HU225785B1 - Modulation of plant response to abscisic acid - Google Patents

Modulation of plant response to abscisic acid Download PDF

Info

Publication number
HU225785B1
HU225785B1 HU0204207A HUP0204207A HU225785B1 HU 225785 B1 HU225785 B1 HU 225785B1 HU 0204207 A HU0204207 A HU 0204207A HU P0204207 A HUP0204207 A HU P0204207A HU 225785 B1 HU225785 B1 HU 225785B1
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
sequence
aba
plant
ser
detection
Prior art date
Application number
HU0204207A
Other languages
English (en)
Inventor
Tim Helentjaris
Original Assignee
Pioneer Hi Bred Int
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Pioneer Hi Bred Int filed Critical Pioneer Hi Bred Int
Publication of HUP0204207A2 publication Critical patent/HUP0204207A2/hu
Publication of HUP0204207A3 publication Critical patent/HUP0204207A3/hu
Publication of HU225785B1 publication Critical patent/HU225785B1/hu

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8291Hormone-influenced development
    • C12N15/8293Abscisic acid [ABA]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
  • Photoreceptors In Electrophotography (AREA)
  • Steroid Compounds (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)

Description

A találmány tárgyát növények genetikai módosítására szolgáló eljárások, különösen a növények abszcizinsavra adott válaszának befolyásolására (modulálására) alkalmas eljárások képezik.
Az abszcizinsav (ABA) egy növényi hormon, amely esszenciális szabályozó szerepet játszik egy sor élettani folyamatban. E hormonnak szerepe van a csíra (embrió) fejlődésében, a magvak nyugalmi állapotában (dormancia), a lélegzésben és a környezeti hatásokhoz való adaptációban. Az ABA szabályozza a növények fejlődésének számos, mezőgazdaságilag fontos eseményét, így a magvak tartalék fehérjéinek és szénhidrátjainak szintézisét vagy a légzőnyílások (sztómák) záródását. Az ABA-érzékeny promoterek vizsgálata egy sor különböző, potenciális c/'sz-reaktív szabályozóelemet tárt fel.
Az ABA bioszintézisét érintő mutációk számos növényfajban ismertek; lásd például Leung és Giraudat [Annu. Rév. Plánt Physiol. Plánt Mól. Bioi. 49, 199-222 (1998)] összefoglalóját és az abban idézett közleményeket. Az Arabldopsisban több, genetikailag különböző, ABA-érzéketlen lokuszt azonosítottak. Ezeket a mutánsokat azon tulajdonságuk alapján szelektálták, hogy magvaik az ABA gátlókoncentrációinak jelenlétében is képesek a csírázásra. A mutációk a magfejlődés más folyamatait, így a tartalék fehérjék és lipidek felhalmozódását, illetve a klorofill lebontását és a kiszáradástűrést is érintik.
Napjainkig számos mutánst és gént jellemeztek a növényekben. Öt, mutáción keresztül azonosított ABAreaktív lokuszt klónoztak, amelyek három fehérjeosztályba tartoznak. Az egyikbe a kukorica két ortológ transzkripciós regulátora (Viviaparous1=Vp1) és az Arabldopsis ABA-érzéketlen-3 (ABI3) regulátora, a másikba a foszfatáz 2C fehérjecsalád két, erősen homológ tagja, míg a harmadikba az Arabidopsis farneziltranszferáza tartozik [lásd például McCarty ef al., Cell 66, 895-905 (1991); Giraudat et al., Plánt Cell 4, 1251-1261 (1992); Leung ef al., Science 264, 1448-1452 (1994); és Cuither ef al., Science 273, 1239-1241 (1996)].
A magfejlődés érési fázisában a csíra nyugalmi állapotba kerül az életben maradó szövetekben, és a száraz mag tűrőképessé válik a kiszáradással szemben. A kukoricában és más pázsitfűfélékben ez a mag táplálószövete (endospermium) aleuronrétegének sejtjeit is érinti. A kukorica „elevenszülő” mutánsában az érési program van gátolva, ezért a mutáns embrió csíranövénnyé fejlődik még az anyanövényen. A kilenc leírt elevenszülő lokusz mindegyike a karotinoidok és az abszcizinsav bioszintézisének bevezető lépéseit befolyásolja. A vp1 embriók csökkent ABA-érzékenységet mutatnak szövettenyészetben, ami arra utal, hogy az eredeti Vp1 egy olyan tényezőt kódol, amely az ABA érzékelésében játszik szerepet.
Molekuláris szinten az embrió érése a gének széles körének aktiválódásával jár, és az ekkor kifejeződő gének közül sokat az ABA-hormon szabályoz. Ennek ellenére az ABA hatásának molekuláris mechanizmusa nagyrészt ismeretlen.
A fejlődés ABA-közvetítésű szabályozása a növények alapvető válaszreakciója a kedvezőtlen környezeti hatásokra. Mivel keveset tudunk az ABA-közvetítésű fejlődésszabályozás molekuláris mechanizmusáról, szükség van olyan eljárásokra, amelyekkel befolyásolni lehet a növények válaszát az ABA-ra, és különösen olyanokra, amelyekkel a terméshozamot lehet fokozni.
A találmány tárgyát növények, különösen magtermő növények terméshozamát fokozó készítmények és eljárások képezik. Az eljárások magukban foglalják az ABA érzékelésének és jelátvitelének befolyásolását a fejlődő magvakban. Ezek az eljárások alkalmasak arra, hogy megvédjük a növényeket a stressz káros és/vagy pusztító hatásaitól és a hátrányos környezeti körülményektől. A készítmények genetikai szerkezeteket tartalmaznak, amelyekről tudjuk, hogy növények vagy növényi sejtek ABA-érzékenységét befolyásolják. Különösen fontosak az ABA-asszociált szekvenciák. Az ABAasszociált szekvenciák közé tartoznak az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó gének, azok mutánsai, fragmentumai és változatai, valamint az előbbiek antiszensz nukleotidszekvenciái. A DNSszekvenciákat olyan szerkezetekben használhatjuk, amelyek időfüggő, a fejlődési fázistól függő vagy szövetspecifikus kifejeződést biztosítanak.
A készítmények stresszhatás - különösen abiotikus stressz - alatt álló növények terméshozamának fokozására szolgáló eljárásokban használhatók. Ezen a módon megszüntethető az ABA káros hatása a virágzat és a magbél fejlődésére.
Találmányunk továbbá transzformált növényeket, növényi sejteket, szöveteket és magvakat is biztosít.
A találmány szerint rendelkezésre bocsátunk egy eljárást növényben magfejlődés, magbélfejlődés vagy magérés során abszcizinsavra (ABA) adott válasz befolyásolására, amely eljárás abból áll, hogy az illető növénybe egy korai magbél (kernel)/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezetet juttatunk be, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest.
A találmány rendelkezésre bocsát továbbá:
- egy eljárást fejlődő növényi magot, érésben levő növényi magot vagy fejlődő magbelet érő stressz káros hatásainak megelőzésére, amely eljárás egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezetnek az illető növénybe való bejuttatásából áll, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest;
- olyan növényt, amelybe egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezet van stabilan bejuttatva, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest;
HU 225 785
- olyan növényi sejtet, amelynek genomjába egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezet van bejuttatva, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest;
- egy eljárást fejlődő növényi magot, érésben levő növényi magot vagy fejlődő magbelet érő stressz káros hatásainak megelőzésére, amely eljárás abból áll, hogy egy késői magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó DNSszerkezetet juttatunk be egy olyan növénybe, ahol a növénynek az említett szekvenciát érintő funkcióvesztéses mutációja van, és az említett késői magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest;
- olyan növényt, amelybe egy késői magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezet van stabilan bejuttatva, amelyben az említett késői magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest;
- olyan növényi sejtet, amelynek genomjába egy késői magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezet van bejuttatva, amelyben az említett késői magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest;
- a találmány szerinti növény transzformált magját; és
- a találmány szerinti növény transzformált utódját.
Eljárásokat biztosítunk növények abszcizinsavval szembeni korai válaszának befolyásolására, különösen terméshozam biztosítására azáltal, hogy megszüntetjük az ABA ártalmas hatását a magvak fejlődésére. Pontosabban, találmányunk olyan készítményeket és eljárásokat biztosít, amelyek megszakítják az ABA jelátvitelét vagy működését. A készítmények és eljárások alkalmasak az ABA hatásának egy szövetben, fejlődési fázistól függő módon történő megszakítására, hogy ezzel elszigeteljük a női szaporítószöveteket a stressztől és a káros környezeti hatásoktól.
Találmányunkban a „növények válasza” kifejezés alatt a szaporítószövet fejlődését, a mag fejlődését, a táplálószövet fejlődését és a mag érését értjük. Az ABA-nak szerepe van a növények életciklusának számos más élettani és fejlődési folyamatában is, mint amilyen a magvak nyugalmi állapota, az abiotikus környezeti stresszhatásokhoz (például hideg, szárazság, magas sótartalom és a többi) való alkalmazkodás, a tápanyagtartalékok felhalmozása, a kiszáradástűrés elérése, a légzőnyílások záródása és a többi. A korai szakaszokban az ABA szabályozza a magvak érését és tartja fenn a csíra nyugalmi állapotát. Később, az egyedfejlődés kezdetén, az ABA közvetítésével jelenik meg számos adaptív válaszreakció a környezeti hatásokra, mint amilyenek a kiszáradás, a hideg, a sóstressz és más stresszhatások, ugyanakkor az ABA negatív növekedésszabályozóként is működik. Általánosságban, az ABA kétirányú növekedésszabályozó hatást fejt ki: egyrészt befolyásolja a sejtek növekedését (valószínűleg a turgor szabályozásával), másrészt leállítja a sejtek osztódását a negatív növekedésszabályozó szerepének megfelelően.
Találmányunk magában foglalja a növények ABA-ra adott korai válaszreakciójának szabályozását vagy befolyásolását. A „befolyásolás alatt az ABA-ra adott növényi válaszreakció fokozását (felszabályozását) vagy csökkentését (leszabályozását) értjük. Találmányunk szempontjából a befolyásolás általában leszabályozást jelent, ami az ABA szintézisének megszakításán vagy az ABA érzékelésének vagy jelátvitelének megszakításán keresztül valósulhat meg. Belátható, hogy az ABA működésének teljes megszakítása a növényben nem célszerű, mert az ABA-nak több szerepe van a fejlődés folyamán. Találmányunk szempontjából általában az a célszerű, ha csak azon a helyen szüntetjük meg az ABA hatását, ahol ténylegesen nincs rá szükség, azaz a gabonanövények kalászaiban. Ezen a módon - az ABA érzékelését vagy jelátvitelét megszakítva - hatásos stratégiát biztosíthatunk a gabonafélék női szaporítószövetének elszigetelésére a stresszhatásoktól.
A megtermékenyülés után bekövetkező környezeti stresszhatások meggátolják a raktározókapacitás felépülésének korai eseményeit, és ezzel csökkenthetik a terméshozamot. A gabonák esetében például az endospermium a raktározott tartalék tápanyagok fő forrása az érett magvakban. A raktározókapacitás a mag fejlődésének korai szakaszában épül fel. Felismerve az ABA szerepét a növények stresszre adott korai válaszában, találmányunkkal arra törekszünk, hogy kiiktassuk az ABA káros hatásait a magvak fejlődésére, és ezzel javítsuk a magvak és magkészítmények, különösen a gabonák és más magvak minőségét és mennyiségét [Mambelli és Setter, Physioí Ptantarum 104, 266-272 (1998); Tuberosa eí a/., Theor. Appl. Génét. 744-755 (1998)].
Amint jeleztük, találmányunk magában foglalja olyan szekvenciák bejuttatását a célnövénybe, amely befolyásolja az ABA érzékelését és jelátvitelét. Az „ABA érzékelését és jelátvitelét befolyásoló szekvenciák” vagy az „ABA érzékelésében és jelátvitelében érintett szekvenciák” kifejezések alatt olyan mutánsokat és géneket értünk, amelyek megszakítják az ABA szintézisét vagy érzékelését és jelátvitelét. Az ABA szintézisét, érzékelését vagy jelátvitelét megszakító mutánsokat, géneket és szekvenciákat találmányunkban „ABA-asszociált szekvenciákénak is nevezzük. Az ilyen szekvenciák közé tartoznak - nem korlátozó módon - az ABA-érzéketlen vagy hiperszenzitív mutánsok, vagy a mutáns vagy vad típusú géneknek megfelelő antiszensz szekvenciák. A szakterületen ismert ABA-mutánsok közé tartozik az ab/1-5 és era1-3 [Cutler et a/., Science 273, 1239-1241 (1996)], a gca1/8 [Benning et aí, Workshop Abscisic Acid Signal
HU 225 785
Transduction in Arabidopsis, Madrid, p. 34. (1996)], az axr2 [Wilson ef a/., Mól. Gén. Génét. 222, 377-383 (1990)], a y'arl [Staswick ef a/., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 6837-6840 (1992)], a jin4 [Berger ef a/., Plánt Physiol. 111, 525-531 (1996)], a bri1 [Clouse ef a/., Plánt Physiol. 111, 671-678 (1996)], a sax (Arabidopsis thaliana), a vpl [McCarty ef al., Cell 66, 895-905 (1991); Robichaud ef al., J. Plánt Physiol. 126, 235-242 (1986)], a reál (Zea mays) [Sturaro ef al., J. Exp. Bot. 47, 755-762 (1996)], a cool (Hordeum vulgare) [Raskin ef al., Planta 173, 73-78 (1988)], az aóa1 (Nicotiana plumbaginifolia) [Bitoun ef al., Mól. Gén. Génét. 220, 234-239 (1990); Leydecker ef al., Plánt Physiol. 107, 1427-1431 (1995)] és a hasonlók. Ezek és más ABA-asszociált mutánsok találmányunk gyakorlatában alkalmazhatók.
Egy szekvenciát akkor tekintünk „megfelelő-nek egy gén vagy szekvencia számára, ha képes olyan fokú hibridizálódásra a génnel vagy szekvenciával, amely a transzkripció megakadályozásához szükséges. Felismertük, hogy a találmányunkban alkalmazott ABA-asszociált szekvenciától függően vagy a kódoló-, vagy az antiszensz szekvencia lehet előnyös. A kódolószekvencia azonban a megcélzott gén expressziöjának koszuppresszálására is használható. így például az egyik stratégia magában foglalja mutáns gének, például az abi1 vagy abi2 kifejeztetését egy korai magbél/embrió promoterrel, ami domináns módon megszünteti az ABA hatását e szövetek korai stádiumában. Egy ilyen megoldás nem fogja megszüntetni az ABAnak a mag éréséhez szükséges funkcióit. Más megoldásként gének, például a Vp1 vad típusú alléljei leszabályozhatok koszuppresszióval vagy antiszensz stratégiával, hogy felfüggesszük az ABA hatását. Ez utóbbi példában egy korai magbél/embrió promotert használhatunk ama, hogy a Vp1 egy kódolószekvenciájának (koszuppresszióhoz) vagy egy antiszensz szekvenciájának expresszióját működtessük vele. Egy harmadik példában úgy transzformálhatunk egy növényt egy késői magbélpromoterrel, hogy az a vad típusú Vp1 szekvenciát működtesse, majd ezt a transzformált növényt egy vp1 mutáns növénnyel keresztezzük. Ebben a példában a vp1 mutáns azon tulajdonsága, hogy az ABA nem képes indukálni, szigeteli el a korai magbelet a káros hatásoktól. Ugyanakkor a DNS-szerkezet biztosítja a magbél képességét a normális érésre, (gy tehát @BAJUSZ = amit az alábbiakban részletesen is leírunk - számos célpontjelölt gén áll rendelkezésünkre olyan promoterekkel való összekapcsoláshoz, amelyek korlátozott kifejeződési lehetőségei biztosítják a fokozott termésbiztonságot az abiotikus stresszhatásokkal szemben.
A kukorica viviparous-1 (Vp1, „elevenszülő) génjére szükség van az érési program lefutásához a mag fejlődésében. A VP1 egy új transzkripciós faktor, amelynek valószínűleg része van egy magspecifikus hormonválasz potenciálásában. A Vp1 nukleinsavszekvenciáját az 1. számú, aminosavszekvenciáját a 2. számú szekvenciavázlatként mutatjuk be. A kukorica elevenszülő mutánsaiban az érési program van gátolva. Ennek következtében a mutáns embrió idő előtt, még az anyanövényen csíranövénnyé fejlődik. Számos elevenszülő mutánst írtak le. A funkciót veszített vp1 mutánsok további jellegzetessége például az ABAérzéketlen fenotípus (azaz a külső ABA csírázásgátló hatása iránti csökkent érzékenység szövettenyészetben) és/vagy az Em promoter csökkent aktiválhatósága. A szakemberek könnyen azonosíthatják a Vp1 funkcióvesztéses mutációit, amelyek alkalmasak a találmány szerinti felhasználásra, (gy például Hill és munkatársai azt találták, hogy a Vp1 N-terminális savas területe és az erősen konzervatív BR1 dómén esszenciális szerepet játszanak a Vp1 működésében [J. Bioi. Chem. 7, 3366 (1966)]. További vp1 mutánsok is ismertek [Neill ef al., Planta 169, 87-96 (1986); McCarty ef al., Cell 66, 895-905 (1991); Robichaud ef al., Dev. Génét. 1, 325-330 (1980); Robichaud és Sussex, Plánt Physiol. 130, 181-188 (1987); Robichaud ef al., J. Plánt Physiol. 126, 235-242 (1986); McCarty ef al., Physiol. Plantarum 81, 267-272 (1990); Eyster ef al., Genetics 16, 457-590 (1931)].
Ugyancsak rendelkezésre álnak az Arabidopsis ABA-érzéketlen mutánsai is. Az ilyen mutánsok magfejlődésében pleiotrop hibák vannak, mint amilyen az ABA csírázásgátló hatása iránti csökkent érzékenység a megváltozott magspecifikus génkifejeződés következtében [Finkelstein ef al., Plánt Cell 10, 1043-1045 (1998); Leung et al., Science 264, 1448-1452 (1994); Leung, Plánt Cell 9, 759-771 (1997); Giraudat ef al., Plánt Cell 4, 1251-1261 (1992); Myer ef al., Science 264, 1452-1455 (1994); Koornneef ef al., Plánt Physiol. 90, 463-469 (1989); Nambara ef al., Plánt J. 2, 435-441 (1992); Finkelstein és Somerville, Plánt Physiol. 94, 1172-1179 (1990); Leung és Giraudat, Annu. Rév. Plánt Physiol. Plánt Mól. Bioi. 49, (1998); Robinson és Hill, Plánt, Cell and Environment 22, 117-123 (1999); Rodriguez et al., FEBS Letters 421, 185-190 (1998)]; valamint a fentiekben hivatkozott közlemények, amelyek mindegyikét referenciaként tartjuk számon. A vad típusú ABI1, ABI2, ABI3 és ABI4 gének nukleinsavszekvenciáját és aminosavszekvenciáját a 3-10. számú szekvenciavázlatokként adjuk meg. A másféle ABA-asszociált mutánsok közé tartozik az Arabidopsis thaliana bili génje, aminek szekvenciája az AF 017056 génbanki nyilvántartó szám alatt, illetve Li és munkatársai [Cell 90, 929-938 (1997)] közleményében található meg; mindkettőt referenciaként tartjuk számon.
Az érdeklődésre számot tartó abi mutánsok egyike az abil, amely egy domináns mutáció az ABI1 gén szerkezeti részében. A mutáció egy nukleotid átalakulása guaninből adeninné, aminek következtében egy GGC triplett GAC-vé változik, és emiatt a 3. szekvenciavázlat 180-as helyzetében a vad típus glicinje helyére aszparaginsav kerül [Meyer ef al., Science 264, 1452-1455 (1994)]. Az ab/2 szintén a találmányunk szempontjából fontos, domináns mutánsok közé tartozik; ez esetben is egy GGC-»GAC átalakulás történik a 6. szekvenciavázlat 168-as helyzetében, ahová glicin helyett aszparaginsav kerül [Rodriguez ef al., FEBS
HU 225 785
Letters 421, 185-190 (1998)]. A szakemberek könnyen találhatnak további mutációkat (dominánst és recesszívet egyaránt) más ABA-asszociált szekvenciákban is, amelyek alkalmasak lehetnek a találmány szerinti felhasználásra.
A fent felsorolt mutánsokat „ABA-asszociált mutánsok”-nak nevezzük. E fogalom alatt olyan géneket és szekvenciákat értünk, amelyek megszakítják az ABA jelátvitelét és/vagy érzékelését egy növényben. A fenti szekvenciák felhasználásával más növényekből, köztük gabonákból, izolálhatunk hasonló szekvenciákat. Egyes esetekben jó hatású lehet egy olyan ABA-asszociált szekvencia alkalmazása, amely megfelel egy, a szóban forgó célnövényből származó szekvenciának. így például kukoricában való használatra előnyös az ABAasszociált szekvencia kukoricahomológja, vagy egy, a kukoricahomológnak megfelelő szekvencia.
Találmányunk az ABA-asszociált szekvenciákat használja a növények ABA-val szembeni válaszreakciójának szabályozására. A termésveszteség megelőzésére általában előnyös az ABA jelátvitelének vagy érzékelésének gátlása. Az ABA-asszociált szekvenciák, kódoló- és antiszensz szekvenciák alkalmazásával szabályozható az ABA expressziója és érzékelése egy növényben. Amint alább részletesebben leírjuk, az ilyen szekvenciák rekombináns módszerekkel, valamint hagyományos nemesítési eljárásokkal juttathatók be az érdeklődésre számot tartó növényekbe.
