JP2002523049A - Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】 本開示の要旨において、本発明は、Chlamydiaの株(詳細には、C.pneumoniae)による感染により引き起こされた疾患に対して、宿主(ヒトを含む)の核酸(DNAを含む)免疫の方法を提供し、この方法は、Chlamydia pneumoniaeの株のCPN 100111、CPN 100224、CPN 100230、CPN 100231、CPN 100232、CPN 100235、CPN 100394、およびCPN 100395のポリペプチドのいずれかをコードするヌクレオチド配列および宿主においてこれらのポリペプチドのいずれかの発現をもたらすプロモーターを含むベクターを使用する。改変は、本発明の範囲内で可能である (57) [Summary] In the summary of the present disclosure, the present invention provides a method of immunizing a host (including human) for nucleic acid (including DNA) against a disease caused by infection by a strain of Chlamydia (specifically, C. pneumoniae). Provided in the nucleotide sequence and host encoding any of the polypeptides of CPN 100111, CPN 100224, CPN 100230, CPN 100231, CPN 1000023, CPN 100235, CPN 100394, and CPN 100395 of a strain of Chlamydia pneumoniae. A vector is used that contains a promoter that directs the expression of any of these polypeptides. Modifications are possible within the scope of the present invention
Description
【0001】 (関連米国出願) 本特許出願は、1998年8月20日に出願された、米国特許仮出願U.S.
S.N.60/097,187号、同第60/097,188号、同第60/0
97,189号、同第60/097,190号、同第60/097,195号、
同第60/097,196号および同第60/097,197号、ならびに19
98年8月27日に出願されたU.S.S.N.60/097,191号に対す
る優先権を主張する。(Related US Application) This patent application is filed from United States Provisional Application U.S.A. S.
S. N. No. 60 / 097,187, No. 60 / 097,188, No. 60/0
Nos. 97,189, 60 / 097,190, 60 / 097,195,
Nos. 60 / 097,196 and 60 / 097,197, and 19
U.S.A. filed on Aug. 27, 1998 S. S. N. Claim priority to 60 / 097,191.
【0002】 (発明の分野) 本発明は、Chlamydia抗原および対応するDNA分子に関し、これら
は、哺乳動物(例えば、ヒト)におけるChlamydia感染によって引き起
こされる疾患を予防および処置する方法において使用され得る。FIELD OF THE INVENTION [0002] The present invention relates to Chlamydia antigens and corresponding DNA molecules, which can be used in methods of preventing and treating diseases caused by Chlamydia infection in mammals (eg, humans).
【0003】 (発明の背景) クラミジアは、原核生物である。これらは、三層外膜(リポ多糖類およびいく
つかの膜タンパク質を含む)を含む、グラム陰性細菌に対する形態学的および構
造的類似性を示す。クラミジアは、その形態学および独特の発生サイクルによっ
て他の細菌とは区別される。これらは、代謝学的に不活性であるが感染性の細胞
外ステージおよび複製するが非感染性の細胞内ステージからなる独特の二相性ラ
イフサイクルを有する、偏性細胞内寄生生物である。ライフサイクルの複製ステ
ージは、感染した宿主細胞の細胞質から細菌を隔離する膜結合封入体内で起こる
。[0003] Chlamydia are prokaryotes. They show morphological and structural similarities to Gram-negative bacteria, including the outer trilayer (including lipopolysaccharides and some membrane proteins). Chlamydia is distinguished from other bacteria by its morphology and unique developmental cycle. These are obligate intracellular parasites with a unique biphasic life cycle consisting of a metabolically inactive but infectious extracellular stage and a replicating but non-infectious intracellular stage. The replication stage of the life cycle occurs in membrane-bound inclusions that sequester bacteria from the cytoplasm of infected host cells.
【0004】 クラミジアは小さく、そして感受性細胞内でのみ増幅するので、長い間、ウイ
ルスであると考えられていた。しかし、クラミジアは、他の細菌と共通する多く
の特徴を有する:(1)DNAおよびRNAの両方を含む、(2)二分裂によっ
て分裂する、(3)その細胞エンベロープが他のグラム陰性細菌と似ている、(
4)他の細菌のリボソームと類似のリボソームを含む、そして(5)様々な抗生
物質に感受性である。クラミジアは、光学顕微鏡において観察され得、そしてそ
のゲノムは、Escherichia coliゲノムのサイズの約3分の1で
ある。[0004] Chlamydia has long been considered a virus because it is small and only amplifies in susceptible cells. However, chlamydia has many features in common with other bacteria: (1) it contains both DNA and RNA, (2) it divides by dichotomy, and (3) its cell envelope differs from other Gram-negative bacteria. Similar, (
4) contains ribosomes similar to those of other bacteria, and (5) is sensitive to various antibiotics. Chlamydia can be observed under light microscopy, and its genome is about one-third the size of the Escherichia coli genome.
【0005】 クラミジアの多くの異なる株は、トリ、ヒト、および他の哺乳動物から単離さ
れており、これらの株は、宿主範囲、ビルレンス、病原性、および抗原性組成に
基づいて区別され得る。各種内にはDNAの強い相同性が存在するが、驚くべき
ことに、種間での相同性はわずかであり、このことは、長年にわたる進化的分離
を示唆する。[0005] Many different strains of Chlamydia have been isolated from birds, humans, and other mammals, and these strains can be distinguished based on host range, virulence, pathogenicity, and antigenic composition . Although there is strong homology of DNA within each species, surprisingly there is little homology between species, suggesting many years of evolutionary segregation.
【0006】 C.trachomatisは、高程度の宿主特異性を有し、ほとんど完全に
ヒトに限定される;このことは、幅広く変化する重症度の眼の感染および尿生殖
器感染を引き起こす。対照的に、C.psittaci株は、ヒトにおいては稀
であるが、広範な範囲のトリに見出され、そしてまた、野生哺乳動物、家畜哺乳
動物、および研究用哺乳動物において見出され、ここでは、多くの器官の細胞に
おいて増幅する。C. Trachomatis has a high degree of host specificity and is almost completely restricted to humans; this causes widely varying degrees of eye and urogenital infections. In contrast, C.I. Psittaci strains are rare in humans, but are found in a wide range of birds and are also found in wild, domestic and research mammals, where many organs Amplify in cells.
【0007】 C.pneumoniaeは、一般的なヒト病原体であり、もともとは、C.
psittaciのTWAR株として記載されたが、後に、新たな種であると認
識された。C.pneumoniaeは、他のChlamydia種(C.tr
achomatis、C.pecorumおよびC.psittaci)とは、
抗原的、遺伝的、および形態学的に区別される。これは、C.trachoma
tisまたはC.psittaciのいずれかと10%以下のDNA配列相同性
を示し、そしてこれまでのところ、単一株TWARのみからなるようである。C. pneumoniae is a common human pathogen, originally from C.
Although described as a TWAR strain of psittaci, it was later recognized as a new species. C. pneumoniae is another Chlamydia species (C. tr.
achomatis, C.I. pecorum and C.I. psittaci)
It is distinguished antigenically, genetically, and morphologically. This is C.I. trachoma
tis or C.I. It shows no more than 10% DNA sequence homology with any of the psittaci, and so far appears to consist only of a single strain TWAR.
【0008】 C.pneumoniaeは、市中肺炎の一般的な原因であり、Strept
ococcus pneumoniaeおよびMycoplasma pneu
moniaeよりわずかに少ない頻度である。Graystonら、J.Inf
ect.Dis.168:1231(1995);Camposら、Inves
t.Ophthalmol.Vis.Sci.36:1477(1995)(各
々が、本明細書中で参考として援用される)。これはまた、上気道症状および疾
患(気管支炎および副鼻腔炎を含む)を引き起こし得る。例えば、Grayst
onら、J.Infect.Dis.168:1231(1995);Camp
osら、Invest.Ophthalmol.Vis.Sci.36:147
7(1995);Graystonら、J.Infect.Dis.161:6
18(1990);Marrie,Clin.Infect.Dis.18:5
01(1993)を参照のこと。成人集団の大部分(60%を超える)は、C.
pneumoniaeに対する抗体を有し(Wangら、Chlamydial
Infections,Cambridge University Pre
ss,Cambridge,329ページ(1986))、これは、認識されな
かったかまたは無症候性の過去の感染を示す。C. pneumoniae is a common cause of community-acquired pneumonia;
ococcus pneumoniae and Mycoplasma pneu
Slightly less frequent than S. moniae. Grayston et al. Inf
ect. Dis. 168: 1231 (1995); Campos et al., Inves.
t. Ophthalmol. Vis. Sci. 36: 1477 (1995), each of which is incorporated herein by reference. It can also cause upper respiratory symptoms and diseases, including bronchitis and sinusitis. For example, Grayst
on et al. Infect. Dis. 168: 1231 (1995); Camp.
os et al., Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 36: 147
7 (1995); Grayston et al. Infect. Dis. 161: 6
18 (1990); Marrie, Clin. Infect. Dis. 18: 5
01 (1993). The majority (> 60%) of the adult population is C.I.
pneumoniae (Wang et al., Chlamydial)
Infections, Cambridge University Pre
ss, Cambridge, p. 329 (1986)), which indicates an unrecognized or asymptomatic past infection.
【0009】 C.pneumoniae感染は、通常、急性呼吸性疾患(すなわち、咳、咽
喉炎、嗄声、および熱;聴診時の異常な胸部音)として現れる。ほとんどの患者
について、咳は、2〜6週間持続し、そして回復は遅い。これらの症例の約10
%において、上気道感染の後に、気管支炎および肺炎が続く。さらに、C.pe
numoniaeの流行の間、続く肺炎球菌との同時感染は、これらの肺炎患者
(特に衰弱者および高齢者)の約半分において記載されてきた。上記のように、
C.pneumoniae感染はまた、呼吸性感染とは異なる疾患に関連すると
いう一層多くの証拠が存在する。C. Pneumoniae infection usually manifests as an acute respiratory disorder (ie, cough, sore throat, hoarseness, and fever; abnormal chest sounds at auscultation). For most patients, cough persists for 2-6 weeks and recovery is slow. About 10 of these cases
In%, upper respiratory tract infection is followed by bronchitis and pneumonia. Further, C.I. pe
During the numoniae epidemic, subsequent coinfection with pneumococci has been described in about half of these pneumonia patients, especially the debilitated and elderly. As described above,
C. There is more evidence that pneumoniae infection is also associated with diseases different from respiratory infections.
【0010】 生物についてのリザーバーは、おそらくヒトである。C.psittaci感
染とは対照的に、トリまたは動物リザーバーは知られていない。伝播は、明確に
は規定されていない。これは、分泌物との直接接触、formites、または
空気媒介性伝播から生じ得る。潜伏期間は長く、これは、何ヶ月も続き得る。流
行の分析に基づくと、C.pneumoniaeは、集団を通じてゆっくりと(
場合によって、平均30日間隔)伝播するようである。なぜなら、感染した人々
は、生物の非能率的な伝播者であるからである。C.pneumoniaeに対
する感受性は普遍的である。再感染は、小児の一次感染に続いて、成人期の間に
起こる。C.pneumoniaeは、世界中で、増加した発生数(流行)の重
なった間隔(2〜3年間持続する)が注目される風土病であるようである。C.
trachomatis感染は、C.pneumoniaeに対する交叉免疫性
を付与しない。感染は、経口抗生物質(テトラサイクリンまたはエリスロマイシ
ン)で容易に処置される(少なくとも10〜14日間、2g/日)。近年開発さ
れた薬物であるアジスロマイシンは、クラミジア感染に対する単回投薬治療とし
て非常に効果的である。[0010] The reservoir for an organism is probably a human. C. In contrast to psittaci infection, no bird or animal reservoir is known. Propagation is not explicitly defined. This can result from direct contact with secretions, formats, or air-borne transmission. The incubation period is long, which can last for months. Based on epidemic analysis, C.I. pneumoniae slowly grows throughout the population (
In some cases (average 30-day intervals). Because infected people are inefficient spreaders of living things. C. Susceptibility to pneumoniae is universal. Reinfection occurs during adulthood, following the primary infection in children. C. Pneumoniae appears to be endemic throughout the world, with overlapping intervals (lasting 2-3 years) of increased incidence (epidemic). C.
Trachomatis infection is C. trachomatis infection. It does not confer cross immunity against Pneumoniae. Infections are easily treated with oral antibiotics (tetracycline or erythromycin) (2 g / day) for at least 10-14 days. Azithromycin, a recently developed drug, is very effective as a single-dose treatment for chlamydial infections.
【0011】 ほとんどの場合において、C.pneumoniae感染は軽度であり、かつ
合併症を伴わず、そして感染の90%までは、亜急性であるかまたは認識されな
い。先進工業国の小児の間では、感染は、5歳までは珍しいと考えられてきたが
、近年の研究は、この年齢群の多くの子供が、セロネガティブであるにもかかわ
らず、感染のPCR証拠を示し、そして2〜4歳で17〜19%の有病率と推定
することを報告している。Normannら、Acta Paediatric
a,87:23−27(1998)を参照のこと。開発途上国において、若年の
小児の間のC.pneumoniaeの血清有病率(seroprevalen
ce)は上昇し、そしてC.pneumoniaeが、世界の熱帯地域において
、乳児および小児についての急性下気道疾患および死亡率の重要な原因であり得
ると疑われる。In most cases, C.I. Pneumoniae infection is mild and uncomplicated, and up to 90% of infections are subacute or unrecognized. Although infections have been considered uncommon among children in industrialized nations up to the age of five, recent studies have shown that many children in this age group, despite being seronegative, were not It shows evidence and reports an estimated prevalence of 17-19% at 2-4 years. Normann et al., Acta Paediatric
a, 87: 23-27 (1998). In developing countries, C.I. pneumoniae serum prevalence (seroprevalen)
ce) rises and C.I. It is suspected that pneumoniae may be an important cause of acute lower respiratory illness and mortality for infants and children in tropical regions of the world.
【0012】 血清有病率の研究および局所流行の研究から、最初のC.pneumonia
e感染は、通常、5歳と20歳との間に起こる。例えば、米国では、C.pne
umoniaeによって引き起こされる小児期の肺炎は、毎年30,000症例
であると推定される。感染は、小児または若年成人の群(例えば、学童または徴
兵)の間で集団化し得る。[0012] From studies of serum prevalence and studies of local epidemics, the first C. pneumonia
e-infection usually occurs between the ages of 5 and 20 years. For example, in the United States, C.I. pne
Childhood pneumonia caused by Umoniae is estimated to be 30,000 cases each year. Infections can be clustered among groups of children or young adults (eg, school children or conscripts).
【0013】 C.pneumoniaeは、市中下気道感染の10〜25%を引き起こす(
スウェーデン、イタリア、フィンランド、および米国から報告されるように)。
流行の間、C.pneumonia感染は、肺炎の症例の50〜60%を計上し
得る。これらの期間の間、また、S.pneumoniaeとの混合感染のより
多くの発症が報告されている。C. pneumoniae causes 10-25% of community-acquired lower respiratory tract infections (
As reported by Sweden, Italy, Finland, and the United States).
During the epidemic, C.I. Pneumonia infection can account for 50-60% of cases of pneumonia. During these periods, and More onset of co-infection with Pneumoniae has been reported.
【0014】 成人期の間の再感染は一般的である;臨床的症状は、より軽度である傾向であ
る。集団血清有病率研究に基づいて、年齢とともに暴露が増加する傾向にあり、
これは、特に、男性の間で明白である。何人かの研究者は、持続性無症候C.p
neumoniae感染状態が一般的であると推測した。Reinfection during adulthood is common; clinical symptoms tend to be milder. Exposure tends to increase with age based on population serum prevalence studies,
This is especially evident among men. Some investigators report persistent asymptomatic C.I. p
neumoniae infection was presumed to be common.
【0015】 中年またはそれ以上の成人では、C.pneumoniae感染は、慢性気管
支炎および副鼻腔炎に進行し得る。米国での研究は、60歳未満のヒトにおいて
C.pneumoniaeによって引き起こされる肺炎の発生数が、1症例/1
,000人/年であることを明らかにした;しかし高齢者においては、この疾患
の発生数は、3倍に上昇した。C.pneumoniae感染は、内在する疾病
を有する患者を除いて、入院をもたらすのは稀である。In middle-aged or older adults, C.I. Pneumoniae infection can progress to chronic bronchitis and sinusitis. Studies in the United States have shown that C. in humans younger than 60 years. pneumoniae caused pneumonia 1 case / 1
2,000 / year; however, in the elderly, the incidence of the disease has tripled. C. Pneumoniae infection rarely results in hospitalization except in patients with underlying disease.
【0016】 非常に重要な点は、アテローム性動脈硬化症とC.pneumoniae感染
の関連である。C.pneumoniaeの以前の感染と、心臓発作、冠状動脈
疾患および頸動脈疾患の相関を示すいくつかの疫学研究が存在する。Saikk
uら、Lancet 2:983(1988);Thomら、JAMA 268
:68(1992);Linnanmakiら、Circulation 87
:1030(1993);Saikkuら、Annals Int.Med.1
16:273(1992);Melnickら、Am.J.Med.95:49
9(1993)を参照のこと。さらに、この生物は、冠状動脈および冠状大動脈
、頸動脈および頸大動脈、末梢動脈および末梢大動脈の、アテロームおよび脂肪
線条において検出されている。Shorら、South African Me
d.J.82:158(1992);Kuoら、J.Infect.Dis.1
67:841(1993);Kuoら、Arteriosclerosis a
nd Thrombosis 13:1500(1993);Campbell
ら、J.Infect.Dis.172:585(1995);Chiuら、C
irculation 96:2144−2148(1997)を参照のこと。
生存可能なC.pneumoniaeは、冠状動脈および頸動脈から回収されて
いる。Ramirezら、Annals Int.Med.125:979(1
996);Jacksonら、Abst.K121、272頁、第36回ICA
AC、New Orleans(1996)。さらに、C.pneumonia
eは、ウサギモデルにおけるアテローム性動脈硬化症の変化を誘導し得ることが
示されている。Fongら、(1997)Journal of Clinic
al Microbiology 35:48を参照のこと。まとめると、これ
らの結果は、C.pneumoniaeはヒトにおいてアテローム性動脈硬化症
を引き起こし得る蓋然性が高いが、クラミジアアテローム性動脈硬化症の疫学的
重要性が実証されないままであることを示す。Of great importance are atherosclerosis and C. cerevisiae. pneumoniae infection. C. There are several epidemiological studies that correlate previous infections with pneumoniae with heart attacks, coronary artery disease and carotid artery disease. Saikk
u et al., Lancet 2: 983 (1988); Thom et al., JAMA 268.
: 68 (1992); Linnanmaki et al., Circulation 87.
: 1030 (1993); Saikku et al., Annals Int. Med. 1
16: 273 (1992); Melnick et al., Am. J. Med. 95:49
9 (1993). In addition, the organism has been detected in the atheroma and adipose striatum of the coronary arteries and coronary aorta, carotid artery and carotid aorta, peripheral arteries and peripheral aorta. Shor et al., South Africa Me
d. J. 82: 158 (1992); Kuo et al. Infect. Dis. 1
67: 841 (1993); Kuo et al., Arteriosclerosis a.
nd Thrombosis 13: 1500 (1993); Campbell
J. et al. Infect. Dis. 172: 585 (1995); Chiu et al., C.
irculation 96: 2144-2148 (1997).
Viable C.I. pneumoniae has been recovered from the coronary and carotid arteries. Ramirez et al., Annals Int. Med. 125: 979 (1
996); Jackson et al., Abst. K121, 272 pages, 36th ICA
AC, New Orleans (1996). Further, C.I. pneumonia
e has been shown to be able to induce changes in atherosclerosis in a rabbit model. Fong et al., (1997) Journal of Clinic.
See al Microbiology 35:48. Taken together, these results indicate that C.I. Although pneumoniae is likely to cause atherosclerosis in humans, it shows that the epidemiological significance of chlamydia atherosclerosis remains unproven.
【0017】 近年の多数の研究はまた、C.pneumoniae感染とぜん息との間の関
連を示している。感染は、ぜん鳴、ぜん息性気管支炎、成人発症ぜん息、および
成人におけるぜん息の急性再燃に関連しており、そして小さな規模の研究は、持
続した抗生物質処置が、何人かの個体における疾患の重症度を大きく減少させる
に有効であることを示した。Hahnら、Ann Allergy Asthm
a Immunol.80:45−49(1998);Hahnら、Epide
miol Infect.117:513−517(1996);Bjorns
sonら、Scand J Infect Dis.28:63−69(199
6);Hahn,J.Fam.Pract.41:345−351(1995)
;Allegraら、Eur.Respir.J.7:2165−2168(1
994);Hahnら、JAMA 266:225−230(1991)。A number of recent studies have also described C.I. Figure 2 shows an association between pneumoniae infection and asthma. Infection is associated with asthma, asthmatic bronchitis, adult-onset asthma, and acute relapse of asthma in adults, and small-scale studies suggest that sustained antibiotic treatment may result in severe disease in some individuals. It was shown to be effective in greatly reducing the degree. Hahn et al., Ann Allergy Asthm.
a Immunol. 80: 45-49 (1998); Hahn et al., Epide.
miol Infect. 117: 513-517 (1996); Bjorns.
Son et al., Scan J Infect Dis. 28: 63-69 (199
6); Hahn, J .; Fam. Pract. 41: 345-351 (1995)
Allegra et al., Eur. Respir. J. 7: 2165-2168 (1
994); Hahn et al., JAMA 266: 225-230 (1991).
【0018】 これらの結果に照らして、C.pneumoniae感染によって引き起こさ
れる疾患に対する防御的ワクチンは、かなり重要である。ヒトのC.pneum
oniae感染に有効なワクチンはまだ存在しない。にもかかわらず、C.tr
achomatisおよびC.psittaciを用いた研究は、このことが、
達成可能な目的であることを示す。例えば、C.trachomatisの肺感
染から回復したマウスは、続く膣チャレンジによって誘導される不妊症から保護
される。Palら、Infection and Immunity 64:5
341(1996)。同様に、不活化C.psittaciで免疫したヒツジは
、続くクラミジア誘導性流産および死産から保護された。Jonesら、Vac
cine 13:715(1995)。クラミジア感染からの保護は、Th1免
疫応答、特にINFγ産生CD4+T細胞の誘導と関連している。Igiets
emesら、Immunology 5:317(1993)。CD4+細胞株
またはクローンの、ヌードマウスまたはSCIDマウスへの養子性移入は、チャ
レンジからの保護を付与するか、または慢性疾患を一掃し(Igietseme
ら、Regional Immunology 5:317(1993);Ma
geeら、Regional Immunology 5:305(1992)
、そしてインビボでのCD4+T細胞の枯渇は、チャレンジ後の疾患を悪化させ
た(Landersら、Infection&Immunity 59:377
4(1991);Mageeら、Infection&Immunity 63
:516(1995))。しかし、粘膜表面の中和抗体の十分な高力価の存在は
また、保護効果を発揮し得る。Cotterら、Infection and
Immunity 63:4704(1995)。In light of these results, C.I. Protective vaccines against diseases caused by pneumoniae infection are of considerable importance. Human C. pneum
There is still no effective vaccine for oniae infection. Nevertheless, C.I. tr
achomatis and C.I. Studies using psittaci have shown that
Indicates a achievable goal. For example, C.I. Mice recovered from pulmonary infection with Trachomatis are protected from infertility induced by subsequent vaginal challenge. Pal et al., Infection and Immunity 64: 5.
