JP2005534752A - カンピロバクターグリカンおよびグリコペプチド - Google Patents
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Abstract
Description
タンパク質糖鎖形成(protein glycosylation)を研究するための、一般的な適用を有している研究道具を提供することも望ましい。タンパク質の糖鎖形成は、真核生物に固有の(specifically)現象であると考えられたが、しかし古細菌(Archaea)および真正細菌(Eubacteria)のドメイン(1, 2)の双方に広く存在していることが現在明かとなっている。
N−および0−型両方のグリコシド結合(Glycosidic linkages)は、原核生物の多様なグループにおいて同定されており、古細菌において明らかなN連結型糖(N−linked sugars)が優勢(preponderance)である。しかし、これまで真正細菌において同定された糖タンパク質においてはO型の結合単位(linkage units)が優位(predominate)である(1,2)。加えて、細菌性のN−および0−結合は、真核生物性の糖タンパク質において観察されたものよりも、広い範囲の糖を形成する。
本発明者らは、次のことを発見した。それは即ち、特定のグリコペプチド(glycopeptides)およびグリカン部分が、複数の株のカンピロバクター菌に対するワクチンおよび抗体に対する効果的な基礎を形成することである。このことは、複数の株および種を横断する不変(invariant)(又はほとんど不変の)の形態において、これらの細菌の表面にそれらが遍在性に存在することによる。また、このグリカンは、カンピロバクターの複数の表面糖タンパク質のコンポーネントとして存在し、それゆえに免疫的な標的としての、その価値が増強される。
最近、特定の遺伝子座位が、腸内の病原体カンピロバクター ジェジュニ(Campylobacter jejuni)において同定された(これは複数のタンパク質の糖鎖形成に関与していると思われる)。このことにより、グラム陰性菌(gram−negative bacterium)において、広範囲に広がったタンパク質糖鎖形成に関する経路の最初の証拠が提供された(3)。pgl(protein glycosylationに対する)と称される本座位内の遺伝子の突然変異誘発(Mutagenesis)により、複数のタンパク質における免疫原性(immunogenicity)の欠損(loss)が生じた。これらのタンパク質のグリカン部分(glycan moieties)が、実験的に感染させたヒトのボランティアから採取した抗血清により認識されたことも示された(3)。pgl突然変異によるグリカン部分の除去により、減少した接着(adherence)および浸潤(invasion)をインビトロで並びにマウスコロニー形成(mouse colonization)の欠損をインビボで生じ(4)、このことはタンパク質糖鎖形成が、この生物体のビルレンス特性(virulence properties)に影響することを示唆している。
本発明者等は、C.jejuni株(NCTC 11168)のタンパク質の翻訳後修飾を同定し、特性を調査した。この株に関する、全ゲノム配列はParkhill等により記載された(6)。
2Dゲル上で複数のスポットを生じるタンパク質のなかに、PEB3(またはCj0289c)が存在し、これはC.jejuniの主要な抗原性タンパク質(antigenic protein)であり、Pei等により最初に記載された(7)。
1D SDS−PAGEにより精製および分析した際に、2つのバンド(−1500Daの質量差)が現れ、その双方は標準的なPEB3(authentic PEB3)に対応するN末端配列を有していた。我々のPEB3における観察と同時(Concurrent)にLintonら(8)は、2つの推定上の糖タンパク質をC.jejuniからGalNAc特異的なレクチン(ダイズ凝集素)を使用して同定した。そのうちの一方はPEB3であり、他方は推定上のペリプラスムタンパク質(putative periplasmic protein) Cj1670cであった(彼らはCgpAと命名した)。また、前記著者は、いくつかの他の推定上の糖タンパク質を観察したが(前記レクチンと結合する彼らの能力に基づいて)、これらは同定されなかった。さらにまた、前記レクチンへのタンパク質結合は、pgl座位中の遺伝子の突然変異誘発(mutagenesis)によっても影響された。加えて、我々は遺伝子pglBの突然変異を示した。これのSaccharomyces cerevisaeのN連結型オリゴサッカリルトランスフェラーゼ(N−linked oligosaccharyltransferase)のSTT3サブユニットに対する相同性(homology)は、糖タンパク質生合成に役割を有すること(3, 9)、同定された糖タンパク質の糖鎖形成に特異的に影響することを示唆している。
そのうえ、炭水化物(carbohydrates)は、生命の全てのドメイン(domains)において様々な機能と結び付けられる。一般的には、細菌株と関連する種との間の、抗原性表面グリカン(antigenic surface glycans)における糖タンパク質及びそれらのグリカン部分の変動(variance)は高い水準で存在するが、このことは常に事実であるわけではない。また、このような例外により、細菌を排除するための抗体またはワクチンに基づく戦略に適切な優れた候補者が提示される。特に、係る炭水化物の1つは、カンピロバクター糖タンパク質のグリカン部分(glycan moiety)である。重要な食品媒介病原体 カンピロバクター ジェジュニのグリコム(glycome)を特徴付けるための我々の最近の努力は、全ての表面グリカン構造、即ち、リポオリゴ糖(LOS;lipooligosaccharide)、莢膜多糖類(CPS;capsular polysaccharide)、N連結型グリカン、および0連結型グリカンの解明へと向けられた(5,12−15)。
本明細書中で使用される「家畜(livestock)」は、哺乳動物および家禽(poultry)を含む。
1つの側面に基づいて、本発明は、式Iの七糖類を含む化合物を提供する: GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,4−[Glc−β1,3]GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,3−Bacであって、Bacは、2,4−ジアセトアミド−2,4,6−トリデオキシ−D−グルコピラノース(2, 4−diacetamido−2, 4, 6−trideoxy−D−glucopyranose)である。また、式Iは、上記の化合物の免疫学的に活性なフラグメントを含む。「免疫学的に活性な(immunologically active)」は、係るフラグメントがカンピロバクターに対するワクチンの活性なコンポーネントを含み得ること、或いは係る化合物に特異的に結合する及び同一物が投与された生物体においてカンピロバクターを中和する、抗体または抗体フラグメントを提供し得ることを意味する。これらのグリカンは、単離した形態で提供し得る又は新規のグリコペプチドを形成するために、オリゴペプチドまたはアミノ酸と連結し得る。前記アミノ酸は、N−連結型のグリコペプチドを形成するための、アスパラギンを具備してもよい。これらのグリカンまたはグリコペプチドは、グラム陰性菌から由来する又は単離および精製されたものであってもよい。この糖タンパク質グリカン部分(glycoprotein glycan moiety)は、治療上の調製物(preparations)および方法(以下に記載される)の基礎(basis)を提供できる。
さらに別の側面に基づいて、本発明は、細菌性の糖タンパク質のグリカン部分を検出する方法を提供する、該方法は、前記サンプルを高分解能マジック角スピニング核磁気共鳴(HR−MAS NMR)分光学に供試することを含む。この方法により、グリカン部分(その供給元を直接的に形成する)の検出を、前記タンパク質を精製する必要を伴うことなく可能にする。
更なる側面に基づいて、本発明は、式Iの七糖類および生理学的に許容される担体(physiologically acceptable carrier)を含む、薬学的組成物を提供する。好ましくは、前記薬学的組成物は、前記グリカンもしくはグリコペプチド又はそのフラグメントに結合する、免疫原性の抱合体および/または免疫賦活薬(immunostimulant)を更に含んでいてもよい。係る薬学的組成物は、カンピロバクター病原体により生じる病気に対して、ヒトまたは動物を免疫するためのワクチンとして有用である。係る病気は、例えば、胃腸の感染症(gastro−intestinal infections)、Guillain Barre GBSおよびミラーフィッシャー症候群(Miller Fisher syndromes)、関節炎(arthritis)および菌血症(bacteremia)である。係るワクチンは、1以上の注射を介して又は別の医学的に許容される方法により、投与されてもよい。
別の側面に基づいて、本発明は、式Iのグリカン部分に相互作用し且つ特異的に結合する、抗体または抗原結合性の抗体フラグメントを提供する。係る抗体またはフラグメントは、動物またはヒトのレシピエント(recipient)に投与された場合、1以上のカンピロバクター種を中和(neutralize)するだろう。係る抗体は、多様な既知の方法により取得することができる;この方法には、上記の七糖類またはグリコペプチドで事前に(previously)免疫した動物の血清から単離すること、或いは係る化合物に対する、マウスのモノクローナル抗体を調製することが含まれる。別の手段は、組換えDNA技術を介するものであり;例えば、係る抗体または抗体フラグメントを、ラクダから以前に単離されたドメイン抗体(「dAb」)遺伝子のライブラリーセット(a library set)をクローニングすることにより取得し、そして次にバクテリオファージ ライブラリー中で発現させ、パニングし、そして次にバクテリオファージ中で、七糖類、グリコペプチド又はそのフラグメントに対して親和性を有する配列dAbs(a sequence dAbs)を発現させることである。好適なラクダ(camelid)は、Camelus bactriamus、Camelus dromaderius、Lama pPaccos、Lama ggGlamaおよびLama vAlternativelyから選択される;別の方法は、単一鎖抗体フラグメント(scFv) Vicugnaのバクテリオファージ ライブラリーをスクリーニングすることを伴う(involve)であろう。また、本発明は、上記の抗体又はその抗原結合性フラグメント、および生理学的に許容される担体を含む薬学的組成物を提供する。係る薬学的組成物を、動物またはヒトにおける治療薬(therapeutic agent)として使用できる。
適切な抗体フラグメントは、Fabフラグメント(ラクダ種は、軽鎖を含有しない独特な型の抗体を産生することが注目され、従来の用語(例えば、「Fab」)は修正されるだろう)を含み、これには上記の技術により又は他の伝統的な技術により単離状態に調製され(prepared in isolation)且つ抗体全体(a whole antibody)に直接的に由来しない、フラグメントが含まれる。
