JP2009514526A - IRE−1α基質 - Google Patents
IRE−1α基質 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2009514526A JP2009514526A JP2008538855A JP2008538855A JP2009514526A JP 2009514526 A JP2009514526 A JP 2009514526A JP 2008538855 A JP2008538855 A JP 2008538855A JP 2008538855 A JP2008538855 A JP 2008538855A JP 2009514526 A JP2009514526 A JP 2009514526A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- substrate
- ire
- moiety
- protein
- donor
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Withdrawn
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
- C12Q1/6818—Hybridisation assays characterised by the detection means involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
Abstract
Description
本発明は、IRE-1αに対する基質に関する。
折り畳まれていないタンパク質への反応(unfolded protein response)(UPR)とは、小胞体(ER)管腔において誤って折り畳まれたタンパク質の蓄積に反応する、細胞内シグナル伝達経路である。UPRは多くのヒト疾患における特筆すべき因子として、認識が高まっている。UPRのアップレギュレーションは、腫瘍生存およびB細胞自己免疫に対して重要であると考えられているが、UPR抑制はアルツハイマー病および二型糖尿病などの疾患と関連づけられている。
本発明は、とりわけIRE-1αに対する最小の基質を提供し、これはIRE-1α RNアーゼ活性、特にヒトIRE-1α RNアーゼ活性のアゴニストおよびアンタゴニストを同定するための本発明のスクリーニングアッセイに使用できる。また本発明は、IRE-1αが切断しない変異基質を提供し、これはスクリーニングアッセイにおいて対照として用いることができる。
に関して一つまたは複数のヌクレオチドが改変されているものである。RNAループは、野生型配列に関して、一つまたは複数の改変されたヌクレオチドを含むことができる。必要に応じて、変異は、IRE-1αが切断できない変異基質を形成するために、RNAループ内に導入することができる。一つの態様では、変異基質のRNAループは、配列5'-CCCCAGC-3'を含む。
本明細書で使用されるように、「ドナー部分」とは、フルオロフォアまたは発光性部分である。「アクセプター部分」の吸収スペクトルは、ドナー部分の発光スペクトルと一部重なる。アクセプター部分は蛍光性である必要は無く、フルオロフォア、発色団、もしくはクエンチャーとすることができる。いくつかの態様では、ドナー部分およびアクセプター部分の両方が、蛍光タンパク質である。他の態様では、ドナー部分およびアクセプター部分の両方が、発光性部分である。さらに他の態様では、ドナー部分またはアクセプター部分のどちらかを蛍光タンパク質とすることができ、もう一方の部分が発光性部分である。他の態様では、アクセプター部分は「クエンチャー部分」である。
いくつかの好ましい態様では、ドナー部分およびアクセプター部分のどちらかまたは両方が蛍光タンパク質である。好ましい蛍光タンパク質は、緑色蛍光タンパク質(GFP)、赤色蛍光タンパク質(RFP)、黄色蛍光タンパク質(YFP)、シアン蛍光タンパク質(CFP)を含む。有用な蛍光タンパク質はまた、蛍光を発する能力を保有するこれらのタンパク質の変異体およびスペクトルバリアント(spectral variant)を含む。
IRE-1α基質における有用な発光性部分は、キレート(例えばセリウム、プラセオジム、ネオジム、プロメチウム、サマリウム、ユーロピウム、ガドリニウム、テルビウム、ジスプロシウム、ホルミウム、エルビウム、ツリウム、またはイッテルビウムのβ-ジケトンキレート)を含むランタニド複合体を含む、キレートの形状であるランタニドを含む。ランタニドキレートは、当技術分野において周知である。Soini および Kojola, Clin. Chem. 29, 65, 1983; Hemmila et al., Anal. Biochem. 137, 335 1984; Lovgren et al., In: Collins および Hoh, eds., Alternative Immunoassays, Wiley, Chichester, U.K., p. 203, 1985; Hemmila, Scand. J. Clin. Lab. Invest. 