JP2001149074A

JP2001149074A - 新規ｔｂｐ結合蛋白質

Info

Publication number: JP2001149074A
Application number: JP33207399A
Authority: JP
Inventors: Tsukasa Oda; 司小田; Masaaki Muramatsu; 正明村松
Original assignee: Helix Research Institute
Current assignee: Helix Research Institute
Priority date: 1999-11-22
Filing date: 1999-11-22
Publication date: 2001-06-05

Abstract

(57)【要約】【課題】 TATA結合蛋白質に結合し転写を制御する活性
を有する新規な脊椎動物由来の蛋白質およびその遺伝
子、並びにそれらの製造および用途を提供する。【解決手段】 TATA結合蛋白質（TBP）に結合し、クラ
スIIプロモーターの転写活性を in vitro および in vi
vo で増強する新規核蛋白質「ABT1」を同定することに
成功した。また、「ABT1」蛋白質に結合する新規蛋白質
「I62」を同定した。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【発明の属する技術分野】本発明は、TATA結合蛋白質に
結合し転写を制御する活性を有する新規な蛋白質、該蛋
白質に結合する蛋白質、およびそれらの遺伝子、並びに
それら分子の製造および用途に関する。

【０００２】

【従来の技術】真核生物のほとんどの遺伝子は、発生の
各段階や細胞周期、細胞環境の変化に対する応答などに
おいて、その発現が調節されている。RNAポリメラーゼI
I（polII）により転写される、蛋白質をコードする遺伝
子は、主に転写レベルで調節されている（Roeder, R.G.
(1996) Trends Biochem. Sci., 21, 327-335; Bjorklu
nd, S. and Kim, Y.-J. (1996) Trends Biochem. Sci.,
21, 335-337; Chang,M. and Jaehning, J.A. (1997) N
ucleic Acids Res., 25, 4861-4865）。そしてRNA pol
IIの転写制御は、特定のDNA配列とこれらの配列上にア
センブルした蛋白質因子群により行われている（Roede
r, R.G. (1996) Trends Biochem. Sci., 21, 327-335;
Bjorklund, S. and Kim, Y.-J. (1996) Trends Bioche
m. Sci.,21, 335-337; Verrijzer, C.P. and Tjian, R.
(1996) Trends Biochem. Sci.,21, 338-342; Kaiser,
K. and Meisterernst, M. (1996) Trends Biochem. Sc
i., 21, 342-345; Sauer, F. and Tjian, R. (1997) Cu
rr. Opin. Genet. & Dev., 7, 176-181; Lee, T.I. and
Young, R.A. (1998) Genes Dev., 12, 1398-1408）。D
NA配列には、１）RNA pol II、および TFIIA、B、D、
E、F、およびH などの基本転写因子群（general transc
ription factors; GTF群）がアセンブルしてプレイニシ
エーションコンプレックスを形成する共通コアプロモー
ター配列、２）調節因子により認識される遺伝子特異的
DNA配列、の２つのタイプが存在する（Roeder, R.G. (1
996) Trends Biochem. Sci., 21, 327-335; Sauer, F.
and Tjian, R. (1997) Curr. Opin. Genet. & Dev., 7,
176-181）。このスキームによると、RNA pol II およ
び対応するGTF群は、コアプロモーターからの固有基本
転写を低いレベルで誘導（initiate）することができ
る。この基本転写機構は、様々な遺伝子や細胞型に特異
的な調節因子の究極的な標的であり、これらの調節因子
によりポジティブなシグナルやネガティブなシグナルが
伝えられ、転写活性が調節される。

【０００３】TATA結合蛋白質（TBP）は、遺伝子発現の
基本調節や遺伝子特異的な調節に重要な役割を果たして
いる様々な因子群と結合している。例えば、TFIIDはも
ともと必須なGTFとして同定されたが、これはTBPがTBP
結合因子群（TBP-associatedfactors; TAF_II群）と結合
して形成されたものである（Horikoshi, M. et al. (19
89) Nature, 341, 299-303; Hoey, T. et al. (1990) C
ell, 61, 1179-1186;Kao, C.C. et al. (1990) Scienc
e, 248, 1646-1650; Hoffmann, A. et al. (1990b) Nat
ure, 346, 387-390）。このTBPは、TAF_II群と共に転写
調節因子とのコミュニケーションや基本転写機構におい
て鍵となる役割を果たしている（Verrijzer, C.P. and
Tjian, R. (1996) Trends Biochem. Sci., 21, 338-34
2）。TFIIDとTBPは共に、TATAを含むプロモーターの基
本転写を媒介する能力を持つが、精製された系ではTFII
Dだけが活性化された転写を媒介することができる（Pug
h, B.F. and Tjian, R. (1990) Cell, 61, 1187-1197;
Verrijzer, C.P. and Tjian,R. (1996) Trends Bioche
m. Sci., 21, 338-342）。TAF_II群は、活性化された転
写を媒介するコアクチベーターであると考えられてきた
が、最近の研究から、TAF_II群は、コアプロモーター選
択的基本転写（Shen, W.-C. and Green, M.R. (1997) C
ell, 90, 615-624; Martinez, E. et al. (1998) Mol.
Cell. Biol., 18, 6571-6583）、ヒストンアセチルトラ
ンスフェラーゼ（HAT）活性（Mizzen, C.A. et al. (19
96) Cell, 87, 1261-1270）、およびTFIIFのリン酸化
（Dikstein,R. et al. (1996) Cell, 84, 781-790）を
含む複数の機能を有していることが示された。TAF_II群
はTBP結合能を基に同定され、18-250kDaの分子量の複数
の蛋白質から構成される（Verrijzer, C.P. and Tjian,
R. (1996) Trends Biochem.Sci., 21, 338-342; Lee,
T.I. and Young, R.A. (1998) Genes Dev., 12, 1398-1
408）。主要なTAF_II群は酵母、ハエ、および哺乳動物で
クローニングされており、これらのカウンターパートの
ほとんどは進化的に高度に保存されている。12の酵母TA
F_II群のうち11は、細胞の生存に必須である（Lee, T.I.
and Young,R.A. (1998) Genes Dev., 12, 1398-1408）
ことは、TAF_II群が真核生物の転写において重要である
ことを示している。

【０００４】TBPはTAF_II群に結合するだけでなく、c-fo
s（Ransone, L.J. et al. (1993) Gene Expr, 3, 37-4
8; Metz, R. et al. (1994) Mol. Cell. Biol., 14, 60
21-6029）、c-myc（Hateboer, G. et al. (1993) Proc.
Natl. Acad. Sci. USA, 90,8489-8493; Maheswaran,
S. et al. (1994) Mol. Cell. Biol., 14, 1147-115
2）、およびp53（Seto, E. et al. (1992) Proc. Natl
Acad. Sci. USA, 89, 12028-12032; Truant, R. et al.
(1993) J. Biol. Chem., 268, 2284-2287）などの因子
とも結合する。ごく最近になり、クラスII遺伝子群を制
御する他のTBP結合蛋白質、例えばSAGA（Eisenmann, D.
M. et al. (1992) Genes Dev., 6, 1319-1331; Barlev,
N.A. et al. (1995) J. Biol. Chem., 270, 19337-193
44; Saleh, A. et al. (1997) J. Biol. Chem.,272, 55
71-5578）、MotI（Auble, D.T. and Hahn, S. (1993) G
enes Dev., 7, 844-856; Auble, D.T. et al. (1994) G
enes Dev., 8, 1920-1934; Wade, P.A. and Jaehning,
J.A. (1996) Mol. Cell. Biol., 16, 1641-1648）、NC2
（Meisterernst, M. and Roeder, R.G. (1991) Cell, 6
7, 557-567; Inostroza, J.A. (1992) Cell, 70, 477-4
89; Kim, T.K. et al. (1995) J. Biol. Chem., 270, 1
0976-10981; Goppelt, A. et al. (1996) EMBO J., 15,
3105-3116）、およびNOT群（Lee, T.I. et al. (1998)
Mol. Cell. Biol., 18, 4455-4462）が見出された。ク
ラスII遺伝子群の調節の多様性を考えると、TBPを介し
た転写調節に、さらに複数の因子が関与していることが
予想される。TBPは、複数の蛋白質群を大きな複合体に
アセンブルさせ、転写の開始と調節を行なわせるのに中
心的な働きをする因子と考えられている（Lee, T.I. an
d Young, R.A. (1998) Genes Dev., 12, 1398-1408）。
このような知見をさらに前進させるためには、TBPに結
合する蛋白質群や関連する他の因子を同定することが重
要である。

【０００５】

【発明が解決しようとする課題】本発明は、TATA結合蛋
白質に結合し転写を制御する活性を有する脊椎動物由来
の蛋白質、該蛋白質に結合する蛋白質、それらの遺伝
子、並びにそれら分子の製造および用途を提供する。

【０００６】

【課題を解決するための手段】本発明者らは、SHD（Od
a, T. et al. (1997) Oncogene, 15, 1255-1262）のSH2
ドメインを用いた酵母の2ハイブリッドスクリーニング
を行なった結果、同一遺伝子に由来する複数のcDNAクロ
ーンを単離した。ABT1と命名した代表クローンの塩基配
列を決定したところ、該クローンは、1276bpの塩基配列
からなり、269アミノ酸の潜在的なオープンリーディン
グフレームをコードしていた。

【０００７】ノーザンブロット解析の結果、ABT1はマウ
スの様々な組織においてユビキタスに発現しており、ま
た、データ−ベース検索の結果、ABT1には、C. elegans
および S. cerevisiaeのホモログの存在が見出され
た。これら事実から、ABT1は細胞で本質的な役割を果た
していることが示唆されたため、本発明者等は、次ぎ
に、ABT1欠損酵母を作製し、酵母におけるABT1遺伝子の
機能の検討を行なった。その結果、該酵母は、ABT1遺伝
子の欠損により増殖能を失ったため、ABT1は酵母におい
て必須遺伝子であることが示された。

【０００８】細胞内におけるABT1の局在をEGFP蛋白質を
レポーター蛋白質として利用して解析した結果、ABT1が
核蛋白質であることが判明した。また、ABT1蛋白質は、
そのN末端に特徴的な酸性に富む領域を持つことが見出
された。酸性に富む領域は多くの転写因子に見られ、転
写活性化ドメインとして作用することが証明されている
（例えば VP16、GAL4、GCN4、およびp53）（Hope, I.A.
and Struhl, K. (1986) Cell, 46, 885-894; Gill, G.
and Ptashne, M. (1987) Cell, 51, 121-126;Friedma
n, A.D. et al. (1988) Nature, 335, 454-454; Sadows
ki, I. et al.(1988) Nature, 3351 563-564; Truant,
R. et al. (1993) J. Biol. Chem., 268, 2284-2287; O
liner, J.D. (1993) Nature, 362, 857-860）。また、
多くの転写因子がTBPまたはTFIIDと相互作用することが
示されている。そこで、本発明者らは、ABT1が転写に関
与しているのではないかと考え、ABT1が転写因子として
機能することの証拠を得るため、ABT1がTBPと相互作用
をするか否かの検討を行なった。その結果、ABT1は、He
Laの核抽出液においてTBPと結合しており、また精製TBP
を用いた in vitro 実験においても TBPと結合すること
が判明した。さらに、細胞内で強発現させたABT1は、in
vivo において内在性TBPと免疫沈降にて共沈すること
が判明した。

【０００９】次に、ABTの一連の変異体を用いてTBPとの
結合に必要な領域の特定を試みた。その結果、マウスAB
T1のTBP結合領域は34-102残基を含む領域に存在してい
た。このドメインは異なる種間においてもよく保存され
ていることから、TBPとの相互作用は、この蛋白にとっ
て進化的に保存された特徴であることが示唆された。

【００１０】ABT1がTBPに結合することから、本発明者
らは、次ぎに、ABT1が転写調節に関与しているか否かを
検討した。まず、基本転写機構やそれに関連する因子を
アッセイするのに適している再構成無細胞転写系を用い
て、クラスIIプロモーターに対するこの蛋白質の機能を
調べた。精製RNA pol II、組換えTBP、TFIIB、およびTF
IIFを蛋白因子として用い、アデノウイルス主要後期プ
ロモーター（AdMLプロモーター）からの転写の活性化を
測定した結果、AdMLプロモーターからの in vitro 転写
は ABT1の用量に依存して3倍にまで上昇した。この結果
をABT1がTBPと結合するという事実と考え合わせると、A
BT1と基本転写機構の間で機能的な相互作用が起こるこ
とが示唆された。

【００１１】ABT1が無細胞系で基本転写レベルを増強す
ることから、本発明者らは、次ぎに、ABT1をトランスフ
ェクトした細胞においても作用できるかの検討を行なっ
た。その結果、ABT1を共発現させることで、転写は4倍
にまで増強された。この効果にエンハンサー配列は必要
でなく、この結果は、ABT1が in vitroで基本転写を活
性化できることと適合した。

【００１２】ABT1は、また、CRE、SRE、AP-1、およびNF
-κBなどのエンハンサーにより誘導されるレポーター遺
伝子の転写を、約3-8倍に増強した。この結果は、ABT1
は、CRE、SRE、AP-1、およびNF-κB シス調節配列によ
り支配されている調節された転写を媒介する調節因子や
コファクターとして機能しているのではないことを示唆
した。むしろ、これらのレポーター遺伝子で観察された
転写の活性化は、ABT1による基本転写の活性化によるも
のと考えられる。これらの結果は、調節因子特異的に作
用するTAF_II群と違い、TBPと結合し、基本転写を活性化
するABT1のユニークな特徴を示した。

【００１３】さらに本発明者らは、酵母の2ハイブリッ
ド系を利用して、ABT1蛋白質に結合する蛋白質のスクリ
ーニングを行い、ラット由来の新規な蛋白質「I62」を
単離することに成功した。I62蛋白質は核に存在し、そ
の核内局在はABT1蛋白質と一致していた。

【００１４】ABT1蛋白質がTBPに結合し、in vitro、in
vivo双方において基本転写を活性化する機能を有してい
ることから、該蛋白質は、細胞の転写レベルを制御し、
遺伝子の発現量を制御するために有用であると考えられ
る。また、I62などABT1に結合する分子により、同様の
制御を行うことが考えられる。これにより細胞の代謝や
増殖、生存を制御することも可能である。また、本発明
のABT1蛋白質またはI62蛋白質、それらの遺伝子、ある
いはこれら蛋白質の活性を制御する化合物等は、例えば
外来遺伝子の発現を上昇させたり、転写量の異常を伴う
各種疾患の治療などへの応用も期待される。

