JP4415282B2 - Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability - Google Patents
Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability Download PDFInfo
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Description
本発明は基質特異性及び/又は熱安定性が改良された改変型グルコースデヒドロゲナーゼ(GDH)に関し、詳しくはピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とする改変型PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(以下PQQGDHとも略記する。)、その製造法及びグルコースセンサーに関する。
本発明の改変型PQQGDHは、臨床検査や食品分析などにおけるグルコースの定量に有用である。
The present invention relates to a modified glucose dehydrogenase (GDH) having improved substrate specificity and / or thermal stability, and more specifically, a modified PQQ-dependent glucose dehydrogenase (hereinafter also abbreviated as PQQGDH) using pyrroloquinoline quinone (PQQ) as a coenzyme. ), Its manufacturing method and glucose sensor.
The modified PQQGDH of the present invention is useful for the determination of glucose in clinical examinations and food analysis.
PQQGDHは、ピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とするグルコースデヒドロゲナーゼである。グルコースを酸化してグルコノラクトンを生成する反応を触媒するから、血糖の測定に用いることができる。血中グルコース濃度は、糖尿病の重要なマーカーとして臨床診断上きわめて重要な指標である。現在、血中グルコース濃度の測定は、グルコースオキシダーゼを使用したバイオセンサーを用いる方法が主流となっているが、反応が溶存酸素濃度に影響されるから、測定値に誤差が生じる可能性があった。このグルコースオキシダーゼにかわる新たな酵素としてPQQ依存性グルコース脱水素酵素が注目されている。 PQQGDH is a glucose dehydrogenase using pyrroloquinoline quinone (PQQ) as a coenzyme. Since it catalyzes the reaction of oxidizing glucose to produce gluconolactone, it can be used for blood glucose measurement. Blood glucose concentration is an extremely important index for clinical diagnosis as an important marker of diabetes. Currently, blood glucose concentration is measured mainly by a method using a biosensor using glucose oxidase, but the reaction is affected by the dissolved oxygen concentration, which may cause an error in the measured value. . PQQ-dependent glucose dehydrogenase has attracted attention as a new enzyme that replaces this glucose oxidase.
我々のグループは、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii) NCIMB11517株が、PQQ依存性グルコース脱水素酵素を産生することを見出し,遺伝子のクローニングならびに高発現系を構築した(特許文献1参照)。PQQ依存性グルコース脱水素酵素はグルコースオキシダーゼに比べて基質特異性、熱安定性に問題点があった。
本発明は、従来技術の課題を背景になされたもので、PQQGDHの基質特異性及び/又は熱安定性を課題としてその改良に関するものである。 The present invention has been made against the background of the problems of the prior art, and relates to the improvement of the substrate specificity and / or thermal stability of PQQGDH.
本発明者らは上記課題を解決するため、鋭意研究した結果、遂に本発明を完成するに到った。即ち本発明は、
1. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDH。
2. 野生型のグルコースデヒドロゲナーゼよりも二糖類に対する作用性が低下したことを特徴とする1.に記載の改変型PQQGDH。
3. 二糖類がマルトースであることを特徴とする2.に記載の改変型PQQGDH。
4. マルトースに対する作用性がグルコースに対する作用性の90%以下であることを特徴とする2.記載の改変型PQQGDH。
5. 二糖類に対するに対するKm値が大きくなったことを特徴とする2.に記載の改変型PQQGDH。
6. 二糖類がマルトースであることを特徴とする5.記載の改変型PQQGDH。
7. マルトースに対するKm値が8mM以上であることを特徴とする5.記載の改変型PQQGDH。
8. 二糖類に対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいことを特徴とする2.記載の改変型PQQGDH。
9. 二糖類がマルトースであることを特徴とする8.記載の改変型PQQGDH。
10. マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値の1.5倍以上であることを特徴とする8.記載の改変型PQQGDH。
11. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、グルコースやPQQとの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
12. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
13. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、67位、68位、69位、76位、89位、129位、130位、131位、167位、168位、169位、170位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、249位、300位、349位及び429位からなる群から選ばれる少なくとも1つの位置のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
14. アミノ酸置換が、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H,
Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H, L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G,L169E,A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q,
E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T, E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N,T349S,T349P,T349Y,N429F,N429P,N429L,N429Y,からなる群から選択される13.に記載の改変型PQQGDH。
15. アミノ酸置換が、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W,
L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (K89E+K300R), (Q168A+L169D), (Q168S+L169S), (N167E+Q168G+L169T), (N167S+Q168N+L169R), (Q168G+L1
69T), (N167G+Q168S+L169Y), (N167L+Q168S+L169G), (N167G+Q168S+L169S+L174F+K49N), (Q168N+L168N+S189R), (N167E+Q168G+L169A+S189G), (N167G+Q168R+L169A), (N167S+Q168G+L169A), (N167G+Q168V+L169S), (N167S+Q168V+L169S), (N167T+Q168I+L169G), (N167G+Q168W+L169N), (N167G+Q168S+L169N), (N167G+Q168S+L169V), (Q168R+L169C), (N167S+Q168L+L168G), (Q168C+L169S), (N167T+Q168N+L169K), (N167G+Q168T+L169A+S207C), (N167A+Q168A+L169P), (N167G+Q168S+L169G), (N167G+Q168G), (N167G+Q168D+L169K), (Q168P+L169G), (N167G+Q168N+L169S), (Q168S+L169G), (N188I+T349S), (N167G+Q168G+L169A+F215Y), (N167G+Q168T+L169G), (Q168G+L169V), (N167G+Q168V+L169T), (N167E+Q168N+L169A), (Q168R+L169A), (N167G+Q168R), (N167G+Q168T), (N167G+Q168T+L169Q), (Q168I+L169G+K300T), (N167G+Q168A), (N167T+Q168L+L169K), (N167M+Q168Y+L169G), (N167E+Q168S), (N167G+Q168T+L169V+S189G), (N167G+Q168G+L169C), (N167G+Q168K+L169D), (Q168A+L169D), (Q168S+E245D), (Q168S+L169S), (A351T), (N167S+Q168S+L169S), (Q168I+L169Q), (N167A+Q168S+L169S), (Q168S+L169E), (Q168A+L169G), (Q168S+L169P), (P67K+E68K),
(P67R+E68R+I69C), (P67D+E68T+I69C), (E129R+K130G+P131G), (E129Q+K130T+P131R), (E129N+P131T), (E129A+K130R+P131K), (E341L+M342P+A343R), (E341S+M342I), A343I, (E341P+M342V+A343C), (E341P+M342V+A343R), (E341L+M342R+A343N), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F),
(Q168A+L169H), (Q168A+L169I), (Q168A+L169K), (Q168A+L169M), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R),
(Q168A+L169S), (Q168A+L169T), (Q168A+L169V), (Q168A+L169W)及び(Q168A+L169Y)からなる群から選択され、該アミノ酸置換により基質特異性が向上した13.に記載の改変型PQQGDH。
16. Acinetobacter属由来PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、428位と429位の間にアミノ酸が挿入されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
17. 1.〜16.のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。
18. 17.に記載の遺伝子を含むベクター。
19. 18.に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
20. 19.に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。
21. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。
22. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。
23. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。
24. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも安定性が向上した改変型PQQGDH。
25. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が48%以上であることを特徴とする24.記載の改変型PQQGDH。
26. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が55%以上であることを特徴とする24.記載の改変型PQQGDH。
27. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が70%以上であることを特徴とする24.記載の改変型PQQGDH。
28. Acinetobacter属由来PQQGDHにおいて、20位、76位、89位、168位、169位、245位、246位及び300位からなる群から選ばれる少なくとも1つの位置のアミノ酸が置換されている、24.に記載のPQQGDH。
29. アミノ酸置換が、K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D,
L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y,L169G及びE245Dからなる群から選択される28.に記載の改変型PQQGDH。
30. アミノ酸置換が、K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S,(Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169K), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169T), (Q168A+L169Y), (Q168A + L169G), (Q168A+L169P+E245D),(Q168A+L169G+E245D) からなる群から選択され、該アミノ酸置換により熱安定性が向上した29.に記載の改変型PQQGDH。
31. 24.〜30.のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。
32. 31.に記載の遺伝子を含むベクター。
33. 32.に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
34. 33.に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。
35. 24.〜33.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。
36. 24.〜33.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。
37. 24.〜33.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。
38. 野生型酵素の活性型立体構造における活性中心から半径15Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.に記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
39. 野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
40. 基質がグルコースで有る39.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
41. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
42. 基質がグルコースである41.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
43. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
44.基質がグルコースで有る43.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
である。
As a result of intensive studies to solve the above problems, the present inventors have finally completed the present invention. That is, the present invention
1. Modified PQQGDH having reduced activity on disaccharides and / or improved stability compared to wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH).
2. 1. The activity on disaccharides is lower than that of wild-type glucose dehydrogenase. Modified PQQGDH described in 1.
3. 1. The disaccharide is maltose Modified PQQGDH described in 1.
4). 1. The action on maltose is 90% or less of the action on glucose. Modified PQQGDH as described.
5). 1. Increased Km value for disaccharides Modified PQQGDH described in 1.
6). 4. The disaccharide is maltose Modified PQQGDH as described.
7). 4. Km value for maltose is 8 mM or more. Modified PQQGDH as described.
8). 1. Km value for disaccharide is larger than Km value for glucose Modified PQQGDH as described.
9. 7. The disaccharide is maltose Modified PQQGDH as described.
10. 7. Km value for maltose is 1.5 times or more of Km value for glucose Modified PQQGDH as described.
11. 1. In the Acinetobacter genus-derived PQQ-dependent glucose dehydrogenase, amino acids involved in binding to glucose and PQQ and / or surrounding amino acids are substituted. Modified PQQGDH described in 1.
12 1. In the Acinetobacter genus PQQ-dependent glucose dehydrogenase, amino acids involved in calcium ion binding and / or surrounding amino acids are substituted. Modified PQQGDH described in 1.
13. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from the genus Acinetobacter, the 67th, 68th, 69th, 76th, 89th, 129th, 130th, 131st, 167th, 168th, 169th, 170th, 170th, 341th, 342 Position, 343, 351, 49, 174, 188, 189, 207, 215, 245, 249, 300, 349 and 429 1. amino acids are substituted; Modified PQQGDH described in 1.
14 Amino acid substitution is Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q8A, Q16E, Q8A, Q16E
Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H, L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G, L169E, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F245Y, 452Y, E45Y, E45Y
E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N130T131T, T129T130 E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N, T349S, T349P, T349Y, N429F, N429P, N429P, N429P Modified PQQGDH described in 1.
15. Amino acid substitution is Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q16H, Q8L, Q16L, Q16K, Q16L, Q16L
L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245H, E245H, E245H, E245H N249Q, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (K89E + K300R), (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (N167E + Q168G + L169T), 8N16L + 16 + 16
69T), (N167G + Q168S + L169Y), (N167L + Q168S + L169G), (N167G + Q168S + L169S + L174F + K49N), (Q168N + L168N + S189R), (N167E + Q168G + L169A + S189G), (N167G + Q168R + L169A), (N167S + Q168G + L169A), (N167G + Q168V + L169S), (N167S + Q168V + L169S), (N167T + Q168I + L169G), (N167G + Q168W + L169N), (N167G + Q168S + L169N) , (N167G + Q168S + L169V), (Q168R + L169C), (N167S + Q168L + L168G), (Q168C + L169S) ), (N167T + Q168N + L169K), (N167G + Q168T + L169A + S207C), (N167A + Q168A + L169P), (N167G + Q168S + L169G), (N167G + Q168G), (N167G + Q168D + L169K), (Q168P + L169G), (N167G + Q168N + L169S), (Q168S + L169G), (N188I + T349S), (N167G + Q168G + L169A + F215Y), (N167G + Q168T + L169G), (Q168G + L169V), (N167G + Q168V + L169T), (N167E + Q168N + L169A), (Q168R + L169A), (N167G + Q168R), (N167G + Q168T), ( N167G + Q168T + L169Q), (Q168I + L169G + K300T), (N167G + Q168A), (N167T + Q168L + L169K), (N167M + Q168Y + L169G), (N167E + Q168S), (N167G + Q168T + L169V + S189G), (N167G + Q168G + L169C), (N167G + Q168K + L169D), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169S), (A351T) , (N167S + Q168S + L169S), (Q168I + L169Q), (N167A + Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P), (P67K + E6) 8K),
(P67R + E68R + I69C), (P67D + E68T + I69C), (E129R + K130G + P131G), (E129Q + K130T + P131R), (E129N + P131T), (E129A + K130R + P131K), (E341L + M342P + A343R), (E341S + M342I), A343I, (E341P + M342V + A343C), (E341P + M342V + A343R), (E341L + M342R + A343N), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F),
(Q168A + L169H), (Q168A + L169I), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R),
12. (Q168A + L169S), (Q168A + L169T), (Q168A + L169V), (Q168A + L169W) and (Q168A + L169Y) are selected from the group consisting of (Q168A + L169Y), and the substrate specificity is improved by the amino acid substitution. Modified PQQGDH described in 1.
16. 1. An amino acid is inserted between positions 428 and 429 in the PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from the genus Acinetobacter. Modified PQQGDH described in 1.
17. 1. -16. A gene encoding the modified PQQGDH according to any one of the above.
18. 17. A vector comprising the gene described in 1.
19. 18. A transformant transformed with the vector described in 1.
20. 19. A method for producing modified PQQGDH, comprising culturing the transformant described in 1. above.
21. 1. -20. A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
22. 1. -20. A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
23. 1. -20. A glucose measurement method comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
24. Modified PQQGDH having improved stability over wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH).
25. 24. The activity remaining rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 48% or more. Modified PQQGDH as described.
26. 23. The activity remaining rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 55% or more. Modified PQQGDH as described.
