配列の長さのいずれか短い方である。
いくつかの実施形態において、2つのアミノ酸配列の間のパーセント同一性を決定するための方法は、Brutlag et al.[Comp App Biosci(1990)6:237−245;その開示をここで引用してその全体を援用する]のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータプログラムを用いて、全体的配列整列ともいう、問い合わせ配列(例えば、配列番号2のアミノ酸配列)および質問すべき配列の間の最良の総じてのマッチを決定する方法である。配列整列においては、問い合わせおよび質問配列は共にアミノ酸配列である。該全体的配列整列の結果は、パーセント同一性で表される。FASTDBアミノ酸整列で用いられる好ましいパラメータは:マトリックス=PAM 0、k−tuple=2、ミスマッチペナルティ=1、接合ペナルティ=20、ランダム化グループ25、長さ=0、カットオフスコア=1、ウィンドウサイズ=配列の長さ、ギャップペナルティ=5、ギャップサイズペナルティ=0.05、ウィンドウサイズ=247または質問されたアミノ酸配列の長さのいずれか短い方である。
内部欠失のためではなく、N−またはC末端欠失のために問い合わせ配列よりも質問配列が短いならば、パーセント同一性で表した結果は手動で修正しなければならない。なぜならば、FASTDBプログラムは、全体的パーセント同一性を計算する場合に、質問配列のN−およびC末端切形を考慮しないためである。N−およびC末端で切形された質問配列については、問い合わせ配列に対して、問い合わせ配列の合計bsesのパーセントとして、対応する質問配列の残基とマッチ/整列しない、質問配列のN−およびC末端である問い合わせ配列の残基の数を計算することによってパーセント同一性は修正される。残基がマッチ/整列したか否かは、FASTDB配列整列の結果によって決定される。次いで、このパーセンテージを、特定のパラメータを用いて前記FASTDBプログラムによって計算されたパーセント同一性から差し引いて、最終のパーセント同一性スコアに到達する。この最終パーセント同一性スコアは、本発明の目的のために用いられるものである。問い合わせ配列とマッチ/整列しない、質問配列のN−およびC末端に対する残基のみが、パーセント同一性スコアを手動で調整する目的と考えられる。すなわち、質問配列の最も遠いN−およびC末端残基の外側の問い合わせアミノ酸残基のみである。
例えば、90アミノ酸残基の質問配列を100−残基の問い合わせ配列と整列させて、パーセント同一性配列を決定する。欠失は質問配列のN末端で起こり、従って、FASTDB整列はN末端の最初の残基とはマッチ/整列しない。10の不対残基は配列の10%を表し(マッチしないN−およびC末端における残基の数/問い合わせ配列中の残基の合計数)、従って、FASTDBプログラムによって計算されたパーセント同一性スコアから10%を差し引く。もし残りの90残基が完全にマッチすれば、最終のパーセント同一性は90%となろう。
もう1つの例において、90−残基の質問配列の100−残基の問い合わせ配列と比較する。この時、欠失は内部にあり、従って、問い合わせとマッチ/整列しない残基は質問配列のN−またはC末端にはない。この場合、FASTDBによって計算されたパーセント同一性は手動で修正されない。もう一度、手動で問い合わせ配列とマッチ/整列しない、FASTDB整列で表示されるように、対象の配列のN−およびC末端の外側である残基位置のみが手動で修正される。他の修正は本発明目的ではなされない。
(b.融合タンパク質)
ある実施形態において、注目するポリペプチドは融合タンパク質であって、例えば、アフィニティータグドメインまたはレポータードメインを含むことができる。適当なアフィニティータグは、もう1つの部位、通常はもう1つのポリペプチド、最も通常には抗体に対して特異的に結合することができるいずれかのアミノ酸配列を含む。適当なアフィニティータグは、上記分野で知られているように、エピトープタグ、例えば、V5タグ、FLAGタグ、(ヘマグルチミンインフルエンザウィルスからの)HAタグ、mycタグ等を含む。適当なアフィニティータグは、上記分野で知られているように、結合基質が知られているドメイン、例えば、HIS、GSTおよびMBPタグ、および特異的結合パートナー、例えば、抗体、特にモノクローナル抗体が入手できる他のタンパク質からのドメインも含む。適当なアフィニティータグは、特異的に結合することができ、適当な結合パートナー、例えば、IgG Fcレセプターを用いて検出することができる、IgG Fc領域のようないずれかのタンパク質−タンパク質相互作用ドメインも含む。そのような融合タンパク質が、欠失された、または別のアミノ酸で置換されたいずれかのそのN末端メチオニン残基を有するGPCRとイン−フレーム融合した異種N末端ドメイン(例えば、エピトープタグ)を含むことができると明示的に考えられる。
ある実施形態において、注目するポリペプチドは融合タンパク質であって、例えば、アフィニティータグドメインまたはレポータードメインを含むことができる。適当なアフィニティータグは、もう1つの部位、通常はもう1つのポリペプチド、最も通常には抗体に対して特異的に結合することができるいずれかのアミノ酸配列を含む。適当なアフィニティータグは、上記分野で知られているように、エピトープタグ、例えば、V5タグ、FLAGタグ、(ヘマグルチミンインフルエンザウィルスからの)HAタグ、mycタグ等を含む。適当なアフィニティータグは、上記分野で知られているように、結合基質が知られているドメイン、例えば、HIS、GSTおよびMBPタグ、および特異的結合パートナー、例えば、抗体、特にモノクローナル抗体が入手できる他のタンパク質からのドメインも含む。適当なアフィニティータグは、特異的に結合することができ、適当な結合パートナー、例えば、IgG Fcレセプターを用いて検出することができる、IgG Fc領域のようないずれかのタンパク質−タンパク質相互作用ドメインも含む。そのような融合タンパク質が、欠失された、または別のアミノ酸で置換されたいずれかのそのN末端メチオニン残基を有するGPCRとイン−フレーム融合した異種N末端ドメイン(例えば、エピトープタグ)を含むことができると明示的に考えられる。
適当なレポータードメインは、ポリペプチドの存在を報告することができるいずれのドメインも含む。アフィニティータグを用いて、例えば、タグに特異的に結合する標識された抗体を用いてポリペプチドの存在を報告することができると認識されるが、発光レポータードメインがより通常には用いられる。適当な発光レポータードメインは(例えば、蛍、Vargula、Renilla reniformisまたはRenilla muelleriからの)ルシフェラーゼ、またはその発光改変体を含む。他の適当なレポータードメインは(例えば、クラゲ、サンゴ、およびAequoria、Renilla、Ptilosarcus、Stylatula種からのもののような他の腔腸動物からの)蛍光タンパク質、またはその発光改変体を含む。これらのレポータータンパク質の発光改変体は上記分野で非常によく知られており、天然レポータータンパク質と比較して、より明るく、より暗くすることができ、あるいは異なる励起および/または発光スペクトルを有することができる。例えば、上記分野で知られているように、いくつかの改変体は、それらがもはや緑色には見えず、青色、シアン色、黄色、増強された黄色赤(各々、BFP、CFP、YFP eYFPおよびRFPという)に見えることができ、または他の発光スペクトルを有するように変化される。他の適当なレポータードメインは、β−ガラクトシダーゼ、β−グルクロニダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、および分泌された胚性アルカリ性ホスファターゼのような、生化学または色変化を通じてポリペプチドの存在を報告することができるドメインを含む。
また上記分野で知られているように、アフィニティータグまたはレポータードメインは注目するポリペプチド中のいずれの位置に存在させることもできる。しかしながら、ほとんどの実施形態において、それは注目するポリペプチドのC−またはN末端に存在させる。
(2.注目するGPCRポリペプチドをコードする核酸)
核酸を操作するための遺伝子暗号および組換え技術、および前記したように注目するGPCRポリペプチドのアミノ酸配列は公知であるため、注目するGPCRポリペプチドをコードする核酸の組換えおよび生産は当業者の十分に技量内のものである。ある実施形態においては、標準的な組換えDNA技術(Ausubel,et al.,Short Protocols in Molecular Biology,第3版,Wiley & Sons,(1995);Sambrook,et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第二版,(1989)Cold Spring Harbor,N.Y.)方法が用いられる。例えば、GPCRコーディング配列は、本明細書中に記載する必要がない種々の組換え方法のいずれか1つ、またはその組合せを用いてGPCRコーディング配列のライブラリーから単離することができる。また、タンパク質をコードする核酸配列におけるヌクレオチドの引き続いての置換、欠失および/または付加を標準的な組換えDNA技術を用いて行うこともできる。
核酸を操作するための遺伝子暗号および組換え技術、および前記したように注目するGPCRポリペプチドのアミノ酸配列は公知であるため、注目するGPCRポリペプチドをコードする核酸の組換えおよび生産は当業者の十分に技量内のものである。ある実施形態においては、標準的な組換えDNA技術(Ausubel,et al.,Short Protocols in Molecular Biology,第3版,Wiley & Sons,(1995);Sambrook,et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第二版,(1989)Cold Spring Harbor,N.Y.)方法が用いられる。例えば、GPCRコーディング配列は、本明細書中に記載する必要がない種々の組換え方法のいずれか1つ、またはその組合せを用いてGPCRコーディング配列のライブラリーから単離することができる。また、タンパク質をコードする核酸配列におけるヌクレオチドの引き続いての置換、欠失および/または付加を標準的な組換えDNA技術を用いて行うこともできる。
例えば、部位特異的突然変異誘発およびサブクローニングを用いて、注目するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに核酸残基を導入し/欠失し/置換することができる。他の実施形態においては、PCRを用いることができる。また、全くオリゴヌクレオチドからの化学適合性によって、注目するポリペプチドをコードする核酸を作製することもできる(例えば、Cello et al.,Science(2002)297:1016−8)。
いくつかの実施形態において、注目するポリペプチドをコードする核酸のコドンは、特定の種、特に哺乳動物、例えば、マウス、ラット、ハムスター、非ヒト霊長類、またはヒト種の細胞における発現のために最適化させる。いくつかの実施形態においては、注目するポリペプチドをコードする核酸のコドンは、特定の種、特に両生類種の細胞における発現のために最適化される。
(a.ベクター)
本発明は、さらに、対象の核酸を含む(「構築体」ともいう)ベクターを提供する。本発明の多くの実施形態において、対象の核酸配列は、該配列が、例えば、プロモーターを含めた発現制御配列に連結された後、宿主において発現される。また、対象の核酸は、典型的には、エピソームとして、または宿主の染色体DNAの一体的部分として宿主細胞中で複製することができる発現ベクターに入れられる。通常、発現ベクターは、所望のDNA配列で形質転換された細胞の検出を可能とするために選択マーカー、例えば、テトラサイクリンまたはネオマイシンを含む(例えば、ここで引用して援用する米国特許第4,704,362号参照)。単一およびデュアル発現カセットベクターを含めたベクターは上記分野でよく知られている(Ausubel,et al.,Short Protocols in Molecular Biology,第3版,Wiley & Sons,(1995);Sambrook,et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第二版,(1989)Cold Spring Harbor,N.Y.)。適当なベクターはウィルスベクター、プラスミド、コスミド、人工染色体(ヒト人工染色体、細菌人工染色体、酵母人工染色体等)、ミニ−染色体等を含む。レトロウィルス、アデノウイルスおよびアデノ−関連ウィルスベクターを用いることができる。
本発明は、さらに、対象の核酸を含む(「構築体」ともいう)ベクターを提供する。本発明の多くの実施形態において、対象の核酸配列は、該配列が、例えば、プロモーターを含めた発現制御配列に連結された後、宿主において発現される。また、対象の核酸は、典型的には、エピソームとして、または宿主の染色体DNAの一体的部分として宿主細胞中で複製することができる発現ベクターに入れられる。通常、発現ベクターは、所望のDNA配列で形質転換された細胞の検出を可能とするために選択マーカー、例えば、テトラサイクリンまたはネオマイシンを含む(例えば、ここで引用して援用する米国特許第4,704,362号参照)。単一およびデュアル発現カセットベクターを含めたベクターは上記分野でよく知られている(Ausubel,et al.,Short Protocols in Molecular Biology,第3版,Wiley & Sons,(1995);Sambrook,et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第二版,(1989)Cold Spring Harbor,N.Y.)。適当なベクターはウィルスベクター、プラスミド、コスミド、人工染色体(ヒト人工染色体、細菌人工染色体、酵母人工染色体等)、ミニ−染色体等を含む。レトロウィルス、アデノウイルスおよびアデノ−関連ウィルスベクターを用いることができる。
細胞中で注目するポリペプチドを生産する目的で、種々の発現ベクターが当業者に入手できる。ある実施形態で用いられる1つの適当なベクターはpCMVである。このベクターは、特許手続を目的とする微生物の寄託の国際的承認に関するブタペスト条約の規定の下で、1998年10月13日にAmerican Type Culture Collection(ATCC)に寄託された(10801 University Blvd.,Manassas,VA 20110−2209 USA)。該DNAはATCCによってテストされ、生きていると判断された。ATCCは以下の受託番号をpCMVに割り当てた:ATCC#203351。
対象の核酸は、通常、注目する対象のポリペプチドをコードする単一のオープンリーディングフレームを含むが、ある実施形態においては、注目するポリペプチドの発現用の宿主細胞は真核生物細胞、例えば、ヒト細胞のような哺乳動物細胞であり得るため、オープンリーディングフレームはイントロンによって中断され得る。適当な核酸は、典型的には、対象の核酸に加えて、RNAの安定性、翻訳効率などを指令することができる3’および5’非翻訳領域(UTR)を含むことができる転写ユニットの一部である。また、対象の核酸は、注目するポリペプチドの転写および発現を指令するプロモーター、および転写ターミネーターを、対象の核酸に加えて含む発現カセットの一部であってもよい。
真核生物プロモーターは、ウィルスプロモーター、および真核生物遺伝子に由来するプロモーターを含めた真核生物宿主細胞において機能的であるいずれのプロモーターでもあり得る。例示的真核生物プロモーターは、限定されるものではないが、以下の:マウスメタロチオネインI遺伝子配列のプロモーター(Hamer et al.,J.Mol.Appl.Gen.1:273−288,1982);ヘルペスウィルスのTKプロモーター(McKnight,Cell 31:355−365,1982);SV40初期プロモーター(Benoist et al.,Nature(London)290:304−310,1981);酵母gall遺伝子配列プロモーター(Johnston et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)79:6971−6975,1982;Silver et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)81:5951−59SS,1984)、CMVプロモーター、EF−1プロモーター、エクジソン−応答性プロモーター、テトラサイクリン−応答性プロモーター等を含む。ウィルスプロモーターは一般には特に強力なプロモーターであるので特に興味深いであろう。ある実施形態においては、標的病原体のプロモーターであるプロモーターが用いられる。本発明で用いるプロモーターは、それが導入される細胞型(および/または動物)で機能的であるように選択される。ある実施形態においては、プロモーターはCMVプロモーターである。
ある実施形態においては、対象のベクターは選択マーカーの発現も提供することができる。適当なベクターおよび選択マーカーは上記分野でよく知られており、Ausubel,et al.,(Short Protocols in Molecular Biology,第3版,Wiley & Sons,(1995))およびSambrook,et al.,(Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第3版,(2001)Cold Spring Harbor,N.Y.)で議論されている。種々の異なる遺伝子が選択マーカーとして使用されており、選択マーカーとして対象のベクターで使用される特別な遺伝子は便宜のために主として選択される。公知の選択マーカー遺伝子は:チミジンキナーゼ遺伝子、ジヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子、キサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ遺伝子、CAD、アデノシンデアミナーゼ遺伝子、アスパラギンシンターゼ遺伝子、抗生物質抵抗性遺伝子、例えば、tetr、ampr、Cmrまたはcat、kanrまたはneor(アミノグリコシドホスホトランスフェラーゼ遺伝子)、ヒグロマイシンBホスホトランスフェラーゼ遺伝子を含む。
前記したように、注目するポリペプチドは、アフィニティードメインおよび/またはレポータードメインを含む融合タンパク質であり得る。例えば、GPCRのC−またはN末端においてレポーターまたはタグおよびGPCRの間に融合を作製する方法は十分に当業者の技量内のものであり(例えば、McLean et al.,Mol.Pharma.Mol.Pharmacol.1999 56:1182−91;Ramsay et al.,Br.J.Pharmacology,2001,315−323)、さらに記載しない。そのような融合タンパク質は、欠失されたまたは別のアミノ酸で置換されたそのN末端メチオニン残基を有するGPCRとイン−フレーム融合した異種N末端ドメイン(例えば、エピトープタグ)を含むことができるのは明示的に考えられる。注目するポリペプチドは、まず、天然ポリペプチドから作製することができ、次いで、前記した適当なレポーター/タグに操作可能に連結させることができる。
対象の核酸は、通常、注目するポリペプチドをコードする核酸の構築を容易とするために制限部位、多数クローニング部位、プライマー結合部位、連結可能末端、組換え部位等を含むこともできる。
(b.宿主細胞)
本発明は、さらに、対象の核酸を含むベクターを含む宿主細胞を提供する。適当な宿主細胞は原核生物、例えば、細菌細胞(例えば、E.coli)、ならびに真核生物細胞、例えば、動物細胞(例えば、昆虫、哺乳動物、魚類、両生類、鳥類または爬虫類細胞)、植物細胞(例えば、トウモロコシまたはArabidopsis細胞)、真菌細胞(例えば、S.cerevisiae細胞)を含む。ある実施形態においては、注目するポリペプチドをコードする核酸を発現するのに適したいずれの細胞も宿主細胞として用いることができる。通常、動物宿主細胞系が用いられ、その例は以下の通りである:サル腎臓細胞(COS細胞)、SV40によって形質転換されたサル腎臓CVI細胞(COS−7、ATCC CRL 165 1);ヒト胚腎臓細胞(HEK−293[「293」]、Graham et al.,J.Gen Virol.36:59(1977));HEK−293T[「293T」]細胞;ベビーハムスター腎臓細胞(BHK,ATCC CCL 10);チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO,Urlaup and Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)77:4216,(1980);シリアンゴールデンハムスター細胞MCB3901(ATCC CRL−9595);マウスsertoli細胞(TM4,Mather,Biol.Reprod.23:243−251(1980));サル腎臓細胞(CVI ATCC CCL 70);アフリカミドリザル腎臓細胞(VERO−76,ATCC CRL−1587);ヒト頸部癌腫細胞(HELA,ATCC CCL 2);イヌ腎臓細胞(MDCK,ATCC CCL 34);バッファローラット肝臓細胞(BRL 3A,ATCC CRL 1442);ヒト肺細胞(W138,ATCC CCL 75);ヒト肝臓細胞(hep G2,HB 8065);マウス乳癌(MMT 060562、ATCC CCL 51);TRI細胞(Mather et al.,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44−68(1982));NIH/3T3細胞(ATCC CRL−1658);およびマウスL細胞(ATCC CCL−1)。ある実施形態においては、メラノフォアを用いる。メラノフォアは下等脊椎動物で見出される皮膚細胞である。関連する材料および方法は米国特許第5,462,856号および米国特許第6,051,386号の開示に従うであろう。これらの特許の開示をここで引用してその全体を援用する。さらなる細胞系は当業者に明らかであり、広く種々の細胞系がAmerican Type Culture Collection,10801 University Boulevard,Manassas,Va.20110−2209から入手できる。
本発明は、さらに、対象の核酸を含むベクターを含む宿主細胞を提供する。適当な宿主細胞は原核生物、例えば、細菌細胞(例えば、E.coli)、ならびに真核生物細胞、例えば、動物細胞(例えば、昆虫、哺乳動物、魚類、両生類、鳥類または爬虫類細胞)、植物細胞(例えば、トウモロコシまたはArabidopsis細胞)、真菌細胞(例えば、S.cerevisiae細胞)を含む。ある実施形態においては、注目するポリペプチドをコードする核酸を発現するのに適したいずれの細胞も宿主細胞として用いることができる。通常、動物宿主細胞系が用いられ、その例は以下の通りである:サル腎臓細胞(COS細胞)、SV40によって形質転換されたサル腎臓CVI細胞(COS−7、ATCC CRL 165 1);ヒト胚腎臓細胞(HEK−293[「293」]、Graham et al.,J.Gen Virol.36:59(1977));HEK−293T[「293T」]細胞;ベビーハムスター腎臓細胞(BHK,ATCC CCL 10);チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO,Urlaup and Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)77:4216,(1980);シリアンゴールデンハムスター細胞MCB3901(ATCC CRL−9595);マウスsertoli細胞(TM4,Mather,Biol.Reprod.23:243−251(1980));サル腎臓細胞(CVI ATCC CCL 70);アフリカミドリザル腎臓細胞(VERO−76,ATCC CRL−1587);ヒト頸部癌腫細胞(HELA,ATCC CCL 2);イヌ腎臓細胞(MDCK,ATCC CCL 34);バッファローラット肝臓細胞(BRL 3A,ATCC CRL 1442);ヒト肺細胞(W138,ATCC CCL 75);ヒト肝臓細胞(hep G2,HB 8065);マウス乳癌(MMT 060562、ATCC CCL 51);TRI細胞(Mather et al.,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44−68(1982));NIH/3T3細胞(ATCC CRL−1658);およびマウスL細胞(ATCC CCL−1)。ある実施形態においては、メラノフォアを用いる。メラノフォアは下等脊椎動物で見出される皮膚細胞である。関連する材料および方法は米国特許第5,462,856号および米国特許第6,051,386号の開示に従うであろう。これらの特許の開示をここで引用してその全体を援用する。さらなる細胞系は当業者に明らかであり、広く種々の細胞系がAmerican Type Culture Collection,10801 University Boulevard,Manassas,Va.20110−2209から入手できる。
(B.候補化合物のスクリーニング)
(1.遺伝的GPCRスクリーニングアッセイ技術)
Gタンパク質レセプターが活性となると、それはGタンパク質(例えば、Gq、Gs、Gi、Go、Gz)に結合し、GTPのGタンパク質への結合を刺激する。次いで、Gタンパク質はGTPaseとして作用し、GTPをGDPにゆっくりと加水分解し、それにより、正常な条件下では、レセプターは脱活性化されるようになる。しかしながら、活性化されたレセプターはGDPをGTPに変化させ続ける。GTPの非−加水分解性アナログ(35S)GTPγSを用いて、活性化されたレセプターを発現する膜への増強された結合をモニターすることができる。(35S)GTPγSを用いて、リガンドの不存在下および存在下において膜へのGタンパク質カップリングをモニターすることができる、と報告されている。とりわけ、当業者によく知られかつ入手可能なこのモニタリングの例は、1995年にTraynorおよびNahorskiによって報告された。このアッセイシステムの好ましい使用は候補化合物の最初のスクリーニングである。なぜならば、該システムは、レセプターの細胞内ドメインと相互作用する特定のGタンパク質にかかわらず、全てのGタンパク質共役型レセプターに一般に適用できるためである。
(1.遺伝的GPCRスクリーニングアッセイ技術)
Gタンパク質レセプターが活性となると、それはGタンパク質(例えば、Gq、Gs、Gi、Go、Gz)に結合し、GTPのGタンパク質への結合を刺激する。次いで、Gタンパク質はGTPaseとして作用し、GTPをGDPにゆっくりと加水分解し、それにより、正常な条件下では、レセプターは脱活性化されるようになる。しかしながら、活性化されたレセプターはGDPをGTPに変化させ続ける。GTPの非−加水分解性アナログ(35S)GTPγSを用いて、活性化されたレセプターを発現する膜への増強された結合をモニターすることができる。(35S)GTPγSを用いて、リガンドの不存在下および存在下において膜へのGタンパク質カップリングをモニターすることができる、と報告されている。とりわけ、当業者によく知られかつ入手可能なこのモニタリングの例は、1995年にTraynorおよびNahorskiによって報告された。このアッセイシステムの好ましい使用は候補化合物の最初のスクリーニングである。なぜならば、該システムは、レセプターの細胞内ドメインと相互作用する特定のGタンパク質にかかわらず、全てのGタンパク質共役型レセプターに一般に適用できるためである。
(2.特異的GPCRスクリーニングアッセイ技術)
「ジェネリック」Gタンパク質共役型レセプターアッセイ(すなわち、アゴニスト、逆アゴニストまたはアンタゴニストである化合物を選択するためのアッセイ)を用いて一旦候補化合物が同定されれば、いくつかの実施形態においては、レセプター部位に該化合物が相互作用したことを確認するためのさらなるスクリーニングが好ましい。例えば、「ジェネリック」アッセイによって同定された化合物はレセプターに結合しないであろうが、その代わり、細胞内ドメインからのGタンパク質を単に「カップリング解除」させることができる。
「ジェネリック」Gタンパク質共役型レセプターアッセイ(すなわち、アゴニスト、逆アゴニストまたはアンタゴニストである化合物を選択するためのアッセイ)を用いて一旦候補化合物が同定されれば、いくつかの実施形態においては、レセプター部位に該化合物が相互作用したことを確認するためのさらなるスクリーニングが好ましい。例えば、「ジェネリック」アッセイによって同定された化合物はレセプターに結合しないであろうが、その代わり、細胞内ドメインからのGタンパク質を単に「カップリング解除」させることができる。
別の実施形態において、限定されるものではなくその例として、前記で提供される「特異的」Gタンパク質共役型レセプターアッセイを用いて候補化合物を、初期スクリーニングを介して同定することができる。
(a.Gs、Gi、GoおよびGz)