【００１５】本発明は、以上のような知見からなされた
ものであり、より具体的には、（１）TATA結合蛋白質
（TBP）およびDNAと結合し、クラスIIプロモーターから
の転写を活性化することができる、脊椎動物由来の蛋白
質をコードするDNA、（２）下記（ａ）から（ｄ）のい
ずれかに記載された、（１）に記載のDNA、（ａ）配列
番号：２または４に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質
をコードするDNA、（ｂ）配列番号：１または３に記載
の塩基配列のコード領域を含むDNA、（ｃ）配列番号：
２または４に記載のアミノ酸配列において１若しくは複
数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および／または付加
したアミノ酸配列を有する蛋白質をコードするDNA、
（ｄ）配列番号：１または３に記載の塩基配列からなる
DNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするD
NA、（３）配列番号：２または４に記載のアミノ酸配列
からなる蛋白質の部分ペプチドをコードするDNA、
（４）配列番号：４に記載のアミノ酸配列において34位
から102位のアミノ酸配列を含むペプチド、または配列
番号：２に記載のアミノ酸配列において36位から99位の
アミノ酸配列を含むペプチドをコードする、（３）に記
載のDNA、（５）（１）または（２）に記載のDNAにより
コードされるタンパク質に結合する活性を有するタンパ
ク質をコードする、下記（ａ）から（ｄ）のいずれかに
記載のDNA、（ａ）配列番号：２５に記載のアミノ酸配
列からなる蛋白質をコードするDNA、（ｂ）配列番号：
２４に記載の塩基配列のコード領域を含むDNA、（ｃ）
配列番号：２５に記載のアミノ酸配列において１若しく
は複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および／または
付加したアミノ酸配列からなる蛋白質をコードするDN
A、（ｄ）配列番号：２４に記載の塩基配列からなるDNA
とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDN
A、（６）配列番号：２５に記載のアミノ酸配列からな
る蛋白質の部分ペプチドをコードするDNA、（７）
（１）から（６）のいずれかにDNAが挿入されたベクタ
ー、（８）（７）に記載のベクターを保持する宿主細
胞、（９）（１）から（４）のいずれかに記載のDNAに
よりコードされる蛋白質、（１０）（５）または（６）
に記載のDNAによりコードされる蛋白質、（１１）
（８）に記載の宿主細胞を培養し、該細胞内で発現した
組み換え蛋白質を、該細胞またはその培養上清から回収
する工程を含む、（９）または（１０）に記載の蛋白質
の製造方法、（１２）（９）または（１０）に記載の蛋
白質に対する抗体、（１３）配列番号：１、３、または
２４に記載の塩基配列からなるDNAまたはその相補鎖に
相補的な少なくとも15ヌクレオチドを含むポリヌクレオ
チド、（１４）（９）または（１０）に記載の蛋白質に
結合する化合物をスクリーニングする方法であって、
（ａ）（９）または（１０）に記載の蛋白質に被検試料
を接触させる工程、（ｂ）該蛋白質と被検試料との結合
活性を検出する工程、（ｃ）該蛋白質に結合する活性を
有する化合物を選択する工程、を含む方法、（１５）ク
ラスIIプロモーターからの転写を調節するための化合物
をスクリーニングする方法であって、（ａ）被検試料存
在下で、（９）に記載の蛋白質とTATA結合蛋白質（TB
P）とを接触させる工程、（ｂ）（９）に記載の蛋白質
とTATA結合蛋白質（TBP）との結合活性を検出する工
程、（ｃ）被検試料非存在下の場合と比較して、該結合
活性を低下させる化合物を選択する工程、を含む方法、
（１６）クラスIIプロモーターからの転写を調節するた
めの化合物をスクリーニングする方法であって、（ａ）
被検試料存在下で、（９）に記載の蛋白質と（１０）に
記載の蛋白質とを接触させる工程、（ｂ）（９）に記載
の蛋白質と（１０）に記載の蛋白質との結合活性を検出
する工程、（ｃ）被検試料非存在下の場合と比較して、
該結合活性を低下させる化合物を選択する工程、を含む
方法、（１７）（２）および／または（５）に記載のDN
Aによりコードされる蛋白質の発現が改変されるように
操作された非ヒト脊椎動物、（１８）ノックアウト動物
またはトランスジェニック動物である、（１７）に記載
の非ヒト脊椎動物、（１９）マウスである、（１８）に
記載の非ヒト脊椎動物、を提供するものである。

【００１６】

【発明の実施の形態】本発明は、転写を増強する活性を
有する新規な蛋白質「ABT1」を提供する。本発明の蛋白
質に含まれるヒト「ABT1」蛋白質のアミノ酸配列を配列
番号：２に、該蛋白質をコードする遺伝子の塩基配列を
配列番号：１に、また、マウス「ABT1」蛋白質のアミノ
酸配列を配列番号：４に、該蛋白質をコードする遺伝子
の塩基配列を配列番号：３に示す。「ABT1」蛋白質はTB
Pに in vitro および in vivoで結合し、コアプロモー
ターからの転写活性を上昇させる活性を示した。

【００１７】「ABT1」蛋白質による転写活性の増大には
様々な利用が考えられる。例えば、有用な遺伝子産物を
細胞で産生させる場合に、「ABT1」蛋白質の転写増強活
性を利用すれば、遺伝子産物の発現量が増大し、収率が
高くなることが期待される。実際、実施例に示されるよ
うに、「ABT1」の作用により細胞に導入された遺伝子産
物の発現量が大きく増加した（図１５および１６）。

【００１８】また、本発明により、「ABT1」蛋白質がク
ラスII遺伝子の転写の調節因子として作用することを示
す証拠が提示されたが、「ABT1」蛋白質がクラスIやク
ラスIIIプロモーターにも作用する可能性がある。TBPは
プロモーター選択的複合体の転写機構に含まれており
（Lee, T.I. and Young, R.A. (1998) Genes Dev., 12,
1398-1408）、「ABT1」蛋白質は核小体にも存在するこ
とから、「ABT1」蛋白質がクラスIやクラスIIIプロモー
ターにも作用し、その転写活性を制御している可能性が
ある。細胞増殖に伴いクラスIプロモーターで制御され
るリボソームRNAの発現量が増加することなどが知られ
ていることから、例えば「ABT1」蛋白質を利用して、ク
ラスIプロモーターの制御を介して有用な細胞の増殖を
制御することも可能であると考えられる。

【００１９】また、本発明は、「ABT1」蛋白質に結合す
る新規な蛋白質「I62」を提供する。「I62」遺伝子は、
酵母のtwoハイブリッド系を用いたスクリーニングによ
り「ABT1」蛋白質に結合する新規な蛋白質をコードする
遺伝子としてクローニングされた。単離されたラット由
来の「I62」遺伝子は 842アミノ酸からなる蛋白質をコ
ードする。ラット「I62」蛋白質のアミノ酸配列を配列
番号：２５に、「I62」遺伝子の塩基配列を配列番号：
２４に示す。

【００２０】「I62」および「ABT1」をCOS細胞内で共発
現させた結果、両者の核内局在は一致しており、生理的
条件下でこれらの蛋白質が結合しうることが確認され
た。「I62」蛋白質は「ABT1」蛋白質に結合することに
より、「ABT1」蛋白質のTBPまたはDNAへの結合を調節し
たり、「ABT1」の転写増強活性を制御している可能性が
ある。従って、「I62」蛋白質は「ABT1」蛋白質の活性
を制御するために有用であると考えられる。また、「I6
2」蛋白質と「ABT1」蛋白質との結合活性を利用して、
「ABT1」蛋白質をアフィニティーにより調製するために
も有用である。

【００２１】本発明の蛋白質は、組み換え蛋白質とし
て、また天然の蛋白質として調製することが可能であ
る。組み換え蛋白質は、例えば、後述するように本発明
の蛋白質をコードするDNAを挿入したベクターを適当な
宿主細胞に導入し、形質転換体内で発現した蛋白質を精
製することにより調製することが可能である。一方、天
然の蛋白質は、例えば、後述する本発明の蛋白質に対す
る抗体を結合したアフィニティーカラムを利用して調製
することができる (Current Protocols in Molecular B
iology edit. Ausubel et al. (1987) Publish. Jhon W
ily & Sons Section16.1-16.19)。アフィニティー精製
に用いる抗体は、ポリクローナル抗体であってもモノク
ローナル抗体であってもよい。また、インビトロトラン
スレーション（例えば、「On the fidelity of mRNA tr
anslation in the nuclease-treatedrabbit reticulocy
te lysate system. Dasso,M.C.,Jackson,R.J.(1989) Nu
cleicAcids Res. 17:3129-3144」参照）などにより本発
明の蛋白質を調製することも可能である。

【００２２】また、本発明には、本実施例において同定
されたヒトおよびマウス由来の「ABT1」蛋白質と機能的
に同等な蛋白質が含まれる。ここで「機能的に同等」と
は、対象となる蛋白質が、TBPおよびDNAと結合し、かつ
クラスIIプロモーターからの転写を活性化する機能を有
することを指す。TBPやDNAとの結合活性や転写を活性化
する機能を有するか否かは、実施例に記載の方法に従っ
て検出することができる。

【００２３】また、本発明には、本実施例において同定
されたラット由来の「I62」蛋白質と機能的に同等な蛋
白質が含まれる。ここで「機能的に同等」とは、対象と
なる蛋白質が、「ABT1」蛋白質と結合する活性を有する
ことを指す。結合する活性を有するか否かは、免疫沈
降、twoハイブリッド、BIACORE、またはRIAなどの公知
の方法に従って決定することができる。

【００２４】これら本実施例において同定された蛋白質
と機能的に同等な蛋白質は、当業者であれば、例えば、
蛋白質中のアミノ酸配列に変異を導入する方法（例え
ば、部位特異的変異誘発法(Current Protocols in Mole
cular Biology edit. Ausubelet al. (1987) Publish.
Jhon Wily & Sons Section 8.1-8.5)）を利用して調製
することができる。また、このような蛋白質は、自然界
におけるアミノ酸の変異により生じることもある。本発
明には、このように本実施例において同定された蛋白質
と同等の機能を有する限り、そのアミノ酸配列（配列番
号：２、４、または２５）において１もしくは複数のア
ミノ酸が置換、欠失、挿入および／もしくは付加などに
より異なる蛋白質も含まれる。

【００２５】蛋白質におけるアミノ酸の変異数や変異部
位は、その機能が保持される限り制限はない。変異数
は、典型的には、全アミノ酸の10％以内であり、好まし
くは全アミノ酸の5％以内であり、さらに好ましくは全
アミノ酸の1％以内である。置換されるアミノ酸は、蛋
白質の機能の保持の観点から、置換前のアミノ酸と似た
性質を有するアミノ酸であることが好ましい。例えば、
Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Met、Phe、Trpは、共に非極
性アミノ酸に分類されるため、互いに似た性質を有する
と考えられる。また、非荷電性としては、Gly、Ser、Th
r、Cys、Tyr、Asn、Glnが挙げられる。また、酸性アミ
ノ酸としては、AspおよびGluが挙げられる。また、塩基
性アミノ酸としては、Lys、Arg、Hisが挙げられる。

【００２６】また、本実施例において同定された蛋白質
と機能的に同等な蛋白質は、当業者に周知のハイブリダ
イゼーション技術あるいは遺伝子増幅技術を利用して単
離することも可能である。即ち、当業者であれば、ハイ
ブリダイゼーション技術 (Current Protocols in Molec
ular Biology edit. Ausubel et al. (1987) Publish.
Jhon Wily & Sons Section 6.3-6.4)を用いて本実施例
において同定された蛋白質をコードするDNAの塩基配列
（配列番号：１、３、または２４）またはその一部をも
とにこれと相同性の高いDNAを単離して、該DNAから機能
的に同等な蛋白質を得ることは、通常行いうることであ
る。本発明には、本実施例において同定された蛋白質と
同等の機能を有する限り、これら蛋白質をコードするDN
AとハイブリダイズするDNAによりコードされる蛋白質も
含まれる。機能的に同等な蛋白質を単離する生物として
は、例えば、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、ブタ、ウ
シ等の脊椎動物が挙げられるが、これらに制限されな
い。

【００２７】機能的に同等な蛋白質をコードするDNAを
単離するためのハイブリダイゼーションのストリンジェ
ントな条件は、通常「1xSSC、0.1% SDS、37℃」程度で
あり、より厳しい条件としては「0.5xSSC、0.1% SDS、4
2℃」程度であり、さらに厳しい条件としては「0.1xSS
C、0.1% SDS、65℃」程度であり、ハイブリダイゼーシ
ョンの条件が厳しくなるほどプローブ配列と高い相同性
を有するDNAの単離を期待しうる。但し、上記SSC、SDS
および温度の条件の組み合わせは例示であり、当業者で
あれば、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシー
を決定する上記若しくは他の要素（例えば、プローブ濃
度、プローブの長さ、ハイブリダイゼーション反応時間
など）を適宜組み合わせることにより、上記と同様のス
トリンジェンシーを実現することが可能である。

【００２８】このようなハイブリダイゼーション技術を
利用して単離される蛋白質は、配列番号：２、４、また
は２５に記載の本発明の蛋白質と比較して、通常、その
アミノ酸配列において高い相同性を有する。高い相同性
とは、少なくとも20％以上、好ましくは40％以上、さら
に好ましくは70％以上（例えば、90％以上）の配列の同
一性を指す。相同性の特定は、BLAST検索アルゴリズム
を用いて決定することができる。

【００２９】また、遺伝子増幅技術（PCR）（Current p
rotocols in Molecular Biology edit. Ausubel et a
l. (1987) Publish. John Wiley & Sons Section 6.1-
6.4）を用いて、本実施例において同定されたDNA配列
（配列番号：１、３、または２４）の一部をもとにプラ
イマーを設計し、これらDNA配列またはその一部と相同
性の高いDNA断片を単離して、これをもとに本実施例に
おいて同定された蛋白質と機能的に同等な蛋白質を得る
ことも可能である。

【００３０】本発明は、また、本発明の蛋白質の部分ペ
プチドを提供する。本発明の「ABT1」蛋白質の部分ペプ
チドには、TBPと結合活性を有する部分ペプチドが含ま
れる。本発明において、マウス「ABT1」蛋白質のアミノ
酸配列（配列番号：４）において34位から102位のアミ
ノ酸配列からなるペプチドがTBP結合活性を有すること
が示されたため、マウス「ABT1」蛋白質の該領域を含む
ペプチドや、マウスの該領域に対応した他の哺乳動物由
来の「ABT1」蛋白質の領域を含むペプチドも本発明の部
分ペプチドに含まれる。例えば、ヒト「ABT1」蛋白質で
あれば、配列番号：２の36位から99位のアミノ酸配列を
含むペプチドが挙げられる。特に、TBPと結合するが転
写を活性化する能力のない部分ペプチドは、「ABT1」蛋
白質の競合阻害剤として有用である。また、本発明の
「I62」蛋白質の部分ペプチドには、「ABT1」蛋白質と
結合活性を有する部分ペプチドが含まれる。また、本発
明の部分ペプチドには抗体調製のための抗原ペプチドが
含まれる。本発明の部分ペプチドは、少なくとも7アミ
ノ酸、好ましくは9アミノ酸以上、より好ましくは12ア
ミノ酸以上、より好ましくは15アミノ酸以上のアミノ酸
配列からなる。本発明の部分ペプチドは、例えば、遺伝
子工学的手法、公知のペプチド合成法、あるいは本発明
の蛋白質を適当なペプチダーゼで切断することによって
製造する。

【００３１】本発明は、また、本発明の蛋白質をコード
するDNAを提供する。本発明のDNAとしては、本発明の蛋
白質をコードしうるものであれば、その形態に特に制限
はなく、cDNAの他、ゲノムDNA、化学合成DNAなども含ま
れる。また、本発明の蛋白質をコードしうる限り、遺伝
暗号の縮重に基づく任意の塩基配列を有するDNAが含ま
れる。本発明の蛋白質をコードするDNAは、上記のよう
に、配列番号：１、３または２４に記載のDNA配列もし
くはその一部をプローブとしたハイブリダイゼーション
法やこれらDNA配列の情報に基づき設計したプライマー
を用いたPCR法等の常法により単離することが可能であ
る。

【００３２】本発明は、また、本発明の蛋白質をコード
するDNAが挿入されたベクターを提供する。本発明のベ
クターとしては、挿入したDNAを安定に保持するもので
あれば特に制限されず、例えば宿主に大腸菌を用いる
のであれば、クローニング用ベクターとしてはpBluescr
iptベクター(Stratagene社製）などが好ましい。本発明
の蛋白質を生産する目的においてベクターを用いる場合
には、特に発現ベクターが有用である。発現ベクターと
しては、試験管内、大腸菌内、培養細胞内、生物個体内
で蛋白質を発現するベクターであれば特に制限されない
が、例えば、試験管内発現であればpBESTベクター（プ
ロメガ社製）、大腸菌であればpETベクター（Invitroge
n社製）、培養細胞であればpME18S-FL3ベクター（GenBa
nk Accession No. AB009864）、生物個体であればpME18
Sベクター（Mol Cell Biol. 8:466〜472(1988)）などが
好ましい。本発明の蛋白質をコードするDNAのベクター
への挿入は常法、例えば、制限酵素サイトを用いたリガ
ーゼ反応（Current protocols in Molecular Biology
edit. Ausubel et al. (1987) Publish. John Wiley& S
ons．Section 11.4〜11.11）により行うことができる。

