JP4029346B2 - Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability - Google Patents

Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability Download PDF

Info

Publication number
JP4029346B2
JP4029346B2 JP2003315797A JP2003315797A JP4029346B2 JP 4029346 B2 JP4029346 B2 JP 4029346B2 JP 2003315797 A JP2003315797 A JP 2003315797A JP 2003315797 A JP2003315797 A JP 2003315797A JP 4029346 B2 JP4029346 B2 JP 4029346B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
glucose
pqqgdh
seq
maltose
modified
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
JP2003315797A
Other languages
Japanese (ja)
Other versions
JP2004313172A (en
Inventor
誠嗣 竹嶋
肇庸 松村
高英 岸本
岡  正則
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Toyobo Co Ltd
Original Assignee
Toyobo Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority to JP2003315797A priority Critical patent/JP4029346B2/en
Application filed by Toyobo Co Ltd filed Critical Toyobo Co Ltd
Priority to CNA2004800257689A priority patent/CN1849392A/en
Priority to US10/570,904 priority patent/US7479383B2/en
Priority to EP04772464A priority patent/EP1666586B1/en
Priority to PCT/JP2004/012508 priority patent/WO2005026340A1/en
Priority to DE602004023736T priority patent/DE602004023736D1/en
Priority to TW093127096A priority patent/TW200525033A/en
Publication of JP2004313172A publication Critical patent/JP2004313172A/en
Application granted granted Critical
Publication of JP4029346B2 publication Critical patent/JP4029346B2/en
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Landscapes

  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Description

本発明は基質特異性及び/又は熱安定性が改良された改変型グルコースデヒドロゲナーゼ(GDH)に関し、詳しくはピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とする改変型PQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)、その製造法及びグルコースセンサーに関する。
本発明の改変型PQQGDHは、臨床検査や食品分析などにおけるグルコースの定量に有用である。
The present invention relates to a modified glucose dehydrogenase (GDH) having improved substrate specificity and / or thermal stability, and more specifically, a modified PQQ-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH) having pyrroloquinoline quinone (PQQ) as a coenzyme, The present invention relates to a production method and a glucose sensor.
The modified PQQGDH of the present invention is useful for the determination of glucose in clinical examinations and food analysis.

PQQGDHは、ピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とするグルコースデヒドロゲナーゼである。グルコースを酸化してグルコノラクトンを生成する反応を触媒するから、血糖の測定に用いることができる。血中グルコース濃度は、糖尿病の重要なマーカーとして臨床診断上きわめて重要な指標である。現在、血中グルコース濃度の測定は、グルコースオキシダーゼを使用したバイオセンサーを用いる方法が主流となっているが、反応が溶存酸素濃度に影響されるから、測定値に誤差が生じる可能性があった。このグルコースオキシダーゼにかわる新たな酵素としてPQQ依存性グルコース脱水素酵素が注目されている。我々のグループは、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii) NCIMB11517株が、PQQ依存性グルコース脱水素酵素を産生することを見出し,遺伝子のクローニングならびに高発現系を構築した(特許文献1参照)。PQQ依存性グルコース脱水素酵素はグルコースオキシダーゼに比べて基質特異性、熱安定性に問題点があった。
特開平11−243949号公報
PQQGDH is a glucose dehydrogenase using pyrroloquinoline quinone (PQQ) as a coenzyme. Since it catalyzes the reaction of oxidizing glucose to produce gluconolactone, it can be used for blood glucose measurement. Blood glucose concentration is an extremely important index for clinical diagnosis as an important marker of diabetes. Currently, blood glucose concentration is measured mainly by a method using a biosensor using glucose oxidase, but the reaction is affected by the dissolved oxygen concentration, which may cause an error in the measured value. . PQQ-dependent glucose dehydrogenase has attracted attention as a new enzyme that replaces this glucose oxidase. Our group found that Acinetobacter baumanni NCIMB11517 produces PQQ-dependent glucose dehydrogenase, and constructed a gene cloning and high expression system (see Patent Document 1). PQQ-dependent glucose dehydrogenase has problems in substrate specificity and thermal stability compared to glucose oxidase.
Japanese Patent Laid-Open No. 11-243949

本発明は、従来技術の課題を背景になされたもので、PQQ−GDHの基質特異性及び/又は熱安定性を課題としてその改良に関するものである。   The present invention has been made against the background of the problems of the prior art, and relates to the improvement of the substrate specificity and / or thermal stability of PQQ-GDH.

本発明者らは上記課題を解決するため、鋭意研究した結果、遂に本発明を完成するに到った。即ち本発明は、
1. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも二糖類に対する作用性が低下した、及び/又は、安定性が向上した改変型PQQGDH。
2. 野生型のグルコースデヒドロゲナーゼよりも二糖類に対する作用性が低下したことを特徴とする1.に記載の改変型PQQGDH。
3. 二糖類がマルトースであることを特徴とする2.に記載の改変型PQQGDH。
4. マルトースに対する作用性がグルコースに対する作用性の90%以下であることを特徴とする2.記載の改変型PQQGDH。
5. 二糖類に対するに対するKm値が大きくなったことを特徴とする2.に記載の改変型PQQGDH。
6. 二糖類がマルトースであることを特徴とする5.記載の改変型PQQGDH。
7. マルトースに対するKm値が8mM以上であることを特徴とする5.記載の改変型PQQGDH。
8. 二糖類に対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きいことを特徴とする2.記載の改変型PQQGDH。
9. 二糖類がマルトースであることを特徴とする8.記載の改変型PQQGDH。
10. マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値の1.5倍以上であることを特徴とする8.記載の改変型PQQGDH。
11. 配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、グルコースの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
12. 配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
13. 配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、170位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、249位、300位、349位、129位、130位及び131位からなる群から選ばれる少なくとも1つの位置のアミノ酸が置換されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
14. アミノ酸置換が、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H, L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T, E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N, L169P, L169G及びL169Eからなる群から選択される13.に記載の改変型PQQGDH。
15. アミノ酸置換が、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (K89E+K300R), (Q168A+L169D), (Q168S+L169S), (N167E+Q168G+L169T), (N167S+Q168N+L169R), (Q168G+L169T), (N167G+Q168S+L169Y), (N167L+Q168S+L169G), (N167G+Q168S+L169S+L174F+K49N), (Q168N+L168N+S189R), (N167E+Q168G+L169A+S189G), (N167G+Q168R+L169A), (N167S+Q168G+L169A), (N167G+Q168V+L169S), (N167S+Q168V+L169S), (N167T+Q168I+L169G), (N167G+Q168W+L169N), (N167G+Q168S+L169N), (N167G+Q168S+L169V), (Q168R+L169C), (N167S+Q168L+L168G), (Q168C+L169S), (N167T+Q168N+L169K), (N167G+Q168T+L169A+S207C), (N167A+Q168A+L169P), (N167G+Q168S+L169G), (N167G+Q168G), (N167G+Q168D+L169K), (Q168P+L169G), (N167G+Q168N+L169S), (Q168S+L169G), (N188I+T349S), (N167G+Q168G+L169A+F215Y), (N167G+Q168T+L169G), (Q168G+L169V), (N167G+Q168V+L169T), (N167E+Q168N+L169A), (Q168R+L169A), (N167G+Q168R), (N167G+Q168T), (N167G+Q168T+L169Q), (Q168I+L169G+K300T), (N167G+Q168A), (N167T+Q168L+L169K), (N167M+Q168Y+L169G), (N167E+Q168S), (N167G+Q168T+L169V+S189G), (N167G+Q168G+L169C), (N167G+Q168K+L169D), (Q168A+L169D), (Q168S+E245D), (Q168S+L169S), (A351T), (N167S+Q168S+L169S), (Q168I+L169Q), (N167A+Q168S+L169S), (Q168S+L169E), (Q168A+L169G), (Q168S+L169P), (P67K+E68K), (P67R+E68R+I69C), (P67D+E68T+I69C), (E129R+K130G+P131G), (E129Q+K130T+P131R), (E129N+P131T), (E129A+K130R+P131K), (E341L+M342P+A343R), (E341S+M342I), A343I, (E341P+M342V+A343C), (E341P+M342V+A343R), (E341L+M342R+A343N), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169I), (Q168A+L169K), (Q168A+L169M), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169S), (Q168A+L169T), (Q168A+L169V), (Q168A+L169W)及び(Q168A+L169Y)からなる群から選択され、該アミノ酸置換により基質特異性が向上した13.に記載の改変型PQQGDH。
16. 配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、428位と429位の間にアミノ酸が挿入されている、2.に記載の改変型PQQGDH。
17. 1.〜16.のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。
18. 17.に記載の遺伝子を含むベクター。
19. 18.に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
20. 19.に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。
21. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。
22. 1.〜20.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。
23. 野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)よりも安定性が向上した改変型PQQGDH。
24. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が48%以上であることを特徴とする23.記載の改変型PQQGDH。
25. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が55%以上であることを特徴とする23.記載の改変型PQQGDH。
26. 58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が70%以上であることを特徴とする23.記載の改変型PQQGDH。
27. 配列番号1に記載されるPQQGDHにおいて、20位、76位、89位、168位、169位、246位及び300位からなる群から選ばれる少なくとも1つの位置のアミノ酸が置換されている、23.に記載のPQQGDH。
28. アミノ酸置換が、K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D, L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y及びL169Gからなる群から選択される27.に記載の改変型PQQGDH。
29. アミノ酸置換が、K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S,(Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169K), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169T), (Q168A+L169Y)及び(Q168A + L169G)からなる群から選択され、該アミノ酸置換により熱安定性が向上した28.に記載の改変型PQQGDH。
30. 23.〜29.のいずれかに記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子。
31. 30.に記載の遺伝子を含むベクター。
32. 31.に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
33. 32.に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。
34. 23.〜32.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。
35. 23.〜32.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。
36. 23.〜32.のいずれかに記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。
37. 野生型酵素の活性型立体構造における活性中心から半径15Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.に記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
38. 野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
39. 基質がグルコースで有る38.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
40. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
41. 基質がグルコースである40.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
42. 野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られる1.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
43.基質がグルコースで有る42.記載の改変型グルコースデヒドロゲナーゼ。
である。
As a result of intensive studies to solve the above problems, the present inventors have finally completed the present invention. That is, the present invention
1. Modified PQQGDH having reduced activity on disaccharides and / or improved stability compared to wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH).
2. 1. The activity on disaccharides is lower than that of wild-type glucose dehydrogenase. Modified PQQGDH described in 1.
3. 1. The disaccharide is maltose Modified PQQGDH described in 1.
4). 1. The action on maltose is 90% or less of the action on glucose. Modified PQQGDH as described.
5. 1. Increased Km value for disaccharides Modified PQQGDH described in 1.
6). 4. The disaccharide is maltose Modified PQQGDH as described.
7). 4. Km value for maltose is 8 mM or more. Modified PQQGDH as described.
8). 1. Km value for disaccharide is larger than Km value for glucose Modified PQQGDH as described.
9. 7. The disaccharide is maltose Modified PQQGDH as described.
10. 7. Km value for maltose is 1.5 times or more of Km value for glucose Modified PQQGDH as described.
11. 1. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1, amino acids involved in glucose binding and / or surrounding amino acids are substituted. Modified PQQGDH described in 1.
12 1. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1, amino acids involved in calcium ion binding and / or surrounding amino acids are substituted. Modified PQQGDH described in 1.
13. In the PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1, position 67, position 68, position 69, position 76, position 89, position 167, position 168, position 169, position 170, position 341, position 342, position 343, At least one selected from the group consisting of 351, 49, 174, 188, 189, 207, 215, 245, 249, 300, 349, 129, 130 and 131 1. the amino acid at position is substituted; Modified PQQGDH described in 1.
14 Amino acid substitution is Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q8A, Q16A, Q16A, Q16A Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169C, L169H A170F, A170W, A170P, K89E, K30 0R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245Q, E245Q, E245Q, E245Q, E245Q, E245Q P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T, E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343P, A343P, A343P, A343P M342R, A343N, L169P, L169G and L 13 selected from the group consisting of 69E. Modified PQQGDH described in 1.
15. Amino acid substitution is Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q16H, Q8K, Q16L, Q16L, Q16L L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245H, E245H, E245H, E245M (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (K89E + K300R), (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (N167E + Q168G + L169T), (N167S + Q168N + L169R), (Q168G + L169T), (N167G + Q168S + L169Y), (N167L + Q168S + L169G), (N167G + Q168S + L169S + L174F + K49N), (Q168N + L168N + S189R), (N167E + Q168G + L169A + S189G), (N167G + Q168R + L169A) , (N167S + Q168G + L169A), (N167G + Q168V + L169S), (N167S + Q168V + L169S), (N167T + Q168I + L169G), (N 67G + Q168W + L169N), (N167G + Q168S + L169N), (N167G + Q168S + L169V), (Q168R + L169C), (N167S + Q168L + L168G), (Q168C + L169S), (N167T + Q168N + L169K), (N167G + Q168T + L169A + S207C), (N167A + Q168A + L169P), (N167G + Q168S + L169G), (N167G + Q168G), (N167G + Q168D + L169K), (Q168P + L169G) , (N167G + Q168N + L169S), (Q168S + L169G), (N188I + T349S), (N167G + Q168G + L169A + F215Y), (N167G + Q168T + L 69G), (Q168G + L169V), (N167G + Q168V + L169T), (N167E + Q168N + L169A), (Q168R + L169A), (N167G + Q168R), (N167G + Q168T), (N167G + Q168T + L169Q), (Q168I + L169G + K300T), (N167G + Q168A), (N167T + Q168L + L169K), (N167M + Q168Y + L169G), (N167E + Q168S) , (N167G + Q168T + L169V + S189G), (N167G + Q168G + L169C), (N167G + Q168K + L169D), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169T), (A35) N167S + Q168S + L169S), (Q168I + L169Q), (N167A + Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P), (P67K + E68K), (P67R + E68R + I69C), (P67D + E68T + I69C), (E129R + K130G + P131G), (E129Q + K130T + P131R), (E129N + P131T), (E129A + K130R + P131K) , (E341L + M342P + A343R), (E341S + M342I), A343I, (E341P + M342V + A343C), (E341P + M342V + A343R), (E341L + M342R + A343N), (Q168A + L169A) ), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169I), (Q168A + L169K), (Q168A + L169N), (Q168A + L16N), (Q168A + L16N) 12. selected from the group consisting of (Q168A + L169T), (Q168A + L169V), (Q168A + L169W) and (Q168A + L169Y), and the substrate specificity is improved by the amino acid substitution. Modified PQQGDH described in 1.
16. 1. An amino acid is inserted between positions 428 and 429 in the PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1. Modified PQQGDH described in 1.
17. 1. -16. A gene encoding the modified PQQGDH according to any one of the above.
18. 17. A vector comprising the gene described in 1.
19. 18. A transformant transformed with the vector described in 1.
20. 19. A method for producing modified PQQGDH, comprising culturing the transformant described in 1. above.
21. 1. -20. A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
22. 1. -20. A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
23. Modified PQQGDH having improved stability over wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH).
24. 23. The residual activity rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 48% or more. Modified PQQGDH as described.
25. 23. The residual activity rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 55% or more. Modified PQQGDH as described.
26. 23. The residual activity ratio after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is 70% or more. Modified PQQGDH as described.
27. 20. In PQQGDH described in SEQ ID NO: 1, an amino acid at at least one position selected from the group consisting of positions 20, 76, 89, 168, 169, 246, and 300 is substituted; PQQGDH described in 1.
28. Amino acid substitution is K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L9P, L169P, L169P 27. Selected from the group consisting of Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y and L169G Modified PQQGDH described in 1.
29. Amino acid substitutions are K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, 16168, Q168H, 16168 Q168S, (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169A), (Q16A + L169H) (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q 168A + L169Y) and (Q168A + L169G), and the amino acid substitution improved thermal stability. Modified PQQGDH described in 1.
30. 23. -29. A gene encoding the modified PQQGDH according to any one of the above.
31. 30. A vector comprising the gene described in 1.
32. 31. A transformant transformed with the vector described in 1.
33. 32. A method for producing modified PQQGDH, comprising culturing the transformant described in 1. above.
34. 23. ~ 32. A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
35. 23. ~ 32. A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
36. 23. ~ 32. A glucose measurement method comprising the modified PQQGDH according to any one of the above.
37. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 15 mm from the active center in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described in 1.
38. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
39. The substrate is glucose 38. The modified glucose dehydrogenase described.
40. 1. It is obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 mm from the OH group bonded to the 1st carbon of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild type enzyme. The modified glucose dehydrogenase described.
41. The substrate is glucose40. The modified glucose dehydrogenase described.
42. 1. It can be obtained by mutating an amino acid located within a radius of 10 mm from the OH group bonded to the carbon at the 2-position of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild type enzyme The modified glucose dehydrogenase described.
43. The substrate is glucose 42. The modified glucose dehydrogenase described.
It is.

