JP2003512036A - Tadg−15:癌において過剰発現されている細胞外セリンプロテアーゼ - Google Patents
Tadg−15:癌において過剰発現されている細胞外セリンプロテアーゼInfo
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6851—Quantitative amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
Abstract
Description
続出願であり、米国特許法第120条の規定による優先権を主張する。
より詳細には、本発明は、癌において過剰発現されている、腫瘍抗原誘導遺伝子
(Tumor antigen-derived gene)15(TADG−15)と称される細胞外セリン
プロテアーゼに関する。
直接関連している。限定はされないが、個々のクラスのプロテアーゼは、(a)
腫瘍原発巣の周りのストローマの消化;(b)腫瘍細胞の解離をもたらす細胞接
着分子の消化;(c)転移性増殖、ならびに腫瘍増殖因子および血管新生促進因
子の活性化のための基底膜の浸潤;に関連する。
介在し、腫瘍細胞の周りの細胞外マトリックス成分の除去、悪性腫瘍細胞の解離
をもたらす細胞間接着分子の消化、および多くの増殖因子および血管新生促進因
子の活性化に寄与する1-3。触媒ドメインの特性に依存して、プロテアーゼは4
つのファミリーに分類される:セリンプロテアーゼ、メタロプロテアーゼ、アス
パラギン酸プロテアーゼ、およびシステインプロテアーゼ3。それらプロテアー
ゼの中で、メタロプロテアーゼは、腫瘍増殖および進行に関連して詳細に研究さ
れており、細胞外マトリックスを分解し、それによって悪性腫瘍細胞の浸潤能を
高め得ることが知られている1,4,5。セリンプロテアーゼに関して、今までの研
究は、腫瘍細胞におけるプラスミノーゲン活性化因子の産生の増強、ならびに、
プラスミノーゲン活性化因子の活性と癌の攻撃性との正の相関を示している6,7
。前立腺特異的抗原(セリンプロテアーゼ)は異常な前立腺増殖の指標としても
広く用いられている8。つい最近、いくつかの他のセリンプロテアーゼ、すなわ
ち、卵巣癌において過剰発現され、腫瘍細胞の細胞外溶解活性を高めることによ
って悪性進行に寄与する、ヘプシンおよび角質層キモトリプシン酵素(SCCE
)が報告された9。
効なスクリーニング手段を欠く。本発明は、本技術分野における長年の必要性お
よび要求を満たすものである。
現を用いて、増幅PCR産物を調べることによって、癌において過剰発現されて
いるプロテアーゼを同定するためのスクリーニングプログラムについて開示する
。腫瘍細胞において過剰発現されている候補遺伝子を同定するための試みは、セ
リンプロテアーゼの触媒ドメインの三つ組アミノ酸残基(His-Asp-Ser)の周囲の
高度に保存されたドメインを利用する。本明細書において、今まで文献で報告さ
れていない、卵巣癌において高度に発現されている独自の形態のセリンプロテア
ーゼに関する証拠を示す。正常組織、悪性度の低い潜在的腫瘍(low malignant p
otential tumor)、および明らかな癌の、差別的PCR増幅を用いたスクリーニ
ング法によって、癌にのみ存在するPCR産物をサブクローン化および配列決定
し、さらに、セリンプロテアーゼファミリーと一致する触媒ドメインを有するこ
とを見つけた。その転写物の完全クローニングおよび配列決定、ならびに卵巣腫
瘍細胞におけるその発現に関する証拠をこの中で報告する。
5)タンパク質をコードする単離DNA;(b)前記(a)の単離DNAに対し
て、高ストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつTADG−15タン
パク質をコードする単離DNA;(c)遺伝暗号の縮重のせいでコドン配列にお
いて前記(a)および(b)の単離DNAと異なり、かつTADG−15タンパ
ク質をコードする単離DNA;より成る群から選択される、TADG−15タン
パク質をコードするDNAを提供する。本実施形態は、TADG−15 DNA
と、細胞において前記DNAを発現させるのに必要な調節要素とを包含するベク
ターをさらに含む。さらには、TADG−15アンチセンス mRNAが産生さ
れるように、TADG−15 DNAが調節要素に対して逆配向で配置されてい
るベクターを含む。
る単離DNA;(b)前記(a)の単離DNAに対してハイブリダイズし、かつ
TADG−15タンパク質をコードする単離DNA;(c)遺伝暗号の縮重のせ
いでコドン配列において前記(a)および(b)の単離DNAと異なり、かつT
ADG−15タンパク質をコードする単離DNA;より成る群から選択されたD
NAによってコードされる、単離および精製TADG−15タンパク質を提供す
る。
ーブと試料とを接触させ;さらに(b)試料中におけるTADG−15 mRN
Aに対するプローブの結合を検出する;各工程を含んでなる、TADG−15
mRNAを検出する方法を提供する。本発明のさらに別の実施形態において、T
ADG−15に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを含んでなるTADG−1
5 mRNAを検出するキットを提供する。キットにおいて、検出のための標識
がさらに具体化されている。
料とを接触させ;さらに、(b)試料中におけるTADG−15タンパク質に対
する抗体の結合を検出する;各工程を含んでなる、試料中のTADG−15タン
パク質を検出する方法を具体化する。同様に、本発明は、TADG−15または
その断片に特異的な抗体を含んでなる、試料中のTADG−15タンパク質を検
出するキットを具体化する。
に特異的な抗体を提供する。
化合物とを接触させ;さらに(b)TADG−15プロテアーゼ活性を測定する
;各工程を含んでなる、TADG−15を阻害する化合物をスクリーニングする
方法を提供する。通常、化合物の不在下でのTADG−15プロテアーゼ活性と
比較して、化合物の存在下でのTADG−15プロテアーゼ活性が低いことが、
TADG−15を阻害する化合物の指標となる。
り、ベクターの発現によって細胞中にTADG−15アンチセンスmRNAが産
生され、TADG−15アンチセンスmRNAが内因性TADG−15 mRN
Aにハイブリダイズし、それによって細胞におけるTADG−15の発現が阻害
されることを特徴とする、細胞におけるTADG−15の発現を阻害する方法を
提供する。
細胞に導入する工程を含んでなり、抗体のTADG−15タンパク質への結合に
よって、TADG−15タンパク質が阻害されることを特徴とする、細胞におけ
るTADG−15タンパク質を阻害する方法を提供する。
療部分とを含む化合物を個体に投与する工程を含んでなる、個体にターゲティン
グ療法を施す方法を提供する。
(b)その試料中におけるTADG−15を検出する;各工程を含んでなり、試
料中にTADG-15が存在すれば個体に癌が存在することを示唆し、さらに試
料中にTADG−15が存在しなければ個体に癌が存在しないことを示唆する、
個体における癌を診断する方法を提供する。
DG-15タンパク質またはその断片を個体に接種する工程を含んでなり、TA
DG-15タンパク質またはその断片の接種によって、個体において免疫応答が
誘導され、それによって個体にTADG−15に対するワクチン接種が行われる
、個体にTADG−15に対するワクチン接種を行う方法を提供する。
15タンパク質またはその断片に、樹状細胞を暴露させる工程を含んでなり、T
ADG−15またはその断片の暴露によって樹状細胞が活性化され、それによっ
てTADG−15に特異的な免疫活性化細胞が産生されることを特徴とする、T
ADG−15に特異的な免疫活性化細胞を産生させる方法を提供する。
アジュバントとを含んでなる、免疫原組成物を提供する。
の現在の好ましい実施形態の記載から明らかであろう。
容が達成されかつ詳細に理解されるように、添付図面に例示された本発明のある
実施形態を参照することによって、前記において簡単に要約された本発明につい
てのより詳細な説明を行う。それら図面は本明細書の一部を構成する。しかしな
がら、添付図面は本発明の好ましい実施形態を例示したものであり、本発明の範
囲を限定することを意図していないことに注意すべきである。
(Try、配列番号5)、キモトリプシン(Chymb、配列番号6)、7因子(Fac7、配
列番号7)、および組織プラスミノーゲン活性化因子(Tpa、配列番号8)と、T
ADG−15のセリンプロテアーゼ触媒ドメインとの比較を示す。星印は、触媒
三つ組残基の保存アミノ酸を指示する。
5タンパク質のアミノ酸配列を示す。推定開始コドンは、ヌクレオチド23−2
5に位置する。
ミノ酸配列を示す。潜在的膜貫通配列に下線を引いている。星印はCUBドメイ
ンの保存システイン残基を指示する。LDL受容体リガンド結合反復様ドメイン
のSDE-モチーフを線で囲んでいる。矢印は、活性化に基づき切断されるアル
ギニン−バリン結合を示す。触媒三つ組残基:ヒスチジン、アスパラギン酸、お
よびセリン残基:の保存アミノ酸を丸で囲む。
-54)、2;膜貫通ドメイン(aa #55-57)、3;細胞外ドメイン(aa #78-213)
、4−5;CUB反復(aa #214-447)、6−9;LDL受容体リガンド結合反
復(クラスAモチーフ)様ドメイン(aa #453-602)、10;セリンプロテアー
ゼ(aa #615-855)。
における、TADG−15 mRNA発現のノーザンブロット分析を示す。全て
のサブタイプの癌、および2つの卵巣癌細胞株SW626およびCAOV3にお
いて、TADG−15の1つの強い転写が観察されたが、一方、正常卵巣または
2つの乳癌細胞株では全く可視的なバンドが検出されなかった。正常胎児性組織
の中で、胎児性腎臓が増強された転写を示し、さらに、胎児性肺で弱い発現が検
出された。正常成体組織では、小腸および前立腺における弱い発現と共に、結腸
においてTADG−15が検出された。
対するTADG−15の発現レベルは、全てのLMP腫瘍において有意に上昇し
ている。m;粘液性、s;漿液性。
の発現に対するTADG−15発現の比を示す。正常卵巣における発現と比較し
て、LMP腫瘍(*;p<0.001)および癌(**;p<0.0001)の両方において、TA
DG−15 mRNA発現レベルは有意に上昇していた。10の正常卵巣試料の
全てが、低レベルのTADG−15発現を示した。
ADG−15の発現を示す。
およびCAOV3細胞の溶解物を示す。ライン1および2は、陰性対象として免
疫前のウサギ血清を用いて実験した。ライン3および4は、TADG−15タン
パク質配列由来のカルボキシル末端ペプチドに対して作成されたウサギポリクロ
ナール抗体を用いて実験した。
を用いた正常卵巣上皮の免疫組織化学染色が、ストローマまたは上皮の染色を全
く示さないことを示唆する(図10A)。しかしながら、癌の抗体染色において
