JP2005516188A5 - - Google Patents

Claims (22)

1. 色素処理が施されている標本の複数のピクセルからなるカラー画像から、各ピクセルのＲＧＢトリプレットを形成するために該画像の各ピクセルについてＲＧＢ色空間中の赤色チャネル、緑色チャネル、及び青色チャネルの各チャネルにおける前記処理済み標本の透過率を決定するステップと、
   それぞれのＲＧＢトリプレットの赤色チャネル、緑色チャネル、及び青色チャネルにおける最小透過率に応じてＲＧＢトリプレットをグループ分けするステップと、
   各グループにおいてそれぞれの正規化されたＲＧＢトリプレットを形成するために各グループのＲＧＢトリプレットを赤色チャネル、緑色チャネル、及び青色チャネルの各チャネルにおける透過率の和を求めて、和が求められた透過率のそれぞれをそれぞれのグループのＲＧＢトリプレットの数で割ることによってＲＧＢトリプレットの各グループを正規化するステップと、
   前記色素に対する対応表を作成するために、前記正規化されたＲＧＢトリプレットを、各正規化されたＲＧＢトリプレットの最小透過率に応じて透過率０％乃至１００％の間で透過率が広がるようにして表にまとめるステップと
   を含む色素をモデリングする方法。
2. 前記処理済み標本のカラー画像を形成するために、ＲＧＢカメラ及びＲＧＢ構成スキャナの少なくとも１つを有するカラー画像取込装置を使ってビデオ顕微鏡システムにおいて該処理済み標本の画像を取り込むステップを更に含む請求項１に記載の方法。
3. 前記処理済み標本の画像を取り込むステップが、ケーラー照明環境のもとに前記標本を照明するステップと、色収差補正されたビデオ顕微鏡システムで前記標本の画像を取り込むステップと、光源を用いて前記標本を照明し、赤色チャネル、緑色チャネル、及び青色チャネルの各チャネルに該標本を透過した光の透光度を測定するステップとから選ばれた少なくとも１つのステップを更に含む請求項２に記載の方法。
4. 前記対応表の中にある透過率増分値に対応する前記正規化されたＲＧＢトリプレットが存在しないときに、
   対応する正規化されたＲＧＢトリプレットが存在しない透過率増分値に関して前記対応表の中でそれより高い透過率増分値とそれより低い透過率増分値の両方において対応する正規化されたＲＧＢトリプレットを有する参照透過率増分値を特定するステップと、
   対応する正規化されたＲＧＢトリプレットが存在しないその透過率増分値に対して近似の正規化されたＲＧＢトリプレットに応じた赤色チャンネル、緑色チャンネル、及び青色チャンネルの各チャンネルの近似透過率を形成するために、前記参照透過率増分値の赤色チャネル、緑色チャネル、及び青色チャネルの各チャネルのそれぞれの透過率の間を補間するステップと
   を更に含む請求項１に記載の方法。
5. グループ内のＲＧＢトリプレット数について重要度閾値を設定し、該重要度閾値を満たせないどのグループに対してもそのようなグループに属するＲＧＢトリプレットを無意味なものとして切り捨てるステップを更に含む請求項１に記載の方法。
6. 各グループのＲＧＢトリプレットを正規化するのに先立って、それぞれの色素についての３次元ＲＧＢ表現を構成するためにＲＧＢ色空間内に前記カラー画像の各ピクセルのＲＧＢトリプレットをプロットするステップを更に含む請求項１に記載の方法。
7. ＲＧＢ色空間内を走るそれぞれの色素の特性ＲＧＢ経路を取得するために該ＲＧＢ色空間内に前記正規化されたＲＧＢトリプレットをプロットするステップを更に含む請求項１に記載の方法。
8. 前記対応表をグラフとして表現するために前記正規化されたＲＧＢトリプレットを１次元スケール上にプロットするステップを更に含む請求項１に記載の方法。
9. 請求項１〜８のいずれかに記載の方法に従って、前記複数の色素の各色素に対応表を作成するステップと、
   前記複数の色素の各色素に１次元を有し該複数の色素の組み合わせに対する参照モデルを提供する色素空間表現を構成するために該複数の色素の対応表を直交的に加算するステップと
   を含む複数の色素の組み合わせをモデリングする方法。
10. 前記複数の色素の対応表を直交的に加算するステップが、ランバート・ベールの法則に基づいて該複数の色素の対応表を直交的に加算するステップを更に含む請求項９に記載の方法。
