JP2004313180A - Modified product of pyrrolo-quinoline quinone (ppq)-dependent glucose dehyrogenase excellent in substrate specificity or stability - Google Patents

Modified product of pyrrolo-quinoline quinone (ppq)-dependent glucose dehyrogenase excellent in substrate specificity or stability Download PDF

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肇庸 松村
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高英 岸本
Masanori Oka
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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To obtain a pyrrolo-quoinoline quinone-dependent glucose dehyrogenase (PQQGDH) improved in substrate specificity and/or heat stability. <P>SOLUTION: A modified PQQGDH decreased in activity on disaccharides when compared with a wild-type PQQGDH and/or a modified PQQGDH improved in stability when compared with the wild-type PQQGDH are provided, respectively. <P>COPYRIGHT: (C)2005,JPO&NCIPI

Description

本発明は基質特異性及び/又は熱安定性が改良された改変型グルコースデヒドロゲナーゼ(GDH)に関し、詳しくはピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とする改変型PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(以下PQQGDHとも略記する。)、その製造法及びグルコースセンサーに関する。
本発明の改変型PQQGDHは、臨床検査や食品分析などにおけるグルコースの定量に有用である。
The present invention relates to a modified glucose dehydrogenase (GDH) having improved substrate specificity and / or thermostability, and more particularly to a modified PQQ-dependent glucose dehydrogenase (hereinafter abbreviated as PQQGDH) having pyrroloquinoline quinone (PQQ) as a coenzyme. ), Its production method and a glucose sensor.
The modified PQQGDH of the present invention is useful for glucose quantification in clinical tests, food analysis, and the like.

PQQGDHは、ピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とするグルコースデヒドロゲナーゼである。グルコースを酸化してグルコノラクトンを生成する反応を触媒するから、血糖の測定に用いることができる。血中グルコース濃度は、糖尿病の重要なマーカーとして臨床診断上きわめて重要な指標である。現在、血中グルコース濃度の測定は、グルコースオキシダーゼを使用したバイオセンサーを用いる方法が主流となっているが、反応が溶存酸素濃度に影響されるから、測定値に誤差が生じる可能性があった。このグルコースオキシダーゼにかわる新たな酵素としてPQQ依存性グルコース脱水素酵素が注目されている。   PQQGDH is a glucose dehydrogenase using pyrroloquinoline quinone (PQQ) as a coenzyme. Since it catalyzes the reaction of oxidizing glucose to produce gluconolactone, it can be used for measuring blood sugar. Blood glucose concentration is a very important indicator for clinical diagnosis as an important marker of diabetes. At present, the measurement of blood glucose concentration is mainly based on a method using a biosensor using glucose oxidase, but since the reaction is affected by the dissolved oxygen concentration, an error may occur in the measurement value. . As a new enzyme replacing glucose oxidase, PQQ-dependent glucose dehydrogenase has attracted attention.

我々のグループは、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii) NCIMB11517株が、PQQ依存性グルコース脱水素酵素を産生することを見出し,遺伝子のクローニングならびに高発現系を構築した(特許文献1参照)。PQQ依存性グルコース脱水素酵素はグルコースオキシダーゼに比べて基質特異性、熱安定性に問題点があった。
特開平11−243949号公報
Our group found that Acinetobacter baumannii NCIMB11517 strain produces a PQQ-dependent glucose dehydrogenase, and constructed a gene cloning and high expression system (see Patent Document 1). PQQ-dependent glucose dehydrogenase has problems in substrate specificity and thermostability compared to glucose oxidase.
JP-A-11-243949

本発明は、従来技術の課題を背景になされたもので、PQQGDHの基質特異性及び/又は熱安定性を課題としてその改良に関するものである。   The present invention has been made in view of the problems of the prior art, and relates to an improvement of PQQGDH with the object of substrate specificity and / or thermal stability.

本発明者らは上記課題を解決するため、鋭意研究した結果、遂に本発明を完成するに到った。即ち本発明は、
1. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDH。
2. 野生型のグルコースデヒドロゲナーゼよりも二糖類に対する作用性が低下したことを特徴とする1.に記載の改変型PQQGDH。
3. 二糖類がマルトースであることを特徴とする2.に記載の改変型PQQGDH。
4. マルトースに対する作用性がグルコースに対する作用性の90%以下であることを特徴とする2.記載の改変型PQQGDH。
5. 二糖類に対するに対するKm値が大きくなったことを特徴とする2.に記載の改変型PQQGDH。
6. 二糖類がマルトースであることを特徴とする5.記載の改変型PQQGDH。
7. マルトースに対するKm値が8mM以上であることを特徴とする5.記載の改変型PQQGDH。
8. 二糖類に対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいことを特徴とする2.記載の改変型PQQGDH。
9. 二糖類がマルトースであることを特徴とする8.記載の改変型PQQGDH。
10. マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値の1.5倍以上であることを特徴とする8.記載の改変型PQQGDH。
11. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、グルコースやPQQとの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
12. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
13. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、67位、68位、69位、76位、89位、129位、130位、131位、167位、168位、169位、170位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、249位、300位、349位及び429位からなる群から選ばれる少なくとも1つの位置のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
14. アミノ酸置換が、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H,
Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H, L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G,L169E,A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q,
E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T, E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N,T349S,T349P,T349Y,N429F,N429P,N429L,N429Y,からなる群から選択される13.に記載の改変型PQQGDH。
15. アミノ酸置換が、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W,
L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (K89E+K300R), (Q168A+L169D), (Q168S+L169S), (N167E+Q168G+L169T), (N167S+Q168N+L169R), (Q168G+L169T), (N167G+Q168S+L169Y), (N167L+Q168S+L169G), (N167G+Q168S+L169S+L174F+K49N), (Q168N+L168N+S189R), (N167E+Q168G+L169A+
S189G), (N167G+Q168R+L169A), (N167S+Q168G+L169A), (N167G+Q168V+L169S), (N167S+Q168V+L169S), (N167T+Q168I+L169G), (N167G+Q168W+L169N), (N167G+Q168S+L169N), (N167G+Q168S+L169V), (Q168R+L169C), (N167S+Q168L+L168G), (Q168C+L169S), (N167T+Q168N+L169K), (N167G+Q168T+L169A+S207C), (N167A+Q168A+L169P), (N167G+Q168S+L169G), (N167G+Q168G), (N167G+Q168D+L169K), (Q168P+L169G), (N167G+Q168N+L169S), (Q168S+L169G), (N188I+T349S), (N167G+Q168G+L169A+F215Y), (N167G+Q168T+L169G), (Q168G+L169V), (N167G+Q168V+L169T), (N167E+Q168N+L169A), (Q168R+L169A), (N167G+Q168R), (N167G+Q168T), (N167G+Q168T+L169Q), (Q168I+L169G+K300T), (N167G+Q168A), (N167T+Q168L+L169K), (N167M+Q168Y+L169G), (N167E+Q168S), (N167G+Q168T+L169V+S189G), (N167G+Q168G+L169C), (N167G+Q168K+L169D), (Q168A+L169D), (Q168S+E245D), (Q168S+L169S), (A351T), (N167S+Q168S+L169S), (Q168I+L169Q), (N167A+Q168S+L169S), (Q168S+L169E), (Q168A+L169G), (Q168S+L169P), (P67K+E68K),
(P67R+E68R+I69C), (P67D+E68T+I69C), (E129R+K130G+P131G), (E129Q+K130T+P131R), (E129N+P131T), (E129A+K130R+P131K), (E341L+M342P+A343R), (E341S+M342I), A343I, (E341P+M342V+A343C), (E341P+M342V+A343R), (E341L+M342R+A343N), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F),
(Q168A+L169H), (Q168A+L169I), (Q168A+L169K), (Q168A+L169M), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R),
(Q168A+L169S), (Q168A+L169T), (Q168A+L169V), (Q168A+L169W)及び(Q168A+L169Y)からなる群から選択され、該アミノ酸置換により基質特異性が向上した13.に記載の改変型PQQGDH。
16. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、428位と429位の間にアミノ酸が挿入されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
17. 1.〜16.のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。
18. 17.に記載の遺伝子を含むベクター。
19. 18.に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
20. 19.に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。
21. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。
22. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。
23. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。
24. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQG
DH)よりも安定性が向上した改変型PQQGDH。
25. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が48%以上であることを特徴とする24.記載の改変型PQQGDH。
26. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が55%以上であることを特徴とする24.記載の改変型PQQGDH。
27. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が70%以上であることを特徴とする24.記載の改変型PQQGDH。
28. Acinetobacter属由来PQQGDHにおいて、20位、76位、89位、168位、169位、245位、246位及び300位からなる群から選ばれる少なくとも1つの位置のアミノ酸が置換されている、24.に記載のPQQGDH。
29. アミノ酸置換が、K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D,
L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y,L169G及びE245Dからなる群から選択される28.に記載の改変型PQQGDH。
30. アミノ酸置換が、K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S,(Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169K), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169T), (Q168A+L169Y), (Q168A + L169G), (Q168A+L169P+E245D),(Q168A+L169G+E245D) からなる群から選択され、該アミノ酸置換により熱安定性が向上した29.に記載の改変型PQQGDH。
31. 24.〜30.のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。
32. 31.に記載の遺伝子を含むベクター。
33. 32.に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
34. 33.に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。
35. 24.〜33.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。
36. 24.〜33.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。
37. 24.〜33.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。
38. 野生型酵素の活性型立体構造における活性中心から半径15Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.に記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
39. 野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
40. 基質がグルコースで有る39.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
41. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変
型グルコースデヒドロゲナーゼ。
42. 基質がグルコースである41.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
43. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
44.基質がグルコースで有る43.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
である。
The present inventors have conducted intensive studies in order to solve the above problems, and as a result, have finally completed the present invention. That is, the present invention
1. A modified PQQGDH having reduced activity on disaccharides and / or improved stability compared to wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH).
2. 1. The activity of disaccharides is lower than that of wild-type glucose dehydrogenase. 3. The modified PQQGDH according to [1].
3. 1. The disaccharide is maltose. 3. The modified PQQGDH according to [1].
4. 1. The activity on maltose is 90% or less of the activity on glucose. The modified PQQGDH as described.
5. 1. The Km value for disaccharides is increased. 3. The modified PQQGDH according to [1].
6. 4. The disaccharide is maltose. The modified PQQGDH as described.
7. 4. The Km value for maltose is 8 mM or more. The modified PQQGDH as described.
8. 1. The Km value for disaccharides is larger than the Km value for glucose. The modified PQQGDH as described.
9. 7. The disaccharide is maltose. The modified PQQGDH as described.
10. 7. The Km value for maltose is at least 1.5 times the Km value for glucose. The modified PQQGDH as described.
11. 1. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from the genus Acinetobacter, amino acids involved in binding to glucose or PQQ and / or peripheral amino acids are substituted. 3. The modified PQQGDH according to [1].
12. 1. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from the genus Acinetobacter, amino acids involved in calcium ion binding and / or peripheral amino acids are substituted. 3. The modified PQQGDH according to [1].
13. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from Acinetobacter, 67, 68, 69, 76, 89, 129, 130, 131, 167, 168, 169, 170, 341 and 342 At least one position selected from the group consisting of positions 343, 351, 49, 174, 188, 189, 207, 215, 245, 249, 300, 349 and 429 1. The amino acid of has been substituted. 3. The modified PQQGDH according to [1].
14. Amino acid substitution is performed as follows: Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q16A, Q16A, Q16A, Q16A, Q16A, N
Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H, L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G, L169E, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, E189G, F215Y, 2,2,2,2,2
E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, P131G, E129N, E129N, E129N, E129R A group consisting of E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N, T349S, T349P, T349Y, N429F, N429P, N429L. 3. The modified PQQGDH according to [1].
15. Amino acid substitutions are as follows:
L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245N, E245M, E245M, E245M, E245N N249Q, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (K89E + K300R), (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (N167E + Q168G + L169T), (N167N + 16G + 16G + 16G) S + L169G), (N167G + Q168S + L169S + L174F + K49N), (Q168N + L168N + S189R), (N167E + Q168G + L169A +
S189G), (N167G + Q168R + L169A), (N167S + Q168G + L169A), (N167G + Q168V + L169S), (N167S + Q168V + L169S), (N167T + Q168I + L169G), (N167G + Q168W + L169N), (N167G + Q168S + L169N), (N167G + Q168S + L169V), (Q168R + L169C), (N167S + Q168L + L168G), (Q168C + L169S), (N167T + Q168N + L169K) , (N167G + Q168T + L169A + S207C), (N167A + Q168A + L169P), (N167G + Q168S + L169G), (N167G + Q168G), (N167G + Q168D) L169K), (Q168P + L169G), (N167G + Q168N + L169S), (Q168S + L169G), (N188I + T349S), (N167G + Q168G + L169A + F215Y), (N167G + Q168T + L169G), (Q168G + L169V), (N167G + Q168V + L169T), (N167E + Q168N + L169A), (Q168R + L169A), (N167G + Q168R), (N167G + Q168T) , (N167G + Q168T + L169Q), (Q168I + L169G + K300T), (N167G + Q168A), (N167T + Q168L + L169K), (N167M + Q168Y + L169G), (N167E + Q168S), (N167G) 168T + L169V + S189G), (N167G + Q168G + L169C), (N167G + Q168K + L169D), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169S), (A351T), (N167S + Q168S + L169S), (Q168I + L169Q), (N167A + Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P) , (P67K + E68K),
(P67R + E68R + I69C), (P67D + E68T + I69C), (E129R + K130G + P131G), (E129Q + K130T + P131R), (E129N + P131T), (E129A + K130R + P131K), (E341L + M342P + A343R), (E341S + M342I), A343I, (E341P + M342V + A343C), (E341P + M342V + A343R), (E341L + M342R + A343N), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F),
(Q168A + L169H), (Q168A + L169I), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R),
12. It is selected from the group consisting of (Q168A + L169S), (Q168A + L169T), (Q168A + L169V), (Q168A + L169W) and (Q168A + L169Y), and the amino acid substitution improves substrate specificity. 3. The modified PQQGDH according to [1].
16. 1. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from the genus Acinetobacter, an amino acid is inserted between positions 428 and 429. 3. The modified PQQGDH according to [1].
17. 1. ~ 16. A gene encoding the modified PQQGDH according to any one of the above.
18. 17. A vector comprising the gene according to 1.
19. 18. A transformant transformed with the vector described in 1. above.
20. 19. A method for producing a modified PQQGDH, which comprises culturing the transformant described in (1).
21. 1. ~ 20. A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
22. 1. ~ 20. A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
23. 1. ~ 20. A method for measuring glucose comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
24. Wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQG
A modified PQQGDH having improved stability over DH).
25. 25. The activity retention ratio after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 48% or more. The modified PQQGDH as described.
26. 25. The residual activity after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 55% or more. The modified PQQGDH as described.
27. 25. The activity retention ratio after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 70% or more. The modified PQQGDH as described.
28. 23. PQQGDH derived from the genus Acinetobacter, wherein the amino acid at at least one position selected from the group consisting of positions 20, 76, 89, 168, 169, 245, 246 and 300 is substituted. PQQGDH according to the above.
29. Amino acid substitutions are K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D.
L169E, L169N, L169E, L169E, L169E, L169E, L169N, L169E, L169E, L169N, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E, L169E 3. The modified PQQGDH according to [1].
30. Amino acid substitutions are K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q16G, Q16G, Q16G, Q168G, Q16G, Q16G, Q16G Q168S, (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169,16A), (16A), (16A) (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q 168A + L169Y), (Q168A + L169G), (Q168A + L169P + E245D), and (Q168A + L169G + E245D), and the amino acid substitution improved thermal stability. 29. 3. The modified PQQGDH according to [1].
31. 24. ~ 30. A gene encoding the modified PQQGDH according to any one of the above.
32. 31. A vector comprising the gene according to 1.
33. 32. A transformant transformed with the vector described in 1. above.
34. 33. A method for producing a modified PQQGDH, which comprises culturing the transformant described in (1).
35. 24. ~ 33. A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
36. 24. ~ 33. A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
37. 24. ~ 33. A method for measuring glucose comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
38. It is obtained by mutating amino acids located within a radius of 15 ° from the active center in the active conformation of the wild-type enzyme. 3. The modified glucose dehydrogenase according to 1.).
39. 1. Obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
40. 39. the substrate is glucose The modified glucose dehydrogenase described.
41. It is obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the OH group bonded to the carbon at position 1 in the active conformation of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
42. 41. the substrate is glucose The modified glucose dehydrogenase described.
43. It is obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the OH group bonded to the carbon at position 2 of the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
44. 43. the substrate is glucose The modified glucose dehydrogenase described.
It is.

