IT8224948A1 - Modified vaccine virus and methods for its production and use - Google Patents

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Description

DESCRIZIONE DESCRIPTION

Quest 'invenzione tratta di virus vaccinico modificato, i metodi per la produzione ed uso del medesimo ed altri microrganismi modificati e non modificati, nonch? di certe sequenze del DNA, prodotte o coinvolte in qualit? di intermediari nella produzione di virus vaccinico modificato.?Pi? particolarmente, l'invenzione tratta di virus'vaccinico in cui il genoma naturalmente presente nel virus ? stato alterato (i cosiddetti mutanti vaccinici) e di metodi impiegati nella produzione ed utilizzo di tali mutanti vaccinici, nonch? di altri microrganismi non modificati e geneticamente modificati, e di certe sequenze del DNA, prodotte o coinvolte in qualit? di intermediari nella produzione di mutanti vaccinici. This invention deals with modified vaccine virus, the methods for the production and use of the same and other modified and unmodified microorganisms, as well as? of certain DNA sequences, produced or involved in quality? of intermediaries in the production of modified vaccine virus. particularly, the invention deals with the vaccine virus in which the genome naturally present in the virus? been altered (the so-called vaccine mutants) and of the methods used in the production and use of such vaccine mutants, as well as? of other unmodified and genetically modified microorganisms, and of certain DNA sequences, produced or involved in quality? of intermediaries in the production of vaccine mutants.

Il virus vaccinico ? il prototipo del virus della famiglia dei poxvirus che, al pari di altri membri del gruppo dei poxvirus, si distingue dalle sue grandi dimensioni e complessit?.? Il DNA del virus vaccinico ? parimenti grande e complesso.?Ad esempio, il DNA vaccinico ? di misura pari a circa 120 megadalton, contro appena 3,6 megadalton per il-virus SV40 della scimmia. La molecola del DNA vaccinico ? a doppia catena ad avvolgimento elicoidale delle estremit?, sicch? la denaturazione del DNA porta alla formazione d'un anello a catena singola. La mappa fisica del DNA vaccinico ? stata costruita con l?ausilio d'un munero di differenti enzimi detti di restrizione e svariate mappe del genere sono riportate nella monografia di Panicali e coll, pubblicata sul J.?Virol.?37:1000-1010, 1981, che cita l'esistenza di due varianti principali del DNA nel ceppo WR del virus vaccinico (ATCC No. VR 119), vale a dire il ceppo pi? comunemente utilizzato per lo studio e la caratterizzazione dei poxvirus. La differenza tra le due varianti consiste nel fatto che la . variante S ("small, ossia corta) (ATCC No. VR 2034 dep.'18-11-81) possiede una delezione di 6, 3 megadalton che invece manca nel DNA della variante L ("large", ossia lunga) (ATCC No. VR 2035 dep. 18-11-81).-La citata pubblicazione presenta le mappe risultanti dal trattamento di queste varianti con gli enzimi di restrizione tipo Hind III, Ava I, Xho I, Sst I e Sma I. The vaccine virus? the virus prototype of the poxvirus family which, like other members of the poxvirus group, is distinguished by its large size and complexity. The DNA of the vaccine virus? equally large and complex. For example, vaccine DNA? measuring approximately 120 megadaltons, compared to just 3.6 megadaltons for the SV40 monkey virus. The vaccine DNA molecule? double chain with helical winding of the ends ?, so? DNA denaturation leads to the formation of a single-stranded ring. The physical map of vaccine DNA? was built with the help of a munero of different enzymes called restriction and various maps of the kind are reported in the monograph by Panicali and coll, published in J.?Virol.?37:1000-1010, 1981, which cites the existence of two main DNA variants in the WR strain of the vaccine virus (ATCC No. VR 119), namely the pi? commonly used for the study and characterization of poxviruses. The difference between the two variants is that the. variant S ("small, ie short) (ATCC No. VR 2034 dep.'18-11-81) has a deletion of 6.3 megadaltons that is missing in the DNA of variant L (" large ", i.e. long) (ATCC No. VR 2035 dep. 18-11-81) .- The aforementioned publication presents the maps resulting from the treatment of these variants with restriction enzymes such as Hind III, Ava I, Xho I, Sst I and Sma I.

Il virus vaccinico appartiene al gruppo eucariotico riprodotto per intero entro il citoplasma della cellula ospite.?E' un virus litico, vale a dire un virus la cui replicazione endocellulare porta alla lisi della cellula.'Questo virus ? ritenuto non oncogenico.? Esso ha trovato impiego da circa 200 anni nei vaccini usati per inoculazione contro il vaiolo e nei circoli medici sono ben note le propriet? del virus usato nel vaccino.'Per quanto l'inoculazione con il virus vaccinico comporti un certo rischio, tali rischi sono in linea di massima ben noti e definiti ed il virus stesso ? considerato di natura relativamente benigna. The vaccine virus belongs to the eukaryotic group reproduced entirely within the cytoplasm of the host cell. It is a lytic virus, that is, a virus whose intracellular replication leads to cell lysis. deemed non-oncogenic. It has been used for about 200 years in vaccines used for inoculation against smallpox and in medical circles the properties are well known. of the virus used in the vaccine. 'Although inoculation with the vaccine virus involves a certain risk, these risks are generally well known and defined and the virus itself? considered to be relatively benign in nature.

L'invenzione essenzialmente riguarda la modifica del genoma naturalmente presente nel virus vaccinico al fine di produrre mutanti vaccinici mediante il riassetto del genoma naturale, l'eliminazione del DNA dal genoma, e/o la inserzione nel genoma vaccinico naturale del DNA atto a modificare il genoma naturale ("DNA estraneo"). Il DNA estraneo pu? essere naturalmente presente nel virus vaccinico oppure pu? essere di origine sintetica o anche naturale, ma in un organismo diverso da quello vaccinico. Nella misura in cui il DNA estraneo ? portatore di informazioni genetiche, esiste-,la possibilit? d'introdurre le informazioni stesse in un organismo eucariotico a mezzo del virus vaccinico modificato. In altri termini, il virus modificato rappresenta un vettore relativamente innocuo della clonazione eucariotica susseguente alla soppressione, l'inserzione o il riassetto dell'inforinazione genetica.' Poich? il virus si replica entro il citoplasma della cellula infetta, i.1 virus vaccinico modificato costituisce un singolare vettore di clonificazione eucariotica senza uguali tra quelli studiati nel passal'incirca, pari a circa 10 kbp (kilobasi accoppiate). Poich? i segmenti centrali del DNA sono simili in tutti i poxvirus, mentre quelli terminali differiscono di pi?, appare verosimile che il segmento centrale sia responsabile delle funzioni comuni a tutti i virus, ad esempio la replicazione, mentre i segmenti terminali sarebbero responsabili di altre caratteristiche, ad esempio la patogenicit?, lo spettro d'infettivit? e cos? via. Dovendosi modificare ,un genoma per il riassetto o l'eliminazione di frammenti del DNA o per l'introduzione di frammenti di DNA esogeno con il proposito di arrivare ad un mutante stabile e vitale, ? ovvio che la frazione del -DNA naturale che si voglia riordinare, sopprimere o disgregare mediante l'introduzione del DNA esogeno deve essere non essenziale alla vitalit? e stabilit? dell'organismo ospite, in questo caso il virus vaccinico. Nel ceppo WR del virus vaccinico esistono segmenti non essenziali del genoma, ad esempio nel tratto preservato nella variante L, ma soppresso in quella S, oppure nel frammento Hind III F del genoma. The invention essentially concerns the modification of the genome naturally present in the vaccine virus in order to produce vaccine mutants through the rearrangement of the natural genome, the elimination of DNA from the genome, and / or the insertion into the natural vaccine genome of the DNA capable of modifying the natural genome ("foreign DNA"). Foreign DNA can be naturally present in the vaccine virus or can? be of synthetic or even natural origin, but in an organism other than the vaccine one. To the extent that foreign DNA? carrier of genetic information, exists-, the possibility? to introduce the information itself into a eukaryotic organism by means of the modified vaccine virus. In other words, the modified virus represents a relatively harmless vector of eukaryotic cloning following the suppression, insertion or rearrangement of the genetic information. ' Since? the virus replicates within the cytoplasm of the infected cell, the modified vaccine virus constitutes a singular eukaryotic cloning vector without equal among those studied in the past approximately, equal to about 10 kbp (coupled kilobases). Since? the central segments of DNA are similar in all poxviruses, while the terminal ones differ more, it seems likely that the central segment is responsible for the functions common to all viruses, for example replication, while the terminal segments would be responsible for other characteristics , for example the pathogenicity, the spectrum of infectivity? and so? Street. Having to modify, a genome for the rearrangement or elimination of DNA fragments or for the introduction of exogenous DNA fragments with the purpose of arriving at a stable and viable mutant,? obvious that the fraction of the natural -DNA that one wants to rearrange, suppress or break up through the introduction of exogenous DNA must be non-essential to vitality? and stability host organism, in this case the vaccine virus. In the WR strain of the vaccine virus there are non-essential segments of the genome, for example in the trait preserved in variant L, but suppressed in variant S, or in the Hind III F fragment of the genome.

La modifica del virus vaccinico tramite l'incorporazione di informazioni genetiche esogene trova un esempio nella modifica del ceppo WR del virus stesso nel frammento Hind III F, consistente nella incorpora? cos? il determinante antigenico in vivo. The modification of the vaccine virus through the incorporation of exogenous genetic information finds an example in the modification of the WR strain of the virus itself in the Hind III F fragment, consisting of the incorporate? cos? the antigenic determinant in vivo.

Un ulteriore vantaggio dei mutanti vaccinici usati quali vettori nelle cellule eucariotiche, come vaccini o per la produzione di composti biologici diversi dagli antigeni, risiede nella possibilit? di modificare dopo il processo di translocazione le proteine risultanti dalla trascrizione dei geni esogeni introdotti nella cellula a mezzo del virus. Tali modifiche post-translocative , ad esempio la glucosilazione delle proteine, sono poco probabili entro un sistema procariotico, essendo invece possibili nelle cellule eucariotiche che dispongono degli enzimi supplementari necessairi per tali modifiche. Un ulteriore vantaggio dei mutanti vaccinici ad uso inoculazione sta nella possibilit? di ampliare la risposta anticorpo incorporando nel mutante coppie replicate del gene per l'antigeno o elementi genetici addizionali atti a stimolare la reazione immunologica, o mediante l'uso di potenti attivatori nel virus modificato. Un simile vantaggio si riscontra nella produzione di sostanze biologiche diverse dall'antigeno. A further advantage of vaccine mutants used as vectors in eukaryotic cells, as vaccines or for the production of biological compounds other than antigens, lies in the possibility? to modify after the translocation process the proteins resulting from the transcription of the exogenous genes introduced into the cell by the virus. Such post-translocative modifications, for example the glucosylation of proteins, are unlikely within a prokaryotic system, being instead possible in eukaryotic cells which have the additional enzymes necessary for such modifications. A further advantage of vaccine mutants for inoculation use lies in the possibility? to broaden the antibody response by incorporating replicated pairs of the antigen gene or additional genetic elements into the mutant to stimulate the immunological reaction, or by using potent activators in the modified virus. A similar advantage is found in the production of biological substances other than antigen.

Riprendendo ora un esame pi? minuzioso del genoma vaccinico, le doppie catene elicoidali del DNA sono caratterizzate da elementi ripetitivi terminali invertiti, ciascuno della lunghezza di 8,6 megadalton al? marne la potenza antigenica. D?altronde, i vaccini derivati da organismi viventi attenuati comportano sempre il rischio che l'organismo attenuato possa riprendere la virulenza patogenetica.?Viceversa,?quando il vaccino consiste d'un mutante del virus vaccinico opportunamente modificato con un gene codificato per il determinante antigenico dell'organismo patogenetico, si evita la possibilit? d'una reversione allo stato patogenetico, in quanto il virus vaccinico contiene solamente il gene codificato per il determinante antigenico dell'organismo morboso e non invece quelle frazioni genetiche dell'organismo che sono responsabili della replicazione del patogeno. Resuming now an exam pi? detail of the vaccine genome, the double helical DNA chains are characterized by inverted terminal repetitive elements, each of the length of 8.6 megadaltons at? marne the antigenic potency. On the other hand, vaccines derived from attenuated living organisms always carry the risk that the attenuated organism can resume pathogenic virulence. antigenic of the pathogenetic organism, you avoid the possibility? of a reversion to the pathogenetic state, since the vaccine virus contains only the gene encoded for the antigenic determinant of the morbid organism and not those genetic fractions of the organism which are responsible for the replication of the pathogen.

L'invenzione oggetto della presente offre dei vantaggi anche rispetto alla moderna tecnologia basata sull 'ingegneria genetica intesa a produrre l'antigeno a mezzo d'un organismo procariotico recombinante contenente dei plasmidi come espressione d'una proteina antigenica estranea.?A titolo di esempio, una tale tecnologia richiede la produzione di.numerose cellule pr?? cariotiche di ricombinazione seguita dalla purificazione delle risultanti proteine antigeniche. Al contrario, il virus vaccinico modificato ad uso inoculazioni conforme all'invenzione in oggetto si replica nell'individuo inoculato a scopo di immunizzazione, accrescendo to o al momento attuale.?? The present invention also offers advantages over modern technology based on genetic engineering intended to produce antigen by means of a recombinant prokaryotic organism containing plasmids as the expression of a foreign antigenic protein. , such a technology requires the production of numerous PR cells. karyotic recombination followed by purification of the resulting antigenic proteins. On the contrary, the modified vaccine virus for inoculation use according to the subject invention replicates in the individual inoculated for the purpose of immunization, increasing at the present time.

Una tale scoperta comporta una variet? di conseguenze utili, tra cui (A) metodi innovativi,per la vaccinazione dei mammiferi suscettibili al virus vaccinico per indurre in essi una risposta anticorpale agli antigeni codificati per il DNA estraneo introdotto nel virus vaccinico, (B) metodi innovativi per la produzione tramite le cellule eucariotiche di prodotti biologici diversi dagli antigeni, e (C) metodi innovativi per l'introduzione negli individui o nelle popolazioni umane od animali, di geni mancanti o di materiale genetico atto a modificare, sostituire o riparare i geni difettosi in tali individui o popola? zioni.-I mutanti vaccinici opportunamente modificati come portatori di geni esogeni espressi nellOrganismo ospite sotto forma di fattori antigenici determinanti capaci di stimolare nell'ospite la produzione di anti? corpi verso l'antigeno, costituiscono un nuovo tipo di vaccini esenti dagli incovenienti dei vaccini comuni derivati da organismi uccisi o viventi ma attenuati. Cos? ad esempio la produzione di vaccini da organismi uccisi necessita la crescita di ingenti quantitativi dell'organismo seguita da un trattamento atto a distruggerne elettivamente la capacit? infettiva, senza meno zione entro quel frammento d'un gene del virus herpes simplex tipo I (HSV) responsabile della produzione Such a discovery involves a variety? of useful consequences, including (A) innovative methods, for the vaccination of mammals susceptible to the vaccine virus to induce in them an antibody response to the antigens encoded for the foreign DNA introduced into the vaccine virus, (B) innovative methods for the production through eukaryotic cells of biological products other than antigens, and (C) innovative methods for the introduction into individuals or populations of humans or animals, of missing genes or genetic material capable of modifying, replacing or repairing defective genes in such individuals or populations ? tions .-- The vaccine mutants suitably modified as carriers of exogenous genes expressed in the host organism in the form of determining antigenic factors capable of stimulating the production of anti? bodies towards antigen, constitute a new type of vaccines free from the drawbacks of common vaccines derived from killed or living but attenuated organisms. What? for example, the production of vaccines from killed organisms requires the growth of large quantities of the organism followed by a treatment aimed at electively destroying its capacity? infectious, not least within that fragment of a herpes simplex virus type I (HSV) gene responsible for producing

di timidina chinasi (TK). La TK ? un enzima atto a thymidine kinase (TK). The TK? an enzyme suitable for a

fosforilare la timidina, una sostanza nucleoside, formando il relativo nucleotide mono?fosforilato che di seguito viene incorporato nel DNA. phosphorylate thymidine, a nucleoside substance, to form the related mono? phosphorylated nucleotide which is then incorporated into DNA.

Il gene HSV TK costituisce il DNA estraneo al virus vaccinico, che secondo l'invenzione attuale ? opportuno introdurre nel virus vaccinico per un numero di motivi. In primo luogo, la disponibilit? del gene ? relativamente elevata nel frammento DNA del virus herpes simplex risultante dalla scissione con l'endonucleasi Barn HI, secondo quanto pubblicato da The HSV TK gene constitutes DNA foreign to the vaccine virus, which according to the current invention? appropriate to introduce into the vaccine virus for a number of reasons. First, the availability? of the gene? relatively high in the herpes simplex virus DNA fragment resulting from cleavage with the Barn HI endonuclease, as published by

Colbere-Garapin e coll, in Proc. Nati. Acad. Sci. Colbere-Garapin et al, in Proc. Nati. Acad. Ski.

USA 76:3755-3759, 1979. In secondo luogo, ? gi? nota USA 76: 3755-3759, 1979. Second,? already? Note

1 'introduzione di tale frammento del HSV Barn HI in plasmidi e sistemi eucariotici, ad esempio dalle pubblicazioni di Colbere-Garapin e coll., loc. cit. nonch? di Wigler e coll. Celi 1J_:223-232, 1977. In terzo luogo, l'esperienza dimostra che se il HSV TK pu? essere introdotto sotto forma di un gene esogeno in un sistema eucariotico - un 'espressione che richiede precisa e fedelissima traslocazione e trascrizione del locus genetico allora altri geni esogeni possono essere analogamente introdotti ed espressi. The introduction of this fragment of the HSV Barn HI in plasmids and eukaryotic systems, for example from the publications of Colbere-Garapin et al., Loc. cit. as well? by Wigler and coll. Cell 1J_: 223-232, 1977. Thirdly, experience shows that if the HSV TK can? be introduced in the form of an exogenous gene into a eukaryotic system - an expression that requires precise and very faithful translocation and transcription of the genetic locus then other exogenous genes can be similarly introduced and expressed.

Per miglior comprensione dell'invenzione, si fa riferimento agli acclusi grafici in cui, For a better understanding of the invention, reference is made to the attached graphs in which,

La figura 1 ? una mappa delle citate varianti L ed S del ceppo WR vaccinico, determinate con l'ausilio del Hind III come enzima di restrizione, che illustra la delezione delle sequenze nel frammento C terminale della variante L, essendo la delezione al di fuori della zona terminale di ripetizione del genoma. Le sequenze DNA cos? delezionate sono caratteristica esclusiva della struttura L e poich? la crescita delle varianti S ed L (dep. 18-11-81) ? identica, la zona di delezione deve essere non essenziale; Figure 1? a map of the aforementioned L and S variants of the vaccine WR strain, determined with the aid of Hind III as a restriction enzyme, which illustrates the deletion of the sequences in the C terminal fragment of the L variant, the deletion being outside the terminal zone of repetition of the genome. The DNA sequences cos? deletion are an exclusive feature of the L structure and since? the growth of the S and L variants (dep. 18-11-81)? identical, the deletion zone must be non-essential;

La figura 2 illustra pi? dettagliatamente il frammento Hind III F vaccinico, compresi altri due siti di restrizione, e cio? Sst I e Barn HI, di cui almeno quest'ultimo offre un locus atto all'introduzione del DNA esogeno nel frammento Hind III F vaccinico, senza alcuna interferenza con i geni vaccinici essenziali; le figure 3 A - C illustrano schematicamente un metodo per l'introduzione del gene HSV TK nel frammento Hind III F vaccinico; Figure 2 illustrates more? in detail the vaccine Hind III F fragment, including two other restriction sites, i.e. Sst I and Barn HI, of which at least the latter offers a locus suitable for introducing exogenous DNA into the vaccine Hind III F fragment, without any interference with the essential vaccine genes; Figures 3 A - C schematically illustrate a method for introducing the HSV TK gene into the vaccine Hind III F fragment;

la figura 4 costituisce una mappa di restrizione di certi mutanti vaccinici prodotti secondo l'attuale invenzione, dove viene indicata in dettaglio la posizione del HSV TK inserito nel frammento Hind III F in due mutanti del Virus, contraddistinti dalla sigla VP-1 e VP-2 (dep. 18-11-81); Figure 4 constitutes a restriction map of certain vaccine mutants produced according to the present invention, where the position of the HSV TK inserted in the Hind III F fragment in two mutants of the Virus is indicated in detail, marked by the initials VP-1 and VP- 2 (dep. 18-11-81);

la figura 5 riassume in forma di specchietto certe tecniche utili nella cernita di virus potenzialmente idonei alla ricombina'zione, per determinarne la presenza o l?assenza del gene HSV TK; e Figure 5 summarizes in the form of a mirror certain techniques useful in sorting viruses potentially suitable for recombination, to determine the presence or absence of the HSV TK gene; And

?le figure 6 A - C sono mappe di restrizione del segmento terminale di sinistra del genoma vaccinico WR che illustrano la correlazione entro i vari frammenti di restrizione e la caratteristica sequenza DNA riscontrata nella variante L e soppressa in quella S. Figures 6 A - C are restriction maps of the left terminal segment of the WR vaccine genome illustrating the correlation within the various restriction fragments and the characteristic DNA sequence found in variant L and suppressed in variant S.

Riferendoci ora alla figura 1, se vogliamo sottoporre le varianti L ed S del virus vaccinico all?azione del Hind III, un ben noto enzima di restrizione gi? disponibile nel mercato, i genomi virali saranno scissi rispettivamente in 15 o in 14 segmenti contrassegnati dalle lettere A sino ad 0, essendo A il frambiento pi? -lungo ed 0 quello pi? corto. La citata pubblicazione di Panicali e coll., J. Virol. 37i1000-1010, 1981, descrive ed illustra la separazione elettroforetica dei frammenti di restrizione. Il frammento F ottenuto in questo modo da una delle varianti L o S possiede un peso molecolare pari a 8,6 megadalton. Referring now to figure 1, if we want to subject the L and S variants of the vaccine virus to the action of Hind III, a well-known restriction enzyme already? available on the market, the viral genomes will be split respectively into 15 or 14 segments marked by the letters A to 0, being A the most? -long and 0 the more? short. The aforementioned publication by Panicali and coll., J. Virol. 37i1000-1010, 1981, describes and illustrates the electrophoretic separation of the restriction fragments. The F fragment obtained in this way from one of the L or S variants has a molecular weight of 8.6 megadalton.

L'ubicazione del frammento F ? segnata nella mappa di restrizione presentata in figura 1 allegata alla domanda di brevetto, ?mentre un'altra mappa di restrizione del frammento F ? illustrata nella figura 2. L'enzima di restrizione Hind III riconosce la sequenza nucleotidica -AAGCTT- e scinde il DNA tra i due gruppi adenosinici adiacenti, dando luogo *a frammenti dotati di 'monconi appiccicosi' e la sequenza AGCT-. Poich? i quantitativi del frammento Hind III F vaccinico necessari per le manipolazioni previste dall'attuale invenzione superano quelli convenientemente ottenibili dalla restrizione del genoma vaccinico, il frammento F va inserito in un vettore plasmidico di clonazione ai fini dell'accrescimento. The location of the fragment F? marked in the restriction map presented in Figure 1 attached to the patent application, while another restriction map of the fragment F? shown in Figure 2. The Hind III restriction enzyme recognizes the nucleotide sequence -AAGCTT- and cleaves the DNA between the two adjacent adenosine groups, resulting in * 'sticky stump' fragments and the AGCT- sequence. Since? the quantities of the vaccine Hind III F fragment necessary for the manipulations envisaged by the present invention exceed those conveniently obtainable by restricting the vaccine genome, the F fragment must be inserted into a plasmid vector for cloning for growth.