48, 389, 1988; Mikola et al., Bioconjugate Chem. 6, 235, 1995; Peruski et al., J. Immunol. Methods 263, 35-41, 2002; 米国特許第4,374,120号; ならびに米国特許第6,037,185号参照。好ましいβ-ジケトンは、例えば、2-ナフトイルトリフルオロアセトン(2-NTA)、1-ナフトイルトリフルオロアセトン(1-NTA)、p-メトキシベンゾイルトリフルオロアセトン(MO-BTA)、p-フルオロベンゾイルトリフルオロアセトン(F-BTA)、ベンゾイルトリフルオロアセトン(BTA)、フロイルトリフルオロアセトン(FTA)、ナフトイルフロイルメタン(NFM)、ジセノイルメタン(DTM)、およびジベンゾイルメタン(DBM)である。US 20040146895も参照。
いくつかの態様では、アクセプター部分はクエンチャー部分であり、好ましくは当技術分野において公知のように「ダーククエンチャー」(もしくは「ブラックホールクエンチャー」)である。この場合、RNアーゼ活性に伴って生じる立体配座における変化はクエンチングを排除し、ドナー部分からのエネルギー放出を増大させる。「ダーククエンチャー」自体は、光子を放出しない。「ダーククエンチャー」の利用は、利用しなければドナー部分からのエネルギー輸送の結果として現れるバックグラウンド蛍光または発光を、抑制または排除する。好ましいクエンチャー部分は、BLACK HOLE QUENCHER(商標)色素(例えば、BHQ-0(商標)、 BHQ-1(商標)、 BHQ-2(商標)、BHQ-3(商標))を含み、Biosearch Technologies, Inc.から入手でき、またQSY(商標)色素はInvitrogenから入手できる。好ましいクエンチャー部分は、例えば、US 2005/0118619; US 2005/0112673; および US 2004/0146959 において開示されている。
本発明のIRE-1α基質は、IRE-1α RNアーゼ活性を検出、測定、および定量化する様々なシステムに使用できる。そのようなアッセイは、例えば、RNアーゼ活性を測定するため、またはIRE-1α活性のアゴニストもしくはアンタゴニストとしての試験化合物を同定するために使用できる。IRE-1α RNアーゼ活性を増強させる試験化合物(例えばアゴニスト)は、アルツハイマー病および二型糖尿病を処置するための潜在的な治療薬(または治療薬を開発するためのリード化合物)である。IRE-1α RNアーゼ活性を減少させる試験化合物(例えばアンタゴニスト)は、B細胞自己免疫疾患、狼瘡、および癌を処置するための潜在的な治療薬(または治療薬を開発するためのリード化合物)である。
試験化合物は、当技術分野において公知である薬理学的薬剤であり得るか、または、任意の薬理学的活性を有する未知の化合物であり得る。化合物は、天然または研究室で設計されたものであり得る。それらは、微生物、動物、もしくは植物から単離することができ、且つ組換えにより産生することができ、または当技術分野において公知である化学的方法により合成することができる。必要に応じて、試験化合物は、これらに制限されないが、生物学的ライブラリー、空間的に位置指定可能な(spatially addressable)平行固相もしくは液相ライブラリー、デコンヴォルーションを必要とする合成ライブラリー法、「1ビーズ1化合物(one-bead one-compound)」ライブラリー法、ならびにアフィニティークロマトクラフィー選抜法を用いる合成ライブラリー法を含む、当技術分野において公知である多数のコンビナトリアルライブラリー法のいずれかを用いて得ることができる。
本発明のスクリーニング方法は、ハイスループットスクリーニング形式において使用できる。ハイスループットスクリーニングを使用することで、多数の試験化合物が迅速にスクリーニングできるように、多くの別々の化合物を平行に試験することができる。最も広く確立された技術は96-ウェルマイクロタイタープレートを用いるが、384-プレートまたは1536-プレートも用いることができる。当技術分野において公知のように、種々の手段、材料、ピペッター、ロボット、プレートウォッシャー、およびプレートリーダーは市販されている。
IRE-1αタンパク質
グルタチオンSトランスフェラーゼ(GST)およびヒトIRE-1αを含む融合タンパク質(GST-IRE-1α)を、500 mlバキュロウイルス-感染昆虫細胞培養物から得た。昆虫細胞を、緩衝液A(25 mM Tris-HCl pH7.5、50 mM KCl、5 mM MgCl2、1 mM EDTA、2.5 mM DTT、0.1 mM ATP、10%滅菌グリセロール、0.005% NP-40、1μg/mLロイペプチン、100 mM NaF、100 mM NaVO4、 100 mM PMSF;500 mL培養物あたり30 mL)中で懸濁し、その懸濁液を高速遠心分離チューブに移し、氷上でその懸濁液を超音波処理することによって溶解した。超音波処理した試料を、4℃で30分間、13000×gで遠心処理した。
IRE-1α活性のアッセイ
実施例1に記載されたようにして得られたIRE-1αタンパク質試料を、以下の4つの基質を用いてRNアーゼ活性について様々な希釈度で試験した。
33塩基野生型基質
FAM(5') およびBHQ-1(商標)(3')で標識した15塩基野生型基質
33塩基変異基質
ならびにFAM(5') およびBHQ (3')で標識した15塩基変異基質
。
1、野生型33塩基、IRE-1α無し;
2、変異33塩基、IRE-1α無し;
3、野生型33pb、IRE-1α(切断)有り;
4、変異33塩基、IRE-1α(切断せず)有り;
5、ポリエチレングリコール(PEG)を反応に加えた対照:野生型33塩基、IRE-1α無し;
6、ポリエチレングリコール(PEG)を反応に加えた対照:変異33塩基;
7、野生型33pb、PEG有り、IRE-1α(切断)有り;
8、変異33塩基、PEG有り、IRE-1α(切断せず)有り;
9、野生型33pb、PEG有り、1:3に希釈されたIRE-1α(切断)有り;
10、野生型33pb、PEG有り、1:12に希釈されたIRE-1α(切断)有り;
11、FAM-BHQ1標識された野生型15塩基基質(シグナル無し)、IRE-1α無し;
12、FAM-BHQ1標識された変異15塩基基質(シグナル無し)、IRE-1α無し;
13、FAM-BHQ1標識された野生型15塩基基質(シグナル)、IRE-1α有り;
14、FAM-BHQ1標識された変異15塩基基質(シグナル無し)、IRE-1α無し;
15、FAM-BHQ1標識された野生型15塩基基質(シグナル)、1:3に希釈されたIRE-1α有り、
である。
1、反応緩衝液中の野生型基質、IRE-1α無し;
2、反応緩衝液中の変異基質#1、IRE-1α無し;
3、反応緩衝液中の変異基質#2、IRE-1α無し;
4、反応緩衝液中の変異基質#3、IRE-1α無し;
5、反応緩衝液中の変異基質#4、IRE-1α無し;
6、反応緩衝液中の変異基質#5、IRE-1α無し;
7、反応緩衝液中の野生型基質、IRE-1α有り;
8、反応緩衝液中の変異基質#1、IRE-1α有り;
9、反応緩衝液中の変異基質#2、IRE-1α有り;
10、反応緩衝液中の変異基質#3、IRE-1α有り;
11、反応緩衝液中の変異基質#4、IRE-1α有り;
12、反応緩衝液中の変異基質#5、IRE-1α有り、
である。
最小の基質の長さの決定
上述のアッセイを用いて、最小の基質の長さを、15塩基基質(野生型、配列番号:3;変異、配列番号:4)および11塩基基質
を用いて決定した。このアッセイでは、酵素活性にATPおよびADPを必要としない。GST-IRE-1αは、高濃度のATP中で精製されるが、最終的にこれは洗浄され、非常に極僅かなレベルまで希釈される。
IRE-1α媒介性基質切断の動態
IRE-1α媒介性基質切断の動態を、精製された活性を有するIRE-1αおよびFAM-BHQ-1(商標)標識された野生型15pb基質を用いて、上述のようなアッセイにおいて計測した。プレートを30℃でインキュベートし5分ごとに読んだ。
基質特異性
本実施例は、読み取りとして、二重標識された15塩基野生型基質(配列番号:3)を用いる競合アッセイを示す。非標識野生型(配列番号:1)または変異33塩基基質(配列番号:2)の各量を増やしながら、実施例2に記載した標準的な反応において、30℃で1時間インキュベートした。
1、IRE-1αの無い、および競合物質(バックグラウンドシグナル)の無い、野生型15塩基FAM BHQ-1(商標)基質;
2、IRE-1α(バックグラウンドシグナル)の無い、野生型15塩基FAM BHQ-1(商標)基質に加えて50倍モル過剰の非標識野生型33塩基基質(より長い33塩基基質への過剰な可能なハイブリダイズによるフルオロフォアのクエンチングの可能性についての対照);
3、IRE-1αを有する野生型15塩基FAM BHQ-1(商標)基質、および野生型33塩基基質と同量;
4、2×野生型33塩基基質を有する3と同じ;
5、5×野生型33塩基基質を有する3と同じ;
6、10×野生型33塩基基質を有する3と同じ;
7、20×野生型33塩基基質を有する3と同じ;
8、50×野生型33塩基基質を有する3と同じ;
9、IRE-1α(バックグラウンドシグナル)の無い、野生型15塩基FAM BHQ-1(商標)基質に加えて、50倍モル過剰の非標識変異33塩基基質(より長い33塩基基質への過剰な可能なハイブリダイズによるフルオロフォアのクエンチングの可能性についての対照(本質的に2と同じ));
10、IRE-1αを有する野生型15塩基FAM BHQ-1(商標)基質、および変異33塩基基質と同量;
11、2× 33塩基変異基質を有する3と同じ;
12、5× 33塩基変異基質を有する3と同じ;
13、10× 33塩基変異基質を有する3と同じ;
14、20× 33塩基変異基質を有する3と同じ;
15、50× 33塩基変異基質を有する3と同じ;
16、IRE-1αを有する野生型15塩基FAM-BHQ-1(商標)基質(陽性対照)、
である。
ハイスループットスクリーニングアッセイ
Beckman Biomek FXロボットを、以下の順に、384ウェルプレートに反応の全成分をローディングするために用いた:試験化合物を有する緩衝液、IRE-1α、および基質(384ウェルプレート中)。アッセイの結果を表1および図6に示す。基質のみを有する対照およびIRE-1αと基質とを有する対照を、信号対ノイズ比(signal to noise ratio)およびウェル間の変動を測定するために用いた(図6における左側の最初の2つの列それぞれ)。図6における最も右の2つのレーンは、RNアーゼ混入に対する品質管理チェックとして、IRE-1αを有するかまたは有さない、二重標識変異15塩基基質を含む。
(図2)IRE-1α基質の図。
33塩基野生型基質
33塩基変異基質
5'FAMおよび3'BHQ-1(商標)部分
を伴う15塩基野生型基質;
5'FAMおよび3'BHQ-1(商標)部分
を伴う15塩基変異基質。
(図3)図3A〜Cは、IRE-1α基質の切断を示す、ポリアクリルアミドゲルの写真である。図3A、radiant red染色;図3B、切断された15塩基FAM基質由来のシグナル。図3C、radiant red染色。
(図4)30℃でのIRE-1α RNアーゼ活性の時間経過を示すグラフ。
(図5)33塩基基質(配列番号:1)の存在下で、15塩基基質(配列番号:3)の活性を決定するための競合アッセイの結果を示すバーグラフ。
(図6)IRE-1α RNアーゼ活性のハイスループットアッセイの結果を示すグラフ。
Claims (27)
- (i)IRE-1αに対する切断部位を含むRNAループ;および
(ii)4、5、6、7、8、9、または10ヌクレオチド塩基対からなるヌクレオチドステム、
からなるオリゴヌクレオチド分子を含む、IRE-1αに対する基質。 - ドナー部分が励起された場合に検出可能な共鳴エネルギー移動を示す、ドナー部分およびアクセプター部分をさらに含む基質であって、
ドナー部分がオリゴヌクレオチド分子の5'末端または3'末端の一方に結合し、且つアクセプター部分がオリゴヌクレオチド分子の5'末端または3'末端のもう一方に結合している、請求項1記載の基質。 - 検出可能な標識をさらに含む、請求項1記載の基質。
- RNAループがヌクレオチド配列5'-CCGCAGC-3'を含む、請求項1記載の基質。
- 配列番号:1または配列番号:3を含む、請求項1記載の基質。
- ヌクレオチドステムがDNAを含む、請求項1記載の基質。
- ヌクレオチドステムがRNAを含む、請求項1記載の基質。
- ヌクレオチドステムがヌクレオチドアナログを含む、請求項1記載の基質。
- ドナー部分およびアクセプター部分の少なくとも一つが蛍光タンパク質である、請求項2記載の基質。
- ドナー部分およびアクセプター部分の各々が蛍光タンパク質である、請求項2記載の基質。
- アクセプター部分が発光性部分である、請求項2記載の基質。
- 発光性部分が発光性タンパク質およびランタニドキレートからなる群より選択される、請求項11記載の基質。
- アクセプター部分が、クマリン、キサンテン、フルオレセイン、蛍光タンパク質、サーキュラリーパーミュテッド(circularly permuted)蛍光タンパク質、ロードル(rhodol)、ローダミン、レゾルフィン、シアニン、ジフルオロボラジアザインダセン(difluoroboradiazaindacene)、フタロシアニン、インディゴ、ベンゾキノン、アントラキノン、アゾ化合物、ニトロ化合物、インドアニリン、ジフェニルメタン、トリフェニルメタン、および双性イオンアゾピリジニウム化合物からなる群より選択される、請求項2記載の基質。
- ドナー部分が、クマリン、キサンテン、ロードル、ローダミン、レゾルフィン、シアニン色素、ビマン(bimane)、アクリジン、イソインドール、ダンシル色素、アミノフタル酸ヒドラジド、アミノフタルイミド、アミノナフタルイミド、アミノベンゾフラン、アミノキノリン、ジシアノヒドロキノン、半導体蛍光ナノ結晶(semiconductor fluorescent nanocrystal)、蛍光タンパク質、サーキュラリーパーミュテッド蛍光タンパク質、および蛍光ランタニドキレートからなる群より選択される、請求項2記載の基質。
- ドナー部分が、緑色蛍光タンパク質(GFP)、赤色蛍光タンパク質(RFP)、黄色蛍光タンパク質(YFP)、青色蛍光タンパク質(BFP)、およびシアン蛍光タンパク質(CFP)からなる群より選択される蛍光タンパク質である、請求項2記載の基質。
- アクセプター部分が発光性タンパク質である、請求項2記載の基質。
- 発光性タンパク質が、エクオリン、オベリン、ルクス(lux)タンパク質、ルシフェラーゼタンパク質、フィコビリタンパク質、ホラジン(pholasin)、および緑色蛍光タンパク質からなる群より選択される、請求項16記載の基質。
- (i)IRE-1αに対する変異切断部位を有するRNAループ;および
