JP2006317457A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2006317457A5 JP2006317457A5 JP2006153999A JP2006153999A JP2006317457A5 JP 2006317457 A5 JP2006317457 A5 JP 2006317457A5 JP 2006153999 A JP2006153999 A JP 2006153999A JP 2006153999 A JP2006153999 A JP 2006153999A JP 2006317457 A5 JP2006317457 A5 JP 2006317457A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- spectrum
- mass fragment
- vector
- fragment spectrum
- mass
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Claims (5)
- マスフラグメントスペクトルの一部にアクセスするステップと、
前記マスフラグメントスペクトルの一部の強度バランス及び/又はピーク対の差異に応じて、前記マスフラグメントスペクトルの一部を評価するステップと、
前記評価ステップに応じて前記マスフラグメントスペクトルを処理するステップと、
を含むことを特徴とするコンピュータにより制御される方法。 - 前記評価ステップが、
前記マスフラグメントスペクトルの前記強度バランス及び/又はピーク対の差異に応じて、ベクトルを構築するステップと、
訓練データにより定められる少なくとも1つの表面により分離される複数の領域を含む多次元空間に前記ベクトルを配置するステップと、
をさらに含む請求項1に記載の方法。 - さらに、前記マスフラグメントスペクトルの前記強度バランスに応じて、ベクトルを構築するステップを含み、前記ベクトル及び/又はピーク対の差異が、およそ18デカ(Da)だけ異なるm/z値をもつピーク対の正規化された強度に応じるものである請求項1に記載の方法。
- 前記正規化ステップが、順位に基づく強度正規化方式を使用することを含む請求項3に記載の方法。
- マスフラグメントスペクトルを生成するマス分光計(mass spectrometer)と、
前記マスフラグメントスペクトルの少なくとも一部にアクセスし、前記スペクトルの強度バランス及び/又はピーク対の差異に応じたベクトルを構築し、前記ベクトルに応じてスペクトルを選択するフィルタを採用するコンピュータと、
を備えることを特徴とする装置。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US11/122,364 US7230235B2 (en) | 2005-05-05 | 2005-05-05 | Automatic detection of quality spectra |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2006317457A JP2006317457A (ja) | 2006-11-24 |
JP2006317457A5 true JP2006317457A5 (ja) | 2009-06-18 |
JP4679438B2 JP4679438B2 (ja) | 2011-04-27 |
Family
ID=36803445
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2006153999A Expired - Fee Related JP4679438B2 (ja) | 2005-05-05 | 2006-05-02 | 品質スペクトルの自動検出 |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US7230235B2 (ja) |
EP (1) | EP1720114A1 (ja) |
JP (1) | JP4679438B2 (ja) |
Families Citing this family (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20020115056A1 (en) | 2000-12-26 | 2002-08-22 | Goodlett David R. | Rapid and quantitative proteome analysis and related methods |
GB0305796D0 (en) | 2002-07-24 | 2003-04-16 | Micromass Ltd | Method of mass spectrometry and a mass spectrometer |
CA2567839C (en) * | 2004-05-24 | 2011-06-28 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Mass spectrometry with selective ion filtration by digital thresholding |
US20070166033A1 (en) * | 2006-01-10 | 2007-07-19 | Fujitsu Limited | Analyzing the quality of an optical waveform |
JP4941561B2 (ja) * | 2007-10-22 | 2012-05-30 | 株式会社島津製作所 | 質量分析データ処理装置 |
US8344315B2 (en) * | 2010-05-27 | 2013-01-01 | Math Spec, Inc. | Process for rapidly finding the accurate masses of subfragments comprising an unknown compound from the accurate-mass mass spectral data of the unknown compound obtained on a mass spectrometer |
US11798656B2 (en) * | 2019-02-22 | 2023-10-24 | Nevada Research & Innovation Corporation | Computer-implemented methods and systems for identifying a species from mass spectra |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5538897A (en) * | 1994-03-14 | 1996-07-23 | University Of Washington | Use of mass spectrometry fragmentation patterns of peptides to identify amino acid sequences in databases |
GB9821393D0 (en) | 1998-10-01 | 1998-11-25 | Brax Genomics Ltd | Protein profiling 2 |
DE60031030T2 (de) | 1999-04-06 | 2007-05-10 | Micromass UK Ltd., Simonsway | Verfahren zur Identifizierung von Peptiden und Proteinen mittels Massenspektromterie |
US6799121B2 (en) | 2000-03-30 | 2004-09-28 | York University | Sequencing of peptides by mass spectrometry |
US7158862B2 (en) * | 2000-06-12 | 2007-01-02 | The Arizona Board Of Regents On Behalf Of The University Of Arizona | Method and system for mining mass spectral data |
JP2005510732A (ja) * | 2001-11-30 | 2005-04-21 | ヨーロピアン モレキュラー バイオロジー ラボラトリー | 質量分析法によって自動的にタンパク質の配列決定を行うシステムおよび方法 |
GB0212470D0 (en) * | 2002-05-30 | 2002-07-10 | Shimadzu Res Lab Europe Ltd | Mass spectrometry |
US6770871B1 (en) | 2002-05-31 | 2004-08-03 | Michrom Bioresources, Inc. | Two-dimensional tandem mass spectrometry |
US20060249668A1 (en) * | 2005-05-05 | 2006-11-09 | Palo Alto Research Center Incorporated | Automatic detection of quality spectra |
-
2005
- 2005-05-05 US US11/122,364 patent/US7230235B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-05-02 JP JP2006153999A patent/JP4679438B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2006-05-05 EP EP06009373A patent/EP1720114A1/en not_active Ceased
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2006317457A5 (ja) | ||
Gauch Jr | A simple protocol for AMMI analysis of yield trials | |
JP2010509031A5 (ja) | ||
JP7073348B2 (ja) | 脅威スコアリングシステム及び方法 | |
WO2005119955A3 (en) | System, method and computer program product for validating an identity claimed by a subject | |
Fu et al. | Joint tensor factorization and outlying slab suppression with applications | |
EP2860658A1 (en) | Classifying malware by order of network behavior artifacts | |
WO2007056624A3 (en) | Methods and apparatus for metering portable media players | |
WO2007082044A3 (en) | Method and apparatus for processing algorithm steps of multimedia data in parallel processing systems | |
WO2006082091A3 (en) | Low latency massive parallel data processing device | |
WO2006110832A3 (en) | System for extracting relevant data from an intellectual property database | |
WO2007041134A3 (en) | Computer method and system for predicting physical properties using a conceptual segment model | |
JP2012500439A5 (ja) | ||
Kang et al. | Linear combinations of biomarkers to improve diagnostic accuracy with three ordinal diagnostic categories | |
WO2014011131A3 (en) | A method enabling verification of the user id by means of an interactive voice response system | |
WO2007020456A3 (en) | Neural network method and apparatus | |
de Figueiredo et al. | Application of mixed models for evaluating stability and adaptability of maize using unbalanced data | |
WO2005031290A3 (en) | Method and apparatus for mass spectrometry | |
WO2008120317A1 (ja) | 照合装置、認証装置、照合方法、認証方法、照合プログラム及び認証プログラム | |
WO2006121913A3 (en) | Relation-based product development | |
JP2005208766A5 (ja) | ||
CN106596506B (zh) | 一种基于压缩存储和列选主元高斯消去法的airPLS实现方法 | |
JP2008165314A5 (ja) | ||
CN115834251B (zh) | 基于超图Transformer威胁狩猎模型建立方法 | |
Lin et al. | Evaluating the reliability of spectral variables selected by subsampling methods |