JP2007525167A - 乳房内皮細胞発現パターン - Google Patents
乳房内皮細胞発現パターン Download PDFInfo
- Publication number
- JP2007525167A JP2007525167A JP2006509475A JP2006509475A JP2007525167A JP 2007525167 A JP2007525167 A JP 2007525167A JP 2006509475 A JP2006509475 A JP 2006509475A JP 2006509475 A JP2006509475 A JP 2006509475A JP 2007525167 A JP2007525167 A JP 2007525167A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- protein
- type
- collagen
- binding
- antigen
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 title claims abstract description 37
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 title claims abstract description 25
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 title abstract description 33
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 121
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims abstract description 46
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 36
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims abstract description 33
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims abstract description 32
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 16
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 94
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 94
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 63
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 26
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims description 20
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims description 20
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 19
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 19
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 19
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 18
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 18
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 16
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 claims description 16
- 108010028750 Integrin-Binding Sialoprotein Proteins 0.000 claims description 15
- 102000016921 Integrin-Binding Sialoprotein Human genes 0.000 claims description 15
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 claims description 15
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims description 15
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 13
- 102100024341 10 kDa heat shock protein, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 12
- 102100036597 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein Human genes 0.000 claims description 12
- 102000004300 GABA-A Receptors Human genes 0.000 claims description 12
- 108090000839 GABA-A Receptors Proteins 0.000 claims description 12
- 102100029698 Metallothionein-1A Human genes 0.000 claims description 12
- 101710196500 Metallothionein-1A Proteins 0.000 claims description 12
- 102100040283 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B Human genes 0.000 claims description 12
- 102100022122 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 Human genes 0.000 claims description 12
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 claims description 12
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 claims description 12
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 12
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 12
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 12
- 108010044156 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase b Proteins 0.000 claims description 12
- 108010049224 perlecan Proteins 0.000 claims description 12
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 claims description 12
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 11
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 11
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 11
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 9
- 108010080422 CD39 antigen Proteins 0.000 claims description 8
- 102100037904 CD9 antigen Human genes 0.000 claims description 8
- 102000055006 Calcitonin Human genes 0.000 claims description 8
- 108060001064 Calcitonin Proteins 0.000 claims description 8
- 108090000312 Calcium Channels Proteins 0.000 claims description 8
- 102000003922 Calcium Channels Human genes 0.000 claims description 8
- 102100023949 Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4 Human genes 0.000 claims description 8
- 102000004168 Dysferlin Human genes 0.000 claims description 8
- 102100032248 Dysferlin Human genes 0.000 claims description 8
- 108090000620 Dysferlin Proteins 0.000 claims description 8
- 102100029722 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 Human genes 0.000 claims description 8
- 101710198859 G-protein coupled receptor 4 Proteins 0.000 claims description 8
- 102100028976 HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain Human genes 0.000 claims description 8
- 101710142296 HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain Proteins 0.000 claims description 8
- 102100028971 HLA class I histocompatibility antigen, C alpha chain Human genes 0.000 claims description 8
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 claims description 8
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 claims description 8
- 101000738354 Homo sapiens CD9 antigen Proteins 0.000 claims description 8
- 101001111225 Homo sapiens Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4 Proteins 0.000 claims description 8
- 101001016184 Homo sapiens Dysferlin Proteins 0.000 claims description 8
- 101000986084 Homo sapiens HLA class I histocompatibility antigen, C alpha chain Proteins 0.000 claims description 8
- 101001082070 Homo sapiens Interferon alpha-inducible protein 6 Proteins 0.000 claims description 8
- 101000950648 Homo sapiens Malectin Proteins 0.000 claims description 8
- 101000836225 Homo sapiens Solute carrier organic anion transporter family member 2A1 Proteins 0.000 claims description 8
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 claims description 8
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 claims description 8
- 102100027354 Interferon alpha-inducible protein 6 Human genes 0.000 claims description 8
- 108700003486 Jagged-1 Proteins 0.000 claims description 8
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 claims description 8
- 102100032702 Protein jagged-1 Human genes 0.000 claims description 8
- 108700037966 Protein jagged-1 Proteins 0.000 claims description 8
- 102000009203 Sema domains Human genes 0.000 claims description 8
- 108050000099 Sema domains Proteins 0.000 claims description 8
- 102100027187 Solute carrier organic anion transporter family member 2A1 Human genes 0.000 claims description 8
- 102100027027 Transmembrane protein 204 Human genes 0.000 claims description 8
- BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N calcitonin Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(N)=O)C(C)C)C(=O)[C@@H]1CSSC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1 BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N 0.000 claims description 8
- 229960004015 calcitonin Drugs 0.000 claims description 8
- 102000044101 human GPR4 Human genes 0.000 claims description 8
- 230000007954 hypoxia Effects 0.000 claims description 8
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 claims description 8
- 108010028930 invariant chain Proteins 0.000 claims description 8
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 8
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 claims description 8
- 102100029761 Cadherin-5 Human genes 0.000 claims description 7
- 101000763433 Homo sapiens Transmembrane protein 204 Proteins 0.000 claims description 7
- 102000002023 NADH:ubiquinone oxidoreductases Human genes 0.000 claims description 7
- 108050009313 NADH:ubiquinone oxidoreductases Proteins 0.000 claims description 7
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 claims description 7
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 claims description 7
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims description 7
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 7
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 claims description 7
- 102100031571 40S ribosomal protein S16 Human genes 0.000 claims description 6
- 102000001762 6-phosphogluconolactonase Human genes 0.000 claims description 6
- 108010029731 6-phosphogluconolactonase Proteins 0.000 claims description 6
- 102100033416 60S acidic ribosomal protein P1 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100022289 60S ribosomal protein L13a Human genes 0.000 claims description 6
- 102100025601 60S ribosomal protein L27 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100040131 60S ribosomal protein L37 Human genes 0.000 claims description 6
- 102000004954 Biglycan Human genes 0.000 claims description 6
- 108090001138 Biglycan Proteins 0.000 claims description 6