【００３３】本発明は、また、本発明の蛋白質をコード
するDNAが挿入されたベクターを保持する形質転換体を
提供する。本発明のベクターが導入される宿主細胞とし
ては特に制限はなく、目的に応じて種々の宿主細胞が用
いられる。宿主細胞は、例えば、本発明のタンパク質の
製造のために使用することができる。タンパク質製造の
ための産生系は、in vitroおよびin vivo の産生系があ
る。in vitroの産生系としては、真核細胞を使用する産
生系や原核細胞を使用する産生系が挙げられる。真核細
胞を使用する場合、例えば、動物細胞、植物細胞、真菌
細胞を宿主に用いることができる。また、本発明の宿主
細胞には、「ABT1」蛋白質の機能解析や「ABT1」蛋白質
を利用したその機能阻害剤や機能促進剤のスクリーニン
グのために用いる目的の細胞も含まれる。宿主細胞への
ベクター導入は、例えば、リン酸カルシウム沈殿法、電
気パルス穿孔法（Current protocols in Molecular Bio
logy edit. Ausubel et al. (1987) Publish. John Wi
ley & Sons．Section 9.1-9.9）、リポフェクタミン法
（GIBCO-BRL社製）、マイクロインジェクション法など
の方法で行うことが可能である。形質転換体からの「AB
T1」蛋白質の調製は、当業者に公知の蛋白質の分離・精
製法を利用して行なうことができる。

【００３４】本発明はまた、配列番号：１、３、または
２４に記載の塩基配列からなるDNAまたはその相補鎖に
相補的な少なくとも15ヌクレオチドを含むDNAを提供す
る。ここで「相補鎖」とは、A:T、G:Cの塩基対からなる
2本鎖DNAの一方の鎖に対する他方の鎖を指す。また、
「相補的」とは、少なくとも15個の連続したヌクレオチ
ド領域で完全に相補配列である場合に限られず、少なく
とも70% 、好ましくは少なくとも80% 、より好ましくは
90% 、さらに好ましくは95% 以上の塩基配列上の相同性
を有すればよい。相同性を決定するためのアルゴリズム
は本明細書に記載したものを使用すればよい。

【００３５】このようなDNAは、本発明の蛋白質をコー
ドするDNAを検出、単離するためのプローブとして、ま
た、本発明のDNAを増幅するためのプライマーとして利
用することが可能である。プライマーとして用いる場合
には、通常、15bp〜100bp、好ましくは15bp〜35bpの鎖
長を有する。また、プローブとして用いる場合には、本
発明のDNAの少なくとも一部若しくは全部の配列を有
し、少なくとも15bpの鎖長のDNAが用いられる。プライ
マーとして用いる場合、3'側の領域は相補的である必要
があるが、5'側には制限酵素認識配列やタグなどを付加
することができる。

【００３６】本発明のDNAは、本発明の蛋白質の異常を
検査・診断するために利用することができる。例えば、
本発明のDNAをプローブやプライマーとして用いたノー
ザンハイブリダイゼーションやRT-PCRにより、発現異常
を検査したり、本発明のDNAをプライマーとして用いた
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によりゲノムDNA-PCRやRT-P
CRにより本発明の蛋白質をコードするDNAやその発現制
御領域を増幅し、RFLP解析、SSCP、シークエンシング等
の方法により、配列の異常を検査・診断することができ
る。

【００３７】また、「配列番号：１、３または２４に記
載の塩基配列からなるDNAまたはその相補鎖に相補的な
少なくとも15ヌクレオチドを含むDNA」には、本発明の
「ABT1」蛋白質や「I62」蛋白質の発現を抑制するため
のアンチセンスDNAが含まれる。アンチセンスDNAは、ア
ンチセンス効果を引き起こすために、少なくとも15bp以
上、好ましくは100bp、さらに好ましくは500bp以上の鎖
長を有し、通常、3000bp以内、好ましくは2000bp以内の
鎖長を有する。このようなアンチセンスDNAには、本発
明の蛋白質の異常（機能異常や発現異常）などに起因し
た疾患の遺伝子治療への応用も考えられる。基本転写に
関わると考えられている蛋白質の異常が、ある神経系疾
患の原因となることが報告されており、本発明の蛋白質
も神経系疾患に関わっている可能性がある。該アンチセ
ンスDNAは、例えば、配列番号：１、３、または２４に
記載のDNAの配列情報を基にホスホロチオネート法（Ste
in, 1988 Physicochemical properties of phosphoroth
ioate oligodeoxynucleotides. Nucleic Acids Res 16,
3209-21 (1988)）などにより調製することが可能であ
る。

【００３８】本発明のDNAまたはアンチセンスDNAは、遺
伝子治療に用いる場合には、例えば、レトロウイルスベ
クター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス
ベクターなどのウイルスベクターやリポソームなどの非
ウイルスベクターなどを利用して、ex vivo法やin vivo
法などにより患者へ投与を行う。

【００３９】本発明は、また、本発明の蛋白質に結合す
る抗体を提供する。本発明の抗体の形態には特に制限は
なく、ポリクローナル抗体やモノクローナル抗体または
抗原結合性を有するそれらの一部も含まれる。また、全
てのクラスの抗体が含まれる。さらに、本発明の抗体に
は、ヒト化抗体などの特殊抗体も含まれる。

【００４０】本発明の抗体は、ポリクローナル抗体の場
合には、常法に従いアミノ酸配列に相当するオリゴペプ
チドを合成して家兎に免疫することにより得ることが可
能であり（Current protocols in Molecular Biology e
dit. Ausubel et al. (1987)Publish. John Wiley & So
ns. Section 11.12〜11.13）、一方、モノクローナル抗
体の場合には、常法に従い大腸菌で発現し精製した蛋白
質を用いてマウスを免疫し、脾臓細胞と骨髄腫細胞を細
胞融合させたハイブリドーマ細胞の中から得ることがで
きる（Current protocols in Molecular Biology edit.
Ausubel etal. (1987) Publish. John Wiley & Sons．
Section 11.4〜11.11）。

【００４１】本発明の蛋白質に結合する抗体は、本発明
の蛋白質の精製に加え、例えば、これら蛋白質の発現異
常や構造異常の検査・診断に利用することも考えられ
る。具体的には、例えば組織、血液、または細胞などか
ら蛋白質を抽出し、ウェスタンブロッティング、免疫沈
降、ELISA等の方法による本発明の蛋白質の検出を通し
て、発現や構造の異常の有無を検査・診断することがで
きる。

【００４２】本発明の蛋白質に結合する抗体は、本発明
の蛋白質に関連した疾患の治療などの目的に利用するこ
とも考えられる。抗体を患者の治療目的で用いる場合に
は、ヒト抗体またはヒト化抗体が免疫原性の少ない点で
好ましい。ヒト抗体は、免疫系をヒトのものと入れ換え
たマウス（例えば、「Functional transplant of megab
ase human immunoglobulin loci recapitulates human
antibody response inmice, Mendez, M.J. et al.(199
7) Nat.Genet.15:146-156」参照）に免疫することによ
り調製することができる。また、ヒト化抗体は、モノク
ローナル抗体の超可変領域を用いた遺伝子組み換えによ
って調製することができる(Methods inEnzymology 203,
99-121(1991))。

【００４３】また、本発明は、本発明の蛋白質に結合す
る化合物のスクリーニング方法を提供する。このスクリ
ーニング方法は、（ａ）本発明の蛋白質に被検試料を接
触させる工程、（ｂ）該蛋白質と被検試料との結合活性
を検出する工程、および（ｃ）該蛋白質に結合する活性
を有する化合物を選択する工程、を含む。

【００４４】具体的な方法としては、例えば、本発明の
蛋白質のアフィニティーカラムに被検試料を接触させ精
製する方法、twoハイブリッドシステムを利用する方
法、ウエストウエスタンブロッティング法、コンビナト
リアルケミストリー技術におけるハイスループットスク
リーニングによる方法など多くの公知の方法を利用する
ことができる。また、BIACORE（Pharmacia社）などの測
定装置を利用して、本発明の蛋白質と被検化合物との結
合を評価することによりスクリーニングを行うこともで
きる。スクリーニングに用いる被検試料としては、これ
らに制限されないが、例えば、細胞抽出液、遺伝子ライ
ブラリーの発現産物、合成低分子化合物、合成ペプチ
ド、天然化合物などが挙げられる。

【００４５】このスクリーニングにより単離される化合
物は、本発明の蛋白質の活性を促進または阻害する化合
物（アゴニスト、アンタゴニスト）の候補となる。ま
た、生体内において、本発明の蛋白質とこれと相互作用
する分子との該相互作用を阻害する化合物の候補とな
る。これら化合物は、本発明の蛋白質が関連する疾患の
予防や治療のための医薬品として応用が考えられる。

【００４６】本発明は、また、クラスIIプロモーターか
らの転写を調節するための化合物をスクリーニングする
方法を提供する。このスクリーニング方法の1つの態様
は、「ABT1」蛋白質とTATA結合蛋白質（TBP）との結合
を指標とする方法であり、具体的には、（ａ）被検試料
存在下で「ABT1」蛋白質とTBPとを接触させる工程、
（ｂ）「ABT1」蛋白質とTBPとの結合活性を検出する工
程、および（ｃ）該結合活性を低下させる化合物を選択
する工程、を含む方法である。

【００４７】被検試料としては、上記スクリーニング方
法と同様に、例えば、細胞抽出液、遺伝子ライブラリー
の発現産物、合成低分子化合物、合成ペプチド、天然化
合物などが挙げられるが、これらに制限されない。ま
た、「ABT1」蛋白質との結合活性を指標とした上記のス
クリーニング方法により単離された化合物を被検試料と
して用いることも可能である。

【００４８】用いられる「ABT1」蛋白質は、天然由来の
蛋白質であっても、タグを付加した蛋白質や他の蛋白質
との融合蛋白質であってもよい。また、精製蛋白質であ
っても、組換え蛋白質を分泌する形質転換細胞の培養上
清であってもよい。また、TBPと結合する部分ペプチド
であってもよい。

【００４９】具体的な方法としては、例えば、「ABT1」
蛋白質に結合する抗体を用いた免疫沈降法、「ABT1」蛋
白質のアフィニティーカラムに被検試料を接触させ精製
する方法、twoハイブリッドシステムを利用する方法、
ウエストウエスタンブロッティング法、コンビナトリア
ルケミストリー技術におけるハイスループットスクリー
ニングによる方法など多くの公知の方法を利用すること
ができる。

【００５０】一例として、酵母のtwoハイブリッド系に
よるスクリーニング方法を示す。まず、LexAオペレータ
ーに制御されるテトラサイクリン受容体（TetR）遺伝子
と、テトラサイクリン（tet）オペレーターに制御され
るHIS3遺伝子を持つ酵母株を用意する。「ABT1」遺伝子
産物とTBP遺伝子産物が結合すると、酵母twoハイブリッ
ドの原理によりTetRが発現される。このTetRはtetオペ
レーターに結合し、HIS3の発現を抑制する。その結果、
この酵母はヒスチジンが含まれていない培地では生育で
きない（図２０A）。仮に、培地中に添加した被検化合
物が「ABT1」蛋白質とTBP蛋白質の結合を阻害すれば、T
etRの発現は抑制され、HIS3が発現し、酵母はヒスチジ
ンを含まない培地でも生育することができるようになる
（図２０B）。これを指標にスクリーニングを行うこと
によって、「ABT1」蛋白質とTBPとの結合を低下させる
化合物を単離することが可能である。

【００５１】このようなスクリーニングにおける検出の
結果、「ABT1」蛋白質とTBPとの結合が有意に阻害され
れば、用いた化合物は、クラスIIプロモーターからの転
写を調節する能力を有する化合物の候補となる。

【００５２】クラスIIプロモーターからの転写を調節す
るための化合物をスクリーニングする方法の他の態様
は、「ABT1」蛋白質と「I62」蛋白質との結合を指標と
する方法であり、具体的には、（ａ）被検試料存在下
で、「ABT1」蛋白質と「I62」蛋白質とを接触させる工
程、（ｂ）「ABT1」蛋白質と「I62」蛋白質との結合活
性を検出する工程、（ｃ）被検試料非存在下の場合と比
較して、該結合活性を低下させる化合物を選択する工
程、を含む。具体的には、上記の「ABT1」蛋白質とTATA
結合蛋白質との結合を指標とする方法と同様の原理でス
クリーニングを行うことができる。このスクリーニング
により単離される「ABT1」蛋白質と「I62」蛋白質の結
合を阻害する化合物は、「ABT1」蛋白質が関与する転写
活性の制御剤として機能する可能性が考えられる。

【００５３】本発明の蛋白質および上記スクリーニング
により単離される化合物は、転写を制御するために有用
である。これらを医薬品として用いる場合には、それ自
体を医薬品として用いることも可能であるが、公知の製
剤学的方法により製剤化して用いることも可能である。
例えば、薬理学上許容される担体もしくは媒体、具体的
には、滅菌水や生理食塩水、植物油、乳化剤、懸濁剤な
どと適宜組み合わせて製剤化して用いることが考えられ
る。患者への投与は、例えば、動脈内注射、静脈内注
射、皮下注射など当業者に公知の方法により行いうる。
投与量は、患者の体重や年齢、投与方法などにより変動
するが、当業者であれば適当な投与量を適宜選択するこ
とが可能である。また、該化合物がDNAによりコードさ
れうるものであれば、該DNAを遺伝子治療用ベクターに
組込み、遺伝子治療を行うことも考えられる。投与量、
投与方法は、患者の体重や年齢、症状などにより変動す
るが、当業者であれば適宜選択することが可能である。

【００５４】また、本発明は、本発明の蛋白質の発現が
改変されるように操作された非ヒト脊椎動物を提供す
る。ここで「発現の改変」には、発現の増強および減弱
が含まれる。また、「蛋白質の発現の改変」は、転写と
翻訳のいずれのステップの改変も含まれる。このような
非ヒト脊椎動物には、内因性の本発明の蛋白質の発現を
停止または減少させるように操作された動物（ノックア
ウト動物）および外来性の本発明の蛋白質を発現するよ
うに該蛋白質をコードする遺伝子が導入された動物（ト
ランスジェニック動物）が含まれる。このようなノック
アウトおよびトランスジェニック非ヒト脊椎動物は、文
献「ニューロサイエンス・ラボマニュアル３、神経生物
学のための胚と個体の遺伝子操作法（編集・近藤寿人、
シュプリンガー・フェアラーク東京株式会社）」に従っ
て作製することができる。

【００５５】例えば、本発明の「ABT1」または「I62」
蛋白質をコードするDNAが染色体に組込まれたトランス
ジェニック動物を作製することにより、これらの蛋白質
の発現を上昇させたり、発現パターンや分布の改変を行
うことができる。また、これらの内因性遺伝子の発現制
御領域に変異を導入したり、他の発現制御領域を付加ま
たは置換することなどにより、本来の遺伝子の発現レベ
ルと比較して人工的に転写レベルを上昇、下降、または
発現パターンや分布の改変を行うことができる。一方、
エキソンの一部を欠損させたり、翻訳領域への点突然変
異の導入により終止コドンへ置換することにより、タン
パク質への翻訳を修飾することもできる。また、アンチ
センスRNAやリボザイムを発現させることで、「ABT1」
または「I62」遺伝子の発現を制御することも可能であ
る。これらの変異の導入は、公知の方法により行うこと
ができる。このような非ヒト脊椎動物は、転写機能の研
究、転写に関連する疾患のメカニズムの解明、医薬品の
スクリーニング等に用いる疾患モデル動物の開発に有用
である。

【００５６】

【実施例】次に、本発明を実施例によりさらに具体的に
説明するが、本発明は下記実施例に限定されるものでは
ない。 [実施例１] マウスABT1、ならびにヒト、酵母および線
虫のホモログの同定マウスABT1 cDNAは、SHDと相互作用する分子を同定する
試みにおいて単離された。すなわち、SHDのSH2ドメイン
（Oda, T. et al. (1997) Oncogene, 15, 1255-1262）
を含む plexA SH2/SHD を酵母 EGY48 株（Clontech)に
導入し、lexA-SH2/SHD キメラ蛋白質を発現している形
質転換株を得た。これに、Mouse Embryo（mRNA源は NIH
/3T3細胞株）MATCHMAKER LexA cDNA Library（Clontec
h)を導入し、酵母２ハイブリッド系によるスクリーニン
グを行った。トリプトファン、ヒスチジン、ウラシル、
ロイシンを含まない合成培地で生育でき、且つβ-ガラ
クトシダーゼ合成能持つクローンを陽性クローンとして
選択したところ、同一の遺伝子に由来する４つの独立し
たcDNAクローンが単離された。

