JP2010115122A5 - - Google Patents

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Claims (30)

以下の（ａ）または（ｂ）に記載の塩基配列で表される核酸を用いてアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌の同定を行うことを特徴とするアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌の検出方法。
（ａ）配列番号１若しくは２に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、又はその相補配列
（ｂ）配列番号１若しくは２に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、又はその相補配列 A method for detecting an Aspergillus fumigatus ( Aspergillus fumigatus ) -related bacterium characterized by identifying an Aspergillus fumigatus ( Aspergillus fumigatus ) -related bacterium using a nucleic acid represented by the base sequence described in (a) or (b) below .
(A) Partial base sequence of β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 1 or 2 or its complementary sequence (b) One or several bases are deleted or replaced in the base sequence described in SEQ ID NO: 1 or 2 or added in the nucleotide sequence, or its complementary sequence 同定を行うために、前記（ａ）または（ｂ）に記載の塩基配列で表される核酸中の領域を遺伝子増幅し、遺伝子増幅産物の有無を確認することを特徴とする請求項１記載のアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌の検出方法。 The region of the nucleic acid represented by the base sequence described in (a) or (b) above is subjected to gene amplification for identification, and the presence or absence of a gene amplification product is confirmed. A method for detecting an Aspergillus fumigatus related bacterium. 前記アスペルギルス フミガタス類縁菌がアスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）、アスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）及びアスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）からなる群より選ばれる少なくとも１種である請求項１又は２記載の検出方法。 The Aspergillus fumigatus related bacteria Aspergillus lentus (Aspergillus lentulus), Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus) and Aspergillus Udagawae (Aspergillus udagawae) at least one detection method according to claim 1 or 2, wherein selected from the group consisting of. 前記アスペルギルス フミガタス類縁菌がアスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）であって、以下の（ａ−１）または（ｂ−１）に記載の塩基配列で表される核酸中の領域を遺伝子増幅し、遺伝子増幅産物の有無を確認することを特徴とする請求項２又は３記載の検出方法。
（ａ−１）配列番号１に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、若しくはその相補配列
（ｂ−１）配列番号１に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、若しくはその相補配列 The Aspergillus fumigatus-related bacterium is Aspergillus lentulus and / or Aspergillus fumicinetus ( Aspergillus fumignanematus ), which is represented by the base sequence described in the following (a-1) or (b-1) The detection method according to claim 2 or 3, wherein the region is subjected to gene amplification and the presence or absence of a gene amplification product is confirmed.
(A-1) Partial base sequence of β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 1 or its complementary sequence (b-1) One or several bases deleted or substituted in the base sequence described in SEQ ID NO: 1 Or the added base sequence or its complementary sequence 前記アスペルギルス フミガタス類縁菌がアスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）であって、以下の（ａ−２）または（ｂ−２）に記載の塩基配列で表される核酸中の領域を遺伝子増幅し、遺伝子増幅産物の有無を確認することを特徴とする請求項２又は３記載の検出方法。
（ａ−２）配列番号２に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、若しくはその相補配列
（ｂ−２）配列番号２に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、若しくはその相補配列 The Aspergillus fumigatus related bacteria an Aspergillus Udagawae (Aspergillus udagawae), the following areas in the nucleic acid represented by the nucleotide sequence set forth in (a-2) or (b-2) gene amplification, gene amplification products 4. The detection method according to claim 2 or 3, wherein the presence or absence of the above is confirmed.
(A-2) Partial base sequence of the β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 2 or its complementary sequence (b-2) One or several bases are deleted or replaced in the base sequence described in SEQ ID NO: 2 Or the added base sequence or its complementary sequence 前記遺伝子増幅反応をポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）法によって行うことを特徴とする請求項２〜５のいずれか１項に記載の検出方法。 The detection method according to any one of claims 2 to 5 , wherein the gene amplification reaction is performed by a polymerase chain reaction (PCR) method. 下記（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドを核酸プライマーとして用いて増幅反応を行い、アスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）を検出することを特徴とする請求項６記載の検出方法。
（ｃ）配列番号３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつプライマーとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｄ）配列番号４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつプライマーとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド The following oligonucleotides (c) and (d) perform an amplification reaction using as a nucleic acid primer, Aspergillus lentus (Aspergillus lentulus) and / or Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus) according to claim 6, wherein the detecting the Detection method.