341 (1996). Similarly, inactivated C.I. Sheep immunized with psittaci were protected from subsequent Chlamydia-induced abortion and stillbirth. Jones et al., Vac
cine 13: 715 (1995). Protection from Chlamydia infection is associated with a Th1 immune response, particularly the induction of INFγ-producing CD4 + T cells. Igies
emes et al., Immunology 5: 317 (1993). Adoptive transfer of CD4 + cell lines or clones to nude or SCID mice confers protection from challenge or eliminates chronic disease (Igietseme).
Et al., Regional Immunology 5: 317 (1993); Ma.
gee et al., Regional Immunology 5: 305 (1992).
And depletion of CD4 + T cells in vivo exacerbated disease following challenge (Landers et al., Infection & Immunity 59: 377).
4 (1991); Magee et al., Infection & Immunity 63.
: 516 (1995)). However, the presence of sufficiently high titers of neutralizing antibodies on mucosal surfaces can also exert a protective effect. Cotter et al., Infection and
Immunity 63: 4704 (1995).
【0019】 C.pneumoniae種内の抗原多様性の程度は、十分には特徴付けられ
ていない。C.trachomatisの血液型亜型は、主要な外膜タンパク質
(MOMP)における抗原多様性に基づいて定義されるが、公開されたC.pn
eumoniaeのMOMP遺伝子配列は、生物のいくつかの多様な単離体の間
の変動を示さない。Campbellら、Infection and Imm
unity 58:93(1990);McCaffertyら、Infect
ion and Immunity 63:2387−9(1995);Knu
dsenら、Third Meeting of the European
Society for Chlamydia Research,Vienn
a(1996)を参照のこと。他のクラミジアのMOMPにおいて保存されてい
ることが公知のタンパク質の領域は、C.pneumoniaeにおいて保存さ
れている。Campbellら、Infection and Immunit
y 58:93(1990);McCaffertyら、Infection
and Immunity 63:2387−9(1995)を参照のこと。あ
る研究は、通常の分子量より大きなMOMPを有するC.pneumoniae
の株を記載したが、その遺伝子は、配列決定されていない。Graystonら
、J.Infect.Dis.168:1231(1995)。9の多様な単離
体からの外膜タンパク質2の部分配列はもまた、普遍であることが見出された。
Ramirezら、Annals Int.Med.125:979(1996
)。HSP60およびHSP70についての遺伝子は、予期されたように、他の
クラミジア種からの変動をほとんど示さない。76kDaの抗原をコードする遺
伝子は、C.pneumoniaeの単一株からクローニングされている。これ
は他の既知のクラミジア遺伝子との有意な類似性を有しない。Marrie,C
lin.Infect.Dis.18:501(1993)。C. The degree of antigenic diversity within the Pneumoniae species is not well characterized. C. Trachomatis serovars are defined based on antigenic diversity in major outer membrane proteins (MOMPs), but have been published by C. trachomatis. pn
The E. moniae MOMP gene sequence does not show variability among several diverse isolates of the organism. Campbell et al., Infection and Imm.
unity 58:93 (1990); McCafferty et al., Infect.
ion and Immunity 63: 2387-9 (1995); Knu
dsen et al., Third Meeting of the European.
Society for Chlamydia Research, Vienna
a (1996). Regions of the protein known to be conserved in other Chlamydia MOMPs are described in pneumoniae. Campbell et al., Infection and Immunity.
y 58:93 (1990); McCafferty et al., Infection.
and Immunity 63: 2387-9 (1995). Certain studies have shown that C.P. pneumoniae
But the gene has not been sequenced. Grayston et al. Infect. Dis. 168: 1231 (1995). The partial sequence of outer membrane protein 2 from 9 diverse isolates was also found to be universal.
Ramirez et al., Annals Int. Med. 125: 979 (1996)
). The genes for HSP60 and HSP70 show little variation from other Chlamydia species, as expected. The gene encoding the 76 kDa antigen is C. pneumoniae has been cloned from a single strain. It has no significant similarity to other known chlamydia genes. Marrie, C
lin. Infect. Dis. 18: 501 (1993).
【0020】 C.pneumoniaeに対する免疫血清によって認識される多くの抗原は
、全てのクラミジアにわたって保存されているが、98kDa、76kDaおよ
び54kDaのタンパク質は、C.pneumoniae特異的であり得る。C
amposら、Invest.Ophthalmol.Vis.Sci.36:
1477(1995);Marrie,Clin.Infect.Dis.18
:501(1993);Wiedmann−Al−Ahmadら、Clin.D
iagn.Lab.Immunol.4:700−704(1997)。患者か
らの血清を用いた単離体のイムノブロッティングは、単離体間のブロッティング
パターンの変動を示し、このことは、C.pneumoniae血清型が存在し
得ることを示す。Graystonら、J.Infect.Dis.168:1
231(1995);Ramirezら、Annals Int.Med.12
5:979(1996)。しかし、結果は、患者の感染状態によって混乱する可
能性がある。なぜなら、患者の血清のイムノブロットプロフィールは、感染後の
時間とともに変化するからである。任意の血清型の数および相対頻度の評価、な
らびに抗原の決定は未だ可能ではない。C. Many antigens recognized by immune sera against P. pneumoniae are conserved across all Chlamydia, but 98 kDa, 76 kDa, and 54 kDa proteins are C. pneumoniae. pneumoniae-specific. C
ampos et al., Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 36:
1477 (1995); Marrie, Clin. Infect. Dis. 18
: 501 (1993); Wiedmann-Al-Ahmad et al., Clin. D
iagn. Lab. Immunol. 4: 700-704 (1997). Immunoblotting of isolates with serum from patients showed a variation in the blotting pattern between the isolates, pneumoniae serotype may be present. Grayston et al. Infect. Dis. 168: 1
231 (1995); Ramirez et al., Annals Int. Med. 12
5: 979 (1996). However, the results can be confused by the infection status of the patient. This is because the immunoblot profile of the patient's serum changes over time after infection. Evaluation of the number and relative frequency of any serotype and determination of antigen is not yet possible.
【0021】 従って、Chlamydia感染を予防、処置および診断するために有効な組
成物の必要性が残存する。Thus, there remains a need for compositions that are effective for preventing, treating, and diagnosing Chlamydia infection.
【0022】 (発明の要旨) 1つの局面において、本発明は、Chlamydiaコードする、精製および
単離されたDNA分子を提供し、これらは、Chlamydia感染を予防、処
置および診断するための方法において使用され得る。本発明は、8つの別の好ま
しいDNA分子(各々、個別かつ別々に、配列番号1、3、5、7、9、11、
13、または15により規定される)を提供する。さらに、8つの別の好ましい
ポリペプチド(各々、個別かつ別々に、配列番号2、4、6、8、10、12、
114、または16により規定される)が本発明において提供される。当業者は
、本発明がまた、本明細書中に記載されるような非必須アミノ酸の付加、欠失ま
たは置換から生じる、このようなポリペプチドの変異体、改変体および誘導体を
コードするDNA分子を含むことを理解する。本発明はまた、本発明のDNA分
子に対応する、RNA分子を含む。SUMMARY OF THE INVENTION In one aspect, the present invention provides Chlamydia-encoded, purified and isolated DNA molecules, which are used in methods for preventing, treating, and diagnosing Chlamydia infection. Can be done. The present invention provides eight additional preferred DNA molecules (each individually and separately, SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11,
13 or 15). In addition, eight other preferred polypeptides (each individually and separately, SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12,
114, or 16) are provided in the present invention. Those skilled in the art will appreciate that the present invention also provides for DNA molecules encoding variants, variants and derivatives of such polypeptides, which result from the addition, deletion or substitution of non-essential amino acids as described herein. Understand that it includes. The present invention also includes RNA molecules corresponding to the DNA molecules of the present invention.
【0023】 DNA分子およびRNA分子に加え、本発明は、その対応するポリペプチドお
よびこのようなポリペプチドに特異的に結合する単一特異的抗体を含む。In addition to DNA and RNA molecules, the invention includes its corresponding polypeptide and monospecific antibodies that specifically bind to such a polypeptide.
【0024】 本発明は、広範な適用を有し、そして発現カセット、発現ベクター、および本
発明のポリヌクレオチドで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を含む。
従って、本発明は、以下を提供する:(i)組換え宿主系において本発明のポリ
ペプチドを産生する方法、ならびに関連する発現カセット、発現ベクター、およ
び形質転換またはトランスフェクトされた細胞を産生する方法;(ii)本発明
のポリヌクレオチドを含む、生ワクチンベクター(例えば、ウイルス性または細
菌性の生ワクチンベクター(ポックスウイルスベクター、アルファウイルスベク
ター、Salmonella typhimuriumベクター、またはVib
rio choleraeベクターを含む))(このようなワクチンベクターは
、希釈剤またはキャリア、および関連する薬学的組成物ならびに関連する治療方
法および/または予防方法と組み合わせて、例えば、Chlamydia感染を
予防および処置するために有用である。);(iii)本発明のRNA分子また
はDNA分子(裸の形態または送達ビビクルとの処方形態のいずれか)、本発明
のポリペプチドまたはポリペプチドの組み合わせ、あるいは単一特異的抗体、お
よび関連する薬学的組成物の投与を含む、治療方法および/または予防方法;(
iv)本発明のDNA分子またはRNA分子、単一特異的抗体、あるいはポリペ
プチドの使用を含み得る、生物学的サンプルにおけるChlamydiaの存在
を診断するための方法;および(v)抗体ベースのアフィニティークロマトグラ
フィーによって本発明のポリペプチドを精製する方法。The present invention has a wide range of applications and includes expression cassettes, expression vectors, and cells transformed or transfected with a polynucleotide of the present invention.
Accordingly, the invention provides: (i) a method of producing a polypeptide of the invention in a recombinant host system, and related expression cassettes, expression vectors, and producing transformed or transfected cells. (Ii) a live vaccine vector (eg, a viral or bacterial live vaccine vector (eg, a poxvirus vector, an alphavirus vector, a Salmonella typhimurium vector, or a Vib) comprising the polynucleotide of the present invention;
rio cholerae vectors)) (such vaccine vectors, in combination with diluents or carriers, and associated pharmaceutical compositions and associated methods of treatment and / or prevention, for example, to prevent and treat Chlamydia infections). (Iii) an RNA or DNA molecule of the invention (either in naked form or formulated with a delivery vehicle), a polypeptide or combination of polypeptides of the invention, or monospecific. Therapeutic and / or prophylactic methods, including the administration of a specific antibody and a related pharmaceutical composition; (
iv) a method for diagnosing the presence of Chlamydia in a biological sample, which may involve the use of a DNA or RNA molecule, a monospecific antibody, or a polypeptide of the invention; and (v) an antibody-based affinity chromatograph. A method for purifying a polypeptide of the invention by chromatography.
【0025】 (発明の詳細な説明) C.pneumoniaeゲノムにおいて、クラミジアポリペプチドをコード
するオープンリーディングフレーム(ORF)が同定されている。これらのポリ
ペプチドは、細菌の膜構造において恒久的に見出されるポリペプチド、細菌の膜
の外部近傍に存在するポリペプチドを含み、封入膜構造に恒久的に見出されるポ
リペプチド、封入膜の外部近傍に存在するポリペプチド、および感染細胞の細胞
質内に放出されるポリペプチドを含む。これらのポリペプチドは、Chlamy
dia感染を予防および処置するためのワクチン接種方法において使用され得る
。(Detailed Description of the Invention) In the pneumoniae genome, an open reading frame (ORF) encoding a Chlamydia polypeptide has been identified. These polypeptides include those that are permanently found in the bacterial membrane structure, those that are located near the exterior of the bacterial membrane, those that are permanently found in the encapsulated membrane structure, And polypeptides released into the cytoplasm of infected cells. These polypeptides are available from Chlamy.
dia infections can be used in vaccination methods to prevent and treat.
【0026】 本発明の第1の局面に従って、Chlamydiaポリペプチドの前駆体およ
び成熟形態をコードする、単離されたポリヌクレオチドが提供される。According to a first aspect of the present invention there is provided an isolated polynucleotide encoding a precursor and mature form of a Chlamydia polypeptide.
【0027】 本発明の単離されたポリヌクレオチドは、Chlamydiaアミノ酸配列に
相同なアミノ酸配列、配列番号2、4、6、8、10、12、14、または16
に示されるようなアミノ酸配列からなる群より選択されるChlamydiaア
ミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする。The isolated polynucleotide of the invention has an amino acid sequence homologous to the Chlamydia amino acid sequence, SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, or 16
Encodes a polypeptide having a Chlamydia amino acid sequence selected from the group consisting of the amino acid sequences shown in Table 1.
【0028】 用語「単離されたポリヌクレオチド」は、その天然に存在する環境から取り出
されたポリヌクレオチドとして定義される。例えば、細菌のゲノムに存在する、
天然に存在するDNA分子は、単離されていないが、例えば、クローニング事象
(増幅)の結果として、細菌ゲノムの残りの部分から分離されたそのDNA分子
は、単離されている。代表的には、単離されたDNA分子は、それが天然に存在
するゲノムにおいて5’末端または3’末端においてすぐに連続するDNA領域
(例えば、コード領域)を含まない。このような単離されたポリヌクレオチドは
、ベクターまたは組成物の一部であり得、そしてなお、このようなベクターまた
は組成物が、その天然の環境の一部ではないという点で単離されている。The term “isolated polynucleotide” is defined as a polynucleotide that has been removed from its naturally occurring environment. For example, in the bacterial genome,
A naturally occurring DNA molecule has not been isolated, but has been isolated, for example, as a result of a cloning event (amplification), from the rest of the bacterial genome. Typically, an isolated DNA molecule does not contain a DNA region (eg, a coding region) that is immediately contiguous at the 5 ′ end or 3 ′ end in the genome where it naturally occurs. Such an isolated polynucleotide may be part of a vector or composition, and still be isolated in that such a vector or composition is not part of its natural environment. I have.
【0029】 本発明のポリヌクレオチドは、RNAまたはDNA(例えば、cDNA、ゲノ
ムDNA、または合成DNA)の形態、あるいはその改変体または組み合わせで
あり得る。DNAは、二本鎖または一本鎖であり得、そして一本鎖である場合、
コード鎖または非コード(アンチセンス)鎖であり得る。配列番号2、4、6、
8、10、12、14、または16に示されるような本発明のポリペプチドをコ
ードする配列は、(a)配列番号1、3、5、7、9、11、13および15の
いずれかに示されるようなコード配列;(b)(a)の転写によって誘導される
リボヌクレオチド配列;あるいは(c)異なるコード配列であり得;この後者は
、遺伝コードの重複性または縮重性の結果として、ヌクレオチド配列が配列番号
1、3、5、7、9、11、13および15に示されるDNA分子と同じポリペ
プチドをコードする。The polynucleotide of the present invention may be in the form of RNA or DNA (eg, cDNA, genomic DNA, or synthetic DNA), or a variant or combination thereof. DNA can be double-stranded or single-stranded, and if single-stranded,
It can be the coding strand or the non-coding (antisense) strand. SEQ ID NOs: 2, 4, 6,
The sequence encoding the polypeptide of the present invention as shown in 8, 10, 12, 14, or 16 comprises (a) any of SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 and 15 A coding sequence as indicated; (b) a ribonucleotide sequence induced by the transcription of (a); or (c) a different coding sequence; the latter as a result of the redundancy or degeneracy of the genetic code. Encodes the same polypeptide as the DNA molecule whose nucleotide sequence is set forth in SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, and 15.
【0030】 「相同アミノ酸配列」とは、配列番号2、4、6、8、10、12、14また
は16に示されるアミノ酸配列と、1以上の保存的アミノ酸置換によってのみ、
あるいはポリペプチドの特異的抗原性を破壊しない位置に位置する1以上の非保
存的アミノ酸の置換、欠失または付加によって異なるアミノ酸配列を意味する。“Homologous amino acid sequence” refers to the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 or 16 only by one or more conservative amino acid substitutions.
Alternatively, it means an amino acid sequence that differs by substitution, deletion or addition of one or more non-conservative amino acids located at positions that do not destroy the specific antigenicity of the polypeptide.
【0031】 好ましくは、このような配列は、配列番号2、4、6、8、10、12、14
または16に示されるアミノ酸配列に、少なくとも75%、より好ましくは80
%、そして最も好ましくは90%同一である。Preferably, such a sequence is SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14
Or at least 75%, more preferably 80%
%, And most preferably 90% identical.
【0032】 相同アミノ酸配列は、配列番号2、4、6、8、10、12、14および16
に示されるようなアミノ酸配列に同一または実質的に同一である配列を含む。「
実質的に同一であるアミノ酸配列」とは、参照のアミノ酸配列に少なくとも90
%、好ましくは95%、より好ましくは97%、そして最も好ましくは99%同
一であり、そして好ましくは、少しでも置換がある場合、大半が保存的アミノ酸
置換によってその参照の配列と異なる配列を意味する。The homologous amino acid sequences are shown in SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, and 16.
And sequences that are identical or substantially identical to the amino acid sequence as shown in "
An “amino acid sequence that is substantially identical” refers to at least 90 amino acids in the reference amino acid sequence.
%, Preferably 95%, more preferably 97%, and most preferably 99% identical, and preferably means any sequence that differs from its reference sequence, if any, by conservative amino acid substitutions. I do.
【0033】 保存的アミノ酸置換は、代表的に、同じクラスのアミノ酸間での置換を含む。
これらのクラスとしては、例えば、以下が挙げられる:(a)非荷電極性側鎖を
有するアミノ酸(例えば、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニンおよ
びチロシン);(b)塩基性側鎖を有するアミノ酸(例えば、リジン、アルギニ
ンおよびヒスチジン);(c)酸性側鎖を有するアミノ酸(例えば、アスパラギ
ン酸およびグルタミン酸);ならびに(d)非極性側鎖を有するアミノ酸(例え
ば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニ
ルアラニン、メチオニン、トリプトファンおよびシステイン)。[0033] Conservative amino acid substitutions typically involve substitutions between amino acids of the same class.
These classes include, for example: (a) amino acids with uncharged polar side chains (eg, asparagine, glutamine, serine, threonine and tyrosine); (b) amino acids with basic side chains (eg, , Lysine, arginine and histidine); (c) amino acids with acidic side chains (eg, aspartic acid and glutamic acid); and (d) amino acids with non-polar side chains (eg, glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, Proline, phenylalanine, methionine, tryptophan and cysteine).
【0034】 相同性は、代表的に、配列分析ソフトウェア(例えば、Sequence A
nalysis Software Package of the Gene
tics Computer Group,University of Wi
sconsin Biotechnology Center,1710 Un
iversity Avenue,Madison,WI53705)を使用し
て測定される。類似アミノ酸配列は、最大程度の相同性(すなわち、同一性)を
得るよう整列化される。この目的のために、配列にギャップを導入することが必
要であり得る。一旦、最適なアライメントが設定された場合、相同性(すなわち
、同一性)の程度は、位置の総数に対して、両方の配列のアミノ酸が同一である
全ての位置を、記録することによって確定される。Homology is typically determined by sequence analysis software (eg, Sequence A).
analysis Software Package of the Gene
tics Computer Group, University of Wi
scossin Biotechnology Center, 1710 Un
(Average Avenue, Madison, WI 53705). Similar amino acid sequences are aligned to obtain a maximum degree of homology (ie, identity). For this purpose, it may be necessary to introduce gaps in the sequence. Once the optimal alignment has been set, the degree of homology (ie, identity) is determined by recording all positions where the amino acids in both sequences are identical to the total number of positions. You.
【0035】 あるいは、相同性は、アライメントツール(例えば、Needlemanら、
J.Mol.Biol.48:443(1970)に記載の動的プログラミング
アルゴリズム、およびAlign Program(DNAstar,Inc.
によって生産される市販のソフトウェアパッケージ)(これらの教示は、本明細
書中に参考として援用される))を使用して、候補配列および参照配列を整列化
することによって決定され得る。初期アライメントが作製された後、これは、関
連タンパク質のファミリーの複数の配列アライメントに対する比較によって洗練
され得る。一旦、候補配列と参照配列との間のアライメントが、作製および洗練
されると、相同性パーセントスコアが計算される。各配列の個々のアミノ酸は、
互いのそれらの類似性に従って連続的に比較される。Alternatively, homology can be determined by alignment tools (eg, Needleman et al.,
J. Mol. Biol. 48: 443 (1970), and Align Program (DNAstar, Inc.).
(A commercial software package produced by) (the teachings of which are incorporated herein by reference)) can be determined by aligning the candidate and reference sequences. After an initial alignment has been created, it can be refined by comparison to multiple sequence alignments of a family of related proteins. Once the alignment between the candidate sequence and the reference sequence has been created and refined, a percent homology score is calculated. The individual amino acids in each sequence are
They are continuously compared according to their similarity to each other.
【0036】 類似性因子としては、類似の大きさ、形状および電荷が挙げられる。アミノ酸
類似性を決定する1つの特に好ましい方法は、Dayhoffら、5 ATLA
S OF PROTEIN SEQUENCE AND STRUCTURE
345−352(1978および補遺)(本明細書中に参考として援用される)
に記載される、PAM25Oマトリクスである。類似性スコアは、最初に、整列
化された対合アミノ酸類似性スコアの合計として計算される。挿入および欠失は
、相同性パーセントおよび同一性パーセントの目的のために無視される。従って
、ギャップペナルティーは、この計算に使用されない。次いで、生のスコアを候
補化合物および参照配列のスコアの相乗平均で除算することによって、その生の
スコアが正規化される。相乗平均は、これらのスコアの積の平方根である。正規
化された生のスコアは、相同性パーセントである。Similarity factors include similar sizes, shapes, and charges. One particularly preferred method of determining amino acid similarity is described in Dayhoff et al., 5 ATLA.
S OF PROTEIN SEQUENCE AND Structure
345-352 (1978 and addenda), incorporated herein by reference.
It is a PAM25O matrix described in (1). The similarity score is initially calculated as the sum of the aligned paired amino acid similarity scores. Insertions and deletions are ignored for purposes of percent homology and percent identity. Therefore, gap penalties are not used in this calculation. The raw score is then normalized by dividing the raw score by the geometric mean of the scores of the candidate compound and the reference sequence. The geometric mean is the square root of the product of these scores. The normalized raw score is the percent homology.
【0037】 好ましくは、相同配列は、配列番号1、3、5、7、9、10、11、13、
および15のコード配列に、少なくとも45%、より好ましくは60%、そして
最も好ましくは85%同一である配列である。Preferably, the homologous sequence is SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 10, 11, 13,
And 15 coding sequences are at least 45%, more preferably 60%, and most preferably 85% identical to the 15 coding sequences.