Pi? precisamente, il frammento vaccinico Hind III F prodotto in questa maniera viene convenientemente introdotto nel plasmide pBR 322 scisso una volta sola da un numero di enzimi di restrizione, compreso quello Hind III. Il plasmide pBR 322 fu descritto per la prima volta da Bolivar e coll, in Gene ??:95-113, 1977, ed ? attualmente disponibile nel mercato statunitense da svariati fornitori. Pi? precisely, the Hind III F vaccine fragment produced in this way is conveniently introduced into the pBR 322 plasmid cleaved only once by a number of restriction enzymes, including the Hind III one. The plasmid pBR 322 was first described by Bolivar et al, in Gene ??: 95-113, 1977, ed? currently available in the US market from a variety of suppliers.

L'ubicazione del sito di scissione dell'Hind III sul plasmide pBR 322 ? segnata nella figura 3A in rapporto al sito di scissione di altri due enzimi di restrizione, e cio? l'Eco RI ed il Barn HI. Spezzando il plasmide pBR 322 con Hind III e miscelando il risultante DNA scisso con il frammento vaccinico Hind III F per legare poi i frammenti con la ligasi T DNA, come indicato nella figura 3A, il frammento F viene incorporato nel plasmide, dando luogo ad un nuovo plasmide pDF 3, illustrato schematicamente nella figura 3B, avente un peso molecolare pari a circa 11,3 magadalton. Il frammento vaccinico Hind III F comprende circa 13 kilobasi accoppiate, contro 4,5 kbp riscontrate nel segmento pBR 322 del pDP 3. La ligasi DNA ? un enzima disponibile nel mercato e le sue condizioni d'impiego nella modalit? indicata sono ben note agli esperti in materia. The location of the Hind III cleavage site on the pBR 322 plasmid? marked in Figure 3A in relation to the cleavage site of two other restriction enzymes, i.e. the Eco RI and the Barn HI. By cleaving the pBR 322 plasmid with Hind III and mixing the resulting cleaved DNA with the Hind III vaccine fragment F to then bind the fragments with the DNA ligase T, as indicated in Figure 3A, the fragment F is incorporated into the plasmid, resulting in a new plasmid pDF 3, schematically illustrated in Figure 3B, having a molecular weight equal to about 11.3 magadalton. The Hind III F vaccine fragment comprises approximately 13 paired kilobases, versus 4.5 kbps found in the pBR 322 segment of the pDP 3. The DNA ligase? an enzyme available on the market and its conditions of use in the modality? indicated are well known to those skilled in the art.

Il plasmide pDP 3 viene ora introdotto in un microrganismo quale la Escherichia coli (E. coli) per mezzo di trasformazione con il proposito di replicare il frammento Hind III F e recuperare un quantitativo maggiore del frammento stesso. Queste tecniche per la scissione d'un plasmide allo scopo di produrre DNA lineare avente terminali legabili, per inserirne poi il DNA esogeno dotato di terminali complementari al fine di formare un replicon (in questo caso il pBR 322 contenente il frammento vaccinico Hind III F) sono gi? note e lo stesso dicasi dell'inserimento del replicon entro un microrganismo a mezzo di trasformazione The pDP 3 plasmid is now introduced into a microorganism such as Escherichia coli (E. coli) by means of transformation with the aim of replicating the Hind III F fragment and recovering a greater quantity of the fragment itself. These techniques for the cleavage of a plasmid in order to produce linear DNA with binding terminals, to then insert the exogenous DNA with complementary terminals in order to form a replicon (in this case the pBR 322 containing the Hind III F vaccine fragment) are they already? known and the same applies to the insertion of the replicon into a microorganism by means of transformation

(vedi brevetto U.S.A. 4.237.224). (see U.S. Patent 4,237,224).

Il plasmide pBR 322 non modificato conferisce resistenza all?ampici-llina (Amp-) nonch? alla tetraciclina (TetR) al proprio microrganismo ospite, in questo caso la E. coli. Tuttavia, poich? il Hind III spezza il plasmide pBR 322 nel gene TetR, l?introduzione del frammento vaccinico Hind III F distrugge il gene R The unmodified pBR 322 plasmid confers resistance to ampicylin (Amp-) as well as? to tetracycline (TetR) to its host organism, in this case E. coli. However, since? the Hind III breaks the plasmid pBR 322 in the TetR gene, the introduction of the Hind III F vaccine fragment destroys the R gene

Tet , perdendosi cos? la resistenza alla tetraciclina. Pertanto, i trasformanti della E. coli contenenti il plasmide pDP 3 si distinguono dalla E. coli non trasformata per la presenza simultanea della resistenza all?ampicillina e suscettibilit? alla tetraciclina. Sono questi batteri E. coli trasformati con pDP 3 che si accrescono grandemente per ricavarne grossi quantitativi del pDP.3. Tet, getting lost in this way? resistance to tetracycline. Therefore, E. coli transformants containing the pDP 3 plasmid are distinguished from untransformed E. coli by the simultaneous presence of ampicillin resistance and susceptibility. to tetracycline. It is these E. coli bacteria transformed with pDP 3 that grow greatly to obtain large amounts of the pDP. 3.

Le condizioni dell'accrescimento plasmidico nei batteri E. coli sono ben note agli esperti in materia, ad esempio dalla relazione di Clewel pubblicata sulla rivista J. Bacteriol. 110:667-676, 1972. Parimenti ben note sono le tecniche per l?isolamento del plasmide accresciuto dall?ospite batteriano E. coli, come descritte ad esempio da Clewel e coll, nel Proc. Nati. Acad. Sci. USA 62:1159-1166, 1969. The conditions of plasmid growth in E. coli bacteria are well known to those skilled in the art, for example from the Clewel report published in the journal J. Bacteriol. 110: 667-676, 1972. Equally well known are the techniques for isolating the plasmid grown from the bacterial host E. coli, as described for example by Clewel et al, in Proc. Nati. Acad. Sci. USA 62: 1159-1166, 1969.

Per analogia, il plasmide pBR 322 si pu? opportunamente scindere per trattamento con l?enzima di restrizione Ban HI, derivandone poi un plasmide modificato mediante l'inserzione d'un frammento Ban HSV TK, come precisato nel citato articolo di Colbere-Garapin e coll., loc. cit. Il plasmide modificato contenente il frammento Barn HI completo di gene HSV TK pu? essere re-introdotto nell'E. coli con tecniche gi? note ed i batteri trasformati possono coltivarsi per accrescere grossi quantitativi del plasmide. In seguito, l'accresciuto plasmide ricombinante Barn HSV TK-pBR 322 si pu? scindere con Barn HI onde isolarne il frammento Barn HI contenente il gene HSV TK con le medesime tecniche gi? note e citate in precedenza in relazione all'accrescimento del frammento vaccinico Hind III F. By analogy, the plasmid pBR 322 can be suitably cleave by treatment with the Ban HI restriction enzyme, then deriving a modified plasmid by inserting a Ban HSV TK fragment, as specified in the cited article by Colbere-Garapin et al., loc. cit. The modified plasmid containing the Bam HI fragment complete with HSV TK gene can? be re-introduced in E. coli with techniques already? known and transformed bacteria can be cultured to increase large quantities of the plasmid. Thereafter, the enhanced recombinant Barn HSV plasmid TK-pBR 322 can be performed. cleave with Barn HI in order to isolate the Barn HI fragment containing the HSV TK gene with the same techniques already? notes and previously cited in relation to the growth of the Hind III F. vaccine fragment.

Al fine di costruire un plasmide ricombinante avente il frammento Barn HI HSV TK incorporato nel frammento vaccinico Hind III F, il plasmide pDP 3 viene poi esposto ad una restrizione parziale con il Barn Hi, in modo che uno solo dei due siti di scissione Barn HI entro il plasmide sia_scisso, vale a dire o il sito Barn HI entro il frammento Hind III F o il sito Barn HI entro la frazione pBR 322 del plasmide pDP 3, come illustrato nella figura 3B. Il DNA scisso, ora lineare, viene poi combinato con il frammento Barn HSV TK purificato. I segmenti lineari vengono combinati e legati trattandoli con la ligasi T DNA secondo tecniche gi? note. In order to construct a recombinant plasmid having the Barn HI HSV TK fragment incorporated into the Hind III F vaccine fragment, the pDP 3 plasmid is then exposed to partial restriction with the Barn Hi, so that only one of the two Barn HI cleavage sites within the plasmid is cleaved, i.e. either the Barn HI site within the Hind III F fragment or the Barn HI site within the pBR 322 fraction of the pDP 3 plasmid, as illustrated in Figure 3B. The cleaved DNA, now linear, is then combined with the purified Barn HSV TK fragment. The linear segments are combined and linked by treating them with the T DNA ligase according to already techniques. Note.

La combinazione del frammento Barn HSV TK con il plasmide pDP 3 scisso costituisce un avvenimento casuale o un'evenienza statistica potenzialmente atta a produrre numerose specie formate da diverse combinazioni dei frammenti presenti nella miscela, ognuno di essi dotato di identici 'monconi appiccicosi'. Pertanto, una delle possibilit? consiste d'una semplice rigiunzione delle estremit? scisse del plasmide pDP 3 per ricreare l'anello plasmidico.-Un'altra possibilit? consiste della giunzione di due o pi? frammenti The combination of the HSV TK Barn fragment with the cleaved pDP 3 plasmid constitutes a random event or a statistical occurrence potentially capable of producing numerous species formed by different combinations of the fragments present in the mixture, each of them equipped with identical 'sticky stumps'. Therefore, one of the possibilities? consists of a simple rejoining of the ends? cleaved of the plasmid pDP 3 to recreate the plasmid ring.-Another possibility? consists of the junction of two or more? fragments

Barn HSV TK in una delle due orientazioni. Inoltre, il frammento Barn HSV TK (od un multiplo) pu? essere combinato con il DNA lineare d'un plasmide pDP 3 scisso al sito Barn HI entro il tratto pBR 322, anch'esso in una delle due orientazioni, oppure uno o pi? frammenti Barn HSV TK si possono combinare in una delle due orientazioni con il DNA lineare del plasmide pDP 3 scisso al sito Barn HI entro quel tratto del plasmide pDP 3 che costituisce il frammento vaccinico Hind III F. Barn HSV TK in one of two orientations. Furthermore, the HSV TK Barn fragment (or a multiple) can be combined with the linear DNA of a pDP 3 plasmid cleaved at the Barn HI site within the pBR 322 tract, also in one of the two orientations, or one or more? Barn HSV TK fragments can be combined in either orientation with the linear DNA of the pDP 3 plasmid cleaved at the Barn HI site within that tract of the pDP 3 plasmid that constitutes the Hind III F vaccine fragment.

Onde consentire l'identificazione e la separazione di queste varie possibilit?, i prodotti del legame vengono inseriti in un microrganismo monocellulare quale la E. coli con tecniche gi? note e descritte in precedenza. I batteri E. coli trattati in questa maniera vengono poi coltivati su un terreno contenente 1'ampicillina. Se i batteri contengono il plasmide, si mostreranno resistenti all'ampicillina in quanto tutti i plasmidi del genere contengono il gene del pBR 322 atto a conferirne la resistenza all'ampicillina.' Pertanto, i batteri sopravvissuti sono tutti prodotti di trasformazione, idonei ad una cernita ulteriore per determinarne la possibile presenza o assenza del frammento Barn HSV TK. In order to allow the identification and separation of these various possibilities, the binding products are inserted into a single-celled microorganism such as E. coli with techniques that are already in use. notes and described above. E. coli bacteria treated in this manner are then cultured on a medium containing ampicillin. If the bacteria contain the plasmid, they will be resistant to ampicillin as all such plasmids contain the pBR 322 gene which confers resistance to ampicillin. ' Therefore, the surviving bacteria are all transformation products, suitable for a further sorting to determine the possible presence or absence of the Barn HSV TK fragment.

A tal uopo, i batteri dotati d'un gene TK vanno identificati mediante l'ibridazione con il TK DNA radiomarcato. Ove il gene TK ? presente nei batteri, il TK DNA radiomarcato former? un ibrido con la frazione plasmidica presente nel batterio. Essendo l'ibrido radioattivo, le colonie contenenti il TK plasmidico possono essere saggiate con l'ausilio della autoradiografia. A loro volta, i batteri contenenti il TK possono essere coltivati. Infine, i batteri contenenti i plasmidi dotati del TK incorporato nel tratto pBR 322 possono essere identificati e separati da quelli recanti il frammento TK entro il frammento vaccinico Hind For this purpose, bacteria endowed with a TK gene must be identified by hybridization with radiolabeled TK DNA. Where the TK gene? present in bacteria, the radiolabeled TK DNA former? a hybrid with the plasmid fraction present in the bacterium. Being the radioactive hybrid, the colonies containing the plasmidic TK can be tested with the aid of autoradiography. In turn, TK-containing bacteria can be cultured. Finally, the bacteria containing the plasmids endowed with the TK incorporated in the pBR 322 tract can be identified and separated from those carrying the TK fragment within the Hind vaccine fragment.

III F mediante analisi con endonucleasi di restrizione.? Pi? particolarmente, i batteri che sopravvivono alla coltivazione su lastre d'agar nutriente inoculate di ampicillina vengono trasferiti in parte ad un filtro nitrocellulosico per contatto tra il filtro e la lastra. Quei batteri che'permangono sulla lastra vengono ricoltivati mentre quelli trasferiti al filtro nitrocellulosico con il proposito di creare una replica della lastra originale vengono poi soggetti a trattamento atto a denaturarne il DNA.?La denaturazione si compie, ad esempio, trattando i batteri trasferiti con l?idrossido di sodio, al quale fanno seguito la neutralizzazione ed il lavaggio, dopo di che il DNA denaturato presente sul filtro nitrocellulosico viene ibridato mediante trattamento con HSV Barn TK marcato con 32p radioattivo. Dopo tale trattamento, il filtro nitrocellulosico viene esposto su pellicola roentgenografica che si opacizza nelle zone corrispondenti alla ibridazione con il Barn HSV TK radiomarcato. L?impressione roentgenografica sulla pellicola opacizzata viene poi paragonata con la lastra originale e le colonie coltivate su tale lastra originale in corrispondenza alle colonie che hanno dato luogo alle opacit? sulla pellicola vengono identificate quali colonie contenenti un plasmide avente il Barn HSV TK. III F by restriction endonuclease analysis. Pi? particularly, bacteria that survive cultivation on ampicillin inoculated nutrient agar plates are transferred in part to a nitrocellulose filter by contact between the filter and plate. Those bacteria that remain on the plate are recultivated while those transferred to the nitrocellulose filter with the aim of creating a replica of the original plate are then subjected to a treatment to denature the DNA. sodium hydroxide, which is followed by neutralization and washing, after which the denatured DNA present on the nitrocellulose filter is hybridized by treatment with radioactive 32p-labeled HSV Barn TK. After this treatment, the nitrocellulose filter is exposed on a roentgenographic film which becomes opaque in the areas corresponding to the hybridization with the radiolabelled HSV TK Barn. The roentgenographic impression on the opacified film is then compared with the original plate and the colonies grown on that original plate in correspondence with the colonies that gave rise to the opacities. on the film, colonies containing a plasmid having the Barn HSV TK are identified.

Infine, per poter distinguere i batteri contenenti il plasmide il cui gene Barn HSV TK ? stato incorporato nel tratto pBR 322 da quelli in cui il Barn HSV TK ? presente nel frammento plasmidico F, vengono impostate piccole colture batteriche per isolarne poi i plasmidi mediante t?cniche minilitiche gi? note e descritte nella relazione di Holmes e coll., Finally, to be able to distinguish the bacteria containing the plasmid whose gene Barn HSV TK? been incorporated into the pBR 322 section from those in which the HSV TK Barn? present in the plasmid fragment F, small bacterial cultures are set up to isolate the plasmids by means of minilitic techniques already? notes and described in the report by Holmes et al.,

Anal.?Bioch. 114:193-197, 1981. I plasmidi vengono in seguito fermentati con l'enzima di restrizione Hind III che spezza l'anello plasmidico nei due punti in cui il frammento F era originariamente congiunto con la catene pBR 322 DNA. Il peso molecolare del prodotto di fermentazione viene poi determinato mediante elettroforesi su gel agarosici, essendo la distanza di migrazione sul gel un indice del peso molecolare. Anal.?Bioch. 114: 193-197, 1981. The plasmids are then fermented with the Hind III restriction enzyme which breaks the plasmid ring at the two points where the F fragment was originally joined with the pBR 322 DNA chain. The molecular weight of the fermentation product is then determined by electrophoresis on agarose gels, the migration distance on the gel being an index of the molecular weight.

Qualora il plasmide fermentato contenga nel segmento F il frammento Barn HSV TK o un multiplo, il gel evidenzier? un frammento pBR 322 ed un altro frammento avente un peso molecolare superiore a quello del frammento F per il peso molecolare del segmento 0 dei segmenti Barn HSV TK DNA presenti nel medesimo. Viceversa, quando il Barn HSV TK ? presente nel pBR 322, l'elettroforesi evidenzier? un frammento F del peso molecolare normale in pi? ad un altro frammento superante il pBR 322 per il peso molecolare del frammento o dei frammenti Barn HSV TK inclusi nel medesimo.? 1 batteri modificati con il Barn HSV TK nella frazione plasmidica pBR 322 vengono scartati, lasciando invece quelli modificati nel frammento F del plasmide. Questi ultimi sono i plasmidi usati per 1*incorporamento vaccinico del framment? Barn HSV TK. If the fermented plasmid contains the Barn HSV TK fragment or a multiple in the F segment, the gel will highlight? a pBR 322 fragment and another fragment having a molecular weight higher than that of the F fragment by the molecular weight of the segment 0 of the Barn HSV TK DNA segments present therein. Conversely, when the HSV TK Barn? present in the pBR 322, the electrophoresis evidenzier? a fragment F of the normal molecular weight in pi? to another fragment exceeding pBR 322 for the molecular weight of the Barn HSV TK fragment or fragments included therein. The bacteria modified with Barn HSV TK in the plasmid fraction pBR 322 are discarded, leaving instead those modified in the fragment F of the plasmid. The latter are the plasmids used for the vaccine incorporation of the fragment? Barn HSV TK.

Come gi? detto, la combinazione dei,frammenti DNA intesa a rigenerare un plasmide costituisce un avvenimento casuale che pu? sfociare in una variet? di strutture plasmidiche recanti il Barn HSV TK nel frammento F. How already? said, the combination of the DNA fragments intended to regenerate a plasmid constitutes a random event that can? result in a variety? of plasmid structures bearing the HSV TK Barn in the F.

Con il proposito di determinare l'rientazione del frammento Barn HSV TK entro il frammento F, nonch? il numero di tali frammenti di Barn HSV TK eventualmente presenti, i plasmidi vengono recuperati da tutte quelle colonie batteriane che risultano dotate del frammento Barn HSV TK nel frammento F del plasmide. With the purpose of determining the orientation of the Barn HSV TK fragment within the F fragment, as well as? the number of such HSV TK Barn fragments possibly present, the plasmids are recovered from all those bacterial colonies which are endowed with the Barn HSV TK fragment in the F fragment of the plasmid.

La citata tecnica di mini-lisi viene impiegata a questo proposito. I plasmidi vengono quindi nuovamente assoggettati all'analisi di restrizione, questa volta con l'ausilio dell'enzima di restrizione Sst I di provenienza commerciale. Poich? ogni frammento Barn HSV TK reca un sito di restrizione Sst I e poich? il frammento vaccinico F parimenti reca un unico sito di restrizione Sst I (vedi le rispettive raffigurazioni di tali frammenti nelle figure 3A e 3B), ci ? dato di individuare un numero diverso di frammenti di diverso peso molecolare mediante l'elettroforesi su gel agaro? sico, essendo il numero ed il peso molecolare dei segmenti una funzione dell'orientazione del frammento Barn HSV TK entro il franamento F e del numero dei frammenti Barn TK presenti. L'orientazione del frammento Barn TK entro il frammento F si pu? individuare grazie alla sistemazione asimmetrica del frammento 3am HSV TK in rapporto al relativo sito Sst I (vedi figura 33). The aforementioned mini-lysis technique is employed in this regard. The plasmids are then subjected to restriction analysis again, this time with the aid of the commercially sourced restriction enzyme Sst I. Since? each fragment Barn HSV TK bears a restriction site Sst I and since? the vaccine fragment F likewise bears a single restriction site Sst I (see the respective representations of such fragments in Figures 3A and 3B), ci? given to identify a different number of fragments of different molecular weight by means of agar gel electrophoresis? physical, since the number and molecular weight of the segments are a function of the orientation of the Barn HSV TK fragment within the landslide F and of the number of Barn TK fragments present. Is the orientation of the Barn TK fragment within the F fragment? identify thanks to the asymmetrical arrangement of the 3am HSV TK fragment in relation to the relative Sst I site (see figure 33).

Ad esempio, nel corso degli esperimenti qui discussi fu possibile di individuare sei colonie batteriane, ciascuna recante uno o pi? frammenti Barn HSV TK entro il frammento F del plasmide, tra quelli atti a trasformare l'E. coli. A seguito d'un'analisi di restrizione dei plasmidi batteriani come tracciato in precedenza, due dei plasmidi ricombinanti furono selezionati per ulteriore esame grazie al fatto che i frammenti Barn HSV TK entro il frammento F furono orientati in direzione opposta. For example, in the course of the experiments discussed here it was possible to identify six bacterial colonies, each bearing one or more? Barn HSV TK fragments within the F fragment of the plasmid, among those capable of transforming E. coli. Following a restriction analysis of the bacterial plasmids as outlined above, two of the recombinant plasmids were selected for further examination due to the fact that the Barn HSV TK fragments within the F fragment were oriented in the opposite direction.

A questo punto conviene precisare che l'introduzione del gene HSV TK nel frammento vaccinico F, come discusso in maggior dettaglio in precedenza, serve semplicemente a titolo di esempio come una di numerose possibili tecniche per modificare il genoma vaccinico con il proposito di arrivare a mutanti vaccinici auspicati. Pertanto, l'introduzione dello stesso gene esogeno in qualche altro tratto del genoma vaccinico, oppure l'introduzi?ne di diverso materiale genetico nel frammento vaccinico F o qualche altro frammento, possono necessitar? la modifica dello schema gi? discusso a titolo di esempio, per 1'identificazione degli organismi ricombinanti. At this point it should be pointed out that the introduction of the HSV TK gene into the vaccine fragment F, as discussed in greater detail above, simply serves as an example as one of several possible techniques for modifying the vaccine genome with the aim of reaching mutants desired vaccines. Therefore, the introduction of the same exogenous gene into some other section of the vaccine genome, or the introduction of different genetic material into the vaccine fragment F or some other fragment, may be necessary. the modification of the scheme already? discussed by way of example, for the identification of recombinant organisms.

Ad esempio, quando la variante vaccinica L viene digestionata con Ava I, ne risulta un frammento H situato per intero nella regione di delezione della variante S (vedi figura 6 A e la relativa discussione pi? oltre). Il frammento H contiene siti Barn HI che ne consentono l'introduzione del gene HSV TIC. Tali ricombinanti del frammento H si prestano all'identificazione con le medesime tecniche suggerite per 1'identificazione dei ricombinanti del frammento F-HSV TK. For example, when the vaccine variant L is digested with Ava I, the result is an H fragment located entirely in the deletion region of variant S (see Figure 6 A and related discussion below). Fragment H contains Bam HI sites that allow the introduction of the HSV TIC gene. These recombinants of the H fragment are suitable for identification with the same techniques suggested for the identification of the recombinants of the F-HSV TK fragment.