、漿液性の悪性度の低い潜在的腫瘍(図10B);粘液性の悪性度の低い潜在的
腫瘍(図10C);漿液性癌(図10D);の細胞質におけるTADG−15発
現の存在;ならびに子宮内膜様癌(図10E)の細胞質および細胞表面の両方に
おけるTADG−15発現の存在を確認した。
配列の整列を示し、2つの配列が、843アミノ酸に亘り、84%類似で81%
同一であることを示す。2つのタンパク質の間で同一の残基は、“−”で指示さ
れ、一方、“*”はTADG−15翻訳終結部分を示す。それら2つのタンパク
質の間の最も重要な差異はカルボキシル末端にあり、エピチンはTADG−15
に存在しない47アミノ酸を含む。
のヌクレオチド配列の比較を示す。
る。卵巣癌の進行に寄与するプロテアーゼを分類する目的で、触媒三つ組残基Hi
s、Asp、およびSerの周囲の保存アミノ酸ドメインに対する重複プライマーを利
用して、癌において差別的に発現されているセリンプロテアーゼを増幅させた。
本方法を用いて、TADG−15(腫瘍抗原誘導遺伝子15)と称されるセリン
プロテアーゼが卵巣腫瘍において過剰発現されていることを確認した。TADG
−15は膜貫通型マルチドメインセリンプロテアーゼであると考えられる。PC
R、ノーザンブロット、および免疫学的局在決定によると、TADG−15は卵
巣腫瘍において高度に過剰発現されている。
ードする3147塩基対長(配列番号1)である。TADG−15遺伝子を利用
可能であることは、多くの有用性をもたらす。例えば、卵巣癌、ならびに乳癌、
前立腺癌、肺癌および結腸癌等の他の癌における診断または治療ターゲットとし
てTADG−15遺伝子を用いることができる。
前記(a)の単離DNAに対して、高ストリンジェントな条件下でハイブリダイ
ズし、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;(c)遺伝暗号
の縮重のせいでコドン配列において前記(a)および(b)の単離DNAと異な
り、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA:より成る群から選
択される腫瘍抗原誘導遺伝子(TADG−15)タンパク質をコードするDNA
に関する。DNAが配列番号1記載の配列を有し、かつTADG−15タンパク
質が配列番号2記載のアミノ酸配列を有することが好ましい。
調節要素とを含んでなるベクター、あるいは、TADG−15アンチセンスmR
NAが産生されるように、TADG−15 DNAが調節要素に対して逆配向で
配置されているベクターに関する。通常、DNAは、配列番号2記載のアミノ酸
配列を有するTADG−15タンパク質をコードする。また、本発明は、前記の
ベクターの何れかでトランスフェクトされた宿主細胞に関する。例示的宿主細胞
は、細菌細胞、哺乳類細胞、植物細胞、および昆虫細胞である。好ましくは、細
菌細胞は大腸菌(E.coli)である。
高ストリンジェントな条件下で前記(a)の単離DNAに対してハイブリダイズ
し、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;(c)遺伝暗号の
縮重のせいでコドン配列において前記(a)および(b)の単離DNAと異なり
、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;より成る群から選択
されたDNAによってコードされる、単離および精製TADG−15タンパク質
に関する。好ましくは、本タンパク質は配列番号2記載のアミノ酸配列を有する
。
らに、(b)試料中におけるTADG−15 mRNAに対するプローブの結合
を検出する;各工程を含んでなる、TADG−15 mRNAを検出する方法に
関する。本発明はまた、(a)TADG−15またはその断片に特異的な抗体と
試料とを接触させ;さらに、(b)試料中におけるTADG−15タンパク質に
対する抗体の結合を検出する;各工程を含んでなる、試料中のTADG−15タ
ンパク質を検出する方法に関する。通常、試料は生物学的試料であり;好ましく
は、その生物学的試料は個体に由来するものであり;さらに通常、その個体は癌
を有する疑いがある個体である。
る、TADG−15 mRNAを検出するキットに関する。本キットは:プロー
ブを標識するための標識;および標識を検出する手段;をさらに含んでいて差し
支えない。さらに、本発明は、TADG−15タンパク質またはその断片に特異
的な抗体を含んでなる、TADG−15タンパク質を検出するキットに関する。
本キットは、抗体を検出する手段をさらに含んでいて差し支えない。
。
(b)TADG−15プロテアーゼ活性を測定する;各工程を含んでなる、TA
DG−15を阻害する化合物をスクリーニングする方法に関する。通常、化合物
の不在下でのTADG−15プロテアーゼ活性と比較して、化合物の存在下での
TADG−15プロテアーゼ活性が低いことが、TADG−15を阻害する化合
物の指標となる。
ンスmRNAを発現するベクターを細胞に導入し、それによって細胞におけるT
ADG−15の発現を阻害する工程を含んでなる、細胞におけるTADG−15
の発現を阻害する方法に関する。
またはその断片に特異的な抗体を細胞に導入する工程を含んでなる、細胞におけ
るTADG−15タンパク質を阻害する方法に関する。通常、TADG−15タ
ンパク質の阻害は、癌を治療するためである。
合物を個体に投与する工程を含んでなる、個体にターゲティング療法を施す方法
に関する。例示的ターゲット部分は、TADG−15に特異的な抗体、およびT
ADG−15に結合するリガンドまたはリガンド結合ドメイン(例えば、CUB
、LDLR、プロテアーゼ、および細胞外ドメイン)である。同様に、例示的治
療部分は、放射性同位体、毒素、化学療法剤、および免疫促進剤である。通常、
前記の方法は、個体が、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、肺癌、結腸癌、および子宮頸
癌に罹っている場合に有用である。
におけるTADG−15を検出する;各工程を含んでなる、個体における癌を診
断する方法に関する。通常、試料中にTADG-15が存在すれば個体に癌が存
在することを示唆し、さらに試料中にTADG−15が存在しなければ個体に癌
が存在しないことを示唆する。通常、生物学的試料は、血液、腹水、尿、涙液、
唾液、または間質液である。TADG−15を検出する一般的手段は、ノーザン
ブロット、ウェスタンブロット、PCR、ドットブロット、ELISA、ラジオ
イムノアッセイ、DNAチップ、または腫瘍細胞標識である。本方法は,卵巣癌
、乳癌、ならびに肺癌、前立腺癌および結腸癌のようなTADG−15が過剰発
現されている他の癌において有用であろう。
するアンチセンスオリゴヌクレオチドに関する。本発明はまた、そのようなアン
チセンスヌクレオチド、および該アンチセンスヌクレオチドのための生理的に許
容される担体を含んでなる組成物に関する。
程を含んでなる、治療を必要とする個体の個々の症候群における、新生物性の症
状を治療する方法に関する。好ましくは、新生物性の症状は、卵巣癌、乳癌、肺
癌、前立腺癌、結腸癌、ならびにTADG−15が過剰発現されている他の癌よ
り成る群から選択される。そのような治療のため、オリゴヌクレオチド単独で、
または他の抗新生物薬と組み合わせて、全身投与または局所投与等、種々の投与
形態に適応させて製剤化することができる。技術および製剤は、Remington’s P
harmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, Paに記載されている
。通常、投与形態および剤形に基づき、例えば充填剤、増量剤、結合剤、湿潤剤
、崩壊剤、界面活性剤、または滑剤等の希釈剤または賦形剤のような生理的に許
容される担体と、オリゴヌクレオチド活性材料とを組み合わせる。一般的な剤形
として、錠剤;粉末;懸濁液、エマルジョン、および溶液等の液体製剤;顆粒剤
;カプセル;および坐剤;ならびにリポソーム製剤等の注射用液体製剤等が挙げ
られる。
注射のため、本発明のオリゴヌクレオチドは、溶液中、好ましくは生理学的に適
合するバッファー中に製剤化される。さらに、オリゴヌクレオチドを固形製剤と
し、使用直前に再溶解または懸濁させても差し支えない。凍結乾燥形態であって
も差し支えない。全身投与に用いられる用量は、好ましくは、約0.01mg/kgから5
0mg/kgの範囲であり、1日当たり1回または2回投与する。しかしながら、(1
)ターゲットDNAの活性を阻害する個々のオリゴヌクレオチドの能力、(2)
病的症状の重篤度または程度、あるいは(3)所定のオリゴヌクレオチドの薬物
動力学的挙動に基づいて、様々な用量スケジュールを用いることができる。
たはその断片を個体に接種する工程を含んでなる、TADG−15過剰発現に対
して個体にワクチン接種する方法に関する。TADG-15タンパク質またはそ
の断片の接種は、個体における免疫応答を誘導し、それによって個体にTADG
−15に対するワクチン接種が行われる。この中に記載のTADG−15のワク
チン接種は、癌を有し、癌を有する疑いがあり、あるいは癌に罹る危険性のある
個体を対象とする。通常、個体にワクチン接種するのに有用であるTADG−1
5断片は、配列番号2、19、20、21、29、39、49、50、59、7
9、80、81、82、83、84、89、および90に記載の好ましい9残基
断片を有する、9残基断片から20残基断片である。
たはその断片に樹状細胞を暴露させる工程を含んでなり、TADG−15または
その断片への暴露によって樹状細胞が活性化され、それによってTADG−15
に特異的な免疫活性化細胞が産生されることを特徴とする、TADG−15に特
異的な免疫活性化細胞を産生させる方法を提供する。例示的免疫活性化細胞は、
B細胞、T細胞、および樹状細胞である。通常、TADG−15断片は、配列番
号2、19、20、21、29、39、49、50、59、79、80、81、
82、83、84、89、および90に記載の好ましい9残基断片を有する、9
残基断片から20残基断片である。好ましくは、暴露前に樹状細胞を個体から単
離し、暴露後、活性化樹状細胞を個体に再導入する。通常、本方法が適用される
個体は、癌を有し、癌を有する疑いがあり、あるいは癌に罹る危険性のある個体
である。
含んでなる、免疫原組成物に関する。通常、TADG−15断片は、配列番号2
、19、20、21、29、39、49、50、59、79、80、81、82
、83、84、89、および90に記載の好ましい9残基断片を有する、9残基
断片から20残基断片である。
術を用いて差し支えない。そのような技術は文献に全て記載されている。例えば
、Maniatis, Fritsch&Sambrook, “Molecular Cloning”: A Laboratory Manua
l (1988); “DNA Cloning: A Practical Approach”, Volumes I and II (D.N.
