JP2001512667A - Human orphan receptor NTR-1 - Google Patents

Human orphan receptor NTR-1

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JP2001512667A
JP2001512667A JP2000506239A JP2000506239A JP2001512667A JP 2001512667 A JP2001512667 A JP 2001512667A JP 2000506239 A JP2000506239 A JP 2000506239A JP 2000506239 A JP2000506239 A JP 2000506239A JP 2001512667 A JP2001512667 A JP 2001512667A
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JP
Japan
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human
ntr
human ntr
polypeptide
cell
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Withdrawn
Application number
JP2000506239A
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Japanese (ja)
Inventor
ピオトル ジェイ. マシアコウスキ,
ジョディ モリス,
デイビッド エム. バレンズエラ,
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Regeneron Pharmaceuticals Inc
Procter and Gamble Co
Original Assignee
Regeneron Pharmaceuticals Inc
Procter and Gamble Co
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
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Publication date
Application filed by Regeneron Pharmaceuticals Inc, Procter and Gamble Co filed Critical Regeneron Pharmaceuticals Inc
Publication of JP2001512667A publication Critical patent/JP2001512667A/en
Withdrawn legal-status Critical Current

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Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70578NGF-receptor/TNF-receptor superfamily, e.g. CD27, CD30, CD40, CD95
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Abstract

(57)【要約】 本発明はヒトNTR−1と命名された核酸配列を提供し、これは膵臓および胎児の心臓において発現される新規なオーファンレセプターをコードする。本発明はまた、ヒトNTR−1遺伝子産物に結合するリガンドを検出、および/または測定するために使用され得るアッセイ系を提供する。本発明はまた、NTR−1と、NTR−1との結合を介してシグナル伝達を開始する薬剤との間の相互作用に基づく、診断方法および治療方法を提供する。   (57) [Summary] The present invention provides a nucleic acid sequence designated human NTR-1, which encodes a novel orphan receptor expressed in pancreatic and fetal hearts. The invention also provides an assay system that can be used to detect and / or measure a ligand that binds to a human NTR-1 gene product. The invention also provides diagnostic and therapeutic methods based on the interaction between NTR-1 and an agent that initiates signal transduction via binding to NTR-1.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】 この国際出願は、1997年8月6日に出願された米国仮出願第60/054
,869号の優先権を請求する。この出願を通して、種々の刊行物が参照される
。これらの刊行物の開示は、その全体が本出願に参考として援用される。
[0001] This international application is related to US Provisional Application No. 60/054, filed on August 6, 1997.
, 869, claim priority. Throughout this application, various publications are referenced. The disclosures of these publications are incorporated herein by reference in their entirety.

【0002】 (序論) 本発明の分野は、細胞機能を調節するポリペプチド分子、このポリペプチドを
コードする核酸配列、ならびにこの核酸配列およびこのポリペプチドを使用する
方法である。本発明は新規なオーファンレセプター分子、それらの使用、および
これらのレセプターと相互作用する新規なリガンドを同定するのに有用なアッセ
イ系を提供する。
INTRODUCTION The field of the invention is polypeptide molecules that regulate cell function, nucleic acid sequences encoding the polypeptide, and methods of using the nucleic acid sequence and the polypeptide. The present invention provides novel orphan receptor molecules, their uses, and assay systems useful for identifying novel ligands that interact with these receptors.

【0003】 (発明の背景) 腫瘍壊死因子レセプター(TNFR)スーパーファミリーは主に、種々の細胞
においてシグナル形質導入を誘発する膜貫通のタンパク質からなる。腫瘍壊死因
子α(TNF−α)は、活性化マクロファージによって主として産生されるサイ
トカインである。TNF−αは、T細胞およびB細胞増殖を刺激し、そして内皮
細胞における接着分子の発現を誘導する。このサイトカインも、感染に対する宿
主防御に重要な役割を果たす。
BACKGROUND OF THE INVENTION The tumor necrosis factor receptor (TNFR) superfamily consists primarily of transmembrane proteins that trigger signal transduction in various cells. Tumor necrosis factor α (TNF-α) is a cytokine produced primarily by activated macrophages. TNF-α stimulates T and B cell proliferation and induces the expression of adhesion molecules in endothelial cells. This cytokine also plays an important role in host defense against infection.

【0004】 TNF−α活性は、2つの異なるレセプター、TNFR−p55およびTNF
R−p75によって媒介される。これらの2つのレセプターはまた、主として活
性化リンパ球により分泌される可溶性リンホトキシンα(LT−α)によって引
き起こされる活性を媒介する。TNFR−p55の特異的刺激は、例えばインビ
トロ腫瘍細胞傷害性のようなTNF活性、内皮細胞およびケラチノサイトにおけ
る接着分子の発現、セラミドの付随増加でのスフィンゴミエリナーゼの活性化、
NF−κBの活性化、ならびにマンガンスーパーオキシドジスムターゼmRNA
の誘導を誘導する。TNFR−p75の特異的刺激は、マウスおよびヒトの胸腺
細胞および細胞傷害性T細胞、線維芽細胞およびナチュラルキラー細胞の増殖性
応答、ならびにPC60細胞におけるGM−CSF分泌を生じる。
[0004] TNF-α activity is determined by two distinct receptors, TNFR-p55 and TNF.
It is mediated by R-p75. These two receptors also mediate the activity caused by soluble lymphotoxin α (LT-α), which is mainly secreted by activated lymphocytes. Specific stimulation of TNFR-p55 may include, for example, TNF activity such as in vitro tumor cytotoxicity, expression of adhesion molecules in endothelial cells and keratinocytes, activation of sphingomyelinase with a concomitant increase in ceramide,
Activation of NF-κB and manganese superoxide dismutase mRNA
Induction of induction. Specific stimulation of TNFR-p75 results in a proliferative response of mouse and human thymocytes and cytotoxic T cells, fibroblasts and natural killer cells, and GM-CSF secretion in PC60 cells.

【0005】 骨吸収を調節するTNFRスーパーファミリーの新メンバーの同定は、最近報
告された。この新しく同定されたタンパク質は骨プロテグリン(Osteopr
otegrin)(OPG)と名付けられ、破骨細胞(骨吸収の原因である細胞
)の分化をブロックすることにより骨吸収の体液性制御因子として作用すると仮
定された。(Simonet,W.S.,ら、1997、Cell 89:30
9−319;Amgen,Inc.の名前で、1997年7月3日に発行された
国際公開第WO 97/23614号)。しかし、破骨細胞の発達を調節するよ
うに生理学的に作用する可溶性因子については比較的ほとんど知られていない。
[0005] The identification of a new member of the TNFR superfamily that regulates bone resorption has recently been reported. This newly identified protein is bone protegrin (Osteopr)
otegrin (OPG) and was hypothesized to act as a humoral regulator of bone resorption by blocking the differentiation of osteoclasts (the cells responsible for bone resorption). (Simonet, WS, et al., 1997, Cell 89:30.
9-319; Amgen, Inc. International Publication No. WO 97/23614 published on July 3, 1997). However, relatively little is known about soluble factors that act physiologically to regulate osteoclast development.

【0006】 新規なレセプター分子は、例えばPCRに基づくスクリーニング、またはこの
ファミリーメンバー間の公知の相同性領域を含むESTデータベースのコンピュ
ーターサーチを使用して、レセプターの公知のファミリーのさらなるメンバーを
サーチすることにより、しばしば同定および単離される。(例えば、Maiso
npierre,ら、1993、Oncogene 8:1631−1637を
参照のこと)。このような所謂「オーファン」レセプター(このリガンドは全く
知られていない)の単離、およびこのようなレセプターが発現される組織の引き
続く決定は、標的組織中の細胞の成長、増殖、および再生の調節に対する見識を
提供する。さらにこのようなレセプターはこれらの同族のリガンドを単離するの
に使用され得、次にこれはこのレセプターを発現する細胞の生存、成長および再
生を調節するのに使用され得る。あるいは可溶性レセプターの場合に、このレセ
プター自体リガンドとして挙動し得る。
[0006] New receptor molecules are searched for additional members of the known family of receptors using, for example, PCR-based screening or computer searches of the EST database containing regions of known homology between members of the family. Are often identified and isolated by (For example, Maiso
npierre, et al., 1993, Oncogene 8: 1631-1637). Isolation of such a so-called "orphan" receptor (of which no ligand is known), and subsequent determination of the tissue in which such receptor is expressed, is dependent on the growth, proliferation and regeneration of cells in the target tissue. Provide insight into the regulation of Further, such receptors can be used to isolate these cognate ligands, which in turn can be used to regulate the survival, growth and regeneration of cells that express the receptor. Alternatively, in the case of a soluble receptor, this receptor itself can behave as a ligand.

