JP2003319782A

JP2003319782A - イネの品種の識別方法

Info

Publication number: JP2003319782A
Application number: JP2002130645A
Authority: JP
Inventors: Kenji Fujino; 賢治藤野
Original assignee: HOKKAIDO GREEN BIO KENKYUSHO K; HOKKAIDO GREEN BIO KENKYUSHO KK; HOKUREN; HOKUREN FEDERATION OF AGRICULT COOP
Current assignee: HOKKAIDO GREEN BIO KENKYUSHO K; HOKKAIDO GREEN BIO KENKYUSHO KK; HOKUREN; HOKUREN FEDERATION OF AGRICULT COOP
Priority date: 2002-05-02
Filing date: 2002-05-02
Publication date: 2003-11-11

Abstract

(57)【要約】（修正有）【課題】イネの品種識別能に優れるＤＮＡマーカーを提
供して、さらに、これを用いたイネの品種識別手段を見
出すこと。【解決手段】イネの遺伝子の特定のＳＳＲ配列を指標と
して、イネの品種を識別する、イネの品種の識別方法を
提供し、さらに、この識別方法に好適に用いることがで
きる、遺伝子増幅用プライマーを提供することにより、
数多くのイネの品種を識別することが可能であり、上記
の課題を解決し得ることを見出した。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【発明の属する技術分野】本発明は、イネの品種の識別
方法に関する発明である。

【０００２】

【従来の技術】食品、ことに農畜産物の品質は、主に、
品種、産地、生産者によって規定され得るものであり、
これらを消費者に向けて明らかにするために、いわゆる
原産地表示がなされている。

【０００３】しかしながら、原産地表示の内容について
は、販売者と消費者の間の信頼関係に頼らざるを得ず、
近年、この原産地表示の信憑性が揺らぎ始めており、原
産地表示の内容の確認手段の確立が急がれている。

【０００４】原産地表示が問題となる農畜産物として、
イネが挙げられる。イネの種子（コメ）は、販売に際し
ては、品種名（ブランド）が優先され、食味品質も大き
く品種に依存する。それにもかかわらず、イネの種子
は、外観のみでは品種の識別が困難であり、客観的な手
段により、品種識別表示の確認を行うことが、特に、望
まれている。

【０００５】

【発明が解決しようとする課題】客観的な農畜産物の品
種の識別手段の一つとして、ＤＮＡ鑑定が挙げられる。
イネの品種を、ＤＮＡ鑑定により識別することができれ
ば、上述したような品種識別表示の確認を行うことが可
能になり、さらに、流通過程におけるイネの品種の管理
を、客観的に行うことが可能になる。また、栽培用のイ
ネ種子の販売においても、客観的な品種管理を行うこと
が可能になる。

【０００６】近年は、ＤＮＡ多型に基づく品種識別方法
が開発されている。この多型の検出方法としては、例え
ば、ＲＦＬＰ法[Botstein,D,et al.,(1980)AM.J.Hum.Ge
net.32:314-331] 、ＡＦＬＰ法[Zabeau,M.and P.Vos(19
93)European Patent Apprication,EP0534858) 、ＲＬＧ
Ｓ法[Hatada,I. et al.,(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA
88:9523-9527]等が提供されている。しかしながら、こ
れらの手段においては、イネの栽培品種間のような、極
近縁な品種間で品種識別を行うほどの多型の検出効率が
認められがたい面がある。

【０００７】これに対して、イネの遺伝子において、塩
基の繰り返しのパターンにより構成されるＳＳＲ(Simpl
e sequence repeats) 配列領域は、近縁品種間において
も多型頻度が高く、極近縁間における品種識別を行うの
に適していると考えられる[Powell,W.et al.,(1996) Tr
ends Plant Sci 1:215-222、McCouch,SR.et al.,(1997)
Plant Mol Biol 35:89-99]。イネに対しては、ＳＳＲ配
列を利用したＤＮＡマーカーが特許出願されている（特
開平１０−５７０７３号公報）が、近縁間イネ品種の品
種識別を行うには、一層、多様なマーカーが提供される
ことが望ましい。

【０００８】そこで、本発明が解決すべき課題は、イネ
の品種識別能に優れるＤＮＡマーカーを提供して、さら
に、これを用いたイネの品種識別手段を見出すことにあ
る。

【０００９】

【課題を解決するための手段】本発明者は、この課題の
解決に向けて、近縁の品種間においても多型が認められ
るイネの遺伝子のＳＳＲ(Simple sequence repeats) 配
列領域の存在に関して検討を重ね、相当種類の品種判別
マーカーとなり得るＳＳＲマーカーを見出し、さらに、
これらのＳＳＲマーカーを組み合わせて用いることによ
り、イネの近縁の品種間の識別を高い精度で行うことが
可能であることを見出し、本発明を完成した。

【００１０】すなわち、本発明は、イネの遺伝子の特定
のＳＳＲ配列を指標として、イネの品種を識別する、イ
ネの品種の識別方法（以下、本品種識別方法ともいう）
を提供する発明である。また、本発明は、この識別方法
に好適に用いることができる、遺伝子増幅用プライマー
（以下、本増幅用プライマーともいう）を提供する発明
である。

【００１１】なお、本発明において、「イネ」とは、イ
ネの植物体全体（茎、葉、根部、イネ種子等）を意味す
るものとする。ここで、「イネ種子」とは、文字通り、
植物体として成立しているイネの種子という意味から、
精米処理を施した「コメ粒」(通常は加熱調理前）まで
を意味するものとする。

【００１２】

【発明の実施の形態】以下、本発明の実施の形態を説明
する。本品種識別方法は、多型の存在する遺伝子領域
（ＳＳＲ領域）を、ＰＣＲ法等の遺伝子増幅手段によ
り、その遺伝子領域を増幅させて、得られた遺伝子増幅
産物の塩基長の差異で、多型による遺伝子型の異同を検
出することにより、イネの品種を識別する方法である。

【００１３】本品種識別方法で、品種識別マーカーとし
て用いるＳＳＲ領域は、配列番号１〜１７で表される、
１７種のイネの遺伝子の領域である。イネのＳＳＲ領域
については、既存のソフトウエアで検索を行うことがで
きる〔例えば、「ＳＳＲＩＴ」(http://ars-genome.cor
nell.edu/cgi-bin/rice/ssrtool.pl) 等〕が、これらの
１７種類のＳＳＲ領域を、イネの品種識別マーカーとし
て用い得ることは知られていない。

【００１４】本品種識別方法における識別の対象となる
イネの品種は、少なくとも下記の品種である。なお、こ
れらの品種の他にも、配列番号１〜１７で表される塩基
配列を含むＳＳＲマーカーを用いることにより、識別可
能なイネの品種が数多く存在ことが予想される。

【００１５】欧州品種：「Italica Livorno 」（以
下、ＩＬともいう）、「Dunghan Shali 」（以下、ＤＳ
ともいう）、「Arroz Da Terra」（以下、ＡＤＴともい
う）、「Ｆａｎｙ」（以下、ＦＡＮＹともいう）または
「USSR22」（以下、Ｕ２２ともいう）インド品種「Kasalath」（以下、カサラスともいう）日本品種「きたいぶき」、「はやまさり」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、
「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３
号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早
生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」ま
たは「たんねもち」

【００１６】本品種識別方法における、イネの品種の識
別を行うための要素となるＳＳＲ配列は、配列番号１〜
１７で表される塩基配列を含む塩基配列であり、本品種
識別方法は、イネの遺伝子において、配列番号１〜１７
で表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マー
カーとして、被験イネの品種を識別する、イネの品種の
識別方法として提供される。なお、増幅遺伝子マーカー
となり得るＳＳＲ配列を増幅するための鋳型遺伝子は、
イネであれば、あらゆる部分から採取可能である。すな
わち、葉、茎、根の他、イネ種子等から採取可能であ
る。特に、イネ種子は、品種表示の内容の確認を、現品
から行うためには、不可欠の遺伝子原料である。