Glover ed. 1985); “Oligonucleotide Synthesis” (M.J. Gait ed. 1984); “
Nucleic Acid Hybridization” [B.D.Hames&S.J.Higgins eds. (1985)]; “Tra
nscription and Translation” [B.D. Hames &S.J. Higgins eds. (1984)]; “
Animal Cell Culture” [R.I. Freshney, ed. (1986)]; “Immobilized Cells A
nd Enzymes” [IRL Press, (1986)]; B.Perbal, “A Practical Guide To Molec
ular Cloning” (1984)を参照。
製物を称する。
連鎖を読むことによって特定されるアミノ酸配列を意味する。
ローブを用いて、適切な条件下においてプローブに対して相補的である配列が特
定DNAライブラリ−中に存在するか否かを調べる方法を称する。さらには、「
ライブラリーをスクリーニングする」ことは、PCRによって実施しても差し支
えない。
よび第4,683,202号(Mullis)の主題であるポリメラーゼ連鎖反応、な
らびに当業界で現在公知である他の改良法を称する。
、ポリペプチドによる免疫グロブリン−結合の所望の機能的特性が維持される限
り、「D」異性体の残基もLアミノ酸残基を代用し得る。NH2はポリペプチド
のアミノ末端に存在するフリーのアミノ基を称する。COOHはポリペプチドの
カルボキシル末端に存在するフリーのカルボキシル基を称する。標準的ポリペプ
チド命名法, J Biol. Chem., 243: 3552-59 (1969)を踏まえて、アミノ酸残基の
省略形は当業界で公知である。
ルボキシル末端への従来の方向で示されていることに注意すべきである。さらに
は、アミノ残基配列の始めまたは終わりにおけるダッシュ記号は、1つ以上のア
ミノ酸残基から成る別の配列に対するペプチド結合を指示する。
すなわち、それ自体の制御下において複製し得る任意の遺伝要素(例えば、プラ
スミド、染色体、ウィルス)である。
コンであり、それに対して別のDNA断片が結合してその結合した断片の複製を
もたらすことができる。
ヌクレオチド(アデニン、グアニン、チミンまたはシトシン)の重合体を称する
。DNA分子の用語は、その分子の1次および2次構造のみを称し、特定の3次
構造に限定されない。従って、DNA分子の用語は、特に、線状DNA分子(例
えば制限酵素断片)、ウィルス、プラスミドおよび染色体において認められる二
本鎖DNAを含む。この中で構造について議論する際に、DNAの転写されない
鎖(すなわちmRNAに相同な配列を有する鎖)に沿って5’から3’方向にあ
る配列のみを与える通常のやり方に従う。
配列に、ポリペプチドをコードする核酸配列が作動可能に結合した複製可能な構
築物である。そのような制御配列の必要性は、選択された細胞および選択された
形質転換法に依存して変化するであろう。通常、制御配列は、転写プロモーター
および/またはエンハンサー、適切なmRNAリボソーム結合部位、ならびに転
写および翻訳の終結を制御する配列を含む。適切な転写および翻訳制御シグナル
を包含する発現ベクターを構築するために、当業者に周知の方法を用いることが
できる。例えば、Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory M
anual (2nd Ed.), Cold Spring Harbor Press, N.Y. に記載の技術を参照のこと
。転写制御配列が効率的に遺伝子の転写を制御する場合には、遺伝子とその転写
制御配列とが「作動可能に結合している」と定義される。本発明のベクターとし
て、限定はされないが、プラスミドベクターおよびウィルスベクターが挙げられ
る。本発明の好ましいウィルスベクターとして、レトロウィルス、アデノウィル
ス、アデノ随伴ウィルス、SV40ウィルスまたはヘルペスウィルスが挙げられ
る。通常、発現ベクターは、挿入されたDNA断片の効率的な転写を促進させる
、宿主と関連して用いられるプロモーター配列を含む。発現ベクターは、通常、
複製起点、プロモーター、ターミネーター、ならびに形質転換細胞において表現
型の選択をもたらし得る特定遺伝子を包含する。当業界で公知の手段に従って形
質転換宿主を発酵および培養して、最適な細胞増殖を得ることができる。
ボにおいて、転写されかつポリペプチドに翻訳される二本鎖DNA配列を称する
。5’(アミノ)末端における開始コドンおよび3’(カルボキシル)末端にお
ける翻訳終止コドンによって、コード配列の境界が特定される。コード配列とし
て、限定はされないが、原核生物の配列、真核生物のmRNA由来のcDNA、
真核生物(例えば、哺乳類)のDNA由来のゲノムDNA配列、および合成DN
A配列等が挙げられる。ポリアデニル酸シグナルおよび転写終結配列は、通常、
コード配列の3’側に位置する。
、例えばプロモーター、エンハンサー、ポリアデニル酸シグナル、ターミネータ
ー等のDNA調節配列である。
(3’側)のコード配列の転写を開始し得るDNA調節領域である。本発明を特
定する目的において、プロモーター配列は、その3’末端において転写開始部位
に結合し、さらに、バックグラウンドを越える検出可能なレベルで転写を開始す
るのに必要な最小数の塩基または要素を含むように上流(5’側)に伸長する。
プロモーター配列内に、転写開始部位、ならびにRNAポリメラーゼに対する結
合を担うタンパク質結合部位(コンセンサス配列)が認められるであろう。真核
生物のプロモーターは、必ずではないが、「TATA」ボックスおよび「CAT
」ボックスを包含することが多い。原核生物プロモーターは、−10および−3
5コンセンサス配列に加えて、シャイン・ダルガーノ配列を包含する。
DNA配列である。RNAポリメラーゼがコード配列をmRNAに転写し、さら
にその転写物がそのコード配列によってコードされるタンパク質に翻訳される場
合、コード配列は転写および翻訳制御配列の「制御下」にある。
ル配列は、宿主細胞に伝達してそのポリペプチドを細胞表面に方向付けし、ある
いはそのポリペプチドを媒体中に分泌させる、そのポリペプチドのN末端にある
シグナルペプチドをコードし、シグナルペプチドは、タンパク質が細胞から遊離
する前に宿主細胞によって切り離される。シグナル配列は、原核生物および真核
生物に天然に存在する種々のタンパク質と関連して見出される。
語は、特定ヌクレオチド配列部分またはその近くで二本鎖DNAを切断する酵素
を称する。
によって「形質転換されている」。形質転換DNAは細胞のゲノム中に(共有結
合して)組み込まれても組み込まれなくても差し支えない。例えば、原核細胞、
酵母および哺乳類細胞において、形質転換DNAは、プラスミドのようなエピソ
ーム要素上に保持されていて差し支えない。真核細胞に関して、安定に形質転換
された細胞は、形質転換DNAが染色体に組み込まれて、染色体複製を介して娘
細胞に受け継がれるような細胞である。その安定性は、真核細胞が、形質転換D
NAを包含する娘細胞の集団から成る細胞株またはクローンを樹立する能力によ
って説明される。「クローン」は、有糸分裂によって単一の細胞または祖先に由
来する細胞集団である。「細胞株」は何世代にも亘りインビトロで安定に増殖し
得る初代細胞のクローンである。
は約80%以上、さらに最も好ましくは約90%または95%以上)が一致する
場合、2つのDNA配列は「実質的に相同である」。配列データバンクにおいて
利用可能な標準ソフトウェアを用いて配列を比較することによって、あるいは、
例えば、特定の系のために決定されたストリンジェントな条件下におけるサザン
ハイブリダイゼーション実験において、実質的に相同である配列を同定すること
ができる。適切なハイブリダイゼーション条件を決定することは、当業技術の範
囲内である。例えば、Maniatis et al., supra; DNA Cloning, Vols. I&II, su
pra; Nucleic Acid Hybridization, supraを参照。
断片であって、そのより大きな分子に関連して天然では認められないDNA断片
である。従って、その異種領域が哺乳類遺伝子をコードする場合、通常、その遺
伝子は、その由来生物のゲノム中ではその哺乳類遺伝子に隣接しないようなDN
Aに隣接するであろう。別の例において、コード配列は、そのコード配列自体が
天然では認められないような構造である(例えば、ゲノムコード配列がイントロ
ンまたは天然遺伝子と異なるコドンを有する合成配列を包含するようなcDNA
)。対立遺伝子変異または自然に生じる突然変異事象は、この中で定義されたD
NAの異種領域を生じさせない。
紫外線に暴露された際に蛍光を発する化学物質等である。多くの蛍光物質が公知
であり、標識として用いることができる。蛍光物質として、例えば、フルオレセ
イン、ローダミン、オーラミン、テキサスレッド、AMCAブルーおよびルシフ
ァーイエロー(Lucifer Yellow)が挙げられる。特定の検出物質は、ヤギにおいて
調製しかつイソチオシアネートを介してフルオレセインに結合させた抗ウサギ抗
体である。
任意の現在利用可能な測定法によって放射能標識を検出することができる。3H
、14C、32P、35S、36Cl、51Cr、57Co、58Co、59F
e、90Y、125I、131Iおよび186Reから好ましいアイソトープを
選択することができる。
光測光、電流滴定またはガス定量技術によって検出することができる。カルボジ
イミド、ジイソシアネート、グルタールアルデヒド等のような架橋分子を用いた
反応によって、選択された粒子に酵素を結合させる。それら方法において用いら
れる多くの酵素は公知でありかつ利用可能である。好ましい酵素は、ペロキシダ
ーゼ、β−グルクロニダーゼ、β−D−グルコシダーゼ、β−D−ガラクトシダ
ーゼ、ウレアーゼ、グルコースオキシダーゼとペロキシダーゼ、およびアルカリ
ホスファターゼである。代替の標識物質および方法の開示を例示する目的で、米
国特許第3,654,090号、第3,850,752号および第4,016,
043号を参照する。
して知られている。受容体測定法において、測定すべき物質を適切に標識し、次
に、多くのその標識物質を特定細胞試験コロニーに接種し、その後、標識物質が
細胞受容体に結合する割合を特定するために結合試験を行う。本方法において、
物質間の親和性の違いを確かめることができる。
られている。詳細には、その測定法は2つの遺伝子構築物を用い、第一の構築物
は通常適切な細胞株にトランスフェクトされた場合に特定の関心受容体を連続的
に発現するプラスミドであり、第二の構築物は受容体/リガンド複合体の制御下