- 101000645291 Bos taurus Metalloproteinase inhibitor 2 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100025172 Calpain-1 catalytic subunit Human genes 0.000 claims description 6
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims description 6
- 108010059013 Chaperonin 10 Proteins 0.000 claims description 6
- 108010042086 Collagen Type IV Proteins 0.000 claims description 6
- 102000004266 Collagen Type IV Human genes 0.000 claims description 6
- 102000012432 Collagen Type V Human genes 0.000 claims description 6
- 108010022514 Collagen Type V Proteins 0.000 claims description 6
- 102000002734 Collagen Type VI Human genes 0.000 claims description 6
- 108010043741 Collagen Type VI Proteins 0.000 claims description 6
- 102100033601 Collagen alpha-1(I) chain Human genes 0.000 claims description 6
- 102100031611 Collagen alpha-1(III) chain Human genes 0.000 claims description 6
- 102100022145 Collagen alpha-1(IV) chain Human genes 0.000 claims description 6
- 102100031162 Collagen alpha-1(XVIII) chain Human genes 0.000 claims description 6
- 102100036213 Collagen alpha-2(I) chain Human genes 0.000 claims description 6
- 229940122097 Collagenase inhibitor Drugs 0.000 claims description 6
- 102100033777 Complement C4-B Human genes 0.000 claims description 6
- 108010077762 Complement C4b Proteins 0.000 claims description 6
- 102000013700 Cyclin-Dependent Kinase 3 Human genes 0.000 claims description 6
- 108010025466 Cyclin-Dependent Kinase 3 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100026139 DNA damage-inducible transcript 4 protein Human genes 0.000 claims description 6
- 102100029721 DnaJ homolog subfamily B member 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100039328 Endoplasmin Human genes 0.000 claims description 6
- 102100029531 Fas-activated serine/threonine kinase Human genes 0.000 claims description 6
- 101710117201 Fas-activated serine/threonine kinase Proteins 0.000 claims description 6
- 102100033300 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100035903 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-5 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100032610 Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas Human genes 0.000 claims description 6
- 102100040352 Heat shock 70 kDa protein 1A Human genes 0.000 claims description 6
- 102100027421 Heat shock cognate 71 kDa protein Human genes 0.000 claims description 6
- 102100030338 Hexokinase-1 Human genes 0.000 claims description 6
- 101710198391 Hexokinase-1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000980303 Homo sapiens 10 kDa heat shock protein, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 6
- 101000712357 Homo sapiens 60S acidic ribosomal protein P1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000681240 Homo sapiens 60S ribosomal protein L13a Proteins 0.000 claims description 6
- 101000671735 Homo sapiens 60S ribosomal protein L37 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000794587 Homo sapiens Cadherin-5 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000934069 Homo sapiens Calpain-1 catalytic subunit Proteins 0.000 claims description 6
- 101000945357 Homo sapiens Collagen alpha-1(I) chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000993285 Homo sapiens Collagen alpha-1(III) chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000901150 Homo sapiens Collagen alpha-1(IV) chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000940068 Homo sapiens Collagen alpha-1(XVIII) chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000875067 Homo sapiens Collagen alpha-2(I) chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101000912753 Homo sapiens DNA damage-inducible transcript 4 protein Proteins 0.000 claims description 6
- 101000866018 Homo sapiens DnaJ homolog subfamily B member 1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000812663 Homo sapiens Endoplasmin Proteins 0.000 claims description 6
- 101000926823 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001073252 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-5 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001014590 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas Proteins 0.000 claims description 6
- 101001014594 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short Proteins 0.000 claims description 6
- 101001037759 Homo sapiens Heat shock 70 kDa protein 1A Proteins 0.000 claims description 6
- 101001080568 Homo sapiens Heat shock cognate 71 kDa protein Proteins 0.000 claims description 6
- 101001014572 Homo sapiens MARCKS-related protein Proteins 0.000 claims description 6
- 101000669513 Homo sapiens Metalloproteinase inhibitor 1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001014610 Homo sapiens Neuroendocrine secretory protein 55 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000601047 Homo sapiens Nidogen-1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001116674 Homo sapiens Prefoldin subunit 2 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000797903 Homo sapiens Protein ALEX Proteins 0.000 claims description 6
- 101001048958 Homo sapiens Protein FAM76A Proteins 0.000 claims description 6
- 101000738322 Homo sapiens Prothymosin alpha Proteins 0.000 claims description 6
- 101001092185 Homo sapiens Regulator of cell cycle RGCC Proteins 0.000 claims description 6
- 101000829212 Homo sapiens Serine/arginine repetitive matrix protein 2 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000864800 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase Sgk1 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000596277 Homo sapiens TSC22 domain family protein 3 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000659345 Homo sapiens Tax1-binding protein 3 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000800116 Homo sapiens Thy-1 membrane glycoprotein Proteins 0.000 claims description 6
- 101000843562 Homo sapiens Transcription factor HES-4 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000625727 Homo sapiens Tubulin beta chain Proteins 0.000 claims description 6
- 101001057508 Homo sapiens Ubiquitin-like protein ISG15 Proteins 0.000 claims description 6
- 102000004369 Insulin-like growth factor-binding protein 4 Human genes 0.000 claims description 6
- 108090000969 Insulin-like growth factor-binding protein 4 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100029228 Insulin-like growth factor-binding protein 7 Human genes 0.000 claims description 6
- 102000043136 MAP kinase family Human genes 0.000 claims description 6
- 108091054455 MAP kinase family Proteins 0.000 claims description 6
- 102100032514 MARCKS-related protein Human genes 0.000 claims description 6
- 102100039364 Metalloproteinase inhibitor 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 108700027653 Mitogen-Activated Protein Kinase 9 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100037809 Mitogen-activated protein kinase 9 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100037369 Nidogen-1 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100021010 Nucleolin Human genes 0.000 claims description 6
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 claims description 6
- 108010049358 Oncogene Protein p65(gag-jun) Proteins 0.000 claims description 6
- 108010044843 Peptide Initiation Factors Proteins 0.000 claims description 6
- 102000005877 Peptide Initiation Factors Human genes 0.000 claims description 6
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 claims description 6
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 claims description 6
- 102100024920 Prefoldin subunit 2 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100023827 Protein FAM76A Human genes 0.000 claims description 6
- 102100024601 Protein tyrosine phosphatase type IVA 3 Human genes 0.000 claims description 6
- 101710138647 Protein tyrosine phosphatase type IVA 3 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100037925 Prothymosin alpha Human genes 0.000 claims description 6
- 102100035542 Regulator of cell cycle RGCC Human genes 0.000 claims description 6
- 102100021431 Rho GTPase-activating protein 4 Human genes 0.000 claims description 6
- 101710116901 Rho GTPase-activating protein 4 Proteins 0.000 claims description 6
- 102000042463 Rho family Human genes 0.000 claims description 6
- 108091078243 Rho family Proteins 0.000 claims description 6
- 102100022379 SOSS complex subunit B1 Human genes 0.000 claims description 6
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 claims description 6
- 102100023657 Serine/arginine repetitive matrix protein 2 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100030070 Serine/threonine-protein kinase Sgk1 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100038721 T-box transcription factor TBX2 Human genes 0.000 claims description 6