【0007】 (発明の要旨) 本発明は、ヒトNTR−1と名付けられた、新規のオーファンヒトレセプター
を提供し、これは、膵臓、骨格筋、筋肉ならびに胎児および成体の心臓中に発現
される。このタンパク質は骨プロテグリン(OPG)に関し、腫瘍壊死因子レセ
プター(TNFR)に関する。本発明はさらに、ヒトNTR−1をコードする単
離核酸分子を提供する。その骨プロテグリンとの相同性に基づいて、ヒトNTR
−1は骨質量の調節に関与し、骨芽細胞または破骨細胞の発達、増殖、および死
を調節するのに、あるいは筋肉代謝を調節するのに有用であり得、ならびに筋肉
の疾患または障害に関係し得る。
SUMMARY OF THE INVENTION [0007] The present invention provides a novel orphan human receptor, designated human NTR-1, which is expressed in pancreas, skeletal muscle, muscle, and fetal and adult heart. You. This protein is related to bone protegrin (OPG) and to tumor necrosis factor receptor (TNFR). The present invention further provides an isolated nucleic acid molecule encoding human NTR-1. Based on its homology to bone protegrins, human NTR
-1 is involved in the regulation of bone mass and can be useful in regulating the development, proliferation and death of osteoblasts or osteoclasts or in regulating muscle metabolism, and muscle diseases or disorders May be related to

【0008】 本発明はまた、ヒトNTR−1の細胞外ドメイン、およびこのような細胞外ド
メインをコードする核酸を含有するタンパク質またはポリペプチドを提供する。
本発明はさらに、ヒトNTR−1またはその細胞外ドメインをコードする単離さ
れた核酸分子を含有するベクターを提供し、これは、細菌細胞、酵母細胞、昆虫
細胞、または哺乳動物細胞、好ましくはCOSまたはCHO細胞内で、ヒトNT
R−1またはその細胞外ドメインを発現するのに使用され得る。
[0008] The invention also provides extracellular domains of human NTR-1 and proteins or polypeptides containing nucleic acids encoding such extracellular domains.
The invention further provides a vector comprising an isolated nucleic acid molecule encoding human NTR-1 or an extracellular domain thereof, which comprises a bacterial cell, a yeast cell, an insect cell, or a mammalian cell, preferably Human NT in COS or CHO cells
It can be used to express R-1 or its extracellular domain.

【0009】 本発明はさらに、ヒトNTR−1と相互作用する薬物のスクリーニングにおい
て、ヒトNTR−1レセプターまたはその細胞外もしくは細胞内ドメインの使用
を提供する。本明細書中に記載されるレセプターに結合する新規な薬剤は、この
レセプターを自然に発現する細胞内で生存および分化を仲介し得るが、またこの
レセプターを発現するように操作した細胞を処理するのに使用した場合、生存お
よび増殖を与え得る。特定の実施態様において、ヒトNTR−1の細胞外ドメイ
ン(可溶性レセプター)は、同族のリガンドのスクリーニングに利用される。
[0009] The present invention further provides the use of the human NTR-1 receptor or extracellular or intracellular domains thereof in screening for drugs that interact with human NTR-1. Novel agents that bind to the receptors described herein can mediate survival and differentiation in cells that naturally express the receptor, but also process cells that have been engineered to express the receptor When used to provide survival and growth. In certain embodiments, the extracellular domain of human NTR-1 (soluble receptor) is utilized in screening for cognate ligands.

【0010】 本発明のヒトNTR−1ポリペプチドの好ましい使用には、このレセプターポ
リペプチドに結合する薬剤のスクリーニングが挙げられる。この薬剤は生物学的
に活性な薬剤(アゴニスト)(これはヒトNTR−1レセプターを活性化する)
であり得るか、またはレセプターに結合し、そしてその活性化をブロックし得る
(アンタゴニスト)。スクリーニング方法は、この薬剤の存在なしで、このポリ
ペプチドが基準親和性でこの結合標的に特異的に結合するという条件下で、細胞
外ヒトNTR−1ポリペプチド特異的結合標的および候補薬の存在下で、ヒトN
TR−1ポリペプチドをインキュベートする工程;このポリペプチドのこの結合
標的に対する結合親和性を検出し、薬剤で偏った親和性を決定し、ここでこの薬
剤で偏った親和性とこの基準親和性との間の相違は、この薬剤がこのポリペプチ
ドのこの結合標的への結合を調節することを示唆する工程、を包含する。
[0010] Preferred uses of the human NTR-1 polypeptide of the present invention include screening for agents that bind to the receptor polypeptide. The drug is a biologically active drug (agonist), which activates the human NTR-1 receptor
Or it can bind to a receptor and block its activation (antagonist). The screening method involves the presence of an extracellular human NTR-1 polypeptide-specific binding target and a candidate drug under the condition that the polypeptide specifically binds to the binding target with a reference affinity in the absence of the drug. Below, human N
Incubating the TR-1 polypeptide; detecting the binding affinity of the polypeptide for the binding target and determining the drug-biased affinity, wherein the drug-biased affinity and the reference affinity The difference between comprises suggesting that the agent modulates the binding of the polypeptide to the binding target.

【0011】 本発明はまた、ヒトおよび動物におけるNTR−1発現組織の検出に有用なヒ
トNTR−1をコードする核酸配列内に含まれる配列とハイブリダイズし得る核
酸プローブを提供する。
The present invention also provides a nucleic acid probe capable of hybridizing with a sequence contained in a nucleic acid sequence encoding human NTR-1 useful for detecting NTR-1 expressing tissues in humans and animals.

【0012】 本発明はさらに、ヒトNTR−1に指向される抗体を提供する。[0012] The present invention further provides antibodies directed to human NTR-1.

【0013】 本発明にはまた、診断のおよび治療の有効性を有する。本発明の特定の実施態
様において、本明細書に記載されるレセプターの機能または発現における異常を
検出する方法は、この障害の診断に使用され得る。他の実施態様において、この
レセプターと結合するレセプターまたはアゴニストまたはアンタゴニストの操作
は、疾患の処置に使用され得る。さらなる実施態様において、このレセプターの
細胞外ドメインは、レセプターのその標的への結合をブロックするブロッキング
剤として利用される。
The present invention also has diagnostic and therapeutic efficacy. In certain embodiments of the present invention, the methods for detecting abnormalities in receptor function or expression described herein can be used in the diagnosis of this disorder. In other embodiments, manipulation of a receptor or agonist or antagonist that binds to the receptor can be used to treat a disease. In a further embodiment, the extracellular domain of the receptor is utilized as a blocking agent to block binding of the receptor to its target.

【0014】 本発明のさらなる実施態様において、過剰のNTR−1で障害を受ける患者は
、このヒトNTR−1遺伝子コード領域と一致する効果のある量のアンチセンス
RNAまたはアンチセンスオリゴデオキシリボヌクレオチドを投与することで処
置され得、これによりNTR−1の発現を減少する。
In a further embodiment of the invention, the patient suffering from an excess of NTR-1 is administered an effective amount of antisense RNA or antisense oligodeoxyribonucleotide consistent with the human NTR-1 gene coding region. Can reduce the expression of NTR-1.