A találmány szerinti nukleotidszekvenciák felhasználhatók megfelelő szekvenciák izolálására más szervezetekből, különösen más növényekből, még különösebben gabonákból. E célra olyan eljárások alkalmasak, mint a polimeráz-láncreakció (PCR), a hibridizálás vagy bármely hasonló módszer, amely alkalmas az ilyen szekvenciák azonosítására a találmány szerinti ABA-asszociált szekvenciákkal mutatott homológiájuk alapján. A szekvenciák a teljes ABA-asszociált szekvenciával vagy annak fragmentumaival való homológiájuk alapján izolálhatok.
Ha PCR-t alkalmazunk, olígonukleotidprimerek tervezhetők a megfelelő DNS-szekvenciák sokszorozásához a cDNS-ből vagy genom-DNS-ből, amit bármely, az érdeklődésre számot tartó növényből vonunk ki. A PCR-primerek tervezésének és a PCR-rel végzett klónozásnak a módszerei általában ismertek a szakterületen, és olyan kézikönyvekben vannak leírva, mint a „Molecular Cloning; A Laboratory Manual” [Sambrook et al. (eds.), 2. kiadás, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, New York, 1989], „PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications” [Innis et al., (eds.), Academic Press, New York, 1990], „PCR Strategies” [Innis és Gelfand (eds.), Academic Press, New York, 1995] vagy „PCR Methods Manual” [Innis és Gelfand (eds.), Academic Press, New York, 1990]. A PCR ismert eljárásaihoz tartoznak a párosított, csoportosított, egyedi specifikus, degenerált, génspecifikus, vektorspecifikus vagy részben kevert printereket alkalmazó eljárások; a felsorolás nem kizáró jellegű.
A hibridizációs technikákban egy ismert nukleotidszekvencia egészét vagy részét használjuk próbaként, hogy szelektíven hibridizálódjon más, megfelelő nukleotidszekvenciákkal, amelyek egy adott szervezetből klónozott genom-DNS-fragmentumok vagy cDNS-fragmentumok populációjában (azaz genom- vagy cDNSkönyvtárakban) vannak jelen. A hibridizációs próbák lehetnek genom-DNS-, cDNS-, RNS- vagy más oligonukleotidfragmentumok, és egy kimutatható csoporttal, például 32P-izotóppal vagy mással lehetnek megjelölve. így például a próbák úgy készíthetők el, hogy jelölt oligonukleotídokat szintetizálunk a találmány szerinti ABA-asszociált szekvenciák alapján. A hibridizációs próbák elkészítésének módja, valamint a genom- és cDNS-könyvtárak elkészítése Sambrook és munkatársai már idézett kézikönyvében van leírva.
így például a találmány szerinti ABA-asszociált szekvencia egészét, illetve egy vagy több részét használhatjuk próbaként arra, hogy specifikusan hibridizálódjanak a megfelelő szekvenciákkal és mRNS-ekkel. Ahhoz, hogy specifikus hibridizálódást érjünk el különböző körülmények között, az ilyen próbáknak olyan szekvenciákat kell tartalmazniuk, amelyek egyediek a szóban forgó szekvenciák között, és a próba hosszának legalább körülbelül 10 és legelőnyösebben legalább körülbelül 20 nukleotidnak kell lennie. Az ilyen próbák arra használhatók, hogy a megfelelő szekvenciákat sokszorozzuk velük egy adott növényből, PCRrel. Ez a technika arra is alkalmas, hogy további kódolószekvenciákat izoláljunk vele egy kívánt növényből, vagy hogy megállapítsuk vele egy kódolószekvencia jelenlétét egy növényben. A hibridizációs technikák közé tartozik a szélesztett DNS-könyvtárak szűrővizsgálata is (akár tarfoltok, akár telepek; lásd például Sambrook és munkatársai, id. mű).
Az ilyen szekvenciák hibridizálása szigorú feltételek között hajtható végre. A „szigorú feltételek” vagy „szigorú hibridizációs feltételek” kifejezések olyan körülményeket jelentenek, amelyek között egy „próba” kimutathatóan nagyobb (a hátteret legalább kétszeresen meghaladó) mértékben hibridizálódik a célszekvenciájával, mint más szekvenciákkal. A szigorú feltételek szekvenciafüggőek, és függenek a körülményektől is. A hibridizálás és/vagy a mosás szigorúságának változtatásával felismerhetők azok a célszekvenciák is, amelyek 100%-ban komplementerek a próbával (homológiavizsgálat). Másrészt a szigorúság feltételei úgy is beállíthatók, hogy a kisebb hasonlósági fokú szekvenciák összekeveredve kimutathatók legyenek (heterológiapróba). A próba általában rövidebb, mint 1000 nukleotid, előnyösen nem éri el az 500 nukleotid hosszúságot.
A szigorú feltételek tipikusan olyanok, hogy a sókoncentráció kisebb, mint körülbelül 1,5 mol/l nátriumion, tipikusan körülbelül 0,01-1,0 mol/l nátriumion (vagy másféle só) 7,0-8,3 pH között, és a hőmérséklet legalább körülbelül 30 °C a rövid próbák (azaz a 10-50 nukleotid hosszúságúak), és legalább körülbelül 60 °C a hosszabb próbák (azaz az 50 nukleotidnál hosszabbak) számára. A hibridizálás időtartama általában rövidebb, mint körülbelül 24 óra, rendszerint körülbelül 4-12 óra. A szigorú feltételek létrehozhatók destabilizálóreagensek, például formamid hozzáadásával
HU 225 785 is. Példaszerűen alacsony szigorúságé feltételeket biztosít egy pufferoldat 30-35% formamiddal, 1 mol/l nátrium-kloriddal és 1% SDS-sel (nátrium-dodecil-szulfát) 37 °C-on, és a mosás 1*-2*SSC-vel 50-55 °C-on (20*SSC=3,0 mol/l nátrium-klorid+0,3 mol/l trinátriumcitrát). Közepes szigorúságé feltételt biztosít a hibridizáció 40-45% formamid, 1 mol/l nátrium-klorid és 1% SDS jelenlétében, 37 °C-on, és a mosás 0,5*-1 *SSCvel 55-60 °C-on. Erősen szigorú feltételek az 50% formamid, 1 mol/l nátrium-klorid és 1% SDS 37 °C-on, és a mosás 0,1xSSC-vel 60-65 °C-on.
A specificitás tipikusan a hibridizálódás utáni mosásnál derül ki; a kritikus tényezők a mosóoldat ionerőssége és hőmérséklete. A DNS/DNS hibridek esetében a Tm jól megközelíthető Meinkoth és Wahl egyenletével [Anal. Biochem. 138, 267-284 (1984)], ami szerint
Tm=81,5 °C+16,6(logM)+0,41(%GC)-0,61(% formamid)-500/L ahol M az egyértékű kationok molaritása, %GC a guanozin és citozin nukleotidok aránya a DNS-ben, % formamid a formamid aránya a hibridizálóoldatban, és L a hibrid hossza bázispárokban mérve. A Tm az a hőmérséklet (adott ionerősségen és pH-η), amelyen egy komplementer célszekvencia 50%-a hibridizálódik a tökéletesen hozzáillő próbával. A kevertség minden 1%-os fokozódásával a Tm körülbelül 1 °C-kal csökken; így tehát a Tm, a hibridizálás és/vagy a mosás körülményei úgy állíthatók be, hogy a kívánt azonosságú szekvenciák hibridizálódjanak. így például ha >90%-os azonosságú szekvenciákat keresünk, akkor a Tm 10 °C-kal csökkenthető. A szigorú feltételeket általában úgy választjuk meg, hogy a hőmérséklet körülbelül 5 °C-kal alacsonyabb legyen az adott szekvencia és komplementere olvadási hőmérsékleténél az adott ionerősség és pH mellett. Az igen szigorú feltételek esetén a hibridizálást és/vagy a mosást a Tm-nél 1, 2, 3 vagy 4 °C-kal alacsonyabb hőmérsékleten végezhetjük; a kismértékben szigorú feltételek esetén a hibridizálást és/vagy a mosást a Tm-nél 6, 7, 8, 9 vagy 10 °C-kal alacsonyabb hőmérsékleten végezhetjük; a kismértékben szigorú feltételek esetén a hibridizálást és/vagy a mosást a Tm-nél 11,12, 13, 14, 15 vagy 20 °C-kal alacsonyabb hőmérsékleten végezhetjük. A fenti egyenletet használva a szakemberek meghatározhatják a hibridizálás és mosás körülményeit. Ha a kevertség kívánt foka miatt a Tm alacsonyabb lenne, mint 45 °C (vizes oldatban) vagy mint 32 °C (formamidos oldatban), akkor előnyös az SSC koncentrációját úgy megemelni, hogy magasabb hőmérsékletet használhassunk. A nukleinsavak hibridizálásához kimerítő útmutatást találunk Tijssen „Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology - Hybridization with Nucleic Acid Probes” című kézikönyvében, valamint Ausubel és munkatársai, illetve Sambrook és munkatársai már idézett műveiben.
így tehát a találmány tárgyához tartoznak azok az izolált, „megfelelő ABA-asszociált szekvenciák”, amelyek módosítják a növény ABA-ra adott válaszát, és szigorú körülmények között hibridizálódnak a találmány szerinti ABA-asszociált szekvenciákkal vagy azok fragmentumaival. Az ilyen szekvenciák legalább körülbelül 70-75, körülbelül 80-85, vagy éppen 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 vagy 99%-os, vagy magasabb arányú homológiát mutatnak a találmány szerinti szekvenciákkal. Ez azt jelenti, hogy a szekvenciaazonosság foka legalább körülbelül 70-75, körülbelül 80-85, vagy éppen 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 vagy 99%-os, vagy magasabb az adott szekvenciák között.
A találmány szerinti ABA-asszociált szekvenciák szövet- vagy fejlődésspecifikus promoterekkel használhatók arra, hogy szövet- vagy fejlődésspecifikus módon szakítsuk meg az ABA funkcióit. Az e szempontból különösen fontos promoterek közé tartoznak a magspecifikus promoterek, különösen a korai és késői magbél/embrió promoterek.
A magbél megporzás utáni fejlődése körülbelül három fő szakaszra osztható. A lagfázis a megporzástól (0. nap) körülbelül 10-12 napon át tart. Ezalatt a magbél tömege nem növekszik jelentősen, de annál fontosabb események zajlanak benne, amelyek meghatározzák a magbél életképességét (például a sejtek száma). A lineáris feltöltődés fázisában (a 10-12.-től a körülbelül 40. napig) a magbél elnyeri csaknem teljes végső tömegét, és különböző raktározott termékek (például keményítő, fehérjék, olaj) halmozódnak fel benne. Végül az érési fázis a körülbelül 40. naptól a betakarításig tart. Ebben a fázisban a magbél nyugalmi állapotba jut, és megkezdődik a kiszáradása, amivel a magbél felkészül a dormancia hosszú időszakára a csírázás előtt. Találmányunkban a „korai magbél/embrió promoterek” alatt a fejlődés első fázisában aktív promotereket értjük, míg a „késői magbél/embrió promoterek alatt azokat, amelyek a fejlődés körülbelül 12. napjától az érési folyamat végéig aktívak. A promoter megválasztása a felhasznált ABA-asszociált szekvenciától fog függeni.
A korai magbél/embrió promoterek közé tartozik például a cim1, egy pollen- és teljes magbélspecifikus promoter, amely 5 beporzás utáni napon (DAP) aktív (lásd például a WO 00/11177 számú szabadalmi iratot, amit referenciaként tartunk számon). További korai magbél/embrió promoterek az end1 magspecifikus promoter, amely a 7-10. DAP-okon, valamint az end2, amely a teljes magbélben a 9-14. DAP-okon, az endospermiumban és a perikarpiumban pedig a 10. DAP-on aktív (lásd például a WO 00/12733 számú szabadalmi iratot, amit referenciaként tartunk számon). További, a találmány szerinti eljárásokban felhasználható korai magbél/embrió promoterek közé tartozik még az Ipt2 magspecifikus promoter (13. számú szekvenciavázlat), amely a 6-24. DAP-ok között aktív (US 5,525,716 számú szabadalmi irat, amit referenciaként tekintünk).
Az ilyen, korai magbél/embrió promoterek az ABA érzékelésének vagy jelátvitelének génjeivel vagy mutánsaival használhatók. Mutáns gének, mint amilyen az aó/1 vagy az abi2, működőképes módon egy korai magbél/embrió promoterhez kapcsolva dominánsan
HU 225 785 megszakítják az ABA hatását a szövetekben azelőtt, hogy később szükségessé válik a mag éréséhez. Más megoldásként a korai magbél/embrió promoter működőképes módon összekapcsolható egy ABA-asszociált szekvencia vad típusú (koszuppresszió) vagy antíszensz nukleotidszekvenciájával. A korai magbél/embrió promoter az ABA hatásának magérés előtti megszakítására alkalmazható.
A késői magbél/embrió promoterek közé tartoznak például az oleozingének promoterei [Plánt et al., Plánt Mól. Bioi. 25, 193-205 (1994); Keddie ef al., Plánt Mól. Bioi. 24, 327-340 (1994); Keddie ef a/., Plánt Mól. Bioi. 19, 443-453 (1992); Hong ef al., Plánt Mól. Bioi. 34, 549-555 (1997)]. A 11. szekvenciavázlat a Glycine max oleozinpromoter szekvenciáját (génbanki nyilvántartási száma U71381), a 12. szekvenciavázlat a Brassica junceáét (AF134411) mutatja be, míg az Arabidopsis thalianáét az US 5,977,436 számú szabadalmi iratban találjuk meg. A fenti idézetek mindegyikét referenciaként tartjuk számon. További késői magbél/embrió promoterek közé tartozik az smilps, egy embrióspecifikus promoter, amely a 13-14. DAP-okon, valamint a cz19B1, egy teljes magbélspecifikus promoter, amely a 13-40. DAP-okon aktív (WO 00/40710 számú szabadalmi irat, amit referenciaként tartunk számon).
A késői magbél/embrió promoterek, például az oleozingéneké, felhasználhatók a vad típusú Vp1 allélek expressziójának működtetésére, majd az ilyen növények keresztezhetők egy vp1 mutációt hordozó növénnyel. Ebben a példában a vp1 mutáns allélnek azon tulajdonsága, hogy nem képes kölcsönhatásba lépni az ABA-val, el fogja szigetelni a fiatal magbelet a káros hatásoktól. A Vp1 gén terméke a magbél fejlődésének igen korai szakaszában van jelen. Az ABA jelenlétében a VP1 hatásossá válik. A módosított gén, amit a transzgén szülő szolgáltat, fogja biztosítani a normális beérés lehetőségét a magbél számára. Találmányunkban az „endogén ABA-asszociált szekvencia kifejezésen bármely olyan, ABA-asszociált szekvenciát értünk, amelyet nem egy transzformációs eseménnyel juttatunk a növénybe.
Az ilyen ABA-asszociált gének arra használhatók, hogy szabályozzuk a stressz hatását a növényekre. A kiszáradástűrés elérése során a tápanyagtartalékok felhalmozódása együtt jár specifikus mRNS-együttesek expressziójával. Azokat a transzkriptumokat, amelyek a raktározott fehérjéket vagy a „late-embryogenesis-abundant” (LEA) fehérjéket kódolják, és vélhetően részük van a kiszáradástűrés létrejöttében, idő előtt indukálja az exogén ABA az embriótenyészetekben. így tehát az ABA-gének késői expressziója összekapcsolható transzgén raktárfehérjékkel, hogy növeljük a magvak tápanyagtartalékát.
Az ABA érzékelését vagy jelátvitelét befolyásoló szekvenciák „bejuttatása” egy célnövénybe magában foglal bármely módot, amivel a szóban forgó szekvencia beépíthető a célnövénybe. Erre hagyományos nemesítés! módszerek, genetikai transzformációs módszerek vagy bármilyen elérhető módszer alkalmas lehet. A találmány szerinti eljárások nem függenek egy adott, a nukleotidszerkezetek növényekbe juttatására szolgáló módszertől; a feltétel csak az, hogy a nukleotidszerkezet sikeresen eljusson a növény legalább egy sejtjének belsejébe. A „stabil transzformáció” fogalom alatt azt értjük, hogy a növénybe juttatott nukleotidszerkezet beépül a növény genomjába, és képes az utódokba átöröklődni.
Gének vad típusú alléljei, például a Vp1, a korai promoterekkel leszabályozhatok akár a koszuppressziós, akár az antiszensz stratégia alkalmazásával. Ismeretes, hogy ezekkel a szekvenciákkal olyan antiszensz szerkezetek készíthetők, amelyek az ABAasszociált szekvenciák mRNS-einek legalább egy részével komplementerek. Az antiszensz nukleotidok úgy vannak megszerkesztve, hogy hibridizálódjanak a megfelelő mRNS-ekkel. Az antiszensz szekvenciák mindaddig módosíthatók, amíg hibridizálódnak a megfelelő mRNS-sel és interferálnak expressziójával. Az antiszensz szerkezetek akkor használhatók, ha 70%-os, előnyösen 80%-os, előnyösebben 85%-os szekvenciahasonlóságot mutatnak a célszekvenciával. Továbbá az antiszensz nukleotidok részei is használhatók a megcélzott gén kifejeződésének megszakítására. Általában legalább 50, 100, 200 vagy több nukleotidból álló szekvenciákat használhatunk.
Jól ismertek a szakterületen azok a módszerek, ahol szensz orientációjú nukleotidszekvenciákat használnak gének expressziójának elnyomására növényekben. Ezek az eljárások általában magukban foglalják a növények transzformálását egy olyan DNS-szerkezettel, amely egy promotert tartalmaz működőképes módon egy nukleotidszekvencia legalább egy részéhez kapcsolva, amely szekvencia megfelel az endogén gén transzkriptumának (azaz egy ABA-asszociált szekvencia). Egy ilyen nukleotidszekvencia és az endogén gén transzkriptumának szekvenciája közötti azonosság foka előnyösen nagyobb, mint körülbelül 65%, előnyösebben nagyobb, mint körülbelül 85%, és legelőnyösebben nagyobb, mint körülbelül 95% (US 5,283,184 és 5,034,323 számú szabadalmi iratok, amelyeket referenciaként tartunk számon).
Felismertük, hogy találmányunkban az ABA-asszociált gének fragmentumai és/vagy változatai is alkalmazhatók. így tehát találmányunkhoz tartoznak az ABA-asszociált nukleotidszekvenciák fragmentumai és változatai, valamint az általuk kódolt fehérjék. A „fragmentum” fogalom alatt egy nukleotidszekvencia egy részét vagy egy aminosavszekvencia egy részét értjük. Egy nukleotidszekvencia fragmentumai fehérjefragmentumokat kódolhatnak, amelyek megőrizhetik a természetes fehérje biológiai aktivitását, és ezáltal befolyásolhatják az ABA-val szembeni válaszreakciókat. Másrészt egy nukleotidszekvencia azon fragmentumai, amelyek hibridizációs próbáknak alkalmasak, általában nem kódolnak biológiailag aktív fehérjefragmentumokat. Ennek megfelelően egy nukleotidszekvencia fragmentumainak hossza legalább körülbelül 20 nukleotidtól körülbelül 50 vagy körülbelül 100 nukleotidig, vagy a találmány szerinti nukleotidszekvencia teljes hosszáig terjedhet.
HU 225 785
A „változatok” fogalom alatt lényegében hasonló szekvenciákat értünk. A nukleotidszekvenciák esetében a természetben előforduló változatok jól ismert molekulárbiológiai technikákkal, például polimerázláncreakcióval (PCR) vagy hibridizációs technikákkal azonosíthatók. A nukleotidszekvenciák változatai magukban foglalják a szintetikus eredetű nukleotidszekvenciákat is, amelyeket például helyre irányított mutagenezissel állítanak elő. Általában egy adott nukleotidszekvencia találmány szerinti változatai legalább körülbelül 40, 50, 60, 65 vagy 70%-os, előnyösen legalább körülbelül 75, 80 vagy 85%-os, előnyösebben legalább körülbelül 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96 vagy 97%-os, és legelőnyösebben legalább körülbelül 98 vagy 99%-os szekvenciaazonosságot mutatnak az adott nukleotidszekvenciával, ha azt a később leírandó szekvenciaegyeztető programokkal, alapbeállítási paraméterek használatával határozzuk meg.
A szekvenciák egyeztetése az összehasonlítás céljából jól ismert a szakterületen. A százalékban kifejezett azonosság bármely két szekvencia között egy matematikai algoritmus alkalmazásával határozható meg. Az ilyen algoritmusokra nem korlátozó példaként említjük Myers és Miller algoritmusát [CABIOS 4, 11-17 (1988)], Smith és munkatársai lokális homológiát kereső algoritmusát [Adv. Appl. Math. 2, 482 (1981)], Needleman és Wunsch homológiaegyeztető algoritmusát [J. Mól. Bioi. 48, 443 (1970)], Pearson és Lipman hasonlóságkereső módszerét [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 2444-2448 (1988)] vagy Kariin és Altschul algoritmusát [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 2264 (1990)], amit később szerzői módosítottak [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 5873-5877 (1993)].
Az említett matematikai algoritmusok számítógépes alkalmazásai használhatók szekvenciák összehasonlítására a szekvenciaazonosság meghatározása céljából. Az ilyen alkalmazások közé tartozik például a CLUSTAL a PC/Gene programban (Intelligenetics, Mountain View, Ca.), az ALIGN program (2.0 verzió) vagy a GAP, BESTFIT, BLAST, FASTA és TFASTA programok a Wisconsin Genetics Software Package 8. verziójában (GCG, Madison, Wi.). Az egyeztetés a programok alapbeállítási paramétereivel végezhető. A CLUSTAL programot többen is jól leírták [Higgins et a/., Gene 73, 237-244 (1988); CABIOS 5, 151-153 (1989); Corpet ef al., Nucl. Acids Rés. 16, 10 881-90 (1988); Huang ef al., Computer Appl. Biosci. 8, 155-165 (1992) és Pearson ef al., Methods in Mól. Bioi. 24, 307-331 (1994)]. Az ALIGN program Myers és Miller algoritmusán alapul. Aminosavszekvenciák összehasonlításakor az ALIGN a PAM120 súlymaradvány-táblázatot használja; a résért 4, a rés hosszáért 12 büntetőpontot ad. A BLAST programcsaládot Altschul ef al. dolgozták ki [J. Mól. Bioi. 215, 403 (1990)] Kariin és Altschul algoritmusa alapján. A nukleotidok keresését a BLASTN végzi (találat=100, szóhossz=12), hogy megtalálja egy találmány szerinti fehérjét kódoló nukleinsavszekvencia homológjait; a BLASTX olyan aminosavszekvenciákat keres, amelyek egy találmány szerinti fehérje vagy polipeptid homológjai (találat=50, szóhossz=3). Hézagos illesztés céljára a Gapped BLAST (a BLAST 2.0 verzióban) használható, míg a molekulák közötti távoli rokonság felfedésére a PSI-BLAST alkalmas [Altschul ef al., Nucl. Acids Rés. 25, 3389-3402 (1997)]. Ha a BLAST-ot, Gapped BLAST-ot vagy PSI-BLAST-ot használjuk, akkor a paraméterek alapbeállításait alkalmazhatjuk (például a BLATN-t a nukleotidszekvenciákhoz, a BLASTX-et a fehérjékhez). A BLAST szoftver nyilvánosan hozzáférhető a National Center fór Biotechnology Information honlapján át (http://www.ncbi.hlm.nih.gov). Az egyeztetés kézzel is elvégezhető.