- 101710167702 T-box transcription factor TBX2 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100035260 TSC22 domain family protein 3 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100036221 Tax1-binding protein 3 Human genes 0.000 claims description 6
- 101001110004 Tetrahymena thermophila 60S acidic ribosomal protein P1 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100033523 Thy-1 membrane glycoprotein Human genes 0.000 claims description 6
- 108010031374 Tissue Inhibitor of Metalloproteinase-1 Proteins 0.000 claims description 6
- 102000005353 Tissue Inhibitor of Metalloproteinase-1 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100030774 Transcription factor HES-4 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100034697 Transducin-like enhancer protein 2 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100024717 Tubulin beta chain Human genes 0.000 claims description 6
- 102100027266 Ubiquitin-like protein ISG15 Human genes 0.000 claims description 6
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 6
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 claims description 6
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 claims description 6
- 102000015736 beta 2-Microglobulin Human genes 0.000 claims description 6
- 108010081355 beta 2-Microglobulin Proteins 0.000 claims description 6
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 claims description 6
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 claims description 6
- 239000002442 collagenase inhibitor Substances 0.000 claims description 6
- 108010048032 cyclophilin B Proteins 0.000 claims description 6
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 claims description 6
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 claims description 6
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 6
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 6
- 230000000937 inactivator Effects 0.000 claims description 6
- 102000028416 insulin-like growth factor binding Human genes 0.000 claims description 6
- 108091022911 insulin-like growth factor binding Proteins 0.000 claims description 6
- 108010008598 insulin-like growth factor binding protein-related protein 1 Proteins 0.000 claims description 6
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 claims description 6
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 claims description 6
- 102000043253 matrix Gla protein Human genes 0.000 claims description 6
- 108010057546 matrix Gla protein Proteins 0.000 claims description 6
- 108010044762 nucleolin Proteins 0.000 claims description 6
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 claims description 6
- 108010062302 rac1 GTP Binding Protein Proteins 0.000 claims description 6
- 150000004492 retinoid derivatives Chemical class 0.000 claims description 6
- 108010092955 ribosomal protein S16 Proteins 0.000 claims description 6
- 108010067528 ribosomal proteins L27 Proteins 0.000 claims description 6
- 230000035939 shock Effects 0.000 claims description 6
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 claims description 6
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 claims description 5
- 101000609255 Homo sapiens Plasminogen activator inhibitor 1 Proteins 0.000 claims description 5
- 101000802105 Homo sapiens Transducin-like enhancer protein 2 Proteins 0.000 claims description 5
- 101000702691 Homo sapiens Zinc finger protein SNAI1 Proteins 0.000 claims description 5
- 102100039418 Plasminogen activator inhibitor 1 Human genes 0.000 claims description 5
- 102100030917 Zinc finger protein SNAI1 Human genes 0.000 claims description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 5
- 108010059841 serine carboxypeptidase Proteins 0.000 claims description 5
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 claims description 5
- XUHRVZXFBWDCFB-QRTDKPMLSA-N (3R)-4-[[(3S,6S,9S,12R,15S,18R,21R,24R,27R,28R)-12-(3-amino-3-oxopropyl)-6-[(2S)-butan-2-yl]-3-(2-carboxyethyl)-18-(hydroxymethyl)-28-methyl-9,15,21,24-tetrakis(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20,23,26-nonaoxo-1-oxa-4,7,10,13,16,19,22,25-octazacyclooctacos-27-yl]amino]-3-[[(2R)-2-[[(3S)-3-hydroxydecanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CCCCCCC[C@H](O)CC(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]1[C@@H](C)OC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CO)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC1=O)[C@@H](C)CC XUHRVZXFBWDCFB-QRTDKPMLSA-N 0.000 claims description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims description 4
- 102100040739 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 101001038731 Homo sapiens Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000990902 Homo sapiens Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000577202 Homo sapiens Neurogenic locus notch homolog protein 3 Proteins 0.000 claims description 4
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 claims description 4
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 claims description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 4
- 102100030412 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100025247 Neurogenic locus notch homolog protein 3 Human genes 0.000 claims description 4
- 108020002230 Pancreatic Ribonuclease Proteins 0.000 claims description 4
- 102000005891 Pancreatic ribonuclease Human genes 0.000 claims description 4
- 102000004389 Ribonucleoproteins Human genes 0.000 claims description 4
- 108010081734 Ribonucleoproteins Proteins 0.000 claims description 4
- 102100024547 Tensin-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010088950 Tensins Proteins 0.000 claims description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 4
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 4
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 4
- 239000002523 lectin Substances 0.000 claims description 4
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 claims description 4
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 claims description 4
- 102000007365 Sialoglycoproteins Human genes 0.000 claims description 3
- 108010032838 Sialoglycoproteins Proteins 0.000 claims description 3
- 208000035269 cancer or benign tumor Diseases 0.000 claims description 3
- 230000003436 cytoskeletal effect Effects 0.000 claims description 3
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 claims description 3
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 claims description 3
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 claims description 3
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 claims description 3
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 claims description 3
- 201000011374 Alagille syndrome Diseases 0.000 claims description 2
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 claims description 2
- 102000017177 Fibromodulin Human genes 0.000 claims description 2
- 108010013996 Fibromodulin Proteins 0.000 claims description 2
- 102000014736 Notch Human genes 0.000 claims description 2
- 108010070047 Notch Receptors Proteins 0.000 claims description 2
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 claims description 2
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 claims description 2
- 230000006378 damage Effects 0.000 claims description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 238000002493 microarray Methods 0.000 claims description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 claims description 2
- 102100037421 Regulator of G-protein signaling 5 Human genes 0.000 claims 3
- 101710140403 Regulator of G-protein signaling 5 Proteins 0.000 claims 3
- 101000947501 Camptotheca acuminata (S)-8-oxocitronellyl enol synthase CYC1 Proteins 0.000 claims 2
- 102100040510 Galectin-3-binding protein Human genes 0.000 claims 2
- 102100023999 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R Human genes 0.000 claims 2
- 101710141315 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R Proteins 0.000 claims 2
- 101000967904 Homo sapiens Galectin-3-binding protein Proteins 0.000 claims 2
- 101150052863 THY1 gene Proteins 0.000 claims 2
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 claims 2
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 claims 2
- 108010048418 alpha Subunit Hypoxia-Inducible Factor 1 Proteins 0.000 claims 2
- 102000009120 alpha Subunit Hypoxia-Inducible Factor 1 Human genes 0.000 claims 2
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 claims 2
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 claims 2
- 230000007838 tissue remodeling Effects 0.000 claims 2
- ACTIUHUUMQJHFO-UHFFFAOYSA-N Coenzym Q10 Natural products COC1=C(OC)C(=O)C(CC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)=C(C)C1=O ACTIUHUUMQJHFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 101001046870 Homo sapiens Hypoxia-inducible factor 1-alpha Proteins 0.000 claims 1