本発明による改変型PQQGDHは野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下したもの、および/または、野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上した酵素である。本発明による改変型PQQGDHをグルコースアッセイキット及びグルコースセンサに使用することにより、野生型PQQGDHを使用したものよりもより高精度な分析が可能となったり、より安定性の高いグルコースアッセイキット及びグルコースセンサを提供することができる。   The modified PQQGDH according to the present invention is an enzyme having a reduced action on disaccharides compared to wild-type PQQGDH and / or an enzyme having improved thermal stability than wild-type PQQGDH. By using the modified PQQGDH according to the present invention for a glucose assay kit and a glucose sensor, it is possible to perform analysis with higher accuracy than that using a wild type PQQGDH, and a glucose assay kit and glucose sensor with higher stability. Can be provided.

以下、本発明を詳細に説明する。
本明細書においては、アミノ酸の位置は、シグナル配列が除かれたアスパラギン酸を1として番号付けする。
Hereinafter, the present invention will be described in detail.
In the present specification, amino acid positions are numbered as 1 with aspartic acid from which the signal sequence has been removed.

本発明の改変型PQQGDHは、野生型PQQGDHよりも二糖類に対する作用性が低下したもの、および/または、野生型PQQGDHよりも熱安定性の向上したものを含む。
二糖類としては、マルトース、シュクロース、ラクトース、セロビオースなどが例示され、特にマルトースが例示される。
二糖類に対する作用性とは、二糖類を脱水素する作用を意味する。
本発明の改変型PQQGDHは、二糖類に対する作用性が野生型PQQGDHより低下していれば、グルコースに対する作用性は上昇、不変、低下のいずれであっても本発明の改変型PQQGDHに包含される。
The modified PQQGDH of the present invention includes those having a reduced action on disaccharides than wild-type PQQGDH and / or those having improved thermal stability than wild-type PQQGDH.
Examples of the disaccharide include maltose, sucrose, lactose, cellobiose, and particularly maltose.
The action with respect to a disaccharide means the effect | action which dehydrogenates a disaccharide.
The modified PQQGDH of the present invention is included in the modified PQQGDH of the present invention, regardless of whether the activity on glucose is increased, unchanged or decreased, as long as the activity on the disaccharide is lower than that on the wild type PQQGDH. .

本発明の改変型PQQGDHは、グルコース濃度の測定において二糖類に対する作用性が野生型PQQGDHを用いた場合と比較して低下したものである。本発明の改変型PQQGDHは、特にマルトースに対する作用性が低下したものである。マルトースに対する作用性は、好ましくは野生型PQQGDHの90%以下、より好ましくは75%以下、さらに好ましくは60%以下、特に40%以下である。   In the modified PQQGDH of the present invention, the action on disaccharides in the measurement of glucose concentration is lower than when wild-type PQQGDH is used. The modified PQQGDH of the present invention has a particularly reduced action on maltose. The activity against maltose is preferably 90% or less, more preferably 75% or less, still more preferably 60% or less, particularly 40% or less of wild-type PQQGDH.

本発明の改変型PQQGDHは、さらに、野生型PQQGDHよりも二糖類に対するに対するKm値が大きくなってもよい。特にマルトースに対するKm値が大きくなった改変型PQQGDHが好ましい。マルトースに対するKm値は、好ましくは8mM以上、より好ましくは12mM以上、特に20mM以上である。   The modified PQQGDH of the present invention may have a larger Km value for disaccharides than the wild type PQQGDH. In particular, modified PQQGDH having a large Km value for maltose is preferable. The Km value for maltose is preferably 8 mM or more, more preferably 12 mM or more, particularly 20 mM or more.

あるいは、本発明の改変型PQQGDHは、さらに、二糖類に対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きくなってもよい。特に、マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値よりも大きい改変型PQQGDHが好ましい。好ましくは、マルトースに対するKm値がグルコースに対するKm値の1.5倍以上、より好ましくは3倍以上である。
ここで、マルトースに対する作用性とは、グルコースを基質としたときと二糖類、特にマルトースを基質としたときの反応速度の相対比%を意味する。
Alternatively, in the modified PQQGDH of the present invention, the Km value for the disaccharide may be larger than the Km value for glucose. In particular, modified PQQGDH is preferred in which the Km value for maltose is larger than the Km value for glucose. Preferably, the Km value for maltose is 1.5 times or more, more preferably 3 times or more the Km value for glucose.
Here, the action on maltose means the relative ratio% of the reaction rate when glucose is used as a substrate and when disaccharides, particularly maltose is used as a substrate.

熱安定性の向上の程度は、58℃、30分間の熱処理後の活性残存率が野生型PQQGDHよりも高いのが好ましい。活性残存率は、好ましくは48%以上、より好ましくは55%以上、特に70%以上である。   The degree of improvement in thermal stability is preferably such that the activity remaining rate after heat treatment at 58 ° C. for 30 minutes is higher than that of wild-type PQQGDH. The activity remaining ratio is preferably 48% or more, more preferably 55% or more, particularly 70% or more.

基質特異性の改良された本発明の改変型PQQGDHとしては、例えば配列番号1のアミノ酸配列において、67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、170位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、249位、300位、349位、129位、130位及び131位の少なくとも1つの位置においてアミノ酸置換を有するGDH及び428位と429位の間にアミノ酸が挿入されているGDHが例示される。   Examples of the modified PQQGDH of the present invention having improved substrate specificity include, for example, the 67th, 68th, 69th, 76th, 89th, 167th, 168th, 169th, 169th, 170th in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. 341, 342, 343, 351, 49, 174, 188, 189, 207, 215, 245, 249, 300, 349, 129, 130 and Examples include GDH having an amino acid substitution at at least one position of position 131 and GDH having an amino acid inserted between positions 428 and 429.

好ましくは、Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H, L169F, L169R, L169K, L169I, L169T, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, A351T, P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T, E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341L, M342P, A343R, A343I, E341P, M342V, E341S, M342I, A343C, M342R, A343N, L169P, L169G及びL169Eからなる群から選ばれるアミノ酸置換を有するGDH及び428位と429位の間にL、AまたはKが挿入されているGDHである。67位、68位、69位、76位、89位、167位、168位、169位、341位、342位、343位、351位、49位、174位、188位、189位、207位、215位、245位、300位、349位、129位、130位及び131位の置換は、1ヶ所であってもよく、また複数箇所であってもよい。   Preferably, Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, N167E, N167L, N167G, N167T, N167S, N167A, N167M, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168A, Q168E , Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169D, L169S, L169W, L169Y, L169A, L169N, L169M, L169V, L169C, L169Q, L169H , A170W, A170P, K89E, K300R, S207C, N188I, T349S, K300T, L174F, K49N, S189G, F215Y, S189G, E245D, E245F, E245H, E245M, E245M, E245M, E245M, E245M, E245M, E245M P67K, E68K, P67D, E68T, I69C, P67R, E68R, E129R, K130G, P131G, E129N, P131T, E129Q, K130T, P131R, E129A, K130R, P131K, E341R, M34P, E341L, M34P M342I, A3 3C, a M342R, A343N, L169P, between GDH and 428 and 429 of which have amino acid substitutions selected from the group consisting L169G and L169E L, A or K is inserted GDH. 67th, 68th, 69th, 76th, 89th, 167th, 168th, 169th, 169th, 341st, 342th, 343th, 351st, 49th, 49th, 174th, 188th, 188th, 189th, 207th The substitutions at positions 215, 245, 300, 349, 129, 130, and 131 may be at one place or at multiple places.

ここで、「Q76N」は、76位のQ(Gln)をN(Asn)に置換することを意味する。   Here, “Q76N” means that Q (Gln) at position 76 is replaced with N (Asn).

Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168R, Q168S, Q168W, L169A, L169V, L169H, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245Q, E245V, E245C, N249G, N249A, N249E, N249Q, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (K89E+K300R), (Q168A+L169D), (Q168S+L169S), (N167E+Q168G+L169T), (N167S+Q168N+L169R), (Q168G+L169T), (N167G+Q168S+L169Y), (N167L+Q168S+L169G), (N167G+Q168S+L169S+L174F+K49N), (Q168N+L168N+S189R), (N167E+Q168G+L169A+S189G), (N167G+Q168R+L169A), (N167S+Q168G+L169A), (N167G+Q168V+L169S), (N167S+Q168V+L169S), (N167T+Q168I+L169G), (N167G+Q168W+L169N), (N167G+Q168S+L169N), (N167G+Q168S+L169V), (Q168R+L169C), (N167S+Q168L+L168G), (Q168C+L169S), (N167T+Q168N+L169K), (N167G+Q168T+L169A+S207C), (N167A+Q168A+L169P), (N167G+Q168S+L169G), (N167G+Q168G), (N167G+Q168D+L169K), (Q168P+L169G), (N167G+Q168N+L169S), (Q168S+L169G), (N188I+T349S), (N167G+Q168G+L169A+F215Y), (N167G+Q168T+L169G), (Q168G+L169V), (N167G+Q168V+L169T), (N167E+Q168N+L169A), (Q168R+L169A), (N167G+Q168R), (N167G+Q168T), (N167G+Q168T+L169Q), (Q168I+L169G+K300T), (N167G+Q168A), (N167T+Q168L+L169K), (N167M+Q168Y+L169G), (N167E+Q168S), (N167G+Q168T+L169V+S189G), (N167G+Q168G+L169C), (N167G+Q168K+L169D), (Q168A+L169D), (Q168S+E245D), (Q168S+L169S), (A351T), (N167S+Q168S+L169S), (Q168I+L169Q), (N167A+Q168S+L169S), (Q168S+L169E), (Q168A+L169G), (Q168S+L169P), (P67K+E68K), (P67R+E68R+I69C), (P67D+E68T+I69C), (E129R+K130G+P131G), (E129Q+K130T+P131R), (E129N+P131T), (E129A+K130R+P131K), (E341L+M342P+A343R), (E341S+M342I), A343I, (E341P+M342V+A343C), (E341P+M342V+A343R), (E341L+M342R+A343N), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169I), (Q168A+L169K), (Q168A+L169M), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169S), (Q168A+L169T), (Q168A+L169V), (Q168A+L169W)及び(Q168A+L169Y)の置換及び428位と429位の間へのL、AまたはKの挿入は、PQQGDHの基質特異性の向上に寄与する。ここで、基質特異性とは、グルコースを基質としたときと二糖類、特にマルトースを基質としたときの反応速度の相対比%を意味する。   Q76N, Q76E, Q76T, Q76M, Q76G, Q76K, Q168I, Q168V, Q168A, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168M, Q168M, Q168M, Q168M L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, L169C, A170L, A170I, A170K, A170F, A170W, A170P, E245F, E245H, E245M, E245N, E245N, E245N, E245N, E245N, E245N (Q168A + L169P + E245D), (K89E + K300R), (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (N167E + Q168G + L169T), (N167S + Q168N + L169R), (Q168G + L169T), (N167G + Q168S + L169Y), (N167L + Q168S + L169G), (N167G + Q168S + L169S + L174F + K49N), (Q168N + L168N + S189R), (N167E + Q168G + L169A + S189G), (N167G + Q168R + L169A ), (N167S + Q168G + L169A), (N167G + Q168V + L169S), (N167S + Q168V + L169S), (N167T + Q1 8I + L169G), (N167G + Q168W + L169N), (N167G + Q168S + L169N), (N167G + Q168S + L169V), (Q168R + L169C), (N167S + Q168L + L168G), (Q168C + L169S), (N167T + Q168N + L169K), (N167G + Q168T + L169A + S207C), (N167A + Q168A + L169P), (N167G + Q168S + L169G), (N167G + Q168G), (N167G + Q168D + L169K) , (Q168P + L169G), (N167G + Q168N + L169S), (Q168S + L169G), (N188I + T349S), (N167G + Q168G + L169A + F2) 5Y), (N167G + Q168T + L169G), (Q168G + L169V), (N167G + Q168V + L169T), (N167E + Q168N + L169A), (Q168R + L169A), (N167G + Q168R), (N167G + Q168T), (N167G + Q168T + L169Q), (Q168I + L169G + K300T), (N167G + Q168A), (N167T + Q168L + L169K), (N167M + Q168Y + L169G) , (N167E + Q168S), (N167G + Q168T + L169V + S189G), (N167G + Q168G + L169C), (N167G + Q168K + L169D), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D) , (Q168S + L169S), (A351T), (N167S + Q168S + L169S), (Q168I + L169Q), (N167A + Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P), (P67K + E68K), (P67R + E68R + I69C), (P67D + E68T + I69C), (E129R + K130G + P131G), ( (E129Q + K130T + P131R), (E129N + P131T), (E129A + K130R + P131K), (E341L + M342P + A343R), (E341S + M342I), A343I, (E341P + M342V + A343C), (E341V), (E341V) (E341L + M342R + A343N), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169I), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R ), (Q168A + L169S), (Q168A + L169T), (Q168A + L169V), (Q168A + L169W) and (Q168A + L169Y) substitution and insertion of L, A or K between positions 428 and 429 improves the substrate specificity of PQQGDH Contribute. Here, the substrate specificity means the relative ratio% of the reaction rate when glucose is used as a substrate and when disaccharides, particularly maltose is used as a substrate.

熱安定性の改良された本発明のPQQGDHは、配列番号1のアミノ酸配列において、20位、76位、89位、168位、169位、246位及び300位の少なくとも1つの位置においてアミノ酸置換を有し、好ましくは、K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169D, L169E, L169P, L169S, Q246H, K300R, Q76N, Q76T, Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y及びL169Gからなる群から選ばれるアミノ酸置換を有する。20位、76位、89位、168位、169位、246位及び300位の置換は、1ヶ所であってもよく、複数ヶ所であってもよい。   The PQQGDH of the present invention with improved thermal stability has an amino acid substitution in at least one of positions 20, 76, 89, 168, 169, 246, and 300 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. Preferably, K20E, Q76M, Q76G, K89E, Q168A, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S, L169P, L169P, L169P, L169P Q76T, Q76K, L169A, L169C, L169E, L169F, L169H, L169K, L169N, L169Q, L169R, L169T, L169Y and L169 Have amino acid substitutions selected from the group consisting of. The substitutions at the 20th, 76th, 89th, 168th, 169th, 246th, and 300th positions may be one or more.

ここで、「K20E」は、20位のK(Lys)をE(Glu)に置換することを意味する。   Here, “K20E” means that K (Lys) at the 20th position is replaced with E (Glu).

特に、K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168W, Q168Y, Q168S,(Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A+L169A), (Q168A+L169C), (Q168A+L169E), (Q168A+L169F), (Q168A+L169H), (Q168A+L169K), (Q168A+L169N), (Q168A+L169P), (Q168A+L169Q), (Q168A+L169R), (Q168A+L169T)、(Q168A+L169Y)及び(Q168A + L169G)のアミノ酸置換は、PQQGDHの熱安定性の向上に寄与する。   In particular, K20E, Q76M, Q76G, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), Q246H, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168G, Q168H, Q168G (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L16A), (Q168A + L16K), (Q168A + L16A) ), (Q168A + L 69T), amino acid substitution (Q168A + L169Y) and (Q168A + L169G) contributes to the improvement of the thermal stability of PQQGDH.

配列番号1で示される改変されるべき野生型PQQGDHタンパク質及び配列番号2で示されるその塩基配列は、公知であり、特開平11−243949号公報に記載されている。   The wild-type PQQGDH protein to be modified shown by SEQ ID NO: 1 and its base sequence shown by SEQ ID NO: 2 are known and described in JP-A-11-243949.

また、アシネトバクター・カルコアセティカス(Acinetobacter calcoaceticus) LMD79.41株由来の酵素のX線結晶構造解析の結果が報告され、活性中心をはじめとした本酵素の高次構造が明らかとなった(非特許文献1,2,3,4参照)。
J.Mol.Biol.,289,319−333(1999) PNAS,96(21),11787−11791(1999) The EMBO Journal,18(19),5187−5194(1999) Protein Science,9,1265−1273(2000)
In addition, the results of X-ray crystallographic analysis of the enzyme derived from Acinetobacter calcoaceticus LMD79.41 were reported, and the higher-order structure of the enzyme including the active center was revealed (non-native). (See Patent Documents 1, 2, 3, and 4).
J. et al. Mol. Biol. , 289, 319-333 (1999) PNAS, 96 (21), 11787-11791 (1999) The EMBO Journal, 18 (19), 5187-5194 (1999) Protein Science, 9, 1265-1273 (2000)

本発明の改変型PQQGDHは、配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、グルコースの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されているものを含む。
また、本発明の改変型PQQGDHは、配列番号1に記載されるPQQ依存性グルコースデヒドロゲナーゼにおいて、カルシウムイオンの結合に関与するアミノ酸及び/またはその周辺のアミノ酸が置換されているものを含む。
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造における活性中心から半径15Å以内、好ましくは半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質の1位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。
また、本発明の改変型PQQGDHは、野生型酵素の活性型立体構造において基質の2位の炭素に結合するOH基から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものを含む。特に、基質がグルコースであるとき、野生型酵素の活性型立体構造において基質から半径10Å以内の範囲に位置するアミノ酸を変異することにより得られるものが好ましい。
The modified PQQGDH of the present invention includes a PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1 in which amino acids involved in glucose binding and / or surrounding amino acids are substituted.
The modified PQQGDH of the present invention includes the PQQ-dependent glucose dehydrogenase described in SEQ ID NO: 1 in which amino acids involved in calcium ion binding and / or surrounding amino acids are substituted.
The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 15 mm, preferably within a radius of 10 mm, from the active center in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme.
The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. In particular, when the substrate is glucose, those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme are preferable.
The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the OH group that binds to the 1st carbon of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. . In particular, when the substrate is glucose, those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme are preferable.
The modified PQQGDH of the present invention includes those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the OH group that binds to the carbon at the 2-position of the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme. . In particular, when the substrate is glucose, those obtained by mutating amino acids located within a radius of 10 mm from the substrate in the active three-dimensional structure of the wild-type enzyme are preferable.

本発明の改変タンパク質の製造方法は、特に限定されないが、以下に示すような手順で製造することが可能である。タンパク質を構成するアミノ酸配列を改変する方法としては、通常行われる遺伝情報を改変する手法が用いられる。すなわち、タンパク質の遺伝情報を有するDNAの特定の塩基を変換することにより、或いは特定の塩基を挿入または欠失させることにより、改変蛋白質の遺伝情報を有するDNAが作成される。DNA中の塩基を変換する具体的な方法としては、例えば市販のキット(TransformerMutagenesis Kit;Clonetech製,EXOIII/Mung Bean Deletion Kit;Stratagene製,QuickChange Site Directed Mutagenesis Kit;Stratagene製など)の使用、或いはポリメラーゼ連鎖反応法(PCR)の利用が挙げられる。   Although the manufacturing method of the modified protein of this invention is not specifically limited, It is possible to manufacture in the procedure as shown below. As a method for modifying the amino acid sequence constituting the protein, a commonly used technique for modifying genetic information is used. That is, a DNA having genetic information of a modified protein is created by converting a specific base of DNA having genetic information of the protein, or by inserting or deleting a specific base. Specific methods for converting bases in DNA include, for example, commercially available kits (Transformer Mutagenesis Kit; manufactured by Clonetech, EXOIII / Mung Bean Deletion Kit; manufactured by Stratagene, QuickChange SiteDirectedMetStainedMistageStained Kit, etc.) Use of the chain reaction method (PCR) is mentioned.

作製された改変タンパク質の遺伝情報を有するDNAは、プラスミドと連結された状態にて宿主微生物中に移入され、改変タンパク質を生産する形質転換体となる。この際のプラスミドとしては、例えば、エシェリヒア・コリー(Escherichia coli)を宿主微生物とする場合にはpBluescript,pUC18などが使用できる。宿主微生物としては、例えば、エシェリヒア・コリー W3110、エシェリヒア・コリーC600、エシェリヒア・コリーJM109、エシェリヒア・コリーDH5αなどが利用できる。宿主微生物に組換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主微生物がエシェリヒア属に属する微生物の場合には、カルシウムイオンの存在下で組換えDNAの移入を行なう方法などを採用することができ、更にエレクトロポレーション法を用いても良い。更には、市販のコンピテントセル(例えば、コンピテントハイJM109;東洋紡績製)を用いても良い。   The prepared DNA having genetic information of the modified protein is transferred into a host microorganism in a state of being linked to a plasmid, and becomes a transformant that produces the modified protein. As the plasmid at this time, for example, pBluescript, pUC18, etc. can be used when Escherichia coli is used as a host microorganism. Examples of host microorganisms that can be used include Escherichia coli W3110, Escherichia coli C600, Escherichia coli JM109, and Escherichia coli DH5α. As a method for transferring the recombinant vector into the host microorganism, for example, when the host microorganism is a microorganism belonging to the genus Escherichia, a method of transferring the recombinant DNA in the presence of calcium ions can be employed. An electroporation method may be used. Furthermore, a commercially available competent cell (for example, competent high JM109; manufactured by Toyobo) may be used.

こうして得られた形質転換体である微生物は、栄養培地で培養されることにより、多量の改変タンパク質を安定して生産し得る。形質転換体である宿主微生物の培養形態は宿主の栄養生理的性質を考慮して培養条件を選択すればよく、通常多くの場合は液体培養で行うが、工業的には通気撹拌培養を行うのが有利である。培地の栄養源としては微生物の培養に通常用いられるものが広く使用され得る。炭素源としては資化可能な炭素化合物であればよく、例えば、グルコ−ス,シュークロース、ラクトース、マルトース、フラクトース、糖蜜、ピルビン酸などが使用される。窒素源としては利用可能な窒素化合物であればよく、例えばペプトン、肉エキス、酵母エキス、カゼイン加水分解物、大豆粕アルカリ抽出物などが使用される。その他、リン酸塩、炭酸塩、硫酸塩、マグネシウム、カルシウム、カリウム、鉄、マンガン、亜鉛などの塩類、特定のアミノ酸、特定のビタミンなどが必要に応じて使用される。培養温度は菌が発育し、改変蛋白質を生産する範囲で適宜変更し得るが、エシェリヒア・コリーの場合、好ましくは20〜42℃程度である。培養時間は条件によって多少異なるが、改変タンパク質が最高収量に達する時期を見計らって適当時期に培養を終了すればよく、通常は6〜48時間程度である。培地pHは菌が発育し改変タンパク質を生産する範囲で適宜変更し得るが、特に好ましくはpH6.0〜9.0程度である。   Microorganisms which are transformants thus obtained can stably produce a large amount of modified protein by being cultured in a nutrient medium. The culture form of the host microorganism, which is a transformant, may be selected in consideration of the nutritional and physiological properties of the host. Usually, the culture is performed in liquid culture, but industrially, aeration and agitation culture is performed. Is advantageous. As a nutrient source of the medium, those commonly used for culturing microorganisms can be widely used. Any carbon compound that can be assimilated may be used as the carbon source. For example, glucose, sucrose, lactose, maltose, fructose, molasses, pyruvic acid and the like are used. The nitrogen source may be any nitrogen compound that can be used. For example, peptone, meat extract, yeast extract, casein hydrolyzate, soybean meal alkaline extract, and the like are used. In addition, phosphates, carbonates, sulfates, salts such as magnesium, calcium, potassium, iron, manganese, and zinc, specific amino acids, specific vitamins, and the like are used as necessary. The culture temperature can be appropriately changed within the range in which the fungus grows and produces the modified protein. In the case of Escherichia coli, it is preferably about 20 to 42 ° C. Although the culturing time varies somewhat depending on conditions, the culturing may be terminated at an appropriate time in consideration of the time when the modified protein reaches the maximum yield, and is usually about 6 to 48 hours. The medium pH can be appropriately changed within the range in which the bacteria grow and produce the modified protein, but is particularly preferably about pH 6.0 to 9.0.