【００１７】配列番号１のＳＳＲマーカー配列番号１（１０ＴＣ・１２ＣＡ）で表されるＳＳＲ配
列を増幅遺伝子マーカーとして用いることにより、被験
イネが、下記ｉ）〜iii)から選ばれるいずれの群の品種
であるかを識別することができる。

【００１８】ｉ）「Kasalath」 ii）「きたいぶき」または「はやまさり」 iii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ar
roz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、
「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３
号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早
生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」ま
たは「たんねもち」

【００１９】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲ配
列を含む遺伝子領域を、ＰＣＲ法等の遺伝子増幅法で増
幅させて、増幅遺伝子マーカーとするため、増幅を行う
鋳型遺伝子の５’末端と３’末端に対して、実質的に相
補的な、遺伝子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プラ
イマーが必要である。かかる遺伝子増幅用プライマーの
選択は、目的とする遺伝子領域を、遺伝子増幅反応で増
幅可能なものである限り、特に限定されず、ＰＣＲ法等
の遺伝子増幅反応を、一般的に行う際における、プライ
マー選択基準に基づき選択することができる。

【００２０】すなわち、配列番号１で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号１８で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。

【００２１】また、アンチセンスプライマーとしては、
１種または２種以上の配列番号１９で表されるヌクレオ
チド鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩
基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の
塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖、からなる
群から選ばれる、１種または２種以上のヌクレオチド鎖
とすることを好適な態様として挙げることができる。

【００２２】配列番号１８と配列番号１９で表されるヌ
クレオチド鎖は、共に、公開されているイネの遺伝子の
塩基配列に対して相補的な配列のヌクレオチド鎖であ
り、後述する実施例に示すように、これらのヌクレオチ
ド鎖を、遺伝子増幅反応のセンスプライマーとアンチセ
ンスプライマーとして用いることが好適である。しかし
ながら、例えば、これら連続する２０塩基全体を用いな
くても、これらの配列のうち、少なくとも、連続する１
５塩基が、鋳型遺伝子における遺伝子増幅反応の開始点
において相補的であれば、プライマーの全ての部分が鋳
型遺伝子と、完全に相補的である必要はない（センスプ
ライマーであれば、５’末端側１５塩基以上が配列番号
１８の配列と一致し、アンチセンスプライマーであれば
３’末端側１５塩基以上が配列番号１９の配列と一致す
ることが好適である）。また、このような条件を満た
す、遺伝子増幅用プライマーの全塩基長は、５０塩基以
下程度であることが、一般的である。

【００２３】なお、センスプライマーまたはアンチセン
スプライマーが、配列番号１８または１９で表されるヌ
クレオチド鎖の塩基配列以外の塩基配列を有している場
合も、センスプライマーまたはアンチセンスプライマー
全体として、遺伝子増幅反応時に結合するイネ遺伝子に
対して相補的な配列であることが好適であることは、明
らかである（後述する、配列番号２〜１７で表されるＳ
ＳＲ配列を増幅するために用いられる、他のセンスプラ
イマーまたはアンチセンスプライマーにおいても同様で
ある）。

【００２４】このように、配列番号１８にかかわるセン
スプライマーと、配列番号１９にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の遺伝子増幅を行う
ことにより、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる
塩基長を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００２５】配列番号２のＳＳＲマーカー配列番号２（７ＧＧＡ）で表されるＳＳＲ配列を増幅遺
伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、下
記ｉ）〜iii)から選ばれるいずれの群の品種であるかを
識別することができる。

【００２６】ｉ）「Kasalath」 ii）「はくちょうもち」または「たんねもち」 iii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ar
roz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶ
き」、「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカ
リ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツ
マエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０
号」、「農林１１号」、「北海早生」、「胆振早生」ま
たは「赤毛」

【００２７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号２で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００２８】すなわち、配列番号２で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号２０で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号２１で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００２９】このように、配列番号２０にかかわるセン
スプライマーと、配列番号２１にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００３０】配列番号３のＳＳＲマーカー配列番号３（１２ＴＡＴＧ）で表されるＳＳＲ配列を増
幅遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネ
が、下記ｉ）〜ｖ）から選ばれるいずれの群の品種であ
るかを識別することができる。

【００３１】ｉ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀ノ
尾」、「ほのか224 」、「きらら397 」、「ほしのゆ
め」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「キタヒカ
リ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツ
マエ」、「農林１１号」、「北海早生」、「はくちょう
もち」または「たんねもち」 ii）「Kasalath」 iii)「Italica Livorno 」または「Arroz Da Terra」 iv）「Dunghan Shali 」ｖ）「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「ゆきま
る」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０
号」、「胆振早生」または「赤毛」

【００３２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号３で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００３３】すなわち、配列番号３で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号２２で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号２３で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００３４】このように、配列番号２２にかかわるセン
スプライマーと、配列番号２３にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００３５】配列番号４のＳＳＲマーカー配列番号４（１８ＣＴ）で表されるＳＳＲ配列を増幅遺
伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、下
記ｉ）〜iv) から選ばれるいずれの群の品種であるかを
識別することができる。

【００３６】ｉ）「ほのか224 」または「はやまさり」 ii）「Kasalath」 iii)「Italica Livorno 」、「Ｆａｎｙ」、若しくは、
「USSR22」または「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀の
尾」、「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「き
たいぶき」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、「巴まさり」、「栄光」、「キヨカゼ」、「農林
３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早
生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねも
ち」 iv) 「Dunghan Shali 」または「Arroz Da Terra」

【００３７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号４で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００３８】すなわち、配列番号４で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号２４で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号２５で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００３９】このように、配列番号２４にかかわるセン
スプライマーと、配列番号２５にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００４０】配列番号５のＳＳＲマーカー配列番号５（２１ＧＡ）で表されるＳＳＲ配列を増幅遺
伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、下
記ｉ）〜iv) から選ばれるいずれの群の品種であるかを
識別することができる。

【００４１】ｉ）「Kasalath」、「コシヒカリ」、「亀
ノ尾」、「ほのか224 」、「きらら397 」、「ほしのゆ
め」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「マツマ
エ」、「農林１１号」、「北海早生」、「はくちょうも
ち」または「たんねもち」 ii) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ｆ
ａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「ゆきまる」、「キタ
ヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、
「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆
振早生」または「赤毛」 iii)「Arroz Da Terra」 iv) 「USSR22」

【００４２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号５で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００４３】すなわち、配列番号５で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号２６で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号２７で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００４４】このように、配列番号２６にかかわるセン
スプライマーと、配列番号２７にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００４５】配列番号６のＳＳＲマーカー配列番号６（１０ＴＣ）で表されるＳＳＲ配列を増幅遺
伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、下
記ｉ）〜iv) から選ばれるいずれの群の品種であるかを
識別することができる。

【００４６】ｉ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀ノ
尾」、「ほのか224 」、「きらら397 」、「ほしのゆ
め」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「マツマ
エ」、「農林１１号」、「北海早生」、「はくちょうも
ち」または「たんねもち」 ii) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ka
salath」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、「巴まさり」、「栄光」または「キヨカゼ」 iii)「Ｆａｎｙ」、「日本晴」または「彩」 iv)「Arroz Da Terra」

【００４７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号６で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００４８】すなわち、配列番号６で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号２８で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号２９で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００４９】このように、配列番号２８にかかわるセン
スプライマーと、配列番号２９にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００５０】配列番号７のＳＳＲマーカー配列番号７（１３ＣＴＴ）で表されるＳＳＲ配列を増幅
遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、
下記ｉ）〜iv) から選ばれるいずれの群の品種であるか
を識別することができる。

【００５１】ｉ）「Kasalath」 ii）「はくちょうもち」または「たんね」 iii)「ほのか224 」、「きらら397 」、「ゆきまる」、
「キタヒカリ」、「キタアケ」、「栄光」、「農林１１
号」または「北海早生」 iv) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ar
roz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「彩」、「ほしの
ゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「巴まさ
り」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、
「農林２０号」、「胆振早生」または「赤毛」

【００５２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号７で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００５３】すなわち、配列番号７で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号３０で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号３１で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００５４】このように、配列番号３０にかかわるセン
スプライマーと、配列番号３１にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００５５】配列番号８のＳＳＲマーカー配列番号８（１１ＴＡＴＣ）で表されるＳＳＲ配列を増
幅遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネ
が、下記ｉ）〜iv) から選ばれるいずれの群の品種であ
るかを識別することができる。