- 102100022875 Hypoxia-inducible factor 1-alpha Human genes 0.000 claims 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims 1
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 claims 1
- ACTIUHUUMQJHFO-UPTCCGCDSA-N coenzyme Q10 Chemical compound COC1=C(OC)C(=O)C(C\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CCC=C(C)C)=C(C)C1=O ACTIUHUUMQJHFO-UPTCCGCDSA-N 0.000 claims 1
- 235000017471 coenzyme Q10 Nutrition 0.000 claims 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims 1
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 claims 1
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 claims 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims 1
- 229930027945 nicotinamide-adenine dinucleotide Natural products 0.000 claims 1
- BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N nicotinamide-adenine dinucleotide Chemical compound C1=CCC(C(=O)N)=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)O)O1 BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N 0.000 claims 1
- NPCOQXAVBJJZBQ-UHFFFAOYSA-N reduced coenzyme Q9 Natural products COC1=C(O)C(C)=C(CC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)C(O)=C1OC NPCOQXAVBJJZBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 235000002020 sage Nutrition 0.000 claims 1
- 229940035936 ubiquinone Drugs 0.000 claims 1
- 210000003038 endothelium Anatomy 0.000 abstract description 6
- 238000011161 development Methods 0.000 abstract description 5
- 230000001772 anti-angiogenic effect Effects 0.000 abstract description 4
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 abstract description 2
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 abstract 1
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract 1
- 230000005747 tumor angiogenesis Effects 0.000 abstract 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 19
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 10
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 10
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 9
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 8
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 8
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 7
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 7
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 7
- 229940000406 drug candidate Drugs 0.000 description 7
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 7
- 102000001776 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 description 6
- 108010015302 Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 description 6
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 6
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 6
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 5
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 5
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 5
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 5
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 5
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 5
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 5
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 5
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 5
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 5
- 210000005166 vasculature Anatomy 0.000 description 5
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 4
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 4
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 4
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 4
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 4
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 4
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 4
- 101710205883 Amino-terminal enhancer of split Proteins 0.000 description 3
- 108010027344 Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors Proteins 0.000 description 3
- 102000018720 Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors Human genes 0.000 description 3
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- 108091008113 H19 Proteins 0.000 description 3
- 101000824892 Homo sapiens SOSS complex subunit B1 Proteins 0.000 description 3
- 108090000829 Ribosome Inactivating Proteins Proteins 0.000 description 3
- 102100033766 TLE family member 5 Human genes 0.000 description 3
- 101710187338 TLE family member 5 Proteins 0.000 description 3
- 239000004037 angiogenesis inhibitor Substances 0.000 description 3
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 3
- 108010018828 cadherin 5 Proteins 0.000 description 3
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 3
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 3
- 238000003196 serial analysis of gene expression Methods 0.000 description 3
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 3
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 3
- STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 7-Cyan-hept-2t-en-4,6-diinsaeure Natural products C1=2C(O)=C3C(=O)C=4C(OC)=CC=CC=4C(=O)C3=C(O)C=2CC(O)(C(C)=O)CC1OC1CC(N)C(O)C(C)O1 STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 108091006027 G proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000030782 GTP binding Human genes 0.000 description 2
- 108091000058 GTP-Binding Proteins 0.000 description 2
- 102000013382 Gelatinases Human genes 0.000 description 2
- 108010026132 Gelatinases Proteins 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 108010028501 Hypoxia-Inducible Factor 1 Proteins 0.000 description 2
- 102000016878 Hypoxia-Inducible Factor 1 Human genes 0.000 description 2
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 2
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 2
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000008790 VE-cadherin Human genes 0.000 description 2
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 230000030570 cellular localization Effects 0.000 description 2
- STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N daunorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 239000003596 drug target Substances 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 2
- IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N phthalocyanine Chemical compound N1C(N=C2C3=CC=CC=C3C(N=C3C4=CC=CC=C4C(=N4)N3)=N2)=C(C=CC=C2)C2=C1N=C1C2=CC=CC=C2C4=N1 IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000030761 polycystic kidney disease Diseases 0.000 description 2
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 102000003390 tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 2
- -1 type 2 Proteins 0.000 description 2
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 2
- PNDPGZBMCMUPRI-HVTJNCQCSA-N 10043-66-0 Chemical compound [131I][131I] PNDPGZBMCMUPRI-HVTJNCQCSA-N 0.000 description 1
- WUAPFZMCVAUBPE-NJFSPNSNSA-N 188Re Chemical compound [188Re] WUAPFZMCVAUBPE-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 1
- 108010066676 Abrin Proteins 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 241000228254 Aspergillus restrictus Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- UJKPHYRXOLRVJJ-MLSVHJFASA-N CC(O)C1=C(C)/C2=C/C3=N/C(=C\C4=C(CCC(O)=O)C(C)=C(N4)/C=C4\N=C(\C=C\1/N\2)C(C)=C4C(C)O)/C(CCC(O)=O)=C3C Chemical compound CC(O)C1=C(C)/C2=C/C3=N/C(=C\C4=C(CCC(O)=O)C(C)=C(N4)/C=C4\N=C(\C=C\1/N\2)C(C)=C4C(C)O)/C(CCC(O)=O)=C3C UJKPHYRXOLRVJJ-MLSVHJFASA-N 0.000 description 1
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 1
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- WEAHRLBPCANXCN-UHFFFAOYSA-N Daunomycin Natural products CCC1(O)CC(OC2CC(N)C(O)C(C)O2)c3cc4C(=O)c5c(OC)cccc5C(=O)c4c(O)c3C1 WEAHRLBPCANXCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010012689 Diabetic retinopathy Diseases 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 241000251948 Dolophilodes major Species 0.000 description 1
- 101710082714 Exotoxin A Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 102000003688 G-Protein-Coupled Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000045 G-Protein-Coupled Receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000237858 Gastropoda Species 0.000 description 1
- 108700004714 Gelonium multiflorum GEL Proteins 0.000 description 1
- 102100033299 Glia-derived nexin Human genes 0.000 description 1
- 102100024025 Heparanase Human genes 0.000 description 1
- 241001272567 Hominoidea Species 0.000 description 1
- 101000997803 Homo sapiens Glia-derived nexin Proteins 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 1
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 231100000742 Plant toxin Toxicity 0.000 description 1
- 102000013566 Plasminogen Human genes 0.000 description 1
- 108010051456 Plasminogen Proteins 0.000 description 1
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 1
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 1