【0038】 配列番号2、4、6、8、10、12、14、または16に示される配列の1
つに相同な配列を有するポリペプチドとしては、天然に存在する対立遺伝子改変
体、ならびに配列番号2、4、6、8、10、12、14、または16に示され
るような配列を有するポリペプチドに対して、抗原性の点で類似する変異体およ
び改変体または任意の他の天然に存在しない改変体が挙げられる。One of the sequences shown in SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, or 16
Polypeptides having sequences homologous to each other include naturally-occurring allelic variants and polypeptides having sequences as shown in SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, or 16. Variants include variants and variants similar in antigenicity or any other non-naturally occurring variants.
【0039】 対立遺伝子改変体は、ポリペプチドの生物学的機能を実質的に変更しない、1
以上のアミノ酸の置換、欠失または付加を有することで特徴付けられる、ポリペ
プチドの代替形態である。「生物学的機能」とは、たとえその機能が細胞の増殖
または生存に必要ではなくとも、ポリペプチドが天然に存在するところの細胞に
おける、そのポリペプチドの機能を意味する。例えば、ポーリンの生物学的機能
は、細胞外培地中に存在する化合物の細胞への侵入を可能にすることである。生
物学的機能は、抗原性機能とは異なる。ポリペプチドは、1より多い生物学的機
能を有し得る。An allelic variant does not substantially alter the biological function of the polypeptide.
An alternative form of the polypeptide characterized by having the above amino acid substitutions, deletions or additions. By "biological function" is meant the function of a polypeptide in a cell where the polypeptide is naturally present, even if the function is not necessary for the growth or survival of the cell. For example, the biological function of porin is to allow the entry of compounds present in the extracellular medium into cells. Biological functions differ from antigenic functions. A polypeptide may have more than one biological function.
【0040】 対立遺伝子改変体は、天然において非常に一般的である。例えば、細菌種(例
えば、C.pneumoniae)は、通常、マイナーな対立遺伝子改変によっ
て互いに異なる種々の株によって代表される。実際、異なる株において同じ生物
学的機能を満たすポリペプチドは、各々の株において同一ではないアミノ酸配列
を有し得る。このような対立遺伝子の変動は、ポリヌクレオチドレベルで等しく
反映され得る。Allelic variants are very common in nature. For example, bacterial species (eg, C. pneumoniae) are typically represented by different strains that differ from each other by minor allelic alterations. In fact, polypeptides that fulfill the same biological function in different strains may have amino acid sequences that are not identical in each strain. Such allelic variations can be equally reflected at the polynucleotide level.
【0041】 ポリペプチド抗原の対立遺伝子改変体の使用の支持は、例えば、Chlamy
dial MOMP抗原の研究により生じる。MOMPのアミノ酸配列は、株ご
とに変動するが、株を越える(cross−strain)抗体結合および感染
性の中和がなお生じ、これは、MOMPが、免疫原として使用される場合、アミ
ノ酸変動に耐性であることを示す。[0041] Support for the use of allelic variants of a polypeptide antigen is described, for example, by Chlamy.
generated by studies of the dial MOMP antigen. Although the amino acid sequence of MOMP varies from strain to strain, cross-strain antibody binding and neutralization of infectivity still occur, which is a consequence of the amino acid variation when MOMP is used as an immunogen. Indicates resistance.
【0042】 対立遺伝子改変体をコードするポリヌクレオチド(例えば、DNA分子)は、
従来の方法によって抽出された細菌のゲノムDNAのポリメラーゼ連鎖反応(P
CR)増幅によって、容易に回収され得る。これは、コードドメインの5’末端
および3’末端の上流および下流に適合する、合成オリゴヌクレオチドプライマ
ーの使用を含む。適切なプライマーは、配列番号1、3、5、7、9、11、1
3、および15に提供されるヌクレオチド配列情報に従って設計され得る。代表
的には、プライマーは、10〜40ヌクレオチド、好ましくは15〜25ヌクレ
オチドからなり得る。効率的なハイブリダイゼーションを保証するのに十分な割
合で、CおよびGヌクレオチドを含有する(例えば、総ヌクレオチド量の少なく
とも40%、好ましくは50%のCおよびGヌクレオチド量)プライマーを選択
することもまた、有利であり得る。A polynucleotide (eg, a DNA molecule) encoding an allelic variant can include:
Polymerase chain reaction (P) of bacterial genomic DNA extracted by conventional methods
By CR) amplification, it can be easily recovered. This involves the use of synthetic oligonucleotide primers that fit upstream and downstream of the 5 'and 3' ends of the coding domain. Suitable primers are SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 1
3 and 15 can be designed according to the nucleotide sequence information provided. Typically, a primer may consist of 10 to 40 nucleotides, preferably 15 to 25 nucleotides. It is also possible to select primers containing C and G nucleotides in sufficient proportions to ensure efficient hybridization (eg, at least 40%, preferably 50% C and G nucleotides) of the total nucleotides. It can also be advantageous.
【0043】 天然に存在しない有用なホモログは、アミノ酸配列の変化および/または欠失
に耐性であるような抗原の領域を同定するための公知の方法を利用して、設計さ
れ得る。例えば、異なる種由来の抗原の配列が比較されて、保存された配列が同
定され得る。Useful non-naturally occurring homologs can be designed utilizing known methods for identifying regions of the antigen that are resistant to amino acid sequence changes and / or deletions. For example, sequences of antigens from different species can be compared to identify conserved sequences.
【0044】 本発明のポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド誘導体としては
、例えば、フラグメント、全長ポリペプチドに由来する大きな内部欠失を有する
ポリペプチド、および融合タンパク質が挙げられる。[0044] Polypeptide derivatives encoded by the polynucleotides of the present invention include, for example, fragments, polypeptides having large internal deletions derived from full-length polypeptides, and fusion proteins.
【0045】 本発明のポリペプチドフラグメントは、このフラグメントがその親ポリペプチ
ドの所望される実質的な抗原性(特異的抗原性)を保持する程度まで、配列番号
2、4、6、8、10、12、14または16に示される配列のいずれかに相同
な配列を有するポリペプチドから誘導され得る。ポリペプチド誘導体はまた、所
望の特異的抗原性を保持しながら、親ポリペプチドの実質的な部分を除去する大
きな内部欠失によって構築され得る。一般に、ポリペプチド誘導体は、その抗原
性を維持するために、少なくとも約12アミノ酸長であるべきである。有利には
、これは、少なくとも20アミノ酸長、好ましくは少なくとも50アミノ酸長、
より好ましくは少なくとも75アミノ酸長、そして最も好ましくは少なくとも1
00アミノ酸長であり得る。[0045] The polypeptide fragment of the present invention has SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10 to the extent that the fragment retains the desired substantial antigenicity (specific antigenicity) of its parent polypeptide. , 12, 14 or 16 can be derived from a polypeptide having a sequence homologous to any of the sequences shown in FIG. Polypeptide derivatives can also be constructed by large internal deletions that remove a substantial portion of the parent polypeptide while retaining the desired specific antigenicity. Generally, a polypeptide derivative should be at least about 12 amino acids in length to maintain its antigenicity. Advantageously, this is at least 20 amino acids in length, preferably at least 50 amino acids in length,
More preferably at least 75 amino acids in length, and most preferably at least 1
It can be as long as 00 amino acids.
【0046】 有用なポリペプチド誘導体(例えば、ポリペプチドフラグメント)は、表面に
露出される抗原性領域としての可能性を有するタンパク質抗原における部位を同
定するために、アミノ酸配列のコンピューター利用解析を使用して設計され得る
。Hughesら、Infect.Immun.60:3497(1992)。Useful polypeptide derivatives (eg, polypeptide fragments) use computer-assisted analysis of amino acid sequences to identify sites in protein antigens that have potential as surface exposed antigenic regions. Can be designed. Hughes et al., Infect. Immun. 60: 3497 (1992).
【0047】 ポリペプチドフラグメントおよび大きな内部欠失を有するポリペプチドは、相
でなければ親ポリペプチドにおいてマスクされており、そして、例えば防御T細
胞依存性免疫応答を誘導するために重要であり得るエピトープを明らかにするた
めに使用され得る。欠失はまた、株間の高い可変性の免疫優性領域を除去し得る
。Polypeptide fragments and polypeptides with large internal deletions are otherwise masked in the parent polypeptide and may be, for example, epitopes that may be important for inducing a protective T cell-dependent immune response Can be used to reveal Deletions can also remove highly variable immunodominant regions between strains.
【0048】 タンパク質免疫原のフラグメントおよび改変体を、ワクチンおよび免疫原とし
て使用することは、免疫学の分野における認められた常套手段である。なぜなら
、タンパク質に対する免疫応答を誘導するために必要とされるのは、そのタンパ
ク質の小さい(例えば、8〜10アミノ酸)領域のみであり得るからである。こ
れは、Chlamydia以外の病原体に対する多くのワクチンについてなされ
ている。例えば、病原体の表面露出抗原に対応する短い合成ペプチド(例えば、
マウス乳腺癌ウイルスの、11アミノ酸を含むペプチド(Dionら、Viro
logy 179:474−477(1990));セムリキ森林ウイルスの、
16アミノ酸を含むペプチド(Snijdersら、J.Gen.Virol.
72:557−565(1991));およびイヌパルボウイルスの2つの重複
ペプチド(各々、15アミノ酸を含む)(Langeveldら、Vaccin
e 12:1473−1480(1994)))は、これらそれぞれの病原体に
対する有効なワクチン抗原であることが示されている。[0048] The use of fragments and variants of protein immunogens as vaccines and immunogens is a recognized routine in the field of immunology. This is because only a small (eg, 8-10 amino acid) region of the protein may be required to elicit an immune response to the protein. This has been done for many vaccines against pathogens other than Chlamydia. For example, a short synthetic peptide corresponding to the surface-exposed antigen of a pathogen (eg,
Peptide containing 11 amino acids of mouse mammary adenocarcinoma virus (Dion et al., Viro
logy 179: 474-477 (1990));
Peptides containing 16 amino acids (Snijders et al., J. Gen. Virol.
72: 557-565 (1991)); and two overlapping peptides of canine parvovirus, each containing 15 amino acids (Langeveld et al., Vaccin.
e 12: 1473-1480 (1994))) have been shown to be effective vaccine antigens against each of these pathogens.
【0049】 ポリペプチドフラグメントおよび大きな内部欠失を有するポリペプチドをコー
ドするポリヌクレオチドは、例えば、PCR(インバース(inverse)P
CRを含む)によるか、クローン化DNA分子の制限酵素処理によるか、または
Kunkelら(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:44
8(1985))の方法による、標準的な方法(例えば、Ausubelら、C
URRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOG
Y,John Wiley&Sons Inc.(1994)を参照のこと)を
使用して(生物学的材料はStratagenから入手可能)構築され得る。[0049] Polypeptide fragments and polynucleotides encoding polypeptides with large internal deletions can be produced, for example, by PCR (inverse P
(Including CR), by restriction enzyme treatment of the cloned DNA molecule, or by Kunkel et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:44).
8 (1985)) by standard methods (eg, Ausubel et al., C.I.
URENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOG
Y, John Wiley & Sons Inc. (See (1994)) (biological material is available from Stratagen).
【0050】 ポリペプチド誘導体はまた、例えば、N末端またはC末端で、任意の他のポリ
ペプチドに融合された本発明のポリペプチドまたはポリペプチド誘導体を含む、
融合ポリペプチドとして生成され得る。ハイブリッド融合タンパク質に対応する
アミノ酸配列をコードするDNAの構築のため、CPN100111、CPN1
00224、CPN100230、CPN100231、CPN100232、
CPN100233、CPN100394、CPN100395のヌクレオチド
配列(配列番号1、3、5、7、9、11、13または15)の部分に対応する
アミノ酸配列をコードする第1のDNAは、例えば、米国特許第5,844,0
95号(本明細書中に参考として援用される)に記載される方法を使用して、第
2のDNAに結合される。次いで、産物は、この遺伝子融合物の翻訳によって容
易に得られ得る。融合ポリペプチドを発現するためのベクターは、市販されてい
る(例えば、New England BiolabsのpMal−c2系また
はpMal−p2系(ここで、融合ペプチドは、マルトース結合タンパク質であ
る)、Pharmaciaのグルタチオン−S−トランスフェラーゼ系、または
Novagenから入手可能なHis−Tag系)。これらおよび他の発現系は
、本発明のポリペプチドおよび誘導体のさらなる精製のための簡便な手段を提供
する。[0050] Polypeptide derivatives also include a polypeptide or polypeptide derivative of the invention fused to any other polypeptide, for example, at the N-terminus or C-terminus.
It can be produced as a fusion polypeptide. To construct a DNA encoding the amino acid sequence corresponding to the hybrid fusion protein, CPN100111, CPN1
00224, CPN100230, CPN100231, CPN100232,
The first DNA encoding the amino acid sequence corresponding to the portion of the nucleotide sequence (SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, or 15) of CPN100233, CPN100394, CPN100395 is described in, for example, US Pat. 844,0
No. 95, incorporated by reference herein, is ligated to the second DNA. The product can then be easily obtained by translation of the gene fusion. Vectors for expressing the fusion polypeptide are commercially available (eg, the New England Biolabs pMal-c2 or pMal-p2 systems, where the fusion peptide is a maltose binding protein), and Pharmacia glutathione-. S-transferase system, or His-Tag system available from Novagen). These and other expression systems provide a convenient means for further purification of the polypeptides and derivatives of the present invention.
【0051】 本発明に含まれる融合ポリペプチドの別の特定の例としては、アジュバント活
性を有するポリペプチド(例えば、コレラ毒素またはE.coli非耐熱性毒素
のいずれかのサブユニットBのような)に融合された、本発明のポリペプチドま
たはポリペプチド誘導体が挙げられる。いくつかの可能性が、融合を達成するた
めに使用され得る。第1に、本発明のポリペプチドは、アジュバント活性を有す
るポリペプチドのN末端、または好ましくはC末端に融合され得る。第2に、本
発明のポリペプチドフラグメントは、アジュバント活性を有するポリペプチドの
アミノ酸配列内に融合され得る。Another specific example of a fusion polypeptide included in the invention is a polypeptide having adjuvant activity (eg, such as subunit B of either cholera toxin or E. coli non-thermostable toxin). And a polypeptide or polypeptide derivative of the present invention fused to Several possibilities can be used to achieve fusion. First, the polypeptides of the present invention can be fused to the N-terminus, or preferably the C-terminus, of a polypeptide having adjuvant activity. Second, polypeptide fragments of the present invention can be fused within the amino acid sequence of a polypeptide having adjuvant activity.
【0052】 上記のように、本発明のポリヌクレオチドは、前駆体形態または成熟形態のC
hlamydiaポリペプチドをコードする。これらはまた、異種シグナルペプ
チドを含むハイブリッド前駆体をコードし得、これは、本発明のポリペプチドに
成熟し得る。「異種シグナルペプチド」とは、本発明のポリペプチドの天然に存
在する前駆体に見出されないシグナルペプチドを意味する。As mentioned above, the polynucleotides of the present invention may be in the precursor or mature form of C
encodes a hlamydia polypeptide. They may also encode hybrid precursors containing a heterologous signal peptide, which may mature into a polypeptide of the invention. "Heterologous signal peptide" means a signal peptide that is not found in naturally occurring precursors of a polypeptide of the invention.
【0053】 相同なコード配列を有する、本発明のポリヌクレオチドは、配列番号2、4、
6、8、10、12、14および16に示されるような配列を有するポリヌクレ
オチドに、好ましくはストリンジェントな条件下でハイブリダイズする。ハイブ
リダイゼーション手順は、例えば、Ausubelら、CURRENT PRO
TOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY,John Wil
ey&Sons Inc.(1994);Silhavyら、EXPERIME
NTS WITH GENE FUSIONS,Cold Spring Ha
rbor Lanoratory Press(1984);Davisら、A
MANUAL FOR GENETIC ENGINEERING:ADVA
NCED BACTERIAL GENETICS,Cold Spring
Harbor Laboratory Press(1980)(各々は、本明
細書中に参考として援用される)に記載される。ハイブリダイゼーション条件を
最適化するために考慮され得る重要なパラメーターは、臨界値(2つの相補的D
NA鎖が互いに離れる融解温度)の算出を可能にする式に反映される。Case
yおよびDavidson,Nucl.Acid Res.4:1539(19
77)。この式は、以下のとおりである: Tm=81.5+0.5×(%G+C)+1.6log(陽イオン濃度)−0
.6×(%ホルムアミド)。A polynucleotide of the present invention having a homologous coding sequence comprises SEQ ID NOs: 2, 4,
It hybridizes to a polynucleotide having a sequence as set forth in 6, 8, 10, 12, 14, and 16, preferably under stringent conditions. Hybridization procedures are described, for example, in Ausubel et al., CURRENT PRO.
TOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wil
eye & Sons Inc. (1994); Silhavey et al., EXPERIME.
NTS WITH GENE FUSIONS, Cold Spring Ha
rbor Lanoratory Press (1984); Davis et al., A.
MANUAL FOR GENETIC ENGINEERING: ADVA
NCED BACTERIAL GENETICS, Cold Spring
Harbor Laboratory Press (1980), each of which is incorporated herein by reference. An important parameter that can be considered for optimizing hybridization conditions is the critical value (two complementary D
The melting temperature at which the NA chains separate from each other) is reflected in the equation that allows the calculation. Case
y and Davidson, Nucl. Acid Res. 4: 1539 (19
77). This equation is as follows: Tm = 81.5 + 0.5 × (% G + C) +1.6 log (cation concentration) −0
. 6x (% formamide).
【0054】 適切なストリンジェンシー条件下で、ハイブリダイゼーション温度(Th)は
、算出されたTmより約20〜40℃、20〜25℃、または好ましくは、30
〜40℃低い。当業者は、最適の温度および塩条件が、従来の手順を使用した予
備実験において、容易に経験的に決定され得ることを理解する。Under appropriate stringency conditions, the hybridization temperature (Th) can be about 20-40 ° C., 20-25 ° C., or preferably 30 ° C. above the calculated Tm.
~ 40 ° C lower. One skilled in the art will understand that optimal temperature and salt conditions can be readily determined empirically in preliminary experiments using conventional procedures.
【0055】 例えば、ストリンジェント条件は、プレハイブリダイゼーションおよびハイブ
リダイゼーションインキュベーションの両方について、(i)50%ホルムアミ
ドを含有する6×SSC中、42℃で、4〜16時間以内、または(ii)6×
SSC水溶液(1M NaCl、0.1M クエン酸ナトリウム(pH 7.0
))中、65℃で、4〜16時間以内で、達成され得る。For example, stringent conditions include (i) within 4-16 hours at 42 ° C. in 6 × SSC containing 50% formamide for both prehybridization and hybridization incubation, or (ii) 6 ×
SSC aqueous solution (1 M NaCl, 0.1 M sodium citrate (pH 7.0)
)) At 65 ° C. within 4 to 16 hours.
【0056】 30〜600ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドについては、上記の式が使
用され、次いで、減算(600/塩基対中のポリヌクレオチドの大きさ)するこ
とによって補正される。ストリンジェンシー条件は、Tmより5〜10℃低いT
hによって定義される。For polynucleotides containing 30-600 nucleotides, the above formula is used and then corrected by subtraction (600 / size of polynucleotide in base pairs). Stringency conditions are Tm 5-10 ° C below Tm.
h.
【0057】 20〜30塩基より短いオリゴヌクレオチドに関するハイブリダイゼーション
条件は、上記の規則に正確には従わない。このような場合、Tmを算出するため
の式は、以下のとおりである: Tm=4×(G+C)+2(A+T)。 例えば、50%のG+Cの18ヌクレオチドフラグメントは、約54℃のTmを
有する。Hybridization conditions for oligonucleotides shorter than 20-30 bases do not exactly follow the rules described above. In such a case, the formula for calculating Tm is as follows: Tm = 4 × (G + C) +2 (A + T). For example, a 50% G + C 18 nucleotide fragment has a Tm of about 54 ° C.
【0058】 本発明のポリヌクレオチド分子(RNA、DNA、あるいはこれらの改変体ま
たは組み合わせを含む)は、種々の適用を有し得る。例えば、DNA分子は、(
i)組換え宿主系においてコードされるポリペプチドを生成するためのプロセス
において、(ii)Chlamydia感染を予防および/または処置するため
の方法および組成物においてさらに使用される、ポックスウイルスのようなワク
チンベクターの構築において、(iii)裸の形態の、または送達ビヒクルで処
方されたワクチン剤(およびRNA分子)として、ならびに(iv)本発明のポ
リヌクレオチドを過剰発現し得るか、または適切ならば、そのポリヌクレオチド
を、改変され、変異された形態(例えば、非毒性形態)で発現し得る、弱毒化C
hlamydia株の構築において、使用され得る。Chlamydiaによっ
て引き起こされる疾患に対する防御のための、本発明のタンパク質およびペプチ
ドならびにコードヌクレオチドのワクチン組成物および使用について、このタン
パク質またはペプチドをコードする裸のDNA、およびこれらのヌクレオチドの
鼻内または筋肉内投与を使用することは好ましくない。これらのタンパク質につ
いて、コード核酸を別の経路によって(例えば、皮内)投与すること、および/
またはコード核酸を免疫応答を改善(または、補助)するように処方することが
好ましい。免疫剤としての使用のために、組換え生ベクター(例えば、ウイルス
ベクターまたは細菌ベクター)の一部としてコード核酸を含むこともまた好まし
い。本発明のタンパク質またはペプチド自体を含むワクチン処方物で免疫するこ
ともまた好ましい。これらのワクチン処方物は、アジュバントの使用を含み得る
。The polynucleotide molecules of the present invention (including RNA, DNA, or variants or combinations thereof) may have a variety of applications. For example, a DNA molecule is (
A vaccine, such as a poxvirus, further used in (i) a process for producing the encoded polypeptide in a recombinant host system, (ii) in a method and composition for preventing and / or treating Chlamydia infection. In the construction of the vector, (iii) as a vaccine agent (and RNA molecule) in naked form or formulated in a delivery vehicle, and (iv) the polynucleotide of the invention can be overexpressed or, if appropriate, An attenuated C that can express the polynucleotide in a modified, mutated (eg, non-toxic) form
hlamydia strains can be used in construction. For vaccine compositions and uses of the proteins and peptides and coding nucleotides of the invention for protection against diseases caused by Chlamydia, naked DNA encoding the protein or peptide, and intranasal or intramuscular administration of these nucleotides Is not preferred. For these proteins, administering the encoding nucleic acid by another route (eg, intradermal); and / or
Alternatively, it is preferred to formulate the encoding nucleic acid to improve (or assist) the immune response. It is also preferred to include the encoding nucleic acid as part of a recombinant live vector (eg, a viral or bacterial vector) for use as an immunizing agent. It is also preferred to immunize with a vaccine formulation comprising the protein or peptide of the invention itself. These vaccine formulations may involve the use of adjuvants.