Hacsak másként nem adjuk meg, az itt közölt szekvenciaazonosság- és/vagy -hasonlóság-értékeket a GAP programmal (10. verzió) számítottuk ki a következő paraméterek használatával: a százalékos azonosság kiszámításához a réssúly=50, a hosszsúly=3; a százalékos hasonlóság kiszámításához a réssúly=12, a hosszsúly=4. Használhatunk ezzel egyenértékű programokat is. „Egyenértékű” bármely olyan szekvencia-összehasonlító program, amely bármely két szekvencia között ugyanolyan nukleotid- vagy aminosavegyezéseket talál, és ugyanolyan fokú szekvenciaazonosságot határoz meg, mint az előnyös program.
A GAP Needleman és Wunsch (id. közi.) algoritmusát használja az egyezések megtalálására két teljes szekvencia között úgy, hogy maximálja az egyezések és minimalizálja a hézagok számát. A GAP figyelembe vesz minden lehetséges egyezést és hézagot, majd olyan illesztést készít, ahol legnagyobb az egyező bázisok és legkisebb a hézagok száma. Lehetővé teszi a hézagkészítés és hézagkiterjesztés büntetőpontozását az egyező bázisok egységében. A GAP-nek „profitot” kell elérnie minden egyes bevezetett hézag hézagkészítési büntetőpontjaiból. Ha a hézagkiterjesztés büntetőpontját zérónál nagyobbra választjuk meg, akkor a GAP-nek úgy kell profitot elérnie minden bevezetett hézag után, hogy annak büntetőpontjait megszorozza a hézagkiterjesztés büntetőpontjával. A hézagkészítés és hézagkiterjesztés büntetőpontjainak alapértékei fehérjeszekveciákhoz rendre 8 és 2 a Wisconsin Genetics Software Package 10. verziójában. Ugyanezek az értékek nukleinsavszekvenciákhoz 50 és 3. A hézagkészítés és hézagkiterjesztés büntetőpontjainak értékeit a 0 és 200 közötti egész számok közül választhatjuk ki; így például ezek egymástól függetlenül 0,1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9,10,15, 20, 25, 30, 35,40,45, 50, 55, 60, 65 vagy nagyobb számok lehetnek.
A GAP egyik tagja az illesztőprogramok családjának, de az összes többinél jobb minőségű. A GAP négy számmal mutatja be az illesztés jóságát: ezek a „Minőség, az „Arány”, az „Azonosság” és a „Hasonlóság”. A Minőség egy mérőszám a szekvencia egyezésének mértékére. Az Arány egyenlő a Minőség osztva a rövidebb szegmentum bázisainak számával. Az Azonosság a ténylegesen megegyező szimbólumok százalékos aránya, a Hasonlóság pedig a hasonló szimbólumoké. A hasonlóság akkor kap értéket, ha az értékadó mátrix értéke egy szimbólumpárra nagyobb vagy egyenlő 0,50-dal, a hasonlósági küszöbbel. A Wiscon8
HU 225 785 sin Genetics Software Package 10. verziója a BLOSUM62 értékadó mátrixot használja (Henikoff és Henikoff, id. közi.).
A fehérjék esetében a „változat egy olyan fehérje, amely egy natív fehérjéből származik egy vagy több aminosav elhagyásával (úgynevezett csonkítás) vagy hozzáadásával a natív fehérje N- vagy C-terminális végeinél; egy vagy több aminosav kivágásával vagy beépítésével a natív fehérje egy vagy több pontján; vagy egy vagy több aminosav kicserélésével (szubsztitúciójával) a natív fehérje egy vagy több pontján. Az ilyen változatok keletkezésének oka például a genetikai polimorfizmus vagy az emberi beavatkozás lehet.
A találmány szerinti fehérjék különböző utakon változtathatók meg, így aminosavak cseréjével, kihagyásával vagy inszertálásával, vagy csonkítással. Az ilyen módosítások módszerei általában ismertek a szakterületen. A mutagenezis módszerei és a nukleotidszekvencia megváltoztatásai jól ismertek a szakterületen [lásd például Kunkel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 488-492 (1985); Kunkel ef a/., Meth. Enzymol. 154, 367-382 (1987); Walker és Gaastra (eds.): „Techniques In Molecular Biology”; MacMillan Publishing Co., New York, 1983; és a fentiekben idézett munkákat]. Az olyan aminosavcserékhez, amelyek nem befolyásolják a szóban forgó fehérje biológiai aktivitását, Dayhoff és munkatársai modelljében találunk útmutatást („Atlas of Protein Sequence and Structure”, Natl. Biomed. Rés. Found., Washington, D. C., 1978), amit itt referenciaként tartunk számon. Előnyösek a konzervatív szubsztitúciók, amikor egy aminosavat egy hasonló tulajdonságúval cserélünk ki.
[gy tehát a találmány szerinti gének és nukleotidszekvenciák magukban foglalják mind a természetes szekvenciákat, mind azok mutáns változatait. Hasonlóképpen, a találmány szerinti fehérjék is magukban foglalják mind a természetes fehérjéket, mind azok változatait és módosított formáit. Az ilyen változatok megőrzik a kívánt aktivitást. Magától értetődik, hogy a változatot kódoló DNS-ben végrehajtott mutáció nem helyezkedhet el a leolvasási kereten kívül, és előnyösen nem hoz létre olyan komplementer területeket, amelyek másodlagos mRNS-szerkezetek keletkezéséhez vezetnének (EP-A 75,444).
A találmány szerinti fehérjeszekvenciákban végrehajtott kihagyásoktól, beépítésektől és cseréktől nem várjuk el, hogy gyökeresen megváltoztassák a fehérje jellemzőit. Ha azonban bonyolult előre látni a csere, kihagyás vagy hozzáadás pontos hatását, akkor a szakemberek elfogadják, hogy a hatást rutin-szűrővizsgálattal kell megállapítani.
A nukleotidszekvenciák és fehérjék változataihoz tartoznak azok a nukleotidszekvenciák és fehérjék is, amelyek egy mutagén és rekombinánsokat eredményező eljárás, a DNS megkeverése útján keletkeznek. Egy ilyen eljárással egy vagy több különböző, ABA-asszociált kódolószekvencia módosítható úgy, hogy egy új, de a kívánt tulajdonságokat megőrző ABA-asszociált fehérjét hozzunk létre. Ezen a módon rekombináns polinukleotidok könyvtárai hozhatók létre hasonló szekvenciájú polinukleotidok egy populációjából, amely könyvtárak egymáshoz lényegesen hasonlító, illetve in vltro és in vivő egymással homológ módon rekombinálódó szekvenciákat tartalmaznak. A DNS megkeverésének stratégiái jól ismertek a szakterületen [Stemmer, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 10 747-10 751 (1994); Stemmer, Natúré 370, 389-391 (1994); Crameri ef a/., Natúré Biotech. 15, 436-438 (1997); Moore ef a/., J. Mól. Bioi. 272, 336-347 (1997); Zhang ef al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 4504-4509 (1997); Cameri ef al., Natúré 391, 288-291 (1998); és az US 5,605,793 és 5,837,458 számú szabadalmi iratok].
A találmány szerinti ABA-asszociált szekvenciák expressziós keretekbe foglalva juttathatók be az érintett növényekbe. A keret 5’ és 3’ regulátorszekvenciákat tartalmazhat működőképes módon egy találmány szerinti ABA-asszociált szekvenciához kapcsolva. A „működőképes módon” kifejezés egy funkcionális kapcsolatot jelent egy promoter és egy második szekvencia között, ahol a promoterszekvencia indítja meg és közvetíti a második szekvenciának megfelelő DNSszekvencia transzkripcióját. Általában a „működőképes módon összekapcsolva” azt jelenti, hogy a nukleinsavszekvenciák folytatólagosan és ugyanabban a keretben vannak egyesítve. A keret adott esetben tartalmazhat még legalább egy további gént a szervezet kotranszformációja céljából. Más megoldásként a további gének több expressziós keretben is bejuttathatok.
Az ilyen expressziós keretek restrikciós helyek sokaságát tartalmazhatják a szóban forgó szekvencia beillesztése céljából a regulátorterületek transzkripciót szabályozó hatása alá. Az expressziós keretek adott esetben szelektálható markergéneket is tartalmazhatnak.
Az expressziós keret a transzkripció 5’->3' irányában tartalmaz egy transzkripciós és transzlációs kezdőterületet, egy találmány szerinti DNS-szekvenciát és egy transzkripciós és transzlációs terminátorterületet, amelyek működőképesek egy növényben. A transzkripciós kezdőterület, a promoter lehet natív, analóg, idegen vagy heterológ a gazdanövény számára. Emellett a promoter lehet egy természetes vagy egy szintetikus szekvencia. Az „idegen” jelző azt jelenti, hogy a transzkripciós kezdőterület eredetileg nem található meg abban a növényben, amelybe bejuttatjuk. Egy „kiméra gén egy kódolószekvenciát tartalmaz működőképes módon összekapcsolva egy olyan transzkripciós kezdőterülettel, amely heterológ a kódológénhez képest. Bár előnyös lehet a szekvenciákat heterológ promoterekkel kifejeztetni, használhatunk natív promoterszekvenciákat is. Ennek megfelelően megváltozik a növény vagy sejt fenotípusa.
A terminátorterület származhat a transzkripciós kezdőhellyel vagy az ahhoz kapcsolt DNS-szekvenciával azonos vagy eltérő forrásból. Kényelmesen használható terminátorterületek nyerhetők az A. tumefaciens Ti-plazmidjából; ilyenek az oktopin-szintetáz- és a nopalin-szintetáz-gének terminátorterületei [Guerineau ef al., Mól. Gén. Génét. 262, 141-144 (1991); Proudfoot, Cell 64, 671-674 (1991); Sanfacon ef al.,
HU 225 785
Genes. Dev. 5, 141-149 (1991); Mogen ef al., Plánt Cell 2, 1261-1272 (1990); Munroe ef al., Gene 91, 151-158 (1990); Ballas ef al., Nucl. Acids Rés. 17, 7891-7903 (1989); Joshi ef al., Nucl. Acids Rés. 15, 9627-9639 (1987)].
Ahol az a megfelelő, a gén(ek) optimalizálható(k) a növényben való fokozott kifejeződés érdekében. így tehát a gének a növények által előnyben részesített kodonok felhasználásával szintetizálhatok. A növényekben előnyös gének szintézisének módszerei rendelkezésünkre állnak [US 5,380,831 és 5,463,391 számú szabadalmi iratok, valamint Murray et al., Nucl. Acids Rés. 17, 477-498 (1989); a hivatkozott közleményeket referenciaként tartjuk számon].
Ismertek másféle szekvenciamódosítások is, amelyekkel egy gén expressziója fokozható egy gazdasejtben. Ezek közé tartozik a gén kifejeződését megnehezítő, jól ismert szekvenciák eltávolítása: ilyenek a hamis poliadenilációs szekvenciák, az exon-intron tapadási helyek, a transzpozonszerű ismétlések és hasonlók. A szekvencia G/C aránya is beállítható az adott gazdasejtnek megfelelő átlagértékre, ami a sejt ismert génjeiből számítható ki. Ha lehetséges, a szekvenciát úgy módosítjuk, hogy elkerüljük a másodlagos „hajtű mRNS-szerkezetek keletkezését.
Az expressziós keret adott esetben tartalmazhat 5' vezetőszekvenciákat is a szerkezetében. Az ilyen vezetőszekvenciák fokozhatják a transzlációt. Az ismert transzlációvezetők közé tartoznak a következők: picornavírus-vezetők, például az EMCV-vezető [enkefalomiokarditisz 5’ nem kódoló terület; Elroy-Stein ef al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 6126-6130 (1989)], potyvírus-vezetők, például a TEV- (dohány karcolatos vírus) vagy az MDMV- (kukorica törpe mozaik vírus) vezető [Allison ef al., Virology 154, 9-20 (1986)], a humán immunglobulin nehézlánc-kötő fehérje [BiP; Macejak ef al., Natúré 353, 90-94 (1991)], a lucernamozaik-vírus köpenyfehérje mRNS-ének nem lefordított vezetője [AMV RNA4; Jobbling ef al., Natúré 325, 622-625 (1987)], a dohánymozaik-vírus vezetője [TMV; Gallie et al., in „Molecular Biology of RNA”, pp. 237,256; Cech (ed.), Liss, New York, 1989] és a kukorica klorotikus foltosság vírus vezetője [MCMV; Lömmel ef al., Virology 81, 382-385 (1991)]. A fentiekről lásd még Della-Cioppa és munkatársai közleményét [Plánt Physiol. 84, 965-968 (1987)]. A transzláció fokozására más, ismert módszerek, például intronok alkalmazása és hasonlók is használhatók.
Az expressziós keret elkészítése során a különböző DNS-fragmentumok manipulálhatók például úgy, hogy a szekvenciák a megfelelő irányultságúak és a megfelelő leolvasási keretben legyenek. A manipulációk közé tartozik adapterek vagy linkerek alkalmazása a DNS-fragmentumok egyesítéséhez, vagy más műveletek, például kényelmesen használható restrikciós helyek biztosítása, felesleges DNS-szakaszok és restrikciós helyek eltávolítása és a többi. Erre a célra in vitro mutagenezis, primerjavítás, restrikció, összeolvasztás és reszubsztitúciók, például áthelyezések és átfordítások alkalmazhatók.
A transzformáció, valamint a nukleotidszekvenciák növényekbe juttatásának módja a megcélzott növény vagy növényi sejt típusától (például egy- vagy kétszikű) függhet. A nukleotidszekvenciák növényi sejtekbe juttatására, majd azt követően a növény genomjába való beépítésére alkalmas módszerek közé tartozik a mikroinjektálás [Crossway ef al., Biotechniques 4, 320-334 (1986)], az elektroporáció [Riggs ef al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 5602-5606 (1986)], az Agrobacteriummal közvetített transzformáció (US 5,563,055 és 5,981,840), a közvetlen géntranszfer [Paszkowszki ef al., EMBO J. 3, 2717-2722 (1984)] és a ballisztikus részecskegyorsítás [US 4,945,050; Tömés ef al., in „Plánt Cell, Tissue and Organ Culture: Fundamental Methods; Gamborg és Phillips (eds.), Springer Verlag, Berlin, 1995; McCabe etal., Biotechnology 6, 923-926 (1988)]. A témával kapcsolatban lásd még Weissinger és munkatársai [Annu. Rév. Génét. 22, 421-477 (1988)], Sanford és munkatársai [Particulate Science and Technology 5, 27-37 (1987), hagyma], Christou és munkatársai [Plánt Physiol. 87, 671-674 (1988), szója], McCabe és munkatársai [Bio/Technology 6, 923-926 (1988), szója], Finer és McMullen [In Vitro Cell Dev. Bioi. 27P, 175-182 (1991), szója], Singh és munkatársai [Theor. Appl. Génét. 96, 319-324 (1998), szója], Datta és munkatársai [Biotechnology 8, 736-740 (1990), rizs], Klein és munkatársai [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 4305-4309 (1988), kukorica], Klein és munkatársai [Biotechnology 6, 559-563 (1988), kukorica], Klein és munkatársai [Plánt Physiol. 91, 440-444 (1988), kukorica], Fromm és munkatársai [Biotechnology 8, 833-839 (1990), kukorica], Hooykaas-VanSIogteren és munkatársai [Natúré 311, 763-764 (1984)], Bytebier és munkatársai [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 5345-5349 (1987), liliomfélék], De Wet és munkatársai [in „The Experimental Manipulation ofövule Tissues, pp. 197-209 (pollen), Chapman ef al. (eds.), Longman, New York, 1985], Kaeppler és munkatársai [Plánt Cell Reports 9, 415-418 (1990) és Theor. Appl. Génét. 84, 560-566 (1992), habveréssel segített transzformáció], D’Halluin és munkatársai [Plánt Cell 4, 1495-1505 (1992), elektroporáció], Li és munkatársai [Plánt Cell Reports 12, 250-255 (1993), rizs], Christou és Ford [Annals of Botany 75, 407-413 (1995), rizs] és Osjoda és munkatársai [Natúré Biotechnology 14, 745-750 (1996), kukorica Agrobacterium tumefaciensen át] közleményeit, valamint az US 5,240,855, 5,322,783, 5,324,646 és 5,736,369 számú szabadalmi iratokat, amelyeket referenciaként tartunk számon.
A transzformált sejtekből növények nevelhetők fel szokványosnak tekinthető módszerekkel [lásd például McCormick et al., Plánt Cell Reports 5, 81-84 (1996)]. A felnevelt növények ezután megtermékenyíthetők ugyanabból vagy más transzformált klónból származó virágporral, és az így kapott hibridekben azonosítható a kívánt fenotípusos tulajdonság konstitutív kifejeződése. Két vagy több nemzedéket lehet felnevelni, hogy meggyőződhessünk a kívánt fenotípusos tulajdonság konstitutív kifejeződésének állandósulásáról és örökle10
HU 225 785 tessé válásáról, azaz a magvakkal való átvihetőségéről egyik nemzedékből a másikba.
A találmány szerinti eljárások bármely növényfaj, mind egyszikűek, mind kétszikűek transzformálására alkalmasak, mint amilyenek a kukorica (Zea mays), a káposztafajok (Brassica napus, B. rapa. B juncea), különösen azok a Srass/ca-fajok, amelyek magvai olajforrásként használhatók, a lucerna (Medicago sativa), a rizs (Oryza sativa), a rozs (Secale cereale), a cirok (Sorghum bicolor, S. vulgare), a gyöngyköles (Pennisetum glaucum), a köles (Panicum miliaceum), az olasz muhar (Setaria italica), az ujjas muhar (Eleusine coracana), a napraforgó (Helianthus annuus), az olajözön (Carthamus tinctorius), a búza (Triticum aestivum), a szója (Glycine max), a dohány (Nicotiana tabacum), a burgonya (Solanum tuberosum), a földimogyoró (Arachis hypogaea), a gyapot (Gossypium barbadense, G. hirsutum), az édesburgonya (Ipomoea batatas), a tápióka (Manihot esculenta), a kávé (Coffea spp.), a kókusz (Cocos nucifera), az ananász (Ananas comosus), a citrusok (Citrus spp.), a kakaó (Theobroma cacao), a tea (Camellia sinensis), a banán (Musa spp.), az avokádó (Persea americana), a füge (Ficus caríca), a guava (Psidium guajava), a mangó (Mangifera indica), az olajfa (Olea europaea), a papaja (Caríca papaya), a kesu (Anacardium occidentale), a Macadamia integrifolia, a mandula (Prunus amygdalus), a cukorrépa (Béta vulgáris), a cukornád (Saccharum spp.), a zab, az árpa, zöldségnövények, dísznövények és tűlevelűek; a felsorolás nem kizáró jellegű.
A zöldségnövények közé tartozik a paradicsom (Lycopersicon esculentum), a saláta (Lactuca sativa), a zöldbab (Phaseolus vulgáris), a limabab (Phaseolus limensis), a borsó (Pisum sativum) és a Cucumis nemzetség fajai (C. sativus, C. cantalupensis, C. meló). A dísznövények közé tartozik az azálea (Rhododendron spp.), a hortenzia (Hydrangea macrophylla), a mályvarózsa (Hybiscus rosanensis), a rózsa (Rosa spp.), a tulipán (Tulipa spp.), a nárcisz (Narcissus spp.), a petúnia (Petúnia hybrida), a szegfű (Dianthus caryiphyllus), a mikulásvirág (Euphorbia pulcherrima) és a krizantém. A találmányunk gyakorlatában alkalmazható tűlevelűek közé tartozik a Pinus tadea, P. elliotii, P. ponderosa, P. contorta és P. radiata, a Pseudotsuga menziesii, a Tsuga canadensis, a Picea glauca, a Sequoia sempervirens, az Abies amabilis és az A. balsamea, a Thuja plicata és a Chamaecyparis nootkatensis. A találmány szerinti növények előnyösen haszonnövények (például rizs, kukorica, lucerna, napraforgó, Srass/ca-fajok, szója, gyapot, olajözön, földimogyoró, cirok, köles, búza, dohány és a többi), előnyösebben kukorica-, rizs- és cirokfajták.
Különösen fontosak a gabonafélék, az olajos magvúak és a hüvelyesek. A gabonamagvak közül fontos a kukorica, búza, árpa, rizs, cirok, rozs és a többi. Az olajos magvúak közé tartozik a gyapot, szója, olajözön, napraforgó, repce, kukorica, lucerna, olajpálma, kókusz és a többi. A hüvelyesek közé tartoznak a babok és borsók. A babok közé tartozik a guarbab, szentjánoskenyér, görögszéna, szója, a veteménybabok, tehénborsó, mungóbab, limabab, lóbab, a lencsék, csicseriborsó és a többi.
Az alábbi példák csak a bemutatást szolgálják, és nem korlátozzák találmányunk oltalmi körét.
1. példa
Kukorica transzformálása részecskebombázással és a transzgén növények felnevelése Üvegházban nevelt kukoricanövényekről nyert, éretlen embriókat bombázunk egy plazmiddal, amely az ABI3 szekvenciát, egy működőképes módon hozzákapcsolt korai mag/embrió promotert és egy szelektálható markergént [PAT; Wohlleben et al., Gene 70, 25-37 (1988)] tartalmaz, ami a bialafosz herbiciddel szembeni rezisztenciát kódolja. Más megoldásként a szelektálható markergént külön plazmidban juttatjuk be. A transzformáció módját és a tápközegek receptjeit az alábbiakban közöljük.
A célszövet előkészítése
A kukoricacsöveket lefosztjuk, és felületüket 30%-os Clorox fehérítőt és 0,5% Micro detergenst tartalmazó oldattal fertőtlenítjük 20 percen át, majd steril vízzel kétszer leöblítjük. Az éretlen embriókat kimetsszük, és az embriótengellyel lefelé (a scutellummal felfelé) 560Y táptalajba ágyazzuk (25 embriót lemezenként) 4 órára, majd elrendezzük azokat a bombázás 2,5 cm-es célfelületére.
A DNS előkészítése
Elkészítünk egy plazmidvektort, amely ABI3 szekvenciát tartalmaz működőképes módon összekapcsolva egy korai mag/embrió promoterrel. Ezt a plazmidDNS-t és a PAT szelektálható markert tartalmazó plazmid-DNS-t 1,1 pm átlagos átmérőjű volfrámszemcsékre csapatjuk ki egy kalcium-kloridos eljárással, amihez a következő anyagokat használjuk:
100 pl előkészített volfrámszemcse vízben, μΙ (1 pg) DNS Tris-EDTA pufferben (összesen pg DNS),