更に別の側面に基づいて、本発明は、カンピロバクター細菌の存在を家畜において減少させる方法を提供する。前記方法は、家畜に、式Iのグリカン部分と相互作用する(interacts)及び結合する(binds)、抗体または抗原結合性抗体フラグメントを投与することを含む。
前記抗体または抗体フラグメントは、動物飼料または水の何れかに添加し得る、或いは動物飼料植物(an animal feed plant)の遺伝的な修飾(これにより係る植物に前記抗体または抗体フラグメントを発現させる)の結果として存在するものであってもよい。
なお別の側面に基づいて、本発明は、ヒトまたは動物におけるカンピロバクター病原体により生じる病気を治療する方法を提供し、該方法は、上記で定義した抗体又はその抗原結合性フラグメントを前記ヒトへ投与することを含む。前記抗体又はその抗原結合性フラグメントを、カンピロバクター病原体により生じる病気に関して、動物またはヒトを治療するための医薬(medicament)の調製において使用できる。
別の側面に基づいて、本発明は、カンピロバクター病原体の地下水汚染(ground water contamination)を阻止する方法を提供する。この汚染は、家畜による前記細菌の糞便発散(fecal shedding)、引き続く水源(water supply)への糞便物質(fecal matter)の侵入(entry)の結果として生じる。前記方法は、病原体の存在を家畜から排除すること又は減少させることを具備する(前記家畜に上記で規定した抗体又はその抗原結合性フラグメントを投与することによる)。
また、このことにより前記病原体がヒトに到達すること(reaching humans)を阻止する方法が構成され、その結果、彼らはこれらの病原体により生じる病気から防御される。
また、本発明の抗体および抗体フラグメントを診断上の道具として使用して、ヒトおよび動物における及び環境から採取された(drawn)サンプル(例えば、水または肥料のサンプル)における、カンピロバクターの存在を検出できる。
一般的な実験手順
細菌株およびプラスミド:
C.jejuni NCTC 11168を、ミュラーヒントン寒天(Mueller Hinton agar)上で微好気性(microaerophilic)の条件(10%C02、5%02、85%N2)下で37℃で規定どおり成長させた。大腸菌DH10B(インビトロゲン)をクローニング実験に関する宿主株として使用した。そしてクローンをLuria S−gal寒天(シグマ)またはMH寒天で37℃で成長させた。適切な場合、抗生物質を次の最終濃度まで添加した、即ち: カナマイシン30μg/mLおよびアンピシリン150μg/mLである。
プラスミドpPCR−Script Amp(ストラタジーン)をクローニングベクターとして使用した。
糖タンパク質抽出物の調製
一晩成長させた2つのプレートからの細胞を、10mLミュラーヒントンブロスに再懸濁した、そして1リッターのMH培養培地(MH culture medium)への接種に使用した。培養物を、微好気性条件下で37℃、24h、150rpmで振盪させて成長させた。12リッターの培養培地からの細菌細胞(Bacterial cells)を、遠心分離(10,000xg)を15min処理して収穫し、そして即座に−75℃で凍結した。凍結した細胞ペレットを、氷上で0.2MグリシンHCl緩衝剤 pH2.2(13)中で融解し、そして15min抽出した(穏やかに撹拌して)。抽出物を、遠心分離(10,000xg)を15minすることにより清澄(clarified)し、純水(Milli−Qシステム、ミリポア社)に対して透析し、そして凍結乾燥した。
PEB3の精製および分析:
PEB3タンパク質を、グリシン抽出物を陽イオン交換クロマトグラフィーすることにより、均一(homogeneity)に精製した(以前に記載の通り(7))。ファルマシアMonoS HR 5/5カラムを、AKTAエクスプローラーLCシステム(アマシャムバイオサイエンス)に使用した。カラム溶出液を、UV吸光度(280nm)に関してモニターした。そしてフラクション(fractions)を、Mini Protean IIスラブゲル(バイオラドラボラトリーズ)中でSDS−PAGE分析(21)により試験した。個々のタンパク質のN末端シークエンシングを、SDSゲルからプロブロット(ProBlotTM)PVDF膜(アプライドバイオシステム社)への転写に引き続き、モデル491 プロサイズ(Procise)タンパク質配列決定システム(アプライドバイオシステム社)で実施した(LeGendre等の記載の通り)(22)。
選択したフラクションのタンパク質分子量プロフィールを、エレクトロスプレーイオン化質量分析により決定した(アプライドバイオシステム/サイエックス Qスターハイブリッド四重極 飛行時間型質量分析計を用いて)。
前記フラクションを、最初に頻繁に透析して塩を除去し、30%メタノール、0.2%ギ酸に対して調製した。溶液を1μL/minの流速で流し、そしてスペクトルをm/z 600>2000の範囲で取得した。
選択したフラクションを、修飾型トリプシン(プロメガ)を50mMアンモニウムバイカルボネート中で一晩37℃で消化し、Q−TOF2ハイブリッド四重極 飛行時間型質量分析計(Micromass)と連結したキャピラリーHPLCシステム(CapLC、ウォーターズ)を用いた、キャピラリーLCタンデム型質量分析により分析した。約250ngの各消化物を、0.3x150mmのPepMapC18キャピラリーLCカラム(Dionex/LC−Packings)に注入し、そして勾配溶離(5−90%アセトニトリル、0.2%ギ酸を45分間で)により分離した。質量分析計をセットして、自動MS/MS獲得モードで実行した。そしてスペクトルを二重(doubly)、三重(triply)、および四重(quadruply)に荷電したイオンに関して獲得した。
トリプシン消化物(tryptic digest)のラージスケール分離を、4.6mm x 250mm Jupiter C18 LCカラム(Phenomenex Inc.)上で実施した。グリコペプチドを含有しているフラクションを、次に一定の流速(1μL/min)でQ−TOF2質量分析計のマイクロエレクトロスプレー界面へと注入した。グリコペプチドのフラグメンテーション(MS/MS分析の前の)を、フロントエンド衝突誘発解離(front−end collision−induced dissociation)により達成した(開口部電位を通常値40Vから100Vに増加させた)。この様式で産生された単一に荷電したフラグメント イオンに対するMS/MS衝突オフセットは、20−25Vであった(参照のラボ フレーム(lab frame))。Rademaker等(23)の方法によるβ脱離実験(β−elimination experiments)に関して、グリコペプチド含有フラクションの約半分を蒸留して乾燥させて、そして25%水性アンモニウム水酸化物(25% aqueous ammonium hydroxide)に溶解した。前記溶液を、室温で一晩静置し、蒸留して乾燥させ(二回目の)、そして水中で再溶解させた。
前記溶液を、次にインフュージョンMS(infusion−MS)で試験した(上記の通り)。
全糖タンパク質の精製および分析:
グリシン抽出物からの糖タンパク質を、アフィニティークロマトグラフィーによりSBAレクチン/アガロース(シグマアルドリッチ社)上で分離した。凍結乾燥したグリシン抽出物を、PBS(100mM塩化ナトリウム、50mMリン酸ナトリウムpH7.5)中に再溶解し、そしてSBA/アガロースカラム(事前にPBSで平衡化させた)を通過させた。前記カラムを10カラム容量のPBSで洗浄し、結合した糖タンパク質を0.1M GalNAc(PBS中)で溶出した。糖タンパク質含有フラクション(Glycoprotein−containing fractions)を、プール(pooled)し、Milli−Q水に対して透析し、凍結乾燥した。
糖タンパク質を、SDS−PAGEにより12.5%の均質なポリアクリルアミドゲル上で分離した(21)。2D−PAGEを、pH3−10、pH4−7(バイオラドラボラトリーズ)またはpH6−11(アマシャムバイオサイエンス)の何れかの固定化された直線状pHグラジエントを含有する、プレキャストIEFストリップを用いて実施した。タンパク質を、製造者の使用説明書にしたがってサンプル緩衝剤中に溶解し、そして等電点フォーカシング(プレキャストIEFストリップ上で)と、引き続くSDS−PAGE(均質な12.5%スラブゲル上、20x20cm、二次元目に関して)とにより分離した。
ゲルを、バイオセーフ(Bio−Safe)コロイドG−250クーマシーブルー染色(バイオラドラボラトリーズ)または銀染色で染色した(23)。引き続くレクチンのプロービング(probing)に関して、前記ゲルを、PVDF膜上に50Vで1時間、10mM 3−(シクロヘキシルアミノ)−1−プロパンスルホン酸緩衝剤(pH11、10%メタノール含有)中で電気ブロット(electroblotted)した。前記膜をMilli−Q水中で洗浄し、そしてトリスで緩衝した(Tris−buffered)生理食塩水(100mM塩化ナトリウム、50mMトリスpH7.5)に0.05% Tween20を有するもの及び2%ブロッキング緩衝剤(ロシュ モレキュラー バイオケミカルズ)で、2時間室温でブロックした。
ブロッキング(blockage)後、転写物(blots)を、SBA−アルカリホスファターゼ抱合体(EY Laboratories Inc.)を10μg/mLの濃度で上記ブロッキング溶液中に含有するもので、1時間室温で、更にインキュベートした。転写物を、トリス生理食塩水に0.05% Tween20を添加したもので3回洗浄し、そしてニトロブルーテトラゾリウム クロライド(NBT)および5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル リン酸(BCIP)を0.1M塩化ナトリウム、0.1M トリスpH9.5(50mM MgCl2を添加)中に有する溶液を用いて発色させた。
2D−ゲルスポットのMS分析:
タンパク質スポットを、切除し、1:1比率の30mMフェリシアン化カリウムおよび100mMチオ硫酸ナトリウム(24)で脱染色した。ゲルスポット(gel spots)を、脱イオン水で頻繁に洗浄し、アセトニトリルで収縮させ、50mMアンモニウムバイカルボネート(プロメガ修飾型トリプシン(10ng/uL)を含有する)で再膨潤(re−swollen)させた。そして十分な50mMアンモニウムバイカルボネートをゲル片に添加してカバーした(典型的には30uL)。
チュウブを密封し、一晩37℃でインキュベーションした。消化液を除去し、ゲル片を50μLの5%酢酸で抽出し、次に50μLの5%酢酸(50%水性メタノール中の)で抽出した。抽出液を、消化液と共にプールし、約10μLに濃縮した。
強いタンパク質スポットからのペプチド抽出物を、MALDI−LR質量分析計(Micromass)を用いた、MALDI−TOFMSで分析した。
約0.5μLのMALDIマトリックス溶液剤(10mg/mL α−シアノ−4−ヒドロキシ−桂皮酸を50%アセトニトリル、0.2%TFA中に含有する)を、ターゲットプレート上に沈着(deposited)させ、乾燥させた。ペプチド抽出物を、C18 ZipTipsTM(ミリポア)を用いて脱塩し、そしてマトリックススポット上に直接沈着させた。
