JP2007075109A6 - Purine nucleoside producing bacteria and method for producing purine nucleoside - Google Patents

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Abstract

【課題】プリンヌクレオシド及びプリンヌクレオチドなどのプリン系物質の発酵生産の効率を向上させる製造方法、および製造に使用される微生物の提供。
【解決手段】高浸透圧下で耐性を有するように突然変異処理等により改変され、かつプリンヌクレオシド生産能を有するバチルス属細菌。この細菌を培養し、細菌または培地からイノシン、キサントシン、およびグアノシンのようなプリンヌクレオシドを回収するプリンヌクレオシドの製造法。
【選択図】なし
A production method for improving the efficiency of fermentation production of purine-based substances such as purine nucleosides and purine nucleotides, and a microorganism used for the production.
A bacterium belonging to the genus Bacillus which is modified by a mutation treatment or the like so as to be resistant under high osmotic pressure and has purine nucleoside-producing ability. A method for producing a purine nucleoside comprising culturing the bacterium and recovering purine nucleosides such as inosine, xanthosine, and guanosine from the bacterium or medium.
[Selection figure] None

Description

本発明は、5′−イノシン酸、5′−キサンチル酸、5′−グアニル酸の合成のための原料として重要であるイノシン、キサントシン、およびグアノシンといったプリンヌクレオシドを製造するための方法、および製造に使用される新規な微生物に関する。   The present invention relates to a process for producing purine nucleosides such as inosine, xanthosine, and guanosine, which are important as raw materials for the synthesis of 5'-inosinic acid, 5'-xanthylic acid, 5'-guanylic acid, and the production thereof. It relates to the novel microorganism used.

イノシン、グアノシン、キサントシン等のプリンヌクレオシドは、アデニン栄養要求性や、またはプリン類似体、サルファ剤、メチオニン類似体、抗葉酸剤、ポリミキシンといった種々の薬剤に対する薬剤耐性が付与されたバチルス(Bacillus)属(特許文献1〜11、非特許文献1)、またはエシェリヒア(Escherichia)属(特許文献12)およびその他の微生物を利用した発酵法によって工業的に製造されてきた。     Purine nucleosides such as inosine, guanosine, and xanthosine have adenine auxotrophy or genus Bacillus with drug resistance to various drugs such as purine analogs, sulfa drugs, methionine analogs, antifolates, and polymyxins ( It has been industrially produced by fermentation methods using Patent Documents 1 to 11, Non-Patent Document 1), or Escherichia (Patent Document 12) and other microorganisms.

ヌクレオシド生産用の発酵培地は、高濃度のグルコース、リン酸ナトリウム、およびMgSOを含有しており、自然界に比べて浸透圧は極めて高い。また、発酵生産過程で培地中に著量のプリンヌクレオシドを蓄積する。蓄積されたヌクレオシドは、培地の浸透強度(浸透圧)をさらに増大させる。高い浸透圧は、全体的な細胞活性に負の影響を及ぼし、ヌクレオシド生合成を抑制することがある。 The fermentation medium for nucleoside production contains high concentrations of glucose, sodium phosphate, and MgSO 4 , and has an extremely high osmotic pressure compared to the natural world. In addition, a significant amount of purine nucleoside is accumulated in the medium during fermentation production. Accumulated nucleosides further increase the osmotic strength (osmotic pressure) of the medium. High osmotic pressure can negatively affect overall cellular activity and inhibit nucleoside biosynthesis.

高い浸透圧における増殖に反応して、細胞は浸透保護剤(osmoprotectant)、すなわち、細胞の生理機能に高度に適合するオスモライト(osmolyte)を蓄積することが知られている(非特許文献2 非特許文献3)。浸透圧バランスに対する貢献とあわせて、浸透圧保護剤は、高イオン強度の有害作用に対し、酵素および細胞成分の安定化剤として役立つと考えられる。浸透圧保護剤の中でも、環状アミノ酸L−プロリンは、高浸透圧に対する細菌の適応反応において、非常に重要な役割を果たしていると考えられ、多量のL−プロリンは、高浸透圧下における増殖に反応し、デノボ合成(de novo synthesis)を通して細胞によって蓄積されることが報告されている。(非特許文献2〜4)。さらに、バチルス種はプロリン生合成に多数の酵素が関与している考えられ、それらの酵素をコードする遺伝子のいくつかは、高濃度の塩によって誘導されるという報告がある。(非特許文献5)。さらに、高浸透圧は、L−プロリンの取込みを誘導し、細胞内のプロリン蓄積により、増殖が阻害される浸透圧条件下での細胞増殖を可能にする(非特許文献3〜6)。   In response to proliferation at high osmotic pressure, cells are known to accumulate osmoprotectants, ie, osmolytes that are highly compatible with cell physiology (Non-Patent Document 2) Patent Document 3). In conjunction with its contribution to osmotic pressure balance, osmotic protectants are thought to be useful as stabilizers for enzymes and cellular components against the harmful effects of high ionic strength. Among the osmoprotective agents, the cyclic amino acid L-proline is thought to play a very important role in the bacterial adaptive response to high osmotic pressure, and a large amount of L-proline responds to proliferation under high osmotic pressure. However, it has been reported to be accumulated by cells through de novo synthesis. (Non-patent documents 2 to 4). Furthermore, Bacillus species are thought to involve many enzymes in proline biosynthesis, and there are reports that some of the genes encoding these enzymes are induced by high concentrations of salts. (Non-patent document 5). Furthermore, the high osmotic pressure induces the uptake of L-proline and enables cell growth under osmotic conditions where proliferation is inhibited by intracellular proline accumulation (Non-Patent Documents 3 to 6).

しかし現在は、高浸透圧に対して耐性のバチルス属に属する細菌を用いた、イノシン、アデノシン、キサントシン、およびグアノシンのようなプリンヌクレオシド製造の報告はない。
特公昭38−23039号公報 特公昭54−17033号公報 特公昭55−2956号公報 特公昭55−45199号公報 特開昭56−162998号公報 特公昭57−14160号公報 特公昭57−41915号公報 特開昭59−42895号公報 特開2003−259861号公報 特公昭第51−5075号公報 特公昭58−17592号公報 国際公開9903988号パンフレット Agric. Biol. Chem.1978年、第42巻、p.399 チョンカ(Csonka)著、Microbiol. Rev.、1989年、第53巻、p.121−147; ケンプおよびブレマー(Kempf & Bremer)著、Arch. Microbiol.、1998年、第170巻、p.319−30 ガリンスキおよびトゥルーパー(Galinski & Truper)著、FEMS Microbiol. Rev.、1994年、第29巻、p.95−108 ヤンシー(Yancey, P. H.)著、「Cellular and Molecular Physiology of Cell Volume Regulation(細胞体積調節の細胞および分子生理学)」 ストレインジ(Strange, K.)編、CRCプレス、米国、ボカラトン、1994年、p.81−109、
However, there are currently no reports of purine nucleosides such as inosine, adenosine, xanthosine, and guanosine using bacteria belonging to the genus Bacillus that are resistant to hyperosmolarity.
Japanese Examined Patent Publication No. 38-23039 Japanese Examined Patent Publication No. 54-17033 Japanese Patent Publication No.55-2956 Japanese Patent Publication No. 55-45199 JP 56-162998 A Japanese Patent Publication No.57-14160 Japanese Patent Publication No.57-41915 JP 59-42895 JP 2003-259861 A Japanese Patent Publication No.51-5075 Japanese Patent Publication No.58-17592 International Publication No. 9903988 Pamphlet Agric. Biol. Chem. 1978, 42, p. 399 Csonka, Microbiol. Rev., 1989, Vol. 53, p. 121-147; Kempf & Bremer, Arch. Microbiol. 1998, 170, p. 319-30 By Galinski & Truper, FEMS Microbiol. Rev., 1994, Vol. 29, p. 95-108 Yancey, PH, “Cellular and Molecular Physiology of Cell Volume Regulation” Edited by Strange, K., CRC Press, Boca Raton, USA, 1994, p. 81-109,

本発明の目的は、発酵法によってプリンヌクレオシドを製造するための好適なバチルス属細菌を創生すること、及び同細菌を用いたプリンヌクレオシド、プリンヌクレオチドの製造法を提供することを課題とする。   An object of the present invention is to create a suitable Bacillus bacterium for producing a purine nucleoside by a fermentation method, and to provide a method for producing a purine nucleoside and a purine nucleotide using the bacterium.