【0015】 (発明の詳細な説明) 本発明は、単離されたヒトNTR−1ポリペプチド、ならびにヒトNTR−1
アミノ酸配列、またはアッセイ認識可能なヒトNTR−1特異的活性を有するそ
の機能的ヒトNTR−1ポリペプチドドメインを含む組換えポリペプチドを含む
ヒトNTR−1ポリペプチドを提供する。従って、このポリペプチドは、開示さ
れたヒトNTR−1ポリペプチドの欠失変異体であり得、そして例えば、非ヒト
NTR−1ポリペプチドとの融合産物として提供され得る。本発明のヒトNTR
−1ポリペプチドドメインは、ヒトNTR−1特異的活性または機能を有する。
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The present invention relates to isolated human NTR-1 polypeptides, as well as human NTR-1.
Provided is a human NTR-1 polypeptide comprising an amino acid sequence or a recombinant polypeptide comprising the functional human NTR-1 polypeptide domain having human NTR-1 specific activity recognizable in an assay. Thus, the polypeptide can be a deletion mutant of the disclosed human NTR-1 polypeptide, and can be provided, for example, as a fusion product with a non-human NTR-1 polypeptide. Human NTR of the present invention
-1 polypeptide domain has human NTR-1 specific activity or function.

【0016】 ヒトNTR−1についての多くの適用は、その特性から示唆される。ヒトNT
R−1は、TNFを使用して処置されるものと同様の症状の研究および処置に有
用であり得る。さらに、ヒトNTR−1 cDNAは、例えば、細胞株における
ポリペプチドについてのアッセイにおける抗体の使用、あるいはオリゴヌクレオ
チドプライマーに対する配列類似性を有するものを増幅するためおよびどれくら
い多くのヒトNTR−1が存在するかを知るためのPCRテストにおけるプライ
マーとしてのオリゴヌクレオチドの使用による、診断ツールとして有用であり得
る。もちろん、ヒトNTR−1の単離も、その推定リガンド、他のヒトNTR−
1結合ポリペプチドを単離するため、および/またはその特性を研究するための
手がかりを提供する。
Many applications for human NTR-1 are suggested by its properties. Human NT
R-1 may be useful in studying and treating conditions similar to those treated using TNF. In addition, human NTR-1 cDNA can be used, for example, to use antibodies in assays for polypeptides in cell lines or to amplify those that have sequence similarity to oligonucleotide primers and how much human NTR-1 is present. The use of oligonucleotides as primers in PCR tests to find out may be useful as a diagnostic tool. Of course, isolation of human NTR-1 also depends on its putative ligand, other human NTR-
Provides clues for isolating the 1-binding polypeptide and / or studying its properties.

【0017】 ヒトNTR−1特異的活性または機能は、便利なインビトロ、細胞ベースの、
またはインビボアッセイ−例えば、インビトロ結合アッセイ、細胞培養アッセイ
、動物(例えば、免疫応答、遺伝子治療、トランスジェニックなど)などによっ
て決定され得る。結合アッセイは、結合標的とヒトNTR−1ポリペプチドとの
特異的分子相互作用が評価される何らかのアッセイを包含する。この結合標的は
、天然の結合標的、または抗体のような特異的免疫ポリペプチドのような非天然
結合標的、または以下に記載のアッセイで同定されるようなヒトNTR−1特異
的薬剤であり得る。
[0017] Human NTR-1 specific activity or function is a convenient in vitro, cell-based,
Or in vivo assays-for example, determined by in vitro binding assays, cell culture assays, animals (eg, immune responses, gene therapy, transgenics, etc.), and the like. Binding assays include any assay in which the specific molecular interaction between a binding target and a human NTR-1 polypeptide is evaluated. The binding target can be a natural binding target, or a non-natural binding target, such as a specific immune polypeptide such as an antibody, or a human NTR-1 specific agent as identified in the assays described below. .

【0018】 本発明のポリペプチドは、単離されたまたは純粋であり得−「単離された」ポ
リペプチドはその天然の状態で会合される物質のいくつかをもはや付随せず、そ
して好ましくは所定の試料中の総ポリペプチド重量の少なくとも約0.5%、お
よびより好ましくは少なくとも約5%を構成するものであり;「純粋な」ポリペ
プチドは、所定の試料中の総ポリペプチドの重量の少なくとも約90%、および
好ましくは少なくとも約99%を構成する。本発明のポリペプチドおよびポリペ
プチドドメインは、合成され、組換え技術によって産生され、または細胞から精
製され得る。広範な種々の分子および生化学的方法が、本発明の組成物の生化学
的合成、分子発現、および精製に利用可能であり、例えば、Molecular
Cloning, A Laboratory Manual (Sambr
ookら, Cold Spring Harbor Laboratory)
、Current Protocols in Molecular Biol
ogy (Ausubelら編, Greene Publ. Assoc.,
Wiley−Interscience, NY)を参照のこと。
The polypeptides of the present invention may be isolated or pure—an “isolated” polypeptide is no longer associated with any of the materials with which it is associated in its natural state, and preferably "Pure" polypeptide comprises at least about 0.5%, and more preferably at least about 5%, of the total polypeptide weight in a given sample; the "pure" polypeptide is the weight of the total polypeptide in a given sample. At least about 90%, and preferably at least about 99%. The polypeptides and polypeptide domains of the present invention can be synthesized, produced by recombinant technology, or purified from cells. A wide variety of molecular and biochemical methods are available for the biochemical synthesis, molecular expression, and purification of the compositions of the present invention, including, for example, Molecular
Cloning, A Laboratory Manual (Sambr
OK et al., Cold Spring Harbor Laboratory).
, Current Protocols in Molecular Biol
ogy (edited by Ausubel et al., Green Publ. Assoc.,
Wiley-Interscience, NY).

【0019】 本発明のポリペプチドは、免疫原として、スクリーニングアッセイにおける標
的として、細胞増殖、分化、および/または機能などを調節するための生物活性
試薬としての使用を含む、広範な種々の使用を見いだす。例えば、本発明は、添
加されたポリペプチドが培地の成分および/または細胞の生理機能の変化に影響
を及ぼす細胞外表面と特異的に相互作用する条件下で、外因性ヒトNTR−1ポ
リペプチドと細胞または細胞のまわりの培地とを接触させることによって、細胞
外表面を含む細胞の生理機能を調節するための方法を提供する。これらの方法に
よれば、細胞外表面は、血漿膜関連レセプターを含み;外因性ヒトNTR−1は
、細胞によって生成されないか、またはそうであれば非天然レベル、時期、また
は生理学的位置で発現されるポリペプチドをいい;そして適切な培地は、インビ
トロ培養培地および血液、滑液などのような生理学的液体を含む。ポリペプチド
は、マイクロインジェクション、組換え酵素のプロモーター特異的発現、脂質ベ
シクルの標的された送達などのような何らかの便利な方法によって、細胞の特異
的集団中で導入、発現、または抑制され得る。
The polypeptides of the present invention find a wide variety of uses, including as immunogens, as targets in screening assays, as bioactive reagents to modulate cell proliferation, differentiation, and / or function, and the like. Find out. For example, the invention provides for exogenous human NTR-1 polypeptides under conditions in which the added polypeptide specifically interacts with components of the medium and / or the extracellular surface that affects changes in cell physiology. A method for regulating the physiology of a cell, including the extracellular surface, by contacting the cell with the medium or the medium surrounding the cell. According to these methods, the extracellular surface contains a plasma membrane associated receptor; exogenous human NTR-1 is not produced by the cell or is otherwise expressed at a non-natural level, stage, or physiological location And suitable media include in vitro culture media and physiological fluids such as blood, synovial fluid, and the like. Polypeptides can be introduced, expressed, or suppressed in a specific population of cells by any convenient method, such as microinjection, promoter-specific expression of a recombinant enzyme, targeted delivery of lipid vesicles, and the like.

【0020】 本発明は、ヒトNTR−1特異的結合剤、このような薬剤を同定および製造す
る方法、ならびに診断、治療、および薬学的開発におけるその使用を提供する。
ヒトNTR−1特異的結合剤は、体細胞で組換えたタンパク質レセプター様特異
的抗体またはT細胞抗原レセプターのようなヒトNTR−1特異的レセプターを
含み(例えば、HarlowおよびLane (1988) Antibodi
es, A Laboratory Manual, Cold Spring
Harbor Laboratoryを参照のこと)、そしてまた、1、2、
および3ハイブリッドスクリーニングのようなアッセイで同定した他の結合剤、
ならびに以下に記載のような化学ライブラリーのスクリーニングで同定される非
天然結合剤を含む。特定の目的の薬剤は、ヒトNTR−1機能を調節する。
The present invention provides human NTR-1 specific binding agents, methods for identifying and producing such agents, and their use in diagnosis, therapy, and pharmaceutical development.
Human NTR-1 specific binding agents include human NTR-1 specific receptors, such as protein receptor-like specific antibodies or T-cell antigen receptors that have been recombinant in somatic cells (eg, Harlow and Lane (1988) Antibody).
es, A Laboratory Manual, Cold Spring
See Harbor Laboratory) and also 1, 2,
And other binding agents identified in assays such as three-hybrid screening,
As well as non-natural binders identified in screening chemical libraries as described below. Certain drugs of interest modulate human NTR-1 function.

