JP2005322216A5 - - Google Patents

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  1. 大規模の蛋白質相互作用データを視覚化するために蛋白質をノード(node)として蛋白質間相互作用をエッジ(edge)とする３次元グラフを生成する大規模蛋白質相互作用データを、コンピューターを用いて表示部に効率的に視覚化表示する方法において、
    上記コンピューターの入力手段を通じて入力された上記蛋白質相互作用データの全てのノードを、上記コンピューターの制御手段により極座標の水平及び垂直角度を増加させることによって、球体(sphere)表面に配置し、初期レイアウトを生成する第1段階、及び、
    上記コンピューターの演算手段により上記初期レイアウトの各ノードを隣接ノードとのローカルスプリングフォース(local spring force)と非隣接ノードとのグローバルスプリングフォース(global spring force)を考慮して平衡位置(equilibrium position)に移動させる過程を事前に決められた回数だけ上記制御手段により反復してグラフを上記表示部に生成する第２段階、
    を含むことを特徴とする大規模蛋白質相互作用データを、コンピューターを用いて表示部に効率的に視覚化表示する方法。
  2. 上記第２段階の反復回数は、ユーザ(user)によって上記入力手段を通じて変更可能であることを特徴とする請求項1に記載の大規模蛋白質相互作用データを、コンピューターを用いて表示部に効率的に視覚化表示する方法。
  3. 上記蛋白質相互作用データが上記コンピューターの記憶装置に格納(store)されているデータベースと連動することを特徴とする請求項1に記載の大規模蛋白質相互作用データを、コンピューターを用いて表示部に効率的に視覚化表示する方法。
  4. ユーザが、上記入力手段を通じて、選択したノードに対する隣ノードとの距離レベルを一定距離までに制限することによって、上記制御手段が上記グラフを簡略化する第３段階をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の大規模蛋白質相互作用データを、コンピューターを用いて表示部に効率的に視覚化表示する方法。
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