本発明による改変型PQQGDHは野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下したもの、および/または、野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上した酵素である。本発明による改変型PQQGDHをグルコースアッセイキット及びグルコースセンサに使用することにより、野生型PQQGDHを使用したものよりもより高精度な分析が可能となったり、より安定性の高いグルコースアッセイキット及びグルコースセンサを提供することができる。   The modified PQQGDH according to the present invention is an enzyme having a lower activity on disaccharides than wild-type PQQGDH and / or an enzyme having improved thermostability compared to wild-type PQQGDH. By using the modified PQQGDH according to the present invention for a glucose assay kit and a glucose sensor, a more accurate analysis can be performed than that using wild-type PQQGDH, or a more stable glucose assay kit and glucose sensor can be obtained. Can be provided.

以下、本発明を詳細に説明する。   Hereinafter, the present invention will be described in detail.

本発明の改変型PQQGDHは、野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下したもの、および/または、野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上したものである。   The modified PQQGDH of the present invention has a lower activity on disaccharides than wild-type PQQGDH and / or has improved thermal stability than wild-type PQQGDH.

二糖類に対する作用性とは、二糖類を脱水素する作用を意味する。二糖類としては、マルトース、シュクロース、ラクトース、セロビオースなどが例示され、特にマルトースが例示される。本願発明では、二糖類に対する作用性が低下したことを、基質特異性の向上とも表現する。   The action on a disaccharide means an action of dehydrogenating the disaccharide. Examples of the disaccharide include maltose, sucrose, lactose, cellobiose and the like, and particularly maltose. In the present invention, the decrease in the action on the disaccharide is also referred to as an improvement in the substrate specificity.

本発明の改変型PQQGDHは、二糖類に対する作用性が野生型PQQGDHより低下していれば、グルコースに対する作用性は上昇、不変、低下のいずれであっても本発明の改変型PQQGDHに包含される。   The modified PQQGDH of the present invention is encompassed in the modified PQQGDH of the present invention regardless of whether its activity on glucose is increased, unchanged, or reduced, as long as its activity on disaccharides is lower than that of wild-type PQQGDH. .

本発明の改変型PQQGDHは、グルコース濃度の測定において二糖類に対する作用性が野生型PQQGDHを用いた場合と比較して低下したものを含む。好ましくは、マルトースに対する作用性が低下したものである。マルトースに対する作用性は、好ましくは野生型PQQGDHの90%以下、より好ましくは75%以下、さらに好ましくは60%以下、特に40%以下である。   The modified PQQGDH of the present invention includes those in which the action on disaccharides in the measurement of glucose concentration is reduced as compared with the case where wild-type PQQGDH is used. Preferably, it has reduced action on maltose. The activity on maltose is preferably 90% or less, more preferably 75% or less, still more preferably 60% or less, particularly 40% or less of wild-type PQQGDH.

本発明の改変型PQQGDHは、マルトースに対する作用性がグルコースに対する作用性の90%以下であるものを含む。   The modified PQQGDH of the present invention includes those having an activity on maltose of 90% or less on glucose.

本発明の改変型PQQGDHは、野生型PQQGDHよりも二糖類に対するに対するKm値が大きいものを含む。好ましくは、マルトースに対するKm値が大きいものである。マルトースに対するKm値は、好ましくは8mM以上、より好ましくは12mM以上、特に20mM以上である。   The modified PQQGDH of the present invention includes those having a larger Km value for disaccharides than wild-type PQQGDH. Preferably, the Km value for maltose is large. The Km value for maltose is preferably at least 8 mM, more preferably at least 12 mM, especially at least 20 mM.

本発明の改変型PQQGDHは、二糖類に対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいものを含む。好ましくは、マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいものである。あるいは、好ましくは、マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値の1.5倍以上、より好ましくは3倍以上である。   The modified PQQGDH of the present invention includes those in which the Km value for disaccharide is larger than the Km value for glucose. Preferably, the Km value for maltose is greater than the Km value for glucose. Alternatively, preferably, the Km value for maltose is 1.5 times or more, more preferably 3 times or more, the Km value for glucose.

本発明における安定性(熱安定性ともいう)は、58℃、30分間の熱処理後の活性残存率によって評価される。本発明の改変型PQQGDHは、58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が野生型PQQGDHよりも高いものを含む。活性残存率は、好ましくは48%以上、より好ましくは55%以上、特に好ましくは70%以上である。   The stability (also referred to as thermal stability) in the present invention is evaluated by the residual activity rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes. The modified PQQGDH of the present invention includes those having a higher activity residual ratio after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes than wild-type PQQGDH. The residual activity is preferably at least 48%, more preferably at least 55%, particularly preferably at least 70%.

野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下した本発明の改変型PQQGDHとしては、例えばAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列において、67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、170位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、249位、300位、349位、129位、130位、131位及び429位の少なくとも1つの位置においてアミノ酸置換を有する、及び/または、428位と429位の間にアミノ酸が挿入されている、改変型PQQGDHが例示される。   Examples of the modified PQQGDH of the present invention in which the activity on disaccharides is lower than that of wild-type PQQGDH include, for example, in the amino acid sequence of PQQGDH derived from the genus Acinetobacter, positions 67, 68, 69, 76, 89, 167, 168, 169, 170, 341, 342, 343, 351, 49, 174, 188, 189, 207, 215, 245, 249, 300, 349 Modified PQQGDH having an amino acid substitution at at least one of positions 129, 130, 131 and 429 and / or having an amino acid inserted between positions 428 and 429.

基質特異性の改良された本発明の改変型PQQGDHとしては、例えばAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列において、アミノ酸置換を有するGDH及び428位と429位の間にアミノ酸が挿入されているGDHが例示される。   Examples of the modified PQQGDH of the present invention having improved substrate specificity include, for example, GDH having an amino acid substitution and GDH having an amino acid inserted between positions 428 and 429 in the amino acid sequence of Acinetobacter-derived PQQGDH. You.

好ましくは、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H,
L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G, L169E, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T,
E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N, T349S, T349P, T349Y, N429F, N429P, N429L, N429Y,からなるA343N, L169P, L169G及びL169Eからなる群から選ばれるアミノ酸置換のうち少なくとも1つを有する、及び/または、428位と429位の間にL、AまたはKが挿入されている、改変型PQQGDHである。
Preferably, Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168F, Q168A, Q168A, Q168A, Q168A , Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H
L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G, L169E, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K17E, K89E, K300E S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E67K, E67K, E67K, E67K, P67D P131T,
From E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M343R, T343P, M343R, A343N A modified PQQGDH having at least one amino acid substitution selected from the group consisting of A343N, L169P, L169G and L169E, and / or having L, A or K inserted between positions 428 and 429. is there.

67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、300位、349位、129位、130位及び131位の置換は、1ヶ所であってもよく、また複数箇所であってもよい。   67, 68, 69, 76, 89, 167, 168, 169, 341, 342, 343, 351, 49, 174, 188, 189, 207 The substitution at positions 215, 245, 300, 349, 129, 130 and 131 may be performed at one position or at multiple positions.

ここで、「Q76N」は、76位のQ(Gln)をN(Asn)に置換することを意味する。   Here, “Q76N” means that Q (Gln) at position 76 is replaced with N (Asn).

次の段落に示すいずれかの置換、及び/または、428位と429位の間へのL、AまたはKの挿入は、PQQGDHの基質特異性の向上に寄与する。   Any of the substitutions shown in the next paragraph and / or the insertion of L, A or K between positions 428 and 429 contribute to improving the substrate specificity of PQQGDH.

Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M,
Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (K89E+K300R), (Q168A+L169D), (Q168S+L169S), (N167E+Q168G+L169T), (N
167S+Q168N+L169R), (Q168G+L169T), (N167G+Q168S+L169Y), (N167L+Q168S+L169G), (N167G+Q168S+L169S+L174F+K49N), (Q168N+L168N+S189R), (N167E+Q168G+L169A+S189G), (N167G+Q168R+L169A), (N167S+Q168G+L169A), (N167G+Q168V+L169S), (N167S+Q168V+L169S), (N167T+Q168I+L169G), (N167G+Q168W+L169N), (N167G+Q168S+L169N), (N167G+Q168S+L169V), (Q168R+L169C), (N167S+Q168L+L168G), (Q168C+L169S), (N167T+Q168N+L169K), (N167G+Q168T+L169A+S207C), (N167A+Q168A+L169P), (N167G+Q168S+L169G), (N167G+Q168G), (N167G+Q168D+L169K), (Q168P+L169G), (N167G+Q168N+L169S), (Q168S+L169G), (N188I+T349S), (N167G+Q168G+L169A+F215Y), (N167G+Q168T+L169G), (Q168G+L169V), (N167G+Q168V+L169T), (N167E+Q168N+L169A), (Q168R+L169A), (N167G+Q168R), (N167G+Q168T), (N167G+Q168T+L169Q), (Q168I+L169G+K300T), (N167G+Q168A), (N167T+Q168L+L169K), (N167M+Q168Y+L169G), (N167E+Q168S), (N167G+Q168T+L169V+S189G), (N167G+Q168G+L169C), (N167G+Q168K+L169D), (Q168A+L169D), (Q168S+E245D), (Q168S+L169S), (A351T), (N167S+Q168S+L169S), (Q168I+L169Q), (N167A+Q168S+L169S), (Q168S+L169E), (Q168A+L169G),
(Q168S+L169P), (P67K+E68K), (P67R+E68R+I69C), (P67D+E68T+I69C), (E129R+K130G+P131G), (E129Q+K130T+P131R), (E129N+P131T), (E129A+K130R+P131K), (E341L+M342P+A343R), (E341S+M342I), A343I, (E341P+M342V+A343C), (E341P+M342V+A343R), (E341L+M342R+A343N), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169I), (Q168A+L169K), (Q168A+L169M), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169S), (Q168A+L169T), (Q168A+L169V), (Q168A+L169W)及び(Q168A+L169Y)
Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168M, Q168M
Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170K, A170K, A170K, A170K, A170K, A170K, A170K E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (K89E + K300R), (Q168A + L169D), (Q168S + L169N, 16S + L169N)
167S + Q168N + L169R), (Q168G + L169T), (N167G + Q168S + L169Y), (N167L + Q168S + L169G), (N167G + Q168S + L169S + L174F + K49N), (Q168N + L168N + S189R), (N167E + Q168G + L169A + S189G), (N167G + Q168R + L169A), (N167S + Q168G + L169A), (N167G + Q168V + L169S), (N167S + Q168V + L169S), (N167T + Q168I + L169G), (N167G + Q168W + L169N) , (N167G + Q168S + L169N), (N167G + Q168S + L169V), (Q168R + L169C), (N167 S + Q168L + L168G), (Q168C + L169S), (N167T + Q168N + L169K), (N167G + Q168T + L169A + S207C), (N167A + Q168A + L169P), (N167G + Q168S + L169G), (N167G + Q168G), (N167G + Q168D + L169K), (Q168P + L169G), (N167G + Q168N + L169S), (Q168S + L169G), (N188I + T349S), (N167G + Q168G + L169A + F215Y) , (N167G + Q168T + L169G), (Q168G + L169V), (N167G + Q168V + L169T), (N167E + Q168N + L169A), (Q168R + L169A), (N 67G + Q168R), (N167G + Q168T), (N167G + Q168T + L169Q), (Q168I + L169G + K300T), (N167G + Q168A), (N167T + Q168L + L169K), (N167M + Q168Y + L169G), (N167E + Q168S), (N167G + Q168T + L169V + S189G), (N167G + Q168G + L169C), (N167G + Q168K + L169D), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D) , (Q168S + L169S), (A351T), (N167S + Q168S + L169S), (Q168I + L169Q), (N167A + Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168A + L1) 9G),
(Q168S + L169P), (P67K + E68K), (P67R + E68R + I69C), (P67D + E68T + I69C), (E129R + K130G + P131G), (E129Q + K130T + P131R), (E129N + P131T), (E129A + K130R + P131K), (E341L + M342P + A343R), (E341S + M342I), A343I, (E341P + M342V + A343C), (E341P + M342V + A343R), (E341L + M342R + A343N), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169I), (Q168A + L) 69K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169S), (Q168A + L169T), (Q168A + L169V), (Q168A + L169W) and (Q168A + L169Y)

野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上した本発明のPQQGDHとしては、例えばAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列において、20位、76位、89位、168位、169位、245位、246位及び300位の少なくとも1つの位置においてアミノ酸置換を有する、改変型PQQGDHが例示される。   Examples of the PQQGDH of the present invention having improved thermal stability over wild-type PQQGDH include, for example, amino acid sequences of PQQGDH derived from the genus Acinetobacter at positions 20, 76, 89, 168, 169, 245, 246, and 300 in the amino acid sequence. Modified PQQGDH having an amino acid substitution at at least one of the positions is exemplified.

好ましくは、K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D, L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L1
69E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y及びL169Gからなる群から選ばれるアミノ酸置換を有する。20位、76位、89位、168位、169位、246位及び300位の置換は、1ヶ所であってもよく、複数ヶ所であってもよい。
Preferably, K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L16D, L16D, L16D, L16D, L16D, L16D, L16D, L16D , L169A, L169C, L1
69E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y and L169G. The substitution at the 20-position, 76-position, 89-position, 168-position, 169-position, 246-position and 300-position may be performed at one position or at multiple positions.

ここで、「K20E」は、20位のK(Lys)をE(Glu)に置換することを意味する。   Here, “K20E” means that K (Lys) at the 20th position is replaced with E (Glu).