(C) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 3 or an oligonucleotide represented by a base sequence having 70% or more homology to the base sequence and usable as a primer (d) Oligonucleotide represented by the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4, or oligonucleotide represented by a nucleotide sequence having 70% or more homology with the nucleotide sequence and usable as a primer 下記（ｅ）及び（ｆ）のオリゴヌクレオチドを核酸プライマーとして用いて増幅反応を行い、アスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）を検出することを特徴とする請求項６記載の検出方法。
（ｅ）配列番号５に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつプライマーとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｆ）配列番号６に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつプライマーとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド The detection method according to claim 6 , wherein an amplification reaction is carried out using the following oligonucleotides (e) and (f) as nucleic acid primers to detect Aspergillus udagawae .
(E) the oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 5 or the oligonucleotide represented by the base sequence that has 70% or more homology to the base sequence and can be used as a primer (f) Oligonucleotide represented by the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 6, or oligonucleotide represented by a nucleotide sequence having 70% or more homology with the nucleotide sequence and usable as a primer 前記遺伝子増幅反応をＬｏｏｐ ｍｅｄｉａｔｅｄ ｉｓｏｔｈｅｒｍａｌ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ（ＬＡＭＰ）法によって行うことを特徴とする請求項２〜５のいずれか１項に記載の検出方法。 The detection method according to any one of claims 2 to 5 , wherein the gene amplification reaction is carried out by a loop mediated thermal amplification (LAMP) method. 下記（ｇ）〜（ｊ）のオリゴヌクレオチドセットを核酸プライマーとして用いて増幅反応を行い、アスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）を検出することを特徴とする請求項９記載の検出方法。
（ｇ）配列番号７に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｈ）配列番号８に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｉ）配列番号９に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｊ）配列番号１０に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド The oligonucleotide sets the following (g) ~ (j) carried out an amplification reaction using as a nucleic acid primer according to claim 9, wherein the detecting Aspergillus lentus (Aspergillus lentulus) and / or Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus) Detection method.
(G) Oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 7 (h) Oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 8 (i) Oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 9 Nucleotide (j) Oligonucleotide represented by the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 10 請求項１０記載の検出方法であって、さらに下記（ｋ）及び／又は（ｌ）のオリゴヌクレオチドを核酸プライマーとして用いる請求項１０記載の検出方法。
（ｋ）配列番号１１に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｌ）配列番号１２に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド A claim 1 0 detection method according further detection method of claim 1 0, wherein using oligonucleotide as a nucleic acid primer below (k) and / or (l).
(K) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 11 (l) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 12 下記（ｍ）〜（ｐ）のオリゴヌクレオチドセットを核酸プライマーとして用いて増幅反応を行い、アスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）を検出することを特徴とする請求項９記載の検出方法。
（ｍ）配列番号１３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｎ）配列番号１４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｏ）配列番号１５に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｐ）配列番号１６に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド The detection method according to claim 9 , wherein an amplification reaction is performed using the following oligonucleotide sets (m) to (p) as nucleic acid primers to detect Aspergillus udagawae .
(M) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 13 (n) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 14 (o) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 15 Nucleotide (p) Oligonucleotide represented by the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 16 請求項１２記載の検出方法であって、さらに下記（ｑ）及び／又は（ｒ）のオリゴヌクレオチドを核酸プライマーとして用いる請求項１２記載の検出方法。
（ｑ）配列番号１７に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｒ）配列番号１８に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド The detection process of claim 1 2 further detection method of claim 1 wherein using the oligonucleotide as a nucleic acid primer below (q) and / or (r).