(ii)4、5、6、7、8、9、または10ヌクレオチド塩基対からなるヌクレオチドステム、
からなるオリゴヌクレオチド分子を含むIRE-1αに対する変異基質。 - RNAループがヌクレオチド配列5'-CCCCAGC-3'を含む、請求項18記載の変異基質。
- ドナー部分が励起された場合に検出可能な共鳴エネルギー移動を示す、ドナー部分およびアクセプター部分をさらに含む変異基質であって、
ドナー部分がオリゴヌクレオチド分子の5'末端または3'末端の一方に結合し、且つアクセプター部分がオリゴヌクレオチド分子の5'末端または'末端のもう一方に結合する、請求項18記載の変異基質。 - 検出可能な標識をさらに含む、請求項18記載の変異基質。
- 以下の工程を含むIRE-1αポリペプチドのRNアーゼ活性を検出する方法:
(1)
(a)
(i)IRE-1αに対する切断部位を含むRNAループ;
(ii)4、5、6、7、8、9、または10リボヌクレオチド塩基対からなるヌクレオチドステム;
からなるオリゴヌクレオチド分子;ならびに
(b)ドナー部分がオリゴヌクレオチド分子の5'末端または3'末端の一方に結合し、且つアクセプター部分がオリゴヌクレオチド分子の5'末端または3'末端のもう一方に結合しており、ドナー部分が励起された場合に検出可能な共鳴エネルギー移動を示す、ドナー部分およびアクセプター部分、
を含む基質とIRE-1αポリペプチドを接触させる工程;ならびに
(2)ドナー部分とアクセプター部分との間の共鳴エネルギー移動を検出する工程であって、それにより共鳴エネルギー移動における変化がIRE-1αポリペプチドのRNアーゼ活性を示す、工程。 - 試験化合物の存在下で共鳴エネルギー移動を検出する工程をさらに含む、請求項22記載の方法。
- IRE-1αポリペプチドおよび基質が無細胞系中にある、請求項22記載の方法。
- 共鳴エネルギーにおける変化が、励起波長でのモル吸光係数、量子効率、励起スペクトル、発光スペクトル、最大励起波長、最大発光波長、2つの波長での励起振幅の比、2つの波長での発光振幅の比、励起状態寿命、異方性、放出された光の偏光、共鳴エネルギー移動、およびある波長での発光のクエンチングからなる群より選択される特性を決定することによって検出される、請求項22記載の方法。
- IRE-1αポリペプチドが完全長IRE-1αタンパク質である、請求項22記載の方法。
- IRE-1αポリペプチドがキナーゼドメインを含む、請求項22記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US11/266,603 US8017331B2 (en) | 2005-11-04 | 2005-11-04 | IRE-1α substrates |
PCT/US2005/040342 WO2007053151A1 (en) | 2005-11-04 | 2005-11-07 | IRE-1α SUBSTRATES |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012226780A Division JP2013048628A (ja) | 2005-11-04 | 2012-10-12 | IRE−1α基質 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2009514526A true JP2009514526A (ja) | 2009-04-09 |
Family
ID=38004190
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008538855A Withdrawn JP2009514526A (ja) | 2005-11-04 | 2005-11-07 | IRE−1α基質 |
JP2012226780A Pending JP2013048628A (ja) | 2005-11-04 | 2012-10-12 | IRE−1α基質 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012226780A Pending JP2013048628A (ja) | 2005-11-04 | 2012-10-12 | IRE−1α基質 |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US8017331B2 (ja) |
EP (1) | EP1943262B1 (ja) |
JP (2) | JP2009514526A (ja) |
WO (1) | WO2007053151A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2020522520A (ja) * | 2017-06-01 | 2020-07-30 | クエンティス セラピューティクス インコーポレイテッド | Ire1小分子阻害薬 |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102015606B (zh) | 2007-06-08 | 2015-02-04 | 满康德股份有限公司 | IRE-1α抑制剂 |
