JP2006217864A - B型肝炎ウイルスcccDNAの測定方法並びにそのためのプライマー及びプローブ - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 検体中のHBVcccDNAを測定する方法は、HBVcccDNAの特定の領域に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成るフォワード側プライマーと、HBVcccDNAの特定のの相補鎖に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成るリバース側プライマーと、前記フォワード側プライマーと前記リバース側プライマーとの間に挟まれる領域にハイブリダイズし、レポーター色素及びクエンチャー色素で標識された15ヌクレオチド以上のサイズを有する核酸プローブとを用いたリアルタイムPCR法により検体中のHBVcccDNAを測定する。
【選択図】 なし
Description
特許文献1に記載のフォワード側プライマー(配列番号1の1674nt〜1691nt)及びリバース側プライマー(配列番号1の1796nt〜1776ntの相補鎖)を用いたことを除き、実施例1と同様に測定を行った。その結果、増幅が起きず、測定ができなかった。
非特許文献3に記載のフォワード側プライマー(配列番号1の1553nt〜1572nt)及びリバース側プライマー(配列番号1の1830nt〜1851ntの相補鎖及び配列番号1の2040nt〜2061ntの相補鎖)を用いたことを除き、実施例1と同様に測定を行った。その結果、増幅が起きず、測定ができなかった。
Claims (9)
- 配列表の配列番号1に示される塩基配列の1414nt〜1454ntの領域に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成るフォワード側プライマー又は配列番号1に示される塩基配列の1383nt〜1422ntの領域に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成るフォワード側プライマーと、配列番号1に示される塩基配列の1727nt〜1765ntの領域の相補鎖に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成るリバース側プライマーと、前記フォワード側プライマーと前記リバース側プライマーとの間に挟まれる領域にハイブリダイズし、レポーター色素及びクエンチャー色素で標識された、12ヌクレオチド以上のサイズを有する核酸プローブとを用いたリアルタイムPCR法により、検体中のHBVcccDNAを測定する方法。
- 前記フォワード側プライマーが、配列番号1に示される塩基配列の1421nt〜1447ntの領域に含まれる連続する少なくとも18ヌクレオチド又は配列番号1に示される塩基配列の1390nt〜1415ntの領域に含まれる連続する少なくとも18ヌクレオチドから成り、前記リバース側プライマーが、配列番号1に示される塩基配列の1734nt〜1758ntの領域の相補鎖に含まれる連続する少なくとも18ヌクレオチドから成る請求項1記載の方法。
- 前記核酸プローブが、配列番号1に示される塩基配列の1645nt〜1682ntの領域又はその相補鎖に含まれる連続する少なくとも12ヌクレオチド、又は配列番号1に示される塩基配列の1409nt〜1442ntの領域又はその相補鎖に含まれる連続する少なくとも12ヌクレオチドから成る請求項1又は2記載の方法。
- 前記フォワード側プライマーが、配列番号2で示される塩基配列を有する21ヌクレオチドから成る核酸、前記リバース側プライマーが、配列番号3で示される塩基配列を有する19ヌクレオチドから成る核酸、前記プローブが配列番号4で示される塩基配列を有する18ヌクレオチドから成る核酸である請求項3記載の方法。
- 前記フォワード側プライマーが、配列番号5で示される塩基配列を有する20ヌクレオチドから成る核酸、前記リバース側プライマーが、配列番号3で示される塩基配列を有する19ヌクレオチドから成る核酸、前記プローブが配列番号6で示される塩基配列を有する14ヌクレオチドから成る核酸である請求項3記載の方法。
- 配列表の配列番号1に示される塩基配列の1414nt〜1454ntの領域に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成るフォワード側プライマー又は配列番号1に示される塩基配列の1383nt〜1422ntの領域に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成る、請求項1記載の方法に用いられるフォワード側プライマー。
- 配列番号1に示される塩基配列の1727nt〜1765ntの領域の相補鎖に含まれる連続する少なくとも15ヌクレオチドから成る、請求項1記載の方法に用いられるリバース側プライマー。
- 配列番号1に示される塩基配列の1645nt〜1682ntの領域若しくはその相補鎖に含まれる連続する少なくとも12ヌクレオチドから成り、又は配列番号1に示される塩基配列の1409nt〜1442ntの領域又はその相補鎖に含まれる連続する少なくとも12ヌクレオチドから成り、レポーター色素及びクエンチャー色素で標識された、請求項3記載の方法に用いられる核酸プローブ。
- 請求項6記載のフォワード側プライマーと、請求項7記載のリバース側プライマーと、請求項8記載の核酸プローブとを少なくとも含む、HBVcccDNA測定用キット。
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