培養物中の改変タンパク質を生産する菌体を含む培養液をそのまま採取し利用することもできるが、一般には常法に従って改変タンパク質が培養液中に存在する場合は、濾過,遠心分離などにより、改変タンパク質含有溶液と微生物菌体とを分離した後に利用される。改変タンパク質が菌体内に存在する場合には、得られた培養物から濾過または遠心分離などの手段により菌体を採取し、次いでこの菌体を機械的方法またはリゾチームなどの酵素的方法で破壊し、また必要に応じてEDTA等のキレート剤及びまたは界面活性剤を添加して改変タンパク質を可溶化し、水溶液として分離採取する。   Although it is possible to collect and use the culture solution containing the bacterial cells producing the modified protein in the culture as it is, in general, when the modified protein is present in the culture solution according to a conventional method, filtration, centrifugation, etc. It is used after separating the modified protein-containing solution and the microbial cells. When the modified protein is present in the microbial cells, the microbial cells are collected from the obtained culture by means of filtration or centrifugation, and then the microbial cells are destroyed by a mechanical method or an enzymatic method such as lysozyme. If necessary, a chelating agent such as EDTA and / or a surfactant is added to solubilize the modified protein, and it is separated and collected as an aqueous solution.

この様にして得られた改変タンパク質含有溶液を、例えば、減圧濃縮、膜濃縮、更に硫酸アンモニウム、硫酸ナトリウムなどの塩析処理、或いは親水性有機溶媒、例えばメタノール、エタノール、アセトンなどによる分別沈澱法により沈澱せしめればよい。また、加熱処理や等電点処理も有効な精製手段である。吸着剤或いはゲル濾過剤などによるゲル濾過、吸着クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーにより、精製された改変タンパク質を得ることができる。   The modified protein-containing solution thus obtained is subjected to, for example, vacuum concentration, membrane concentration, salting-out treatment such as ammonium sulfate or sodium sulfate, or fractional precipitation using a hydrophilic organic solvent such as methanol, ethanol, acetone or the like. It may be allowed to settle. Heat treatment and isoelectric point treatment are also effective purification means. A purified modified protein can be obtained by gel filtration using an adsorbent or a gel filtration agent, adsorption chromatography, ion exchange chromatography, or affinity chromatography.

本発明では、配列番号1に示されるPQQGDHの76位、167位、168位、169位、170位および245位に着目し、そのアミノ酸置換体を作成したところ、基質特異性が改善されたPQQGDH改変体を得ることができた。基質特異性に関しては、Q76K, Q168A, A170P, E245D, (Q168A+L169G+E245D), (Q168A+L169P+E245D), (Q168S + L169S), (Q168A + L169D), (Q168S + E245D), (Q168S + L169E), (Q168A + L169G), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169S) および (Q168A + L169T)が特に好ましい。   In the present invention, focusing on positions 76, 167, 168, 169, 170, and 245 of PQQGDH shown in SEQ ID NO: 1, when amino acid substitutions were made, PQQGDH with improved substrate specificity was obtained. A variant could be obtained. Regarding substrate specificity, Q76K, Q168A, A170P, E245D, (Q168A + L169G + E245D), (Q168A + L169P + E245D), (Q168S + L169S), (Q168A + L169D), (Q168S +) ), (Q168S + L169P), (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169K), (Q168A + L169M), (Q168A + L16L) (Q168A + L169S) and (Q168A + L169T) are particularly preferred.

本発明では、配列番号1に示されるPQQGDHの20位、76位、89位、168位、169位、246位及び300位に着目し、そのアミノ酸置換体を作成したところ、安定性が改善されたPQQGDH改変体を得ることができた。熱安定性に関する限り、K20E, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + L169G), Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168S, Q168W, Q168Y, (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q168A + L169F), (Q168A + L169H), (Q168A + L169K), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q168A + L169R), (Q168A + L169T), (Q168A + L169Y) 及びQ246Hの置換が特に望ましい。   In the present invention, focusing on the 20th, 76th, 89th, 168th, 169th, 246th, and 300th positions of PQQGDH shown in SEQ ID NO: 1, and making the amino acid substitution, stability was improved. PQQGDH variants could be obtained. As far as thermal stability is concerned, K20E, (K89E + K300R), Q168A, (Q168A + L169D), (Q168S + L169S), (Q168S + L169E), (Q168S + L169P), (Q168A + Q16E, Q168E, Q168E, Q168E) Q168F, Q168G, Q168H, Q168M, Q168P, Q168S, Q168W, Q168Y, (Q168A + L169A), (Q168A + L169C), (Q168A + L169E), (Q16A +), L16A + ), (Q168A + L169N), (Q168A + L169P), (Q168A + L169Q), (Q16 A + L169R), (Q168A + L169T), (Q168A + L169Y) and substitution Q246H is particularly desirable.

改変タンパク質は、液状(水溶液、懸濁液等)、粉末、凍結乾燥など種々の形態をとることができる。凍結乾燥法としては、特に制限されるものではなく常法に従って行えばよい。本発明の酵素を含む組成物は凍結乾燥物に限られず、凍結乾燥物を再溶解した溶液状態であってもよい。また、グルコース測定を行なう際には、グルコースアッセイキット、グルコースセンサーなどの種々の形態をとることができる。この様にして得られた精製された改変タンパク質は、以下のような方法により安定化することができる。   The modified protein can take various forms such as liquid (aqueous solution, suspension, etc.), powder, and lyophilized. The lyophilization method is not particularly limited and may be performed according to a conventional method. The composition containing the enzyme of the present invention is not limited to a lyophilized product, and may be in a solution state in which the lyophilized product is redissolved. Moreover, when measuring glucose, various forms, such as a glucose assay kit and a glucose sensor, can be taken. The purified modified protein thus obtained can be stabilized by the following method.

精製された改変タンパク質に(1)アスパラギン酸、グルタミン酸、α−ケトグルタル酸、リンゴ酸、α−ケトグルコン酸、α−サイクロデキストリンおよびそれらの塩からなる群から選ばれた1種または2種以上の化合物および(2)アルブミンを共存せしめることにより、改変タンパク質をさらに安定化することができる。
凍結乾燥組成物中においては、PQQGDH含有量は、酵素の起源によっても異なるが、通常は約5〜50%(重量比)の範囲で好適に用いられる。酵素活性に換算すると、100〜2000U/mgの範囲で好適に用いられる。
アスパラギン酸、グルタミン酸、αーケトグルタル酸、リンゴ酸、及びαーケトグルコン酸の塩としては、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、及びマグネシウム等の塩が挙げられるが特に限定されるものではない。上記化合物とその塩及びα−シクロデキストリンの添加量は、1〜90%(重量比)の範囲で添加することが好ましい。これらの物質は単独で用いてもよいし、複数組み合わせてもよい。
含有される緩衝液としては特に限定されるものではないが、トリス緩衝液、リン酸緩衝液、ホウ酸緩衝液、GOOD緩衝液などが挙げられる。該緩衝液のpHは5.0〜9.0程度の範囲で使用目的に応じて調整される。凍結乾燥物中においては緩衝剤の含有量は、特に限定されるものではないが、好ましくは0.1%(重量比)以上、特に好ましくは0.1〜30%(重量比)の範囲で使用される。
使用できるアルブミンとしては、牛血清アルブミン(BSA)、卵白アルブミン(OVA)などが挙げられる。特にBSAが好ましい。該アルブミンの含有量は、好ましくは1〜80%(重量比)、より好ましくは5〜70%(重量比)の範囲で使用される。
組成物には、さらに他の安定化剤などをPQQGDHの反応に特に悪い影響を及ぼさないような範囲で添加してもよい。本発明の安定化剤の配合法は特に制限されるものではない。例えばPQQGDHを含む緩衝液に安定化剤を配合する方法、安定化剤を含む緩衝液にPQQGDHを配合する方法、あるいはPQQGDHと安定化剤を緩衝液に同時に配合する方法などが挙げられる。
(1) One or more compounds selected from the group consisting of (1) aspartic acid, glutamic acid, α-ketoglutaric acid, malic acid, α-ketogluconic acid, α-cyclodextrin, and salts thereof And (2) By coexisting albumin, the modified protein can be further stabilized.
In the lyophilized composition, the PQQGDH content varies depending on the origin of the enzyme, but is usually suitably used in the range of about 5 to 50% (weight ratio). When converted into enzyme activity, it is preferably used in the range of 100 to 2000 U / mg.
Examples of salts of aspartic acid, glutamic acid, α-ketoglutaric acid, malic acid, and α-ketogluconic acid include salts such as sodium, potassium, ammonium, calcium, and magnesium, but are not particularly limited. The addition amount of the above compound, its salt and α-cyclodextrin is preferably in the range of 1 to 90% (weight ratio). These substances may be used alone or in combination.
The buffer solution to be contained is not particularly limited, and examples thereof include Tris buffer solution, phosphate buffer solution, borate buffer solution, and GOOD buffer solution. The pH of the buffer is adjusted in the range of about 5.0 to 9.0 according to the purpose of use. The content of the buffering agent in the lyophilized product is not particularly limited, but is preferably 0.1% (weight ratio) or more, particularly preferably 0.1 to 30% (weight ratio). used.
Examples of albumin that can be used include bovine serum albumin (BSA) and ovalbumin (OVA). BSA is particularly preferable. The content of the albumin is preferably 1 to 80% (weight ratio), more preferably 5 to 70% (weight ratio).
Further, other stabilizers and the like may be added to the composition within a range that does not particularly adversely affect the reaction of PQQGDH. The blending method of the stabilizer of the present invention is not particularly limited. For example, a method of blending a stabilizer in a buffer solution containing PQQGDH, a method of blending PQQGDH in a buffer solution containing a stabilizer, or a method of blending PQQGDH and a stabilizer in a buffer solution at the same time can be mentioned.

また、カルシウムイオンと特定のアミノ酸を併用しても安定化効果が得られる。すなわち、(1)カルシウムイオンまたはカルシウム塩、および(2)グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されたアミノ酸を含有させることにより、改変タンパク質を安定化させることができる。
カルシウム塩としては、塩化カルシウムまたは酢酸カルシウムもしくはクエン酸カルシウム等の無機酸または有機酸のカルシウム塩などが例示される。また、水性組成物において、カルシウムイオンの含有量は、1×10−4〜1×10−2Mであることが好ましい。カルシウムイオンまたはカルシウム塩のみを含有させた場合、安定性にわずかな効果が見られるが、さらに下記アミノ酸を含有させることにより、安定性がさらに向上する。
グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されるアミノ酸は、1種または2種以上であってもよい。前記の水性組成物において、グルタミン酸、グルタミンおよびリジンからなる群から選択されたアミノ酸の含有量は、0.01〜0.2重量%であることが好ましい。
さらに血清アルブミンを含有させてもよい。前記の水性組成物に血清アルブミンを添加する場合、その含有量は0.05〜0.5重量%であることが好ましい。
緩衝剤としては、通常のものが使用され、通常、組成物のpHを5〜10とするものが好ましい。具体的にはトリス塩酸、ホウ酸、グッド緩衝液が用いられるが、カルシウムと不溶性の塩を形成しない緩衝液はすべて使用できる。
前記の水性組成物には、必要により他の成分、例えば界面活性剤、安定化剤、賦形剤などを添加しても良い。
In addition, a stabilizing effect can be obtained even when calcium ions and specific amino acids are used in combination. That is, the modified protein can be stabilized by containing (1) calcium ion or calcium salt and (2) an amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine.
Examples of calcium salts include calcium chloride, calcium salts of inorganic acids such as calcium acetate and calcium citrate, and organic acids. In the aqueous composition, the calcium ion content is preferably 1 × 10 −4 to 1 × 10 −2 M. When only calcium ions or calcium salts are contained, a slight effect is seen on the stability, but the stability is further improved by further containing the following amino acids.
One or more amino acids selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine may be used. In the aqueous composition, the content of an amino acid selected from the group consisting of glutamic acid, glutamine and lysine is preferably 0.01 to 0.2% by weight.
Further, serum albumin may be contained. When serum albumin is added to the aqueous composition, the content is preferably 0.05 to 0.5% by weight.
As a buffering agent, a normal thing is used, and what makes pH of a composition 5-10 normally is preferable. Specifically, Tris-HCl, boric acid, and Good's buffer are used, but any buffer that does not form an insoluble salt with calcium can be used.
If necessary, other components such as surfactants, stabilizers and excipients may be added to the aqueous composition.