【0059】 それゆえ、本発明の第2の局面に従って、以下が提供される:(i)発現に必
要とされるエレメントの制御下(特に、適切なプロモーターの制御下)に配置さ
れた本発明のDNA分子を含む、発現カセット;(ii)本発明の発現カセット
を含む発現ベクター;(iii)本発明の発現カセットおよび/または発現ベク
ターで形質転換あるいはトランスフェクトされた、原核生物細胞または真核生物
細胞、ならびに(iv)本発明のポリヌクレオチドによってコードされるポリペ
プチドまたはポリペプチド誘導体を産生するためのプロセスであって、本発明の
発現カセットおよび/または発現ベクターで形質転換あるいはトランスフェクト
された、原核生物細胞または真核生物細胞を、本発明のDNA分子の発現を可能
にする条件下で培養する工程、およびこの細胞培養物からコードされたポリペプ
チドまたはポリペプチド誘導体を回収する工程を包含する、プロセス。Thus, according to a second aspect of the present invention there is provided: (i) the present invention arranged under the control of elements required for expression, especially under the control of a suitable promoter. (Ii) an expression vector containing the expression cassette of the present invention; (iii) a prokaryotic cell or eukaryotic transformed or transfected with the expression cassette and / or the expression vector of the present invention. Biological cells, and (iv) a process for producing a polypeptide or polypeptide derivative encoded by a polynucleotide of the invention, wherein the process is transformed or transfected with an expression cassette and / or expression vector of the invention. A prokaryotic or eukaryotic cell that allows expression of a DNA molecule of the present invention. And recovering the encoded polypeptide or polypeptide derivative from the cell culture.
【0060】 組換え発現系は、原核生物宿主および真核生物宿主から選択され得る。真核生
物宿主には、酵母細胞(例えば、Saccharomyces cerevis
iaeまたはPichia pastoris)、哺乳動物細胞(例えば、CO
S1細胞、NIH3T3細胞、またはJEG3細胞)、節足動物細胞(例えば、
Spodoptera frugiperda(SF9)細胞)、および植物細
胞が挙げられる。好ましくは、原核生物宿主(例えば、E.coli)が使用さ
れる。細菌細胞および真核生物細胞は、多くの異なる供給源(例えば、Amer
ican Type Culture Collection(ATCC;Ro
ckville,Maryland))より、当業者に利用可能である。[0060] Recombinant expression systems can be selected from prokaryotic and eukaryotic hosts. Eukaryotic hosts include yeast cells (eg, Saccharomyces cerevis).
iae or Pichia pastoris, mammalian cells (eg, CO
S1 cells, NIH3T3 cells, or JEG3 cells), arthropod cells (eg,
Spodoptera frugiperda (SF9) cells), and plant cells. Preferably, a prokaryotic host (eg, E. coli) is used. Bacterial and eukaryotic cells are derived from many different sources (eg, Amer
ican Type Culture Collection (ATCC; Ro)
ckville, Maryland)) available to those skilled in the art.
【0061】 発現系の選択は、発現されるポリペプチドについての所望の特徴に依存する。
例えば、特定の脂質化された形態または任意の他の形態で本発明のポリペプチド
を産生することが有用であり得る。The choice of the expression system depends on the desired characteristics for the expressed polypeptide.
For example, it may be useful to produce a polypeptide of the invention in a particular lipidated or any other form.
【0062】 発現カセットの選択は、選択される宿主系ならびに発現されるポリペプチドに
ついての所望の特徴に依存する。代表的には、発現カセットは、選択された宿主
系において機能的であり、そして構成的または誘導的であり得るプロモーター;
リボソーム結合部位;必要な場合、開始コドン(ATG);シグナルペプチド(
例えば、脂質化シグナルペプチド)をコードする領域;本発明のDNA分子;停
止コドン;および必要に応じて3’末端領域(翻訳ターミネーターおよび/また
は転写ターミネーター)を含む。シグナルペプチドコード領域は、本発明のポリ
ヌクレオチドに隣接し、そして適切なリーディングフレームに配置される。この
シグナルペプチドコード領域は、成熟ポリペプチドをコードするDNA分子に対
して同種または異種であり得、そして発現のために使用される宿主の分泌装置に
特異的であり得る。本発明のDNA分子によって構成されるオープンリーディン
グフレームは、単独で、またはシグナルペプチドとともに、プロモーターの制御
下に置かれて、その結果、宿主系において転写および翻訳が起こる。プロモータ
ー、シグナルペプチドコード領域は、当業者に広範に公知でありかつ使用可能で
あり、そして例えば、Salmonella typhimuriumのプロモ
ーター(および誘導体)(これは、アラビノースによって誘導可能であり(プロ
モーターaraB)、そしてグラム陰性細菌(例えば、E.coli)において
機能的である(米国特許第5,028,530号において、およびCagnon
ら(Cagnonら、Protein Engineering 4:843(
1991))において記載されるように));RNAポリメラーゼをコードする
バクテリオファージT7の遺伝子のプロモーター(これは、T7ポリメラーゼを
発現する多数のE.coli株において機能的である(米国特許第4,952,
496号に記載される));OspA脂質化シグナルペプチド;およびRlpB
脂質化シグナルペプチド(Takaseら、J.Bact.169:5692(
1987))が挙げられる。The choice of the expression cassette will depend on the host system chosen as well as the characteristics desired for the polypeptide to be expressed. Typically, the expression cassette is functional in the selected host system and can be constitutive or inducible;
Ribosome binding site; initiation codon (ATG) if necessary; signal peptide (
For example, a region coding for a lipidated signal peptide); a DNA molecule of the present invention; a stop codon; The signal peptide coding region is adjacent to the polynucleotide of the invention and is located in a suitable reading frame. The signal peptide coding region can be homologous or heterologous to the DNA molecule encoding the mature polypeptide, and can be specific for the secretory apparatus of the host used for expression. The open reading frame constituted by the DNA molecule of the present invention, alone or together with a signal peptide, is placed under the control of a promoter, resulting in transcription and translation in the host system. Promoters, signal peptide coding regions, are widely known and available to those of skill in the art, and include, for example, the promoter (and derivative) of Salmonella typhimurium, which is inducible by arabinose (promoter araB), and gram. Functional in negative bacteria (eg, E. coli) (US Pat. No. 5,028,530; and Cagnon
(Cagnon et al., Protein Engineering 4: 843 (
1991))); the promoter of the gene for bacteriophage T7, which encodes an RNA polymerase, which is functional in many E. coli strains expressing T7 polymerase (US Pat. 952
No. 496)); OspA lipidated signal peptide; and RlpB
Lipidation signal peptide (Takase et al., J. Bact. 169: 5692 (
1987)).
【0063】 発現カセットは、代表的には発現ベクターの一部であり、これは、選択された
発現系においてその複製する能力について選択される。発現ベクター(例えば、
プラスミドベクターまたはウイルスベクター)は、Pouwelsら(Clon
ing Vectors:Laboratory Manual,85,補遺、
1997)において記載されたベクターから選択され得る。これらは、種々の商
業的な供給源から購入され得る。The expression cassette is typically part of an expression vector, which is selected for its ability to replicate in the chosen expression system. Expression vectors (eg,
Plasmid vectors or viral vectors) are described in Pouwels et al.
ing Vectors: Laboratory Manual, 85, addendum,
1997). These can be purchased from various commercial sources.
【0064】 発現ベクターを用いて宿主細胞を形質転換/トランスフェクトするための方法
は、Ausubelら、Current Protocols in Mole
cular Biology,John Wiley&Sons Inc.(1
994)において記載されるように選択される宿主系に依存する。Methods for transforming / transfecting host cells with expression vectors are described in Ausubel et al., Current Protocols in Mole.
cultural Biology, John Wiley & Sons Inc. (1
994), depending on the host system chosen.
【0065】 発現に際して、本発明の組換えポリペプチド(またはポリペプチド誘導体)は
、細胞内区画において産生され、そしてそこに残存するか、細胞外の培地または
細胞周辺腔中に分泌/排出されるか、あるいは細胞膜に包埋される。次いで、ポ
リペプチドは、細胞抽出物から、または組換え細胞培養物の遠心分離後の上清か
ら、実質的に精製された形態で回収され得る。代表的には、この組換えポリペプ
チドは、抗体に基づくアフィニティー精製、または当業者によって容易に適合さ
れ得る任意の他の方法(例えば、小さなアフィニティー結合ドメインへの遺伝子
の融合による方法)によって精製され得る。抗体に基づくアフィニティー精製法
もまた、Chlamydia株から抽出された本発明のポリペプチドを精製する
ために利用し得る。免疫アフィニティーによって本発明のポリペプチドを精製す
るための有用な抗体は、以下のようにして得られ得る。Upon expression, a recombinant polypeptide (or polypeptide derivative) of the invention is produced in the intracellular compartment and remains there or secreted / excreted into the extracellular medium or into the periplasmic space. Or embedded in the cell membrane. The polypeptide may then be recovered in substantially purified form from the cell extract or from the supernatant after centrifugation of the recombinant cell culture. Typically, the recombinant polypeptide is purified by antibody-based affinity purification, or any other method that can be readily adapted by one of skill in the art, such as by fusion of the gene to a small affinity binding domain. obtain. Antibody-based affinity purification methods can also be used to purify polypeptides of the invention extracted from Chlamydia strains. Useful antibodies for purifying the polypeptide of the present invention by immunoaffinity can be obtained as follows.
【0066】 本発明のポリヌクレオチドはまた、ワクチンの分野において(例えば、DNA
ワクチン投与を達成することのために)有用であり得る。2つの主な可能性が存
在し、これらは、ウイルスもしくは細菌宿主を遺伝子送達ビヒクルとして使用す
る(生ワクチンベクター)か、または遊離の形態で遺伝子を投与する(例えば、
プラスミドに挿入して)かのいずれかである。本発明のポリヌクレオチドの治療
的または予防的効力は、以下に記載されるように評価され得る。The polynucleotides of the present invention may also be used in the field of vaccines (eg, DNA
(To achieve vaccination). There are two main possibilities, either using a viral or bacterial host as a gene delivery vehicle (live vaccine vector) or administering the gene in free form (eg,
(Inserted into a plasmid). The therapeutic or prophylactic efficacy of a polynucleotide of the present invention can be assessed as described below.
【0067】 従って、本発明の第3の局面において、以下が提供される:(i)発現のため
に必要であるエレメントの制御下に配置される本発明のDNA分子を含む、ワク
チンベクター(例えば、ポックスウイルス);(ii)希釈剤またはキャリアと
ともに、本発明のワクチンベクターを含む組成物;特に、(iii)本発明のワ
クチンベクターの治療的または予防的な量を含む薬学的組成物;(iv)哺乳動
物(例えば、ヒト;あるいは、この方法は、動物(例えば、ネコまたは鳥類)の
Chlamydia感染を処置または予防するための獣医学的な適用において使
用され得る)においてChlamydiaに対して免疫応答を誘導するための方
法であって、この方法は、哺乳動物に、免疫原的に有効な量の本発明のワクチン
ベクターを投与して、免疫応答(例えば、Chlamydiaに対する予防的ま
たは治療的免疫応答)を誘発する工程を包含する、方法;および、特に、(v)
Chlamydia(例えば、C.trachomatis、C.psitta
ci、C.pneumonia、C.pecorum)感染を予防および/また
は処置するための方法であって、この方法は、必要がある個体に、本発明のワク
チンベクターの予防的または治療的な有効量を投与する工程を包含する、方法。
さらに、本発明の第3の局面は、Chlamydia感染を予防および/または
処置するための医薬の調製における本発明のワクチンベクターの使用を包含する
。Thus, in a third aspect of the invention there is provided: (i) a vaccine vector (eg, a vaccine vector comprising a DNA molecule of the invention which is placed under the control of elements required for expression) (Poxvirus); (ii) a composition comprising a vaccine vector of the invention together with a diluent or carrier; in particular, (iii) a pharmaceutical composition comprising a therapeutic or prophylactic amount of a vaccine vector of the invention; iv) Immune response against Chlamydia in mammals (eg, humans; alternatively, this method can be used in veterinary applications to treat or prevent Chlamydia infection in animals (eg, cats or birds)) A method for inducing a mammal with an immunogenically effective amount of a vaccine vector of the present invention. Administering, to elicit an immune response (eg, a prophylactic or therapeutic immune response against Chlamydia); and, in particular, (v)
Chlamydia (eg, C. trachomatis, C. psitta)
ci, C.I. pneumonia, C.I. pecorum) A method for preventing and / or treating an infection, comprising administering to a person in need thereof a prophylactically or therapeutically effective amount of a vaccine vector of the present invention. .
Further, a third aspect of the present invention includes the use of a vaccine vector of the present invention in the preparation of a medicament for preventing and / or treating Chlamydia infection.
【0068】 本発明のワクチンベクターは、本発明の1つまたはいくつかのポリペプチドま
たは誘導体、ならびに少なくとも1つのさらなるChlamydia抗原、その
フラグメント、ホモログ、変異体、または誘導体を発現し得る。さらに、それは
、免疫応答を増強する(アジュバント効果)、サイトカイン(例えば、インター
ロイキン−2(IL−2)またはインターロイキン−12(IL−12))を発
現し得る。従って、ワクチンベクターは、哺乳動物細胞における発現のために必
要とされるエレメントの制御下に配置された、例えば、クラミジア抗原またはサ
イトカインをコードするさらなるDNA配列を含み得る。A vaccine vector of the invention may express one or several polypeptides or derivatives of the invention, as well as at least one additional Chlamydia antigen, fragment, homolog, variant, or derivative thereof. In addition, it may express a cytokine (eg, interleukin-2 (IL-2) or interleukin-12 (IL-12)) that enhances the immune response (adjuvant effect). Thus, a vaccine vector may include additional DNA sequences, eg, encoding a chlamydia antigen or cytokine, placed under the control of elements required for expression in mammalian cells.
【0069】 あるいは、本発明の組成物は、いくつかのワクチンベクターを含み得、これら
の各々は、本発明のポリペプチドまたは誘導体を発現し得る。組成物はまた、さ
らなるChlamydia抗原あるいはそのサブユニット、フラグメント、ホモ
ログ、変異体、または誘導体;あるいはサイトカイン(例えば、IL−2もしく
はIL−12)を発現し得るワクチンベクターを含み得る。Alternatively, a composition of the invention may comprise several vaccine vectors, each of which may express a polypeptide or derivative of the invention. The composition may also include a further Chlamydia antigen or subunit, fragment, homolog, variant, or derivative thereof; or a vaccine vector capable of expressing a cytokine (eg, IL-2 or IL-12).
【0070】 哺乳動物細胞における感染を処置または予防するためのワクチン投与方法にお
いて、本発明のワクチンベクターは、ワクチンの分野での使用における任意の従
来的な経路によって、特に粘膜(例えば、眼、鼻内、口、胃、肺、腸、直腸、膣
、または尿路)表面に、または非経口(例えば、皮下、皮内、筋肉内、静脈内、
または腹腔内)経路を介して、投与され得る。好ましい経路は、ワクチンベクタ
ーの選択に依存する。投与は、単回用量において、または間隔をあけて反復して
達成され得る。適切な投薬量は、当業者によって理解される種々のパラメーター
(例えば、ワクチンベクターそれ自体、投与の経路、またはワクチン投与される
哺乳動物の状態(体重、齢など))に依存する。In a method of administering a vaccine to treat or prevent infection in a mammalian cell, the vaccine vector of the invention may be administered by any conventional route of use in the field of vaccines, especially mucosal (eg, ocular, nasal) Intra-orally, stomach, lung, intestinal, rectal, vaginal, or urinary tract, or parenterally (eg, subcutaneously, intradermally, intramuscularly, intravenously,
Or intraperitoneal) route. The preferred route depends on the choice of vaccine vector. Administration can be accomplished in a single dose or repeatedly at intervals. The appropriate dosage depends on various parameters understood by those skilled in the art, such as the vaccine vector itself, the route of administration, or the condition (body weight, age, etc.) of the mammal to be vaccinated.
【0071】 当該分野において利用可能な生ワクチンベクターには、ウイルスベクター(例
えば、アデノウイルス、アルファウイルス、およびポックスウイルス)、ならび
に細菌ベクター(例えば、Shigella、Salmonella、Vibr
io cholerae、Lactobacillus、Bacille bi
lie de Calmette−Guerin(BCG)、およびStrep
tococcus)が含まれる。Live vaccine vectors available in the art include viral vectors (eg, adenovirus, alphavirus, and poxvirus), and bacterial vectors (eg, Shigella, Salmonella, Vibr)
io cholerae, Lactobacillus, Bacille bi
lie de Calmette-Guerin (BCG) and Strep
tococcus).
【0072】 アデノウイルスベクターの例、ならびに本発明のDNA分子を発現し得るアデ
ノウイルスベクターを構築するための方法は、米国特許第4,920,209号
に記載される。使用され得るポックスウイルスベクターには、例えば、ワクシニ
アウイルスおよびカナリア痘ウイルスが含まれ、これらはそれぞれ、米国特許第
4,722,848号および米国特許第5,364,773号に記載される(例
えば、ワクシニアウイルスベクターの記載については、Tartagliaら、
Virology 188:217(1992);およびカナリア痘ウイルスの
参考文献については、Taylorら、Vaccine 13:539(199
5)もまた参照のこと)。本発明のポリヌクレオチドを発現し得るポックスウイ
ルスベクターは、Kienyら、Nature 312:163(1984)に
記載されるように、相同組換えによって得られ得、その結果、本発明のポリヌク
レオチドは、哺乳動物細胞における発現に適切な条件下でウイルスゲノムに挿入
される。一般的に、ワクチンウイルスベクターの用量は、治療的または予防的使
用については、1キログラム当たり、約1×104〜約1×1011、有利には、
約1×107〜1×1010、好ましくは約1×107〜約1×109プラーク形成
ユニットであり得る。好ましくは、ウイルスベクターは、非経口的に投与される
;例えば、4週間間隔をあけて、3回の投与である。当業者は、本発明のウイル
スベクターを含む組成物に、化学アジュバントを添加することを避けることが好
ましく、それによってウイルスベクターそれ自体への免疫応答を最小化すること
を認識する。Examples of adenovirus vectors, as well as methods for constructing adenovirus vectors capable of expressing a DNA molecule of the present invention, are described in US Pat. No. 4,920,209. Poxvirus vectors that can be used include, for example, vaccinia virus and canarypox virus, which are described in U.S. Patent Nos. 4,722,848 and 5,364,773, respectively (e.g., For a description of vaccinia virus vectors, see Tartaglia et al.,
Virology 188: 217 (1992); and for references on canarypox virus, see Taylor et al., Vaccine 13: 539 (199).
See also 5)). Poxvirus vectors capable of expressing the polynucleotides of the present invention can be obtained by homologous recombination, as described in Kieny et al., Nature 312: 163 (1984), so that the polynucleotides of the present invention can be used in mammals. Inserted into the viral genome under conditions appropriate for expression in animal cells. Generally, the dose of the vaccine viral vector will range from about 1 × 10 4 to about 1 × 10 11 per kilogram for therapeutic or prophylactic use, advantageously
About 1 × 10 7 ~1 × 10 10 , may be preferably about 1 × 10 7 ~ about 1 × 10 9 plaque forming units. Preferably, the viral vector is administered parenterally; for example, three administrations at four week intervals. One skilled in the art will recognize that it is preferable to avoid adding a chemical adjuvant to the composition comprising the viral vector of the present invention, thereby minimizing the immune response to the viral vector itself.
【0073】 生経口ワクチンとして有用な非毒素産生のVibrio cholerae変
異株は、Mekalanosら、Nature 306:551(1983)お
よび米国特許第4,882,278号(2つのctxA対立遺伝子の各々のコー
ド配列の実質的な量が除去され、その結果、機能的なコレラ毒素が産生されない
株);WO 92/11354(irgA遺伝子座が変異により不活性化されて
いる株;この変異はctxA変異を有する単一の株中で組み合わされ得る);お
よびWO 94/1533(機能的なctxAおよびattRS1 DNA配列
を欠く欠失変異体)において記載される。これらの株は、WO 94/1948
2において記載されるように、遺伝子操作されて異種抗原を発現し得る。本発明
のDNA分子によってコードされるポリペプチドまたはポリペプチド誘導体を発
現し得るVibrio cholerae株の有効なワクチン用量は、選択され
た投与の経路について適切な容量で、例えば、約1×105〜約1×109、好ま
しくは約1×106〜約1×108の生存可能な細菌を含み得る。好ましい投与の
経路には、すべての粘膜経路が含まれ;最も好ましくは、これらのベクターは、
鼻腔内または経口的に投与される。Non-toxin producing Vibrio cholerae mutants useful as live oral vaccines are described in Mekalanos et al., Nature 306: 551 (1983) and US Pat. No. 4,882,278 (the coding sequence for each of the two ctxA alleles). WO 92/11354 (strain in which the irgA locus is inactivated by mutation; this mutation is And WO 94/1533 (deletion mutant lacking functional ctxA and attRS1 DNA sequences). These strains are described in WO 94/1948.
2, can be engineered to express a heterologous antigen. An effective vaccine dose of a Vibrio cholerae strain capable of expressing the polypeptide or polypeptide derivative encoded by the DNA molecule of the present invention will be in a volume appropriate for the route of administration selected, for example, from about 1 × 10 5 to about It may contain 1 × 10 9 , preferably from about 1 × 10 6 to about 1 × 10 8 viable bacteria. Preferred routes of administration include all mucosal routes; most preferably, these vectors
It is administered intranasally or orally.
【0074】 異種抗原の組換え発現のために遺伝子操作されたか、または遺伝子操作されて
いない弱毒化されたSalmonella typhimurium株、および
経口ワクチンとしてのそれらの使用は、Nakayamaら、Bio/Tech
nology 6:693(1988)およびWO 92/11361に記載さ
れる。好ましい投与の経路には、すべての粘膜経路が含まれ;最も好ましくは、
これらのベクターは、鼻腔内または経口的に投与される。Attenuated Salmonella typhimurium strains, engineered or unengineered for recombinant expression of heterologous antigens, and their use as oral vaccines are described in Nakayama et al., Bio / Tech.
No. 6: 693 (1988) and WO 92/11361. Preferred routes of administration include all mucosal routes; most preferably,
These vectors are administered intranasally or orally.
【0075】 ワクチンベクターとして有用な他の細菌株は、Highら、EMBO 11:
1991(1992);Sizemoreら、Science 270:299
(1995)(Shigella flexneri);Medagliniら
、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:6868(1995
)(Streptococcus gordonii);およびFlynn、C
ell.Mol.Biol.40:31(1994)、WO 88/6626、
WO 90/0594、WO 91/13157、WO 92/1796、およ
びWO 92/21376(Bacille Calmette Guerin
)に記載される。Other bacterial strains useful as vaccine vectors are described in High et al., EMBO 11:
1991 (1992); Sizemore et al., Science 270: 299.
(1995) (Shigella flexneri); Medaglini et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92: 6868 (1995)
) (Streptococcus gordonii); and Flynn, C
ell. Mol. Biol. 40:31 (1994), WO 88/6626,
WO 90/05594, WO 91/13157, WO 92/1796, and WO 92/21376 (Bacille Calmette Guerin)
).
【0076】 細菌ベクターに従って、本発明のポリヌクレオチドは、細菌ゲノムに挿入され
得るか、または、プラスミドに含まれて、遊離の状態で残存し得る。Depending on the bacterial vector, the polynucleotides of the present invention may be inserted into the bacterial genome or may be included in a plasmid and remain free.