【0021】 本発明は、ヒトNTR−1核酸を提供し、これは、翻訳可能な転写物、ハイブ
リダイゼーションプローブ、PCRプライマー、診断核酸などとしての使用、な
らびにヒトNTR−1遺伝子および遺伝子転写物の存在を検出することならびに
追加のヒトNTR−1ホモログおよび構造アナログをコードする核酸を検出また
は増幅することにおける使用を包含する、広範な種々の適用を見いだす。
The present invention provides human NTR-1 nucleic acids, which are used as translatable transcripts, hybridization probes, PCR primers, diagnostic nucleic acids, and the like, as well as human NTR-1 genes and gene transcripts. A wide variety of applications find use in detecting the presence and use in detecting or amplifying nucleic acids encoding additional human NTR-1 homologs and structural analogs.

【0022】 本発明の核酸は、合成/非天然配列であり、および/または単離される、すな
わち、その天然状態で会合される物質のいくつかをもはや付随せず、好ましくは
所定の画分に存在する総核酸の重量の少なくとも約0.5%、より好ましくは少
なくとも約5%を構成し、そして通常組換えは、非天然配列または天然染色体上
で連結される以外のヌクレオチドに連結される天然配列を含むことを意味する。
本明細書に開示されるヌクレオチド配列およびそのフラグメントを含む核酸は、
天然の染色体上で連結されるもの以外の配列に直に隣接した、または天然の染色
体上で連結されるもの以外の配列に直に隣接する10kbより少ない、好ましく
は2kbより少ないネイティブのフランキング領域に隣接した末端に、このよう
な配列またはフラグメントを含む。核酸は、通常、RNAまたはDNAであるが
、しばしば、他の塩基を含む核酸あるいは改変された安定性を提供するためのヌ
クレオチドアナログなどを使用するために有利である。
The nucleic acids of the invention are synthetic / non-naturally occurring sequences and / or are isolated, that is to say no longer associated with some of their materials associated in their natural state, preferably in a predetermined fraction. It constitutes at least about 0.5%, more preferably at least about 5%, by weight of the total nucleic acid present, and usually recombination occurs with non-native sequences or naturally-linked nucleotides other than those linked on the native chromosome. Means containing an array.
Nucleic acids comprising the nucleotide sequences disclosed herein and fragments thereof,
A native flanking region of less than 10 kb, preferably less than 2 kb, immediately adjacent to sequences other than those linked on the natural chromosome, or immediately adjacent to sequences other than those linked on the natural chromosome. Such sequences or fragments are included at the terminus adjacent to. The nucleic acid is usually RNA or DNA, but is often advantageous for using nucleic acids containing other bases or nucleotide analogs to provide altered stability.

【0023】 開示されたヒトNTR−1ポリペプチドのアミノ酸配列は、選択された発現系
(Hollerら (1993) Gene 136: 323−328;Ma
rtinら (1995) Gene 154: 150−166)について最
適化されたヒトNTR−1ポリペプチドをコードする核酸を逆翻訳するために使
用され、または天然のヒトNTR−1をコードする核酸配列の単離における使用
のための縮重オリゴヌクレオチドプライマーおよびプローブを生成するために使
用される(「GCG」ソフトウエア, Genetics Computer
Group, Inc., Madison, WI)。ヒトNTR−1をコー
ドする核酸は、発現ベクターの一部であり得、そして例えば、発現およびスクリ
ーニングのため、トランスジェニック動物のため、ヒトNTR−1媒介シグナル
形質導入と関連する疾患についての候補薬物の有効性のような機能的研究のため
などに、組換え宿主細胞に組み込まれ得る。発現系は、代替翻訳後プロセシング
によってヒトNTR−1ポリペプチド構造的および機能的改変体に影響を及ぼす
ために選択および/または適合される。
[0023] The amino acid sequence of the disclosed human NTR-1 polypeptide can be determined using selected expression systems (Holler et al. (1993) Gene 136: 323-328; Ma).
rtin et al. (1995) Gene 154: 150-166) used to reverse translate nucleic acids encoding human NTR-1 polypeptides, or a single copy of the nucleic acid sequence encoding native human NTR-1. Used to generate degenerate oligonucleotide primers and probes for use in isolation ("GCG" software, Genetics Computer)
Group, Inc. , Madison, WI). The nucleic acid encoding human NTR-1 can be part of an expression vector, and is a candidate drug for diseases associated with human NTR-1 mediated signal transduction, for example, for expression and screening, for transgenic animals, Can be incorporated into recombinant host cells, such as for functional studies such as the efficacy of E. coli. Expression systems are selected and / or adapted to affect human NTR-1 polypeptide structural and functional variants by alternative post-translational processing.

【0024】 本発明はまた、ヒトNTR−1 cDNA特異的配列を有しおよび配列番号1
との特異的ハイブリダイゼーションをもたらすために十分な核酸ハイブリダイゼ
ーションプローブおよび複製/増幅プライマーを提供する。特異的ハイブリダイ
ゼーションを証明することは、一般的に、ストリンジェント条件を必要とし、こ
の条件は、例えば、5×SSPE(0.18M NaCl、0.01M NaP
4、pH 7.7、0.001M EDTA)緩衝液中30%ホルムアミドを 含む緩衝液中で42℃の温度にてハイブリダイズすること、および0.2×SS
PEで42℃にて洗浄する場合に結合したままであること;好ましくは5×SS
PE緩衝液中50%ホルムアミドを含む緩衝液中で42℃の温度にてハイブリダ
イズすることおよび42℃の0.2×SSPE緩衝で42℃にて洗浄する場合に
結合したままであることである。ヒトNTR−1 cDNAホモログはまた、B
LASTX(Altschulら (1990) Basic Local A
lignment Search Tool, J. Mol. Biol.
215: 403−410)のようなアラインメントアルゴリズムを使用して他
のポリペプチドとは区別され得る。
The present invention also has a human NTR-1 cDNA specific sequence and SEQ ID NO: 1.
Provide sufficient nucleic acid hybridization probes and replication / amplification primers to effect specific hybridization with Demonstrating specific hybridization generally requires stringent conditions, such as 5 × SSPE (0.18 M NaCl, 0.01 M NaP
Hybridization at a temperature of 42 ° C. in a buffer containing 30% formamide in buffer (O 4 , pH 7.7, 0.001 M EDTA) and 0.2 × SS
Remains bound when washed at 42 ° C. with PE; preferably 5 × SS
Hybridizing at a temperature of 42 ° C. in a buffer containing 50% formamide in PE buffer and remaining bound when washing at 42 ° C. with 0.2 × SSPE buffer at 42 ° C. . The human NTR-1 cDNA homolog is also
LASTX (Altschul et al. (1990) Basic Local A
Lignent Search Tool, J.M. Mol. Biol.
215: 403-410) can be used to distinguish it from other polypeptides.

