JP2007512801A - 結腸直腸癌用のバイオマーカーパネル - Google Patents
結腸直腸癌用のバイオマーカーパネル Download PDFInfo
- Publication number
- JP2007512801A JP2007512801A JP2006521116A JP2006521116A JP2007512801A JP 2007512801 A JP2007512801 A JP 2007512801A JP 2006521116 A JP2006521116 A JP 2006521116A JP 2006521116 A JP2006521116 A JP 2006521116A JP 2007512801 A JP2007512801 A JP 2007512801A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- panel
- colorectal
- seq
- nos
- polynucleotide
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57419—Specifically defined cancers of colon
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Abstract
【選択図】 図4A
Description
本出願は、Nancy M. Lee等により2003年7月18日に出願された「結腸直腸癌判定用の分子マーカーパネル」の名称を有する米国仮出願第60/488,660号(代理人整理番号:CPMC-01000US0)及びNancy M. Lee等により2003年10月22日に出願された「結腸直腸癌用のバイオマーカーパネル」の名称を有する米国出願第10/690,880号(代理人整理番号:CPMC-01000US1)の優先権を主張する。何れの出願の内容は参照することにより本明細書に組み込まれる。
本明細書の開示の技術分野は、結腸直腸癌(colorectal cancer)(CRC)用のバイオマーカーに関する。これらのバイオマーカーは、CRCのリスクアセスメント、早期検出、予後の確立、介入の評価、再発並びに治療的介入の発見及びその使用方法に有用である。
現在認められているCRCスクリーニング法は別として、求められている別のアプローチは、CRCの検出及び治療において価値のあるバイオマーカーの探索であった。40年を超える期間、α−フェトプロテイン(AFP)及び癌胎児性抗原(CEA)の発見以来、癌の検出及び治療用バイオマーカーの探索は全般的に進展状態であった。癌のバイオマーカーは、患者の治療管理において5つの強力な用途を有する。理想としては、バイオマーカーは、リスク管理、早期診断、予後の確立、治療の監視及び再発の検出に使用されるだろう。更に、そのようなバイオマーカーは治療的介入の開発において大切な役割を果たすことができるだろう。
Claims (95)
- 配列番号1〜5から選ばれる少なくとも2つのポリヌクレオチドを含む、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネル。
- パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープについてのポリヌクレオチド発現レベルの分析のために選択される、請求項1に記載のパネル。
- ポリヌクレオチド発現レベルがmRNAである、請求項2に記載のパネル。
- ポリヌクレオチド発現レベルがcDNAである、請求項2に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドが断片である、請求項1に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドが変種である、請求項1に記載のパネル。
- パネルを結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープにおける患者治療の管理のために使用する、請求項1に記載のパネル。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項7に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項1に記載のパネル。
- 配列番号1〜5から選ばれる少なくとも2つのポリヌクレオチド及び
配列番号6〜14から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチド
を含む、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネル。 - パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープについてのポリヌクレオチド発現レベルの分析のために選択される、請求項10に記載のパネル。
- ポリヌクレオチド発現レベルがmRNAである、請求項11に記載のパネル。
- ポリヌクレオチド発現レベルがcDNAである、請求項11に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドが断片である、請求項10に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドが変種である、請求項10に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープに対する患者治療の管理において使用する、請求項10に記載のパネル。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項16に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項10に記載のパネル。
- 配列番号1〜5から選ばれる少なくとも2つのポリヌクレオチド、
配列番号6〜14から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチド、及び
配列番号15〜22から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチド、
を含む、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネル。 - パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープについてのポリヌクレオチド発現レベルの分析のために選択される、請求項19に記載のパネル。
- ポリヌクレオチド発現レベルがmRNAである、請求項20に記載のパネル。
- ポリヌクレオチド発現レベルがcDNAである、請求項20に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドが断片である、請求項19に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリヌクレオチドが変種である、請求項19に記載のパネル。
- パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープにおける患者治療の管理の基礎である、請求項25に記載のパネル。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項19に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項25に記載のパネル。
- 配列番号23〜27から選ばれる少なくとも2つのポリペプチドを含む、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネル。
- パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープについてのポリペプチド発現レベルの分析のために選択される、請求項28に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリペプチドが断片である、請求項28に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリペプチドが変種である、請求項28に記載のパネル。
- パネルを結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープにおける患者治療の管理において使用する、請求項28に記載のパネル。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項32に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項28に記載のパネル。
- 配列番号23〜27から選ばれる少なくとも2つのポリペプチド、及び
配列番号28〜36から選ばれる少なくとも1つのポリペプチド
を含む、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネル。 - パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープについてのポリペプチド発現レベルの分析のために選択される、請求項35に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリペプチドが断片である、請求項35に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリペプチドが変種である、請求項35に記載のパネル。
- パネルを結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープにおける患者治療の管理において使用する、請求項35に記載のパネル。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項39に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項35に記載のパネル。
- 配列番号23〜27から選ばれる少なくとも2つのポリペプチド、
配列番号28〜36から選ばれる少なくとも1つのポリペプチド、及び
配列番号37〜44から選ばれる少なくとも1つのポリペプチド
を含む、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネル。 - パネルが結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープについてのポリペプチド発現レベルの分析のために選択される、請求項42に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリペプチドが断片である、請求項42に記載のパネル。
- 少なくとも1つのポリペプチドが変種である、請求項42に記載のパネル。
- パネルを結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープにおける患者治療の管理において使用する、請求項42に記載のパネル。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項46に記載のパネル。
- パネルを、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項42に記載のパネル。
- 結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用バイオマーカーからのポリヌクレオチドの発現レベルを測定する方法であって、
配列番号1〜5からの少なくとも2つのポリヌクレオチドを含むバイオマーカーのパネルを選択する工程、
生物試料を得る工程、
該試料から細胞RNAを単離する工程、
該パネルの各バイオマーカーについて、該試料からのcDNAのコピーを増幅する工程、及び、
該試料から増幅したcDNAのレベルを定量する工程
を含む方法。 - バイオマーカーのパネルを選択する工程が、配列番号6〜14からの少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む、請求項49に記載の方法。
- バイオマーカーのパネルを選択する工程が、配列番号6〜14からの少なくとも1つのポリヌクレオチド及び配列番号15〜22からの少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む、請求項49に記載の方法。
- cDNAのコピーを増幅する工程が、配列番号45〜50から選ばれるプライマーの少なくとも2セットを更に含む、請求項49に記載の方法。
- cDNAのコピーを増幅する工程が、cDNA調製用の酵素及び試薬を使用する工程を更に含む、請求項52に記載の方法。
- cDNAのレベルを定量する工程が、cDNAを標識する工程を更に含む、請求項49に記載の方法。
- cDNAを標識する工程が、少なくとも1つの発色団を含む、請求項54に記載の方法。
- 試料についてのcDNAレベルを対照と比較する、請求項49に記載の方法。
- 比較を、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの患者治療の管理において使用する、請求項56に記載の方法。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項57に記載の方法。
- 比較を、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項56に記載の方法。
- 生物試料を得る工程が、結腸直腸細胞試料を得ることによるものである、請求項49に記載の方法。
- 結腸直腸細胞試料を得る工程が最小限に侵襲性である、請求項60に記載の方法。
- 最小限に侵襲性の工程がスワブの使用によるものである、請求項61に記載の方法。
- 結腸直腸細胞試料を得る工程が非侵襲性である、請求項60に記載の方法。
- 非侵襲性の工程が便試料の収集によるものである、請求項63に記載の方法。
- 結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用バイオマーカーからのポリペプチドの発現レベルを測定する方法であって、
配列番号23〜27からの少なくとも2つのポリペプチドを含むバイオマーカーのパネルを選択する工程、
生物試料を得る工程、