本発明者は、上記課題を解決するために、鋭意研究を行った。その結果、 バチルス属に属し、かつ高浸透圧に対する耐性を付与した微生物が、培地中に多くのプリンヌクレオシドを産生および蓄積することを見出し、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は以下のとおりである。
(1)高浸透圧下で耐性を有し、かつプリンヌクレオシド生産能を有するバチルス属細菌。
(2)バチルス属に属する親株から誘導された変異株であって、浸透圧を上昇させる物質を含有する培地中で培養したときに、親株よりも生育が良好である、(1)の細菌。
(3)前期浸透圧を上昇させる物質が塩化ナトリウムである、(1)または(2)の細菌。
(4)前記培地が2.0Mの塩化ナトリウムを含有する、(1)〜(3)の細菌。
(5)前記バチルス属細菌が、バチルス・スブチリス(Bacillus subtilis)または、バチルス・アミロリケファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)から選択される細菌である、(1)〜(4)に記載の細菌。
(6)前記プリンヌクレオシドが、イノシン、キサントシン、アデノシン、およびグアノシンからなる群より選択される、(1)〜(5)に記載の細菌。
(7)(1)〜(6)に記載のバチルス属細菌を培地で培養し、同細菌または培地中にプリンヌクレオシドを蓄積せしめ、同細胞又は培地からプリンヌクレオシドを回収することを特徴とする、プリンヌクレオシドの製造法。
(8)前記プリンヌクレオシドが、イノシン、キサントシン、アデノシン、およびグアノシンからなる群より選ばれる、(7)の方法。
(9)(7)または(8)に記載の方法によりプリンヌクレオシドを製造し、該プリンヌクレオシドに、ポリ燐酸、フェニル燐酸、及びカルバミル燐酸からなる群より選択される燐酸供与体と、ヌクレオシド−5’−燐酸エステルを生成する能力を有する微生物又は酸性フォスファターゼを作用させて、プリンヌクレオチドを生成せしめ、該プリンヌクレオチドを採取することを特徴とするプリンヌクレオチドの製造法。
(10)前記プリンヌクレオチドが、5′−イノシン酸、5′−キサンチル酸、5′−グアニル酸、5′−アデニル酸からなる群より選択される、(9)に記載の方法。
In order to solve the above problems, the present inventor has conducted earnest research. As a result, the present inventors have found that a microorganism belonging to the genus Bacillus and imparting resistance to high osmotic pressure produces and accumulates many purine nucleosides in the medium, and has completed the present invention.
That is, the present invention is as follows.
(1) A Bacillus bacterium having resistance under high osmotic pressure and having the ability to produce purine nucleosides.
(2) The bacterium according to (1), which is a mutant derived from a parent strain belonging to the genus Bacillus and has a better growth than the parent strain when cultured in a medium containing a substance that increases osmotic pressure.
(3) The bacterium according to (1) or (2), wherein the substance that increases the osmotic pressure is sodium chloride.
(4) The bacterium according to (1) to (3), wherein the medium contains 2.0 M sodium chloride.
(5) The bacterium according to (1) to (4), wherein the bacterium belonging to the genus Bacillus is a bacterium selected from Bacillus subtilis or Bacillus amyloliquefaciens.
(6) The bacterium according to (1) to (5), wherein the purine nucleoside is selected from the group consisting of inosine, xanthosine, adenosine, and guanosine.
(7) The Bacillus bacterium described in (1) to (6) is cultured in a medium, and purine nucleosides are accumulated in the bacteria or the medium, and the purine nucleosides are recovered from the cells or the medium. A method for producing purine nucleosides.
(8) The method according to (7), wherein the purine nucleoside is selected from the group consisting of inosine, xanthosine, adenosine, and guanosine.
(9) A purine nucleoside is produced by the method according to (7) or (8), and a phosphoric acid donor selected from the group consisting of polyphosphoric acid, phenylphosphoric acid, and carbamylphosphoric acid, and nucleoside-5 '-A method for producing a purine nucleotide, characterized in that a purine nucleotide is produced by the action of a microorganism having the ability to produce a phosphate ester or acid phosphatase to produce the purine nucleotide.
(10) The method according to (9), wherein the purine nucleotide is selected from the group consisting of 5'-inosinic acid, 5'-xanthylic acid, 5'-guanylic acid, 5'-adenylic acid.

本発明の微生物を用いることにより、効率よくプリンヌクレオシド、プリンヌクレオチドを発酵生産することができる。 By using the microorganism of the present invention, purine nucleosides and purine nucleotides can be efficiently produced by fermentation.

(1)本発明のバチルス属細菌
本発明の細菌は、高浸透圧下で耐性を有するように改変され、かつプリンヌクレオシド生産能を有するバチルス属細菌である。
本発明において「プリンヌクレオシド生産能」は、本発明のバチルス属細菌を培地中で培養したときに、プリンヌクレオシドを細胞または培地から回収できる程度に細胞内または培地中に生成、分泌、蓄積できる能力をいう。通常、培地中に50mg/lを下回らない、好ましくは0.5g/lを下回らないプリンヌクレオシドを蓄積する能力を意味する。
(1) Bacillus bacteria of the present invention
The bacterium of the present invention is a bacterium belonging to the genus Bacillus that has been modified to have resistance under high osmotic pressure and has the ability to produce purine nucleosides.
In the present invention, “purine nucleoside-producing ability” refers to the ability to produce, secrete, and accumulate intracellularly or in a medium to the extent that purine nucleoside can be recovered from the cell or medium when the Bacillus bacterium of the present invention is cultured in the medium Say. Usually means the ability to accumulate purine nucleosides in the medium that do not fall below 50 mg / l, preferably not below 0.5 g / l.

本発明において「プリンヌクレオシド」は、イノシン、キサントシン、アデノシン、およびグアノシンを含む。なお、本発明のバチルス属細菌は、上記プリンヌクレオシドのうち、2種類以上の生産能を有するものであってもよい。   In the present invention, “purine nucleoside” includes inosine, xanthosine, adenosine, and guanosine. In addition, the Bacillus bacterium of the present invention may have two or more kinds of production ability among the purine nucleosides.

本発明において「バチルス属に属する細菌」とは、分類法に従って、バチルス属として分類されることを意味する。本発明において使用されるバチルス属に属する細菌の代表例は、バチルス・スブチリス(B. subtilis)、およびバチルス・アミロリケファシエンス(B. amyloliquefaciens)であるが、これに制限されない。   In the present invention, “bacteria belonging to the genus Bacillus” means that the bacterium is classified as a genus Bacillus according to the classification method. Representative examples of bacteria belonging to the genus Bacillus used in the present invention are, but not limited to, Bacillus subtilis and B. amyloliquefaciens.

バチルス属に属する細菌の具体例としては、バチルス・スブチリス168 Marburg 株(ATCC6051)、バチルス・スブチリスPY79(Plasmid、1984年、第12巻、p.1−9)が挙げられ、バチルス・アミロリケファシエンスの実例は、バチルス・アミロリケファシエンスT(ATCC23842)、バチルス・アミロリケファシエンスN(ATCC23845)およびその他同様のものを含むがこれに制限されない。これらの菌株は、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(American Type Culture Collection)住所P.O BOX1549 Manassas VA 20108 USA)から入手することができる。   Specific examples of bacteria belonging to the genus Bacillus include Bacillus subtilis 168 Marburg strain (ATCC6051), Bacillus subtilis PY79 (Plasmid, 1984, Vol. 12, p. 1-9), and Bacillus amyloliquefacii. Examples of ence include, but are not limited to, Bacillus amyloliquefaciens T (ATCC 23842), Bacillus amyloliquefaciens N (ATCC 23845) and the like. These strains can be obtained from the American Type Culture Collection address P.O BOX1549 Manassas VA 20108 USA).

プリンヌクレオシド生産能を有するバチルス属細菌は、上記のようなバチルス属細菌に例えば、プリンヌクレオシド要求性、又はさらにプリンアナログ等の薬剤に耐性を付与することにより、取得することができる。
例えば、このような方法で取得された菌株として、バチルス・スブチリス株AJ12707(FERM P−12951)(特開昭61−13876)、バチルス・スブチリス株AJ3772(FERM−P 2555)(特開昭62−014794)、バチルス・プミルス株NA−1102(FERM BP−289)、バチルス・スブチリスNA−6011(FERM BP−291)、バチルス・アミロリケファシエンス(「バチルス・スブチリス」)G1136A(ATCC No.19222)(米国特許3,575,809号)、バチルス・スブチリスNA−6012(FERM BP−292)(米国特許4,701,413号)、バチルス.プミリス・ゴテイル(B. pumilis Gottheil)No.3218(ATCC No.21005)(米国特許3,616,206)バチルス.アミロリケファシエンス株AS115−7(VKPM B−6134)(ロシア特許第2003678号)等が挙げられる。
Bacteria belonging to the genus Bacillus having the ability to produce purine nucleosides can be obtained, for example, by imparting resistance to drugs such as purine nucleoside requirement or further purine analogues to the Bacillus bacterium as described above.
For example, as strains obtained by such a method, Bacillus subtilis strain AJ12707 (FERM P-12951) (Japanese Patent Laid-Open No. 61-13876), Bacillus subtilis strain AJ3772 (FERM-P 2555) (Japanese Patent Laid-Open No. 62-55). 014794), Bacillus pumilus strain NA-1102 (FERM BP-289), Bacillus subtilis NA-6011 (FERM BP-291), Bacillus amyloliquefaciens ("Bacillus subtilis") G1136A (ATCC No. 19222) (US Pat. No. 3,575,809), Bacillus subtilis NA-6012 (FERM BP-292) (US Pat. No. 4,701,413), Bacillus. B. pumilis Gottheil No. 3218 (ATCC No. 21005) (US Pat. No. 3,616,206) Bacillus. Amiloliquefaciens strain AS115-7 (VKPM B-6134) (Russian Patent No. 20030378) and the like.