Gsは酵素アデニリルシクラーゼを刺激する。他方、Gi(およびGzおよびGo)はアデニリルシクラーゼを阻害する。アデニリルシクラーゼはATPのcAMPへの変換を触媒し;かくして、Gsタンパク質にカップリングする活性化されたGPCRはcAMPの増大した細胞レベルと関連する。他方、Gi(またはGz、Go)タンパク質にカップリングする活性化されたGPCRはcAMPの減少した細胞レベルに関連する。一般に、「Indirect Mechanisms of Synaptic Transmission」,第8章,From Neuron To Brain(第3版)Nichols,J.G.et al.編,Sinauer Associates,Inc.(1992)参照。かくして、cAMPを検出するアッセイを利用して、候補化合物が、例えば、レセプターに対して逆アゴニストであるかを決定することができる(すなわち、そのような化合物はcAMPのレベルを減少させるであろう)。cAMPを測定するための上記分野で知られた種々のアプローチを利用することができ;いくつかの実施形態においては、好ましいアプローチはELISAベースのフォーマットでの抗cAMP抗体の使用に頼る。利用できるもう1つのタイプのアッセイは全細胞二次メッセンジャーレポーターシステムアッセイである。遺伝子に対するプロモーターは特定の遺伝子がコードするタンパク質の発現を駆動する。環状AMPは、次いで、cAMP応答エレメントと呼ばれる特異的部位におけるプロモーターに結合し、遺伝子の発現を駆動するcAMP−応答性DNA結合タンパク質または転写因子(CREB)の結合を促進することによって遺伝子発現を駆動する。レポーター遺伝子、例えば、β−ガラクトシダーゼまたはルシフェラーゼ前に多数のcAMP応答エレメントを含有するプロモーターを有するレポーターシステムを構築することができる。かくして、活性化されたGs−連結レセプターは、次いで、遺伝子を活性化するcAMPの蓄積、およびレポータータンパク質の発現を引き起こす。次いで、標準的な生化学アッセイ(Chen et al.1995)を用いて、β−ガラクトシダーゼまたはルシフェラーゼのようなレポータータンパク質を検出することができる。
Gsは酵素アデニリルシクラーゼを刺激する。他方、Gi(およびGzおよびGo)はアデニリルシクラーゼを阻害する。アデニリルシクラーゼはATPのcAMPへの変換を触媒し;かくして、Gsタンパク質にカップリングする活性化されたGPCRはcAMPの増大した細胞レベルと関連する。他方、Gi(またはGz、Go)タンパク質にカップリングする活性化されたGPCRはcAMPの減少した細胞レベルに関連する。一般に、「Indirect Mechanisms of Synaptic Transmission」,第8章,From Neuron To Brain(第3版)Nichols,J.G.et al.編,Sinauer Associates,Inc.(1992)参照。かくして、cAMPを検出するアッセイを利用して、候補化合物が、例えば、レセプターに対して逆アゴニストであるかを決定することができる(すなわち、そのような化合物はcAMPのレベルを減少させるであろう)。cAMPを測定するための上記分野で知られた種々のアプローチを利用することができ;いくつかの実施形態においては、好ましいアプローチはELISAベースのフォーマットでの抗cAMP抗体の使用に頼る。利用できるもう1つのタイプのアッセイは全細胞二次メッセンジャーレポーターシステムアッセイである。遺伝子に対するプロモーターは特定の遺伝子がコードするタンパク質の発現を駆動する。環状AMPは、次いで、cAMP応答エレメントと呼ばれる特異的部位におけるプロモーターに結合し、遺伝子の発現を駆動するcAMP−応答性DNA結合タンパク質または転写因子(CREB)の結合を促進することによって遺伝子発現を駆動する。レポーター遺伝子、例えば、β−ガラクトシダーゼまたはルシフェラーゼ前に多数のcAMP応答エレメントを含有するプロモーターを有するレポーターシステムを構築することができる。かくして、活性化されたGs−連結レセプターは、次いで、遺伝子を活性化するcAMPの蓄積、およびレポータータンパク質の発現を引き起こす。次いで、標準的な生化学アッセイ(Chen et al.1995)を用いて、β−ガラクトシダーゼまたはルシフェラーゼのようなレポータータンパク質を検出することができる。
(b.Gq)
Gqは酵素ホスホリパーゼCの活性化に関連し、これは、今度は、リン脂質PIP2を加水分解し、2つの細胞内メッセンジャー:ジアシルグリセロール(DAG)およびイノシトール1,4,5−三リン酸(IP3)を放出する。IP3の増加した蓄積はGq−およびGo−関連レセプターの活性化に関連する。一般に、「Indirect Mechanisms of Synaptic Transmission」,第8章,From Neuron To Brain(第3版)Nichols,J.G.et al編,Sinauer Associates,Inc.(1992)参照。IP3蓄積を検出するアッセイを利用して、候補化合物が、例えば、Gq関連レセプターに対する逆アゴニストであるかを決定することができる(すなわち、そのような化合物はIP3のレベルを低下させるであろう)。また、Gq−関連レセプターを、Gq−依存性ホスホリパーゼCがAP1エレメントを含有する遺伝子の活性化を引き起こす点で、AP1レポーターアッセイを用いて調査することができ;かくして、活性化されたGq−関連レセプターはそのような遺伝子の発現の増加の証拠となり、それにより、それに対する逆アゴニストはそのような発現の減少の証拠となり、およびアゴニストはそのような発現の増加の証拠となる。そのような検出のための商業的に入手可能なアッセイが利用できる。
Gqは酵素ホスホリパーゼCの活性化に関連し、これは、今度は、リン脂質PIP2を加水分解し、2つの細胞内メッセンジャー:ジアシルグリセロール(DAG)およびイノシトール1,4,5−三リン酸(IP3)を放出する。IP3の増加した蓄積はGq−およびGo−関連レセプターの活性化に関連する。一般に、「Indirect Mechanisms of Synaptic Transmission」,第8章,From Neuron To Brain(第3版)Nichols,J.G.et al編,Sinauer Associates,Inc.(1992)参照。IP3蓄積を検出するアッセイを利用して、候補化合物が、例えば、Gq関連レセプターに対する逆アゴニストであるかを決定することができる(すなわち、そのような化合物はIP3のレベルを低下させるであろう)。また、Gq−関連レセプターを、Gq−依存性ホスホリパーゼCがAP1エレメントを含有する遺伝子の活性化を引き起こす点で、AP1レポーターアッセイを用いて調査することができ;かくして、活性化されたGq−関連レセプターはそのような遺伝子の発現の増加の証拠となり、それにより、それに対する逆アゴニストはそのような発現の減少の証拠となり、およびアゴニストはそのような発現の増加の証拠となる。そのような検出のための商業的に入手可能なアッセイが利用できる。
(3.GPCR融合タンパク質)
逆アゴニストまたはアゴニストの直接的同定用の候補化合物のスクリーニングで用いられる内因性の構成的に活性なGPCRまたは非−内因性の構成的に活性化されたGPCRの使用は、定義により、レセプターはそれに結合した内因性リガンドの不存在下においてでさえ活性化である点で、興味深いスクリーニング挑戦を提供する。かくして、そのような化合物が逆アゴニストまたはアゴニストであり得るか、あるいはそのようなレセプターに対して効果を有しないか否かに関する理解を可能とするためのそのような差別化を目的として、候補化合物の存在下における非−内因性レセプターおよびその化合物の不存在下における非−内因性レセプターの間を区別するために、いくつかの実施形態においては、そのような区別を増強することができるアプローチを利用するのが好ましい。いくつかの実施形態において、好ましいアプローチはGPCR融合タンパク質の使用である。
逆アゴニストまたはアゴニストの直接的同定用の候補化合物のスクリーニングで用いられる内因性の構成的に活性なGPCRまたは非−内因性の構成的に活性化されたGPCRの使用は、定義により、レセプターはそれに結合した内因性リガンドの不存在下においてでさえ活性化である点で、興味深いスクリーニング挑戦を提供する。かくして、そのような化合物が逆アゴニストまたはアゴニストであり得るか、あるいはそのようなレセプターに対して効果を有しないか否かに関する理解を可能とするためのそのような差別化を目的として、候補化合物の存在下における非−内因性レセプターおよびその化合物の不存在下における非−内因性レセプターの間を区別するために、いくつかの実施形態においては、そのような区別を増強することができるアプローチを利用するのが好ましい。いくつかの実施形態において、好ましいアプローチはGPCR融合タンパク質の使用である。
一般に、一旦、前記したアッセイ技術(ならびに当業者に知られた技術)を用いて非−内因性GPCRが構成的に活性化されると判断されれば、内因性GPCRにカップリングする圧倒的なGタンパク質を決定することが可能である。Gタンパク質のGPCRへのカップリングは、評価することができるシグナリング経路を提供する。いくつかの実施形態においては、哺乳動物発現系を用いてスクリーニングを行うのが好ましい。というのは、そのようなシステムは内因性Gタンパク質をその中に有すると期待されるためである。かくして、定義によると、そのようなシステムにおいては、非−内因性の構成的に活性化されたGPCRは連続的にシグナルを発するであろう。いくつかの実施形態においては、このシグナルは、例えば、レセプターに対する逆アゴニストの存在下で、特に、それが逆アゴニストと接触した場合にレセプターとの間で、スクリーニングの関係で、より容易に区別できるようであるようにこのシグナルが増強されるのが好ましい。
GPCR融合タンパク質は、非−内因性GPCRとのGタンパク質カップリングの効率を高めることを意図する。GPCR融合タンパク質は、内因性の構成的に活性なGPCR、または非−内因性の構成的に活性化されたGPCRいずれかでのスクリーニングで好ましい。なぜならば、そのようなアプローチはそのようなスクリーニング技術で生じるシグナルを増加させるためである。これは有意な「ノイズに対するシグナル」比率を促進するのに重要であり;そのような有意な比率は、本明細書中に開示された候補化合物のスクリーニングで好ましい。
GPCR融合タンパク質の発現にいうような構築体の構築は、当業者の技量内のものである。商業的に入手可能な発現ベクターおよびシステムは、調査者の特定の要求にフィットできる種々のアプローチを提供する。そのようなGPCR融合タンパク質構築体の構築における重要な基準は、限定されるものではないが、GPCR配列およびGタンパク質配列が共にイン−フレームであること(好ましくは、内因性GPCRについての配列はGタンパク質配列の上流にある)、およびGPCRの「停止」コドンが、GPCRの発現に際して、Gタンパク質も発現できるように欠失されるか、または置き換えられていることも含む。GPCRはGタンパク質に直接連結させることができるか、あるいは2つ(好ましくは、この数は当業者によって容易に確認できるが約12以下)の間にスペーサー残基があり得る。便宜に基づき、スペーサーを用いるのが好ましい。いくつかの実施形態において、非−内因性GPCRにカップリングするGタンパク質はGPCR融合タンパク質構築体の創製に先立って同定されているのが好ましい。同定されているGタンパク質は数個に過ぎない故に、Gタンパク質の配列を含む構築体(すなわち、ユニバーサルGタンパク質構築体、後記実施例4(a)参照)は内因性GPCR配列のその中への挿入のために利用できるのが好ましい;これは、異なる配列を有する種々の異なる内因性GPCRの大規模なスクリーニングの関係でさらなる効率を提供する。
前記したように、Gi、GoおよびGzにカップリングする活性化されたGPCRは、これらのタイプのGPCR挑戦に基づいてcAMP作製アッセイの形成を阻害すると予測される[すなわち、cAMPシグナルは活性化に際して減少し、かくして、例えば、(さらにこのシグナルを減少させるであろう)アゴニストの挑戦の直接的同定を行う]。本明細書中で開示するように、これらのタイプのレセプターについて、精力的なシクラーゼ−ベースのアッセイを確立する努力において、GPCRの内因性Gタンパク質に基づかないGPCR融合タンパク質を創製するのが可能である。かくして、例えば、内因性Gi共役型レセプターをGsタンパク質に融合させることができ−そのような融合構築体は、発現に際して、内因性GPCRが、シクラーゼ−ベースのアッセイを確立することができるように、「天然」Giタンパク質よりはむしろ例えば、Gsとカップリングするように「駆動する」または「強いる」。かくして、Gi、GoおよびGz共役型レセプターについては、いくつかの実施形態において、GPCR融合タンパク質を用い、アッセイがアデニリルシクラーゼ活性の検出に基づく場合には、融合構築体がGs(酵素アデニリルシクラーゼの形成を刺激する同等のGタンパク質)で確立されるのが好ましい。
(4.シグナル−エンハンサーGs共役型GPCRでの標的Gi共役型GPCRの共トランスフェクション(cAMPベースのアッセイ))
Gi共役型レセプターはアデニリルシクラーゼを阻害し、従って、cAMP生産のレベルを減少させ、これはcAMPレベルの挑戦の評価をなすことができることが知られている。いくつかの実施形態においては、活性化に際して圧倒的にGiにカップリングするレセプターの活性化の指標としてcAMPの生産の減少を測定する効果的な技術は、シグナルエンハンサー、例えば、活性化に際してGsと圧倒的にカップリングする非−内因性の構成的に活性化されたレセプター(例えば、TSHR−A623I;前記参照)を、Gi連結GPCRで共トランスフェクトすることによって達成することができる。明らかなように、Gs共役型レセプターの活性化は、cAMPの生産の増加に基づいて決定することができる。Gi共役型レセプターの活性化は、cAMP生産の減少に導く。かくして、共トランスフェクションアプローチはこれらの「反対」効果を有利に開発することを意図する。例えば、発現ベクター単独での、非−内因性の構成的に活性化されたGs共役型レセプター(「シグナルエンハンサー」)の共トランスフェクションはベースラインcAMPシグナルを生じる(すなわち、Gi共役型レセプターはcAMPレベルを減少させるが、これは、構成的に活性化されたGs共役型シグナルエンハンサーによって確立されたcAMPレベルの実質的増加に対するものである)。次いで、シグナルエンハンサーを「標的レポーター」で共トランスフェクトすることによって、Gi共役型標的レセプターの逆アゴニストは測定されたcAMPシグナルを増加させ、他方、Gi共役型標的レセプターのアゴニストはこのシグナルを減少する。
Gi共役型レセプターはアデニリルシクラーゼを阻害し、従って、cAMP生産のレベルを減少させ、これはcAMPレベルの挑戦の評価をなすことができることが知られている。いくつかの実施形態においては、活性化に際して圧倒的にGiにカップリングするレセプターの活性化の指標としてcAMPの生産の減少を測定する効果的な技術は、シグナルエンハンサー、例えば、活性化に際してGsと圧倒的にカップリングする非−内因性の構成的に活性化されたレセプター(例えば、TSHR−A623I;前記参照)を、Gi連結GPCRで共トランスフェクトすることによって達成することができる。明らかなように、Gs共役型レセプターの活性化は、cAMPの生産の増加に基づいて決定することができる。Gi共役型レセプターの活性化は、cAMP生産の減少に導く。かくして、共トランスフェクションアプローチはこれらの「反対」効果を有利に開発することを意図する。例えば、発現ベクター単独での、非−内因性の構成的に活性化されたGs共役型レセプター(「シグナルエンハンサー」)の共トランスフェクションはベースラインcAMPシグナルを生じる(すなわち、Gi共役型レセプターはcAMPレベルを減少させるが、これは、構成的に活性化されたGs共役型シグナルエンハンサーによって確立されたcAMPレベルの実質的増加に対するものである)。次いで、シグナルエンハンサーを「標的レポーター」で共トランスフェクトすることによって、Gi共役型標的レセプターの逆アゴニストは測定されたcAMPシグナルを増加させ、他方、Gi共役型標的レセプターのアゴニストはこのシグナルを減少する。
このアプローチを用いて直接的に同定された候補化合物を独立して評価して、これらがシグナル増強レセプターを標的化しないことを確認すべきである(これは、共トランスフェクトされたレセプターに対するスクリーニングに先立って、またはその後に行うことができる)。
(C.医療化学)
(候補化合物)
上記分野で知られたいずれの分子も、本発明のGPCRの活性を調節する(増加させる、または減少させる)その能力につきテストすることができる。活性を調節する化合物を同定するためには、候補化合物を、レセプターを発現する細胞に直接的に供することができる。
(候補化合物)
上記分野で知られたいずれの分子も、本発明のGPCRの活性を調節する(増加させる、または減少させる)その能力につきテストすることができる。活性を調節する化合物を同定するためには、候補化合物を、レセプターを発現する細胞に直接的に供することができる。
本発明のこの実施形態は、レセプターの量または活性を調節する、例えば、阻害する、拮抗するまたは作動する分子についての化学的ライブラリーをスクリーニングするのによく適合する。化学的ライブラリーはペプチドライブラリー、ペプチドミメティックライブラリー、化学的に合成されたライブラリー、組換えの、例えば、ファージ提示ライブラリー、およびインビトロ翻訳−ベースのライブラリー、他の非ペプチド合成有機ライブラリー等であり得る。本発明のこの実施形態は、限定されるものではないが、血漿および組織抽出物を含めた生物学的物質を含む内因性候補化合物をスクリーニングし、生物学的活性を有することが知られた内因性化合物のライブラリーをスクリーニングするのにもよく適合する。
いくつかの実施形態において、候補化合物の直接的同定は、コンビナトーリアル化学技術を介して精製させた化合物と組み合わせて行われ、それにより、何千もの化合物がそのような分析のためにランダムに調製される。候補化合物は化学ライブラリーのメンバーであり得る。これはいずれかの便宜な数の個々のメンバー、例えば、数十〜数百〜数千〜数百万の適当な化合物、例えば、ペプチド、ペプトイドおよび他のオリゴマー化合物(環状または線状)、および鋳型−ベースのより小さな分子、例えば、ベンゾジアゼピン、ヒダントイン、ビアリール、炭素環および多環化合物(例えば、ナフタレン、フェノチアジン、アクリジン、ステロイド等)、炭水化物およびアミノ酸誘導体、ジヒトドピリジン、ベンズヒドリルおよび複素環(例えば、トリジン、インドール、チアゾリジン等)を含むことができる。引用した数およびリストした化合物のタイプは例示的であって、限定するものではない。好ましい化学ライブラリーは低分子量の化学化合物および潜在的治療剤を含む。
例示的化学ライブラリーはいくつかの源(ArQule、Tripos/PanLabs、ChemDesign、Pharmacopoeia)から商業的に入手可能である。いくつかの場合において、これらの化学ライブラリーは、それに対してメンバー化合物が結合し、かくして、効果的なモジュレーターである分子の直接的かつ即座の同定を可能とする基材上の各メンバーのライブラリーの同一性をコードするコンビナトーリアル戦略を作り出される。かくして多くのコンビナトーリアルアプローチにおいて、化合物のプレート上の位置はその化合物の組成を特定する。また、1つの例においては、単一のプレート位置は、注目する相互作用を含むウェルへの投与によってスクリーニングすることができる1〜20の化学物質を有することができる。かくして、もし調節が検出されれば、相互作用対のより徐々により小さくするプールを調節活性につきアッセイすることができる。そのような方法によって、多くの候補分子をスクリーニングすることができる。
用いるのに適した多くの多様なライブラリーは上記分野で知られており、それを用いて、本発明にしたがってテストすべき化合物を提供することができる。別法として、ライブラリーは標準的な方法を用いて構築することができる。さらに、より一般的で構造的に拘束された有機性の多様な(例えば、非ペプチド)ライブラリーを用いることもできる。その例として、ベンゾジアゼピンライブラリー(例えば、Bunin et al.,1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:4708−4712)を用いることができる。
本発明のもう1つの実施形態において、コンビナトーリアル化学を用いて、本発明のGPCRのモジュレーターを同定することができる。コンビナトーリアル化学は、その多くが構造的に同様であり得る数十万の化合物を含有するライブラリーを作り出すことができる。高スループットスクリーニングプログラムは既知の標的に対する親和性につきこれらの膨大なライブラリーをスクリーニングすることができるが、より小さなジメンションのライブラリーを達成するが、最大の化学的多様性を提供する新しいアプローチが開発されている(例えば、Matter,1997,Journal of Medicinal Chemistry 40 1219−1229参照)。
コンビナトーリアル化学、アフィニティーフィンガープリンティングの1つの方法は、タンパク質の規定されたパネルに対する結合親和性につき低分子の区別されるライブラリーをテストするのに従前用いられてきた。スクリーニングによって得られたフィンガープリントを用いて、注目する他のタンパク質またはレセプター(本発明においては、本発明のレセプター)に対する個々のライブラリーメンバーの親和性を予測する。フィンガープリントを、注目するタンパク質と反応することが知られている他の化合物から得られたフィンガープリントと比較して、ライブラリー化合物が同様に反応するか否かを予測する。例えば、複合体またはタンパク質成分との相互作用についての大きなライブラリー中の各リガンドをテストするよりはむしろ、その活性を有することが知られている他の化合物と同様なフィンガープリントを有するリガンドのみをテストすることができよう(例えば、Kauvar et al.,1995,Chemistry and Biology 2:107−118;Kauvar,1995,Affinity fingerprinting,Pharmaceutical Manufacturing International. 8:25−28;およびKauvar,Toxic−Chemical Detection by Pattern Recognition in New Frontiers in Agrochemical Immunoassay,D.Kurtz.L.Stanker and J.H.Skerritt.Editors,1995,AOAC:Washington,D.C.,305−312参照。)。
(モジュレーターとして同定された候補化合物)
一般に、そのようなスクリーニングの結果はユニークなコア構造を有する化合物であろう;然る後、これらの化合物を好ましいコア構造(類)の周りの追加の化学的修飾に付して、その医学的特性をさらに増強することができる。そのような技術は当業者に知られており、本特許処理においては詳細には取り扱わない。
一般に、そのようなスクリーニングの結果はユニークなコア構造を有する化合物であろう;然る後、これらの化合物を好ましいコア構造(類)の周りの追加の化学的修飾に付して、その医学的特性をさらに増強することができる。そのような技術は当業者に知られており、本特許処理においては詳細には取り扱わない。
いくつかの実施形態において、該同定されたモジュレーターは生物学的に入手可能である。当業者に利用可能な多数の計算アプローチが、薬物の経口生物学的利用性の予測のために開発されている[Ooms et al.,Biochim Biophys Acta(2002)1587:118−25;Clark & Grootenhuis,Curr OpinDrug Discov Devel(2002)5:382−90;Cheng et al.,J Comput Chem (2002)23:172−83;Norinder & Haeberlein,Adv Drug Deliv Rev(2002)54:291−313;Matter et al.,Comb Chem High Throughput Screen(2001)] 4:453−75;Podlogar & Muegge,Curr Top Med Chem(2001)1:257−75;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。さらに、陽電子射出断層撮影法(PET)が、非ヒト霊長類およびヒト身体を含めた薬物の経口投与後に、哺乳動物身体中での経口生物学的利用性の評価を含めた薬物分布の直接的測定を得るのに多数のグループによって成功して用いられてきた[Noda et al.,J Nucl Med(2003)44:105−8;Gulyas et al.,Eur J Nucl Med Mol Imaging (2002)29:1031−8;Kanerva et al.,Psychopharmacology (1999)145:76−81;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。また、実施例18を含め、後記参照。
(D.薬学的組成物)
本発明は、治療上有効量の本発明のモジュレーターを治療(または予防)を必要とする個体に投与することによる治療(および予防)の方法を提供する[また、例えば、2002年8月29日にWO 02/066505として公開されたPCT出願番号PCT/IB02/01461参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]。好ましい局面において、モジュレーターは精製されている。該個体は、好ましくは、限定されるものではないが、ウシ、ブタ、ウマ、ニワトリ、ネコ、イヌ、ウサギ、ラット、マウスなどを含めた動物であり、好ましくは、哺乳動物、より好ましくはヒトである。
本発明は、治療上有効量の本発明のモジュレーターを治療(または予防)を必要とする個体に投与することによる治療(および予防)の方法を提供する[また、例えば、2002年8月29日にWO 02/066505として公開されたPCT出願番号PCT/IB02/01461参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]。好ましい局面において、モジュレーターは精製されている。該個体は、好ましくは、限定されるものではないが、ウシ、ブタ、ウマ、ニワトリ、ネコ、イヌ、ウサギ、ラット、マウスなどを含めた動物であり、好ましくは、哺乳動物、より好ましくはヒトである。
本発明のモジュレーターは、単独で、あるいは当業者によく知られた技術を用いて適当なキャリアまたは賦形剤と混合される場合には薬学的または生理学的に受容可能な組成物にて非ヒト動物(後記実施例参照)および/またはヒトに投与することができる。適当な薬学的に受容可能なキャリアは当業者に入手可能である;例えば、Remington‘s Pharmaceutical Sciences,第16版,1980,Mack Publishing Co.,(Oslo et al.編)参照。
次いで、薬学的または生理学的に受容可能な組成物を治療上効果的な用量で供する。治療上効果的な用量とは、心臓病の兆候または生理学的状態の予防または軽減をもたらすのに十分なモジュレーターの量をいう。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室中隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺性心、リウマチ性心疾患、および心室機能障害を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全症、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱、僧帽弁逸脱、三尖弁逸脱、僧帽弁閉鎖不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大型心筋症、鬱血性心筋症、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋障害を含む。他の実施形態において、治療上有効な用量とは、心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、および家族性肥大型心筋症からなる群より選択される障害に由来する肥大型心筋症の兆候または生理学的状態の予防または軽減をもたらすのに十分なモジュレーターの量をいう。いくつかの実施形態において、治療上有効な用量とは、鬱血性心臓機能障害の兆候または生理学的状態の予防または軽減をもたらすのに十分なモジュレーターの量をいう。先天性心臓欠陥は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺動脈中隔欠損、ファロー三徴症、心室中隔欠損症、および家族性肥大型心筋症を含む。いくつかの実施形態において、治療上有効な用量は、肥大した心臓と共に提示される障害の兆候または生理学的状態の予防または軽減をもたらすのに十分なモジュレーターの量をいう。