27. 23. The activity remaining rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 70% or more. Modified PQQGDH as described.
28. 21. Amino acid at the at least one position selected from the group consisting of
29. Amino acid substitution is K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D,
L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169T, L169R, 16L Modified PQQGDH described in 1.
30. Amino acid substitutions are K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168H, 16P Q168S, (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169A), (Q16A + L169H) (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q 168A + L169Y), (Q168A + L169G), (Q168A + L169P + E245D), (Q168A + L169G + E245D), and the amino acid substitution has improved thermal stability. Modified PQQGDH described in 1.
31. 24. -30. A gene encoding the modified PQQGDH according to any one of the above.
32. 31. A vector comprising the gene described in 1.
33. 32. A transformant transformed with the vector described in 1.
34. 33. A method for producing modified PQQGDH, comprising culturing the transformant described in 1. above.
35. 24. -33. A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
36. 24. -33. A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
37. 24. -33. A glucose measurement method comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
38. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 15 mm from the active center in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described in 1.
39. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
40. The substrate is glucose39. The modified glucose dehydrogenase described.
41. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 mm from the OH group bonded to the 1st carbon of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
42. 41. The substrate is glucose The modified glucose dehydrogenase described.
43. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 mm from the OH group bonded to the carbon at the 2-position of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
44. The substrate is glucose 43. The modified glucose dehydrogenase described.
It is.
本発明による改変型PQQGDHは野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下したもの、および/または、野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上した酵素である。本発明による改変型PQQGDHをグルコースアッセイキット及びグルコースセンサに使用することにより、野生型PQQGDHを使用したものよりもより高精度な分析が可能となったり、より安定性の高いグルコースアッセイキット及びグルコースセンサを提供することができる。 The modified PQQGDH according to the present invention is an enzyme having a reduced action on disaccharides compared to wild-type PQQGDH and / or an enzyme having improved thermal stability than wild-type PQQGDH. By using the modified PQQGDH according to the present invention for a glucose assay kit and a glucose sensor, it is possible to perform analysis with higher accuracy than that using a wild type PQQGDH, and a glucose assay kit and glucose sensor with higher stability. Can be provided.
以下、本発明を詳細に説明する。 Hereinafter, the present invention will be described in detail.
本発明の改変型PQQGDHは、野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下したもの、および/または、野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上したものである。 The modified PQQGDH of the present invention has a reduced activity on disaccharides compared to wild-type PQQGDH and / or has improved thermal stability than wild-type PQQGDH.
二糖類に対する作用性とは、二糖類を脱水素する作用を意味する。二糖類としては、マルトース、シュクロース、ラクトース、セロビオースなどが例示され、特にマルトースが例示される。本願発明では、二糖類に対する作用性が低下したことを、基質特異性の向上とも表現する。 The action with respect to a disaccharide means the effect | action which dehydrogenates a disaccharide. Examples of the disaccharide include maltose, sucrose, lactose, cellobiose, and particularly maltose. In the present invention, the decrease in the activity on disaccharides is also expressed as an improvement in substrate specificity.
本発明の改変型PQQGDHは、二糖類に対する作用性が野生型PQQGDHより低下していれば、グルコースに対する作用性は上昇、不変、低下のいずれであっても本発明の改変型PQQGDHに包含される。 The modified PQQGDH of the present invention is included in the modified PQQGDH of the present invention, regardless of whether the activity on glucose is increased, unchanged or decreased, as long as the activity on the disaccharide is lower than that on the wild type PQQGDH. .
本発明の改変型PQQGDHは、グルコース濃度の測定において二糖類に対する作用性が野生型PQQGDHを用いた場合と比較して低下したものを含む。好ましくは、マルトースに対する作用性が低下したものである。マルトースに対する作用性は、好ましくは野生型PQQGDHの90%以下、より好ましくは75%以下、さらに好ましくは60%以下、特に40%以下である。 The modified PQQGDH of the present invention includes those in which the action on disaccharides in the measurement of glucose concentration is lower than when wild-type PQQGDH is used. Preferably, the action property to maltose is reduced. The activity against maltose is preferably 90% or less, more preferably 75% or less, still more preferably 60% or less, particularly 40% or less of wild-type PQQGDH.
本発明の改変型PQQGDHは、マルトースに対する作用性がグルコースに対する作用性の90%以下であるものを含む。 The modified PQQGDH of the present invention includes those having an action on maltose of 90% or less of the action on glucose.
本発明の改変型PQQGDHは、野生型PQQGDHよりも二糖類に対するに対するKm値が大きいものを含む。好ましくは、マルトースに対するKm値が大きいものである。マルトースに対するKm値は、好ましくは8mM以上、より好ましくは12mM以上、特
に20mM以上である。
Modified PQQGDH of the present invention includes those having a larger Km value for disaccharides than wild-type PQQGDH. Preferably, the Km value for maltose is large. The Km value for maltose is preferably 8 mM or more, more preferably 12 mM or more, particularly 20 mM or more.
本発明の改変型PQQGDHは、二糖類に対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいものを含む。好ましくは、マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいものである。あるいは、好ましくは、マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値の1.5倍以上、より好ましくは3倍以上である。 The modified PQQGDH of the present invention includes those in which the Km value for disaccharide is larger than the Km value for glucose. Preferably, the Km value for maltose is greater than the Km value for glucose. Alternatively, preferably, the Km value for maltose is 1.5 times or more, more preferably 3 times or more of the Km value for glucose.
本発明における安定性(熱安定性ともいう)は、58℃、30分間の熱処理後の活性残存率によって評価される。本発明の改変型PQQGDHは、58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が野生型PQQGDHよりも高いものを含む。活性残存率は、好ましくは48%以上、より好ましくは55%以上、特に好ましくは70%以上である。 The stability (also referred to as thermal stability) in the present invention is evaluated by the activity remaining rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes. The modified PQQGDH of the present invention includes those whose activity remaining rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is higher than that of wild-type PQQGDH. The activity remaining rate is preferably 48% or more, more preferably 55% or more, and particularly preferably 70% or more.
野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下した本発明の改変型PQQGDHとしては、例えばAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列において、67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、170位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、249位、300位、349位、129位、130位、131位及び429位の少なくとも1つの位置においてアミノ酸置換を有する、及び/または、428位と429位の間にアミノ酸が挿入されている、改変型PQQGDHが例示される。 Examples of the modified PQQGDH of the present invention having a reduced activity on disaccharides compared to wild-type PQQGDH include, for example, the amino acid sequence of the Acinetobacter genus PQQGDH at positions 67, 68, 69, 76, 89, 167, 168, 169, 170, 341, 342, 343, 351, 49, 49, 174, 188, 189, 207, 215, 245, 245, 249, 300, 349 Examples include modified PQQGDH having an amino acid substitution at at least one of positions 129, 130, 131 and 429 and / or having an amino acid inserted between positions 428 and 429.
基質特異性の改良された本発明の改変型PQQGDHとしては、例えばAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列において、アミノ酸置換を有するGDH及び428位と429位の間にアミノ酸が挿入されているGDHが例示される。 Examples of the modified PQQGDH of the present invention with improved substrate specificity include GDH having an amino acid substitution in the amino acid sequence of PQQGDH derived from Acinetobacter genus and GDH in which an amino acid is inserted between positions 428 and 429. The
好ましくは、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H,
L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G, L169E, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R,
K130G, P131G, E129N, P131T,
E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N, T349S, T349P, T349Y, N429F, N429P, N429L, N429Y,からなるA343N, L169P, L169G及びL169Eからなる群から選ばれるアミノ酸置換のうち少なくとも1つを有する、及び/または、428位と429位の間にL、AまたはKが挿入されている、改変型PQQGDHである。
Preferably, Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168A, Q168E , Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H
L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, L169P, L169G, L169E, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, A170M, K89E, K300R, S8C S189G, E245D, E245F, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E67K, P67R, E68K, P67D
K130G, P131G, E129N, P131T,
E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, T343S, T343S A modified PQQGDH having at least one amino acid substitution selected from the group consisting of A343N, L169P, L169G and L169E, and / or having L, A or K inserted between positions 428 and 429 is there.
67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、341位
、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、300位、349位、129位、130位及び131位の置換は、1ヶ所であってもよく、また複数箇所であってもよい。
67th, 68th, 69th, 76th, 89th, 167th, 168th, 169th, 169th, 341st, 342th, 343th, 351st, 49th, 49th, 174th, 188th, 188th, 189th, 207th The substitutions at positions 215, 245, 300, 349, 129, 130, and 131 may be at one place or at multiple places.
ここで、「Q76N」は、76位のQ(Gln)をN(Asn)に置換することを意味する。 Here, “Q76N” means that Q (Gln) at position 76 is replaced with N (Asn).
次の段落に示すいずれかの置換、及び/または、428位と429位の間へのL、AまたはKの挿入は、PQQGDHの基質特異性の向上に寄与する。 Any substitution shown in the next paragraph and / or insertion of L, A or K between positions 428 and 429 contributes to improved substrate specificity of PQQGDH.
Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M,
Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (K89E+K300R), (Q168A+L169D), (Q168S+L169S), (N167E+Q168G+L169T), (N167S+Q168N+L169R), (Q168G+L169T), (N167G+Q168S+L169Y), (N167L+Q168S+L169G), (N167G+Q168S+L169S+L174F+K49N), (Q168N+L168N+S189R), (N167E+Q168G+L169A+S189G), (N167G+Q168R+L169A), (N167S+Q168G+L169A), (N167G+Q168V+L169S), (N167S+Q168V+L169S), (N167T+Q168I+L169G), (N167G+Q168W+L169N), (N167G+Q168S+L169N), (N167G+Q168S+L169V), (Q168R+L169C), (N167S+Q168L+L168G), (Q168C+L169S), (N167T+Q168N+L169K), (N167G+Q168T+L169A+S207C), (N167A+Q168A+L169P), (N167G+Q168S+L169G), (N167G+Q168G), (N167G+Q168D+L169K), (Q168P+L169G), (N167G+Q168N+L169S), (Q168S+L169G), (N188I+T349S), (N167G+Q168G+L169A+F215Y), (N167G+Q168T+L169G), (Q168G+L169V), (N167G+Q168V+L169T), (N167E+Q168N+L169A), (Q168R+L169A), (N167G+Q168R), (N167G+Q168T), (N167G+Q168T+L169Q), (Q168I+L169G+K300T), (N167G+Q168A), (N167T+Q168L+L169K), (N167M+Q168Y+L169G), (N167E+Q168S), (N167G+Q168T+L169V+S189G), (N167G+Q168G+L169C), (N167G+Q168K+L169D), (Q168A+L169D), (Q168S+E245D), (Q168S+L169S), (A351T), (N167S+Q168S+L169S), (Q168I+L169Q), (N167A+Q168S+L169S), (Q168S+L169E), (Q168A+L169G),
(Q168S+L169P), (P67K+E68K), (P67R+E68R+I69C), (P67D+E68T+I69C), (E129R+K130G+P131G), (E129Q+K130T+P131R), (E129N+P131T)
, (E129A+K130R+P131K), (E341L+M342P+A343R), (E341S+M342I), A343I, (E341P+M342V+A343C), (E341P+M342V+A343R), (E341L+M342R+A343N), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169I), (Q168A+L169K), (Q168A+L169M), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169S), (Q168A+L169T), (Q168A+L169V), (Q168A+L169W)及び(Q168A+L169Y)
Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168M, Q168M
Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A2 45 E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (K89E + K300R), (Q168A + L169S), (Q168S + L16S), (Q168S + L16S) + Q168S + L169Y), (N167L + Q168S + L169G), (N167G + Q168S + L169S + L174F + K49N), (Q168N + L168N + S189R), (N167E + Q168G + L169A + S189G), (N167G + Q168R + L169A), (N167S + Q168G + L169A), (N167G + Q168V + L169S), (N167S + Q168V + L169S), (N167T + Q168I + L169G), (N167G + Q168W + L169N), (N167G + Q168S + L169N), (N167G + Q168S + L169V) , (Q168R + L169C), (N167S + Q168L + L168G), (Q168C + L169S), (N167T + Q 68N + L169K), (N167G + Q168T + L169A + S207C), (N167A + Q168A + L169P),, (N167G + Q168S + L169G) (N167G + Q168G), (N167G + Q168D + L169K), (Q168P + L169G), (N167G + Q168N + L169S), (Q168S + L169G), (N188I + T349S), (N167G + Q168G + L169A + F215Y),, (N167G + Q168T + L169G) (Q168G + L169V) , (N167G + Q168V + L169T), (N167E + Q168N + L169A), (Q168R + L169A), (N167G + Q168R), (N167G + Q168T), (N167G + Q168T) + L169Q),, (Q168I + L169G + K300T), (N167G + Q168A) (N167T + Q168L + L169K), (N167M + Q168Y + L169G), (N167E + Q168S), (N167G + Q168T + L169V + S189G), (N167G + Q168G + L169C), (N167G + Q168K + L169D), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169S), (A351T) , (N167S + Q168S + L169S), (Q168I + L169Q), (N167A + Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G),
(Q168S + L169P), (P67K + E68K), (P67R + E68R + I69C), (P67D + E68T + I69C), (E129R + K130G + P131G), (E129Q + K130T + P131R), (E129N + P131T)
, (E129A + K130R + P131K), (E341L + M342P + A343R), (E341S + M342I), A343I, (E341P + M342V + A343C), (E341P + M342V + A343R), (E341L + M342R + A343N), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169I) , (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169S), (Q168A + L169T) 69V), (Q168A + L169W) and (Q168A + L169Y)
野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上した本発明のPQQGDHとしては、例えばAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列において、20位、76位、89位、168位、169位、245位、246位及び300位の少なくとも1つの位置においてアミノ酸置換を有する、改変型PQQGDHが例示される。
Examples of the PQQGDH of the present invention having improved thermal stability compared to wild-type PQQGDH include, for example, the amino acid sequence of the Acinetobacter genus PQQGDH at
好ましくは、K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D, L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L1
69E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y及びL169Gからなる群から選ばれるアミノ酸置換を有する。20位、76位、89位、168位、169位、246位及び300位の置換は、1ヶ所であってもよく、複数ヶ所であってもよい。
Preferably, K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L9D, L9D, L9D, L16 , L169A, L169C, L1
It has an amino acid substitution selected from the group consisting of 69E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y and L169G. The substitutions at the 20th, 76th, 89th, 168th, 169th, 246th, and 300th positions may be one or more.