100 pl 2,5 M kalcium-klorid-oldat és 10 pl 0,1 M spermidinoldat.
Az egyes reagenseket egymás után adjuk a volfrámszemcsék szuszpenziójához folytonos keverés közben. A végső elegyet ultrahanggal röviden kezeljük, majd keverés közben inkubáljuk 10 percen át. A kicsapódási idő után a csöveket lecentrifugáljuk, a folyadékot leöntjük, az üledéket 500 pl 100%-os etanollal mossuk és 30 másodpercig centrifugáljuk. A folyadékot újra eltávolítjuk, majd a kész volfrámszemcse-üledékhez 105 pl 100%-os etanolt adunk. A bombázáshoz a volfrám/DNS szemcséket ultrahanggal röviden kezeljük, 10 μΙ-t helyezünk minden makrohordozó közepére, és 2 percen át száradni hagyjuk a bombázás előtt.
Kezelés a szemcsékkel
A mintalemezeket a 4-es szinten bombáztuk HE34—1 vagy HE34-2 részecskeágyúval. Minden minta egy lövést kapott 4472 kPa nyomással; csövenként 10 aliquot szemcse/DNS szuszpenziót használunk fel.
További kezelések
A bombázás után az embriókat az 560Y tápközegben tartjuk 2 napon át, majd átrakjuk az 560R tápkö11
HU 225 785 zegbe, amely 3 mg/l bialafoszt tartalmaz. Itt körülbelül 10 héten át neveljük, miközben kéthetente felfrissítjük a tápközeget. Ezután a szelekcióra rezisztens kalluszokat átrakjuk a 288J tápközegbe, ahol megindul a növény regenerálódása. A szomatikus embriók érése (2-4 hét) után a jól fejlődő szomatikus embriókat csíráztató tápközegbe tesszük át, és megvilágított tenyésztőszobában helyezzük el. Körülbelül 7-10 nappal később a fejlődő növénykéket a 272V hormonmentes táptalajra visszük át kémcsövekbe, 7-10 napra, amíg a növénykék jól beállnak. Ezután átültetjük azokat 6,5 cm-es cserepekbe, talajba, 1 hétig neveljük tenyésztőkamrában, további 1-2 hétig üvegházban, majd újra átültetjük 6 l-es dézsákba és teljesen felneveljük. A növényeket megfigyeljük és értékeljük.
Tápközegek
560Y (bombázó tápközeg): 4,0 g/l N6 alapsókeverék (Sigma, C-1416), 1,0 ml/l Eriksson-féle vitaminkeverék (1000x Sigma-1511), 0,5 mg/l tiamin-hidroklorid, 120,0 g/l szacharóz, 1,0 mg/l 2,4-D és 2,88 g/l L-prolin; desztillált vízzel feltöltjük a kívánt térfogatra, a pH-t 5,8-re állítjuk kálium-hidroxiddal; hozzáadunk 2,0 g/l Gelrite-et, sterilizáljuk, majd lehűlés után 8,5 mg/l ezüst-nitrátot adunk hozzá.
560R (szelektáló tápközeg): 4,0 g/l N6 alapsókeverék, 1,0 ml Eriksson-féle vitaminkeverék, 0,5 mg/l tiamin-hidroklorid, 30,0 g/l szacharóz és 2,0 mg/l 2,4-D; desztillált vízzel feltöltjük a kívánt térfogatra, a pH-t 5,8-re állítjuk kálium-hidroxiddal; hozzáadunk 3,0 g/l Gelrite-et, sterilizáljuk, majd lehűlés után 0,85 mg/l ezüst-nitrátot és 3,0 mg/l bialafoszt adunk hozzá.
288J (regeneráló tápközeg): 4,3 g/l MS sókeverék (Gibco 11117-074), 5,0 ml/l MS vitamintörzsoldat [0,100 g/l nikotinsav, 0,02 g/l tiamin-hidroklorid, 0,10 g/l piridoxin-hidroklorid és 0,40 g/l glicin desztillált vízben; Murashige és Skoog, Physiol. Plánt. 15, 473 (1962)], 100 mg/l mioinozitol, 0,5 mg/l zeatin, 60 g/l szacharóz és 1,0 ml/l 0,1 mM abszcizinsav; desztillált vízzel feltöltjük a kívánt térfogatra, a pH-t 5,6-re állítjuk, hozzáadunk 3,0 g/l Gelrite-et, sterilizáljuk, majd 60 °C-ra való lehűlés után 1,0 mg/l indol-ecetsavat és 3,0 mg/l bialafoszt adunk hozzá.
272V (hormonmentes tápközeg): 4,3 g/l MS sókeverék, 5,0 ml MS vitamintörzsoldat, 0,1 g/l mioinozitol és 40,0 g/l szacharóz; desztillált vízzel feltöltjük a kívánt térfogatra, a pH-t 5,6-re állítjuk, hozzáadunk 6 g/l Bacto-agart, sterilizáljuk és 60 °C-ra lehűtjük.
2. példa
Agrobacterium-közvef/fésű transzformálás
A kukorica Agroöacfer/um-közvetítésű transzformálásához egy ABI3 szekvenciával és a működőképes módon hozzá kapcsolt korai mag/embrió promoterrel előnyösen Zhao eljárását alkalmazzuk (US 5,981840 és WO 98/32326 számú szabadalmi iratok, amelyeket referenciaként tartunk számon). Röviden, éretlen embriókat izolálunk a kukoricáról, majd azokat egy Agroőacfenum-szuszpenzióval érintkeztetjük, ahol a baktérium képes az ABI3 szekvenciát és a működőképes módon hozzá kapcsolt korai mag/embrió promotert átvinni legalább egy éretlen embrió legalább egy sejtjébe (1. lépés: a fertőzés). Ebben a lépésben az éretlen embriót előnyösen bemerítjük egy Agrobacterium-szuszpenzióba a fertőzés megindításához. Ezután az embriókat az Agrobacteríummal együtt tenyésztjük (2. lépés: a közös tenyésztés). Az éretlen embriókat a fertőzési lépés után előnyösen egy szilárd táptalajon tenyésztjük. A közös tenyésztés után adott esetben egy „pihentető lépést is beiktathatunk, amikor az embriókat legalább egy olyan antibiotikum jelenlétében inkubáljuk, amely tudottan gátolja az Agrobacterium szaporodását, de nem alkalmazunk olyan szert, amely szelektálná a transzformált növényeket (3. lépés: a pihentetés). A következő lépésben az inokulált embriókat egy szelektálószert tartalmazó táptalajon tenyésztjük, ahonnan megkapjuk a növekedő, transzformáit kalluszokat (4. lépés: a szelekció). A kalluszokat növényekké regeneráltatjuk (5. lépés: a regeneráció), azaz a szelektív táptalajon növekedő kalluszokat előnyösen szilárd táptalajon tenyésztve növényekké neveljük fel.
3. példa
Szójacsíra transzformálása
A szójacsírákat egy olyan plazmiddal, ágyúzással transzformáljuk, amely az ABI3 nukleotidszekvenciát tartalmazza egy működőképes módon hozzá kapcsolt korai magbél/embrió promoterrel együtt. A szomatikus embriók indukálásához 3-5 mm hosszúságú szikleveleket metszünk ki az A2872 szójafajta sterilezett felszínű, éretlen magvaiból, majd megvilágításban vagy sötétben, 26 °C-on neveljük azokat egy megfelelő, agaros táptalajon, 6-10 héten át. A másodlagos szomatikus embriókat ezután kivágjuk és egy megfelelő tápfolyadékba tesszük. A szomatikus embriókat ismételten szelektálva kiválasztjuk azokat, amelyek korai, globuláris állapotú embrióként szaporodnak, majd ezekből szuszpenziótenyészetet készítünk az alábbiak szerint.
A szója embriogén szuszpenziótenyészetet 35 ml tápfolyadékban, forgó rázógépen (150 f/perc), 26 °C hőmérsékleten, fluoreszcensz fényben, 16/8 órás fény/sötét ciklus mellett tartjuk fenn. A tenyészeteket kéthetente felújítjuk, amikor körülbelül 35 mg szövetet viszünk át 35 ml friss tápfolyadékba.
A szója embriogén szuszpenziótenyészetet a részecskebelövéses módszerrel transzformáljuk [Klein et al., Natúré 327, 70-73 (1987); US 4,945,050], A transzformáláshoz egy DuPont Biolistic PDS1000/HE (héliumtöltésű) készüléket használunk.
A szelektálható jelzőgén, ami a szója transzformálását segíti, egy transzgén készítmény, ami a karfiolmozaik-vírus [CMV; Odell et al., Natúré 313, 810-812 (1985)] 35S promoteréből, az E. coli higromicin-foszfotranszferáz-génjéből [a pJR225 plazmidból véve; Gritz et al., Gene 25, 179-188 (1983)] és az Agrobacteríum tumefaciens Ti-plazmidja T-DNS-ében lévő nopalinszintetáz-gén 3’-területéből van összeépítve. Az ABI3 nukleotidszekvenciát és a hozzá működőképes módon kapcsolt korai magbél/embrió promotert tartalmazó expresszíós keretet restrikciós fragmentumként
HU 225 785 izolálhatjuk, ami azután beépíthető a jelzőgént hordozó vektor egy egyedi restrikciós helyére.
Az 1 pm szemcseméretű aranyszemcse-szuszpenzió (60 mg/ml) 50 μΙ-éhez sorban 5 μΙ DNS-oldatot (1 μθ/μΙ), 20 μΙ spermidinoldatot (0,1 M) és 50 μΙ kalcium-klorid-oldatot (2,5 M) adunk. Ezután a készítményt 3 percen át rázzuk, majd egy mikrocentrifugában 10 s-ig ülepítjük, és a felülúszót eltávolítjuk. A DNS-sel bevont szemcséket 400 μΙ 70%-os etanollal mossuk, és 40 μΙ vízmentes etanolban felszuszpendáljuk. A DNS/szemcse szuszpenziót háromszor 1 s-ig ultrahanggal kezeljük, majd 5 μΙ-es adagokat teszünk minden makrohordozókorongra.
A kéthetes szuszpenziótenyészetből körülbelül 300-400 mg-ot teszünk egy üres, 60*15 mm-es Petricsészébe, és a felesleges tápfolyadékot pipettával eltávolítjuk. Minden transzformációs kísérletben körülbelül 5-10 szövetmintát ágyúzunk. A membránt átszakító nyomást 7568 kPa-ra állítjuk be, a kamrában 94,92 kPa vákuumot létesítünk. A szövetmintát körülbelül 8,9 cm-re tesszük a visszatartó rácstól, majd három lövést adunk le rá. Az ágyúzás után a szövetet két részre osztjuk, és friss tápfolyadékban tenyésztjük tovább a fent leírt módon.
A transzformálás utáni 5-7. napon a tápfolyadékot frissre cseréljük, majd a 11-12. napon újra friss, de 50 mg/ml higromicint tartalmazó tápfolyadékra. Ezt a szelektáló tápfolyadékot hetente cseréljük. A transzformálás után 7-8 héttel zöld, transzformált szövet figyelhető meg, amint kinő a transzformálatlan, nekrotikus embriogén sejthalmazokból. A zöld szövetet izoláljuk, és egyedi palackokba oltva, új kiónokként tenyésztjük tovább a transzformált embriogén szuszpenziótenyészeteket. Minden új vonalat független transzformációs eseményként kezelünk. Ezután a szuszpenziókat fióktenyészetekre osztjuk, és vagy éretlen embriók halmazaként tenyésztjük tovább, vagy teljes növényeket regenerálunk belőlük az egyes embriók megérlelése és csíráztatása útján.
4. példa
Napraforgó-merisztéma transzformálása
A napraforgó-merisztémát egy olyan expressziós kerettel transzformáljuk, amely az ABI3 szekvenciát tartalmazza működőképes módon összekapcsolva egy korai magbél/embrió promoterrel [lásd az EP 486233 számú szabadalmi iratot, illetve Malone-Schoneberg ef a/., Plánt Sci. 103, 199-207 (1994) közleményét]. Érett napraforgómagvakat (Helianthus annuus L.) kalászcséplővel lehántolunk, majd a magbelek felszínét 20%-os, 50 ml-enként 2 csepp Tween 20-at tartalmazó Chlorox fehérítőszerrel fertőtlenítjük 30 percen át. Az így kezelt magbeleket steril desztillált vízzel kétszer leöblítjük.
Embriótengely-preparátumot készítünk Schrammeijer és munkatársai módosított eljárásával [Plánt Cell Rep. 9, 55-60 (1990)]. A magvakat a fertőtlenítés után 60 percre desztillált vízbe áztatjuk. Ezután az egyes magok szikleveleit kitörjük az embriótengely síkjában, levágjuk a gyökércsúcsot, majd az embriót hosszában kettévágjuk a két elsődleges levél között. A két féldarabot ezután vágott felszínükkel felfelé GBA táptalajra fektetjük, ami Murashige-Skoog-nyomelemoldatot [Murashige ef a/., Physiol. Plánt. 15, 473-479 (1962)], Shepard-féle vitaminadalékot (Shepard, in „Emergent Techniques fór the Genetic Improvement of Crops”; Univ. Minnesota Press, St. Paul. Mi., 1980), 40 mg/l adenin-szulfátot, 30 g/l szacharózt, 0,5 mg/l 6-benzil-amino-purint (BAP), 0,25 mg/l indol-3-ecetsavat (IAA), 0,1 mg/l gibberellinsavat (GA3) és 8 g/l Phytagart tartalmaz; pH-ja 5,6.
Az explantátumokat mikroszemcsés ágyúzással kezeljük az Agrobacterium-os kezelés előtt [Bidney et al., Plánt Mól. Bioi. 18, 301-313 (1992)]. Ehhez 30-40 embriótengelyt helyezünk el körben, a 60*20 mm-es lemez közepén. Körülbelül 4,7 mg, 1,8 μπι átmérőjű volfrámszemcsét elszuszpendálunk 25 ml steril TE-pufferben (10 mM Tris-HCI, 1 mM EDTA, pH=8,0), majd a szuszpenzióból lövésenként 1,5 ml-eket használunk fel. Minden lemezre kétszer lövünk egy 150 mm-es Nytex hálón át, ami 2 cm-rel van a minta felett kifeszítve. Az ágyúzáshoz egy PDS 1000 szemcsegyorsító készüléket használunk.
„Hatástalanított Agrobacterium tumefaciens törzset (EHA105) használunk minden transzformációs kísérletben. Egy kettős plazmidvektort - amely az ABI3 gént és a működőképes módon hozzákapcsolt korai magbél/embríó promotert tartalmazó expressziós keretet hordozza - juttatunk az EHA105 Agrobacterium törzsbe Holster és munkatársai fagyasztás-olvasztás módszerével [Mól. Gén. Génét. 163, 181-187 (1978)]. Ez a plazmid tartalmaz még egy szelektálható jelzőgént is (kanamicinrezisztencia, nptll). A növények transzformálásához a baktériumot egy éjszakán át tenyésztjük (28 °C, 100 f/perc állandó rázás) YEP tápfolyadékban [10 g/l élesztőkivonat, 10 g/l pepton (Bacto) és 5 g/l nátrium-klorid, pH=7,0], a megfelelő antibiotikumokkal kiegészítve, amelyek a baktériumtörzs és a kettős plazmid fenntartásához szükségesek. A szuszpenziót akkor használjuk, amikor 600 nm-nél mért optikai sűrűsége körülbelül 0,4-0,8 lesz. Ekkor a sejteket kiülepítjük, majd felszuszpendáljuk OD600=0,5 sűrűségre egy inokuláló tápfolyadékban, ami 12,2 mM MES-t (pH=5,7), 1 g/l ammónium-kloridot és 0,3 g/l magnézium-szulfátot tartalmaz.
A frissen ágyúzott explantátumokat az Agrobacteríum-szuszpenzióba tesszük, elkeverjük, majd 30 percre állni hagyjuk. Ezután áttesszük azokat a GBA táptalajra, vágott felszínükkel lefelé, és 26 °C-on, 18 órás megvilágítás mellett inkubáljuk. Három nap múlva az explantátumokat áttesszük a 374B táptalajra (GBA táptalaj növekedésszabályozók nélkül és 1%-ra csökkentett szacharóztartalommal), ami 250 mg/l cefotaximmal és 50 mg/l kanamicin-szulfáttal van kiegészítve. Ezen tenyésztjük az explantátumokat 2-5 héten át szelektálás céljából, majd áttesszük friss, kanamlclnt nem tartalmazó 374B táptalajra, 1-2 hétre, a továbbfejlődés céljából. A differenciálódó, antibiotikumrezisztens, de kivágásra alkalmas hajtást nem hozó explantátumokat újra GBA táptalajra (250 mg/l cefotaxim) tesszük egy
HU 225 785 második, 3 napos hormonkezelésre. A zöld, kanamicinrezisztens hajtásokról vett levélmintákat ELISA-val megvizsgáljuk az NPTII jelenlétére, valamint az átvitt gén expressziójára azzal, hogy ellenőrizzük a növény válaszát az ABA-ra.
Az NPTII-pozitív hajtásokat a Pioneer® 6440 hibrid napraforgó-csíranövények gyökérnyakába oltjuk. A csíranövényeket in vitro neveljük: sterilezett felszínű magvakat csíráztatunk 48-0 táptalajon (félerősségű MS-sóoldat, 0,5% szacharóz, 0,3% Gelrite, pH=5,6), az explantátumtenyészet körülményei között. A csíranövények felső részét levágjuk, a hajtást függőleges irányban, 1 cm hosszan bevágjuk, és a transzformált hajtást a vágásba illesztjük. Az egész területet Parafilmbe tekerjük, hogy a hajtást biztosítsuk. Az oltott növényeket 1 hetes in vitro nevelés után talajba ültetjük át, előbb magas páratartalom mellett neveljük, majd lassan akklimatizáljuk az üvegházi körülményekhez. Az üvegházban felnevelt To növények (szülői generáció) transzformált szektorait például NPTII ELISA-val azonosítjuk levélkivonatokból, az NPTII-pozitív To növényekről szedett transzgén magvakat pedig úgy ellenőrizzük, hogy megvizsgáljuk a növény ABA-ra adott válaszának módosulását.
5. példa
Kukorica transzformálása
Transzgén kukoricanövényeket hozunk létre az 1. példában leírt módon, egy olyan DNS-szerkezetet használva, amely egy vad típusú Vp1 szekvenciát (1. számú szekvenciavázlat) tartalmaz működőképes módon egy oleozinpromoterhez kapcsolva. A plazmid része még a PAT szelektálható jelzőgén is [Wohlleben et a/., Gene 70, 25-37 (1998)]. Amint az 1. példában leírtuk, izoláljuk azokat a növényeket, amelyekbe az oleozin:Vp1 DNS-szerkezet stabilan beépült.
Eyster és munkatársai módszerével izoláljuk azokat a növényeket, amelyekben a vp1 funkcióvesztéssel járó mutációja jelent meg [Genetics 16, 574-590 (1931); referenciaként tartjuk számon]. Az ilyen növényeket a csökkent ABA-érzékenység jellemzi. A stabilan beépült oleozin:Vp1 DNS-szerkezetet hordozó, transzgén kukoricanövényeket ezután funkcióvesztett vp1-mutáns növényekkel keresztezzük. Az így kapott utódokat visszakeresztezve olyan növényt kapunk, amelynek genotípusa vp1/vp1; oleozin:Vp1/oleozin:Vp1. Ebben a növényben nem érvényesül az ABA káros hatása a korai embrióra, de működni fog benne a Vp1 a késői magbél/embrió fejlődés során, és lehetővé teszi a magbél normális beérését.
A leírásban idézett összes közlemény és szabadalmi irat azt a szakmai szintet jelzi a szakemberek számára, amelyen találmányunk is elhelyezkedik. Az összes idézett közleményt és szabadalmi iratot referenciaként tartjuk számon ugyanolyan mértékben, mintha az egyes közleményeknél és szabadalmi iratoknál kifejezetten feltüntettük volna ezt a tényt.
Bár találmányunkat részletesen leírtuk a bemutatás céljával, és példákkal illusztráltuk a világosabb érthetőség kedvéért, nyilvánvaló, hogy bizonyos változtatások és módosítások végezhetők azon az igénypontok oltalmi körén belül.
(SZEKVENCIÁK JEGYZÉKE) SEQUENCE LISTING <110> Helentjaris, Tim <120> Modulation of Abscisic Acid <130> 35718/205302 <150> US 60/166,080 <151> 1999-11-17 <160> 13 <170> FastSEQ fór Windows Version 4.0 <210> 1 <211> 2456 <212> DNA <213> Zea mays <220>
<221> misc_feature <222> (0)...(0) <223> vpl cDNA (Genbank Accession No. M60214) <221> CDS <222> (73)...(2148)
HU 225 785 <400> 1 ctacacccga gaggcggcgg cggcagacac agacaccgtc tctctcctcc ctttgtcgtc gtgcctctct gc atg gaa gcc tcc tcc ggc tcg tcg cca ccg cac tcc caa
Met Glu Alá Ser Ser Gly Ser Ser Pro Pro His Ser Gin 15 10
111
gag Glu aac Asn 15 ccg Pro ccg Pro gag Glu cac His ggt Gly 20 ggc Gly gac Asp atg Met gga Gly ggg Gly 25 gcc Alá ccc Pro gcg Alá gag Glu
gag atc gga ggg gag gcg gcg gat gac ttc atg ttc get gaa gac acg
Glu Ile Gly Gly Glu Alá Alá Asp Asp Phe Met Phe Alá Glu Asp Thr
30 35 40 45
ttc ccc tcc ctc ccg gac ttc cet tgc ctt tcg tcg ccg tcc agc tcc
Phe Pro Ser Leu Pro Asp Phe Pro Cys Leu Ser Ser Pro Ser Ser Ser
50 55 60
acc ttc tcg tcc aac tcc tcg tea aac tcc tcc agc gcc tac acc aac
Thr Phe Ser Ser Asn Ser Ser Ser Asn Ser Ser Ser Alá Tyr Thr Asn
65 70 75
acg gca gga aga gcc ggc ggc gag ccc tcc gag cet get tcg gcc gga
Thr Alá Gly Arg Alá Gly Gly Glu Pro Ser Glu Pro Alá Ser Alá Gly
80 85 90
gaa ggg ttt gat gcg ctc gat gac atc gac cag ctc ctc gac ttc gcg
Glu Gly Phe Asp Alá Leu Asp Asp Ile Asp Gin Leu Leu Asp Phe Alá
95 100 105
tcg ctt tcc atg ccg tgg gac tcc gag ccg ttc ccg ggg gtt agc atg
Ser Leu Ser Met Pro Trp Asp Ser Glu Pro Phe Pro Gly Val Ser Met
110 115 120 125
atg cta gag aac gcc atg tcg gcg ccg ccg cag ccg gtg ggc gac ggc
Met Leu Glu Asn Alá Met Ser Alá Pro Pro Gin Pro Val Gly Asp Gly
130 135 140
atg agt gaa gag aaa gcc gtg ccg gaa ggg acc acg ggg gga gag gag
Met Ser Glu Glu Lys Alá Val Pro Glu Gly Thr Thr Gly Gly Glu Glu
145 150 155
gcc tgc atg gat gcg tcg gag ggg gag gag ctg ccg egg ttc ttc atg
Alá Cys Met Asp Alá Ser Glu Gly Glu Glu Leu Pro Arg Phe Phe Met
160 165 170
gag tgg ctc acg agc aac ege gaa aac atc tcg gcc gag gat ctc ege
Glu Trp Leu Thr Ser Asn Arg Glu Asn Ile Ser Alá Glu Asp Leu Arg
175 180 185
ggg atc ege ctc ege ege tcc acc atc gag gcc gcc gcc gcc egg ctc
Gly Ile Arg Leu Arg Arg Ser Thr Ile Glu Alá Alá Alá Alá Arg Leu
190 195 200 205
ggc ggc ggg ege cag ggc acc atg cag ctg ctc aag ctc atc ctc acc
Gly Gly Gly Arg Gin Gly Thr Met Gin Leu Leu Lys Leu Ile Leu Thr
210 215 220
159
207
255
303
351
399
447
495
543
591
639
687
735
HU 225 785
tgg Trp gtg Val cag Gin aac Asn 225 cac His cac His ctc Leu cag Gin agg Arg 230 aag Lys ege Arg ccg Pro ege Arg gac Asp 235 gtg Val atg Met 783
gag gag gag gcg ggc ctg cac gtc cag ctc ccc agc ccg gtc gcc aac 831
Glu Glu Glu Alá Gly Leu His Val Gin Leu Pro Ser Pro Val Alá Asn
240 245 250
cca cca gga tac gag ttc ccc gcc ggc gga cag gac atg gcc gcg ggc 879
Pro Pro Gly Tyr Glu Phe Pro Alá Gly Gly Gin Asp Met Alá Alá Gly
255 260 265
ggc ggc aca tct tgg atg ccc cac cag cag gca ttc acg ccg cet get 927
Gly Gly Thr Ser Trp Met Pro His Gin Gin Alá Phe Thr Pro Pro Alá
270 275 280 285
gcg tac ggc ggc gac gcg gtg tac ccg agc gcg gca ggc caa cag tac 975
Alá Tyr Gly Gly Asp Alá Val Tyr Pro Ser Alá Alá Gly Gin Gin Tyr
290 295 300
tct ttc cac cag ggc ccc agc acg agc agc gtg gtc gtg aac agc caa 1023
Ser Phe His Gin Gly Pro Ser Thr Ser Ser Val Val Val Asn Ser Gin
305 310 315
ccg ttc tcc ccg ccg cet gtg ggc gac atg cac ggc gcg aac atg gcc 1071
Pro Phe Ser Pro Pro Pro Val Gly Asp Met His Gly Alá Asn Met Alá
320 325 330
tgg ccg cag cag tac gtg ccg ttc cca ccg cet ggg get tcc acg ggc 1119
Trp Pro Gin Gin Tyr Val Pro Phe Pro Pro Pro Gly Alá Ser Thr Gly
335 340 345
tct tac cet atg ccg cag ccg ttc tcc ccc gga ttc ggc ggg cag tac 1167
Ser Tyr Pro Met Pro Gin Pro Phe Ser Pro Gly Phe Gly Gly Gin Tyr
350 355 360 365
gcc ggc gcc ggc get ggc cac ctc tea gtg gcc ccc cag ege atg gca 1215
Alá Gly Alá Gly Alá Gly His Leu Ser Val Alá Pro Gin Arg Met Alá
370 375 380
ggc gtg gag gcc teg gcg acc aag gag gcc ege aag aag ege atg gcg 1263