Infatti, esistono schemi per la costruzione e l 'identificazione dei ricombinanti del frammento F-HSV TK che rappresentano alternative al progetto gi? discusso dettagliatamente a titolo illustrativo. Ad esempio, il sito Barn HI nel pBR 322 si pu? sopprimere scindendo il plasmide con Barn HI e procedendo al trattamento con la polimerasi I del DNA quale 'riempitivo' dei monconi appiccicosi. Questo prodotto viene poi tagliato con Hind III ed il frammento lineare viene trattato con fosfatasi alcalina onde impedire la recircolazione del plasmide a seguito di legatura. Tuttavia, il DNA estraneo ed in particolare il frammento vaccinico F del Hind III si pu? legare al pBR 322 trattato ed il risultante plasmide sar? recircolarizzato. Il trattamento con Barn HI serve semplicemente a scindere il plasmide entro il relativo tratto del frammento vaccinico F. Il trattamento susseguente del prodotto di scissione con la fosfatasi alcalina e legatura con il frammento Barn Hi HSV TK produrr? ricombinanti con un?elevata efficienza, sicch? i ricombinanti potranno assoggettarsi a cernita mediante la scissione con endonucleasi di restrizione e l'elettroforesi sul gel. E? questa una tecnica che.elimina le dispendiose tappe di discriminazione tra i ricombinanti aventi il HSV TK nella frazione pBR 322 o nel frammento F e la ibridazione della colonia. In fact, there are schemes for the construction and identification of the recombinants of the F-HSV TK fragment which represent alternatives to the already project. discussed in detail for illustration. For example, the HI Barn site in the pBR 322 you can? suppress by cleaving the plasmid with Barn HI and proceeding to the treatment with DNA polymerase I as 'filler' of the sticky stumps. This product is then cut with Hind III and the linear fragment is treated with alkaline phosphatase to prevent recirculation of the plasmid following ligation. However, the foreign DNA and in particular the vaccine fragment F of the Hind III can be carried out. bind to the treated pBR 322 and the resulting plasmid will be? recirculated. The treatment with Barn HI simply serves to cleave the plasmid within the relative stretch of the vaccine fragment F. Subsequent treatment of the cleavage product with alkaline phosphatase and ligation with the Barn Hi HSV TK fragment will produce? recombinants with a? high efficiency, so? the recombinants will be able to undergo sorting by means of cleavage with restriction endonuclease and gel electrophoresis. AND? this is a technique which eliminates the costly steps of discrimination between recombinants having HSV TK in the pBR 322 or F fragment and colony hybridization.

Riprendendo ora la discussione dei plasmidi prodotti a titolo di esempio nella mutazione vaccinica tramite l'introduzione del HSV TK nel frammento vaccinico F, i due plasmidi ricombinanti scelti per ulteriore investigazione sono illustrati nella figura 3C, essendo identificati come il primo plasmide nuovo pDP 132, recante un frammento Barn HSV TK nel tratto vaccinico Hind III F, ed il secondo plasmide nuovo pDP 137, recante due frammenti Barn HSV TK, uniti testa a coda. Il frammento singolo del Barn HSV TK ? stato incorporato nel pDP .132 in senso opposto a quello in cui i due frammenti Barn TK sono stati.inclusi in tandem nel pDP 137. In altri t?rmini, la regione del gene TK entro il frammento Barn HI codificato per il terminale 5 ' del mRNA prodotto dal gene ? situata tra il sito di scissione ed il pi? vicino dei due siti Barn HI corrispondenti (vedi figura 3B). La trascrizione del gene HSV TK sul frammento Barn TK procede in direzione dal terminale 5' a quello 3', in senso orario nel pDP 132 come indicato nella figura 3C. (vedi Smiley e coll., Virology 102:83-93, 1980). Viceversa, poich? i frammenti del Barn TK inclusi in tandem nel pDP 137 sono stati incorporati in senso inverso, sinch? la trascrizione dei geni HSV TK contenuti in esso proceder? in direzione opposta, vale a dire in un senso antiorario. La direzione in cui il frammento Barn HSV TK ? incluso nel frammento vaccinico Hind III F pu? rivestire una certa importanza caso mai la trascrizione del gene HSV TK fosse attivata da un sito di attivazione entro il frammento F stesso. Tuttavia, tali siti ,di attivazione del HSV esistono entro il frammento Barn HSV TK stesso, tanto che la trascrizione del gene HSV TK pu? verificarsi indipendentemente dalla direzione in cui il frammento Barn HSV TK ed il gene HSV TK siano stati incorporati nel frammento vaccinico Hind III F. Resuming now the discussion of the plasmids produced by way of example in the vaccine mutation through the introduction of HSV TK in the vaccine fragment F, the two recombinant plasmids chosen for further investigation are illustrated in Figure 3C, being identified as the first new plasmid pDP 132, bearing a Barn HSV TK fragment in the Hind III F vaccine tract, and the second new plasmid pDP 137, bearing two Barn HSV TK fragments, joined head to tail. The single fragment of the HSV TK Barn? was incorporated into the pDP .132 in the opposite direction to that in which the two Barn TK fragments were included in tandem in the pDP 137. In other terms, the region of the TK gene within the Barn HI fragment encoded for the 5 'terminal of the mRNA produced by the gene? located between the site of division and the pi? neighbor of the two corresponding Barn HI sites (see Figure 3B). Transcription of the HSV TK gene on the TK Barn fragment proceeds in the direction from the 5 'to the 3' terminal, clockwise in the pDP 132 as indicated in Figure 3C. (see Smiley et al., Virology 102: 83-93, 1980). Vice versa, since? the fragments of the Barn TK included in tandem in the pDP 137 have been incorporated in the reverse direction, sinch? the transcription of the HSV TK genes contained in it will proceed? in the opposite direction, that is, in a counterclockwise direction. The direction in which the HSV TK Barn fragment? included in the vaccine fragment Hind III F pu? be of some importance in case the HSV TK gene transcription is activated by an activation site within the F fragment itself. However, such sites of activation of the HSV exist within the Barn HSV TK fragment itself, so much so that the transcription of the HSV TK gene can? occur regardless of the direction in which the Barn HSV TK fragment and the HSV TK gene have been incorporated into the Hind III F vaccine fragment.

Vengono coltivati in seguito quei trasformanti dell'E. coli contenenti il pDP 132 od il pDP 137, per ricavarne maggiori quantitativi di plasinidi per ulteriore lavorazione. Una volta isolato un quantitativo sufficiente del plasmide DNA, la restrizione enzimatica mediante il Hind III rende un frammento vaccinico Hind III F modificato dotato 'del gene HSV TK. Questo frammento Hind III F modificato viene ora introdotto nel virus vaccinico con metodi originali, descritti in seguito, per produrre l'entit? infettiva. Those transformants of E. coli containing pDP 132 or pDP 137, to obtain greater quantities of plasinides for further processing. Once a sufficient quantity of the DNA plasmid has been isolated, enzymatic restriction by Hind III yields a modified Hind III F vaccine fragment endowed with the HSV TK gene. This modified Hind III F fragment is now being introduced into the vaccine virus by original methods, described below, to produce the entity. infectious.

Per passare in rassegna le cognizioni preesistenti, il vettore attualmente pi? usato per introdurre il DNA esogeno nelle cellule eucariotiche ? il SV 40. Il DNA dello SV40 ? circolare e suscettibile di trattamento come un plasmide. In altri termini, il DNA circolare viene scisso con un enzima di restrizione, indi combinato con il DNA esogeno e legato. Il DNA modificato pu? essere introdotto nelle cellule eucariotiche, ad esempio quelle animali, mediante tecniche standardizzate (vedi Hamer e coll., Nature 281:35-40, 1979). Il DNA ? infettivo e si replicher? nel nucleo cellulare producendo virus di mutazione vitali. Conversamente, il virus vaccinico si replica nel citoplasma della cellula eucariotica. Il DNA purificato di questo virus non ? infettivo e non si presta per se alla produzione di mutanti vaccinici nella cellula per analogia allo SV40. Piuttosto, si deve far ricorso a tecniche innovative basate sulla mutazione di virus vaccinici 'selvaggi' con DNA estraneo, vivo ed entro la cellula. To review the pre-existing knowledge, the vector currently pi? used to introduce exogenous DNA into eukaryotic cells? the SV 40. The DNA of the SV40? circular and amenable to treatment as a plasmid. In other words, the circular DNA is cleaved with a restriction enzyme, then combined with the exogenous DNA and bound. The modified DNA can? be introduced into eukaryotic cells, such as animal cells, by standardized techniques (see Hamer et al., Nature 281: 35-40, 1979). DNA? infectious and will replicate? in the cell nucleus producing viable mutation viruses. Conversely, the vaccine virus replicates in the cytoplasm of the eukaryotic cell. The purified DNA of this virus is not? infectious and does not per se lend itself to the production of vaccine mutants in the cell by analogy to SV40. Rather, one must resort to innovative techniques based on the mutation of 'wild' vaccine viruses with foreign DNA, both living and within the cell.

Una comunicazione inedita dei richiedenti, scritta in collaborazione con Eileen Nakano, descrive la dimostrazione del cosiddetto 'recupero' di marcatura nel virus vaccinico. Stando a queste sperimentazioni, quel tratto della variante L del DNA che ordinariamente manca nella variante S pu? essere reintrodotto ('recuperato') nella variante S in opportune circostanze.1A tal fine, le cellule eucariotiche vengono trattate con la variante S vivente ed infettiva del virus vaccinico insieme con frammenti non infettivi di restrizione della variante L del DNA, costituente il DNA 'estraneo' alla variante S, d'una struttura particolare. Pi? precisamente, quel tratto della variante L del DNA che va recuperato deve essere presente entro una catena DNA avente tratti co-lineari con la catena DNA del frammento S nel quale va introdotto. In altri termini, il DNA estraneo da introdursi nella variante S deve possedere ad ambo le estremit? della catena DNA una regione del DNA che sia l'omologo delle corrispondenti sequenze nella variante S. Tali sequenze omologhe possono essere intese come ?braccia" congiunte alla regione della variante L del DNA che ha da recuperarsi con la Variante S. An unpublished communication from the applicants, written in collaboration with Eileen Nakano, describes the demonstration of the so-called 'recovery' of marking in the vaccine virus. According to these experiments, that trait of the L variant of the DNA that is ordinarily missing in the S variant can? be reintroduced ('recovered') into the S variant under appropriate circumstances.1 To this end, eukaryotic cells are treated with the living and infectious S variant of the vaccine virus together with non-infectious restriction fragments of the L variant of the DNA, making up the DNA ' unrelated to variant S, of a particular structure. Pi? precisely, that stretch of the L variant of the DNA that is to be recovered must be present within a DNA chain having sections co-linear with the DNA chain of the S fragment into which it is to be introduced. In other words, the foreign DNA to be introduced in the S variant must have both ends? of the DNA chain a DNA region that is the homolog of the corresponding sequences in the S variant. Such homologous sequences can be understood as "arms" joined to the region of the L variant of the DNA which has to be recovered with the S variant.

Il meccanismo di questa ricombinazione ? complesso e non si ? riusciti sinora a realizzarlo in vitro. The mechanism of this recombination? complex and not yes? managed to achieve it in vitro so far.

Apparentemente , la ricombinazione della variante L del DNA nella variante S consiste dell'appaiamento di basi omologhe nei segmenti circostanti la zona di delezione della variante S. Con tutta probabilit?, i cross-over cio? gli interscambi da un filamento del DNA ad un altro portano ad una ricombinazione del DNA in vivo, atta a recuperare il tratto soppresso. Apparently, the recombination of the L variant of the DNA into the S variant consists of the pairing of homologous bases in the segments surrounding the deletion zone of the S variant. the exchanges from one DNA strand to another lead to an in vivo recombination of the DNA, capable of recovering the suppressed trait.

Una tale tecnica di ricombinazione in vivo si presta all'introduzione del DNA estraneo che non sia il DNA vaccinico nelle varianti sia S o L del virus vaccinico. Quindi, il frammento modificato Hind III F che incorpora il frammento Barn HSV TK in qualit? di DNA estraneo al virus vaccinico pu? essere introdotto in quest'ultimo trattando le cellule eucariotiche con il frammento F modificato insieme con le varianti L e/o S infettive del virus vaccinico. In tal caso, i tratti del frammento F affiancati al frammento Barn HSV TK fungono da "braccia" come gi? citato, aventi il DNA omologo al DNA presente nelle varianti L o S nelle quali va introdotto il frammento F modificato. Anche qui, per via d'un processo intracellulare in vivo, il cui meccanismo non ? ancora conosciuto nei suoi particolari , il frammento F del HSV TK modificato viene incorporato nelle varianti vacciniche entro la cellula, essendo poi capace di replicazione ed espressione controllata dal virus vaccinico. Such an in vivo recombination technique lends itself to the introduction of foreign DNA other than vaccine DNA into either S or L variants of the vaccine virus. Hence, the modified Hind III F fragment incorporating the HSV TK Barn fragment in quality? of DNA foreign to the vaccine virus pu? be introduced into the latter by treating the eukaryotic cells with the modified F fragment together with the infectious L and / or S variants of the vaccine virus. In this case, the portions of the F fragment flanked by the Barn HSV TK fragment act as "arms" as already? mentioned, having the DNA homologous to the DNA present in the L or S variants in which the modified F fragment is introduced. Again, due to an intracellular process in vivo, the mechanism of which is not? still known in its details, the F fragment of the modified HSV TK is incorporated into the vaccine variants within the cell, being then capable of replication and expression controlled by the vaccine virus.

Questa tecnica di ricombinazione in vivo trova larga applicazione all'introduzione di altri DNA estranei nel virus vaccinico, offrendo cos? un percorso per cui il genoma vaccinico pu? essere modificato al fine di incorporarne una vasta gamma di materiale genetico estraneo, compreso il DNA estraneo di derivazione vaccinica, quello sintetico o derivato da organismi diversi dal virus vaccinico. This in vivo recombination technique finds wide application to the introduction of other foreign DNAs into the vaccine virus, thus offering a path for which the vaccine genome can? be modified to incorporate a wide range of foreign genetic material, including foreign DNA derived from vaccines, synthetic DNA or derived from organisms other than the vaccine virus.

Diversissime cellule possono servire da ospite ai fini della citata ricombinazione in vivo. Tuttavia, l'efficienza della ricombinazione varier? a seconda della cellula ospite. Tra quelle investigate sinora, le cellule epatiche del criceto siriaco neonato Very different cells can serve as hosts for the aforementioned in vivo recombination. However, the efficiency of the recombination will vary? depending on the host cell. Among those investigated so far, the liver cells of the newborn Syriac hamster

[BHK-21 (Clone 13) (ATCC No.CCLIO)] hanno evidenziato l'efficienza maggiore nei processi di ricombinazione. Comunque, altre cellule comprese le CV?1 (ATCC NO.' CCL70) , una linea di cellule epatiche della scimmia verde, cellule TK umane (linea 143) ed un mutante resistente alla 5'-BUdR derivato dalle cellule di linea umana R970-5, sono anche state infettate in questa maniera per generare dei mutanti vaccinici. [BHK-21 (Clone 13) (ATCC No.CCLIO)] showed the highest efficiency in the recombination processes. However, other cells including CV? 1 (ATCC NO. 'CCL70), a green monkey liver cell line, human TK cells (line 143) and a 5'-BUdR resistant mutant derived from human R970- 5, were also infected in this manner to generate vaccine mutants.

Queste cellule?vanno opportunamente trattate con il virus vaccinico ed il DNA estraneo per l?incorporazione vaccinica mentre per maggior convenienza le cellule si trovano sotto forma di uno strato monomolecolare. Ai fini della ricombinazione in vivo, le cellule si possono assoggettare all?infezione vaccinica, passando poi al trattamento con il DNA estraneo da incorporarsi nelle medesime, oppure possono essere prima messe a contatto con il DNA estraneo, per procedere poi all'infezione vaccinica. Un'ulteriore alternativa consiste nell?esporre le cellule simultaneamente al trattamento vaccinico e di DNA estraneo. These cells should be suitably treated with the vaccine virus and foreign DNA for vaccine incorporation while for greater convenience the cells are found in the form of a monomolecular layer. For the purpose of in vivo recombination, the cells can be subjected to vaccine infection, then passing to the treatment with the foreign DNA to be incorporated into them, or they can first be put in contact with the foreign DNA, to then proceed with the vaccine infection. A further alternative is to expose the cells simultaneously to vaccine and foreign DNA treatment.

I virus vengono opportunamente posti a contatto con lo strato monomolecolare di cellule in un comune medium liquido, tale come una soluzione salina tamponata al fosfato, una soluzione salina tamponata all'Hepes o la soluzione speciale di Eagle (con o senza aggiunta di siero), ecc.f purch? compatibile con tali cellule e virus. Viruses are conveniently placed in contact with the monolayer of cells in a common liquid medium, such as phosphate buffered saline, Hepes buffered saline or Eagle's special solution (with or without added serum), etc f as long as? compatible with such cells and viruses.

Opportunamente il DNA estraneo viene usato nel trattamento delle cellule sotto forma di fosfato di calcio precipitato. Tali metodiche per l'introduzione del DNA nelle cellule sono gi? note da descrizioni anteriori di Graham e coll.??, Virology 52:456-467, 1973.? Metodi modificati sono stati pubblicati da Stow e coll.', nel J. Gen. Virol.?33:447-458, 1976 e da Wigler e coll, nel Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76.:1373-1376, 1979.? I trattamenti suggeriti in queste pubblicazioni procedono opportunamente a temperatura ambiente, tuttavia le condizioni di temperatura possono essere variate entro certi limiti compatibili con la vitalit? cellulare, e lo stesso dicasi della durata del trattamento cellulare con il virus e/o il? precipitato del DNA estraneo, risultando in diversi gradi di efficienza nella ricombinazione in vivo. Inoltre, il tasso o il grado di ricombinazione sar? influenzato dalla concentrazione del virus vaccinico infettivo e dal quantitativo del precipitato DNA estraneo che sia impiegato. Gli altri fattori quali l'atmosfera ecc. sono tutti prescelti con il proposito di preservare la vitalit? cellulare. A parte questo, purch? siano presenti i tre costituenti necessari (la cellula, il virus ed il DNA), la ricombinazione in vivo proceder? almeno entro determinati limiti.?La scelta delle condizioni ottimali per il caso particolare ? senz'altro entro le capacit? degli esperti nelle arti microbiologiche. Conveniently, foreign DNA is used in the treatment of cells in the form of precipitated calcium phosphate. Are these methods for introducing DNA into cells already? Notes from earlier descriptions by Graham et al., Virology 52: 456-467, 1973.? Modified methods have been published by Stow et al. ', In J. Gen. Virol.?33:447-458, 1976 and by Wigler et al., In Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76.:1373-1376, 1979.? The treatments suggested in these publications proceed suitably at room temperature, however the temperature conditions can be varied within certain limits compatible with viability. cellular, and the same applies to the duration of cellular treatment with the virus and / or the? precipitate of foreign DNA, resulting in varying degrees of efficiency in in vivo recombination. Also, the rate or degree of recombination will be? influenced by the concentration of the infectious vaccine virus and the amount of foreign DNA precipitate that is used. The other factors such as the atmosphere etc. are all chosen with the purpose of preserving vitality? cell phone. Apart from that, as long as? the three necessary constituents are present (the cell, the virus and the DNA), the in vivo recombination will proceed? at least within certain limits. The choice of optimal conditions for the particular case? certainly within the capabilities? experts in the microbiological arts.

Completata la fase di ricombinazione, si rende necessario procedere all'identificazione dei virus vaccinici mutati per ricombinazione in vivo, separandoli da quelli non modificati. Once the recombination phase has been completed, it is necessary to proceed with the identification of the mutated vaccine viruses by recombination in vivo, separating them from the unmodified ones.

I virus vaccinici mutati a mezzo di ricombinazio? ne in vivo del DNA -estraneo possono -essere separati da quelli non modificati con l'alisilio di almeno due metodi, indipendenti dalla natura del DNA estraneo o dalla abilit? del mutante di esprimere un gene qualsiasi presente nel DNA estraneo. Cos?, in primo luogo, il DNA estraneo si pu? individuare nel genoma del mutante mediante analisi per restrizione del genoma, al fine di individuare la presenza d'un pezzo extra del DNA nell'organismo mutato.?In questo metodo, vengono col" tivati virus individuali isolati da piastrine purificate per estrarne il DNA destinato ad analisi per restrizione con l'uso di opportuni enzimi di restrizione.1Individuando il numero dei frammenti ed il relativo peso molecolare, si arriva per deduzione alla struttura del genoma antecedente la restrizione. Tuttavia, si tratta d'un metodo laborioso, dispendioso di tempo ed incerto, data la necessit? di coltivare piastrine purificate, ed il rischio che nonostante le numerose analisi richieste, le piastrine coltivate ed analizzate possano risultare prive di qualsiasi mutante.' Un ulteriore metodo per individuare il DNA estraneo nel virus vaccinico consiste in una modificazione della tecnica esposta da Villarreal e coll, nella rivista Science 196;183-185, 1977. Qui, il virus infettivo viene trasferito da'piastrine virali trovate sullo strato monomolecolare di cellule infette, ad un filtro di nitrocellulosa. Opportunamente si procede a replicare un'immagine speculare del virus trasferito sul filtro nitrocellulosico, ponendo a contatto un altro filtro del genere con quel lato del primo filtro nitrocellulosico sul quale sono stati trasferiti i virus. Una parte dei virus sul primo filtro viene cos? trasferita sul secondo. L'uno o l'altro dei filtri, generalmente il primo, viene ora usato per l'ibridazione. Vaccine viruses mutated by recombination? ne in vivo of the foreign DNA can be separated from the unmodified ones with the alysilium of at least two methods, independent of the nature of the foreign DNA or of the ability? of the mutant to express any gene present in the foreign DNA. So, in the first place, foreign DNA can be found. identify in the mutant genome by genome restriction analysis in order to detect the presence of an extra piece of DNA in the mutated organism. analysis by restriction with the use of suitable restriction enzymes.1 By identifying the number of fragments and their molecular weight, we arrive at the structure of the genome prior to restriction by deduction. However, it is a laborious, time-consuming method and uncertain, given the need to cultivate purified platelets, and the risk that despite the numerous analyzes required, the cultured and analyzed platelets may be devoid of any mutant. ' A further method for detecting foreign DNA in the vaccine virus consists of a modification of the technique expounded by Villarreal et al, in the journal Science 196; 183-185, 1977. Here, the infectious virus is transferred from viral platelets found on the monolayer of infected cells, to a nitrocellulose filter. Appropriately, a mirror image of the virus transferred on the nitrocellulose filter is replicated, placing another such filter in contact with that side of the first nitrocellulose filter on which the viruses have been transferred. of the viruses on the first filter are thus transferred to the second one, one or the other of the filters, usually the first, is now used for hybridization.

L'altro filtro viene preservato per recuperarne il virus ricombinante, una volta individuato il relativo locus del compagno replicato sul filtro ad immagine speculare, mediante la tecnica di ibridazione. The other filter is preserved to recover the recombinant virus, once the relative locus of the mate replicated on the mirror image filter has been identified, using the hybridization technique.

Ai fini dell'ibridazione, i virus riscontrati sul filtro nitrocellulosico vengono denaturati con idrossido di sodio mediante tecniche gi? conosciute.?Il materiale genetico cos? denaturato viene ora ibridato con una controparte radiomarcata del gene la cui presenza si cerca di individuare. Ad esempio, per individuare la possibile presenza di mutanti vaccinici aventi il frammento Barn HSV TK, viene impiegato il corrispondente frammento del Barn HSV TK marcato con P, per analogia al metodo gi? discusso in rapporto all'individuazione di plasmidi modificati causa la presenza di questo,frammento. Il DNA non ibridato viene rimosso per lavaggio dal filtro di nitrocellulosa ed il rimanente DNA ibridato, che ? radioattivo, viene localizzato mediante autoradiografia, vale a dire ponendo zi filtro a contatto con una pellicola radiografica. For the purpose of hybridization, the viruses found on the nitrocellulose filter are denatured with sodium hydroxide by means of already existing techniques. known. denatured is now hybridized with a radiolabeled counterpart of the gene whose presence we are trying to identify. For example, to identify the possible presence of vaccine mutants having the Barn HSV TK fragment, the corresponding fragment of the Barn HSV TK labeled with P is used, by analogy to the gi? Method. discussed in connection with the detection of modified plasmids due to the presence of this fragment. The unhybridized DNA is washed off the nitrocellulose filter and the remaining hybridized DNA, which? radioactive, is localized by autoradiography, that is to say by placing the filter in contact with a radiographic film.