においてルシフェラーゼのような受容体を発現するプラスミドである。従って、
例えば、特定受容体に対するリガンドとして化合物を評価するのが望ましい場合
、第一のプラスミドは選択された細胞株において受容体の発現をもたらす構築物
であり、一方、第二のプラスミドは特定受容体に対する応答要素が挿入された、
ルシフェラーゼ遺伝子に結合したプロモーターを有するであろう。試験された化
合物が受容体のアゴニストである場合、そのリガンドは受容体と複合体を形成し
、得られた複合体が応答要素に結合してルシフェラーゼ遺伝子の転写を開始させ
るであろう。得られた化学ルミネセンスを光度計測によって測定し、さらに用量
反応曲線を作成して公知リガンドのものと比較する。前記プロトコルは米国特許
第4,981,784号に詳細に記載されている。
および動物細胞等の真核細胞も含むことを意味する。本発明のヒトTADG−1
5タンパク質をコードする組換えDNA分子または遺伝子を用いて、当業者に周
知である任意の技術を利用して、宿主を形質転換させることができる。原核生物
を形質転換させる目的において、本発明のヒトTADG−15タンパク質をコー
ドする遺伝子のコード配列を包含するベクターを用いることが特に好ましい。原
核宿主として、大腸菌(E.coli)、サルモネラ・タイフィムリウム(S. typhimuriu
m)(ネズミチフス菌)、セラシア・マルセッセンスおよび枯草菌が挙げられる。
真核宿主として、ピッチア・パストリス(Pichia pastoris)のような酵母、哺乳
類細胞および昆虫細胞が挙げられる。
み、そのDNA鎖は、配列番号1記載の配列の少なくとも15連続ヌクレオチド
から成る配列を包含するプローブに対して、高ストリンジェントな条件下でハイ
ブリダイズするであろう。本発明のDNAによってコードされるタンパク質は、
図3および4に挙げられたアミノ酸(配列番号2)と80%以上(好ましくは8
5%以上、さらに最も好ましくは95%以上)の配列の一致を有するであろう。
より好ましくは、そのDNAは、図2のヌクレオチド(配列番号1)のコード配
列、またはそのような配列の縮重変異体を包含する。本発明はまた、図2に示さ
れたヌクレオチド(配列番号1)の1から3147までのヌクレオチドの領域の
少なくとも15(好ましくは20、より好ましくは30、さらに好ましくは50
、最も好ましくは全て)の連続ヌクレオチドの配列を包含する実質的に純粋なD
NAを含む。
離(部分精製または全精製)によって、あるいは請求DNAに隣接する配列の変
化によって、そのDNAが自然に生じた環境の一部ではなくなったDNAを意味
する。従って、その用語は、例えば、ベクター、自律複製プラスミドもしくはウ
ィルスに組み込まれたまたは原核生物または真核生物のゲノムDNAに組み込ま
れた組換えDNA、あるいは他の配列から独立した分離分子(例えば、cDNA
、あるいはポリメラーゼ連鎖反応(PCR)または制限エンドヌクレアーゼ消化
によって作成されたゲノムもしくはcDNA断片)として存在する組換えDNA
を含む。また、その用語は、例えば融合タンパク質のような追加のポリペプチド
配列をコードするハイブリッド遺伝子の一部である組換えDNAを含む。また、
その用語は、TADG−15の選択的スプライシング変異体(TADG−15V
)をコードする、図2に挙げられているヌクレオチド(配列番号1)の一部を包
含する組換えDNAを含む。
くつかから分離されたタンパク質を意味する。通常、インビボにおいて目的タン
パク質と共に自然に生じたタンパク質および天然の他の有機分子を含まないで6
0重量%以上の純度である場合に、そのタンパク質は実質的に純粋である。好ま
しくは、調製物の純度は、75重量%以上、より好ましくは90重量%以上、さ
らに最も好ましくは99重量%以上である。例えば、天然供給源からの抽出によ
って;TADG−15ポリペプチドをコードする組換え核酸の発現によって;ま
たはタンパク質の化学合成によって;実質的に純粋なTADG−15タンパク質
を得ることができる。TADG−15に特異的な抗体を用いたイムノアフィニテ
ィークロマトグラフィーのようなカラムクロマトグラフィー、ポリアクリルアミ
ドゲル電気泳動、またはHPLC分析のような任意の適切な方法によって純度を
測定することができる。天然の状態において目的タンパク質に付随する不純物の
少なくともいくつかから分離された場合には、そのタンパク質は天然において付
随する成分を実質的に含まない。従って、化学的に合成されたまたはそれが天然
において由来する細胞と異なる細胞系において産生されたタンパク質は、定義に
よれば、天然において付随する成分を実質的に含まない。従って、実質的に純粋
なタンパク質は、大腸菌、他の原核生物、あるいはそれらタンパク質が自然には
生じない任意の他の生物体において合成された原核生物タンパク質を含む。
くは3つより多くのリボヌクレオチドを包含する分子として定義される。その正
確なサイズは、そのオリゴヌクレオチドの最終機能および用途に依存する多くの
因子に基づくであろう。この中で用いられている「プライマー」の用語は、精製
制限酵素消化物の場合のような自然に生じたものであるかあるいは合成されたも
のであるかにかかわらず、適切な条件下、すなわち適切な温度およびpHにおい
てヌクレオチドおよびDNAポリメラーゼのような誘発剤の存在下に置かれた場
合に、特定核酸に相補的な鎖の合成を開始させることができるオリゴヌクレオチ
ドを称する。プライマーは一本鎖であっても二本鎖であっても差し支えなく、誘
発剤の存在下において所望の伸長産物の合成を開始させるのに十分な長さである
必要がある。プライマーの正確な長さは、温度、プライマーの配列および/また
は相同性、ならびに使用する方法等の多くの因子に依存するであろう。例えば、
診断に用いる場合には、ターゲット配列の複雑さに依存し、オリゴヌクレオチド
プライマーは通常15−25以上のヌクレオチドを包含するが、それより少ない
ヌクレオチドを包含するものであっても差し支えない。
的であるように選択される。このことは、プライマーが各鎖とハイブリダイズす
るのに十分相補的でなければならないことを意味する。従って、プライマー配列
は、鋳型の正確な配列を反映する必要はない。例えば、非相補的ヌクレオチド断
片(すなわち、制限酵素部位を有する)は、プライマー配列の残り部分がその鎖
に相補的であるプライマーの5’末端に結合することができる。あるいは、プラ
イマー配列がその鎖に十分な相補性を有しまたはその鎖とハイブリダイズして伸
長産物の合成のための鋳型を形成することを条件として、非相補的塩基またはよ
り長い配列がプライマー中に散在していて差し支えない。
れたヌクレオチド(配列番号1)のコード配列またはその相補体の好ましくは2
0連続ヌクレオチド、より好ましくは40ヌクレオチド、よりさらに好ましくは
50ヌクレオチド、最も好ましくは100ヌクレオチド以上(100%まで)の
配列から成る。そのようなプローブは、(a)細胞から採取したmRNAを、標
識TADG−15ハイブリダイゼーションプローブと接触させ;さらに(b)そ
のプローブとmRNAとのハイブリダイゼーションを検出する;各工程を含んで
なる方法によって、細胞におけるTADG−15の発現を検出するのに有用であ
る。
での洗浄条件のような、高温および低い塩濃度によって特徴付けされるDNAハ
イブリダイゼーションおよび洗浄の条件、あるいは機能的にそれに対応するよう
な条件を意味する。例えば、非常に厳しい条件として:約50%ホルムアミドの
存在下における約42℃でのハイブリダイゼーション;1%SDSを含有する約
2xSSCによる約65℃での1回目の洗浄;続く約0.1xSSCによる約6
5℃での2回目の洗浄;が挙げられる。
対して、約70%以上、好ましくは75%以上(例えば80%以上)、最も好ま
しくは90%以上の同一性を有する。その2つの配列間の同一性は、マッチング
数または同一位置の数の一次関数である。例えば2つのDNA分子のそれぞれに
おいて所定の位置がアデニンによって占められている場合のように、その2つの
配列の両方における特定位置が同じ単量サブユニットで占められている場合に、
その位置においてそれら2つの配列は同一である。例えば、長さが10ヌクレオ
チドの配列中の7つの位置が、第2の10ヌクレオチド配列中の対応する位置と
同一である場合に、その2つの配列は70%配列同一性を有する。比較配列の長
さは、通常、50ヌクレオチド以上であり、好ましくは60ヌクレオチド以上、
より好ましくは75ヌクレオチド以上、最も好ましくは100ヌクレオチドであ
る。通常、配列分析ソフトウェア(Sequence Analysis Software Package of th
e Genetics Computer Group(GCG), University of Wisconsin Biotechnology Ce
nter, 1710 University Avenue, Madison, WI 53705)を用いて、配列同一性を
測定する。
ベクターを含み、そのベクターは、宿主において複製でき、作動可能に結合した
a)複製起点;b)プロモーター;およびc)TADG−15タンパク質をコー
ドするDNA配列:を包含する。好ましくは、本発明のベクターは、配列番号1
記載のDNA配列の一部を包含する。「ベクター」は、TADG−15タンパク
質またはその断片をコードする核酸を増幅および/または発現させるために用い
られる。
(配列番号2)の断片(例えば抗原性断片)も含む。この中で用いられている、
ポリペプチドに適用される「断片」は、一般的に6残基以上、より一般的に9−
12残基以上、さらに好ましくは13−20残基以上の長さであるが、完全な無
傷の配列よりは短い。あるいは、断片は、配列番号2からの20−120残基の
個々のドメインであっても差し支えない。例えば、天然のまたは組換えのTAD
G−15タンパク質の酵素消化によって、またはTADG−15の特定断片をコ
ードする発現ベクターを用いた組換えDNA技術によって、または化学合成によ
って、当業者に公知の方法でTADG−15タンパク質の断片を作成することが
できる。この中に記載の方法によって、候補断片がTADG−15の特性(例え
ばTADG−15に特異的な抗体に結合する)を示す能力を評価することができ
る。当業者に公知の標準的プロトコルによって、精製TADG−15またはTA
DG−15の抗原性断片を用いて、新規な抗体を作成しまたは既存の抗体を試験
する(例えば、診断的測定における陽性コントロールとして)ことができる。例
えばウサギにおいて免疫原としてTADG−15またはTADG−15の断片を
用いることによって作成されたポリクロナール抗血清も本発明に含まれる。当業
者に公知であるモノクロナールおよびポリクロナール抗体作成の標準的プロトコ