次に示すいずれかのアミノ酸置換は、PQQGDHの熱安定性の向上に寄与する。
特に、K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H,
Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S,(Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169K), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169T)、 (Q168A+L169Y)、 (Q168A + L169G)、 (Q168A+L169P+E245D)、 (Q168A+L169G+E245D)
Any of the following amino acid substitutions contributes to improvement of the thermal stability of PQQGDH.
Particularly, K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H.
Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (16A), (16A), (16A), (16A) (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q168A + L169Y), (Q168A + L169G), (Q168A + L169P + E245D), (Q168A + L9G2E2)

上記のAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列は、好ましくはAcinetobacter calcoaceticusまたはAcinetobacter baumannii由来PQQGDHのアミノ酸配列である。中でも好ましくは配列番号1である。配列番号1で示される野生型PQQGDHタンパク質及び配列番号2で示されるその塩基配列は、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)NCIMB11517株を起源とするものであり、特開平11−243949号公報に開示されている。なお、上記および配列番号1において、アミノ酸の表記は、シグナル配列が除かれたアスパラギン酸を1として番号付けされている。   The amino acid sequence of PQQGDH derived from the genus Acinetobacter is preferably the amino acid sequence of PQQGDH derived from Acinetobacter calcoaceticus or Acinetobacter baumannii. Among them, SEQ ID NO: 1 is preferable. The wild-type PQQGDH protein represented by SEQ ID NO: 1 and its base sequence represented by SEQ ID NO: 2 originate from Acinetobacter baumannii NCIMB 11517 strain, and are disclosed in JP-A-11-243949. I have. In the above and SEQ ID NO: 1, the amino acids are numbered as 1 with aspartic acid from which the signal sequence is removed.

アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)NCIMB11517株は、以前、Acinetobacter calcoaceticusに分類されていた。   Acinetobacter baumannii NCIMB 11517 strain was previously classified as Acinetobacter calcoaceticus.

なお、本発明の改変型PQQGDHは、グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有する限り、好ましくは二糖類に対する作用性及び/又は安定性に対して実質的な悪影響を及ぼさない限り、さらに他のアミノ酸残基の一部が欠失または置換されていてもよく、また他のアミノ酸残基が付加されていてもよい。   It should be noted that the modified PQQGDH of the present invention may further have a part of other amino acid residues as long as it has glucose dehydrogenase activity, preferably as long as it has no substantial adverse effect on the action and / or stability on disaccharides. May be deleted or substituted, and another amino acid residue may be added.

ところで、本願出願時において、アシネトバクター・カルコアセティカス(Acinetobacter calcoaceticus) LMD79.41株由来の酵素のX線結晶構造解析の結果が報告され、活性中心をはじめとした該酵素の高次構造が明らかとなっている(非特許文献1,2,3,4を参照。)。
J.Mol.Biol.,289,319−333(1999) PNAS,96(21),11787−11791(1999) The EMBO Journal,18(19),5187−5194(1999) Protein Science,9,1265−1273(2000)
By the way, at the time of filing the present application, the result of X-ray crystal structure analysis of an enzyme derived from Acinetobacter calcoaceticus LMD79.41 strain was reported, and the higher-order structure of the enzyme including the active center was revealed. (See Non-Patent Documents 1, 2, 3, and 4).
J. Mol. Biol. , 289, 319-333 (1999). PNAS, 96 (21), 11787-11791 (1999) The EMBO Journal, 18 (19), 5187-5194 (1999). Protein Science, 9, 1265-1273 (2000)

その高次構造に関する知見を基に、該酵素の構造と機能の相関に関する研究が進められているが、まだ完全に明らかになったとは言えない。例えば、水溶性グルコース脱水素酵素の第6番目のW−モチーフ、のBストランドとCストランドを結ぶループ領域(W6BC)中のアミノ酸残基の構造遺伝子の特定の部位に変異を導入することによりグルコースに対する選択性を改良しうることが考察されている(例えば、特許文献2を参照。)しかしながら、効果が実証されているのは実施例に開示されているものだけである。
特開2001−197888
Research on the correlation between the structure and function of the enzyme has been carried out based on the knowledge on its higher-order structure, but it has not been completely elucidated yet. For example, by introducing a mutation into a specific site of a structural gene of an amino acid residue in a loop region (W6BC) connecting the B-strand and the C-strand of the sixth W-motif of water-soluble glucose dehydrogenase, However, it is considered that the selectivity to the compound can be improved (see, for example, Patent Document 2). However, only those disclosed in Examples are effective.
JP 2001-197888 A

一方、発明者らは、本願発明の成果をもとにこれらの高次構造に関する知見を見直したところ、二糖類に対する作用性および/または安定性の改変に、PQQの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸、グルコースの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸 の少なくとも1つ以上が関わっているのではないかと考えている。   On the other hand, the present inventors have reviewed the findings on these higher-order structures based on the results of the present invention, and found that amino acids and / or amino acids involved in PQQ binding are involved in altering the action and / or stability of disaccharides. Alternatively, it is considered that at least one of the amino acids in the vicinity thereof, the amino acids involved in glucose binding and / or the surrounding amino acids, the amino acids involved in calcium ion binding and / or the surrounding amino acids may be involved. ing.

本発明の改変型PQQGDHは、配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、PQQの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸、および/または、グルコースの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されているものを含む。非特許文献3および4には、PQQに結合するアミノ酸として、Y344、W346、R228、N229、K377、R406、R408、D424、グルコースに結合するアミノ酸としては、Q76、D143、H144、D163、Q168、L169、などの記載がある。   The modified PQQGDH of the present invention is characterized in that, in the PQQ-dependent glucose dehydrogenase shown in SEQ ID NO: 1, an amino acid involved in PQQ binding and / or an amino acid in the vicinity thereof and / or an amino acid involved in glucose binding and / or Or those in which amino acids in the vicinity have been substituted. Non-Patent Documents 3 and 4 disclose that amino acids binding to PQQ include Y344, W346, R228, N229, K377, R406, R408, D424, and amino acids binding to glucose include Q76, D143, H144, D163, Q168, L169.

また、本発明の改変型PQQGDHは、配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されているものを含む。非特許文献1には、活性中心のカルシウムイオンに結合するアミノ酸としては、P248、G247、Q246、D252、T348などの記載がある。   Further, the modified PQQGDH of the present invention includes those in which the amino acids involved in calcium ion binding and / or peripheral amino acids in the PQQ-dependent glucose dehydrogenase shown in SEQ ID NO: 1 are substituted. Non-Patent Document 1 describes P248, G247, Q246, D252, T348, and the like as amino acids that bind to calcium ions at the active center.

また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造における活性中心から半径15Å以内、好ましくは半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。   The modified PQQGDH of the present invention also includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 15 °, preferably within a radius of 10 ° from the active center in the active conformation of the wild-type enzyme.

また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。   The modified PQQGDH of the present invention also includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme. In particular, when the substrate is glucose, it is preferably obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme.

また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。   Further, the modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the OH group bonded to the carbon at position 1 in the active conformation of the wild-type enzyme. . In particular, when the substrate is glucose, it is preferably obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme.

また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。   The modified PQQGDH of the present invention also includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the OH group bonded to the carbon at position 2 in the active conformation of the wild-type enzyme. . In particular, when the substrate is glucose, it is preferably obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme.

以上の教示にしたがって、当業者は、他の起源に由来する改変型PQQGDHについても、当該領域でアミノ酸残基を置換することにより、野生型のPQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDHを得ることができる。   In accordance with the above teachings, those skilled in the art will also appreciate that, for modified PQQGDH from other sources, substituting amino acid residues in that region has reduced activity on disaccharides over wild-type PQQGDH, and And / or a modified PQQGDH with improved stability can be obtained.

例えば、配列番号1のアミノ酸配列と、アシネトバクター・カルコアセティカス(Acinetobacter calcoaceticus)LMD79.41株由来酵素のアミノ酸配列を比較すると、相違箇所はわずかで、相同性は92.3%(シグナル配列含む)となり、非常に類似しているので、配列番号1におけるある残基が、他起源の酵素のどのアミノ酸残基に該当するかを容易に認識することができる。そして、本発明にしたがって、そのような1またはそれ以上の箇所においてアミノ酸残基を他のアミノ酸残基で欠失、置換あるいは挿入等することにより、野生型のPQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDHを得ることができる。これらの改変型PQQGDHグルコース脱水素酵素も本発明の範囲内に含まれる。   For example, when the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 is compared with the amino acid sequence of the enzyme derived from Acinetobacter calcoaceticus LMD79.41, the difference is slight and the homology is 92.3% (including the signal sequence). ), So that it is easy to recognize which amino acid residue of a certain residue in SEQ ID NO: 1 corresponds to an enzyme of another origin. In addition, according to the present invention, by deleting, substituting or inserting an amino acid residue at one or more such positions with another amino acid residue, the action on the disaccharide is more than that of wild-type PQQGDH. A modified PQQGDH with reduced and / or improved stability can be obtained. These modified PQQGDH glucose dehydrogenases are also included within the scope of the present invention.

本発明の改変型PQQGDHをコードする遺伝子は、微生物など種々の起源より得られる野生型PQQGDHをコードする遺伝子を含むDNA断片を改変することにより得られる可能性がある。具体的には、例えばアシネトバクター・カルコアセティカス、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)、シュードモナス・エルギノサ(Pseudomonasaeruginosa)、シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida)、シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens)、グルコノバクター・オキシダンス等の酸化細菌やアグロバクテリウム・ラジオバクター(Agrobacteriumradiobacter)、エシェリヒア・コリ、クレブシーラ・エーロジーンズ(Klebsiella aerogenes)等の腸内細菌を挙げることができる。ただし、エシェリヒア・コリなどに存在する膜型酵素を改変して可溶型にすることは困難であり、起源としてはアシネトバクター・カルコアセティカスもしくはアシネトバクター・バウマンニなどの可溶性PQQGDHを選択することが好ましい。   The gene encoding the modified PQQGDH of the present invention may be obtained by modifying a DNA fragment containing a gene encoding a wild-type PQQGDH obtained from various sources such as microorganisms. More specifically, for example, Acinetobacter calcoaceticus, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas esomodus pusumosa pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pudumonas pusomodus pusomodus pusomodus pusomodus pusumosa pudusas Oxidizing bacteria such as dance and intestinal bacteria such as Agrobacterium radiobacter, Escherichia coli and Klebsiella aerogenes can be mentioned. However, it is difficult to modify a membrane-type enzyme present in Escherichia coli or the like into a soluble form, and it is preferable to select a soluble PQQGDH such as Acinetobacter calcoaceticus or Acinetobacter baumannii as a source. .

野生型PQQGDHをコードする遺伝子を改変する方法としては、通常行われる遺伝情報を改変する手法が用いられる。すなわち、タンパク質の遺伝情報を有するDNAの特定の塩基を変換することにより、或いは特定の塩基を挿入または欠失させることにより、改変蛋白質の遺伝情報を有するDNAが作成される。DNA中の塩基を変換する具体的な方法としては、例えば市販のキット(TransformerMutagenesis Kit;Clonetech製,EXOIII/Mung Bean Deletion Kit;Stratagene製,QuickChange Site Directed Mutagenesis Kit;Stratagene製など)の使用、或いはポリメラーゼ連鎖反応法(PCR)の利用が挙げられる。   As a method for modifying a gene encoding wild-type PQQGDH, a commonly used technique for modifying genetic information is used. That is, a DNA having the genetic information of the modified protein is prepared by converting a specific base of the DNA having the genetic information of the protein or by inserting or deleting a specific base. As a specific method for converting bases in DNA, for example, commercially available kits (Transformer Mutagenesis Kit; manufactured by Clonetech, EXOIII / Mung Bean Deletion Kit; manufactured by Stratagene, and available from QuickChange Site Digest, a company of QuickChange Sites, etc.) The use of the chain reaction method (PCR) is mentioned.

作製された改変タンパク質の遺伝情報を有するDNAは、プラスミドと連結された状態にて宿主微生物中に移入され、改変タンパク質を生産する形質転換体となる。この際のプラスミドとしては、例えば、エシェリヒア・コリー(Escherichia coli)を宿主微生物とする場合にはpBluescript,pUC18などが使用できる。宿主微生物としては、例えば、エシェリヒア・コリー W3110、エシェリヒア・コリーC600、エシェリヒア・コリーJM109、エシェリヒア・コリーDH5αなどが利用できる。宿主微生物に組換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主微生物がエシェリヒア属に属する微生物の場合には、カルシウムイオンの存在下で組換えDNAの移入を行なう方法などを採用することができ、更にエレクトロポレーション法を用いても良い。更には、市販のコンピテントセル(例えば、コンピテントハイJM109;東洋紡績製)を用いても良い。   The prepared DNA having the genetic information of the modified protein is transferred into a host microorganism in a state of being linked to a plasmid, and becomes a transformant that produces the modified protein. As a plasmid at this time, for example, when Escherichia coli is used as a host microorganism, pBluescript, pUC18 and the like can be used. Examples of the host microorganism include Escherichia coli W3110, Escherichia coli C600, Escherichia coli JM109, and Escherichia coli DH5α. As a method for transferring the recombinant vector to the host microorganism, for example, when the host microorganism is a microorganism belonging to the genus Escherichia, a method for transferring the recombinant DNA in the presence of calcium ions can be used. Electroporation may be used. Further, a commercially available competent cell (for example, competent high JM109; manufactured by Toyobo) may be used.

このような遺伝子はこれらの菌株より抽出してもよく、また化学的に合成することもできる。さらに、PCR法の利用により、PQQGDH遺伝子を含むDNA断片を得ることも可能である。   Such genes may be extracted from these strains or may be chemically synthesized. Furthermore, a DNA fragment containing the PQQGDH gene can be obtained by utilizing the PCR method.

本発明において、PQQGDHをコードする遺伝子を得る方法としては、次のような方法が挙げられる。例えばアシネトバクター・カルコアセティカスNCIB11517 の染色体を分離、精製した後、超音波処理、制限酵素処理等を用いてDNAを切断したものと、リニアーな発現ベクターと両DNAの平滑末端または付着末端においてDNAリガーゼなどにより結合閉鎖させて組換えベクターを構築する。該組換えベクターを複製可能な宿主微生物に移入した後、ベクターのマーカーと酵素活性の発現を指標としてスクリーニングして、PQQを補欠分子族とするGDHをコードする遺伝子を含有する組換えベクターを保持する微生物を得る。   In the present invention, a method for obtaining a gene encoding PQQGDH includes the following method. For example, the chromosome of Acinetobacter calcoaceticus NCIB11517 is separated and purified, and then the DNA is cut using sonication, restriction enzyme treatment, etc., and a linear expression vector and DNA at the blunt end or cohesive end of both DNAs. The recombinant vector is constructed by binding and closing with ligase or the like. After the recombinant vector is transferred to a replicable host microorganism, screening is performed using the vector marker and the expression of the enzyme activity as indices, and the recombinant vector containing the GDH-encoding gene having PQQ as a prosthetic group is retained. Get the microorganisms that work.

次いで、上記組換えベクターを保持する微生物を培養して、該培養微生物の菌体から該組換えベクターを分離、精製し、該発現ベクターからGDHをコードする遺伝子を採取することができる。例えば、遺伝子供与体であるアシネトバクター・カルコアセティカスNCIB11517 の染色体DNAは、具体的には以下のようにして採取される。   Next, the microorganism carrying the recombinant vector is cultured, the recombinant vector is separated and purified from the cells of the cultured microorganism, and the gene encoding GDH can be collected from the expression vector. For example, the chromosomal DNA of Acinetobacter calcoaceticus NCIB11517, which is a gene donor, is specifically collected as follows.