11. 前記複数の色素の色素空間表現を色素数に応じた多次元スケール上にプロットするステップを更に含む請求項９に記載の方法。
12. 前記複数の色素の対応表を直交的に加算するステップが、前記複数の色素についての複数の合成ＲＧＢトリプレットが透過率０％乃至１００％の間に分布する組み合わされた複数の色素についての合成対応表を作成するために前記複数の色素の対応表を直交的に加算するステップを更に含む請求項９に記載の方法。
13. 少なくとも１つの分子種が標本を構成しており、各分子種はそれぞれの色素によって標示される該少なくとも１つの分子種の量をカラー画像取込装置によって取り込まれた前記標本の画像から決定する方法であって、
    請求項９〜１２のいずれかに記載の方法に従って、各色素に複数の正規化されたＲＧＢトリプレットからなるそれぞれの対応する対応表を有する複数の色素についての表現であって各色素に１次元を有しかつ該複数の色素の組み合わせに対する参照モデルを提供する色素空間表現を構成するステップと、
    前記標本は前記複数の色素の組み合わせによって処理されており、該標本の画像の各ピクセルはそれぞれのＲＧＢトリプレットによって特徴付けられるカラーを有するものであって、こうしたそれぞれのピクセルのカラーを構成する色素のそれぞれの対応表から前記正規化されたＲＧＢトリプレットの最適な組み合わせであって該組み合わせの正規化されたＲＧＢトリプレットは、それぞれの色素に応じて特定可能なものを決定するために、前記標本の画像の各ピクセルを前記複数の色素の組み合わせの前記参照モデルと比較するステップと、
    前記標本の画像上におけるそれぞれの色素の分布を標示して対応する分子種の量の決定をしやすくするために前記最適な組み合わせから決まる各色素の前記正規化されたＲＧＢトリプレットから該標本の画像に対応する人為画像を形成するステップと
    を含む方法。
14. 前記標本の画像の各ピクセルと前記複数の色素の組み合わせに対する前記参照モデルとの間の誤差をそれぞれのピクセルと該参照モデルとの間の最小ユークリッド距離として決定するステップを更に含む請求項１３に記載の方法。
15. 前記参照モデルからのどんな偏差も見つけ出すために前記画像上のそれぞれのピクセルの誤差をプロットするステップを更に含む請求項１４に記載の方法。
16. 前記画像の中に対応するピクセルによって画定されるオブジェクトを識別し、該オブジェクトが前記複数の色素の組み合わせで処理されているかどうかの判定の目安とするために該オブジェクトを構成するピクセルに対する誤差を統合するステップを更に含む請求項１４に記載の方法。
17. 前記画像の各ピクセルを前記参照モデルと比較するステップは、それぞれの色素の前記対応表内にある正規化されたＲＧＢトリプレットについて、赤色チャネル、緑色チャネル、及び青色チャネルのいずれかのチャネルにおいてその透過率が観察に基づくＲＧＢトリプレットの対応するチャネルにおける透過率を下回るものについてはどの正規化されたＲＧＢトリプレットも無視するステップを更に含む請求項１３に記載の方法。
18. 請求項１〜１７のいずれかに記載の方法を実行することが可能な少なくとも１つの実行可能部を備える、コンピューターソフトウェアプログラム製品。
19. コンピューターデバイスが、請求項１８に記載のコンピューターソフトウェアプログラム製品を処理することが可能な少なくとも１つの処理部を備える、標本内の分子種を標示する色素をその色素によって処理が施されている標本の画像からモデリングするためのシステム。
20. ＲＧＢカメラと連動して動作可能な顕微鏡とＲＧＢ構成スキャナの少なくとも１つを備えており前記コンピューターデバイスと連動して動作可能で前記標本の拡大デジタル画像を取り込むことができるように構成されたカラー画像取込装置を更に備える請求項１９に記載のシステム。
21. 前記カラー画像取込装置と前記コンピューターデバイスが、更に、協働して色収差補正されたビデオ顕微鏡システムを形成するように構成されている請求項２０に記載のシステム。
22. 更に、ケーラー照明環境において標本を照明するように前記光源を構成する請求項２０に記載のシステム。