また、プリンヌクレオシド生合成に関与する酵素の細胞内の活性を増大させることによってもプリンヌクレオシド生産能を付与することができる。(米国特許出願2004−0166575)。「細胞内の活性を増大させること」は、活性を野生型のバチルス細菌のような改変されていないバチルス細菌より高いレベルに増大させることを意味する。実例は、これに制限されないが、細胞あたりの酵素分子の数を増大させること、酵素分子当たりの比活性を増大させること、およびその他同様のものを含む。    Purine nucleoside-producing ability can also be imparted by increasing the intracellular activity of an enzyme involved in purine nucleoside biosynthesis. (US Patent Application 2004-0166575). “Increasing intracellular activity” means increasing the activity to a higher level than an unmodified Bacillus bacterium, such as a wild-type Bacillus bacterium. Examples include, but are not limited to, increasing the number of enzyme molecules per cell, increasing specific activity per enzyme molecule, and the like.

プリンヌクレオシド生合成に関与する酵素としては、たとえば、ホスホリボシルピロリン酸(PRPP)アミドトランスフェラーゼ、ホスホリボシルピロリン酸(PRPP)シンセターゼ、アデノシンデアミナーゼ等が挙げられる。   Examples of enzymes involved in purine nucleoside biosynthesis include phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) amide transferase, phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) synthetase, and adenosine deaminase.

また、プリンオペロンの発現量増加によっても、プリンヌクレオシド生合成に関与する酵素の細胞内の活性を増大させることができる。具体的には、イノシン生合成に関与する酵素のフィードバック阻害のレギュレーションを解除する方法により、プリンオペロンの発現量が増大され、プリンヌクレオシド生産能を向上させることができる。(WO99/03988)。プリンヌクレオシド生合成に関与している上記のような酵素のレギュレーション解除としては、たとえば、プリンリプレッサーの欠失が挙げられる。(米国特許第6,284,495号)。プリンリプレッサーを欠失する方法の実例は、プリンリプレッサーをコードしている遺伝子(purR 配列番号5、GenBankアクセッション番号Z99104)の破壊が挙げられる。(米国特許第6,284,495号)   Moreover, the intracellular activity of the enzyme involved in purine nucleoside biosynthesis can also be increased by increasing the expression level of the purine operon. Specifically, the expression level of the purine operon is increased and the purine nucleoside-producing ability can be improved by a method of releasing the regulation of feedback inhibition of an enzyme involved in inosine biosynthesis. (WO99 / 03988). Examples of the deregulation of the enzyme involved in purine nucleoside biosynthesis include deletion of purine repressor. (US Pat. No. 6,284,495). An example of a method for deleting the purine repressor includes disruption of the gene encoding purine repressor (purR SEQ ID NO: 5, GenBank accession number Z99104). (US Pat. No. 6,284,495)

さらに、プリンヌクレオシド産生能はイノシン生合成から分岐している生合成系をブロックすることにより、イノシン以外の代謝産物(副生物)の産生量を減少させることによっても付与することができる(WO99/03988)。プリンヌクレオシド生合成から分枝し、結果として別の代謝産物を生じる反応の実例は、たとえば、スクシニルアデノシン一リン酸(AMP)シンターゼ(purA 配列番号5)、イノシン−グアノシンキナーゼ、6−ホスホグルコン酸脱水素酵素、ホスホグルコイソメラーゼ等が挙げられる。スクシニル−アデノシン一リン酸(AMP)シンターゼは、purA(GenBankアクセッション番号Z99104 配列番号5)によりコードされている。   Furthermore, purine nucleoside-producing ability can be imparted by blocking the biosynthetic system branched from inosine biosynthesis, thereby reducing the production of metabolites (by-products) other than inosine (WO99 / 03988). Examples of reactions that branch from purine nucleoside biosynthesis and result in another metabolite are, for example, succinyl adenosine monophosphate (AMP) synthase (purA SEQ ID NO: 5), inosine-guanosine kinase, 6-phosphogluconic acid Examples include dehydrogenase and phosphoglucoisomerase. Succinyl-adenosine monophosphate (AMP) synthase is encoded by purA (GenBank accession number Z99104 SEQ ID NO: 5).

さらに、プリンヌクレオシド産生能は、プリンヌクレオシド分解活性を低減または除去することにより増大されることも可能である(WO99/03998)。プリンヌクレオシドの分解活性を低減または除去する方法は、プリンヌクレオシドホスホリラーゼをコードする遺伝子(deoD 配列番号3)を破壊する方法を含む。(特開2004-242610)   Furthermore, purine nucleoside producing ability can also be increased by reducing or eliminating purine nucleoside degradation activity (WO 99/03998). The method for reducing or eliminating the degradation activity of purine nucleoside includes a method for destroying a gene encoding purine nucleoside phosphorylase (deoD SEQ ID NO: 3). (JP 2004-242610)

目的の酵素活性の低下は、以下のような方法で達成できる。
バチルス属細菌の細胞内の目的酵素の活性を低下させるには、例えば、バチルス属細菌を紫外線照射またはN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン(NTG)もしくはEMS(エチルメタンスルフォネート)等の通常変異処理に用いられている変異剤によって処理し、目的酵素の活性が低下した変異株を選択する方法が挙げられる。また、目的酵素の活性が低下したバチルス属細菌は、変異処理の他に、例えば、遺伝子組換え法を用いた相同組換え法(Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory press (1972); Matsuyama, S. and Mizushima, S., J. Bacteriol., 162, 1196(1985))により、染色体上の目的酵素をコードする遺伝子を、正常に機能しない遺伝子(以下、「破壊型遺伝子」ということがある)で置換することによって行うことができる。
Reduction of the target enzyme activity can be achieved by the following method.
In order to decrease the activity of the target enzyme in the cells of the genus Bacillus, for example, the bacterium belonging to the genus Bacillus is irradiated with ultraviolet light, N-methyl-N′-nitro-N-nitrosoguanidine (NTG) or EMS (ethyl methanesulfonate). And the like, and a method of selecting a mutant strain having a decreased activity of the target enzyme. Moreover, in addition to mutation treatment, Bacillus bacteria whose target enzyme activity has decreased include, for example, homologous recombination using genetic recombination (Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory press (1972); Matsuyama, According to S. and Mizushima, S., J. Bacteriol., 162, 1196 (1985), a gene encoding a target enzyme on a chromosome may be referred to as a gene that does not function normally (hereinafter referred to as a “destructive gene”). ).

破壊型遺伝子を、宿主染色体上の正常遺伝子と置換するには、例えば以下のようにすればよい。以下の例では、purR遺伝子を例として説明するが、他の遺伝子、例えばpurA又はdeoDについても、同様にして遺伝子破壊を行うことができる。
相同組換えは、染色体上の配列と相同性を有する配列を持つプラスミド等が菌体内に導入されると、ある頻度で相同性を有する配列の箇所で組換えを起こし、導入されたプラスミド全体が染色体上に組み込まれる。この後さらに染色体上の相同性を有する配列の箇所で組換えを起こすと、再びプラスミドが染色体上から抜け落ちるが、この時組換えを起こす位置により破壊された遺伝子の方が染色体上に固定され、元の正常な遺伝子がプラスミドと一緒に染色体上から抜け落ちることもある。このような菌株を選択することにより、破壊型purR遺伝子が染色体上の正常なpurR遺伝子と置換された菌株を取得することができる。
In order to replace a disrupted gene with a normal gene on a host chromosome, for example, the following may be performed. In the following example, the purR gene will be described as an example, but other genes such as purA or deoD can be similarly disrupted.
In homologous recombination, when a plasmid or the like having a sequence homologous to a sequence on a chromosome is introduced into a microbial cell, recombination occurs at a certain frequency at a sequence having homology, and the entire introduced plasmid is Integrated on the chromosome. After this, when recombination occurs at the position of the homologous sequence on the chromosome, the plasmid falls off from the chromosome again, but at this time the gene destroyed by the position where recombination occurs is fixed on the chromosome, The original normal gene may fall off the chromosome along with the plasmid. By selecting such a strain, a strain in which the disrupted purR gene is replaced with a normal purR gene on the chromosome can be obtained.

このような相同組換えによる遺伝子破壊技術は既に確立しており、直鎖DNAを用いる方法、温度感受性プラスミドを用いる方法等が利用できる。また、薬剤耐性等のマーカー遺伝子が内部に挿入されたpurR遺伝子を含み、かつ、目的とする微生物細胞内で複製できないプラスミドを用いることによっても、purR遺伝子の破壊を行うことができる。すなわち、前記プラスミドで形質転換され、薬剤耐性を獲得した形質転換体は、染色体DNA中にマーカー遺伝子が組み込まれている。このマーカー遺伝子は、その両端のpurR遺伝子配列と染色体上のpurR遺伝子との相同組換えによって組み込まれる可能性が高いため、効率よく遺伝子破壊株を選択することができる。   Such a gene disruption technique by homologous recombination has already been established, and a method using linear DNA, a method using a temperature-sensitive plasmid, and the like can be used. The purR gene can also be disrupted by using a plasmid containing a purR gene into which a marker gene such as drug resistance is inserted and which cannot be replicated in the target microorganism cell. That is, a transformant that has been transformed with the plasmid and has acquired drug resistance has a marker gene incorporated in the chromosomal DNA. Since this marker gene is highly likely to be incorporated by homologous recombination between the purR gene sequence at both ends and the purR gene on the chromosome, a gene-disrupted strain can be efficiently selected.