該遺伝子供与微生物を例えば1〜3日間攪拌培養して得られた培養液を遠心分離により集菌し、次いで、これを溶菌させることによりPQQを補欠分子族とするGDH遺伝子の含有溶菌物を調製することができる。溶菌の方法としては、例えばリゾチーム等の溶菌酵素により処理が施され、必要に応じてプロテアーゼや他の酵素やラウリル硫酸ナトリウム(SDS)等の界面活性剤が併用される。さらに、凍結融解やフレンチプレス処理のような物理的破砕方法と組み合わせてもよい。   For example, a culture solution obtained by stirring and culturing the gene-donating microorganism for 1 to 3 days is collected by centrifugation, and then lysed to prepare a lysate containing the GDH gene having PQQ as a prosthetic group. can do. As a method of lysis, for example, treatment is performed with a lytic enzyme such as lysozyme, and if necessary, a protease, another enzyme, or a surfactant such as sodium lauryl sulfate (SDS) is used in combination. Further, it may be combined with a physical crushing method such as freeze-thawing or French pressing.

上記のようにして得られた溶菌物からDNAを分離精製するには、常法に従って、例えばフェノール処理やプロテアーゼ処理による除蛋白処理や、リボヌクレアーゼ処理、アルコール沈殿処理などの方法を適宜組み合わせることにより行うことができる。   In order to separate and purify DNA from the lysate obtained as described above, a conventional method is used, for example, by appropriately combining methods such as protein removal treatment by phenol treatment or protease treatment, ribonuclease treatment, and alcohol precipitation treatment. be able to.

微生物から分離、精製されたDNAを切断する方法は、例えば超音波処理、制限酵素処理などにより行うことができる。好ましくは特定のヌクレオチド配列に作用するII型制限酵素が適している。   The method of cutting DNA isolated and purified from microorganisms can be performed by, for example, ultrasonic treatment, restriction enzyme treatment, or the like. Preferably, a type II restriction enzyme acting on a specific nucleotide sequence is suitable.

クローニングする際のベクターとしては、宿主微生物内で自律的に増殖し得るファージまたはプラスミドから遺伝子組換え用として構築されたものが適している。ファージとしては、例えばエシェリヒア・コリを宿主微生物とする場合にはLambda gt10 、Lambda gt11 などが例示される。また、プラスミドとしては、例えば、エシェリヒア・コリを宿主微生物とする場合には、pBR322、pUC19 、pBluescript などが例示される。   As a vector for cloning, a vector constructed for gene recombination from a phage or a plasmid capable of autonomous growth in a host microorganism is suitable. Examples of the phage include Lambda gt10 and Lambda gt11 when Escherichia coli is used as a host microorganism. Examples of plasmids include pBR322, pUC19, and pBluescript when Escherichia coli is used as a host microorganism.

クローニングの際、上記のようなベクターを、上述したGDHをコードする遺伝子供与体である微生物DNAの切断に使用した制限酵素で切断してベクター断片を得ることができるが、必ずしも該微生物DNAの切断に使用した制限酵素と同一の制限酵素を用いる必要はない。微生物DNA断片とベクターDNA断片とを結合させる方法は、公知のDNAリガーゼを用いる方法であればよく、例えば微生物DNA断片の付着末端とベクター断片の付着末端とのアニーリングの後、適当なDNAリガーゼの使用により微生物DNA断片とベクターDNA断片との組換えベクターを作成する。必要に応じて、アニーリングの後、宿主微生物に移入して生体内のDNAリガーゼを利用し組換えベクターを作製することもできる。   At the time of cloning, a vector fragment can be obtained by cutting the above vector with the restriction enzyme used for cutting the above-described GDH-encoding gene donor microbial DNA. It is not necessary to use the same restriction enzymes as those used in Example 1. The method for binding the microbial DNA fragment to the vector DNA fragment may be a method using a known DNA ligase. For example, after annealing the cohesive end of the microbial DNA fragment and the cohesive end of the vector fragment, a suitable DNA ligase is used. A recombinant vector of a microorganism DNA fragment and a vector DNA fragment is prepared by use. If necessary, after annealing, the vector can be transferred to a host microorganism and a recombinant vector can be prepared using in-vivo DNA ligase.

クローニングに使用する宿主微生物としては、組換えベクターが安定であり、かつ自律増殖可能で外来性遺伝子の形質発現できるものであれば特に制限されない。一般的には、エシェリヒア・コリW3110 、エシェリヒア・コリC600、エシェリヒア・コリHB101 、エシェリヒア・コリJM109 、エシェリヒア・コリDH5 αなどを用いることができる。   The host microorganism used for cloning is not particularly limited as long as the recombinant vector is stable, can be autonomously propagated, and can express a foreign gene. Generally, Escherichia coli W3110, Escherichia coli C600, Escherichia coli HB101, Escherichia coli JM109, Escherichia coli DH5α and the like can be used.

宿主微生物に組換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主微生物がエシェリヒア・コリの場合には、カルシウム処理によるコンピテントセル法やエレクトロポーレーション法などを用いることができる。   As a method for transferring the recombinant vector to the host microorganism, for example, when the host microorganism is Escherichia coli, a competent cell method or an electroporation method by calcium treatment can be used.

上記のように得られた形質転換体である微生物は、栄養培地で培養されることにより、多量のGDHを安定に生産し得る。宿主微生物への目的組換えベクターの移入の有無についての選択は、目的とするDNAを保持するベクターの薬剤耐性マーカーとPQQの添加によりGDH活性を同時に発現する微生物を検索すればよい。例えば、薬剤耐性マーカーに基づく選択培地で生育し、かつGDHを生成する微生物を選択すればよい。   The microorganism, which is a transformant obtained as described above, can stably produce a large amount of GDH by being cultured in a nutrient medium. Selection of the presence or absence of transfer of the target recombinant vector to the host microorganism may be carried out by searching for a microorganism that simultaneously expresses a GDH activity by adding a drug resistance marker of the vector holding the target DNA and PQQ. For example, a microorganism which grows on a selective medium based on a drug resistance marker and produces GDH may be selected.

上記の方法により得られたPQQを補欠分子族とするGDH遺伝子の塩基配列は、Science ,第214巻,1205(1981)に記載されたジデオキシ法により解読した。また、GDHのアミノ酸配列は上記のように決定された塩基配列より推定した。   The base sequence of the GDH gene obtained by the above method and having PQQ as a prosthetic group was decoded by the dideoxy method described in Science, Vol. 214, 1205 (1981). The amino acid sequence of GDH was deduced from the nucleotide sequence determined as described above.

上記のようにして、一度選択されたPQQを補欠分子族とするGDH遺伝子を保有する組換えベクターより、PQQ生産能を有する微生物にて複製できる組換えベクターへの移入は、GDH遺伝子を保持する組換えベクターから制限酵素やPCR法によりGDH遺伝子であるDNAを回収し、他のベクター断片と結合させることにより容易に実施できる。また、これらのベクターによるPQQ生産能を有する微生物の形質転換は、カルシウム処理によるコンピテントセル法やエレクトロポーレーション法などを用いることができる。   As described above, the transfer of the once selected recombinant vector having a GDH gene having PQQ as a prosthetic group into a recombinant vector capable of replicating in a microorganism having PQQ-producing ability retains the GDH gene. It can be easily carried out by recovering the DNA which is the GDH gene from the recombinant vector by a restriction enzyme or the PCR method and ligating it to another vector fragment. The transformation of microorganisms having PQQ-producing ability with these vectors can be performed by a competent cell method or an electroporation method using calcium treatment.

PQQ生産能を有する微生物としては、メチロバクテリウム(Methylobacterium)属等のメタノール資化性細菌、アセトバクター(Acetobacter )属やグルコノバクター(Gluconobacter )属の酢酸菌、フラボバクテリウム(Flavobacterium)属、シュードモナス属、アシネトバクター属等の細菌を挙げることができる。なかでも、シュードモナス属細菌とアシネトバクター属細菌が利用できる宿主−ベクター系が確立されており利用しやすいので好ましい。   Examples of microorganisms having a PQQ-producing ability include methanol-assimilating bacteria such as methylobacterium, acetic acid bacteria of the genus Acetobacter and genus Gluconobacter, and genus Flavobacterium. And bacteria of the genus Pseudomonas, Acinetobacter and the like. Among them, a host-vector system in which Pseudomonas bacteria and Acinetobacter bacteria can be used has been established and is easy to use.

シュードモナス属細菌では、シュードモナス・エルギノサ、シュードモナス・フルオレッセンス、シュードモナス・プチダなどを用いることができる。また、アシネトバクター属細菌ではアシネトバクター・カルコアセティカス、アシネトバクター・バウマンニ等を用いることができる。   As Pseudomonas bacteria, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas putida, and the like can be used. As the Acinetobacter bacteria, Acinetobacter calcoaceticus, Acinetobacter baumannii and the like can be used.

上記微生物にて複製できる組換えベクターとしては、RSF1010 由来のベクターもしくはとその類似のレプリコンを有するベクターがシュードモナス属細菌に利用可能である。例えば、pKT240、pMMB24等(M.M.Bagdasarian ら,Gene,26,273(1983))、pCN40 、pCN60 等(C.C.Nieto ら,Gene,87,145(1990))やpTS1137 等を挙げることができる。また、pME290等(Y.Itohら、Gene,36,27(1985))、pNI111、pNI20C(N.Itohら,J.Biochem.,110,614(1991))も利用できる。   As a recombinant vector capable of replicating in the above microorganism, a vector derived from RSF1010 or a vector having a replicon similar thereto can be used for Pseudomonas bacteria. For example, pKT240, pMMB24, etc. (MM Bagdasarian et al., Gene, 26, 273 (1983)), pCN40, pCN60 etc. (CC Nieto et al., Gene, 87, 145 (1990)), pTS1137 etc. be able to. Also, pME290, etc. (Y. Itoh et al., Gene, 36, 27 (1985)), pNI111, pNI20C (N. Itoh et al., J. Biochem., 110, 614 (1991)) can be used.

アシネトバクター属細菌では、pWM43 等(W.Minas ら,Appl.Environ.Microbiol. ,59,2807(1993))、pKT230、pWH1266 等(M.Hungerら,Gene,87,45(1990))がベクターとして利用可能である。   Among the bacteria belonging to the genus Acinetobacter, pWM43 and the like (W. Minas et al., Appl. Environ. Microbiol., 59, 2807 (1993)), pKT230, pWH1266 and the like (M. Hunger et al., Gene, 87, 45 (1990)) are used as vectors. Available.

こうして得られた形質転換体である微生物は、栄養培地で培養されることにより、多量の改変タンパク質を安定して生産し得る。形質転換体である宿主微生物の培養形態は、宿主の栄養生理的性質を考慮して培養条件を選択すればよく、多くの場合は液体培養で行う。工業的には通気攪拌培養を行うのが有利である。   The microorganism thus obtained as a transformant can stably produce a large amount of the modified protein by being cultured in a nutrient medium. The culture form of the host microorganism, which is a transformant, may be selected in consideration of the nutritional and physiological properties of the host, and in most cases, liquid culture is used. Industrially, it is advantageous to carry out aeration and stirring culture.

培地の栄養源としては,微生物の培養に通常用いられるものが広く使用され得る。炭素源としては資化可能な炭素化合物であればよく、例えば、グルコース、シュークロース、ラクトース、マルトース、ラクトース、糖蜜、ピルビン酸などが使用される。また、窒素源としては利用可能な窒素化合物であればよく、例えば、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、カゼイン加水分解物、大豆粕アルカリ抽出物などが使用される。その他、リン酸塩、炭酸塩、硫酸塩、マグネシウム、カルシウム、カリウム、鉄、マンガン、亜鉛などの塩類、特定のアミノ酸、特定のビタミンなどが必要に応じて使用される。   As the nutrient source of the medium, those commonly used for culturing microorganisms can be widely used. The carbon source may be any assimilable carbon compound, and for example, glucose, sucrose, lactose, maltose, lactose, molasses, pyruvic acid and the like are used. The nitrogen source may be any nitrogen compound that can be used, and examples thereof include peptone, meat extract, yeast extract, casein hydrolyzate, and soybean meal alkaline extract. In addition, phosphates, carbonates, sulfates, salts such as magnesium, calcium, potassium, iron, manganese, and zinc, specific amino acids, and specific vitamins are used as needed.

培養温度は菌が成育し、改変型PQQGDHを生産する範囲で適宜変更し得るが、上記のようなPQQ生産能を有する微生物の場合、好ましくは20〜42℃程度である。培養時間は条件によって多少異なるが、改変型PQQGDHが最高収量に達する時期を見計らって適当時期に培養を完了すればよく、通常は6〜48時間程度である。培地のpHは菌が発育し、改変型PQQGDHを生産する範囲で適宜変更し得るが、好ましくはpH6.0〜9.0程度の範囲である。   The culture temperature can be appropriately changed within a range in which the bacteria grow and produce the modified PQQGDH. In the case of the microorganism having the PQQ-producing ability as described above, the temperature is preferably about 20 to 42 ° C. The cultivation time varies somewhat depending on the conditions, but the cultivation may be completed at an appropriate time in consideration of the time when the modified PQQGDH reaches the maximum yield, and is usually about 6 to 48 hours. The pH of the medium can be appropriately changed within a range in which the bacteria grow and produce the modified PQQGDH, but is preferably in a range of about pH 6.0 to 9.0.

培養物中の改変型PQQGDHを生産する菌体を含む培養液をそのまま採取し、利用することもできるが、一般には、常法に従って、改変型PQQGDHが培養液中に存在する場合はろ過、遠心分離などにより、改変型PQQGDH含有溶液と微生物菌体とを分離した後に利用される。改変型PQQGDHが菌体内に存在する場合には、得られた培養物からろ過または遠心分離などの手段により菌体を採取し、次いで、この菌体を機械的方法またはリゾチームなどの酵素的方法で破壊し、また、必要に応じて、EDTA等のキレート剤及び界面活性剤を添加してGDHを可溶化し、水溶液として分離採取する。   The culture solution containing the cells producing the modified PQQGDH in the culture can be directly collected and used. However, in general, if the modified PQQGDH is present in the culture solution, filtration and centrifugation are performed according to a conventional method. It is used after separating the modified PQQGDH-containing solution from the microbial cells by separation or the like. When the modified PQQGDH is present in the cells, the cells are collected from the obtained culture by means such as filtration or centrifugation, and then the cells are subjected to a mechanical method or an enzymatic method such as lysozyme. GDH is destroyed, and if necessary, a chelating agent such as EDTA and a surfactant are added to solubilize GDH, and the GDH is separated and collected as an aqueous solution.

上記のようにして得られたGDH含有溶液を、例えば減圧濃縮、膜濃縮、さらに硫酸アンモニウム、硫酸ナトリウムなどの塩析処理、あるいは親水性有機溶媒、例えばメタノール、エタノール、アセトンなどによる分別沈殿法により沈殿せしめればよい。また、加熱処理や等電点処理も有効な精製手段である。その後、吸着剤あるいはゲルろ過剤などによるゲルろ過、吸着クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティクロマトグラフィーを行うことにより、精製されたGDHを得ることができる。   The GDH-containing solution obtained as described above is precipitated by, for example, concentration under reduced pressure, membrane concentration, salting-out treatment with ammonium sulfate, sodium sulfate or the like, or fractional precipitation with a hydrophilic organic solvent such as methanol, ethanol, acetone, or the like. I'll let you go. Heat treatment and isoelectric point treatment are also effective purification means. Thereafter, purified GDH can be obtained by performing gel filtration with an adsorbent or a gel filtration agent, adsorption chromatography, ion exchange chromatography, and affinity chromatography.