(Q) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 17 (r) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 18 同定を行うために、被検菌のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列を決定し、該遺伝子の塩基配列中に前記（ａ）または（ｂ）に記載の核酸の塩基配列が含まれるか否かを確認することを特徴とする請求項１記載のアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌の検出方法。  In order to perform identification, the base sequence of the β-tubulin gene of the test bacterium is determined, and whether the base sequence of the nucleic acid described in (a) or (b) is included in the base sequence of the gene The method for detecting an Aspergillus fumigatus-related bacterium according to claim 1, wherein: 前記アスペルギルス フミガタス類縁菌がアスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）、アスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）及びアスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）からなる群より選ばれる少なくとも１種である請求項１４記載の検出方法。  15. The method according to claim 14, wherein the Aspergillus fumigatus-related fungus is at least one species selected from the group consisting of Aspergillus lentulus, Aspergillus fumicinetus and Aspergillus udagawae. アスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌の検出に用いるための、下記（ａ）または（ｂ）に記載の塩基配列で表されるＤＮＡ。
（ａ）配列番号１若しくは２に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、又はその相補配列
（ｂ）配列番号１若しくは２に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、又はその相補配列 A DNA represented by the base sequence described in the following (a) or (b) for use in detecting an Aspergillus fumigatus- related bacterium.
(A) Partial base sequence of β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 1 or 2 or its complementary sequence (b) One or several bases are deleted or replaced in the base sequence described in SEQ ID NO: 1 or 2 Or the added base sequence or its complementary sequence アスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）の検出に用いるための、下記（ａ−１）または（ｂ−１）に記載の塩基配列で表されるＤＮＡ。
（ａ−１）配列番号１に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、若しくはその相補配列
（ｂ−１）配列番号１に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、若しくはその相補配列 Aspergillus lentus for use in the detection of (Aspergillus lentulus) and / or Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus), DNA represented by the nucleotide sequence set forth in the following (a-1) or (b-1).
(A-1) Partial base sequence of β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 1 or its complementary sequence (b-1) One or several bases deleted or substituted in the base sequence described in SEQ ID NO: 1 Or the added base sequence or its complementary sequence アスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）の検出に用いるための、下記（ａ−２）または（ｂ−２）に記載の塩基配列で表されるＤＮＡ。
（ａ−２）配列番号２に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、若しくはその相補配列
（ｂ−２）配列番号２に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、若しくはその相補配列 A DNA represented by the base sequence described in the following (a-2) or (b-2) for use in detecting Aspergillus udagawae .
(A-2) Partial base sequence of the β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 2 or its complementary sequence (b-2) One or several bases are deleted or replaced in the base sequence described in SEQ ID NO: 2 Or the added base sequence or its complementary sequence 下記（ａ）または（ｂ）に記載の塩基配列で表される核酸にハイブリダイズすることができ、アスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌を特異的に検出するための核酸プローブ又は核酸プライマーとして機能し得るアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌検出用オリゴヌクレオチド。
（ａ）配列番号１若しくは２に記載のβ−チューブリン遺伝子の部分塩基配列、又はその相補配列
（ｂ）配列番号１若しくは２に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列、又はその相補配列 It can hybridize to a nucleic acid represented by the base sequence described in (a) or (b) below, and functions as a nucleic acid probe or nucleic acid primer for specifically detecting an Aspergillus fumigatus- related bacterium. Obtained oligonucleotide for detecting Aspergillus fumigatus-related bacteria.
(A) Partial base sequence of β-tubulin gene described in SEQ ID NO: 1 or 2 or its complementary sequence (b) One or several bases are deleted or replaced in the base sequence described in SEQ ID NO: 1 or 2 Or the added base sequence or its complementary sequence 前記検出用オリゴヌクレオチドが、配列番号３〜１８のいずれかに記載の塩基配列若しくはその相補配列で表されるオリゴヌクレオチド、または当該塩基配列若しくはその相補配列に対して７０％以上の相同性を有するオリゴヌクレオチドであることを特徴とする請求項１９記載のアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌検出用オリゴヌクレオチド。 The oligonucleotide for detection has 70% or more homology with the oligonucleotide represented by the base sequence shown in any of SEQ ID NOs: 3 to 18 or its complementary sequence, or the base sequence or its complementary sequence Aspergillus according to claim 1 9, wherein the oligonucleotide fumigatus (Aspergillus fumigatus) analogous bacteria detector oligonucleotide. 下記の（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドからなるアスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）検出用オリゴヌクレオチド対。
（ｃ）配列番号３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつ検出用オリゴヌクレオチドとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｄ）配列番号４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつ検出用オリゴヌクレオチドとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド Following (c) and (d) of Aspergillus lentus (Aspergillus lentulus) consisting of oligonucleotides and / or Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus) detector oligonucleotide pair.