本発明のモジュレーターは、単独で、または他の薬学的または生理学的に受容可能な化合物と組み合わせて供することができると明示的に考えられる。本発明の障害の治療用の他の化合物は現在上記分野でよく知られている。本発明の1つの局面は、さらに、カプトプリル、エナラプリルマレイン酸塩、リニノプリル、ラミプリル、ペリンドプリル、フロセミド、トラセミド、クロロチアジド、ヒドロクロロチアジド、アミロライド塩酸塩、スピロノラクトン、アテノロール、ビソプロロール、カルベジロール、メトプロロール酒石酸塩、およびジロキシンからなる群より選択される1以上の剤を含む本明細書中に開示された実施形態に従う使用を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室中隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺性心、リウマチ性心疾患、および心室機能障害を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全症、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱、僧帽弁逸脱、三尖弁逸脱、僧帽弁閉鎖不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大型心筋症、鬱血性心筋症、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は血行動態または遺伝性疾患に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎および家族性肥大型心筋症からなる群より選択される障害に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は先天性心臓欠陥である。先天性心臓欠陥は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺動脈中隔欠損、ファロー三徴症、心室中隔欠損症、および家族性肥大型心筋症を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は肥大した心臓と共に提示される障害である。
(投与の経路)
適当な投与の経路は、上記分野で知られた方法を用いる、経口、鼻腔内、直腸、経粘膜、または腸投与、筋肉内、皮下、髄質内注射を含めた非経口送達、ならびにクモ膜下腔、直接的心室内、静脈内、腹腔内、鼻腔内、肺内(吸入)または眼内注射を含む。他の特に好ましい投与経路はエアロゾルおよびデポ処方である。本発明の医薬の徐放性処方、特にデポ剤は明示的に考えられる。いくつかの実施形態において、投与の経路は経口である。
適当な投与の経路は、上記分野で知られた方法を用いる、経口、鼻腔内、直腸、経粘膜、または腸投与、筋肉内、皮下、髄質内注射を含めた非経口送達、ならびにクモ膜下腔、直接的心室内、静脈内、腹腔内、鼻腔内、肺内(吸入)または眼内注射を含む。他の特に好ましい投与経路はエアロゾルおよびデポ処方である。本発明の医薬の徐放性処方、特にデポ剤は明示的に考えられる。いくつかの実施形態において、投与の経路は経口である。
(組成物/処方)
本発明に従って用いられる薬学的または生理学的に受容可能な組成物および医薬は、賦形剤および補助剤を含む1以上の生理学的に受容可能なキャリアを用いて便宜な方法で処方することができる。適切な処方は選択された投与の経路に依存する。
本発明に従って用いられる薬学的または生理学的に受容可能な組成物および医薬は、賦形剤および補助剤を含む1以上の生理学的に受容可能なキャリアを用いて便宜な方法で処方することができる。適切な処方は選択された投与の経路に依存する。
本明細書中に記載されたある種の医薬は薬学的または生理学的に受容可能なキャリアおよび少なくとも1つの本発明のモジュレーターを含むであろう。注射のためには、本発明の剤は水性溶液、好ましくは、ハンクスの溶液、リンゲル液のような生理学的適合する緩衝液、またはリン酸または炭酸水素塩緩衝液のような生理食塩水中に処方することができる。経粘膜投与のためには、浸透させるべきバリアに対して適切な浸透剤を処方で用いる。そのような浸透剤は一般に上記分野で知られている。
経口により摂取することができる薬学的または生理学的に受容可能な製剤はゼラチンで作製されたプッシュ−フィットカプセル、ならびにゼラチン、およびグリセロールまたはソルビトールのような可塑剤で作製されたソフトなシールされたカプセルを含む。該プッシュ−フィットカプセルはラクトースのような充填剤、澱粉のようなバインダーおよび/またはタルクまたはステアリン酸マグネシウムのような滑沢剤および、所望により、安定化剤と混合した有効成分を含むことができる。ソフトカプセルにおいては、活性な化合物を脂肪油、流動パラフィン、または液体ポリエチレングリコールのような適当な液体に溶解または懸濁させることができる。また、安定剤も添加できる。経口投与のための全ての処方はそのような投与に適当な用量であるべきである。
バッカル投与では、組成物は慣用的に処方された錠剤またはロゼンジの形態を取ることができる。
吸入による投与では、本発明に従って用いられる化合物は、便宜には、適当な気体状プロペラント、例えば、二酸化炭素を用い、ネビュライザー用の圧縮パックからエアロゾルスプレーの形態で送達される。圧縮エアロゾルの場合には、投与単位は、計量された量を送達するためのバルブを供することによって決定することができる。吸入器または散布器で用いられる、例えば、ゼラチンのカプセルおよびカートリッジを、化合物およびラクトースまたは澱粉のような適当な粉末基剤の粉末ミックスを含有するように処方することができる。
化合物は注射によって、例えば、ボーラス注射または連続的注入による非経口投与用に処方することができる。注射のための処方は、例えば、保存剤を加えたアンプルまたは多用量容器中で単位投与量にて供すことができる。組成物は水性ビヒクル中の懸濁液、溶液またはエマルジョンのような形態を取ることができ、懸濁化剤、安定化剤および/または分散剤のような処方剤を含むことができる。
非経口投与のための薬学的または生理学的に受容可能な処方は、水溶性形態の活性化合物の水溶液を含む。水性懸濁液はナトリウムカルボキシメチルセルロース、ソルビトールまたはデキストランのような懸濁液の粘度を増加させる物質を含有することができる。所望により、懸濁液は、適当な安定化剤、あるいは高度に濃縮された溶液の調製を可能とするための化合物の溶解度を増加させる剤を含有することもできる。
別法として、有効成分は、滅菌されたパイロジェン−フリー水のような適当なビヒクルでの使用前の復元のために粉末または凍結乾燥形態とすることができる。
前記した処方に加えて、化合物はデポ製剤として処方することもできる。そのような長期作用処方は移植によって(例えば、皮下または筋肉内)、あるいは筋肉内注射によって投与することができる。かくして、例えば、化合物は(例えば、に受容可能な油中のエマルジョンとして)適当なポリマーまたは疎水性物質、またはイオン交換樹脂とで、あるいは貧溶解性誘導体、例えば、貧溶解性塩として処方することができる。
特別な実施形態において、化合物は制御放出系を介して送達することができる。1つの実施形態において、ポンプを用いることができる(Langer,前掲;Sefton,1987,CRC Crit.Ref.Biomed.Eng.14:201−240;Buchwald et al.,1980,Surgery 88:507−516;Saudek et al.,1989,N.Engl.J.Med.321:574−579)。もう1つの実施形態において、ポリマー物質を用いることができる(Medical Applications of Controlled Release,Langer and Wise編,CRC Press,Boca Raton,Florida,1974;Controlled Drug Bioavailability,Drug Product Design and Performance,Smolen and Ball編,Wiley,New York,1984;Ranger and Peppas,1983,Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.23:61;Levy et al.,1985,Science 228:190−192;During et al.,1989,Ann.Neurol.25:351−356;Howard et al.,1989,J.Neurosurg.71:858−863)。他の制御放出系はLangerによってレビューで考察されている(1990,Science 249:1527−1533)。
加えて、化合物は、治療剤を含有する固体疎水性ポリマーの半浸透性マトリックスのような徐放系を用いて送達することができる。種々の徐放物質が確立されており、当業者によく知られている。徐放カプセルは、その化学的性質に応じて、数週間から100日以上まで化合物を放出することができる。
治療剤の化学的性質、および生物学的安定性に応じて、モジュレーター安定化のためのさらなる戦略を使用することができる。
また、薬学的または生理学的に受容可能な組成物は適当な固体またはゲル相キャリアまたは賦形剤を含むこともできる。そのようなキャリアまたは賦形剤の例は、限定されるものではないが、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム、種々の糖、澱粉、セルロース誘導体、ゼラチン、およびポリエチレングリコールのようなポリマーを含む。
(効果的な投与量)
本発明で用いるのに適した薬学的または生理学的に受容可能な組成物は、有効成分がその意図した目的を達成するのに十分な量で含有された組成物を含む。より具体的には、治療上有効量は、治療すべき対象の現存する兆候の進展を予防し、またはそれを軽減するのに十分な量を意味する。効果的な量の決定は、特に、本明細書中に提供された詳細な開示に徴して当業者の能力の範囲内のものであろう。
本発明で用いるのに適した薬学的または生理学的に受容可能な組成物は、有効成分がその意図した目的を達成するのに十分な量で含有された組成物を含む。より具体的には、治療上有効量は、治療すべき対象の現存する兆候の進展を予防し、またはそれを軽減するのに十分な量を意味する。効果的な量の決定は、特に、本明細書中に提供された詳細な開示に徴して当業者の能力の範囲内のものであろう。
本発明の方法で用いるいずれの化合物についても、治療上有効な用量は細胞培養アッセイからまず見積もることができる。例えば、用量は、インビトロ系で細胞死滅−保護的であることが示された濃度点または範囲を含む循環濃度範囲を達成するように動物モデルで処方することができる(例えば、インビトロアッセイおよびインビボ動物モデルについては後記参照)。そのような情報を用いて、ヒトにおいて有用な用量を用いてより正確に決定することができる。
治療上有効な用量とは、患者において兆候の軽減をもたらす化合物の量をいう。そのような化合物の毒性および治療効果は、例えば、LD50(テスト集団の50%にとって致死的な用量)およびED50(テスト集団の50%において治療上有効な用量)を決定するために、細胞培養または実験動物において標準的な医薬手法によって決定することができる。毒性効果および治療効果の間の用量比率は治療指標であり、それは、LD50およびED50の間の比率として表すことができる。高い治療指数を示した化合物が好ましい。
これらの細胞培養アッセイおよび動物実験から得られたデータは、ヒトで用いる投与量の範囲を処方するのに用いることができる。そのような化合物の投与量は、好ましくは、毒性がほとんど無いまたは全く無い、ED50を含む循環濃度の範囲内にある。該投与量は、使用する投与形態および利用する投与の経路に応じてこの範囲内で変化させることができる。正確な処方、投与の経路および投与量は、患者の状態を考慮して個々の意志によって選択され得る(例えば、Fingl et al.,1975,「The Pharmacological Basis of Therapeutics」,Ch.1参照)。
投与の量および間隔は、特定の状況に応じて、本発明の障害を予防または治療するのに十分な活性化合物の血漿中レベルを供するように個々に調整することができる。これらの効果を達成するのに必要な投与量は、個々の特徴および投与の経路に依存するであろう。
また、投与の間隔は、最小有効濃度についての値を用いて決定することもできる。化合物は、血漿中レベルを上記時間の10〜90%の間、好ましくは30〜99%の間、最も好ましくは50〜90%の間、最小有効濃度上のレベルに維持する方法を用いて投与すべきである。局所投与または選択的摂取の場合には、薬物の有効な局所濃度は血漿中濃度には無関係であろう。
投与される組成物の量は、勿論、治療すべき対象、対象の重量、疾患の重傷度、投与の方法、および主治医の判断に依存するであろう。
所望の効果、本発明の障害の予防または治療を達成するために日または正規のベースに基づいて投与することができる本発明のモジュレーターの量についての好ましい投与量範囲は0.1〜100mg/kg体重である。他の好ましい投与量範囲は0.1〜30mg/kg体重である。他の好ましい投与量範囲は0.1〜10mg/kg体重である。他の好ましい投与量範囲は0.1〜3.0mg/kg体重である。勿論、これらの日投与量は、1日の間に周期的に少量ずつ送達または投与することができる。これらの投与量範囲は好ましい範囲に過ぎず、本発明で限定するつもりではないことに注意されたし。いくつかの実施形態において、本発明の該疾患は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室中隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺性心、リウマチ性心疾患、および心室機能障害を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全症、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱、僧帽弁逸脱、三尖弁逸脱、僧帽弁閉鎖不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大型心筋症、鬱血性心筋症、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は血行動態または遺伝性疾患に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、および家族性肥大型心筋症からなる群より選択される障害に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、先天性心臓欠陥である。先天性機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺動脈中隔欠損、ファロー三徴症、心室中隔欠損症、および家族性肥大型心筋症を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、肥大した心臓と共に提示される障害である。
(E.治療の方法)
本発明は、本発明のモジュレーターでの上記治療を必要とする個体に供することを含む、本発明の障害を予防または治療する方法にとりわけ向けられる。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室中隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺性心、リウマチ性心疾患、および心室機能障害を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全症、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱、僧帽弁逸脱、三尖弁逸脱、僧帽弁閉鎖不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大型心筋症、鬱血性心筋症、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は血行動態または遺伝性疾患に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、および家族性肥大型心筋症からなる群より選択される障害に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、先天性心臓欠陥である。先天性機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺動脈中隔欠損、ファロー三徴症、心室中隔欠損症、および家族性肥大型心筋症を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、肥大した心臓と共に提示される障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的利用可能である。いくつかの実施形態において、モジュレーターは経口的に摂取される薬学的組成物にて個体に供される。好ましくは、個体は哺乳動物、最も好ましくはヒトである。
本発明は、本発明のモジュレーターでの上記治療を必要とする個体に供することを含む、本発明の障害を予防または治療する方法にとりわけ向けられる。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は心臓病である。心臓病は、限定されるものではないが、鬱血性心不全、鬱血性心筋症、心肥大、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心臓破裂、心室中隔破裂、(細菌を含めた)心内膜炎、心臓動脈瘤、肺性心、リウマチ性心疾患、および心室機能障害を含む。また、心臓病は限定されるものではないが、大動脈弁不全症、大動脈弁狭窄、大動脈弁逸脱、僧帽弁逸脱、三尖弁逸脱、僧帽弁閉鎖不全、僧帽弁狭窄、および三尖弁狭窄を含む心臓弁疾患を含む。心臓病は、さらに、限定されるものではないが、肥大型心筋症、鬱血性心筋症、大動脈弁下狭窄、肺弁下狭窄、拘束型心筋症、シャガス心筋症を含む心筋障害を含む。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は血行動態または遺伝性疾患に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、および家族性肥大型心筋症からなる群より選択される障害に由来する肥大型心筋症である。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、先天性心臓欠陥である。先天性機能障害は、限定されるものではないが、大動脈縮窄、大動脈肺動脈中隔欠損、ファロー三徴症、心室中隔欠損症、および家族性肥大型心筋症を含む。いくつかの実施形態において、本発明の該障害は、肥大した心臓と共に提示される障害である。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該モジュレーターは経口的に生物学的利用可能である。いくつかの実施形態において、モジュレーターは経口的に摂取される薬学的組成物にて個体に供される。好ましくは、個体は哺乳動物、最も好ましくはヒトである。
(F.他の用途)
RUP40レセプターの機能を調節する(すなわち、増加させる、減少させる、またはブロックする)剤は、候補化合物をRUP40レセプターと接触させ、RUP40レセプターの機能に対する候補化合物の効果を測定することによって同定することができる。RUP40レセプターの機能を調節する化合物の選択性は、RUP40レセプターに対する効果を、RUP40以外の複数のGタンパク質共役型レセプターに対するその効果と比較することによって見積もることができる。いくつかの実施形態において、内因性ヒトRUP40レセプターの機能を調節する化合物の選択性は、内因性ヒトRUP40レセプターに対する効果を、RUP40以外の複数の内因性ヒトGタンパク質共役型レセプターに対するその効果と比較することによって見積もることができる。RUP40レセプターの機能を調節する化合物の同定に続き、そのような候補化合物は、さらに、限定されるものではないが、インビボモデルを含めた他のアッセイでテストして、それらの活性を確認または定量することができる。RUP40レセプターの機能のモジュレーターは、正常または異常RUP40レセプター機能が関連する病気および生理学的状態の予防または治療で治療上有用である。
RUP40レセプターの機能を調節する(すなわち、増加させる、減少させる、またはブロックする)剤は、候補化合物をRUP40レセプターと接触させ、RUP40レセプターの機能に対する候補化合物の効果を測定することによって同定することができる。RUP40レセプターの機能を調節する化合物の選択性は、RUP40レセプターに対する効果を、RUP40以外の複数のGタンパク質共役型レセプターに対するその効果と比較することによって見積もることができる。いくつかの実施形態において、内因性ヒトRUP40レセプターの機能を調節する化合物の選択性は、内因性ヒトRUP40レセプターに対する効果を、RUP40以外の複数の内因性ヒトGタンパク質共役型レセプターに対するその効果と比較することによって見積もることができる。RUP40レセプターの機能を調節する化合物の同定に続き、そのような候補化合物は、さらに、限定されるものではないが、インビボモデルを含めた他のアッセイでテストして、それらの活性を確認または定量することができる。RUP40レセプターの機能のモジュレーターは、正常または異常RUP40レセプター機能が関連する病気および生理学的状態の予防または治療で治療上有用である。
心血管障害のモジュレーターである(すなわち、それを増加させ、減少させ、またはブロックする)剤は、候補化合物をRUP40レセプターと接触させ、RUP40レセプターの機能に対する候補化合物の効果を測定することによって同定することができる。RUP40レセプターの機能を調節する化合物の選択性は、RUP40レセプターに対するその効果を、RUP40以外の複数のGタンパク質共役型レセプターに対するその効果を比較することによって見積もることができる。いくつかの実施形態において、内因性ヒトRUP40レセプターの機能を調節する化合物の選択性は、内因性ヒトRUP40レセプターに対するその効果を、RUP40以外の複数の内因性ヒトGタンパク質共役型レセプターに対するその効果を比較することによって見積もることができる。RUP40レセプターの機能を調節する化合物の同定に続き、そのような候補化合物は、さらに、限定されるものではないがインビボモデルを含めた他のアッセイでテストして、それらの活性を確認または定量することができる。RUP40レセプターの機能のモジュレーターは、肥大型心筋症および鬱血性心不全、特に、心筋梗塞後リモデリング、心臓弁疾患、持続した心後負荷、心筋炎、および家族性肥大型心筋症に由来する肥大型心筋症を含めた心臓病の予防または治療で治療的に有用である。
他の実施形態においては、心臓病のモジュレーターである(すなわち、それを増加させ、減少させ、またはブロックする)剤は、候補化合物をRUP40レセプターと接触させ、次いで、RUP40レセプター発現に対する候補化合物の効果を測定することによって同定することができる。いくつかの実施形態において、該剤は細胞においてRUP40レセプターの発現を低下させる。いくつかの実施形態において、該剤は心筋細胞においてRUP40レセプターの発現を低下させる。いくつかの実施形態において、該剤はヒト心筋細胞においてRUP40レセプターの発現を低下させる。いくつかの実施形態において、RUP40レセプターは細胞または心筋細胞によって内因的に発現される。いくつかの実施形態において、RUP40レセプター発現のレベルは抗−RUP40レセプター抗体を用いて測定される。限定されるものではなく例として、抗−RUP40レセプター抗体は実施例12に記載されたものであり得る。当業者であれば、細胞におけるRUP40発現のレベルを測定するのに用いることができるヒト、ラットまたはマウスRUP40レセプターに対する抗体を生産する能力が保証される。いくつかの実施形態において、RUP40レセプター発現のレベルは、RUP40レセプターに特異的な放射性標識リガンドを用いて測定される(後記参照)。いくつかの実施形態において、RUP40レセプター発現のレベルはノーザンブロットまたはRT−PCRによって測定される。
また、本発明は、候補化合物が細胞においてRUP40レセプターの発現を低下させる剤であるか否かを同定する方法に関し、該方法は:
(a)RUP40レセプターを含む複数の細胞を候補化合物と接触させ、または接触させず;
(b)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベル、および候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを測定し;次いで、
(c)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを比較する工程を含み;ここで、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルと比較した候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルの低下は、候補化合物が細胞においてRUP40レセプターの発現を低下させる剤であることを示す。
(a)RUP40レセプターを含む複数の細胞を候補化合物と接触させ、または接触させず;
(b)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベル、および候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを測定し;次いで、
(c)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを比較する工程を含み;ここで、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルと比較した候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルの低下は、候補化合物が細胞においてRUP40レセプターの発現を低下させる剤であることを示す。
また、本発明は、候補化合物が心臓病を減少させ、またはブロックする剤であるか否かを同定する方法に関し、該方法は:
(a)RUP40レセプターを含む複数の細胞を候補化合物と接触させ、または接触させず;
(b)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルおよび候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを測定し;次いで、
(c)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルと比較する工程を含み、ここで、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルと比較した、候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルの低下は、候補化合物が心臓病を減少させる、またはブロックさせる剤であることを示す。
(a)RUP40レセプターを含む複数の細胞を候補化合物と接触させ、または接触させず;
(b)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルおよび候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを測定し;次いで、
(c)候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルを、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルと比較する工程を含み、ここで、候補化合物と接触させなかった細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルと比較した、候補化合物と接触させた細胞におけるRUP40レセプター発現のレベルの低下は、候補化合物が心臓病を減少させる、またはブロックさせる剤であることを示す。
本発明は、細胞(例えば、心筋細胞)においてRUP40発現を低下させる該剤、該剤を含む組成物(例えば、薬学的組成物)、および(例えば、肥大性心筋細胞障害または鬱血性心不全のような心臓病を予防または治療するための)該組成物を使用する方法に関し、ここで、該化合物はアンチセンス核酸(例えば、アンチセンスRNA)である。本発明は、細胞(例えば、心筋細胞)においてRUP40発現を低下させる該剤、該剤を含む組成物(例えば、薬学的組成物)、および(例えば、肥大型心筋症または鬱血性心不全のような心臓病の予防または治療のための)該組成物を用いる方法に関し、ここで、該化合物は標準的な手法に従ってRUP40 GPCRをコードする遺伝子のヌクレオチド配列に由来するヌクレオチド配列を含む小さな干渉性RNA(siRNA)または短いヘアピンRNA(shRNA)分子である。当業者に知られているように、siRNA、shRNAおよびアンチセンスRNAは、一般に、標的遺伝子の発現を調節することができる[例えば、Holmlund JT,Ann NY Acad Sci(2003)1002:244−251;およびDevroe et al.,Expert Opin Biol Ther(2004)4:319−327参照;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。