遺伝子破壊に用いる破壊型purR遺伝子は、具体的には、制限酵素消化及び再結合によるpurR遺伝子の一定領域の欠失、purR遺伝子への他のDNA断片(マーカー遺伝子等)の挿入、または部位特異的変異法(Kramer, W. and Frits, H. J.,
Methods in Enzymology, 154, 350 (1987))や次亜硫酸ナトリウム、ヒドロキシルアミン等の化学薬剤による処理(Shortle, D. and Nathans, D., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 75, 270(1978))によって、purR遺伝子のコーディング領域またはプロモーター領域等の塩基配列の中に1つまたは複数個の塩基の置換、欠失、挿入、付加または逆位を起こさせることにより、コードされるリプレッサーの活性を低下又は消失させるか、又はpurR遺伝子の転写を低下または消失させることにより、取得することができる。これらの態様の中では、制限酵素消化及び再結合によりpurR遺伝子の一定領域を欠失させる方法、又はpurR遺伝子へ他のDNA断片を挿入する方法が、確実性及び安定性の点から好ましい。
Specifically, a disrupted purR gene used for gene disruption specifically includes deletion of a certain region of the purR gene by restriction enzyme digestion and recombination, insertion of another DNA fragment (such as a marker gene) into the purR gene, or site-specificity. Mutation method (Kramer, W. and Frits, HJ,
Methods in Enzymology, 154, 350 (1987)) and treatment with chemical agents such as sodium hyposulfite and hydroxylamine (Shortle, D. and Nathans, D., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 270 (1978) )) To cause substitution, deletion, insertion, addition or inversion of one or more bases in the base sequence of the purR gene coding region or promoter region, etc. It can be obtained by reducing or eliminating the activity or reducing or eliminating the transcription of the purR gene. Among these embodiments, a method of deleting a certain region of the purR gene by restriction enzyme digestion and recombination, or a method of inserting another DNA fragment into the purR gene is preferable from the viewpoint of certainty and stability.

purR遺伝子は、プリンオペロンを持つ微生物の染色体DNAから、公知のpurR遺伝子の塩基配列に基づいて作製したオリゴヌクレオチドをプライマーとするPCR法によって取得することができる。また、プリンオペロンを持つ微生物の染色体DNAライブラリーから、公知のpurR遺伝子の塩基配列に基づいて作製したオリゴヌクレオチドをプローブとするハイブリダイゼーション法によって、purR遺伝子を取得することができる。バチルス・ズブチリス168 Marburg株では、purR遺伝子の塩基配列が報告されている(GenBank accession No.D26185(コード領域は塩基番号118041〜118898)、DDBJ Accession No.Z99104(コード領域は塩基番号54439〜55296))。purR遺伝子の塩基配列及び同遺伝子によってコードされるアミノ酸配列を、配列表の配列番号1及び2に示す。PCRに用いるプライマーとしては、purR遺伝子を増幅することができるものであればよい。   The purR gene can be obtained from a chromosomal DNA of a microorganism having a purine operon by a PCR method using an oligonucleotide prepared based on a known base sequence of the purR gene as a primer. The purR gene can be obtained from a chromosomal DNA library of a microorganism having a purine operon by a hybridization method using an oligonucleotide prepared based on the known base sequence of the purR gene as a probe. In the Bacillus subtilis 168 Marburg strain, the base sequence of the purR gene has been reported (GenBank accession No. D26185 (coding region is base number 180441-118898), DDBJ Accession No. Z99104 (coding region is base number 54439-55296) ). The nucleotide sequence of the purR gene and the amino acid sequence encoded by the gene are shown in SEQ ID NOs: 1 and 2 in the sequence listing. Any primer can be used as long as it can amplify the purR gene.

本発明に用いるpurRは、それぞれの破壊型遺伝子の作製に用いるため、必ずしも全長を含む必要はなく、遺伝子破壊を起こすのに必要な長さを有していればよい。また、各遺伝子の取得に用いる微生物は、同遺伝子が、遺伝子破壊株の創製に用いる微生物の相同遺伝子と相同組換えを起こす程度の相同性を有していれば特に制限されない。しかし、通常は、目的とするバチルス属細菌と同じ細菌に由来する遺伝子を用いることが好ましい。   The purR used in the present invention is not necessarily required to include the entire length because it is used for the preparation of each disrupted gene, and may have a length necessary to cause gene disruption. In addition, the microorganism used for obtaining each gene is not particularly limited as long as the gene has homology that causes homologous recombination with the homologous gene of the microorganism used to create the gene-disrupted strain. However, it is usually preferable to use a gene derived from the same bacterium as the target Bacillus bacterium.

バチルス属細菌のpurR遺伝子と相同組換えを起こし得るDNAとしては、配列番号2に示すアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、又は付加を含むアミノ酸配列をコードするDNAが挙げられる。前記「数個」は、例えば2〜50個、好ましくは、2〜30個、より好ましくは2〜10個である。   As DNA capable of causing homologous recombination with the purR gene of the genus Bacillus, DNA encoding an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion, or addition of one or several amino acids in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 Is mentioned. The “several” is, for example, 2 to 50, preferably 2 to 30, more preferably 2 to 10.

前記バチルス属細菌のpurR遺伝子と相同組換えを起こし得るDNAとしては具体的には、配列番号1に示す塩基配列を有するDNAと、例えば70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上の相同性を有するDNAが挙げられる。より具体的には、配列番号1に示す塩基配列を有するDNAと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAが挙げられる。ストリンジェントな条件としては、60℃、1×SSC,0.1%SDS、好ましくは、0.1×SSC、0.1%SDSに相当する塩濃度で洗浄が行われる条件が挙げられる。   Specifically, the DNA capable of causing homologous recombination with the purR gene of the genus Bacillus is, for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90%, with DNA having the base sequence shown in SEQ ID NO: 1. Examples thereof include DNA having the above homology. More specifically, a DNA that hybridizes with a DNA having the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 under stringent conditions can be mentioned. The stringent conditions include conditions in which washing is performed at a salt concentration corresponding to 60 ° C., 1 × SSC, 0.1% SDS, preferably 0.1 × SSC, 0.1% SDS.

前記マーカー遺伝子としては、スペクチノマイシン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子等の薬剤耐性遺伝子が挙げられる。エンテロコッカス・フェカリス(Enterococcus faecalis)由来のスペクチノマイシン耐性遺伝子は、バチルス ジェネチック ストック センター(BGSC)より市販されているエシェリヒア・コリ ECE101株から、プラスミドpDG1726を調製し、該プラスミドからカセットとして取り出すことにより、取得することができる。また、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)のエリスロマイシン耐性遺伝子は、バチルス ジェネチック ストック センター(BGSC)より市販されているエシェリヒア・コリECE91株から、プラスミドpDG646を調製し、該プラスミドからカセットとして取り出すことにより、取得することができる。さらに、カナマイシン耐性遺伝子は、ストレプトコッカス・フェカリス(Streptococcus faecalis)由来カナマイシン耐性遺伝子を含むpDG783プラスミド(バチルス・ジェネティック・ストック・センターより市販されているエシェリヒア・コリECE94株から調製できる)を鋳型とし、PCRを行うことによって、取得することができる。   Examples of the marker gene include drug resistance genes such as a spectinomycin resistance gene and a kanamycin resistance gene. The spectinomycin resistance gene derived from Enterococcus faecalis was prepared by preparing plasmid pDG1726 from Escherichia coli ECE101 strain commercially available from Bacillus Genetic Stock Center (BGSC) and removing it from the plasmid as a cassette. Can get. For the erythromycin resistance gene of Staphylococcus aureus, prepare plasmid pDG646 from Escherichia coli ECE91 marketed by Bacillus Genetic Stock Center (BGSC), and take it out as a cassette from the plasmid. Can be obtained. Furthermore, the kanamycin resistance gene is a pDG783 plasmid containing a kanamycin resistance gene derived from Streptococcus faecalis (can be prepared from the Escherichia coli ECE94 strain commercially available from Bacillus Genetic Stock Center), and PCR is performed. It can be obtained by doing.