MALDI−TOFMSスペクトルの獲得を自動的に実行した。スペクトルを、ペプチド標準(peptide standards)を用いて外部的に較正(calibrated)し、トリプシン自己消化ペプチドを用いて内部的に較正した。データベース探索を、バッチモードでMascot Daemons TM(Matrix Science)を用いて、C.jejuni NCTC11168ゲノム配列データベースを対象に実行した。
微かな(fainter)タンパク質スポットからの抽出物を、Q−TOF2質量分析計を用いたnanoLC−MS/MSで分析した。全サンプルを、0.3x5mm C18ミクロプレカラムカートリッジ(Dionex/LC−Packings)に注入した。ペプチドは、サンプル溶液が洗浄され廃棄される間に保持された。トラップを75μm x 150mm C18Nanoシリーズカラム(Dionex/LC−Packings)上に配置した。そしてペプチドをCapLCポンプ(15〜75%アセトニトリル、0.2%ギ酸を30分間、約300nL/min流速)により供給されるグラジエント(gradient)で分離した。質量分析計をセットして、自動化モードでMS/MSスペクトルを取得した(上記のとおり)。
データベース探索を、MALDI−TOFMS分析に関する記載にしたがって実行した。
グリコペプチド調製:
凍結乾燥したトータルの糖タンパク質(5mg)を、250μLの100mM Tris pH8.0(2mM CaCl2を含有)に溶解し、そしてプロナーゼ(pronase)で消化した(以前に記載の通り)(31)。消化物を、微量遠心(10,000xg、15min)し、上清をBioGel P4、200メッシュ(BioRad Laboratories)のカラム(1x120cm)にアプライした。カラムを水中で実施し、カラム溶出液を屈折率(refractive index)によりモニターした。フラクションを、ESIMSおよび前駆物質イオン走査質量分析(m/z 204でのHexNAcオキソニウムイオンの前駆物質)をAPI3000 三重四重極質量分析計(Applied Biosystems/Sciex)上で実施することにより選抜(screened)した。HexNAc イオンサイン(ion signature)を提示するフラクションを、プールし、凍結乾燥した。グリコペプチドを、BioGel P2ファイングレードの1x120cmカラム上で更に精製した(フラクションは上記のとおりモニターされ、選抜される)。
NMR分光学:
全スペクトルを、Varian Inova 600MHz分光計(標準のVarianソフトウェアを用いて)を用いて取得した。グラジエント 4mm間接検出 高分解能マジック角スピニング(A gradient 4 mm indirect detection high−resolution magic angle spinning) nano−NMRプローブ(Varian)に、広帯域(broadband)のデカップリングコイル(decoupling coil)を備えたものを使用した。サンプルを、駆動(drive)およびベアリング(bearing) ガスとしての乾燥窒素と共に、3KHzでスピンさせた。スピン比率(spin rate)は、コンピュータ制御されなかったが、セット値の10Hz内で一定に保持された。
サンプル(40μLのD20溶液中)を、より鋭いピークを産生させるために、25℃で及び35℃で記録した。pHは、小さい容量のため分からなかった。重水素化したEDTA(CDN Isotopes Inc.)を添加して、金属イオンをキレートし、バシロサミン(bacillosamine)およびアミノ酸に対する鋭いピークを提供した。グリコペプチド単離物(P4カラムからの)が、いくつかのアミノ酸および糖 不純物(impurities)を含有していたにもかかわらず、スペクトルは、15mMの重水素化型EDTA(deuterated EDTA)の存在下において、グリコペプチドの完全な共鳴帰属(resonance assignments)を許容する十分な質のものであった。多くのNMR構造研究は、このサンプルで継続した(更なる精製による、分離されたグリコペプチドのバルクを失うリスクのため)。導き出された構造(The derived structure)は、グリコペプチドにおける付加的なNMR実験により確認された;このグリコペプチドは、P2カラムを用いて精製され、凍結乾燥され、そして40μLのD2O(1mM 重水素化型EDTAを有する)に溶解されたものであった。実験は、HDOシグナルの抑制(suppression)を4.78ppm(25℃)および4.67ppm(35℃)で行い実施された。2次元実験(COSY、TOCSY、NOESY、HMQC、HMBC)の取得(Acquisition)および処理(processing)を、以前に記載されたとおり実施した(32)。1H リファレンスを、外部のアセトンにより2.23ppmでセットした。13C リファレンスを、外部のアセトンのメチル共鳴で31.07ppmにセットした。1Hおよび13C 化学シフト(表1における)を、プロトン スペクトルから及びC−Hクロスピークから(HMQCおよびHMBCスペクトルにおける)測定した。1D TOCSY実験(30−151msの多様なスピン−ロック時間)および1D NOESY(400−800msの混合時間)を、以前に記載されたとおり実施した(25,26)。選択的な実験を、1D EXP〔選択されたスピン(selected spins)、選択励起バンド幅(selective excitation bandwidth)、混合時間(mixing time)、ここでEXPはTOCSYまたはNOESY〕として記載した。
RFおよび磁場均質性(magnetic−field homogeneities)の双方の存在下において、マジック角スピニング(MAS;magic angle spinning)を液体状態サンプルに対して使用することは、TOCSY実験において混合シークエンス(mixing sequences)の性能に有意に影響することが示されており、これにより性能が劣化され得る(27,28)。断熱性(WURST)混合シークエンスは、係る効果を排除できる(27,29)。標準の2D TOCSYおよび1D TOCSYシークエンスを、MLEV−17またはDIPSI−2混合シークエンスが断熱性(adiabatic)WURST−2パルスで置換されるように修飾した。断熱性(WURST−2)混合は、Tp=1/MASスピン比率の単一の断熱性反転パルス長(adiabatic inversion pulse length)、8の変調深度(a modulation depth)、および2の断熱度(adiabicity)を有していた。典型的には、WURST−2パルスに関して、スイープ帯域幅(sweep bandwidth)は、24kHz、Tp=0.333ms(3000+/−10HzのMASスピン比率で)、B1(max)=8.51kHz、B1(RMS)=4.77kHzであった。
GC−MS分析:
P2産物のGlcおよびGalNAcコンポーネントの鏡像異性配置(enantiomeric configurations)は、ガス液体クロマトグラフィー質量分析においてbut−2−イル グリコシド(but−2−yl glycosides)のキャラクタリゼーションにより割り当てられた(21)。誘導体(derivatives)を、ヒューレットパッカード クロマトグラフに30m DB−17キャピラリーカラム(180℃から260℃を3.5℃/min)を備えた装置を用いて分析した。また、電子衝撃モード(electron impact mode)におけるスペクトルを、バリアンサターン(Varian Saturn)II質量分析計で取得(obtained)した。
pglB突然変異体の構築およびキャラクタリゼーション:
pglB突然変異体の構築に関して、遺伝子Cj1121cからCj1126cを、C.jejuni NCTC11168から、次のプライマーを用いてPCR増幅した: 即ち、Cj1121cF(5’−ACTCACTATTGCCATTAAGATAAGC−3’)およびCj1126cR(5’− AAAACCCTTATTTAGTTTTGTTTGC−3’)である。PCR産物を、Pfuポリメラーゼで削り(polished)、そしてpPCR−Script Amp(ストラタジーン)へと製造者の使用説明書にしたがって連結した。ライゲーション混合物を、電気穿孔法を適用可能な(electrocompetent)大腸菌DH10Bへと電気穿孔して導入し、そしてLB S−gal寒天(シグマ−アルドリッチ)にアンピシリンを含有させた培地で選択した。pILL600からのブラントエンド化したカナマイシン抵抗性カセット(37)を、pglBのフィルインしたXbal制限酵素部位に挿入して、pEAp26を作出した。前記カセットの方向性を、ckanBプライマー(5’−CCTGGGTTTCAAGCATTAG−3’)でシークエンシングすることにより決定した。DNAを、ターミネーター化学およびAmpliTaqサイクル シークエンシング キット(アプライドバイオシステム)を用いて配列決定し、アプライドバイオシステム373DNAシーケンサーで分析した。突然変異したプラスミドDNAを、C.jejuni NCTC11168への電気穿孔に使用した(32)。また、カナマイシン耐性の形質転換体をPCRにより特性を調査して、入った(incoming)プラスミドDNAが二重の交差イベントにより統合されたことを確認した。
タンパク質を、0.2Mグリシン(pH2.2)を用いて、C.jejuni細胞全体から抽出し(10)、そして水に対し透析した。サンプルを、11cm pH3−10のReadyStripIPG strips(バイオラドラボラトリーズ)およびプレキャスト12x8cm 8−16%グラジエント・クライテリオン・スラブゲル(gradient Criterion slab gels、バイオラドラボラトリーズ)を用いた2D−PAGEにより分析した。ゲルを、コロイド性クーマシーブルーで染色し、写真をとり、次に水中で洗浄することにより部分的に脱染色した。タンパク質を、1h、207mAでPVDF膜上に転写した(トランス−ブロットSDセミドライ転写セル(バイオラド)を用いた)。ブロッキングを一晩した後、膜を1:500希釈のHS:2セロタイピング血清(serotyping serum)で、続いて1:5000希釈のヤギ抗ウサギ抗血清(シグマ−アルドリッチ)でプローブし、そしてNBT/BCIP(ロシュ モレキュラー バイオケミカルズ)で発色させた。
カンピロバクター細胞からのグリカンの検出のための実験手順
細菌株および成長条件:
カンピロバクター ジェジュニNCTC11168(HS:2)は、ヒト腸炎の症例から分離された(46)、そしてParkhill等(6)により後に配列決定された。C.jejuni血清株(serostrains):HS:1(ATCC 43429)、HS:2(ATCC 43430)、HS:3(ATCC 43431)、HS:4(ATCC 43432)、HS:10(ATCC 43438)、HS:19(ATCC 43446)、HS:36(ATCC 43456)およびHS:41(ATCC 43460)は、ATCCから取得された;C.jejuni HS:23は、Peggy Godschalk博士(エラスムス大学医療センター、ロッテルダム)から入手された;C.jejuni OH4382およびOH4384は、ヘルスカナダ(Health Canada)から入手された;並びにC.coli HS:30(NCTC 12532)は、NCTCから入手された。全カンピロバクター株を、ミュラーヒントン寒天(ディフコ)上で微好気性条件下(37℃)でルーチン的に成長させた。