また、本発明は、ヒトを含めた、組織サンプル中のRUP40をつきとめ、それを定量するための、および放射性同位体−標識化合物の結合を阻害することによってRUP40リガンドを同定するために、インビトロおよびインビボ双方において、放射性イメージングのみならず、アッセイにおいても有用であろうRUP40のモジュレーターまたはリガンドとして同定される本発明の化合物の放射性同位体−標識バージョンに関する。そのような放射性同位体−標識化合物を含む新規なRUP40アッセイを開発するのが本発明のさらなる目的である。限定されるものではなく、例として、放射性イメージングを介して可視化された正常な範囲を超える上昇した心室RUP40は、本発明の心血管障害、例えば、肥大型心筋症または鬱血性心不全の危険性がある、またはそれに向けて進行する個体を同定することができると考えられる。
本発明は、RUP40のモジュレーターまたはリガンドとして同定された本発明の化合物の放射性同位体−標識バージョンを含む。
いくつかの実施形態において、化合物の放射性同位体−標識バージョンは、1以上の原子が、典型的には天然で見出される(すなわち、天然で生じる)原子質量または質量数とは異なる原子質量または質量数を有する原子によって置き換えられ、または置換されるという事実を除いて該化合物と同一である。本発明の化合物に取り込むことができる適当な放射性核種は、限定されるものではないが、2H(ジューテリウム)、3H(トリチウム)、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、18F、35S、36Cl、82Br、75Br、76Br、77Br、123I、124I、125Iおよび131Iを含む。本発明の放射性標識化合物に取り込まれる放射性核種は、その放射性標識化合物の具体的適用に依存するであろう。例えば、インビトロRUP40標識および競合アッセイでは、3H、14C、82Br、125I、131I、35Sを取り込む化合物は一般には最も有用であろう。放射性イメージング適用では、11C、18F、125I、123I、124I、131I、75Br、76Brまたは77Brは、一般には、最も有用である。いくつかの実施形態においては、放射性核種は3H、11C、18F、14C、125I、124I、131I、35Sおよび82Brからなる群より選択される。
有機化合物に放射性同位体を取り込むための合成方法を本発明の化合物に適用することができ、それは上記分野においてよく知られている。例えば、活性レベルのトリチウムを標的分子に取り込むこれらの合成方法は、以下の通りである:
A.トリチウムガスでの接触還元−この手法は、通常、高い特異的活性の産物を生じ、ハロゲン化または不飽和前駆体を必要とする
B.ホウ水素化ナトリウム[3H]での還元−この手法はむしろ高価であって、アルデヒド、ケトン、ラクトン、エステルなどのような還元可能な官能基を含む前駆体を必要とする
C.水素化アルミニウムリチウム[3H]での還元−この手法は、ほとんど理論的な特異的活性にて産物を供する。また、それは、アルデヒド、ケトン、ラクトン、エステルなどのような還元可能な官能基を含有する前駆体を必要とする
D.トリチウムガス暴露標識−この手法は、適当な触媒の存在下で、交換可能なプロトンを含む前駆体をトリチウムガスに暴露することを含む
E.ヨウ化メチル[3H]を用いるN−メチル化−この手法は、通常、適当な前駆体を高い特異的活性のヨウ化メチル[3H]で処理することによってO−メチルまたはN−メチル(3H)産物を調製するのに使用される。この方法は、一般に、例えば、約70〜90Ci/ミリモルのようなより高い特異的活性を可能とする。
A.トリチウムガスでの接触還元−この手法は、通常、高い特異的活性の産物を生じ、ハロゲン化または不飽和前駆体を必要とする
B.ホウ水素化ナトリウム[3H]での還元−この手法はむしろ高価であって、アルデヒド、ケトン、ラクトン、エステルなどのような還元可能な官能基を含む前駆体を必要とする
C.水素化アルミニウムリチウム[3H]での還元−この手法は、ほとんど理論的な特異的活性にて産物を供する。また、それは、アルデヒド、ケトン、ラクトン、エステルなどのような還元可能な官能基を含有する前駆体を必要とする
D.トリチウムガス暴露標識−この手法は、適当な触媒の存在下で、交換可能なプロトンを含む前駆体をトリチウムガスに暴露することを含む
E.ヨウ化メチル[3H]を用いるN−メチル化−この手法は、通常、適当な前駆体を高い特異的活性のヨウ化メチル[3H]で処理することによってO−メチルまたはN−メチル(3H)産物を調製するのに使用される。この方法は、一般に、例えば、約70〜90Ci/ミリモルのようなより高い特異的活性を可能とする。
活性レベルの125Iを標的分子に取り込むための合成方法は以下のものを含む:
A.サンドマイヤー(Sandmeyer)および類似の反応−この手法は、アリールまたはヘテロアリールアミンを、テトラフルオロホウ酸塩のようなジアゾニウム塩に、引き続いて、Na125Iを用いて125I標識化合物に変換する。示された手法はJ. Org.Chem.2002,67,943−948においてZhu,D.−G.および共同研究者によって報告された
B.フェノールのオルト125ヨウ素化−この手法は、J.Labeled Compd Radiopharm.1999,42,S264−S266においてCollier,T.L.および共同研究者によって報告されているようにフェノールのオルト位置における125Iの取り込みを可能とする
C.125Iでの臭化アリールおよびヘテロアリール交換−この方法は、一般に、2工程プロセスである。最初の工程は、トリ−アルキルスズハライドまたはヘキサアルキルニスズ[例えば、(CH3)3SnSn(CH3)3]の存在下で、例えば、Pd触媒反応を用いる[すなわち、Pd(Ph3P)4]、またはアリールまたはヘテロアリールリチウムを介する、臭化アリールまたはヘテロアリールの対応するトリ−アルキルスズ中間体への変換である。示された手法は、J.Labeled Compd Radiopharm.2001,44,S280−S282においてBas,M.−D.および共同研究者によって報告された。
A.サンドマイヤー(Sandmeyer)および類似の反応−この手法は、アリールまたはヘテロアリールアミンを、テトラフルオロホウ酸塩のようなジアゾニウム塩に、引き続いて、Na125Iを用いて125I標識化合物に変換する。示された手法はJ. Org.Chem.2002,67,943−948においてZhu,D.−G.および共同研究者によって報告された
B.フェノールのオルト125ヨウ素化−この手法は、J.Labeled Compd Radiopharm.1999,42,S264−S266においてCollier,T.L.および共同研究者によって報告されているようにフェノールのオルト位置における125Iの取り込みを可能とする
C.125Iでの臭化アリールおよびヘテロアリール交換−この方法は、一般に、2工程プロセスである。最初の工程は、トリ−アルキルスズハライドまたはヘキサアルキルニスズ[例えば、(CH3)3SnSn(CH3)3]の存在下で、例えば、Pd触媒反応を用いる[すなわち、Pd(Ph3P)4]、またはアリールまたはヘテロアリールリチウムを介する、臭化アリールまたはヘテロアリールの対応するトリ−アルキルスズ中間体への変換である。示された手法は、J.Labeled Compd Radiopharm.2001,44,S280−S282においてBas,M.−D.および共同研究者によって報告された。
いくつかの実施形態において、化合物の放射性同位体−標識バージョンは、放射性核種を含む1以上の置換基の付加を除いて、該化合物と同一である。いくつかのさらなる実施形態において、該化合物はポリペプチドである。いくつかのさらなる実施形態において、該化合物は抗体またはその抗原結合フラグメントである。いくつかのさらなる実施形態において、該抗体はモノクローナルである。適当な該放射性核種は、限定されるものではないが、2H(ジューテリウム)、3H(トリチウム)、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、18F、35S、36Cl、82Br、75Br、76Br、77Br、123I、124I、125Iおよび131Iを含む。本発明の放射性標識化合物に取り込まれる放射性核種は、その放射性標識化合物の具体的適用に依存するであろう。例えば、インビトロRUP40標識および競合アッセイでは、3H、14C、82Br、125I、131I、35Sを取り込む化合物は一般には最も有用であろう。放射性イメージング適用では、11C、18F、125I、123I、124I、131I、75Br、76Brまたは77Brは、一般には、最も有用である。いくつかの実施形態においては、放射性核種は3H、11C、18F、14C、125I、124I、131I、35Sおよび82Brからなる群より選択される。
放射性核種を含む1以上の置換基を付加する方法は当業者の技量内のものであり、限定されるものではないが、酵素的方法による[Marchalonic JJ,Biochemical Journal(1969)113:299−305;Thorell JI and Johansson BG,Biochimica et Biophysica Acta (1969)251:363−9;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]および/またはクロラミン−T/ヨードゲン/ヨードビーズ方法によって[Hunter WM and Greenwood FC,Nature(1962)194:495−6;Greenwood FC et al.,Biochemical Journal(1963)89:114−23;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]放射性同位体ヨウ素の付加を含む。
開示されたレセプターおよび方法の他の使用は、とりわけ、本特許書類をレビューすることに基づき当業者に明らかとなるであろう。
以下の実施例は、本発明の明瞭化を目的とするものに掲げ、本発明を限定するものではない。具体的な核酸およびアミノ酸配列を本明細書中で開示するが、当業者であれば、同一または実質的に同様な以下に報告する結果を達成しつつ、これらの配列に対して重要でない修飾をなす能力が備わっている。
以下の実施例は、説明目的で掲げ、限定するものではない。当業者であれば、本明細書中の開示に基づいて同等なアッセイおよび方法を設計することができ、その全ては本発明の一部を形成する。
種々の発現ベクターは、細胞において注目するポリペプチドを生産する目的で当業者に入手可能である。1つの適当なベクターはpCMVであり、これはある実施形態で用いられる。このベクターは、特許手続の目的での微生物の寄託の国際的承認に関するブタベスト条約の規定に従い、1998年10月13日にAmerican Type Culture Collection(ATCC)(10801 University Blvd.,Manassas,VA 20110−2209 USA)に寄託された。該DNAはATCCによってテストされ、生きていると判断された。ATCCは以下の受託番号をpCMVに割り当てた:ATCC #203351。ある実施形態においては、利用するベクターはアデノウイルス発現ベクターであるのが好ましい。例示的アデノウイルス発現ベクターはQBiogene(Carlsbad,CA)から商業的に入手可能であり、または米国特許第5,922,576号に記載されたものを含む。
本発明の対象の事項に関連し、当業者によく知られた組換えDNA技術は、例えば、その各々の開示をここで引用してその全体を一体化させる、Maniatis T et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(1989)Cold Spring Harbor Laboratory;米国特許第6,399,373号;および2002年8月29日にWO 02/066505として公開されたPCT出願番号PCT/IB02/01461に見出すことができる。
(実施例1)
(内因性ヒトRUP40の全長クローニング)
内因性ヒトRUP40をコードするポリヌクレオチドはClontech多重組織cDNAパネル、カタログ番号K1425−1、具体的には、ヒト胎児脾臓第一鎖cDNA成分からクローン化した。
(内因性ヒトRUP40の全長クローニング)
内因性ヒトRUP40をコードするポリヌクレオチドはClontech多重組織cDNAパネル、カタログ番号K1425−1、具体的には、ヒト胎児脾臓第一鎖cDNA成分からクローン化した。
該クローンは、以下の遺伝子−特異的プライマー:
5’−ATATGGTACCATGAAATCCCCAAGGAGAACCACTTTGTGCC−3’(配列番号7;アンチセンス)
5’−ATATGCGGCCGCTTAGTTGAGCAACGAAGAAGCACTGGATGAG−3’(配列番号8センス)
を用い、Advantage HF−2ポリメラーゼ(Clontechカタログ番号K1914−y)を用いるポリメラーゼ連鎖反応によって生じさせた。アンチセンスプライマーは下線を施したKpn1制限部位、および太文字/イタリック体開始コドンを含む。センスプライマーは下線を施したNot1制限部位、および太文字/イタリック体の停止コドンを含む。
5’−ATATGGTACCATGAAATCCCCAAGGAGAACCACTTTGTGCC−3’(配列番号7;アンチセンス)
5’−ATATGCGGCCGCTTAGTTGAGCAACGAAGAAGCACTGGATGAG−3’(配列番号8センス)
を用い、Advantage HF−2ポリメラーゼ(Clontechカタログ番号K1914−y)を用いるポリメラーゼ連鎖反応によって生じさせた。アンチセンスプライマーは下線を施したKpn1制限部位、および太文字/イタリック体開始コドンを含む。センスプライマーは下線を施したNot1制限部位、および太文字/イタリック体の停止コドンを含む。
Advantage HF−2ポリメラーゼは、工程2〜3を35回反復し、以下のサイクルによって50μL反応中での増幅のために用いた:工程1:15秒間の94.0C;工程2:15秒間の94.0C;工程3:6.0分間の68.0C;工程4:3.0分間の68.0C。ほぼ4.1kbのPCRフラグメントを1%アガロースゲルから単離し、pcr4−TOPOベクター(Invitrogen)にクローン化し、ABI Big Dye Terminatorキット(P.E.Biosystems)を用いて完全に配列決定した。核酸配列については配列番号1、および推定されるアミノ酸配列については配列番号2参照。
例えば、ラット心臓、肺または脂肪組織から生じたcDNAを鋳型として用い、内因性ラットRUP40をコードするポリヌクレオチドを同様にクローン化するのは当業者の技量内のものである。
(実施例2)
(レセプターの発現)
種々の細胞がタンパク質の発現のための技術で入手可能であるが、哺乳動物細胞またはメラノフォアを利用するのが最も好ましい。この一番の理由は現実性、すなわち、GPCRの発現のための例えば酵母細胞の利用に基づいて予測され、可能であれば、哺乳動物系で進化したレセプター−カップリング、遺伝的メカニズムおよび分泌経路を含まない(事実、酵母の場合には含まない)非−哺乳動物細胞をプロトコルに導入し;かくして、潜在的使用として、非−哺乳動物細胞で得られた結果は哺乳動物細胞またはメラノフォアから得られたのと同程度には好ましくない。哺乳動物細胞のうち、CHO、COS−7、293および293T細胞は特に好ましいが、利用される特異的哺乳動物細胞は当業者の特別な用語に基づいて予測できる。いくつかの実施形態において、心筋細胞が好ましい。実施例8を含めたメラノフォアに関連し、後記参照。
(レセプターの発現)
種々の細胞がタンパク質の発現のための技術で入手可能であるが、哺乳動物細胞またはメラノフォアを利用するのが最も好ましい。この一番の理由は現実性、すなわち、GPCRの発現のための例えば酵母細胞の利用に基づいて予測され、可能であれば、哺乳動物系で進化したレセプター−カップリング、遺伝的メカニズムおよび分泌経路を含まない(事実、酵母の場合には含まない)非−哺乳動物細胞をプロトコルに導入し;かくして、潜在的使用として、非−哺乳動物細胞で得られた結果は哺乳動物細胞またはメラノフォアから得られたのと同程度には好ましくない。哺乳動物細胞のうち、CHO、COS−7、293および293T細胞は特に好ましいが、利用される特異的哺乳動物細胞は当業者の特別な用語に基づいて予測できる。いくつかの実施形態において、心筋細胞が好ましい。実施例8を含めたメラノフォアに関連し、後記参照。
(a.一過的トランスフェクション)
1日において、6×106/10cm皿の293細胞ウェルを平板培養する。2日に、2つの反応試験管を調製する(各試験管に従う割合はプレート当たりである):試験管Aは4μgDNA(例えば、pCMVベクター;レセプターcDNAを持つpCMVベクター)を0.5mLの無血清DMEM(Gibco BRL)中で混合することによって調製した;試験管Bは、0.5mLの無血清DMEM中で24μLのリポフェクタミン(Gibco BRL)を混合することによって調製した。試験管AおよびBを逆さにすることによって(数回)混合し、続いて、室温で30〜45分間インキュベートした。混合物を「トランスフェクション混合物」という。平板培養した293細胞を1×PBSで洗浄し、続いて、5mLの無血清DMEMを添加する。1mLのトランスフェクション混合物を細胞に加え、続いて、37℃/5%CO2にて4時間インキュベートする。トランスフェクション混合物を吸引によって除去し、続いて、10mLのDMEM/10%胎児ウシ血清を加えた。細胞を37℃/5%CO2でインキュベートする。48時間のインキュベーションの後、細胞を収穫し、分析のために利用する。
1日において、6×106/10cm皿の293細胞ウェルを平板培養する。2日に、2つの反応試験管を調製する(各試験管に従う割合はプレート当たりである):試験管Aは4μgDNA(例えば、pCMVベクター;レセプターcDNAを持つpCMVベクター)を0.5mLの無血清DMEM(Gibco BRL)中で混合することによって調製した;試験管Bは、0.5mLの無血清DMEM中で24μLのリポフェクタミン(Gibco BRL)を混合することによって調製した。試験管AおよびBを逆さにすることによって(数回)混合し、続いて、室温で30〜45分間インキュベートした。混合物を「トランスフェクション混合物」という。平板培養した293細胞を1×PBSで洗浄し、続いて、5mLの無血清DMEMを添加する。1mLのトランスフェクション混合物を細胞に加え、続いて、37℃/5%CO2にて4時間インキュベートする。トランスフェクション混合物を吸引によって除去し、続いて、10mLのDMEM/10%胎児ウシ血清を加えた。細胞を37℃/5%CO2でインキュベートする。48時間のインキュベーションの後、細胞を収穫し、分析のために利用する。
(b.安定な細胞株)
ほぼ12×106の293細胞を15cmの組織培養プレート上で平板培養する。10パーセントの胎児ウシ血清および1パーセントのピルビン酸ナトリウム、L−グルタミン、および抗生物質を含有するDME高グルコース培地中で増殖させる。293細胞の24時間の平板培養に続き(または〜80%密集まで)、12μgのDNA(例えば、レセプターcDNAを含むpCMVベクター)を用いて細胞をトランスフェクトする。12μgのDNAを60μLのリポフェクタミンおよび2mLのDME高グルコース培地(血清無し)と組合わせる。培地を平板から吸引し、細胞を血清を含まない培地で1回洗浄する。DNA、リポフェクタミンおよび培地混合物を10mLの血清を含まない培地と共にプレートに添加する。37℃における4〜5時間のインキュベーションに続き、培地を吸引し、血清を含有する25mLの培地を加える。トランスフェクションから24時間後に、培地を再度吸引し、血清を含む新鮮な培地を加える。トランスフェクションから48時間後、培地を吸引し、最終濃度500μg/mLのゲネチシン(G418薬物)を含有する血清を含む培地を加える。トランスフェクトされた細胞は、今や、G418抵抗性遺伝子を含有する積極的にトランスフェクトした細胞についての選択を受ける。培地は選択が起こるので4〜5日ごとに取り替える。選択の間、細胞を増殖させて安定なプールが得られ、安定なクローン選択のために分ける。
ほぼ12×106の293細胞を15cmの組織培養プレート上で平板培養する。10パーセントの胎児ウシ血清および1パーセントのピルビン酸ナトリウム、L−グルタミン、および抗生物質を含有するDME高グルコース培地中で増殖させる。293細胞の24時間の平板培養に続き(または〜80%密集まで)、12μgのDNA(例えば、レセプターcDNAを含むpCMVベクター)を用いて細胞をトランスフェクトする。12μgのDNAを60μLのリポフェクタミンおよび2mLのDME高グルコース培地(血清無し)と組合わせる。培地を平板から吸引し、細胞を血清を含まない培地で1回洗浄する。DNA、リポフェクタミンおよび培地混合物を10mLの血清を含まない培地と共にプレートに添加する。37℃における4〜5時間のインキュベーションに続き、培地を吸引し、血清を含有する25mLの培地を加える。トランスフェクションから24時間後に、培地を再度吸引し、血清を含む新鮮な培地を加える。トランスフェクションから48時間後、培地を吸引し、最終濃度500μg/mLのゲネチシン(G418薬物)を含有する血清を含む培地を加える。トランスフェクトされた細胞は、今や、G418抵抗性遺伝子を含有する積極的にトランスフェクトした細胞についての選択を受ける。培地は選択が起こるので4〜5日ごとに取り替える。選択の間、細胞を増殖させて安定なプールが得られ、安定なクローン選択のために分ける。
(実施例3)
(GPCR活性化の評価のためのアッセイ)
種々のアプローチが、哺乳動物GPCRの活性化の評価で利用できる。以下に例示する;当業者であれば、当業者の用語に優先的に有益である技術を決定する能力が備わる。
(GPCR活性化の評価のためのアッセイ)
種々のアプローチが、哺乳動物GPCRの活性化の評価で利用できる。以下に例示する;当業者であれば、当業者の用語に優先的に有益である技術を決定する能力が備わる。
(1.膜結合アッセイ:[35S]GTPγSアッセイ)
Gタンパク質共役型レセプターが、リガンド結合または構成的活性化の結果のいずれかとして、その活性状態にある場合、レセプターはGタンパク質にカップリングし、GDPの放出、および引き続いてのGTPのGタンパク質への結合を刺激する。Gタンパク質−レセプター複合体のアルファサブユニットはGTPaseとして作用し、GTPをGDPへとゆっくりと加水分解し、その時点で、レセプターは正常には脱活性化される。活性化されたレセプターはGTPの代わりにGDPで交換を続ける。非−加水分解性GTPアナログ[35S]GTPγSを利用して、活性化されたレセプターを発現する膜への[35S]GTPγSの増強された結合を示すことができる。活性化を測定するために[35S]GTPγS結合を用いる利点は(a)それが全てのGタンパク質共役型レセプターに一般的に適用でき;(b)それは膜表面において基部側にあり、細胞内カスケードに影響する分子をあまり拾わないようにすることである。
Gタンパク質共役型レセプターが、リガンド結合または構成的活性化の結果のいずれかとして、その活性状態にある場合、レセプターはGタンパク質にカップリングし、GDPの放出、および引き続いてのGTPのGタンパク質への結合を刺激する。Gタンパク質−レセプター複合体のアルファサブユニットはGTPaseとして作用し、GTPをGDPへとゆっくりと加水分解し、その時点で、レセプターは正常には脱活性化される。活性化されたレセプターはGTPの代わりにGDPで交換を続ける。非−加水分解性GTPアナログ[35S]GTPγSを利用して、活性化されたレセプターを発現する膜への[35S]GTPγSの増強された結合を示すことができる。活性化を測定するために[35S]GTPγS結合を用いる利点は(a)それが全てのGタンパク質共役型レセプターに一般的に適用でき;(b)それは膜表面において基部側にあり、細胞内カスケードに影響する分子をあまり拾わないようにすることである。
該アッセイは、関連レセプターを発現する膜への[35S]GTPγS結合を刺激するGタンパク質共役型レセプターの能力を利用する。該アッセイは、従って、直接的同定方法で用いて、内因性GPCRおよび非−内因性の構成的に活性化されたGPCRに対する候補化合物をスクリーニングすることができる。該アッセイは一般的であって、全てのGタンパク質共役型レセプターにおける薬物発見に適用できる。
該[35S]GTPγSアッセイは20mM HEPESおよび1および約20mMの間のMgCl2(20mMが好ましいが、この量は結果の最適化のために調整することができる)pH7.4、約0.3および約1.2nMの間の[35S]GTPγS(1.2が好ましいが、この量は結果の最適化のための調整することができる)を含む結合緩衝液、および12.5〜75μgの膜タンパク質(例えば、Gs融合タンパク質を発現する293細胞;この量は最適化のために調整することができる)および10μM GDP(この量は最適化のために変化させることができる)中で1時間インキュベートする。次いで、小麦胚芽アグルチミンビーズ(25μL;Amersham)を加え、混合物を室温にてさらに30分間インキュベートする。次いで、試験管を室温にて1500×gにおいて5分間遠心し、次いで、シンチレーションカウンターで計数する。
(2.アデニリルシクラーゼ)
細胞ベースのアッセイのために設計されたFlash PlateTMアデニリルシクラーゼキット(New England Nuclear;カタログ番号SMP004A)は、粗製原形質膜で用いるのに修飾することができる。該Flash Plateウェルは、cAMPを認識する特異的抗体も含むシンチラントコーティングを含むことができる。ウェルで生じたcAMPは、放射性cAMPトレーサーのcAMP抗体への結合につき直接的競合によって定量することができる。以下のものは、レセプターを発現する全細胞におけるcAMPレベルの変化の測定のための簡単なプロトコルとして働く。
細胞ベースのアッセイのために設計されたFlash PlateTMアデニリルシクラーゼキット(New England Nuclear;カタログ番号SMP004A)は、粗製原形質膜で用いるのに修飾することができる。該Flash Plateウェルは、cAMPを認識する特異的抗体も含むシンチラントコーティングを含むことができる。ウェルで生じたcAMPは、放射性cAMPトレーサーのcAMP抗体への結合につき直接的競合によって定量することができる。以下のものは、レセプターを発現する全細胞におけるcAMPレベルの変化の測定のための簡単なプロトコルとして働く。
トランスフェクトされた細胞を一過的トランスフェクションからほぼ24時間後に収穫する。培地を注意深く吸引により除き、捨てる。10mLのPBSを細胞の各皿に温和に加え、続いて、注意深く吸引する。1mLのSigma細胞解離緩衝液および3mLのPBSを各プレートに加える。細胞をピペットによりプレートから取り出し、細胞懸濁液を50mLの円錐遠心チューブに集める。次いで、細胞を室温にて1,100rpmにて5分間遠心する。細胞ペレットを適当な容量のPBSに注意深く再度懸濁させる(約3mL/プレート)。次いで、ヘモサイトメーターを用いて細胞をカウントし、さらなるPBSを加えて、適当な数の細胞を得る(最終容量は約50μL/ウェルである)。
cAMP標準および{11mLの検出緩衝液に対して1μCiのトレーサー[125I]cAMP(50μL)を含む}検出緩衝液を調製し、製造業者の指示に従って維持する。スクリーニングのためにアッセイ緩衝液を新しく調製し、それは、50μLの刺激緩衝液、3μLのテスト化合物(12μMの最終アッセイ濃度)および50μLの細胞を含むものであった。アッセイ緩衝液を使用するまで氷上で保存する。アッセイは、50μLのcAMP標準を適当なウェルに添加し、50μLのPBSAをウェルH11およびH12に添加することによって開始する。50μLの刺激緩衝液を全てのウェルに加える。DMSO(または選択された候補化合物)を、3μLの化合物溶液を分注することができ、ピンツールを用いて適当なウェルに加え、最終アッセイ濃度は12μMのテスト化合物および100μLの合計アッセイ容量である。次いで、細胞をウェルに加え、室温にて60分間インキュベートする。次いで、トレーサーcAMPを含有する100μLの検出ミックスをウェルに加える。次いで、プレートをさらに2時間インキュベートし、続いて、Wallac MicroBetaシンチレーションカウンターでカウントする。次いで、各アッセイプレート内に含まれる標準cAMP曲線からcAMP/ウェルの値を外挿する。
(3.Gi共役型標的GPCRのための細胞−ベースのcAMP)