ルを用いる。組換えTADG−15 cDNAクローンを同定する能力、および
公知のcDNAクローンからTADG−15 cDNAクローンを区別する能力
について、本方法によって作成したモノクロナール抗体をスクリーニングするこ
とができる。
セッシング事象の産物のような、配列番号2記載の配列の一部によって少なくと
もその一部がコードされているTADG−15タンパク質、あるいはTADG−
15の配列の一部分が欠失しているTADG−15タンパク質も本発明に含まれ
る。例えば標識、リガンド、または抗原性を高める手段として作用するような別
のポリペプチドに、TADG−15ポリペプチドの断片または完全TADG−1
5ポリペプチドを共有結合させて差し支えない。
はモノクロナール抗体も含む。本発明は、完全なモノクロナール抗体のみならず
、例えばFabまたは(Fab)2断片;人工単鎖Fv分子;または例えばマウス
由来の1つの抗体の結合特異性および例えばヒト由来の別の抗体の残りの部分を
有する抗体のようなキメラ分子:等の免疫活性抗体断片も含む。
、非放射性同位体標識、蛍光標識、化学ルミネセンス標識、常磁性標識、酵素標
識または比色標識等の検出可能な標識に結合させて差し支えない。適切な毒素の
例として、ジフテリア毒素、シュードモナス内毒素A、リシン、およびコレラ毒
素が挙げられる。適切な酵素標識として、リンゴ酸ヒドロゲナーゼ、ブドウ球菌
ヌクレアーゼ、δ−5−ステロイドイソメラーゼ、アルコール脱水素酵素、α−
グリセロールリン酸デヒドロゲナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、ペロキ
シダーゼ、アルカリホスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオキシダー
ゼ、β−ガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラーゼ、グル
コース−6−リン酸デヒドロゲナーゼ、グルコアミラーゼ、アセチルコリンエス
テラーゼ等が挙げられる。適切な放射性標識として、3H、125I、131I
、32P、35S、14C等が挙げられる。
えない。磁気共鳴画像法において有用である元素について多くの例がある。イン
ビボでの核磁気共鳴画像法について検討するために、例えば、Schaefer et al.,
(1989) JACC 14, 472-480; Shreve et al., (1986) Magn. Reson. Med. 3, 336
-340; Wolf, G.L., (1984) Physiol. Chem. Phys. Med. NMR 16, 93-95; Wesbey
et al., (1984) Physiol. Chem. Phys. Med. NMR 16, 145-155; Runge et al.,
(1984) Invest. Radiol. 19, 408-415を参照。適切な蛍光標識の例として、イ
ソチオシアネート標識、ローダミン標識、フィコエリスリン標識、フィコシアニ
ン標識、アロフィコシアニン標識、オフタルデヒド(ophthaldehyde)標識、フル
オレサミン標識等が挙げられる。化学ルミネセンス標識の例として、ルミナル標
識、イソルミナル標識、芳香族アクリジニウムエステル標識、イミダゾール標識
、アクリジニウム塩標識、シュウ酸エステル標識、ルシフェリン標識、ルシフェ
ラーゼ標識、エクオリン標識等が挙げられる。
であろう。当業者に公知の標準技術を用いて、それら標識を抗体またはその断片
に結合させることができる。一般的な技術は、Kennedy et al., (1976) Clin. C
him. Acta 70, 1-31; and Schurs et al., (1977) Clin. Chim. Acta 81, 1-40
に記載されている。後者の文献に記載のカップリング技術はグルタールアルデヒ
ド法、過ヨウ素酸法、ジマレイミド法、m−マレイミドベンジル−N−ヒドロキ
シ−スクシニミドエステル法である。それら方法の全てが参照によってこの中に
組み込まれる。
であり、その方法は、例えば放射能でタグ付けしたTADG−15特異的抗体の
ような標識抗体と、試料とを接触させ、さらにその抗体が試料中の成分に結合し
たか否かを特定する工程を含む。免疫測定において、TADG−15タンパク質
に対する抗体を用いて、新生物性形質転換の疑いが高い組織におけるTADG−
15タンパク質発現レベルの上昇を検出することができる。ノーザンブロット法
および分析を用いてそれら同じ用途を達成できる。
えば、本発明において開示されたTADG−15タンパク質は、そのタンパク質
が腫瘍細胞において高度に過剰発現されていることから、様々な組織における癌
を診断するのに有用である。TADG−15に特異的なエピトープに結合する抗
体(またはその抗原結合断片)は、癌または新生物の形質転換を診断するための
、生物学的試料中のTADG−15タンパク質を検出する方法において有用であ
る。本方法は、癌を有する疑いがある患者から生物学的試料(例えば細胞、血液
、血漿、組織等)を採取し、さらにELISAのような標準的免疫測定技術を用
いてTADG−15タンパク質を検出する各工程を含んでなる。生物学的試料に
対する抗体結合は、その試料がTADG−15内のエピトープを有する成分を含
むことを示唆する。
ンハイブリダイゼーション技術に基づいて、癌であることが疑わしい細胞または
組織中におけるTADG−15 mRNAの相対量を確かめることができる。そ
のノーザン法は、例えば、配列番号1(図2)に相補的である配列を有する完全
長の一本鎖DNA、あるいは20以上(好ましくは30以上、より好ましくは5
0以上、さらに最も好ましくは100以上の連続ヌクレオチドの長さ)の前記D
NA配列の断片の何れかを包含する放射性標識TADG−15 cDNAのよう
なハイブリダイゼーションプローブを用いる。当業者に周知の様々な方法によっ
て、そのDNAハイブリダイゼーションプローブを標識することができる。
何ら本発明を限定することを意図していない。
を回収して氷上に置いた。特定組織試料の単離および同定のために、その試料を
研修医の病理学者に渡した。最終的に、液体窒素中においてその試料を凍結し、
実験記録に記入して、−80℃に保存した。
試料はCHTNによって調製され、ドライアイスに入れて出荷された。到達する
と、それら試料(例えば、血液(血清)、尿、唾液、涙液、および間質液)を実
験記録に記入して、−80℃で保存した。腫瘍組織の提供において、ヒト組織ネ
ットワーク協会(CHTN)の以下の部門の参加が承認されている:西部部門、
ウェスタンリザーブ大学(クリーブランド、オハイオ州);中西部部門、オハイオ
州立大学(コロンバス、オハイオ州);東部部門、NDRI(フィラデルフィア、ペ
ンシルベニア州);小児科部門、子供病院(コロンバス、オハイオ州);南部部
門、バーミンガムのアラバマ大学(バーミンガム、アラバマ州)。
に10の正常卵巣を外科的試料から得て、液体窒素中において凍結した。Americ
an Type Culture Collection(Rockville, MD)から、ヒト卵巣癌細胞株SW62
6およびCAOV3、ならびに、ヒト乳癌細胞株MDA−MB−231およびM
DA−MB−435Sを購入した。10%(v/v)ウシ胎児血清および抗生物
質を補足したダルベッコの改良イーグル培地中において、サブコンフルエントに
なるまで細胞を培養した。
て、その取扱説明書に基づいて、mRNAを単離した。その方法において、オリ
ゴ(dT)セルロースを介したアフィニティークロマトグラフィーを用いて、組
織溶解物からポリA+mRNAを直接単離した。回収されたmRNAの量は、U
V分光測光法によって定量化された。
ロトコルに基づき、5.0μg mRNA、ならびにランダムヘキサマーまたはオ
リゴ(dT)プライマーの何れかを用いて、第一鎖相補的DNA(cDNA)を
合成した。p53遺伝子に特異的なプライマーを用いたPCRによって、cDN
Aの純度を評価した。ゲノムDNAが混入したcDNAから純粋なcDNAを区
別できるように、プライマーはイントロンに架かる。
マーとして、前進の5’−TGGGTIGTIACIGCIGCICA(C/T
)TG−3’(配列番号11)、および反対の5’−A(A/G)IGGICC
ICCI(C/G)(T/A)(A/G)TCICC−3’(配列番号12)を
用いて、正常および癌のcDNAからのPCR産物を比較した。
産物を連結し、さらに、その連結産物を用いて、JM109コンピテント細胞(P
romega)を形質転換した。増幅のために陽性コロニーを培養し、さらに、WizardT M Miniprep DNA精製システム(Promega)によってプラスミドDNAを単離し
、その後、ApaIおよびSacI制限酵素でプラスミドを消化し、挿入物のサイズを特
定した。以前に記載のPCR産物ゲル電気泳動によって可視化されたサイズの挿
入物を有するプラスミドを配列決定した。
用いてプラスミドDNAを単離した。直接的cDNA配列決定のために、Applie
d Biosystemsモデル373A DNAシークエンスシステムを用いた。クローニ
ング部位近傍のプラスミド特異的プライマーを利用して、製品の取扱説明書に基
づき、PRISMTM Ready Reaction Dye DeoxyTMターミネーターサイクルシークエン
スキット(Applied Biosystems)を用いてヌクレオチド配列決定を実施した。Cent
ri-sepTMスピンカラム(Princeton Separation)を用いて、完了した配列決定反応
から染色ターミネーターを除去した。特定された配列に基づき、関心遺伝子を特
異的に増幅させるプライマーを設計および合成した。
リダイゼーション技術13によって卵巣腫瘍cDNAライブラリーをスクリーニン
グするためのプローブとして用いた。そのライブラリーは、ステージIII/グレ
ードIIIの卵巣腺癌患者の癌細胞から単離したmRNAを用いて、8ZAP中に
構築された。3147ヌクレオチドに架かる3つの重複するクローンを得た。
1%ホルムアルデヒド−アガロースゲルを用いた電気泳動によって、mRNA(
10μg)をサイズ分離した。次に、20xSSPE中での毛管現象によって、H
ybond-N+ナイロン膜(Amersham)上にmRNAをブロットした。80℃で2時間加
熱乾燥することによって、RNAを膜に固定した。Prime-a-Gene標識システム(P
romega)によって、32P標識cDNAプローブを作成した。前記と同じプライ
マーによって増幅させたPCR産物をプローブに用いた。ブロットを30分間プ
レハイブリダイズさせ、さらにExpressHybハイブリダイゼーション溶液(CLONTEC