【0077】 アジュバントはまた、ワクチン細菌ベクターを含む組成物に添加され得る。多
数のアジュバントが当業者に公知である。好ましいアジュバントは、以下に提供
されるリストから選択され得る。An adjuvant may also be added to the composition containing the vaccine bacterial vector. Numerous adjuvants are known to those skilled in the art. Preferred adjuvants may be selected from the list provided below.
【0078】 本発明の第4の局面において、以下がまた提供される:(i)希釈剤またはキ
ャリアとともに、本発明のポリヌクレオチドを含む組成物;(ii)本発明のポ
リヌクレオチドの治療的または予防的有効量を含む薬学的組成物;(iii)哺
乳動物においてChlamydiaに対する免疫応答を誘導するための方法であ
って、この方法は、哺乳動物に、免疫原的有効量の本発明のポリヌクレオチドを
投与して、免疫応答(例えば、Chlamydiaに対する防御的免疫応答)を
誘発する工程による、方法;および、特に、(iv)Chlamydia(例え
ば、C.trachomatis、C.psittaci、C.pneumon
iae、またはC.pecorum)感染を予防および/または処置するための
方法であって、この方法は、必要がある個体に本発明のポリヌクレオチドの予防
的または治療的量を投与する工程による、方法。さらに、本発明の第4の局面は
、Chlamydia感染を予防および/または処置するための医薬の調製にお
ける本発明のポリヌクレオチドの使用を包含する。本発明の第4の局面は、好ま
しくは、哺乳動物細胞における発現のための条件下におかれたDNA分子(例え
ば、哺乳動物細胞中で複製できず、かつ哺乳動物ゲノム中に実質的に組み込まれ
得ないプラスミド中で)の使用を含む。In a fourth aspect of the invention, there is also provided: (i) a composition comprising a polynucleotide of the invention together with a diluent or carrier; (ii) a therapeutic or A pharmaceutical composition comprising a prophylactically effective amount; (iii) a method for inducing an immune response against Chlamydia in a mammal, the method comprising: providing a mammal with an immunogenically effective amount of a polynucleotide of the invention. By inducing an immune response (eg, a protective immune response against Chlamydia); and, in particular, (iv) Chlamydia (eg, C. trachomatis, C. psittaci, C. pneumon).
iae, or C.I. pecorum) A method for preventing and / or treating an infection, the method comprising administering to a subject in need thereof a prophylactic or therapeutic amount of a polynucleotide of the present invention. Further, a fourth aspect of the present invention encompasses the use of a polynucleotide of the present invention in the preparation of a medicament for preventing and / or treating Chlamydia infection. A fourth aspect of the present invention relates to a DNA molecule, preferably placed under conditions for expression in a mammalian cell (eg, unable to replicate in a mammalian cell and substantially integrated into a mammalian genome). (In plasmids that cannot be used).
【0079】 本発明のポリヌクレオチド(DNAまたはRNA)はまた、それ自体ワクチン
目的(例えば、治療目的または予防目的)のために哺乳動物に投与され得る。本
発明のDNA分子が使用される場合、それは哺乳動物細胞中で複製され得ず、か
つ哺乳動物ゲノムに組み込まれ得ないプラスミドの形態においてであり得る。代
表的には、DNA分子は、哺乳動物細胞における発現に適切なプロモーターの制
御下におかれる。そのプロモーターは、遍在的にかまたは組織特異的に機能し得
る。非組織特異的なプロモーターの例には、初期サイトメガロウイルス(CMV
)プロモーター(米国特許第4,168,062号に記載される)、およびラウ
ス肉腫ウイルスプロモーター(Norton&Coffin,Molec.Ce
ll Biol.5:281(1985)に記載される)が含まれる。デスミン
プロモーター(Liら、Gene 78:243(1989)、Li&Paul
in,J.Biol.Chem.266:6562(1991)、およびLi&
Paulin,J.Biol.Chem.268:10403(1993))は
、組織特異的であり、そして筋肉細胞における発現を駆動する。より一般的には
、有用なベクターは、とりわけ、WO 94/21797およびHartikk
aら、Human Gene Therapy 7:1205(1996)に記
載される。The polynucleotides (DNA or RNA) of the present invention can also be administered to a mammal for vaccine purposes, eg, for therapeutic or prophylactic purposes. When a DNA molecule of the present invention is used, it may be in the form of a plasmid that cannot be replicated in mammalian cells and that cannot be integrated into the mammalian genome. Typically, the DNA molecule will be under the control of a promoter appropriate for expression in mammalian cells. The promoter can function ubiquitously or tissue-specific. Examples of non-tissue specific promoters include early cytomegalovirus (CMV)
) Promoter (described in U.S. Patent No. 4,168,062), and the Rous sarcoma virus promoter (Norton & Coffin, Molec. Ce).
11 Biol. 5: 281 (1985)). Desmin promoter (Li et al., Gene 78: 243 (1989), Li & Paul)
in, J .; Biol. Chem. 266: 6562 (1991), and Li &
Paulin, J. et al. Biol. Chem. 268: 10403 (1993)) are tissue-specific and drive expression in muscle cells. More generally, useful vectors are, inter alia, WO 94/21797 and Hartikk.
a, et al., Human Gene Therapy 7: 1205 (1996).
【0080】 DNA/RNAワクチン投与のために、本発明のポリヌクレオチドは、前駆体
型または成熟型をコードし得る。それが前駆体型をコードする場合、前駆体型は
同種または異種であり得る。後者の場合において、組織型プラスミノーゲン因子
(tPA)リーダー配列のような真核生物リーダー配列が使用され得る。For DNA / RNA vaccination, the polynucleotides of the invention may encode the precursor form or the mature form. If it encodes a precursor type, the precursor type can be homogeneous or heterogeneous. In the latter case, a eukaryotic leader sequence such as a tissue type plasminogen factor (tPA) leader sequence may be used.
【0081】 本発明の組成物は、本発明の1つまたはいくつかのポリヌクレオチドを含み得
る。それはまた、別のChlamydia抗原あるいはそのフラグメント、誘導
体、変異体、またはアナログをコードする少なくとも1つのさらなるポリヌクレ
オチドを含み得る。サイトカイン(例えば、インターロイキン−2(IL−2)
またはインターロイキン−12(IL−12))をコードするポリヌクレオチド
もまた、この組成物に添加され得、その結果、免疫応答が増強される。これらの
さらなるポリヌクレオチドは、発現のために適切な制御下におかれる。有利には
、同じ組成物中に含まれる本発明のDNA分子および/またはさらなるDNA分
子は、同じプラスミド中に含まれ得る。[0081] The compositions of the invention may comprise one or several polynucleotides of the invention. It may also include at least one additional polynucleotide encoding another Chlamydia antigen or fragment, derivative, variant, or analog thereof. Cytokines (eg, interleukin-2 (IL-2)
Alternatively, a polynucleotide encoding interleukin-12 (IL-12)) can also be added to the composition, resulting in an enhanced immune response. These additional polynucleotides are under appropriate control for expression. Advantageously, the DNA molecules of the invention and / or further DNA molecules contained in the same composition may be contained in the same plasmid.
【0082】 ポリヌクレオチドを調製および精製するための分子生物学の標準的な技術は、
本発明のポリヌクレオチド治療剤の調製において使用され得る。ワクチンとして
の使用のために、本発明のポリヌクレオチドは、種々の方法に従って処方され得
る。Standard techniques of molecular biology for preparing and purifying polynucleotides include:
It can be used in the preparation of a polynucleotide therapeutic of the invention. For use as a vaccine, the polynucleotides of the invention can be formulated according to various methods.
【0083】 第1に、ポリヌクレオチドは、裸の形態、すなわち、任意の送達ビヒクル(例
えば、アニオン性リポソーム、カチオン性脂質、微粒子(例えば、金微粒子)、
沈殿剤(例えば、リン酸カルシウム)、または任意の他のトランスフェクション
促進剤)なしで、使用され得る。この場合において、このポリヌクレオチドは、
単に生理学的に受容可能な溶液(例えば、滅菌生理食塩水または滅菌緩衝化生理
食塩水)中に、キャリアとともにまたはキャリアなしで、希釈され得る。存在す
る場合、そのキャリアは、好ましくは、等張性、低張性、または弱い高張性であ
り、そして、ショ糖溶液(例えば、20%ショ糖を含む溶液)によって提供され
るような、相対的に低いイオン強度を有する。First, the polynucleotide is in a naked form, ie, any delivery vehicle (eg, anionic liposomes, cationic lipids, microparticles (eg, gold microparticles),
It can be used without a precipitant, such as calcium phosphate, or any other transfection facilitating agent. In this case, the polynucleotide is
It can be diluted simply in a physiologically acceptable solution, such as sterile saline or sterile buffered saline, with or without a carrier. When present, the carrier is preferably isotonic, hypotonic, or weakly hypertonic and relative to one another, such as provided by a sucrose solution (eg, a solution containing 20% sucrose). It has an extremely low ionic strength.
【0084】 あるいは、ポリヌクレオチドは、細胞の取り込みを補助する薬剤と付随され得
る。それは、とりわけ、(i)ブピバカイン(例えば、WO 94/16737
を参照のこと)のような細胞の透過性を改変する化学薬剤で補充されるか、(i
i)リポソーム中にカプセル化されるか、あるいは(iii)カチオン性脂質、
または、シリカ微粒子、金微粒子、もしくはタングステン微粒子と付随され得る
。[0084] Alternatively, the polynucleotide may be associated with an agent that aids cellular uptake. It includes, inter alia, (i) bupivacaine (eg, WO 94/16737)
Supplemented with chemical agents that modify the permeability of cells, such as (i.
i) encapsulated in liposomes or (iii) cationic lipids,
Alternatively, it can be accompanied by silica fine particles, gold fine particles, or tungsten fine particles.
【0085】 アニオン性リポソームおよび中性リポソームは当該分野で周知であり(例えば
、リポソームの作製方法についての詳細な記載については、Liposomes
:A Practical Approach,RPC New Ed.IRL
press(1990)を参照のこと)、そして広い範囲の産物(ポリヌクレ
オチドを含む)を送達するために有用である。Anionic liposomes and neutral liposomes are well known in the art (eg, see Liposomes for a detailed description of how to make liposomes).
: A Practical Approach, RPC New Ed. IRL
press (1990)), and are useful for delivering a wide range of products, including polynucleotides.
【0086】 カチオン性脂質はまた、当該分野で公知であり、そして遺伝子送達のために一
般に使用される。このような脂質は、LipofectinTM(DOTMA(N
−[1−(2,3−ジオレイルオキシ)プロピル]−N,N,N−トリメチルア
ンモニウムクロライド)としても知られる)、DOTAP(1,2−ビス(オレ
イルオキシ)−3−(トリメチルアンモニオ)プロパン)、DDAB(ジメチル
ジオクタデシルアンモニウムブロマイド)、DOGS(ジオクタデシルアミドロ
グリシルスペルミン(dioctadecylamidologlycylsp
ermine))およびコレステロール誘導体(例えば、DC−Chol(3β
−(N−(N’,N’−ジメチルアミノメタン)−カルバモイル)コレステロー
ル))を含む。これらのカチオン性脂質の記載は、EP 187,702、WO
90/11092、米国特許第5,283,185号、WO 91/1550
1、WO 95/26356、および米国特許第5,527,928号に見出さ
れ得る。遺伝子送達のためのカチオン性脂質は、好ましくは、例えばWO 90
/11092に記載されるように、中性脂質(例えば、DOPE(ジオレイルホ
スファチジルエタノールアミン))と付随して使用される。[0086] Cationic lipids are also known in the art and are commonly used for gene delivery. Such lipids are known as Lipofectin ™ (DOTMA (N
-[1- (2,3-dioleyloxy) propyl] -N, N, N-trimethylammonium chloride)), DOTAP (1,2-bis (oleyloxy) -3- (trimethylammonio) ) Propane), DDAB (dimethyldioctadecyl ammonium bromide), DOGS (dioctadecylamidologlysyl spermine)
ermine)) and cholesterol derivatives (eg, DC-Chol (3β
-(N- (N ', N'-dimethylaminomethane) -carbamoyl) cholesterol)). Descriptions of these cationic lipids are given in EP 187,702, WO
90/11092, U.S. Pat. No. 5,283,185, WO 91/1550
1, WO 95/26356, and US Pat. No. 5,527,928. The cationic lipid for gene delivery is preferably, for example, WO 90
/ 11092, as used in conjunction with neutral lipids such as DOPE (dioleyl phosphatidylethanolamine).
【0087】 他のトランスフェクション促進化合物は、カチオン性リポソームを含む処方物
に添加され得る。それらの多くは、例えば、WO 93/18759、WO 9
3/19768、WO 94/25608、およびWO95/2397に記載さ
れる。それらには、とりわけ、核膜を通してのDNAの輸送を容易にするために
有用なスペルミン誘導体(例えば、WO 93/18759を参照のこと)、お
よび膜透過化合物(例えば、GALA、グラミシジンS、およびカチオン性胆汁
酸塩)(例えば、WO 93/19768を参照のこと)が含まれる。[0087] Other transfection facilitating compounds may be added to the formulation containing the cationic liposomes. Many of them are described, for example, in WO 93/18759, WO 9
3/19768, WO 94/25608, and WO 95/2397. They include, inter alia, spermine derivatives useful for facilitating the transport of DNA across the nuclear membrane (see, eg, WO 93/18759), and membrane permeable compounds (eg, GALA, gramicidin S, and cations). Sex bile salts) (see, for example, WO 93/19768).
【0088】 金微粒子またはタングステン微粒子もまた、WO 91/359、WO 93
/17706、およびTangら(Nature 356:152(1992)
)に記載されるように、遺伝子送達のために使用され得る。この場合において、
微粒子コートされたポリヌクレオチドは、針を使わない注射デバイス(「遺伝子
銃」)(例えば、米国特許第4,945,050号、同第5,015,580号
、およびWO 94/24263に記載されるデバイス)を使用して、皮内また
は上皮内経路を介して注入され得る。Gold or tungsten microparticles are also described in WO 91/359, WO 93
/ 17706, and Tang et al. (Nature 356: 152 (1992)
), Can be used for gene delivery. In this case,
Microparticle-coated polynucleotides have been described in needleless injection devices ("gene guns") (see, e.g., U.S. Patent Nos. 4,945,050, 5,015,580, and WO 94/24263). Can be injected via the intradermal or intraepithelial route.
【0089】 ワクチンレシピエントにおいて使用されるDNAの量は、例えば、DNA構築
物において使用されるプロモーターの強さ、発現された遺伝子産物の免疫原性、
投与のために意図される哺乳動物の状態(例えば、体重、齢、および哺乳動物の
一般的健康)、投与の様式、および処方の型に依存する。一般的に、約1μg〜
約1mg、好ましくは約10μg〜約800μg、そしてより好ましくは、約2
5μg〜約250μgの治療的または予防的有効用量が、ヒト成体に投与され得
る。この投与は、単回用量または間隔をあけて反復して達成され得る。The amount of DNA used in a vaccine recipient depends, for example, on the strength of the promoter used in the DNA construct, the immunogenicity of the expressed gene product,
It depends on the intended condition of the mammal for administration (eg, body weight, age, and general health of the mammal), the mode of administration, and the type of formulation. Generally, from about 1 μg to
About 1 mg, preferably about 10 μg to about 800 μg, and more preferably about 2 μg
A therapeutically or prophylactically effective dose of 5 μg to about 250 μg can be administered to adult humans. This administration can be accomplished in a single dose or repeatedly at intervals.
【0090】 投与の経路は、ワクチンの分野において使用される従来的な経路のいずれかで
あり得る。一般的なガイダンスとして、本発明のポリヌクレオチドは、粘膜表面
(例えば、眼、鼻内、肺、口、腸、直腸、膣、および尿路の表面);または非経
口経路(例えば、静脈内、皮下、腹腔内、皮内、上皮内、または筋肉内の経路に
よる)を介して投与され得る。投与経路の選択は、例えば、選択される処方に依
存する。ブピバカインと付随して処方されるポリヌクレオチドは、有利に筋肉に
投与される。中性リポソームもしくはアニオン性リポソームまたはカチオン性脂
質(例えば、DOTMAまたはDC−Chol)が使用される場合、その処方物
は、静脈内経路、鼻内経路(エーロゾル適用)、筋肉内経路、皮内経路、および
皮下経路を介して、有利に注入され得る。裸の形態のポリヌクレオチドは、筋肉
内経路、皮内経路、または皮下経路を介して、有利に投与され得る。The route of administration may be any of the conventional routes used in the field of vaccines. As general guidance, polynucleotides of the present invention may be administered to mucosal surfaces (eg, ocular, nasal, lung, oral, intestinal, rectal, vaginal, and urinary tract surfaces); or parenteral routes (eg, intravenous, (By subcutaneous, intraperitoneal, intradermal, intraepithelial, or intramuscular route). The choice of the route of administration depends, for example, on the formulation chosen. The polynucleotide formulated with bupivacaine is advantageously administered to muscle. If neutral or anionic liposomes or cationic lipids (eg, DOTMA or DC-Chol) are used, the formulation may be intravenous, intranasal (aerosol applied), intramuscular, intradermal. , And via the subcutaneous route. Naked forms of the polynucleotides may be advantageously administered via the intramuscular, intradermal, or subcutaneous routes.
【0091】 絶対的に必要であるのではないが、このような組成物はまた、アジュバントを
含み得る。そうである場合、アジュバント効果を示すために併用投与を必要とし
ない全身性のアジュバント(例えば、QS21であり、これは、米国特許第5,
057,546号に記載される)が、好ましい。[0091] Although not absolutely necessary, such compositions may also include an adjuvant. If so, a systemic adjuvant that does not require co-administration to exhibit an adjuvant effect (eg, QS21, which is described in US Pat.
057,546) are preferred.
【0092】 本出願において提供される配列情報は、診断において有用であり得る特定のヌ
クレオチドプローブおよびプライマーの設計を可能にする。従って、本発明の第
5の局面において、配列番号1、3、5、7、9、11、13および15に示さ
れる配列に見出される配列か、またはこれらの配列から遺伝コードの縮重によっ
て誘導される配列を有するヌクレオチドプローブまたはプライマーが提供される
。The sequence information provided in the present application allows for the design of particular nucleotide probes and primers that may be useful in diagnosis. Accordingly, in a fifth aspect of the invention, the sequences found in the sequences shown in SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 and 15 or derived from these sequences by degeneracy of the genetic code A nucleotide probe or primer having the sequence to be provided is provided.
【0093】 本出願において使用される場合、用語「プローブ」とは、上記に定義されるよ
うなストリンジェントな条件下で、配列番号1、3、5、7、9、11、13お
よび15に示される配列と相同な配列を有する核酸分子に、または相補的な配列
もしくはアンチセンス配列にハイブリダイズする、DNA分子(好ましくは一本
鎖)またはRNA分子(またはその修飾物もしくは組合せ)をいう。一般的に、
プローブは、配列番号1、3、5、7、9、11、13および15に示される全
長配列よりも有意に短く;例えば、それらは約5〜約100、好ましくは約10
〜約80ヌクレオチドを含み得る。特に、プローブは、配列番号1、3、5、7
、9、11、13および15に示される配列の一部に少なくとも75%、好まし
くは少なくとも85%、より好ましくは95%相同である配列、またはこのよう
な配列に相補的である配列を有する。プローブは、イノシン、メチル−5−デオ
キシシチジン、デオキシウリジン、ジメチルアミノ−5−デオキシウリジン、ま
たはジアミノ−2,6−プリンのような修飾した塩基を含み得る。糖またはリン
酸残基もまた、修飾または置換され得る。例えば、デオキシリボース残基は、ポ
リアミドによって置換され得(Nielsenら、Science 254:1
497(1991))、そしてリン酸残基は、エステル基(例えば、ジホスフェ
ートエステル、アルキルエステル、アリールホスホネートエステル、およびホス
ホロチオエートエステル)によって置換され得る。さらに、リボヌクレオチドの
2’−ヒドロキシル基は、例えば、アルキル基を含むことによって修飾され得る
。As used in this application, the term “probe” refers to SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 and 15 under stringent conditions as defined above. A DNA molecule (preferably single-stranded) or RNA molecule (or a modification or combination thereof) that hybridizes to a nucleic acid molecule having a sequence homologous to the indicated sequence, or to a complementary or antisense sequence. Typically,
Probes are significantly shorter than the full-length sequence shown in SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 and 15; for example, they are about 5 to about 100, preferably about 10
〜80 nucleotides. In particular, the probes have SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7
, 9, 11, 13 and 15 have a sequence that is at least 75%, preferably at least 85%, more preferably 95% homologous, or a sequence that is complementary to such a sequence. Probes can include modified bases such as inosine, methyl-5-deoxycytidine, deoxyuridine, dimethylamino-5-deoxyuridine, or diamino-2,6-purine. Sugar or phosphate residues can also be modified or substituted. For example, a deoxyribose residue may be replaced by a polyamide (Nielsen et al., Science 254: 1).
497 (1991)), and phosphate residues can be substituted by ester groups such as diphosphate esters, alkyl esters, aryl phosphonate esters, and phosphorothioate esters. In addition, the 2'-hydroxyl group of a ribonucleotide can be modified, for example, by including an alkyl group.
【0094】 本発明のプローブは、捕捉または検出プローブとして、診断試験において使用
され得る。このような捕捉プローブは、共有結合的手段によって、または受動的
吸着によって、直接的または間接的に、従来どおりに固体支持体上に固定化され
得る。検出プローブは、放射性同位元素;酵素(例えば、ペルオキシダーゼ、ア
ルカリホスファターゼ、および色素産生基質、蛍光産生基質、または発光性基質
を加水分解し得る酵素);色素産生、蛍光産生または発光性である化合物;ヌク
レオチド塩基アナログ;ならびにビオチン、から選択される検出マーカーによっ
て標識され得る。The probes of the present invention can be used in diagnostic tests as capture or detection probes. Such capture probes can be conventionally immobilized on a solid support, directly or indirectly, by covalent means or by passive adsorption. The detection probe is a radioisotope; an enzyme (eg, an enzyme capable of hydrolyzing peroxidase, alkaline phosphatase, and a chromogenic, fluorogenic, or luminescent substrate); a compound that is chromogenic, fluorogenic, or luminescent; Nucleotide base analogs; and biotin.
【0095】 本発明のプローブは、例えば、ドットブロット(Maniatisら、Mol
ecular Cloning:A Laboratory Manual(1
982)Cold Spring Harbor Laboratory Pr
ess,Cold Spring Harbor,New York)、サザン
ブロット(Southern,J.Mol.Biol.98:503(1975
))、ノーザンブロット(標的としてRNAが使用される以外は、サザンブロッ
トと同一である)、またはサンドウィッチ技術(Dunnら、Cell 12:
23(1977))のような任意の慣用的なハイブリダイゼーション技術におい
て使用され得る。後者の技術は、少なくとも部分的に互いに異なるヌクレオチド
配列とともに、特異的な捕捉プローブおよび/または特異的な検出プローブの使
用を含む。The probes of the present invention can be used, for example, in dot blots (Maniatis et al., Mol.
ecological Cloning: A Laboratory Manual (1
982) Cold Spring Harbor Laboratory Pr
ess, Cold Spring Harbor, New York, Southern Blot (Southern, J. Mol. Biol. 98: 503 (1975).