マーカー遺伝子として薬剤耐性遺伝子を用いる場合は、該遺伝子をプラスミド中のpurR遺伝子の適当な部位に挿入し、得られるプラスミドで微生物を形質転換し、薬剤耐性となった形質転換体を選択すれば、purR遺伝子破壊株が得られる。染色体上のpurR遺伝子が破壊されたことは、サザンブロッティングやPCR法により、染色体上のpurR遺伝子又はマーカー遺伝子を解析することによって、確認することができる。前記スペクチノマイシン耐性遺伝子、エリスロマイシン耐性遺伝子又はカナマイシン耐性遺伝子が染色体DNAに組み込まれたことの確認は、これらの遺伝子を増幅することができるプライマーを用いたPCRにより、行うことができる。   When using a drug resistance gene as a marker gene, insert the gene into an appropriate site of the purR gene in the plasmid, transform the microorganism with the resulting plasmid, and select a transformant that has become drug resistant. A purR gene-disrupted strain is obtained. The disruption of the purR gene on the chromosome can be confirmed by analyzing the purR gene or marker gene on the chromosome by Southern blotting or PCR. Confirmation that the spectinomycin resistance gene, erythromycin resistance gene or kanamycin resistance gene has been incorporated into the chromosomal DNA can be carried out by PCR using primers capable of amplifying these genes.

このような方法で、プリンヌクレオシド生合成能が高められた株として、
バチルス・ズブチルス KMBS16(特開2004−242610)
バチルス・ズブチルス SB112K(特開平11−346778)
等が挙げられる。

(2)バチルス属に属する細菌において高浸透圧下での耐性を付与する方法
In such a way, as a strain with increased purine nucleoside biosynthesis ability,
Bacillus subtilis KMBS16 (Japanese Patent Laid-Open No. 2004-242610)
Bacillus subtilis SB112K (Japanese Patent Laid-Open No. 11-346778)
Etc.

(2) Method for imparting resistance under high osmotic pressure in bacteria belonging to the genus Bacillus

本発明において「高浸透圧下での耐性を有するように改変された」は、(1)に記載するバチルス属に属し、プリンヌクレオシド生産能を有する親株から誘導された変異株であって、浸透圧を上昇させる物質を含有する培地中で培養したときに親株より生育が良好であるように改変された細菌を意味する。また親株は野生株でもよく、高浸透圧下での耐性を付与することにより、プリンヌクレオシド生産能が付与された株でもよい。
本発明において、「浸透圧を上昇させる物質」とは、培地中に添加することで、培地の浸透圧を高くする(高浸透圧)にする物質を意味し、塩化ナトリウム、マンニトール、ソルビトール等が挙げられる。
本発明において高浸透圧下とは、浸透圧が2osm/L以上、好ましくは 3 osm/L以上、さらに好ましくは4osm/L以上の条件を意味する。
In the present invention, “modified to have resistance under high osmotic pressure” is a mutant strain belonging to the genus Bacillus described in (1) and derived from a parent strain having purine nucleoside-producing ability, Means a bacterium that has been modified to grow better than the parent strain when cultured in a medium containing a substance that increases The parent strain may be a wild strain or a strain to which purine nucleoside-producing ability is imparted by imparting resistance under high osmotic pressure.
In the present invention, the “substance that increases the osmotic pressure” means a substance that increases the osmotic pressure of the medium (high osmotic pressure) by adding it to the medium. Sodium chloride, mannitol, sorbitol, etc. Can be mentioned.
In the present invention, under high osmotic pressure means a condition where the osmotic pressure is 2 osm / L or more, preferably 3 osm / L or more, more preferably 4 osm / L or more.

ここで、高浸透圧下での耐性を付与する為に用いられる培地は、固形培地が好ましい。すなわち、高浸透圧下で耐性を有しない親株は、浸透圧を上昇させる物質を含まない培地で培養した場合と比べて生育しないか、またか生育は遅くなる。具体的には例えば、固体培地で一定時間培養した場合、浸透圧を上昇させる物質を含む培地では、浸透圧を上昇させる物質を含まない培地と比べてコロニーの直径が小さくなる。これに対し、本発明のバチルス属細菌は、高浸透圧下での生育阻害が低減されるように改変されており、NaClまたはマンニトールまたはソルビトールといった浸透圧活性物質を含有する培地中で培養された場合、親株に比べてより良好な増殖を示し、非改変株が生育できない高浸透圧下の培地で生育できる、あるいはコロニーの直径が大きくなる。
たとえば、2.0MのNaClを含有するM9最少培地あるいは、2Mのソルビトールを含有するM9最少培地上で、34℃における40時間以内の培養でコロニーを形成することが可能な細菌は、高浸透圧による増殖阻害に対し耐性であるといえる。
Here, the medium used for imparting resistance under high osmotic pressure is preferably a solid medium. That is, a parent strain that does not have resistance under high osmotic pressure does not grow or grows slower than when cultured in a medium that does not contain a substance that increases osmotic pressure. Specifically, for example, when cultured in a solid medium for a certain period of time, a colony diameter is smaller in a medium containing a substance that increases the osmotic pressure than in a medium not including a substance that increases the osmotic pressure. In contrast, the Bacillus bacterium of the present invention has been modified to reduce growth inhibition under high osmotic pressure, and is cultured in a medium containing an osmotically active substance such as NaCl, mannitol or sorbitol. It exhibits better growth than the parent strain, can grow on a medium under high osmotic pressure where an unmodified strain cannot grow, or the colony diameter increases.
For example, a bacterium that can form colonies in culture within 40 hours at 34 ° C. on M9 minimal medium containing 2.0 M NaCl or M9 minimal medium containing 2 M sorbitol has a high osmotic pressure. It can be said that it is resistant to the growth inhibition caused by.

前記選択培地は、最小培地が好ましく、例えば以下の組成を有する培地が挙げられる。(グルコース20g/L、塩化アンモニウム5g/L、リン酸二水素カリウム4g/L、硫酸鉄0.01g/L、硫酸マンガン0.01g/L、クエン酸ナトリウム0.5g/L (サンブルック(Sambrook, J.)、フリッチ(Fritsch, E. F.)、およびマニアティス(Maniatis T.)著「Molecular clonig : a laboratory manual(分子クローニング:研究室マニュアル)」第2版、コールドスプリンブハーバーラボラトリープレス、ニューヨーク州、コールドスプリングハーバー、1989年参照)   The selective medium is preferably a minimal medium, for example, a medium having the following composition. (Glucose 20 g / L, ammonium chloride 5 g / L, potassium dihydrogen phosphate 4 g / L, iron sulfate 0.01 g / L, manganese sulfate 0.01 g / L, sodium citrate 0.5 g / L (Sambrook, J. ), Fritsch, EF, and Maniatis T. "Molecular clonig: a laboratory manual", 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring, NY (See Harbor, 1989)

なお、本明細書において最小培地は必要に応じて生育に必須な栄養素を含んでいてもよい。例えば、イノシン生産菌の多くがアデニン要求株であり、培地には増殖に必要な程度のアデニンを含有させる。しかしアデニン量が多すぎると、ある種のプリンアナログでは、その生育阻害効果が減少するので、アデニン量は制限することが好ましい。具体的には0.1g/L程度の濃度が好ましい。   In the present specification, the minimum medium may contain nutrients essential for growth as necessary. For example, most inosine-producing bacteria are adenine-requiring strains, and the medium contains a degree of adenine necessary for growth. However, if the amount of adenine is too large, the growth inhibitory effect of certain purine analogs decreases, so it is preferable to limit the amount of adenine. Specifically, a concentration of about 0.1 g / L is preferable.

本発明の細菌は、紫外線照射、X線照射、放射線照射、および化学的突然変異誘発物質による処理および、それに続くレプリカ法による選択のような、通常の突然変異誘発を用いた突然変異により取得されることが可能である。好ましい突然変異誘発物質は、N−ニトロ−N′−メチル−N−ニトロソグアニジン(以後NTGと呼ばれる)である。また、自然突然性変異によっても取得することが可能である。   The bacterium of the present invention is obtained by mutation using normal mutagenesis, such as treatment with ultraviolet radiation, X-ray radiation, radiation, and chemical mutagens followed by selection by replica method. Is possible. A preferred mutagen is N-nitro-N'-methyl-N-nitrosoguanidine (hereinafter referred to as NTG). It can also be obtained by spontaneous mutation.

さらに、液体培地によっても、高浸透圧下で耐性を有するように改変されたことを確認できる。改変株および親株の細胞懸濁液を浸透圧を上昇させる物質を含有する液体培地へ各々接種され、細胞は最適増殖温度付近の、たとえば34℃の温度において、数時間〜1日、好ましくは約18時間培養する。改変株が、少なくとも対数増殖期または定常期の、少なくともいずれかにおいて、親株に比較してより高い培地の光学密度(OD)または濁度を示したなら、増殖が改善していると推察される。特に、もし改変株が、非改変株あるいは親株と比べ対数増殖期に達するか、またはもしODの最大値がより高ければ、増殖は改善していると推察される。前述の対数増殖期は、増殖曲線上で細胞数が対数的に増加する期間を指す。定常期は、対数増殖期が終わり、細胞分裂および増殖が停止し、細胞数の増加がもはや見られない期間を指す(生化学事典、第3版、東京化学同人)。
液体培地が使用される場合、固形培地が使用される場合に比べ、高浸透圧による増殖阻害における差異を検出することがより難しいことがある。本発明においては、液体培地を用いることでは高浸透圧による増殖阻害の差異が検出されない場合であっても、固形培地上で親株に比較してより好適な増殖を示すことが評価される限り、本発明の微生物に含まれる。
Furthermore, it can be confirmed that the liquid medium is modified to have resistance under high osmotic pressure. The cell suspensions of the modified and parent strains are each inoculated into a liquid medium containing a substance that increases osmotic pressure, and the cells are in the vicinity of the optimum growth temperature, for example, at a temperature of 34 ° C. for several hours to 1 day, preferably about Incubate for 18 hours. If the modified strain exhibits a higher optical density (OD) or turbidity of the medium compared to the parent strain, at least either in logarithmic growth phase or at stationary phase, it is assumed that growth has improved. . In particular, if the modified strain reaches the logarithmic growth phase compared to the unmodified strain or the parent strain, or if the maximum value of OD is higher, it is assumed that the growth is improved. The aforementioned logarithmic growth phase refers to a period in which the number of cells increases logarithmically on the growth curve. The stationary phase refers to a period in which the logarithmic growth phase ends, cell division and proliferation stop, and the increase in the number of cells can no longer be seen (Biochemical Encyclopedia, 3rd edition, Tokyo Kagaku Dojin).
When a liquid medium is used, it may be more difficult to detect a difference in growth inhibition due to high osmotic pressure than when a solid medium is used. In the present invention, even when a difference in growth inhibition due to high osmotic pressure is not detected by using a liquid medium, as long as it is evaluated that it shows more suitable growth compared to the parent strain on a solid medium, Included in the microorganism of the present invention.