該パネルの各バイオマーカーについての抗体パネルを作成する工程、
該抗体パネルを使用して該試料からポリペプチドを結合させる工程及び、
該試料から該抗体パネルへ結合したポリペプチドのレベルを定量する工程
を含む方法。 - バイオマーカーのパネルを選択する工程が、配列番号28〜36からの少なくとも1つのポリペプチドを更に含む、請求項65に記載の方法。
- バイオマーカーのパネルを選択する工程が、配列番号28〜36からの少なくとも1つのポリペプチド及び配列番号37〜44からの少なくとも1つのポリペプチドを更に含む、請求項65に記載の方法。
- 試料についてのポリペプチドレベルを対照と比較する、請求項65に記載の方法。
- 比較を、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの患者治療の管理において使用する、請求項68に記載の方法。
- 患者治療の管理が、リスクアセスメント、早期診断、予後の確立、患者の治療の監視及び再発の検出の1以上を含む、請求項69に記載の方法。
- 比較を、結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの治療的介入の発見において使用する、請求項に記載のパネル。
- 生物試料を得る工程が、結腸直腸細胞試料を得ることによるものである、請求項65に記載の方法。
- 結腸直腸細胞試料を得る工程が最小限に侵襲性である、請求項72に記載の方法。
- 最小限に侵襲性の工程がスワブの使用によるものである、請求項73に記載の方法。
- 結腸直腸細胞試料を得る工程が非侵襲性である、請求項72に記載の方法。
- 非侵襲性の工程が便試料の収集によるものである、請求項75に記載の方法。
- 結合したポリペプチドを定量する工程が、該ポリペプチドを標識する工程を更に含む、請求項65に記載の方法。
- ポリペプチドを標識する工程が、第二抗体を使用する工程を含む、請求項77に記載の方法。
- 結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの判定用のキットであって、
結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネルについてポリヌクレオチド発現レベルの分析に使用する少なくとも1つの試薬、及び
該発現レベルの分析のために該キットを使用するための使用説明書
を含み、
該パネルは配列番号1〜5に列挙される少なくとも2つのポリヌクレオチドを含んでいるキット。 - バイオマーカーのパネルが、配列番号6〜14に列挙される少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む、請求項79に記載のキット。
- バイオマーカーのパネルが、配列番号6〜14から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチド、及び、配列番号15〜22から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む、請求項79に記載のキット。
- ポリヌクレオチド発現レベルがmRNAである、請求項79に記載のキット。
- ポリヌクレオチド発現レベルがcDNAである、請求項79に記載のキット。
- 試薬が、配列番号45〜50から選ばれるプライマーの少なくとも2セットを含む、請求項83に記載のキット。
- cDNA調製用の試薬を更に含む、請求項84に記載のキット。
- ポリヌクレオチドの検出及び定量に使用する試薬を含む、請求項79に記載のキット。
- 試薬が、少なくとも1つの発色団を含む、請求項86に記載のキット。
- 試料の収集、試料の調製及び試料の分析の少なくとも1つのための消耗実験器具を更に含む、請求項79に記載のキット。
- 結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープの判定用のキットであって、
結腸直腸癌及び結腸直腸ポリープ用のバイオマーカーのパネルについてポリペプチド発現レベルの分析に使用する少なくとも1つの試薬、及び
該発現レベルの分析のために該キットを使用するための使用説明書
を含み、
該パネルは配列番号23〜27に列挙される少なくとも2つのポリペプチドを含んでいるキット。 - バイオマーカーのパネルが、配列番号28〜36に列挙される少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む、請求項89に記載のキット。
- バイオマーカーのパネルが、配列番号28〜36から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチド、及び、配列番号37〜44から選ばれる少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む、請求項89に記載のキット。
- 試薬が、パネルにおいて選択されたポリペプチドに結合する抗体試薬である、請求項89に記載のキット。
- 結合したポリペプチドの検出及び定量に使用する試薬を更に含む、請求項89に記載のキット。
- 試薬が第二抗体を含む、請求項93に記載のキット。
- 試料の収集、試料の調製及び試料の分析の少なくとも1つのための消耗実験器具を更に含む、請求項89に記載のキット。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US48866003P | 2003-07-18 | 2003-07-18 | |
US10/690,880 US20050014165A1 (en) | 2003-07-18 | 2003-10-22 | Biomarker panel for colorectal cancer |
PCT/US2004/022594 WO2005010486A2 (en) | 2003-07-18 | 2004-07-14 | Biomarker panel for colorectal cancer |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2007512801A true JP2007512801A (ja) | 2007-05-24 |
JP2007512801A5 JP2007512801A5 (ja) | 2007-08-30 |
Family
ID=34068448
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2006521116A Pending JP2007512801A (ja) | 2003-07-18 | 2004-07-14 | 結腸直腸癌用のバイオマーカーパネル |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20050014165A1 (ja) |
EP (1) | EP1654526A4 (ja) |
JP (1) | JP2007512801A (ja) |
KR (1) | KR20060034712A (ja) |
AU (2) | AU2004259431A1 (ja) |
CA (1) | CA2534633A1 (ja) |