- 240000003946 Saponaria officinalis Species 0.000 description 1
- 108010084592 Saporins Proteins 0.000 description 1
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 1
- 241000710960 Sindbis virus Species 0.000 description 1
- 102100033130 T-box transcription factor T Human genes 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N Technetium-99 Chemical compound [99Tc] GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 101710101302 Transducin-like enhancer protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 102000006747 Transforming Growth Factor alpha Human genes 0.000 description 1
- 101800004564 Transforming growth factor alpha Proteins 0.000 description 1
- 102100026482 Tubulin-folding cofactor B Human genes 0.000 description 1
- 101710087831 Tubulin-folding cofactor B Proteins 0.000 description 1
- VWQVUPCCIRVNHF-OUBTZVSYSA-N Yttrium-90 Chemical compound [90Y] VWQVUPCCIRVNHF-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 229940009456 adriamycin Drugs 0.000 description 1
- REDXJYDRNCIFBQ-UHFFFAOYSA-N aluminium(3+) Chemical compound [Al+3] REDXJYDRNCIFBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000002491 angiogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000003527 anti-angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- JCXGWMGPZLAOME-AKLPVKDBSA-N bismuth-212 Chemical compound [212Bi] JCXGWMGPZLAOME-AKLPVKDBSA-N 0.000 description 1
- JCXGWMGPZLAOME-RNFDNDRNSA-N bismuth-213 Chemical compound [213Bi] JCXGWMGPZLAOME-RNFDNDRNSA-N 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 229960004562 carboplatin Drugs 0.000 description 1
- 190000008236 carboplatin Chemical compound 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000011712 cell development Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 210000005220 cytoplasmic tail Anatomy 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 229960000975 daunorubicin Drugs 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000012631 diagnostic technique Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 229960004679 doxorubicin Drugs 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 231100000655 enterotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 229960003569 hematoporphyrin Drugs 0.000 description 1
- 108010037536 heparanase Proteins 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 230000008606 intracellular interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 108010082117 matrigel Proteins 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 230000004899 motility Effects 0.000 description 1
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000002077 nanosphere Substances 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 238000002428 photodynamic therapy Methods 0.000 description 1
- 239000003123 plant toxin Substances 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000001023 pro-angiogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 1
- 239000002213 purine nucleotide Substances 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- WUAPFZMCVAUBPE-IGMARMGPSA-N rhenium-186 Chemical compound [186Re] WUAPFZMCVAUBPE-IGMARMGPSA-N 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 102000027257 transmembrane receptors Human genes 0.000 description 1
- 108091008578 transmembrane receptors Proteins 0.000 description 1
- 231100000588 tumorigenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000000381 tumorigenic effect Effects 0.000 description 1
- 229940121358 tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 239000005483 tyrosine kinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 230000006444 vascular growth Effects 0.000 description 1
- 210000004509 vascular smooth muscle cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 230000007998 vessel formation Effects 0.000 description 1
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
- A61K39/39533—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals
- A61K39/39558—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals against tumor tissues, cells, antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K51/00—Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
- A61K51/02—Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
- A61K51/04—Organic compounds
- A61K51/08—Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
- A61K51/10—Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody
- A61K51/1018—Antibodies or immunoglobulins; Fragments thereof, the carrier being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. a camelised human single domain antibody or the Fc fragment of an antibody against material from animals or humans
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
- G01N33/5011—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing antineoplastic activity
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57415—Specifically defined cancers of breast
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
- C07K2317/34—Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Mycology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
Abstract
乳房腫瘍血管形成のより良好な理解を得るために、乳房内皮細胞（EC）を単離し、および遺伝子発現パターンを評価した。正常および悪性の乳房組織由来の乳房ECからの転写物が比較された場合、腫瘍関連乳房内皮において特異的に上昇した遺伝子が明らかにされた。これらの結果は、ヒト乳房における新生物内皮および正常な内皮が分子レベルで識別可能であること、および将来において抗血管形成治療の開発のための顕著な意味を有することを確証する。
Description
本発明は、血管形成および抗血管形成の分野に関する。詳細には、本発明は乳房腫瘍内皮細胞中で特徴的に発現される遺伝子に関する。なお、本願は、2003年4月1日に出願された米国仮出願出願番号第60/458,960号に対する優先権を主張する。
現在まで、内皮細胞特異的集団からの全体的な遺伝子発現プロフィールは、正常組織および腫瘍形成性の結腸組織に限られている[St Croix, 2000]。結腸でない腫瘍についての診断的および治療的な薬剤が開発されることが可能であるように、他の組織からの内皮細胞の分析の必要性が当技術分野において存在する。
発明の概要
本発明の一つの態様によれば、乳房腫瘍の診断を補助するための方法が提供される。新生物であることが疑われる第1の乳房組織試料における少なくとも1種の遺伝子の発現産物（タンパク質またはRNA）が検出される。
少なくとも1種の遺伝子は、仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル（Alagille）症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン（enactin）);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)からなる群より選択される。第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現は、正常である第2の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現と比較される。第2の組織試料に対する第1の乳房内皮組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現の増加により、第1の乳房組織試料が、新生物の可能性があると同定される。
本発明の一つの態様によれば、乳房腫瘍の診断を補助するための方法が提供される。新生物であることが疑われる第1の乳房組織試料における少なくとも1種の遺伝子の発現産物（タンパク質またはRNA）が検出される。
少なくとも1種の遺伝子は、仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル（Alagille）症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン（enactin）);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)からなる群より選択される。第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現は、正常である第2の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現と比較される。第2の組織試料に対する第1の乳房内皮組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現の増加により、第1の乳房組織試料が、新生物の可能性があると同定される。
本発明の別の態様によれば、乳房腫瘍を治療する方法が提供される。乳房腫瘍の細胞は抗体と接触させる。抗体は、ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);CD9抗原(p24);ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;Gタンパク質共役レセプター4;仮想タンパク質FLJ20898;低酸素症アップレギュレート1;最初期応答3;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);ジャグド1(アラジル症候群);KIAA0152遺伝子産物;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;主要組織適合複合体、クラスI、B;主要組織適合複合体、クラスI、C;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;ノッチホモログ3(ショウジョウバエ);原形質膜小胞関連タンパク質;溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;およびTEM17からなる群より選択されるタンパク質の細胞外エピトープに特異的に結合する。それによって乳房腫瘍の細胞の免疫破壊が引き起こされる。
本発明のさらに別の態様によれば、潜在的な抗癌剤または抗乳房腫瘍剤としての試験化合物を同定する方法が提供される。試験化合物は、仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)からなる群より選択される少なくとも1種の遺伝子を発現する細胞に接触させる。少なくとも1種の遺伝子の発現産物がモニターされる。試験化合物は、それが少なくとも1種の遺伝子の発現を減少する場合に潜在的な抗癌剤であると同定される。
本発明のなお別の態様は、乳房腫瘍に対する免疫応答を誘導するための方法である。タンパク質またはタンパク質をコードする核酸は、哺乳動物、好ましくはヒトに投与される。タンパク質は、仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)からなる群より選択される。タンパク質に対する免疫応答がそれによって誘導される。
従って、本発明は、乳房腫瘍を診断する方法および治療する方法を当技術分野に提供する。
発明の詳細な説明
SAGE(遺伝子発現の連続分析（Serial Analysis of Gene Expression）)プロフィールを使用して、本発明者らは、非増殖性細胞と病理的内皮細胞との間を区別する、以前に認識されていない、血管形成特異的マーカーを同定することが可能であった。さらに、他の腫瘍型(結腸および/または脳)から以前に同定された血管形成特異的マーカーのセットは、同様に乳房腫瘍内皮において発現されることが見い出された。本発明者らは、正常乳房内皮においてよりも乳房腫瘍内皮において有意に高いレベルで発現した111種のヒト遺伝子を同定した。表1を参照されたい。11種のヒト遺伝子に対して同様に使用されることが可能であるさらなるこのような遺伝子は表2に示される。本発明者らは、これらのマーカーをBEM(乳房腫瘍内皮マーカー(breast tumor endothelial markers))と名付けた。結腸と乳房の両方の腫瘍上皮において発現されるBEMは表3において同定される。脳と乳房の両方の腫瘍上皮において発現されるBEMは表4において同定される。脳、結腸および乳房のそれぞれの腫瘍内皮において発現されるBEMは表5において同定される。
SAGE(遺伝子発現の連続分析（Serial Analysis of Gene Expression）)プロフィールを使用して、本発明者らは、非増殖性細胞と病理的内皮細胞との間を区別する、以前に認識されていない、血管形成特異的マーカーを同定することが可能であった。さらに、他の腫瘍型(結腸および/または脳)から以前に同定された血管形成特異的マーカーのセットは、同様に乳房腫瘍内皮において発現されることが見い出された。本発明者らは、正常乳房内皮においてよりも乳房腫瘍内皮において有意に高いレベルで発現した111種のヒト遺伝子を同定した。表1を参照されたい。11種のヒト遺伝子に対して同様に使用されることが可能であるさらなるこのような遺伝子は表2に示される。本発明者らは、これらのマーカーをBEM(乳房腫瘍内皮マーカー(breast tumor endothelial markers))と名付けた。結腸と乳房の両方の腫瘍上皮において発現されるBEMは表3において同定される。脳と乳房の両方の腫瘍上皮において発現されるBEMは表4において同定される。脳、結腸および乳房のそれぞれの腫瘍内皮において発現されるBEMは表5において同定される。
（表1）111種の乳房マーカー
（表2）乳房におけるさらなる腫瘍内皮マーカー
（表3）結腸および乳房の腫瘍上皮におけるマーカー
（表4）脳および乳房の腫瘍上皮におけるマーカー
（表5）乳房、脳、および結腸腫瘍の内皮マーカー