Una volta identificati i virus mutati, si procede ad individuare le corrispondenti piastrine virali sul secondo filtro, quello che contiene l'immagine speculare dei virus trasferiti sul primo filtro, allo scopo di coltivazione e replicazione di virus mutati.' Once the mutated viruses have been identified, the corresponding viral platelets are identified on the second filter, the one that contains the mirror image of the viruses transferred to the first filter, for the purpose of cultivation and replication of mutated viruses. '

I due metodi appena descritti comportano l'analisi genotipica dell'organismo in questione e, come gi? detto, si possono usare indipendentemente dall'eventuale espressione del gene presente nel DNA estraneo incorporato nel virus vaccinico. Tuttavia, trovandosi espresso il DNA estraneo, si pu? ricorrere all'analisi fenotipica per individuare i mutanti. The two methods just described involve the genotypic analysis of the organism in question and, how already? said, they can be used regardless of the possible expression of the gene present in the foreign DNA incorporated in the vaccine virus. However, when the foreign DNA is expressed, one can? use phenotypic analysis to identify mutants.

Ad esempio, se il gene si manifesta attraverso la produzione d'una proteina avente un anticorpo relativo, i mutanti si possono individuare con metodi basati sulla formazione di complessi antigene-anticorpi (vedi Bieberfeld e coll.1, J.?Immunol. Methods 6x 249-259, 1975). Vale a dire, le piastrine virali contenenti i.presunti mutanti vengono trattate con 1'anticorpo attivo contro la proteina prodotta da genotipo vaccinico del mutante. L'eccesso di anticorpi viene tolto dalle piastrine per lavaggio, dopo di che queste ultime vengono trattate con proteina A radiomarcata con 125I. La proteina A ? atta a formare legami con le catene pesanti degli anticorpi, costituendo cos? una radiomarc atura specifica del compl?sso antigene-an,ticorpo residuato sullo strato monomolecolare della cellula.?Una volta eliminata l'eccessiva proteina A radioattiva, gli strati monomolecolari vengono di nuovo trasferiti dalle piastrine ai filtri nitrocellulosici a scopo di autoradiografia, per individuarne la presenza di complessi radiomarcati immuni. Questo metodo serve all'identificazione dei virus vaccinici di mutazione, atti a produrre le proteine antigeniche. For example, if the gene manifests itself through the production of a protein having a relative antibody, the mutants can be detected by methods based on the formation of antigen-antibody complexes (see Bieberfeld et al. 1, J.?Immunol. Methods 6x 249-259, 1975). That is, the viral platelets containing the assumed mutants are treated with the antibody active against the protein produced by the vaccine genotype of the mutant. Excess antibodies are washed off the platelets, after which the platelets are treated with 125I-radiolabelled protein A. Protein A? able to form bonds with the heavy chains of the antibodies, thus constituting cos? a specific radiolab ature of the antigen complex, residual type on the monomolecular layer of the cell. the presence of radiolabeled immune complexes. This method is used to identify mutation vaccine viruses, capable of producing antigenic proteins.

Nel caso particolare del DNA estraneo corredato d'un gene HSV TK, una volta accertato che il virus vaccinico di mutazione esprime il proprio gene HSV TK, esiste un metodo molto pi? semplice ed elegante per individuare la presenza del gene. Infatti, la facilit? di distinguere tra i mutanti vaccinici recanti il gene HSV TK ed il virus vaccinico non modificato ed esente dal gene stesso, costituisce un mezzo potente per distinguere i mutanti del virus vaccinico contenenti altri geni esogeni presenti sia da soli nel genoma vaccinico o in combinazione con il gene HSV TK.' Questi metodi saranno descritti in maggior dettaglio pi? oltre. In the particular case of foreign DNA accompanied by an HSV TK gene, once it is ascertained that the mutating vaccine virus expresses its own HSV TK gene, there is a much simpler method? simple and elegant to identify the presence of the gene. In fact, the ease? to distinguish between vaccine mutants carrying the HSV TK gene and the unmodified vaccine virus free from the gene itself, constitutes a powerful means of distinguishing vaccine virus mutants containing other exogenous genes present either alone in the vaccine genome or in combination with the HSV TK gene. ' These methods will be described in greater detail in more detail. beyond.

Poich? le cellule eucariotiche posseggono il proprio gene TK, cos? come il virus vacc?nico possiede il suo gene TK (utilizzato come gi? detto in precedenza per l'incorporazione della timidina nel DNA), si rende necessario trovare qualche modo per distinguere la presenza e l'espressione di questi geni dalla presenza e l'espressione del gene HSV TK nei mutanti vaccinici che sono oggetto di questa discussione. A tal fine ci si serve del fatto che il gene HSV TK ? capace di fosforilare la deossicitidina alogenata, pi? specificatamente la iododeossicitidina (IDC), un nucleoside, ma n? il gene vaccinico TK n? il gene TK cellulare posseggono quest'azione fosforilante.-Quando l'IDC viene incorporato nel DNA cellulare, diventa insolubile. Viceversa, l'IDC non incorporato si elutria agevolmente dalle colture cellulari con un mezzo acquoso, ad esempio una soluzione tampone fisiologica. Avvantaggiandosi di questi fatti, si procede come segue per individuare l'espressione del gene HSV TK nei mutanti vaccinici. Since? eukaryotic cells have their own TK gene, so? as the vaccine virus possesses its TK gene (used as previously mentioned for the incorporation of thymidine into DNA), it becomes necessary to find some way to distinguish the presence and expression of these genes from the presence and expression of the HSV TK gene in vaccine mutants that are the subject of this discussion. To this end, we use the fact that the HSV TK? capable of phosphorylating halogenated deoxycytidine, pi? specifically iododeoxicitidine (IDC), a nucleoside, but n? the vaccine gene TK n? the cellular TK gene possess this phosphorylating action.-When IDC is incorporated into cellular DNA, it becomes insoluble. Conversely, the unincorporated IDC is easily eluted from cell cultures with an aqueous medium, such as a physiological buffer solution. Taking advantage of these facts, we proceed as follows to detect HSV TK gene expression in vaccine mutants.

Gli strati cellulari mononucleari vengono infettati con virus di mutazione in condizioni atte a stimolare la formazione delle piastrine, attivando la erescita cellulare e l? replicazione virale. Le cellule infettate vengono poi trattate con l'IDC radiomarcato di provenienza commerciale (IDC*), marcato agevolmente con I. Purch? le cellule siano state infette con il virus contenente il gene HSV TK, e purch? il gene stesso ne sia espresso, la cellula prov eder? ad incorporare l'IDC* nel proprio DNA. Lavando ora.lo strato cellulare monomolecolare con la soluzione fisiologica tampone, l'IDC* non incorporato verr? eliminato per eluzione. Se gli strati cellulari monomolecolari vengono in seguito trasferiti ad un filtro nitrocellulosico ed esposti su una pellicola roentgen, la pellicola risulter? opacizzata in corrispondenza dell'IDC* presente nelle piastrine, a dimostrazione del gene HSV TK espresso dai mutanti vaccinici. The mononuclear cell layers are infected with mutation viruses in conditions capable of stimulating the formation of platelets, activating cell growth and l? viral replication. Infected cells are then treated with commercially-sourced radiolabelled IDC (IDC *), easily labeled with I. Purch? the cells have been infected with the virus containing the HSV TK gene, and provided? the gene itself is expressed, the cell prov eder? to incorporate the IDC * into their DNA. By washing the monomolecular cell layer now with the saline buffer, the non-incorporated IDC * will be released. eliminated by elution. If the monomolecular cell layers are then transferred to a nitrocellulose filter and exposed on a roentgen film, the film will result? opacified at the IDC * present in platelets, demonstrating the HSV TK gene expressed by vaccine mutants.

Servendosi delle citate analisi genotipiche e fenotipiche, i richiedenti sono riusciti ad identificare due mutanti vaccinici denominati VP-1 e VP-2.?Il mutante VP?1 (ATCC No. VR 2032 dep. 18-11-81) ? un virus viccinico ricombinante derivato dalla variante vaccinica S modificata mediante ricombinazione in vivo Using the aforementioned genotypic and phenotypic analyzes, the applicants were able to identify two vaccine mutants named VP-1 and VP-2.?The mutant VP? 1 (ATCC No. VR 2032 dep. 18-11-81)? a recombinant vickin virus derived from the vaccine variant S modified by in vivo recombination

con il plasmide pDP 13?2. Il mutante VP-2 (ATCC No. with the plasmid pDP 13? 2. The VP-2 mutant (ATCC No.

VR 2030 dep. 18-1181) ? la variante S del virus vaccinico, modificato per ricombinazione con il plasmide pDP 137. VR 2030 dep. 18-1181)? the S variant of the vaccine virus, modified by recombination with the plasmid pDP 137.

La figura 4A costituisce una mappa Hind III di restrizione del genoma vaccinico, indicante il sito d'inserimento del gene HSV TK. Le figure 4B e 4C illustrano su scala ingrandita il frammento Hind III F contenuto, rispettivamente, nei mutanti VF-1 e VP-2, per indicarne 1'orientamento del frammento Barn HI HSV TK. L'attenzione viene richiamata al fatto che la ricombinazione in vivo del pDP 137 con la variante S Figure 4A constitutes a Hind III restriction map of the vaccine genome, indicating the HSV TK gene insertion site. Figures 4B and 4C illustrate on an enlarged scale the Hind III F fragment contained, respectively, in the mutants VF-1 and VP-2, to indicate the orientation of the Barn HI HSV TK fragment. Attention is drawn to the fact that in vivo recombination of pDP 137 with variant S

(cio? VP-2) opera a sopprimere uno dei frammenti (ie VP-2) works to suppress one of the fragments

Barn HI HSV TK presenti in coppia tandem nel plasmide d'origine.-Come gi? menzionato in precedenza, il fatto che il gene HSV TK sia espresso pu? servire alla rapida ed agevole individuazione ed identificazione dei mutanti con o senza il gene HSV TK, o d'un gene estraneo che sia presente da solo o in associazione con il gene HSV. La prova con le relative basi teoriche ? descritta in seguito. Barn HI HSV TK present in tandem pair in the plasmid of origin.-How already? previously mentioned, the fact that the HSV TK gene is expressed can serve for the quick and easy identification and identification of mutants with or without the HSV TK gene, or of a foreign gene that is present alone or in association with the HSV gene. The proof with its theoretical basis? described below.

I richiedenti sono riusciti ad isolare in forma biologicamente pura un mutante vaccinico, e pi? precisamente una variante S, esente da qualsiasi gene TK funzionale di origine naturale, che ? stato denominato VTK-79 (ATC-C NO.?VR 2031 dep. 18-11-81). Di regola, le varianti S ed L discusse in precedenza portano un gene TK nel frammento Hind III J. Ove,il .mutante in parola, privo di attivit? del gene vaccinico TK, viene impiegato nella produzione di altri organismi di mutazione dotati del gene HSV TK, incorporato nel mutante vaccinico con i metodi gi? descritti, il gene HSV TK presente in tali mutanti sar? l?unico gene funzionale TK presente nel virus/ -La presenza o l'assenza di tale gene HSV TK si individua agevolmente coltivando le cellule infette dai virus su uno dei vari nutrienti di elezione. The applicants succeeded in isolating a vaccine mutant in biologically pure form, and more? precisely a variant S, free from any functional TK gene of natural origin, which? been called VTK-79 (ATC-C NO.?VR 2031 dep. 18-11-81). As a rule, the S and L variants discussed above carry a TK gene in the Hind III J fragment. Where, the mutant in question, devoid of activity? of the vaccine gene TK, is used in the production of other mutation organisms endowed with the HSV TK gene, incorporated in the vaccine mutant with the methods already? described, the HSV TK gene present in these mutants will be? the only functional TK gene present in the virus / -The presence or absence of this HSV TK gene can be easily identified by culturing the cells infected by the virus on one of the various nutrients of choice.

Uno dei nutrienti d'elezione contiene la bromodeossiuridina (BUdR), un nucleoside analogo alla timidina per? ad elevato potere mutagenico e tossico all'organismo, come quello cellulare o virale, se presente nel DNA incorporato nel medesimo.?Un tale medium nutriente ? stato descritto da Kit e coll., Exp/ Celi Res/ 31:297-312, 1963/ Altri medium d'elezione sono l'ipoxantina/aminopterina/timidina (HAT), il medium di Littlefield, Proc/ Nati. Acad. Sci. USA One of the nutrients of choice contains bromodeoxyuridine (BUdR), a nucleoside analogous to thymidine for? with high mutagenic and toxic power to the organism, such as cellular or viral, if present in the DNA incorporated in the same.? Such a nourishing medium? been described by Kit et al., Exp / Celi Res / 31: 297-312, 1963 / Other mediums of choice are hypoxanthin / aminopterin / thymidine (HAT), Littlefield's medium, Proc / Nati. Acad. Sci. USA

50:568-573, 1963 e le relative varianti come il MTAGG descritto da Davis e coll., J. Virol/ 13:140-145, 1974 od un'altra variante del MTAGG descritta da Campione-Piccardo e coll, nel J. Virol. 3l_:281-287, 1979. Questi nutrienti sono tutti elettivamente capaci di distinguere tra organismi contenenti un gene TK espresso e quelli non contenenti alcun gene TK espresso. 50: 568-573, 1963 and related variants such as the MTAGG described by Davis et al., J. Virol / 13: 140-145, 1974 or another variant of the MTAGG described by Campione-Piccardo et al, in J. Virol. 3l_: 281-287, 1979. These nutrients are all electively capable of distinguishing between organisms containing an expressed TK gene and those containing no expressed TK gene.

L'azione elettiva del medium ? relazionata ai fattori descritti in seguito. The elective action of the medium? related to the factors described below.

Esistono due percorsi metabolici per la fosforilazione della timidina. Quello principale ? indipendente dalla timidina chinasi e mentre sintetizza la timidina fosforilata per mezzo di meccanismi intermedi, non ? capace di fosforilare il BUdR n? di fosforilare direttamente la timidina. Il secondo percorso metabolico si basa sull'azione della timidina chinasi e porta alla fosforilazione tanto della timidina come del relativo analogo, BUdR.?Poich? il BUdR ? una sostanza tossica di elevato potere mutagenico, la presenza del TK, ad esempio il HSV TK in parola, entro l'organismo porter? alla fosforilazione del BUdR e la sua incorporazione nel DNA dell'organismo vivente risulter? nella morte di quest'ultimo. Al contrario, se il gene TK manca o non ? espresso ed il susseguente percorso metabolico primario porta alla sintesi della timidina fosforilata, ma non alla fosforilazione del BUdR, allora l'organismo metabolizzante potr? sopravvivere in presenza del BUdR, poich? quest'ultimo non viene incorporato nel relativo DNA.' There are two metabolic pathways for thymidine phosphorylation. The main one? independent of thymidine kinase and while synthesizing phosphorylated thymidine by means of intermediate mechanisms, not? capable of phosphorylating the BUdR n? to phosphorylate thymidine directly. The second metabolic pathway is based on the action of thymidine kinase and leads to the phosphorylation of both thymidine and its analogue, BUdR. the BUdR? a toxic substance of high mutagenic power, the presence of TK, for example the HSV TK in word, within the organism porter? to the phosphorylation of BUdR and its incorporation into the DNA of the living organism will result? in the death of the latter. Conversely, whether the TK gene is missing or not? expressed and the subsequent primary metabolic pathway leads to the synthesis of phosphorylated thymidine, but not to the phosphorylation of BUdR, then the metabolizing organism will be able to? survive in the presence of the BUdR, since? the latter is not incorporated into its DNA. '

Il vario comportamento nella crescita qui esposto viene riassunto nella figura 5 riprodotta in allegato, che riporta il relativo comportamento e cio? gli organismi in cui il 'TK va espresso * (TK<+>) e quelli privi o non esprimenti il gene TK (TK ) su un mezzo di coltura normale, o su uno elettivo quale il HAT che blocca il percorso metabolico primario in assenza del TK, o ancora su uno contenente il BUdR. Gli organismi TK+ e TK~ cresceranno ambedue in un nutriente normale per via del percorso metabolico primario indipendente dal TK. In un nutriente elettivo quale il HAT che blocca il percorso metabolico primario indi? pendentemente dal TK, l'organismo TK cionondimeno seguit? la propria crescita in quanto l'enzima prow e? der? alla fosforilazione richiesta affinch? la timidina sia incorporata nel DNA/ Viceversa, l'organismo TK non potr? sopravvivere.?Conversamente, trattandosi di organismi coltivati su un mezzo nutriente che contiene il BUdR, le varianti TK+ non sopravvivono, dato che il TK attua la fosforilazione del BUdR, e questa sostanza tossica viene quindi incorporata nel DNA..Per contrasto, poich? il BUdR non ? fosforilato tramite il percorso metabolico primario, la variante TK? potr? accrescersi in quanto il BUdR non viene incorporato nel DNA. The various growth behavior shown here is summarized in figure 5 reproduced in the annex, which shows the relative behavior and what? organisms in which 'TK is to be expressed * (TK <+>) and those without or not expressing the TK gene (TK) on a normal culture medium, or on an elective one such as HAT which blocks the primary metabolic pathway in the absence of the TK, or on one containing the BUdR. The TK + and TK ~ organisms will both grow in a normal nutrient due to the primary metabolic pathway independent of TK. In an elective nutrient such as HAT which blocks the primary metabolic pathway indi? pending from TK, the TK body nevertheless followed? its own growth as the enzyme prow e? der? to the phosphorylation required so that? the thymidine is incorporated in the DNA / Vice versa, the organism TK will not be able? Conversely, being organisms grown on a nutrient medium that contains the BUdR, the TK + variants do not survive, since the TK phosphorylation of the BUdR, and this toxic substance is then incorporated into the DNA. the BUdR not? phosphorylated via the primary metabolic pathway, the TK? I can? increase as the BUdR is not incorporated into the DNA.

Pertanto, se un virus vaccinico privo del TK vaccinico, come ad esempio il VTK 79? viene impiegato per inserirvi il gene HSV TK secondo le tecniche esposte in questa invenzione, riesce agevole determinare la presenza e l'espressione, o l?assenza del gene Therefore, what if a vaccine virus devoid of vaccine TK, such as VTK 79? is used to insert the HSV TK gene according to the techniques described in this invention, it is easy to determine the presence and expression, or absence of the gene

HSV TK, coltivando semplicemente i ricombinanti in un medium elettivo quale l'HAT.Il virus di mutazione potranno sopravvivere poich? utilizzano il gene HSV TK per sintetizzare il DNA. HSV TK, by simply culturing the recombinants in an elective medium such as HAT. Will the mutation virus survive as it? they use the HSV TK gene to synthesize DNA.

Difatti, i richiedenti sono riusciti a preparare svariati mutanti del virus vaccinico privi del TK vaccinico, denominati VP-3 (ATCC No. VR 2036 dep.'18-11-81), che ? un r ricombinante del VTK 79 e del pDP 132, e In fact, the applicants were able to prepare several mutants of the vaccine virus without vaccine TK, named VP-3 (ATCC No. VR 2036 dep.'18-11-81), which? a recombinant r of VTK 79 and pDP 132, e

VP-4 (ATCC No. VR 2033 dep. 18-11-81), che ? un ricombinante del VTK~ 79 e del pDO 137. Quest'ultimo esprime il gene HSV di agevole identificazione con l'ausilio dei medium elettivi gi? menzionati.1 VP-4 (ATCC No. VR 2033 dep. 18-11-81), what? a recombinant of VTK ~ 79 and of pDO 137. The latter expresses the HSV gene that can be easily identified with the help of the already elective mediums? mentioned. 1

Altri due virus di ricombinazione, denominati il VP?5 (ATCC No. VR 2028 dep.-18-11-81) ed il VP-6 Two other recombination viruses, named VP? 5 (ATCC No. VR 2028 dep.-18-11-81) and VP-6

(ATCC No.?VR 2029 dep.?18-11-81) sono rispettivamente i ricombinanti del pDP 132 e pDP 137 con il VTK**11 (ATCC No. VR 2027 dep. 18-11-81), che ? una nota variante L vaccinica incapace di esprimere il gene TK vaccinico, sicch? consente l'introduzione del DNA eccedente la lunghezza massima del genoma vaccinico. (ATCC No.?VR 2029 dep.?18-11-81) are respectively the recombinants of pDP 132 and pDP 137 with VTK ** 11 (ATCC No. VR 2027 dep. 18-11-81), which? a known vaccine variant L unable to express the vaccine TK gene, so? allows the introduction of DNA exceeding the maximum length of the vaccine genome.

Le tecniche esposte in quest'invenzione si prestano all'introduzione del gene HSV TK in pezzi diversi del genoma vaccinico al fine di identificare i tratti non essenziali del genoma stesso, in altri termini, ove il gene HSV TIC si pu? inserire nel genoma vaccinico, cos? come si inserisce nel frammento Hind III F, quella regione del genoma che ha subito l'introduzione ? evidentemente non essenziale. Ogni sito non essenziale entro il genoma ? un candidato verosimile per l'inserzione del gene esogeno, di modo che i metodi esposti nella presente invenzione sono utili al fine di costruire le mappe di tali siti non essenziali entro il genoma vaccinico. The techniques exposed in this invention lend themselves to the introduction of the HSV TK gene in different pieces of the vaccine genome in order to identify the non-essential features of the genome itself, in other words, where the HSV TIC gene can be used. insert in the vaccine genome, cos? how does that region of the genome which has undergone the introduction fit into the Hind III fragment F? evidently not essential. Any non-essential site within the genome? a likely candidate for exogenous gene insertion, so that the methods set forth in the present invention are useful in building the maps of such non-essential sites within the vaccine genome.

Inoltre, se il gene HSV TK viene accoppiato con un altro gene esogeno ed il risultante materiale DNA di combinazione viene introdotto in un virus vaccinico esente del gene TK vaccinico, ad esempio il VTK 79, i ricombinanti che si formano e che contengono il gene estraneo esprimeranno il gene HSV TK e si possono agevolmente separare dalle varianti TK-*con la tecnica di cernita ora descritta. Furthermore, if the HSV TK gene is paired with another exogenous gene and the resulting combination DNA material is introduced into a vaccine virus free of the vaccine TK gene, for example VTK 79, the recombinants that are formed and contain the foreign gene they will express the HSV TK gene and can be easily separated from the TK- * variants with the sorting technique just described.

Un'altra realizzazione di quest'invenzione riguarda la preparazione d'un frammento vaccinico Hind III F avente un gene esogeno, nonch? il trattamento delle cellule con tale frammento insieme con un mutante vaccinico incapace di esprimere il gene vaccinico TK, ma recante il gene HSV TK incorporato tramite ricombinazione in vivo, secondo le tecniche esposte nell'attuale invenzione.?Al pari del gi? discusso recupero di marcatura e delle tecniche utilizzate per l'incorporazione del frammento TK modificato di Hind III F nel virus vaccinico, si possono verificare 'cros-over' e ricombinazioni onde produrre un altro mutante in cui il frammento F modificato dal HSV TK viene sostituito da un frammento F avente un altro gene esogeno. Il risultante mutante vaccinico, in cui il frammento HSV TK F sia stato sostituito da un frammento F recante il gene esogeno, sar? completamente privo di TK, mentre il virus predominante, quello d'origine non mutato, sar? sempre il HSV TK+.?Analogamente, un gene estraneo pu? risultare inserito nel gene HSV TK presente in tale mutante vaccinico, sconvolgendo l'integrit? del gene e volgendo l'organismo ricombinante in TK?, al contrario del genitore non mutato che permane TK .?In ambo i casi, ? facile distinguere tra i mutanti vaccinici dotati del gene estraneo e quelli privi di qualsiasi TK, coltivandoli su terreno BUdR e/o nutrienti speciali quali l'HAT. Another embodiment of this invention relates to the preparation of a Hind III F vaccine fragment having an exogenous gene, as well as an exogenous gene. the treatment of the cells with this fragment together with a vaccine mutant unable to express the vaccine gene TK, but carrying the HSV TK gene incorporated by recombination in vivo, according to the techniques exposed in the present invention. labeling recovery and techniques used for incorporation of the modified Hind III F TK fragment into the vaccine virus discussed, 'cros-over' and recombinations may occur to produce another mutant in which the HSV TK modified F fragment is replaced from an F fragment having another exogenous gene. The resulting vaccine mutant, in which the HSV TK F fragment has been replaced by an F fragment bearing the exogenous gene, will be? completely devoid of TK, while the predominant virus, the one of origin not mutated, will be? always the HSV TK +.? Similarly, a foreign gene can? be inserted in the HSV TK gene present in this vaccine mutant, upsetting the integrity? of the gene and turning the recombinant organism into TK?, as opposed to the unchanged parent who remains TK.? In both cases,? It is easy to distinguish between vaccine mutants with the foreign gene and those without any TK, by cultivating them on BUdR medium and / or special nutrients such as HAT.