WO (1) | WO2005010486A2 (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2011517765A (ja) * | 2007-06-04 | 2011-06-16 | ダイアグノプレックス エセアー | 結腸直腸癌のためのバイオマーカの組み合わせ |
JP2013533977A (ja) * | 2010-07-14 | 2013-08-29 | コモンウェルス サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ オーガニゼイション | 大腸癌の診断 |
JP2017510304A (ja) * | 2014-04-10 | 2017-04-13 | バイオ−マルケア テクノロジーズ リミテッド | 前癌性結腸直腸ポリープおよび結腸直腸癌を特定するための方法およびキット |
Families Citing this family (56)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2004013311A2 (en) * | 2002-08-06 | 2004-02-12 | Diadexus, Inc. | Compositions and methods relating to ovarian specific genes and proteins |
GB0307403D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Selection by compartmentalised screening |
GB0307428D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Compartmentalised combinatorial chemistry |
US20060078893A1 (en) | 2004-10-12 | 2006-04-13 | Medical Research Council | Compartmentalised combinatorial chemistry by microfluidic control |
US20050014165A1 (en) * | 2003-07-18 | 2005-01-20 | California Pacific Medical Center | Biomarker panel for colorectal cancer |
US20050221339A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Medical Research Council Harvard University | Compartmentalised screening by microfluidic control |
WO2006012522A1 (en) | 2004-07-23 | 2006-02-02 | Pacific Edge Biotechnology Ltd. | Urine markers for detection of bladder cancer |
US20060088862A1 (en) * | 2004-09-30 | 2006-04-27 | Nancy Lee | Drug screening and molecular diagnostic test for early detection of colorectal cancer: reagents, methods, and kits thereof |
US7968287B2 (en) | 2004-10-08 | 2011-06-28 | Medical Research Council Harvard University | In vitro evolution in microfluidic systems |
JP2009536313A (ja) | 2006-01-11 | 2009-10-08 | レインダンス テクノロジーズ, インコーポレイテッド | ナノリアクターの形成および制御において使用するマイクロ流体デバイスおよび方法 |
AU2007204826B2 (en) * | 2006-01-11 | 2013-01-10 | Genomic Health, Inc. | Gene expression markers for colorectal cancer prognosis |
NZ545243A (en) * | 2006-02-10 | 2009-07-31 | Pacific Edge Biotechnology Ltd | Urine gene expression ratios for detection of cancer |
EP2530168B1 (en) | 2006-05-11 | 2015-09-16 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic Devices |
US9562837B2 (en) | 2006-05-11 | 2017-02-07 | Raindance Technologies, Inc. | Systems for handling microfludic droplets |
WO2008021123A1 (en) | 2006-08-07 | 2008-02-21 | President And Fellows Of Harvard College | Fluorocarbon emulsion stabilizing surfactants |
JP5168943B2 (ja) * | 2006-09-15 | 2013-03-27 | 東ソー株式会社 | エプスタイン・バー・ウィルス核抗原2共活性化因子p100の検出による癌の検査方法および検査試薬 |
US8772046B2 (en) | 2007-02-06 | 2014-07-08 | Brandeis University | Manipulation of fluids and reactions in microfluidic systems |
US7910293B2 (en) * | 2007-03-28 | 2011-03-22 | University Of Southern California | Development of prognostic markers from the saliva of head and neck cancer patients |
EP1986010A1 (en) * | 2007-04-05 | 2008-10-29 | Vereniging voor christelijk hoger onderwijs, wetenschappelijk onderzoek en patiëntenzorg | Methods and tools for discriminating colorectal adenomas and adenocarcinomas |
WO2008130623A1 (en) | 2007-04-19 | 2008-10-30 | Brandeis University | Manipulation of fluids, fluid components and reactions in microfluidic systems |