C.jejuni NCTC11168突然変異体を、ミュラーヒントン寒天に30μg/mLカナマイシンを有する培地で成長させた。
部位特異的突然変異体の構築およびキャラクタリゼーション:
C.jejuni NCTC11168 kpsM(12)およびpglB(13)突然変異体の構築は、既に記載されている。
1つの寒天プレートから一晩成長させたC.jejuni(〜1010細胞)を、収穫し、そして1mLの10mMカリウム緩衝生理食塩水(potassium buffered saline)(pH7)(10%アジ化ナトリウム(w/v)を含有しているD20で作出された)中に懸濁した。前記懸濁液を1h、室温でインキュベーションして、前記細菌を殺傷した。前記細胞を、遠心分離(7500 x g、2min)により沈殿させ、そして10mMカリウム緩衝生理食塩水(D20中)で1回洗浄した。前記ペレットを、20μLのD20を添加することにより再懸濁させた。次に40μLの前記懸濁液を分析のためにローター(rotor)に挿入した。
HR−MAS NMR分光学:
HR−MAS実験を、Varian Inova 600MHz分光計にVarian nano−NMRプローブを備えた装置を用いて、以前に記載されたとおりに実施した(12,13)。40μLサンプルからのスペクトルを、3KHzでスピンさせ、そして外界温度(ambient temperature)(21℃)で記録した。実験を、HODシグナル(4.8ppmで)の抑制により実行した。
細菌細胞のプロトン スペクトルを、Carr−Purcell−Meiboom−Gill(CPMG)パルス シークエンス[90−(τ−180−τ)n−acquisition](34)で獲得して、脂質および固体様物質(solid−like material)から生じる広幅なライン(broad lines)を除去した。CPMGパルス(n*2τ)の全体の継続時間は、10msにτセットから(1/MASスピン比率)を伴っていた。1次元の選択的なTOCSY実験(30−150msの多様なスピン−ロック時間を有する)および選択的なNOESY(100−400msの混合時間を有する)を、以前に記載されたとおり実施した(25,35)。MAS条件下での使用のために、TOCSYシークエンスを、DIPSI−2混合シークエンスが断熱性(adiabatic)WURST−2パルスで置換されるように修飾した(13)。選択的な実験を、EXP〔選択されたスピン(selected spins)、選択励起バンド幅(selective excitation bandwidth)、混合時間(mixing time)〕として記載した(ここでEXPはTOCSYまたはNOESYである)。典型的には、細菌細胞のプロトン スペクトルは、256から1024トランジェント(transients)(15minから1時間)を用いて、取得できるであろう。細菌細胞においてマイナーなコンポーネントとして存在するN連結型グリカン共鳴においての選択的実験(selective experiments)に関して、各TOCSYおよびNOESYに関する前記時間は1から8時間まで変化していた。
PEB3タンパク質(Cj0289c)は、グリシン抽出物の2Dゲル中に、ペプチドマスフィンガープリント法により、pH9−10の範囲内に集束しているスポットの群のコンポーネントとして、同定された(結果示さず)。PEB3は、前記抽出物から陽イオン交換クロマトグラフィーで精製され、そして同じカラム上で再分画されて(より浅い塩化ナトリウムの勾配を用いて)、結果的に前記PEB3は3つのフラクションに出現した(図1)。SDS−PAGE分析により、2つのバンドが示された。前記バンドのN末端配列は、前記バンドをPVDF膜へと転写した後に決定された。10サイクルのシークエンシングにより、低質量の種(lower mass species)がPEB3と同定された。一方で、高質量(より豊富なコンポーネント)もPEB3であって、PEB3にPEB4(Cj0596)に対応する若干の配列(a minor sequence)を有するものであった。
マススペクトルおよびフラクション#31に関する再構築された分子量プロファイルを、図2a)およびb)に示す。3つのピークが、再構築された分子量プロファイルにおいて観察された。25,454 Daおよび28,376 Daでのピークは、それぞれPEB3(25,453 Da、Cj0289c)およびPEB4(28,377 Da、Cj0596)の推定上の分子量と良く一致した(シグナルペプチドなし)。質量26,861 Daのタンパク質を同定するため、CapLC−MS/MS分析を本フラクションのトリプシン消化物に関して実行した。同定されたペプチドの1つを除いた全てを、PEB3またはPEB4に帰属させることが可能であった(N末端配列データと一致して)。未同定のイオンのMS/MS分析(図3a)により、それがグリコペプチドであることが明瞭に同定された。HexNAc(203Da)の連続的な欠損(sequential losses)を構成するフラグメンテーションシリーズ(fragmentation series)および単一のHex(162Da)が、本スペクトルにおいて観察できる。トリプシンペプチド(tryptic peptide)は、68 DFNVSK 73と同定された(PEB3より)。このグリコペプチドのオリゴ糖部分の残基質量(residue mass)は1406Daであり、これはPEB3の分子量および未知のタンパク質ピーク(図2bにおいて観察される)における差とよく対応している。従って、約50%のPEB3タンパク質(このフラクション中の)は、単一のオリゴ糖(5HexNAcs、1Hexおよび228Daの残基質量を有する異常な糖から構成される)で修飾されたと思われる。そのうえ、MS/MSスペクトルは、オリゴ糖が228Daの糖部分(sugar moiety)を介して前記ペプチドに連結していることを指摘した。
実施例2 グリコペプチド結合(glycopeptide linkage)のキャラクタリゼーション
PEB3トリプシンペプチド(これに前記オリゴ糖が付着している)は、N−および0−結合(即ち、AsnおよびSer)の両方に対する部位を含有している。従って、この結合の素性(nature)を決定するための更なる実験を実行することが必要であった。以前、我々はβ脱離(β−elimination)を使用して、0−連結型の炭水化物を、C.jejuni81−176のフラジェリン(flagellin)から除去した(5)。しかしながら、この手順は、この事例において前記オリゴ糖の除去に失敗した。このことは、前記オリゴ糖がN連結型であるとの我々の最初の指摘であった。このことは、無傷の(intact)グリコペプチドのフロントエンド衝突誘起解離により産生された、単一的にプロトン化したフラグメント イオン(m/z 937.0での)のMS/MS分析により確認された(図3b)。このイオンは、トリプシンペプチド プラス 異常な(unusual)228Da糖のみから構成されている。特定のイオンがm/z 605.1で観察された。これはb3フラグメント イオン プラス 228Da糖部分にのみ帰属できた。フラグメント イオンは観察されず、炭水化物がセリン残基に連結していることが示唆された。この証拠の全ては、前記オリゴ糖が前記ペプチドにAsn70で連結していることを強く示唆している。
興味深いことに、このペプチドは、真核生物のN−結合コンセンサス シークオン(consensus sequon) Asn−Xaa−Serを含有している。
実施例3 糖タンパク質の単離および同定
推定上の糖タンパク質を、SBAアフィニティークロマトグラフィーで、40g湿重量の細胞のグリシン抽出物から精製した。推定上の糖タンパク質の収量(yield)は、UV吸光度(280nmでの)により推定されたとおり5mgであった。
GalNAc溶出物を、1Dおよび2D−PAGEに供試し(図4)、この様式で精製されたタンパク質がレクチン結合特性(非特異的な結合特性ではなく)を有していることを確立した。また、ウエスタンブロット法(SBA/アルカリホスファターゼ抱合体での)を実施した。約13のタンパク質種を、1D SDS−PAGEに続いて視覚化した。しかし、この数は、前記産物が2D−PAGEにより分析された場合、実質的に増加した。個々のバンド(1D SDS−PAGEからの)およびスポット(2D−PAGEからの)中のタンパク質を、マスフィンガープリント法およびデータベース検索により同定した(表I)。同定されたタンパク質のなかには、以前Linton等により同定された、PEB3(Cj0829c)およびCgpA(Cj1670c)が認められた(8)。Cj1670cおよび他のタンパク質により同一のplsで提示されたスポットの、垂直方向のパターンは、様々な程度の糖鎖形成を指摘しているようである。というのもそれらの予想されたアミノ酸配列(C.jejuni NCTC11168(6)の全体のゲノム配列に由来する)の調査(examination)が、複数の潜在的なN−連結した糖鎖形成部位(シークオンAsn−Xaa−Ser/Thrを含有する)の存在を明らかにしているからである(表I)。事実、Cj1670cを含有しているインゲル消化物の抽出物のMS/MS分析は、6つのN−連結部位のうち3つが、様々な程度に占有されることを指摘した(3つのCj1670cグリコペプチドはcapLC−MS/MSにより検出された、即ち: 7TDQNITLVAPPEFQKEEVK25、77VLDVSVTIPEKNSSK91および92QESNSTANVEIPLQVAK108である。また、単一のグリコペプチドが、Cj0114(71LSQVEENNQNIENNFTSEIQK91)に関して及びCj0200c(1DSLKLEGTIAQIYDNNK17)に関しても観察された。さらにまた、全てのそれらのグリコペプチドのグリカンコンポーネントの質量および組成は、PEB3に関して観察されたものと同一であると思われる。
しかしながら、2D−PAGEから同定された特定のタンパク質、特にCj0147c、Cj0169、Cj0332c、Cj0334、Cj0638c、Cj1181cおよびCj1534cは、任意のこれらの特定のシークオンス(sequons)を、彼らのアミノ酸配列中に含有していない。これらのタンパク質の何れもが、非共有結合性にSBA結合タンパク質と相互作用するか又は非特異的に前記カラムに結合する。この結論は、これらのタンパク質スポットがSBA/アルカリホスファターゼ抱合体と反応しない(2D PAGEおよび電気ブロッティング後)との失敗により支持される(表I)。
実施例4 グリコペプチドの調製
混合した糖タンパク質サンプルを、2ラウンドのプロナーゼ消化に供試した、そして産物をゲル濾過(BioGel P4)で分離した(図5a)。炭水化物含有フラクションを、質量分析により決定した、NMR試験後(以下を参照)、前記サンプルをBioGel P2上で再精製した(図5b)。最終的な精製サンプルは、単一のAsnに連結したオリゴ糖から主に構成されていた。グリカンコンポーネント(glycan component)において如何なる変化の証拠も存在していなかった。グリコペプチドの収量は、約200μgであると推定された。