本発明においては以下の種々の方法によりグルコースを測定することができる。
グルコースアッセイキット
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキットを特徴とする。本発明のグルコースアッセイキットは、本発明に従う改変型PQQGDHを少なくとも1回のアッセイに十分な量で含む。典型的には、キットは、本発明の改変型PQQGDHに加えて、アッセイに必要な緩衝液、メディエーター、キャリブレーションカーブ作製のためのグルコース標準溶液、ならびに使用の指針を含む。本発明に従う改変型PQQGDHは種々の形態で、例えば、凍結乾燥された試薬として、または適切な保存溶液中の溶液として提供することができる。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で提供されるが、アポ酵素の形態で提供し、使用時にホロ化することもできる。
In the present invention, glucose can be measured by the following various methods.
Glucose Assay Kit The present invention also features a glucose assay kit comprising a modified PQQGDH according to the present invention. The glucose assay kit of the present invention comprises a modified PQQGDH according to the present invention in an amount sufficient for at least one assay. Typically, the kit contains, in addition to the modified PQQGDH of the present invention, buffers necessary for the assay, mediators, a glucose standard solution for creating a calibration curve, and directions for use. The modified PQQGDH according to the present invention can be provided in various forms, for example, as a lyophilized reagent or as a solution in a suitable storage solution. Preferably, the modified PQQGDH of the present invention is provided in the form of a holo, but can be provided in the form of an apoenzyme and can be holoed at the time of use.

グルコースセンサー
本発明はまた、本発明に従う改変型PQQGDHを用いるグルコースセンサーを特徴とする。電極としては、カーボン電極、金電極、白金電極などを用い、この電極上に本発明の酵素を固定化する。固定化方法としては、架橋試薬を用いる方法、高分子マトリックス中に封入する方法、透析膜で被覆する方法、光架橋性ポリマー、導電性ポリマー、酸化還元ポリマーなどがあり、あるいはフェロセンあるいはその誘導体に代表される電子メディエーターとともにポリマー中に固定あるいは電極上に吸着固定してもよく、またこれらを組み合わせて用いてもよい。好ましくは本発明の改変型PQQGDHはホロ化した形態で電極上に固定化するが、アポ酵素の形態で固定化し、PQQを別の層としてまたは溶液中で提供することもできる。典型的には、グルタルアルデヒドを用いて本発明の改変型PQQGDHをカーボン電極上に固定化した後、アミン基を有する試薬で処理してグルタルアルデヒドをブロッキングする。
Glucose Sensor The present invention also features a glucose sensor that uses a modified PQQGDH according to the present invention. As the electrode, a carbon electrode, a gold electrode, a platinum electrode or the like is used, and the enzyme of the present invention is immobilized on this electrode. Immobilization methods include a method using a crosslinking reagent, a method of encapsulating in a polymer matrix, a method of coating with a dialysis membrane, a photocrosslinkable polymer, a conductive polymer, a redox polymer, etc., or ferrocene or a derivative thereof. It may be fixed in a polymer or adsorbed and fixed on an electrode together with a representative electron mediator, or a combination thereof. Preferably, the modified PQQGDH of the present invention is immobilized on the electrode in a holo form, but may be immobilized in the form of an apoenzyme and the PQQ provided as a separate layer or in solution. Typically, the modified PQQGDH of the present invention is immobilized on a carbon electrode using glutaraldehyde and then treated with a reagent having an amine group to block glutaraldehyde.

グルコース濃度の測定は、以下のようにして行うことができる。恒温セルに緩衝液を入れ、PQQおよびCaCl、およびメディエーターを加えて一定温度に維持する。メディエーターとしては、フェリシアン化カリウム、フェナジンメトサルフェートなどを用いることができる。作用電極として本発明の改変型PQQGDHを固定化した電極を用い、対極(例えば白金電極)および参照電極(例えばAg/AgCl電極)を用いる。カーボン電極に一定の電圧を印加して、電流が定常になった後、グルコースを含む試料を加えて電流の増加を測定する。標準濃度のグルコース溶液により作製したキャリブレーションカーブに従い、試料中のグルコース濃度を計算することができる。 The glucose concentration can be measured as follows. The buffer is placed in a thermostatic cell, and PQQ and CaCl 2 and mediator are added to maintain a constant temperature. As the mediator, potassium ferricyanide, phenazine methosulfate, or the like can be used. As the working electrode, an electrode on which the modified PQQGDH of the present invention is immobilized is used, and a counter electrode (for example, platinum electrode) and a reference electrode (for example, Ag / AgCl electrode) are used. After a constant voltage is applied to the carbon electrode and the current becomes steady, a sample containing glucose is added and the increase in current is measured. The glucose concentration in the sample can be calculated according to a calibration curve prepared with a standard concentration glucose solution.

以下、本発明を実施例に基づきより詳細に説明する。
実施例1 :PQQ依存性グルコース脱水素酵素遺伝子の発現プラスミドの構築
野生型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の発現プラスミドpNPG5は、ベクターpBluescript SK(−)のマルチクローニング部位にアシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii) NCIMB11517株由来のPQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする構造遺伝子を挿入したものである。その塩基配列を配列表の配列番号2に、また該塩基配列から推定されるPQQ依存性グルコース脱水素酵素のアミノ酸配列を配列表の配列番号1に示す。
Hereinafter, the present invention will be described in more detail based on examples.
Example 1: Construction of PQQ-dependent glucose dehydrogenase gene expression plasmid The wild-type PQQ-dependent glucose dehydrogenase expression plasmid pNPG5 was transformed into the multiple cloning site of the vector pBluescript SK (-) at Acinetobacter baumannii. A structural gene encoding a PQQ-dependent glucose dehydrogenase derived from NCIMB11517 strain is inserted. The base sequence is shown in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing, and the amino acid sequence of PQQ-dependent glucose dehydrogenase deduced from the base sequence is shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.

実施例2:変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の作製
野生型PQQ依存性グルコース脱水素酵素遺伝子を含む組換えプラスミドpNPG5と配列番号3記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、QuickChangeTM Site−Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE製)を用いて、そのプロトコールに従って変異処理操作を行い、更に塩基配列を決定して、配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがアスパラギンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M1)を取得した。
pNPG5と配列番号4記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M2)を取得した。
pNPG5と配列番号5記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがスレオニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M3)を取得した。
pNPG5と配列番号6記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがメチオニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M4)を取得した。
pNPG5と配列番号7記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがグリシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M5)を取得した。
pNPG5と配列番号8記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の76番目のグルタミンがリジンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M6)取得した。
pNPG5と配列番号9記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがイソロイシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M7)を取得した。
pNPG5と配列番号10記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがバリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M8)を取得した。
pNPG5と配列番号11記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M9)を取得した。
pNPG5と配列番号22記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の20番目のリジンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M10)を取得した。
pNPG5と配列番号23記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の89番目のリジンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミドを取得した。更にこのプラスミドと配列番号24記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の89番目のリジンがグルタミン酸に、300番目のリジンがアルギニンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M11)を取得した。
pNPG5と配列番号25記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の246番目のグルタミンがヒスチジンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M12)を取得した。
pNPG5と配列番号26記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがセリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M13)を取得した。
pNPG5と配列番号27記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに、169番目のロイシンがアスパラギン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M14)を取得した。
pNPG5と配列番号66記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがグルタミン酸に置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M15)を取得した。
pNPG5と配列番号67記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがセリンに、169番目のロイシンがプロリンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M16)を取得した。
pNPG5と配列番号68記載の合成オリゴヌクレオチド及びこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを基に、上記方法と同様にして配列番号2記載のアミノ酸配列の168番目のグルタミンがアラニンに、169番目のロイシンがグリシンに置換された変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素をコードする組換えプラスミド(pNPG5M17)を取得した。
pNPG5、pNPG5M1、pNPG5M2、pNPG5M3、pNPG5M4、pNPG5M5、pNPG5M6、pNPG5M7、pNPG5M8、pNPG5M9、pNPG5M10、pNPG5M11、pNPG5M12、pNPG5M13、pNPG5M14、pNPG5M15、pNPG5M16,pNPG5M17の各組換えプラスミドで大腸菌コンピテントセル(エシェリヒア・コリーJM109;東洋紡績製)を形質転換し、該形質転換体をそれぞれ取得した。
Example 2: Preparation of mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase A recombinant plasmid pNPG5 containing a wild-type PQQ-dependent glucose dehydrogenase gene, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 3 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto Based on that, using QuickChange Site-Directed Mutagenesis Kit (manufactured by STRATAGENE), mutation treatment operation was performed according to the protocol, the nucleotide sequence was further determined, and the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 was converted to asparagine. A recombinant plasmid (pNPG5M1) encoding a substituted mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with glutamic acid in the same manner as described above, based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 4 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M2) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with threonine based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 5 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M3) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with methionine based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 6 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M4) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with glycine based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 7 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, in the same manner as described above A recombinant plasmid (pNPG5M5) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 76th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with lysine in the same manner as described above, based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 8 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M6) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with isoleucine based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 9 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, in the same manner as above. A recombinant plasmid (pNPG5M7) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with valine on the basis of pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 10 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M8) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with alanine based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 11 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto. A recombinant plasmid (pNPG5M9) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 20th lysine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is replaced with glutamic acid based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 22 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, in the same manner as described above. A recombinant plasmid (pNPG5M10) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Mutant PQQ in which the 89th lysine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with glutamic acid in the same manner as described above based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 23, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained. Further, based on this plasmid, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 24, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 89th lysine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is converted to glutamic acid, the 300th A recombinant plasmid (pNPG5M11) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase in which lysine was replaced with arginine was obtained.
Mutant PQQ in which the 246th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is substituted with histidine in the same manner as described above, based on the synthetic oligonucleotide described in pNPG5 and SEQ ID NO: 25 and the synthetic oligonucleotide complementary thereto A recombinant plasmid (pNPG5M12) encoding a dependent glucose dehydrogenase was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 26, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is the serine and the 169th leucine is the same as the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M13) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with serine was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 27, and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is alanine, and the 169th leucine is similar to the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M14) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with aspartic acid was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 66, and the synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is the serine and the 169th leucine is the same as the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M15) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with glutamic acid was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 67 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 is serine and the 169th leucine is similar to the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M16) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with proline was obtained.
Based on pNPG5, the synthetic oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 68 and a synthetic oligonucleotide complementary thereto, the 168th glutamine of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is alanine and the 169th leucine is similar to the above method. A recombinant plasmid (pNPG5M17) encoding a mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenase substituted with glycine was obtained.
pNPG5, pNPG5M1, pNPG5M2, pNPG5M3, pNPG5M4, pNPG5M5, pNPG5M, pNPG5M, pNPG5M ; Manufactured by Toyobo Co., Ltd.), and each of the transformants was obtained.

実施例3:シュードモナス属細菌で複製できる発現ベクターの構築
実施例2で得た組換えプラスミドpNPG5M1のDNA5μgを制限酵素BamHIおよびXHoI(東洋紡績製)で切断して、変異型PQQ依存性グルコース脱水素酵素の構造遺伝子部分を単離した。単離したDNAとBamHIおよびXHoIで切断したpTM33(1μg)とをT4DNAリガーゼ1単位で16℃、16時間反応させ、DNAを連結した。連結したDNAはエシェリヒア・コリDH5αのコンピテントセルを用いて形質転換を行った。得られた発現プラスミドをpNPG6M1と命名した。
pNPG5、pNPG5M2、pNPG5M3、pNPG5M4、pNPG5M5、pNPG5M6、pNPG5M7、pNPG5M8、pNPG5M9、pNPG5M10、pNPG5M11、pNPG5M12、pNPG5M13、pNPG5M14、pNPG5M15、pNPG5M16,pNPG5M17の各組換えプラスミドについても上記方法と同様にして発現プラスミドを取得した。得られた発現プラスミドそれぞれpNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17と命名した。
Example 3: Construction of an expression vector capable of replication in Pseudomonas bacteria 5 μg of the recombinant plasmid pNPG5M1 DNA obtained in Example 2 was cleaved with restriction enzymes BamHI and XHoI (Toyobo Co., Ltd.) to obtain mutant PQQ-dependent glucose dehydrogenation. The structural gene part of the enzyme was isolated. The isolated DNA and pTM33 (1 μg) cleaved with BamHI and XHoI were reacted with 1 unit of T4 DNA ligase at 16 ° C. for 16 hours to ligate the DNA. Ligated DNA was transformed with Escherichia coli DH5α competent cells. The resulting expression plasmid was named pNPG6M1.
pNPG5, pNPG5M2, pNPG5M3, pNPG5M4, pNPG5M5, pNPG5M6, pNPG5M7, pNPG5M8, pNPG5M9, pNPG5M10, pNPG5M did. The obtained expression plasmids were pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M11, pNPG6M12, pNPG6M13, pNPG6M14, pNPG6M13, pNPG6M13, pNPG6M13, pNPG6M14.

実施例4:シュードモナス属細菌の形質転換体の作製
シュードモナス・プチダTE3493(微工研寄12298号)をLBG培地(LB培地+0.3%グリセロール)で30℃、16時間培養し、遠心分離(12,000rpm、10分間)により菌体を回収し、この菌体に氷冷した300mMシュークロースを含む5mMK−リン酸緩衝液(pH7.0)8mlを加え、菌体を懸濁した。再度遠心分離(12,000rpm、10分間)により菌体を回収し、この菌体に氷冷した300mMシュークロースを含む5mMK−リン酸緩衝液(pH7.0)0.4mlを加え、菌体を懸濁した。
該懸濁液に実施例3で得た発現プラスミドpNPG6M1を0.5μg加え、エレクトロポレーション法により形質転換した。100μg/mlのストレプトマイシンを含むLB寒天培地に生育したコロニーより、目的とする形質転換体を得た。
pNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17の各発現プラスミドについても上記方法と同様にして、該形質転換体をそれぞれ取得した。
Example 4: Preparation of Pseudomonas genus transformant Pseudomonas putida TE3493 (Microtechnology 12298) was cultured in LBG medium (LB medium + 0.3% glycerol) at 30 ° C. for 16 hours and centrifuged (12 The bacterial cells were collected by 2,000 rpm for 10 minutes, and 8 ml of 5 mM K-phosphate buffer (pH 7.0) containing 300 mM sucrose ice-cooled was added to the bacterial cells to suspend the bacterial cells. The bacterial cells were collected again by centrifugation (12,000 rpm, 10 minutes), and 0.4 ml of 5 mM K-phosphate buffer (pH 7.0) containing 300 mM sucrose ice-cooled was added to the bacterial cells. Suspended.
0.5 μg of the expression plasmid pNPG6M1 obtained in Example 3 was added to the suspension and transformed by electroporation. A target transformant was obtained from a colony grown on an LB agar medium containing 100 μg / ml streptomycin.
pNPG6, pNPG6M2, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M10, pNPG6M16, pNPG6M16, pNPG6M Respectively.