H)中において、32P標識cDNAプローブと、68℃で60分間ハイブリダイ
ズさせた。β−チューブリンプローブを用いて、相対的ゲル装填量を特定するた
めの対照ハイブリダイゼーションを実施した。
腺、精巣、卵巣、小腸、結腸、および末梢血白血球、ならびに正常ヒト胎児性組
織;脳、肺、肝臓および腎臓(Human Multiple Tissue Northern Blot; CLONTECH
)も評価した。CLONTECHから購入した別途の多様組織ノーザン(MTN)ブロッ
トは、ヒトMTNブロット、ヒトMTN IIブロット、ヒト胎児性MTN IIブロ
ット、およびヒト脳MTN IIIブロットを含む。
)由来の、ポリリジン結合複合Agペプチドで免疫することによって、ウサギポ
リクロナール抗体を作成した。約20μgの細胞溶解物を15%SDS-PAGE
ゲルで分離し、4℃、100Vで40分間、PVDFに電気ブロッティングした
。50%MeOH中において10分間インキュベートすることによってタンパク
質を膜に固定した。0.2%脱脂乳を含有するTBS(pH7.8)中において、膜を1晩
ブロッキングした。0.2%乳/TBSで1:100に希釈した一次抗体を膜に添
加し、室温で2時間インキュベートした。ブロットを洗浄し、1:3000に希
釈したアルカリホスファターゼ結合ヤギ抗ウサギIgG(BioRad)と共に室温で1
時間インキュベートした。ブロットを洗浄し、化学発光性基質と共にインキュベ
ートした後、可視化のためにX線フィルムを10秒間感光させた。
報告された方法11、12に基づいて、定量的PCRを実施した。オリゴヌクレオチ
ドプライマーとして:TADG−15のために、前進の5’−ATGACAGA
GGATTCAGGTAC−3’(配列番号14)、および反対の5’−GAA
GGTGAAGTCATTGAAGA−3’(配列番号15);およびβ−チュ
ーブリンのために、前進の5’−CGCATCAACGTGTACTACAA−
3’(配列番号16)、反対の5’−TACGAGCTGGTGGACTGAG
A−3’(配列番号17)を用いた。β−チューブリンは内部対照として用いら
れた。
、mRNA(50ng)から誘導されたcDNA、TADG−15遺伝子およびβ
−チューブリン遺伝子のためのセンスおよびアンチセンスプライマー(5pmol)
、dNTPs(200μmol)、α-32PdCTP(5μCi)、ならびにTa
q DNAポリメラーゼ(0.25unit)を含む。β−チューブリン遺伝子
と並行させて、ターゲット配列を増幅させた。サーマルサイクラー(Thermal Cyc
ler)(Perkin Elmer Gene Amp 2400; Perkin-Elmer Cetus)において、PCRを3
0サイクル実施した。PCRの各サイクルは、94℃での30秒間の変性、60
℃での30秒間のアニーリング、および72℃での30秒間の伸長を含む。アニ
ーリング温度は、PCR反応に用いられるプライマーによって変化する。縮重プ
ライマーを含む反応のため、48℃のアニーリング温度を用いた。TADG−1
5特異的プライマーおよびβ-チューブリン特異的プライマーのための適切なア
ニーリング温度は62℃である。
ャー(Molecular Dynamics)を用いることによって、各PCR産物の放射能を特定
した。本研究では、発現比(TADG−15/β−チューブリン)を用いて遺伝
子発現を評価し、さらに、正常卵巣の平均値±2SDを、過剰発現を特定するた
めのカットオフ値として定義した。正常卵巣と腫瘍の平均値を比較するために、
student’s-t testを用いた。
。ホルマリン固定およびパラフィン包埋した切片をいつものように脱パラフィン
処理し、さらに、0.01Mクエン酸ナトリウムバッファー(pH6.0)中におい
てマイクロ波熱処理によって処理した。湿気のあるチャンバー中において30分
間、正常ヤギ血清と共にその切片をインキュベートした。ビオチン化抗ウサギI
gGと共に30分間インキュベートした後、その切片をABC試薬(Vector)と共
に30分間インキュベートした。ABC基質系(DAKO)を用いて最終生成物を可視
化し、さらに標本にする前にヘマトキシリンで対比染色した。一次抗体の代わり
に正常血清を用いることによって、陰性対照を実施した。
DG−15をクローン化および発現させた。例えば、アンチセンスRNAを用い
て、細胞中の相補的RNAにハイブリダイズさせ、それによってTADG−15 RNAのタンパク質への翻訳を阻害する。
15タンパク質を調べて、一般人口の上位8つのハプロタイプに対する各ペプチ
ドの結合を順位付けした(Parker et al., (1994))。<http://www-bimas.dcrt
.nih.gov/molbio/hlabind/>において、その分析に用いられるコンピュータープ
ログラムを見つけることができる。表1は、各ペプチドの特定HLA対立遺伝子
に対する結合の予測半減期に基づくペプチドの順位付けを示す。より長い半減期
は、そのペプチドと特定HLA分子とのより強い結合を示唆する。HLA対立遺
伝子に対して強く結合するTADG−15ペプチドは推定上の免疫原であり、か
つ個体にTADG−15に対するワクチン接種を行うために用いられる。
ることによる、ヒト癌において過剰発現されているプロテアーゼを同定するため
のスクリーニング戦略を開発した。本試みの間、触媒ドメインのNH3末端にあ
る保存されたヒスチジンドメインに対する重複センスプライマー、および下流の
保存されたセリンドメインに対するアンチセンスプライマーを用いて、候補遺伝
子を同定した。プロテアーゼをコードする遺伝子を同定するため、そのようなP
CR反応において増幅された適切な480塩基対のバンドをサブクローニングお
よび配列決定した。増幅された触媒ドメインの中で、TADG−15(腫瘍抗原
誘導遺伝子15)と称される新規なセリンプロテアーゼ遺伝子を同定した。その
新規に同定されたTADG−15タンパク質の触媒ドメインは、他のセリンプロ
テアーゼのものと類似しており、具体的には、チロシン様セリンプロテアーゼフ
ァミリーの触媒ドメインに適した保存アミノ酸を包含している。
ASTAプログラム(Wisconsin Package Version 9.1, GCG, Madison, Wisconsi
n)を用いたGenEMBLデータベースのコンピューター検索は、他の公知のヒトプロ
テアーゼとの相同性が55%を越えないことを示した。図1は、他のヒトセリン
プロテアーゼと比較して、TADG−15のプロテアーゼドメインを整列させた
ものを示す。GCGを介して利用可能なBESTFITプログラムを用いた結果、TA
DG−15と、チロシン、キモトリプシン、および組織プラスミノーゲン活性化
因子との間の類似性は、それぞれ、51%、46%、および52%であった。
ライブラリーのスクリーニングのためTADG−15特異的プローブを増幅させ
た。卵巣癌ライブラリーをスクリーニングした後、TADG−15転写物の3’
末端を含む1つの1785 bpクローンを得た。その新規に検出されたクロー
ンの5’末端を用いてさらにスクリーニングすることによって、TADG−15
転写物の5’末端を含む、別の1362 bpのcDNAを提供する、追加のク
ローンを同定した。配列決定されたcDNAの全長は、約3.15kbであった。得
られた全ヌクレオチド配列は、予測された855アミノ酸部分をコードする単一
のオープンリーディングフレームの前にあるコザックのコンセンサス配列を含む
(図2)。
ングフレーム(図2、3、および4)は、以下のようないくつかの別個のドメイ
ンを含む:アミノ末端細胞質テイル(アミノ酸(aa) #1-54);潜在的膜貫通ドメ
イン(aa #55-57);細胞外膜ドメイン(aa #78-213);2つの補体サブコンポ
ーネント Clr/Cls、 Uegf、および骨形成タンパク質1(CUB)反復(aa #214
-447);4つの低密度リポタンパク質(LDL)受容体様ドメインのリガンド結
合反復(aa #453-602);ならびにセリンプロテアーゼドメイン(aa #615-855)
。TADG−15タンパク質はまた、2つの潜在的N-結合グリコシル化部位(aa
#109および302)、ならびに本タンパク質のカルボキシル末端においてプロテア
ーゼを遊離および/または活性化させることができる、プロテアーゼドメインの
上流にある潜在的タンパク質分解性切断部位(aa #614)を含む。さらには、TA
DG−15は、細胞−細胞接着に関連するタンパク質において共通に見出されて
いる、RGDモチーフ(aa #249-251)を含む。
調べるため、代表的な組織タイプの癌、一連の細胞株、胎児性組織、および正常
生体組織について、ノーザンブロットハイブリダイゼーションを実施した(図5
)。TADG−15メッセージの転写物サイズは約3.2kbとして特定され、1
つの強い転写物が、調べた癌の全てに存在することが観察されたが、正常卵巣で
は全く可視バンドが検出されなかった(図5)。その転写物サイズは、配列デー
タから予測した転写物サイズ3.15kbともよく一致している。卵巣腫瘍細胞株S
W626およびCAOV3も多量の転写物を示したが、乳癌細胞株MDA−MB
−231およびMDA−MB−4355では殆どまたは全く転写物が検出されな
かった。正常ヒト胎児性組織の中で、胎児性腎臓が多量のTADG−15転写物
を示し、さらに胎児性肺においても低い発現が検出された。正常生体組織では、
小腸および前立腺における低レベルでの発現と共に、結腸においてTADG-1
5が検出された(図5)。
するため。半定量的PCRを実施した(図6)。予備実験において、本測定法11 ,12 の直線性を確認しており、その結果はノーザンブロットおよび免疫組織化学
分析と相関した。ホスホイメージャーを用いてデータを定量化し、発現比(TA
DG−15/β-チューブリン)として比較した。結果は、TADG−15転写
物発現が、調べた腫瘍の全てにおいて、カットオフ値(正常卵巣の平均値±2S
D)を越える高いレベルで検出されるが、正常卵巣では検出されないかまたは低
レベルで検出されることを示唆した(図6AおよびB)。疾患の初期および末期
を含む卵巣癌サブタイプの分析は、調べた全ての癌におけるTADG−15の過
剰発現を確認した(表2)。5症例のステージIおよび3症例のステージIIの
癌を含む、調べた癌の全てが、TADG−15遺伝子の過剰発現を示した。
ての病期および全ての組織学的サブタイプの癌がTADG−15を過剰発現して
いることが示唆された。発現比(平均値±SD)は、正常卵巣群が0.182±0.024
、LMP腫瘍群が0.847±0.419、癌群が0.771±0.380であった(表2)。正常卵
巣群と腫瘍群との比較は、LMP癌群と癌群の両方において、TADG−15遺