【００５６】ｉ）「Kasalath」 ii）「Italica Livorno 」 iii)「Ｆａｎｙ」、「日本晴」または「彩」 iv) 「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「USSR
22」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、
「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キ
タアケ」、「巴まさり」、「マツマエ」、「キヨカ
ゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１
号」、「北海早生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はく
ちょうもち」または「たんねもち」

【００５７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号８で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００５８】すなわち、配列番号８で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号３２で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号３３で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００５９】このように、配列番号３２にかかわるセン
スプライマーと、配列番号３３にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００６０】配列番号９のＳＳＲマーカー配列番号９（１１ＣＴ）で表されるＳＳＲ配列を増幅遺
伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、下
記ｉ）〜vi) から選ばれるいずれの群の品種であるかを
識別することができる。

【００６１】ｉ）「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Ter
ra」、「USSR22」、「日本晴」、「亀ノ尾」、「ほのか
224 」、「彩」、「はやまさり」、「キタヒカリ」、
「キタアケ」、「はくちょうもち」または「たんねも
ち」 ii)「Kasalath」 iii) 「コシヒカリ」、「きらら397 」、「ほしのゆ
め」、「きたいぶき」、「ゆきまる」、「巴まさり」、
「栄光」、「マツマエ」または「キヨカゼ」 iv)「USSR22」または「農林３３号」、「農林２０
号」、「農林１１号」、「胆振早生」または「赤毛」ｖ)「北海早生」 vi)「Ｆａｎｙ」

【００６２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号９で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００６３】すなわち、配列番号９で表される塩基配列
のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカーと
する場合には、センスプライマーとして、１種または２
種以上の配列番号３４で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態様
として挙げることができる。また、アンチセンスプライ
マーとしては、１種または２種以上の配列番号３５で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００６４】このように、配列番号３４にかかわるセン
スプライマーと、配列番号３５にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００６５】配列番号１０のＳＳＲマーカー配列番号１０（２７ＡＴＡ）で表されるＳＳＲ配列を増
幅遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネ
が、下記ｉ）〜vii)から選ばれるいずれの群の品種であ
るかを識別することができる。

【００６６】ｉ）「Italica Livorno 」または「赤毛」 ii) 「Dunghan Shali 」 iii)「Arroz Da Terra」 iv) 「Ｆａｎｙ」、「Kasalath」、「日本晴」、
「彩」、「キヨカゼ」または「北海早生」 v)「コシヒカリ」、「亀の尾」、「巴まさり」、「マツ
マエ」 vi) 「ほのか224 」または「キタヒカリ」 vii)「USSR22」または「きらら397 」、「ほしのゆ
め」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきま
る」、「キタアケ」、「栄光」、「農林３３号」、「農
林２０号」、「農林１１号」、「胆振早生」、「はくち
ょうもち」または「たんねもち」

【００６７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１０で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００６８】すなわち、配列番号１０で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号３６で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号３７で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００６９】このように、配列番号３６にかかわるセン
スプライマーと、配列番号３７にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００７０】配列番号１１のＳＳＲマーカー配列番号１１（２５ＴＡ）で表されるＳＳＲ配列を増幅
遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、
下記ｉ）〜vii)から選ばれるいずれの群の品種であるか
を識別することができる。

【００７１】ｉ）「Italica Livorno 」、「Arroz Da T
erra」または「Kasalath」 ii) 「Dunghan Shali 」 iii)「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「きらら397
」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「栄光」または「キヨカゼ」 iv) 「USSR22」、「亀の尾」、「ほのか224 」、「マツ
マエ」、「農林３３号」、「農林１１号」、「胆振早
生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」 v)「コシヒカリ」、「ほしのゆめ」または「農林２０
号」 vi) 「北海早生」または「赤毛」 vii)「キタアケ」または「巴まさり」

【００７２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１１で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００７３】すなわち、配列番号１１で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号３８で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号３９で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００７４】このように、配列番号３８にかかわるセン
スプライマーと、配列番号３９にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００７５】配列番号１２のＳＳＲマーカー配列番号１２（５１ＡＴＡ・１０ＡＡＧ）で表されるＳ
ＳＲ配列を増幅遺伝子マーカーとして用いることによ
り、被験イネが、下記ｉ）〜viii) から選ばれるいずれ
の群の品種であるかを識別することができる。

【００７６】ｉ）「Italica Livorno 」 ii）「Dunghan Shali 」、「ほしのゆめ」、「巴まさ
り」または「キヨカゼ」 iii)「Arroz Da Terra」 iv）「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「ほのか224 」、
「彩」または「はやまさり」ｖ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀の尾」、「きら
ら397 」、「きたいぶき」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、「栄光」、「マツマエ」、「農林１１号」、「赤
毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」 vi）「Kasalath」 vii) 「ゆきまる」、「農林３３号」、「農林２０号」
または「胆振早生」 viii)「北海早生」

【００７７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１２で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００７８】すなわち、配列番号１２で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号４０で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号４１で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００７９】このように、配列番号４０にかかわるセン
スプライマーと、配列番号４１にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００８０】配列番号１３のＳＳＲマーカー配列番号１３（１４ＴＡ）で表されるＳＳＲ配列を増幅
遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、
下記ｉ）〜xi) から選ばれるいずれの群の品種であるか
を識別することができる。

【００８１】ｉ）「コシヒカリ」、「ほのか224 」、
「きらら397 」、「きたいぶき」または「はやまさり」 ii) 「Kasalath」 iii) 「Italica Livorno 」 iv) 「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、
「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「キヨカ
ゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早
生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねも
ち」ｖ）「ほしのゆめ」 vi) 「日本晴」または「彩」 vii)「亀の尾」 viii) 「USSR22」 ix) 「Arroz Da Terra」または「農林１１号」ｘ）「Dunghan Shali 」または「北海早生」 xi) 「Ｆａｎｙ」

【００８２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１３で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００８３】すなわち、配列番号１３で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号４２で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号４３で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００８４】このように、配列番号４２にかかわるセン
スプライマーと、配列番号４３にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００８５】配列番号１４のＳＳＲマーカー配列番号１４（１８ＡＴ）で表されるＳＳＲ配列を増幅
遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、
下記ｉ）〜xi) から選ばれるいずれの群の品種であるか
を識別することができる。

【００８６】ｉ）「コシヒカリ」、「ほのか224 」、
「きらら397 」、「きたいぶき」または「はやまさり」 ii) 「Kasalath」 iii) 「Italica Livorno 」 iv) 「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、
「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「キヨカ
ゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早
生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねも
ち」ｖ）「ほしのゆめ」 vi) 「日本晴」または「彩」 vii)「亀の尾」 viii) 「USSR22」 ix) 「Arroz Da Terra」または「農林１１号」ｘ）「Dunghan Shali 」または「北海早生」 xi) 「Ｆａｎｙ」

【００８７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１４で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００８８】すなわち、配列番号１４で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号４４で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号４５で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００８９】このように、配列番号４４にかかわるセン
スプライマーと、配列番号４５にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００９０】配列番号１５のＳＳＲマーカー配列番号１５（２０ＴＡ・２０ＡＧ）で表されるＳＳＲ
配列を増幅遺伝子マーカーとして用いることにより、被
験イネが、下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるいずれの群の品
種であるかを識別することができる。

【００９１】ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」また
は「農林２０号」 ii）「Kasalath」 iii)「Arroz Da Terra」、「Italica Livorno 」または
「日本晴」 iv）「きらら397 」、「ほしのゆめ」または「キタア
ケ」ｖ）「コシヒカリ」または「彩」

【００９２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１５で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００９３】すなわち、配列番号１５で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号４６で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号４７で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００９４】このように、配列番号４６にかかわるセン
スプライマーと、配列番号４７にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【００９５】配列番号１６のＳＳＲマーカー配列番号１６（１６ＡＧ）で表されるＳＳＲ配列を増幅
遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、
下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるいずれの群の品種であるか
を識別することができる。