内皮細胞（EC）は、正常組織または腫瘍組織中での全体の細胞のマイナーな画分のみを表し、より高いレベルで発現されたEC転写物のみが分画されていない組織から構築されたライブラリー中で表されることが期待される。それゆえに、現在の研究において記載される遺伝子は、未来におけるヒト乳房血管形成の基礎的および臨床的な研究のための価値ある資源を提供する。
本発明に従う単離および精製された核酸は、それらがヒトゲノム中で連結された遺伝子には連結されていない核酸である。さらに、それらは、別個の遺伝子から区別される多数の配列を含むライブラリーのような混合物中には存在しない。しかし、それらは、それらが天然には隣接しないベクター配列または他の遺伝子の配列のような他の遺伝子に連結され得る。
核酸配列は、センス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかを表し得る。核酸およびタンパク質は特定の配列を伴って本明細書中で開示されたが、単一の個体に由来し得る。ヒトの集団中に存在する対立遺伝子改変体は、このような核酸およびタンパク質の範囲内に含まれる。当業者は、同じ遺伝子またはタンパク質であるとして対立遺伝子改変体を十分に同定することができる。核酸が与えられれば、当業者は容易に存在するオープンリーディングフレームを、および結果的にそのオープンリーディングフレームによってコードされるポリペプチドの配列を決定することができ、そして当該分野において周知の技術を使用して、適切な宿主中でこのようなタンパク質を発現することができる。このようなポリペプチドを含むタンパク質は、天然に存在するタンパク質、ヒトまたは他の種由来の他の遺伝子からの外因性配列を含む融合タンパク質、エピトープタグ化ポリペプチドなどであり得る。単離および精製されたタンパク質は細胞中になく、核酸、脂質などのような通常の細胞構成成分から分離されている。代表的には、タンパク質は、それがタンパク質の優勢な種を含むような程度まで、例えば、存在するタンパク質の50%、60%、70%、80%、90%、または95%さえよりも高くまで精製される。
本発明に従うタンパク質を使用して、当業者は、タンパク質に特異的に結合する抗体を容易に産生し得る。このような抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルであり得る。これらは、キメラ抗体、ヒト化抗体、または全体としてヒト抗体であり得る。Fab、Fab'、Fab2、Fab'2、および単鎖可変領域を含む、抗体の任意の機能的フラグメントまたは誘導体が使用され得る。フラグメントまたは誘導体が内皮マーカータンパク質についての結合の特異性を保持する限り、それは使用され得る。抗体は、所定の一連の条件下での関連性のない抗原または抗原の混合物への結合に対して適切な抗原への結合を比較することによって結合の特異性について試験され得る。抗体が、関連性のない抗原または抗原の混合物よりも適切な抗原に少なくとも2倍、5倍、7倍、および好ましくは10倍結合するならば、これは特異的であると見なされる。
このような部分的なヒト抗体から完全なヒト抗体までを作製するための技術は当該分野において公知であり、任意のそのような技術が使用され得る。1つの特に好ましい態様に従って、完全なヒト抗体配列は、ヒト重鎖抗体遺伝子およびヒト軽鎖抗体遺伝子を発現するように操作されたトランスジェニックマウスにおいて作製される。異なるクラスの抗体を産生し得るこのようなトランスジェニックマウスの複数の系統が作製され得る。所望の抗体を産生するトランスジェニックマウスからのB細胞は、所望の抗体の継続的な産生のためのハイブリドーマ細胞株を作製するために融合され得る。例えば、以下を参照されたい：
抗体はまた、ファージディスプレイ技術を使用して作製され得る。このような技術は最初の抗体を単離するために、または変化した特異性または結合活性特性を有する改変体を生成するために使用され得る。単鎖Fvもまた、好都合に使用され得る。これらは、所望される場合、ワクチン投与されたトランスジェニックマウスから作製され得る。抗体は、細胞培養、ファージ、または種々の動物（雌ウシ、ウサギ、ヤギ、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、ヒツジ、イヌ、ネコ、サル、チンパンジー、類人猿を含むがこれらに限定されない）中で産生され得る。
抗体は、放射性原子、発色団、蛍光団などのような検出可能な部分で標識され得る。このような標識された抗体は、インビボまたは単離された試験試料のいずれかにおいて、診断的技術のために使用され得る。抗体はまた、例えば、化学療法剤または毒素のような薬学的剤に結合体化され得る。これらは、サイトカイン、リガンド、別の抗体に結合され得る。抗腫瘍効果を達成するために抗体に結合するための適切な薬剤には、インターロイキン2（IL-2）および腫瘍壊死因子（TNF）のようなサイトカイン；光線力学的治療における使用のための光増感剤（アルミニウム(III)フタロシアニンテトラスルホネート、ヘマトポルフィリン、およびフタロシアニンを含む）；ヨウ素-131（131I）、イットリウム-90（90Y）、ビスマス-212（212Bi）、ビスマス-213（213Bi）、テクネチウム-99m（99mTc）、レニウム-186（186Re）、およびレニウム-188（188Re）のような放射性核種；ドキソルビシン、アドリアマイシン、ダウノルビシン、メトトレキサート、ダウノマイシン、ネオカルチノスタチン、およびカルボプラチンのような抗生物質；ジフテリア毒素、pseudomonas外毒素A、staphylococcalエンテロトキシンA、abrin-A毒素、リシンA（脱グリコシル化リシンAおよび未変性リシンA）、TGFα毒素、チャイニーズコブラ（naja naja atra）由来のサイトトキシン、およびゲロニン（植物毒素）のような細菌、植物、および他の毒素；レストリクトシン（Aspergillus restrictusによって産生されるリボソーム不活性化タンパク質）、サポリン（Saponaria officinalisからのリボソーム不活性化タンパク質）、およびRNaseのような植物、細菌、および真菌からのリボソーム不活性化タンパク質；チロシンキナーゼインヒビター；ly207702（2フッ素化プリンヌクレオチド）；抗腫瘍剤を含むリポソーム（例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド、毒素、メトトレキサートなどをコードするプラスミド）；および他の抗体または抗体フラグメント（例えば、F(ab)）が含まれる。
当業者は、それらが当該分野において周知であるので、このような抗体誘導体を容易に理解しかつ作製することができる。この抗体は、それら自体上で細胞傷害性であり得、またはこれらは身体の特定の位置に細胞傷害性薬剤を送達するために使用され得る。抗体は、受動免疫の形態としての必要に応じて個体に投与され得る。
タンパク質配列からの細胞表面についての細胞外領域および分泌タンパク質の特徴付けは、シグナル配列、膜貫通ドメイン、および機能的ドメインの予測に基づく。抗体は、好ましくは、膜結合タンパク質と免疫反応性であり、特にそのようなタンパク質の細胞外ドメインに、または分泌タンパク質に対してであり得る。このような標的は、細胞または核の内部への接近を代表的には有しない抗体に対して容易に接近可能である。しかし、いくつかの適用において、細胞内タンパク質に指向された抗体が同様に有用であり得る。さらに、診断目的のために、細胞内タンパク質は等しく良好な標的であり得る。なぜなら、細胞溶解物が全細胞アッセイよりもむしろ使用され得るからである。
コンピュータプログラムが、その配列が未知であるタンパク質の細胞外ドメインを同定するために使用され得る。そのようなプログラムには、SMARTソフトウェア（Schultzら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 : 5857-5864, 1998)および Pfamソフトウェア（BaBEManら、Nucleic acids Res. 28 : 263-266,2000) ならびにPSORTIIが含まれる。代表的には、そのようなプログラムは膜貫通ドメインを同定し；細胞外ドメインは膜貫通ドメインにじかに隣接すると同定される。細胞外ドメインおよびシグナル切断部位の予測は近似的にすぎない。これは、+5残基または-5残基の誤差の限界を有し得る。シグナル配列は、より高い正確さのために3つの異なる方法を使用して予測され得る（Nielsenら、Protein Engineering 10: 1-6,1997、 Jaglaら、Bioinformatics 16: 245-250,2000, Nakai, KおよびHorton, P. Trends in Biochem. Sci. 24: 34-35,1999)。同様に、膜貫通（TM）ドメインは複数の予測方法によって同定され得る（Pasquierら、Protein Eng. 12: 381-385,1999, Sonnhammerら、Proc. of Sixth Int. Conf. on Intelligent Systems for Molecular Biology, 175-182頁, J. Glasgow, T. Littlejohn, F. Major, R. Lathrop, D. Sankoff, and C. Sensen Menlo Park, CA編: AAAI Press, 1998, Kleinら、Biochim. Biophys. Acta, 815: 468,1985, NakaiおよびKanehisa Genomics, 14: 897-911,1992）。不明瞭な場合において、十分に特徴付けられたタンパク質中の機能的ドメインの位置が、細胞局在化を割り当てるためのガイドとして使用される。
新規なタンパク質の推定の機能または機能ドメインは、BLAST検索 (Altschulら、Nucleic Acid Res. 25: 3389-3402,1997) によって、ならびに/またはPfam(BaBEManら、Nucleic Acids Res. 27: 260-262 1999) 、BLOCKS (Henikoffら、Nucl. Acids Res. 28: 228- 230,2000)、およびSMART (Pontingら、Nucleic Acid Res. 27,229-232, 1999) のような保存性ドメインデータベースから、同定されたデータベース中の相同領域から推測され得る。細胞外ドメインには、単一の膜貫通ドメインタンパク質（アウト-インまたはI型クラス）中の膜貫通ドメインに隣接する領域が含まれる。複数の膜貫通ドメインタンパク質について、細胞外ドメインはまた、2つの隣接する膜貫通ドメイン（イン-アウトおよびアウト-イン）の間の領域を含む。N末端領域が細胞質性であるII型膜貫通ドメインについては、膜貫通ドメインの後の領域は一般的に細胞外である。他方、分泌されたタンパク質は膜貫通ドメインを有さず、それゆえに、全体のタンパク質が細胞外と見なされる。
膜結合タンパク質は膜貫通ドメインを欠失するように操作され得、従って、リガンドに結合し得る細胞外部分を遊離させる。このような可溶性型の膜貫通レセプタータンパク質は、リガンドへの結合のための天然型と競合させるために使用され得る。従って、このような可溶性型はインヒビターとして機能し、抗血管形成剤として治療的に、天然のリガンドの定量のための診断ツールとして、およびBEM:リガンド複合体の活性を調節または模倣する低分子の同定のためのアッセイにおいて使用され得る。
代替的には、内皮マーカーそれ自体がワクチン投与された動物またはヒトにおける免疫応答を惹起するためのワクチンとして使用され得る。このような使用のために、関心対象の細胞内、細胞外、または分泌性のBEMに対応するタンパク質またはこのようなタンパク質の免疫原性フラグメントが被験体に投与される。免疫原性薬剤は精製された調製物として、または適切に発現された細胞中で提供され得る。投与は、被験体に対する免疫原性薬剤の送達によって直接的であり得るか、または、被験体中で関心対象の免疫原性薬剤の発現を生じる条件下での免疫原性薬剤をコードする核酸の送達を通して間接的であり得る。関心対象のBEMは、乳房腫瘍内皮細胞の精製された集団または融合された乳房腫瘍内皮細胞および樹状細胞の集団のような発現細胞中で送達され得る。関心対象のBEMをコードする核酸はウイルス性または非ウイルス性の送達ベクターまたはビヒクル中で送達され得る。関心対象のヒトBEMまたは他の哺乳動物ホモログをコードする非ヒト配列が、ヒト被験体中の所望の免疫応答を誘導するために使用され得る。本発明のBEMのいくつかについては、マウス、ラット、または他のオルソログ配列が文献からもしくは当該分野に十分にある技術を使用して入手され得る。
内皮細胞特異的であると本明細書に開示されているマーカーを使用して内皮細胞が同定され得る。これらのマーカーに対して特異的な抗体は、抗体をいくつかの内皮細胞を含む細胞の集団と接触させることによって、このような細胞を同定するために使用され得る。抗体と交差反応性の物質の存在は、特定の細胞を内皮性であると同定する。同様に、細胞の溶解物は、交差反応性物質の存在について試験され得る。交差反応性物質を検出するための任意の公知の様式または技術が使用され得、これには、イムノブロット、ラジオイムノアッセイ、ELISA、免疫沈降、および免疫組織化学が含まれる。さらに、これらのマーカーのための核酸プローブもまた、内皮細胞を同定するために使用され得る。ノーザンブロッティング、RT-PCR、マイクロアッセイ、ハイブリダイゼーション、およびインサイチューハイブリダイゼーションを含む、当該分野において公知のハイブリダイゼーション技術が使用され得る。
1種または複数のBEMを含むことが疑われる細胞を試験して、診断目的のために乳房腫瘍内皮細胞を同定し得る。被験体の組織と身体の両方を試験し得る。例えば、細胞内および膜結合BEMの証明のため、ならびに分泌されたBEMのために、患者の血液を試験し得る。本明細書中において特に興味深いのは、乳房腺管液の試験である。細胞内および/または膜結合BEMは、これらの因子の高レベル発現の結果として、および/またはBEMを発現する細胞の溶解を通して、体液中に存在し得る。
種々の型の内皮細胞の集団がまた、本発明の内皮マーカーに対する抗体を使用して作製され得る。この抗体は、蛍光活性化セルソーティングを含むがこれに限定されない、当該分野で公知の任意の技術に従って細胞集団を精製するために使用され得る。このような技術は、正常、腫瘍、または汎内皮的であるかに関わらず、少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、および99%でさえの所望される内皮細胞である集団の単離を可能にする。抗体は、このような集団をポジティブに選択するのとネガティブに選択するのの両方のために使用され得る。好ましくは、適切なマーカーの少なくとも1%、5%、10%、15%、20%、または25%が内皮細胞集団によって発現される。
本明細書中に記載されるように作製された内皮細胞の集団は、腫瘍の血管構造の増殖を阻害することによって、腫瘍の増殖を阻害することに適切な因子を同定するための薬物をスクリーニングするために使用され得る。
本明細書中に記載されるように作製された内皮細胞の集団は、腫瘍の血管系の増殖を阻害することによって、腫瘍もしくは他の望ましくない血管構造の増殖を阻害すること、または代替的には、内皮細胞の増殖を促進し、および従って、新規なもしくはさらなる大きな血管もしくは微小血管構造を刺激することのような、血管形成を調節することに適切なものを同定するための候補薬物をスクリーニングするために使用され得る。
内皮細胞の増殖を阻害することは、対照系と比較した場合に、すでに存在している血管構造の退化、または処理した系における新規な血管新生の発生の遅延化もしくは非存在のいずれかを意味する。内皮細胞の増殖を刺激することによって、新規な血管構造の発生（新血管形成）またはさらなる血管構造の発生（血管再生）に影響を与え得る。所定の候補薬物の血管形成特性および/または抗血管形成特性を試験するための種々のモデルスクリーニング系が利用可能である。典型的な試験には、増殖、移動、分化、および/または所定の候補薬物との細胞内相互作用のような内皮細胞応答を測定するアッセイが含まれる。このような試験によって、試験刺激のシグナルおよび効果を研究し得る。いくつかの一般的なスクリーニングには、ヘパラナーゼの阻害の測定、Matrigel上での内皮管形成、内皮細胞の引っ掻き傷誘導性運動性、血小板由来成長因子によって駆動される血管平滑筋細胞の増殖、および大動脈環アッセイ（これは1種のみの細胞型よりも毛細血管形成の利点を提供する）の測定が含まれる。
薬物は、腫瘍内皮細胞および/または内皮細胞の増殖を、模倣または調節、阻害または刺激する能力についてスクリーニングし得る。薬物は、腫瘍内皮増殖を阻害するが正常な内皮の増殖または生存を阻害しない能力についてスクリーニングされ得る。同様に、ヒト細胞集団、例えば、正常な内皮集団または乳房腫瘍内皮細胞集団が、試験物質と接触され得、乳房腫瘍内皮マーカーおよび/または正常な内皮マーカーの発現が決定される。乳房腫瘍内皮マーカー（BEM）の発現を減少させる試験物質は、血管形成および腫瘍の増殖を阻害するための候補である。BEMの活性が既知である場合において、薬剤は活性を減少または増加させるそれらの能力についてスクリーニングされ得る。
膜貫通領域を含むと同定された乳房腫瘍内皮マーカーについて、細胞表面で見い出されたBEMレセプターに結合することができる薬物候補を同定することが所望される。いくつかの応用のために、そのネイティブなリガンドからのBEMレセプターをブロックすることができる薬物候補の同定が所望される。いくつかの応用のために、BEMレセプターに結合することができる薬物候補の同定は、治療薬剤または診断薬剤を送達するための手段として使用され得る。他の応用のために、ネイティブなリガンドの活性を模倣することができる薬物候補の同定が所望される。従って、膜貫通BEMレセプター:リガンド複合体の結合を操作することによって、さらなる内皮細胞の発生、およびそれゆえに血管新生を促進または阻害することができ得る。
分泌タンパク質、すなわち、細胞外であると同定された乳房腫瘍内皮マーカーについては、分泌されたBEMタンパク質に結合することができる薬物候補を同定することが所望される。いくつかの応用のために、分泌されたBEMの結合を妨害することができる薬物候補の同定は、ネイティブなレセプターである。他の適用のために、ネイティブなレセプターの活性を模倣することができる薬物候補の同定が所望される。従って、分泌されたBEM:レセプター複合体の結合を操作することによって、内皮細胞のさらなる発生、およびそれゆえに血管新生を促進または阻害することができ得る。
任意の便利な方法に従って発現がモニターされ得る。タンパク質またはmRNAがモニターされ得る。特定の遺伝子発現をモニターするために当該分野において公知の任意の技術が使用され得、これらには、ELISA、SAGE、マイクロアレイハイブリダイゼーション、ウェスタンブロットが含まれるがこれらに限定されない。単一のマーカーの発現の変化は、潜在的な血管形成促進性、抗血管形成性、または抗腫瘍剤として有意な効果のための判断基準として使用され得る。しかし、少なくとも5、10、15、または20の関連するマーカーの発現を調節することができる試験物質（例えば、腫瘍内皮マーカーまたは正常な内皮マーカー）をスクリーニングすることもまた所望され得る。BEMタンパク質活性の阻害はまた、薬物スクリーニングとして使用され得る。