(C) the oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 3 or the oligonucleotide represented by the base sequence having 70% or more homology to the base sequence and usable as a detection oligonucleotide (D) the oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 4 or the oligonucleotide represented by the base sequence having 70% or more homology to the base sequence and usable as a detection oligonucleotide 下記の（ｅ）及び（ｆ）のオリゴヌクレオチドからなるアスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）検出用オリゴヌクレオチド対。
（ｅ）配列番号５に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつ検出用オリゴヌクレオチドとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド
（ｆ）配列番号６に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は当該塩基配列に対して７０％以上の相同性を有しかつ検出用オリゴヌクレオチドとして使用できる塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド A pair of oligonucleotides for detection of Aspergillus udagawae comprising the following oligonucleotides (e) and (f):
(E) the oligonucleotide represented by the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 5 or the oligonucleotide represented by the nucleotide sequence having 70% or more homology with the nucleotide sequence and usable as a detection oligonucleotide (F) an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 6 or an oligonucleotide represented by a base sequence having 70% or more homology to the base sequence and usable as a detection oligonucleotide 前記オリゴヌクレオチド対が核酸プライマー対であることを特徴とする、請求項２１または２２記載のオリゴヌクレオチド対。 Characterized in that the oligonucleotide pair is a nucleic acid primer pair, the oligonucleotide pair of claim 2 1, 2 2 wherein. 核酸プライマー対として請求項２１記載のオリゴヌクレオチド対及び／又は請求項２２記載のオリゴヌクレオチド対を含むアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌検出用キット。 Claim 2 1 oligonucleotide pair and / or claim 2 Aspergillus fumigatus (Aspergillus fumigatus) containing 2 oligonucleotide pair described analogous bacteria detecting kit according as a nucleic acid primer pair. 下記の（ｇ）〜（ｊ）のプライマーからなるアスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）検出用プライマーセット。
（ｇ）配列番号７に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｈ）配列番号８に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｉ）配列番号９に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｊ）配列番号１０に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー Following (g) ~ consisting primer (j) Aspergillus lentus (Aspergillus lentulus) and / or Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus) detection primer set.
(G) a primer composed of an oligonucleotide represented by the base sequence described in SEQ ID NO: 7 (h) a primer composed of an oligonucleotide represented by the base sequence described in SEQ ID NO: 8 (i) a base described in SEQ ID NO: 9 Primer comprising an oligonucleotide represented by the sequence (j) Primer comprising the oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 10 請求項２５記載のプライマーセットがさらに下記（ｋ）及び／又は（ｌ）のプライマーを含むことを特徴とする請求項２５記載のアスペルギルス レンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｌｅｎｔｕｌｕｓ）及び／又はアスペルギルス フミシネマタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｓｙｎｎｅｍａｔｕｓ）検出用プライマーセット。
（ｋ）配列番号１１に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｌ）配列番号１２に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー Claim 2 5 primer set described further below (k) and / or claim 2 5, wherein the Aspergillus lentus, characterized in that it comprises a primer (l) (Aspergillus lentulus) and / or Aspergillus Fumishinematasu (Aspergillus fumisynnematus) Detection primer set.