実施例5 単離された七糖類の調製
実施例4(式I)において同定された七糖類部分(heptasaccharide moiety)は、既知の方法で単離することにより取得し得る。例えば、アミノ酸部分(Asn)を、実施例4において調製されたオリゴペプチドから、当該技術分野において周知の酵素的または化学的な加水分解により切断し得る。本発明者等は上記の工程を実施しなかったが、係る工程を実施して前記七糖類を単離し得ることが明らかであろうことが注目される。また、前記七糖類は、前記糖タンパク質から直接取得できる(グリコペプチドを経由することなく)。また、この切断は、酵素的または化学的な加水分解により実施できる。例えば、Patel等(41)は、係る切断に関してヒドララジン(hydrazine)の使用を教示している。
実施例6 NMR分光学
精選された方法(selective methods)を使用したので、不純物のあるP4サンプルで作業可能であった。糖部分の完全な共鳴帰属(resonance assignment)を、更なる精製に際するグリコペプチドの損失の恐れがあるため、このサンプルで実施した。P2カラムを用いた第二の精製後、25%のグリコペプチドが損失した(P4およびP2精製サンプルに関するS/N比の測定により判断された)。HMQC実験を、P2精製サンプルで再試験して、P4精製サンプルを用いて取得した帰属を確認した。質量分析の結果、前記グリコペプチドは、5HexNAc残基、Hex残基、および未知の糖(質量228Daを有する)から構成されていた。HexNAcおよびHex残基の絶対配置(absolute configuration)は、化学分析によりDであると決定された。1Hおよび13C NMRデータの分析により、アルファベット順にラベルされた8アノマープロトン(8 anomeric protons)の存在が指摘された(図6)。アノマー共鳴に関する一連の1D TOCSYを、プロトンの帰属(proton assignments)に関して実施した(図7)。異なる混合時間(mixing times)を使用して、各残基内のスピンを帰属させた。HMQCおよびHMBCを使用して、次に13C共鳴を帰属させた。NMR帰属を表IIに示す。1D NOESY実験(図7)を使用して、示されるシークエンスを取得した(図6)。
残基gは、β−D−Glcpと帰属された。144msの混合時間によるg1の1D TOCSY(図7a)に関して、H6およびH6’共鳴までの全てのスピンを検出した(β−グルコピラノースの典型的な、大きいJH, Hカップリングの表示)。また、共鳴g1はf2とオーバーラップし、これによりf1からf4共鳴の検出を可能にする。残基gは末端(terminal)であった(C2からC6に関する13Cおよび1H化学シフトの、β−D−グルコピラノースのものに対する類似する結果から)(36)。
5つの残基(a、c、d、e、およびf)は、α−D−GalpNAcと同定された。J1, 2の3.6+/−0.2Hz(強いH1−H2 NOE(図7))、およびJH, Hカップリングパターン(H4に対する小さいカップリングを含む(図7))の値により、それらのユニットがα−D−ガラクトピラノシル配置を有することが示された。e1およびf1のアノマー共鳴は狭いバンド幅(10Hz)で選択的に励起されうるが、e1およびf1の連続的な励起(simultaneous excitation)に関するスペクトルは図7bに示される。
また、共鳴f2からf4は、g1f2の1D TOCSYに対して検出された(図7a)。51ppmに近いC2に関する化学シフトは、アセトアミド基の表示(indicative)であった。(C2,H4)HMBC相関を使用して、5つのGalNAc残基のC2共鳴を帰属させた。1D TOCSY−NOESY(H1,H4)を使用して、NOE(H4およびH5の間の)を検出し、H5共鳴を帰属させた(25)。1D−TOCSY実験(H5共鳴において)を、次に使用してH6s共鳴を検出した(示さず)。P2精製サンプルの統合(図6b)は7NAc基を指摘した、それらのうち5つは5つのGalNAc残基に相当している。
GalNAcユニットの13C化学シフトとα−D−GalpNAcのものとの比較により、残基a、c、e、fがO−4で連結していることが指摘された(C4に関する低磁場シフトによる)(37)。残基fが分岐点(O−3で)を有していたことが、C3に関する低磁場変化(downfield shift)により樹立された。残基dは末端(terminal)であった(C2からC6に関する13C化学シフトの、α−D−GalpNAcのものに対する類似する結果から)(37)。
残基bは、β−D−バシロサミン(2,4−ジアセトアミド−2,4,6−トリデオキシ−β−D−グルコピラノース)に帰属された。残基bおよびcに関して、アノマー共鳴(anomeric resonances)が部分的にオーバーラップした。b1およびc1共鳴(144msの混合時間を有する)の1D TOCSYに関して(図7e)、広い共鳴がCH3共鳴(b6)まで1.14ppmで同定できた。1.14ppmでのb6(66msの混合時間を有する)の1D TOCSYに関して(図7d)、b4までのピークが観察された。
異なる混合時間(30msから144msまでの)を有する、一連の1D TOCSYを実施して、ピークを帰属させた。残基bに関して、広いピークは、カップリング定数(coupling constants)を提供しない。しかしながら、b1の1D TOCSY(144msの混合時間を有する)に関して、H6までの共鳴が観察できた(β−Glcp(残基g)のH1に対する1D TOCSYと類似する)。それ故、このような効率的な伝達は、β−グルコピラノシル配置に典型的な、大きいカップリング定数の表示であった。b1−b3およびb1−b5 NOEs(図7kにおいて観察された)も、典型的なβアノマーの配置であった。C2およびC4に関する化学シフト(55および58ppmでの)は、アセトアミド基の表示であった(前記構造における7NAc基の存在と一致する)(図6a)。化学シフト(C1に関して、79ppmおよびH1 5.1ppm)は、β−GlcNAc−Asnに関して発見されたものに類似する、N−連結型アノマーを表示した(20)。残基bの化学シフトと2,4−ジアミノ−2,4,6−トリデオキシ−β−D−グルコピラノース(他の構造において発見された)の化学シフトとの比較により、BacがO−3(唯一可能なグリコシド化部位)で連結したことが指摘された(38−40)。
残基bの絶対配置が、NOEsによって取得された(バシロサミンを含有している別の構造に関して以前記載されたように)(38)。1.14ppmでのCH3共鳴(b6)および1.95ppmでのNAcの間で観察された強いNOEは、CH3基(C6での)のNAC−CH3基(C4での)に対する密接な近接性によるものであった。NAc共鳴(1.95ppmでの)は他のNAC共鳴から分離されていたので、それを選択的に励起できた。強いNOEが、このNAc共鳴と残基aのα−D−GalpNAc H1共鳴との間で観察された。これは(1−3)b結合による(以下に示されるとおり)。残基bがD−配置(残基bのC4でのNAc基が、残基aのアノマープロトンの近くに近接(3Å)する)を有する場合のみ、このNOEが発生し得る。残基bがL−配置を有する場合、このNOEは可能ではない(H1a/4b−NAcプロトン間 距離が5Åよりも大きいので)。
実施例7 pglB突然変異体のキャラクタリゼーション
pglB突然変異体を、カセット突然変異誘発により構築した(図8)。
突然変異体細胞のグリシン抽出物により、タンパク質の免疫反応性における劇的な変化が実証された(2D−PAGEと共にHS:2セロタイピング血清でウエスタンブロット法を行うことによって)(図8b、e)。2Dゲル上の移動度および/または免疫反応性において変化を示した、タンパク質のいくつかを、マスフィンガープリント分析により同定した(表I)。タンパク質同定はSBAレクチンアフィニティークロマトグラフィーにより同定されたものと一致し、このことによりGalNAcレクチンと反応性のタンパク質が、Pgl経路によりグリコシル化されることに関する更なる証拠が提供される。SBA反応性タンパク質の完全なセットは、本実験では観察されなかった。というのも前記実験は、全グリシン抽出物(whole glycine extracts)で且つ異なるpH範囲で実施されたからである(即ち、図4および8は直接的に比較できない)。加えて、PEB3は、pglB突然変異体からイオン交換クロマトグラフィーで精製された(上記のとおり)。そして、質量分析法による分析により、タンパク質が前記グリカンを完全に欠損していることが示された(図2c、d)。
pglB突然変異が糖タンパク質の糖鎖形成にのみ影響することを示すため、分析を前記突然変異体のリポオリゴ糖および莢膜多糖類に関して実施した。プロテイナーゼK消化物のデオキシコレートPAGE(Deoxycholate−PAGE)および質量分析により、突然変異体LOSコア(the mutant LOS core)の質量が野生型のものと同一であったことが示された(結果示さず)。加えて、同一の莢膜の反復(capsular repeats)は、野生型および同質遺伝子的な突然変異体(isogenic mutant)の細胞の抽出物のデオキシコレートPAGE上で可視であった。カプセル(capsule)が不変(unaltered)であったことを更に実証するために、我々は前記ポリ多糖をHR−MAS NMRにより試験した。
前記突然変異体のスペクトルは、野生型のものと比較して不変(unchanged)であった(結果示さず)。
実施例8 細胞全体におけるN連結型グリカンのHR−MAS NMRによる検出
完全な(intact)カンピロバクター細胞のHR−MAS NMRスペクトルにおいて(図9)、共通の1H共鳴のセットが検出された。我々は、以前にC.jejuni NCTC11168のN連結型グリカンの構造を、MSおよびnano−NMR技術を用いて、七糖類であると決定した(13)。C.jejuni NCTC11168、NCTC11168 kpsM−、C.jejuni HS:19およびC.coli HS:30のHR−MASスペクトルにおいて観察できるように、精製されたN連結型グリカンのものと一致したアノマー共鳴が観察され、このことは本グリカンが全てに共通であったことを示唆している(図9)。NCTC11168のスペクトルにおいて(図9b)、N連結型グリカンに対応する共鳴は、CPSからの共鳴およびオーバーラップしたアノマー共鳴のいくつかと比較して、より低い強度であった。しかしながら、莢膜の共鳴がNCTC11168 kpsM突然変異体において排除される場合、それらは明瞭に区別できるだろう(図9c)。共通のグリカン共鳴のN連結型グリカンに対する帰属(assignment)は、NCTC11168 pglB突然変異体(ここではタンパク質糖鎖形成が消失している)のスペクトルを試験することにより更に確認できた(3, 13)。予想どおり、N連結型グリカンの共鳴は、この突然変異体のNMRスペクトルにおいて観察できなかった(図9f)。