EP2555768B1 (en) | 2010-04-05 | 2018-08-29 | Fosun Orinove Pharmatech, Inc. | Ire-1 inhibitors |
WO2013033436A1 (en) | 2011-09-01 | 2013-03-07 | University Of Iowa Research Foundation | Oligonucleotide-based probes for detection of bacterial nucleases |
CN105008716B (zh) | 2013-03-12 | 2018-11-16 | 株式会社捷太格特 | 风力发电设备 |
EP3102704B1 (en) | 2014-02-07 | 2020-02-12 | University of Iowa Research Foundation | Oligonucleotide-based probes and methods for detection of microbes |
WO2018102751A1 (en) * | 2016-12-02 | 2018-06-07 | Quentis Therapeutics, Inc. | Ire1 small molecule inhibitors |
US10392367B2 (en) | 2017-06-01 | 2019-08-27 | Quentis Therapeutics, Inc. | IRE1 small molecule inhibitors |
WO2018222917A1 (en) * | 2017-06-01 | 2018-12-06 | Quentis Therapeutics, Inc. | Ire1 small molecule inhibitors |
CN110950877B (zh) * | 2019-12-11 | 2022-06-28 | 齐鲁工业大学 | 一种双检测荧光探针、制备方法及其在检测硫化氢和铜离子中的应用 |
WO2022221660A1 (en) * | 2021-04-16 | 2022-10-20 | Meso Scale Technologies, Llc. | Methods, compositions, and kits for detecting hydrolase enzyme activity |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004513619A (ja) * | 2000-07-07 | 2004-05-13 | ヴィジゲン バイオテクノロジーズ インコーポレイテッド | リアルタイム配列決定 |
JP2004515229A (ja) * | 2000-11-27 | 2004-05-27 | スローン−ケッタリング インスティテュート フォー キャンサー リサーチ | 核酸の切断を検出するための蛍光エネルギー変換プローブの使用方法 |
JP2004532649A (ja) * | 2001-06-25 | 2004-10-28 | ジョージア テック リサーチ コーポレイション | 二重共鳴エネルギー転移核酸プローブ |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH05137600A (ja) * | 1991-05-15 | 1993-06-01 | Amoco Corp | ビブリオ属細菌を検出するための組成物及び方法 |
US5925517A (en) * | 1993-11-12 | 1999-07-20 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits |
US5610012A (en) * | 1994-04-08 | 1997-03-11 | Wisconsin Alumni Research Foundation | DNA probes specific for virulent listeria monocytogenes |
US5871983A (en) * | 1996-09-13 | 1999-02-16 | Eli Lilly And Company | Glucosyltransferase gene GTFE from amycolatopsis orientalis |
GB9626074D0 (en) * | 1996-12-16 | 1997-02-05 | Cytocell Ltd | Nucleic acids amplification assay |
JPH1156398A (ja) * | 1997-08-11 | 1999-03-02 | Hamamatsu Photonics Kk | 二本鎖核酸分解酵素活性の測定方法 |
-
2005