【0025】 ヒトNTR−1ハイブリダイゼーションプローブは、臨床および実験室試料に
おいて野生型および変異体対立遺伝子を同定することにおける使用を見いだす。
変異体対立遺伝子は、高処理能力比臨床診断のための対立遺伝子特異的オリゴヌ
クレオチド(ASO)プローブを生成するために使用される。ヒトNTR−1核
酸はまた、活性ヒトNTR−1の細胞発現または細胞内濃度または利用可能性を
調節するために使用される。ヒトNTR−1阻害核酸は、代表的には、開示され
たヒトNTR−1コード配列の相補物を含むアンチセンス−一本鎖配列である。
所定のヒトNTR−1ポリペプチドの発現のアンチセンス調節は、遺伝子調節配
列に作動可能に連結したアンチセンス核酸を用い得る。細胞は、遺伝子の転写が
、内因性ヒトNTR−1をコードするmRNAに結合し得るアンチセンス転写物
を得るように配向したプロモーター配列とともにヒトNTR−1配列を含むベク
ターでトランスフェクトされる。アンチセンス核酸の転写は、構成的または誘導
性であり得、そしてベクターは、安定な染色体外維持または組込みを提供し得る
。あるいは、所定のヒトNTR−1ポリペプチドをコードするゲノムDNAまた
はmRNAに結合する一本鎖アンチセンス核酸は、標的されたポリペプチドの発
現における実質的な減少を生じる濃度で、宿主中でまたは宿主から一時的に単離
される標的細胞に投与され得る。ヒトNTR−1発現における富化は、対応する
遺伝子産物の機能的発現を増加させるヒトNTR−1核酸を標的された細胞タイ
プに導入することによってもたらされる。このような核酸は、ヒトNTR−1発
現ベクター、内因性対立遺伝子の機能的発現をアップレギュレートするベクター
、または変異体対立遺伝子の標的された修正についての置換ベクターであり得る
。生存可能な細胞への核酸の導入のための技術は、当該技術分野で公知であり、
そしてレトロウイルスベースのトランスフェクション、ウイルスコートタンパク
質−リポソーム媒介トランスフェクションなどを含む。
Human NTR-1 hybridization probes find use in identifying wild-type and mutant alleles in clinical and laboratory samples.
Variant alleles are used to generate allele-specific oligonucleotide (ASO) probes for high-throughput clinical diagnostics. Human NTR-1 nucleic acids are also used to modulate cellular expression or intracellular concentration or availability of active human NTR-1. A human NTR-1 inhibitory nucleic acid is typically an antisense-single-stranded sequence that includes the complement of the disclosed human NTR-1 coding sequence.
Antisense regulation of the expression of a given human NTR-1 polypeptide can employ an antisense nucleic acid operably linked to a gene regulatory sequence. The cells are transfected with a vector containing the human NTR-1 sequence together with a promoter sequence oriented such that the transcription of the gene results in an antisense transcript capable of binding to mRNA encoding endogenous human NTR-1. Transcription of the antisense nucleic acid can be constitutive or inducible, and the vector can provide stable extrachromosomal maintenance or integration. Alternatively, the single-stranded antisense nucleic acid that binds to genomic DNA or mRNA encoding a given human NTR-1 polypeptide is present in or in the host at a concentration that results in a substantial decrease in expression of the targeted polypeptide. Can be administered to target cells that are temporarily isolated from. Enrichment in human NTR-1 expression is provided by introducing a human NTR-1 nucleic acid that increases the functional expression of the corresponding gene product into the targeted cell type. Such a nucleic acid can be a human NTR-1 expression vector, a vector that upregulates the functional expression of an endogenous allele, or a replacement vector for targeted modification of a mutant allele. Techniques for introducing nucleic acids into viable cells are known in the art,
And retrovirus-based transfection, virus coat protein-liposome mediated transfection, and the like.

【0026】 本発明は、ヒトNTR−1調節可能な細胞機能のレベルで活性な薬剤について
、薬剤、化合物、先導化合物を同定する効率的方法を提供する。一般的に、これ
らのスクリーニング方法は、天然のヒトNTR−1結合標的とのヒトNTR−1
の相互作用を調節する化合物についてアッセイする工程を包含する。タンパク質
−タンパク質結合アッセイ、イムノアッセイ、細胞ベースのアッセイなどを含む
、結合剤についての広範な種々のアッセイが提供される。好ましい方法は、先導
化合物についての化学ライブラリーの自動化された費用効率の良い高処理能力ス
クリーニングに従う。
The present invention provides efficient methods for identifying agents, compounds, and lead compounds for agents active at the level of human NTR-1 regulatable cell function. In general, these screening methods involve human NTR-1 binding to natural human NTR-1 binding targets.
Assaying for a compound that modulates the interaction of A wide variety of assays for binding agents are provided, including protein-protein binding assays, immunoassays, cell-based assays, and the like. The preferred method follows automated, cost-effective, high-throughput screening of chemical libraries for lead compounds.

【0027】 インビトロ結合アッセイは、ヒトNTR−1ポリペプチドを含む成分の混合物
を用い、これは、他のペプチドまたはポリペプチド、例えば、検出または固定の
ためのタグなどとの融合産物の一部であり得る。アッセイ混合物は、天然のヒト
NTR−1結合標的を含む。ネイティブな結合標的は使用され得るが、一部がア
ッセイで便利に測定可能な本発明のヒトNTR−1に対する結合親和性およびア
ビディティーを提供する限り、その一部を使用することが、しばしば好ましい。
アッセイ混合物はまた、候補薬理学的薬剤を含む。候補薬剤は、多数の化学クラ
スを含むが、代表的には、これらは、有機化合物、好ましくは小有機化合物であ
り、そして合成または天然化合物のライブラリーを含む広範な種々の供給源から
得られる。塩、緩衝剤、中性タンパク質(例えば、アルブミン)、洗浄剤、プロ
テアーゼインヒビター、ヌクレアーゼインヒビター、抗菌剤などのような種々の
他の試薬も含まれ得る。混合物成分は、必須の結合を提供する任意の順序で添加
され得、そしてインキュベーションは、最適結合を容易にする任意の温度で行わ
れ得る。混合物は、候補薬理学的薬剤の存在がなければ、ヒトNTR−1が、参
照結合親和性を有する細胞結合標的、一部、またはアナログを特異的に結合する
条件下でインキュベートされる。インキュベーション期間は、最適結合について
選択されるが、迅速な高処理能力比スクリーニングを容易にするためにも最小に
される。
The in vitro binding assay uses a mixture of components comprising a human NTR-1 polypeptide, which is a portion of the fusion product with another peptide or polypeptide, such as a tag for detection or immobilization. possible. The assay mixture contains the natural human NTR-1 binding target. Although native binding targets can be used, it is often preferred to use some of them, provided that they provide the binding affinity and avidity for human NTR-1 of the present invention that can be conveniently measured in an assay. .
The assay mixture also contains the candidate pharmacological agent. Candidate agents include many chemical classes, but typically they are organic compounds, preferably small organic compounds, and are obtained from a wide variety of sources including libraries of synthetic or natural compounds. . A variety of other reagents may also be included such as salts, buffers, neutral proteins (eg, albumin), detergents, protease inhibitors, nuclease inhibitors, antimicrobial agents, and the like. The mixture components can be added in any order that provides the requisite binding, and the incubation can be performed at any temperature that facilitates optimal binding. The mixture is incubated under conditions in which human NTR-1 specifically binds a cell binding target, part, or analog with reference binding affinity, in the absence of the candidate pharmacological agent. The incubation period is selected for optimal binding, but is also minimized to facilitate rapid high throughput ratio screening.

【0028】 インキュベーション後、ヒトNTR−1と1つ以上の結合標的との間の薬剤で
偏った結合は、何らかの便利な方法によって検出される。無細胞結合タイプアッ
セイについては、分離工程が、結合していない成分と結合した成分を分離するた
めにしばしば使用される。分離は、沈殿、固定などによって、次いで、例えば、
メンブラン濾過またはゲルクロマトグラフィーによる洗浄によって、もたらされ
得る。無細胞結合アッセイについては、成分の1つは、通常、標識を含むかまた
は標識に結合される。標識は、放射活性、発光、光学または電子密度などのよう
な直接的検出、あるいはエピトープタグ、酵素などのような間接的検出を提供し
得る。例えば、光学または電子密度、放射発光、非放射エネルギー転移によって
、または抗体結合体で間接的に検出されるなどの、標識の性質および他のアッセ
イ成分に依存して標識を検出するために、種々の方法が使用され得る。薬剤の存
在下での結合親和性と比較して薬剤の不在下での標的に対するヒトNTR−1ポ
リペプチドの結合親和性の差は、薬剤が、対応する結合標的へのヒトNTR−1
ポリペプチドの結合を調節することを示す。本明細書で使用される場合、差は、
統計学的に有意であり、そして好ましくは、少なくとも50%、より好ましくは
少なくとも90%差を示す。
After incubation, drug-biased binding between human NTR-1 and one or more binding targets is detected by any convenient method. For cell-free binding type assays, a separation step is often used to separate unbound and bound components. Separation is by precipitation, fixation, etc., and then, for example,
It can be effected by washing by membrane filtration or gel chromatography. For a cell-free binding assay, one of the components usually contains or is conjugated to a label. Labels can provide direct detection, such as radioactivity, luminescence, optical or electron density, or indirect detection, such as epitope tags, enzymes, and the like. Depending on the nature of the label and other assay components, such as, for example, detection by optical or electron density, radiative emission, non-radiative energy transfer, or indirectly with antibody conjugates, various Can be used. The difference in the binding affinity of a human NTR-1 polypeptide for a target in the absence of a drug as compared to the binding affinity in the presence of a drug indicates that the drug has a human NTR-1 binding activity to the corresponding binding target.
Fig. 7 illustrates modulating the binding of a polypeptide. As used herein, the difference is
It is statistically significant and preferably exhibits at least 50%, more preferably at least 90% difference.