さらに、高浸透圧による増殖阻害の程度はまた、突然変異株の懸濁液を、浸透圧活性物質を含有する固形培地、および浸透圧活性物質を含有しない固形培地上へ適用すること、および、同じ条件下での培養の後に現れるコロニーのサイズを、上述のように比較することにより評価されることも可能である。たとえば、バチルス・スブチリス168マルブルグ株に由来する、purR、purA、およびdeoDにおける三重欠損性株KMBS16を培地中の高い浸透圧において培養された場合、相対増殖度は、約18時間の培養時間では5%を超えないのに対し、実施例の節において得られた突然変異株は、約18時間の培養時間および同じ含有量の浸透圧活性物質により、30%を下回らない相対増殖度を示した。それゆえ、相対増殖度を指標として用いることにより、高浸透圧による増殖阻害は親株との比較なしに評価されることが可能である。しかしながら、高浸透圧による増殖阻害はまた、親株と突然変異株との相対増殖度を比較することによっても評価されることが可能である。   Furthermore, the degree of growth inhibition by hyperosmotic pressure is also applied to the suspension of the mutant strain on a solid medium containing the osmotically active substance and on a solid medium not containing the osmotically active substance, and It is also possible to assess the size of colonies appearing after culturing under the same conditions by comparing as described above. For example, when the triple-deficient strain KMBS16 in purR, purA, and deoD, derived from the Bacillus subtilis 168 Marburg strain, was cultured at high osmotic pressure in the medium, the relative growth rate was 5 for a culture time of about 18 hours. In contrast, the mutant strain obtained in the Examples section showed a relative growth rate of no less than 30% with an incubation time of about 18 hours and the same content of osmotically active substance. Therefore, by using the relative degree of growth as an index, growth inhibition due to high osmotic pressure can be evaluated without comparison with the parent strain. However, growth inhibition by hyperosmolarity can also be assessed by comparing the relative degree of growth between the parent strain and the mutant strain.

上記手法によって得た代表的な実例は、バチルス・スブチリス51−53H(VKPM B−8997)、バチルス・アミロリケファシエンス23−68H(VKPM B−8996)である。本発明に使用される細菌は、高浸透圧に対する耐性と、より高い収量のプリンヌクレオシドを産生する能力とを除いて、親株と同じ細菌学的性質を有する。バチルス・スブチリス51−53Hおよびバチルス・アミロリケファシエンス23−68Hは、2005年3月10日に、ロシア・ナショナル・コレクション・オブ・インダストリアル・マイクロオーガニズムス(Russian National Collection of Industrial Microorganisms)(VKPM)(ロシア、モスクワ市117545、第1ドロジニーPr.1(Russia, 117545 Moscow, 1st Dorozhny proezd,1))に、各々アクセッション番号VKPM B−8997、およびVKPM B−8996で寄託されている。
(3)プリンヌクレオシド及びプリンヌクレオチドの製造法
Typical examples obtained by the above method are Bacillus subtilis 51-53H (VKPM B-8997) and Bacillus amyloliquefaciens 23-68H (VKPM B-8996). The bacteria used in the present invention have the same bacteriological properties as the parental strain, except for resistance to hyperosmolarity and the ability to produce higher yields of purine nucleosides. Bacillus subtilis 51-53H and Bacillus amyloliquefaciens 23-68H, on March 10, 2005, Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (Russia, 117545 Moscow, 1st Dorozhny proezd, 1), with accession numbers VKPM B-8997 and VKPM B-8996, respectively.
(3) Process for producing purine nucleosides and purine nucleotides

本発明のバチルス属細菌は、プリンヌクレオシドを効率よく生産する。従って、本発明のバチルス属細菌を好適な培地で培養することによって、細菌の細胞内または培地中にプリンヌクレオシドを生成蓄積せしめることができる。   The Bacillus bacterium of the present invention efficiently produces purine nucleosides. Therefore, by culturing the Bacillus bacterium of the present invention in a suitable medium, it is possible to produce and accumulate purine nucleosides in the bacterial cells or in the medium.

プリンヌクレオシド産生に使用されるべき培地は、炭素源、窒素源、無機イオン、および、必要な他の有機成分を含有する通常の培地でよい。炭素源としては、グルコース、ラクトース、ガラクトース、フルクトース、アラビノース、マルトース、キシロース、トレハロース、リボース、および、デンプンの加水分解物のような糖質;グリセロール、マンニトール、およびソルビトールのようなアルコール;グルコン酸、フマル酸、クエン酸、およびコハク酸のような有機酸、およびその他同様のものが使用可能である。窒素源としては、硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、およびリン酸アンモニウムのような無機アンモニウム塩;ダイズ加水分解物のような有機窒素;アンモニアガス;アンモニア水およびその他同様のものが使用可能である。ビタミンB1のようなビタミン類、必要な物質、たとえば、アデニンおよびRNAのような核酸、または酵母抽出物およびその他同様のものが、微量の有機栄養素として適量含まれていることが望ましい。これら以外に、必要であれれば少量のリン酸カルシウム、硫酸マグネシウム、鉄イオン、マンガンイオン、およびその他同様のものが添加されてもよい。   The medium to be used for purine nucleoside production may be a normal medium containing a carbon source, a nitrogen source, inorganic ions, and other necessary organic components. Carbon sources include glucose, lactose, galactose, fructose, arabinose, maltose, xylose, trehalose, ribose, and carbohydrates such as starch hydrolysates; glycerol, mannitol, and alcohols such as sorbitol; gluconic acid, Organic acids such as fumaric acid, citric acid, and succinic acid, and the like can be used. As the nitrogen source, inorganic ammonium salts such as ammonium sulfate, ammonium chloride, and ammonium phosphate; organic nitrogen such as soybean hydrolysate; ammonia gas; aqueous ammonia and the like can be used. It is desirable that vitamins such as vitamin B1, necessary substances, for example, nucleic acids such as adenine and RNA, yeast extract and the like are included in appropriate amounts as trace amounts of organic nutrients. In addition to these, small amounts of calcium phosphate, magnesium sulfate, iron ions, manganese ions, and the like may be added if necessary.

培養は、好ましくは好気的条件下に16〜72時間行なわれ、培養の間の培養温度は、30〜45℃以内に、pHは5〜8以内に調節される。pHは、無機または有機の、酸性またはアルカリ性物質、ならびにアンモニアガスの使用により調節されることが可能である。   The culture is preferably performed under aerobic conditions for 16 to 72 hours, and the culture temperature during the culture is adjusted within 30 to 45 ° C. and the pH within 5 to 8. The pH can be adjusted by the use of inorganic or organic, acidic or alkaline materials, and ammonia gas.

プリンヌクレオシドは、イオン交換樹脂および沈殿析出を利用する技術のような、通常の方法のいずれか、または任意の組合せにより、発酵液から回収されることが可能である。
また、本発明の微生物を用いて生産されたプリンヌクレオシドに、ホスホトランスフェラーゼを作用させることによってリン酸化し、プリンヌクレオチド(ヌクレオシド−5’−燐酸エステル)を生産することも可能である。(特開2000-295996)例えば、エシェリヒア・コリのイノシングアノシンキナーゼをコードする遺伝子を導入したエシェリヒア属細菌を用いるプリンヌクレオチドの製造法(WO91/08286号パンフレット)、エキシグオバクテリウム・アセチリカムのイノシングアノシンキナーゼをコードする遺伝子を導入したコリネバクテリウム・アンモニアゲネスを用いたプリンヌクレオチドの製造法(WO96/30501号パンフレット)を採用することができる。
Purine nucleosides can be recovered from the fermentation broth by any conventional method, such as techniques that utilize ion exchange resins and precipitation, or any combination.
It is also possible to produce a purine nucleotide (nucleoside-5′-phosphate ester) by phosphorylating the purine nucleoside produced using the microorganism of the present invention by allowing phosphotransferase to act. (Japanese Patent Laid-Open No. 2000-295996) For example, a method for producing a purine nucleotide using an Escherichia bacterium into which a gene encoding Escherichia coli innosing anosine kinase has been introduced (WO91 / 08286 pamphlet); A method for producing purine nucleotides using Corynebacterium ammoniagenes into which a gene encoding kinase is introduced (WO96 / 30501 pamphlet) can be employed.