伝子の過剰発現が統計的に有意であることを示した(LMP腫瘍:p<0.001、癌
:p<0.0001)。
たが、以下の組織の何れにおいても、検出可能なレベルでは存在しなかった:a
)正常卵巣、b)胎児性の肝臓および脳、c)生体の脾臓、胸腺、精巣、卵巣、
および末梢血白血球、d)骨格筋、肝臓、脳、または心臓。本評価を約40腫瘍
からなる標準的パネルに広げた。TADG−15特異的プライマーを用いて、図
7に示すような卵巣癌組織および乳癌組織由来の腫瘍細胞株、ならびに図8に示
すような他の腫瘍組織においても発現を調べた。TADG−15の発現は、乳癌
、結腸癌、前立腺癌、および肺癌でも観察された。
て作成されたポリクロナール抗体を用いて、正常卵巣および卵巣腫瘍におけるウ
ェスタンブロットおよび免疫学的局在決定によって、細胞株におけるTADG−
15発現を調べた。抗体および免疫前血清の両方を用いて、SW626およびC
AOV3細胞由来の細胞抽出物のウェスタンブロットを調べた(図9)。約100,
000ダルトン、約60,000ダルトン、および32,000ダルトンのバンドを含む、いく
つかのバンドが、抗体を用いて検出された。完全TADG−15分子の予想分子
サイズは、約100,000ダルトンと推定され、さらに、aa #614でタンパク質分解性
切断によって遊離されるであろうプロテアーゼドメインは約32,000ダルトンと推
定された。いくつかの中間のタンパク質分解産物が60,000ダルトンのバンドに該
当するであろう。
癌の細胞質にTADG−15プロテアーゼが存在することを支持する(それぞれ
、図10B、C、およびD)。その広汎性染色パターンは、TADG−15が詰
め込まれて細胞表面に輸送されている時の細胞内のTADG−15の検出のせい
であろう。子宮内膜様癌において、抗原は癌細胞表面にはっきりと検出された(
図10E)正常卵巣の上皮細胞およびストローマ細胞では全く染色が検出されな
かった(図10A)。27の一連の腫瘍の免疫組織化学染色は、悪性度の低い潜
在的腫瘍群を含む、調べた全ての癌のサブタイプに、TADG−15タンパク質
が存在することを示唆した。9例の悪性度の低い潜在的腫瘍の内7例、および1
8の癌のうち13例において、強い染色が観察された(表3)。
報告されている14。エピチンは、細胞質ドメイン、膜貫通ドメイン、2つのCU
Bドメイン、4つのLDLR様ドメイン、およびカルボキシル末端セリンプロテ
アーゼドメインを有する点においてTADG−15に類似する構造を有する、9
02アミノ酸タンパク質である。TADG−15とエピチンは、843アミノ酸
に亘り84%類似しており、2つのタンパク質がオーソロガスな関係にある(ort
hologous)ことを示唆する(図11)。エピチンの正確な役割はまだ明らかにさ
れていない。
一部に相対的に高い相同性を有する1つの配列をもたらした。#182から31
39ヌクレオチドまでのTADG−15の一部とSNC−19(GenBank登録番
号#U20428)との類似性は、約97%である(図12)。しかしながら、SNC
−19とTADG−15との間には顕著な違いがある。例えば、TADG−15
は855アミノ酸のオープンリーディングフレームを有するが、SNC−19の
最も長いオープンリーディングフレームは173アミノ酸である。さらに、SN
C−19は翻訳開始のための適切な開始部位を含まないばかりか、TADG−1
5によってコードされているタンパク質のアミノ末端部分も含まない。さらには
、SNC−19は、機能的であるために必要である触媒三つ組残基のHis、Asp、
およびSer残基が異なるリーディングフレーム中にコードされているため、機能
的セリンプロテアーゼのためのオープンリーディングフレームを含まない。
ァミリーのメンバー、および補体サブコンポーネントClr/Clsに相対的に類似し
ている。それらタンパク質は、CUBおよびプロテアーゼドメインの両方を含み
、リガンド結合ドメインを介した複合体形成がその機能に必須である。Clrおよ
びClsのセリンプロテアーゼドメインの活性化は、それぞれ、Arg-GlyおよびArg-
Ile結合のタンパク質分解性切断を必要とする15。同様に、TADG−15タン
パク質が、他のセリンプロテアーゼチモーゲンの活性化機構に類似する、Arg614 とVal615との間の切断によって活性化されるチモーゲンとして合成されることが
予測される。培養細胞の溶解物のウェスタンブロット分析は、推定されるチモー
ゲン(完全分子)およびTADG−15の切断プロテアーゼ産物に対応する10
0kDaおよび32kDaペプチドの両方を確認した(図9)。それらデータは
、類似のII型セリンプロテアーゼにおいて生じるような、TADG−15のタン
パク質分解性遊離および/または活性化のモデルを支持する。
例えば骨形成タンパク質−1(BMP-1)およびトロイド遺伝子産物18-20のよ
うな、発生上調節されるタンパク質において広範囲に存在するモジュールである
ことが分かっている。それら反復の役割はまだ分かっていない。しかしながら、
いくつかのモデルは、CUBドメインがタンパク質−タンパク質相互作用に関連
していることを示唆する。ClrおよびClsのCUBドメインは、タンパク質−タン
パク質相互作用ドメインを提供することによって、補体の古典経路の活性化にお
けるCls-Clr-Clr-Cls四量複合体の集合に参加する15。ショウジョウバエのデカ
ペンタプレギック(decapentaplegic)タンパク質(DPP)は、胚の背部−腹部
の指定に必須であり、さらにショウジョウバエのトロイド(TLD)は、その活
性を調節するためにDPPと複合体を形成する19,20。トロイドタンパク質のC
UBドメインにおけるミスセンス変異は、DPP複合体とのタンパク質相互作用
を許さない発現型をもたらす19。
間に、CUB様ドメインの2つのタンデム反復を含む。それら反復のそれぞれは
、約110アミノ酸長であり、それぞれ、他のCUBの特性を示している4つの
保存システイン残基を有する(アミノ酸214、244、268、294、340、366、397、4
10)。類推によると、TADG−15タンパク質のCUB反復は、多重結合複合
体の形成を促進し、さらにターゲットタンパク質またはTADG−15自身の活
性を調節することができる、インターラクティブなドメインを形成するであろう
。
ら成る、LDL受容体リガンド結合反復(クラスAモチーフ)様ドメイン(アミ
ノ酸残基453−602)を含む。システインに富む反復のそれぞれは、約40
アミノ酸長であり、6つのシステイン残基と共に、保存された負に荷電した配列
(Ser-Asp-Glu)を含む。LDL受容体タンパク質において、その反復は、リポ
タンパク質中に存在するリジンおよびアルギニン残基と相互作用するタンパク質
結合ドメインとして機能すると考えられている21,22。さらには、LDL受容体
の最初の反復は、Ca2+に結合し、リポタンパク質には結合しないと考えられる 23 。類推によると、TADG−15におけるLDL受容体様反復は、他のタンパ
ク質の正に荷電した領域と相互作用する同様の態様でおよび/またはCa2+結合
部位として、作用する可能性がある。リガンド結合および受容体−リガンド複合
体の形成の結果として、LDL受容体はクラスリン被覆小孔を介して内側に取り
込まれる2,4。TADG−15は、サイトゾル領域中にそのモチーフを含まず、
さらには、TADG−15の細胞質ドメインにおいて、他の公知タンパク質の配
列との類似性が全く認められなかった。そのような所見は、TADG−15が、
細胞外マトリックス中に類似のリガンド結合反復を有するが、エンドサイトーシ
ス受容体(例えばLDL受容体)とは異なる態様で機能することを示唆する。
て明らかに過剰発現されている。例えばIV型コラゲナーゼおよびプラスミノー
ゲン活性化因子のような様々なプロテアーゼは、腫瘍浸潤の過程に関連し、悪性
進行におけるプロテアーゼカスケードの構成要素であると考えられている。TA
DG−15は、そのような活性を構成し、さらに腫瘍の周囲の細胞外マトリック
ス成分を直接消化し、あるいは、不活性前駆体の切断によって他のプロテアーゼ
を活性化して、腫瘍の増殖および浸潤を間接的に増強させるであろう。TADG
−15が、他の増殖因子または情報伝達タンパク質と複合体を形成してそれらの
活性を調節することによって、トロイド/BMP-1ファミリーのメンバーと同様
に機能することもあり得る。
マトリックスおよび最終的に循環へのプロテアーゼドメインの遊離を介して、卵
巣癌の早期検出のための有用なマーカーとなる可能性を高める。また、それらデ
ータは、CUB/LDLRリガンド結合ドメインを狙った送達システムによる、
治療的介入のためのターゲットとしてTADG−15を用いることができる可能
性を示唆する。
業者のレベルを示す。それら特許および刊行物は、個々の刊行物が具体的におよ
び個別的に参照によって組み込まれることが示唆されたのと同様に、参照によっ
てこの中に組み込まれる。
の結果ならびに利点を得ることを容易に理解するであろう。この中において方法
、手段、処置、分子および特定化合物と共に記載した本実施例は、現在での好ま
しい実施形態の代表であり、例示であり、本発明の範囲に対する限定として見な
されない。当業者はそれらに対する変化および他の用途を考えつき、それらは本
請求の範囲によって特定された本発明の精神に含まれる。
(Try、配列番号5)、キモトリプシン(Chymb、配列番号6)、7因子(Fac7、配
列番号7)、および組織プラスミノーゲン活性化因子(Tpa、配列番号8)と、T
ADG−15のセリンプロテアーゼ触媒ドメインとの比較を示す
−15タンパク質のアミノ酸配列を示す
ミノ酸配列を示す
における、TADG−15 mRNA発現のノーザンブロット分析を示す
-チューブリンの発現に対するTADG−15発現の比を示す
株におけるTADG−15の発現を示す
。
した、SW626およびCAOV3の細胞溶解物を示す
を用いた正常卵巣上皮の免疫組織化学染色が、ストローマまたは上皮の染色を全
く示さないことを示唆する
の配列の整列を示す
8)とのヌクレオチド配列の比較を示す
Claims (52)
- 【請求項1】 (a)TADG−15タンパク質をコードする単離DNA;
(b)前記(a)の単離DNAに対して、高ストリンジェントな条件下でハイブ
リダイズし、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;ならびに
、 (c)遺伝暗号の縮重のせいでコドン配列において前記(a)および(b)の単
離DNAと異なり、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;よ
り成る群から選択される、腫瘍抗原誘導遺伝子15(TADG−15)タンパク