ここで、「K20E」は、20位のK(Lys)をE(Glu)に置換することを意味する。 Here, “K20E” means that K (Lys) at the 20th position is replaced with E (Glu).
次に示すいずれかのアミノ酸置換は、PQQGDHの熱安定性の向上に寄与する。
特に、K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H,
Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S,(Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169K), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169T)、 (Q168A+L169Y)、 (Q168A + L169G)、 (Q168A+L169P+E245D)、 (Q168A+L169G+E245D)
Any of the following amino acid substitutions contributes to the improvement of the thermal stability of PQQGDH.
In particular, K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H
Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169A), (L16E), (Q16A + L169A) (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q168A + L169Y), (Q168A + L169G), (Q168A + L169P + E245D), 16Q + 2
上記のAcinetobacter属由来PQQGDHのアミノ酸配列は、好ましくはAcinetobacter calcoaceticusまたはAcinetobacter baumannii由来PQQGDHのアミノ酸配列である。中でも好ましくは配列番号1である。配列番号1で示される野生型PQQGDHタンパク質及び配列番号2で示されるその塩基配列は、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)NCIMB11517株を起源とするものであり、特開平11−243949号公報に開示されている。なお、上記および配列番号1において、アミノ酸の表記は、シグナル配列が除かれたアスパラギン酸を1として番号付けされている。 The amino acid sequence of PQQGDH derived from the genus Acinetobacter is preferably the amino acid sequence of PQQGDH derived from Acinetobacter calcoaceticus or Acinetobacter baumannii. Among them, SEQ ID NO: 1 is preferable. The wild-type PQQGDH protein represented by SEQ ID NO: 1 and its base sequence represented by SEQ ID NO: 2 originate from Acinetobacter baumannii NCIMB11517 strain, and are disclosed in JP-A-11-243949 Yes. In the above and SEQ ID NO: 1, the amino acid notation is numbered with 1 aspartic acid from which the signal sequence has been removed.
アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)NCIMB11517株は、以前、Acinetobacter calcoaceticusに分類されていた。 Acinetobacter baumannii NCIMB11517 strain was previously classified as Acinetobacter calcaceticus.
なお、本発明の改変型PQQGDHは、グルコースデヒドロゲナーゼ活性を有する限り、好ましくは二糖類に対する作用性及び/又は安定性に対して実質的な悪影響を及ぼさない限り、さらに他のアミノ酸残基の一部が欠失または置換されていてもよく、また他のアミノ酸残基が付加されていてもよい。 In addition, the modified PQQGDH of the present invention is a part of other amino acid residues as long as it has glucose dehydrogenase activity, and preferably has no substantial adverse effect on the activity and / or stability against disaccharides. May be deleted or substituted, and other amino acid residues may be added.
ところで、本願出願時において、アシネトバクター・カルコアセティカス(Acinetobacter calcoaceticus) LMD79.41株由来の酵素のX線結晶構造解析の結果が報告され、活性中心をはじめとした該酵素の高次構造が明らかとなっている(非特許文献1,2,3,4を参照。)。
その高次構造に関する知見を基に、該酵素の構造と機能の相関に関する研究が進められているが、まだ完全に明らかになったとは言えない。例えば、水溶性グルコース脱水素酵素の第6番目のW−モチーフ、のBストランドとCストランドを結ぶループ領域(W6BC)中のアミノ酸残基の構造遺伝子の特定の部位に変異を導入することによりグルコースに対する選択性を改良しうることが考察されている(例えば、特許文献2を参照。)しかしながら、効果が実証されているのは実施例に開示されているものだけである。
一方、発明者らは、本願発明の成果をもとにこれらの高次構造に関する知見を見直したところ、二糖類に対する作用性および/または安定性の改変に、PQQの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸、グルコースの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸 の少なくとも1つ以上が関わっているのではないかと考えている。 On the other hand, the inventors reviewed the findings regarding these higher-order structures based on the results of the present invention. As a result, amino acids and / or / Or at least one of the surrounding amino acids, the amino acids involved in the binding of glucose and / or the surrounding amino acids, the amino acids involved in the binding of calcium ions and / or the surrounding amino acids. ing.
本発明の改変型PQQGDHは、配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、PQQの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸、および/または、グルコースの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されているものを含む。非特許文献3および4には、PQQに結合するアミノ酸として、Y344、W346、R228、N229、K377、R406、R408、D424、グルコースに結合するアミノ酸としては、Q76、D143、H144、D163、Q168、L169、などの記載がある。
The modified PQQGDH of the present invention is a PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1, amino acids involved in PQQ binding and / or surrounding amino acids, and / or amino acids involved in glucose binding and / or Or the surrounding amino acid is substituted.
また、本発明の改変型PQQGDHは、配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されているものを含む。非特許文献1には、活性中心のカルシウムイオンに結合するアミノ酸としては、P248、G247、Q246、D252、T348などの記載がある。
The modified PQQGDH of the present invention includes the PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1 in which amino acids involved in calcium ion binding and / or surrounding amino acids are substituted.
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造における活性中心
から半径15Å以内、好ましくは半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。
The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 15 mm, preferably within a radius of 10 mm, from the active center in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme.
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。 The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. In particular, when the substrate is glucose, those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme are preferable.
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。 The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the OH group that binds to the 1st carbon of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. . In particular, when the substrate is glucose, those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme are preferable.
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。 The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the OH group that binds to the carbon at the 2-position of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. . In particular, when the substrate is glucose, those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme are preferable.
以上の教示にしたがって、当業者は、他の起源に由来する改変型PQQGDHについても、当該領域でアミノ酸残基を置換することにより、野生型のPQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDHを得ることができる。 In accordance with the above teachings, those skilled in the art have also found that modified PQQGDHs derived from other sources have reduced disaccharide activity compared to wild type PQQGDH by substituting amino acid residues in the region, and Or, modified PQQGDH with improved stability can be obtained.
例えば、配列番号1のアミノ酸配列と、アシネトバクター・カルコアセティカス(Acinetobacter calcoaceticus)LMD79.41株由来酵素のアミノ酸配列を比較すると、相違箇所はわずかで、相同性は92.3%(シグナル配列含む)となり、非常に類似しているので、配列番号1におけるある残基が、他起源の酵素のどのアミノ酸残基に該当するかを容易に認識することができる。そして、本発明にしたがって、そのような1またはそれ以上の箇所においてアミノ酸残基を他のアミノ酸残基で欠失、置換あるいは挿入等することにより、野生型のPQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDHを得ることができる。これらの改変型PQQGDHグルコース脱水素酵素も本発明の範囲内に含まれる。 For example, when the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 is compared with the amino acid sequence of the enzyme derived from Acinetobacter calcoaceticus LMD79.41, the difference is slight and the homology is 92.3% (including the signal sequence). ) And are very similar, it can be easily recognized which amino acid residue of an enzyme of another origin corresponds to a certain residue in SEQ ID NO: 1. Then, according to the present invention, the amino acid residue is deleted, substituted or inserted with another amino acid residue at one or more of such sites, thereby having an action on disaccharides more than wild-type PQQGDH. A modified PQQGDH with reduced and / or improved stability can be obtained. These modified PQQGDH glucose dehydrogenases are also included within the scope of the present invention.
本発明の改変型PQQGDHをコードする遺伝子は、微生物など種々の起源より得られる野生型PQQGDHをコードする遺伝子を含むDNA断片を改変することにより得られる可能性がある。具体的には、例えばアシネトバクター・カルコアセティカス、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)、シュードモナス・エルギノサ(Pseudomonasaeruginosa)、シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida)、シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens)、グルコノバクター・オキシダンス等の酸化細菌やアグロバクテリウム・ラジオバクター(Agrobacteriumradiobacter)、エシェリヒア・コリ、クレブシーラ・エーロジーンズ(Klebsiella aerogenes)等の腸内細菌を挙げることができる。ただし、エシェリヒア・コリなどに存在する膜型酵素を改変して可溶型にすることは困難であり、起源としてはアシネトバクター・カルコアセティカスもしくはアシネトバクター・バウマンニなどの可溶性PQQGDHを選択することが好ましい。 The gene encoding the modified PQQGDH of the present invention may be obtained by modifying a DNA fragment containing a gene encoding wild-type PQQGDH obtained from various sources such as microorganisms. Specifically, for example, Acinetobacter calcoaceticus, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluseus, Pseudomonas plutida, Pseudomonas plutida Examples include oxidative bacteria such as dance, and enterobacteria such as Agrobacterium radiobacter, Escherichia coli, and Klebsiella aerogenes. However, it is difficult to modify the membrane enzyme present in Escherichia coli to make it soluble, and it is preferable to select soluble PQQGDH such as Acinetobacter calcoaceticus or Acinetobacter baumannii as the origin. .
野生型PQQGDHをコードする遺伝子を改変する方法としては、通常行われる遺伝情
報を改変する手法が用いられる。すなわち、タンパク質の遺伝情報を有するDNAの特定の塩基を変換することにより、或いは特定の塩基を挿入または欠失させることにより、改変蛋白質の遺伝情報を有するDNAが作成される。DNA中の塩基を変換する具体的な方法としては、例えば市販のキット(TransformerMutagenesis Kit;Clonetech製,EXOIII/Mung Bean Deletion Kit;Stratagene製,QuickChange Site Directed Mutagenesis Kit;Stratagene製など)の使用、或いはポリメラーゼ連鎖反応法(PCR)の利用が挙げられる。
As a method for modifying the gene encoding wild-type PQQGDH, a commonly performed technique for modifying genetic information is used. That is, a DNA having genetic information of a modified protein is created by converting a specific base of DNA having genetic information of the protein, or by inserting or deleting a specific base. As a specific method for converting bases in DNA, for example, a commercially available kit (Transformer Mutagenesis Kit; manufactured by Clonetech, EXOIII / Mung Bean Selection Kit; manufactured by Stratagene, QuickChange SiteDirected MutagenStained MutaseNeste, etc.) Use of the chain reaction method (PCR) is mentioned.
作製された改変タンパク質の遺伝情報を有するDNAは、プラスミドと連結された状態にて宿主微生物中に移入され、改変タンパク質を生産する形質転換体となる。この際のプラスミドとしては、例えば、エシェリヒア・コリー(Escherichia coli)を宿主微生物とする場合にはpBluescript,pUC18などが使用できる。宿主微生物としては、例えば、エシェリヒア・コリー W3110、エシェリヒア・コリーC600、エシェリヒア・コリーJM109、エシェリヒア・コリーDH5αなどが利用できる。宿主微生物に組換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主微生物がエシェリヒア属に属する微生物の場合には、カルシウムイオンの存在下で組換えDNAの移入を行なう方法などを採用することができ、更にエレクトロポレーション法を用いても良い。更には、市販のコンピテントセル(例えば、コンピテントハイJM109;東洋紡績製)を用いても良い。 The prepared DNA having genetic information of the modified protein is transferred into a host microorganism in a state of being linked to a plasmid, and becomes a transformant that produces the modified protein. As the plasmid at this time, for example, pBluescript, pUC18, etc. can be used when Escherichia coli is used as a host microorganism. Examples of host microorganisms that can be used include Escherichia coli W3110, Escherichia coli C600, Escherichia coli JM109, and Escherichia coli DH5α. As a method for transferring the recombinant vector into the host microorganism, for example, when the host microorganism is a microorganism belonging to the genus Escherichia, a method for transferring the recombinant DNA in the presence of calcium ions can be employed. An electroporation method may be used. Furthermore, a commercially available competent cell (for example, competent high JM109; manufactured by Toyobo) may be used.
このような遺伝子はこれらの菌株より抽出してもよく、また化学的に合成することもできる。さらに、PCR法の利用により、PQQGDH遺伝子を含むDNA断片を得ることも可能である。 Such genes may be extracted from these strains or chemically synthesized. Furthermore, it is possible to obtain a DNA fragment containing the PQQGDH gene by using the PCR method.
本発明において、PQQGDHをコードする遺伝子を得る方法としては、次のような方法が挙げられる。例えばアシネトバクター・カルコアセティカスNCIB11517 の染色体を分離、精製した後、超音波処理、制限酵素処理等を用いてDNAを切断したものと、リニアーな発現ベクターと両DNAの平滑末端または付着末端においてDNAリガーゼなどにより結合閉鎖させて組換えベクターを構築する。該組換えベクターを複製可能な宿主微生物に移入した後、ベクターのマーカーと酵素活性の発現を指標としてスクリーニングして、PQQを補欠分子族とするGDHをコードする遺伝子を含有する組換えベクターを保持する微生物を得る。 In the present invention, a method for obtaining a gene encoding PQQGDH includes the following methods. For example, after separating and purifying the chromosome of Acinetobacter calcoaceticus NCIB11517, DNA was cleaved using sonication, restriction enzyme treatment, etc., linear expression vector and DNA at the blunt or sticky ends of both DNAs The recombinant vector is constructed by ligation and closing with ligase or the like. After transferring the recombinant vector into a replicable host microorganism, screening is performed using the expression of the vector marker and enzyme activity as an index, and a recombinant vector containing a gene encoding GDH having PQQ as a prosthetic group is retained. To obtain microorganisms.