AU2008260075A1 (en) * | 2007-05-31 | 2008-12-11 | California Pacific Medical Center | Method to predict or diagnose a gastrointestinal disorder or disease |
US8883440B2 (en) | 2007-07-26 | 2014-11-11 | Nancy M. Lee | Method to predict or diagnose a gastrointestinal disorder or disease |
CN102089443A (zh) * | 2008-04-10 | 2011-06-08 | 基因信息公司 | 用于测定受试者中结肠直肠癌的概率的方法和装置 |
KR100976218B1 (ko) | 2008-05-26 | 2010-08-17 | 한국표준과학연구원 | 비행시간이차이온질량분광법을 이용한 질병의 진단 방법,질병 지표의 스크린 방법, 및 질병 지표 |
WO2010009365A1 (en) | 2008-07-18 | 2010-01-21 | Raindance Technologies, Inc. | Droplet libraries |
US20100112713A1 (en) * | 2008-11-05 | 2010-05-06 | The Texas A&M University System | Methods For Detecting Colorectal Diseases And Disorders |
EP3415235A1 (en) | 2009-03-23 | 2018-12-19 | Raindance Technologies Inc. | Manipulation of microfluidic droplets |
WO2010127322A1 (en) * | 2009-05-01 | 2010-11-04 | Genomic Health Inc. | Gene expression profile algorithm and test for likelihood of recurrence of colorectal cancer and response to chemotherapy |
EP2910650A1 (en) | 2009-08-24 | 2015-08-26 | National University Corporation Kanazawa University | Detection of colorectal cancer by gene expression profiling |
WO2011042564A1 (en) | 2009-10-09 | 2011-04-14 | Universite De Strasbourg | Labelled silica-based nanomaterial with enhanced properties and uses thereof |
US10837883B2 (en) | 2009-12-23 | 2020-11-17 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Microfluidic systems and methods for reducing the exchange of molecules between droplets |
US10351905B2 (en) | 2010-02-12 | 2019-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
US9399797B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-07-26 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
JP5934657B2 (ja) | 2010-02-12 | 2016-06-15 | レインダンス テクノロジーズ, インコーポレイテッド | デジタル検体分析 |
US9366632B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-06-14 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
EP3447155A1 (en) | 2010-09-30 | 2019-02-27 | Raindance Technologies, Inc. | Sandwich assays in droplets |
WO2012088146A2 (en) * | 2010-12-20 | 2012-06-28 | The University Of Notre Dame | Biomarkers and uses thereof in prognosis and treatment strategies for right-side colon cancer disease and left-side colon cancer disease |
US20120172244A1 (en) | 2010-12-20 | 2012-07-05 | Steven Buechler | Biomarkers and uses thereof in prognosis and treatment strategies for right-side colon cancer disease and left-side colon cancer disease |
WO2012109600A2 (en) | 2011-02-11 | 2012-08-16 | Raindance Technologies, Inc. | Methods for forming mixed droplets |
EP2675819B1 (en) | 2011-02-18 | 2020-04-08 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Compositions and methods for molecular labeling |
US8841071B2 (en) | 2011-06-02 | 2014-09-23 | Raindance Technologies, Inc. | Sample multiplexing |
EP2714970B1 (en) | 2011-06-02 | 2017-04-19 | Raindance Technologies, Inc. | Enzyme quantification |
US8658430B2 (en) | 2011-07-20 | 2014-02-25 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulating droplet size |
WO2013045464A1 (en) | 2011-09-26 | 2013-04-04 | Roche Diagnostics Gmbh | Cdna biomarkers in whole blood for colorectal cancer assessment |