TSHRは、活性化に際してcAMPの蓄積を引き起こすGs共役型GPCRである。TSHRは、アミノ酸残基623を突然変異することによって(すなわち、アラニン残基をイソロイシン残基に変化させることによって)構成的に活性化される。Gi共役型レセプターはアデニリルシクラーゼを阻害すると予測され、従って、cAMP生産のレベルを減少させ、これは、cAMPレベル挑戦の評価をなすことができる。Gi共役型レセプターの構成的活性化の指標としてのcAMPの生産の減少を測定するための効果的な技術は、最も好ましくは、Gi連結標的GPCRで、「シグナルエンハンサー」としての非−内因性の構成的に活性化されたTSHR(TSHR−A623I)(または内因性の構成的に活性なGs共役型レセプター)を共トランスフェクトして、cAMPのベースラインレベルを確立することによって達成することができる。Gi共役型レセプターの非−内因性バージョンを創製するに際して、次いで、標的GPCRのこの非−内因性バージョンをシグナルエンハンサーで共トランスフェクトし、スクリーニングで用いることができるのはこの物質である。我々は、そのようなアプローチを利用して、cAMPアッセイを用いる場合にシグナルを効果的に発生させ;このアプローチは、好ましくは、Gi共役型レセプターに対する候補化合物の直接的同定で用いられる。Gi共役型GPCRについては、シグナルエンハンサーのこのアプローチを内因性または構成的に活性化されたGi共役型GPCRいずれかと組み合わせて用いる場合に、標的GPCRの逆アゴニストはcAMPシグナルを増加させ、アゴニストはcAMPシグナルを減少させることに注意されたし。
TSHRは、活性化に際してcAMPの蓄積を引き起こすGs共役型GPCRである。TSHRは、アミノ酸残基623を突然変異することによって(すなわち、アラニン残基をイソロイシン残基に変化させることによって)構成的に活性化される。Gi共役型レセプターはアデニリルシクラーゼを阻害すると予測され、従って、cAMP生産のレベルを減少させ、これは、cAMPレベル挑戦の評価をなすことができる。Gi共役型レセプターの構成的活性化の指標としてのcAMPの生産の減少を測定するための効果的な技術は、最も好ましくは、Gi連結標的GPCRで、「シグナルエンハンサー」としての非−内因性の構成的に活性化されたTSHR(TSHR−A623I)(または内因性の構成的に活性なGs共役型レセプター)を共トランスフェクトして、cAMPのベースラインレベルを確立することによって達成することができる。Gi共役型レセプターの非−内因性バージョンを創製するに際して、次いで、標的GPCRのこの非−内因性バージョンをシグナルエンハンサーで共トランスフェクトし、スクリーニングで用いることができるのはこの物質である。我々は、そのようなアプローチを利用して、cAMPアッセイを用いる場合にシグナルを効果的に発生させ;このアプローチは、好ましくは、Gi共役型レセプターに対する候補化合物の直接的同定で用いられる。Gi共役型GPCRについては、シグナルエンハンサーのこのアプローチを内因性または構成的に活性化されたGi共役型GPCRいずれかと組み合わせて用いる場合に、標的GPCRの逆アゴニストはcAMPシグナルを増加させ、アゴニストはcAMPシグナルを減少させることに注意されたし。
1日に、2×104の293細胞/ウェルが平板培養される。2日に、2つの反応試験管を調製する(各試験管についての割合はプレート当たりである):試験管Aは、1.2mLの無血清DMEM(Irvine Scientific,Irvine,CA)中の合計4μgのDNA(例えば、pCMVベクター;突然変異したTHSRを含むpCMVベクター(TSHR−A623I);TSHR−A623IおよびGPCRなど)につき、トランスフェクトされた各レセプターの2μgDNAを哺乳動物細胞に混合することによって調製され;試験管Bは、1.2mLの無血清DMEM中に120μLのリポフェクタミン(Gibco BRL)を混合することによって調製される。次いで、試験管AおよびBを逆さにすることによって(数回)混合し、続いて、室温にて30〜45分間インキュベートする。該混合物は「トランスフェクション混合物」という。平板培養した293細胞を1×PBSで洗浄し、続いて、10mLの無血清DMEMを加える。次いで、2.4mLのトランスフェクション混合物を細胞に加え、続いて、37℃/5%CO2で4時間インキュベートする。次いで、吸引によってトランスフェクション混合物を取り出し、続いて、25mLのDMEM/10%胎児ウシ血清を加える。次いで、細胞を37℃/5%CO2でインキュベートする。インキュベーションの24時間後、次いで、細胞を収穫し、分析で利用する。
Flash PlateTMアデニリルシクラーゼキット(New England Nuclear;カタログ番号SMP004A)は細胞−ベースのアッセイのために設計されたが、当業者の要望に応じて、粗製原形質膜で用いるのに修飾することができる。該Flash Plateウェルは、cAMPを認識する特異的抗体をやはり含むシンチラントコーティングを含む。ウェル中で生じたcAMPは、放射性cAMPトレーサーのcAMP抗体への結合につき直接的競合によって定量することができる。以下のものは、レセプターを発現する全細胞中のcAMPレベルの変化の測定のための簡単なプロトコルとして働く。
一過性トランスフェクションからほぼ24時間後に、トランスフェクトされた細胞を収穫する。培地を注意深く吸引して取り出し、捨てる。10mLのPBSを温和に細胞の各皿に加え、続いて、注意深く吸引する。1mLのSigma細胞解離緩衝液および3mLのPBSを各プレートに加える。細胞をピペットによりプレートから取り出し、細胞懸濁液を50mLの円錐遠心チューブに集める。次いで、細胞を1,100rpmにて室温で5分間遠心する。細胞ペレットを注意深く適当な容量のPBSに再懸濁させる(約3mL/プレート)。次いで、ヘモサイトメーターを用いて細胞をカウントし、さらなるPBSを加えて、適当な数の細胞を得る(最終容量は約50μL/ウェルである)。
cAMP標準および{11mLの検出緩衝液に対して1μCiのトレーサー[125I]cAMP(50μL)を含む}検出緩衝液を調製し、製造業者の指示に従って維持する。アッセイ緩衝液はスクリーニングのために新たに調製すべきであり、それは50μLの刺激緩衝液、3μLのテスト化合物(12μMの最終アッセイ濃度)および50μLの細胞を含む。アッセイ緩衝液は用いるまで氷上で貯蔵することができる。該アッセイは、50μLのcAMP標準を適当なウェルに加え、50μLのPBSAをウェルH−11およびH12に加えることによって開始させることができる。50μLの刺激緩衝液を全てのウェルに加える。3μLの化合物溶液を分注することができるピンツールを用いて、選択された化合物(例えば、TSH)を適当なウェルに加え、最終アッセイ濃度は12μMのテスト化合物および100μLの合計アッセイ容量である。次いで、細胞をウェルに加え、室温にて60分間インキュベートする。次いで、トレーサーcAMPを含有する100μLの検出ミックスをウェルに加える。次いで、プレートをさらに2時間インキュベートし、続いて、Wallac MicroBetaシンチレーションカウンターでカウントする。次いで、各アッセイプレート内に含まれる標準cAMP曲線からcAMP/ウェルの値を外挿する。
(4.レポーター−ベースのアッセイ)
(a.CRE−LUCレポーターアッセイ(Gs−関連レセプター))
293および293T細胞をウェル当たり2×104細胞の密度にて90ウェルプレート上で平板培養し、製造業者の指示に従って翌日にリポフェクタミン試薬(BRL)を用いてトランスフェクトする。DNA/脂質混合物を以下のようにして各6−ウェルトランスフェクションのために調製し:100μLのDMEM中の260ngのプラスミドDNAを100μLのDMEM中の2μLの脂質と温和に混合する{260ngのプラスミドDNAは200ngの8×CRE−Lucレポータープラスミド、内因性レセプターまたは非−内因性レセプターを含む50ngのpCMV、またはpCMV単独、および10ngのGPRS発現プラスミド[pcDNA3中のGPRS(Invitrogen)]よりなる}。8×CRE−Lucレポータープラスミドは以下のようにして調製した:pβgal−Basic Vector(Clontech)中のBglV−HindIII部位においてラットソマトスタチンプロモーター(−71/+51)をクローン化することによって、ベクターSRIF−β−galを得た。8コピーのcAMP応答エレメントは、アデノウイルス鋳型AdpCF126CCRE8[Suzuki et al.,Hum Gene Ther (1996)7:1883−1893参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]からPCRによって得、Kpn−BglV部位にてSRIF−β−galベクターにクローン化し、その結果、8×CRE−β−galレポーターベクターが得られた。8×CRE−Lucレポータープラスミドは、8×CRE−β−galレポーターベクター中のベータ−ガラクトシダーゼ遺伝子をHindIII−BamHI部位にて、pGL3−Basic Vector(Promega)から得られたルシフェラーゼ遺伝子で置き換えることによって生じた。室温での30分間のインキュベーションに続き、DNA/脂質混合物を400μLのDMEMで希釈し、100μLの希釈された混合物を各ウェルに加える。10%FCSを含む100μLのDMEMを細胞培養インキュベーター中での4時間のインキュベーションの後に各ウェルに加える。翌日、トランスフェクトされた細胞を200μL/ウェルの10%FCSを含むDMEMで変化させる。8時間後、ウェルは、PBSでの1回の洗浄の後に、フェノールレッド無くして100μL/ウェルのDMEMに変化させた。製造業者の指示に従って、LucLiteTMレポーター遺伝子アッセイキット(Packard)を用いてルシフェラーゼ活性を翌日に測定し、1450 MicroBetaTMシンチレーションおよびルミネッセンスカウンター(Wallac)で読む。
(a.CRE−LUCレポーターアッセイ(Gs−関連レセプター))
293および293T細胞をウェル当たり2×104細胞の密度にて90ウェルプレート上で平板培養し、製造業者の指示に従って翌日にリポフェクタミン試薬(BRL)を用いてトランスフェクトする。DNA/脂質混合物を以下のようにして各6−ウェルトランスフェクションのために調製し:100μLのDMEM中の260ngのプラスミドDNAを100μLのDMEM中の2μLの脂質と温和に混合する{260ngのプラスミドDNAは200ngの8×CRE−Lucレポータープラスミド、内因性レセプターまたは非−内因性レセプターを含む50ngのpCMV、またはpCMV単独、および10ngのGPRS発現プラスミド[pcDNA3中のGPRS(Invitrogen)]よりなる}。8×CRE−Lucレポータープラスミドは以下のようにして調製した:pβgal−Basic Vector(Clontech)中のBglV−HindIII部位においてラットソマトスタチンプロモーター(−71/+51)をクローン化することによって、ベクターSRIF−β−galを得た。8コピーのcAMP応答エレメントは、アデノウイルス鋳型AdpCF126CCRE8[Suzuki et al.,Hum Gene Ther (1996)7:1883−1893参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]からPCRによって得、Kpn−BglV部位にてSRIF−β−galベクターにクローン化し、その結果、8×CRE−β−galレポーターベクターが得られた。8×CRE−Lucレポータープラスミドは、8×CRE−β−galレポーターベクター中のベータ−ガラクトシダーゼ遺伝子をHindIII−BamHI部位にて、pGL3−Basic Vector(Promega)から得られたルシフェラーゼ遺伝子で置き換えることによって生じた。室温での30分間のインキュベーションに続き、DNA/脂質混合物を400μLのDMEMで希釈し、100μLの希釈された混合物を各ウェルに加える。10%FCSを含む100μLのDMEMを細胞培養インキュベーター中での4時間のインキュベーションの後に各ウェルに加える。翌日、トランスフェクトされた細胞を200μL/ウェルの10%FCSを含むDMEMで変化させる。8時間後、ウェルは、PBSでの1回の洗浄の後に、フェノールレッド無くして100μL/ウェルのDMEMに変化させた。製造業者の指示に従って、LucLiteTMレポーター遺伝子アッセイキット(Packard)を用いてルシフェラーゼ活性を翌日に測定し、1450 MicroBetaTMシンチレーションおよびルミネッセンスカウンター(Wallac)で読む。
(b.AP1レポーターアッセイ(Gq−関連レセプター))
Gq刺激を検出するための方法は、そのプロモーターにAP1エレメントを含有する遺伝子の活性化を引き起こすGq−依存性ホスホリパーゼCの既知の特性に依存する。PathdetectTM AP−1シス−レポーティングシステム(Strategene,カタログ番号219073)を、リン酸カルシウム沈殿の成分が410ngのpAP1−lUC、80ngのpCMV−レセプター発現プラスミド、および20ng CMV−SEAPである以外は、CREDレポーターアッセイに関して前記したプロトコルに従って利用することができる。
Gq刺激を検出するための方法は、そのプロモーターにAP1エレメントを含有する遺伝子の活性化を引き起こすGq−依存性ホスホリパーゼCの既知の特性に依存する。PathdetectTM AP−1シス−レポーティングシステム(Strategene,カタログ番号219073)を、リン酸カルシウム沈殿の成分が410ngのpAP1−lUC、80ngのpCMV−レセプター発現プラスミド、および20ng CMV−SEAPである以外は、CREDレポーターアッセイに関して前記したプロトコルに従って利用することができる。
(c.SRF−Lucレポーターアッセイ(Gq−関連レセプター))
Gq刺激を検出するための1つの方法は、そのプロモーター中に血清応答因子を含有する遺伝子の活性化を引き起こすGq−依存性ホスホリパーゼCの既知の特性に依存する。PathdetectTM SRF−Luc−レポーティングシステム(Strategene)を利用して、例えば、COS7細胞におけるGq共役型活性につきアッセイすることができる。細胞は、製造業者の指示に従い、Mammalian TransfectionTMキット(Strategene,カタログ番号200285)を用い、該システムのプラスミド成分、および内因性または非−内因性GPCRをコードする示された発現プラスミドでトランスフェクトする。簡単に述べれば、410ngのSRF−Luc、80ngのpCMV−レセプター発現プラスミドおよび20ngのCMV−SEAP(分泌されたアルカリ性ホスファターゼ発現プラスミド;アルカリ性ホスファターゼ活性はサンプル間のトランスフェクション効率の変動につき制御するためにトランスフェクトされた細胞の培地中で測定する)を、製造業者の指令に従って、リン酸カルシウム沈殿中で合わせる。沈殿の半分を96−ウェルプレート中の3ウェルに等しく分配し、無血清培地中で細胞を24時間保持する。示されれば、最後の5時間、細胞をテスト化合物または適当なコントロールと共にインキュベートする。次いで、細胞を溶解させ、製造業者の指示に従い、LucliteTMキット(Packard,カタログ番号6016911)および「Trilux 1450 Microbeta」液体シンチレーションおよびルミネッセンスカウンター(Wallac)を用いてルシフェラーゼ活性につきアッセイする。データはGraphPad PrismTM 2.0a(GraphPad Software Inc.)を用いて分析することができる。
Gq刺激を検出するための1つの方法は、そのプロモーター中に血清応答因子を含有する遺伝子の活性化を引き起こすGq−依存性ホスホリパーゼCの既知の特性に依存する。PathdetectTM SRF−Luc−レポーティングシステム(Strategene)を利用して、例えば、COS7細胞におけるGq共役型活性につきアッセイすることができる。細胞は、製造業者の指示に従い、Mammalian TransfectionTMキット(Strategene,カタログ番号200285)を用い、該システムのプラスミド成分、および内因性または非−内因性GPCRをコードする示された発現プラスミドでトランスフェクトする。簡単に述べれば、410ngのSRF−Luc、80ngのpCMV−レセプター発現プラスミドおよび20ngのCMV−SEAP(分泌されたアルカリ性ホスファターゼ発現プラスミド;アルカリ性ホスファターゼ活性はサンプル間のトランスフェクション効率の変動につき制御するためにトランスフェクトされた細胞の培地中で測定する)を、製造業者の指令に従って、リン酸カルシウム沈殿中で合わせる。沈殿の半分を96−ウェルプレート中の3ウェルに等しく分配し、無血清培地中で細胞を24時間保持する。示されれば、最後の5時間、細胞をテスト化合物または適当なコントロールと共にインキュベートする。次いで、細胞を溶解させ、製造業者の指示に従い、LucliteTMキット(Packard,カタログ番号6016911)および「Trilux 1450 Microbeta」液体シンチレーションおよびルミネッセンスカウンター(Wallac)を用いてルシフェラーゼ活性につきアッセイする。データはGraphPad PrismTM 2.0a(GraphPad Software Inc.)を用いて分析することができる。
(5.細胞内IP3蓄積アッセイ(Gq−関連レセプター))
1日に、レポーター(内因性および/または非−内因性)を含む細胞を通常1×105細胞/ウェルにて(この数は最適化することができる)24ウェルプレート上で平板培養することができる。2日に、まず50μLの無血清DMEM/ウェル中の0.25μgDNAおよび50μLの無血清DMEM/ウェル中の2μLのリポフェクタミンを混合することによって細胞をトランスフェクトすることができる。溶液を温和に混合し、室温にて15〜30分間インキュベートする。細胞を0.5mLのPBSで洗浄し、400μLの無血清培地をトランスフェクション培地と混合し、細胞に加える。次いで、細胞を37℃/5%CO2にて3〜4時間インキュベートし、次いで、トランスフェクション培地を除去し、1mL/ウェルの正規の増殖培地で置き換える。3日に、細胞を3H−myo−イノシトールで標識する。簡単に述べれば、培地を除去し、細胞を0.5mLのPBSで洗浄する。次いで、0.5mLの無イノシトール/無血清培地(Gibco BRL)を加え/0.25μCiの3H−myo−イノシトール/ウェルを含むウェルおよび細胞を37℃/5%CO2にて16〜18時間インキュベートする。4日に、細胞を0.5mLのPBSで洗浄し、無イノシトール/無血清培地、10μMパルギリン、10mM塩化リチウム、または0.4mLのアッセイ培地および50μLの10×ケタンセリン(ket)を最終濃度10μMまで含有する0.45mLのアッセイ培地を加える。次いで、細胞を37℃にて30分間インキュベートする。次いで、細胞を0.5mLのPBSで洗浄し、200μLの新鮮な/氷冷停止溶液(1M KOH;18mMホウ酸ナトリウム;3.8mM EDTA)を加える/ウェル。溶液を5〜10分間、または細胞が溶解するまで氷上に維持し、次いで、200μLの新鮮な/氷冷中和溶液(7.5%HCL)によって中和する。次いで、溶解物を1.5mLのエッペンドルフチューブに移し、1mLのクロロホルム/メタノール(1:2)を加える/チューブ。溶液を15秒間渦巻かせ、上相をBiorad AG1−X8TMアニオン交換樹脂(100〜200メッシュ)に適用する。まず、樹脂を1:1.25W/Vにて水で洗浄し、0.9mLの上相をカラムに負荷する。カラムを10mLの5mM myo−イノシトールおよび10mLの5mMホウ酸ナトリウム/60mMギ酸ナトリウムで洗浄する。イノシトール三リン酸を、2mLの0.1Mギ酸/1Mギ酸アンモニウムを含む10mLのシンチレーションカクテルを含有するシンチレーションバイアルに溶出させる。10mLの0.1Mギ酸/3Mギ酸アンモニウムで洗浄することによってカラムを再生させ、dd H2Oで2回濯ぎ、4℃にて水中に保存する。
1日に、レポーター(内因性および/または非−内因性)を含む細胞を通常1×105細胞/ウェルにて(この数は最適化することができる)24ウェルプレート上で平板培養することができる。2日に、まず50μLの無血清DMEM/ウェル中の0.25μgDNAおよび50μLの無血清DMEM/ウェル中の2μLのリポフェクタミンを混合することによって細胞をトランスフェクトすることができる。溶液を温和に混合し、室温にて15〜30分間インキュベートする。細胞を0.5mLのPBSで洗浄し、400μLの無血清培地をトランスフェクション培地と混合し、細胞に加える。次いで、細胞を37℃/5%CO2にて3〜4時間インキュベートし、次いで、トランスフェクション培地を除去し、1mL/ウェルの正規の増殖培地で置き換える。3日に、細胞を3H−myo−イノシトールで標識する。簡単に述べれば、培地を除去し、細胞を0.5mLのPBSで洗浄する。次いで、0.5mLの無イノシトール/無血清培地(Gibco BRL)を加え/0.25μCiの3H−myo−イノシトール/ウェルを含むウェルおよび細胞を37℃/5%CO2にて16〜18時間インキュベートする。4日に、細胞を0.5mLのPBSで洗浄し、無イノシトール/無血清培地、10μMパルギリン、10mM塩化リチウム、または0.4mLのアッセイ培地および50μLの10×ケタンセリン(ket)を最終濃度10μMまで含有する0.45mLのアッセイ培地を加える。次いで、細胞を37℃にて30分間インキュベートする。次いで、細胞を0.5mLのPBSで洗浄し、200μLの新鮮な/氷冷停止溶液(1M KOH;18mMホウ酸ナトリウム;3.8mM EDTA)を加える/ウェル。溶液を5〜10分間、または細胞が溶解するまで氷上に維持し、次いで、200μLの新鮮な/氷冷中和溶液(7.5%HCL)によって中和する。次いで、溶解物を1.5mLのエッペンドルフチューブに移し、1mLのクロロホルム/メタノール(1:2)を加える/チューブ。溶液を15秒間渦巻かせ、上相をBiorad AG1−X8TMアニオン交換樹脂(100〜200メッシュ)に適用する。まず、樹脂を1:1.25W/Vにて水で洗浄し、0.9mLの上相をカラムに負荷する。カラムを10mLの5mM myo−イノシトールおよび10mLの5mMホウ酸ナトリウム/60mMギ酸ナトリウムで洗浄する。イノシトール三リン酸を、2mLの0.1Mギ酸/1Mギ酸アンモニウムを含む10mLのシンチレーションカクテルを含有するシンチレーションバイアルに溶出させる。10mLの0.1Mギ酸/3Mギ酸アンモニウムで洗浄することによってカラムを再生させ、dd H2Oで2回濯ぎ、4℃にて水中に保存する。
(実施例4)
(融合タンパク質の調製)
(a.GPCR:Gs融合構築体)
構成的に活性化されたGPCR−Gタンパク質融合構築体の設計は以下のように達成された:ラットGタンパク質Gsα(長形態;Itoh,H.et al.,83 PNAS 3776(1986))の5’および3’両末端は、その上にHindIII(5’−AAGCTT−3’)を含むように作製した。(フランキングHindIII配列を含めた)正しい配列の確認に続き、そのベクターのHindIII制限部位を用いるサブクローニングによって、全配列をpcDNA3.1(−)(Invitrogen,カタログ番号V795−20)にシャトルした。Gsα配列についての正しい向きはpcDNA3.1(−)へのサブクローニングの後に決定した。次いで、HindIII配列にラットGsα遺伝子を含む修飾されたpcDNA3.1(−)を確認した;このベクターは、今や、「ユニバーサル」Gsαタンパク質ベクターとして入手できた。pcDNA3.1(−)ベクターは、HindIII部位の上流に種々のよく知られた制限部位を含み、かくして、Gsタンパク質の上流に、内因性の構成的に活性なGPCRのコーディング配列を挿入する能力を便宜には供する。この同一アプローチを利用して、他の「ユニバーサル」Gタンパク質ベクターを作り出すことができ、勿論、当業者に知られた他の商業的に入手可能なまたは適当なベクターを利用することができ−重要な基準は、GPCRについての配列がGタンパク質のそれより上流であって、それとイン−フレームであることである。
(融合タンパク質の調製)
(a.GPCR:Gs融合構築体)
構成的に活性化されたGPCR−Gタンパク質融合構築体の設計は以下のように達成された:ラットGタンパク質Gsα(長形態;Itoh,H.et al.,83 PNAS 3776(1986))の5’および3’両末端は、その上にHindIII(5’−AAGCTT−3’)を含むように作製した。(フランキングHindIII配列を含めた)正しい配列の確認に続き、そのベクターのHindIII制限部位を用いるサブクローニングによって、全配列をpcDNA3.1(−)(Invitrogen,カタログ番号V795−20)にシャトルした。Gsα配列についての正しい向きはpcDNA3.1(−)へのサブクローニングの後に決定した。次いで、HindIII配列にラットGsα遺伝子を含む修飾されたpcDNA3.1(−)を確認した;このベクターは、今や、「ユニバーサル」Gsαタンパク質ベクターとして入手できた。pcDNA3.1(−)ベクターは、HindIII部位の上流に種々のよく知られた制限部位を含み、かくして、Gsタンパク質の上流に、内因性の構成的に活性なGPCRのコーディング配列を挿入する能力を便宜には供する。この同一アプローチを利用して、他の「ユニバーサル」Gタンパク質ベクターを作り出すことができ、勿論、当業者に知られた他の商業的に入手可能なまたは適当なベクターを利用することができ−重要な基準は、GPCRについての配列がGタンパク質のそれより上流であって、それとイン−フレームであることである。
(b.Gq(6アミノ酸欠失)/Gi(融合構築体))
Gq(DEL)/Gi融合構築体の設計は以下のようにして達成できる:N末端の6つのアミノ酸(TLESIM Cqγ−サブユニットの配列を有するアミノ酸2〜7)を欠失し、配列EYNL部位を有するC末端の5つのアミノ酸を、配列DCGLFを有するGiαタンパク質の対応するアミノ酸と置き換える。この融合構築体は以下のプライマー:
Gq(DEL)/Gi融合構築体の設計は以下のようにして達成できる:N末端の6つのアミノ酸(TLESIM Cqγ−サブユニットの配列を有するアミノ酸2〜7)を欠失し、配列EYNL部位を有するC末端の5つのアミノ酸を、配列DCGLFを有するGiαタンパク質の対応するアミノ酸と置き換える。この融合構築体は以下のプライマー:
TaqPlus Precision DNAポリメラーゼ(Strategene)は以下のサイクルによって、工程2〜4を35回反復する。増幅で利用される:2分間の95℃;20秒間の95℃;20秒間の56℃;2分間の72℃;および7分間の72℃。PCR産物をpCRII−TOPOベクター(Invitrogen)にクローン化し、ABI Big Dye Terminatorキット(P.E.Biosystems)を用いて配列決定した。融合構築体の配列を含むTOPOクローンからのインサートを、2工程クローニングプロセスによって、HindIII/BamHI部位にて発現ベクターpcDNA3.1(+)にシャトルする。また、その開示をここで引用してその全体を援用する、2002年9月6日にWO 02068600として公表されたPCT出願番号PCT/US02/05625参照。
(実施例5)
([35S]GTPγSアッセイ)
(膜調製)
いくつかの実施形態において、注目する標的GPCRを含み、例えば、逆アゴニスト、アゴニスト、またはアンタゴニストとして候補化合物の直接的同定で用いるための膜は、好ましくは、以下のように調製される:
(a.材料)
「膜掻取緩衝液」は20mM HEPESおよび10mM EDTA。pH7.4を含み;「膜洗浄緩衝液」は20mM HEPESおよび0.1mM EDTA、ph7.4を含み;「結合緩衝液」は20mM HEPES、100mM NaCl2および10mM MgCl2、pH7.4を含む。
([35S]GTPγSアッセイ)
(膜調製)
いくつかの実施形態において、注目する標的GPCRを含み、例えば、逆アゴニスト、アゴニスト、またはアンタゴニストとして候補化合物の直接的同定で用いるための膜は、好ましくは、以下のように調製される:
(a.材料)
「膜掻取緩衝液」は20mM HEPESおよび10mM EDTA。pH7.4を含み;「膜洗浄緩衝液」は20mM HEPESおよび0.1mM EDTA、ph7.4を含み;「結合緩衝液」は20mM HEPES、100mM NaCl2および10mM MgCl2、pH7.4を含む。
(b.手法)
全ての材料は該手法を通じて氷上に維持する。まず、培地を細胞の密集単層から吸引し、続いて、10mLの冷PBS濯ぎ、続いて、吸引する。しかる後、5mLの膜膜掻取緩衝液を加えて、細胞を掻取り;氷に続けて、細胞抽出物を50mLの遠心チューブに移す(20、000rpmにおいて4℃にて17分間遠心)。しかる後、上澄みを吸引し、ペレットを30mLの膜洗浄緩衝液に再懸濁させ、続いて、20、000rpmにおいて4℃にて17分間遠心する。次いで、上澄みを吸引し、ペレットを結合緩衝液に再懸濁させる。次いで、Brinkman PolytronTMホモゲナイザーを用いてホモゲナイズする(全ての材料が懸濁液となるまで15〜20秒間バースト)。これを、本明細書中においては、「膜タンパク質」という。