Gly Val Glu Alá Ser Alá Thr Lys Glu Alá Arg Lys Lys Arg Met Alá
385 390 395
aga cag cgg ege ctg tcc tgc ctg cag cag cag ege agc cag cag ctg 1311
Arg Gin Arg Arg Leu Ser Cys Leu Gin Gin Gin Arg Ser Gin Gin Leu
400 405 410
agc ctg ggc cag atc cag acc tcc gtc cac ctg cag gag ccg tcc cet 1359
Ser Leu Gly Gin Ile Gin Thr Ser Val His Leu Gin Glu Pro Ser Pro
415 420 425
cgg tcc acg cac tcc ggc ccg gtc acg ccg tea gca ggc ggc tgg gga 1407
Arg Ser Thr His Ser Gly Pro Val Thr Pro Ser Alá Gly Gly Trp Gly
430 435 440 445
ttc tgg teg ccg agc agc cag cag cag gtc cag aac ccg ctc tcc aag 1455
Phe Trp Ser Pro Ser Ser Gin Gin Gin Val Gin Asn Pro Leu Ser Lys
450 455 460
HU 225 785
tcc Ser aat Asn tcc Ser tea Ser 465 agg gcg Arg Alá ccg Pro cet Pro tcc Ser 470 teg Ser ctg Leu gaa Glu gcg Alá gcg Alá 475 gcg Alá gcg Alá 1503
get cca cag aca aag ccc gcg cet get ggt get egg cag gac gac att 1551
Alá Pro Gin Thr Lys Pro Alá Pro Alá Gly Alá Arg Gin Asp Asp Ile
480 485 490
cac cac ege ctc gca gcg get tea gat aag egg cag ggc gcc aag gcg 1599
His His Arg Leu Alá Alá Alá Ser Asp Lys Arg Gin Gly Alá Lys Alá
495 500 505
gac aag aac ctg egg ttc ctg ctg cag aag gtg ctg aag cag agc gac 1647
Asp Lys Asn Leu Arg Phe Leu Leu Gin Lys Val Leu Lys Gin Ser Asp
510 515 520 525
gtc ggg agc ctc ggc ege atc gtg ctc ccc aaa aag gaa gcg gag gtt 1695
Val Gly Ser Leu Gly Arg Ile Val Leu Pro Lys Lys Glu Alá Glu Val
530 535 540
cac ctg ccg gag ctg aag acg agg gat ggc atc tcc atc ccc atg gag 1743
His Leu Pro Glu Leu Lys Thr Arg Asp Gly Ile Ser Ile Pro Met Glu
545 550 555
gac atc gga acg teg ege gtg tgg aac atg egg tac agg ttt tgg ccc 1791
Asp Ile Gly Thr Ser Arg Val Trp Asn Met Arg Tyr Arg Phe Trp Pro
560 565 570
aac aac aag agc aga atg tat ctg ctg gaa aac aca ggg gaa ttt gtt 1839
Asn Asn Lys Ser Arg Met Tyr Leu Leu Glu Asn Thr Gly Glu Phe Val
575 580 585
cgt tcc aac gag ett cag gag ggg gat ttc ata gtg atc tac tec gat 1887
Arg Ser Asn Glu Leu Gin Glu Gly Asp Phe Ile Val Ile Tyr Ser Asp
590 595 600 605
gtc aag teg ggc aaa tat ctg ata egg ggc gtg aag gta agg ccc ccg 1935
Val Lys Ser Gly Lys Tyr Leu Ile Arg Gly Val Lys Val Arg Pro Pro
610 615 620
ccg gcg caa gag caa ggc agt ggt tcc agc ggg gga ggc aag cac agg 1983
Pro Alá Gin Glu Gin Gly Ser Gly Ser Ser Gly Gly Gly Lys His Arg
625 630 635
ccc ctc tgt cca gca ggt cca gag aga gcc gca gcc gcc ggt get cet 2031
Pro Leu Cys Pro Alá Gly Pro Glu Arg Alá Alá Alá Alá Gly Alá Pro
640 645 650
gaa gac gcc gtc gtc gac ggg gtc agc ggc gcc tgc aag ggg agg tet 2079
Glu Asp Alá Val Val Asp Gly Val Ser Gly Alá Cys Lys Gly Arg Ser
655 660 665
ccg gaa ggc gtg egg egg gtt egg cag cag gga gcc ggc gcc atg agc 2127
Pro Glu Gly Val Arg Arg Val Arg Gin Gin Gly Alá Gly Alá Met Ser
670 675 680 685
cag atg gcg gtg agc atc tga aagagcagca ggctccgcca tatattgatc 2178
Gin Met Alá Val Ser Ile *
690
HU 225 785 gatcgaccaa tcgatcgtta gttctccaag ttactattag ctagctatag cccgaaacag ctgaactgat gatgacgatg gtaacctccg tcgtgtgtgt gctaagcatg tagcgtgcta ggagatgata tattaaatat aatcgagtag tagagcctac ccgctgtgtg acgctaaatt tgtgtgcatt tggtttggtt tgtgagttgg gcccgtgcgt ggctgtgtca tgtcgtggtt aattagctat actagtcctg tctgtacatg catggaca <210> 2 <211> 691 <212> PRT <213> Zea mays <400> 2
Met Glu Alá Ser Ser Gly Ser Ser Pro Pro His Ser Gin Glu Asn Pro 15 10 15
Pro Glu His Gly Gly Asp Met Gly Gly Alá Pro Alá Glu Glu Ile Gly 20 25 30
Gly Glu Alá Alá Asp Asp Phe Met Phe Alá Glu Asp Thr Phe Pro Ser 35 40 45
Leu Pro Asp Phe Pro Cys Leu Ser Ser Pro Ser Ser Ser Thr Phe Ser 50 55 60
Ser Asn Ser Ser Ser Asn Ser Ser Ser Alá Tyr Thr Asn Thr Alá Gly
70 75 80
Arg Alá Gly Gly Glu Pro Ser Glu Pro Alá Ser Alá Gly Glu Gly Phe
90 95
Asp Alá Leu Asp Asp Ile Asp Gin Leu Leu Asp Phe Alá Ser Leu Ser 100 105 110
Met Pro Trp Asp Ser Glu Pro Phe Pro Gly Val Ser Met Met Leu Glu 115 120 125
Asn Alá Met Ser Alá Pro Pro Gin Pro Val Gly Asp Gly Met Ser Glu 130 135 140
Glu Lys Alá Val Pro Glu Gly Thr Thr Gly Gly Glu Glu Alá Cys Met
145 150 155 160
Asp Alá Ser Glu Gly Glu Glu Leu Pro Arg Phe Phe Met Glu Trp Leu
165 170 175
Thr Ser Asn Arg Glu Asn Ile Ser Alá Glu Asp Leu Arg Gly Ile Arg 180 185 190
Leu Arg Arg Ser Thr Ile Glu Alá Alá Alá Alá Arg Leu Gly Gly Gly 195 200 205
Arg Gin Gly Thr Met Gin Leu Leu Lys Leu Ile Leu Thr Trp Val Gin 210 215 220
Asn His His Leu Gin Arg Lys Arg Pro Arg Asp Val Met Glu Glu Glu
225 230 235 240
Alá Gly Leu His Val Gin Leu Pro Ser Pro Val Alá Asn Pro Pro Gly
245 250 255
2238
2298
2358
2418
2456
HU 225 785
Tyr Glu Phe Pro 260 Alá Gly Gly Gin Asp 265 Met Alá Alá Gly Gly 270 Gly Thr
Ser Trp Met Pro His Gin Gin Alá Phe Thr Pro Pro Alá Alá Tyr Gly
275 280 285
Gly Asp Alá Val Tyr Pro Ser Alá Alá Gly Gin Gin Tyr Ser Phe His
290 295 300
Gin Gly Pro Ser Thr Ser Ser Val Val Val Asn Ser Gin Pro Phe Ser
305 310 315 320
Pro Pro Pro Val Gly Asp Met His Gly Alá Asn Met Alá Trp Pro Gin
325 330 335
Gin Tyr Val Pro Phe Pro Pro Pro Gly Alá Ser Thr Gly Ser Tyr Pro
340 345 350
Met Pro Gin Pro Phe Ser Pro Gly Phe Gly Gly Gin Tyr Alá Gly Alá
355 360 365
Gly Alá Gly His Leu Ser Val Alá Pro Gin Arg Met Alá Gly Val Glu
370 375 380
Alá Ser Alá Thr Lys Glu Alá Arg Lys Lys Arg Met Alá Arg Gin Arg
385 390 395 400
Arg Leu Ser Cys Leu Gin Gin Gin Arg Ser Gin Gin Leu Ser Leu Gly
405 410 415
Gin Ile Gin Thr Ser Val His Leu Gin Glu Pro Ser Pro Arg Ser Thr
420 425 430
His Ser Gly Pro Val Thr Pro Ser Alá Gly Gly Trp Gly Phe Trp Ser
435 440 445
Pro Ser Ser Gin Gin Gin Val Gin Asn Pro Leu Ser Lys Ser Asn Ser
450 455 460
Ser Arg Alá Pro Pro Ser Ser Leu Glu Alá Alá Alá Alá Alá Pro Gin
465 470 475 480
Thr Lys Pro Alá Pro Alá Gly Alá Arg Gin Asp Asp Ile His His Arg
485 490 495
Leu Alá Alá Alá Ser Asp Lys Arg Gin Gly Alá Lys Alá Asp Lys Asn
500 505 510
Leu Arg Phe Leu Leu Gin Lys Val Leu Lys Gin Ser Asp Val Gly Ser
515 520 525
Leu Gly Arg Ile Val Leu Pro Lys Lys Glu Alá Glu Val His Leu Pro
530 535 540
Glu Leu Lys Thr Arg Asp Gly Ile Ser Ile Pro Met Glu Asp Ile Gly
545 550 555 560
Thr Ser Arg Val Trp Asn Met Arg Tyr Arg Phe Trp Pro Asn Asn Lys
565 570 575
HU 225 785
Ser Arg Met Tyr 580 Leu Leu Glu Asn Thr Gly Glu 585 Phe Val Arg 590 Ser Asn
Glu Leu Gin Glu Gly Asp Phe Ile Val Ile Tyr Ser Asp Val Lys Ser
595 600 605
Gly Lys Tyr Leu Ile Arg Gly Val Lys Val Arg Pro Pro Pro Alá Gin
610 615 620
Glu Gin Gly Ser Gly Ser Ser Gly Gly Gly Lys His Arg Pro Leu Cys
625 630 635 640
Pro Alá Gly Pro Glu Arg Alá Alá Alá Alá Gly Alá Pro Glu Asp Alá
645 650 655
Val Val Asp Gly Val Ser Gly Alá Cys Lys Gly Arg Ser Pro Glu Gly
660 665 670
Val Arg Arg Val Arg Gin Gin Gly Alá Gly Alá Met Ser Gin Met Alá
675 680 685
Val Ser Ile
690 <210> 3 <211> 1981 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <220>
<221> misc_feature <222> (0)...(0) <223> ABI1 cDNA (Genbank Accession No. X77116) <221> CDS <222> (432)...(1736) <400> 3 catttcctcc ttctttctct cttctatctg tgaacaaggc acattagaac tcttcttttc 60 aactttttta ggtgtatata gatgaatcta gaaatagttt tatagttgga aattaattga 120 agagagagag atattactac accaatcttt tcaagaggtc ctaacgaatt acccacaatc 180 caggaaaccc ttattgaaat tcaattcatt tctttctttc tgtgtttgtg attttcccgg 240 gaaatatttt tgggtatatg tctctctgtt tttgctttcc tttttcatag gagtcatgtg 300 tttcttcttg tcttcctagc ttcttctaat aaagtccttc tcttgtgaaa atctctcgaa 360 ttttcatttt tgttccattg gagctatctt atagatcaca accagagaaa aagatcaaat 420 ctttaccgtt a atg gag gaa gta tct ccg gcg atc gca ggt cet ttc agg 470
Met Glu Glu Val Ser Pro Alá Ile Alá Gly Pro Phe Arg
10
cca Pro ttc Phe 15 tcc Ser gaa Glu acc Thr cag Gin atg Met 20 gat Asp ttc Phe acc Thr ggg Gly atc Ile 25 aga Arg ttg Leu ggt Gly aaa Lys 518
ggt tac tgc aat aac caa tac tea aat caa gat tcc gag aac gga gat 566
Gly Tyr Cys Asn Asn Gin Tyr Ser Asn Gin Asp Ser Glu Asn Gly Asp
30 35 40 45
HU 225 785
cta Leu atg gtt tcg Ser tta Leu 50 ccg Pro gag Glu act Thr tea Ser tea Ser 55 tgc Cys tet Ser gtt Val tet Ser ggg Gly 60 tea Ser 614
Met Val
cat ggt tet gaa tet agg aaa gtt ttg att tet egg atc aat tet cet 662
His Gly Ser Glu Ser Arg Lys Val Leu Ile Ser Arg Ile Asn Ser Pro
65 70 75
aat tta aac atg aag gaa tea gca get get gat ata gtc gtc gtt gat 710
Asn Leu Asn Met Lys Glu Ser Alá Alá Alá Asp Ile Val Val Val Asp
80 85 90
atc tcc gcc gga gat gag atc aac ggc tea gat att act agc gag aag 758
Ile Ser Alá Gly Asp Glu Ile Asn Gly Ser Asp Ile Thr Ser Glu Lys
95 100 105
aag atg atc agc aga aca gag agt agg agt ttg ttt gaa ttc aag agt 806
Lys Met Ile Ser Arg Thr Glu Ser Arg Ser Leu Phe Glu Phe Lys Ser
110 115 120 125
gtg cet ttg tat ggt ttt act tcg att tgt gga aga aga cet gag atg 854
Val Pro Leu Tyr Gly Phe Thr Ser Ile Cys Gly Arg Arg Pro Glu Met
130 135 140
gaa gat get gtt tcg act ata cca aga ttc ett caa tet tcc tet ggt 902
Glu Asp Alá Val Ser Thr Ile Pro Arg Phe Leu Gin Ser Ser Ser Gly
145 150 155
tcg atg tta gat ggt egg ttt gat cet caa tcc gcc get cat ttc ttc 950
Ser Met Leu Asp Gly Arg Phe Asp Pro Gin Ser Alá Alá His Phe Phe
160 165 170
ggt gtt tac gac ggc cat ggc ggt tet cag gta gcg aac tat tgt aga 998
Gly Val Tyr Asp Gly His Gly Gly Ser Gin Val Alá Asn Tyr Cys Arg
175 180 185
gag agg atg cat ttg get ttg gcg gag gag ata get aag gag aaa ccg 1046
Glu Arg Met His Leu Alá Leu Alá Glu Glu Ile Alá Lys Glu Lys Pro
190 195 200 205
atg ctc tgc gat ggt gat acg tgg ctg gag aag tgg aag aaa get ett 1094
Met Leu Cys Asp Gly Asp Thr Trp Leu Glu Lys Trp Lys Lys Alá Leu
210 215 220
ttc aac tcg ttc ctg aga gtt gac tcg gag att gag tea gtt gcg ccg 1142
Phe Asn Ser Phe Leu Arg Val Asp Ser Glu Ile Glu Ser Val Alá Pro
225 230 235
gag acg gtt ggg tea acg tcg gtg gtt gcc gtt gtt ttc ccg tet cac 1190
Glu Thr Val Gly Ser Thr Ser Val Val Alá Val Val Phe Pro Ser His
240 245 250
atc ttc gtc get aac tgc ggt gac tet aga gcc gtt ett tgc ege ggc 1238
Ile Phe Val Alá Asn Cys Gly Asp Ser Arg Alá Val Leu Cys Arg Gly
255 260 265
aaa act gca ett cca tta tcc gtt gac cat aaa ccg gat aga gaa gat 1286
Lys Thr Alá Leu Pro Leu Ser Val Asp His Lys Pro Asp Arg Glu Asp
270 275 280 285
HU 225 785
gaa Glu get Alá gcg Alá agg Arg att Ile 290 gaa gcc Glu Alá gca Alá gga Gly ggg Gly 295 aaa Lys gtg Val att Ile cag Gin tgg Trp 300 aat Asn 1334
gga get cgt gtt ttc ggt gtt ctc gcc atg teg aga tcc att ggc gat 1382
Gly Alá Arg Val Phe Gly Val Leu Alá Met Ser Arg Ser Ile Gly Asp
305 310 315
aga tac ttg aaa cca tcc atc att cet gat ccg gaa gtg acg get gtg 1430
Arg Tyr Leu Lys Pro Ser Ile Ile Pro Asp Pro Glu Val Thr Alá Val
320 325 330
aag aga gta aaa gaa gat gat tgt ctg att ttg gcg agt gac ggg gtt 1478
Lys Arg Val Lys Glu Asp Asp Cys Leu Ile Leu Alá Ser Asp Gly Val
335 340 345
tgg gat gta atg acg gat gaa gaa gcg tgt gag atg gca agg aag egg 1526
Trp Asp Val Met Thr Asp Glu Glu Alá Cys Glu Met Alá Arg Lys Arg
350 355 360 365
att ctc ttg tgg cac aag aaa aac gcg gtg get ggg gat gca teg ttg 1574
Ile Leu Leu Trp His Lys Lys Asn Alá Val Alá Gly Asp Alá Ser Leu
370 375 380
ctc gcg gat gag egg aga aag gaa ggg aaa gat cet gcg gcg atg tcc 1622
Leu Alá Asp Glu Arg Arg Lys Glu Gly Lys Asp Pro Alá Alá Met Ser
385 390 395
gcg get gag tat ttg tea aag ctg gcg ata cag aga gga agc aaa gac 1670
Alá Alá Glu Tyr Leu Ser Lys Leu Alá Ile Gin Arg Gly Ser Lys Asp
400 405 410
aac ata agt gtg gtg gtg gtt gat ttg aag cet egg agg aaa ctc aag 1718
Asn Ile Ser Val Val Val Val Asp Leu Lys Pro Arg Arg Lys Leu Lys
415 420 425
1766 agc aaa Ser Lys 430 ccc ttg aac Pro Leu Asn tga ggcagagagg gtcctttttc ttaattttta ★ aaatgaatat ttaactaaca cttgactaca acaacataca gggtctctcc agttataacc ttctaaaaag ttaagatgta aagaaaaagt atatggagat ccccttgtat gtattattgt atttactatt aatgaagctt ttttcttccc ttaaa attaatttgt gcttattttt aatgtgttaa gctcttttgt gggctaattg taatatggtt
1826
1886
1946
1981 <210> 4 <211> 434 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana
<400> 4 Alá Ile Alá Gly Pro 10 Phe Arg Pro Phe 15 Ser
Met 1 Glu Glu Val Ser 5 Pro
Glu Thr Gin Met 20 Asp Phe Thr Gly Ile Arg Leu 25 Gly Lys Gly 30 Tyr Cys
Asn Asn Gin 35 Tyr Ser Asn Gin Asp 40 Ser Glu Asn Gly Asp 45 Leu Met Val
HU 225 785
Ser Leu Pro Glu Thr 50
Glu Ser Arg Lys Val 65
Met Lys Glu Ser Alá 85
Gly Asp Glu Ile Asn 100
Ser Arg Thr Glu Ser 115
Tyr Gly Phe Thr Ser 130
Val Ser Thr Ile Pro 145
Asp Gly Arg Phe Asp 165
Asp Gly His Gly Gly 180
His Leu Alá Leu Alá 195
Asp Gly Asp Thr Trp 210
Phe Leu Arg Val Asp 225
Gly Ser Thr Ser Val 245
Alá Asn Cys Gly Asp 260
Leu Pro Leu Ser Val 275
Arg Ile Glu Alá Alá 290
Val Phe Gly Val Leu 305
Lys Pro Ser Ile Ile 325
Lys Glu Asp Asp Cys 340
Met Thr Asp Glu Glu 355
Ser Ser Cys Ser Val Ser 55
Leu Ile Ser Arg Ile Asn 70 75
Alá Alá Asp Ile Val Val 90
Gly Ser Asp Ile Thr Ser 105
Arg Ser Leu Phe Glu Phe 120
Ile Cys Gly Arg Arg Pro 135
Arg Phe Leu Gin Ser Ser 150 155
Pro Gin Ser Alá Alá His 170
Ser Gin Val Alá Asn Tyr 185
Glu Glu Ile Alá Lys Glu 200
Leu Glu Lys Trp Lys Lys 215
Ser Glu Ile Glu Ser Val 230 235
Val Alá Val Val Phe Pro 250
Ser Arg Alá Val Leu Cys 265
Asp His Lys Pro Asp Arg 280
Gly Gly Lys Val Ile Gin 295
Alá Met Ser Arg Ser Ile 310 315
Pro Asp Pro Glu Val Thr 330
Leu Ile Leu Alá Ser Asp 345
Alá Cys Glu Met Alá Arg 360
Gly Ser His Gly Ser 60
Ser Pro Asn Leu Asn 80
Val Asp Ile Ser Alá 95
Glu Lys Lys Met Ile 110
Lys Ser Val Pro Leu 125
Glu Met Glu Asp Alá 140
Ser Gly Ser Met Leu 160
Phe Phe Gly Val Tyr 175
Cys Arg Glu Arg Met 190
Lys Pro Met Leu Cys 205
Alá Leu Phe Asn Ser 220
Alá Pro Glu Thr Val 240
Ser His Ile Phe Val 255
Arg Gly Lys Thr Alá 270
Glu Asp Glu Alá Alá 285
Trp Asn Gly Alá Arg 300
Gly Asp Arg Tyr Leu 320
Alá Val Lys Arg Val 335
Gly Val Trp Asp Val 350
Lys Arg Ile Leu Leu 365
HU 225 785
Trp His 370 Lys Lys Asn Alá Val Alá 375 Gly Asp Alá Ser 380 Leu Leu Alá Asp
Glu Arg Arg Lys Glu Gly Lys Asp Pro Alá Alá Met Ser Alá Alá Glu
385 390 395 400
Tyr Leu Ser Lys Leu Alá Ile Gin Arg Gly Ser Lys Asp Asn Ile Ser
405 410 415
Val Val Val Val Asp Leu Lys Pro Arg Arg Lys Leu Lys Ser Lys Pro
420 425 430
Leu Asn <210> 5 <211> 1470 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <220>
<221> misc_feature <222> (0)...(0) <223> ABI2 cDNA (Genbank Accession No. Y08965) <221> CDS <222> (51)...(1322) <400> 5 tttttgttaa agttcaagaa agttcttttt tctttttttt tcctccttta atg gac 56
Met Asp
gaa Glu gtt Val tct Ser 5 cet Pro gca Alá gtc Val get Alá gtt Val 10 cca Pro ttc Phe aga Arg cca Pro ttc Phe 15 act Thr gac Asp cet Pro 104
cac gcc gga ett aga ggc tat tgc aac ggt gaa tct agg gtt act tta 152
His Alá Gly Leu Arg Gly Tyr Cys Asn Gly Glu Ser Arg Val Thr Leu
20 25 30
ccg gaa agt tct tgt tct ggc gac gga get atg aaa gat tct tcc ttt 200
Pro Glu Ser Ser Cys Ser Gly Asp Gly Alá Met Lys Asp Ser Ser Phe
35 40 45 50
gag atc aat aca aga caa gat tea ttg aca tea tea tea tct get atg 248
Glu Ile Asn Thr Arg Gin Asp Ser Leu Thr Ser Ser Ser Ser Alá Met
55 60 65
gca ggt gtg gat atc tcc gcc gga gat gaa atc aac ggt tea gat gag 296
Alá Gly Val Asp Ile Ser Alá Gly Asp Glu Ile Asn Gly Ser Asp Glu
70 75 80
ttt gat ccg aga teg atg aat cag agt gag aag aaa gta ett agt aga 344
Phe Asp Pro Arg Ser Met Asn Gin Ser Glu Lys Lys Val Leu Set Arg
85 90 95
aca gag agt aga agt ctg ttt gag ttc aag tgt gtt cet tta tat gga 392
Thr Glu Ser Arg Ser Leu Phe Glu Phe Lys Cys Val Pro Leu Tyr Gly
100 105 110
HU 225 785
gtg Val 115 act Thr tcg Ser att Ile tgt Cys ggt Gly 120 aga Arg cga Arg cca Pro gag Glu atg Met 125 gaa Glu gat Asp tct Ser gtc Val tea Ser 130 440
acg att cet aga ttc ctt caa gtt tct tct agt tcg ttg ctt gat ggt 488
Thr Ile Pro Arg Phe Leu Gin Val Ser Ser Ser Ser Leu Leu Asp Gly
135 140 145
cga gtc act aat gga ttt aat cet cac ttg agt get cat ttc ttt ggt 536
Arg Val Thr Asn Gly Phe Asn Pro His Leu Ser Alá His Phe Phe Gly
150 155 160
gtt tac gat ggc cat ggc ggt tct cag gta gcg aat tat tgt cgt gag 584
Val Tyr Asp Gly His Gly Gly Ser Gin Val Alá Asn Tyr Cys Arg Glu
165 170 175
agg atg cat ctg get ttg acg gag gag ata gtg aag gag aaa ccg gag 632
Arg Met His Leu Alá Leu Thr Glu Glu Ile Val Lys Glu Lys Pro Glu
180 185 190
ttt tgt gac ggt gac acg tgg caa gag aag tgg aag aag get ttg ttc 680
Phe Cys Asp Gly Asp Thr Trp Gin Glu Lys Trp Lys Lys Alá Leu Phe
195 200 205 210
aac tct ttt atg aga gtt gac tcg gag att gaa act gtg get cat get 728
Asn Ser Phe Met Arg Val Asp Ser Glu Ile Glu Thr Val Alá His Alá
215 220 225
ccg gaa act gtt ggg tct acc tcg gtg gtt gcg gtt gtc ttt ccg act 776
Pro Glu Thr Val Gly Ser Thr Ser Val Val Alá Val Val Phe Pro Thr
230 235 240
cac atc ttt gtc gcg aat tgc ggc gac tct agg gcg gtt ttg tgt ege 824
His Ile Phe Val Alá Asn Cys Gly Asp Ser Arg Alá Val Leu Cys Arg
245 250 255
ggc aaa acg cca ctc gcg ttg tcg gtt gat cac aaa ccg gat agg gat 872
Gly Lys Thr Pro Leu Alá Leu Ser Val Asp His Lys Pro Asp Arg Asp
260 265 270
gat gaa gcg gcg agg ata gaa get gcc ggt ggg aaa gta atc cgg tgg 920
Asp Glu Alá Alá Arg Ile Glu Alá Alá Gly Gly Lys Val Ile Arg Trp
275 280 285 290
aac ggg get cgt gta ttt ggt gtt ctc gca atg tea aga tcc att ggc 968
Asn Gly Alá Arg Val Phe Gly Val Leu Alá Met Ser Arg Ser Ile Gly
295 300 305
gat aga tac ctt aaa ccg tea gta att ccg gat cca gaa gtg act tea 1016
Asp Arg Tyr Leu Lys Pro Ser Val Ile Pro Asp Pro Glu Val Thr Ser
310 315 320
gtg cgg cga gta aaa gaa gat gat tgt ctc atc tta gca agt gat ggt 1064
Val Arg Arg Val Lys Glu Asp Asp Cys Leu Ile Leu Alá Ser Asp Gly
325 330 335
ctt tgg gat gta atg aca aac gaa gaa gtg tgc gat ttg get cgg aaa 1112
Leu Trp Asp Val Met Thr Asn Glu Glu Val Cys Asp Leu Alá Arg Lys
340 345 350
HU 225 785
cgg att tta cta tgg cat Trp His 360 aag aag aac gcg atg gcc gga gag get ttg Leu 370 1160
Arg 355 Ile Leu Leu Lys Lys Asn Alá Met 365 Alá Gly Glu Alá
ctt ccg gcg gag aaa aga gga gaa gga aaa gat cet gca gca atg tcc 1208
Leu Pro Alá Glu Lys Arg 375 Gly Glu Gly Lys 380 Asp Pro Alá Alá Met 385 Ser
gcg gca gag tat ttg tcg aag atg get ttg caa aaa gga agc aaa gac 1256
Alá Alá Glu Tyr 390 Leu Ser Lys Met Alá Leu 395 Gin Lys Gly Ser Lys 400 Asp
aat ata agt gtg gta gtg gtt gat ttg aag gga ata agg aaa ttc aag 1304
Asn Ile Ser 405 Val Val Val Val Asp 410 Leu Lys Gly Ile Arg 415 Lys Phe Lys
agc Ser aaa tcc Lys Ser 420 ttg Leu aat tga Asn * aaaagaaggt ttggaagaaa agtgaaaaaa 1352
aaagttttga ' tggtgggtaa aaattctctt tagtgaaaaa agaaagataa aacaacaggt 1412
aataattaca ttgtaatatt aatttcctgc ttaaatttgt tatttaettt ctcaaaaa 1470
<210> 6 <211> 423 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <400> 6
Met 1 Asp Glu Val Ser 5 Pro Alá Val Alá Val 10 Pro Phe Arg Pro Phe 15 Thr
Asp Pro His Alá Gly Leu Arg Gly Tyr Cys Asn Gly Glu Ser Arg Val
20 25 30
Thr Leu Pro Glu Ser Ser Cys Ser Gly Asp Gly Alá Met Lys Asp Ser
35 40 45
Ser Phe Glu Ile Asn Thr Arg Gin Asp Ser Leu Thr Ser Ser Ser Ser
50 55 60
Alá Met Alá Gly Val Asp Ile Ser Alá Gly Asp Glu Ile Asn Gly Ser
65 70 75 80
Asp Glu Phe Asp Pro Arg Ser Met Asn Gin Ser Glu Lys Lys Val Leu
85 90 95
Ser Arg Thr Glu Ser Arg Ser Leu Phe Glu Phe Lys Cys Val Pro Leu
100 105 110
Tyr Gly Val Thr Ser Ile Cys Gly Arg Arg Pro Glu Met Glu Asp Ser
115 120 125
Val Ser Thr Ile Pro Arg Phe Leu Gin Val Ser Ser Ser Ser Leu Leu
130 135 140
Asp Gly Arg Val Thr Asn Gly Phe Asn Pro His Leu Ser Alá His Phe
145 150 155 160
HU 225 785
Phe Gly Val Tyr Asp Gly His Gly Gly Ser Gin Val Alá Asn Tyr Cys 165 170 175
Arg Glu Arg Met His Leu Alá Leu Thr Glu Glu Ile Val Lys Glu Lys 180 185 190
Pro Glu Phe Cys Asp Gly Asp Thr Trp Gin Glu Lys Trp Lys Lys Alá 195 200 205
Leu Phe Asn Ser Phe Met Arg Val Asp Ser Glu Ile Glu Thr Val Alá 210 215 220
His Alá Pro Glu Thr Val Gly Ser Thr Ser Val Val Alá Val Val Phe
225 230 235 240
Pro Thr His Ile Phe Val Alá Asn Cys Gly Asp Ser Arg Alá Val Leu
245 250 255
Cys Arg Gly Lys Thr Pro Leu Alá Leu Ser Val Asp His Lys Pro Asp 260 265 270
Arg Asp Asp Glu Alá Alá Arg Ile Glu Alá Alá Gly Gly Lys Val Ile 275 280 285
Arg Trp Asn Gly Alá Arg Val Phe Gly Val Leu Alá Met Ser Arg Ser 290 295 300
Ile Gly Asp Arg Tyr Leu Lys Pro Ser Val Ile Pro Asp Pro Glu Val
305 310 315 320
Thr Ser Val Arg Arg Val Lys Glu Asp Asp Cys Leu Ile Leu Alá Ser
325 330 335
Asp Gly Leu Trp Asp Val Met Thr Asn Glu Glu Val Cys Asp Leu Alá 340 345 350
Arg Lys Arg Ile Leu Leu Trp His Lys Lys Asn Alá Met Alá Gly Glu 355 360 365