La comprensione dell'invenzione e dei suoi molteplici vantaggi potr? giovarsi di esempi specifici, citati qui a titolo illustrativo. Salvo indicazione contraria, le percentuali s'intendono rapportate al peso.' Understanding the invention and its multiple advantages can? take advantage of specific examples, cited here for illustrative purposes. Unless otherwise indicated, the percentages are referred to the weight. '

Esempio I - Isolamento dei frammenti vaccinici Hind III su gelatina agarosica Example I - Isolation of Hind III vaccine fragments on agarose gelatin

L'endonucleasi Hind III di restrizione fu acquistata presso la soc.?Boehringer Mannheim.?La preparazione fermentativa del DNA fu compiuta in 0,6 mi di soluzione tampone Hind III avente un contenuto minimolare di 10 mM Tris-HCl (pH 7,6), 50 mM NaCl, 10 mM MgCl2? 14 mM ditiotreitolo (DTT) e 10 mcg/ml di sieroalbumina bovina BSA, contenente 10-20 yig di DNA vaccinico e 20-40 unit? di Hind III (un'unit? corrisponde al quantitativo di enzima sufficiente a scindere 1 yig di X -DNA completamente nel giro di 30 minuti).? The restriction Hind III endonuclease was purchased from Boehringer Mannheim. The DNA fermentative preparation was performed in 0.6 ml of Hind III buffer solution having a minimolar content of 10 mM Tris-HCl (pH 7.6 ), 50 mM NaCl, 10 mM MgCl2? 14 mM dithiothreitol (DTT) and 10 mcg / ml of BSA bovine serum albumin, containing 10-20 yig of vaccine DNA and 20-40 units? of Hind III (one unit corresponds to the quantity of enzyme sufficient to split 1 yig of X-DNA completely within 30 minutes).

Il DNA Vaccinico fu estratto e purificato dalle particelle virali (viri?ni) come segue. I virioni purificati furono disintegrati ad una concentrazione pari ad una densit? ottica di 50 per mi, determinata , a 260 nanometri (A260) 10 m d Tris?HC1 (PH 7,8), 50 mM ??mercaptoetanolo, 100 mM NaCl, 10 mM Na^EDTA, 1% Sarkosyl NL-97 e 26% di saccaroso. La proteinasi K fu aggiunta a 100 pg/ml ed il prodotto di lisi fu incubato per una notte a 37?C. Il DNA fu estratto con l'aggiunta dello stesso volume di fenolo-cloroformio nel rapporto di 1:1. Fu tolta la fase'organica procedendo alla ri-estrazione della fase acquosa fino ad ottenere una superficie di separazione limpida.?Seguirono altre due estrazioni al cloroformio dopo di che la fase acquosa fu dializzata a fondo contro 10 mM di Tris-HCl (pH 7,4) contenente 0,1 mM di Na3 EDTA a 4?C. Il DNA fu concentrato a circa 100 p.g/ml con Ficoll, un copolimero di sintesi ad elevato peso molecolare di saccaroso e di epicloroidrina. Vaccine DNA was extracted and purified from viral particles (viri? Ni) as follows. The purified virions were disintegrated at a concentration equal to a density? 50 per ml optics, determined, at 260 nanometers (A260) 10 m d Tris? HC1 (PH 7,8), 50 mM ?? mercaptoethanol, 100 mM NaCl, 10 mM Na ^ EDTA, 1% Sarkosyl NL-97 and 26 % saccharose. Proteinase K was added at 100 µg / ml and the lysis product was incubated overnight at 37 ° C. The DNA was extracted by adding the same volume of phenol-chloroform in the ratio of 1: 1. The organic phase was removed by re-extracting the aqueous phase until a clear separation surface was obtained. Two more chloroform extractions followed after which the aqueous phase was thoroughly dialyzed against 10 mM of Tris-HCl (pH 7 , 4) containing 0.1 mM of Na3 EDTA at 4 ° C. The DNA was concentrated at about 100 µg / ml with Ficoll, a high molecular weight synthetic copolymer of sucrose and epichlorohydrin.

La fermentazione del DNA procedette per 4 h a 37?C, poi, per arrestare la reazione, fu riscaldato a 65?C per 10 minuti, aggiungendovi poi una soluzione acquosa atta ad arrestare la reazione, consistente di agaroso 2,5%, glicerina 40%, dodecil solfato sodico 5% (SDS) e violetto bromofenolo 0,25% (BPB). I campioni furono applicati a strati su gelatina agarosica a 65?C e lasciati indurire prima di procedere all'elettroforesi. The fermentation of the DNA proceeded for 4 h at 37 ° C, then, to stop the reaction, it was heated to 65 ° C for 10 minutes, then adding an aqueous solution suitable to stop the reaction, consisting of agarose 2.5%, glycerin 40 %, sodium dodecyl sulfate 5% (SDS) and bromophenol violet 0.25% (BPB). The samples were applied in layers on agarose gelatin at 65 ° C and allowed to harden before proceeding to electrophoresis.

L'elettroforesi fu eseguita su gelatina agarosica al 0,8% (0,3 x 14,5 x 30 cm) in soluzione tampone per elettroforesi contenente 36 mM Tris-HCl (pH 7,8), Electrophoresis was performed on 0.8% agarose gelatin (0.3 x 14.5 x 30 cm) in electrophoresis buffer containing 36 mM Tris-HCl (pH 7.8),

30 mM NaH2PO4 e 1 mM EDTA. Si fece l'elettroforesi a 4?C per 42 h a 50 V. Le gelatine furono colorate con bromuro etidico (1 jzg/ml in soluzione tampone per elettroforesi) . I frammenti di restrizione furono visualizzati con luce ultravioletta (UV) per individuare frammenti da tagliare dalla gelatina. 30 mM NaH2PO4 and 1 mM EDTA. Electrophoresis was done at 4 ° C for 42 h at 50 V. The gelatins were stained with ethide bromide (1 µg / ml in electrophoresis buffer solution). The restriction fragments were visualized with ultraviolet (UV) light to identify fragments to be cut from the gelatin.

Per separare i frammenti dalla gelatina agarosica ci si serv? del procedimento di Vogelstein e coll., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 7_6:615-519, 1979 utilizzando pulviscolo vitreo come segue. La gelatina agarosica contenente il frammento del DNA fu sciolta in 2,0 mi d'una soluzione acquosa satura di Nal. Si aggiunsero 10 mg di polvere vitrea per ogni ]*g di DNA presente secondo i calcoli. La soluzione fu agitata per una notte a 25?C per legare il DNA alla polvere vitrea ed 11 DNA cos? legato alla polvere fu raccolto mediante centrifugazione a 2000 giri/min per 5 minuti.?La miscela DNA-vetro fu indi lavata con 5 mi di Nal al 70% e raccolta nuovamente per centrifugazione, per lavaggio con una miscela di soluzione tampone al 50% [20 mM Tris-HCl (pH 7,2), 200 mM NaCl, 2 mM EDTA] ed etanolo al 50%. La miscela DNA-vetro fu nuovamente raccolta mediante centrifugazione e sospesa con cura in 0,5 mi di 20 mM Tris HC1 (pH 7,2), 200 mM NaCl e 2 mM EDTA. To separate the fragments from the agarose gelatin we used? of the proceedings of Vogelstein et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 7_6: 615-519, 1979 using vitreous dust as follows. The agarose gelatin containing the DNA fragment was dissolved in 2.0 ml of a saturated aqueous solution of Nal. 10 mg of vitreous powder was added for each] * g of DNA present according to the calculations. The solution was stirred overnight at 25 ° C to bind the DNA to the vitreous powder and thus the DNA. bound to the powder was collected by centrifugation at 2000 rpm for 5 minutes. The DNA-glass mixture was then washed with 5 ml of 70% Nal and collected again by centrifugation, by washing with a mixture of 50% buffer solution. [20 mM Tris-HCl (pH 7.2), 200 mM NaCl, 2 mM EDTA] and 50% ethanol. The DNA-glass mixture was again collected by centrifugation and carefully suspended in 0.5ml of 20mM Tris HCl (pH 7.2), 200mM NaCl and 2mM EDTA.

Il DNA fu quindi tolto per eluzione dalla polvere vitrea a 37?C.mediante incubazione per 30 minuti. Il vetro fu estratto centrifugando a 10,000 giri/min per 15 minuti. Il DNA fu recuperato dal residuo mediante precipitazione etanolica, e fu sciolto in 10 mM Tris-HCl (pH 7,2) contenente 1 mM EDTA.? The DNA was then eluted from the vitreous dust at 37 ° C by incubation for 30 minutes. The glass was extracted by centrifuging at 10,000 rpm for 15 minutes. The DNA was recovered from the residue by ethanol precipitation, and was dissolved in 10 mM Tris-HCl (pH 7.2) containing 1 mM EDTA.

Il frammento F isolato in questa maniera fu impiegato negli esempi esposti in seguito. Fragment F isolated in this manner was used in the examples set forth below.

Esempio II - Inserimento del frammento vaccinico Example II - Insertion of the vaccine fragment

Hind III F nel sito Hind III del pBR 322 (costruzione del pDP 3 fplasmide ricombinante pBR 322 del frammento vaccinico Hind III F]) Hind III F in the Hind III site of the pBR 322 (construction of the pDP 3 fplasmid recombinant pBR 322 of the Hind III F vaccine fragment])

Il frammento vaccinico Hind III F fu isolato dalla gelatina agarosica di preparazione come esposto nell?Esempio I. Questo frammento fu poi inserito al sito Hind III del pBR 322 (Bolivar e coll...Gene, 2:95-113, 1977) come segue. The Hind III F vaccine fragment was isolated from the preparation agarose gelatin as set out in Example I. This fragment was then inserted at the Hind III site of pBR 322 (Bolivar et al. Gene, 2: 95-113, 1977) as follows.

Circa 200 nanogrammi (ng) di pBR 322 furono scissi con Hind III in 10 mM Tris-HCl (pH 7,6). 50 mM NaCl, 10 mM MgCl2 e 14 mM DTT (soluzione tampone Hind III) utilizzando 1 unit? d'enzima per 1 h a 37?C. La reazione fu arrestata riscaldando a 65?C per 10 minuti.-500 ng del frammento vaccinico Hind III F isolato furono aggiunti ed il DNA fu co-precipitato con 2 volumi di etanolo a -70?C per 30 minuti,-Il DNA fu poi lavato con etanolo acquoso al 70% , essiccato e ri-sospeso nella soluzione tampone di legatura consistente di 50 mM Tris-HCl (pH 7,6), 10 mM MgCl2, 10 mM DTT ed 1 mM di adenosina trifosfato (ATP). Circa 100 unit? di T DNA legasi (New England Biolabs) furono poi aggiunte e la miscela fu incubata a 10?C per una notte. Il DNA trattato con la legasi fu quindi impiegato per la trasformazione dell'E. coli HB101 (Boyer e coll.?, J. Mol.>Biol.'41,:459-472, 1969) About 200 nanograms (ng) of pBR 322 were cleaved with Hind III in 10 mM Tris-HCl (pH 7.6). 50 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 14 mM DTT (Hind III buffer solution) using 1 unit? of enzyme for 1 h at 37 ° C. The reaction was stopped by heating at 65 ° C for 10 minutes. -500 ng of the isolated Hind III F vaccine fragment was added and the DNA was co-precipitated with 2 volumes of ethanol at -70 ° C for 30 minutes. then washed with 70% aqueous ethanol, dried and re-suspended in the ligating buffer solution consisting of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6), 10 mM MgCl2, 10 mM DTT and 1 mM adenosine triphosphate (ATP). About 100 units of T DNA binding (New England Biolabs) were then added and the mixture was incubated at 10 ° C overnight. The DNA treated with the ligase was then used for the transformation of E. coli HB101 (Boyer et al.?, J. Mol.> Biol.'41,: 459-472, 1969)

Esempio III - Trasformazione di E. Coli e selezione di plasmidi ricombinanti Example III - Transformation of E. Coli and selection of recombinant plasmids

Le cellule competenti furono preparate e trasformate con i plasmidi secondo il procedimento descritto da Dagert e coll.?, Gene 6:23-28, 1979.?Le cellule di E/ coli HB101 furono rese competenti inoculando 50 mi del brodo LB (bact?triptona 1%, estratto bacto-lievito 0,5% e NaCl 0,5% supplementato con 0,2% di glucosio) con 0,3 mi d?una coltura di cellule incubate per una notte e coltivate a 37?C quanto necessario per registrare una densit? ottica (estinzione) di 0,2 a 650 nanometri (A650) sullo spettrofotometro.?Quindi, le cellule furono refrigerate su ghiaccio per 10 minuti, centrifugate per formare pallottole, sospese nuovamente in 20 mi di CaCl2 decimolare (0,1 M) raffreddato ed incubate su ghiaccio per 20 minuti. Le cellule furono quindi compresse in pallottole e sospese nuovamente in 0,5 mi di 0,1 M CaClg raffreddato e lasciate per 24 h a 4?C. Le cellule furono trasformate aggiungendo DNA legato (o,2-0,5 mg in 0,01-0,02 mi di soluzione tampone di legatura) a 0,1 mi di cellule competenti. Queste ultime furono poi incubate su ghiaccio per 10 minuti e a 37?C per 5 minuti. Si aggiunsero-quindi 2,0 mi di brodo LB e le cellule furono incubate a 37?C per 1 h, agitando. Aliquote di 10 o 100 microlitri (??) furono poi spalmate'su lastre di agar LB contenente ampicillina (Amp) in concentrazione pari a 100 pg/ml. Competent cells were prepared and transformed with plasmids according to the procedure described by Dagert et al., Gene 6: 23-28, 1979. E / coli HB101 cells were made competent by inoculating 50 ml of the LB broth (bact? tripton 1%, bacto-yeast extract 0.5% and NaCl 0.5% supplemented with 0.2% glucose) with 0.3 ml gives a culture of cells incubated overnight and cultured at 37 ° C as needed to register a density? optics (extinction) of 0.2 to 650 nanometers (A650) on the spectrophotometer. Then, the cells were chilled on ice for 10 minutes, centrifuged to form pellets, suspended again in 20 mL of cooled decimolar (0.1 M) CaCl2 and incubated on ice for 20 minutes. The cells were then pelleted and resuspended in 0.5 ml of cooled 0.1 M CaClg and left for 24 h at 4 ° C. The cells were transformed by adding bound DNA (or, 2-0.5 mg in 0.01-0.02 ml of ligating buffer) to 0.1 ml of competent cells. The latter were then incubated on ice for 10 minutes and at 37 ° C for 5 minutes. 2.0 ml of LB broth was then added and the cells were incubated at 37 ° C for 1 h with stirring. Aliquots of 10 or 100 microliters (??) were then spread on LB agar plates containing ampicillin (Amp) in a concentration equal to 100 pg / ml.

Si procedette quindi alla cernita dei batteri di trasformazione per individuare i plasmidi ricombinanti, trasferendo le colonie resistenti all1ampieillina (Amp ) su terreno agar LB contenente tetraciclina (Tet) in concentrazione pari a 15 pg/ml. Quelle colonie che risultarono resistenti all?ampicillina (Amp<R>) ma sensibili alla tetraciclina (Tet ) (circa 1%) furono saggiate per frammenti vaccinici intatti di Hind III F inseriti nel pBR 322 secondo il procedimento suggerito da Holmes e coll., Anal. Bioch. 114?193-197, 1981. The transformation bacteria were then sorted to identify the recombinant plasmids, transferring the ampieillin-resistant colonies (Amp) to LB agar medium containing tetracycline (Tet) in a concentration equal to 15 pg / ml. Those colonies which were found to be resistant to ampicillin (Amp <R>) but sensitive to tetracycline (Tet) (approximately 1%) were tested for intact vaccine fragments of Hind III F inserted in pBR 322 according to the procedure suggested by Holmes et al., Anal. Bioch. 114? 193-197, 1981.

?Colture di 2,0 mi di E_. coli di trasformazione furono coltivate per una notte a 3730. I batteri furono centrifugati per formarne pallottole, sospesi nuovamente in 105 ?l d'una soluzione di saccaroso 8%, Triton ? 2.0 ml cultures of E_. coli transformation were cultured overnight at 3730. The bacteria were centrifuged to form pellets, suspended again in 105 µl of an 8% sucrose solution, Triton

X-100 5%, 50 mM EDTA e 50 mM Tris-HCl (pH 8,0) al che segui l'aggiunta di 7,5 ?l d'una soluzione appositamente preparata di lisozima (worthington Biochemicals) [10 mg/ml in 50 mM Tris-HCl (pH 8,0)]. I lisati furono immessi per 1 minuto in un bagno d'acqua bollente, e quindi centrifugati per 15 minuti a 10,000 giri/min.? Il residuo fu estratto ed il plasmide DNA precipitato con l'identico volume di isopropanolo. I plasmidi furono nuovamente sospesi in 40 ?? di soluzione tampone Hind III e fermentati con 1 unit? di Hind III per 2 h. I pr?-4ot-ti-di digestione enzimatica furono poi analizzati su una gelatina agarosica all'1% uso analisi per individuare gli opportuni frammenti Hind III F. Uno di X-100 5%, 50 mM EDTA and 50 mM Tris-HCl (pH 8.0) followed by the addition of 7.5 µl of a specially prepared lysozyme solution (worthington Biochemicals) [10 mg / ml in 50 mM Tris-HCl (pH 8.0)]. The lysates were placed for 1 minute in a boiling water bath, and then centrifuged for 15 minutes at 10,000 rpm. The residue was extracted and the DNA plasmid precipitated with the identical volume of isopropanol. The plasmids were again suspended in 40 ?? of Hind III buffer solution and fermented with 1 unit? of Hind III for 2 h. The pr? -4ot-ti-enzymatic digestion were then analyzed on a 1% agarose gelatin use analysis to identify the appropriate Hind III F fragments.

tali" plasmidi di ricombinazione, avente un frammento Hind III F intatto, denominato il pDP 3, fu utilizzato per ulteriore modificazione (vedi figura 3B).? such "recombination plasmids, having an intact Hind III F fragment, termed the pDP 3, was used for further modification (see Figure 3B)."

Esempio IV - Isolamento preparativo di pDP 3 Example IV - Preparative isolation of pDP 3

L'isolamento e la purificazione su larga scala Large-scale isolation and purification

del plasmide DNA fu attuato adattando il procedimento di Clewel e coll., Proc. Nati.?Acad. Sci/ USA 62:1159-1166, 1969.? 500 mi di brodo LB furono inoculati con 1,0 mi di batteri E. coli HB 101 coltivati per una notte e contenenti il pDP 3. Raggiunta la densit? ottica di circa 0,6 ad A6? , si aggiunse 100 pg/ml di cloramfenicolo onde accrescere la produzione plasmidica (Clewel, J. Bacteriol. 110:667-676, 1972). I batteri furono incubati a 37?C per altre 12-16 ore, quindi raccolti per centrifugazione a 5.000 giri per 5 minuti, lavati una volta in 100 mi di soluzione tampone TEN [0,1 mM Tris-HCl (pH 8,0), 150 mM NaCl e 10 mM EDTA], raccolti per centrifugazione e sospesi nuovamente in 14 mi d?una soluzione di saccaroso al 25% in 0,05 M Tris-HCl plasmid DNA was implemented by adapting the procedure of Clewel et al., Proc. Nati.?Acad. Sci / USA 62: 1159-1166, 1969.? 500 ml of LB broth was inoculated with 1.0 ml of E. coli HB 101 bacteria cultured overnight and containing the pDP 3. Density reached? optics of about 0.6 to A6? , 100 pg / ml of chloramphenicol was added to increase plasmid production (Clewel, J. Bacteriol. 110: 667-676, 1972). Bacteria were incubated at 37 ° C for another 12-16 hours, then collected by centrifugation at 5,000 rpm for 5 minutes, washed once in 100 ml of TEN [0.1 mM Tris-HCl (pH 8.0) buffer solution. , 150 mM NaCl and 10 mM EDTA], collected by centrifugation and suspended again in 14 ml gives a 25% sucrose solution in 0.05 M Tris-HCl

(pH 8,0).?4,0 mi di soluzione di lisozima [5 mg/ml in 0,25 M Tris-HCl (pH 8,0)] furono aggiunti e la miscela fu incubata a temperatura ambiente per 30 minuti, prima di aggiungervi 4.,0 ml di 0,25 M EDTA (pH 8,0), La miscela fu quindi posta su ghiaccio per 10 minuti. 2,0 ml di RNasi pancreatica A (sigma Chemical Co.) [1 mg/ml in 0,25 M Tris-HCl (pH 8,0)] furono aggiunti a tale miscela che venne poi incubata a temperatura ambiente per 1 minuto. Le cellule furono quindi soggette a lisi per l?aggiunta di 26 mi d'una soluzione litica al Tritone [Triton x-100 1%, 0,05 M EDTA, 0,05 M Tris-HCl (pH 8,0)]. La miscela fu incubata a temperatura ambiente per 30-60 minuti ed il lisato fu elarificato per centrifugazione a 17.000 giri per 30 minuti a 4?C. si estrasse poi il residuo e si procedette a separare il plasmide DNA dal DNA cromosomico su gradazioni di colorante CsCl galleggiante. (pH 8.0). 4.0 mL lysozyme solution [5 mg / mL in 0.25 M Tris-HCl (pH 8.0)] was added and the mixture was incubated at room temperature for 30 minutes, before adding 4.0 ml of 0.25 M EDTA (pH 8.0) to it, the mixture was then placed on ice for 10 minutes. 2.0 ml of pancreatic RNase A (sigma Chemical Co.) [1 mg / ml in 0.25 M Tris-HCl (pH 8.0)] was added to this mixture which was then incubated at room temperature for 1 minute. The cells were then subjected to lysis by adding 26 ml of a lytic solution to the Triton [Triton x-100 1%, 0.05 M EDTA, 0.05 M Tris-HCl (pH 8.0)]. The mixture was incubated at room temperature for 30-60 minutes and the lysate was elarified by centrifugation at 17,000 rpm for 30 minutes at 4 ° C. the residue was then extracted and the DNA plasmid was separated from the chromosomal DNA on gradations of floating CsCl dye.

A tal fine si prepararono gradazioni di bromuro CsCl etidico, sciogliendo 22 g di CsCl in 23,7 ml di lisato chiarificato. Alla soluzione furono aggiunti 1,125 ml di bromuro etidico acquoso (10 mg/ml). La miscela fu quindi centrifugata in tubetti poliallomerici in un miscelatore Beckman 60 Ti a 44.000 giri/min per 48-72 h. I risultanti filamenti DNA nelle gradazioni furono visualizzati sotto luce ultravioletta ed il filamento inferiore, corrispondente al plasmide DNA a chiusura covalente, fu tolto perforando il tubetto con un ago calibro 18 connesso ad una siringa. Il bromuro etidico fu estratto dal plasmide mediante ripetuta estrazione con il doppio volume di cloroformioalcool isoamilico nel rapporto di 24:1. Si procedette quindi ad una dialisi a fondo dei plasmidi contro 10 mM di Tris-HCl (pH 7,4) contenente 0,1 mM EDTA per eliminare il CsCl. Il plasmide DNA fu poi concentrato per precipitazione etanolica. For this purpose, ethide CsCl bromide grades were prepared by dissolving 22 g of CsCl in 23.7 ml of clarified lysate. 1.125 ml of aqueous ethide bromide (10 mg / ml) was added to the solution. The mixture was then centrifuged in polyalomeric tubes in a Beckman 60 Ti mixer at 44,000 rpm for 48-72 h. The resulting DNA strands in the gradations were visualized under ultraviolet light and the lower strand, corresponding to the covalently closed DNA plasmid, was removed by piercing the tube with an 18 gauge needle connected to a syringe. The ethide bromide was extracted from the plasmid by repeated extraction with the double volume of isoamyl alcohol chloroform in the ratio of 24: 1. A thorough dialysis of the plasmids was then carried out against 10 mM of Tris-HCl (pH 7.4) containing 0.1 mM EDTA to eliminate the CsCl. The DNA plasmid was then concentrated by ethanol precipitation.