次いで、上記組換えベクターを保持する微生物を培養して、該培養微生物の菌体から該組換えベクターを分離、精製し、該発現ベクターからGDHをコードする遺伝子を採取することができる。例えば、遺伝子供与体であるアシネトバクター・カルコアセティカスNCIB11517 の染色体DNAは、具体的には以下のようにして採取される。 Subsequently, the microorganism holding the recombinant vector can be cultured, the recombinant vector can be isolated and purified from the cells of the cultured microorganism, and the gene encoding GDH can be collected from the expression vector. For example, the chromosomal DNA of Acinetobacter calcoaceticus NCIB11517, which is a gene donor, is specifically collected as follows.
該遺伝子供与微生物を例えば1〜3日間攪拌培養して得られた培養液を遠心分離により集菌し、次いで、これを溶菌させることによりPQQを補欠分子族とするGDH遺伝子の含有溶菌物を調製することができる。溶菌の方法としては、例えばリゾチーム等の溶菌酵素により処理が施され、必要に応じてプロテアーゼや他の酵素やラウリル硫酸ナトリウム(SDS)等の界面活性剤が併用される。さらに、凍結融解やフレンチプレス処理のような物理的破砕方法と組み合わせてもよい。 For example, a culture solution obtained by stirring and culturing the gene-donating microorganism for 1 to 3 days is collected by centrifugation, and then lysed to prepare a GDH gene-containing lysate containing PQQ as a prosthetic group can do. As a method for lysis, for example, treatment is performed with a lytic enzyme such as lysozyme, and a protease, other enzyme, or a surfactant such as sodium lauryl sulfate (SDS) is used in combination as necessary. Further, it may be combined with a physical crushing method such as freeze-thawing or French press treatment.
上記のようにして得られた溶菌物からDNAを分離精製するには、常法に従って、例えばフェノール処理やプロテアーゼ処理による除蛋白処理や、リボヌクレアーゼ処理、アルコール沈殿処理などの方法を適宜組み合わせることにより行うことができる。 In order to separate and purify DNA from the lysate obtained as described above, a conventional method is used, for example, by appropriately combining methods such as deproteinization treatment by phenol treatment or protease treatment, ribonuclease treatment, and alcohol precipitation treatment. be able to.
微生物から分離、精製されたDNAを切断する方法は、例えば超音波処理、制限酵素処理などにより行うことができる。好ましくは特定のヌクレオチド配列に作用するII型制限酵素が適している。 A method of cleaving DNA separated and purified from microorganisms can be performed by, for example, ultrasonic treatment, restriction enzyme treatment, or the like. Type II restriction enzymes that act on specific nucleotide sequences are suitable.
クローニングする際のベクターとしては、宿主微生物内で自律的に増殖し得るファージまたはプラスミドから遺伝子組換え用として構築されたものが適している。ファージとしては、例えばエシェリヒア・コリを宿主微生物とする場合にはLambda gt10 、Lambda gt11 などが例示される。また、プラスミドとしては、例えば、エシェリヒア・コリを宿主微生物とする場合には、pBR322、pUC19 、pBluescript などが例示される。 As a vector for cloning, a vector constructed for gene recombination from a phage or plasmid that can autonomously grow in a host microorganism is suitable. Examples of the phage include Lambda gt10 and Lambda gt11 when Escherichia coli is used as a host microorganism. Examples of plasmids include pBR322, pUC19, and pBluescript when Escherichia coli is used as a host microorganism.
クローニングの際、上記のようなベクターを、上述したGDHをコードする遺伝子供与体である微生物DNAの切断に使用した制限酵素で切断してベクター断片を得ることができるが、必ずしも該微生物DNAの切断に使用した制限酵素と同一の制限酵素を用いる必要はない。微生物DNA断片とベクターDNA断片とを結合させる方法は、公知のDNAリガーゼを用いる方法であればよく、例えば微生物DNA断片の付着末端とベクター断片の付着末端とのアニーリングの後、適当なDNAリガーゼの使用により微生物DNA断片とベクターDNA断片との組換えベクターを作成する。必要に応じて、アニーリングの後、宿主微生物に移入して生体内のDNAリガーゼを利用し組換えベクターを作製することもできる。 At the time of cloning, a vector fragment can be obtained by cleaving the above-mentioned vector with the restriction enzyme used for cleaving the microbial DNA that is the gene donor encoding GDH described above. It is not necessary to use the same restriction enzyme as that used in the above. The method for binding the microbial DNA fragment and the vector DNA fragment may be a method using a known DNA ligase. For example, after annealing of the sticky end of the microbial DNA fragment and the sticky end of the vector fragment, an appropriate DNA ligase may be used. A recombinant vector of a microbial DNA fragment and a vector DNA fragment is prepared by use. If necessary, after annealing, it can be transferred to a host microorganism and a recombinant vector can be prepared using in vivo DNA ligase.
クローニングに使用する宿主微生物としては、組換えベクターが安定であり、かつ自律増殖可能で外来性遺伝子の形質発現できるものであれば特に制限されない。一般的には、エシェリヒア・コリW3110 、エシェリヒア・コリC600、エシェリヒア・コリHB101 、エシェリヒア・コリJM109 、エシェリヒア・コリDH5 αなどを用いることができる。 The host microorganism used for cloning is not particularly limited as long as the recombinant vector is stable, can autonomously grow, and can express a foreign gene. Generally, Escherichia coli W3110, Escherichia coli C600, Escherichia coli HB101, Escherichia coli JM109, Escherichia coli DH5α, and the like can be used.
宿主微生物に組換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主微生物がエシェリヒア・コリの場合には、カルシウム処理によるコンピテントセル法やエレクトロポーレーション法などを用いることができる。 As a method for transferring the recombinant vector into the host microorganism, for example, when the host microorganism is Escherichia coli, a competent cell method or an electroporation method using calcium treatment can be used.
上記のように得られた形質転換体である微生物は、栄養培地で培養されることにより、多量のGDHを安定に生産し得る。宿主微生物への目的組換えベクターの移入の有無についての選択は、目的とするDNAを保持するベクターの薬剤耐性マーカーとPQQの添加によりGDH活性を同時に発現する微生物を検索すればよい。例えば、薬剤耐性マーカーに基づく選択培地で生育し、かつGDHを生成する微生物を選択すればよい。 The microorganism which is a transformant obtained as described above can stably produce a large amount of GDH by being cultured in a nutrient medium. The selection of whether or not the target recombinant vector is transferred to the host microorganism may be performed by searching for a microorganism that simultaneously expresses GDH activity by adding a drug resistance marker of the vector holding the target DNA and PQQ. For example, a microorganism that grows in a selective medium based on a drug resistance marker and generates GDH may be selected.
上記の方法により得られたPQQを補欠分子族とするGDH遺伝子の塩基配列は、Science ,第214巻,1205(1981)に記載されたジデオキシ法により解読した。また、GDHのアミノ酸配列は上記のように決定された塩基配列より推定した。 The base sequence of the GDH gene having PQQ as a prosthetic group obtained by the above method was decoded by the dideoxy method described in Science, Vol. 214, 1205 (1981). The amino acid sequence of GDH was estimated from the base sequence determined as described above.
上記のようにして、一度選択されたPQQを補欠分子族とするGDH遺伝子を保有する組換えベクターより、PQQ生産能を有する微生物にて複製できる組換えベクターへの移入は、GDH遺伝子を保持する組換えベクターから制限酵素やPCR法によりGDH遺伝子であるDNAを回収し、他のベクター断片と結合させることにより容易に実施できる。また、これらのベクターによるPQQ生産能を有する微生物の形質転換は、カルシウム処理によるコンピテントセル法やエレクトロポーレーション法などを用いることができる。 As described above, transfer from a recombinant vector having a GDH gene having PQQ selected once as a prosthetic group to a recombinant vector capable of replicating in a microorganism capable of producing PQQ retains the GDH gene. It can be easily carried out by collecting DNA, which is a GDH gene, from a recombinant vector by a restriction enzyme or PCR method and binding it to other vector fragments. Moreover, the transformation of the microorganism which has PQQ production ability by these vectors can use the competent cell method by electrolysis, the electroporation method, etc.
PQQ生産能を有する微生物としては、メチロバクテリウム(Methylobacterium)属等のメタノール資化性細菌、アセトバクター(Acetobacter
)属やグルコノバクター(Gluconobacter )属の酢酸菌、フラボバクテリウム(Flavobacterium)属、シュードモナス属、アシネトバクター属等の細菌を挙げることができる。なかでも、シュードモナス属細菌とアシネトバクター属細菌が利用できる宿主−ベクター系が確立されており利用しやすいので好ましい。
Examples of microorganisms capable of producing PQQ include methanol-utilizing bacteria such as the genus Methylobacterium, Acetobacter
) And acetic acid bacteria of the genus Gluconobacter, Flavobacterium, Pseudomonas, and Acinetobacter. Among them, a host-vector system that can use Pseudomonas bacteria and Acinetobacter bacteria is established and is preferable because it is easy to use.
シュードモナス属細菌では、シュードモナス・エルギノサ、シュードモナス・フルオレッセンス、シュードモナス・プチダなどを用いることができる。また、アシネトバクター属細菌ではアシネトバクター・カルコアセティカス、アシネトバクター・バウマンニ等を用いることができる。 For Pseudomonas bacteria, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas petitida and the like can be used. As Acinetobacter bacteria, Acinetobacter calcoaceticus, Acinetobacter baumannii and the like can be used.
上記微生物にて複製できる組換えベクターとしては、RSF1010 由来のベクターもしくはとその類似のレプリコンを有するベクターがシュードモナス属細菌に利用可能である。例えば、pKT240、pMMB24等(M.M.Bagdasarian ら,Gene,26,273(1983))、pCN40 、pCN60 等(C.C.Nieto ら,Gene,87,145(1990))やpTS1137 等を挙げることができる。また、pME290等(Y.Itohら、Gene,36,27(1985))、pNI111、pNI20C(N.Itohら,J.Biochem.,110,614(1991))も利用できる。 As a recombinant vector that can be replicated in the microorganism, a vector derived from RSF1010 or a vector having a similar replicon can be used for Pseudomonas bacteria. For example, pKT240, pMMB24, etc. (MM Bagdasarian et al., Gene, 26, 273 (1983)), pCN40, pCN60, etc. (CC Nito et al., Gene, 87, 145 (1990)), pTS1137, etc. be able to. Further, pME290 and the like (Y. Itoh et al., Gene, 36, 27 (1985)), pNI111, pNI20C (N. Itoh et al., J. Biochem., 110, 614 (1991)) can also be used.
アシネトバクター属細菌では、pWM43 等(W.Minas ら,Appl.Environ.Microbiol. ,59,2807(1993))、pKT230、pWH1266 等(M.Hungerら,Gene,87,45(1990))がベクターとして利用可能である。 In bacteria belonging to the genus Acinetobacter, pWM43 and the like (W. Minas et al., Appl. Environ. Microbiol., 59, 2807 (1993)), pKT230, pWH1266 and the like (M. Hunger et al., Gene, 87, 45 (1990)) are used as vectors. Is available.
こうして得られた形質転換体である微生物は、栄養培地で培養されることにより、多量の改変タンパク質を安定して生産し得る。形質転換体である宿主微生物の培養形態は、宿主の栄養生理的性質を考慮して培養条件を選択すればよく、多くの場合は液体培養で行う。工業的には通気攪拌培養を行うのが有利である。 Microorganisms which are transformants thus obtained can stably produce a large amount of modified protein by being cultured in a nutrient medium. The culture form of the host microorganism, which is a transformant, may be selected in consideration of the nutritional physiological properties of the host, and in many cases, the culture is performed in liquid culture. Industrially, aeration and agitation culture is advantageous.
培地の栄養源としては,微生物の培養に通常用いられるものが広く使用され得る。炭素源としては資化可能な炭素化合物であればよく、例えば、グルコース、シュークロース、ラクトース、マルトース、ラクトース、糖蜜、ピルビン酸などが使用される。また、窒素源としては利用可能な窒素化合物であればよく、例えば、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、カゼイン加水分解物、大豆粕アルカリ抽出物などが使用される。その他、リン酸塩、炭酸塩、硫酸塩、マグネシウム、カルシウム、カリウム、鉄、マンガン、亜鉛などの塩類、特定のアミノ酸、特定のビタミンなどが必要に応じて使用される。 As a nutrient source of the medium, those commonly used for culturing microorganisms can be widely used. Any carbon compound that can be assimilated may be used as the carbon source. For example, glucose, sucrose, lactose, maltose, lactose, molasses, pyruvic acid and the like are used. The nitrogen source may be any available nitrogen compound. For example, peptone, meat extract, yeast extract, casein hydrolyzate, soybean cake alkaline extract, and the like are used. In addition, phosphates, carbonates, sulfates, salts such as magnesium, calcium, potassium, iron, manganese, and zinc, specific amino acids, specific vitamins, and the like are used as necessary.
培養温度は菌が成育し、改変型PQQGDHを生産する範囲で適宜変更し得るが、上記のようなPQQ生産能を有する微生物の場合、好ましくは20〜42℃程度である。培養時間は条件によって多少異なるが、改変型PQQGDHが最高収量に達する時期を見計らって適当時期に培養を完了すればよく、通常は6〜48時間程度である。培地のpHは菌が発育し、改変型PQQGDHを生産する範囲で適宜変更し得るが、好ましくはpH6.0〜9.0程度の範囲である。 The culture temperature can be appropriately changed within the range in which the fungus grows and produces modified PQQGDH. However, in the case of the microorganism having the PQQ production ability as described above, it is preferably about 20 to 42 ° C. Although the culture time varies somewhat depending on conditions, the culture may be completed at an appropriate time in consideration of the time when the modified PQQGDH reaches the maximum yield, and is usually about 6 to 48 hours. The pH of the medium can be appropriately changed as long as the bacteria grow and produce modified PQQGDH, but is preferably in the range of about pH 6.0 to 9.0.
培養物中の改変型PQQGDHを生産する菌体を含む培養液をそのまま採取し、利用することもできるが、一般には、常法に従って、改変型PQQGDHが培養液中に存在する場合はろ過、遠心分離などにより、改変型PQQGDH含有溶液と微生物菌体とを分離した後に利用される。改変型PQQGDHが菌体内に存在する場合には、得られた培養物からろ過または遠心分離などの手段により菌体を採取し、次いで、この菌体を機械的方法またはリゾチームなどの酵素的方法で破壊し、また、必要に応じて、EDTA等のキレート
剤及び界面活性剤を添加してGDHを可溶化し、水溶液として分離採取する。
Although the culture solution containing the cells producing the modified PQQGDH in the culture can be collected and used as it is, in general, when the modified PQQGDH is present in the culture solution, it is filtered and centrifuged. It is used after separating the modified PQQGDH-containing solution and microbial cells by separation or the like. When the modified PQQGDH is present in the microbial cells, the microbial cells are collected from the obtained culture by means of filtration or centrifugation, and then the microbial cells are collected by a mechanical method or an enzymatic method such as lysozyme. In addition, if necessary, a chelating agent such as EDTA and a surfactant are added to solubilize GDH, and it is separated and collected as an aqueous solution.
上記のようにして得られたGDH含有溶液を、例えば減圧濃縮、膜濃縮、さらに硫酸アンモニウム、硫酸ナトリウムなどの塩析処理、あるいは親水性有機溶媒、例えばメタノール、エタノール、アセトンなどによる分別沈殿法により沈殿せしめればよい。また、加熱処理や等電点処理も有効な精製手段である。その後、吸着剤あるいはゲルろ過剤などによるゲルろ過、吸着クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティクロマトグラフィーを行うことにより、精製されたGDHを得ることができる。 The GDH-containing solution obtained as described above is precipitated by, for example, vacuum concentration, membrane concentration, salting-out treatment with ammonium sulfate, sodium sulfate or the like, or fractional precipitation with a hydrophilic organic solvent such as methanol, ethanol, acetone, etc. You just have to let them know. Heat treatment and isoelectric point treatment are also effective purification means. Thereafter, purified GDH can be obtained by performing gel filtration using an adsorbent or a gel filter, adsorption chromatography, ion exchange chromatography, and affinity chromatography.
例えば、セファデックス(Sephadex)ゲル(ファルマシアバイオテク)などによるゲルろ過、DEAEセファロースCL−6B (ファルマシアバイオテク)、オクチルセファロースCL−6B (ファルマシアバイオテク)等のカラムクロマトグラフィーにより分離、精製し、精製酵素標品を得ることができる。該精製酵素標品は、電気泳動(SDS−PAGE)的に単一のバンドを示す程度に純化されていることが好ましい。 For example, it is separated and purified by gel filtration using Sephadex gel (Pharmacia Biotech), column chromatography such as DEAE Sepharose CL-6B (Pharmacia Biotech), octyl Sepharose CL-6B (Pharmacia Biotech), etc. Goods can be obtained. The purified enzyme preparation is preferably purified to the extent that it shows a single band on electrophoresis (SDS-PAGE).
上記のようにして得られた精製酵素を、例えば凍結乾燥、真空乾燥やスプレードライなどにより粉末化して流通させることが可能である。その際、精製酵素はリン酸緩衝液、トリス塩酸緩衝液やGOODの緩衝液に溶解しているものを用いることができる。好適なものはGOODの緩衝液であり、なかでも、PIPES、MESもしくはMOPS緩衝液が特に好ましい。また、カルシウムイオンまたはその塩、およびグルタミン酸、グルタミン、リジン等のアミノ酸類、さらに血清アルブミン等を添加することによりGDHをより安定化することができる。 The purified enzyme obtained as described above can be pulverized and distributed, for example, by freeze drying, vacuum drying, spray drying, or the like. At this time, the purified enzyme may be one dissolved in a phosphate buffer, a Tris-HCl buffer, or a GOOD buffer. Preferred are GOOD buffers, with PIPES, MES or MOPS buffers being particularly preferred. Further, GDH can be further stabilized by adding calcium ions or salts thereof, amino acids such as glutamic acid, glutamine, and lysine, and serum albumin.
本発明の改変タンパク質の製造方法は、特に限定されないが、以下に示すような手順で製造することが可能である。タンパク質を構成するアミノ酸配列を改変する方法としては、通常行われる遺伝情報を改変する手法が用いられる。すなわち、タンパク質の遺伝情報を有するDNAの特定の塩基を変換することにより、或いは特定の塩基を挿入または欠失させることにより、改変蛋白質の遺伝情報を有するDNAが作成される。DNA中の塩基を変換する具体的な方法としては、例えば市販のキット(TransformerMutagenesis Kit;Clonetech製,EXOIII/Mung Bean
Deletion Kit;Stratagene製,QuickChange Site Directed Mutagenesis Kit;Stratagene製など)の使用、或いはポリメラーゼ連鎖反応法(PCR)の利用が挙げられる。
Although the manufacturing method of the modified protein of this invention is not specifically limited, It is possible to manufacture in the procedure as shown below. As a method for modifying the amino acid sequence constituting the protein, a commonly used technique for modifying genetic information is used. That is, a DNA having genetic information of a modified protein is created by converting a specific base of DNA having genetic information of the protein, or by inserting or deleting a specific base. As a specific method for converting a base in DNA, for example, a commercially available kit (Transformer Mutagenesis Kit; manufactured by Clonetech, EXOIII / Mung Bean)
And the use of the polymerase chain reaction method (PCR), etc.), or the use of a selection kit (made by Stratagene, QuickChange Site Directed Mutagenesis Kit; made by Stratagene, etc.).
本発明では、配列番号1に示されるPQQGDHの76位、167位、168位、169位、170位および245位に着目し、そのアミノ酸置換体を作成したところ、基質特異性が改善されたPQQGDH改変体を得ることができた。基質特異性に関しては、Q76K, Q168A, A170P, E245D, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (Q168S + L169S), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A +
L169P), (Q168A + L169S) および (Q168A + L169T)が特に好ましい。
In the present invention, focusing on positions 76, 167, 168, 169, 170, and 245 of PQQGDH shown in SEQ ID NO: 1, when amino acid substitutions were made, PQQGDH with improved substrate specificity was obtained. A variant could be obtained. Regarding substrate specificity, Q76K, Q168A, A170P, E245D, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (Q168S + L169S), (Q168A + L169D), (Q168S +) ), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L16
L169P), (Q168A + L169S) and (Q168A + L169T) are particularly preferred.
本発明では、配列番号1に示されるPQQGDHの20位、76位、89位、168位、169位、245位、246位及び300位に着目し、そのアミノ酸置換体を作成したところ、安定性が改善されたPQQGDH改変体を得ることができた。熱安定性に関する
限り、K20E, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A +
L169D), (Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169G), Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P,
Q168S, Q168W, Q168Y, (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169K), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A +
L169T), (Q168A + L169Y), (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D)及びQ246Hの置換が特に望ましい。
In the present invention, focusing on the 20th, 76th, 89th, 168th, 169th, 245th, 246th, and 300th positions of PQQGDH shown in SEQ ID NO: 1, the amino acid substitution product was prepared, It was possible to obtain a modified PQQGDH with improved. As far as thermal stability is concerned, K20E, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A +
L169D), (Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169G), Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168M, Q168P
Q168S, Q168W, Q168Y, (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L16L + 16) + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A +
The substitution of (L169T), (Q168A + L169Y), (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D) and Q246H is particularly desirable.
改変タンパク質は、液状(水溶液、懸濁液等)、粉末、凍結乾燥など種々の形態をとることができる。凍結乾燥法としては、特に制限されるものではなく常法に従って行えばよい。本発明の酵素を含む組成物は凍結乾燥物に限られず、凍結乾燥物を再溶解した溶液状態であってもよい。また、グルコース測定を行なう際には、グルコースアッセイキット、グルコースセンサーなどの種々の形態をとることができる。この様にして得られた精製された改変タンパク質は、以下のような方法により安定化することができる。 The modified protein can take various forms such as liquid (aqueous solution, suspension, etc.), powder, and lyophilized. The lyophilization method is not particularly limited and may be performed according to a conventional method. The composition containing the enzyme of the present invention is not limited to a lyophilized product, and may be in a solution state in which the lyophilized product is redissolved. Moreover, when measuring glucose, various forms, such as a glucose assay kit and a glucose sensor, can be taken. The purified modified protein thus obtained can be stabilized by the following method.
精製された改変タンパク質に(1)アスパラギン酸、グルタミン酸、α−ケトグルタル酸、リンゴ酸、α−ケトグルコン酸、α−サイクロデキストリンおよびそれらの塩からなる群から選ばれた1種または2種以上の化合物および(2)アルブミンを共存せしめることにより、改変タンパク質をさらに安定化することができる。 (1) One or more compounds selected from the group consisting of (1) aspartic acid, glutamic acid, α-ketoglutaric acid, malic acid, α-ketogluconic acid, α-cyclodextrin, and salts thereof And (2) By coexisting albumin, the modified protein can be further stabilized.
凍結乾燥組成物中においては、PQQGDH含有量は、酵素の起源によっても異なるが、通常は約5〜50%(重量比)の範囲で好適に用いられる。酵素活性に換算すると、100〜2000U/mgの範囲で好適に用いられる。 In the lyophilized composition, the PQQGDH content varies depending on the origin of the enzyme, but is usually suitably used in the range of about 5 to 50% (weight ratio). When converted into enzyme activity, it is preferably used in the range of 100 to 2000 U / mg.
アスパラギン酸、グルタミン酸、αーケトグルタル酸、リンゴ酸、及びαーケトグルコン酸の塩としては、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、及びマグネシウム等の塩が挙げられるが特に限定されるものではない。上記化合物とその塩及びα−シクロデキストリンの添加量は、1〜90%(重量比)の範囲で添加することが好ましい。これらの物質は単独で用いてもよいし、複数組み合わせてもよい。 Examples of salts of aspartic acid, glutamic acid, α-ketoglutaric acid, malic acid, and α-ketogluconic acid include salts such as sodium, potassium, ammonium, calcium, and magnesium, but are not particularly limited. The addition amount of the above compound, its salt and α-cyclodextrin is preferably in the range of 1 to 90% (weight ratio). These substances may be used alone or in combination.
含有される緩衝液としては特に限定されるものではないが、トリス緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、GOOD緩衝液などが挙げられる。該緩衝液のpHは5.0〜9.0程度の範囲で使用目的に応じて調整される。凍結乾燥物中においては緩衝剤の含有量は、特に限定されるものではないが、好ましくは0.1%(重量比)以上、特に好ましくは0.1〜30%(重量比)の範囲で使用される。 The buffer solution to be contained is not particularly limited, and examples thereof include Tris buffer solution, phosphate buffer solution, borate buffer solution, and GOOD buffer solution. The pH of the buffer is adjusted in the range of about 5.0 to 9.0 according to the purpose of use. The content of the buffering agent in the lyophilized product is not particularly limited, but is preferably 0.1% (weight ratio) or more, particularly preferably 0.1 to 30% (weight ratio). used.
使用できるアルブミンとしては、牛血清アルブミン(BSA)、卵白アルブミン(OVA)などが挙げられる。特にBSAが好ましい。該アルブミンの含有量は、好ましくは1〜80%(重量比)、より好ましくは5〜70%(重量比)の範囲で使用される。 Examples of albumin that can be used include bovine serum albumin (BSA) and ovalbumin (OVA). BSA is particularly preferable. The content of the albumin is preferably 1 to 80% (weight ratio), more preferably 5 to 70% (weight ratio).
組成物には、さらに他の安定化剤などをPQQGDHの反応に特に悪い影響を及ぼさないような範囲で添加してもよい。本発明の安定化剤の配合法は特に制限されるものではない。例えばPQQGDHを含む緩衝液に安定化剤を配合する方法、安定化剤を含む緩衝液にPQQGDHを配合する方法、あるいはPQQGDHと安定化剤を緩衝液に同時に配合
する方法などが挙げられる。
Further, other stabilizers and the like may be added to the composition within a range that does not particularly adversely affect the reaction of PQQGDH. The blending method of the stabilizer of the present invention is not particularly limited. For example, a method of blending a stabilizer in a buffer solution containing PQQGDH, a method of blending PQQGDH in a buffer solution containing a stabilizer, or a method of blending PQQGDH and a stabilizer in a buffer solution at the same time can be mentioned.
また、カルシウムイオンを添加しても安定化効果が得られる。すなわち、カルシウムイオンまたはカルシウム塩を含有させることにより、改変タンパク質を安定化させることができる。カルシウム塩としては、塩化カルシウムまたは酢酸カルシウムもしくはクエン酸カルシウム等の無機酸または有機酸のカルシウム塩などが例示される。また、水性組成物において、カルシウムイオンの含有量は、1×10−4〜1×10−2Mであることが好ましい。 Moreover, the stabilization effect is acquired even if calcium ion is added. That is, the modified protein can be stabilized by containing calcium ions or calcium salts. Examples of calcium salts include calcium chloride, calcium salts of inorganic acids such as calcium acetate and calcium citrate, and organic acids. In the aqueous composition, the calcium ion content is preferably 1 × 10 −4 to 1 × 10 −2 M.
カルシウムイオンまたはカルシウム塩を含有させることによる安定化効果は、グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されたアミノ酸を含有させることにより、さらに向上する。 The stabilizing effect by containing calcium ions or calcium salts is further improved by containing an amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine.
グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されるアミノ酸は、1種または2種以上であってもよい。前記の水性組成物において、グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されたアミノ酸の含有量は、0.01〜0.2重量%であることが好ましい。 One or more amino acids selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine may be used. In the aqueous composition, the content of an amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine is preferably 0.01 to 0.2% by weight.
さらに血清アルブミンを含有させてもよい。前記の水性組成物に血清アルブミンを添加する場合、その含有量は0.05〜0.5重量%であることが好ましい。 Further, serum albumin may be contained. When serum albumin is added to the aqueous composition, the content is preferably 0.05 to 0.5% by weight.
緩衝剤としては、通常のものが使用され、通常、組成物のpHを5〜10とするものが好ましい。具体的にはトリス塩酸、ホウ酸、グッド緩衝液が用いられるが、カルシウムと不溶性の塩を形成しない緩衝液はすべて使用できる。 As a buffering agent, a normal thing is used, and what makes pH of a composition 5-10 normally is preferable. Specifically, Tris-HCl, boric acid, and Good's buffer are used, but any buffer that does not form an insoluble salt with calcium can be used.
前記の水性組成物には、必要により他の成分、例えば界面活性剤、安定化剤、賦形剤などを添加しても良い。 If necessary, other components such as surfactants, stabilizers and excipients may be added to the aqueous composition.
本発明においては以下の種々の方法によりグルコースを測定することができる。
グルコースアッセイキット
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキットを特徴とする。本発明のグルコースアッセイキットは、本発明に従う改変型PQQGDHを少なくとも1回のアッセイに十分な量で含む。典型的には、キットは、本発明の改変型PQQGDHに加えて、アッセイに必要な緩衝液、メディエーター、キャリブレーションカーブ作製のためのグルコース標準溶液、ならびに使用の指針を含む。本発明に従う改変型PQQGDHは種々の形態で、例えば、凍結乾燥された試薬として、または適切な保存溶液中の溶液として提供することができる。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で提供されるが、アポ酵素の形態で提供し、使用時にホロ化することもできる。
In the present invention, glucose can be measured by the following various methods.
Glucose Assay Kit The present invention also features a glucose assay kit comprising a modified PQQGDH according to the present invention. The glucose assay kit of the present invention comprises a modified PQQGDH according to the present invention in an amount sufficient for at least one assay. Typically, the kit contains, in addition to the modified PQQGDH of the present invention, buffers necessary for the assay, mediators, a glucose standard solution for creating a calibration curve, and directions for use. The modified PQQGDH according to the present invention can be provided in various forms, for example, as a lyophilized reagent or as a solution in a suitable storage solution. Preferably, the modified PQQGDH of the present invention is provided in the form of a holo, but can be provided in the form of an apoenzyme and can be holoed at the time of use.
グルコースセンサー
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを用いるグルコースセンサーを特徴とする。電極としては、カーボン電極、金電極、白金電極などを用い、この電極上に本発明の酵素を固定化する。固定化方法としては、架橋試薬を用いる方法、高分子マトリックス中に封入する方法、透析膜で被覆する方法、光架橋性ポリマー、導電性ポリマー、酸化還元ポリマーなどがあり、あるいはフェロセンあるいはその誘導体に代表される電子メディエーターとともにポリマー中に固定あるいは電極上に吸着固定してもよく、またこれらを組み合わせて用いてもよい。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で電極上に固定化するが、アポ酵素の形態で固定化し、PQQを別の層としてまたは溶液中で提供することもできる。典型的には、グルタルアルデヒドを用いて本発明の改変型PQQGDHをカーボン電極上に固定化した後、アミン基を有する試薬で処理してグルタルア
ルデヒドをブロッキングする。
Glucose Sensor The present invention also features a glucose sensor that uses a modified PQQGDH according to the present invention. As the electrode, a carbon electrode, a gold electrode, a platinum electrode or the like is used, and the enzyme of the present invention is immobilized on this electrode. Immobilization methods include a method using a crosslinking reagent, a method of encapsulating in a polymer matrix, a method of coating with a dialysis membrane, a photocrosslinkable polymer, a conductive polymer, a redox polymer, etc., or ferrocene or a derivative thereof. It may be fixed in a polymer or adsorbed and fixed on an electrode together with a representative electron mediator, or a combination thereof may be used. Preferably, the modified PQQGDH of the present invention is immobilized on the electrode in a holo form, but may be immobilized in the form of an apoenzyme and the PQQ provided as a separate layer or in solution. Typically, the modified PQQGDH of the present invention is immobilized on a carbon electrode using glutaraldehyde and then treated with a reagent having an amine group to block glutaraldehyde.
グルコース濃度の測定は、以下のようにして行うことができる。恒温セルに緩衝液を入れ、PQQおよびCaCl2、およびメディエーターを加えて一定温度に維持する。メディエーターとしては、フェリシアン化カリウム、フェナジンメトサルフェートなどを用いることができる。作用電極として本発明の改変型PQQGDHを固定化した電極を用い、対極(例えば白金電極)および参照電極(例えばAg/AgCl電極)を用いる。カーボン電極に一定の電圧を印加して、電流が定常になった後、グルコースを含む試料を加えて電流の増加を測定する。標準濃度のグルコース溶液により作製したキャリブレーションカーブに従い、試料中のグルコース濃度を計算することができる。
The glucose concentration can be measured as follows. The buffer is placed in a thermostatic cell, and PQQ and
以下、本発明を実施例に基づきより詳細に説明する。
実施例1 :PQQ依存性グルコース脱水素酵素遺伝子の発現プラスミドの構築
野生型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の発現プラスミドpNPG5は、ベクターpBluescript SK(−)のマルチクローニング部位にアシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii) NCIMB11517株由来のPQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする構造遺伝子を挿入したものである。その塩基配列を配列表の配列番号2に、また該塩基配列から推定されるPQQ依存性グルコース脱水素酵素のアミノ酸配列を配列表の配列番号1に示す。
Hereinafter, the present invention will be described in more detail based on examples.
Example 1: Construction of PQQ-dependent glucose dehydrogenase gene expression plasmid The wild-type PQQ-dependent glucose dehydrogenase expression plasmid pNPG5 was transformed into the multiple cloning site of the vector pBluescript SK (-) at Acinetobacter baumannii. A structural gene encoding a PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from NCIMB11517 strain is inserted. The base sequence is shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing, and the amino acid sequence of PQQ-dependent glucose dehydrogenase deduced from the base sequence is shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.
実施例2:変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の作製
野生型PQQ依存性グルコース脱水素酵素遺伝子を含む組換えプラスミドpNPG5と配列番号3記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、QuickChangeTM Site−Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE製)を用いて、そのプロトコールに従って変異処理操作を行い、更に塩基配列を決定して、配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがアスパラギンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M1)を取得した。
pNPG5と配列番号4記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M2)を取得した。
pNPG5と配列番号5記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがスレオニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M3)を取得した。
pNPG5と配列番号6記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがメチオニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M4)を取得した。
pNPG5と配列番号7記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがグリシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M5)を取得した。
pNPG5と配列番号8記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがリジンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M6)取得した。
pNPG5と配列番号9記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴ
ヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがイソロイシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M7)を取得した。
pNPG5と配列番号10記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがバリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M8)を取得した。
pNPG5と配列番号11記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M9)を取得した。
pNPG5と配列番号22記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の20番目のリジンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M10)を取得した。
pNPG5と配列番号23記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の89番目のリジンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミドを取得した。更にこのプラスミドと配列番号24記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の89番目のリジンがグルタミン酸に、300番目のリジンがアルギニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M11)を取得した。
pNPG5と配列番号25記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の246番目のグルタミンがヒスチジンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M12)を取得した。
pNPG5と配列番号26記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがセリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M13)を取得した。
pNPG5と配列番号27記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに、169番目のロイシンがアスパラギン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M14)を取得した。
pNPG5と配列番号66記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M15)を取得した。
pNPG5と配列番号67記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがプロリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M16)を取得した。
pNPG5と配列番号68記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに、169番目のロイシンがグリシンに置換された変異型PQ
Q依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M17)を取得した。
pNPG5、pNPG5M1、pNPG5M2、pNPG5M3、pNPG5M4、pNPG5M5、pNPG5M6、pNPG5M7、pNPG5M8、pNPG5M9、pNPG5M10、pNPG5M11、pNPG5M12、pNPG5M13、pNPG5M14、pNPG5M15、pNPG5M16,pNPG5M17の各組換えプラスミドで大腸菌コンピテントセル(エシェリヒア・コリーJM109;東洋紡績製)を形質転換し、該形質転換体をそれぞれ取得した。
Example 2: Preparation of mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase A recombinant plasmid pNPG5 containing a wild-type PQQ-dependent glucose dehydrogenase gene, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 3 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto Based on this, mutation processing operation was performed according to the protocol using QuickChangeTM Site-Directed Mutagenesis Kit (manufactured by STRATAGENE), the base sequence was determined, and the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 was replaced with asparagine. A recombinant plasmid (pNPG5M1) encoding the mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with glutamic acid in the same manner as described above, based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 4 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M2) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with threonine based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 5 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M3) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with methionine based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 6 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M4) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with glycine based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 7 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, in the same manner as described above A recombinant plasmid (pNPG5M5) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with lysine in the same manner as described above, based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 8 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M6) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with isoleucine based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 9 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, in the same manner as above. A recombinant plasmid (pNPG5M7) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with valine on the basis of pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 10 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M8) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with alanine based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 11 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M9) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 20th lysine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is replaced with glutamic acid based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 22 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, in the same manner as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M10) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 89th lysine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with glutamic acid in the same manner as described above based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 23, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained. Further, based on this plasmid, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 24, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 89th lysine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is converted to glutamic acid, the 300th A recombinant plasmid (pNPG5M11) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase in which lysine was replaced with arginine was obtained.
Mutant PQQ in which the 246th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with histidine in the same manner as described above, based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 25 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M12) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 26, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is the serine and the 169th leucine is the same as the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M13) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with serine was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 27, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is alanine, and the 169th leucine is similar to the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M14) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with aspartic acid was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 66, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is the serine and the 169th leucine is the same as the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M15) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with glutamic acid was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 67 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is serine and the 169th leucine is similar to the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M16) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with proline was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 68 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is alanine and the 169th leucine is similar to the above method. Mutant PQ substituted with glycine
A recombinant plasmid (pNPG5M17) encoding a Q-dependent glucose dehydrogenase was obtained.
pNPG5, pNPG5M1, pNPG5M2, pNPG5M3, pNPG5M4, pNPG5M5, pNPG5M, pNPG5M, pNPG5M ; Manufactured by Toyobo Co., Ltd.), and each of the transformants was obtained.
実施例3:シュードモナス属細菌で複製できる発現ベクターの構築
実施例2で得た組換えプラスミドpNPG5M1のDNA5μgを制限酵素BamHIおよびXHoI(東洋紡績製)で切断して、変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の構造遺伝子部分を単離した。単離したDNAとBamHIおよびXHoIで切断したpTM33(1μg)とをT4DNAリガーゼ1単位で16℃、16時間反応させ、DNAを連結した。連結したDNAはエシェリヒア・コリDH5αのコンピテントセルを用いて形質転換を行った。得られた発現プラスミドをpNPG6M1と命名した。
pNPG5、pNPG5M2、pNPG5M3、pNPG5M4、pNPG5M5、pNPG5M6、pNPG5M7、pNPG5M8、pNPG5M9、pNPG5M10、pNPG5M11、pNPG5M12、pNPG5M13、pNPG5M14、pNPG5M15、pNPG5M16,pNPG5M17の各組換えプラスミドについても上記方法と同様にして発現プラスミドを取得した。得られた発現プラスミドそれぞれpNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17と命名した。
Example 3: Construction of an expression vector capable of replication in Pseudomonas bacteria 5 μg of the recombinant plasmid pNPG5M1 DNA obtained in Example 2 was cleaved with restriction enzymes BamHI and XHoI (Toyobo Co., Ltd.) to obtain mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenation. The structural gene part of the enzyme was isolated. The isolated DNA and pTM33 (1 μg) cleaved with BamHI and XHoI were reacted with 1 unit of T4 DNA ligase at 16 ° C. for 16 hours to ligate the DNA. Ligated DNA was transformed with Escherichia coli DH5α competent cells. The resulting expression plasmid was named pNPG6M1.
pNPG5, pNPG5M2, pNPG5M3, pNPG5M4, pNPG5M5, pNPG5M6, pNPG5M7, pNPG5M8, pNPG5M9, pNPG5M10, pNPG5M did. The obtained expression plasmids were pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M11, pNPG6M12, pNPG6M13, pNPG6M14, pNPG6M13, pNPG6M13, pNPG6M13, pNPG6M14.
実施例4:シュードモナス属細菌の形質転換体の作製
シュードモナス・プチダTE3493(微工研寄12298号)をLBG培地(LB培地+0.3%グリセロール)で30℃、16時間培養し、遠心分離(12,000rpm、10分間)により菌体を回収し、この菌体に氷冷した300mMシュークロースを含む5mMK−リン酸緩衝液(pH7.0)8mlを加え、菌体を懸濁した。再度遠心分離(12,000rpm、10分間)により菌体を回収し、この菌体に氷冷した300mMシュークロースを含む5mMK−リン酸緩衝液(pH7.0)0.4mlを加え、菌体を懸濁した。
該懸濁液に実施例3で得た発現プラスミドpNPG6M1を0.5μg加え、エレクトロポレーション法により形質転換した。100μg/mlのストレプトマイシンを含むLB寒天培地に生育したコロニーより、目的とする形質転換体を得た。
pNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17の各発現プラスミドについても上記方法と同様にして、該形質転換体をそれぞれ取得した。
Example 4: Preparation of Pseudomonas genus transformant Pseudomonas putida TE3493 (Microtechnology 12298) was cultured in LBG medium (LB medium + 0.3% glycerol) at 30 ° C. for 16 hours and centrifuged (12 The bacterial cells were collected by 2,000 rpm for 10 minutes, and 8 ml of 5 mM K-phosphate buffer (pH 7.0) containing 300 mM sucrose ice-cooled was added to the bacterial cells to suspend the bacterial cells. The bacterial cells were collected again by centrifugation (12,000 rpm, 10 minutes), and 0.4 ml of 5 mM K-phosphate buffer (pH 7.0) containing 300 mM sucrose ice-cooled was added to the bacterial cells. Suspended.
0.5 μg of the expression plasmid pNPG6M1 obtained in Example 3 was added to the suspension and transformed by electroporation. A target transformant was obtained from a colony grown on an LB agar medium containing 100 μg / ml streptomycin.
pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M16, pNPG6M16, pNPG6M Respectively.
試験例1
GDH活性の測定方法
測定原理
D−グルコース+PMS+PQQGDH → D−グルコノ−1,5−ラクトン + PMS(red)
2PMS(red) + NTB → 2PMS + ジホルマザン
フェナジンメトサルフェート(PMS)(red)によるニトロテトラゾリウムブルー(
NTB)の還元により形成されたジホルマザンの存在は、570nmで分光光度法により測定した。
単位の定義
1単位は、以下に記載の条件下で1分当たりジホルマザンを0.5ミリモル形成させるPQQGDHの酵素量をいう。
(3)方法
試薬
A.D−グルコース溶液:0.5M(0.9g D−グルコース(分子量180.16)/10ml H2O)
B.PIPES−NaOH緩衝液, pH6.5:50mM(60mLの水中に懸濁した1.51gのPIPES(分子量302.36)を、5N NaOHに溶解し、2.2mlの10% Triton X−100を加える。5N NaOHを用いて25℃でpHを6.5±0.05に調整し、水を加えて100mlとした。)
C.PMS溶液:3.0mM(9.19mgのフェナジンメトサルフェート(分子量817.65)/10mlH2O)
D.NTB溶液:6.6mM(53.96mgのニトロテトラゾリウムブルー(分子量817.65)/10mlH2O)
E.酵素希釈液:1mM CaCl2, 0.1% Triton X−100, 0.1% BSAを含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
手順
遮光ビンに以下の反応混合物を調製し、氷上で貯蔵した(用時調製)
1.8ml D−グルコース溶液 (A)
24.6ml PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5) (B)
2.0ml PMS溶液 (C)
1.0ml NTB溶液 (D)
Test example 1
GDH activity measurement method Measurement principle D-glucose + PMS + PQQGDH → D-glucono-1,5-lactone + PMS (red)
2PMS (red) + NTB → 2PMS + nitrotetrazolium blue by diformazan phenazine methosulfate (PMS) (red) (
The presence of diformazan formed by the reduction of NTB) was measured spectrophotometrically at 570 nm.
Definition of Unit One unit refers to the amount of PQQGDH enzyme that forms 0.5 mmol of diformazan per minute under the conditions described below.
(3) Method reagents A. D-glucose solution: 0.5 M (0.9 g D-glucose (molecular weight 180.16) / 10 ml H2O)
B. PIPES-NaOH buffer, pH 6.5: 50 mM (1.51 g of PIPES (molecular weight 302.36) suspended in 60 mL of water is dissolved in 5N NaOH and 2.2 ml of 10% Triton X-100 is added. The pH was adjusted to 6.5 ± 0.05 at 25 ° C. using 5N NaOH, and water was added to make 100 ml.)
C. PMS solution: 3.0 mM (9.19 mg phenazine methosulfate (molecular weight 817.65) / 10 ml H2O)
D. NTB solution: 6.6 mM (53.96 mg of nitrotetrazolium blue (molecular weight 817.65) / 10 ml H2O)
E. Enzyme dilution: 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5) containing 1 mM CaCl2, 0.1% Triton X-100, 0.1% BSA
Procedure Prepare the following reaction mixture in a light-proof bottle and store on ice (prepared at the time of use)
1.8 ml D-glucose solution (A)
24.6 ml PIPES-NaOH buffer (pH 6.5) (B)
2.0ml PMS solution (C)
1.0ml NTB solution (D)
3.0mlの反応混合液を試験管(プラスチック製)に入れ、37℃で5分間予備加温した。
0.1mlの酵素溶液を加え、穏やかに反転して混合した。
570nmでの水に対する吸光度の増加を37℃に維持しながら分光光度計で4〜5分間記録し、曲線の初期直線部分からの1分当たりのΔODを計算した(ODテスト)。
同時に、酵素溶液に代えて酵素希釈液(E)加えることを除いては同一の方法を繰り返し、ブランク(ΔODブランク)を測定した。
アッセイの直前に氷冷した酵素希釈液(E)で酵素粉末を溶解し、同一の緩衝液で0.1−0.8U/mlに希釈した(該酵素の接着性のためにプラスチックチューブの使用が好ましい)。
計算
活性を以下の式を用いて計算する:
U/ml={ΔOD/min(ΔODテスト− ΔODブランク)×Vt×df}/(20.1×1.0×Vs)
U/mg=(U/ml)×1/C
Vt:総体積(3.1ml)
Vs:サンプル体積(1.0ml)
20.1:ジホルマザンの1/2ミリモル分子吸光係数
1.0:光路長(cm)
df:希釈係数
C:溶液中の酵素濃度(c mg/ml)
3.0 ml of the reaction mixture was placed in a test tube (made of plastic) and preheated at 37 ° C. for 5 minutes.
0.1 ml enzyme solution was added and mixed by gentle inversion.
The increase in absorbance for water at 570 nm was recorded for 4-5 minutes on a spectrophotometer while maintaining at 37 ° C., and ΔOD per minute from the initial linear portion of the curve was calculated (OD test).
At the same time, the same method was repeated except that the enzyme diluent (E) was added instead of the enzyme solution, and a blank (ΔOD blank) was measured.
Immediately before the assay, the enzyme powder was dissolved in an ice-cold enzyme diluent (E) and diluted to 0.1-0.8 U / ml with the same buffer (use of a plastic tube for adhesion of the enzyme) Is preferred).
Calculation Activity is calculated using the following formula:
U / ml = {ΔOD / min (ΔOD test−ΔOD blank) × Vt × df} / (20.1 × 1.0 × Vs)
U / mg = (U / ml) × 1 / C
Vt: Total volume (3.1 ml)
Vs: Sample volume (1.0 ml)
20.1: 1/2 mmol molecular extinction coefficient of diformazan 1.0: optical path length (cm)
df: Dilution factor C: Enzyme concentration in solution (c mg / ml)
ホロ型発現精製酵素の調製方法
500mlのTerrific brothを2L容坂口フラスコに分注し、121℃、20分間オートクレーブを行い、放冷後別途無菌濾過したストレプトマイシンを100μg/mlになるように添加した。この培地に100μg/mlのストレプトマイシンを含むPY培地で予め30℃、24時間培養したシュードモナス・プチダTE3493(pNPG6M1)の培養液を5ml接種し、30℃で40時間通気攪拌培養した。培養終了時のPQQ依存性グルコース脱水素酵素活性は、前記活性測定において、培養液1ml当たり約120U/mlであった。
上記菌体を遠心分離により集菌し、20mMリン酸緩衝液(pH7.0)に懸濁した後、超音波処理により破砕し、更に遠心分離を行い、上清液を粗酵素液として得た。得られた粗酵素液をHiTrap−SP(アマシャム−ファルマシア)イオン交換カラムクロマトグラフィーにより分離・精製した。次いで10mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)で透析した後に終濃度が1mMになるように塩化カルシウムを添加した。最後にHiTrap−DEAE(アマシャム−ファルマシア)イオン交換カラムクロマトグラフィーにより分離・精製し、精製酵素標品を得た。本方法により得られた標品は、SDS−PAGE的にほぼ単一なバンドを示した。
pNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17によるシュードモナス・プチダTE3493形質転換体についても上記方法と同様にして精製酵素標品を取得した。
このようにして取得した精製酵素を用いて性能を評価した。
Preparation Method of Holo-type
The cells were collected by centrifugation, suspended in 20 mM phosphate buffer (pH 7.0), disrupted by sonication, and further centrifuged to obtain a supernatant as a crude enzyme solution. . The obtained crude enzyme solution was separated and purified by HiTrap-SP (Amersham-Pharmacia) ion exchange column chromatography. Next, after dialyzing with 10 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5), calcium chloride was added to a final concentration of 1 mM. Finally, it was separated and purified by HiTrap-DEAE (Amersham-Pharmacia) ion exchange column chromatography to obtain a purified enzyme preparation. The sample obtained by this method showed an almost single band by SDS-PAGE.
pNPG6, pNPG6M3, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M An enzyme preparation was obtained.
The performance was evaluated using the purified enzyme thus obtained.
Km値の測定
上記の活性測定方法に従い、PQQGDHの活性を測定した。グルコースに対するKm値の測定は、上記活性測定方法の基質濃度を変化させて実施した。また、マルトースに対するKm値の測定は、上記活性測定方法のグルコース溶液をマルトース溶液に置き換え、グルコースに対するKm値の測定同様基質濃度を変化させて実施した。結果を表2A表2B、表6,表9,表14及び表18に示す。
Measurement of Km Value According to the above activity measurement method, the activity of PQQGDH was measured. Measurement of the Km value for glucose was carried out by changing the substrate concentration in the above activity measurement method. The measurement of the Km value for maltose was carried out by replacing the glucose solution in the above activity measurement method with a maltose solution and changing the substrate concentration as in the measurement of the Km value for glucose. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 6, Table 9, Table 14, and Table 18.
基質特異性
上記の活性測定方法に従い、PQQGDHの活性を測定した。グルコースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性値とマルトースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性値を測定し、グルコースを基質とした場合の測定値を100とした場合の相対値を求めた。マルトースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性に際しては、0.5Mのマルトース溶液を調製して活性測定に用いた。結果を表2A、表2B、表4、表5、表6、表8、表9、表11、表13、表14及び表18に示す。
Substrate specificity The activity of PQQGDH was measured according to the above activity measurement method. The dehydrogenase activity value when glucose is used as the substrate solution and the dehydrogenase activity value when maltose is used as the substrate solution are measured, and the relative value is obtained when the measured value when glucose is used as the substrate is 100. It was. For dehydrogenase activity when maltose was used as a substrate solution, a 0.5 M maltose solution was prepared and used for activity measurement. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 4, Table 5, Table 6, Table 8, Table 9, Table 11, Table 13, Table 14, and Table 18.
熱安定性の測定
各種PQQGDHを酵素濃度5U/ml、緩衝液(1mM CaCl2、1μM PQQを含む10mM PIPES−NaOH(pH6.5)中で保存し、58℃で熱処理後の活性残存率を求めた。結果を表2A、表2B、表6、表9、表14及び表18に示す。なお、熱処理を行なった時間は、表2B、表18の試験のみ30分間、その他の試験は20分間である。
Measurement of thermal stability Various PQQGDHs were stored in an enzyme concentration of 5 U / ml in a buffer solution (10 mM PIPES-NaOH (pH 6.5) containing 1 mM CaCl2, 1 μM PQQ), and the activity remaining rate after heat treatment was determined at 58 ° C. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 6, Table 9, Table 14 and Table 18. The heat treatment time was 30 minutes only for the tests in Table 2B and Table 18, and the other tests were 20 minutes. is there.
至適pHの測定
0.22% Triton−X100を含む 50mMリン酸緩衝液(pH5.0〜8.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM 酢酸緩衝液(pH3.0〜6.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.0〜7.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM
トリス塩酸緩衝液(pH7.0〜9.0)中で酵素活性を測定した。結果を図1に示す。また、最も高い活性を示したpHを表2Aに示す。
Measurement of optimum pH 50 mM phosphate buffer (pH 5.0 to 8.0) containing 0.22% Triton-X100, 50 mM acetate buffer (pH 3.0 to 6.0) containing 0.22% Triton-X100 ), 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.0-7.0) containing 0.22% Triton-X100, 50 mM containing 0.22% Triton-X100
Enzyme activity was measured in Tris-HCl buffer (pH 7.0-9.0). The results are shown in FIG. In addition, Table 2A shows the pH that showed the highest activity.
Q76Kのグルコース定量性の確認
0.45U/mlのQ76Kを含んだ下記反応試薬を調整した。
50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
1mM CaCl2
0.22% Triton−X100
0.4mM PMS
0.26mM WST−1(水溶性テトラゾリウム塩、同仁化学研究所製)
下記に示すグルコース量の測定方法に従い、試料として精製水、100mg/dl標準液及びグルコース水溶液(600mg/dl)の10水準の希釈系列を測定し、直線性を確認した。
結果を図2に示した。
Confirmation of glucose quantification of Q76K The following reaction reagent containing 0.45 U / ml of Q76K was prepared.
50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5)
1 mM CaCl2
0.22% Triton-X100
0.4 mM PMS
0.26 mM WST-1 (water-soluble tetrazolium salt, manufactured by Dojindo Laboratories)
In accordance with the method for measuring the amount of glucose shown below, 10-level dilution series of purified water, 100 mg / dl standard solution and glucose aqueous solution (600 mg / dl) were measured as samples to confirm linearity.
The results are shown in FIG.
グルコース量の測定方法
試料量3μlに試薬300μlを加え、試薬添加後2分後からの1分間における吸光度変化を求め、精製水及びグルコース100mg/dl標準液での2点検量線に基づき試料中のグルコース量を求めた。尚、測定装置は日立7150形自動分析装置を使用し、測定波長は、主波長480nmのみ、測定温度は37℃で実施した。
図2より、0−600mg/dlの範囲で良好な直線性が確認された。
Method for measuring glucose amount Add 300 μl of reagent to 3 μl of sample volume, determine the change in absorbance in 1 minute after 2 minutes from the addition of the reagent, and use the two-inspection curve with purified water and
From FIG. 2, good linearity was confirmed in the range of 0 to 600 mg / dl.
Q76Kのマルトース作用性の確認
0.45U/mlのQ76Kを含んだ下記反応試薬を調整した。
50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
1mM CaCl2
0.22% Triton−X100
0.4mM PMS
0.26mM WST−1(同仁化学研究所製)
サンプルとしては100mg/dlまたは300mg/dlのグルコースをベースに0,120,240,360mg/dlのマルトースを上乗せした物を準備した。 上記、グルコース量の測定方法に従い、測定を実施した。
マルトースを含まない100mg/dlグルコース溶液と100とし、ベースに100mg/dlのグルコースを含むサンプルの測定値をそれぞれ相対評価した。同様にマルトースを含まない300mg/dlグルコース溶液と100とし、ベースに300mg/dlのグルコースを含むサンプルの測定値をそれぞれ相対評価した。結果を図3に示す。
Confirmation of Maltose Activity of Q76K The following reaction reagent containing 0.45 U / ml of Q76K was prepared.
50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5)
1 mM CaCl2
0.22% Triton-X100
0.4 mM PMS
0.26 mM WST-1 (Dojindo Laboratories)
Samples were prepared by adding 0,120,240,360 mg / dl maltose on the basis of 100 mg / dl or 300 mg / dl glucose. The measurement was performed according to the method for measuring the glucose amount.
A 100 mg / dl glucose solution containing no maltose and 100 were measured, and the measured values of the samples containing 100 mg / dl glucose in the base were evaluated relative to each other. Similarly, a 300 mg / dl glucose solution not containing maltose and 100 were used, and the measured values of the samples containing 300 mg / dl glucose in the base were relatively evaluated. The results are shown in FIG.
Q76Eのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Eを用いて作用性を評価した。酵素は、0.24U/mlの濃度で添加した。結果を図4に示す。
Confirmation of Q76E Maltose Activity As in the confirmation of Q76K maltose activity, the activity was evaluated using Q168E. Enzyme was added at a concentration of 0.24 U / ml. The results are shown in FIG.
Q168Vのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Vを用いて作用性を評価した。酵素は、0.35U/mlの濃度で添加した。結果を図5に示す。
Confirmation of Q168V Maltose Activity As in the confirmation of Q76K maltose activity, the activity was evaluated using Q168V. Enzyme was added at a concentration of 0.35 U / ml. The results are shown in FIG.
Q168Aのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Aを用いて作用性を評価した。酵素は、0.6U/mlの濃度で添加した。結果を図6に示す。
Confirmation of Q168A Maltose Activity As in the confirmation of Q76K maltose activity, the activity was evaluated using Q168A. Enzyme was added at a concentration of 0.6 U / ml. The results are shown in FIG.
野生型酵素のマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様に野生型酵素を用いて作用性を評価した。酵素は、0.1U/mlの濃度で添加した。結果を図7に示す。
図3、図4、図5、図6、図7より、Q76K、Q76E、Q168V及びQ168Aは野生型酵素に比べ、マルトースに対する作用性が低下していることが確認された。
Confirmation of Maltose Activity of Wild Type Enzyme The activity was evaluated using wild type enzyme in the same manner as the confirmation of maltose activity of Q76K. Enzyme was added at a concentration of 0.1 U / ml. The results are shown in FIG.
From FIG. 3, FIG. 4, FIG. 5, FIG. 6, and FIG. 7, it was confirmed that Q76K, Q76E, Q168V, and Q168A have a reduced action on maltose compared to the wild-type enzyme.
実施例5:変異ライブラリーの構築とスクリーニング
発現プラスミドpNPG5をテンプレートとして、PCR法により構造遺伝子中の167−169領域にランダム変異を導入した。PCR反応は表3に示す組成の溶液中で、98℃2分間、次に、98℃20秒間、60℃30秒間、及び72℃4分間を30サイクルの条件で行った。
Example 5: Construction and screening of mutation library Random mutations were introduced into the 167-169 region in the structural gene by the PCR method using the expression plasmid pNPG5 as a template. The PCR reaction was performed in a solution having the composition shown in Table 3 at 98 ° C. for 2 minutes, then at 98 ° C. for 20 seconds, 60 ° C. for 30 seconds, and 72 ° C. for 4 minutes under 30 cycles.
得られた変異ライブラリーを大腸菌DH5αに形質転換し、形成された各コロニーを180μl/wellのLB培地(100μg/mlのアンピシリンと26μMのPQQを含む)の分注されたマイクロタイタープレートに植菌し、37℃、24時間培養した。培養液各50μlを別のマイクロタイタープレートに移し、凍結融解の繰り返しによって培養菌体を破砕した後、遠心分離(2000rpm、10分間)を行い、上清を回収した。回収した上清を2枚のマイクロタイタープレートに各10μl分注した。1枚のマイクロタイタープレートはグルコースを基質とした活性測定試薬を用いて活性測定し、もう一枚はマルトースを基質とした活性測定試薬を用いて活性測定し、反応性を比較した。マルトースに対する反応性の変化したクローンが多数得られた。
マルトースに対する反応性の変化したクローンをLB培地(100μg/mlのアンピシリンと26μMのPQQを含む)5mlの分注された試験管で培養し、確認実験を行ったところ、マルトースに対する反応性の変化したクローンが多数得られた。
結果を表4に示す。
The obtained mutation library was transformed into E. coli DH5α, and each formed colony was inoculated into a microtiter plate dispensed with 180 μl / well of LB medium (containing 100 μg / ml ampicillin and 26 μM PQQ). And cultured at 37 ° C. for 24 hours. 50 μl of each culture solution was transferred to another microtiter plate, and the cultured cells were disrupted by repeated freeze-thawing, followed by centrifugation (2000 rpm, 10 minutes), and the supernatant was collected. The collected supernatant was dispensed into two microtiter plates, 10 μl each. One microtiter plate was subjected to activity measurement using an activity measurement reagent using glucose as a substrate, and the other plate was subjected to activity measurement using an activity measurement reagent using maltose as a substrate, and the reactivity was compared. Many clones with altered reactivity to maltose were obtained.
When clones with altered reactivity to maltose were cultured in LB medium (containing 100 μg / ml ampicillin and 26 μM PQQ) in 5 ml dispensed tubes and confirmed, the reactivity to maltose changed. Many clones were obtained.
The results are shown in Table 4.
同様にして67−69領域(フォワードプライマー:配列番号14に記載、リバースプライマー:配列番号15に記載を使用)、129−131領域(フォワードプライマー:配列番号16に記載、リバースプライマー:配列番号17に記載を使用)、341−343領域(フォワードプライマー:配列番号18に記載、リバースプライマー:配列番号19に記載を使用)にも変異導入した。また、428と429(フォワードプライマー:配列番号20に記載、リバースプライマー:配列番号21に記載を使用)の間に挿入を試みた。
結果を表5に示す。
Similarly, 67-69 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 14, reverse primer: used in SEQ ID NO: 15), 129-131 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 16, reverse primer: in SEQ ID NO: 17) And the 341-343 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 18, reverse primer: used as described in SEQ ID NO: 19) was also mutated. Further, insertion was attempted between 428 and 429 (forward primer: described in SEQ ID NO: 20, reverse primer: described in SEQ ID NO: 21).
The results are shown in Table 5.
これらのうち、マルトースに対する作用性が大きく低下している変異体を選抜(Q168S+E245D、Q168A+L169D、Q168S+L169S、Q168S+L169E、Q168A+L169G、Q168S+L169P)し、これらの変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表6に示す。 Among these, mutants having significantly reduced activity against maltose were selected (Q168S + E245D, Q168A + L169D, Q168S + L169S, Q168S + L169E, Q168A + L169G, Q168S + L169P), and plasmids were extracted from these mutants, Example 3 and Example 4 Pseudomonas was transformed according to the method described to express a holo-type enzyme, and purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 6.
実施例6:Q168部位の変異による基質特異性への影響
実施例5に記載の方法に準じて、Q168C、Q168D、Q168E,Q168F,Q168G,Q168H,Q168K,Q168L,Q168M,Q168N,Q168P、Q168R,Q168S,Q168T、Q168W、Q168Yの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表7に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表8に示す。更に、各変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表9に示す。
Example 6: Influence on substrate specificity by mutation of Q168 site According to the method described in Example 5, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168P, Q168R, Each mutant of Q168S, Q168T, Q168W, and Q168Y was prepared. The primers used for the preparation of each mutant are shown in Table 7. In addition, Table 8 shows the results of comparing the reactivity to maltose with the disrupted liquid prepared by test tube culture using each prepared mutant. Furthermore, a plasmid was extracted from each mutant, Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4, to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 9.
実施例7:L169部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、L169A,L169V,L169H、L169Y、L169K,L169D,L169S,L169N,L169G,L169Cの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表10に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表11に示す。
Example 7: Influence on substrate specificity by mutation of L169 site According to the method described in Example 2, L169A, L169V, L169H, L169Y, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, and L169C mutants Prepared. The primers used for the preparation of each mutant are shown in Table 10. In addition, Table 11 shows the results of comparing the reactivity to maltose with each of the prepared mutants and the disrupted solution prepared by test tube culture.
実施例8:Q168A変異体に対するL169部位の変異の組み合わせによる基質特異性
への影響
実施例5に記載の方法に準じて、Q168A+L169A、Q168A+L169C、Q168A+L169E、Q168A+L169F、Q168A+L169H、Q168A+L169I、Q168A+L169K、Q168A+L169M、Q168A+L169N、Q168A+L169P、Q168A+L169Q、Q168A+L169R、Q168A+L169S、Q168A+L169T、Q168A+L169V、Q168A+L169W、Q168A+L169Yの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表12に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表13に示す。更に、各変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表14に示す。
Example 8: Influence on substrate specificity by combination of mutations at L169 site for Q168A mutant According to the method described in Example 5, Q168A + L169A, Q168A + L169C, Q168A + L169E, Q168A + L169F, Q168A + L169A, Q168A + L169A, Q168A + L169A, Q168A + L16A Variants of Q168A + L169P, Q168A + L169Q, Q168A + L169R, Q168A + L169S, Q168A + L169T, Q168A + L169V, Q168A + L169W, Q168A + L169Y were prepared. Table 12 shows the primers used for the preparation of each mutant. In addition, Table 13 shows the results of comparing the reactivity to maltose with each of the prepared mutants and the disrupted solution prepared by test tube culture. Furthermore, a plasmid was extracted from each mutant, Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4, to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 14.
実施例9:A170部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、A170C、A170D、A170E,A170F,A170G,A170H,A170K,A170L,A170M,A170N,A170P、A170R,A170S,A170T、A170W、A170Y,A170V,A170I,A170Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号69記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号69と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表15に示す。
Example 9: Effect on substrate specificity by mutation of A170 site According to the method described in Example 2, A170C, A170D, A170E, A170F, A170G, A170H, A170K, A170L, A170M, A170N, A170P, A170R, A170S, A170T, A170W, A170Y, A170V, A170I, and A170Q mutants were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 69 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 69 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 15 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.
実施例10:E245部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、E245C、E245D、E245A,E245F,E245G,E245H,E245K,E245L,E245M,E245N,E245P、E245R,E245S,E245T、E245W、E245Y,E245V,E245I,E245Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号70記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号70と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表16に示す。
Example 10: Effect on substrate specificity by mutation of E245 site According to the method described in Example 2, E245C, E245D, E245A, E245F, E245G, E245H, E245K, E245L, E245M, E245N, E245P, E245R, Each mutant of E245S, E245T, E245W, E245Y, E245V, E245I, E245Q was prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 70 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 70 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 16 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.
実施例11:N249部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、N249C、N249D、N249A,N249F,N249G,N249H,N249K,N249L,N249M,N249E,N249P、N249R,N249S,N249T、N249W、N249V,N249I,N249Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号71記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号71と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表17に示す。
Example 11: Influence on substrate specificity by mutation of N249 site According to the method described in Example 2, N249C, N249D, N249A, N249F, N249G, N249H, N249K, N249L, N249M, N249E, N249P, N249R, N249S, N249T, N249W, N249V, N249I, and N249Q mutants were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 71 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 71 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 17 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.
実施例12:E245D変異の組み合わせによる基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、(Q168A+L169G+E245D)、(Q168A+L169P+E245D)の各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号72記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号72と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。また、鋳型DNAとしては実施例8で取得した(Q168A+L169G)または(Q168A+L169P)のplasmidを使用した。調製した変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表18に示す。
Example 12: Effect on substrate specificity by combination of E245D mutations According to the method described in Example 2, mutants (Q168A + L169G + E245D) and (Q168A + L169P + E245D) were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 72 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 72 was used as a reverse primer. As the template DNA, plasmid (Q168A + L169G) or (Q168A + L169P) obtained in Example 8 was used. A plasmid was extracted from the prepared mutant, Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4, to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 18.
実施例13:T349部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、T349S、T349P、T349Yの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号73記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号73と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した
。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表19に示す。
Example 13: Effect on substrate specificity by mutation of T349 site According to the method described in Example 2, mutants of T349S, T349P, and T349Y were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 73 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 73 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 19 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.
実施例14:N429部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、N429F、N429P、N429L、N429Yの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号74記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号74と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表20に示す。
Example 14: Influence on substrate specificity by mutation of N429 site According to the method described in Example 2, mutants of N429F, N429P, N429L, and N429Y were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 74 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 74 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 20 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.
本発明によれば、基質特異性及び/又は熱安定性が改善されたPQQGDHを得ることができる。この改変型PQQGDHは、グルコースアッセイキット、グルコースセンサに利用できる。 According to the present invention, PQQGDH having improved substrate specificity and / or thermal stability can be obtained. This modified PQQGDH can be used for glucose assay kits and glucose sensors.
Claims (8)
A glucose measurement method comprising the modified PQQGDH according to claim 1.
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