また、本発明の微生物を用いて生産されたプリンヌクレオシドに、ポリ燐酸、フェニル燐酸、カルバミル燐酸からなる群より選択された燐酸供与体と、ヌクレオシド−5’−燐酸エステルを生成する能力を有する微生物や、酸性フォスファターゼ(EC 3.1.3.2)を作用させることによって、プリンヌクレオチド(ヌクレオシド−5’−燐酸エステル)を生産することも可能である。ヌクレオシド−5’−燐酸エステルを生成する能力を有する微生物は、プリンヌクレオシドをプリンヌクレオチドに変換する能力を有するものであれば特に制限されないが、例えば、国際公開パンフレットWO9637603号に記載されたような微生物が挙げられる。   Moreover, the microorganism which has the capability to produce | generate the phosphoric acid donor selected from the group which consists of polyphosphoric acid, phenylphosphoric acid, carbamyl phosphoric acid, and nucleoside-5'-phosphate ester in the purine nucleoside produced using the microorganisms of this invention Alternatively, purine nucleotides (nucleoside-5′-phosphate esters) can be produced by the action of acid phosphatase (EC 3.1.3.2). The microorganism having the ability to produce a nucleoside-5′-phosphate ester is not particularly limited as long as it has the ability to convert purine nucleosides into purine nucleotides. For example, the microorganism as described in International Publication Pamphlet WO9637603 Is mentioned.

また、特開平07−231793に開示されているようなエシェリヒア・ブラッタエ(Escherichia blattae)JCM 1650、セラチア・フィカリア(Serratia ficaria)ATCC 33105、クレブシエラ・プランティコラ(Klebsiella planticola)IFO 14939 (ATCC 33531)、クレブシエラ・ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)IFO 3318 (ATCC 8724)、クレブシエラ・テリゲナ(Klebsiella terrigena)IFO 14941 (ATCC 33257)、モルガネラ・モルガニ(Morganella morganii)IFO 3168、エンテロバクター・アエロゲネス(Enterobacter aerogenes)IFO 12010、エンテロバクター・アエロゲネス IFO 13534 (ATCC 13048)、クロモバクテリウム・フルヴィアティレ(Chromobacterium fluviatile)IAM 13652、クロモバクテリウム・ヴィオラセウム(Chromobacterium violaceum)IFO 12614、セデセア・ラパゲイ(Cedecea lapagei)JCM 1684、セデセア・ダヴィシエ(Cedecea davisiae)JCM 1685、セデセア・ネテリ(Cedecea neteri)JCM 5909などを用いることもできる。   In addition, Escherichia blattae JCM 1650, Serratia ficaria ATCC 33105, Klebsiella planticola IFO 14939 (ATCC 33531), as disclosed in JP-A-07-231793, Klebsiella pneumoniae IFO 3318 (ATCC 8724), Klebsiella terrigena IFO 14941 (ATCC 33257), Morganella morganii IFO 3168, Enterobacter aerogenes 2010 Bacter Aerogenes IFO 13534 (ATCC 13048), Chromobacterium fluviatile IAM 13652, Chromobacterium violaceum IFO 12614, Cedecea lapagei JCM 1684, Cedecea edea ec davi siae) JCM 1685, Cedecea neteri JCM 5909, and the like can also be used.

酸性フォスファターゼとしては、例えば、特開2002−000289に開示されているようなものを用いることができ、より好ましくはヌクレオシドに対する親和性が上昇した酸性フォスファターゼ(特開平10−201481参照)やヌクレオチダーゼ活性が低下した変異型酸性フォスファターゼ(WO9637603参照)、燐酸エステル加水分解活性が低下した変異型酸性フォスファターゼ(特開2001−245676)などを用いることができる。   As the acid phosphatase, for example, those disclosed in JP-A-2002-000289 can be used, and more preferably, acid phosphatase (see JP-A-10-201481) having increased affinity for nucleoside and nucleotidase activity. Mutant acid phosphatase (see WO9637603) having a reduced pH, mutant acid phosphatase (JP 2001-245676) having a reduced phosphate ester hydrolysis activity, and the like can be used.

本発明の微生物を用いて生産されたプリンヌクレオシドを化学的にリン酸化することにより、プリンヌクレオチドを得ることも可能である。(Bulletin of the Chemical Society of Japan 42,3505)また、微生物が有しているATP再生系を利用して、本発明のXMP生産能を有する微生物とXMPアミナーゼ活性を共役させることによってGMPを得る方法、イノシンキナーゼを共役させることによってIMPを得る方法も採用できる(Biosci.Biotech.Biochem.,51,840(1997) 特開昭63-230094)
[実施例]
以下に、本発明を実施例によりさらに具体的に説明する。
Purine nucleotides can also be obtained by chemically phosphorylating purine nucleosides produced using the microorganism of the present invention. (Bulletin of the Chemical Society of Japan 42,3505) In addition, a method for obtaining GMP by coupling an XMP aminase activity with a microorganism having XMP production ability of the present invention using an ATP regeneration system possessed by the microorganism. In addition, a method of obtaining IMP by conjugating inosine kinase can also be adopted (Biosci. Biotech. Biochem., 51,840 (1997), JP-A-63-230094).
[Example]
Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples.

高浸透圧下で耐性のバチルス属細菌の取得
バチルス・スブチリスKMBS16(特開2004-242610号公報)の細胞を、200μg/mlのN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン(NTG)で15分間処理し、変異を誘発した。次いで処理した細胞を、1.8M、2.2M、または2.4MのNaClを含有する、L−ブロス(サンブルック(Sambrook, J.)、フリッチ(Fritsch, E. F.)、およびマニアティス(Maniatis T.)著「Molecular cloning : a laboratory manual(分子クローニング:研究室マニュアル)」第2版、コールドスプリンブハーバーラボラトリープレス、ニューヨーク州、コールドスプリングハーバー、1989年)寒天プレート(寒天20g/lを含む)上にプレートした。接種したプレートは、34℃において5日間インキュベートされた。現れた突然変異体のコロニーの中から、バチルス・スブチリス株51−53H(VKPM B−8997)が選択された。
バチルス・スブチリス51−53H株と親株であるKMBS16株の塩化ナトリウムに対する耐性を、以下の方法によって評価した。異なる塩化ナトリウム濃度を添加することによって調製された、50mg/lのトリプトファンを含有するM9グルコース最少培地3mlを含有する試験管に微生物を接種し、L−ブロス中で18時間、振盪により増殖した。約10細胞/mlの試験株が接種され、振盪培養は37℃において18時間行なわれた。結果として得られたブロスは水で適宜希釈され、540nmにおける希釈物の吸光度を測定した(SCOD540)。NaClを含まないM9培地上での同じ株の増殖度(D540)を100として、NaCl含有培地上での相対増殖は、(SCOD540)/(D540)×100によって示した。(表1)
Obtaining Bacillus bacteria resistant to high osmotic pressure Cells of Bacillus subtilis KMBS16 (Japanese Patent Laid-Open No. 2004-242610) were treated with 200 μg / ml N-methyl-N′-nitro-N-nitrosoguanidine (NTG). Treated for minutes to induce mutations. The treated cells were then treated with L-broth (Sambrook, J., Fritsch, EF), and Maniatis T containing 1.8 M, 2.2 M, or 2.4 M NaCl. .) "Molecular cloning: a laboratory manual" 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989) Agar plates (including agar 20 g / l) Plated on top. Inoculated plates were incubated at 34 ° C. for 5 days. Bacillus subtilis strain 51-53H (VKPM B-8997) was selected from the mutant colonies that appeared.
The resistance to sodium chloride of the Bacillus subtilis 51-53H strain and the parent strain KMBS16 strain was evaluated by the following method. Microbes were inoculated into tubes containing 3 ml of M9 glucose minimal medium containing 50 mg / l tryptophan, prepared by adding different sodium chloride concentrations, and grown in L-broth by shaking for 18 hours. About 10 7 cells / ml of the test strain was inoculated, and shaking culture was performed at 37 ° C. for 18 hours. The resulting broth was diluted appropriately with water and the absorbance of the dilution at 540 nm was measured (SCOD 540 ). The relative growth on NaCl-containing medium was indicated by (SCOD 540 ) / (D 540 ) × 100, where the degree of growth (D 540 ) of the same strain on M9 medium without NaCl was 100. (Table 1)

表1から、バチルス・スブチリス51−53Hが、高濃度の塩化ナトリウムに対しより耐性があること:NaClの高い濃度でも親株と比べて増殖可能であることが分かった。
Table 1 shows that Bacillus subtilis 51-53H is more resistant to high concentrations of sodium chloride: it can grow compared to the parent strain even at high concentrations of NaCl.