【0029】 本発明は、培地と接触して細胞外表面を含む細胞の生理機能を改変する方法を
提供し、この方法は、このポリペプチドが、この細胞の生理機能の変化に影響を
及ぼすためのこの培地および細胞外表面の少なくとも1つの成分と特異的に相互
作用する条件下で、外因性ヒトNTR−1ポリペプチドとこの培地とを接触させ
る工程を包含する。
The present invention provides a method of altering the physiology of a cell, including the extracellular surface, upon contact with a culture medium, the method comprising: Contacting an exogenous human NTR-1 polypeptide with the medium under conditions that specifically interact with the medium and at least one component of the extracellular surface.

【0030】 本発明は、生物学的に活性な薬剤についてスクリーニングする方法をさらに提
供し、この方法は、a)この薬剤の存在がなければ、ポリペプチドが参照親和性
で結合標的を特異的に結合する条件下で、細胞外ヒトNTR−1ポリペプチド特
異的結合標的および候補薬剤の存在下でヒトNTR−1ポリペプチドをインキュ
ベートする工程;b)薬剤で偏った親和性を決定するためにこの結合標的に対す
るこのポリペプチドの結合親和性を検出する工程であって、ここで薬剤で偏った
親和性と参照親和性との間の差が、この薬剤がこの結合標的へのポリペプチドの
結合を調節することを示す、工程を包含する。
The present invention further provides a method of screening for a biologically active agent, the method comprising the steps of: a) in the absence of the agent, wherein the polypeptide specifically binds a binding target with a reference affinity. Incubating the human NTR-1 polypeptide in the presence of an extracellular human NTR-1 polypeptide specific binding target and a candidate agent under binding conditions; b) determining the drug-biased affinity Detecting the binding affinity of the polypeptide for the binding target, wherein the difference between the drug-biased affinity and the reference affinity indicates that the agent is responsible for binding the polypeptide to the binding target. Adjusting, including adjusting.

【0031】 本発明の1つの実施態様は、本明細書に記載のアミノ酸配列を含む単離された
ヒトNTR−1ポリペプチドまたはヒトNTR−1特異的活性を有するそのフラ
グメントである。
One embodiment of the present invention is an isolated human NTR-1 polypeptide comprising an amino acid sequence described herein or a fragment thereof having human NTR-1 specific activity.

【0032】 本発明の他の実施態様は、本明細書に記載のアミノ酸配列を含むヒトNTR−
1ポリペプチドをコードする組換え核酸またはヒトNTR−1特異的活性を有す
るそのフラグメントである。
[0032] Another embodiment of the present invention provides a human NTR-comprising an amino acid sequence described herein.
A recombinant nucleic acid encoding one polypeptide or a fragment thereof having human NTR-1 specific activity.

【0033】 さらに他の実施態様は、本明細書に記載のヌクレオチド配列を含む単離された
核酸、または少なくとも18の連続する塩基を有しそして天然のヒトNTR−1
cDNAの存在下で本明細書に記載の配列を有する核酸と特異的にハイブリダ
イズするために十分なそのフラグメントである。
[0033] Still other embodiments are isolated nucleic acids comprising a nucleotide sequence described herein, or native human NTR-1 having at least 18 contiguous bases.
A fragment thereof sufficient to specifically hybridize with a nucleic acid having a sequence described herein in the presence of the cDNA.

【0034】 本発明はまた、例えば、診断適用においてポリペプチドの検出に有用である本
明細書に記載のヒトNTR−1ポリペプチドに対する抗体を提供する。このヒト
NTR−1ポリペプチドに対するモノクローナル抗体の調製については、培養物
中の連続細胞株による抗体分子の産生を提供する何らかの技術が使用され得る。
例えば、KohlerおよびMilstein (1975, Nature
256:495−497)によって最初に開発されたハイブリドーマ技術、なら
びにトリオーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術(Kozborら, 19
83, Immunology Today :72)、およびヒトモノクロ
ーナル抗体を産生するためのEBV−ハイブリドーマ技術(Coleら, 19
85,「Monoclonal Antibodies and Cancer
Therapy」, Alan R. Liss, Inc. 77−96頁
)などは、本発明の範囲内である。
The present invention also provides antibodies to the human NTR-1 polypeptides described herein that are useful, for example, for detecting the polypeptide in diagnostic applications. For the preparation of monoclonal antibodies to the human NTR-1 polypeptide, any technique which provides for the production of antibody molecules by continuous cell lines in culture can be used.
See, for example, Kohler and Milstein (1975, Nature).
256: 495-497), as well as the trioma technology, the human B cell hybridoma technology (Kozbor et al., 19).
83, Immunology Today 4: 72) , and to produce human monoclonal antibodies EBV- hybridoma technique (Cole et al., 19
85, "Monoclonal Antibodies and Cancer"
Therapy, "Alan R. Liss, Inc. 77-96) are within the scope of the present invention.

【0035】 診断または治療使用のためのモノクローナル抗体は、ヒトモノクローナル抗体
またはキメラヒト−マウス(または他の種)モノクローナル抗体であり得る。ヒ
トモノクローナル抗体は、当該技術分野で公知の多くの技術のいずれかによって
作製され得る(例えば、Tengら, 1983, Proc. Natl.
Acad. Sci. U.S.A. 80:7308−7312;Kozbo
rら, 1983, Immunology Today 4:72−79;O
lssonら, 1982, Meth. Enzymol. 92:3−16
)。ヒト定常領域とともにマウス抗原結合ドメインを含むキメラ抗体分子が調製
され得る(Morrisonら, 1984, Proc. Natl. Ac
ad. Sci. U.S.A. 81:6851, Takedaら, 19
85, Nature 314:452)。
[0035] Monoclonal antibodies for diagnostic or therapeutic use can be human monoclonal antibodies or chimeric human-mouse (or other species) monoclonal antibodies. Human monoclonal antibodies can be made by any of a number of techniques known in the art (eg, Teng et al., 1983, Proc. Natl.
Acad. Sci. U. S. A. 80: 7308-7312; Kozbo
R et al., 1983, Immunology Today 4: 72-79;
lsson et al., 1982, Meth. Enzymol. 92: 3-16
). Chimeric antibody molecules can be prepared that contain a mouse antigen binding domain together with a human constant region (Morrison et al., 1984, Proc. Natl. Ac.
ad. Sci. U. S. A. 81: 6851, Takeda et al., 19
85, Nature 314: 452).