質をコードするDNA。 - 【請求項2】 配列番号1記載の配列を有することを特徴とする請求項1記
載のDNA。 - 【請求項3】 前記TADG−15タンパク質が、配列番号2記載のアミノ
酸配列を有することを特徴とする請求項1記載のDNA。 - 【請求項4】 請求項1記載のDNAと、細胞における該DNAの発現に必
要である調節要素とを含んでなるベクター。 - 【請求項5】 前記DNAが、配列番号2記載のアミノ酸配列を有するTA
DG−15タンパク質をコードすることを特徴とする請求項4記載のベクター。 - 【請求項6】 TADG−15アンチセンスmRNAが産生されるように、
前記DNAが、前記調節要素に対して逆配向で配置されていることを特徴とする
請求項4記載のベクター。 - 【請求項7】 TADG−15タンパク質を発現する請求項4記載のベクタ
ーでトランスフェクトされた宿主細胞。 - 【請求項8】 細菌細胞、哺乳類細胞、植物細胞、および細菌細胞より成る
群から選択されることを特徴とする請求項7記載の宿主細胞。 - 【請求項9】 大腸菌であることを特徴とする請求項8記載の宿主細胞。
- 【請求項10】 (a)TADG−15タンパク質をコードする単離DNA
;(b)前記(a)の単離DNAに対して、高ストリンジェントな条件下でハイ
ブリダイズし、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;ならび
に、 (c)遺伝暗号の縮重のせいでコドン配列において前記(a)および(b)の単
離DNAと異なり、かつTADG−15タンパク質をコードする単離DNA;よ
り成る群から選択されたDNAによってコードされる単離および精製TADG−
15タンパク質。 - 【請求項11】 配列番号2記載のアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項10記載のTADG−15タンパク質。 - 【請求項12】 (a)TADG−15に特異的なプローブと試料とを接触
させ;さらに (b)前記試料中におけるTADG−15 mRNAに対する前記プローブの結
合を検出する;各工程を含んでなる、試料中のTADG−15 mRNAを検出
する方法。 - 【請求項13】 前記試料が生物学的試料であることを特徴とする請求項1
2記載の方法。 - 【請求項14】 前記生物学的試料が個体由来であることを特徴とする請求
項13記載の方法。 - 【請求項15】 前記個体が、癌を有する疑いがあることを特徴とする請求
項14記載の方法。 - 【請求項16】 TADG−15に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを
含んでなる、TADG−15 mRNAを検出するキット。 - 【請求項17】 前記プローブを標識するための標識;および前記標識を検
出する手段;をさらに含んでなる請求項16記載のキット。 - 【請求項18】 (a)TADG−15またはその断片に特異的な抗体と試
料とを接触させ;さらに、 (b)前記試料中におけるTADG−15タンパク質に対する前記抗体の結合を
検出する;各工程を含んでなる、試料中のTADG−15タンパク質を検出する
方法。 - 【請求項19】 前記試料が生物学的試料であることを特徴とする請求項1
8記載の方法。 - 【請求項20】 前記生物学的試料が個体由来であることを特徴とする請求
項19記載の方法。 - 【請求項21】 前記個体が、癌を有する疑いがあることを特徴とする請求
項20記載の方法。 - 【請求項22】 TADG−15タンパク質またはその断片に特異的な抗体
を含んでなる、TADG−15タンパク質を検出するキット。 - 【請求項23】 前記抗体を検出する手段をさらに含んでなる請求項22記
載のキット。 - 【請求項24】 TADG−15タンパク質またはその断片に特異的な抗体
。 - 【請求項25】 (a)TADG−15タンパク質を含む試料と化合物とを
接触させ;さらに、 (b)TADG−15プロテアーゼ活性を測定する;各工程を含んでなり、 前記化合物の不在下でのTADG−15プロテアーゼ活性と比較して、前記化
合物の存在下でのTADG−15プロテアーゼ活性が低いことが、TADG−1
5を阻害する化合物の指標となることを特徴とする、TADG−15を阻害する
化合物をスクリーニングする方法。 - 【請求項26】 細胞に請求項6記載のベクターを導入する工程を含んでな
り、前記ベクターの発現によって前記細胞中にTADG−15アンチセンスmR
NAが産生され、前記TADG−15アンチセンスmRNAが内因性TADG−
15 mRNAにハイブリダイズし、それによって前記細胞におけるTADG−
15の発現が阻害されることを特徴とする、細胞におけるTADG−15の発現
を阻害する方法。 - 【請求項27】 TADG−15タンパク質またはその断片に特異的な抗体
を細胞に導入する工程を含んでなり、前記抗体のTADG−15タンパク質への
結合によって、TADG−15タンパク質が阻害されることを特徴とする、細胞
におけるTADG−15タンパク質を阻害する方法。 - 【請求項28】 TADG−15に特異的なターゲット部分と、治療部分と
を有する化合物を個体に投与する工程を含んでなる、個体にターゲティング療法
を施す方法。 - 【請求項29】 前記ターゲット部分が、TADG−15に特異的な抗体、
およびTADG−15に結合するリガンドまたはリガンド結合ドメインより成る
群から選択されることを特徴とする請求項28記載の方法。 - 【請求項30】 前記治療部分が、放射性同位体、毒素、化学療法剤、免疫
促進剤、および細胞傷害性物質より成る群から選択されることを特徴とする請求
項28記載の方法。 - 【請求項31】 前記個体が、卵巣癌、肺癌、前立腺癌、結腸癌、およびT
ADG−15が過剰発現されている他の癌より成る群から選択される癌に罹って
いることを特徴とする請求項28記載の方法。 - 【請求項32】 (a)個体から生物学的試料を採取し;さらに、 (b)前記試料中におけるTADG−15を検出する;各工程を含んでなり、 前記試料中にTADG-15が存在すれば前記個体に癌が存在することを示唆し
、前記試料中にTADG−15が存在しなければ前記個体に癌が存在しないこと
を示唆する、個体における癌を診断する方法。 - 【請求項33】前記生物学的試料が、血液、尿、唾液、涙液、間質液、腹水
、腫瘍生検組織、および循環腫瘍細胞より成る群から選択されることを特徴とす
る請求項32記載の方法。 - 【請求項34】 前記TADG−15の検出が、ノーザンブロット、ウェス
タンブロット、PCR、ドットブロット、ELISAサンドイッチ法、ラジオイ
ムノアッセイ、DNAチップ、またはフローサイトメトリーより成る群から選択
される手段によってなされることを特徴とする請求項32記載の方法。 - 【請求項35】 前記癌が、卵巣癌、乳癌、肺癌、結腸癌、前立腺癌、およ
びTADG−15が過剰発現されている他の癌より成る群から選択されることを
特徴とする請求項32記載の方法。 - 【請求項36】 TADG−15プロテアーゼ活性を欠くTADG-15タ
ンパク質またはその断片を個体に接種する工程を含んでなり、 TADG-15タンパク質またはその断片の接種によって、個体において免疫応
答が誘導され、それによって、個体にTADG−15に対するワクチン接種が行
われることを特徴とする、個体にTADG−15に対するワクチン接種を行う方
法。 - 【請求項37】 前記個体が、癌を有し、癌を有する疑いがあり、あるいは
癌に罹る危険性があることを特徴とする請求項36記載の方法。 - 【請求項38】 前記TADG−15断片が、9残基断片から20残基断片
までの断片より成る群から選択されることを特徴とする請求項36記載の方法。 - 【請求項39】 前記TADG−15断片が、配列番号2、19、20、2
1、29、39、49、50、59、79、80、81、82、83、84、8
9、および90に記載の配列より成る群から選択される9残基断片であることを
特徴とする、請求項38記載の方法。 - 【請求項40】 TADG−15プロテアーゼ活性を欠くTADG-15タ
ンパク質またはその断片に、樹状細胞を暴露させる工程を含んでなり、 TADG−15またはその断片への暴露によって樹状細胞が活性化され、それ
によってTADG−15に特異的な免疫活性化細胞が産生されることを特徴とす
る、TADG−15に特異的な免疫活性化細胞を産生させる方法。 - 【請求項41】 前記免疫活性化細胞が、B細胞、T細胞、および樹状細胞
より成る群から選択されることを特徴とする請求項40記載の方法。 - 【請求項42】 前記TADG−15断片が、9残基断片から20残基断片
までの断片より成る群から選択されることを特徴とする請求項40記載の方法。 - 【請求項43】 前記TADG−15断片が、配列番号2、19、20、2
1、29、39、49、50、59、79、80、81、82、83、84、8
9、および90に記載の配列より成る群から選択される9残基断片であることを
特徴とする、請求項42記載の方法。 - 【請求項44】 前記暴露前に個体から樹状細胞を単離し、暴露後、活性化
樹状細胞を個体に再導入することを特徴とする、請求項40記載の方法。 - 【請求項45】 前記個体が、癌を有し、癌を有する疑いがあり、あるいは
癌に罹る危険性があることを特徴とする請求項44記載の方法。 - 【請求項46】 TADG-15タンパク質の免疫原断片と、適切なアジュ
バントとを含んでなる免疫原組成物。 - 【請求項47】 前記TADG−15断片が、9残基断片から20残基断片
までの断片より成る群から選択されることを特徴とする請求項46記載の免疫原
組成物。 - 【請求項48】 前記TADG−15断片が、配列番号2、19、20、2
1、29、39、49、50、59、79、80、81、82、83、84、8
9、および90に記載の配列より成る群から選択される9残基断片であることを
特徴とする、請求項47記載の免疫原組成物。 - 【請求項49】 請求項1記載のDNAに相補的であるヌクレオチド配列を
有するオリゴヌクレオチド。 - 【請求項50】 請求項49記載のオリゴヌクレオチドと、該オリゴヌクレ
オチドのための生理学的に許容される担体とを含んでなる組成物。 - 【請求項51】 有効量の請求項49記載のオリゴヌクレオチドを個体に投
与する工程を含んでなる、治療を必要とする個体おける新生物性の症状を治療す
る方法。 - 【請求項52】 前記新生物性の症状が、卵巣癌、乳癌、肺癌、結腸癌、前
立腺癌、およびTADG−15が過剰発現されている他の癌より成る群から選択
されることを特徴とする請求項51記載の方法。
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