試験例1
GDH活性の測定方法
測定原理
D−グルコース+PMS+PQQGDH → D−グルコノ−1,5−ラクトン + PMS(red)
2PMS(red) + NTB → 2PMS + ジホルマザン
フェナジンメトサルフェート(PMS)(red)によるニトロテトラゾリウムブルー(NTB)の還元により形成されたジホルマザンの存在は、570nmで分光光度法により測定した。
単位の定義
1単位は、以下に記載の条件下で1分当たりジホルマザンを0.5ミリモル形成させるPQQGDHの酵素量をいう。
(3)方法
試薬
A.D−グルコース溶液:0.5M(0.9g D−グルコース(分子量180.16)/10ml HO)
B.PIPES−NaOH緩衝液, pH6.5:50mM(60mLの水中に懸濁した1.51gのPIPES(分子量302.36)を、5N NaOHに溶解し、2.2mlの10% Triton X−100を加える。5N NaOHを用いて25℃でpHを6.5±0.05に調整し、水を加えて100mlとした。)
C.PMS溶液:3.0mM(9.19mgのフェナジンメトサルフェート(分子量817.65)/10mlHO)
D.NTB溶液:6.6mM(53.96mgのニトロテトラゾリウムブルー(分子量817.65)/10mlHO)
E.酵素希釈液:1mM CaCl, 0.1% Triton X−100, 0.1% BSAを含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
手順
遮光ビンに以下の反応混合物を調製し、氷上で貯蔵した(用時調製)
1.8ml D−グルコース溶液 (A)
24.6ml PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5) (B)
2.0ml PMS溶液 (C)
1.0ml NTB溶液 (D)
Test example 1
Method for measuring GDH activity Measurement principle D-glucose + PMS + PQQGDH → D-glucono-1,5-lactone + PMS (red)
The presence of diformazan formed by the reduction of nitrotetrazolium blue (NTB) by 2PMS (red) + NTB → 2PMS + diformazan phenazine methosulfate (PMS) (red) was measured spectrophotometrically at 570 nm.
Definition of Unit One unit refers to the amount of PQQGDH enzyme that forms 0.5 mmol of diformazan per minute under the conditions described below.
(3) Method reagents A. D-glucose solution: 0.5 M (0.9 g D-glucose (molecular weight 180.16) / 10 ml H 2 O)
B. PIPES-NaOH buffer, pH 6.5: 50 mM (1.51 g of PIPES (molecular weight 302.36) suspended in 60 mL of water is dissolved in 5N NaOH and 2.2 ml of 10% Triton X-100 is added. The pH was adjusted to 6.5 ± 0.05 at 25 ° C. using 5N NaOH, and water was added to make 100 ml.)
C. PMS solution: 3.0 mM (9.19 mg phenazine methosulfate (molecular weight 817.65) / 10 ml H 2 O)
D. NTB solution: 6.6 mM (53.96 mg of nitrotetrazolium blue (molecular weight 817.65) / 10 ml H 2 O)
E. Enzyme dilution: 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5) containing 1 mM CaCl 2 , 0.1% Triton X-100, 0.1% BSA
Procedure Prepare the following reaction mixture in a light-proof bottle and store on ice (prepared at the time of use)
1.8 ml D-glucose solution (A)
24.6 ml PIPES-NaOH buffer (pH 6.5) (B)
2.0ml PMS solution (C)
1.0ml NTB solution (D)

3.0mlの反応混合液を試験管(プラスチック製)に入れ、37℃で5分間予備加温した。
0.1mlの酵素溶液を加え、穏やかに反転して混合した。
570nmでの水に対する吸光度の増加を37℃に維持しながら分光光度計で4〜5分間記録し、曲線の初期直線部分からの1分当たりのΔODを計算した(ODテスト)。
同時に、酵素溶液に代えて酵素希釈液(E)加えることを除いては同一の方法を繰り返し、ブランク(ΔODブランク)を測定した。
アッセイの直前に氷冷した酵素希釈液(E)で酵素粉末を溶解し、同一の緩衝液で0.1−0.8U/mlに希釈した(該酵素の接着性のためにプラスチックチューブの使用が好ましい)。
計算
活性を以下の式を用いて計算する:
U/ml={ΔOD/min(ΔODテスト− ΔODブランク)×Vt×df}/(20.1×1.0×Vs)
U/mg=(U/ml)×1/C
Vt:総体積(3.1ml)
Vs:サンプル体積(1.0ml)
20.1:ジホルマザンの1/2ミリモル分子吸光係数
1.0:光路長(cm)
df:希釈係数
C:溶液中の酵素濃度(c mg/ml)
3.0 ml of the reaction mixture was placed in a test tube (made of plastic) and preheated at 37 ° C. for 5 minutes.
0.1 ml enzyme solution was added and mixed by gentle inversion.
The increase in absorbance for water at 570 nm was recorded for 4-5 minutes on a spectrophotometer while maintaining at 37 ° C., and ΔOD per minute from the initial linear portion of the curve was calculated (OD test).
At the same time, the same method was repeated except that the enzyme diluent (E) was added instead of the enzyme solution, and a blank (ΔOD blank) was measured.
Immediately before the assay, the enzyme powder was dissolved in an ice-cold enzyme diluent (E) and diluted to 0.1-0.8 U / ml with the same buffer (use of a plastic tube for adhesion of the enzyme) Is preferred).
Calculation Activity is calculated using the following formula:
U / ml = {ΔOD / min (ΔOD test−ΔOD blank) × Vt × df} / (20.1 × 1.0 × Vs)
U / mg = (U / ml) × 1 / C
Vt: Total volume (3.1 ml)
Vs: Sample volume (1.0 ml)
20.1: 1/2 mmol molecular extinction coefficient of diformazan 1.0: optical path length (cm)
df: Dilution factor C: Enzyme concentration in solution (c mg / ml)

ホロ型発現精製酵素の調製方法
500mlのTerrific brothを2L容坂口フラスコに分注し、121℃、20分間オートクレーブを行い、放冷後別途無菌濾過したストレプトマイシンを100μg/mlになるように添加した。この培地に100μg/mlのストレプトマイシンを含むPY培地で予め30℃、24時間培養したシュードモナス・プチダTE3493(pNPG6M1)の培養液を5ml接種し、30℃で40時間通気攪拌培養した。培養終了時のPQQ依存性グルコース脱水素酵素活性は、前記活性測定において、培養液1ml当たり約120U/mlであった。
上記菌体を遠心分離により集菌し、20mMリン酸緩衝液(pH7.0)に懸濁した後、超音波処理により破砕し、更に遠心分離を行い、上清液を粗酵素液として得た。得られた粗酵素液をHiTrap−SP(アマシャム−ファルマシア)イオン交換カラムクロマトグラフィーにより分離・精製した。次いで10mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)で透析した後に終濃度が1mMになるように塩化カルシウムを添加した。最後にHiTrap−DEAE(アマシャム−ファルマシア)イオン交換カラムクロマトグラフィーにより分離・精製し、精製酵素標品を得た。本方法により得られた標品は、SDS−PAGE的にほぼ単一なバンドを示した。
pNPG6、pNPG6M2、pNPG6M3、pNPG6M4、pNPG6M5、pNPG6M6、pNPG6M7、pNPG6M8、pNPG6M9、pNPG6M10、pNPG6M11、pNPG6M12、pNPG6M13、pNPG6M14、pNPG6M15、pNPG6M16,pNPG6M17によるシュードモナス・プチダTE3493形質転換体についても上記方法と同様にして精製酵素標品を取得した。
このようにして取得した精製酵素を用いて性能を評価した。
Preparation Method of Holo-type Expression Purified Enzyme 500 ml of terrific broth was dispensed into a 2 L Sakaguchi flask, autoclaved at 121 ° C. for 20 minutes, allowed to cool and then separately sterile filtered streptomycin was added to 100 μg / ml. This medium was inoculated with 5 ml of a Pseudomonas putida TE3493 (pNPG6M1) culture solution previously cultured at 30 ° C. for 24 hours in a PY medium containing 100 μg / ml streptomycin, and cultured at 30 ° C. for 40 hours with aeration and stirring. The PQQ-dependent glucose dehydrogenase activity at the end of the culture was about 120 U / ml per 1 ml of the culture solution in the activity measurement.
The cells were collected by centrifugation, suspended in 20 mM phosphate buffer (pH 7.0), disrupted by sonication, and further centrifuged to obtain a supernatant as a crude enzyme solution. . The obtained crude enzyme solution was separated and purified by HiTrap-SP (Amersham-Pharmacia) ion exchange column chromatography. Next, after dialyzing with 10 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5), calcium chloride was added to a final concentration of 1 mM. Finally, it was separated and purified by HiTrap-DEAE (Amersham-Pharmacia) ion exchange column chromatography to obtain a purified enzyme preparation. The sample obtained by this method showed an almost single band by SDS-PAGE.
pNPG6, pNPG6M3, pNPG6M3, pNPG6M4, pNPG6M5, pNPG6M6, pNPG6M7, pNPG6M8, pNPG6M9, pNPG6M An enzyme preparation was obtained.
The performance was evaluated using the purified enzyme thus obtained.

Km値の測定
上記の活性測定方法に従い、PQQGDHの活性を測定した。グルコースに対するKm値の測定は、上記活性測定方法の基質濃度を変化させて実施した。また、マルトースに対するKm値の測定は、上記活性測定方法のグルコース溶液をマルトース溶液に置き換え、グルコースに対するKm値の測定同様基質濃度を変化させて実施した。結果を表2A表2B、表6,表9及び表14に示す。
Measurement of Km Value According to the above activity measurement method, the activity of PQQGDH was measured. Measurement of the Km value for glucose was carried out by changing the substrate concentration in the above activity measurement method. The measurement of the Km value for maltose was carried out by replacing the glucose solution in the above activity measurement method with a maltose solution and changing the substrate concentration as in the measurement of the Km value for glucose. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 6, Table 9, and Table 14.

基質特異性
上記の活性測定方法に従い、PQQGDHの活性を測定した。グルコースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性値とマルトースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性値を測定し、グルコースを基質とした場合の測定値を100とした場合の相対値を求めた。マルトースを基質溶液とした場合の脱水素酵素活性に際しては、0.5Mのマルトース溶液を調製して活性測定に用いた。結果を表2A、表2B、表4、表5、表6、表8、表9、表11、表13及び表14に示す。
Substrate specificity The activity of PQQGDH was measured according to the above activity measurement method. The dehydrogenase activity value when glucose is used as the substrate solution and the dehydrogenase activity value when maltose is used as the substrate solution are measured, and the relative value is obtained when the measured value when glucose is used as the substrate is 100. It was. For dehydrogenase activity when maltose was used as a substrate solution, a 0.5 M maltose solution was prepared and used for activity measurement. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 4, Table 5, Table 6, Table 8, Table 9, Table 11, Table 13, and Table 14.

熱安定性の測定
各種PQQGDHを酵素濃度5U/ml、緩衝液(1mM CaCl、1μM PQQを含む10mM PIPES−NaOH(pH6.5)中で保存し、58℃で熱処理後の活性残存率を求めた。結果を表2A、表2B、表6、表9及び表14に示す。なお、熱処理を行なった時間は、表2Bの試験のみ30分間、その他の試験は20分間である。
Measurement of thermal stability Various PQQGDHs were stored in an enzyme concentration of 5 U / ml and buffer (1 mM CaCl 2 , 10 mM PIPES-NaOH (pH 6.5) containing 1 μM PQQ), and the residual activity rate after heat treatment was determined at 58 ° C. The results are shown in Table 2A, Table 2B, Table 6, Table 9, and Table 14. The heat treatment time is 30 minutes only for the tests in Table 2B, and 20 minutes for the other tests.

至適pHの測定
0.22% Triton−X100を含む 50mMリン酸緩衝液(pH5.0〜8.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM 酢酸緩衝液(pH3.0〜6.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.0〜7.0)、0.22% Triton−X100を含む50mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0〜9.0)中で酵素活性を測定した。結果を図1に示す。また、最も高い活性を示したpHを表2Aに示す。
Measurement of optimum pH 50 mM phosphate buffer (pH 5.0 to 8.0) containing 0.22% Triton-X100, 50 mM acetate buffer (pH 3.0 to 6.0) containing 0.22% Triton-X100 ), 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.0 to 7.0) containing 0.22% Triton-X100, 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0 to 9.0) containing 0.22% Triton-X100 The enzyme activity was measured in. The results are shown in FIG. Moreover, the pH which showed the highest activity is shown in Table 2A.