全ての材料は該手法を通じて氷上に維持する。まず、培地を細胞の密集単層から吸引し、続いて、10mLの冷PBS濯ぎ、続いて、吸引する。しかる後、5mLの膜膜掻取緩衝液を加えて、細胞を掻取り;氷に続けて、細胞抽出物を50mLの遠心チューブに移す(20、000rpmにおいて4℃にて17分間遠心)。しかる後、上澄みを吸引し、ペレットを30mLの膜洗浄緩衝液に再懸濁させ、続いて、20、000rpmにおいて4℃にて17分間遠心する。次いで、上澄みを吸引し、ペレットを結合緩衝液に再懸濁させる。次いで、Brinkman PolytronTMホモゲナイザーを用いてホモゲナイズする(全ての材料が懸濁液となるまで15〜20秒間バースト)。これを、本明細書中においては、「膜タンパク質」という。
(Bradfordタンパク質アッセイ)
ホモゲナイゼーションに続き、Bradfordタンパク質アッセイを用い、膜のタンパク質濃度を測定する。(本明細書中タンパク質は約1.5mg/Lまで希釈し、アリコットし、後に用のために凍結することができる(−80℃);凍結する場合、用いるプロトコルは以下の通りである:アッセイの日、凍結された膜タンパク質を室温で解凍し、続いて、攪拌し、次いで、約12×1,000rpmにおいて約5〜10秒間、Polytronでホモゲナイズする;多数の調製では、異なる調製のホモゲナイゼーションの間にホモゲナイザーは徹底的に洗浄すべきである)。
ホモゲナイゼーションに続き、Bradfordタンパク質アッセイを用い、膜のタンパク質濃度を測定する。(本明細書中タンパク質は約1.5mg/Lまで希釈し、アリコットし、後に用のために凍結することができる(−80℃);凍結する場合、用いるプロトコルは以下の通りである:アッセイの日、凍結された膜タンパク質を室温で解凍し、続いて、攪拌し、次いで、約12×1,000rpmにおいて約5〜10秒間、Polytronでホモゲナイズする;多数の調製では、異なる調製のホモゲナイゼーションの間にホモゲナイザーは徹底的に洗浄すべきである)。
(a.材料)
結合緩衝液(前記);Bradford色素試薬;Bradfordタンパク質標準を製造業者の指令に従って利用する(Biorad、カタログ番号00〜0006)。
結合緩衝液(前記);Bradford色素試薬;Bradfordタンパク質標準を製造業者の指令に従って利用する(Biorad、カタログ番号00〜0006)。
(b.手法)
二連チューブを調製し、一つは膜を含み、一つはコントロール「ブランク」としてのものである。各々は800μLの結合緩衝液を含有した。しかる後、10μLのBradfordタンパク質標準(1mg/L)を各チューブに加え、次いで、10μLの膜タンパク質を丁度一つのチューブ(ブランクではない)に加える。しかる後、200μLのBradford色素試薬を各チューブに加え、続いて、各々を攪拌する。5分後、チューブを再度渦巻かせ、その中の材料をキュベットに移す。次いで、波長595において、CECIL3041分光光度計を用いてキュベットを読む。
二連チューブを調製し、一つは膜を含み、一つはコントロール「ブランク」としてのものである。各々は800μLの結合緩衝液を含有した。しかる後、10μLのBradfordタンパク質標準(1mg/L)を各チューブに加え、次いで、10μLの膜タンパク質を丁度一つのチューブ(ブランクではない)に加える。しかる後、200μLのBradford色素試薬を各チューブに加え、続いて、各々を攪拌する。5分後、チューブを再度渦巻かせ、その中の材料をキュベットに移す。次いで、波長595において、CECIL3041分光光度計を用いてキュベットを読む。
(直接的同定アッセイ)
(a.材料)
GDP緩衝液は37.5mLの結合緩衝液および2mgのGDP(Sigma、カタログ番号G−7127)よりなるものであって、続いて、結合緩衝液に系列希釈し、0.2μMのGDPを得た(各ウェル中のGDPの最終濃度は0.1μM GDPであった);候補化合物を含む各ウェルは、100μLのGDP緩衝液(最終濃度、0.1μM GDP)、結合緩衝液中の50μMの膜タンパク質、および結合緩衝液中の50μLの[35S]GTPγS(0.6nm)(10mLの結合緩衝液当たり2.5μLの[35S]GTPγS)よりなる200μLの最終容量を有する。
(a.材料)
GDP緩衝液は37.5mLの結合緩衝液および2mgのGDP(Sigma、カタログ番号G−7127)よりなるものであって、続いて、結合緩衝液に系列希釈し、0.2μMのGDPを得た(各ウェル中のGDPの最終濃度は0.1μM GDPであった);候補化合物を含む各ウェルは、100μLのGDP緩衝液(最終濃度、0.1μM GDP)、結合緩衝液中の50μMの膜タンパク質、および結合緩衝液中の50μLの[35S]GTPγS(0.6nm)(10mLの結合緩衝液当たり2.5μLの[35S]GTPγS)よりなる200μLの最終容量を有する。
(b.手法)
候補化合物は、好ましくは、96−ウェルプレートフォーマットを用いてスクリーニングする(これらは−80℃凍結することができる)。膜タンパク質(またはコントロールとしての、標的GPCRを排除する発現ベクターを含む膜)を懸濁するまで軽くホモゲナイズする。次いで、前記したBradfordタンパク質アッセイを用いてタンパク質濃度を測定する。次いで、膜タンパク質(およびコントロール)を結合緩衝液中で0.25mg/Lまで希釈する(最終アッセイ濃度、12.5μgウェル)。しかる後、100μLのGDP緩衝液をWallac ScintitripTM(Wallac)の各ウェルに加える。次いで、5μLのピン−ツールを用いて、5μLの候補化合物をかかるウェルに移動する(すなわち、200μLの合計アッセイ容量中5μLは、候補化合物の最終スクリーニング濃度が10μMとなるように1:40の比率である)。再度、汚染を回避するために、各移動工程ののち、ピンツールは水(1×)、エタノール(1×)および水(2×)を含む三つの貯蔵器中で濯ぐべきであり−各濯ぎの後に過剰の液体はツールから振盪し、紙およびキムワイプ(kimwipe)で乾燥すべきである。しかる後、50μLの膜タンパク質を各ウェルに加え(標的GPCR無しの膜を含むコントロールウェルを利用した)、室温にて5〜10分間プレインキュベートした。しかる後、結合緩衝液中の50μLの[35S]GTPγS(0.6nM)を各ウェルに加え、続いて、室温にて60分間シェーカーでインキュベートする(再度、この例においては、プレートをホイルで被覆した)。次いで、4000RPMにおいて22℃にて15分間プレートを回転させることによって、アッセイを停止させた。次いで、プレートを8チャンネルのマニフォールドで吸引し、プレートカバーでシールする。次いで、(製造業者の指令に従い)設定「Prot.#37」を用いてプレートをWallac1450で読む。
候補化合物は、好ましくは、96−ウェルプレートフォーマットを用いてスクリーニングする(これらは−80℃凍結することができる)。膜タンパク質(またはコントロールとしての、標的GPCRを排除する発現ベクターを含む膜)を懸濁するまで軽くホモゲナイズする。次いで、前記したBradfordタンパク質アッセイを用いてタンパク質濃度を測定する。次いで、膜タンパク質(およびコントロール)を結合緩衝液中で0.25mg/Lまで希釈する(最終アッセイ濃度、12.5μgウェル)。しかる後、100μLのGDP緩衝液をWallac ScintitripTM(Wallac)の各ウェルに加える。次いで、5μLのピン−ツールを用いて、5μLの候補化合物をかかるウェルに移動する(すなわち、200μLの合計アッセイ容量中5μLは、候補化合物の最終スクリーニング濃度が10μMとなるように1:40の比率である)。再度、汚染を回避するために、各移動工程ののち、ピンツールは水(1×)、エタノール(1×)および水(2×)を含む三つの貯蔵器中で濯ぐべきであり−各濯ぎの後に過剰の液体はツールから振盪し、紙およびキムワイプ(kimwipe)で乾燥すべきである。しかる後、50μLの膜タンパク質を各ウェルに加え(標的GPCR無しの膜を含むコントロールウェルを利用した)、室温にて5〜10分間プレインキュベートした。しかる後、結合緩衝液中の50μLの[35S]GTPγS(0.6nM)を各ウェルに加え、続いて、室温にて60分間シェーカーでインキュベートする(再度、この例においては、プレートをホイルで被覆した)。次いで、4000RPMにおいて22℃にて15分間プレートを回転させることによって、アッセイを停止させた。次いで、プレートを8チャンネルのマニフォールドで吸引し、プレートカバーでシールする。次いで、(製造業者の指令に従い)設定「Prot.#37」を用いてプレートをWallac1450で読む。
(実施例6)
(環状AMPアッセイ)
例えば、逆アゴニスト、アゴニストまたはアンタゴニストとしての候補化合物を直接的に同定するためのもう一つのアッセイアプローチは、シコラーゼーベースのアッセイを利用することによって達成される。直接的同定に加えて、このアッセイアプローチは独立したアプローチとして利用して、前記実施例に記載された[35S]GTPγSアプローチからの結果の確認を供することができる。
(環状AMPアッセイ)
例えば、逆アゴニスト、アゴニストまたはアンタゴニストとしての候補化合物を直接的に同定するためのもう一つのアッセイアプローチは、シコラーゼーベースのアッセイを利用することによって達成される。直接的同定に加えて、このアッセイアプローチは独立したアプローチとして利用して、前記実施例に記載された[35S]GTPγSアプローチからの結果の確認を供することができる。
以下のプロトコルに従い、内因性または非−内因性の構成的に活性化されたGPCRに対する逆アゴニストおよびアゴニストとしての候補化合物の直接的同定のために、修飾されたFlash PlateTMアデニリルシクラーゼキット(New England Nuclear;カタログ番号SMP004A)を好ましくは利用する。
トランスフェクトされた細胞をトランスフェクションからほぼ三日後に収穫する。膜は、20mM HEPES、pH7.4および10mM MgCl2を含有する緩衝液中での懸濁された細胞のホモゲナイゼーションによって調製された。ホモゲナイゼーションは、Brinkman PolytronTMを用いて氷上でほぼ10秒間行う。得られたホモゲネートを49、000×gにおいて4℃にて15分間遠心する。次いで、20mM HEPES、pH7.4および0.1mM EDTAを含有する緩衝液に得られたペレットを再懸濁させ、10秒間ホモゲナイズし、続いて、49、000×gにおいて4℃にて15分間遠心する。次いで、用いるまで、得られたペレットを−80℃で貯蔵する。直接的同定スクリーニングの日に、膜ペレットを室温にてゆっくりと解凍し、20mM HEPES、pH7.4および10mM MgCl2を含有する緩衝液に再懸濁させ、0.60mg/mLの最終タンパク質濃度を得る(再懸濁させた膜は使用するまで氷の上に置く)。
cAMP標準および(11mLの検出緩衝液に対して2μCiのトレーサー[125I]cAMP100μL)を含む)検出緩衝液を調製し、製造業者の指示に従って維持する。アッセイ緩衝液をスクリーニングのために新たに調製し、それは20mM HEPES、pH7.4、10mM MgCl2、20mMホスホクレアチン(Sigma)、0.1ユニット/mLのクレアチンホスホキナーゼ(Sigma)50μM GTP(Sigma)、および0.2mM ATP(Sigma)を含有した;次いで、アッセイ緩衝液を用いるまで氷上で貯蔵した。
候補化合物は、好ましくは、40μLの膜タンパク質(30μg/ウェル)および50μLのアッセイ緩衝液と共に96−ウェルプレートのウェルに加える(3μL/ウェル;12μM最終アッセイ濃度)。次いで、この混合物を温和に振盪しつつ室温にて30分間インキュベートした。
インキュベーションに続き、100μLの検出緩衝液を各ウェルに加え、続いて、2〜24時間インキュベートする。次いで、(製造業者の指示に従い)「Prot.#31」を用い、プレートをWallac MicroBetaTMプレートリーダーでカウントする。
限定されるものではなく例として、得られた代表的なスクリーミングアッセイプレート(96ウェルフォーマット)の結果を図1に示す。各棒線は各ウェルで異なる化合物の結果を表し、「標的GPCR」は内因性の構成的に活性なGs−共役型GPCRのGsα融合タンパク質である。また、図1で示される代表的な結果は、各プレート(「m」)の平均結果に基づく標準偏差を提供し、一次スクリーニングからの「リード」としての逆アゴニストの選択についての平均+二つの任意の優先性は、少なくとも平均プレート応答から2標準偏差を差し引いたものだけ、パーセント応答を低下させる候補化合物の選択を含む。逆に、一次スクリーニングからの「リード」としてのアゴニストの選択についての任意の優先性は、少なくとも平均プレート応答から2標準偏差を差し引いたものだけ、パーセント応答を増加させる候補化合物の選択を含む。これらの選択プロセスに基づき、以下のウェル中の候補化合物を、各々、ウェルA2およびG9において該内因性GPSCに対する推定逆アゴニスト(化合物A)およびアゴニスト(化合物B)として直接的に同定された。図1参照。明瞭性のためには:これらの化合物は、このGPCRに対する内因性リガンドのいずれの知識もなくして直接的に同定されたことに注意された。レセプター機能に基づくアッセイ技術に焦点を当てることによって、我々は、このレセプター(化合物A)の機能的活性を低下させ、ならびにレセプター(化合物B)機能的活性を増加させることができる化合物を確認することができる。
(実施例7)
(細胞内カルシウム濃度の測定のための蛍光測定イメージングプレートリーダー(FLIPR)アッセイ(Gq関連レセプター))
各クローン系からの標的GPCR(実験)およびpCMV(陰性コントロール)により安定にトランスフェクトされた細胞を、翌日のアッセイのために、完全培養基(10%FBS、2mM L−グルタミン、1mMピルビン酸ナトリウムを含むDMEM)を含むウェル当たり5.5×104細胞にてポリ−D−リシンでプレ処理した96−ウェルプレート(Becton−Dickinson、#356640)に蒔く。Fluo4−AM(Molecular Probe、#F14202)インキュベーション緩衝液ストックを調製するために、2mgのFluo4−AMO467μLのDMSOおよび467μLのプルオロン酸(Molecular Probe、#P3000)に溶解させて、1mMストック溶液が得られ、これは−20℃にて一ヶ月間貯蔵することができる。Fluo4−AMは蛍光カルシウムインジケータ色素である。
(細胞内カルシウム濃度の測定のための蛍光測定イメージングプレートリーダー(FLIPR)アッセイ(Gq関連レセプター))
各クローン系からの標的GPCR(実験)およびpCMV(陰性コントロール)により安定にトランスフェクトされた細胞を、翌日のアッセイのために、完全培養基(10%FBS、2mM L−グルタミン、1mMピルビン酸ナトリウムを含むDMEM)を含むウェル当たり5.5×104細胞にてポリ−D−リシンでプレ処理した96−ウェルプレート(Becton−Dickinson、#356640)に蒔く。Fluo4−AM(Molecular Probe、#F14202)インキュベーション緩衝液ストックを調製するために、2mgのFluo4−AMO467μLのDMSOおよび467μLのプルオロン酸(Molecular Probe、#P3000)に溶解させて、1mMストック溶液が得られ、これは−20℃にて一ヶ月間貯蔵することができる。Fluo4−AMは蛍光カルシウムインジケータ色素である。
候補化合物は洗浄緩衝液(pH7.4の1× HBSS/2.5mMプロベニシド/20mM HEPES)中で調製する。
アッセイの時点において、培養基をウェルから取り出し、細胞に、pH7.4の100μLの4μM Fluo4−AM/2.5mMプロベニシド(Sigma、#P8761)/20mM HEPES/完全培地を負荷する。37℃/5%CO2におけるインキュベーションを60分間進行させる。
1時間のインキュベーションの後、Fluo4−AMインキュベーション緩衝液を取り出し、細胞を100μLの洗浄緩衝液で二回洗浄する。各ウェルには100μLの洗浄緩衝液を残す。プレートを37℃/5%CO2のインキュベーターに60分間戻す。
FLIPR(蛍光測定イメージングプレートリーダー;Molecular Device)を、30秒目に50μLの候補化合物を加え、さらに150秒間で候補化合物によって惹起された細胞内カルシウム濃度([Ca2+])の一過性変化を読むようにプログラムする。合計蛍光変化カウントを用いて、FLIPRソフトウェアを用いて、アゴニストの活性を決定する。機器ソフトウェアは蛍光の読みを正規化して、ゼロにおける同等な初期の読みを得る。
いくつかの実施形態において、標的GPCRを含む細胞は、さらに、乱交雑Gアルファ15/16またはキメラGq/Giアルファユニットを含む。
前記したものは、安定にトランスフェクトされた細胞を用いるアゴニスト活性についてのFLIPRアッセイを提供するが、当業者であれば、該アッセイを容易に修飾して、アンタゴニスト活性を特徴付けることができよう。また、該当業者は、別法として、一過的にトランスフェクトされた細胞を用いることができるのも容易に認識するであろう。
(実施例8)
(メラノフォア技術)
メラノフォアは下等脊椎動物で見出される皮膚細胞である。それは色素を含むメラノソームと呼ばれるオルガネラを含む。メラノフォアは、Gタンパク質共役型レセプター(GPCR)活性化に際して、微小管ネットワークに沿ってこれらのメラノソームを再分布させることができる。この色素移動の結果は、細胞の明らかな明化または逆明化である。メラノフォアにおいて、Gi−共役型レセプターの活性化に由来する細胞内cAMPの減少したレベルはメラノソームを細胞の中心に移動させ、その結果、色が劇的に明るくなる。もしcAMPレベルが次いで上昇すれば、Gs−共役型レセプターの活性化に続き、メラノソームは再度分配され、細胞は再度暗く見える。また、Gq−共役型レセプターの活性化に由来するジアシルグリセロールの増大したレベルは、この再分布を誘導することができる。加えて、該技術は、ある種のレセプターチロシンキナーゼの研究にも適合する。メラノフォアの応答はレセプター活性から数分以内に送り、その結果、単純で頑強な色の変化が起こる。該応答は、慣用的な吸光度マイクロプレートリーダーまたは適当なビデオイメージングシステムを用いて容易に検出することができる。他の皮膚細胞とは異なり、メラノフォアは神経堤に由来し、シグナリングタンパク質の十分な補充を発現するようである。特に、該細胞は極端に広い範囲のGタンパク質を発現し、従って、機能的にほとんど全てのGPCRを発現することができる。
(メラノフォア技術)
メラノフォアは下等脊椎動物で見出される皮膚細胞である。それは色素を含むメラノソームと呼ばれるオルガネラを含む。メラノフォアは、Gタンパク質共役型レセプター(GPCR)活性化に際して、微小管ネットワークに沿ってこれらのメラノソームを再分布させることができる。この色素移動の結果は、細胞の明らかな明化または逆明化である。メラノフォアにおいて、Gi−共役型レセプターの活性化に由来する細胞内cAMPの減少したレベルはメラノソームを細胞の中心に移動させ、その結果、色が劇的に明るくなる。もしcAMPレベルが次いで上昇すれば、Gs−共役型レセプターの活性化に続き、メラノソームは再度分配され、細胞は再度暗く見える。また、Gq−共役型レセプターの活性化に由来するジアシルグリセロールの増大したレベルは、この再分布を誘導することができる。加えて、該技術は、ある種のレセプターチロシンキナーゼの研究にも適合する。メラノフォアの応答はレセプター活性から数分以内に送り、その結果、単純で頑強な色の変化が起こる。該応答は、慣用的な吸光度マイクロプレートリーダーまたは適当なビデオイメージングシステムを用いて容易に検出することができる。他の皮膚細胞とは異なり、メラノフォアは神経堤に由来し、シグナリングタンパク質の十分な補充を発現するようである。特に、該細胞は極端に広い範囲のGタンパク質を発現し、従って、機能的にほとんど全てのGPCRを発現することができる。
メラノフォアを用いて、GPCRに対する天然リガンドを含めた化合物を同定することができる。この方法は、特定の刺激体に応答してそれらの色素を分散または凝集させることができる色素細胞系のテスト細胞を導入し、GPCRにつきコードする内因性クローンを発現させることによって行うことができる。刺激体、例えば、メラトニンは色素沈着の初期状態を設定し、ここで、もしGPCRの活性化が色素分散を誘導するならば、色素がテスト細胞内で凝集する。しかしながら、細胞を刺激体で刺激すると色素配置の初期状態を設定し、ここで、もしGPCRが色素凝集を誘導するならば、色素は分散される。次いで、テスト細胞を化学化合物と接触させ、細胞中の色素配置が色素配置の初期状態から変化したか否かを判断する。限定されるものではないが、GPCRにカップリングしたリガンドを含めた候補化合物による色素細胞の分散がペトリ皿上で暗く見え、他方、色素細胞の凝集は明るく見える。
材料および候補は米国特許第5、462,856号および米国特許第6、051、386号の開示に従う。これらの特許の開示はここで引用してその全体を援用する。
細胞を96−ウェルプレート中で平板培養する(プレート当たり一つのレセプター)。トランスフェクションから48時間後、各プレート上の細胞の半分を10nMメラトニンで処理する。メラトニンはメラノフォア中の内因性Gi−共役型レセプターを活性化し、それらがその色素を凝集させるようにする。細胞の残りの半分を無血清培地0.7× L−15(Gibco)に移す。一時間のち、無血清培地中の細胞は色素が分散した状態のままであり、他方、メラトニン−処理細胞は色素が凝集した状態にある。この時点で、細胞をテスト化合物の用量応答で処理する。もし平板培養したGPCRがテスト化合物に結合すれば、メラノフォアは該化合物に応答して色変化を受けると予測される。もしレセプターがGsまたはGq共役型レセプターいずれかであれば、メラトニン−凝集メラノフォアは色素分散を受けるであろう。コントロール的に、もしレセプターがGi−共役型レセプターであれば、色素が分散した細胞は用量−依存性色素凝集を受けると予測される。
(実施例9)
(MAPキナーゼアッセイ)
MAPキナーゼ(マイトジェン活性化キナーゼ)をモニターして、レセプターの活性化を見積もることができる。MAPキナーゼはいくつかのアプローチによって検出することができる。一つのアプローチは、未リン酸化(不活性)またはリン酸化(活性)いずれかにて、リン酸化の見積もりに基づく。リン酸化されたタンパク質はSDS−PAGE中でより遅い移動度を有し、従って、ウェスタンブロッティングを用いて未刺激タンパク質と比較することができる。別法として、リン酸化されたタンパク質に対して特異的な抗体が入手可能であり(New EnglandBiolabs)、これを用いて、リン酸化されたキナーゼの増加を検出することができる。いずれの方法においても、細胞をテスト化合物で刺激し、次いで、Laemmli緩衝液で抽出する。可溶性画分をSDS−PAGEゲルに適用し、タンパク質を電気泳動によりニトロセルロースまたはImmobilinに移動させる。免疫反応性バンドは標準的なウェスタンブロッティング技術によって測定される。目で見える、またはケミルミネセントシグナルをフィルム上に記録し、これは、デンシトメトリーによって定量することができる。
(MAPキナーゼアッセイ)
MAPキナーゼ(マイトジェン活性化キナーゼ)をモニターして、レセプターの活性化を見積もることができる。MAPキナーゼはいくつかのアプローチによって検出することができる。一つのアプローチは、未リン酸化(不活性)またはリン酸化(活性)いずれかにて、リン酸化の見積もりに基づく。リン酸化されたタンパク質はSDS−PAGE中でより遅い移動度を有し、従って、ウェスタンブロッティングを用いて未刺激タンパク質と比較することができる。別法として、リン酸化されたタンパク質に対して特異的な抗体が入手可能であり(New EnglandBiolabs)、これを用いて、リン酸化されたキナーゼの増加を検出することができる。いずれの方法においても、細胞をテスト化合物で刺激し、次いで、Laemmli緩衝液で抽出する。可溶性画分をSDS−PAGEゲルに適用し、タンパク質を電気泳動によりニトロセルロースまたはImmobilinに移動させる。免疫反応性バンドは標準的なウェスタンブロッティング技術によって測定される。目で見える、またはケミルミネセントシグナルをフィルム上に記録し、これは、デンシトメトリーによって定量することができる。
もう一つのアプローチは、リン酸化アッセイを介するMAPキナーゼ活性の見積もりに基づく。細胞をテスト化合物で刺激し、可溶性抽出物を調製する。調製物を、ガンマ−32P−ATP、ATP再生系、およびインスリンまたはPHAS−Iによって調節されたリン酸化加熱および酸安定タンパク質のようなMAPキナーゼに対する特異的基質と共に30℃にて10分間インキュベートする。反応は、H3PO4の添加によって停止させ、サンプルを氷にうつす。アリコットをWhatman P81クロマトグラフィーペーパー上にスポットし、これは、リン酸化されたタンパク質を保持する。該クロマトグラフィーペーパーを洗浄し、液体シンチュレーションカウンターで32Pをカウントする。別法として、細胞抽出物をガンマ−32P−ATP、ATP再生系、およびフィルター支持体に対するストレプトアビジンが結合したビオチニル化ミエリン塩基性タンパク質と共にインキュベートする。ミエリン塩基性タンパク質が活性化されたMAPキナーゼに対する基質である。リン酸化反応は30℃にて10分間行う。次いで、抽出物をフィルターを通して吸引し、これは、リン酸化されたミエリン塩基性タンパク質を保持する。フィルターを洗浄し、液体シンチュレーションカウンティングによって32Pにつきカウントする。
(実施例10)
(MAPK/ERKキナーゼキナーゼ−1(MEKK1)アッセイ)
MEKK1のインビトロキナーゼ活性はMinamino et alによって記載されているように測定する。[Proc Natl et al.、 si USA(2002)99:3866−3871;その開示をここで引用してその全体を援用する]。簡単に述べれば、細胞溶解物(400μg)をMEKK1(2μg)(カタログ番号sc−252、Sants Cruz Biotechnology、Sants Cruz、CA)に対する一次抗体で4時間免疫沈澱させ、続いて、タンパク質G−セファロース(50%wt/vol、Amersham Pharmacia)と共に4℃に2時間インキュベートする。GST−SEK1(Upstate Biotechnology、 Lake Placid、NY)を基質として用いる。サンプルをSDS/PAGEによって分解し、PhoshorImager(Molecular Probes)を用いることによって、リン酸化された基質を検出し、定量する。
(MAPK/ERKキナーゼキナーゼ−1(MEKK1)アッセイ)
MEKK1のインビトロキナーゼ活性はMinamino et alによって記載されているように測定する。[Proc Natl et al.、 si USA(2002)99:3866−3871;その開示をここで引用してその全体を援用する]。簡単に述べれば、細胞溶解物(400μg)をMEKK1(2μg)(カタログ番号sc−252、Sants Cruz Biotechnology、Sants Cruz、CA)に対する一次抗体で4時間免疫沈澱させ、続いて、タンパク質G−セファロース(50%wt/vol、Amersham Pharmacia)と共に4℃に2時間インキュベートする。GST−SEK1(Upstate Biotechnology、 Lake Placid、NY)を基質として用いる。サンプルをSDS/PAGEによって分解し、PhoshorImager(Molecular Probes)を用いることによって、リン酸化された基質を検出し、定量する。
(実施例11)
(ヒトRUP40の組織分布)
(A.Affymetrix GeneChip(登録商標)技術)
オリゴヌクレオチドを含有するマイクロアレイの設計および製造のためのAffymetrixにヌクレオチド配列を提出して、それらのGeneChip(登録商標)技術を用いてGタンパク質共役型レセプター(GPCR)の発現レベルをモニターした。また、マイクロアレイには、Harvard Brane Bankからの、または商業的に入手可能な源から得られた特徴付けしたヒトの脳組織用のプローブが存在した。RNAサンプルを増幅し、標識し、マイクロアレイにハイブリダイズさせ、製造業者の指示に従ってデータを解析した。
(ヒトRUP40の組織分布)
(A.Affymetrix GeneChip(登録商標)技術)
オリゴヌクレオチドを含有するマイクロアレイの設計および製造のためのAffymetrixにヌクレオチド配列を提出して、それらのGeneChip(登録商標)技術を用いてGタンパク質共役型レセプター(GPCR)の発現レベルをモニターした。また、マイクロアレイには、Harvard Brane Bankからの、または商業的に入手可能な源から得られた特徴付けしたヒトの脳組織用のプローブが存在した。RNAサンプルを増幅し、標識し、マイクロアレイにハイブリダイズさせ、製造業者の指示に従ってデータを解析した。
GeneChipを用い、ヒトRUP40の発現プロフィールを質問した。図2参照。図2は、種々の組織におけるヒトRUP40の発現レベルを表すプロットである。ヒトRUP40が心臓、肺、大動脈および脂肪でコードに発現されることは明らかである。ヒトRUP40は脾臓においてはより低いレベルで発現される。心臓内では、RUP40は左心室によってコードに発現される。また、RUP40の選択的発現がマウスにおいて心臓、肺および脂肪で見られる。(データは示さず)。
(実施例12)
(ラット心臓におけるRUP40の免疫染色)
配列番号4のアミノ酸964〜985に対応するペプチドNTGGWDSSGCTVEDDGRDNRDRを用い、ラットRUP40に対して向けられたアフィニティ−精製ポリクローナルウサギ抗体を調製した。(SynPep、Dublin、CA)。麻酔した成体雌Sprague−Dawleyラットからの単離された心臓組織をセクショニングのためにパラフィンに埋めた。左心室を通る系列的6ミクロンの横方向セクションを調製し、標準的な技術を用いて、ペルオキシダーゼ−ベースの免疫組織化学を行った。非−免疫化ウサギ(カタログ番号#N1699、DakoCytomation、Carpinteria、CA)からの免疫グロブリンを陰性コントロールとして用いた。心筋細胞は、サイトゾル全体に渡って散漫な染色を示し、原型質膜において染色はより強かった(図3)。
(ラット心臓におけるRUP40の免疫染色)
配列番号4のアミノ酸964〜985に対応するペプチドNTGGWDSSGCTVEDDGRDNRDRを用い、ラットRUP40に対して向けられたアフィニティ−精製ポリクローナルウサギ抗体を調製した。(SynPep、Dublin、CA)。麻酔した成体雌Sprague−Dawleyラットからの単離された心臓組織をセクショニングのためにパラフィンに埋めた。左心室を通る系列的6ミクロンの横方向セクションを調製し、標準的な技術を用いて、ペルオキシダーゼ−ベースの免疫組織化学を行った。非−免疫化ウサギ(カタログ番号#N1699、DakoCytomation、Carpinteria、CA)からの免疫グロブリンを陰性コントロールとして用いた。心筋細胞は、サイトゾル全体に渡って散漫な染色を示し、原型質膜において染色はより強かった(図3)。
(実施例13)
(新生ラット心室心筋細胞(NRVM)によるRUP40の発現)
(一次細胞培養)
新生ラット心室筋細胞(NRVM)を従前に記載されているように単離し、培養した[Adams、JV et al.、JBiolChem (1996)271:1179−1186]。簡単に述べれば、1〜2日齢Sprague−Dawleyラット子供から心臓を得、コラゲナーゼで消化し、Percollグラジエントを通過させることによって筋細胞を精製した。細胞を、1%ゼラチンで予めコートした組織培養皿上で平板培養し、10%ウマ血清、5%胎児ウシ血清、および抗生物質(100ユニット/mLのペニシリンおよび100μg/mLのストレプトマイシン)を補足した4:1 DMEM/培地−199中で一晩維持した。平板培養培地中での18時間後に、筋細胞を維持培地(DMEM/培地199+抗生物質)で洗浄して、死滅した細胞およびデブリスを除去し、実験の持続の間が維持培地を交換した。
(新生ラット心室心筋細胞(NRVM)によるRUP40の発現)
(一次細胞培養)
新生ラット心室筋細胞(NRVM)を従前に記載されているように単離し、培養した[Adams、JV et al.、JBiolChem (1996)271:1179−1186]。簡単に述べれば、1〜2日齢Sprague−Dawleyラット子供から心臓を得、コラゲナーゼで消化し、Percollグラジエントを通過させることによって筋細胞を精製した。細胞を、1%ゼラチンで予めコートした組織培養皿上で平板培養し、10%ウマ血清、5%胎児ウシ血清、および抗生物質(100ユニット/mLのペニシリンおよび100μg/mLのストレプトマイシン)を補足した4:1 DMEM/培地−199中で一晩維持した。平板培養培地中での18時間後に、筋細胞を維持培地(DMEM/培地199+抗生物質)で洗浄して、死滅した細胞およびデブリスを除去し、実験の持続の間が維持培地を交換した。
(RT−PCR)
前記したようにNRVMおよび線維芽細胞から単離した全RNAを、製造業者の指示に従って、PCRキット(Becton Dickinson、Franklin、NJ)用のRTを用い、逆転写されたDNA(RT−DNA)の生成のための鋳型として用いた。RUP40発現はPCRによってRT−DNAサンプルで検出した。PCR条件が:2分間の96℃;30秒間の96℃、30秒間の55℃、2分間の72℃の30サイクル;10分間の72℃であった。
前記したようにNRVMおよび線維芽細胞から単離した全RNAを、製造業者の指示に従って、PCRキット(Becton Dickinson、Franklin、NJ)用のRTを用い、逆転写されたDNA(RT−DNA)の生成のための鋳型として用いた。RUP40発現はPCRによってRT−DNAサンプルで検出した。PCR条件が:2分間の96℃;30秒間の96℃、30秒間の55℃、2分間の72℃の30サイクル;10分間の72℃であった。
用いたラットRUP40順方向プライマーは配列番号
(結果)
RUP40は心筋細胞で発現することが判明した。結果は図4に示す。RT−PCRは、無血清(SFM)条件下に24時間維持した新生心室筋細胞(NRVM)におけるRUP40転写体の発現を示す。筋細胞におけるRUP40転写体レベルはフォルボール12−ミニステート13−アセテート(PMA)の添加から24時間後に劇的に降下したが、フェニレフリン(PE)またはプロスタグランジンF2アルファ(PG)の培地への添加の後には上昇したままであった。一次心室線線維芽細胞(Fibro)におけるRUP40発現のほとんど検出不可能なレベルに注意した。G3PDH PCR産物は、PCR反応で用いた鋳型の等しいレベル、およびゲル負荷の合致性を示す。増幅は、鋳型の不存在下における増幅に対応するゲルの「−」レーンによって示されるように、鋳型−依存性であった。ラット心室筋細胞によるRUP40の発現は、実施例11で決定され、図2に示されたヒトおよびマウス(図示せず)RUP40の発現プロフィールに合致する。
RUP40は心筋細胞で発現することが判明した。結果は図4に示す。RT−PCRは、無血清(SFM)条件下に24時間維持した新生心室筋細胞(NRVM)におけるRUP40転写体の発現を示す。筋細胞におけるRUP40転写体レベルはフォルボール12−ミニステート13−アセテート(PMA)の添加から24時間後に劇的に降下したが、フェニレフリン(PE)またはプロスタグランジンF2アルファ(PG)の培地への添加の後には上昇したままであった。一次心室線線維芽細胞(Fibro)におけるRUP40発現のほとんど検出不可能なレベルに注意した。G3PDH PCR産物は、PCR反応で用いた鋳型の等しいレベル、およびゲル負荷の合致性を示す。増幅は、鋳型の不存在下における増幅に対応するゲルの「−」レーンによって示されるように、鋳型−依存性であった。ラット心室筋細胞によるRUP40の発現は、実施例11で決定され、図2に示されたヒトおよびマウス(図示せず)RUP40の発現プロフィールに合致する。
(実施例14)
(増大したIP3蓄積における心筋細胞結果でのRUP40の過剰発現)
(一次細胞培養)
新生ラット心室筋細胞(NRVM)を従前に記載されているように単離し、培養した[Adams、JW et al.,J Bion Chem(1996)2719:86;その開示をここで引用してその全体を援用する]。簡単に述べれば、心臓を1〜2日齢Sprague−Dawleyラット子供から得、コラゲナーゼで消化し、筋細胞をPercollグラジエントを通すことによって生成した。細胞を0.2×106細胞/ウェルにて24ウェルゼラチンコートプレート上で平板培養し、10%ウマ血清、5%胎児ウシ血清、および抗生物質(100ユニット/mLのペニシリンおよび100μg/mLのストレプトマイシン)を補足した4:1 DMEM/培地−199中で一晩維持した。平板培養培地中での18時間の後、筋細胞を維持培地(DMEM/培地199+抗生物質)で洗浄して、死滅した細胞およびデブリスを除去し、実験の継続中には維持培地を交換した。
(増大したIP3蓄積における心筋細胞結果でのRUP40の過剰発現)
(一次細胞培養)
新生ラット心室筋細胞(NRVM)を従前に記載されているように単離し、培養した[Adams、JW et al.,J Bion Chem(1996)2719:86;その開示をここで引用してその全体を援用する]。簡単に述べれば、心臓を1〜2日齢Sprague−Dawleyラット子供から得、コラゲナーゼで消化し、筋細胞をPercollグラジエントを通すことによって生成した。細胞を0.2×106細胞/ウェルにて24ウェルゼラチンコートプレート上で平板培養し、10%ウマ血清、5%胎児ウシ血清、および抗生物質(100ユニット/mLのペニシリンおよび100μg/mLのストレプトマイシン)を補足した4:1 DMEM/培地−199中で一晩維持した。平板培養培地中での18時間の後、筋細胞を維持培地(DMEM/培地199+抗生物質)で洗浄して、死滅した細胞およびデブリスを除去し、実験の継続中には維持培地を交換した。
(RUP40アデノウイルスベクターの構築)
アデノウイルスの実験では、配列番号2のヒトRUP40ポリペプチドをコードする配列番号1のポリヌクレオチドを、HEK293細胞における相同組換えによる組換え体RUP40(AdRUP40)の生成に先立ち、pShuttleCMV(Qpiogene、Carlsbad、CA)にサブクローンした。
アデノウイルスの実験では、配列番号2のヒトRUP40ポリペプチドをコードする配列番号1のポリヌクレオチドを、HEK293細胞における相同組換えによる組換え体RUP40(AdRUP40)の生成に先立ち、pShuttleCMV(Qpiogene、Carlsbad、CA)にサブクローンした。
(アデノウイルス感染)
平板培養の期間の後、筋細胞を前記した維持細胞にスイッチし、組換えアデノウイルスで直ちに感染させるか、または偽感染させた。アデノウイルスベクターでのNRVMの感染が従前に記載されているように行った[Adams、JW ET al.、Circ Res(2000)87:1180−7]。感染の最適多重度(MOI)は、0.1〜500PFU/細胞の用量範囲にわたって細胞当たり20〜50プラーク形成単位(PFU)であると測定された。20PFU/細胞のMOIの結果、GPFをコードするコントロールアデノウィルス(Adagfaでの感染のち最初の48時間の間にいずれの細胞傷害性なくして、[このコントロールウィルスに感染したNRVMにおける緑色蛍光タンパク質(GFP)発現によって測定して]95%を超える感染効率がもたらされた。
平板培養の期間の後、筋細胞を前記した維持細胞にスイッチし、組換えアデノウイルスで直ちに感染させるか、または偽感染させた。アデノウイルスベクターでのNRVMの感染が従前に記載されているように行った[Adams、JW ET al.、Circ Res(2000)87:1180−7]。感染の最適多重度(MOI)は、0.1〜500PFU/細胞の用量範囲にわたって細胞当たり20〜50プラーク形成単位(PFU)であると測定された。20PFU/細胞のMOIの結果、GPFをコードするコントロールアデノウィルス(Adagfaでの感染のち最初の48時間の間にいずれの細胞傷害性なくして、[このコントロールウィルスに感染したNRVMにおける緑色蛍光タンパク質(GFP)発現によって測定して]95%を超える感染効率がもたらされた。
(IP3アッセイ)
アデノウイルス感染筋細胞を、20mM HEPES−緩衝化培地中に10mM LiClを含有するアッセイ培地の添加に先立ち、2μCi/mLの[3H]ミオイノシトールを含有する維持倍地中で18〜24時間インキュベートした。アッセイ緩衝液中の30分の後、細胞を冷酸固定し、(0.1Mギ酸)、溶解物を、Dowex 100〜200メッシュ(ホルメート形態)樹脂ビーズを含有するカラムに移した。イノシトールリン酸を1Mギ酸アンモニウムおよび0.1Mギ酸で溶出させ、液体シンチレーションカウンティングによって定量した。
アデノウイルス感染筋細胞を、20mM HEPES−緩衝化培地中に10mM LiClを含有するアッセイ培地の添加に先立ち、2μCi/mLの[3H]ミオイノシトールを含有する維持倍地中で18〜24時間インキュベートした。アッセイ緩衝液中の30分の後、細胞を冷酸固定し、(0.1Mギ酸)、溶解物を、Dowex 100〜200メッシュ(ホルメート形態)樹脂ビーズを含有するカラムに移した。イノシトールリン酸を1Mギ酸アンモニウムおよび0.1Mギ酸で溶出させ、液体シンチレーションカウンティングによって定量した。
(結果)
Anova/Bonferroni adhoc統計解析によって判断して、心筋細胞におけるRUP40の過剰発現は増大したIP3蓄積を刺激した。従って、過剰発現されたRUP40は、アッセイの条件下で構成的Gqカップリング活性のレベルを発現した。結果を図5に示す。
Anova/Bonferroni adhoc統計解析によって判断して、心筋細胞におけるRUP40の過剰発現は増大したIP3蓄積を刺激した。従って、過剰発現されたRUP40は、アッセイの条件下で構成的Gqカップリング活性のレベルを発現した。結果を図5に示す。
(実施例15)
(RUP40の過剰発現は心筋細胞において肥大および心房性ナトリウム利尿因子(ANF)発現を刺激する)
(一次細胞培養)
新生ラット心室筋細胞(NRVM)を従前に記載されているように[Adams、JW et al.,JBiolChem(1996)271:1179−86]、実施例14に記載されているように調製した。
(RUP40の過剰発現は心筋細胞において肥大および心房性ナトリウム利尿因子(ANF)発現を刺激する)
(一次細胞培養)
新生ラット心室筋細胞(NRVM)を従前に記載されているように[Adams、JW et al.,JBiolChem(1996)271:1179−86]、実施例14に記載されているように調製した。
(RUP40アデノウイルスベクターの構築)
(アデノウイルス感染)
RUP40アデノウイルスベクター構築およびアデノウイルス感染は実施例11に記載されているように行った。
(アデノウイルス感染)
RUP40アデノウイルスベクター構築およびアデノウイルス感染は実施例11に記載されているように行った。
(結果:肥大)
RUP40の過剰発現は心筋細胞における肥大を刺激した。結果を図6Aに示した。細胞当たり20プラーク形成単位(PFU)にてAdrup40で48時間感染させたNRMVは、AdGFPコントロールウィルスで感染させたコントロール細胞と比較して増大した細胞サイズを示した。
RUP40の過剰発現は心筋細胞における肥大を刺激した。結果を図6Aに示した。細胞当たり20プラーク形成単位(PFU)にてAdrup40で48時間感染させたNRMVは、AdGFPコントロールウィルスで感染させたコントロール細胞と比較して増大した細胞サイズを示した。
(結果:心房性ナトリウム利尿因子(ANF)の発現)
RUP40の過剰発現は、心筋細胞における心房性ナトリウム利尿因子(ANF)の発現を刺激した。結果を図6Bに示し、これは、内因性ANF転写体の発現のレベルおよび、組換えヒトRUP40転写体の発現のレベルを示す。NRVMを、20PFU/細胞の感染多重度にて、ヒトRUP40をコードする組換体アデノウイルスまたはコントロールアデノウィルス(Adgfp)で処理した。アデノウイルス感染の24時間の後に、全RNAを単離し、ノーザンブロット分析を行って、ウィルスにより発現されたRUP40のレベルを測定した。ヌクレオチド2,858〜3、606よりなるラットRUP40のcDNAフラグメントをプローブとして用いた。同一膜を、心房性ナトリウム利尿因子(ANF)の発現、心筋細胞肥大の遺伝子マーカーにつきプローブした[Rockman et al.,Proc Natl Acad Sci USA(1991)88:8277−81]。プローブはランダムプライミングによって[32P]で標識した。加えて、膜をメチレンブルーで染色して、RNAの同等負荷および導入を確認した。
RUP40の過剰発現は、心筋細胞における心房性ナトリウム利尿因子(ANF)の発現を刺激した。結果を図6Bに示し、これは、内因性ANF転写体の発現のレベルおよび、組換えヒトRUP40転写体の発現のレベルを示す。NRVMを、20PFU/細胞の感染多重度にて、ヒトRUP40をコードする組換体アデノウイルスまたはコントロールアデノウィルス(Adgfp)で処理した。アデノウイルス感染の24時間の後に、全RNAを単離し、ノーザンブロット分析を行って、ウィルスにより発現されたRUP40のレベルを測定した。ヌクレオチド2,858〜3、606よりなるラットRUP40のcDNAフラグメントをプローブとして用いた。同一膜を、心房性ナトリウム利尿因子(ANF)の発現、心筋細胞肥大の遺伝子マーカーにつきプローブした[Rockman et al.,Proc Natl Acad Sci USA(1991)88:8277−81]。プローブはランダムプライミングによって[32P]で標識した。加えて、膜をメチレンブルーで染色して、RNAの同等負荷および導入を確認した。
(実施例16)
(横方向大動脈収縮(TAC)に由来する圧力過剰負荷の条件下でのRUP40の心筋発現)
(横方向大動脈収縮(TAC))
マウスにおける横方向大動脈の外科的収縮は従前に記載されているように行った[Rockman、HA et al.,ProcNatlAcatSci USA(1991)88:8277−81]。簡単に述べれば、8週齢マウス(C57/BL6)をケタミンおよびキシラジンの混合物で麻酔した。解剖顕微鏡下で、中線頸部切開を行って、ミクロ外科技術によって気管および頚動脈を露出させた。成功した気管内挿管の後、0.2mLの時機容量での補足酸素および一分当たり110の呼吸速度にて、カニーレを容量サイクルドげっ歯類ベンティレータ(Harvard Apparatus)に連結させた。胸腔を小さな切開を通じて左上方胸骨縁の第二の肋間空間に入れ、27−ゲージの針に対する7−0ナイロン縫合結紮を結ぶことによって大動脈収縮を行って、針を抜いたときの直径の0.4mm狭化および60〜70%の再現性のある横方向大動脈収縮(TAC)が得られた。大動脈バンディングに続き、気胸を排気し、動物から抜管し、回復させる。コントロール偽−手術マウスは外科的処置を受けたが、横方向大動脈収縮(TAC)には付さない。外科的処置から7日後に、生存する動物を安楽死させ、逆方向灌流によって心臓をホルマリンで固定した。
(横方向大動脈収縮(TAC)に由来する圧力過剰負荷の条件下でのRUP40の心筋発現)
(横方向大動脈収縮(TAC))
マウスにおける横方向大動脈の外科的収縮は従前に記載されているように行った[Rockman、HA et al.,ProcNatlAcatSci USA(1991)88:8277−81]。簡単に述べれば、8週齢マウス(C57/BL6)をケタミンおよびキシラジンの混合物で麻酔した。解剖顕微鏡下で、中線頸部切開を行って、ミクロ外科技術によって気管および頚動脈を露出させた。成功した気管内挿管の後、0.2mLの時機容量での補足酸素および一分当たり110の呼吸速度にて、カニーレを容量サイクルドげっ歯類ベンティレータ(Harvard Apparatus)に連結させた。胸腔を小さな切開を通じて左上方胸骨縁の第二の肋間空間に入れ、27−ゲージの針に対する7−0ナイロン縫合結紮を結ぶことによって大動脈収縮を行って、針を抜いたときの直径の0.4mm狭化および60〜70%の再現性のある横方向大動脈収縮(TAC)が得られた。大動脈バンディングに続き、気胸を排気し、動物から抜管し、回復させる。コントロール偽−手術マウスは外科的処置を受けたが、横方向大動脈収縮(TAC)には付さない。外科的処置から7日後に、生存する動物を安楽死させ、逆方向灌流によって心臓をホルマリンで固定した。
固定された心臓組織をOCT:Aqua Mountの50:50混合物(VWR、#41799−008、West Chester、PA)に埋め込み、ドライアイス/エタノール中で凍結した。ブロックを低温セクショニングを行うまで−80℃に維持した。低温セクショニングの後、組織セクションをシールされたスライドボックス中で−20℃にて貯蔵した。
(インサイチュハイブリダイゼーション)
配列番号5のマウスRUP40ポリヌクレオチドを、SP6およびT7プロモーターに近接挟まれた部位にてPCRII−TOPOベクター(Invitrogen、Carlsbad、CA)にサブクローンした。時節的には製造業者の指令に従い、Promega RiboProbe転写キット(#P1460;Madison、WI)からのSP6RNAポリメラーゼを用い、配列番号5のポリヌクレオチドに相補的な[35S]−放射性標識アンチセンスマウスRUP40 mRNAプローブを調製した。コントロール放射性標識センスプローブはT7 RNAポリメラーゼを用いて同様にして調製した。
配列番号5のマウスRUP40ポリヌクレオチドを、SP6およびT7プロモーターに近接挟まれた部位にてPCRII−TOPOベクター(Invitrogen、Carlsbad、CA)にサブクローンした。時節的には製造業者の指令に従い、Promega RiboProbe転写キット(#P1460;Madison、WI)からのSP6RNAポリメラーゼを用い、配列番号5のポリヌクレオチドに相補的な[35S]−放射性標識アンチセンスマウスRUP40 mRNAプローブを調製した。コントロール放射性標識センスプローブはT7 RNAポリメラーゼを用いて同様にして調製した。
固定した組織セクションを解凍し、直ちに、室温における一連の固定後インキュベーションに付した:3分間でPBS;10分間で10%ホルマリン;10分間でPBS;および10分間でPBS。
次いで、組織セクションを浸透化およびアセチル化に付した。この目的で、組織セクションをプロテイナーゼK(0.5Mトリス、0.25M ETTA、pH8.0中0.001%プロテイナーゼK)と共に37℃にて10分間インキュベートし、続いて、室温にて5分間洗浄した。次いで、組織セクションをトリエタノールアミン緩衝液(0.1M TFA、pH8.0)と共に室温にて5分間インキュベートし、続いて、0.1M TEA pH8.0中の2.5%無水酢酸と共に室温にて5分間インキュベートした。次いで、組織セクションを、各々、2× SSC;50%エタノール;95%エタノール;および100%エタノールと共に室温にて2分間インキュベートした。次いで、組織セクションを乾燥し、翌日のハイブリダイゼーションまで乾燥下に維持した。
組織セクションのハイブリダイゼーションを、セクション当たり80〜100μLの容量にて、0.47mMACl、54%ホルムアミド中で60℃にて20時間行った。放射性標識プローブを1×107cpm/mLで用いた。次いで、組織セクションを室温にて4× SSCで毎回10分間、4回洗浄した。ハイブリダイズしなかったプローブを、37℃における30分間のRNaseA(0.5M NaCl、10mMトリス、1mM EDTA、pH8.0中20μg/mL)でのインキュベーションで消化した。次いで、組織セクションを室温にて2× sscで毎回5分間2回洗浄し、続いて、1× SSCで室温にて10分間洗浄し、続いて、0.5× SSCで室温にて10分間洗浄した。続いて、組織セクションを0.1× SSCで65℃にて30分間洗浄し、続いて、0.1× SSCで室温にて5分間洗浄し、続いて、アルコール中で脱水した。
次いで、ハイブリダイゼーションを受けた組織セクションをX−線フィルムに暴露し、オートラジオグラフィーによってRUP40ハイブリダイゼーションシグナルを可視化した。この目的で、組織セクションをBiomax MRフィルムに一日間、4日間、次いで、暴露した。オートラジオグラフィーの後、MTB−2液体エマルジョン(VWR、#IB1654433、West、Chester、PA)を用いて組織セクションをエマルジョン浸漬した。エマルジョン浸漬した組織セクションを一週間エマルジョンに暴露し、ついで、現像した。現像の後、組織セクションをビスベンズイミド(PBS中0.001%)で逆染色し、カバーグラスに乗せた。暗視野コンデンサー(銀粒は白色に見える)およびDAPIフィルターキューブを用いて組織セクションを写真に撮って、(蛍光ビスベンズイミド逆染色を観察した)。
(結果)
横方向大動脈収縮(TAC)に由来する圧力過剰負荷の条件下で、RUP40の肥大レベルは維持される、またはわずかに増大した。結果を図7に示す。インサイチュハイブリダイゼーションは、成体マウス心臓における広い心筋発現を示した。アンチセンスRUP40放射性標識リボプローブは、心臓の全てのチャンバーにおけるRUP40発現を検出した。陰性コントロールとしての対象偽−操作マウスからのさらなるセクションについてセンスコントロールリボプローブを用いて、心臓セクションのプローブ標識のノイズ比率を示した。
横方向大動脈収縮(TAC)に由来する圧力過剰負荷の条件下で、RUP40の肥大レベルは維持される、またはわずかに増大した。結果を図7に示す。インサイチュハイブリダイゼーションは、成体マウス心臓における広い心筋発現を示した。アンチセンスRUP40放射性標識リボプローブは、心臓の全てのチャンバーにおけるRUP40発現を検出した。陰性コントロールとしての対象偽−操作マウスからのさらなるセクションについてセンスコントロールリボプローブを用いて、心臓セクションのプローブ標識のノイズ比率を示した。
(実施例17)
(肥大心筋障害のインビボ動物モデル)
本発明の化合物は、限定されるものではなく例示する意図の、Rockman et al.のインビボ動物モデル[Proc Natl Acad Sci USA(1991)88:8277−81;その開示をここで引用してその全体を援用する]を用いる肥大心筋障害についての予防または治療の効果を有することが示すことができ、ここで、マウスは横方向大動脈収縮(TAC)に由来する圧力過剰負荷の条件に付される。いくつかの実施形態において、該化合物は逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該化合物は腹腔内注射によって投与される。好ましい用量は0.1〜100mg/kgである。他の好ましい用量は0.1mg/kg、0.3mg/kg;1.0mg/kg;3.0mg/kg;10mg/kg;30mg/kgおよび100mg/kgからなる群より選択される。プラセボ群にはビヒクルを単独で投与する。
(肥大心筋障害のインビボ動物モデル)
本発明の化合物は、限定されるものではなく例示する意図の、Rockman et al.のインビボ動物モデル[Proc Natl Acad Sci USA(1991)88:8277−81;その開示をここで引用してその全体を援用する]を用いる肥大心筋障害についての予防または治療の効果を有することが示すことができ、ここで、マウスは横方向大動脈収縮(TAC)に由来する圧力過剰負荷の条件に付される。いくつかの実施形態において、該化合物は逆アゴニストまたはアンタゴニストである。該化合物は腹腔内注射によって投与される。好ましい用量は0.1〜100mg/kgである。他の好ましい用量は0.1mg/kg、0.3mg/kg;1.0mg/kg;3.0mg/kg;10mg/kg;30mg/kgおよび100mg/kgからなる群より選択される。プラセボ群にはビヒクルを単独で投与する。
マウスにおける横方向大動脈の外科的収縮は従前に記載されているように行う。[Rockman、HA et al,.Proc Natl Acad Sci USA(1991)88:8277−81]。簡単に述べれば、8週齢マウス(C57/BL6)をケタミンおよびヒシラジンの混合物で麻酔する。解剖顕微鏡下で、中線頸部切開を行って、ミクロ外科技術によって気管および頚動脈を露出させる。成功した気管内挿管の後、0.2mLの時機容量での補足酸素および一分当たり110の呼吸速度にて、カニューレを容量サイクルドげっ歯類ベンティレータ(Harvard Apparatus)に連結させた。胸腔を小さな切開を通じて左上方胸骨縁の第二の肋間空間に入れ、27−ゲージの針に対する7−0ナイロン縫合結紮を結ぶことによって大動脈収縮を行って、針を抜いたときの直径の0.4mm狭化および60〜70%の再現性のある横方向大動脈収縮(TAC)が得られた。大動脈バンディングに続き、気胸を排気し、動物から抜管し、回復させる。コントロール偽−手術マウスは外科的処置を受けたが、横方向大動脈収縮(TAC)には付さない。テスト化合物およびビヒクル単独の用量を腹腔内注射によって毎日投与する。外科的処置から7日後、生存する動物を安楽死させ、肥大心筋障害のいくつかのパラメータを評価した[Rockman、HA et al.,Proc Natl Acad Sci USA(1991)88:8277−81]。
湿潤および乾燥心臓重量を評価する。湿潤および乾燥心臓重量/体重比率を評価する。筋細胞の断面積(核における平均細胞面積)を評価する。mRNAの該レベルにおける心房性ナトリウム利尿因子(ANF)遺伝子の誘導を評価する。湿潤または乾燥心臓重量の低下、湿潤または乾燥心臓重量/体重比率の低下、筋細胞の断面積の低下、化合物の投与でのANF遺伝子の誘導のレベルの低下は、肥大型心筋症の予防または治療についての用途を有する化合物を示す。
(実施例18)
(経口生物学的利用性)
経口生物学的利用性を直接的に評価するための物理化学的分析アプローチは当業者によく知られており、それを用いることができる[例えば、限定するものではないが:Wong PC et al.,CardiovasCDrug Rev(200)20:137−52:およびP et al.,Headache(2002)Suppl 2:S54−62;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。限定されるものではなくさらに説明するために、該代替分析アプローチは液体クロマトグラフィー−タンデム質量測定を含むことができる[Chavez−Emg CM et al.,J ChromatogrB Analyt Technol Biomed Life Sci(2002)767:117−29;Jettr A et al.,Clil Pharmacol Ther(2002)71:21−9;Zimmerman JJ et al.,J Clin Pharmacof(1999)39:1155−61;およびBarrish A et al.,Rapid Commun Mass Spectrom(1996)10:1033−7;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。
(経口生物学的利用性)
経口生物学的利用性を直接的に評価するための物理化学的分析アプローチは当業者によく知られており、それを用いることができる[例えば、限定するものではないが:Wong PC et al.,CardiovasCDrug Rev(200)20:137−52:およびP et al.,Headache(2002)Suppl 2:S54−62;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。限定されるものではなくさらに説明するために、該代替分析アプローチは液体クロマトグラフィー−タンデム質量測定を含むことができる[Chavez−Emg CM et al.,J ChromatogrB Analyt Technol Biomed Life Sci(2002)767:117−29;Jettr A et al.,Clil Pharmacol Ther(2002)71:21−9;Zimmerman JJ et al.,J Clin Pharmacof(1999)39:1155−61;およびBarrish A et al.,Rapid Commun Mass Spectrom(1996)10:1033−7;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。
陽電子射出断層測定法(PET)は、薬物の経口投与の後に哺乳動物身体において、経口生物学的利用性を含めた薬物分布の直接的測定を得るのに成功して用いられてきた[Gulyas et al.,Eur J Nucl Med Mol Imaging(2002)29:1031−8;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
別法として、本発明のモジュレーターの経口生物学的利用性は、限定するものではなく例えば説明として、実施例17のマウスモデルを介して発展させたインビボデータに基づいて決定することができる。モジュレーターは、0.1mg kg−1〜100mg kg−1の範囲の用量にて経口胃管栄養によって投与される。モジュレーターの経口投与は、肥大型心筋症の予防または治療の用途を有することが示される。モジュレーターの効果は、用量−依存性であって、腹腔内投与の後の効果に匹敵することが示される。経口投与を介する、湿潤または乾燥心臓重量、湿潤または乾燥心臓重量/体重比率心筋細胞の断面積、またはANF遺伝子の誘導のレベルの半最大低下を達成するのに必要なモジュレーターの用量は、腹腔内投与を介する、湿潤または乾燥心臓重量、湿潤または乾燥心臓重量/体重比率心筋細胞の断面積、またはANF遺伝子の誘導のレベルの半最大低下を達成するのに必要なモジュレーターの用量に匹敵する。その例として、もし該経口用量が該腹腔内用量の2倍であれば、モジュレーターの経口生物学的利用性は50%をとる。より一般的には、もし該用量がθmg kg−1であって該腹腔内用量がρmg kg−1であれば、パーセンテージとしてのモジュレーターの経口生物学的利用性は[(ρ/θ)×100]をとる。いくつかの実施形態において、モジュレーターは逆アゴニストまたはアンタゴニストである。
本発明のモジュレーターの経口生物学的利用性の測定は、限定するものではなく例示する目的で本明細書中に示したもの以外のインビボ動物モデルを用いて行うことができるのは当業者に明らかであろう。参照投与経路は腹腔内以外とすることができるのは容易に考えられる。いくつかの実施形態において、該参照投与経路は静脈内とすることができる。
(実施例19)
(ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニックマウス/ラット/ブタ)
また、本発明は、ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物に関する方法および組成物を提供し、該レセプターは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;および
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、該非ヒト哺乳動物はマウス、ラットまたはブタである。
(ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニックマウス/ラット/ブタ)
また、本発明は、ヒトRUP40 GPCRの発現を含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物に関する方法および組成物を提供し、該レセプターは:
(a)配列番号2のアミノ酸1〜1,346;
(b)配列番号2のアミノ酸1〜990;
(c)配列番号2のアミノ酸991〜1,346;および
(d)配列番号2のアミノ酸954〜997;
からなる群より選択されるアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメント;配列番号2のアミノ酸配列の構成的に活性化された変異体、またはその該生物学的に活性なフラグメントを含む。いくつかの実施形態において、該非ヒト哺乳動物はマウス、ラットまたはブタである。
マウス、ラットおよびブタのようなトランスジェニック動物を作製する方法は当業者によく知られており、いずれのそのような方法も本発明で用いることができる。簡単に述べれば、トランスジェニック哺乳動物は、例えば、ES細胞のような多能性幹細胞を、ヒトRUP40 GPCRをコードするポリニクレオチド(「導入遺伝子」)でトランフェクトすることによって生産することができる。次いで、首尾よく形質転換されたES細胞を初期の段階の胚に導入することができ、次いで、これを同一種の哺乳動物の子宮に移植する。ある場合には、形質転換された(「トランスジェニック」)細胞は得られた動物の胚系の一部を含み、次いで、該胚系中のトランスジェニック細胞を含む成体動物を他の動物と接合させることができ、それにより、結局は、それらの細胞の各々中の導入遺伝子を有し、かつそれらの子孫の各々に導入遺伝子を安定に伝達することができるトランスジェニック動物の集団を生産することができる。ポリヌクレオチドを導入する他の方法を用いることができ、例えば、マイクロインジェクションを介して、ヒトRUP40 GPCRをコードするポリヌクレオチドを受精卵または初期段階の胚に導入する。別法として、導入遺伝子は、導入遺伝子を含有するレトロウィルスで接合体を感染させることによって動物に導入することができる[Jaenisch,R,Proc Natl Acad Sci USA(1976)73:1260−4]。トランスジェニック哺乳動物を作製する方法は、例えば、その各々の開示をここで引用してその全体を援用する、Wall et al.,J Cell Biochem(1992)49:113−20;Hogn et al.,in Manipulating the Mouse Embryo.,A Laboratory Manual.(1986)Cold Spring Harbour Laboratory Press,Cold Spring Harbour,N.Y.;in Costa et al.,FASEB J(1999)13:1762−73;WO 91/08216;米国特許第4,736,866号;および米国特許第6,504,080号に記載されている。
いくつかの実施形態において、ヒトRUP40 GPCRの該発現は心筋細胞−選択的である。いくつかの実施形態において、該ヒトRUP40 GPCRの該心筋細胞−選択的発現はアルファミオシン重鎖プロモーターによって付与される[Subramaniam A et al.,J Biol Chem (1991)266:24613−20;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
(実施例20)
(肥大型心筋症のトランスジェニックインビボ動物モデル)
本発明の化合物は、実施例19に記載されたトランスジェニックインビボ動物モデルを用い、心血管障害の予防または治療の効果を有することが示すことができ、ここで、該トランスジェニック動物は野生型コントロール動物に対して肥大型心筋症に対する素因を呈し、または肥大型心筋症を発現する。該心血管障害は心臓病、さらに詳しくは肥大型心筋症および鬱血性心不全を含む。もしいずれかの年齢において、上記動物が年齢にマッチした野生型コントロール動物に対して、増大した湿潤または乾燥心臓重量、増大した湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率、心筋細胞の増大した断面積、ANF遺伝子の誘導の増大したレベルを呈するならば、該トランスジェニック動物は肥大型心筋症に対する該素因を呈し、または肥大型心筋症を発現する。いくつかの実施形態において、該動物はマウスである。
(肥大型心筋症のトランスジェニックインビボ動物モデル)
本発明の化合物は、実施例19に記載されたトランスジェニックインビボ動物モデルを用い、心血管障害の予防または治療の効果を有することが示すことができ、ここで、該トランスジェニック動物は野生型コントロール動物に対して肥大型心筋症に対する素因を呈し、または肥大型心筋症を発現する。該心血管障害は心臓病、さらに詳しくは肥大型心筋症および鬱血性心不全を含む。もしいずれかの年齢において、上記動物が年齢にマッチした野生型コントロール動物に対して、増大した湿潤または乾燥心臓重量、増大した湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率、心筋細胞の増大した断面積、ANF遺伝子の誘導の増大したレベルを呈するならば、該トランスジェニック動物は肥大型心筋症に対する該素因を呈し、または肥大型心筋症を発現する。いくつかの実施形態において、該動物はマウスである。
該化合物は、該化合物を肥大型心筋症表現型の開始に先立って該トランスジェニック動物に投与し、ビヒクル単独が投与された該トランスジェニック動物によって呈された該肥大型心筋症表現型を妨げるかを判断することによって該心血管障害の予防の効果につき評価することができる。該化合物は、もしビヒクル単独を投与された該トランスジェニック動物によって呈された増大した湿潤または乾燥心臓重量、増大した湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率、心筋細胞の増大した断面積、またはANF遺伝子の誘導の増大したレベルを該化合物の投与が妨げれば、該心血管障害の予防につき効果を有すると示すことができる。
該化合物は、肥大型心筋症表現型の開始後に該化合物を該トランスジェニック動物に投与し、該投与が肥大型心筋症を阻害し、または軽減するかを決定することによって、外心血管障害の治療につき効果を評価することができる。該化合物は、もし該化合物の投与が、ビヒクル単独を投与された該トランスジェニック動物によって呈された増大した湿潤または乾燥心臓重量、増大した湿潤または乾燥心臓重量/体重の比率、心筋細胞の増大した断面積、またはANF遺伝子の誘導の増大したレベルを阻害するか軽減するならば、該心血管障害の阻害または軽減の効果を有すると示すことができる。
いくつかの実施形態において、該化合物は逆アゴニストまたはアンタゴニストである。いくつかの実施形態において、該化合物は腹腔内注射によって投与される。好ましい用量は0.1〜100mg/kgである。他の好ましい用量は0.1mg/kg、0.3mg/kg;1.0mg/kg;3.0mg/kg;10mg/kg;30mg/kgおよび100mg/kgからなる群より選択される。プラセボ群にはビヒクル単独を投与する。いくつかの実施形態において、該用量は毎日投与される。いくつかの実施形態において、該用量は1週間、2週間、3週間、および4週間の群から選択される期間の間投与される。この投与の経路、これらの投与量範囲、用量投与のこの頻度、および用量投与のこの持続は例示的なものであって、本発明を限定する意図のものではないことに注意されたし。
(実施例21)
(RUP40遺伝子中の破壊を含むトランスジェニックマウス/ラット/ブタ)
(マウス)
好ましいDNA構築体は、5’−末端から3’−末端へと:(a)マウスRUP40ゲノム配列に含まれる最初のヌクレオチド配列;(b)ネオマイシン抵抗性についてのマーカー(neo)のような陽性選択マーカーを含むヌクレオチド配列;および(c)マウスRUP40ゲノム配列に含まれ、最初のマウスRUP40ヌクレオチド配列(a)の下流のゲノムに位置する第2のヌクレオチド配列を含む。マウスRUP40ゲノム配列は、当業者によく知られた方法を用いて単離される(Maniatis T et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual (1989)Cold Spring Harbour Laboratory;その開示をここで引用してその全体を援用する)。マウスRUP40ゲノム配列の該単離用のプローブは、マウスRUP40ポリペプチドをコードするcDNAに由来し、ここで、該cDNAはマウス心臓、肺または脂肪組織からのmRNAを鋳型として用いて得ることができる。
(RUP40遺伝子中の破壊を含むトランスジェニックマウス/ラット/ブタ)
(マウス)
好ましいDNA構築体は、5’−末端から3’−末端へと:(a)マウスRUP40ゲノム配列に含まれる最初のヌクレオチド配列;(b)ネオマイシン抵抗性についてのマーカー(neo)のような陽性選択マーカーを含むヌクレオチド配列;および(c)マウスRUP40ゲノム配列に含まれ、最初のマウスRUP40ヌクレオチド配列(a)の下流のゲノムに位置する第2のヌクレオチド配列を含む。マウスRUP40ゲノム配列は、当業者によく知られた方法を用いて単離される(Maniatis T et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual (1989)Cold Spring Harbour Laboratory;その開示をここで引用してその全体を援用する)。マウスRUP40ゲノム配列の該単離用のプローブは、マウスRUP40ポリペプチドをコードするcDNAに由来し、ここで、該cDNAはマウス心臓、肺または脂肪組織からのmRNAを鋳型として用いて得ることができる。
好ましい実施形態において、このDNA構築体はヌクレオチド配列(a)の上流、またはヌクレオチド配列(c)の下流に位置する陰性選択マーカーも含む。好ましくは、陰性選択マーカーはチミジンキナーゼ(tk)遺伝子[Thomas et al.,Cell(1986)44:419−28]、ヒグロマイシンベータ遺伝子[Te Reid et al.,Proc Natl Acad Sci USA(1990)87:4299−4303]またはジフテリアトキシンAフラグメント(Dt−A)遺伝子[Nada et al.,Cell(1993)73:1125−35;Yagi et al.,Proc Natl Acad Sci USA(1990)87:9918−9922]を含み、それらの開示をここで引用してその全体を援用する。好ましくは、陽性選択マーカーは、マウスRUP40ポリペプチドをコードする配列を中断するように、マウスRUP40エクソン配列内に位置する。これらの置き換えベクターは、例えば、その開示をここで引用してその全体を援用する、Thomas et al.,Cell(1986)44:419−28;Thomas et al.,Cell(1987)51:503−12;Mansour et al.,Nature(1988)336:348−52;Koller et al.,Annu Rev Immunol(1992)10:705−30;および米国特許第5,631,153号によって記載されている。
第1および第2のヌクレオチド配列(a)および(c)はマウスRUP40調節配列、イントロン配列、エクソン配列または調節および/またはイントロンおよび/またはエクソン配列双方を含む配列内に異ならなく位置することができる。ヌクレオチド配列(a)および(c)のサイズは1〜50kb、好ましくは1〜10kb、より好ましくは2〜6kb、最も好ましくは2〜4kbの範囲である。
選択された遺伝子に破壊を含むトランスジェニックマウスを作製する方法は当業者によく知られており、首尾よく広い範囲の遺伝子を不活化するのに用いられてきた。
(ラット)
類似の、または別の[例えば、Zan et al.,Nature Biotechnology(2003)21:645−51;その開示をここで引用してその全体を援用する]方法を用いて、RUP40遺伝子中に破壊を含むトランスジェニックラットを作製することができる。
類似の、または別の[例えば、Zan et al.,Nature Biotechnology(2003)21:645−51;その開示をここで引用してその全体を援用する]方法を用いて、RUP40遺伝子中に破壊を含むトランスジェニックラットを作製することができる。
(ブタ)
類似の、または別の方法を用いて、RUP40遺伝子中に破壊を含むトランスジェニックブタを作製することができる。[例えば、Lai et al.,Science(2002)295:1089−1092参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
類似の、または別の方法を用いて、RUP40遺伝子中に破壊を含むトランスジェニックブタを作製することができる。[例えば、Lai et al.,Science(2002)295:1089−1092参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
(Cre loxP系:)
(RUP40遺伝子中に心筋細胞−選択的破壊を含むトランスジェニックマウス/ラット/ブタ)
(マウス)
これらの新しいDNA構築体は、P1ファージの部位特異的組換え系を用いる。該P1ファージは34塩基対loxP部位と相互作用するCreと呼ばれるレコンビナーゼを保有する。該loxP部位は8bpの保存された配列によって分離された13bpの2つの回文配列を含む[Hoess RH et al.,Nucleic Acids Res(1986)14;2287−300;その開示をここで引用してその全体を援用する]。同一の向きを有する2つのloxP部位の間のCre酵素による組換えは、DNAフラグメントの欠失に導く。
(RUP40遺伝子中に心筋細胞−選択的破壊を含むトランスジェニックマウス/ラット/ブタ)
(マウス)
これらの新しいDNA構築体は、P1ファージの部位特異的組換え系を用いる。該P1ファージは34塩基対loxP部位と相互作用するCreと呼ばれるレコンビナーゼを保有する。該loxP部位は8bpの保存された配列によって分離された13bpの2つの回文配列を含む[Hoess RH et al.,Nucleic Acids Res(1986)14;2287−300;その開示をここで引用してその全体を援用する]。同一の向きを有する2つのloxP部位の間のCre酵素による組換えは、DNAフラグメントの欠失に導く。
相同組換え技術と組み合わせて用いるCre−loxP系はGu et al.によって最初に記載された[Gu H et al.,Cell(1993)73:1155−64;Gu H et al.,Science(1994)265:103−6;その開示をここで引用してその全体を援用する]。簡単に述べれば、ゲノムの標的とする位置に挿入すべき注目するヌクレオチド配列は、同一の向きに、かつ組換え体ゲノムから切り出すべきヌクレオチド配列の各末端に位置する少なくとも2つのloxP部位を保有する。切り出し事象は、組換え細胞宿主の核内にレコンビナーゼ(Cre)酵素の存在を必要とする。レコンビナーゼ酵素は(a)Baubonis et al.によって記載されているような[Baubonis W and Sauer B,Nucleic Acids Res(1993)21:2025−9;その開示をここで引用してその全体を援用する]、酵素の細胞へのリポフェクションによるように、Cre酵素を所望の細胞に直接的に注射することによって、この酵素を含有する培養基中で組換え細胞宿主をインキュベートし;(b)Gu et al.[Gu H et al.,Cell(1993)73:1155−64;その開示をここで引用してその全体を援用する]およびSauer et al.[Sauer B and Henderson N,Proc Natl Acad Sci USA(1988)85:5166−70;その開示をここで引用してその全体を援用する]によって記載されているように、組換え宿主細胞において機能的なプロモーターに操作可能に連結したCreコーディング配列を含むベクターで宿主細胞をトランスフェクトし、そのプロモーターは所望により誘導性であり、該ベクターは組換え細胞宿主に導入され;(c)Gu et al.[Gu H et al.,Science(1994)265:103−6;その開示をここで引用してその全体を援用する]によって記載されているように、組換え細胞宿主において機能的なプロモーターに操作可能に連結したCreコーディング配列を含むポリヌクレオチドを宿主細胞のゲノムに導入することによって(そのプロモーターは所望により誘導性であり、該ポリヌクレオチドはランダム挿入事象または相同組換え事象いずれかによって宿主細胞のゲノムに挿入される)所望の時点に運ぶことができる。
Cre−loxP系を用いるベクターおよび方法は、例えば、その各々の開示をここで引用してその全体を援用するZou et al.(1994);Minamisawa S et al.,J Biol Chem(1999)274:10066−70;Chen et al.,J Biol Chem(1998)273:1252−6;Chen et al.,Development(1998)125:1943−9によって記載されている。
本発明の好ましい実施形態において、Creは前記戦略(c)によって宿主細胞のゲノムに導入され、ここで、該プロモーターは心筋細胞選択的であり、(loxP−近接;「フロックスド(floxed)」)マウスRUP40ゲノム配列の心筋細胞選択的破壊に導く。いくつかの実施形態において、該心筋細胞選択的プロモーターはミオシン軽鎖2(mLc−2v)の心室特異的イソ形態のためのそれである[Minamisawa S et al.,J Biol Chem (1999)274:10066−70;Chen et al.,J Biol Chem(1998)274:1252−6;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する]。Creレコンビナーゼをコードする配列の内因性mlc−2v遺伝子座への挿入を含むトランスジェニックマウス(「mlc−2v creノック−インマウス」)は記載されている[Chen et al.,Development(1998)125:1943−9;その開示をここで引用してその全体を援用する]。選択された遺伝子をフロックスする方法は当業者の技量内のものである[例えば、Chen et al.,Development(1998)125:1943−9参照]。
いくつかの実施形態において、本発明は、mlc−2cre対立遺伝子(前掲)をフロックスドRUP40遺伝子と交雑することを含む、RUP40遺伝子の心筋細胞選択的破壊を含むトランスジェニックマウスの作製方法をその要旨とする。
RUP40遺伝子に心筋細胞選択的破壊を含むトランスジェニックマウスを作製する他の方法は当業者によく知られている;例えば、Kuhn R and Torres RM,Methods Mol Biol(2002)180:175−204;Sauer B,Methods(1998)14:381−92;Gutstein DE et al.,Circulation Research(2001)88:333;Minamino T et al.,Circulation Research(2001)88:587;およびBex A et al.,J Urol(2002)168:2641−2644参照;その各々の開示をここで引用してその全体を援用する。
(ラット)
類似の、または別の[例えば、Zen et al.,Nature Biotechnology(2003)21:645−51参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]方法を用いて、RUP40遺伝子に心筋細胞破壊を含むトランスジェニックラットを作製することができる。
類似の、または別の[例えば、Zen et al.,Nature Biotechnology(2003)21:645−51参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]方法を用いて、RUP40遺伝子に心筋細胞破壊を含むトランスジェニックラットを作製することができる。
(ブタ)
類似の、または別の方法を用いて、RUP40遺伝子に心筋細胞−選択的破壊を含むトランスジェニックブタを作製することができる。[例えば、Lai et al.,Science(2002)295:1089−1092参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
類似の、または別の方法を用いて、RUP40遺伝子に心筋細胞−選択的破壊を含むトランスジェニックブタを作製することができる。[例えば、Lai et al.,Science(2002)295:1089−1092参照;その開示をここで引用してその全体を援用する]。
Claims (11)
- 心臓肥大、左心室肥大、右心室肥大、および肥大型心筋症より選択される障害を予防または処置するため、あるいは該障害の予防または処置に適した組成物であって、配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 Gタンパク質共役型レセプター(GPCR)の逆アゴニストを含む、組成物。
- 鬱血性心不全または鬱血性心筋症における心筋細胞肥大を予防または処置するため、あるいは鬱血性心不全または鬱血性心筋症における心筋細胞肥大の予防または処置に適した組成物であって、配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストを含む、組成物。
- 心筋梗塞後リモデリングにおける心筋細胞肥大を予防または処置するため、あるいは心筋梗塞後リモデリングにおける心筋細胞肥大の予防または処置に適した組成物であって、配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストを含む、組成物。
- 前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、請求項1〜3のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記RUP40レセプターがヒトRUP40レセプターである、請求項1〜4のいずれか1項に記載の組成物。
- 心臓肥大、左心室肥大、右心室肥大、および肥大型心筋症より選択される障害を予防または処置するため、あるいは該障害の予防または処置に適した薬学的組成物であって、配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 Gタンパク質共役型レセプター(GPCR)の逆アゴニストを含む、薬学的組成物。
- 鬱血性心不全または鬱血性心筋症における心筋細胞肥大を予防または処置するため、あるいは鬱血性心不全または鬱血性心筋症における心筋細胞肥大の予防または処置に適した薬学的組成物であって、配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストを含む、薬学的組成物。
- 心筋梗塞後リモデリングにおける心筋細胞肥大を予防または処置するため、あるいは心筋梗塞後リモデリングにおける心筋細胞肥大の予防または処置に適した薬学的組成物であって、配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 GPCRの逆アゴニストを含む、薬学的組成物。
- 前記肥大型心筋症が、以下:
(a)心筋梗塞後リモデリング;
(b)心臓弁疾患;
(c)持続した心後負荷;
(d)心筋炎;および
(e)家族性肥大型心筋症;
からなる群より選択される障害に由来する、請求項6〜8のいずれか1項に記載の薬学的組成物。 - 前記RUP40レセプターがヒトRUP40レセプターである、請求項6〜9のいずれか1項に記載の薬学的組成物。
- 配列番号2のアミノ酸配列、または、1以上のアミノ酸の置換、付加および/もしくは欠失によって配列番号2から誘導された内因性のアミノ酸配列を有するRUP40 Gタンパク質共役型レセプター(GPCR)の逆アゴニストを含む、薬学的組成物。
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