Alá Leu Leu Pro Alá Glu Lys Arg Gly Glu Gly Lys Asp Pro Alá Alá 370 375 380
Met Ser Alá Alá Glu Tyr Leu Ser Lys Met Alá Leu Gin Lys Gly Ser
385 390 395 400
Lys Asp Asn Ile Ser Val Val Val Val Asp Leu Lys Gly Ile Arg Lys
405 410 415
Phe Lys Ser Lys Ser Leu Asn 420 <210> 7 <211> 2868 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <220>
<221> misc_feature <222> (0)...(0) <223> ABI3 cDNA (Genbank Accession No, X68141)
HU 225 785 <221> CDS <222> (406)...(2568) <400> 7 ctttgtgaac aaaacacatc tcgtatactt cagatctaga ctcgaaaatt ttagacctct 60 ttacaattgg tctttgttca tctgaagttg gagaaaatag ttagcttagg tcggatcttt 120 tcatatgctt tggatcctcc ttcgtctctt ttgtataatt ttaaccttat caagagttct 180 ttttgaatct caaaagatta tatagtagta tagaaggttt atatgtatat gtatagccag 240 atagtttatg ttgtttaaag attcgatgat agccaagttg ggttaacttt ctttttcctt 300 gcctccttac tcacatacaa accctatctg tccgtacaaa atactaaaaa ccctaacttt 360 tctctctcca ccaatctagt ttattgtttc atttccactt caacg atg aaa agc ttg 417
Met Lys Ser Leu 1
cat His 5 gtg Val gcg gcc Alá Alá aac Asn gcc Alá 10 gga Gly gat Asp ctg Leu get Alá gag Glu 15 gat Asp tgt Cys gga Gly ata Ile ctc Leu 20 465
ggt gga gac get gat gat act gtt ttg atg gat gga att gat gaa gtt 513
Gly Gly Asp Alá Asp Asp Thr Val Leu Met Asp Gly Ile Asp Glu Val
25 30 35
ggt aga gag atc tgg tta gat gac cat gga gga gat aat aat cat gtt 561
Gly Arg Glu Ile Trp Leu Asp Asp His Gly Gly Asp Asn Asn His Val
40 45 50
cat ggt cat caa gat gat gat ttg att gtt cat cat gac cet tea atc 609
His Gly His Gin Asp Asp Asp Leu Ile Val His His Asp Pro Ser Ile
55 60 65
ttc tat gga gat ctc cca acg ett cet gat ttc cca tgc atg teg tet 657
Phe Tyr Gly Asp Leu Pro Thr Leu Pro Asp Phe Pro Cys Met Ser Ser
70 75 80
tea tea teg tet tea aca tet cca get cet gtc aac gca atc gtc tcc 705
Ser Ser Ser Ser Ser Thr Ser Pro Alá Pro Val Asn Alá Ile Val Ser
85 90 95 100
tea gcc tet tet tet teg gca get tet tcc tcc act tcc tea get get 753
Ser Alá Ser Ser Ser Ser Alá Alá Ser Ser Ser Thr Ser Ser Alá Alá
105 110 115
tet tgg get ata ttg aga tea gat gga gaa gat ccg act cca aac caa 801
Ser Trp Alá Ile Leu Arg Ser Asp Gly Glu Asp Pro Thr Pro Asn Gin
120 125 130
aac caa tac gca tea gga aac tgt gac gac tet tet ggt gca ttg caa 849
Asn Gin Tyr Alá Ser Gly Asn Cys Asp Asp Ser Ser Gly Alá Leu Gin
135 140 145
tcc aca get tcc atg gag att cca tta gac agc agt caa ggt ttt ggt 897
Ser Thr Alá Ser Met Glu Ile Pro Leu Asp Ser Ser Gin Gly Phe Gly
150 155 160
tgc ggc gaa ggc ggt ggt gat tgc att gat atg atg gag act ttc ggg 945
Cys Gly Glu Gly Gly Gly Asp Cys Ile Asp Met Met Glu Thr Phe Gly
165 170 175 180
HU 225 785
tac Tyr atg Met gat Asp cta Leu ctt Leu 185 gat Asp agc Ser aac Asn gag Glu ttc Phe 190 ttt Phe gac Asp acc Thr tea Ser get Alá 195 ata Ile 993
ttt agc caa gac gac gac acg caa aac cet aac ttg atg gac caa acc 1041
Phe Ser Gin Asp Asp Asp Thr Gin Asn Pro Asn Leu Met Asp Gin Thr
200 205 210
ctt gag aga caa gaa gac cag gtc gtt gtt ccg atg atg gag aat aac 1089
Leu Glu Arg Gin Glu Asp Gin Val Val Val Pro Met Met Glu Asn Asn
215 220 225
agt ggt gga gac atg caa atg atg aat tet tcc ttg gaa cag gac gat 1137
Ser Gly Gly Asp Met Gin Met Met Asn Ser Ser Leu Glu Gin Asp Asp
230 235 240
gat ctc get get gtg ttt ttg gag tgg cta aag aac aac aag gag act 1185
Asp Leu Alá Alá Val Phe Leu Glu Trp Leu Lys Asn Asn Lys Glu Thr
245 250 255 260
gtg teg get gag gat ttg agg aaa gta aag ata aag aaa get acg att 1233
Val Ser Alá Glu Asp Leu Arg Lys Val Lys Ile Lys Lys Alá Thr Ile
265 270 275
gaa tea gcg gca aga aga cta ggc ggt ggt aaa gaa gcg atg aag cag 1281
Glu Ser Alá Alá Arg Arg Leu Gly Gly Gly Lys Glu Alá Met Lys Gin
280 285 290
ctt tta aag ctg att ctt gaa tgg gtc caa act aat cac tta caa aga 1329
Leu Leu Lys Leu Ile Leu Glu Trp Val Gin Thr Asn His Leu Gin Arg
295 300 305
aga ege acc acc acc acc acc acc aac ctc tet tat caa caa tea ttc 1377
Arg Arg Thr Thr Thr Thr Thr Thr Asn Leu Ser Tyr Gin Gin Ser Phe
310 315 320
caa caa gat cca ttt caa aac cet aac cet aat aac aac aac cta atc 1425
Gin Gin Asp Pro Phe Gin Asn Pro Asn Pro Asn Asn Asn Asn Leu Ile
325 330 335 340
cca ccg tcc gac caa acc tgt ttc tea cet tea aca tgg gtt cet cca 1473
Pro Pro Ser Asp Gin Thr Cys Phe Ser Pro Ser Thr Trp Val Pro Pro
345 350 355
cca cca caa caa caa get ttt gtc teg gac ccg ggt ttt gga tac atg 1521
Pro Pro Gin Gin Gin Alá Phe Val Ser Asp Pro Gly Phe Gly Tyr Met
360 365 370
cet get cca aac tat ccg cca cag cca gag ttc ctt cet tta ctt gaa 1569
Pro Alá Pro Asn Tyr Pro Pro Gin Pro Glu Phe Leu Pro Leu Leu Glu
375 380 385
tet cca ccg tea tgg cca cca cca cca cag tet ggt ccc atg cca cat 1617
Ser Pro Pro Ser Trp Pro Pro Pro Pro Gin Ser Gly Pro Met Pro His
390 395 400
caa caa ttc ccc atg ccg cca acc teg cag tat aat caa ttt gga gat 1665
Gin Gin Phe Pro Met Pro Pro Thr Ser Gin Tyr Asn Gin Phe Gly Asp
405 410 415 420
HU 225 785
cca Pro aca Thr ggt Gly ttc Phe aat Asn 425 gga Gly tac Tyr aac Asn atg Met aat Asn 430 ccg Pro tac Tyr caa Gin tat Tyr cet Pro 435 tat Tyr 1713
gtt cet gca gga caa atg aga gat cag aga tta ctc cgt ttg tgt tcc 1761
Val Pro Alá Gly Gin Met Arg Asp Gin Arg Leu Leu Arg Leu Cys Ser
440 445 450
tea gca act aaa gag gca aga aag aaa egg atg gcg aga cag agg agg 1809
Ser Alá Thr Lys Glu Alá Arg Lys Lys Arg Met Alá Arg Gin Arg Arg
455 460 465
ttc ttg tet cat cac cac aga cat aac aac aac aac aac aac aac aac 1857
Phe Leu Ser His His His Arg His Asn Asn Asn Asn Asn Asn Asn Asn
470 475 480
aat aat cag cag aac caa acc caa atc gga gaa acc tgt gcc gcg gtg 1905
Asn Asn Gin Gin Asn Gin Thr Gin Ile Gly Glu Thr Cys Alá Alá Val
485 490 495 500
get cca caa ett aac ccc gtg gcc aca acc gcc acg gga ggg acc tgg 1953
Alá Pro Gin Leu Asn Pro Val Alá Thr Thr Alá Thr Gly Gly Thr Trp
505 510 515
atg tat tgg cet aat gtc ccg gca gtg ccg cet caa tta ccg cca gtg 2001
Met Tyr Trp Pro Asn Val Pro Alá Val Pro Pro Gin Leu Pro Pro Val
520 525 530
atg gag act cag tta cet acc atg gac cga get ggc tea get tet get 2049
Met Glu Thr Gin Leu Pro Thr Met Asp Arg Alá Gly Ser Alá Ser Alá
535 540 545
atg cca cgt cag cag gtg gta cca gat ege egg cag gga tgg aaa cca 2097
Met Pro Arg Gin Gin Val Val Pro Asp Arg Arg Gin Gly Trp Lys Pro
550 555 560
gaa aag aat ttg egg ttt ctc ttg cag aaa gtc ttg aag caa agc gac 2145
Glu Lys Asn Leu Arg Phe Leu Leu Gin Lys Val Leu Lys Gin Ser Asp
565 570 575 580
gtg ggt aac ctc gga agg atc gtt ttg cca aaa aaa gaa get gag aca 2193
Val Gly Asn Leu Gly Arg Ile Val Leu Pro Lys Lys Glu Alá Glu Thr
585 590 595
cac ttg ccg gag cta gag gca aga gac ggc atc tet ctg gcc atg gaa 2241
His Leu Pro Glu Leu Glu Alá Arg Asp Gly Ile Ser Leu Alá Met Glu
600 605 610
gac atc gga acc tet cgt gtt tgg aac atg ege tac agg ttt tgg cet 2289
Asp Ile Gly Thr Ser Arg Val Trp Asn Met Arg Tyr Arg Phe Trp Pro
615 620 625
aac aac aaa agc agg atg tat ctc ctc gag aac acc ggc gat ttt gtg 2337
Asn Asn Lys Ser Arg Met Tyr Leu Leu Glu Asn Thr Gly Asp Phe Val
630 635 640
aaa acc aat ggg ctc caa gaa ggt gat ttc ata gtc ata tac tcc gac 2385
Lys Thr Asn Gly Leu Gin Glu Gly Asp Phe Ile Val Ile Tyr Ser Asp
645 650 655 660
HU 225 785
gtc Val aaa Lys tgt Cys ggc Gly aaa Lys 665 tat Tyr ttg Leu ata Ile cga Arg ggg Gly 670 gtt Val aaa Lys gta Val aga Arg caa Gin 675 ccg Pro 2433
agc gga caa aag ccg gag gcc cca ccg tcg tea gca get acg aag aga 2481
Ser Gly Gin Lys Pro Glu Alá Pro Pro Ser Ser Alá Alá Thr Lys Arg
680 685 690
caa aac aag tcg caa agg aac ata aac aat aac tet ccg tcg gcg aat 2529
Gin Asn Lys Ser Gin Arg Asn Ile Asn Asn Asn Ser Pro Ser Alá Asn
695 700 705
gtg gtg gtc get tea cca act tet caa act gtt aaa tga aaaacagaga 2578
Val Val Val Alá Ser Pro Thr Ser Gin Thr Val Lys
710 715 720
caaaaagaaa caatataaat attattatgt accaaataag aaagagggca aaaggaaaaa 2638 atggcagcgt acccgagtgt gccacttctc gtgcatgcat gggatcttga agacaaatgg 2698 agggtcatga ttaaagctgt ttggtcaggg tccgggtttt tactccattt tttgcctttt 2758 cttgtcgagt cggttctttt ataactcttt actcttttta ccttcaggat attgtagaga 2818 tgattaattc tggaaatggt gtttgtgtta taaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2868 <210> 8 <211> 720 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <400> 8
Met Lys Ser Leu His Val Alá Alá Asn Alá Gly Asp Leu Alá Glu Asp 15 10 15
Cys Gly Ile Leu Gly Gly Asp Alá Asp Asp Thr Val Leu Met Asp Gly 20 25 30
Ile Asp Glu Val Gly Arg Glu Ile Trp Leu Asp Asp His Gly Gly Asp 35 40 45
Asn Asn His Val His Gly His Gin Asp Asp Asp Leu Ile Val His His 50 55 60
Asp Pro Ser Ile Phe Tyr Gly Asp Leu Pro Thr Leu Pro Asp Phe Pro
70 75 80
Cys Met Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Thr Ser Pro Alá Pro Val Asn
90 95
Alá Ile Val Ser Ser Alá Ser Ser Ser Ser Alá Alá Ser Ser Ser Thr 100 105 110
Ser Ser Alá Alá Ser Trp Alá Ile Leu Arg Ser Asp Gly Glu Asp Pro 115 120 125
Thr Pro Asn Gin Asn Gin Tyr Alá Ser Gly Asn Cys Asp Asp Ser Ser 130 135 140
Gly Alá Leu Gin Ser Thr Alá Ser Met Glu Ile Pro Leu Asp Ser Ser
145 150 155 160
Gin Gly Phe Gly Cys Gly Glu Gly Gly Gly Asp Cys Ile Asp Met Met
165 170 175
HU 225 785
Glu Thr Phe Gly Tyr Met Asp Leu Leu Asp Ser Asn Glu Phe Phe Asp
180 185 190
Thr Ser Alá Ile Phe Ser Gin Asp Asp Asp Thr Gin Asn Pro Asn Leu
195 200 205
Met Asp Gin Thr Leu Glu Arg Gin Glu Asp Gin Val Val Val Pro Met
210 215 220
Met Glu Asn Asn Ser Gly Gly Asp Met Gin Met Met Asn Ser Ser Leu
225 230 235 240
Glu Gin Asp Asp Asp Leu Alá Alá Val Phe Leu Glu Trp Leu Lys Asn
245 250 255
Asn Lys Glu Thr Val Ser Alá Glu Asp Leu Arg Lys Val Lys Ile Lys
260 265 270
Lys Alá Thr Ile Glu Ser Alá Alá Arg Arg Leu Gly Gly Gly Lys Glu
275 280 285
Alá Met Lys Gin Leu Leu Lys Leu Ile Leu Glu Trp Val Gin Thr Asn
290 295 300
His Leu Gin Arg Arg Arg Thr Thr Thr Thr Thr Thr Asn Leu Ser Tyr
305 310 315 320
Gin Gin Ser Phe Gin Gin Asp Pro Phe Gin Asn Pro Asn Pro Asn Asn
325 330 335
Asn Asn Leu Ile Pro Pro Ser Asp Gin Thr Cys Phe Ser Pro Ser Thr
340 345 350
Trp Val Pro Pro Pro Pro Gin Gin Gin Alá Phe Val Ser Asp Pro Gly
355 360 365
Phe Gly Tyr Met Pro Alá Pro Asn Tyr Pro Pro Gin Pro Glu Phe Leu
370 375 380
Pro Leu Leu Glu Ser Pro Pro Ser Trp Pro Pro Pro Pro Gin Ser Gly
385 390 395 400
Pro Met Pro His Gin Gin Phe Pro Met Pro Pro Thr Ser Gin Tyr Asn
405 410 415
Gin Phe Gly Asp Pro Thr Gly Phe Asn Gly Tyr Asn Met Asn Pro Tyr
420 425 430
Gin Tyr Pro Tyr Val Pro Alá Gly Gin Met Arg Asp Gin Arg Leu Leu
435 440 445
Arg Leu Cys Ser Ser Alá Thr Lys Glu Alá Arg Lys Lys Arg Met Alá
450 455 460
Arg Gin Arg Arg Phe Leu Ser His His His Arg His Asn Asn Asn Asn
465 470 475 480
Asn Asn Asn Asn Asn Asn Gin Gin Asn Gin Thr Gin Ile Gly Glu Thr
485
490
495
HU 225 785
Cys Alá Alá Val Alá Pro Gin Leu Asn Pro Val Alá Thr Thr Alá Thr 500 505 510
Gly Gly Thr Trp Met Tyr Trp Pro Asn Val Pro Alá Val Pro Pro Gin 515 520 525
Leu Pro Pro Val Met Glu Thr Gin Leu Pro Thr Met Asp Arg Alá Gly 530 535 540
Ser Alá Ser Alá Met Pro Arg Gin Gin Val Val Pro Asp Arg Arg Gin
545 550 555 560
Gly Trp Lys Pro Glu Lys Asn Leu Arg Phe Leu Leu Gin Lys Val Leu
565 570 575
Lys Gin Ser Asp Val Gly Asn Leu Gly Arg Ile Val Leu Pro Lys Lys 580 585 590
Glu Alá Glu Thr His Leu Pro Glu Leu Glu Alá Arg Asp Gly Ile Ser 595 600 605
Leu Alá Met Glu Asp Ile Gly Thr Ser Arg Val Trp Asn Met Arg Tyr 610 615 620
Arg Phe Trp Pro Asn Asn Lys Ser Arg Met Tyr Leu Leu Glu Asn Thr
625 630 635 640
Gly Asp Phe Val Lys Thr Asn Gly Leu Gin Glu Gly Asp Phe Ile Val
645 650 655
Ile Tyr Ser Asp Val Lys Cys Gly Lys Tyr Leu Ile Arg Gly Val Lys 660 665 670
Val Arg Gin Pro Ser Gly Gin Lys Pro Glu Alá Pro Pro Ser Ser Alá 675 680 685
Alá Thr Lys Arg Gin Asn Lys Ser Gin Arg Asn Ile Asn Asn Asn Ser 690 695 700
Pro Ser Alá Asn Val Val Val Alá Ser Pro Thr Ser Gin Thr Val Lys 705 710 715 720 <210> 9 <211> 1500 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <220>
<221> misc_feature <222> (0)...(0) <223> ABI4 cDNA (Genbank Accession No. AF040959) (221) CDS (222) (151)...(1137) <400> 9 aatcgaccat tcacaacgat gacattcaaa cactcttcag tttcccttcc ttcttgattc gtcctctcca ctatttttct caatttcttt aatctctctc tttctctctc tacttcctct
120
HU 225 785 tcctcttctt cttcttcttc ttcttcatct atg gac cet tta get tcc caa cat Met Asp Pro Leu Alá Ser Gin His
5
174
caa Gin cac His 10 aac Asn cat His ctg Leu gaa Glu gat Asp 15 aat Asn aac Asn caa Gin acc Thr cta Leu 20 acc Thr cat His aat Asn aat Asn
cet caa tcc gat tcc acc acc gac tea tea act tcc tcc get caa ege
Pro Gin Ser Asp Ser Thr Thr Asp Ser Ser Thr Ser Ser Alá Gin Arg
25 30 35 40
aaa ege aaa ggc aaa ggt ggt ccg gac aac tcc aag ttc cgt tac cgt
Lys Arg Lys Gly Lys Gly Gly Pro Asp Asn Ser Lys Phe Arg Tyr Arg
45 50 55
ggc gtt cga caa aga agc tgg ggc aaa tgg gtc gcc gag atc cga gag
Gly Val Arg Gin Arg Ser Trp Gly Lys Trp Val Alá Glu Ile Arg Glu
60 65 70
cca cgt aag ege act ege aag tgg ett ggt act ttc gca acc gcc gaa
Pro Arg Lys Arg Thr Arg Lys Trp Leu Gly Thr Phe Alá Thr Alá Glu
75 80 85
gac gcc gca cgt gcc tac gac egg get gcc gtt tac cta tac ggg tea
Asp Alá Alá Arg Alá Tyr Asp Arg Alá Alá Val Tyr Leu Tyr Gly Ser
90 95 100
cgt get cag ctc aac tta acc cet teg tct cet tcc tcc gtc tct tcc
Arg Alá Gin Leu Asn Leu Thr Pro Ser Ser Pro Ser Ser Val Ser Ser
105 110 115 120
tct tcc tcc tcc gtc tcc gcc get tct tct cet tcc acc tcc tct tcc
Ser Ser Ser Ser Val Ser Alá Alá Ser Ser Pro Ser Thr Ser Ser Ser
125 130 135
tcc act caa acc cta aga cet ctc ctc cet ege ccc gcc gcc gcc acc
Ser Thr Gin Thr Leu Arg Pro Leu Leu Pro Arg Pro Alá Alá Alá Thr
140 145 150
gta gga gga gga gcc aac ttt ggt ccg tac ggt atc cet ttt aac aac
Val Gly Gly Gly Alá Asn Phe Gly Pro Tyr Gly Ile Pro Phe Asn Asn
155 160 165
aac atc ttc ett aat ggt ggg acc tct atg tta tgc cet agt tat ggt
Asn Ile Phe Leu Asn Gly Gly Thr Ser Met Leu Cys Pro Ser Tyr Gly
170 175 180
ttt ttc cet caa caa caa caa caa caa aat cag atg gtc cag atg gga
Phe Phe Pro Gin Gin Gin Gin Gin Gin Asn Gin Met Val Gin Met Gly
185 190 195 200
caa ttc caa cac caa cag tat cag aat ett cat tct aat act aac aat
Gin Phe Gin His Gin Gin Tyr Gin Asn Leu His Ser Asn Thr Asn Asn
205 210 215
aac aag att tct gac atc gag ctc act gat gtt ccg gta act aat teg
Asn Lys Ile Ser Asp Ile Glu Leu Thr Asp Val Pro Val Thr Asn Ser
220 225 230
222
270
318
366
414
462
510
558
606
654
702
750
798
846
HU 225 785 act tcg ttt cat cat gag gtg gcg tta ggg cag gaa caa gga gga agt 894
Thr Ser Phe His His Glu Val Alá Leu Gly Gin Glu Gin Gly Gly Ser
235 240 245 ggg tgt aat aat aat agt tcg atg gag gat ttg aac tct cta get ggt 942
Gly Cys Asn Asn Asn Ser Ser Met Glu Asp Leu Asn Ser Leu Alá Gly
250 255 260 tcg gtg ggt tcg agt cta tea ata act cat cca ccg ccg ttg gtt gat 990
Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Ile Thr His Pro Pro Pro Leu Val Asp
265 270 275 280 ccg gta tgt tct atg ggt ctg gat ccg ggt tat atg gtt gga gat gga 1038
Pro Val Cys Ser Met Gly Leu Asp Pro Gly Tyr Met Val Gly Asp Gly
285 290 295 tct tcg acc att tgg cet ttt gga gga gaa gaa gaa tat agt cat aat 1086
Ser Ser Thr Ile Trp Pro Phe Gly Gly Glu Glu Glu Tyr Ser His Asn
300 305 310 tgg ggg agt att tgg gat ttt att gat ccc atc ttg ggg gaa ttc tat 1134
Trp Gly Ser Ile Trp Asp Phe Ile Asp Pro Ile Leu Gly Glu Phe Tyr
315 320 325 taa tttgtttttg tggaagatca tattatatac gatgagcatc cctaaggtcg 1187 ★
gtcaagagca ttggagattc attgttgaga ggaatcaaag agattgeatt ctatgaggag 1247 ctctgcatgc aaaattttgg aggatttttt tactacctat agagataaat aagagggtat 1307 ttttattatt tttttgaaga tttttatttt caaggaattc gtaaaagaga ttacggttcc 1367 aataaagtat gtatatgtgg aagagaateg gaggagatgg tggaaagttg tatgggaatt 1427 ttattggttc aacacttcct tcacagtgtg cctaccttaa tatataatta ttgataggat 1487 atgataattt ctg 1500 <210> 10 <211> 328 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <400> 10
Met Asp Pro Leu Alá Ser Gin His Gin His Asn His Leu Glu Asp Asn 15 10 15
Asn Gin Thr Leu Thr His Asn Asn Pro Gin Ser Asp Ser Thr Thr Asp 20 25 30
Ser Ser Thr Ser Ser Alá Gin Arg Lys Arg Lys Gly Lys Gly Gly Pro 35 40 45
Asp Asn Ser Lys Phe Arg Tyr Arg Gly Val Arg Gin Arg Ser Trp Gly 50 55 60
Lys Trp Val Alá Glu Ile Arg Glu Pro Arg Lys Arg Thr Arg Lys Trp 65 70 75 80
Leu Gly Thr Phe Alá Thr Alá Glu Asp Alá Alá Arg Alá Tyr Asp Arg 85 90 95
Alá Alá Val Tyr Leu Tyr Gly Ser Arg Alá Gin Leu Asn Leu Thr Pro
HU 225 785
Ser Ser Pro 115 Ser Ser Val Ser Ser 120 Ser Ser Ser Ser Val 125 Ser Alá Alá
Ser Ser Pro Ser Thr Ser Ser Ser Ser Thr Gin Thr Leu Arg Pro Leu
130 135 140
Leu Pro Arg Pro Alá Alá Alá Thr Val Gly Gly Gly Alá Asn Phe Gly
145 150 155 160
Pro Tyr Gly Ile Pro Phe Asn Asn Asn Ile Phe Leu Asn Gly Gly Thr
165 170 175
Ser Met Leu Cys Pro Ser Tyr Gly Phe Phe Pro Gin Gin Gin Gin Gin
180 185 190
Gin Asn Gin Met Val Gin Met Gly Gin Phe Gin His Gin Gin Tyr Gin
195 200 205
Asn Leu His Ser Asn Thr Asn Asn Asn Lys Ile Ser Asp Ile Glu Leu
210 215 220
Thr Asp Val Pro Val Thr Asn Ser Thr Ser Phe His His Glu Val Alá
225 230 235 240
Leu Gly Gin Glu Gin Gly Gly Ser Gly Cys Asn Asn Asn Ser Ser Met
245 250 255
Glu Asp Leu Asn Ser Leu Alá Gly Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Ile
260 265 270
Thr His Pro Pro Pro Leu Val Asp Pro Val Cys Ser Met Gly Leu Asp
275 280 285
Pro Gly Tyr Met Val Gly Asp Gly Ser Ser Thr Ile Trp Pro Phe Gly
290 295 300
Gly Glu Glu Glu Tyr Ser His Asn Trp Gly Ser Ile Trp Asp Phe Ile
305 310 315 320
Asp Pro Ile Leu Gly Glu Phe Tyr
325 <210> 11 <211> 286 <212> DNA <213> Glycine max <220>
<221> promoter <222> (0)...(0) <223> Oleosin promoter (Genbank Accession No. U71381) <400> 11 actaatttat gtaatgtgat ttcaataagt gaggtaaact ccgattgatt gaagatacca 60 ccaacaccaa caccaccacc acctgcgaaa ctgtacgtat ctcaattgtc cttaataaaa 120 atgtaaatag tacattattc tccttgcctg tcattattta tgtgccccca gcttaatttt 180 tctgatgtac ttaacccagg gcaaaactga aacaagttcc tcatgcaaag ccccaactca 240 tcatgcatca tgtaccgtgt catcatccag caactccact tttgca 286
HU 225 785 <210> 12 <211> 940 <212> DNA <213> Brassica juncea <220>
<221> promoter <222> (0)...(0) <223> Oleosin promoter (Genbank Accession No. AF134411) <400> 12 tctagaactt tcgggataaa gcaatcacct ggcgattcaa cgtggtcgga tcatgacgtt 60 cccagaagac atcgagtaag ctctcgaagc tgacctcttg cggatcgtac tgaacccgaa 120 caatctcgtt atgtcccgtc gtctccgaac agacatcctc gtatctcgga ttatcgacta 180 atccatggct atacccaacc tccgtcttcg tcacgcctgg aaccctctgg tacgccaatt 240 ccgctcccca gaaacaaccg gcgccgaatt gcgcgaattg ctgacctggg agacggaaca 300 tcgtcgtcgg gtccttgcgc gattgcggcg gaagccgggt cgggttgggg acgaaaccga 360 atccgagcct ggtgaatagg ttgttcatcg gagatttata gacggagatg gatctagcgt 420 tttgggaaag ggaagtggtt tggctctttt ggatagagag agtgcagctt tggagagaga 480 ctggagaggt ttagagagag acgcggcgga gattaccgga ggagaggcga cgagagatag 540 cattatcgaa gggaagggag aaagagtgac gtggagaaat aagaaaccgt taagagtcgg 600 atatttatta tattaaaagc ccaatgggcc taaacccatt taaacaagac aagataaatg 660 ggccgtgtgg taacagagtg ttacgttcgg cttcaaatgc caacgccata ggaacaaaac 720 aaacgtgtcc tcaagtaaac ccctgccgtt tacacctcaa tgactgcatg gtgaagccat 780 taacacgtgg cgtaggatgc atgacgacgc cattgacacc tgactttctt cccttctctt 840 catatatctc taatcaattc aactactcac agtcatagct attcggaaaa tacatacaca 900 tccttttctc ttcgatctct ctcaattcac aagaagcaaa 940 <210> 13 <211> 807 <212> DNA <213> Hordeum vulgare <220>
<221> promoter <222> (0)...(0) <223> lpt2 promoter <400> 13 gatctcgatg tgtagtctac gagaagggtt aaccgtctct tcgtgagaat aaccgtggcc 60 taaaaataag ccgatgagga taaataaaat gtggtggtac agtacttcaa gaggtttact 120 catcaagagg atgcttttcc gatgagctct agtagtacat cggacctcac atacctccat 180 tgtggtgaaa tattttgtgc tcatttagtg atgggtaaat tttgtttatg tcactctagg 240 ttttgacatt tcagttttgc cactcttagg ttttgacaaa taatttccat tccgcggcaa 300 aagcaaaaca attttatttt acttttacca ctcttagctt tcacaatgta tcacaaatgc 360 cactctagaa attctgttta tgccacagaa tgtgaaaaaa aacactcact tatttgaagc 420 caaggtgttc atggcatgga aatgtgacat aaagtaacgt tcgtgtataa gaaaaaattg 480 tactcctcgt aacaagagac ggaaacatca tgagacaatc gcgtttggaa ggctttgcat 540 cacctttgga tgatgcgcat gaatggagtc gtctgcttgc tagccttcgc ctaccgccca 600 ctgagtccgg gcggcaacta ccatcggcga acgacccagc tgacctctac cgaccggact 660 tgaatgcgct accttcgtca gcgacgatgg ccgcgtacgc tggcgacgtg cccccgcatg 720 catggcggca catggcgagc tcagaccgtg cgtggctggc tacaaatacg taccccgtga 780 gtgccctagc tagaaactta cacctgc 807