スクリーニングのための試験物質は任意の供給源由来であり得る。これらは、天然産物のライブラリー、コンビナトリアル化学ライブラリー、組換えライブラリーによって作製された生物学的生成物などであり得る。試験物質の供給源は本発明に対して決定的ではない、本発明は、他のスクリーニングスキームにおいて以前に見落とされていたかもしれない化合物および組成物をスクリーニングするための手段を提供する。本発明の核酸および対応するコードされるタンパク質は種々の様式で治療的に使用され得る。BEMは、血管構造の増殖を刺激するために例えば、創傷治癒のために、またはブロックされた血管を回避するために使用され得る。核酸およびコードされたタンパク質は、当該分野で公知の任意の方法によって投与され得る。そのような方法には、リポソーム、ナノスフェア、ウイルスベクター、ポリカチオンを含む非ウイルスベクターなどを使用することが含まれる。適切なウイルスベクターには、アデノウイルス、レトロウイルス、およびシンドビスウイルスが含まれる。投与様式は当該分野において任意の公知のものであり得、非経口、静脈内、筋肉内、腹腔内、局所的、鼻内、直腸内、気管支内などが含まれる。
BEMの特異的生物学的アンタゴニストはまた、治療的利益のために使用され得る。例えば、抗体、BEMに特異的なT細胞、BEMに対するアンチセンス、BEMに対する干渉RNA、およびBEMに特異的なリボザイムが、腫瘍または他の異常なまたは望ましくない血管系増殖を制限、阻害、減少、および/または減退させるために使用され得る。このようなアンタゴニストは、一般的にこれらのアンタゴニストのクラスについて当該分野において知られているように投与され得る。抗血管形成薬物および薬剤は、腫瘍増殖を阻害するために、ならびに、糖尿病性網膜症、慢性関節リウマチ、乾癬、腎多嚢胞病（PKD）、およびそれらの病理のための血管形成を必要とする他の疾患を治療するために使用され得る。
ヒトBEMに対するマウス対応物は、マウス癌モデルにおいて、または細胞株において、またはインビトロにおいて、潜在的な抗血管形成性または抗腫瘍性の化合物または治療剤を評価するために使用され得る。これらの発現は、効果の指標としてモニターされ得る。マウスBEMは、マウス腫瘍モデルにおいて試験され得る抗体を惹起させるための抗原として使用され得る。膜貫通ドメインを有するマウスBEMは、この目的のために特に好ましい。マウスBEMはまた、ヒトオルソログに対して、ヒトにおける免疫応答を惹起させるためのワクチンとして使用され得る。
上記の開示は一般的に本発明を記載する。本明細書中で開示されるすべての参考文献は、明白にその全体が参照として組み入れられる。より完全な理解は、例証のみの目的のために提供され、本明細書の範囲を制限することを意図しない、以下の特定の実施例への参照によって得られ得る。
実施例1
BEMタンパク質の機能は、バイオインフォマティックスツールを使用して決定した。短い細胞質テールを有する推定機能的レセプターであるBEMは、特に関心対象の標的を生じる。
BEMタンパク質の機能は、バイオインフォマティックスツールを使用して決定した。短い細胞質テールを有する推定機能的レセプターであるBEMは、特に関心対象の標的を生じる。
実施例2
プロテインキナーゼをBEM間で同定した。これらは、とりわけ低分子のための、特に良好な薬物標的である。
プロテインキナーゼをBEM間で同定した。これらは、とりわけ低分子のための、特に良好な薬物標的である。
実施例3
非タンパク質基質を有するキナーゼもまた同定した。これらは、同様に、非常に良好な薬物標的と考えられる。
非タンパク質基質を有するキナーゼもまた同定した。これらは、同様に、非常に良好な薬物標的と考えられる。
実施例4
成長因子をBEM間で同定した。
成長因子をBEM間で同定した。
実施例5
ホスファターゼは、キナーゼと同様に、インヒビター、とりわけ低分子インヒビターのスクリーニングに容易に適用することが出来る。
ホスファターゼは、キナーゼと同様に、インヒビター、とりわけ低分子インヒビターのスクリーニングに容易に適用することが出来る。
実施例6
GPCRをBEM間で同定した。
GPCRをBEM間で同定した。
実施例7
BEMの細胞局在を、以下に示すように、細胞質、細胞外、膜、または核のいずれかとして決定した。
BEMの細胞局在を、以下に示すように、細胞質、細胞外、膜、または核のいずれかとして決定した。
参考文献
Claims (42)
- 乳房腫瘍の診断を補助するための方法であって、以下の工程を含む方法：
新生物であることが疑われる第1の脳組織試料における少なくとも1種の遺伝子の発現産物を検出する工程であって、該少なくとも1種の遺伝子が、
仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル（Alagille）症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン（enactin）);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)からなる群より選択される工程;ならびに
第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現を、正常である第2の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現と比較する工程であって、第2の組織試料に対する第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現の増加により、第1の乳房組織試料が、新生物の可能性があると同定される工程。 - 第2の組織試料に対する第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現の増加が少なくとも2倍高い、請求項1記載の方法。
- 第2の組織試料に対する第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現の増加が少なくとも5倍高い、請求項1記載の方法。
- 第2の組織試料に対する第1の乳房組織試料中の少なくとも1種の遺伝子の発現の増加が少なくとも10倍高い、請求項1記載の方法。
- 発現産物がRNAである、請求項1記載の方法。
- 発現産物がタンパク質である、請求項1記載の方法。
- 第1の組織試料および第2の組織試料がヒト由来である、請求項1記載の方法。
- 第1の組織試料および第2の組織試料が同じヒト由来である、請求項1記載の方法。
- 検出する工程がウェスタンブロットを使用して実行される、請求項1記載の方法。
- 検出する工程がイムノアッセイを使用して実行される、請求項1記載の方法。
- 検出する工程が免疫組織化学アッセイを使用して実行される、請求項1記載の方法。
- 検出する工程がSAGEを使用して実行される、請求項1記載の方法。
- 検出する工程がマイクロアレイに対するハイブリダイゼーションを使用して実行される、請求項1記載の方法。
- 乳房腫瘍を治療する方法であって、以下の工程を含む方法:
乳房腫瘍の細胞を抗体と接触させる工程であって、ここで、該抗体が、ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);CD9抗原(p24);ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;Gタンパク質共役レセプター4;仮想タンパク質FLJ20898;低酸素症アップレギュレート1;最初期応答3;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);ジャグド1(アラジル症候群);KIAA0152遺伝子産物;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;主要組織適合複合体、クラスI、B;主要組織適合複合体、クラスI、C;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;ノッチホモログ3(ショウジョウバエ);原形質膜小胞関連タンパク質;溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;およびTEM17からなる群より選択されるタンパク質の細胞外エピトープに特異的に結合し、それによって該乳房腫瘍の細胞の免疫破壊が引き起こされる工程。 - 抗体が診断用薬剤または治療用薬剤に結合している、請求項14記載の方法。
- 乳房腫瘍が多剤耐性感受性である、請求項14記載の方法。
- 薬剤が化学療法剤である、請求項14記載の方法。
- 薬剤が細胞毒である、請求項14記載の方法。
- 薬剤が非放射活性標識である、請求項14記載の方法。
- 薬剤が放射活性化合物である、請求項14記載の方法。
- 乳房腫瘍がヒトにおけるものである、請求項14記載の方法。
- 潜在的な抗癌剤または抗乳房腫瘍剤としての試験化合物を同定する方法であって、以下の工程を含む方法：
仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)からなる群より選択される少なくとも1種の遺伝子を発現する細胞に試験化合物を接触させる工程;
該少なくとも1種の遺伝子の発現産物をモニタリングする工程；および
該少なくとも1種の遺伝子の発現を減少する場合に、該試験化合物を潜在的抗癌剤であると同定する工程。 - 細胞がヒト細胞である、請求項22記載の方法。
- 細胞が乳房腫瘍細胞である、請求項22記載の方法。
- 細胞がヒト乳房腫瘍細胞である、請求項22記載の方法。
- 発現産物がRNAである、請求項22記載の方法。
- 発現産物がタンパク質である、請求項22記載の方法。
- 細胞が同じ組織の正常細胞と比較して少なくとも1種の遺伝子を過剰発現する、請求項22記載の方法。
- 少なくとも2種の遺伝子の発現がモニターされる、請求項22記載の方法。
- 少なくとも3種の遺伝子の発現がモニターされる、請求項22記載の方法。
- 少なくとも4種の遺伝子の発現がモニターされる、請求項22記載の方法。
- 試験化合物が、発現の減少が少なくとも2倍である場合に同定される、請求項22記載の方法。
- 試験化合物が、発現の減少が少なくとも5倍である場合に同定される、請求項22記載の方法。
- 発現の減少が少なくとも10倍である、請求項22記載の方法。
- 試験化合物が抗乳房腫瘍剤として同定される、請求項22記載の方法。
- 乳房腫瘍に対する免疫応答を誘導するための方法であって、以下の群からなる群より選択されるタンパク質またはタンパク質をコードする核酸を哺乳動物へ投与し、それによってタンパク質に対する免疫応答が誘導される工程を含む方法：
仮想タンパク質DKFZp434G171;熱ショック70kDaタンパク質1A;ジャグド1(アラジル症候群);サイクリン依存性キナーゼ3;6-ホスホグルコノラクトナーゼ;ラットおよびマウスのレチノイド誘導性セリンカルボキシペプチダーゼの可能性のあるホモログ;原形質膜小胞関連タンパク質;NADH:ユビキノンオキシドレダクターゼMLRQサブユニットホモログ;HIF-1応答性RTP801;リボソームタンパク質L27;分泌タンパク質、酸性、システインリッチ(オステオネクチン);ヘキソキナーゼ1;リボソームタンパク質L13a;コラーゲン、IV型、α1;インスリン様成長因子結合タンパク質7;コラーゲン、III型、α1(IV型エーラース-ダンロー症候群、常染色体優性);熱ショック10kDaタンパク質1(シャペロニン10);カルシウムチャネル、電位依存性、α1Hサブユニット;CD9抗原(p24);TEM17;TEM13、Thy-1細胞表面抗原;Tax相互作用タンパク質1;ジスフェリン、肢帯筋ジストロフィー2B(常染色体劣性);仮想のタンパク質MGC34648;推定の翻訳開始因子;インスリン様成長因子結合タンパク質4;マトリックスメタロプロテイナーゼ9(ゼラチナーゼB、92kDaゼラチナーゼ、92kDa IV型コラゲナーゼ);異種核リボヌクレオタンパク質R;bHLH因子Hes4;コラーゲン、VI型、α2;T-ボックス2;グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ;G-タンパク質共役レセプター4;コラーゲン、I型、α1;ras関連C3ボツリヌス毒素基質1(rhoファミリー、低分子量GTP結合タンパク質Rac1);リボソームタンパク質、ラージ、P1;TEM10、COL1A2、組織再構築に関与;熱ショック70kDaタンパク質8;KIAA0152遺伝子産物;Ca2+促進性Rasインアクチベーター;セリン/アルギニン反復性マトリックス2;低酸素症誘導性因子1、αサブユニット(塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢);エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ1;ヘパラン硫酸プロテオグリカン2(パーレカン);フィブロモジュリン;YRPWモチーフ1と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;コラーゲン、V型、α3;YRPWモチーフ様と関連するスプリットの毛様/エンハンサー;仮想タンパク質MGC2731;スプリットのアミノ末端エンハンサー;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ9;Gタンパク質シグナル伝達のレギュレーター5;プロサイモシン、α(遺伝子配列28);チューブリン、β、2;プロテアーゼ、セリン、23;仮想タンパク質FLJ20898;カルパイン1、(mu/I)ラージサブユニット;インターフェロン、α誘導性タンパク質(クローンIFI-6-16);EST、T25031仮想タンパク質T20D3.3-Caenorhabditis elegans[C.elegans]に弱く類似;主要組織適合複合体、クラスI、C;低酸素症アップレギュレート1;補体成分4B;プレフォールジン2;細胞骨格結合タンパク質1;Rho GTPase活性化タンパク質4;Homo sapiensクローンFLC1492 PRO3121 mRNA、完全cds;スプリット2(E(sp1)ホモログ、ショウジョウバエ)のトランスデューシン様エンハンサー;リボソームタンパク質L37;仮想タンパク質MGG4677;EST、MT1A_HUMAN METALLOTHIONEIN-IA(MT-1A)[H.sapiens]に高度に類似;TEM11、ニドジェン(エナクチン);グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ5;マトリックスGlaタンパク質;熱ショック105kD;GNAS複合体遺伝子座;Homo sapiens cDNA FLJ11658 fis、クローンHEMBA1004577;H19、インプリントされた母性的に発現された非翻訳mRNA;タンパク質チロシンホスファターゼIVA型、メンバー3;スネイルホモログ1(ショウジョウバエ);インテグリン結合シアロタンパク質(骨シアロタンパク質、骨シアロタンパク質II);メタロプロテイナーゼ1の組織インヒビター(赤血球強化活性、コラゲナーゼインヒビター);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(サイクロフィリンB);MARCKS様タンパク質;FASTキナーゼ;プロテアーゼ、セリン11(IGF結合);β-2-ミクログロブリン;デルタ睡眠誘導ペプチド、免疫リアクター;コラーゲン、IV型、α2;最初期応答3;カドヘリン5、2型、VE-カドヘリン(血管上皮);RGC32タンパク質;グアニル酸シクラーゼ1、可溶性、β3;主要組織適合複合体、クラスI、B;リボヌクレアーゼ、RNaseAファミリー、1(膵臓);コラーゲン、XVIII型、α1;v-jun肉腫ウイルス17オンコジーンホモログ(鳥類);Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp686G1610(クローンDKFZp686G1610由来);ヌクレオリン;レクチン、ガラクトシド結合、可溶性、3結合タンパク質;リソソーム結合マルチスパニング膜タンパク質-5;リボソームタンパク質S16;グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、γ12;セリン(またはシステイン)プロテイナーゼインヒビター、クレードE(ネキシン、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター1型)、メンバー1;ビグリカン;DnaJ(Hsp40)ホモログ、サブファミリーB、メンバー1;腫瘍拒絶抗原(gp96)1;インターフェロン、α-誘導性タンパク質(クローンIFI-15K);溶質キャリアファミリー21(プロスタグランジントランスポーター)、メンバー2;CD74抗原(主要組織適合複合体、クラスII抗原関連のインバリアントポリペプチド);血清/糖質コルチコイド調節キナーゼ;マイトジェン活性化プロテインキナーゼ;レセプター(カルシトニン)活性修飾タンパク質3;セマドメイン、免疫グロブリンドメイン(Ig);ベンゾジアゼピンレセプター(末梢)-ミトコンドリア;C1ドメイン含有ホスファターゼおよびテンシン様;ならびにノッチホモログ3(ショウジョウバエ)。 - タンパク質が投与される、請求項36記載の方法。
- 核酸が投与される、請求項36記載の方法。
- 核酸が筋肉内に投与される、請求項38記載の方法。
- 哺乳動物に免疫アジュバントを投与する工程をさらに包含する、請求項36記載の方法。
- 哺乳動物が乳房腫瘍を有する、請求項36記載の方法。
- 哺乳動物の乳房腫瘍が外科的に除去されている、請求項36記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US45896003P | 2003-04-01 | 2003-04-01 | |
| PCT/US2004/009704 WO2004091383A2 (en) | 2003-04-01 | 2004-03-31 | Breast endothelial cell expression patterns |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2007525167A true JP2007525167A (ja) | 2007-09-06 |
Family
ID=33299657
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2006509475A Pending JP2007525167A (ja) | 2003-04-01 | 2004-03-31 | 乳房内皮細胞発現パターン |
Country Status (4)
| Country | Link |
|---|---|
| US (5) | US20070178090A1 (ja) |
| EP (3) | EP2060918A3 (ja) |
| JP (1) | JP2007525167A (ja) |
| WO (1) | WO2004091383A2 (ja) |
Families Citing this family (31)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6984522B2 (en) | 2000-08-03 | 2006-01-10 | Regents Of The University Of Michigan | Isolation and use of solid tumor stem cells |
| EP1755653B1 (en) * | 2004-05-14 | 2014-12-31 | Abraxis BioScience, LLC | Treatment methods utilizing albumin-binding proteins as targets |
| AU2006249235B2 (en) * | 2004-05-14 | 2010-11-11 | Abraxis Bioscience, Llc | Sparc and methods of use thereof |
| US8420603B2 (en) | 2004-05-14 | 2013-04-16 | Abraxis Bioscience, Llc | SPARC and methods of use thereof |