高浸透圧耐性株のイノシン生産の確認
バチルス・スブチリス51−53H株、および親株バチルス・スブチリスKMBS16は、各々34℃において20時間にわたり、18時間の通気を用いて、L−ブロスにおいて培養された。次いで、0.3mlの得られた培養物を、20x200mmの試験管内で、3mlの実施例2の発酵培地中へ接種し、34℃で72時間、ロータリーシェーカーを用いて培養された。
Confirmation of inosin production of hyperosmotic strains The Bacillus subtilis 51-53H strain and the parent strain Bacillus subtilis KMBS16 were each cultured in L-broth using 18 hours aeration for 20 hours at 34 ° C. 0.3 ml of the resulting culture was then inoculated into 3 ml of the fermentation medium of Example 2 in a 20 × 200 mm test tube and cultured on a rotary shaker at 34 ° C. for 72 hours.

培養の後、培地中に蓄積されたイノシンの量は、HPLCにより測定された。培地の試料(500μl)は15,000rpmで5分間遠心分離され、上清はHOで100倍希釈され、HPLCによって分析された。
分析条件
カラム:Luna C18(2)2503mm,5u(フェノメネックス(Phenomenex)、米国)
緩衝液:2%COH、0.8%(v/v)トリエチルアミン、0.55(v/v)酢酸(氷)、pH4.5
温度:30℃
流速:0.3ml/分
検出:UV250nm
保持時間(分)
キサントシン 13.7
イノシン 9.6
ヒポキサンチン 5.2
グアノシン 11.4
アデノシン 28.2
結果を、表2に示した。

表2に示されたように、バチルス・スブチリス株51−53Hは親株よりも多量のイノシンを蓄積した。
After incubation, the amount of inosine accumulated in the medium was measured by HPLC. A sample of medium (500 μl) was centrifuged at 15,000 rpm for 5 minutes and the supernatant was diluted 100-fold with H 2 O and analyzed by HPLC.
Analytical condition column: Luna C18 (2) 250 * 3 mm, 5u (Phenomenex, USA)
Buffer: 2% C 2 H 5 OH, 0.8% (v / v) triethylamine, 0.55 (v / v) acetic acid (ice), pH 4.5
Temperature: 30 ° C
Flow rate: 0.3 ml / min Detection: UV 250 nm
Retention time (minutes)
Xanthosine 13.7
Inosine 9.6
Hypoxanthine 5.2
Guanosine 11.4
Adenosine 28.2
The results are shown in Table 2.

As shown in Table 2, Bacillus subtilis strain 51-53H accumulated a larger amount of inosine than the parent strain.

NaClに耐性のバチルス・アミロリケファシエンス株の取得と評価
バチルス・アミロリケファシエンスAJ1991(ATCC19222)の細胞を、200μg/mlのNTGで処理し、2M、2.2M、または2.4MのNaClを含有するLB寒天プレート上にプレートした。接種されたプレートは、34℃で5日間インキュベートされた。現れた突然変異体のコロニーの中から、バチルス・アミロリケファシエンス株23−68H(VKPM B−8996)が選択された。
Acquisition and evaluation of NaCl-resistant Bacillus amyloliquefaciens strains Bacillus amyloliquefaciens AJ1991 (ATCC19222) cells were treated with 200 μg / ml NTG and treated with 2M, 2.2M or 2.4M NaCl. On LB agar plates containing The inoculated plate was incubated at 34 ° C. for 5 days. Bacillus amyloliquefaciens strain 23-68H (VKPM B-8996) was selected from the mutant colonies that appeared.

バチルス・アミロリケファシエンス株23−68Hおよび親株、バチルス・アミロリケファシエンスAJ1991は、各々34℃において18時間、L−ブロス中で培養された。次いで、0.3mlの得られた培養物は、20x200mm試験管内で、3mlの発酵培地中に接種され、34℃で72時間、ロータリーシェーカーを用いて培養された。
発酵培地の組成:(g/l)
グルコース 80.0
KHPO 1.0
MgSO 0.4
FeSO 7H 0.01
MnSO 5H 0.01
NHCl 15.0
アデニン 0.3
大豆加水分解物(窒素量) 0.8
CaCO 25.0
培養の後、培地中に蓄積されたイノシンおよびグアノシンの量は、上記のようにHPLCによって測定された。結果は表3に示した。
Bacillus amyloliquefaciens strain 23-68H and the parent strain, Bacillus amyloliquefaciens AJ1991, were each cultured in L-broth for 18 hours at 34 ° C. Then 0.3 ml of the resulting culture was inoculated into 3 ml of fermentation medium in a 20 × 200 mm test tube and cultured on a rotary shaker at 34 ° C. for 72 hours.
Composition of fermentation medium: (g / l)
glucose 80.0
KH 2 PO 4 1.0
MgSO 4 0.4
FeSO 4 * 7H 2 O 0.01
MnSO 4 * 5H 2 O 0.01
NH 4 Cl 15.0
Adenine 0.3
Soy hydrolyzate (nitrogen content) 0.8
CaCO 3 25.0
After incubation, the amount of inosine and guanosine accumulated in the medium was measured by HPLC as described above. The results are shown in Table 3.

表に示されたように、高浸透圧に耐性のバチルス・アミロリケファシエンス23−68H株は、親株よりもより多くのイノシンおよびグアノシンを蓄積した。 As shown in the table, the Bacillus amyloliquefaciens 23-68H strain resistant to high osmotic pressure accumulated more inosine and guanosine than the parent strain.

Claims (10)

高浸透圧下で耐性を有するように改変され、かつプリンヌクレオシド生産能を有するバチルス属細菌。 A Bacillus bacterium modified to have resistance under high osmotic pressure and having the ability to produce purine nucleosides. バチルス属に属する親株から誘導された改変株であって、浸透圧を上昇させる物質を含有する培地中で培養したときに、親株よりも生育が良好であるように改変されたことを特徴とする、請求項1の細菌。 A modified strain derived from a parent strain belonging to the genus Bacillus, characterized in that it is modified to grow better than the parent strain when cultured in a medium containing a substance that increases osmotic pressure. The bacterium of claim 1. 前期浸透圧を上昇させる物質が塩化ナトリウムである、請求項1または2の細菌。 The bacterium according to claim 1 or 2, wherein the substance that increases the osmotic pressure is sodium chloride. 前記培地が2.0Mの塩化ナトリウムを含有する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細菌。 The bacterium according to any one of claims 1 to 3, wherein the medium contains 2.0 M sodium chloride. 前記バチルス属細菌が、バチルス・スブチリス(Bacillus subtilis)または、バチルス・アミロリケファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)から選択される細菌である、請求項1から4のいずか一項に記載の細菌。 The bacterium according to any one of claims 1 to 4, wherein the Bacillus bacterium is a bacterium selected from Bacillus subtilis or Bacillus amyloliquefaciens. 前記プリンヌクレオシドが、イノシン、キサントシン、アデノシン、およびグアノシンからなる群より選択される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の細菌。 The bacterium according to any one of claims 1 to 5, wherein the purine nucleoside is selected from the group consisting of inosine, xanthosine, adenosine, and guanosine. 請求項1〜6のいずれか一項に記載のバチルス属細菌を培地で培養し、同細菌または培地中にプリンヌクレオシドを蓄積せしめ、同細胞又は培地からプリンヌクレオシドを回収することを特徴とする、プリンヌクレオシドの製造法。 The Bacillus bacterium according to any one of claims 1 to 6 is cultured in a culture medium, purine nucleosides are accumulated in the bacteria or the culture medium, and the purine nucleosides are recovered from the cells or the culture medium. A method for producing purine nucleosides. 前記プリンヌクレオシドが、イノシン、キサントシン、アデノシン、およびグアノシンからなる群より選ばれる、請求項7の方法。 8. The method of claim 7, wherein the purine nucleoside is selected from the group consisting of inosine, xanthosine, adenosine, and guanosine. 請求項7又は8に記載の方法によりプリンヌクレオシドを製造し、該プリンヌクレオシドに、ポリ燐酸、フェニル燐酸、及びカルバミル燐酸からなる群より選択される燐酸供与体と、ヌクレオシド−5’−燐酸エステルを生成する能力を有する微生物又は酸性フォスファターゼを作用させて、プリンヌクレオチドを生成せしめ、該プリンヌクレオチドを採取することを特徴とするプリンヌクレオチドの製造法。 A purine nucleoside is produced by the method according to claim 7 or 8, and a phosphoric acid donor selected from the group consisting of polyphosphoric acid, phenylphosphoric acid, and carbamylphosphoric acid is added to the purine nucleoside, and a nucleoside-5'-phosphate ester. A method for producing a purine nucleotide, characterized in that a purine nucleotide is produced by the action of a microorganism or acid phosphatase having the ability to produce the purine nucleotide, and the purine nucleotide is collected. 前記プリンヌクレオチドが、5′−イノシン酸、5′−キサンチル酸、5′−グアニル酸、5′−アデニル酸からなる群より選択される、請求項9に記載の方法。 10. The method of claim 9, wherein the purine nucleotide is selected from the group consisting of 5'-inosinic acid, 5'-xanthylic acid, 5'-guanylic acid, 5'-adenylic acid.
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