)), Northern blots (same as Southern blots except that RNA is used as the target), or sandwich technology (Dunn et al., Cell 12:
23 (1977)) can be used in any conventional hybridization technique. The latter technique involves the use of specific capture probes and / or specific detection probes, with nucleotide sequences at least partially different from each other.
【0096】 プライマーは、通常、増幅プロセス(例えば、PCR)において、伸長プロセ
スにおいて、または逆転写方法において、DNAの酵素的重合を開始するために
使用される約10〜約40ヌクレオチドのプローブである。PCRを含む診断的
方法において、プライマーは標識され得る。A primer is typically a probe of about 10 to about 40 nucleotides used to initiate enzymatic polymerization of DNA in an amplification process (eg, PCR), in an extension process, or in a reverse transcription method. . In diagnostic methods, including PCR, primers can be labeled.
【0097】 従って、本発明はまた、(i)生物学的材料においてChlamydiaの存
在を検出および/または同定するための本発明のプローブを含む試薬;(ii)
生物学的材料においてChlamydiaの存在を検出および/または同定する
ための方法であって、ここで(a)サンプルが生物学的材料から回収されるかま
たは生物学的材料に由来し、(b)この材料からDNAまたはRNAが抽出され
、そして変性され;そして(c)本発明のプローブ(例えば、捕捉プローブ、検
出プローブ、またはその両方)に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション
条件下で曝露され、その結果、ハイブリダイゼーションが検出される、方法;な
らびに(iii)生物学的材料においてChlamydiaの存在を検出および
/または同定するための方法であって、ここで、(a)サンプルが生物学的材料
から回収されるかまたは生物学的材料に由来し、(b)DNAがそこから抽出さ
れ、(c)本発明の少なくとも1つ、好ましくは2つのプライマーを用いて、抽
出されたDNAがプライムされ、そしてポリメラーゼ連鎖反応によって増幅され
、そして(d)増幅されたDNAフラグメントが産生される、方法、を包含する
。Accordingly, the present invention also provides (i) a reagent comprising a probe of the present invention for detecting and / or identifying the presence of Chlamydia in a biological material; (ii)
A method for detecting and / or identifying the presence of Chlamydia in a biological material, wherein (a) the sample is recovered from or derived from the biological material, DNA or RNA is extracted from this material and denatured; and (c) exposed to a probe of the invention (eg, a capture probe, a detection probe, or both) under stringent hybridization conditions, and A method for detecting and / or identifying the presence of Chlamydia in a biological material, wherein (a) recovering a sample from the biological material Or derived from biological material, (b) DNA is extracted therefrom, and (c) the DNA of the present invention One even without preferably includes using two primers, the extracted DNA is primed, and is amplified by polymerase chain reaction, and (d) the amplified DNA fragment is produced, a method, a.
【0098】 以前に言及したように、新しく同定されたオープンリーディングフレームの発
現に際して産生され得るポリペプチドは、有用なワクチン薬剤である。As previously mentioned, polypeptides that can be produced upon expression of a newly identified open reading frame are useful vaccine agents.
【0099】 従って、本発明の第6の局面は、本発明のポリヌクレオチドによってコードさ
れるアミノ酸配列を有する、実質的に精製されたポリペプチドまたはポリペプチ
ド誘導体を特徴とする。Accordingly, a sixth aspect of the invention features a substantially purified polypeptide or polypeptide derivative having an amino acid sequence encoded by a polynucleotide of the invention.
【0100】 「実質的に精製されたポリペプチド」は、天然にそのポリペプチドが存在する
環境から分離されたポリペプチド、および/またはそのポリペプチドが合成され
た環境中に存在するポリペプチドの大部分を含まないポリペプチドとして定義さ
れる。例えば、実質的に精製されたポリペプチドは、細胞質ポリペプチドを含ま
ない。当業者は、本発明のポリペプチドが、天然の供給源(すなわち、Chla
mydia株)から精製され得るか、または組換え手段によって産生され得るこ
とを理解する。A “substantially purified polypeptide” is a polypeptide that has been separated from the environment in which it naturally occurs and / or the polypeptide present in the environment in which it was synthesized. It is defined as a polypeptide that does not contain a moiety. For example, a substantially purified polypeptide does not include a cytoplasmic polypeptide. One skilled in the art will appreciate that the polypeptides of the present invention can be obtained from natural sources (ie, Chla).
mydia strain) or may be produced by recombinant means.
【0101】 本発明のポリヌクレオチドによってコードされる相同なポリペプチドまたはポ
リペプチド誘導体を、配列番号2、4、6、8、10、12、14および16に
示されるアミノ酸配列を有する参照ポリペプチドに対して惹起された抗血清を用
いる交差反応の試験によって、特異的抗原性についてスクリーニングし得る。手
短には、単一特異的過免疫抗血清を、それ自体としてまたは融合ポリペプチドと
しての精製された参照ポリペプチド(例えば、MBP、GST、またはHis−
タグ系の発現産物、あるいは抗原性であることが予測される合成ペプチド)に対
して惹起され得る。特異的抗原性についてスクリーニングされる相同ポリペプチ
ドまたは誘導体は、それ自体としてか、または融合ポリペプチドとして産生され
得る。後者の場合であって、抗血清がまた、融合ポリペプチドに対して惹起され
る場合、2つの異なる融合系が使用される。特異的抗原性は、以下に記載するよ
うに、ウェスタンブロット(Towbinら、Proc.Natl.Acad.
Sci.USA 76:4350(1979))、ドットブロット、およびEL
ISAを含む多数の方法に従って決定され得る。A homologous polypeptide or polypeptide derivative encoded by a polynucleotide of the present invention is converted to a reference polypeptide having the amino acid sequence shown in SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, and 16. Testing for cross-reactivity with the raised antisera can screen for specific antigenicity. Briefly, a monospecific hyperimmune antiserum is purified by itself or as a fusion polypeptide, using a purified reference polypeptide (eg, MBP, GST, or His-
Tag-based expression products, or synthetic peptides that are predicted to be antigenic). Homologous polypeptides or derivatives to be screened for specific antigenicity can be produced as such or as fusion polypeptides. In the latter case, where an antiserum is also raised against the fusion polypeptide, two different fusion systems are used. Specific antigenicity was determined by Western blot (Towbin et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 76: 4350 (1979)), dot blots, and EL
It can be determined according to a number of methods, including ISA.
【0102】 ウェスタンブロットアッセイにおいて、スクリーニングするべき産物を、精製
された調製物としてか、またはE.coli全抽出物のいずれかとして、Lae
mmli(Nature 227:680(1970))によって記載されるよ
うに、SDS−PAGE電気泳動に供する。ニトロセルロース膜に転写した後、
この材料をさらに、約1:5〜約1:5000、好ましくは約1:100〜約1
:500の希釈の範囲で希釈された単一特異的過免疫抗血清とともに、インキュ
ベートする。特異的抗原性は、一旦、産物に対応するバンドが上記の範囲におけ
る任意の希釈での反応性を示すと、示される。In a Western blot assay, the products to be screened were purified as purified preparations or E. coli. E. coli whole extract, Lae
Subject to SDS-PAGE electrophoresis as described by mmli (Nature 227: 680 (1970)). After transferring to nitrocellulose membrane,
The material is further added to about 1: 5 to about 1: 5000, preferably about 1: 100 to about 1
: Incubate with monospecific hyperimmune antiserum diluted in a range of 500 dilutions. Specific antigenicity is indicated once the band corresponding to the product shows reactivity at any dilution in the above range.
【0103】 ELISAアッセイにおいて、スクリーニングされるべき産物は、好ましくは
、コーティングする抗原として使用される。精製された産物が好ましいが、全細
胞抽出物もまた、使用され得る。手短には、約10μgタンパク質/mlでの約
100μlの調製物を、96ウェルポリカーボネートELISAプレートのウェ
ル中に分配する。このプレートを、37℃で2時間、次に4℃で一晩インキュベ
ートする。このプレートを、0.05%のTween20を含むリン酸緩衝化生
理食塩水(PBS)(PBS/Tween緩衝液)で洗浄する。ウェルを1%の
ウシ血清アルブミン(BSA)を含む250μlのPBSで満たし、非特異的抗
体結合を防ぐ。37℃での1時間のインキュベーションの後、このプレートをP
BS/Tween緩衝液で洗浄する。抗血清を、0.5%のBSAを含有するP
BS/Tween緩衝液中で、連続的に希釈する。希釈液の100μlを、1ウ
ェルあたりに添加する。このプレートを、37℃で90分間インキュベートし、
洗浄し、そして標準的な手順に従って評価する。例えば、特異的抗体がウサギに
おいて惹起された場合、ヤギ抗ウサギペルオキシダーゼ結合体を、ウェルに添加
する。インキュベーションを37℃で90分間行い、そしてこのプレートを洗浄
する。反応物を適切な基質を用いて発色させ、そしてこの反応を比色法によって
測定する(分光光度的に測定した吸光度)。上記の実験条件下で、ポジティブ反
応が、非免疫コントロール血清よりも大きなO.D.値によって示される。In an ELISA assay, the product to be screened is preferably used as a coating antigen. Although purified products are preferred, whole cell extracts can also be used. Briefly, about 100 μl of the preparation at about 10 μg protein / ml is dispensed into the wells of a 96-well polycarbonate ELISA plate. The plate is incubated at 37 ° C. for 2 hours and then at 4 ° C. overnight. The plate is washed with phosphate buffered saline (PBS) containing 0.05% Tween 20 (PBS / Tween buffer). Fill wells with 250 μl of PBS containing 1% bovine serum albumin (BSA) to prevent non-specific antibody binding. After 1 hour incubation at 37 ° C., the plate is
Wash with BS / Tween buffer. The antiserum was prepared using P containing 0.5% BSA.
Dilute serially in BS / Tween buffer. Add 100 μl of diluent per well. The plate is incubated at 37 ° C. for 90 minutes,
Wash and evaluate according to standard procedures. For example, if specific antibodies were raised in rabbits, goat anti-rabbit peroxidase conjugate is added to the wells. Incubation is performed at 37 ° C. for 90 minutes, and the plate is washed. The reaction is developed with the appropriate substrate and the reaction is measured by colorimetry (absorbance measured spectrophotometrically). Under the experimental conditions described above, a positive reaction resulted in a greater O.D. than non-immune control sera. D. Indicated by value.
【0104】 ドットブロットアッセイにおいて、精製された産物が好ましいが、全細胞抽出
物もまた、使用され得る。手短には、約100μl/mlの産物の溶液を、50
mM Tris−HCl(pH 7.5)中で連続的に2倍希釈する。各希釈液
の100μlを、96ウェルのドットブロット装置(Biorad)中にセット
したニトロセルロース膜0.45μmにアプライする。このシステムに真空を適
用することによって緩衝液を取り除く。ウェルを、50mM Tris−HCl
(pH7.5)の添加によって洗浄し、そしてその膜を風乾する。その膜をブロ
ッキング緩衝液(50mM Tris−HCl(pH7.5) 0.15M N
aCl、10g/L スキムミルク)中に浸し、約1:50〜約1:5000、
好ましくは約1:500の希釈の抗血清とともに、インキュベートする。反応を
標準的な手順に従って明らかにする。例えば、ウサギ抗体が使用される場合、ヤ
ギ抗ウサギペルオキシダーゼ結合体を、ウェルに添加する。インキュベーション
を37℃で90分間行い、そしてこのブロットを洗浄する。反応物を適切な基質
を用いて発色させ、そして終了する。この反応を、着色したスポットの出現によ
って可視的に定量する(例えば、比色法)。上記の実験条件下で、一旦、着色し
たスポットが、少なくとも約1:5、好ましくは少なくとも約1:500の希釈
に付随すると、ポジティブ反応が示される。In a dot blot assay, purified products are preferred, but whole cell extracts can also be used. Briefly, a solution of about 100 μl / ml of the product is
Dilute serially 2-fold in mM Tris-HCl (pH 7.5). 100 μl of each dilution is applied to a 0.45 μm nitrocellulose membrane set in a 96-well dot blot apparatus (Biorad). The buffer is removed by applying a vacuum to the system. Wells were filled with 50 mM Tris-HCl
Wash by adding (pH 7.5) and air dry the membrane. The membrane was treated with a blocking buffer (50 mM Tris-HCl (pH 7.5) 0.15 M N
aCl, 10 g / L skim milk), from about 1:50 to about 1: 5000,
Incubate with antiserum, preferably at a dilution of about 1: 500. The reaction is revealed according to standard procedures. For example, if a rabbit antibody is used, a goat anti-rabbit peroxidase conjugate is added to the well. Incubation is performed at 37 ° C. for 90 minutes, and the blot is washed. The reaction is developed with the appropriate substrate and terminated. The reaction is quantified visually by the appearance of a colored spot (eg, a colorimetric method). Under the experimental conditions described above, once a colored spot is associated with a dilution of at least about 1: 5, preferably at least about 1: 500, a positive reaction is indicated.
【0105】 本発明のポリペプチドまたは誘導体の治療的または予防的効力は、下記のよう
に評価され得る。The therapeutic or prophylactic efficacy of a polypeptide or derivative of the present invention can be assessed as follows.
【0106】 本発明の第7の局面に従って、以下が提供される(i)希釈剤またはキャリア
とともに本発明のポリペプチドを含有する組成物;特に(ii)本発明のポリペ
プチドの治療的または予防的有効量を含む薬学的組成物;(iii)免疫応答を
誘発するための本発明のポリペプチドの免疫学的有効量を哺乳動物に投与するこ
とによって、哺乳動物においてChlamydiaに対する免疫応答(例えば、
Chlamydiaに対する防御的免疫応答)を誘導する方法;および、特に(
iv)必要とする個体に対して、本発明のポリペプチドの予防的有効量または治
療的有効量を投与することによって、Chlamydia(例えば、C.tra
chomatis、C.psittaci、C.pneumoniae、または
C.pecorum)感染を、予防および/または処置する方法。さらに、本発
明の第7の局面は、Chlamydia感染を予防および/または処置するため
の医薬の調製における、本発明のポリペプチドの使用を包含する。According to a seventh aspect of the present invention there is provided: (i) a composition comprising a polypeptide of the present invention together with a diluent or carrier; in particular (ii) therapeutic or prophylactic treatment of a polypeptide of the present invention. (Iii) administering to a mammal an immunologically effective amount of a polypeptide of the present invention to elicit an immune response, such as an immune response to Chlamydia (e.g.,
A method of inducing a protective immune response against Chlamydia);
iv) by administering to a subject in need thereof a prophylactically or therapeutically effective amount of a polypeptide of the present invention, a Chlamydia (eg, C. tra).
chomatis, C.I. psittaci, C.I. pneumoniae, or C.I. pecorum) A method of preventing and / or treating infection. Furthermore, a seventh aspect of the present invention includes the use of a polypeptide of the present invention in the preparation of a medicament for preventing and / or treating Chlamydia infection.
【0107】 本発明の免疫原性組成物は、ワクチンの分野における使用において、任意の従
来の経路(特に粘膜(例えば、眼、鼻内、肺、経口、胃、腸、直腸、膣、または
尿路)表面に対してか、または非経口(例えば、皮下、皮内、筋肉内、静脈内、
または腹膜内)経路を介して)によって投与され得る。投与経路の選択は、多数
のパラメーター(例えば、ポリペプチドに付随するアジュバント)に依存する。
例えば、粘膜アジュバントが使用される場合、鼻内または経口経路が好ましく、
脂質処方物またはアルミニウム化合物を使用する場合、非経口経路が好ましい。
後者の場合、皮下経路または筋肉内経路が、最も好ましい。この選択はまた、ワ
クチン剤の性質にも依存し得る。例えば、CTBまたはLTBと融合した本発明
のポリペプチドは、粘膜表面に対して、最も良好に投与される。The immunogenic compositions of the present invention may be used in the field of vaccines by any conventional route, especially mucosal (eg, ocular, intranasal, pulmonary, oral, gastric, intestinal, rectal, vaginal, or urine) Tract) surface or parenterally (eg, subcutaneous, intradermal, intramuscular, intravenous,
Or via the intraperitoneal route). The choice of the route of administration will depend on a number of parameters, such as the adjuvant associated with the polypeptide.
For example, if a mucosal adjuvant is used, the intranasal or oral route is preferred,
When using lipid formulations or aluminum compounds, the parenteral route is preferred.
In the latter case, the subcutaneous or intramuscular route is most preferred. The choice may also depend on the nature of the vaccine. For example, a polypeptide of the invention fused to CTB or LTB is best administered to mucosal surfaces.
【0108】 本発明の組成物は、1つまたは数個の本発明のポリペプチドまたは誘導体を含
み得る。本発明の組成物はまた、少なくとも1つのさらなるChlamydia
抗原、またはそのサブユニット、フラグメント、ホモログ、変異体、もしくは誘
導体を含み得る。A composition of the present invention may include one or several polypeptides or derivatives of the present invention. The composition of the present invention may also comprise at least one additional Chlamydia
It may comprise an antigen, or a subunit, fragment, homolog, variant or derivative thereof.
【0109】 本発明の組成物の使用のために、ポリペプチドまたはその誘導体を、リポソー
ム(好ましくは、中性リポソームまたはアニオン性リポソーム)、ミクロスフェ
ア、ISCOMS、またはウイルス様粒子(VLP)中に、またはこれらととも
に処方して、送達を促進し得、そして/または免疫応答を増強し得る。これらの
化合物は、当業者にとって、容易に利用可能である;例えば、LIPOSOME
S:A PRACTICAL APPROACH(上記)を参照のこと。For use of the compositions of the present invention, polypeptides or derivatives thereof are incorporated into liposomes (preferably neutral or anionic liposomes), microspheres, ISCOMS, or virus-like particles (VLPs). Or may be formulated with them to facilitate delivery and / or enhance the immune response. These compounds are readily available to those skilled in the art; for example, LIPOSOME
S: A PRACTICAL APPROACH (see above).
【0110】 リポソームなど以外のアジュバントもまた、使用され得、そして当該分野で公
知である。適切な選択は、当業者によって従来的になされ得る(例えば、以下に
提供されるリストから)。Adjuvants other than liposomes and the like can also be used and are known in the art. Appropriate selections can be made conventionally by one of ordinary skill in the art (eg, from the list provided below).
【0111】 投与は、当業者によって決定され得るように、単回用量において達成され得る
か、または必要に応じて間隔をおいて繰り返され得る。例えば、初回刺激用量の
後、週1回または月1回の間隔での3回の追加免疫用量を続け得る。適切な用量
は、当業者によって決定され得るように、レシピエント(例えば、成人または幼
児)、特定のワクチン抗原、投与の経路および頻度、アジュバントの存在/不存
在またはタイプ、ならびに所望の効果(例えば、防御および/または処置)を含
む種々のパラメーターに依存する。一般に、本発明のワクチン抗原は、約10μ
g〜約500mg、好ましくは約1mg〜約200mgの量において、粘膜経路
によって投与され得る。投与の非経口経路のために、用量は、通常約1mg(好
ましくは、約100μg)を越えるべきではない。Administration can be accomplished in a single dose, or can be repeated at intervals as needed, as can be determined by one skilled in the art. For example, a priming dose may be followed by three booster doses at weekly or monthly intervals. Appropriate doses can be determined by one skilled in the art, as can the recipient (eg, adult or infant), the particular vaccine antigen, the route and frequency of administration, the presence / absence or type of adjuvant, and the desired effect (eg, , Protection and / or treatment). Generally, the vaccine antigens of the present invention have a
It may be administered by a mucosal route in an amount of from g to about 500 mg, preferably from about 1 mg to about 200 mg. For parenteral routes of administration, the dose should generally not exceed about 1 mg (preferably, about 100 μg).
【0112】 ワクチン剤として使用する場合、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチ
ドは、多段階の免疫プロセスの一部として連続的に使用され得る。例えば、哺乳
動物は、ポックスウイルスのような本発明のワクチンベクターを用いて(例えば
、非経口経路を介して)最初に初回刺激され得、次に、ワクチンベクターによっ
てコードされるポリペプチドを用いて2回追加免疫(例えば、粘膜経路を介して
)され得る。別の例において、本発明のポリペプチドまたは誘導体と会合するリ
ポソームはまた、初回刺激のために使用され得、追加免疫が、粘膜アジュバント
(例えば、LT)と組み合わせた本発明の可溶性のポリペプチドまたは誘導体を
使用して粘膜的に行われる。When used as a vaccine, the polynucleotides and polypeptides of the invention can be used sequentially as part of a multi-step immune process. For example, a mammal can be initially primed (eg, via a parenteral route) with a vaccine vector of the invention, such as a poxvirus, and then with a polypeptide encoded by the vaccine vector. Two boosts (eg, via the mucosal route) can be provided. In another example, liposomes associated with a polypeptide or derivative of the present invention can also be used for priming, wherein a booster is administered with a soluble polypeptide of the present invention in combination with a mucosal adjuvant (eg, LT) or It is performed mucosally using derivatives.
【0113】 本発明のポリペプチド誘導体はまた、抗Chlamydia抗体の存在(例え
ば、血液サンプル中)の検出のための診断試薬として有用である。そのようなポ
リペプチドは、約5〜約80、好ましくは約10〜約50アミノ酸長であり、そ
して診断方法に依存して標識されても標識されなくてもよい。そのような試薬を
含む診断方法を、以下に記載する。The polypeptide derivatives of the present invention are also useful as diagnostic reagents for detecting the presence of an anti-Chlamydia antibody (eg, in a blood sample). Such polypeptides are about 5 to about 80, preferably about 10 to about 50 amino acids in length, and may be labeled or unlabeled depending on the diagnostic method. Diagnostic methods involving such reagents are described below.
【0114】 本発明のDNA分子の発現の際に、ポリペプチドまたはポリペプチド誘導体を
産生し、そして公知の実験室技術を使用して精製し得る。例えば、ポリペプチド
またはポリペプチド誘導体は、精製を促進する融合したテールを含む融合タンパ
ク質として産生され得る。融合産物を使用して、ポリペプチドまたはポリペプチ
ド誘導体に対する抗体(単一特異的抗体)を惹起するために、小哺乳動物(例え
ば、マウスまたはウサギ)を免疫し得る。従って、本発明の第8の局面は、本発
明のポリペプチドまたはポリペプチド誘導体に結合する単一特異的抗体を提供す
る。Upon expression of a DNA molecule of the present invention, a polypeptide or polypeptide derivative may be produced and purified using known laboratory techniques. For example, a polypeptide or polypeptide derivative can be produced as a fusion protein containing a fused tail that facilitates purification. The fusion product can be used to immunize a small mammal (eg, a mouse or rabbit) to raise antibodies against the polypeptide or polypeptide derivative (monospecific antibodies). Accordingly, an eighth aspect of the present invention provides a monospecific antibody that binds to a polypeptide or polypeptide derivative of the present invention.