推定上の共通グリカン(the putative common glycan)の同一性を、選択的なTOCSYおよびNOESY実験を用いて更に確認した(図10)。実験をC.jejuni HS:19細胞を用いて実施した(というのもN連結型グリカンのアノマー共鳴が明瞭に観察できたからである)。標準の選択的なNOESY実験(HS:19におけるa1共鳴の選択的な照射で開始される)により、4.21ppmでの共鳴との相関が確認された(図10a)。この共鳴は、精製したグリコペプチドのa1共鳴に関するNOESYスペクトルにおいて観察されたa2共鳴と同じ化学シフトを有している(図10b)。
HS:19と精製されたN連結型グリカンとの間の、他のアノマー共鳴に関するNOEパターンの比較により、2セットの実験間の類似する一致が明瞭に示された(図10c−f)。NOE実験により、イントラおよびインター残基相関(intra− and inter−residue correlations)の双方が明らかにされた。この一致は、共通グリカンのシークエンスが、以前に報告された精製されたN連結型グリカンのものと同一であることを示唆している(13)。選択的なTOCSY実験(g1およびf2オーバーラップ共鳴を4.5ppmで照射する)により、g2およびf3共鳴に対応する交差ピーク(cross peaks)が生じた(図10g)。それらの多重線形状(multiplet shape)および化学シフトは、精製されたN連結型グリカンに関する、対応する実験において観察されたものと一致していた(図10h)。観察された他の共鳴は、より強いCPS共鳴の部分的な励起によるものであった。従って、細菌細胞で実施した選択照射実験により、共通のN連結型グリカンのインサイチューでの同一性が確認された。
多様なカンピロバクター種のHR−MASプロトンNMRスペクトルにおけるN連結型グリカンの検出を、図11に示す。N連結型グリカンの構造を、前記スペクトルの上部に示す。C.jejuni NCTC11168における精製されたN連結型グリカンのスペクトル(aからgとラベルされたアノマー共鳴を示し、垂直方向の点線で示した共通の共鳴を有している)を、比較のために示す。細胞全体(whole cells)の10ms CPMGフィルターを用いたHR−MAS NMRスペクトルが示される;該細胞は、C.coli HS:30(NCTC 12532、ブリュッセルのブタから単離された)、C.coli 423(アルバータのニワトリから単離された)およびC. fetus ssp. venerealis Biotype A(NCTC 10354、雌ウシの膣粘液から分離された)である。HOD共鳴(4.8ppmでの)は、飽和され(saturated)、デジタル方式でフィルターされた。
図12は、高分解能マジック角スピニングNMR(high resolution magic angle spinning NMR)を塩化コバルトの有り無しで実施して、N連結型Pglグリカンの表面暴露を実証した図である。各々におけるトップスペクトル(top spectrum)は、CoCl2が添加されたサンプルからのものである。それらは、同じく処理された。トップスペクトルの信号雑音比(S/N)が、各々のボトムスペクトルのものよりも非常に低いことに注目すべきである。前記スペクトルはT2フィルターで効率的に取得されるので、それゆえCoCl2で広げられたラインは弱く出現する。kspM突然変異体に関して、3.15ppmに近いピークが非常に異なる相対強度を3ppmに近いピーク(s)に対して呈したことに注目すべきである。3.15ppmに近いピークに関する絶対的なS/N(CoCl2の有り/無し)はほぼ同じであるが、一方で3ppmでのピークに対する絶対的なS/Nは非常に異なっている。
このことは次のこと、即ち、3.15ppmでのピークは、内部(internal)である可能性が高く、CoCl2に対して有効(available)ではないことを指摘している。このように、外部(external)の残基は、強度が有意に減少している。
HS:19の場合において、同じ観察が3.15ppm 対 3ppmのピークに関してなされる。更に、〜2.7および〜2.85ppmでのアスパラギン酸ピーク(Szymanski et al, JBC, 2003を参照されたい)は、CoCl2の存在下で消失する。このことにより外部表面または中間部(medium)に暴露される残基が広げられた(broadened)ことが確認される。N−連結型Pglグリカン共鳴(Szymanski et al, JBC, 2003および図9を参照されたい)は、CoCl2の存在下で基本的に消失するので、このことはそれらも細胞表面に存在することを指摘している。
抗体およびワクチンの調製および投与
本発明によるグリカン部分に特異的に結合する、抗体又はその抗原結合性フラグメント(antigen−binding fragments thereof)は、従来の方法で生産し得る。例えば、マウスモノクローナル抗体は、式I(フラグメントを含む)のグリカン(随意にオリゴペプチドまたはアミノ酸または免疫原性の抱合体に連結された)に対して産生し得る。別の戦略は、ラクダのリンパ球に由来し且つdAb抗体フラグメントを発現する能力を有する、クローン化された遺伝子の既存ライブラリー(pre−existing library)を、パン(pan)して、選択した抗原に対して免疫原性活性を有しているフラグメントを発現する能力を有する遺伝子を同定および単離することである。このように単離された遺伝子(s)は、バクテリオファージライブラリー(この遺伝子を含有するように修飾された)において発現されてもよい。係る抗原は、上記の七糖類または係る七糖類のフラグメント(随意に上記のとおりアミノ酸、オリゴペプチドまたは他の抱合体と連結される)を含んでいてもよい。この方法は、米国特許番号5,759,808(Castermanらに対する)に記載される。なお更なる戦略は、前記遺伝子を、選択された抗体またはフラグメントを発現させるために、適切な植物のゲノムに導入することである;これにより次に家畜の食物源として機能し得る。係る植物は、抗体または抗体フラグメントを発現するだろう、そして家畜により消費される際に、抗体またはフラグメントの適切な用量を動物に配送するだろう。
本発明のグリカンに特異的に結合する抗体またはフラグメントを産生するための様々な方法が存在することが理解される。係る抗体フラグメントを、完全抗体(a complete antibody)と独立して(independently)調製または産生し得る。
また、抗体は、係る抗体を動物(上記の実施例において同定された抗原の適切な量を投与された)の血清から単離する伝統的な手段により調製し得る。
例えば、係る方法は、米国特許5,759,808(Casterman等に対する)に記載されている。この参照文献は、独特のタイプの抗体(軽鎖を含有しない)を産生するために、ラクダ種の使用を記載している。
上記のような抗体またはフラグメントは、適切な担体と共にヒトまたは家畜に、受動免疫の形態で投与し得る。
家畜(例えば、家禽)に投与する場合、好適なアプローチは、抗体またはフラグメントを飼料(feed)または飲料水(drinking water)と共に供給することである(濃縮物中に混合すること又は植物産物(抗体または抗体フラグメントを発現するために修飾された)を供給することのいずれであれ)。別々に提供される場合、抗体またはフラグメントを、適切な担体と共に濃縮物(concentrate)として、使用前に飼料または飲料に混合するために供給し得る。
家畜に投与される係る抗体またはフラグメントは家畜に存在するカンピロバクターと戦い、このようにして家畜を、動物生産物を食し且つ取り扱うヒトに伝播性の病原体の伝播から防御(preventing)し、同様に地下水を動物の排泄物から保護する。
また、これらの抗体およびフラグメントを使用して、ヒトまたは動物におけるカンピロバクター細菌の存在を、従来の手段により診断し得る。同様に、それらをアッセイのコンポーネントとして使用して、サンプル(例えば、水、土壌または肥料)におけるカンピロバクターの存在を決定し得る。
七糖類またはフラグメント(任意にアミノ酸、オリゴペプチドまたは他の適切な抱合体と連結された)を、ワクチンとして投与するための、適切なアジュバンドおよび免疫賦活薬(immunostimulants)と組み合わせてもよい。このような目的に対して、1以上の適切な用量が、従来の様式で投与される。
Bac, バシロサミン, 2,4−ジアセトアミド−2,4,6−トリデオキシ−D−グルコピラノース;
capLC−MS/MS, キャピラリー液体クロマトグラフィータンデム型質量分析(capillary liquid chromatography−tandem mass spectrometry);
CE, キャピラリー電気泳動法;
CPMG, Carr−Purcell−Meiboom−Gill;
CPS, 莢膜多糖類(capsular polysaccharide);
COSY, 相関分光法(correlated spectroscopy);
DIPS−2, スカラー結合(scalar interactions)の存在下におけるデカップリング;
ESI−MS, エレクトロスプレーイオン化 質量分析;
GBS, ギラン−バレー症候群(Guillain−Barre Syndrome);
HMBC, 異核間の複数の結合にわたる相関(heteronuclear multiple−bond correlation);
HMQC, 異核間の複数の量子にわたる相関(heteronuclear multiple quantum correlation);
HR−MAS, 高解像度マジック角スピニング(high−resolution magic angle spinning);
LOS, リポオリゴ糖(lipooligosaccharides);
LPS, リポ多糖(lipopolysaccharide);
MALDI−TOFMS, マトリックス支援レーザー脱離 飛行時間型質量分析(matrix assisted laser desorption time−of−flight mass spectrometry);
MAS, マジック角スピニング(magic angle spinning);
MLEV−17, Malcolm Levitt’sカップリングサイクル;
MS−質量分析
MS/MS−タンデム型質量分析
NOESY, 核オーバーハウザー効果分光法;
PVDF, ポリビニリデン ジフルオライド(polyvinylidene difluoride);
SBA, ダイズ凝集素(soybean agglutinin);
TOCSY, 全相関分光法(total correlation spectroscopy);並びに
WURST−2, 広帯域(wideband), 均一割合(uniform rate), およびスムース トランケーション(smooth truncation)。
表I
b 2DゲルのウエスタンブロットにおけるSBAとの反応性。
c 2Dゲルでの変化したスポット位置および/または免疫反応性を有するタンパク質(pglB突然変異体における)。Cj1018c&Cj1643は、SBAクロマトグラフィーで単離されなかった。
d CapLC−MS/MSで観察されたグリコペプチド。
表II
C. jejuni Asn結合型 グリコペプチドの化学シフト(ppm)。
600MHz(1H) D20中、35℃ HOD 4.67ppmで測定した。dH 2.23ppmおよびdc 31.07pppmでの外部アセトンメチル共鳴。dcにおけるエラーは±0.2ppm、またdHに関して±0.02ppm。dH2.07、2.05、2.04、2.03、2.02、2.02および1.95ppmでの7つのNAc共鳴。23.1−23.4ppmでのNAc−CH3 dc。175−176ppmでのNAc−CO dc。