【0036】 当該技術分野で公知の種々の手順は、本明細書に記載のヒトNTR−1ポリペ
プチドのエピトープに対するポリクローナル抗体の産生について使用され得る。
抗体の産生について、種々の宿主動物は、ヒトNTR−1ポリペプチド、あるい
はそのフラグメントまたは誘導体の注射によって免疫され得、これにはウサギ、
マウス、およびラットが含まれるがこれらに限定されない。宿主種に依存して、
免疫学適応答を増加させるために種々のアジュバントが使用され得、これには、
フロイント(完全および不完全)、水酸化アルミニウムのような無機物ゲル、リ
ゾレシチンのような表面活性物質、プルロニックポリオール、ポリアニオン、ペ
プチド、油乳剤、キーホールリンペットヘモシアニン、ジニトロフェノール、お
よびBCG(Bacille Calmette−Guerin)およびCor
ynebacterium parvumのような潜在的に有用なヒトアジュバ
ントを含むが、これらに限定されない。
Various procedures known in the art can be used for the production of polyclonal antibodies against an epitope of the human NTR-1 polypeptide described herein.
For the production of antibodies, various host animals can be immunized by injection of a human NTR-1 polypeptide, or a fragment or derivative thereof, including rabbits,
Includes but is not limited to mice and rats. Depending on the host species,
Various adjuvants can be used to increase the immunological response, including:
Freund (complete and incomplete), mineral gels such as aluminum hydroxide, surfactants such as lysolecithin, pluronic polyols, polyanions, peptides, oil emulsions, keyhole limpet hemocyanin, dinitrophenol, and BCG (Bacille Calmette- Guerin) and Cor
Includes, but is not limited to, potentially useful human adjuvants such as ynebacterium parvum.

【0037】 選択されたヒトNTR−1ポリペプチドエピトープに対する抗体の分子クロー
ンは、公知の技術によって調製され得る。組換えDNA方法論(例えば、Man
iatisら, 1982, Molecular Cloning, A L
aboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, New
Yorkを参照のこと)は、モノクローナル抗体分子、またはその抗原結合領
域をコードする核酸配列を構築するために使用され得る。
[0037] Molecular clones of antibodies to the selected human NTR-1 polypeptide epitope can be prepared by known techniques. Recombinant DNA methodology (eg, Man
iatis et al., 1982, Molecular Cloning, AL.
laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, New
York) can be used to construct a nucleic acid sequence encoding a monoclonal antibody molecule, or antigen-binding region thereof.

【0038】 本発明は、抗体分子およびこのような抗体分子のフラグメントを提供する。分
子のイディオタイプを含む抗体フラグメントは、公知の技術によって生成され得
る。例えば、このようなフラグメントは、抗体分子のペプシン切断によって産生
され得るF(ab’)2フラグメント;F(ab’)2フラグメントのジスルフ ィド架橋を還元することによって生成され得るFab’フラグメント;ならびに
パパインおよび還元剤で抗体分子を処理することによって生成され得るFabフ
ラグメントを含むが、これらに限定されない。抗体分子は、公知の技術、例えば
、免疫吸着または免疫アフィニティークロマトグラフィー、HPLC(高速液体
クロマトグラフィー)のようなクロマトグラフ方法、またはその組み合わせによ
って精製され得る。
[0038] The present invention provides antibody molecules and fragments of such antibody molecules. Antibody fragments which contain the idiotype of the molecule can be generated by known techniques. For example, such fragments are F (ab ') 2 fragments that can be produced by pepsin cleavage of the antibody molecule; Fab' fragments that can be produced by reducing the disulfide bridges of the F (ab ') 2 fragment; Includes, but is not limited to, Fab fragments that can be generated by treating an antibody molecule with papain and a reducing agent. Antibody molecules can be purified by known techniques, for example, immunoadsorption or immunoaffinity chromatography, chromatographic methods such as HPLC (high performance liquid chromatography), or a combination thereof.

【0039】 以下の実施例は、例示によって提供され、そして限定を提供するものではない
The following examples are provided by way of illustration, and not by way of limitation.

【0040】 (実施例1 ヒトNTR−1遺伝子のクローニングおよび配列決定) TNFファミリーの公知のヒトおよびマウスメンバーのアミノ酸配列を、mR
NA配列のランダムフラグメントのNIH ESTデータベースを検索するため
のtblastn疑問として使用した(Altschul, Stephen
F., Warren Gish, Webb Miller, Eugene
W. Myers, およびDavid J. Lipman (1990)
. Basic local alignment search tool.
J. Mol. Biol. 215:403−10)。各疑問は、ヒットの
リスト、すなわち、疑問配列に対する実質的な配列類似性を有するEST配列を
生成した。代表的には、リストの上部におけるヒットは、疑問タンパク質のmR
NAコピー、次いでファミリーおよびランダム−チャンス類似性の他のメンバー
に由来するESTに対応した。
Example 1 Cloning and Sequencing of the Human NTR-1 Gene The amino acid sequences of known human and mouse members of the TNF family were
Used as a tblastn question to search the NIH EST database for random fragments of NA sequences (Altschul, Stephen)
F. , Warren Gish, Webb Miller, Eugene
W. Myers, and David J. et al. Lipman (1990)
. Basic local alignment search tool.
J. Mol. Biol. 215: 403-10). Each question generated a list of hits, ie, EST sequences with substantial sequence similarity to the query sequence. Typically, the hit at the top of the list is the mR of the protein in question.
NA copies were followed by ESTs from the family and other members of the random-chance similarity.

【0041】 parserプログラムを使用して、ファミリーのメンバーのすべてとの検索
からヒットのすべてを組み合わせおよび分類した。これは、公知のタンパク質に
対応するヒットのすべての迅速な削減を可能にした。残りのヒットを、ファミリ
ーに特徴的な配列モチーフの保存について分析した。追加のデータベース検索を
行って、重複するESTを同定した。2つのヒトcDNAクローン、I.M.A
.G.Eコンソーシアムからの識別番号366305(’305クローン)およ
び592256(’256クローン)が相同性配列を含むことが識別された。こ
れらのクローン、GeneBank受託番号AA025672およびAA155
646はResearch Genetics,Inc.(Huntsvill
e,AL)から入手し、ABI 373A DNA sequencerおよび
Taq Dideoxy Terminator Cycle Sequenc
ing Kit(Applied Biosystems,Inc.,Fost
er City,CA)を使用して配列決定した。
Using the parser program, all of the hits from the search with all of the family members were combined and classified. This allowed for a rapid reduction of all hits corresponding to known proteins. The remaining hits were analyzed for conservation of sequence motifs characteristic of the family. An additional database search was performed to identify duplicate ESTs. Two human cDNA clones, I.P. M. A
. G. FIG. Identification numbers 366305 ('305 clone) and 592256 (' 256 clone) from the E Consortium were identified to contain homologous sequences. These clones, GeneBank accession numbers AA025672 and AA155
646 is Research Genetics, Inc. (Huntsville
e, AL) and obtained from ABI 373A DNA sequencer and Taq Video Terminator Cycle Sequence.
ing Kit (Applied Biosystems, Inc., Fost)
er City, CA).

【0042】 この’305クローンは終止コドンおよびポリAテールを含有し、従ってこの
分子の3’末端をコードすることを決定した。この’256クローンはこの’3
05クローンの5’末端で、約300ヌクレオチド長に渡って整列させた。互い
に、この重複クローンは、約220アミノ酸のポリペプチドをコードするが、骨
プロテグリンと比較した場合、この5’末端から約80アミノ酸が不足していた
。さらに、予想したシグナルペプチドについて、または最初のメチオニンについ
てのコード配列が無いので、この’256クローンの5’末端は不完全であると
みなされた。次いで、この5’RACE手順を、このシグナルペプチドを含む6
3個の不足アミノ酸をコードするヌクレオチド配列を得るために使用した。この
コード配列と隣接するPCRプライマーを使用して、この全コード配列を含む単
一フラグメントを構築した。次いで、ヒトNTR−1の配列を、配列決定により
、さらに確認した。ヒトNTR−1のヌクレオチドおよび推定アミノ酸配列を本
明細書に示す。ノーザン分析は、成体肺、骨格筋、腎臓、胎盤、および膵臓、な
らびに胎児心臓および胃におけるヒトNTR−1転写物を明らかにした。
The '305 clone contained a stop codon and a polyA tail and was therefore determined to encode the 3' end of the molecule. This '256 clone is this' 3
The 5 'end of the 05 clone was aligned over a length of about 300 nucleotides. Each other, the duplicated clone encodes a polypeptide of about 220 amino acids, but lacks about 80 amino acids from its 5 'end when compared to bone protegrin. In addition, the 5 'end of the' 256 clone was considered incomplete because there was no coding sequence for the expected signal peptide or for the first methionine. The 5 'RACE procedure was then performed on the 6' containing the signal peptide.
It was used to obtain a nucleotide sequence encoding three missing amino acids. Using the PCR primers flanking this coding sequence, a single fragment containing the entire coding sequence was constructed. The sequence of human NTR-1 was then further confirmed by sequencing. The nucleotide and deduced amino acid sequence of human NTR-1 is provided herein. Northern analysis revealed human NTR-1 transcripts in adult lung, skeletal muscle, kidney, placenta, and pancreas, and fetal heart and stomach.