EP3495817A1 (en) | 2012-02-10 | 2019-06-12 | Raindance Technologies, Inc. | Molecular diagnostic screening assay |
EP3524693A1 (en) | 2012-04-30 | 2019-08-14 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
EP2986762B1 (en) | 2013-04-19 | 2019-11-06 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
US11901041B2 (en) | 2013-10-04 | 2024-02-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analysis of nucleic acid modification |
US9944977B2 (en) | 2013-12-12 | 2018-04-17 | Raindance Technologies, Inc. | Distinguishing rare variations in a nucleic acid sequence from a sample |
WO2015103367A1 (en) | 2013-12-31 | 2015-07-09 | Raindance Technologies, Inc. | System and method for detection of rna species |
US10647981B1 (en) | 2015-09-08 | 2020-05-12 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Nucleic acid library generation methods and compositions |
CN107151708B (zh) * | 2017-07-05 | 2020-10-09 | 昆明医科大学第一附属医院 | 多功能转录调控因子ctcf的dna结合位点ctcf_13的应用 |
CN107164532B (zh) * | 2017-07-05 | 2020-05-22 | 昆明医科大学第一附属医院 | 多功能转录调控因子ctcf的dna结合位点ctcf_94的应用 |
CN107119144B (zh) * | 2017-07-05 | 2020-10-09 | 昆明医科大学第一附属医院 | 多功能转录调控因子ctcf的dna结合位点ctcf_55的应用 |
US10998178B2 (en) | 2017-08-28 | 2021-05-04 | Purdue Research Foundation | Systems and methods for sample analysis using swabs |
CN113488121B (zh) * | 2021-07-24 | 2024-03-15 | 山东省千佛山医院 | 一种结肠癌肠道微生态精准检测评估干预系统及方法 |
Family Cites Families (29)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ATE291583T1 (de) * | 1993-11-03 | 2005-04-15 | Orchid Biosciences Inc | Polymorphismus von mononukleotiden und ihre verwendung in der genanalyse |
KR100230909B1 (ko) * | 1993-11-29 | 1999-12-01 | 다니엘 엘. 캐시앙 | 광범위의 유기체로부터 핵산 추출 방법 |
US5962477A (en) * | 1994-04-12 | 1999-10-05 | Adolor Corporation | Screening methods for cytokine inhibitors |
US7625697B2 (en) * | 1994-06-17 | 2009-12-01 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for constructing subarrays and subarrays made thereby |
US5804684A (en) * | 1995-08-24 | 1998-09-08 | The Theobald Smith Research Institute, Inc. | Method for isolating nucleic acids |
US5741650A (en) * | 1996-01-30 | 1998-04-21 | Exact Laboratories, Inc. | Methods for detecting colon cancer from stool samples |
US6025336A (en) * | 1996-02-15 | 2000-02-15 | University Of Pittsburgh | Determining exposure to ionizing radiation agent with persistent biological markers |
US5935790A (en) * | 1996-08-06 | 1999-08-10 | Rutgers, The State University Of New Jersey | Method for detecting a predisposition to susceptibility to toxic effects of drugs and poisons |
US5952178A (en) * | 1996-08-14 | 1999-09-14 | Exact Laboratories | Methods for disease diagnosis from stool samples |
FI971124A0 (fi) * | 1997-03-18 | 1997-03-18 | Locus Genex Oy | Metod foer diagnostisering av magcancer |
US6406857B1 (en) * | 1997-06-16 | 2002-06-18 | Exact Sciences Corporation | Methods for stool sample preparation |
US6268136B1 (en) * | 1997-06-16 | 2001-07-31 | Exact Science Corporation | Methods for stool sample preparation |
US6423491B1 (en) * | 1998-05-13 | 2002-07-23 | University Of Iowa Research Foundation | Method of diagnosing juvenile polyposis (JP) |
WO2000061808A2 (en) * | 1999-04-09 | 2000-10-19 | Exact Laboratories, Inc. | Methods for detecting nucleic acids indicative of cancer |