Claims (32)
- 式 GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,4−[Glc−β1,3]GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,3−Bac,の七糖類を含む化合物であって、
前記Bacは、2,4−ジアセトアミド−2,4,6−トリデオキシ−D−グルコピラノース又はその免疫学的に活性なフラグメントである化合物。 - アミノ酸またはオリゴペプチドと連結された、請求項1記載の化合物。
- 前記アミノ酸がアスパラギンである、請求項2記載の化合物。
- カンピロバクター細菌から単離および精製された糖タンパク質に由来する、請求項1、2または3の何れか1項に記載の化合物。
- 請求項4記載の化合物であって、前記細菌が、C.jejuni、C.coliおよびC.fetus ssp. Venerealisから選択される化合物。
- 細菌の糖タンパク質のグリカン部分を検出する方法であって、前記サンプルを高分解能マジック角スピニング 核磁気共鳴(HR−MAS−NMR)分光学に供試することを含む方法。
- 請求項1〜5の何れかに記載の化合物および生理学的に許容される担体を含む薬学的組成物。
- 請求項7記載の薬学的組成物であって、免疫原性の抱合体を更に含む薬学的組成物。
- 請求項7または8記載の薬学的組成物であって、免疫賦活薬を更に含む薬学的組成物。
- 請求項7から9の何れか1項に記載の薬学的組成物の、動物またはヒトにおけるワクチンとしての使用。
- 式 GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,4−[Glc−β1,3]GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,4−GalNAc−a1,3−Bac,のグリカンを含む化合物と特異的に結合する、抗体または抗体の抗原結合性フラグメントであって、
前記Bacは、2,4−ジアセトアミド−2,4,6−トリデオキシ−D−グルコピラノース又はその免疫学的に活性なフラグメントである、抗体または抗体の抗原結合性フラグメント。 - 請求項1から65の何れかに記載の化合物と特異的に結合する、抗体または抗体の抗原結合性フラグメント。
- 請求項1から65の何れか1項に記載の化合物と特異的に結合する、抗体または抗体の抗原結合フラグメントであって、ラクダから単離した遺伝子に由来する抗体または抗体の抗原結合性フラグメント。
- 請求項13記載の抗体又はその抗原結合性フラグメントであって、前記ラクダが、Camelus bactriamus、Camelus dromaderius、Lama pPaccos、Lama ggGlamaおよびLama vVicugnaから選択される、抗体又はその抗原結合性フラグメント。
- 請求項11から14の何れか1項に記載の抗体または抗原結合性フラグメント、および生理学的に許容される担体を含む薬学的組成物。
- 請求項15記載の薬学的組成物の、ヒトまたは動物における治療薬としての使用。
- カンピロバクター病原体の存在を家畜から減少させる方法であって、前記家畜に請求項11から15の何れか1項に記載の抗体または抗原結合性フラグメントを投与することを含む方法。
- 請求項17記載の方法であって、前記投与が、前記家畜に前記抗体または抗原結合性フラグメントと混合した飼料を給餌することからなる方法。
- 請求項17または18記載の方法であって、前記家畜が家禽である方法。
- ヒトにおけるカンピロバクター病原体により生じるカンピロバクター感染を阻止する方法であって、前記病原体を家畜から請求項17記載の方法により除去することを含む方法。
- ヒトまたは動物におけるカンピロバクター病原体により生じる病気を治療する方法であって、請求項11から14の何れか1項に記載の抗体または抗原結合性フラグメントを投与することを含む方法。
- カンピロバクター病原体による地下水汚染を阻止する方法であって、前記病原体の存在を家畜から、請求項17記載の方法により減少させることを含む方法。
- 家畜のための動物飼料または飲料(animal feed or drink)であって、請求項11から14の何れか1項に記載した、抗体または抗原結合性フラグメントを含む動物飼料または飲料。
- 前記抗体またはフラグメントを含む添加物(additive)を含む、請求項23記載の飼料または飲料。
- 請求項23記載の飼料であって、修飾されて前記抗体またはフラグメントを発現するゲノムを含有している植物を含む飼料。
- 請求項11から14の何れかに記載の抗体または抗体フラグメントを発現する能力を有する遺伝子を含有している植物ゲノム。
- 請求項26記載のゲノムを含有している植物細胞。
- 請求項27記載の細胞を含有している植物。
- 前記遺伝子が、ラクダ遺伝子(camelid genes)のライブラリーを、請求項1から5に記載の化合物を含むプローブで、前記抗体フラグメントを発現する能力を有するラクダ遺伝子に関してパニングすることと、および前記遺伝子を植物ゲノムに導入することとにより取得される、請求項26記載の植物ゲノム。
- カンピロバクターの存在を動物またはヒトにおいて検出するための診断用キットであって、請求項11〜14の何れかに記載の抗体または抗体フラグメントを含む診断用キット(diagnostic kit)。
- カンピロバクターの存在をサンプルにおいて検出するための診断用キットであって、請求項11〜14の何れかに記載の抗体または抗体フラグメントを含む診断用キット(diagnostic kit)。
- 前記サンプルが水、土壌、および肥料から選択される、請求項31記載のキット。
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013519737A (ja) * | 2010-02-11 | 2013-05-30 | ザ・ガバナーズ・オブ・ザ・ユニバーシティー・オブ・アルバータ | N結合型グリカン化合物 |
JP2013224867A (ja) * | 2012-04-20 | 2013-10-31 | Shimadzu Corp | 糖ペプチドの質量分析法 |
JP2018509176A (ja) * | 2015-01-26 | 2018-04-05 | カデナ・バイオ・インコーポレイテッド | 動物飼料として使用するためのオリゴ糖組成物及びその生成方法 |
JP2021507959A (ja) * | 2017-12-19 | 2021-02-25 | ザ・ガバナーズ・オブ・ザ・ユニバーシティー・オブ・アルバータ | ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)表面グリカンおよびその使用 |
Families Citing this family (34)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7173003B2 (en) | 2001-10-10 | 2007-02-06 | Neose Technologies, Inc. | Granulocyte colony stimulating factor: remodeling and glycoconjugation of G-CSF |
WO2004099231A2 (en) | 2003-04-09 | 2004-11-18 | Neose Technologies, Inc. | Glycopegylation methods and proteins/peptides produced by the methods |
US7214660B2 (en) * | 2001-10-10 | 2007-05-08 | Neose Technologies, Inc. | Erythropoietin: remodeling and glycoconjugation of erythropoietin |
US20050287628A1 (en) | 2002-03-07 | 2005-12-29 | Markus Aebi | System and method for the production of recombinant glycosylated proteins in a prokaryotic host |
AU2002952121A0 (en) * | 2002-10-17 | 2002-10-31 | Alchemia Limited | Novel carbohydrate based anti-bacterials |
WO2005012484A2 (en) | 2003-07-25 | 2005-02-10 | Neose Technologies, Inc. | Antibody-toxin conjugates |
US8633157B2 (en) | 2003-11-24 | 2014-01-21 | Novo Nordisk A/S | Glycopegylated erythropoietin |
US20080305992A1 (en) | 2003-11-24 | 2008-12-11 | Neose Technologies, Inc. | Glycopegylated erythropoietin |
EP1694351A2 (en) * | 2003-12-03 | 2006-08-30 | Neose Technologies, Inc. | Glycopegylated follicle stimulating hormone |
WO2006010143A2 (en) | 2004-07-13 | 2006-01-26 | Neose Technologies, Inc. | Branched peg remodeling and glycosylation of glucagon-like peptide-1 [glp-1] |
EP1814573B1 (en) | 2004-10-29 | 2016-03-09 | ratiopharm GmbH | Remodeling and glycopegylation of fibroblast growth factor (fgf) |
ES2449195T3 (es) | 2005-01-10 | 2014-03-18 | Ratiopharm Gmbh | Factor estimulante de colonias de granulocitos glicopegilado |
EP1871795A4 (en) | 2005-04-08 | 2010-03-31 | Biogenerix Ag | COMPOSITIONS AND METHOD FOR PRODUCING GLYCOSYLATION MUTANTS OF A PROTEASE-RESISTANT HUMAN GROWTH HORMONE |
AU2006245969B8 (en) * | 2005-05-11 | 2011-08-25 | Eth Zurich | Recombinant N-glycosylated proteins from procaryotic cells |