Claims (44)

  1. SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1. Eljárás növényben a magfejlődés, magbélfejlődés vagy magérés során abszcizinsavra (ABA) adott válasz befolyásolására, azzal jellemezve, hogy az illető növénybe egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezetet juttatunk be, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest.
  2. 2. Az 1. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a befolyásolás az ABA-ra adott válasz csökkentése.
  3. 3. A 2. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a következők által alkotott csoportból kiválasztott:
    a) az 1., 3., 5., 7. vagy 9. számú szekvenciavázlatban bemutatott nukleotidszekvencia;
    b) a 2., 4., 6., 8. vagy 10. számú szekvenciavázlatban bemutatott polipeptidet kódoló nukleotidszekvencia;
    c) az 1., 3., 5., 7. vagy 9. számú szekvenciavázlatban bemutatottal legalább 70% szekvenciaazonosságot mutató nukleotidszekvencia, amely szekvencia expressziója csökkenti az ABA-ra adott választ;
    d) az 1., 3., 5., 7. vagy 9. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia komplementjével 50% formamidot, 1 M nátrium-kloridot, 1% SDS-t tartalmazó elegyben 37 °C-on szigorú körülmények között végzett hibridizálást és 0,1*SSC-ben 60-65 °C-on végzett mosást követően hibridizáló nukleotidszekvencia, amely nukleotidszekvencia expressziója csökkenti az ABA-ra adott választ;
    e) az a), b), c) vagy d) pont szerinti nukleotidszekvencia antiszensz szekvenciáját tartalmazó nukleinsavmolekula; és
    f) az 1., 3., 5., 7. vagy 9. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia legalább 20 egymást követő nukleotldját tartalmazó nukleinsavmolekula, amely nukleinsavmolekula expressziója csökkenti az ABA-ra adott választ.
  4. 4. Eljárás fejlődő növényi magot, érésben levő növényi magot vagy fejlődő magbelet érő stressz káros hatásainak megelőzésére, azzal jellemezve, hogy az illető növénybe egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezetet juttatunk be, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest.
  5. 5. A 4. igénypont szerinti eljárás, ahol az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia expressziója befolyásolja az ABA-ra adott választ.
  6. 6. Az 5. igénypont szerinti eljárás, ahol a befolyásolás az ABA-ra adott csökkentett válasz.
  7. 7. A 6. igénypont szerinti eljárás, ahol az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a 3. igénypontban megadott.
  8. 8. A 2. vagy 6. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett kapcsolt szekvencia egy, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia antiszensz szekvenciája.
  9. 9. A 2. vagy 6. Igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett kapcsolt szekvencia egy, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó mutáns szekvencia, és egy, az aő/Ί és abi2 által alkotott csoportból választott szekvenciát tartalmaz.
  10. 10. Az 1. vagy 4. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia megfelel egy, a növényből származó szekvenciának.
  11. 11. Az 1-10. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett növény egy egyszikű vagy kétszikű.
  12. 12. A 11. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett növény egy gabona.
  13. 13. A 12. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett gabona kukorica.
  14. 14. A 2. vagy 6. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a bejuttatás keresztezéssel vagy transzformációval történik.
  15. 15. Növény, amelybe egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó olyan DNS-szerkezet van stabilan bejuttatva, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest.
  16. 16. A 15. igénypont szerinti növény, amelyben az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia expressziója befolyásolja az ABA-ra adott választ.
  17. 17. A 16. igénypont szerinti növény, amelyben az említett befolyásolás csökkenti az ABA-ra adott választ.
  18. 18. A 16. igénypont szerinti növény, amelyben az említett szekvencia az ABA érzékelésében és jelátvitelében vesz részt, és egy kódolószekvencia.
  19. 19. A 15. igénypont szerinti növény, amelyben az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a 3. vagy 8-10. igénypontok bármelyikében meghatározott.
  20. 20. A 15. igénypont szerinti növény, amelyben az említett DNS-szerkezet stabilan integrálva van a növény genomjába.
  21. 21. Növényi sejt, amelynek genomjába egy olyan DNS-szerkezet van bejuttatva, amely egy korai magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmaz, amelyben az említett korai magbél/embrió promoter az említett kapcsolt szekvenciához képest heterológ.
  22. 22. A 21. igénypont szerinti növényi sejt, amelyben az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia expressziója befolyásolja az ABA-ra adott választ.
  23. 23. A 22. igénypont szerinti növényi sejt, amelyben az említett befolyásolás csökkenti az ABA-ra adott választ.
    HU 225 785
  24. 24. A 21. igénypont szerinti növényi sejt, amelyben az említett szekvencia az ABA érzékelésében és jelátvitelében vesz részt, és egy kódolószekvencia.
  25. 25. A 21. igénypont szerinti növényi sejt, amelyben az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a 3. vagy 8-10. igénypontok bármelyikében meghatározott.
  26. 26. Eljárás fejlődő növényi magot, érésben levő növényi magot vagy fejlődő magbelet érő stressz káros hatásának megelőzésére, azzal jellemezve, hogy egy késői magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó DNS-szerkezetet juttatunk be egy olyan növénybe, ahol a növénynek egy, az ABA érzékelésében és jelátvitelében érintett említett szekvenciára funkcióvesztéses mutációja van, és az említett késői magbél/embrió promoter az említett kapcsolt szekvenciához képest heterológ.
  27. 27. A 26. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a bejuttatás egy első növénynek - amelynek genomjába az említett DNS-szerkezet stabilan be van épülve - egy második növénnyel való keresztezéséből - amelynek egy, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciára funkcióvesztéses mutációja van - és az utód izolálásából áll.
  28. 28. A 26. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a befolyásolás az ABA-ra adott válasz csökkentése.
  29. 29. A 26. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a következők által alkotott csoportból kiválasztott:
    a) az 1. vagy 7. számú szekvenciavázlatban bemutatott nukleotidszekvencia;
    b) a 2. vagy 8. számú szekvenciavázlatban bemutatott polipeptidet kódoló nukleotidszekvencia;
    c) az 1. vagy 7. számú szekvenciavázlatban bemutatottal legalább 70% azonosságot mutató olyan nukleotidszekvencia, ahol az 1. számú szekvenciavázlatban bemutatottal legalább 70% azonosságot mutató nukleotidszekvencia egy VP1-aktivitással rendelkező polipeptidet, a 7. számú szekvenciavázlatban bemutatottal legalább 70% azonosságot mutató nukleotidszekvencia pedig egy ABI3-aktivitással rendelkező polipeptidet kódol;
    d) az 1. vagy 7. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia komplementjével 50% formamidot, 1 M nátrium-klorldot, 1% SDS-t tartalmazó elegyben 37 °C-on szigorú körülmények között végzett hibridizálást és 0,1*SSC-ben 60-65 °C-on végzett mosást jelentő szigorú körülmények között hibridizáló olyan nukleotidszekvencia, ahol az 1. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia komplementjével szigorú körülmények között hibridizáló nukleotidszekvencia egy VP1-aktivitással rendelkező polipeptidet, a 7. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia komplementjével szigorú körülmények között hibridizáló nukleotidszekvencia pedig egy ABI3-aktivitással rendelkező polipeptidet kódol; és
    e) az 1. vagy 7. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia legalább 20 egymást követő nukleotidját tartalmazó olyan nukleinsavmolekula, ahol az 1. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia legalább 20 egymást követő nukleotidját tartalmazó nukleinsavmolekula egy VP1-aktivitással rendelkező polipeptidet, a 7. számú szekvenciavázlatban bemutatott szekvencia legalább 20 egymást követő nukleotidját tartalmazó nukleinsavmolekula pedig egy ABI3-aktivitással rendelkező polipeptidet kódol.
  30. 30. A 26-29. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az említett késői magbél/embrió promoter egy oleozinpromoter.
  31. 31. A 26. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a DNS-szerkezetet transzformálással juttatjuk be.
  32. 32. Növény, amely egy késői magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó, stabilan beépült DNS-szerkezettel rendelkezik, ahol a késői magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest.
  33. 33. A 32. igénypont szerinti növény, amely egy endogén, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciában még egy funkcióvesztéses mutációt is tartalmaz.
  34. 34. A 33. igénypont szerinti növény, amelyben az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a 29. igénypontban megadott.
  35. 35. A 32-34. igénypontok bármelyike szerinti növény, amelyben az említett késői magbél/embrió promoter egy oleozinpromoter.
  36. 36. Növényi sejt, amely egy késői magbél/embrió promoterhez működőképesen kapcsolt, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciát tartalmazó, stabilan beépült DNS-szerkezettel rendelkezik, ahol a késői magbél/embrió promoter heterológ az említett kapcsolt szekvenciához képest.
  37. 37. A 36. igénypont szerinti növényi sejt, amely még egy funkcióvesztéses mutációt is tartalmaz egy endogén, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvenciában.
  38. 38. A 36. igénypont szerinti növényi sejt, amelyben az említett, az ABA érzékelésében és jelátvitelében szerepet játszó szekvencia a 29. igénypontban megadott.
  39. 39. A 15-20. vagy 32-35. igénypontok bármelyike szerinti növény, amely növény egy egyszikű vagy kétszikű.
  40. 40. A 39. igénypont szerinti növény, amely egyszikű növény kukorica.
  41. 41. A 15-20., 32-35., 39. vagy 40. igénypontok bármelyike szerinti növény transzformált magja.
  42. 42. A 15-20., 32-35., 39. vagy 40. igénypontok bármelyike szerinti növény transzformált utódja.
  43. 43. A 21-25. vagy 36-38. igénypontok bármelyike szerinti növényi sejt, amely növényi sejt egy egyszikűből vagy kétszikűből származik.
  44. 44. A 43. igénypont szerinti növényi sejt, ahol az említett egyszikű kukorica.
HU0204207A 1999-11-17 2000-11-17 Modulation of plant response to abscisic acid HU225785B1 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US16608099P 1999-11-17 1999-11-17
PCT/US2000/031739 WO2001036596A2 (en) 1999-11-17 2000-11-17 Modulation of plant response to abscisic acid