| GEP20125516B (en) * | 2004-08-16 | 2012-05-25 | Quark Biotech Inc | Therapeutic uses of inhibitors of rtp801 |
| CN101123994B (zh) | 2004-08-16 | 2012-11-14 | 夸克医药公司 | Rtp801的抑制剂的治疗性用途 |
| US8685659B2 (en) | 2005-01-28 | 2014-04-01 | Children's Medical Center Corporation | Method for diagnosis and prognosis of epithelial cancers |
| EP1869077A2 (en) * | 2005-02-18 | 2007-12-26 | Abraxis BioScience, Inc. | Q3 sparc deletion mutant and uses thereof |
| CN102539734B (zh) * | 2005-05-12 | 2016-02-03 | 清华大学 | 核仁素辅助的癌症诊断与治疗方法 |
| DOP2007000015A (es) | 2006-01-20 | 2007-08-31 | Quark Biotech Inc | Usos terapéuticos de inhibidores de rtp801 |
| WO2008054534A2 (en) | 2006-05-11 | 2008-05-08 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Screening systems utilizing rtp801 |
| WO2007141796A2 (en) | 2006-06-09 | 2007-12-13 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Therapeutic uses of inhibitors of rtp801l |
| PL2032166T3 (pl) | 2006-06-13 | 2013-09-30 | Oncomed Pharm Inc | Kompozycje i sposoby diagnozowania i leczenia nowotworów |
| WO2008091781A1 (en) * | 2007-01-22 | 2008-07-31 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Reducing tumor growth |
| EP2125887A4 (en) | 2007-01-24 | 2010-11-10 | Oncomed Pharm Inc | COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DIAGNOSIS AND TREATMENT OF CANCER |
| EP2137205A2 (en) | 2007-02-26 | 2009-12-30 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Inhibitors of rtp801 and their use in disease treatment |
| EA200700940A1 (ru) | 2007-04-27 | 2007-12-28 | Петр Генриевич ЛОХОВ | Способ получения противоопухолевой вакцины на основе поверхностных антигенов эндотелиальных клеток |
| EP2155249A4 (en) | 2007-05-15 | 2011-11-16 | Oncomed Pharm Inc | COMPOSITIONS AND METHOD FOR DIAGNOSIS AND TREATMENT OF CANCER |
| GB2460769C (en) | 2007-11-30 | 2011-09-07 | Applied Genomics Inc | TLE3 as a marker for chemotherapy |
| US8614311B2 (en) | 2007-12-12 | 2013-12-24 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | RTP801L siRNA compounds and methods of use thereof |
| US9132189B2 (en) | 2008-07-08 | 2015-09-15 | Oncomed Pharmaceuticals, Inc. | Notch1 binding agents and methods of use thereof |
| SI2307051T1 (sl) | 2008-07-08 | 2015-04-30 | Oncomed Pharmaceuticals, Inc. | Notch-vezavna sredstva in antagonisti ter postopki njihove uporabe |
| ES2363669B1 (es) * | 2009-06-10 | 2012-08-09 | Fundacio Privada Institut D'investigacio Biomedica De Bellvitge (Idibell) | Metodo para determinar el riesgo de desarrollar metastasis cerebral y un kit para llevar a cabo dicho procedimiento |
| EP2501800A4 (en) | 2009-11-17 | 2013-05-22 | Musc Found For Res Dev | HUMAN MONOCLONAL ANTIBODIES FOR HUMAN NUCLEOLIN |
| CN102958534B (zh) | 2010-01-13 | 2014-11-05 | 昂考梅德药品有限公司 | Notch1结合剂及其使用方法 |
| WO2013035095A1 (en) * | 2011-09-08 | 2013-03-14 | Ben-Gurion University Of The Negev Research And Development Authority | Methods for diagnosing cancer |
| US9127053B2 (en) | 2012-06-22 | 2015-09-08 | Cytomx Therapeutics, Inc. | Anti-jagged 1/jagged 2 cross-reactive antibodies, activatable anti-jagged antibodies and methods of use thereof |
| US11976329B2 (en) | 2013-03-15 | 2024-05-07 | Veracyte, Inc. | Methods and systems for detecting usual interstitial pneumonia |
| EP3177732A4 (en) * | 2014-08-08 | 2018-04-25 | ModernaTX, Inc. | Compositions and methods for the treatment of ophthalmic diseases and conditions |
| CN107206043A (zh) | 2014-11-05 | 2017-09-26 | 维拉赛特股份有限公司 | 使用机器学习和高维转录数据在经支气管活检上诊断特发性肺纤维化的系统和方法 |
| US11217329B1 (en) | 2017-06-23 | 2022-01-04 | Veracyte, Inc. | Methods and systems for determining biological sample integrity |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2002059377A2 (en) * | 2001-01-24 | 2002-08-01 | Protein Design Labs | Methods of diagnosis of breast cancer, compositions and methods of screening for modulators of breast cancer |
Family Cites Families (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6075181A (en) | 1990-01-12 | 2000-06-13 | Abgenix, Inc. | Human antibodies derived from immunized xenomice |
| AU5333298A (en) * | 1996-12-27 | 1998-07-31 | Instituto De Investigaciones Bioquimicas Fundacion Campomar | Compositions and methods for tumour therapy |
| US6811776B2 (en) * | 2000-12-27 | 2004-11-02 | The Regents Of The University Of Michigan | Process for ex vivo formation of mammalian bone and uses thereof |
| WO2001098359A2 (en) * | 2000-06-21 | 2001-12-27 | Wyeth | Cyr61 as a target for treatment and diagnosis of breast cancer |
| EP1418943A1 (en) * | 2001-02-14 | 2004-05-19 | Protein Design Labs, Inc. | Methods of diagnosis of angiogenesis, compositions and methods of screening for angiogenesis modulators |
| JP2003043046A (ja) * | 2001-07-31 | 2003-02-13 | Chemo Sero Therapeut Res Inst | 乳癌判定用マーカー及び該マーカーを用いる乳癌の判定方法 |
| US6855554B2 (en) * | 2001-09-21 | 2005-02-15 | Board Of Regents, The University Of Texas Systems | Methods and compositions for detection of breast cancer |
| EP1448599A2 (en) * | 2001-11-14 | 2004-08-25 | Lorantis Limited | Inhibitors of the notch signalling pathway for use in the treatment of cancer |
| CN1643163A (zh) * | 2002-02-20 | 2005-07-20 | Ncc技术投资私人有限公司 | 关于癌症诊断的材料和方法 |
| WO2004085621A2 (en) * | 2003-03-20 | 2004-10-07 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Gene expression in breast cancer |
| US20050249666A1 (en) * | 2003-07-10 | 2005-11-10 | Central Institute For Experimental Animals | Establishment of human cancer cell lines with metastatic potential using NOD/SCID |
| JP4286085B2 (ja) * | 2003-07-28 | 2009-06-24 | Ｏｋｉセミコンダクタ株式会社 | 増幅器及びそれを用いた半導体記憶装置 |
-
2004
- 2004-03-31 US US10/551,217 patent/US20070178090A1/en not_active Abandoned
- 2004-03-31 EP EP09154001A patent/EP2060918A3/en not_active Withdrawn
- 2004-03-31 WO PCT/US2004/009704 patent/WO2004091383A2/en active Application Filing
- 2004-03-31 EP EP10169744A patent/EP2233926A3/en not_active Withdrawn
- 2004-03-31 JP JP2006509475A patent/JP2007525167A/ja active Pending
- 2004-03-31 EP EP04759056A patent/EP1608255A4/en not_active Withdrawn
-
2008
- 2008-11-12 US US12/269,418 patent/US20090117038A1/en not_active Abandoned
-
2011
- 2011-07-05 US US13/176,222 patent/US8568985B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2013
- 2013-10-29 US US14/065,587 patent/US20140056911A1/en not_active Abandoned
-
2015
- 2015-07-15 US US14/800,457 patent/US20150315269A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2002059377A2 (en) * | 2001-01-24 | 2002-08-01 | Protein Design Labs | Methods of diagnosis of breast cancer, compositions and methods of screening for modulators of breast cancer |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP1608255A2 (en) | 2005-12-28 |
| US20090117038A1 (en) | 2009-05-07 |
| EP1608255A4 (en) | 2008-06-25 |
| EP2060918A2 (en) | 2009-05-20 |
| US20070178090A1 (en) | 2007-08-02 |
| US8568985B2 (en) | 2013-10-29 |
| WO2004091383A2 (en) | 2004-10-28 |
| EP2233926A3 (en) | 2011-01-12 |
| US20150315269A1 (en) | 2015-11-05 |
| WO2004091383A3 (en) | 2007-01-18 |
| EP2060918A3 (en) | 2009-08-26 |
| US20140056911A1 (en) | 2014-02-27 |
| EP2233926A2 (en) | 2010-09-29 |
| US20110262350A1 (en) | 2011-10-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2007525167A (ja) | 乳房内皮細胞発現パターン | |
| EP2365004B1 (en) | Membrane associated tumor endothelium markers | |
| JP6196338B2 (ja) | 診断および治療のための腫瘍関連抗原の同定 | |
| TWI554280B (zh) | Ｈｌａ-ａ*１１０１限制性ｗｔ１胜肽之用途 | |
| JP2007518399A (ja) | 肺癌を診断および治療する組成物並びに方法 | |
| JP5380075B2 (ja) | がん関連抗原 | |
| JP4527544B2 (ja) | 癌およびその前駆病変の検出のための化合物および方法 | |
| JP2003524017A (ja) | タンパク質 | |
| US20210108276A1 (en) | Tumor-associated markers for detection of minimal residual disease using digital droplet pcr | |
| JPH10512158A (ja) | 膀胱の核マトリックスタンパク質ならびに細胞増殖性疾患の検出及び治療におけるその使用 | |
| US20030166023A1 (en) | Novel compositions and methods for the identification, assessment, prevention, and therapy of human cancers | |
| US20030170755A1 (en) | Tumor-associated antigen RHAMM | |
| WO2009120039A2 (en) | Use of cd9 for a target protein to develop anticancer drug of solid cancers that overexpress cd9 | |
| WO2002016939A2 (en) | Methods of diagnosis of cancer and screening for cancer modulators | |
| US20220289854A1 (en) | Methods for treating cancer using combinations of anti-cx3cr1 and immune checkpoint blockade agents | |
| US20030087245A1 (en) | Uses of PBH1 in the diagnosis and therapeutic treatment of prostate cancer | |
| AU1570301A (en) | Nuclear matrix proteins, polynucleotide sequences encoding them, and their use |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20100513 |
|
| A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20100810 |
|
| A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20100817 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20101112 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20101206 |
|
| A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20110328 |