- 2005-11-04 US US11/266,603 patent/US8017331B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2005-11-07 JP JP2008538855A patent/JP2009514526A/ja not_active Withdrawn
- 2005-11-07 WO PCT/US2005/040342 patent/WO2007053151A1/en active Application Filing
- 2005-11-07 EP EP05816986A patent/EP1943262B1/en not_active Not-in-force
-
2011
- 2011-07-19 US US13/185,693 patent/US8124343B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2012
- 2012-10-12 JP JP2012226780A patent/JP2013048628A/ja active Pending
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004513619A (ja) * | 2000-07-07 | 2004-05-13 | ヴィジゲン バイオテクノロジーズ インコーポレイテッド | リアルタイム配列決定 |
JP2004515229A (ja) * | 2000-11-27 | 2004-05-27 | スローン−ケッタリング インスティテュート フォー キャンサー リサーチ | 核酸の切断を検出するための蛍光エネルギー変換プローブの使用方法 |
JP2004532649A (ja) * | 2001-06-25 | 2004-10-28 | ジョージア テック リサーチ コーポレイション | 二重共鳴エネルギー転移核酸プローブ |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
JPN6011026246; NATURE Vol.415, 2002, p.92-96 * |
JPN6011026250; GENES & DEVELOPMENT Vol.16, 2002, p.452-466 * |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2020522520A (ja) * | 2017-06-01 | 2020-07-30 | クエンティス セラピューティクス インコーポレイテッド | Ire1小分子阻害薬 |
JP7126084B2 (ja) | 2017-06-01 | 2022-08-26 | コーネル ユニバーシティー | Ire1小分子阻害薬 |
US11649224B2 (en) | 2017-06-01 | 2023-05-16 | Cornell University | IRE1 small molecule inhibitors |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US8124343B2 (en) | 2012-02-28 |
US20070105123A1 (en) | 2007-05-10 |
US20110287952A1 (en) | 2011-11-24 |
WO2007053151A1 (en) | 2007-05-10 |
EP1943262B1 (en) | 2013-01-23 |
EP1943262A1 (en) | 2008-07-16 |
EP1943262A4 (en) | 2011-01-19 |
US8017331B2 (en) | 2011-09-13 |
JP2013048628A (ja) | 2013-03-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US8124343B2 (en) | IRE-1α substrates | |
US8236523B2 (en) | Camp reporters and high throughput assays | |
CA2602972C (en) | Assays of molecular or subcellular interactivity using depolarization after resonance energy transfer (daret) | |
Shimozono et al. | Engineering FRET constructs using CFP and YFP | |
Hung et al. | Comparison of fluorescence energy transfer primers with different donor–acceptor dye combinations | |
EP3098322A1 (en) | Method to detect activity of a polymerase | |
EP2812698B1 (en) | Dual-acceptor time-resolved-fret | |