【0115】 「単一特異的抗体」によって、独特の天然に存在するChlamydiaポリ
ペプチドと反応し得る抗体が意味される。本発明の抗体は、ポリクローナル抗体
またはモノクローナル抗体であり得る。単一特異的抗体は、組換え(例えば、キ
メラ(例えば、ヒト定常領域と会合したマウス起源の可変領域から構成される)
、ヒト化(動物(例えば、マウス)起源の超可変領域をともなうヒト免疫グロブ
リン定常骨格)、および/または単鎖)であり得る。ポリクローナル抗体および
単一特異的抗体の両方もまた、免疫グロブリンフラグメント(例えば、F(ab
)’2またはFabフラグメント)の形態であり得る。本発明の抗体は、任意の
アイソタイプ(例えば、IgGまたはIgA)であり得、そしてポリクローナル
抗体は、単一のアイソタイプであっても、アイソタイプの混合物を含んでもよい
。By “monospecific antibody” is meant an antibody capable of reacting with a unique, naturally occurring Chlamydia polypeptide. The antibodies of the present invention can be polyclonal or monoclonal antibodies. Monospecific antibodies are recombinant (eg, chimeric (eg, composed of a variable region of murine origin associated with a human constant region)).
, Humanized (human immunoglobulin constant scaffold with hypervariable regions of animal (eg, mouse) origin), and / or single-chain. Both polyclonal and monospecific antibodies are also immunoglobulin fragments (eg, F (ab
) '2 or Fab fragment). Antibodies of the invention can be of any isotype (eg, IgG or IgA), and polyclonal antibodies can be of a single isotype or comprise a mixture of isotypes.
【0116】 本発明のポリペプチドまたはポリペプチド誘導体に対して惹起される本発明の
抗体を産生し得、そして標準的な免疫学的アッセイ(例えば、ウエスタンブロッ
ト分析、ドットブロット分析、またはELISA(例えば、Coliganら、
CURRENT PROTOCOLS IN IMMUNOLOGY(1994
)John Wiley&Sons,Inc.,New York,NYを参照
のこと))を使用して、同定され得る。この抗体を、診断方法において使用して
、サンプル(例えば、生物学的サンプル)中のChlamydia抗原の存在を
検出し得る。この抗体を、本発明のポリペプチドまたはポリペプチド誘導体の精
製のためのアフィニティークロマトグラフィー方法においてもまた、使用し得る
。以下にさらに考察されるように、そのような抗体を、予防的および治療的受動
免疫方法において、使用し得る。Antibodies of the invention raised against a polypeptide or polypeptide derivative of the invention can be produced and standard immunological assays (eg, Western blot analysis, dot blot analysis, or ELISA (eg, , Colligan et al.
CURRENT PROTOCOLS IN IMMUNOLOGY (1994
) John Wiley & Sons, Inc. , New York, NY)). This antibody can be used in diagnostic methods to detect the presence of Chlamydia antigen in a sample (eg, a biological sample). This antibody may also be used in affinity chromatography methods for purifying the polypeptide or polypeptide derivative of the present invention. As discussed further below, such antibodies may be used in prophylactic and therapeutic passive immunization methods.
【0117】 従って、本発明の第9の局面は、以下を提供する、(i)本発明の抗体、ポリ
ペプチド、またはポリペプチド誘導体を含む、生物学的サンプル中のChlam
ydiaの存在を検出するための試薬;および(ii)生物学的サンプルを本発
明の抗体、ポリペプチド、またはポリペプチド誘導体と接触させ、その結果、免
疫複合体を形成させる工程、およびそのような複合体を検出して、サンプル中ま
たはそのサンプルが由来する生物中のChlamydiaの存在を示す工程によ
って、生物学的サンプル中のChlamydiaの存在を検出する診断方法。Thus, a ninth aspect of the invention provides: (i) a Chlam in a biological sample comprising an antibody, polypeptide or polypeptide derivative of the invention.
reagents for detecting the presence of ydia; and (ii) contacting a biological sample with an antibody, polypeptide, or polypeptide derivative of the invention, thereby forming an immune complex; and A diagnostic method for detecting the presence of Chlamydia in a biological sample by detecting the complex and indicating the presence of Chlamydia in the sample or in the organism from which the sample is derived.
【0118】 当業者は、抗体、ポリペプチド、またはポリペプチド誘導体のいずれが使用さ
れても、サンプルの成分と、その抗体、ポリペプチド、またはポリペプチド誘導
体との間で免疫複合体が形成され、そして任意の未結合物質が、複合体の検出前
に除去され得ることを理解する。容易に理解され得るように、ポリペプチド試薬
は、サンプル(例えば、血液サンプル)中の抗Chlamydia抗体の存在を
検出するために有用であるが、本発明の抗体は、サンプル(例えば、胃抽出物、
または生検)をChlamydiaポリペプチドの存在についてスクリーニング
するために使用され得る。[0118] One of skill in the art will recognize that whether an antibody, polypeptide, or polypeptide derivative is used, an immune complex will be formed between the components of the sample and the antibody, polypeptide, or polypeptide derivative; And it is understood that any unbound material can be removed prior to detection of the complex. As can be readily appreciated, polypeptide reagents are useful for detecting the presence of anti-Chlamydia antibodies in a sample (eg, a blood sample), while the antibodies of the invention are useful for detecting the presence of a sample (eg, a gastric extract). ,
Or a biopsy) can be used to screen for the presence of a Chlamydia polypeptide.
【0119】 診断適用における使用のために、試薬(すなわち、本発明の抗体、ポリペプチ
ド、またはポリペプチド誘導体)は、遊離の状態であっても、固体支持体(例え
ば、チューブ、ビーズ、またはこの分野で使用される任意の他の従来の支持体)
に固定化されてもよい。固定化は、直接的手段または間接的手段を使用して達成
され得る。直接的手段としては、支持体と試薬との間の、受動的吸着(非共有結
合)または共有結合が挙げられる。「間接的手段」によって、試薬と相互作用す
る抗試薬化合物を、最初に固体支持体に付着することが、意味される。例えば、
ポリペプチド試薬を使用する場合、もしその試薬に結合する抗体が生物学的サン
プル中の抗体の認識に関与しないエピトープに結合するならば、その試薬に結合
する抗体が、抗試薬として供され得る。間接的手段はまた、リガンド−レセプタ
ー系(例えば、ビタミンのような分子を、ポリペプチド試薬上に移植し得、そし
て対応するレセプターを、固相上に固定化し得る)を利用し得る。この系は、ビ
オチン−ストレプトアビジン系によって例示される。あるいは、間接的手段を、
例えば、化学的にか、または遺伝子操作によってペプチドのテールを試薬に付加
し、そして移植した産物または融合した産物を、ペプチドテールの受動的吸着ま
たは共有結合によって固定化することによって、使用し得る。For use in diagnostic applications, the reagents (ie, the antibodies, polypeptides, or polypeptide derivatives of the invention) may be in a free state, even when in solid form (eg, tubes, beads, or the like). Any other conventional support used in the field)
May be immobilized. Immobilization can be achieved using direct or indirect means. Direct means include passive adsorption (non-covalent bonding) or covalent bonding between the support and the reagent. By "indirect means" is meant that the anti-reagent compound that interacts with the reagent is first attached to the solid support. For example,
When using a polypeptide reagent, an antibody that binds to the reagent can serve as an anti-reagent if the antibody that binds to that reagent binds to an epitope that is not involved in the recognition of the antibody in a biological sample. Indirect means may also utilize a ligand-receptor system (eg, molecules such as vitamins can be implanted on a polypeptide reagent and the corresponding receptor can be immobilized on a solid phase). This system is exemplified by the biotin-streptavidin system. Alternatively, indirect means
For example, a peptide tail can be used chemically or by genetic manipulation to add to the reagent, and the implanted or fused product immobilized by passive adsorption or covalent attachment of the peptide tail.
【0120】 本発明の第10の局面に従って、生物学的サンプルから本発明のポリペプチド
またはポリペプチド誘導体を精製するプロセスが提供される。このプロセスは、
生物学的サンプルを用いる、抗体に基づくアフィニティークロマトグラフィーの
実行を包含し、ここでこの抗体は、本発明の単一特異的抗体である。According to a tenth aspect of the present invention, there is provided a process for purifying a polypeptide or polypeptide derivative of the present invention from a biological sample. This process is
It involves performing an antibody-based affinity chromatography using a biological sample, wherein the antibody is a monospecific antibody of the invention.
【0121】 本発明の精製プロセスにおける使用のために、抗体は、ポリクローナルまたは
単一特異的であり得、そして好ましくは、IgGタイプである。精製されたIg
Gは、標準的な方法を用いて抗血清から調製され得る(例えば、Coligan
ら、前出を参照のこと)。従来のクロマトグラフィー支持体、ならびに抗体移植
の標準的な方法が、例えば、ANTIBODIES:A LABORATORY
MANUAL,D.Lane,E.Harlow編(1988)に開示される
。For use in the purification process of the invention, the antibodies may be polyclonal or monospecific, and are preferably of the IgG type. Purified Ig
G can be prepared from antisera using standard methods (eg, Colligan)
See above). Conventional chromatographic supports, as well as standard methods of antibody implantation, are described, for example, in ANTIBODIES: A LABORATORY.
MANUAL, D. Lane, E .; Harlow (1988).
【0122】 手短には、生物学的サンプル(例えば、C.pneumoniae抽出物、好
ましくは、緩衝溶液中)を、クロマトグラフィー材料(好ましくは、生物学的サ
ンプルを希釈するために使用される緩衝液で平衡化される)にアプライし、その
結果、本発明のポリペプチドまたはポリペプチド誘導体(すなわち、抗原)を、
その材料上に吸着させる。クロマトグラフィー材料(例えば、本発明の抗体に結
合したゲルまたは樹脂)は、バッチ形態であっても、カラム中にであってもよい
。未結合の成分を洗い流し、次に抗原を適切な溶出緩衝液(例えば、グリシン緩
衝液またはカオトロピック剤(例えば、グアニジンHCl)または高塩濃度(例
えば、3M MgCl2)を含む緩衝液)で溶出する。溶出された画分を取り除
き、そして抗原の存在を検出する(例えば、280nmでの吸収を測定すること
による)。Briefly, a biological sample (eg, a C. pneumoniae extract, preferably in a buffer solution) is converted into a chromatographic material (preferably a buffer used to dilute the biological sample). ), So that the polypeptide or polypeptide derivative of the invention (ie, antigen) is
Adsorb on the material. The chromatography material (eg, a gel or resin bound to the antibody of the invention) may be in batch form or in a column. Wash off unbound components and then elute the antigen with a suitable elution buffer (eg, glycine buffer or a buffer containing a chaotropic agent (eg, guanidine HCl) or a high salt concentration (eg, 3M MgCl 2 )). . The eluted fraction is removed and the presence of the antigen is detected (eg, by measuring the absorbance at 280 nm).
【0123】 本発明の抗体を、以下に記載のように、治療的効力についてスクリーニングし
得る。本発明の第11の局面に従って、以下が提供される(i)希釈剤またはキ
ャリアとともに本発明の単一特異的抗体を含有する組成物;(ii)本発明の単
一特異的抗体の治療的または予防的有効量を含む薬学的組成物;および(iii
)必要とする個体に対して、本発明の単一特異的抗体の予防的有効量または治療
的有効量を投与することによって、Chlamydia(例えば、C.trac
homatis、C.psittaci、C.pneumoniae、またはC
.pecorum)感染を、処置または予防する方法。さらに、本発明の第11
の局面は、Chlamydia感染を処置または予防するための医薬の調製にお
ける、本発明の単一特異的抗体の使用を包含する。The antibodies of the invention can be screened for therapeutic efficacy, as described below. According to an eleventh aspect of the invention, there is provided: (i) a composition comprising a monospecific antibody of the invention together with a diluent or carrier; (ii) therapeutic use of a monospecific antibody of the invention. Or a pharmaceutical composition comprising a prophylactically effective amount; and (iii)
)) Administering to a person in need thereof a prophylactically or therapeutically effective amount of a monospecific antibody of the invention, thereby allowing Chlamydia (eg, C. trac) to be administered.
homatis, C.I. psittaci, C.I. pneumoniae, or C
. pecorum) A method of treating or preventing an infection. Further, the eleventh aspect of the present invention
Aspects include the use of a monospecific antibody of the invention in the preparation of a medicament for treating or preventing a Chlamydia infection.
【0124】 この目的のために、単一特異的抗体は、ポリクローナルであっても、モノクロ
ーナルであってもよく、好ましくは、IgAアイソタイプ(主に)であり得る。
受動免疫において、抗体を、哺乳動物の粘膜表面(例えば、胃粘膜(例えば、経
口的または胃内に))に、有利には、炭酸水素塩緩衝液の存在下で投与し得る。
あるいは、全身投与(炭酸水素塩緩衝液を必要としない)を実行し得る。本発明
の単一特異的抗体を、単一の活性成分としてか、または異なるChlamydi
aポリペプチドに対して特異的な少なくとも1つの単一特異的抗体との混合物と
して投与され得る。使用される抗体の量および特定の療法は、当業者によって容
易に決定され得る。例えば、1週間にわたる約100〜1,000mgの抗体の
毎日の投与、または1〜3日間にわたる約100〜1,000mgの抗体の1日
あたり3用量の投与は、ほとんどの目的にとって効果的な療法であり得る。For this purpose, the monospecific antibody may be polyclonal or monoclonal, and preferably may be of the IgA isotype (mainly).
In passive immunization, the antibodies may be administered to the mucosal surface of a mammal, such as the gastric mucosa (eg, orally or intragastrically), advantageously in the presence of a bicarbonate buffer.
Alternatively, systemic administration (which does not require bicarbonate buffer) can be performed. The monospecific antibodies of the invention can be used as a single active ingredient or as different Chlamydi
a can be administered as a mixture with at least one monospecific antibody specific for the polypeptide. The amount of antibody used and the particular therapy can be readily determined by one skilled in the art. For example, daily administration of about 100-1,000 mg of antibody for one week, or three doses per day of about 100-1,000 mg of antibody for 1-3 days, is an effective therapy for most purposes. Can be
【0125】 治療的または予防的効力を、例えばC.pneumoniaeマウスモデルを
使用する、当該分野で標準的な方法(例えば、粘膜免疫応答の誘導、または防御
的および/または治療的免疫の誘導の測定による)を使用して評価し得る。当業
者は、このモデルのC.pneumoniae株が、別のChlamydia株
で置換され得ることを認識する。例えば、C.pneumoniae由来のDN
A分子およびポリペプチドの効力は、好ましくは、C.pneumoniae株
を使用するマウスモデルにおいて評価される。防御を、コントロール群に対して
Chlamydia感染の程度を比較することによって決定し得る。防御は、コ
ントロール群と比較することによって感染が減少する場合に、示される。そのよ
うな評価は、ポリヌクレオチド、ワクチンベクター、ポリペプチドおよびこれら
の誘導体、ならびに本発明の抗体について、なされ得る。[0125] Therapeutic or prophylactic efficacy may be assessed, for example, by C.I. Pneumoniae mouse models can be used to assess using standard methods in the art (eg, by inducing a mucosal immune response, or by measuring the induction of protective and / or therapeutic immunity). One skilled in the art will appreciate the C.I. It recognizes that the strain pneumoniae can be replaced by another strain of Chlamydia. For example, C.I. pneumoniae-derived DN
The potency of the A molecule and polypeptide is preferably that of C.A. pneumoniae strain is evaluated in a mouse model. Protection can be determined by comparing the extent of Chlamydia infection to the control group. Protection is indicated if the infection is reduced by comparing to the control group. Such evaluation can be made for polynucleotides, vaccine vectors, polypeptides and derivatives thereof, and antibodies of the invention.
【0126】 上記の任意のワクチン組成物において有用なアジュバントは、以下のとおりで
ある。Adjuvants useful in any of the above vaccine compositions are as follows.
【0127】 非経口投与のためのアジュバントとしては、アルミニウム化合物(例えば、水
酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、および水酸化リン酸アルミニウム)が
挙げられる。抗原は、標準的なプロトコールに従って、アルミニウム化合物とと
もに沈殿し得るか、またはアルミニウム化合物に吸着され得る。他のアジュバン
ト(例えば、RIBI(ImmunoChem,Hamilton,MT))を
、非経口投与に使用し得る。Adjuvants for parenteral administration include aluminum compounds, such as aluminum hydroxide, aluminum phosphate, and aluminum hydroxide phosphate. The antigen can be precipitated with the aluminum compound or adsorbed to the aluminum compound according to standard protocols. Other adjuvants, such as RIBI (ImmunoChem, Hamilton, MT), can be used for parenteral administration.
【0128】 粘膜投与のためのアジュバントとしては、細菌毒素(例えば、コレラ毒素(C
T)、E.coli熱不安定性毒素(LT)、Clostridium dif
ficile毒素Aおよび百日咳毒素(PT)、またはそれらの組み合わせ、サ
ブユニット、トキソイド、または変異体が挙げられる。例えば、天然のコレラ毒
素サブユニットB(CTB)の精製された調製物が使用され得る。もし、これら
の任意の毒素のフラグメント、ホモログ、誘導体、および融合物がアジュバント
活性を保持するならば、これらもまた、適切である。好ましくは、減少した毒性
を有する変異体が使用される。適切な変異体が、例えば、WO95/17211
(Arg−7−Lys CT変異体)、WO96/6627(Arg−192−
Gly LT変異体)、およびWO95/34323(Arg−9−Lysおよ
びGlu−129−Gly PT変異体)において、記載される。本発明の方法
および組成物において使用され得るさらなるLT変異体としては、例えば、Se
r−63−Lys、Ala−69−Gly、Glu−110−Asp、およびG
lu−112−Asp変異体が挙げられる。例えば、E.coli、Salmo
nella minnesota、Salmonella typhimuri
um、またはShigella flexneriの細菌モノホスホリル脂質A
(MPLA);サポニン、あるいはポリラクチドグリコリド(PLGA)ミクロ
スフェアのような他のアジュバントもまた、粘膜投与において使用し得る。Adjuvants for mucosal administration include bacterial toxins such as cholera toxin (C
T), E. coli heat labile toxin (LT), Clostridium dif
ficile toxin A and pertussis toxin (PT), or a combination, subunit, toxoid, or variant thereof. For example, a purified preparation of natural cholera toxin subunit B (CTB) can be used. If fragments, homologs, derivatives and fusions of any of these toxins retain adjuvant activity, they are also appropriate. Preferably, variants with reduced toxicity are used. Suitable variants are described, for example, in WO 95/17211.
(Arg-7-Lys CT mutant), WO96 / 6627 (Arg-192-
Gly LT variants), and WO 95/34323 (Arg-9-Lys and Glu-129-Gly PT variants). Additional LT variants that can be used in the methods and compositions of the present invention include, for example, Se
r-63-Lys, Ala-69-Gly, Glu-110-Asp, and G
lu-112-Asp mutant. For example, E. coli, Salmo
nella minnesota, Salmonella typhimuri
um, or bacterial monophosphoryl lipid A of Shigella flexneri
Other adjuvants such as (MPLA); saponins, or polylactide glycolide (PLGA) microspheres, may also be used in mucosal administration.
【0129】 粘膜投与および非経口投与の両方のために有用なアジュバントとしては、ポリ
ホスファゼン(WO95/2415)、DC−コール(3b−(N−(N’,N
’−ジメチルアミノメタン)−カルバモイル)コレステロール(DC−chol
(3b−(N−(N’,N’−dimethyl aminomethane)
−carbamoyl)cholesterol)(米国特許第5,283,1
85号およびWO96/14831)およびQS−21(WO88/9336)
が挙げられる。Adjuvants useful for both mucosal and parenteral administration include polyphosphazene (WO95 / 2415), DC-chol (3b- (N- (N ', N
'-Dimethylaminomethane) -carbamoyl) cholesterol (DC-chol
(3b- (N- (N ', N'-dimethylaminomethane))
-Carbamoyl) cholesterol) (U.S. Pat. No. 5,283,1)
No. 85 and WO 96/14831) and QS-21 (WO 88/9336)
Is mentioned.
【0130】 本発明の任意の薬学的組成物(本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、ポ
リペプチド誘導体、または抗体を含む)を、従来の様式において製造し得る。特
に、この組成物は、薬学的に受容可能な希釈剤またはキャリア(例えば、水また
はリン酸緩衝化生理食塩水のような生理食塩水溶液)とともに処方され得る。一
般に、希釈剤またはキャリアを、投与の様式および経路、ならびに標準的な薬学
的実施に基づいて選択し得る。適切な薬学的キャリアまたは希釈剤、ならびに薬
学的処方物中におけるその使用のための薬学的な必要物は、Remington
’s Pharmaceutical Sciences(この分野での標準的
な参考テキスト)中、およびUSP/NF中に記載される。[0130] Any of the pharmaceutical compositions of the present invention, including the polynucleotides, polypeptides, polypeptide derivatives or antibodies of the present invention, may be manufactured in conventional manner. In particular, the composition can be formulated with a pharmaceutically acceptable diluent or carrier, for example, water or saline solution, such as phosphate buffered saline. Generally, the diluent or carrier may be selected based on the mode and route of administration, and standard pharmaceutical practice. Suitable pharmaceutical carriers or diluents, as well as pharmaceutical requirements for their use in pharmaceutical formulations, can be found in Remington
's Pharmaceutical Sciences (standard reference text in the field) and in USP / NF.
【0131】 本発明はまた、抗生物質、制酸剤、スクラルファートまたはこれらの組み合わ
せと組み合わせた、本発明のChlamydiaポリペプチドおよび粘膜アジュ
バントの経口投与によってChlamydia感染を処置する方法を含む。ワク
チン抗原およびアジュバントとともに投与され得るそのような化合物の例は、例
えば、マクロライド、テトラサイクリンおよびその誘導体を含む抗生物質(使用
され得る抗生物質の具体的な例としては、アジスロマイシンまたはドキシサイク
リン(doxicyclin)が挙げられる)あるいはサイトカインまたはステ
ロイドのような免疫調節薬が挙げられる。さらに、上記に列挙した成分の1つよ
り多くを、ともに結合して含む化合物を使用し得る。本発明はまた、これらの方
法を実施するための組成物(すなわち、薬学的に受容可能なキャリアまたは希釈
剤中の、本発明のChlamydia抗原、アジュバント、および1つより多い
上記に列挙した化合物を含む組成物)を含む。The invention also includes a method of treating a Chlamydia infection by oral administration of a Chlamydia polypeptide of the invention and a mucosal adjuvant in combination with an antibiotic, antacid, sucralfate or a combination thereof. Examples of such compounds that can be administered with vaccine antigens and adjuvants include, for example, antibiotics, including macrolides, tetracyclines and derivatives thereof (particular examples of antibiotics that can be used include azithromycin or doxycycline). Or immunomodulators such as cytokines or steroids. Additionally, compounds that include more than one of the above-listed components bound together may be used. The present invention also provides compositions for practicing these methods (ie, a Chlamydia antigen of the present invention, an adjuvant, and more than one of the above-listed compounds in a pharmaceutically acceptable carrier or diluent). Comprising a composition).
【0132】 本発明の方法および組成物において使用される、上記に列挙した化合物の量を
、当業者は容易に決定し得る。さらに、当業者は、処置/免疫スケジュールを容
易に設計し得る。例えば、非ワクチン成分を、1〜14日目に投与し得、そして
ワクチン抗原+アジュバントを、7、14、21、および28日目に投与し得る
。The amount of the above-listed compounds used in the methods and compositions of the present invention can be readily determined by one skilled in the art. In addition, one skilled in the art can easily design a treatment / immunization schedule. For example, the non-vaccine components can be administered on days 1-14, and the vaccine antigen plus adjuvant can be administered on days 7, 14, 21, and 28.