【００５７】ABT1と名付けた代表クローン（pB42AD-ABT
1）の両鎖の塩基配列を、ABI 377 DNA シークエンサー
（Perkin Elmer）を用いて決定したところ、このクロー
ンは1276bpの遺伝子断片（配列番号：３）を有してお
り、269アミノ酸の潜在的なオープンリーディングフレ
ーム（配列番号：４）を持っていた（図１）。ヌクレオ
チド14-16位に存在する予想される開始ATGコドンはKoza
kのコンセンサス配列と一致していた。3'末端にはpoly
(A)⁺ tailがあり、その上流にはポリアデニレーション
シグナルが見られた。ノーザンブロット解析（後述）の
結果、このクローンは、1.4kbの全長mRNAのほぼすべて
をカバーしていることが判明した。ABT1蛋白質のアミノ
酸配列をquery（質問式）としてGenBankデータベースの
検索を行ったが、機能が既知の類似配列は見出されなか
った。唯一、ABT1は S. cerevisiaeの仮想蛋白質YNR054
c、およびC. elegansの仮想蛋白質F57B10.8（それぞ
れ、GenBankアクセッション番号P53743およびAF03971
3）と類似性を示した。

【００５８】C. elegansのカウンターパートが実際に転
写されているのかを調べるため、逆転写ポリメラーゼ連
鎖反応（RT-PCR）によるクローニングを試みた。プライ
マー（5'-TTT GAA TTC ATG GCG CCT ATT CCA AAA AAG-
3'／配列番号：５）および（5'-GAG AGG ATC CTT ATT T
GA AGA TCA TAT TCA TCA ATT C-3'／配列番号：６）を
用いてRT-PCRを行ったところ、0.8kbのcDNAがクローニ
ングされた。PCR産物は pT7Blue Tベクターにサブクロ
ーニングし、配列を決定した。配列の解析の結果、この
cDNAは268アミノ酸のオープンリーディングフレームを
コードしており（図２参照）、C. elegansのゲノム配列
から予想されたF57B10.8と同一であった。

【００５９】EST（Expression Sequence Tags）データ
ベース中から見出だされたヒトABT1の3'-非翻訳領域と
思われる配列情報を基に、5'-RACE（Rapid Amplificati
on ofcDNA Ends）により、NT2ヒトテラトカルシノーマ
細胞からヒトABT1 cDNAをクローニングした。すなわ
ち、ESTデータベースを基に作成したプライマー配列
（5'-TGC CTG GAC TAG GCA TTA TCC-3'／配列番号：
７）および（5'-TTG GAA ATA AAGGCC CTT TCT-3'／配列
番号：８）をそれぞれ第1鎖 cDNA 合成およびPCRに用
い、NT2 ヒトテラトカルシノーマ細胞株から5'-RACE（G
IBCO BRL）により、説明書に従ってクローニングした。
PCR産物をpT7Blue Tベクター（Novagen）にサブクロー
ニングし、配列を決定したところ、ヒトABT1 cDNA（配
列番号：１）は、272アミノ酸のオープンリーディング
フレーム（配列番号：２）をコードしていた（図２）。

【００６０】マウスABT1（mABT1）蛋白質、ならびにヒ
ト、S. cerevisiae、およびC. elegansにおけるそのカ
ウンターパート（それぞれhABT1、ScABT1、およびCeABT
1）の配列のアライメントを図２に示した。hABT1、ScAB
T1、およびCeABT1のmABT1に対するアミノ酸の同一性
は、それぞれ 75.6％、21.8％、26.5％であった。これ
らの蛋白質内のホモロジーは、配列全体にわたって分布
する小さな保存されたストレッチとして観察された。２
つの核局在化シグナルと予想されるモチーフ以外に、mA
BT1に機能的モチーフは見出されなかった。ABT1には典
型的なDNA結合モチーフはないが、mABT1（1-39アミノ
酸）、hABT1（1-39アミノ酸）、ScABT1（1-86アミノ
酸）、およびCeABT1（1-75アミノ酸）のN-末端はグルタ
ミン酸およびアスパラギン酸に富む（それぞれ 30.1
％、41.0％、36.0％、および37.3％）ことから、ABT1は
転写因子であることが示唆された。

【００６１】ABT1のマウスにおける発現の組織分布を調
べるため、様々なマウス組織由来のpoly(A)⁺ RNAのノー
ザンブロット解析を行った。³²PラベルしたマウスABT1
cDNAをプローブにして、Mouse multiple tissue Northe
rn blot（Clontech）をExpressHyb Hybridization solu
tion（Clontech）中で65℃でプレハイブリダイゼーショ
ンおよびハイブリダイゼーションを行った。ブロットを
0.3M NaCl、0.03MNa Citrate、0.1% SDSを含む溶液で
室温で1時間の洗浄を2回行い、15mM NaCl、1.5mM Na Ci
trate、0.1% SDSを含む溶液で65℃で1時間洗浄した後オ
ートラジオグラフィーを行った。その結果、ABT1 mRNA
はユビキタスに発現しており、転写産物のサイズは約1.
4kbであった（図３）。

【００６２】[実施例２] 酵母ABT1ホモログは増殖に必
須である ABT1は酵母からヒト細胞まで保存されていることから、
本発明者らは、ABT1は重要な細胞機能を担っていると予
想した。その機能の手がかりを得るため、本発明者らは
酵母のScABT1遺伝子（別名 YNR054c）を破壊する実験を
行った。

【００６３】まず酵母ABT1相同DNAを末端に持つDNA断片
を以下のように作製した。既知のkan^r オープンリーデ
ィングフレームを含み、geneticin（G418）を用いて形
質転換体を容易に選択することが可能なpFA6a-KanMX4
（Wach, A. et al. (1994) Yeast, 10, 1793-1808）を
鋳型として、２つのプライマー（5'-AGC AAA CAG TTT A
CTGCA GCA GAG TGA AGT AAA TTT TTA CGC CGT ACG CTG
CAG GTC GAC-3'／配列番号：９および5'-AGC ATT GGC C
AC GGC TTG TTT CCA CAC GAC GTT GTT TAA ATT ATCGAT
GAA TTC GAG CTC G-3'／配列番号：１０）を用い、25pm
olプライマー、50ng 鋳型、250μM 各dNTP、2mM MgC
l₂、1×KODポリメラーゼバッファー、および2.5unit KO
Dポリメラーゼ（TOYOBO）を含む反応液中で、95℃15
秒、60℃30秒、74℃60秒を40サイクルの条件でPCR増幅
を行った。C110-1（a/α leu2-3/leu2-3 leu2-112/leu2
-112 ura3-52/ura3-52 his6/HIS6）酵母細胞（Uemura,
H. and Jigami, Y. (1995) Genetics, 139, 511-521）
を、酢酸リチウム法を用いて直鎖状DNA断片で形質転換
し、0.2mg/ml G418を含むYPDプレートで選択した。G418
耐性クローンを単離し、酵母ABT1遺伝子 YNR054c が破
壊されていることをPCRで確認した。

【００６４】このようにして、２倍体株のScABT1遺伝子
の１コピーが破壊された ScABT1欠損酵母を２クローン
（ynr054cΔ-6およびynr054cΔ-8）作りだし、これらの
クローンの四分子（tetrad）分析を行った。四分子分析
では、ABT1が破壊されたクローンを1% 酢酸カリウム中2
5℃でインキュベートして胞子を形成させ、分離した胞
子をYPDプレート上で30℃で3日間インキュベートした。
ynr054cΔ-6およびynr054cΔ-8から取り出した40の四分
子のうち、36についてはYPDプレートで増殖可能な胞子
は２つしか出来なかった（図４）。これらの増殖可能な
胞子は、いずれもG418を含むYPDプレートでは増殖でき
なかったことから、これらのハプロイドはもともとのTB
R054cを有していることが示された（データ省略）。こ
の結果は、酵母ABT1が必須遺伝子であることを明確に示
唆するものであり、また、哺乳動物のABT1も重要な機能
を有していることが類推される。

【００６５】[実施例３] ABT1は核および核小体に局在
する哺乳動物ABT1の細胞内局在を調べるため、EGFP（Enhanc
ed Green FluorescentProtein）と融合させたABT1（EGF
P-ABT1）をCOS7細胞で一過的に発現させる実験を行った
（以後の機能解析にはマウスABT1を用いた）。

【００６６】まず、pB42AD ABT1 のEcoRI-XhoI cDNA 断
片を、pEGFP-C2プラスミド（Clontech）のEcoRI-SalI部
位にサブクローニングしてEGFP-ABT1を発現するプラス
ミドpEGFP-ABT1を構築した。COS7細胞を、10% ウシ胎児
血清（FBS）、ペニシリン、ストレプトマイシンを含む
ダルベッコ改変イーグル培地（DMEM）で培養した。トラ
ンスフェクションの約16時間前に、細胞を35mm マルチ
ウェルプレート（Falcon）に2.0×10⁵ 細胞の密度で播
いた。2μgの上記プラスミドと13μlのリポフェクタミ
ン（GIBCO BRL）を、200μlの血清不含のDMEM中で室温
で45分間プレインキュベートした。細胞を1回DMEMで洗
浄し、最終1mlになるようにDMEMで希釈したプレインキ
ュベート混合液を細胞に加えた。37℃で5時間細胞をイ
ンキュベートし、FBSを最終濃度10％になるよう加え
た。トランスフェクト24時間後、EGFP-ABT1融合蛋白質
の局在を、蛍光顕微鏡（Axiovert 135 microscope ; ZE
ISS）を用いて観察した。

【００６７】対照のEGFP蛋白質は核と細胞質の両方に分
布した（データ省略）が、EGFP-ABT1融合蛋白質は専ら
核に局在し、いくつかのケースでは核小体に局在した
（図５）。ヘマグルチニンタグを付加したABT1（HA-ABT
1）の細胞内局在を、抗HA抗体を用いた免疫蛍光法によ
り解析したところ、やはりABT1は核に局在していること
が確かめられた（データ省略）。ABT1には２つの予想さ
れる核局在シグナル KKKKK（40-44）、および KRKKK（8
7-91）を有するが、そのいずれか、または両方のモチー
フを欠失した変異蛋白質でも核に局在することが判明し
た（データ省略）。従って、これらのモチーフはABT1の
核局在に必須ではない。ABT1には、他の核局在シグナル
が存在しているか、またはサイズが小さいため拡散によ
り受動的に核に輸送されているのかも知れない。

【００６８】[実施例４] ABT1はTBPと相互作用する酸性に富む領域は、VP16、GAL4、GCN4、およびp53など
のいくつかの転写因子において転写活性化ドメインとし
て報告されている（Hope, I.A. and Struhl, K. (1986)
Cell, 46, 885-894; Gill, G. and Ptashne, M. (198
7) Cell, 51, 121-126; Friedman, A.D. et al. (1988)
Nature, 335, 454-454; Sadowski, I. et al. (1988)
Nature, 3351 563-564; Truant, R. et al. (1993) J.
Biol. Chem., 268, 2284-2287; Oliner, J.D. (1993) N
ature, 362, 857-860）ことから、本発明者らは、ABT1
の機能は転写と関連しているに違いないと予想した。GT
F群、特にTFIIDと相互作用する転写活性化因子や転写コ
アクチベーターなど、転写には多くの分子が関与してい
る。従って、本発明者らはまず、ABT1がTFIIDの主要な
構成成分であるTBPと結合するかを調べた。

【００６９】まず、pB42AD-ABT1 のEcoRI-XhoI cDNA 断
片を、pGEX-4T-1（Pharmacia）のEcoRI-XhoI部位にサブ
クローニングして、グルタチオン-S-トランスフェラー
ゼ融合ABT1を発現するプラスミド pGEX-ABT1を構築し
た。pGEX-ABT1または対照のpGEX-4T-1プラスミドで形質
転換した大腸菌JM109を、100μg/mlのアンピシリンを含
むLB培地20mlに接種し、37℃で一晩培養した。培養液を
200mlのLB Amp培地中に1:10に希釈し、OD₆₀₀ が0.8にな
るまで25℃で培養した。isopropyl-β-D-thiogalactopy
ranoside (IPTG) を最終濃度0.2mMになるように加え、G
ST融合蛋白質を誘導した。IPTG存在下25℃で20時間イン
キュベートした後、大腸菌を回収し、0.2mMのphenylmet
hylsulfonyl fluoride (PMSF)を含むPBS 20mlに再懸濁
した。大腸菌懸濁液をソニケーションにかけ、1% Trito
n X-100存在下4℃で30分インキュベートした。懸濁液を
遠心し、上清をグルタチオンセファロース4B（Pharmaci
a）とインキュベートしてGST融合蛋白質をセファロース
に固定化した。

【００７０】HeLa核抽出液は以下のように調製した。lo
gフェーズで増殖しているHeLa細胞を回収し、0.5mM MgC
l₂を含むPBSで2回、バッファーA（10mM Tris-HCl pH7.
5, 1.5mM MgCl₂, 10mM KCl, 0.5mM dithiothreitol (DT
T)）で2回洗浄した。細胞をバッファーAに再懸濁し、Po
tter-Elvehjemホモジェナイザーでホモジェナイズし、
遠心した。上清を除いた後、沈殿をバッファーC（20mM
Tris-HCl pH7.5, 0.2mM EDTA, 0.45M NaCl, 5mM MgCl₂,
0.5mM DTT, 25% glycerol）に再懸濁し、Potter-Elveh
jemホモジェナイザーでホモジェナイズした。ホモジェ
ネートを遠心チューブに移し、4℃で30分ロックした。
その後、ホモジェネートを遠心し、上清を回収してHeLa
核抽出液とした。5×10⁷細胞から4mlの核抽出液が得ら
れた。

【００７１】上述のGST融合蛋白質セファロース（GST融
合蛋白質量およびセファロース容量は、それぞれ約5μg
および5μlとなるよう標準化した）を200μlのHeLa核抽
出液と共に4℃で一晩インキュベートした。グルタチオ
ンセファロースは、0.1% TritonX-100を含むリン酸緩衝
生理食塩水（PBS）、または 0.5M LiCl で４回洗浄し、
セファロースを回収した。GST-ABT1またはGSTに結合し
た蛋白質を、SDS-PAGE（ドデシル硫酸ナトリウム−ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動）で分離し、抗TBP抗体で
イムノブロットを行った。すなわち、SDS-PAGEで分離し
た蛋白質試料は、Sem-Dry Transfer Cell（Bio-Rad）を
用いてPVDF膜（Bio-Rad）に転写し、余剰な結合部位
を、0.05% Tween 20および5% non-fat milkを含むPBSで
4℃で一晩インキュベートすることによりブロッキング
した。その後、ブロットは抗TBP抗体で4-16時間、4℃で
インキュベートした。抗体反応は、西洋ワサビパーオキ
シダーゼ結合２次抗体（Amersham）で検出し、enhanced
Luminol reagent（NEN）で可視化した（図６）。

【００７２】その結果、抗TBP抗体により、ヒトTBPに対
応する分子量約 37kD の明瞭な１本のバンドが、GST-AB
T1をHeLa核抽出液とインキュベートした時にのみ検出さ
れた（図６レーン2）。このバンドは、GSTをHeLa核抽
出液とインキュベートした時には検出されなかった（図
６レーン1）。このTBPのバンドは、セファロースを0.5
M LiClで洗浄すると消失した（図６レーン4）ことか
ら、結合はイオン強度に感受性であることが示された。
このTBPのバンドは、セファロースをNP40バッファー（2
0mM Tris-HCl pH8.0, 1mM EDTA, 150mM NaCl, 1% NP40,
10% glycerol）で洗浄しても検出できたが、 0.1% SDS
を含むNP40バッファーで洗浄した場合は検出できなかっ
た（データ省略）。

【００７３】ABT1とTBPとの相互作用をさらに検証する
ため、以下のようにCOS7細胞でABT1を発現させ、免疫沈
降によるアッセイを行った。まず、pcDNA3（Invitroge
n）のHindIIIおよびEcoRI部位に、プライマー（5'-A GC
T GCC ATG GAA CAA AAA CTC ATC TCA GAA GAG GAT CTG
GGA TCC AAG CTT G-3'／配列番号：１１および5'-AA TT
C AAG CTT GGA TCC CAG ATC CTC TTC TGA GAT GAG TTT
TTG TTC CAT GGC-3'／配列番号：１２）をアニールさせ
て挿入し、pcDNA3-mycを構築した。次に、上記pB42AD-A
BT1のEcoRI-XhoI cDNA 断片を、pcDNA3およびpcDNA3-my
cのEcoRI-XhoI部位にサブクローニングし、ABT1蛋白質
を発現するpcDNA3-ABT1、およびmyc-ABT1融合蛋白質を
発現するpcDNA3-myc-ABT1を構築した。

【００７４】COS7細胞（1.2×10⁶細胞）を、12μgのpcD
NA3-myc-ABT1および75μlのリポフェクタミンを用いて
実施例３と同様にトランスフェクトした。細胞を、10μ
g/mlaprotinin、10μg/ml leupeptin、10μg/ml trypsi
n inhibitor、2μl/ml pepstatin A、0.2mM PMSF、およ
び1mM DTTを含むNP40バッファー（20mM Tris-HCl pH8.
0, 1mM EDTA, 150mM NaCl, 1% NP40, 10% glycerol）1m
l中でリシスさせた。ライセートを遠心し、400μlの上
清を抗TBP抗体または対照のウサギIgGで4℃で16時間イ
ンキュベートした。続いて、各7μlのプロテインAセフ
ァロースおよびプロテインGセファロースを加え、混合
液を4℃で2時間インキュベートして免疫複合体を吸収さ
せた。セファロースを0.1% Triton X-100を含むPBS 1ml
で4回洗浄し、セファロース結合蛋白質をSDS-PAGEで分
離し、抗Myc抗体または抗TBP抗体で上記と同様にしてイ
ムノブロットを行った（図７）。これらの実験条件にお
いて、myc-ABT1はTBPと共沈した（レーン2）ことから、
ABT1はTBPと in vivo で複合体を形成することが示唆さ
れる。

【００７５】次に、ABT1とTBPとの相互作用が直接的な
ものなのか否かを調べた。大腸菌で産生させたヒスチジ
ンタグを付加したTBP（His-TBP）蛋白質約5ngを、上記
と同様にして調製したセファロースに結合させたGST-AB
T1またはGSTと共に4℃で一晩インキュベートした（上記
と同様に、GST融合蛋白質量およびセファロース容量
は、それぞれ約5μgおよび5μlとなるよう標準化し
た）。セファロースをPBSバッファーで洗浄し、セファ
ロースに結合した蛋白質を、抗His抗体を用いたウェス
タンブロットにより解析した（図８）。GST-ABT1（レー
ン2）には、His-TBPに対応する１本の明瞭なバンドが検
出されたが、GST（レーン1）には検出されなかった。こ
の結果は、ABT1とTBPは in vitroにおいて直接結合する
ことを示している。

【００７６】[実施例５] TBPと結合するABT1の領域この項では、TBPに結合するABT1の領域について記載す
る。大腸菌を用いて、ABT1の異なる領域を持つ一連のGS
T-ABT1融合蛋白質を以下のように産生し、精製した（図
９）。

【００７７】一連のGST-ABT1融合蛋白質を発現するpGEX
-ABT1変異プラスミドは、pcDNA3-myc-ABT1から増幅した
PCR産物のEcoRI-XhoI 断片を、pGEX-4T-1のEcoRI-XhoI
部位にサブクローニングして構築した。ABT1 cDNA 断片
の増幅に用いたオリゴヌクレオチド配列は、pcDNA3-S
（5'-TAA TAC GAC TCA CTA TAG-3'／配列番号：１
３）、pcDNA3-AS（5'-ATT TAG GTG ACA CTA TAG-3'／配
列番号：１４）、A34（5'-TTT GAA TTC ATG GCC TGC AG
C GCA-3'／配列番号：１５）、A97（5'-TTT GAA TTCGGA
GGA AAG AAG GGA GCT-3'／配列番号：１６）、A39（5'
-TTT CTC GAG GCT GCT GCT GCT GCA GGC-3'／配列番
号：１７）、A102（5'-TTT CTC GAG AGC TCC CTTCTT TC
C TCC-3'／配列番号：１８）、A204（5'-TTT CTC GAG A
TC CCC ATC AGCTGC AAG-3'／配列番号：１９）である。
PCRに用いたオリゴヌクレオチドの組み合わせは、ABT1
34-269にはA34およびpcDNA3-AS、ABT1 1-39にはpcDNA3-
SおよびA39、ABT1 1-102にはpcDNA3-SおよびA102、ABT1
1-204にはpcDNA3-SおよびA204、ABT1 34-102にはA34お
よびA102、ABT1 97-204にはA97およびA204、ABT1 34-20
4にはA34およびA204である。

【００７８】HeLaの核抽出液またはHis-タグを付加した
TBPをこれらのトランケート（部分欠失）したABT1融合
蛋白質と混合し、プルダウン実験を行った。HeLa核抽出
液を用いた場合、GST-ABT1野生型（図１０レーン2）と
同様、GST-ABT1（34-269）、GST-ABT1（1-102）、およ
びGST-ABT1（1-204）においても、TBPとの相互作用が検
出された（それぞれ、図１０のレーン3、5、および
6）。これに対して、GST-ABT1（1-39）（レーン4）はTB
Pとの相互作用が見られなかった。これらの結果は、ABT
1の34-102残基を含む領域が、TBPとの結合に必要である
ことを示している。

【００７９】このドメインは異なる種間においてもよく
保存されていることから、TBPとの相互作用は、この蛋
白にとって進化的に保存された特徴であることが示唆さ
れる。いくつかのTBP結合蛋白質では、TBP結合モチーフ
が報告されている（Jiang, S.-W. and Eberhardt, N.L.
(1996) J. Biol. Chem., 271, 9510-9518）が、ABT1の
TBP結合領域にこれらのモチーフを特定することはでき
なかった。

【００８０】HeLa核抽出液中のTBPの場合と同様、His-T
BPに対しても、精製したGST-ABT1 WT（図１１のレーン2
および 8）、GST-ABT1（34-269）、GST-ABT1（1-10
2）、およびGST-ABT1（1-204）は相互作用を示した（そ
れぞれ、レーン3、5、および6）が、GST-ABT1（1-39）
（レーン4）はTBPとの相互作用が見られなかった。結合
に十分な領域をさらに詳細に決定するため、GST-ABT1
（34-102）、GST-ABT1（34-204）、およびGST-ABT1（97
-204）融合蛋白質を産生して結合実験を行った。その結
果、GST-ABT1（34-102）およびGST-ABT1（34-204）は、
WTと同様にHis-TBPとの相互作用が観察された（それぞ
れレーン9および10）。しかし、GST-ABT1（97-204）
は、His-TBPとの相互作用は全く見られなかった（レー
ン11）。

【００８１】[実施例６] ABT1は in vitro で基本転写
を刺激する ABT1がTBPと相互作用することが明らかとなったことか
ら、本発明者らは、ABT1が機能的に転写に関与している
のかを、再構成転写反応系を用いて調べた。まず、ABT1
が、アデノウイルス主要後期プロモーター（AdMLプロモ
ーター）からの基本転写を刺激するかを調べた。AdMLプ
ロモーターは、コアプロモーターしか含まれておらず、
上流の調節配列は除去されている。

【００８２】in vitro 転写アッセイは以下の条件で行
った。反応液は、10mM Hepes-KOH, pH7.6、3% glycero
l、25mM KCl、6mM MgCl₂、620μM ATP, UTP、25μM CT
P、200μM O-methyl-GTP、5μCi α-³²P CTP、800ng 鋳
型（G-lessカセットと融合したAdMLプロモーターを含む
(Sawadogo, M. and Roeder, R.G. (1985) Proc. Natl A
cad. Sci. USA, 82, 4394-4398)）、50ng 組換えTFII
B、120ng 組換えTFIIF、45ng 組換えTBP、0.2μg ウシ
胸腺由来の精製 RNA polII、および様々な量のGST-ABT1
を含み、総量は20μlとした。ヌクレオチドを含まない
反応混合液を氷上で20分インキュベートし、ヌクレオチ
ドを加えRNA合成を開始させ、27℃で45分間インキュベ
ートした。合成されたRNAはフェノール−クロロホルム
で抽出し、エタノールで沈殿させ、5％ポリアクリルア
ミド−8M 尿素ゲルで解析した。転写産物量はイメージ
アナライザー(BAS 1500, Fuji）で測定し、対照（GST-A
BT1なし）に対する活性化の倍率を決定した。

【００８３】in vitro転写反応系にGST-ABT1を 12.5n
g、25ng、および50ng添加すると、転写レベルは有意に
刺激され、対照（0ng 添加, 図１２レーン1）に比べ、
それぞれ 3.6、4.9、および5.4倍に上昇した（レーン2-
4）。対照のGST蛋白質を 12.5ng、25ng、および50ng添
加した場合でも、転写レベルは僅かに刺激され、それぞ
れ 1.2、1.5、および2.2倍に上昇した（レーン5-7）。i
n vitro 転写におけるABT1の刺激効果は、GST蛋白質の
刺激効果に比べ約３倍高い。これらの結果は、ABT1が基
本転写をin vitroで活性化することを明確に示してい
る。GST-ABT1による転写の増強は、50ngのGST-ABT1で飽
和に達し、200ng GST-ABT1よりも高い用量ではむしろ転
写が阻害された（データ省略）。これは、機能的TBPが
プロモーターDNAから隔離されてしまったことによるの
かも知れない。

【００８４】[実施例７] ABT1はin vivo で基本転写を
刺激する ABT1が基本転写をin vivo でも活性化することができる
かを調べた。まず、TATAボックスとルシフェラーゼ遺伝
子を持つが、いずれのシス調節配列も持たないレポータ
ー遺伝子 pTATA-Lucを、pAP1-Lucプラスミド（Stratage
ne）のAP-1結合配列を除去することで構築した。すなわ
ち、２つのオリゴヌクレオチド（5'-CGCAAG CTT GCG GA
G ACT CTA GAG GG-3'／配列番号：２０および5'-TTC TG
C CCG AAC GG-3'／配列番号：２１）を用いて、pAP1-Lu
cからTATAボックスとルシフェラーゼコード配列の一部
を含む配列をPCRで増幅した。PCR産物を消化し、AP-1結
合配列、TATAボックス、およびルシフェラーゼコード配
列の一部を含むpAP1-LucのHindIII-SplI断片と置換し
た。

【００８５】このpTATA-Lucを、mycタグを付加したABT1
の発現ベクター pcDNA3-myc-ABT1と共にCOS7細胞に以下
の要領でコトランスフェクトした。まず、COS7細胞を、
上記と同様に10% ウシ胎児血清（FBS）、ペニシリン、
ストレプトマイシンを含むダルベッコ改変イーグル培地
（DMEM）で培養し、トランスフェクションの約16時間前
に、細胞を35mm マルチウェルプレート（Falcon）に2.0
×10⁵ 細胞の密度で播いた。0.1μgのpTATA-Lucおよび
0〜2μg pcDNA3-myc-ABT1プラスミドと13μlのリポフェ
クタミン（GIBCO BRL）を、200μlの血清不含のDMEM中
で室温で45分間プレインキュベートした。プラスミドの
総量は、pcDNA3-mycプラスミドで標準化した。細胞を1
回DMEMで洗浄し、最終1mlになるようにDMEMで希釈した
プレインキュベート混合液を細胞に加えた。37℃で5時
間細胞をインキュベートし、FBSを最終濃度10％となる
よう加えた。トランスフェクション24時間後、細胞をDM
EMで1回洗浄し、DMEM-10% FBSで24時間インキュベート
した。トランスフェクション48時間後、細胞を冷PBSで2
回洗浄し、150μlのリシスバッファー（25mM Glycyl gl
ycine, pH7.8, 15% Glycerol, 8mM MgSO₄, 1mM ethylen
ediaminetetraacetate (EDTA), 1% Triton X-100）でリ
シスさせ、さらに20分 4℃でインキュベートした。細胞
溶解液を1.5mlチューブに移し、遠心した。上清10μlを
ルシフェラーゼアッセイに用いた。ルシフェラーゼアッ
セイは、ピッカジーン^R 試薬（和光純薬工業）を用い
て、AutoLumat LB953測定装置（Berthold(ベルトール
ド)社）により測定した。

【００８６】測定の結果、ABT1の発現の上昇に伴って、
pTATA-Lucからのルシフェラーゼ活性の上昇が観察さ
れ、用量依存的に４倍まで上昇した（図１３）。転写の
増強には、比較的高いレベルのABT1の発現が必要であっ
た。これらの結果から、ABT1の過剰発現は、in vitroで
も in vivo でも、基本転写を刺激することが実証され
た。

【００８７】本発明者らは、さらに、CRE、AP-1、SRE、
およびNF-κB調節配列をそれぞれ含む他のレポーター遺
伝子（pCRE-Luc、pSRE-Luc、pAP1-Luc、pNF-κB-Luc; S
tratagene社）の発現を ABT1 が増強するかを、コトラ
ンスフェクション実験によって調べた。CRE、SRE、AP-
1、およびNF-κB cis調節配列を含むレポーター遺伝子1
μgを、1μgのpcDNA3-myc（Mock）またはpcDNA-myc-ABT
1（myc-ABT1）と共に、上記と同様にコトランスフェク
トした。トランスフェクション後の培養液として、DMEM
-10% FBSの代わりに、1％ウシ血清アルブミン（BSA）を
含むDMEM（DMEM-1% BSA）を用いて細胞を培養し、イン
キュベーション48時間後に細胞溶解物を調製し、ルシフ
ェラーゼアッセイを行った。その結果、ABT1の発現はこ
れらのレポーター遺伝子 pCRE-Luc（4倍）、pSRE-Luc
（7倍）、pAP-1-Luc（5倍）、およびpNF-κB-Luc（2.9
倍）からのルシフェラーゼ活性を上昇させた（図１
４）。これらのヘテロなプロモーターからの転写の増強
は、コアプロモーター（pTATA-Luc、4倍、図１３参照）
による増強と多かれ少なかれ同様のレベルであった。こ
れは、ABT1はエンハンサー特異的に作用するのではな
く、むしろユビキタスに作用することを示唆している。
この観察は、ABT1はin vivoにおいて基本転写を刺激す
るが、これらのエンハンサー配列は活性化しないという
考えに一致する。これらのアッセイで発現をモニターす
るために mycタグを付加したABT1を使用したが、タグを
持たないABT1でも同様の結果を得た（データ省略）こと
から、mycタグはルシフェラーゼ活性の増強には貢献し
ていない。

【００８８】[実施例８] ABT1は遺伝子の発現をmRNAレ
ベルでも蛋白質レベルでも増強するルシフェラーゼ活性の測定に加え、本発明者らは、mRNA
および蛋白質レベルでモニターすることにより、遺伝子
発現の増強を確認した。1μgのGAL4-CREB融合蛋白質発
現プラスミド（pFA-CREB; Stratagene社）を、1μgのpc
DNA3-myc-ABT1の存在下または非存在下で、実施例３に
記載の方法と同様にしてCOS7細胞にコトランスフェクト
した。インキュベート後、全RNAを回収し、RT-PCR解析
によりGAL4-CREB mRNAを定量した。すなわち、TRIZOL
（GIBCO BRL）を用いてCOS7細胞から単離した全RNA 2μ
gをDNaseI（GIBCO BRL）で処理した。RNA試料とランダ
ムヘキサマーを用いて、SuperscriptII（GIBCO BRL）に
より逆転写を行った。外来的にトランスフェクトしたGA
L4-CREB遺伝子の部分配列に対応するDNA断片を2つのオ
リゴヌクレオチド（5'-ATT GGC TTC AGT GGA GAC-3'／
配列番号：２２および5'-GAA TCA GTT ACA CTA TCC-3'
／配列番号：２３）を用いてPCRにより選択的に増幅し
た。PCR反応は、変性94℃1分、アニーリング44℃1分、
およびポリメライゼーション72℃1分を35サイクル行っ
た。PCR産物はアガロースゲル電気泳動で分離し、エチ
ジウムブロマイドで染色した。

【００８９】図１５に示したように、GAL4-CREB発現ベ
クターとpcDNA3-mycをトランスフェクトしたCOS7細胞か
ら調製した全RNAでは、用いた実験条件において、35サ
イクルのRT-PCR後でもGAL4-CREBの転写産物は検出され
なかった。これに対してGAL4-CREB発現ベクターとpcDNA
3-myc-ABT1をトランスフェクトしたCOS7細胞から調製し
た全RNAでは、GAL4-CREBの転写産物は、25サイクルのRT
-PCRで容易に検出された。GAL4-CREB蛋白質量を、抗CRE
B抗体を用いたウェスタンブロットで決定したところ、A
BT1のコトランスフェクションにより、GAL4-CREB mRNA
と同様、蛋白質量も増加することが確認された（図１
５）。本発明者らはさらに、GAL4-FosまたはGAL4-ATF2
を発現する別のプラスミド（それぞれpFA-cFosおよびpF
A-ATF2; Stratagene社）をコトランスフェクトして、AB
T1がそれらの遺伝子発現をも増強するかを調べた。抗GA
L4抗体を用いたウェスタンブロットにより、GAL4-Fosお
よびGAL4-ATF2キメラ蛋白質の発現レベルは、ABT1を共
発現させることで劇的に増加することが明確に示された
（図１６）。

【００９０】[実施例９] ABT1はDNAに結合する ABT1がDNAに結合するか否かを調べた。0.8μgの精製し
たGST-ABT1を15μlのDNA-セルロース（Pharmacia社）と
4℃で3時間インキュベートした後、1mlのNaCl溶液（0.2
〜1.0M）で4回洗浄した。DNA-セルロースに結合してい
るタンパク質をSDS-PAGEにかけ、メンブレンに移した
後、抗GST抗体でウエスタンブロッティングを行った。
その結果、ABT1はDNAに結合し、その結合は1.0MのNaCl
溶液ではずれることがわかった（図１７）。

【００９１】[実施例１０] ABT1に結合する蛋白質のス
クリーニング酵母のtwoハイブリッド系により、ABT1蛋白質に結合す
る蛋白質のスクリーニングを行った。ABT1遺伝子断片を
含むpBTM118-ABT1を酵母株L40に導入し、LexA-ABT1キメ
ラタンパク質を発現している形質転換株を得た。次にpG
AD10 Rat BraincDNA library（Clontech）をこの酵母に
導入し、トリプトファン、ロイシン、ヒスチジンを含ま
ない培地で生育でき、且つβ-ガラクトシダーゼ陽性の
クローンを得た。その中の一つ、I62をデータベースで
調べたところ、酵母、ショウジョウバエ、および線虫で
ホモロジーを持つものが見つかった。しかし、脊椎動物
ではESTとしては存在したものの全長を含むクローンは
なく、また単離されたクローンも全長ではなかった（配
列番号：２４に示すI62 cDNAの394位〜1882位の断片で
あった）。そこでRT-PCRを行い 5'側と3'側のcDNA断片
をクローニングし、それらを酵母twoハイブリッドで得
られたcDNA断片と繋ぎ、全長のI62 cDNAを得た。得られ
たcDNAはABT1 cDNAと同様にシークエンスを行った。I62
cDNAの塩基配列を配列番号：２４に、コードされる蛋
白質のアミノ酸配列を配列番号：２５に示す。

【００９２】[実施例１１] ABT1とI62の結合 ABT1とI62の結合は酵母twoハイブリッドアッセイで確認
した。LexA-ABT1を発現するL40酵母株とGAL4-I62を発現
するAMR70酵母株を接合させ、フィルターβ-ガラクトシ
ダーゼアッセイを行った。空ベクターを対照として用い
た。ABT1とI62があると酵母の色は青に変わり、2つのタ
ンパク質が結合することがわかった（図１８）。

【００９３】[実施例１２] ABT1とI62は細胞核内の同
じところに局在する 2つの異なる蛍光タンパク質EYFPとECFPにそれぞれABT1
とI62を繋ぎ、COS7細胞内で共発現させた。それぞれの
蛍光を指標にABT1とI62の局在を調べたところ、ABT1とI
62は核内の同じ場所に局在していることがわかった(図
１９）。このことは、ABT1とI62が細胞内で結合し複合
体をつくり、転写の制御に関わっている可能性を示唆す
る。

【００９４】

【発明の効果】本発明の「ABT1」蛋白質は、転写を増強
する活性を有するため、「ABT1」蛋白質やその遺伝子、
「ABT1」蛋白質の活性を制御する化合物は、細胞の転写
量を制御するために有用である。これにより、蛋白質産
生量を増大させることが可能である他、細胞の増殖や代
謝を制御することも可能となる。また、転写量の制御が
必要な各種疾患に対する新しい医薬品開発への応用が期
待される。

【００９５】

【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> Helix Research Institute <120> A gene encoding a transcription activator that binds to TATA-binding protein (TBP) <130> H1-109 <140> <141> <160> 25 <170> PatentIn Ver. 2.0 <210> 1 <211> 1166 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (21)..(836) <400> 1 tgccgctcgt gtcagtcaac atg gag gca gag gaa tcg gag aag gcc gca acg 53 Met Glu Ala Glu Glu Ser Glu Lys Ala Ala Thr 1 5 10 gag caa gag ccg ctg gaa ggg aca gaa cag aca cta gat gcg gag gag 101 Glu Gln Glu Pro Leu Glu Gly Thr Glu Gln Thr Leu Asp Ala Glu Glu 15 20 25 gag cag gag gaa tcc gaa gaa gcg gcc tgt ggc agc aag aag cgg gta 149 Glu Gln Glu Glu Ser Glu Glu Ala Ala Cys Gly Ser Lys Lys Arg Val 30 35 40 gtg cca ggt att gtg tac ctg ggc cat atc ccg ccg cgc ttc cgg ccc 197 Val Pro Gly Ile Val Tyr Leu Gly His Ile Pro Pro Arg Phe Arg Pro 45 50 55 ctg cac gtc cgc aac ctt ctc agc gcc tat ggc gag gtc gga cgc gtc 245 Leu His Val Arg Asn Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Glu Val Gly Arg Val 60 65 70 75 ttc ttt cag gct gag gac cgg ttc gtg aga cgc aag aag aag gca gca 293 Phe Phe Gln Ala Glu Asp Arg Phe Val Arg Arg Lys Lys Lys Ala Ala 80 85 90 gca gct gcc gga gga aaa aag cgg tcc tac acc aag gac tac acc gag 341 Ala Ala Ala Gly Gly Lys Lys Arg Ser Tyr Thr Lys Asp Tyr Thr Glu 95 100 105 gga tgg gtg gag ttc cgt gac aag cgc ata gcc aag cgc gtg gcg gcc 389 Gly Trp Val Glu Phe Arg Asp Lys Arg Ile Ala Lys Arg Val Ala Ala 110 115 120 agt cta cac aac acg cct atg ggt gcc cgc agg cgc agc ccc ttc cgt 437 Ser Leu His Asn Thr Pro Met Gly Ala Arg Arg Arg Ser Pro Phe Arg 125 130 135 tat gat ctt tgg aac ctc aag tac ttg cac cgt ttc acc tgg tcc cac 485 Tyr Asp Leu Trp Asn Leu Lys Tyr Leu His Arg Phe Thr Trp Ser His 140 145 150 155 ctc agc gag cac ctc gcc ttt gag cgc cag gtg cgc agg cag cgc ttg 533 Leu Ser Glu His Leu Ala Phe Glu Arg Gln Val Arg Arg Gln Arg Leu 160 165 170 aga gcg gag gtt gct caa gcc aag cgt gag acc gac ttc tat ctt caa 581 Arg Ala Glu Val Ala Gln Ala Lys Arg Glu Thr Asp Phe Tyr Leu Gln 175 180 185 agt gtg gaa cgg gga caa cgc ttt ctt gcg gcc gat ggg gac cct gct 629 Ser Val Glu Arg Gly Gln Arg Phe Leu Ala Ala Asp Gly Asp Pro Ala 190 195 200 cgc cca gat ggc tcc tgg aca ttt gcc cag cgt cct act gag cag gaa 677 Arg Pro Asp Gly Ser Trp Thr Phe Ala Gln Arg Pro Thr Glu Gln Glu 205 210 215 ctg agg gcc cgt aaa gca gca cgg cca ggg gga cgt gaa cgg gct cgc 725 Leu Arg Ala Arg Lys Ala Ala Arg Pro Gly Gly Arg Glu Arg Ala Arg 220 225 230 235 ctg gca act gcc cag gac aag gcc cgc tcc aac aaa ggg ctc ctg gcc 773 Leu Ala Thr Ala Gln Asp Lys Ala Arg Ser Asn Lys Gly Leu Leu Ala 240 245 250 agg atc ttt gga gcc ccg cca ccc tca gag agc atg gag gga cct tcc 821 Arg Ile Phe Gly Ala Pro Pro Pro Ser Glu Ser Met Glu Gly Pro Ser 255 260 265 ctt gtc agg gac tcc tgagggcctg ggtggcccct tccatttcct ggccctgctc 876 Leu Val Arg Asp Ser 270 tgcttcctgt ctacctcata ctagaatgat cgtgactacc cgggcagaca ttttactgtg 936 tttctcagac caagtgtcta ctgatggccc aaacatggag ttttgtgggc ttccactgtc 996 cccactccga actcctgtat gtgcctggct gagtcaccta attcatactg tcatactagc 1056 ataattatga ctattgcata tgcttgtttt gtttgactct tggctgccta cgtctgtagg 1116 gtcccctgaa aatcccactt cctgccccca gaaagggcct ttatttccaa 1166 <210> 2 <211> 272 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Glu Ala Glu Glu Ser Glu Lys Ala Ala Thr Glu Gln Glu Pro Leu 1 5 10 15 Glu Gly Thr Glu Gln Thr Leu Asp Ala Glu Glu Glu Gln Glu Glu Ser 20 25 30 Glu Glu Ala Ala Cys Gly Ser Lys Lys Arg Val Val Pro Gly Ile Val 35 40 45 Tyr Leu Gly His Ile Pro Pro Arg Phe Arg Pro Leu His Val Arg Asn 50 55 60 Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Glu Val Gly Arg Val Phe Phe Gln Ala Glu 65 70 75 80 Asp Arg Phe Val Arg Arg Lys Lys Lys Ala Ala Ala Ala Ala Gly Gly 85 90 95 Lys Lys Arg Ser Tyr Thr Lys Asp Tyr Thr Glu Gly Trp Val Glu Phe 100 105 110 Arg Asp Lys Arg Ile Ala Lys Arg Val Ala Ala Ser Leu His Asn Thr 115 120 125 Pro Met Gly Ala Arg Arg Arg Ser Pro Phe Arg Tyr Asp Leu Trp Asn 130 135 140 Leu Lys Tyr Leu His Arg Phe Thr Trp Ser His Leu Ser Glu His Leu 145 150 155 160 Ala Phe Glu Arg Gln Val Arg Arg Gln Arg Leu Arg Ala Glu Val Ala 165 170 175 Gln Ala Lys Arg Glu Thr Asp Phe Tyr Leu Gln Ser Val Glu Arg Gly 180 185 190 Gln Arg Phe Leu Ala Ala Asp Gly Asp Pro Ala Arg Pro Asp Gly Ser 195 200 205 Trp Thr Phe Ala Gln Arg Pro Thr Glu Gln Glu Leu Arg Ala Arg Lys 210 215 220 Ala Ala Arg Pro Gly Gly Arg Glu Arg Ala Arg Leu Ala Thr Ala Gln 225 230 235 240 Asp Lys Ala Arg Ser Asn Lys Gly Leu Leu Ala Arg Ile Phe Gly Ala 245 250 255 Pro Pro Pro Ser Glu Ser Met Glu Gly Pro Ser Leu Val Arg Asp Ser 260 265 270 <210> 3 <211> 1276 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <221> CDS <222> (14)..(820) <400> 3 cccagatctt gcc atg gtg aaa gcg gga gag ttg gtg gag cag caa aag 49 Met Val Lys Ala Gly Glu Leu Val Glu Gln Gln Lys 1 5 10 gct gcg atg gag gaa gag gcg aat gca gag gcg gcg gag gat cag gag 97 Ala Ala Met Glu Glu Glu Ala Asn Ala Glu Ala Ala Glu Asp Gln Glu 15 20 25 gag ccc gag gac acg gcc tgc agc agc agc agc aag aag aag aag aag 145 Glu Pro Glu Asp Thr Ala Cys Ser Ser Ser Ser Lys Lys Lys Lys Lys 30 35 40 gta gtt ccg ggg att gtg tac ctg ggc cac gtc ccg ccg cga ttc cgg 193 Val Val Pro Gly Ile Val Tyr Leu Gly His Val Pro Pro Arg Phe Arg 45 50 55 60 ccc ctt cac gta cgc aac ctg ctc agc gcc tac ggc gag gtg gga cgc 241 Pro Leu His Val Arg Asn Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Glu Val Gly Arg 65 70 75 gtt ttc ttc cag gcc gag gac cac ttt gtg aaa cgc aag aag aag gca 289 Val Phe Phe Gln Ala Glu Asp His Phe Val Lys Arg Lys Lys Lys Ala 80 85 90 gcc gcg gcc gca gga gga aag aag gga gct aag tac agc aag gac tat 337 Ala Ala Ala Ala Gly Gly Lys Lys Gly Ala Lys Tyr Ser Lys Asp Tyr 95 100 105 acc gaa ggc tgg gtg gag ttc cga gac aag cgt gta gcc aag cga gtg 385 Thr Glu Gly Trp Val Glu Phe Arg Asp Lys Arg Val Ala Lys Arg Val 110 115 120 gca gcc agt cta cat aac acg ccc atg ggc gcc cgc aag cgc agc ccc 433 Ala Ala Ser Leu His Asn Thr Pro Met Gly Ala Arg Lys Arg Ser Pro 125 130 135 140 ttc cgt tat gac ctg tgg aac ctc aag tat ttg cat cgt ttt act tgg 481 Phe Arg Tyr Asp Leu Trp Asn Leu Lys Tyr Leu His Arg Phe Thr Trp 145 150 155 tcc cac ctc agt gaa cac ctt gcc ttt gag cgc caa gta cga agg caa 529 Ser His Leu Ser Glu His Leu Ala Phe Glu Arg Gln Val Arg Arg Gln 160 165 170 cgc ctg aga gca gag gtc gcc caa gca aag aga gag act gac ttc tat 577 Arg Leu Arg Ala Glu Val Ala Gln Ala Lys Arg Glu Thr Asp Phe Tyr 175 180 185 ctt cga aac gta gaa cag gga caa cac ttc ctt gca gct gat ggg gat 625 Leu Arg Asn Val Glu Gln Gly Gln His Phe Leu Ala Ala Asp Gly Asp 190 195 200 gct act cgg cca aat agc tcc tgg aca ttc acc cag cgt ccc act gag 673 Ala Thr Arg Pro Asn Ser Ser Trp Thr Phe Thr Gln Arg Pro Thr Glu 205 210 215 220 cag gag ttt agg gcc cgg aaa gct gca cgg cca gga ggg cgg gaa aga 721 Gln Glu Phe Arg Ala Arg Lys Ala Ala Arg Pro Gly Gly Arg Glu Arg 225 230 235 gca cgg ctg gct aat gtc gag gac cag gcc cga tcc aac aga ggg ctc 769 Ala Arg Leu Ala Asn Val Glu Asp Gln Ala Arg Ser Asn Arg Gly Leu 240 245 250 ctt gcc aag atc ttt gga gcc cct cta cct gca gag agc aag gaa aaa 817 Leu Ala Lys Ile Phe Gly Ala Pro Leu Pro Ala Glu Ser Lys Glu Lys 255 260 265 ccg tagtcaataa gggactcctg gtgatggaag aaatacctac cagccctgcg 870 Pro ccattctgat ctgcttcctg aagagtgtga ccatctaggc agatgttttc tctattccac 930 acaccaagag tctggtaaag gccttttgtt ggtgtctttt acctactttg aacaaatcct 990 gtaagtgcca gcctgagaac cttactcgtc ctatccaggg tgaagaccac tggaggtgcc 1050 tgttgtgttt tgtttgattt ctgattgcct gcctctttct cagtggacag ctaacagttt 1110 ctgactgaaa gagtggactt gccctccact agggtagtgg tctgtggtgt ttgttcactg 1170 tggtggaagg ctgaattagc aggaattgga ttagaggtcc aatttgaggc ttatatttga 1230 aaataaaaaa taatttattt ttaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaa 1276 <210> 4 <211> 269 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 4 Met Val Lys Ala Gly Glu Leu Val Glu Gln Gln Lys Ala Ala Met Glu 1 5 10 15 Glu Glu Ala Asn Ala Glu Ala Ala Glu Asp Gln Glu Glu Pro Glu Asp 20 25 30 Thr Ala Cys Ser Ser Ser Ser Lys Lys Lys Lys Lys Val Val Pro Gly 35 40 45 Ile Val Tyr Leu Gly His Val Pro Pro Arg Phe Arg Pro Leu His Val 50 55 60 Arg Asn Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Glu Val Gly Arg Val Phe Phe Gln 65 70 75 80 Ala Glu Asp His Phe Val Lys Arg Lys Lys Lys Ala Ala Ala Ala Ala 85 90 95 Gly Gly Lys Lys Gly Ala Lys Tyr Ser Lys Asp Tyr Thr Glu Gly Trp 100 105 110 Val Glu Phe Arg Asp Lys Arg Val Ala Lys Arg Val Ala Ala Ser Leu 115 120 125 His Asn Thr Pro Met Gly Ala Arg Lys Arg Ser Pro Phe Arg Tyr Asp 130 135 140 Leu Trp Asn Leu Lys Tyr Leu His Arg Phe Thr Trp Ser His Leu Ser 145 150 155 160 Glu His Leu Ala Phe Glu Arg Gln Val Arg Arg Gln Arg Leu Arg Ala 165 170 175 Glu Val Ala Gln Ala Lys Arg Glu Thr Asp Phe Tyr Leu Arg Asn Val 180 185 190 Glu Gln Gly Gln His Phe Leu Ala Ala Asp Gly Asp Ala Thr Arg Pro 195 200 205 Asn Ser Ser Trp Thr Phe Thr Gln Arg Pro Thr Glu Gln Glu Phe Arg 210 215 220 Ala Arg Lys Ala Ala Arg Pro Gly Gly Arg Glu Arg Ala Arg Leu Ala 225 230 235 240 Asn Val Glu Asp Gln Ala Arg Ser Asn Arg Gly Leu Leu Ala Lys Ile 245 250 255 Phe Gly Ala Pro Leu Pro Ala Glu Ser Lys Glu Lys Pro 260 265 <210> 5 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 5 tttgaattca tggcgcctat tccaaaaaag 30 <210> 6 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 6 gagaggatcc ttatttgaag atcatattca tcaattc 37 <210> 7 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 7 tgcctggact aggcattatc c 21 <210> 8 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 8 ttggaaataa aggccctttc t 21 <210> 9 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 9 agcaaacagt ttactgcagc agagtgaagt aaatttttac gccgtacgct gcaggtcgac 60 <210> 10 <211> 61 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 10 agcattggcc acggcttgtt tccacacgac gttgtttaaa ttatcgatga attcgagctc 60 g 61 <210> 11 <211> 53 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 11 agctgccatg gaacaaaaac tcatctcaga agaggatctg ggatccaagc ttg 53 <210> 12 <211> 53 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 12 aattcaagct tggatcccag atcctcttct gagatgagtt tttgttccat ggc 53 <210> 13 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 13 taatacgact cactatag 18 <210> 14 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 14 atttaggtga cactatag 18 <210> 15 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 15 tttgaattca tggcctgcag cgca 24 <210> 16 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 16 tttgaattcg gaggaaagaa gggagct 27 <210> 17 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 17 tttctcgagg ctgctgctgc tgcaggc 27 <210> 18 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 18 tttctcgaga gctcccttct ttcctcc 27 <210> 19 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 19 tttctcgaga tccccatcag ctgcaag 27 <210> 20 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 20 cgcaagcttg cggagactct agaggg 26 <210> 21 <211> 14 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 21 ttctgcccga acgg 14 <210> 22 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 22 attggcttca gtggagac 18 <210> 23 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: artificially synthesized primer sequence <400> 23 gaatcagtta cactatcc 18 <210> 24 <211> 3381 <212> DNA <213> Rattus norvegicus <220> <221> CDS <222> (124)..(2649) <400> 24 aatgtgctcc atgtgaactc agactgggat cggaaaagag tagtgagtaa ctgtggttgt 60 ccgtcggtat ctcctgtgat tttactttgt ttctctggat atttcttcat taagactgta 120 aaa atg tcc tcc aaa caa gaa ata atg gat gac cag cgg ttc agg cgg 168 Met Ser Ser Lys Gln Glu Ile Met Asp Asp Gln Arg Phe Arg Arg 1 5 10 15 gtt tca aag gat ccc aga ttt tgg gag atg cca gaa aag gac cga aaa 216 Val Ser Lys Asp Pro Arg Phe Trp Glu Met Pro Glu Lys Asp Arg Lys 20 25 30 gtc aaa att gac aag agg ttt cga gcc atg ttt cat gac aaa aaa ttt 264 Val Lys Ile Asp Lys Arg Phe Arg Ala Met Phe His Asp Lys Lys Phe 35 40 45 aaa ttg aac tat gcc gtt gat aaa aga gga cgt cct att agc cac agc 312 Lys Leu Asn Tyr Ala Val Asp Lys Arg Gly Arg Pro Ile Ser His Ser 50 55 60 act aca gag gac ttg aag cgt ttc tat gac ctt tca gac tct gat tct 360 Thr Thr Glu Asp Leu Lys Arg Phe Tyr Asp Leu Ser Asp Ser Asp Ser 65 70 75 gat ctc tct gat gaa gaa agt aaa gta ctg gat gaa aag aga gtg aag 408 Asp Leu Ser Asp Glu Glu Ser Lys Val Leu Asp Glu Lys Arg Val Lys 80 85 90 95 gag aaa aaa aaa cag acc aaa aag gaa aca aag tca aaa aca ccg att 456 Glu Lys Lys Lys Gln Thr Lys Lys Glu Thr Lys Ser Lys Thr Pro Ile 100 105 110 gag gag aaa aag aaa gaa acc aag aaa act gac caa aag gat tct ata 504 Glu Glu Lys Lys Lys Glu Thr Lys Lys Thr Asp Gln Lys Asp Ser Ile 115 120 125 aat aaa aat gac tta aat aat tct gaa aga att cag aaa atg aaa aac 552 Asn Lys Asn Asp Leu Asn Asn Ser Glu Arg Ile Gln Lys Met Lys Asn 130 135 140 tca cat aaa tct ccg aag ata gat tca gaa gta agt ccc aaa gat agt 600 Ser His Lys Ser Pro Lys Ile Asp Ser Glu Val Ser Pro Lys Asp Ser 145 150 155 gaa gaa tcc cta caa agt aga aaa aag aaa agg gac acc act gac ctt 648 Glu Glu Ser Leu Gln Ser Arg Lys Lys Lys Arg Asp Thr Thr Asp Leu 160 165 170 175 agt gtt gaa gct tcg ccc aaa gga aaa ctg agg acc aaa gat ccc agt 696 Ser Val Glu Ala Ser Pro Lys Gly Lys Leu Arg Thr Lys Asp Pro Ser 180 185 190 acc tct gca atg gtg aaa tct tca aca gtc agt ggt tct aag gca aaa 744 Thr Ser Ala Met Val Lys Ser Ser Thr Val Ser Gly Ser Lys Ala Lys 195 200 205 aga gaa aag caa gca gtc ata atg gca aaa gac aat gct ggt aga atg 792 Arg Glu Lys Gln Ala Val Ile Met Ala Lys Asp Asn Ala Gly Arg Met 210 215 220 ctt cac gaa gag gcc ccg gag gaa gat tca gac agc gcc agt gaa cta 840 Leu His Glu Glu Ala Pro Glu Glu Asp Ser Asp Ser Ala Ser Glu Leu 225 230 235 gga aga gat gag gaa tcc gaa ggt gaa atc aca agt gat gat aga gcc 888 Gly Arg Asp Glu Glu Ser Glu Gly Glu Ile Thr Ser Asp Asp Arg Ala 240 245 250 255 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Asp Ala Ala Ser Glu Val 465 470 475 gat cta aca gca tat aaa cca aag tat ttc aca tct gct gca atg gga 1608 Asp Leu Thr Ala Tyr Lys Pro Lys Tyr Phe Thr Ser Ala Ala Met Gly 480 485 490 495 aca tca acg gtg gag atc act tgg gat gag act gat cac gaa aga atc 1656 Thr Ser Thr Val Glu Ile Thr Trp Asp Glu Thr Asp His Glu Arg Ile 500 505 510 acg aca ctg aac aga aag ttt aaa aag gat gag ctt ttg gac atg gac 1704 Thr Thr Leu Asn Arg Lys Phe Lys Lys Asp Glu Leu Leu Asp Met Asp 515 520 525 ttt gaa gcc tac ttg gct tct tcc agc gag gat gag gaa gag gtg gag 1752 Phe Glu Ala Tyr Leu Ala Ser Ser Ser Glu Asp Glu Glu Glu Val Glu 530 535 540 gaa gca cca gaa ggt gaa gat gga gtc agc ata gaa gat ggg aaa aca 1800 Glu Ala Pro Glu Gly Glu Asp Gly Val Ser Ile Glu Asp Gly Lys Thr 545 550 555 aag aaa agt cag aag gat gat gaa gaa caa att gca aaa tat aga cag 1848 Lys Lys Ser Gln Lys Asp Asp Glu Glu Gln Ile Ala Lys Tyr Arg Gln 560 565 570 575 ctc ttg cag gtt att caa gaa aaa gaa aag aaa gga aaa gaa aat gat 1896 Leu Leu Gln Val Ile Gln Glu Lys Glu Lys Lys Gly Lys Glu Asn Asp 580 585 590 atg gaa atg gaa atc aag tgg gtt cca gga ctt aag gag agt gca gaa 1944 Met Glu Met Glu Ile Lys Trp Val Pro Gly Leu Lys Glu Ser Ala Glu 595 600 605 gag atg gtc aaa aac aag ttg gag gga aag gat aaa ctg acc cct tgg 1992 Glu Met Val Lys Asn Lys Leu Glu Gly Lys Asp Lys Leu Thr Pro Trp 610 615 620 gaa caa ttc tta gag aag aag aaa gag aag aaa aga ctg aaa aag aaa 2040 Glu Gln Phe Leu Glu Lys Lys Lys Glu Lys Lys Arg Leu Lys Lys Lys 625 630 635 cag aag gct ctt gct gaa gaa gcc agt gaa gat gag att cct tct gat 2088 Gln Lys Ala Leu Ala Glu Glu Ala Ser Glu Asp Glu Ile Pro Ser Asp 640 645 650 655 gtt gat cta aat gat ccc tac ttt gct gaa gaa gtt aaa aaa ata ggt 2136 Val Asp Leu Asn Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Glu Val Lys Lys Ile Gly 660 665 670 ata aag aaa aaa tca atg aaa tct gca aaa gac ggc gca act tca gag 2184 Ile Lys Lys Lys Ser Met Lys Ser Ala Lys Asp Gly Ala Thr Ser Glu 675 680 685 gaa gaa act gaa cta gaa aaa caa aag gcc gag atg gct tta ctt gta 2232 Glu Glu Thr Glu Leu Glu Lys Gln Lys Ala Glu Met Ala Leu Leu Val 690 695 700 atg gat gag gaa gag gat agc aag aaa cac ttc aat tat gac aag atc 2280 Met Asp Glu Glu Glu Asp Ser Lys Lys His Phe Asn Tyr Asp Lys Ile 705 710 715 gta gag cac cag aat ctg agc aaa aag aag aag aaa cag ctt atg aaa 2328 Val Glu His Gln Asn Leu Ser Lys Lys Lys Lys Lys Gln Leu Met Lys 720 725 730 735 aag aag gag tta ctt gaa gat gac ttt gag gta aat gtc agt gat gca 2376 Lys Lys Glu Leu Leu Glu Asp Asp Phe Glu Val Asn Val Ser Asp Ala 740 745 750 cgg ttt cag gca atg tac act tcc cac ttg ttc aat ttg gat ccc tct 2424 Arg Phe Gln Ala Met Tyr Thr Ser His Leu Phe Asn Leu Asp Pro Ser 755 760 765 gat cct aat ttc aag aaa aca aaa gct atg gaa aaa att ctg gag gag 2472 Asp Pro Asn Phe Lys Lys Thr Lys Ala Met Glu Lys Ile Leu Glu Glu 770 775 780 aaa gca cga cat cga gaa cag aaa gaa gaa cga ctc att caa gca gtg 2520 Lys Ala Arg His Arg Glu Gln Lys Glu Glu Arg Leu Ile Gln Ala Val 785 790 795 gag aga gca cag cag gac acg gga aag cca gca 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Lys Asp Ser Glu 145 150 155 160 Glu Ser Leu Gln Ser Arg Lys Lys Lys Arg Asp Thr Thr Asp Leu Ser 165 170 175 Val Glu Ala Ser Pro Lys Gly Lys Leu Arg Thr Lys Asp Pro Ser Thr 180 185 190 Ser Ala Met Val Lys Ser Ser Thr Val Ser Gly Ser Lys Ala Lys Arg 195 200 205 Glu Lys Gln Ala Val Ile Met Ala Lys Asp Asn Ala Gly Arg Met Leu 210 215 220 His Glu Glu Ala Pro Glu Glu Asp Ser Asp Ser Ala Ser Glu Leu Gly 225 230 235 240 Arg Asp Glu Glu Ser Glu Gly Glu Ile Thr Ser Asp Asp Arg Ala Ser 245 250 255 Ala Asp Asp Asp Glu Asn Glu Asp Glu Glu Glu Glu Glu Asp Gly Glu 260 265 270 Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Asp Glu Ser Asp Asp Glu Ser 275 280 285 Asp Ser Gly Pro Asp Leu Ala Arg Gly Lys Gly Asn Val Glu Thr Ser 290 295 300 Ser Glu Asp Glu Asp Asp Leu Ala Asp Leu Phe Pro Glu Glu Pro Gly 305 310 315 320 Phe Glu His Ala Trp Arg Glu Leu Asp Lys Asp Ala Pro Arg Ala Asp 325 330 335 Glu Ile Thr Arg Arg Leu Ala Val Cys Asn Met Asp Trp Asp Arg Leu 340 345 350 Lys Ala Lys Asp Leu Leu Ala Leu Phe Asn Ser Phe Lys Pro Lys Gly 355 360 365 Gly Val Val Phe Ser Val Lys Ile Tyr Pro Ser Glu Phe Gly Lys Gln 370 375 380 Arg Met Lys Glu Glu Gln Ile Gln Gly Pro Val Glu Leu Leu Ser Ile 385 390 395 400 Pro Glu Asp Ala Pro Glu Lys Asp Trp Ala Ser Arg Glu Lys Leu Arg 405 410 415 Asp Tyr Gln Phe Lys Arg Leu Lys Tyr Tyr Tyr Ala Val Val Glu Cys 420 425 430 Asp Ser Pro Glu Thr Ala Ser Lys Ile Tyr Glu Asp Cys Asp Gly Leu 435 440 445 Glu Phe Glu Ser Ser Cys Ser Phe Ile Asp Leu Arg Phe Ile Pro Asp 450 455 460 Asp Ile Thr Phe Asp Asp Glu Pro Lys Asp Ala Ala Ser Glu Val Asp 465 470 475 480 Leu Thr Ala Tyr Lys Pro Lys Tyr Phe Thr Ser Ala Ala Met Gly Thr 485 490 495 Ser Thr Val Glu Ile Thr Trp Asp Glu Thr Asp His Glu Arg Ile Thr 500 505 510 Thr Leu Asn Arg Lys Phe Lys Lys Asp Glu Leu Leu Asp Met Asp Phe 515 520 525 Glu Ala Tyr Leu Ala Ser Ser Ser Glu Asp Glu Glu Glu Val Glu Glu 530 535 540 Ala Pro Glu Gly Glu Asp Gly Val Ser Ile Glu Asp Gly Lys Thr Lys 545 550 555 560 Lys Ser Gln Lys Asp Asp Glu Glu Gln Ile Ala Lys 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Glu Glu Lys 770 775 780 Ala Arg His Arg Glu Gln Lys Glu Glu Arg Leu Ile Gln Ala Val Glu 785 790 795 800 Arg Ala Gln Gln Asp Thr Gly Lys Pro Ala Gln Lys Gln Pro Met Asp 805 810 815 Pro Ala Leu Ser Met Leu Ile Lys Ser Val Lys Asn Lys Thr Glu Gln 820 825 830 Phe Gln Ala Arg Lys Lys Gln Arg Ile Lys 835 840

【図面の簡単な説明】

【図１】マウスABT1クローンのヌクレオチド配列および
予想されるアミノ酸配列を示す図である。オープンリー
ディングフレームの269アミノ酸は１文字のシンボルで
表した。

【図２】マウス、ヒト、酵母、および線虫のABT1のアラ
イメントを示す図である。S. cerevisiae の仮想蛋白質
配列（YNR054）、C. elegans の仮想蛋白質配列（F57B1
0.8）、およびヒト ABT1は、マウスABT1配列と高い類似
性を示した。マウスABT1と同一のアミノ酸残基は背景を
黒で示す。４つのABT1蛋白質の酸性領域は矢印で示す。

【図３】マウスにおけるABT1遺伝子の発現を示す図であ
る。ノーザンブロット解析の結果、マウスにおいて ABT
1 mRNA のユビキタスな組織発現が示された。調べたす
べての臓器で、ABT1 mRNA は約1.4kbの転写産物として
発現されていた。

【図４】酵母ABT1遺伝子は増殖に必須であることを示す
図である。２倍体株のScABT1遺伝子の１コピーを破壊
し、ScABT1遺伝子が破壊された２つの酵母クローン（yn
r054Δ-6およびynr054Δ-8）を用いて４分子分析を行っ
た。クローンは1% 酢酸カリウム中、25℃で培養して胞
子を形成させ、各クローンの約20の４分子から得た胞子
を分離し、YPDプレート上で30℃で3日間インキュベート
した。

【図５】ABT1の細胞内局在を示す図である。pEGFP-ABT1
をCOS7細胞にトランスフェクトし、24時間後に細胞で発
現しているEGFP融合蛋白質を蛍光顕微鏡を用いて位相差
(A)、および暗視野(B)にてモニターした。

【図６】GST-ABT1とHeLa核抽出液中のTBPとの相互作用
を示す図である。大腸菌で発現させたGST-ABT1融合蛋白
質（レーン2、4）またはGST蛋白質（レーン1、3）をグ
ルタチオンセファロースに固定化し、HeLa核抽出液とイ
ンキュベートした。0.1%Triton X-100を含むPBSで洗浄
後（レーン1、2）、または0.5M LiClで洗浄後（レーン
3、4）、セファロースに結合した蛋白質をSDS-PAGEに供
し、抗TBP抗体を用いて免疫検出を行った。HeLa核抽出
液を陽性対照として用いた(レーン5）。矢印は37kDのTB
Pのバンドを示す。

【図７】ABT1とTBPの共-免疫沈降を示す図である。COS7
細胞にpcDNA3-myc-ABT1をトランスフェクトし、ライセ
ートを調製した。対照のウサギIgG(レーン1）または抗T
BP抗体(レーン2）で免疫沈降を行い、免疫複合体をTBP
に対する抗体(α-TBPブロット）またはc-mycに対する抗
体（α-Mycブロット）で解析した。全細胞溶解物中のTB
Pおよびmyc-ABT1はレーン3に示した。

【図８】ABT1と精製TBPとの相互作用を示す図である。
組換えHis-TBPをGST-ABT1（レーン2）またはGST（レー
ン1）とインキュベートし、0.1% Triton X-100を含むPB
Sで洗浄後、セファロースに結合した蛋白質をSDS-PAGE
に供し、抗His抗体を用いて免疫検出を行った。矢印はH
is-TBPを示す。

【図９】ABT1のTBP結合領域を決定した結果を示す図で
ある。一連のGST-ABT1変異体の模式図と結合特性のまと
めを示した。数字はABT1のアミノ酸の配列位置を示す。
HeLa核抽出液中のTBPおよび精製His-TBPを用いた相互作
用解析の結果を右にまとめた（○; 相互作用、×; 相互
作用なし、ND; 未決定）。

【図１０】ABT1のTBP結合領域を決定した結果を示す図
である。GST-ABT1欠失変異体とHeLaの核抽出液中のTBP
との相互作用を示す図である。一連のGST-ABT1欠失変異
体をHeLa核抽出液とインキュベートし、GST融合蛋白質
と結合した蛋白質を抗TBP抗体を用いたイムノブロット
により検出した。レーン1; GST、レーン2; ABT1 WT、レ
ーン3; ABT1 34-269、レーン4; ABT1 1-39、レーン5; A
BT1 1-102、レーン6; ABT1 1-204、レーン8; 対照のHeL
a核抽出液。

【図１１】ABT1のTBP結合領域を決定した結果を示す図
である。一連のGST-ABT1欠失変異体をHisタグを付加し
たTBPとインキュベートし、GST融合蛋白質と結合した蛋
白質を抗His抗体を用いたイムノブロッティングで検出
した。レーン1および7; GST、レーン2および8; ABT1 W
T、レーン3; ABT1 34-269、レーン4; ABT1 1-39、レー
ン5; ABT1 1-102、レーン6; ABT1 1-204、レーン9; ABT
1 34-102、レーン10;ABT1 34-204、レーン11; ABT1 97-
204。

【図１２】ABT1は再構成無細胞系における転写を刺激す
ることを示す図である。AdMLプロモーターからの in vi
tro 転写を、GST-ABT1またはGSTの量を増加させながら
測定した。レーン1: GST-ABT1なし、レーン2: 12.5ng G
ST-ABT1、レーン3: 25ng GST-ABT1、レーン4: 50ng GST
-ABT1、レーン5: 12.5ng GST、レーン6: 25ng GST、レ
ーン7: 50ng GST。ラット肝臓から調製した核抽出液を
陽性対照として用いた。転写産物量はイメージアナライ
ザー(BAS 1500, Fuji）で測定し、活性化の倍率を下に
示した。

【図１３】ABT1はトランスフェクトを受けた細胞の転写
を刺激することを示す図である。ABT1の共発現はpTATA-
Lucレポーター遺伝子からのルシフェラーゼ活性を刺激
する。0.1μgのpTATA-Lucを異なる量のpcDNA3-myc-ABT1
（0-2μg）と共にCOS7細胞にコトランスフェクトした。
各トランスフェクションで使用したプラスミドの総量
は、pcDNA3-mycプラスミドで標準化した。細胞はDMEM-1
0% FBSで培養した。48時間インキュベートし、細胞溶解
物を調製後、イムノブロッティングとルシフェラーゼア
ッセイを行った。各試料のmyc-ABT1の発現レベルを抗my
c抗体（挿入図）を用いたイムノブロッティングで検出
した。

【図１４】異なるシス（cis）調節配列を持つレポータ
ー遺伝子からのルシフェラーゼ活性のABT1による刺激を
示す図である。レポータープラスミドの構造と発現プラ
スミドの構造は上に示した。CRE、SRE、AP-1、およびNF
-κB cis調節配列を含むレポーター遺伝子 1μgを、1μ
gのpcDNA3-myc（Mock）またはpcDNA-myc-ABT1（myc-ABT
1）と共にコトランスフェクトした。細胞はDMEM-1% BSA
で培養し、インキュベーション48時間後に細胞溶解物
を調製し、ルシフェラーゼアッセイを行った。

【図１５】ABT1はコトランスフェクトされた遺伝子から
のmRNAレベルおよび蛋白質レベルの双方を増強すること
を示す図である。(A) COS7細胞にpFA-CREBと共に、pcDN
A3-myc（Mock）またはpcDNA3-myc-ABT1（ABT1）をトラ
ンスフェクトした。全RNA（1μg）をRT-PCR（RT+）また
はRT反応なしのPCR（RT-）に供した。PCR反応の 15、2
0、25、30、および35サイクル目に試料を回収し、1％ア
ガロースゲルで分離しエチジウムブロマイドで染色し
た。GAL4-CREB mRNA に由来する485pbのPCR産物を矢印
で示した。(B) 抗CREB抗体を用いたイムノブロッティン
グ。上述のようにトランスフェクトしたCOS7細胞から細
胞抽出液を調製し、SDS-PAGEに供し、抗CREB抗体を用い
たイムノブロッティングを行った。矢印はGAL4-CREB融
合蛋白質を示す。各２つの対照(-)およびABT1(+)試料
は、独立に調製した。

【図１６】抗GAL4抗体を用いたイムノブロッティングの
結果を示す図である。COS7細胞にpFA-cFosまたはpFA-AT
F2を、pcDNA3-myc-ABT1と共に、またはpcDNA3-myc-ABT1
なしでコトランスフェクトした。48時間後に細胞抽出液
を調製し、抗GAL4抗体を用いて解析した。矢印は、抗体
で検出されたGAL4-FosおよびGAL4-ATF2融合蛋白質を示
す。（レーン1: pFA-cFos + pcDNA3-myc、レーン2: pFA
-cFos + pcDNA3-myc-ABT1、レーン3: pFA-ATF2 + pcDNA
3-myc、レーン4: pFA-ATF2 + pcDNA3-myc-ABT1）

【図１７】0.8μgの精製したGST-ABT1（レーン2，4，
6，8，10）または GST（レーン1，3，5，7，9）を15μl
のDNA-セルロース（Pharmacia社）と4℃で3時間インキ
ュベートした後、1mlのNaCl溶液（0.2〜1.0M）で4回洗
浄した。DNA-セルロースに結合しているタンパク質をSD
S-PAGEにかけ、メンブレンに移した後、抗GST抗体でウ
エスタンブロッティングを行った。ABT1がDNAに結合
し、その結合は1.0MのNaCl溶液ではずれることがわかっ
た。レーン11および12は、それぞれGST-ABT1およびGST
そのもののウエスタンブロッティングである。

【図１８】ABT1とI62の結合を、酵母twoハイブリッドア
ッセイで確認した結果を示す図である。ABT1とI62があ
ると酵母の色は青に変わり、2つのタンパク質が結合す
ることがわかる。

【図１９】ABT1とI62の細胞内局在を調べた結果を示す
図である。2つの異なる蛍光タンパク質EYFPとECFPにそ
れぞれABT1とI62を繋ぎ、COS7細胞内で共発現させた。
それぞれの蛍光を指標にABT1とI62の局在を調べた。A：
COS7細胞位相差顕微鏡像。B：ECFP-I62の発現部位。C：
EYFP-ABT1の発現部位。D：BとCを重ねたもの。

【図２０】ABT1とTBPとの結合を低下させる化合物をtwo
ハイブリッド系によりスクリーニングする場合の原理を
示す図である。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号ＦＩテーマコート゛(参考）Ｃ１２Ｎ 1/19 Ｃ１２Ｎ 1/21 1/21 Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ 5/10 Ｇ０１Ｎ 33/15 ＺＣ１２Ｐ 21/02 33/50 ＺＧ０１Ｎ 33/15 33/566 33/50 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ 33/566 5/00 ＡＦターム(参考） 2G045 AA34 BB20 DA12 DA13 DA36 FA16 FB01 FB02 FB03 FB12 GC15 4B024 AA01 BA43 BA80 CA04 CA09 CA12 DA02 DA06 EA04 FA02 GA03 GA11 GA13 GA27 HA03 HA13 HA14 4B064 AG01 CA06 CA10 CA19 CA20 CC24 CE12 DA01 DA13 4B065 AA72Y AA90Y AA91Y AA93Y AB01 AB04 BA02 BA05 BA08 BA25 CA24 CA44 CA46 4H045 AA10 AA11 AA20 BA10 CA15 CA40 CA50 DA76 EA20 EA50 FA72 FA74 GA26

Claims

【特許請求の範囲】

【請求項１】 TATA結合蛋白質（TBP）およびDNAと結合
し、クラスIIプロモーターからの転写を活性化すること
ができる、脊椎動物由来の蛋白質をコードするDNA。
【請求項２】下記（ａ）から（ｄ）のいずれかに記載
された、請求項１に記載のDNA。（ａ）配列番号：２または４に記載のアミノ酸配列から
なる蛋白質をコードするDNA。（ｂ）配列番号：１または３に記載の塩基配列のコード
領域を含むDNA。（ｃ）配列番号：２または４に記載のアミノ酸配列にお
いて１若しくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、お
よび／または付加したアミノ酸配列を有する蛋白質をコ
ードするDNA。（ｄ）配列番号：１または３に記載の塩基配列からなる
DNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするD
NA。
【請求項３】配列番号：２または４に記載のアミノ酸
配列からなる蛋白質の部分ペプチドをコードするDNA。
【請求項４】配列番号：４に記載のアミノ酸配列にお
いて34位から102位のアミノ酸配列を含むペプチド、ま
たは配列番号：２に記載のアミノ酸配列において36位か
ら99位のアミノ酸配列を含むペプチドをコードする、請
求項３に記載のDNA。
【請求項５】請求項１または２に記載のDNAによりコ
ードされるタンパク質に結合する活性を有するタンパク
質をコードする、下記（ａ）から（ｄ）のいずれかに記
載のDNA。（ａ）配列番号：２５に記載のアミノ酸配列からなる蛋
白質をコードするDNA。（ｂ）配列番号：２４に記載の塩基配列のコード領域を
含むDNA。（ｃ）配列番号：２５に記載のアミノ酸配列において１
若しくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および／
または付加したアミノ酸配列からなる蛋白質をコードす
るDNA。（ｄ）配列番号：２４に記載の塩基配列からなるDNAと
ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA。
【請求項６】配列番号：２５に記載のアミノ酸配列か
らなる蛋白質の部分ペプチドをコードするDNA。
【請求項７】請求項１から６のいずれかにDNAが挿入
されたベクター。
【請求項８】請求項７に記載のベクターを保持する宿
主細胞。
【請求項９】請求項１から４のいずれかに記載のDNA
によりコードされる蛋白質。
【請求項１０】請求項５または６に記載のDNAにより
コードされる蛋白質。
【請求項１１】請求項８に記載の宿主細胞を培養し、
該細胞内で発現した組み換え蛋白質を、該細胞またはそ
の培養上清から回収する工程を含む、請求項９または１
０に記載の蛋白質の製造方法。
【請求項１２】請求項９または１０に記載の蛋白質に
対する抗体。
【請求項１３】配列番号：１、３、または２４に記載
の塩基配列からなるDNAまたはその相補鎖に相補的な少
なくとも15ヌクレオチドを含むポリヌクレオチド。
【請求項１４】請求項９または１０に記載の蛋白質に
結合する化合物をスクリーニングする方法であって、
（ａ）請求項９または１０に記載の蛋白質に被検試料を
接触させる工程、（ｂ）該蛋白質と被検試料との結合活
性を検出する工程、（ｃ）該蛋白質に結合する活性を有
する化合物を選択する工程、を含む方法。
【請求項１５】クラスIIプロモーターからの転写を調
節するための化合物をスクリーニングする方法であっ
て、（ａ）被検試料存在下で、請求項９に記載の蛋白質
とTATA結合蛋白質（TBP）とを接触させる工程、（ｂ）
請求項９に記載の蛋白質とTATA結合蛋白質（TBP）との
結合活性を検出する工程、（ｃ）被検試料非存在下の場
合と比較して、該結合活性を低下させる化合物を選択す
る工程、を含む方法。
【請求項１６】クラスIIプロモーターからの転写を調
節するための化合物をスクリーニングする方法であっ
て、（ａ）被検試料存在下で、請求項９に記載の蛋白質
と請求項１０に記載の蛋白質とを接触させる工程、
（ｂ）請求項９に記載の蛋白質と請求項１０に記載の蛋
白質との結合活性を検出する工程、（ｃ）被検試料非存
在下の場合と比較して、該結合活性を低下させる化合物
を選択する工程、を含む方法。
【請求項１７】請求項２および／または５に記載のDN
Aによりコードされる蛋白質の発現が改変されるように
操作された非ヒト脊椎動物。
【請求項１８】ノックアウト動物またはトランスジェ
ニック動物である、請求項１７に記載の非ヒト脊椎動
物。
【請求項１９】マウスである、請求項１８に記載の非
ヒト脊椎動物。