JP2020062032A (ja) | 二重蛍光体を用いた酵素アッセイに使用するための細胞 | |
US20030224469A1 (en) | Methods and kits for assays utilizing fluorescence polarization | |
WO2006023972A2 (en) | cAMP REPORTERS | |
Fernando et al. | Unfolding of trp repressor studied using fluorescence spectroscopic techniques | |
US9017962B2 (en) | Intracellular reporters | |
JP2004505636A (ja) | 二色蛍光測定によるプロテアーゼ検査 | |
Dillingham et al. | Protein modification for single molecule fluorescence microscopy | |
CN100384871C (zh) | 来自clytia gregaria的分离荧光蛋白质(cgfp)及其应用 | |
Riss et al. | Homogeneous Multiwell Assays for Measuring Cell Viabiltiy, Cytotoxicity, and Apoptosis | |
US8080235B2 (en) | Protein kinase A reporters useful in high throughput assays | |
WO2011096763A2 (en) | Kit including sequence specific binding protein and method and device for determining nucleotide sequence of target nucleic acid | |
US9625466B2 (en) | Signal amplification methods for the imaging of protein synthesis and neurotransmitter transport | |
Rettig et al. | Luminescent lanthanide chelates for improved resonance energy transfer and application to biology | |
AU3269999A (en) | Fluorescent assay for topoisomerase inhibitors | |
US7528230B2 (en) | Enhanced inserted yellow fluorescence protein and its application | |
Cinelli et al. | Engineering single-molecule fluorescence dynamics for advanced biomolecular applications | |
Tolosa et al. | Fluorescence probes for biochemical systems | |
Karhunen | Switchable Lanthanide Luminescence for Detection of Biomolecules |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20110525 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20110816 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20110823 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20111124 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20120613 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20121012 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20121012 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20121102 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20121214 |
|
A761 | Written withdrawal of application |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A761 Effective date: 20130405 |