Publications (3)

Publication Number Publication Date
HUP0204207A2 HUP0204207A2 (hu) 2003-04-28
HUP0204207A3 HUP0204207A3 (en) 2004-10-28
HU225785B1 true HU225785B1 (en) 2007-09-28

Family

ID=22601740

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU0204207A HU225785B1 (en) 1999-11-17 2000-11-17 Modulation of plant response to abscisic acid

Country Status (11)

Country Link
US (1) US8115052B2 (hu)
EP (1) EP1230377B1 (hu)
AT (1) ATE287964T1 (hu)
AU (1) AU779111B2 (hu)
CA (1) CA2391879C (hu)
DE (1) DE60017781T2 (hu)
ES (1) ES2236005T3 (hu)
HU (1) HU225785B1 (hu)
MX (1) MXPA02004932A (hu)
PT (1) PT1230377E (hu)
WO (1) WO2001036596A2 (hu)

Families Citing this family (65)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7718699B1 (en) * 2005-03-04 2010-05-18 Broyles Robert H Abscissic acid and derivatives thereof for the treatment of diseases
WO2005113771A1 (en) 2004-05-13 2005-12-01 Applied Biotechnology Institute Llc An embryo preferred promoter and method of using same
MX2010008882A (es) * 2008-02-13 2010-10-25 Pioneer Hi Bred Int Genes de señalizacion de aba de zea mays y metodos de uso.
US7947877B2 (en) 2008-05-14 2011-05-24 Monosanto Technology LLC Plants and seeds of spring canola variety SCV328921
US7964774B2 (en) 2008-05-14 2011-06-21 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV384196
US7935870B2 (en) 2008-05-14 2011-05-03 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV354718
US8829282B2 (en) 2008-05-14 2014-09-09 Monsanto Technology, Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV425044
CN106434738A (zh) 2009-02-13 2017-02-22 加州大学董事会 用于改善植物抗逆性的组成型活性的pyr/pyl受体蛋白
WO2010147825A1 (en) 2009-06-09 2010-12-23 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Early endosperm promoter and methods of use
US8071848B2 (en) 2009-06-17 2011-12-06 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV218328
US8440891B2 (en) 2009-09-22 2013-05-14 Board of Trustees of the University of Akransas, N.A. Rice cultivar CL 142-AR
BR112012007516A2 (pt) 2009-10-02 2015-09-15 Pioneer Hi Bred Int ácido nucléico isolado, plantas , células vegetais, métodos de redução de produção de etileno em uma planta, de aumento de produtividade em uma planta e de aumento de tolerância à aridez, cassete de expressão e semente
US8440892B2 (en) 2009-10-15 2013-05-14 Board Of Trustees Of The University Of Arkansas, N.A. Rice cultivar CL 181-AR
MX2012004819A (es) 2009-10-26 2012-06-25 Pioneer Hi Bred Int Promotor especifico de ovulo somatico y metodos de uso.
US8148611B2 (en) 2010-02-26 2012-04-03 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV453784
US8138394B2 (en) 2010-02-26 2012-03-20 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV431158
US8143488B2 (en) 2010-02-26 2012-03-27 Monsanto Technoloy LLC Plants and seeds of spring canola variety SCV470336
US8581048B2 (en) 2010-03-09 2013-11-12 Monsanto Technology, Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV119103
US8153865B2 (en) 2010-03-11 2012-04-10 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV152154
AR081242A1 (es) * 2010-04-28 2012-07-18 Univ California Receptores pyr/pyl modificados activados por ligandos ortogonales
US8513487B2 (en) 2011-04-07 2013-08-20 Zenon LISIECZKO Plants and seeds of spring canola variety ND-662c
US8513494B2 (en) 2011-04-08 2013-08-20 Chunren Wu Plants and seeds of spring canola variety SCV695971
WO2012148835A1 (en) 2011-04-29 2012-11-01 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Down-regulation of a homeodomain-leucine zipper i-class homeobox gene for improved plant performance
US8507761B2 (en) 2011-05-05 2013-08-13 Teresa Huskowska Plants and seeds of spring canola variety SCV372145
US8513495B2 (en) 2011-05-10 2013-08-20 Dale Burns Plants and seeds of spring canola variety SCV291489
HUE042487T2 (hu) 2011-07-01 2019-06-28 Univ California Konstitutívan aktív aba receptormutánsok
CA2879993A1 (en) * 2011-10-13 2013-04-18 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Drought tolerant genes and methods of use
US9204603B2 (en) 2011-12-21 2015-12-08 The Curators Of The University Of Missouri Soybean variety S05-11482
US20130167262A1 (en) 2011-12-21 2013-06-27 The Curators Of The University Of Missouri Soybean variety s05-11268
EP2800816A1 (en) 2012-01-06 2014-11-12 Pioneer Hi-Bred International Inc. Ovule specific promoter and methods of use
US9006515B2 (en) 2012-01-06 2015-04-14 Pioneer Hi Bred International Inc Pollen preferred promoters and methods of use
US8835720B2 (en) 2012-04-26 2014-09-16 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV967592
US8878009B2 (en) 2012-04-26 2014-11-04 Monsanto Technology, LLP Plants and seeds of spring canola variety SCV318181
US8802935B2 (en) 2012-04-26 2014-08-12 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV942568
US8859857B2 (en) 2012-04-26 2014-10-14 Monsanto Technology Llc Plants and seeds of spring canola variety SCV259778
CA2887571A1 (en) 2012-10-11 2014-04-17 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Guard cell promoters and uses thereof
CA2905743C (en) 2013-03-13 2021-09-28 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Glyphosate application for weed control in brassica
CA3200166A1 (en) 2013-03-14 2014-09-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
CN105051196B (zh) 2013-03-14 2018-07-17 加利福尼亚大学董事会 正交配体激活的修饰的pyr/pyl受体
CA2901316A1 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Phi-4 polypeptides and methods for their use
WO2015023846A2 (en) 2013-08-16 2015-02-19 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
ES2937045T3 (es) 2013-09-13 2023-03-23 Pioneer Hi Bred Int Proteínas insecticidas y métodos para su uso
MX2016010187A (es) 2014-02-07 2017-07-11 Pioneer Hi Bred Int Proteinas insecticidas y metodos para su uso.
US20170218384A1 (en) 2014-08-08 2017-08-03 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Ubiquitin promoters and introns and methods of use
US20170247719A1 (en) 2014-09-17 2017-08-31 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
BR112017007932A2 (pt) 2014-10-16 2018-01-23 Du Pont proteínas inseticidas e métodos para uso das mesmas
US20170359965A1 (en) 2014-12-19 2017-12-21 E I Du Pont De Nemours And Company Polylactic acid compositions with accelerated degradation rate and increased heat stability
CN116333064A (zh) 2015-05-19 2023-06-27 先锋国际良种公司 杀昆虫蛋白及其使用方法
WO2016205445A1 (en) 2015-06-16 2016-12-22 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
EP3943602A1 (en) 2015-08-06 2022-01-26 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Plant derived insecticidal proteins and methods for their use
CA2992488A1 (en) 2015-08-28 2017-03-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Ochrobactrum-mediated transformation of plants
US20180325119A1 (en) 2015-12-18 2018-11-15 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
US11104911B2 (en) 2015-12-22 2021-08-31 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Embryo-preferred Zea mays promoters and methods of use
EP3960863A1 (en) 2016-05-04 2022-03-02 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
CA3022858A1 (en) 2016-06-16 2017-12-21 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
EP4083215A1 (en) 2016-06-24 2022-11-02 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Plant regulatory elements and methods of use thereof
MX2018015906A (es) 2016-07-01 2019-04-04 Pioneer Hi Bred Int Proteinas insecticidas de plantas y metodos para sus usos.
US20210292778A1 (en) 2016-07-12 2021-09-23 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods to control insect pests
EP3535285B1 (en) 2016-11-01 2022-04-06 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use
US10905120B2 (en) 2016-11-28 2021-02-02 The Regents Of The University Of California ABA receptor agonists that modulate transpiration
CN111373046A (zh) 2017-09-25 2020-07-03 先锋国际良种公司 组织偏好性启动子和使用方法
US11702668B2 (en) 2018-05-22 2023-07-18 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Plant regulatory elements and methods of use thereof
US20210277409A1 (en) 2018-06-28 2021-09-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methods for selecting transformed plants
CA3111090A1 (en) 2018-10-31 2020-05-07 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods for ochrobactrum-mediated plant transformation
US20230235352A1 (en) 2020-07-14 2023-07-27 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Insecticidal proteins and methods for their use

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1999055840A1 (en) 1998-04-27 1999-11-04 The Regents Of The University Of California A transcription factor and method for regulation of seed development, quality and stress-tolerance

Also Published As

Publication number Publication date
WO2001036596A3 (en) 2002-01-17
ATE287964T1 (de) 2005-02-15
WO2001036596A2 (en) 2001-05-25
US20040148654A1 (en) 2004-07-29
AU779111B2 (en) 2005-01-06
DE60017781T2 (de) 2006-01-05
CA2391879C (en) 2006-04-25
HUP0204207A3 (en) 2004-10-28
AU1777501A (en) 2001-05-30
PT1230377E (pt) 2005-05-31
HUP0204207A2 (hu) 2003-04-28
ES2236005T3 (es) 2005-07-16
CA2391879A1 (en) 2001-05-25
MXPA02004932A (es) 2003-02-27
EP1230377B1 (en) 2005-01-26
US8115052B2 (en) 2012-02-14
EP1230377A2 (en) 2002-08-14
DE60017781D1 (de) 2005-03-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
HU225785B1 (en) Modulation of plant response to abscisic acid
MXPA04011039A (es) Secuencias de polinucleotidos semejantes a clavata 3 de maiz y metodos de uso.
CN104703998B (zh) 植物中雄性育性的遗传减少
EP0698098A1 (en) Method for obtaining male-sterile plants
US20020083494A1 (en) Genes regulating circadian clock function and photoperiodism
US6713666B2 (en) Invertase inhibitors and methods of use
JP3357907B2 (ja) ペチュニアの転写因子PetSPL2の遺伝子の導入によって花序の節間を短縮させる方法
US7544857B2 (en) Brachytic2 (Br2) promoter from maize and methods of use
US6887988B2 (en) Plant reproduction polynucleotides and methods of use
US8124836B2 (en) Zea mays ABA signaling genes and methods of use
US20020059657A1 (en) Homeobox binding sites and their uses
AU2012361915A1 (en) Use of auxin synthase for improving crop yield
AU2002337759A1 (en) Plant reproduction polynucleotides and methods of use
WO2002078426A2 (en) Final segregation of male meiotic products in plants

Legal Events

Date Code Title Description
TH4A Erratum
MM4A Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees