JP2001500724A - T1 receptor-like ligand II - Google Patents

T1 receptor-like ligand II

Info

Publication number
JP2001500724A
JP2001500724A JP10510698A JP51069898A JP2001500724A JP 2001500724 A JP2001500724 A JP 2001500724A JP 10510698 A JP10510698 A JP 10510698A JP 51069898 A JP51069898 A JP 51069898A JP 2001500724 A JP2001500724 A JP 2001500724A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
ligand
polypeptide
amino acid
sequence
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
JP10510698A
Other languages
Japanese (ja)
Other versions
JP2001500724A5 (en
Inventor
ニー,ジャン
エル. ジェンツ,ライナー
エム. ルーベン,スティーブン
Original Assignee
ヒューマン ジノーム サイエンシーズ,インコーポレイテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ヒューマン ジノーム サイエンシーズ,インコーポレイテッド filed Critical ヒューマン ジノーム サイエンシーズ,インコーポレイテッド
Publication of JP2001500724A publication Critical patent/JP2001500724A/en
Publication of JP2001500724A5 publication Critical patent/JP2001500724A5/ja
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Abstract

(57)【要約】 本発明は、新規のT1R様リガンドIIタンパク質に関する。詳細には、T1R様リガンドIIタンパク質をコードする単離された核酸分子が提供される。T1R様リガンドIIポリペプチド、組換えベクターおよびこれらを発現するための宿主細胞もまた提供される。   (57) [Summary] The present invention relates to a novel T1R-like ligand II protein. Specifically, an isolated nucleic acid molecule encoding a T1R-like ligand II protein is provided. Also provided are T1R-like ligand II polypeptides, recombinant vectors and host cells for expressing them.

Description

【発明の詳細な説明】 T1レセプター様リガンドII 発明の背景 発明の分野 本発明は、新規のT1レセプター(T1R)様リガンドIIタンパク質に関する。詳 細には、T1R様リガンドIIタンパク質をコードする単離された核酸分子が提供さ れる。T1R様リガンドIIポリペプチド、組換えベクターおよびこれらを発現する ための宿主細胞もまた提供される。 関連分野 インターロイキン-1(IL-1)。インターロイキン-1(IL-1αおよびIL-1β)は 、ほとんど全ての細胞型に影響する「多機能性」サイトカインであり、そしてし ばしば、他のサイトカインまたはメディエータ小分子と共同して影響する。(Din arello,C.A.,Blood 87:2095-2147(1996年3月15日)。)L-1遺伝子ファミリー の3つのメンバー:IL-1α、IL-1β、およびIL-1レセプターアンタゴニスト(IL- 1Ra)が存在する。IL-1αおよびIL-1βはアゴニストであり、IL-1Raは特異的なレ セプターアンタゴニストである。IL-1αおよびβは、リーダー配列を有さない前 駆体として合成される。各前駆体の分子量は31kDである。IL-1αまたはIL-1βの 17kDの「成熟」形態へのプロセシングは、特異的な細胞性プロテアーゼを必要と する。対照的に、IL-1Raは、シグナルペプチドを伴って進化し、そして細胞の外 に容易に輸送され、そして分泌IL-1Ra(sIL-1Ra)と呼ばれる。 IL-lレセプターおよびリガンド。IL-l経路のレセプターおよびリガンドは十分 に規定されている(総説については、Dinarello,C.A.,FASE BJ.8:1314-1325( 1994);Sims,J.E.ら、Interleukin-1 signal transduction:Advances in Cell a nd Molecular Biology of Membranes and Organelles,3巻、JAI Press,Inc. ,Greenwich,CT(1994),197-222頁)。3つのリガンド、IL-1α、IL-1β、およ びIL-1レセプターアンタゴニスト(IL-1ra)は、3つの型のIL-1レセプター、 80-kDa I型IL-1レセプター(IL-1R1)(Sims,J.E.ら、Science 241:585-589(1988) ),68-kDa II型IL-1レセプター(IL-1RII)(McMahan,C.J.ら、EMBO J.10:2821-2 832(1991)、および可溶性形態のII型IL-1R(sIL-1RII)を結合する(Colotta,F.ら 、Science 261:472-475(1993))。 IL-1リガンドとレセプターとの間の相互作用は、損傷および感染へのIL-1媒介 宿主応答の刺激および調節に必須の役割を果たす。IL-1RIを発現する細胞および IL-1αまたはIL-1βで処理した細胞は、以下を含むいくつかの特定の方法で応答 する:関連する転写因子、NF-κβの核局在化を刺激すること(総説については、 Thanos,D.& Maniatis,T.Cell 80:529-532(1996)を参照のこと)、上皮増殖因 子レセプター(EGFR)のスレオニン669残基(Thr-669)をリン酸化するマイトジェン 活性化タンパク質キナーゼスーパーファミリーのタンパク質キナーゼの活性化(G uy,G.R.ら、J.Biol.Chem.267:1846-1852(1992);Bird,T.A.ら、J.Biol.Chem.268: 22861-22870(1991);Bird,T.A.ら、J.Biol.chem.269:31836-31844(1994))、およ びIL-8遺伝子の転写の刺激(Mukaida,N.ら、J.Bol.chem.265:21128-21133(1990)) 。 IL-1RI様ファミリー。多様な系に由来する多くのタンパク質が、IL-1RIの細胞 質内ドメインに相同性を示す。この拡大したIL-1RI様ファミリーは、哺乳動物タ ンパク質、Drosophilaタンパク質、および植物(タバコ)タンパク質を含む。 (Gay,N.J.& Keith,F.J.,Nature 351:355-356(1991);Hashimoto,C.ら、Cell 52:2 69-279(1988);Schneider,D.S.ら、Genes & Dev.5:797-807(1991);Edon,E.ら、De velopment 120:885-899(1994);Mitchan,J.L.ら、J.Biol.Chem 271:5777-5782(19 96年3月8日))。 哺乳動物IL-1RI様レセプターファミリーメンバーは、マウスタンパク質MyD88( Lord,K.A.ら、Oncogene 5:1095-1097(1990))およびヒト遺伝子、rsc786(Nomura ,N.ら、DNA Res.1:27-35(1994))を含む。別のマウスレセプターメンバー、T1/ ST2は、BAL/c-3T3細胞において発現される新規の一次応答遺伝子として以前に特 徴付けられた(Klemenz,Rら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:5708-5712(1989);To minaga,S.,FEBS Lett.258:301-304(1989);Tominga,S.ら、FEBS Lett.318-87(199 3))。膜貫通タンパク質mu1L-1R AcP(Greenfeder,S.A.ら、J.B iol.Chem.270:13757-13765(1995))は、I型およびII型IL-1Rの両方に相同性を有 する。IL-1R AcPは、IL-1RIのIL-1βに対する親和性を増強することが最近示さ れており、そしてIL-1応答を媒介することに関与し得る。 T1レセプター。IL-1レセプターファミリーのメンバーとしてのT1/ST2レセプタ ー(以降、「T1レセプター」)(Bergers,Gら、EMBO J.13:1176(1994))は、異な る種において種々のホモログを有する。ラットでは、それはFit-lと呼ばれ、マ ウスIL-1RIおよびIIそれぞれに対して26%〜29%のアミノ酸相同性を共有するエ ストロゲン誘導性、c-fos-依存性膜貫通タンパク質である。マウスでは、Fit-1 タンパク質はST2と呼ばれ、ヒトではT1と呼ばれる。2つのIL-1レセプターおよ びFit-1/ST2/T1遺伝子の機構は、それらが共通の祖先に由来することを示す(Sim s,J.E.ら、Cytokine 7:483(1995))。Fit-1は、2つの形態で存在する:IL-1RI およびFit-1Sのサイトゾルドメインに類似したサイトゾルドメインを有する膜形 態(Fit-1M)、これは分泌され、そしてFit-Mの細胞外ドメインからなる。 多くの方法において、これらの2つの形態のFit-1タンパク質は、膜結合およ び可溶性IL-1RIの形態に類似する。IL-1sRIが細胞結合形態のタンパク質分解切 断に由来することが知られている(Sims,J.E.ら、Cytokine 7:483(1995))。他方 では、Fit-1遺伝子は、2つのプロモーターの制御下にある。これは、膜のレセ プターまたは可溶性形態のレセプターのいずれかをコードする2つのイソ型を生 じる。2つのRNA転写物は、遺伝子の3'末端のオルタナティブRNAスプライシング から生じる。IL-1βは、Fit-1に弱く結合し、そしてシグナルを伝達しない(Reik erstorger,A.ら、J.Biol.Chem.270:17645(1995))が、サイトゾルFit-1に融合さ れた細胞外マウスIL-1RIからなるキメラレセプターはIL-1シグナルを伝達する(R eikerstorger,A.ら、J.Biol.Chem.270:17645(1995))。Fit-1のサイトゾル部分は 、IL-1RIのGTPase様配列と整列化する(Hopp,T.P.,Protein Sci.4:1851(1995) )(下記参照)。 種々の疾患状態におけるIL-1産生。増大したIL-1産生は、種々のウイルス、細 菌、真菌、および寄生体の感染;血管内凝固;高用量IL-2治療;固形腫瘍;白血 病;アルツハイマー病;HIV-1感染;自己免疫障害;外傷(外科);血液透析;虚 血性疾患(心筋梗塞);非感染性肝炎;喘息;UV照射;閉鎖性頭部損傷;膵 炎;歯周病;対宿主性移植片病;移植片拒絶を有する患者、および激しい運動後 の健康な被検体において報告されている。アルツハイマー病を有する患者におけ る増大したIL-1β産生とアミロイド前駆体タンパク質の放出における考えられる IL-1の役割との関連が存在する(Vasilakos,J.P.ら、FEBS Lett.354:289(1994) )。しかし、ほとんどの条件において、IL-1は、産生の増大を示す唯一のサイト カインではなく、従って、任意の特定の疾患の病原に関連するようなIL-1知見の 特異性は欠損している。種々の疾患状態において、IL-1αではなくIL-1βは、循 環において検出される。 治療におけるIL-1。IL-1は、多くの重要な生物学的活性を発揮することが見出 されているが、治療用量に近接した用量で毒性であることも見出されている。(D inarello,C.A.,Blood 87:2095-2147(1996年3月15日))。一般に、IL-1のいず れかのイソ型の急性毒性は、皮下注射と比較して静脈注射後で大きかった。皮下 注射は、有意な局所的疼痛、紅斑、および膨潤(Kitamura,T.,& Takaku,F.,Exp. Med.7:170(1989);Laughlin,M.J.,Ann.Hematol.67:267(1993))。100ng/kg以上 の用量でIL-1を静脈に投与した患者は有意な低血圧を経験した。皮下に4〜32ng /kgのIL-1βを与えた患者では、最も高い用量レベルで唯一低血圧の発症があっ ただけであった(Laughlin,M.J.,Ann.Hematol.67:267(1993))。 正常な髄貯蔵を有する患者におけるIL-1関連骨髄刺激とは対照的に、5日周用 量(30〜100mg/kg)のIL-1αで処置された再生不良性貧血を有する患者は、末梢 血計数または骨髄細胞性において増大を有さなかった(Walsh,C.E.ら、Br.J.Hae matol 80:106(1992))。IL-1は、好中球減少および血小板減少の最下点を元に戻 すために、化学療法の種々の措置を受けた患者に投与される。 自己の骨髄または幹細胞の0日〜13日の40ng/kgのIL-1αでの日周処置は、好 中球減少のより早い回復を生じた(中央値、12日;P<0.001)(Weisdorf,D.ら、Bl ood 84:2044(1994)。処置の14日後、骨髄は、関係付けられた骨髄球前駆細胞で 有意に富化された。同様の結果が、パージした骨髄またはパージしていない骨髄 の移植のときに開始して5日間、50ng/kg/dのIL-1βを与えたAMLを有する患者に おいて報告された(Nemunaitis,J.ら、Blood 83:3473(1994))。低容量のIL-1 αまたはIL-1βのいずれかをヒトに注射することによって、印象的な発熱性お よび分子の低血圧誘導性特性が確認される。 可溶性IL-1レセプターを用いる疾患の回復。マウスIL-1sRIのマウスへの投与 は、異所(heterotopic hear)同種移植片の生存を増大し、そして同種移植間の 細胞の過形成性リンパ節応答を減少した(Fanslow,W.C.ら、Science 248:739(1 990))。抗原誘導性関節炎のラットモデルにおいて、マウスIL-1sRIの局所滴下 は、関節膨張および組織破壊を減少した(Dower,S.K.ら、Therapeutic Immunol .1:113(1994))。これらのデータは、正常な対側関節に投与されたIL-1sRIの総 量が全身的に作用したことを示す。実験的な自己免疫脳炎のモデルにおいて、IL -1sRIは、この疾患の重篤度を減少した(Jacobs,C.A.ら、J.Immunol.146:2983 (1991))。 発明の要旨 本発明は、図1(配列番号2)のアミノ酸配列を有するヒトT1レセプター(T1R) 様リガンドIIポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸 分子を提供する。T1R様リガンドIIは、N末端メチオニン、約26アミノ酸残基のリ ーダー配列、約168残基の細胞外成熟ドメイン、約23残基の膜貫通ドメインおよ び約12アミノ酸残基の細胞内ドメイン、および約26kDaの推定分子量を含む、約2 29アミノ酸残基のポリペプチドをコードするオープンリーディングフレームを含 む。予想された成熟細胞外T1R様リガンドIIタンパク質の168アミノ酸配列を図1 および配列番号2(残基27〜194)に示す。 別の局面において、本発明は、1996年7月12日にATCC受託番号98655として寄 託されたクローンのcDNAによってコードされたアミノ酸配列を有するT1R様リガ ンドIIをコードする単離された核酸分子を提供する。好ましくは、核酸分子は、 上記の寄託されたcDNAによってコードされる成熟ポリペプチドをコードする。 本発明は、さらに、本明細書中に記載される核酸分子の核酸フラグメントに関 する。寄託されたcDNAのヌクレオチド配列または図1(配列番号1)に示される ヌクレオチド配列を有する単離された核酸分子のフラグメントによって、本明細 書中で考察されるような診断プローブおよびプライマーとして有用である少なく とも約15nt、そしてより好ましくは少なくとも約20nt、なおより好ましくは少な くとも約30nt、そしてさらにより好ましくは少なくとも約40ntの長さのフラグメ ントが意図される。もちろん、50〜741ntの長さのより大きなフラグメントもま た、奇託されたcDNAまたは図1(配列番号1)に示されるヌクレオチド配列の( 全てではなくとも)ほとんどに一致するフラグメントと同様に、本発明に従って 有用である。少なくとも20ntの長さのフラグメントによって、例えば、寄託され たcDNAのヌクレオチド配列または図1(配列番号1)に示されるヌクレオチド配 列からの20以上の連続した塩基を含むフラグメントが意図される。遺伝子が寄託 されており、そして図1(配列番号1)に示されるヌクレオチド配列が提供され るので、このようなDNAフラグメントを作製することは、当業者にとって日常的 である。例えば、制限エンドヌクレアーゼ切断または超音波による剪断は、種々 のサイズのフラグメントを作製するために容易に使用され得る。あるいは、この ようなフラグメントは、合成的に作製され得る。 好ましい核酸フラグメントは、約26アミノ酸残基(図1(配列番号2)の約1〜 約26のアミノ酸残基)のリーダー配列;約168残基の細胞外成熟ドメイン(図1(配 列番号2)の約27〜約194のアミノ酸残基);約23アミノ酸の膜貫通ドメイン(図1 (配列番号2)の約195〜約217のアミノ酸残基);約8アミノ酸の細胞内ドメイン( 図1(配列番号2)の約218〜229のアミノ酸残基);膜貫領域の全てまたは一部が 欠失した細胞外および細胞内ドメインを含むペプチドをコードする核酸分子を含 む。 本発明のさらなる実施態様は、本明細書中に記載される核酸分子のいずれかの ヌクレオチド配列に少なくとも90%同一であり、そしてより好ましくは、少なく とも95%、96%、97%、98%、または99%同一であるヌクレオチド配列を有する 単離された核酸分子を含む。 本発明はまた、本発明の単離された核酸分子を含む組換えベクター、組換えベ クターを含む宿主細胞、および組換え技術によるT1R様リガンドIIポリペプチド またはそのフラグメントの産生に関する。 本発明のポリペプチドは、寄託されたcDNAによってコードされるポリペプチド 、図1(配列番号2)のポリペプチド(詳細には、成熟ポリペプチド)、ならびに寄 託されたcDNAによってコードされるポリペプチド、図1(配列番号2)のポリペ プチド、またはそれらのフラグメントのアミノ酸配列に対して少なくとも90%の 類似性、より好ましくは少なくとも95%の類似性を有するアミノ酸配列を有する ポリペプチドを含む。本発明のさらなるポリペプチドは、寄託されたcDNAによっ てコードされるポリペプチド、図1(配列番号2)のポリペプチド、またはそれ らのフラグメントのアミノ酸配列に少なくとも80%同一、より好ましくは少なく とも90%または95%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。 本発明による好ましいポリペプチドフラグメントは、成熟ポリペプチド、細胞 外ドメイン、膜貫通ドメイン、細胞内ドメイン、または膜貫通ドメインの全てま たは一部を欠失した細胞外および細胞内ドメインを含むポリペプチドを含む。 本発明のさらなる実施態様は、本明細書中に記載のT1R様リガンドIIのエピト ープ保有部分のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはペプチドに関する。本 発明のIL-1様ポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列を有するペプチ ドまたはポリペプチドは、少なくとも6〜30または9〜50のアミノ酸を有するこ のようなポリペプチドの部分を含むが、本明細書中に記載される本発明のポリペ プチドの全アミノ酸配列の長さまでの任意の長さ(全体を含む)のエピトープ保 有部分ポリペプチドもまた含まれる。 別の実施態様において、本発明は、本明細書中に記載されるアミノ酸配列を有 するT1R様リガンドIIポリペプチドに特異的に結合する単離された抗体を提供す る。 本発明のT1R様リガンドIIの生物学的活性は、T1RリガンドおよびIL-1の生物学 的活性に類似であり得ると考えられる。「正常な」T1R様リガンドII遺伝子発現 レベル(すなわち、T1Rリガンド関連障害またはIL-1関連障害を有さない個体由 来の組織または体液における発現レベル)と比較して、有意により高いまたはよ り低いレベルのT1R様リガンドIIが、T1Rリガンド関連障害またはIL-1関連障害を 有する個体由来の組織または体液(例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液 )において検出され得る。従って、本発明によるT1R様リガンドII遺伝子発現の 発現を検出することは、診断マーカーである。 さらなる実施態様において、本発明は、身体における増大または減少したレベ ルのT1R様リガンドII活性の必要性を有する個体を処置する方法に関する。この 方法は、T1R様リガンドIIポリペプチドまたはそのインヒビターを含む組成物を そのような個体に投与することを含む。 本発明は、本明細書中に記載されるアミノ酸配列を有するT1R様リガンドIIポ リペプチドに特異的に結合する抗体を単離するための方法をさらに提供する。こ のような抗体は、上記のように、診断または治療に有用であり得る。 図面の簡単な説明 図1は、ATCC受託番号98655に含まれるcDNAクローンを配列決定することによ って決定されたT1R様リガンドIIタンパク質のヌクレオチド配列(配列番号1) および推定アミノ酸配列(配列番号2)を示す。約1〜約26のアミノ酸は、シグ ナルペプチドを示し(第1の下線を付した配列);約27〜約194のアミノ酸は細 胞外ドメインを示し(第1と第2の下線を付した配列の間の配列);約195〜約2 17のアミノ酸は膜貫通ドメインを示し(第2の下線を付した配列);および約21 8〜約229のアミノ酸は細胞内ドメインを示す(残りの配列)。 図2は、T1R様リガンドIIのアミノ酸配列とGenBank登録番号U41804(配列番号3 )のタンパク質配列との間の類似性の領域を示し、全体で56%同一性を示す。 図3は、T1R様リガンドIIアミノ酸配列の分析を提供する。α、β、ターンお よびコイル領域;親水性および疎水性領域;両親媒性領域;可動性領域;抗原性 指数ならびに表面確率が示される。 発明の詳細な説明 本発明は、図1(配列番号2)に示されるアミノ酸配列(クローン化されたcD NAを配列決定することによって決定された)を有するT1R様リガンドIIタンパク 質をコードするポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子を提供する。本発 明のT1R様リガンドIIタンパク質は、T1Rリガンド(図2)と配列相同性を共有す る。 図1(配列番号1)に示されるヌクレオチド配列は、HE96K24クローンを配列 決定することによって得られた。これは、1996年7月12日に、アメリカンタイプ カルチャーコレクション,12301 Park Lawn Drvie,Rockville,Maryland 20852 に寄託され、そして受託番号第97655号を与えられた。寄託されたクローンは、p Bluescript SK(-)プラスミド(Stratagene,LaJolla,CA)中に含まれる。 核酸分子 他に示されない限り、本明細書中でDNA分子を配列決定することによって決定 されたすべてのヌクレオチド配列は、自動化DNA配列決定機(例えば、Applied B iosystems,Inc.からのModel 373)を用いて決定され、そして本明細書中で決定 されるDNA分子によってコードされるペプチド、ポリペプチド、またはタンパク 質のすべてのアミノ酸配列は、上記のように決定されるDNA配列の翻訳によって 予想された。従って、この自動化アプローチによって決定された任意のDNA配列 について当該分野において公知のように、本明細書中で決定される任意のヌクレ オチド配列はいくつかの誤りを含み得る。自動化によって決定されるヌクレオチ ド配列は、配列決定されるDNA分子の実際のヌクレオチド配列に対して、代表的 には少なくとも約90%の同一、より代表的には少なくとも約95%から少なくとも 約99.99%の同一である。 実際の配列は、当該分野において周知の手動DNA配列決定方法を含む他のアプ ローチによってより正確に決定され得る。当該分野においてまた公知のように、 実際の配列と比較した、決定されるヌクレオチド配列における単一の挿入または 欠失は、ヌクレオチド配列の翻訳におけるフレームシフトを引き起こし、その結 果、決定されるヌクレオチド配列によってコードされる予想されるアミノ酸配列 は、挿入または欠失のような点にて始まる配列決定されるDNA分子によって実際 にコードされるアミノ酸配列とは完全に異なる。 他に示されない限り、本明細書中に示される各「ヌクレオチド配列」は、デオ キシリボヌクレオチド(A,G,C,およびTと省略される)の配列として示される。 しかし、核酸分子またはポリヌクレオチドの「核酸配列」によって、DNA分子ま たはポリヌクレオチドにはデオキシリボヌクレオチドの配列が、そしてRNA分子 またはポリヌクレオチドにはリボヌクレオチド(A,G,C,およびU)の対応する配 列(ここで特定されるデオキシヌクレオチド配列における各チミジンデオキシヌ クレオチド(T)は、リボヌクレオチドのウリジン(U)によって置き換えられ る)が意図される。例えば、デオキシリボヌクレオチドの略語を用いて示される 配列番号1の配列を有するRNA分子との言及は、配列番号1の各デオキシヌクレ オチドA,GまたはCが、対応するリボヌクレオチドA,G,またはCによって置き換 えられ、そして各デオキシヌクレオチドTが、リボヌクレオチドUによって置き換 えられる配列を有するRNA分子を示すことが意図される。 「単離された」核酸分子によって、天然の環境から取り出された核酸分子(DN AまたはRNA)が意図される。例えば、ベクター中に含まれる組換えDNA分子は、 本発明の目的のために単離されることが考慮される。単離されたDNA分子のさら なる例は、異種の宿主細胞において維持される組換えDNA分子、または溶液中の 精製された(部分的または実質的)DNA分子を含む。単離されたRNA分子は、本発 明のDNA分子のインビボまたはインビトロでのRNA転写物を含む。本発明に従って 単離された核酸分子は、合成的に生成されるような分子をさらに含む。 本明細書中で提供される情報(例えば、図1(配列番号1)中のヌクレオチド 配列)を用いて、T1R様リガンドIIポリペプチドをコードする本発明の核酸分子 は、標準的なクローニングおよびスクリーニング手順(例えば、開始物質として mRNAを用いるクローニングcDNAのための手順)を用いて得られ得る。本発明の例 として図1(配列番号1)において記載される核酸分子は、9週齢ヒト胎児組織 由来のcDNAライブラリー中で発見された。さらに、遺伝子はまた、ヒト細胞の以 下の型由来のcDNAライブラリーにおいて見出された:前立腺、反応不顕性T細胞 、TF274間質細胞、WI38、Soares乳房細胞、およびSoares胎盤。 T1R様リガンドIIcDNAは、開始コドンが図1(配列番号1)において示される ヌクレオチド配列の55〜57位である約229アミノ酸残基のタンパク質をコードす るオープンリーディングフレームを含む;約26アミノ酸残基の予想されるリーダ ー配列、および約26kDaの推定分子量。成熟したT1R様リガンドIIタンパク質のア ミノ酸配列のアミノ酸残基27から残基229までを図1(配列番号2)中に示す。 成熟したT1R様リガンドIIタンパク質は、3つの主要な構造的ドメインを有する 。これらは、図1(配列番号2)中の約27〜約194のアミノ酸残基由来の細胞外 ドメイン;図1(配列番号2)中の約195〜約217のアミノ酸残基由来の膜貫通ド メイン;および図1(配列番号2)中の約218〜約229のアミノ酸残基由来の細胞 内 ドメイン。図1(配列番号2)中の本発明のT1R様リガンドIIタンパク質は、T1R リガンドに対して約56%同一、そして約75%類似であり、それは、GenBankに、 受託番号第U41804号として利用され得る。 当業者が理解するように、上記の配列決定誤差の可能性、ならびに異なる公知 のタンパク質におけるリーダーの切断部位の可変性に起因して、寄託されたcDNA によってコードされる実際のT1R様リガンドIIは、約229のアミノ酸を含むが、21 5〜245の範囲のアミノ酸で任意の場所であり得る;そしてこのタンパク質の推定 リーダー配列は、約26アミノ酸であるが、約15〜約30の範囲のアミノ酸で任意の 場所であり得る。さらに、例えば、図1(配列番号2)におけるT1R様リガンドI Iタンパク質細胞外ドメイン、細胞内ドメイン、および膜貫通ドメインの正確な 位置は、ドメインを定義するために使用される基準に依存してわずかに変化し得 る(例えば、正確なアミノ酸の位置は、図1に示されるものと比較して約1〜約 5の残基で異なり得る)。 示されるように、本発明の核酸分子は、RNA(例えば、mRNA)の形態、またはD NAの形態(例えば、クローニングによって得られるか、または合成的に生成され るcDNAおよびゲノムDNAを含む)なかに存在し得る。DNAは、二本鎖または一本鎖 であり得る。一本鎖DNAまたはRNAは、コード鎖(センス鎖としても知られる)で あり得るか、またはそれは、非コード鎖(アンチセンス鎖としても知られる)で あり得る。 本発明の単離された核酸分子は、図1(配列番号1)において示されるヌクレ オチド配列の55〜57位で開始コドンを有するオープンリーディングフレーム(ORF )を含むDNA分子を含み、そしてさらに、開始コドンが図1(配列番号1)中のヌ クレオチド配列の55〜57位にあるORFのすべてまたは一部と実質的に異なる配列 を含むが、遺伝コードの縮重に起因して、T1R様リガンドIIタンパク質またはそ のフラグメントをなおコードするDNA分子を含む。当然のことながら、遺伝コー ドは当該分野において周知である。従って、上記のような縮重した変異体を生成 することは、当業者にとって日常的である。 別の局面において、本発明は、1996年7月12日にATCC寄託番号97655として寄 託されたプラスミド中に含まれるcDNAクローンによってコードされるアミノ酸配 列を有するT1R様リガンドIIタンパク質をコードする単離された核酸分子を提供 する。好ましくは、核酸分子は、上記の寄託されたcDNAクローンによってコード される成熟ポリペプチドをコードする。 本発明は、さらに、図1(配列番号1)に示されるヌクレオチド配列、もしく は上記の寄託されたクローン中に含まれるT1R様リガンドIIcDNAのヌクレオチド 配列を有する単離された核酸分子、または上記の配列の一つと相補的な配列を有 する核酸分子を提供する。そのような単離された分子、特にDNA分子は、染色体 とのインサイチュハイブリダイゼーションによって遺伝子マッピングするため、 および例えばノーザンブロット分析によってヒト組織中のT1R様リガンドII遺伝 子の発現を検出するためのプローブとして有用である。以下に詳細に記載される ように、特定の組織におけるT1R様リガンドII遺伝子発現の変化を検出すること は、特定の障害の指標であり得る。 本発明は、さらに、本明細書中で記載される単離した核酸分子のフラグメント に関する。寄託されたcDNAのヌクレオチド配列、または図1(配列番号1)に示 されるヌクレオチド配列を有する単離された核酸分子のフラグメントによって、 本明細書中で考察されるように、診断的プローブおよびプライマーとして有用で ある、長さが、少なくとも約15nt、そしてより好ましくは少なくとも約20nt、さ らにより好ましくは少なくとも約30nt、そしてさらにより好ましくは少なくとも 約40ntが意図される。当然のことながら、長さがより大きなフラグメント50〜12 00ntもまた、寄託されたcDNAのヌクレオチド配列、または図1(配列番号1)に おいて示されるようなヌクレオチド配列のすべてではなくともほとんどに対応す るフラグメントのように、本発明に従って有用である。例えば、長さが少なくと も20ntのフラグメントによって、寄託されたcDNAのヌクレオチド配列、または図 1(配列番号1)に示されるようなヌクレオチド配列からの20以上の隣接した塩 基を含むフラグメントが意図される。この遺伝子が寄託され、そして図1(配列 番号1)において示されるヌクレオチド配列が提供されるので、そのようなDNA フラグメントを生成することは、当業者にとって日常的である。例えば、制限エ ンドヌクレアーゼ切断、または超音波処理による剪断は、種々のサイズのフラグ メントを生成するために容易に使用され得る。あるいは、そのようなフラグメン トは、合成的に生成され得る。 本発明の好ましい核酸フラグメントは、以下をコードする核酸分子を含む:T1 R様リガンドII細胞外ドメインを含むポリペプチド(図1(配列番号l)中の約2 7〜約194のアミノ酸残基);T1R様リガンドII膜貫通ドメインを含むポリペプチ ド(図1(配列番号1)中の約195〜約217のアミノ酸残基);およびT1R様リガ ンドII細胞内ドメインを含むポリペプチド(図1(配列番号2)中の約218〜約2 29のアミノ酸残基);ならびに欠失した膜貫通ドメインの全てまたは一部を有す るT1R様リガンドII細胞外および細胞内ドメインを有するポリペプチド。本発明 のさらに好ましい核酸フラグメントは、T1R様リガンドIIタンパク質のエピトー プ保有部分をコードする核酸分子を含む。特に、図1(配列番号2)(これは、 本発明者ら、T1R様リガンドIIタンパク質の抗原性領域であると決定している) 中の以下のアミノ酸残基を含むポリペプチドをコードする単離した核酸分子が提 供される:図1(配列番号2)中の約43〜約52のアミノ酸残基を含むポリペプチ ド;図1(配列番号2)中の約82〜約98のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図 1(配列番号2)中の約129〜約146のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1( 配列番号2)中の約162〜約175のアミノ酸残基を含むポリペプチド;および約18 1〜約197のアミノ酸残基を含むポリペプチド。T1R様リガンドIIタンパク質の他 のそのようなエピトープ保有部分を決定するための方法は、以下に詳細に記載さ れる。 別の局面において、本発明は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条 件下で、上記の本発明の核酸分子(例えば、ATCC寄託第97655号中に含まれるcDN Aクローン)中のポリヌクレオチドの一部にハイブリダイズするポリヌクレオチ ドを含む単離した核酸分子を提供する。「ストリンジェントなハイブリダイゼー ション条件」によって、括弧内を含む溶液(50%ホルムアミド、5×SSC(150mM のNaCl、15mMのクエン酸三ナトリウム)、50mMのリン酸ナトリウム(pH7.6)、5 ×デンハート液、10%硫酸デキストラン、および20μg/mlの変性剪断サケ精子D NA)中42℃での一晩のインキュベーション、続く約65℃にて0.1×SSCにおいてフ ィルターを洗浄することが意図される。ポリヌクレオチドの「一部」にハイブリ ダイズするポリヌクレオチドによって、参照のポリヌクレオチドの少なくとも約 15ヌクレオチド(nt)、そしてより好ましくは少なくとも約20nt、さらにより好ま しくは少なくとも約30nt、そしてさらにより好ましくは約30〜70ntにハイブリダ イズするポリヌクレオチド(DNAまたはRNAのいずれか)が意図される。これらは 、以上、および以下でより詳細に考察されるような診断用プローブおよびプライ マーとして有用である。 当然のことながら、参照のポリヌクレオチド(例えば、寄託されたcDNAクロー ン)のより大きな部分(例えば、長さが100〜750ntの部分)、または参照のポリ ヌクレオチドの完全長とまでもハイブリダイズするポリヌクレオチドはまた、寄 託されたcDNAのヌクレオチド配列または図1(配列番号1)に示されるようなヌ クレオチド配列のすべてではなくともほとんどに対応するポリヌクレオチドのよ うに、本発明に従ったプローブとして有用である。例えば、「長さが少なくとも 20nT」のポリヌクレオチドの部分によって、参照のポリヌクレオチドのヌクレオ チド配列(例えば、寄託されたcDNA、または図1(配列番号1)に示されるよう なヌクレオチド配列)からの20以上の連続したヌクレオチドが意図される。示さ れるように、そのような部分は、従来のDNAハイブリダイゼーション技術に従っ たプローブとして、または例えば、Sambrook,J.ら編、Molecular Cloning,ALa boratory Manual,第2版、Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Sprin g Harbor,NY(1989)に記載されるようなポリメラーゼ連鎖反応(PCR)による標的 配列の増幅のためのプライマーとしてのいずれかで診断的に有用である。 T1R様リガンドIIcDNAクローンは寄託されており、そしてその決定されたヌク レオチド配列が図1(配列番号1)において提供されるので、T1R様リガンドIIc DNA分子の一部にハイブリダイズするポリヌクレオチドを生成することは、当業 者に日常的である。例えば、T1R様リガンドIIcDNAクローンの制限エンドヌクレ アーゼ切断または超音波による剪断は、T1R様リガンドIIcDNA分子の一部にハイ ブリダイズするポリヌクレオチドである種々のサイズのDNA部分を生成するため に容易に使用され得る。あるいは、本発明のハイブリダイズするポリヌクレオチ ドは、公知の技術に従って合成的に生成され得る。 当然のことながら、ポリA配列(例えば、図1(配列番号1)に示されるTIR様 リガンドIIcDNAの3'末端ポリ(A)付加物)にのみ、またはT(またはU)の相補的な 部分(stretch)にハイブリダイズするポリヌクレオチドは、本発明の核酸の一部 にハイブリダイズするために使用される本発明のポリヌクレオチドに含まれない 。なぜなら、そのようなポリヌクレオチドは、ポリ(A)伸長またはその相補物を 含む任意の核酸分子(例えば、実際上任意の二本鎖cDNAクローン)にハイブリダ イズする。 示されるように、T1R様リガンドIIをコードする本発明の核酸分子は、以下を 含むが、それらに限定されない:それ自体によって、成熟ポリペプチドのアミノ 酸配列をコードする核酸分子;成熟したポリペプチドのコード配列およびさらな る配列(例えば、約26のアミノ酸リーダー配列をコードする配列)(例えば、プ レタンパク質配列またはプロタンパク質配列またはプレプロタンパク質配列); 成熟ポリペプチドのコード配列で、上記のさらなるコード配列を含むかまたは含 まず、さらなる非コード配列とともに集まっており、この配列はイントロンおよ び非コード5'および3'配列(例えば、転写、mRNAプロセシング(スプライシング およびポリアデニル化シグナル(例えば、リボソーム結合およびmRNAの安定性) を含む)において役割を担う転写非翻訳配列)を含むがこれらに限定されない; さらなる機能性を提供するようなさらなるアミノ酸をコードするさらなるコード 配列。従って、例えば、ポリペプチドをコードする配列は、マーカー配列(例え ば、融合されたポリペプチドの精製を容易にするペプチドをコードする配列)に 融合され得る。本発明のこの局面の特定の好ましい実施態様において、マーカー アミノ酸配列は、ヘキサ-ヒスチジンペプチド(例えば、pQEベクター(とりわけ 、Qiagen,Inc.)において提供されるタグであり、それらの多くは公的および/ または商業的に入手可能)である。例えば、Gentzら、Proc.Natl.Acad.Sci. USA 86:821-824(1989)において記載されるように、ヘキサヒスチジンは、融合タ ンパク質の簡便な精製を提供する。「HA」タグは、インフルエンザ赤血球凝集素 (HA)タンパク質由来のエピトープに対応する精製のために有用な別のペプチドで あり、それは、Wilsonら、Cell 37:767(1984)によって記載されている。他のそ のような融合タンパク質は、NまたはC末端にてFcに融合されるT1R様リガンドI Iタンパク質またはそのフラグメントを含む。 本発明は、さらに、T1R様リガンドIIタンパク質の一部、アナログ、または誘 導体をコードする本発明の核酸分子の変異体に関する。変異体は、天然の対立遺 伝子変異体のように、天然に生じ得る。「対立遺伝子変異体」によって、生物の 染色体上の所定の遺伝子座を占める遺伝子のいくつかの交換可能な形態の1つが 意図される。天然に存在しない変異体は、例えば当該分野で公知の変異誘発技術 を用いて生成され得る。 そのような変異体は、ヌクレオチド置換、欠失、または添加によって生成され る変異体を含む。置換、欠失、または添加は、1つ以上のヌクレオチドを含み得 る。変異体は、コードもしくは非コード領域、またはその両方において変化され 得る。コード領域における変異は、保存性もしくは非保存性アミノ酸置換、欠失 、または添加を生成し得る。これらの中で特に好ましいものは、サイレント置換 、添加、および欠失であり、これらは、T1R様リガンドIIまたはその一部の特性 および活性を変化しない。これらの点において特にまた好ましいものは、保存性 置換である。 本発明のさらなる実施態様は、(a)図1(配列番号2)に示される完全なアミ ノ酸配列(リーダーを含む)を有するか、もしくはATCC受託番号97655に含まれ るcDNAクローンによってコードされる全長T1R様リガンドIIをコードするヌクレ オチド配列;(b)図1(配列番号2)中のほぼ27位からほぼ229位のアミノ酸配列 を有するか、もしくはATCC受託番号97655に含まれるcDNAクローンによってコー ドされる成熟T1R様リガンドII(リーダー配列が除去された全長ポリペプチド)を コードするヌクレオチド配列;(c)図1(配列番号2)中のほぼ27位からほぼ194 位のアミノ酸配列を有するか、もしくはATCC受託番号97655に含まれるcDNAクロ ーンによってコードされるT1R様リガンドII細胞外ドメインをコードするヌクレ オチド配列;(d)図1(配列番号2)中のほぼ195位からほぼ217位のアミノ酸配 列を有するか、もしくはATCC受託番号97655に含まれるcDNAクローンによってコ ードされるT1R様リガンドII膜貫通ドメインをコードするヌクレオチド配列;(e) 図1(配列番号2)中のほぼ218位からほぼ229位のアミノ酸配列を有するか、も しくはATCC受託番号97655に含まれるcDNAクローンによってコードされるT1R様リ ガンドII細胞内ドメインをコードするヌクレオチド配列;または(f)(a)、(b)、( c)、(d)、もしくは(e)のヌクレオチド配列のいずれかと相補的なヌクレオ チド配列と、少なくとも90%同一のヌクレオチド配列を有し、そしてより好まし くは少なくとも95%、96%、97%、98%、または99%同一のヌクレオチド配列を 有するポリヌクレオチドを含む単離された核酸分子を含む。 T1R様リガンドIIポリペプチドをコードする参照ヌクレオチド配列と少なくと も、例えば、95%「同一」のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによっ て、ポリヌクレオチド配列が、T1R様リガンドIIポリペプチドをコードする参照 ヌクレオチド配列の各100ヌクレオチドあたり5つまでの変異を含み得ることを 除いて、ポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が、参照配列と同一であることが 意図される。言い換えれば、参照ヌクレオチド配列と少なくとも95%同一である ヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを得るために、参照配列における5 %までのヌクレオチドが欠失され得るかもしくは別のヌクレオチドで置換され得 るか、または参照配列において全ヌクレオチドの5%までの多数のヌクレオチド が、参照配列中に挿入され得る。参照配列のこれらの変異は、参照ヌクレオチド 配列の5'もしくは3'末端位置でか、または参照配列内のヌクレオチドの中で個々 に、もしくは参照配列内の1つ以上の連続した群でのいずれかで散在されて、こ れらの末端位置の間のどこかで生じ得る。 実際には、任意の特定の核酸分子が、例えば、図1に示されるヌクレオチド配 列または寄託されたcDNAクローンのヌクレオチド配列に少なくとも90%、95%、 96%、97%、98%、または99%同一であるかどうかは、BESTFITプログラム(Wisc onsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix,Genetics Computer G roup,University Research Park,575 Science Drive,Madison,WI 53711)の ような公知のコンピュータープログラムを用いて従来通りに決定され得る。BEST FITは、SmithおよびWaterman,Adv.Appl.Math.2:482-489(1981)の局所的相同 性アルゴリズムを用いて、2つの配列間の相同性の最適のセグメントを見出す。 BESTFITまたは任意の他の配列整列プログラムを使用して、特定の配列が、例え ば本発明による参照配列に95%同一であるか否かを決定する場合、パラメーター は、もちろん、同一性の割合が、参照ヌクレオチド配列の全長にわたって計算さ れるように、そして参照配列の総ヌクレオチド数の5%までの相同性におけるギ ャップが許容されるように、設定される。 本出願は、T1R様リガンドIIタンパク質活性を有するポリペプチドをコードす るか否かに関係なく、上記の核酸配列と少なくとも90%、95%、96%、97%、98 %、または99%同一である核酸分子に関する。これは、特定の核酸分子がT1R様 リガンドII活性を有するポリペプチドをコードしない場合でさえ、当業者は、核 酸分子をどのようにして、例えば、ハイブリダイゼーションプローブ、またはポ リメラーゼ連鎖反応(PCR)のプライマーとして使用するかをなお知るからである 。T1R様リガンドII活性を有するポリペプチドをコードしない本発明の核酸分子 の使用としては、とりわけ(1)T1R様リガンドII遺伝子またはその対立遺伝子変異 体をcDNAライブラリーから単離すること;(2)Vermaら,Human Chromosomes:a Ma nual of Basic Techniques,Pergamon Press,New York(1988)に記載の、T1R様 リガンドII遺伝子の正確な染色体位置を提供するための分裂中期染色体展開物に 対するインサイチュハイブリダイゼーション(例えば、「FISH」);および、(3) 特定の組織におけるT1R様リガンドII mRNA発現を検出するためのノーザンブロッ ト分析、が挙げられる。 しかし、実際に、T1R様リガンドIIタンパク質活性を有するポリペプチドをコ ードする上記の核酸配列に少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99 %同一である配列を有する核酸分子が好ましい。 「T1R様リガンドIIタンパク質活性を有するポリペプチド」によって、特定の 生物学的アッセイにおいて測定される場合、本発明のT1R様リガンドIIタンパク 質の活性と類似する(しかし、必ずしも同一ではない)活性を示すポリペプチド が意図される。T1R様リガンドII活性は、公知のレセプター結合アッセイを用い てアッセイされ得る(Mitcham,J.L.ら,J.Biol.Chem.271:5777-5783(1996);および Gayle,M.A.ら,J.Biol.Chem.271:5784-5789(1996))。これらのアッセイは、NF-κ Bゲルシフトアッセイ、インビトロThr-669キナーゼアッセイ、およびIL-8プロモ ーター活性化アッセイを含む。 これらのアッセイを実施するために、最初に、哺乳動物細胞を適切なレセプタ ーに対するcDNAを含む発現ベクターでトランスフェクトする必要がある。例えば 、T1/ST2レセプターに対するcDNAを含む発現ベクターが使用され得る。このcDNA は記載されるように得られ得る。(Klemenz R.ら,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.8 6:5708-5712(1989);Tominaga,S.,FEBS Lett.258:301-304 Bergers,G.ら,EMBO J. 13:1176-1188))。あるいは、T1/ST2 cDNAは、ポリメラーゼ連鎖反応を用いて増 幅され得る。適切な組織または細胞型(例えば、NIH-3T3細胞(Klemenz,R.ら,Pro c,Natl..Acad.Sci.U.S.A.86:5708-5712(1989))由来のmRNAから調製された市販の cDNAライブラリーが、テンプレートとして使用され得る。当業者に周知の任意の いくつかのトランスフェクション法を用いて、適切な細胞株(例えば、COS 7細 胞)が、T1/ST2発現プラスミドでトランスフェクトされ得る。レセプターの発現 は、ラジオイムノアッセイによって確認され得る(Mitcham,J.L.ら,J.Biol.Chem. 271:5777-5783(1996)を参照のこと)。トランスフェクションの1〜3日後、コン フルエントなトランスフェクトCOS7細胞が、1〜10ngのT1R様リガンドIIタンパ ク質で15分〜2時間刺激される。T1R様リガンドIIタンパク質による刺激の持続 時間は、どのアッセイが使用されるかに依存して変動し、そして日常的な実験の みを用いて決定され得る。 NF-κBアッセイを実施するために、トランスフェクト細胞からの核抽出物が、 刺激後、直ちに調製される(Ostrowski,J.ら,J.Biol.Chem.266:12,722-12,733(19 91))。免疫グロブリンκ軽鎖由来のNF-κBエンハンサーエレメントを含む2本鎖 合成オリゴヌクレオチドプローブ(5’TGACAGAGGGACTTTCCGAGAGGA 3')が、[γ-32 P]ATPでのリン酸化によって5'末端標識される。核抽出物(10μg)が、室温で20 分間放射標識プローブとインキュベートされ、そしてタンパク質-DNA複合体が0. 5×TBE、10%ポリアクリルアミドゲルにおける電気泳動によって分離される。 インビトロThr-669キナーゼアッセイを実施するために、トランスフェクトさ れた細胞の細胞質抽出物が、刺激後直ちに調製される(Bird,T.A.ら,Cytokine 4 :429-440(1992))。10μlの細胞抽出物が、20mM HEPES緩衝液(pH 7.4)、15mM Mg Cl2、15μM ATP、75μl/ml[γ-32P]ATP、および750μM基質ペプチド(EGFRの残 基663〜673)を含む20μlの反応混合液へ添加される。混合物はペプチドの代わ りに蒸留水とともにインキュベートされる。30℃で20分間のインキュベーション 後、反応はギ酸の添加によって終結される。反応物は遠心分離によって明澄化さ れ、そして30μlの上清がホスホセルロース濾紙ディスク上にスポットされる。 洗浄(75mMオルトリン酸で3回)および乾燥の後、ペプチドに取り込まれたカウ ントは、チェレンコフカウントをモニターすることによって測定される。結果は 、刺激細胞において検出された活性と比較しての、非刺激細胞において検出され たThr-669キナーゼ活性の割合として表される。 IL-8プロモーター活性化アッセイを実施するために、COS7細胞(マルチウェル 組織培養プレートにおいて1ウェルあたり1×105細胞)を、T1/ST2レセプター発 現ベクターおよびpIL8pレポータープラスミドで同時トランスフェクトされる(Mi tcham,J.L.ら,J.Biol.Chem.271:5777-5783(1996))。トランスフェクションの1 日後、培地が交換され、そして細胞は、1ng/ml IL-1αで刺激されるかまたは刺 激されないかのいずれかである。刺激の12〜16時間後、細胞は、5%(w/v)無脂 肪乾燥ミルク(5%MBM)を含む結合培地で2回洗浄され、そして2mlの5%MBMを 用いて室温で30分間ブロックされる。次いで、細胞は室温で60〜90分間、1μg /mlの抗IL-2Rα抗体(R&D Systems,Minneapolis,MN)を含む5%MBM 1.5ml/ウェ ルとともに、ゆっくり揺らしながらインキュベートされる。細胞は、5%MBMで 1度洗浄され、そして1:100希釈の125Iヤギ抗マウスIgG(Sigma,St.Louis,MO) を含む5%MBM 1ml/ウェルとともに60分間、室温でインキュベートされる。ウェ ルは、5%MBMで4回およびリン酸緩衝化生理食塩水で2回洗浄される。ウェル は、1mlの0.5M NaOHの添加によってはがされ、そして全カウントが測定される。 結果は、2つの2連ウェルまたは3つの3連ウェルにわたって平均化された全cp mとして表される。 従って、「T1R様リガンドIIタンパク質活性を有するポリペプチド」は、上記 のアッセイにおいてT1R様リガンドIIタンパク質活性を示すポリペプチドを含む 。 もちろん、遺伝子コードの縮重のために、当業者は、上記の核酸配列に少なく とも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一である配列を有する多数の 核酸分子が、「T1R様リガンドIIタンパク質活性を有する」ポリペプチドをコー ドすることを直ちに認識する。実際に、これらのヌクレオチド配列の縮重改変体 の全ては同じポリペプチドをコードするので、これは上記の比較アッセイを実施 することなしでさえ当業者に明らかである。縮重改変体でないそのような核酸分 子について、合理的な数がまたT1R様リガンドII活性を有するポリペプチドをコ ードすることが、当該分野でさらに認識される。これは、当業者が、タンパク質 の機能により低い有意性で影響しそうであるか、または有意には影響しそうにな いかのいずれかのアミノ酸置換(例えば、1つの脂肪族アミノ酸の第二の脂肪族 アミノ酸への置換)を完全に知っているからである。 例えば、どのように表現型的にサイレントなアミノ酸置換を作製するかに関す るガイダンスは、Bowie,J.U.ら,Science 247:1306-1310(1990)に提供される。 ここで著者らは、アミノ酸配列の変化に対する寛容を研究するための2つの主要 なアプローチが存在することを示す。第一の方法は、進化のプロセスに依存し、 ここで変異は、自然淘汰によって受容されるか拒絶されるかのいずれかである。 第二のアプローチは、クローン化遺伝子の特定の位置でアミノ酸変化を導入する ために遺伝子操作を、そして機能を維持する配列を同定するために選択またはス クリーニングを用いる。著者らが述べるように、これらの研究は、タンパク質が 、アミノ酸置換に驚くほど寛容であることを明らかにしている。著者らは、どの アミノ酸の変化が、タンパク質の特定の位置で許容性でありそうであるかをさら に示している。例えば、大部分の埋没したアミノ酸残基は非極性側鎖を必要とし 、一方表面の側鎖の特性は一般的にわずかしか保存されていない。他のこのよう な表現型的にサイレントな置換は、Bowie,J.U.ら,前出およびその中に引用され る参考文献に記載される。 ベクターおよび宿主細胞 本発明はまた、本発明の単離されたDNA分子を含むベクター、組換えベクター で遺伝子操作された宿主細胞、および組換え技術によるT1R様リガンドIIポリペ プチドまたはそのフラグメントの産生に関する。 組換え構築物は、感染、形質導入、トランスフェクション、トランスベクショ ン(transvection)、エレクトロポレーション、および形質転換のような周知の技 術を用いて宿主細胞に導入され得る。ベクターは、例えば、ファージベクター、 プラスミドベクター、ウイルスベクター、またはレトロウイルスベクターであり 得る。レトロウイルスベクターは、複製可能かまたは複製欠損であり得る。後者 の場合、ウイルスの増殖は、一般的に、相補宿主細胞においてのみ生じる。 ポリヌクレオチドは、宿主における増殖のための選択マーカーを含むベクター に結合され得る。一般的に、プラスミドベクターは、リン酸カルシウム沈殿物の ような沈殿物中か、または荷電された脂質との複合体中で導入される。ベクター がウイルスである場合、ベクターは、適切なパッケージング細胞株を用いてイン ビトロでパッケージングされ得、次いで宿主細胞に形質導入され得る。 目的のポリヌクレオチドに対するシス作用性制御領域を含むベクターが好まし い。適切なトランス作用性因子は、宿主によって供給される得るか、相補ベクタ ーによって供給され得るか、または宿主への導入の際にベクター自体によって供 給され得る。 この事に関する特定の好ましい実施態様において、ベクターは、誘導性および /または細胞型特異的であり得る特異的な発現を提供する。このようなベクター の中で特に好ましいベクターは、温度および栄養添加物のような操作することが 容易である環境因子によって誘導性のベクターである。 本発明において有用な発現ベクターとしては、染色体ベクター、エピソームベ クター、およびウイルス由来ベクター(例えば、細菌プラスミド、バクテリオフ ァージ、酵母エピソーム、酵母染色体エレメント、ウイルス(例えば、バキュロ ウイルス、パポバウイルス、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、トリポック スウイルス、仮性狂犬病ウイルス、およびレトロウイルス)に由来するベクター 、ならびにそれらの組合せに由来するベクター(例えば、コスミドおよびファー ジミド)が挙げられる。 DNAインサートは、適切なプロモーター(例えば、少し名を挙げると、ファー ジλPLプロモーター、E.coli lacプロモーター、trpプロモーター、およびtacプ ロモーター、SV40初期プロモーターおよび後期プロモーター、ならびにレトロウ イルスLTRのプロモーター)に作動可能に連結されるべきである。他の適切なプ ロモーターは、当業者に公知である。発現構築物は、さらに、転写開始、転写終 結のための部位、および、転写領域中に翻訳のためのリボゾーム結合部位を含む 。構築物によって発現される成熟転写物のコード部分は、翻訳されるべきポリペ プチドの始めに転写開始AUGを含み、そして終わりに適切に位置される終止コド ンを含む。 示されるように、発現ベクターは、好ましくは少なくとも1つの選択マーカー を含む。このようなマーカーとしては、真核生物細胞培養についてはジヒドロ葉 酸レダクターゼまたはネオマイシン耐性、およびE.coliおよび他の細菌における 培養についてはテトラサイクリン耐性遺伝子またはアンピシリン耐性遺伝子が挙 げられる。適切な宿主の代表的な例としては、細菌細胞(例えば、E.coli細胞、 Streptomyces細胞、およびSalmonella typhimurium細胞);真菌細胞(例えば酵 母細胞);昆虫細胞(例えば、Drosophila S2細胞およびSpodoptera Sf9細胞) ;動物細胞(例えば、CHO細胞、COS細胞、およびBowes黒色腫細胞);ならびに 植物細胞が挙げられる。上記の宿主細胞のための適切な培養培地および条件は当 該分野で公知である。 細菌における使用に好ましいベクターの中には、pQE70、pQE60、およびpQE-9 (Qiagenから入手可能);pBSベクター、Phagescriptベクター、Bluescriptベク ター、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratageneから入手可能);ならびにptr c99a、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pR1T5(Pharmaciaから入手可能)が含まれ る。好ましい真核生物ベクターの中には、pWLNEO、pSV2CAT、pOG44、pXT1、およ びpSG(Stratageneから入手可能);pSVK3、pBPV、pMSG、およびpSVL(Pharmacic aから入手可能);ならびにpA2(Qiagenから入手可能)がある。他の適切なベク ターは、当業者に容易に明らかである。 本発明における使用に適した公知の細菌プロモーターの中には、E.coli lacI およびlacZプロモーター、T3プロモーターおよびT7プロモーター、gptプロモー ター、λPRプロモーターおよびλPLプロモーター、ならびにtrpプロモーターが 含まれる。適切な真核生物プロモーターとしては、CMV前初期プロモーター、HSV チミジンキナーゼプロモーター、初期SV40プロモーターおよび後期SV40プロモー ター、レトロウイルスLTRのプロモーター(例えば、ラウス肉腫ウイルス(RSV)の プロモーター)、ならびにメタロチオネインプロモーター(例えば、マウスメタ ロチオネインIプロモーター)が挙げられる。 宿主細胞への構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクシ ョン、エレクトロポレーション、形質導入、感染または他の方法によってもたら され得る。このような方法は、Davisら,Basic Methods in Molecular Biology( 1986)のような多くの標準的研究室マニュアルに記載されている。 高等真核生物による本発明のポリペプチドをコードするDNAの転写は、ベクタ ー中にエンハンサー配列を挿入することによって増大され得る。エンハンサーは 、所定の宿主細胞型におけるプロモーターの転写活性を増大するように働く、通 常約10〜300bpのDNAのシス作用性エレメントである。エンハンサーの例としては 、SV40エンハンサー(これは、複製起点の後期側上の100〜270bpに位置される) 、サイトメガロウイルスの初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後期側上 のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。 翻訳されたタンパク質の小胞体の管腔内へか、周辺質空間内へか、または細胞 外環境内への分泌のために、適切な分泌シグナルが、発現されるポリペプチド中 に組み込まれ得る。シグナルは、ポリペプチドに対して内因性であり得るか、ま たはそれらは異種シグナルであり得る。 従って、ポリペプチドは、融合タンパク質のような改変された形態で発現され 得、そして分泌シグナルだけでなく、付加的な異種の機能的領域も含み得る。例 えば、付加的なアミノ酸、特に荷電性アミノ酸の領域が、宿主細胞内での、精製 の間の、または続く操作および保存の間の、安定性および持続性を改善するため に、ポリペプチドのN末端に付加され得る。また、ペプチド部分が、精製を容易 にするためにポリペプチドへ付加され得る。そのような領域は、ポリペプチドの 最終調製の前に除去され得る。とりわけ、分泌または排出を生じるため、安定性 を改善するため、および精製を容易にするためのペプチド部分のポリペプチドへ の付加は、当該分野でよく知られており、そして日常的な技術である。好ましい 融合タンパク質は、タンパク質の可溶化に有用な免疫グロブリン由来の異種領域 を含む。例えば、EP-A-0 464 533(カナダ対応出願2045869)は、別のヒトタン パク質またはその一部とともに免疫グロブリン分子の定常領域の種々の部分を含 む融合タンパク質を開示する。多くの場合、融合タンパク質中のFc部分は、治療 および診断における使用に十分に有利であり、従って、例えば改善された薬物動 態学的特性を生じる(EP-A 0232 262)。一方、いくつかの使用について、融合タ ンパク質が、記載される有利な様式で、発現され、検出され、および精製された 後にFc部分が欠失され得ることが望ましい。これは、Fc部分が、治療および診断 における使用の妨害であると判明する場合(例えば、融合タンパク質が免疫のた めの抗原として使用されるべき場合)である。薬物探索において、例えばhIL-5 のようなヒトタンパク質は、hIL-5のアゴニストを同定するための高処理能力ス クリーニングアッセイの目的でFc部分と融合されている。D.Bennettら,Journal of Molecular Recognition Vol.8 52-58(1995)、およびK.Johansonら,The Jou rnal of Biological Chemistry Vol.270,No.16,9459-9471頁(1995)を参照のこ と。 T1R様リガンドIIは、硫安沈殿またはエタノール沈殿、酸抽出、陰イオンまた は陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎 水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロ キシアパタイトクロマトグラフィー、およびレクチンクロマトグラフィーを含む 周知の方法によって組換え細胞培養物から回収され、そして精製され得る。最も 好ましくは、高速液体クロマトグラフィー(「HPLC」)が精製のために用いられ る。 本発明のポリペプチドは、天然の精製産物、化学合成手順の産物、および原核 生物宿主または真核生物宿主(例えば、細菌細胞、酵母細胞、高等植物細胞、昆 虫細胞、および哺乳動物細胞を含む)から組換え技術によって産生された産物を 含む。組換え産生手順において用いられる宿主に依存して、本発明のポリペプチ ドは、グリコシル化され得るか、または非グリコシル化され得る。さらに、本発 明のポリペプチドはまた、いくつかの場合、宿主媒介プロセスの結果として、開 始の改変メチオニン残基を含み得る。 T1R様リガンドIIポリペプチドおよびペプチド 本発明はさらに、寄託されたcDNAによってコードされるアミノ酸配列、もしく は図1(配列番号2)のアミノ酸配列を有する単離されたT1R様リガンドIIポリ ペプチド、または上記ポリペプチドの一部を含むペプチドもしくはポリペプチド を提供する。用語「ペプチド」および「オリゴペプチド」は、(通常認識される ように)同義語と考えられ、そして各用語は、文脈がペプチド結合によって結合 された少なくとも2つのアミノ酸の鎖を示すことを必要とする場合、交換可能に 使用され得る。用語「ポリペプチド」は、10より多いアミノ酸残基を含む鎖に対 して本明細書中で使用される。本明細書中の全てのオリゴペプチドおよびポリペ プチドの式または配列は、左から右へ、そしてアミノ末端からカルボキシ末端の 方向に書かれる。 「単離された」ポリペプチドまたはタンパク質によって、その天然の環境から 取り出されたポリペプチドまたはタンパク質が意図される。例えば、宿主細胞中 で発現された組換え産生されたポリペプチドおよびタンパク質は、例えば、Smit hおよびJohnson,Gene 67:31-40(1988)に記載の一段階法のような任意の適切な 技術によって実質的に精製されている天然または組換えのポリペプチドおよびタ ンパク質がそうであるように、本発明の目的で単離されていると考えられる。 T1R様リガンドIIのいくつかのアミノ酸配列が、このタンパク質の構造または 機能に有意に影響することなく改変され得ることが、当該分野で認識される。配 列内のこのような差異が意図される場合、活性を決定するタンパク質の重要な領 域が存在することを覚えておくべきである。一般的に、類似の機能を実行する残 基が使用される場合、三次構造を形成する残基の置換が可能である。他の例にお いて、残基の型は、変化がタンパク質の重要でない領域で生じる場合、全く重要 でないかもしれない。 従って、本発明は、さらに、実質的なT1R様リガンドII活性を示すか、または 下記に考察されるタンパク質部分のようなT1R様リガンドIIの領域を含むT1R様リ ガンドIIの改変体を含む。このような変異体は、欠失、挿入、逆転、反復、およ びタイプ置換(例えば、親水性の残基の別の残基への置換、しかし通常は強く親 水性の残基を強く疎水性の残基には置換しない)を含む。小さな変化、またはこ のような「中性」アミノ酸置換は、一般的にほとんど活性に影響しない。 代表的に保存的置換と見られるのは、脂肪族アミノ酸Ala、Val、Leu、およびI leの中での1つのアミノ酸の別のアミノ酸への置換;ヒドロキシル残基Serおよ びThrの交換、酸性残基AspおよびGluの交換、アミド残基AsnおよびGlnの間の置 換、塩基性残基LysおよびArgの交換、ならびに芳香族残基Phe、Tyrの間の置換で ある。 上記に詳細に示されるように、どのアミノ酸の変化が表現型的にサイレントで ありそうか(すなわち、機能に対して有意に有害な効果を有しそうにないか)に 関するさらなるガイダンスは、Bowie,J.U.ら「Deciphering the Message in Pr otein Sequences:Tolerance to Amino Acid Substitutions」,Science 247:13 06-1310(1990)に見出され得る。 本発明のポリペプチドは、リーダー配列を含む寄託されたcDNAによってコード されるポリペプチド、寄託されたcDNAによってコードされるポリペプチドからリ ーダーを除いたポリペプチド(すなわち成熟タンパク質)、リーダーを含む図1 (配列番号2)のポリペプチド、リーダーを除いた図1(配列番号2)のポリペ プチド、T1R様リガンドII細胞外ドメイン、T1R様リガンドII膜貫通ドメイン、お よびT1R様リガンドII細胞内ドメイン、ならび上記のポリペプチドと少なくとも9 0%の類似性、より好ましくは少なくとも95%の類似性、およびさらにより好ま しくは少なくとも96%、97%、98%、または99%の類似性を有するポリペプチド を含む。さらに本発明のポリペプチドは、本明細書中に記載のポリペプチドと、 少なくとも80%同一、より好ましくは少なくとも90%または95%同一、さらによ り好ましくは少なくとも96%、97%、98%、または99%同一であるポリペプチド を含み、そしてまた、少なくとも30アミノ酸、およびより好ましくは少なくとも 50アミノ酸を有するこのようなポリペプチドの部分を含む。 2つのポリペプチドについての「%類似性」によって、BESTFITプログラム(W isconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix,Genetics Compute r Group,University Resarch Park,575 Science Drive,Madison,WI 53711) および類似性を決定するための省略時設定(default setting)を用いて2つのポ リペプチドのアミノ酸配列を比較することによって生じる類似性のスコアが意図 される。BESTFITは、SmithおよびWaterman,Adv.Appl.Math.2:482-489(1981) の局所的相同性アルゴリズムを、2つの配列間の類似性の最適のセグメントを見 出すために使用する。 T1R様リガンドIIポリペプチドの参照アミノ酸配列に少なくとも、例えば、95 %「同一な」アミノ酸配列を有するポリペプチドにより、ポリペプチド配列がT1 R様リガンドIIポリペプチドの参照アミノ酸配列の各100アミノ酸毎に5つまでの アミノ酸変化を含み得ることを除いて、ポリペプチドのアミノ酸配列は参照配列 と同一であることが意図される。言い換えれば、参照アミノ酸配列に少なくとも 95%同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドを得るために、参照配列におい て5%までのアミノ酸残基が、欠失されるかもしくは別のアミノ酸で置換され得 、または参照配列における5%までの総アミノ酸残基の多数のアミノ酸が参照配 列に挿入され得る。これらの参照配列の改変は、参照アミノ酸配列のアミノ末端 位置もしくはカルボキシ末端位置で、または参照配列内または参照配列内の1つ 以上の近接した基内の残基間のいずれかで個々に散在したこれらの末端位置の間 のどこかで、起こり得る。 実際には、任意の特定のポリペプチドが、例えば、図1(配列番号2)に示さ れるアミノ酸配列、または寄託されたcDNAクローンによりコードされるアミノ酸 配列に対して、少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であ るかどうかは、Bestfitプログラム(Wisconsin Sequence Analysis Package,Ve rsion 8 Unix版、Genetics Computer Group,University Research Park,575 S cience Drive,Madison,WI 53711)のような公知のコンピュータープログラム を使用して慣習的に決定され得る。特定の配列が、例えば、本発明の参照配列に 95%同一であるかどうかを決定するために、Bestfitまたは任意の他の配列アラ インメントプログラムを使用する場合、当然、同一性の百分率が参照アミノ酸配 列の全長にわたって計算され、そして参照配列内のアミノ酸残基の総数の5%ま での相同性におけるギャップが許容されるようなパラメーターが設定される。 下記に詳細に記載するように、本発明のポリペプチドは、下記のようにT1R様 リガンドII発現を検出するための診断アッセイにおいて有用である、またはT1R 様リガンドIIタンパク質機能を増強または阻害し得るアゴニストおよびアンタゴ ニストとして、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を惹起するために 使用され得る。さらに、このようなポリペプチドは、本発明の候補アゴニストお よびアンタゴニストでもあるT1R様リガンドII結合タンパク質を「捕獲する」た めの酵母ツーハイブリッドシステムにおいて使用され得る。酵母ツーハイブリッ ドシステムは、FieldsおよびSong,Nature 340:245-246(1989)に記載されてい る。 別の局面において、本発明は、本発明のポリペプチドのエピトープ-保有部分 を含む、ペプチドまたはポリペプチドを提供する。このポリペプチドのエピトー プ部分は、本発明のポリペプチドの免疫原性または抗原性エピロープである。 「免疫原性エピトープ」は、タンパク質全体が免疫原である場合、抗体応答を誘 発するタンパク質の一部として定義される。これらの免疫原性エピトープは、分 子上の2、3の焦点に制限されると考えられている。一方では、抗体が結合し得 るタンパク質分子の領域は、「抗原性エピトープ」と定義され得る。タンパク質 の免疫原性エピトープの数は、一般には、抗原性エピトープの数よりも少ない。 例えば、Geysen,H.M.ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:3998-4002(1984) を参照のこと。 抗原性エピトープを保有するペプチドまたはポリペプチド(すなわち、抗体が 結合し得るタンパク質分子の領域を含む)の選択に関して、タンパク質配列の一 部を模倣する比較的短い合成ペプチドが、部分的に模倣されたタンパク質と反応 する抗血清を日常的に誘発し得ることが当該分野で周知である。例えば、Sutcli ffe,J.G.ら、Science 219:660-666(1983)を参照のこと。タンパク質-反応性血清 を誘発し得るペプチドは、しばしばタンパク質の一次配列で頻繁に示され、そし て単純な化学的法則のセットにより特徴付けられ得、そしてインタクトなタンパ ク質の免疫ドミナント領域(すなわち、免疫原性エピトープ)にも、アミノ末端 またはカルボキシル末端にも、制限されない。極度に疎水性であるペプチドおよ び6以下の残基のペプチドは、一般には、模倣タンパク質に結合する抗体の誘導 に効果がなく;より長い、可溶性ペプチド、特にプロリン残基を含むペプチドは 、通常は有効である。Sutcliffeら、前出、661。例えば、これらのガイドライン に従って設計された20のペプチドのうち18(インフルエンザウイルス赤血球凝集 素HA1ポリペプチド鎖の配列の75%を覆う8-39残基を含む)は、HA1タンパク質ま たはインタクトなウイルスと反応する抗体を誘導した;そしてMuLVポリメラーゼ からの12/12ペプチドおよび狂犬病糖タンパク質からの18/18はそれぞれのタンパ ク質を沈澱する抗体を誘導した。 本発明の抗原性エピトープ-保有ペプチドおよびポリペプチドは、それゆえ、 本発明のポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体を含む抗体を惹起 するのに有用である。従って、抗原エピトープ-保有ペプチドで免疫化されたド ナーからの脾臓細胞の融合により得られるハイブリドーマの大部分は、一般に天 然のタンパク質と反応性がある抗体を分泌する。Sutcliffeら、前出、663。抗原 性エピトープ-保有ペプチドまたはポリペプチドにより惹起された抗体は、模倣 タンパク質を検出するのに有用であり、そして異なるペプチドに対する抗体が、 翻訳後プロセシングを受けるタンパク質前駆体の種々の領域の末路を追跡するた めに使用され得る。免疫沈降アッセイにおいて、短いペプチド(例えば、約9ア ミノ酸)でさえ、より長いペプチドに結合しそして置換し得ることが示されてい るので、ペプチドおよび抗ペプチド抗体は、模倣タンパク質についての種々の定 性的または定量的アッセイ、例えば、競合的アッセイにおいて使用され得る。例 えば、Wilson,I.A.ら、Cell 37:767-778(1984)777を参照のこと。本発明の抗 ペプチド抗体もまた、模倣タンパク質の精製(例えば、当該分野で周知の方法を 使用して、吸着クロマトグラフィーにより)に有用である。 上記のガイドラインに従って設計された本発明の抗原性エピトープ-保有ペプ チドおよびポリペプチドは、好ましくは本発明のポリペプチドのアミノ酸配列内 に含まれる少なくとも7、より好ましくは少なくとも9、そして最も好ましくは 約15〜約30アミノ酸の間の配列を含む。しかし、本発明のポリペプチドのアミノ 酸配列の約30〜約50アミノ酸または全体までの任意の長さおよび全体を含む、本 発明のポリペプチドのアミノ酸配列のより大部分を含むペプチドまたはポリペプ チドもまた、本発明のエピトープ-保有ペプチドまたはポリペプチドであると考 えられ、そしてまた模倣タンパク質と反応する抗体を誘導するのに有用である。 好ましくは、エピトープ-保有ペプチドのアミノ酸配列は、水性溶媒中で実質的 な溶解性を提供するように選択され(すなわち、その配列は、比較的親水性残基 を含み、そして高度な疎水性配列は好ましくは回避される);そしてプロリン残 基を含む配列が特に好ましい。 T1R様リガンドII特異的抗体またはフラグメントを産生するために使用され得 る抗原性ポリペプチドの非限定的な例には、図1(配列番号2)における約43〜 約52のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1(配列番号2)における約82〜約 98のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1(配列番号2)における約129〜約1 46のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1(配列番号2)における約162〜約1 75のアミノ酸残基を含むポリペプチド;および図1(配列番号2)における約18 1〜約197のアミノ酸残基を含むポリペプチドが挙げられる。上記に示されるよう に、本発明者らは、上記のポリペプチドフラグメントがT1R様IIタンパク質の抗 原性領域であることを決定した。 本発明のエピトープ-保有ペプチドおよびポリペプチドは、本発明の核酸分子 を使用する組換え手段を含むペプチドまたはポリペプチドを作製するための任意 の従来の手段により産生され得る。例えば、短いエピトープ-保有アミノ酸配列 は、組換え体産生および精製の間、ならびに抗ペプチド抗体を産生するための免 疫化の間、キャリアとして作用するより大きなポリペプチドに融合され得る。エ ピトープ-保有ペプチドはまた、化学合成の公知の方法を使用して合成され得る 。例えば、Houghtenは、4週間未満で、調製されそして特徴付けられた(ELISA- タイプ結合研究により)HA1ポリペプチドのセグメントの単一のアミノ酸改変体 を示す10〜20mgの248の異なる13残基ペプチドのような多数のペプチドの合成の ための簡単な方法を記載している。Houghten,R.A.,Proc.Natl.Acad.Sci.U SA 82:5131-5135(1985)。この「Simultaneous Multiple Peptide Synthesis( SMPS)」プロセスは、さらにHoughtenら(1986)の米国特許第4,631,211号に記 載される。この手順において、種々のペプチドの固相合成のための個々の樹脂は 、別々の溶媒透過性パケットに含まれ、固相法に関連する多くの同一の反復工程 の最適な使用を可能にする。完全なマニュアル手順は、500〜1000以上の合成が 同時に行われるのを可能にする。Houghtenら、前出、5134。 本発明のエピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドは、当該分野に周知の方 法によって抗体を誘導するために使用される。例えば、Sutcliffeら、前出;Wil sonら、前出;Chow,M.ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:910-914;およびBi ttle,F.J.ら、J.Gen.Virol.66:2347-2354(1985)を参照のこと。一般には 、動物は遊離ペプチドで免疫化され得る;しかし、抗ペプチド抗体力価はペプチ ドを高分子キャリア(例えば、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)また は破傷風トキソイド)にカップリングすることにより追加免疫され得る。例えば 、システインを含有するペプチドは、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシス クシンイミドエステル(MBS)のようなリンカーを使用してキャリアにカップリ ングされ得、一方、他のペプチドは、グルタルアルデヒドのようなより一般的な 連結剤を使用してキャリアにカップリングされ得る。ウサギ、ラット、およびマ ウ スのような動物は、遊離またはキャリア-カップリングペプチドのいずれかで、 例えば、約100μgのペプチドまたはキャリアタンパク質およびFreundのアジュ バントを含むエマルジョンの腹腔内および/または皮内注射により免疫化される 。いくつかの追加免疫注射が、例えば、固体表面に吸着された遊離ペプチドを使 用してELISAアッセイにより検出され得る有用な力価の抗ペプチド抗体を提供す るために、例えば、約2週間の間隔で必要とされ得る。免疫化動物からの血清に おける抗ペプチド抗体の力価は、抗ペプチド抗体の選択により、例えば、当該分 野で周知の方法による固体支持体上のペプチドへの吸着および選択された抗体の 溶出により増加され得る。 本発明の免疫原性エピトープ-保有ペプチド、すなわち、全体のタンパク質が 免疫原性である場合、抗体応答を惹起するタンパク質の部分は、当該分野で公知 の方法により同定される。例えば、Geysenら(1984)前出は、酵素-結合免疫吸 着アッセイにおける反応に十分に純粋な何百というペプチドの固体支持体上の迅 速な同時合成の手順を開示する。合成ペプチドの抗体との相互作用は、次いで、 それらを支持体から除去することなく容易に検出される。この様式において、所 望のタンパク質の免疫原性エピトープを保有するペプチドは、当業者により日常 的に同定され得る。例えば、口蹄疫ウイルスのコートタンパク質における免疫学 的に重要なエピトープは、タンパク質の213のアミノ酸配列全体を覆う全ての208 の可能なヘキサペプチドの重複セットの合成による7アミノ酸の解明によりGeys enらによって位置付けされた。次いで、全ての20アミノ酸が順にエピトープ内の 各位置で置換されたペプチドの完全な置換セットが合成され、そして抗体との反 応のための特異性を与える特定のアミノ酸が決定された。従って、本発明のエピ トープ-保有ペプチドのペプチドアナログは、この方法により日常的に作成され 得る。Geysen(1987)の米国特許第4,708,781号は、所望のタンパク質の免疫原 性エピトープを保有するペプチドを同定するこの方法をさらに記載している。 さらになお、Geysen(1990)の米国特許第5,194,392号は、目的の抗体の特定 のパラトープ(抗原結合部位)に相補的であるエピトープの位相幾何学的等価物 (すなわち、「ミモトープ」)であるモノマー(アミノ酸または他の化合物)の 配列を検出または決定する一般的な方法を記載する。より一般的には、Geysen (1989)の米国特許第4,433,092号は、目的の特定のレセプターのリガンド結合 部位に相補的であるリガンドの位相等価であるモノマーの配列を検出または決定 する方法を記載する。同様に、Peralkylated Oligopeptide MixturesにおけるHo ughten,R.A.ら(1996)の米国特許第5,480,971号は、線状C1-C7-アルキル過ア ルキル化(peralkylated)オリゴペプチドおよびセットおよびこのようなペプチ ドのライブラリー、ならびに目的のアクセプター分子に、優先的に結合する過ア ルキル化オリゴペプチドの配列を決定するためにこのようなオリゴペプチドセッ トおよびライブラリーを使用する方法を開示する。従って、本発明のエピトープ -保有ペプチドの非ペプチドアナログはまた、これらの方法により日常的に作成 され得る。 「ポリペプチドおよびペプチド」のこの節に引用される各文書の全体の開示は 、ここで参考として本明細書中に援用される。 当業者が理解するように、本発明のT1R様リガンドIIポリペプチドおよび上記 のそのエピトープ保有フラグメントは、免疫グロブリン(IgG)の定常ドメイン の一部と結合し得、キメラペプチドを生じる。これらの融合タンパク質は、精製 を促進し、そしてインビボで増加した半減期を示す。これは、例えば、ヒトCD4- ポリペプチドの最初の2つのドメインおよび哺乳動物免疫グロブリンの重鎖また は軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質について示されて いる(EPA394,827;Trauneckerら、Nature 331:84-86(1988))。IgG部分によ るジスルフィド結合ダイマー構造を有する融合タンパク質はまた、他の分子の結 合および中和において、モノマーT1R様リガンドIIタンパク質またはタンパク質 フラグメント単独よりも効率的であり得る(Fountoulakisら、J.Biochem.270: 3958-3964(1995))。 T1R様リガンドII関連障害診断 T1R様リガンドII関連障害について、「標準」T1R様リガンドII遺伝子発現レベ ル(すなわち、障害を有さない個体からの組織または体液におけるT1R様リガン ドII遺伝子発現レベル)と比較して、実質的に変化した(増加または減少した) レベルのT1R様リガンドII遺伝子発現が、このような障害を有する個体から採取 された組織または他の細胞または体液(例えば、血清、血漿、尿、滑液、また脊 髄液)において検出され得ると考えられる。従って、本発明は、T1R様リガンドI I関連障害の診断の間に有用な診断方法を提供する。これは個体からの組織また は他の細胞または体液におけるT1R様リガンドIIをコードする遺伝子の発現レベ ルを測定すること、および測定した遺伝子発現レベルと標準T1R様リガンドII遺 伝子発現レベルとを比較することを含む。それにより、標準と比較された遺伝子 発現レベルにおける増加または減少は、T1R様リガンドII関連障害の指標である 。 T1R様リガンドII関連障害には、白血病、リンパ腫、動脈硬化症、自己免疫疾 患、炎症性疾患、アルツハイマー病、眼の疾患、アポトーシス、子宮内増殖遅延 、子癇前症、天疱瘡、および乾癬が挙げられることが考えられるが、これらに限 定されない。 個体により、哺乳動物個体、好ましくはヒトが意図される。「T1R様リガンドI Iをコードする遺伝子の発現レベルを測定すること」により、第一の生物学的サ ンプルにおいて直接的(例えば、絶対的なタンパク質レベルまたはmRNAレベルを 測定または評価することにより)または相対的(例えば、第二の生物学的サンプ ルにおけるT1R様リガンドIIタンパク質レベルまたはmRNAレベルと比較すること により)のいずれかで、T1R様リガンドIIタンパク質のレベルまたはT1R様リガン ドIIタンパク質をコードするmRNAレベルの定性的測定もしくは定量的測定または 評価が意図される。好ましくは、第一の生物学的サンプルにおけるT1R様リガン ドIIタンパク質レベルまたはmRNAレベルが測定または評価され、そして標準T1R 様リガンドIIタンパク質レベルまたはmRNAレベルと比較される。標準は、障害を 有さない個体から得られた第二の生物学的サンプルから得られるか、または障害 を有さない個体の集団からの平均レベルにより決定され得る。当該分野において 評価されるように、一旦標準T1R様リガンドIIタンパク質レベルまたはmRNAレベ ルが公知になると、それは比較のための標準として繰り返して使用され得る。 「生物学的サンプル」によって、個体、体液、細胞株、組織培養物、またはT1 R様リガンドIIタンパク質もしくはmRNAを含む他の供給源から得られる任意の生 物学的サンプルが意図される。示されるように、生物学的サンプルは、分泌され た成熟T1R様リガンドIIを含む体液(例えば、血清、血漿、尿、滑液、および随 液)あるいはT1R様リガンドIIタンパク質を発現することが見出された組織供給 源を含む。哺乳動物から組織生検および体液を得るための方法は当該分野で周知 である。生物学的サンプルがmRNAを含む場合、組織生検が好ましい供給源である 。 全細胞RNAが、任意の適切な技術(例えば、ChomczynskiおよびSacchi,Anal. Biochem.162:156-159(1987)に記載されている一工程のグアニジン-チオシアネ ート-フェノール-クロロホルム法)を使用して生物学的サンプルから単離され得 る。次いで、T1R様リガンドIIをコードするmRNAのレベルが、任意の適切な方法 を用いてアッセイされる。これらは、ノーザンブロット分析、S1ヌクレアーゼマ ッピング、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、ポリメラーゼ連鎖反応と組み合わせ た逆転写(RT-PCR)、およびリガーゼ連鎖反応と組み合わせた逆転写(RT-LCR) を含む。 ノーザンブロット分析は、Haradaら、Cell 63:303-312(1990)に記載されてい るように行われ得る。簡潔には、全RNAが上記のように生物学的サンプルから調 製される。ノーザンブロットのためには、RNAは適切な緩衝液(例えば、グリオ キサール/ジメチルスルホキシド/リン酸ナトリウム緩衝液)中で変性され、ア ガロースゲル電気泳動に供され、そしてニトロセルロースフィルターに転写され る。RNAがUVリンカーによってフィルターに結合された後、フィルターは、ホル ムアミド、SSC、デンハルト溶液、変性させたサケ精子、SDS、およびリン酸ナト リウム緩衝液を含有する溶液中で予備ハイブリダイゼーションされる。任意の適 切な方法(例えば、32PマルチプライムDNA標識システム(Amersham))に従って標 識されたT1R様リガンドII cDNAが、プローブとして使用される。一晩のハイブリ ダイゼーション後、フィルターは洗浄され、そしてX線フィルムに曝される。本 発明に従うプローブとしての使用のためのcDNAは、上記の節に記載されており、 そして少なくとも15bpの長さが好ましい。 S1マッピングは、Fujitaら、Cell 49:357-367(1987)に記載されているように 行われ得る。S1マッピングでの使用のためのプローブDNAを調製するために、上 記のcDNAのセンス鎖がテンプレートとして使用され、標識されたアンチセンスDN Aが合成される。次いで、アンチセンスDNAが、適切な制限エンドヌクレアーゼを 使用して消化され、所望の長さのさらなるDNAプローブが生成され得る。この ようなアンチセンスプローブは、標的mRNA(すなわち、T1R様リガンドIIをコー ドするmRNA)に対応する保護されたバンドを可視化するために有用である。ノー ザンブロット分析が、上記のように行われ得る。 好ましくは、T1R様リガンドIIをコードするmRNAのレベルは、Makinoら、Techn ique 2:295-301(1990)に記載されるようなRT-PCR法を使用してアッセイされる 。この方法によれば、ポリアクリルアミドゲルバンド中の「アンプリコン」の放 射活性は、標的mRNAの初期濃度に直線的に相関する。簡潔には、この方法は、RT プライマーおよび適切な緩衝液を含む反応混合物中の生物学的サンプルから単離 された全RNAを添加する工程を包含する。プライマーのアニーリングのためのイ ンキュベーション後、混合物はRT緩衝液、dNTP、DTT、RNaseインヒビター、およ び逆転写酵素を補充され得る。RNAの逆転写を達成するためのインキュベーショ ン後、次いで、RT産物は標識されたプライマーを使用するPCRに供される。ある いは、プライマーを標識するよりもむしろ、標識されたdNTPがPCR反応混合物中 に含まれ得る。PCR増幅は、従来技術に従ってDNAサーマルサイクラー中で行われ 得る。増幅を達成するための適切な数のラウンド後、PCR反応混合物はポリアク リルアミドゲル上で電気泳動される。ゲルの乾燥後、適切なバンド(T1R様リガ ンドIIをコードするmRNAに対応する)の放射活性は、画像解析機を使用して定量 される。RTおよびPCR反応の成分および条件、試薬およびゲル濃度、ならびに標 識方法は、当該分野で周知である。RT-PCR法の変形は当業者に明らかである。 逆転写された標的のmRNAを増幅する任意のオリゴヌクレオチドプライマーのセ ットが使用され得、そして上記の節で記載されるように設計され得る。 生物学的サンプル中のT1R様リガンドIIレベルのアッセイは、任意の当該分野 で公知の方法を使用して行われ得る。抗体に基づく技術が、生物学的サンプル中 のT1R様リガンドIIレベルをアッセイするために好ましい。例えば、組織中でのT 1R様リガンドIIの発現は、伝統的な免疫組織学的方法で研究され得る。これらの 場合、特異的認識は一次抗体(ポリクローナルまたはモノクローナル)によって 提供されるが、二次検出系は、蛍光、酵素、または他の結合された二次抗体を利 用し得る。結果として、病理学試験のための組織切片の免疫組織学的染色が得ら れる。組織はまた、ウェスタンブロットまたはドット/スロットアッセイ(Jalk anen,M.ら、J.Cell.Biol.101:976-985(1985);Jalkanen,Mら、J.Cell.Bi ol.105:3087-3096(1987))のためのT1R様リガンドIIの遊離のために、例えば、 尿素および中性の界面活性剤を用いて抽出され得る。陽イオン性固相の使用に基 づくこの技術において、T1R様リガンドIIの定量は、単離されたT1R様リガンドII を標準として使用して達成され得る。この技術はまた、体液にも適用され得る。 これらのサンプルに関して、T1R様リガンドIIのモル濃度は、血清、血漿、尿、 滑液、随液などのような異なる体液について、T1R様リガンドII含量の標準値の 設定を補助する。次いで、T1R様リガンドIIの量の正常値は、健常な個体に由来 する値を使用して設定され得、これは、試験被検体から得られる値と比較され得 る。 T1R様リガンドIIレベルを検出するために有用な他の抗体に基づく方法は、イ ムノアッセイ(例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)およびラジオイム ノアッセイ(RIA))を含む。例えば、T1R様リガンドII特異的モノクローナル抗 体は、T1R様リガンドIIを検出および定量するための、免疫吸着剤としておよび 酵素標識プローブとしての両方に使用され得る。サンプル中に存在するT1R様リ ガンドIIの量は、直線回帰コンピューターアルゴリズムを使用して、標準的な調 製物中に存在する量との比較によって算出され得る。腫瘍抗原を検出するための このようなELISAは、Iacobelliら、Breast Cancer Research and Treatment 11: 19-30(1988)に記載されている。別のELISAアッセイにおいては、2つの異なる 特異的なモノクローナル抗体が、体液中のT1R様リガンドIIを検出するために使 用され得る。このアッセイにおいて、一方の抗体が免疫吸着剤として使用され、 そして他方が酵素標識プローブとして使用される。 上記の技術は、本質的に、「一工程」または「二工程」アッセイとして行われ 得る。「一工程」アッセイは、固定化抗体とT1R様リガンドIIとを接触させる工 程を包含し、そして洗浄する工程、標識された抗体と混合物とを接触させる工程 は含まない。「二工程」アッセイは、洗浄する工程、その後、標識された抗体と 混合物とを接触させる工程を包含する。他の従来の方法もまた、適切に使用され 得る。通常、支持体上にアッセイ系の1つの成分を固定することが所望され、そ れによって系の他の成分は、その成分との接触およびサンプルからの容易な除去 を生じることが可能となる。 適切な酵素標識は、例えば、基質との反応による過酸化水素の生成を触媒する オキシダーゼ群由来のものを含む。グルコースオキシダーゼは、それが良好な安 定性を有し、そしてその基質(グルコース)が容易に入手できるために、特に好 ましい。オキシダーゼ標識の活性は、酵素-標識抗体/基質反応によって形成さ れる過酸化水素の濃度を測定することによってアッセイされ得る。酵素に加えて 、他の適切な標識として、放射性同位元素(例えば、ヨウ素(125I、121I)、炭 素(14C)、イオウ(35S)、トリチウム(3H)、インジウム(112In)、および テクネチウム(99mTc))、ならびに蛍光標識(例えば、フルオレセインおよび ローダミン)ならびにビオチンが挙げられる。 個体から得られる生物学的サンプル中のT1R様リガンドIIレベルをアッセイす ることに加えて、T1R様リガンドIIはまた、画像解析によってインビボで検出さ れ得る。T1R様リガンドIIのインビボでの画像解析のための抗体標識またはマー カーとして、X線撮影法、NMR、またはESRによって検出可能なものが挙げられる 。X線撮影法については、適切な標識として、検出可能な放射線を放射するが、 被検体に対して明らかには有害ではない、バリウムまたはセシウムのような放射 性同位元素が挙げられる。NMRおよびESRのための適切なマーカーとして、関連の ハイブリドーマの栄養分の標識によって抗体中に取り込まれ得る、重水素のよう な検出可能な特徴的な回転を有するものが挙げられる。 放射性同位元素(例えば、131I、111In、99mTc)、放射性不透明体(radio-op aque)基質、または核磁気共鳴によって検出可能な物質のような適切な検出可能 な画像解析部分で標識されている、T1R様リガンドII-特異的抗体または抗体フラ グメントが、障害について試験される噛乳動物中に(例えば、非経口的、皮下、 または静脈内)導入される。被検体の大きさおよび使用される画像解析システム によって、診断用の画像を生じるために必要とされる画像解析部分の量が決定さ れることが、当該分野で理解される。放射性同位元素部分の場合、ヒト被検体に ついては、注射される放射活性の量は、通常約5〜20ミリキュリーの範囲の99mTc である。次いで、標識抗体または抗体フラグメントは、T1R様リガンドIIを含む 細胞の位置に優先的に蓄積する。インビボでの腫瘍画像解析は、S.W.Burchiel ら、 「Immunopharmacokinetics of Radiolabeled Antibodies and Their Portions」 (Tumer Imaging第13章:The Radiochemical Detection of Cancer,Burchiel, S.W.およびRhodes,B.A.編、Masson Publishing Inc.(1982))に記載されてい る。 本発明での使用のためのT1R様リガンドII特異的抗体は、完全なT1R様リガンド IIまたはその抗原性ポリペプチドフラグメントに対して惹起され得る。これは、 アルブミンのようなキャリアタンパク質と共に、またはそれが充分に長い(少な くとも約25アミノ酸)場合はキャリアを伴わずに、動物系(例えば、ウサギまた はマウス)に対して提示され得る。 本明細書中で使用される場合、用語「抗体」(Ab)または「モノクローナル抗 体」(Mab)は、T1R様リガンドIIに特異的に結合し得る完全な分子および抗体フ ラグメント(例えば、FabおよびF(ab')2フラグメントのような)を含むことを意 味する。FabおよびF(ab')2フラグメントは完全な抗体のFcフラグメントを欠いて おり、循環によってさらに迅速に除去され、そして完全な抗体の非特異的組織結 合をほとんど有し得ない(Wahlら、J.Nucl.Med.24:316-325(1983))。従って 、これらの部分が好ましい。 本発明の抗体は、任意の種々の方法によって調製され得る。例えば、T1R様リ ガンドIIまたはその抗原性フラグメントを発現する細胞は、ポリクローナル抗体 を含む血清の産生を誘導するために動物に投与され得る。好ましい方法において 、T1R様リガンドIIタンパク質の調製物は、それが天然の混入物を実質的に含ま ないように、上記のように調製され、そして精製される。次いで、このような調 製物は、より大きな特異的活性のポリクローナル抗血清を産生するために動物に 導入される。 最も好ましい方法において、本発明の抗体はモノクローナル抗体(またはその T1R様リガンドII結合フラグメント)である。このようなモノクローナル抗体は 、ハイブリドーマ技術(例えば、Colligan,Current Protocols in Immunology ,Wiley Interscience,New York(1990-1996);HarlowおよびLane,Antibodies :A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,N.Y .(1988),第6〜9章,Current Protocols on Molecular Biology,Ausubel、 前 出、第11章を参照のこと、これらの参考文献は、その全体が本明細書中に参考と して援用される)を用いて調製され得る。一般に、このような手順は、T1R様リ ガンドII抗原で、またはより好ましくはT1R様リガンドII発現細胞で動物(好ま しくは、マウス)を免疫する工程を包含する。適切な細胞は、抗T1R様リガンドI I抗体に結合するそれらの能力によって認識され得る。このような細胞は、任意 の適切な組織培養培地中で培養され得る;しかし、10%ウシ胎児血清(約56℃で 不活化した)を補充し、約10μg/lの非必須アミノ酸、約1,000U/mlのペニシリ ン、および約100μg/mlのストレプトマイシンを補充したEarle改変イーグル培 地中で細胞を培養することが好ましい。このようなマウスの脾細胞が抽出され、 そして適切な骨髄腫細胞株と融合される。任意の適切な骨髄腫細胞株が、本発明 に従って使用され得る;しかし、アメリカンタイプカルチャーコレクション(AT CC)(Rockville,Maryland,USA)から入手可能な親骨髄腫細胞株(SP2O)を使用 することが好ましい。融合後、得られたハイブリドーマ細胞はHAT培地中で選択 的に維持され、次いでWandsら、Gastroenterology 80:225-232(1981);Harlowお よびLane、前出、第7章に記載されているような限界希釈によってクローニング される。次いで、このような選択によって得られたハイブリドーマ細胞は、T1R 様リガンドII抗原に結合し得る抗体を分泌するクローンを同定するためにアッセ イされる。 あるいは、T1R様リガンドII抗原に結合し得るさらなる抗体が、抗イディオタ イプ抗体の使用を通じて二工程手順で産生され得る。このような方法は、抗体は それ自体が抗原であるという事実を使用し、従って、二次抗体に結合する抗体を 得ることが可能である。この方法に従って、T1R様リガンドII特異的抗体は、動 物(好ましくは、マウス)を免疫するために使用される。次いで、このような動 物の脾細胞はハイブリドーマ細胞を産生するために使用され、そしてハイブリド ーマ細胞は、T1R様リガンドII-特異的抗体に結合する能力がT1R様リガンドII-抗 原によってブロックされ得る抗体を産生するクローンを同定するためにスクリー ニングされる。このような抗体は、T1R様リガンドII-特異的抗体に対する抗イデ ィオタイプ抗体を含み、そしてさらなるT1R様リガンドII-特異的抗体の形成を誘 導するために動物を免疫するために使用され得る。 FabおよびF(ab')2および本発明の抗体の他のフラグメントが本明細書中で開示 される方法に従って使用され得ることが明らかである。このようなフラグメント は、代表的には、パパイン(Fabフラグメントを生じる)またはペプシン(F(ab' )2フラグメントを生じる)のような酵素を使用するタンパク質分解による切断に よって産生される。あるいは、T1R様リガンドII-結合フラグメントは、組換えDN A技術の適用または合成化学によって産生され得る。 ヒトにおける診断のために、インビボでのイメージングを用いて、上昇したレ ベルのT1R様リガンドIIを検出する場合、「ヒト化」キメラモノクローナル抗体 を使用することが好ましくあり得る。このような抗体は、上記のモノクローナル 抗体を生成するハイブリドーマ細胞由来の遺伝構築物を用いて生成され得る。キ メラ抗体を生成するための方法は、当該分野で公知である。総説については、Mo rrison,Science 229:1202(1985);Oiら,BioTechniques 4:214(1986);Cabillyら ,米国特許第4,816,567号;Taniguchiら,EP 171496:Morrisonら,EP 173494;Ne ubergerら,WO 8601533;Robinsonら,WO 8702671;Boulianneら,Nature 312:643 (1984);Neubergerら,Nature 314:268(1985)を参照のこと。 本発明のT1R様リガンドII特異的抗体にさらに適切な標識は、以下に提供され る。適切な酵素標識の例は、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、スタフィロコッカスヌ クレアーゼ、Δ-5-ステロイドイソメラーゼ、酵母アルコールデヒドロゲナーゼ 、α-グリセロールリン酸デヒドロゲナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、 ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオ キシダーゼ、β-ガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラー ゼ、グルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ、グルコアミラーゼ、およびアセチ ルコリンエステラーゼを含む。 適切な放射性同位体標識の例は、3H、111In、125I、131I、32P、35S、14 C、51Cr、57To、58Co、59Fe、75Se、152Eu、90Y、67Cu、217Ci、211Ai、212Pb 、47Sc、109Pdなどを含む。111Inは、インビボでのイメージングが用いられる場 合に好ましい同位体である。なぜなら、これは、125Iまたは131Iで標識したモ ノクローナル抗体の肝臓による脱ハロゲン化の問題を回避するからである。さら に、この放射性核種(radionucleotide)は、イメージングのためにより好まし いγ放出エネルギー を有する(Perkinsら,Eur.J.Nucl.Med.10:296-301(1985);Carasquilloら, J.Nucl.Med.28:281-287(1987))。例えば、1-(P-イソチオシアネートベンジ ル)-DPTAを用いてモノクローナル抗体にカップリングした111Inは、非腫瘍性組 織(特に肝臓)における取り込みをほとんど示さなかった。それゆえ、腫瘍局在 化の特異性を増強する(Estebanら,J.Nucl.Med.28:861-870(1987))。 適切な非放射性同位体標識の例は、157Gd、55Mn、162Dy、52Tr、および56Feを 含む。 適切な蛍光標識の例は、152Eu標識、フルオレセイン標識、イソチオシアネー ト標識、ローダミン標識、フィコエリトリン標識、フィコシアニン標識、アロフ ィコシアニン標識、o-フタルアルデヒド(o-phthaldehyde)標識、およびフルオ レサミン標識を含む。 適切な毒素標識の例は、ジフテリア毒素、リシン、およびコレラ毒素を含む。 化学発光標識の例は、ルミナール標識、イソルミナール標識、芳香族アクリジ ニウムエステル標識、イミダゾール標識、アクリジニウム塩標識、シュウ酸エス テル標識、ルシフェリン標識、ルシフェラーゼ標識、およびエクオリン標識を含 む。 核磁気共鳴コントラスト剤の例は、Gd、Mn、およびFeのような重金属原子核を 含む。 上記の標識を抗体に結合するための代表的な技術は、Kennedyら(Clin.Chim. Acta 70:1-31 (1976))およびSchursら(Clin.Chim.Acta 81:1-40(1977))に より提供される。後者において言及されるカップリング技術は、グルタルアルデ ヒド方法、過ヨウ素酸方法、ジマレイミド方法、m-マレイミドベンジル-N-ヒド ロキシ-スクシンイミドエステル方法であり、これらの方法は全て本明細書中に 参考として援用される。 染色体アッセイ 本発明の核酸分子はまた、染色体の同定に有用である。配列は、個々のヒト染 色体上の特定の位置に特異的に標的化され、そしてその位置にハイブリダイズし 得る。さらに、現在は染色体上の特定の部位を同定する必要性がある。現在、実 際の配列データ(反復多型)に基づいた染色体標識化試薬はほとんど染色体位置 の標識に利用可能でない。本発明によるDNAの染色体へのマッピングは、これら の配列と、疾患に関連する遺伝子との相関付けにおいて重要な第1工程である。 この点における特定の好ましい実施態様において、本明細書中に開示されるcD NAは、T1R様リガンドII遺伝子のゲノムDNAをクローニングするために使用される 。これは、種々の周知の技術および一般に市販されているライブラリーを使用し て達成され得る。次いで、ゲノムDNAは、この目的のための周知の技術を使用し てインサイチュ染色体マッピングのために使用される。代表的には、染色体マッ ピングの日常的な手順に従う、いくつかの試行錯誤が、良好なインサイチュハイ ブリダイゼーションシグナルを与えるゲノムプローブを同定するために必要であ り得る。 いくつかの場合において、さらに、配列は、cDNAからPCRプライマー(好まし くは15〜25bp)を調製することにより染色体にマップされ得る。遺伝子の3'非翻 訳領域のコンピューター解析が、ゲノムDNA内で1より多いエキソンにまたがら ず、従って増幅プロセスを複雑化しないプライマーを迅速に選択するために使用 される。次いで、これらのプライマーは、個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブ リッドのPCRスクリーニングに使用される。プライマーに対応するヒト遺伝子を 含むそれらのハイブリッドのみが増幅部分を生じる。 体細胞ハイブリッドのPCRマッピングは、特定の染色体に特定のDNAを割り当て るための迅速な手順である。同じオリゴヌクレオチドプライマーを本発明と共に 使用して、特定の染色体由来の部分のパネルまたは類似の様式での大きなゲノム クローンのプールを用いて、準位置決定(sublocalization)が達成され得る。染 色体にマップするために同様に使用され得る他のマッピングストラテジーは、イ ンサイチュハイブリダイゼーション、標識してフロー選別した(flow-sorted)染 色体を用いるプレスクリーニング、および染色体特異的cDNAライブラリーを構築 するためのハイブリダイゼーションによる予備選択を含む。 cDNAクローンの中期染色体スプレッド(spread)への蛍光インサイチュハイブ リダイゼーション(「FISH」)は、1工程で正確な染色体位置を提供するために 使用され得る。この技術は、50bpまたは60bpほどの短いcDNA由来のプローブを用 いて使用され得る。この技術の総説については、Vermaら,Human Chromosomes: A Manual of Basic Techniques,Pergamon Press,New York(1988)を参照のこと 。 一旦配列が正確な染色体位置にマップされると、配列の染色体上での物理的な 位置を遺伝地図のデータと相関させ得る。このようなデータは、例えば、V.McK usick,Mendelian Inheritance in Man(Johns Hopkins University,Welch Medi cal Libraryからオンラインで入手可能である)において見出される。次いで、同 じ染色体領域にマップされた遺伝子と疾患との聞の関係が、連鎖解析(物理的に 隣接した遺伝子の同時遺伝)により同定される。 次に、罹患個体と非罹患個体との間のcDNA配列またはゲノム配列における相違 を決定する必要がある。変異がいくつかまたは全ての罹患個体に観察されるが、 いずれの正常な個体にも観察されない場合、この変異は疾患の原因因子であるよ うである。 物理的マッピング技術および遺伝的マッピング技術の現在の解像度では、疾患 に関連する染色体領域に正確に位置決めされたcDNAは、50と500との間の潜在的 原因遺伝子の1つであり得る。(これは、1メガベースのマッピング解像度、お よび20kbあたり1遺伝子と仮定する)。 T1R様リガンドII障害の処置 本発明者らにより、本発明のT1R様リガンドIIポリペプチドが、インターロイ キン-1(IL-1)およびT1Rリガンドと生物学的活性を共有すると考えられる。従 って、T1R様リガンドII(特に成熟形態)は、治療的効果を生じるために細胞、 組織、または個体の身体に外因的に添加され得る。特に、T1R様リガンドIIタン パク質活性の標準的なレベルにおける減少により生じた障害は、本発明のT1R様 リガンドIIポリペプチドの有効量を投与することにより処置され得る。好ましく は、T1R様リガンドIIタンパク質活性を増加させるのに有効な量の本発明の単離 されたT1R様リガンドIIポリペプチドを含む薬学的組成物が投与される。このよ うな治療が有効であるようである障害が上記でおよび下記で議論される。 当業者は、T1R様リガンドIIポリペプチドの有効量が、このようなポリペプチ ドの投与が示される各々の条件について経験的に決定され得ることを認識する。 T1R様リガンドII活性を有するポリペプチドは、薬学的組成物中で、1つ以上の 薬学的に受容可能なキャリア、希釈剤、および/または賦形剤と組み合わせて投 与され得る。ヒト患者に投与される場合、本発明の薬学的組成物の総日使用量が 、音医療判断の範囲内で担当医により決定されることが理解される。任意の特定 の患者についての特定の治療有効用量レベルは、達成されるべき応答の型および 程度;(もしあれば)用いられる特定の組成および他の薬剤;患者の年齢、体重 、全身の健康状態、性別、および常食;投与の時間、投与経路、および組成物の 排泄速度;処置の持続期間;特定の組成物と組み合わせるか、または同時に用い られる薬物(例えば、化学療法剤);ならびに医療の分野で周知の同様の要素を 含む種々の要素に依存する。 治療に用いられるT1R様リガンドII組成物はまた、個々の患者の臨床状態(特 にT1R様リガンドII単独での処置の副作用)、T1R様リガンドII組成物の送達部位 、投与方法、投与スケジュール、および実施者に公知の他の要素を考慮して、良 好な医療行為と一致した様式で処方および投薬される。従って、本明細書中の目 的のためのT1R様リガンドIIポリペプチドの「有効量」は、このような考慮によ って決定される。 一般的提案として、1用量あたりで非経口投与されるT1R様リガンドIIポリペ プチドの総薬学的有効量は、患者の体重あたり、約0.01ng/kg/日〜10μg/kg/日 の範囲であるが、上記のように、これは治療的自由裁量に供される。より好まし くは、この用量は、少なくとも1.0ng/kg/日、そして最も好ましくはヒトについ てホルモンで、約1.0〜100ng/kg/日である。連続的に与えられる場合、T1R様リ ガンドIIは、代表的には、約0.01ng/kg/時間〜約100ng/kg/時間の用量速度で、 1日あたり1〜4回の注射、または例えば、ミニポンプを用いる連続的皮下注入 のいずれかにより投与される。静脈内バック溶液もまた用いられ得る。 免疫系に影響を与えるためのT1R様リガンドIIポリペプチド処置の経過は、特 定の最小日数(マウスの場合7日間)より長く持続される場合、最適であるよう である。変化を観察するために必要とされる処置の長さ、および処置後に応答が 起きるまでの間隔は、所望される効果に従って変化するようである。 T1R様リガンドIIポリペプチドはまた、持続放出系により適切に投与される。 持続放出組成物の適切な例は、造形品(例えば、フィルムまたはマイクロカプセ ル)の形態の半透過性ポリマーマトリックスを含む。持続放出マトリックスは、 ポリラクチド(米国特許第3,773,919号、EP 58,481)、L-グルタミン酸とγ-エ チル-L-グルタメートとのコポリマー(U.Sidmanら,Biopolymers 22:547-556(1 983))、ポリ(2-ヒドロキシエチルメタクリレート)(R.Langerら,J.Biomed Mater.Res.15:167-277(1981)およびR.Langer,Chem.Tech.12:98-105(1982) )、エチレンビニルアセテート(R.Langerら,同書)、またはポリ-D-(-)3-ヒ ドロキシ酪酸(EP 133,988)を含む。持続放出T1R様リガンドII組成物はまた、 リポソームに封入されたT1R様リガンドIIポリペプチドを含む。T1R様リガンドII ポリペプチドを含むリポソームは、それ自体が公知の方法により調製される:DE 3,218,121:Epsteinら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3688-3692(1985);Hwang ら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4030-4034(1980);EP 52,322;EP 36,676;EP 88,046;EP 143,949;EP 142,641;日本国特許出願第83-118008号;米国特許第4,48 5,045号および同第4,544,545号;ならびにEP 102,324。通常、リポソームは、小 さな(約200〜800オングストローム)単層型のものであり、ここで脂質含量は約 30mol.%コレステロールより高く、選択される比率は、最適なT1R様リガンドII 治療のために調整される。 非経口投与のために、1つの実施態様では、T1R様リガンドIIポリペプチドは 、一般的に、所望の程度の純度で単位投薬量の注射可能な形態(溶液、懸濁液、 または乳濁液)のこのポリペプチドを、薬学的に受容可能なキャリア(すなわち 、用いられる投薬量および濃度でレシピエントに対して非毒性であり、処方物の 他の成分と適合性であるキャリア)と混合することにより処方される。例えば、 処方物は、好ましくは、酸化剤、およびポリペプチドに対して有害であることが 公知である他の化合物を含まない。 一般的に、処方物は、T1R様リガンドIIポリペプチドを、液体キャリアまたは 微細に分割された固体キャリアまたはその両方と均一にかつ直接接触させること により調製される。次いで、必要な場合、産物は、所望の処方物に成形される。 好ましくは、キャリアは、非経口キャリア、より好ましくはレシピエントの血液 と等張である溶液である。このようなキャリアビヒクルの例は、水、生理食塩水 、 リンゲル溶液、およびデキストロース溶液を含む。固定油およびオレイン酸エチ ルのような非水性ビヒクルはまた、本明細書中で、ならびにリポソームで有用で ある。 キャリアは、等張性および化学的安定性を増強する物質のような、微量の添加 剤を適切に含む。このような物質は、用いられる投薬量および濃度でレシピエン トに対して非毒性であり、そしてリン酸、クエン酸、コハク酸、酢酸、および他 の有機酸またはそれらの塩のような緩衝剤;アスコルビン酸のような抗酸化剤; 低分子量(約10残基未満)ポリペプチド(例えば、ポリアルギニンまたはトリペ プチド);血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリンのようなタンパク 質;ポリビニルピロリドンのような親水性ポリマー;グリシン、グルタミン酸、 アスパラギン酸、またはアルギニンのようなアミノ酸;セルロースもしくはその 誘導体、グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む、単糖類、二糖類 、および他の炭水化物;EDTAのようなキレート化剤;マンニトールまたはソルビ トールのような糖アルコール;ナトリウムのような対イオン;ならびに/あるい はポリソルベート、ポロオキサマー(poloxamer)またはPEGのような非イオン性 界面活性剤を含む。 T1R様リガンドIIは、代表的に、このようなビヒクルに、約0.001ng/ml〜500ng /ml、好ましくは0.1〜10ng/mlの濃度で、約3〜8のpHで処方される。上述の賦 形剤、キャリア、または安定化剤の特定のものの使用が、T1R様リガンドII塩の 処方物をもたらすことが理解される。 治療的投与のために用いられるべきT1R様リガンドIIは、無菌でなければなら ない。無菌は、無菌の濾過メンブレン(例えば、0.2ミクロンメンブレン)を通 しての濾過により容易に達成される。治療的T1R様リガンドII組成物は、一般的 に、無菌の出入り口を有する容器(例えば、静脈内溶液バッグまたは皮下注射針 が貫通し得るストッパーを有するバイアル)に入れられる。 T1R様リガンドIIは、通常、単位用量または多回用量の容器(例えば、シール されたアンプルまたはバイアル)において、水溶液または再構成のための凍結乾 燥処方物として保存される。凍結乾燥処方物の1例として、10mlバイアルが、無 菌濾過された1%(w/v)水性T1R様リガンドII溶液5mlで満たされ、そして得ら れた混合物は凍結乾燥される。注入溶液は、凍結乾燥されたT1R様リガンドIIを 、静菌性の注射用蒸留水を用いて再構成することにより調製される。 例えば、満足できる結果は、1回または分割された用量で、1日あたり1〜4 回投与される、0.05〜5000ng/kg/日、好ましくは0.1〜1000ng/kg/日、より好ま しくは10〜100ng/kg/日のオーダーの投薬量における、T1R様リガンドII活性を有 するポリペプチドの経口投与により得られる。例えば、i.v.点滴または注入によ る非経口投与では、0.01〜500ng/kg/日、好ましくは0.05〜100ng/kg/日、そして より好ましくは0.1〜50ng/kg/日のオーダーの投薬量が用いられ得る。従って、 患者に対して適切な日投薬量は、2.5ng〜250μg(経口)、好ましくは5ng〜50 μg(経口)、より好ましくは50ng〜12.5μg(経口)のオーダーであるか、ま たは0.5ng〜25μg(静注)、好ましくは2.5ng〜500μg(静注)、そしてより 好ましくは5ng〜2.5μg(静注)のオーダーである。 T1R様リガンドII抗体治療 本発明により、上昇したレベルのT1R様リガンドIIタンパク質活性により生じ る障害は、本発明のT1R様リガンドIIポリペプチドのアンタゴニストの有効量を 投与することにより処置され得る。それゆえ、T1R様リガンドIIレセプターへの 結合についてインタクトなタンパク質と競合する可溶性のT1R様リガンドIIタン パク質(例えば、細胞外ドメイン)と同様に、本発明のT1R様リガンドIIポリペ プチドを結合する抗体(好ましくはモノクローナル)または抗体フラグメントは 、T1R様リガンドII関連障害の処置において有用である。このような抗体および /または可溶性T1R様リガンドIIタンパク質は、好ましくは薬学的に受容可能な 組成物において提供される。 本発明の薬学的組成物は、例えば、非経口、皮下、静脈内、筋肉内、腹腔内、 経皮、または頬の経路により投与され得る。あるいは、または同時に、投与は、 経口であり得る。投与される投薬量は、レシピエントの年齢、健康状態、および 体重、(もしあれば)同時処置の種類、処置の頻度、ならびに所望される効果の 性質に依存する。 本発明の範囲内の組成物は、抗体、フラグメント、または誘導体が、その意図 される目的を達成するために有効な量で含まれる全ての組成物を含む。個々の必 要性は異なるが、各成分の有効量の最適な範囲の決定は、当該分野の技量の範囲 内である。有効用量は、個々のキメラ抗体またはモノクローナル抗体、結合した 治療剤(下記を参照のこと)の存在および性質、患者およびその臨床状態の関数 であり、そして約10ng/kg体重〜約100mg/kg体重で変化し得る。好ましい投薬量 は、0.1〜10mg/kg体重を含む。 イメージングのための検出可能に標識された形態、または治療のための遊離も しくは結合した形態のような、非経口投与のためのT1R様リガンドII抗体または フラグメントの調製物は、無菌の水性または非水性の溶液、懸濁液、および乳濁 液を含む。非水性溶媒の例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール 、植物油(例えばオリーブ油)、および注入可能な有機エステル(例えば、オレ イン酸エチル)である。水性キャリアは、生理食塩水および緩衝化媒体を含む、 水、アルコール/水溶液、乳濁液、または懸濁液、塩化ナトリウム溶液を含む非 経口ビヒクル、リンゲルデキストロース、デキストロースおよび塩化ナトリウム 、乳酸加リンゲル、または固定油を含む。静脈内ビヒクルは、流体補充物および 栄養補充物(replenisher)(例えば、リンゲルデキストロースに基づく補充物 )などを含む。保存剤および他の添加剤はまた、例えば、抗菌剤、抗酸化剤、キ レート化剤、および不活性ガスなどのように存在し得る。一般的に、Remington' s Pharmaceutical Science,第16版,Mack Publishing Co.,Easton,PA,1980 を参照のこと。 本明細書中に記載される抗体は、他のモノクローナル抗体またはキメラ抗体と 、あるいは抗体と相互作用するエフェクター細胞の数もしくは活性を増加させる のに役立つ、リンホカインまたは造血性増殖因子などと組み合わせて有利に利用 され得る。 T1R様リガンドIIの予想される多面的な生物学的効果 本発明のT1R様リガンドIIポリペプチドは、下記の表1に示される多くの効果 を含む多面的な生物学的効果を有すると予想される。同様の生物学的効果は、IL -1について、特に、膵臓内分泌組織(Mandrup-Poulsen,T.ら,Cytokine 5:185 (1993))、甲状腺(Rasmussen,A.K.,Autoimmunity 16:141(1993))、視床下部 −下垂体−副腎軸(Fantuzzi,G.,およびGhezzi,P.,Mediator Inflamm.2:263 (1993);Rivier,C.,Ann.NY Acad.Sci.697:97(1993);Rivier,C.,およびRive st,S.,Ciba.Found.Symp.172:204(1993))、発熱(Coceani,F.,「Fever:B asic Mechanisms and Management」,New York,NY,Raven(1991)59頁)、骨 代謝(Takakis,D.N.,J.Peridontol 64:416(1993))、慢性関節リウマチの病 因における軟骨の破壊(Arend,W.P.,およびDayer,J.M.,Arthritis Rheum 33 :305(1990);Krane,S.M.ら,Ann.NY Acad.Sci.580:340(1990))、子宮着床( Lewis,M.P.ら,Placenta 15:13(1994))、および赤身体質量の損失(Roubenoff ,R.ら,J.Clin.Invest.93:2379(1994))に関連したものについて示されてい る。 表1.T1R様リガンドIIの可能な生物学的効果 用いたアッセイ:膵臓内分泌組織(Mandrup-Poulsen,T.ら,Cytokine 5:185(19 93))、甲状腺(Rasmussen,A.K.,Autoimmunity 16:141(1993))、視床下部-下 垂体-副腎軸(Fantuzzi,G.およびGhezzi,P.,Mediator Inflamm.2:263(1993) ;Rivier,C.,Ann.NY Acad.Sci.697:97(1993);Rivier,C.,およびRivest,S .,Ciba.Found.Symp.172:204(1993))、発熱(Coceani,F.,「Fever:Basic Mechanisms and Management」,New York,NY,Raven(1991)59頁)、骨代謝( Tatakis,D.N.,J.Peridontol 64:416(1993))、慢性関節リウマチの病因にお ける軟骨の破壊(Arend,W.P.およびDayer,J.M.,Arthritis Rheum 33:305(199 0);Krane,S.M.ら,Ann.NY Acad.Sci.580:340(1990))、子宮着床(Lewis,M .P.ら,Placenta 15:13(1994))および赤身体質量の損失(Roubenoff,R.ら,J .Clin.Invest.93:2379(1994))。 本発明を一般的に記載してきたが、本発明は、例示のために提供され、そして 限定することを意図しない以下の実施例を参照することにより、さらに容易に理 解される。 実施例 実施例1:E.coliにおけるT1R様リガンドIIの発現および精製 寄託されたcDNAクローンにおいてT1R様リガンドIIの成熟細胞外可溶化部分 をコードするDNA配列を、T1R様リガンドIIのアミノ酸末端配列および遺伝子に 対してベクター配列3'に特異的なPCRオリゴヌクレオチドプライマーを用いて増 幅した。クローニングを容易にするための制限部位を含むさらなるヌクレオチド を、それぞれ5'および3'の配列に添加した。 当業者は、完全長成熟T1R様リガンドIIタンパク質(約27〜約229アミノ酸) が、適切な5'および3'オリゴヌクレオチドプライマーを用いて、E.coliにおいて 発現し得ることを理解する。 寄託されたクローンにおける完全長T1R様リガンドIIの細胞外ドメインをコ ードするcDNA配列を、遺伝子の5'および3'配列に対応するPCRオリゴヌクレオチ ドプライマーを用いて増幅する。5'プライマーは、配列5'CGC CCA TGG CCG GCT TCA CAC CTT CC 3'(配列番号4)を有し、これは下線を付したNcoI制限部位を 含み、続いて図1(配列番号1)の配列をコードするT1R様リガンドIIタンパ ク質の17ヌクレオチド(ヌクレオチド131〜147)は、シグナルペプチドの直後で 開始する。 3'プライマーは、配列5'CGC AAG CTT TCA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3'(配 列番号5)を有し、これはHindIII制限部位を含み、続いて図1(配列番号1) の配列をコードするT1R様リガンドIIのヌクレオチド619〜621に相補的であり そして逆方向である停止コドンおよび18ヌクレオチドを含む。 制限部位は、細菌発現ベクターpQE60の制限酵素部位に対して都合良く、これ らの実施例においてM15/rep4宿主細胞における細菌発現のために使用した(Qiag en,Inc.Chatsworth,CA,91311)。pQE60は、アンピシリン抗生物質耐性(「A mpr」)をコードし、細菌の複製起点(「ori」)、IPTG誘導プロモーター、リボ ソーム結合部位(「RBS」)、6-Hisタグ、および制限酵素部位を含む。 増幅されたT1R様リガンドIIDNAおよびベクターpQE60の両方をNcoIおよびHin dIIIで消化し、次いで消化されたDNAを一緒に連結する。T1R様リガンドIIDNA の制限されたpQE60ベクターへの挿入は、T1R様リガンドIIコード領域を、ベク ターのIPTG誘導プロモーターの下流に、かつこれに作動可能に連結するように、 そしてT1R様リガンドIIの翻訳のために適切に位置される開始AUGにインフレー ムに配置する。 連結混合物を、標準的な手順を用いて、コンピテントなE.coli細胞に形質転換 した。このような手順は、Sambrookら、Molecular Cloning:A Laboratory Manua l、第2版;Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y. (1989)に記載されている。複数のコピーのプラスミドpREP4(これは、lacリプレ ッサーを発現し、そしてカナマイシン耐性(Kanr)を付与する)を含有するE. coli株M15/rep4を本明細書に記載の例示的な実施例を行うにあたって使用する。 この株(これは、T1R様リガンドIIを発現するために適切である多くの株の内 の唯一である)は、Qiagenから市販されている。 形質転換体を、アンピシリンおよびカナマイシンの存在下でLBプレート上で増 殖するそれらの能力により同定する。プラスミドDNAを耐性コロニーから単離し 、そしてクローン化DNAの同定を制限分析により確認する。 所望の構築物を含むクローンを、アンピシリン(100μg/ml)とカナマイシン (25μg/ml)との両方を補充したLB培地における液体培養で一晩(「O/N」)増 殖した。 O/N培養物を用いて約1:100〜1:250の希釈で大規模培養に接種した。細胞を、0 .4と0.6との間の600nmでの吸光度(「OD600」)にまで増殖させる。次いで、イ ソプロピル-B-D-チオガラクトピラノシド(「IPTG」)を加えて1mMの最終濃度 にし、lacIリプレッサーを不活性化することにより、lacリプレッサー感受性プ ロモーターからの転写を誘導する。細胞をさらに3〜4時間引き続きインキュベ ートする。次いで、標準的方法によって細胞を遠心分離により採集し、そして破 壊する。日常的な回収技術を用いて破壊した細胞から封入体を精製し、そしてタ ンパク質を封入体から8M尿素中へ可溶化する。可溶化したタンパク質を含む8 M尿素溶液を、2×リン酸緩衝化生理食塩水(「PBS」)中でPD-10カラムを通し 、それによって尿素を除去し、緩衝液を交換し、そしてタンパク質を再び折り畳 む。タンパク質をクロマトグラフィーのさらなる工程によって精製してエンドト キシンを除去する。次いで、濾過滅菌した。濾過滅菌したタンパク質調製物を、 2×PBS中で保存する。 ポリアクリルアミドゲル電気泳動の標準的な方法による調製物の分析は、調製 物が、約26kDaの推定分子量を有する約95%のモノマーT1R様リガンドIIを含む ことを明らかにした。 実施例2:バキュロウイルス発現系におけるT1R様リガンドIIのクローニング および発現 寄託されたクローンにおける完全長T1R様リガンドIIをコードするcDNA配列 を、この遺伝子の5'配列および3'配列に対応するPCRオリゴヌクレオチドプラ イマーを用いて増幅する: 5'プライマーは、配列5’CGC GGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 ’(配列番号6)を有し、下線を付したBamHI制限酵素部位を含み、続いて図1 の配列(配列番号1)のT1R様リガンドIIの配列の18ヌクレオチド(ヌクレオ チド55〜72)を含む。以下に記載のように発現ベクターに挿入した、T1R様リガ ンドIIをコードする増幅したフラグメントの5'末端は、有効なシグナルペプチ ドを提供する。真核生物細胞における翻訳の開始に有効なシグナルは、Kozak,M .,J.Mol.Biol.196:947-950(1987)によって記載されるように、構築物のベクタ ー部分に適切に配置される。 3'プライマーは、配列5’CGC GGT ACC TCA CAA TGT TAC GTA CTC TAG 3'(配 列番号7)を有し、これは下線を付したAsp718制限部位を含み、続いて図1に示 す配列をコードするT1R様リガンドIIのヌクレオチド754〜771(配列番号1) に相補的でありそして逆である停止コドンおよび18ヌクレオチドを含む。 寄託されたクローンにおける完全長T1R様リガンドIIの細胞外ドメインをコ ードするcDNA配列を、この遺伝子の5'および3'配列に対応するPCRオリゴヌク レオチドプライマーを用いて増幅する: 5'プライマーは、配列5’CGC GGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 ’(配列番号6)を有し、下線を付したBamHI制限酵素部位を含み、続いて図1 の配列(配列番号1)に示されるT1R様リガンドIIをコードする配列の18ヌク レオチド(ヌクレオチド55〜72)を含む。以下に記載のように発現ベクターに挿 入した、T1R様リガンドIIをコードする増幅したフラグメントの5'末端は、有 効なシグナルペプチドを提供する。真核生物細胞における翻訳の開始に有効なシ グナルは、Kozak,M.,J.Mol.Biol.196:947-950(1987)によって記載されるよ うに、構築物のベクター部分に適切に配置される。 3'プライマーは、配列5’CGC GGT ACC TCA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3'(配 列番号8)を有し、これは下線を付したAsp718制限部位を含み、続いて図1に示 す配列をコードするT1R様リガンドIIのヌクレオチド619〜636(配列番号1) に相補的でありそして逆である停止コドンおよび18ヌクレオチドを含む。 増幅されたフラグメントを、市販のキット(「Geneclean」BIO 101 Inc.,La Jolla,Ca.)を用いて、1%アガロースゲルより単離する。次いで、このフラグ メントをBamHIおよびAsp718で消化し、そして1%アガロースゲルで再び精製す る。このフラグメントを、本明細書中でF2と命名する。 ベクターpA2を用いて、Summersら、A Manual of Methods for Baculovirus Ve ctors and Insect Cell Culture Procedures,Texas Agricultural Experimenta l Station Bulletin No.1555(1987)に記載の標準的な方法を用いて、完全長T 1R様リガンドIIおよびT1R様リガンドIIの細胞外ドメインをバキュロウイル ス発現系において発現する。pA2ベクターは、シグナルペプチドコード領域を含 まない。従って、T1R様リガンドIIシグナルペプチドは、(図1のヌクレオチ ド55〜132(配列番号1));図1のアミノ酸1〜26(配列番号2)に依存する 。 T1R様リガンドIIシグナルペプチドが、T1R様リガンドIIタンパク質の有効 な発現を生じない場合、pA2ベクターのかわりにpA2-GPベクターを使用し得る。A cMNPV gp67のシグナルペプチド(N末端メチオニンを含む)は、BamHI部位のち ょうど上流に位置する。当業者は、pA2-GP発現ベクターを使用する場合、使用さ れる5'オリゴヌクレオチドは、T1R様リガンドIIシグナルペプチドをコードす る配列を含むはずではないことを理解する。かわりに、5'オリゴヌクレオチドは 、ヌクレオチド131で開始するはずである。 pA2およびpA2-GPの両方の発現ベクターは、Autographa californica核多角体 病ウイルス(AcMNPV)の強力なポリヘドリンプロモーター、それに続く都合のい い制限部位を含む。シミアンウイルス40(「SV40」)のポリアデニル化部位を、 効率的なポリアデニル化のために用いる。組換えウイルスの容易な選択のために 、E.coli由来のβガラクトシダーゼ遺伝子をポリヘドリンプロモーターと同方向 に挿入し、そしてポリヘドリン遺伝子のポリアデニル化シグナルが続く。ポリヘ ドリン配列を、野生型ウイルスDNAとの細胞媒介性相同組換えのためにウイルス 配列によって両側に隣接させ、クローン化ポリヌクレオチドを発現する生存可能 なウイルスを生成する。 当業者が容易に理解するように、構築が転写、翻訳、輸送などのために適切に 位置したシグナル(例えば、必要ならばインフレームでのAUGおよびシグナルペ プチド)を提供する、多くの他のバキュロウイルスベクター(例えば、pAc373、 pVL941,およびpAcIM1)が、pA2またはpA2-GPの代わりに用いられ得る。このよ うなベクターは、とりわけ、Luckowら、Virology,170:31-39に記載される。 当該分野で公知の日常的な手順を用いて、プラスミドを制限酵素XbaIで消化し 、次いでウシ腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化する。次いで、市販のキット (「Geneclean」 BIO 101 Inc.,La Jolla,Ca)を用いてDNAを1%アガロースゲ ルから単離する。このベクターDNAを、本明細書中で「V2」と命名する。 フラグメントF2および脱リン酸化プラスミドV2を、T4 DNAリガーゼでともに連 結する。E.coli HB101細胞を連結混合物で形質転換し、そして培養プレート上に 播く。XbaIを用いて個々のコロニーからのDNAを消化し、次いでゲル電気泳動に よって消化産物を分析することによって、ヒトT1R様リガンドII遺伝子を有す るプラスミドを含む細菌を同定する。クローン化フラグメントの配列を、DNA配 列決定により確認する。このプラスミドを、本明細書中でpBacT1R-like ligand Iと命名する。 5μgのプラスミドpBacT1R-like ligand Iを、FelgnerらProc.Natl.Acad. Sci.USA 84:7413-7417(1987)によって記載されるリポフェクション法を用いて 、1.0μgの市販の線状化バキュロウイルスDNA(「BaculoGoldTM baculovirus DN A」,Pharmingen,San Diego,CA.)とともに同時トランスフェクトする。1μg のBaculoGoldTMウイルスDNAおよび5μgのプラスミドpBacT1R-like ligand Iを 、50μlの無血清グレース培地(Life Technologies Inc.,Gaithersburg,MD) を含むマイクロタイタープレートの無菌ウェル中で混合する。その後、10μlの リポフェクチンおよび90μlのグレース培地を添加し、混合し、そして室温にて 15分間インキュベートする。次いで、そのトランスフェクション混合物を、無血 清グレース培地1mlを有する35mm組織培養プレート内に播種されたSf9昆虫細胞 (ATCC CRL 1711)に滴下する。プレートを、新たに添加した溶液を混合するた めに、前後に振盪する。次いでプレートを、27℃で5時間インキュベートする。 5時間後、トランスフェクション溶液をプレートから除去し、そして10%ウシ胎 児血清を補充した1mlのグレース昆虫培地を添加する。プレートをインキュベー ターに戻し、そして27℃で4日間培養を続ける。 4日後、上清を回収し、そしてSummersおよびSmith(上記で引用)に記載され るようにプラークアッセイを行う。青く染色されたプラークを産生するgal発現 クローンの容易な同定および単離を可能にするために、「Blue Gal」(Life Tec hnologies Inc.,Gaithersburg)を有するアガロースゲルを用いる。(このタイ プの「プラークアッセイ」の詳細な説明はまた、Life Technologies Inc.、Gait hersburg、で配布される昆虫細胞培養およびバキュロウイルス学の使用者ガイド (9〜10頁)においても見い出され得る)。 連続希釈の4日後、ウイルスを細胞に添加する。適切なインキュベーションの 後、青く染色されたプラークをエッペンドルフピペットのチップで拾う。次いで 、組換えウイルスを含む寒天を、200μlのグレース培地を含むエッペンドルフ チューブ中に再懸濁する。寒天を、短時間の遠心分離により除去し、そして組換 えバキュロウイルスを含む上清を、35mmディッシュに播種されたSf9細胞に感染 するために用いる。4日後、これらの培養ディッシュの上清を回収し、次いでそ れらを4℃で保存する。適切に挿入されたhESSB I、II、およびIIIを含むクロー ンを、この制限マッピングおよび配列決定を含むDNA分析によって同定する。こ れを、本明細書中でV-T1R-like ligand Iと命名する。 Sf9細胞を、10%熱不活化FBSを補充したグレース培地中で増殖する。細胞を、 約2(約1〜約3)の感染多重度(「M0I」)で組換えバキュロウイルスV-T1R-lik e ligand Iで感染させる。6時間後、その培地を除去し、そしてメチオニンおよ びシステインを除いたSF900 II培地(Life Technologies Inc.,Gaithersburgか ら入手可能)に置き換える。42時間後、5μCiの35S-メチオニンおよび5μCi の35S-システイン(Amershamから入手可能)を添加する。細胞をさらに16時間 インキュベートし、次いで細胞を遠心分離により収集し、溶解し、そして標識さ れたタンパク質をSDS-PAGEおよびオートラジオグラフィーにより可視化する。 実施例3:哺乳動物細胞におけるクローニングおよび発現 哺乳動物細胞における、T1R様リガンドIIタンパク質遺伝子配列の一過的発 現に使用されるベクターのほとんどは、SV40複製起点を有するはずである。この ことは、ウイルスDNA合成の開始に必要なT抗原を発現する細胞(例えば、COS細 胞)において、高コピー数のベクターの複製を可能にする。任意の他の哺乳動物 細胞株もまた、この目的に利用し得る。 代表的な哺乳動物発現ベクターは、プロモーターエレメント(mRNAの転写の開 始を媒介する)、タンパク質コード配列、ならびに転写の終結および転写物のポ リアデニル化に必要なシグナルを含む。さらなるエレメントとしては、エンハン サー、ドナーによって隣接するKozak配列および介在配列、ならびにRNAスプライ シングのためのアクセプター部位が挙げられる。非常に有効な転写を、SV40由来 の初期および後期プロモーター、レトロウイルス由来の長末端反復(LTR)(例 えば、RSV、HTLVI,HIVI)ならびにサイトメガロウイルス(CMV)の初期プロモ ーターで達成し得る。しかし、細胞シグナルもまた使用され得る(例えば、ヒト アクチンプロモーター)。本発明の実施における使用に適切な発現ベクターとし ては、例えば、pSVLおよびpMSG(Pharmacia,Uppsala,Sweden)、pRSVcat(ATC C 37152)、pSV2dhfr(ATCC 37146)、ならびにpBC12MI(ATCC 67109)のような ベクターが挙げられる。使用し得る哺乳動物宿主細胞としては、ヒトHela、283 、H9およびJurkat細胞、マウスNIH3T3およびC127細胞、Cos1、Cos7およびCV1、 アフリカミドリザル細胞、ウズラQC1-3細胞、マウスL細胞、ならびにチャイニー ズハムスター卵巣細胞が挙げられる。 あるいは、遺伝子は、染色体に取り込まれるその遺伝子を含む安定な細胞株に おいて発現され得る。選択マーカー(例えば、dhfr,gpt、ネオマイシン、ハイ グロマイシン)どの同時トランスフェクションは、トランスフェクト細胞の同定 および単離を可能にする。 トランスフェクトされた遺伝子はまた、増幅されて大量のコードされるタンパ ク質を発現し得る。DHFR(ジヒドロ葉酸レダクターゼ)は、目的の遺伝子の数百 または数千ものコピーを有する細胞株を開発するのに有用なマーカーである。別 の有用な選択マーカーは、酵素グルタミンシンターゼ(GS)である(Murphyら、 Biochem J.227:277-279(1991);Bebbingtonら、Bio/Technology 10:169-175(19 92))。これらのマーカーを使用して、哺乳動物細胞を選択培地において増殖さ せ、そして最も高い耐性を有する細胞を選択する。これらの細胞株は染色体に取 り込まれる増幅遺伝子(単数または複数)を含む。チャイニーズハムスター卵巣 (CHO)細胞は、タンパク質の産生にしばしば使用される。 発現ベクターpC1およびpC4は、ラウス肉腫ウイルスの強力なプロモーター(LT R)(Cullenら、Molecular and Cellular Biolugy,438-4470(1985年3月)) およびCMV-エンハンサーのフラグメント(Boshartら、Cell 41:521-530(1985) )を含む。複数のクローニング部位(例えば、制限酵素切断部位BamHI、XbaI、 およびAsp718)は、目的の遺伝子のクローニングを容易にする。ベクターはさら に、ラットプレプロインシュリン遺伝子の3'イントロン、ポリアデニル化、およ び終結シグナルを含む。 実施例3(a):COS細胞におけるクローニングおよび発現 発現プラスミドを、T1R様リガンドIIをコードするcDNAを発現ベクターpcDNA I/Amp(Invitrogen,Inc.から入手し得る)内へクローニングすることによって作 製する。 発現ベクターpcDNAI/ampは以下:(Dower,Colotta,F.ら、Immunol Today 15 :562(1994))E.coliおよび他の原核生物細胞における増殖に効果的なE.coli複製 起点;(Greenfeder,S.A.ら、J.Biol.Chem.270:13757(1995))プラスミド含 有原核生物細胞の選択のためのアンピシリン耐性遺伝子;(Polan,M.L.ら、Am .J.Obstet.Gynecol.170:1000(1994))真核生物細胞における増殖のためのSV 40複製起点;(Carinci,Mora,M.ら、Prog.Clin.Biol.Res.349:205(1990) )CMVプロモーター、ポリリンカー、SV40イントロン;および、cDNAが、都合良 くCMVプロモーターの発現制御下におかれ、そしてポリリンカーにおける制限部 位によってSV40イントロンおよびポリアデニル化シグナルに作動可能に連結し得 るように配列されたポリアデニル化シグナルを含む。 完全T1R様リガンドII前駆体をコードするDNAフラグメントおよびその3'末端 にインフレームで融合しHAタグを、ベクターのポリリンカー領域にクローン化し 、その結果組み換えタンパク質発現をCMVプロモーターによって導かれる。HAタ グは、Wilsonら、Cell 37:767(1984)によって記載されるインフルエンザ血液凝 集素タンパク質由来のエピトープに対応する。標的タンパク質へのHAタグの融合 は、HAエピトープを認識する抗体を用いる組換えタンパク質の簡単な検出を可能 にす る。 プラスミド構築ストラテジーは以下のようである。 寄託されたクローンのT1R様リガンドII cDNAを、上記のE.coliにおけるT1R 様リガンドIIの発現のための発現ベクターの構築についてと同様に、都合の良 い制限部位を含むプライマーを用いて増幅する。発現されたT1R様リガンドII の検出、精製、および特徴づけを容易にするために、1つのプライマーは、上記 のように血液凝集素タグ(「HAタグ」)を含む。 当業者は、完全長T1R様リガンドIIタンパク質(約1〜約229アミノ酸)を、 適切な5'および3'オリゴヌクレオチドプライマーを用いて、COS細胞において発 現し得ることを理解する。 寄託されたクローンにおける完全長T1R様リガンドIIの細胞外ドメインをコ ードするcDNA配列を、遺伝子の5'および3'配列に対応するPCRオリゴヌクレオチ ドプライマーを用いて増幅する。5'プライマーは、以下の配列: 5' CGC GGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3'(配列番号6)を有し 、これは下線を付したBamHI部位および図1(配列番号1)に示されるT1R様リガ ンドIIコード配列の18ヌクレオチド(ヌクレオチド55-72)を有する。 3'プライマーは、以下の配列: 5' CGC TCT AGA TCA AGC GTA GTC TGG GAC GTC GTA TGG GTA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3'(配列番号9)を有し、これは下線を付したXbaI制限部位、停止コ ドン、HAタグ、および図1(配列番号1)に示されるT1R様リガンドIIコード 配列のヌクレオチド619-639に逆および相補的な18ヌクレオチド(ヌクレオチド5 5-72)を有する。 PCR増幅DNAフラグメントおよびベクターpcDNAI/AmpをBamHIおよびXbaIで消化 し、次いで連結する。連結混合物を、E.coli株SUREへ形質転換し(Stratagene Cl oning Systems,11099 North Torrey Pines Road,La Jolla,CA 92037より入手 可能)、そして形質転換培養物を、次いでインキュベートしてアンピシリン耐性 コロニーの増殖を可能にするアンピシリン培地プレートへプレーティングする。 プラスミドDNAを耐性コロニーから単離し、T1R様リガンドII-コードフラグメ ントの存在について制限分析およびゲルサイズ画分によって試験する。 組換えT1R様リガンドIIの発現のために、COS細胞を、例えば、Sambrookら, Molecular Cloning:A Laboratory Mannual,Cold Spring Laboratory Press,Co ld Spring Harbor,New York(1989)に記載のDEAE-DEXTRANを用いて、上記のよう に発現ベクターでトランスフェクトする。細胞をべクターによるhuXAG-1の発現 のための条件下でインキュベートする。 T1R様リガンドII HA融合タンパク質の発現を、例えば、Harlowら,Antibodi es:A Laboratory Manual,第2版;Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York(1988)に記載の方法を用いて放射標識化および免疫沈 降法によって検出する。この目的を達するため、トランスフェクションの2日後 に、細胞を、35S-システインを含む培地中で8時間インキュベートすることによ って標識する。細胞および培地を回収し、そして細胞を洗浄し、そしてWilsonら (上記に引用された)に記載されるように界面活性剤含有RIPA緩衝液:150mM Na Cl、1% NP-40、0.1% SDS、1% NP-40、0.5% DOC、50mM TRIS、pH7.5で溶解 する。タンパク質を、HA特異的モノクローナル抗体を用いて細胞溶解物および培 養培地から沈降する。次いで、沈降されたタンパク質をSDS-PAGEゲルおよびオー トラジオグラフィーによって分析する。期待されるサイズの発現産物が細胞溶解 物において観察され、これはネガティブコントロールにおいては観察されない。 実施例3(b):CHO細胞におけるクローニングおよび発現 ベクターpC4を、T1R様リガンドIIタンパク質の発現のために使用する。プラ スミドpC4は、プラスミドpSV2-dhfr(ATCC受託番号37146)の誘導体である。こ のプラスミドは、SV40初期プロモーターの制御下で、マウスDHFR遺伝子を含む。 これらのプラスミドでトランスフェクトされるジヒドロ葉酸活性を欠如するチャ イニーズハムスター卵巣細胞または他の細胞は、化学治療剤メトトレキサートを 補充した選択培地(αマイナスMEM、Life Technologies)中で細胞を増殖させる ことによって選択され得る。メトトレキサート(MTX)に耐性である細胞におけ るDHFR遺伝子の増幅は、よく考証されている(例えば、Alt,F.W.,Kellems,R. M.,Bertino,J.R.およびSchimke,R.T.,1978,J.Biol.Chem.253:1357-1370 、 Hamlin,J.L.およびMa,C.1990,Biochem.et Biophys.Acta,1097:107-143、P age,M.J.およびSydenham,M.A.1991,Biotechnology第9巻:64-68を参照のこと )。漸増濃度のMTXにおける細胞増殖は、DHFR遺伝子の増幅の結果として、標的 酵素DHFRを過剰産生することによって薬物への耐性を生じる。第二の遺伝子がDH FR遺伝子に連結される場合、通常、同時増幅され、そして過剰発現される。遺伝 子の1,000を越えるコピーを有する細胞株を開発することは最先端である。続い て、メトトレキサートが取り除かれる場合、細胞株は、染色体(単数または複数 )に取り込まれる増幅遺伝子を含む。 プラスミドpC4は、ラウス肉腫ウイルス(Cullenら、Molecular and Cellulor biology.,1985年3月438-4470)の長末端反復(LTR)の目的の強力なプロモー ターの遺伝子、およびヒトサイトメガロウイルス(CMV)(Boshartら、Cell 41: 521-530,1985)の最初期遺伝子のエンハンサーから単離されたフラグメントの遺 伝子の発現を含む。プロモーターの下流は、続く遺伝子の取り込みを可能にする BamHI、 PvuIIおよびNruIの単一の制限酵素切断部位である。これらのクローニ ング部位の後ろに、プラスミドは、3つ全てのリーディングフレーム中の転写ス トップコドン、続いてラットプレプロインシュリン遺伝子の3'イントロンおよび ポリアデニル化部位を含む。他の高効率プロモーターもまた、発現のために使用 し得る(例えば、ヒトβアクチンプロモーター、SV40初期もしくは後期プロモー ター、または他のレトロウイルス(例えば、HIVおよびHTLVI)からの長末端反復 )。mRNAのポリアデニル化のために、他のシグナル(例えば、ヒト成長ホルモン またはグロビン遺伝子由来)も同様に使用し得る。 染色体に挿入された目的の遺伝子を有する安定な細胞株もまた、選択マーカー (例えば、gpt、G418、またはハイグロマイシン)での同時トランスフェクトに 基づいて選択し得る。開始における2つ以上の選択マーカー(例えば、G418およ びメトトレキサート)を使用することが有用である。 プラスミドpC4を制限酵素BamHIで消化し、次いでウシ小腸ホスファターゼを用 いて、当該分野で公知の手順によって脱リン酸化する。次いで、ベクターを、1 %アガロースゲルから単離する。 T1R様リガンドIIタンパク質をコードするDNA配列を、T1R様リガンドIIタ ンパク質のアミノ末端配列および遺伝子のベクター配列3'に特異的なPCRオリゴ ヌクレオチドプライマーを用いて増幅する。クローニングを容易にするための制 限部位を含むさらなるヌクレオチドを、それぞれ5'および3'配列に付加する。 全長T1R様リガンドIIをコードするcDNA配列を、遺伝子の5'および3'配列に 対応するPCRオリゴヌクレオチドプライマーを用いて増幅する。5'プライマーは 、配列5' CGC GGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3'(配列番号6)を 有し、これは、下線を付したBamHI制限酵素部位、続いて図1(配列番号1)のT 1R様リガンドIIの配列の18ヌクレオチド(ヌクレオチド55〜72)を含む。発現 ベクター(以下に記載)に挿入した、ヒトT1R様リガンドIIをコードする増幅 したフラグメントの5'末端は、有効なシグナルペプチドを提供する。真核生物細 胞における翻訳開始のために十分なシグナル(Kozak,M.,J.Mol.Biol.196:9 47-950(1987)によって記載される)を、構築物のベクター部分に適切に配置する 。 3'プライマーは、配列5' GCG GGT ACC TCA CAA TGT TAC GTA CTC TAG 3'(配 列番号7)を有し、これは、下線を付したAsp718制限、続いて停止コドンおよび 図1(配列番号1)のT1R様リガンドIIコード配列のヌクレオチド754〜771と 逆ならびに相補的な17ヌクレオチドを含む。制限部位は、CHO発現ベクターPC-4 における制限酵素部位に都合がよい。 全長T1R様リガンドIIの細胞外ドメインをコードするcDNA配列を、遺伝子の5 'および3'配列に対応するPCRオリゴヌクレオチドプライマーを用いて増幅する。 5'プライマーは、配列5' CGC GGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3' (配列番号6)を有し、これは、下線を付したBamHI制限酵素部位、および図1 のT1R様リガンドIIの配列の18ヌクレオチド(ヌクレオチド55〜72)(配列番 号1)を含む。発現ベクター(以下に記載)に挿入した、T1R様リガンドIIを コードする増幅したフラグメントの5'末端は、有効なシグナルペプチドを提供す る。真核生物細胞における翻訳開始のために有効なシグナル(Kozak,M.,J.Mo l.Biol.196:947-950(1987)によって記載される)を、構築物のベクター部分に 適切に配置する。 3'プライマーは、配列5' CGC GGT ACC TCA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3'(配 列番号8)を有し、これは、下線を付したAsp718制限、続いて停止コドンおよび 図 1(配列番号1)のT1R様リガンドIコード配列のヌクレオチド619〜636と逆お よび相補的な18ヌクレオチドを含む。 増幅したT1R様リガンドII DNAを、BamHIおよびAsp718で消化する。ベクター pC4をBamHIで消化し、次いで消化したDNAをともに連結する。次いで、単離され たフラグメントおよび脱リン酸化ベクターをT4 DNAリガーゼで連結する。T1R様 リガンドIIタンパク質DNAのBamHIで制限されたベクターへの挿入は、T1R様リ ガンドIIタンパク質コード領域をベクターのプロモーターの下流に配置し、そ してベクターのプロモーターに作動可能に連結する。次いで、E.coli HB101細胞 を形質転換し、そして制限酵素BamHIを用いて正しい配向に挿入されたプラスミ ドpC4を含む細菌を同定する。連結混合物を、例えば、Sambrookら、MOLECUAR CL ONING:A LABORATORY MANUAL、第2版、Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor,N.Y.(1989)に記載されるような標準的な手順を用いて、コ ンピテントなE.coli細胞に形質転換する。形質転換培養物を、アンピシリン培地 プレートにプレーティングし、次いでインキュベートして、アンピシリン耐性コ ロニーの増殖を可能にする。プラスミドDNAを耐性コロニーから単離し、そしてT 1R様リガンドIIコードフラグメントの配列について、制限分析およびゲル測定 することによって試験する。挿入した遺伝子の配列を、DNA配列決定によって確 認する。 CHO-DHFR細胞のトランスフェクション 活性なDHFR酵素を欠如するチャイニーズハムスター卵巣細胞を、トランスフェ クションのために使用する。5μgの発現プラスミドC4を、リポフェクション法 (Felgnerら、前出)を用いて、0.5μgのプラスミドpSV2-neoとともに同時トラ ンスフェクトする。プラスミドpSV2-neoは優性選択マーカー(G418を含む一群の 抗生物質への耐性を与える酵素をコードするTn5由来の遺伝子neo)を含む。細胞 を、1mg/mlのG418を補充したαマイナスMEMに播種する。2日後、細胞をトリプ シン処理し、ハイブリドーマクローニングプレート(Greiner,Germany)に播種 し、そして約10〜14日培養する。その後、単一のクローンをトリプシン処理し、 次いで異なる濃度のメトトレキサート(25nM、50nM、100nM、200nM、400nM)を 用いて、6ウェルペトリ皿または10mlフラスコに播種する。次いで、最高濃度の メトトレキサートで増殖するクローンを、さらに高濃度のメトトレキサート(50 0nM、1μM、2μM、5μM)含む新たな6ウェルプレートに移す。同じ手順 を、クローンが100μMの濃度で増殖するまで繰り返す。 所望の遺伝子産物の発現を、例えば、SDS-PAGEおよびウエスタンブロット分析 によって分析する。T1R様リガンドII融合タンパク質の発現を、例えば、Harlo wら、Antibodies:A Laboratory Manual,第2版;Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York(1988)に記載の方法を用いて、放射性標 識および免疫沈降によって検出する。この目的のために、トランスフェクション の2日後、細胞を、35S-システインを含む培地中で8時間のインキュベーション によって標識する。細胞および培地を回収し、そして細胞を洗浄し、そしてWils onら(前出)によって記載されるように、界面活性剤含有RIPA緩衝液(150mM Na Cl、1%NP-40、0.1%SDS、1%NP-40、0.5%DOC、50mM TRIS(pH7.5))で溶解 させる。タンパク質を、HA特異的モノクローナル抗体を用いて、細胞溶解物およ び細胞培地から沈殿させる。次いで、沈殿したタンパク質を、SDS-PAGEゲルおよ びオートラジオグラフィーによって分析する。予想したサイズの発現産物を細胞 溶解物において見いだし、これはネガティブコントロールにおいては見いだされ ない。 実施例4:T1R様リガンドII遺伝子発現の組織分布 ノーザンブロット分析を行って、とりわけSambrookら(上記に引用される)に よって記載される方法を用いて、ヒト組織におけるT1R様リガンドII遺伝子の 発現レベルの試験を行う。本発明の完全T1R様リガンドIIヌクレオチド配列( 配列番号1)を含むcDNAプローブ(配列番号1)を、rediprimeTMDNA標識系(Am ersham Life Science)を用いて、製造業者の説明書に従って、32Pで標識する。 標識後、プローブを、CHROMA SPIN-100TMカラム(Clontech Laboratories,Inc. )を用いて、製造業者のプロトコル番号PT1200-1に従って、精製する。次いで、 精製した標識化プローブを使用して、T1R様リガンドII遺伝子の発現について 、種々のヒト組織を試験する。 種々のヒト組織(H)およびヒト免疫系組織(IM)を含む多組織ノーザン(MTN )ブロットをClontechから入手し、そしてExpressHybTM Hybridization Solutio n(Clontech)を用いて、製造業者のプロトコル番号PT1190-1に従って、標識化 プローブで試験する。ハイブリダイゼーションおよび洗浄に続いて、ブロットを 取り付け、そして-70℃にて一晩フィルムに暴露し、そして標準的な手順に従っ てフィルムを現像する。 本発明が、前述の説明および実施例に詳細に記載される以外に実施され得るこ とは明白である。 本発明の多数の改変および変異が、上記の教示に照らして可能であり、それゆ え添付の請求項の範囲内である。 本明細書中に参考として援用される全ての刊行物の開示の全体が、本明細書で 参考として援用される。 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION                         T1 receptor-like ligand II                                Background of the Invention Field of the invention   The present invention relates to a novel T1 receptor (T1R) -like ligand II protein. Details Specifically, an isolated nucleic acid molecule encoding a T1R-like ligand II protein is provided. It is. T1R-like ligand II polypeptides, recombinant vectors and expressing them Also provided are host cells. Related fields   Interleukin-1 (IL-1). Interleukin-1 (IL-1α and IL-1β) Are "multifunctional" cytokines that affect almost all cell types, and Often it works in concert with other cytokines or small mediator molecules. (Din arello, C.A., Blood 87: 2095-2147 (March 15, 1996). ) L-1 gene family Three members: IL-1α, IL-1β, and an IL-1 receptor antagonist (IL- 1Ra) exists. IL-1α and IL-1β are agonists, and IL-1Ra is a specific receptor. Scepter antagonist. IL-1α and β have no leader sequence Synthesized as a precursor. The molecular weight of each precursor is 31 kD. IL-1α or IL-1β Processing to the 17-kD “mature” form requires specific cellular proteases I do. In contrast, IL-1Ra evolves with a signal peptide and is extracellular. It is easily transported to and called secreted IL-1Ra (sIL-1Ra).   IL-1 receptor and ligand. Sufficient IL-1 pathway receptor and ligand (For a review, see Dinarello, C.A., FASE BJ. 8: 1314-1325 ( 1994); Sims, J.E., et al., Interleukin-1 signal transduction: Advances in Cell a nd Molecular Biology of Membranes and Organelles, Volume 3, JAI Press, Inc. Greenwich, CT (1994), pp. 197-222). Three ligands, IL-1α, IL-1β, and And IL-1 receptor antagonists (IL-1ra) comprise three types of IL-1 receptors: 80-kDa type I IL-1 receptor (IL-1R1) (Sims, J.E., et al., Science 241: 585-589 (1988) ), 68-kDa type II IL-1 receptor (IL-1RII) (McMahan, C.J., et al., EMBO J. 10: 2821-2). 832 (1991), and binds the soluble form of type II IL-1R (sIL-1RII) (Colotta, F. et al. Science 261: 472-475 (1993)).   Interaction between IL-1 ligand and receptor is IL-1 mediated to damage and infection Plays an essential role in stimulating and regulating host responses. Cells expressing IL-1RI and Cells treated with IL-1α or IL-1β respond in several specific ways, including: To: Stimulate nuclear localization of a related transcription factor, NF-κβ (for a review, see Thanos, D. & Maniatis, T .; Cell 80: 529-532 (1996)), epithelial growth factor Mitogen that phosphorylates the threonine 669 residue (Thr-669) of the child receptor (EGFR) Activation of protein kinases from the activated protein kinase superfamily (G uy, G.R. et al., J. Biol. Chem. 267: 1846-1852 (1992); Bird, T.A. et al., J. Biol. Chem. 268: 22861-22870 (1991); Bird, T.A. et al., J. Biol.chem. 269: 31836-31844 (1994)), and And transcriptional stimulation of the IL-8 gene (Mukaida, N. et al., J. Bol.chem. 265: 21128-21133 (1990)) .   IL-1RI-like family. Many proteins from diverse systems are found in IL-1RI cells Shows homology to intraplasmic domains. This expanded IL-1RI-like family is Includes proteins, Drosophila proteins, and plant (tobacco) proteins. (Gay, N.J. & Keith, F.J., Nature 351: 355-356 (1991); Hashimoto, C. et al., Cell 52: 2. 69-279 (1988); Schneider, D.S. et al., Genes & Dev. 5: 797-807 (1991); Edon, E. et al., De. velopment 120: 885-899 (1994); Mitchan, J.L. et al., J. Biol. Chem 271: 5777-5782 (19 March 8, 1996)).   A member of the mammalian IL-1RI-like receptor family is the mouse protein MyD88 ( Lord, K.A. et al., Oncogene 5: 1095-1097 (1990)) and the human gene, rsc786 (Nomura , N. et al., DNA Res. 1: 27-35 (1994)). Another mouse receptor member, T1 / ST2 was previously identified as a novel primary response gene expressed in BAL / c-3T3 cells. (Klemenz, R et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 5708-5712 (1989); To minaga, S., FEBS Lett. 258: 301-304 (1989); Tominga, S. et al., FEBS Lett. 318-87 (199) 3)). Transmembrane protein mu1L-1R AcP (Greenfeder, S.A. et al., J.B. iol.Chem.270: 13757-13765 (1995)) has homology to both type I and type II IL-1R. I do. IL-1R AcP has recently been shown to enhance the affinity of IL-1RI for IL-1β And may be involved in mediating the IL-1 response.   T1 receptor. T1 / ST2 receptor as a member of the IL-1 receptor family -(Hereinafter "T1 receptor") (Bergers, G et al., EMBO J. 13: 1176 (1994)) Some species have various homologs. In rats, it is called Fit-l and That share 26% to 29% amino acid homology to mouse IL-1RI and II, respectively. It is a strogen-induced, c-fos-dependent transmembrane protein. In mice, Fit-1 The protein is called ST2 and in humans T1. Two IL-1 receptors and And the organization of the Fit-1 / ST2 / T1 gene indicate that they are from a common ancestor (Sim s, J.E. et al., Cytokine 7: 483 (1995)). Fit-1 exists in two forms: IL-1RI With a cytosolic domain similar to the cytosolic domains of Fit and Fit-1S (Fit-1M), which is secreted and consists of the extracellular domain of Fit-M.   In many methods, these two forms of the Fit-1 protein are membrane bound and And a form of soluble IL-1RI. IL-1sRI is a cell-bound form of proteolytic cleavage (Sims, J.E. et al., Cytokine 7: 483 (1995)). The other In the Fit-1 gene is under the control of two promoters. This is the membrane Generates two isoforms that encode either the receptor or the soluble form of the receptor I will. Two RNA transcripts provide alternative RNA splicing at the 3 'end of the gene Arising from IL-1β binds weakly to Fit-1 and does not transmit signals (Reik erstorger, A. et al., J. Biol. Chem. 270: 17645 (1995)) was fused to cytosol Fit-1. Chimeric receptor consisting of isolated extracellular mouse IL-1RI transmits IL-1 signal (R eikerstorger, A. et al., J. Biol. Chem. 270: 17645 (1995)). The cytosol part of Fit-1 Aligns with the GTPase-like sequence of IL-1RI (Hopp, T.P., Protein Sci. 4: 1851 (1995) )(See below).   IL-1 production in various disease states. Increased IL-1 production is associated with various viruses, Fungal, fungal, and parasitic infections; intravascular coagulation; high-dose IL-2 treatment; solid tumors; Disease; Alzheimer's disease; HIV-1 infection; autoimmune disorders; trauma (surgery); hemodialysis; Hematologic disease (myocardial infarction); Non-infectious hepatitis; Asthma; UV irradiation; Closed head injury; Pancreas Inflammation; periodontal disease; graft versus host disease; patients with graft rejection and after strenuous exercise Has been reported in healthy subjects. In patients with Alzheimer's disease Possible increase in IL-1β production and release of amyloid precursor protein There is an association with the role of IL-1 (Vasilakos, J.P. et al., FEBS Lett. 354: 289 (1994) ). However, in most conditions, IL-1 is the only site showing increased production Not IL-1 and therefore IL-1 findings as relevant to the pathogenesis of any particular disease Specificity is lacking. In various disease states, IL-1β, but not IL-1α, is circulating. Detected in the ring.   IL-1 in therapy. IL-1 has been found to exert many important biological activities However, it has also been found to be toxic at doses close to the therapeutic dose. (D inarello, C.A., Blood 87: 2095-2147 (March 15, 1996)). Generally, no IL-1 The acute toxicity of these isoforms was greater after intravenous injection compared to subcutaneous injection. subcutaneous Injections showed significant local pain, erythema, and swelling (Kitamura, T., & Takaku, F., Exp. Med. 7: 170 (1989); Laughlin, M.J., Ann. Hematol. 67: 267 (1993)). 100ng / kg or more Patients who received IL-1 intravenously at the following doses experienced significant hypotension. 4-32ng subcutaneously / kg IL-1β had the only onset of hypotension at the highest dose level. (Laughlin, M.J., Ann. Hematol. 67: 267 (1993)).   5 days week as opposed to IL-1-related bone marrow stimulation in patients with normal marrow reserve Patients with aplastic anemia treated with an amount (30-100 mg / kg) of IL-1α Had no increase in blood counts or myeloidity (Walsh, C.E., et al., Br. J. Hae matol 80: 106 (1992)). IL-1 restores the lowest point of neutropenia and thrombocytopenia To be administered to patients who have undergone various measures of chemotherapy.   Daily treatment of autologous bone marrow or stem cells with 40 ng / kg IL-1α from day 0 to day 13 is preferred. Produced earlier recovery of neutropenia (median, 12 days; P <0. 001) (Weisdorf, D. Bl ood 84: 2044 (1994). Fourteen days after treatment, bone marrow is filled with associated myeloid progenitor cells. Significantly enriched. Similar results were obtained with purged or unpurged bone marrow. Patients with AML who received 50 ng / kg / d IL-1β for 5 days starting at the time of transplantation (Nemunaitis, J .; Blood 83: 3473 (1994)). Low capacity IL-1 By injecting either α or IL-1β into humans, impressive febrile And the hypotension-inducing properties of the molecule are confirmed.   Recovery of disease using soluble IL-1 receptor. Administration of mouse IL-1sRI to mice Increases the survival of heterotopic hear allografts and Reduced cellular hyperplastic lymph node response (Fanslow, W. et al. C. Et al., Science 248: 739 (1 990)). Topical instillation of mouse IL-1sRI in a rat model of antigen-induced arthritis Reduced joint swelling and tissue destruction (Dower, S .; K. Et al., Therapeutic Immunol . 1: 113 (1994)). These data show the total IL-1sRI administered to normal contralateral joints. Indicates that the amount worked systemically. In an experimental model of autoimmune encephalitis, IL -1sRI reduced the severity of the disease (Jacobs, C. et al. A. J. Immunol. 146: 2983 (1991)).                                Summary of the Invention   The present invention relates to a human T1 receptor (T1R) having the amino acid sequence of FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). Nucleic Acids Containing Polynucleotides Encoding Ligand-Ligand II Polypeptides Provide molecules. T1R-like ligand II is an N-terminal methionine, a 26 amino acid residue Sequence, extracellular mature domain of about 168 residues, transmembrane domain of about 23 residues and About 2 amino acids, including an intracellular domain of about 12 amino acid residues and a predicted molecular weight of about 26 kDa. Includes an open reading frame encoding a 29 amino acid residue polypeptide No. Figure 1 shows the predicted 168 amino acid sequence of the mature extracellular T1R-like ligand II protein. And SEQ ID NO: 2 (residues 27-194).   In another aspect, the present invention has been deposited on July 12, 1996 as ATCC accession number 98655. T1R-like riga having the amino acid sequence encoded by the cDNA of the deposited clone Provided is an isolated nucleic acid molecule that encodes a DNA II. Preferably, the nucleic acid molecule is Encodes the mature polypeptide encoded by the deposited cDNA described above.   The invention further relates to nucleic acid fragments of the nucleic acid molecules described herein. I do. The nucleotide sequence of the deposited cDNA or shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) The present invention relates to fragments of an isolated nucleic acid molecule having a nucleotide sequence. Less useful as diagnostic probes and primers as discussed in the textbook Both about 15 nt, and more preferably at least about 20 nt, and even more preferably less Fragments at least about 30 nt, and even more preferably at least about 40 nt in length Is intended. Of course, larger fragments 50 to 741 nt long are also better. In addition, the amino acid sequence of the deposited cDNA or the nucleotide sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) Like most (if not all) matching fragments, according to the invention Useful. Deposited by fragments at least 20 nt long, for example Nucleotide sequence of the cDNA or the nucleotide sequence shown in FIG. Fragments containing 20 or more contiguous bases from a row are contemplated. Gene deposited And the nucleotide sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) is provided. Therefore, producing such a DNA fragment is routine for those skilled in the art. It is. For example, restriction endonuclease cutting or ultrasonic shearing can be Can be easily used to generate fragments of the following sizes: Or this Such fragments can be made synthetically.   A preferred nucleic acid fragment comprises about 26 amino acid residues (about 1 to about 1 Leader sequence of about 26 amino acid residues; extracellular mature domain of about 168 residues (Fig. A transmembrane domain of about 23 amino acids (FIG. 1); (About 195 to about 217 amino acid residues of (SEQ ID NO: 2)); an intracellular domain of about 8 amino acids ( FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) (about 218 to 229 amino acid residues); Contains nucleic acid molecules encoding peptides containing deleted extracellular and intracellular domains No.   A further embodiment of the present invention relates to any of the nucleic acid molecules described herein. At least 90% identical to the nucleotide sequence, and more preferably Both have nucleotide sequences that are 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical Includes an isolated nucleic acid molecule.   The present invention also provides a recombinant vector, a recombinant vector comprising the isolated nucleic acid molecule of the present invention. Cells containing recombinant vector and T1R-like ligand II polypeptide by recombinant technology Or the production of fragments thereof.   The polypeptide of the present invention is a polypeptide encoded by the deposited cDNA. , The polypeptide of FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) (specifically, the mature polypeptide), and The polypeptide encoded by the deposited cDNA, the polypeptide of FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) At least 90% of the amino acid sequence of the peptide or their fragments Have an amino acid sequence with similarity, more preferably at least 95% similarity Including polypeptides. Further polypeptides of the invention may be provided by the deposited cDNA. Or the polypeptide of FIG. 1 (SEQ ID NO: 2), or At least 80% identical, more preferably less, to the amino acid sequence of these fragments Polypeptides having amino acid sequences that are 90% or 95% identical to each other.   Preferred polypeptide fragments according to the invention are mature polypeptides, cells All ectodomains, transmembrane domains, intracellular domains, or transmembrane domains. Or polypeptides containing extracellular or intracellular domains with or without deletions.   A further embodiment of the present invention is directed to an epitope of a T1R-like ligand II as described herein. The present invention relates to a polypeptide or peptide having an amino acid sequence of a loop-bearing portion. Book Peptides having the amino acid sequence of the epitope-bearing portion of an IL-1-like polypeptide of the invention The peptide or polypeptide has at least 6 to 30 or 9 to 50 amino acids. The polypeptides of the invention described herein, including portions of a polypeptide such as Epitopes of any length (including the whole) up to the length of the entire amino acid sequence of the peptide Partial polypeptides are also included.   In another embodiment, the present invention has an amino acid sequence described herein. An isolated antibody that specifically binds to a T1R-like ligand II polypeptide You.   The biological activity of the T1R-like ligand II of the present invention is the biological activity of T1R ligand and IL-1. It is believed that the activity can be similar to the activity. "Normal" T1R-like ligand II gene expression Levels (ie, individuals without T1R ligand-related disorders or IL-1-related disorders) Expression level in the original tissue or body fluid). Lower levels of T1R-like ligand II may cause a T1R ligand-related disorder or an IL-1-related disorder. Tissue or body fluid (eg, serum, plasma, urine, synovial fluid, or cerebrospinal fluid from an individual having ) Can be detected. Thus, the expression of the T1R-like ligand II gene Detecting expression is a diagnostic marker.   In a further embodiment, the present invention provides an increased or decreased level in the body. And methods for treating an individual having a need for T1R-like ligand II activity. this The method comprises forming a composition comprising a T1R-like ligand II polypeptide or an inhibitor thereof. Administration to such individuals.   The present invention relates to a T1R-like ligand II having the amino acid sequence described herein. Further provided are methods for isolating antibodies that specifically bind to a polypeptide. This Antibodies such as can be useful for diagnosis or therapy, as described above.                             BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES   FIG. 1 shows that the cDNA clone contained in ATCC Accession No. 98655 was sequenced. Nucleotide sequence of T1R-like ligand II protein determined according to (SEQ ID NO: 1) And a deduced amino acid sequence (SEQ ID NO: 2). About 1 to about 26 amino acids are sig Indicates the null peptide (first underlined sequence); about 27 to about 194 amino acids are small. Indicates extracellular domain (sequence between first and second underlined sequence); about 195 to about 2 17 amino acids represent the transmembrane domain (second underlined sequence); and about 21 Eight to about 229 amino acids represent the intracellular domain (remaining sequence).   FIG. 2 shows the amino acid sequence of T1R-like ligand II and GenBank accession number U41804 (SEQ ID NO: 3). ) Shows regions of similarity to the protein sequence of FIG.   FIG. 3 provides an analysis of the T1R-like ligand II amino acid sequence. α, β, turn And coil regions; hydrophilic and hydrophobic regions; amphiphilic regions; mobile regions; The index as well as the surface probabilities are shown.                             Detailed description of the invention   The present invention relates to the amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) (cloned cD T1R-like ligand II protein (determined by sequencing NA) Provided is an isolated nucleic acid molecule comprising a polynucleotide encoding a quality. Departure Ming T1R-like ligand II protein shares sequence homology with T1R ligand (FIG. 2) You.   The nucleotide sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) corresponds to the HE96K24 clone. Obtained by determining. This is an American type on July 12, 1996 Culture Collection, 12301 Park Lawn Drvie, Rockville, Maryland 20852 And given accession number 97655. The deposited clone is p Included in Bluescript SK (-) plasmid (Stratagene, LaJolla, CA). Nucleic acid molecule   Unless otherwise indicated, determined by sequencing a DNA molecule herein. All sequenced nucleotide sequences are automatically sequenced by an automated DNA sequencer (eg, Applied B iosystems, Inc. Determined using Model 373) and determined herein. Peptide, polypeptide, or protein encoded by the DNA molecule All amino acid sequences of quality are obtained by translation of the DNA sequence determined as described above. As expected. Therefore, any DNA sequence determined by this automated approach As is known in the art for any of the nucleic acids determined herein. Otide sequences can contain some errors. Nucleochy determined by automation Sequence is representative of the actual nucleotide sequence of the DNA molecule to be sequenced. Has at least about 90% identity, more typically at least about 95% to at least About 99. 99% identical.   The actual sequence may be obtained from other applications, including manual DNA sequencing methods well known in the art. It can be more accurately determined by roach. As also known in the art, A single insertion in the determined nucleotide sequence compared to the actual sequence or Deletions cause a frameshift in translation of the nucleotide sequence, which The predicted amino acid sequence encoded by the determined nucleotide sequence Is actually due to the DNA molecule being sequenced starting at a point such as an insertion or deletion. Is completely different from the amino acid sequence encoded by   Unless otherwise indicated, each "nucleotide sequence" set forth herein is a Shown as the sequence of xyribonucleotides (abbreviated A, G, C, and T). However, depending on the "nucleic acid sequence" of the nucleic acid molecule or polynucleotide, the DNA molecule or the Or a polynucleotide contains a sequence of deoxyribonucleotides and an RNA molecule Alternatively, the polynucleotide has a corresponding arrangement of ribonucleotides (A, G, C, and U). Sequence (each thymidine deoxynucleotide in the deoxynucleotide sequence identified herein) The nucleotide (T) is replaced by the ribonucleotide uridine (U) Is intended. For example, indicated using abbreviations for deoxyribonucleotides Reference to an RNA molecule having the sequence of SEQ ID NO: 1 refers to each deoxynucleotide of SEQ ID NO: 1. Otide A, G or C is replaced by the corresponding ribonucleotide A, G or C And each deoxynucleotide T is replaced by a ribonucleotide U It is intended to indicate an RNA molecule having the resulting sequence.   An “isolated” nucleic acid molecule allows nucleic acid molecules (DN A or RNA) is intended. For example, a recombinant DNA molecule contained in a vector is: It is contemplated that it is isolated for the purposes of the present invention. Further isolation of isolated DNA molecules Examples are recombinant DNA molecules maintained in heterologous host cells, or in solution. Includes purified (partially or substantially) DNA molecules. The isolated RNA molecule is Includes in vivo or in vitro RNA transcripts of defined DNA molecules. According to the present invention Isolated nucleic acid molecule further includes those molecules that are produced synthetically.   The information provided herein (eg, the nucleotides in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) Nucleic acid molecules of the invention encoding T1R-like ligand II polypeptides Uses standard cloning and screening procedures (eg, starting material Procedure for cloning cDNA using mRNA). Example of the present invention The nucleic acid molecule described in Figure 1 (SEQ ID NO: 1) is a 9-week-old human fetal tissue Was found in the derived cDNA library. In addition, genes can also Found in a cDNA library from the following types: prostate, occult T cells , TF274 stromal cells, WI38, Soares breast cells, and Soares placenta.   The T1R-like ligand II cDNA has the initiation codon shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) Encodes a protein of about 229 amino acid residues 55-57 of the nucleotide sequence. Open reading frame; predicted leader of approximately 26 amino acid residues Sequence and estimated molecular weight of approximately 26 kDa. Mature T1R-like ligand II protein Amino acid residues 27 to 229 of the amino acid sequence are shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). Mature T1R-like ligand II protein has three major structural domains . These are extracellular from about 27 to about 194 amino acid residues in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). Domain; a transmembrane domain derived from about 195 to about 217 amino acid residues in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) Main; and cells derived from about 218 to about 229 amino acid residues in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). Inside domain. The T1R-like ligand II protein of the present invention in FIG. About 56% identical and about 75% similar to the ligand, which It can be used as accession number U41804.   As will be appreciated by those skilled in the art, the potential for sequencing errors described above, as well as different known CDNA deposited due to the variability of the leader cleavage site in other proteins The actual T1R-like ligand II encoded by contains approximately 229 amino acids, May be anywhere in the range of 5-245 amino acids; and a putative of this protein The leader sequence is about 26 amino acids, but may range from about 15 to about 30 amino acids. Can be a place. Further, for example, the T1R-like ligand I in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) I protein extracellular, intracellular, and transmembrane domains The location may vary slightly depending on the criteria used to define the domain (E.g., the exact amino acid positions may be from about 1 to about 5 residues).   As shown, the nucleic acid molecules of the invention can be in the form of RNA (eg, mRNA), or D The form of NA (eg, obtained by cloning or synthetically produced CDNA and genomic DNA). DNA is double-stranded or single-stranded Can be Single-stranded DNA or RNA consists of the coding strand (also known as the sense strand) Can be, or is not, the non-coding strand (also known as the antisense strand) possible.   The isolated nucleic acid molecule of the present invention has the nucleotide sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1). Open reading frame (ORF) with an initiation codon at positions 55-57 of the otide sequence ), And further wherein the initiation codon is the nucleus in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1). A sequence that is substantially different from all or part of the ORF at positions 55-57 of the nucleotide sequence But due to the degeneracy of the genetic code, the T1R-like ligand II protein or its DNA fragments still encoding the fragment of Naturally, genetic code Are well known in the art. Therefore, degenerate mutants as described above are generated It is routine for those skilled in the art.   In another aspect, the present invention has been deposited on July 12, 1996 as ATCC Deposit No. 97655. Amino acid sequence encoded by the cDNA clone contained in the deposited plasmid Providing an isolated nucleic acid molecule encoding a T1R-like ligand II protein having a sequence I do. Preferably, the nucleic acid molecule is encoded by the deposited cDNA clone described above. Encoding the mature polypeptide to be made.   The present invention further relates to the nucleotide sequence shown in FIG. Is the nucleotide of T1R-like ligand II cDNA contained in the deposited clone An isolated nucleic acid molecule having a sequence or a sequence complementary to one of the above sequences A nucleic acid molecule is provided. Such isolated molecules, especially DNA molecules, are To perform gene mapping by in situ hybridization with And T1R-like ligand II inheritance in human tissues, for example by Northern blot analysis It is useful as a probe for detecting offspring expression. Described in detail below To detect changes in T1R-like ligand II gene expression in specific tissues May be indicative of a particular disorder.   The present invention further provides fragments of the isolated nucleic acid molecules described herein. About. The nucleotide sequence of the deposited cDNA or as shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) By a fragment of the isolated nucleic acid molecule having the nucleotide sequence As discussed herein, useful as diagnostic probes and primers Some are at least about 15 nt in length, and more preferably at least about 20 nt in length. More preferably at least about 30 nt, and even more preferably at least About 40 nt is intended. Naturally, larger fragments 50-12 00nt is also the nucleotide sequence of the deposited cDNA, or shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1). Correspond to most if not all of the nucleotide sequences as shown in Like fragments that are useful according to the invention. For example, if the length is small Nucleotide sequence of the deposited cDNA, also by the 20 nt fragment, or figure 20 or more adjacent salts from the nucleotide sequence as shown in SEQ ID NO: 1 (SEQ ID NO: 1) Fragments containing groups are contemplated. This gene has been deposited and is shown in FIG. The nucleotide sequence shown in No. 1) is provided, such DNA Generating fragments is routine for those skilled in the art. For example, Nuclease cutting or shearing by sonication can be performed with various sizes of flags. Can be easily used to generate the Or such a fragment Can be generated synthetically.   Preferred nucleic acid fragments of the invention include nucleic acid molecules that encode: T1 Polypeptide containing R-like ligand II extracellular domain (about 2 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1)) Polypeptides containing T1R-like ligand II transmembrane domain (From about 195 to about 217 amino acid residues in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1)); and T1R-like Riga And a polypeptide containing the intracellular domain of intracellular II (from about 218 to about 2 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2)). 29 amino acid residues); with all or part of the deleted transmembrane domain Polypeptide having extracellular and intracellular domains. The present invention More preferred nucleic acid fragments are epitopes of the T1R-like ligand II protein. A nucleic acid molecule encoding the carrier-bearing moiety. In particular, FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) The present inventors have determined that it is the antigenic region of the T1R-like ligand II protein) An isolated nucleic acid molecule encoding a polypeptide containing the following amino acid residues in Provided: a polypeptide comprising about 43 to about 52 amino acid residues in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) A polypeptide comprising about 82 to about 98 amino acid residues in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2); 1 (SEQ ID NO: 2) comprising a polypeptide comprising about 129 to about 146 amino acid residues; A polypeptide comprising about 162 to about 175 amino acid residues in SEQ ID NO: 2); and about 18 A polypeptide comprising 1 to about 197 amino acid residues. Other T1R-like ligand II proteins Methods for determining such epitope-bearing portions of are described in detail below. It is.   In another aspect, the invention relates to stringent hybridization conditions. In some cases, the nucleic acid molecule of the present invention described above (for example, the cDN contained in ATCC Deposit No. 97655) A) Polynucleotide that hybridizes to a part of the polynucleotide in Provided, comprising an isolated nucleic acid molecule comprising: "Stringent hybridization Solution (50% formamide, 5 × SSC (150 mM NaCl, 15 mM trisodium citrate), 50 mM sodium phosphate (pH 7. 6), 5 × Denhardt's solution, 10% dextran sulfate, and 20 μg / ml denatured sheared salmon sperm D NA) overnight incubation at 42 ° C in 0. 1 × SSC It is intended to clean the filter. Hybridize to "part of" polynucleotide Depending on the polynucleotide soyed, at least about 15 nucleotides (nt), and more preferably at least about 20 nt, even more preferably Or at least about 30 nt, and even more preferably about 30-70 nt. The polynucleotide (either DNA or RNA) to be amplified is contemplated. They are Diagnostic probes and primers as discussed in more detail above, and below. Useful as a marker.   It will be appreciated that the reference polynucleotide (eg, the deposited cDNA clone) Part) (for example, a 100-750 nt length) or reference poly Polynucleotides that hybridize to the full length of the nucleotide also The nucleotide sequence of the deposited cDNA or a nucleotide sequence as shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1). Polynucleotides that correspond to most, if not all, of the nucleotide sequences Thus, it is useful as a probe according to the present invention. For example, "Length at least The 20nT "polynucleotide portion allows the nucleoside of the reference polynucleotide to be Pide sequences (eg, the deposited cDNA, or as shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1)) Or more contiguous nucleotides from the same nucleotide sequence is contemplated. Show As such, such portions may be made in accordance with conventional DNA hybridization techniques. As probes or as described, for example, in Sambrook, J .; Ed., Molecular Cloning, ALa boratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Sprin g Harbor, NY (1989) Polymerase chain reaction (PCR) target Diagnostically useful either as a primer for sequence amplification.   A T1R-like ligand II cDNA clone has been deposited and the determined Since the reotide sequence is provided in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1), the T1R-like ligand IIc Generating polynucleotides that hybridize to a portion of a DNA molecule is an art. Everyday to the person. For example, the restriction endonuclease of a T1R-like ligand II cDNA clone Aase cleavage or ultrasonic shearing can cause some T1R-like ligand II cDNA molecules to To produce DNA fragments of various sizes that are polynucleotides to be hybridized Can be used easily. Alternatively, the hybridizing polynucleotide of the invention Can be produced synthetically according to known techniques.   Naturally, the TIR-like sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) 3 (terminal poly (A) adduct of ligand II cDNA) or T (or U) complementary The polynucleotide that hybridizes to the stretch is a part of the nucleic acid of the present invention. Not included in the polynucleotide of the present invention used to hybridize to . Because such a polynucleotide may have a poly (A) extension or its complement. To any nucleic acid molecule (eg, virtually any double-stranded cDNA clone) To   As shown, the nucleic acid molecule of the invention encoding T1R-like ligand II comprises: Including, but not limited to: by itself, the amino acid of the mature polypeptide A nucleic acid molecule encoding an acid sequence; the coding sequence for the mature polypeptide and further Sequences (eg, sequences encoding about 26 amino acid leader sequences) (eg, Protein sequence or proprotein sequence or preproprotein sequence); The coding sequence of the mature polypeptide, including or including the additional coding sequence described above. First, they are assembled with additional non-coding sequences, which are composed of introns and And non-coding 5 ′ and 3 ′ sequences (eg, transcription, mRNA processing (splicing) And polyadenylation signals (eg, ribosome binding and mRNA stability) Transcribed and untranslated sequences that play a role in Additional codes encoding additional amino acids to provide additional functionality Array. Thus, for example, a sequence encoding a polypeptide may have a marker sequence (eg, For example, a sequence encoding a peptide that facilitates purification of the fused polypeptide) Can be fused. In certain preferred embodiments of this aspect of the invention, the marker The amino acid sequence may be a hexa-histidine peptide (eg, a pQE vector (especially , Qiagen, Inc. ), Many of which are public and / or Or commercially available). See, for example, Gentz et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 821-824 (1989). Provides convenient purification of proteins. The “HA” tag is for influenza hemagglutinin (HA) Another peptide useful for purification corresponding to the protein-derived epitope And it is described by Wilson et al., Cell 37: 767 (1984). Other A fusion protein such as T1R-like ligand I fused to Fc at the N- or C-terminus I proteins or fragments thereof.   The invention further relates to a portion, analog, or derivative of a T1R-like ligand II protein. The present invention relates to a variant of the nucleic acid molecule of the present invention which encodes a conductor. Mutants are natural alleles Like a gene variant, it can occur naturally. "Allelic variants" One of several interchangeable forms of a gene occupying a given locus on a chromosome Intended. Non-naturally occurring variants can be obtained, for example, by mutagenesis techniques known in the art. Can be generated using   Such variants are generated by nucleotide substitutions, deletions, or additions. Mutants. Substitutions, deletions, or additions may involve one or more nucleotides You. Variants can be altered in the coding or non-coding region, or both. obtain. Mutations in the coding region can be conservative or non-conservative amino acid substitutions, deletions , Or an addition. Particularly preferred among these are silent substitutions. , Additions, and deletions, which are characteristic of T1R-like ligand II or a portion thereof. And does not change activity. Particularly preferred in these respects is the storability. Permutation.   A further embodiment of the present invention relates to (a) the complete amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). No acid sequence (including leader) or contained in ATCC accession number 97655 Nucleic acid encoding full-length T1R-like ligand II encoded by a cDNA clone Otide sequence; (b) amino acid sequence from about position 27 to about position 229 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) Or the cDNA clone contained in ATCC Accession No. 97655 Mature T1R-like ligand II (full length polypeptide with the leader sequence removed) Encoding nucleotide sequence; (c) from about position 27 to about 194 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) CDNA sequence having the amino acid sequence of position 1 or contained in ATCC accession number 97655 Encoding the T1R-like ligand II extracellular domain encoded by the Otide sequence; (d) amino acid sequence from about position 195 to about position 217 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) Or cloned by the cDNA clone contained in ATCC Accession No. 97655. A nucleotide sequence encoding the T1R-like ligand II transmembrane domain to be loaded; (e) Has the amino acid sequence from about position 218 to about position 229 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2); Or a T1R-like library encoded by a cDNA clone contained in ATCC accession number 97655. A nucleotide sequence encoding a Gand II intracellular domain; or (f) (a), (b), ( Nucleotide complementary to any of the nucleotide sequences of c), (d), or (e) Has a nucleotide sequence at least 90% identical to the nucleotide sequence, and is more preferably Or at least 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical nucleotide sequence. An isolated nucleic acid molecule comprising a polynucleotide having the same.   A reference nucleotide sequence encoding a T1R-like ligand II polypeptide and at least May also be, for example, a polynucleotide having a 95% "identical" nucleotide sequence. The polynucleotide sequence encodes a T1R-like ligand II polypeptide That each nucleotide in the nucleotide sequence can contain up to 5 mutations. Except that the nucleotide sequence of the polynucleotide is identical to the reference sequence. Intended. In other words, at least 95% identical to the reference nucleotide sequence In order to obtain a polynucleotide having a nucleotide sequence, 5 Up to% nucleotides can be deleted or replaced with another nucleotide Or a large number of nucleotides up to 5% of the total nucleotides in the reference sequence Can be inserted into the reference sequence. These mutations in the reference sequence are At the 5 'or 3' end of the sequence or within nucleotides within the reference sequence Or in one or more contiguous groups within the reference sequence, It can occur anywhere between these terminal positions.   In practice, any particular nucleic acid molecule may be, for example, a nucleotide sequence as shown in FIG. At least 90%, 95%, in the nucleotide sequence of the sequence or deposited cDNA clone, 96%, 97%, 98%, or 99% identity is determined by the BESTFIT program (Wisc onsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer G roup, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711) It can be determined conventionally using such known computer programs. BEST FIT is described in Smith and Waterman, Adv. Appl. Math. 2: 482-489 (1981) local homology A sex algorithm is used to find the best segment of homology between the two sequences. Using BESTFIT or any other sequence alignment program, if a particular sequence is For example, to determine if it is 95% identical to a reference sequence according to the invention, the parameters Is, of course, the percent identity calculated over the entire length of the reference nucleotide sequence. And in homology up to 5% of the total nucleotide number of the reference sequence It is set so that caps are allowed.   The present application encodes a polypeptide having T1R-like ligand II protein activity. At least 90%, 95%, 96%, 97%, 98% % Or 99% identical nucleic acid molecules. This is because the specific nucleic acid molecule is T1R-like Even if they do not encode a polypeptide with ligand II activity, one of skill in the art How the acid molecule can be used, for example, in a hybridization probe or Because you still know whether to use it as a primer for the remerase chain reaction (PCR) . Nucleic acid molecules of the invention that do not encode a polypeptide having T1R-like ligand II activity The use of (1) T1R-like ligand II gene or its allelic variation Isolating the body from a cDNA library; (2) Verma et al., Human Chromosomes: a Ma T1R, described in the Manual of Basic Techniques, Pergamon Press, New York (1988) Metaphase chromosome spread to provide precise chromosomal location of ligand II gene In situ hybridization to (eg, "FISH"); and (3) Northern blocks to detect T1R-like ligand II mRNA expression in specific tissues Analysis.   However, in practice, polypeptides having T1R-like ligand II protein activity At least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% Nucleic acid molecules having sequences that are% identical are preferred.   By "polypeptide having T1R-like ligand II protein activity", The T1R-like ligand II protein of the invention, when measured in a biological assay Polypeptide exhibiting an activity similar (but not necessarily identical) to the quality activity Is intended. T1R-like ligand II activity was determined using a known receptor binding assay. (Mitcham, J. L. J. Biol. Chem. 271: 5777-5783 (1996); and Gayle, M. A. J. Biol. Chem. 271: 5784-5789 (1996)). These assays are based on NF-κ B gel shift assay, in vitro Thr-669 kinase assay, and IL-8 promoter Includes a protein activation assay.   To perform these assays, first a mammalian cell is loaded with the appropriate receptor. Must be transfected with an expression vector containing the cDNA for the cDNA. For example Expression vectors containing cDNA for the T1 / ST2 receptor can be used. This cDNA Can be obtained as described. (Klemenz R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 8 6: 5708-5712 (1989); Tominaga, S. , FEBS Lett. 258: 301-304 Bergers, G. EMBO J. 13: 1176-1188)). Alternatively, T1 / ST2 cDNA is amplified using the polymerase chain reaction. Can be widthed. Appropriate tissues or cell types (e.g., NIH-3T3 cells (Klemenz, R. Pro c, Natl. . Acad. Sci. U. S. A. 86: 5708-5712 (1989)). A cDNA library can be used as a template. Any known to those skilled in the art Using several transfection methods, the appropriate cell line (eg, COS 7 Vesicles) can be transfected with the T1 / ST2 expression plasmid. Receptor expression Can be confirmed by radioimmunoassay (Mitcham, J. L. J. Biol. Chem. 271: 5777-5783 (1996)). 1-3 days after transfection, Fluent, transfected COS7 cells produce 1-10 ng of T1R-like ligand II protein. Stimulated for 15 minutes to 2 hours. Sustained stimulation by T1R-like ligand II protein The time will vary depending on which assay is used, and for routine experiments Can be determined using only   To perform the NF-κB assay, nuclear extracts from transfected cells were Prepared immediately after stimulation (Ostrowski, J. et al. J. Biol. Chem. 266: 12,722-12,733 (19 91)). Duplex containing NF-κB enhancer element derived from immunoglobulin κ light chain The synthetic oligonucleotide probe (5'TGACAGAGGGACTTTCCGAGAGGA 3 ') was labeled [γ-32 5 'end labeling by phosphorylation with [P] ATP. Nuclear extract (10 μg) Incubate with the radiolabeled probe for 0 min and allow the protein-DNA complex to Separated by electrophoresis on 5 × TBE, 10% polyacrylamide gel.   Transfected to perform the in vitro Thr-669 kinase assay A cytoplasmic extract of the isolated cells is prepared immediately after stimulation (Bird, T.A. et al., Cytokine 4 : 429-440 (1992)). 10 μl of the cell extract was mixed with 20 mM HEPES buffer (pH 7.4), 15 mM Mg ClTwo, 15 μM ATP, 75 μl / ml [γ-32P] ATP and 750 μM substrate peptide (remaining EGFR The reaction mixture is added to 20 μl of the reaction mixture containing the bases 663-673). Mixture replaces peptide And incubated with distilled water. Incubation at 30 ° C for 20 minutes Later, the reaction is terminated by the addition of formic acid. Reaction cleared by centrifugation And 30 μl of the supernatant are spotted on phosphocellulose filter paper discs. After washing (3 times with 75 mM orthophosphoric acid) and drying, the Is measured by monitoring the Cherenkov count. Result is Detected in unstimulated cells compared to the activity detected in stimulated cells It is expressed as a percentage of the Thr-669 kinase activity.   To perform the IL-8 promoter activation assay, COS7 cells (multiwell 1 × 10 per well in tissue culture plateFiveCells) from T1 / ST2 receptor Co-transfected with the current vector and the pIL8p reporter plasmid (Mi tcham, J.L. et al., J. Biol. Chem. 271: 5777-5783 (1996)). Transfection 1 One day later, the medium is changed and cells are stimulated or punctured with 1 ng / ml IL-1α. Either not intensified. 12-16 hours after stimulation, cells are 5% (w / v) non-fat Wash twice with binding medium containing fat dried milk (5% MBM) and add 2 ml of 5% MBM Block for 30 minutes at room temperature. The cells are then 1 μg for 60-90 minutes at room temperature. 5% MBM containing 1.5 ml / ml anti-IL-2Rα antibody (R & D Systems, Minneapolis, MN) And shake with gentle shaking. Cells are 5% MBM Washed once and diluted 1: 100125I goat anti-mouse IgG (Sigma, St. Louis, MO) With 1 ml / well of 5% MBM containing for 60 minutes at room temperature. We Are washed four times with 5% MBM and twice with phosphate buffered saline. Well Is 1 ml of 0. Peel off by the addition of 5M NaOH and measure the total count. Results are total cp averaged over two duplicate wells or three triple wells Expressed as m.   Therefore, "a polypeptide having T1R-like ligand II protein activity" Contains polypeptides that exhibit T1R-like ligand II protein activity in assays for .   Of course, due to the degeneracy of the genetic code, those skilled in the art Multiples having sequences that are 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical The nucleic acid molecule encodes a polypeptide having “T1R-like ligand II protein activity”. Immediately recognize that In fact, degenerate variants of these nucleotide sequences Perform the comparative assay described above, since all encode the same polypeptide. Even without doing it will be apparent to the skilled person. Such nucleic acid components that are not degenerate variants For a child, a reasonable number also encodes a polypeptide having T1R-like ligand II activity. Is recognized in the art. This means that those skilled in the art Is likely to affect the function of the Any amino acid substitution (eg, one aliphatic amino acid in a second aliphatic (Substitution with an amino acid).   For example, how to make phenotypically silent amino acid substitutions. Guidance is provided by Bowie, J. U. Et al., Science 247: 1306-1310 (1990). Here the authors report two primary approaches to study tolerance to amino acid sequence changes. Shows that there is a unique approach. The first depends on the process of evolution, Here, the mutation is either accepted or rejected by natural selection. The second approach introduces amino acid changes at specific positions in the cloned gene Genetic engineering, and select or switch to identify sequences that maintain function. Use cleaning. As the authors state, these studies show that protein Have shown that they are surprisingly tolerant of amino acid substitutions. The authors Investigate whether an amino acid change is likely to be permissive at a particular position in the protein. Is shown in For example, most buried amino acid residues require nonpolar side chains. On the other hand, the properties of surface side chains are generally poorly conserved. Other like this Phenotypically silent substitutions are described in Bowie, J .; U. Et al., Cited above and in it. Described in references.   Vectors and host cells   The present invention also relates to a vector comprising the isolated DNA molecule of the present invention, a recombinant vector. Genetically engineered host cells, and recombinant T1R-like ligand II polypeptides For the production of a peptide or a fragment thereof.   Recombinant constructs can be used for infection, transduction, transfection, trans Well known techniques such as transvection, electroporation, and transformation It can be introduced into host cells using techniques. Vectors include, for example, phage vectors, Plasmid vector, viral vector, or retroviral vector obtain. Retroviral vectors can be replicable or replication-defective. the latter In this case, propagation of the virus generally occurs only in complementing host cells.   The polynucleotide is a vector comprising a selectable marker for propagation in a host. Can be combined. Generally, a plasmid vector contains a calcium phosphate precipitate. It is introduced in such a precipitate or in a complex with a charged lipid. vector If is a virus, the vector is imported using the appropriate packaging cell line. It can be packaged in vitro and then transduced into host cells.   Vectors containing a cis-acting control region for the polynucleotide of interest are preferred. No. Suitable trans-acting factors can be supplied by the host or Supplied by the vector, or supplied by the vector itself upon introduction into the host. Can be paid.   In certain preferred embodiments in this regard, the vector is inducible and And / or to provide specific expression which may be cell type specific. Vector like this Particularly preferred vectors among are those that can be manipulated such as temperature and nutrient additives. It is a vector that is easily induced by environmental factors.   Expression vectors useful in the present invention include chromosomal vectors and episomal vectors. And virus-derived vectors (eg, bacterial plasmids, Virus, yeast episome, yeast chromosome element, virus (eg, baculo Virus, papovavirus, vaccinia virus, adenovirus, trypock Virus, pseudorabies virus, and retrovirus) And vectors derived from combinations thereof (eg, cosmids and furs). Diimide).   The DNA insert is compatible with a suitable promoter (eg, to name a few Di λPL promoter, E. coli lac promoter, trp promoter, and tac promoter Motor, SV40 early and late promoters, and retroviruses. Irs LTR). Other suitable Motors are known to those skilled in the art. The expression constructs further include transcription initiation, transcription termination. Includes a site for ligation and a ribosome binding site for translation in the transcribed region . The coding portion of the mature transcript expressed by the construct A stop cod that contains the transcription initiation AUG at the beginning of the peptide and is properly positioned at the end Including   As indicated, the expression vector preferably comprises at least one selectable marker. including. Such markers include dihydro leaf for eukaryotic cell culture. Acid reductase or neomycin resistance, and E. coli and other bacteria For culture, tetracycline resistance genes or ampicillin resistance genes were listed. I can do it. Representative examples of suitable hosts include bacterial cells (e.g., E. coli). coli cells, Streptomyces cells, and Salmonella typhimurium cells); fungal cells (eg, yeast Mother cells); insect cells (eg, Drosophila S2 cells and Spodoptera Sf9 cells) Animal cells (eg, CHO cells, COS cells, and Bowes melanoma cells); Plant cells. Appropriate culture media and conditions for the above host cells are It is known in the art.   Among the preferred vectors for use in bacteria are pQE70, pQE60, and pQE-9. (Available from Qiagen); pBS vector, Phasescript vector, Bluescript vector PNH8A, pNH16a, pNH18A, pNH46A (available from Stratagene); and ptr Includes c99a, pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pR1T5 (available from Pharmacia) You. Among preferred eukaryotic vectors are pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, and And pSG (available from Stratagene); pSVK3, pBPV, pMSG, and pSVL (Pharmacic and pA2 (available from Qiagen). Other suitable vectors The parameters will be readily apparent to those skilled in the art.   Among known bacterial promoters suitable for use in the present invention are E. coli. coli lacI And lacZ promoter, T3 and T7 promoters, gpt promoter Promoter, λPR promoter and λPL promoter, and trp promoter included. Suitable eukaryotic promoters include the CMV immediate-early promoter, HSV Thymidine kinase promoter, early SV40 promoter and late SV40 promoter The retroviral LTR promoter (eg, Rous sarcoma virus (RSV) Promoters), as well as metallothionein promoters (eg, mouse meta Rothionein I promoter).   Introduction of the construct into host cells can be achieved by calcium phosphate transfection, DEAE Dextran-mediated transfection, cationic lipid-mediated transfection By electroporation, electroporation, transduction, infection or other methods Can be done. Such methods are described in Davis et al., Basic Methods in Molecular Biology ( 1986) in many standard laboratory manuals.   Transcription of a DNA encoding a polypeptide of the present invention by higher eukaryotes may be a vector Can be increased by inserting an enhancer sequence into the protein. Enhancers Acts to increase the transcriptional activity of the promoter in a given host cell type; It is always a cis-acting element of about 10-300 bp DNA. Examples of enhancers , SV40 enhancer, which is located 100-270 bp on the late side of the replication origin , Cytomegalovirus early promoter enhancer, late on the replication origin And adenovirus enhancers.   Into the lumen of the endoplasmic reticulum of the translated protein, into the periplasmic space, or into cells For secretion into the external environment, an appropriate secretion signal is added to the expressed polypeptide Can be incorporated. The signal can be endogenous to the polypeptide, or Or they can be heterologous signals.   Thus, the polypeptide is expressed in an altered form, such as a fusion protein. And may contain not only secretion signals but also additional heterologous functional regions. An example For example, additional amino acids, especially regions of charged amino acids, may be purified in host cells. To improve stability and durability during or during subsequent operations and storage To the N-terminus of the polypeptide. In addition, the peptide part facilitates purification Can be added to the polypeptide to Such a region is a region of the polypeptide It can be removed before final preparation. Stability, especially due to secretion or excretion To the polypeptide of the peptide moiety to improve purification and to facilitate purification The addition of is well known in the art and is a routine technique. preferable Fusion proteins are heterologous regions derived from immunoglobulins that are useful for solubilizing proteins. including. For example, EP-A-0 464 533 (Canadian correspondence application 2045869) discloses another human protein. It contains various parts of the constant region of the immunoglobulin molecule together with the protein or part thereof. A fusion protein is disclosed. In many cases, the Fc portion of the fusion protein And is of great advantage for use in diagnostics, thus, for example, with improved pharmacokinetics. Produces morphological properties (EP-A 0232 262). On the other hand, for some uses, fusion tags The protein was expressed, detected, and purified in the advantageous manner described. It is desirable that the Fc portion can be deleted later. This means that the Fc part is If the fusion protein proves to be an obstacle to use in If it is to be used as an antigen). In drug discovery, for example, hIL-5 Human proteins, such as, are high-throughput techniques for identifying hIL-5 agonists. It has been fused with an Fc portion for the purpose of a cleaning assay. D. Bennett et al., Journal  of Molecular Recognition Vol. 8 52-58 (1995), and K. Johanson et al., The Jou rnal of Biological Chemistry Vol. 270, No. 16, pages 9549-9471 (1995) When.   T1R-like ligand II is prepared by ammonium sulfate precipitation or ethanol precipitation, acid extraction, anion or Indicates cation exchange chromatography, phosphocellulose chromatography, Aqueous interaction chromatography, affinity chromatography, hydro Including xiapatite chromatography and lectin chromatography It can be recovered from recombinant cell culture and purified by well known methods. most Preferably, high performance liquid chromatography ("HPLC") is used for purification. You.   The polypeptides of the present invention can be obtained from natural purified products, products of chemical synthetic procedures, and prokaryotic Biological or eukaryotic hosts (eg, bacterial cells, yeast cells, higher plant cells, Insect cells, and mammalian cells). Including. Depending on the host used in the recombinant production procedure, the polypeptides of the invention Can be glycosylated or non-glycosylated. In addition, The clear polypeptide may also be opened in some cases as a result of a host-mediated process. An initial modified methionine residue may be included. T1R-like ligand II polypeptides and peptides   The present invention further provides an amino acid sequence encoded by the deposited cDNA, Is an isolated T1R-like ligand II polypeptide having the amino acid sequence of FIG. Peptide, or peptide or polypeptide containing a part of the above polypeptide I will provide a. The terms “peptide” and “oligopeptide” (commonly recognized ) Is considered synonymous, and each term is contextually linked by peptide bonds Exchangeable if needed to indicate a chain of at least two amino acids Can be used. The term "polypeptide" refers to a chain containing more than 10 amino acid residues. As used herein. All oligopeptides and polypeptides herein The peptide formula or sequence is from left to right and from the amino terminus to the carboxy terminus. Written in the direction.   By an "isolated" polypeptide or protein from its natural environment An isolated polypeptide or protein is contemplated. For example, in a host cell Recombinantly produced polypeptides and proteins expressed in h and Johnson, Gene 67: 31-40 (1988). Natural or recombinant polypeptides and proteins that have been substantially purified by the technique. As with proteins, it is considered isolated for the purposes of the present invention.   Some amino acid sequences of T1R-like ligand II It is recognized in the art that modifications can be made without significantly affecting function. Arrangement If such differences in columns are intended, the important area of the protein that determines activity Remember that territory exists. Generally, the remaining functions that perform similar functions If a group is used, substitution of residues forming a tertiary structure is possible. In another example And the type of residue is crucial if the change occurs in a non-critical region of the protein Maybe not.   Accordingly, the present invention further provides substantial T1R-like ligand II activity, or T1R-like ligands containing regions of T1R-like ligand II such as the protein portions discussed below Includes variants of Gand II. Such variants include deletions, insertions, inversions, repetitions, and And type substitutions (eg, substitution of a hydrophilic residue for another, but usually (Aqueous residues are not replaced by strongly hydrophobic residues). Small changes, or this Such "neutral" amino acid substitutions generally have little effect on activity.   Typically seen as conservative substitutions are the aliphatic amino acids Ala, Val, Leu, and I substitution of one amino acid for another in le; hydroxyl residues Ser and Exchange of Thr and Thr, exchange of acidic residues Asp and Glu, substitution between amide residues Asn and Gln With the exchange of the basic residues Lys and Arg, and the substitution between the aromatic residues Phe, Tyr is there.   As detailed above, which amino acid changes are phenotypically silent Probable (ie, likely to have a significant detrimental effect on function) Further guidance on Bowie, J. U. Et `` Deciphering the Message in Pr otein Sequences: Tolerance to Amino Acid Substitutions, '' Science 247: 13 06-1310 (1990).   The polypeptide of the present invention is encoded by the deposited cDNA comprising a leader sequence. From the polypeptide encoded by the deposited cDNA, Figure 1 including the leader-free polypeptide (ie mature protein) and leader The polypeptide of FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) excluding the polypeptide of (SEQ ID NO: 2) and leader Peptide, T1R-like ligand II extracellular domain, T1R-like ligand II transmembrane domain, and And T1R-like ligand II intracellular domain, and at least 9 0% similarity, more preferably at least 95% similarity, and even more preferably Or polypeptides having at least 96%, 97%, 98%, or 99% similarity including. Further, the polypeptide of the present invention, the polypeptide described herein, At least 80% identical, more preferably at least 90% or 95% identical, and even more More preferably, polypeptides that are at least 96%, 97%, 98%, or 99% identical And also at least 30 amino acids, and more preferably at least Includes portions of such polypeptides having 50 amino acids.   The "% similarity" between two polypeptides allows the BESTFIT program (W isconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Compute r Group, University Resarch Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711) And two defaults using a default setting to determine similarity. The similarity score generated by comparing the amino acid sequences of the polypeptides is intended Is done. BESTFIT is described in Smith and Waterman, Adv. Appl. Math. 2: 482-489 (1981) Local homology algorithm to find the best segment of similarity between two sequences Use to get out.   At least a reference amino acid sequence of a T1R-like ligand II polypeptide, e.g., 95 % Polypeptide having a "identical" amino acid sequence Up to 5 for each 100 amino acids of the reference amino acid sequence of the R-like ligand II polypeptide Except that it may include amino acid changes, the amino acid sequence of the polypeptide is the reference sequence. It is intended to be identical to In other words, at least the reference amino acid sequence To obtain a polypeptide having an amino acid sequence that is 95% identical to the reference sequence, Up to 5% of amino acid residues can be deleted or replaced with another amino acid Or a number of amino acids of up to 5% of the total amino acid residues in the reference sequence Can be inserted into a column. These reference sequence modifications are based on the amino terminus of the reference amino acid sequence. Position or at the carboxy-terminal position, or within the reference sequence or one within the reference sequence Between these terminal positions individually scattered anywhere between the residues in these close groups Somewhere, it can happen.   In fact, any particular polypeptide may be, for example, as shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). Amino acid sequence or amino acid encoded by the deposited cDNA clone At least 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical to the sequence The best fit program (Wisconsin Sequence Analysis Package, Ve rsion 8 Unix version, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 S publicly known computer programs such as cience drive, Madison, WI 53711) Can be determined conventionally. A particular sequence may be, for example, a reference sequence of the invention. Bestfit or any other sequence alignment to determine if it is 95% identical When using an infusion program, the percentage identity is, of course, Calculated over the entire length of the sequence and up to 5% of the total number of amino acid residues in the reference sequence The parameters are set such that a gap in homology at is allowed.   As described in detail below, the polypeptides of the invention may be T1R-like as described below. Useful in diagnostic assays to detect ligand II expression, or T1R And antago that can enhance or inhibit the function of liposome-like ligand II protein To raise polyclonal and monoclonal antibodies Can be used. In addition, such polypeptides may be used as candidate agonists of the invention. To "capture" T1R-like ligand II binding proteins that are also antagonists For use in yeast two-hybrid systems. Yeast two hybrid Field systems are described in Fields and Song, Nature 340: 245-246 (1989). You.   In another aspect, the invention provides an epitope-bearing portion of a polypeptide of the invention. Or a peptide or polypeptide comprising: Epitope of this polypeptide The moieties are immunogenic or antigenic epilobes of a polypeptide of the invention. An "immunogenic epitope" is one that elicits an antibody response when the entire protein is the immunogen. Defined as part of the evolving protein. These immunogenic epitopes It is believed to be limited to a few focuses on the child. On the one hand, antibodies can bind The region of the protein molecule that is described can be defined as an "antigenic epitope." protein Is generally less than the number of antigenic epitopes. For example, Geysen, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 3998-4002 (1984) checking ...   A peptide or polypeptide bearing an antigenic epitope (ie, an antibody (Including regions of protein molecules that can bind). Relatively short synthetic peptide mimicking part reacts with partially mimicked protein It is well known in the art that antisera can be routinely induced. For example, Sutcli ffe, J. G. See Science 219: 660-666 (1983). Protein-reactive serum Are often represented in the primary sequence of the protein, and Can be characterized by a simple set of chemical laws, and The immunodominant region of the protein (ie, the immunogenic epitope) also has an amino-terminal Nor is it limited to the carboxyl terminus. Extremely hydrophobic peptides and Peptides with up to 6 residues are generally used to induce antibodies that bind to the mimetic protein. Longer, soluble peptides, especially those containing proline residues, , Is usually effective. Sutcliffe et al., Supra, 661. For example, these guidelines Out of 20 peptides designed according to (influenza virus hemagglutination (Including 8-39 residues covering 75% of the sequence of the native HA1 polypeptide chain) Or induced antibodies that react with intact virus; and MuLV polymerase 12/12 peptide from rabies glycoprotein and 18/18 from rabies glycoprotein Antibodies that precipitate proteins were induced.   The antigenic epitope-bearing peptides and polypeptides of the present invention are therefore Elicit antibodies, including monoclonal antibodies, that specifically bind to a polypeptide of the invention Useful to do. Thus, a domain immunized with an antigenic epitope-bearing peptide Most of the hybridomas obtained by fusion of spleen cells from Secretes antibodies that are reactive with natural proteins. Sutcliffe et al., Supra, 663. antigen Antibodies elicited by a neutral epitope-bearing peptide or polypeptide mimic Useful for detecting proteins, and antibodies against different peptides Follow the path of various regions of the protein precursor undergoing post-translational processing Can be used for In immunoprecipitation assays, short peptides (eg, about 9 Even amino acids) can bind and displace longer peptides. Thus, peptides and anti-peptide antibodies may be used in various assays for mimetic proteins. It can be used in sexual or quantitative assays, such as competitive assays. An example For example, Wilson, I. A. See Cell 37: 767-778 (1984) 777. The present invention Peptide antibodies can also be used to purify mimetic proteins (eg, using methods well known in the art). Used by adsorption chromatography).   Antigenic epitope-bearing peptides of the invention designed according to the above guidelines The tides and polypeptides are preferably within the amino acid sequence of the polypeptides of the invention. At least 7, more preferably at least 9, and most preferably It includes sequences between about 15 and about 30 amino acids. However, the amino acids of the polypeptides of the invention The book, comprising any length and up to about 30 to about 50 amino acids or the entirety of the acid sequence. Peptides or polypeptides comprising a greater part of the amino acid sequence of the polypeptide of the invention Tides are also considered to be epitope-bearing peptides or polypeptides of the invention. And is also useful for inducing antibodies that react with the mimetic protein. Preferably, the amino acid sequence of the epitope-bearing peptide is substantially (Ie, the sequence is relatively hydrophilic) And highly hydrophobic sequences are preferably avoided); and the proline residue Sequences containing groups are particularly preferred.   Can be used to produce T1R-like ligand II-specific antibodies or fragments Non-limiting examples of antigenic polypeptides include about 43 to about 43 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). A polypeptide comprising about 52 amino acid residues; from about 82 to about 82 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). A polypeptide comprising 98 amino acid residues; from about 129 to about 1 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). A polypeptide comprising 46 amino acid residues; from about 162 to about 1 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). A polypeptide comprising 75 amino acid residues; and about 18 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2). Polypeptides containing from 1 to about 197 amino acid residues are included. As shown above In addition, the present inventors have determined that the above polypeptide fragment It was determined to be a region of origin.   Epitope-bearing peptides and polypeptides of the invention are nucleic acid molecules of the invention. For producing peptides or polypeptides including recombinant means using Can be produced by conventional means. For example, a short epitope-bearing amino acid sequence Has been approved during recombinant production and purification, and for the production of anti-peptide antibodies. During epidemiology, it can be fused to a larger polypeptide that acts as a carrier. D Pitope-bearing peptides can also be synthesized using known methods of chemical synthesis. . For example, Houghten was prepared and characterized in less than four weeks (ELISA- Single amino acid variant of a segment of the HA1 polypeptide (by type-binding studies) Shows the synthesis of multiple peptides such as 10-20 mg of 248 different 13 residue peptides An easy way to do that is described. Houghten, R. A. , Proc. Natl. Acad. Sci. U SA 82: 5131-5135 (1985). This "Simultaneous Multiple Peptide Synthesis ( The SMPS) process is further described in US Patent No. 4,631,211 to Houghten et al. (1986). Will be posted. In this procedure, the individual resins for solid phase synthesis of various peptides are: Many identical iterative steps involved in solid phase methods, contained in separate solvent permeable packets Enables optimal use of Complete manual procedures require more than 500-1000 synthesis Allow them to be done simultaneously. Houghten et al., Supra, 5134.   The epitope-bearing peptides and polypeptides of the present invention can be prepared by methods known in the art. Used to induce antibodies by the method. For example, Sutcliffe et al., Supra; Wil. son et al., supra; Chow, M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82: 910-914; and Bi ttle, F. J. J. et al. Gen. Virol. 66: 2347-2354 (1985). Generally Animals can be immunized with free peptide; however, anti-peptide antibody titers can be To a polymer carrier (eg, keyhole limpet hemocyanin (KLH)) Can be boosted by coupling to tetanus toxoid. For example , A cysteine containing peptide is m-maleimidobenzoyl-N-hydroxys Coupling to carriers using linkers such as succinimide esters (MBS) Other peptides may be more common, such as glutaraldehyde. It can be coupled to a carrier using a linking agent. Rabbit, rat, and rabbit C Animals, either free or carrier-coupled peptides, For example, about 100 μg of peptide or carrier protein and Freund's adjuvant Immunized by intraperitoneal and / or intradermal injection of an emulsion containing bunt . Some booster injections use, for example, free peptide adsorbed on a solid surface. To provide useful titers of anti-peptide antibodies that can be detected by an ELISA assay For example, it may be required at intervals of about two weeks. In serum from immunized animals The titer of the anti-peptide antibody can be determined, for example, by the selection of the anti-peptide antibody. Adsorption to Peptides on Solid Supports and Selection of Selected Antibodies It can be increased by elution.   The immunogenic epitope-bearing peptide of the invention, ie, the entire protein If immunogenic, the portion of the protein that elicits the antibody response is known in the art. Identified by the method of For example, Geysen et al. (1984) supra provide an enzyme-linked immunosorbent. Hundreds of peptides that are pure enough for the reaction in the A procedure for rapid simultaneous synthesis is disclosed. The interaction of the synthetic peptide with the antibody then They are easily detected without removing them from the support. In this style, Peptides bearing an immunogenic epitope of the desired protein are routinely available to those of skill in the art. Can be identified. For example, immunology of foot-and-mouth disease virus coat protein Critical epitopes are all 208 that cover the entire 213 amino acid sequence of the protein. Geys by elucidation of 7 amino acids by synthesis of overlapping sets of possible hexapeptides Positioned by en et al. Then all 20 amino acids are in turn within the epitope A complete substitution set of peptides substituted at each position is synthesized and reacted with the antibody. Specific amino acids that confer specificity for response have been determined. Therefore, the epi of the present invention Peptide analogs of the tope-bearing peptide are routinely made by this method. obtain. Geysen (1987) US Pat. No. 4,708,781 discloses an immunogen for a desired protein. This method of identifying a peptide bearing a sexual epitope is further described.   Still further, Geysen (1990) US Pat. No. 5,194,392 describes the identification of antibodies of interest. Topological equivalent of an epitope that is complementary to the paratope (antigen binding site) of Escherichia coli Of monomers (amino acids or other compounds) that are (ie, “mimotopes”) A general method for detecting or determining a sequence is described. More generally, Geysen (1989) U.S. Pat. No. 4,433,092 discloses ligand binding of a particular receptor of interest. Detect or determine the sequence of monomers that are topologically equivalent to a ligand that is complementary to the site How to do it. Similarly, Ho in Peralkylated Oligopeptide Mixtures ughten, R.A. A. (1996) US Pat. No. 5,480,971 discloses a linear C1-C7-Alkyl Peralkylated oligopeptides and sets and such peptides Library that binds preferentially to the acceptor molecule of interest. To determine the sequence of the alkylated oligopeptide, such an oligopeptide And methods of using libraries. Therefore, the epitope of the present invention -Non-peptide analogs of retained peptides are also routinely made by these methods Can be done.   The entire disclosure of each document cited in this section of "Polypeptides and peptides" is , Hereby incorporated by reference herein.   As those skilled in the art will appreciate, the T1R-like ligand II polypeptides of the present invention and Its epitope-bearing fragment is the constant domain of an immunoglobulin (IgG) To produce a chimeric peptide. These fusion proteins are purified And show increased half-life in vivo. This is, for example, human CD4- The first two domains of the polypeptide and the heavy chain or Is shown for a chimeric protein consisting of various domains of the constant region of the light chain. (EPA 394,827; Traunecker et al., Nature 331: 84-86 (1988)). By IgG part A fusion protein with a disulfide-bonded dimer structure can also bind other molecules. In combination and neutralization, monomeric T1R-like ligand II protein or protein May be more efficient than fragments alone (Fountoulakis et al., J. Biochem. 270: 3958-3964 (1995)). Diagnosis of T1R-like ligand II-related disorders   For T1R-like ligand II-related disorders, the “standard” T1R-like ligand II gene expression level (Ie, T1R-like ligands in tissues or fluids from individuals without disorders) Substantially increased (increased or decreased) as compared to Levels of T1R-like ligand II gene expression are collected from individuals with such disorders Tissue or other cells or body fluids (eg, serum, plasma, urine, synovial fluid, Cerebrospinal fluid). Therefore, the present invention provides a T1R-like ligand I Provide useful diagnostic methods during the diagnosis of I-related disorders. This is the tissue or Is the expression level of the gene encoding T1R-like ligand II in other cells or body fluids. Measuring gene expression levels and standard T1R-like ligand II Comparing with gene expression levels. Thereby, the gene compared to the standard An increase or decrease in expression levels is indicative of a T1R-like ligand II-related disorder .   T1R-like ligand II-related disorders include leukemia, lymphoma, arteriosclerosis, autoimmune diseases Disease, inflammatory disease, Alzheimer's disease, eye disease, apoptosis, delayed intrauterine growth But may include, but are not limited to, preeclampsia, pemphigus, and psoriasis. Not determined.   By individual is intended a mammalian individual, preferably a human. "T1R-like ligand I Measuring the expression level of the gene that encodes I Directly at the sample (eg, absolute protein or mRNA levels By measuring or evaluating) or relative (eg, a second biological sample) Comparing T1R-like ligand II protein levels or mRNA levels in Depending on the level of T1R-like ligand II protein or T1R-like ligand Qualitative or quantitative measurement of the level of mRNA encoding Evaluation is intended. Preferably, a T1R-like ligand in the first biological sample Is measured or evaluated, and the standard T1R Like ligand II protein level or mRNA level. Standards for obstacles Or a disorder obtained from a second biological sample obtained from an individual without Can be determined by the average level from a population of individuals who do not have In the field As assessed, once the standard T1R-like ligand II protein level or mRNA level Once the file becomes known, it can be used repeatedly as a standard for comparison.   Depending on the "biological sample", the individual, body fluid, cell line, tissue culture, or T1 Any source obtained from other sources, including R-like ligand II protein or mRNA A physical sample is intended. As shown, the biological sample is secreted Body fluids containing mature T1R-like ligand II (eg, serum, plasma, urine, synovial fluid, and Solution) or tissue supply found to express T1R-like ligand II protein Including source. Methods for obtaining tissue biopsies and body fluids from mammals are well known in the art It is. If the biological sample contains mRNA, tissue biopsy is the preferred source .   Total cellular RNA can be obtained using any suitable technique (eg, Chomczynski and Sacchi, Anal. Biochem. 162: 156-159 (1987), one-step guanidine-thiocyane Can be isolated from biological samples using the You. The level of mRNA encoding T1R-like ligand II can then be determined by any suitable method. And assayed using These include Northern blot analysis, S1 nuclease Combined with polymerase chain reaction (PCR), polymerase chain reaction Reverse transcription (RT-PCR) and reverse transcription combined with ligase chain reaction (RT-LCR) including.   Northern blot analysis is described in Harada et al., Cell 63: 303-312 (1990). It can be done as follows. Briefly, total RNA is prepared from biological samples as described above. Made. For Northern blots, RNA is prepared in an appropriate buffer (eg, Xyl / dimethylsulfoxide / sodium phosphate buffer). Gallose gel electrophoresis and transfer to nitrocellulose filter You. After the RNA is bound to the filter by the UV linker, the filter is Muamide, SSC, Denhardt's solution, denatured salmon sperm, SDS, and sodium phosphate Prehybridization is performed in a solution containing lium buffer. Any suitable A sharp method (for example,32P multiprime DNA labeling system (Amersham)) The recognized T1R-like ligand II cDNA is used as a probe. Overnight hybrid After dicing, the filters are washed and exposed to X-ray film. Book CDNAs for use as probes according to the invention are described in the section above, And a length of at least 15 bp is preferred.   S1 mapping was performed as described in Fujita et al., Cell 49: 357-367 (1987). Can be done. To prepare the probe DNA for use in S1 mapping, The sense strand of the above cDNA was used as a template, and the labeled antisense DN A is synthesized. The antisense DNA then provides the appropriate restriction endonuclease. Digestion to produce additional DNA probes of desired length. this Such an antisense probe will target the target mRNA (ie, T1R-like ligand II). This is useful for visualizing the protected band corresponding to the mRNA that has been read. No Zan blot analysis can be performed as described above.   Preferably, the level of mRNA encoding T1R-like ligand II is determined by Makino et al., Techn. assayed using the RT-PCR method as described in ique 2: 295-301 (1990) . According to this method, the release of “amplicons” in a polyacrylamide gel band The radioactivity is linearly correlated to the initial concentration of the target mRNA. Briefly, this method uses RT Isolate from biological samples in reaction mixtures containing primers and appropriate buffers And adding the obtained total RNA. For primer annealing After incubation, the mixture contains RT buffer, dNTPs, DTT, RNase inhibitors, and And reverse transcriptase. Incubation to achieve reverse transcription of RNA After that, the RT product is then subjected to PCR using labeled primers. is there Alternatively, rather than labeling the primers, labeled dNTPs Can be included. PCR amplification is performed in a DNA thermal cycler according to conventional techniques. obtain. After the appropriate number of rounds to achieve amplification, the PCR reaction mixture is Electrophoresed on a Lilamide gel. After drying the gel, the appropriate band (T1R-like Radioactivity is determined using an image analyzer. Is done. RT and PCR reaction components and conditions, reagent and gel concentrations, and standards Knowledge methods are well known in the art. Variations on the RT-PCR method will be apparent to those skilled in the art.   Set up any oligonucleotide primer that amplifies the reverse transcribed target mRNA. A kit may be used and may be designed as described in the section above.   Assaying T1R-like ligand II levels in biological samples can be performed by any Can be performed using known methods. Antibody-based technology in biological samples Preferred for assaying T1R-like ligand II levels. For example, T Expression of 1R-like ligand II can be studied by traditional immunohistological methods. these In some cases, specific recognition is by primary antibody (polyclonal or monoclonal) Although provided, the secondary detection system utilizes fluorescence, enzymes, or other conjugated secondary antibodies. Can be used. The result was immunohistological staining of tissue sections for pathology testing. It is. Tissue can also be obtained by Western blot or dot / slot assay (Jalk anen, M .; J. et al. Cell. Biol. 101: 976-985 (1985); Jalkanen, M et al. Cell. Bi ol. 105: 3087-3096 (1987)) for the release of T1R-like ligand II, for example It can be extracted with urea and a neutral detergent. Based on the use of cationic solid phase In this technique, the quantification of T1R-like ligand II is based on the isolation of isolated T1R-like ligand II. Can be achieved using as a standard. This technique can also be applied to body fluids. For these samples, the molar concentration of T1R-like ligand II was in serum, plasma, urine, For different bodily fluids such as synovial fluid and perfusion fluid, the standard value of the T1R-like ligand II content Assist in setting. Next, the normal value of the amount of T1R-like ligand II is derived from a healthy individual. Values that can be compared to values obtained from the test subject. You.   Other antibody-based methods useful for detecting T1R-like ligand II levels include Muno assays (eg, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and radioimmunoassay) Assay (RIA)). For example, a T1R-like ligand II-specific monoclonal antibody The body can be used as an immunosorbent and for detecting and quantifying T1R-like ligand II. It can be used both as an enzyme-labeled probe. T1R-like solution present in sample The amount of Gand II was calculated using standard linear regression computer algorithms It can be calculated by comparison with the amount present in the product. For detecting tumor antigens Such ELISAs are described in Iacobelli et al., Breast Cancer Research and Treatment 11: 19-30 (1988). In another ELISA assay, two different Specific monoclonal antibodies are used to detect T1R-like ligand II in body fluids. Can be used. In this assay, one antibody is used as an immunosorbent, The other is used as an enzyme-labeled probe.   The above techniques are essentially performed as "one-step" or "two-step" assays. obtain. The “one-step” assay involves contacting the immobilized antibody with T1R-like ligand II. Washing and contacting the labeled antibody with the mixture. Is not included. A “two-step” assay consists of a washing step followed by a labeled antibody Contacting the mixture. Other conventional methods are also used properly obtain. It is usually desirable to immobilize one component of the assay system on a support, This allows other components of the system to come into contact with the components and to be easily removed from the sample. Can be generated.   Suitable enzyme labels, for example, catalyze the production of hydrogen peroxide by reaction with a substrate Including those from the oxidase group. Glucose oxidase is a good cheap Qualitative and its substrate (glucose) is readily available. Good. The activity of the oxidase label is formed by the enzyme-labeled antibody / substrate reaction. Can be assayed by measuring the concentration of hydrogen peroxide. In addition to enzymes , As other suitable labels, radioisotopes (eg, iodine (125I,121I), charcoal Element (14C), sulfur (35S), tritium (ThreeH), indium (112In), and technetium(99mTc)), and fluorescent labels (eg, fluorescein and Rhodamine) and biotin.   Assaying T1R-like ligand II levels in a biological sample obtained from an individual In addition, T1R-like ligand II is also detected in vivo by image analysis. Can be Antibody labels or markers for in vivo image analysis of T1R-like ligand II Cars include those that can be detected by radiography, NMR, or ESR . For radiography, appropriate labels emit detectable radiation, Radiation, such as barium or cesium, that is not explicitly harmful to the subject Sex isotopes. Related markers as appropriate markers for NMR and ESR Like deuterium, which can be incorporated into antibodies by labeling the hybridoma's nutrients One having a characteristic rotation that can be detected.   Radioisotopes (for example,131I,111In,99mTc), radioactive opaque (radio-op aque) appropriate detectable, such as substrate or substance detectable by nuclear magnetic resonance T1R-like ligand II-specific antibodies or antibody fragments labeled with Is administered to the mammal being tested for the disorder (eg, parenterally, subcutaneously, Or intravenously) introduced. Subject size and image analysis system used Determines the amount of image analysis needed to produce a diagnostic image. Is understood in the art. In the case of radioisotope parts, Thus, the amount of radioactivity injected is usually in the range of about 5-20 millicuries.99mTc It is. The labeled antibody or antibody fragment then contains the T1R-like ligand II Accumulates preferentially at cell locations. In vivo tumor image analysis is described in SW. Burchiel Et al., "Immunopharmacokinetics of Radiolabeled Antibodies and Their Portions" (Tumer Imaging Chapter 13: The Radiochemical Detection of Cancer, Burchiel, S.W. and Rhodes, B.A., Masson Publishing Inc. (1982)) You.   A T1R-like ligand II-specific antibody for use in the present invention comprises a complete T1R-like ligand II or an antigenic polypeptide fragment thereof. this is, With or with carrier proteins such as albumin long enough In the case of at least about 25 amino acids, animals without animal carriers (for example, rabbits or Can be presented to mouse).   As used herein, the term "antibody" (Ab) or "monoclonal antibody" The "body" (Mab) is a complete molecule and antibody molecule capable of specifically binding to T1R-like ligand II. Fragmentation (eg, Fab and F (ab ')Two(Like fragments) To taste. Fab and F (ab ')TwoFragment lacks Fc fragment of whole antibody And is more rapidly removed by the circulation, and non-specific tissue binding of intact antibodies. Can have little (Wahl et al., J. Nucl. Med. 24: 316-325 (1983)). Therefore , These parts are preferred.   The antibodies of the present invention can be prepared by any of a variety of methods. For example, T1R Cells expressing Gand II or an antigenic fragment thereof are polyclonal antibodies Can be administered to animals to induce the production of serum containing. In a preferred way The preparation of the T1R-like ligand II protein is substantially free of natural contaminants Prepared and purified as described above. Then, such a tone The product is used by animals to produce polyclonal antisera with greater specific activity. be introduced.   In the most preferred method, the antibodies of the invention are monoclonal antibodies (or T1R-like ligand II binding fragment). Such a monoclonal antibody , Hybridoma technology (eg, Colligan, Current Protocols in Immunology , Wiley Interscience, New York (1990-1996); Harlow and Lane, Antibodies : A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. . (1988), Chapters 6-9, Current Protocols on Molecular Biology, Ausubel, Previous See Chapter 11, which references are incorporated by reference in their entirety. , Incorporated by reference). Generally, such a procedure is a T1R-like Animals with Gand II antigen or more preferably cells expressing T1R-like ligand II Immunization of a mouse). Suitable cells are anti-T1R-like ligand I Can be recognized by their ability to bind to the I antibody. Such cells are optional Can be cultured in a suitable tissue culture medium; however, 10% fetal bovine serum (at about 56 ° C.) (Inactivated), about 10 μg / l of non-essential amino acids, about 1,000 U / ml of penicillin Earle modified Eagle medium supplemented with streptomycin and approximately 100 μg / ml streptomycin. Preferably, the cells are cultured in the ground. The spleen cells of such mice are extracted, And fused with an appropriate myeloma cell line. Any suitable myeloma cell line may be used according to the invention. But can be used according to the American Type Culture Collection (AT CC) (SP) (Rockville, Maryland, USA)TwoUse O) Is preferred. After fusion, the resulting hybridoma cells are selected in HAT medium And then Wands et al., Gastroenterology 80: 225-232 (1981); Harlow et al. And Lane, limiting dilution as described in Chapter 7, supra, cloning Is done. Then, the hybridoma cells obtained by such a selection were T1R Assay to identify clones that secrete antibodies capable of binding to It is done.   Alternatively, an additional antibody capable of binding to a T1R-like ligand II antigen is an anti-idiota It can be produced in a two-step procedure through the use of ip antibodies. In such a method, antibodies Use the fact that it is itself an antigen, and therefore It is possible to get. According to this method, T1R-like ligand II-specific antibodies Used to immunize an object (preferably a mouse). Then, such behavior Spleen cells are used to produce hybridoma cells, and Tumor cells have the ability to bind to T1R-like ligand II-specific antibodies. Screen to identify clones producing antibodies that can be blocked by the Be tuned. Such antibodies can be used as anti-ideas to T1R-like ligand II-specific antibodies. Inducing additional T1R-like ligand II-specific antibodies It can be used to immunize animals to guide.   Fab and F (ab ')TwoAnd other fragments of the antibodies of the invention are disclosed herein. Obviously, it can be used according to the method performed. Such a fragment Is typically papain (to produce a Fab fragment) or pepsin (F (ab ' )TwoFor proteolytic cleavage using enzymes such as It is produced. Alternatively, the T1R-like ligand II-binding fragment is a recombinant DN It can be produced by the application of A technology or synthetic chemistry.   Using in vivo imaging for elevated levels of diagnostics in humans When detecting Bell T1R-like ligand II, a "humanized" chimeric monoclonal antibody It may be preferred to use Such an antibody may be a monoclonal antibody as described above. It can be produced using a genetic construct from a hybridoma cell that produces the antibody. Ki Methods for producing mela antibodies are known in the art. For a review, see Mo rrison, Science 229: 1202 (1985); Oi et al., BioTechniques 4: 214 (1986); Cabilly et al. No. 4,816,567; Taniguchi et al., EP 171496; Morrison et al., EP 173494; Ne. uberger et al., WO 8601533; Robinson et al., WO 8702671; Boulianne et al., Nature 312: 643. (1984); Neuberger et al., Nature 314: 268 (1985).   Further suitable labels for the T1R-like ligand II-specific antibodies of the invention are provided below. You. Examples of suitable enzyme labels include malate dehydrogenase, Staphylococcus Creatase, Δ-5-steroid isomerase, yeast alcohol dehydrogenase , Α-glycerol phosphate dehydrogenase, triose phosphate isomerase, Peroxidase, alkaline phosphatase, asparaginase, glucose Oxidase, β-galactosidase, ribonuclease, urease, catala , Glucose-6-phosphate dehydrogenase, glucoamylase, and acetyl Contains rucholinesterase.   Examples of suitable radioisotope labels areThreeH,111In,125I,131I,32P,35S,14 C,51Cr,57To,58Co,59Fe,75Se,152EU,90Y,67Cu,217Ci,211Ai,212Pb ,47Sc,109Including Pd.111In is where in vivo imaging is used Are preferred isotopes. Because this is125I or131Model labeled with I This is because the problem of liver dehalogenation of noclonal antibodies is avoided. Further In addition, this radionucleotide is more preferred for imaging. Gamma emission energy (Perkins et al., Eur. J. Nucl. Med. 10: 296-301 (1985); Carasquillo et al., J. Nucl. Med. 28: 281-287 (1987)). For example, 1- (P-isothiocyanate benzene B) coupled to a monoclonal antibody using -DPTA111In a non-neoplastic group It showed little uptake in the tissues (especially the liver). Therefore, tumor localization (Esteban et al., J. Nucl. Med. 28: 861-870 (1987)).   Examples of suitable non-radioactive isotope labels include157Gd,55Mn,162Dy,52Tr, and56Fe Including.   Examples of suitable fluorescent labels are152Eu label, fluorescein label, isothiocyanate Label, rhodamine label, phycoerythrin label, phycocyanin label, aloph Lycocyanine labeling, o-phthaldehyde labeling, and fluorinated Includes resamine label.   Examples of suitable toxin labels include diphtheria toxin, ricin, and cholera toxin.   Examples of chemiluminescent labels are luminal label, isoluminal label, aromatic acridi Label, imidazole label, acridinium salt label, oxalate Includes Tel, Luciferin, Luciferase, and Aequorin labels No.   Examples of nuclear magnetic resonance contrast agents include heavy metal nuclei such as Gd, Mn, and Fe. Including.   Representative techniques for coupling the above labels to antibodies are described by Kennedy et al. (Clin. Chim. Acta 70: 1-31 (1976)) and Schurs et al. (Clin. Chim. Acta 81: 1-40 (1977)). Provided by The coupling technique mentioned in the latter is glutar alde Hyd method, periodic acid method, dimaleimide method, m-maleimidobenzyl-N-hydride Roxy-succinimide ester methods, all of which are described herein. Incorporated as a reference.   Chromosome assay   The nucleic acid molecules of the invention are also useful for chromosome identification. The sequence contains individual human stains. Specifically targeted to a specific location on the chromosome, and hybridized to that location obtain. In addition, there is now a need to identify specific sites on the chromosome. Currently, Chromosome labeling reagents based on sequence data (repetitive polymorphisms) Not available for signs. The mapping of DNA to chromosome according to the present invention This is an important first step in correlating the sequence with the gene associated with the disease.   In certain preferred embodiments in this regard, the cDs disclosed herein NA is used to clone the genomic DNA of the T1R-like ligand II gene . This uses a variety of well-known techniques and publicly available libraries. Can be achieved. The genomic DNA can then be converted using well-known techniques for this purpose. Used for in situ chromosome mapping. Typically, a chromosome map Follow the routines of ping, some trial and error, but good in-situ high Required to identify genomic probes that give hybridization signals Can get.   In some cases, in addition, sequences may be used to convert cDNA to PCR primers (preferred). Or 15-25 bp) can be mapped to the chromosome. 3 'untranslated gene Computer analysis of translation regions spans more than one exon in genomic DNA Used to quickly select primers that do not complicate the amplification process Is done. These primers are then used for somatic cell hybrids containing individual human chromosomes. Used for PCR screening of lids. The human gene corresponding to the primer Only those hybrids that contain produce an amplified portion.   PCR mapping of somatic cell hybrids assigns specific DNA to specific chromosomes A quick procedure for Use the same oligonucleotide primer with the present invention Use a large genome in a panel of parts from a particular chromosome or in a similar fashion With the pool of clones, sublocalization can be achieved. Dye Other mapping strategies that can also be used to map to color bodies are In situ hybridization, labeling and flow-sorted staining Prescreening using chromosomes and construction of chromosome-specific cDNA libraries Preselection by hybridization to perform   Fluorescence in situ hive on the metaphase chromosome spread of cDNA clones Redidation ("FISH") is a process that provides accurate chromosomal location in one step. Can be used. This technology uses probes from cDNAs as short as 50 bp or 60 bp. Can be used. For a review of this technology, see Verma et al., Human Chromosomes: A See Manual of Basic Techniques, Pergamon Press, New York (1988) .   Once a sequence has been mapped to a precise chromosomal location, the physical The location can be correlated with the genetic map data. Such data is described, for example, in McK usick, Mendelian Inheritance in Man (Johns Hopkins University, Welch Medi (available online from the Cal Library). Then, Linkage analysis (physical analysis) (Inheritance of adjacent genes).   Next, differences in the cDNA or genomic sequence between affected and unaffected individuals Need to decide. The mutation is observed in some or all affected individuals, If not observed in any normal individual, this mutation is a causative agent of the disease. It is.   With the current resolution of physical and genetic mapping techniques, disease A cDNA correctly located in a chromosomal region associated with a potential of between 50 and 500 It may be one of the causative genes. (This is a 1 megabase mapping resolution, And one gene per 20 kb). Treatment of T1R-like ligand II disorders   By the present inventors, the T1R-like ligand II polypeptide of the present invention It is thought to share biological activity with kin-1 (IL-1) and T1R ligands. Obedience Thus, T1R-like ligand II (especially the mature form) It can be added exogenously to the tissue, or to the body of the individual. In particular, T1R-like ligand II tan Disorders caused by a decrease in standard levels of protein activity are T1R-like It can be treated by administering an effective amount of a Ligand II polypeptide. Preferably Is an isolated amount of the present invention that is effective to increase T1R-like ligand II protein activity. A pharmaceutical composition comprising the administered T1R-like ligand II polypeptide is administered. This Disorders for which such treatments appear to be effective are discussed above and below.   One of skill in the art will recognize that an effective amount of a T1R-like ligand II polypeptide will It is recognized that administration of the drug can be empirically determined for each condition indicated. A polypeptide having T1R-like ligand II activity can have one or more than one polypeptide in a pharmaceutical composition. Injected in combination with a pharmaceutically acceptable carrier, diluent, and / or excipient. Can be given. When administered to human patients, the total daily usage of the pharmaceutical compositions of the present invention is It is understood that the sound medical decision is determined by the attending physician. Any specific The particular therapeutically effective dose level for a given patient will depend on the type of response to be achieved and Degree; specific composition and other drugs used (if any); age and weight of patient , General health, gender, and diet; time of administration, route of administration, and composition Excretion rate; duration of treatment; combined with or used with a particular composition Drugs (eg, chemotherapeutic agents); as well as similar elements well known in the medical arts. Depends on various factors.   The T1R-like ligand II compositions used for therapy may also vary in the individual patient's clinical Side effect of treatment with T1R-like ligand II alone), site of delivery of T1R-like ligand II composition Taking into account, dosing method, dosing schedule, and other factors known to the practitioner. Prescribed and dispensed in a manner consistent with good medical practice. Therefore, the eyes in this specification An “effective amount” of a T1R-like ligand II polypeptide for targeting depends on such considerations. Is determined.   As a general proposal, the T1R-like ligand II polypeptide administered parenterally per dose The total pharmaceutically effective amount of the peptide is about 0.01 ng / kg / day to 10 μg / kg / day per patient weight , But as noted above, this is subject to therapeutic discretion. More preferred Preferably, this dose is at least 1.0 ng / kg / day, and most preferably for humans. The hormone is about 1.0-100ng / kg / day. When given continuously, T1R-like Gand II is typically administered at a dose rate of about 0.01 ng / kg / hr to about 100 ng / kg / hr, 1-4 injections per day or continuous subcutaneous infusion, for example using a minipump Administered by any of An intravenous bag solution may also be used.   The course of T1R-like ligand II polypeptide treatment to affect the immune system is Optimum if lasting longer than a fixed minimum number of days (7 days for mice) It is. The length of treatment required to observe the change, and the response after treatment The interval to wake up seems to vary according to the desired effect.   The T1R-like ligand II polypeptide is also suitably administered by a sustained release system. Suitable examples of sustained release compositions include shaped articles (eg, films or microcapsules). A) a semipermeable polymer matrix in the form of The sustained release matrix is Polylactide (US Pat. No. 3,773,919, EP 58,481), L-glutamic acid and γ-d Copolymers with chill-L-glutamate (U. Sidman et al., Biopolymers 22: 547-556 (1 983)), poly (2-hydroxyethyl methacrylate) (R. Langer et al., J. Biomed Mater. Res. 15: 167-277 (1981) and R.M. Langer, Chem. Tech. 12: 98-105 (1982) ), Ethylene vinyl acetate (R. Langer et al., Ibid.), Or poly-D-(-) 3- Contains droxybutyric acid (EP 133,988). The sustained release T1R-like ligand II composition also comprises Includes T1R-like ligand II polypeptide encapsulated in liposomes. T1R-like ligand II Liposomes containing polypeptides are prepared by methods known per se: DE 3,218,121: Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82: 3688-3692 (1985); Hwang Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 4030-4034 (1980); EP 52,322; EP 36,676; EP  88,046; EP 143,949; EP 142,641; Japanese Patent Application No. 83-118008; U.S. Patent No. 4,48 5,045 and 4,544,545; and EP 102,324. Usually, liposomes are small Sana (about 200-800 angstroms) monolayer type, where the lipid content is about Higher than 30 mol.% Cholesterol, the ratio chosen is the optimal T1R-like ligand II Adjusted for treatment.   For parenteral administration, in one embodiment, the T1R-like ligand II polypeptide is In general, unit dose injectable forms (solutions, suspensions, Or an emulsion) of the polypeptide with a pharmaceutically acceptable carrier (ie, Non-toxic to recipients at the dosages and concentrations employed, and And a carrier that is compatible with the other ingredients. For example, The formulation is preferably harmful to oxidants, and polypeptides Excludes other known compounds.   Generally, the formulation comprises a T1R-like ligand II polypeptide in a liquid carrier or Uniform and direct contact with finely divided solid carrier or both Prepared by Then, if necessary, the product is shaped into the desired formulation. Preferably, the carrier is a parenteral carrier, more preferably the blood of the recipient. And a solution that is isotonic. Examples of such carrier vehicles are water, saline , Includes Ringer's solution and dextrose solution. Fixed oil and ethyl oleate Non-aqueous vehicles such as liposomes are also useful herein, as well as in liposomes. is there.   Carriers may be added in small amounts, such as substances that enhance isotonicity and chemical stability. Agents are suitably included. Such substances may be added to the recipe at the dosages and concentrations used. Non-toxic to phosphates, and phosphoric, citric, succinic, acetic, and other Buffers such as organic acids or salts thereof; antioxidants such as ascorbic acid; Low molecular weight (less than about 10 residues) polypeptides (eg, polyarginine or tripe Peptides); proteins such as serum albumin, gelatin, or immunoglobulin Quality; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; glycine, glutamic acid, Amino acids such as aspartic acid or arginine; cellulose or its Monosaccharides, disaccharides containing derivatives, glucose, mannose or dextrin And other carbohydrates; chelating agents such as EDTA; mannitol or sorby Sugar alcohols such as tall; counterions such as sodium; and / or Is a nonionic such as polysorbate, poloxamer or PEG Contains a surfactant.   T1R-like ligand II is typically present in such vehicles at about 0.001 ng / ml to 500 ng. / ml, preferably at a concentration of 0.1-10 ng / ml, at a pH of about 3-8. As mentioned above Use of certain of the excipients, carriers, or stabilizers may lead to T1R-like ligand II salts It is understood that this results in a formulation.   T1R-like ligand II to be used for therapeutic administration must be sterile Absent. Sterility is passed through a sterile filtered membrane (eg, a 0.2 micron membrane). This is easily achieved by subsequent filtration. Therapeutic T1R-like ligand II compositions are commonly used In a container having a sterile access port (for example, an intravenous solution bag or a hypodermic injection needle). Is placed in a vial with a stopper which can be pierced.   The T1R-like ligand II is usually administered in unit-dose or multi-dose containers (eg, sealed Aqueous solution or lyophilized for reconstitution Stored as a dry formulation. As an example of a lyophilized formulation, a 10 ml vial is available Filled with 5 ml of a filtered 1% (w / v) aqueous T1R-like ligand II solution and obtained The resulting mixture is lyophilized. Injection solution contains lyophilized T1R-like ligand II Prepared by using bacteriostatic distilled water for injection.   For example, satisfactory results have been seen in single or divided doses of 1 to 4 per day. Administered once, 0.05 to 5000 ng / kg / day, preferably 0.1 to 1000 ng / kg / day, more preferably Or T1R-like ligand II activity at dosages on the order of 10-100 ng / kg / day. Obtained by oral administration of the polypeptide. For example, by i.v. Parenteral administration, 0.01 to 500 ng / kg / day, preferably 0.05 to 100 ng / kg / day, and More preferably, dosages on the order of 0.1-50 ng / kg / day may be used. Therefore, Suitable daily dosages for patients are 2.5 ng to 250 μg (oral), preferably 5 ng to 50 μg. μg (oral), more preferably on the order of 50 ng to 12.5 μg (oral), or Or 0.5 ng to 25 μg (iv), preferably 2.5 ng to 500 μg (iv), and more Preferably it is on the order of 5 ng to 2.5 μg (iv).   T1R-like ligand II antibody therapy   In accordance with the present invention, an increased level of T1R-like ligand II protein activity Obstructs the effective amount of an antagonist of the T1R-like ligand II polypeptide of the present invention. It can be treated by administration. Therefore, T1R-like ligand II receptor Soluble T1R-like ligand II tan competes with intact proteins for binding As with proteins (eg, extracellular domains), the T1R-like ligand II polypeptides of the invention Antibodies (preferably monoclonal) or antibody fragments that bind the peptide , Useful in treating T1R-like ligand II-related disorders. Such antibodies and And / or the soluble T1R-like ligand II protein is preferably pharmaceutically acceptable Provided in a composition.   Pharmaceutical compositions of the invention include, for example, parenteral, subcutaneous, intravenous, intramuscular, intraperitoneal, It can be administered transdermally or by the buccal route. Alternatively or simultaneously, the administration is Can be oral. The dosage administered will depend on the age, health, and condition of the recipient. Weight, type of concurrent treatment (if any), frequency of treatment, and desired effect Depends on the nature.   Compositions within the scope of the present invention are those wherein the antibody, fragment, or derivative has an intended purpose. And all compositions contained in an amount effective to achieve the intended purpose. Individual must Determining the optimal range of effective amounts for each ingredient, while varying in necessity, is within the skill of the art. Is within. Effective doses include individual chimeric or monoclonal antibodies, bound The presence and nature of the therapeutic agent (see below), a function of the patient and its clinical condition And can vary from about 10 ng / kg body weight to about 100 mg / kg body weight. Preferred dosage Contains 0.1-10 mg / kg body weight.   Detectable labeled form for imaging or release for therapeutic purposes Or T1R-like ligand II antibody for parenteral administration, such as Fragment preparations can be prepared in sterile aqueous or non-aqueous solutions, suspensions, and emulsions. Contains liquid. Examples of non-aqueous solvents are propylene glycol, polyethylene glycol , Vegetable oils (eg, olive oil), and injectable organic esters (eg, Ethyl formate). Aqueous carriers include saline and buffered media. Water, alcoholic / aqueous solutions, emulsions or suspensions, including sodium chloride solution Oral vehicle, Ringer's dextrose, dextrose and sodium chloride , Lactated Ringer's, or fixed oils. Intravenous vehicles contain fluid supplements and Nutritional replenishers (eg, supplements based on Ringer's dextrose) ). Preservatives and other additives may also be present, for example, antimicrobials, antioxidants, Rate agents, and inert gases and the like. Generally, Remington ' s Pharmaceutical Science, 16th edition, Mack Publishing Co., Easton, PA, 1980 checking ...   Antibodies described herein are compatible with other monoclonal or chimeric antibodies. Or increase the number or activity of effector cells that interact with the antibody Useful in combination with lymphokines or hematopoietic growth factors Can be done. Expected pleiotropic biological effects of T1R-like ligand II   The T1R-like ligand II polypeptides of the present invention have many of the effects shown in Table 1 below. It is expected to have pleiotropic biological effects including: A similar biological effect is IL -1, especially pancreatic endocrine tissue (Mandrup-Poulsen, T. et al., Cytokine 5: 185 (1993)), thyroid (Rasmussen, A.K., Autoimmunity 16: 141 (1993)), hypothalamus -Pituitary-Adrenal axis (Fantuzzi, G., and Ghezzi, P., Mediator Inflamm. 2: 263 (1993); Rivier, C., Ann. NY Acad. Sci. 697: 97 (1993); Rivier, C., and Rive st, S., Ciba. Found. Symp. 172: 204 (1993)), fever (Coceani, F., "Fever: B asic Mechanisms and Management ”, New York, NY, Raven (1991) p. 59), bone Metabolism (Takakis, D.N., J. Peridontol 64: 416 (1993)), disease of rheumatoid arthritis Destruction of cartilage in the cause (Arend, W.P., and Dayer, J.M., Arthritis Rheum 33 : 305 (1990); Krane, S.M. et al., Ann. NY Acad. Sci. 580: 340 (1990)), implantation into the uterus ( Lewis, M.P. et al., Placenta 15:13 (1994)) and loss of red body mass (Roubenoff J., R. et al. Clin. Invest. 93: 2379 (1994)). You.                Table 1. Possible biological effects of T1R-like ligand II Assay used: pancreatic endocrine tissue (Mandrup-Poulsen, T. et al., Cytokine 5: 185 (19 93)), thyroid (Rasmussen, A.K., Autoimmunity 16: 141 (1993)), hypothalamus-lower Pituitary-adrenal axis (Fantuzzi, G. and Ghezzi, P., Mediator Inflamm. 2: 263 (1993) Rivier, C., Ann. NY Acad. Sci. 697: 97 (1993); Rivier, C., and Rivest, S. ., Ciba. Found. Symp. 172: 204 (1993)), fever (Coceani, F., "Fever: Basic" Mechanisms and Management ”, New York, NY, Raven (1991), p. 59), bone metabolism ( Tatakis, D.N., J. Peridontol 64: 416 (1993)), the etiology of rheumatoid arthritis Cartilage destruction (Arend, W.P. and Dayer, J.M., Arthritis Rheum 33: 305 (199 0); Krane, S.M. et al., Ann. NY Acad. Sci. 580: 340 (1990)), implantation into the uterus (Lewis, M. .P. Et al., Placenta 15:13 (1994)) and loss of red body mass (Roubenoff, R. et al., J. . Clin. Invest. 93: 2379 (1994)).   Having generally described the invention, the invention is provided by way of illustration and This can be more easily explained by reference to the following examples, which are not intended to be limiting. Understood.                                  Example Example 1: Expression and purification of T1R-like ligand II in E. coli   Mature extracellular solubilizing portion of T1R-like ligand II in the deposited cDNA clone The amino acid terminal sequence of T1R-like ligand II and the gene On the other hand, using a PCR oligonucleotide primer specific for the vector sequence 3 '. Width. Additional nucleotides containing restriction sites to facilitate cloning Was added to the 5 'and 3' sequences, respectively.   One skilled in the art will appreciate that the full-length mature T1R-like ligand II protein (about 27 to about 229 amino acids) Using appropriate 5 'and 3' oligonucleotide primers in E. coli Understand that it can be expressed.   Copy the extracellular domain of full-length T1R-like ligand II in the deposited clone. CDNA sequences to be loaded are translated into PCR oligonucleotides corresponding to the 5 'and 3' sequences of the gene. Amplify using primers. The 5 'primer has the sequence 5' CGCCCA TGG CCG GCT It has a TCA CAC CTT CC 3 '(SEQ ID NO: 4), which contains an underlined NcoI restriction site. T1R-like ligand II protein encoding the sequence of FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) The 17 nucleotides (nucleotides 131 to 147) of the protein are immediately after the signal peptide. Start.   The 3 'primer has the sequence 5'CGCAAG CTT TCA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3 '(distribution No. 5), which contains a HindIII restriction site, followed by FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) Is complementary to nucleotides 619-621 of T1R-like ligand II encoding the sequence And contains the opposite stop codon and 18 nucleotides.   The restriction site is convenient for the restriction enzyme site of the bacterial expression vector pQE60, In these examples used for bacterial expression in M15 / rep4 host cells (Qiag en, Inc. Chatsworth, CA, 91111). pQE60 is resistant to ampicillin antibiotics ("A mpr)), The bacterial origin of replication ("ori"), an IPTG-inducible promoter, Includes asome binding site ("RBS"), a 6-His tag, and a restriction enzyme site.   Both the amplified T1R-like ligand II DNA and the vector pQE60 were digested with NcoI and Hin. Digest with dIII and then ligate the digested DNA together. T1R-like ligand II DNA Insertion into the pQE60 vector is restricted by the T1R-like ligand II coding region. Downstream of and operably linked to the IPTG-inducible promoter of the And inflation into the starting AUG appropriately located for translation of T1R-like ligand II Place it on the   Transform the ligation mixture into competent E. coli cells using standard procedures did. Such a procedure is described in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manua. l, 2nd edition; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989). Multiple copies of plasmid pREP4 (this is the lac Expression and kanamycin resistance (KanrE.) E. coli strain M15 / rep4 is used in performing the illustrative examples described herein. This strain (which is one of many strains that are suitable for expressing T1R-like ligand II) Is commercially available from Qiagen.   Transformants were grown on LB plates in the presence of ampicillin and kanamycin. Identify by their ability to breed. Isolate plasmid DNA from resistant colonies And the identity of the cloned DNA is confirmed by restriction analysis.   Clones containing the desired construct were ligated with ampicillin (100 μg / ml) and kanamycin. Overnight ("O / N") in liquid culture in LB medium supplemented with both (25 μg / ml) Bred.   Large scale cultures were inoculated at a dilution of about 1: 100 to 1: 250 using the O / N culture. Replace cells with 0 Grow to an absorbance at 600 nm ("OD600") of between 0.4 and 0.6. Next, Add isopropyl-B-D-thiogalactopyranoside ("IPTG") to a final concentration of 1 mM And inactivate the lacI repressor to increase the lac repressor sensitivity Induces transcription from the promoter. Continue incubation of cells for another 3-4 hours. To The cells are then harvested by standard methods by centrifugation and disrupted. Break. The inclusion bodies are purified from the disrupted cells using routine harvest techniques and The protein is solubilized from the inclusion bodies into 8M urea. 8 containing solubilized proteins M urea solution is passed through a PD-10 column in 2x phosphate buffered saline ("PBS") , Thereby removing urea, replacing the buffer, and refolding the protein No. The protein is purified by an additional step of chromatography and Removes xin. Then, it was sterilized by filtration. Filter-sterilized protein preparation Save in 2x PBS.   Analysis of the preparation by standard methods of polyacrylamide gel electrophoresis Contains about 95% of monomeric T1R-like ligand II with a predicted molecular weight of about 26 kDa It revealed that. Example 2: Cloning of T1R-like ligand II in baculovirus expression system And expression   CDNA sequence encoding full-length T1R-like ligand II in the deposited clone To the PCR oligonucleotide primers corresponding to the 5 'and 3' sequences of this gene. Amplify using an immer:   The 5 'primer has the sequence 5' CGCGGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 ′ (SEQ ID NO: 6) and contains an underlined BamHI restriction enzyme site, followed by FIG. 18 nucleotides (nucleotide) of the sequence of T1R-like ligand II of the sequence (SEQ ID NO: 1) Pide 55-72). T1R-like Riga inserted into the expression vector as described below The 5 'end of the amplified fragment encoding Provide Effective signals for initiating translation in eukaryotic cells are described in Kozak, M. ., J. Mol. Biol. 196: 947-950 (1987). Properly placed on the part.   The 3 'primer has the sequence 5' CGCGGT ACC TCA CAA TGT TAC GTA CTC TAG 3 '(distribution Column number 7), which contains the underlined Asp718 restriction site and is subsequently shown in FIG. Nucleotides 754 to 771 of T1R-like ligand II encoding the sequence (SEQ ID NO: 1) And a stop codon and 18 nucleotides that are complementary to and reverse to.   Copy the extracellular domain of full-length T1R-like ligand II in the deposited clone. The cDNA sequences to be ligated are translated into PCR oligonucleotides corresponding to the 5 'and 3' sequences of this gene. Amplify using leotide primers:   The 5 'primer has the sequence 5' CGCGGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 ′ (SEQ ID NO: 6) and contains an underlined BamHI restriction enzyme site, followed by FIG. 18 nucleotides of the sequence encoding T1R-like ligand II shown in SEQ ID NO: 1 Reotide (nucleotides 55-72). Insert into expression vector as described below The 5 'end of the amplified fragment encoding T1R-like ligand II Provide an effective signal peptide. Effective system for initiation of translation in eukaryotic cells Gunnar is described by Kozak, M., J .; Mol. Biol. 196: 947-950 (1987) As such, it is appropriately located in the vector portion of the construct.   The 3 'primer has the sequence 5' CGCGGT ACC TCA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3 '(distribution Column number 8), which contains the underlined Asp718 restriction site and is subsequently shown in FIG. Nucleotides 619 to 636 of T1R-like ligand II encoding the sequence And a stop codon and 18 nucleotides that are complementary to and reverse to.   The amplified fragment was purified using a commercially available kit (“Geneclean” BIO 101 Inc., La. (Jolla, Ca.) using a 1% agarose gel. Then this flag Is digested with BamHI and Asp718 and purified again on a 1% agarose gel. You. This fragment is designated herein as F2.   Using the vector pA2, Summers et al., A Manual of Methods for Baculovirus Ve ctors and Insect Cell Culture Procedures, Texas Agricultural Experimenta l Station Bulletin No. Using the standard method described in 1555 (1987), the full-length T Baculoyl for extracellular domains of 1R-like ligand II and T1R-like ligand II Is expressed in the expression system. The pA2 vector contains the signal peptide coding region. No. Therefore, the T1R-like ligand II signal peptide is (nucleotide of FIG. 1) 55-132 (SEQ ID NO: 1)); depends on amino acids 1-26 (SEQ ID NO: 2) in FIG. .   T1R-like ligand II signal peptide is effective for T1R-like ligand II protein If no significant expression occurs, the pA2-GP vector can be used instead of the pA2 vector. A The signal peptide of cMNPV gp67 (including the N-terminal methionine) is located after the BamHI site. It is located upstream. Those skilled in the art will appreciate that if a pA2-GP expression vector is used, 5 ′ oligonucleotide encodes a T1R-like ligand II signal peptide Understand that it should not contain any sequences. Instead, the 5 'oligonucleotide is Should start at nucleotide 131.   Both pA2 and pA2-GP expression vectors are Autographa californica nuclear polyhedra. Strong polyhedrin promoter of disease virus (AcMNPV) followed by unfavorable Including restriction sites. Simian virus 40 ("SV40") polyadenylation site Used for efficient polyadenylation. For easy selection of recombinant viruses , The β-galactosidase gene from E. coli is oriented in the same direction as the polyhedrin promoter And followed by the polyadenylation signal of the polyhedrin gene. Polyhe The drin sequence is inserted into the virus for cell-mediated homologous recombination with wild-type viral DNA. Viable flanked by sequences and expressing cloned polynucleotides Produces a virus.   As will be readily appreciated by those skilled in the art, the construction must be suitable for transcription, translation, transport, etc. Positioned signals (eg, AUG and signal pairs in frame if necessary) Many other baculovirus vectors (eg, pAc373, pVL941, and pAcIM1) can be used instead of pA2 or pA2-GP. This Such vectors are described, inter alia, in Luckow et al., Virology, 170: 31-39.   Digest the plasmid with the restriction enzyme XbaI using routine procedures known in the art. Followed by dephosphorylation using bovine intestinal phosphatase. Then, a commercially available kit ("Geneclean" BIO 101 Inc., La Jolla, Ca) using 1% agarose gel Isolated from the This vector DNA is designated herein as "V2".   Fragment F2 and dephosphorylated plasmid V2 were ligated together with T4 DNA ligase. Tie. E. coli HB101 cells are transformed with the ligation mixture and plated on culture plates. Sow. Digest DNA from individual colonies using XbaI, then run on gel electrophoresis Therefore, by analyzing the digestion product, it is possible to have the human T1R-like ligand II gene. Identify the bacteria containing the plasmid. The sequence of the cloned fragment is Confirm by column determination. This plasmid is referred to herein as pBacT1R-like ligand Name it I.   5 μg of plasmid pBacT1R-like ligand I was transferred to Felgner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 7413-7417 (1987) using the lipofection method. 1.0 μg of commercially available linearized baculovirus DNA (“BaculoGoldTM baculovirus DN A ", Pharmingen, San Diego, CA.). 1 μg BaculoGoldTMViral DNA and 5 μg of plasmid pBacT1R-like ligand I , 50 μl serum-free Grace's medium (Life Technologies Inc., Gaithersburg, MD) Mix in sterile wells of a microtiter plate containing Then 10 μl Add Lipofectin and 90 μl Grace's medium, mix and at room temperature Incubate for 15 minutes. The transfection mixture is then Sf9 insect cells seeded in 35 mm tissue culture plates with 1 ml of clear Grace's medium (ATCC CRL 1711). Mix the plate with the newly added solution. Shake back and forth. The plate is then incubated at 27 ° C. for 5 hours. After 5 hours, the transfection solution was removed from the plate and 10% calf Add 1 ml Grace's insect medium supplemented with baby serum. Incubate plate And continue the culture at 27 ° C. for 4 days.   After 4 days, the supernatant was collected and described in Summers and Smith (cited above). Perform plaque assay as described. Gal expression produces blue-stained plaques To allow for easy identification and isolation of clones, use "Blue Gal" (Life Tec agarose gel with hnologies Inc., Gaithersburg) is used. (This Thailand A detailed description of the “plaque assay” is also available from Life Technologies Inc., Gait Insect cell culture and baculovirology user guide distributed in hersburg (Also found in pages 9-10).   Four days after serial dilution, virus is added to the cells. Proper incubation Later, the plaque stained blue is picked up with the tip of an Eppendorf pipette. Then Agar containing recombinant virus, eppendorf containing 200 μl Grace's medium Resuspend in tube. Agar is removed by brief centrifugation and recombined Infection of Sf9 cells seeded in 35 mm dish with supernatant containing baculovirus Used to Four days later, the supernatants of these culture dishes are collected and then Store them at 4 ° C. Claw containing hESSB I, II, and III properly inserted Are identified by DNA analysis including this restriction mapping and sequencing. This This is named V-T1R-like ligand I in this specification.   Sf9 cells are grown in Grace's medium supplemented with 10% heat-inactivated FBS. Cells At a multiplicity of infection ("M0I") of about 2 (about 1 to about 3), the recombinant baculovirus V-T1R-lik Infect with e ligand I. After 6 hours, the medium was removed and methionine and SF900 II medium (Life Technologies Inc., Gaithersburg? Available). 42 hours later, 5 μCi35S-methionine and 5 μCi of35Add S-cysteine (available from Amersham). Cells for an additional 16 hours Incubate, then collect cells by centrifugation, lyse and label The proteins are visualized by SDS-PAGE and autoradiography.   Example 3: Cloning and expression in mammalian cells   Transient expression of T1R-like ligand II protein gene sequence in mammalian cells Most currently used vectors should have the SV40 origin of replication. this This means that cells expressing the T antigen required to initiate viral DNA synthesis (eg, COS cells) Vesicles) allows the replication of high copy number vectors. Any other mammal Cell lines may also be used for this purpose.   A typical mammalian expression vector is a promoter element (an mRNA transcription opener). Mediating initiation), protein coding sequences, and termination of transcription and transcription of transcripts. Contains signals required for liadenylation. A further element is Enhan Kozak and intervening sequences flanked by donors, donors, and RNA splices Acceptor sites for Thing. Very effective transcription from SV40 Early and late promoters, long terminal repeats (LTRs) from retroviruses (eg For example, the early promoters of RSV, HTLVI, and HIVI) and cytomegalovirus (CMV) Can be achieved with data. However, cellular signals can also be used (eg, human Actin promoter). Suitable expression vectors for use in the practice of the present invention For example, pSVL and pMSG (Pharmacia, Uppsala, Sweden), pRSVcat (ATC C37152), pSV2dhfr (ATCC 37146), and pBC12MI (ATCC 67109) Vector. Mammalian host cells that can be used include human Hela, 283 , H9 and Jurkat cells, mouse NIH3T3 and C127 cells, Cos1, Cos7 and CV1, African green monkey cells, quail QC1-3 cells, mouse L cells, and Chinese Hamster ovary cells.   Alternatively, the gene is transferred to a stable cell line containing the gene, which is integrated into the chromosome. Can be expressed in Selectable markers (eg, dhfr, gpt, neomycin, high Glomycin) Which co-transfection identifies transfected cells And allows for isolation.   Transfected genes can also be amplified to encode large amounts of encoded protein. Can be expressed. DHFR (dihydrofolate reductase) contains hundreds of genes of interest Or a marker useful for developing cell lines with thousands of copies. Another A useful selectable marker for is the enzyme glutamine synthase (GS) (Murphy et al., Biochem J. 227: 277-279 (1991); Bebbington et al., Bio / Technology 10: 169-175 (19 92)). Using these markers, mammalian cells can be grown in selective media. And select the cells with the highest resistance. These cell lines integrate into chromosomes. Contains the amplified gene (s) to be incorporated. Chinese hamster ovary (CHO) cells are often used for the production of proteins.   The expression vectors pC1 and pC4 contain the strong promoter of Rous sarcoma virus (LT R) (Cullen et al., Molecular and Cellular Biolugy, 438-4470 (March 1985)) And fragments of the CMV-enhancer (Boshart et al., Cell 41: 521-530 (1985)) )including. Multiple cloning sites (eg, restriction sites BamHI, XbaI, And Asp718) facilitate cloning of the gene of interest. Vector In addition, the 3 'intron, polyadenylation, and And termination signals. Example 3 (a): Cloning and expression in COS cells   Expression plasmid, cDNA encoding T1R-like ligand II, expression vector pcDNA Created by cloning into I / Amp (available from Invitrogen, Inc.). To make.   The expression vector pcDNAI / amp is as follows: (Dower, Colotta, F. et al., Immunol Today 15 : 562 (1994)) E. coli replication effective for growth in E. coli and other prokaryotic cells (Greenfeder, S.A., et al., J. Biol. Chem. 270: 13757 (1995)) Plasmid included Ampicillin resistance gene for selection of prokaryotic cells; (Polan, M.L. et al., Am . J. Obstet. Gynecol. 170: 1000 (1994)) SV for growth in eukaryotic cells (Carinci, Mora, M. et al., Prog. Clin. Biol. Res. 349: 205 (1990). ) CMV promoter, polylinker, SV40 intron; Often under the control of expression of the CMV promoter and restriction sites in the polylinker Position operably linked to SV40 intron and polyadenylation signal A polyadenylation signal arranged in such a manner.   DNA fragment encoding the complete T1R-like ligand II precursor and its 3 'end HA tag fused in-frame to the vector and cloned into the polylinker region of the vector. Thus, the recombinant protein expression is driven by the CMV promoter. HA The influenza blood clot described by Wilson et al., Cell 37: 767 (1984). Corresponds to an epitope from the confluent protein. HA tag fusion to target protein Enables simple detection of recombinant proteins using antibodies that recognize the HA epitope Nasu You.   The plasmid construction strategy is as follows.   The T1R-like ligand II cDNA of the deposited clone was replaced with the T1R in E. coli described above. As well as for the construction of expression vectors for the expression of Amplification using primers containing restriction sites. Expressed T1R-like ligand II To facilitate detection, purification, and characterization of Hemagglutinin tag ("HA tag").   One skilled in the art will appreciate that the full length T1R-like ligand II protein (about 1 to about 229 amino acids) Generated in COS cells using the appropriate 5 'and 3' oligonucleotide primers Understand what it can do.   Copy the extracellular domain of full-length T1R-like ligand II in the deposited clone. CDNA sequences to be loaded are translated into PCR oligonucleotides corresponding to the 5 'and 3' sequences of the gene. Amplify using primers. The 5 'primer has the following sequence:   5 'CGCGGA TCC Has GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 '(SEQ ID NO: 6) This is the underlined BamHI site and the T1R-like ligase shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1). And 18 nucleotides of the coding sequence (nucleotides 55-72).   The 3 'primer has the following sequence:   5 'CGCTCT AGATCA AGC GTA GTC TGG GAC GTC GTA TGG GTA TCT ATC AAA GTT  GCT TTC 3 '(SEQ ID NO: 9), which is underlined XbaI restriction site, stop Don, HA tag, and T1R-like ligand II code shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1) 18 nucleotides that are reverse and complementary to nucleotides 619-639 of the sequence (nucleotide 5 5-72).   Digest PCR amplified DNA fragment and vector pcDNAI / Amp with BamHI and XbaI And then ligate. The ligation mixture was transformed into E. coli strain SURE (Stratagene Cl oning Systems, 11099 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037 Possible), and then incubate the transformed cultures for ampicillin resistance Plate onto ampicillin media plates that allow colonies to grow. Plasmid DNA was isolated from the resistant colonies and the T1R-like ligand II-encoded fragment Is tested for the presence of the fragment by restriction analysis and gel size fraction.   For expression of recombinant T1R-like ligand II, COS cells were prepared as described, for example, in Sambrook et al. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, Co Using DEAE-DEXTRAN described in ld Spring Harbor, New York (1989), Transfected with an expression vector. Expression of huXAG-1 by vector in cells Incubate under conditions for   Expression of a T1R-like ligand II HA fusion protein is described, for example, in Harlow et al., Antibodi. es: A Laboratory Manual, 2nd edition; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Radiolabeling and immunoprecipitation using the method described in Spring Harbor, New York (1988). Detect by descending method. To achieve this goal, two days after transfection And the cells35By incubating for 8 hours in a medium containing S-cysteine Sign. Harvest cells and media, wash cells, and use Wilson et al. Detergent-containing RIPA buffer as described in (cited above): 150 mM Na Dissolved in Cl, 1% NP-40, 0.1% SDS, 1% NP-40, 0.5% DOC, 50mM TRIS, pH 7.5 I do. Proteins are lysed and cultured using HA-specific monoclonal antibodies. Settle out of the nutrient medium. Then, the precipitated protein was subjected to SDS-PAGE gel and Analyze by triradiography. Cell lysis of expression product of expected size , Which is not observed in the negative control. Example 3 (b): Cloning and expression in CHO cells   The vector pC4 is used for the expression of the T1R-like ligand II protein. Plastic Smid pC4 is a derivative of plasmid pSV2-dhfr (ATCC Accession No. 37146). This Contains the mouse DHFR gene under the control of the SV40 early promoter. Tea lacking dihydrofolate activity transfected with these plasmids Inish hamster ovary cells or other cells receive the chemotherapeutic drug methotrexate. Grow cells in supplemented selection medium (α minus MEM, Life Technologies) Can be selected by In cells that are resistant to methotrexate (MTX) Amplification of the DHFR gene has been well documented (eg, Alt, F.W., Kellems, R. et al. M., Bertino, J.R. and Schimke, R.T., 1978, J.M. Biol. Chem. 253: 1357-1370 , Hamlin, J.L. and Ma, C. 1990, Biochem. et Biophys. Acta, 1097: 107-143, P See age, M.J. and Sydenham, M.A. 1991, Biotechnology 9: 64-68. ). Cell growth at increasing concentrations of MTX was targeted as a result of DHFR gene amplification. Overproduction of the enzyme DHFR results in resistance to the drug. The second gene is DH When linked to the FR gene, it is usually co-amplified and over-expressed. Heredity Developing cell lines with more than 1,000 copies of offspring is state of the art. Continued Therefore, if methotrexate is removed, the cell line will be chromosomal (single or multiple). )).   Plasmid pC4 is used for Rous sarcoma virus (Cullen et al., Molecular and Cellulor biology., March 1985, 438-4470) A powerful promoter for the purpose of long terminal repeats (LTRs). Gene and human cytomegalovirus (CMV) (Boshart et al., Cell 41: 521-530,1985) fragment isolated from the immediate-early gene enhancer. Including gene expression. Downstream of the promoter allows for subsequent gene uptake Single restriction enzyme cleavage site for BamHI, PvuII and NruI. These cloni Behind the reading site, the plasmid contains transcriptional readings in all three reading frames. Top codon followed by the 3 'intron of the rat preproinsulin gene and Contains a polyadenylation site. Other high efficiency promoters are also used for expression (Eg, the human β-actin promoter, SV40 early or late promoter). Long terminal repeats from other retroviruses (eg, HIV and HTLVI) ). Due to polyadenylation of mRNA, other signals (eg, human growth hormone) Or from the globin gene) can be used as well.   Stable cell lines with the gene of interest inserted into the chromosome can also be used as selectable markers. (Eg, gpt, G418, or hygromycin) You can make a selection based on: Two or more selectable markers at the start (eg, G418 and And methotrexate).   Plasmid pC4 is digested with the restriction enzyme BamHI, followed by bovine intestinal phosphatase. And dephosphorylation by procedures known in the art. The vector is then % Agarose gel.   A DNA sequence encoding a T1R-like ligand II protein is PCR oligos specific for the amino terminal sequence of the protein and the 3 'vector sequence of the gene Amplify using nucleotide primers. System to facilitate cloning Additional nucleotides, including restriction sites, are added to the 5 'and 3' sequences, respectively.   The cDNA sequence encoding full-length T1R-like ligand II was replaced with the 5 'and 3' sequences of the gene. Amplify using the corresponding PCR oligonucleotide primers. The 5 'primer is , Sequence 5 'CGCGGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 '(SEQ ID NO: 6) This is an underlined BamHI restriction enzyme site, followed by the Tam in FIG. 1 (SEQ ID NO: 1). Includes 18 nucleotides (nucleotides 55-72) of the sequence of 1R-like ligand II. Expression Amplification encoding human T1R-like ligand II inserted into a vector (described below) The 5 'end of the resulting fragment provides an effective signal peptide. Eukaryote Signal sufficient for translation initiation in cells (Kozak, M., J. Mol. Biol. 196: 9 47-950 (1987)) in the vector portion of the construct .   The 3 'primer has the sequence 5' GCGGGT ACC TCA CAA TGT TAC GTA CTC TAG 3 '(distribution Column number 7), which is underlined Asp718 restriction, followed by a stop codon and Nucleotides 754-771 of the T1R-like ligand II coding sequence of FIG. Includes reverse as well as complementary 17 nucleotides. The restriction site is CHO expression vector PC-4 Is convenient for the restriction enzyme site.   The cDNA sequence encoding the extracellular domain of full-length T1R-like ligand II Amplify using PCR oligonucleotide primers corresponding to the 'and 3' sequences.   The 5 'primer has the sequence 5' CGCGGA TCC GCC ATC ATG GGC GAC AAG ATC TGG 3 ' (SEQ ID NO: 6), which is an underlined BamHI restriction enzyme site and FIG. 18 nucleotides (nucleotides 55 to 72) of the sequence of T1R-like ligand II of SEQ ID NO: No. 1). T1R-like ligand II inserted into an expression vector (described below) The 5 'end of the encoded amplified fragment provides an effective signal peptide You. Signals effective for translation initiation in eukaryotic cells (Kozak, M., J. Mo. l. Biol. 196: 947-950 (1987)) in the vector portion of the construct. Place properly.   The 3 'primer has the sequence 5' CGCGGT ACC TCA TCT ATC AAA GTT GCT TTC 3 '(distribution Column number 8), which is underlined Asp718 restriction, followed by a stop codon and Figure 1 (SEQ ID NO: 1) reverse to nucleotides 619-636 of the T1R-like ligand I coding sequence And 18 complementary nucleotides.   The amplified T1R-like ligand II DNA is digested with BamHI and Asp718. vector pC4 is digested with BamHI, and the digested DNA is ligated together. Then isolated Ligated fragment and dephosphorylated vector with T4 DNA ligase. T1R Insertion of ligand II protein DNA into a BamHI restricted vector is a T1R-like The Gand II protein coding region is placed downstream of the vector promoter and And operably linked to a vector promoter. Then, E. coli HB101 cells And the plasmid inserted in the correct orientation using the restriction enzyme BamHI. Bacteria containing pC4 are identified. The ligation mixture can be used, for example, in Sambrook et al., MOLECUAR CL ONING: A LABORATORY MANUAL, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Using standard procedures as described in Cold Spring Harbor, N.Y. (1989), Transform competent E. coli cells. Transform the culture into ampicillin medium Plate on plate, then incubate to allow ampicillin resistant colonies Allows Ronnie to grow. Plasmid DNA was isolated from resistant colonies and Restriction analysis and gel determination of the sequence of the 1R-like ligand II coding fragment Test by doing. The sequence of the inserted gene is confirmed by DNA sequencing. Admit. Transfection of CHO-DHFR cells   Transferring Chinese hamster ovary cells lacking active DHFR enzyme Used for action. 5 μg of expression plasmid C4 was lipofected (Felgner et al., Supra) using 0.5 μg of plasmid pSV2-neo for simultaneous tracing. Transfect. Plasmid pSV2-neo contains a dominant selectable marker (a group of It contains the gene neo) from Tn5 which encodes an enzyme that confers resistance to antibiotics. cell Are seeded in α-minus MEM supplemented with 1 mg / ml G418. After 2 days, try to remove cells Shin-treated and seeded on hybridoma cloning plates (Greiner, Germany) And culture for about 10-14 days. The single clone is then trypsinized, Then different concentrations of methotrexate (25 nM, 50 nM, 100 nM, 200 nM, 400 nM) To seed a 6-well petri dish or 10 ml flask. Then the highest concentration Clones that grow on methotrexate are replaced with higher concentrations of methotrexate (50 (NM, 1 μM, 2 μM, 5 μM). Same procedure Is repeated until the clones grow at a concentration of 100 μM.   Expression of the desired gene product can be determined, for example, by SDS-PAGE and Western blot analysis. Analyze by Expression of a T1R-like ligand II fusion protein is determined, for example, by Harlo w et al., Antibodies: A Laboratory Manual, 2nd edition; Cold Spring Harbor Laboratory  Press, Cold Spring Harbor, New York (1988) Detection by immunological precipitation and immunoprecipitation. For this purpose, transfection Two days after, the cells are358 hours incubation in medium containing S-cysteine Label with Harvest cells and media and wash cells, and Wils detergent containing RIPA buffer (150 mM Na Dissolved in Cl, 1% NP-40, 0.1% SDS, 1% NP-40, 0.5% DOC, 50mM TRIS (pH 7.5) Let it. The protein was lysed and analyzed using a HA-specific monoclonal antibody. And precipitate from the cell culture medium. Then, the precipitated protein was subjected to SDS-PAGE gel and And analyzed by autoradiography. Transfer the expression product of the expected size to the cell. Found in the lysate, which is found in the negative control Absent. Example 4: T1R-like ligand II tissue expression tissue distribution   Northern blot analysis was performed and described, inter alia, in Sambrook et al. (Cited above). Thus, using the method described, the T1R-like ligand II gene in human tissues Test expression levels. The complete T1R-like ligand II nucleotide sequence of the invention ( A cDNA probe (SEQ ID NO: 1) containing SEQ ID NO: 1) wasTMDNA labeling system (Am ersham Life Science) according to the manufacturer's instructions32Label with P. After labeling, the probe was changed to CHROMA SPIN-100.TMColumns (Clontech Laboratories, Inc. ) According to the manufacturer's protocol number PT1200-1. Then Expression of T1R-like ligand II gene using purified labeled probe Test various human tissues.   Multi-tissue Northern (MTN) containing various human tissues (H) and human immune system tissues (IM) ) Blots were obtained from Clontech and ExpressHybTM Hybridization Solutio n (Clontech) according to the manufacturer's protocol number PT1190-1 Test with probe. Following hybridization and washing, blots are Mount and expose to film overnight at -70 ° C and follow standard procedures To develop the film.   The present invention may be practiced other than as specifically described in the foregoing description and examples. Is obvious.   Numerous modifications and variations of the present invention are possible in light of the above teachings, It is within the scope of the appended claims.   The entire disclosure of all publications incorporated herein by reference is incorporated herein by reference. Incorporated as a reference.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C07K 16/28 C07K 16/28 C12N 1/15 C12N 1/15 1/19 1/19 1/21 1/21 5/10 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/68 Z C12Q 1/68 G01N 33/53 D G01N 33/53 M 33/566 33/566 C12P 21/08 // C12P 21/08 C12N 5/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),EA(AM,AZ,BY ,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AM,AU ,BG,BR,BY,CA,CN,CZ,EE,FI, GE,HU,IL,JP,KG,KP,KR,KZ,L T,LV,MD,MN,MX,NO,NZ,PL,RO ,RU,SG,SI,SK,TJ,TM,TR,UA, US,UZ,VN (72)発明者 ジェンツ,ライナー エル. アメリカ合衆国 メリーランド 20904, シルバー スプリング,フェアランド パ ーク ドライブ 13404 (72)発明者 ルーベン,スティーブン エム. アメリカ合衆国 メリーランド 20832, オルニー,ヘリテイジ ヒルズ ドライブ 18528──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C07K 16/28 C07K 16/28 C12N 1/15 C12N 1/15 1/19 1/19 1/21 1 / 21 5/10 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/68 Z C12Q 1/68 G01N 33/53 D G01N 33/53 M 33/566 33/566 C12P 21/08 // C12P 21/08 C12N 5 / 00 A (81) Designated countries EP (AT, BE, CH, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), EA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM), AM, AU, BG, BR, BY, CA, CN, CZ, EE, FI, GE, HU, IL, JP, KG, KP, KR , KZ, LT LV, MD, MN, MX, NO, NZ, PL, RO, RU, SG, SI, SK, TJ, TM, TR, UA, US, UZ, VN (72) Inventor Genz, Rainer L. USA Maryland 20904, Silver Spring, Fairland Park Drive 13404 (72) Inventor Leuven, Stephen M. Maryland, United States 20832, Olney, Heritage Hills Drive 18528

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1.以下からなる群から選択される配列に少なくとも95%同一であるヌクレオチ ド配列を有するポリヌクレオチドを含有する単離された核酸分子: (a)図1(配列番号2)に示されるアミノ酸配列を有するか、またはATCC受託番 号第98655号に含まれるcDNAクローンによってコードされる、全長T1R様リガンド IIポリペプチドをコードするヌクレオチド配列; (b)図1(配列番号2)に示されるアミノ酸配列を有するか、またはATCC受託番 号第98655号に含まれるcDNAクローンによってコードされる、成熟T1R様リガンド IIポリペプチドをコードするヌクレオチド配列; (c)図1(配列番号2)に示されるアミノ酸配列を有するか、またはATCC受託番 号第98655号に含まれるcDNAクローンによってコードされる、T1R様リガンドII細 胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列; (d)図1(配列番号2)に示されるアミノ酸配列を有するか、またはATCC受託番 号第98655号に含まれるcDNAクローンによってコードされる、T1R様リガンドII膜 貫通ドメインをコードするヌクレオチド配列; (e)図1(配列番号2)に示されるアミノ酸配列を有するか、またはATCC受託番 号第98655号に含まれるcDNAクローンによってコードされる、T1R様リガンドII細 胞内ドメインをコードするヌクレオチド配列; (f)(a)、(b)、(c)、(d)または(e)のポリヌクレオチドのいずれか1つのヌクレ オチド配列に相補的であるヌクレオチド配列。 2.前記ポリヌクレオチドが、膜貫通ドメインの全てまたは一部が欠失されてい るT1R様リガンドIIポリペプチド細胞外ドメインおよび細胞内ドメインをコード する配列に少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を有する、請求項1に記 載の核酸分子。 3.請求項1に記載の(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、または(f)のヌクレオチド配列 と同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドに、ストリンジェントなハ イブリダイゼーション条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む単離 された核酸分子であって、ハイブリダイズする該ポリヌクレオチドが、ストリン ジェントなハイブリダイゼーション条件下で、A残基のみまたはT残基のみから なるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにはハイブリダイズしない、単 離された核酸分子。 4.請求項1に記載の(a)、(b)、(c)、(d)、または(e)のアミノ酸配列を有するT 1R様リガンドIIポリペプチドのエピトープ保有部分のアミノ酸配列をコードする ポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。 5.以下からなる群から選択されるT1R様リガンドIIポリペプチドのエピトープ 保有部分をコードする、請求項4に記載の単離された核酸分子:図1(配列番号 2)の約43〜約52のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1(配列番号2)の約 82〜約98のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1(配列番号2)の約129〜約1 46のアミノ酸残基を含むポリペプチド;約162〜約175のアミノ酸残基を含むポリ ペプチド;および約181〜約197のアミノ酸残基を含むポリペプチド。 6.請求項1に記載の単離された核酸分子をベクターに挿入する工程を包含する 、組換えベクターを作製する方法。 7.請求項6に記載の方法によって産生される、組換えベクター。 8.請求項7に記載の組換えベクターを宿主細胞を導入する工程を包含する、組 換え宿主細胞を作製する方法。 9.請求項8に記載の方法によって産生される組換え宿主細胞。 10.ポリペプチドを産生するための組換え方法であって、請求項9に記載の宿 主細胞を、該ポリペプチドが発現されるような条件下で培養する工程、および該 ポリペプチドを回収する工程を包含する、方法。 11.以下からなる群から選択される配列に少なくとも95%同一であるアミノ酸 配列を有する単離されたT1R様リガンドIIポリペプチド: (a)図1(配列番号2)に示されるか、またはATCC受託番号第98655号に含まれる cDNAクローンによってコードされる全長T1R様リガンドIIボリペプチドのアミノ 酸配列; (b)図1(配列番号2)に示されるか、またはATCC受託番号第98655号に含まれる cDNAクローンによってコードされる成熟T1R様リガンドIIポリペプチドのアミノ 酸配列; (c)図1(配列番号2)に示されるか、またはATCC受託番号第98655号に含まれる cDNAによってコードされるT1R様リガンドIIポリペプチド細胞外ドメインのアミ ノ酸配列; (d)図1(配列番号2)に示されるか、またはATCC受託番号第98655号に含まれる cDNAによってコードされるT1R様リガンドIIポリペプチド膜貫通ドメインのアミ ノ酸配列; (e)図1(配列番号2)に示されるか、またはATCC受託番号第98655号に含まれる cDNAによってコードされるT1R様リガンドIIポリペプチド細胞内ドメインのアミ ノ酸配列; (f)図1(配列番号2)に示されるか、またはATCC受託番号第98655号に含まれる cDNAによってコードされるT1R様リガンドIIポリペプチド細胞外ドメインおよび 細胞内ドメインのアミノ酸配列であって、膜貫通ドメインの全てまたは一部が欠 失されている、アミノ酸配列;および (g)(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、または(f)のポリペプチドのいずれか1つのエ ピトープ保有部分のアミノ酸配列。 12.T1R様リガンドIIタンパク質のエピトープ保有部分を含む単離されたポリ ペプチドであって、該部分が以下からなる群から選択される、単離されたポリペ プチド:図1(配列番号2)の約43〜約52のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図 1(配列番号2)の約82〜約98のアミノ酸残基を含むポリペプチド;図1(配列 番号2)の約129〜約146のアミノ酸残基を含むポリペプチド;約162〜約175のア ミノ酸残基を含むポリペプチド;および約181〜約197のアミノ酸残基を含むポリ ペプチド。 13.請求項11に記載のT1R様リガンドIIポリペプチドに特異的に結合する、 単離された抗体。 14.増大したレベルのT1R様リガンドII活性の必要性を有する個体を処置する 方法であって、該個体に請求項11に記載の単離されたポリペプチドを含む組成 物を投与する工程を含む、方法。 15.減少したレベルのT1R様リガンドII活性の必要性を有する個体を処置する 方法であって、該個体に請求項13に記載の単離された抗体を含む組成物を投与 する工程を含む、方法。 16.障害の診断の間に有用である方法であって: (a)個体の細胞または体液におけるT1R様リガンドII遺伝子発現レベルを測定す る工程; (b)該個体のT1R様リガンドII遺伝子発現レベルと標準的なT1R様リガンドII遺 伝子発現レベルとを比較し、それによって該標準を上回るT1R様リガンドII遺伝 子発現レベルにおける増大または減少が、T1R様リガンドII関連障害の指標であ る、工程、 を包含する、方法。[Claims] 1. A nucleotide that is at least 95% identical to a sequence selected from the group consisting of: Nucleic acid molecule containing a polynucleotide having a nucleotide sequence:   (a) has the amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or has an ATCC accession number No. 98655, full length T1R-like ligand encoded by the cDNA clone contained in A nucleotide sequence encoding a II polypeptide;   (b) has the amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or has an ATCC accession number No. 98655, mature T1R-like ligand encoded by the cDNA clone contained in A nucleotide sequence encoding a II polypeptide;   (c) has the amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or has an ATCC accession number No. 98655, encoded by a cDNA clone contained in T1R-like ligand II A nucleotide sequence encoding an extracellular domain;   (d) has the amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or has an ATCC accession number No. 98655, encoded by the cDNA clone contained in T1R-like ligand II membrane A nucleotide sequence encoding a transduction domain;   (e) has the amino acid sequence shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or has an ATCC accession number No. 98655, encoded by a cDNA clone contained in T1R-like ligand II A nucleotide sequence encoding an intracellular domain;   (f) a nucleic acid of any one of the polynucleotides of (a), (b), (c), (d) or (e); A nucleotide sequence that is complementary to an otide sequence. 2. The polynucleotide has all or part of the transmembrane domain deleted. Encoding extracellular and intracellular domains of T1R-like ligand II polypeptides 2. The method of claim 1, wherein the nucleotide sequence is at least 95% identical to the corresponding sequence. Nucleic acid molecules listed. 3. The nucleotide sequence of (a), (b), (c), (d), (e), or (f) according to claim 1. A polynucleotide having the same nucleotide sequence as Isolation involving polynucleotides that hybridize under hybridization conditions A nucleic acid molecule, wherein the hybridizing polynucleotide is a string Under gentle hybridization conditions, only A residue or T residue Does not hybridize to a polynucleotide having the nucleotide sequence of Isolated nucleic acid molecule. 4. The T having the amino acid sequence of (a), (b), (c), (d), or (e) according to claim 1. Encodes the amino acid sequence of the epitope-bearing portion of the 1R-like ligand II polypeptide An isolated nucleic acid molecule, including a polynucleotide. 5. An epitope of a T1R-like ligand II polypeptide selected from the group consisting of: 5. The isolated nucleic acid molecule of claim 4, which encodes a retaining moiety: Figure 1 (SEQ ID NO: 2) a polypeptide comprising about 43 to about 52 amino acid residues; FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) A polypeptide comprising 82 to about 98 amino acid residues; about 129 to about 1 in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) A polypeptide comprising 46 amino acid residues; a polypeptide comprising about 162 to about 175 amino acid residues A peptide; and a polypeptide comprising about 181 to about 197 amino acid residues. 6. Inserting the isolated nucleic acid molecule of claim 1 into a vector. , A method for producing a recombinant vector. 7. A recombinant vector produced by the method of claim 6. 8. A method comprising introducing a host cell into the recombinant vector according to claim 7. A method for producing a recombinant host cell. 9. A recombinant host cell produced by the method of claim 8. 10. A recombinant method for producing a polypeptide, wherein the inn according to claim 9 is used. Culturing the main cells under conditions such that the polypeptide is expressed; and A method comprising recovering the polypeptide. 11. An amino acid that is at least 95% identical to a sequence selected from the group consisting of: An isolated T1R-like ligand II polypeptide having the sequence:   (a) shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or included in ATCC Accession No. 98655 Amino acids of full-length T1R-like ligand II polypeptide encoded by a cDNA clone Acid sequence;   (b) shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or included in ATCC Accession No. 98655 Amino acid of mature T1R-like ligand II polypeptide encoded by cDNA clone Acid sequence;   (c) shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or included in ATCC Accession No. 98655 Amino acids in the extracellular domain of the T1R-like ligand II polypeptide encoded by the cDNA No acid sequence;   (d) shown in Figure 1 (SEQ ID NO: 2) or included in ATCC Accession No. 98655 T1R-like ligand II polypeptide encoded by cDNA No acid sequence;   (e) shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or included in ATCC Accession No. 98655 T1R-like ligand II polypeptide encoded by cDNA No acid sequence;   (f) as shown in FIG. 1 (SEQ ID NO: 2) or included in ATCC Accession No. 98655 T1R-like ligand II polypeptide extracellular domain encoded by cDNA and The amino acid sequence of the intracellular domain, wherein all or part of the transmembrane domain is missing. Missing amino acid sequence; and   (g) an antibody to any one of the polypeptides of (a), (b), (c), (d), (e), or (f). Amino acid sequence of pitope-bearing part. 12. An isolated polyprotein comprising an epitope-bearing portion of a T1R-like ligand II protein An isolated polypeptide, wherein said moiety is selected from the group consisting of: Peptide: a polypeptide comprising about 43 to about 52 amino acid residues of FIG. 1 (SEQ ID NO: 2); 1 (SEQ ID NO: 2) comprising about 82 to about 98 amino acid residues; No. 2) a polypeptide comprising about 129 to about 146 amino acid residues; A polypeptide comprising an amino acid residue; and a polypeptide comprising from about 181 to about 197 amino acid residues. peptide. 13. Specifically binds to the T1R-like ligand II polypeptide of claim 11, An isolated antibody. 14. Treating individuals with a need for increased levels of T1R-like ligand II activity A method comprising: wherein the individual comprises the isolated polypeptide of claim 11. Administering a substance. 15. Treating individuals with a need for reduced levels of T1R-like ligand II activity A method comprising administering to said individual a composition comprising the isolated antibody of claim 13. A method comprising the steps of: 16. Methods that are useful during the diagnosis of a disorder:   (a) measuring the T1R-like ligand II gene expression level in the cells or body fluids of the individual Step;   (b) the T1R-like ligand II gene expression level of the individual and the standard T1R-like ligand II Gene expression level, thereby comparing T1R-like ligand II An increase or decrease in offspring expression levels is indicative of a T1R-like ligand II-related disorder. Process A method comprising:
JP10510698A 1996-08-23 1996-08-23 T1 receptor-like ligand II Withdrawn JP2001500724A (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/US1996/013768 WO1998007754A1 (en) 1996-08-23 1996-08-23 T1 receptor-like ligand ii

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2001500724A true JP2001500724A (en) 2001-01-23
JP2001500724A5 JP2001500724A5 (en) 2004-09-24

Family

ID=22255671

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP10510698A Withdrawn JP2001500724A (en) 1996-08-23 1996-08-23 T1 receptor-like ligand II

Country Status (5)

Country Link
EP (1) EP0963205A4 (en)
JP (1) JP2001500724A (en)
AU (1) AU7235296A (en)
CA (1) CA2263832A1 (en)
WO (1) WO1998007754A1 (en)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6605271B2 (en) 1996-08-23 2003-08-12 Human Genome Sciences, Inc. T1 receptor-like ligand II and uses thereof
WO2001042506A1 (en) * 1999-12-10 2001-06-14 Human Genome Sciences, Inc. T1 receptor-like ligand ii and uses thereof
WO2002038794A2 (en) 2000-11-09 2002-05-16 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Cardiovascular disease diagnostic and therapeutic targets
US7670769B2 (en) 2002-05-09 2010-03-02 The Brigham And Women's Hospital, Inc. IL1RL-1 as a cardiovascular disease marker and therapeutic target
JP5383480B2 (en) 2006-04-24 2014-01-08 クリティカル ケア ダイアグノスティクス インコーポレイテッド Predict fatality and detect serious disease
EP3059594A1 (en) 2006-05-01 2016-08-24 Critical Care Diagnostics, Inc. Prognosis of cardiovascular disease
US8147817B2 (en) 2006-05-04 2012-04-03 The Brigham And Women's Hospital, Inc. IL-33 in the treatment and diagnosis of diseases and disorders
PT2660599E (en) 2008-04-18 2014-11-28 Critical Care Diagnostics Inc Predicting risk of major adverse cardiac events
SG11201501271TA (en) 2012-08-21 2015-03-30 Critical Care Diagnostics Inc Multimarker risk stratification

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU6163094A (en) * 1993-01-29 1994-08-15 Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services, The Cloning and expression of plasmodium falciparum transmission-blocking target antigen, pfs230
AU4809497A (en) * 1996-10-04 1998-04-24 Genetics Institute Inc. Secreted proteins

Also Published As

Publication number Publication date
CA2263832A1 (en) 1998-02-26
WO1998007754A1 (en) 1998-02-26
EP0963205A4 (en) 2002-10-02
AU7235296A (en) 1998-03-06
EP0963205A1 (en) 1999-12-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR100497017B1 (en) Highly induced molecule II
KR20000052796A (en) Neutrokine alpha
EP2025682A2 (en) Human endokine alpha
JP2001510035A (en) Interleukin-20
JP2002508652A (en) Novel human growth factor
US6171816B1 (en) Human XAG-1 polynucleotides and polypeptides
JP2002537796A (en) Human glycosylation enzyme
US6521742B2 (en) Human endokine alpha
JP2001500724A (en) T1 receptor-like ligand II
JP2001509663A (en) Human tumor necrosis factor receptor-like gene
US6232100B1 (en) Cortistatin Polypeptides
JP2002508166A (en) Human Dendriac and Brainiac-3
JP2001513641A (en) T1 / ST2-receptor ligand III
US7495084B2 (en) Antibodies to T1 receptor-like ligand II
JP2001504336A (en) Connective tissue growth factor-3
WO1997018224A1 (en) Human stem cell antigen 2
US7994284B2 (en) Connective tissue growth factor (CTGF-3) polypeptides
US7109306B2 (en) Antibodies to human oncogene induced secreted protein I
JP2002514051A (en) T1 receptor-like ligand I
US20020119487A1 (en) Human stem cell antigen 2
US8110659B1 (en) Human tumor necrosis factor receptor-like genes
US20050287606A1 (en) T1 receptor-like ligand I
JP2004041212A (en) T1 receptor-like ligand i
US20060142199A1 (en) CD-44 like protein
NZ514393A (en) Use of antibodies that bind to the endokine alpha polypeptide so as to decrease the level of endokine alpha activity in situ

Legal Events

Date Code Title Description
A761 Written withdrawal of application

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A761

Effective date: 20060303