例えば、セファデックス(Sephadex)ゲル(ファルマシアバイオテク)などによるゲルろ過、DEAEセファロースCL−6B (ファルマシアバイオテク)、オクチルセファロースCL−6B (ファルマシアバイオテク)等のカラムクロマトグラフィーにより分離、精製し、精製酵素標品を得ることができる。該精製酵素標品は、電気泳動(SDS−PAGE)的に単一のバンドを示す程度に純化されていることが好ましい。   For example, it is separated and purified by gel filtration using Sephadex gel (Pharmacia Biotech), column chromatography such as DEAE Sepharose CL-6B (Pharmacia Biotech), octyl Sepharose CL-6B (Pharmacia Biotech), and the purified enzyme standard. Goods can be obtained. The purified enzyme preparation is preferably purified to such an extent that it shows a single band by electrophoresis (SDS-PAGE).

上記のようにして得られた精製酵素を、例えば凍結乾燥、真空乾燥やスプレードライなどにより粉末化して流通させることが可能である。その際、精製酵素はリン酸緩衝液、トリス塩酸緩衝液やGOODの緩衝液に溶解しているものを用いることができる。好適なものはGOODの緩衝液であり、なかでも、PIPES、MESもしくはMOPS緩衝液が特に好ましい。また、カルシウムイオンまたはその塩、およびグルタミン酸、グルタミン、リジン等のアミノ酸類、さらに血清アルブミン等を添加することによりGDHをより安定化することができる。   The purified enzyme obtained as described above can be distributed in a powder form by, for example, freeze-drying, vacuum drying, spray drying, or the like. In this case, the purified enzyme which is dissolved in a phosphate buffer, a Tris-HCl buffer or a GOOD buffer can be used. Preferred are GOOD buffers, among which PIPES, MES or MOPS buffers are particularly preferred. GDH can be further stabilized by adding calcium ions or salts thereof, amino acids such as glutamic acid, glutamine and lysine, and serum albumin and the like.

本発明の改変タンパク質の製造方法は、特に限定されないが、以下に示すような手順で製造することが可能である。タンパク質を構成するアミノ酸配列を改変する方法としては、通常行われる遺伝情報を改変する手法が用いられる。すなわち、タンパク質の遺伝情報を有するDNAの特定の塩基を変換することにより、或いは特定の塩基を挿入または欠失させることにより、改変蛋白質の遺伝情報を有するDNAが作成される。DNA中の塩基を変換する具体的な方法としては、例えば市販のキット(TransformerMutagenesis Kit;Clonetech製,EXOIII/Mung Bean Deletion Kit;Stratagene製,QuickChange Site Directed Mutagenesis Kit;Stratagene製など)の使用、或いはポリメラーゼ連鎖反応法(PCR)の利用が挙げられる。   The method for producing the modified protein of the present invention is not particularly limited, but it can be produced by the following procedure. As a method for modifying an amino acid sequence constituting a protein, a commonly used technique for modifying genetic information is used. That is, a DNA having the genetic information of the modified protein is prepared by converting a specific base of the DNA having the genetic information of the protein or by inserting or deleting a specific base. As a specific method for converting bases in DNA, for example, commercially available kits (Transformer Mutagenesis Kit; manufactured by Clonetech, EXOIII / Mung Bean Deletion Kit; manufactured by Stratagene, and available from QuickChange Site Digest, a company of QuickChange Sites, etc.) The use of the chain reaction method (PCR) is mentioned.

本発明では、配列番号1に示されるPQQGDHの76位、167位、168位、169位、170位および245位に着目し、そのアミノ酸置換体を作成したところ、基質特異性が改善されたPQQGDH改変体を得ることができた。基質特異性に関しては、Q76K, Q168A, A170P, E245D, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (Q168S + L169S), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169S) および (Q168A + L169T)が特に好ましい。   In the present invention, by focusing on positions 76, 167, 168, 169, 170 and 245 of PQQGDH shown in SEQ ID NO: 1, and creating amino acid substitutions thereof, PQQGDH with improved substrate specificity A variant could be obtained. Regarding the substrate specificity, Q76K, Q168A, A170P, E245D, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (Q168S + L169S), (Q168A + L169D), (Q168S16G9,16Q16E16) ), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L16, L16A, L16A) (Q168A + L169S) and (Q168A + L169T) are particularly preferred.

本発明では、配列番号1に示されるPQQGDHの20位、76位、89位、168位、169位、245位、246位及び300位に着目し、そのアミノ酸置換体を作成したところ、安定性が改善されたPQQGDH改変体を得ることができた。熱安定性に関する限り、K20E, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169G), Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P,
Q168S, Q168W, Q168Y, (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169K), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q168A + L169Y), (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D)及びQ246Hの置換が特に望ましい。
In the present invention, focusing on positions 20, 76, 89, 168, 169, 245, 246 and 300 of PQQGDH shown in SEQ ID NO: 1, amino acid substitutions thereof were prepared. A PQQGDH variant having improved PQQGDH was obtained. As far as the thermal stability is concerned, K20E, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + Q168E, Q168A, L168G) Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P,
Q168S, Q168W, Q168Y, (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + A, L168A, L168A) + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q168A + L169Y), (Q168A + L169G + E245D), and (Q168A + L169P, especially desirable, and E246H).

改変タンパク質は、液状(水溶液、懸濁液等)、粉末、凍結乾燥など種々の形態をとることができる。凍結乾燥法としては、特に制限されるものではなく常法に従って行えばよい。本発明の酵素を含む組成物は凍結乾燥物に限られず、凍結乾燥物を再溶解した溶液状態であってもよい。また、グルコース測定を行なう際には、グルコースアッセイキット、グルコースセンサーなどの種々の形態をとることができる。この様にして得られた精製された改変タンパク質は、以下のような方法により安定化することができる。   The modified protein can be in various forms such as liquid (aqueous solution, suspension, etc.), powder, freeze-dried. The freeze-drying method is not particularly limited, and may be performed according to a conventional method. The composition containing the enzyme of the present invention is not limited to a lyophilized product, and may be a solution in which the lyophilized product is redissolved. When performing glucose measurement, various forms such as a glucose assay kit and a glucose sensor can be used. The purified modified protein thus obtained can be stabilized by the following method.

精製された改変タンパク質に(1)アスパラギン酸、グルタミン酸、α−ケトグルタル酸、リンゴ酸、α−ケトグルコン酸、α−サイクロデキストリンおよびそれらの塩からなる群から選ばれた1種または2種以上の化合物および(2)アルブミンを共存せしめることにより、改変タンパク質をさらに安定化することができる。   (1) one or more compounds selected from the group consisting of aspartic acid, glutamic acid, α-ketoglutaric acid, malic acid, α-ketogluconic acid, α-cyclodextrin and salts thereof And (2) the modified protein can be further stabilized by coexisting albumin.

凍結乾燥組成物中においては、PQQGDH含有量は、酵素の起源によっても異なるが、通常は約5〜50%(重量比)の範囲で好適に用いられる。酵素活性に換算すると、100〜2000U/mgの範囲で好適に用いられる。   In the lyophilized composition, the PQQGDH content is preferably used generally in the range of about 5 to 50% (weight ratio), although it varies depending on the origin of the enzyme. In terms of enzyme activity, it is suitably used in the range of 100 to 2000 U / mg.

アスパラギン酸、グルタミン酸、αーケトグルタル酸、リンゴ酸、及びαーケトグルコン酸の塩としては、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、及びマグネシウム等の塩が挙げられるが特に限定されるものではない。上記化合物とその塩及びα−シクロデキストリンの添加量は、1〜90%(重量比)の範囲で添加することが好ましい。これらの物質は単独で用いてもよいし、複数組み合わせてもよい。   Salts of aspartic acid, glutamic acid, α-ketoglutaric acid, malic acid, and α-ketogluconic acid include, but are not particularly limited to, sodium, potassium, ammonium, calcium, and magnesium salts. It is preferable that the above-mentioned compound, its salt and α-cyclodextrin are added in an amount of 1 to 90% (weight ratio). These substances may be used alone or in combination.

含有される緩衝液としては特に限定されるものではないが、トリス緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、GOOD緩衝液などが挙げられる。該緩衝液のpHは5.0〜9.0程度の範囲で使用目的に応じて調整される。凍結乾燥物中においては緩衝剤の含有量は、特に限定されるものではないが、好ましくは0.1%(重量比)以上、特に好ましくは0.1〜30%(重量比)の範囲で使用される。   The buffer to be contained is not particularly limited, and examples thereof include a Tris buffer, a phosphate buffer, a borate buffer, and a GOOD buffer. The pH of the buffer is adjusted in the range of about 5.0 to 9.0 depending on the purpose of use. The content of the buffer in the lyophilized product is not particularly limited, but is preferably 0.1% (weight ratio) or more, and particularly preferably 0.1 to 30% (weight ratio). used.

使用できるアルブミンとしては、牛血清アルブミン(BSA)、卵白アルブミン(OVA)などが挙げられる。特にBSAが好ましい。該アルブミンの含有量は、好ましくは1〜80%(重量比)、より好ましくは5〜70%(重量比)の範囲で使用される。   Examples of albumin that can be used include bovine serum albumin (BSA) and ovalbumin (OVA). BSA is particularly preferred. The albumin content is preferably used in the range of 1 to 80% (weight ratio), more preferably 5 to 70% (weight ratio).

組成物には、さらに他の安定化剤などをPQQGDHの反応に特に悪い影響を及ぼさないような範囲で添加してもよい。本発明の安定化剤の配合法は特に制限されるものではない。例えばPQQGDHを含む緩衝液に安定化剤を配合する方法、安定化剤を含む緩衝液にPQQGDHを配合する方法、あるいはPQQGDHと安定化剤を緩衝液に同時に配合する方法などが挙げられる。   Further, other stabilizers and the like may be added to the composition in such a range that the reaction of PQQGDH is not particularly adversely affected. The method of compounding the stabilizer of the present invention is not particularly limited. Examples of the method include a method of mixing a stabilizer with a buffer containing PQQGDH, a method of mixing PQQGDH with a buffer containing a stabilizer, and a method of simultaneously mixing PQQGDH and a stabilizer with a buffer.

また、カルシウムイオンを添加しても安定化効果が得られる。すなわち、カルシウムイオンまたはカルシウム塩を含有させることにより、改変タンパク質を安定化させることができる。カルシウム塩としては、塩化カルシウムまたは酢酸カルシウムもしくはクエン酸カルシウム等の無機酸または有機酸のカルシウム塩などが例示される。また、水性組成物において、カルシウムイオンの含有量は、1×10−4〜1×10−2Mであることが好ましい。   Further, even if calcium ions are added, a stabilizing effect can be obtained. That is, the modified protein can be stabilized by including calcium ions or calcium salts. Examples of the calcium salt include calcium salts of inorganic or organic acids such as calcium chloride, calcium acetate and calcium citrate. Further, in the aqueous composition, the content of calcium ions is preferably 1 × 10 −4 to 1 × 10 −2 M.

カルシウムイオンまたはカルシウム塩を含有させることによる安定化効果は、グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されたアミノ酸を含有させることにより、さらに向上する。   The stabilizing effect by including calcium ions or calcium salts is further improved by including an amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine.

グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されるアミノ酸は、1種または2種以上であってもよい。前記の水性組成物において、グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されたアミノ酸の含有量は、0.01〜0.2重量%であることが好ましい。   The amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine may be one kind or two or more kinds. In the above aqueous composition, the content of the amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine is preferably 0.01 to 0.2% by weight.

さらに血清アルブミンを含有させてもよい。前記の水性組成物に血清アルブミンを添加する場合、その含有量は0.05〜0.5重量%であることが好ましい。   Further, serum albumin may be contained. When serum albumin is added to the aqueous composition, the content is preferably 0.05 to 0.5% by weight.

緩衝剤としては、通常のものが使用され、通常、組成物のpHを5〜10とするものが好ましい。具体的にはトリス塩酸、ホウ酸、グッド緩衝液が用いられるが、カルシウムと不溶性の塩を形成しない緩衝液はすべて使用できる。   As the buffering agent, an ordinary one is used, and usually, one having a pH of the composition of 5 to 10 is preferable. Specifically, Tris-HCl, boric acid, and Good's buffer are used, but any buffer that does not form an insoluble salt with calcium can be used.

前記の水性組成物には、必要により他の成分、例えば界面活性剤、安定化剤、賦形剤などを添加しても良い。   If necessary, other components such as a surfactant, a stabilizer, and an excipient may be added to the aqueous composition.

本発明においては以下の種々の方法によりグルコースを測定することができる。
グルコースアッセイキット
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキットを特徴とする。本発明のグルコースアッセイキットは、本発明に従う改変型PQQGDHを少なくとも1回のアッセイに十分な量で含む。典型的には、キットは、本発明の改変型PQQGDHに加えて、アッセイに必要な緩衝液、メディエーター、キャリブレーションカーブ作製のためのグルコース標準溶液、ならびに使用の指針を含む。本発明に従う改変型PQQGDHは種々の形態で、例えば、凍結乾燥された試薬として、または適切な保存溶液中の溶液として提供することができる。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で提供されるが、アポ酵素の形態で提供し、使用時にホロ化することもできる。
In the present invention, glucose can be measured by the following various methods.
Glucose Assay Kit The present invention also features a glucose assay kit comprising a modified PQQGDH according to the present invention. The glucose assay kit of the present invention comprises the modified PQQGDH according to the present invention in an amount sufficient for at least one assay. Typically, the kit contains, in addition to the modified PQQGDH of the present invention, buffers necessary for the assay, mediators, glucose standard solutions for preparing calibration curves, and guidelines for use. The modified PQQGDH according to the invention can be provided in various forms, for example, as a lyophilized reagent or as a solution in a suitable storage solution. Preferably, the modified PQQGDH of the present invention is provided in a holo-form, but can also be provided in the form of an apoenzyme and holo-formed at the time of use.

グルコースセンサー
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを用いるグルコースセンサーを特徴とする。電極としては、カーボン電極、金電極、白金電極などを用い、この電極上に本発明の酵素を固定化する。固定化方法としては、架橋試薬を用いる方法、高分子マトリックス中に封入する方法、透析膜で被覆する方法、光架橋性ポリマー、導電性ポリマー、酸化還元ポリマーなどがあり、あるいはフェロセンあるいはその誘導体に代表される電子メディエーターとともにポリマー中に固定あるいは電極上に吸着固定してもよく、またこれらを組み合わせて用いてもよい。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で電極上に固定化するが、アポ酵素の形態で固定化し、PQQを別の層としてまたは溶液中で提供することもできる。典型的には、グルタルアルデヒドを用いて本発明の改変型PQQGDHをカーボン電極上に固定化した後、アミン基を有する試薬で処理してグルタルアルデヒドをブロッキングする。
Glucose Sensor The present invention also features a glucose sensor using the modified PQQGDH according to the present invention. As the electrode, a carbon electrode, a gold electrode, a platinum electrode, or the like is used, and the enzyme of the present invention is immobilized on the electrode. Examples of the immobilization method include a method using a crosslinking reagent, a method of enclosing in a polymer matrix, a method of coating with a dialysis membrane, a photocrosslinkable polymer, a conductive polymer, and a redox polymer. It may be fixed in a polymer together with a representative electron mediator or adsorbed and fixed on an electrode, or may be used in combination. Preferably, the modified PQQGDH of the present invention is immobilized on the electrode in a holated form, but it can also be immobilized in the form of an apoenzyme and PQQ provided as a separate layer or in solution. Typically, the modified PQQGDH of the present invention is immobilized on a carbon electrode using glutaraldehyde, and then treated with a reagent having an amine group to block glutaraldehyde.

グルコース濃度の測定は、以下のようにして行うことができる。恒温セルに緩衝液を入れ、PQQおよびCaCl、およびメディエーターを加えて一定温度に維持する。メディエーターとしては、フェリシアン化カリウム、フェナジンメトサルフェートなどを用いることができる。作用電極として本発明の改変型PQQGDHを固定化した電極を用い、対極(例えば白金電極)および参照電極(例えばAg/AgCl電極)を用いる。カーボン電極に一定の電圧を印加して、電流が定常になった後、グルコースを含む試料を加えて電流の増加を測定する。標準濃度のグルコース溶液により作製したキャリブレーションカーブに従い、試料中のグルコース濃度を計算することができる。 The measurement of the glucose concentration can be performed as follows. The buffer is placed in a thermostat cell, and PQQ and CaCl 2 and a mediator are added to maintain a constant temperature. As the mediator, potassium ferricyanide, phenazine methosulfate and the like can be used. An electrode on which the modified PQQGDH of the present invention is immobilized is used as a working electrode, and a counter electrode (for example, a platinum electrode) and a reference electrode (for example, an Ag / AgCl electrode) are used. After a constant voltage is applied to the carbon electrode and the current becomes steady, a sample containing glucose is added and the increase in the current is measured. The glucose concentration in the sample can be calculated according to a calibration curve prepared using a standard concentration glucose solution.

以下、本発明を実施例に基づきより詳細に説明する。
実施例1 :PQQ依存性グルコース脱水素酵素遺伝子の発現プラスミドの構築
野生型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の発現プラスミドpNPG5は、ベクターpBluescript SK(−)のマルチクローニング部位にアシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii) NCIMB11517株由来のPQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする構造遺伝子を挿入したものである。その塩基配列を配列表の配列番号2に、また該塩基配列から推定されるPQQ依存性グルコース脱水素酵素のアミノ酸配列を配列表の配列番号1に示す。
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples.
Example 1 Construction of Expression Plasmid for PQQ-Dependent Glucose Dehydrogenase Gene Expression plasmid pNPG5 for wild-type PQQ-dependent glucose dehydrogenase was constructed at the multiple cloning site of vector pBluescript SK (-) in Acinetobacter baumannini. This is the one into which a structural gene encoding PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from NCIMB11517 strain has been inserted. The nucleotide sequence is shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing, and the amino acid sequence of PQQ-dependent glucose dehydrogenase deduced from the nucleotide sequence is shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.

実施例2:変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の作製
野生型PQQ依存性グルコース脱水素酵素遺伝子を含む組換えプラスミドpNPG5と配列番号3記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、QuickChangeTM Site−Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE製)を用いて、そのプロトコールに従って変異処理操作を行い、更に塩基配列を決定して、配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがアスパラギンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M1)を取得した。
pNPG5と配列番号4記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M2)を取得した。
pNPG5と配列番号5記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがスレオニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M3)を取得した。
pNPG5と配列番号6記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがメチオニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M4)を取得した。
pNPG5と配列番号7記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがグリシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M5)を取得した。
pNPG5と配列番号8記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがリジンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M6)取得した。
pNPG5と配列番号9記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがイソロイシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M7)を取得した。
pNPG5と配列番号10記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがバリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M8)を取得した。
pNPG5と配列番号11記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M9)を取得した。
pNPG5と配列番号22記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の20番目のリジンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M10)を取得した。
pNPG5と配列番号23記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の89番目のリジンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミドを取得した。更にこのプラスミドと配列番号24記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の89番目のリジンがグルタミン酸に、300番目のリジンがアルギニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M11)を取得した。
pNPG5と配列番号25記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の246番目のグルタミンがヒスチジンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M12)を取得した。
pNPG5と配列番号26記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがセリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M13)を取得した。
pNPG5と配列番号27記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに、169番目のロイシンがアスパラギン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M14)を取得した。
pNPG5と配列番号66記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M15)を取得した。
pNPG5と配列番号67記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがプロリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M16)を取得した。
pNPG5と配列番号68記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに、169番目のロイシンがグリシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M17)を取得した。
pNPG5、pNPG5M1、pNPG5M2、pNPG5M3、pNPG5M4、pNPG5M5、pNPG5M6、pNPG5M7、pNPG5M8、pNPG5M9、pNPG5M10、pNPG5M11、pNPG5M12、pNPG5M13、pNPG5M14、pNPG5M15、pNPG5M16,pNPG5M17の各組換えプラスミドで大腸菌コンピテントセル(エシェリヒア・コリーJM109;東洋紡績製)を形質転換し、該形質転換体をそれぞれ取得した。
Example 2 Preparation of Mutant PQQ-Dependent Glucose Dehydrogenase A recombinant plasmid pNPG5 containing a wild-type PQQ-dependent glucose dehydrogenase gene, a synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 3 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto were prepared. Using QuickChange Site-Directed Mutagenesis Kit (manufactured by STRATAGENE), a mutagenesis operation was performed according to the protocol, the base sequence was determined, and the glutamine at position 76 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 was converted to asparagine. A recombinant plasmid (pNPG5M1) encoding the substituted mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 76 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 has been substituted with glutamic acid in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 4, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M2) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 76 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 is replaced with threonine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 5, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M3) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 76 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 has been substituted with methionine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 6, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M4) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 76 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 has been substituted with glycine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 7, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M5) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 76 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 has been substituted with lysine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 8, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M6) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 168 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is replaced with isoleucine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 9, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M7) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which glutamine at position 168 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is substituted with valine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 10 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M8) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ obtained by substituting 168th glutamine of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 with alanine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 11 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M9) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which lysine at position 20 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 has been substituted with glutamic acid in the same manner as described above, based on pNPG5 and the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 22 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M10) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which lysine at position 89 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 has been substituted with glutamic acid in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 23, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid encoding dependent glucose dehydrogenase was obtained. Further, based on this plasmid and the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 24 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, the lysine at position 89 in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 was replaced with glutamic acid, A recombinant plasmid (pNPG5M11) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase in which lysine was substituted with arginine was obtained.
A mutant PQQ in which glutamine at position 246 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 has been substituted with histidine in the same manner as described above, based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 25, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M12) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Based on pNPG5 and the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 26 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, glutamine at position 168 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 was replaced by serine, and leucine at position 169 was replaced by the same method as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M13) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with serine was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 27 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, glutamine at position 168 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 was replaced with alanine and leucine at position 169 was replaced with the same method as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M14) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with aspartic acid was obtained.
Based on pNPG5 and the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 66 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, glutamine at position 168 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 was replaced with serine, and leucine at position 169 was replaced with the same method as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M15) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with glutamic acid was obtained.
Based on pNPG5 and the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 67 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, 168th glutamine and 169th leucine of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 were used in the same manner as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M16) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with proline was obtained.
Based on pNPG5 and the synthetic oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 68 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, glutamine at position 168 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 was replaced with alanine, and leucine at position 169 was replaced with the same method as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M17) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with glycine was obtained.
pNPG5, pNPG5M1, pNPG5M2, pNPG5M3, pNPG5M4, pNPG5M5, pNPG5M6, pNPG5M7, pNPG5M8, pNPG5M9, pNPG5M10, pNPG5M11, pNPG5M5, pNPG5M5, pNPG5M5 ; Manufactured by Toyobo Co., Ltd.) to obtain the transformants.

実施例3:シュードモナス属細菌で複製できる発現ベクターの構築
実施例2で得た組換えプラスミドpNPG5M1のDNA5μgを制限酵素BamHIおよびXHoI(東洋紡績製)で切断して、変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の構造遺伝子部分を単離した。単離したDNAとBamHIおよびXHoIで切断したpTM33(1μg)とをT4DNAリガーゼ1単位で16℃、16時間反応させ、DNAを連結した。連結したDNAはエシェリヒア・コリDH5αのコンピテントセルを用いて形質転換を行った。得られた発現プラスミドをpNPG6M1と命名した。
pNPG5、pNPG5M2、pNPG5M3、pNPG5M4、pNPG5M5、pNPG5M6、pNPG5M7、pNPG5M8、pNPG5M9、pNPG5M10、pNPG5M11、pNPG5M12、pNPG5M13、pNPG5M14、pNPG5M15、pNPG5M16,pNPG5M17の各組換えプラスミドについても上記方法と同様にして発現プラスミドを取得した。得られた発現プラスミドそれぞれpNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17と命名した。
Example 3 Construction of Expression Vector Capable of Replicating in Pseudomonas Bacteria 5 μg of the DNA of the recombinant plasmid pNPG5M1 obtained in Example 2 was digested with restriction enzymes BamHI and XHoI (manufactured by Toyobo Co., Ltd.), and mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenation was performed. The structural gene portion of the enzyme was isolated. The isolated DNA and pTM33 (1 μg) digested with BamHI and XHoI were reacted with 1 unit of T4 DNA ligase at 16 ° C. for 16 hours to ligate the DNA. The ligated DNA was transformed using competent cells of Escherichia coli DH5α. The resulting expression plasmid was named pNPG6M1.
pNPG5, pNPG5M2, pNPG5M3, pNPG5M4, pNPG5M5, pNPG5M6, pNPG5M7, pNPG5M8, pNPG5M9, pNPG5M10, pNPG5M11, pNPG5M12, pNPG5M13, pNPG5M14, pNPG5M15, pNPG5M16, obtain an expression plasmid in the same manner as the above-mentioned method also each recombinant plasmid pNPG5M17 did. Each resulting expression plasmid pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M11, pNPG6M12, pNPG6M13, pNPG6M14, pNPG6M15, pNPG6M16, was named PNPG6M17.

実施例4:シュードモナス属細菌の形質転換体の作製
シュードモナス・プチダTE3493(微工研寄12298号)をLBG培地(LB培地+0.3%グリセロール)で30℃、16時間培養し、遠心分離(12,000rpm、10分間)により菌体を回収し、この菌体に氷冷した300mMシュークロースを含む5mMK−リン酸緩衝液(pH7.0)8mlを加え、菌体を懸濁した。再度遠心分離(12,000rpm、10分間)により菌体を回収し、この菌体に氷冷した300mMシュークロースを含む5mMK−リン酸緩衝液(pH7.0)0.4mlを加え、菌体を懸濁した。
該懸濁液に実施例3で得た発現プラスミドpNPG6M1を0.5μg加え、エレクトロポレーション法により形質転換した。100μg/mlのストレプトマイシンを含むLB寒天培地に生育したコロニーより、目的とする形質転換体を得た。
pNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17の各発現プラスミドについても上記方法と同様にして、該形質転換体をそれぞれ取得した。
Example 4 Preparation of Transformant of Pseudomonas Species Bacteria Pseudomonas putida TE3493 (Miyakoken No. 12298) was cultured in an LBG medium (LB medium + 0.3% glycerol) at 30 ° C. for 16 hours, and centrifuged (12). (000 rpm, 10 minutes), and 8 ml of ice-cooled 5 mM K-phosphate buffer (pH 7.0) containing 300 mM sucrose was added to suspend the cells. The cells were collected again by centrifugation (12,000 rpm, 10 minutes), and 0.4 ml of an ice-cooled 5 mM K-phosphate buffer (pH 7.0) containing 300 mM sucrose was added. Suspended.
0.5 μg of the expression plasmid pNPG6M1 obtained in Example 3 was added to the suspension, and the suspension was transformed by electroporation. The desired transformant was obtained from a colony grown on an LB agar medium containing 100 μg / ml streptomycin.
pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M11, pNPG6M12, pNPG6M12, pNPG6M12, pNPG6M13, pNPG6M13, pNPG6M6, pNPG6M13, pNPG6M16, pNPG6M16, pNPG6M16, pNPG6M6, pNPG6M13, pNPG6M6, pNPG6M6, pNPG6M6, pNPG6M6, pNPG6M6, pNPG6M6 Were acquired respectively.

試験例1
GDH活性の測定方法
測定原理
D−グルコース+PMS+PQQGDH → D−グルコノ−1,5−ラクトン + PMS(red)
2PMS(red) + NTB → 2PMS + ジホルマザン
フェナジンメトサルフェート(PMS)(red)によるニトロテトラゾリウムブルー(NTB)の還元により形成されたジホルマザンの存在は、570nmで分光光度法により測定した。
単位の定義
1単位は、以下に記載の条件下で1分当たりジホルマザンを0.5ミリモル形成させるPQQGDHの酵素量をいう。
(3)方法
試薬
A.D−グルコース溶液:0.5M(0.9g D−グルコース(分子量180.16)/10ml HO)
B.PIPES−NaOH緩衝液, pH6.5:50mM(60mLの水中に懸濁した1.51gのPIPES(分子量302.36)を、5N NaOHに溶解し、2.2mlの10% Triton X−100を加える。5N NaOHを用いて25℃でpHを6.5±0.05に調整し、水を加えて100mlとした。)
C.PMS溶液:3.0mM(9.19mgのフェナジンメトサルフェート(分子量817.65)/10mlHO)
D.NTB溶液:6.6mM(53.96mgのニトロテトラゾリウムブルー(分子量817.65)/10mlHO)
E.酵素希釈液:1mM CaCl, 0.1% Triton X−100, 0.1% BSAを含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
手順
遮光ビンに以下の反応混合物を調製し、氷上で貯蔵した(用時調製)
1.8ml D−グルコース溶液 (A)
24.6ml PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5) (B)
2.0ml PMS溶液 (C)
1.0ml NTB溶液 (D)
Test example 1
Measurement method of GDH activity Measurement principle D-glucose + PMS + PQQGDH → D-glucono-1,5-lactone + PMS (red)
2PMS (red) + NTB → 2PMS + The presence of diformazan formed by reduction of nitrotetrazolium blue (NTB) with diformazanphenazine methosulfate (PMS) (red) was measured spectrophotometrically at 570 nm.
Definition of Unit One unit refers to the amount of PQQGDH enzyme that forms 0.5 mmol of diformazan per minute under the conditions described below.
(3) Method reagent A. D- glucose solution: 0.5M (0.9 g D- glucose (molecular weight 180.16) / 10ml H 2 O)
B. PIPES-NaOH buffer, pH 6.5: Dissolve 1.51 g of PIPES (molecular weight 302.36) suspended in 60 mL of water in 5N NaOH and add 2.2 ml of 10% Triton X-100. The pH was adjusted to 6.5 ± 0.05 at 25 ° C. using 5N NaOH, and water was added to make 100 ml.)
C. PMS solution: 3.0 mM (9.19 mg of phenazine methosulfate (molecular weight 817.65) / 10 ml H 2 O)
D. NTB solution: 6.6 mM (53.96 mg nitrotetrazolium blue (molecular weight 817.65) / 10 ml H 2 O)
E. FIG. Enzyme diluent: 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5) containing 1 mM CaCl 2 , 0.1% Triton X-100, 0.1% BSA
Procedure Prepare the following reaction mixture in a light-shielded bottle and store on ice (prepared before use)
1.8 ml D-glucose solution (A)
24.6 ml PIPES-NaOH buffer (pH 6.5) (B)
2.0ml PMS solution (C)
1.0 ml NTB solution (D)

Figure 2004313180
Figure 2004313180

3.0mlの反応混合液を試験管(プラスチック製)に入れ、37℃で5分間予備加温した。
0.1mlの酵素溶液を加え、穏やかに反転して混合した。
570nmでの水に対する吸光度の増加を37℃に維持しながら分光光度計で4〜5分間記録し、曲線の初期直線部分からの1分当たりのΔODを計算した(ODテスト)。
同時に、酵素溶液に代えて酵素希釈液(E)加えることを除いては同一の方法を繰り返し、ブランク(ΔODブランク)を測定した。
アッセイの直前に氷冷した酵素希釈液(E)で酵素粉末を溶解し、同一の緩衝液で0.1−0.8U/mlに希釈した(該酵素の接着性のためにプラスチックチューブの使用が好ましい)。
計算
活性を以下の式を用いて計算する:
U/ml={ΔOD/min(ΔODテスト− ΔODブランク)×Vt×df}/(20.1×1.0×Vs)
U/mg=(U/ml)×1/C
Vt:総体積(3.1ml)
Vs:サンプル体積(1.0ml)
20.1:ジホルマザンの1/2ミリモル分子吸光係数
1.0:光路長(cm)
df:希釈係数
C:溶液中の酵素濃度(c mg/ml)
3.0 ml of the reaction mixture was placed in a test tube (made of plastic) and preliminarily heated at 37 ° C. for 5 minutes.
0.1 ml of enzyme solution was added and mixed by gentle inversion.
The increase in absorbance for water at 570 nm was recorded on a spectrophotometer for 4-5 minutes while maintaining at 37 ° C., and the ΔOD per minute from the initial linear portion of the curve was calculated (OD test).
At the same time, a blank (ΔOD blank) was measured by repeating the same method except that an enzyme diluent (E) was added instead of the enzyme solution.
Immediately before the assay, the enzyme powder was dissolved in ice-cold enzyme diluent (E) and diluted to 0.1-0.8 U / ml with the same buffer (use of a plastic tube for adhesion of the enzyme). Is preferred).
Calculation Activity is calculated using the following formula:
U / ml = {ΔOD / min (ΔOD test−ΔOD blank) × Vt × df} / (20.1 × 1.0 × Vs)
U / mg = (U / ml) × 1 / C
Vt: Total volume (3.1 ml)
Vs: sample volume (1.0 ml)
20.1: 1/2 mmol molecular absorption coefficient of diformazan 1.0: Optical path length (cm)
df: dilution coefficient C: enzyme concentration in solution (c mg / ml)

ホロ型発現精製酵素の調製方法
500mlのTerrific brothを2L容坂口フラスコに分注し、121℃、20分間オートクレーブを行い、放冷後別途無菌濾過したストレプトマイシンを100μg/mlになるように添加した。この培地に100μg/mlのストレプトマイシンを含むPY培地で予め30℃、24時間培養したシュードモナス・プチダTE3493(pNPG6M1)の培養液を5ml接種し、30℃で40時間通気攪拌培養した。培養終了時のPQQ依存性グルコース脱水素酵素活性は、前記活性測定において、培養液1ml当たり約120U/mlであった。
上記菌体を遠心分離により集菌し、20mMリン酸緩衝液(pH7.0)に懸濁した後、超音波処理により破砕し、更に遠心分離を行い、上清液を粗酵素液として得た。得られた粗酵素液をHiTrap−SP(アマシャム−ファルマシア)イオン交換カラムクロマトグラフィーにより分離・精製した。次いで10mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)で透析した後に終濃度が1mMになるように塩化カルシウムを添加した。最後にHiTrap−DEAE(アマシャム−ファルマシア)イオン交換カラムクロマトグラフィーにより分離・精製し、精製酵素標品を得た。本方法により得られた標品は、SDS−PAGE的にほぼ単一なバンドを示した。
pNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17によるシュードモナス・プチダTE3493形質転換体についても上記方法と同様にして精製酵素標品を取得した。
このようにして取得した精製酵素を用いて性能を評価した。
Preparation method of holo-type expression purified enzyme 500 ml of Terrific broth was dispensed into a 2 L Sakaguchi flask, autoclaved at 121 ° C. for 20 minutes, and allowed to cool, and then separately sterile-filtered streptomycin was added to 100 μg / ml. To this medium, 5 ml of a culture solution of Pseudomonas putida TE3493 (pNPG6M1) previously cultured at 30 ° C. for 24 hours in a PY medium containing 100 μg / ml streptomycin was inoculated, and cultured under aeration and stirring at 30 ° C. for 40 hours. The PQQ-dependent glucose dehydrogenase activity at the end of the culture was about 120 U / ml per 1 ml of the culture in the above activity measurement.
The cells were collected by centrifugation, suspended in 20 mM phosphate buffer (pH 7.0), disrupted by sonication, and further centrifuged to obtain a supernatant as a crude enzyme solution. . The obtained crude enzyme solution was separated and purified by HiTrap-SP (Amersham-Pharmacia) ion exchange column chromatography. Then, after dialysis against a 10 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5), calcium chloride was added to a final concentration of 1 mM. Finally, it was separated and purified by HiTrap-DEAE (Amersham-Pharmacia) ion exchange column chromatography to obtain a purified enzyme preparation. The sample obtained by this method showed an almost single band on SDS-PAGE.
pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M11, pNPG6M12, pNPG6M12, pNPG6M13, pNPG6M6, pNPG6M6, pNPG6M13, pNPG6M6, pNPG6M13, pNPG6M6 An enzyme preparation was obtained.
The performance was evaluated using the purified enzyme thus obtained.

Km値の測定
上記の活性測定方法に従い、PQQGDHの活性を測定した。グルコースに対するKm値の測定は、上記活性測定方法の基質濃度を変化させて実施した。また、マルトースに対するKm値の測定は、上記活性測定方法のグルコース溶液をマルトース溶液に置き換え、グルコースに対するKm値の測定同様基質濃度を変化させて実施した。結果を表2A表2B、表6,表9,表14及び表18に示す。
Measurement of Km value The activity of PQQGDH was measured according to the activity measurement method described above. The measurement of the Km value for glucose was performed by changing the substrate concentration in the above-described activity measurement method. Further, the Km value for maltose was measured by replacing the glucose solution of the above-described activity measurement method with a maltose solution and changing the substrate concentration as in the measurement of the Km value for glucose. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 6, Table 9, Table 14, and Table 18.

基質特異性
上記の活性測定方法に従い、PQQGDHの活性を測定した。グルコースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性値とマルトースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性値を測定し、グルコースを基質とした場合の測定値を100とした場合の相対値を求めた。マルトースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性に際しては、0.5Mのマルトース溶液を調製して活性測定に用いた。結果を表2A、表2B、表4、表5、表6、表8、表9、表11、表13、表14及び表18に示す。
Substrate specificity The activity of PQQGDH was measured according to the activity measurement method described above. The dehydrogenase activity value when glucose was used as the substrate solution and the dehydrogenase activity value when maltose was used as the substrate solution were measured, and the relative value when the measured value was 100 when glucose was used as the substrate was determined. Was. For dehydrogenase activity when maltose was used as a substrate solution, a 0.5 M maltose solution was prepared and used for activity measurement. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 4, Table 5, Table 6, Table 8, Table 9, Table 11, Table 13, Table 14, and Table 18.

熱安定性の測定
各種PQQGDHを酵素濃度5U/ml、緩衝液(1mM CaCl、1μM PQQを含む10mM PIPES−NaOH(pH6.5)中で保存し、58℃で熱処理後の活性残存率を求めた。結果を表2A、表2B、表6、表9、表14及び表18に示す。なお、熱処理を行なった時間は、表2B、表18の試験のみ30分間、その他の試験は20分間である。
Measurement of thermal stability Various PQQGDHs were stored in a buffer solution (1 mM CaCl 2 , 10 mM PIPES-NaOH (pH 6.5) containing 1 μM PQQ) at an enzyme concentration of 5 U / ml, and the residual activity after heat treatment at 58 ° C. was determined. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 6, Table 9, Table 14, and Table 18. The heat treatment time was 30 minutes for the tests of Tables 2B and 18 only, and 20 minutes for the other tests. It is.

至適pHの測定
0.22% Triton−X100を含む 50mMリン酸緩衝液(pH5.0〜8.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM 酢酸緩衝液(pH3.0〜6.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.0〜7.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0〜9.0)中で酵素活性を測定した。結果を図1に示す。また、最も高い活性を示したpHを表2Aに示す。
Measurement of optimal pH 50 mM phosphate buffer (pH 5.0 to 8.0) containing 0.22% Triton-X100, 50 mM acetate buffer (pH 3.0 to 6.0) containing 0.22% Triton-X100 ), 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.0-7.0) containing 0.22% Triton-X100, 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0-9.0) containing 0.22% Triton-X100. The enzyme activity was measured in. The results are shown in FIG. The pH showing the highest activity is shown in Table 2A.

Figure 2004313180
Figure 2004313180

Q76Kのグルコース定量性の確認
0.45U/mlのQ76Kを含んだ下記反応試薬を調整した。
50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
1mM CaCl2
0.22% Triton−X100
0.4mM PMS
0.26mM WST−1(水溶性テトラゾリウム塩、同仁化学研究所製)
下記に示すグルコース量の測定方法に従い、試料として精製水、100mg/dl標準液及びグルコース水溶液(600mg/dl)の10水準の希釈系列を測定し、直線性を確認した。
結果を図2に示した。
Confirmation of glucose quantitative property of Q76K The following reaction reagent containing 0.45 U / ml of Q76K was prepared.
50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5)
1 mM CaCl2
0.22% Triton-X100
0.4 mM PMS
0.26 mM WST-1 (water-soluble tetrazolium salt, Dojindo Laboratories)
According to the glucose amount measurement method described below, 10 levels of dilution series of purified water, 100 mg / dl standard solution and glucose aqueous solution (600 mg / dl) were measured as samples, and the linearity was confirmed.
The results are shown in FIG.

グルコース量の測定方法
試料量3μlに試薬300μlを加え、試薬添加後2分後からの1分間における吸光度変化を求め、精製水及びグルコース100mg/dl標準液での2点検量線に基づき試料中のグルコース量を求めた。尚、測定装置は日立7150形自動分析装置を使用し、測定波長は、主波長480nmのみ、測定温度は37℃で実施した。
図2より、0−600mg/dlの範囲で良好な直線性が確認された。
Measurement method of glucose amount 300 μl of a reagent was added to a sample amount of 3 μl, the change in absorbance in 1 minute from 2 minutes after the addition of the reagent was determined, and the amount of glucose in the sample was determined based on two calibration curves with purified water and glucose 100 mg / dl standard solution. The amount of glucose was determined. The measurement was performed using a Hitachi 7150 type automatic analyzer, the measurement wavelength was only 480 nm, and the measurement temperature was 37 ° C.
From FIG. 2, good linearity was confirmed in the range of 0 to 600 mg / dl.

Q76Kのマルトース作用性の確認
0.45U/mlのQ76Kを含んだ下記反応試薬を調整した。
50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
1mM CaCl2
0.22% Triton−X100
0.4mM PMS
0.26mM WST−1(同仁化学研究所製)
サンプルとしては100mg/dlまたは300mg/dlのグルコースをベースに0,120,240,360mg/dlのマルトースを上乗せした物を準備した。 上記、グルコース量の測定方法に従い、測定を実施した。
マルトースを含まない100mg/dlグルコース溶液と100とし、ベースに100mg/dlのグルコースを含むサンプルの測定値をそれぞれ相対評価した。同様にマルトースを含まない300mg/dlグルコース溶液と100とし、ベースに300mg/dlのグルコースを含むサンプルの測定値をそれぞれ相対評価した。結果を図3に示す。
Confirmation of maltose action of Q76K The following reaction reagent containing 0.45 U / ml of Q76K was prepared.
50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5)
1 mM CaCl2
0.22% Triton-X100
0.4 mM PMS
0.26 mM WST-1 (manufactured by Dojindo Laboratories)
A sample was prepared by adding 0,120,240,360 mg / dl maltose based on 100 mg / dl or 300 mg / dl glucose. The measurement was performed according to the above-described method for measuring the amount of glucose.
A 100 mg / dl glucose solution containing no maltose was set to 100, and the measured values of the sample containing 100 mg / dl glucose in the base were relatively evaluated. Similarly, a 300 mg / dl glucose solution containing no maltose was set to 100, and the measured values of samples containing 300 mg / dl glucose in the base were relatively evaluated. The results are shown in FIG.

Q76Eのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Eを用いて作用性を評価した。酵素は、0.24U/mlの濃度で添加した。結果を図4に示す。
Confirmation of maltose action of Q76E The action was evaluated using Q168E similarly to the confirmation of maltose action of Q76K. Enzyme was added at a concentration of 0.24 U / ml. FIG. 4 shows the results.

Q168Vのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Vを用いて作用性を評価した。酵素は、0.35U/mlの濃度で添加した。結果を図5に示す。
Confirmation of maltose action of Q168V The action was evaluated using Q168V similarly to the confirmation of maltose action of Q76K. Enzyme was added at a concentration of 0.35 U / ml. FIG. 5 shows the results.

Q168Aのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Aを用いて作用性を評価した。酵素は、0.6U/mlの濃度で添加した。結果を図6に示す。
Confirmation of maltose action of Q168A In the same manner as confirmation of maltose action of Q76K, the action was evaluated using Q168A. The enzyme was added at a concentration of 0.6 U / ml. FIG. 6 shows the results.

野生型酵素のマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様に野生型酵素を用いて作用性を評価した。酵素は、0.1U/mlの濃度で添加した。結果を図7に示す。
図3、図4、図5、図6、図7より、Q76K、Q76E、Q168V及びQ168Aは野生型酵素に比べ、マルトースに対する作用性が低下していることが確認された。
Confirmation of maltose action of wild-type enzyme Action of maltose action of Q76K was evaluated in the same manner as that of wild-type enzyme. The enzyme was added at a concentration of 0.1 U / ml. FIG. 7 shows the results.
From FIG. 3, FIG. 4, FIG. 5, FIG. 6, and FIG. 7, it was confirmed that Q76K, Q76E, Q168V, and Q168A had lower action on maltose than the wild-type enzyme.

実施例5:変異ライブラリーの構築とスクリーニング
発現プラスミドpNPG5をテンプレートとして、PCR法により構造遺伝子中の167−169領域にランダム変異を導入した。PCR反応は表3に示す組成の溶液中で、98℃2分間、次に、98℃20秒間、60℃30秒間、及び72℃4分間を30サイクルの条件で行った。
Example 5: Construction and screening of mutation library Using the expression plasmid pNPG5 as a template, random mutation was introduced into the 167-169 region in the structural gene by PCR. The PCR reaction was performed in a solution having the composition shown in Table 3 at 98 ° C. for 2 minutes, and then at 98 ° C. for 20 seconds, 60 ° C. for 30 seconds, and 72 ° C. for 4 minutes for 30 cycles.

Figure 2004313180
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得られた変異ライブラリーを大腸菌DH5αに形質転換し、形成された各コロニーを180μl/wellのLB培地(100μg/mlのアンピシリンと26μMのPQQを含む)の分注されたマイクロタイタープレートに植菌し、37℃、24時間培養した。培養液各50μlを別のマイクロタイタープレートに移し、凍結融解の繰り返しによって培養菌体を破砕した後、遠心分離(2000rpm、10分間)を行い、上清を回収した。回収した上清を2枚のマイクロタイタープレートに各10μl分注した。1枚のマイクロタイタープレートはグルコースを基質とした活性測定試薬を用いて活性測定し、もう一枚はマルトースを基質とした活性測定試薬を用いて活性測定し、反応性を比較した。マルトースに対する反応性の変化したクローンが多数得られた。
マルトースに対する反応性の変化したクローンをLB培地(100μg/mlのアンピシリンと26μMのPQQを含む)5mlの分注された試験管で培養し、確認実験を行ったところ、マルトースに対する反応性の変化したクローンが多数得られた。
結果を表4に示す。
The resulting mutant library was transformed into Escherichia coli DH5α, and each formed colony was inoculated on a microtiter plate in which 180 μl / well of LB medium (containing 100 μg / ml of ampicillin and 26 μM of PQQ) was dispensed. Then, the cells were cultured at 37 ° C for 24 hours. Each 50 μl of the culture solution was transferred to another microtiter plate, and the cultured cells were disrupted by repeated freezing and thawing, followed by centrifugation (2000 rpm, 10 minutes) to collect the supernatant. The collected supernatant was dispensed into two microtiter plates in an amount of 10 μl each. One microtiter plate was measured for activity using an activity measuring reagent using glucose as a substrate, and the other was measured for activity using an activity measuring reagent using maltose as a substrate, and the reactivity was compared. Numerous clones with altered reactivity to maltose were obtained.
A clone having a changed reactivity to maltose was cultured in a test tube in which 5 ml of LB medium (containing 100 μg / ml of ampicillin and 26 μM of PQQ) was dispensed, and a confirmation experiment was performed. Many clones were obtained.
Table 4 shows the results.

Figure 2004313180
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同様にして67−69領域(フォワードプライマー:配列番号14に記載、リバースプライマー:配列番号15に記載を使用)、129−131領域(フォワードプライマー:配列番号16に記載、リバースプライマー:配列番号17に記載を使用)、341−343領域(フォワードプライマー:配列番号18に記載、リバースプライマー:配列番号19に記載を使用)にも変異導入した。また、428と429(フォワードプライマー:配列番号20に記載、リバースプライマー:配列番号21に記載を使用)の間に挿入を試みた。
結果を表5に示す。
Similarly, regions 67-69 (forward primer: described in SEQ ID NO: 14, reverse primer: used in SEQ ID NO: 15), regions 129-131 (forward primer: described in SEQ ID NO: 16, reverse primer: SEQ ID NO: 17) Mutations were also introduced into the 341-343 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 18 and reverse primer: used in SEQ ID NO: 19). Insertion was attempted between 428 and 429 (forward primer: described in SEQ ID NO: 20, reverse primer: described in SEQ ID NO: 21).
Table 5 shows the results.

Figure 2004313180
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これらのうち、マルトースに対する作用性が大きく低下している変異体を選抜(Q168S+E245D、Q168A+L169D、Q168S+L169S、Q168S+L169E、Q168A+L169G、Q168S+L169P)し、これらの変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表6に示す。   Among these, mutants having significantly reduced activity on maltose were selected (Q168S + E245D, Q168A + L169D, Q168S + L169S, Q168S + L169E, Q168A + L169G, Q168S + L169P), and plasmids were extracted from these mutants, Example 3 and Example 4. According to the method described, Pseudomonas was transformed to express a holo-type enzyme, a purified enzyme was obtained, and its properties were evaluated. Table 6 shows the results.

Figure 2004313180
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実施例6:Q168部位の変異による基質特異性への影響
実施例5に記載の方法に準じて、Q168C、Q168D、Q168E,Q168F,Q168G,Q168H,Q168K,Q168L,Q168M,Q168N,Q168P、Q168R,Q168S,Q168T、Q168W、Q168Yの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表7に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表8に示す。更に、各変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表9に示す。
Example 6: Effect of mutation at Q168 site on substrate specificity According to the method described in Example 5, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168P, Q168R, Each mutant of Q168S, Q168T, Q168W, and Q168Y was prepared. Table 7 shows the primers used for preparing each mutant. In addition, Table 8 shows the results of comparing the reactivity of maltose with the crushed liquid prepared in a test tube culture using each prepared mutant. Further, a plasmid was extracted from each mutant, and Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4 to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained and its properties were evaluated. Table 9 shows the results.

Figure 2004313180
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Figure 2004313180
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実施例7:L169部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、L169A,L169V,L169H、L169Y、L169K,L169D,L169S,L169N,L169G,L169Cの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表10に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表11に示す。
Example 7: Influence on substrate specificity by mutation of L169 site According to the method described in Example 2, each mutant of L169A, L169V, L169H, L169Y, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G and L169C was used. Prepared. Table 10 shows the primers used for preparing each mutant. Table 11 shows the results of comparison of the reactivity of maltose with the crushed liquid prepared in a test tube culture using each prepared mutant.

Figure 2004313180
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実施例8:Q168A変異体に対するL169部位の変異の組み合わせによる基質特異性への影響
実施例5に記載の方法に準じて、Q168A+L169A、Q168A+L169C、Q168A+L169E、Q168A+L169F、Q168A+L169H、Q168A+L169I、Q168A+L169K、Q168A+L169M、Q168A+L169N、Q168A+L169P、Q168A+L169Q、Q168A+L169R、Q168A+L169S、Q168A+L169T、Q168A+L169V、Q168A+L169W、Q168A+L169Yの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表12に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表13に示す。更に、各変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表14に示す。
Example 8 Effect of Combination of Mutations at L169 Site on Q168A Mutant on Substrate Specificity According to the method described in Example 5, Q168A + L169A, Q168A + L169C, Q168A + L169E, Q168A + L169F, Q168A + L169H, Q168A + 16A, Q168A + L16H Each mutant of Q168A + L169P, Q168A + L169Q, Q168A + L169R, Q168A + L169S, Q168A + L169T, Q168A + L169V, Q168A + L169W, and Q168A + L169Y was prepared. Table 12 shows the primers used for preparing each mutant. Table 13 shows the results of comparison of the reactivity of maltose with the crushed liquid prepared in a test tube culture using each prepared mutant. Further, a plasmid was extracted from each mutant, and Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4 to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained and its properties were evaluated. Table 14 shows the results.

Figure 2004313180
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実施例9:A170部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、A170C、A170D、A170E,A170F,A170G,A170H,A170K,A170L,A170M,A170N,A170P、A170R,A170S,A170T、A170W、A170Y,A170V,A170I,A170Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号69記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号69と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表15に示す。
Example 9: Influence of mutation at A170 site on substrate specificity According to the method described in Example 2, A170C, A170D, A170E, A170F, A170G, A170H, A170K, A170L, A170M, A170N, A170P, A170R, Each mutant of A170S, A170T, A170W, A170Y, A170V, A170I and A170Q was prepared. For preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 69 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 69 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 15 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared by test tube culture.

Figure 2004313180
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実施例10:E245部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、E245C、E245D、E245A,E245F,E245G,E245H,E245K,E245L,E245M,E245N,E245P、E245R,E245S,E245T、E245W、E245Y,E245V,E245I,E245Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号70記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号70と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表16に示す。
Example 10: Effect on mutation of E245 site on substrate specificity According to the method described in Example 2, E245C, E245D, E245A, E245F, E245G, E245H, E245K, E245L, E245M, E245N, E245P, E245R, Each mutant of E245S, E245T, E245W, E245Y, E245V, E245I, and E245Q was prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 70 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 70 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 16 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

Figure 2004313180
Figure 2004313180

実施例11:N249部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、N249C、N249D、N249A,N249F,N249G,N249H,N249K,N249L,N249M,N249E,N249P、N249R,N249S,N249T、N249W、N249V,N249I,N249Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号71記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号71と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表17に示す。
Example 11: Effect of mutation at N249 site on substrate specificity According to the method described in Example 2, N249C, N249D, N249A, N249F, N249G, N249H, N249K, N249L, N249M, N249E, N249P, N249R, Each mutant of N249S, N249T, N249W, N249V, N249I, and N249Q was prepared. For preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 71 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 71 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 17 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

Figure 2004313180
Figure 2004313180

実施例12:E245D変異の組み合わせによる基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、(Q168A+L169G+E245D)、(Q168A+L169P+E245D)の各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号72記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号72と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。また、鋳型DNAとしては実施例8で取得した(Q168A+L169G)または(Q168A+L169P)のplasmidを使用した。調製した変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表18に示す。
Example 12: Effect of combination of E245D mutation on substrate specificity According to the method described in Example 2, (Q168A + L169G + E245D) and (Q168A + L169P + E245D) mutants were prepared. For preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 72 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 72 was used as a reverse primer. As the template DNA, the plasmid (Q168A + L169G) or the plasmid (Q168A + L169P) obtained in Example 8 was used. A plasmid was extracted from the prepared mutant, and Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4 to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained and its properties were evaluated. The results are shown in Table 18.

Figure 2004313180
Figure 2004313180

実施例13:T349部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、T349S、T349P、T349Yの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号73記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号73と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表19に示す。
Example 13: Effect of mutation at T349 site on substrate specificity According to the method described in Example 2, each mutant of T349S, T349P, and T349Y was prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 73 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 73 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 19 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

Figure 2004313180
Figure 2004313180

実施例14:N429部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、N429F、N429P、N429L、N429Yの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号74記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号74と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表20に示す。
Example 14: Effect of mutation at N429 site on substrate specificity According to the method described in Example 2, N429F, N429P, N429L, and N429Y mutants were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 74 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 74 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 20 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

Figure 2004313180
Figure 2004313180

本発明によれば、基質特異性及び/又は熱安定性が改善されたPQQGDHを得ることができる。この改変型PQQGDHは、グルコースアッセイキット、グルコースセンサに利用できる。 According to the present invention, PQQGDH with improved substrate specificity and / or thermal stability can be obtained. This modified PQQGDH can be used for a glucose assay kit and a glucose sensor.

Q76N、Q76E、Q168I、Q168V、Q76T、Q76M、Q168A、野生型、Q76G、Q76Kの至適pHの測定結果を示す。横軸はpH、縦軸は相対活性を示す。図中、黒丸(Acetate)が0.22% Triton−X100を含む50mM 酢酸緩衝液(pH3.0〜6.0)で酵素活性を測定した結果である。同様に、黒四角(PIPES)が0.22% Triton−X100を含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.0〜7.0)、黒三角(K−PB)が0.22% Triton−X100を含む 50mMリン酸緩衝液(pH5.0〜8.0)、黒菱形(Tris−HCl)が0.22% Triton−X100を含む50mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0〜9.0)中でそれぞれ酵素活性を測定した結果である。なお測定値は最大活性を示したものを100%とした相対値で示している。The measurement results of the optimum pH of Q76N, Q76E, Q168I, Q168V, Q76T, Q76M, Q168A, wild type, Q76G, and Q76K are shown. The horizontal axis indicates pH, and the vertical axis indicates relative activity. In the figure, solid circles (Acetate) indicate the results of measurement of enzyme activity using a 50 mM acetate buffer (pH 3.0 to 6.0) containing 0.22% Triton-X100. Similarly, a black square (PIPES) is a 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.0 to 7.0) containing 0.22% Triton-X100, and a black triangle (K-PB) is 0.22% Triton-X100. 50 mM phosphate buffer (pH 5.0-8.0), black diamond (Tris-HCl) in 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0-9.0) containing 0.22% Triton-X100, respectively It is the result of measuring the enzyme activity. In addition, the measured value is shown as a relative value with the value showing the maximum activity being 100%. Q76Kのグルコース定量性の確認結果を示す。横軸は1水準の希釈系列、縦軸はグルコース濃度の測定値(mg/dl)を示す。The result of confirming the glucose quantification of Q76K is shown. The horizontal axis represents a one-level dilution series, and the vertical axis represents the measured value (mg / dl) of the glucose concentration. Q76Kのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The result of confirming the maltose action of Q76K is shown. The horizontal axis indicates the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis indicates the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose was added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black diamond indicates a case where maltose was added based on 300 mg / dl glucose as a sample. Q76Eのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The result of confirming the maltose action of Q76E is shown. The horizontal axis indicates the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis indicates the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose was added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black diamond indicates a case where maltose was added based on 300 mg / dl glucose as a sample. Q168Vのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The result of confirming the maltose action of Q168V is shown. The horizontal axis indicates the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis indicates the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose was added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black diamond indicates a case where maltose was added based on 300 mg / dl glucose as a sample. Q168Aのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The result of confirming the maltose action of Q168A is shown. The horizontal axis indicates the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis indicates the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose was added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black diamond indicates a case where maltose was added based on 300 mg / dl glucose as a sample. 野生型酵素のマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The result of confirming the maltose action of the wild-type enzyme is shown. The horizontal axis indicates the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis indicates the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose was added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black diamond indicates a case where maltose was added based on 300 mg / dl glucose as a sample.

Claims (14)

野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDH。   A modified PQQGDH having reduced activity on disaccharides and / or improved stability compared to wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH). Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、グルコースやPQQとの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、請求項1に記載の改変型PQQGDH。   2. The modified PQQGDH according to claim 1, wherein in the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from the genus Acinetobacter, amino acids involved in binding to glucose or PQQ and / or peripheral amino acids are substituted. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、請求項1に記載の改変型PQQGDH。   The modified PQQGDH according to claim 1, wherein an amino acid involved in calcium ion binding and / or amino acids around the amino acid have been substituted in the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from Acinetobacter. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも安定性が向上した改変型PQQGDH。   A modified PQQGDH having improved stability over wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH). 請求項1〜4のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。   A gene encoding the modified PQQGDH according to claim 1. 請求項5に記載の遺伝子を含むベクター。   A vector comprising the gene according to claim 5. 請求項6に記載のベクターで形質転換された形質転換体。   A transformant transformed with the vector according to claim 6. 請求項7に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。   A method for producing a modified PQQGDH, which comprises culturing the transformant according to claim 7. 請求項1〜4のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。   A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to claim 1. 請求項1〜4のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。   A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to claim 1. 請求項1〜4のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。   A method for measuring glucose comprising the modified PQQGDH according to claim 1. 野生型酵素の活性型立体構造における活性中心から半径15Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる請求項1に記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。   The modified glucose dehydrogenase according to claim 1, which is obtained by mutating amino acids located within a radius of 15 ° from the active center in the active conformation of the wild-type enzyme. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる請求項1に記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。   The modified glucose dehydrogenase according to claim 1, which is obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 ° from an OH group bonded to carbon at position 1 of the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる請求項1に記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。   The modified glucose dehydrogenase according to claim 1, which is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 ° from an OH group bonded to the carbon at position 2 of the substrate in the active conformation of the wild-type enzyme.
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