Esempio V - Costruzione di plasmidi ricombinanti di pBR 322/virus herpes vaccinici TK Example V - Construction of recombinant plasmids of pBR 322 / TK herpes vaccine virus

Le figure 3B e 3C riassumono le fasi coinvolte nella costruzione dei plasmidi ricombinanti utilizzati per 1'inserimento del frammento Barn HSV TK nelle varianti vacciniche S o L. Figures 3B and 3C summarize the steps involved in the construction of the recombinant plasmids used for the insertion of the Barn HSV TK fragment in the S or L vaccine variants.

Circa 15 pg di pDP 3 a chiusura covalente furono scissi mediante fermentazione parziale con Barn HI (Bethesda Research Laboratories) cio? 1'incubazione in una soluzione tampone Barn HI, consistente di 20 mM Tris-HCl (pH 8,0), 7 mM MgCl2, 100 mM NaCl e 2 mM di ?-mercaptoetanolo , utilizzando 7 unit? di Barn HI per 10 minuti a 37?C. Poich? sia il pBR 322 che il frammento vaccinico Hind III F contengono un sito Barn HI, la scissione parziale risulta in una miscela di plasmidi lineari interrotti in corrispondenza al sito pBR 322 o quello del Barn HI vaccinico. Questi plasmidi lineari miscelati furono poi separati dai frammenti del pDF 3 tagliati ai due siti pBR 322 e quello Barn HI vaccinico per mezzo di elettroforesi su gelatina agarosica ed i plasmidi lineari ? taglio singolo furono isolati con il metodo della polvere vitrea descritto nell?esempio I. About 15 µg of covalently closed pDP 3 were cleaved by partial fermentation with Barn HI (Bethesda Research Laboratories) ie. Incubation in a Barn HI buffer solution, consisting of 20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 7 mM MgCl2, 100 mM NaCl and 2 mM? -Mercaptoethanol, using 7 units? of Barn HI for 10 minutes at 37 ° C. Since? both the pBR 322 and the Hind III F vaccine fragment contain a Barn HI site, partial cleavage results in a mixture of interrupted linear plasmids at the pBR 322 site or that of the vaccine Barn HI. These mixed linear plasmids were then separated from the pDF 3 fragments cut at the two sites pBR 322 and the vaccine Barn HI by means of agarose gelatin electrophoresis and the linear plasmids? single cut were isolated by the vitreous powder method described in Example I.

Un pBR 322 ricombinante dotato del frammento HSV Barn HI di 2,3 megadalton (md) codificato per HSV TK, come esposto da Colbere?Garapin e coll., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76_:3755-3759, 1979, fu portato a digestione completa con Barn HI ed il frammento Barn TK di 2,3 megadalton fu isolato dal terreno agarosico come descritto in precedenza. A recombinant pBR 322 endowed with the 2.3 megadalton (md) HSV Barn HI fragment encoded for HSV TK, as exposed by Colbere? Garapin et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76_: 3755-3759, 1979, was brought to complete digestion with Barn HI and the 2.3 megadalton Barn TK fragment was isolated from the agarose medium as described above.

I plasmidi ricombinanti pDP 3 Barn TK furono costruiti provvedendo al legame di circa 1 pg di pDP 3 linearizzato per Barn HI a circa 0,2 pg del frammento Barn TK isolato in 20 pi di soluzione tampone da legame, contenente 100 unit? di legasi DNA, a 10?C per una notte. Questa miscela legante fu poi utilizzata per trasformare le cellule competenti di E. coli HB 101, come esposto nell?esempio III. The recombinant pDP 3 Barn TK plasmids were constructed by binding approximately 1 µg of linearized pDP 3 per Barn HI to approximately 0.2 µg of the Barn TK fragment isolated in 20 µl binding buffer, containing 100 units. of DNA binding, at 10 ° C overnight. This binding mixture was then used to transform the competent cells of E. coli HB 101, as set forth in Example III.

Esempio VI - La cernita di cellule di trasformazione per identificare quelle recanti i plasmidi ricombinanti dotati di inserti HSV TK Example VI - Sorting of transformation cells to identify those bearing recombinant plasmids equipped with HSV TK inserts

Le cellule di trasformazione dotate di plasmidi ricombinanti furono soggette a cernita per individuare gli-inserti HSV TK mediante l'ibridazione di colonie, come essenzialmente esposto da Hahahan e coll., Gene 10:63-67, 1980. Transformation cells equipped with recombinant plasmids were subjected to sorting to identify HSV TK-inserts by hybridization of colonies, as essentially exposed by Hahahan et al., Gene 10: 63-67, 1980.

Un corredo iniziale di filtri nitrocellulosici (Schleicher & Schull BA85) furono sistemati su capsule di Petri riempite di nutriente agar LB contenente 100 pg/ml di ampicillina. Le cellule di trasformazione furono applicate sui filtri e si procedette ad incubare le capsule a 30?C per una notte, o quanto bastasse a rendere le colonie appena visibili. Si realizz? un filtro nitrocellulosico di replica per ciascuno dei filtri originali, sovrapponendo un filtro nitrocellulosico sterile su ciascuno dei predetti filtri originali e pressando l'uno fermamente contro l'altro. Indi si pratic? su ciascuna coppia di filtri un'incisione con una lama da bisturi sterile, dopo di che i filtri furono separati e trasferiti ad un'altra lastra di agar LB contenente ampicillina 100 pg/ml per 4?6 h. Il corredo originale di filtri fu poi sistemato su lastre di agar LB contenenti 200 ?g/ml di cloramfenicolo per aumentare la produzione plasmidica. I filtri di replica furono conservati a 4?C. An initial set of nitrocellulose filters (Schleicher & Schull BA85) were placed on Petri dishes filled with nutrient LB agar containing 100 µg / ml of ampicillin. Transformation cells were applied to the filters and the capsules were incubated at 30 ° C overnight, or long enough to make the colonies barely visible. Did it happen? a replica nitrocellulose filter for each of the original filters, by superimposing a sterile nitrocellulose filter on each of the aforementioned original filters and pressing one firmly against the other. Then you practiced? on each pair of filters an incision with a sterile scalpel blade, after which the filters were separated and transferred to another LB agar plate containing ampicillin 100 pg / ml for 4-6 h. The original kit of filters was then placed on LB agar plates containing 200 µg / ml of chloramphenicol to increase plasmid production. Replication filters were stored at 4 ° C.

Dopo 24 h sul cloramfenicolo, i filtri nitrocellulosici originali furono preparati per l'ibridazione come segue. Ciascun filtro nitrocellulosico fu sistemato su un foglio di carta filtrante vhatman satura di 0,5 N NaOH per 5 minuti, asciugato con carta filtrante asciutta per 3 minuti e ricollocato sulla carta filtrante satura di NaOH per 5 minuti allo scopo di indurne la lisi dei batteri e denaturarne il DNA. Questa sequenza fu poi ripetuta utilizzando fogli di carta filtrante vhatman saturi di 1,0 M Tris-HCl (pH 8,0) e ripetuta per la terza volta su fogli di carta filtrante saturi di 1,0 M Tris-HCl (pH 8,0) contenenti 1,5 M NaCl ai fini della neutralizzazione. I filtri nitrocellulosici cosi trattati furono quindi essiccati all'aria e cotti al vuoto per 2 h alla temperatura di 80?C. After 24 h on chloramphenicol, the original nitrocellulose filters were prepared for hybridization as follows. Each nitrocellulose filter was placed on a sheet of 0.5 N NaOH saturated vhatman filter paper for 5 minutes, dried with dry filter paper for 3 minutes and returned to the NaOH saturated filter paper for 5 minutes to induce bacterial lysis. and denaturing its DNA. This sequence was then repeated using vhatman filter paper saturated with 1.0 M Tris-HCl (pH 8.0) and repeated for the third time on filter paper saturated with 1.0 M Tris-HCl (pH 8, 0) containing 1.5 M NaCl for neutralization purposes. The nitrocellulose filters thus treated were then air dried and vacuum fired for 2 h at a temperature of 80 ° C.

Prima di procedere all'ibridazione, i filtri nitrocellulosici furono poi trattati per 6-18 h incubandoli a 60?C in una soluzione tampone di pre-ibridazione e cio? una miscela acquosa di 6 x SSC [1 x SSC = 0,15 M NaCl con 0,015 M di citrato sodico (pH 7,2)], 1 x Denharts (1 x Denharts = una soluzione contenente 0,2% di Ficoll, BSA e polivinilpirrolidone, rispettivamente) e 100-200 ?g/ml di DNA dello sperma reciso denaturato di salmone (S.S.DNA), 1 mM EDTA e 0,1% SDS. Il trattamento ? inteso a ridurre la quantit? del legante tra il filtro ed il campione DNA non ibridato destinato all'applicazione'sul filtro. Before proceeding with the hybridization, the nitrocellulose filters were then treated for 6-18 h by incubating them at 60 ° C in a pre-hybridization buffer solution. an aqueous mixture of 6 x SSC [1 x SSC = 0.15 M NaCl with 0.015 M sodium citrate (pH 7.2)], 1 x Denharts (1 x Denharts = a solution containing 0.2% Ficoll, BSA and polyvinylpyrrolidone, respectively) and 100-200 μg / ml DNA from salmon denatured cut sperm (S.S.DNA), 1 mM EDTA and 0.1% SDS. The treatment ? intended to reduce the quantity? of the binder between the filter and the non-hybridized DNA sample intended for application on the filter.

Nella ricerca dei plasmidi ricombinanti dotati di inserti HSV TK, le colonie di trasformazione aderenti ai filtri nitrocellulosici originali cos? trattati, furono ibridate con il frammento Barn HSV TK marcato al P mediante l'immersione dei filtri m una soluzione tampone di ibridazione contenente 2 x SSC In the search for recombinant plasmids equipped with HSV TK inserts, the transformation colonies adhering to the original nitrocellulose filters so? treated, were hybridized with the P-labeled HSV TK Barn fragment by dipping the filters in a hybridization buffer containing 2 x SSC

(pH 7,2), 1 x la soluzione Denhart, 50 pg/ml di S.S. (pH 7.2), 1 x Denhart solution, 50 pg / ml of S.S.

DNA, 1 mM EDTA, 0,1% di SDS, 10% di solfato di dextran 32 DNA, 1 mM EDTA, 0.1% SDS, 10% dextran sulfate 32

nonch? P Barn TK quale sonda d'ibridazione. Il livello di radioattivit? della soluzione fu pari ad un conteggio di circa 100.000 al minuto (cpm) per millilitro. as well? P Barn TK as a hybridization probe. The level of radioactivity? of the solution was equal to a count of about 100,000 per minute (cpm) per milliliter.

L'ibridazione fu portata a termine a 60?C per 18-24 h (wahl e coll., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76:3683-3687, 1979). Hybridization was completed at 60 ° C for 18-24 h (wahl et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76: 3683-3687, 1979).

[Per approntare la sonda d'ibridazione, il frammento 2,3 md Barn TK fu marcato per traslazione del tratto inciso secondo il metodo di Rigby e coll., J. [To prepare the hybridization probe, the 2.3 md Barn TK fragment was marked by translation of the incised portion according to the method of Rigby et al., J.

Mol, Biol. 113:237-251, 1977. Precisamente, si appront? 0,1 mi d'una miscela di reagente contenente 50 mM Tris-HCl (pH 7,6), 5 mM MgCl^, 20 pM di trifosfato di desossicit idina (dCTP), 20 pM di trifosfato di desossi? adenosina (dATP), 20 pM di trifosfato di desossiguanosina (dGTP), 2 pM (?- P) trifosfato di deossitimidina (dTTP) (410 curie/mMol) (Amersham Corporation), 1 ng di DNasi I, 100 unit? di DNA polimerasi I (Boehringer Mannheim) ed 1 pg del frammento Barn TK. La miscela di reagente fu incubata a 14?C per 2 h. Per arresicir? Mol, Biol. 113: 237-251, 1977. Precisely, it was ready? 0.1 ml of a reagent mixture containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.6), 5 mM MgCl ^, 20 pM deoxicity triphosphate (dCTP), 20 pM deoxy triphosphate? adenosine (dATP), 20 pM deoxyguanosine triphosphate (dGTP), 2 pM (? - P) deoxytimidine triphosphate (dTTP) (410 curie / mMol) (Amersham Corporation), 1 ng of DNase I, 100 units? of DNA polymerase I (Boehringer Mannheim) and 1 µg of the Barn TK fragment. The reagent mixture was incubated at 14 ° C for 2 h. To surrender?

la reazione, si aggiunsero 50 pi di 0,5 M EDTA, riscal? dando a 65?C per 10 minuti. I trifosfati non incorporati furono estratti per filtrazione su gelatina della miscela reagente su Sephadex G50.] the reaction, 50 µl of 0.5 M EDTA were added, heated? giving it at 65? C for 10 minutes. The unincorporated triphosphates were extracted by gelatin filtration of the reagent mixture on Sephadex G50.]

Dopo l'ibridazione, l'eccesso del campione di sondaggio fu estratto dai filtri nitrocellulosici mediante 5 lavaggi in 2 x SSC (pH 7,2) contenente 0,1% di After hybridization, the excess of the probing sample was extracted from the nitrocellulose filters by 5 washes in 2 x SSC (pH 7.2) containing 0.1% of

SDS a temperatura ambiente, seguiti da 3 lavaggi in SDS at room temperature, followed by 3 washes in

0,2 x SSC (pH 7,2) contenente 0,1% di SDS a 60?C, essendo ogni lavaggio protratto per 30 minuti. I filtri lavati furono poi essiccati all'aria ed utilizzati 0.2 x SSC (pH 7.2) containing 0.1% SDS at 60 ° C, each wash being continued for 30 minutes. The washed filters were then air dried and used

per esposizione di pellicola radiografica (Kodak x-omat R) a -70?C per 6-18 h, usando uno schermo Cronex Lightening Plus della Soc. du Pont per intensificare l'immagine. by exposure of X-ray film (Kodak x-omat R) at -70 ° C for 6-18 h, using a Soc. du Pont Cronex Lightening Plus screen to intensify the image.

Dopo l'esposizione e lo sviluppo, la pellicola radiografica serv? poi ad individuare le colonie contenenti i plasmidi pBR 322 ricombinanti del Barn HSV TK vaccinico. Le pellicole radiografiche furono collocate sui corrispondenti filtri nitrocellulosici di replica. Le colonie che risultarono positive furono poi raccolte dai filtri di replica per ulteriore analisi. After exposure and development, the radiographic film serves? then to identify the colonies containing the recombinant pBR 322 plasmids of the vaccine HSV TK Barn. The radiographic films were placed on the corresponding replica nitrocellulose filters. Colonies that tested positive were then collected by replication filters for further analysis.

Delle mille colonie all'incirca soggette a tale cernita, 65 risultarono tentativamente identificate per recare l?inserto Barn TK entro il plasmide pDP 3. Of the approximately one thousand colonies subjected to this sorting, 65 were found to be tentatively identified to carry the Barn TK insert within the pDP 3 plasmid.

Esempio VII - Analisi per restrizione dei plasmidi ricombinanti dotati del Barn HSV TK Example VII - Restriction analysis of recombinant plasmids endowed with Barn HSV TK

Ciascuna delle 65 colonie tentativamente identificate quali portatrici di plasmidi ricombinanti con l?inserto Barn HSV TK serv? ad inoculare colture di 2,0 ml di brodo LB contenente ampicillina alla ragione di 100 pg/ml. Le colture furono poi incubate a 37?C per una notte, prima di estrarne i plasmidi come gi? esposto all?esempio III. I plasmidi furono sciolti in 50 ?l d?acqua dopo la precipitazione all?isopropa? nolo. Each of the 65 colonies tentatively identified as carriers of recombinant plasmids with the Barn HSV TK insert served? to inoculate cultures of 2.0 ml of LB broth containing ampicillin at the rate of 100 pg / ml. The cultures were then incubated at 37 ° C for one night, before plasmids were extracted as already. shown in example III. The plasmids were dissolved in 50? L d? Water after precipitation to isopropa? freight.

Per accertare se i plasmidi contenessero un frammento 2,3 md Barn HSV TK intatto ed in quale sito Barn HI entro il pDF 3 fosse stato inserito il Barn HSV TK, furono miscelati 25 ?l di ciascun preparato plasmidico con 25 ?l di soluzione tampone 2 x Hind III, e fermentati a 37?C per 2 h con 1 unit? di Hind III. I risultanti frammenti furono poi analizzati per elettroforesi su una gelatina agarosica all'1%, come descritto in precedenza. To ascertain whether the plasmids contained an intact 2.3 md Barn HSV TK fragment and at which Barn HI site within the pDF 3 Barn HSV TK had been inserted, 25 µl of each plasmid preparation was mixed with 25 µl of buffer solution. 2 x Hind III, and fermented at 37? C for 2 h with 1 unit? by Hind III. The resulting fragments were then analyzed by electrophoresis on a 1% agarose gelatin, as described above.

Dei 65 preparati plasmidici cos? analizzati, 6 risultarono dotati dei frammenti Barn HSV TK inseriti al sito Barn HI nel tratto Hind III F vaccinico del plasmide, vale a dire, se ne derivarono frammenti di restrizione Hind III d'un peso molecolare pari al pBR 322 lineare (2,8 md) nonch? frammenti d'un peso molecolare superiore a quello dei frammenti Hind III F vaccinici (8,6 md). Of the 65 plasmid preparations so? analyzed, 6 resulted with the Barn HSV TK fragments inserted at the Barn HI site in the vaccine Hind III F tract of the plasmid, i.e., Hind III restriction fragments of a molecular weight equal to linear pBR 322 (2.8 md) as well as? fragments of a molecular weight higher than that of vaccine Hind III F fragments (8.6 md).

Questi 6 plasmidi furono soggetti ad ulteriore analisi con Sst I (un isoschizomero del Sac 1) per accertare il numero e l'orientamento dei frammenti These 6 plasmids were subjected to further analysis with Sst I (an isoschizomer of Sac 1) to ascertain the number and orientation of the fragments

Barn HSV TK inseriti nel frammento vaccinico Hind III F, poich? Sst I (Sac I) scinde sia il frammento Barn HSV TK che il frammento vaccinico Hind III F asimmetricamente.?Si effettuarono le analisi miscelando 25 pi del plasmide con 25 pi della soluzione tampone 2 x Sst [50 mM Tris?HC1 (pH 8,0), 10 mM di MgCl2, 100 mM di NaCl e 10 mM di DTT) e fermentandoli con 1 unit? di Sst I (Bethesda Research Laboratories) a 37?C per 2 h. I risultanti frammenti furono analizzati per elettroforesi su gelatine agarosiche all'1%. Dei sei plasmidi cos? analizzati, 5 risultarono dotati d'una coppia di frammenti Sst I aventi un peso molecolare di 10,1 md e 3,5 md, indicativo d'un solo inserto Barn HSV TK. Barn HSV TK inserted in the Hind III F vaccine fragment, since? Sst I (Sac I) cleaves both the Barn HSV TK fragment and the Hind III F vaccine fragment asymmetrically. The analyzes were performed by mixing 25 µl of the plasmid with 25 µl of the 2 x Sst [50 mM Tris? HC1 buffer solution (pH 8 , 0), 10 mM of MgCl2, 100 mM of NaCl and 10 mM of DTT) and fermenting them with 1 unit? of Sst I (Bethesda Research Laboratories) at 37 ° C for 2 h. The resulting fragments were analyzed by electrophoresis on 1% agarose jellies. Of the six plasmids cos? analyzed, 5 resulted equipped with a pair of Sst I fragments having a molecular weight of 10.1 md and 3.5 md, indicative of a single Barn HSV TK insert.

Uno di questi plasmidi fu scelto per ulteriori indagini sotto la designazione pDP 132. L'altro plasmide frutt? tre frammenti Sst I del peso molecolare di 10,8 md, 2,8 md e 2,3 md, indicativi di coppie in tandem di inserti Barn HSV TK orientati testa a coda e di orientamento opposto a quello del pDP 132.?Questo plasmide fu designato pDP 137.'La Figura 30 ? un diagramma dei plasmidi pDP 132 e pDP 137.' One of these plasmids was selected for further investigation under the designation pDP 132. The other plasmid fru? three Sst I fragments with molecular weights of 10.8 md, 2.8 md and 2.3 md, indicative of tandem pairs of HSV TK Barn inserts oriented head-to-tail and of opposite orientation to that of pDP 132. was designated pDP 137. 'Figure 30? a diagram of the plasmids pDP 132 and pDP 137. '

Esempio VIII - Isolamento d'una variante TK*?s del virus vaccinico Example VIII - Isolation of a TK *? S variant of the vaccine virus

Per isolare una variante TK~ S del virus vaccinico mutante, una popolazione virale fu soggetta ad elevata pressione selettiva per ottenere un mutante del genere coltivando il virus nelle cellule alla presenza del BUdR che ? letale agli organismi portatori del gene TK. Pi? specificatamente, strati confluenti monomolecolari di cellule TK? umane (linea 143) coltivate sul nutriente speciale di Eagle in capsule di Petn di 150 mm furono infetti con circa 3 x 10<3 >di unit? formanti le piastrine (pfu, per 'plaque forming units') della variante S del virus vaccinico per ciascuna capsula (un totale di 20), alla presenza di 20 ?g di BUdR/ml. (il nutriente speciale di Eagle ? un medium disponibile nel commercio per la coltivazione di quasi tutte le linee cellulari.?Alternativamente si possono utilizzare altri nutrienti quali Eagle*s Minimum Essential Medium, Basai Eagle*s Medium, Ham*s-F1Q, Medium 199, RPMI-1640 ecc.) La coltivazione viene effettuata a 37?C in un'atmosfera arricchita di CO2. Per maggior'convenienza, ci si pu? servire d'un incubaiore a C02 che eroga aria sufficientemente arricchita di CO2 per averne una concentrazione del 5% all'incirca. To isolate a TK ~ S variant of the mutant vaccine virus, a viral population was subjected to high selective pressure to obtain such a mutant by culturing the virus in cells in the presence of the BUdR which? lethal to organisms carrying the TK gene. Pi? specifically, confluent monolayers of TK cells? humans (line 143) grown on Eagle's special nutrient in 150 mm Petn capsules were infected with about 3 x 10 <3> of unit? forming platelets (pfu, for 'plaque forming units') of variant S of the vaccine virus for each capsule (a total of 20), in the presence of 20? g of BUdR / ml. (Eagle's special nutrient is a commercially available medium for growing almost all cell lines. Alternatively other nutrients such as Eagle * s Minimum Essential Medium, Basai Eagle * s Medium, Ham * s-F1Q, Medium can be used. 199, RPMI-1640 etc.) Cultivation is carried out at 37 ° C in a CO2 enriched atmosphere. For greater convenience, you can? serve as a C02 incubator that delivers air sufficiently enriched with CO2 to have a concentration of approximately 5%.

, Novantatre delle piastrine sviruppate furono isolate e ri-piastrinate su cellule umane TK (linea 143) nelle medesime condizioni gi? citate, sempre alla presenza di 20 ?g di BUdR/ml/ Un certo numero (5) di piastrine grandi e ben isolate fu prescelto per ulteriore analisi/ Ninety-three of the developed platelets were isolated and re-plateleted on human TK cells (line 143) under the same conditions already. mentioned, again in the presence of 20? g of BUdR / ml / A certain number (5) of large and well isolated platelets were selected for further analysis /

Le cinque piastrine isolate furono saggiate per crescita su strati cellulari monomolecolari nelle medesime condizioni usate in precedenza, con o senza 20 ?g di BUdR/ml. Si prese nota della relativa crescita di ciascuna piastrina con o senza il BUdR che fu paragonata alla crescita relativa in simili colture cellulari su strati monomolecolari dalla variante S del virus progenitore. Si ottennero i risultati esposti qui di seguito: The five isolated platelets were assayed for growth on monomolecular cell layers under the same conditions as previously used, with or without 20 µg BUdR / ml. The relative growth of each platelet with or without the BUdR was noted which was compared to the relative growth in similar cell cultures on monolayers by the S variant of the parent virus. The following results were obtained:

La crescita del materiale isolato dalla piastrina N. 79 fu esaminato ulteriormente alla pres?nza di 0, The growth of the material isolated from plate No. 79 was further examined at the presence of 0,

20 e 40 pg di BUdR/ml e paragonato alla crescita della variante S del virus progenitore. Si ottennero i seguenti risultati: 20 and 40 µg BUdR / ml and compared to the growth of the S variant of the parent virus. The following results were obtained:

Inoltre i predetti cinque isolati piastrinici e In addition, the aforementioned five platelet isolates e

la variante S del virus progenitore furono controllati in quanto alla crescita su cellule umane TK<- >(linea 143) in presenza di MTAGG che ? un nutriente speciale di Eagle, modificato per la presenza di: the S variant of the parent virus were controlled for growth on human TK <-> cells (line 143) in the presence of MTAGG that? a special nutrient from Eagle, modified for the presence of:

(vedi Davis e coll.', op.:cit.) che possiede azione elettiva per la timidina chinasi e contro gli organismi privi del gene di timidina chinasi.?Il saggio port? ai seguenti risultati: (see Davis et al. ', op.:cit.) which has elective action for thymidine kinase and against organisms lacking the thymidine kinase gene. to the following results:

Dei tre materiali isolati dalle piastrine che manifestavano inibizione completa della crescita in presenza di MTAGG, l'isolato N. 79 fu scelto arbitrariamente e si approntarono estratti delle cellule infette con il virus N.?79 per confrontarli con gli estratti approntati da cellule non infette nonch? da quelle infette dalla variante s del virus progenitore, per saggiarne la capacit? di fosforilare la timidina al tritio ( H).?La tabella seguente riassume i risultati: a Of the three materials isolated from platelets that exhibited complete inhibition of growth in the presence of MTAGG, isolate No. 79 was chosen arbitrarily and extracts from cells infected with virus No.? 79 were prepared to compare with extracts from uninfected cells. as well? from those infected with the s variant of the parent virus, to test its capacity? to phosphorylate thymidine to tritium (H). The following table summarizes the results: a

Stando ai seguenti fattori, (1) resistenza al According to the following factors, (1) resistance to

BUdR, (2) inibizione di sviluppo su un terreno contenente il MTAGG,,e (3) mancanza di fosforilazione d?una certa entit? della timidina negli estratti cellulari infetti, si presume che il materiale isolato della piastrina N/ 79 manca di attivit? di timidina chinasi.? BUdR, (2) growth inhibition on a medium containing MTAGG, and (3) lack of phosphorylation of some magnitude. of thymidine in infected cell extracts, it is assumed that the isolated N / 79 platelet material lacks activity. of thymidine kinase.

Il materiale isolato porta la designazione VTK 79. The insulated material carries the designation VTK 79.

Esempio IX - Recupero di marcatura della variante L Example IX - Marking recovery of variant L

del DNA vaccinico mediante la variante S of vaccine DNA by the S variant

Per le indagini sul recupero di marcatura furono approntati quattro preparati della variante L del DNA.? Four preparations of the DNA variant L were prepared for the investigation of the labeling recovery.

Il primo consisteva della variante L purificata ed The first consisted of the purified L variant and

intatta del DNA vaccinico. Il secondo preparato era intact vaccine DNA. The second preparation was

una variante L del DNA vaccinico fermentata con Bst an L variant of vaccine DNA fermented with Bst

E II, una endonucleasi di restrizione generante un E II, a restriction endonuclease generating a

frammento DNA donatore, il frammento C, completo di donor DNA fragment, fragment C, complete with

quel DNA che manca nella variante S ma ? proprio della variante L, essendo per di pi? corredato alle due that DNA that is missing in the S variant but? just the variant L, being for more? accompanied at two o'clock

estremit? della catena DNA d?una regione del DNA omolo extremity of the DNA chain gives a region of the homol DNA

go alla corrispond?nte sequenza nella variante S. Il preparato N/ 3 e N. 4, rispettivamente, consistevano della variante L del DNA fermentata con Ava I e Hind III, che sono endonucleasi di restrizione atte a scindere il genoma vaccinico entro la sequenza DNA caratteristica della variante L. Le indagini sul recupero di marcatura eseguite con 'i quattro preparati in parola dimostrano che i frammenti della variante L del DNA corredati della regione di delezione che invece manca nella variante S possono essere reintrodotti nella variante S mediante una tecnica di ricombinazione in vivo, purch? il frammento contenga oltre alla regione di delezione anche le regioni terminali omologhe alla corrispondente sequenza nella variante S.-Per una comprensione migliore dei frammenti impiegati in queste indagini si fa riferimento alle figure 6 A?C, essendo mappe di restrizione d'un tratto del terminale sinistro del genoma vaccinico. In particolare, ciascuna mappa si riferisce alla regione terminale sinistra del genoma comprendente circa 60 kilobasi accoppiate, come illustrato nella figura. Quel tratto del genoma vaccinico che risulta soppresso nella variante S viene rappresentato in ogni mappa come la regione tra le linee tratteggiate nelle figure, pari in lunghezza a circa 10 kilobasi accopp ate. to the corresponding sequence in variant S. Preparation N / 3 and No. 4, respectively, consisted of DNA variant L fermented with Ava I and Hind III, which are restriction endonucleases capable of cleaving the vaccine genome within the sequence DNA characteristic of the L variant. The investigations on the recovery of labeling carried out with the four preparations in question show that the fragments of the L variant of the DNA accompanied by the deletion region that is missing in the S variant can be reintroduced in the S variant by means of a technique of in vivo recombination, provided? the fragment contains in addition to the deletion region also the terminal regions homologous to the corresponding sequence in the variant S. - For a better understanding of the fragments used in these investigations, reference is made to figures 6 A? C, since they are suddenly restriction maps of the left terminal of the vaccine genome. In particular, each map refers to the left end region of the genome comprising about 60 paired kilobases, as shown in the figure. That section of the vaccine genome which is suppressed in the S variant is represented in each map as the region between the dashed lines in the figures, equal in length to about 10 coupled kilobases.

Con riferimento particolare alla figura 6AP ? manifesto che il frammento H ricavato dalla fermentazione con Ava I ? completamente situato entro la regione di delezione, per? manca di frammenti DNA terminali omologhi al DNA della variante S per il motivo che i siti di scissione Ava I sono situati per intero entro la regione soppressa nella variante S. With particular reference to figure 6AP? manifest that the fragment H obtained from fermentation with Ava I? completely located within the region of deletion, for? lacks terminal DNA fragments homologous to variant S DNA due to the fact that the Ava I cleavage sites are located entirely within the suppressed region in variant S.

La mappa di restrizione illustrata nella figura 6B relativa al Hind III mostra che anche questo enzima di restrizione non riesce a produrre il frammento DNA della variante L omologa alla regione soppressa nella variante S. In questo caso, le sequenze omologhe alla variante S si trovano al terminale sinistro del frammento C del Hind III. Tuttavia, il sito di restrizione al terminale destro del frammento C ? situato entro la regione di delezione, mancando invece una sequenza terminale omologa alla sequenza DNA della variante S.?-Al contrario, la mappa di restrizione illustrata nella figura 6C corrispondente al Bst E II indica che la fermentazione con questo enzima produce un frammento, il frammento C, completo della regione di delezione che invece manca nella variante S, e corredato pure di tratti terminali all'estremit? destra e quella sinistra, che sono omologhe al tratto corrispondente della variante S.? The restriction map shown in Figure 6B relative to Hind III shows that this restriction enzyme also fails to produce the DNA fragment of the L variant homologous to the suppressed region in the S variant. In this case, the sequences homologous to the S variant are found at the left terminal of the C fragment of the Hind III. However, the restriction site at the right terminal of the C fragment? located within the deletion region, lacking instead a terminal sequence homologous to the DNA sequence of the S variant. fragment C, complete with the region of deletion which is missing in the variant S, and also equipped with terminal sections at the end? right and left, which are homologous to the corresponding section of the variant S.?

Secondo quanto discusso appresso, i risultati di queste indagini dimostrano che il DNA presente nella variante L ma soppresso nella variante S pu? essere recuperato dalla variante S con un elevato grado di efficienza dal genoma intatto della variante L e con minor efficienza dal frammento C del Bst E II; ' invece, non pu? essere recuperato dai frammenti DNA della variante L preparati con le endonucleasi di restrizione Ava I e Hind III. As discussed below, the results of these investigations show that the DNA present in the L variant but suppressed in the S variant can? be recovered from variant S with a high degree of efficiency from the intact genome of variant L and with less efficiency from the C fragment of Bst E II; 'instead, can not? be recovered from the L variant DNA fragments prepared with the restriction endonucleases Ava I and Hind III.

L'elevato grado di efficienza con cui la sequenza soppressa viene recuperata dalla variante L intatta si pu? attribuire al fatto che basta un solo interscambio (crossover) tra la variante L intatta e quella S per produrre un genoma del tipo variante L. D'altro canto, per recuperare il tratto soppresso dal frammento .C del Bst E II, si rende necessario un interscambio tra il frammento e la variante S nel tratto terminale sia sinistro che destro del frammento C, al fine di incorporare la regione di delezione nella variante S. In ultimo, poich? n? la fermentazione con Ava I n? la fermentazione con Hind III pu? produrre frammenti DNA capaci di incorporazione nella variante S tramite qualsiasi interscambio, non si verifica alcun recupero del tratto soppresso. The high degree of efficiency with which the suppressed sequence is recovered from the intact variant L can? attributing to the fact that only one interchange (crossover) between the intact L variant and the S variant is enough to produce a genome of the variant type L. On the other hand, to recover the trait suppressed by the .C fragment of the Bst E II, it is necessary an interchange between the fragment and the variant S in both the left and right terminal tract of the fragment C, in order to incorporate the deletion region in the variant S. Finally, since? n? fermentation with Ava I n? fermentation with Hind III pu? producing DNA fragments capable of incorporation into the S variant via any interchange, no recovery of the suppressed trait occurs.

Il recupero di marcatura fu eseguito su strati monomolecolari CV-1 utilizzando la tecnica del fosfato di calcio esposta da Graham e coll., Virology 52:456-467, 1973 nella modifica di Stow e coll, e Wigler e coll., gi? citati in precedenza. A tale scopo, strati monomolecolari confluenti di CV-1 furono infetti di virus vaccinico variante S per creare circa 50 - 200 piastrine in un numero (5-20) di capsule Petri del diametro di 6 cm. Per infettare le cellule, il nutriente (ad esempio il terreno speciale Eagle contenente siero vitellino 10%) viene aspirato ed una diluizione del virus contenente 50-200 pfu/0,2 mi in un nutriente compatibile con la cellula, ad esempio Eagle's Special con siero vitellino al 2%, viene applicata allo strato monomolecolare della cellula. Marking recovery was performed on CV-1 monolayers using the calcium phosphate technique expounded by Graham et al., Virology 52: 456-467, 1973 in the modification by Stow et al, and Wigler et al., Already? mentioned above. For this purpose, confluent monolayers of CV-1 were infected with variant vaccine virus S to create approximately 50 - 200 platelets in a number (5-20) of 6 cm diameter Petri dishes. To infect the cells, the nutrient (e.g. Eagle special medium containing 10% calf serum) is aspirated and a virus dilution containing 50-200 pfu / 0.2 ml in a cell compatible nutrient, e.g. Eagle's Special with 2% calf serum, is applied to the monolayer of the cell.

Dopo un periodo d'incubazione d'un'ora a 37?C in un incubatore a C02 per consentire alle cellule di assorbire il virus, diversi preparati della variante L del DNA, tra i quattro menzionati in precedenza, furono separatamente aggiunti agli strati monomolecolari sotto forma d'un precipitato di fosfato calcico contenente per ogni capsula un microgramma del preparato della variante L del DNA. Dopo 40 minuti si aggiunse il nutriente speciale di Eagle con siero vitellino al 10% e a quattro ore di distanza dall'aggiunta iniziale del DNA, lo strato cellulare monomolecolare fu esposto ad 1 ml di sulfossido dimetilico tamponato al 25% per quattro minuti. La soluzione tampone contiene 8 g di NaCl, 0,37 g di KC1, 0,125 g di Na2HP0 .2H20, 1 g di destrosio e 5 g di N-(2-idrossietil) piperazina, N'-(2-acido etanosulfonico) (Hepes) per litro, con un livello pH finale di 7,05. Si estrasse il sulfossido dimetilico e gli strati monomolecolari furono lavati e sormontati da uno?strato di nutriente all'agar. Dopo tre giorni in un incubatore al CO2 alla temperatura di 37?C, le cellule furono colorate con uno strato di nutriente all?agar contenente un colorante rosso neutro idoneo a colorare le cellule non infette (il nutriente all?agar = nutriente speciale di Eagle contenente siero vitellino al 10% ed agar 1%). L'indomani si tolse lo strato di agar e si trasferirono gli strati monomolecolari ai filtri nitrocellulosici,ove furono preparati per ibridazione in situ secondo il metodo di Villarreal e coll., loc. cit. Poich? la fermentazione del genoma della variante L con Ava I genera un frammento di 6,8 kilobasi accoppiate, il frammento H che risiede per intero entro la singolare sequenza DNA soppressa nel genoma della variante S (vedi figura 6A), il frammento Ava I H marcato al <32>P e traslato per incisione fornisce una sonda altamente specifica per individuare il recupero della .singolare sequenza DNA della -variante L da parte di quella S. After a one-hour incubation period at 37 ° C in a CO2 incubator to allow the cells to absorb the virus, several preparations of the L variant of DNA, among the four mentioned above, were separately added to the monolayers. in the form of a precipitate of calcium phosphate containing for each capsule a microgram of the preparation of the L variant of the DNA. After 40 minutes Eagle's special nutrient with 10% calf serum was added and four hours after the initial DNA addition, the monolayer cell layer was exposed to 1 ml of 25% buffered dimethyl sulfoxide for four minutes. The buffer solution contains 8 g of NaCl, 0.37 g of KC1, 0.125 g of Na2HP0 .2H20, 1 g of dextrose and 5 g of N- (2-hydroxyethyl) piperazine, N '- (2-ethanosulfonic acid) ( Hepes) per liter, with a final pH level of 7.05. The dimethyl sulfoxide was extracted and the monolayers were washed and topped with an agar nutrient layer. After three days in a CO2 incubator at 37 ° C, the cells were stained with an agar nutrient layer containing a neutral red dye suitable for staining uninfected cells (the agar nutrient = Eagle's special nutrient containing 10% yolk serum and 1% agar). The next day the agar layer was removed and the monomolecular layers were transferred to nitrocellulose filters, where they were prepared by in situ hybridization according to the method of Villarreal et al., Loc. cit. Since? fermentation of the L variant genome with Ava I generates a paired fragment of 6.8 kilobases, the H fragment residing entirely within the singular suppressed DNA sequence in the S variant genome (see Figure 6A), the Ava I H fragment labeled at <32> P and translated by incision provides a highly specific probe to detect recovery of the single DNA sequence of the -variant L by that of S.

Per l'ibridazione i filtri nitrocellulosici furono posti fra cerchietti ritagliati di carta filtrante Whatman N.1 in capsule Petri del diametro di 6 cm e pre-ibridati per 6 h a 60?C in una soluzione tampone di preibridazione (SSC, soluzione di Denhardt, EDTA e S.S.DNA), come gi? descritto in precedenza nell'esempio VI. La sonda radioattiva costituita dal frammento Ava I H della variante L, marcato al <32>Pe traslato per incisione, avente un'attivit? specifica pari a circa 1 x 10<8 >cpm/pg fu impiegata per l'ibridazione in 2 x SSC, 1 x Denhardt, 1 mM EDTA, 0,1% 3DS, 10% di solfato di dextran e 50 yig/ml di S.S.DNA trattato ad onde sonore, per una notte a circa 1 x 10 cpm/ml a 60?C. La sonda radioattiva fu preparata secondo il metodo di Rigby e coll., J. Mol. Biol. 113:237-251,1977. I filtri furono lavati ripetutamente a temperatura ambiente ed a 60?c utilizzando il procedimento di lavaggio descritto all'esempio VI, poi essiccati all'aria e radioautografati. For hybridization the nitrocellulose filters were placed between cut-out circles of Whatman No.1 filter paper in Petri dishes with a diameter of 6 cm and pre-hybridized for 6 h at 60 ° C in a pre-hybridization buffer solution (SSC, Denhardt's solution, EDTA and S.S.DNA), as already? previously described in Example VI. The radioactive probe constituted by the Ava I H fragment of the variant L, marked at <32> Pe translated by incision, having an activity? specification of approximately 1 x 10 <8> cpm / pg was used for hybridization in 2 x SSC, 1 x Denhardt, 1 mM EDTA, 0.1% 3DS, 10% dextran sulfate and 50 yig / ml of S.S.DNA treated with sound waves, overnight at approximately 1 x 10 cpm / ml at 60 ° C. The radioactive probe was prepared according to the method of Rigby et al., J. Mol. Biol. 113: 237-251.1977. The filters were repeatedly washed at room temperature and 60 ° C using the washing procedure described in Example VI, then air dried and radio-autographed.

I risultati di queste prove sono riassunti nella seguente Tabella I. The results of these tests are summarized in the following Table I.

Per ciascun preparato donatore di DNA furono analizzate non meno di 5.000 piastrine. No less than 5,000 platelets were analyzed for each DNA donor preparation.

Esempio X - Ricombinazione in vivo utilizzando il pDP 132 ed il pDP 137 per generare i mutanti del virus vaccinico VP?1 sino al VP-6 e la relativa identificazione Example X - In vivo recombination using pDP 132 and pDP 137 to generate mutants of the vaccine virus VP? 1 up to VP-6 and the relative identification

con l'ausilio di filtri di replica with the help of replication filters

Un primo precipitato di ortofosfato calcico del A first precipitate of calcium orthophosphate of

DNA donatore fu approntato combinando 5 pg di DNA fermentato con pDP 132 Hind III in 50 pi d'acqua, 4 pg Donor DNA was prepared by combining 5µg of DNA fermented with pDP 132 Hind III in 50µl of water, 4µg

del DNA portatore di variante S (preparato secondo l'esempio I) in 40 pi d'acqua e 10 pi di 2,5 M CaCl2, combinando la risultante miscela con pari volume di of the S variant carrier DNA (prepared according to Example I) in 40 µl of water and 10 µl of 2.5 M CaCl2, combining the resulting mixture with an equal volume of

2 x tampone fosfatico di Hepes comprendente 280 mM di NaCl, 50 mM di Hepes e 1,5 mM di fosfato sodico (pH 7,1) e lasciando il precipitato a formarsi per un periodo di 30 minuti a temperatura ambiente. Un secon 2 x Hepes phosphate buffer comprising 280 mM NaCl, 50 mM Hepes and 1.5 mM sodium phosphate (pH 7.1) and leaving the precipitate to form for a period of 30 minutes at room temperature. A secon

do precipitato fu approntato nella stessa modalit? e con identici quantitativi, salvo che il DNA fu quello fermentato con pDP 137 Hind'III, do precipitate was prepared in the same way? and with identical quantities, except that the DNA was that fermented with pDP 137 Hind'III,

(Secondo la descrizione pi? dettagliata di Stow e coll. loc. cit. e wigler e coll., loc. cit. le modifiche della tecnica di precipitazione di Graham e coll, citate in precedenza si valgono del DNA portatore quale composto ad elevato peso molecolare per incrementare l'efficienza della formazione del precipitato dell 'ortofosfato di calcio. Il DNA portatore che viene impiegato ? quello proveniente dal virus usato per infettare le cellule dello strato monomolecolare secondo la tecnica di ricombinazione in vivo.) (According to the more detailed description by Stow and coll. Loc.cit. And Wigler and coll., Loc.cit., The modifications of the Graham et al. Precipitation technique, cited above, use carrier DNA as a high weight compound molecular to increase the efficiency of the precipitate formation of calcium orthophosphate. The carrier DNA that is used is that coming from the virus used to infect the cells of the monolayer according to the in vivo recombination technique.)

Ai fini della ricombinazione in vivo, strati confluenti monomolecolari di CV-1 coltivato sul nutriente speciale di Eagle contenente il siero vitellino al 10% furono infetti con la variante S del virus vaccinico ad un titolo infettivo d'un multiplo di 1 pfu/cellula. Il procedimento infettivo ? analogo a quello dell'esempio IX. Il virus fu lasciato ad assorbirsi per 60 minuti a 37?C in un incubatore al CO2, dopo di che si aspir? il materiale d'inoculazione e si lav? lo.strato cellulare monomolecolare. I preparati del DNA precipitato furono applicati su strati cellulari separati e dopo 40 minuti in un incubatore C02 a 37?0, si sovrimpose uno strato di nutriente liquido, cio? il medium speciale di Eagle contenente siero vitelli? no al 10%. In ogni caso, il virus fu raccolto dopo 24 ore a 37?C nell'incubaiore a CO2 mediante tre cicli di congelamento/disgelamento , e tritato su strati CV-1 monomolecolari. Furono saggiate circa 15.000 piastrine su strati monomolecolari CV-1 per individuare il virus di ricombinazione utilizzando filtri di replica approntati come descritto in seguito. For in vivo recombination purposes, confluent monolayers of CV-1 cultured on Eagle's special nutrient containing 10% calf serum were infected with the S variant of the vaccine virus at an infectious titer of a multiple of 1 pfu / cell. The infectious process? analogous to that of Example IX. The virus was allowed to absorb for 60 minutes at 37 ° C in a CO2 incubator, after which it was aspirated. the inoculation material and lav? the monomolecular cell layer. The precipitated DNA preparations were applied on separate cell layers and after 40 minutes in a C02 incubator at 37? Eagle's special medium containing calf serum? up to 10%. In each case, the virus was collected after 24 hours at 37 ° C in the CO2 incubator by three freeze / thaw cycles, and minced on monomolecular CV-1 layers. Approximately 15,000 platelets on CV-1 monolayers were tested for recombination virus using replication filters prepared as described below.

Le piastrine formate su strati confluenti monomolecolari di CV-1 sotto lo strato del nutriente all'agar furono trasferite su filtri nitrocellulosici, togliendo delicatamente lo strato su^erimposto di agar con un bisturi e ponendo i filtri nitrocellulosici sullo strato monomolecolare. Per stabilire un contatto adeguato tra il filtro e lo strato monomolecolare si collocarono fogli di carta filtrante Whatman N. 3, inumiditi con 50 mM di tampone Tris (pH 7,4) e 0,015 mM NaCl, sopra il filtro di nitrocellulosa pestandoli con un tappo di gomma sino a che lo strato monomolecolare trasferito sulla nitrocellulosa non mostrasse un colore uniforme intorno a zone distinte non colorate sulle piastrine. (Lo strato monomolecolare venne in precedenza colorato con rosso neutro che viene assorbito dalle cellule vitali, cio? quelle che non hanno subito la lisi dovuta all'infezione virale). Platelets formed on confluent monolayers of CV-1 beneath the agar nutrient layer were transferred to nitrocellulose filters, gently removing the superimposed agar layer with a scalpel and placing the nitrocellulose filters on the monolayer. To establish adequate contact between the filter and the monolayer, sheets of Whatman No. 3 filter paper, moistened with 50 mM of Tris buffer (pH 7.4) and 0.015 mM NaCl, were placed on top of the nitrocellulose filter and pounded with a cap. of rubber until the monomolecular layer transferred onto the nitrocellulose showed a uniform color around distinct non-colored areas on the platelets. (The monomolecular layer was previously stained with neutral red which is absorbed by viable cells, ie those that have not undergone lysis due to viral infection).

Il filtro nitrocellulosico recante lo strato monomolecolare di trasferimento viene ora tolto dalla capsula di Petri e collocato con il lato monomolecolare volto in su. Un altro filtro nitrocellulosico inumidito nella citata soluzione Tris-NaCl viene ora sistemato direttamente sul primo filtro ed i due vengono posti fermamente a contatto, pestandoli con un tappo di gomma, avendo preventivamente protetto i filtri con un cerchio ritagliato di carta Whatman N. 3?. Tolta la carta filtrante, i filtri di nitrocellulosa vengono intaccati per orientamento e poi separati. A questo punto il secondo filtro nitrocellulosico (la replica) contiene un'immagine speculare dello strato cellulare monomolecolare trasferito sul primo filtro di nitrocellulosa. Per convenienza, il secondo filtro viene posto in una capsula Petri pulita e viene congelato. Il primo filtro viene ibridato utilizzando a titolo di sonda il frammento Barn HSV TK marcato al <32>.P La preparazione della sonda e la tecnica d'ibridazione sono state descritte nell'esempio VI. The nitrocellulose filter bearing the transfer monolayer is now removed from the Petri dish and placed with the monolayer side up. Another nitrocellulose filter moistened in the aforementioned Tris-NaCl solution is now placed directly on the first filter and the two are firmly placed in contact, stamping them with a rubber stopper, having previously protected the filters with a circle cut out of Whatman No. 3 paper? . Once the filter paper is removed, the nitrocellulose filters are notched by orientation and then separated. At this point the second nitrocellulose filter (the replica) contains a mirror image of the monomolecular cell layer transferred to the first nitrocellulose filter. For convenience, the second filter is placed in a clean Petri dish and frozen. The first filter is hybridized using the <32> .P-labeled HSV TK Barn fragment as a probe. The preparation of the probe and the hybridization technique were described in Example VI.

Circa 0,5% delle piastrine saggiate per ibridazione risultarono positive, vale a dire si trattava del virus ricombinante corredato del gene Barn HSV TK. Approximately 0.5% of the platelets tested for hybridization were positive, ie they were the recombinant virus with the Barn HSV TK gene.

Le piastrine di virus ricombinante corrispondenti a quelle identificate nei primi filtri di nitrocellulosa per mezzo dell'ibridazione furono poi isolati The recombinant virus platelets corresponding to those identified in the first nitrocellulose filters by means of hybridization were then isolated.

dai filtri nitrocellulosici di replica con la seguente tecnica, ai fini di ulteriore purificazione. from replication nitrocellulose filters with the following technique, for the purpose of further purification.

Utilizzando un trapano di sughero avente un diametro leggermente pi? grande della piastrina da prelevarsi, la piastrina prescelta viene punzonata dal Using a cork drill having a slightly larger diameter of the plate to be picked up, the selected plate is punched from

primo filtro nitrocellulosico, quello originale usato per l'identificazione dei virus ricombinanti mediante ibridazione. Il risultante filtro perforato viene poi usato come mascherino per individuare ed isolare la piastrina corrispondente sul filtro di replica. Precisamente, il filtro di replica viene collocato con il first nitrocellulose filter, the original one used for the identification of recombinant viruses by hybridization. The resulting perforated filter is then used as a matte to locate and isolate the corresponding chip on the replication filter. Precisely, the replication filter is placed with the

lato monomolecolare volto in su, sopra una superficie sterile, e coperto con un foglio di plastica Saran. monomolecular side facing up, over a sterile surface, and covered with a Saran plastic sheet.

Il primo od originale filtro perforato viene ora collocato con il rispettivo strato monomolecolare volto The first or original perforated filter is now placed with the respective monolayer facing

in gi?, sopra il secondo filtro, e le tacche di orientamento segnate sui filtri vengono allineate per far coincidere le immagini speculari sulle piastrine. above the second filter, and the orientation notches marked on the filters are aligned to match the mirror images on the plates.

Usando sempre il trapano di sughero, si leva un tappo dal filtro di replica, si toglie il foglio protettivo di Saran e si pone in 1 ml di nutriente speciale di Always using the cork drill, a cap is removed from the replica filter, the protective sheet of Saran is removed and placed in 1 ml of special nutrient of

Eagle contenente siero vitellino al 2%. Il tappo nitrocellulosico viene trattato in questo medium con onde sonore per 30 secondi sul.ghiaccio per liberarne il virus. Eagle containing 2% calf serum. The nitrocellulose cap is treated in this medium with sound waves for 30 seconds on ice to release the virus.

0,2 ml di questo preparato virale e 0,2 ml di una diluizione 1:10 del preparato stesso vengono applicati sugli strati monomolecolari CV-1 nelle capsule Petri di 6 cm di diametro. 0.2 ml of this viral preparation and 0.2 ml of a 1:10 dilution of the preparation itself are applied on the monolayers CV-1 in the 6 cm diameter Petri dishes.

A titolo di purificazione della piastrina, fu poi ripetuta l'intera sequenza della preparazione del primo filtro nitrocellulosico, del filtro di replica, l'ibridazione e l'isolamento della piastrina dal filtro di replica. By way of purification of the platelet, the entire sequence of preparation of the first nitrocellulose filter, replication filter, hybridization and isolation of the platelet from the replication filter was then repeated.

Un campione della piastrina purificata approntato in questa maniera da un precipitato dOrtofosfato di calcio del DNA fermentato con pDP 132 Hind III fu denominato il virus vaccinico VP-1. Per analogia, ima piastrina contenente il virus ricombinante preparato dal DNA fermentato con PDF-137 Hind III fu denominata VP?2.?Ambedue i campioni furono coltivati su opportuni terreni cellulari per ulteriore indagine, compresa la identificazione mediante analisi di restrizione e altre tecniche.? A sample of the purified platelet prepared in this manner from a calcium d orthophosphate precipitate of DNA fermented with Hind III pDP 132 was termed the vaccine virus VP-1. By analogy, a platelet containing the recombinant virus prepared from DNA fermented with PDF-137 Hind III was named VP2. Both samples were cultured on suitable cell media for further investigation, including identification by restriction analysis and other techniques. ?

In maniera analoga furono approntati altri due mutanti vaccinici, denominati rispettivamente VP-3 e VP-4, per ricombinazione in vivo servendosi del VTK~79 (una variante S del virus vaccinico TK gi? descritto nell'esempio Vili) quale virus di recupero e del pDP 132 e PDP 137, rispettivamente, quale DNA donatore di pia? smidi. I precipitati furono formati come gi? descritto in precedenza, salvo che 5 pg del DNA donatore di plasmidi contenuto in 50 pi d'acqua, 4 pg di DNA portatore di VTK~79 in 150 pi d'acqua e 50 ?l di 2,5 M CaC12 furono combinati ed aggiunti goccia a goccia ad un?pari volume di 250 ?? del tampone fosfatico Hepes descritto in precedenza. Similarly, two other vaccine mutants were prepared, respectively named VP-3 and VP-4, by in vivo recombination using VTK ~ 79 (an S variant of the TK vaccine virus already described in Example VIII) as recovery virus and of pDP 132 and PDP 137, respectively, which pia donor DNA? smidi. The precipitates were formed as already? described above, except that 5 µg of plasmid donor DNA contained in 50 µl of water, 4 µg of VTK carrier DNA ~ 79 in 150 µl of water and 50 µl of 2.5 M CaC12 were combined and added drop by drop to an? equal volume of 250 ?? of the Hepes phosphate buffer described above.

Inoltre, le cellule prescelte per l'infezione da parte del portatore virale VTK-79 furono quelle BHK-21 (Clone 13) invece di CV-1. Furthermore, the cells chosen for infection by the viral carrier VTK-79 were those BHK-21 (Clone 13) instead of CV-1.

Altri due mutanti del virus vaccinico denominati VP-5 e VP-6 furono approntati utilizzando precipitati ortofosfatici di calcio del pDP 132 e pDP 137, rispettivamente, preparati analogamente ai mutanti VP-3 e VP-4. Tuttavia, nel caso dei mutanti VP-5 e VP-6, il DNA portatore fu il virus vaccinico VTK~11 anzich? VTK 79. Two other vaccine virus mutants named VP-5 and VP-6 were prepared using calcium orthophosphatic precipitates of pDP 132 and pDP 137, respectively, prepared similarly to mutants VP-3 and VP-4. However, in the case of the VP-5 and VP-6 mutants, the carrier DNA was the VTK ~ 11 vaccine virus instead of the VP-5 and VP-6 mutants. VTK 79.

Anche qui, gli strati monomolecolari infetti furono quelli delle cellule BHK-21 (C-13), mentre il virus di recupero fu il VTK~11 in questo caso. Here too, the infected monolayers were those of BHK-21 (C-13) cells, while the recovery virus was VTK ~ 11 in this case.

Esempio XI - Espressione del HSV TK mediante il mutante vaccinico VP?2 -e l'uso dell'IDC?* per la relativa identificazione Example XI - Expression of HSV TK by the vaccine mutant VP? 2 - and the use of IDC? * For its identification

Il prodotto virale ottenuto nell'esempio X mediante la ricombinazione in vivo della variante s del virus vaccinico- ed il precipitato ortofosfatico di calcio del DNA fermentato con pDP-137 Hind III fu spalmato su strati confluenti monomolecolari di cellule CV-1 presenti in circa venti capsule Petri di 6 cm, ad una concentrazione sufficiente a formare circa 150 piastrine per ogni capsula. Le piastrine furono coperte con un nutriente liquido, ad esempio il medium speciale di?Eagle contenente siero vitellino al 10%. Dopo 24 fino a 48 ore d'incubazione a 37?C in un incubatore a CO2, il nutriente liquido di copertura fu tolto dalle capsule e sostituito in ogni caso da 1,5 mi dello stesso medium liquido di copertura contenente 1?10 ?Ci di iododesossicitidina marcata allo <125>I (IDC ). Le lastre furono poi incubate per una notte a 37?C in un'atmosfera ricca di C02, dopo di che lo strato cellulare monomolecolare fu colorato con l?aggiunta del rosso neutro per visualizzare le piastrine per contrasto. The viral product obtained in Example X by the in vivo recombination of the variant s of the vaccine virus and the calcium orthophosphatic precipitate of the DNA fermented with pDP-137 Hind III was spread on confluent monomolecular layers of CV-1 cells present in about twenty Petri dishes of 6 cm, at a concentration sufficient to form approximately 150 platelets per capsule. The platelets were covered with a liquid nutrient, for example? Eagle's special medium containing 10% calf serum. After 24 to 48 hours of incubation at 37 ° C in a CO2 incubator, the liquid cover nutrient was removed from the capsules and replaced in each case by 1.5 ml of the same liquid cover medium containing 1? 10? Ci <125> I labeled iododeoxycytidine (IDC). The plates were then incubated overnight at 37 ° C in a C02-rich atmosphere, after which the monomolecular cell layer was stained with the addition of neutral red to visualize the platelets by contrast.

A questo punto si tolse il nutriente per aspirazione, gli strati monomolecolari si lavarono tre volte con una soluzione salina tamponata al fosfato, e lo strato monomolecolare delle cellule su ogni?lastra venne impresso su un corrispondente filtro di nitrocellulosa. Quest'ultim? fu poi esposto a pellicola roentgen per 1 sino a 3'giorni, e quindi sviluppato. At this point the nutrient was removed by aspiration, the monomolecular layers were washed three times with a phosphate buffered saline solution, and the monomolecular layer of the cells on each plate was imprinted on a corresponding nitrocellulose filter. The latter? it was then exposed to roentgen film for 1 to 3 days, and then developed.

- ---Quelle piastrine virali.che contengono ed esprimono il gene HSV TK sono capaci di fosforilare l'IDC ed incorporarlo nel proprio DNA, rendendo quest'ultimo insolubile. Il residuo di IDC* non fosforilato e non incorporato fu tolto per lavaggio, sicch? le piastrine che opacizzano la pellicola radiografica sono quelle atte ad esprimere il gene ricombinante HSV TK. N? le cellule CV-i n? il virus vaccinico, per quanto dotato di TK, sono capaci di fosforilare ed incorporare l'IDC* nel modo elettivo caratteristica del gene HSV TK. - --- Those viral platelets which contain and express the HSV TK gene are capable of phosphorylating the IDC and incorporating it into their DNA, making the latter insoluble. The non-phosphorylated and non-incorporated IDC * residue was washed off, so the platelets that opacify the radiographic film are those capable of expressing the recombinant HSV TK gene. N? the CV-i n cells? the vaccine virus, although endowed with TK, are capable of phosphorylating and incorporating IDC * in the elective mode characteristic of the HSV TK gene.

Dopo 1'identificazione dell'organismo ricombinante a mezzo di radioautografia, si ritagliarono tappi di filtro dai filtri nitrocellulosici, che furono poi posti in 1 mi del nutriente di copertura (il medium speciale di Eagle contenente siero vitellino al 10%), trattati ad onde sonore e ri-spalmati sugli strati monomolecolari di CV?1. Il saggio all'lSD* fu quindi ripetuto per purificare ulteriormente il materiale virale isolato. In tale maniera, un virus identico al mutante VP-2 identificato per ibridazione all'esempio X fu isolato mediante una tecnica che si basa sull'espressione del gene HSV TK presente nel medesimo. ? After identification of the recombinant organism by means of radioautography, filter caps were cut out of the nitrocellulose filters, which were then placed in 1 ml of the covering nutrient (Eagle's special medium containing 10% calf serum), treated with waves. sonorous and re-smeared on the monomolecular layers of CV? 1. The LSD * assay was then repeated to further purify the isolated viral material. In this way, a virus identical to the VP-2 mutant identified by hybridization in example X was isolated by a technique based on the expression of the HSV TK gene present in the same. ?

Anche qui, i risultati di questo esempio dimostrano l'espressione del gene HSV TK presente negli organismi ricombinanti .in conformit? all'attuale invenzione, a mezzo di taluni di questi organismi. Again, the results of this example demonstrate the expression of the HSV TK gene present in recombinant organisms. to the present invention, by means of some of these organisms.

I mutanti vaccinici derivati del pDP 137, vale a dire il VP-2, VP-4 e VP-6 sono tutti atti'ad esprimere il gene HSV TK presente nei medesimi mediante la fosforilazione e l'incorporazione dell?lDC*, nella maniera descritta in precedenza. Conversamente, le varianti VP?1, VF-3 e VP-5 derivate dal pDP 132 non sono atte ad esprimere il gene, possibilmente per il fatto che l'orientamento del gene entro il virus ? opposto alla direzione in cui il gene viene trascritto. The vaccine mutants derived from pDP 137, namely VP-2, VP-4 and VP-6 are all capable of expressing the HSV TK gene present in them by phosphorylation and incorporation of lDC *, in the manner described above. Conversely, the variants VP? 1, VF-3 and VP-5 derived from pDP 132 are not capable of expressing the gene, possibly due to the fact that the orientation of the gene within the virus? opposite to the direction in which the gene is transcribed.

Esempio XII - L'uso d'un terreno elettivo per l'identificazione e l'isolamento dei virus ricombinanti contenenti il gene HSV TK Example XII - The use of an elective medium for the identification and isolation of recombinant viruses containing the HSV TK gene

I virus preparati secondo l'esempio X per la ricombinazione in vivo entro le cellule BHK-21 (C-13) del virus vaccinico VTK~79 e d'un precipitato ortofosfatico di calcio del pDP 137, furono usati per infettare le cellule TK umane (linea 143). Pi? specificatamente, strati cellulari .monomolecolari posti in cinque capsule Petri di 6 cm in diametro, furono infetti da virus descritto all'esempio X, in una diluizione virale da 10 a 10 in presenza del nutriente elettivo MTAGG. The viruses prepared according to Example X for in vivo recombination within the BHK-21 (C-13) cells of the vaccine virus VTK ~ 79 and an orthophosphatic precipitate of calcium of the pDP 137, were used to infect human TK cells (line 143). Pi? specifically, monomolecular cell layers placed in five Petri dishes of 6 cm in diameter, were infected with the virus described in Example X, in a viral dilution of 10 to 10 in the presence of the elective nutrient MTAGG.

La tecnica infettiva fu identica a quella gi? esposta. Was the infectious technique identical to that already? exposed.

Si isolarono cinque piastrine ben separate ed una Five well separated platelets and one were isolated

Claims (1)

RIVENDICAZIONI 1. Un virus vaccinico modificato dalla presenza del DNA esogeno nel genoma vaccinico. 1. A vaccine virus modified by the presence of exogenous DNA in the vaccine genome. 2. Un virus vaccinico secondo la rivendicazione 1, in cui il suddetto DNA esogeno viene espresso in un organismo ospite per mezzo della produzione d?una proteina. A vaccine virus according to claim 1, wherein said exogenous DNA is expressed in a host organism by means of the production of a protein. 3.'Un virus vaccinico secondo la rivendicazione 2, in cui la suddetta proteina ? un antigeno.? 3. A vaccine virus according to claim 2, wherein said protein? an antigen.? 4. Un virus vaccinico secondo la rivendicazione 2, in cui il suddetto DNA esogeno ? un gene di herpes simplex espresso in un organismo ospite per mezzo?della prodvizione di timidina chinasi. 4. A vaccine virus according to claim 2, wherein said exogenous DNA? a herpes simplex gene expressed in a host organism by means of thymidine kinase production. 5. Un virus vaccinico secondo la rivendicazione 4, in cui il suddetto1virus ? privo del gene vaccinico produttore di timidina chinasi. 5. A vaccine virus according to claim 4, wherein the aforementioned virus? devoid of the vaccine gene producing thymidine kinase. 6.1 Il virus vaccinico VP-1 secondo la rivendicazione 1. 6.1 The vaccine virus VP-1 according to claim 1. 7. Il virus vaccinico VP-2 secondo la rivendicazione 1. The VP-2 vaccine virus according to claim 1. 8. Il virus vaccinico VP-3 secondo la rivendicazione 1. The VP-3 vaccine virus according to claim 1. 9. Il virus vaccinico VP-4 secondo la rivendicazione 1. The VP-4 vaccine virus according to claim 1. 10. Il virus vaccinico VP-5 secondo la rivendicazione 1.* 10. The VP-5 vaccine virus according to claim 1. * 11. Il virus vaccinico VP-6 secondo la rivendicazione 1. The VP-6 vaccine virus according to claim 1. 12.?Un metodo per la ricombinazione in vivo del virus vaccinico e del DNA donatore che comprende la messa a contatto d'uno strato cellulare monomolecolare con un terreno di coltura compatibile con la cellula contenente il suddetto virus vaccinico e con un terreno di coltura compatibile con la cellula contenente il suddetto DNA donatore, il detto DNA donatore avente il DNA esogeno presente entro un segmento altrimenti co-lineare del DNA vaccinico in una regione-non essenziale entro tale segmento. 12. A method for in vivo recombination of vaccine virus and donor DNA which includes contacting a monomolecular cell layer with a culture medium compatible with the cell containing the aforementioned vaccine virus and with a compatible culture medium with the cell containing the aforementioned donor DNA, said donor DNA having the exogenous DNA present within an otherwise co-linear segment of the vaccine DNA in a non-essential region within that segment. 13.?Un metodo secondo la rivendicazione 12, in 21.?Un metodo 'secondo la rivendicazione 20, in cui il suddetto DNA ? espresso da tale cellula. 13. A method according to claim 12, in 21. A method according to claim 20, wherein said DNA is expressed by that cell. 22.?Un metodo secondo la rivendicazione 21, in cui il suddetto DNA ? espresso dalla produzione in tale cellula d?una sostanza biologica. 22. A method according to claim 21, wherein said DNA is expressed by the production in this cell gives a biological substance. 23.-Un metodo secondo la rivendicazione 22, in cui il suddetto DNA da replicarsi contiene il gene dell'herpes simplex TK e la suddetta sostanza biologica ? la timidina chinasi. 23.-A method according to claim 22, in which the aforesaid DNA to be replicated contains the herpes simplex TK gene and the aforesaid biological substance? thymidine kinase. 24.1Un plasmide ricombinante comprendente il DNA del pBR 322 in uno con un membro scelto da un gruppo consistente del frammento vaccinico Hind III F del DNA ed almeno un frammento di Barn HI HSN TK.? 24.1 A recombinant plasmid comprising pBR 322 DNA in one with a member selected from a group consisting of the Hind III F vaccine DNA fragment and at least one Bam HI HSN TK fragment. 25. Un plasmide secondo la rivendicazione 24, che ? il pDP 3. 25. A plasmid according to claim 24, which? the PDP 3. 26/ Un plasmide secondo la rivendicazione 24, che ? il pDP 132. 26 / A plasmid according to claim 24, which? the PDP 132. 27.'Un plasmide secondo la rivendicazione 24, che ? il pDP 137. 27. A plasmid according to claim 24, which? the PDP 137. 28. Il metodo di accrescere una proteina che comprende l'inoculazione dell'animale ospite, suscettibile al virus vaccinico, con un virus vaccinico secondo la rivendicazione 2. The method of augmenting a protein comprising inoculating the host animal, susceptible to the vaccine virus, with a vaccine virus according to claim 2. 29. Il metodo di accrescere una proteina che comprende l'inoculazione dell?animale ospite, suscettibile cui il suddetto segmento" altrimenti co-lineare del DNA vaccinico ? clonabile con un plasmide. 29. The method of augmenting a protein comprising inoculation of the host animal, susceptible to which the above "otherwise co-linear" segment of the vaccine DNA is clonable with a plasmid. 14. Un metodo secondo la rivendicazione 13, in cui il suddetto segmento co-lineare del DNA vaccinico ? il relativo frammento Hind III F.' A method according to claim 13, wherein the aforementioned co-linear segment of the vaccine DNA? the relative fragment Hind III F. ' 15. Un metodo secondo la rivendicazione 14, in cui il suddetto DNA esogeno include il gene Barn HI TK dell'herpes simplex. A method according to claim 14 wherein said exogenous DNA includes the herpes simplex Barn HI TK gene. 16. Un metodo secondo la rivendicazione 12, in cui il suddetto DNA donatore ? presente sotto forma di precipitato ortofosfatico di calcio del detto DNA donatore. 16. A method according to claim 12, wherein said donor DNA? present in the form of calcium orthophosphatic precipitate of said donor DNA. 17. Un metodo secondo la rivendicazione 12, in cui il suddetto virus vaccinico ? privo d'un gene vaccinico produttore di timidina chinasi. 17. A method according to claim 12, wherein the aforementioned vaccine virus? devoid of a vaccine gene producing thymidine kinase. 18/ Una coltura biologicamente pura del virus vaccinico VTK~79.? 18 / A biologically pure culture of the vaccine virus VTK ~ 79.? 19. Il metodo di replicazione del DNA in una cellula eucariotica mediante infezione della suddetta cellula con un virus vaccinico modificato per contenere tale DNA, essendo il DNA esogeno al suddetto virus vaccinico. 19. The method of DNA replication in a eukaryotic cell by infecting said cell with a vaccine virus modified to contain such DNA, the DNA being exogenous to the aforementioned vaccine virus. 20. Un metodo secondo la rivendicazione 19, in cui il suddetto DNA ? parimenti esogeno alla detta cellula. 20. A method according to claim 19, wherein the aforementioned DNA? equally exogenous to said cell. al virus vaccinico,' conun virus vaccinico secondo la rivendicazione 3.? to the vaccine virus, with a vaccine virus according to claim 3.? 30.' Il metodo d'immunizzazione dell'animale ospite, suscettibile al virus vaccinico, per sviluppare anticorpi contro un antigeno, il quale metodo comprende l'inoculazione dell'animale ospite con un virus vaccinico avente entro il genoma vaccinico il DNA esogeno a tale genoma e codificato per il detto antigeno. 30. ' The method of immunization of the host animal, susceptible to the vaccine virus, to develop antibodies against an antigen, which method comprises the inoculation of the host animal with a vaccine virus having within the vaccine genome the DNA exogenous to that genome and encoded for the said antigen.
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