US6586177B1 (en) * | 1999-09-08 | 2003-07-01 | Exact Sciences Corporation | Methods for disease detection |
US6919174B1 (en) * | 1999-12-07 | 2005-07-19 | Exact Sciences Corporation | Methods for disease detection |
ATE458831T1 (de) * | 1999-12-07 | 2010-03-15 | Exact Sciences Corp | Verfahren zum nachweis von lungenneoplasmen in fäkalen proben |
US6794137B2 (en) * | 2000-09-08 | 2004-09-21 | New York University | Gene markers useful for detecting skin damage in response to ultraviolet radiation |
US20030096781A1 (en) * | 2001-08-31 | 2003-05-22 | University Of Southern California | IL-8 is an autocrine growth factor and a surrogate marker for Kaposi's sarcoma |
DE10155600B4 (de) * | 2001-11-09 | 2009-08-27 | Oligene Gmbh | Nukleinsäure-Array |
EP2385139A1 (en) * | 2002-07-31 | 2011-11-09 | University of Southern California | Polymorphisms for predicting disease and treatment outcome |
AU2003301338A1 (en) * | 2002-10-15 | 2004-05-04 | University Of Utah Research Foundation | High throughput detection of glutathione s-transferase polymorphic alleles |
WO2004041076A2 (en) * | 2002-11-04 | 2004-05-21 | Protein Design Labs, Inc. | Methods of detecting colorectal cancer |
US7919083B2 (en) * | 2002-11-15 | 2011-04-05 | Morehouse School Of Medicine | Anti-chemokine and associated receptors antibodies for inhibition of growth of neoplasms |
US20040259101A1 (en) * | 2003-06-20 | 2004-12-23 | Shuber Anthony P. | Methods for disease screening |
US20050014165A1 (en) * | 2003-07-18 | 2005-01-20 | California Pacific Medical Center | Biomarker panel for colorectal cancer |
US20060088862A1 (en) * | 2004-09-30 | 2006-04-27 | Nancy Lee | Drug screening and molecular diagnostic test for early detection of colorectal cancer: reagents, methods, and kits thereof |
US20070042402A1 (en) * | 2005-07-21 | 2007-02-22 | Johnson Thomas E | Method for Predicting Human Longevity |
US20080085524A1 (en) * | 2006-08-15 | 2008-04-10 | Prometheus Laboratories Inc. | Methods for diagnosing irritable bowel syndrome |
-
2003
- 2003-10-22 US US10/690,880 patent/US20050014165A1/en not_active Abandoned
-
2004
- 2004-07-14 CA CA002534633A patent/CA2534633A1/en not_active Abandoned
- 2004-07-14 KR KR1020067001240A patent/KR20060034712A/ko not_active Application Discontinuation
- 2004-07-14 AU AU2004259431A patent/AU2004259431A1/en not_active Abandoned
- 2004-07-14 JP JP2006521116A patent/JP2007512801A/ja active Pending
- 2004-07-14 EP EP04756988A patent/EP1654526A4/en not_active Withdrawn
- 2004-07-14 WO PCT/US2004/022594 patent/WO2005010486A2/en active Application Filing
-
2007
- 2007-07-12 US US11/827,894 patent/US20080206756A1/en not_active Abandoned
-
2010
- 2010-03-01 AU AU2010200755A patent/AU2010200755A1/en not_active Abandoned
Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
JPN6010023526, Clin. Cancer Res., vol. 7, pages 3298−3304 (2001) * |
JPN6010023529, Am. J. Pathol., vol. 147, pages 1238−1247 (1995) * |
JPN6010023533, Trends Pharmacol. Sci., vol. 24, pages 96−102 (Feb. 2003) * |
JPN6010072522, Cancer Res., vol. 64, pages 3694−3700 (2004) * |
JPN7010001320, Clin. Cancer Res., vol. 11, pages 1400−1407 (2005) * |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2011517765A (ja) * | 2007-06-04 | 2011-06-16 | ダイアグノプレックス エセアー | 結腸直腸癌のためのバイオマーカの組み合わせ |
JP2013533977A (ja) * | 2010-07-14 | 2013-08-29 | コモンウェルス サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ オーガニゼイション | 大腸癌の診断 |
JP2017510304A (ja) * | 2014-04-10 | 2017-04-13 | バイオ−マルケア テクノロジーズ リミテッド | 前癌性結腸直腸ポリープおよび結腸直腸癌を特定するための方法およびキット |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20050014165A1 (en) | 2005-01-20 |
AU2010200755A1 (en) | 2010-03-18 |
WO2005010486A2 (en) | 2005-02-03 |
WO2005010486A3 (en) | 2009-04-09 |
EP1654526A4 (en) | 2009-12-02 |
CA2534633A1 (en) | 2005-02-03 |
US20080206756A1 (en) | 2008-08-28 |
AU2004259431A1 (en) | 2005-02-03 |
KR20060034712A (ko) | 2006-04-24 |
EP1654526A2 (en) | 2006-05-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2007512801A (ja) | 結腸直腸癌用のバイオマーカーパネル | |
JP6369857B2 (ja) | 肝細胞癌に関する情報の取得方法、ならびに肝細胞癌に関する情報を取得するためのマーカーおよびキット | |
JP3688585B2 (ja) | 肺癌を診断し、モニターし、そして病期決定する新規方法 | |
JP2008514234A (ja) | 直腸結腸癌の早期発見のための薬剤スクリーニング及び分子診断検査:その試薬、方法及びキット | |
US11377694B2 (en) | Unbiased DNA methylation markers define an extensive field defect in histologically normal prostate tissues associated with prostate cancer: new biomarkers for men with prostate cancer | |
JP3538381B2 (ja) | 結腸癌を診断し、モニターし、そして病期決定する新規方法 | |
CN112280865B (zh) | 一种用于检测肝癌的试剂组合,试剂盒及其用途 | |
US20120135877A1 (en) | DNA Methylation Markers For Prostate Cancer Field Defect | |
CN112501293A (zh) | 一种用于检测肝癌的试剂组合,试剂盒及其用途 | |
US20210404018A1 (en) | Unbiased dna methylation markers define an extensive field defect in histologically normal prostate tissues associated with prostate cancer: new biomarkers for men with prostate cancer | |
WO2023226938A1 (zh) | 甲基化生物标记物、试剂盒及用途 | |
Grady et al. | Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma biomarkers | |
CN117363733B (zh) | Per1和lox双基因甲基化联合诊断的检测引物探针组在制备膀胱癌诊断试剂中的应用 | |
TWI316959B (ja) | ||
JP3677210B2 (ja) | 前立腺がんを診断し、モニターし、そして病期決定する新規な方法 | |
Hamada et al. | Diagnostic usefulness of PCR profiling of the differentially expressed marker genes in thyroid papillary carcinomas | |
CN116064786A (zh) | 一种用于检测胃癌的组合物,试剂盒及其用途 | |
CN111733236A (zh) | 胆管癌和胆囊癌的piRNA标记物及其应用 | |
CN101415837A (zh) | 结肠直肠癌的生物标志物组 | |
EP2978861A2 (en) | Unbiased dna methylation markers define an extensive field defect in histologically normal prostate tissues associated with prostate cancer: new biomarkers for men with prostate cancer | |
Schmidt et al. | A blood-based DNA test for colorectal cancer screening | |
WO2024001602A1 (zh) | 一种用于检测胃癌的组合物,试剂盒及其用途 | |
US11807908B2 (en) | Genetic markers used for identifying benign and malignant pulmonary micro-nodules and the application thereof | |
JP2006166789A (ja) | 癌の新規診断方法 | |
JP2004248508A (ja) | 膀胱癌に対する分子マーカーとしてのhurp遺伝子 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20070713 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20070713 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20100510 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20100810 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20100817 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20101110 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20101220 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20110912 |