【００９６】ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」、
「農林２０号」または「日本晴」 ii）「Kasalath」 iii)「Arroz Da Terra」または「Italica Livorno 」 iv）「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「キタアケ」ま
たは「コシヒカリ」ｖ）「彩」

【００９７】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１６で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【００９８】すなわち、配列番号１６で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号４８で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号４９で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【００９９】このように、配列番号４８にかかわるセン
スプライマーと、配列番号４９にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【０１００】配列番号１７のＳＳＲマーカー配列番号１７（１１ＡＧ）で表されるＳＳＲ配列を増幅
遺伝子マーカーとして用いることにより、被験イネが、
下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるいずれの群の品種であるか
を識別することができる。

【０１０１】ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」、
「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「農林２０号」、
「キタアケ」または「コシヒカリ」 ii) 「Kasalath」 iii)「Italica Livorno 」 iv) 「Arroz Da Terra」または「日本晴」ｖ）「彩」

【０１０２】ここでは、配列番号１で表されるＳＳＲマ
ーカーと同様に、増幅を行う鋳型遺伝子である、配列番
号１７で表されるＳＳＲ配列を含む遺伝子領域における
５’末端と３’末端に対して、実質的に相補的な、遺伝
子増幅反応を行うための遺伝子増幅用プライマーを、一
般的な遺伝子増幅用プライマー選択基準に基づき選択す
ることができる。

【０１０３】すなわち、配列番号１７で表される塩基配
列のＳＳＲ配列を含む遺伝子領域を増幅遺伝子マーカー
とする場合には、センスプライマーとして、１種または
２種以上の配列番号５０で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖とすることが好適な態
様として挙げることができる。また、アンチセンスプラ
イマーとしては、１種または２種以上の配列番号５１で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以上
のヌクレオチド鎖とすることを好適な態様として挙げる
ことができる。

【０１０４】このように、配列番号５０にかかわるセン
スプライマーと、配列番号５１にかかわるアンチセンス
プライマーを用いて、イネの遺伝子の増幅を行うことに
より、被験イネの上記品種の別に応じて、異なる塩基長
を与える増幅遺伝子マーカーが得られる。

【０１０５】上述した、特有のイネの品種の組合せを識
別可能な、異なる遺伝子増幅用プライマーを用いた本品
種識別方法を組み合わせて行うことにより、的確に、被
験イネの品種を識別することが可能である。

【０１０６】

【実施例】以下、本発明の実施例を説明する。ただし、
この実施例の記載により、本発明の技術的範囲が限定さ
れるものではない。〔実施例１〕特定ＳＳＲマーカーによるイネの品種の
識別識別対象品種本実施例において、品種識別の対象としたイネは、上述
した日本内外の３０品種である。すなわち、欧州品種：「Italica Livorno 」（ＩＬ）、「Dungha
n Shali 」（ＤＳ）、「Arroz Da Terra」（ＡＤＴ）、
「Ｆａｎｙ」（ＦＡＮＹ）および「USSR22」（Ｕ２２）インド品種「Kasalath」（カサラス）日本品種「きたいぶき」、「はやまさり」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、
「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３
号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早
生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」お
よび「たんねもち」

【０１０７】ＤＮＡ試料の調製上記のイネ品種の品種識別のためのＤＮＡ試料の調製
は、各々のイネの緑葉から、ＣＴＡＢ法により、ＤＮＡ
を抽出した。ここで行ったＣＴＡＢ法は、マーレイ・ト
ンプソン法[Murray,H.G. and Thompson,W.F.(1980)Nucl
eic.Acid Res.8:4321-4325) の改変法であり、各々の緑
葉の凍結組織をホモジネートして、これから、ＤＮＡを
抽出した。このようにして得られた各品種のＤＮＡ試料
を、特定のＳＳＲマーカーを遺伝子増幅するための鋳型
として、下記のＰＣＲ反応を行った。なお、ここでＤＮ
Ａ抽出のために用いたＣＴＡＢ法は、イネ種子に対して
も用いることができる。

【０１０８】遺伝子増幅反応（１）イネゲノム研究プログラムの公開データー（htt
p://rgp.dna.affrc.go.jp）に対して、ＳＳＲ検索ソフ
トウエア「ＳＳＲＩＴ」(http://ars-genome.cornell.e
du/cgi-bin/rice/ssrtool.pl) を用いて、配列番号１〜
１７に示すＳＳＲ配列の情報を得た。次いで、この配列
番号１〜１７記載のＳＳＲ配列近傍の、イネ遺伝子にお
ける塩基配列を基に、このＳＳＲ近傍領域を、ＰＣＲ法
により増幅可能なＰＣＲプライマーを、コンピューター
ソフトウエア「Oligo4.04 」(National Bioscience社
製）を用いて設計し、下記の塩基配列のオリゴヌクレオ
チド（配列番号１８〜５１）を、ＤＮＡシンセサイザー
（System plus ：ベックマン社製）で合成し〔アール・
エル・レンジャー等の方法(R.T.Letsinger,W.B.Lursfor
d,J.Am.Chem.Society.98,3655)に従う〕、これらをＰＣ
Ｒ反応のセンスプライマーまたはアンチセンスプライマ
ーとして用いた。

【０１０９】（２）各ＳＳＲマーカーとセンスプライマ
ーとアンチセンスプライマーの対応関係を、下記に示
す。配列番号１（１０ＴＣ１２ＣＡ）で表されるＳＳＲマー
カー（１０ＴＣと１２ＣＡの間に、他の塩基が入る可能
性あり）センスプライマー：ＣＴＴＧＴＴＡＡＡＴＴＴＣＣＡＴ
ＴＣＣＣ（配列番号１８）アンチセンスプライマー：ＡＴＣＴＣＣＴＴＡＧＣＴＣ
ＡＴＣＡＡＧＣ（配列番号１９）

【０１１０】配列番号２（７ＧＧＡ）で表されるＳＳＲ
マーカーセンスプライマー：ＧＧＣＣＧＧＡＴＣＴＴＴＴＴＴＴ
ＡＧＣＴ（配列番号２０）アンチセンスプライマー：ＧＴＣＡＡＣＴＣＧＡＡＣＣ
ＴＧＣＡＣＡＣ（配列番号２１）

【０１１１】配列番号３（１２ＴＡＴＧ）で表されるＳ
ＳＲマーカーセンスプライマー：ＴＴＡＴＴＧＡＡＴＡＧＧＴＧＴＡ
ＡＧＴＣ（配列番号２２）アンチセンスプライマー：ＡＣＴＡＡＴＣＣＴＡＴＴＧ
ＡＴＴＴＡＧＧ（配列番号２３）

【０１１２】配列番号４（１８ＣＴ）で表されるＳＳＲ
マーカーセンスプライマー：ＧＧＣＣＣＡＧＴＴＧＡＣＡＡＡＣ
ＡＧＧＣ（配列番号２４）アンチセンスプライマー：ＣＡＧＡＧＡＧＣＡＴＣＡＴ
ＧＧＧＣＣＡＧ（配列番号２５）

【０１１３】配列番号５（２１ＧＡ）で表されるＳＳＲ
マーカーセンスプライマー：ＡＴＴＴＧＴＧＴＴＧＣＴＧＣＡＴ
ＧＣＡＧ（配列番号２６）アンチセンスプライマー：ＡＣＴＣＧＡＴＣＴＣＧＴＧ
ＴＧＴＧＣＣＡ（配列番号２７）

【０１１４】配列番号６（１０ＴＣ）で表されるＳＳＲ
マーカーセンスプライマー：ＴＴＡＧＧＴＡＡＡＡＴＴＡＡＧＧ
ＣＡＣＣ（配列番号２８）アンチセンスプライマー：ＴＣＴＧＴＴＧＴＡＧＧＴＧ
ＴＡＧＣＡＧＣ（配列番号２９）

【０１１５】配列番号７（１３ＣＴＴ）で表されるＳＳ
Ｒマーカーセンスプライマー：ＧＡＴＴＧＣＴＣＴＧＣＴＣＡＡＧ
ＴＧＴＡ（配列番号３０）アンチセンスプライマー：ＣＧＡＣＴＴＴＴＴＴＣＡＣ
ＡＧＴＴＣＴＴ（配列番号３１）