【0133】 上記の開示は、一般に本発明を記載する。より完全な理解が、以下の具体的な
例を参照して得られ得る。これらの例は、例示の目的のみのために記載され、本
発明の範囲を限定することを意図しない。形態の変更および等価物への置換は、
付随的な事柄として考慮され、そして都合かよいとして示唆され得るか、または
都合がよいとされ得る。本明細書において具体的な用語を用いたが、そのような
用語は、記述的意味におけることが意図され、そして限定の目的のためであるこ
とは意図されない。The above disclosure generally describes the present invention. A more complete understanding can be obtained with reference to the following specific examples. These examples are set forth for illustrative purposes only and are not intended to limit the scope of the invention. Changes in form and substitution of equivalents are:
It may be considered as an incidental matter and may be suggested as convenient or may be convenient. Although specific terms have been used herein, such terms are intended in a descriptive sense and not for purposes of limitation.
【0134】 (等価物) 本発明の具体的な実施態様の、上記の詳細な記載から、独特のChlamyd
ia抗原が記載されたことが明らかであるはずである。特定の実施態様は、本明
細書において詳細に開示されてきたが、この開示は、説明の目的のみのための例
示の手段としてなされ、そして添付の特許請求の範囲に関して、限定することを
意図しない。特に、特許請求の範囲に規定される本発明の趣旨および範囲から逸
脱することなく、種々の置換、変更、および改変が、本発明に対してなされ得る
ことが、本発明者らによって意図される。Equivalents From the foregoing detailed description of the specific embodiments of this invention, note that the unique Chlamyd
It should be clear that the ia antigen has been described. Although particular embodiments have been disclosed in detail herein, this disclosure is made by way of example only for illustrative purposes, and is not intended to be limiting with respect to the appended claims. . In particular, it is contemplated by the inventors that various substitutions, changes, and modifications may be made to the invention without departing from the spirit and scope of the invention as defined in the claims. .
【配列表】 [Sequence list]
本発明は、以下の図面を参照して、以下の説明からさらに理解され得る。 The invention can be better understood from the following description with reference to the following drawings.
【図1】 図1は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配列
)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100111ポリペプチドの
、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 1 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and the deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100111 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図2A】 図2Aは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2B】 図2Bは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2C】 図2Cは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2D】 図2Dは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2E】 図2Eは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2F】 図2Fは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2F shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2G】 図2Gは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2G shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2H】 図2Hは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2H shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2I】 図2Iは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2I shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2J】 図2Jは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2J shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図2K】 図2Kは、C.pneumoniae CPN100111をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 2K shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100111.
【図3】 図3は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配列
)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100224ポリペプチドの
、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 3 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100224 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図4A】 図4Aは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4B】 図4Bは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4C】 図4Cは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4D】 図4Dは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4E】 図4Eは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4F】 図4Fは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4F shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4G】 図4Gは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4G shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4H】 図4Hは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4H shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4I】 図4Iは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4I shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4J】 図4Jは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4J shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4K】 図4Kは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4K shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4L】 図4Lは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4L shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4M】 図4Mは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4M shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図4N】 図4Nは、C.pneumoniae CPN100224をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 4N shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100224.
【図5】 図5は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配列
)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100230ポリペプチドの
、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 5 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100230 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図6A】 図6Aは、C.pneumoniae CPN100230をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 6A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100230.
【図6B】 図6Bは、C.pneumoniae CPN100230をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 6B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100230.
【図6C】 図6Cは、C.pneumoniae CPN100230をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 6C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100230.
【図6D】 図6Dは、C.pneumoniae CPN100230をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 6D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100230.
【図6E】 図6Eは、C.pneumoniae CPN100230をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 6E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100230.
【図7】 図7は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配列
)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100231ポリペプチドの
、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 7 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100231 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図8A】 図8Aは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8B】 図8Bは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8C】 図8Cは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8D】 図8Dは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8E】 図8Eは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8F】 図8Fは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8F shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8G】 図8Gは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8G shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8H】 図8Hは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8H shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8I】 図8Iは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8I shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8J】 図8Jは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8J shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図8K】 図8Kは、C.pneumoniae CPN100231をコードするヌク
レオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 8K shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100231.
【図9】 図9は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配列
)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100232ポリペプチドの
、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 9 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100232 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図10A】 図10Aは、C.pneumoniae CPN100232をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 10A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100232.
【図10B】 図10Bは、C.pneumoniae CPN100232をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 10B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100232.
【図10C】 図10Cは、C.pneumoniae CPN100232をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 10C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100232.
【図10D】 図10Dは、C.pneumoniae CPN100232をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 10D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100232.
【図10E】 図10Eは、C.pneumoniae CPN100232をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 10E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100232.
【図10F】 図10Fは、C.pneumoniae CPN100232をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 10F shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100232.
【図11】 図11は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配
列)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100233ポリペプチド
の、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 11 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100233 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図12A】 図12Aは、C.pneumoniae CPN100233をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 12A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100233.
【図12B】 図12Bは、C.pneumoniae CPN100233をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 12B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100233.
【図12C】 図12Cは、C.pneumoniae CPN100233をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 12C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100233.
【図13】 図13は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配
列)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100394ポリペプチド
の、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 13 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100394 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図14A】 図14Aは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14B】 図14Bは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14C】 図14Cは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14D】 図14Dは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14E】 図14Eは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14F】 図14Fは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14F shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14G】 図14Gは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14G shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14H】 図14Hは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14H shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14I】 図14Iは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14I shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図14J】 図14Jは、C.pneumoniae CPN100394をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 14J shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100394.
【図15】 図15は、Chlamydia pneumoniae由来の全長(中段の配
列)およびプロセシングされた(下段の配列)CPN100395ポリペプチド
の、ヌクレオチド配列(上段の配列)および推定アミノ酸配列を示す。FIG. 15 shows the nucleotide sequence (upper sequence) and deduced amino acid sequence of the full-length (middle sequence) and processed (lower sequence) CPN100395 polypeptide from Chlamydia pneumoniae.
【図16A】 図16Aは、C.pneumoniae CPN100395をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 16A shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100395.
【図16B】 図16Bは、C.pneumoniae CPN100395をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 16B shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100395.
【図16C】 図16Cは、C.pneumoniae CPN100395をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 16C shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100395.
【図16D】 図16Dは、C.pneumoniae CPN100395をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 16D shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100395.
【図16E】 図16Eは、C.pneumoniae CPN100395をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 16E shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100395.
【図16F】 図16Fは、C.pneumoniae CPN100395をコードするヌ
クレオチド配列の制限酵素分析を示す。FIG. 16F shows C.I. 1 shows a restriction enzyme analysis of the nucleotide sequence encoding pneumoniae CPN100395.
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C07K 14/295 C07K 16/12 4C085 16/12 C12N 1/15 4C087 C12N 1/15 1/19 4H045 1/19 1/21 1/21 C12P 21/02 C 5/10 21/08 C12P 21/02 C12Q 1/68 A 21/08 G01N 33/15 Z C12Q 1/68 33/50 Z G01N 33/15 33/566 33/50 33/569 F 33/566 33/577 B 33/569 C12N 15/00 ZNAA 33/577 5/00 A (31)優先権主張番号 60/097,189 (32)優先日 平成10年8月20日(1998.8.20) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 60/097,190 (32)優先日 平成10年8月20日(1998.8.20) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 60/097,195 (32)優先日 平成10年8月20日(1998.8.20) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 60/097,196 (32)優先日 平成10年8月20日(1998.8.20) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 60/097,197 (32)優先日 平成10年8月20日(1998.8.20) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 60/097,191 (32)優先日 平成10年8月27日(1998.8.27) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 09/376,770 (32)優先日 平成11年8月17日(1999.8.17) (33)優先権主張国 米国(US) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,UG,ZW),E A(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ ,TM),AE,AL,AM,AT,AU,AZ,BA ,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,CR, CU,CZ,DE,DK,DM,EE,ES,FI,G B,GD,GE,GH,GM,HR,HU,ID,IL ,IN,IS,JP,KE,KG,KP,KR,KZ, LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV,MD,M G,MK,MN,MW,MX,NO,NZ,PL,PT ,RO,RU,SD,SE,SG,SI,SK,SL, TJ,TM,TR,TT,UA,UG,US,UZ,V N,YU,ZA,ZW Fターム(参考) 2G045 AA25 AA28 AA34 AA35 AA40 CB17 CB21 DA12 DA13 DA14 DA36 FB01 FB02 FB03 FB04 4B024 AA01 AA13 BA31 CA02 CA07 CA09 CA20 DA01 DA02 DA05 DA11 FA18 GA11 HA13 HA14 HA15 HA17 4B063 QA01 QA13 QA18 QA19 QQ06 QQ43 QQ53 QQ79 QR32 QR39 QR48 QR56 QR62 QS16 QS25 QS33 QS34 QX02 4B064 AG01 AG27 CA02 CA05 CA10 CA11 CA19 CA20 CC01 CC24 DA01 DA15 4B065 AA01X AA01Y AA58X AA72X AA87X AB01 AC14 BA02 CA24 CA45 CA46 4C085 AA03 BA45 DD22 DD23 DD62 EE01 EE06 FF24 4C087 AA01 AA03 BB64 BB65 CA12 NA14 ZB35 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10 BA41 CA11 DA75 DA86 EA29 EA31 EA52 FA71 FA74 ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C07K 14/295 C07K 16/12 4C085 16/12 C12N 1/15 4C087 C12N 1/15 1/19 4H045 1 / 19 1/21 1/21 C12P 21/02 C 5/10 21/08 C12P 21/02 C12Q 1/68 A 21/08 G01N 33/15 Z C12Q 1/68 33/50 Z G01N 33/15 33/566 33/50 33/569 F 33/566 33/577 B 33/569 C12N 15/00 ZNAA 33/577 5/00 A (31) Priority claim number 60 / 097,189 (32) Priority date 1998 (20 August 1998) (33 Aug. 1998) (33) Priority claiming country United States (US) (31) Priority claim number 60 / 097,190 (32) Priority date August 20, 1998 (1998. 20) (33) Priority claim country United States (US) (31) Priority claim number 60/097 195 (32) Priority date August 20, 1998 (August 20, 1998) (33) Priority country United States (US) (31) Priority claim number 60 / 097,196 (32) Priority date 1998 August 20, 1998 (August 20, 1998) (33) Priority claiming country United States (US) (31) Priority claim number 60 / 097,197 (32) Priority date August 20, 1998 (1998. 8.20) (33) Priority claim country United States (US) (31) Priority claim number 60 / 097,191 (32) Priority date August 27, 1998 (August 27, 1998) (33) Priority Claiming country United States (US) (31) Priority claim number 09 / 376,770 (32) Priority date August 17, 1999 (August 17, 1999) (33) Priority claiming country United States (US) ( 81) Designated countries EP (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OA (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, M , NE, SN, TD, TG), AP (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SL, SZ, UG, ZW), EA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU) , TJ, TM), AE, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV , MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZWF terms (reference) 2G045 AA25 AA28 AA34 AA35 AA40 CB17 CB21 DA12 DA13 DA14 DA36 FB01 FB02 FB03 FB04 4B024 AA01 AA13 BA31 CA02 CA07 CA09 CA20 DA01 DA02 DA05 DA11 FA18 GA11 HA13 HA14 HA15 HA17 4B063 QA01 QA13 QA18 QA19 QQ06 QQ43 QQ53 QQ79 QR32. CA11 CA19 CA20 CC01 CC24 DA01 DA15 4B065 AA01X AA01Y AA58X AA72X AA87X AB01 AC14 BA02 CA24 CA45 CA46 4C085 AA03 BA45 DD22 DD23 DD62 EE01 EE06 FF24 4C087 AA01 AA03 BB64 BB65 CA12 NA14 AB AA ABA A31 AB A31 AA BAA ABA A31 AA BAA FA74
Claims (53)
ド: (a)配列番号1、3、5、7、9、11、13、および15からなる群より
選択されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチド、およびその機能的フラ
グメント; (b)配列番号2、4、6、8、10、12、14、および16からなる群よ
り選択されるアミノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプ
チドをコードするポリヌクレオチド、およびその機能的フラグメント;ならびに (c)配列番号1、3、5、7、9、11、13、および15のヌクレオチド
配列をさらに含む配列を有するポリヌクレオチドのいずれかに、ストリンジェン
トな条件下でハイブリダイズし得るポリヌクレオチド、およびその機能的フラグ
メント。1. An isolated polynucleotide selected from the group consisting of: (a) a nucleotide selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, and 15 A polynucleotide having a sequence, and a functional fragment thereof; (b) a sequence that is at least 75% homologous to an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, and 16 And a functional fragment thereof; and (c) a polynucleotide having a sequence further comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, and 15. Either a polynucleotide capable of hybridizing under stringent conditions, or a functional fragment thereof.
12、14、および16からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプ
チドの機能的フラグメントをコードする、請求項1に記載のヌクレオチド。2. The method of claim 2, wherein the polynucleotide is SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10,
2. The nucleotide of claim 1, which encodes a functional fragment of a polypeptide comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of 12, 14, and 16.
クレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号2のアミ
ノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコードする
、請求項1に記載のポリヌクレオチド。3. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, and wherein the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
クレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号4のアミ
ノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコードする
、請求項1に記載のポリヌクレオチド。4. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 and the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
クレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号6のアミ
ノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコードする
、請求項1に記載のポリヌクレオチド。5. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 and the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
クレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号8のアミ
ノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコードする
、請求項1に記載のポリヌクレオチド。6. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 and the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
クレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号10のア
ミノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコードす
る、請求項1に記載のポリヌクレオチド。7. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9 and the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10 The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
ヌクレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号12の
アミノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコード
する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。8. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 and the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12 The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
ヌクレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号14の
アミノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコード
する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。9. A sequence wherein the polynucleotides of (a) and (c) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 and the polynucleotide of (b) is at least 75% homologous to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14 The polynucleotide according to claim 1, which encodes a polypeptide having:
のヌクレオチド配列を有し、そして(b)のポリヌクレオチドが、配列番号16
のアミノ酸配列と少なくとも75%相同である配列を有するポリペプチドをコー
ドする、請求項1に記載のポリヌクレオチド。10. The polynucleotide of (a) and (c) is SEQ ID NO: 15
And the polynucleotide of (b) has the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16
The polynucleotide of claim 1 which encodes a polypeptide having a sequence that is at least 75% homologous to the amino acid sequence of
からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも75%相同であるアミノ酸
配列を有する、単離されたポリペプチド。11. SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, and 16
An isolated polypeptide having an amino acid sequence that is at least 75% homologous to an amino acid sequence selected from the group consisting of:
の機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。12. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or a functional fragment thereof.
の機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。13. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 or a functional fragment thereof.
の機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。14. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 or a functional fragment thereof.
の機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。15. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 or a functional fragment thereof.
その機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。16. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10 or a functional fragment thereof.
その機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。17. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12 or a functional fragment thereof.
その機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。18. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14 or a functional fragment thereof.
その機能的フラグメントを有する、請求項11に記載のポリペプチド。19. The polypeptide according to claim 11, wherein said polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16 or a functional fragment thereof.
連結される、請求項1に記載のポリヌクレオチド。20. The polynucleotide of claim 1, wherein said polynucleotide is linked to a second nucleotide sequence encoding a fusion polypeptide.
請求項20に記載のヌクレオチド。21. The fusion polypeptide is a heterologous signal peptide.
A nucleotide according to claim 20.
プチドを含む、ポリペプチド。22. A polypeptide comprising the polypeptide of claim 21 linked to a fusion polypeptide.
項22に記載のポリペプチド。23. The polypeptide of claim 22, wherein said fusion polypeptide is a signal peptide.
ポリペプチドを含む、請求項23に記載のポリペプチド。24. The polypeptide of claim 23, wherein said fusion polypeptide comprises a heterologous polypeptide having adjuvant activity.
リヌクレオチドを含む、発現カセット。25. An expression cassette comprising the polynucleotide of claim 1 operably linked to a promoter.
の宿主細胞。28. The host cell of claim 27, wherein said host cell is a prokaryotic cell.
の宿主細胞。29. The host cell of claim 27, wherein said host cell is a eukaryotic cell.
の工程: (a)請求項27に記載の宿主細胞を、該ポリペプチドの発現を可能にする条
件下で培養する工程;および (b)該組換えポリペプチドを回収する工程、 を包含する、方法。30. A method for producing a recombinant polypeptide, comprising the following steps: (a) culturing the host cell according to claim 27 under conditions allowing expression of said polypeptide. And (b) recovering the recombinant polypeptide.
N 100224、CPN 100230、CPN 100231、CPN 1
00232、CPN 100235、CPN 100394、およびCPN 1
00395からなる群より選択される、請求項30に記載の方法。31. The recombinant polypeptide may be CPN 100111, CP
N 100224, CPN 100230, CPN 100231, CPN 1
00232, CPN 100235, CPN 100394, and CPN 1
31. The method of claim 30, wherein the method is selected from the group consisting of: 00395.
ー。32. A vaccine vector comprising the expression cassette according to claim 25.
チンベクター。33. The vaccine vector according to claim 32, wherein said host mammal is a human.
ワクチンベクター。34. The vaccine vector of claim 32, wherein said vaccine vector is in a pharmaceutically acceptable excipient.
ターを含む、薬学的組成物。35. A pharmaceutical composition comprising an immunologically effective amount of the vaccine vector of claim 32.
、以下の工程: 該哺乳動物に、免疫学的に有効な量の、請求項32に記載のワクチンベクター
を投与する工程であって、ここで該投与が、免疫応答を誘導する、工程、 を包含する、方法。36. A method for inducing an immune response in a mammal, comprising the steps of: administering to said mammal an immunologically effective amount of the vaccine vector of claim 32. Wherein the administration induces an immune response.
、および薬学的に受容可能な希釈剤を含む、薬学的組成物。37. A pharmaceutical composition comprising an immunologically effective amount of the polypeptide of claim 11, and a pharmaceutically acceptable diluent.
成物。38. The pharmaceutical composition according to claim 37, further comprising an adjuvant.
求項37に記載の薬学的組成物。39. The pharmaceutical composition according to claim 37, further comprising one or more known Chlamydia antigens.
、以下の工程: 該哺乳動物に、免疫学的に有効な量の、請求項37に記載の薬学的組成物を投
与する工程であって、ここで該投与が、免疫応答を誘導する、工程、 を包含する、方法。40. A method for inducing an immune response in a mammal, comprising the steps of: administering to said mammal an immunologically effective amount of the pharmaceutical composition of claim 37. And wherein said administering induces an immune response.
ポリヌクレオチドプローブ試薬であって、ストリンジェントな条件下で請求項1
に記載のポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む、ポリ
ヌクレオチドプローブ試薬。41. A polynucleotide probe reagent capable of detecting the presence of Chlamydia in a biological material, wherein the reagent is a stringent condition.
A polynucleotide probe reagent comprising a polynucleotide that hybridizes to the polynucleotide according to 1.
のポリヌクレオチドプローブ試薬。42. The polynucleotide probe reagent according to claim 41, wherein the reagent is a DNA primer.
ハイブリダイゼーション方法であって、以下の工程: (a)該サンプルからポリヌクレオチドを得る工程; (b)該得られたポリヌクレオチドを、請求項41に記載のポリヌクレオチド
プローブ試薬と、該プローブおよび該サンプルのハイブリダイゼーションを可能
にする条件下でハイブリダイズさせる工程;ならびに (c)該検出試薬と、該サンプル中のポリヌクレオチドとの該ハイブリダイゼ
ーションを検出する工程、 を包含する、方法。43. A hybridization method for detecting the presence of Chlamydia in a sample, comprising the following steps: (a) obtaining a polynucleotide from the sample; (b) 43. Hybridizing the polynucleotide probe reagent of claim 41 with the probe and the sample under conditions that permit hybridization; and (c) combining the detection reagent with a polynucleotide in the sample. Detecting hybridization.
増幅方法であって、以下の工程: (a)該サンプルからポリヌクレオチドを得る工程; (b)該得られたポリヌクレオチドを、請求項41に記載の1以上のポリヌク
レオチドプローブ試薬を使用して増幅する工程;および (c)該増幅したポリペプチドを検出する工程、 を包含する、方法。44. An amplification method for detecting the presence of Chlamydia in a sample, the method comprising: (a) obtaining a polynucleotide from the sample; (b) obtaining the polynucleotide from the sample 42. A method comprising: amplifying using one or more polynucleotide probe reagents according to item 41; and (c) detecting the amplified polypeptide.
方法であって、以下の工程: (a)該サンプルを、ポリペプチドに結合する検出試薬と接触させて、複合体
を形成する、工程であって、該ポリペプチドが、CPN 100111、CPN 100224、CPN 100230、CPN 100231、CPN 10
0232、CPN 100235、CPN 100394、およびCPN 10
0395からなる群より選択される、工程;および (b)該形成された複合体を検出する工程、 を包含する、方法。45. A method for detecting the presence of Chlamydia in a sample, comprising: (a) contacting the sample with a detection reagent that binds a polypeptide to form a complex; In the process, the polypeptide is CPN 100111, CPN 100224, CPN 100230, CPN 100231, CPN 10
0232, CPN 100235, CPN 100394, and CPN 10
0395; and (b) detecting the formed complex.
載の方法。47. The method of claim 46, wherein said antibody is a monoclonal antibody.
載の方法。48. The method according to claim 46, wherein said antibody is a polyclonal antibody.
ニティークロマトグラフィー方法であって、以下の工程: (a)該Chlamydia抗原を含むサンプルを、ポリペプチドに結合する
検出試薬と接触させて、複合体を形成する工程であって、該ポリペプチドが、C
PN 100111、CPN 100224、CPN 100230、CPN
100231、CPN 100232、CPN 100235、CPN 100
394、およびCPN 100395からなる群より選択される、工程; (b)該形成された複合体を単離する工程; (c)該形成された複合体を解離させる工程;および (d)該解離したChlamydia抗原を単離する工程、 を包含する、方法。49. An affinity chromatography method for substantially purifying a Chlamydia antigen, comprising the steps of: (a) contacting a sample containing the Chlamydia antigen with a detection reagent that binds to a polypeptide; Forming a complex, wherein the polypeptide comprises C
PN 100111, CPN 100224, CPN 100230, CPN
100231, CPN 100232, CPN 100235, CPN 100
394, and CPN 100395; (b) isolating the formed complex; (c) dissociating the formed complex; and (d) dissociating. Isolating the isolated Chlamydia antigen.
載の方法。51. The method of claim 50, wherein said antibody is a monoclonal antibody.
載の方法。52. The method of claim 50, wherein said antibody is a polyclonal antibody.
抗体、またはその結合ドメインを含む該抗体のフラグメントもしくは誘導体。53. An antibody that immunospecifically binds to the polypeptide of claim 11, or a fragment or derivative of the antibody comprising a binding domain thereof.
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