【0043】 先の発明は、理解の明確さのために、図解および実施例によりいくらか詳細に
記載されたが、特定の変化および改変は、この添付の請求項の精神または範囲か
ら逸脱することなく、さらになされ得ることは、本発明の教示に照らして当業者
に容易に明らかである。
While the foregoing invention has been described in some detail by way of illustration and example for purposes of clarity of understanding, certain changes and modifications may be made without departing from the spirit or scope of the appended claims. What can be done will be readily apparent to those skilled in the art in light of the teachings of the present invention.

【0044】 本発明は、本明細書に記載される特定の実施態様による範囲に限定されない。
実際は、本発明の種々の改変は、本明細書に記載されたものに加えて、上述およ
び添付図から、当該者に明らかになる。このような改変は、この添付の請求の範
囲の範囲内にあることが意図される。
The present invention is not limited in scope by the specific embodiments described herein.
Indeed, various modifications of the invention in addition to those described herein will become apparent to those skilled in the art from the foregoing and accompanying figures. Such modifications are intended to fall within the scope of the appended claims.

【配列表】[Sequence list]

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 1/21 C12P 21/02 C 5/10 21/08 C12P 21/02 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/08 5/00 B (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM ,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM) ,AL,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG, BR,BY,CA,CH,CN,CU,CZ,DE,D K,EE,ES,FI,GB,GE,GH,GM,HR ,HU,ID,IL,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,L V,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI, SK,SL,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,U S,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 マシアコウスキ, ピオトル ジェイ. アメリカ合衆国 ニューヨーク 12569, プレザント バレー, ボックス 404, ホルター レーン (72)発明者 モリス, ジョディ アメリカ合衆国 ニューヨーク 10956, ニュー シティ, ブリストル コート 3 (72)発明者 バレンズエラ, デイビッド エム. アメリカ合衆国 ニューヨーク 10598, ヨークタウン ハイツ, ギオルダノ ドライブ 529 Fターム(参考) 4B024 AA11 BA63 CA04 DA02 HA01 HA12 HA15 4B064 AG01 AG27 CA10 CA19 CC24 DA01 DA13 4B065 AA90X AA91X AA93Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA44 CA46 4H045 AA11 AA30 CA40 DA51 EA50 FA74 ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C12N 1/21 C12P 21/02 C 5/10 21/08 C12P 21/02 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/08 5/00 B (81) Designated country EP (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE ), OA (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG), AP (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SZ, UG, ZW), EA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM), AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA CH, CN, CU, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, GB, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC , LK, LR, LS, LT, LU, LV, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZW (72) Inventor Maciaskowski, Piotr Jay. United States New York 12569, Pleasant Valley, Box 404, Holter Lane (72) Inventor Morris New York 10956, New York, Bristol Court 3 (72) Inventor Valenzuela, David M. New York 10598, Yorktown Tsu, Giorudano drive 529 F-term (reference) 4B024 AA11 BA63 CA04 DA02 HA01 HA12 HA15 4B064 AG01 AG27 CA10 CA19 CC24 DA01 DA13 4B065 AA90X AA91X AA93Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA44 CA46 4H045 AA11 AA30 CA40 DA51 EA50 FA74

Claims (18)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 ヒトNTR−1をコードする単離された核酸分子。1. An isolated nucleic acid molecule encoding human NTR-1. 【請求項2】 以下からなる群より選択される配列を有する、請求項1に記
載の単離された核酸分子: (a)配列番号1に記載のヒトNTR−1のコード領域を含むヌクレオチド配
列; (b)(a)のヌクレオチド配列にストリンジェント条件下でハイブリダイズ
し、そしてヒトNTR−1の生物学的活性を有する分子をコードする、ヌクレオ
チド配列;または (c)遺伝コードの縮重がなければ、(a)または(b)のヌクレオチド配列
にハイブリダイズし、そしてヒトNTR−1の生物学的活性を有する分子をコー
ドする、ヌクレオチド配列。
2. The isolated nucleic acid molecule of claim 1, having a sequence selected from the group consisting of: (a) a nucleotide sequence comprising the coding region of human NTR-1 of SEQ ID NO: 1. (B) a nucleotide sequence that hybridizes under stringent conditions to the nucleotide sequence of (a) and encodes a molecule having the biological activity of human NTR-1; or (c) the degeneracy of the genetic code Otherwise, a nucleotide sequence that hybridizes to the nucleotide sequence of (a) or (b) and encodes a molecule having the biological activity of human NTR-1.
【請求項3】 請求項1または2に記載の核酸分子を含むベクター。3. A vector comprising the nucleic acid molecule according to claim 1 or 2. 【請求項4】 前記核酸分子が、宿主細胞においてその発現を指向し得る発
現制御配列に作動可能に連結される、請求項3に記載のベクター。
4. The vector of claim 3, wherein said nucleic acid molecule is operably linked to an expression control sequence capable of directing its expression in a host cell.
【請求項5】 プラスミドである、請求項3または4に記載のベクター。5. The vector according to claim 3, which is a plasmid. 【請求項6】 単離されたヒトNTR−1ポリペプチド。6. An isolated human NTR-1 polypeptide. 【請求項7】 配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する、単離されたヒト
NTR−1ポリペプチド。
7. An isolated human NTR-1 polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
【請求項8】 宿主細胞中に請求項3または4に記載のベクターを含む、ヒ
トNTR−1の産生のための宿主−ベクター系。
8. A host-vector system for the production of human NTR-1, comprising a vector according to claim 3 or 4 in a host cell.
【請求項9】 前記宿主細胞が、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺
乳動物細胞である、請求項8に記載の宿主−ベクター系。
9. The host-vector system according to claim 8, wherein said host cell is a bacterial cell, a yeast cell, an insect cell, or a mammalian cell.
【請求項10】 NTR−1が前記のとおり産生される条件下で請求項8ま
たは9に記載の宿主−ベクター系の細胞を増殖させる工程を包含する、ヒトNT
R−1を産生する方法。
10. A human NT comprising the step of growing cells of the host-vector system according to claim 8 or 9 under conditions in which NTR-1 is produced as described above.
A method for producing R-1.
【請求項11】 請求項6または7に記載のヒトNTR−1を特異的に結合
する抗体。
An antibody that specifically binds to human NTR-1 according to claim 6 or 7.
【請求項12】 モノクローナル抗体である、請求項11に記載の抗体。12. The antibody according to claim 11, which is a monoclonal antibody. 【請求項13】 請求項6または7に記載のヒトNTR−1、およびキャリ
アを含む、組成物。
13. A composition comprising the human NTR-1 according to claim 6 and a carrier.
【請求項14】 請求項11または12に記載の抗体、およびキャリアを含
む、組成物。
14. A composition comprising the antibody according to claim 11 or 12 and a carrier.
【請求項15】 ヒトまたは動物の体の処置の方法における、あるいは診断
方法における使用のための、請求項6または7に記載のヒトNTR−1、請求項
11または12に記載の抗体、あるいは請求項13または14に記載の組成物。
15. The human NTR-1 according to claim 6 or 7, the antibody according to claim 11 or 12, or the claim, for use in a method of treatment of the human or animal body or in a diagnostic method. Item 15. The composition according to Item 13 or 14.
【請求項16】 請求項10に記載の方法によって産生されるポリペプチド
16. A polypeptide produced by the method according to claim 10.
【請求項17】 免疫グロブリン定常領域に融合されたヒトNTR−1レセ
プターの細胞外部分を含む、レセプター体。
17. A receptor body comprising the extracellular portion of the human NTR-1 receptor fused to an immunoglobulin constant region.
【請求項18】 前記定常領域がヒト免疫グロブリンγ−1定常領域である
、請求項17に記載のレセプター体。
18. The receptor according to claim 17, wherein the constant region is a human immunoglobulin γ-1 constant region.
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