【０１１６】配列番号８（１１ＴＡＴＣ）で表されるＳ
ＳＲマーカーセンスプライマー：ＴＧＡＧＴＴＴＧＧＡＧＴＧＡＴＴ
ＧＧＡＴ（配列番号３２）アンチセンスプライマー：ＣＴＣＡＡＡＧＡＡＴＧＡＣ
ＡＣＣＧＡＴＧ（配列番号３３）

【０１１７】配列番号９（１１ＣＴ）で表されるＳＳＲ
マーカーセンスプライマー：ＴＣＴＣＴＣＣＣＡＡＧＴＣＣＣＡ
ＡＴＣＣ（配列番号３４）アンチセンスプライマー：ＣＴＡＡＣＣＧＴＡＧＣＧＣ
ＧＣＴＣＴＣＣ（配列番号３５）

【０１１８】配列番号１０（２７ＡＴＡ）で表されるＳ
ＳＲマーカーセンスプライマー：ＡＴＧＡＴＴＴＣＣＴＡＡＡＴＡＡ
ＡＴＴＡ（配列番号３６）アンチセンスプライマー：ＴＴＴＡＡＡＣＡＣＴＡＧＣ
ＡＡＴＡＴＡＴ（配列番号３７）

【０１１９】配列番号１１（２５ＴＡ）で表されるＳＳ
Ｒマーカーセンスプライマー：ＣＣＴＣＴＴＣＣＣＴＴＣＴＴＧＴ
ＧＴＣＡ（配列番号３８）アンチセンスプライマー：ＧＧＧＡＴＴＴＴＴＴＣＡＴ
ＣＧＡＡＡＴＴ（配列番号３９）

【０１２０】配列番号１２（５１ＡＴＡ・１０ＡＡＧ）
で表されるＳＳＲマーカー（５１ＡＴＡと１０ＡＡＧの
間に、他の塩基が入る可能性あり）センスプライマー：ＡＧＡＧＣＡＴＡＡＣＡＴＣＡＡＡ
ＧＣＣＡ（配列番号４０）アンチセンスプライマー：ＡＴＡＧＣＴＣＣＡＡＴＴＣ
ＧＡＴＣＴＴＣ（配列番号４１）

【０１２１】配列番号１３（１４ＴＡ）で表されるＳＳ
Ｒマーカーセンスプライマー：ＧＡＴＣＣＡＧＧＡＡＡＴＣＧＡＡ
ＣＣＴＣ（配列番号４２）アンチセンスプライマー：ＧＣＡＡＣＴＣＴＧＣＴＡＡ
ＡＣＧＡＡＴＴ（配列番号４３）

【０１２２】配列番号１４（１８ＡＴ）で表されるＳＳ
Ｒマーカーセンスプライマー：ＴＧＴＡＴＧＴＴＧＴＧＴＣＴＧＣ
ＴＡＣＧ（配列番号４４）アンチセンスプライマー：ＧＣＡＡＣＴＣＴＧＣＴＡＡ
ＡＣＧＡＡＴＴ（配列番号４５）

【０１２３】配列番号１５（２０ＴＡ・２０ＡＧ）で表
されるＳＳＲマーカー（２０ＴＡと２０ＡＧの間に、他
の塩基が入る可能性あり）センスプライマー：ＣＣＡＴＡＧＡＧＧＣＣＴＡＣＡＡ
ＧＴＡＴ（配列番号４６）アンチセンスプライマー：ＣＣＡＧＡＴＧＡＴＡＧＡＡ
ＧＡＧＧＴＧＴ（配列番号４７）

【０１２４】配列番号１６（１６ＡＧ）で表されるＳＳ
Ｒマーカーセンスプライマー：ＡＡＡＡＧＣＡＴＡＴＡＧＡＧＧＣ
ＡＣＣＧ（配列番号４８）アンチセンスプライマー：ＡＣＴＣＣＧＴＣＡＧＧＴＴ
ＴＴＣＡＴＣＴ（配列番号４９）

【０１２５】配列番号１７（１１ＡＧ）で表されるＳＳ
Ｒマーカーセンスプライマー：ＧＡＡＡＣＧＡＧＧＴＧＡＡＧＡＧ
ＧＡＡＧ（配列番号５０）アンチセンスプライマー：ＣＴＡＡＴＣＣＡＣＴＣＡＡ
ＴＣＣＴＣＣＣ（配列番号５１）

【０１２６】（３）上述したＳＳＲマーカーと遺伝子増
幅用のセンスプライマーとアンチセンスプライマーの対
応関係に従って、上記（１）に従って調製した、各品種
のイネの緑葉から抽出したＤＮＡを鋳型として、ＰＣＲ
反応を行い、配列番号１〜１７で示すＳＳＲ配列近傍の
遺伝子増幅産物を、それぞれ調製して、被験イネ毎の、
これらの遺伝子増幅産物の塩基長の差異を検出すること
により、イネの品種の識別が可能か否かを検討した。

【０１２７】本例において、ＰＣＲ反応は、ウイリアム
ズ(Williams)らの方法に従い、反応混液を調製し、ジー
ン・アンプＰＣＲ９７００（パーキンエルマー社製）ま
たはｉサイクラー（バイオラッド社製）を用いて、ＤＮ
Ａの増幅を行った[Theor.Apple.Genet.82,489-498(199
0)]。このＰＣＲ反応より得られたＤＮＡ増幅産物の検
出は、ＰＣＲ反応が終了した反応液に、泳動用色素液を
添加し、６％変性ポリアクリルアミドゲルにより、電気
泳動装置(Model S2,Gibco BRL 社製) を用い、９６０Ｖ
で、約３時間通電した。電気泳動終了後、銀染色(Silve
r Sequence、プロメガ社製）により、遺伝子増幅産物を
検出した。

【０１２８】その結果、下記第１表に示すＳＳＲ配列
が、上記の３０品種のイネに対する識別マーカーとして
用いることが可能であることが見出された。

【０１２９】なお、表中におけるＡ〜Ｋのアルファベッ
トは、表に示した各々のＳＳＲマーカーを、各々の被験
イネ品種に対して用いた結果、電気泳動において現れた
バンドを区別するための記号である。例えば、Ｎｏ．１
のＳＳＲマーカーにおいて、共に「Ａ」で示されてい
る、「きたいぶき」と「はやまさり」では、同一のバン
ドが現れたことを意味し、「Ｂ」で示されている「カサ
ラス」や、「Ｃ」で示されている他の品種は、これとは
別の分子量を示すバンドが現れたことを意味している。
また、これらのアルファベットＡ〜Ｋは、同一のＳＳＲ
マーカーにおいて現れる異なるバンドを区別するための
記号であり、例えば、Ｎｏ，１のＳＳＲマーカーの欄に
示されている「Ａ」と、Ｎｏ．２のＳＳＲマーカーの欄
に示されている「Ａ」とは、各々、全く無関係のバンド
を表している。

【０１３０】

【表１】

【０１３１】実施例１において示した１７種類のＳＳＲ
マーカーを用いて、イネの品種識別を、品種毎、また
は、いくつかの品種の組毎に行うことができる。実際
上、これらのＳＳＲマーカーを単独で用いるのみでは、
イネの品種識別の内容として十分でない場合が多い。す
なわち、実施例において示した、異なるイネの品種の識
別機能を有するＳＳＲマーカー同士を組み合わせて用い
ることにより、イネの品種の識別を的確に行うことがで
きる。

【０１３２】すなわち、本発明は、イネの遺伝子におい
て、配列番号１〜１７で表されるＳＳＲ配列を含む塩基
配列から選ばれる１種または２種以上、好ましくは、２
種以上の塩基配列を増幅遺伝子マーカーとして、被験イ
ネの品種を識別するイネの品種の識別方法を提供する発
明であり、このイネの品種の識別方法により、上述の３
０品種のイネを、少なくとも３組以上に識別することが
できる。