US20070105755A1 (en) * | 2005-10-26 | 2007-05-10 | Neose Technologies, Inc. | One pot desialylation and glycopegylation of therapeutic peptides |
US20090048440A1 (en) | 2005-11-03 | 2009-02-19 | Neose Technologies, Inc. | Nucleotide Sugar Purification Using Membranes |
CN101516388B (zh) | 2006-07-21 | 2012-10-31 | 诺和诺德公司 | 通过o-联糖基化序列的肽的糖基化 |
WO2008057683A2 (en) | 2006-10-03 | 2008-05-15 | Novo Nordisk A/S | Methods for the purification of polypeptide conjugates |
KR20100016160A (ko) | 2007-04-03 | 2010-02-12 | 바이오제너릭스 에이지 | 글리코페길화 g―csf를 이용하는 치료 방법 |
WO2008154639A2 (en) | 2007-06-12 | 2008-12-18 | Neose Technologies, Inc. | Improved process for the production of nucleotide sugars |
DK2240595T4 (da) | 2008-01-03 | 2019-10-07 | Cornell Res Foundation Inc | Glykosyleret proteinekspression i prokaryoter |
CN102037004A (zh) * | 2008-01-08 | 2011-04-27 | 生物种属学股份公司 | 使用寡糖基转移酶的多肽的糖缀合 |
US8895014B2 (en) | 2008-02-20 | 2014-11-25 | Glycovaxyn Ag | Bioconjugates made from recombinant N-glycosylated proteins from procaryotic cells |
ES2476690T3 (es) | 2008-02-27 | 2014-07-15 | Novo Nordisk A/S | Moléculas conjugadas del Factor VIII |
ES2646320T3 (es) | 2009-03-27 | 2017-12-13 | Eidgenössische Technische Hochschule Zürich | Salmonella enterica que presenta un N-glicano de C. Jejuni o derivados del mismo |
AU2010322454B2 (en) | 2009-11-19 | 2016-05-19 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | Biosynthetic system that produces immunogenic polysaccharides in prokaryotic cells |
US8841099B2 (en) * | 2010-04-20 | 2014-09-23 | National Research Council Of Canada | Cell-based production of nonulosonates |
CN103079591B (zh) | 2010-05-06 | 2017-07-28 | 格林考瓦因有限公司 | 荚膜革兰氏阳性细菌生物缀合物疫苗 |
US9308246B2 (en) * | 2010-05-28 | 2016-04-12 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy | Capsule composition for use as immunogen against Campylobacter jejuni |
ES2753369T3 (es) | 2013-04-05 | 2020-04-08 | Univ Alberta | Vacuna de Campylobacter |
US11898187B2 (en) | 2017-08-15 | 2024-02-13 | Northwestern University | Protein glycosylation sites by rapid expression and characterization of N-glycosyltransferases |
US11530432B2 (en) | 2018-03-19 | 2022-12-20 | Northwestern University | Compositions and methods for rapid in vitro synthesis of bioconjugate vaccines in vitro via production and N-glycosylation of protein carriers in detoxified prokaryotic cell lysates |
US11725224B2 (en) | 2018-04-16 | 2023-08-15 | Northwestern University | Methods for co-activating in vitro non-standard amino acid (nsAA) incorporation and glycosylation in crude cell lysates |
WO2022256920A1 (en) * | 2021-06-07 | 2022-12-15 | The University Of British Columbia | Acholetin biopolymers and methods for enzymatic synthesis |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH09502604A (ja) * | 1993-08-27 | 1997-03-18 | エンテリック リサーチ ラボラトリーズ インコーポレイテッド | Campylobacterjejuni抗原、並びにそれらの製造及び利用 |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4925796A (en) * | 1986-03-07 | 1990-05-15 | Massachusetts Institute Of Technology | Method for enhancing glycoprotein stability |
US5200344A (en) * | 1990-11-13 | 1993-04-06 | Blaser Martin J | Diagnostic testing for campylobacter jejuni or campylobacter coli infections using novel antigens |
DE69518246T2 (de) * | 1994-09-06 | 2000-12-21 | Ab Lund Bioflexin | Aminosäuren konjugaten |
US5840547A (en) * | 1995-01-05 | 1998-11-24 | Ramot University Authority For Applied Research & Indfustrial Development Ltd. | Bioemulsifiers |
US6676946B2 (en) * | 1997-03-27 | 2004-01-13 | Institut Pasteur | Multiple antigen glycopeptide carbohydrate vaccine comprising the same and use thereof |
US6699705B2 (en) * | 1999-02-01 | 2004-03-02 | National Research Council Of Canada | Campylobacter glycosyltransferases for biosynthesis of gangliosides and ganglioside mimics |
EP1159002A2 (en) * | 1999-03-05 | 2001-12-05 | Trustees Of Tufts College | Emulsan and emulsan analogs immunization formulations and use |
US6512014B2 (en) * | 2000-12-13 | 2003-01-28 | Ramot University Authority For Applied Research And Industrial Development Limited | Compositions containing bioemulsifiers and a method for their preparation |
EP2279755B1 (en) * | 2001-10-10 | 2014-02-26 | ratiopharm GmbH | Remodelling and glycoconjugation of Fibroblast Growth Factor (FGF) |
US20030232401A1 (en) * | 2002-06-12 | 2003-12-18 | Pugia Michael J. | Bacterial test method by glycated label binding |
JP5044754B2 (ja) * | 2005-09-21 | 2012-10-10 | アメリカ合衆国 | カンピロバクター・ジェジュニに対するワクチン成分として使用される免疫原莢膜組成物 |
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013519737A (ja) * | 2010-02-11 | 2013-05-30 | ザ・ガバナーズ・オブ・ザ・ユニバーシティー・オブ・アルバータ | N結合型グリカン化合物 |
JP2013224867A (ja) * | 2012-04-20 | 2013-10-31 | Shimadzu Corp | 糖ペプチドの質量分析法 |
JP2018509176A (ja) * | 2015-01-26 | 2018-04-05 | カデナ・バイオ・インコーポレイテッド | 動物飼料として使用するためのオリゴ糖組成物及びその生成方法 |
JP2021507959A (ja) * | 2017-12-19 | 2021-02-25 | ザ・ガバナーズ・オブ・ザ・ユニバーシティー・オブ・アルバータ | ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)表面グリカンおよびその使用 |
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