(K) Primer comprising an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 11 (l) Primer comprising an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 12 下記の（ｍ）〜（ｐ）のプライマーからなるアスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）検出用プライマーセット。
（ｍ）配列番号１３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｎ）配列番号１４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｏ）配列番号１５に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｐ）配列番号１６に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー A primer set for detecting Aspergillus udagawae comprising the following primers (m) to (p):
(M) a primer composed of an oligonucleotide represented by the base sequence described in SEQ ID NO: 13 (n) a primer composed of an oligonucleotide represented by the base sequence described in SEQ ID NO: 14 (o) a base described in SEQ ID NO: 15 Primer comprising an oligonucleotide represented by the sequence (p) Primer comprising the oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 16 請求項２７記載のプライマーセットがさらに下記（ｑ）及び／又は（ｒ）のプライマーを含むことを特徴とする請求項２７記載のアスペルギルス ウダガワエ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｕｄａｇａｗａｅ）検出用プライマーセット。
（ｑ）配列番号１７に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー
（ｒ）配列番号１８に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドからなるプライマー Claim 2 7 claims 2 7 Aspergillus Udagawae (Aspergillus udagawae) detection primer set according primer set further characterized in that it comprises the following primers (q) and / or (r) according.
(Q) Primer consisting of an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 17 (r) Primer consisting of an oligonucleotide represented by the base sequence set forth in SEQ ID NO: 18 アスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列から選択される標的領域の配列の５’側から順に、塩基配列領域としてＦ３、Ｆ２及びＦ１を選択し、
前記標的領域の３’側から順に、塩基配列領域としてＢ３ｃ、Ｂ２ｃ及びＢ１ｃを選択し、
前記Ｆ３、Ｆ２及びＦ１の相補的塩基配列を、それぞれＦ３ｃ、Ｆ２ｃ及びＦ１ｃとし、
前記Ｂ３ｃ、Ｂ２ｃ及びＢ１ｃに相補的な塩基配列を、それぞれＢ３、Ｂ２及びＢ１としたとき、
以下の（ａ）〜（ｆ）のいずれかに該当する塩基配列で表されるアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌検出用オリゴヌクレオチド。
（ａ）前記Ｂ２領域を３’側に有し、前記Ｂ１ｃ領域を５’側に有する塩基配列
（ｂ）前記Ｂ３領域を有する塩基配列
（ｃ）前記Ｆ２領域を３’側に有し、前記Ｆ１ｃ領域を５’側に有する塩基配列
（ｄ）前記Ｆ３領域を有する塩基配列
（ｅ）前記Ｂ１領域と前記Ｂ２領域の間の部分と相補的な配列を有する塩基配列
（ｆ）前記Ｆ１領域と前記Ｆ２領域の間の部分と相補的な配列を有する塩基配列 F3, F2 and F1 are selected as base sequence regions in order from the 5 ′ side of the sequence of the target region selected from the base sequence of the β-tubulin gene of Aspergillus fumigatus- related bacteria.
In order from the 3 ′ side of the target region, B3c, B2c and B1c are selected as base sequence regions,
The complementary base sequences of F3, F2 and F1 are F3c, F2c and F1c, respectively.
When the base sequences complementary to B3c, B2c and B1c are B3, B2 and B1, respectively,
An oligonucleotide for detecting Aspergillus fumigatus- related bacteria represented by a base sequence corresponding to any of the following (a) to (f):
(A) a base sequence having the B2 region on the 3 ′ side and a B1c region on the 5 ′ side (b) a base sequence having the B3 region (c) having the F2 region on the 3 ′ side; A base sequence having an F1c region on the 5 ′ side (d) a base sequence having the F3 region (e) a base sequence having a sequence complementary to a portion between the B1 region and the B2 region (f) the F1 region A base sequence having a sequence complementary to a portion between the F2 regions 請求項２５、２６、２７若しくは２８記載のプライマーセットまたは請求項２９記載のオリゴヌクレオチドと、
ＤＮＡポリメラーゼと、
ｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ及びｄＴＴＰを含むｄＮＴＰと、
を含むアスペルギルス フミガタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）類縁菌検出キット。
The claims 2 5, 2 6, 2 7 or 2 8 primer sets or claim 2 9, wherein the oligonucleotide according,
DNA polymerase;
dNTPs including dATP, dCTP, dGTP and dTTP;
Aspergillus fumigatus ( Aspergillus fumigatus ) -related bacteria detection kit.
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