Q76Kのグルコース定量性の確認
0.45U/mlのQ76Kを含んだ下記反応試薬を調整した。
50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
1mM CaCl2
0.22% Triton−X100
0.4mM PMS
0.26mM WST−1(水溶性テトラゾリウム塩、同仁化学研究所製)
下記に示すグルコース量の測定方法に従い、試料として精製水、100mg/dl標準液及びグルコース水溶液(600mg/dl)の10水準の希釈系列を測定し、直線性を確認した。
結果を図2に示した。
Confirmation of glucose quantification of Q76K The following reaction reagent containing 0.45 U / ml of Q76K was prepared.
50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5)
1 mM CaCl2
0.22% Triton-X100
0.4 mM PMS
0.26 mM WST-1 (water-soluble tetrazolium salt, manufactured by Dojindo Laboratories)
In accordance with the method for measuring the amount of glucose shown below, 10-level dilution series of purified water, 100 mg / dl standard solution and glucose aqueous solution (600 mg / dl) were measured as samples to confirm linearity.
The results are shown in FIG.

グルコース量の測定方法
試料量3μlに試薬300μlを加え、試薬添加後2分後からの1分間における吸光度変化を求め、精製水及びグルコース100mg/dl標準液での2点検量線に基づき試料中のグルコース量を求めた。尚、測定装置は日立7150形自動分析装置を使用し、測定波長は、主波長480nmのみ、測定温度は37℃で実施した。
図2より、0−600mg/dlの範囲で良好な直線性が確認された。
Method for measuring glucose amount Add 300 μl of reagent to 3 μl of sample volume, determine the change in absorbance in 1 minute after 2 minutes from the addition of the reagent, and use the two-inspection curve with purified water and glucose 100 mg / dl standard solution. The amount of glucose was determined. In addition, the measurement apparatus used Hitachi 7150 type automatic analyzer, the measurement wavelength was implemented only at the main wavelength of 480 nm, and measurement temperature was 37 degreeC.
From FIG. 2, good linearity was confirmed in the range of 0 to 600 mg / dl.

Q76Kのマルトース作用性の確認
0.45U/mlのQ76Kを含んだ下記反応試薬を調整した。
50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.5)
1mM CaCl2
0.22% Triton−X100
0.4mM PMS
0.26mM WST−1(同仁化学研究所製)
サンプルとしては100mg/dlまたは300mg/dlのグルコースをベースに0,120,240,360mg/dlのマルトースを上乗せした物を準備した。 上記、グルコース量の測定方法に従い、測定を実施した。
マルトースを含まない100mg/dlグルコース溶液と100とし、ベースに100mg/dlのグルコースを含むサンプルの測定値をそれぞれ相対評価した。同様にマルトースを含まない300mg/dlグルコース溶液と100とし、ベースに300mg/dlのグルコースを含むサンプルの測定値をそれぞれ相対評価した。結果を図3に示す。
Confirmation of Maltose Activity of Q76K The following reaction reagent containing 0.45 U / ml of Q76K was prepared.
50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.5)
1 mM CaCl2
0.22% Triton-X100
0.4 mM PMS
0.26 mM WST-1 (Dojindo Laboratories)
Samples were prepared by adding 0,120,240,360 mg / dl maltose on the basis of 100 mg / dl or 300 mg / dl glucose. The measurement was performed according to the method for measuring the glucose amount.
A 100 mg / dl glucose solution containing no maltose and 100 were measured, and the measured values of the samples containing 100 mg / dl glucose in the base were evaluated relative to each other. Similarly, a 300 mg / dl glucose solution not containing maltose and 100 were used, and the measured values of the samples containing 300 mg / dl glucose in the base were relatively evaluated. The results are shown in FIG.

Q76Eのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Eを用いて作用性を評価した。酵素は、0.24U/mlの濃度で添加した。結果を図4に示す。
Confirmation of Q76E Maltose Activity As in the confirmation of Q76K maltose activity, the activity was evaluated using Q168E. Enzyme was added at a concentration of 0.24 U / ml. The results are shown in FIG.

Q168Vのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Vを用いて作用性を評価した。酵素は、0.35U/mlの濃度で添加した。結果を図5に示す。
Confirmation of Q168V Maltose Activity As in the confirmation of Q76K maltose activity, the activity was evaluated using Q168V. Enzyme was added at a concentration of 0.35 U / ml. The results are shown in FIG.

Q168Aのマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様にQ168Aを用いて作用性を評価した。酵素は、0.6U/mlの濃度で添加した。結果を図6に示す。
Confirmation of Q168A Maltose Activity As in the confirmation of Q76K maltose activity, the activity was evaluated using Q168A. Enzyme was added at a concentration of 0.6 U / ml. The results are shown in FIG.

野生型酵素のマルトース作用性の確認
Q76Kのマルトース作用性の確認同様に野生型酵素を用いて作用性を評価した。酵素は、0.1U/mlの濃度で添加した。結果を図7に示す。
図3、図4、図5、図6、図7より、Q76K、Q76E、Q168V及びQ168Aは野生型酵素に比べ、マルトースに対する作用性が低下していることが確認された。
Confirmation of Maltose Activity of Wild Type Enzyme The activity was evaluated using wild type enzyme in the same manner as the confirmation of maltose activity of Q76K. Enzyme was added at a concentration of 0.1 U / ml. The results are shown in FIG.
From FIG. 3, FIG. 4, FIG. 5, FIG. 6, and FIG. 7, it was confirmed that Q76K, Q76E, Q168V, and Q168A have a reduced action on maltose compared to the wild-type enzyme.

実施例5:変異ライブラリーの構築とスクリーニング
発現プラスミドpNPG5をテンプレートとして、PCR法により構造遺伝子中の167−169領域にランダム変異を導入した。PCR反応は表3に示す組成の溶液中で、98℃2分間、次に、98℃20秒間、60℃30秒間、及び72℃4分間を30サイクルの条件で行った。
Example 5: Construction and screening of mutation library Random mutations were introduced into the 167-169 region in the structural gene by the PCR method using the expression plasmid pNPG5 as a template. The PCR reaction was performed in a solution having the composition shown in Table 3 at 98 ° C. for 2 minutes, then at 98 ° C. for 20 seconds, 60 ° C. for 30 seconds, and 72 ° C. for 4 minutes under 30 cycles.

得られた変異ライブラリーを大腸菌DH5αに形質転換し、形成された各コロニーを180μl/wellのLB培地(100μg/mlのアンピシリンと26μMのPQQを含む)の分注されたマイクロタイタープレートに植菌し、37℃、24時間培養した。培養液各50μlを別のマイクロタイタープレートに移し、凍結融解の繰り返しによって培養菌体を破砕した後、遠心分離(2000rpm、10分間)を行い、上清を回収した。回収した上清を2枚のマイクロタイタープレートに各10μl分注した。1枚のマイクロタイタープレートはグルコースを基質とした活性測定試薬を用いて活性測定し、もう一枚はマルトースを基質とした活性測定試薬を用いて活性測定し、反応性を比較した。マルトースに対する反応性の変化したクローンが多数得られた。
マルトースに対する反応性の変化したクローンをLB培地(100μg/mlのアンピシリンと26μMのPQQを含む)5mlの分注された試験管で培養し、確認実験を行ったところ、マルトースに対する反応性の変化したクローンが多数得られた。
結果を表4に示す。
The obtained mutation library was transformed into E. coli DH5α, and each formed colony was inoculated into a microtiter plate dispensed with 180 μl / well of LB medium (containing 100 μg / ml ampicillin and 26 μM PQQ). And cultured at 37 ° C. for 24 hours. 50 μl of each culture solution was transferred to another microtiter plate, and the cultured cells were disrupted by repeated freeze-thawing, followed by centrifugation (2000 rpm, 10 minutes), and the supernatant was collected. The collected supernatant was dispensed into two microtiter plates, 10 μl each. One microtiter plate was subjected to activity measurement using an activity measurement reagent using glucose as a substrate, and the other plate was subjected to activity measurement using an activity measurement reagent using maltose as a substrate, and the reactivity was compared. Many clones with altered reactivity to maltose were obtained.
When clones with altered reactivity to maltose were cultured in LB medium (containing 100 μg / ml ampicillin and 26 μM PQQ) in 5 ml dispensed tubes and confirmed, the reactivity to maltose changed. Many clones were obtained.
The results are shown in Table 4.

同様にして67−69領域(フォワードプライマー:配列番号14に記載、リバースプライマー:配列番号15に記載を使用)、129−131領域(フォワードプライマー:配列番号16に記載、リバースプライマー:配列番号17に記載を使用)、341−343領域(フォワードプライマー:配列番号18に記載、リバースプライマー:配列番号19に記載を使用)にも変異導入した。また、428と429(フォワードプライマー:配列番号20に記載、リバースプライマー:配列番号21に記載を使用)の間に挿入を試みた。
結果を表5に示す。
Similarly, 67-69 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 14, reverse primer: used in SEQ ID NO: 15), 129-131 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 16, reverse primer: in SEQ ID NO: 17) And the 341-343 region (forward primer: described in SEQ ID NO: 18, reverse primer: used as described in SEQ ID NO: 19) was also mutated. Further, insertion was attempted between 428 and 429 (forward primer: described in SEQ ID NO: 20, reverse primer: described in SEQ ID NO: 21).
The results are shown in Table 5.

これらのうち、マルトースに対する作用性が大きく低下している変異体を選抜(Q168S+E245D、Q168A+L169D、Q168S+L169S、Q168S+L169E、Q168A+L169G、Q168S+L169P)し、これらの変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表6に示す。   Among these, mutants having significantly reduced activity against maltose were selected (Q168S + E245D, Q168A + L169D, Q168S + L169S, Q168S + L169E, Q168A + L169G, Q168S + L169P), and plasmids were extracted from these mutants, Example 3 and Example 4 Pseudomonas was transformed according to the method described to express a holo-type enzyme, and purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 6.

実施例6:Q168部位の変異による基質特異性への影響
実施例5に記載の方法に準じて、Q168C、Q168D、Q168E,Q168F,Q168G,Q168H,Q168K,Q168L,Q168M,Q168N,Q168P、Q168R,Q168S,Q168T、Q168W、Q168Yの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表7に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表8に示す。更に、各変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表9に示す。
Example 6: Influence on substrate specificity by mutation of Q168 site According to the method described in Example 5, Q168C, Q168D, Q168E, Q168F, Q168G, Q168H, Q168K, Q168L, Q168M, Q168N, Q168P, Q168R, Each mutant of Q168S, Q168T, Q168W, and Q168Y was prepared. The primers used for the preparation of each mutant are shown in Table 7. In addition, Table 8 shows the results of comparing the reactivity to maltose with the disrupted liquid prepared by test tube culture using each prepared mutant. Furthermore, a plasmid was extracted from each mutant, Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4, to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 9.

実施例7:L169部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、L169A,L169V,L169H、L169Y、L169K,L169D,L169S,L169N,L169G,L169Cの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表10に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表11に示す。
Example 7: Influence on substrate specificity by mutation of L169 site According to the method described in Example 2, L169A, L169V, L169H, L169Y, L169K, L169D, L169S, L169N, L169G, and L169C mutants Prepared. The primers used for the preparation of each mutant are shown in Table 10. In addition, Table 11 shows the results of comparing the reactivity to maltose with each of the prepared mutants and the disrupted solution prepared by test tube culture.

実施例8:Q168A変異体に対するL169部位の変異の組み合わせによる基質特異性への影響
実施例5に記載の方法に準じて、Q168A+L169A、Q168A+L169C、Q168A+L169E、Q168A+L169F、Q168A+L169H、Q168A+L169I、Q168A+L169K、Q168A+L169M、Q168A+L169N、Q168A+L169P、Q168A+L169Q、Q168A+L169R、Q168A+L169S、Q168A+L169T、Q168A+L169V、Q168A+L169W、Q168A+L169Yの各変異体を調製した。各変異体の調製に使用したプライマーを表12に示す。また、調製した各変異体を用い、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表13に示す。更に、各変異体からプラスミドを抽出し、実施例3並びに実施例4記載の方法に準じてシュードモナスを形質転換してホロ型酵素を発現し、精製酵素を取得して特性を評価した。結果を表14に示す。
Example 8: Influence on substrate specificity by combination of mutations at L169 site for Q168A mutant According to the method described in Example 5, Q168A + L169A, Q168A + L169C, Q168A + L169E, Q168A + L169F, Q168A + L169A, Q168A + L169A, Q168A + L169A, Q168A + L16A Variants of Q168A + L169P, Q168A + L169Q, Q168A + L169R, Q168A + L169S, Q168A + L169T, Q168A + L169V, Q168A + L169W, Q168A + L169Y were prepared. Table 12 shows the primers used for the preparation of each mutant. In addition, Table 13 shows the results of comparing the reactivity to maltose with each of the prepared mutants and the disrupted solution prepared by test tube culture. Furthermore, a plasmid was extracted from each mutant, Pseudomonas was transformed according to the method described in Example 3 and Example 4, to express a holo-type enzyme, and a purified enzyme was obtained to evaluate the characteristics. The results are shown in Table 14.