【０１３３】〔実施例２〕複数のＳＳＲマーカーを用
いたイネの品種の識別（１）本実施例においては、ＳＳＲマーカーとして、配列番号
１３のＳＳＲマーカー（第１マーカー）、配列番号１１
のＳＳＲマーカー（第２マーカー）、配列番号１２のＳ
ＳＲマーカー（第３マーカー）、配列番号１０のＳＳＲ
マーカー（第４マーカー）、および、配列番号１５のＳ
ＳＲマーカー（第５マーカー）として、イネの品種の識
別を試みた。

【０１３４】上位のマーカー（第１マーカー）から、
下位のマーカー（第５マーカー）へと順番に、これらの
各々のマーカー単独で識別可能な品種については、その
マーカーに止めて、その上位マーカー単独では、単一
品種として識別ができない品種の群について、一つ下位
のマーカー（例えば、第１マーカーの一つ下位のマーカ
ーは、第２のマーカー）について、の作業を行った。

【０１３５】これらとの手順を、第１マーカーから
第５マーカーまで、繰り返し行った結果、第２表に示す
結果が得られた。

【０１３６】

【表２】

【０１３７】第２表に示すように、第１マーカーによ
り、「カサラス」、「ＩＬ」、「ＦＡＮＹ」、「ほしの
ゆめ」、「亀の尾」および「Ｕ２２」を、それぞれ単独
で識別することが可能である。また、第１マーカーの依
存下、第２マーカーにより、「北海早生」、「ＤＳ」、
「ＡＤＴ」、「農林１１号」、「赤毛」、「農林２０
号」、「コシヒカリ」および「ほのか224 」を、それぞ
れ単独で識別することが可能である。また、第１・第２
マーカーの依存下、第３マーカーにより、「キタア
ケ」、「巴まさり」、「キヨカゼ」、「ゆきまる」およ
び「はやまさり」を、それぞれ単独で識別することが可
能である。また、第１〜３マーカーの依存下、「キタヒ
カリ」、「栄光」、「マツマエ」、「はくちょうもち・
たんねもち」の組、および、「農林３３号・胆振早生」
の組を、それぞれ識別することが可能である。また、第
１〜４マーカーの依存下、第５マーカーにより、「きた
いぶき」、「きらら397 」、「日本晴」および「彩」
を、それぞれ単独で識別することが可能である。

【０１３８】〔実施例３〕複数のＳＳＲマーカーを用
いたイネの品種の識別（２）本実施例においては、ＳＳＲマーカーとして、配列番号
１２のＳＳＲマーカー（第１マーカー）、配列番号１１
のＳＳＲマーカー（第２マーカー）、および、配列番号
１５のＳＳＲマーカー（第３マーカー）として、「ほし
のゆめ」、「ゆきまる」、「ほのか224 」、「彩」、
「日本晴」、「きらら397 」、「はくちょうもち」およ
び「コシヒカリ」からなる群において、イネの品種の識
別を試みた。

【０１３９】すなわち、実施例２において示した手順
を、上位のマーカー（第１マーカー）から、下位のマ
ーカー（第３マーカー）へと順番に、繰り返し行った結
果、第３表に示す結果が得られた。

【０１４０】

【表３】

【０１４１】第３表に示すように、第１マーカーによ
り、「ほしのゆめ」および「ゆきまる」を、それぞれ単
独で識別することが可能である。また、第１マーカーの
依存下、第２マーカーにより、「ほのか224 」、「きら
ら397 」、「はくちょうもち」および「コシヒカリ」
を、それぞれ単独で識別することが可能である。また、
第１・第２マーカーの依存下、第３マーカ−により、
「彩」および「日本晴」を、それぞれ単独で識別するこ
とが可能である。

【０１４２】実施例２、３により、本発明により提供さ
れる１７種類のイネ遺伝子のＳＳＲ配列を、それぞれの
品種識別機能に着目して、必要に応じて組み合わせて遺
伝子マーカーとして用いることにより、イネの品種の識
別を行うことができることがわかる。

【０１４３】なお、実際のイネの品種の識別を行う際に
は、上記のＳＳＲマーカーの異なる組を用いた品種識別
を、組み合わせて行い、互いの識別結果を確認すること
により、品種識別の確度を向上させることができる。

【０１４４】

【発明の効果】本発明により、イネの品種識別能に優れ
るＤＮＡマーカーと、これを用いたイネの品種識別手段
が提供される。

【０１４５】

【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> HOKUREN Federation of Agricultural Cooperatives Hokkaido Green-Bio Institute <120> Method of Identification of Variety of Rice Plant <130> PHO8 <140> <141> <160> 51 <170> PatentIn Ver. 2.1 <210> 1 <211> 44 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 1 tctctctctc tctctctctc cacacacaca cacacacaca caca 44 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 2 ggaggaggag gaggaggagg a 21 <210> 3 <211> 48 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 3 tatgtatgta tgtatgtatg tatgtatgta tgtatgtatg tatgtatg 48 <210> 4 <211> 36 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 4 ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctctct 36 <210> 5 <211> 42 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 5 gagagagaga gagagagaga gagagagaga gagagagaga ga 42 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 6 tctctctctc tctctctctc 20 <210> 7 <211> 39 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 7 cttcttcttc ttcttcttct tcttcttctt cttcttctt 39 <210> 8 <211> 44 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 8 tatctatcta tctatctatc tatctatcta tctatctatc tatc 44 <210> 9 <211> 22 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 9 ctctctctct ctctctctct ct 22 <210> 10 <211> 81 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 10 ataataataa taataataat aataataata ataataataa taataataat aataataata 60 ataataataa taataataat a 81 <210> 11 <211> 50 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 11 tatatatata tatatatata tatatatata tatatatata tatatatata 50 <210> 12 <211> 183 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 12 ataataataa taataataat aataataata ataataataa taataataat aataataata 60 ataataataa taataataat aataataata ataataataa taataataat aataataata 120 ataataataa taataataat aataataata ataaagaaga agaagaagaa gaagaagaag 180 aag 183 <210> 13 <211> 28 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 13 tatatatata tatatatata tatatata 28 <210> 14 <211> 36 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 14 atatatatat atatatatat atatatatat atatat 36 <210> 15 <211> 80 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 15 tatatatata tatatatata tatatatata tatatatata agagagagag agagagagag 60 agagagagag agagagagag 80 <210> 16 <211> 32 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 16 agagagagag agagagagag agagagagag ag 32 <210> 17 <211> 22 <212> DNA <213> Oryza sp. <400> 17 agagagagag agagagagag ag 22 <210> 18 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 18 cttgttaaat ttccattccc 20 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 19 atctccttag ctcatcaagc 20 <210> 20 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 20 ggccggatct ttttttagct 20 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 21 gtcaactcga acctgcacac 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 22 ttattgaata ggtgtaagtc 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 23 actaatccta ttgatttagg 20 <210> 24 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 24 ggcccagttg acaaacaggc 20 <210> 25 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 25 cagagagcat catgggccag 20 <210> 26 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 26 atttgtgttg ctgcatgcag 20 <210> 27 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 27 actcgatctc gtgtgtgcca 20 <210> 28 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 28 ttaggtaaaa ttaaggcacc 20 <210> 29 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 29 tctgttgtag gtgtagcagc 20 <210> 30 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 30 gattgctctg ctcaagtgta 20 <210> 31 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 31 cgactttttt cacagttctt 20 <210> 32 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 32 tgagtttgga gtgattggat 20 <210> 33 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 33 ctcaaagaat gacaccgatg 20 <210> 34 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 34 tctctcccaa gtcccaatcc 20 <210> 35 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 35 ctaaccgtag cgcgctctcc 20 <210> 36 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 36 atgatttcct aaataaatta 20 <210> 37 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 37 tttaaacact agcaatatat 20 <210> 38 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 38 cctcttccct tcttgtgtca 20 <210> 39 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 39 gggatttttt catcgaaatt 20 <210> 40 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 40 agagcataac atcaaagcca 20 <210> 41 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 41 atagctccaa ttcgatcttc 20 <210> 42 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 42 gatccaggaa atcgaacctc 20 <210> 43 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 43 gcaactctgc taaacgaatt 20 <210> 44 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 44 tgtatgttgt gtctgctacg 20 <210> 45 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 45 gcaactctgc taaacgaatt 20 <210> 46 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 46 ccatagaggc ctacaagtat 20 <210> 47 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 47 ccagatgata gaagaggtgt 20 <210> 48 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 48 aaaagcatat agaggcaccg 20 <210> 49 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 49 actccgtcag gttttcatct 20 <210> 50 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 50 gaaacgaggt gaagaggaag 20 <210> 51 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Primer <400> 51 ctaatccact caatcctccc 20

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続きＦターム(参考） 4B024 AA07 AA11 CA01 CA20 HA11 4B063 QA13 QA18 QQ04 QQ42 QR08 QR32 QR35 QR40 QR42 QR62 QS16 QS25 QS36 QX01

Claims

【特許請求の範囲】

【請求項１】イネの遺伝子において、配列番号１で表さ
れるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカーと
して、被験イネが、下記ｉ）〜iii)から選ばれるいずれ
の群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「Kasalath」 ii）「きたいぶき」または「はやまさり」 iii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ar
roz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、
「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３
号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早
生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」ま
たは「たんねもち」
【請求項２】配列番号１で表されるＳＳＲ配列を含む遺
伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライマ
ーが、配列番号１８で表されるヌクレオチド鎖の塩基配
列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオチ
ド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１５
〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンスプ
ライマーが、配列番号１９で表されるヌクレオチド鎖の
塩基配列から選ばれる、連続した１５〜３０塩基のヌク
レオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項１
記載のイネの品種の識別方法。
【請求項３】配列番号１で表されるＳＳＲ配列を含む遺
伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライマ
ーが、配列番号１８で表されるヌクレオチド鎖であり、
同アンチセンスプライマーが、配列番号１９で表される
ヌクレオチド鎖である、請求項１記載のイネの品種の識
別方法。
【請求項４】１種または２種以上の配列番号１８で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号１９で表されるヌクレ
オチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０
塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体
の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖、からな
る群から選ばれる、１種または２種以上のヌクレオチド
鎖。
【請求項５】イネの遺伝子において、配列番号２で表さ
れるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカーと
して、被験イネが、下記ｉ）〜iii)から選ばれるいずれ
の群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「Kasalath」 ii）「はくちょうもち」または「たんねもち」 iii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ar
roz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶ
き」、「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカ
リ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツ
マエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０
号」、「農林１１号」、「北海早生」、「胆振早生」ま
たは「赤毛」
【請求項６】配列番号２で表されるＳＳＲ配列を含む遺
伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライマ
ーが、配列番号２０で表されるヌクレオチド鎖の塩基配
列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオチ
ド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１５
〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンスプ
ライマーが、配列番号２１で表されるヌクレオチド鎖の
塩基配列から選ばれる、連続した１５〜３０塩基のヌク
レオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項５
記載のイネの品種の識別方法。
【請求項７】配列番号２で表されるＳＳＲ配列を含む遺
伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライマ
ーが、配列番号２０で表されるヌクレオチド鎖であり、
同アンチセンスプライマーが、配列番号２１で表される
ヌクレオチド鎖である、請求項５記載のイネの品種の識
別方法。
【請求項８】１種または２種以上の配列番号２０で表
されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続し
た１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号２１で表されるヌクレ
オチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０
塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体
の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖、からな
る群から選ばれる、１種または２種以上のヌクレオチド
鎖。
【請求項９】イネの遺伝子において、配列番号３で表さ
れるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカーと
して、被験イネが、下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるいずれ
の群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほの
か224 」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたい
ぶき」、「はやまさり」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「農林
１１号」、「北海早生」、「はくちょうもち」または
「たんねもち」 ii)「Kasalath」 iii) 「Italica Livorno 」または「Arroz Da Terra」 iv)「Dunghan Shali 」ｖ）「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「ゆきま
る」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０
号」、「胆振早生」または「赤毛」
【請求項１０】配列番号３で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２２で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号２３で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項９
記載のイネの品種の識別方法。
【請求項１１】配列番号３で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２２で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号２３で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項９記載のイネの品種
の識別方法。
【請求項１２】１種または２種以上の配列番号２２で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号２３
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項１３】イネの遺伝子において、配列番号４で表
されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカー
として、被験イネが、下記ｉ）〜iv) から選ばれるいず
れの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「ほのか224 」または「はやまさり」 ii)「Kasalath」 iii) 「Italica Livorno 」、「Ｆａｎｙ」、「USSR2
2」、「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀の尾」、
「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶ
き」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、
「巴まさり」、「栄光」、「キヨカゼ」、「農林３３
号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早
生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねも
ち」 iv) 「Dunghan Shali 」または「Arroz Da Terra」
【請求項１４】配列番号４で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２４で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号２５で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項１
３記載のイネの品種の識別方法。
【請求項１５】配列番号４で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２４で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号２５で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項１３記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項１６】１種または２種以上の配列番号２４で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号２５
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項１７】イネの遺伝子において、配列番号５で表
されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカー
として、被験イネが、下記ｉ）〜iv) から選ばれるいず
れの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「Kasalath」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほ
のか224 」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きた
いぶき」、「はやまさり」、「マツマエ」、「農林１１
号」、「北海早生」、「はくちょうもち」または「たん
ねもち」 ii) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ｆ
ａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「ゆきまる」、「キタ
ヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、
「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆
振早生」または「赤毛」 iii)「Arroz Da Terra」 iv) 「USSR22」
【請求項１８】配列番号５で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２６で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号２７で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項１
７記載のイネの品種の識別方法。
【請求項１９】配列番号５で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２６で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号２７で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項１７記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項２０】１種または２種以上の配列番号２６で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号２７
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項２１】イネの遺伝子において、配列番号６で表
されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカー
として、被験イネが、下記ｉ）〜iv) から選ばれるいず
れの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほの
か224 」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたい
ぶき」、「はやまさり」、「マツマエ」、「農林１１
号」、「北海早生」、「はくちょうもち」または「たん
ねもち」 ii) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ka
salath」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、「巴まさり」、「栄光」または「キヨカゼ」 iii) 「Ｆａｎｙ」、「日本晴」または「彩」 iv)「Arroz Da Terra」
【請求項２２】配列番号６で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２８で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号２９で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項２
１記載のイネの品種の識別方法。
【請求項２３】配列番号６で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号２８で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号２９で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項２１記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項２４】１種または２種以上の配列番号２８で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号２９
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項２５】イネの遺伝子において、配列番号７で表
されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカー
として、被験イネが、下記ｉ）〜iv) から選ばれるいず
れの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「Kasalath」 ii）「はくちょうもち」または「たんね」 iii ）「ほのか224 」、「きらら397 」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「栄光」、「農
林１１号」または「北海早生」 iv) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ar
roz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本
晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「彩」、「ほしの
ゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「巴まさ
り」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、
「農林２０号」、「胆振早生」または「赤毛」
【請求項２６】配列番号７で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号３０で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号３１で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項２
５記載のイネの品種の識別方法。
【請求項２７】配列番号７で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号３０で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号３１で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項２５記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項２８】１種または２種以上の配列番号３０で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号３１
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項２９】イネの遺伝子において、配列番号８で表
されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカー
として、被験イネが、下記ｉ）〜iv) から選ばれるいず
れの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「Kasalath」 ii）「Italica Livorno 」 iii ）「Ｆａｎｙ」、「日本晴」または「彩」 iv) 「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「USSR
22」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、
「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キ
タアケ」、「巴まさり」、「マツマエ」、「キヨカ
ゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１
号」、「北海早生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はく
ちょうもち」または「たんねもち」
【請求項３０】配列番号８で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号３２で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号３３で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項２
９記載のイネの品種の識別方法。
【請求項３１】配列番号８で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号３２で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号３３で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項２９記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項３２】１種または２種以上の配列番号３２で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号３３
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項３３】イネの遺伝子において、配列番号９で表
されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカー
として、被験イネが、下記ｉ）〜vi) から選ばれるいず
れの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別方
法。ｉ）「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「USSR
22」、「日本晴」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、
「彩」、「はやまさり」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、はくちょうもち」または「たんねもち」 ii)「Kasalath」 iii) 「コシヒカリ」、「きらら397 」、「ほしのゆ
め」、「きたいぶき」、「ゆきまる」、「巴まさり」、
「栄光」、「マツマエ」または「キヨカゼ」 iv)「USSR22」、「農林３３号」、「農林２０号」、
「農林１１号」、「胆振早生」または「赤毛」ｖ）「北海早生」 vi)「Ｆａｎｙ」
【請求項３４】配列番号９で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号３４で表されるヌクレオチド鎖の塩基
配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオ
チド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１
５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセンス
プライマーが、配列番号３５で表されるヌクレオチド鎖
の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌ
クレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基長
が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項３
３記載のイネの品種の識別方法。
【請求項３５】配列番号９で表されるＳＳＲ配列を含む
遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプライ
マーが、配列番号３４で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号３５で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項３３記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項３６】１種または２種以上の配列番号３４で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号３５
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項３７】イネの遺伝子において、配列番号１０で
表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカ
ーとして、被験イネが、下記ｉ）〜Vii)から選ばれるい
ずれの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別
方法。ｉ）「Italica Livorno 」または「赤毛」 ii) 「Dunghan Shali 」 iii)「Arroz Da Terra」 iv) 「Ｆａｎｙ」、「Kasalath」、「日本晴」、
「彩」、「キヨカゼ」または「北海早生」 v)「コシヒカリ」、「亀の尾」、「巴まさり」または
「マツマエ」 vi) 「ほのか224 」または「キタヒカリ」 vii)「USSR22」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、
「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきまる」、「キ
タアケ」、「栄光」、「農林３３号」、「農林２０
号」、「農林１１号」、「胆振早生」、「はくちょうも
ち」または「たんねもち」
【請求項３８】配列番号１０で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号３６で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号３７で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
３７記載のイネの品種の識別方法。
【請求項３９】配列番号１０で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号３６で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号３７で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項３８記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項４０】１種または２種以上の配列番号３６で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号３７
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項４１】イネの遺伝子において、配列番号１１で
表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカ
ーとして、被験イネが、下記ｉ）〜Vii)から選ばれるい
ずれの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別
方法。ｉ）「Italica Livorno 」、「Arroz Da Terra」または
「Kasalath」 ii) 「Dunghan Shali 」 iii)「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「きらら397
」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきま
る」、「キタヒカリ」、「栄光」または「キヨカゼ」 iv) 「USSR22」または「亀の尾」、「ほのか224 」、
「マツマエ」、「農林３３号」、「農林１１号」、「胆
振早生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」 v)「コシヒカリ」、「ほしのゆめ」または「農林２０
号」 vi) 「北海早生」または「赤毛」 vii)「キタアケ」または「巴まさり」
【請求項４２】配列番号１１で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号３８で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号３９で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
４１記載のイネの品種の識別方法。
【請求項４３】配列番号１１で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号３８で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号３９で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項４１記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項４４】１種または２種以上の配列番号３８で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号３９
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項４５】イネの遺伝子において、配列番号１２で
表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカ
ーとして、被験イネが、下記ｉ）〜viii) から選ばれる
いずれの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識
別方法。ｉ）「Italica Livorno 」 ii) 「Dunghan Shali 」、「ほしのゆめ」、「巴まさ
り」または「キヨカゼ」 iii)「Arroz Da Terra」 iv) 「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「ほのか224 」、
「彩」または「はやまさり」 v)「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀の尾」、「きらら
397 」、「きたいぶき」、「キタヒカリ」、「キタア
ケ」、「栄光」、「マツマエ」、「農林１１号」、「赤
毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」 vi)「Kasalath」 vii) 「ゆきまる」、「農林３３号」、「農林２０号」
または「胆振早生」 viii)「北海早生」
【請求項４６】配列番号１２で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４０で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号４１で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
４６記載のイネの品種の識別方法。
【請求項４７】配列番号１２で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４０で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号４１で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項４６記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項４８】１種または２種以上の配列番号４０で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号４１
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項４９】イネの遺伝子において、配列番号１３ま
たは１４で表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺
伝子マーカーとして、被験イネが、下記ｉ）〜xi) から
選ばれるいずれの群の品種であるかを識別する、イネの
品種の識別方法。ｉ）「コシヒカリ」、「ほのか224 」、「きらら397
」、「きたいぶき」または「はやまさり」 ii) 「Kasalath」 iii) 「Italica Livorno 」 iv) 「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、
「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「キヨカ
ゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早
生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねも
ち」ｖ）「ほしのゆめ」 vi) 「日本晴」または「彩」 vii)「亀の尾」 viii) 「USSR22」 ix) 「Arroz Da Terra」または「農林１１号」ｘ）「Dunghan Shali 」または「北海早生」 xi) 「Ｆａｎｙ」
【請求項５０】配列番号１３で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４２で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号４３で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
４９記載のイネの品種の識別方法。
【請求項５１】配列番号１４で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４４で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号４５で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
４９記載のイネの品種の識別方法。
【請求項５２】配列番号１３で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４２で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号４３で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項４９記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項５３】配列番号１４で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４４で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号４５で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項４９記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項５４】１種または２種以上の配列番号４２で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号４３
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項５５】１種または２種以上の配列番号４４で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号４５
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項５６】イネの遺伝子において、配列番号１５で
表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカ
ーとして、被験イネが、下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるい
ずれの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別
方法。ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」または「農林２０
号」 ii) 「Kasalath」 iii) 「Arroz Da Terra」、「Italica Livorno 」また
は「日本晴」 iv) 「きらら397 」、「ほしのゆめ」または「キタア
ケ」ｖ）「コシヒカリ」または「彩」
【請求項５７】配列番号１５で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４６で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号４７で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
５６記載のイネの品種の識別方法。
【請求項５８】配列番号１５で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４６で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号４７で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項５６記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項５９】１種または２種以上の配列番号４６で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号４７
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項６０】イネの遺伝子において、配列番号１６で
表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカ
ーとして、被験イネが、下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるい
ずれの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別
方法。ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」、「農林２０号」
または「日本晴」 ii) 「Kasalath」 iii) 「Arroz Da Terra」または「Italica Livorno 」 iv) 「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「キタアケ」ま
たは「コシヒカリ」ｖ）「彩」
【請求項６１】配列番号１６で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４８で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号４９で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
６０記載のイネの品種の識別方法。
【請求項６２】配列番号１６で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号４８で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号４９で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項６０記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項６３】１種または２種以上の配列番号４８で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号４９
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。
【請求項６４】イネの遺伝子において、配列番号１７で
表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を増幅遺伝子マーカ
ーとして、被験イネが、下記ｉ）〜ｖ) から選ばれるい
ずれの群の品種であるかを識別する、イネの品種の識別
方法。ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」、「きらら397
」、「ほしのゆめ」、「農林２０号」、「キタアケ」
または「コシヒカリ」 ii) 「Kasalath」 iii) 「Italica Livorno 」 iv) 「Arroz Da Terra」または「日本晴」ｖ）「彩」
【請求項６５】配列番号１７で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号５０で表されるヌクレオチド鎖の塩
基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレ
オチド鎖を５’末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、
１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖であり、同アンチセン
スプライマーが、配列番号５１で表されるヌクレオチド
鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基の
ヌクレオチド鎖を３’末端側に含み、かつ、全体の塩基
長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖である、請求項
６４記載のイネの品種の識別方法。
【請求項６６】配列番号１７で表されるＳＳＲ配列を含
む遺伝子領域の遺伝子増幅産物を得るためのセンスプラ
イマーが、配列番号５０で表されるヌクレオチド鎖であ
り、同アンチセンスプライマーが、配列番号５１で表さ
れるヌクレオチド鎖である、請求項６４記載のイネの品
種の識別方法。
【請求項６７】１種または２種以上の配列番号５０で
表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続
した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５’末端側に含
み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオ
チド鎖、および、１種または２種以上の配列番号５１
で表されるヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連
続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３’末端側に
含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレ
オチド鎖、からなる群から選ばれる、１種または２種以
上のヌクレオチド鎖。