実施例9:A170部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、A170C、A170D、A170E,A170F,A170G,A170H,A170K,A170L,A170M,A170N,A170P、A170R,A170S,A170T、A170W、A170Y,A170V,A170I,A170Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号69記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号69と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表15に示す。
Example 9: Effect on substrate specificity by mutation of A170 site According to the method described in Example 2, A170C, A170D, A170E, A170F, A170G, A170H, A170K, A170L, A170M, A170N, A170P, A170R, A170S, A170T, A170W, A170Y, A170V, A170I, and A170Q mutants were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 69 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 69 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 15 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

実施例10:E245部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、E245C、E245D、E245A,E245F,E245G,E245H,E245K,E245L,E245M,E245N,E245P、E245R,E245S,E245T、E245W、E245Y,E245V,E245I,E245Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号70記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号70と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表16に示す。
Example 10: Effect on substrate specificity by mutation of E245 site According to the method described in Example 2, E245C, E245D, E245A, E245F, E245G, E245H, E245K, E245L, E245M, E245N, E245P, E245R, Each mutant of E245S, E245T, E245W, E245Y, E245V, E245I, E245Q was prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 70 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 70 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 16 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

実施例11:N249部位の変異による基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、N249C、N249D、N249A,N249F,N249G,N249H,N249K,N249L,N249M,N249E,N249P、N249R,N249S,N249T、N249W、N249V,N249I,N249Qの各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号71記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号71と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。調製した変異ライブラリーをスクリーニングして目的の変異体を取得した。試験管培養にて調製した破砕液を用いてマルトースに対する反応性を比較した結果を表17に示す。
Example 11: Influence on substrate specificity by mutation of N249 site According to the method described in Example 2, N249C, N249D, N249A, N249F, N249G, N249H, N249K, N249L, N249M, N249E, N249P, N249R, N249S, N249T, N249W, N249V, N249I, and N249Q mutants were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 71 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 71 was used as a reverse primer. The prepared mutant library was screened to obtain the target mutant. Table 17 shows the results of comparing the reactivity to maltose using the crushed liquid prepared in the test tube culture.

実施例12:E245D変異の組み合わせによる基質特異性への影響
実施例2に記載の方法に準じて、(Q168A+L169G+E245D)、(Q168A+L169P+E245D)の各変異体を調製した。各変異体の調製にはフォワードプライマーとして配列番号72記載の合成オリゴヌクレオチドを、リバースプライマーとして配列番号72と相補的な合成オリゴヌクレオチド使用した。また、鋳型DNAとしては実施例8で取得した(Q168A+L169G)または(Q168A+L169P)のplasmidを使用した。調製した変異体を、試験管培養にて調製した破砕液でマルトースに対する反応性を比較した結果を表18に示す。
Example 12: Effect on substrate specificity by combination of E245D mutations According to the method described in Example 2, mutants (Q168A + L169G + E245D) and (Q168A + L169P + E245D) were prepared. For the preparation of each mutant, a synthetic oligonucleotide described in SEQ ID NO: 72 was used as a forward primer, and a synthetic oligonucleotide complementary to SEQ ID NO: 72 was used as a reverse primer. As the template DNA, plasmid (Q168A + L169G) or (Q168A + L169P) obtained in Example 8 was used. Table 18 shows the results of comparing the reactivity of the prepared mutants to maltose with a crushing solution prepared by test tube culture.

本発明によれば、基質特異性及び/又は熱安定性が改善されたPQQGDHを得ることができる。この改変型PQQGDHは、グルコースアッセイキット、グルコースセンサに利用できる。 According to the present invention, PQQGDH having improved substrate specificity and / or thermal stability can be obtained. This modified PQQGDH can be used for glucose assay kits and glucose sensors.

Q76N、Q76E、Q168I、Q168V、Q76T、Q76M、Q168A、野生型、Q76G、Q76Kの至適pHの測定結果を示す。横軸はpH、縦軸は相対活性を示す。図中、黒丸(Acetate)が0.22% Triton−X100を含む50mM 酢酸緩衝液(pH3.0〜6.0)で酵素活性を測定した結果である。同様に、黒四角(PIPES)が0.22% Triton−X100を含む50mM PIPES−NaOH緩衝液(pH6.0〜7.0)、黒三角(K−PB)が0.22% Triton−X100を含む 50mMリン酸緩衝液(pH5.0〜8.0)、黒菱形(Tris−HCl)が0.22% Triton−X100を含む50mM トリス塩酸緩衝液(pH7.0〜9.0)中でそれぞれ酵素活性を測定した結果である。なお測定値は最大活性を示したものを100%とした相対値で示している。The measurement result of the optimum pH of Q76N, Q76E, Q168I, Q168V, Q76T, Q76M, Q168A, wild type, Q76G, Q76K is shown. The horizontal axis represents pH, and the vertical axis represents relative activity. In the figure, a black circle (Acetate) is a result of measuring enzyme activity with 50 mM acetate buffer (pH 3.0 to 6.0) containing 0.22% Triton-X100. Similarly, a black square (PIPES) contains 0.22% Triton-X100, 50 mM PIPES-NaOH buffer (pH 6.0 to 7.0), a black triangle (K-PB) contains 0.22% Triton-X100. 50 mM phosphate buffer solution (pH 5.0 to 8.0), black rhombus (Tris-HCl) in 50 mM Tris-HCl buffer solution (pH 7.0 to 9.0) containing 0.22% Triton-X100, respectively It is the result of measuring enzyme activity. In addition, the measured value is shown as a relative value with the maximum activity being 100%. Q76Kのグルコース定量性の確認結果を示す。横軸は1水準の希釈系列、縦軸はグルコース濃度の測定値(mg/dl)を示す。The confirmation result of the glucose quantitative property of Q76K is shown. The horizontal axis represents a one-level dilution series, and the vertical axis represents the measured glucose concentration (mg / dl). Q76Kのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The confirmation result of the maltose activity of Q76K is shown. The horizontal axis represents the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis represents the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose is added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black rhombus indicates a case where maltose is added based on 300 mg / dl glucose as a sample. Q76Eのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The confirmation result of the maltose action property of Q76E is shown. The horizontal axis represents the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis represents the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose is added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black rhombus indicates a case where maltose is added based on 300 mg / dl glucose as a sample. Q168Vのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The confirmation result of the maltose activity of Q168V is shown. The horizontal axis represents the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis represents the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose is added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black rhombus indicates a case where maltose is added based on 300 mg / dl glucose as a sample. Q168Aのマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The confirmation result of the maltose action property of Q168A is shown. The horizontal axis represents the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis represents the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose is added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black rhombus indicates a case where maltose is added based on 300 mg / dl glucose as a sample. 野生型酵素のマルトース作用性の確認結果を示す。横軸は、上乗せしたマルトース濃度(mg/dl)、縦軸はマルトース添加濃度が0のときの測定値を100%としたときの相対%を示す。図中、黒三角はサンプルとして100mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合、黒菱形はサンプルとして300mg/dlのグルコースをベースにマルトースを上乗せした場合をそれぞれ示す。The confirmation result of the maltose activity of the wild type enzyme is shown. The horizontal axis represents the added maltose concentration (mg / dl), and the vertical axis represents the relative% when the measured value when the maltose addition concentration is 0 is 100%. In the figure, a black triangle indicates a case where maltose is added based on 100 mg / dl glucose as a sample, and a black rhombus indicates a case where maltose is added based on 300 mg / dl glucose as a sample.

Claims (8)

配列番号1のアミノ酸配列を有する野生型のピロロキノリンキノン依存性グルコースデヒドロゲナーゼ(PQQGDH)において、168位のグルタミン(Q)をアラニン(A)に、および、169位のロイシン(L)をプロリン(P)に、それぞれ置換した、改変型PQQGDH。In wild-type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase (PQQGDH) having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, glutamine (Q) at position 168 is alanine (A), and leucine (L) at position 169 is proline (P ), And modified PQQGDH, respectively. 請求項に記載の改変型PQQGDHをコードする遺伝子であって、配列番号2の塩基配列を有するDNAがコードするタンパク質の168位のグルタミン(Q)に該当するコドンをアラニン(A)に該当するコドンに、および、169位のロイシン(L)に該当するコドンをプロリン(P)に該当するコドンに、それぞれ置換した、改変型PQQGDHをコードする遺伝子。 The gene encoding the modified PQQGDH according to claim 1 , wherein a codon corresponding to glutamine (Q) at position 168 of the protein encoded by the DNA having the base sequence of SEQ ID NO: 2 corresponds to alanine (A) A gene encoding modified PQQGDH in which a codon and a codon corresponding to leucine (L) at position 169 are substituted with a codon corresponding to proline (P), respectively. 請求項に記載の遺伝子を含むベクター。 A vector comprising the gene according to claim 2 . 請求項に記載のベクターで形質転換された形質転換体。 A transformant transformed with the vector according to claim 3 . 請求項に記載の形質転換体を培養することを特徴とする改変型PQQGDHの製造法。 A method for producing modified PQQGDH, wherein the transformant according to claim 4 is cultured. 請求項に記載の改変型PQQGDHを含むグルコースアッセイキット。 A glucose assay kit comprising the modified PQQGDH according to claim 1 . 請求項に記載の改変型PQQGDHを含むグルコースセンサー。 A glucose sensor comprising the modified PQQGDH according to claim 1 . 請求項に記載の改変型PQQGDHを含むグルコース測定方法。

A glucose measurement method comprising the modified PQQGDH according to claim 1 .

JP2003315797A 2003-03-24 2003-09-08 Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability Expired - Fee Related JP4029346B2 (en)

Priority Applications (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2003315797A JP4029346B2 (en) 2003-03-24 2003-09-08 Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability
US10/570,904 US7479383B2 (en) 2003-09-08 2004-08-31 Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity
EP04772464A EP1666586B1 (en) 2003-09-08 2004-08-31 Pyrroloquinoline quinone (pqq)-dependent glucose dehydrogenase modification having excellent substrate specificity
PCT/JP2004/012508 WO2005026340A1 (en) 2003-09-08 2004-08-31 Pyrroloquinoline quinone (pqq)-dependent glucose dehydrogenase modification having excellent substrate specificity
CNA2004800257689A CN1849392A (en) 2003-09-08 2004-08-31 Pyrroloquinoline quinone (PQQ)-dependent glucose dehydrogenase modification having excellent substrate specificity
DE602004023736T DE602004023736D1 (en) 2003-09-08 2004-08-31 PYRROLOCHINOLINE-CHINONE (PQQ) -dependent GLUCOSEDEHYDROGENASE MODIFICATION WITH EXCELLENT SUBSTRATE SPECIFICITY
TW093127096A TW200525033A (en) 2003-09-08 2004-09-08 PQQ dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2003080244 2003-03-24
JP2003080310 2003-03-24
JP2003315797A JP4029346B2 (en) 2003-03-24 2003-09-08 Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2006141210A Division JP4058701B2 (en) 2003-03-24 2006-05-22 Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2004313172A JP2004313172A (en) 2004-11-11
JP4029346B2 true JP4029346B2 (en) 2008-01-09

Family

ID=33479621

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2003315797A Expired - Fee Related JP4029346B2 (en) 2003-03-24 2003-09-08 Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JP4029346B2 (en)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP4494978B2 (en) 2002-12-24 2010-06-30 池田食研株式会社 Coenzyme-linked glucose dehydrogenase
EP2365074A1 (en) 2005-03-25 2011-09-14 Ikeda Food Research Co. Ltd. Coenzyme-linked glucose dehydrogenase and polynucleotide encoding the same
KR101387240B1 (en) 2005-06-20 2014-04-21 아크레이 가부시키가이샤 Mutant glucose dehydrogenase
JP4665235B2 (en) 2006-06-29 2011-04-06 池田食研株式会社 FAD-linked glucose dehydrogenase gene

Also Published As

Publication number Publication date
JP2004313172A (en) 2004-11-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7476525B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) dependent glucose dehydrogenase with superior substrate specificity and stability
JP2004344145A (en) Pyrroloquinoline quinone (pqq) dependent modified glucosedehydrogenase substance excellent in substrate specificity and stability
JP4332794B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability
US7479383B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity
JP4029346B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability
JP5114756B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability
JP4058701B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability
JP2012055229A (en) Method for improving specific activity of flavin adenine dinucleotide-dependent glucose dehydrogenase
JP2006217811A (en) Modified product of pqq (pyrroloquinoline quinone)-dependent glucose dehydrogenase having excellent substrate specificity
JP4415283B2 (en) Modified pyrroloquinoline quinone (PQQ) -dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity or stability
JP2007043983A (en) Modified type pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase excellent in substrate specificity
JP4478865B2 (en) Modified metalloenzyme
JP4452988B2 (en) Method for improving specific activity of pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase, and pyrroloquinoline quinone-dependent glucose dehydrogenase with improved specific activity
JP4419044B2 (en) Modified sarcosine oxidase
JP4591074B2 (en) Heat-treated dehydrogenase
JP2006081407A (en) Method for producing pqq-dependent glucose dehydrogenase
JP2006034165A (en) Method for producing pqqgdh
JP2006217810A (en) Modified product of pqq (pyrroloquinoline quinone)-dependent glucose dehydrogenase having excellent substrate specificity
JP2009055919A (en) Modified sarcosine oxidase
JP2009072196A (en) Modified sarcosine oxidase
JP2005328793A (en) Pyrroloquinoline quinone (pqq)-dependent glucose dehydrogenase modifier excellent in substrate specificity
JP2009095348A (en) Modified sarcosine oxidase
JP2009034112A (en) Modified sarcosine oxidase
JP2009055916A (en) Modified sarcosine oxidase
JP2009055918A (en) Modified sarcosine oxidase

Legal Events

Date Code Title Description
A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20060323

A521 Written amendment

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20060522

A521 Written amendment

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20060605

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20070111

A521 Written amendment

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20070312

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20070920

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20071003

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20101026

Year of fee payment: 3

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20111026

Year of fee payment: 4

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121026

Year of fee payment: 5

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121026

Year of fee payment: 5

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131026

Year of fee payment: 6

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees